JP7842395B2 - エクソンスキッピングを可能にするアンチセンス核酸 - Google Patents

エクソンスキッピングを可能にするアンチセンス核酸

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Description

本発明は、標的遺伝子の複数のエクソンを同時にスキッピングさせることが可能なアンチセンスオリゴマー及び該オリゴマーを含む医薬組成物に関する。
近年、疾患を引き起こす変異を有する遺伝子のエクソンをスキッピングさせることにより部分的に機能を有するタンパク質を生じさせ、これにより疾患を治療するエクソンスキッピング療法が注目されている。このようなエクソンスキッピング療法によって治療可能な疾患の例としてデュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)が挙げられる。
DMDは出生男子約3,500人に1人が発症する最も頻度の高い遺伝性進行性筋疾患である。DMD患者は乳幼児期には健常者とほぼ変わらない運動機能を示すが、4~5歳頃から筋力低下がみられる。その後、DMD患者の筋力低下は年齢とともに進行し12歳頃までに歩行不能になり、20歳代で心不全又は呼吸不全により死に至る。このため、有効な治療薬の開発が強く求められている。
DMDの原因はジストロフィン遺伝子の変異であることが知られている。ジストロフィン遺伝子はX染色体に存在し、220万塩基のDNAから成る巨大な遺伝子である。DNAからpre-mRNAに転写され、さらにスプライシングによりイントロンが除かれ79のエクソンが結合したmRNAは13,993塩基になる。このmRNAから3,685のアミノ酸に翻訳され、ジストロフィンタンパク質が生成される。ジストロフィンタンパク質は筋細胞の膜安定性の維持に関与しており、筋細胞を壊れにくくするために必要である。DMD患者はジストロフィン遺伝子に変異を有するため、患者の筋細胞においては、機能するジストロフィンタンパク質がほぼ発現しない。そのため、DMD患者体内では、筋収縮時に筋細胞の構造を維持できなくなり、多量のカルシウムイオンが筋細胞内に流れ込む。その結果、筋細胞壊死と線維化が進み、次第に筋細胞が再生されにくくなる。
ベッカー型筋ジストロフィー(BMD)もジストロフィン遺伝子の変異が原因であるが、その症状は筋力低下を呈するものの一般にDMDと比較して軽く、筋力低下の進行も遅く、多くの場合、成人期に発症する。DMDとBMDとの臨床症状の違いは、変異によりジストロフィンのmRNAがジストロフィンタンパク質へと翻訳される際のアミノ酸読み取り枠が破壊されるか、あるいは維持されるかによるものと考えられている(非特許文献1)。つまり、DMDでは、アミノ酸読み取り枠がずれる変異を有することにより、機能的なジストロフィンタンパク質がほぼ発現しないが、BMDでは変異によりエクソンの一部は欠失しているが、アミノ酸読み取り枠は維持されているために不完全ながらも機能し得るジストロフィンタンパク質が産生される。
DMDの治療法として、エクソンスキッピング法が期待されている。この方法は、スプライシングを改変することでジストロフィンのmRNAのアミノ酸読み取り枠を修復し、部分的に機能を回復したジストロフィンタンパク質の発現を誘導する方法である(非特許文献2)。エクソンスキッピングの対象となるエクソンから翻訳されるアミノ酸配列部分は失われることになる。そのためこの治療で発現されるジストロフィンタンパク質は正常のものより短くなるが、アミノ酸読み取り枠が維持されるために筋細胞を安定化する機能が部分的に保持される。したがって、エクソンスキッピングにより、DMDは、より軽症のBMDと同じような症状を呈するようになると期待されている。エクソンスキッピング法は、マウスやイヌによる動物実験を経て、ヒトDMD患者に対する臨床試験が行われている。
エクソンスキッピングは、5’又は3’スプライス部位周辺のいずれか若しくは両方、又はエクソンの内部を標的とするアンチセンス核酸の結合により誘導することができる。エクソンは両方のスプライス部位がスプライソソーム複合体によって認識された場合のみmRNAに包含される。したがって、スプライス部位周辺をアンチセンス核酸でターゲッティングすることにより、エクソンスキッピングを誘導することができる。また、エクソンがスプライシングの機構に認識されるためにはエクソンスプライシングエンハンサー(ESE)へのセリンとアルギニンに富むSRタンパク質の結合が必要であると考えられており、ESEをターゲッティングすることでもエクソンのスキッピングを誘導することができる。
ジストロフィン遺伝子の変異はDMD患者によって異なるため、遺伝子変異の場所や種類に応じたアンチセンス核酸が必要になる。ジストロフィン遺伝子の単一エクソンに対して、一つの連続する塩基配列を標的としてエクソンスキッピングを誘導するアンチセンス核酸について複数の報告がある(特許文献1~6並びに非特許文献1及び2)。また、ジストロフィン遺伝子の同一エクソンを標的とする二種類のアンチセンス核酸を混合して作用させると(二重標的化)、各アンチセンス核酸を単独で用いた場合よりスキッピング活性が増強される場合があることが報告されている(特許文献7)。
また、上記のように1つのエクソンをスキップさせるのではなく、複数のエクソン(エクソン群)をスキップするマルチエクソンスキッピングという方法が注目されている。当該方法によれば、ジストロフィン遺伝子の広範囲の変異をエクソンスキッピングによる治療の対象とすることが可能となる。例えば、ジストロフィン遺伝子において、エクソン45~55は遺伝子変異のホットスポットとして知られており、これら11個のエクソンをスキップすることで、欠失変異を有するDMD患者の約60%を治療対象とすることができることが報告されている(非特許文献3)。また、エクソン45~55を先天的に欠失しているとBMDを発症するが、そのほとんどの患者は無症状又は軽症であることが知られている(非特許文献4)。これらのことから、エクソン45~55スキッピングを誘導しうる薬剤は、DMD治療薬として有望であると期待されている。
マルチエクソンスキッピングを誘導する方法としては、例えば、エクソンスキッピングの対象となる領域の全てのエクソンをそれぞれ標的とするアンチセンス核酸を用いる方法(非特許文献5、7、8、及び10)、エクソンスキッピングさせる対象となる領域の3’側及び5’側の2つの異なるエクソンをそれぞれ標的とするアンチセンス核酸を用いる方法(非特許文献6及び9並びに特許文献8)が報告されている。
しかし、イントロンのドナー付近又はアクセプター付近を含む領域を標的としたアンチセンス核酸がマルチエクソンスキッピングを誘導することは未だ報告がない。
国際公開公報第2004/048570号 国際公開公報第2009/139630号 国際公開公報第2010/048586号 米国特許公開公報第2010/0168212号 国際公開公報第2011/057350号 国際公開公報第2006/000057号 国際公開公報第2007/135105号 国際公開公報第2004/083446号
Annemieke Aartsma-Rus et al., (2002) Neuromuscular Disorders 12: S71-S77 Wilton S. D., e t al., Molecular Therapy 2007: 15: p. 1288-96 Christophe Beroud et al., Human Mutation, 28(2), 2007, 196-202 Yusuke Echigoya et al., Molecular Therapy‐Nucleic Acids, 4(2), 2015, e225 Yoshitsugu Aoki et al., PNAS, 109(34), 2012, 13763-13768 Laura van Vliet et al., BMC Medical Genetics, 9, 105, 2008 Joshua Lee et al., PLoS ONE, 13(5), e0197084, 2018 Joshua Lee et al., Methods in Molecular Biology, 1828, 141-150, 2018 Annemieke Aartsma-Rus et al, Am. J. Hum. Genet. 74(1), 83-92, 2004 Yusuke Echigoya et al., Molecular Therapy, 27(11), 1-13, 2019
上記のような状況において、目的pre-mRNAの複数のエクソン(エクソン群)を同時にスキッピングさせることにより種々の変異を有する患者を治療するための医薬が求められていた。
本発明者らは、上記文献に記載の技術内容及びジストロフィン遺伝子の構造などを詳細に研究した結果、ヒトジストロフィンpre-mRNAの特定の領域を標的とするアンチセンス核酸が、エクソン45~55のうち複数のエクソンを同時にスキッピングさせ得ることを見出した。本発明者らは、この知見に基づき、本発明を完成させた。
即ち、本発明は、以下のとおりである。
[1]
ヒトジストロフィンpre-mRNAにおける第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか2つ以上の番号順に連続するエクソンを同時にスキッピングさせるアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物であって、
前記アンチセンスオリゴマーは、
前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第NA番目のエクソンの3’末端から5’末端方向にNX塩基の塩基配列及び第NB番目のイントロンの5’末端から3’末端方向にNY塩基の塩基配列からなる領域Rn(nは1~23の奇数)、及び
前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第NA番目のイントロンの3’末端から5’末端方向にNX塩基の塩基配列及び第NB番目のエクソンの5’末端から3’末端方向にNY塩基の塩基配列からなる領域Rn(nは2~24の偶数)
で示される領域R1~R24からなる群より選択される少なくとも1つの領域の塩基配列又はその一部の塩基配列に相補的な塩基配列を含み、
ここで、
n=1のとき、NA=44、NB=44、NX=20、及びNY=400であるか、
n=2のとき、NA=44、NB=45、NX=600、及びNY=50であるか、
n=3のとき、NA=45、NB=45、NX=20、及びNY=400であるか、
n=4のとき、NA=45、NB=46、NX=400、及びNY=50であるか、
n=5のとき、NA=46、NB=46、NX=20、及びNY=400であるか、
n=6のとき、NA=46、NB=47、NX=400、及びNY=50であるか、
n=7のとき、NA=47、NB=47、NX=20、及びNY=400であるか、
n=8のとき、NA=47、NB=48、NX=400、及びNY=50であるか、
n=9のとき、NA=48、NB=48、NX=20、及びNY=400であるか、
n=10のとき、NA=48、NB=49、NX=400、及びNY=50であるか、
n=11のとき、NA=49、NB=49、NX=20、及びNY=400であるか、
n=12のとき、NA=49、NB=50、NX=400、及びNY=50であるか、
n=13のとき、NA=50、NB=50、NX=20、及びNY=400であるか、
n=14のとき、NA=50、NB=51、NX=400、及びNY=50であるか、
n=15のとき、NA=51、NB=51、NX=20、及びNY=400であるか、
n=16のとき、NA=51、NB=52、NX=400、及びNY=50であるか、
n=17のとき、NA=52、NB=52、NX=20、及びNY=400であるか、
n=18のとき、NA=52、NB=53、NX=400、及びNY=50であるか、
n=19のとき、NA=53、NB=53、NX=20、及びNY=400であるか、
n=20のとき、NA=53、NB=54、NX=400、及びNY=50であるか、
n=21のとき、NA=54、NB=54、NX=20、及びNY=400であるか、
n=22のとき、NA=54、NB=55、NX=400、及びNY=50であるか、
n=23のとき、NA=55、NB=55、NX=20、及びNY=400であるか、又は
n=24のとき、NA=55、NB=56、NX=400、及びNY=50である、前記アンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。[2]
領域R1が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第44番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第44番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R2が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第44番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に600塩基の塩基配列及び第45番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R3が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第45番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第45番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R4が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第45番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第46番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R5が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第46番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第46番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R6が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第46番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第47番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R7が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第47番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第47番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R8が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第47番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第48番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R9が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第48番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第48番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R10が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第48番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第49番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R11が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第49番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第49番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R12が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第49番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第50番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R13が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第50番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第50番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R14が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第50番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第51番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R15が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第51番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第51番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R16が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第51番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第52番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R17が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第52番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第52番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R18が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第52番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第53番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R19が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第53番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第53番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R20が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第53番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第54番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R21が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第54番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第54番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R22が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第54番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第55番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R23が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第55番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第55番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、又は
領域R24が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第55番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第56番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域である、
[1]に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[3]
前記アンチセンスオリゴマーが、
(a)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列、
(b)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列に相補的な塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列、
(c)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、又は
(d)前記(a)、(b)、及び(c)からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列の一部の塩基配列
に相補的な塩基配列を含む、[1]又は[2]に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[4]
前記アンチセンスオリゴマーが、2つ以上のユニットオリゴマーが連結したアンチセンスオリゴマーであって、
前記各々のユニットオリゴマーは、前記領域R1~R24からなる群より選択されるいずれか1つの領域の塩基配列又はその一部の塩基配列に相補的な塩基配列を含み、かつ各々のユニットオリゴマーの塩基配列は連続又は互いに重複するものではない、
[1]~[3]のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[5]
前記アンチセンスオリゴマーが、2つ以上のユニットオリゴマーが連結したアンチセンスオリゴマーであって、前記各々のユニットオリゴマーは
(a)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列、
(b)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列に相補的な塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列、
(c)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、又は
(d)前記(a)、(b)、及び(c)からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列の一部の塩基配列
に相補的な塩基配列を含み、かつ各々のユニットオリゴマーの塩基配列は連続又は互いに重複するものではない、[1]~[3]のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[6]
前記各々のユニットオリゴマーが、前記領域中の連続する5~20塩基長の塩基配列に相補的な塩基配列を含む、[4]又は[5]に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[7]
(1)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列、又は
(2)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
からなる、[1]~[3]のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[8]
配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなる、[1]~[3]及び[7]のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[9]
配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなる、[1]~[3]及び[7]~[8]のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[10]
オリゴヌクレオチドである、[1]~[9]のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[11]
前記オリゴヌクレオチドを構成する少なくとも1つのヌクレオチドの糖部分及び/又はリン酸結合部分が修飾されている、[10]に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[12]
前記オリゴヌクレオチドを構成する少なくとも1つのヌクレオチドの糖部分が、2’位の-OH基が、-OR、-R、-R’OR、-SH、-SR、-NH、-NHR、-NR、-N、-CN、-F、-Cl、-Br、及び-Iからなる群より選択されるいずれかの基で置換されたリボースである、[10]又は[11]に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物
(前記Rは、アルキル又はアリールを示し、前記R’は、アルキレンを示す。)。
[13]
前記オリゴヌクレオチドを構成する少なくとも1つのヌクレオチドのリン酸結合部分が、ホスホロチオエート結合、ホスホロジチオエート結合、アルキルホスホネート結合、ホスホロアミデート結合、及びボラノフォスフェート結合からなる群より選択されるいずれか1つのものである、[10]~[12]のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[14]
モルホリノオリゴマーである、[1]~[9]のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[15]
ホスホロジアミデートモルホリノオリゴマーである、[14]に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[16]
5’末端が、下記化学式(1)~(3)のいずれかの基である、[14]又は[15]に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[17]
ヒトジストロフィンpre-mRNAの第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか1つのエクソンが単一でスキッピングすることを抑制するサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物であって、
前記サプレッサーアンチセンスオリゴマーが、
(a)配列番号370~384からなる群より選択される塩基配列のいずれか1つの塩基配列、若しくは
(b)配列番号370~384からなる群より選択される塩基配列のいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、又は
(c)前記(a)若しくは(b)の塩基配列の一部の塩基配列
に相補的な塩基配列を含む、
前記サプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[18]
(1)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列、又は(2)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
からなる、[17]に記載のサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[19]
配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなる、[17]又は[18]に記載のサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[20]
オリゴヌクレオチドである、[17]~[19]のいずれか一項に記載のサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[21]
前記オリゴヌクレオチドを構成する少なくとも1つのヌクレオチドの糖部分及び/又はリン酸結合部分が修飾されている、[20]に記載のサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[22]
前記オリゴヌクレオチドを構成する少なくとも1つのヌクレオチドの糖部分が、2’位の-OH基が、-OR、-R、-R’OR、-SH、-SR、-NH、-NHR、-NR、-N、-CN、-F、-Cl、-Br、及び-Iからなる群より選択されるいずれかの基で置換されたリボースである、[20]又は[21]に記載のサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物
(先記Rは、アルキル又はアリールを示し、前記R’は、アルキレンを示す。)。
[23]
前記オリゴヌクレオチドを構成する少なくとも1つのヌクレオチドのリン酸結合部分が、ホスホロチオエート結合、ホスホロジチオエート結合、アルキルホスホネート結合、ホスホロアミデート結合、及びボラノフォスフェート結合からなる群より選択されるいずれか1つのものである、[20]~[22]のいずれか一項に記載のサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[24]
モルホリノオリゴマーである、[17]~[19]のいずれか一項に記載のサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[25]
ホスホロジアミデートモルホリノオリゴマーである、[24]に記載のサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[26]
5’末端が、下記化学式(1)~(3)のいずれかの基である、[24]又は[25]に記載のサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
[27]
[1]~[16]のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物を含む、医薬組成物。
[28]
[17]~[26]のいずれか一項に記載のサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物をさらに含む、[27]に記載の医薬組成物。
[29]
[1]~[16]のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物と、[17]~[26]のいずれか一項に記載のサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物とを含む、医薬組成物。
[30]
(1)前記アンチセンスオリゴマーが配列番号75からなるオリゴマーであり、前記サプレッサーアンチセンスオリゴマーが配列番号260からなるオリゴマーであるか、
(2)前記アンチセンスオリゴマーが配列番号75からなるオリゴマーであり、前記サプレッサーアンチセンスオリゴマーが配列番号261からなるオリゴマーであるか、又は(3)前記アンチセンスオリゴマーが配列番号75からなるオリゴマーであり、前記サプレッサーアンチセンスオリゴマーが配列番号263からなるオリゴマーである、
[28]又は[29]に記載の医薬組成物。
[31]
さらに医薬的に許容可能な担体を含む、[27]~[30]のいずれか一項に記載の医薬組成物。
[32]
筋ジストロフィーの治療のための、[27]~[31]のいずれか一項に記載の医薬組成物。
[33]
ヒト患者に投与するための、[27]~[32]のいずれか一項に記載の医薬組成物。[34]
[1]~[16]のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩若しくはそれらの水和物、又は[27]~[33]のいずれか一項に記載の医薬組成物を、筋ジストロフィー患者に投与する工程を含む、筋ジストロフィーの治療方法。
[35]
前記筋ジストロフィー患者が、ジストロフィン遺伝子にエクソン45~55スキップの対象となる変異を有する患者である、[34]に記載の治療方法。
[36]
前記患者がヒトである、[34]又は[35]に記載の治療方法。
[37]
筋ジストロフィー治療用医薬の製造における、[1]~[16]のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩若しくはそれらの水和物、又は[27]~[33]のいずれか一項に記載の医薬組成物の使用。
[38]
筋ジストロフィー治療に使用するための[1]~[16]のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩若しくはそれらの水和物、又は[27]~[33]のいずれか一項に記載の医薬組成物。
[39]
前記治療が、ヒトジストロフィンpre-mRNAの第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか2つ以上の番号順に連続するエクソンのスキッピングを行うことを伴う、[38]に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩若しくはそれらの水和物又は医薬組成物。
[40]
前記治療において、筋ジストロフィー患者がヒトである、[38]又は[39]に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩若しくはそれらの水和物又は医薬組成物。
[41]
目的pre-mRNAから2つ以上の番号順に連続するエクソンをスキッピングする際に、前記目的pre-mRNAのスプライシングサイレンサー配列、スプライス部位配列、又はブランチ部位配列を阻害する工程を含む、
前記2つ以上の番号順に連続するエクソンがスキッピングされる効率を増大させる方法。
[42]
前記スプライシングサイレンサー配列がheterogeneous nuclear
ribonucleoprotein A1 (hnRNPA1)の認識配列である、[41]に記載の方法。
[43]
前記目的pre-mRNAがヒトジストロフィンpre-mRNAである、[41]又は[42]に記載の方法。
[44]
前記2つ以上の番号順に連続するエクソンが、ヒトジストロフィンpre-mRNAの第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択される、[41]~[43]のいずれか一項に記載の方法。
[45]
前記目的pre-mRNAの2つ以上の番号順に連続するエクソンのスキッピングが、[1]~[16]のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物を用いて行われる、[44]に記載の方法。
[46]
前記スプライシングサイレンサー配列、スプライス部位配列、又はブランチ部位配列を特異的に阻害する工程が、[17]~[26]のいずれか一項に記載のサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物を用いて行われる、[44]又は[45]に記載の方法。
また、本発明は以下の態様を含み得る。
[47]
目的pre-mRNAから2つ以上の番号順に連続するエクソンを同時にスキッピングさせるアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物であって、
前記アンチセンスオリゴマーは、
(1)前記目的pre-mRNAのいずれかのエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び該エクソンに対して3’側に隣接するイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列から構成される領域、又は
(2)前記目的pre-mRNAのいずれかのイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基又は600塩基の範囲の塩基配列及び該イントロンに対して3’側に隣接するエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の範囲の塩基配列から構成される領域、
からなる群より選択されるいずれか1つの領域の塩基配列又はその一部の塩基配列に相補的な塩基配列を含む、
前記アンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。[48]
前記目的pre-mRNAがヒトジストロフィンpre-mRNAである、[47]に記載のアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物。
本発明により標的の複数のエクソンを同時にスキッピングさせるアンチセンスオリゴマーが提供される。また、本発明の別の態様により、目的pre-mRNAの複数のエクソンを同時にスキッピングさせることにより種々の変異を有する患者を治療するための医薬組成物が提供される。また、本発明の別の態様により、目的pre-mRNAのエクソンが単一でスキッピングすることを抑制するサプレッサーアンチセンスオリゴマー又は当該オリゴマーを含む医薬組成物が提供される。また、本発明の別の態様により、ヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55を同時に高効率にスキッピングさせることが可能である。
RD細胞(ヒト横紋筋肉腫細胞)におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55のスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55のスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55のスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55のスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55のスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55のスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55のスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55のスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55のスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55のスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55のスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55のスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55のスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55のスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55のスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55のスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55のマルチスキッピング及びエクソン45のシングルスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~55のマルチスキッピング及びエクソン45のシングルスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~49間のマルチスキッピング及びエクソン45のシングルスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~49間のマルチスキッピングを、RT-PCRにより検討し、エクソン45~46、エクソン45~47、エクソン45~48、及びエクソン45~49の各スキッピングの合計量(全マルチスキッピング産物)を算出した結果を示す図である。当該各スキッピングはすべて治療効果を有すると考えられる。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~52間のマルチスキッピング及びエクソン45のシングルスキッピングを、RT-PCRにより検討した結果を示す図である。 RD細胞におけるヒトジストロフィンpre-mRNAのエクソン45~52間のマルチスキッピングを、RT-PCRにより検討し、エクソン45~47、エクソン45~48、エクソン45~49、エクソン45~50、エクソン45~51、及びエクソン45~52の各スキッピングの合計量(左)又はエクソン45~47、エクソン45~48、エクソン45~49、及びエクソン45~51の各スキッピング合計量(右)を算出した結果を示す図である。エクソン45~47、エクソン45~48、エクソン45~49、及びエクソン45~51の各スキッピングはすべて治療効果を有する。
以下、本発明を詳細に説明する。以下の実施の形態は、本発明を説明するための例示であり、本発明をこの実施の形態のみに限定する趣旨ではない。本発明は、その要旨を逸脱しない限り、様々な形態で実施をすることができる。
1.アンチセンスオリゴマー
本発明は、目的pre-mRNAから2つ以上の番号順に連続するエクソンを同時にスキッピングさせるアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物であって、
前記アンチセンスオリゴマーは、
(1)前記目的pre-mRNAのいずれかのエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び該エクソンに対して3’側に隣接するイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列から構成される領域、又は
(2)前記目的pre-mRNAのいずれかのイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基又は600塩基の範囲の塩基配列及び該イントロンに対して3’側に隣接するエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の範囲の塩基配列から構成される領域、
からなる群より選択されるいずれか1つの領域の塩基配列又はその一部の塩基配列に相補的な塩基配列を含む、
前記アンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物を提供する。
本明細書において、2つ以上の番号順に連続するエクソンを「同時にスキッピングさせる」とは、各エクソンのpre-mRNAからの除去のタイミングが完全に同一である場合のみならず、pre―mRNAから成熟mRNAに至る期間内で各エクソンを順次除去する場合も含む。すなわち、2つ以上の番号順に連続するエクソンを「同時にスキッピングさせる」とはpre―mRNAに対して、2つ以上の番号順に連続する複数のエクソンを除去することをいう。
本明細書において、「2つ以上の番号順に連続するエクソン」は目的pre-mRNAに含まれるエクソンのうち(全エクソン数をTexonとする)、エクソン番号が1ずつ増加する複数のエクソンを意味する。エクソン番号とは、pre-mRNAの最も5’側に存在するエクソンを第1番目のエクソンと定め、5’側から3’側に順次存在するエクソンを順に第2番目、第3番目と振り分けられる番号を意味する。ある遺伝子の2つ以上の番号順に連続するエクソンをスキッピングする場合、そのエクソン番号a,・・・,aは数列{a}として表すことができる。数列{a}の一般項aは以下の式で表される。
[式1]
aj=m+(j-1)
ここでmは1≦m≦(Texon-1)を満たす任意の自然数であり、jは2≦(m+j)≦Texon+1を満たす自然数である。
例えば、目的pre-mRNAがヒトジストロフィンpre-mRNAである場合、Texonは79である。
ある態様ではjは1~11から選択される任意の自然数である。また、別の態様ではjは11であり、jは10であり、jは9であり、jは8であり、jは7であり、jは6であり、jは5であり、jは4であり、jは3であり、jは2であり、jは1である。
本明細書において、「遺伝子」には、ゲノム遺伝子以外に、cDNA、pre-mRNA及びmRNAも含まれ、好ましくは、遺伝子はpre-mRNAである。本明細書において、「pre-mRNA」とは、ゲノム上の標的遺伝子から転写されたエクソン及びイントロンを含むRNA分子であり、mRNA前駆体である。
ある態様において、本発明は、ヒトジストロフィンpre-mRNAにおける第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか2つ以上の番号順に連続するエクソンを同時にスキッピングさせるアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物(以下、前記アンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物を総じて「本発明のアンチセンスオリゴマー」ともいう。本発明のアンチセンスオリゴマーは、前記アンチセンスオリゴマー、若しくはその医薬的に許容可能な塩、又はそれらの水和物のそれぞれを指す場合もある。)を提供する。
ヒトジストロフィンpre-mRNAは、ゲノム上のヒトジストロフィン遺伝子から転写されたエクソン及びイントロンを含むRNA分子であり、mRNA前駆体である。当業者は、ヒトジストロフィンpre-mRNAの塩基配列の情報を、ヒトジストロフィン遺伝子のゲノム配列(GenBank Accession No. NG_012232.1)からの類推により入手可能である。
ヒトゲノムにおいて、ヒトジストロフィン遺伝子は遺伝子座Xp21.2に存在する。ヒトジストロフィン遺伝子は、約3.0Mbpのサイズを有しており、既知のヒト遺伝子としては最大の遺伝子である。但し、ヒトジストロフィン遺伝子のコード領域はわずか約14kbに過ぎず、該コード領域は79個のエクソンとしてジストロフィン遺伝子内に分散している(Roberts, RG., et al., Genomics, 16: 536-538 (1993))。ヒトジストロフィン遺伝子の転写物であるpre-mRNAは、スプライシングを受けて約14kbの成熟mRNAを生成する。ヒトの野生型ジストロフィン遺伝子成熟mRNAの塩基配列は公知である(GenBank Accession No. NM_004006)。
上記態様における本発明のアンチセンスオリゴマーは、
ヒトジストロフィンpre-mRNAの第NA番目のエクソンの3’末端から5’末端方向にNX塩基の塩基配列及び第NB番目のイントロンの5’末端から3’末端方向にNY塩基の塩基配列からなる領域Rn(nは1~23の奇数)、及び
ヒトジストロフィンpre-mRNAの第NA番目のイントロンの3’末端から5’末端方向にNX塩基の塩基配列及び第NB番目のエクソンの5’末端から3’末端方向にNY塩基の塩基配列からなる領域Rn(nは2~24の偶数)
で示される領域R1~R24からなる群より選択される少なくともいずれか1つの領域を標的とする。以下、領域R1~R24を「本発明のアンチセンスオリゴマーの標的領域」又は相互交換的に「本発明の標的領域」と呼ぶ。
本明細書において、「標的とする」とは、対象となる塩基配列が、標的領域の塩基配列又は標的配列の一部の塩基配列に相補的な塩基配列であることをいう。
また、上記態様における本発明のアンチセンスオリゴマーは、本発明の標的領域R1~R24からなる群より選択される少なくともいずれか1つの領域の塩基配列又はその一部の塩基配列に相補的な塩基配列を含む。
上記態様における本発明の標的領域Rnの例としては、以下のものが挙げられる。
n=1のとき、NA=44、NB=44、NX=20、及びNY=400であるか、
n=2のとき、NA=44、NB=45、NX=600、及びNY=50であるか、
n=3のとき、NA=45、NB=45、NX=20、及びNY=400であるか、
n=4のとき、NA=45、NB=46、NX=400、及びNY=50であるか、
n=5のとき、NA=46、NB=46、NX=20、及びNY=400であるか、
n=6のとき、NA=46、NB=47、NX=400、及びNY=50であるか、
n=7のとき、NA=47、NB=47、NX=20、及びNY=400であるか、
n=8のとき、NA=47、NB=48、NX=400、及びNY=50であるか、
n=9のとき、NA=48、NB=48、NX=20、及びNY=400であるか、
n=10のとき、NA=48、NB=49、NX=400、及びNY=50であるか、
n=11のとき、NA=49、NB=49、NX=20、及びNY=400であるか、
n=12のとき、NA=49、NB=50、NX=400、及びNY=50であるか、
n=13のとき、NA=50、NB=50、NX=20、及びNY=400であるか、
n=14のとき、NA=50、NB=51、NX=400、及びNY=50であるか、
n=15のとき、NA=51、NB=51、NX=20、及びNY=400であるか、
n=16のとき、NA=51、NB=52、NX=400、及びNY=50であるか、
n=17のとき、NA=52、NB=52、NX=20、及びNY=400であるか、
n=18のとき、NA=52、NB=53、NX=400、及びNY=50であるか、
n=19のとき、NA=53、NB=53、NX=20、及びNY=400であるか、
n=20のとき、NA=53、NB=54、NX=400、及びNY=50であるか、
n=21のとき、NA=54、NB=54、NX=20、及びNY=400であるか、
n=22のとき、NA=54、NB=55、NX=400、及びNY=50であるか、
n=23のとき、NA=55、NB=55、NX=20、及びNY=400であるか、又は
n=24のとき、NA=55、NB=56、NX=400、及びNY=50である。
別の態様において、本発明の標的領域Rnの例としては、以下のものも挙げられるが、これに限定されるものではない。
n=1のとき、NA=44、NB=44、NX=20、及びNY=400であるか、
n=2のとき、NA=44、NB=45、NX=600、及びNY=19であるか、
n=3のとき、NA=45、NB=45、NX=20、及びNY=400であるか、
n=4のとき、NA=45、NB=46、NX=400、及びNY=50であるか、
n=5のとき、NA=46、NB=46、NX=20、及びNY=400であるか、
n=6のとき、NA=46、NB=47、NX=400、及びNY=37であるか、
n=7のとき、NA=47、NB=47、NX=20、及びNY=400であるか、
n=8のとき、NA=47、NB=48、NX=400、及びNY=19であるか、
n=9のとき、NA=48、NB=48、NX=20、及びNY=400であるか、
n=10のとき、NA=48、NB=49、NX=400、及びNY=42であるか、
n=11のとき、NA=49、NB=49、NX=20、及びNY=400であるか、
n=12のとき、NA=49、NB=50、NX=400、及びNY=44であるか、
n=13のとき、NA=50、NB=50、NX=20、及びNY=400であるか、
n=14のとき、NA=50、NB=51、NX=400、及びNY=25であるか、
n=15のとき、NA=51、NB=51、NX=20、及びNY=400であるか、
n=16のとき、NA=51、NB=52、NX=400、及びNY=24であるか、
n=17のとき、NA=52、NB=52、NX=20、及びNY=400であるか、
n=18のとき、NA=52、NB=53、NX=400、及びNY=34であるか、
n=19のとき、NA=53、NB=53、NX=20、及びNY=400であるか、
n=20のとき、NA=53、NB=54、NX=400、及びNY=43であるか、
n=21のとき、NA=54、NB=54、NX=20、及びNY=400であるか、
n=22のとき、NA=54、NB=55、NX=400、及びNY=25であるか、
n=23のとき、NA=55、NB=55、NX=20、及びNY=400であるか、又は
n=24のとき、NA=55、NB=56、NX=400、及びNY=50である。
本発明の標的領域Rnの例であるR1~R24は、別の態様では以下のように表記されるものが挙げられるが、これに限定されるものではない。
例えば、ある態様では、領域R1が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第44番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第44番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R2が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第44番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に600塩基の塩基配列及び第45番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R3が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第45番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第45番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R4が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第45番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第46番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R5が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第46番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第46番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R6が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第46番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第47番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R7が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第47番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第47番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R8が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第47番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第48番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R9が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第48番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第48番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R10が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第48番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第49番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R11が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第49番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第49番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R12が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第49番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第50番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R13が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第50番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第50番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R14が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第50番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第51番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R15が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第51番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第51番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R16が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第51番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第52番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R17が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第52番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第52番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R18が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第52番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第53番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R19が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第53番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第53番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R20が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第53番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第54番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R21が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第54番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第54番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R22が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第54番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第55番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R23が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第55番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第55番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、又は
領域R24が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第55番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第56番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域である。
別の態様において、本発明の標的領域Rnの例であるR1~R24は、上記の態様では以下のように表記されるものも挙げられるが、これに限定されるものではない。
例えば、ある態様では、領域R1が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第44番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第44番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R2が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第44番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に600塩基の塩基配列及び第45番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に19塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R3が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第45番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第45番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R4が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第45番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第46番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R5が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第46番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第46番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R6が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第46番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第47番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に37塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R7が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第47番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第47番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R8が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第47番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第48番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に19塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R9が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第48番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第48番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R10が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第48番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第49番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に42塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R11が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第49番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第49番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R12が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第49番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第50番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に44塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R13が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第50番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第50番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R14が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第50番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第51番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に25塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R15が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第51番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第51番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R16が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第51番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第52番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に24塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R17が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第52番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第52番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R18が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第52番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第53番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に34塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R19が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第53番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第53番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R20が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第53番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第54番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に43塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R21が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第54番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第54番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R22が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第54番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第55番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に25塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R23が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第55番目のエクソンの3’末端から5’末端方向に20塩基の塩基配列及び第55番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、又は
領域R24が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第55番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列及び第56番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に50塩基の塩基配列からなる領域である。
また、本発明の標的領域Rnの例であるR1~R24は、別の態様では以下のように表記されるものが挙げられるが、これに限定されるものではない。
(A1) 領域R1
領域R1は、エクソン44の3’末端とイントロン44の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-20塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、-20塩基~-1塩基の範囲で表される領域はエクソン44に属し、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン44に属する。
(A2) 領域R2
領域R2は、イントロン44の3’末端とエクソン45の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-600塩基~+50塩基の範囲で表される領域である。この際、-600塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン44に属し、+1塩基~+50塩基の範囲で表される領域はエクソン45に属する。
(A3) 領域R3
領域R3は、エクソン45の3’末端とイントロン45の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-20塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、-20塩基~-1塩基の範囲で表される領域はエクソン45に属し、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン45に属する。
(A4) 領域R4
領域R4は、イントロン45の3’末端とエクソン46の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+50塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン45に属し、+1塩基~+50塩基の範囲で表される領域はエクソン46に属する。
(A5) 領域R5
領域R5は、エクソン46の3’末端とイントロン46の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-20塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、-20塩基~-1塩基の範囲で表される領域はエクソン46に属し、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン46に属する。
(A6) 領域R6
領域R6は、イントロン46の3’末端とエクソン47の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+50塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン46に属し、+1塩基~+50塩基の範囲で表される領域はエクソン47に属する。
(A7) 領域R7
領域R7は、エクソン47の3’末端とイントロン47の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-20塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、-20塩基~-1塩基の範囲で表される領域はエクソン47に属し、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン47に属する。
(A8) 領域R8
領域R8は、イントロン47の3’末端とエクソン48の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+50塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン47に属し、+1塩基~+50塩基の範囲で表される領域はエクソン48に属する。
(A9) 領域R9
領域R9は、エクソン48の3’末端とイントロン48の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-20塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、-20塩基~-1塩基の範囲で表される領域はエクソン48に属し、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン48に属する。
(A10) 領域R10
領域R10は、イントロン48の3’末端とエクソン49の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+50塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン48に属し、+1塩基~+50塩基の範囲で表される領域はエクソン49に属する。
(A11) 領域R11
領域R11は、エクソン49の3’末端とイントロン49の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-20塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、-20塩基~-1塩基の範囲で表される領域はエクソン49に属し、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン49に属する。
(A12) 領域R12
領域R12は、イントロン49の3’末端とエクソン50の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+50塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン49に属し、+1塩基~+50塩基の範囲で表される領域はエクソン50に属する。
(A13) 領域R13
領域R13は、エクソン50の3’末端とイントロン50の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-20塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、-20塩基~-1塩基の範囲で表される領域はエクソン50に属し、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン50に属する。
(A14) 領域R14
領域R14は、イントロン50の3’末端とエクソン51の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+50塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン50に属し、+1塩基~+50塩基の範囲で表される領域はエクソン51に属する。
(A15) 領域R15
領域R15は、エクソン51の3’末端とイントロン51の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-20塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、-20塩基~-1塩基の範囲で表される領域はエクソン51に属し、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン51に属する。
(A16) 領域R16
領域R16は、イントロン51の3’末端とエクソン52の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3‘側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+50塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン51に属し、+1塩基~+50塩基の範囲で表される領域はエクソン52に属する。
(A17) 領域R17
領域R17は、エクソン52の3’末端とイントロン52の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-20塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、-20塩基~-1塩基の範囲で表される領域はエクソン52に属し、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン52に属する。
(A18) 領域R18
領域R18は、イントロン52の3’末端とエクソン53の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+50塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン52に属し、+1塩基~+50塩基の範囲で表される領域はエクソン53に属する。
(A19) 領域R19
領域R19は、エクソン53の3’末端とイントロン53の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-20塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、-20塩基~-1塩基の範囲で表される領域はエクソン53に属し、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン53に属する。
(A20) 領域R20
領域R20は、イントロン53の3’末端とエクソン54の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+50塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン53に属し、+1塩基~+50塩基の範囲で表される領域はエクソン54に属する。
(A21) 領域R21
領域R21は、エクソン54の3’末端とイントロン54の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-20塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、-20塩基~-1塩基の範囲で表される領域はエクソン54に属し、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン54に属する。
(A22) 領域R22
領域R22は、イントロン54の3’末端とエクソン55の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+50塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン54に属し、+1塩基~+50塩基の範囲で表される領域はエクソン55に属する。
(A23) 領域R23
領域R23は、エクソン55の3’末端とイントロン55の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-20塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、-20塩基~-1塩基の範囲で表される領域はエクソン55に属し、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン55に属する。
(A24) 領域R24
領域R24は、イントロン55の3’末端とエクソン56の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+50塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン55に属し、+1塩基~+50塩基の範囲で表される領域はエクソン56に属する。
別の態様において、本発明の標的領域Rnの例であるR2、R6、R8、R10、R12、R14、R16、R18、R20、及びR22は、上記の態様では以下のように表記されるものも挙げられるが、これに限定されるものではない。
(A2) 領域R2
領域R2は、イントロン44の3’末端とエクソン45の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-600塩基~+19塩基の範囲で表される領域である。この際、-600塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン44に属し、+1塩基~+19塩基の範囲で表される領域はエクソン45に属する。
(A6) 領域R6
領域R6は、イントロン46の3’末端とエクソン47の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+37塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン46に属し、+1塩基~+37塩基の範囲で表される領域はエクソン47に属する。
(A8) 領域R8
領域R8は、イントロン47の3’末端とエクソン48の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+19塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン47に属し、+1塩基~+19塩基の範囲で表される領域はエクソン48に属する。
(A10) 領域R10
領域R10は、イントロン48の3’末端とエクソン49の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+42塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン48に属し、+1塩基~+42塩基の範囲で表される領域はエクソン49に属する。
(A12) 領域R12
領域R12は、イントロン49の3’末端とエクソン50の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+44塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン49に属し、+1塩基~+44塩基の範囲で表される領域はエクソン50に属する。
(A14) 領域R14
領域R14は、イントロン50の3’末端とエクソン51の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+25塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン50に属し、+1塩基~+25塩基の範囲で表される領域はエクソン51に属する。
(A16) 領域R16
領域R16は、イントロン51の3’末端とエクソン52の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+24塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン51に属し、+1塩基~+24塩基の範囲で表される領域はエクソン52に属する。
(A18) 領域R18
領域R18は、イントロン52の3’末端とエクソン53の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+34塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン52に属し、+1塩基~+34塩基の範囲で表される領域はエクソン53に属する。
(A20) 領域R20
領域R20は、イントロン53の3’末端とエクソン54の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+43塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン53に属し、+1塩基~+43塩基の範囲で表される領域はエクソン54に属する。
(A22) 領域R22
領域R22は、イントロン54の3’末端とエクソン55の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)、3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、-400塩基~+25塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン54に属し、+1塩基~+25塩基の範囲で表される領域はエクソン55に属する。
領域R1~R24の塩基配列の具体例は以下のものが挙げられる。本明細書において、チミン「T」とウラシル「U」は相互に交換可能であり、「T」であっても「U」であっても本発明のアンチセンスオリゴマーのエクソンスキッピング活性に本質的に影響は生じないので、本明細書で示される塩基配列においては「T」が「U」である場合も含み、同一の配列番号で示すこととする。以下の表において、pre-mRNAにおける塩基配列であっても「U」を「T」で表記する場合があるが、当業者であれば適宜「T」を「U」に置き換えてRNA配列を理解することができる。
別の態様において、領域R2、R6、R8、R10、R12、R14、R16、R18、R20、及びR22の塩基配列の具体例は以下のものも挙げられる。
さらに別の態様において、本発明のアンチセンスオリゴマーは、
ヒトジストロフィンpre-mRNAの第NB番目のイントロンの5’末端から3’末端方向にNY塩基の塩基配列からなる領域Rn(nは1~23の奇数)、及び
ヒトジストロフィンpre-mRNAの第NA番目のイントロンの3’末端から5’末端方向にNX塩基の塩基配列からなる領域Rn(nは2~24の偶数)
で示される領域R1~R24からなる群より選択される少なくともいずれか1つの領域を標的とする。
上記の態様において、本発明の標的領域Rnの例としては、以下のものが挙げられるが、これに限定されるものではない。
n=1のとき、NB=44及びNY=400であるか、
n=2のとき、NA=44及びNX=600であるか、
n=3のとき、NB=45及びNY=400であるか、
n=4のとき、NA=45及びNX=400であるか、
n=5のとき、NB=46及びNY=400であるか、
n=6のとき、NA=46及びNX=400であるか、
n=7のとき、NB=47及びNY=400であるか、
n=8のとき、NA=47及びNX=400であるか、
n=9のとき、NB=48及びNY=400であるか、
n=10のとき、NA=48及びNX=400であるか、
n=11のとき、NB=49及びNY=400であるか、
n=12のとき、NA=49及びNX=400であるか、
n=13のとき、NB=50及びNY=400であるか、
n=14のとき、NA=50及びNX=400であるか、
n=15のとき、NB=51及びNY=400であるか、
n=16のとき、NA=51及びNX=400であるか、
n=17のとき、NB=52及びNY=400であるか、
n=18のとき、NA=52及びNX=400であるか、
n=19のとき、NB=53及びNY=400であるか、
n=20のとき、NA=53及びNX=400であるか、
n=21のとき、NB=54及びNY=400であるか、
n=22のとき、NA=54及びNX=400であるか、
n=23のとき、NB=55及びNY=400であるか、又は
n=24のとき、NA=55及びNX=400である。
上記態様に係る本発明の標的領域Rnの例であるR1~R24は、さらに別の態様では以下のように表記されるものが挙げられるが、これに限定されるものではない。
例えば、ある態様では、領域R1が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第44番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R2が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第44番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に600塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R3が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第45番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R4が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第45番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R5が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第46番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R6が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第46番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R7が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第47番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R8が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第47番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基からなる領域であり、
領域R9が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第48番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R10が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第48番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R11が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第49番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R12が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第49番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R13が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第50番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R14が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第50番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R15が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第51番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R16が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第51番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R17が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第52番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R18が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第52番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R19が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第53番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R20が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第53番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R21が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第54番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R22が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第54番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、
領域R23が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第55番目のイントロンの5’末端から3’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域であり、又は
領域R24が、前記ヒトジストロフィンpre-mRNAの第55番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に400塩基の塩基配列からなる領域である。
また、上記態様に係る本発明の標的領域Rnの例であるR1~R24は、別の態様では以下のように表記されるものが挙げられるが、これに限定されるものではない。
(A1) 領域R1
領域R1は、エクソン44の3’末端とイントロン44の5’末端との境界を基点0とし、基点より3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン44に属する。
(A2) 領域R2
領域R2は、イントロン44の3’末端とエクソン45の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)で示した場合に、-600塩基~-1塩基の範囲で表される領域である。この際、-600塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン44に属する。
(A3) 領域R3
領域R3は、エクソン45の3’末端とイントロン45の5’末端との境界を基点0とし、基点より3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン45に属する。
(A4) 領域R4
領域R4は、イントロン45の3’末端とエクソン46の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)で示した場合に、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン45に属する。
(A5) 領域R5
領域R5は、エクソン46の3’末端とイントロン46の5’末端との境界を基点0とし、基点より3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン46に属する。
(A6) 領域R6
領域R6は、イントロン46の3’末端とエクソン47の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)で示した場合に、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン46に属する。
(A7) 領域R7
領域R7は、エクソン47の3’末端とイントロン47の5’末端との境界を基点0とし、基点より3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン47に属する。
(A8) 領域R8
領域R8は、イントロン47の3’末端とエクソン48の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)で示した場合に、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン47に属する。
(A9) 領域R9
領域R9は、エクソン48の3’末端とイントロン48の5’末端との境界を基点0とし、基点より3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン48に属する。
(A10) 領域R10
領域R10は、イントロン48の3’末端とエクソン49の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)で示した場合に、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン48に属する。
(A11) 領域R11
領域R11は、エクソン49の3’末端とイントロン49の5’末端との境界を基点0とし、基点より3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン49に属する。
(A12) 領域R12
領域R12は、イントロン49の3’末端とエクソン50の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)で示した場合に、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン49に属する。
(A13) 領域R13
領域R13は、エクソン50の3’末端とイントロン50の5’末端との境界を基点0とし、基点より3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン50に属する。
(A14) 領域R14
領域R14は、イントロン50の3’末端とエクソン51の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)で示した場合に、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン50に属する。
(A15) 領域R15
領域R15は、エクソン51の3’末端とイントロン51の5’末端との境界を基点0とし、基点より3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン51に属する。
(A16) 領域R16
領域R16は、イントロン51の3’末端とエクソン52の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)で示した場合に、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン51に属する。
(A17) 領域R17
領域R17は、エクソン52の3’末端とイントロン52の5’末端との境界を基点0とし、基点より3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン52に属する。
(A18) 領域R18
領域R18は、イントロン52の3’末端とエクソン53の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)で示した場合に、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン52に属する。
(A19) 領域R19
領域R19は、エクソン53の3’末端とイントロン53の5’末端との境界を基点0とし、基点より3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン53に属する。
(A20) 領域R20
領域R20は、イントロン53の3’末端とエクソン54の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)で示した場合に、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン53に属する。
(A21) 領域R21
領域R21は、エクソン54の3’末端とイントロン54の5’末端との境界を基点0とし、基点より3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン54に属する。
(A22) 領域R22
領域R22は、イントロン54の3’末端とエクソン55の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)で示した場合に、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン54に属する。
(A23) 領域R23
領域R23は、エクソン55の3’末端とイントロン55の5’末端との境界を基点0とし、基点より3’側(下流)の塩基配列領域を「+」で示した場合に、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域である。この際、+1塩基~+400塩基の範囲で表される領域はイントロン55に属する。
(A24) 領域R24
領域R24は、イントロン55の3’末端とエクソン56の5’末端との境界を基点0とし、基点より5’側(上流)の塩基配列領域を「-」(マイナス)で示した場合に、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域である。この際、-400塩基~-1塩基の範囲で表される領域はイントロン55に属する。
上記の態様において、領域R1~R24の塩基配列の具体例は以下のものが挙げられる。
また、本発明のアンチセンスオリゴマーの標的領域R1~R24には、ヒトジストロフィンpre-mRNAに関して、野生型(例えば配列番号233~256、341~369、及び385~389に示される領域)だけではなく、変異型のものも含まれる。かかる変異型は、具体的には、以下の塩基配列(B0)及び(B1)~(B16)からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列を有する。
(B0)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列に相補的な塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列;
(B1)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列
(B2)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と86%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±14%以内の長さを有する塩基配列
(B3)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と87%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±13%以内の長さを有する塩基配列
(B4)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と88%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±12%以内の長さを有する塩基配列
(B5)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と89%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±11%以内の長さを有する塩基配列
(B6)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と90%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±10%以内の長さを有する塩基配列
(B7)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と91%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±9%以内の長さを有する塩基配列
(B8)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と92%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±8%以内の長さを有する塩基配列
(B9)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と93%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±7%以内の長さを有する塩基配列
(B10)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と94%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±6%以内の長さを有する塩基配列
(B11)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と95%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±5%以内の長さを有する塩基配列
(B12)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と96%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±4%以内の長さを有する塩基配列
(B13)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と97%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±3%以内の長さを有する塩基配列
(B14)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と98%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±2%以内の長さを有する塩基配列
(B15)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±1%以内の長さを有する塩基配列
(B16)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99.5%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±0.5%以内の長さを有する塩基配列
本明細書において、「ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列」とは、例えば配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列に相補的な塩基配列の全部又は一部をプローブとして、コロニーハイブリダイゼーション法、プラークハイブリダイゼーション法又はサザンハイブリダイゼーション法などを用いることにより得られる塩基配列をいう。ハイブリダイゼーションの方法としては、例えば“Sambrook & Russel, Molecular Cloning: A Laboratory Manual Vol. 3, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001”、“Ausubel, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, 1987-1997”などに記載されている方法を利用することができる。
本明細書において、「相補的な塩基配列」とは、対象となる塩基配列とワトソン・クリック対を形成する塩基配列に限定されるものではなく、揺らぎ塩基対(Wobble base pair)を形成する塩基配列も含む。ここで、ワトソン・クリック対とは、アデニン-チミン、アデニン-ウラシル、及びグアニン-シトシン間に水素結合が形成される塩基対を意味し、揺らぎ塩基対とは、グアニン-ウラシル、イノシン-ウラシル、イノシン-アデニン、及びイノシン-シトシン間に水素結合が形成される塩基対を意味する。また、「相補的な塩基配列」とは、対象となる塩基配列と100%の相補性を有していなくてもよく、例えば、対象となる塩基配列に対して、1塩基、2塩基、3塩基、4塩基、又は5塩基の非相補的塩基が含まれていてもよく、また、対象となる塩基配列に対して、1塩基、2塩基、3塩基、4塩基、又は5塩基短い塩基配列であってもよい。
本明細書において、「ストリンジェントな条件」とは、低ストリンジェントな条件、中ストリンジェントな条件、及び高ストリンジェントな条件のいずれでもよい。「低ストリンジェントな条件」は、例えば、5×SSC、5×デンハルト溶液、0.5%SDS、50%ホルムアミド、32℃の条件である。また、「中ストリンジェントな条件」は、例えば、5×SSC、5×デンハルト溶液、0.5%SDS、50%ホルムアミド、42℃又は5×SSC、1%SDS、50mM Tris-HCl(pH7.5)、50%ホルムアミド、42℃の条件である。「高ストリンジェントな条件」は、例えば、5×SSC、5×デンハルト溶液、0.5%SDS、50%ホルムアミド、50℃又は0.2×SSC、0.1%SDS、65℃の条件である。これらの条件において、温度を上げるほど高い配列同一性を有する塩基配列が効率的に得られることが期待できる。ただし、ハイブリダイゼーションのストリンジェンシーに影響する要素としては温度、プローブ濃度、プローブの長さ、イオン強度、時間、塩濃度等の複数の要素が考えられ、当業者であればこれらの要素を適宜選択することで同様のストリンジェンシーを実現することが可能である。
なお、ハイブリダイゼーションに市販のキットを用いる場合は、例えばAlkPhos Direct Labelling and Detection System(GEヘルスケア社)を用いることができる。この場合は、キットに添付のプロトコールにしたがい、標識したプローブとのインキュベーションを一晩行った後、メンブレンを55℃の条件下で0.1%(w/v)SDSを含む1次洗浄バッファーで洗浄後、ハイブリダイゼーションを検出することができる。あるいは、配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と相補的な塩基配列の全部又は一部に基づいてプローブを作製する際に、市販の試薬(例えば、PCRラベリングミックス(ロシュ・ダイアグノスティックス社)等)を用いて該プローブをジゴキシゲニン(DIG)ラベルした場合には、DIG核酸検出キット(ロシュ・ダイアグノスティックス社)等を用いてハイブリダイゼーションを検出することができる。
なお、塩基配列の同一性は、カーリン及びアルチュールによるアルゴリズムBLAST(Basic Local Alignment Search Tool)(Proc. Natl. Acad. Sci. USA 872264-2268, 1990; Proc Natl Acad Sci USA 90: 5873, 1993)を用いて決定できる。BLASTのアルゴリズムに基づいたBLASTNやBLASTXと呼ばれるプログラムが開発されている(Altschul SF, et al: J Mol Biol 215: 403, 1990)。BLASTNを用いて塩基配列を解析する場合は、パラメーターは、例えばscore=100、wordlength=12とする。BLASTとGapped BLASTプログラムを用いる場合は、各プログラムのデフォルトパラメーターを用いる。
本発明のアンチセンスオリゴマーは、本発明の標的領域R1~R24からなる群より選択される少なくともいずれか1つの領域の塩基配列又はその一部の塩基配列に相補的な塩基配列を含む。「その一部」とは、標的領域R1~R24からなる群より選択される少なくともいずれか1つの領域の全長を除く領域、つまり標的領域R1~R24からなる群より選択される少なくともいずれか1つの領域の部分領域を意味する。部分領域の長さは、10~60塩基長、10~55塩基長、10~50塩基長、10~45塩基長、10~40塩基長、10~35塩基長、10~30塩基長、10~25塩基長、15~60塩基長、15~55塩基長、15~50塩基長、15~45塩基長、15~40塩基長、15~35塩基長、15~30塩基長、15~25塩基長、16~60塩基長、16~55塩基長、16~50塩基長、16~45塩基長、16~40塩基長、16~35塩基長、16~30塩基長、16~25塩基長、17~60塩基長、17~55塩基長、17~50塩基長、17~45塩基長、17~40塩基長、17~35塩基長、17~30塩基長、17~25塩基長、18~60塩基長、18~55塩基長、18~50塩基長、18~45塩基長、18~40塩基長、18~35塩基長、18~30塩基長、18~25塩基長、19~60塩基長、19~55塩基長、19~50塩基長、19~45塩基長、19~40塩基長、19~35塩基長、19~30塩基長、19~25塩基長、20~60塩基長、20~55塩基長、20~50塩基長、20~45塩基長、20~40塩基長、20~35塩基長、20~30塩基長、20~25塩基長、15~30塩基長、15~29塩基長、15~28塩基長、15~27塩基長、15~26塩基長、15~25塩基長、15~24塩基長、15~23塩基長、15~22塩基長、15~21塩基長、15~20塩基長、15~19塩基長、15~18塩基長、16~30塩基長、16~29塩基長、16~28塩基長、16~27塩基長、16~26塩基長、16~25塩基長、16~24塩基長、16~23塩基長、16~22塩基長、16~21塩基長、16~20塩基長、16~19塩基長、16~18塩基長、17~30塩基長、17~29塩基長、17~28塩基長、17~27塩基長、17~26塩基長、17~25塩基長、17~24塩基長、17~23塩基長、17~22塩基長、17~21塩基長、17~20塩基長、17~19塩基長、17~18塩基長、18~30塩基長、18~29塩基長、18~28塩基長、18~27塩基長、18~26塩基長、18~25塩基長、18~24塩基長、18~23塩基長、18~22塩基長、18~21塩基長、18~20塩基長、18~19塩基長、19~30塩基長、19~29塩基長、19~28塩基長、19~27塩基長、19~26塩基長、19~25塩基長、19~24塩基長、19~23塩基長、19~22塩基長、19~21塩基長、19~20塩基長、20~30塩基長、20~29塩基長、20~28塩基長、20~27塩基長、20~26塩基長、20~25塩基長、20~24塩基長、20~23塩基長、20~22塩基長、20~21塩基長、5~25塩基長、5~24塩基長、5~23塩基長、5~22塩基長、5~21塩基長、5~20塩基長、5~19塩基長、5~18塩基長、5~17塩基長、5~16塩基長、5~15塩基長、5~14塩基長、5~13塩基長、5~12塩基長、7~25塩基長、7~24塩基長、7~23塩基長、7~22塩基長、7~21塩基長、7~20塩基長、7~19塩基長、7~18塩基長、7~17塩基長、7~16塩基長、7~15塩基長、7~14塩基長、7~13塩基長、7~12塩基長、9~25塩基長、9~24塩基長、9~23塩基長、9~22塩基長、9~21塩基長、9~20塩基長、9~19塩基長、9~18塩基長、9~17塩基長、9~16塩基長、9~15塩基長、9~14塩基長、9~13塩基長、9~12塩基長、10~25塩基長、10~24塩基長、10~23塩基長、10~22塩基長、10~21塩基長、10~20塩基長、10~19塩基長、10~18塩基長、10~17塩基長、10~16塩基長、10~15塩基長、10~14塩基長、10~13塩基長、10~12塩基長、60塩基長、59塩基長、58塩基長、57塩基長、56塩基長、55塩基長、54塩基長、53塩基長、52塩基長、51塩基長、50塩基長、49塩基長、48塩基長、47塩基長、46塩基長、45塩基長、44塩基長、43塩基長、42塩基長、41塩基長、40塩基長、39塩基長、38塩基長、37塩基長、36塩基長、35塩基長、34塩基長、33塩基長、32塩基長、31塩基長、30塩基長、29塩基長、28塩基長、27塩基長、26塩基長、25塩基長、24塩基長、23塩基長、22塩基長、21塩基長、20塩基長、19塩基長、18塩基長、17塩基長、16塩基長、15塩基長、14塩基長、13塩基長、12塩基長、11塩基長、10塩基長、9塩基長、8塩基長、7塩基長、6塩基長、又は5塩基長であってもよいが、これらに限定されるものではなく、上記の長さに1、2、又は3塩基長が加えられても減らされてもよい。
本発明のアンチセンスオリゴマーは、ヒトジストロフィンpre-mRNAにおける第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか2つ以上の番号順に連続するエクソンを同時にスキッピングさせる活性を有する。本明細書では、このような目的pre-mRNAからの2つ以上の番号順に連続するエクソンのスキッピングを「マルチエクソンスキッピング」又は「マルチスキッピング」と呼び、この活性を「マルチエクソンスキッピング活性」又は「マルチスキッピング活性」と呼ぶ。
ここで、第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか2つ以上の番号順に連続するエクソンとは、pre-mRNAに含まれる第45番目のエクソンから第55番目のエクソンの11個のエクソンのうち、エクソン番号が1ずつ増加する複数のエクソンを意味する。エクソン番号とは、ヒトジストロフィンpre-mRNAに含まれる79個のエクソンのうち、pre-mRNAの最も5’側に存在するエクソンを第1番目のエクソンと定め、5’側から3’側に順次存在するエクソンを順に第2番目、第3番目・・・第79番目と振り分けられる番号を意味する。なお、イントロンについては、その5’側に存在するエクソンと同じ番号となる。つまり、第45番目のイントロンは、その5’側に第45番目のエクソンが存在し、その3’側に第46番目のエクソンが存在する。また、本明細書において、「第n番目」のエクソン又はイントロンとは、pre-mRNAにおいて5’末端から3’末端に向けて数えてn番目のエクソン又はイントロンを意味する。
第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか2つ以上の番号順に連続するエクソンに含まれるエクソンの組み合わせを表4に示す。
表4に記載したエクソンの組み合わせの中、DMDへのより高い治療効果を発揮することが期待されるスキッピングパターンは、例えば、組み合わせ1、2、3、4、6、8、10、18、20、21、23、25、27、28、30、32、34、36、38、40、41、43、45、46、50、52、又は55である。これらの組み合わせでマルチエクソンスキッピングさせることにより、より多くのDMD患者に治療効果を発揮することが期待される。
また、第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか2つ以上の番号順に連続するエクソンは、連続するエクソン群を複数含んでもよく、限定されるものではないが、例えば(例1)エクソン45~46(第1のエクソン群)とエクソン48~53(第2のエクソン群)、(例2)エクソン46~47(第1のエクソン群)とエクソン49~50(第2のエクソン群)とエクソン52~54(第3のエクソン群)であってもよい。
本発明において「スキッピングさせる活性」(つまりマルチスキッピング活性)とは、ヒトジストロフィンpre-mRNAを例に挙げると、ヒトジストロフィンpre-mRNAにおける第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか2つ以上の番号順に連続するエクソンが欠失したヒトジストロフィンmRNAを生じさせる活性を意味する。
この活性は、言い換えれば、ヒトジストロフィンpre-mRNA上の標的部位に本発明のアンチセンスオリゴマーが結合することにより、該pre-mRNAがスプライシングを受けた際に、欠失するエクソンのすぐ上流のエクソンの3’末端のヌクレオチドに、欠失するエクソンのすぐ下流のエクソンの5’末端のヌクレオチドが連結し、コドンのフレームシフトが起こっていない成熟mRNA(すなわち、フレームシフトを起こさずにエクソンが欠失した成熟mRNA)が形成されることを意味する。
本発明のアンチセンスオリゴマーは生理的条件下でマルチスキッピング活性を示す。上記「生理的条件下」とは、生体内と類似のpH、塩組成、温度に調節された条件を意味する。例えば、25~40℃、好ましくは37℃、pH5~8、好ましくは、pH7.4であって、塩化ナトリウム濃度が150mMの条件が挙げられる。マルチスキッピングを誘導する際、本発明のアンチセンスオリゴマーは、1種又は複数種、例えば2、3、4、5、6、7、8、9又は10種のアンチセンスオリゴマーを組み合わせて用いることができる。
マルチスキッピングが生じたか否かは、ジストロフィン発現細胞(例えば、ヒト横紋筋肉腫細胞)に本発明のアンチセンスオリゴマーを導入し、前記ジストロフィン発現細胞の全RNAから、ヒトジストロフィン遺伝子のmRNAのエクソン45~55の周辺領域をRT-PCR増幅し、該PCR増幅産物に対してnested PCR又はシークエンス解析を行うことにより確認することができる。マルチスキッピング効率は、ヒトジストロフィン遺伝子のmRNAを被検細胞から回収し、該mRNAのうち、エクソン45~55のうちいずれか2つ以上の番号順に連続したエクソンがスキップしたバンドのポリヌクレオチド量「A」と、エクソン45~55のうちいずれか1つのエクソンがスキッピングしたバンドのポリヌクレオチド量「B」と、スキッピングが生じていないバンドのポリオリゴヌクレオチド量「C」とを測定し、これら「A」、「B」、及び「C」の測定値に基づき、以下の式に従って計算することができる。
スキッピング効率(%)=A/(A+B+C)×100
例えば、エクソン45~55のマルチスキッピング効率は、エクソン44に対するフォワードプライマーとエクソン56に対するリバースプライマーを用いて、エクソン45~55マルチスキップしたバンドのポリヌクレオチド量「A」を測定し、エクソン44に対するフォワードプライマーとエクソン46に対するリバースプライマーを用いて、エクソン45シングルスキップしたバンドのポリヌクレオチド量「B」を測定し、エクソン44に対するフォワードプライマーとエクソン46に対するリバースプライマーを用いてスキッピングが生じていないバンドのポリヌクレオチド量「C」を測定し、これら「A」、「B」、及び「C」の測定値に基づき、上記の式に従って計算することができる。
本発明のアンチセンスオリゴマーによりヒトジストロフィンmRNAにおいて欠失するエクソンの数は、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、又は11個である。これを欠失パターンと称するが、1回のスキッピング実験又はスキッピング治療で得られる結果で種々の欠失パターンが混在することもある。たとえば、ヒトジストロフィンpre-mRNAを発現する細胞に本発明のアンチセンスオリゴマーを導入し、そのmRNAを回収すると、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、又は11個のエクソンが欠失したmRNAが混在して得られることになる。
ある実施態様では「スキッピングさせる活性」は、以下の(C1)~(C10)として定義することができる。
(C1)ヒトジストロフィンpre-mRNAにおける第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか2個の番号順に連続するエクソンが、5%以上、10%以上、15%以上、20%以上、25%以上、30%以上、35%以上、40%以上、45%以上、50%以上、55%以上、60%以上、65%以上、70%以上、75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上の効率でスキッピングされる。
ここで前記2個の番号順に連続するエクソンは、第45番目及び第46番目のエクソン、第46番目及び第47番目のエクソン、第47番目及び第48番目のエクソン、第48番目及び第49番目のエクソン、第49番目及び第50番目のエクソン、第50番目及び第51番目のエクソン、第51番目及び第52番目のエクソン、第52番目及び第53番目のエクソン、第53番目及び第54番目のエクソン、又は第54番目及び第55番目のエクソンであってよい。
(C2)ヒトジストロフィンpre-mRNAにおける第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか3個の番号順に連続するエクソンが、5%以上、10%以上、15%以上、20%以上、25%以上、30%以上、35%以上、40%以上、45%以上、50%以上、55%以上、60%以上、65%以上、70%以上、75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上の効率でスキッピングされる。
ここで前記3個の番号順に連続するエクソンは、第45番目~第47番目のエクソン、第46番目~第48番目のエクソン、第47番目~第49番目のエクソン、第48番目~第50番目のエクソン、第49番目~第51番目のエクソン、第50番目~第52番目のエクソン、第51番目~第53番目のエクソン、第52番目~第54番目のエクソン、又は第53番目~第55番目のエクソンであってよい。
(C3)ヒトジストロフィンpre-mRNAにおける第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか4個の番号順に連続するエクソンが、5%以上、10%以上、15%以上、20%以上、25%以上、30%以上、35%以上、40%以上、45%以上、50%以上、55%以上、60%以上、65%以上、70%以上、75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上の効率でスキッピングされる。
ここで前記4個の番号順に連続するエクソンは、第45番目~第48番目のエクソン、第46番目~第49番目のエクソン、第47番目~第50番目のエクソン、第48番目~第51番目のエクソン、第49番目~第52番目のエクソン、第50番目~第53番目のエクソン、第51番目~第54番目のエクソン、又は第52番目~第55番目のエクソンであってよい。
(C4)ヒトジストロフィンpre-mRNAにおける第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか5個の番号順に連続するエクソンが、5%以上、10%以上、15%以上、20%以上、25%以上、30%以上、35%以上、40%以上、45%以上、50%以上、55%以上、60%以上、65%以上、70%以上、75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上の効率でスキッピングされる。
ここで前記5個の番号順に連続するエクソンは、第45番目~第49番目のエクソン、第46番目~第50番目のエクソン、第47番目~第51番目のエクソン、第48番目~第52番目のエクソン、第49番目~第53番目のエクソン、第50番目~第54番目のエクソン、又は第51番目~第55番目のエクソンであってよい。
(C5)ヒトジストロフィンpre-mRNAにおける第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか6個の番号順に連続するエクソンが、5%以上、10%以上、15%以上、20%以上、25%以上、30%以上、35%以上、40%以上、45%以上、50%以上、55%以上、60%以上、65%以上、70%以上、75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上の効率でスキッピングされる。
ここで前記6個の番号順に連続するエクソンは、第45番目~第50番目のエクソン、第46番目~第51番目のエクソン、第47番目~第52番目のエクソン、第48番目~第53番目のエクソン、第49番目~第54番目のエクソン、又は第50番目~第55番目のエクソンであってよい。
(C6)ヒトジストロフィンpre-mRNAにおける第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか7個の番号順に連続するエクソンが、5%以上、10%以上、15%以上、20%以上、25%以上、30%以上、35%以上、40%以上、45%以上、50%以上、55%以上、60%以上、65%以上、70%以上、75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上の効率でスキッピングされる。
ここで前記7個の番号順に連続するエクソンは、第45番目~第51番目のエクソン、第46番目~第52番目のエクソン、第47番目~第53番目のエクソン、第48番目~第54番目のエクソン、又は第49番目~第55番目のエクソンであってよい。
(C7)ヒトジストロフィンpre-mRNAにおける第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか8個の番号順に連続するエクソンが、5%以上、10%以上、15%以上、20%以上、25%以上、30%以上、35%以上、40%以上、45%以上、50%以上、55%以上、60%以上、65%以上、70%以上、75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上の効率でスキッピングされる。
ここで前記8個の番号順に連続するエクソンは、第45番目~第52番目のエクソン、第46番目~第53番目のエクソン、第47番目~第54番目のエクソン、又は第48番目~第55番目のエクソンであってよい。
(C8)ヒトジストロフィンpre-mRNAにおける第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか9個の番号順に連続するエクソンが、5%以上、10%以上、15%以上、20%以上、25%以上、30%以上、35%以上、40%以上、45%以上、50%以上、55%以上、60%以上、65%以上、70%以上、75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上の効率でスキッピングされる。
ここで前記9個の番号順に連続するエクソンは、第45番目~第53番目のエクソン、第46番目~第54番目のエクソン、又は第47番目~第55番目のエクソンであってよい。
(C9)ヒトジストロフィンpre-mRNAにおける第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか10個の番号順に連続するエクソンが、5%以上、10%以上、15%以上、20%以上、25%以上、30%以上、35%以上、40%以上、45%以上、50%以上、55%以上、60%以上、65%以上、70%以上、75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上の効率でスキッピングされる。
ここで前記10個の番号順に連続するエクソンは、第45番目~第54番目のエクソン、又は第46番目~第55番目のエクソンであってよい。
(C10)ヒトジストロフィンpre-mRNAにおける第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択される11個の番号順に連続するエクソンが、5%以上、10%以上、15%以上、20%以上、25%以上、30%以上、35%以上、40%以上、45%以上、50%以上、55%以上、60%以上、65%以上、70%以上、75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上の効率でスキッピングされる。
ここで前記11個の番号順に連続するエクソンは、第45番目~第55番目のエクソンである。
本発明のアンチセンスオリゴマーは10~60塩基長、10~55塩基長、10~50塩基長、10~45塩基長、10~40塩基長、10~35塩基長、10~30塩基長、10~25塩基長、15~60塩基長、15~55塩基長、15~50塩基長、15~45塩基長、15~40塩基長、15~35塩基長、15~30塩基長、15~25塩基長、16~60塩基長、16~55塩基長、16~50塩基長、16~45塩基長、16~40塩基長、16~35塩基長、16~30塩基長、16~25塩基長、17~60塩基長、17~55塩基長、17~50塩基長、17~45塩基長、17~40塩基長、17~35塩基長、17~30塩基長、17~25塩基長、18~60塩基長、18~55塩基長、18~50塩基長、18~45塩基長、18~40塩基長、18~35塩基長、18~30塩基長、18~25塩基長、19~60塩基長、19~55塩基長、19~50塩基長、19~45塩基長、19~40塩基長、19~35塩基長、19~30塩基長、19~25塩基長、20~60塩基長、20~55塩基長、20~50塩基長、20~45塩基長、20~40塩基長、20~35塩基長、20~30塩基長、20~25塩基長、15~30塩基長、15~29塩基長、15~28塩基長、15~27塩基長、15~26塩基長、15~25塩基長、15~24塩基長、15~23塩基長、15~22塩基長、15~21塩基長、15~20塩基長、15~19塩基長、15~18塩基長、16~30塩基長、16~29塩基長、16~28塩基長、16~27塩基長、16~26塩基長、16~25塩基長、16~24塩基長、16~23塩基長、16~22塩基長、16~21塩基長、16~20塩基長、16~19塩基長、16~18塩基長、17~30塩基長、17~29塩基長、17~28塩基長、17~27塩基長、17~26塩基長、17~25塩基長、17~24塩基長、17~23塩基長、17~22塩基長、17~21塩基長、17~20塩基長、17~19塩基長、17~18塩基長、18~30塩基長、18~29塩基長、18~28塩基長、18~27塩基長、18~26塩基長、18~25塩基長、18~24塩基長、18~23塩基長、18~22塩基長、18~21塩基長、18~20塩基長、18~19塩基長、19~30塩基長、19~29塩基長、19~28塩基長、19~27塩基長、19~26塩基長、19~25塩基長、19~24塩基長、19~23塩基長、19~22塩基長、19~21塩基長、19~20塩基長、20~30塩基長、20~29塩基長、20~28塩基長、20~27塩基長、20~26塩基長、20~25塩基長、20~24塩基長、20~23塩基長、20~22塩基長、20~21塩基長、60塩基長、59塩基長、58塩基長、57塩基長、56塩基長、55塩基長、54塩基長、53塩基長、52塩基長、51塩基長、50塩基長、49塩基長、48塩基長、47塩基長、46塩基長、45塩基長、44塩基長、43塩基長、42塩基長、41塩基長、40塩基長、39塩基長、38塩基長、37塩基長、36塩基長、35塩基長、34塩基長、33塩基長、32塩基長、31塩基長、30塩基長、29塩基長、28塩基長、27塩基長、26塩基長、25塩基長、24塩基長、23塩基長、22塩基長、21塩基長、20塩基長、19塩基長、18塩基長、17塩基長、16塩基長、15塩基長、14塩基長、13塩基長、12塩基長、11塩基長、又は10塩基長であってもよいが、これらに限定されるものではなく、上記の長さに1、2、又は3塩基長が加えられても減らされてもよい。
本発明のアンチセンスオリゴマーの一態様は、複数のユニットオリゴマーが相互に連結した構成を有する連結型アンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物である(以下、「本発明の連結型アンチセンスオリゴマー」という)。ユニットオリゴマーとは、本発明の連結型アンチセンスオリゴマーを構成する各オリゴマーを意味する。つまり、本発明の連結型アンチセンスオリゴマーがヒトジストロフィンpre-mRNA上の標的塩基配列に結合する際に、連続する塩基配列を有する標的塩基配列とハイブリダイゼーションを生じる塩基配列を含む部分(ユニット)を意味する。
具体的には、本発明の連結型アンチセンスオリゴマーは、
2つ以上のユニットオリゴマーが連結したアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物であって、
前記各々のユニットオリゴマーは、前記領域R1~R24(野生型である配列番号233~256、341~369、及び385~389に示される領域並びにその変異型も含まれ得る)からなる群より選択されるいずれか1つの領域の塩基配列又はその一部の塩基配列に相補的な塩基配列を含み、かつ各々のユニットオリゴマーの塩基配列は連続又は互いに重複するものではないアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物である。
ユニットオリゴマーは、ハイブリダイゼーションに寄与しないリンカーを介して連結していてもよく、あるいはリンカーを介さずに直接連結していてもよい。ユニットオリゴマー同士が直接連結する場合、5’末端側に位置するユニットの3’末端と、3’末端側に位置するユニットの5’末端とがリン酸結合又は以下のいずれかの基を形成する。
(式中、Xは、-OH、-CH、-O-CH、-S-CH、-NR、又はFを表し;
は、H、アルキルを表し;
及びRは、同一又は異なって、H、アルキル、シクロアルキル、又はアリールを表し;
は、O、S、CH、又はNRを表し;
は、O、S、又はNRを表し;
Zは、O又はSを表す。)
本発明の連結型アンチセンスオリゴマーでは、各ユニットオリゴマーは、領域R1~R24の中、別々の領域に含まれる塩基配列を標的としてもよいし、同一の領域に含まれる塩基配列を標的としてもよい。また、本発明の連結型アンチセンスオリゴマーは、各々のユニットオリゴマーの塩基配列は連続又は互いに重複するものではない。各々のユニットオリゴマーの塩基配列が連続するものではないというのは、本発明の連結型アンチセンスオリゴマーを構成する各ユニットオリゴマーの標的塩基配列がヒトジストロフィンpre-mRNA上の塩基配列として連続していないことを意味する。したがって、各ユニットオリゴマーの標的塩基配列をヒトジストロフィンpre-mRNAの塩基配列と対比すると、前記標的塩基配列の間にはヒトジストロフィンpre-mRNAの塩基配列として少なくとも1塩基が介在する。一方、各々のユニットオリゴマーの塩基配列が互いに重複するものではないとは、ユニットオリゴマーの標的塩基配列がヒトジストロフィンpre-mRNA上の塩基配列として重複していないことを意味する。各々のユニットオリゴマーの塩基配列中に偶然に1、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10塩基程度の一致が存在することは許容される。
本発明の連結型アンチセンスオリゴマーは、前記各々のユニットオリゴマーが、
(D1)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列、
(D2)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
(D3)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列に相補的な塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列、又は
(D4)前記(D1)、(D2)、及び(D3)からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列の一部の塩基配列
に相補的な塩基配列を含み、かつ各々のユニットオリゴマーの塩基配列は連続又は互いに重複するものではない構成を有していてもよい。
本発明の連結型アンチセンスオリゴマーは上記のとおり、(D1)、(D2)、(D3)、及び(D4)からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列に相補的な塩基配列を含みうる。(D2)の塩基配列は、前記(D1)の塩基配列の変異体であり、その例として、
(D2-1)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
(D2-2)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と86%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±14%以内の長さを有する塩基配列、
(D2-3)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と87%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±13%以内の長さを有する塩基配列、
(D2-4)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と88%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±12%以内の長さを有する塩基配列、
(D2-5)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と89%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±11%以内の長さを有する塩基配列、
(D2-6)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と90%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±10%以内の長さを有する塩基配列、
(D2-7)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と91%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±9%以内の長さを有する塩基配列、
(D2-8)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と92%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±8%以内の長さを有する塩基配列、
(D2-9)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と93%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±7%以内の長さを有する塩基配列、
(D2-10)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と94%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±6%以内の長さを有する塩基配列、
(D2-11)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と95%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±5%以内の長さを有する塩基配列、
(D2-12)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と96%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±4%以内の長さを有する塩基配列、
(D2-13)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と97%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±3%以内の長さを有する塩基配列、
(D2-14)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と98%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±2%以内の長さを有する塩基配列、
(D2-15)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±1%以内の長さを有する塩基配列、及び(D2-16)配列番号233~256、341~369、及び385~389からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99.5%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±0.5%以内の長さを有する塩基配列、
も挙げられる。
したがって、本発明の連結型アンチセンスオリゴマーを構成する前記各々のユニットオリゴマーは、前記(D1)、(D2-1)~(D2-16)、(D3)、及び(D4)からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列に相補的な塩基配列を含みうる。
また、本発明の連結型アンチセンスオリゴマーは上記のとおり、(D1)、(D2)、(D3)、及び(D4)からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列に相補的な塩基配列を含みうる。塩基配列(D4)は、前記(D1)、(D2)、及び(D3)からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列の一部の塩基配列に関する。(D4)に関し、「その一部」とは、(D1)、(D2)、又は(D3)の全長を除く、連続する部分領域を意味する。部分領域の長さは、5~25塩基長であり、5~24塩基長、5~23塩基長、5~22塩基長、5~21塩基長、5~20塩基長、5~19塩基長、5~18塩基長、5~17塩基長、5~16塩基長、5~15塩基長、5~14塩基長、5~13塩基長、5~12塩基長、7~25塩基長、7~24塩基長、7~23塩基長、7~22塩基長、7~21塩基長、7~20塩基長、7~19塩基長、7~18塩基長、7~17塩基長、7~16塩基長、7~15塩基長、7~14塩基長、7~13塩基長、7~12塩基長、9~25塩基長、9~24塩基長、9~23塩基長、9~22塩基長、9~21塩基長、9~20塩基長、9~19塩基長、9~18塩基長、9~17塩基長、9~16塩基長、9~15塩基長、9~14塩基長、9~13塩基長、9~12塩基長、10~25塩基長、10~24塩基長、10~23塩基長、10~22塩基長、10~21塩基長、10~20塩基長、10~19塩基長、10~18塩基長、10~17塩基長、10~16塩基長、10~15塩基長、10~14塩基長、10~13塩基長、10~12塩基長、25塩基長、24塩基長、23塩基長、22塩基長、21塩基長、20塩基長、19塩基長、18塩基長、17塩基長、16塩基長、15塩基長、14塩基長、13塩基長、12塩基長、11塩基長、10塩基長、9塩基長、8塩基長、7塩基長、6塩基長、5塩基長であってもよいが、これらに限定されるものではなく、上記の長さに1、2、又は3塩基長が加えられても減らされてもよい。
各ユニットオリゴマーのサイズは、5~30塩基長であり、5~29塩基長、5~28塩基長、5~27塩基長、5~26塩基長、5~25塩基長、5~24塩基長、5~23塩基長、5~22塩基長、5~21塩基長、5~20塩基長、5~19塩基長、5~18塩基長、5~17塩基長、5~16塩基長、5~15塩基長、5~14塩基長、5~13塩基長、5~12塩基長、7~30塩基長、7~29塩基長、7~28塩基長、7~27塩基長、7~26塩基長、7~25塩基長、7~24塩基長、7~23塩基長、7~22塩基長、7~21塩基長、7~20塩基長、7~19塩基長、7~18塩基長、7~17塩基長、7~16塩基長、7~15塩基長、7~14塩基長、7~13塩基長、7~12塩基長、9~30塩基長、9~29塩基長、9~28塩基長、9~27塩基長、9~26塩基長、9~25塩基長、9~24塩基長、9~23塩基長、9~22塩基長、9~21塩基長、9~20塩基長、9~19塩基長、9~18塩基長、9~17塩基長、9~16塩基長、9~15塩基長、9~14塩基長、9~13塩基長、9~12塩基長、10~30塩基長、10~29塩基長、10~28塩基長、10~27塩基長、10~26塩基長、10~25塩基長、10~24塩基長、10~23塩基長、10~22塩基長、10~21塩基長、10~20塩基長、10~19塩基長、10~18塩基長、10~17塩基長、10~16塩基長、10~15塩基長、10~14塩基長、10~13塩基長、10~12塩基長、30塩基長、29塩基長、28塩基長、27塩基長、26塩基長、25塩基長、24塩基長、23塩基長、22塩基長、21塩基長、20塩基長、19塩基長、18塩基長、17塩基長、16塩基長、15塩基長、14塩基長、13塩基長、12塩基長、11塩基長、10塩基長、9塩基長、8塩基長、7塩基長、6塩基長、5塩基長であってもよいが、これらに限定されるものではなく、上記の長さに1、2、又は3塩基長が加えられても減らされてもよい。各ユニットオリゴマーのサイズは同じであってもよく、異なっていてもよい。
ある態様では、本発明の連結型アンチセンスオリゴマーは、
(E1)配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列、又は
(E2)配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
からなるアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物であってもよい。
ここで、(E2)の塩基配列は、(E1)の塩基配列の変異型であるが、変異型としては、
(E2-1)配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
(E2-2)配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と86%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±14%以内の長さを有する塩基配列、
(E2-3)配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と87%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±13%以内の長さを有する塩基配列、
(E2-4)配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と88%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±12%以内の長さを有する塩基配列、
(E2-5)配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と89%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±11%以内の長さを有する塩基配列、
(E2-6)配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と90%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±10%以内の長さを有する塩基配列、
(E2-7)配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と91%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±9%以内の長さを有する塩基配列、
(E2-8)配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と92%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±8%以内の長さを有する塩基配列、
(E2-9)配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と93%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±7%以内の長さを有する塩基配列、
(E2-10)配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と94%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±6%以内の長さを有する塩基配列、
(E2-11)配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と95%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±5%以内の長さを有する塩基配列、
(E2-12)配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と96%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±4%以内の長さを有する塩基配列、
(E2-13)配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と97%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±3%以内の長さを有する塩基配列、
(E2-14)配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と98%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±2%以内の長さを有する塩基配列、
(E2-15)配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±1%以内の長さを有する塩基配列、及び
(E2-16)配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99.5%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±0.5%以内の長さを有する塩基配列、も挙げられる。
したがって、本発明の連結型アンチセンスオリゴマーは、前記(E1)及び(E2-1)~(E2-16)からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなるものであってもよい。
好ましくは、本発明の連結型アンチセンスオリゴマーは、配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列を含む。また、ある態様では本発明の連結型アンチセンスオリゴマーは配列番号18~21、80~111、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなる。
さらに、本発明のアンチセンスオリゴマーは、
(E’1)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列、又は
(E’2)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
からなるアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物であってもよい。
ここで、(E’2)の塩基配列は、(E’1)の塩基配列の変異型であるが、変異型としては、
(E’2-1)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
(E’2-2)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と86%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±14%以内の長さを有する塩基配列、
(E’2-3)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と87%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±13%以内の長さを有する塩基配列、
(E’2-4)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と88%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±12%以内の長さを有する塩基配列、
(E’2-5)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と89%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±11%以内の長さを有する塩基配列、
(E’2-6)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と90%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±10%以内の長さを有する塩基配列、
(E’2-7)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と91%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±9%以内の長さを有する塩基配列、
(E’2-8)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と92%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±8%以内の長さを有する塩基配列、
(E’2-9)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と93%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±7%以内の長さを有する塩基配列、
(E’2-10)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と94%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±6%以内の長さを有する塩基配列、
(E’2-11)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と95%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±5%以内の長さを有する塩基配列、
(E’2-12)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と96%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±4%以内の長さを有する塩基配列、
(E’2-13)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と97%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±3%以内の長さを有する塩基配列、
(E’2-14)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と98%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±2%以内の長さを有する塩基配列、
(E’2-15)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±1%以内の長さを有する塩基配列、及び(E’2-16)配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99.5%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±0.5%以内の長さを有する塩基配列、
も挙げられる。
したがって、本発明のアンチセンスオリゴマーは、前記(E’1)及び(E’2-1)~(E’2-16)からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなるものであってもよい。
好ましくは、本発明のアンチセンスオリゴマーは、配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列を含む。また、ある態様では本発明のアンチセンスオリゴマーは配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなる。
ある態様では、本発明のアンチセンスオリゴマーは、
(E’’1)配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列、又は
(E’’2)配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
からなるアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物であってもよい。
ここで、(E’’2)の塩基配列は、(E’’1)の塩基配列の変異型であるが、変異型としては、
(E’’2-1)配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’2-2)配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と86%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±14%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’2-3)配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と87%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±13%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’2-4)配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と88%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±12%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’2-5)配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と89%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±11%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’2-6)配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と90%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±10%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’2-7)配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と91%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±9%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’2-8)配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と92%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±8%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’2-9)配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と93%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±7%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’2-10)配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と94%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±6%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’2-11)配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と95%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±5%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’2-12)配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と96%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±4%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’2-13)配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と97%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±3%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’2-14)配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と98%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±2%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’2-15)配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±1%以内の長さを有する塩基配列、及び
(E’’2-16)配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99.5%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±0.5%以内の長さを有する塩基配列、
も挙げられる。
したがって、本発明のアンチセンスオリゴマーは、前記(E’’1)及び(E’’2-1)~(E’’2-16)からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなるものであってもよい。
ある態様では、本発明のアンチセンスオリゴマーは、
(E’’’1)配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列、又は
(E’’’2)配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
からなるアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物であってもよい。
ここで、(E’’’2)の塩基配列は、(E’’’1)の塩基配列の変異型であるが、変異型としては、
(E’’’2-1)配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’’2-2)配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と86%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±14%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’’2-3)配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と87%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±13%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’’2-4)配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と88%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±12%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’’2-5)配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と89%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±11%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’’2-6)配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と90%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±10%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’’2-7)配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と91%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±9%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’’2-8)配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と92%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±8%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’’2-9)配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と93%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±7%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’’2-10)配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と94%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±6%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’’2-11)配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と95%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±5%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’’2-12)配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と96%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±4%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’’2-13)配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と97%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±3%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’’2-14)配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と98%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±2%以内の長さを有する塩基配列、
(E’’’2-15)配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±1%以内の長さを有する塩基配列、及び
(E’’’2-16)配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99.5%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±0.5%以内の長さを有する塩基配列、
も挙げられる。
したがって、本発明のアンチセンスオリゴマーは、前記(E’’’1)及び(E’’’2-1)~(E’’’2-16)からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなるものであってもよい。
好ましくは、本発明のアンチセンスオリゴマーは、配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列を含むアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物である。また、ある態様では本発明のアンチセンスオリゴマーは配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなるアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物である。
さらに好ましくは、本発明のアンチセンスオリゴマーは、配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列を含むアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物である。また、ある態様では本発明のアンチセンスオリゴマーは配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなるアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物である。
また、ある態様では本発明の連結型アンチセンスオリゴマーは配列番号80、82、86、92、97、98、100、102、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列を含むアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物である。また、ある態様では、本発明の連結型アンチセンスオリゴマーは配列番号80、82、86、92、97、98、100、102、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなる。さらに好ましくは、本発明の連結型アンチセンスオリゴマーは配列番号102、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列を含む。また、ある態様では、本発明の連結型アンチセンスオリゴマーは配列番号102、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなるアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物である。
本発明のアンチセンスオリゴマーは、領域R1~R24からなる群より選択される少なくともいずれか1つの領域の塩基配列又はその一部の塩基配列に相補的な塩基配列を含む。領域R1~R24に含まれるそれぞれの領域の塩基配列又はその一部の塩基配列に相補的な塩基配列として、上記(E1)及び(E2-1)~(E2-16)からなる群、(E’1)及び(E’2-1)~(E’2-16)からなる群、(E’’1)及び(E’’2-1)~(E’’2-16)からなる群、又は(E’’’1)及び(E’’’2-1)~(E’’’2-16)からなる群から選択されるいずれかの塩基配列を選択することもできる。例えば、領域R1~R24の塩基配列又はその一部の塩基配列に相補的な塩基配列として、領域R4~R24についてはそれぞれの領域の塩基配列又はその一部の塩基配列に相補的な塩基配列とし、領域R1~R3については(E1)及び(E2-1)~(E2-16)からなる群より選択される塩基配列であって、R1~R3の領域に含まれる塩基配列とすることもできる。
本発明のアンチセンスオリゴマー(本発明の連結型アンチセンスオリゴマーを含む)は、オリゴヌクレオチド、モルホリノオリゴマー、又はペプチド核酸(Peptide Nucleic Acid:PNA)オリゴマーであってもよい(以下、それぞれを、「本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド」、「本発明のアンチセンスモルホリノオリゴマー」、又は「本発明のアンチセンスペプチド核酸オリゴマー」ともいう。)。
本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、ヌクレオチドを構成単位とするアンチセンスオリゴマーであり、かかるヌクレオチドは、リボヌクレオチド、デオキシリボヌクレオチド、又は修飾ヌクレオチドのいずれであってもよい。
修飾ヌクレオチドとは、リボヌクレオチド又はデオキシリボヌクレオチドを構成する核酸塩基、糖部分、及びリン酸結合部分の全部又は一部が修飾されているものをいう。
核酸塩基としては、例えば、アデニン、グアニン、ヒポキサンチン、シトシン、チミン、ウラシル、又はそれらの修飾塩基を挙げることができる。かかる修飾塩基としては、例えば、シュードウラシル、3-メチルウラシル,ジヒドロウラシル、5-アルキルシトシン(例えば、5-メチルシトシン)、5-アルキルウラシル(例えば、5-エチルウラシル)、5-ハロウラシル(例えば、5-ブロモウラシル)、6-アザピリミジン、6-アルキルピリミジン(例えば、6-メチルウラシル)、2-チオウラシル、4-チオウラシル、4-アセチルシトシン、5-(カルボキシヒドロキシメチル)ウラシル、5-カルボキシメチルアミノメチル-2-チオウラシル、5-カルボキシメチルアミノメチルウラシル、1-メチルアデニン、1-メチルヒポキサンチン、2,2-ジメチルグアニン、3-メチルシトシン、2-メチルアデニン、2-メチルグアニン、N6-メチルアデニン、7-メチルグアニン、5-メトキシアミノメチル-2-チオウラシル、5-メチルアミノメチルウラシル、5-メチルカルボニルメチルウラシル、5-メチルオキシウラシル、5-メチル-2-チオウラシル、2-メチルチオ-N6-イソペンテニルアデニン、ウラシル-5-オキシ酢酸、2-チオシトシン、プリン、2,6-ジアミノプリン、2-アミノプリン、イソグアニン、インドール、イミダゾール、キサンチン等が挙げられるが、これらに限定されるものではない。
糖部分の修飾としては、例えば、リボースの2’位の修飾及び糖のその他の部分の修飾を挙げることができる。リボースの2’位の修飾としては、例えば、リボースの2’位の-OH基を-OR、-R、-R’OR、-SH、-SR、-NH、-NHR、-NR、-N、-CN、-F、-Cl、-Br、-Iに置換する修飾を挙げることができる。ここで、Rはアルキル又はアリールを表す。R’はアルキレンを表す。
糖のその他の部分の修飾としては、例えば、リボース又はデオキシリボースの4’位のOをSに置換したもの、糖の2’位と4’位を架橋したもの、例えば、LNA(Locked Nucleic Acid)又はENA(2'-O,4'-C-Ethylene-bridged Nucleic Acids)などが挙げられるが、これらに限定されるものではない。
リン酸結合部分の修飾としては、例えば、ホスホジエステル結合をホスホロチオエート結合、ホスホロジチオエート結合、アルキルホスホネート結合、ホスホロアミデート結合、ボラノフォスフェート結合(例えば、Enya et al: Bioorganic & Medicinal Chemistry,2008, 18, 9154-9160を参照)に置換する修飾を挙げることができる(例えば、再公表特許公報第2006/129594号及び再公表特許公報第2006/038608号を参照)。
本明細書において、アルキルとしては、直鎖状又は分枝鎖状の炭素数1~6のアルキルが好ましい。具体的には、例えば、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、n-ブチル、イソブチル、sec-ブチル、tert-ブチル、n-ペンチル、イソペンチル、ネオペンチル、tert-ペンチル、n-ヘキシル、イソヘキシルが挙げられる。当該アルキルは置換されていてもよく、かかる置換基としては、例えば、ハロゲン、アルコキシ、シアノ、ニトロを挙げることができ、これらで1~3個置換されていてもよい。
本明細書において、シクロアルキルとしては、炭素数3~12のシクロアルキルが好ましい。具体的には、例えば、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル、シクロデシル、シクロドデシルが挙げられる。
本明細書において、ハロゲンとしては、フッ素、塩素、臭素、ヨウ素を挙げることができる。
本明細書において、アルコキシとしては、直鎖状又は分枝鎖状の炭素数1~6のアルコキシ、例えば、メトキシ、エトキシ、n-プロポキシ、イソプロポキシ、n-ブトキシ、イソブトキシ、sec-ブトキシ、tert-ブトキシ、n-ペンチルオキシ、イソペンチルオキシ、n-ヘキシルオキシ、イソヘキシルオキシ等を挙げることができる。とりわけ、炭素数1~3のアルコキシが好ましい。
本明細書において、アリールとしては、炭素数6~10のアリールが好ましい。具体的には、例えば、フェニル、α-ナフチル、β-ナフチルを挙げることができる。とりわけフェニルが好ましい。当該アリールは置換されていてもよく、かかる置換基としては、例えば、アルキル、ハロゲン、アルコキシ、シアノ、ニトロを挙げることができ、これらが1~3個置換されていてもよい。
本明細書において、アルキレンとしては、直鎖状又は分枝鎖状の炭素数1~6のアルキレンが好ましい。具体的には、例えば、メチレン、エチレン、トリメチレン、テトラメチレン、ペンタメチレン、ヘキサメチレン、2-(エチル)トリメチレン、1-(メチル)テトラメチレンを挙げることができる。
本明細書において、アシルとしては、直鎖状若しくは分枝鎖状のアルカノイル又はアロイルを挙げることができる。アルカノイルとしては、例えば、ホルミル、アセチル、2-メチルアセチル、2,2-ジメチルアセチル、プロピオニル、ブチリル、イソブチリル、ペンタノイル、2,2-ジメチルプロピオニル、ヘキサノイル等が挙げられる。アロイルとしては、例えば、ベンゾイル、トルオイル、ナフトイルを挙げることができる。かかるアロイルは置換可能な位置において置換されていてもよく、アルキルで置換されていてもよい。
本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、好ましくは、リボースの2’位の-OH基がメトキシで置換され、リン酸結合部分がホスホロチオエート結合である、下記一般式で表される基を構成単位とする本発明のアンチセンスオリゴマーである。
(式中、Baseは、核酸塩基を表す。)
本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、各種自動合成装置(例えば、AKTA oligopilot plus 10 / 100(GE Healthcare))を用いて容易に合成することが可能であり、あるいは、第三者機関(例えば、Promega社又はTakara社)等に委託して作製することもできる。
本発明のアンチセンスモルホリノオリゴマーは、下記一般式で表される基を構成単位とするアンチセンスオリゴマーである。
(式中、Baseは、前記と同義であり;
Wは、以下のいずれかの式で表わされる基を表す。
(式中、Xは、-CH、-O-CH、-S-CH、-NR、又はFを表し;
は、H、アルキルを表し;
及びRは、同一又は異なって、H、アルキル、シクロアルキル、又はアリールを表し;
は、O、S、CH、又はNRを表し;
は、O、S、又はNRを表し;
Zは、O又はSを表す。))
本発明のアンチセンスモルホリノオリゴマーを合成するのに用いるモルホリノモノマー化合物の例としては、表5に示すモルホリノモノマー化合物(A)、モルホリノモノマー化合物(C)、モルホリノモノマー化合物(T)、及びモルホリノモノマー化合物(G)が挙げられるがこれらに限定されるものではない。
本発明において、モルホリノオリゴマーは、好ましくは、以下の式で表わされる基を構成単位とするオリゴマー(ホスホロジアミデートモルホリノオリゴマー(以下、「PMO」という))である。
(式中、Base、R、Rは、前記と同義である。)
モルホリノオリゴマーは、例えば、国際公開公報第1991/009033号、又は国際公開公報第2009/064471号に記載の方法に従って製造することができる。特に、PMOは、国際公開公報第2009/064471号、又は国際公開公報第2013/100190号に記載の方法に従って製造することができる。
本発明のアンチセンスペプチド核酸オリゴマーは、下記一般式で表される基を構成単位とするアンチセンスオリゴマーである。
(式中、Baseは、前記と同義である。)
ペプチド核酸オリゴマーは、例えば、以下の文献に従って製造することができる。
1)P. E. Nielsen, M. Egholm, R. H. Berg, O. Buchardt,Science, 254, 1497 (1991)2)M. Egholm, O. Buchardt, P. E. Nielsen, R. H. Berg,JACS, 114, 1895 (1992)3)K. L. Dueholm, M. Egholm, C. Behrens, L. Christensen, H. F. Hansen, T. Vulpius, K. H. Petersen, R. H. Berg, P. E. Nielsen, O. Buchardt,J. Org. Chem., 59, 5767 (1994)
4)L. Christensen, R. Fitzpatrick, B. Gildea, K. H. Petersen, H. F. Hansen, T. Koch, M. Egholm,O. Buchardt, P. E. Nielsen, J. Coull, R. H. Berg, J. Pept. Sci., 1, 175 (1995)5)T. Koch, H. F. Hansen, P. Andersen, T. Larsen, H. G. Batz, K. Otteson, H. Orum, J. Pept. Res., 49, 80 (1997)
本発明のアンチセンスオリゴマー(本発明の連結型アンチセンスオリゴマーを含む)は、その医薬的に許容可能な塩の形態、水和物の形態、又は医薬的に許容可能な塩の水和物の形態であってもよい。
本発明のアンチセンスオリゴマーの医薬的に許容可能な塩の例としては、ナトリウム塩、カリウム塩、リチウム塩のようなアルカリ金属塩、カルシウム塩、マグネシウム塩のようなアルカリ土類金属塩;アルミニウム塩、鉄塩、亜鉛塩、銅塩、ニッケル塩、コバルト塩などの金属塩;アンモニウム塩;t-オクチルアミン塩、ジベンジルアミン塩、モルホリン塩、グルコサミン塩、フェニルグリシンアルキルエステル塩、エチレンジアミン塩、N-メチルグルカミン塩、グアニジン塩、ジエチルアミン塩、トリエチルアミン塩、ジシクロヘキシルアミン塩、N,N’-ジベンジルエチレンジアミン塩、クロロプロカイン塩、プロカイン塩、ジエタノールアミン塩、N-ベンジル-フェネチルアミン塩、ピペラジン塩、テトラメチルアンモニウム塩、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン塩のような有機アミン塩;弗化水素酸塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、沃化水素酸塩のようなハロゲン化水素酸塩;硝酸塩、過塩素酸塩、硫酸塩、リン酸塩などの無機酸塩;メタンスルホン酸塩、トリフルオロメタンスルホン酸塩、エタンスルホン酸塩のような低級アルカンスルホン酸塩;ベンゼンスルホン酸塩、p-トルエンスルホン酸塩のようなアリールスルホン酸塩;酢酸塩、りんご酸塩、フマール酸塩、コハク酸塩、クエン酸塩、酒石酸塩、シュウ酸塩、マレイン酸塩などの有機酸塩;グリシン塩、リジン塩、アルギニン塩、オルニチン塩、グルタミン酸塩、アスパラギン酸塩のようなアミノ酸塩などが挙げられる。これらの塩は、公知の方法で製造することができる。あるいは、本発明のアンチセンスオリゴマーは、その水和物の形態にあってもよい。
2.サプレッサーアンチセンスオリゴマー
本発明の別の態様において、エクソンが単一でスキッピングすること(以下、「シングルスキッピング」という)を抑制する、サプレッサーアンチセンスオリゴマーを提供する。サプレッサーアンチセンスオリゴマーは、シングルスキッピングを抑制することにより、アンチセンスオリゴマーによるマルチエクソンスキッピングの効果を高めることができる。シングルスキッピングは、複数のエクソンを同時にスキッピングさせるのではなく、1つのエクソンのみがスキッピングされることに関する。
具体的には、本発明は、ヒトジストロフィンpre-mRNAの第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか1つのエクソンが単一でスキッピングすることを抑制するサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物を提供する。以下、前記サプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物を総じて「本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマー」ともいう。本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーは、前記サプレッサーアンチセンスオリゴマー、その医薬的に許容可能な塩、若しくはそれらの水和物のそれぞれを指す場合もある。
本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーは、ヒトジストロフィンpre-mRNA上のスプライシングサイレンサー配列、ブランチ部位配列、又はスプライス部位配列の部位を標的してスプライシングを阻害することで、シングルスキッピングを抑制する。本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーにより、対照と比較して、対象となるエクソンのシングルスキッピングの効率が低下する。
例えば、第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか1つのエクソンが単一でスキッピングすることを抑制するサプレッサーアンチセンスオリゴマーは、第44番目から第56番目のいずれかのエクソンのスプライシングサイレンサー配列、あるいは第44番目から第55番目のいずれかのイントロンのスプライシングサイレンサー配列、ブランチ部位配列、又はスプライス部位配列を標的とする。
本明細書において、スプライシングサイレンサー配列は、エクソンの認識を抑制する働きを有するpre-mRNA上の塩基配列要素である。スプライシングサイレンサー配列としては、例えば、heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1(hnRNP A1)、hnRNP A2/B1、DAZAP1、hnRNP I、Fox-1、Fox-2、hnRNP H1、hnRNP H2、hnRNP H3、hnRNP L、Sam68、SRp40等のタンパク質又はタンパク質複合体の認識配列等が挙げられる。
本明細書において、スプライス部位は、エクソンとイントロンの境界である。スプライス部位は、イントロンの5’末端がGU、AU等で始まり、イントロンの3’末端がAG、AC等で終わることから、推定することができる。
本明細書において、ブランチ部位は、スプライシング反応中に5’スプライス部位を攻撃し、共有結合するイントロン中の配列である。ブランチ部位配列とは、ブランチ部位を含むイントロン中の塩基配列を指す。
本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーの標的(以下、「サプレッサー配列」という)となるスプライシングサイレンサー配列、ブランチ部位配列、又はスプライス部位配列としては、例えば、以下の塩基配列(配列番号370~384及び390)が挙げられる。また、サプレッサー配列、ブランチ部位配列、及びスプライス部位配列の位置は、SpliceAid(Francesco Piva et al., Bioinformatics, 25(9), 1211-1213, 2009)、SpliceAid-2(Francesco Piva et al., Human Mutation, 33(1), 81-85, 2012)、SpliceAid-F(Matteo Giulietti et al., Nucleic Acids Res., 41, D125-D131, 2012)、ATtRACT-a(Girolamo Giudice et al., Database (Oxford), baw035, 2016)、SROOGLE(Schraga Schwartz et al., Nucleic Acids Res., 37, W189-W192, 2009)、Reg RNA(Hsi-Yuan Huang et al., Nucleic Acids Res., 34, W429-W434, 2006)、Reg RNA 2.0(Tzu-Hao Chang et al., BMC bioinformatics, 14(Suppl 2), S4, 2013)、Human Splicing Finder(Francois-Olivier Desmet et al., Nucleic Acids Res., 37, 9, e67, 2009)、SVM-BPfinder(Andre Corvelo et al., PLoS Comput Biol., 6, 11, e1001016, 2010)等のソフトウェアを使用して検出することができる。
ここで、スプライシングサイレンサー配列の具体例としては、配列番号370~382が挙げられる。また、配列番号370~382の変異体として、
(F1)配列番号370~382からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
(F2)配列番号370~382からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と86%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±14%以内の長さを有する塩基配列、
(F3)配列番号370~382からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と87%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±13%以内の長さを有する塩基配列、
(F4)配列番号370~382からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と88%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±12%以内の長さを有する塩基配列、
(F5)配列番号370~382からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と89%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±11%以内の長さを有する塩基配列、
(F6)配列番号370~382からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と90%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±10%以内の長さを有する塩基配列、
(F7)配列番号370~382からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と91%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±9%以内の長さを有する塩基配列、
(F8)配列番号370~382からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と92%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±8%以内の長さを有する塩基配列、
(F9)配列番号370~382からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と93%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±7%以内の長さを有する塩基配列、
(F10)配列番号370~382からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と94%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±6%以内の長さを有する塩基配列、
(F11)配列番号370~382からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と95%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±5%以内の長さを有する塩基配列、
(F12)配列番号370~382からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と96%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±4%以内の長さを有する塩基配列、
(F13)配列番号370~382からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と97%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±3%以内の長さを有する塩基配列、
(F14)配列番号370~382からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と98%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±2%以内の長さを有する塩基配列、
(F15)配列番号370~382からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±1%以内の長さを有する塩基配列、及び
(F16)配列番号370~382からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99.5%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±0.5%以内の長さを有する塩基配列、
も挙げられる。
本発明のある態様では、前記スプライシングサイレンサー配列がheterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1(hnRNP A1)の認識配列であってもよい。ヒトhnRNP A1の認識配列の例を配列番号370~379に示す。
またここで、スプライス部位配列の具体例としては、配列番号384又は390が挙げられる。また、配列番号384又は390の変異体として、
(G1)配列番号384又は390の塩基配列と80%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±20%以内の長さを有する塩基配列、も挙げられる
またここで、ブランチ部位配列の具体例としては、配列番号383が挙げられる。また、配列番号383の変異体として、
(H1)配列番号383の塩基配列と80%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±20%以内の長さを有する塩基配列、
も挙げられる。
また、上記サプレッサー配列の変異型として、以下の標的領域も本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーの標的塩基配列に含まれる。
(I1)配列番号370~384及び390からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
(I2)配列番号370~384及び390からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と86%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±14%以内の長さを有する塩基配列、
(I3)配列番号370~384及び390からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と87%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±13%以内の長さを有する塩基配列、
(I4)配列番号370~384及び390からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と88%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±12%以内の長さを有する塩基配列、
(I5)配列番号370~384及び390からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と89%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±11%以内の長さを有する塩基配列、
(I6)配列番号370~384及び390からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と90%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±10%以内の長さを有する塩基配列、
(I7)配列番号370~384及び390からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と91%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±9%以内の長さを有する塩基配列、
(I8)配列番号370~384及び390からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と92%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±8%以内の長さを有する塩基配列、
(I9)配列番号370~384及び390からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と93%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±7%以内の長さを有する塩基配列、
(I10)配列番号370~384及び390からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と94%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±6%以内の長さを有する塩基配列、
(I11)配列番号370~384及び390からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と95%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±5%以内の長さを有する塩基配列、
(I12)配列番号370~384及び390からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と96%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±4%以内の長さを有する塩基配列、
(I13)配列番号370~384及び390からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と97%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±3%以内の長さを有する塩基配列、
(I14)配列番号370~384及び390からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と98%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±2%以内の長さを有する塩基配列、
(I15)配列番号370~384及び390からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±1%以内の長さを有する塩基配列、及び
(I16)配列番号370~384及び390からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99.5%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±0.5%以内の長さを有する塩基配列、
も挙げられる。
本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーの一態様としては、配列番号370~384及び390に示す塩基配列及び上記(I1)~(I16)に示す変異型塩基配列からなる群より選択される塩基配列のいずれか1つの塩基配列又はその一部の塩基配列に相補的な塩基配列を含むものが挙げられる。また、別の態様では、本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーは配列番号370~384及び390に示す塩基配列からなる群より選択される塩基配列のいずれか1つの塩基配列又はその一部の塩基配列に相補的な塩基配列からなるものが挙げられる。
ここで「その一部」とは本発明のアンチセンスオリゴマーの項目で述べた定義と同様である。
本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーのさらなる態様としては、
(J1)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列、又は
(J2)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
からなるサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物が挙げられる。
ここで、(J2)の塩基配列は、(J1)の塩基配列の変異型であるが、変異型としては、
(J2-1)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
(J2-2)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と86%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±14%以内の長さを有する塩基配列、
(J2-3)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と87%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±13%以内の長さを有する塩基配列、
(J2-4)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と88%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±12%以内の長さを有する塩基配列、
(J2-5)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と89%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±11%以内の長さを有する塩基配列、
(J2-6)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と90%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±10%以内の長さを有する塩基配列、
(J2-7)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と91%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±9%以内の長さを有する塩基配列、
(J2-8)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と92%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±8%以内の長さを有する塩基配列、
(J2-9)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と93%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±7%以内の長さを有する塩基配列、
(J2-10)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と94%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±6%以内の長さを有する塩基配列、
(J2-11)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と95%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±5%以内の長さを有する塩基配列、
(J2-12)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と96%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±4%以内の長さを有する塩基配列、
(J2-13)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と97%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±3%以内の長さを有する塩基配列、
(J2-14)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と98%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±2%以内の長さを有する塩基配列、
(J2-15)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±1%以内の長さを有する塩基配列、及び
(J2-16)配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99.5%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±0.5%以内の長さを有する塩基配列、
も挙げられる。
したがって、本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーのさらなる態様としては、(J1)及び(J2-1)~(J2-16)からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなるサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物が挙げられる。
本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーのさらなる態様としては、
(J’1)配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列、又は
(J’2)配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
からなるサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物が挙げられる。
ここで、(J’2)の塩基配列は、(J’1)の塩基配列の変異型であるが、変異型としては、
(J’2-1)配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
(J’2-2)配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と86%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±14%以内の長さを有する塩基配列、
(J’2-3)配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と87%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±13%以内の長さを有する塩基配列、
(J’2-4)配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と88%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±12%以内の長さを有する塩基配列、
(J’2-5)配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と89%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±11%以内の長さを有する塩基配列、
(J’2-6)配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と90%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±10%以内の長さを有する塩基配列、
(J’2-7)配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と91%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±9%以内の長さを有する塩基配列、
(J’2-8)配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と92%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±8%以内の長さを有する塩基配列、
(J’2-9)配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と93%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±7%以内の長さを有する塩基配列、
(J’2-10)配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と94%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±6%以内の長さを有する塩基配列、
(J’2-11)配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と95%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±5%以内の長さを有する塩基配列、
(J’2-12)配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と96%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±4%以内の長さを有する塩基配列、
(J’2-13)配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と97%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±3%以内の長さを有する塩基配列、
(J’2-14)配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と98%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±2%以内の長さを有する塩基配列、
(J’2-15)配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±1%以内の長さを有する塩基配列、及び
(J’2-16)配列番号260、261、及び263からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99.5%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±0.5%以内の長さを有する塩基配列、
も挙げられる。
したがって、本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーのさらなる態様としては、(J’1)及び(J’2-1)~(J’2-16)からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなるサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物が挙げられる。
本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーは生理的条件下でマルチスキッピング効果を高める。上記「生理的条件下」とは、生体内と類似のpH、塩組成、温度に調節された条件を意味する。例えば、25~40℃、好ましくは37℃、pH5~8、好ましくは、pH7.4であって、塩化ナトリウム濃度が150mMの条件が挙げられる。
本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーがマルチエクソンスキッピングの効果を高めたかどうかは、(i)本発明のアンチセンスオリゴマーだけを用いたマルチエクソンスキッピングの実験系と、(ii)本発明のアンチセンスオリゴマーと本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーを用いたマルチエクソンスキッピングの実験系、を他の条件をそろえて準備し、実験系(ii)で得られるマルチエクソンスキッピング効果と実験系(i)で得られるマルチエクソンスキッピング効果との差を観察することにより、確認することができる。
マルチスキッピングの効果の測定は、本発明のアンチセンスオリゴマーの項目「1.アンチセンスオリゴマー」で述べたとおりである。
本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーは10~60塩基長であり、10~55塩基長、10~50塩基長、10~45塩基長、10~40塩基長、10~35塩基長、10~30塩基長、10~25塩基長、15~60塩基長であり、15~55塩基長、15~50塩基長、15~45塩基長、15~40塩基長、15~35塩基長、15~30塩基長、15~25塩基長、16~60塩基長であり、16~55塩基長、16~50塩基長、16~45塩基長、16~40塩基長、16~35塩基長、16~30塩基長、16~25塩基長、17~60塩基長であり、17~55塩基長、17~50塩基長、17~45塩基長、17~40塩基長、17~35塩基長、17~30塩基長、17~25塩基長、18~60塩基長であり、18~55塩基長、18~50塩基長、18~45塩基長、18~40塩基長、18~35塩基長、18~30塩基長、18~25塩基長、19~60塩基長であり、19~55塩基長、19~50塩基長、19~45塩基長、19~40塩基長、19~35塩基長、19~30塩基長、19~25塩基長、20~60塩基長であり、20~55塩基長、20~50塩基長、20~45塩基長、20~40塩基長、20~35塩基長、20~30塩基長、20~25塩基長、15~30塩基長であり、15~29塩基長、15~28塩基長、15~27塩基長、15~26塩基長、15~25塩基長、15~24塩基長、15~23塩基長、15~22塩基長、15~21塩基長、15~20塩基長、15~19塩基長、15~18塩基長、16~30塩基長であり、16~29塩基長、16~28塩基長、16~27塩基長、16~26塩基長、16~25塩基長、16~24塩基長、16~23塩基長、16~22塩基長、16~21塩基長、16~20塩基長、16~19塩基長、16~18塩基長、17~30塩基長であり、17~29塩基長、17~28塩基長、17~27塩基長、17~26塩基長、17~25塩基長、17~24塩基長、17~23塩基長、17~22塩基長、17~21塩基長、17~20塩基長、17~19塩基長、17~18塩基長、18~30塩基長であり、18~29塩基長、18~28塩基長、18~27塩基長、18~26塩基長、18~25塩基長、18~24塩基長、18~23塩基長、18~22塩基長、18~21塩基長、18~20塩基長、18~19塩基長、19~30塩基長であり、19~29塩基長、19~28塩基長、19~27塩基長、19~26塩基長、19~25塩基長、19~24塩基長、19~23塩基長、19~22塩基長、19~21塩基長、19~20塩基長、20~30塩基長であり、20~29塩基長、20~28塩基長、20~27塩基長、20~26塩基長、20~25塩基長、20~24塩基長、20~23塩基長、20~22塩基長、20~21塩基長、60塩基長、59塩基長、58塩基長、57塩基長、56塩基長、55塩基長、54塩基長、53塩基長、52塩基長、51塩基長、50塩基長、49塩基長、48塩基長、47塩基長、46塩基長、45塩基長、44塩基長、43塩基長、42塩基長、41塩基長、40塩基長、39塩基長、38塩基長、37塩基長、36塩基長、35塩基長、34塩基長、33塩基長、32塩基長、31塩基長、30塩基長、29塩基長、28塩基長、27塩基長、26塩基長、25塩基長、24塩基長、23塩基長、22塩基長、21塩基長、20塩基長、19塩基長、18塩基長、17塩基長、16塩基長、15塩基長、14塩基長、13塩基長、12塩基長、11塩基長、又は10塩基長であってもよいが、これらに限定されるものではなく、上記の長さに1、2、又は3塩基長が加えられても減らされてもよい。
本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーは、複数のユニットオリゴマーが相互に連結した構成を有する連結型アンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物であってもよい。ユニットオリゴマーは、前述のとおり、ハイブリダイゼーションに寄与しないリンカーを介して連結していてもよく、あるいはリンカーを介さずに直接連結していてもよい。本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーが連結型の場合、各々のユニットオリゴマーの塩基配列は連続又は互いに重複するものではない。
本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーは、オリゴヌクレオチド、モルホリノオリゴマー、又はペプチド核酸(Peptide Nucleic Acid:PNA)オリゴマーであってもよい。
本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーがオリゴヌクレオチドの場合(以下、「本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴヌクレオチド」という)、本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴヌクレオチドは、ヌクレオチドを構成単位とするサプレッサーアンチセンスオリゴマーであり、かかるヌクレオチドは、リボヌクレオチド、デオキシリボヌクレオチド、又は修飾ヌクレオチドのいずれであってもよい。
修飾ヌクレオチドは、前述のとおりである。
本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴヌクレオチドは、好ましくは、リボースの2’位の-OH基がメトキシで置換され、リン酸結合部分がホスホロチオエート結合である、下記一般式で表される基を構成単位とする本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーである。
(式中、Baseは、前記と同義である。)
本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴヌクレオチドは、各種自動合成装置(例えば、AKTA oligopilot plus 10 / 100(GE Healthcare))を用いて容易に合成することが可能であり、あるいは、第三者機関(例えば、Promega社又はTakara社)等に委託して作製することもできる。
本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーがモルホリノオリゴマーの場合(以下、「本発明のサプレッサーアンチセンスモルホリノオリゴマー」という)、本発明のサプレッサーアンチセンスモルホリノオリゴマーは、下記一般式で表される基を構成単位とするサプレッサーアンチセンスオリゴマーである。
(式中、Base、Wは、前記と同義である。)
本発明のサプレッサーアンチセンスモルホリノオリゴマーを合成するのに用いるモルホリノモノマー化合物の例としては、表7に示すモルホリノモノマー化合物(A)、モルホリノモノマー化合物(C)、モルホリノモノマー化合物(T)、及びモルホリノモノマー化合物(G)が挙げられるがこれらに限定されるものではない。
本発明のサプレッサーアンチセンスモルホリノオリゴマーにおいて、モルホリノオリゴマーは、好ましくは、PMOである。
モルホリノオリゴマーは、例えば、国際公開公報第1991/009033号、又は国際公開公報第2009/064471号に記載の方法に従って製造することができる。特に、PMOは、国際公開公報第2009/064471号、又は国際公開公報第2013/100190号に記載の方法に従って製造することができる。
本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーがペプチド核酸オリゴマーの場合(以下、「本発明のサプレッサーアンチセンスペプチド核酸オリゴマー」という)、本発明のサプレッサーアンチセンスペプチド核酸オリゴマーは、下記一般式で表される基を構成単位とするサプレッサーアンチセンスオリゴマーである。
(式中、Baseは、前記と同義である。)
ペプチド核酸は、前述のとおり製造することができる。
本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーは、その医薬的に許容可能な塩の形態、水和物の形態、又は医薬的に許容可能な塩の水和物の形態であってもよい。
本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーの医薬的に許容可能な塩の例としては、ナトリウム塩、カリウム塩、リチウム塩のようなアルカリ金属塩、カルシウム塩、マグネシウム塩のようなアルカリ土類金属塩;アルミニウム塩、鉄塩、亜鉛塩、銅塩、ニッケル塩、コバルト塩などの金属塩;アンモニウム塩;t-オクチルアミン塩、ジベンジルアミン塩、モルホリン塩、グルコサミン塩、フェニルグリシンアルキルエステル塩、エチレンジアミン塩、N-メチルグルカミン塩、グアニジン塩、ジエチルアミン塩、トリエチルアミン塩、ジシクロヘキシルアミン塩、N,N’-ジベンジルエチレンジアミン塩、クロロプロカイン塩、プロカイン塩、ジエタノールアミン塩、N-ベンジル-フェネチルアミン塩、ピペラジン塩、テトラメチルアンモニウム塩、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン塩のような有機アミン塩;弗化水素酸塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、沃化水素酸塩のようなハロゲン化水素酸塩;硝酸塩、過塩素酸塩、硫酸塩、リン酸塩などの無機酸塩;メタンスルホン酸塩、トリフルオロメタンスルホン酸塩、エタンスルホン酸塩のような低級アルカンスルホン酸塩;ベンゼンスルホン酸塩、p-トルエンスルホン酸塩のようなアリールスルホン酸塩;酢酸塩、りんご酸塩、フマール酸塩、コハク酸塩、クエン酸塩、酒石酸塩、シュウ酸塩、マレイン酸塩などの有機酸塩;グリシン塩、リジン塩、アルギニン塩、オルニチン塩、グルタミン酸塩、アスパラギン酸塩のようなアミノ酸塩などが挙げられる。これらの塩は、公知の方法で製造することができる。あるいは、本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーは、その水和物の形態にあってもよい。
[PMOの製法]
本発明のアンチセンスオリゴマー及び本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーは、PMOであってもよい。PMOの1つの態様として、例えば、次の一般式(I)で表される化合物(以下、PMO(I)という。)を挙げることができる。
(式中、各Base、R、Rは、前記と同義であり;
nは、1~99の範囲内にある任意の整数であり、好ましくは、18~28の範囲内にある任意の整数である。)
PMO(I)は、公知の方法(例えば、国際公開公報第2009/064471号、又は国際公開公報第2013/100190号を参照)に従い製造することができる。
また、本発明のアンチセンスオリゴマー又は本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーは、5’末端が、下記化学式(1)~(3)のいずれかの基であってもよい。好ましくは(3)-OHである。
以下、上記(1)、(2)、及び(3)で示される基を、それぞれ「基(1)」、「基(2)」、及び「基(3)」と呼ぶ。
3.医薬用途
本発明は、本発明のアンチセンスオリゴマー(その医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物も含まれる)を含む、医薬組成物(以下、「本発明の医薬組成物」という)を提供する。本発明の医薬組成物は、本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマー(その医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物も含まれる)、及び/又は医薬的に許容可能な担体をさらに含んでいてもよい。
また、本発明は、本発明のアンチセンスオリゴマー(その医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物も含まれる)と、本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマー(その医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物も含まれる)とを含む、医薬組成物(以下、「本発明の組み合わせ医薬」という)を提供する。
本発明の医薬組成物が、本発明のアンチセンスオリゴマーと本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーを含む場合、それらのオリゴマーのいずれの組み合わせも含まれる。また、本発明の組み合わせ医薬においては、本発明のアンチセンスオリゴマーと本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーのいずれの組み合わせも含まれる。本発明の医薬組成物又は本発明の組み合わせ医薬に含まれるアンチセンスオリゴマーは、本発明のアンチセンスオリゴマーであればいずれでもよく、特に限定されるわけではないが、好ましくは配列番号1~111、113~177、179、180、182、183、185~193、195~198、200~223、及び225~232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなるアンチセンスオリゴマーであり、より好ましくは配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、28、29、35、38、39、40、41、43、45、46、47、50、51、52、53、54、55、58、59、63、64、65、66、67、68、74、75、76、77、78、80、82、86、92、97、98、100、102、113、119、121、122、124、125、126、128、130、131、132、139、142、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、225、228、231、及び232からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなるアンチセンスオリゴマーであり、さらに好ましくは配列番号1、5、11、27、28、35、40、41、43、45、46、47、50、51、52、54、55、59、63、64、65、66、68、74、75、76、77、78、102、113、119、128、131、132、139、142、161、162、163、225、及び228からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなるアンチセンスオリゴマーである。
また、本発明の医薬組成物又は本発明の組み合わせ医薬に含まれるサプレッサーアンチセンスオリゴマーは、本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーであればいずれでもよく、特に限定されるわけではないが、好ましくは配列番号257~275からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなるサプレッサーアンチセンスオリゴマーであり、より好ましくは配列番号1、5、6、7、8、10、11、14、26、27、であり、より好ましくは配列番号260、261、及び263からなる群から選択されるいずれか1つの塩基配列からなるからなるサプレッサーアンチセンスオリゴマーである。
本発明の医薬組成物が本発明のアンチセンスオリゴマーと本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーを含む場合、好ましくは、上記の本発明のアンチセンスオリゴマーと本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーの組み合わせを含む。また、本発明の組み合わせ医薬は、好ましくは、上記の本発明のアンチセンスオリゴマーと本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーの組み合わせを含むものである。
本発明の組み合わせ医薬において、本発明のアンチセンスオリゴマーと本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーとの組み合わせの例としては以下が挙げられる。
(K1)アンチセンスオリゴマーが配列番号75からなるオリゴマーであり、サプレッサーアンチセンスオリゴマーが配列番号260からなるオリゴマーである組み合わせ、
(K2)アンチセンスオリゴマーが配列番号75からなるオリゴマーであり、サプレッサーアンチセンスオリゴマーが配列番号261からなるオリゴマーである組み合わせ、
(K3)アンチセンスオリゴマーが配列番号75からなるオリゴマーであり、サプレッサーアンチセンスオリゴマーが配列番号263からなるオリゴマーである組み合わせ、
(K4)アンチセンスオリゴマーが配列番号65からなるオリゴマーであり、サプレッサーアンチセンスオリゴマーが配列番号260からなるオリゴマーである組み合わせ、
(K5)アンチセンスオリゴマーが配列番号65からなるオリゴマーであり、サプレッサーアンチセンスオリゴマーが配列番号261からなるオリゴマーである組み合わせ、
(K6)アンチセンスオリゴマーが配列番号65からなるオリゴマーであり、サプレッサーアンチセンスオリゴマーが配列番号263からなるオリゴマーである組み合わせ、
(K7)アンチセンスオリゴマーが配列番号55と59からなるオリゴマーの組み合わせであり、サプレッサーアンチセンスオリゴマーが配列番号260からなるオリゴマーである組み合わせ、
(K8)アンチセンスオリゴマーが配列番号55と59からなるオリゴマーの組み合わせであり、サプレッサーアンチセンスオリゴマーが配列番号261からなるオリゴマーである組み合わせ、
(K9)アンチセンスオリゴマーが配列番号55と59からなるオリゴマーの組み合わせであり、サプレッサーアンチセンスオリゴマーが配列番号263からなるオリゴマーである組み合わせ。
本発明の医薬組成物は、上記組み合わせの本発明のアンチセンスオリゴマー及び本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーを含み得る。
本発明の医薬組成物及び本発明の組み合わせ医薬は、それぞれ、例えば、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、ベッカー型筋ジストロフィー、肢帯型筋ジストロフィー(LGMD)、先天性筋ジストロフィー、エメリ・ドレフュス(Emery-Dreifuss)型筋ジストロフィー、顔面肩甲上腕型筋ジストロフィー、がん咽頭型筋ジストロフィー、皮質下梗塞と白質脳症を伴う常染色体優性脳動脈症(CADASIL)、アルポート症候群等の治療のために用いることができる。また、本発明の組み合わせ医薬及び本発明の医薬組成物は、それぞれヒト患者、特に筋ジストロフィーのヒト患者に投与することができる。本発明の組み合わせ医薬又は本発明の医薬組成物の投与の対象となる患者は、ジストロフィン遺伝子にエクソン45~55からなる群より選択される2つ以上のエクソンのスキッピングの対象となる変異を有するヒト患者であってもよい。
本発明の一態様において、本発明のアンチセンスオリゴマー、又は本発明のアンチセンスオリゴマーと本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーの組み合わせを筋ジストロフィー患者に投与する工程を含む、筋ジストロフィーの治療方法を提供する。
本発明の別の態様において、本発明の医薬組成物又は本発明の組み合わせ医薬を筋ジストロフィー患者に投与する工程を含む、筋ジストロフィーの治療方法を提供する。
前記治療方法は、ヒトジストロフィンpre-mRNAの第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか2つ以上の番号順に連続するエクソンのスキッピングを行うことを伴ってもよい。前記治療方法において、前記筋ジストロフィー患者は、ジストロフィン遺伝子にエクソン45~55スキップの対象となる変異を有する患者であってもよい。前記患者はヒトであってもよく、ジストロフィン遺伝子にエクソン45~55スキップの対象となる変異を有するヒト患者であってもよい。
本発明は、さらに筋ジストロフィー治療用医薬の製造における本発明のアンチセンスオリゴマー、若しくは本発明のアンチセンスオリゴマーと本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーの組み合わせ、又は本発明の医薬組成物、若しくは本発明の組み合わせ医薬の使用を提供する。
さらに本発明は、筋ジストロフィー治療に使用するための本発明のアンチセンスオリゴマー、若しくは本発明のアンチセンスオリゴマーと本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーの組み合わせ、又は本発明の医薬組成物、若しくは本発明の組み合わせ医薬を提供する。前記治療は、ヒトジストロフィンpre-mRNAの第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか2つ以上の番号順に連続するエクソンのスキッピングを行うことを伴ってもよい。前記治療において、前記筋ジストロフィー患者は、ジストロフィン遺伝子にエクソン45~55スキップの対象となる変異を有する患者であってもよい。前記患者はヒトであってもよく、ジストロフィン遺伝子にエクソン45~55スキップの対象となる変異を有するヒト患者であってもよい。
本発明のアンチセンスオリゴマー、若しくは本発明のアンチセンスオリゴマーと本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーの組み合わせ、又は本発明の医薬組成物、若しくは本発明の組み合わせ医薬の投与形態は、医薬的に許容可能な投与形態であれば特に制限されず、治療方法に応じて選択することができるが、筋組織への送達容易性の観点から、静脈内投与、動脈内投与、筋肉内投与、皮下投与、経口投与、組織内投与、経皮投与等が好ましい。また、本発明の組成物が取り得る剤型としては、特に制限されないが、例えば、各種の注射剤、経口剤、点滴剤、吸入剤、軟膏剤、ローション剤等を挙げることができる。
本発明のアンチセンスオリゴマー及び/又は本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーを筋ジストロフィー患者に投与する場合、本発明の組成物は、該オリゴマーの筋組織への送達を促進する担体を含むことが好ましい。このような担体は、医薬的に許容可能なものであれば特に制限されず、その例として、カチオン性リポソーム、カチオン性ポリマー等のカチオン性担体、又はウイルスエンベロープを利用した担体を挙げることができる。カチオン性リポソームとしては、例えば、2-O-(2-ジエチルアミノエチル)カルバモイル-1,3-O-ジオレオイルグリセロールとリン脂質とを必須構成成分として形成されるリポソーム(以下、「リポソームA」という)、オリゴフェクトアミン(登録商標)(Invitrogen社製)、リポフェクチン(登録商標)(Invitrogen社製)、リポフェクトアミン(登録商標)(Invitrogen社製)、Lipofectamine 2000(登録商標)(Invitrogen社製)、DMRIE-C(登録商標)(Invitrogen社製)、GeneSilencer(登録商標)(Gene Therapy Systems社製)、TransMessenger(登録商標)(QIAGEN社製)、TransIT TKO(登録商標)(Mirus社製)、Nucleofector II(Lonza)を挙げることができる。それらの中で、リポソームAが好ましい。カチオン性ポリマーとしては、例えば、JetSI(登録商標)(Qbiogene社製)、Jet-PEI(登録商標)(ポリエチレンイミン、Qbiogene社製)を挙げることができる。ウイルスエンベロープを利用した担体としては、例えば、GenomeOne(登録商標)(HVJ-Eリポソーム、石原産業社製)を挙げることができる。あるいは、特許2924179号に記載の医薬デバイス、再公表特許公報第2006/129594号及び再公表特許公報第2008/096690号に記載のカチオン性担体を用いることもできる。
本発明の医薬組成物及び/又は本発明の組み合わせ医薬に含まれる本発明のアンチセンスオリゴマーの濃度は、担体の種類等によって異なるが、0.1nM~100μMの範囲内が適当であり、1nM~10μMの範囲内が好ましく、10nM~1μMの範囲内がより好ましい。また、本発明の組成物に含まれる本発明のアンチセンスオリゴマーと担体との重量比(担体/本発明のアンチセンスオリゴマー)は、該オリゴマーの性質及び該担体の種類等によって異なるが、0.1~100の範囲内が適当であり、1~50の範囲内が好ましく、10~20の範囲内がより好ましい。
本発明の医薬組成物及び/又は本発明の組み合わせ医薬に含まれる本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーの濃度は、担体の種類等によって異なるが、0.1nM~100μMの範囲内が適当であり、1nM~10μMの範囲内が好ましく、10nM~1μMの範囲内がより好ましい。また、本発明の組成物に含まれる本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーと担体との重量比(担体/本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマー)は、該オリゴマーの性質及び該担体の種類等によって異なるが、0.1~100の範囲内が適当であり、1~50の範囲内が好ましく、10~20の範囲内がより好ましい。
本発明の医薬組成物及び/又は本発明の組み合わせ医薬は、水溶液の形態であってもよい。その場合、本発明の医薬組成物及び/又は本発明の組み合わせ医薬は、本発明のアンチセンスオリゴマーを、2.5~500mg/mL、5~450mg/mL、10~400mg/mL、15~350mg/mL、20~300mg/mL、20~250mg/mL、20~200mg/mL、20~150mg/mL、20~100mg/mL、20~50mg/mL、20~40mg/mL、20~30mg/mL、23~27mg/mL、24~26mg/mL、又は25mg/mLの濃度で含んでいてもよい。または、本発明の医薬組成物及び/又は本発明の組み合わせ医薬は、本発明のアンチセンスオリゴマーを、10~100mg/mL、15~95mg/mL、20~80mg/mL、25~75mg/mL、30~70mg/mL、35~65mg/mL、40~60mg/mL、45~55mg/mL、47~53mg/mL、48~52mg/mL、49~51mg/mL、又は50mg/mLの濃度で含んでいてもよい。
また、本発明の医薬組成物及び/又は本発明の組み合わせ医薬が水溶液の形態である場合、本発明のサプレッサーオリゴマーを、2.5~500mg/mL、5~450mg/mL、10~400mg/mL、15~350mg/mL、20~300mg/mL、20~250mg/mL、20~200mg/mL、20~150mg/mL、20~100mg/mL、20~50mg/mL、20~40mg/mL、20~30mg/mL、23~27mg/mL、24~26mg/mL、又は25mg/mLの濃度で含んでいてもよい。または、本発明の医薬組成物及び/又は本発明の組み合わせ医薬は、本発明のサプレッサーオリゴマーを、10~100mg/mL、15~95mg/mL、20~80mg/mL、25~75mg/mL、30~70mg/mL、35~65mg/mL、40~60mg/mL、45~55mg/mL、47~53mg/mL、48~52mg/mL、49~51mg/mL、又は50mg/mLの濃度で含んでいてもよい。
本発明の医薬組成物及び/又は本発明の組み合わせ医薬は、乾燥形態であってもよい。その場合、水溶液形態の本発明の医薬組成物及び/又は本発明の組み合わせ医薬を調製するために、例えば125mg又は250mgの乾燥形態の本発明のアンチセンスオリゴマーを、0.5mL~100mLの水と混合して(1.25mg/mL~250mg/mL又は2.5mg/mL~500mg/mLの本発明のアンチセンスオリゴマー濃度に相当する)、好ましくは1mL~50mLの水と混合して(2.5mg/mL~125mg/mL又は5mg/mL~250mg/mLの本発明のアンチセンスオリゴマー濃度に相当する)、より好ましくは5mL~10mLの水と混合して(12.5mg/mL~25mg/mL又は25mg/mL~50mg/mLの本発明のアンチセンスオリゴマー濃度に相当する)用いてもよい。
また、本発明の医薬組成物及び/又は本発明の組み合わせ医薬が乾燥形態である場合、水溶液形態の本発明の医薬組成物及び/又は本発明の組み合わせ医薬を調製するために、例えば、125mg又は250mgの乾燥形態の本発明のサプレッサーオリゴマーを0.5mL~100mLの水と混合して(1.25mg/mL~250mg/mL又は2.5mg/mL~500mg/mLの本発明のサプレッサーオリゴマー濃度に相当する)、好ましくは1mL~50mLの水と混合して(2.5mg/mL~125mg/mL又は5mg/mL~250mg/mLの本発明のサプレッサーオリゴマー濃度に相当する)、より好ましくは5mL~10mLの水と混合して(12.5mg/mL~25mg/mL又は25mg/mL~50mg/mLの本発明のサプレッサーオリゴマー濃度に相当する)用いてもよい。
本発明の医薬組成物及び/又は本発明の組み合わせ医薬に含まれる本発明のアンチセンスオリゴマー及び本発明のサプレッサーオリゴマーの前記濃度は、本発明のアンチセンスオリゴマー及び本発明のサプレッサーオリゴマーそれぞれの濃度であってもよいし、本発明のアンチセンスオリゴマー及び本発明のサプレッサーオリゴマーを合わせた濃度であってもよい。
本発明の医薬組成物及び/又は本発明の組み合わせ医薬には、本発明のアンチセンスオリゴマー及び/又は本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーと上述した担体以外に、任意に医薬的に許容可能な添加剤を配合することができる。かかる添加剤として、例えば、乳化補助剤(例えば、炭素数6~22の脂肪酸やその医薬的に許容可能な塩、アルブミン、デキストラン)、安定化剤(例えば、コレステロール、ホスファチジン酸、マンニトール、ソルビトール)、等張化剤(例えば、塩化ナトリウム、グルコース、マルトース、ラクトース、スクロース、トレハロース)、pH調整剤(例えば、塩酸、硫酸、リン酸、酢酸、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、トリエタノールアミン)を挙げることができる。これらを一種又は二種以上使用することができる。本発明の組成物中の当該添加剤の含有量は、90重量%以下が適当であり、70重量%以下が好ましく、50重量%以下がより好ましい。
本発明の医薬組成物及び/又は本発明の組み合わせ医薬は、担体の分散液に本発明のアンチセンスオリゴマー及び/又は本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーを加え、適当に攪拌することにより調製することができる。また、添加剤は、本発明のアンチセンスオリゴマー及び/又は本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーの添加前でも添加後でも適当な工程で添加することができる。本発明のアンチセンスオリゴマー及び/又は本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーを添加させる際に用い得る水性溶媒としては、医薬的に許容可能なものであれば特に制限されず、例えば、注射用水、注射用蒸留水、生理食塩水等の電解質液、ブドウ糖液、マルトース液等の糖液を挙げることができる。また、かかる場合のpH及び温度等の条件は、当業者が適宜選択することができる。
本発明の医薬組成物及び/又は本発明の組み合わせ医薬は、例えば、液剤やその凍結乾燥製剤とすることができる。当該凍結乾燥製剤は、常法により、液剤の形態を有している本発明の組成物を凍結乾燥処理することにより調製することができる。例えば、液剤の形態を有している本発明の組成物を適当な滅菌を行った後、所定量をバイアル瓶に分注し、約-40℃~-20℃の範囲内の条件で予備凍結を2時間程度行い、約0℃~10℃の範囲内で減圧下に一次乾燥を行い、次いで、約15℃~25℃の範囲内で減圧下に二次乾燥して凍結乾燥することができる。そして、一般的にはバイアル内部を窒素ガスで置換し、打栓して本発明の組成物の凍結乾燥製剤を得ることができる。
本発明の医薬組成物及び/又は本発明の組み合わせ医薬の凍結乾燥製剤は、一般には任意の適当な溶液(再溶解液)の添加によって再溶解し使用することができる。このような再溶解液としては、注射用水、生理食塩水、その他一般輸液を挙げることができる。この再溶解液の液量は、用途等によって異なり特に制限されないが、凍結乾燥前の液量の0.5倍量~2倍量又は500mL以下が適当である。
本発明の医薬組成物及び/又は本発明の組み合わせ医薬を投与する際の用量としては、含有される本発明のアンチセンスオリゴマー及び/又は本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーの種類、剤形、年齢や体重等の患者の状態、投与経路、疾患の性質と程度を考慮した上で調節することが望ましいが、成人に対して本発明のアンチセンスオリゴマー及び/又は本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーの量として、1回の投与に体重1kgあたり0.1mg~1g、好ましくは体重1kgあたり1mg~100mg、さらに好ましくは体重1kgあたり1mg~90mg、より好ましくは体重1kgあたり1mg~80mgで投与することができる。投与頻度は、1~3日に1回、1週間に1回、又は2~3週に1回であってもよい。この数値は標的とする疾患の種類、投与形態、標的分子によっても異なる場合がある。したがって、場合によってはこれ以下の用量又は投与頻度でも十分であるし、また逆にこれ以上の用量又は投与頻度を必要とするときもある。
本発明の医薬組成物及び/又は本発明の組み合わせ医薬の別の態様として、本発明のアンチセンスオリゴマー及び/又は本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーを発現し得るベクターと上述した担体とを含む医薬組成物を挙げることができる。かかる発現ベクターは、複数の本発明のアンチセンスオリゴマー及び/又は本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーを発現し得るものであってもよい。当該組成物には、本発明のアンチセンスオリゴマー及び/又は本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーを含有する本発明の組成物と同様に、医薬的に許容可能な添加剤を添加することができる。当該組成物中に含まれる発現ベクターの濃度は、担体の種類等によって異なるが、0.1nM~100μMの範囲内が適当であり、1nM~10μMの範囲内が好ましく、10nM~1μMの範囲内がより好ましい。当該組成物中に含まれる発現ベクターと担体との重量比(担体/発現ベクター)は、発現ベクターの性質、担体の種類等によって異なるが、0.1~100の範囲内が適当であり、1~50の範囲内が好ましく、10~20の範囲内がより好ましい。また、当該組成物中に含まれる担体の含有量は、本発明のアンチセンスオリゴマー及び/又は本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーを含有する本発明の組成物の場合と同様であり、その調製方法等に関しても、本発明の組成物の場合と同様である。
4.ヒトジストロフィン以外の目的pre-mRNA
本明細書は、目的pre-mRNAがヒトジストロフィンpre-mRNAである場合について具体的に述べるが、それに限定されず、ヒトジストロフィン以外の目的pre-mRNAの場合も、アンチセンスオリゴマー及びサプレッサーアンチセンスオリゴマーの設計、製造、使用方法については、本明細書の開示又は当分野の公知の技術及び方法に従って実施することができる。当業者であれば本明細書の開示又は当分野の公知の技術及び方法に基づき、ヒトジストロフィン以外の目的pre-mRNAについても、そのアンチセンスオリゴマー又はサプレッサーアンチセンスオリゴマーを設計、製造及び使用することができる。同様に、当業者は本明細書の開示及び当分野の公知の技術及び方法に基づき、アンチセンスオリゴマーを用いて目的pre-mRNAのマルチエクソンスキッピングをすること、及びサプレッサーアンチセンスオリゴマーを用いてマルチエクソンスキッピングの効率を高めることができる。
本明細書において、目的pre-mRNAの例として、ヒトγ-サルコグリカン(SGCG)、ヒトNotch3、及びヒトジストロフィンのpre-mRNAが挙げられる。本発明のある態様において目的pre-mRNAはヒトジストロフィンpre-mRNAであってもよい。また、本発明の別の態様において、目的pre-mRNAはSGCG又はヒトNotch3であってもよい。
ヒトSGCG及びヒトNotch3の目的pre-mRNAにおけるマルチエクソンスキッピングに用いるアンチセンスオリゴマーの標的領域の塩基配列は以下のとおりである。
本発明における、ヒトSGCGのpre-mRNAの標的領域を、以下に配列番号283及び284として示す。
本発明におけるヒトNotch3のpre-mRNAの標的領域を、以下に示す。
ヒトSGCGのpre-mRNAに対しマルチエクソンスキッピングを誘導するヒトSGCG用アンチセンスオリゴマーとしては、例えば、イントロン3の3’末端を基点とした-400~+50塩基の範囲を標的とするものが挙げられ、具体例として、
(L1)配列番号287~308からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列、又は
(L2)配列番号287~308からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
からなるヒトSGCG用アンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物が挙げられる。
ここで、(L2)の塩基配列は、(L1)の塩基配列の変異型であるが、変異型としては、
(L2-1)配列番号287~308からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
(L2-2)配列番号287~308からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と86%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±14%以内の長さを有する塩基配列、
(L2-3)配列番号287~308からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と87%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±13%以内の長さを有する塩基配列、
(L2-4)配列番号287~308からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と88%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±12%以内の長さを有する塩基配列、
(L2-5)配列番号287~308からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と89%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±11%以内の長さを有する塩基配列、
(L2-6)配列番号287~308からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と90%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±10%以内の長さを有する塩基配列、
(L2-7)配列番号287~308からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と91%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±9%以内の長さを有する塩基配列、
(L2-8)配列番号287~308からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と92%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±8%以内の長さを有する塩基配列、
(L2-9)配列番号287~308からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と93%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±7%以内の長さを有する塩基配列、
(L2-10)配列番号287~308からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と94%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±6%以内の長さを有する塩基配列、
(L2-11)配列番号287~308からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と95%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±5%以内の長さを有する塩基配列、
(L2-12)配列番号287~308からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と96%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±4%以内の長さを有する塩基配列、
(L2-13)配列番号287~308からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と97%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±3%以内の長さを有する塩基配列、
(L2-14)配列番号287~308からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と98%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±2%以内の長さを有する塩基配列、
(L2-15)配列番号287~308からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±1%以内の長さを有する塩基配列、及び
(L2-16)配列番号287~308からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99.5%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±0.5%以内の長さを有する塩基配列、
も挙げられる。
したがって、ヒトSGCG用アンチセンスオリゴマーのさらなる態様としては、
(L1)及び(L2-1)~(L2-16)からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなるヒトSGCG用アンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物が挙げられる。ヒトSGCG用アンチセンスオリゴマーは、本発明に含まれる。
ヒトSGCGのpre-mRNAのシングルスキップのサプレッサーアンチセンスオリゴマー(ヒトSGCG用サプレッサーアンチセンスオリゴマー)としては、例えば、イントロン4のスプライシングサイレンサー配列又はシングルスキッピングのスプライス部位を標的とするものが挙げられ、具体例として、
(M1)配列番号331~335からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列、又は
(M2)配列番号331~335からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
からなるヒトSGCG用サプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物が挙げられる。
ここで、(M2)の塩基配列は、(M1)の塩基配列の変異型であるが、変異型としては、
(M2-1)配列番号331~335からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
(M2-2)配列番号331~335からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と86%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±14%以内の長さを有する塩基配列、
(M2-3)配列番号331~335からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と87%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±13%以内の長さを有する塩基配列、
(M2-4)配列番号331~335からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と88%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±12%以内の長さを有する塩基配列、
(M2-5)配列番号331~335からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と89%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±11%以内の長さを有する塩基配列、
(M2-6)配列番号331~335からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と90%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±10%以内の長さを有する塩基配列、
(M2-7)配列番号331~335からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と91%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±9%以内の長さを有する塩基配列、
(M2-8)配列番号331~335からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と92%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±8%以内の長さを有する塩基配列、
(M2-9)配列番号331~335からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と93%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±7%以内の長さを有する塩基配列、
(M2-10)配列番号331~335からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と94%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±6%以内の長さを有する塩基配列、
(M2-11)配列番号331~335からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と95%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±5%以内の長さを有する塩基配列、
(M2-12)配列番号331~335からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と96%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±4%以内の長さを有する塩基配列、
(M2-13)配列番号331~335からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と97%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±3%以内の長さを有する塩基配列、
(M2-14)配列番号331~335からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と98%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±2%以内の長さを有する塩基配列、
(M2-15)配列番号331~335からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±1%以内の長さを有する塩基配列、及び
(M2-16)配列番号331~335からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99.5%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±0.5%以内の長さを有する塩基配列、
も挙げられる。
したがって、ヒトSGCG用サプレッサーアンチセンスオリゴマーのさらなる態様としては、
(M1)及び(M2-1)~(M2-16)からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなるヒトSGCG用サプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物が挙げられる。ヒトSGCG用サプレッサーアンチセンスオリゴマーは、本発明に含まれる。ヒトトSGCG用サプレッサーアンチセンスオリゴマーは、本発明に含まれる。ヒトSGCG用サプレッサーアンチセンスオリゴマーは、SGCGのpre-mRNAのマルチスキッピングの効率を増大させ得る。
ヒトNotch3のpre-mRNAに対しマルチエクソンスキッピングを誘導するヒトNotch3用アンチセンスオリゴマーとしては、例えば、イントロン3のアクセプター付近の領域、すなわち、イントロン3の3’末端を基点とした-400~+50塩基の範囲を標的とするものが挙げられ、例えば、
(N1)配列番号309~330からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列、又は
(N2)配列番号309~330からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
からなるヒトNotch3用アンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物が挙げられる。
ここで、(N2)の塩基配列は、(N1)の塩基配列の変異型であるが、変異型としては、
(N2-1)配列番号309~330からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
(N2-2)配列番号309~330からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と86%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±14%以内の長さを有する塩基配列、
(N2-3)配列番号309~330からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と87%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±13%以内の長さを有する塩基配列、
(N2-4)配列番号309~330からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と88%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±12%以内の長さを有する塩基配列、
(N2-5)配列番号309~330からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と89%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±11%以内の長さを有する塩基配列、
(N2-6)配列番号309~330からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と90%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±10%以内の長さを有する塩基配列、
(N2-7)配列番号309~330からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と91%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±9%以内の長さを有する塩基配列、
(N2-8)配列番号309~330からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と92%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±8%以内の長さを有する塩基配列、
(N2-9)配列番号309~330からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と93%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±7%以内の長さを有する塩基配列、
(N2-10)配列番号309~330からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と94%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±6%以内の長さを有する塩基配列、
(N2-11)配列番号309~330からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と95%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±5%以内の長さを有する塩基配列、
(N2-12)配列番号309~330からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と96%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±4%以内の長さを有する塩基配列、
(N2-13)配列番号309~330からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と97%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±3%以内の長さを有する塩基配列、
(N2-14)配列番号309~330からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と98%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±2%以内の長さを有する塩基配列、
(N2-15)配列番号309~330からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±1%以内の長さを有する塩基配列、及び
(N2-16)配列番号309~330からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99.5%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±0.5%以内の長さを有する塩基配列、
も挙げられる。
したがって、ヒトNotch3用アンチセンスオリゴマーのさらなる態様としては、(N1)及び(N2-1)~(N2-16)からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなるヒトNotch3用アンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物が挙げられる。ヒトNotch3用アンチセンスオリゴマーは、本発明に含まれる。
ヒトNotch3のpre-mRNAのシングルスキップのサプレッサーアンチセンスオリゴマー(ヒトNotch3用サプレッサーアンチセンスオリゴマー)としては、例えば、イントロン4のスプライセンシングサイレンサー配列又はシングルスキッピングのスプライス部位を標的とするものが挙げられ、具体例として、
(O1)配列番号336~340からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列、又は
(O2)配列番号336~340からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
からなるヒトNotch3用サプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物が挙げられる。
ここで、(O2)の塩基配列は、(O1)の塩基配列の変異型であるが、変異型としては、
(O2-1)配列番号336~340からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と85%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±15%以内の長さを有する塩基配列、
(O2-2)配列番号336~340からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と86%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±14%以内の長さを有する塩基配列、
(O2-3)配列番号336~340からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と87%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±13%以内の長さを有する塩基配列、
(O2-4)配列番号336~340からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と88%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±12%以内の長さを有する塩基配列、
(O2-5)配列番号336~340からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と89%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±11%以内の長さを有する塩基配列、
(O2-6)配列番号336~340からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と90%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±10%以内の長さを有する塩基配列、
(O2-7)配列番号336~340からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と91%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±9%以内の長さを有する塩基配列、
(O2-8)配列番号336~340からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と92%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±8%以内の長さを有する塩基配列、
(O2-9)配列番号336~340からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と93%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±7%以内の長さを有する塩基配列、
(O2-10)配列番号336~340からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と94%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±6%以内の長さを有する塩基配列、
(O2-11)配列番号336~340からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と95%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±5%以内の長さを有する塩基配列、
(O2-12)配列番号336~340からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と96%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±4%以内の長さを有する塩基配列、
(O2-13)配列番号336~340からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と97%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±3%以内の長さを有する塩基配列、
(O2-14)配列番号336~340からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と98%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±2%以内の長さを有する塩基配列、
(O2-15)配列番号336~340からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±1%以内の長さを有する塩基配列、及び
(O2-16)配列番号336~340からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列と99.5%以上の配列同一性を有し、かつ前記選択されるいずれか1つの塩基配列の長さと比べ±0.5%以内の長さを有する塩基配列、
も挙げられる。
したがって、ヒトNotch3用サプレッサーアンチセンスオリゴマーのさらなる態様としては、
(O1)及び(O2-1)~(O2-16)からなる群より選択されるいずれか1つの塩基配列からなるヒトNotch3用サプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物が挙げられる。ヒトNotch3用サプレッサーアンチセンスオリゴマーは、本発明に含まれる。ヒトNotch3用サプレッサーアンチセンスオリゴマーは、Notch3のpre-mRNAのマルチスキッピングの効率を増大させ得る。
以下に、配列番号287~340の塩基配列を示す。
5.マルチエクソンスキッピングの効率を増大させる方法
本発明は、目的pre-mRNAから2つ以上の番号順に連続するエクソンをスキッピングする際に、前記目的pre-mRNAのスプライシングサイレンサー配列、スプライス部位配列、又はブランチ部位配列を阻害する工程を含む、
前記2つ以上の番号順に連続するエクソンがスキッピングされる効率を増大させる方法(以下、「本発明の増大方法」という)を提供する。
本発明の増大方法において、前記目的pre-mRNAの2つ以上の番号順に連続するエクソンのスキッピングは、マルチエクソンスキッピングを誘導するアンチセンスオリゴマー、例えば、本発明のアンチセンスオリゴマー、若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物を用いて行うことができる。
本発明の増大方法は、目的pre-mRNA上のスプライシングサイレンサー配列、スプライス部位配列、又はブランチ部位配列を阻害することでシングルスキッピングを抑制し、マルチエクソンスキッピングの効率を増大させることができる。本発明の増大方法は、これらの目的pre-mRNA上のスプライシングサイレンサー配列、スプライス部位配列、又はブランチ部位配列の機能を阻害することを含み、より具体的には、これらの配列を、サプレッサーアンチセンスオリゴマーで標的することで、エクソンのシングルスキッピングを抑制することを含む。
また、本発明の増大方法において、前記スプライシングサイレンサー配列、スプライス部位、又はブランチ部位配列を阻害する工程は、本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマー等のサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物を用いて行うことができる。
本発明の増大方法においては、サプレッサーアンチセンスオリゴマーとして、目的pre-mRNA上のスプライシングサイレンサー配列、ブランチ部位配列、及びスプライス部位配列に相補的な塩基配列を含むオリゴマーを、スプライシングサイレンサー配列、ブランチ部位配列、及びスプライス部位配列を阻害する工程に使用することができる。
スプライシングサイレンサー配列、ブランチ部位配列、及びスプライス部位配列は、前述のとおりである。本発明の増大方法のある態様では、前記スプライシングサイレンサー配列がheterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1(hnRNP A1)の認識配列であってもよい。ヒトhnRNP A1の認識配列の例を配列番号370~379に示す。
本発明の増大方法に、前記アンチセンスオリゴマー及び前記サプレッサーアンチセンスオリゴマーを「用いる」とは、目的pre-mRNAを発現する細胞に前記アンチセンスオリゴマー及び前記サプレッサーアンチセンスオリゴマーを取り込ませ、目的pre-mRNAにエクソンスキッピングを生じさせることを意味する。前記細胞に前記アンチセンスオリゴマー及び前記サプレッサーアンチセンスオリゴマーを取り込ませる方法としては、カチオン性リポソーム、カチオン性ポリマー等のカチオン性担体、又はウイルスエンベロープを利用した担体を用いた導入方法が挙げられる。カチオン性リポソームとしては、例えば、2-O-(2-ジエチルアミノエチル)カルバモイル-1,3-O-ジオレオイルグリセロールとリン脂質とを必須構成成分として形成されるリポソーム(以下、「リポソームA」という)、オリゴフェクトアミン(登録商標)(Invitrogen社製)、リポフェクチン(登録商標)(Invitrogen社製)、リポフェクトアミン(登録商標)(Invitrogen社製)、Lipofectamine 2000(登録商標)(Invitrogen社製)、DMRIE-C(登録商標)(Invitrogen社製)、GeneSilencer(登録商標)(Gene Therapy Systems社製)、TransMessenger(登録商標)(QIAGEN社製)、TransIT TKO(登録商標)(Mirus社製)、Nucleofector II(Lonza)を挙げることができる。それらの中で、リポソームAが好ましい。カチオン性ポリマーとしては、例えば、JetSI(登録商標)(Qbiogene社製)、Jet-PEI(登録商標)(ポリエチレンイミン、Qbiogene社製)を挙げることができる。ウイルスエンベロープを利用した担体としては、例えば、GenomeOne(登録商標)(HVJ-Eリポソーム、石原産業社製)を挙げることができる。あるいは、特許2924179号に記載の医薬デバイス、再公表特許公報第2006/129594号及び再公表特許公報第2008/096690号に記載のカチオン性担体を用いることもできる。
また、患者の体内において目的pre-mRNAを発現する細胞に前記アンチセンスオリゴマー及び前記サプレッサーアンチセンスオリゴマーを取り込ませる方法としては項目「3.医薬用途」に記載する投与方法を参照することができる。
本発明の増大方法において前記目的pre-mRNAのスプライシングサイレンサー配列、スプライス部位配列、又はブランチ部位配列を阻害することにより、同阻害を行わない場合に得られるマルチエクソンスキッピングの効率を100とした場合、同効率が2%以上、4%以上、6%以上、8%以上、10%以上、12%以上、14%以上、16%以上、18%以上、20%以上、22%以上、24%以上、26%以上、28%以上、30%以上、32%以上、34%以上、36%以上、38%以上、40%以上、42%以上、44%以上、46%以上、48%以上、50%以上、52%以上、54%以上、56%以上、58%以上、60%以上、62%以上、64%以上、66%以上、68%以上、70%以上、72%以上、74%以上、76%以上、78%以上、80%以上、82%以上、84%以上、86%以上、88%以上、90%以上、92%以上、94%以上、96%以上、98%以上、又は100%以上増大する。
本発明の増大方法において、目的pre-mRNAは、例えば、ヒトγ-サルコグリカン(SGCG)、ヒトNotch3、及びヒトジストロフィンのpre-mRNAが挙げられる。本発明のある態様において目的pre-mRNAはヒトジストロフィンpre-mRNAである。目的pre-mRNAはヒトジストロフィンpre-mRNAである場合、前記2つ以上の番号順に連続するエクソンは、ヒトジストロフィンpre-mRNAの第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるエクソンである。
以下に、実施例及び試験例を挙げて、本発明をさらに詳しく説明するが、本発明は実施例に示される範囲に限定されるものではない。
[実施例1:アンチセンスオリゴマーの製造]
アミノポリスチレン樹脂に担持された4-{[(2S,6R)-6-(4-ベンズアミド-2-オキソピリミジン-1-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]メトキシ}-4-オキソブタン酸(化合物1)の製造
工程1:4-{[(2S,6R)-6-(4-ベンズアミド-2-オキソピリミジン-1(2H)-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]メトキシ}-4-オキソブタン酸の製造
アルゴン雰囲気下、N-{1-[(2R,6S)-6-(ヒドロキシメチル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]-2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-4-イル}ベンズアミド3.44gと4-ジメチルアミノピリジン(4-DMAP)1.1gをジクロロメタン50mLに懸濁し、無水コハク酸0.90gを加え、室温で3時間撹拌した。反応液にメタノール10mLを加え、減圧濃縮した。残渣に酢酸エチルと0.5Mのリン酸二水素カリウム水溶液を用いて抽出操作を行った。得られた有機層を0.5Mのリン酸二水素カリウム水溶液、水、飽和食塩水で順に洗浄した。得られた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、減圧濃縮し、4.0gの目的物を得た。
工程2:アミノポリスチレン樹脂に担持された4-{[(2S,6R)-6-(4-ベンズアミド-2-オキソピリミジン-1-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]メトキシ}-4-オキソブタン酸の製造
4-{[(2S,6R)-6-(4-ベンズアミド-2-オキソピリミジン-1(2H)-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]メトキシ}-4-オキソブタン酸4.0gをピリジン(脱水)200mLに溶解し、4-DMAP0.73g、1-エチル-3‐(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩11.5gを加えた。次いで、アミノポリスチレン樹脂:Primer support 200 amino(GE Healthcare Japan社製、17-5214-97)25.0g、トリエチルアミン8.5mLを加え、室温で4日間振とうした。反応後、樹脂をろ取した。得られた樹脂をピリジン、メタノール、ジクロロメタンで順に洗浄し、減圧乾燥した。得られた樹脂にテトラヒドロフラン(脱水)200mL、無水酢酸15mL、2,6-ルチジン15mLを加え、室温で2時間振とうした。樹脂をろ取し、ピリジン、メタノール、ジクロロメタンで順に洗浄し、減圧乾燥し、26.7gの目的物を得た。
当該目的物のローディング量は、公知の方法を用いて、樹脂1g当たりのトリチルのモル量を409nmにおけるUV吸光度を測定することにより決定した。樹脂のローディング量は、129.2μmol/gであった。
UV測定条件
機器:U-2910(日立製作所)
溶媒:メタンスルホン酸
波長:409 nm
ε値:45000
アミノポリスチレン樹脂に担持された4-{[(2S,6R)-6-(5-メチル-2,4-ジオキソピリミジン-1-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]メトキシ}-4-オキソブタン酸(化合物2)の製造
化合物1と同様の方法に従って、標記化合物を製造した。但し、化合物1の製造の工程1で用いたN-{1-[(2R,6S)-6-(ヒドロキシメチル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]-2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-4-イル}ベンズアミドの代わりに、本工程では、1-[(2R,6S)-6-(ヒドロキシメチル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオンを使用した。
当該目的物のローディング量は、公知の方法を用いて、樹脂1g当たりのトリチルのモル量を409nmにおけるUV吸光度を測定することにより決定した。樹脂のローディング量は、164.0μmol/gであった。
アミノポリスチレン樹脂に担持された4-{[(2S,6R)-6-(6-ベンズアミドプリン-9-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]メトキシ}-4-オキソブタン酸(化合物3)の製造
化合物1と同様の方法に従って、標記化合物を製造した。但し、化合物1の製造の工程1で用いたN-{1-[(2R,6S)-6-(ヒドロキシメチル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]-2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-4-イル}ベンズアミドの代わりに、本工程では、N-{9-[(2R,6S)-6-(ヒドロキシメチル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]プリン-6-イル}ベンズアミドを使用した。
当該目的物のローディング量は、公知の方法を用いて、樹脂1g当たりのトリチルのモル量を409nmにおけるUV吸光度を測定することにより決定した。樹脂のローディング量は、185.7μmol/gであった。
アミノポリスチレン樹脂に担持された4-{{(2S,6R)-6-{6-(2-シアノエトキシ)-2-[(2-フェノキシアセチル)アミノ]プリン-9-イル}-4-トリチルモルホリン-2-イル}メトキシ}-4-オキソブタン酸(化合物4)の製造
化合物1と同様の方法に従って、標記化合物を製造した。但し、化合物1の製造の工程1で用いたN-{1-[(2R,6S)-6-(ヒドロキシメチル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]-2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-4-イル}ベンズアミドの代わりに、本工程では、N-{6-(2-シアノエトキシ)-9-[(2R,6S)-6-(ヒドロキシメチル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]プリン-2-イル}-2-フェノキシアセトアミドを使用した。
当該目的物のローディング量は、公知の方法を用いて、樹脂1g当たりのトリチルのモル量を409nmにおけるUV吸光度を測定することにより決定した。樹脂のローディング量は、164.8μmol/gであった。
ヒトジストロフィン遺伝子のイントロンのドナー付近又はアクセプター付近の領域を標的とするアンチセンスPMOの製造
以下の記載に従い、表10に示すヒトジストロフィンpre-mRNAのイントロン44~55のドナー付近又はアクセプター付近の領域を標的とする、表11のPMO No.1~232の塩基配列(配列番号1~232)を有するPMOを合成した。PMOの5’末端は下記基(3)である。合成したPMOを注射用水(大塚製薬工場社製)で溶解した。
なお、本発明のアンチセンスオリゴマー又は本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーの標的塩基配列は、「Ha1_b1-c1」、「Ha2_b2-c2_Ha3_b3-c3」、又は「Ha4_b4-c4_Ha5_b5-c5_Ha6_b6-c6」のように記載した。
「Ha1_b1-c1」は、本明細書における第一の態様のアンチセンスオリゴマーの標的塩基配列である。「Ha1」はヒトジストロフィン遺伝子の第a番目のエクソンを表し、「b1」は標的塩基配列の5’末端の塩基を表し、「c1」は標的塩基配列の3’末端の塩基を表す。「Ha1_b1-c1」は、その3’末端に付加的な1塩基を有していてもよく、そのような標的塩基配列は、「Ha1_b1-c1_N」で表される(「N」は任意の塩基を表す)。
「b1」、「c1」が正の整数の場合、「b1」、「c1」はそれぞれ、第a番目のエクソンの5’末端塩基を1番目の塩基としたときに、3’末端方向の何番目の塩基なのかを表す。一方、「b1」、「c1」が負の整数である場合、「b1」、「c1」はそれぞれ、第(a-1)番目のイントロンの3’末端の塩基を-1番目としたときに、5’末端方向の何番目の塩基なのかを表す。
例えば、「H45_(-10)-15」の場合、当該標的塩基配列の5’末端が第44番目のイントロンの3’末端から5’末端方向に10番目の塩基であり、当該標的塩基配列の3’末端が第45番目のエクソンの5’末端から3’末端方向に15番目の塩基である塩基配列を意味する。
「Ha2_b2-c2_Ha3_b3-c3」は、本明細書における第二の態様のアンチセンスオリゴマーの標的塩基配列である。「Ha2_b2-c2_Ha3_b3-c3」の第1の部分である「Ha2_b2-c2」は、該アンチセンスオリゴマーを構成する3’末端側ユニットオリゴマーの標的塩基配列を意味し、第2の部分である「Ha3_b3-c3」は、該アンチセンスオリゴマーを構成する5’末端側ユニットオリゴマーの標的塩基配列を意味する。「Ha3_b3-c3」は、その3’末端に付加的な1塩基を有していてもよく、そのような標的塩基配列は、「Ha2_b2-c2_Ha3_b3-c3_N」で表される(「N」は任意の塩基を表す)。各「Ha2_b2-c2」及び「Ha3_b3_-c3」は、上記「Ha1_b1-c1」の表記方法と同様である。
なお、「Ha2」と「Ha3」が同じである場合には、「_Ha3」部分を省略することもできる。
例えば、「H45_(-5)-5_25-35」又は「H45_(-5)-5_H45_25-35」の場合、アンチセンスオリゴマーを構成する3’末端側ユニットオリゴマーの標的塩基配列が「H45_(-5)-5」であり、5’末端側ユニットオリゴマーの標的塩基配列が「H45_25-35」である塩基配列を意味する。
「Ha4_b4-c4_Ha5_b5-c5_Ha6_b6-c6」は、本明細書における第三の態様のアンチセンスオリゴマーの標的塩基配列である。「Ha4_b4-c4_Ha5_b5-c5_Ha6_b6-c6」の第1の部分である「Ha4_b4-c4」は、該アンチセンスオリゴマーを構成する3’末端側ユニットオリゴマーの標的塩基配列を意味し、第2の部分である「Ha5_b5-c5」は、該アンチセンスオリゴマーを構成する中間部ユニットオリゴマーの標的塩基配列を意味し、第3の部分である「Ha6_b6-c6」は、該アンチセンスオリゴマーを構成する5’末端側ユニットオリゴマーの標的塩基配列を意味する。「Ha6_b6-c6」は、その3’末端に付加的な1塩基を有していてもよく、そのような標的塩基配列は、「Ha4_b4-c4_Ha5_b5-c5_Ha6_b6-c6_N」で表される(「N」は任意の塩基を表す)。各「Ha4_b4-c4」、「Ha5_b5_-c5」、及び「Ha6_b6_-c6」は、上記「Ha1_b1-c1」の表記方法と同様である。
なお、「Ha4」と「Ha5」及び「Ha6」が同じである場合には、「_Ha5」及び「_Ha6」部分を省略することもできる。
例えば、「H45_(-5)-5_25-35_60-70」又は「H45_(-5)-5_H45_25-35_H45_60-70」の場合、アンチセンスオリゴマーを構成する3’末端側ユニットオリゴマーの標的塩基配列が「H45_(-5)-5」であり、中間部分ユニットオリゴマーの標的塩基配列が「H45_25-35」であり、5’末端側ユニットオリゴマーの標的塩基配列が「H45_60-70」である塩基配列を意味する。
表11のPMOの中、
R2を標的領域とするものは、別の態様においてはPMO No.22~71、91~93、98~99が挙げられ、さらに別の態様においてはPMO No.22~59、91~93、98~99が挙げられ;
R4を標的領域とするものは、別の態様においてはPMO No.150~163が挙げられ、さらに別の態様においてはPMO No.150~160が挙げられ;
R6を標的領域とするものは、別の態様においてはPMO No.171~177が挙げられ、さらに別の態様においてはPMO No.171~176が挙げられ;
R8を標的領域とするものは、別の態様においてはPMO No.180が挙げられ;R10を標的領域とするものは、別の態様においてはPMO No.183が挙げられ;R12を標的領域とするものは、別の態様においてはPMO No.186~191が挙げられ;
R16を標的領域とするものは、別の態様においてはPMO No.197、198が挙げられ、さらに別の態様においてはPMO No.197が挙げられ;
R18を標的領域とするものは、別の態様においてはPMO No.201~206が挙げられ;
R22を標的領域とするものは、別の態様においてはPMO No.217~223が挙げられ、さらに別の態様においてはPMO No.217~222が挙げられ;
R24を標的とするものは、別の態様においてはPMO No.128~142が挙げられる。
5’末端塩基に対応する、アミノポリスチレン樹脂に担持された4-{[(2S,6R)-6-(4-ベンズアミド-2-オキソピリミジン-1-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]メトキシ}-4-オキソブタン酸(化合物1)、アミノポリスチレン樹脂に担持された4-{[(2S,6R)-6-(5-メチル-2,4-ジオキソピリミジン-1-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]メトキシ}-4-オキソブタン酸(化合物2)、アミノポリスチレン樹脂に担持された4-{[(2S,6R)-6-(6-ベンズアミドプリン-9-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]メトキシ}-4-オキソブタン酸(化合物3)、又はアミノポリスチレン樹脂に担持された4-{{(2S,6R)-6-{6-(2-シアノエトキシ)-2-[(2-フェノキシアセチル)アミノ]プリン-9-イル}-4-トリチルモルホリン-2-イル}メトキシ}-4-オキソブタン酸(化合物4)0.2gをフィルター付きカラムに充填し、核酸合成機(AKTA Oligopilot 10 plus)を使用して、表12に示す合成サイクルを開始した。表11に記載の各PMOの塩基配列になるよう、各カップリングサイクルにおいて所望のモルホリノモノマー化合物を添加した(表12を参照)。
なお、デブロック溶液としては、3%(w/v)トリフルオロ酢酸を含有するジクロロメタン溶液を用いた。中和・洗浄溶液としては、N,N-ジイソプロピルエチルアミンを10%(v/v)になるように、かつテトラヒドロフランを5%(v/v)になるように、35%(v/v)のアセトニトリルを含有するジクロロメタン溶液で溶解したものを用いた。カップリング溶液Aとしては、モルホリノモノマー化合物を0.10Mになるように、テトラヒドロフランで溶解したものを用いた。カップリング溶液Bとしては、N,N-ジイソプロピルエチルアミンを20%(v/v)になるように、かつテトラヒドロフランを10%(v/v)になるように、アセトニトリルで溶解したものを用いた。キャッピング溶液としては、アセトニトリルに対して20%(v/v)の無水酢酸と30%(v/v)の2,6-ルチジンを溶解したものを使用した。
モルホリノモノマー化合物としては、表13に記載のモルホリノモノマー化合物(A)、モルホリノモノマー化合物(C)、モルホリノモノマー化合物(T)、及びモルホリノモノマー化合物(G)を用いた。
上記で合成したPMOが担持されたアミノポリスチレン樹脂を反応容器から回収し、2時間以上室温で減圧乾燥した。乾燥したアミノポリスチレン樹脂に担持されたPMOを反応容器に入れ、28%アンモニア水-エタノール(1/4)5mLを加え、55℃で15時間撹拌した。アミノポリスチレン樹脂をろ別し、水-エタノール(1/4)1mLで洗浄した。得られたろ液を減圧濃縮した。得られた残渣を20mMの酢酸-トリエチルアミン緩衝液(TEAA緩衝液)とアセトニトリルの混合溶媒(4/1)10mLに溶解し、メンブレンフィルターでろ過した。得られたろ液を逆相HPLCにて精製した。使用した条件を表14に示す。
各フラクションを分析して、目的物を回収し、減圧濃縮した。濃縮残渣に2Mのリン酸水溶液0.5mLを加え、15分間攪拌した。さらに、2Mの水酸化ナトリウム水溶液2mLを加えてアルカリ性とし、メンブレンフィルター(0.45μm)でろ過した。
得られた目的物を含有する水溶液を陰イオン交換樹脂カラムで精製した。使用した条件を表15に示す。
各フラクションを分析(HPLC)し、目的物を水溶液として得た。得られた水溶液に0.1Mのリン酸緩衝液(pH6.0)を添加し中和した。次いで、表16に示す条件で逆相HPLCにて脱塩した。
目的物を回収し、減圧濃縮した。得られた残渣を水に溶かし、凍結乾燥して、白色綿状固体として目的化合物である各PMOを得た。ESI-TOF-MSの計算値、測定値を下記表17に示す。
ヒトジストロフィン遺伝子のイントロン中のスプライシングサイレンサー又はシングルスキッピングに関与するスプライス部位を標的とするアンチセンスPMOの製造
イントロンのドナー付近又はアクセプター付近の領域を標的とするPMOと同様の方法で、ヒトジストロフィン遺伝子の(i)イントロン44のスプライシングサイレンサー配列又はシングルスキッピングに関与するスプライス部位を標的とするPMO No.233の塩基配列(配列番号257)を有するPMO、(ii)イントロン45のスプライシングサイレンサー配列又はシングルスキッピングに関与するスプライス部位を標的とするPMO No.234~244の塩基配列(配列番号258~268)を有するPMO、(iii)イントロン44のアクセプター付近の領域(R2)とイントロン45のスプライシングサイレンサー配列又はシングルスキッピングに関与するスプライス部位を標的とするPMO No.245~249の塩基配列(配列番号269~273)を有するPMO(連結型)、及び(iv)エクソン45のスプライシングサイレンサー配列を標的とするPMO No.250~251の塩基配列(配列番号274~275)を有するPMOを合成した。各PMOの5’末端は、イントロンのドナー付近又はアクセプター付近の領域を標的とするPMOと同様に基(3)である。各PMOを表18に示し、ESI-TOF-MSの計算値、測定値を表19に示す。
下線はイントロン中のスプライシングサイレンサー配列又はシングルスキッピングに関与するスプライス部位に対応すると予想される塩基配列を示す。
[実施例2:アンチセンスオリゴマーのマルチエクソンスキッピング活性試験]
<試験例1>
ヒトジストロフィン遺伝子のマルチエクソンスキッピングのIn vitroアッセイ(1):マルチエクソンスキッピングの誘導
手順
RD細胞(ヒト横紋筋肉腫細胞株、CCL-136、ATCCより購入)3.5×10個に対して、表11のアンチセンスオリゴマー(PMO No.55、59、78、65、75、77、102、35、52、47、50、46、43、40、139、119、142、113、51、11、45、54、41、74、66、64、63、68、76、28、27、225、228、1、5、132、131、128、163、162、及び161(配列番号55、59、78、65、75、77、102、35、52、47、50、46、43、40、139、119、142、113、51、11、45、54、41、74、66、64、63、68、76、28、27、225、228、1、5、132、131、128、163、162、及び161))をそれぞれ25~50μMの濃度で単独、あるいは2,3本の組合せで導入した。試薬はAmaxa Cell Line Nucleofector Kit Lを用いてNucleofector II(Lonza)により導入した。プログラムはT-030を用いた。
導入後、細胞を、10%ウシ胎児血清(FBS)(インビトロジェン社製)を含むEagle's minimal essential medium(EMEM)培地(シグマ社製、以下同じ)2mL中、37℃、5%COの条件下で三晩培養した。
細胞をPBS(ニッスイ社製、以下同じ)で1回洗浄した後、1%の2-メルカプトエタノール(ナカライテスク社製)を含むBuffer RLT(キアゲン社製)を350μL細胞に添加し、数分間室温に放置して細胞を溶解させ、QIAshredder ホモジナイザー(キアゲン社製)に回収した。15,000rpmで2分間遠心し、ホモジネートを作製した。RNeasy Mini Kit(キアゲン社製)に添付のプロトコールに従って全RNAを抽出した。抽出した全RNAの濃度はNanoDrop ND-1000(エル・エム・エス社製)を用いて測定した。
抽出した全RNA800ngに対し、QIAGEN OneStep RT-PCR Kit(キアゲン社製)を用いてOne-Step RT-PCRを行った。キットに添付のプロトコールに従って、反応液を調製した。サーマルサイクラーはTaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Touch(タカラバイオ社製)を用いた。用いたRT-PCRのプログラムは、以下のとおりである。
50℃、30分間:逆転写反応
95℃、15分間:ポリメラーゼ活性化、逆転写酵素不活性化、cDNA熱変性
[94℃、10秒間:57℃、30秒間;72℃、1分間]×33サイクル:PCR増幅
72℃、10分間:最終伸長反応
RT-PCRに使用したフォワードプライマーとリバースプライマーの塩基配列は以下のとおりである。
フォワードプライマー:5'-ATTTGACAGATCTGTTGAGAAATGG-3'(配列番号276)リバースプライマー1:5'-GGCTGTTTTCATCCAGGTTGTG-3'(配列番号277)リバースプライマー2:5'-AGTTGCTGCTCTTTTCCAGGT-3'(配列番号278)
フォワードプライマーとリバースプライマー2の組合せで、エクソン45~55のマルチエクソンスキッピングが生じた転写産物を検出することができる。また、フォワードプライマーとリバースプライマー1の組合せで、スキッピングが生じていない転写産物及びエクソン45の単独エクソンスキッピングが生じた転写産物を検出することができる。
上記PCRの反応産物をBioanalyzer(アジレント社製)及びMultiNA(島津製作所社製)を用いて解析した。
エクソン45~55のうちいずれか2つ以上の番号順に連続するエクソンがスキップしたバンドのポリオリゴヌクレオチド量「A」と、エクソン45~55のうちいずれか1つのエクソンがスキッピングしたバンドのポリヌクレオチド量「B」と、スキッピングが生じていないバンドのポリオリゴヌクレオチド量「C」を測定した。これら「A」、「B」、及び「C」の測定値に基づき、以下の式に従って、マルチエクソンスキッピングのスキッピング効率を求めた。
スキッピング効率(%)=A/(A+B+C)×100
結果
結果を図1~16に示す。PMO No.55、59、78、65、75、77、102、35、52、47、50、46、43、40、139、119、142、113、51、11、45、54、41、74、66、64、63、68、76、28、27、225、228、1、5、132、131、128、163、162、及び161(配列番号55、59、78、65、75、77、102、35、52、47、50、46、43、40、139、119、142、113、51、11、45、54、41、74、66、64、63、68、76、28、27、225、228、1、5、132、131、128、163、162、及び161)を単独で、あるいは組合せて導入することにより、エクソン45~55のマルチエクソンスキッピングが誘導された。
したがって、表11に記載の本発明のアンチセンスオリゴマーは、単独で又は組合せて用いることにより、マルチエクソンスキッピングを有効に誘導する、あるいは誘導するであろうことが判明した。
なお、PMO No.6、7、8、10、14、26、29、38、39、53、58、67、80、82、86、92、97、98、100、121、122、124、125、126、130、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、231、232(配列番号6、7、8、10、14、26、29、38、39、53、58、67、80、82、86、92、97、98、100、121、122、124、125、126、130、144、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、231、232)を導入することによっても、エクソン45~55のマルチエクソンスキッピングが誘導されることが確認されている。
<試験例2>
ヒトジストロフィン遺伝子のマルチエクソンスキッピングのIn vitroアッセイ(2):マルチエクソンスキッピングの促進
手順
RD細胞(ヒト横紋筋肉腫細胞株、CCL-136, ATCCより購入)3.5×10個に対して、表11のアンチセンスオリゴマー(PMO No.75)25~50μMに加えて、表18のアンチセンスオリゴマー(PMO No.236、237、又は239)25~50μMを組合せて導入し、試験例1と同様の手順でアッセイを行った。
結果
結果を図17及び18に示す。PMO No.75(配列番号75)単独の場合と比較して、PMO No.236、237、又は239(配列番号260、261、又は263)を組合せて導入した場合には、エクソン45~55のマルチエクソンスキッピングのスキッピング効率が増大した。一方、エクソン45の単独エクソンスキッピングのスキッピング効率は減少した。
したがって、表11に記載の本発明のアンチセンスオリゴマーに表18に記載の本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーを組合せて用いることにより、マルチエクソンスキッピングを促進する、あるいは促進するであろうことが判明した。
<試験例3>
ヒトジストロフィン遺伝子のマルチエクソンスキッピングのIn vitroアッセイ(3):全般的なマルチエクソンスキッピングの促進
手順
試験例3はOne-Step RT-PCRを以下のように行ったことを除き、試験例2と同様の手順で行った。
抽出した全RNA800ngに対し、QIAGEN OneStep RT-PCR Kit(キアゲン社製)を用いてOne-Step RT-PCRを行った。キットに添付のプロトコールに従って、反応液を調製した。サーマルサイクラーはTaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Touch(タカラバイオ社製)を用いた。用いたRT-PCRのプログラムは、以下のとおりである。
50℃、30分間:逆転写反応
95℃、15分間:ポリメラーゼ活性化、逆転写酵素不活性化、cDNA熱変性
[94℃、10秒間;60℃、30秒間;72℃、2分間]×40サイクル:PCR増幅
72℃、10分間:最終伸長反応
RT-PCRに使用したフォワードプライマーとリバースプライマーの塩基配列は以下のとおりである。
フォワードプライマー2:5'-ATTTGACAGATCTGTTGAGAAATGG-3'(配列番号279)リバースプライマー3:5'-GGCTCCAATAGTGGTCAGTCC-3'(配列番号280)フォワードプライマー3:5'-CCTGAGAATTGGGAACATGC-3'(配列番号281)リバースプライマー4: 5'-CCTCCTTCCATGACTCAAGC-3'(配列番号282)
ヒトジストロフィン遺伝子の、エクソン45~46、エクソン45~47、エクソン45~48、又はエクソン45~49のマルチエクソンスキッピングが生じた転写産物は、フォワードプライマー2とリバースプライマー3の組合せで検出することができる。一方、エクソン45~46、エクソン45~47、エクソン45~48、エクソン45~49、エクソン45~50、エクソン45~51、又はエクソン45~52のマルチエクソンスキッピングが生じた転写産物は、フォワードプライマー3とリバースプライマー4の組合せで検出される。
上記PCRの反応産物をBioanalyzer(アジレント社製)及びMultiNA(島津製作所社製)を用いて分析し、各エクソンスキッピングが生じた転写産物のPCR産物量を定量した。
結果
結果を図19~22に示す。PMO No.75(配列番号75)単独の場合と比較して、PMO No.236又は239(配列番号260又は263)を組合せて導入した場合には、エクソン45~55のマルチエクソンスキッピングのスキッピング(試験例2)に加えて、エクソン45~46、エクソン45~47、エクソン45~48、又はエクソン45~49、エクソン45~50、エクソン45~51、及びエクソン45~52のマルチエクソンスキッピングのスキッピング効率も増大した。
したがって、表11に記載の本発明のアンチセンスオリゴマーに表18に記載の本発明のサプレッサーアンチセンスオリゴマーを組合せて用いることにより、全般的にマルチエクソンスキッピングを促進する、あるいは促進するであろうことが判明した。
本発明によりヒトジストロフィンのマルチエクソンスキッピングを可能にするアンチセンスオリゴマー及びサプレッサーアンチセンスオリゴマーが提供される。本発明のアンチセンスオリゴマー及びサプレッサーアンチセンスオリゴマーを用いることにより、新たなDMD治療薬及び治療方法が提供される。

Claims (13)

  1. (i)ヒトジストロフィンpre-mRNAにおける第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか2つ以上の番号順に連続するエクソンを同時にスキッピングさせるアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物、及び
    (ii)ヒトジストロフィンpre-mRNAの第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか1つのエクソンが単一でスキッピングすることを抑制するサプレッサーアンチセンスオリゴマー若しくはその医薬的に許容可能な塩又はそれらの水和物
    を含む医薬組成物であって、
    (1)前記アンチセンスオリゴマーが配列番号75からなるオリゴマーであり、前記サプレッサーアンチセンスオリゴマーが配列番号260からなるオリゴマーであるか、
    (2)前記アンチセンスオリゴマーが配列番号75からなるオリゴマーであり、前記サプレッサーアンチセンスオリゴマーが配列番号261からなるオリゴマーであるか、又は
    (3)前記アンチセンスオリゴマーが配列番号75からなるオリゴマーであり、前記サプレッサーアンチセンスオリゴマーが配列番号263からなるオリゴマーである、
    医薬組成物。
  2. 前記アンチセンスオリゴマー及び/又は前記サプレッサーアンチセンスオリゴマーがオリゴヌクレオチドである、請求項1に記載の医薬組成物。
  3. 前記オリゴヌクレオチドを構成する少なくとも1つのヌクレオチドの糖部分及び/又はリン酸結合部分が修飾されている、請求項に記載の医薬組成物。
  4. 前記オリゴヌクレオチドを構成する少なくとも1つのヌクレオチドの糖部分が、2’位の-OH基が、-OR、-R、-R’OR、-SH、-SR、-NH、-NHR、-NR、-N、-CN、-F、-Cl、-Br、及び-Iからなる群より選択されるいずれかの基で置換されたリボースである、請求項又はに記載の医薬組成物
    (前記Rは、アルキル又はアリールを示し、前記R’は、アルキレンを示す。)。
  5. 前記オリゴヌクレオチドを構成する少なくとも1つのヌクレオチドのリン酸結合部分が、ホスホロチオエート結合、ホスホロジチオエート結合、アルキルホスホネート結合、ホスホロアミデート結合、及びボラノフォスフェート結合からなる群より選択されるいずれか1つのものである、請求項のいずれか一項に記載の医薬組成物。
  6. 前記アンチセンスオリゴマー及び/又は前記サプレッサーアンチセンスオリゴマーがモルホリノオリゴマーである、請求項1に記載の医薬組成物。
  7. 前記アンチセンスオリゴマー及び/又は前記サプレッサーアンチセンスオリゴマーがホスホロジアミデートモルホリノオリゴマーである、請求項に記載の医薬組成物。
  8. 前記アンチセンスオリゴマー及び/又は前記サプレッサーアンチセンスオリゴマーの5’末端が、下記化学式(1)~(3)のいずれかの基である、請求項又はに記載の医薬組成物。
  9. さらに医薬的に許容可能な担体を含む、請求項1~のいずれか一項に記載の医薬組成物。
  10. 筋ジストロフィーの治療のための、請求項1~のいずれか一項に記載の医薬組成物。
  11. ヒト患者に投与するための、請求項1~10のいずれか一項に記載の医薬組成物。
  12. 前記患者が、ジストロフィン遺伝子にエクソン45~55スキップの対象となる変異を有する患者である、請求項11に記載の医薬組成物。
  13. 前記治療が、ヒトジストロフィンpre-mRNAの第45番目のエクソンから第55番目のエクソンからなる群より選択されるいずれか2つ以上の番号順に連続するエクソンのスキッピングを行うことを伴う、請求項1012のいずれか一項に記載の医薬組成物。
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