JPH05501058A - 乳頭腫ウイルス属のアンチセンスオリゴヌクレオチド阻害 - Google Patents

乳頭腫ウイルス属のアンチセンスオリゴヌクレオチド阻害

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JPH05501058A JP91502693A JP50269391A JPH05501058A JP H05501058 A JPH05501058 A JP H05501058A JP 91502693 A JP91502693 A JP 91502693A JP 50269391 A JP50269391 A JP 50269391A JP H05501058 A JPH05501058 A JP H05501058A
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 乳頭腫ウィルス属のアンチセンスオリゴヌクレオチド阻害発明の分野 本発明は、乳頭腫ウィルス属の阻害および乳頭腫ウィルス属によって引き起こさ れる動物の感染の診断および治療に関する1本発明は、更に、乳頭腫ウィルス属 を含んでいると疑われるti:料での乳BXmウィルス属の検出および定量に間 する。
更に、本発明は、乳頭腫ウィルス属由来のメツセンジャーRNAの機能を妨害す るかまたは変調するオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチド類似体に関す る。このような妨害を、乳頭腫ウィルス属感染の診断および治療の手段として用 いることができる。それは、検査試薬のための並びに研究用および診断用双方の キットのための主成分を形成することもできる。
発明の背景 乳頭腫ウィルス属(PA)は天然に広く分布しており、概して、いぼとして一般 的に称される良性の上皮および線維上皮病変に関係している。それらは、ヒト、 ウシ、ウサギ、シカおよび数種類の鳥類の種を含む様々な高等を推動物で検出さ れ且つ単離された。これらのウィルスは、概して、良性の病変に関係しているが 、ある特定の種類のウィルスは、癌に進行することがある病変に関係していた。
これらのウィルスがある種のヒトの癌の発達において病因の役割を果たすことが あるという密接な関係は、転写活性ヒト乳頭腫ウィルス(HPV)デオキシリボ 核酸がある種の癌病変に高率で存在することを示した多数の研究の結果による。
ツア・ハウゼン・エイチ(Zur Hausen、H)およびシュナイダー・エ イ(Schneider、A、>1987.The Pa ovavirida e。
第2巻、エヌ・ピー・ザルラマン(N、P、Sal zman)およびビー・エ ム・ハウリー(P、M、Howley)監修、254〜264頁、プレナム・プ レス(Plenum Press)、ニューヨーク。
ヒトにおいて、ヒト乳頭腫ウィルスは、手および足の一般的ないぼ、喉頭いぼ並 びに性器いぼを含む種々の疾患を引き起こす、57種類を上回るHPVがこれま でに確認された。各HPVには好ましい解剖学的感染部位があり、各ウィルスは 、概して、特定の病変に関係することがある。性病いぼおよび尖圭コンジローム とも称される性器いぼは、Pv感染の最も重大な発現の一つである。疾病管理セ ンターによって報告されたように、性器いぼの性的伝播形式は十分に確立され− 性器いぼの発生率は増加しつつある。性器いぼの重要性は、HPV DNAが頚 部上皮的新形成の全グレード(CIN I〜III)で見出すことができること および特定の種類のHPV種を頚部の現場の癌で見出すことができるという最近 の発見によって強調されている。したがって、特定のHPV種を含む性器いぼの ある女性は、子宮頚癌の発達の危険性が高いと現在考えられている。性器いぼに 対する現在の治療は不十分である。
乳頭腫ウィルス属を妨害することができる物質の組成物を提供する大きな希望は あるが、今のところまだ果たされていない、同様に、動物の乳頭腫ウィルス属感 染のための治療法および診断法を達成することが望まれる。更に、乳頭腫ウィル ス属の研究で用いるための改良されたキットおよび検査試薬が必要である。
発明の目的 本発明の目的は、乳頭腫ウィルス属のメツセンジャーRNAとハイブリッド形成 して、そのメツセンジャーRNAの機能を阻害することができるオリゴヌクレオ チドおよびオリゴヌクレオチド類似体を提供することである。
もう一つの目的は、ウィルスのメツセンジャーRNAとのアンチセンス相互作用 によって乳頭腫ウィルス属DNAの機能性発現を変調することができるオリゴヌ クレオチドおよび類似体を提供することである。
本発明のもう一つの目的は、動物における乳頭腫ウィルス属のための診断法およ び治療法を提供することである。
乳頭腫ウィルス属を含んでいると疑われる試料でのその存在または不在を検出す るための方法、材料およびキットは、本発明のもう一つの目的である。
新規のオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチド類似体は本発明のその他の 目的である。
これらの目的および他の目的は、本明細書および添付の請求の範囲を検討するこ とにより当業者に明らかになるものである。
図面の簡単な説明 図1は、若干のPvゲノムの遺伝体制の概略地図である。
図2は、ウシ乳頭腫ウィルスであるBPV−1の部分的な遺伝子地図であり。
ゲノムは読取り枠0RFsを示し、メツセンジャーRNAはそのゲノムから転写 されている。
図3は、ヌクレオチド2443から4203までを示すBPV−I E2トラン スアクティベーター遺伝子mRNAのヌクレオチド配列である。
図4は、ヌクレオチド2443から3080tでを有するドメイン示すBPV− I E2トランスアクティベーター遺伝子mRNAのヌクレオチド配列である。
図5は、ヌクレオチド89から304までを有するドメイン示す初期メツセンジ ャーRNAをコードするBPV−1の5′共通非翻訳領域のヌクレオチド配列で ある。
図6は、本発明の技法によって製造されたアンチセンスオリゴヌクレオチドのヌ クレオチド配列およびE2 mRNA上のオリゴヌクレオチドの相対位置である 。オリゴヌクレオチドの識別記号、配列および機能的役割を記載する。
図7は、本発明の技法によって製造されたアンチセンスオリゴヌクレオチドのE 2発現に対する作用を示すグラフである* mRNAのCAP領域を標的とする オリゴヌクレオチド(11751)およびE2トランスアクティベーターの翻訳 コドン(11753)は、マイクロモルの濃度でE21−ランスアクティベータ ーンを減少させることが分かる。
図8は、本発明の技法によって製造されたアンチセンスオリゴヌクレオチドの用 量反応を示すグラフである。
これらの用量反応曲線は、翻訳開始コドンを含む領域のE2トランスアクティベ ーションメッセンジャーRNAに相補的であるアンチセンスオリゴヌクレオチド 11753の50%阻害濃度(IC5o)は50〜100ナノモルであるが、同 一のメツセージのCAP領域を標的とするオリゴヌクレオチド(11751)の I C5oは500ナノモルの範囲であることを示す。
図9は、本発明の技法によって製造され、E2 mRNAのトランスアクティベ ーターおよびトランスソグレマザー領域を標的としたアンチセンスオリゴヌクレ オチドのヌクレオチド配列である。
図10は、E2 mRNAのトランスアクティベーター領域を標的とする選択さ れたオリゴヌクレオチドの作用を示すグラフである1本発明の技法によって製造 された15〜20マーのアンチセンスオリゴヌクレオチドは、E2トランスアク ティベーションを阻害することが示される。
図11は、E2 mRNAのトランスリグレマザー領域を標的とする選択された オリゴヌクレオチドの作用を示すグラフである0本発明の技法によって製造され た15〜20マーのアンチセンスオリゴヌクレオチドは、E2トランスリプレッ ションを阻害することが示される。
図12は、BPV−1の生物学上、現場でE2)−ランスアクティベーターの減 少の結果を示す写真である0本発明の技法によって製造されたアンチセンスオリ ゴヌクレオチドは、C1274[B胞のBPV−1形質転換を阻害または減少さ せる能力について試験された。
図13は、E2 mRNAのトランスアクティベーター領域を標的とする選択さ れたオリゴヌクレオチドの作用を示すグラフである0本発明の技法によって製造 されたアンチセンスオリゴヌクレオチドによるBPV−1フオーカス形成の阻害 を示す、11751および11753についてのこれらの用量反応曲線により、 11753のICは10ナノモルの範囲であるが、11751のIC5oは10 0ナノモルの範囲であることが示される。
図14は、BPV−1のゲノムを複製するその能力に対する本発明の技法によっ て製造されたアンチセンスオリゴヌクレオチドの作用を示すグラフである。ウィ ルスによって形質転換された細胞を11751および11753で処理し、ウィ ルスのDNAを定量した。
図15は、代謝的にWA識されたオリゴヌクレオチドで処理した細胞または未処 理対照を単クローン性抗体を用いて免疫沈降させた免疫沈降検定の結果を示す。
図16は、E2の翻訳開始コドンの領域でのHPV−11のヌクレオチド配列で ある。
発明の要約 本発明の好ましい実施!9′mにより、乳頭腫ウィルス属由来のメツセンジャー RNAとハイブリッド形成しうるオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチド 類似体を提供する。この関係を、一般的に、「アンチセンス(antisens e)」と称する。オリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチド類似体は、RN Aの機能であるタンパク質への翻訳、細胞質への転座かまたはその生物学的機能 全体に必要な任意の他の活性を阻害することができる。メツセンジャーRNAが その機能の全部または一部分を行うことができないと、乳頭腫ウィルス属ゲノム は適切に発現されないことになり、すなわち、増殖しないし、正しい子孫が有効 数で形成されないし、そして乳頭腫ウィルス属に感染した動物によるこのような 子孫の有害な作用が変調される。
ここで、乳頭腫ウィルス属のいくつかのメツセンジャーRNAによって表わされ るアンチセンス攻撃に対するそのゲノム部分を標的とするのが好ましいことが分 かった。ここで、乳頭腫ウィルス属のE2、El、ElおよびE6−7のmRN Aがこの研究に特に適していることが発見された0例えば、オリゴヌクレオチド またはオリゴヌクレオチド類似体によるハイプリダイセーションに望ましいメツ センジャーRNAは、E2、El、ElまたはE6−7のメツセンジャーRNA であることが好ましい、なお一層好ましい実施態様により、ウシ乳頭腫ウィルス −1においてヌクレオチド2443から3080までまたは89から304まで で例示されるような乳頭腫ウィルス属のE2)−ランスアクティベーター領域ま たは5′共通非翻訳領域から転写されたRNA部分と相補的であるように設計さ れたヌクレオチド塩基配列を含むオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチド 類似体を提供する。
最も好ましい実施!g様により、E2トランスアクティベーターに対するmRN A CAP領域および翻訳コドンを標的とするオリゴヌクレオチドを提供する。
これらのオリゴヌクレオチドは、BPV−1のヌクレオチド2443から418 0まででコードされるE2 mRNAとハイブリッド形成するように設計される 。
ここで、乳頭腫ウィルス属の発現を変調させる方法は、前記の乳頭腫ウィルス属 由来のメツセンジャーRNAを、その乳頭腫ウィルス属由来のメツセンジャーR NAとハイブリッド形成しうるオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類 似体と接触させることを含み、そのオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチ ド類似体は、それとハイブリッド形成した場合、前記のメツセンジャーRNAの 機能を阻害することが発見された。乳頭腫ウィルス属のE2、El、Elまたは E6−7のmRNAとハイブリッド形成するように設計されているオリゴヌクレ オチドまたはオリゴヌクレオチド類似体を用いることは好適である。
更に、ここで、動物における乳頭腫ウィルス属感染の作用を変調する方法は、そ の動物を乳頭腫ウィルス属由来のメツセンジャーRNAとハイブリッド形成しう るオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体と接触させることを含み 、それによって、それとハイブリッド形成した場合、前記のメツセンジャーRN Aの機能を阻害することが発見された。乳頭腫ウィルス属のE2、El、Elま たはE6−7のmRNAとハイブリッド形成しうるオリゴヌクレオチドまたはオ リゴヌクレオチド類似体は好適である。
このようなオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体を用いて乳頭腫 ウィルス属の存在または不在を検出するための診断法は、更に、このようなハイ ブリダイゼーションによるこの種の診断上の活性のためのキットおよび検査用試 薬と同様に本発明の範囲内である。
発明の詳細な説明 性器いぼは、最も頻繁に診断されるウィルス性の性的伝播疾患である。臨床的に は、それらは二つの主要なグループ、すなわち、尖圭コンジロームおよび偏平顕 部いぼに分類することができる。コンジロームはウィルス粒子を含むことが分か っており、分子研究により、90%を上回るこれらの病変がHPV−6かまたは HPV−11のDNAを含むことが実証された。ギスマン・エル(Gls″sm ann、L、)、ウォルニク・エル(Wolnik、L、)、イケンバーグ・エ イチ(Ikenberg、H,)、コルドフスキー・ニー(Ko l d、ov sky、U、) 、シュナーチ・エイチ・ジー(Schnurch。
H,G、)およびツアーハウゼン・エイチ(zur Hausen、H,)。
Proc、Nat 1.Acad、Sc i、USA、80,560〜563( 1983)、尖圭コンジロームは、概して、陰茎、外陰部または肛門周囲部分に 生じる。それらは自然に後退するかまたは何年も存続することがあり、侵食癌へ の進行は低頻度でのみ生じる。他の性器いぼとは異なり、子宮頚部で生じるもの は尖形よりもむしろ偏平な形態を示し、通常、パパニコラウスミアで臨床的に検 出される。子宮頚部形成異常の病因である乳頭腫ウィルス属は、1970年代の 末期に、HPV感染による細胞学的変化と形成異常のものとのババニコラウスミ アでの関係を実証した細胞学者の研究によって示唆された。fl!1の研究では 、これらの病変の形成異常細胞の多くにウィルス粒子およびウィルスカプシド抗 原が存在することが示された。この関係は、従来の臨床研究で、子宮頚部形成異 常(CINまたは頚部上皮肉新生物とも称する)は現場の癌に対する前駆体であ って、順次に、頚部の侵食鱗状上皮細胞癌に対する前駆体であると認められると いうことが確証されたので重要である。HPV−16型および18型は子宮頚癌 から直接クローン化された。デュルスト・エム(Deurst、M) 、ギスマ ン・ポジヤード・エム(Boshart、M、)、ギスマン・エル、イケンバー グ・エイチ、クラインハインツ・エイ(Kleinhelnz、A)、シュアレ ン・ダブリュー(Scheurfen、W、)およびツア・ハウゼン・エイチ、 EMBOJ、、旦、1151〜1157 (1984)、これらをハイプリダイ セーションプローブとして引き続き用いて、70%を上回るヒト子宮頚癌および 誘発された細胞系がこれらの両方のHPV型の存在に対して陽性であることを示 した。他の20%には、更に別のHPV型、例えば、HPV−31、HPV−3 3およびHPV−35が含まれる。
米国治療指数から集められたデータにより、1984年には、性器いぼの初診が 224,900件および陰部ヘルペスの初診156.720件であることが示さ れた。性器いぼの発生率は、1950年から1978年の平均発生率がioo、 ooo人当り106.5人に達したという疫学的研究によって実証されたように 、1970年から1980年にわたって着実に増加してきた。25才から55才 の女性での頚部HPV感染の罹患率は0.8%であったが、22才の女性では2 .7%であった。細胞学的に正常な女性についての最近の研究により、潜伏感染 の発生率は11%であることが実証された。したかって、一層高い発生率および 罹患率を示唆する疾患の潜伏期があると考えられる。
活発な性器いぼは妊娠した米国人女性の約2.5%で確認することができ、した がって、1年間に60.000〜90.000件の妊娠に関係している。HP■ PVは、妊娠した女性で流行するとして3回以上である。毎年、喉頭乳頭重症の 新規の症例が推定で1,500件あり、母親から新生児への感染の危険率がに8 0〜1 : 200であることを示している。
喉頭乳頭腫は喉頭の良性上皮腫瘍である。2種類のPV型、すなわち、HPV− 6およびRPV−11が喉頭乳頭腫に最も一般的に関係している。臨床的には、 喉頭乳頭腫は二つのグループ、すなわち、未成年者の発病および成人の発病に分 類される。未成年者の発病では、新生児が、性器P■に感染した!親の産道を通 過した時点で感染すると考えられる。疾患は、通常、2才で判明し、良性乳頭腫 が徐々にはであるが着実に成長して、外科的介入がないと最終的には気道を閉塞 することを特徴とする。これらの子供は、典型的に、乳頭腫を再発する度に何度 も外科手術を受ける。fk終的に、患者は度重なる外科手術による合併症に倒れ る。
現在のところ、未成年者で発病する喉頭乳頭腫症に対する治療法はなく、自然の 後退はまれである。成人で発病する喉頭乳頭腫は攻撃的ではなく、自然緩解の経 過をとることが多い。
乳頭腫ウィルス属感染に関係した最も一般的な疾患は、良性の皮膚いぼである。
概して、一般的ないぼはHPVI型、2型、3型、4型または10型を含む、こ れらのいぼは、典型的に、足の裏に生じる足底いぼかまたは手に生じる。一般的 な皮膚いぼは、子供および若い成人で見出されるのが最も多い、晩年には、一般 的ないぼの発生率は、おそらくは免疫学的変化および生理的変化によって低下す る1足底いぼは、しばしば衰弱させることがあり且つ外科的に除去することが必 要であり、それらは手術後に再発することが多い、現在のところ、足底いぼに対 する信頼できる治療法はない0手の一般的ないぼは醜いが、衰弱させることはほ とんどなく、したがって、外科的に処置しないのが一般的である。
ゆうぜい状表皮発育異常症(EV)は、希な遺伝的伝播疾患であり、小さい赤み がかった斑として現れる散在性偏平いぼを特徴とする0種々のHPV型がEVに 関係していた0時がたつにつれて、EV患者の約3分の1が、多数の部分で皮膚 の偏平上皮癌(SCC)を発症する。概して、SCCは、皮膚の太陽に晒された 部分で生じる。EVに関係した種類のPVのみがSCCで見出され、HPV−5 およびHPV−8である。遺伝的素因、免疫学的変化およびUV照射並びにHP Vはいずれも、これらの患者のSCCの発症の原因となることがある。
P■ゲノムは、約8,000の塩基対を有する二重鎖の、共有結合によって閉じ た環状DNA分子から成る。多数の動物およびヒトのPVの完全なヌクレオチド 配列および遺伝体制は、ウシ乳頭腫ウィルス1型(BPV−11などで決定され た。チェノ・イー・ワイ(Chen、E、Y、) 、ハウソー・ピー・エム(H owley、P、M、)、レビンソン・エイ・ディー(Levinson。
A、D、)およびシーバーブ・ピー・エイチ(Seeburg、P、H,)、N ature、299.529〜534 (1982)、若干のpvの概略地図を 図1に示す、ウィルスの転写は一定方向であり、すなわち、ウィルスmRNA全 部が同一のウィルスDNA!Ifから転写される。エンゲル・エル・ダブリュー (Enge l、L、W、)、バイルマン・シー・エイ(He i Iman、 C。
A、 ) オヨヒハ’y’)−−h”−−エム、J、Vi ro 1..47. 516〜528(1983);バイルマン・シー・エイ、エンゲル・エル、ロー ライ・ディー・アール(Lowy、D、R,)およびハウソー・ピー・エム、兄 上−立±立五ヱ1119.22〜34 (1982)、遺伝暗号鎖は読取り枠( ORF s )と称される10種類を含む1個々の0RFsは、生産性に感染し た細胞に対する非生産性細胞でのPvゲノムおよびそれらの発現パターンにおけ るそれらの位置に基づいて「初期Jかまたは「後期」として分類される0図2は 、ウシ乳頭腫ウイルスー1のいくつかの0RFsの関係を示す。
替歯類動物4I胞を形質転換し且つそのゲノムを形質転換した細胞中のエビソー ムとして保持する能力ゆえに、BPV−1はインビトロの研究での模範の乳頭腫 ウィルス属として役立った。結果として、BPV−1は、全乳頭展属ウィルスの 中で最も特徴を示すものである。BPV−1ゲノムは長さが7946塩基対であ り、クローン化され且つ配列順序が決定された。チェ2ら、1982.上記、B PV−1のDNA配列分析により、8個の初期(E)および2個の後期(L)! 収り枠<0RFs)を決定しな、初期または後期という0RFsの呼称は、寛容 的に感染した細胞に対する非生産的に感染した形質転換細胞でのそれらの発現パ ターンに基づいた。バイルマンら、1982.上記;ベーカー・シー・シー(B aker、C,C,)およびハウツー・ビー・エム、EMBOJ、、6゜102 7〜1035 (1987)。
0RFs全部は同一のDNA!a上に含まれ、そして現在特徴化されているmR NA全部が遺伝暗号鎖から転写されていることが示された。アムトマン・イーい くつかの0RFsが多機な機能を有することが分かった。E5およびE6は、( Lusky、M、)およびボチャン・エム・アール(Botchan、M。
スDNZ複製の変調暗号をコードする。ロバーツ・ジェイ・エム(Robert s、J、M、)およびワイントララブ・エイチ(Weintraub、H,)、 Ce11.生6,741〜752 (1986)。
完全な長さのE2 0RFは、ウィルスの転写をトランスアクティベートするタ ンパク質をコードし[スパルホルッ・ビー・エイ(Spalholz、B、A、 )、ヤン・ワイ・シーおよびハウツー・ビー・エム、Ce目、42,183〜1 .91 (1985)]、そして3’E2 0RFは、ウィルスの転写のトラン スリプレッサーをコードする。ランバート・ビー・エフ(Lambert、P。
F、)、スパルホルツ・ビー・エイおよびハウツー・ビー・ダタブリュー。
Ce1l、旦旦、69〜78 (1987)、BPV−1のE3、E4およびE 8についての機能はまだ決定されていない。
Ll[カラサート・エル・エム(Cowsert、L、M、)、ピラジンスキ・ ダブリュー・ビー(Pi 1acinski、W、P、)およびジs’/ソン・ エイ・ビー(Jenson、A、B、)、vt roし2jLL・ 16旦・6 13〜をまたは一部分を標的とするオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチ ド類似プライスパターンの存在によって複雑になっている。これまでに、18種 類の異なるmRNANが、種々の方法によって決定された。アムトマン・イーお よびサワー・ジー、J、Virol、、旦、59〜66 (1982);プルネ ット・ニス(Burnett、S、>、モレノ・ロベツ・ジェイ(Moreno −シー・エイ、エンゲル・エル、ローライ・ディー・アールおよびハウツー・ビ ー・エム、Virolo 、1上9.22〜34 (1982);ベーカー・シ ー・シーおよびハウツー・ビー・エム、EMBOJ、、旦、1027〜1035 (1987)、ステンランド・エイ<5tenJund、A、>、ザビールスキ ・ジェイ(Zabielski、J、)、オーラ・エイチ(AhoIa、H,) 、モレノ・ロペツ・ジェイおよびペターマン・ニー、J、Mo1.Biol、。
1旦2,541〜554 (1985);並びにヤン・ワイ・シー、オカヤマ・ エイチおよびハウツー・ビーエム、Proc、Natl Acad、Sc1゜と の間の共通の領域を含む、他のmRNA5の5′末端はnt890.2443ス カプシドにはエンベロープがなく、グリコジル化されていない、LLおよびL2 と称する28Mのウィルスにコードされたタンパク質がカプシドを構成している 。Llは主要なカプシドタンパク質であり、とリオン中に存在するタンパク質の 80%を含み且つその分子量は50〜60kDである。L2は少量のカプシドタ ンパク質であり、理論分子量は51kDであるが、76kDに移動することが分 かった。Pvはインビトロで生産されることができないし、しかも生産性病変で は極めて僅かの成熟ピリオンしか見出されないので、PVの血清学についての詳 細な研究を行うのは不可能であった。
乳頭腫ウィルス属の生活環は複雑であり、今の時点ではほとんど理解されていな い、現在のところ、成熟P■ピリオンの生産を可能にするインビトロのシステム は、乳頭腫ウィルス属の生活環を特徴化することが不可能であった結果として、 開発されていなかった。PVの宿主域は限定され、種の障壁を滅多に越えること がない、更に、PV感染は、粘膜かまたは角質の上皮を差別するのみである。P ■遺伝子発現の調節は、宿主上皮細胞の差別プログラムに最初に連結されると考 えられる。P■生活環の現在のところ好ましいモデルは下記のとおりであり、す なわち、感染性17粒子が外傷を介して上皮外層に貫入し且つ宿主組織の基底細 胞に感染する。ウィルスは比較的低コピーの染色体外の要素として保持される。
上皮細胞が差別を受け始めると、PVゲノムは高コピー数に複製され、細胞が終 末段階の差別を受け始めると、後期遺伝子が発現され、そしてウィルスゲノムが 被包される。
乳頭腫ウィルス属は、アンチセンス療法に理想的な標的であることが発見された 。第一に、乳頭腫ウィルス属病変は外面的であり、アンチセンスオリゴヌクレオ チドを送出する局所的試験を可能にし、急速なりリアランスなどの多くの問題を 排除し、そして合成オリゴヌクレオチドの全身性投与にrIIJ(Xしたオリゴ ヌクレオチドの臨床的活性組II濃度が得られる。第二に、ウィルスゲノムは感 染した細胞中で分離遺伝要素として保持される。これは、症状を泊陵するのに提 案されたように、bイルスの複製機能を攻撃することによって治療法の可能性へ の扉を開くものである。
乳頭腫ウィルス属ゲノムのE2 0RPは、特に、アンチセンスオリゴヌクレオ チド設計に十分に遺していることが発見された。E2は、BPV−1およびHP v系双方におけるウィルス転写の主要なトランスアクティベーターであることが 分かった。E2 0RFの突然変異は、形質転換および染色体外DNA複製に対 する多面発現作用を有する。ディメイオ・ディー(DiMaio、D、)+ J 。
Virol、、旦ヱ、475〜480 (1986);ディメイオ・ディーおよ びセトルマン・ジェイ(Settleman、J、)、EMBOJ、、7゜11 97〜1204 (1988);グロブ。ディー・イー(Groff、D。
E、)およびランカスター・ダブリュー・ディー(Lancaster、W。
D、)、Vi二立上旦盈ヱ、上50,221〜230 (1986);ラプソン ・エム・ニス(Rabson、M、S、)、イー・シー(Yee、C,)、ヤン ・ライ・シーおよびハウソー・ビー・エム、J、Virol、、並、626〜6 34 (1986);並びにサーバー・エフ(Sarver、N、)、ラプソン ・エム・ニス、ヤン・ライ・シー、バーン・ジエイ・シー(Byrne、J。
C,>およびハウソー・ビー・エム、J、Vi ro 1..52.37’7− 388(1984)、続いて、E2 0RFは転写トランスアクティベーターを コードすることが分かつな、スバルホルツ・ビー・エイ、ヤン・ライ・シーおよ びハウソー・ビー・エム、Ce11.旦、183〜191 (1985)、内部 のAUGでの翻訳開始によって生じたE2の一部省略された翻訳部分は、転写の トランスリプレッサーであることが分かった。ランバート・ビー・エフ、スバル ホルツ・ビー・エイおよびハウソー・ビー・エム、Ce1l、Σ旦、69〜78 (1987>、DNA結合ドメインであるカルボキシ末端の100個のアミノ酸 [マクブライド・エイ・エイ(McBride、A、A、)、シュシーゲル・ア ール(Schlege7.R,)およびハウソー・ビー・エム、EMBOJ、。
ヱ、533〜539 (1988>]およびDNA認識配列であるACCN60 GT[アンドロフィー・イー・ジエイ(Androphy、E、J、)、Q−ラ イ・ディー・アールおよびシラー・ジェイ・ティー(SchI I Ier、J 、T、)、Nature、32旦、70〜73 (1987)並びにモスカルク ・シー(Moskaluk、C,)およびバスティア・ディー (Bast t a、D、)、Proc、Natl、Acad、Scf、USA、旦4.1215 〜1218(1987> ]が決定された。E2転写調節回路は乳頭腫ウィルス 属それぞれの一般的な特徴である。E2トランスレギュレーションは、これまで に試験された他の乳頭腫ウィルス属それぞれにおいて実証された。ギウス・ディ ー(Gi、us。
D、)、グロスマン・ニス(Grossman、S、)、ベデル・エム・エイ( Bede 11.M、A、)およびライミンス・エルーXイ(Lai、m1ns 。
L、A暑、J、Vi ro 1..62.665〜672 (19881;ヒロ チカ・エイチ(Hirochika、H,>、ブローカー・ティー・アール(B roker、T、R,)およびチャタ・エル・ティー<Chow、L、T、)、 J、Vi ro 1..61.2599〜2606 (1987);チン・エム ・ティー (Chi n、M、T、) 、ヒロ千カ・アール(Hirochtk a、R,)、ヒロ千カ・エイチ、ブローカー・ティー・アールおよびチャタ・エ ル・ティー、J、Virol、、62.2994〜3002 (1988);フ ェルラス・ダブりニー・シー(Phe lps、w、C1)およびハウソー・ビ ーーxム、正。
Vi rol、、61.1630−1638 (1987);並びにスイーリー ・エフ(Thierry、F、)およびヤニブ・エム(Yaniv、M、) 、 EM旦OJ、、623391〜3397 (1987)。
本発明で、動物およびヒト乳頭腫ウィルスそれぞれに分担されている義務的なウ ィルス転写要素の差別は、E2が乳頭腫ウィルス属の検査、診断および治療に対 するアンチセンスアプローチのための最も重要な標的であるようにするというこ とを決定した。
本発明は、E1遺伝子座が、更に、乳頭腫ウィルス属による攻撃のための位置と して有望であることを決定した。M歯頚動物の線維芽細胞のBPV−1形質転換 についての最初の突然変臭分析で、ElをウィルスDNA複製の候補レギュレー ターとして決定した。3’E1 0RFは、ウィルスゲノム複製および維持に必 要な因子をコードする。サーバー・エフ、ラブマン・エム・ニス、ヤン・ライ・ シー、バーン・ジェイ・シーおよびハウソー・ビー・エム、J、Virol、。
Σ2,377〜388 (1984)ニラスキー・エムおよびボチャン・エム・ アール、J、Virol、、5ユ、955〜965 (1985);並びにラス キー・エムおよびボチャン・エム・アール、J、Virol、、60.729〜 742 (1986)、E1転写の発現の阻害は、BPV−1(および潜在的に 、)(PV)の、そのDNAを感染しな#I胞中で複製する能力を阻害するへし いと考えられる。
発明者は、更に、E7部位が、乳頭腫ウィルス属の治療、診断および検査のため の別の入り口をおそらく提供するであろうということを決定しな、BPV−1に おいて、Elは、ウィルスDNA複製の調節に関係していることが分かった。
ベルブ・エル・ジェイ(Berg、L、J、>、センス・ケイ(Singh。
K、)およびボチャンーxム、Mo1.eel 1.Biol、、6.859〜 869 (1986)、HPV−16において、Elは、形質転換および不滅化 に関係していることが実証された。今のところ明らかではないが、HPVsのE lがウィルスDNAの複製に関係しているならば、しかしながら、E7特異性ア ンチセンスオリゴヌクレオチドおよび類似体はBPV−1ウイルスDNAの複製 を阻害すると考えられる。
HPVのE6−E7領域は、形質転換領域であることが分かった。ウィルスの生 活環におけるこの領域の正確な役割は今のところ知られていない、しかしながら 、この領域は、ウィルスによって誘発された病変のアンチセンスの生物学におい て中心となっているので、この領域を標的とするオリゴヌクレオチドも、おそら く同様に、本発明の目的に有用であると決定された。
最近の研究で、mRNA5の5′領域、好ましくは、キャップ領域および開始コ ドンに対して向けられたアンチセンスオリゴヌクレオチドは、遺伝子の発現を阻 害するのに最も有効であるということが示唆された。乳頭腫ウィルス属転写の一 つの特徴は、多数のmRNA5が共通の5′非翻訳領域およびキャップを有する ことである。したがって、この領域に対して向けられたアンチセンスオリゴヌク レオチドは多数のmRNAの能力を奪う可能性を有すると決定された。多数のウ ィルス遺伝子の阻害は、おそらく、追加の方式においておよび感染した細胞から のウィルスゲノムの放射においておそらく相乗作用によって最低限度で作用する 。
本発明のある種の好ましい実施態様を実施することによって、アンチセンス攻撃 に好ましい標的であるmRNA5を生じる乳頭腫ウィルス属ゲノムのOR,Fs も、同様に、他のmRNA5の部分をコードすることは理解される。
前述の0RFsを表1に要約する。
紅 乳頭型ウィルス属読取り枠およびそれらに帰属した機能ORF !I(1属機能 E(BPV−1> (3′部分)複製(BPV〜1)E2(全長) 転写トラン スアクティベーション(BPV−1、HPV−6、HPV−16> (3′部分) 転写阻害(BPV−1)E4 いぼ中の細胞質リンタンパク質( HPV−1)E5 形質転換、DNA合成の刺激(BPV−1)E6 形質転換 (BPV−1) El プラスミドコピー数制御(BPV−1>Ll 主要カプシドタンパク質 L2 少量カアシドタンパク質 本発明は、乳頭腫ウィルス属のメツセンジャーRNAの機能のアンチセンス阻臀 で用いるためのオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチド類似体を用いる。
本発明の文脈において、「オリゴヌクレオチド」という用語は、本来のホスホジ エステル結合によって結合した天然に存在する塩基およびシクロフラニシル基か ら生成されたポリヌクレオチドを意味する。この用語は、天然に存在するsiま たは、天然に存在するサブユニットまたはそれらに近い同族体から生成された合 成種を効果的に意味する。
rオリゴヌクレオチド類似体」という用語を本発明に関して用いる場合、オリゴ ヌクレオチドと同様に機能するが、天然に存在しない部分を有し、そして近密に 相同ではない部分を意味する。したがって、オリゴヌクレオチド類似体は、糖部 分または筒内結合が変更されていてもよい、これらの例は、当該技術分野で用い ることが知られているホスホロチオエートおよび他の硫黄含有種である。若干の 好ましい実施態様により、オリゴヌクレオチドの少なくともいくつかのホスホジ エステル結合は、活性が変調されるべきRNAが位!している細胞の領域に貫入 する組成物の能力を増大させるように機能する構造で置換された。このような置 換は、ホスホロチオエート結合、メチルホスホチオエート結合または短鎖アルキ ル若しくはシクロアルキル構造を含むのが好ましい、好ましい実施態様により、 基形態を含む種を挙げることができる0例えば、天然に通常見出されるもの以外 のプリンおよびピリジンをそのように用いることができる。同様に、ヌクレオチ ドサブユニットのシクロフラノース部分の変更は、本発明の本質的な見解に固執 する限りにおいて生じてもよい。
このような類似体は、天然のオリゴヌクレオチド(または天然の系統に沿ったし て、そのRNAの機能を阻害するように機能する限りにおいて、本発明によつし ている。
本発明のオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチド類似体は、乳頭腫ウィル ス属のメツセンジャーRNAとハイブリッド形成するように設計される。このよ うなハイブリダイゼーションは、達成された場合、メツセンジャーRNAの通常 の機能を妨害して、ウィルスに対するその有用性を失わせる。妨害されるメツセ ンジャーRNAの機能としては、全生体機能、例えば、タンパク質問状のための 位置へのRNAの転座、RNAからのタンパク質の実際の翻訳、およびRNAが 携わることができるおそらく全く独立した触媒活性がある。RNA機能をこのよ うに妨害する全体の効果は、乳頭腫ウィルス属にそのRNAの利点を失わせ、そ して全体として、ウィルスゲノムの発現に関する妨害を経験させることである。
このような妨害は、概して致命的である。
本発明により、ウィルスに対する代謝の重要性が増大したと決定されたメツセン ジャーRNAを妨害するように設計されたオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌク レオチド類似体を提供することが好ましい、T#記で説明したように、El、E 2、ElまなはE6−7乳頭腫ウィルスmRNA5が好ましい標的である。
更に、ウシ乳頭腫ウィルス−lゲノムの2443から3080までまたは89か ら3041でのヌクレオチドに実質的に同等のヌクレオチドによつてコードされ たRNAを妨害することは、それらが必須のタンパク質を導く多数のRNA5を コードすると考えられる場合に、これらが攻撃に対して特に攻撃を受けやすい位 置を表わすと考えられるので好ましい、興なる乳頭腫ウィルス属は、ウシ乳頭腫 ウィルス−1とはある程度興なる構造を有するが、本質的に類似の部分を日常的 な方法で決定することができることは理解される。
図3、図4および図5に、ウシ乳頭腫ウィルス−1ゲノムでのこれらの部分をは いずれも、このような乳頭腫ウィルス属の作用を妨害する場合に特別な有用性を 有すると考えられる。ウシ乳頭腫ウィルス−1の82mRNAで標的とされた典 型的なオリゴヌクレオチドを表2に示す。
轟旦 BPV−1,E2アンチセンスオリゴヌクレオチドoo5(Lcoos、x+n ) AAATGCGTCCAGCACCににCCATGGTGCAGT l−ラ ンスリグレツサー出発点 006(LCOO6,ABl) AGCACCGGCCATGGT トランスリ グレッサー014(LC014,入ax) GGACAGTCACCCCTT  5 ’ コード釘口或o1s(Lco1!i、AJI4) TGTACAAAT TGCTGTM;ACAGTGT入CCAC?中間コード領;或016 (LC O16,AEl)αゴGTAGACAにTGTA 中間コード領域017(LC O17,ABl) GTGCGAGCGAGGACCGTCCCGTACCCM CC3’ :7−ドW7I域01B(LCOlB、ABl)G(:ACCGTC CC(:TACC3’ コード釘0或019(I、CO19,ABl)’!Tr AACAGGTGGAATCCATCATrGGTにGTG 5’ :7−ド9 R域020(LCO20,ABl)GG鮎TccxTcATTcc 5’ コー ド饋j或HPV−11の翻訳開始コドンを標的とした典型的なオリゴヌクレオチ ドを表HPV−11の翻訳開始コドンを標的としたアンチセンスオリゴヌクレオ チド [ヒ#!t8+1番号 5′ −−−−−一−−−−−−−−−3’識別配列し たがって、前記に示した200種類オリゴヌクレオチド(またはそれらの類似体 )のいずれか、または当業者が、前記で論及したように、乳頭腫ウィルス属ゲノ ムのE20R,Fのそれぞれの好ましい領域についての知識から製造することが できる類似のオリゴヌクレオチド(または類似体)のいずれかを用いるのが好ま しい、類似の表を、これらのそれぞれの領域の配列についての知識から、乳頭腫 ウィルス属の他の好ましい0RFt’!的、El、ElおよびE6−7について 作成することができる。
オリゴヌクレオチドまたは類似体が、前述の表で記載したように正確に−または 乳頭腫ウィルス属ゲノムの地図についての独創性に欠ける解釈によって必要とさ れるように正確にある必要はない、むしろ、本発明の精神は、ゲノム構造に対し て厳密に固執することからある程度外れることを許し、それを文字通りオリゴヌ クレオチドに「翻訳」する、このような構造の変更は、オリゴヌクレオチドおよ びそれらの類似体の本質的なハイブリッド形成機能が生じる限りにおいて行うこ とができる。
同様に、種々の乳頭腫ウィルス属の間で種の変化が生じることは理解される。
種々のIF!域、例えば、E2、El等は種毎に極めて似ているが、若干の相違 が生じる。これらの変1ヒを説明するオリゴヌクレオチドおよび類似体の変化は 、本発明によって具体的に考えられる。
本発明で用いられるオリゴヌクレオチドおよび類似体は、固相合成の周知の技法 によって便宜上且つ日常的に製造することができる。このような合成のための装 置は、アプライド・バイオシステムズ(Applied Bio−system s)などのいくつかの発売元によって販売されている。しかしながら、このよう な合成のための任意の他の手段も用いることができる。有用なオリゴヌクレオチ ドは発酵法によって好都合に得ることができ、これは、多量の物質が望まれる場 合に好適であることができる。オリゴヌクレオチドの実際の合成は、日常的な従 事者の手腕の範囲内で十分である。
更に、類似の技法を用いて他のオリゴヌクレオチド類似体、例えば、ホスホチオ エートおよびアルキル化誘導体を製造することが知られている。
E2発現を阻害するアンチセンスオリゴヌクレオチドに持具的なE2の能力を試 験するのに好ましい検定法は、E2の十分に実証されたトランスアクテイベーシ ョンの性質に基づいた。スバルツホルツら、J、Virol、、61.2128 〜2137 <1987>、リポータ−プラスミド(E2RECAT)は、E2 依存エンハンサ−として櫟能するE2反応性要素を含むように構成された。
E2RECATは、更に、SV40初期プロモーター、初期ポリアデニル化シグ ナルおよびクロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ遺伝子(CAT) を含む、このプラスミドの前後関係において、CAT発現はE2の発現に依存す る。E2の存在に対するCAT発現の依存関係は、このプラスミドを、BPV− 1で形質転換したC127細胞、非感染C127細胞および、E2RF、CAT およびE2発現ベクターでコトランスフエクトした127M胞中にトランスフェ クションすることによって試験された。
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、主要なE22トランスアクテイベーターR NA (図6)を標的にして設計された。標的としては、制限されないが、mR NA CAP領域、翻訳開始コドン、翻訳終結コドンおよびポリアデニル化シグ ナルがあった。N々の標的に相補的な15残基または30残基オリゴヌクレオチ ドは、野生型ホスホジエステルのヌクレオシド間結合または変性ホスホロチオエ ートのヌクレオシド間結合を用いて合成した。mRNA CAP領域を標的とし たオリゴヌクレオチド(11751)およびE2トランスアクティベーターのた めの翻訳コドン(11753)は、予備スクリーンにおいて1マイクロモル濃度 でE2トランスアクティベーションを減少させることが分かった(図7)、E2 トランスリプレッサーの翻訳開始コドンを標的としたオリゴヌクレオチド117 56(図6)は、CAT活性によって実証され且つそれを増加させるトランスリ プレッションの部分的除去を与えることができた(図7)、同様の長さおよび塩 基組成を有するが、E2mRNAの他の部分並びに他の非感覚制御を標的とした 他のオリゴヌクレオチドは、アンチセンス作用を与えることができなかった。概 して、ホスホロチオエートのヌクレオシド間結合一時変異を有するオリゴヌクレ オチドは、天然のホスホジエステルのヌクレオシド間結合を有する同一配列のオ リゴヌクレオチドよりも効果的であった。おそらく、これは、血清中および細胞 内に含まれた核酸分解酵素に対するホスホロチオエートの抵抗性が増加したこと によるものである。用量反応曲線は、11753の50%阻害濃度(IC5o) は50〜100ナノモルの範囲であるが、11.751のIC5oは10倍を越 える500ナノモルの範囲であることを示す(図8)、E2のトランスアクティ ベーターおよびトランスリプレッサーの翻訳開始コドンを成功したアンチセンス 標的として同定した後、追加の組のホスホロチオエートを、その領域を一層注意 深く精査するように設計した(図9)、これらのデータにより、適切なAUGを 覆った15〜20マーのオリゴヌクレオチドは、E2のトランスアクテイベーシ ョンかまたはトランスリプレッションを阻害することができることが示された( 図10および図41)。
BPV−1の生物学上、現場でE2トランスアクティベーターの減少の結果を確 認するために、アンチセンスオリゴヌクレオチドを、C127細胞のBPV−1 形質転換を阻害するまたは減少させる能力について試験した(図12)、117 51および11753についての用量反応曲線により、11753のI Cci  。
は10ナノモルの範囲であるが、11751のI Cs oは100ナノモルの 範囲であることが示されたが(図13)、この検定でのこれらの2種類の化合物 のI Cs oのこの10倍の差は、翻訳開始コドンが一層優れた標的であるこ とを示唆するトランスアクティベーターンの阻害の検定で観察されたのと同様で ある。
BPV−1をゲノムに複製するその能力に対するE2を標的としたアンチセンス オリゴヌクレオチドの作用を試験するために、BPV−1によって安定に形質転 換されたl−38細胞をI 1751および11753で処理し、ウィルスDN Aを定量した(図14>、1マイクロモルで処理して48時間後に、IAI胞当 り塩基に対するウィルスDNAコピー数を、およそ3の因子で減少させた。この 検定の軽過中に、細胞は2回〜3回分裂した。このデータは、ウィルスDNAが 細胞のDNAと同時進行によって複製することができなかったことを示唆して1 する。
E22タンパク質成に対する11753の作用を試験するために、l−3841 胞を代謝的に標識し且つE2特異性単クローン性抗体を用いて免疫沈殿させた。
オリゴヌクレオチドに暴露されなかった細胞またはセンス(sense)若しく は不適切なオリゴヌクレオチドで処理された細胞には、46kdのE2タンパク 質が存在している(図15>、E2を標的としたオリゴヌクレオチドで処理され た細胞では、46kdバンドが欠けており、オリゴヌクレオチドを翻訳の)1イ ブリダイセーシヨン阻止によって操作していることを示唆する。
本発明のオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチド類似体は、診断、治療で 、そして研究試薬およびキットとして用いることができる。治療の使用に対して は、オリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体を、乳頭腫ウィルス属 感染、例えば、手のいぼ、足のいぼ、喉頭のいぼ、尖圭コンジローム、ゆうぜい 状表皮発育異常症、偏平頚部いぼ、頚部上皮肉新形成、または乳頭腫ライlレス 属に関係する任意の他の感染に苦しむ動物に対して投与する。IIして、本発明 による治療剤を局所的にまたは病変内に適用するのが好ましい、経皮またG、に 筋内内によるなどの他の投与形態も有用であることができる。坐剤中に混入する こと番よ、現在、おそらく極めて有用であると考えられる9本発明のオリゴヌク レオチドおよびオリゴヌクレオチド類似体の予防法での使用も有用であると考え られる。このようなものは、例えば、薬剤をコンドームのコーティング等として 提供することによって達成することができる。薬理学的に許容し得る担体の使用 番よ、い(つかの実施Ws様に好適である。
本発明は、更に、診断においておよび研究において有用である0本発明のオリゴ ヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチド類似体は乳頭腫ウィルス属に対してハイ ブリッド形成するので、サンドイツチ法および他の検定法は、この事を利用する ように容易に組み立てることができる。オリゴヌクレオチドまたは類似体と。
乳頭腫ウィルス属を含むと疑われる試料中に存在する乳頭腫ウィルス属とのハイ ブリダイゼーシヨンを検出するための手段を有する設備は日常的に得ることがで きる。このような設備として、酵素抱合、放射性標識または任意の他の適当な検 出システムを挙げることができる。乳頭腫ウィルス属の存在または不在を検出す るためのキットも好適であることができる。
実施例1 アンチセンスオリゴヌクレオチドによるBPV−IE2の発現の阻害 BPV−1で形質転換したC127411!胞を12ウエルプレートに入れる。
E2REIによるトランスフェクションの24時間前に、アンチセンスオリゴヌ クレオチドを最終濃度5.15および30ミリモルで増殖培地に加えることによ って細胞を前処理する。翌日、細胞を、B2REICATを10μg用いてリン 酸カルシウム沈殿によってトランスフェクトする。E2REICATを10μg および担体DNA (PUC19)10μgを、最終容量250μlのH2O中 、2モて室温で30分間インキュベートする。この溶液100μlを各試験ウェ ルに加え、37℃で4時間インキュベートする。インキュベーション後、細胞に 、リセロールを用いて室温で1分間グリセロールショックを与える。ショックを 与えた後、細胞を血清不合DMEMで2回洗浄し、10%ウシ胎児血清および元 の濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドを含むDMEMを再供給した。トラン スフェクションして48時間後に細胞を採取し且っCAT活性について検定する 。
CAT活性を決定するために、細胞をリンMM*溶液で2回洗浄し、かき落とし て採取する。細胞を250ミリモルトリスHC1,pH8,0,100μm中に 再懸濁させ、凍結−解凍を3回行うことによって破壊する。4ft胞抽出物24 μlを各検定に用いる。各検定に対して、下記、ナなおち、m胞抽出物25μm 。
4ミリモルアセチル補酵素A5μl、H2O18μIおよび14C−クロラムフ ェニコール1μm、40〜60mC1/ミリモルを1.5mlのエツベンドルフ チューブ中で一緒に混合し且つ37℃で1時間インキュベートする。インキュベ ーション後、クロラムフェニコール(アセチル化形態および非アセチル化形態) を酢酸エチルで抽出し且つ蒸発乾固させる。試料を酢酸エチル25μmに再懸濁 させ、薄層クロマトグラフィープレート上にスポットし、そしてクロロホルム: メタノール(19:1)でクロマトグラフィーを行う、薄層クロマトグラフィー はオートラジオグラフィーによって分析される。アセチル化および非アセチル化 14C−クロラムフエニコールに対応するスポットを薄層クロマトグラフィープ レートから摘出し、CAT活性の定量用の液体シンチレーションによって計数す る。用量依存様式でCAT活性を低下させるアンチセンスオリゴヌクレオチドは 陽性と考えられる。
実施例2 アンチセンスオリゴヌクレオチドによる)fPV E2発現の阻害ア ンチセンスオリゴヌクレオチドによるHPV E2の阻害についての検定は、B PV−IE2のそれと本質的に同一である。HPV検定に対しては、適当なHP Vsを、前記に記載したリン酸カルシウム法を用いて、CV−1かまたはA43 1細胞中にPSV2NEO細胞と一緒に同時にトランスフェクトする。DNAを 取り込んだ細胞は、抗生物質0418を含む培地中で培養することによって選択 される9次に、0418It性細胞をHPVのDNAおよびRNAについて分析 する。E2を発現する細胞をアンチセンス研究用の標的細胞として用いる。各ア ンチセンスオリゴヌクレオチドに対して、細胞を前記のように前処理した後、E 2REICATによるトランスフェクションを行い、そして前記のようにCAT 活性の分析を行う、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、それらが用量依存様式 でCAT活性を低下させることができる場合、陽性の作用を有すると考えられる 。
実施例3 アンチセンスオリゴヌクレオチドによるHPV E7発現の阻害HP V−16のElは、Ad E2プロモーターをトランスアクティベートすること ができることが分かった[フェルプス・ダブりニー・シー(Phelps。
W、C,)、イー・シー・エル、ムンガー・ゲイ(Munger、に、)および ハウシー・ビー・エム、1988、アデノウィルスEIAと同様のトランスアク ティベーシヨンおよび形質転換機能をコードするヒト乳頭腫ウィルス16型E7 遺伝子(The Human Papi[Iomavirus Type 16 E7 Gene Encodes Transactivation andT ransformation Functions 51m1lar t。
Those of Adenovirus EIA)、Ce1l、5ユニ539 〜547]、この活性を監視するために、Ad E2プロモーター(AdE2C AT)の制御下でクロラムフェニコール転移酵素遺伝子を含んだプラスミドを構 築する。この検定条件下では、CAT発現はHVP Elの発現に依存する。こ の検定に対して、細胞系は、SV40初期プロモーターの制御下でHPVE7を 含むように生じさせる。各アンチセンスオリゴヌクレオチドに対して、細胞を前 記のように前処理した後、AdE2CATによるトランスフェクションを行い、 そして前記のようにCAT活性の分析を行う。
実施例4 アンチセンスオリゴヌクレオチドによるBPV−I Elの発現の阻 害 BPV−1のElは、ウィルスゲノム複製のレギュレーターであることが分かっ た。アンチセンスオリゴヌクレオチドのウィルス複製に対する作用を試験するた めに、C127細胞BPV−1に感染させ、オリゴヌクレオチドを最終濃度5. 15および30マイクロモルで増殖培地に加えることによって、E1特興性アン って評価される。更に、アンチセンスオリゴヌクレオチドのウィルスゲノムコピ ー数に対する作用は、全ゲノムDNAに対するサザン法によって決定される。
実施例5 実験的に誘発したウシ線維乳頭腫に対するBPV−1アンチセンスオ あったオリゴヌクレオチド並びに対照で処理する。線維乳頭腫の後退を誘発する エム、1985、多数の形質転換遺伝子を含むウシ乳頭腫ウィルス(Bovin e papillomavirus contains−ルー3−オン−1,1 −ジオキシドを用いて各カップリング後に硫化を行った[アイアー・アール・ビ ー(Iyer、R,P、)、フィリップス・エル・アール(Phillips、 L、R,>、イーガン・ダブリュー(Egan、W、)、シーガン・ジェイ(R egan、J、)およびビューケージ・ニス・エル(Beaucage、S、L 、)、1990.3H−1,2−ペンツジチオール−3−オン−1,1−ジオキ シドを硫黄転位試薬として用いる硫黄含有オリゴデオキシリボヌクレオチドの自 動合成(The AutomatedSynthesis of Sulfur −Containlng 011g。
deoxyribonucleotides Using 3H−1,2−Be nsodithiol−3−one 1.1−Dioxides as aSu lfur−Transfer Reagent)、J、Or 、Chem。
、1旦:4693〜4699] 、完全なチオ化を確実にするために、増大する オリゴヌクレオチドを、各硫化段階の後にキャップした0合成マトリックスから の開裂、脱保護およびデトリイレーシゴン(detriylatlon>の後、 オリゴヌクレオチドをNaC1から2回エタノール沈殿させ且つ水に懸濁させた 。
オリゴヌクレオチドの濃度は、260nmでの光学濃度によって決定した。41 胞培養検定で用いるために、オリゴヌクレオチドを日常的な方法で稀釈して10 0マイクロモルストックにし且つ使用するまで80℃で貯蔵した。オリゴヌクレ オチド調製試料の純度、完全さおよび量は、マニアティス(Maniatis) らによって記載されたように製造した20%アクリルアミド7モル尿素ゲル(4 0cmX20cmXO,75cm>上の電気泳動によって決定した[マニアティ ス・ティー (Mani at i s、T、) 、フリッチュ・イー・エフ( Fritsch、E、F、)およびサムプルツク・ジェイ(Sambrook。
J、、)、Mo1ecular C1onin :実験室マニュアル(ALab oratory Manual):コールド・スプリング・ハーバ−・ラボラト リ−(Cold Spring Hrbor Laboratory);ニュー ヨー°り、1982]、電気泳動したオリゴヌクレオチドは、シグマ(Sigm a)から購入したE−9379のl−エチル−2[3−(1−エチルナプトル[ 1,2−d]−チアゾリン−2−イリデン)−2−メチル−10ベニル[ナグト ル[1,2−d]−チアゾリウム臭化物である「スティング・オール」で染色す ることによってゲル中で視覚化された[ダールバーグ・エイ・イー(Dahlb erg、A、E、)、ディグマン・シー・ダブリュー(Di gman、C,W 、)およびピーコック・エイ・シー(Peacock。
A、C,)、 1969、J、Mo1.Biol、、41:39コ。
実施例7 分子構築物 本研究で用いたE2クロラムフェニコールアセチル転移酵素(CAT)リポータ −プラスミドは以前に記載された[スバルツホルツ・ビー・エイ、バーン・ジエ イ・シーおよびハウシー・ビー・エム、1988、ウシ乳HIlウィルス1型の E2トランス−レギュレーションでのE2結合部位間の共同性の実証(Evid ence for Cooperativity betweenE2 Bin ding 5ites in E2 trans−regulatfon of  Bovine PapillomavirusT’yPe 1)、J、Vlr oll、62:3143〜31501.簡潔に、BPV−1の82反応性要素で あるE2RE1 (nt7611〜7806)は、オリゴヌクレオチドを用いて 再構築され、SV40エンハンサ−であるSph、1断片が欠失したpsVZc AT中にクローン化された。このプラスミドからのCATの発現は、完全な長さ のE2に依存することが分かった。プラスミドC59は、SV40プロモーター およびエンハンサ−から発現されたE2cDNAを含み、他のところで詳細に記 載された[ヤン・ケイ・シー、オカヤマ・エイチおよびハウシー・ビー・エム、 1985、多数の形質転換遺伝子を含むウシ乳頭腫ウィルス(Bovine p apillomavirus containsmultfple trans formlng genes)、Proc。
Natl、Acad、Sci、USA、82:1030〜1034]、2種類の HPV−11の完全な長さのE2発現構築物が製造された。IPV115は、フ ァーマシア(Pharmacia)から購入しなpMsG(カタログ番号27− 4506>のSmaI部位にクローン化されたHPV−11(nt2665〜4 988)のXmnl11片を含み、TPV118は、pSVL (77?シア、 カタログ番号27−4509)のSma1部位にクローン化された同一のHPV 〜11のXm口■断片を含む。
実施例8 細胞系 マウスC127細胞[ドボレツキ・アイ(Dvoretzky、1.)、スコバ ー・アール(Schober、R,)およびローライ・ディー、1980、ウシ 乳頭腫ウィルス1型のマウス細胞でのフォーカス検定(FocusAssay  in Mouse Ce1ls for BovinePapHlomavir us typ、1)、V土ro土旦盈工、L O3:369〜375コを、10 %ウシ胎児血清、ペニシリン<100U/ml)、ストレプトマイシン<110 0u/ml)およびL−グルタミン(4ミリモル)を補足したダルベツコモディ ファイドイーグル培地中で増殖させた。l−38細胞系は、精製されたBPV− 1によって形質転換されたC127m胞の単一フォーカスに由来した[カラサー ト・エル・エム(Cowsert、L、M、)、レイク・ビー(Lake、P、 )およびジェンマン・エイ・ビー(Jenson、A。
B、)、1987、単クローン性抗体によって規定されたウシ乳頭腫ウィルス1 型の構造の輪郭およびコンホーメーション上のエピトープ(Topograph ical and conformationalEpltopes of B ovine Paplllomavirustype I Defined b y MonoclonalAntibodies)、JNCI、79:1053 −1057]。
実施例9 E2依存トランスアクテイベーション検定のオリゴヌクレオチド阻害 E2のトランスアクテイベーションまたはトランスリプレッションを阻害するラ ハム(Graham)らによって記載されたように、リン酸カルシウム沈殿法に よってトランスフェクトさせ[グラハム・エフ・エル(Graham、F。
L、)およびファン・デア・ニブ・エイ・ジエイ(van der Eb A。
J、)、1973、ヒトアデノウィルス5DNAの感染性検定用の新規の技法( A New Technique for the As5ay ofInfe ctivity of Human Adenovirus 5 DNA)、V 上ro工立lΣ、52:456〜461L沈@1mL中の20μg全部がDNA であった。60mmの皿それぞれで、DNAを4マイクトゲラム含む沈殿200 マイクロリツトルが得られた。沈殿したDNAを加えて4時間後に、上澄みを吸 引し、細胞を15%グリセロールで処理したしフロスト・イー(Frost、E 、)およびウィリアムス・ジエイ(Wi I I iams、J、)、1978 、マーカー保護によるアデノウィルス5型の地図で示す温度感受性および宿主域 変異(Mapping Temperature−3ensitiveand  host−range mutaion ofAdenovirus type  5 by Marker Re5cue)、ヱ上二立1旦旦ヱ、立工:39〜 50]、洗浄後、細胞にオリゴヌクレオチドを元の濃度で含む培地を再供給し、 48時間インキュベートした。
多数の具体的な実a態様を示したが、本発明は、下記の請求の範囲によってのみ 制限されるものである。
配列表 (1)一般情報: (1)出願人:クルーク・スタンシー・ティー(Crooke。
5tan、1ey T暑、ミラベリ・クリストファー・ケイ<Mirabell i、Christopher K、)、エラカー・デビーyド、ジェイ(Eck er、David J、)、コスワート・レックス・エム(Coswert、L ex M、) (it)発明の名称:乳頭腫ウィルス属のアンチセンスオリゴヌクレオチド抑I I (iii)配列の数:6 (1v)宛先: (A)住所:ウッドコック・ウォシュバーン・カーラ・マツキーヴイ′〉・アン ド・ノリス(Woodcock Washburn KurtzMackiew icz & Norris)(B)地区:ワン・リバティ・ルイス(One L ibertyPlace> 46tll (C)車名:フィラデルフィア (D)州名:ペンシルバニア (E)国名:米国 (F)郵便番号:19103 (V)コンピューター読取り形式: (A)中型:小型ディスク、3.5インチ、記憶装21.44Mb(B)コンピ ューター:IBM PS/2(C)操作システム: PC−DOS (D>ソフトウェア:ワードパーフェクト(Wordperfect)5.0 (vi)最近の出願資料: (A)出願番号: PCT/US90107067(B)出願臼:1990年1 2月3日 (C)分類: (vii)先行出願資料: (A)出願番号: (B)出顧日: (wijt)弁理士/代理人情報: (A)氏名:ジェイン・マシー・ライカタ(Jane MasseyLlcat a) (B)登録番号:32,257 (C)照会/事件整理番号、rsIs−0033(ix)通信情報: ’ (A)を話: (215)568−3100(B)ファクシミリ: (21 5)568−3439(2)配列識別番号:1の情報: (i)配列の特徴 (A)長さ:15 (B)種類:核酸 GCTTCCATCT TCCTC15(2ン配列識別番号:2の情報: (i)配列の特徴 <A)長さ:16 (B)種類:核酸 (xl)配列種類:配列識別番号:2:GCTTCC:ATCT TCCTCG  16(2)配列識別番号:3の情報: (1)配列の特徴 (A)長さ=17 (B)種M:核酸 (xi)配列種類:配列識別番号:3:TGCTTCCATCTTCCTCG  17(2)配列識別番号=4の情報: (i)配列の特徴 (A)長さ:18 (B)!!1類:核酸 (xi)配列種類:配列識別番号=4:TGCTTCCATCTTCCTCGT  18(2)配列識別番号=5の情報: (i)配列の特徴 (A)長さ:19 CBIN票=核酸 (xi)配列種類:配列識別番号=5:TTGCTTCCAT CTTCCTC GT 19(2)配列識別番号=6の情報: (i)配列の特徴 (A)長さ:20 (B)種類二様酸 (xi>配列M類:配列識別番号:6:TTGCTTCCAT CTTCCTC GTC20M ? to r−co CI’l Or4 tn t、oへn ?  In00 m n M M f ? OO’f ? ? ?FIG、12 0UTC口1751 巴1753 −Lヶ・14 FIG、 15 r+u+ l l 要約書 乳頭腫ウイルスノメッセンシャーRNAとアンチセンスの関係であることができ るオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチド類似体が提供される。そのよう なオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチド類似体は研究目的と同様に診断 および治療に使用できる。本発明の好適な態様によれば乳頭腫ウィルスのメツセ ンジャーRNAがハイブリダイズするオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオ チド類似体が提供される。このオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類 似体はRNAの機能を阻害でき、従って例えば乳頭腫ウィルスによる感染の治療 に有用である。好適な態様によれば乳頭腫ウィルスの部分はアンチセンス攻撃の 標的である。このようにE2.El、ETまたはE6−7メツセンジーRNA5 とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドが好ましく提供される。
補正書の翻訳文提比嘗 (特許法第184条の8) 平成 4年 6月 4日 特許庁長官 深 沢 亘 殿 イ仏 1、特許出願の表示 2、発明の名称 乳頭腫ウィルス属のアンチセンスオリゴヌクレオチド阻害ファラデイ・アベニュ ー 2280 名 称 アイシス・ファーマシューティカ失8インコーボシーテッド新大手町ビ ル 206区 5、補正書の提8日 請求の範囲 1. 乳uIlウィルス属由来のE2、El、ElまなはE6−7メツセンジヤ ーRNAとハイブリッド形成しうる、8個〜50個の塩基を含むオリゴヌクレオ チドまたはオリゴヌクレオチド類似体であって、前記のメツセンジャーR,NA の機能を、それとハイブリッド形成した場合に阻害する前記のオリゴヌクレオチ ドまたはオリゴヌクレオチド類似体。
2、 前記のE2メツセンジャーRNAが、乳頭腫ウィルス属RNAのE2トラ ンスアクティベータ一部分を含む請求項1に記載のオリゴヌクレオチドまたはオ リゴヌクレオチド類似体。
3、 表2の配列の少なくとも1種類による塩基配列を含むオリゴヌクレオチド またはオリゴヌクレオチド類似体。
4、 乳頭腫ウィルス属の発現を変調する方法であって、前記の乳頭腫ウィルス 属由来のメツセンジャーRNAを、請求項1.2または3に記載のオリゴヌクレ オチドまたはオリゴヌクレオチド類似体と接触させることを含む前記の方法。
5、 動物での乳頭腫ウィルス属感染の作用を変調する方法であって、動物を、 請求項1.2まなは3に記載のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類 似体と接触させることを含む前記の方法。
6、 乳頭腫ウィルス属を含むことが疑われる試料でのその存在または不在を検 出するための方法であって、その試料と、請求項1.2または3に記載のオリゴ ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体と接触させ:そしてハイブリダイ ゼーシヨンを検出することを含む前記の方法。
7、 乳頭腫ウィルス属を含むことが疑われる試料でのその存在または不在を検 出するためのキットであって、請求項1.2または3に記載のオリゴヌクレオチ ドまたは類似体:およびハイブリダイゼーションを検出するための手段を含む前 記のキット。
[アイアー・アール・ビー(Iyer、R,P、)、フィリップス・エル・アー ル(Phi I 1ips、L、R,)−イーガン・ダブリュー (Egan、 W、)、シーガン・ジエイ(Regan、J、)およびビューケージ・ニス・エ ル(Beaucage、S、L、)、1990.3H−1,2−ペンヅジチオー ルー3−オン−1,1−ジオキシドを硫黄転位試薬として用いる硫黄含有オリゴ デオキシリボヌクレオチドの自動合成(The AutomatedBenzo dithfol−3−one 1,1−Dioxides as aSulfu r−Transfer Reagent)、J、Or 、Chenn。
60mmの皿それぞれで、DNAを4マイクログラム含む沈殿200マイクロリ ツトルが得られた。
ゴーし、ケlし、659も FtG、12 0IJTc 口1751 巴1753 −L々・14 国際調査報告 mmal A$1’ 4*マロに−フ声

Claims (51)

    【特許請求の範囲】
  1. 1.乳頭腫ウイルス属由来のメッセンジャーRNAとハイブリッド形成しうるオ リゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体であって、前記のメッセンジ ャーRNAの機能を、それとハイブリッド形成した場合に阻害する前記のオリゴ ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体。
  2. 2.前記のメッセンジャーRNAが、乳頭腫ウイルス属E2RNAの少なくとも 一部分の配列を含む請求項1に記載のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオ チド類似体。
  3. 3.前記のメッセンジャーRNAが、乳頭腫ウイルス属ElRNAの少なくとも 一部分の配列を含む請求項1に記載のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオ チド類似体。
  4. 4.前記のメッセンジャーRNAが、乳頭腫ウイルス属E7RNAの少なくとも 一部分の配列を含む請求項1に記載のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオ チド類似体。
  5. 5.前記のメッセンジャーRNAが、乳頭腫ウイルス属E6−7RNAの少なく とも一部分の配列を含む請求項1に記載のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌク レオチド類似体。
  6. 6.乳頭腫ウイルス属RNAのE2トランスアクティベーター部分の少なくとも 一部分と相補的である請求項1に記載のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレ オチド類似体。
  7. 7.前記のトランスアクティベーター部分が、ウシ乳頭腫ウイルス−1の244 3から3080までのヌクレオチドに対応する請求項6に記載のオリゴヌクレオ チドまたはオリゴヌクレオチド類似体。
  8. 8.乳頭腫ウイルス属RNAの5′非翻訳領域の少なくとも一部分と相補的であ る請求項1に記載のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体。
  9. 9.前記の5′非翻訳部分が、ウシ乳頭腫ウイルス−1の89から304までの ヌクレオチドに対応する請求項8に記載のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌク レオチド類似体。
  10. 10.塩基単位約3個〜約50個を含む請求項1に記載のオリゴヌクレオチドま たはオリゴヌクレオチド類似体。
  11. 11.塩基単位約8個〜約25個を含む請求項1に記載のオリゴヌクレオチドま たはオリゴヌクレオチド類似体。
  12. 12.塩基準位約12個〜約20個を含む請求項1に記載のオリゴヌクレオチド またはオリゴヌクレオチド類似体。
  13. 13.前記のメッセンジャーRNAのタンパク質への翻訳を、それとハイブリッ ド形成した場合に阻害する請求項1に記載のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌ クレオチド類似体。
  14. 14.表2の配列の少なくとも1種類による塩基配列を含むオリゴヌクレオチド またはオリゴヌクレオチド類似体。
  15. 15.乳頭腫ウイルス属の発現を変調する方法であって、前記の乳頭腫ウイルス 属由来のメッセンジャーRNAを、乳頭腫ウイルス属由来のメッセンジャーRN Aとハイブリッド形成しうるオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似 体であって前記のメッセンジャーRNAの機能を、それとハイブリッド形成した 場合に阻害する前記のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体と接 触させることを含む前記の方法。
  16. 16.前記のメッセンジャーRNAが、乳頭腫ウイルス属E2RNAの少なくと も一部分の配列を含む請求項15に記載の方法。
  17. 17.前記のメッセンジャーRNAが、乳頭腫ウイルス属ElRNAの少なくと も一部分の配列を含む請求項15に記載の方法。
  18. 18.前記のメッセンジャーRNAが、乳頭腫ウイルス属E7RNAの少なくと も一部分の配列を含む請求項15に記載の方法。
  19. 19.前記のメッセンジャーRNAが、乳頭腫ウイルス属E6−7RNAの少な くとも一部分の配列を含む請求項15に記載の方法。
  20. 20.前記のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体が、乳頭腫ウ イルス属RNAのE2トランスアクティベーター部分の少なくとも一部分と相補 的である請求項15に記載の方法。
  21. 21.前記のトランスアクティベーター部分が、ウシ乳頭腫ウイルス−1の24 43から3080までのヌクレオチドに対応する請求項20に記載の方法。
  22. 22.前記のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体が、乳頭腫ウ イルス属RNAの5′非翻訳領域の少なくとも一部分と相補的である請求項15 に記載の方法。
  23. 23.前記の5′非翻訳部分が、ウシ乳頭腫ウイルス−1の89から304まで のヌクレオチドに対応する請求項22に記載の方法。
  24. 24.前記のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体が、塩基単位 約3個〜約50個を含む請求項15に記載の方法。
  25. 25.前記のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体が、塩基単位 約8個〜約25個を含む請求項15に記載の方法。
  26. 26.前記のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体が、塩基単位 約12個〜約20個を含む請求項15に記載の方法。
  27. 27.前記のメッセンジャーRNAのタンパク質への翻訳を阻害する請求項15 に記載の方法。
  28. 28.前記のメッセンジャーRNAの細胞質への転座を阻害する請求項15に記 載の方法。
  29. 29.動物での乳頭腫ウイルス属感染の作用を変調する方法であって、該動物を 、乳頭腫ウイルス属由来のメッセンジャーRNAとハイブリッド形成しうるオリ ゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体であって前記のメッセンジャー RNAの機能を、それとハイブリッド形成した場合に阻害する前記のオリゴヌク レオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体と接触させることを含む前記の方法。
  30. 30.前記のメッセンジャーRNAが、乳頭腫ウイルス属E2RNAの少なくと も一部分の配列を含む請求項29に記載の方法。
  31. 31.前記のメッセンジャーRNAが、乳頭腫ウイルス属ElRNAの少なくと も一部分の配列を含む請求項29に記載の方法。
  32. 32.前記のメッセンジャーRNAが、乳頭腫ウイルス属E7RNAの少なくと も一部分の配列を含む請求項29に記載の方法。
  33. 33.前記のメッセンジャーRNAが、乳頭腫ウイルス属E6−7RNAの少な くとも一部分の配列を含む請求項29に記載の方法。
  34. 34.前記のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体が、乳頭腫ウ イルス属RNAのE2トランスアクティベーター部分の少なくとも一部分と相補 的である請求項29に記載の方法。
  35. 35.前記のトランスアクティベーター部分が、ウシ乳頭腫ウイルス−1の24 43から3080までのヌクレオチドに対応する請求項34に記載の方法。
  36. 36.前記のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体が、乳頭腫ウ イルス属RNAの5′非翻訳領域の少なくとも一部分と相補的である請求項29 に記載の方法。
  37. 37.前記の5′非翻訳部分が、ウシ乳頭腫ウイルス−1の89から304まで のヌクレオチドに対応する請求項36に記載の方法。
  38. 38.前記のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体が、塩基単位 約3個〜約50個を含む請求項29に記載の方法。
  39. 39.前記のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体が、塩基単位 約8個〜約25個を含む請求項29に記載の方法。
  40. 40.前記のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体が、塩基単位 約12個〜約20個を含む請求項29に記載の方法。
  41. 41.前記のメッセンジャーRNAのタンパク質への翻訳を阻害する請求項29 に記載の方法。
  42. 42.前記の感染が、手のいぼ、足のいぼ、喉頭のいぼ、尖圭コンジローム、ゆ うぜい状表皮発育異常症、偏平頸部いぼまたは頭部上皮内新形成である請求項4 2に記載の方法。
  43. 43.乳頭腫ウイルス属を含むことが疑われる試料でのその存在または不在を検 出するための方法であって、 その試料を、乳頭腫ウイルス属由来のメッセンジャーRNAとハイブリッド形成 しうるオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体と接触させ、そして ハイブリダイゼーションを検出することを含む前記の方法。
  44. 44.前記のメッセンジャーRNAが、乳頭腫ウイルス属E2、E1、E7およ びE6−7RNAsの少なくとも1種類での配列の少なくとも一部分を含む請求 項43に記載の方法。
  45. 45.前記のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体がる、乳頭腫 ウイルス属RNAのE2トランスアクティベーター部分の少なくとも一部分と相 補的である請求項43に記載の方法。
  46. 46.前記のトランスアクティベーター部分が、ウシ乳頭腫ウイルス−1の24 43から3080までのヌクレオチドに対応する請求項45に記載の方法。
  47. 47.前記のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体が、乳頭腫ウ イルス属RNAの5′非翻訳領域の少なくとも一部分と相補的である請求項43 に記載の方法。
  48. 48.前記の5′非翻訳部分が、ウシ乳頭腫ウイルス−1の89から304まで のヌクレオチドに対応する請求項47に記載の方法。
  49. 49.前記の検出段階が、メッセンジャーRNAによってコードした標識タンパ ク質の生成を検出することを含む請求項43に記載の方法。
  50. 50.前記の検出段階が、メッセンジャーRNAによってコードした標識タンパ ク質の作用を検出することを含む請求項43に記載の方法。
  51. 51.乳頭腫ウイルス属を含むことが疑われる試料でのその存在または不在を検 出するためのキットであって、 乳頭腫ウイルス属由来のメッセンジャーRNAとハイブリッド形成しうるオリゴ ヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体およびハイブリダイゼーションを 検出するための手段を含む前記のキット。
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