JPWO2009099005A1 - 胃癌の評価方法、ならびに胃癌評価装置、胃癌評価方法、胃癌評価システム、胃癌評価プログラムおよび記録媒体 - Google Patents
胃癌の評価方法、ならびに胃癌評価装置、胃癌評価方法、胃癌評価システム、胃癌評価プログラムおよび記録媒体 Download PDFInfo
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Abstract
Description
a1×Orn/(Trp+His) + b1×(ABA+Ile)/Leu + c1
・・・(数式1)
a2×Glu/His + b2×Ser/Trp + c2×Arg/Pro + d2
・・・(数式2)
a3×Trp/Gln + b3×His/Glu + c3
・・・(数式3)
a4×Gly/(Glu+Trp+Val) + b4×Arg/His + c4
・・・(数式4)
a5×Ile/Glu + b5×(Gly+Asn+Arg)/His + c5
・・・(数式5)
(数式1においてa1,b1はゼロでない任意の実数、c1は任意の実数であり、数式2においてa2,b2,c2はゼロでない任意の実数、d2は任意の実数であり、数式3においてa3,b3はゼロでない任意の実数、c3は任意の実数であり、数式4においてa4,b4はゼロでない任意の実数、c4は任意の実数であり、数式5においてa5,b5はゼロでない任意の実数、c5は任意の実数である。)
a1×Orn/(Trp+His) + b1×(ABA+Ile)/Leu + c1
・・・(数式1)
a2×Glu/His + b2×Ser/Trp + c2×Arg/Pro + d2
・・・(数式2)
a3×Trp/Gln + b3×His/Glu + c3
・・・(数式3)
a4×Gly/(Glu+Trp+Val) + b4×Arg/His + c4
・・・(数式4)
a5×Ile/Glu + b5×(Gly+Asn+Arg)/His + c5
・・・(数式5)
(数式1においてa1,b1はゼロでない任意の実数、c1は任意の実数であり、数式2においてa2,b2,c2はゼロでない任意の実数、d2は任意の実数であり、数式3においてa3,b3はゼロでない任意の実数、c3は任意の実数であり、数式4においてa4,b4はゼロでない任意の実数、c4は任意の実数であり、数式5においてa5,b5はゼロでない任意の実数、c5は任意の実数である。)
a1×Orn/(Trp+His) + b1×(ABA+Ile)/Leu + c1
・・・(数式1)
a2×Glu/His + b2×Ser/Trp + c2×Arg/Pro + d2
・・・(数式2)
a3×Trp/Gln + b3×His/Glu + c3
・・・(数式3)
a4×Gly/(Glu+Trp+Val) + b4×Arg/His + c4
・・・(数式4)
a5×Ile/Glu + b5×(Gly+Asn+Arg)/His + c5
・・・(数式5)
(数式1においてa1,b1はゼロでない任意の実数、c1は任意の実数であり、数式2においてa2,b2,c2はゼロでない任意の実数、d2は任意の実数であり、数式3においてa3,b3はゼロでない任意の実数、c3は任意の実数であり、数式4においてa4,b4はゼロでない任意の実数、c4は任意の実数であり、数式5においてa5,b5はゼロでない任意の実数、c5は任意の実数である。)
a1×Orn/(Trp+His) + b1×(ABA+Ile)/Leu + c1
・・・(数式1)
a2×Glu/His + b2×Ser/Trp + c2×Arg/Pro + d2
・・・(数式2)
a3×Trp/Gln + b3×His/Glu + c3
・・・(数式3)
a4×Gly/(Glu+Trp+Val) + b4×Arg/His + c4
・・・(数式4)
a5×Ile/Glu + b5×(Gly+Asn+Arg)/His + c5
・・・(数式5)
(数式1においてa1,b1はゼロでない任意の実数、c1は任意の実数であり、数式2においてa2,b2,c2はゼロでない任意の実数、d2は任意の実数であり、数式3においてa3,b3はゼロでない任意の実数、c3は任意の実数であり、数式4においてa4,b4はゼロでない任意の実数、c4は任意の実数であり、数式5においてa5,b5はゼロでない任意の実数、c5は任意の実数である。)
a1×Orn/(Trp+His) + b1×(ABA+Ile)/Leu + c1
・・・(数式1)
a2×Glu/His + b2×Ser/Trp + c2×Arg/Pro + d2
・・・(数式2)
a3×Trp/Gln + b3×His/Glu + c3
・・・(数式3)
a4×Gly/(Glu+Trp+Val) + b4×Arg/His + c4
・・・(数式4)
a5×Ile/Glu + b5×(Gly+Asn+Arg)/His + c5
・・・(数式5)
(数式1においてa1,b1はゼロでない任意の実数、c1は任意の実数であり、数式2においてa2,b2,c2はゼロでない任意の実数、d2は任意の実数であり、数式3においてa3,b3はゼロでない任意の実数、c3は任意の実数であり、数式4においてa4,b4はゼロでない任意の実数、c4は任意の実数であり、数式5においてa5,b5はゼロでない任意の実数、c5は任意の実数である。)
a1×Orn/(Trp+His) + b1×(ABA+Ile)/Leu + c1
・・・(数式1)
a2×Glu/His + b2×Ser/Trp + c2×Arg/Pro + d2
・・・(数式2)
a3×Trp/Gln + b3×His/Glu + c3
・・・(数式3)
a4×Gly/(Glu+Trp+Val) + b4×Arg/His + c4
・・・(数式4)
a5×Ile/Glu + b5×(Gly+Asn+Arg)/His + c5
・・・(数式5)
(数式1においてa1,b1はゼロでない任意の実数、c1は任意の実数であり、数式2においてa2,b2,c2はゼロでない任意の実数、d2は任意の実数であり、数式3においてa3,b3はゼロでない任意の実数、c3は任意の実数であり、数式4においてa4,b4はゼロでない任意の実数、c4は任意の実数であり、数式5においてa5,b5はゼロでない任意の実数、c5は任意の実数である。)
a1×Orn/(Trp+His) + b1×(ABA+Ile)/Leu + c1
・・・(数式1)
a2×Glu/His + b2×Ser/Trp + c2×Arg/Pro + d2
・・・(数式2)
a3×Trp/Gln + b3×His/Glu + c3
・・・(数式3)
a4×Gly/(Glu+Trp+Val) + b4×Arg/His + c4
・・・(数式4)
a5×Ile/Glu + b5×(Gly+Asn+Arg)/His + c5
・・・(数式5)
(数式1においてa1,b1はゼロでない任意の実数、c1は任意の実数であり、数式2においてa2,b2,c2はゼロでない任意の実数、d2は任意の実数であり、数式3においてa3,b3はゼロでない任意の実数、c3は任意の実数であり、数式4においてa4,b4はゼロでない任意の実数、c4は任意の実数であり、数式5においてa5,b5はゼロでない任意の実数、c5は任意の実数である。)
a1×Orn/(Trp+His) + b1×(ABA+Ile)/Leu + c1
・・・(数式1)
a2×Glu/His + b2×Ser/Trp + c2×Arg/Pro + d2
・・・(数式2)
a3×Trp/Gln + b3×His/Glu + c3
・・・(数式3)
a4×Gly/(Glu+Trp+Val) + b4×Arg/His + c4
・・・(数式4)
a5×Ile/Glu + b5×(Gly+Asn+Arg)/His + c5
・・・(数式5)
(数式1においてa1,b1はゼロでない任意の実数、c1は任意の実数であり、数式2においてa2,b2,c2はゼロでない任意の実数、d2は任意の実数であり、数式3においてa3,b3はゼロでない任意の実数、c3は任意の実数であり、数式4においてa4,b4はゼロでない任意の実数、c4は任意の実数であり、数式5においてa5,b5はゼロでない任意の実数、c5は任意の実数である。)
102 制御部
102a 要求解釈部
102b 閲覧処理部
102c 認証処理部
102d 電子メール生成部
102e Webページ生成部
102f 受信部
102g 胃癌状態情報指定部
102h 多変量判別式作成部
102h1 候補多変量判別式作成部
102h2 候補多変量判別式検証部
102h3 変数選択部
102i 判別値算出部
102j 判別値基準評価部
102j1 判別値基準判別部
102k 結果出力部
102m 送信部
104 通信インターフェース部
106 記憶部
106a 利用者情報ファイル
106b アミノ酸濃度データファイル
106c 胃癌状態情報ファイル
106d 指定胃癌状態情報ファイル
106e 多変量判別式関連情報データベース
106e1 候補多変量判別式ファイル
106e2 検証結果ファイル
106e3 選択胃癌状態情報ファイル
106e4 多変量判別式ファイル
106f 判別値ファイル
106g 評価結果ファイル
108 入出力インターフェース部
112 入力装置
114 出力装置
200 クライアント装置(情報通信端末装置)
300 ネットワーク
400 データベース装置
[1−1.本発明の概要]
ここでは、本発明にかかる胃癌の評価方法の概要について図1を参照して説明する。図1は本発明の基本原理を示す原理構成図である。
a1×Orn/(Trp+His) + b1×(ABA+Ile)/Leu + c1
・・・(数式1)
a2×Glu/His + b2×Ser/Trp + c2×Arg/Pro + d2
・・・(数式2)
a3×Trp/Gln + b3×His/Glu + c3
・・・(数式3)
a4×Gly/(Glu+Trp+Val) + b4×Arg/His + c4
・・・(数式4)
a5×Ile/Glu + b5×(Gly+Asn+Arg)/His + c5
・・・(数式5)
(数式1においてa1,b1はゼロでない任意の実数、c1は任意の実数であり、数式2においてa2,b2,c2はゼロでない任意の実数、d2は任意の実数であり、数式3においてa3,b3はゼロでない任意の実数、c3は任意の実数であり、数式4においてa4,b4はゼロでない任意の実数、c4は任意の実数であり、数式5においてa5,b5はゼロでない任意の実数、c5は任意の実数である。)
ここでは、第1実施形態にかかる胃癌の評価方法について図2を参照して説明する。図2は、第1実施形態にかかる胃癌の評価方法の一例を示すフローチャートである。
以上、詳細に説明したように、第1実施形態にかかる胃癌の評価方法によれば、(1)個体から採取した血液からアミノ酸濃度データを測定し、(2)測定した個体のアミノ酸濃度データから欠損値や外れ値などのデータを除去し、(3)欠損値や外れ値などのデータが除去された個体のアミノ酸濃度データに含まれるAsn,Cys,His,Met,Orn,Phe,Trp,Pro,Lys,Leu,Glu,Arg,Ala,Thr,Tyrのうち少なくとも1つの濃度値と予め設定された閾値(カットオフ値)とを比較することで、個体につき、胃癌または非胃癌であるか否かを判別、胃癌の病期を判別、または胃癌の他器官への転移の有無を判別する、もしくは欠損値や外れ値などのデータが除去された個体のアミノ酸濃度データに含まれるAsn,Cys,His,Met,Orn,Phe,Trp,Pro,Lys,Leu,Glu,Arg,Ala,Thr,Tyrのうち少なくとも1つの濃度値およびAsn,Cys,His,Met,Orn,Phe,Trp,Pro,Lys,Leu,Glu,Arg,Ala,Thr,Tyrのうち少なくとも1つを変数として含む予め設定した多変量判別式に基づいて判別値を算出し、算出した判別値と予め設定された閾値(カットオフ値)とを比較することで、個体につき、胃癌または非胃癌であるか否かを判別、胃癌の病期を判別、または胃癌の他器官への転移の有無を判別する。これにより、血液中のアミノ酸の濃度のうち胃癌と非胃癌との2群判別や胃癌の病期の判別や胃癌の他器官への転移の有無の2群判別に有用なアミノ酸の濃度を利用又はこれらの判別に有用な多変量判別式で得られる判別値を利用して、これらの判別を精度よく行うことができる。
a1×Orn/(Trp+His) + b1×(ABA+Ile)/Leu + c1
・・・(数式1)
a2×Glu/His + b2×Ser/Trp + c2×Arg/Pro + d2
・・・(数式2)
a3×Trp/Gln + b3×His/Glu + c3
・・・(数式3)
a4×Gly/(Glu+Trp+Val) + b4×Arg/His + c4
・・・(数式4)
a5×Ile/Glu + b5×(Gly+Asn+Arg)/His + c5
・・・(数式5)
(数式1においてa1,b1はゼロでない任意の実数、c1は任意の実数であり、数式2においてa2,b2,c2はゼロでない任意の実数、d2は任意の実数であり、数式3においてa3,b3はゼロでない任意の実数、c3は任意の実数であり、数式4においてa4,b4はゼロでない任意の実数、c4は任意の実数であり、数式5においてa5,b5はゼロでない任意の実数、c5は任意の実数である。)
[2−1.本発明の概要]
ここでは、本発明にかかる胃癌評価装置、胃癌評価方法、胃癌評価システム、胃癌評価プログラムおよび記録媒体の概要について、図3を参照して説明する。図3は本発明の基本原理を示す原理構成図である。
a1×Orn/(Trp+His) + b1×(ABA+Ile)/Leu + c1
・・・(数式1)
a2×Glu/His + b2×Ser/Trp + c2×Arg/Pro + d2
・・・(数式2)
a3×Trp/Gln + b3×His/Glu + c3
・・・(数式3)
a4×Gly/(Glu+Trp+Val) + b4×Arg/His + c4
・・・(数式4)
a5×Ile/Glu + b5×(Gly+Asn+Arg)/His + c5
・・・(数式5)
(数式1においてa1,b1はゼロでない任意の実数、c1は任意の実数であり、数式2においてa2,b2,c2はゼロでない任意の実数、d2は任意の実数であり、数式3においてa3,b3はゼロでない任意の実数、c3は任意の実数であり、数式4においてa4,b4はゼロでない任意の実数、c4は任意の実数であり、数式5においてa5,b5はゼロでない任意の実数、c5は任意の実数である。)
ここでは、第2実施形態にかかる胃癌評価システム(以下では本システムと記す場合がある。)の構成について、図4から図20を参照して説明する。なお、本システムはあくまでも一例であり、本発明はこれに限定されない。
a1×Orn/(Trp+His) + b1×(ABA+Ile)/Leu + c1
・・・(数式1)
a2×Glu/His + b2×Ser/Trp + c2×Arg/Pro + d2
・・・(数式2)
a3×Trp/Gln + b3×His/Glu + c3
・・・(数式3)
a4×Gly/(Glu+Trp+Val) + b4×Arg/His + c4
・・・(数式4)
a5×Ile/Glu + b5×(Gly+Asn+Arg)/His + c5
・・・(数式5)
(数式1においてa1,b1はゼロでない任意の実数、c1は任意の実数であり、数式2においてa2,b2,c2はゼロでない任意の実数、d2は任意の実数であり、数式3においてa3,b3はゼロでない任意の実数、c3は任意の実数であり、数式4においてa4,b4はゼロでない任意の実数、c4は任意の実数であり、数式5においてa5,b5はゼロでない任意の実数、c5は任意の実数である。)
ここでは、以上のように構成された本システムで行われる胃癌評価サービス処理の一例を、図21を参照して説明する。図21は、胃癌評価サービス処理の一例を示すフローチャートである。
a1×Orn/(Trp+His) + b1×(ABA+Ile)/Leu + c1
・・・(数式1)
a2×Glu/His + b2×Ser/Trp + c2×Arg/Pro + d2
・・・(数式2)
a3×Trp/Gln + b3×His/Glu + c3
・・・(数式3)
a4×Gly/(Glu+Trp+Val) + b4×Arg/His + c4
・・・(数式4)
a5×Ile/Glu + b5×(Gly+Asn+Arg)/His + c5
・・・(数式5)
(数式1においてa1,b1はゼロでない任意の実数、c1は任意の実数であり、数式2においてa2,b2,c2はゼロでない任意の実数、d2は任意の実数であり、数式3においてa3,b3はゼロでない任意の実数、c3は任意の実数であり、数式4においてa4,b4はゼロでない任意の実数、c4は任意の実数であり、数式5においてa5,b5はゼロでない任意の実数、c5は任意の実数である。)
以上、詳細に説明したように、胃癌評価システムによれば、クライアント装置200は個体のアミノ酸濃度データを胃癌評価装置100へ送信し、データベース装置400は胃癌評価装置100からの要求を受けて、胃癌評価用の多変量判別式(具体的には、胃癌と非胃癌との2群判別用の多変量判別式、胃癌の病期の判別用の多変量判別式、胃癌の他器官への転移の有無の2群判別用の多変量判別式、など)を胃癌評価装置100へ送信し、胃癌評価装置100は、クライアント装置200からアミノ酸濃度データを受信すると共にデータベース装置400から多変量判別式を受信し、受信したアミノ酸濃度データおよび多変量判別式に基づいて判別値を算出し、算出した判別値と予め設定した閾値とを比較することで個体につき、胃癌または非胃癌であるか否かを判別、胃癌の病期を判別、または胃癌の他器官への転移の有無を判別し、この判別結果をクライアント装置200やデータベース装置400へ送信し、クライアント装置200は胃癌評価装置100から送信された判別結果を受信して表示し、データベース装置400は胃癌評価装置100から送信された判別結果を受信して格納する。これにより、胃癌と非胃癌との2群判別や胃癌の病期の判別や胃癌の他器官への転移の有無の2群判別に有用な多変量判別式で得られる判別値を利用して、これらの2群判別を精度よく行うことができる。
a1×Orn/(Trp+His) + b1×(ABA+Ile)/Leu + c1
・・・(数式1)
a2×Glu/His + b2×Ser/Trp + c2×Arg/Pro + d2
・・・(数式2)
a3×Trp/Gln + b3×His/Glu + c3
・・・(数式3)
a4×Gly/(Glu+Trp+Val) + b4×Arg/His + c4
・・・(数式4)
a5×Ile/Glu + b5×(Gly+Asn+Arg)/His + c5
・・・(数式5)
(数式1においてa1,b1はゼロでない任意の実数、c1は任意の実数であり、数式2においてa2,b2,c2はゼロでない任意の実数、d2は任意の実数であり、数式3においてa3,b3はゼロでない任意の実数、c3は任意の実数であり、数式4においてa4,b4はゼロでない任意の実数、c4は任意の実数であり、数式5においてa5,b5はゼロでない任意の実数、c5は任意の実数である。)
指標式1:(Asn)/(ABA) + (Leu)/(His)
指標式5:(Gly)/(Glu+Trp+Val) + (Arg)/(His)
指標式6:(Ile)/(Glu)+(Gly+Asn+Arg)/(His)
指標式9:Glu/His + 0.15×Ser/Trp − 0.38×Arg/Pro
指標式12:−6.272×Trp/Gln − 0.08814×His/Glu
Claims (25)
- 評価対象から採取した血液からアミノ酸の濃度値に関するアミノ酸濃度データを測定する測定ステップと、
前記測定ステップで測定した前記評価対象の前記アミノ酸濃度データに含まれるAsn,Cys,His,Met,Orn,Phe,Trp,Pro,Lys,Leu,Glu,Arg,Ala,Thr,Tyrのうち少なくとも1つの前記濃度値に基づいて、前記評価対象につき胃癌の状態を評価する濃度値基準評価ステップと
を含むことを特徴とする胃癌の評価方法。 - 前記濃度値基準評価ステップは、
前記測定ステップで測定した前記評価対象の前記アミノ酸濃度データに含まれるAsn,Cys,His,Met,Orn,Phe,Trp,Pro,Lys,Leu,Glu,Arg,Ala,Thr,Tyrのうち少なくとも1つの前記濃度値に基づいて、前記評価対象につき、前記胃癌または非胃癌であるか否かを判別、前記胃癌の病期を判別、または前記胃癌の他器官への転移の有無を判別する濃度値基準判別ステップ
をさらに含むこと
を特徴とする請求項1に記載の胃癌の評価方法。 - 前記濃度値基準評価ステップは、
前記測定ステップで測定した前記評価対象の前記アミノ酸濃度データに含まれるAsn,Cys,His,Met,Orn,Phe,Trp,Pro,Lys,Leu,Glu,Arg,Ala,Thr,Tyrのうち少なくとも1つの前記濃度値および前記アミノ酸の濃度を変数とする予め設定した多変量判別式に基づいて、当該多変量判別式の値である判別値を算出する判別値算出ステップと、
前記判別値算出ステップで算出した前記判別値に基づいて、前記評価対象につき前記胃癌の前記状態を評価する判別値基準評価ステップと
をさらに含み、
前記多変量判別式は、Asn,Cys,His,Met,Orn,Phe,Trp,Pro,Lys,Leu,Glu,Arg,Ala,Thr,Tyrのうち少なくとも1つを前記変数として含むこと
を特徴とする請求項1に記載の胃癌の評価方法。 - 前記判別値基準評価ステップは、
前記判別値算出ステップで算出した前記判別値に基づいて、前記評価対象につき、前記胃癌または非胃癌であるか否かを判別、前記胃癌の病期を判別、または前記胃癌の他器官への転移の有無を判別する判別値基準判別ステップ
をさらに含むこと
を特徴とする請求項3に記載の胃癌の評価方法。 - 前記多変量判別式は、1つの分数式または複数の前記分数式の和で表され、それを構成する前記分数式の分子および/または分母にAsn,Cys,His,Met,Orn,Phe,Trp,Pro,Lys,Leu,Glu,Arg,Ala,Thr,Tyrのうち少なくとも1つを前記変数として含むこと
を特徴とする請求項4に記載の胃癌の評価方法。 - 前記多変量判別式は、前記判別値基準判別ステップで前記胃癌または前記非胃癌であるか否かを判別する場合は数式1、数式2または数式3であり、前記判別値基準判別ステップで前記胃癌の前記病期を判別する場合は数式4であり、前記判別値基準判別ステップで前記胃癌の前記他器官への転移の有無を判別する場合は数式5であること
a1×Orn/(Trp+His) + b1×(ABA+Ile)/Leu + c1
・・・(数式1)
a2×Glu/His + b2×Ser/Trp + c2×Arg/Pro + d2
・・・(数式2)
a3×Trp/Gln + b3×His/Glu + c3
・・・(数式3)
a4×Gly/(Glu+Trp+Val) + b4×Arg/His + c4
・・・(数式4)
a5×Ile/Glu + b5×(Gly+Asn+Arg)/His + c5
・・・(数式5)
(数式1においてa1,b1はゼロでない任意の実数、c1は任意の実数であり、数式2においてa2,b2,c2はゼロでない任意の実数、d2は任意の実数であり、数式3においてa3,b3はゼロでない任意の実数、c3は任意の実数であり、数式4においてa4,b4はゼロでない任意の実数、c4は任意の実数であり、数式5においてa5,b5はゼロでない任意の実数、c5は任意の実数である。)
を特徴とする請求項5に記載の胃癌の評価方法。 - 前記多変量判別式は、ロジスティック回帰式、線形判別式、重回帰式、サポートベクターマシンで作成された式、マハラノビス距離法で作成された式、正準判別分析で作成された式、決定木で作成された式のいずれか1つであること
を特徴とする請求項4に記載の胃癌の評価方法。 - 前記多変量判別式は、Orn,Gln,Trp,Citを前記変数とする前記ロジスティック回帰式、またはOrn,Gln,Trp,Phe,Cit,Tyrを前記変数とする前記線形判別式、またはGlu,Phe,His,Trpを前記変数とする前記ロジスティック回帰式、またはGlu,Pro,His,Trpを前記変数とする前記線形判別式、またはVal,Ile,His,Trpを前記変数とする前記ロジスティック回帰式、またはThr,Ile,His,Trpを前記変数とする前記線形判別式であること
を特徴とする請求項7に記載の胃癌の評価方法。 - 制御手段と記憶手段とを備え評価対象につき胃癌の状態を評価する胃癌評価装置であって、
前記制御手段は、
アミノ酸の濃度を変数としAsn,Cys,His,Met,Orn,Phe,Trp,Pro,Lys,Leu,Glu,Arg,Ala,Thr,Tyrのうち少なくとも1つを前記変数として含む前記記憶手段で記憶した多変量判別式および前記アミノ酸の濃度値に関する予め取得した前記評価対象のアミノ酸濃度データに含まれるAsn,Cys,His,Met,Orn,Phe,Trp,Pro,Lys,Leu,Glu,Arg,Ala,Thr,Tyrのうち少なくとも1つの前記濃度値に基づいて、当該多変量判別式の値である判別値を算出する判別値算出手段と、
前記判別値算出手段で算出した前記判別値に基づいて、前記評価対象につき前記胃癌の前記状態を評価する判別値基準評価手段と
を備えたこと
を特徴とする胃癌評価装置。 - 前記判別値基準評価手段は、
前記判別値算出手段で算出した前記判別値に基づいて、前記評価対象につき、前記胃癌または非胃癌であるか否かを判別、前記胃癌の病期を判別、または前記胃癌の他器官への転移の有無を判別する判別値基準判別手段
をさらに備えたこと
を特徴とする請求項9に記載の胃癌評価装置。 - 前記多変量判別式は、1つの分数式または複数の前記分数式の和で表され、それを構成する前記分数式の分子および/または分母にAsn,Cys,His,Met,Orn,Phe,Trp,Pro,Lys,Leu,Glu,Arg,Ala,Thr,Tyrのうち少なくとも1つを前記変数として含むこと
を特徴とする請求項10に記載の胃癌評価装置。 - 前記多変量判別式は、前記判別値基準判別手段で前記胃癌または前記非胃癌であるか否かを判別する場合は数式1、数式2または数式3であり、前記判別値基準判別手段で前記胃癌の前記病期を判別する場合は数式4であり、前記判別値基準判別手段で前記胃癌の前記他器官への転移の有無を判別する場合は数式5であること
a1×Orn/(Trp+His) + b1×(ABA+Ile)/Leu + c1
・・・(数式1)
a2×Glu/His + b2×Ser/Trp + c2×Arg/Pro + d2
・・・(数式2)
a3×Trp/Gln + b3×His/Glu + c3
・・・(数式3)
a4×Gly/(Glu+Trp+Val) + b4×Arg/His + c4
・・・(数式4)
a5×Ile/Glu + b5×(Gly+Asn+Arg)/His + c5
・・・(数式5)
(数式1においてa1,b1はゼロでない任意の実数、c1は任意の実数であり、数式2においてa2,b2,c2はゼロでない任意の実数、d2は任意の実数であり、数式3においてa3,b3はゼロでない任意の実数、c3は任意の実数であり、数式4においてa4,b4はゼロでない任意の実数、c4は任意の実数であり、数式5においてa5,b5はゼロでない任意の実数、c5は任意の実数である。)
を特徴とする請求項11に記載の胃癌評価装置。 - 前記多変量判別式は、ロジスティック回帰式、線形判別式、重回帰式、サポートベクターマシンで作成された式、マハラノビス距離法で作成された式、正準判別分析で作成された式、決定木で作成された式のいずれか1つであること
を特徴とする請求項10に記載の胃癌評価装置。 - 前記多変量判別式は、Orn,Gln,Trp,Citを前記変数とする前記ロジスティック回帰式、またはOrn,Gln,Trp,Phe,Cit,Tyrを前記変数とする前記線形判別式、またはGlu,Phe,His,Trpを前記変数とする前記ロジスティック回帰式、またはGlu,Pro,His,Trpを前記変数とする前記線形判別式、またはVal,Ile,His,Trpを前記変数とする前記ロジスティック回帰式、またはThr,Ile,His,Trpを前記変数とする前記線形判別式であること
を特徴とする請求項13に記載の胃癌評価装置。 - 前記制御手段は、
前記アミノ酸濃度データと前記胃癌の前記状態を表す指標に関する胃癌状態指標データとを含む前記記憶手段で記憶した胃癌状態情報に基づいて、前記記憶手段で記憶する前記多変量判別式を作成する多変量判別式作成手段
をさらに備え、
前記多変量判別式作成手段は、
前記胃癌状態情報から所定の式作成手法に基づいて、前記多変量判別式の候補である候補多変量判別式を作成する候補多変量判別式作成手段と、
前記候補多変量判別式作成手段で作成した前記候補多変量判別式を、所定の検証手法に基づいて検証する候補多変量判別式検証手段と、
前記候補多変量判別式検証手段での検証結果から所定の変数選択手法に基づいて前記候補多変量判別式の変数を選択することで、前記候補多変量判別式を作成する際に用いる前記胃癌状態情報に含まれる前記アミノ酸濃度データの組み合わせを選択する変数選択手段と、
をさらに備え、前記候補多変量判別式作成手段、前記候補多変量判別式検証手段および前記変数選択手段を繰り返し実行して蓄積した前記検証結果に基づいて、複数の前記候補多変量判別式の中から前記多変量判別式として採用する前記候補多変量判別式を選出することで、前記多変量判別式を作成すること
を特徴とする請求項9から14のいずれか1つに記載の胃癌評価装置。 - 制御手段と記憶手段とを備えた情報処理装置で実行する、評価対象につき胃癌の状態を評価する胃癌評価方法であって、
前記制御手段で、
アミノ酸の濃度を変数としAsn,Cys,His,Met,Orn,Phe,Trp,Pro,Lys,Leu,Glu,Arg,Ala,Thr,Tyrのうち少なくとも1つを前記変数として含む前記記憶手段で記憶した多変量判別式および前記アミノ酸の濃度値に関する予め取得した前記評価対象のアミノ酸濃度データに含まれるAsn,Cys,His,Met,Orn,Phe,Trp,Pro,Lys,Leu,Glu,Arg,Ala,Thr,Tyrのうち少なくとも1つの前記濃度値に基づいて、当該多変量判別式の値である判別値を算出する判別値算出ステップと、
前記判別値算出ステップで算出した前記判別値に基づいて、前記評価対象につき前記胃癌の前記状態を評価する判別値基準評価ステップと
を実行すること
を特徴とする胃癌評価方法。 - 前記判別値基準評価ステップは、
前記判別値算出ステップで算出した前記判別値に基づいて、前記評価対象につき、前記胃癌または非胃癌であるか否かを判別、前記胃癌の病期を判別、または前記胃癌の他器官への転移の有無を判別する判別値基準判別ステップ
をさらに含むこと
を特徴とする請求項16に記載の胃癌評価方法。 - 前記多変量判別式は、1つの分数式または複数の前記分数式の和で表され、それを構成する前記分数式の分子および/または分母にAsn,Cys,His,Met,Orn,Phe,Trp,Pro,Lys,Leu,Glu,Arg,Ala,Thr,Tyrのうち少なくとも1つを前記変数として含むこと
を特徴とする請求項17に記載の胃癌評価方法。 - 前記多変量判別式は、前記判別値基準判別ステップで前記胃癌または前記非胃癌であるか否かを判別する場合は数式1、数式2または数式3であり、前記判別値基準判別ステップで前記胃癌の前記病期を判別する場合は数式4であり、前記判別値基準判別ステップで前記胃癌の前記他器官への転移の有無を判別する場合は数式5であること
a1×Orn/(Trp+His) + b1×(ABA+Ile)/Leu + c1
・・・(数式1)
a2×Glu/His + b2×Ser/Trp + c2×Arg/Pro + d2
・・・(数式2)
a3×Trp/Gln + b3×His/Glu + c3
・・・(数式3)
a4×Gly/(Glu+Trp+Val) + b4×Arg/His + c4
・・・(数式4)
a5×Ile/Glu + b5×(Gly+Asn+Arg)/His + c5
・・・(数式5)
(数式1においてa1,b1はゼロでない任意の実数、c1は任意の実数であり、数式2においてa2,b2,c2はゼロでない任意の実数、d2は任意の実数であり、数式3においてa3,b3はゼロでない任意の実数、c3は任意の実数であり、数式4においてa4,b4はゼロでない任意の実数、c4は任意の実数であり、数式5においてa5,b5はゼロでない任意の実数、c5は任意の実数である。)
を特徴とする請求項18に記載の胃癌評価方法。 - 前記多変量判別式は、ロジスティック回帰式、線形判別式、重回帰式、サポートベクターマシンで作成された式、マハラノビス距離法で作成された式、正準判別分析で作成された式、決定木で作成された式のいずれか1つであること
を特徴とする請求項17に記載の胃癌評価方法。 - 前記多変量判別式は、Orn,Gln,Trp,Citを前記変数とする前記ロジスティック回帰式、またはOrn,Gln,Trp,Phe,Cit,Tyrを前記変数とする前記線形判別式、またはGlu,Phe,His,Trpを前記変数とする前記ロジスティック回帰式、またはGlu,Pro,His,Trpを前記変数とする前記線形判別式、またはVal,Ile,His,Trpを前記変数とする前記ロジスティック回帰式、またはThr,Ile,His,Trpを前記変数とする前記線形判別式であること
を特徴とする請求項20に記載の胃癌評価方法。 - 前記制御手段で、
前記アミノ酸濃度データと前記胃癌の前記状態を表す指標に関する胃癌状態指標データとを含む前記記憶手段で記憶した胃癌状態情報に基づいて、前記記憶手段で記憶する前記多変量判別式を作成する多変量判別式作成ステップ
をさらに実行し、
前記多変量判別式作成ステップは、
前記胃癌状態情報から所定の式作成手法に基づいて、前記多変量判別式の候補である候補多変量判別式を作成する候補多変量判別式作成ステップと、
前記候補多変量判別式作成ステップで作成した前記候補多変量判別式を、所定の検証手法に基づいて検証する候補多変量判別式検証ステップと、
前記候補多変量判別式検証ステップでの検証結果から所定の変数選択手法に基づいて前記候補多変量判別式の変数を選択することで、前記候補多変量判別式を作成する際に用いる前記胃癌状態情報に含まれる前記アミノ酸濃度データの組み合わせを選択する変数選択ステップと、
をさらに含み、前記候補多変量判別式作成ステップ、前記候補多変量判別式検証ステップおよび前記変数選択ステップを繰り返し実行して蓄積した前記検証結果に基づいて、複数の前記候補多変量判別式の中から前記多変量判別式として採用する前記候補多変量判別式を選出することで、前記多変量判別式を作成すること
を特徴とする請求項16から21のいずれか1つに記載の胃癌評価方法。 - 制御手段と記憶手段とを備え評価対象につき胃癌の状態を評価する胃癌評価装置と、アミノ酸の濃度値に関する前記評価対象のアミノ酸濃度データを提供する情報通信端末装置とを、ネットワークを介して通信可能に接続して構成された胃癌評価システムであって、
前記情報通信端末装置は、
前記評価対象の前記アミノ酸濃度データを前記胃癌評価装置へ送信するアミノ酸濃度データ送信手段と、
前記胃癌評価装置から送信された前記胃癌の前記状態に関する前記評価対象の評価結果を受信する評価結果受信手段と
を備え、
前記胃癌評価装置の前記制御手段は、
前記情報通信端末装置から送信された前記評価対象の前記アミノ酸濃度データを受信するアミノ酸濃度データ受信手段と、
前記アミノ酸の濃度を変数としAsn,Cys,His,Met,Orn,Phe,Trp,Pro,Lys,Leu,Glu,Arg,Ala,Thr,Tyrのうち少なくとも1つを前記変数として含む前記記憶手段で記憶した多変量判別式および前記アミノ酸濃度データ受信手段で受信した前記評価対象の前記アミノ酸濃度データに含まれるAsn,Cys,His,Met,Orn,Phe,Trp,Pro,Lys,Leu,Glu,Arg,Ala,Thr,Tyrのうち少なくとも1つの前記濃度値に基づいて、当該多変量判別式の値である判別値を算出する判別値算出手段と、
前記判別値算出手段で算出した前記判別値に基づいて、前記評価対象につき前記胃癌の前記状態を評価する判別値基準評価手段と、
前記判別値基準評価手段での前記評価対象の前記評価結果を前記情報通信端末装置へ送信する評価結果送信手段と、
を備えたこと
を特徴とする胃癌評価システム。 - 制御手段と記憶手段とを備えた情報処理装置に実行させる、評価対象につき胃癌の状態を評価する胃癌評価プログラムであって、
前記制御手段に、
アミノ酸の濃度を変数としAsn,Cys,His,Met,Orn,Phe,Trp,Pro,Lys,Leu,Glu,Arg,Ala,Thr,Tyrのうち少なくとも1つを前記変数として含む前記記憶手段で記憶した多変量判別式および前記アミノ酸の濃度値に関する予め取得した前記評価対象のアミノ酸濃度データに含まれるAsn,Cys,His,Met,Orn,Phe,Trp,Pro,Lys,Leu,Glu,Arg,Ala,Thr,Tyrのうち少なくとも1つの前記濃度値に基づいて、当該多変量判別式の値である判別値を算出する判別値算出ステップと、
前記判別値算出ステップで算出した前記判別値に基づいて、前記評価対象につき前記胃癌の前記状態を評価する判別値基準評価ステップと
を実行させること
を特徴とする胃癌評価プログラム。 - 請求項24に記載の胃癌評価プログラムを記録したこと
を特徴とするコンピュータ読み取り可能な記録媒体。
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