JP7495126B2 - 組織への治療用核酸の送達のための材料および方法 - Google Patents

組織への治療用核酸の送達のための材料および方法 Download PDF

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Description

関連出願の相互参照
本出願は、2018年5月8日に出願された米国仮出願第62/668,463号の優先権の利益を主張し、該米国仮出願の開示は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本開示は、治療用核酸細胞(および造影剤)を組織に送達するための材料および方法を提供する。
政府支援の声明
本発明は、米国国立糖尿病ならびに消化器系疾患および腎疾患研究所(National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases、NIDDK)によって授与された助成番号1UC4DK116241-01の下で米国政府の支援を受けてなされた。政府は、本発明におけるある特定の権利を有する。
電子的に提出された資料の参照による組込み
本出願は、本開示の別個の部分として、その全体が参照により組み込まれるコンピューター可読形式の配列表(ファイル名:53048A_Seqlisting.txt、サイズ:116,998バイト、2019年5月8日作成)を含む。
糖尿病は、膵臓のベータ細胞によって産生されるホルモンであるインシュリンの不足によって引き起こされる、長期間にわたって高血糖値が存在する一群の代謝障害である。特に、1型糖尿病はベータ細胞の進行性の自己免疫破壊によって引き起こされるが、2型糖尿病では、体が必要とするのに十分な量のインシュリンが生成されない。2型糖尿病へのベータ細胞喪失の寄与が長年議論されてきたが、過去10年間で、ベータ細胞の喪失が2型糖尿病の病態生理にも関与していることが明らかになった(Rojas et al.,Journal of Diabetes Research,vol.2018,Article ID 9601801,19 pages,2018;Donath et al.,Diabetes.2005 Dec;54 Suppl 2:S108-13)。これまでのこの知識にもかかわらず、インビボでベータ細胞(ベータ細胞質量)の数を直接測定するため、またはこれらの重要な細胞に特異的に治療薬を送達するための利用可能な方法はない。確かに、糖尿病の進行を決定する方法は、主に間接的な測定(すなわち、血中のグルコースまたはc-ペプチド濃度の決定)に依存しており、多くの細胞がインシュリンをほとんど生成しないか、または少数の細胞がこのホルモンを大量に生成するかを区別できない。したがって、これらの方法では、糖尿病患者の進行性ベータ細胞の喪失を測定することはできない。ベータ細胞に特異的な適切なマーカーがないことも、ベータ細胞の喪失を停止または逆転させるために、ベータ細胞に特異的に治療薬を送達することを不可能にしている。
RNAアプタマーは、受容体を介した内在化またはクラスリンを介したエンドサイトーシスによって治療用カーゴの細胞内蓄積を能動的に増強するため、多くのヒト疾患の治療におけるsiRNAの効果的な送達媒体として浮上している(35~39,43~74)。目的の治療用RNAをβ細胞に送達するためのアプタマーの使用は、例えば、目的の遺伝子の一過性調節、免疫原性の欠如、および優れた安全性プロファイルなどのウイルスベクターの使用よりも有利である。現在まで、アデノウイルスベクターは主にインビトロで
初代膵島への遺伝子とsiRNAの効率的な送達に使用されてきた(79~84)。しかし、インビボでは、ウイルスベクターの使用における技術的困難に加えて、それらの固有の免疫原性および野生型ウイルスとの可能な組換えは、深刻な安全上の懸念を引き起こす。確かに、ウイルスベクターは、多臓器不全や死さえも含む可能性のある二次的合併症を伴う強力な免疫反応を誘発する可能性がある(85)。レンチウイルスベクターの出現により、免疫原性の懸念の一部が緩和されたが、レンチウイルスは、無傷のヒト膵島の形質導入においてアデノウイルスほど効率的ではない(86,87)。しかし、現在のインビトロプロトコルは最適化されている(88)。それにもかかわらず、ゲノムへのレンチウイルスの統合は、安全性の懸念、挿入型遺伝子変異のリスク、および野生型ウイルスとの組換えを依然として引き起こす。
一態様では、本開示は、1つ以上の薬剤を組織に送達する方法であって、組織を、薬剤に結合した組織に特異的なアプタマーを含む構築物と接触させることを含む、方法を提供する。ある実施形態では、組織は、膵臓、心臓、肺、腎臓、胃、皮膚、および脳からなる群から選択される器官に由来する。ある実施形態では、組織は膵島である。ある実施形態では、薬剤は治療用核酸である。ある実施形態では、治療用核酸は治療用RNAである。ある実施形態では、治療用RNAは、siRNAおよびsaRNAからなる群から選択される。ある実施形態では、薬剤は画像化剤である。例示的な画像化剤には、蛍光色素、フッ素-18、酸素-15、ガリウム68などのポジトロン放出断層撮影トレーサー、ガドリニウム、酸化鉄、鉄白金およびマンガンなどの磁気共鳴画像造影剤が含まれるが、これらに限定されない。本明細書に記載の接触ステップは、インビボまたはインビトロで行うことができる。
別の態様では、本開示は、小さな活性化RNA(saRNA)に結合したアプタマーを含む構築物を提供する。ある実施形態において、アプタマーは、ヒト膵島に特異的である。ある実施形態において、アプタマーは、M12-3773および1-717からなる群から選択される。
ある実施形態において、アプタマーは、クラステリン(CLU、遺伝子ID1191)に特異的である。ある実施形態において、アプタマーは、「膜貫通emp24ドメイン含有タンパク質6」(TMED6、遺伝子ID146456)に特異的である。
ある実施形態では、組織は副腎組織または骨髄であり、アプタマーは173-2273、107-901またはm6-3239である。ある実施形態では、組織は乳房組織、肺組織またはリンパ節組織であり、アプタマーは107-901およびm6-3239である。ある実施形態では、組織は脳小脳であり、アプタマーは173-2273、107-901、m1-2623またはm6-3239である。ある実施形態では、組織は、脳大脳皮質組織、下垂体組織、結腸組織、内皮組織、食道組織、心臓組織または腎臓組織であり、アプタマーは、107-901、m1-2623またはm6-3239である。ある実施形態では、組織は卵管組織であり、アプタマーはm6-3239である。ある実施形態では、組織は肝臓組織であり、アプタマーは166-279、107-901、m1-2623またはm6-3239である。ある実施形態では、組織は卵巣組織であり、アプタマーは107-901である。ある実施形態では、組織は胎盤組織であり、アプタマーは、166-270、173-2273、107-901、m1-2623、またはm6-3239である。ある実施形態では、組織は前立腺組織であり、アプタマーは173-2273または107-901である。ある実施形態では、組織は脊髄組織であり、アプタマーは166-279または173-2273である。ある実施形態では、組織は精巣組織であり、アプタマーは、166-279、173-2273、107-901、m1-2623、m6-3239、およびm12-3773である。ある実施形態では、組織
は胸腺組織であり、アプタマーは173-2273、107-901またはmf-2623である。ある実施形態では、組織は甲状腺組織であり、アプタマーはm1-2623である。ある実施形態では、組織は尿管組織であり、アプタマーは107-901である。ある実施形態では、組織は子宮頸部組織であり、アプタマーは166-279である。ある実施形態では、組織はランゲルハンス島または膵臓組織であり、アプタマーは166-279、173-2273、107-901、1-717、m1-2623、m6-3239またはm12-3773である。
別の態様では、本開示は、1つ以上の薬剤を膵島に送達する方法であって、膵島を、薬剤に結合した膵島に特異的なアプタマーを含む構築物と接触させることを含む、方法を提供する。ある実施形態では、薬剤は治療用核酸である。ある実施形態では、治療用核酸は治療用RNAである。ある実施形態において、治療用RNAは、siRNAおよびsaRNAからなる群から選択される。ある実施形態では、薬剤は画像化剤である。例示的な画像化剤には、蛍光色素、フッ素-18、酸素-15、ガリウム68などのポジトロン放出断層撮影トレーサー、ガドリニウム、酸化鉄、鉄白金およびマンガンなどの磁気共鳴画像造影剤が含まれるが、これらに限定されない。本明細書に記載の接触ステップは、インビボまたはインビトロで行うことができる。
ある実施形態において、アプタマーは、M12-3773および1-717からなる群から選択される。ある実施形態において、アプタマーは、クラステリン(CLU、遺伝子ID1191)に特異的である。ある実施形態において、アプタマーは、「膜貫通emp24ドメイン含有タンパク質6」(TMED6、遺伝子ID146456)に特異的である。
別の態様では、本開示は、ベータ細胞の質量を測定する方法であって、ベータ細胞を、ベータ細胞の質量を測定するのに有効な量の、画像化剤に結合したアプタマーを含む構築物と接触させることを含む、方法を提供する。ある実施形態において、アプタマーは、M12-3773および1-717からなる群から選択される。ある実施形態では、画像化剤は蛍光色素である。ある実施形態では、画像化剤は、PETトレーサーである。ある実施形態では、画像化剤は、MRI造影剤である。ある実施形態では、画像化剤は、キレート剤を介してアプタマーに結合することができる。
別の態様では、本開示は、ベータ細胞の増殖を調節する方法であって、ベータ細胞を、ベータ細胞の増殖を調節するのに有効な量の、治療用核酸に結合したアプタマーを含む構築物と接触させることを含む、方法を提供する。ある実施形態において、アプタマーは、M12-3773および1-717からなる群から選択される。ある実施形態では、治療用核酸は治療用RNAである。ある実施形態において、治療用RNAは、siRNAおよびsaRNAからなる群から選択される。本明細書に記載の接触ステップは、インビボまたはインビトロで行うことができる。
別の局面において、本開示は、ベータ細胞アポトーシスを阻害するための方法であって、ベータ細胞のアポトーシスを阻害するのに有効な量の、治療用核酸に結合したアプタマーを含む構築物とベータ細胞を接触させることを含む、方法を提供する。ある実施形態において、アプタマーは、M12-3773および1-717からなる群から選択される。ある実施形態では、治療用核酸は治療用RNAである。ある実施形態において、治療用RNAは、siRNAおよびsaRNAからなる群から選択される。ある実施形態において、治療用RNAは、タンパク質XIAP(アポトーシス遺伝子ID331のX連鎖阻害剤)をアップレギュレートする。本明細書に記載の接触ステップは、インビボまたはインビトロで行うことができる。
別の局面において、本開示は、組織移植片のアポトーシスの阻害を必要とする対象における組織移植片アポトーシスを阻害するための方法であって、組織移植片のアポトーシスを阻害するのに有効な量の、治療用核酸に結合したアプタマーを含む構築物と組織移植片を接触させることを含む、方法を提供する。ある実施形態では、治療用核酸は治療用RNAである。ある実施形態において、治療用RNAは、siRNAおよびsaRNAからなる群から選択される。ある実施形態において、治療用RNAは、タンパク質XIAP(アポトーシス遺伝子ID331のX連鎖阻害剤)をアップレギュレートする。本明細書に記載の接触ステップは、インビボまたはインビトロで行うことができる。ある実施形態において、組織移植片は、膵臓、心臓、肺、腎臓、胃および皮膚からなる群から選択される器官に由来する。ある実施形態では、アプタマーは筋肉特異的アプタマーであり、組織は心臓組織である。
ある実施形態において、組織は、アプタマーの非存在下でタンパク質XIAPをアップレギュレートする治療用RNAと接触させられる。例えば、別の局面において、本開示は、組織移植片アポトーシスの阻害を必要とする対象における組織移植片アポトーシスを阻害する方法であって、組織移植片を、組織移植片のアポトーシスを阻害するのに有効な量の、タンパク質XIAP(アポトーシス遺伝子ID331のX結合阻害剤)をアップレギュレートする治療用RNAと接触させることを含む、方法を提供する。本明細書に記載の接触ステップは、インビボまたはインビトロで行うことができる。ある実施形態において、組織移植片は、膵臓、心臓、肺、腎臓、胃および皮膚からなる群から選択される器官に由来する。
別の態様では、本開示は、ベータ細胞のT細胞媒介細胞毒性からベータ細胞を保護する方法であって、ベータ細胞を、ベータ細胞のT細胞媒介細胞毒性を阻害するのに有効な量の、治療用核酸に結合したアプタマーを含む構築物と接触させることを含む、方法を提供する。ある実施形態において、アプタマーは、M12-3773および1-717からなる群から選択される。ある実施形態において、治療用核酸は、免疫チェックポイントを増加させることができる。ある実施形態では、治療用核酸は治療用RNAである。ある実施形態において、治療用RNAは、siRNAおよびsaRNAからなる群から選択される。ある実施形態において、治療用RNAは、タンパク質CD274(プログラムされたデスリガンド1、PDL1、遺伝子ID29126)をアップレギュレートする。本明細書に記載の接触ステップは、インビボまたはインビトロで行うことができる。
別の態様では、本開示は、糖尿病の治療を必要とする対象の糖尿病を治療する方法であって、対象の糖尿病を治療するのに有効な量の、小さな活性化RNA(saRNA)に結合したアプタマーを含む構築物を対象に投与することを含む、方法を提供する。ある実施形態において、アプタマーは、M12-3773および1-717からなる群から選択される。
別の態様では、ベータ細胞に特異的な1つまたは複数のアプタマーを組み合わせて使用して、治療薬または画像化剤の送達を増加させることができる。ある実施形態において、アプタマーは、M12-3773および1-717からなる群から選択される。
配列番号264または259に記載のヌクレオチド配列を含むアプタマーも企図される。ある実施形態において、アプタマーは、saRNAに結合している。ある実施形態において、saRNAは、タンパク質XIAP(アポトーシス遺伝子ID331のX連鎖阻害剤)をアップレギュレートする。ある実施形態において、saRNAは、タンパク質CD274(プログラムされたデスリガンド1、PDL1、遺伝子ID29126)をアップレギュレートする。
ヒト膵島および腺房組織を用いてヒト膵島に特異的なアプタマーを単離するための教師なし戦略としてのHTクラスターSELEXを示すフローチャートである。 マウスとヒトの間で交差反応する膵島特異的アプタマーを分離するためのHT-トグル-クラスターSELEXを示すフローチャートである。 マウスとヒトの間で交差反応する膵島特異的アプタマーを分離するためのHT-トグル-クラスターSELEXら得られた画像を示す。 ヒトの腺房組織ではなくヒトの膵島を認識するモノクローナルアプタマーを同定するHT-トグル-クラスターSELEXから得られた画像を示す。 図5A及び図5Bは、アプタマー1-717(図5A)およびM12-3772(図5B)が、ヒト膵島に対して並外れた特異性を示すことを示す。 図5A及び図5Bは、アプタマー1-717(図5A)およびM12-3772(図5B)が、ヒト膵島に対して並外れた特異性を示すことを示す。 図5Cは、様々な選択されたアプタマーによる様々な組織染色の結果を示す表である。 アプタマー1-717およびM12-3772がマウス膵島およびその他のマウス組織を認識することを示す。 アプタマー1-717およびM12-3773がヒトベータ細胞を優先的に認識することを示す。 クラステリンがアプタマーm12-3773の標的となる可能性があることを示す。 TMED6がアプタマー1-717の推定標的であることを示す。 アプタマー1-717とm12-3773の混合物が、個々のクローンよりもインビボでヒト膵島をよりよく認識することを示す。 アプタマー1-717およびM12-3773がインビボでのヒトベータ細胞量の測定を可能にすることを示す。図11Aは、実施例2で実施された実験の概略図である。図11Bおよび11Cは、EFP領域の蛍光シグナルが移植された膵島の数に比例することを示し、これらのアプタマーを使用してインビボでβ細胞量を測定できることを示す。図11Dは、同系(Balb/c)または同種(C57Bl/6)膵島を、免疫応答性Balb/cマウスの皮下(それぞれ右脇腹と左脇腹)にトを移植したことを示す。拒絶反応は、AF750結合アプタマーを静脈内注射し、5時間後にIVISを実行することによって縦方向に監視された。データは、同種異系のC57Bl6膵島移植片の拒絶反応が、左側腹部の信号の喪失によって見られるように、経時的に測定できることを示す。代わりに、同系の膵島移植片の信号(右)は、移植片の生存を示す時間の経過とともに維持される。 膵島特異的アプタマーを介して治療用RNAを送達するためのアプタマーキメラの概略図である。 膵島特異的アプタマーキメラが膵島特異的アプタマーを介した治療用RNAの送達を可能にすることを示す。 p57kip2-siRNA島特異的アプタマーキメラがインビボでヒトベータ細胞の増殖を誘導することを示す。 ヒト「X連鎖アポトーシス阻害因子」(Xiap、遺伝子ID331)に特異的な小さな活性化RNA(saRNA)の同定を示す。 Xiap-saRNAアプタマーキメラは、サイトカイン誘導アポトーシスからヒトベータ細胞を保護する。 図17Aは、Xiap-saRNA/膵島特異的アプタマーキメラがベータ細胞を一次機能不全から保護することを示す。図17Bは、実施例5に記載された実験の概略図である。図17Cは、ヒト膵島は、48時間、24時間にキメラが添加された培地で培養され、移植の日に、ストレプトゾトシン糖尿病NOGマウスの左腎臓被膜にマウスあたり600IEQが移植された。データは、アプタマーキメラによるヒト膵島の前処理が膵島移植の有効性を大幅に改善し、マウスの約80%が2日目までに正常血糖になることを示した。対照的に、膵島を移植された50%odマウス(P=0.02;nキメラ処理=10;n未処理=8)のみが糖尿病を逆転させ、動態が遅れた。 ヒト「PDL1」(CD274、遺伝子ID29126)に特異的な小さな活性化RNA(saRNA)の同定。 PDL1-saRNA/膵島特異的アプタマーキメラはヒトベータ細胞のPDL1をアップレギュレートする。 PDL1-saRNA/アプタマーキメラはインビボでPDL1をアップレギュレートする。
実施例に記載されているように、治療用RNA/アプタマーキメラは、インビボでヒトβ細胞における遺伝子発現を調節して、それらの一過性増殖を誘導し、自己/同種免疫に対するそれらの耐性を改善するために生成された。特に、A)β細胞増殖を誘導するp57kip2に対するsiRNA、B)アポトーシスから膵島を保護するXiap発現を促進するsaRNA、およびC)T細胞の細胞毒性からβ細胞を保護するPDL1発現を促進するsaRNAを送達するための、膵島特異的アプタマーの使用を最適化および検証する。自己免疫T1Dの信頼できるヒト化マウスモデルがないため、我々のアプローチは、アプタマー治療の前にヒト膵島を移植したNSGまたはヒト化NSGマウスの使用に基づいている。ヒト膵島の使用は、p57kip2生物学における種特異的な違い(14)と、ヒト遺伝子に対するPDL1およびXiapsaRNAの特異性によって決定される。エクスビボおよび革新的なインビボ技術を使用して、β細胞増殖、アポトーシス、および免疫系との相互作用の画像化を通じて、インビボ治療に対する応答を定量化する。我々は、これらのアプタマーを、異なる遺伝子を同時に調節できるモノモーダルまたはマルチモーダルアプローチとして使用することを想定している。
このクラスの分子は免疫原性が低く、組織の奥深くまで浸透する能力が高く、同族の標的を高い親和性と特異性で認識する能力があるため、RNAアプタマーのインビボでの使用は特に魅力的である。アプタマーのフッ素化バックボーンにより、アプタマーはRNAse分解に耐性があり、TLRシグナル伝達を誘発できなくなる(41,42)。RNAアプタマーは、多くのヒトの疾患の治療のために、特定の細胞サブセットまたは組織へのsiRNAおよび他の薬物の効果的な送達媒体として出現した(60,62-75)。実際、アプタマーとその細胞膜標的との間の相互作用を通じて、アプタマーは治療薬の細胞内蓄積を積極的に増強する(37-39,43-61)。一部のアプタマー薬はFDAに承認されており、30種以上が臨床試験で試験されている(16~24)。インビボで投与される場合、特定の標的を見つけられないアプタマーは、腎臓を介して急速に排除される。組織または細胞で標的を見つけたものは、最大2週間検出可能である。それらのバイオアベイラビリティ、血漿半減期、および薬物動態特性は、合成中にポリエチレングリコール(PEG)を添加するか、またはナノ粒子と結合させることにより、サイズを大きくすることで簡単に操作できる(60,62~74)。アプタマーは、siRNA、miRNA、またはsaRNAに結合させて、特定の標的に望ましい治療効果をもたらすことができる。高い特異性と定義された機能を備えたアプタマーを直接操作する能力は、抗体や他の小分子に比べて明らかな利点である。
実施例1-ヒト膵島に特異的なモノクローナルRNAアプタマーの単離。
監視されていないトグルSELEXは、マウス膵島に対するポリクローナルアプタマーライブラリーから始めて、膵島枯渇ヒト腺房細胞と4人の異なる死体ドナーからの厳選されたヒト膵島をそれぞれネガティブセレクターとポジティブセレクターとして使用して実行した。これにより、非特異的(腺房組織結合)RNAアプタマーの枯渇が可能になり、
マウスおよびヒトの膵島に特異的なアプタマーのライブラリーが充実した。
図1に示すように、HTクラスターSELEXは、ヒト膵島と腺房組織を使用して、ヒト膵島に特異的なアプタマーを分離するための教師なし戦略として使用された。ランダムアプタマーライブラリーは、2つの定常領域に隣接する40-nt可変領域を含むcDNAランダムライブラリー(TCT CGG ATC CTC AGC GAG TCG TC TG(N40)CCG CAT CGT CCT CCC TA(配列番号413)からPCRおよびDurascribe T7RNA転写によって生成された。このランダムライブラリーの5ug(約8.3x1013アプタマー)は、死体ドナーからの膵島枯渇膵島(ネガティブセレクター)を使用して、腺房組織に結合するアプタマーが枯渇した。次に、結合していないアプタマーを、死体ドナーから厳選した膵島(ポジティブセレクターとしての100~300IEQ)とともにインキュベートした。膵島をPBSで洗浄し、膵島に結合したアプタマーをRNA抽出によって回収し、2’-フッ素-dCTP(2’-F-dCTP)および2’-フッ素-dUTP(2’-F-dUTP)、ATP、およびRNAse耐性が向上したGTPを使用したRT-PCRおよびT7-RNAポリメラーゼによって再増幅した。得られたRNAアプタマーライブラリー(表1)は、膵島特異的アプタマーが豊富で、新しい選択サイクルに使用した。合計8回の選択サイクルが、4人の無関係な死体ドナーからの膵島と腺房組織を使用して実行された。各サイクルのライブラリーをHTシーケンスし、バイオインフォマティクス分析を行って頻度とクラスター分析を実行し、選択プロセス中に濃縮されたモノクローナルアプタマーとアプタマーファミリーを特定した。サイクル8からライブラリーに存在する最も頻繁なファミリーの中で最も頻繁なモノクローナルアプタマーを、経験的試験のために選択した。
Figure 0007495126000014
図2に示すように、HT-トグル-クラスターSELEXを使用して、マウスとヒトの間で交差反応する膵島特異的アプタマーを分離した。HTクラスターSELEXの8サイクルは、ネガティブセレクターおよびポジティブセレクターとしてそれぞれマウス腺房組織およびマウス膵島を使用して、図1に記載されているように実行された(図2A)。サイクル8から得られたポリクローナルアプタマーは、マウスからの腺房組織と膵島、または死体ドナーから分離された腺房組織と膵島のいずれかを使用して、選択の2つの追加サイクルに使用された(図2B)。得られたポリクローナルアプタマーライブラリーは、HTシーケンシングおよびバイオインフォマティクス分析(図2C)を受けて、マウスまたはヒトの組織を使用して選択されたライブラリーに存在する各モノクローナルアプタマーの頻度を決定した。ヒトライブラリーに富むモノクローナルアプタマー(表3)(ヒト膵島に対する推定アプタマー、長方形の選択)が経験的試験のために選択された。表3は、ヒト膵島に対する推定アプタマーも示している。
次に、同定されたモノクローナルアプタマーのヒト膵島に対する特異性を、図1および図2に記載されている2つのハイスループットクラスターSELEX戦略でテストした。簡単に言えば、バイオインフォマティクス分析によって同定された配列に対応するモノクローナルアプタマーは、重複するオリゴヌクレオチドをテンプレートとして使用して、PCRおよびT7RNAポリメラーゼによって生成された。得られたモノクローナルアプタマーはシアニン-3で標識され、死体ドナーからのヒト膵臓の切片の蛍光プローブとして使用された。クローン番号は、HT-トグルクラスターSELEXからのアプタマーの識別を示す接頭辞「m」で報告される。データは、いくつかのアプタマー(m166-279、m5-3229、107-901、m7-2537、m9-3076、1-717、173-2273、m12-3772)が膵島に対して優れた特異性を示す一方で、他のラベルも示すことを示している腺房組織(12-2617、109-2031、m1-2623、m24-3219)、およびその他は染色を示さなかった(208-2529、155-1113、64-2437)。
選択したモノクローナルアプタマーの特異性をさらに評価するために、図4の最高のパフォーマー(166-279、173-2273、107-901、1-717、m1-2623、m5-3239、およびm12-3773)は、FDA承認の組織マイクロアレイの染色に使用された。これらのアレイのそれぞれには、30個のヒト組織(各組織は3人の異なるドナーから複製された)からのセクションが含まれ、通常は抗体スクリーニングに使用されるが、アプタマー評価にはまだ使用されていない。簡単に言えば、これらの組織マイクロアレイは、対照として無関係なアプタマーの選択されたcy3標識RNAアプタマーで染色された。次に、各組織を免疫蛍光顕微鏡法によって分析した。ほとんどのアプタマーは、膵島だけでなく他の組織でも予想通りに結合を示すが(図5C)、アプタマー1-717(図5A)およびアプタマーm12-3773(図5B)は、膵島に対する並外れた特異性、および評価された他の組織(副腎、骨髄、乳房、脳、結腸、内皮、食道、ファロピウス管、心臓、腎臓、肝臓、肺、リンパ節、卵巣、胎盤、前立腺、皮膚、脊髄、脾臓、筋肉、胃、精巣、胸腺、甲状腺、尿管、子宮、および精巣)への結合はごくわずかであることを示す。
アプタマー1-717およびm12-3772がヒト膵島だけでなくマウスの対応物も認識できるかどうかを評価するために、これら2つのCy-3標識モノクローナルアプタマーによる染色を、それぞれ健康なマウスの11組織を含む組織マイクロアレイで行った。これらの実験は、アプタマー1-717とアプタマーm12-3773の両方がマウス膵島も認識できることを示している。図6を参照されたい。しかし、ヒト組織で観察されたものとは対照的に、両方のアプタマーは、膵臓組織だけでなく、脾臓、胃、および空腸も異なるレベルで認識することができる。これらのデータは、同族の標的の分布の違いが
2つの種の間に存在する可能性があることを示唆している。
膵島内のアプタマーの特異性をよりよく評価するために、共焦点顕微鏡法(図7Aおよび図7B)とフローサイトメトリー(図7Cおよび図7D)の2つの異なる技術が採用された。共焦点顕微鏡検査では、ヒト膵臓の切片をcy-3標識アプタマーM12-3773(図7A)またはcy3標識アプタマー1-717(図7B)で染色した。切片をインシュリンとグルカゴンに対する抗体、およびDAPIで対比染色し、共焦点顕微鏡で評価した。データは、両方のアプタマーがアルファ細胞とベータ細胞の両方に結合していることを示すが、ベータ細胞ではシグナルが高くなっている。
フローサイトメトリーでは、ヒト膵島の単一細胞懸濁液をCy3標識アプタマーM12-3773(図7C)またはcy3標識アプタマー1-717(図7D)で染色し、生体色素とインシュリンおよびグルカゴンに特異的な抗体で対比染色し、分析した。アプタマーシグナル(開いたヒストグラム)は、グルカゴン陽性細胞またはインシュリン陽性細胞(等高線)でそれぞれゲーティングした後、アルファ(上のヒストグラム)またはベータ細胞(右のヒストグラム)で定量化された。無関係なアプタマー(塗りつぶされたヒストグラム)をネガティブ対照として使用した。
クラスタリンは、アプタマーm12-3773のターゲットとして可能性がある。3’ビオチン-アプタマーm12-3773は、オリゴシンセサイザーで合成され、ヒト膵島からの単一細胞懸濁液を標識するために使用した。細胞を洗浄し、細胞質をtween20/BSA溶液で溶解した。リガンドに結合したアプタマーは、磁気ビーズと磁気分離によって回収した。捕捉リガンドは、SDSで95℃でアプタマービーズ複合体によって放出され、SDSページで実行した。バンドをカットし、質量分析とマスコットベースの分析を行った(図8A)。クラスタリン(UniProtKB-P10909)(図9B)は、スコアが高い(236)タンパク質の1つであり、質量分析によって同定されたペプチドからカバーされた高い配列を持ち、SDSページから切り取ったバンドの1つと互換性のある分子量を有し、そしてより重要なことに、サイレンシングがベータ細胞に結合するアプタマーm12-7337の能力であって、アプタマー1-717の能力ではない、を低下させた唯一のテストされたものであった(図8C)。
図9は、TMED6がアプタマー1-717の推定標的であることを示している。図9Aは、アプタマー1-717のターゲットを検出するための実験戦略を示している。アプタマー1-717の標的を特定するために、タンパク質アレイ(HuProt(商標)v2.0、Arrayit)を使用した。これらのタンパク質アレイには、19,000を超えるヒト組換えタンパク質が含まれており、インフォマティクス分析により、抗体、ペプチド、またはタンパク質の同族タンパク質を特定できる。この技術は、アプタマーのリガンドの同定に適応されている。簡単に説明すると、事前にブロックされたアレイを、ブロッキングバッファー中でRTで30分間、1-717またはm12-3773と標識された1μgのcy3とハイブリダイズさせた。アレイを洗浄し、Genepixマイクロアレイリーダーで3回読み取り、アドホックで生成されたソフトウェアで分析した。このソフトウェアは、1)gprファイルからデータを取得し、2)(遺伝子ID、対照、ブランク、ND)を使用して説明列を追加し、2)いくつかのポイントで変更された最適化された「plotArray」関数を使用し(スクリプトは特定のタンパク質アレイに加えて、UTFファイル形式の問題)、3)MAプロットの生成を再構築するマイクロアレイ画像を含む品質管理を実行し、4)データを正規化し、背景を減算し、および5)p値分布のグラフ、火山プロット、およびt検定による有意な変調の分析を介して、アレイ間の微分式を分析する。この分析は、TMED6(NM144676.1、タンパク質ID
Q8WW62)をアプタマー1-717の最も可能性の高いリガンドとして提案した。図9Bを参照。競合アッセイ(図9C)は、このターゲットの特異性を確認する。図9C
に示すように、競合アッセイにより、TMED6に対するアプタマー1-717の特異性が確認される。簡単に説明すると、ヒト膵臓の連続切片を、異なる濃度の組換えTMED6タンパク質の存在下でCy-3標識アプタマー1-717で染色した(すなわち、モル比アプタマー/組換えタンパク質範囲=1/1-1/10)。画像は蛍光顕微鏡によって取得され、アプタマー結合はセルプロファイラーによって定量化された。データは、組換えTMED6の添加が用量依存的にアプタマー1-717の結合を阻害することを示しており、TMED6がこのアプタマーの標的であることを強く示唆している。
実施例2-同定されたアプタマーは、インビボで膵島特異的であった。
アプタマー1-717およびm12-3773がインビボでヒト膵島を認識できるかどうかを評価するために、エピジダイマル脂肪パッドにヒト膵島を移植した免疫不全NSGマウスを使用した。さらに、アプタマー1-717およびアプタマーm12-3773の新しい製剤を使用する。この製剤では、各モノクローナルアプタマーがビオチン化され、ストレプトアビジンと複合体を形成して、四量体ナノ粒子(以下、テトラプタマーと呼ぶ)を形成する。この製剤は、対応する単量体アプタマーよりも優れた薬物動態と親和性を持っている。
ビオチン/ストレプトアビジンAlexafluor(AF750)標識アプタマー(アプタマー1-717またはアプタマーm12-3773、または2つのアプタマーの等モル混合物)を免疫不全NSGマウス(上顎脂肪パッド(EFP)にヒト膵島を移植)に静脈内注射した。)m12-3773および1-717がインビボでヒト膵島を認識できるかどうかを評価する。おそらく異なる膵島エピトープが各アプタマーによって標的化されたために、両方のアプタマーの混合物が使用された場合、累積的な相乗的シグナルがEFP領域で観察された(図10A)。4時間後、精巣上体脂肪パッド領域の蛍光シグナルを「インビボイメージングシステム(IVIS)」で測定した。図10Bのデータは、アプタマー1-717とアプタマーm12-3773の両方がインビボで膵島を認識できることを示している。さらに、この実験は、2つのアプタマーの等モル混合物の使用が信号対バックグラウンド比を大幅に増加させることを明らかにしている。
アプタマーm12-3773および1-717を使用してインビボでβ細胞の質量を測定できるかどうかを判断するために、免疫不全NSGマウスに、精巣上体脂肪パッドにさまざまな量(62.5~500IEQの範囲)のヒト膵島を移植した。21日後、アプタマー1-717とm12-3773の等モル混合物のストレプトアビジンへの複合体形成によって生成されたAlexafluor750テトラプタマーをマウスに静脈内注射した。4時間後、信号はIVISによって定量化した。図11Aを参照。アプタマーm12-3773および1-717は、EFPに移植されたマウス内因性膵島とヒト膵島の両方を認識した(図11B)。重要なことに、EFP領域の蛍光シグナルは、移植された膵島の数に比例し、これらのアプタマーを使用してインビボでβ細胞の質量を測定できることを示している(図11Bおよび11C)。膵島からの信号は、注射後10日間持続した(図示せず)。図11Dに示すように、同種異系C57Bl6膵島移植片の拒絶反応は、左側腹部の信号の喪失からわかるように、時間の経過とともに測定できる。代わりに、同系移植片の信号(図11Dの右パネル)は、移植片の生存を示す時間の経過とともに維持される。
要約すると、選択されたアプタマーm12-3773および1-717は、インビトロおよびインビボで良好な特異性でマウスおよびヒトβ細胞に結合するため、インビボでヒトβ細胞を標的とする治療に有用である可能性がある。
実施例3-アプタマーキメラは治療用RNAを膵島に送達することができる
図12に示すように、膵島特異的RNAアプタマー1-717およびm12-3773
は、3’末端をトリヌクレオチドリンカー領域(すなわちGGG)および望ましい治療用RNAのパッセンジャー鎖(パッセンジャーテール)で延長することにより、治療用RNAに容易に結合できる。次に、治療用RNAガイド鎖を70℃で等モル量の2つのRNAを混合し、混合物を室温でゆっくりと冷却することにより、修飾アプタマーに単純にアニーリングする。
アプタマーがβ細胞をトランスフェクトするための非ウイルス代替物になり得るかどうかを評価するために、非解離マウス膵島におけるアプタマー送達インシュリン(INS)1および2を介したノックダウンを目的とした原理実証実験を実施した。図13Aは実験手順の概略図である。膵島特異的アプタマーキメラは、図12に示すように、アプタマー1-717またはアプタマーm12-3773を、マウスインシュリン1/2(INS1/2)または細胞増殖阻害剤ヒトp57kip2(uniprot P49918、エイリアスCDN1c)に特異的なsiRNAと結合させることによって生成された。INS1/2-siRNA/アプタマーキメラは解離していないマウス膵島に加えられたが、p57kip2-siRNA/アプタマーキメラは死体ドナーからのヒト膵島に加えられた。スクランブルsiRNA/アプタマーキメラをネガティブ対照として使用した。72時間後、INS1/2とp57kip2の発現は、トランスフェクトされたマウス膵島とトランスフェクトされたヒト膵島でそれぞれqRT-PCRによって定量化された。図13Bに示すように、アプタマーキメラは標的遺伝子の発現を有意にダウンレギュレートする。
図14に示すように、p57kip2-siRNA島特異的アプタマーキメラはインビボでヒトベータ細胞の増殖を誘導する。図14Aは、実験手順を示す。ストレプトゾトシンで処理された免疫不全NSGマウスに、前房に最適以下の量(250IEQ)のヒト膵島を移植した。インシュリンペレットの皮下移植により、マウスを正常血糖に維持した。21日後、膵島が血管新生されたとき、インシュリンペレットを除去して高血糖を発症させ、マウスにBrdUを7日間与えて細胞増殖を評価し、i)スクランブル-siRNA/アプタマーキメラ、またはii)p57kip2-siRNA/アプタマーキメラで処理した。治療の9日後、マウスを人道的に安楽死させ、インシュリン、グルカゴン、およびBrDU(白)に対する抗体で移植片切片を標識した後、ベータおよびアルファ細胞の増殖を免疫蛍光顕微鏡で評価した。図14Bは、対照キメラまたはp57kip2-siRNA/アプタマーキメラで処理されたマウスからの移植片の免疫蛍光写真を提供する。グルカゴンおよびインシュリン染色は疑似色として濃い灰色で示され、細胞増殖の尺度としてのBrdU染色は疑似色として白で示されている。図14Cは、増殖しているベータ細胞とアルファ細胞の定量化を示している。これらのデータを総合すると、p57kip2-siRNA/アプタマーキメラは、T1およびT2糖尿病を模倣する高血糖状態でインビボのヒトベータ細胞増殖を誘導できることが示されている。
β細胞におけるP57kip2サイレンシングは、重要な治療上の意味を持っている。実際、p57Kip2の変異は、β細胞の劇的な非腫瘍性クローン増殖(14)、インシュリンの過剰産生、および重度の制御不能な低血糖(89,90)を特徴とする臨床症候群である乳児期の限局性高インシュリン症(FHI)に関連している。FHIの限局性病変は、p57kip2の喪失と相関する過剰なβ細胞増殖を特徴としている(91,92)。p57kip2サイレンシングの増殖促進活性は、FHIおよび癌では望ましくないが、一時的に定義されたサイレンシングは、T1Dにおける成人のβ細胞増殖を促進するのに役立つ可能性がある。実際、死亡した成人臓器提供者から得られたヒト膵島におけるアデノウイルスshRNAを介したp57kip2のサイレンシングは、膵島が高血糖の免疫不全マウスに移植されると、β細胞複製を3倍以上増加させた(14)。新たに複製された細胞は、インシュリン、PDX1、NKX6.114の発現など、成熟β細胞の特性を保持していた。興味深いことに、正常血糖マウスではβ細胞の増殖は観察されなかっ
た。これは、高血糖が追加の増殖シグナルを提供する可能性があることを示している(93)。これらの発見は、T1D患者の適切なβ細胞量を回復するため、および/または移植中に必要な膵島の数を減らすための新しい治療的介入の可能性を開いた。しかし、これまでのところ、これらの所見の翻訳可能性は、安定したp57Kip2サイレンシングの結果としてのウイルスベクターの使用および新生物形成に関連する安全性の懸念によって妨げられていた。実際、p57Kip2はヒトの癌で頻繁にダウンレギュレートされ(94)、その異所性発現が腫瘍性細胞の増殖を停止させるのに十分であるため、腫瘍抑制遺伝子として提案されている(94)。しかし、アプタマー送達を介したp57kip2の時間的に制御された調節は、時間的に制御された方法でβ細胞増殖を増加させるために糖尿病において重要である可能性がある。これは、安定したサイレンシングをもたらす可能性のある、制御不能な腫瘍性のようなβ細胞の増殖に関する安全性の懸念を回避しながら、時限投与中にβ細胞量を増加させるのに十分である可能性がある。
実施例4-saRNA-アプタマーキメラを介したXIAPのアップレギュレーションは、β細胞のアポトーシスを阻害する。
アポトーシス細胞死は、あらゆる形態の糖尿病におけるインシュリン産生β細胞の喪失の特徴である(99~101)。白血球の浸潤と活性化、および膵島内の高血糖は、炎症性サイトカイン、ケモカイン、活性酸素種などのアポトーシストリガーの局所濃度を高くする(99)。これらのアポトーシス経路のほとんどは、カスパーゼ(CASP)3および7の活性化に収束し、遺伝子の再プログラミング、ホスファチジルセリンの反転、およびアポトーシス小体の形成をもたらす(102)。
β細胞のアポトーシスは、自己抗原提示と自己反応性T細胞の活性化を刺激することにより、自己免疫プロセスをさらに促進することができる(103)。同様に、膵島移植の設定では、一次機能不全、すなわち、移植後早期に発生する、移植された膵島塊の部分的ではあるが有意な、時には完全な喪失(104~106)。β細胞のアポトーシスは、単離手順中に開始され、移植時に、低酸素症および高血糖症、ならびに凝固促進性および炎症性カスケードによって悪化する(107)。一次機能不全は、移植後の最初の48時間に発生する機能性膵島の質量損失の50%以上を占める(106)。
したがって、一時的なアポトーシスβ細胞死でさえも遮断することは、1型糖尿病(T1D)および膵島移植においてβ細胞量を維持するだけでなく、自己反応性T細胞活性化およびさらなる免疫損傷を低減するためにも非常に望ましい。
このタンパク質はアポトーシス阻害剤ファミリーの最も強力なメンバーであり、CASP 3、7、および9の活性化を防ぎ(108)、ii)ウイルスベクターを使用したXiapの過剰発現は、β細胞の生存率を改善し、サイトカインまたは低酸素誘導アポトーシスを防止し(109~111)、iii)Xiapを形質導入したヒト膵島は、糖尿病NOD-SCIDマウスに移植すると正常血糖を延長した(11)。ただし、Xiapは多くの癌でアップレギュレートされているため、その安定した過剰発現は重要な安全上の懸念を引き起こす。したがって、膵島特異的アプタマーとともに送達されるsaRNAを介した制御されたXiap活性化は、一次機能不全を減らし、β細胞の喪失およびT1Dにおける自己免疫プロセスを防ぐための有用な代替手段となり得る。
小さな活性化RNA(saRNA)は、特定のプロモーター領域で作用を発揮し、mRNAとタンパク質の発現を最大4週間アップレギュレートするオリゴヌクレオチドである(細胞複製、mRNA、タンパク質の代謝回転に応じて)(112~122)。メカニズムを介したsaRNAを介した遺伝子のアップレギュレーションはまだ完全には理解されていないが、エピジェネティックな変化または抑制性RNAのダウンモジュレーションを伴うと考えられている(123~125)。saRNAは、その特異性がCRISP/C
AS9システムのgRNAに匹敵するため、DNAエレメントを挿入せずに安全で特異的かつ一時的な遺伝子活性化を提供するが、不可逆的なDNA修飾は誘導されない126。治療用saRNAは癌治療のために調査されているが、私たちの知る限り、T1Dでの研究は行われていない(127~130)。
したがって、抗アポトーシス遺伝子XIAPを特異的にアップレギュレートできるsaRNAを特定した。簡単に説明すると、最初に、前述のアルゴリズム(112,131)を使用してヒトXIAPプロモーターを調べた。非特異的配列を回避するためのゲノムブラスト分析を含むこの分析は、156を超える推定saRNA標的領域を返した。最高スコアの96個の推定saRNAを合成し、ヒト上皮細胞株A549をトランスフェクトすることによってXiapをアップレギュレートする能力についてテストした。この細胞株は、トランスフェクションが容易で、PDL1とXiapの基礎発現が低いために使用された。qRT-PCRはトランスフェクションの96時間後に実行され、結果はスクランブルsaRNAでトランスフェクトされた同じ細胞株で正規化された(図15)。12個のsaRNA(表5に記載)は、スクランブルされたsaRNAよりも10倍以上(範囲10.4~74.8)Xiap発現をアップレギュレートすることがわかった。
アプタマーによって送達されたXiap-saRNAがβ細胞をアポトーシスから保護できるかどうかを決定するために、死体ドナーから単離されたヒト膵島を使用して、インビトロでの原理実証実験を行った。Xiap-saRNAアプタマーキメラは、同定されたXiap saRNA(-449、表2)をアプタマーm12-3773またはアプタマー1-717のいずれかに結合させることにより、図12に記載されているように生成された。図16Aは実験手順を示す。疥癬ドナーからの新たに単離された、解離されていないヒト膵島(200IEQ)は、培養物にXiap/saRNAアプタマーキメラ(5ug)を加えることによってXiap-saRNAでトランスフェクトされた。スクランブルsaRNA/アプタマーキメラをネガティブ対照として使用した。48時間後、ウェルの半分に炎症性サイトカイン(IFNg、TNFa、IL1b)を投与して、ベータ細胞のアポトーシスを誘導した。ベータ細胞死は、インシュリンとグルカゴンの染色後のベータ/アルファ細胞比を測定することにより、サイトカインチャレンジの24時間後にフローサイトメトリーによって評価した。図16Bは、スクランブルされたsaRNAキメ
ラ(CTRLキメラ)またはXIAP-saRNA/アプタマーキメラ(Xiapキメラ)で処理され、後でサイトカイン(CTK)でチャレンジされた、または未処理(CTKなし)のままにされた膵島の単一細胞懸濁液のフローサイトメトリー分析を示す。図16Cは、アプタマーm12-3773またはアプタマー1-717のいずれかで生成されたキメラを使用した、異なる死体ドナーからの膵島を使用した5つの独立した実験からのスパゲッティプロットである。対応のあるT検定値が報告される。データは、Xiap-saRNAアプタマーキメラがベータ細胞をサイトカイン誘導アポトーシスから保護することを示す。
興味深いことに、サイトカインの非存在下での未処理の膵島は、CTRL-キメラの存在下(図16B)およびキメラの非存在下(データは示さず)でα細胞(β/α細胞比=0.8)でより高い割合を示し、β膵島の単離中、細胞の生存率はα細胞よりも影響を受ける可能性がある。サイトカインの添加により、β細胞の割合がさらに減少した(β/α細胞比約0.5)。特に、Xiap-saRNA/キメラとのインキュベーションは、CTKによるβ細胞の減少(β/α細胞比約1.6)を防ぐだけでなく、膵島の単離に関連するβ細胞の喪失も防いだ。これらのデータは、saRNAキメラを使用してヒト膵島におけるXiap発現を調節できることを示す。
実施例5-一次機能不全を防ぐためのXiap-saRNA/アプタマーキメラの使用
死体ドナーからのヒト膵島は、図17Aに詳述されているようにXiap-saRNAアプタマーキメラまたは対照キメラでトランスフェクトされた。トランスフェクションの24時間後、膵島は免疫不全NSGマウスの前眼房に移植された。膵島細胞のアポトーシスは、インビボアネキシンV(ANXA5)染色およびインビボ顕微鏡検査によって縦方向に評価された。データは、移植前のXiap-saRNA/アプタマーキメラによる治療がアポトーシス(ANXA5)を劇的に減少させ、したがって移植片の細胞喪失を減少させることを示している。
図17Bに、移植片保存用のXiap-saRNA/アプタマーキメラの概略図を示す。図17Cに示すように、ヒト膵島は、48時間、24時間にキメラが添加された培地で培養され、移植の日に、ストレプトゾトシン糖尿病NOGマウスの左腎臓被膜にマウスあたり600IEQが移植された。データは、アプタマーキメラによるヒト膵島の前処理が膵島移植の有効性を大幅に改善し、マウスの約80%が2日目までに正常血糖になることを示した。対照的に、膵島を移植された50%odマウス(P=0.02;nキメラ処理=10;n未処理=8)のみが糖尿病を逆転させ、動態が遅れた。
実施例6-PDL1-saRNA/アプタマーキメラを介してヒト化マウスの同種免疫および自己免疫から膵島を保護する
組織特異的耐性の維持におけるPDL1発現の臨床的重要性は、癌におけるPDL1-PD1アンタゴニストの成功によって強調されている(135)。PDL1によるPD1の関与は、エフェクターT細胞の増殖と活性化をダウンレギュレートし、T細胞周期の停止とアポトーシスを誘導し、IL10産生Tregを促進する(136~139)。興味深いことに、新たな副作用の抗PD1治療の1つはT1D140である。これは、PDL1/PD1がβ細胞に対するT細胞の耐性を制御する上で重要な役割を果たしている可能性があることを示唆している。実際、NODマウスでは、PDL1遮断が雌マウスのT1Dを加速し、雄でそれを誘発する(13)。逆に、同系移植された膵島におけるPDL1異所性発現は、NODマウスをT1D再発から保護する(12,13)。インシュリンプロモーターの制御下でPDL1を発現するNODトランスジェニックマウスは、糖尿病の発生率の遅延、T1D発生率の低下、および全身性の膵島特異的T細胞アネルギーを示す(141)。ヒトでは、PDL1多型はT1Dと関連する(OR=1.44)(142)。
PDL1の発現がβ細胞に対するT細胞の反応性を制御する上で重要であるため、我々はPDL1に特異的なsaRNAを特定した(図18)。簡単に説明すると、PDL1の小さな活性化RNAの推定候補配列は、公的に利用可能なアルゴリズムを使用してPDL1プロモーターをスキャンすることによって特定された。この分析では、200個を超える推定ターゲットsaRNAターゲット領域が返される。より高いスコアを持つ95個の推定saRNAを合成し、ヒト上皮細胞株A549をトランスフェクトすることによってPDL1をアップレギュレートする能力についてテストした。qRT-PCRはトランスフェクションの96時間後に実行され、結果はスクランブルsaRNAでトランスフェクトされた同じ細胞株で正規化された。19個のsaRNAは、スクランブルされたsaRNAよりも3倍以上(範囲3.01~63.27)Xiap発現をアップレギュレートできることがわかった(表6)。
次に、本明細書に記載の膵島特異的アプタマーが、PDL1-saRNAをヒト膵島に効果的に送達し、PDL1発現をアップレギュレートできるかどうかを試験した。アプタマー-PDL1-saRNAキメラは、図12に示すように、アプタマー1-717をPDL1-saRNA-636(表6)に結合させることによって生成された。図19Aに示すように、これらのPDL1-saRNA/アプタマーキメラは、死体ドナーからの解離していないヒト膵島に添加された。48時間後、膵島を解離させ、抗インシュリン、抗グルカゴン、および抗PDL1抗体で標識し、フローサイトメトリーで分析した(図19B)。PDL1の発現は、インシュリン陽性ベータ細胞またはグルカゴン陽性アルファ細胞をゲーティングすることによって評価された。対照キメラによる治療はPDL1発現を変更しないが、PDL1-saRNA/アプタマーによる治療は、ベータ細胞上のこの重要な免疫調節タンパク質の発現を有意にアップレギュレートする(図19B)。興味深い
ことに、アルファ細胞では変化は観察されず、このアプタマーのベータ細胞への優先的結合が間接的に確認された。これらの原理実証データは、アプタマーを効果的に使用して、機能的なPDL1-saRNAをインビトロでヒトβ細胞に送達できることを示している。
次に、インビボでPDL1をアップレギュレートするPDL1-saRNA/アプタマーキメラの能力を評価した。図20Aに示すように、免疫不全のNSGマウスは、死体ドナーからのヒト膵島とともに前眼房に移植された。3週間後、図12および図19に示すように生成されたPDL1-saRNA(636)/1-717-アプタマーキメラでマウスを治療した。スクランブル-saRNA/アプタマーキメラを対照として使用した(CTRLキメラ)。治療の5日後、膵島(濃い灰色)でのPDL1発現(白)は、抗PDL1抗体によるインビボ標識とインビボ顕微鏡検査によって定量化された(図20B)。ベースライン時、またはPDL1-saRNA/アプタマーキメラまたはスクランブル-saRNA/アプタマーキメラ図20C)による治療の5日後の移植された膵島におけるPDL1発現の要約。
これらの結果は、i)インビボでヒト膵島細胞でPDL1を検出することが可能であり、ii)我々のアプタマーキメラがインビボでヒト膵島をトランスフェクトし、およびiii)アプタマーキメラを介してインビボでヒト膵島でPDL1をアップレギュレートすることが可能である、ことを示した。
実施例7-アプタマーを介したXiapアップレギュレーションによるアポトーシスからのβ細胞保護を評価する
最初の一連の実験では、NSGマウスにACEにヒト膵島を移植する。移植の3週間後、マウスはXiapsaRNA-アプタマーキメラまたは対照キメラで治療される。さまざまな時点で、IL1β、TNF-α、およびIFNγの眼内注射によってヒト膵島移植片にチャレンジし、カスパーゼ3および7の活性化を介してβ細胞にアポトーシスを誘導する。カスパーゼ3および7の活性は、CASP3/7 Green Detection Reagentを使用した眼内イメージングシステムによってインビボで評価される。この細胞透過性試薬は、核酸結合色素に結合した4個のアミノ酸ペプチド(DEVD)で構成されている。活性化されると、カスパーゼ3および7はプローブを切断し、色素をDNAに結合させ、ACE28の細胞レベルで検出できる明るい蛍光発生シグナルを放出する。さらに、抗アネキシンV抗体によるインビボ染色を使用して、インビボで膵島細胞のアポトーシスを直接測定する(図7)。
実験の2番目のセットは、抗膵島同種免疫に対するXiap変調の効果を評価することを目的としている。簡単に説明すると、STZ糖尿病NSGマウスには、ACEまたはEFPに500IEQのヒト膵島が移植される。3週間後、マウスはXiapキメラまたはスクランブル対照で治療される。Aim2bで決定されたように治療が繰り返される。最初の治療の1週間後、マウスは、膵島に対するHLAが一致しないCFSE標識ヒトT細胞を受け取る。治療を行わないと、同種異系T細胞の養子移入により、移植片が失われ、3週間以内に高血糖に戻る。したがって、i)血糖、ii)ヒトc-ペプチド血漿レベル、およびACE群では、iii)T細胞浸潤の長期評価(77,78)で示したように、移植された膵島の容量分析を読み出しとして使用して、ヒト膵島同種移植片の生存に対するXiapキメラ治療の保護効果を評価する。
個体間のXiapキメラ効果のデータ再現性を確保するために、EndoC-BH3細胞で同定されたキメラは、6人の死体ドナーからの初代ヒト膵島を使用してさらに検証される。これにより、片側の対応のあるt検定で対照との1.25SDの差を検出するための88%のパワーが提供される。アーティファクトを回避するために、3つの異なる読み
出し方法(qPCR、ウエスタンブロット、および酵素アッセイ)を使用し、3つの異なる死体ドナーからのヒト膵島を使用して各実験に対して少なくとも3つの独立した繰り返しを実行する。移植研究では、群あたり合計9匹のマウス(各繰り返しで3匹)を使用して、90%のパワー(ANOVA、α=0.05)を確保し、対照に対する1.6SDの差を検出する。
実施例8-p57kip2のインビボサイレンシングのために用量を最適化する
最初の一連の実験では、EFPに500IEQのヒト膵島を移植したNSGマウスを、p57kip2siRNAまたはネガティブ対照としてスクランブルsiRNA(対照キメラ)と結合した膵島特異的アプタマーの異なる用量(6、20、および60pmoles/g)でi.v.またはs.c.で処置する。ポジティブ対照と同じp57kip2shRNAトランスフェクト膵島をコードするアデノウイルスを使用する(14)。事前定義された時点(例えば、投与後1、2、3、4、および5日目)で、移植片が採取され、p57kip2の発現がi)レーザーで捕捉された膵島でのqRT-PCR、およびii)定量的コンピューター支援免疫蛍光分析によって定量化される(95)。どちらの手法も、糖尿病研究所(96,97)とPIs95の研究所で最適化されている。用量依存的な毒性の可能性を評価するために、血清および関心のある臓器(脾臓、肝臓、リンパ節、肺、腎臓、および脳)が収集され、組織病理学的評価のためにマイアミ大学のマウス病理学研究所に送られる。
実験の2番目のセットでは、NSGマウスにACEに500IEQのヒト膵島を移植する。3週間後、マウスを静脈内注射するか、または眼内注射(i.o)により、p57kip2 siRNAまたはAF647スクランブルsiRNA(対照キメラ)をネガティブ対照としてロードしたアプタマーキメラを異なる用量(6、20、60pm/g)で処置する。AF647siRNAのインビボトランスフェクション効率は、注射の2、3、4、8、および24時間後に我々の眼内画像化システムで評価される(28)。選択された時点(例えば、治療後2、3、4、および7日)で、移植片が除去され、ACEから外植された膵島でのqRT-PCRによって、およびi)レーザーキャプチャー膵島でのqRT-PCRおよびii)定量的コンピューター支援免疫蛍光顕微鏡分析によって、p57kip2発現が定量化される(95)。
実施例9-アプタマーキメラ投与の処置期間と頻度を最適化する
最適な投与量と投与経路が特定され、p57kip2サイレンシングの動態が評価されたら、実質的な変化(すなわち、≧100%増加)を誘発するために必要なp57kip2siRNA-アプタマーキメラの投与回数を決定する。p57kip2サイレンシングは高血糖マウスでのみβ細胞増殖を誘導することが示されたため(14)、辺縁下のヒト膵島塊(250IEQ)がNSGマウスのEFPまたはACEに移植される。移植の21日後、マウスはストレプトゾトシン(STZ)治療により高血糖になる。ヒトβ細胞はかなり耐性があるため、STZはマウス膵島を選択的に排除する(98)。マウスが高血糖になると(通常、治療後5~6日)、マウスは膵島特異的または対照アプタマーキメラの1、2、3、または4回の投与を受ける。アプタマー投与の頻度は、実施例5で確立された時間経過に基づいて決定される。BrdUは、エクスビボでの増殖測定のために飲料水中で投与される。EPF群のβ細胞量は、IVISによって縦方向(ベースライン、治療中、最後の治療から5日後および10日後)に評価される(図2)。ACE群では、膵島の質量は、膵島の体積のインビボイメージングと定量分析によって評価される(28)。最後の処理から10日後、移植片を採取し、免疫染色によって分析して、(i)BrdUおよびKi76染色によるβ細胞増殖、および(ii)α細胞とβ細胞の比率を決定する。
実施例10-アプタマーを介したサイレンシングが、辺縁下の膵島塊を移植された糖尿病
マウスの正常血糖を回復できるかどうかを判断する
この実施例の目的は、アプタマーを介したp57kip2サイレンシングが、最適以下の数のヒト膵島を移植された糖尿病マウスにおいて正常血糖を回復できるかどうかを試験することである。
最初の一連の実験では、インシュリン療法(持続的なインシュリン放出のためのs.cペレットインプラント)で維持されたSTZ糖尿病NSGマウスに、ACEにさまざまな量のヒト膵島(50、150、350IEQ)を移植する。3週間後、インシュリンペレットを除去し、マウスをp57kip2siRNA-アプタマーキメラまたはスクランブル対照で局所的または全身的に治療する。この治療法を膵島トランスフェクションの今日のゴールドスタンダードと比較するために、マウスの2つの追加群を、対照としてp57kip2shRNAまたはRFPをコードするアデノウイルスベクターで局所的に処置する。アデノウイルスをコードするRFPを使用したパイロット実験は、ACEで実行され、膵島の少なくとも90%を形質導入するために必要な最小用量を決定する。形質導入効率は、我々のインビボイメージングシステムを使用して定量化される(28)。実験群(50、150、および350IEQを受け取った)では、ACE膵島移植片の生体内イメージングおよび体積分析に加えて、血糖値が治療効果の読み取り値として使用される。異なる群のさまざまな辺縁下の膵島の質量も、ヒトの膵島増殖に対する高血糖の促進の程度を明らかにする可能性がある。
実験の2番目のセットでは、STZ糖尿病マウスを、同じ辺縁下のヒト膵島塊(50、150、350IEQ)でEFPに移植し、生着期間中インシュリンを維持する。3週間後、インシュリンペレットを除去し、マウスをp57kip2siRNA-アプタマーキメラまたはスクランブル対照で治療する。読み取り値として、IVISによって血糖値とβ細胞量を縦方向に監視する。
両方の実験セットで、ブドウ糖負荷試験(GTT)は、正常血糖が回復したマウスで実行され、ストレス条件下での膵島機能をさらに評価する。
結果の再現性を確保するために、3人の異なる死体ドナーからのヒト膵島を使用して、各実験に対して少なくとも3回の独立した繰り返しが実行される。実験群ごとに合計9匹のマウス(各反復で3匹)を使用すると、90%のパワー(一元配置分散分析、α=0.05)が得られ、1.6SDの効果サイズを検出して制御できる。群あたり12匹のマウスを使用して、読み取り値の予想される変動が大きくなることを説明する。読み出し固有のアーティファクトを最小限に抑えるために、同じ現象が少なくとも2つの独立した方法で測定される。
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Claims (9)

  1. 配列番号264に記載のヌクレオチド配列を含むアプタマー。
  2. 配列番号259に記載のヌクレオチド配列を含むアプタマー。
  3. 治療用RNAに結合したアプタマーを含む構築物であって、ここで、前記アプタマーが、ランゲルハンス島で発現するクラステリン(配列番号414)に特異的であるか、またはランゲルハンス島で発現する「膜貫通emp24ドメイン含有タンパク質6」(TMED6、Genbankアクセッション番号NM14476.1)に特異的である、構築物。
  4. 前記クラステリンに特異的であるアプタマーが、配列番号264に記載のヌクレオチド配列を含み、前記TMED6に特異的であるアプタマーが、配列番号259に記載のヌクレオチド配列を含む、請求項3に記載の構築物。
  5. 求項3または4に記載の構築物を含む、ベータ細胞の増殖を調節するための医薬組成物。
  6. 求項3または4に記載の構築物を含む、組織移植片のアポトーシスの阻害を必要とする対象における前記組織移植片のアポトーシスを阻害するための医薬組成物であって、前記組織移植片が、クラステリンまたはTMED6を発現している組織移植片である、医薬組成物
  7. 求項3または4に記載の構築物を含む、ベータ細胞に対するT細胞の細胞毒性から前記ベータ細胞を保護するための医薬組成物。
  8. 求項3または4に記載の構築物を含む、糖尿病の治療を必要とする対象における糖尿病を治療するための医薬組成物。
  9. 求項3または4に記載の構築物を含む、治療用RNAを対象におけるランゲルハンス島に送達するための医薬組成物。
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