JP7803502B2 - 口腔扁平苔癬を診断するための新規のバイオマーカー及びその用途 - Google Patents

口腔扁平苔癬を診断するための新規のバイオマーカー及びその用途

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Description

本発明は、口腔扁平苔癬を診断するための新規のバイオマーカーと、それを利用した口腔扁平苔癬を診断するための情報提供方法などに関する。
口腔扁平苔癬（ｏｒａｌ ｌｉｃｈｅｎ ｐｌａｎｕｓ、ＯＬＰ）は、口の中の粘膜に影響を及ぼす持続的な（慢性）炎症状態をいう。口腔扁平苔癬は、白色の網状の斑点のように現れることがある（赤く腫れ上がった組織、又は開いた傷口）。このような病変は、灼熱感、痛み、又はその他の不便を誘発しかねない。
症状は一般に管理できるものの、口腔扁平苔癬のある人は影響を受ける部位に口腔癌が発生する危険があるため、定期的なモニタリングが求められる。また、口腔扁平苔癬は、炎症性疾患の特徴上、その発症原因及び明確な治療方法が確認されておらず、対症的な治療のみが行われている実状である。
それと共に、口腔扁平苔癬は、口腔内の白色病巣などの類似な症状を示す他の疾患との区分が臨床的に容易ではないため、誤った診断及び処置が行われることがある。特に、一部の形態の口腔扁平苔癬は前癌病変としても議論されており、その診断及び治療において格別な注意を要する。
ここで、本発明者は、口腔扁平苔癬の診断に利用できるバイオマーカーを発掘し、それを臨床的に活用するために本発明を完成して提供しようとする。
Integrative analysis of mRNA and miRNA expression profiles in oral lichen planus: preliminary results, Junjun Chen et al., Oral Surg Oral Med Oral Pathol Oral Radiol;124(4):390-402.e17 Tumour Necrosis Factor Alpha (TNF-α) and Oral Squamous Cell Carcinoma, Gary Brierly et al., Cancers (Basel). 2023 Mar; 15(6): 1841. Salivary MMP-1, MMP-2, MMP-3 and MMP-13 Levels in Patients with Oral Lichen Planus and Squamous Cell Carcinoma, Tahereh Nosratzehi et al., Asian Pac J Cancer Prev. 2017; 18(7): 1947-1951.
本発明が達成しようとする技術的な課題は、ＣＬＣ（Ｇａｌｅｃｔｉｎ－１０、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ０５３１５）、ＴＮＦＡＩＰ８（Ｔｕｍｏｒ ｎｅｃｒｏｓｉｓ ｆａｃｔｏｒ ａｌｐｈａ－ｉｎｄｕｃｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎ ８、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｏ９５３７９）、ＥＶＩ５Ｌ（ＥＶＩ５－ｌｉｋｅ ｐｒｏｔｅｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ９６ＣＮ４）、ＩＳＧ１５（Ｕｂｉｑｕｉｔｉｎ－ｌｉｋｅ ｐｒｏｔｅｉｎ ＩＳＧ１５、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ０５１６１）、ＰＩＧＳ（ＧＰＩ ｔｒａｎｓａｍｉｄａｓｅ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ ＰＩＧ－Ｓ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ９６Ｓ５２）、ＳＬＣ４Ａ１（Ｂａｎｄ ３ ａｎｉｏｎ ｔｒａｎｓｐｏｒｔ ｐｒｏｔｅｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ０２７３０）、ＭＹＨ１（Ｍｙｏｓｉｎ－１、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ１２８８２）、ＣＬＴＡ（Ｃｌａｔｈｒｉｎ ｌｉｇｈｔ ｃｈａｉｎ Ａ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ０９４９６）、ＣＣＡＲ２（Ｃｅｌｌ ｃｙｃｌｅ ａｎｄ ａｐｏｐｔｏｓｉｓ ｒｅｇｕｌａｔｏｒ ｐｒｏｔｅｉｎ ２、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ８Ｎ１６３）、ＧＲＫ６（Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ－ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ｋｉｎａｓｅ ６、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ４３２５０）、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ（ＡＴＰ ｓｙｎｔｈａｓｅ ｓｕｂｕｎｉｔ ｄｅｌｔａ、ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ３００４９）、ＡＳＲＧＬ１（Ｉｓｏａｓｐａｒｔｙｌ ｐｅｐｔｉｄａｓｅ／Ｌ－ａｓｐａｒａｇｉｎａｓｅ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ７Ｌ２６６）、ＢＳＴ１（ＡＤＰ－ｒｉｂｏｓｙｌ ｃｙｃｌａｓｅ／ｃｙｃｌｉｃ ＡＤＰ－ｒｉｂｏｓｅ ｈｙｄｒｏｌａｓｅ ２、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ１０５８８）、ＣＹＢＡ（Ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ ｂ－２４５ ｌｉｇｈｔ ｃｈａｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ１３４９８）、ＡＳＡＰ１（Ａｒｆ－ＧＡＰ ｗｉｔｈ ＳＨ３ ｄｏｍａｉｎ、ＡＮＫ ｒｅｐｅａｔ ａｎｄ ＰＨ ｄｏｍａｉｎ－ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ １、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ９ＵＬＨ１）、ＭＡＰ２Ｋ４（Ｄｕａｌ ｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙ ｍｉｔｏｇｅｎ－ａｃｔｉｖａｔｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎ ｋｉｎａｓｅ ｋｉｎａｓｅ ４、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ４５９８５）、ＲＮＡＳＥ２（Ｎｏｎ－ｓｅｃｒｅｔｏｒｙ ｒｉｂｏｎｕｃｌｅａｓｅ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ１０１５３）、ＮＩＰＳＮＡＰ２（Ｐｒｏｔｅｉｎ ＮｉｐＳｎａｐ ｈｏｍｏｌｏｇ ２、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｏ７５３２３）、ＭＭＰ１（Ｉｎｔｅｒｓｔｉｔｉａｌ ｃｏｌｌａｇｅｎａｓｅ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ０３９５６）、ＥＷＳＲ１（ＲＮＡ－ｂｉｎｄｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ ＥＷＳ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ０１８４４）、ＣＣＬ２８（Ｃ－Ｃ ｍｏｔｉｆ ｃｈｅｍｏｋｉｎｅ ２８、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ９ＮＲＪ３）、ＬＥＧ１（Ｐｒｏｔｅｉｎ ＬＥＧ１ ｈｏｍｏｌｏｇ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ６Ｐ５Ｓ２）、ＡＣＢＰ（Ａｃｙｌ－ＣｏＡ－ｂｉｎｄｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ０７１０８）、ＡＰＯＭ（Ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ Ｍ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｏ９５４４５）、ＴＦＦ３（Ｔｒｅｆｏｉｌ ｆａｃｔｏｒ ３、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ０７６５４）、ＦＯＬＲ１（Ｆｏｌａｔｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ａｌｐｈａ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ１５３２８）、ＷＦＤＣ２（ＷＡＰ ｆｏｕｒ－ｄｉｓｕｌｆｉｄｅ ｃｏｒｅ ｄｏｍａｉｎ ｐｒｏｔｅｉｎ ２、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ１４５０８）、ＳＥＲＰＩＮＡ１（Ａｌｐｈａ－１－ａｎｔｉｔｒｙｐｓｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ０１００９）、ＳＬＵＲＰ１（Ｓｅｃｒｅｔｅｄ Ｌｙ－６／ｕＰＡＲ－ｒｅｌａｔｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎ １、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ５５０００）、ＤＥＦＢ４Ａ（Ｄｅｆｅｎｓｉｎ ｂｅｔａ ４Ａ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｏ１５２６３）、ＳＬＰＩ（Ａｎｔｉｌｅｕｋｏｐｒｏｔｅｉｎａｓｅ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ０３９７３）、ＩＧＦＢＰ７（Ｉｎｓｕｌｉｎ－ｌｉｋｅ ｇｒｏｗｔｈ ｆａｃｔｏｒ－ｂｉｎｄｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ ７、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ１６２７０）、ＩＧＬＶ１－５１（Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ ｌａｍｂｄａ ｖａｒｉａｂｌｅ １－５１、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ０１７０１）、ＳＥＲＰＩＮＩ１（Ｎｅｕｒｏｓｅｒｐｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ９９５７４）、ＩＧＬＶ３－９（Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ ｌａｍｂｄａ ｖａｒｉａｂｌｅ ３－９、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ａ０Ａ０７５Ｂ６Ｋ５）、ＳＥＲＰＩＮＡ３（Ａｌｐｈａ－１－ａｎｔｉｃｈｙｍｏｔｒｙｐｓｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ０１０１１）、ＳＰＡＴＳ２Ｌ（ＳＰＡＴＳ２－ｌｉｋｅ ｐｒｏｔｅｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ９ＮＵＱ６）、ＡＰＯＣ１（Ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ Ｃ－Ｉ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ０２６５４）、ＩＧＫＶ２－２９（Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ ｋａｐｐａ ｖａｒｉａｂｌｅ ２－２９、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ａ２ＮＪＶ５）及びＫＡＬＲＮ（Ｋａｌｉｒｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｏ６０２２９）から構成される群より選択されるいずれか１つ以上を含む、口腔扁平苔癬の診断用バイオマーカー組成物を提供する。
本発明が達成しようとする他の技術的な課題は、ＣＬＣ、ＴＮＦＡＩＰ８、ＥＶＩ５Ｌ、ＩＳＧ１５、ＰＩＧＳ、ＳＬＣ４Ａ１、ＭＹＨ１、ＣＬＴＡ、ＣＣＡＲ２、ＧＲＫ６、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ、ＡＳＲＧＬ１、ＢＳＴ１、ＣＹＢＡ、ＡＳＡＰ１、ＭＡＰ２Ｋ４、ＲＮＡＳＥ２、ＮＩＰＳＮＡＰ２、ＭＭＰ１、ＥＷＳＲ１、ＣＣＬ２８、ＬＥＧ１、ＡＣＢＰ、ＡＰＯＭ、ＴＦＦ３、ＦＯＬＲ１、ＷＦＤＣ２、ＳＥＲＰＩＮＡ１、ＳＬＵＲＰ１、ＤＥＦＢ４Ａ、ＳＬＰＩ、ＩＧＦＢＰ７、ＩＧＬＶ１－５１、ＳＥＲＰＩＮＩ１、ＩＧＬＶ３－９、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＰＡＴＳ２Ｌ、ＡＰＯＣ１、ＩＧＫＶ２－２９及びＫＡＬＲＮから構成される群より選択されるいずれか１つ以上のタンパク質又はそれを暗号化する遺伝子の発現レベルを測定できる製剤を含む、口腔扁平苔癬の診断用組成物を提供することにある。
本発明が達成しようとする更なる技術的な課題は、ＣＬＣ、ＴＮＦＡＩＰ８、ＥＶＩ５Ｌ、ＩＳＧ１５、ＰＩＧＳ、ＳＬＣ４Ａ１、ＭＹＨ１、ＣＬＴＡ、ＣＣＡＲ２、ＧＲＫ６、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ、ＡＳＲＧＬ１、ＢＳＴ１、ＣＹＢＡ、ＡＳＡＰ１、ＭＡＰ２Ｋ４、ＲＮＡＳＥ２、ＮＩＰＳＮＡＰ２、ＭＭＰ１、ＥＷＳＲ１、ＣＣＬ２８、ＬＥＧ１、ＡＣＢＰ、ＡＰＯＭ、ＴＦＦ３、ＦＯＬＲ１、ＷＦＤＣ２、ＳＥＲＰＩＮＡ１、ＳＬＵＲＰ１、ＤＥＦＢ４Ａ、ＳＬＰＩ、ＩＧＦＢＰ７、ＩＧＬＶ１－５１、ＳＥＲＰＩＮＩ１、ＩＧＬＶ３－９、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＰＡＴＳ２Ｌ、ＡＰＯＣ１、ＩＧＫＶ２－２９及びＫＡＬＲＮから構成される群より選択されるいずれか１つ以上のタンパク質又はそれを暗号化する遺伝子の発現レベルを測定するステップを含む、口腔扁平苔癬を診断するための情報提供方法を提供することにある。
しかし、本発明が達成しようとする技術的な課題は、以上で言及した課題に制限されず、言及されない更なる課題は、下記の記載によって当技術分野の当業者にとって明確に理解できるものである。
前記課題を解決するために、本発明者は、ＣＬＣ（Ｇａｌｅｃｔｉｎ－１０、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ０５３１５）、ＴＮＦＡＩＰ８（Ｔｕｍｏｒ ｎｅｃｒｏｓｉｓ ｆａｃｔｏｒ ａｌｐｈａ－ｉｎｄｕｃｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎ ８、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｏ９５３７９）、ＥＶＩ５Ｌ（ＥＶＩ５－ｌｉｋｅ ｐｒｏｔｅｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ９６ＣＮ４）、ＩＳＧ１５（Ｕｂｉｑｕｉｔｉｎ－ｌｉｋｅ ｐｒｏｔｅｉｎ ＩＳＧ１５、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ０５１６１）、ＰＩＧＳ（ＧＰＩ ｔｒａｎｓａｍｉｄａｓｅ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ ＰＩＧ－Ｓ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ９６Ｓ５２）、ＳＬＣ４Ａ１（Ｂａｎｄ ３ ａｎｉｏｎ ｔｒａｎｓｐｏｒｔ ｐｒｏｔｅｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ０２７３０）、ＭＹＨ１（Ｍｙｏｓｉｎ－１、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ１２８８２）、ＣＬＴＡ（Ｃｌａｔｈｒｉｎ ｌｉｇｈｔ ｃｈａｉｎ Ａ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ０９４９６）、ＣＣＡＲ２（Ｃｅｌｌ ｃｙｃｌｅ ａｎｄ ａｐｏｐｔｏｓｉｓ ｒｅｇｕｌａｔｏｒ ｐｒｏｔｅｉｎ ２、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ８Ｎ１６３）、ＧＲＫ６（Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ－ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ｋｉｎａｓｅ ６、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ４３２５０）、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ（ＡＴＰ ｓｙｎｔｈａｓｅ ｓｕｂｕｎｉｔ ｄｅｌｔａ、ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ３００４９）、ＡＳＲＧＬ１（Ｉｓｏａｓｐａｒｔｙｌ ｐｅｐｔｉｄａｓｅ／Ｌ－ａｓｐａｒａｇｉｎａｓｅ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ７Ｌ２６６）、ＢＳＴ１（ＡＤＰ－ｒｉｂｏｓｙｌ ｃｙｃｌａｓｅ／ｃｙｃｌｉｃ ＡＤＰ－ｒｉｂｏｓｅ ｈｙｄｒｏｌａｓｅ ２、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ１０５８８）、ＣＹＢＡ（Ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ ｂ－２４５ ｌｉｇｈｔ ｃｈａｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ１３４９８）、ＡＳＡＰ１（Ａｒｆ－ＧＡＰ ｗｉｔｈ ＳＨ３ ｄｏｍａｉｎ、ＡＮＫ ｒｅｐｅａｔ ａｎｄ ＰＨ ｄｏｍａｉｎ－ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ １、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ９ＵＬＨ１）、ＭＡＰ２Ｋ４（Ｄｕａｌ ｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙ ｍｉｔｏｇｅｎ－ａｃｔｉｖａｔｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎ ｋｉｎａｓｅ ｋｉｎａｓｅ ４、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ４５９８５）、ＲＮＡＳＥ２（Ｎｏｎ－ｓｅｃｒｅｔｏｒｙ ｒｉｂｏｎｕｃｌｅａｓｅ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ１０１５３）、ＮＩＰＳＮＡＰ２（Ｐｒｏｔｅｉｎ ＮｉｐＳｎａｐ ｈｏｍｏｌｏｇ ２、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｏ７５３２３）、ＭＭＰ１（Ｉｎｔｅｒｓｔｉｔｉａｌ ｃｏｌｌａｇｅｎａｓｅ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ０３９５６）、ＥＷＳＲ１（ＲＮＡ－ｂｉｎｄｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ ＥＷＳ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ０１８４４）、ＣＣＬ２８（Ｃ－Ｃ ｍｏｔｉｆ ｃｈｅｍｏｋｉｎｅ ２８、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ９ＮＲＪ３）、ＬＥＧ１（Ｐｒｏｔｅｉｎ ＬＥＧ１ ｈｏｍｏｌｏｇ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ６Ｐ５Ｓ２）、ＡＣＢＰ（Ａｃｙｌ－ＣｏＡ－ｂｉｎｄｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ０７１０８）、ＡＰＯＭ（Ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ Ｍ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｏ９５４４５）、ＴＦＦ３（Ｔｒｅｆｏｉｌ ｆａｃｔｏｒ ３、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ０７６５４）、ＦＯＬＲ１（Ｆｏｌａｔｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ａｌｐｈａ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ１５３２８）、ＷＦＤＣ２（ＷＡＰ ｆｏｕｒ－ｄｉｓｕｌｆｉｄｅ ｃｏｒｅ ｄｏｍａｉｎ ｐｒｏｔｅｉｎ ２、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ１４５０８）、ＳＥＲＰＩＮＡ１（Ａｌｐｈａ－１－ａｎｔｉｔｒｙｐｓｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ０１００９）、ＳＬＵＲＰ１（Ｓｅｃｒｅｔｅｄ Ｌｙ－６／ｕＰＡＲ－ｒｅｌａｔｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎ １、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ５５０００）、ＤＥＦＢ４Ａ（Ｄｅｆｅｎｓｉｎ ｂｅｔａ ４Ａ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｏ１５２６３）、ＳＬＰＩ（Ａｎｔｉｌｅｕｋｏｐｒｏｔｅｉｎａｓｅ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ０３９７３）、ＩＧＦＢＰ７（Ｉｎｓｕｌｉｎ－ｌｉｋｅ ｇｒｏｗｔｈ ｆａｃｔｏｒ－ｂｉｎｄｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ ７、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ１６２７０）、ＩＧＬＶ１－５１（Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ ｌａｍｂｄａ ｖａｒｉａｂｌｅ １－５１、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ０１７０１）、ＳＥＲＰＩＮＩ１（Ｎｅｕｒｏｓｅｒｐｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ９９５７４）、ＩＧＬＶ３－９（Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ ｌａｍｂｄａ ｖａｒｉａｂｌｅ ３－９、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ａ０Ａ０７５Ｂ６Ｋ５）、ＳＥＲＰＩＮＡ３（Ａｌｐｈａ－１－ａｎｔｉｃｈｙｍｏｔｒｙｐｓｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ０１０１１）、ＳＰＡＴＳ２Ｌ（ＳＰＡＴＳ２－ｌｉｋｅ ｐｒｏｔｅｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ９ＮＵＱ６）、ＡＰＯＣ１（Ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ Ｃ－Ｉ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ０２６５４）、ＩＧＫＶ２－２９（Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ ｋａｐｐａ ｖａｒｉａｂｌｅ ２－２９、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ａ２ＮＪＶ５）及びＫＡＬＲＮ（Ｋａｌｉｒｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｏ６０２２９）から構成される群より選択されるいずれか１つ以上を含む、口腔扁平苔癬の診断用バイオマーカー組成物を提供する。
本発明の更なる実施形態によれば、ＣＬＣ、ＴＮＦＡＩＰ８、ＥＶＩ５Ｌ、ＩＳＧ１５、ＰＩＧＳ、ＳＬＣ４Ａ１、ＭＹＨ１、ＣＬＴＡ、ＣＣＡＲ２、ＧＲＫ６、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ、ＡＳＲＧＬ１、ＢＳＴ１、ＣＹＢＡ、ＡＳＡＰ１、ＭＡＰ２Ｋ４、ＲＮＡＳＥ２、ＮＩＰＳＮＡＰ２、ＭＭＰ１、ＥＷＳＲ１、ＣＣＬ２８、ＬＥＧ１、ＡＣＢＰ、ＡＰＯＭ、ＴＦＦ３、ＦＯＬＲ１、ＷＦＤＣ２、ＳＥＲＰＩＮＡ１、ＳＬＵＲＰ１、ＤＥＦＢ４Ａ、ＳＬＰＩ、ＩＧＦＢＰ７、ＩＧＬＶ１－５１、ＳＥＲＰＩＮＩ１、ＩＧＬＶ３－９、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＰＡＴＳ２Ｌ、ＡＰＯＣ１、ＩＧＫＶ２－２９及びＫＡＬＲＮから構成される群より選択されるいずれか１つ以上のタンパク質又はそれを暗号化する遺伝子の発現レベルを測定できる製剤を含む、口腔扁平苔癬の診断用組成物が提供される。
一側によれば、前記タンパク質の発現レベルを測定できる製剤は、前記タンパク質に特異的に結合する抗体又はその抗原結合断片、又は、前記タンパク質に特異的に結合するアプタマーであってもよい。
一側によれば、前記遺伝子の発現レベルを測定できる製剤は、前記遺伝子の核酸分子に特異的に結合するプライマー又はプローブであってもよい。
本発明の更なる実施形態によれば、前記いずれか１つの診断用組成物を含む、口腔扁平苔癬の診断キットが提供される。
本発明の更なる実施形態によれば、対象体から分離した生物学的な試料からＣＬＣ、ＴＮＦＡＩＰ８、ＥＶＩ５Ｌ、ＩＳＧ１５、ＰＩＧＳ、ＳＬＣ４Ａ１、ＭＹＨ１、ＣＬＴＡ、ＣＣＡＲ２、ＧＲＫ６、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ、ＡＳＲＧＬ１、ＢＳＴ１、ＣＹＢＡ、ＡＳＡＰ１、ＭＡＰ２Ｋ４、ＲＮＡＳＥ２、ＮＩＰＳＮＡＰ２、ＭＭＰ１、ＥＷＳＲ１、ＣＣＬ２８、ＬＥＧ１、ＡＣＢＰ、ＡＰＯＭ、ＴＦＦ３、ＦＯＬＲ１、ＷＦＤＣ２、ＳＥＲＰＩＮＡ１、ＳＬＵＲＰ１、ＤＥＦＢ４Ａ、ＳＬＰＩ、ＩＧＦＢＰ７、ＩＧＬＶ１－５１、ＳＥＲＰＩＮＩ１、ＩＧＬＶ３－９、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＰＡＴＳ２Ｌ、ＡＰＯＣ１、ＩＧＫＶ２－２９及びＫＡＬＲＮから構成される群より選択されるいずれか１つ以上のタンパク質又はそれを暗号化する遺伝子の発現レベルを測定するステップを含む、口腔扁平苔癬を診断するための情報提供方法が提供される。
一側によれば、前記方法は、対照群から分離した生物学的な試料から、ＣＬＣ、ＴＮＦＡＩＰ８、ＥＶＩ５Ｌ、ＩＳＧ１５、ＰＩＧＳ、ＳＬＣ４Ａ１、ＭＹＨ１、ＣＬＴＡ、ＣＣＡＲ２、ＧＲＫ６、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ、ＡＳＲＧＬ１、ＢＳＴ１、ＣＹＢＡ、ＡＳＡＰ１、ＭＡＰ２Ｋ４、ＲＮＡＳＥ２、ＮＩＰＳＮＡＰ２、ＭＭＰ１、ＥＷＳＲ１、ＣＣＬ２８、ＬＥＧ１、ＡＣＢＰ、ＡＰＯＭ、ＴＦＦ３、ＦＯＬＲ１、ＷＦＤＣ２、ＳＥＲＰＩＮＡ１、ＳＬＵＲＰ１、ＤＥＦＢ４Ａ、ＳＬＰＩ、ＩＧＦＢＰ７、ＩＧＬＶ１－５１、ＳＥＲＰＩＮＩ１、ＩＧＬＶ３－９、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＰＡＴＳ２Ｌ、ＡＰＯＣ１、ＩＧＫＶ２－２９及びＫＡＬＲＮから構成される群より選択される１つ以上のタンパク質又はそれを暗号化する遺伝子の発現レベルを測定するステップ、及び前記対象体及び前記対照群の前記タンパク質又はそれを暗号化する遺伝子の発現レベルを比較するステップをさらに含むことができる。
一側によれば、前記対象体の前記ＣＬＣ、ＴＮＦＡＩＰ８、ＥＶＩ５Ｌ、ＩＳＧ１５、ＰＩＧＳ、ＳＬＣ４Ａ１、ＭＹＨ１、ＣＬＴＡ、ＣＣＡＲ２、ＧＲＫ６、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ、ＡＳＲＧＬ１、ＢＳＴ１、ＣＹＢＡ、ＡＳＡＰ１、ＭＡＰ２Ｋ４、ＲＮＡＳＥ２、ＮＩＰＳＮＡＰ２、ＭＭＰ１及びＥＷＳＲ１からなる群より選択されるいずれか１つ以上のタンパク質又はそれを暗号化する遺伝子の発現レベルが前記対照群よりも高い場合、前記対象体を口腔扁平苔癬であると判断することができる。
一側によれば、前記対象体のＣＣＬ２８、ＬＥＧ１、ＡＣＢＰ、ＡＰＯＭ、ＴＦＦ３、ＦＯＬＲ１、ＷＦＤＣ２、ＳＥＲＰＩＮＡ１、ＳＬＵＲＰ１、ＤＥＦＢ４Ａ、ＳＬＰＩ、ＩＧＦＢＰ７、ＩＧＬＶ１－５１、ＳＥＲＰＩＮＩ１、ＩＧＬＶ３－９、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＰＡＴＳ２Ｌ、ＡＰＯＣ１、ＩＧＫＶ２－２９及びＫＡＬＲＮからなる群より選択されるいずれか１つ以上のタンパク質又はそれを暗号化する遺伝子の発現レベルが前記対照群よりも高い場合、前記対象体を正常として判断することができる。
一側によれば、前記生物学的な試料は唾液であってもよい。
本発明によれば、非侵襲的に採取可能であり、接近性の優れる試料である唾液を用いて迅速かつ正確に口腔扁平苔癬の診断が可能である。
本発明の効果は、以上で言及されたものなどに限定されず、言及されない他の効果は、下記の記載によって当業者にとって明確に理解できるものである。
本発明における唾液試料分析方法を示した模式図である。
本発明者は、口腔扁平苔癬を有する患者群から唾液試料を採取し、それを正常対照群の試料と同じ分析を行い、対照群の試料に比べて口腔扁平苔癬患者群の試料において有意に高いか低く発現するタンパク質を確認し、それをバイオマーカー及び口腔扁平苔癬の診断用組成物の発明として完成して提供しようとする。
本発明者は、ＣＬＣ（Ｇａｌｅｃｔｉｎ－１０、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ０５３１５）、ＴＮＦＡＩＰ８（Ｔｕｍｏｒ ｎｅｃｒｏｓｉｓ ｆａｃｔｏｒ ａｌｐｈａ－ｉｎｄｕｃｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎ ８、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｏ９５３７９）、ＥＶＩ５Ｌ（ＥＶＩ５－ｌｉｋｅ ｐｒｏｔｅｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ９６ＣＮ４）、ＩＳＧ１５（Ｕｂｉｑｕｉｔｉｎ－ｌｉｋｅ ｐｒｏｔｅｉｎ ＩＳＧ１５、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ０５１６１）、ＰＩＧＳ（ＧＰＩ ｔｒａｎｓａｍｉｄａｓｅ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ ＰＩＧ－Ｓ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ９６Ｓ５２）、ＳＬＣ４Ａ１（Ｂａｎｄ ３ ａｎｉｏｎ ｔｒａｎｓｐｏｒｔ ｐｒｏｔｅｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ０２７３０）、ＭＹＨ１（Ｍｙｏｓｉｎ－１、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ１２８８２）、ＣＬＴＡ（Ｃｌａｔｈｒｉｎ ｌｉｇｈｔ ｃｈａｉｎ Ａ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ０９４９６）、ＣＣＡＲ２（Ｃｅｌｌ ｃｙｃｌｅ ａｎｄ ａｐｏｐｔｏｓｉｓ ｒｅｇｕｌａｔｏｒ ｐｒｏｔｅｉｎ ２、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ８Ｎ１６３）、ＧＲＫ６（Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ－ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ｋｉｎａｓｅ ６、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ４３２５０）、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ（ＡＴＰ ｓｙｎｔｈａｓｅ ｓｕｂｕｎｉｔ ｄｅｌｔａ、ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ３００４９）、ＡＳＲＧＬ１（Ｉｓｏａｓｐａｒｔｙｌ ｐｅｐｔｉｄａｓｅ／Ｌ－ａｓｐａｒａｇｉｎａｓｅ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ７Ｌ２６６）、ＢＳＴ１（ＡＤＰ－ｒｉｂｏｓｙｌ ｃｙｃｌａｓｅ／ｃｙｃｌｉｃ ＡＤＰ－ｒｉｂｏｓｅ ｈｙｄｒｏｌａｓｅ ２、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ１０５８８）、ＣＹＢＡ（Ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ ｂ－２４５ ｌｉｇｈｔ ｃｈａｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ１３４９８）、ＡＳＡＰ１（Ａｒｆ－ＧＡＰ ｗｉｔｈ ＳＨ３ ｄｏｍａｉｎ、ＡＮＫ ｒｅｐｅａｔ ａｎｄ ＰＨ ｄｏｍａｉｎ－ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ １、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ９ＵＬＨ１）、ＭＡＰ２Ｋ４（Ｄｕａｌ ｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙ ｍｉｔｏｇｅｎ－ａｃｔｉｖａｔｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎ ｋｉｎａｓｅ ｋｉｎａｓｅ ４、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ４５９８５）、ＲＮＡＳＥ２（Ｎｏｎ－ｓｅｃｒｅｔｏｒｙ ｒｉｂｏｎｕｃｌｅａｓｅ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ１０１５３）、ＮＩＰＳＮＡＰ２（Ｐｒｏｔｅｉｎ ＮｉｐＳｎａｐ ｈｏｍｏｌｏｇ ２、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｏ７５３２３）、ＭＭＰ１（Ｉｎｔｅｒｓｔｉｔｉａｌ ｃｏｌｌａｇｅｎａｓｅ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｐ０３９５６）、ＥＷＳＲ１（ＲＮＡ－ｂｉｎｄｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ ＥＷＳ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ０１８４４）、ＣＣＬ２８（Ｃ－Ｃ ｍｏｔｉｆ ｃｈｅｍｏｋｉｎｅ ２８、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ９ＮＲＪ３）、ＬＥＧ１（Ｐｒｏｔｅｉｎ ＬＥＧ１ ｈｏｍｏｌｏｇ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ６Ｐ５Ｓ２）、ＡＣＢＰ（Ａｃｙｌ－ＣｏＡ－ｂｉｎｄｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ０７１０８）、ＡＰＯＭ（Ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ Ｍ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｏ９５４４５）、ＴＦＦ３（Ｔｒｅｆｏｉｌ ｆａｃｔｏｒ ３、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ０７６５４）、ＦＯＬＲ１（Ｆｏｌａｔｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ａｌｐｈａ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ１５３２８）、ＷＦＤＣ２（ＷＡＰ ｆｏｕｒ－ｄｉｓｕｌｆｉｄｅ ｃｏｒｅ ｄｏｍａｉｎ ｐｒｏｔｅｉｎ ２、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ１４５０８）、ＳＥＲＰＩＮＡ１（Ａｌｐｈａ－１－ａｎｔｉｔｒｙｐｓｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ０１００９）、ＳＬＵＲＰ１（Ｓｅｃｒｅｔｅｄ Ｌｙ－６／ｕＰＡＲ－ｒｅｌａｔｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎ １、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ５５０００）、ＤＥＦＢ４Ａ（Ｄｅｆｅｎｓｉｎ ｂｅｔａ ４Ａ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｏ１５２６３）、ＳＬＰＩ（Ａｎｔｉｌｅｕｋｏｐｒｏｔｅｉｎａｓｅ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ０３９７３）、ＩＧＦＢＰ７（Ｉｎｓｕｌｉｎ－ｌｉｋｅ ｇｒｏｗｔｈ ｆａｃｔｏｒ－ｂｉｎｄｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ ７、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ１６２７０）、ＩＧＬＶ１－５１（Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ ｌａｍｂｄａ ｖａｒｉａｂｌｅ １－５１、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ０１７０１）、ＳＥＲＰＩＮＩ１（Ｎｅｕｒｏｓｅｒｐｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ９９５７４）、ＩＧＬＶ３－９（Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ ｌａｍｂｄａ ｖａｒｉａｂｌｅ ３－９、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ａ０Ａ０７５Ｂ６Ｋ５）、ＳＥＲＰＩＮＡ３（Ａｌｐｈａ－１－ａｎｔｉｃｈｙｍｏｔｒｙｐｓｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ０１０１１）、ＳＰＡＴＳ２Ｌ（ＳＰＡＴＳ２－ｌｉｋｅ ｐｒｏｔｅｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｑ９ＮＵＱ６）、ＡＰＯＣ１（Ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ Ｃ－Ｉ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｐ０２６５４）、ＩＧＫＶ２－２９（Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ ｋａｐｐａ ｖａｒｉａｂｌｅ ２－２９、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ａ２ＮＪＶ５）及びＫＡＬＲＮ（Ｋａｌｉｒｉｎ、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ Ｏ６０２２９）から構成される群より選択されるいずれか１つ以上を含む、口腔扁平苔癬の診断用バイオマーカー組成物を提供する。
前記ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｕｍｂｅｒによるタンパク質又はそれを暗号化する遺伝子の情報は、ｈｔｔｐｓ：／／ｗｗｗ．ＵｎｉＰｒｏｔ．ｏｒｇで確認することができる。
本明細書において「診断」は、疾病発生の予測及び発病危険度（ｒｉｓｋ）又は発病感受性（ｓｕｓｃｅｐｔｉｂｉｌｉｔｙ）を決定したり、病理状態の存在又は特徴を確認することを意味する。本発明の目的上、前記診断は口腔扁平苔癬の診断を意味する。
本発明において用語「診断用（バイオ）マーカー、診断するための（バイオ）マーカー又は診断マーカー」は、口腔扁平苔癬を正常群と区分して診断できるもので、正常細胞に比べて口腔扁平苔癬を有する細胞において増加又は減少の態様を示すポリペプチド又は核酸（例えば、ｍＲＮＡなど）、脂質、糖脂質、糖タンパク質、糖（単糖類、二糖類、オリゴ糖類など）などのような有機生体分子などのレベルを正常細胞と区分することができたり、そのレベルを測定できる製剤を含むマーカー又はそれに含まれる組成物を意味する。
本発明の更なる実施形態によれば、ＣＬＣ、ＴＮＦＡＩＰ８、ＥＶＩ５Ｌ、ＩＳＧ１５、ＰＩＧＳ、ＳＬＣ４Ａ１、ＭＹＨ１、ＣＬＴＡ、ＣＣＡＲ２、ＧＲＫ６、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ、ＡＳＲＧＬ１、ＢＳＴ１、ＣＹＢＡ、ＡＳＡＰ１、ＭＡＰ２Ｋ４、ＲＮＡＳＥ２、ＮＩＰＳＮＡＰ２、ＭＭＰ１、ＥＷＳＲ１、ＣＣＬ２８、ＬＥＧ１、ＡＣＢＰ、ＡＰＯＭ、ＴＦＦ３、ＦＯＬＲ１、ＷＦＤＣ２、ＳＥＲＰＩＮＡ１、ＳＬＵＲＰ１、ＤＥＦＢ４Ａ、ＳＬＰＩ、ＩＧＦＢＰ７、ＩＧＬＶ１－５１、ＳＥＲＰＩＮＩ１、ＩＧＬＶ３－９、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＰＡＴＳ２Ｌ、ＡＰＯＣ１、ＩＧＫＶ２－２９及びＫＡＬＲＮから構成される群より選択されるいずれか１つ以上のタンパク質又はそれを暗号化する遺伝子の発現レベルを測定できる製剤を含む、口腔扁平苔癬の診断用組成物が提供される。
本明細書における用語「発現レベルを測定」は、特定のタンパク質（ペプチド）又は前記タンパク質を暗号化する遺伝子の存在有無、発現有無、又は発現程度を測定するものとして、具体的に、ＣＬＣ、ＴＮＦＡＩＰ８、ＥＶＩ５Ｌ、ＩＳＧ１５、ＰＩＧＳ、ＳＬＣ４Ａ１、ＭＹＨ１、ＣＬＴＡ、ＣＣＡＲ２、ＧＲＫ６、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ、ＡＳＲＧＬ１、ＢＳＴ１、ＣＹＢＡ、ＡＳＡＰ１、ＭＡＰ２Ｋ４、ＲＮＡＳＥ２、ＮＩＰＳＮＡＰ２、ＭＭＰ１、ＥＷＳＲ１、ＣＣＬ２８、ＬＥＧ１、ＡＣＢＰ、ＡＰＯＭ、ＴＦＦ３、ＦＯＬＲ１、ＷＦＤＣ２、ＳＥＲＰＩＮＡ１、ＳＬＵＲＰ１、ＤＥＦＢ４Ａ、ＳＬＰＩ、ＩＧＦＢＰ７、ＩＧＬＶ１－５１、ＳＥＲＰＩＮＩ１、ＩＧＬＶ３－９、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＰＡＴＳ２Ｌ、ＡＰＯＣ１、ＩＧＫＶ２－２９及びＫＡＬＲＮからなる群から選択された１つ以上のタンパク質又はそれを暗号化するｍＲＮＡ又は遺伝子の発現レベルを測定することができる。
一側によれば、前記タンパク質の発現レベルを測定できる製剤は、前記タンパク質に特異的に結合する抗体又はその抗原結合断片、又は、前記タンパク質に特異的に結合するアプタマーであってもよい。
本明細書における用語「抗体（ａｎｔｉｂｏｄｙ）」は当技術分野で公知の用語であって、抗原性部位に対して指示される特異的な免疫グロブリンを意味する。例えば、前記抗体は、ＣＬＣ、ＴＮＦＡＩＰ８、ＥＶＩ５Ｌ、ＩＳＧ１５、ＰＩＧＳ、ＳＬＣ４Ａ１、ＭＹＨ１、ＣＬＴＡ、ＣＣＡＲ２、ＧＲＫ６、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ、ＡＳＲＧＬ１、ＢＳＴ１、ＣＹＢＡ、ＡＳＡＰ１、ＭＡＰ２Ｋ４、ＲＮＡＳＥ２、ＮＩＰＳＮＡＰ２、ＭＭＰ１、ＥＷＳＲ１、ＣＣＬ２８、ＬＥＧ１、ＡＣＢＰ、ＡＰＯＭ、ＴＦＦ３、ＦＯＬＲ１、ＷＦＤＣ２、ＳＥＲＰＩＮＡ１、ＳＬＵＲＰ１、ＤＥＦＢ４Ａ、ＳＬＰＩ、ＩＧＦＢＰ７、ＩＧＬＶ１－５１、ＳＥＲＰＩＮＩ１、ＩＧＬＶ３－９、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＰＡＴＳ２Ｌ、ＡＰＯＣ１、ＩＧＫＶ２－２９及びＫＡＬＲＮから構成された群より選択された１つ以上のタンパク質、又はその断片に対して特異的に結合することができる。前記断片は、前記タンパク質に対する抗体によって認識される１つ以上のエピトープ（ｅｐｉｔｏｐｅ）を有しているタンパク質断片を意味し、例えば、免疫原性の断片であってもよい。前記抗体の形態は、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、又は、組換え抗体を含み、全ての免疫グロブリン抗体が含まれる。また、前記抗体は、ヒト化抗体などの特殊の抗体も含まれる。
このような抗体を用いて当技術分野で公知の酵素免疫測定法（ｅｎｚｙｍｅ ｌｉｎｋｅｄ ｉｍｍｕｎｏｓｏｒｂｅｎｔ ａｓｓａｙ；ＥＬＩＳＡ）、放射線免疫測定法（ｒａｄｉｏｉｍｍｕｎｏａｓｓａｙ；ＲＩＡ）、サンドイッチ測定法（ｓａｎｄｗｉｃｈ ａｓｓａｙ）、ポリアクリルゲル状のウェスタンブロッティング又は免疫ブロッティングなどの方法により生物学的な試料のうち前記タンパク質が発現したかを確認することができる。
本明細書における用語「抗体断片」は、完全な抗体、ペプチド、又はタンパク質の構造を有しないものの、抗原性部位に対して指示される特異的な抗原結合部位又は結合ドメインを有するポリペプチドを意味する。前記断片は、２つの軽鎖及び２つの重鎖を有する完全な形態の抗体ではない、抗体分子の機能的な断片を含む。抗体分子の機能的な断片とは、少なくとも抗原結合の機能を保持している断片を意味し、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）、Ｆ（ａｂ’）２、又はＦｖであってもよい。前記結合断片は最小７個以上のアミノ酸、例えば、９個以上のアミノ酸、１２個以上のアミノ酸を含んでもよい。
前記タンパク質を検出するための分析方法として、ウエスタンブロット、イライザ（ｅｎｚｙｍｅ ｌｉｎｋｅｄ ｉｍｍｕｎｏ ｓｏｒｂｅｎｔ ａｓｓａｙ、ＥＬＩＳＡ）、放射線免疫分析（ＲＩＡ：Ｒａｄｉｏｉｍｍｕｎｏａｓｓａｙ）、放射免疫拡散法（ｒａｄｉｏｉｍｍｕｎｏｄｉｆｆｕｓｉｏｎ）、オクタロニー（Ｏｕｃｈｔｅｒｌｏｎｙ）免疫拡散法、ロケット（ｒｏｃｋｅｔ）免疫電気泳動、組織免疫染色、免疫分析（Ｉｍｍｕｎｏａｓｓａｙ）、免疫化学染色分析（Ｉｍｍｕｎｏｈｉｓｔｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ Ａｓｓａｙ）、免疫沈殿分析法（Ｉｍｍｕｎｏｐｒｅｃｉｐｉｔａｔｉｏｎ Ａｓｓａｙ）、補体結合分析法（Ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔ Ｆｉｘａｔｉｏｎ Ａｓｓａｙ）、蛍光活性化セルソーター（Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ Ａｃｔｉｖａｔｅｄ Ｃｅｌｌ Ｓｏｒｔｅｒ、ＦＡＣＳ）、タンパク質チップ（ｐｒｏｔｅｉｎ ｃｈｉｐ）などがあるが、これに制限されることはない。
一側によれば、前記遺伝子の発現レベルを測定できる製剤は、前記遺伝子の核酸分子に特異的に結合するプライマー又はプローブであってもよい。分析方法として、例えば、逆転写重合酵素反応（ＲＴ－ＰＣＲ）、競争的逆転写重合酵素反応（Ｃｏｍｐｅｔｉｔｉｖｅ ＲＴ－ＰＣＲ）、リアルタイム逆転写重合酵素反応（Ｒｅａｌｔｉｍｅ ＲＴ－ＰＣＲ）、ＲＮａｓｅ保護分析法（ＲＰＡ；ＲＮａｓｅ ｐｒｏｔｅｃｔｉｏｎ ａｓｓａｙ）、ノーザンブロッティング（Ｎｏｒｔｈｅｒｎ ｂｌｏｔｔｉｎｇ）及びＤＮＡチップからなる群より選択される１つ以上を利用した方式が使用されることができる。
本明細書における用語「プライマー（ｐｒｉｍｅｒ）」は、自由３－末端水酸基（ｆｒｅｅ ３’ ｈｙｄｒｏｘｙｌ ｇｒｏｕｐ）を有する核酸配列として、特定の塩基配列に対して相補的な鋳型（ｔｅｍｐｌａｔｅ）と塩基対を形成することができ、鋳鎖型のコピーのための開始地点として作用する核酸配列をいう。プライマーは、適切な緩衝溶液及び温度で重合反応のための試薬（即ち、ＤＮＡポリメラーゼ又は逆転写酵素）及び異なる４種類のヌクレオシド三リン酸の存在下でＤＮＡの合成を開始することができる。例えば、ＣＬＣ、ＴＮＦＡＩＰ８、ＥＶＩ５Ｌ、ＩＳＧ１５、ＰＩＧＳ、ＳＬＣ４Ａ１、ＭＹＨ１、ＣＬＴＡ、ＣＣＡＲ２、ＧＲＫ６、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ、ＡＳＲＧＬ１、ＢＳＴ１、ＣＹＢＡ、ＡＳＡＰ１、ＭＡＰ２Ｋ４、ＲＮＡＳＥ２、ＮＩＰＳＮＡＰ２、ＭＭＰ１、ＥＷＳＲ１、ＣＣＬ２８、ＬＥＧ１、ＡＣＢＰ、ＡＰＯＭ、ＴＦＦ３、ＦＯＬＲ１、ＷＦＤＣ２、ＳＥＲＰＩＮＡ１、ＳＬＵＲＰ１、ＤＥＦＢ４Ａ、ＳＬＰＩ、ＩＧＦＢＰ７、ＩＧＬＶ１－５１、ＳＥＲＰＩＮＩ１、ＩＧＬＶ３－９、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＰＡＴＳ２Ｌ、ＡＰＯＣ１、ＩＧＫＶ２－２９及びＫＡＬＲＮから構成された群より選択された１つ以上のタンパク質を暗号化する遺伝子、又は、ｍＲＮＡに対する特異的なプライマーとして７個の～５０個のヌクレオチド配列を有するセンス及びアンチセンスプライマーを用いてＰＣＲ増幅を実施し、所望する生成物の生成量の測定を介して個体の口腔扁平苔癬の有無を確認することができる。ＰＣＲ条件、センス、及びアンチセンスプライマーの長さは、当業界に周知の技術に応じて適切に選択され得る。前記プライマーは、１０～１００、１５ないし１００、１０～８０、１０～５０、１０～３０、１０～２０、１５～８０、１５～５０、１５～３０、１５～２０、２０～１００、２０～８０、２０～５０、又は、２０～３０ｎｔを有してもよい。
本明細書における用語「プローブ（ｐｒｏｂｅ）」は標的核酸、例えば、ｍＲＮＡと特異的に結合が行われるＲＮＡ又はＤＮＡなどの核酸断片を意味し、特定のｍＲＮＡの存在有無、含量及び発現量を確認できるようにラベリング（ｌａｂｅｌｉｎｇ）されていてもよい。プローブは、オリゴヌクレオチド（ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ）プローブ、一本鎖ＤＮＡ（ｓｉｎｇｌｅ ｓｔｒａｎｄ ＤＮＡ）プローブ、二本鎖ＤＮＡ（ｄｏｕｂｌｅ ｓｔｒａｎｄ ＤＮＡ）プローブ、ＲＮＡプローブなどの形態に製造されてもよい。例えば、ＣＬＣ、ＴＮＦＡＩＰ８、ＥＶＩ５Ｌ、ＩＳＧ１５、ＰＩＧＳ、ＳＬＣ４Ａ１、ＭＹＨ１、ＣＬＴＡ、ＣＣＡＲ２、ＧＲＫ６、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ、ＡＳＲＧＬ１、ＢＳＴ１、ＣＹＢＡ、ＡＳＡＰ１、ＭＡＰ２Ｋ４、ＲＮＡＳＥ２、ＮＩＰＳＮＡＰ２、ＭＭＰ１、ＥＷＳＲ１、ＣＣＬ２８、ＬＥＧ１、ＡＣＢＰ、ＡＰＯＭ、ＴＦＦ３、ＦＯＬＲ１、ＷＦＤＣ２、ＳＥＲＰＩＮＡ１、ＳＬＵＲＰ１、ＤＥＦＢ４Ａ、ＳＬＰＩ、ＩＧＦＢＰ７、ＩＧＬＶ１－５１、ＳＥＲＰＩＮＩ１、ＩＧＬＶ３－９、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＰＡＴＳ２Ｌ、ＡＰＯＣ１、ＩＧＫＶ２－２９及びＫＡＬＲＮから構成された群より選択された１つ以上のタンパク質を暗号化する遺伝子、又は、ｍＲＮＡと相補的な核酸配列を有するプローブを用いて混成化を実施し、混成化の程度を通じてｍＲＮＡの発現量を測定することで個体の口腔扁平苔癬の有無を診断することができる。適切なプローブの選択及び混成化条件は、当技術分野で公知の技術により適切に選択されてもよい。前記プローブは、１０～１００、１５～１００、１０～８０、１０～５０、１０～３０、１０～２０、１５～８０、１５～５０、１５～３０、１５～２０、２０～１００、２０～８０、２０～５０、又は、２０～３０ｎｔを有してもよい。
前記プライマー又はプローブは、ホスホロアミダイト（ｐｈｏｓｐｈｏｒａｍｉｄｉｔｅ）固体支持体合成法又はその他の幅広い周知方法を用いて化学的に合成することができる。また、このような核酸配列は、当技術分野で公知の様々な方法により変わり得る。このような変形の例は、メチル化、キャップ化、天然ヌクレオチドの１つ以上の同族体への置換、又は、ヌクレオチド間の変形、例えば、荷電されない連結体（例えば、メチルホスホネート、ホスホトリエステル、ホスホロアミダート、カーバメートなど）又は荷電された連結体（例えば、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエートなど）への変形を含んでもよい。また、プライマー又はプローブは、検出可能な信号を直接的又は間接的に提供できる標識を用いて変形されてもよい。前記標識の例は、放射性同位元素、蛍光性分子、又はビオチンを含んでもよい。
本発明の更なる実施形態によれば、前記いずれか１つの診断用組成物を含む口腔扁平苔癬の診断キットが提供される。
例えば、口腔扁平苔癬の診断が必要な個体の生物学的な試料からＣＬＣ、ＴＮＦＡＩＰ８、ＥＶＩ５Ｌ、ＩＳＧ１５、ＰＩＧＳ、ＳＬＣ４Ａ１、ＭＹＨ１、ＣＬＴＡ、ＣＣＡＲ２、ＧＲＫ６、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ、ＡＳＲＧＬ１、ＢＳＴ１、ＣＹＢＡ、ＡＳＡＰ１、ＭＡＰ２Ｋ４、ＲＮＡＳＥ２、ＮＩＰＳＮＡＰ２、ＭＭＰ１、ＥＷＳＲ１、ＣＣＬ２８、ＬＥＧ１、ＡＣＢＰ、ＡＰＯＭ、ＴＦＦ３、ＦＯＬＲ１、ＷＦＤＣ２、ＳＥＲＰＩＮＡ１、ＳＬＵＲＰ１、ＤＥＦＢ４Ａ、ＳＬＰＩ、ＩＧＦＢＰ７、ＩＧＬＶ１－５１、ＳＥＲＰＩＮＩ１、ＩＧＬＶ３－９、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＰＡＴＳ２Ｌ、ＡＰＯＣ１、ＩＧＫＶ２－２９及びＫＡＬＲＮから構成される群より選択されるいずれか１つ以上のタンパク質検出製剤を含む組成物を活用して試料内の該当タンパク質の発現程度を確認し、口腔扁平苔癬を診断するための情報を提供することができる。前記キットは、免疫分析キット（Ｉｍｍｕｎｏａｓｓａｙ）であってもよい。
本発明の他の一実施形態に係る口腔扁平苔癬診断キットは、ＣＬＣ、ＴＮＦＡＩＰ８、ＥＶＩ５Ｌ、ＩＳＧ１５、ＰＩＧＳ、ＳＬＣ４Ａ１、ＭＹＨ１、ＣＬＴＡ、ＣＣＡＲ２、ＧＲＫ６、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ、ＡＳＲＧＬ１、ＢＳＴ１、ＣＹＢＡ、ＡＳＡＰ１、ＭＡＰ２Ｋ４、ＲＮＡＳＥ２、ＮＩＰＳＮＡＰ２、ＭＭＰ１、ＥＷＳＲ１、ＣＣＬ２８、ＬＥＧ１、ＡＣＢＰ、ＡＰＯＭ、ＴＦＦ３、ＦＯＬＲ１、ＷＦＤＣ２、ＳＥＲＰＩＮＡ１、ＳＬＵＲＰ１、ＤＥＦＢ４Ａ、ＳＬＰＩ、ＩＧＦＢＰ７、ＩＧＬＶ１－５１、ＳＥＲＰＩＮＩ１、ＩＧＬＶ３－９、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＰＡＴＳ２Ｌ、ＡＰＯＣ１、ＩＧＫＶ２－２９及びＫＡＬＲＮから構成される群より選択されるいずれか１つ以上のタンパク質を暗号化する遺伝子を検出する製剤を含んで口腔扁平苔癬の診断に活用される情報を提供する。例えば、口腔扁平苔癬の診断が必要な個体の生物学的な試料からＣＬＣ、ＴＮＦＡＩＰ８、ＥＶＩ５Ｌ、ＩＳＧ１５、ＰＩＧＳ、ＳＬＣ４Ａ１、ＭＹＨ１、ＣＬＴＡ、ＣＣＡＲ２、ＧＲＫ６、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ、ＡＳＲＧＬ１、ＢＳＴ１、ＣＹＢＡ、ＡＳＡＰ１、ＭＡＰ２Ｋ４、ＲＮＡＳＥ２、ＮＩＰＳＮＡＰ２、ＭＭＰ１、ＥＷＳＲ１、ＣＣＬ２８、ＬＥＧ１、ＡＣＢＰ、ＡＰＯＭ、ＴＦＦ３、ＦＯＬＲ１、ＷＦＤＣ２、ＳＥＲＰＩＮＡ１、ＳＬＵＲＰ１、ＤＥＦＢ４Ａ、ＳＬＰＩ、ＩＧＦＢＰ７、ＩＧＬＶ１－５１、ＳＥＲＰＩＮＩ１、ＩＧＬＶ３－９、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＰＡＴＳ２Ｌ、ＡＰＯＣ１、ＩＧＫＶ２－２９及びＫＡＬＲＮから構成される群より選択されるいずれか１つ以上のタンパク質を暗号化する核酸を抽出し、それを検出する製剤を含む組成物を活用して試料内の該当タンパク質を暗号化する核酸の発現程度（ｍＲＮＡを逆転写した試料を活用する場合にはｃＤＮＡとｃＤＮＡを検出する製剤を適用する）を確認し、口腔扁平苔癬を診断するための情報を提供することができる。前記キットは、ＤＮＡチップであってもよい。
本発明の更なる実施形態によれば、対象体から分離した生物学的な試料からＣＬＣ、ＴＮＦＡＩＰ８、ＥＶＩ５Ｌ、ＩＳＧ１５、ＰＩＧＳ、ＳＬＣ４Ａ１、ＭＹＨ１、ＣＬＴＡ、ＣＣＡＲ２、ＧＲＫ６、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ、ＡＳＲＧＬ１、ＢＳＴ１、ＣＹＢＡ、ＡＳＡＰ１、ＭＡＰ２Ｋ４、ＲＮＡＳＥ２、ＮＩＰＳＮＡＰ２、ＭＭＰ１、ＥＷＳＲ１、ＣＣＬ２８、ＬＥＧ１、ＡＣＢＰ、ＡＰＯＭ、ＴＦＦ３、ＦＯＬＲ１、ＷＦＤＣ２、ＳＥＲＰＩＮＡ１、ＳＬＵＲＰ１、ＤＥＦＢ４Ａ、ＳＬＰＩ、ＩＧＦＢＰ７、ＩＧＬＶ１－５１、ＳＥＲＰＩＮＩ１、ＩＧＬＶ３－９、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＰＡＴＳ２Ｌ、ＡＰＯＣ１、ＩＧＫＶ２－２９及びＫＡＬＲＮから構成される群より選択されるいずれか１つ以上のタンパク質又はそれを暗号化する遺伝子の発現レベルを測定するステップを含む、口腔扁平苔癬を診断するための情報提供方法が提供される。
本明細書における用語「対象体」は、口腔扁平苔癬が発症したり発症し得る全ての生物体を意味し、具体的な例として、犬、猫、マウス、ラット、猿、牛、豚、ミニブタ、家畜、ヒトなどの哺乳動物を含んでもよく、これに限定されることはない。
本明細書における用語「試料」は、前記対象体から由来する物質を意味し、具体的に、組織、細胞、全血、血清、血漿、唾液、喀痰、脳脊髄液、尿などを含んでもよく、好ましくは、唾液、口腔塗抹、鼻咽頭塗抹などの口腔粘膜の組織が含まれるが、これに限定されることはない。
一側によれば、前記方法は、対照群から分離した生物学的な試料から、ＣＬＣ、ＴＮＦＡＩＰ８、ＥＶＩ５Ｌ、ＩＳＧ１５、ＰＩＧＳ、ＳＬＣ４Ａ１、ＭＹＨ１、ＣＬＴＡ、ＣＣＡＲ２、ＧＲＫ６、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ、ＡＳＲＧＬ１、ＢＳＴ１、ＣＹＢＡ、ＡＳＡＰ１、ＭＡＰ２Ｋ４、ＲＮＡＳＥ２、ＮＩＰＳＮＡＰ２、ＭＭＰ１、ＥＷＳＲ１、ＣＣＬ２８、ＬＥＧ１、ＡＣＢＰ、ＡＰＯＭ、ＴＦＦ３、ＦＯＬＲ１、ＷＦＤＣ２、ＳＥＲＰＩＮＡ１、ＳＬＵＲＰ１、ＤＥＦＢ４Ａ、ＳＬＰＩ、ＩＧＦＢＰ７、ＩＧＬＶ１－５１、ＳＥＲＰＩＮＩ１、ＩＧＬＶ３－９、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＰＡＴＳ２Ｌ、ＡＰＯＣ１、ＩＧＫＶ２－２９及びＫＡＬＲＮから構成される群より選択される１つ以上のタンパク質又はそれを暗号化する遺伝子の発現レベルを測定するステップと、前記対象体及び前記対照群の前記タンパク質又はそれを暗号化する遺伝子の発現レベルを比較するステップをさらに含んでもよい。
本明細書における用語「対照群」は、好ましくは、口腔扁平苔癬に関する病理的な状態を示さない群である。
一側によれば、前記対象体の前記ＣＬＣ、ＴＮＦＡＩＰ８、ＥＶＩ５Ｌ、ＩＳＧ１５、ＰＩＧＳ、ＳＬＣ４Ａ１、ＭＹＨ１、ＣＬＴＡ、ＣＣＡＲ２、ＧＲＫ６、ＡＴＰ５Ｆ１Ｄ、ＡＳＲＧＬ１、ＢＳＴ１、ＣＹＢＡ、ＡＳＡＰ１、ＭＡＰ２Ｋ４、ＲＮＡＳＥ２、ＮＩＰＳＮＡＰ２、ＭＭＰ１及びＥＷＳＲ１からなる群より選択されるいずれか１つ以上のタンパク質、又は、それを暗号化する遺伝子の発現レベルが前記対照群よりも高い場合、好ましくは２倍以上高い場合、前記対象体が口腔扁平苔癬であると判断することができる。
一側によれば、前記対象体の前記ＣＣＬ２８、ＬＥＧ１、ＡＣＢＰ、ＡＰＯＭ、ＴＦＦ３、ＦＯＬＲ１、ＷＦＤＣ２、ＳＥＲＰＩＮＡ１、ＳＬＵＲＰ１、ＤＥＦＢ４Ａ、ＳＬＰＩ、ＩＧＦＢＰ７、ＩＧＬＶ１－５１、ＳＥＲＰＩＮＩ１、ＩＧＬＶ３－９、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＰＡＴＳ２Ｌ、ＡＰＯＣ１、ＩＧＫＶ２－２９及びＫＡＬＲＮからなる群より選択されるいずれか１つ以上のタンパク質、又は、それを暗号化する遺伝子の発現レベルが前記対照群よりも高い場合、好ましくは０．５倍以下として低い場合、前記対象体は正常なものと判断することができる。
実施形態で用いた用語は単に説明を目的として使用されたもので、限定しようとする意図として解釈されることはない。単数の表現は、文脈上明白に相違に意味しない限り、複数の表現を含む。本明細書において、「含む」又は「有する」などの用語は、明細書上に記載した特徴、数字、ステップ、動作、構成要素、部品、又はそれを組み合わせたものが存在することを示し、１つ又はそれ以上の他の特徴や数字、ステップ、動作、構成要素、部品、又はそれを組み合わせたものなどの存在又は付加の可能性を予め排除しないものとして理解しなければならない。
異なるように定義さがれない限り、技術的又は科学的な用語を含み、ここで用いる全ての用語は、本実施形態が属する技術分野で通常の知識を有する者によって一般的に理解されるものと同じ意味を有する。一般的に用いられる予め定義された用語は、関連技術の文脈上で有する意味と一致する意味を有するものと解釈されなければならず、本明細書で明白に定義しない限り、理想的又は過度に形式的な意味として解釈されることはない。
本発明は様々な変換を加えることができ、様々な実施形態を有することができ、以下は、特定の実施形態を図面に例示して詳細な説明に詳説しようとする。しかし、これは本発明を特定の実施形態に対して限定しようとものではなく、本発明の思想及び技術範囲に含まれる全ての変換、均等物ないし代替物を含むものとして理解しなければならない。本発明の説明において関連する公知技術に対する具体的な説明が本発明の要旨を曖昧にするものと判断される場合、その詳細な説明は省略する。
実施形態１．試料の収集
盆唐ソウル大学校の病院において、口腔扁平苔癬の患者群１１人と漢陽大学校の病院から正常対照群９人の唾液試料を収集した（ＩＲＢ Ｎｏ．Ｂ－２１０３－６７５－３０１）。唾を吐いて口腔内の粘液と異質物を除去した後、蒸留水１０ｍＬで１分間うがいをした後、吐き出したうがい液を唾液試料として使用した。唾液試料のタンパク質の分解又は変形を防ぐために、タンパク質の分解酵素阻害剤としてｃＯｍｐｌｅｔｅ、Ｍｉｎｉ ＥＤＴＡ－ｆｒｅｅプロテアーゼ阻害剤カクテル（Ｒｏｃｈｅ）を添加した。各試料に阻害剤の最終濃度１．５Ｘになるよう添加した後は、試験に使用する前まで－８０℃で保管した。
実施形態２．収集された唾液試料の定量
収集した唾液試料をビシンコニン酸（ｂｉｃｉｎｃｈｏｎｉｎｉｃ ａｃｉｄ：ＢＣＡ）分析法で定量した。１：２の比率で水で希釈しタンパク質の濃度を測定した。図１には、唾液試料を利用したタンパク質バイオマーカーを発掘するための試験過程の模式図を示した。
実施形態３．質量分析のための試料準備及び溶液状態で分解（Ｉｎ－ｓｏｌｕｔｉｏｎ ｄｉｇｅｓｔｉｏｎ）
質量分析のために、上記の実施形態１で収集された患者群１１個の個別試料は、前述したタンパク質の濃度測定を行った結果に基づいて２００μｇずつ取り、正常対照群の９個の個別試料は、１００μｇずつ取ってそれぞれ１００μＬで濃縮した後、８Ｍ尿素（ｕｒｅａ）と２Ｍチオ尿素（ｔｈｉｏｕｒｅａ）になるよう試料に加えた。０．５μｍｏｌのＴＣＥＰ（ｔｒｉｓ（２－ｃａｒｂｏｘｙｅｔｈｙｌ）ｐｈｏｓｐｈｉｎｅ）を用いて３７℃で二硫化結合を還元させた後、１μｍｏｌのＩＡＡ（２－Ｉｏｄｏａｃｅｔａｍｉｄｅ）を用いて２５℃の暗い環境でアルキル化させた。その後、８Ｍ尿素に２５ｍＭ炭酸水素アンモニウム（ａｍｍｏｎｉｕｍ ｂｉｃａｒｂｏｎａｔｅ）をさらに入れて１Ｍ尿素になるよう希釈した。ＬｙｓＣ（Ｅｎｄｏｐｒｏｔｅｉｎａｓｅ Ｌｙｓ－Ｃ）を１：２５の比率で入れて３０℃で２時間分解させた後、トリプシンを１：５０の比率で加えて２５℃で一晩中分解した。次に、ＳｅｐＰａｋ（登録商標）ｔＣ１８カートリッジ（Ｓｅｐ－Ｐａｋ ｔＣ１８ １ｃｃＶａｃ ｃａｒｔｒｉｇｅ、１００ｍｇ、Ｗａｔｅｒｓ）を用いて精製してから真空乾燥方式で乾燥させた。乾燥されたペプチドを１００ｍＭ臭化テトラエチルアンモニウム（ｔｅｔｒａｅｔｈｙｌａｍｍｏｎｉｕｍ ｂｒｏｍｉｄｅ：ＴＥＡＢ）に溶かした後、ペプチドを１：２５比率で定量した。
実施形態４．ペプチド試料のＴａｎｄｅｍ Ｍａｓｓ Ｔａｇ（ＴＭＴ）ラベリング
ＴＭＴラベリング試薬（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）を８０μＬのアセトニトリルに溶解させ、実施形態３に準備された各試料、４２μｇのペプチド試料に３６μＬのＴＭＴラベリング試薬を加えた。反応物を２０℃で１時間の間にインキュベーションしてペプチドをラベリングした後、５μＬの５％（ｗ／ｖ）ヒドロキシアミン（ｈｙｄｒｏｘｙｌａｍｉｎｅ）を加えて２０℃で１５分間インキュベーションしてラベリング反応を終結させた。ＴＭＴラベリングした試料を１つのチューブに合わせ、ＳｅｐＰａｋ（登録商標）ｔＣ１８カートリッジで精製してから真空乾燥させた。
乾燥された試料は、１０ｍＭギ酸アンモニウム（ａｍｍｏｎｉｕｍ ｆｏｒｍａｔｅ）に溶かした。試料をＡｇｉｌｅｎｔ １２９０ Ｉｎｆｉｎｉｔｙ ｌｉｑｕｉｄ ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙを用いて、Ｘ－Ｂｒｉｄｇｅ ｐｅｐｔｉｄｅ ＢＥＨ Ｃ１８カラム（４．６ｍｍｉ．ｄ．×２５０ｍｍｌｅｎｇｔｈ；ｐｏｒｅ ｓｉｚｅ １３０ Ａ；ｐａｒｔｉｃｌｅ ｓｉｚｅ３．５μｍ、Ｗａｔｅｒｓ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ、Ｍｉｌｆｏｒｄ、ＭＡ、ＵＳＡ）に５００μｇを注入し、高いｐＨ逆相ペプチド分別（Ｈｉｇｈ ｐＨ Ｒｅｖｅｒｓｅｄ－ｐｈａｓｅ Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｆｒａｃｔｉｏｎａｔｉｏｎ）を行った。前記カラムを１００％のバッファＡ１０ｍＭギ酸アンモニウム（ｐＨ１０）で平衡化させた。バッファＢは、１０ｍＭギ酸アンモニウム（ｐＨ１０）の９０％のアセトニトリルであった。作業流速は、次の勾配条件で０．５ｍＬ／分にした。
０分：１００％バッファＡ及び０％バッファＢ、
０分～１０分：０％～５％バッファＢ、
１０分～４８．５分：５％～４０％バッファＢ、
４８．５分～６２．５分：４０％～７０％バッファＢ、
６２．５分～７２．５分：７０％バッファＢ、
７２．５分～８２．５分：７０％～５％バッファＢ、
８２．５分～９２．５分：５％バッファＢ
試料は１０分から８２．５分の間のペプチドを９６個の分画に分けた。９６個の分画を２４個の分画に合わせた後、分画物を真空乾燥させた。乾燥させたペプチド試料は、２０．８３μＬの０．１％ギ酸で再懸濁（ｒｅｓｕｓｐｅｎｄ）して溶かした。
実施形態５．ペプチド質量スペクトルの分析
分画化された各ペプチド試料７μＬをＵｌｔｉｍａｔｅ３０００システム上で逆相ＰｅｐＭａｐ ＲＳＬＣ Ｃ１８カラム（５０ｃｍＸ７５μｍ）に注入した。前記カラムを１００％のバッファＡ（０．１％（ｖ／ｖ）のギ酸を含有する１００％の水）で平衡化させた。バッファＢは、０．１％（ｖ／ｖ）のギ酸を含有する１００％のアセトニトリルであった。作業流速は、次の勾配条件で３００ｎＬ／分にした。
０分：９５％バッファＡ及び５％バッファＢ、
０分～４分：５％バッファＢ、
４分～１３分：５％～１０％バッファＢ、
１３分～１５０分：１０％～２５％バッファＢ、
１５０分～１５５分：２５％～２８％バッファＢ、
１５５分～１６０分：２８％～４０％バッファＢ、
１６０分～１６５分：４０％～８０％バッファＢ、
１６５分～１６７分：８０％バッファＢ、
１６７分～１７０分：８０％～５％バッファＢ、
１７０分～１８０分：５％バッファＢ
ｎａｎｏＬＣシステムをＴｒｉｂｒｉｄ Ｏｒｂｉｔｒａｐ Ｅｃｌｉｐｓｅに装着した。全体－スキャンＭＳスペクトラ（Ｓｕｒｖｅｙ ｆｕｌｌ－ｓｃａｎ ＭＳ ｓｐｅｃｔｒａ、３００～１６、０００ｍ／ｚ）を１マイクロスキャン（ｍｉｃｒｏｓｃａｎ）及び１２０、０００の解像度で収得し、先導物質（ｐｒｅｃｕｒｓｏｒ）を選別して電荷状態を測定するためのプレビューモードを設定した。プレビュー照射スキャンから２０個の最も強力なイオンに対するＭＳ／ＭＳスペクトラを下記のようなオプションで全体スキャンに対するイオントラップで収得した：分離間隔（ｉｓｏｌａｔｉｏｎ ｗｉｎｄｏｗ）、１．４ｍ／ｚ；ＣＩＤ衝突エネルギー（ｃｏｌｌｉｓｉｏｎ ｅｎｅｒｇｙ）、３５％；動的排除時間（ｄｙｎａｍｉｃ ｅｘｃｌｕｓｉｏｎ ｄｕｒａｔｉｏｎ）、３０秒（ｓｅｃ）。ＭＳ３スキャンが定量のために使用された：１０個のｓｙｎｃｈｒｏｎｏｕｓ ｐｒｅｃｕｒｓｏｒ ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ（ＳＰＳ）イオン；５０、０００の解像度（ｒｅｓｏｌｕｔｉｏｎ）；ＨＣＤ衝突エネルギー（ｈｉｇｈｅｒ－ｅｎｅｒｇｙ ｃｏｌｌｉｓｉｏｎａｌ ｄｉｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ（ＨＣＤ）、５５％；スキャン範囲、１００－１０００ｍ／ｚ
実施形態６．タンパク質の同定及びラベル基盤の定量分析のためのデータ処理
それぞれのＬＣ－ＭＳ／ＭＳファイルをＰｒｏｔｅｏｍｅ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｅｒ２．４のＳＥＱＵＥＳＴアルゴリズムを用いて分析した。ＭＳ及びＭＳ／ＭＳデータをＳｗｉｓｓＰｒｏｔヒトデータベース（２０４２３個のタンパク質を含む（２０２３年６月アップデートされる））と比較調査した。照射は２つの未切断（ｍｉｓｓｅｄ ｃｌｅａｖａｇｅｓ）トリプシン分解されたペプチド（ｔｒｙｐｔｉｃ ｐｅｐｔｉｄｅ）を許容することに制限した。システイン（ｃｙｓｔｅｉｎｅ）のカルボアミドメチル化（ｃａｒｂｏａｍｉｄｏｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎ、＋５７．０２１Ｄａ）とライシン（Ｌｙｓｉｎｅ）及びペプチドＮ－端末のＴＭＴラベリング（＋３０４．２０７Ｄａ）固定された数式化で、メチオニン酸化を流動型式化（＋１５．９９５Ｄａ）に設定した。質量許容範囲（ｍａｓｓ ｔｏｌｅｒａｎｃｅ）をＭＳ／ＭＳデータに対して０．６Ｄａ及びＭＳデータに対して１０ｐｐｍに設定した。
正常対照群の試料（９個）、患者群試料（１１個）の２グループに存在するタンパク質の相対的な量をＰｒｏｔｅｏｍｅ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｅｒ２．４を用いてＭＳ３スキャンで各試料に由来したペプチドに標識されたラベルのリポーターイオンのノイズ対比シグナル（ｓｉｇｎａｌ ｔｏ ｎｏｉｓｅ）値を算出した。統計的に有意なタンパク質を捜し出すために、ノイズ対比シグナルに基づいた豊富度値に対して２つの群（口腔扁平苔癬の患者群、正常対照群）を対象にＳｔｕｄｅｎｔ’ｓ ｔ ｔｅｓｔ分析をＰｅｒｓｅｕｓソフトウェアを用いて行った。Ｐ－値が０．０５未満である場合、統計的に有意なものと見なした。
実施形態７．口腔扁平苔癬で差等発現されるタンパク質の同定
口腔扁平苔癬の患者群と正常対照群試料に存在する２つのグループのタンパク質の同定に対する結果から、合計４６０９個のタンパク質がユニークペプチド（ｕｎｉｑｕｅ ｐｅｐｔｉｄｅ）１つ以上に同定されたことが確認された。同定されたタンパク質のうち、３１４５個のタンパク質がラベリング基盤の定量分析可能なノイズ対比シグナル値を有していた。統計的に有意なタンパク質を捜し出すために、３１４５個のタンパク質にノイズ対比シグナル値に基づいた豊富度値に対して２つの群（患者群、正常対照群）を対象に統計分析を行った結果、Ｐ－値が０．０５未満である１３６７個のタンパク質を取得することができた。
統計的に有意な１３６７個のタンパク質で口腔扁平苔癬の患者群において２倍以上の差等発現を示すタンパク質を選別しようとし、上位２０個のタンパク質を確認した。また、口腔扁平苔癬の患者群において、０．５倍以上減少する上位２０個のタンパク質を確認し、その結果をそれぞれの表１及び表２に示した。
以上、本発明の実施形態について図面を参照しながら詳細に説明したが、本発明は、上述の実施形態に限定されるものではなく、当技術分野で通常の知識を有する者であれば、前記に基づいて様々な技術的修正及び変形を適用することができる。例えば、説明された技術が説明された方法とは異なる順に実行されたり、及び／又は説明されたシステム、構造、装置、回路などの構成要素が説明された方法とは異なる形態に結合又は組み合せられたり、他の構成要素又は均等物によって代替、置換されても適切な結果を達成することができる。
したがって、他の具現、他の製造例及び特許請求の範囲と均等なものも後述する請求範囲に属する。

Claims (9)

  1. ＣＬＣ（Ｇａｌｅｃｔｉｎ－１０、ＵｎｉＰｒｏｔ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．Ｑ０５３１５）を含む、口腔扁平苔癬の診断用バイオマーカー組成物。
  2. ＣＬＣであるタンパク質、又は、それを暗号化する遺伝子の発現レベルを測定できる製剤を含む、口腔扁平苔癬の診断用組成物。
  3. 前記タンパク質の発現レベルを測定できる製剤は、前記タンパク質に特異的に結合する抗体又はその抗原結合断片、又は、前記タンパク質に特異的に結合するアプタマーである、請求項２に記載の口腔扁平苔癬の診断用組成物。
  4. 前記遺伝子の発現レベルを測定できる製剤は、前記遺伝子の核酸分子に特異的に結合するプライマー又はプローブである、請求項２に記載の口腔扁平苔癬の診断用組成物。
  5. 対象体から分離した生物学的な試料からＣＬＣであるタンパク質、又は、それを暗号化する遺伝子の発現レベルを測定するステップを含む、口腔扁平苔癬を診断するための情報提供方法。
  6. 前記方法は、対照群から分離した生物学的な試料から、ＣＬＣであるタンパク質又はそれを暗号化する遺伝子の発現レベルを測定するステップと、前記対象体及び前記対照群の前記タンパク質又はそれを暗号化する遺伝子の発現レベルを比較するステップとをさらに含む、請求項５に記載の情報提供方法。
  7. 前記対象体の前記ＣＬＣであるタンパク質又はそれを暗号化する遺伝子の発現レベルが前記対照群よりも高い場合、前記対象体は口腔扁平苔癬として判断する、請求項６に記載の情報提供方法。
  8. 前記生物学的な試料は唾液である、請求項５に記載の情報提供方法。
  9. 請求項２～請求項４のいずれか一項に記載の診断用組成物を含む、口腔扁平苔癬の診断キット。
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* Cited by examiner, † Cited by third party
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CN110846415A (zh) 2019-11-28 2020-02-28 赤峰学院附属医院 一种用于口腔扁平苔藓癌前病变的检测装置
CN112201344A (zh) 2020-10-09 2021-01-08 郑州大学第一附属医院 唾液代谢标志物在早期诊断口腔扁平苔藓的应用
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Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110846415A (zh) 2019-11-28 2020-02-28 赤峰学院附属医院 一种用于口腔扁平苔藓癌前病变的检测装置
CN112201344A (zh) 2020-10-09 2021-01-08 郑州大学第一附属医院 唾液代谢标志物在早期诊断口腔扁平苔藓的应用
CN112216393A (zh) 2020-10-09 2021-01-12 郑州大学第一附属医院 口腔扁平苔藓诊断模型的构建方法、标志物及其应用

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
GHAPANCHI Janan et al.，Evaluation of the serum levels of galectin-3 in patients with oral lichen planus disease，Oral Diseases，2019年，Volume 25，p.p.466-470，DOI: 10.1111/odi.13012
MUNIZ J.M. et al.，Galectin-9 as an important marker in the differential diagnosis between oral squamous cell carcinoma, oral leukoplakia and oral lichen planus，Immunobiology，2015年04月27日，Volume 220，p.p.1006-1011，http://dx.doi.org/10.1016/j.imbio.2015.04.004

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