JP2023182593A - 抗体製造の間のピンク色の形成を制御する方法 - Google Patents

抗体製造の間のピンク色の形成を制御する方法 Download PDF

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Abstract

【課題】抗体製造の間のピンク色の生成を防止する方法を提供する。【解決手段】製造および収集の間の抗体の還元を防止する、または製造および収集の間のシアノコバラミン(CN-Cbl)からヒドロキソコバラミン(HO-Cbl)への変換を阻害することにより、抗体製造の間のピンク色の生成を防止する方法である。細胞培養培地調製および保存エリアにおける白色光を赤色光に置き換えることは、HO-CblへのCN-Cblの変換を阻害する。収集時に清澄化バルクへの過酸化物の添加は抗体ジスルフィド結合の還元を阻害する。【選択図】なし

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2017年5月9日に提出された米国仮出願第62/503615号の利益を主張し、その全体が本明細書に組み込まれる。
モノクローナル抗体(mAb)治療薬は、複数のヒト疾患の治療においてより一般的になる。高分子として、翻訳後修飾の広い範囲のために、mAbはある程度不均一性を有する。製品の品質と安全性、および治療用タンパク質のロット間の一貫性を確保するには、製造プロセスの制御を成功させることが重要である。実際、ICH Q6Bガイドラインには製品の外観書が必要である。
通常の抗体製造では、一般的に許容できる色のばらつきがある(Derfus GE, et.al., MAbs 2014、6(3):679-688, Prentice KM, et. al., MAbs 2013、5(6):974-981, Vijayasankaran N, et.al., Biotechnol Prog 2013、29(5):1270-1277, Xu J, et. al., process Biochemistry 2014、49:130-1394)。しかしながら、工程内の不純物による色のばらつきは、工程制御の欠如の懸念である。最終原薬のピンク/赤色の主な原因の1つは、ビタミンB12-mAb複合体であると特定されている(Derfus, 2014, Prentice, 2013)。相互作用の性質は解明されていないが、ビタミンB12のタンパク質への付着は、プロテインAアフィニティクロマトグラフ、低pHウイルス不活性化、様々なポリッシングクロマトグラフならびに限外ろ過および透析ろ過を含む複数のダウンストリーム精製工程を通して共溶出するほど強いようである。
抗体はチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞などの哺乳動物細胞において一般的に産生され、細胞培養培地へと細胞外に分泌される。培養工程の終了時に、細胞は、収集液体を清澄化するために遠心分離、深層ろ過、または凝集などの方法を使用して、一次回収工程の間に培養培地から分離される。このプロセスの間に、細胞はしばしば機械的せん断、低溶存酸素(DO)環境への曝露、または温度およびpHシフトを含む様々なストレスを受ける。これらのストレスは細胞損傷を引き起こし、清澄化された液体へ望ましくない細胞内成分の放出を引き起こす。脂質や酵素などのこれらの細胞質ゾル成分は、製品の品質に影響を及ぼす可能性があり、慎重に監視または除去されなければならない。例えば、細胞内還元剤の放出は、抗体のジスルフィド結合還元につながる可能性がある。(Mun M., et.al. Biotechnol Bioeng 2015;112:734-742;Ruaudel J, et.al. BMC Proceedings 2015;9(Suppl 9):P24;Mullan B, et.al. BMC Proc. 2011;5(Suppl 8):P110;Trexler-Schmidt M, et.al. Biotechnol Bioeng. 2010;106:452-461;Koterba, KL, et.al. J Biotechnol. 2012;157:261-267;Handlogten MW, et.al. Biotechnol Bioeng. 2017;114:1469-1477;Hutchinson N, et.al. Biotechnol Bioeng. 2006;95:483-491)。
製造プロセスの間、収集操作および/またはプロテインAクロマトグラフィーの後に大幅な抗体の還元が観察された。複数のプロセスパラメータが抗体還元の程度に影響を与えてもよい。例えば、収集の間に高レベルの溶存酸素(DO)を維持することは、抗体分子をインタクトに保つために不可欠である(Mun M. 2015;Trexler-Schmidt M, 2010)。細胞溶解および細胞成分を収集液に漏れ出すことを引き起こす機械的せん断力も還元に大きくかかわる(Kao YH, et.al. Biotechnol Bioeng. 2010;107:622-632;Hutterer KM, et.al. MAbs. 2013;5:608-613)。収集保持時間(Chung WK, et.al. Biotechnol Bioeng. 2017;114:1264-12741)、培地成分(銅イオン、システイン/システインなど)ならびにpHおよび温度(Trexler-Schmidt M, 2010;Chung, 2017)などの他のプロセスパラメーターもまた、ジスルフィド還元の程度に影響を与える。
抗体製品の品質を確保するために、製造の間の製造管理は、抗体ジスルフィド結合の還元から形成される低分子量(LMW)種を制御するために必要である。その結果、近年、ジスルフィド還元を制御するためのいくつかの戦略が提案されている。化学阻害剤は、抗体の還元を防ぐために試験されており、硫酸銅(Chaderjian WB,et.al. Biotechnol Prog. 2005;21:550-553)、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)、チオレドキシン阻害剤(米国特許第8,574,869)システイン、メチルブルー(WO2015/085003)およびコエンザイムQアナログ(Li WW, et.al. J Am Chem Soc. 2005;127:6140-614)などの抗還元剤による収集前および収集後処理を含む。緩和戦略を取り巻く知識と方法は長年にわたって増加しているが、生産におけるこれらの方法の実装には、クロマトグラフィー工程により除去する必要がある化学副産物の導入、処理時間の増加、およびオフターゲット修飾または抗体製品の損傷のリスクなど、困難が伴わないわけではない。
本発明は、以下のいずれか;
1)製造および収集の間の抗体の還元を防止する、または2)製造および収集の間のシアノコバラミン(CN-Cbl)からヒドロキソコバラミン(HO-Cbl)への変換を阻害する、または3)製造および収集の間の抗体の還元を防止し、かつシアノコバラミンからヒドロキソコバラミンへの変換を阻害する、の両方
により、抗体製造の間のピンク色の生成を防止する方法である。
本発明の一実施形態では、HO-CblへのCN-Cbl変換は、培地調製、培地保存、抗体生産および抗体収集から選択される1回以上の間に可視光線への培地露光を防止することにより阻害される。
本発明の一実施形態では、CN-Cblは、培地調製、培地保存、抗体生産および抗体収集から選択される1回以上の間にUVAライトのみに曝される。
本発明の一実施形態では、CN-Cblは、培地調製、培地保存の間に、および所望により抗体生産および抗体収集の間に赤色光(>6000nm)のみに曝される。
本発明の一実施形態では、抗体ジスルフィド結合の還元は、収集時に清澄化バルク(bulk)に過酸化水素を加えることにより防止される。
本発明の別の実施形態は、以下
1)製造および収集の間の抗体ジスルフィド結合の還元を防止すること、または2)細胞培養培地調製、培地保存、細胞培工程または抗体収集の間のHO-CblへのCN-Cblの変換を阻害すること
を含む、製造の間にビタミンB12が抗体に結合することを阻害する方法である。
本発明の別の実施形態は、以下
1)赤色光(>600nm)条件下で細胞培養培地を調製すること、および保存すること、2)赤色光条件下で目的の抗体を産生する細胞を培養すること、3)赤色光条件下で細胞培養物から抗体を収集すること、および4)収集溶液に過酸化水素を加えること
を含む抗体の産生のための方法である。
本発明の別の実施形態は、以下
1)赤色光(>600nm)条件下で細胞培養培地を調製すること、および保存すること、2)赤色光条件下で目的の抗体を産生する細胞を培養すること、および3)赤色光条件下で細胞培養物から目的の抗体を収集することを含む、抗体の産生のための方法である。
本発明の別の実施形態は、以下
1)目的の抗体を産生する細胞を培養すること、2)細胞培養物から目的の抗体を収集すること、および3)収集溶液に過酸化水素を加えること
を含む、抗体の産生ための方法である。
図1A-1Dは、ビタミンB12およびmAb Bの2ロットのスペクトル吸収を示す。1AはビタミンB12およびmAb Bの2ロットの吸収スペクトルである。250から800nmの、PBSで5mg/LでのビタミンB12(シアノコバラミン)(青線)、ピンク色のロット(赤線)および無色ロット(紫線)。1Bは、詳細を示すために(1A)から再スケーリングされたプロットである。1Dは目に見えるピンク色を有するmAb BについてのプロテインA溶出液のボトルである。 図2A-2Dは、抗体へのビタミンB12の付着が二次反応であることを示す。(2A)2つの無色のmAb Aのロット、還元抗体分子が検出されていないロット(「良」ロット)およびもう一つは大多数の還元抗体を有する(「不良」ロット)をCN-CblまたはHO-Cblのいずれかと混合させた。インキュベーション後、過剰の遊離ビタミンB12を除去した。試料は左から右に、良ロットとCN-Cbl;不良ロットとCN-Cbl;良ロットとHO-Cbl;不良ロットとHO-Cblであり;および不良ロットは最初に過酸化水素で処理し、HO-Cblと混合した。(2B)CE SDSにより示されるように、過酸化水素は還元抗体を酸化でき、抗体モノマーを再形成する。(2C)2Bにおいて示される、過酸化水素処理および未処理のmAbにおけるmAbモノマーおよび様々な低分子量種の定量。(2D)ビタミンB12付着前(青線)および後(黒線)のmAb Aバッチ2材料の非還元CE-SDS解析。おそらく空気中での遊離スルフヒドリル基の酸化およびジスルフィド結合の再形成が原因でビタミンB12とのインキュベーションの前後で個々のピークパターンが変化した。 図3A-3Cは、ビタミンB12コンジュゲーション識別のための質量スペクトルデータを示す。(3A)HO-Cblからm/z=664.79およびCN-Cblからm/z=678.29のMS/MSスペクトル。(3B)ペプチド-コバラミン複合体L19-コバラミンおよびL18-19-コバラミンのMS/MSスペクトル。(3C)IgG4抗体ジスルフィド結合の図。ビタミンB12に結合するシステイン残基は青で示され、かつジスルフィド結合を形成するシステイン残基のペアは赤で囲まれる。 図4A-4Eは、実施例1において使用されるカラーフィルターの光透過スペクトルを示す。(4A)RP-UPLCでの分離についてのクロマトグラムおよび360nmでの検出(4B)標準におけるCN-CblおよびHO-Cbl;(4C)mAb Aについての新たな培養培地;(4D)赤色光に曝された培地;および(4E)緑色光に曝された培地。(4Dおよび4E)において、黒、青および赤線はそれぞれ、0.3、0.6、および1.2百万lux時の露光エネルギーを示した。 図5A-5Cは、CBにおける遊離スルフヒドリルレベルおよび低分子量(LMW)を示す。(5A)mAb 1 CB試料の遊離チオールレベルおよび対応するプロテインA精製試料(PAVIB)におけるLMWの存在の相関。PAVIBをLMW種についてNR_Caliperにより解析した。LMW≧5%のそれらの試料は「Yes」として標識し、そうでなけでば「No」である。解析はJMP softwareで行った。(5B)異なる収集処理下でのCBにおける遊離チオールレベルの測定。mAb 1を含有する実験室規模のバイオリアクター(5-L)からの清澄化収集バルク(CB)を硫酸デキストランの非存在下または存在下でpHを4.8に低下させることにより処理した。CB試料を、試料が深層ろ過される前に室温で1時間インキュベートした。深層ろ過後、各試料のアリコートを、遊離スルフヒドリル含量が測定される前に1mM NAPDHの添加のありまたはなしで37℃で75分間インキュベートした。LMWの高い割合の製造ロットおよび代表的なロット(通常のロット)もまた、比較のために含まれる。(5C)(5B)における試料についてインタクトな抗体の割合。インタクトな抗体をプロテインA精製後にNR_Caliperにより測定した。 図6A-6Fは、LMW生成についての予測マーカとしての酸化還元指示薬DCPIP処理および色変化の観察を示す。(6A)DCPIPの構造および反応。(6B)左の>95%LMW(抗体タンパク質あたり3.1スルフヒドリル基)を有するmAb2精製DS試料は、DCPIPで処理すると無色を示した。右の98%以上のインタクトな抗体(抗体タンパク質あたり0.4スルフヒドリル)のmAB2試料はDCPIPの存在下で紫色(pH5.5で)を示した。(6C)異なる培養条件からのmAb 2のCBにおけるDCPIPの色変化。左の2つのチューブのDCPIPは完全に無色となり、CBに高い還元電位が存在したことを示す;真ん中の2つのチューブのDCPIPは青色を有しており、還元作用がないことを示す;および右のチューブのDCPIPは部分的に還元された。(6D)細胞溶解のmAb 2割合の関数としての遊離チオール濃度。mAb 2の100%細胞溶解物を通常のCBと混合し、細胞溶解物の希釈曲線を作成し、遊離チオール濃度を測定し、重複試料の平均として報告した。線形回帰式およびR二乗はExcelで算出した。(6E)DCPIPの色変化の順序および遊離チオール量を試験する研究設計。(6F)表7の研究のDCPIP試験結果の画像。一次回収の前および一次回収の間に上部パネルの試料は空気を入れた。一次回収の前および一時回収の間に底部の試料は窒素ガスフラッシングを受けた。左から右の試験管の順序は上から下への表7における順序と同じであった。 図7A-7Kは、ジスルフィド結合還元を防止する過酸化水素の使用を示す。mAb 2実験室規模生成CBを様々な濃度の過酸化水素の容器に分注した。容器内のエアレス状態を窒素フラッシングにより生成し、1日間室温で保持した。得られた試料をプロテインA精製なしで非還元(7A、7C、7E、7G、7I)および還元(7B、7D、7F、7H、7J)Caliperにより直接解析した。(7Aおよび7B)過酸化水素の添加なしのCBをコントロールとして空気に曝した。過酸化水素0mMのCB(7Cおよび7D)、過酸化水素0.33mMのCB(7Eおよび7F)、過酸化水素1mMのCB(7Gおよび7H)、および過酸化水素3mMのCB(7Iおよび7J)をエアレス状態で保持した。(7K)mAb断片化の非還元Caliper結果の概要。宿主細胞から分泌されるこのmAbの過剰な軽鎖があるため。軽鎖の量は断片として含まれない。LMW種に使用される略語:LC、軽鎖;HC、重鎖;HL、1軽鎖および1重鎖のハーフ抗体;HHL、1軽鎖および2重鎖の部分的な抗体。 図8A-8Fは、最悪の場合におけるジスルフィド結合還元を防止するために過酸化水素を使用することの評価を示す。試験したmAb 2CBは、実施例2に記載されるように100%細胞溶解を有した。空気ありまたはなしの保持条件は図7と同じであった。(8A)過酸化水素処理なし、および空気ありで保持したCB試料は、コントロールとして役立つ。(8B)過酸化水素処理なし、およびエアレス状態で保持したCB試料。(8C)5mM過酸化水素をエアレス状態における保持の前にCB試料に加えた。(8C)10mM過酸化水素をエアレス状態における保持の前にCB試料に加えた。得られたCB試料(8Aから8D)をプロテインA精製なしで直接非還元Caliperにより解析した。(8E)未精製のCBからのmAb断片化の非還元Caliper結果の概要。(8F)プロテインAクロマトグラフィーにより精製され、かつ非還元Caliperにより解析された試料8Aから8Dのインタクトな抗体純度の概要。 図9A-9Dは、抗体ジスルフィド結合還元を防止するための代替過酸化物の使用を示す。過炭酸ナトリウムおよび過ホウ酸ナトリウムを100%細胞溶解とのmAb 2 CBの最悪の場合で使用した。(9A)空気ありで保持し、過酸化物なしのCB試料。(9B)エアレス状態で保持し、過酸化物なしのCB試料。(9C)5mM過炭酸ナトリウム処理CB試料の代表的な結果。過炭酸ナトリウムをエアレス状態での保持の前に加えた。未精製のCBの非還元Caliperからの結果(9Aから9C)。(9D)過炭酸ナトリウムおよび過ホウ酸ナトリウム処理の概要。未精製のCBの非還元Caliperからの結果。
発明の詳細な説明
生物製剤製造の工程管理は製品品質および安全性ならびに治療用タンパク質のロット間の一貫性を確保するために重要である。製造の間の色生成のメカニズムを理解することは制御戦略を開発するために重要である。本発明者らは抗体製造の間のピンク色の生成が、還元抗体の遊離スルフヒドリル基およびビタミンB12の活性型であるヒドロキソコバラミンの両方の濃度に依存する二次反応であることを発見した。両方の反応物が必要であり、いずれか単独ではピンク色を生成するのに十分でない。本発明は、以下;1)製造および収集の間の抗体の還元を防止すること、または2)製造および収集の間のシアノコバラミン(CN-Cbl)からヒドロキソコバラミン(HO-Cbl)への変換を阻害することのいずれかにより、抗体製造の間のピンク色の生成を防止する方法である。あるいは、本発明は、1)製造および収集の間の抗体の還元を防止する、および2)製造および収集の間のシアノコバラミンからヒドロキソコバラミンへの変換を阻害することによる、抗体製造の間のピンク色の生成を防止する方法である。
本発明者らは、ビタミンB12の活性型が重鎖134(HC134)、軽鎖214(LC214)、重鎖321(HC321)、重鎖367(HC367)、および重鎖425(HC425)に位置するシステインの遊離スルフヒドリル基に付着することを発見した。5つのシステイン残基はFabおよびFc領域の両方に分布している。これらの5つのシステイン残基の間には、LC214とHC134およびHC367とHC425、の2対のジスルフィド結合がある(図3c)。これらの特定のジスルフィド結合が製造および収集の間に還元されると、ジスルフィド対におけるシステイン残基の両方がヒドロキソコバラミン付着につき同等のアクセシビリティを有する。
本明細書中で使用されるように、「シアノコバラミン」および「CN-Cbl」は互換的に使用され、および細胞培養培地のビタミンB12(VB12)成分を指す。同様に、「ヒドロキソコバラミン」および「HO-Cbl」は互換的に使用され、製造および収集の間に還元抗体に結合するために利用可能な細胞培養培地におけるビタミンB12の活性型(VB12)を指す。
抗体は通常、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞などの哺乳動物細胞において産生され、細胞培養培地に細胞外へ分泌される。細胞培工程の最後に、細胞は、遠心分離、深層ろ過、または凝集などの方法を使用する一次回収工程の間に培養培地から分離され、収集液体を清澄化する。
本明細書中で使用されるように、「清澄化バルク」および「CB」は互換的に使用され、細胞培養液を清澄化するために使用される遠心分離、深層ろ過、または凝集などの一次回収工程の後に回収された溶液を指す。
本明細書中で使用されるように、「細胞培養培地調製」、「細胞培養培地保存」、「細胞培工程」、「抗体製造」、「抗体生産」、および「抗体収集」、「収集」は、抗体を生産するために必要な多くの工程を指す。各工程は、製造施設内の異なる場所で発生してもよい。
ピンク色の制御戦略としての製造環境での赤色光の使用
ヒドロキソコバラミンおよび還元抗体の両方がピンク色産物の生成に必要とされるため、いずれか一つまたは両方の因子の制御は、ピンク色生成を防止するだろう。
光誘発ビタミンB12変換は、培地調製、培地保存および細胞培工程の間に起こり得る。培地調製、保存期間、およびガラスリアクタ-での細胞培養期間に透明の使い捨てのバイオプロセシングバッグの使用はビタミンB12光曝露および変換のリスクを高める。適切な容器(たとえば、ステンレス鋼容器)を使用する、追加の層材料で覆う、不要な光曝露を避ける、などの一般的な制御戦略は、光からの保護を提供できる。ただし、これらの戦略の実装には課題がないわけではなく、多くの場合追加費用が含まれる。
実施例1は、赤色光がHO-CblへのCN-Cbl変換を誘導しないことを示す。還元mAb Aを白色光、または赤色光または緑色光に曝された、または暗所を保った培養培地にスパイクした。一晩インキュベートした後、mAbをプロテインAカラムで精製し、結合したビタミンB12をELISAアッセイで測定した。表7に示すように、ビタミンB12コンジュゲーション率の順番は、白色光>緑色光>赤色光、および暗所コントロールであった。
本発明の一実施形態では、ヒドロキソコバラミンへのシアノコバラミン変換は、細胞培養培地が調製され、保存されるエリアにおいて、および所望により細胞培養物製造および収集エリアにおいて白色光を赤色光(波長>600nm)と置き換えることにより阻害され、低減され、または防止される。
本発明の別の実施形態では、ヒドロキソコバラミンへのシアノコバラミン変換は、細胞培養培地が調製され、保存されるエリアにおいて、および所望により細胞培養物製造および収集エリアにおいて白色電球を赤色LED電球(波長>600nm)と置き換えることにより阻害され、低減され、または防止される。
本発明の別の実施形態では、ヒドロキソコバラミンへのシアノコバラミン変換は、細胞培養培地が調製され、保存されるエリアにおいて、および所望により細胞培養物製造および収集エリアにおいて白色電球の上に赤色プラスチックシートあるいは赤色チューブを置くことにより阻害され、低減され、または防止される。
本発明の別の実施形態では、細胞培養培地が調製され、保存されるエリアにおける白色光、および、また細胞培養物製造および収集エリアにおける白色光は、白色電球を赤色LED電球(波長>600nm)と置き換えることにより、または白色電球の上に赤色プラスチックシートあるいは赤色チューブを置くことにより赤色光と置換される。
本発明の別の実施形態では、細胞培養培地が調製され、保存されるエリアにおける白色光、および、また、細胞培養物収集エリアにおける白色光は、白色電球を赤色LED電球(波長>600nm)と置き換えることにより、または白色電球の上に赤色プラスチックシートあるいは赤色チューブを置くことにより赤色光と置換される。
本発明の別の実施形態では、細胞培養培地が調製され、保存されるエリアにおける白色光、および、また、細胞培養物製造エリアにおける白色光は、白色電球を赤色LED電球(波長>600nm)と置き換えることにより、または白色電球の上に赤色プラスチックシートあるいは赤色チューブを置くことにより赤色光と置換される。
ピンク色制御戦略としてのタンパク質収集および一次回収の間の抗体還元の防止。
還元抗体およびヒドロキソコバラミンの両方がピンク色産物の生成に必要とされるため、いずれか一つまたは両方の因子の制御は、ピンク色生成を防止するだろう。
mAb製造の間のジスルフィド結合の還元は、酵素酸化還元反応であり、抗体製造プロセスの間の低分子量種(LMW)形成の根本原因である。LMW生成の原因はよく理解されいないが、LMWの出現は抗体の還元環境を作り出す温度、溶存酸素(DO)、pH、生存率、細胞密度、溶解率などの細胞培養条件の組み合わせ効果に起因すると考えられている。これは、還元環境で抗体を保持する清澄化バルク(CB)保持条件(例えば温度、時間、曝気)によってさらに悪化する。LMWの検出は、通常、清澄化バルクまたはプロテインA溶出液プールのステップで視覚化される。
実施例2は、遊離チオールレベルが100mM未満の場合、LMW生成のリスクが低いこと;100~200mMの遊離チオールレベルは警告サインであること;および200mM超えの遊離チオールレベルは、LMW生成のリスクが高いこと、を示す。抗体の還元を防ぐための多くの緩和戦略として、酸化還元反応に関与する酵素を阻害するか、またはNADPHなどの重要な酵素補因子を酸化および枯渇させることが提案されている(Mun M 2015, Trexler-Schmidt M 2010)。エアスパージングは、抗体の還元を防ぐ強力な方法として示されている。しかしながら、総遊離チオールレベルは、製造の間のマイクロモルレベルから、空気なしでCBを保持した後のミリモルレベルまで変動する(表7)。図8は、最悪の清澄化バルク条件の場合、空気への曝露が抗体還元を完全には抑制できなかったことを示している。
本発明者らは、収集の間に清澄化バルクに過酸化物を添加すると、抗体ジスルフィド結合の還元およびLMW種の生成が防止されることを発見した。過酸化物を使用する利点には、1)過酸化物を任意の比率で水と混合できること、および2)過剰な過酸化物の除去は下流の精製に負担がかからないことが含まれる。しかしながら、過酸化水素(H)の10mM溶液が水と酸素に完全に分解すると、理論的に5mMの酸素が生成され得るが、このプロセスは触媒がないと遅くなる。
実施例2は、過酸化水素、または過炭酸ナトリウムや過ホウ酸ナトリウムなどの代替無機または有機過酸化物を清澄化バルクに添加すると、抗体のジスルフィド結合の還元を効果的に防ぐことができることを示す。
本発明の一実施形態では、抗体ジスルフィド結合還元は、収集時に清澄化バルク(bulk)に過酸化水素を加えることにより防止される。
本発明の一実施形態では、抗体ジスルフィド結合還元は、収集時に清澄化バルクに過炭酸ナトリウムまたは過ホウ酸ナトリウムなどの無機または有機過酸化物を加えることにより防止される。
本発明の別の実施形態では、抗体ジスルフィド結合還元は収集時に清澄化バルクの過酸化水素濃度を≦10mMで維持することにより防止される。
本発明の別の実施形態では、抗体ジスルフィド結合還元は収集時に清澄化バルクの過酸化水素濃度を3mMから10mMの間に維持することにより防止される。
実施例1
mAbとのビタミンB12結合
タンパク質ストック
2つの異なる治療用IgG4分子(mAb AおよびB)をこの研究で使用した。それらの両方が元のIgG4のヒンジ領域モチーフCPSCにおいてセリンからプロリンへの1つの点突然変異を有し、IgG1鎖間ジスルフィド結合構造に類似していた。(Liu H et.al.: MAbs 2012、4(1):17-23;Aalberse RC et.al.Immunology 2002、105(1):9-19)。IgG4抗体はCHO細胞において産生され、およびプロテインAクロマトグラフィー、追加のポリッシングクロマトグラフィーおよびヒスチジン-ベースバッファへの最終UF/DFろ過を使用してアフィニティ精製した。原薬(DS)のタンパク質濃度は280nmでの吸光度により決定した。
ビタミンB12ELISA。
精製タンパク質に結合したビタミンB12(VB12)の量の決定には、製造元の推奨手順とともに市販のVB12測定キット(Monobind Inc., Lake Forest, CA)を使用した。
In vitroでの、原薬へのビタミンB12結合。
ヒスチジンベースバッファ中のmAb AまたはmAb B溶液(50mg/ml)をモル比4:1から2:1(タンパク質:VB12)でCN-Cbl(Sigma-Aldrich、V2876、ストック溶液1mg/ml水)またはHO-Cbl(Sigma-Aldrich、V5323、ストック溶液1mg/ml水)のいずれかと混合した。反応は室温で、暗所で1日間行った。リン酸生理食塩水バッファ(PBS、Sigma-Aldrich、D5652)でのバッファ交換はフロースルーにおいて色が見えなくなるまで50kDaカットオフAmicon遠心フィルターを介して行われた。バッファ交換反応溶液をペプチドマッピング分析に供した。
還元抗体の過酸化水素酸化。
mAb Aの1ロットは、製造の間に部分的に還元されたジスルフィド結合であった。原薬を0.1%過酸化水素(30mM)と室温で4時間混合し、過剰な過酸化水素を上述のバッファ交換により除去した。
光曝露研究。
mAb A用に新たに調製した培地を光曝露試験で使用した。CN-Cblを最終濃度10mg/Lまで添加した(1mg/mlストック溶液から)。
13W白色光コンパクト蛍光灯(CFL)を可視光源として使用した。360nmを中心とする13Wの市販のブラックライト電球をUV光源として使用した。ランプは、溶液の加熱を防ぐために、毎分200立方フィートの空気流量でドラフトチャンバーを設置した。ベンチの表面は、光の反射を避けるために暗かった。試料は、ランプから約12~13インチ離れて配置され(平均強度はチューブの表面で672luxあった)、通常の室内照明条件(500~1,000lux)をシミュレートした。光の強度は、光度計(それぞれUVAおよび可視光につきSper Scientific UVA/B光度計Model 850009およびExtech HD400)で測定した。カラーフィルターはArbor Scientific(Kit 33-0190)から購入した。フィルターの透過スペクトルを図4に示す。ポリカーボネートプラスチックシート(厚さ2.4mm)をハードウェアストアから購入し、UVA光をフィルターで除去するために使用した。
すべての培地試料を光源にさらし、可視光の場合は0.3、0.6、および1.2百万lux時間(強度×露光時間)、UVA光の場合は1平方メートルあたり71および212ワットでサンプリングした。
遊離スルフヒドリル基アッセイ。
当該方法は文献(Arner ES et.al. Methods Enzymol 1999、300:226-239)からわずかに変更を加えてエルマン試薬、3,3’-ジチオ-ビス(6-ニトロ安息香酸)、3-カルボキシ-4-ニトロフェニル(nitophenyl)ジスルフィド;2,2’-ジニトロ-5,5’-ジチオ安息香酸(DTNB)を使用する。簡潔には、96ウェルプレートで10μLの原薬の試料を15μLのTEバッファ(50mM Tris-HCl、20mM EDTA、pH7.6)と混合した。DTNB溶液(エタノール中5mg/ml、Sigma-Aldrich、D8130)を、使用前に体積比1:9で0.2M Tris(pH8)中の8Mグアニジン-HClと新たに混合した。次に、100μLのDTNB/グアニジン溶液を各ウェルに加えて混合した。412nmでのスペクトル吸収を測定し、13,600M-1cm-1のモル吸光係数値を計算に使用した。
抗体変性試験。
熱変性のために、1mLのmAb A(プロテインAアフィニティカラム精製後、Trisで中和)をエッペンドルフテストチューブで80℃で20分間加熱した。加熱と冷却の後、目に見える沈殿物が形成された。チューブを18,000xgで20分間遠心分離した。上清をタンパク質アッセイ(OD280)およびビタミンB12ELISAアッセイに使用した。SDS変性について、0.25mLの原薬を、リン酸生理食塩水(PBS)中0.75mLの0.3%ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)と混合し、室温で1日間放置した。余分なSDSは、50kDaカットオフAmicon遠心フィルターを介したPBSとのバッファ交換により除去した。
LC/MS/MSを使用した原薬-ビタミンB12反応混合物のペプチドマッピング解析。
mAb AおよびビタミンB12を含有する試料は、事前の還元またはアルキル化を行わずにトリプシンで消化した。トリプシンを酵素対タンパク質比1:25(重量/重量)で添加する前に、消化バッファ(50mMトリスHCl、10mM塩化カルシウム、2M尿素、pH7.6)を使用して、バッファ交換反応混合物を1mg/mLに希釈した)。37℃でのインキュベーション後、消化された混合物は直接LC/MS/MS解析に供した。ThemoFisher Q-EXACTIVE PLUS Orbitrap質量分析計で分析する前に、Waters Acquity(TM)UPLCを使用して、約10μgのトリプシン消化物をクロマトグラフィーで分離した。Waters Acquity BEH CSH(TM)C18カラム(1.7μm、2.1x100mm)を分離に使用した(45℃で)。60分以上1%から80%の移動相Bの直線勾配を使用して、ペプチドを水中で溶出した(移動相A:0.1%ギ酸および5mMギ酸アンモニウム;移動相B:アセトニトリル中0.1%ギ酸および5mMギ酸アンモニウム)、流速0.2mL/分。Orbitrap質量分析計は、3.0kVのスプレー電圧で陽イオンモードで動作した。ヒーター温度とキャピラリー温度は、それぞれ300℃と275℃に設定した。MSの取得は70,000の分解能で実行され、MS/MS解析用に17,500の分解能で各デューティサイクルで10個の最も強いイオンを選択した。ダイナミックエクスクルージョン機能は有効であった。25の正規化された衝突エネルギーを使用して、フラグメンテーションスペクトルを取得した。
ピンク色を生成するには、ジスルフィド還元mAbとHO-Cblの両方が必要である。
mAbの製造の間に、ピンク色は通常プロテインA溶出ステップで現れることが観察され、mAbが濃縮され、培地組成からバックグラウンド色が除去される。ビタミンB12の含有量をELISA法で分析した結果、ピンク色のロットは無色のバッチよりも約20倍高いビタミンB12を有することがわかった(表1、バッチ1対2)。

表1.ビタミンB12(VB12)付着およびmAb Bの遊離チオール
分子量とビタミンB12およびmAbの濃度に基づいて、着色された材料は47mAb分子中に約1つのビタミンB12分子を有していた。ビタミンB12には、360、420、550nm付近に3つの主要な吸収ピークがある。スペクトルスキャンにより、ピンク色のバッチは320nmより大きいところで無色のバッチよりも高い吸収率を示した(図1Aおよび図1B、赤色対紫色の線)。
ジスルフィド結合の還元と遊離スルフヒドリル基の生成は、ピンク色の出現に関連していることが提案されている(Derfus GE et.al.. MAbs 2014、6(3):679-688)。ピンク色のロットのmAb Bの遊離スルフヒドリル含量は、無色バッチよりも高い遊離スルフヒドリルレベルを有した(表1)。一方、遊離スルフヒドリル含量が高いいくつかのバッチ(mAb AについてN=4、mAb BについてN=2)は、原薬ではピンク色を有していなかった。例えば、mAb Aのバッチ2には、バッチ1よりも高いレベルの遊離スルフヒドリル基が有していたが、両方のバッチは無色で、同様のレベルのビタミンB12を有していた(表2)。これらの結果は、遊離スルフヒドリル基が必要であるが、単独ではピンク色の産物を生成するには不十分であることを示している。
表2. ビタミンB12付着およびmAb Aの遊離チオール
ビタミンB12は、哺乳類の細胞培養に不可欠な補因子である。ビタミンB12の最も安定した形態であるCN-Cblは、細胞培養プロセスで使用される唯一のソースである。光はCN-CblをHO-Cblに変換できることが報告されており、これはmAbに対する反応性が高い(Prentice KM et.al.: MAbs 2013, 5(6):974-981)。原薬でピンク色を生成するには、タンパク質からの遊離チオールおよび反応性HO-Cblの両方の必要性を実証するために、低(バッチ1)または高(バッチ2)レベルの遊離スルフヒドリル含量のmab AとCN-CblまたはHO-Cblをインキュベートすることによって一連の試験を設定した。ビタミンB12アイソフォームとmAbを混合し、室温で1日間暗所でインキュベートした。インキュベーション後、遊離ビタミンB12をろ過により除去した。保持されたビタミンB12量は(表2);
(1)HO-Cblは、同じバッチmAbと複合体を形成するにはCN-Cblよりもはるかに活性が高く、
(2)遊離スルフヒドリル基のレベルが高い原薬は遊離スルフヒドリル基のレベルが低い原薬よりも反応性が高いこと、および
(3)最も高いビタミンB12取り込みはHO─Cbl存在下でかつ高いレベルの遊離スルフヒドリル基を有する原薬において起こり、100倍以上の増加したビタミンB12を引き起こしたことを示した。各試料のビタミンB12量に起因する色における差異は肉眼で明らかであった(図2a)。
遊離スルフヒドリル基は、タンパク質中の還元されたジスルフィド結合に由来する。mAb Aバッチ2の原薬は、タンパク質分子あたり平均3.1の遊離スルフヒドリル基を有し(表2)、抗体分子の95%以上が還元された(図2bおよび図2c)。過酸化水素(0.1%v/v)をバッチ2材料に加え、低分子量種(LMW)の大部分(86.6%)を抗体モノマーに変換した(図2bおよび図2c)。再酸化された材料は、より低い遊離スルフヒドリルレベル(H2O2処理後およびHO-Cblのインキュベーション前に測定)およびHO-Cblに対するより低い反応性を有していた。これらの結果は、ピンク色の生成が二次反応であり、その速度が両方の反応物、すなわち遊離スルフヒドリル基とHO-Cblの濃度に依存することを示す。
ビタミンB12は抗体に共有結合する。
以前の文献では、非共有結合性の性質が示唆されたが、ビタミンB12の付着の性質に関する実験的証拠は提供されていない(Derfus et al.,2014)。推定される非共有結合は、ビタミンB12に対する抗体の構造および電荷の相補性が必要であり、したがって、天然のタンパク質構造の破壊により、結合したビタミンB12が放出されるであろう。2つの変性方法、加熱およびSDS処理を使用した。85℃で20分間加熱すると、mAb Bピンク色の材料が変性して沈殿した。タンパク質をほとんど含まない上清は、開始タンパク質溶液の総ビタミンB12の約3.5%しか含まれていなかった(表1)。SDSは、ペプチド骨格に結合し、変性タンパク質を溶液に溶解した状態に維持することにより、タンパク質を変性させる。ビタミンB12アッセイでは、ビタミンB12のすべてではないにしても、ほとんどが依然として変性タンパク質に結合していることが示された(表1)。非還元キャピラリー電気泳動-SDS(CE-SDS)で、着色物質の移動度シフトが検出された。初期のmAb A原薬とmAb A-ビタミンB12の両方の着色された複合体は、ジスルフィド還元に起因して、非還元CESDSで複数のバンドを有していた。初期材料で対応するピークに重なったピークに加えて、着色物質は高分子量側にシフトする追加のピークがあり、単一の軽鎖や重鎖などの低分子量ピークでシフトがより顕著であって(図2d)。この観察結果は、mAbへのビタミンB12分子の追加として簡単に説明できた。まとめると、これらの結果は、ビタミンB12が変性タンパク質と結合しており、変性条件下でタンパク質と共移動することを実証する。したがって、ビタミンB12とmAbの相互作用が非共有結合的性質であることはないであろう。
CN-CblとHO-Cblの両方が、LC/MS/MS解析によるトリプシン消化物で観察された。CN-CblおよびHO-Cblの理論分子量は、それぞれ1254.567および1345.567Daである。CN-Cblで観察される主なイオンは、m/z678.293の二重荷電イオンであり、2つのプロトンが追加されたCN-Cblに対応する。しかしながら、HO-Cblで観察される最も主なイオンは、配位化合物を放出し、かつプロトンを加える、OHリガンドを有するB12-OHに対応するm/z664.789の二重荷電イオンである。HO-Cblからのm/z664.789種およびCN-Cblからのm/z678.293のMS/MSスペクトルがそれぞれ、図4Aおよび4Bに示される。2つのMS/MSスペクトルには、147.09、359.10、456.72、912.44、および1124.45のm/z値を含む多くの共通するフラグメンテーションがある。CN-CblのMS/MSスペクトルのm/z997.48および1209.49は、CoCN基を失うことなく、m/z912.44および1124.45の種に由来する。
トリプシン消化物のLC/MS/MS解析により、いくつかのシステイン残基との配位により、コバラミンとIgG間の配位共有結合が発見された。各軽鎖には5つのシステイン残基があり、各重鎖には11のシステイン残基がある。しかしながら、表3に記載されているように、MSによってコバラミンと配位錯体を形成することが観察されたのはそのうちの5つ(L-C214、H-C134、H-C321、H-367、H-C425)だけである。L-C214は軽鎖のC末端にあり、それは、配位共有結合の形成に関与する唯一の軽鎖システイン残基である。

表3. IgG-ビタミンB12反応混合物のトリプシン消化物で観察されるペプチド-コバラミン複合体を含有するシステイン
これは、2ppmの質量精度で、C末端ペプチドL19-Cbl複合体(1635.646Da)および不完全消化ペプチドL18-19-Cbl複合体(2139.894Da)で観測される質量によって証明される。これらの配位錯体は、MS/MS解析でも確認された。これら2つのペプチド-Cbl複合体のMS/MSスペクトルは非常に類似しており、主にコバラミンからのフラグメントからなる。MS/MSフラグメントの大部分は、HO-Cblのm/z664.789種のMS/MSスペクトルと比較することで特定できる。図4Aおよび4Bに示すように、m/z147.09、359.10、486.24は、HO-CblのMS/MSスペクトルとまったく同じである。さらに、m/z971.47および1183.48の種は、m/z912.44および1124.45の同じ構造と、コバルト(原子質量58.93Da)からなる。
同様に、重鎖上の4つのシステインがコバラミンと配位結合を形成することが確認されている。H-C134は、FAB領域のL-C214とのジスルフィド結合のカウンターパートである。他の3つのシステイン残基H-C321、HC-C367およびH-C425は、重鎖Fc領域上の3つのC末端システインである。さらに、HC-C367とH-C425は、ネイティブIgG4のペアのジスルフィド架橋である。
HO-CblへのCN-Cblの光変換およびピンク色産物の工程管理。上記のように、ピンク色の反応は、還元抗体分子とHO-Cblの濃度に依存する2次反応である。したがって、抗体分子の還元および/またはHO-Cblの生成を防ぐために、工程管理戦略が必要である。抗体産物の還元の制御は非常に複雑なプロセスであり、抗体再設計(Peters SJ et.al. J Biol Chem 2012、287(29):24525-24533;Aalberse RC et.al, 2002)、培養培地組成(Trexler-Schmidt M et.al. Biotechnol Bioeng 2010、106(3):452-461)、プロセスパラメーター(Mun M et.al. Biotechnol Bioeng 2015、112(4):734-742)および収集処理(Trexler-Schmidt M et.al, 2010)を伴い得る。可視光への曝露を避けることでHO-Cblの量を制御することも代替戦略である。しかしながら、これらのオプションは、操作に不便をもたらす可能性があり、細胞系統特異的であることがある。
CN-Cbl変換を引き起こす波長を特定することでこの問題に取り組み、光源から有害な波長を除去することにより制御戦略を設定した。ビタミンB12は、UVAと可視光の両方の吸収を有する(図1)。新しく調製したmAb A培地を、(1)500-1,000luxの強度の白色蛍光灯チューブから提供される通常の実験室の光、または(2)CFL蛍光灯によって提供される強化可視光、または(3)360nmを中心とする強化UVA光の下で曝露した。CN-CblとHO-Cblは、RP-UPLCによって分離および定量した(図4B)。結果は、CN-CblをHO-Cblに主に変換させたのは、UVA光ではなく可視光であったことを示す(表4)。変換率は通常の実験室の光と高強度の可視光の両方からの全体的な照明(強度×時間)の関数であった。
表4 .UVAライトでなく可視光線がCN-Cbl変換の原因である。
*エネルギー単位は、可視光につきKlux時間およびUVAライト用のメーターにつきワット/sqである。
次に、エネルギーの関数としてCN-Cblの変換を引き起こすことができる可視波長(または色)の範囲を調査した。選択したカラーフィルターを使用して、特定した波長カットオフを持つ光を生成し、光スペクトルの特定の領域を分離した(図4A)。表5に示すように、異なる色の光への露光時間の関数としてのCN-Cbl変換の程度。ポリカーボネートガラスはほとんどのUVA光を遮断できるが、可視光を透過させるため、CN-Cbl変換を防ぐことができなかった。波長が600nmを超える赤色光への曝露は、最も遅いCN-Cbl変換の速度を有した(図4d)。対照的に、緑色光(図4e)と青色光の両方は、はるかに高いCN-Cbl変換率を有する。CN-Cblは、420nmおよび500-550nmの領域に吸収ピークを有し、この研究で使用される青色および緑色の光スペクトルと重なる。これらの結果は、異なる色の光がCN-Cbl変換に異なる影響を及ぼし、<600nmを超える波長のみがCN-Cbl変換を引き起こすという見解を裏付ける確かな証拠を提供する。
表5. 色光はCN-Cbl変換に影響を与える。
ピンク色の管理戦略として、製造環境で赤色光を使用する。通常の白色蛍光灯の代わりに赤色光を使用して、実験室の設定で試験した。還元したmAb A(表2のバッチ2製品)は、収集時に実際の細胞培養と同様のmAb A濃度で培養培地にスパイクした。培養培地は、以前に白色光、赤色光または緑色光にさらした(1.2百万時間)。暗所で一晩(20時間)インキュベートした後、mAbをプロテインAカラムで精製し、結合したビタミンB12をELISAアッセイで測定した。表6に示すように、白と緑の両方の光にさらされた培地におけるビタミンB12付着は、赤光にさらされたものと暗所コントロールよりも多かった。これらの結果は、赤色光が実際にCN-Cblを変換から保護できることを示す。
表6. 様々な色光に曝されたCBにスパイクされたmAb A原薬
実施例2
製造プロセスの間の抗体ジスルフィド結合還元を防止するために過酸化水素を使用すること
タンパク質ストック
2つのIgG4分子(1および2)および2つのIgG1分子(3および4)を本研究において使用した。IgG4分子は、IgG1鎖間ジスルフィド結合構造CPPCに似た元のIgG4のヒンジ領域モチーフCPSCのセリンからプロリンへの単一点突然変異を有していた(Liu H et.al. MAbs. 2012;4:17-23, Aalberse RC et.al.Immunology 2002;105:9-19)。すべてのmAbはCHO細胞培養で産生され、細胞生存率は50から90%の範囲であった。清澄化バルク(CB)は、特に指定がない限り、通常、深層ろ過で生成され、この場合、遠心分離によって生成した。いくつかの場合のmAb 1細胞培養物は、深層ろ過の前に低pHと硫酸デキストランで処理した。ダウンストリーム精製はプロテインAクロマトグラフィー、追加のポリッシングクロマトグラフ工程およびヒスチジン-シュガー-ベースバッファへの最終限外ろ過/透析ろ過工程により達成される。タンパク質濃度はDropsense-96分光計(Trinean NV, 9050 Gent, Belgium)による280nmでの吸光度(A280)により決定した。
遊離スルフヒドリルコンテント(チオール)アッセイ
該方法では文献(Arner ES et.al. Methods Enzymol 1999;300:226-239)を若干改変し、2,2’-ジニトロ-5,5’-ジチオ安息香酸(DTNB)を使用した。簡潔には、10mLの清澄化バルクまたは原薬(DS)の試料を96ウェルプレートで15mLのTEバッファ(50mM Tris-HCl、20mM EDTA、pH7.6)と混合した。DTNB溶液(エタノール中5mg/ml;Sigma-Aldrich、D8130)を使用前に1:9の体積比で0.2M Tris(pH8)中8Mグアニジン-HClと新たに混合した。100mLのDTNB/グアニジン溶液を各ウェルに加え、混合した。重複試料を試験した。412nmでのスペクトル吸収を測定し、モル吸光係数値13,600M-1cm-1を遊離チオール含量の計算に使用した。
酸化還元指示薬アッセイ
2,6-ジクロロフェノールインドフェノール(D2932、Spectrum Chemical MFG Corp、Gardena、CA)を水に溶解して、新鮮な1%ストック溶液を作製した。2,6-ジクロロフェノールインドフェノールの酸化型は中性pHで青色であり、還元されると無色になった。酸性pHでは、2,6-ジクロロフェノールインドフェノールの酸化型は紫色で、還元されると無色に変化した。還元および非還元の試料につきDCPIP色範囲を決定するために、100%mAb 2細胞溶解物を遠心分離により産生された通常の清澄化バルクと混合して一連の細胞溶解物の0、3、5、10、20、30、40、50、60および70%希釈を精製した。各希釈の遊離チオール含量をすぐに測定し、希釈の関数としてプロットした(図6D)。DCPIP(10mL)を一連の細胞溶解希釈物(室温で1mL)に加え、数秒から数分以内に目視検査でどの希釈液が色の変化を示したかを判定した。
非還元および還元Caliper
LabChip GXII Touch HT System(PerkinElmer)を製造元の推奨に従って、還元(R_Caliper)および非還元(NR_Caliper)条件下の両方で、mAb純度解析のために使用した。NR_Caliperは2重鎖1軽鎖(HHL)、1重鎖1軽鎖(HL)、重鎖(HC)および軽鎖(LC)を含む抗体断片を分離しかつ定量するための最も便利なハイスループットツールであった。サイズ排除クロマトグラフィーをインタクトなmAbおよび高分子量(HMW)種をモニターするために使用した。
mAbの抗体酸化の質量分析測定
mAb2および3の試料をジチオトレイトールにより還元し、ヨードアセトアミドによってアルキル化し、トリプシンで消化した。トリプシン消化物を、Thermo Scientific Orbitrap Q-EXACTIVETM PLUS質量分析計(Bremen、Germany)により解析する前に、Waters ACQUITY UPLC system(Milford, MA U.S.A.)クロマトグラフィーで分離した。Waters Acquity BEH C18カラム(1.7mm、2.1£150mm)を分離に使用した(40℃で)。110分間にわたる2%から80%移動相Bの直線勾配を使用して0.2mL/分の流速でペプチド(移動相A:水中0.1%ギ酸;移動相B:アセトニトリル中0.1%ギ酸)を溶出した。
Q Exactive Plus質量分析計はMSとMS/MSの取得を切り替えるためにデータ依存モードで動作していた。40のシースガス流量、10の補助ガス流量、3kVのスプレー電圧、275℃のキャピラリー温度、および60のS-Lens RFレベルを使用して、イオンを生成した。解像度はそれぞれ、サーベイスキャンおよびMS/MSイベントについて70,000(AGCターゲット3e6)および17,500(AGCターゲット1e5)に設定した。10sのダイナミックエクスクルージョン時間は単一の繰り返し回数で使用した。相対的な定量は、サーベイスキャンの選択されたイオンクロマトグラムで、酸化ペプチドのピーク面積を天然ペプチドと酸化ペプチドの合計で割ることにより達成した。
過酸化水素および他の過酸化物処理
30%ストック過酸化水素(Sigma-Aldrich cat. 216763、密度1.11g/mL)を使用前に水で3%ストック(v/v、980mMに等しい)に新たに希釈した。3%ストックを細胞培養物またはCBに加え、必要に応じて0.1から20mMの最終濃度にした。抗体ジスルフィド還元への過酸化水素の影響を試験するために、過酸化水素ストックを最終濃度0、0.1、0.33、1、3、5、10または20mMでCBに加えた。
過酸化水素、過炭酸ナトリウム(Sigma-Aldrich, Cat. 371432、2Na2CO3 3H2O2)および過ホウ酸ナトリウム(Sigma-Aldrich, Cat. 372862、NaBO3 H2O)を含有する2つの無機化学物質も試験した。過炭酸ナトリウムおよび過ホウ酸ナトリウムの両方は、水と接触すると加水分解を受け、それぞれ、過酸化水素ならびに炭酸塩もしくはホウ酸塩を産生する。
ジスルフィド結合還元の小規模モデル
吸引キャップ付きの500mLボトル(FlexBioSys, Cat FXB-500M-0005)を300mL清澄化バルクで充填した。あるいは、50mLのバイオプロセスバッグ(ThermoFisher, Cat SH30658.11)を30mL清澄化バルクで充填した。容器を純窒素ガス供給ラインに接続し、室温で1-2時間窒素ガス(≦5psi)でフラッシュし、その後、1日間エアレス(airless)状態で密閉した。保持後、試料を遊離チオールアッセイで直ちに解析するか、NR_Caliperで解析する前にヨードアセトアミド(最終濃度20mM)と混合した。
抗体ジスルフィド結合還元の最悪の場合を生成するために、100%細胞破壊を機械的破壊により人工的に誘発した。細胞培養物を遠心し(500g、20分間)、細胞ペレットを元の容量の1/10でRIPAバッファ(ThermoFisher, Cat 8990.25mM Tris、150mM NaCl、0.1%SDS、1%デオキシコール酸ナトリウム、1%NP-40、pH7.6)に懸濁し、室温で30分間振とうして溶解し、次いで氷上で冷却し、3分間高速組織ホモジナイザーにかけた。これらの工程で完全な細胞溶解が達成されたと想定された。次に、溶解した材料を遠心分離した上清に戻した。この細胞溶解物を、過酸化水素を含むまたは含まない50mLバッグに充填し、次いで窒素ガスでフラッシュし、上記のように室温で1日間エアレス状態で保持した。インキュベーション後、細胞溶解物を4℃で60分間、3,000gで2回遠心分離し、0.2ミクロンフィルターを通過させ、上記のように解析した。
過酸化水素処理および製品品質特性へのその影響
mAb 4について、実験室規模のバイオリアクターの細胞培養液を次の2つの実験に使用した。最初の実験では、遠心分離と0.2ミクロンフィルターを使用したろ過により、清澄化バルクが生成された。得られた清澄化バルクは、(a)コントロールとして4℃で4日間保存したか、(b)過酸化水素と組み合わせて最終濃度10mMの過酸化物とし、4℃で4日間保存した。第二の実験では、過酸化水素を細胞培養液(細胞を含む)に添加し、遠心分離の前に室温で1時間インキュベートした。得られた清澄化バルクは、(a)コントロールとして4℃で4日間保存するか、(b)3日目に室温に置き、窒素ガスでフラッシュし、もう1日間室温で保持した。
得られたすべての試料は、プロテインAクロマトグラフィーで処理され、続いてプロセス中心点条件を使用する低pHウイルス不活化および中和工程が行われた。製品の品質特性は、インタクトな抗体および凝集体レベルを解析するためのサイズ排除超高速液体クロマトグラフィーにより、電荷変異分布の画像化キャピラリー等電点電気泳動により、および純度に関して還元および非還元条件下でCaliperにより、評価した。工程不純物は、宿主細胞タンパク質についてのELISAおよび残留DNAについてのqPCRによって推定された。
mAb 2について、過酸化水素を最終濃度0、3、5および10mMで清澄化バルクに加え、次いで、窒素ガスを流しながら1日間室温で保持した。得られた試料を解析の前にハイスループットプロテインAクロマトグラフィーを介して処理した。
製造の間のジスルフィド結合還元
mAbの還元は、清澄化バルク(CB)またはプロテインA溶出(PAE)のいずれかにおいて、いくつかのIgG1およびIgG4抗体分子について工程開発で観察された。
他のグループと同様に、我々は収集と一次回収の間に清澄化バルクにおける総遊離チオールの蓄積を観察した(WO2015/085003, Ruaudel J, et.al. BMC Proceedings 2015;9(9):24)。ジスルフィド還元を示したmAb 1清澄化バルクの試料と、示さなかった試料との間の遊離チオール濃度における違いは、顕著であった(図5A)。mAb 1の場合、清澄化バルクにおける遊離チオールレベルが100mM未満であると、低分子量生成のリスクは低かった;100-200mMの遊離チオールレベルは潜在的なリスクをもたらした;および200mMを超える遊離チオールレベルは低分子量生成のリスクが高かった。注意すべき点は、エルマン試薬(2,2’-ジニトロ-5,5’-ジチオ安息香酸;DTNB)がタンパク質における遊離スルフヒドリル基に加えて、還元グルタチオン、システインおよびリポ酸などの小スルフヒドリル含有分子の両方のスルフヒドリル基と反応することである。したがって、遊離チオールレベルのベースラインレベルは、細胞株、培地組成(小スルフヒドリル含有分子)および細胞生存率に依存する。それにもかかわらず、ジスルフィド結合の還元が起こったとき、遊離チオールレベルはベースラインよりもはるかに高くなる傾向があった。
清澄化バルクにおける遊離チオールのレベルは非常に動的であり、組成と処理プロセスに関係する。空気曝露に加えて、保存温度およびpHなどの他の要因も、そのダイナミクスに影響する。mAb 1清澄化バルクのpHを7から4.8に調整し、その後深層ろ過により細胞を除去すると、遊離チオールレベルおよび観察される低分子量の割合がわずかに減少した(図5Bおよび5C)。細胞収集物をpH4.8および硫酸デキストラン(0.05g/Lおよび60分間混合後、遠心分離およびろ過)の組み合わせで処理した場合、遊離チオールレベルは大幅に低下し、凝集(flocculation)がTrx/TrxRおよびGlu/GRを含む宿主細胞タンパク質を除去し、かつ、いくつかの小スルフヒドリル含有分子を除去することがあるという観察と一致した。遊離チオールのレベも温度により異なった。コントロールの清澄化バルクの37℃で75分間のインキュベーションは遊離チオール含量の60%低下を引き起こした。しかしながら、TrxRおよびGR反応に必要な成分である1mMのNADPHを37℃インキュベーションの前にその溶液に加えた場合、遊離チオールレベルの増加がコントロールおよびpH調整CBで見られた(図5A)。これらの動的な変化は、低分子量生成のリスクをよりよく予測するために、収集前から収集後の工程で遊離チオールレベルがモニターされるべきであるということを示す。
ジスルフィド結合還元を予測するために酸化還元指示薬を使用する
ジスルフィド結合還元は酸化還元反応であるため、DTNB試験に代わるシンプルで迅速かつ堅牢な方法として酸化還元指示薬を使用し、かつ収集および回収の間の低分子量形成の潜在的なリスクを予想することができる。酸化還元指示薬は、pH指示薬が特定のpHで色変化を受けるのと同様の方法で、特定の電極電位で明確な色変化を受ける。適切な酸化還元指示薬を見つけるために、一連の市販の酸化還元指示薬が試験され、いくつかを生物製剤製造プロセスで使用できる最良の潜在的候補として特定した。
酸化還元指示薬の例は、2,6-ジクロロフェノールインドフェノール(DCPIP、図6A)である。その色は低分子量の割合が高いmAb 2精製原薬において変化し(図6B)、そしてその色はそれぞれ、高、中、および低レベルの遊離チオールの清澄化バルクにおいて完全に変化し、部分的に変化し、または変化しなかった(図6C)。DCPIP色変化範囲を決定するために、DCPIPストック溶液を既知の遊離チオール濃度のmAb 2細胞溶解物の連続希釈液に加えた(図6D)。DCPIPは3-5%細胞溶解物および80-100mM範囲の遊離チオール濃度でmAb 2 CBにおいて色変化を受けた。したがって、清澄化バルク試料が100mMより高い遊離チオール濃度を有した場合、DCPIPの色が変わり、この機能はDCPIPを製造の間のジスルフィド結合還元のリスクを予測するための迅速かつ使いやすい方法とする。
DCPIPにおける色変化が遊離チオールレベルと相関しているかどうか、および低分子量の生成を正しく予測することができかどうかを調べるために研究を設計した(図6E)。mAb 3清澄化バルクを処理前にフィルタートレイン(filter train)の空気または窒素ガスフラッシングで深層ろ過により生成した。窒素ガスフラッシングを使用して収集プロセスの間に液体に酸素が曝されない「エアレス」状態を生成した。得られた清澄化バルクを液体体積に対して0、20、50および100%空気オーバーレイヘッドスペース体積で小さな容器に分注し、4℃、24℃および37℃で1日インキュベートした。表7に示されるように、収集および回収の間の空気の存在は低分子量生成の防止に重要であった。この場合、開始時の清澄化バルクはエアレス状態(207mM)と比較してより低い遊離チオール濃度(51mM)を有し、かつ溶存酸素(DO)レベルは空気オーバーレイ%および異なる温度での保持条件でも低分子量生成を抑制するのに十分(≧37%)であった。
表7. 生成され、および様々な空気およびエアレス状態で保持されたmAb 3清澄化バルクにおける遊離チオール濃度およびDCPIP色変化。
NA:アプライせず
対照的に、保持の間の%空気オーバーレイはエアレス状態で生成される清澄化バルクにとって重要になった。最悪の場合はエアレス収集およびエアレス保持であり、インタクトなmAbモノマーは96.5%から81.6%に減少した。さらに、空気オーバーレイが20%以上である場合に、ジスルフィド還元は起こらなかった。インキュベーション温度は、遊離チオール濃度に対して異なる効果を有した。最も高い遊離チオール濃度および最大の還元は24℃保持で起こった。4℃保持後の遊離チオール量は、保持前の量と近かった。37℃での保持はTrxRおよびGR酵素活性に最適な温度であると推定された。しかしながら、すべての条件で遊離チオール量が普遍的に減少し、データは図5に示すようにmAb1の結果と一致した。
1日間の保持試験の最後に、各試料をDCPIPストック溶液と混合した。色の変化は、目視で評価した(図6F)。表7は、色変化のシーケンスが遊離チオール濃度と強い相関関係を有することを示し;遊離チオール濃度が高いほど、DCPIPの色の変化は速くなった。曝気条件で収集されたすべての試料は色の変化を何も示さなかった。
異なる標準還元電位の追加の酸化還元指示薬も同様の方法で試験し、チオニンとメチレンブルーは、それぞれ600-800および>1,000mMの遊離チオールレベルで色が変化することがわかった(データは示していない)。これらの色素は、製造の間のリスクのレベルを迅速に予測するための指標のラダーを含むようまとめることができる。
収集および一次回収の間のジスルフィド結合還元を再現するためのスケールダウンモデル
数多くの証拠は、ジスルフィド結合の減少が、収集操作中の細胞溶解および経時的に室温で十分な量の空気が入っていない密閉容器(例:使い捨てバッグ)に保持されている清澄化バルクと相関していることを示唆していますMun M et.al. Biotechnol Bioeng 2015;112:734-742)。したがって、密閉可能な容器に少量の清澄化バルク(10から300mL)を充填し、かつ窒素ガスを流し、室温を保持してその後低分子量についてのNR_Caliper解析によりエアレス状態を作り出すことによりこの現象を模倣する小規模モデルを開発した(図7)。
製造操作からの清澄化バルクは細胞損傷の観点および収集前から収集後に様々な工程の保持時間において、ロット間で変化することがあるため、低分子量含量は数パーセントからほぼ100%までの広範囲にわたって変化し得る。小規模な研究をシミュレートするため、100%細胞溶解をシミュレートするためCHO細胞からの細胞溶解物を元の容量の細胞培養物の上清と混合し、空気の存在下でさえ低分子量の生成させる最悪のシナリオを作製し(上記材料および方法に記載される)(図8A)、密閉可能な容器に充填し、窒素ガスでフラッシュしかつ1日間室温でインキュベートした。これらの条件下で、清澄化バルクにおけるインタクトなmAb 2抗体分子はすべて完全に断片化された(図8Bおよび9B)。100%細胞溶解清澄化バルクにおける遊離チオール含量は1から3mMで測定され、それは通常の操作のものよりも少なくとも10倍以上高かった。
過酸化水素はジスルフィド結合の還元を阻害できる。
mAbにおけるジスルフィド結合の還元を制御する1つの方法は、mAbが還元される前に清澄化バルクに含有される還元電位を除去することである。この目的でH2O2の使用を試験した。図7に示されるように、コントロールmAb 2清澄化バルクは1日間室温でエアレス状態で保持された後に約20%の低分子量を生成した(図7C)。過酸化水素をエアレス保持の前に0.33、1および3mMの濃度で同じ清澄化バルクに加えた。結果は3mM(約0.01%)過酸化水素が低分子量の生成を完全に防止できることを示した(図7E、7Gおよび7I)。これらの結果は過酸化水素がジスルフィド結合還元を効果的に防止することを示す。
最悪の場合で低分子量生成を阻害するのに必要なHの最小濃度を決定するために、上記の100%溶解細胞培養物モデルを使用した。本研究では、100%溶解細胞培養物を0、5または10mM H2O2存在下でエアレス状態で保持した。1日保持後、インタクトなmAb2抗体分子は残らず、低分子量種が、ハーフマー(halfmer)のわずかの分画の軽鎖および重鎖により多数を占めており、これは、空気にさらされたコントロール試料と比較して還元がほぼ完全に完了したことを示す(図9Aおよび9B)。H2O2の5mMおよび10mMの追加はそれぞれ、部分的に(図8C)および完全に(図8D)低分子量生成を阻害できる。未精製のCBからのこれらのNR_Caliperの結果を図8Eにまとめた。プロテインA精製後、0、5および10mM H2O2の試料はNR_caliper結果から、それぞれ0、10.1および98.3%の純度の抗体モノマーを有していた(図8F)。空気にさらされた試料が83%の純度の抗体モノマーを有していた。これらの結果は、10mM H2O2が清澄化バルク処理の最悪の場合でのmAb還元を効果的に防止できることを確認する。
過酸化水素と置き換えられ得る無機または有機の過酸化物含有化合物は多くある。2つの無機形態の過炭酸ナトリウムおよび過ホウ酸ナトリウムを過酸化水素の代替として試験した。結果は、両方の過酸化物が濃度依存的にジスルフィド結合の還元を効果的に抑制できることを示す(図9)。
過酸化水素処理および抗体分子の酸化
過酸化水素を使用する主な懸念の1つは、mAbを酸化する可能性である。メチオニン残基は過酸化水素酸化の影響を最も受けやすい(Luo Q, et.al. J Biol Chem. 2011;286:25134-25144, Stracke J, et.al. MAbs. 2014;6:1229-1242)。mAb 2および3(それぞれ、IgG4およびIgG1サブクラスに属する)を様々な過酸化水素処理後にメチオニン酸化について質量分析により解析した。両方の分子について、H2O2の添加(1mMから10mM)および1日間の室温でのインキュベーション後、H2O2濃度に依存する酸化におけるわずかの増加が、上記の過酸化水素処理下の同一ロットの試料で観察された(表8および9)。しかしながら、トリプシンペプチドマッピングおよびLC-MS/MS法に1%のばらつきがあるため、両方のmAb 2および3についてのH2O2誘導酸化変化はわずかであった。
表8.過酸化水素処理後のmAb 2メチオニン残基の酸化
表9.過酸化水素処理後のmAb 3メチオニン残基の酸化
これらの結果は最適な過酸化物濃度下では、過酸化水素または他の過酸化物により媒介されるmAb酸化は有意な増加を示さず、酸化レベルを制御できることを示す。
製品品質特性への過酸化水素処理の影響
酸化に加えて、他の原薬の品質特性およびダウンストリーム精製プロセスに対する過酸化水素の潜在的な影響も、実験室規模の研究で評価した。実験デザインには、mAb 2(IgG4)およびmAb 4(IgG1)の両方を含んだ。mAb 4について、過酸化水素を収集前細胞培養液および収集後清澄化バルク(細胞なし)に加えた。様々な過酸化水素処理後、得られた清澄化バルクをプロテインAクロマトグラフィーで処理し、その後、解析前に中央プロセスポイント(center process point)条件を使用して低pHウイルス不活性化および中和工程をした。表10に示されるmAb 4についての解析結果は、過酸化水素処理および未処理試料間で試験したすべての特性に目立った変化がないことを示した。工程不純物(宿主細胞タンパク質および残留DNA)はまた、コントロールに匹敵し、プロセス範囲で許容された(データ未掲載)。同様の結果もまた、1日間室温で0、3、5および10mM Hにより処理したmAb 2について観察された(表10)。
表10. mAb 2および4の製品品質特性への過酸化水素処理。
*mAb 4の場合、処理は収集前細胞培養液または清澄化バルク工程のいずれかで行われ、得られた清澄化バルクは、プロセス中心点条件を使用してプロテインAクロマトグラフィーおよび低pHウイルス不活化および中和(PAVIB)ステップをした。解析結果はPAVIB試料から得られた。mAb 2の場合、過酸化水素処理およびコントロール清澄化バルク試料は解析前にハイスループットプロテインAカラムにより精製した。NDは「未決定」である。
したがって、これらの結果は過酸化水素処理(最大10mM)は細胞除去の前および後に過酸化水素で処理された試料において試験されたすべての特性における目立った変化を有しないことを示す。

Claims (16)

  1. a)抗体ジスルフィド結合の還元を防止すること、および
    b)培地におけるシアノコバラミン(CN-Cbl)からヒドロキソコバラミン(HO-Cbl)への変換を阻害すること
    を含む、抗体製造の間のピンク色の形成を阻害する方法。
  2. HO-CblへのCN-Cbl変換が、培地調製、培地保存、抗体生産および抗体収集から選択される1回以上の間に可視光線への細胞培養培地露光を防止することにより阻害される、請求項1に記載の方法。
  3. CN-Cblが、培地調製、培地保存、抗体生産および抗体収集から選択される1回以上の間にUVAライトのみに曝される、請求項2に記載の方法。
  4. CN-Cblが、培地調製、培地保存の間に、および所望により抗体生産および抗体収集の間に赤色光(>6000nm)のみに曝される、請求項2に記載の方法。
  5. 抗体ジスルフィド結合の還元が、収集時に清澄化バルク(bulk)に過酸化水素を加えることにより防止される、請求項1-4のいずれか一項に記載の方法。
  6. 過酸化水素濃度が≦10mMで維持される、請求項5に記載の方法。
  7. タンパク質が、抗体(Ab)、モノクローナル抗体(mAb)、ヒト抗体(HuMAb)、ヒト化抗体およびキメラ抗体から選択される、請求項1に記載の方法。
  8. a)抗体ジスルフィド結合の還元を防止すること、または
    b)培地におけるシアノコバラミン(CN-Cbl)からヒドロキソコバラミン(HO-Cbl)への変換を阻害すること
    を含む、細胞培養物製造の間にビタミンB12が抗体に結合することを阻害する方法。
  9. HO-CblへのCN-Cbl変換が、培地調製、培地保存、抗体生産および抗体収集から選択される1回以上の間に可視光線への細胞培養培地露光を防止することにより阻害される、請求項8に記載の方法。
  10. CN-Cblが、培地調製、培地保存の間に、および所望により抗体生産および抗体収集の間に赤色光(>6000nm)のみに曝される請求項9に記載の方法。
  11. タンパク質ジスルフィド結合の還元が、収集時に清澄化バルク(bulk)に過酸化水素を加えることにより防止される、請求項8のいずれか一項に記載の方法。
  12. 過酸化水素濃度が≦10mMで維持される、請求項11に記載の方法。
  13. タンパク質が、抗体(Ab)、モノクローナル抗体(mAb)、ヒト抗体(HuMAb)、ヒト化抗体およびキメラ抗体から選択される、請求項8に記載の方法。
  14. 以下:
    a)赤色光(>600nm)条件下で細胞培養培地を調製すること、および保存すること、
    b)赤色光条件下で目的の抗体を産生する細胞を培養すること、
    c)赤色光条件下で細胞培養物から抗体を収集すること、および
    d)収集時に清澄化バルクの過酸化水素濃度を≦10mMで維持すること
    を含む、抗体の産生のための細胞培工程。
  15. 以下:
    a) 赤色光(>600nm)条件下で培養培地を調製および保存すること、
    b) 赤色光条件下で目的の抗体を産生する細胞を培養すること、および
    c) 赤色光条件下で細胞培養物から目的の抗体を収集すること
    、を含む抗体の産生のための細胞培工程。
  16. 以下:
    a) 目的の抗体を産生する細胞を培養すること、
    b) 細胞培養物から目的の抗体を収集すること、および
    b) 収集時に清澄化バルクの過酸化水素濃度を≦10mMで維持すること
    、を含む、抗体の産生のための細胞培工程。
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