JP7453788B2 - 抗体製造の間のピンク色の形成を制御する方法 - Google Patents
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Description
本出願は、2017年5月9日に提出された米国仮出願第62/503615号の利益を主張し、その全体が本明細書に組み込まれる。
1)製造および収集の間の抗体の還元を防止する、または2)製造および収集の間のシアノコバラミン(CN-Cbl)からヒドロキソコバラミン(HO-Cbl)への変換を阻害する、または3)製造および収集の間の抗体の還元を防止し、かつシアノコバラミンからヒドロキソコバラミンへの変換を阻害する、の両方
により、抗体製造の間のピンク色の生成を防止する方法である。
1)製造および収集の間の抗体ジスルフィド結合の還元を防止すること、または2)細胞培養培地調製、培地保存、細胞培養工程または抗体収集の間のHO-CblへのCN-Cblの変換を阻害すること
を含む、製造の間にビタミンB12が抗体に結合することを阻害する方法である。
1)赤色光(>600nm)条件下で細胞培養培地を調製すること、および保存すること、2)赤色光条件下で目的の抗体を産生する細胞を培養すること、3)赤色光条件下で細胞培養物から抗体を収集すること、および4)収集溶液に過酸化水素を加えること
を含む抗体の産生のための方法である。
1)赤色光(>600nm)条件下で細胞培養培地を調製すること、および保存すること、2)赤色光条件下で目的の抗体を産生する細胞を培養すること、および3)赤色光条件下で細胞培養物から目的の抗体を収集することを含む、抗体の産生のための方法である。
1)目的の抗体を産生する細胞を培養すること、2)細胞培養物から目的の抗体を収集すること、および3)収集溶液に過酸化水素を加えること
を含む、抗体の産生ための方法である。
生物製剤製造の工程管理は製品品質および安全性ならびに治療用タンパク質のロット間の一貫性を確保するために重要である。製造の間の色生成のメカニズムを理解することは制御戦略を開発するために重要である。本発明者らは抗体製造の間のピンク色の生成が、還元抗体の遊離スルフヒドリル基およびビタミンB12の活性型であるヒドロキソコバラミンの両方の濃度に依存する二次反応であることを発見した。両方の反応物が必要であり、いずれか単独ではピンク色を生成するのに十分でない。本発明は、以下;1)製造および収集の間の抗体の還元を防止すること、または2)製造および収集の間のシアノコバラミン(CN-Cbl)からヒドロキソコバラミン(HO-Cbl)への変換を阻害することのいずれかにより、抗体製造の間のピンク色の生成を防止する方法である。あるいは、本発明は、1)製造および収集の間の抗体の還元を防止する、および2)製造および収集の間のシアノコバラミンからヒドロキソコバラミンへの変換を阻害することによる、抗体製造の間のピンク色の生成を防止する方法である。
mAbとのビタミンB12結合
タンパク質ストック
2つの異なる治療用IgG4分子(mAb AおよびB)をこの研究で使用した。それらの両方が元のIgG4のヒンジ領域モチーフCPSCにおいてセリンからプロリンへの1つの点突然変異を有し、IgG1鎖間ジスルフィド結合構造に類似していた。(Liu H et.al.: MAbs 2012、4(1):17-23;Aalberse RC et.al.Immunology 2002、105(1):9-19)。IgG4抗体はCHO細胞において産生され、およびプロテインAクロマトグラフィー、追加のポリッシングクロマトグラフィーおよびヒスチジン-ベースバッファへの最終UF/DFろ過を使用してアフィニティ精製した。原薬(DS)のタンパク質濃度は280nmでの吸光度により決定した。
精製タンパク質に結合したビタミンB12(VB12)の量の決定には、製造元の推奨手順とともに市販のVB12測定キット(Monobind Inc., Lake Forest, CA)を使用した。
ヒスチジンベースバッファ中のmAb AまたはmAb B溶液(50mg/ml)をモル比4:1から2:1(タンパク質:VB12)でCN-Cbl(Sigma-Aldrich、V2876、ストック溶液1mg/ml水)またはHO-Cbl(Sigma-Aldrich、V5323、ストック溶液1mg/ml水)のいずれかと混合した。反応は室温で、暗所で1日間行った。リン酸生理食塩水バッファ(PBS、Sigma-Aldrich、D5652)でのバッファ交換はフロースルーにおいて色が見えなくなるまで50kDaカットオフAmicon遠心フィルターを介して行われた。バッファ交換反応溶液をペプチドマッピング分析に供した。
mAb Aの1ロットは、製造の間に部分的に還元されたジスルフィド結合であった。原薬を0.1%過酸化水素(30mM)と室温で4時間混合し、過剰な過酸化水素を上述のバッファ交換により除去した。
mAb A用に新たに調製した培地を光曝露試験で使用した。CN-Cblを最終濃度10mg/Lまで添加した(1mg/mlストック溶液から)。
当該方法は文献(Arner ES et.al. Methods Enzymol 1999、300:226-239)からわずかに変更を加えてエルマン試薬、3,3’-ジチオ-ビス(6-ニトロ安息香酸)、3-カルボキシ-4-ニトロフェニル(nitophenyl)ジスルフィド;2,2’-ジニトロ-5,5’-ジチオ安息香酸(DTNB)を使用する。簡潔には、96ウェルプレートで10μLの原薬の試料を15μLのTEバッファ(50mM Tris-HCl、20mM EDTA、pH7.6)と混合した。DTNB溶液(エタノール中5mg/ml、Sigma-Aldrich、D8130)を、使用前に体積比1:9で0.2M Tris(pH8)中の8Mグアニジン-HClと新たに混合した。次に、100μLのDTNB/グアニジン溶液を各ウェルに加えて混合した。412nmでのスペクトル吸収を測定し、13,600M-1cm-1のモル吸光係数値を計算に使用した。
熱変性のために、1mLのmAb A(プロテインAアフィニティカラム精製後、Trisで中和)をエッペンドルフテストチューブで80℃で20分間加熱した。加熱と冷却の後、目に見える沈殿物が形成された。チューブを18,000xgで20分間遠心分離した。上清をタンパク質アッセイ(OD280)およびビタミンB12ELISAアッセイに使用した。SDS変性について、0.25mLの原薬を、リン酸生理食塩水(PBS)中0.75mLの0.3%ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)と混合し、室温で1日間放置した。余分なSDSは、50kDaカットオフAmicon遠心フィルターを介したPBSとのバッファ交換により除去した。
mAb AおよびビタミンB12を含有する試料は、事前の還元またはアルキル化を行わずにトリプシンで消化した。トリプシンを酵素対タンパク質比1:25(重量/重量)で添加する前に、消化バッファ(50mMトリスHCl、10mM塩化カルシウム、2M尿素、pH7.6)を使用して、バッファ交換反応混合物を1mg/mLに希釈した)。37℃でのインキュベーション後、消化された混合物は直接LC/MS/MS解析に供した。ThemoFisher Q-EXACTIVE PLUS Orbitrap質量分析計で分析する前に、Waters Acquity(TM)UPLCを使用して、約10μgのトリプシン消化物をクロマトグラフィーで分離した。Waters Acquity BEH CSH(TM)C18カラム(1.7μm、2.1x100mm)を分離に使用した(45℃で)。60分以上1%から80%の移動相Bの直線勾配を使用して、ペプチドを水中で溶出した(移動相A:0.1%ギ酸および5mMギ酸アンモニウム;移動相B:アセトニトリル中0.1%ギ酸および5mMギ酸アンモニウム)、流速0.2mL/分。Orbitrap質量分析計は、3.0kVのスプレー電圧で陽イオンモードで動作した。ヒーター温度とキャピラリー温度は、それぞれ300℃と275℃に設定した。MSの取得は70,000の分解能で実行され、MS/MS解析用に17,500の分解能で各デューティサイクルで10個の最も強いイオンを選択した。ダイナミックエクスクルージョン機能は有効であった。25の正規化された衝突エネルギーを使用して、フラグメンテーションスペクトルを取得した。
mAbの製造の間に、ピンク色は通常プロテインA溶出ステップで現れることが観察され、mAbが濃縮され、培地組成からバックグラウンド色が除去される。ビタミンB12の含有量をELISA法で分析した結果、ピンク色のロットは無色のバッチよりも約20倍高いビタミンB12を有することがわかった(表1、バッチ1対2)。
表1.ビタミンB12(VB12)付着およびmAb Bの遊離チオール
表2. ビタミンB12付着およびmAb Aの遊離チオール
(1)HO-Cblは、同じバッチmAbと複合体を形成するにはCN-Cblよりもはるかに活性が高く、
(2)遊離スルフヒドリル基のレベルが高い原薬は遊離スルフヒドリル基のレベルが低い原薬よりも反応性が高いこと、および
(3)最も高いビタミンB12取り込みはHO─Cbl存在下でかつ高いレベルの遊離スルフヒドリル基を有する原薬において起こり、100倍以上の増加したビタミンB12を引き起こしたことを示した。各試料のビタミンB12量に起因する色における差異は肉眼で明らかであった(図2a)。
以前の文献では、非共有結合性の性質が示唆されたが、ビタミンB12の付着の性質に関する実験的証拠は提供されていない(Derfus et al.,2014)。推定される非共有結合は、ビタミンB12に対する抗体の構造および電荷の相補性が必要であり、したがって、天然のタンパク質構造の破壊により、結合したビタミンB12が放出されるであろう。2つの変性方法、加熱およびSDS処理を使用した。85℃で20分間加熱すると、mAb Bピンク色の材料が変性して沈殿した。タンパク質をほとんど含まない上清は、開始タンパク質溶液の総ビタミンB12の約3.5%しか含まれていなかった(表1)。SDSは、ペプチド骨格に結合し、変性タンパク質を溶液に溶解した状態に維持することにより、タンパク質を変性させる。ビタミンB12アッセイでは、ビタミンB12のすべてではないにしても、ほとんどが依然として変性タンパク質に結合していることが示された(表1)。非還元キャピラリー電気泳動-SDS(CE-SDS)で、着色物質の移動度シフトが検出された。初期のmAb A原薬とmAb A-ビタミンB12の両方の着色された複合体は、ジスルフィド還元に起因して、非還元CESDSで複数のバンドを有していた。初期材料で対応するピークに重なったピークに加えて、着色物質は高分子量側にシフトする追加のピークがあり、単一の軽鎖や重鎖などの低分子量ピークでシフトがより顕著であって(図2d)。この観察結果は、mAbへのビタミンB12分子の追加として簡単に説明できた。まとめると、これらの結果は、ビタミンB12が変性タンパク質と結合しており、変性条件下でタンパク質と共移動することを実証する。したがって、ビタミンB12とmAbの相互作用が非共有結合的性質であることはないであろう。
表3. IgG-ビタミンB12反応混合物のトリプシン消化物で観察されるペプチド-コバラミン複合体を含有するシステイン
表4 .UVAライトでなく可視光線がCN-Cbl変換の原因である。
表5. 色光はCN-Cbl変換に影響を与える。
表6. 様々な色光に曝されたCBにスパイクされたmAb A原薬
製造プロセスの間の抗体ジスルフィド結合還元を防止するために過酸化水素を使用すること
2つのIgG4分子(1および2)および2つのIgG1分子(3および4)を本研究において使用した。IgG4分子は、IgG1鎖間ジスルフィド結合構造CPPCに似た元のIgG4のヒンジ領域モチーフCPSCのセリンからプロリンへの単一点突然変異を有していた(Liu H et.al. MAbs. 2012;4:17-23, Aalberse RC et.al.Immunology 2002;105:9-19)。すべてのmAbはCHO細胞培養で産生され、細胞生存率は50から90%の範囲であった。清澄化バルク(CB)は、特に指定がない限り、通常、深層ろ過で生成され、この場合、遠心分離によって生成した。いくつかの場合のmAb 1細胞培養物は、深層ろ過の前に低pHと硫酸デキストランで処理した。ダウンストリーム精製はプロテインAクロマトグラフィー、追加のポリッシングクロマトグラフ工程およびヒスチジン-シュガー-ベースバッファへの最終限外ろ過/透析ろ過工程により達成される。タンパク質濃度はDropsense-96分光計(Trinean NV, 9050 Gent, Belgium)による280nmでの吸光度(A280)により決定した。
該方法では文献(Arner ES et.al. Methods Enzymol 1999;300:226-239)を若干改変し、2,2’-ジニトロ-5,5’-ジチオ安息香酸(DTNB)を使用した。簡潔には、10mLの清澄化バルクまたは原薬(DS)の試料を96ウェルプレートで15mLのTEバッファ(50mM Tris-HCl、20mM EDTA、pH7.6)と混合した。DTNB溶液(エタノール中5mg/ml;Sigma-Aldrich、D8130)を使用前に1:9の体積比で0.2M Tris(pH8)中8Mグアニジン-HClと新たに混合した。100mLのDTNB/グアニジン溶液を各ウェルに加え、混合した。重複試料を試験した。412nmでのスペクトル吸収を測定し、モル吸光係数値13,600M-1cm-1を遊離チオール含量の計算に使用した。
2,6-ジクロロフェノールインドフェノール(D2932、Spectrum Chemical MFG Corp、Gardena、CA)を水に溶解して、新鮮な1%ストック溶液を作製した。2,6-ジクロロフェノールインドフェノールの酸化型は中性pHで青色であり、還元されると無色になった。酸性pHでは、2,6-ジクロロフェノールインドフェノールの酸化型は紫色で、還元されると無色に変化した。還元および非還元の試料につきDCPIP色範囲を決定するために、100%mAb 2細胞溶解物を遠心分離により産生された通常の清澄化バルクと混合して一連の細胞溶解物の0、3、5、10、20、30、40、50、60および70%希釈を精製した。各希釈の遊離チオール含量をすぐに測定し、希釈の関数としてプロットした(図6D)。DCPIP(10mL)を一連の細胞溶解希釈物(室温で1mL)に加え、数秒から数分以内に目視検査でどの希釈液が色の変化を示したかを判定した。
LabChip GXII Touch HT System(PerkinElmer)を製造元の推奨に従って、還元(R_Caliper)および非還元(NR_Caliper)条件下の両方で、mAb純度解析のために使用した。NR_Caliperは2重鎖1軽鎖(HHL)、1重鎖1軽鎖(HL)、重鎖(HC)および軽鎖(LC)を含む抗体断片を分離しかつ定量するための最も便利なハイスループットツールであった。サイズ排除クロマトグラフィーをインタクトなmAbおよび高分子量(HMW)種をモニターするために使用した。
mAb2および3の試料をジチオトレイトールにより還元し、ヨードアセトアミドによってアルキル化し、トリプシンで消化した。トリプシン消化物を、Thermo Scientific Orbitrap Q-EXACTIVETM PLUS質量分析計(Bremen、Germany)により解析する前に、Waters ACQUITY UPLC system(Milford, MA U.S.A.)クロマトグラフィーで分離した。Waters Acquity BEH C18カラム(1.7mm、2.1£150mm)を分離に使用した(40℃で)。110分間にわたる2%から80%移動相Bの直線勾配を使用して0.2mL/分の流速でペプチド(移動相A:水中0.1%ギ酸;移動相B:アセトニトリル中0.1%ギ酸)を溶出した。
30%ストック過酸化水素(Sigma-Aldrich cat. 216763、密度1.11g/mL)を使用前に水で3%ストック(v/v、980mMに等しい)に新たに希釈した。3%ストックを細胞培養物またはCBに加え、必要に応じて0.1から20mMの最終濃度にした。抗体ジスルフィド還元への過酸化水素の影響を試験するために、過酸化水素ストックを最終濃度0、0.1、0.33、1、3、5、10または20mMでCBに加えた。
吸引キャップ付きの500mLボトル(FlexBioSys, Cat FXB-500M-0005)を300mL清澄化バルクで充填した。あるいは、50mLのバイオプロセスバッグ(ThermoFisher, Cat SH30658.11)を30mL清澄化バルクで充填した。容器を純窒素ガス供給ラインに接続し、室温で1-2時間窒素ガス(≦5psi)でフラッシュし、その後、1日間エアレス(airless)状態で密閉した。保持後、試料を遊離チオールアッセイで直ちに解析するか、NR_Caliperで解析する前にヨードアセトアミド(最終濃度20mM)と混合した。
mAb 4について、実験室規模のバイオリアクターの細胞培養液を次の2つの実験に使用した。最初の実験では、遠心分離と0.2ミクロンフィルターを使用したろ過により、清澄化バルクが生成された。得られた清澄化バルクは、(a)コントロールとして4℃で4日間保存したか、(b)過酸化水素と組み合わせて最終濃度10mMの過酸化物とし、4℃で4日間保存した。第二の実験では、過酸化水素を細胞培養液(細胞を含む)に添加し、遠心分離の前に室温で1時間インキュベートした。得られた清澄化バルクは、(a)コントロールとして4℃で4日間保存するか、(b)3日目に室温に置き、窒素ガスでフラッシュし、もう1日間室温で保持した。
mAbの還元は、清澄化バルク(CB)またはプロテインA溶出(PAE)のいずれかにおいて、いくつかのIgG1およびIgG4抗体分子について工程開発で観察された。
ジスルフィド結合還元は酸化還元反応であるため、DTNB試験に代わるシンプルで迅速かつ堅牢な方法として酸化還元指示薬を使用し、かつ収集および回収の間の低分子量形成の潜在的なリスクを予想することができる。酸化還元指示薬は、pH指示薬が特定のpHで色変化を受けるのと同様の方法で、特定の電極電位で明確な色変化を受ける。適切な酸化還元指示薬を見つけるために、一連の市販の酸化還元指示薬が試験され、いくつかを生物製剤製造プロセスで使用できる最良の潜在的候補として特定した。
表7. 生成され、および様々な空気およびエアレス状態で保持されたmAb 3清澄化バルクにおける遊離チオール濃度およびDCPIP色変化。
数多くの証拠は、ジスルフィド結合の減少が、収集操作中の細胞溶解および経時的に室温で十分な量の空気が入っていない密閉容器(例:使い捨てバッグ)に保持されている清澄化バルクと相関していることを示唆していますMun M et.al. Biotechnol Bioeng 2015;112:734-742)。したがって、密閉可能な容器に少量の清澄化バルク(10から300mL)を充填し、かつ窒素ガスを流し、室温を保持してその後低分子量についてのNR_Caliper解析によりエアレス状態を作り出すことによりこの現象を模倣する小規模モデルを開発した(図7)。
mAbにおけるジスルフィド結合の還元を制御する1つの方法は、mAbが還元される前に清澄化バルクに含有される還元電位を除去することである。この目的でH2O2の使用を試験した。図7に示されるように、コントロールmAb 2清澄化バルクは1日間室温でエアレス状態で保持された後に約20%の低分子量を生成した(図7C)。過酸化水素をエアレス保持の前に0.33、1および3mMの濃度で同じ清澄化バルクに加えた。結果は3mM(約0.01%)過酸化水素が低分子量の生成を完全に防止できることを示した(図7E、7Gおよび7I)。これらの結果は過酸化水素がジスルフィド結合還元を効果的に防止することを示す。
過酸化水素を使用する主な懸念の1つは、mAbを酸化する可能性である。メチオニン残基は過酸化水素酸化の影響を最も受けやすい(Luo Q, et.al. J Biol Chem. 2011;286:25134-25144, Stracke J, et.al. MAbs. 2014;6:1229-1242)。mAb 2および3(それぞれ、IgG4およびIgG1サブクラスに属する)を様々な過酸化水素処理後にメチオニン酸化について質量分析により解析した。両方の分子について、H2O2の添加(1mMから10mM)および1日間の室温でのインキュベーション後、H2O2濃度に依存する酸化におけるわずかの増加が、上記の過酸化水素処理下の同一ロットの試料で観察された(表8および9)。しかしながら、トリプシンペプチドマッピングおよびLC-MS/MS法に1%のばらつきがあるため、両方のmAb 2および3についてのH2O2誘導酸化変化はわずかであった。
表8.過酸化水素処理後のmAb 2メチオニン残基の酸化
酸化に加えて、他の原薬の品質特性およびダウンストリーム精製プロセスに対する過酸化水素の潜在的な影響も、実験室規模の研究で評価した。実験デザインには、mAb 2(IgG4)およびmAb 4(IgG1)の両方を含んだ。mAb 4について、過酸化水素を収集前細胞培養液および収集後清澄化バルク(細胞なし)に加えた。様々な過酸化水素処理後、得られた清澄化バルクをプロテインAクロマトグラフィーで処理し、その後、解析前に中央プロセスポイント(center process point)条件を使用して低pHウイルス不活性化および中和工程をした。表10に示されるmAb 4についての解析結果は、過酸化水素処理および未処理試料間で試験したすべての特性に目立った変化がないことを示した。工程不純物(宿主細胞タンパク質および残留DNA)はまた、コントロールに匹敵し、プロセス範囲で許容された(データ未掲載)。同様の結果もまた、1日間室温で0、3、5および10mM H2O2により処理したmAb 2について観察された(表10)。
表10. mAb 2および4の製品品質特性への過酸化水素処理。
Claims (8)
- a)収集時に清澄化バルク(bulk)にゼロより大きいが10mMを超えない濃度で過酸化水素を加えることにより、抗体ジスルフィド結合の還元を防止すること、および
b)培地調製、培地保存、抗体生産および抗体収集から選択される1回以上の間に可視光線への細胞培養培地露光を防止することにより、培地におけるシアノコバラミン(CN-Cbl)からヒドロキソコバラミン(HO-Cbl)への変換を阻害すること
を含む、細胞培養物製造の間にビタミンB12が抗体に結合することを阻害する方法。 - CN-Cblが、培地調製、培地保存の間に、および所望により抗体生産および抗体収集の間に赤色光(>600nm)のみに曝される請求項1に記載の方法。
- 以下:
a) 目的の抗体を産生する細胞を培養すること、
b) 細胞培養物から目的の抗体を収集すること、および
c) 収集時に清澄化バルクにゼロより大きいが10mMを超えない濃度で過酸化水素を加えること
、を含む、抗体の産生のための細胞培養方法。 - 収集の間に清澄化バルクにゼロより大きいが10mMを超えない濃度で過酸化物を加えることを含む、抗体ジスルフィド結合還元を防止する方法。
- 過酸化物が過酸化水素である、請求項4に記載の方法。
- 過酸化物が無機または有機過酸化物である、請求項4に記載の方法。
- 過酸化物が過炭酸ナトリウムまたは過ホウ酸ナトリウムである、請求項4に記載の方法。
- 抗体が、モノクローナル抗体(mAb)、ヒト抗体(HuMAb)、ヒト化抗体およびキメラ抗体から選択される、請求項1、3および4のいずれか一項に記載の方法。
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