JP7450410B2 - 医用情報処理装置、医用情報処理方法、及び医用情報処理プログラム - Google Patents
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Description
図1は、第1の実施形態に係る医用情報処理装置の構成例を示す概略図である。
(1)設計段階(データセットの識別)
(2)実装段階(新規症例での処理)
分類尺度ベクトルの分布は、NL個の算出された分類尺度ベクトル、分類尺度ベクトルの分布を表すパラメータ、関心領域の疾患確率を意味する。分布情報の表現方法として、上記のほか、各群の(1又は複数の閾値)による各レベルの発生数、各群の各レベルの発生確率、各群のヒストグラム等の表現方法で保存する構成もあり、これらは同等である。
(b)パターン名称
(c)パターン分類基準
(d)表示基準(と子パターン)
(B)良性群中陽性率(期待値)Ppb=Npb/(Npb+Nnb) -(1-特異度)
(C)良性群中陽性率の信頼区間(下限と上限)-省略
(D)悪性群中陽性率(期待値)Ppm=Npm/(Npm+Nnm) -(感度)
(E)悪性群中陽性率の信頼区間(下限と上限)-省略
(F)予測陽性率(期待値)=Npm/(Npb+Npm) -(陽性的中率PPV)、又は、予測陽性率(期待値)=Ppm×Pm/(Ppb×Pb+Ppm×Pm)
(G)予測陽性率の信頼区間(下限と上限) -省略
図5に示す設計段階において、各群のパターン分類ベクトルの確率分布を多次元正規分布で表し、確率密度関数をフィッティングにより求める。これらの値は分類尺度ベクトルの分布情報として保存される。フィッティングの結果、各群の平均値と標準偏差が求められる。
前述の図3は、特徴ベクトルから分類尺度ベクトルへの変換のパラメータを決定するための構成を示す。分類尺度ベクトルへの変換のモデルパラメータを決めたとき、教師データでの識別成績を求めるステップを簡潔にすることもできる。関心領域iごとに次の式(6)からXiを算出し、パターンhごとに次の式(7)からPpbを算出する。
第2の実施形態に係る医用情報処理装置1Aは、被検体に関するの画像の特徴量により、疾患に関する情報の確率の信頼区間を算出し、それに基づき疾患、あるいは疾患に関わる確率区分を判定するものである。また、医用情報処理装置1Aは、必要に応じて、信頼区間により症例数(又は、検査数)の計数範囲を選択することができるものである。
図13は、処理機能25による疾患などの確率の信頼区間の算出機能と、出力機能23による信頼区間の出力機能とを含む第1の機能f1を示す。例えば、信頼区間の出力機能は、信頼区間を示す表示画面をディスプレイ14に表示する。また、図13は、第1の機能f1と、処理機能25による確率の信頼区間に基づく疾患の確率区分等の判定機能と、出力機能23による判定結果の出力機能とを含む第2の機能f2を示す。例えば、判定結果の出力機能は、判定結果を示す表示画面をディスプレイ14に表示する。図13は、医用情報処理装置1Aの第1及び第2の機能f1,f2をデータフローとして示す図である。
図16は、処理機能25による疾患などの確率の信頼区間の算出機能と、出力機能23による信頼区間の出力機能とを含む第1Aの機能f1Aを示す。また、図16は、第1Aの機能f1Aと、処理機能25による確率の信頼区間に基づく疾患の確率区分等の判定機能と、出力機能23による判定結果の出力機能とを含む第2Aの機能f2Aを示す。第1Aの機能f1A(第2Aの機能f2Aも同様)は、計数範囲を重み関数で表すものである。図16は、医用情報処理装置1Aの第1A及び第2Aの機能f1A,f2Aに係るデータフローを示す図である。
(1)単純閾値:計測値がu(u=u1,u2,…)の場合、重み関数「w」は全てのiについて、ui-ri<xi<ui+riのときは「1」で、その他のときは「0」
(2)多次元ガウス関数:w=exp(-0.5(x-u)TR-1 (x-u))
なお、「R」は正値対称行列である。
図17は、処理機能25による疾患などの確率の信頼区間の算出機能と、出力機能23による信頼区間の出力機能とを含む第1Bの機能f1Bを示す。図17は、第1Bの機能f1Bと、処理機能25による確率の信頼区間に基づく疾患の確率区分等の判定機能と、出力機能23による判定結果の出力機能とを含む第2Bの機能f2Bを示す。第1Bの機能f1B(第2Bの機能f2Bも同様)は、計数範囲を最適化(最大化又は最小化)するものである。図17は、医用情報処理装置1Aの第1B及び第2Bの機能f1B,f2Bに係るデータフローを示す図である。
図19は、処理機能25による疾患などの確率の信頼区間の算出機能と、出力機能23による信頼区間の出力機能とを含む第1Cの機能f1Cを示す。図19は、第1Cの機能f1Cと、処理機能25による確率の信頼区間に基づく疾患の確率区分等の判定機能と、出力機能23による判定結果の出力機能とを含む第2Cの機能f2Cを示す。前述の第1Bの機能f1Bで説明したように、複数の群に対して計数範囲の最適化を行うと、群の数分の計数範囲が得られることになる。第1Cの機能f1C、及び、第2Cの機能f2Cでは、各群の計数範囲で求められた信頼区間の上限値あるいは下限値を用いて1つの群を選択し、その群の計数範囲を他の群に適用して信頼区間を計算しなおすものである。図19は、医用情報処理装置1Aの第1C及び第2Cの機能f1C,f2Cに係るデータフローを示す図である。
(1)1つの疾患群をとった時、その疾患群の信頼区間の下限を最大化する計数範囲を決める。
(2)これを繰り返し全ての群(クラス)の計数範囲の中で信頼区間下限最大値が最も大きい計数範囲を選び主クラス(主群)とする。
(3)主クラス(主群)の計数範囲を他の群(クラス)に再度適用し、各群(クラス)の疾患確率とその信頼区間を求める。
(4)主クラス(主群)の信頼区間下限と、他の群(クラス)の信頼区間上限に基づいて確率カテゴリを判定する。
i)研究データは確定診断されており、様々な脳腫瘍が含まれている。それぞれの脳腫瘍の種類ごとに特徴量の値のヒストグラムが作成されている。選択された4つの大分類を判定群とした場合、4つの統合したヒストグラムが作成される。
ii)被検体での特徴量の計測値の周囲に計数範囲を設定し、「グリオーマ」の確率の信頼区間下限を最大化する計数範囲を求める(図20Aの破線)。同様に、他の群の信頼区間下限を最大化する計数範囲をそれぞれ決定する(図20B~図20Dの破線)。そして各々の群に属する確率(平均)と群に属する確率の信頼区間をそれぞれ算出する。
iii)図20A~図20Dに示す各群の信頼区間下限を示す丸印「●」を比較し、それが最も大きいグリオーマ(図20A)の計数範囲を選択する。グリオーマの信頼区間下限を示す位置の表示形態(例えば、背景色)を他の位置と異ならせることで区別する。このグリオーマが主クラス(主群)となる。操作者は別の群を主クラス(主群)として選択しなおすことが可能である。
iv)表示するのは選択された図20Aの計数範囲から得られる主クラスの情報のみである。
v)選択された主クラス「グリオーマ」の計数範囲で、各群に属する確率(平均)と信頼区間を計算し表示する。
vi)選択されたグリオーマの信頼区間下限と、その他の群の信頼区間上限の値を表示し、その値がどのカテゴリに属するかを判定して表示する(図20Aに示すカテゴリ「可能性大」)。
図22は、処理機能25による疾患などの確率の信頼区間と、処理機能25によるグラフの算出機能と、出力機能23による信頼区間とグラフとの出力機能とを含む第2Dの機能f1Dを示す。図22は、第1Dの機能f1Dと、処理機能25による確率の信頼区間に基づく疾患の確率区分等の判定機能と、出力機能23による判定結果の出力機能とを含む第2Dの機能f2Dを示す。第1Dの機能f1D(第2Dの機能f2Dも同様)は、ヒストグラムと計数範囲を表示するものである。図22は、医用情報処理装置1Aの第1D及び第2Dの機能f1D,f2Dに係るデータフローを示す図である。
図23は、処理機能25による疾患などの確率の信頼区間に基づく群所属確率のカテゴリ判定と、カテゴリ区域図との算出機能と、出力機能23によるカテゴリ判定結果とカテゴリ区域図との出力機能とを含む第1Eの機能f1Eを示す。図23は、第1Eの機能f1Eと、出力機能23による、カテゴリ判定結果とカテゴリ区域図との同時の出力機能とを含む第2Eの機能f2Eを示す。第1Eの機能f1E(第2Eの機能f2Eも同様)は、カテゴリの区域図をグラフとして表示するものである。図23は、医用情報処理装置1Aの第1E及び第2Eの機能f1E,f2Eに係るデータフローを示す図である。信頼区間算出機能252は、群症例数の計数の際、畳み込み演算を行う。
図29は、処理機能25による疾患などの確率の信頼区間と、画像表示と、領域表示との算出機能と、出力機能23による信頼区間と、画像表示と、領域表示との出力機能とを含む第1Fの機能f1Fを示す。図29は、第1Fの機能f1Fと、処理機能25による群所属確率のカテゴリ判定機能と、出力機能23によるカテゴリ判定結果の出力機能とを含む第2Fの機能f2F示す。第1Fの機能f1F(第2Fの機能f2Fも同様)は、画像及び特徴量算出領域を表示するものである。図29は、医用情報処理装置1Aの第1F及び第2Fの機能f1F,f2Fに係るデータフローを示す図である。
処理機能25による第1Gの機能f1G(第2Gの機能f2Gも同様)は、施設の有病率を設定するものである。図30は、医用情報処理装置1Aの第1G及び第2Gの機能f1G,f2Gに係るデータフローを示す図である。
事前確率が、「a2」の時の予測される疾患確率P2は、事前確率が「a1」であるであるときの疾患確率P1から、上記次の式(19),(20)から求める。事前確率が「a2」の時の信頼区間についても同様に求める。
信頼区間算出機能252が、疾患の有無の判定を行う例を中心に説明したが、その場合に限定されるものではない。例えば、判定項目は、群の取り方や、特徴量空間の次元数により様々な応用が可能である。判定項目を次に例示する。
(I)信頼区間を算出する量(確率の信頼区間)
(I-i)1変数の場合:病変の存在確率、重症確率、悪性の確率
(I-ii)複数変数の場合:各疾患の存在確率、カテゴリ分類、ステージ分類、病変タイプの各々の確率、各組織型の確率
(I-iii)予測:薬剤の種類ごとの効果ありの確率、治療(処置)の効果がある確率
(II)群
(II-i)被検体の状態(疾患の有無、種類)
(II-ii)病変の有無、病変の悪性/良性の判定、病変のカテゴリ判定(カテゴリ0~5)、病変のタイプ分類(サブタイプなど)、組織型の判定
(III)予測
(III-i)薬効有無、治療適性(効果有無)、予後(重症化する/しない)、重篤イベントの発生有無、完治する/しない
(IV)判定する属性の数
(IV-i)2水準、1変数~多水準、複数変数(多変数による複数群への分類として考えることが可能)
信頼区間算出機能252が、疾患の有無の判定を行う例を中心に説明したが、その場合に限定されるものではない。特徴量は、次のようなものでもよい。
(V)画像処理の組み合わせで算出する特徴量
(V-i)円形度、球形度
(V-ii)平均値、energy, entropy, contrast etc. (Texture特徴量)
(V-iii)最大直径、体積
(VI)従来の手法による機能マップの統計値
(VI-i)ADC(Apparent diffusion coefficient), FA (fractional anisotropy)
(VI-ii)rCBF (relative regional cerebral blood flow, rCBV (relative regional cerebral blood volume, MTT(mean transit time), TTP (time to peak)
(VI-iii)Ktrans, Kep (Tofts model)
(VII)機械学習により決定する特徴量
(VII-i)Neural network
(VII-ii)Support vector machine
(VII-iii)Random forest, extremely random tree
(VII-iv)Logistic regression
(VIII)画像の特徴量のほかに、心拍のR-R間隔や血液検査の結果、症状有無など、非画像の情報を加えてもよい。
以下、良性/悪性を判定する場合において、良性群の計数範囲を最適化する場合を例にとって説明する。特徴量の次元が2以上の場合について、図35A及び図35Bを用いて説明する。
以下の例で、「下限」は信頼区間下限または信頼区間下限の最大値を表す。また、「上限」は、信頼区間上限、又は、信頼区間上限の最小値を表す。
図41A及び図41Bは、疾患確率を3階層で判定する例である。図41C及び図41Dは、各治療法による治療の効果を3階層で判定する例である。図41E及び図41Fは、QOL良好の確率及び重篤化の確率を3階層で判定する例である。このような判定には、画像データまたは特徴量のデータ、その他非画像検査データ、疾患の種類、選択した治療法とその効果有無、各種QOLの良好/不良および各種重篤化の発生有無について複合的に記録されている症例データを用いる。
ヒストグラムの初期表示では、最適化で求めた計数範囲を、図42に示すように表示する。図42に示すグラフにて、丸印「〇」の特徴量の値と四角印「□」の特徴量の値とで挟まれた範囲が計数範囲である。操作者が丸印「〇」と四角印「□」を入力インターフェース13としてのマウスで操作すると、当該範囲が拡げられるか、あるいは狭められる。その結果、群に所属する確率およびその信頼区間が再計算され、更新された値が表示される。
11 処理回路
12 記憶回路
21,25 処理機能
211 関心領域設定機能
212 特徴算出機能
213 尺度取得機能
22 抽出機能
23 出力機能
24 統計情報収集機能
251 統計情報取得機能
252 信頼区間算出機能
Claims (18)
- 判定対象の画像データが疾患を有する確率と、その確率の信頼度を示す指標である信頼区間とを算出する処理を行う処理部と、
前記確率と、前記確率の信頼区間とに基づく、疾患に関する情報を出力する出力部と、
を備え、
前記処理部は、統計情報取得部と信頼区間算出部とを備え、
前記統計情報取得部は、複数の画像データの特徴に基づき集計された疾患の頻度に関する統計情報を取得し、
前記信頼区間算出部は、前記判定対象の画像データが疾患を有する確率と、その確率の信頼度を示す指標である信頼区間とを、前記統計情報が示す頻度分布を利用して判定対象の計測値を含む任意の範囲から求め、
前記出力部は、前記確率と、前記確率の信頼区間とに基づく、疾患に関する情報を出力する、
医用情報処理装置。 - 前記信頼区間算出部は、前記判定対象の特徴が所属する特徴量の範囲を計数範囲として算出する、
請求項1に記載の医用情報処理装置。 - 前記信頼区間算出部は、前記複数の画像データの中で、前記計数範囲に所属する症例数を群ごとに求め、少なくとも1つの群について、所属する確率の平均値と、信頼区間とを算出する、
請求項2に記載の医用情報処理装置。 - 前記出力部は、前記疾患に関する情報として、前記確率と、前記確率の信頼区間との関係から前記判定対象の疾患に関する判定結果を出力する、
請求項1乃至3のいずれか1項に記載の医用情報処理装置。 - 前記出力部は、前記疾患に関する情報として、前記確率と、前記確率の信頼区間とを出力する、
請求項1乃至3のいずれか1項に記載の医用情報処理装置。 - 前記出力部は、前記信頼区間の判定条件に応じた判定結果を出力する、
請求項4又は5に記載の医用情報処理装置。 - 複数の画像データの特徴に基づき疾患の頻度に関する統計情報を収集する統計情報収集部をさらに備える、
請求項1乃至6のいずれか1項に記載の医用情報処理装置。 - 判定対象の画像データが疾患を有する確率と、その確率の信頼度を示す指標である信頼区間とを算出する処理を行う処理部と、
前記確率と、前記確率の信頼区間とに基づく、疾患に関する情報を出力する出力部と、
を備え、
前記処理部は、尺度算出部と抽出部とを備え、
前記尺度算出部は、前記判定対象の画像データを複数の画像パターンに分類して、各画像パターンの疾患確率を示す前記信頼区間を識別妥当性尺度として算出し、
前記抽出部は、前記複数の画像パターンの各画像パターンの識別妥当性尺度に基づいて、前記複数の画像パターンから、疾患の識別が行いやすい一部の画像パターンを抽出し、
前記出力部は、前記一部の画像パターンを優先して表示部に表示させる、
医用情報処理装置。 - 前記尺度算出部は、前記判定対象の画像データに基づいて識別妥当性尺度を生成する学習済みモデルに対して、前記判定対象の画像データを入力することで、前記識別妥当性尺度を生成する、
請求項8に記載の医用情報処理装置。 - 前記尺度算出部は、前記判定対象の画像データの関心領域を設定し、前記関心領域に基づいて、前記判定対象の画像データを複数の画像パターンに分類する、
請求項8又は9に記載の医用情報処理装置。 - 前記出力部は、前記一部の画像パターンの名称を文字情報として前記表示部に表示させる、
請求項8乃至10のいずれか1項に記載の医用情報処理装置。 - 前記尺度算出部は、前記識別妥当性尺度として、予測悪性率又は予測良性率を示す信頼区間の広さを用いる、
請求項8乃至11のいずれか1項に記載の医用情報処理装置。 - 前記抽出部は、優先度に関係なく、標準で表示する特定の画像パターンを予め規定し、
前記出力部は、前記特定の画像パターンを前記表示部に表示させると共に、前記一部の画像パターンを優先して前記表示部に表示させる、
請求項8乃至12のいずれか1項に記載の医用情報処理装置。 - 前記疾患を有する確率は、腫瘤の良性又は悪性の確率である、
請求項8乃至13のいずれか1項に記載の医用情報処理装置。 - コンピュータが、
判定対象の画像データが疾患を有する確率と、その確率の信頼度を示す指標である信頼区間とを算出する処理を行う処理工程と、
前記確率と、前記確率の信頼区間とに基づく、疾患に関する情報を出力する出力工程と、
を有し、
前記処理工程は、統計情報取得工程と信頼区間算出工程とを有し、
前記統計情報取得工程は、複数の画像データの特徴に基づき集計された疾患の頻度に関する統計情報を取得するものであり、
前記信頼区間算出工程は、前記判定対象の画像データが疾患を有する確率と、その確率の信頼度を示す指標である信頼区間とを、前記統計情報が示す頻度分布を利用して判定対象の計測値を含む任意の範囲から求めるものであり、
前記出力工程は、前記確率と、前記確率の信頼区間とに基づく、疾患に関する情報を出力するものである、
医用情報処理方法。 - コンピュータが、
判定対象の画像データが疾患を有する確率と、その確率の信頼度を示す指標である信頼区間とを算出する処理を行う処理工程と、
前記確率と、前記確率の信頼区間とに基づく、疾患に関する情報を出力する出力工程と、
を有し、
前記処理工程は、尺度算出工程と抽出工程とを有し、
前記尺度算出工程は、前記判定対象の画像データを複数の画像パターンに分類して、各画像パターンの疾患確率を示す前記信頼区間を識別妥当性尺度として算出するものであり、
前記抽出工程は、前記複数の画像パターンの各画像パターンの識別妥当性尺度に基づいて、前記複数の画像パターンから、疾患の識別が行いやすい一部の画像パターンを抽出するものであり、
前記出力工程は、前記一部の画像パターンを優先して表示部に表示させるものである、
医用情報処理方法。 - コンピュータに、
判定対象の画像データが疾患を有する確率と、その確率の信頼度を示す指標である信頼区間とを算出する処理を行う処理機能と、
前記確率と、前記確率の信頼区間とに基づく、疾患に関する情報を出力する出力機能と、
を実現させ、
前記処理機能は、統計情報取得機能と信頼区間算出機能とを有し、
前記統計情報取得機能は、複数の画像データの特徴に基づき集計された疾患の頻度に関する統計情報を取得するものであり、
前記信頼区間算出機能は、前記判定対象の画像データが疾患を有する確率と、その確率の信頼度を示す指標である信頼区間とを、前記統計情報が示す頻度分布を利用して判定対象の計測値を含む任意の範囲から求めるものであり、
前記出力機能は、前記確率と、前記確率の信頼区間とに基づく、疾患に関する情報を出力するものである、
医用情報処理プログラム。 - コンピュータに、
判定対象の画像データが疾患を有する確率と、その確率の信頼度を示す指標である信頼区間とを算出する処理を行う処理機能と、
前記確率と、前記確率の信頼区間とに基づく、疾患に関する情報を出力する出力機能と、
を実現させ、
前記処理機能は、尺度算出機能と抽出機能とを有し、
前記尺度算出機能は、前記判定対象の画像データを複数の画像パターンに分類して、各画像パターンの疾患確率を示す前記信頼区間を識別妥当性尺度として算出するものであり、
前記抽出機能は、前記複数の画像パターンの各画像パターンの識別妥当性尺度に基づいて、前記複数の画像パターンから、疾患の識別が行いやすい一部の画像パターンを抽出するものであり、
前記出力機能は、前記一部の画像パターンを優先して表示部に表示させるものである、
医用情報処理プログラム。
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