JPH1169984A - 慢性腎不全の標的およびマーカーであるCRFG−1b - Google Patents

慢性腎不全の標的およびマーカーであるCRFG−1b

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JPH1169984A
JPH1169984A JP10121550A JP12155098A JPH1169984A JP H1169984 A JPH1169984 A JP H1169984A JP 10121550 A JP10121550 A JP 10121550A JP 12155098 A JP12155098 A JP 12155098A JP H1169984 A JPH1169984 A JP H1169984A
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crfg
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polynucleotide
seq
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ジェイ.ラピン ニコラス
Barbara Olson
オルソン バーバラ
Yuan Zhu
ズ ユアン
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Abstract

(57)【要約】 【課題】 CRFG-1bポリペプチドおよびポリヌクレオチ
ド並びに前記ポリペプチドの組換え法による生産方法を
提供する。 【解決手段】 配列番号2のCRFG-1bポリペプチドをコ
ードするヌクレオチド配列と全長において少なくとも8
0%同一であり、かつCRFG-1b ポリペプチドの活性を有
するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、また
はこのヌクレオチド配列に対して相補的なヌクレオチド
配列を含んでなる単離されたポリヌクレオチド。 【効果】 CRFG-1bポリペプチドおよびポリヌクレオチ
ドは慢性腎疾患、腎性虚血、糖尿病性腎症、急性腎不
全、神経変性疾患およびアルツハイマー病を含む機能障
害または疾病の治療と、このような症状の診断アッセイ
に有用である。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【発明の属する技術分野】本発明は、新たに同定された
ポリヌクレオチド、このポリヌクレオチドによりコード
されるポリペプチド、前記のポリヌクレオチドおよびポ
リペプチドの使用、並びにその生産方法に関する。より
詳細には、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチ
ドは、慢性腎不全遺伝子-1b(以後CRFG-1bと略記する)と
称するGTP結合タンパク質ファミリーに関する。本発
明はまた、このようなポリヌクレオチドおよびポリペプ
チドの作用を阻害または活性化することに関する。
【0002】
【従来の技術】CRFG-1bの配列は、特性決定が行われて
いない酵母(YPL093w)ハロバクテリウム・クチルブラム
(Halobacterium cutirubrum)由来の推定GTP結合タン
パク質およびメタノバクテリウム・サーモオートトロフ
ィカム(Methanobacterium thermoautotrophicum)由来の
GTP1/OBGファミリーのGTP結合タンパク質に類似して
いる。GTP結合タンパク質は細胞内輸送、タンパク質
ターゲッティングおよび小胞融合において重要な役割を
担っている。こうしたことは、GTP結合タンパク質フ
ァミリーに治療用ターゲットとしての確立され実証され
た歴史があることを示している。
【0003】
【発明が解決しようとする課題】明らかに、慢性腎疾
患、腎性虚血、糖尿病性腎症、急性腎不全、神経変性疾
患およびアルツハイマー病を含むがこれらに限らない、
機能障害または疾病を予防し、改善し、治療する上で何
らかの役割を果たすGTP結合タンパク質ファミリーの
新たなメンバーを同定して特性づける必要性が存在して
いる。本発明はかかるメンバーを提供するものである。
【0004】
【課題を解決するための手段】本発明は、一つの態様に
おいて、CRFG-1bポリペプチドおよび組換え物質、並び
にその生産方法に関する。本発明のもう一つの態様はCR
FG-1bポリペプチドおよびポリヌクレオチドの使用方法
に関する。こうした使用には、とりわけ、慢性腎疾患、
腎性虚血、糖尿病性腎症、急性腎不全、神経変性疾患お
よびアルツハイマー病の治療が含まれる。他の態様で
は、本発明は、本発明により提供される物質を用いてア
ゴニストおよびアンタゴニストを同定する方法、並びに
同定された化合物を用いてCRFG-1bの平衡異常と関連し
た状態を治療することに関する。本発明のさらに他の態
様は、不適当なCRFG-1b活性またはCRFG-1bレベルと関連
した疾病を検出するための診断アッセイに関する。
【0005】定義 下記の定義は、本明細書中で頻繁に使用される用語を理
解しやすくするためのものである。「CRFG-1b」とは、
特に、一般的には配列番号2で表されるアミノ酸配列を
有するポリペプチドまたはそのアレル変異体を意味す
る。「CRFG-1b活性またはCRFG-1bポリペプチド活性」ま
たは「CRFG-1bまたはCRFG-1bポリペプチドの生物学的活
性」とは、類似の活性、向上した活性、または望ましく
ない副作用が低下したこれらの活性を含めて、CRFG-1b
の代謝的または生理的機能を意味する。さらに、前記CR
FG-1bの抗原的および免疫原的活性も含まれる。「CRFG-
1b遺伝子」とは、配列番号1で表されるヌクレオチド配
列を有するポリヌクレオチドまたはそのアレル変異体お
よび/またはそれらの相補体を意味する。
【0006】本明細書中で用いる「抗体」には、ポリク
ローナルおよびモノクローナル抗体、キメラ抗体、一本
鎖抗体、ヒト化抗体、さらにFabまたは他の免疫グロ
ブリン発現ライブラリーの産物を含むFabフラグメン
トが含まれる。「単離された」とは、天然の状態から
「人間の手によって」改変されたことを意味する。「単
離された」組成物または物質が天然に存在するのであれ
ば、それはそのもとの環境から変化しているか移動して
おり、またはその両方である。例えば、生存している動
物の体内に自然界で存在するポリヌクレオチドまたはポ
リペプチドは「単離された」ものではないが、その天然
状態の共存物質から分離されたポリヌクレオチドまたは
ポリペプチドは、本明細書中で用いられるように、「単
離された」ものである。
【0007】「ポリヌクレオチド」とは、一般に任意の
ポリリボヌクレオチドまたはポリデオキシリボヌクレオ
チドをさし、これは修飾されていないRNAもしくはD
NA、または修飾されたRNAもしくはDNAであり得
る。「ポリヌクレオチド」には、制限するものではない
が、一本鎖および二本鎖DNA、一本鎖領域と二本鎖領
域が混じり合ったDNA、一本鎖および二本鎖RNA、
一本鎖領域と二本鎖領域が混じり合ったRNA、DNA
とRNAを含むハイブリッド分子(一本鎖でも、または
より典型的には二本鎖でもよく、一本鎖領域と二本鎖領
域が混じり合ったものでもよい)が含まれる。加えて、
「ポリヌクレオチド」はRNAまたはDNAまたはRN
AとDNAの両方からなる三重鎖領域を意味する。「ポ
リヌクレオチド」という用語はまた、1個以上の修飾塩
基を含有するDNAまたはRNA、および安定性または
他の理由のために修飾された骨格を有するDNAまたは
RNAも含む。「修飾」塩基としては、例えば、トリチ
ル化された塩基およびイノシンのような特殊な塩基があ
る。DNAおよびRNAに対してさまざまな修飾が行わ
れてきた。こうして、「ポリヌクレオチド」は、自然界
に一般的に存在するポリヌクレオチドの化学的、酵素的
または代謝的に修飾された形態、並びにウイルスおよび
細胞に特徴的なDNAおよびRNAの化学的形態を包含
する。また、「ポリヌクレオチド」は、しばしばオリゴ
ヌクレオチドと称される比較的短いポリヌクレオチドも
包含する。
【0008】「ポリペプチド」とは、ペプチド結合また
は修飾されたペプチド結合(すなわち、ペプチドアイソ
スター)により連結された2個以上のアミノ酸を含む任
意のペプチドまたはタンパク質を意味する。「ポリペプ
チド」は短鎖(通常はペプチド、オリゴペプチドまたは
オリゴマーという)と長鎖(一般的にはタンパク質とい
う)の両方をさす。ポリペプチドは20種類の遺伝子コ
ード化アミノ酸以外のアミノ酸を含んでもよい。「ポリ
ペプチド」は、翻訳後プロセシングのような天然のプロ
セスで、または当技術分野で公知の化学的修飾法のいず
れかで修飾されたアミノ酸配列を含む。このような修飾
は基本的な教科書、より詳細な学術論文および研究文献
に詳述されている。修飾はペプチド骨格、アミノ酸側
鎖、アミノまたはカルボキシル末端を含めてポリペプチ
ドのどこでも行うことができる。同じタイプの修飾が所
定のポリペプチドのいくつかの部位に同程度でまたはさ
まざまに異なる程度で存在してもよい。また、所定のポ
リペプチドが多くのタイプの修飾を含んでいてもよい。
ポリペプチドはユビキチン化のために分枝していても、
分枝のある又はない環状であってもよい。環状の、分枝
した、または分枝した環状のポリペプチドは翻訳後の天
然プロセスから生じることがあり、また、合成法によっ
て製造することもできる。修飾としては、アセチル化、
アシル化、ADP−リボシル化、アミド化、フラビンの
共有結合、ヘム部分の共有結合、ヌクレオチドまたはヌ
クレオチド誘導体の共有結合、脂質または脂質誘導体の
共有結合、ホスファチジルイノシトールの共有結合、架
橋、環化、ジスルフィド結合の形成、脱メチル化、共有
架橋の形成、シスチンの形成、ピログルタメートの形
成、ホルミル化、γ−カルボキシル化、グリコシル化、
GPIアンカー形成、ヒドロキシル化、ヨウ素化、メチ
ル化、ミリストイル化、酸化、タンパク質分解処理、リ
ン酸化、プレニル化、ラセミ化、セレノイル化、硫酸
化、アルギニル化のようなタンパク質へのアミノ酸の転
移RNA媒介付加、ユビキチン化などがある。例えば、
PROTEINS - STRUCTURE AND MOLECULAR PROPERTIES, 2nd
Ed., T.E. Creighton, W.H. Freeman and Company, Ne
w York, 1993; POSTTRANSLATIONAL COVALENT MODIFICAT
ION OF PROTEINS, B.C. Johnson 編, Academic Press,
New York,1983中のWold, F., Posttranslational Prote
in Modifications: Perspectivesand Prospects, pgs.
1-12; Seifter ら, "Analysis for protein modificati
ons and nonprotein cofactors", Meth Enzymol (1990)
182:626-646; および Rattan ら, "Protein Synthesi
s: Posttranslational Modifications and Aging",Ann
NY Acad Sci (1992) 663:48-62を参照のこと。
【0009】本明細書中で用いる「変異体」とは、基準
のポリヌクレオチドまたはポリペプチドと異なるが、不
可欠な性質を保持しているポリヌクレオチドまたはポリ
ペプチドのことである。典型的なポリヌクレオチドの変
異体は基準ポリヌクレオチドとヌクレオチド配列の点で
相違する。この変異体のヌクレオチド配列の変化は、基
準ポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチド
のアミノ酸配列を変更しても、しなくてもよい。ヌクレ
オチドの変化は、以下で述べるように、基準配列により
コードされるポリペプチドにおいてアミノ酸の置換、付
加、欠失、融合および末端切断(トランケーション)を
生じさせることができる。典型的なポリペプチドの変異
体は基準ポリペプチドとアミノ酸配列の点で相違する。
一般的には、基準ポリペプチドの配列と変異体の配列が
全般的によく類似しており、多くの領域で同一となるよ
うな相違に限られる。変異体と基準ポリペプチドは任意
に組み合わせた1以上の置換、付加、欠失によりアミノ
酸配列が相違していてよい。置換または挿入されるアミ
ノ酸残基は遺伝子コードによりコードされるものであっ
ても、なくてもよい。ポリヌクレオチドまたはポリペプ
チドの変異体はアレル変異体のように天然に存在するも
のでも、天然に存在することが知られていない変異体で
あってもよい。ポリヌクレオチドおよびポリペプチドの
天然に存在しない変異体は、突然変異誘発法または直接
合成により調製することができる。
【0010】当業界で知られた「同一性」とは、ポリペ
プチド配列またはポリヌクレオチド配列の比較により決
定された、2以上のかかる配列間の関係のことである。
当業界ではまた、「同一性」はポリペプチド配列または
ポリヌクレオチド配列の鎖間のマッチ(match)により決
定された、このような配列間の配列関係の程度を意味す
る。「同一性」および「類似性」は公知の方法により難
なく算出することができ、こうした方法として、例えば
Computational Molecular Biology, Lesk, A.M.編, Ox
ford University Press, New York, 1988; Biocomputin
g: Informaticsand Genome Projects, Smith, D.W. 編,
Academic Press, New York, 1993; Computer Analysis
of Sequence Data, Part I, Griffin, A.M. and Griff
in, H.G. 編, Humana Press, New Jersey, 1994; Seque
nce Analysis in Molecular Biology, von Heinje, G.,
Academic Press, 1987; Sequence Analysis Primer, G
ribskov, M. and Devereux, J. 編, M Stockton Press,
New York, 1991; およびCarillo, H. and Lipman, D.,
SIAM J. Applied Math., 48: 1073 (1988) に記載され
た方法があるが、これらに限らない。「同一性」を決定
する方法は、検討する配列間で最大級のマッチが得られ
るように設計される。さらに、「同一性」および「類似
性」を決定する方法は一般に利用可能なコンピュータプ
ログラムに編集されている。2配列間の「同一性」およ
び「類似性」を決定するコンピュータプログラム法とし
ては、GCGプログラムパッケージ (Devereux, J.ら,
Nucleic Acids Research 12(1):387 (1984))、BLAS
TP、BLASTNおよびFASTA (Atschul, S.F.
ら, J. Molec. Biol. 215:403-410 (1990)) があるが、
これらに限らない。BLAST XプログラムはNCB
Iおよび他のソース (BLAST Manual, Altschul, S.ら,
NCBI NLM NIH Bethesda, MD 20894; Altschul,S.ら, J.
Mol. Biol. 215: 403-410 (1990))から一般に入手可能
である。公知のSmith Watermanアルゴリズムも同一性の
決定に使用することができる。
【0011】ポリペプチド配列を比較するためのパラメ
ーターは次のものを含む: 1)アルゴリズム:Needleman and Wunsch, J. Mol. Bi
ol. 48: 443-453 (1970) 比較マトリックス:Hentikoff and Hentikoff, Proc. N
atl. Acad. Sci. USA,89: 10915-10919 (1992) からのB
LOSSUM62 ギャップペナルティー:12 ギャップ長ペナルティー:4 これらのパラメーターと共に有用なプログラムは Genet
ics Computer Group (Madison WI) から「gap」プロ
グラムとして一般に入手可能である。前記のパラメータ
ーはペプチド比較のためのデフォルトパラメーター(def
ault parameter) である(末端ギャップのペナルティー
は無し)。
【0012】ポリヌクレオチド配列を比較するための好
適なパラメーターは次のものを含む: 1)アルゴリズム:Needleman and Wunsch, J. Mol. Bi
ol. 48: 443-453 (1970) 比較マトリックス:マッチ=+10、ミスマッチ=0 ギャップペナルティー:50 ギャップ長ペナルティー:3 Genetics Computer Group (Madison WI)から「gap」
プログラムとして入手可能である。前記のパラメーター
はポリヌクレオチド比較のためのデフォルトパラメータ
ーである。
【0013】ポリヌクレオチドの好適な具体例としては
さらに、配列番号1のポリヌクレオチド基準配列に対し
て少なくとも50、60、70、80、85、90、95、97または10
0%の同一性を有するポリヌクレオチドを含んでなる単
離されたポリヌクレオチドがある。この基準配列は配列
番号1の配列と同一であっても、該基準配列に対して、
ある整数個までのヌクレオチド変異を含んでいてもよ
い。前記変異は少なくとも1個のヌクレオチドの欠失、
置換(トランジションおよびトランスバージョンを含
む)または付加よりなる群から選択され、こうした変異
は基準ヌクレオチド配列の5'もしくは3'末端位置、また
はこれらの末端位置の間のどこに存在してもよく、基準
配列中のヌクレオチドの間に個々に、または基準配列内
に1以上の連続するグループとして点在することができ
る。ヌクレオチド変異の前記の数は、配列番号1のヌク
レオチドの総数に、それぞれの同一性%を規定する数字
を掛け、その積を配列番号1のヌクレオチドの総数から
差し引くことにより、すなわち、次式: nn ≦xn −(xn ×y) により求めることができる。式中、nnはヌクレオチド
変異の数であり、xnは配列番号1のヌクレオチドの総
数であり、yは50%については0.50、60%については0.
60、70%については0.70、80%については0.80、85%に
ついては0.85、90%については0.90、95%については0.
95、97%については0.97または100%については1.00で
あり、ここでxnとyの非整数の積は、その積をxnから
引く前に、最も近似する整数に切り下げる。配列番号2
のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を改
変すると、そのコード配列にナンセンス、ミスセンスま
たはフレームシフト突然変異が生じ、こうした変異後に
該ポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチドを
改変させることもできる。
【0014】ポリペプチドの好適な具体例としてはさら
に、配列番号2のポリペプチド基準配列に対して少なく
とも50、60、70、80、85、90、95、97または100%の同
一性を有するポリペプチドを含んでなる単離されたポリ
ペプチドがある。この基準配列は配列番号2の配列と同
一であっても、該基準配列に対して、ある整数個までの
アミノ酸変異を含んでいてもよい。前記変異は少なくと
も1個のアミノ酸の欠失、置換(同類および非同類アミ
ノ酸置換を含む)または付加よりなる群から選択され、
こうした変異は基準ポリペプチド配列のアミノもしくは
カルボキシ末端位置、またはこれらの末端位置の間のい
ずれに存在してもよく、基準配列中のアミノ酸の間に個
々に、または基準配列内に1以上の連続するグループと
して点在することができる。アミノ酸変異の前記の数
は、配列番号2のアミノ酸の総数に、それぞれの同一性
%を規定する数字を掛け、その積を配列番号2のアミノ
酸の総数から差し引くことにより、すなわち、次式: na ≦xa −(xa ×y) により求めることができる。式中、naはアミノ酸変異
の数であり、xaは配列番号2中のアミノ酸の総数であ
り、yは50%については0.50、60%については0.60、70
%については0.70、80%については0.80、85%について
は0.85、90%については0.90、95%については0.95、97
%については0.97または100%については1.00であり、
ここでxaとyの非整数の積は、その積をxaから引く前
に、最も近似する整数に切り下げる。
【0015】
【発明の実施の形態】本発明のポリペプチド 一つの態様において、本発明はCRFG-1bポリペプチド
(またはCRFG-1bタンパク質)に関する。このCRFG-1bポ
リペプチドには、配列番号2および4のポリペプチドだ
けでなく、配列番号2のアミノ酸配列を含むポリペプチ
ド、その全長において配列番号2のアミノ酸配列と少な
くとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ま
しくは少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む
ポリペプチドも含まれる。さらに、少なくとも97〜9
9%同一であるものが特に好適である。また、その全長
において配列番号2のアミノ酸配列を有するポリペプチ
ドと少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、
より好ましくは少なくとも95%同一であるアミノ酸配
列を有するポリペプチドもCRFG-1bポリペプチドに含ま
れる。さらに、少なくとも97〜99%同一であるもの
が特に好適である。CRFG-1bポリペプチドはCRFG-1bの少
なくとも1つの生物学的活性を示すことが好ましい。
【0016】CRFG-1bポリペプチドは「成熟」タンパク
質の形であっても、融合タンパク質のような、より大き
いタンパク質の一部であってもよい。しばしば、追加の
アミノ酸配列を含めることが有利であり、このようなア
ミノ酸配列としては、分泌すなわちリーダー配列、プロ
配列、多重ヒスチジン残基のような精製に役立つ配列、
または組換え生産の際の安定性を確保する付加的配列な
どがある。
【0017】また、CRFG-1bポリペプチドの断片も本発
明に含まれる。こうした断片は全体的に前記CRFG-1bポ
リペプチドのアミノ酸配列の一部と同一であるが、全部
とは同一でないアミノ酸配列を有するポリペプチドであ
る。CRFG-1bポリペプチドと同様に、断片は「フリース
タンディング」(それ自体で独立)していても、より大
きいポリペプチド内に含まれていてもよく、つまりその
大きいポリペプチドの一部または一領域、最も好ましく
は一つの連続領域、を断片が構成していてもよい。本発
明のポリペプチド断片の代表的な例として、およその見
当でアミノ酸番号1−20、21−40、41−60、
61−80、81−100、および101からCRFG-1b
ポリペプチドの末端までの断片が挙げられる。ここで、
「およそ」とは、上記の範囲の一端または両端で数個、
5個、4個、3個、2個または1個のアミノ酸が増えた
り減ったりした範囲を含むものである。
【0018】好適な断片としては、例えば、アミノ末端
を含む一連の残基もしくはカルボキシル末端を含む一連
の残基の欠失、またはアミノ末端を含むものとカルボキ
シル末端を含むものとの二連の残基の欠失を除いた、CR
FG-1bポリペプチドのアミノ酸配列を有するトランケー
ション(truncation)ポリペプチドが含まれる。また、α
ヘリックスとαヘリックス形成領域、βシートとβシー
ト形成領域、ターンとターン形成領域、コイルとコイル
形成領域、親水性領域、疎水性領域、α両親媒性領域、
β両親媒性領域、可変性領域、表面形成領域、基質結合
領域、および高抗原指数領域を含む断片のような、構造
的または機能的特性により特徴づけられる断片も好適で
ある。その他の好適な断片は生物学的に活性な断片であ
る。生物学的に活性な断片は、同様の活性をもつ断片、
その活性が向上した断片、または望ましくない活性が減
少した断片を含めて、CRFG-1b活性を媒介するものであ
る。さらに、動物、特にヒトにおいて抗原性または免疫
原性がある断片も含まれる。
【0019】これらのポリペプチド断片はどれも、抗原
活性を含めたCRFG-1bの生物学的活性を保持することが
好ましい。中でも、最も好ましい断片は配列番号4のア
ミノ酸配列を有するものである。特定された配列および
断片の変異型も本発明の一部を構成する。好適な変異型
は同類アミノ酸置換により対象物と異なるもの、すなわ
ち、ある残基が同様の性質の他の残基で置換されている
ものである。典型的なこうした置換は、Ala, Val, Leu
と Ileの間;Ser とThr の間;酸性残基 AspとGlu の
間;Asn とGln の間;塩基性残基 LysとArg の間;また
は芳香族残基 PheとTyr の間で起こる。特に、数個、5
〜10個、1〜5個または1〜2個のアミノ酸が任意の
組合せで置換、欠失または付加されている変異型が好適
である。
【0020】本発明のCRFG-1bポリペプチドは任意の適
当な方法で製造することができる。このようなポリペプ
チドには、単離された天然に存在するポリペプチド、組
換え的に生産されたポリペプチド、合成的に製造された
ポリペプチド、またはこれらの方法の組合せにより製造
されたポリペプチドが含まれる。このようなポリペプチ
ドの製造のための手段は当業界でよく理解されている。
【0021】本発明のポリヌクレオチド 本発明のもう一つの態様はCRFG-1bポリヌクレオチドに
関する。CRFG-1bポリヌクレオチドには、CRFG-1b ポリ
ペプチドおよび断片をコードする単離されたポリヌクレ
オチド、並びにこれらと密接に関連したポリヌクレオチ
ドが含まれる。さらに特定すると、本発明のCRFG-1bポ
リヌクレオチドとしては、配列番号2のCRFG-1bポリペ
プチドをコードする配列番号1中に含まれるヌクレオチ
ド配列を含むポリヌクレオチド、および配列番号1およ
び3の特定配列を有するポリヌクレオチドがある。さら
に、CRFG-1bポリヌクレオチドには、配列番号2のCRFG-
1bポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と全長に
おいて少なくとも80%同一であるヌクレオチド配列を
含むポリヌクレオチド、および配列番号1のヌクレオチ
ド配列と全長において少なくとも80%同一であるヌク
レオチド配列を含むポリヌクレオチドが含まれる。これ
に関連して、少なくとも90%同一であるポリヌクレオ
チドが好適であり、特に少なくとも95%同一であるも
のが好適である。さらに、少なくとも97%同一である
ものがより好ましく、少なくとも98〜99%同一であ
るものがより一層好ましく、少なくとも99%同一であ
るものが最も好ましい。また、増幅反応に使用できる条
件下、またはプローブやマーカーとして使用できる条件
下でハイブリダイズするのに十分な、配列番号1中に含
まれるヌクレオチド配列との同一性を有するヌクレオチ
ド配列もCRFG-1bポリヌクレオチドに含まれる。本発明
はまた、このようなCRFG-1bポリヌクレオチドと相補的
なポリヌクレオチドを提供する。
【0022】本発明のCRFG-1bは、ヒトCRFG-1bをコード
するcDNAの配列決定の結果により示されるように、
GTP結合タンパク質ファミリーの他のタンパク質と構
造的に関連している。配列番号1のcDNA配列は配列
番号2の587個のアミノ酸からなるポリペプチドをコ
ードするオープンリーディングフレーム(ヌクレオチド
番号456−2216)を含んでいる。表2のアミノ酸
配列(配列番号2)は587個のアミノ酸残基において
酵母由来のハイポセティカルタンパク質(Hypothetical
protein) YPL093w (H. Busseyら, Nature 387 (6632 Su
ppl), 103-105,1997)に対して約45.8%の同一性を
有する(FASTA使用)。表1のヌクレオチド配列
(配列番号1)は1351個のヌクレオチド残基におい
てサッカロミセス・セレビシエ(Saccharomyces cerevis
iae)染色体XVIコスミド8059/8047(H. Busseyら, Nature
387 (6632 Suppl), 103-105, 1997) に対して約59.
7%の同一性を有する(FASTA使用)。したがっ
て、本発明のCRFG-1bポリペプチドおよびポリヌクレオ
チドは、とりわけ、それらの相同ポリペプチドおよびポ
リヌクレオチドと同様の生物学的機能/特性をもつこと
が予測され、それらの有用性は当業者には自明である。
【0023】
【表1】 TTAAAAATCACATTATTGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCC 40 TGTAATCCCAGCCCTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCA 80 CAAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGTTAACACGGTGA 120 AACCCCGTGTCTACTAAAAATACAAAAAATTAgCTGGGTG 160 TGGTGGCGGGCGCCTGTGGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTG 200 AAGCAgGACAATGGCGTGAACCCAgGAAGTGGAGCTTGCA 240 gTGAGCCAAGATTGCGCCATTGCGTCTTCCCAACAGAACA 280 AGACTCCATCTCAAAAAATAAATAAATaAATaAGCGGGCA 320 CATTACaACTTCaAGAAAATtACGGTGGTGCCGTCCGCCa 360 AGGACTTCATAGACCTCACGTTGTCCAAGACTCAACGAAA 400 GACTCCAACCGTTATTCATAAACATTACCAAATACATCGC 440 ATTAGACATTTTtACATGAGAAAAGTCAAATTTACTCAAC 480 AGAATTACCATGATAGACTTTCACAAATTCTAACAGATTT 520 CCCCAAAtTGGATGATATTCATCCGTTCTATGCTGATTTG 560 ATGAATATTCTcTACGACAAGGATCATTACAAGTTGGCTC 600 TGGGGCAAATAAATATTGCCAAAAATTTAGTGGACAATGT 640 TGCTAAAGATTATGTGCGACTGATGAAGTATGGCGACTCT 680 CTCTACCGCTGCaAACAGCTGAAGCGTGCGGCCCTGGGAC 720 GGATGTGCACAGTGATCAAGAGGCAGAAGCAGAGTTTGGA 760 GTATTTGGAGCAAGTGCGTCAGCATTTATCCCGTTTGCCA 800 ACCATTGATCCGAATACCAGGACCCTGCTTTTGTGTGGGT 840 ACCCAAATGTTGGGAAGTCCAGCTTCATCAACAAGGTGAC 880 GAGAGCAGACGTGGATGTCCAGCCCTATGCGTTCACAACC 920 AAGTCTCTGTTTGTTGGGCACATGGATTATAAGTATCTAC 960 GTTGGCAGGTTGTAGACACTCCTGGGATCCTGGACCACCC 1000 TCTGGAGGATAGGAACACCATCGAGATGCAGGCCATCACT 1040 GCCCTGGCCCACCTCCGTGCTGCGGTCCTGTATGTGATGG 1080 ATTTGTCTGAgCAgTGTGGGCATGGGCTGAgGGAACAgCT 1120 AgAACTCTTCCAGAACATCAGACcTcTcTTcATcAACAAG 1160 CcTcTCATAGTtGTAGCCAAcAAATGTGATGTGAAGAGAA 1200 TAGCTGAACTTTcTGAAGATGATCAGAAAATATTTACAGA 1240 TTTGCAGTcTGAAGGATTCCCTGTAATAGAGACCAGCACC 1280 CTGACTGAGGAAGGTGTTATTAAAGTTAAAACAGAGGCTT 1320 GCGATAGGCTTTTGGCTcATCGAGTGGAAACCAAAATGAA 1360 GGGAAATAAAGTGAATGAGGTGCTGAATAGACTGCACCTG 1400 GCTATCCCAACCAGGAGgGACGATAAGGAGAGGCCCCCTT 1440 TCATCCcTGAAGGAGTGGtGGCTCGCAGGAAGAGGATGGA 1480 AACTGAGGAGTCCAGGAAGAAGAGGGAACGAGATCTTGAG 1520 CTGGAAATGGGAGATGATTATATTTTGGATCTTCAGAAGT 1560 ACTGGGATtTAATGAATTTGTCTGAAAAACATGATAAGAT 1600 ACCAGAAATCTGGGAAGGCCATAATATAGCTGATTATATt 1640 GATCCAGCCATCATGAAGAAATTGGAAGAATTAGAAAAAG 1680 AAGAAGAGCTGAGAACAGCTGCTGGAGAGTATGACAGTGT 1720 ATCTGAGAGTGAAGACGAAGAGATGCTGGAAATCCGACAG 1760 CTGGCAAAGCAAATTCGAGAGAAAAAGAAGTTGAAAATTC 1800 TGGAGTCCAAAGAAAAGAATACACAGGGACCCAGGATGCC 1840 GCGAACTGCTAAGAAGGTTCAGAGGACAGTTTTGGAGAAG 1880 GAGATGCGTAGTCTTGGTGTTGACATGGACGATAAAGACG 1920 ATGCCCATTACGCAGTCCAGGCAAGAAGATCCCGGAGCAT 1960 CACTAGGAAAAGAAAGCGGGAAGACTCTGCTCCCCCGTCC 2000 TCTGTGGCCCGGAGTGGGAGTTGCTCTCGAACTCCACGTG 2040 ACGTTTCTGGTCTTAGGGATGTCAAGATGGTGAAGAAAGC 2080 CAAGACTATGATGAAGAATGCTCAGAAGAAGATGAATCGG 2120 TTGGGGAAGAAAGGGGAGGCGGATAGACACGTGTTTGATA 2160 TGAAGCCCAAGCACTTGCTGTCTGGGAAGAGGAAAGCTGG 2200 TAAAAAGGACAGGAGATAGTATCCGTTTGGTTGGCGTGGC 2240 TTCGCTAGAGTGTTGCTGTTTATTTCCTGTTTTGGCACAG 2280 TATGGTTTCAtGaAAttGGAGCTCtGTATAAACtGAAAAA 2320 GACAAAATAAGTAAAGCACTTGTTGCTTTGCTGAAAACTA 2360 TGGTTAACCCTATATAGGTGtGGGAAATTTTTGTCACTGC 2400 ATAATATTACAAATATTTtGAGTAGACAGTGTTTCCACAT 2440 TTAATGGAGTATCAGTTGCTTCAGATTTTCAGAACTGGGA 2480 AGATTTACTGGTGTAACTGGGTTGTTTTTGATGGAGAAAa 2520 ACCTTATTTTCTTTTGTAAGAGCTGGGAGCAAACACGTTT 2560 ATGAGTGTGTCGGAATCCCGTGCTTAAAATACGCTCTTAA 2600 ATTATTTTCTAGTCTTATTTcACAATGTCTCATTGTAGTC 2640 TGTCTTCAACTATTTTATCCAAAATANACCTCCAGAAGAA 2680 AG 2682 ヒトCRFG-1bのヌクレオチド配列(配列番号1)
【0024】
【表2】 MRKVKFTQQNYHDRLSQILTDFPKLDDIHPFYADLMNILY 40 DKDHYKLALGQINIAKNLVDNVAKDYVRLMKYGDSLYRCK 80 QLKRAALGRMCTVIKRQKQSLEYLEQVRQHLSRLPTIDPN 120 TRTLLLCGYPNVGKSSFINKVTRADVDVQPYAFTTKSLFV 160 GHMDYKYLRWQVVDTPGILDHPLEDRNTIEMQAITALAHL 200 RAAVLYVMDLSEQCGHGLREQLELFQNIRPLFINKPLIVV 240 ANKCDVKRIAELSEDDQKIFTDLQSEGFPVIETSTLTEEG 280 VIKVKTEACDRLLAHRVETKMKGNKVNEVLNRLHLAIPTR 320 RDDKERPPFIPEGVVARRKRMETEESRKKRERDLELEMGD 360 DYILDLQKYWDLMNLSEKHDKIPEIWEGHNIADYIDPAIM 400 KKLEELEKEEELRTAAGEYDSVSESEDEEMLEIRQLAKQI 440 REKKKLKILESKEKNTQGPRMPRTAKKVQRTVLEKEMRSL 480 GVDMDDKDDAHYAVQARRSRSITRKRKREDSAPPSSVARS 520 GSCSRTPRDVSGLRDVKMVKKAKTMMKNAQKKMNRLGKKG 560 EADRHVFDMKPKHLLSGKRKAGKKDRR 587 ヒトCRFG-1bのアミノ酸配列(配列番号2)
【0025】CRFG-1bをコードする本発明の一つのポリ
ヌクレオチドは、標準的なクローニングおよびスクリー
ニングにより、ヒト腎臓および精巣の細胞中のmRNA
から誘導されたcDNAライブラリーから、エクスプレ
スド・シークエンス・タグ(expressed sequence tag:
EST)分析 (Adams, M.D.ら, Science (1991) 252:1651-1
656; Adams, M.D. ら, Nature (1992) 355:632-634; Ad
ams, M.D.ら, Nature(1995) 377 Supp:3-174) を用いて
得ることができる。また、本発明のポリヌクレオチドは
ゲノムDNAライブラリーのような天然源から得ること
ができ、商業的に入手可能な公知の技法を用いて合成す
ることもできる。
【0026】配列番号2のCRFG-1bポリペプチドをコー
ドするヌクレオチド配列は、表1中に含まれるポリペプ
チドコード配列(配列番号1のヌクレオチド番号456
−2216)と同一であっても、遺伝子コードの重複性
(縮重)のため、やはり配列番号2のポリペプチドをコ
ードする配列であってもよい。
【0027】本発明のポリヌクレオチドをCRFG-1bポリ
ペプチドの組換え生産のために用いる場合、そのポリヌ
クレオチドには、成熟ポリペプチドのコード配列または
その断片単独、他のコード配列(例えば、リーダーもし
くは分泌配列、プレ−、プロ−もしくはプレプロ−タン
パク質配列、または他の融合ペプチド部分をコードする
もの)と同じリーディングフレーム内にある成熟ポリペ
プチドのコード配列またはその断片が含まれる。例え
ば、融合ポリペプチドの精製を容易にするマーカー配列
がコードされ得る。本発明のこの態様の好ましい具体例
として、マーカー配列は、pQEベクター(Qiagen, In
c.)により提供されかつGentz ら, Proc. Natl. Acad. S
ci. USA (1989) 86:821-824に記載されるようなヘキサ
−ヒスチジンペプチド、またはHAタグである。また、
このポリヌクレオチドは5'および3'非コード配列、例え
ば、転写されるが翻訳されない配列、スプライシングお
よびポリアデニル化シグナル、リボソーム結合部位、お
よびmRNA安定化配列を含んでいてもよい。
【0028】さらに好適な具体例は、数個、5〜10
個、1〜5個、1〜3個、1〜2個、または1個のアミ
ノ酸残基が任意の組合せで置換、欠失または付加されて
いる、表2のCRFG-1bポリペプチドのアミノ酸配列(配
列番号2)を含むCRFG-1b変異型をコードするポリヌク
レオチドである。中でも、本発明の好ましいポリヌクレ
オチドは表4のアミノ酸配列(配列番号4)をコードす
る表3(配列番号3)中に含まれるポリヌクレオチドで
ある。
【0029】
【表3】 gACTCTGCTC CCCCGTCCTC TGTGGCCCGG AgTGGGAGTT GCTCTCGAAC TCCACGTGAC GTTTCTGGTC TTAGGGATGT 80 CAAgATGGTG AAgAAAGCCA AGACTATGAT GAAGAATGCT CAgAAgAAgA TGAATCGGTT GGGGAAgAAA GGGGAGGCGG 160 ATATACACTT gTTTGATATG AAGCCCAAgC ACTTGCTGTC TGGGAAgAGG AAAGCTGGTa AAAAGGACAG GAGATAgTAT 240 CCGTTTGGTT GGCGTGGCTT CGCTAgAgTG TTGCTGTTTA TTTCCTGGTT TGGCACAGTA TGGTTTCaTG AAATTGGAGC 320 TCTGTaTAAA CTGAAAAAGA CAAAATAAGT AAAGCACTTG TTGCTTTGCT GAAAACTATG GTTAACCCTA TATAGGTGTG 400 GGAAATTTTT GTCaCTGCAT AATATTACaA ATATTCTGAG TAGACAGtGT TTCCACATTT AATGGAGTAT CAGTTGCTTC 480 AGATTTTCAG AACTGGGAAG ATTTACTGGT GTAACTGGGT TGTTTTTGAT GGAGAAAAAC CTTATTTTCT TTTGTAAGAG 560 CTGGGAGCAA ACACGTTTAT GAGTGTGTCG GAATCCCGTG CTTAAAATAC GCTCTTAAAT tATTTTCTAG TCCTTATTTT 640 ACAATGTCTC ATTGTAGTCT GTCTTCAACT ATTTTATCCA AAATAAACCT CCAGAAGGAA AAAAAAAAAA AAAAAA 716 ヒトCRFG-1bの部分ヌクレオチド配列(配列番号3)
【0030】
【表4】 HEDKDDAHYAVQARRSRSITRKRKREDSAPPSSVARSGSC 40 SRTPRDVSGLRDVKMVKKAKTMMKNAQKKMNRLGKKGEAD 80 IHLFDMKPKHLLSGKRKAGKKDRR 104 ヒトCRFG-1bの部分アミノ酸配列(配列番号4)
【0031】本発明はさらに、前記の配列とハイブリダ
イズするポリヌクレオチドに関する。これに関して、本
発明は特にストリンジェントな条件下で前記のポリヌク
レオチドとハイブリダイズするポリヌクレオチドに関す
る。本明細書中で用いる「ストリンジェントな条件」と
は、配列間に少なくとも80%、好ましくは少なくとも
90%、より好ましくは少なくとも95%、より一層好
ましくは少なくとも97〜99%の同一性があるときだ
けハイブリダイゼーションが起こる条件を指す。
【0032】配列番号1中に含まれるヌクレオチド配列
またはその断片(配列番号3の断片を含む)と同一であ
るか実質的に同一である本発明のポリヌクレオチドは、
CRFG-1bポリペプチドをコードする全長cDNAおよび
ゲノムクローンを単離するために、また、CRFG-1b遺伝
子との配列類似性が高い他の遺伝子(ヒト以外の種に由
来する相同体およびオーソログ体(ortholog)をコードす
る遺伝子を含む)のcDNAおよびゲノムクローンを単
離するために、cDNAおよびゲノムDNAのハイブリ
ダイゼーションプローブとして用いることができる。こ
のようなハイブリダイゼーション技法は当業者には公知
である。一般的に、これらのヌクレオチド配列は対象物
のヌクレオチド配列と80%、好ましくは90%、より
好ましくは95%同一である。プローブはたいてい15
個以上のヌクレオチドを含み、好ましくは30個以上を
含み、50個以上のヌクレオチドを有していてもよい。
特に好ましいプローブは30〜50個の範囲のヌクレオ
チドを有するものである。
【0033】一実施態様において、CRFG-1bポリペプチ
ド(ヒト以外の種に由来する相同体およびオーソログ体
を含む)をコードするポリヌクレオチドを得ることは、
配列番号1のヌクレオチド配列またはその断片を有する
標識プローブを用いて、ストリンジェントなハイブリダ
イゼーション条件下で適当なライブラリーをスクリーニ
ングし、前記のポリヌクレオチド配列を含む全長cDN
Aおよびゲノムクローンを単離する各工程を含んでな
る。このようなハイブリダイゼーション技法は当業者に
公知である。かくして、もう一つの態様では、本発明の
CRFG-1bポリヌクレオチドはさらに、配列番号1のヌク
レオチド配列またはその断片(配列番号3の断片を含
む)とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする
ヌクレオチド配列を含んでなるヌクレオチド配列を含む
ものである。CRFG-1bポリペプチドも、前記のハイブリ
ダイゼーション条件により得られたヌクレオチド配列に
よりコードされるアミノ酸配列を含んでなるポリペプチ
ドを含む。ストリンジェントなハイブリダイゼーション
条件は上で定義したとおりであるか、または、50% ホル
ムアミド、5×SSC (150mM NaCl, 15mM クエン酸三ナト
リウム) 、50mMリン酸ナトリウム (pH7.6)、5×Denhar
dt溶液、10% デキストラン硫酸および20μg/mlの変性し
剪断したサケ精子DNAを含有する溶液中で42℃で一
夜インキュベートし、次いでフィルターを 0.1×SSC 中
約65℃で洗浄する条件である。
【0034】本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプ
チドは、動物およびヒトの疾病に対する治療薬および診
断薬を探索するための研究用の試薬および材料として利
用することができる。
【0035】ベクター、宿主細胞、発現 本発明はまた、本発明のポリヌクレオチドを含有するベ
クター、このベクターにより遺伝子操作された宿主細
胞、および組換え法による本発明のポリペプチドの生産
に関する。本発明のDNA構築物から誘導されたRNA
を用いてこの種のタンパク質を生産するための無細胞翻
訳系も使用することができる。
【0036】組換え体生産に関しては、本発明のポリヌ
クレオチドの発現系またはその一部を組み入れるため
に、宿主細胞が遺伝子操作される。宿主細胞へのポリヌ
クレオチドの導入は、Davis ら, BASIC METHODS IN MOL
ECULAR BIOLOGY (1986) およびSambrook ら, MOLECULAR
CLONING: A LABORATORY MANUAL, 2nd Ed., Cold Sprin
g Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.
Y. (1989) などの多くの標準的な実験室マニュアルに記
載される方法、例えば、リン酸カルシウムトランスフェ
クション、DEAE−デキストラン媒介トランスフェク
ション、トランスベクション(transvection)、マイクロ
インジェクション、カチオン性脂質媒介トランスフェク
ション、エレクトロポレーション、形質導入、スクレー
プローディング(scrape loading)、射出導入(ballistic
introduction)または感染により行うことができる。
【0037】適当な宿主の代表的な例として、細菌細胞
(例:ストレプトコッカス、スタフィロコッカス、大腸
菌、ストレプトミセス、枯草菌)、真菌細胞(例:酵
母、アスペルギルス)、昆虫細胞(例:ドロソフィラS
2、スポドプテラSf9)、動物細胞(例:CHO、C
OS、HeLa、C 127、3T3、BHK、HEK 29
3、Bowes メラノーマ細胞)および植物細胞が挙げられ
る。
【0038】多種多様な発現系を使用することができ
る。こうした発現系として、特に、染色体、エピソーム
およびウイルス由来の系、例えば、細菌プラスミド由
来、バクテリオファージ由来、トランスポゾン由来、酵
母エピソーム由来、挿入エレメント由来、酵母染色体エ
レメント由来、ウイルス(例:バキュロウイルス、SV
40のようなパポバウイルス、ワクシニアウイルス、ア
デノウイルス、鶏痘ウイルス、仮性狂犬病ウイルス、レ
トロウイルス)由来のベクター、およびこれらの組合せ
に由来するベクター、例えば、コスミドやファージミド
のようなプラスミドとバクテリオファージの遺伝的要素
に由来するものがある。この発現系は発現を起こさせる
だけでなく発現を調節する制御配列を含んでいてもよ
い。一般的に、宿主内でのポリペプチドの産生のために
ポリヌクレオチドを維持し、増やし、発現するのに適し
た系またはベクターはどれも使用することができる。Sa
mbrookら, MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUAL
(前掲) に記載されるような、日常的に用いられる公知
の技法のいずれかにより、適当なヌクレオチド配列を発
現系に挿入することができる。
【0039】翻訳されたタンパク質を小胞体の内腔に、
細胞周辺腔に、または細胞外の環境に分泌させるため
に、適当な分泌シグナルを目的のポリペプチドに組み込
むことができる。これらのシグナルは目的のポリペプチ
ドに対して内因性であっても、異種シグナルであっても
よい。
【0040】スクリーニングアッセイで使用するためCR
FG-1bポリペプチドを発現させようとする場合、そのポ
リペプチドを細胞の表面に産生させることが好適であ
る。この場合は、スクリーニングアッセイでの使用に先
立って細胞を回収する。CRFG-1bポリペプチドが培地に
分泌される場合は、そのポリペプチドを回収し精製する
ために培地を回収する。細胞内に産生される場合は、そ
の細胞をまず溶解し、その後にポリペプチドを回収する
必要がある。
【0041】組換え細胞培養物からCRFG-1bポリペプチ
ドを回収し精製するには、硫酸アンモニウムまたはエタ
ノール沈殿、酸抽出、アニオンまたはカチオン交換クロ
マトグラフィー、ホスホセルロースクロマトグラフィ
ー、疎水性相互作用クロマトグラフィー、アフィニティ
ークロマトグラフィー、ヒドロキシルアパタイトクロマ
トグラフィーおよびレクチンクロマトグラフィーを含め
た公知の方法を用いることができる。最も好ましくは、
高速液体クロマトグラフィーが精製に用いられる。ポリ
ペプチドが単離および/または精製中に変性されるとき
は、タンパク質を再生させるための公知の技法を用い
て、活性のあるコンフォメーションを復元することが可
能である。
【0042】診断アッセイ 本発明はまた、診断薬としてのCRFG-1bポリヌクレオチ
ドの使用に関する。機能障害と関連したCRFG-1b遺伝子
の変異型の検出は、CRFG-1bの過少発現、過剰発現また
は変化した発現により生ずる疾病またはその罹病性の診
断に追加しうる、またはその診断を下しうる診断用ツー
ルを提供するだろう。CRFG-1b遺伝子に変異がある個体
を、さまざまな技法によりDNAレベルで見つけ出すこ
とができる。
【0043】診断用の核酸は、被験者の細胞、例えば血
液、尿、唾液、組織の生検または剖検材料から得ること
ができる。検出のためにゲノムDNAを直接使用して
も、分析前にPCRまたは他の増幅法を使って酵素的に
増幅してもよい。同様の方法でRNAまたはcDNAを
使用することもできる。欠失および挿入変異は、正常な
遺伝子型と比較したときの増幅産物のサイズの変化によ
り検出できる。点突然変異は増幅DNAを標識CRFG-1b
ヌクレオチド配列とハイブリダイズさせることで同定で
きる。完全にマッチした配列とミスマッチの二重鎖とは
RNアーゼ消化により、または融解温度の差異により区
別できる。また、DNA配列の差異は、変性剤を用いる
または用いないゲルでのDNA断片の電気泳動の移動度
の変化により、または直接DNA配列決定によっても検
出できる(例えば、Myersら, Science (1985) 230:1242
を参照のこと)。特定位置での配列変化はヌクレアー
ゼプロテクションアッセイ(例えば、RNアーゼおよび
S1プロテクション)または化学的開裂法によっても確
認できる(Cottonら, Proc. Natl. Acad. Sci. USA (19
85) 85:4397-4401を参照のこと)。別の実施態様では、
例えば、遺伝子変異の効率のよいスクリーニングを行う
ため、CRFG-1bヌクレオチド配列またはその断片を含む
オリゴヌクレオチドプローブのアレイを構築することが
できる。アレイ技法は公知で、一般的な適用可能性を有
し、遺伝子発現、遺伝的連鎖および遺伝的変異性を含め
た分子遺伝学のさまざまな問題を解きあかすために用い
られている(例えば、M. Cheeら, Science, Vol.274, p
p.610-613 (1996) を参照のこと)。
【0044】診断アッセイは、前記の方法によりCRFG-1
b遺伝子の変異を検出することで、慢性腎疾患、腎性虚
血、糖尿病性腎症、急性腎不全、神経変性疾患およびア
ルツハイマー病への罹りやすさを診断または判定する方
法を提供する。
【0045】さらに、被験者から得られたサンプルから
CRFG-1b ポリペプチドまたはCRFG-1b mRNAのレベル
の異常な低下または増加を測定する方法により、慢性腎
疾患、腎性虚血、糖尿病性腎症、急性腎不全、神経変性
疾患およびアルツハイマー病の診断を下すことができ
る。発現の低下または増加は、当技術分野で公知のポリ
ヌクレオチド定量法のいずれか、例えばPCR、RT−
PCR、RNアーゼプロテクション、ノーザンブロッ
ト、その他のハイブリダイゼーション法によりRNAレ
ベルで測定することができる。宿主から得られたサンプ
ル中のCRFG-1bポリペプチドのようなタンパク質のレベ
ルを測定するためのアッセイ法は当業者によく知られて
いる。こうしたアッセイ法として、ラジオイムノアッセ
イ、競合結合アッセイ、ウエスタンブロット分析、EL
ISAアッセイなどがある。
【0046】かくして、もう一つの態様において、本発
明は、疾病、特に慢性腎疾患、腎性虚血、糖尿病性腎
症、急性腎不全、神経変性疾患およびアルツハイマー病
または該疾病への罹りやすさを診断するためのキットに
関し、このキットは、(a) CRFG-1bポリヌクレオチド
(好ましくは、配列番号1のヌクレオチド配列)もしく
はその断片、(b) (a) のヌクレオチド配列に相補的なヌ
クレオチド配列、(c) CRFG-1bポリペプチド(好ましく
は、配列番号2のポリペプチド)もしくはその断片、ま
たは(d) CRFG-1bポリペプチド(好ましくは、配列番号
2のポリペプチド)に対する抗体、を含んでなる。この
ようなキットにおいて、(a) 、(b) 、(c) または (d)が
実質的な構成成分であることが理解されよう。
【0047】染色体アッセイ 本発明のヌクレオチド配列はまた、染色体の同定にも有
用である。この配列は個々のヒト染色体上の特定の位置
を標的指向し、その特定位置とハイブリダイズすること
ができる。本発明に従って関連配列の染色体地図を作成
することは、これらの配列と遺伝子関連疾患とを相関さ
せる上で重要な第一段階である。ひとたび配列が正確な
染色体位置にマッピングされたら、その染色体上のその
配列の物理的位置を遺伝地図データと相関させることが
できる。この種のデータは、例えば、V. McKusick, Men
delian Inheritance in Man (Johns Hopkins Universit
yWelch Medical Library からオンラインで入手可能)
中に見いだせる。その後、同一の染色体領域にマッピン
グされた遺伝子と疾患との関係を連鎖分析(物理的に隣
接した遺伝子の共遺伝)により同定する。患者と正常個
体とのcDNAまたはゲノム配列の差異も調べることが
できる。患者の一部または全部に変異が観察されて、ど
の正常個体にも観察されない場合は、その変異が疾病の
原因である可能性がある。CRFG-1b遺伝子(配列番号
1)は染色体10p15.2-15.3に存在し、この位置は脳のグ
リオーマ(グリア芽細胞腫)と関連している。
【0048】抗体 本発明のポリペプチドまたはその断片もしくは類似体、
またはそれらを発現する細胞は、CRFG-1bポリペプチド
に免疫特異的な抗体を産生するための免疫原としても使
用することができる。「免疫特異的」とは、その抗体が
従来技術における他の関連ポリペプチドに対するその親
和性よりも本発明のポリペプチドに対して実質的に高い
親和性を有することを意味する。
【0049】CRFG-1bポリペプチドに対する抗体は、慣
用のプロトコールを用いて、動物(好ましくはヒト以
外)に該ポリペプチドまたはエピトープを含む断片、類
似体もしくは細胞を投与することにより得られる。モノ
クローナル抗体の調製には、連続細胞系の培養物により
産生される抗体をもたらす任意の技法を用いることがで
きる。例を挙げると、ハイブリドーマ技法 (Kohler, G.
およびMilstein, C., Nature (1975) 256:495-497)、ト
リオーマ技法、ヒトB細胞ハイブリドーマ技法 (Kozbor
ら, Immunology Today (1983) 4:72) およびEBV−ハ
イブリドーマ技法(Coleら, MONOCLONAL ANTIBODIES AND
CANCER THERAPY, pp.77-96, Alan R. Liss, Inc., 198
5) などがある。
【0050】本発明のポリペプチドに対する一本鎖抗体
をつくるために、一本鎖抗体の調製法(米国特許第4,94
6,778 号)を適応させることができる。また、ヒト化抗
体を発現させるために、トランスジェニックマウスまた
は他の哺乳動物を含む他の生物を利用することができ
る。前記の抗体を用いて、そのポリペプチドを発現する
クローンを単離・同定したり、アフィニティークロマト
グラフィーでそのポリペプチドを精製することもでき
る。CRFG-1bポリペプチドに対する抗体は、とりわけ、
慢性腎疾患、腎性虚血、糖尿病性腎症、急性腎不全、神
経変性疾患およびアルツハイマー病の治療に使用できる
可能性がある。
【0051】ワクチン 本発明の別の態様は、哺乳動物において免疫学的応答を
引き出す方法に関し、この方法は、特に慢性腎疾患、腎
性虚血、糖尿病性腎症、急性腎不全、神経変性疾患およ
びアルツハイマー病から前記動物を防御するための抗体
および/またはT細胞免疫応答を生ずるのに十分なCRFG
-1bポリペプチドまたはその断片を哺乳動物に接種する
ことを含んでなる。本発明のさらに別の態様は、哺乳動
物を疾病から防御する抗体を産生させるような免疫学的
応答を引き出すために、in vivoでCRFG-1bポリヌクレオ
チドの発現を指令するベクターを介してCRFG-1bポリペ
プチドを供給することを含んでなる、哺乳動物において
免疫学的応答を引き出す方法に関する。
【0052】本発明の更なる態様は、哺乳動物宿主に導
入したとき、その哺乳動物においてCRFG-1bポリペプチ
ドに対する免疫学的応答を引き出す免疫学的/ワクチン
製剤(組成物)に関し、この組成物はCRFG-1bポリペプ
チドまたはCRFG-1b遺伝子を含有する。ワクチン製剤は
適当な担体をさらに含んでいてもよい。CRFG-1bポリペ
プチドは胃の中で分解されうるので、非経口的(皮下、
筋肉内、静脈内、皮内等への注射を含む)に投与するこ
とが好ましい。非経口投与に適した製剤としては、酸化
防止剤、緩衝液、静菌剤およびこの製剤を受容者の血液
と等張にする溶質を含みうる水性および非水性の無菌注
射液、並びに懸濁化剤または増粘剤を含みうる水性およ
び非水性の無菌懸濁液がある。こうした製剤は1回量容
器または数回量容器(例えば、密閉アンプルおよびバイ
アル)で提供することができ、また、使用直前に無菌の
液状担体を添加するだけでよい凍結乾燥状態で保管する
こともできる。ワクチン製剤はこの製剤の免疫原性を増
強するためのアジュバント系、例えば水中油型のアジュ
バント系や当技術分野で公知の他のアジュバント系を含
んでいてもよい。投与量はワクチンの比活性で変化し、
ルーチンな実験操作により簡単に決定できる。
【0053】スクリーニングアッセイ 本発明のCRFG-1bポリペプチドは、このポリペプチドを
活性化する化合物(アゴニスト)またはその活性を阻害
する化合物(アンタゴニスト、または阻害剤ともいう)
のスクリーニング法において使用することができる。こ
うして、本発明のポリペプチドは、例えば、細胞、無細
胞調製物、化学物質ライブラリーおよび天然産物の混合
物からアゴニストまたはアンタゴニストを評価し同定す
るためにも用いられる。これらのアゴニストまたはアン
タゴニストは、本発明のポリペプチドの、場合によっ
て、天然のまたは修飾された基質、リガンド、受容体、
酵素などであってよく、また、本発明のポリペプチドの
構造的または機能的な模擬物であってもよい(Coligan
ら, Current Protocols in Immunology 1(2): Chapter5
(1991)を参照のこと)。
【0054】CRFG-1bポリペプチドは多くの病理を含め
て多数の生物学的機能に関与している。したがって、一
方ではCRFG-1bポリペプチドを刺激し、他方ではCRFG-1b
ポリペプチドの機能を阻害し得る化合物および薬物を
見つけ出すことが望まれる。一般的に、アゴニストは慢
性腎疾患、腎性虚血、糖尿病性腎症、急性腎不全、神経
変性疾患およびアルツハイマー病のような症状の治療お
よび予防目的で用いられる。アンタゴニストは慢性腎疾
患、腎性虚血、糖尿病性腎症、急性腎不全、神経変性疾
患およびアルツハイマー病のような症状のさまざまな治
療および予防目的で使用しうる。
【0055】一般に、こうしたスクリーニング法はCRFG
-1bポリペプチドを発現する適当な細胞、またはCRFG-1b
ポリペプチドに応答する適当な細胞を用いるものであ
る。この種の細胞には哺乳動物、酵母、ショウジョウバ
エ由来の細胞または大腸菌細胞が含まれる。次いで、CR
FG-1bポリペプチドを発現する細胞(もしくは発現され
たポリペプチドを含む細胞膜)またはCRFG-1bポリペプ
チドに応答する細胞を試験化合物と接触させて、その結
合または機能的応答の刺激もしくは阻害を観察する。候
補化合物と接触させた細胞の能力を、接触させなかった
同一細胞とCRFG-1b活性に関して比較する。
【0056】これらのアッセイでは候補化合物の結合を
簡単に試験することができ、そこでは候補化合物と直接
または間接に結合された標識により、または標識した競
合物質との競合を用いるアッセイにより、CRFG-1bポリ
ペプチドを担持する細胞への付着が検出される。さら
に、これらのアッセイでは、CRFG-1bポリペプチドを担
持する細胞に適した検出系を用いて、候補化合物がCRFG
-1bポリペプチドの活性化により生ずるシグナルを結果
的にもたらすか否かを試験することができる。一般的
に、活性化の阻害剤は既知のアゴニストの存在下でアッ
セイされ、そして候補化合物の存在がアゴニストによる
活性化に与える影響が調べられる。
【0057】さらに、これらのアッセイは、候補化合物
とCRFG-1bポリペプチドを含む溶液とを混ぜ合わせて混
合物をつくり、この混合物中のCRFG-1b活性を測定し、
そしてこの混合物のCRFG-1b活性を標準と比較する各ス
テップを単に含むだけでよい。
【0058】また、CRFG-1bのcDNA、タンパク質ま
たはこのタンパク質に対する抗体を用いて、細胞内での
CRFG-1b mRNAまたはタンパク質の生産に及ぼす添加
化合物の作用を検出するためのアッセイを組み立てるこ
とができる。例えば、当技術分野で公知の標準方法によ
りモノクローナルまたはポリクローナル抗体を用いて、
CRFG-1bタンパク質の分泌レベルまたは細胞結合レベル
を測定するためのELISAを構築することができ、こ
れは適切に操作された細胞または組織からのCRFG-1bの
生産を抑制または増強する物質(それぞれアンタゴニス
トまたはアゴニストともいう)の探索に用いることがで
きる。
【0059】膜結合受容体または可溶性受容体が存在す
るのであれば、当技術分野で公知の標準的な受容体結合
法によりこの種の受容体を同定するためにCRFG-1bタン
パク質を用いることができる。こうした受容体結合法に
は、限定するものではないが、リガンド結合および架橋
アッセイがあり、このアッセイでは、CRFG-1bを放射性
アイソトープ(例:125I)で標識するか、化学的に修飾
(例:ビオチン化)するか、または検出や精製に適した
ペプチド配列に融合させ、そして推定上の受容体源(細
胞、細胞膜、細胞上清、組織抽出物、体液など)とイン
キュベートする。その他の方法としては、表面プラズモ
ン共鳴および分光学のような生物物理的方法がある。受
容体の精製およびクローニングに用いることに加えて、
これらの結合アッセイは、もし存在するのであれば、CR
FG-1bのその受容体への結合と競合するCRFG-1bのアゴニ
ストまたはアンタゴニストを同定するために用いること
もできる。スクリーニングアッセイを行うための標準的
な方法は当技術分野でよく理解されている。
【0060】CRFG-1bポリペプチドの潜在的なアンタゴ
ニストの例としては、抗体、ある場合には、CRFG-1bポ
リペプチドの、場合により、リガンド、基質、受容体、
酵素などと密接な関係があるオリゴヌクレオチドもしく
はタンパク質(例えば、リガンド、基質、受容体、酵素
などの断片)、または本発明のポリペプチドと結合する
が応答を誘導しない(それゆえポリペプチドの活性を妨
げる)小分子などがある。
【0061】かくして、他の態様において、本発明は、
CRFG-1bポリペプチドのアゴニスト、アンタゴニスト、
リガンド、受容体、基質、酵素など、またはCRFG-1bポ
リペプチドの生産を低下または増加させる化合物を同定
するためのスクリーニングキットに関し、このキット
は、(a) CRFG-1bポリペプチド(好ましくは、配列番号
2のポリペプチド)(b) CRFG-1bポリペプチド(好まし
くは、配列番号2のポリペプチド)を発現する組換え細
胞、(c) CRFG-1bポリペプチド(好ましくは、配列番号
2のポリペプチド)を発現する細胞膜、または(d) CRFG
-1bポリペプチド(好ましくは、配列番号2のポリペプ
チド)に対する抗体、を含んでなる。このようなキット
において、(a) 、(b) 、(c) または (d)が実質的な構成
成分であることが理解されよう。
【0062】予防および治療法 本発明は、CRFG-1bポリペプチド活性の過剰量と不足量
のどちらにも関係した慢性腎疾患、腎性虚血、糖尿病性
腎症、急性腎不全、神経変性疾患、アルツハイマー病な
どの異常な状態の治療法を提供する。CRFG-1bポリペプ
チドの活性が過剰である場合は、いくつかのアプローチ
が利用可能である。一つのアプローチは、例えば、リガ
ンド、基質、受容体、酵素などの結合をブロックするこ
とにより、または第2のシグナルを抑制することで異常
な状態を軽減することにより、CRFG-1bポリペプチドの
機能を阻害するのに有効な量で、前記の阻害剤化合物
(アンタゴニスト)を製剤学上許容される担体とともに
患者に投与することを含んでなる。もう一つのアプロー
チでは、内因性のCRFG-1bポリペプチドとの競合状態で
リガンド、基質、酵素、受容体などと結合する能力がま
だある可溶性形態のCRFG-1bポリペプチドを投与するこ
とができる。このような競合剤の典型的な例はCRFG-1b
ポリペプチドの断片である。
【0063】別のアプローチでは、内因性のCRFG-1bポ
リペプチドとの競合状態でリガンドと結合する能力がま
だある可溶性形態のCRFG-1bポリペプチドを投与するこ
とができる。このような競合剤の典型的な例はCRFG-1b
ポリペプチドの断片である。
【0064】さらに別のアプローチでは、発現阻止法を
使って内因性CRFG-1bポリペプチドをコードする遺伝子
の発現を抑制することができる。こうした公知技術は、
体内で生成されるか別個に投与されるアンチセンス配列
の使用を必要とする。例えば、Oligodeoxynucleotides
as Antisense Inhibitors of Gene Expression, CRCPre
ss, Boca Raton, FL (1988)中のO'Connor, J Neurochem
(1991) 56:560 を参照のこと。あるいはまた、この遺
伝子と共に三重らせんを形成するオリゴヌクレオチドを
供給することもできる。例えば、Lee ら, Nucleic Acid
s Res (1979) 6:3073; Cooney ら, Science (1988) 24
1:456; Dervanら, Science (1991) 251:1360 を参照の
こと。これらのオリゴマーはそれ自体を投与することも
できるし、関連オリゴマーをin vivo で発現させること
もできる。
【0065】CRFG-1bおよびその活性の過少発現に関係
した異常な状態を治療する場合も、いくつかのアプロー
チを取ることができる。一つのアプローチは、治療上有
効な量のCRFG-1bポリペプチドを活性化する化合物(す
なわち、前記のアゴニスト)を製剤学上許容される担体
とともに患者に投与して、異常な状態を緩和することを
含んでなる。別法として、患者の関連細胞においてCRFG
-1bを内因的に産生させるために遺伝子治療を用いるこ
とができる。例えば、上で述べたような複製欠損レトロ
ウイルスベクターによる発現のために本発明のポリヌク
レオチドを遺伝子操作する。次にレトロウイルス発現構
築物を単離し、本発明のポリペプチドをコードするRN
Aを含有するレトロウイルスプラスミドベクターで形質
導入されたパッケージング細胞に導入する。その結果、
パッケージング細胞は対象の遺伝子を含有する感染性の
ウイルス粒子を産生するようになる。in vivo での細胞
処理およびin vivo でのポリペプチド発現のために、こ
れらの産生細胞を患者に投与する。遺伝子治療の概論に
関しては、Human Molecular Genetics, T Strachanand
A P Read, BIOS Scientific Publishers Ltd (1996) 中
のChapter 20, GeneTherapy and other Molecular Gene
tic-based Therapeutic Approaches(およびその中の引
用文献) を参照のこと。もう一つのアプローチは治療量
のCRFG-1bポリペプチドを適当な製剤学上の担体ととも
に投与することである。
【0066】製剤および投与 可溶性形態のCRFG-1bポリペプチドのようなペプチド、
アゴニストおよびアンタゴニストペプチド、または小分
子は適当な製剤学上の担体と組み合わせて製剤化するこ
とができる。このような製剤は治療上有効な量のポリペ
プチドまたは化合物と、製剤学上許容される担体または
賦形剤を含有する。この種の担体としては、食塩水、生
理食塩水、デキストロース、水、グリセロール、エタノ
ール、およびこれらの組合せがあるが、これらに限らな
い。製剤は投与様式に適合させるべきであり、これは当
技術分野の技量の範囲内である。本発明はさらに、前記
の本発明組成物の1以上の成分を充填した1以上の容器
を含んでなる医薬用パックおよびキットに関する。本発
明のポリペプチドおよび他の化合物は単独で使用して
も、他の化合物、例えば治療用化合物と一緒に使用して
もよい。
【0067】医薬組成物を全身投与するときの好ましい
形態は、注入(注射)、典型的には静注である。皮下、
筋肉内または腹腔内のような他の注入経路も使用でき
る。全身投与の別の手段は、胆汁酸塩、フシジン酸、そ
の他の界面活性剤などの浸透剤を用いた経粘膜および経
皮投与である。さらに、腸溶剤またはカプセル剤として
適切に製剤化されているのであれば、経口投与も可能で
ある。これらの化合物は軟膏、ペースト、ゲルなどの剤
形で局所に投与しても、かつ/または局在化させてもよ
い。
【0068】必要な投与量範囲はペプチドの選択、投与
経路、製剤の性質、患者の状態、そして医師の判断に左
右される。しかし、適当な投与量は患者の体重1kgあた
り0.1 〜100 μg の範囲である。利用可能な化合物が多
種多様であり、それぞれの投与経路の効率も異なるた
め、必要とされる投与量は広範に変動することを予想す
べきである。例えば、経口投与は静注による投与よりも
高い投与量を必要とすることが予想される。こうした投
与量レベルの変動は、当技術分野でよく理解されている
ような、標準的経験的な最適化手順を用いて調整するこ
とができる。
【0069】治療に用いるポリペプチドは、上述したよ
うな「遺伝子治療」と称する治療法において、患者の体
内で産生させることもできる。例えば、患者由来の細胞
を、ex vivo でポリペプチドをコードするDNAまたは
RNAのようなポリヌクレオチドにより、例えばレトロ
ウイルスプラスミドベクターを用いて、遺伝子工学的に
操作する。その後、この細胞を患者に導入する。
【0070】慢性腎不全に介入する標的を提供すべく、
2つの動物モデル系が研究されてきた。CRFG-1bは慢性
腎不全の3つの動物モデル、肥満Zuckerラットおよび腎
臓の5/6を摘出したラットにおいてダウンレギュレー
ションされることがディファレンシャル・ディスプレー
PCRにより同定された新規な遺伝子である。さらに、
老齢のFisher 344ラット(24ヶ月齢)は腎臓が肥大して
腎機能が低下しているが、このラットもCRFG-1b の発現
が低下している。腎不全におけるこの遺伝子の発現低下
は腎臓が正常に働くうえでのその重要な役割を示してい
る可能性がある。
【0071】慢性腎不全を発症している5ヶ月齢の肥満
Zuckerラットでは、CRFG-1bのmRNAが痩せて健康な
同月齢の対照ラットにおいて見られるレベルの1/3以
下に減少している。蛋白尿とCRFG-1b発現との相関関係
はないので、CRFG-1bの減少は標準的な臨床指示物質が
出現する前の腎障害の初期マーカーとなる。
【0072】ラットのCRFG-1bは2.5 kbと1.5 kbの2つ
のmRNAサイズを有するが、ヒトではただ1つの分子
量種が2.7 kbに同定されている。ヒトCRFG-1bはヒト染
色体10p15.2-15.3にマップされた。第10染色体のこの領
域は、171840ホスホフルクトキナーゼ、血小板型;6004
49 ジヒドロジオールデヒドロゲナーゼ、タイプ1;601
070 インターロイキン-15 受容体、α;600448 プロテ
インキナーゼC、ζ型;147270 インターαトリプシン
阻害剤、H鎖-1;176870プロテインHC;137800脳のグリ
オーマ;300007 インターロイキン-9受容体;および147
680 インターロイキン-2にリンクしている。
【0073】多数の組織での正常mRNA発現のノーザ
ンブロットにより、骨格筋>精巣>膵臓>心臓>胸腺>
胎盤>腎臓>白血球>脾臓>卵巣>結腸>脳>前立腺に
おける発現が確認される。
【0074】
【実施例】実施例1 CRFG-1bの存在は、Liang P.およびPardee A.B.(Scienc
e, 1992 Aug. 14, Vol.257, pp. 967-71)により開発さ
れたディファレンシャル・ディスプレー・ポリメラーゼ
連鎖反応(DDPCR)を用いて決定した。痩せている
Zuckerラットと肥満したZuckerラットの腎臓に由来する
RNAから相補的DNA(cDNA)を合成するために
オリゴヌクレオチドプライマー(プライマーI)5'-ACC
ACACATCTGA-3'(配列番号5) を用いた。0.5μg のRN
A、1μM のプライマーI、20μMのdNTP、400 単位のM
-MLV 逆転写酵素(Promega, Madison, WI)および製造業
者から提供された1×標準逆転写酵素緩衝液を用いて20
μl の容量にてcDNAを合成した。この反応サンプル
を65℃へ5分加熱した後、42℃で1時間インキュベート
した。次に、上で得られた4μl のcDNA合成反応物
を1.5mM MgCl2 、20μM dNTP、1μM のプライマーI、
1μM のプライマーII (5'-TGTTGGGAACAAG-3')(配列番
号6)、2μCiの[33P]-d-α-ATP、1.25単位のAmplitaq
ポリメラーゼ(Perkin elmer, Foster City, CA) および
製造業者から提供された1×標準PCR緩衝液と共に用
いて20μl の反応容量にてポリメラーゼ連鎖反応(PC
R)を行った。PCRのサイクル条件は、94℃で30秒、
42℃で2分、72℃で30秒を40サイクル行い、最後に72℃
で5分の伸長反応を行うものであった。痩せているZuck
erラットと肥満したZuckerラットの腎臓RNAからの標
識PCR断片を12%SDS−ポリアクリルアミドゲルで
分離し、X線フィルムに16時間露出した。225 個のヌク
レオチドからなるPCR増幅DNA断片は、痩せている
同月齢の対照ラットと比べて、肥満したZuckerラットの
腎臓では減少していることが確認された。この断片を乾
燥ポリアクリルアミドゲルから切り出し、DNAを沸騰
水で溶出した。この溶出DNAを上記と同じ条件でPC
Rにかけた。次に、PCR反応物の2μl アリコートを
用いて、製造業者の標準反応条件によりPCR断片をpC
RIIベクター(Invitrogen, Carlsbad, CA)にサブクロー
ニングした。その後、cDNAインサートの配列をfmol
配列決定キット(Promega, Madison, WA)により決定し
た。この配列情報を用いて、Marathon RACE キット(Clo
netech, Palo, Alto, CA)により追加の5'配列のクロー
ニングのためのアンチセンスプライマーを作製した。次
に、Marathon RACE キットから得られた607 ヌクレオチ
ドの配列を用いて、BLAST 配列分析アルゴリズムにより
ヒト相同体を同定した。このヒト配列は配列番号1で表
される。
【0075】実施例2 ラット腎臓由来のRNAでのノーザンブロットによりCR
FG-1b mRNAを検出した。グアニジニウムチオシアネ
ート変性および酸性化フェノール-クロロホルム抽出(CH
OMCZYNSKI P, SACCHI N: Analyt Biochem 162:156-159,
1987) により腎皮質から全RNAを抽出した。0.2Mホ
ルムアルデヒド-1%アガロースゲル上で全RNA(10μ
g)を分画化し、4×標準塩水クエン酸塩中のナイロン膜
(Nylon-1, Gibco-BRL, Gaithersburg, MD)に移行させ
た。等しい負荷(loading)および移行をメチレンブルー
染色により確かめた。1.5kb と2.5kb でラット由来のm
RNAを認識する、CRFG-1bのためのアンチセンス[32P]
cDNAプローブを作製した。ノーザンブロット分析に
より、腎不全を発症している肥満Zuckerラット由来の腎
臓ではCRFG-1b mRNAが減少していることがわかっ
た。全腎臓塊の5/6を摘出する部分腎切除後の腎臓で
もCRFG-1b mRNAが減少していた。この動物モデルは
慢性腎疾患を発症する(Shea SM, Raskova J, Morrison
AB Am J Pathol 1980 Aug; 100(2): 513-528) 。また、
老齢F344ラットの腎臓においてもCRFG-1bmRNAが減
少していた。F344ラットは加齢とともに腎疾患を発症し
(McDermottGF, Ingram A, Scholey J, Kirkland JL, Wh
iteside CI J Gerontol A Biol Sci Med Sci 1996 Mar;
51(2):M80-M85)、このことはCRFG-1b が腎疾患におい
て減少することを示唆している。
【0076】本明細書中に引用された、特許および特許
出願明細書を含めた全ての刊行物は、あたかも各刊行物
が明確にかつ個々に示されているかのように、その全体
を参考としてここに組み入れるものとする。
【0077】
【配列表】
配列番号:1 配列の長さ:2682 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:cDNA 配列 TTAAAAATCA CATTATTGGC CAGGTGCAGT GGCTCATGCC TGTAATCCCA GCCCTTTGGG 60 AGGCCGAGGC AGGTGGATCA CAAGGTCAGG AGATTGAGAC CATCCTGGTT AACACGGTGA 120 AACCCCGTGT CTACTAAAAA TACAAAAAAT TAGCTGGGTG TGGTGGCGGG CGCCTGTGGT 180 CCCAGCTACT CGGGAGGCTG AAGCAGGACA ATGGCGTGAA CCCAGGAAGT GGAGCTTGCA 240 GTGAGCCAAG ATTGCGCCAT TGCGTCTTCC CAACAGAACA AGACTCCATC TCAAAAAATA 300 AATAAATAAA TAAGCGGGCA CATTACAACT TCAAGAAAAT TACGGTGGTG CCGTCCGCCA 360 AGGACTTCAT AGACCTCACG TTGTCCAAGA CTCAACGAAA GACTCCAACC GTTATTCATA 420 AACATTACCA AATACATCGC ATTAGACATT TTTACATGAG AAAAGTCAAA TTTACTCAAC 480 AGAATTACCA TGATAGACTT TCACAAATTC TAACAGATTT CCCCAAATTG GATGATATTC 540 ATCCGTTCTA TGCTGATTTG ATGAATATTC TCTACGACAA GGATCATTAC AAGTTGGCTC 600 TGGGGCAAAT AAATATTGCC AAAAATTTAG TGGACAATGT TGCTAAAGAT TATGTGCGAC 660 TGATGAAGTA TGGCGACTCT CTCTACCGCT GCAAACAGCT GAAGCGTGCG GCCCTGGGAC 720 GGATGTGCAC AGTGATCAAG AGGCAGAAGC AGAGTTTGGA GTATTTGGAG CAAGTGCGTC 780 AGCATTTATC CCGTTTGCCA ACCATTGATC CGAATACCAG GACCCTGCTT TTGTGTGGGT 840 ACCCAAATGT TGGGAAGTCC AGCTTCATCA ACAAGGTGAC GAGAGCAGAC GTGGATGTCC 900 AGCCCTATGC GTTCACAACC AAGTCTCTGT TTGTTGGGCA CATGGATTAT AAGTATCTAC 960 GTTGGCAGGT TGTAGACACT CCTGGGATCC TGGACCACCC TCTGGAGGAT AGGAACACCA 1020 TCGAGATGCA GGCCATCACT GCCCTGGCCC ACCTCCGTGC TGCGGTCCTG TATGTGATGG 1080 ATTTGTCTGA GCAGTGTGGG CATGGGCTGA GGGAACAGCT AGAACTCTTC CAGAACATCA 1140 GACCTCTCTT CATCAACAAG CCTCTCATAG TTGTAGCCAA CAAATGTGAT GTGAAGAGAA 1200 TAGCTGAACT TTCTGAAGAT GATCAGAAAA TATTTACAGA TTTGCAGTCT GAAGGATTCC 1260 CTGTAATAGA GACCAGCACC CTGACTGAGG AAGGTGTTAT TAAAGTTAAA ACAGAGGCTT 1320 GCGATAGGCT TTTGGCTCAT CGAGTGGAAA CCAAAATGAA GGGAAATAAA GTGAATGAGG 1380 TGCTGAATAG ACTGCACCTG GCTATCCCAA CCAGGAGGGA CGATAAGGAG AGGCCCCCTT 1440 TCATCCCTGA AGGAGTGGTG GCTCGCAGGA AGAGGATGGA AACTGAGGAG TCCAGGAAGA 1500 AGAGGGAACG AGATCTTGAG CTGGAAATGG GAGATGATTA TATTTTGGAT CTTCAGAAGT 1560 ACTGGGATTT AATGAATTTG TCTGAAAAAC ATGATAAGAT ACCAGAAATC TGGGAAGGCC 1620 ATAATATAGC TGATTATATT GATCCAGCCA TCATGAAGAA ATTGGAAGAA TTAGAAAAAG 1680 AAGAAGAGCT GAGAACAGCT GCTGGAGAGT ATGACAGTGT ATCTGAGAGT GAAGACGAAG 1740 AGATGCTGGA AATCCGACAG CTGGCAAAGC AAATTCGAGA GAAAAAGAAG TTGAAAATTC 1800 TGGAGTCCAA AGAAAAGAAT ACACAGGGAC CCAGGATGCC GCGAACTGCT AAGAAGGTTC 1860 AGAGGACAGT TTTGGAGAAG GAGATGCGTA GTCTTGGTGT TGACATGGAC GATAAAGACG 1920 ATGCCCATTA CGCAGTCCAG GCAAGAAGAT CCCGGAGCAT CACTAGGAAA AGAAAGCGGG 1980 AAGACTCTGC TCCCCCGTCC TCTGTGGCCC GGAGTGGGAG TTGCTCTCGA ACTCCACGTG 2040 ACGTTTCTGG TCTTAGGGAT GTCAAGATGG TGAAGAAAGC CAAGACTATG ATGAAGAATG 2100 CTCAGAAGAA GATGAATCGG TTGGGGAAGA AAGGGGAGGC GGATAGACAC GTGTTTGATA 2160 TGAAGCCCAA GCACTTGCTG TCTGGGAAGA GGAAAGCTGG TAAAAAGGAC AGGAGATAGT 2220 ATCCGTTTGG TTGGCGTGGC TTCGCTAGAG TGTTGCTGTT TATTTCCTGT TTTGGCACAG 2280 TATGGTTTCA TGAAATTGGA GCTCTGTATA AACTGAAAAA GACAAAATAA GTAAAGCACT 2340 TGTTGCTTTG CTGAAAACTA TGGTTAACCC TATATAGGTG TGGGAAATTT TTGTCACTGC 2400 ATAATATTAC AAATATTTTG AGTAGACAGT GTTTCCACAT TTAATGGAGT ATCAGTTGCT 2460 TCAGATTTTC AGAACTGGGA AGATTTACTG GTGTAACTGG GTTGTTTTTG ATGGAGAAAA 2520 ACCTTATTTT CTTTTGTAAG AGCTGGGAGC AAACACGTTT ATGAGTGTGT CGGAATCCCG 2580 TGCTTAAAAT ACGCTCTTAA ATTATTTTCT AGTCTTATTT CACAATGTCT CATTGTAGTC 2640 TGTCTTCAAC TATTTTATCC AAAATANACC TCCAGAAGAA AG 2682
【0078】配列番号:2 配列の長さ:587 配列の型:アミノ酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:タンパク質 配列 Met Arg Lys Val Lys Phe Thr Gln Gln Asn Tyr His Asp Arg Leu Ser 1 5 10 15 Gln Ile Leu Thr Asp Phe Pro Lys Leu Asp Asp Ile His Pro Phe Tyr 20 25 30 Ala Asp Leu Met Asn Ile Leu Tyr Asp Lys Asp His Tyr Lys Leu Ala 35 40 45 Leu Gly Gln Ile Asn Ile Ala Lys Asn Leu Val Asp Asn Val Ala Lys 50 55 60 Asp Tyr Val Arg Leu Met Lys Tyr Gly Asp Ser Leu Tyr Arg Cys Lys 65 70 75 80 Gln Leu Lys Arg Ala Ala Leu Gly Arg Met Cys Thr Val Ile Lys Arg 85 90 95 Gln Lys Gln Ser Leu Glu Tyr Leu Glu Gln Val Arg Gln His Leu Ser 100 105 110 Arg Leu Pro Thr Ile Asp Pro Asn Thr Arg Thr Leu Leu Leu Cys Gly 115 120 125 Tyr Pro Asn Val Gly Lys Ser Ser Phe Ile Asn Lys Val Thr Arg Ala 130 135 140 Asp Val Asp Val Gln Pro Tyr Ala Phe Thr Thr Lys Ser Leu Phe Val 145 150 155 160 Gly His Met Asp Tyr Lys Tyr Leu Arg Trp Gln Val Val Asp Thr Pro 165 170 175 Gly Ile Leu Asp His Pro Leu Glu Asp Arg Asn Thr Ile Glu Met Gln 180 185 190 Ala Ile Thr Ala Leu Ala His Leu Arg Ala Ala Val Leu Tyr Val Met 195 200 205 Asp Leu Ser Glu Gln Cys Gly His Gly Leu Arg Glu Gln Leu Glu Leu 210 215 220 Phe Gln Asn Ile Arg Pro Leu Phe Ile Asn Lys Pro Leu Ile Val Val 225 230 235 240 Ala Asn Lys Cys Asp Val Lys Arg Ile Ala Glu Leu Ser Glu Asp Asp 245 250 255 Gln Lys Ile Phe Thr Asp Leu Gln Ser Glu Gly Phe Pro Val Ile Glu 260 265 270 Thr Ser Thr Leu Thr Glu Glu Gly Val Ile Lys Val Lys Thr Glu Ala 275 280 285 Cys Asp Arg Leu Leu Ala His Arg Val Glu Thr Lys Met Lys Gly Asn 290 295 300 Lys Val Asn Glu Val Leu Asn Arg Leu His Leu Ala Ile Pro Thr Arg 305 310 315 320 Arg Asp Asp Lys Glu Arg Pro Pro Phe Ile Pro Glu Gly Val Val Ala 325 330 335 Arg Arg Lys Arg Met Glu Thr Glu Glu Ser Arg Lys Lys Arg Glu Arg 340 345 350 Asp Leu Glu Leu Glu Met Gly Asp Asp Tyr Ile Leu Asp Leu Gln Lys 355 360 365 Tyr Trp Asp Leu Met Asn Leu Ser Glu Lys His Asp Lys Ile Pro Glu 370 375 380 Ile Trp Glu Gly His Asn Ile Ala Asp Tyr Ile Asp Pro Ala Ile Met 385 390 395 400 Lys Lys Leu Glu Glu Leu Glu Lys Glu Glu Glu Leu Arg Thr Ala Ala 405 410 415 Gly Glu Tyr Asp Ser Val Ser Glu Ser Glu Asp Glu Glu Met Leu Glu 420 425 430 Ile Arg Gln Leu Ala Lys Gln Ile Arg Glu Lys Lys Lys Leu Lys Ile 435 440 445 Leu Glu Ser Lys Glu Lys Asn Thr Gln Gly Pro Arg Met Pro Arg Thr 450 455 460 Ala Lys Lys Val Gln Arg Thr Val Leu Glu Lys Glu Met Arg Ser Leu 465 470 475 480 Gly Val Asp Met Asp Asp Lys Asp Asp Ala His Tyr Ala Val Gln Ala 485 490 495 Arg Arg Ser Arg Ser Ile Thr Arg Lys Arg Lys Arg Glu Asp Ser Ala 500 505 510 Pro Pro Ser Ser Val Ala Arg Ser Gly Ser Cys Ser Arg Thr Pro Arg 515 520 525 Asp Val Ser Gly Leu Arg Asp Val Lys Met Val Lys Lys Ala Lys Thr 530 535 540 Met Met Lys Asn Ala Gln Lys Lys Met Asn Arg Leu Gly Lys Lys Gly 545 550 555 560 Glu Ala Asp Arg His Val Phe Asp Met Lys Pro Lys His Leu Leu Ser 565 570 575 Gly Lys Arg Lys Ala Gly Lys Lys Asp Arg Arg 580 585
【0079】配列番号:3 配列の長さ:716 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:cDNA 配列 GACTCTGCTC CCCCGTCCTC TGTGGCCCGG AGTGGGAGTT GCTCTCGAAC TCCACGTGAC 60 GTTTCTGGTC TTAGGGATGT CAAGATGGTG AAGAAAGCCA AGACTATGAT GAAGAATGCT 120 CAGAAGAAGA TGAATCGGTT GGGGAAGAAA GGGGAGGCGG ATATACACTT GTTTGATATG 180 AAGCCCAAGC ACTTGCTGTC TGGGAAGAGG AAAGCTGGTA AAAAGGACAG GAGATAGTAT 240 CCGTTTGGTT GGCGTGGCTT CGCTAGAGTG TTGCTGTTTA TTTCCTGGTT TGGCACAGTA 300 TGGTTTCATG AAATTGGAGC TCTGTATAAA CTGAAAAAGA CAAAATAAGT AAAGCACTTG 360 TTGCTTTGCT GAAAACTATG GTTAACCCTA TATAGGTGTG GGAAATTTTT GTCACTGCAT 420 AATATTACAA ATATTCTGAG TAGACAGTGT TTCCACATTT AATGGAGTAT CAGTTGCTTC 480 AGATTTTCAG AACTGGGAAG ATTTACTGGT GTAACTGGGT TGTTTTTGAT GGAGAAAAAC 540 CTTATTTTCT TTTGTAAGAG CTGGGAGCAA ACACGTTTAT GAGTGTGTCG GAATCCCGTG 600 CTTAAAATAC GCTCTTAAAT TATTTTCTAG TCCTTATTTT ACAATGTCTC ATTGTAGTCT 660 GTCTTCAACT ATTTTATCCA AAATAAACCT CCAGAAGGAA AAAAAAAAAA AAAAAA 716
【0080】配列番号:4 配列の長さ:104 配列の型:アミノ酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:タンパク質 配列 His Glu Asp Lys Asp Asp Ala His Tyr Ala Val Gln Ala Arg Arg Ser 1 5 10 15 Arg Ser Ile Thr Arg Lys Arg Lys Arg Glu Asp Ser Ala Pro Pro Ser 20 25 30 Ser Val Ala Arg Ser Gly Ser Cys Ser Arg Thr Pro Arg Asp Val Ser 35 40 45 Gly Leu Arg Asp Val Lys Met Val Lys Lys Ala Lys Thr Met Met Lys 50 55 60 Asn Ala Gln Lys Lys Met Asn Arg Leu Gly Lys Lys Gly Glu Ala Asp 65 70 75 80 Ile His Leu Phe Asp Met Lys Pro Lys His Leu Leu Ser Gly Lys Arg 85 90 95 Lys Ala Gly Lys Lys Asp Arg Arg 100
【0081】配列番号:5 配列の長さ:13 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:cDNA 配列 ACCACACATC TGA 13
【0082】配列番号:6 配列の長さ:13 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:cDNA 配列 TGTTGGGAAC AAG 13
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 FI A61K 48/00 AAM A61K 48/00 ACV ACV C07K 14/47 C07K 14/47 C12N 1/15 C12N 1/15 1/19 1/19 1/21 1/21 C12P 21/02 C 5/10 C12Q 1/02 C12P 21/02 G01N 33/566 C12Q 1/02 A61K 37/02 AAB G01N 33/566 C12N 5/00 B C (72)発明者 バーバラ オルソン アメリカ合衆国 19403 ペンシルバニア 州, ノリスタウン,デフォード プレイ ス 5069 エー. (72)発明者 ユアン ズ アメリカ合衆国 19422 ペンシルバニア 州, ブルー ベル,オークモント ドラ イブ 203

Claims (20)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 配列番号2のCRFG-1bポリペプチドをコ
    ードするヌクレオチド配列と全長において少なくとも8
    0%同一であり、かつCRFG-1bポリペプチドの活性を有
    するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、また
    はこのヌクレオチド配列に対して相補的なヌクレオチド
    配列を含んでなる単離されたポリヌクレオチド。
  2. 【請求項2】 前記のポリヌクレオチドが、配列番号2
    のCRFG-1bポリペプチドをコードする配列番号1中に含
    まれるヌクレオチド配列を含んでなる、請求項1に記載
    のポリヌクレオチド。
  3. 【請求項3】 前記のポリヌクレオチドが、その全長に
    おいて配列番号1のヌクレオチド配列と少なくとも80
    %同一であるヌクレオチド配列を含んでなる、請求項1
    に記載のポリヌクレオチド。
  4. 【請求項4】 配列番号1のポリヌクレオチドである、
    請求項3に記載のポリヌクレオチド。
  5. 【請求項5】 DNAまたはRNAである、請求項1に
    記載のポリヌクレオチド。
  6. 【請求項6】 配列番号2のCRFG-1bポリペプチドのア
    ミノ酸配列において1もしくは複数のアミノ酸が付加、
    欠失または置換されており、かつCRFG-1bポリペプチド
    の活性を有するアミノ酸配列をコードするヌクレオチド
    配列を含んでなるポリヌクレオチド。
  7. 【請求項7】 下記発現系が適合性の宿主細胞内に存在
    するとき配列番号2のポリペプチドと少なくとも80%
    同一であるアミノ酸配列を含むCRFG-1bポリペプチドを
    産生することができる発現系を含んでなるDNAまたは
    RNA分子。
  8. 【請求項8】 請求項7に記載の発現系を含有する宿主
    細胞。
  9. 【請求項9】 CRFG-1bポリペプチドを産生させるのに
    十分な条件下で請求項8に記載の宿主細胞を培養し、こ
    の培養物から前記ポリペプチドを回収することを含んで
    なる、CRFG-1bポリペプチドの産生方法。
  10. 【請求項10】 宿主細胞が適当な培養条件下でCRFG-1
    bポリペプチドを産生するように、請求項7に記載の発
    現系を用いて宿主細胞を形質転換またはトランスフェク
    ションすることを含んでなる、CRFG-1bポリペプチドを
    産生する細胞の作製方法。
  11. 【請求項11】 全長において配列番号2のアミノ酸配
    列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含んで
    なるCRFG-1bポリペプチド。
  12. 【請求項12】 配列番号2のアミノ酸配列を含む、請
    求項11に記載のポリペプチド。
  13. 【請求項13】 請求項11に記載のCRFG-1bポリペプ
    チドに免疫特異的な抗体。
  14. 【請求項14】 請求項11に記載のCRFG-1bポリペプ
    チドの活性増加または発現増加を必要としている患者を
    治療するための医薬組成物であって、治療上有効な量
    の、 (a) 前記ポリペプチドに対するアゴニスト、および/ま
    たは(b) 前記ポリペプチド活性のin vivo 生産をもたら
    す形の、配列番号2のCRFG-1bポリペプチドをコードす
    るヌクレオチド配列と全長において少なくとも80%同
    一であるヌクレオチド配列、または前記ヌクレオチド配
    列に対して相補的なヌクレオチド配列を含んでなる単離
    されたポリヌクレオチド、を含んでなる医薬組成物。
  15. 【請求項15】 請求項11に記載のCRFG-1bポリペプ
    チドの活性または発現を抑制する必要がある患者を治療
    するための医薬組成物であって、治療上有効な量の、 (a) 前記ポリペプチドに対するアンタゴニスト、および
    /または(b) 前記ポリペプチドをコードするヌクレオチ
    ド配列の発現を抑制する核酸分子、および/または(c)
    前記ポリペプチドのリガンド、基質または受容体に関し
    て前記ポリペプチドと競合するポリペプチド、を含んで
    なる医薬組成物。
  16. 【請求項16】 請求項11に記載のCRFG-1bポリペプ
    チドの発現または活性と関連した被験者の疾病またはそ
    の罹病性の検出方法であって、 (a) 前記被験者由来のゲノム中にCRFG-1bポリペプチド
    をコードするヌクレオチド配列の突然変異があるかどう
    かを調べる、および/または(b) 前記被験者から得られ
    たサンプル中のCRFG-1bポリペプチド発現の存在または
    量を分析する、ことを含んでなる方法。
  17. 【請求項17】 請求項11に記載のCRFG-1bポリペプ
    チドを阻害(拮抗)または活性化する化合物の同定方法
    であって、 (a) CRFG-1bポリペプチドを発現している細胞(もしく
    はCRFG-1bポリペプチドを発現している細胞膜)またはC
    RFG-1bポリペプチドに応答する細胞と候補化合物とを接
    触させ、そして(b) その結合、または機能的応答の刺激
    もしくは抑制を観察するか、または候補化合物と接触さ
    せた細胞(または細胞膜)の能力を、接触させなかった
    同一の細胞と、CRFG-1bポリペプチド活性に関して比較
    する、ことを含んでなる方法。
  18. 【請求項18】 請求項17に記載の方法により同定さ
    れたアゴニスト。
  19. 【請求項19】 請求項17に記載の方法により同定さ
    れたアンタゴニスト。
  20. 【請求項20】 請求項10に記載の方法により作製さ
    れた組換え宿主細胞、またはCRFG-1bポリペプチドを発
    現しているその膜。
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