JP7461658B2 - 操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼバリアント酵素 - Google Patents
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配列表の公式の写しを、作成日2019年6月25日およびサイズ1,547キロバイトのファイル名「CX2-172WO1_ST25.txt」のASCIIフォーマットのテキストファイルとして本明細書と共に、ここに、EFS-Webを介して提出する。EFS-Webを介して提出された配列表は、本明細書の一部であり、その全体が参照によって本明細書に組み込まれる。
I/F155H/T199A、V95I/F155H/Q212A/A215S、V95I/L177V/T199A、V95I/T199A、V95I/Q212A、V95I/Q212A/A215S、V95I/A215S、H98D、H98Y、L101I、L101V、L101V/F155H/T199A、L101V/F155H/T199A/Q212A、L101V/L177V/Q212A、L101V/A215S、I119M、I119T、I119V、D123G、D123M、D123S、D123T、H124R、I129G、I129M、I129S、A130P、A130T、D131M、D131R、F132A、F132C、F132L、F132N、F132S、R136A、R136C、R136D、R136E、R136G、R136I、R136L、R136S、R136V、N137E、N137Q、N137W、V139A、V139D、V139G、V139S、V139T、D140G、K143C、K143E、K143G、K143R、K143V、K143Y、A144F、A144H、A144L、A144R、A144T、A144Y、D148F、D148G、D148I/G175D、D148M、D148R/G175D、R150E、R150M、R150Y、V151F、V151H、V151L、V151N、V151Q、G152A、G152N、G152S、N153C、N153G、N153I、N153L、N153P、N153R、N153S、N153T、N153Y、F155H、F155H/T199A、F155H/Q212A/A215S、F160L、V170R/V203I、K173C、K173E、K173F、K173G、K173H、K173M、K173Q、K173S、K173V、K173W、G175V/Q212A、L177A、L177G、L177T、L177V、L177V/T199A、A191F、A191G、A191P、A191T/D237N、A191V、A191W、A191Y、K196V、T199A、T199A/Q212A、H210G、H210R、Q212A、Q212A/A215S、Q212W、A216C、A216F、A216L、A216R、A216W、A216Y、およびT220Fから選択される少なくとも1つの置換または置換セットを含み、前記ポリペプチド配列のアミノ酸位置は、配列番号126を参照して番号付けされる。
特定の実施形態では、例えば、以下の項目が提供される:
(項目1)
配列番号2、6、126、242および/もしくは684またはそれらの機能的断片と少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはそれよりも高い配列同一性を有するポリペプチド配列を含む操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼであって、前記操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼの前記ポリペプチド配列が、少なくとも1つの置換または置換セットを含み、前記ポリペプチド配列のアミノ酸位置が、配列番号2、6、126、242および/または684を参照して番号付けされる、操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
(項目2)
前記ポリペプチド配列が、配列番号2と少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%またはそれよりも高い配列同一性を有し、前記操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼの前記ポリペプチド配列が、65、2、12、12/42、12/74/80/101/162/214/215、12/74/101、12/80/162/210/215、12/80/210、12/162、12/165/173/210/214、12/187、12/210、20/90、21、25、42、45、69、72、91、95/178/199、105、111、115、155、162、164、171/176/199、176/178/199、176/199、177、178、178/199、179、181、184、199、202、204、207、および212から選択される前記ポリペプチド配列中の1つまたは複数の位置に少なくとも1つの置換または置換セットを含み、前記ポリペプチド配列のアミノ酸位置が、配列番号2を参照して番号付けされる、項目1に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
(項目3)
前記ポリペプチド配列が、配列番号6と少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%またはそれよりも高い配列同一性を有し、前記操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼの前記ポリペプチド配列が、2、2/65、12/42/65、12/65、12/65/74/80/101/162/214/215、12/65/74/101、12/65/80/210、12/65/162、12/65/165/173/210/214、21/65、38、42、42/155、42/177、45/65、54、65/72、65/91、65/105、65/115、65/202、65/212、80、80/95、80/155、80/175、84、91、91/115、95、95/101、95/155、95/155/215、95/212、95/212/215、101、101/105、101/187、101/212、105/155/212/215、108、155、155/177/204、155/184/212/215、155/212、162/199、175、177、184/212/215、199、212、212/215、および215から選択される前記ポリペプチド配列中の1つまたは複数の位置に少なくとも1つの置換または置換セットを含み、前記ポリペプチド配列のアミノ酸位置が、配列番号6を参照して番号付けされる、項目1に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
(項目4)
前記ポリペプチド配列が、配列番号126と少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%またはそれよりも高い配列同一性を有し、前記操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼの前記ポリペプチド配列が、2、2/80/95、2/80/95/155、2/80/95/155/199/212、2/80/95/199、2/80/95/199/212、2/80/101/155/212、2/80/101/212、2/80/155/177/215、2/80/155/215、2/80/175/199、2/80/175/199/212/215、2/80/177、2/80/199/212/215、2/80/215、2/95、2/95/155、2/95/155/199、2/95/155/199/212/215/223、2/95/155/199/215、2/95/155/215、2/95/175、2/95/199、2/95/199/212/215、2/95/212/215、2/95/215、2/101/155、2/155、2/155/177/212、2/155/199、2/199、2/199/212/215、2/212/215、2/215、28、39、42、45、53、54/173、57/175、75、80、80/95/101/155/199、80/95/101/155/199/215、80/95/101/199、80/95/155、80/95/155/175/199/212/215、80/95/155/199、80/95/155/199/212、80/95/155/199/215、80/95/155/212/215、80/95/177、80/95/177/199、80/95/177/212/215、80/95/215、80/101、80/155、80/155/177/199、80/155/177/212/215、80/155/199、80/199、80/212、84、85、95、95/155、95/155/177、95/155/177/199、95/155/177/199/212、95/155/199、95/155/212/215、95/177/199、95/199、95/212、95/212/215、95/215、98、101、101/155/199、101/155/199/212、101/177/212、101/215、119、123、124、129、130、131、132、136、137、139、140、143、144、148、148/175、150、151、152、153、155、155/199、155/212/215、160、170/203、173、175/212、177、177/199、191、191/237、196、199、199/212、210、212、212/215、216、および220から選択される前記ポリペプチド配列中の1つまたは複数の位置に少なくとも1つの置換または置換セットを含み、前記ポリペプチド配列のアミノ酸位置が、配列番号126を参照して番号付けされる、項目1に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
(項目5)
前記ポリペプチド配列が、配列番号242と少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%またはそれよりも高い配列同一性を有し、前記操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼの前記ポリペプチド配列が、7、12、27、28、31、32、35、37、38、52、57、85、94、97、98、100、102、133、136、143、144、145、148、149、150、162、169、170、172、173、195/199、196、199、207、208、208/238、209、210、211、212、213、214、215、217、219、220、221、223、224、227、235、および238から選択される前記ポリペプチド配列中の1つまたは複数の位置に少なくとも1つの置換または置換セットを含み、前記ポリペプチド配列のアミノ酸位置が、配列番号242を参照して番号付けされる、項目1に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
(項目6)
前記ポリペプチド配列が、配列番号684と少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%またはそれよりも高い配列同一性を有し、前記操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼの前記ポリペプチド配列が、10、10/133/227、10/145、10/145/227、18、20、26、29、39/98、39/133/227、60、62、63、74、89、94、97、97/98、108、126、133、135、145、161、162、165、167、168、177、199、208、210、212、224および227から選択される前記ポリペプチド配列中の1つまたは複数の位置に少なくとも1つの置換または置換セットを含み、前記ポリペプチド配列のアミノ酸位置が、配列番号684を参照して番号付けされる、項目1に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
(項目7)
表4.1、5.1、6.1、7.1および/または8.1に示される少なくとも1つの操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼバリアントの配列と少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%またはそれよりも高く同一であるポリペプチド配列を含む、項目1に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
(項目8)
配列番号2と少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%またはそれよりも高く同一であるポリペプチド配列を含む、項目1に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
(項目9)
配列番号4~1002の偶数配列に示される少なくとも1つの操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼバリアントの配列と少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%またはそれよりも高く同一であるポリペプチド配列を含む、項目1に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
(項目10)
配列番号2~1002の少なくとも1つの偶数配列に示されるポリペプチド配列を含む、項目1に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
(項目11)
野生型E.coliのプリンヌクレオシドホスホリラーゼと比較して少なくとも1つの改善された性質を含む、項目1~10のいずれかに記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
(項目12)
前記改善された性質が、基質に対する改善された活性を含む、項目11に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
(項目13)
前記基質が、化合物3を含む、項目12に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
(項目14)
前記基質が、化合物4を含む、項目12に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
(項目15)
前記基質が、化合物8を含む、項目12に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
(項目16)
前記改善された性質が、化合物1の改善された生成を含む、項目11~15のいずれかに記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
(項目17)
前記改善された性質が、化合物10の改善された生成を含む、項目1~12および15のいずれかに記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
(項目18)
精製されている、項目1~17のいずれかに記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
(項目19)
項目1~18のいずれかに記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼを含む組成物。
(項目20)
項目1~18のいずれかに記載の少なくとも1つの操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼをコードするポリヌクレオチド配列。
(項目21)
少なくとも1つの操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼをコードするポリヌクレオチド配列であって、前記ポリヌクレオチド配列が、配列番号1、5、125、241および/または683と少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%またはそれよりも高い配列同一性を含み、前記操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼの前記ポリヌクレオチド配列が、1つまたは複数の位置に少なくとも1つの置換を含む、ポリヌクレオチド配列。
(項目22)
配列番号1、5、125、241および/もしくは683またはそれらの機能的断片と少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはそれよりも高い配列同一性を含む少なくとも1つの操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼをコードするポリヌクレオチド配列。
(項目23)
制御配列に作動可能に連結されている、項目20~22のいずれかに記載のポリヌクレオチド配列。
(項目24)
コドン最適化されている、項目20~23のいずれかに記載のポリヌクレオチド配列。
(項目25)
配列番号3~1001の奇数配列に示されるポリヌクレオチド配列を含む、項目20~24のいずれかに記載のポリヌクレオチド配列。
(項目26)
項目20~25のいずれかに記載の少なくとも1つのポリヌクレオチド配列を含む発現ベクター。
(項目27)
項目26に記載の少なくとも1つの発現ベクターを含む宿主細胞。
(項目28)
項目20~25のいずれかに記載の少なくとも1つのポリヌクレオチド配列を含む宿主細胞。
(項目29)
宿主細胞において操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼを産生させる方法であって、少なくとも1つの操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼが産生するように、適切な条件下で、項目27および/または28に記載の宿主細胞を培養することを含む、方法。
(項目30)
培養物および/または宿主細胞から少なくとも1つの操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼを回収することをさらに含む、項目29に記載の方法。
(項目31)
前記少なくとも1つの操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼを精製するステップをさらに含む、項目29および/または30に記載の方法。
遺伝子によってコードされるアミノ酸について使用される略語は、従来のものであり、以下の通りである:アラニン(AlaまたはA)、アルギニン(ArgまたはR)、アスパラギン(AsnまたはN)、アスパラギン酸(AspまたはD)、システイン(CysまたはC)、グルタミン酸(GluまたはE)、グルタミン(GlnまたはQ)、ヒスチジン(HisまたはH)、イソロイシン(IleまたはI)、ロイシン(LeuまたはL)、リシン(LysまたはK)、メチオニン(MetまたはM)、フェニルアラニン(PheまたはF)、プロリン(ProまたはP)、セリン(SerまたはS)、トレオニン(ThrまたはT)、トリプトファン(TrpまたはW)、チロシン(TyrまたはY)、およびバリン(ValまたはV)。
本発明は、操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ(PNP)酵素、PNP活性を有するポリペプチド、およびこれらの酵素をコードするポリヌクレオチド、ならびにこれらのポリヌクレオチドおよびポリペプチドを含むベクターおよび宿主細胞を提供する。PNP酵素を産生させるための方法も提供する。本発明は、PNP酵素を含む組成物、および操作されたPNP酵素を使用する方法をさらに提供する。本発明は、医薬化合物の生成において特に使用される。
本発明は、操作されたPNPポリペプチド、ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、ポリペプチドを調製する方法、およびポリペプチドを使用するための方法を提供する。記載がポリペプチドに関する場合、これがポリペプチドをコードするポリヌクレオチドも記載することが理解されるべきである。一部の実施形態では、本発明は、野生型PNP酵素と比較して、改善された性質を有する、操作された天然に存在しないPNP酵素を提供する。任意の適切な反応条件が本発明において使用される。一部の実施形態では、方法を使用して、異性化反応を行うための操作されたポリペプチドの改善された特性を分析する。一部の実施形態では、反応条件は、下記および実施例においてさらに記載するように、操作されたPNPの濃度もしくは量、基質(複数可)、緩衝液(複数可)、溶媒(複数可)、pH、温度および反応時間を含む条件、ならびに/または操作されたPNPポリペプチドが固相支持体に固定される条件に関連して、修正される。
本発明は、本明細書に記載の操作された酵素ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを提供する。一部の実施形態では、ポリヌクレオチドを、遺伝子発現を制御する1つまたは複数の異種調節配列に作動可能に連結させて、ポリペプチドを発現する能力を有する組換えポリヌクレオチドを作出する。一部の実施形態では、操作された酵素ポリペプチド(複数可)をコードする少なくとも1つの異種ポリヌクレオチドを含有する発現構築物を、適切な宿主細胞に導入して、対応する酵素ポリペプチド(複数可)を発現させる。
実験および達成された結果を含む以下の実施例は、例示の目的のためにのみ提供され、本発明を限定するものとして解釈されるべきではない。実際に、下記に記載の多くの試薬および機器についてさまざまな適切な供給源がある。本発明が、任意の試薬または機器の品目について任意の特定の供給源に限定されることを意図しない。一部の実施形態では、C末端のヒスチジンタグ(すなわち、6個のヒスチジン残基)は、ポリペプチド配列に含まれる。本明細書と共に提出された配列表は、このヒスチジンタグなしのポリペプチド配列を含む。
HTP PNPを含有する湿細胞ペレットの調製
本発明のバリアントを産生するために使用されるPNP(配列番号2)酵素のための親遺伝子を、E.coliゲノムから得て、pCK110900ベクターにクローニングした。W3110 E.coli細胞を、PNPをコードする遺伝子を含有するそれぞれのプラスミドで形質転換し、1%のグルコースおよび30μg/mlのクロラムフェニコール(CAM)を含有するLB寒天プレートに蒔き、37℃で終夜成長させた。モノクローナルコロニーを採集し、1%のグルコースおよび30μg/mLのクロラムフェニコールを含有する180μlのLBに接種し、96ウェルのシャローウェルマイクロタイタープレートに入れた。プレートをO2透過性シールでシールし、培養物を、30℃、200rpmおよび85%湿度で終夜成長させた。次いで、10μlのそれぞれの細胞培養物を、390μlのTBおよび30μg/mLのCAMを含有する96ウェルのディープウェルプレートのウェルに移した。ディープウェルプレートを、O2透過性シールでシールし、0.6~0.8のOD600に達するまで、30℃、250rpmおよび85%湿度でインキュベートした。次いで、細胞培養物を、イソプロピルチオグリコシド(IPTG)を添加することによって1mMの最終濃度に誘導し、30℃、250rpmでの振とうで終夜インキュベートした。次いで、細胞を、4,000rpmで10分間の遠心分離を使用してペレット化した。上清を廃棄し、ペレットを溶解前に-80℃で凍結させた。
HTP PNP含有細胞溶解物の調製
実施例1に記載のようにして調製された凍結ペレットを、100mMのトリエタノールアミン緩衝液、pH7.5、1mg/mLのリゾチーム、0.5mg/mLのPMBSおよび5mMのMnCl2を含有する200μlの溶解緩衝液を用いて溶解した。溶解混合物を、室温で2時間、振とうした。次いで、プレートを4000rpmおよび4℃で15分間遠心分離した。次いで、上清を、活性レベルを決定するために、澄明な溶解物として生体触媒反応において使用した。
振とうフラスコ(SF)培養物由来の凍結乾燥溶解物の調製
1%のグルコースおよび30μg/mlのCAMを含むLB寒天プレートから採集し、37℃で終夜インキュベートした所望の遺伝子を含有する単一コロニーを、1%のグルコースおよび30μg/mlのCAMを含む6mlのLBに移した。培養物を、30℃、250rpmで18時間成長させ、約0.05の最終OD600まで、30μg/mlのCAMを含有する250mlのTBにおよそ1:50で継代培養した。継代培養物を、0.6~0.8の間のOD600まで、30℃、250rpmでおよそ195分間成長させ、1mM IPTGを用いて誘導した。次いで、継代培養物を30℃、250rpmで20時間成長させた。継代培養物を4000rpmで20分間遠心分離した。上清を廃棄し、ペレットを、5mMのMnCl2を含む35mlの25mMのトリエタノールアミン緩衝液、pH7.5に再懸濁させた。細胞を、Microfluidizer(登録商標)プロセッサーシステム(Microfluidics)を18,000psiで使用して溶解させた。溶解物をペレット化し(10,000rpm×60分)、上清を凍結し、凍結乾燥して、振とうフラスコ(SF)酵素粉末を作成した。
化合物1の生成のための改善されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼバリアント
これらの実験のために、配列番号2を親酵素として選択した。操作された遺伝子のライブラリーを、十分に確立された技法(例えば、飽和変異誘発、および以前に特定された有益な変異の組換え)を使用して、生成した。それぞれの遺伝子によってコードされるポリペプチドを、実施例1に記載されるようにして、HTP中で産生させ、澄明な溶解物を、実施例2に記載されるようにして、作成した。
化合物10の生成のための改善されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼバリアント
化合物10の生成のための改善されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼバリアント
化合物1の生成のための改善されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼバリアント
これらの実験のために、配列番号242を親酵素として選択した。操作された遺伝子のライブラリーを、十分に確立された技法(例えば、飽和変異誘発、および以前に特定された有益な変異の組換え)を使用して、生成した。それぞれの遺伝子によってコードされるポリペプチドを、実施例1に記載されるようにして、HTP中で産生させ、澄明な溶解物を、実施例2に記載されるようにして、200μLの溶解緩衝液の代わりに400μLの溶解緩衝液を用いて、作成した。
化合物1の生成のための改善されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼバリアント
これらの実験のために、配列番号684を親酵素として選択した。操作された遺伝子のライブラリーを、十分に確立された技法(例えば、飽和変異誘発、および以前に特定された有益な変異の組換え)を使用して、生成した。それぞれの遺伝子によってコードされるポリペプチドを、実施例1に記載されるようにして、HTP中で産生させ、澄明な溶解物を、実施例2に記載されるようにして、200μLの溶解緩衝液の代わりに400μLの溶解緩衝液を用いて、作成した。
分析方法
この実施例は、上記の実施例で提供されたデータを収集するために使用した方法を提供する。実施例4に記載の得られたデータは、表9.1における分析方法を使用して収集した。実施例6に記載の得られたデータは、表9.2における分析方法を使用して収集した。実施例5に記載の得られたデータは、表9.3における分析方法を使用して収集した。この実施例において提供される方法は、本発明を使用して産生するバリアントの分析において使用される。しかしながら、他の適切な方法が当業者に公知であるので、本発明が本明細書に記載の方法に限定されることは意図しない。
Claims (23)
- 配列番号6、126、242および/もしくは684またはそれらの機能的断片と少なくとも90%の同一性を有するポリペプチド配列を含む操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼであって、前記操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼの前記ポリペプチド配列が、M65Aの少なくとも1つの置換を含み、前記ポリペプチド配列のアミノ酸位置が、配列番号2を参照して番号付けされ、前記操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼが、野生型E.coliプリンヌクレオシドホスホリラーゼと比較して少なくとも1つの改善された性質を含み、前記改善された性質が、
- 前記ポリペプチド配列が、配列番号242と少なくとも90%の配列同一性を有し、前記操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼの前記ポリペプチド配列が、少なくとも1つの置換A149Pを含み、前記ポリペプチド配列のアミノ酸位置が、配列番号242を参照して番号付けされる、請求項1に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
- 前記ポリペプチド配列が配列番号684と同一である、請求項1に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
- 前記ポリペプチド配列が、配列番号6と少なくとも90%の配列同一性を有し、前記操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼの前記ポリペプチド配列が、2、2/65、12/42/65、12/65、12/65/74/80/101/162/214/215、12/65/74/101、12/65/80/210、12/65/162、12/65/165/173/210/214、21/65、38、42、42/155、42/177、45/65、54、65/72、65/91、65/105、65/115、65/202、65/212、80、80/95、80/155、80/175、84、91、91/115、95、95/101、95/155、95/155/215、95/212、95/212/215、101、101/105、101/187、101/212、105/155/212/215、108、155、155/177/204、155/184/212/215、155/212、162/199、175、177、184/212/215、199、212、212/215、および215から選択される前記ポリペプチド配列中の1つまたは複数の位置に少なくとも1つの置換または置換セットを含み、前記ポリペプチド配列のアミノ酸位置が、配列番号6を参照して番号付けされる、請求項1に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
- 前記ポリペプチド配列が、配列番号126と少なくとも90%の配列同一性を有し、前記操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼの前記ポリペプチド配列が、2、2/80/95、2/80/95/155、2/80/95/155/199/212、2/80/95/199、2/80/95/199/212、2/80/101/155/212、2/80/101/212、2/80/155/177/215、2/80/155/215、2/80/175/199、2/80/175/199/212/215、2/80/177、2/80/199/212/215、2/80/215、2/95、2/95/155、2/95/155/199、2/95/155/199/212/215/223、2/95/155/199/215、2/95/155/215、2/95/175、2/95/199、2/95/199/212/215、2/95/212/215、2/95/215、2/101/155、2/155、2/155/177/212、2/155/199、2/199、2/199/212/215、2/212/215、2/215、28、39、42、45、53、54/173、57/175、75、80、80/95/101/155/199、80/95/101/155/199/215、80/95/101/199、80/95/155、80/95/155/175/199/212/215、80/95/155/199、80/95/155/199/212、80/95/155/199/215、80/95/155/212/215、80/95/177、80/95/177/199、80/95/177/212/215、80/95/215、80/101、80/155、80/155/177/199、80/155/177/212/215、80/155/199、80/199、80/212、84、85、95、95/155、95/155/177、95/155/177/199、95/155/177/199/212、95/155/199、95/155/212/215、95/177/199、95/199、95/212、95/212/215、95/215、98、101、101/155/199、101/155/199/212、101/177/212、101/215、119、123、124、129、130、131、132、136、137、139、140、143、144、148、148/175、150、151、152、153、155、155/199、155/212/215、160、170/203、173、175/212、177、177/199、191、191/237、196、199、199/212、210、212、212/215、216、および220から選択される前記ポリペプチド配列中の1つまたは複数の位置に少なくとも1つの置換または置換セットを含み、前記ポリペプチド配列のアミノ酸位置が、配列番号126を参照して番号付けされる、請求項1に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
- 前記ポリペプチド配列が、配列番号242と少なくとも90%の配列同一性を有し、前記操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼの前記ポリペプチド配列が、7、12、27、28、31、32、35、37、38、52、57、85、94、97、98、100、102、133、136、143、144、145、148、149、150、162、169、170、172、173、195/199、196、199、207、208、208/238、209、210、211、212、213、214、215、217、219、220、221、223、224、227、235、および238から選択される前記ポリペプチド配列中の1つまたは複数の位置に少なくとも1つの置換または置換セットを含み、前記ポリペプチド配列のアミノ酸位置が、配列番号242を参照して番号付けされる、請求項1に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
- 前記ポリペプチド配列が、配列番号684と少なくとも90%の配列同一性を有し、前記操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼの前記ポリペプチド配列が、10、10/133/227、10/145、10/145/227、18、20、26、29、39/98、39/133/227、60、62、63、74、89、94、97、97/98、108、126、133、135、145、161、162、165、167、168、177、199、208、210、212、224および227から選択される前記ポリペプチド配列中の1つまたは複数の位置に少なくとも1つの置換または置換セットを含み、前記ポリペプチド配列のアミノ酸位置が、配列番号684を参照して番号付けされる、請求項1に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
- 配列番号124~1002の偶数配列に示される少なくとも1つの操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼバリアントの配列と少なくとも90%同一であるポリペプチド配列を含む、請求項1に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
- 配列番号124~1002の少なくとも1つの偶数配列に示されるポリペプチド配列を含む、請求項1に記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
- 精製されている、請求項1~9のいずれかに記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼ。
- 請求項1~10のいずれかに記載の操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼを含む組成物。
- 請求項1~10のいずれかに記載の少なくとも1つの操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼをコードするポリヌクレオチド。
- 少なくとも1つの操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼをコードするポリヌクレオチドであって、前記ポリヌクレオチドが、配列番号5、125、241および/または683と少なくとも90%の配列同一性を含み、前記操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼのポリペプチド配列が、M65Aの少なくとも1つの置換を含み、前記ポリペプチド配列のアミノ酸位置が、配列番号2を参照して番号付けされ、前記操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼが、野生型E.coliプリンヌクレオシドホスホリラーゼと比較して少なくとも1つの改善された性質を含み、前記改善された性質が、
- 配列番号5、125、241および/もしくは683またはそれらの機能的断片と少なくとも91%の配列同一性を含む少なくとも1つの操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼをコードするポリヌクレオチドであって、前記操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼのポリペプチド配列が、M65Aの少なくとも1つの置換を含み、前記ポリペプチド配列のアミノ酸位置が、配列番号2を参照して番号付けされ、前記操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼが、野生型E.coliプリンヌクレオシドホスホリラーゼと比較して少なくとも1つの改善された性質を含み、前記改善された性質が、
- 制御配列に作動可能に連結されている、請求項12~14のいずれかに記載のポリヌクレオチド。
- コドン最適化されている、請求項12~15のいずれかに記載のポリヌクレオチド。
- 配列番号123~1001の奇数配列に示されるポリヌクレオチド配列を含む、請求項12~16のいずれかに記載のポリヌクレオチド。
- 請求項12~17のいずれかに記載の少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
- 請求項18に記載の少なくとも1つの発現ベクターを含む宿主細胞。
- 請求項12~17のいずれかに記載の少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む宿主細胞。
- 宿主細胞において操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼを産生させる方法であって、少なくとも1つの操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼが産生するように、適切な条件下で、請求項19および/または20に記載の宿主細胞を培養することを含む、方法。
- 培養物および/または宿主細胞から少なくとも1つの操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼを回収することをさらに含む、請求項21に記載の方法。
- 前記少なくとも1つの操作されたプリンヌクレオシドホスホリラーゼを精製するステップをさらに含む、請求項21および/または22に記載の方法。
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Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2005506842A (ja) | 2001-10-26 | 2005-03-10 | ユーエイビー リサーチ ファンデーション | 変異体プリンヌクレオシドホスホリラーゼタンパク質及びその細胞送達 |
Family Cites Families (65)
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---|---|---|---|---|
US6491905B1 (en) | 1993-09-14 | 2002-12-10 | The Uab Research Foundation | Recombinant bacterial cells for delivery of PNP to tumor cells |
US6395547B1 (en) | 1994-02-17 | 2002-05-28 | Maxygen, Inc. | Methods for generating polynucleotides having desired characteristics by iterative selection and recombination |
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US5928905A (en) | 1995-04-18 | 1999-07-27 | Glaxo Group Limited | End-complementary polymerase reaction |
BR9507817A (pt) | 1994-06-03 | 1997-09-16 | Novo Nordisk Biotech Inc | Construção de dna enzima vetor recombinante célula hospedeira recombinante lacase de ascomicete ou deuteromicete processos para obter uma enzima de lacase para melhorar o rendimento de enzima recombinante para polimerizar um substrato de lignina ou lignossulfato em soluç o para despolimerizar in situ a pasta kraft para oxidar corantes ou precursores de corantes para pintar cabelo e para polimerizar ou oxidar um composto fenólico ou anilina composição de corante e recipiente contendo a mesma |
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US6096548A (en) | 1996-03-25 | 2000-08-01 | Maxygen, Inc. | Method for directing evolution of a virus |
ATE334225T1 (de) | 1997-01-17 | 2006-08-15 | Maxygen Inc | Evolution prokaryotischer ganzer zellen durch rekursive sequenzrekombination |
US7148054B2 (en) | 1997-01-17 | 2006-12-12 | Maxygen, Inc. | Evolution of whole cells and organisms by recursive sequence recombination |
US6326204B1 (en) | 1997-01-17 | 2001-12-04 | Maxygen, Inc. | Evolution of whole cells and organisms by recursive sequence recombination |
WO1998031816A1 (en) | 1997-01-17 | 1998-07-23 | Regents Of The University Of Minnesota | Dna molecules and protein displaying improved triazine compound degrading ability |
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US6917882B2 (en) | 1999-01-19 | 2005-07-12 | Maxygen, Inc. | Methods for making character strings, polynucleotides and polypeptides having desired characteristics |
US6376246B1 (en) | 1999-02-05 | 2002-04-23 | Maxygen, Inc. | Oligonucleotide mediated nucleic acid recombination |
US6368861B1 (en) | 1999-01-19 | 2002-04-09 | Maxygen, Inc. | Oligonucleotide mediated nucleic acid recombination |
US6961664B2 (en) | 1999-01-19 | 2005-11-01 | Maxygen | Methods of populating data structures for use in evolutionary simulations |
US8457903B1 (en) | 1999-01-19 | 2013-06-04 | Codexis Mayflower Holdings, Llc | Method and/or apparatus for determining codons |
EP1108783A3 (en) | 1999-01-19 | 2001-09-05 | Maxygen, Inc. | Oligonucleotide-mediated nucleic acid recombination |
US7024312B1 (en) | 1999-01-19 | 2006-04-04 | Maxygen, Inc. | Methods for making character strings, polynucleotides and polypeptides having desired characteristics |
US7873477B1 (en) | 2001-08-21 | 2011-01-18 | Codexis Mayflower Holdings, Llc | Method and system using systematically varied data libraries |
US7702464B1 (en) | 2001-08-21 | 2010-04-20 | Maxygen, Inc. | Method and apparatus for codon determining |
US20070065838A1 (en) | 1999-01-19 | 2007-03-22 | Maxygen, Inc. | Oligonucleotide mediated nucleic acid recombination |
KR20010102069A (ko) | 1999-02-11 | 2001-11-15 | 추후제출 | 고효율 질량 분석 |
WO2000052155A2 (en) | 1999-03-05 | 2000-09-08 | Maxygen, Inc. | Recombination of insertion modified nucleic acids |
US6703240B1 (en) | 1999-04-13 | 2004-03-09 | Maxygar, Inc. | Modified starch metabolism enzymes and encoding genes for improvement and optimization of plant phenotypes |
HUP0203049A3 (en) | 1999-08-20 | 2007-03-28 | Roche Diagnostics Gmbh | Enzymatic synthesis of deoxyribonucleosides |
US7430477B2 (en) | 1999-10-12 | 2008-09-30 | Maxygen, Inc. | Methods of populating data structures for use in evolutionary simulations |
US6519065B1 (en) | 1999-11-05 | 2003-02-11 | Jds Fitel Inc. | Chromatic dispersion compensation device |
US6686515B1 (en) | 1999-11-23 | 2004-02-03 | Maxygen, Inc. | Homologous recombination in plants |
AU2788101A (en) | 2000-01-11 | 2001-07-24 | Maxygen, Inc. | Integrated systems and methods for diversity generation and screening |
WO2001075767A2 (en) | 2000-03-30 | 2001-10-11 | Maxygen, Inc. | In silico cross-over site selection |
DE60144145D1 (de) | 2000-04-03 | 2011-04-14 | Maxygen Inc | Subtilisin-variante |
ES2564570T3 (es) | 2002-03-01 | 2016-03-23 | Codexis Mayflower Holdings, Llc | Métodos, sistemas y software para la identificación de biomoléculas funcionales |
US7747391B2 (en) | 2002-03-01 | 2010-06-29 | Maxygen, Inc. | Methods, systems, and software for identifying functional biomolecules |
US20050084907A1 (en) | 2002-03-01 | 2005-04-21 | Maxygen, Inc. | Methods, systems, and software for identifying functional biomolecules |
WO2003078583A2 (en) | 2002-03-09 | 2003-09-25 | Maxygen, Inc. | Optimization of crossover points for directed evolution |
EP2250595B1 (en) | 2008-02-12 | 2017-06-14 | Codexis, Inc. | Method of selecting an optimized diverse population of variants |
US8768871B2 (en) | 2008-02-12 | 2014-07-01 | Codexis, Inc. | Method of generating an optimized, diverse population of variants |
US8383346B2 (en) | 2008-06-13 | 2013-02-26 | Codexis, Inc. | Combined automated parallel synthesis of polynucleotide variants |
DK2285958T3 (en) | 2008-06-13 | 2016-03-29 | Codexis Inc | Method for synthesizing polynucleotides |
US20090312196A1 (en) | 2008-06-13 | 2009-12-17 | Codexis, Inc. | Method of synthesizing polynucleotide variants |
EP3150220A1 (en) | 2008-08-15 | 2017-04-05 | The UAB Research Foundation | Purine nucleoside phosphorylase as enzymatic activator of nucleoside prodrugs |
HUE042817T2 (hu) | 2011-06-28 | 2019-07-29 | Codexis Inc | Fehérjevariánsok elõállítása régiókeveréssel |
US20150133698A1 (en) | 2012-04-20 | 2015-05-14 | Codexis, Inc. | Production of fatty alcohols from engineered microorganisms |
US11162105B2 (en) | 2018-07-09 | 2021-11-02 | Codexis, Inc. | Engineered purine nucleoside phosphorylase variant enzymes |
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