JP7326453B2 - スルホン化2(7)-アミノアクリドンおよび1-アミノピレン色素ならびに特に炭水化物分析のための、蛍光タグとしてのそれらの使用 - Google Patents
スルホン化2(7)-アミノアクリドンおよび1-アミノピレン色素ならびに特に炭水化物分析のための、蛍光タグとしてのそれらの使用 Download PDFInfo
- Publication number
- JP7326453B2 JP7326453B2 JP2021542325A JP2021542325A JP7326453B2 JP 7326453 B2 JP7326453 B2 JP 7326453B2 JP 2021542325 A JP2021542325 A JP 2021542325A JP 2021542325 A JP2021542325 A JP 2021542325A JP 7326453 B2 JP7326453 B2 JP 7326453B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- alkyl
- group
- groups
- formula
- substituted
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 239000000975 dye Substances 0.000 title claims description 95
- YZVWKHVRBDQPMQ-UHFFFAOYSA-N 1-aminopyrene Chemical compound C1=C2C(N)=CC=C(C=C3)C2=C2C3=CC=CC2=C1 YZVWKHVRBDQPMQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 title description 35
- MFUFBSLEAGDECJ-UHFFFAOYSA-N pyren-2-ylamine Natural products C1=CC=C2C=CC3=CC(N)=CC4=CC=C1C2=C43 MFUFBSLEAGDECJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 title description 13
- 238000012511 carbohydrate analysis Methods 0.000 title description 4
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 claims description 190
- -1 2,3,5,6-tetrafluorophenyl Chemical group 0.000 claims description 146
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 100
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 claims description 46
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 45
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 claims description 42
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 39
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 claims description 35
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 claims description 32
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 claims description 31
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 claims description 31
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 claims description 29
- 125000002768 hydroxyalkyl group Chemical group 0.000 claims description 27
- 125000000636 p-nitrophenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(=C([H])C([H])=C1*)[N+]([O-])=O 0.000 claims description 27
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 claims description 26
- 125000000538 pentafluorophenyl group Chemical group FC1=C(F)C(F)=C(*)C(F)=C1F 0.000 claims description 26
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims description 25
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 23
- 125000000623 heterocyclic group Chemical group 0.000 claims description 23
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 claims description 23
- 238000006268 reductive amination reaction Methods 0.000 claims description 23
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 claims description 22
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims description 22
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 claims description 21
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 20
- 125000005010 perfluoroalkyl group Chemical group 0.000 claims description 19
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 claims description 18
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 claims description 18
- 229910052805 deuterium Inorganic materials 0.000 claims description 17
- 125000002467 phosphate group Chemical group [H]OP(=O)(O[H])O[*] 0.000 claims description 17
- 229910052794 bromium Inorganic materials 0.000 claims description 16
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 15
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 15
- OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N Hydrazine Chemical compound NN OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 14
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 claims description 14
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 claims description 14
- 230000000269 nucleophilic effect Effects 0.000 claims description 14
- 125000004001 thioalkyl group Chemical group 0.000 claims description 14
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 claims description 13
- 125000004105 2-pyridyl group Chemical group N1=C([*])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 claims description 12
- YZCKVEUIGOORGS-OUBTZVSYSA-N Deuterium Chemical compound [2H] YZCKVEUIGOORGS-OUBTZVSYSA-N 0.000 claims description 12
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 claims description 12
- 125000001140 1,4-phenylene group Chemical group [H]C1=C([H])C([*:2])=C([H])C([H])=C1[*:1] 0.000 claims description 11
- 125000000339 4-pyridyl group Chemical group N1=C([H])C([H])=C([*])C([H])=C1[H] 0.000 claims description 11
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 11
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 claims description 11
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 claims description 11
- 150000003457 sulfones Chemical class 0.000 claims description 11
- RMMXTBMQSGEXHJ-UHFFFAOYSA-N Aminophenazone Chemical compound O=C1C(N(C)C)=C(C)N(C)N1C1=CC=CC=C1 RMMXTBMQSGEXHJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L Carbonate Chemical compound [O-]C([O-])=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L 0.000 claims description 10
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 claims description 10
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 claims description 10
- 125000005842 heteroatom Chemical group 0.000 claims description 10
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 claims description 10
- 125000000467 secondary amino group Chemical group [H]N([*:1])[*:2] 0.000 claims description 10
- 150000001345 alkine derivatives Chemical group 0.000 claims description 9
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 9
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 claims description 9
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 claims description 8
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 8
- BFMYDTVEBKDAKJ-UHFFFAOYSA-L disodium;(2',7'-dibromo-3',6'-dioxido-3-oxospiro[2-benzofuran-1,9'-xanthene]-4'-yl)mercury;hydrate Chemical compound O.[Na+].[Na+].O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC(Br)=C([O-])C([Hg])=C1OC1=C2C=C(Br)C([O-])=C1 BFMYDTVEBKDAKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 claims description 8
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 claims description 8
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 claims description 8
- 125000004404 heteroalkyl group Chemical group 0.000 claims description 8
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 8
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 8
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 8
- 125000005581 pyrene group Chemical group 0.000 claims description 8
- 239000003053 toxin Substances 0.000 claims description 8
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 claims description 8
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 claims description 8
- 125000001340 2-chloroethyl group Chemical group [H]C([H])(Cl)C([H])([H])* 0.000 claims description 7
- AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N Hydroxylamine Chemical compound ON AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- AKZWRTCWNXHHFR-PDIZUQLASA-N [(3S)-oxolan-3-yl] N-[(2S,3S)-4-[(5S)-5-benzyl-3-[(2R)-2-carbamoyloxy-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]-4-oxo-3H-pyrrol-5-yl]-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl]carbamate Chemical compound NC(=O)O[C@@H]1Cc2ccccc2C1C1C=N[C@](C[C@H](O)[C@H](Cc2ccccc2)NC(=O)O[C@H]2CCOC2)(Cc2ccccc2)C1=O AKZWRTCWNXHHFR-PDIZUQLASA-N 0.000 claims description 7
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 7
- 150000005829 chemical entities Chemical class 0.000 claims description 7
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 claims description 7
- 125000004431 deuterium atom Chemical group 0.000 claims description 7
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 claims description 7
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 claims description 7
- 150000001299 aldehydes Chemical class 0.000 claims description 6
- 125000004390 alkyl sulfonyl group Chemical group 0.000 claims description 6
- 125000002837 carbocyclic group Chemical group 0.000 claims description 6
- 150000001735 carboxylic acids Chemical group 0.000 claims description 6
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 6
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 claims description 6
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims description 6
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 claims description 6
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 claims description 6
- 125000004178 (C1-C4) alkyl group Chemical group 0.000 claims description 5
- MSWZFWKMSRAUBD-IVMDWMLBSA-N 2-amino-2-deoxy-D-glucopyranose Chemical compound N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O MSWZFWKMSRAUBD-IVMDWMLBSA-N 0.000 claims description 5
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 claims description 5
- 108090001008 Avidin Proteins 0.000 claims description 5
- FZHXIRIBWMQPQF-UHFFFAOYSA-N Glc-NH2 Natural products O=CC(N)C(O)C(O)C(O)CO FZHXIRIBWMQPQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- ZDZOTLJHXYCWBA-VCVYQWHSSA-N N-debenzoyl-N-(tert-butoxycarbonyl)-10-deacetyltaxol Chemical compound O([C@H]1[C@H]2[C@@](C([C@H](O)C3=C(C)[C@@H](OC(=O)[C@H](O)[C@@H](NC(=O)OC(C)(C)C)C=4C=CC=CC=4)C[C@]1(O)C3(C)C)=O)(C)[C@@H](O)C[C@H]1OC[C@]12OC(=O)C)C(=O)C1=CC=CC=C1 ZDZOTLJHXYCWBA-VCVYQWHSSA-N 0.000 claims description 5
- 108010003723 Single-Domain Antibodies Proteins 0.000 claims description 5
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 claims description 5
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 claims description 5
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 claims description 5
- 125000001028 difluoromethyl group Chemical group [H]C(F)(F)* 0.000 claims description 5
- 229960003668 docetaxel Drugs 0.000 claims description 5
- QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N nitrogen group Chemical group [N] QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 5
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 claims description 5
- 125000003172 aldehyde group Chemical group 0.000 claims description 4
- 150000001336 alkenes Chemical class 0.000 claims description 4
- 150000001450 anions Chemical class 0.000 claims description 4
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 claims description 4
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 claims description 4
- 239000011616 biotin Substances 0.000 claims description 4
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 4
- 239000002841 Lewis acid Substances 0.000 claims description 3
- 150000001298 alcohols Chemical class 0.000 claims description 3
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims description 3
- 239000012491 analyte Substances 0.000 claims description 3
- 150000001491 aromatic compounds Chemical class 0.000 claims description 3
- 150000001767 cationic compounds Chemical class 0.000 claims description 3
- 238000009833 condensation Methods 0.000 claims description 3
- 230000005494 condensation Effects 0.000 claims description 3
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 claims description 3
- 150000007517 lewis acids Chemical class 0.000 claims description 3
- 239000011707 mineral Substances 0.000 claims description 3
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 claims description 3
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 claims description 3
- 150000002892 organic cations Chemical class 0.000 claims description 3
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 claims description 3
- 238000012546 transfer Methods 0.000 claims description 3
- 125000003342 alkenyl group Chemical group 0.000 claims description 2
- 125000002344 aminooxy group Chemical group [H]N([H])O[*] 0.000 claims description 2
- 150000001975 deuterium Chemical group 0.000 claims description 2
- BDHFUVZGWQCTTF-UHFFFAOYSA-M sulfonate Chemical compound [O-]S(=O)=O BDHFUVZGWQCTTF-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 2
- 125000000896 monocarboxylic acid group Chemical group 0.000 claims 2
- 238000003795 desorption Methods 0.000 claims 1
- 125000005843 halogen group Chemical group 0.000 claims 1
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 96
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 41
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 41
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 35
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 35
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 34
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 30
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 25
- HWCKGOZZJDHMNC-UHFFFAOYSA-M tetraethylammonium bromide Chemical compound [Br-].CC[N+](CC)(CC)CC HWCKGOZZJDHMNC-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 25
- XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N argon Substances [Ar] XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 24
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 23
- BBEAQIROQSPTKN-UHFFFAOYSA-N pyrene Chemical compound C1=CC=C2C=CC3=CC=CC4=CC=C1C2=C43 BBEAQIROQSPTKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 23
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 22
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 22
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 20
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 19
- 229940124530 sulfonamide Drugs 0.000 description 19
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 18
- 238000000132 electrospray ionisation Methods 0.000 description 17
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N silicon dioxide Inorganic materials O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 17
- 238000002330 electrospray ionisation mass spectrometry Methods 0.000 description 15
- 239000000463 material Substances 0.000 description 15
- RLOWWWKZYUNIDI-UHFFFAOYSA-N phosphinic chloride Chemical compound ClP=O RLOWWWKZYUNIDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- 238000006862 quantum yield reaction Methods 0.000 description 15
- GLUUGHFHXGJENI-UHFFFAOYSA-N Piperazine Chemical compound C1CNCCN1 GLUUGHFHXGJENI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 14
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 14
- 238000004809 thin layer chromatography Methods 0.000 description 14
- 229910052786 argon Inorganic materials 0.000 description 13
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 13
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 13
- 239000000047 product Substances 0.000 description 13
- 230000003595 spectral effect Effects 0.000 description 13
- KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N Palladium Chemical compound [Pd] KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 12
- GVEPBJHOBDJJJI-UHFFFAOYSA-N fluoranthrene Natural products C1=CC(C2=CC=CC=C22)=C3C2=CC=CC3=C1 GVEPBJHOBDJJJI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 12
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- 150000008052 alkyl sulfonates Chemical class 0.000 description 11
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 11
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 11
- MJYGRUSMTCUJGK-UHFFFAOYSA-N 2-nitro-10h-acridin-9-one Chemical compound C1=CC=C2C(=O)C3=CC([N+](=O)[O-])=CC=C3NC2=C1 MJYGRUSMTCUJGK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- SMXLUGIDFGYLER-UHFFFAOYSA-N 3-[8-amino-3,6-bis(3-hydroxypropylsulfonyl)pyren-1-yl]sulfonylpropan-1-ol Chemical class OCCCS(=O)(=O)C1=CC(=C2C=CC3=C(C=C(C4=CC=C1C2=C34)N)S(=O)(=O)CCCO)S(=O)(=O)CCCO SMXLUGIDFGYLER-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 239000000370 acceptor Substances 0.000 description 10
- 238000004896 high resolution mass spectrometry Methods 0.000 description 10
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 10
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 10
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 125000005600 alkyl phosphonate group Chemical group 0.000 description 9
- 150000008051 alkyl sulfates Chemical class 0.000 description 9
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 description 9
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 9
- 150000003220 pyrenes Chemical class 0.000 description 9
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 9
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 9
- WVLBCYQITXONBZ-UHFFFAOYSA-N trimethyl phosphate Chemical compound COP(=O)(OC)OC WVLBCYQITXONBZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 8
- 229910004298 SiO 2 Inorganic materials 0.000 description 8
- 125000001797 benzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])* 0.000 description 8
- UORVGPXVDQYIDP-UHFFFAOYSA-N borane Chemical compound B UORVGPXVDQYIDP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 125000004181 carboxyalkyl group Chemical group 0.000 description 8
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 8
- 239000000460 chlorine Substances 0.000 description 8
- 238000001917 fluorescence detection Methods 0.000 description 8
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 description 8
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 description 8
- 235000021317 phosphate Nutrition 0.000 description 8
- 150000003456 sulfonamides Chemical class 0.000 description 8
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 8
- 150000003568 thioethers Chemical class 0.000 description 8
- OJQMNHVWZRYGFI-UHFFFAOYSA-N 8-amino-1-N,3-N,6-N-tris(2-hydroxyethyl)-1-N,3-N,6-N-trimethylpyrene-1,3,6-trisulfonamide Chemical compound NC=1C=C(C=2C=CC3=C(C=C(C=4C=CC=1C=2C=43)S(=O)(=O)N(C)CCO)S(=O)(=O)N(C)CCO)S(=O)(=O)N(C)CCO OJQMNHVWZRYGFI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 7
- FZEYVTFCMJSGMP-UHFFFAOYSA-N acridone Chemical compound C1=CC=C2C(=O)C3=CC=CC=C3NC2=C1 FZEYVTFCMJSGMP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 125000001769 aryl amino group Chemical group 0.000 description 7
- 238000001818 capillary gel electrophoresis Methods 0.000 description 7
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 7
- 229910052801 chlorine Inorganic materials 0.000 description 7
- 239000003480 eluent Substances 0.000 description 7
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 7
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 7
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 7
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 7
- 238000002953 preparative HPLC Methods 0.000 description 7
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 7
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- GDALETGZDYOOGB-UHFFFAOYSA-N Acridone Natural products C1=C(O)C=C2N(C)C3=CC=CC=C3C(=O)C2=C1O GDALETGZDYOOGB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 6
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 6
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 6
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 6
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 6
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 6
- 125000000542 sulfonic acid group Chemical group 0.000 description 6
- 125000000472 sulfonyl group Chemical group *S(*)(=O)=O 0.000 description 6
- QAEDZJGFFMLHHQ-UHFFFAOYSA-N trifluoroacetic anhydride Chemical compound FC(F)(F)C(=O)OC(=O)C(F)(F)F QAEDZJGFFMLHHQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 125000004169 (C1-C6) alkyl group Chemical group 0.000 description 5
- HBNXIBTUNZZSGL-UHFFFAOYSA-N 3-[8-amino-3,6-bis(3-sulfopropylsulfonyl)pyren-1-yl]sulfonylpropane-1-sulfonic acid Chemical compound S(=O)(=O)(O)CCCS(=O)(=O)C=1C=C(C2=CC=C3C(=CC(=C4C=CC=1C2=C43)S(=O)(=O)CCCS(=O)(=O)O)S(=O)(=O)CCCS(=O)(=O)O)N HBNXIBTUNZZSGL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 5
- 238000000862 absorption spectrum Methods 0.000 description 5
- 125000003282 alkyl amino group Chemical group 0.000 description 5
- 125000006615 aromatic heterocyclic group Chemical group 0.000 description 5
- 230000008033 biological extinction Effects 0.000 description 5
- 238000005251 capillar electrophoresis Methods 0.000 description 5
- 150000001732 carboxylic acid derivatives Chemical group 0.000 description 5
- IJKVHSBPTUYDLN-UHFFFAOYSA-N dihydroxy(oxo)silane Chemical compound O[Si](O)=O IJKVHSBPTUYDLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 5
- 230000005012 migration Effects 0.000 description 5
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 description 5
- MOOYVEVEDVVKGD-UHFFFAOYSA-N oxaldehydic acid;hydrate Chemical compound O.OC(=O)C=O MOOYVEVEDVVKGD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 5
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 5
- 238000006722 reduction reaction Methods 0.000 description 5
- 125000000999 tert-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 5
- ONBQEOIKXPHGMB-VBSBHUPXSA-N 1-[2-[(2s,3r,4s,5r)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]oxy-4,6-dihydroxyphenyl]-3-(4-hydroxyphenyl)propan-1-one Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=CC(O)=CC(O)=C1C(=O)CCC1=CC=C(O)C=C1 ONBQEOIKXPHGMB-VBSBHUPXSA-N 0.000 description 4
- WBMPYOXBHLVYMK-UHFFFAOYSA-N 1-amino-10h-acridin-9-one Chemical compound N1C2=CC=CC=C2C(=O)C2=C1C=CC=C2N WBMPYOXBHLVYMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- UVVJCLVKLJXKRN-UHFFFAOYSA-N 2,2,2-trifluoro-N-(3,6,8-tribromopyren-1-yl)acetamide Chemical compound FC(C(=O)NC1=CC(=C2C=CC3=C(C=C(C4=CC=C1C2=C34)Br)Br)Br)(F)F UVVJCLVKLJXKRN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- LCQJBJUNDQTNTB-UHFFFAOYSA-N 2,2,2-trifluoro-N-[3,6,8-tris(3-hydroxypropylsulfonyl)pyren-1-yl]acetamide Chemical compound FC(C(=O)NC1=CC(=C2C=CC3=C(C=C(C4=CC=C1C2=C34)S(=O)(=O)CCCO)S(=O)(=O)CCCO)S(=O)(=O)CCCO)(F)F LCQJBJUNDQTNTB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- IDPMQFBEJUQEGX-UHFFFAOYSA-N 2,2,2-trifluoro-n-pyren-1-ylacetamide Chemical compound C1=C2C(NC(=O)C(F)(F)F)=CC=C(C=C3)C2=C2C3=CC=CC2=C1 IDPMQFBEJUQEGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- NDJFJYDIKGUXRV-UHFFFAOYSA-N 2-anilino-4-nitrobenzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1NC1=CC=CC=C1 NDJFJYDIKGUXRV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000001494 2-propynyl group Chemical group [H]C#CC([H])([H])* 0.000 description 4
- UUTWIRZCMNOTRN-UHFFFAOYSA-N 3-[3,6-bis(3-sulfopropylsulfanyl)-8-[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]pyren-1-yl]sulfanylpropane-1-sulfonic acid Chemical compound C1(=C2C=CC3=C4C2=C(C(SCCCS(=O)(=O)O)=C1)C=CC4=C(NC(=O)C(F)(F)F)C=C3SCCCS(=O)(=O)O)SCCCS(=O)(=O)O UUTWIRZCMNOTRN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- SHLSSLVZXJBVHE-UHFFFAOYSA-N 3-sulfanylpropan-1-ol Chemical compound OCCCS SHLSSLVZXJBVHE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- SVWJADQCQOIJDM-UHFFFAOYSA-N 7-nitro-9-oxo-10h-acridine-2-sulfonic acid Chemical compound C1=C([N+]([O-])=O)C=C2C(=O)C3=CC(S(=O)(=O)O)=CC=C3NC2=C1 SVWJADQCQOIJDM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- PAYRUJLWNCNPSJ-UHFFFAOYSA-N Aniline Chemical compound NC1=CC=CC=C1 PAYRUJLWNCNPSJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N Hydrogen peroxide Chemical compound OO MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 4
- CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L Sodium Carbonate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]C([O-])=O CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 4
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 4
- 229910000085 borane Inorganic materials 0.000 description 4
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 description 4
- 229940126142 compound 16 Drugs 0.000 description 4
- 239000012043 crude product Substances 0.000 description 4
- ZBCBWPMODOFKDW-UHFFFAOYSA-N diethanolamine Chemical compound OCCNCCO ZBCBWPMODOFKDW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000001177 diphosphate Substances 0.000 description 4
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 4
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 4
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 4
- 125000001072 heteroaryl group Chemical group 0.000 description 4
- 239000005457 ice water Substances 0.000 description 4
- 150000007976 iminium ions Chemical class 0.000 description 4
- 239000000543 intermediate Substances 0.000 description 4
- GQWYWHOHRVVHAP-DHKPLNAMSA-N jaspamide Chemical compound C1([C@@H]2NC(=O)[C@@H](CC=3C4=CC=CC=C4NC=3Br)N(C)C(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](C)C/C(C)=C/[C@H](C)C[C@@H](OC(=O)C2)C)=CC=C(O)C=C1 GQWYWHOHRVVHAP-DHKPLNAMSA-N 0.000 description 4
- GQWYWHOHRVVHAP-UHFFFAOYSA-N jasplakinolide Natural products C1C(=O)OC(C)CC(C)C=C(C)CC(C)C(=O)NC(C)C(=O)N(C)C(CC=2C3=CC=CC=C3NC=2Br)C(=O)NC1C1=CC=C(O)C=C1 GQWYWHOHRVVHAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108010052440 jasplakinolide Proteins 0.000 description 4
- UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N monobenzene Natural products C1=CC=CC=C1 UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- LQNUZADURLCDLV-UHFFFAOYSA-N nitrobenzene Chemical compound [O-][N+](=O)C1=CC=CC=C1 LQNUZADURLCDLV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- ABLZXFCXXLZCGV-UHFFFAOYSA-N phosphonic acid group Chemical group P(O)(O)=O ABLZXFCXXLZCGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 4
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 4
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 4
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 4
- 230000003381 solubilizing effect Effects 0.000 description 4
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 4
- NVBFHJWHLNUMCV-UHFFFAOYSA-N sulfamide Chemical group NS(N)(=O)=O NVBFHJWHLNUMCV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000000565 sulfonamide group Chemical group 0.000 description 4
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 4
- 150000003573 thiols Chemical class 0.000 description 4
- CXNIUSPIQKWYAI-UHFFFAOYSA-N xantphos Chemical compound C=12OC3=C(P(C=4C=CC=CC=4)C=4C=CC=CC=4)C=CC=C3C(C)(C)C2=CC=CC=1P(C=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 CXNIUSPIQKWYAI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- GLGNXYJARSMNGJ-VKTIVEEGSA-N (1s,2s,3r,4r)-3-[[5-chloro-2-[(1-ethyl-6-methoxy-2-oxo-4,5-dihydro-3h-1-benzazepin-7-yl)amino]pyrimidin-4-yl]amino]bicyclo[2.2.1]hept-5-ene-2-carboxamide Chemical compound CCN1C(=O)CCCC2=C(OC)C(NC=3N=C(C(=CN=3)Cl)N[C@H]3[C@H]([C@@]4([H])C[C@@]3(C=C4)[H])C(N)=O)=CC=C21 GLGNXYJARSMNGJ-VKTIVEEGSA-N 0.000 description 3
- SZUVGFMDDVSKSI-WIFOCOSTSA-N (1s,2s,3s,5r)-1-(carboxymethyl)-3,5-bis[(4-phenoxyphenyl)methyl-propylcarbamoyl]cyclopentane-1,2-dicarboxylic acid Chemical compound O=C([C@@H]1[C@@H]([C@](CC(O)=O)([C@H](C(=O)N(CCC)CC=2C=CC(OC=3C=CC=CC=3)=CC=2)C1)C(O)=O)C(O)=O)N(CCC)CC(C=C1)=CC=C1OC1=CC=CC=C1 SZUVGFMDDVSKSI-WIFOCOSTSA-N 0.000 description 3
- KEQGZUUPPQEDPF-UHFFFAOYSA-N 1,3-dichloro-5,5-dimethylimidazolidine-2,4-dione Chemical compound CC1(C)N(Cl)C(=O)N(Cl)C1=O KEQGZUUPPQEDPF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 2-Aminoethan-1-ol Chemical group NCCO HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 125000003349 3-pyridyl group Chemical group N1=C([H])C([*])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 3
- CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N Carbon dioxide Chemical compound O=C=O CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- XDTMQSROBMDMFD-UHFFFAOYSA-N Cyclohexane Chemical compound C1CCCCC1 XDTMQSROBMDMFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N Fructose Chemical compound OC[C@H]1O[C@](O)(CO)[C@@H](O)[C@@H]1O RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N 0.000 description 3
- 229930186217 Glycolipid Natural products 0.000 description 3
- 229910004373 HOAc Inorganic materials 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- PBCJIPOGFJYBJE-UHFFFAOYSA-N acetonitrile;hydrate Chemical compound O.CC#N PBCJIPOGFJYBJE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229940045714 alkyl sulfonate alkylating agent Drugs 0.000 description 3
- 150000004982 aromatic amines Chemical class 0.000 description 3
- SQVRNKJHWKZAKO-UHFFFAOYSA-N beta-N-Acetyl-D-neuraminic acid Natural products CC(=O)NC1C(O)CC(O)(C(O)=O)OC1C(O)C(O)CO SQVRNKJHWKZAKO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 150000001721 carbon Chemical group 0.000 description 3
- 235000011089 carbon dioxide Nutrition 0.000 description 3
- 125000006297 carbonyl amino group Chemical group [H]N([*:2])C([*:1])=O 0.000 description 3
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 3
- 239000003638 chemical reducing agent Substances 0.000 description 3
- 125000001309 chloro group Chemical group Cl* 0.000 description 3
- XTHPWXDJESJLNJ-UHFFFAOYSA-N chlorosulfonic acid Substances OS(Cl)(=O)=O XTHPWXDJESJLNJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 3
- 229940126543 compound 14 Drugs 0.000 description 3
- 229940125758 compound 15 Drugs 0.000 description 3
- 125000004663 dialkyl amino group Chemical group 0.000 description 3
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 description 3
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 3
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 3
- 150000002367 halogens Chemical class 0.000 description 3
- 150000002429 hydrazines Chemical class 0.000 description 3
- 238000002013 hydrophilic interaction chromatography Methods 0.000 description 3
- 238000005286 illumination Methods 0.000 description 3
- 150000002466 imines Chemical class 0.000 description 3
- 125000000325 methylidene group Chemical group [H]C([H])=* 0.000 description 3
- 229910052763 palladium Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 description 3
- 125000001436 propyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 3
- 238000004366 reverse phase liquid chromatography Methods 0.000 description 3
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 3
- 125000006413 ring segment Chemical group 0.000 description 3
- SQVRNKJHWKZAKO-OQPLDHBCSA-N sialic acid Chemical compound CC(=O)N[C@@H]1[C@@H](O)C[C@@](O)(C(O)=O)OC1[C@H](O)[C@H](O)CO SQVRNKJHWKZAKO-OQPLDHBCSA-N 0.000 description 3
- AOSZTAHDEDLTLQ-AZKQZHLXSA-N (1S,2S,4R,8S,9S,11S,12R,13S,19S)-6-[(3-chlorophenyl)methyl]-12,19-difluoro-11-hydroxy-8-(2-hydroxyacetyl)-9,13-dimethyl-6-azapentacyclo[10.8.0.02,9.04,8.013,18]icosa-14,17-dien-16-one Chemical compound C([C@@H]1C[C@H]2[C@H]3[C@]([C@]4(C=CC(=O)C=C4[C@@H](F)C3)C)(F)[C@@H](O)C[C@@]2([C@@]1(C1)C(=O)CO)C)N1CC1=CC=CC(Cl)=C1 AOSZTAHDEDLTLQ-AZKQZHLXSA-N 0.000 description 2
- CLEFMNFFCLUQCZ-UHFFFAOYSA-N 1-N,3-N,6-N-tris(2-hydroxyethyl)-1-N,3-N,6-N-trimethyl-8-(methylamino)pyrene-1,3,6-trisulfonamide Chemical compound CNC=1C=C(C=2C=CC3=C(C=C(C=4C=CC=1C=2C=43)S(=O)(=O)N(C)CCO)S(=O)(=O)N(C)CCO)S(=O)(=O)N(C)CCO CLEFMNFFCLUQCZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KXLIIONJZBLQIJ-UHFFFAOYSA-N 2,2,2-trifluoro-N-[3,6,8-tris(3-hydroxypropylsulfanyl)pyren-1-yl]acetamide Chemical compound FC(C(=O)NC1=CC(=C2C=CC3=C(C=C(C4=CC=C1C2=C34)SCCCO)SCCCO)SCCCO)(F)F KXLIIONJZBLQIJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IMSODMZESSGVBE-UHFFFAOYSA-N 2-Oxazoline Chemical compound C1CN=CO1 IMSODMZESSGVBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- YIQNLCCTMNAQGE-UHFFFAOYSA-N 2-[[3,6,8-tris(3-hydroxypropylsulfonyl)pyren-1-yl]amino]acetic acid Chemical compound OCCCS(=O)(=O)C=1C=C(C2=CC=C3C(=CC(=C4C=CC=1C2=C43)S(=O)(=O)CCCO)S(=O)(=O)CCCO)NCC(=O)O YIQNLCCTMNAQGE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000000175 2-thienyl group Chemical group S1C([*])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 2
- QUEKGYQTRJVEQC-UHFFFAOYSA-N 2516-96-3 Chemical compound OC(=O)C1=CC([N+]([O-])=O)=CC=C1Cl QUEKGYQTRJVEQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OLEDFMOUJAWHOK-UHFFFAOYSA-N 3-[3,6-bis(3-sulfopropylsulfonyl)-8-[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]pyren-1-yl]sulfonylpropane-1-sulfonic acid Chemical compound C(CCS(=O)(=O)C1=C2C=CC3=C4C2=C(C(S(=O)(=O)CCCS(=O)(=O)O)=C1)C=CC4=C(C=C3S(=O)(=O)CCCS(=O)(=O)O)NC(=O)C(F)(F)F)S(=O)(=O)O OLEDFMOUJAWHOK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OAAFMYIUPWBQHS-UHFFFAOYSA-N 3-[8-(aminomethyl)-3,6-bis(3-hydroxypropylsulfonyl)pyren-1-yl]sulfonylpropan-1-ol Chemical compound OCCCS(=O)(=O)C=1C=C(C2=CC=C3C(=CC(=C4C=CC=1C2=C43)S(=O)(=O)CCCO)S(=O)(=O)CCCO)CN OAAFMYIUPWBQHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000001541 3-thienyl group Chemical group S1C([H])=C([*])C([H])=C1[H] 0.000 description 2
- 125000001963 4 membered heterocyclic group Chemical group 0.000 description 2
- WCDLCPLAAKUJNY-UHFFFAOYSA-N 4-[4-[3-(1h-pyrazol-4-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-6-yl]phenyl]morpholine Chemical compound C1COCCN1C1=CC=C(C2=CN3N=CC(=C3N=C2)C2=CNN=C2)C=C1 WCDLCPLAAKUJNY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000002373 5 membered heterocyclic group Chemical group 0.000 description 2
- 125000004070 6 membered heterocyclic group Chemical group 0.000 description 2
- 125000003341 7 membered heterocyclic group Chemical group 0.000 description 2
- WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N Bromine atom Chemical compound [Br] WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000006539 C12 alkyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940126657 Compound 17 Drugs 0.000 description 2
- SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N D-mannomethylose Natural products CC1OC(O)C(O)C(O)C1O SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 description 2
- OKKJLVBELUTLKV-MZCSYVLQSA-N Deuterated methanol Chemical compound [2H]OC([2H])([2H])[2H] OKKJLVBELUTLKV-MZCSYVLQSA-N 0.000 description 2
- JOYRKODLDBILNP-UHFFFAOYSA-N Ethyl urethane Chemical compound CCOC(N)=O JOYRKODLDBILNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N Fucose Natural products C[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N 0.000 description 2
- 229920001503 Glucan Polymers 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- 241000257303 Hymenoptera Species 0.000 description 2
- SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N L-fucopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N 0.000 description 2
- PEEHTFAAVSWFBL-UHFFFAOYSA-N Maleimide Chemical compound O=C1NC(=O)C=C1 PEEHTFAAVSWFBL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N Malonic acid Chemical compound OC(=O)CC(O)=O OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XOGTZOOQQBDUSI-UHFFFAOYSA-M Mesna Chemical compound [Na+].[O-]S(=O)(=O)CCS XOGTZOOQQBDUSI-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- BAQMYDQNMFBZNA-UHFFFAOYSA-N N-biotinyl-L-lysine Natural products N1C(=O)NC2C(CCCCC(=O)NCCCCC(N)C(O)=O)SCC21 BAQMYDQNMFBZNA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OPKOKAMJFNKNAS-UHFFFAOYSA-N N-methylethanolamine Chemical compound CNCCO OPKOKAMJFNKNAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OFBQJSOFQDEBGM-UHFFFAOYSA-N Pentane Chemical compound CCCCC OFBQJSOFQDEBGM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L Sodium Sulfate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]S([O-])(=O)=O PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-MICDWDOJSA-N Trichloro(2H)methane Chemical compound [2H]C(Cl)(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-MICDWDOJSA-N 0.000 description 2
- XSTXAVWGXDQKEL-UHFFFAOYSA-N Trichloroethylene Chemical compound ClC=C(Cl)Cl XSTXAVWGXDQKEL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NPUXORBZRBIOMQ-RUZDIDTESA-N [(2R)-1-[[4-[[3-(benzenesulfonylmethyl)-5-methylphenoxy]methyl]phenyl]methyl]-2-pyrrolidinyl]methanol Chemical compound C=1C(OCC=2C=CC(CN3[C@H](CCC3)CO)=CC=2)=CC(C)=CC=1CS(=O)(=O)C1=CC=CC=C1 NPUXORBZRBIOMQ-RUZDIDTESA-N 0.000 description 2
- 229910052783 alkali metal Inorganic materials 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N alpha-D-galactose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N 0.000 description 2
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 2
- 239000012736 aqueous medium Substances 0.000 description 2
- 239000012300 argon atmosphere Substances 0.000 description 2
- 150000001499 aryl bromides Chemical class 0.000 description 2
- 239000012298 atmosphere Substances 0.000 description 2
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002585 base Substances 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 2
- 230000001588 bifunctional effect Effects 0.000 description 2
- BAQMYDQNMFBZNA-MNXVOIDGSA-N biocytin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)NCCCC[C@H](N)C(O)=O)SC[C@@H]21 BAQMYDQNMFBZNA-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 2
- GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N bromine Substances BrBr GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000000484 butyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- 238000005515 capillary zone electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 150000004657 carbamic acid derivatives Chemical class 0.000 description 2
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-N carbonic acid Chemical compound OC(O)=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VYXSBFYARXAAKO-WTKGSRSZSA-N chembl402140 Chemical compound Cl.C1=2C=C(C)C(NCC)=CC=2OC2=C\C(=N/CC)C(C)=CC2=C1C1=CC=CC=C1C(=O)OCC VYXSBFYARXAAKO-WTKGSRSZSA-N 0.000 description 2
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 2
- 229940125810 compound 20 Drugs 0.000 description 2
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 2
- 239000010949 copper Substances 0.000 description 2
- ZYGHJZDHTFUPRJ-UHFFFAOYSA-N coumarin Chemical compound C1=CC=C2OC(=O)C=CC2=C1 ZYGHJZDHTFUPRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 2
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 2
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 2
- 238000006880 cross-coupling reaction Methods 0.000 description 2
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 description 2
- 239000003792 electrolyte Substances 0.000 description 2
- 125000006575 electron-withdrawing group Chemical group 0.000 description 2
- 238000007336 electrophilic substitution reaction Methods 0.000 description 2
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 2
- 238000001704 evaporation Methods 0.000 description 2
- 230000008020 evaporation Effects 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 238000002189 fluorescence spectrum Methods 0.000 description 2
- 238000001215 fluorescent labelling Methods 0.000 description 2
- 239000006260 foam Substances 0.000 description 2
- 235000021255 galacto-oligosaccharides Nutrition 0.000 description 2
- 150000003271 galactooligosaccharides Chemical class 0.000 description 2
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 2
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 2
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 2
- JAXFJECJQZDFJS-XHEPKHHKSA-N gtpl8555 Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)N[C@H](B1O[C@@]2(C)[C@H]3C[C@H](C3(C)C)C[C@H]2O1)CCC1=CC=C(F)C=C1 JAXFJECJQZDFJS-XHEPKHHKSA-N 0.000 description 2
- 230000002427 irreversible effect Effects 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- 125000001449 isopropyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- 238000001499 laser induced fluorescence spectroscopy Methods 0.000 description 2
- 238000004020 luminiscence type Methods 0.000 description 2
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 2
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 description 2
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 2
- 125000004433 nitrogen atom Chemical group N* 0.000 description 2
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 2
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 2
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 2
- 150000004714 phosphonium salts Chemical class 0.000 description 2
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 2
- 150000003141 primary amines Chemical class 0.000 description 2
- 125000004076 pyridyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000000246 pyrimidin-2-yl group Chemical group [H]C1=NC(*)=NC([H])=C1[H] 0.000 description 2
- 125000004527 pyrimidin-4-yl group Chemical group N1=CN=C(C=C1)* 0.000 description 2
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 2
- 238000010992 reflux Methods 0.000 description 2
- PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N rhodamine B Chemical class [Cl-].C=12C=CC(=[N+](CC)CC)C=C2OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000001022 rhodamine dye Substances 0.000 description 2
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 2
- 150000003335 secondary amines Chemical class 0.000 description 2
- 235000012239 silicon dioxide Nutrition 0.000 description 2
- 238000001542 size-exclusion chromatography Methods 0.000 description 2
- 229910000029 sodium carbonate Inorganic materials 0.000 description 2
- BEOOHQFXGBMRKU-UHFFFAOYSA-N sodium cyanoborohydride Chemical compound [Na+].[B-]C#N BEOOHQFXGBMRKU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FRTIVUOKBXDGPD-UHFFFAOYSA-M sodium;3-sulfanylpropane-1-sulfonate Chemical compound [Na+].[O-]S(=O)(=O)CCCS FRTIVUOKBXDGPD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 125000000547 substituted alkyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000001273 sulfonato group Chemical group [O-]S(*)(=O)=O 0.000 description 2
- YBBRCQOCSYXUOC-UHFFFAOYSA-N sulfuryl dichloride Chemical compound ClS(Cl)(=O)=O YBBRCQOCSYXUOC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 2
- 239000001226 triphosphate Substances 0.000 description 2
- XSTNYACEWLNWPY-UHFFFAOYSA-K trisodium;8-aminopyrene-1,3,6-trisulfonate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].C1=C2C(N)=CC(S([O-])(=O)=O)=C(C=C3)C2=C2C3=C(S([O-])(=O)=O)C=C(S([O-])(=O)=O)C2=C1 XSTNYACEWLNWPY-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 238000001195 ultra high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- 238000010626 work up procedure Methods 0.000 description 2
- DAAXYQZSKBPJOX-FQEVSTJZSA-N (2S)-2-amino-3-[4-[5-[3-(4-hydroxyphenyl)-4-methoxyphenyl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]phenyl]propanoic acid Chemical compound COC1=C(C=C(C=C1)C2=NC(=NO2)C3=CC=C(C=C3)C[C@@H](C(=O)O)N)C4=CC=C(C=C4)O DAAXYQZSKBPJOX-FQEVSTJZSA-N 0.000 description 1
- CDVZCUKHEYPEQS-FOASUZNUSA-N (2s,3r,4r)-2,3,4,5-tetrahydroxypentanal;(2r,3s,4r)-2,3,4,5-tetrahydroxypentanal Chemical compound OC[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C=O.OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C=O CDVZCUKHEYPEQS-FOASUZNUSA-N 0.000 description 1
- QFLWZFQWSBQYPS-AWRAUJHKSA-N (3S)-3-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[5-[(3aS,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]-3-methylbutanoyl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]-4-[1-bis(4-chlorophenoxy)phosphorylbutylamino]-4-oxobutanoic acid Chemical compound CCCC(NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CCCCC1SC[C@@H]2NC(=O)N[C@H]12)C(C)C)P(=O)(Oc1ccc(Cl)cc1)Oc1ccc(Cl)cc1 QFLWZFQWSBQYPS-AWRAUJHKSA-N 0.000 description 1
- IWZSHWBGHQBIML-ZGGLMWTQSA-N (3S,8S,10R,13S,14S,17S)-17-isoquinolin-7-yl-N,N,10,13-tetramethyl-2,3,4,7,8,9,11,12,14,15,16,17-dodecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-3-amine Chemical compound CN(C)[C@H]1CC[C@]2(C)C3CC[C@@]4(C)[C@@H](CC[C@@H]4c4ccc5ccncc5c4)[C@@H]3CC=C2C1 IWZSHWBGHQBIML-ZGGLMWTQSA-N 0.000 description 1
- ZYECOAILUNWEAL-NUDFZHEQSA-N (4z)-4-[[2-methoxy-5-(phenylcarbamoyl)phenyl]hydrazinylidene]-n-(3-nitrophenyl)-3-oxonaphthalene-2-carboxamide Chemical compound COC1=CC=C(C(=O)NC=2C=CC=CC=2)C=C1N\N=C(C1=CC=CC=C1C=1)/C(=O)C=1C(=O)NC1=CC=CC([N+]([O-])=O)=C1 ZYECOAILUNWEAL-NUDFZHEQSA-N 0.000 description 1
- YBMDPYAEZDJWNY-UHFFFAOYSA-N 1,2,3,3,4,4,5,5-octafluorocyclopentene Chemical compound FC1=C(F)C(F)(F)C(F)(F)C1(F)F YBMDPYAEZDJWNY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003363 1,3,5-triazinyl group Chemical class N1=C(N=CN=C1)* 0.000 description 1
- FSSPGSAQUIYDCN-UHFFFAOYSA-N 1,3-Propane sultone Chemical compound O=S1(=O)CCCO1 FSSPGSAQUIYDCN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WGLIJWFRDRLVPN-UHFFFAOYSA-N 10-methyl-2-nitroacridin-9-one Chemical compound [O-][N+](=O)C1=CC=C2N(C)C3=CC=CC=C3C(=O)C2=C1 WGLIJWFRDRLVPN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YPDNTRFJWMVKHJ-UHFFFAOYSA-N 10-methyl-7-nitro-9-oxoacridine-2-sulfonic acid Chemical compound CN1C=2C=CC(=CC=2C(C2=CC(=CC=C12)S(=O)(=O)O)=O)[N+](=O)[O-] YPDNTRFJWMVKHJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GHARBIDZJIDTIL-UHFFFAOYSA-N 2,2,2-trifluoro-N-[3,6,8-tris[2-hydroxyethyl(methyl)sulfamoyl]pyren-1-yl]acetamide Chemical compound FC(C(=O)NC=1C=C(C=2C=CC3=C(C=C(C=4C=CC=1C=2C=43)S(=O)(=O)N(C)CCO)S(=O)(=O)N(C)CCO)S(=O)(=O)N(C)CCO)(F)F GHARBIDZJIDTIL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003923 2,5-pyrrolediones Chemical class 0.000 description 1
- ZYHQGITXIJDDKC-UHFFFAOYSA-N 2-[2-(2-aminophenyl)ethyl]aniline Chemical compound NC1=CC=CC=C1CCC1=CC=CC=C1N ZYHQGITXIJDDKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000954 2-hydroxyethyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])O[H] 0.000 description 1
- AUAGZKACVJYGHU-UHFFFAOYSA-N 3,6,8-trisulfonylpyren-1-amine Chemical compound O=S(=O)=C1CC(=S(=O)=O)C2=CC=C3C(N)=CC(=S(=O)=O)C4=CC=C1C2=C43 AUAGZKACVJYGHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LJGHYPLBDBRCRZ-UHFFFAOYSA-N 3-(3-aminophenyl)sulfonylaniline Chemical compound NC1=CC=CC(S(=O)(=O)C=2C=C(N)C=CC=2)=C1 LJGHYPLBDBRCRZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HNFMVVHMKGFCMB-UHFFFAOYSA-N 3-[3-[4-(1-aminocyclobutyl)phenyl]-5-phenylimidazo[4,5-b]pyridin-2-yl]pyridin-2-amine Chemical compound NC1=NC=CC=C1C1=NC2=CC=C(C=3C=CC=CC=3)N=C2N1C1=CC=C(C2(N)CCC2)C=C1 HNFMVVHMKGFCMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GZAJOEGTZDUSKS-UHFFFAOYSA-N 5-aminofluorescein Chemical compound C12=CC=C(O)C=C2OC2=CC(O)=CC=C2C21OC(=O)C1=CC(N)=CC=C21 GZAJOEGTZDUSKS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QWMFKVNJIYNWII-UHFFFAOYSA-N 5-bromo-2-(2,5-dimethylpyrrol-1-yl)pyridine Chemical compound CC1=CC=C(C)N1C1=CC=C(Br)C=N1 QWMFKVNJIYNWII-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FZWIIGKQNLYDQI-UHFFFAOYSA-N 8-aminopyrene-1,3,6-trisulfonic acid Chemical compound C1=C2C(N)=CC(S(O)(=O)=O)=C(C=C3)C2=C2C3=C(S(O)(=O)=O)C=C(S(O)(=O)=O)C2=C1 FZWIIGKQNLYDQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920000945 Amylopectin Polymers 0.000 description 1
- 229920000856 Amylose Polymers 0.000 description 1
- JRQXXYMQPNKKHN-UHFFFAOYSA-N BCC1=NC=CC=C1 Chemical compound BCC1=NC=CC=C1 JRQXXYMQPNKKHN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LSNNMFCWUKXFEE-UHFFFAOYSA-M Bisulfite Chemical compound OS([O-])=O LSNNMFCWUKXFEE-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000005738 Borch reduction reaction Methods 0.000 description 1
- KXDHJXZQYSOELW-UHFFFAOYSA-M Carbamate Chemical compound NC([O-])=O KXDHJXZQYSOELW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229920002101 Chitin Polymers 0.000 description 1
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M Chloride anion Chemical compound [Cl-] VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000689227 Cora <basidiomycete fungus> Species 0.000 description 1
- 229920000742 Cotton Polymers 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-CUHNMECISA-N D-Cellobiose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-CUHNMECISA-N 0.000 description 1
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical group OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930091371 Fructose Natural products 0.000 description 1
- 239000005715 Fructose Substances 0.000 description 1
- IAJILQKETJEXLJ-UHFFFAOYSA-N Galacturonsaeure Natural products O=CC(O)C(O)C(O)C(O)C(O)=O IAJILQKETJEXLJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920002527 Glycogen Polymers 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 229920002683 Glycosaminoglycan Polymers 0.000 description 1
- 101000801643 Homo sapiens Retinal-specific phospholipid-transporting ATPase ABCA4 Proteins 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 description 1
- 101000860173 Myxococcus xanthus C-factor Proteins 0.000 description 1
- OVRNDRQMDRJTHS-CBQIKETKSA-N N-Acetyl-D-Galactosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@@H](O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-CBQIKETKSA-N 0.000 description 1
- BNSTVBLCTRZUDD-KEWYIRBNSA-N N-[(3R,4S,5S,6R)-2,3,4,5-tetrahydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]acetamide Chemical compound CC(=O)NC1(O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BNSTVBLCTRZUDD-KEWYIRBNSA-N 0.000 description 1
- OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N N-acelyl-D-glucosamine Natural products CC(=O)NC1C(O)OC(CO)C(O)C1O OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N N-acetyl-D-galactosamine Natural products CC(=O)NC(C=O)C(O)C(O)C(O)CO MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OVRNDRQMDRJTHS-FMDGEEDCSA-N N-acetyl-beta-D-glucosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-FMDGEEDCSA-N 0.000 description 1
- MBLBDJOUHNCFQT-LXGUWJNJSA-N N-acetylglucosamine Natural products CC(=O)N[C@@H](C=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO MBLBDJOUHNCFQT-LXGUWJNJSA-N 0.000 description 1
- 108010026552 Proteome Proteins 0.000 description 1
- 102100033617 Retinal-specific phospholipid-transporting ATPase ABCA4 Human genes 0.000 description 1
- 229910006069 SO3H Inorganic materials 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- LNUFLCYMSVYYNW-ZPJMAFJPSA-N [(2r,3r,4s,5r,6r)-2-[(2r,3r,4s,5r,6r)-6-[(2r,3r,4s,5r,6r)-6-[(2r,3r,4s,5r,6r)-6-[[(3s,5s,8r,9s,10s,13r,14s,17r)-10,13-dimethyl-17-[(2r)-6-methylheptan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1h-cyclopenta[a]phenanthren-3-yl]oxy]-4,5-disulfo Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](COS(O)(=O)=O)O[C@@H]([C@@H]([C@H]1OS(O)(=O)=O)OS(O)(=O)=O)O[C@@H]1[C@@H](COS(O)(=O)=O)O[C@@H]([C@@H]([C@H]1OS(O)(=O)=O)OS(O)(=O)=O)O[C@@H]1[C@@H](COS(O)(=O)=O)O[C@H]([C@@H]([C@H]1OS(O)(=O)=O)OS(O)(=O)=O)O[C@@H]1C[C@@H]2CC[C@H]3[C@@H]4CC[C@@H]([C@]4(CC[C@@H]3[C@@]2(C)CC1)C)[C@H](C)CCCC(C)C)[C@H]1O[C@H](COS(O)(=O)=O)[C@@H](OS(O)(=O)=O)[C@H](OS(O)(=O)=O)[C@H]1OS(O)(=O)=O LNUFLCYMSVYYNW-ZPJMAFJPSA-N 0.000 description 1
- 238000004847 absorption spectroscopy Methods 0.000 description 1
- GPWHDDKQSYOYBF-UHFFFAOYSA-N ac1l2u0q Chemical class Br[Br-]Br GPWHDDKQSYOYBF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DHKHKXVYLBGOIT-UHFFFAOYSA-N acetaldehyde Diethyl Acetal Natural products CCOC(C)OCC DHKHKXVYLBGOIT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001241 acetals Chemical class 0.000 description 1
- 125000002777 acetyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 1
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 description 1
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 1
- IAJILQKETJEXLJ-QTBDOELSSA-N aldehydo-D-glucuronic acid Chemical compound O=C[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)C(O)=O IAJILQKETJEXLJ-QTBDOELSSA-N 0.000 description 1
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000033 alkoxyamino group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001350 alkyl halides Chemical class 0.000 description 1
- 239000002168 alkylating agent Substances 0.000 description 1
- 229940100198 alkylating agent Drugs 0.000 description 1
- 230000029936 alkylation Effects 0.000 description 1
- 238000005804 alkylation reaction Methods 0.000 description 1
- 125000003368 amide group Chemical group 0.000 description 1
- 239000012062 aqueous buffer Substances 0.000 description 1
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 1
- 125000000637 arginyl group Chemical group N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)* 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- 125000003354 benzotriazolyl group Chemical group N1N=NC2=C1C=CC=C2* 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N beta-maltose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N 0.000 description 1
- 150000001615 biotins Chemical class 0.000 description 1
- 239000012267 brine Substances 0.000 description 1
- 230000031709 bromination Effects 0.000 description 1
- 238000005893 bromination reaction Methods 0.000 description 1
- 125000001246 bromo group Chemical group Br* 0.000 description 1
- 239000008366 buffered solution Substances 0.000 description 1
- 238000000738 capillary electrophoresis-mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 238000004325 capillary sieving electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 125000002057 carboxymethyl group Chemical group [H]OC(=O)C([H])([H])[*] 0.000 description 1
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 1
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- PBAYDYUZOSNJGU-UHFFFAOYSA-N chelidonic acid Natural products OC(=O)C1=CC(=O)C=C(C(O)=O)O1 PBAYDYUZOSNJGU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000013375 chromatographic separation Methods 0.000 description 1
- 238000011097 chromatography purification Methods 0.000 description 1
- 230000035071 co-translational protein modification Effects 0.000 description 1
- 229910052681 coesite Inorganic materials 0.000 description 1
- 229940125773 compound 10 Drugs 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 150000001879 copper Chemical class 0.000 description 1
- 235000001671 coumarin Nutrition 0.000 description 1
- 229960000956 coumarin Drugs 0.000 description 1
- 229910052906 cristobalite Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000003431 cross linking reagent Substances 0.000 description 1
- UKJLNMAFNRKWGR-UHFFFAOYSA-N cyclohexatrienamine Chemical group NC1=CC=C=C[CH]1 UKJLNMAFNRKWGR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000011157 data evaluation Methods 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000001212 derivatisation Methods 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- YDVNLQGCLLPHAH-UHFFFAOYSA-N dichloromethane;hydrate Chemical compound O.ClCCl YDVNLQGCLLPHAH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000007865 diluting Methods 0.000 description 1
- 150000002016 disaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 230000005684 electric field Effects 0.000 description 1
- 239000012039 electrophile Substances 0.000 description 1
- 238000007345 electrophilic aromatic substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 238000001425 electrospray ionisation time-of-flight mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 1
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 1
- 238000000295 emission spectrum Methods 0.000 description 1
- 238000006911 enzymatic reaction Methods 0.000 description 1
- CCGKOQOJPYTBIH-UHFFFAOYSA-N ethenone Chemical compound C=C=O CCGKOQOJPYTBIH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001301 ethoxy group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])O* 0.000 description 1
- 125000004494 ethyl ester group Chemical group 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 1
- 238000003818 flash chromatography Methods 0.000 description 1
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001153 fluoro group Chemical group F* 0.000 description 1
- 125000002485 formyl group Chemical group [H]C(*)=O 0.000 description 1
- 125000002541 furyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229940097043 glucuronic acid Drugs 0.000 description 1
- 230000037362 glycan biosynthesis Effects 0.000 description 1
- 229940096919 glycogen Drugs 0.000 description 1
- 108091005608 glycosylated proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000035122 glycosylated proteins Human genes 0.000 description 1
- 230000026030 halogenation Effects 0.000 description 1
- 238000005658 halogenation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 238000005570 heteronuclear single quantum coherence Methods 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940042795 hydrazides for tuberculosis treatment Drugs 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-M hydroxide Chemical compound [OH-] XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 125000002883 imidazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 238000004190 ion pair chromatography Methods 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 125000000959 isobutyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000002183 isoquinolinyl group Chemical group C1(=NC=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000000842 isoxazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- ZLVXBBHTMQJRSX-VMGNSXQWSA-N jdtic Chemical compound C1([C@]2(C)CCN(C[C@@H]2C)C[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H]2NCC3=CC(O)=CC=C3C2)=CC=CC(O)=C1 ZLVXBBHTMQJRSX-VMGNSXQWSA-N 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 238000004895 liquid chromatography mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 238000012594 liquid chromatography nuclear magnetic resonance Methods 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 1
- 125000000250 methylamino group Chemical group [H]N(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 235000013336 milk Nutrition 0.000 description 1
- 239000008267 milk Substances 0.000 description 1
- 210000004080 milk Anatomy 0.000 description 1
- 239000002480 mineral oil Substances 0.000 description 1
- 235000010446 mineral oil Nutrition 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 229950006780 n-acetylglucosamine Drugs 0.000 description 1
- FEMOMIGRRWSMCU-UHFFFAOYSA-N ninhydrin Chemical compound C1=CC=C2C(=O)C(O)(O)C(=O)C2=C1 FEMOMIGRRWSMCU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000655 nuclear magnetic resonance spectrum Methods 0.000 description 1
- 238000005935 nucleophilic addition reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 239000012044 organic layer Substances 0.000 description 1
- 239000011368 organic material Substances 0.000 description 1
- 125000001715 oxadiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- MHYFEEDKONKGEB-UHFFFAOYSA-N oxathiane 2,2-dioxide Chemical compound O=S1(=O)CCCCO1 MHYFEEDKONKGEB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002971 oxazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005704 oxymethylene group Chemical group [H]C([H])([*:2])O[*:1] 0.000 description 1
- 238000010651 palladium-catalyzed cross coupling reaction Methods 0.000 description 1
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 1
- 238000012746 preparative thin layer chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000000425 proton nuclear magnetic resonance spectrum Methods 0.000 description 1
- 125000003373 pyrazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004528 pyrimidin-5-yl group Chemical group N1=CN=CC(=C1)* 0.000 description 1
- 125000000714 pyrimidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000168 pyrrolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000010453 quartz Substances 0.000 description 1
- 238000010791 quenching Methods 0.000 description 1
- 230000000171 quenching effect Effects 0.000 description 1
- 125000002943 quinolinyl group Chemical group N1=C(C=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 238000005932 reductive alkylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003252 repetitive effect Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 238000007127 saponification reaction Methods 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 125000003156 secondary amide group Chemical group 0.000 description 1
- 238000011896 sensitive detection Methods 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 238000007873 sieving Methods 0.000 description 1
- 239000000377 silicon dioxide Substances 0.000 description 1
- 235000021309 simple sugar Nutrition 0.000 description 1
- 229910052938 sodium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011152 sodium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- XMVONEAAOPAGAO-UHFFFAOYSA-N sodium tungstate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-][W]([O-])(=O)=O XMVONEAAOPAGAO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RPACBEVZENYWOL-XFULWGLBSA-M sodium;(2r)-2-[6-(4-chlorophenoxy)hexyl]oxirane-2-carboxylate Chemical compound [Na+].C=1C=C(Cl)C=CC=1OCCCCCC[C@]1(C(=O)[O-])CO1 RPACBEVZENYWOL-XFULWGLBSA-M 0.000 description 1
- HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M sodium;chloride;hydrate Chemical compound O.[Na+].[Cl-] HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 1
- 238000004611 spectroscopical analysis Methods 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 229910052682 stishovite Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- FDDDEECHVMSUSB-UHFFFAOYSA-N sulfanilamide Chemical compound NC1=CC=C(S(N)(=O)=O)C=C1 FDDDEECHVMSUSB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N sulfuric acid Substances OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010189 synthetic method Methods 0.000 description 1
- FRACPXUHUTXLCX-BELIEFIBSA-N tert-butyl N-{1-[(1S)-1-{[(1R,2S)-1-(benzylcarbamoyl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]carbamoyl}-2-cyclopropylethyl]-2-oxopyridin-3-yl}carbamate Chemical compound CC(C)(C)OC(=O)NC1=CC=CN(C1=O)[C@@H](CC2CC2)C(=O)N[C@@H](C[C@@H]3CCNC3=O)[C@H](C(=O)NCC4=CC=CC=C4)O FRACPXUHUTXLCX-BELIEFIBSA-N 0.000 description 1
- 150000003512 tertiary amines Chemical class 0.000 description 1
- CZDYPVPMEAXLPK-UHFFFAOYSA-N tetramethylsilane Chemical compound C[Si](C)(C)C CZDYPVPMEAXLPK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001113 thiadiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000335 thiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001544 thienyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000101 thioether group Chemical group 0.000 description 1
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 1
- 125000005208 trialkylammonium group Chemical group 0.000 description 1
- 229910052905 tridymite Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000004044 trifluoroacetyl group Chemical group FC(C(=O)*)(F)F 0.000 description 1
- 238000005583 trifluoroacetylation reaction Methods 0.000 description 1
- HRXKRNGNAMMEHJ-UHFFFAOYSA-K trisodium citrate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O HRXKRNGNAMMEHJ-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
- C07C311/00—Amides of sulfonic acids, i.e. compounds having singly-bound oxygen atoms of sulfo groups replaced by nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups
- C07C311/30—Sulfonamides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by singly-bound nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups
- C07C311/37—Sulfonamides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by singly-bound nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups having the sulfur atom of at least one of the sulfonamide groups bound to a carbon atom of a six-membered aromatic ring
- C07C311/38—Sulfonamides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by singly-bound nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups having the sulfur atom of at least one of the sulfonamide groups bound to a carbon atom of a six-membered aromatic ring having sulfur atoms of sulfonamide groups and amino groups bound to carbon atoms of six-membered rings of the same carbon skeleton
- C07C311/39—Sulfonamides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by singly-bound nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups having the sulfur atom of at least one of the sulfonamide groups bound to a carbon atom of a six-membered aromatic ring having sulfur atoms of sulfonamide groups and amino groups bound to carbon atoms of six-membered rings of the same carbon skeleton having the nitrogen atom of at least one of the sulfonamide groups bound to hydrogen atoms or to an acyclic carbon atom
- C07C311/40—Sulfonamides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by singly-bound nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups having the sulfur atom of at least one of the sulfonamide groups bound to a carbon atom of a six-membered aromatic ring having sulfur atoms of sulfonamide groups and amino groups bound to carbon atoms of six-membered rings of the same carbon skeleton having the nitrogen atom of at least one of the sulfonamide groups bound to hydrogen atoms or to an acyclic carbon atom to an acyclic carbon atom of a hydrocarbon radical substituted by singly-bound oxygen atoms
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/58—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances
- G01N33/582—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances with fluorescent label
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
- C07C317/00—Sulfones; Sulfoxides
- C07C317/26—Sulfones; Sulfoxides having sulfone or sulfoxide groups and nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups, bound to the same carbon skeleton
- C07C317/32—Sulfones; Sulfoxides having sulfone or sulfoxide groups and nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups, bound to the same carbon skeleton with sulfone or sulfoxide groups bound to carbon atoms of six-membered aromatic rings of the carbon skeleton
- C07C317/34—Sulfones; Sulfoxides having sulfone or sulfoxide groups and nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups, bound to the same carbon skeleton with sulfone or sulfoxide groups bound to carbon atoms of six-membered aromatic rings of the carbon skeleton having sulfone or sulfoxide groups and amino groups bound to carbon atoms of six-membered aromatic rings being part of the same non-condensed ring or of a condensed ring system containing that ring
- C07C317/36—Sulfones; Sulfoxides having sulfone or sulfoxide groups and nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups, bound to the same carbon skeleton with sulfone or sulfoxide groups bound to carbon atoms of six-membered aromatic rings of the carbon skeleton having sulfone or sulfoxide groups and amino groups bound to carbon atoms of six-membered aromatic rings being part of the same non-condensed ring or of a condensed ring system containing that ring with the nitrogen atoms of the amino groups bound to hydrogen atoms or to carbon atoms
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
- C07C317/00—Sulfones; Sulfoxides
- C07C317/26—Sulfones; Sulfoxides having sulfone or sulfoxide groups and nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups, bound to the same carbon skeleton
- C07C317/32—Sulfones; Sulfoxides having sulfone or sulfoxide groups and nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups, bound to the same carbon skeleton with sulfone or sulfoxide groups bound to carbon atoms of six-membered aromatic rings of the carbon skeleton
- C07C317/34—Sulfones; Sulfoxides having sulfone or sulfoxide groups and nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups, bound to the same carbon skeleton with sulfone or sulfoxide groups bound to carbon atoms of six-membered aromatic rings of the carbon skeleton having sulfone or sulfoxide groups and amino groups bound to carbon atoms of six-membered aromatic rings being part of the same non-condensed ring or of a condensed ring system containing that ring
- C07C317/38—Sulfones; Sulfoxides having sulfone or sulfoxide groups and nitrogen atoms, not being part of nitro or nitroso groups, bound to the same carbon skeleton with sulfone or sulfoxide groups bound to carbon atoms of six-membered aromatic rings of the carbon skeleton having sulfone or sulfoxide groups and amino groups bound to carbon atoms of six-membered aromatic rings being part of the same non-condensed ring or of a condensed ring system containing that ring with the nitrogen atom of at least one amino group being part of any of the groups, X being a hetero atom, Y being any atom, e.g. N-acylaminosulfones
- C07C317/40—Y being a hydrogen or a carbon atom
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D219/00—Heterocyclic compounds containing acridine or hydrogenated acridine ring systems
- C07D219/04—Heterocyclic compounds containing acridine or hydrogenated acridine ring systems with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to carbon atoms of the ring system
- C07D219/08—Nitrogen atoms
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
- C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic Table
- C07F9/02—Phosphorus compounds
- C07F9/28—Phosphorus compounds with one or more P—C bonds
- C07F9/38—Phosphonic acids [RP(=O)(OH)2]; Thiophosphonic acids ; [RP(=X1)(X2H)2(X1, X2 are each independently O, S or Se)]
- C07F9/3804—Phosphonic acids [RP(=O)(OH)2]; Thiophosphonic acids ; [RP(=X1)(X2H)2(X1, X2 are each independently O, S or Se)] not used, see subgroups
- C07F9/3808—Acyclic saturated acids which can have further substituents on alkyl
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
- C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic Table
- C07F9/02—Phosphorus compounds
- C07F9/547—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom
- C07F9/553—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom having one nitrogen atom as the only ring hetero atom
- C07F9/576—Six-membered rings
- C07F9/64—Acridine or hydrogenated acridine ring systems
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
- C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic Table
- C07F9/02—Phosphorus compounds
- C07F9/547—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom
- C07F9/6561—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom containing systems of two or more relevant hetero rings condensed among themselves or condensed with a common carbocyclic ring or ring system, with or without other non-condensed hetero rings
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H1/00—Processes for the preparation of sugar derivatives
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H15/00—Compounds containing hydrocarbon or substituted hydrocarbon radicals directly attached to hetero atoms of saccharide radicals
- C07H15/18—Acyclic radicals, substituted by carbocyclic rings
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C09—DYES; PAINTS; POLISHES; NATURAL RESINS; ADHESIVES; COMPOSITIONS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; APPLICATIONS OF MATERIALS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
- C09B—ORGANIC DYES OR CLOSELY-RELATED COMPOUNDS FOR PRODUCING DYES, e.g. PIGMENTS; MORDANTS; LAKES
- C09B15/00—Acridine dyes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C09—DYES; PAINTS; POLISHES; NATURAL RESINS; ADHESIVES; COMPOSITIONS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; APPLICATIONS OF MATERIALS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
- C09B—ORGANIC DYES OR CLOSELY-RELATED COMPOUNDS FOR PRODUCING DYES, e.g. PIGMENTS; MORDANTS; LAKES
- C09B57/00—Other synthetic dyes of known constitution
- C09B57/001—Pyrene dyes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
- C07C2603/00—Systems containing at least three condensed rings
- C07C2603/02—Ortho- or ortho- and peri-condensed systems
- C07C2603/40—Ortho- or ortho- and peri-condensed systems containing four condensed rings
- C07C2603/42—Ortho- or ortho- and peri-condensed systems containing four condensed rings containing only six-membered rings
- C07C2603/50—Pyrenes; Hydrogenated pyrenes
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2400/00—Assays, e.g. immunoassays or enzyme assays, involving carbohydrates
- G01N2400/10—Polysaccharides, i.e. having more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic linkages; Derivatives thereof, e.g. ethers, esters
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Plural Heterocyclic Compounds (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
- Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)
Description
一般に、天然炭水化物は、シアル酸、グルクロン酸またはスルホン化もしくはリン酸化単糖単位などの荷電残基を含有するものを除き、大部分が電気的中性であるため、それらの質量対電荷比によって分離できない。
今日、標識グリカンの「現実の」高スループット分析は、典型的には、市販の多重CGEシステムで実施される。これらのxCGE-LIF機器は、荷電分析物(例えば、APTS標識グリカン)の分離のための多重キャピラリーゲル電気泳動ユニット、レーザーおよび蛍光検出器を含有する。
R1、R2、R3、R4、R5は、互いに独立しており、
H、CH3、C2H5、直鎖状もしくは分枝状C3~C12、好ましくはC3~C6アルキルもしくはペルフルオロアルキル基、ホスホニル化アルキル基(CH2)mP(O)(OH)2(式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状もしくは分枝状アルキル鎖を有する)、(CH2)nCOOH(式中、n=1~12、好ましくは1~5)、または(CH2)nCOOR6(式中、n=1~12、好ましくは1~5、R6は、アルキル、特に、C1~C6アルキル、CH2CN、ベンジル、フルオレン-9-イル、ポリハロゲノアルキル、ポリハロゲノフェニル、例えば、テトラもしくはペンタフルオロフェニル、ペンタクロロフェニル、2-および4-ニトロフェニル、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリルもしくは他の潜在的に求核反応性の脱離基であってもよい)、スルホン酸アルキル((CH2)nSO3H)もしくは硫酸アルキル((CH2)nOSO3H)(式中、n=1~12、好ましくは1~5、いずれの(CH2)n中のアルキル鎖も直鎖状もしくは分枝状であってもよい);
ヒドロキシアルキル基(CH2)mOHもしくはチオアルキル基(CH2)mSH(式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状もしくは分枝状アルキル鎖を有する)、リン酸化ヒドロキシアルキル基(CH2)mOP(O)(OH)2(式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状もしくは分枝状アルキル鎖を有する)を表してもよく;R1またはR2基のうちの一方は、カーボネートまたはカルバメート誘導体(CH2)mOCOOR7または(CH2)mNHCOOR7(式中、m=1~12、R7=メチル、エチル、tert-ブチル、ベンジル、フルオレン-9-イル、CH2CN、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリル、フェニル、置換フェニル基、例えば、2-または4-ニトロフェニル、ペンタクロロフェニル、ペンタフルオロフェニル、2,3,5,6-テトラフルオロ-フェニル、2-ピリジル、4-ピリジル、ピリミド-4-イル);
(CH2)mNRaRb(式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有し;Ra、Rbは、互いに独立しており、水素および/またはC1~C4アルキル基を表す)、ヒドロキシアルキル基(CH2)mOH(式中、m=2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する)、リン酸化ヒドロキシアルキル基(CH2)mOP(O)(OH)2(式中、m=2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する);
アルキルアジド(CH2)mN3(式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する)であってもよく;
R1、R2、R3、R4、R5は、末端アルキルオキシアミノ基(CH2)mONH2(式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有し、これは、1つまたは複数のアルキルアミノ(CH2)mNHまたはアルキルアミド(CH2)mCONH基を、m=0~12のすべての可能な組合せで含み得る);
(CH2)nCONHR8(式中、n=1~12、好ましくは1~5;R8=H、C1~C6アルキル、(CH2)mN3または(CH2)m-N-マレイミド、(CH2)m-NH-COCH2X(X=BrまたはI)、m=1~12、好ましくは2~6、(CH2)n、(CH2)mおよびR6中に直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する);
第一級アミノ基を含有してもよく;
さらに、残基R1、R2、R3、R4、R5のうちの1つは、CH2-C6H4-NH2、COC6H4-NH2、CONHC6H4-NH2またはCSNHC6H4-NH2(C6H4は、1,2-、1,3-または1,4-フェニレンである)、COC5H3N-NH2またはCH2-C5H3N-NH2(C5H3Nは、ピリジン-2,4-ジイル、ピリジン-2,5-ジイル、ピリジン-2,6-ジイルまたはピリジン-3,5-ジイルである)を表してもよく;
さらに、R 2 ---R 3 (R 4 ---R 5 )は、4、5、6または7員環を形成してもよく、または、環の炭素原子の1つに結合した、第一級アミノ基NH 2 、第二級アミノ基NHR a (式中、R a =C 1 ~C 6 アルキル)、ヒドロキシル基OH若しくはリン酸化ヒドロキシル基-OP(O)(OH) 2 を有する若しくは有さない4、5、6もしくは7員環を形成してもよく;
場合により、R2---R3(R4---R5)は、4、5、6または7員複素環(この複素環にはO、NまたはSなどのさらに1~3個のヘテロ原子が含まれる)を形成してもよく;
さらに、R1は、非置換フェニル基、OH、SH、NH2、NHRa、NRaRb、RaO、RaS(式中、RaおよびRbは、互いに独立しており、直鎖状または分枝炭素鎖を有するC1~C6アルキル基であってもよい)の組から選択される1つまたはいくつかの電子供与体置換基を有するフェニル基、NO2、CN、COH、COOH、CH=CHCN、CH=C(CN)2、SO2Ra、CORa、COORa、CH=CHCORa、CH=CHCOORa、CONHRa、SO2NRaRb、CONRaRb(式中、RaおよびRbは、互いに独立しており、Hまたは直鎖状もしくは分枝状炭素鎖を有するC1~C6アルキル基であってもよい)の組から選択される1つまたはいくつかの電子受容体を有するフェニル基を表してもよく;
またはR1は、複素芳香族基を表してもよく;
ただし、上記式Aのすべての化合物において、塩基性条件下、すなわち7<pH<14で、少なくとも2つ、好ましくは少なくとも3、4、5または6つの負荷電基が存在し、これらの負荷電基は、以下:SH、COOH、スルホン酸残基SO3H、第一リン酸基OP(O)(OH)2、第二リン酸基OP(O)(OH)Ra(Ra=C1~C4アルキルまたは置換C1~C4アルキル)、第一ホスホン酸基P(O)(OH)2、第二ホスホン酸基P(O)(OH)Ra(式中、Ra=C1~C4アルキルまたは置換C1~C4アルキル)から選択されるイオン化可能基の少なくとも部分的に脱プロトン化された残基を表す]
R1および/またはR2は、互いに独立しており、
H、重水素、アルキルもしくは重水素置換アルキル(アルキル基の1個、いくつかもしくはすべてのH原子は重水素で交換されていてもよい)、特に、1~12個のC原子、好ましくは1~6個のC原子を有するアルキルもしくは重水素置換アルキル、例えば、CH3、C2H5、直鎖状もしくは分枝状C3~C12アルキルもしくはペルフルオロアルキル基、または置換C2~C12アルキル基;特に、(CH2)nCOOR3(式中、n=1~12、好ましくは1~5、R3は、H、アルキル、特にC1~C6、CH2CN、ベンジル、2-および4-ニトロフェニル、フルオレン-9-イル、ポリハロゲノアルキル、ポリハロゲノ-フェニル、例えば、テトラもしくはペンタフルオロフェニル、ペンタクロロフェニル、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリルまたは他の潜在的に求核反応性の脱離基であってもよく、(CH2)nのアルキル鎖は直鎖状または分枝状であってもよい)を表してもよく;
R 1 ---R 2 は、4、5、6または7員非芳香族炭素環を形成してもよく、この炭素環は、環の炭素原子の1つに結合したさらなる第一級アミノ基NH 2 、第二級アミノ基NHR a (式中、R a =C 1 ~C 6 アルキル)、またはヒドロキシル基OHを有する;場合により、R1---R2は、4、5、6または7員非芳香族複素環(この複素環にはO、NまたはSなどのさらなるヘテロ原子が含まれる)を形成してもよく;
ヒドロキシアルキル基(CH2)mOH(式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する);R1またはR2基のうちの一方は、カーボネートまたはカルバメート誘導体(CH2)mOCOOR4または(CH2)mNHCOOR4(式中、m=1~12、R4=メチル、エチル、2-クロロエチル、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリル、フェニル基または置換フェニル基、例えば、2-および4-ニトロフェニル、ペンタクロロフェニル、ペンタフルオロフェニル、2,3,5,6-テトラフルオロ-フェニル、2-ピリジルまたは4-ピリジルである);
(CH2)mNRaRb(式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有し;Ra、Rbは、互いに独立しており、Hまたは置換されていてもよいC1~C4アルキル基であってもよい)であってもよく、特にR1またはR2基のうちの一方は、アルキルアジド基(CH2)mN3(式中、m=2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する)であってもよく;
R1またはR2のうちの一方は、(CH2)nSO2NR5NH2(式中、n=1~12であり、置換基R5は、H、アルキル、ヒドロキシアルキルまたはペルフルオロアルキル基C1~C12によって表されることができる)であってもよく;
R1またはR2基のうちの一方は、アリールヒドラジンAr-NR6NH2(式中、Arは式Bの全ピレン残基であり、R6=Hまたはアルキル)を形成する第一級アミノ基であってもよく;
R1またはR2基のうちの一方は、アリールヒドラジンAr-NR6NH2(式中、Arは式Bの全ピレン残基であり、R6=Hまたはアルキル)を形成する第一級アミノ基であってもよく;
R1またはR2基のうちの一方は、アリールヒドロキシルアミンAr-NR7OH(式中、Arは式Bの全ピレン残基であり、R7=Hまたはアルキル)を形成するヒドロキシ基であってもよく;
R1またはR2基のうちの一方は、アルキルオキシアミノ基(CH2)nONH2(式中、n=1~12)であってもよく;
R1またはR2基のうちの一方は、(CH2)nCOOR8(式中、n=1~5、直鎖状または分枝状アルキル鎖(CH2)nを有し、R8は、H、直鎖状または分枝状C1~C6アルキル、CH2CN、2-および4-ニトロフェニル、2,3,5,6-テトラフルオロフェニル、ペンタクロロフェニル、ペンタフルオロフェニル、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾ-トリアゾリルから選択される)であってもよく;
さらに、R1もしくはR2のうちの一方は、(CH2)nCONHR9(式中、n=1~5、R9=H、C1~C6アルキル、(CH2)mN3、(CH2)m-N-マレイミド、(CH2)m-NHCOCH2X(X=BrまたはI)、m=2~6、(CH2)nおよびR9中に直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する)であってもよい)であってもよく;またはR1もしくはR2のうちの一方は、CH2-C6H4-NH2、COC6H4-NH2、CONHC6H4-NH2もしくはCSNHC6H4-NH2(C6H4は、1,2-、1,3-もしくは1,4-フェニレンである)、COC5H3N-NH2もしくはCH2-C5H3N-NH2(C5H3Nは、ピリジン-2,4-ジイル、ピリジン-2,5-ジイル、ピリジン-2,6-ジイルもしくはピリジン-3,5-ジイルである)を表してもよく;またはR1もしくはR2のうちの一方は、アルキルアジド(CH)N3もしくはアルキン、特にプロパルギルであってもよく;
リンカーL(色素コアと基Xを連結し、色素のスペクトル特性を調節する)は、少なくとも1個の炭素原子を含み、任意の出現において、C1~C12の範囲の長さの直鎖状または分枝状の、アルキル、ヘテロアルキル、特にアルキルオキシ、例えば、CH2OCH2、CH2CH2O CH2CH2OCH2、アルキルアミノまたはジアルキルアミノ、特にジエタノールアミンまたはN-メチル(アルキル)モノエタノールアミン部分、例えば、N(CH3)CH2CH2O-およびN(CH2CH2O-)2、ジフルオロメチル(CF2)、アルケンまたはアルキン部分を、任意の組合せで含んでもよく;
リンカーLはまた、カルボニル(CH2CO、CF2CO)部分も含んでもよく;
Xは、特に、ヒドロキシアルキル(CH2)nOH、チオアルキル((CH2)nSH)、カルボキシアルキル((CH2)nCO2H)、スルホン酸アルキル((CH2)nSO3H)、硫酸アルキル((CH2)nOSO3H)、リン酸アルキル((CH2)nOP(O)(OH)2)もしくはホスホン酸アルキル((CH2)nP(O)(OH)2)(式中、nは、0~12または1~12の範囲の整数である)、またはその類似体を含む群から選択される部分からなるまたはそれらを含む可溶性および/またはイオン化可能アニオン提供部分を示し、CH2基の1つまたは複数がCF2によって交換されており、
さらに、アニオン提供部分は、非芳香族O、NおよびS含有複素環、例えば、ピペラジン、ピペコリンによって結合されていてもよく、または代替的に基Xのうちの1つは、基R1およびR2に関して上で列挙した部分のうちの任意のものを、また基Lに関して列挙した任意の種類の結合と共に、他の置換基とは独立して有していてもよく、
ただし、式Bによって表されるすべての化合物において、塩基性条件下、すなわち7<pH<14で、式Bの残基Xに3または6つの負荷電基が存在し、これらの負荷電基は、以下:SH、COOH、SO3H、OSO3H、OP(O)(OH)2、OP(O)(OH)Ra(式中、Ra=C1~C4アルキルまたは置換C1~C4アルキル)、P(O)(OH)2、P(O)(OH)Ra(式中、Ra=C1~C4アルキルまたは置換C1~C4アルキル)から選択されるイオン化可能基の少なくとも部分的に脱プロトン化された残基を表す]
の化合物またはその塩からなる群から選択される。
より具体的には、IUPAC規則に従うと、以下のスキーム4の基本構造式に示される通り、式Aの化合物は、7-アミノアクリドン-2-スルホンアミドであり、一方、式Bの化合物は、3、6、8位に官能基置換されたスルホニル基を有する1-アミノピレン色素、すなわち、(官能基置換された)1,6,8-トリスルホニル-3-アミノピレンである。
・ pH約2~5における効率的かつ清潔な還元的アミノ化または炭水化物との直接縮合のためのpKb=11~8(pKa=3~6)を有する芳香族アミノ(ArNH2)、ヒドラジン(NRNH2)、ヒドラジド(CONRNH2)、ヒドロキシルアミン(RNHOH)またはアルコキシアミノ基(RONH2);好ましくは、芳香族アミノ基は、第一級アミノ基であるが、第二級アミノ基であってもよい;構造についてはスキーム4を参照
・ コンジュゲート中の大きな正味電荷 - pH=7~10において-3~-6の範囲
・ 広範囲のpHにおける水性媒体への非常に良好な溶解性;高輝度(これは、蛍光量子収率および消光の全体的な結果である)
・ ボラン系試薬によるpH=3~6における還元に対する色素コアの例外的な安定性
・ スペクトルの完全一致および高い蛍光量子収率でアルゴンイオンレーザー(488および514nmで発光)により励起される能力
・ およそ520nmにおける最小発光
・ 色素は、99%までの精製が可能である。
上記式Aにおいて、NR1および/またはN(R2)R3は、カルボニル-または求核反応性基を含む。好ましくは、R1、R2およびR3は、H、直鎖状または分枝状アルキル、ヒドロキシアルキルまたはペルフルオロアルキル基によって表される。置換基R3、R4およびR5は、好ましくは、可溶性および/またはアニオン提供基、特に、ヒドロキシアルキル((CH2)nOH)、チオアルキル((CH2)nSH)、カルボキシアルキル((CH2)nCO2H)、スルホン酸アルキル((CH2)nSO3H)、硫酸アルキル((CH2)nOSO3H)、リン酸アルキル((CH2)nOP(O)(OH)2)またはホスホン酸アルキル((CH2)nP(O)(OH)2)(nは、1~12の範囲の整数である)を含む。
式AのR1は、水素、低級アルキル基(C1~C4)、非置換フェニル基、OH、SH、NH2、NHRa、NRaRb、RaO、RaS、OP(O)(ORa)(ORb)(RaおよびRbは、互いに独立しており、直鎖状または分枝状鎖を有するC1~C12、好ましくはC1~C6アルキル基であってもよい)の組から選択される1つまたはいくつかの電子供与体置換基を有するフェニル基、NO2、CN、COH、COOH、CH=CHCN、CH=C(CN)2、SO2Ra、SO3Ra、CORa、COORa、CH=CHCORa、CH=CHCOORa、CONHRa、SO2NRaRb、CONRaRb、P(O)(ORa)(ORb)(式中、RaおよびRbは、互いに独立しており、Hまたは直鎖状もしくは分枝状炭素鎖を有するC1~C6アルキル基であってもよい)の組から選択される1つまたはいくつかの電子受容体を有するフェニル基を表し;
あるいは、R1は、芳香族複素環式基、特に、2-ピリジル、3-ピリジル、4-ピリジル、2-チエニル、3-チエニル、ピリミジン-4-イル、ピリミジン-2-イル、ピリミジン-5-イルまたは芳香族複素環から誘導される他の電子受容体基、例えば、4-ピリジル-N-オキシド、N-アルキルピリジニウム塩またはベタイン、特に、N-(ω-スルホアルキル)-4-ピリジニウム、N-(ω-スルホアルキル)-2-ピリジニウム、N-(1-ヒドロキシ-4,4,5,5-テトラフルオロ-シクロペンタ-1-エン-3-オン-2-イル)-4-ピリジニウム、N-(1-ヒドロキシ-4,4,5,5-テトラフルオロシクロペンタ-1-エン-3-オン-2-イル)-2-ピリジニウムを表してもよい。
典型的には、その存在の結果、APTS色素タグ(断片Lは存在せず、XはOHである)と比較して、488nm市販レーザーとのより良好な一致を伴い、大きく深蛍光シフトおよび深色シフトする。
R1および/またはR2は、互いに独立しており、
H、重水素、アルキルまたは重水素置換アルキル(アルキル基の1個、いくつかまたはすべてのH原子は重水素原子で交換されていてもよい)、特に、1~12個のC原子、好ましくは1~6個のC原子を有するアルキルまたは重水素アルキル、例えば、CH3、C2H5、直鎖状または分枝状C3~C12、好ましくはC3~C6アルキル基または置換C2~C12、好ましくはC2~C6アルキル基;特に、(CH2)nCOOR3(式中、n=1~12、好ましくは1~5、R3は、H、CH2CN、2-および4-ニトロフェニル、2,3,5,6-テトラフルオロフェニル、ペンタクロロフェニル、ペンタフルオロフェニル、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリルであってもよく、(CH2)nのアルキル鎖は、直鎖状または分枝状であってもよい)を表してもよく;
R 1 ---R 2 は、4、5、6または7員非芳香族炭素環を形成してもよく、この炭素環は、環の炭素原子の1つに結合したさらなる第一級アミノ基NH 2 、第二級アミノ基NHR a (式中、R a =C 1 ~C 6 アルキル)、またはヒドロキシル基OHを有する;場合により、R1---R2は、4、5、6または7員非芳香族複素環(この複素環にはO、NまたはSなどのさらなるヘテロ原子が含まれる)を形成してもよく;
ヒドロキシアルキル基(CH2)mOH(式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する);R1またはR2基のうちの一方は、カーボネートまたはカルバメート誘導体(R1またはR2基のうちの一方は、(CH2)mOCOOR4または(CH2)mNHCOOR4(式中、m=1~12、R4=メチル、エチル、2-クロロエチル、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、フェニル基または置換フェニル基、例えば、2-および4-ニトロフェニル、ペンタクロロフェニル、ペンタフルオロフェニル、2,3,5,6-テトラフルオロ-フェニル、2-ピリジルまたは4-ピリジル)である);
(CH2)mNRaRb(式中、m=1~12、好ましくは2~6;直鎖状または分枝状アルキル鎖を有し;Ra、Rbは、互いに独立しており、Hまたは置換されていてもよいC1~C4アルキル基であってもよい)であってもよく、特にR1またはR2基のうちの一方は、アルキルアジド基(CH2)mN3(式中、m=2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する)であってもよく;
R1またはR2基のうちの一方は、(CH2)nCOOR5(式中、n=1~5、直鎖状または分枝状アルキル鎖(CH2)nを有し、R3は、H、直鎖状または分枝状C1~C6アルキル、CH2CN、4-ニトロフェニル、2,3,5,6-テトラフルオロフェニル、ペンタクロロフェニル、ペンタフルオロフェニル、N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリルから選択される)であってもよく;
さらに、R1もしくはR2のうちの一方は、(CH2)nCONHR6(式中、n=1~12、好ましくは1~5、R6=H、C1~C6アルキル、(CH2)mN3、(CH2)m-N-マレイミド、(CH2)m-NHCOCH2X(式中、X=BrもしくはI)、m=2~6、(CH2)nおよびR6中に直鎖状もしくは分枝状アルキル鎖を有する)であってもよく;またはR1もしくはR2のうちの一方は、CH2-C6H4-NH2、COC6H4-NH2、CONHC6H4-NH2もしくはCSNHC6H4-NH2(C6H4は、1,2-、1,3-もしくは1,4-フェニレンである)、COC5H3N-NH2もしくはCH2-C5H3N-NH2(C5H3Nは、ピリジン-2,4-ジイル、ピリジン-2,5-ジイル、ピリジン-2,6-ジイルもしくはピリジン-3,5-ジイルである)を表してもよく;
式CのSO2断片と残基Xとの間の(CH2)n-CH2リンカー(式中、n=1~5)は、2~6個の炭素原子を有する直鎖、分枝状または環式基を表してもよく;
X=SH、COOH、OSO3H、SO3H、OP(O)(OH)2、OP(O)(OH)Ra(式中、Ra=置換されていてもよいC1~C4アルキル)、P(O)(OH)2、P(O)(OH)Ra(式中、Ra=置換されていてもよいC1~C4アルキル)であり;
ただし、式Cによって表されるすべての化合物において、塩基性条件下、すなわち7<pH<14で、式Cの残基Xに3または6つの負荷電基が存在し、これらの負荷電基は、以下:SH、COOH、OSO3H、SO3H、OP(O)(OH)2、OP(O)(OH)Ra(式中、Ra=C1~C4アルキルまたは置換C1~C4アルキル)、P(O)(OH)2、P(O)(OH)Ra(式中、Ra=C1~C4アルキルまたは置換C1~C4アルキル)から選択されるイオン化可能基の少なくとも部分的に脱プロトン化された残基を表す]
に示される通りのアルキルスルホニル誘導体である。
R1および/またはR2は、互いに独立しており、H、重水素、アルキルまたは重水素置換アルキル(アルキル基の1個、いくつかまたはすべてのH原子は、重水素原子によって交換されていてもよい)、特に、1~12個のC原子、好ましくは1~6個のC原子を有するアルキルまたは重水素-アルキル、例えば、CH3、C2H5または直鎖状もしくは分枝状の置換されていてもよいC3~C12、好ましくはC3~C6アルキル基;特に、(CH2)nCOOR4(式中、n=1~12、好ましくは1~5、R4は、H、CH2CN、2-および4-ニトロフェニル、2,3,5,6-テトラフルオロフェニル、ペンタクロロフェニル、ペンタフルオロフェニル、N-スクシンイミジル、N-スルホスクシンイミジルであってもよく、(CH2)n中のアルキル鎖は、直鎖状または分枝状であってもよい)を表してもよく;
R 1 ---R 2 は、4、5、6または7員非芳香族炭素環を形成してもよく、この炭素環は、環の炭素原子の1つに結合したさらなる第一級アミノ基NH 2 、第二級アミノ基NHR a (式中、R a =置換されていてもよいC 1 ~C 6 アルキル)、またはヒドロキシル基OHを有する;または場合により、R1---R2は、4、5、6もしくは7員非芳香族複素環(この複素環にはO、NもしくはSなどのヘテロ原子が含まれる)を形成してもよく;
R1および/またはR2は、
ヒドロキシアルキル基(CH2)mOH(式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状の置換されていてもよいアルキル鎖を有する)をさらに表してもよく;R1またはR2基のうちの一方は、カーボネートまたはカルバメート誘導体(CH2)mOCOOR5または(CH2)mNHCOOR5(式中、m=1~12、R5=メチル、エチル、2-クロロエチル、CH2CN、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリル、フェニル基または置換フェニル基、例えば、2-および4-ニトロフェニル、ペンタクロロフェニル、ペンタフルオロ-フェニル、2,3,5,6-テトラフルオロフェニル、2-ピリジル、4-ピリジル);
(CH2)mNRaRb(式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有し;Ra、Rbは、互いに独立しており、水素および/または置換されていてもよいC1~C4アルキル基を表す);
(CH2)mN3(式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する);
-(CH2)nCOOR4(式中、n=1~12、好ましくは1~5、直鎖状または分枝状アルキル鎖(CH2)nを有し、R4は、H、直鎖状または分枝状C1~C6アルキル、CH2CN、2-および4-ニトロフェニル、2,3,5,6-テトラフルオロフェニル、ペンタクロロフェニル、ペンタフルオロフェニル、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリルから選択される);
(CH2)nCONHR5(式中、n=1~12、好ましくは1~5、R5=H、置換または非置換C1~C6アルキル、(CH2)mN3、(CH2)m-N-マレイミド、(CH2)m-NHCOCH2Y(式中、Y=Br、I)、m=1~12、好ましくは2~6、(CH2)nおよびR5中に直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する)であってもよく;
さらに、R1またはR2は、CH2-C6H4-NH2、COC6H4-NH2、CONHC6H4-NH2またはCSNHC6H4-NH2(C6H4は、1,2-、1,3-または1,4-フェニレンである)、COC5H3N-NH2またはCH2-C5H3N-NH2(C5H3Nは、ピリジン-2,4-ジイル、ピリジン-2,5-ジイル、ピリジン-2,6-ジイルまたはピリジン-3,5-ジイルである)を表してもよく;
R3=H、(CH2)qCH2X、C2H5、直鎖状または分枝状C3~C6アルキル基、CmH2mOR(式中、m=2~6、直鎖状または分枝状アルカン-ジイル鎖CmH2mを有する)、R3=H、CH3、C2H5、C3H7、CH3(CH2CH2O)kCH2CH2(式中、k=1~12)であり;一方、(CH2)qCH2リンカーは、2~6個の炭素原子を有する直鎖、分枝状または環式基を表してもよく;
式Dにおいて、スルホンアミド断片SO2Nと残基Xとの間の(CH2)n-CH2リンカー(式中、n=1~12、好ましくは1~5)は、2~6個の炭素原子を有する直鎖、分枝状または環式基を表してもよく;
X=SH、COOH、SO3H、OSO3H、OP(O)(OH)2、OP(O)(OH)Ra(式中、Ra=置換または非置換C1~C4アルキル)、P(O)(OH)2、P(O)(OH)Ra(式中、Ra=置換または非置換C1~C4アルキルである)であり;
ただし、式Dによって表されるすべての化合物において、塩基性条件下、すなわち7<pH<14で、式Cの残基Xに3、6、9または12個の負荷電基が存在し、これらの負荷電基は、以下:SH、COOH、SO3H、OSO3H、OP(O)(OH)2、OP(O)(OH)Ra(式中、Ra=C1~C4アルキルまたは置換C1~C4アルキル)、P(O)(OH)2、P(O)(OH)Ra(式中、Ra=C1~C4アルキルまたは置換C1~C4アルキル)から選択されるイオン化可能基の少なくとも部分的に脱プロトン化された残基を表す]
に示される通りのスルファミド誘導体である。
式BのR1および/またはR2は、H、重水素、アルキルまたは重水素置換アルキル(アルキル基の1個、いくつかまたはすべてのH原子は、重水素原子によって交換されていてもよい)、特に、1~12個のC原子、好ましくは1~6個のC原子を有するアルキルまたは重水素アルキル、例えば、メチル、エチル、プロピルなど、4,6-ジハロ-1,3,5-トリアジニル(C3N3X2)(ハロゲンXは、好ましくは、塩素である)、2-、3-もしくは4-アミノベンゾイル(COC6H4NH2)、2-、3-もしくは4-アミノフェニルウレイル(NCONHC6H4NH2)、2-、3-もしくは4-アミノフェニルチオウレイル(NCSNHC6H4NH2)、または一般式(CH2)m1COOR3、(CH2)m1OCOOR3(CH2)n1COOR3もしくは(CO)m1(CH2)m2(CO)n1(NH)n2(CO)n3(CH2)n4COOR3の結合カルボン酸残基およびその反応性エステル(式中、整数m1、m2およびn1、n2、n3、n4は、独立して、それぞれ1~12および0~12の範囲であり、鎖(CH2)m/nは、直鎖状、分枝状、飽和、不飽和、部分もしくは完全重水素化であるおよび/またはN、OもしくはSを含有する炭素環もしくは複素環に含まれ、R3は、H、Dまたは求核反応性脱離基であり、好ましくは、これらに限定されないが、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリル、シアノメチル、ポリハロゲノアルキル、ポリハロゲノフェニル、例えば、テトラ-またはペンタフルオロフェニル、2-または4-ニトロフェニルを含む)を表す。
本発明の好ましい一実施形態は、上記式A~BまたはA~Dの化合物に関し、負電荷は、いくつかの第一リン酸基、特に、二重O-リン酸化7-アミノアクリドン-2-スルホンアミド(2つのリン酸基)、三重O-リン酸化1,6,8-トリス[(ω-ヒドロキシアルキル)スルホニル]-ピレン-3-アミン(3つのリン酸基)および1,6,8-トリス[N-(ω-ヒドロキシアルキル)スルホニルアミド]ピレン-3-アミンによってもたらされる。これらの化合物は、APTSと比較して優れた輝度、および大幅により良好な電気泳動移動度を有する。
より具体的には、前記コンジュゲート、特に炭水化物コンジュゲート中の色素は、以下のスキーム6に示される通りの式6-H、6-Me、8-H、15または19および20の化合物から選択される。
新しいスルホン化2(7)-アミノアクリドンおよび1-アミノピレン色素の合成経路が以下のスキーム7~10に示される。
本発明は、下記の態様も包含する。
態様1
複数のイオン化可能基および/または負荷電基を有する蛍光色素であって、以下の一般式AおよびB:
R 1 、R 2 、R 3 、R 4 、R 5 は、互いに独立しており、
H、CH 3 、C 2 H 5 、直鎖状もしくは分枝状C 3 ~C 12 、好ましくはC 3 ~C 6 アルキルもしくはペルフルオロアルキル基、ホスホニル化アルキル基(CH 2 ) m P(O)(OH) 2 (式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状もしくは分枝状アルキル鎖を有する)、(CH 2 ) n COOH(式中、n=1~12、好ましくは1~5)、または(CH 2 ) n COOR 6 (式中、n=1~12、好ましくは1~5、R 6 は、アルキル、特に、C 1 ~C 6 アルキル、CH 2 CN、ベンジル、フルオレン-9-イル、ポリハロゲノアルキル、ポリハロゲノフェニル、例えば、テトラもしくはペンタフルオロフェニル、ペンタクロロフェニル、2-および4-ニトロフェニル、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリルもしくは他の潜在的に求核反応性の脱離基であってもよい)、スルホン酸アルキル((CH 2 ) n SO 3 H)もしくは硫酸アルキル((CH 2 ) n OSO 3 H)(式中、n=1~12、好ましくは1~5、いずれの(CH 2 ) n 中のアルキル鎖も直鎖状もしくは分枝状であってもよい);
ヒドロキシアルキル基(CH 2 ) m OHもしくはチオアルキル基(CH 2 ) m SH(式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状もしくは分枝状アルキル鎖を有する)、リン酸化ヒドロキシアルキル基(CH 2 ) m OP(O)(OH) 2 (式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状もしくは分枝状アルキル鎖を有する)を表してもよく;R 1 またはR 2 基のうちの一方は、カーボネートまたはカルバメート誘導体(CH 2 ) m OCOOR 7 または(CH 2 ) m NHCOOR 7 (式中、m=1~12、R 7 =メチル、エチル、tert-ブチル、ベンジル、フルオレン-9-イル、CH 2 CN、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリル、フェニル、置換フェニル基、例えば、2-または4-ニトロフェニル、ペンタクロロフェニル、ペンタフルオロフェニル、2,3,5,6-テトラフルオロ-フェニル、2-ピリジル、4-ピリジル、ピリミド-4-イル);
(CH 2 ) m NR a R b (式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有し;R a 、R b は、互いに独立しており、水素および/またはC 1 ~C 4 アルキル基を表す)、ヒドロキシアルキル基(CH 2 ) m OH(式中、m=2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する)、リン酸化ヒドロキシアルキル基(CH 2 ) m OP(O)(OH) 2 (式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する);
アルキルアジド(CH 2 ) m N 3 (式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する)であってもよく;
R 1 、R 2 、R 3 、R 4 、R 5 は、末端アルキルオキシアミノ基(CH 2 ) m ONH 2 (式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有し、これは、1つまたは複数のアルキルアミノ(CH 2 ) m NHまたはアルキルアミド(CH 2 ) m CONH基を、m=0~12のすべての可能な組合せで含み得る);
(CH 2 ) n CONHR 8 (式中、n=1~12、好ましくは1~5;R 8 =H、C 1 ~C 6 アルキル、(CH 2 ) m N 3 または(CH 2 ) m -N-マレイミド、(CH 2 ) m -NH-COCH 2 X(式中、X=BrまたはI)、m=1~12、好ましくは2~6であり、(CH 2 )n、(CH 2 ) m およびR 8 中に直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する);
好ましくは、R 1 、R 2 またはR 3 として、アリールヒドラジンを形成する第一級アミノ基;
好ましくは、R 2 またはR 3 として、アリールヒドロキシルアミンを形成するヒドロキシ基;
アルキルオキシアミノ基(CH 2 ) n ONH 2 (式中、n=1~12)を含有してもよく;
さらに、残基R 1 、R 2 、R 3 、R 4 、R 5 のうちの1つは、CH 2 -C 6 H 4 -NH 2 、COC 6 H 4 -NH 2 、CONHC 6 H 4 -NH 2 またはCSNHC 6 H 4 -NH 2 (C 6 H 4 は、1,2-、1,3-または1,4-フェニレンである)、COC 5 H 3 N-NH 2 またはCH 2 -C 5 H 3 N-NH 2 (C 5 H 3 Nは、ピリジン-2,4-ジイル、ピリジン-2,5-ジイル、ピリジン-2,6-ジイルまたはピリジン-3,5-ジイルである)を表してもよく;
さらに、R 2 ---R 3 (R 4 ---R 5 )は、4、5、6または7員環を形成してもよく、または、環の炭素原子の1つに結合した、第一級アミノ基NH 2 、第二級アミノ基NHR a (式中、R a =C 1 ~C 6 アルキル)、ヒドロキシル基OH若しくはリン酸化ヒドロキシル基-OP(O)(OH) 2 を有する若しくは有さない4、5、6もしくは7員環を形成してもよく;
場合により、R 2 ---R 3 (R 4 ---R 5 )は、4、5、6または7員複素環(この複素環にはO、NまたはSなどのさらに1~3個のヘテロ原子が含まれる)を形成してもよく;
さらに、R 1 は、非置換フェニル基、OH、SH、NH 2 、NHR a 、NR a R b 、R a O、R a S(式中、R a およびR b は、互いに独立しており、直鎖状または分枝炭素鎖を有するC 1 ~C 6 アルキル基であってもよい)の組から選択される1つまたはいくつかの電子供与体置換基を有するフェニル基、NO 2 、CN、COH、COOH、CH=CHCN、CH=C(CN) 2 、SO 2 R a 、COR a 、COOR a 、CH=CHCOR a 、CH=CHCOOR a 、CONHR a 、SO 2 NR a R b 、CONR a R b (式中、R a およびR b は、互いに独立しており、Hまたは直鎖状もしくは分枝状炭素鎖を有するC 1 ~C 6 アルキル基であってもよい)の組から選択される1つまたはいくつかの電子受容体を有するフェニル基を表してもよく;
またはR 1 は、複素芳香族基を表してもよく;
ただし、上記式Aのすべての化合物において、塩基性条件下、すなわち7<pH<14で、少なくとも2つ、好ましくは少なくとも3、4、5または6つの負荷電基が存在し、これらの負荷電基は、以下:SH、COOH、スルホン酸残基SO 3 H、第一リン酸基OP(O)(OH) 2 、第二リン酸基OP(O)(OH)R a (式中、R a =C 1 ~C 4 アルキルまたは置換C 1 ~C 4 アルキル)、第一ホスホン酸基P(O)(OH) 2 、第二ホスホン酸基P(O)(OH)R a (式中、R a =C~C 4 アルキルまたは置換C 1 ~C 4 アルキル)から選択されるイオン化可能基の少なくとも部分的に脱プロトン化された残基を表す]
R 1 および/またはR 2 は、互いに独立しており、
H、重水素、アルキルもしくは重水素置換アルキル(アルキル基の1個、いくつかもしくはすべてのH原子は重水素原子で交換されることができる)、特に、1~12個のC原子、好ましくは1~6個のC原子を有するアルキルもしくは重水素置換アルキル、例えば、CH 3 、C 2 H 5 、直鎖状もしくは分枝状C 3 ~C 12 アルキルもしくはペルフルオロアルキル基、または置換C 2 ~C 12 アルキル基;特に、(CH 2 ) n COOR 3 (式中、n=1~12、好ましくは1~5、R 3 は、H、アルキル、特にC 1 ~C 6 アルキル、CH 2 CN、ベンジル、フルオレン-9-イル、ポリハロゲノアルキル、ポリハロゲノ-フェニル、例えば、テトラもしくはペンタフルオロフェニル、ペンタクロロフェニル、2-および4-ニトロフェニル、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリルまたは他の潜在的に求核反応性の脱離基であってもよく、(CH 2 ) n のアルキル鎖は直鎖状または分枝状であってもよい)を表してもよく;
R 1 ---R 2 は、4、5、6または7員非芳香族炭素環を形成してもよく、この炭素環は、環の炭素原子の1つに結合したさらなる第一級アミノ基NH 2 、第二級アミノ基NHR a (式中、R a =C 1 ~C 6 アルキル)、またはヒドロキシル基OHを有する;場合により、R 1 ---R 2 は、4、5、6または7員非芳香族複素環(この複素環にはO、NまたはSなどのさらなるヘテロ原子が含まれる)を形成してもよく;
ヒドロキシアルキル基(CH 2 ) m OH(式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する);
R 1 またはR 2 基のうちの一方は、カーボネートまたはカルバメート誘導体(CH 2 ) m OCOOR 4 または(CH 2 ) m NHCOOR 4 (式中、m=1~12、R 4 =メチル、エチル、2-クロロエチル、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリル、フェニル基または置換フェニル基、例えば、2-および4-ニトロフェニル、ペンタクロロフェニル、ペンタフルオロフェニル、2,3,5,6-テトラフルオロ-フェニル、2-ピリジルまたは4-ピリジルである);
(CH 2 ) m NR a R b (式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有し;R a 、R b は、互いに独立しており、Hまたは置換されていてもよいC 1 ~C 4 アルキル基であってもよい)であってもよく、特にR 1 またはR 2 基のうちの一方は、アルキルアジド基(CH 2 ) m N 3 (式中、m=2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する)であってもよく;R 1 またはR 2 のうちの一方は、(CH 2 ) n SO 2 NR 5 NH 2 (式中、n=1~12であり、置換基R 5 は、H、アルキル、ヒドロキシアルキルまたはペルフルオロアルキル基C 1 ~C 12 によって表されることができる)であってもよく;
R 1 またはR 2 基のうちの一方は、アリールヒドラジンAr-NR 6 NH 2 (式中、Arは式Bの全ピレン残基であり、R 6 =Hまたはアルキル)を形成する第一級アミノ基であってもよく;
R 1 またはR 2 基のうちの一方は、アリールヒドロキシルアミンAr-NR 7 OH(式中、Arは式Bの全ピレン残基であり、R 7 =Hまたはアルキル)を形成するヒドロキシ基であってもよく;
R 1 またはR 2 基のうちの一方は、アルキルオキシアミノ基(CH 2 ) n ONH 2 (式中、n=1~12)であってもよく;
R 1 またはR 2 基のうちの一方は、CO(CH 2 ) n COOR 8 (式中、n=1~5、直鎖状または分枝状アルキル鎖(CH 2 ) n を有し、R 8 は、H、直鎖状または分枝状C 1 ~C 6 アルキル、CH 2 CN、2-および4-ニトロフェニル、2,3,5,6-テトラフルオロフェニル、ペンタクロロフェニル、ペンタフルオロフェニル、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾ-トリアゾリルから選択される)であってもよく;
さらに、R 1 もしくはR 2 のうちの一方は、(CH 2 ) n CONHR 9 (式中、n=1~5、R 9 =H、C 1 ~C 6 アルキル、(CH 2 ) m N 3 、(CH 2 ) m -N-マレイミド、(CH 2 ) m -NHCOCH 2 X(式中、X=BrまたはI)、m=2~6、(CH 2 )nおよびR 9 中に直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する)であってもよく;
またはR 1 もしくはR 2 のうちの一方は、CH 2 -C 6 H 4 -NH 2 、COC 6 H 4 -NH 2 、CONHC 6 H 4 -NH 2 もしくはCSNHC 6 H 4 -NH 2 (C 6 H 4 は、1,2-、1,3-もしくは1,4-フェニレンである)、COC 5 H 3 N-NH 2 もしくはCH 2 -C 5 H 3 N-NH 2 (C 5 H 3 Nは、ピリジン-2,4-ジイル、ピリジン-2,5-ジイル、ピリジン-2,6-ジイルもしくはピリジン-3,5-ジイルである)を表してもよく;またはR 1 もしくはR 2 のうちの一方は、アルキルアジド(CH)N 3 もしくはアルキン、特にプロパルギルであってもよく;
リンカーLは、二価または多価であってもよく、少なくとも1個の炭素原子を含み、任意の出現において、C 1 ~C 12 の範囲の長さの直鎖状または分枝状の、アルキル、ヘテロアルキル、ペルフルオロアルキル、アルキルオキシ、例えば、CH 2 OCH 2 、CH 2 CH 2 O CH 2 CH 2 OCH 2 、アルキルアミノまたはジアルキルアミノ、特にジエタノールアミンまたはN-メチル(アルキル)モノエタノールアミン部分、例えば、N(CH 3 )CH 2 CH 2 O-およびN(CH 2 CH 2 O-) 2 、1つまたは複数のアミド、エステル(esther)またはウレタン部分、単一または複数のジフルオロメチル(CF 2 )、アルケンまたはアルキン部分を任意の組合せで含んでもよく;
リンカーLはまた、アミド基の一部としても、カルボニル(CH 2 CO、CF 2 CO)部分を含んでもよく;
リンカーLはまた、1,3,5-トリアジンの残基を含むまたは含有してもよく、したがって、基Xへの2つの結合点を提供し;
Xは、特に、ヒドロキシアルキル(CH 2 ) n OH、チオアルキル((CH 2 ) n SH)、カルボキシアルキル((CH 2 ) n CO 2 H)、スルホン酸アルキル((CH 2 ) n SO 3 H)、硫酸アルキル((CH 2 ) n OSO 3 H)、リン酸アルキル((CH 2 ) n OP(O)(OH) 2 )もしくはホスホン酸アルキル((CH 2 ) n P(O)(OH) 2 )(式中、nは、0~12の範囲の整数である)、またはその類似体を含む群から選択される部分からなるまたはそれらを含む可溶性および/またはイオン化可能アニオン提供部分を示し、CH 2 基の1つまたは複数がCF 2 によって交換されており、
さらに、アニオン提供部分は、非芳香族O、NおよびS含有複素環、例えば、ピペラジン、ピペコリンによって結合されていてもよく、または代替的に基Xのうちの1つは、基R 1 およびR 2 に関して上で列挙した部分のうちの任意のものを、また基Lに関して列挙した任意の種類の結合と共に、他の置換基とは独立して有していてもよく、
ただし、式Bによって表されるすべての化合物において、塩基性条件下、すなわち7<pH<14で、式Bの残基Xに3または6つの負荷電基が存在し、これらの負荷電基は、以下:SH、COOH、SO 3 H、OSO 3 H、OP(O)(OH) 2 、OP(O)(OH)R a (式中、R a =C 1 ~C 4 アルキルまたは置換C 1 ~C 4 アルキル)、P(O)(OH) 2 、P(O)(OH)R a (式中、R a =C 1 ~C 4 アルキルまたは置換C 1 ~C 4 アルキル)から選択されるイオン化可能基の少なくとも部分的に脱プロトン化された残基を表す]
の化合物またはその塩からなる群から選択される、蛍光色素。
態様2
式AのR 1 が、非置換フェニル基、OH、SH、NH 2 、NHR a 、NR a R b 、R a O、R a S(式中、R a およびR b は、互いに独立しており、直鎖状または分枝炭素鎖を有するC 1 ~C 6 アルキル基であってもよい)の組から選択される1つまたはいくつかの電子供与体置換基を有するフェニル基、NO 2 、CN、CF 3 、COH、COOH、CH=CHCN、CH=C(CN) 2 、SO 2 R a 、SO 3 R、COR a 、COOR a 、CH=CHCOR a 、CH=CHCOOR a 、CONHR a 、SO 2 NR a R b 、CONR a R b 、P(O)(OR a )(OR b )(式中、R a およびR b は、互いに独立しており、Hまたは直鎖状もしくは分枝状炭素鎖を有するC 1 ~C 6 アルキル基(単数又は複数)であってもよい)の組から選択される1つまたはいくつかの電子受容体を有するフェニル基を表し;または、R 1 が、芳香族複素環式基、特に、2-ピリジル、3-ピリジル、4-ピリジル、2-チエニル、3-チエニル、ピリミジン-4-イル、ピリミジン-2-イル、ピリミジン-5-イルまたは芳香族複素環から誘導される他の電子受容体基、例えば、4-ピリジル-N-オキシド、N-アルキルピリジニウム塩またはベタイン、特に、N-(ω-スルホアルキル)-4-ピリジニウム、N-(ω-スルホアルキル)-2-ピリジニウム、N-(1-ヒドロキシ-4,4,5,5-テトラフルオロ-シクロペンタ-1-エン-3-オン-2-イル)-4-ピリジニウム、N-(1-ヒドロキシ-4,4,5,5-テトラフルオロシクロペンタ-1-エン-3-オン-2-イル)-2-ピリジニウムを表す、態様1に記載の蛍光色素。
態様3
式B(式中、Xが、各出現において、1または複数の部位でそれぞれのリンカー基Lに結合した1~4つの基SO 3 Hを表してもよい)を有する態様1に記載の蛍光色素。
態様4
少なくとも1つのアルキルスルホニル基を有する、式C
n=1~12、好ましくは1~6;
R 1 および/またはR 2 は、互いに独立しており、
H、重水素、アルキルまたは重水素置換アルキル(アルキル基の1個、いくつかまたはすべてのH原子は重水素原子で交換されることができる)、特に、1~12個のC原子、好ましくは1~6個のC原子を有するアルキルまたは重水素置換アルキル、例えば、CH 3 、C 2 H 5 、直鎖状または分枝状C 3 ~C 12 、好ましくはC 3 ~C 6 アルキル基または置換C 2 ~C 12 、好ましくはC 2 ~C 6 アルキル基;特に、(CH 2 ) n COOR 3 (式中、n=1~12、好ましくは1~5、R 3 は、H、CH 2 CN、2-および4-ニトロフェニル、2,3,5,6-テトラフルオロフェニル、ペンタクロロフェニル、ペンタフルオロフェニル、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリルであってもよく、(CH 2 ) n のアルキル鎖は、直鎖状または分枝状であってもよい)を表してもよく;
R 1 ---R 2 は、4、5、6または7員非芳香族炭素環を形成してもよく、この炭素環は、環の炭素原子の1つに結合したさらなる第一級アミノ基NH 2 、第二級アミノ基NHR a (式中、R a =C 1 ~C 6 アルキル)、またはヒドロキシル基OHを有する;場合により、R 1 ---R 2 は、4、5、6または7員非芳香族複素環(この複素環にはO、NまたはSなどのさらなるヘテロ原子が含まれる)を形成してもよく;
ヒドロキシアルキル基(CH 2 ) m OH(式中、m=2~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する);R 1 またはR 2 基のうちの一方は、カーボネートまたはカルバメート誘導体(CH 2 ) m OCOOR 4 または(CH 2 ) m NHCOOR 4 (式中、m=1~12、R 4 =メチル、エチル、2-クロロエチル、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリル、フェニル基または置換フェニル基、例えば、2-および4-ニトロフェニル、ペンタクロロフェニル、ペンタフルオロフェニル、2,3,5,6-テトラフルオロフェニル、2-ピリジルまたは4-ピリジルである);
(CH 2 ) m NR a R b (式中、m=2~12、好ましくは2~6;直鎖状または分枝状アルキル鎖を有し;R a 、R b は、互いに独立しており、Hまたは置換されていてもよいC 1 ~C 4 アルキル基(単数又は複数)であってもよい)であってもよく、特にR 1 またはR 2 基のうちの一方は、アルキルアジド基(CH 2 ) m N 3 (式中、m=2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する)であってもよく;
R 1 またはR 2 基のうちの一方は、(CH 2 ) n COOR 5 (式中、n=1~5、直鎖状または分枝状アルキル鎖(CH 2 ) n を有し、R 5 は、H、直鎖状または分枝状C 1 ~C 6 アルキル、CH 2 CN、2-および4-ニトロフェニル、2,3,5,6-テトラフルオロフェニル、ペンタクロロフェニル、ペンタフルオロフェニル、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリルから選択される)であってもよく;
R 1 またはR 2 のうちの一方は、式Bに関して記載の通り、アリールヒドラジンを形成する第一級アミノ基であってもよく;
R 1 またはR 2 基のうちの一方は、式Bに関して記載の通り、アリールヒドロキシルアミンを形成するヒドロキシ基であってもよく;
R 1 またはR 2 基のうちの一方は、アルキルオキシアミノ基(CH 2 ) n ONH 2 (式中、n=1~12)であってもよく;
さらに、R 1 もしくはR 2 のうちの一方は、(CH 2 ) n CONHR 6 (式中、n=1~12、好ましくは1~5、R 6 =H、C 1 ~C 6 アルキル、(CH 2 ) m N 3 、(CH 2 ) m -N-マレイミド、(CH 2 ) m -NHCOCH 2 X(式中、X=BrもしくはI)、m=2~6、(CH 2 )nおよびR 6 中に直鎖状もしくは分枝状アルキル鎖を有する)であってもよく;またはR 1 もしくはR 2 のうちの一方は、CH 2 -C 6 H 4 -NH 2 、COC 6 H 4 -NH 2 、CONHC 6 H 4 -NH 2 もしくはCSNHC 6 H 4 -NH 2 (C 6 H 4 は、1,2-、1,3-もしくは1,4-フェニレンである)、COC 5 H 3 N-NH 2 もしくはCH 2 -C 5 H 3 N-NH 2 (C 5 H 3 Nは、ピリジン-2,4-ジイル、ピリジン-2,5-ジイル、ピリジン-2,6-ジイルもしくはピリジン-3,5-ジイルである)を表してもよく;
式BのSO 2 断片と残基Xとの間の(CH 2 )n-CH 2 リンカー(式中、n=1~12、好ましくは1~5)は、2~6個の炭素原子を有する直鎖、分枝状または環式基を表してもよく;
X=SH、COOH、SO 3 H、OSO 3 H、OP(O)(OH) 2 、OP(O)(OH)R a (式中、R a =置換されていてもよいC 1 ~C 4 アルキル)、P(O)(OH) 2 、P(O)(OH)R a (式中、R a =置換されていてもよいC 1 ~C 4 アルキル)であり;
ただし、式Cによって表されるすべての化合物において、塩基性条件下、すなわち7<pH<14で、式Bの残基Xに3または6つの負荷電基が存在し、これらの負荷電基は、以下:SH、COOH、SO 3 H、OSO 3 H、OP(O)(OH) 2 、OP(O)(OH)R a (R a =C 1 ~C 4 アルキルまたは置換C 1 ~C 4 アルキル)、P(O)(OH) 2 、P(O)(OH)R a (式中、R a =C 1 ~C 4 アルキルまたは置換C 1 ~C 4 アルキル)から選択されるイオン化可能基の少なくとも部分的に脱プロトン化された残基を表す]
またはその塩を有する、態様1に記載の蛍光色素。
態様5
式C(式中、Xが、各出現において、SO 3 Hであり、nが、1~12、好ましくは1~6である)を有する、態様3に記載の蛍光色素。
態様6
少なくとも1つのスルホンアミド基を有する、以下の式D
R 1 および/またはR 2 は、互いに独立しており、H、重水素、アルキルまたは重水素置換アルキル(アルキル基の1個、いくつかまたはすべてのH原子は、重水素原子によって交換されることができる)、特に、1~12個のC原子、好ましくは1~6個のC原子を有するアルキルまたは重水素置換アルキル、例えば、CH 3 、C 2 H 5 または直鎖状もしくは分枝状の置換されていてもよいC 3 ~C 12 、好ましくはC 3 ~C 6 アルキル基;特に、(CH 2 ) n COOR 4 (式中、n=1~12、好ましくは1~5、R 4 は、H、CH 2 CN、2-および4-ニトロフェニル、2,3,5,6-テトラフルオロフェニル、ペンタクロロフェニル、ペンタフルオロフェニル、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリルであってもよく、(CH 2 ) n 中のアルキル鎖は、直鎖状または分枝状であってもよい)を表してもよく;
R 1 ---R 2 は、4、5、6または7員非芳香族炭素環を形成してもよく、この炭素環は、環の炭素原子の1つに結合したさらなる第一級アミノ基NH 2 、第二級アミノ基NHR a (式中、R a =置換されていてもよいC 1 ~C 6 アルキル)、またはヒドロキシル基OHを有する;または場合により、R 1 ---R 2 は、4、5、6もしくは7員非芳香族複素環(この複素環にはO、NもしくはSなどのヘテロ原子が含まれる)を形成してもよく;
R 1 および/またはR 2 は、
ヒドロキシアルキル基(CH 2 ) m OH(式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状の置換されていてもよいアルキル鎖を有する)をさらに表してもよく;R 1 またはR 2 基のうちの一方は、カーボネートまたはカルバメート誘導体(CH 2 ) m OCOOR 5 または(CH 2 ) m NHCOOR 5 (式中、m=1~12、R 5 =メチル、エチル、2-クロロエチル、CH 2 CN、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリル、フェニル基または置換フェニル基、例えば、2-および4-ニトロフェニル、ペンタクロロフェニル、ペンタフルオロ-フェニル、2,3,5,6-テトラフルオロフェニル、2-ピリジル、4-ピリジル);
(CH 2 ) m NR a R b (式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有し;R a 、R b は、互いに独立しており、水素および/または置換されていてもよいC 1 ~C 4 アルキル基を表す);
(CH 2 ) m N 3 (式中、m=1~12、好ましくは2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する);
CH 2 ) n CONHR 6 (式中、n=1~12、好ましくは1~5、R 6 =H、置換または非置換C 1 ~C 6 アルキル、(CH 2 ) m N 3 、(CH 2 )m-N-マレイミド、(CH 2 )m-NHCOCH 2 Y(式中、Y=Br、I)、m=2~6、(CH 2 )nおよびR 6 中に直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する)であってもよく;
R 1 またはR 2 基の一方は、式Bに関して記載の通り、アリールヒドラジンを形成する第一級アミノ基であってもよく;
R 1 またはR 2 基の一方は、式Bに関して記載の通り、アリールヒドロキシルアミンを形成するヒドロキシ基であってもよく;
R 1 またはR 2 基の一方は、アルキルオキシアミノ基(CH 2 ) n ONH 2 (式中、n=1~12)であってもよく;
さらに、R 1 またはR 2 は、CH 2 -C 6 H 4 -NH 2 、COC 6 H 4 -NH 2 、CONHC 6 H 4 -NH 2 またはCSNHC 6 H 4 -NH 2 (C 6 H 4 は、1,2-、1,3-または1,4-フェニレンである)、COC 5 H 3 N-NH 2 またはCH 2 -C 5 H 3 N-NH 2 (C 5 H 3 Nは、ピリジン-2,4-ジイル、ピリジン-2,5-ジイル、ピリジン-2,6-ジイルまたはピリジン-3,5-ジイルである)を表してもよく;
R 3 は、H、(CH 2 ) q CH 2 X、C 2 H 5 、直鎖状または分枝状C 3 ~C 6 アルキル基、C m H 2m OR 7 (式中、m=2~6、直鎖状または分枝状アルカン-ジイル鎖C m H 2m を有し、R 7 =H、CH 3 、C 2 H 5 、C 3 H 7 、CH 3 (CH 2 CH 2 O) k CH 2 CH 2 (式中、k=1~12)である)を表してもよく;一方、(CH 2 ) q CH 2 リンカーは、2~6個の炭素原子を有する直鎖、分枝状または環式基を表してもよく;
式Dにおいて、スルホンアミド断片SO 2 Nと残基Xとの間の(CH 2 ) n -CH 2 リンカー(式中、n=1~12、好ましくは1~5)は、2~6個の炭素原子を有する直鎖、分枝状または環式基を表してもよく;
X=SH、COOH、SO 3 H、OSO 3 H、OP(O)(OH) 2 、OP(O)(OH)R a (式中、R a =置換または非置換C 1 ~C 4 アルキル)、P(O)(OH) 2 、P(O)(OH)R a (式中、R a =置換または非置換C 1 ~C 4 アルキルである)であり;
ただし、式Dによって表されるすべての化合物において、塩基性条件下、すなわち7<pH<14で、式Cの残基Xに3、6、9または12個の負荷電基が存在し、これらの負荷電基は、以下:SH、COOH、SO 3 H、OSO 3 H、OP(O)(OH) 2 、OP(O)(OH)R a (式中、R a =C 1 ~C 4 アルキルまたは置換C 1 ~C 4 アルキル)、P(O)(OH) 2 、P(O)(OH)R a (式中、R a =C 1 ~C 4 アルキルまたは置換C 1 ~C 4 アルキル)から選択されるイオン化可能基の少なくとも部分的に脱プロトン化された残基を表す]
またはその塩である、態様1に記載の蛍光色素。
態様7
式B、CまたはDのR 1 および/またはR 2 が、H、重水素、アルキルまたは重水素置換アルキル(アルキル基の1個、いくつかまたはすべてのH原子は、重水素原子によって交換されることができる)、特に、1~12個のC原子、好ましくは1~6個のC原子を有するアルキルまたは重水素置換アルキル、4,6-ジハロ-1,3,5-トリアジニル(C 3 N 3 X 2 )(ハロゲンXは、好ましくは、塩素である)、2-、3-もしくは4-アミノベンゾイル(COC 6 H 4 NH 2 )、N-[(2-,N-[(3-またはN-[(4-アミノフェニル)ウレイド基(NHCONHC 6 H 4 NH 2 )、N-[(2-,N-[(3-またはN-[(4-アミノフェニル)チオウレイド基(NHCSNHC 6 H 4 NH 2 )、または一般式(CH 2 ) m1 COOR 3 、(CH 2 ) m1 OCOOR 3 、(CH 2 ) n1 COOR 3 もしくは(CO) m1 (CH 2 ) m2 (CO) n1 (NH) n2 (CO) n3 (CH 2 ) n4 COOR 3 の結合カルボン酸残基およびその反応性エステル(式中、整数m1、m2およびn1、n2、n3、n4は、独立して、それぞれ1~12および0~12の範囲であり、鎖(CH 2 ) m/n は、直鎖状、分枝状、飽和、不飽和、部分もしくは完全重水素化であるおよび/またはN、OもしくはSを含有する炭素環もしくは複素環に含まれ、R 3 は、H、Dまたは求核反応性脱離基であり、好ましくは、これらに限定されないが、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリル、シアノメチル、ポリハロゲノアルキル、ポリハロゲノフェニル、例えば、テトラ-またはペンタフルオロフェニル、2-または4-ニトロフェニルを含む)を表す、態様1から6のいずれかに記載の蛍光色素。
態様8
分析物-反応性基としてヒドロキシルアミンまたはヒドラジン部分を有し、それが色素コアに直接連結している、またはヒドロキシルアミン、ヒドラジンもしくはスルホニルヒドラジド部分が、リンカー基、特に、アルキル、ヘテロアルキルもしくは式Bに関して態様1に定義した通りのリンカーLを介して連結している、式AおよびBの蛍光色素。
態様9
式Aの置換基R 1 、R 2 およびR 3 が、1または複数のカルボニル反応性アリールヒドラジン部分を表し、例えば、R 2 =H、R 1 もしくはR 3 =NH 2 、またはR 1 =NH 2 、R 2 、R 3 =アルキル、ペルフルオロアルキルもしくはアルキルであり、これはさらに、R 4 およびR 5 についての可能な候補として列挙されている、可溶性および/またはアニオン提供部分、特に:ヒドロキシアルキル(CH 2 ) n OH、チオアルキル((CH 2 ) n SH)、カルボキシアルキル((CH 2 ) n CO 2 H)、スルホン酸アルキル((CH 2 ) n SO 3 H)、硫酸アルキル((CH 2 ) n OSO 3 H)、リン酸アルキル((CH 2 ) n OP(O)(OH) 2 )またはホスホン酸アルキル((CH 2 ) n P(O)(OH) 2 )(式中、nは、0または1~12の範囲の整数である)とコンジュゲートされておりまたはそれにより置換されており;
あるいは、ヒドラジン誘導体が、スルホニルヒドラジド部分(R 4 =NH 2 であり、一方、R 5 は、アルキル、ペルフルオロアルキルまたは上述の種類の可溶性および/またはアニオン提供基とコンジュゲートまたはそれにより置換されたアルキル基である)によって表されてもよい、
態様1または8に記載の蛍光色素。
態様10
式Aのアリールアミノ基NR 1 およびNR 2 R 3 が、直接または(ポリ)メチレン、カルボニル、アミド、窒素、酸素もしくは硫黄含有リンカー、特に、(CH 2 ) m CON(R 9 )、CO(O)NR’、CO(CH 2 ) m N(R 9 )、CO(CH 2 ) m S(CH 2 ) n 、(CH 2 ) m S(CH 2 ) n CO、CO(CH 2 ) m SO 2 (CH 2 ) n 、(CH 2 ) m SO 2 (CH 2 ) n COまたはその組合せを介して間接的に、分析物-反応性基に、特に、芳香族または複素環式アミン、カルボン酸、カルボン酸のエステル、特に、N-ヒドロキシスクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリルまたは別のアミノ反応性エステル、アルキルアジド、アルキン、(CH 2 ) n ONH 2 、マレイミド、COCH 2 X(X=Cl、BrおよびI)、NRCOCH 2 X(R=H、C 1 ~C 6 -アルキル、X=Cl、Br、I)を含む群から選択される分析物-反応性基に連結しており;mおよびnが、0または1~12の範囲の整数であり、置換基R 9 が、前記態様1においてR 1 、R 2 、R 3 、R 4 およびR 5 に関して定義され残基であってもよく;
あるいは、式Aのアリールアミノ基NR 1 および/またはNR 2 R 3 が、リンカー、特に上で定義した通りのリンカーを介して間接的に、アシルヒドラジンまたはアルキルヒドラジン部分に連結しており、したがって、それぞれ、ヒドラジド(ZCONHNH 2 )またはヒドラジン(ZNHNH 2 )を表し;
Zが、アリールアミノ基およびリンカーを含む式Aの色素残基を示し;
特に、R 1 およびR 2 が、(CH 2 ) m CON(R 10 )、CO(CH 2 ) m N(R 10 )、CO(CH 2 ) m S(CH 2 ) n 、(CH 2 ) m S(CH 2 ) n CO、CO(CH 2 ) m SO 2 (CH 2 ) n 、(CH 2 ) m SO 2 (CH 2 ) n COおよびそれらの組合せ(式中、mおよびnは、0または1~12の範囲の整数である)によって表されてもよく;
R 10 が、前記態様1において官能基R 1 、R 2 、R 3 、R 4 およびR 5 のうちの任意のものに関して定義した通りであり;特に、ヒドロキシアルキル(CH 2 ) n OH、チオアルキル((CH 2 ) n SH)、カルボキシアルキル((CH 2 ) n CO 2 H)、スルホン酸アルキル((CH 2 ) n SO 3 H)、硫酸アルキル((CH 2 ) n OSO 3 H)、リン酸アルキル((CH 2 ) n OP(O)(OH) 2 )またはホスホン酸アルキル((CH 2 ) n P(O)(OH) 2 )(式中、nは、0または1~12の範囲の整数である)であり;
リンカーがまた、非芳香族O、NおよびS含有複素環、例えば、ピペラジン、ピペコリンによって表されてもよい、
態様1に記載の蛍光色素。
態様11
以下の式
態様12
特に、7~13のpH範囲の水性媒体中で、0、-2、-4もしくはそれよりも高い、好ましくは-4の正味電荷qを有する式Aによる化合物、または0、-1、-3、-6もしくは-12、好ましくは-6もしくは-12の正味電荷zを有する式B、CおよびDの化合物。
態様13
負荷電スルホン酸基および/またはリン酸基、ならびに無機または有機カチオンから選択される対イオン、好ましくは、アルカリ金属カチオン、アンモニウムカチオンまたは有機アンモニウムもしくはホスホニウム化合物のカチオンを含み、ならびに/または正荷電基もしくは式A~Dの色素の窒素部N(R 1 )R 2 に形成された電荷移動錯体を、強鉱酸、有機酸もしくはルイス酸のアニオンから選択される対イオンと共に含む、態様1から12のいずれかに記載の蛍光色素塩。
態様14
炭水化物-反応性基、特にヒドラジンN(R)NH 2 、ヒドロキシルアミンN(R)OHまたはアミノオキシONH 2 基(式中、Rは、H、アルキル、ヘテロアルキル、アルケニルまたはペルフルオロアルキルである)が、式AまたはBの色素の窒素部N(R 1 )R 2 に、式Bの基Lに関して列挙したすべての種類のリンカーを介して連結される、態様1から13のいずれかに記載の蛍光色素。
態様15
還元的アミノ化に、および還元糖、すなわち、グリカンを含む遊離形態のまたはセミアセタールとしてのアルデヒド基を有するモノマー、オリゴマーまたはポリマー炭水化物との縮合に使用するための、態様1から14のいずれかに記載の化合物およびその塩。
態様16
アミノ酸、ペプチド、一次および二次抗体、単一ドメイン抗体、ドセタキセル、アビジン、ストレプトアビジンおよびそれらの変形を含むタンパク質、アプタマー、ヌクレオチド、核酸、毒素、脂質、2-デオキシ-2-アミノグルコースおよび他の2-デオキシ-2-アミノアミノピラノシド、グリカンを含む炭水化物、ビオチンならびに他の低分子、すなわち、1500Da未満の分子質量を有する分子、例えば、ジャスプラキノリドおよびその変形のための蛍光標識として使用するための、態様1から14のいずれかに記載の化合物およびその塩。
態様17
以下の化合物の組:7-R(R=H、Me)、13a、13b、16および18
態様18
分析物へのコンジュゲーションのための蛍光試薬としての、態様1から14のいずれかに記載の化合物およびその塩の使用であって、コンジュゲーションが、任意の化学実体、ペプチド、タンパク質、炭水化物、核酸、毒素および脂質とカップリングした化学実体または物質、例えば、アミン、カルボン酸、アルデヒド、アルコール、芳香族化合物、複素環、色素、アミノ酸、アミノ酸残基との少なくとも1つの共有化学結合または少なくとも1つの分子錯体の形成を含む、使用。
態様19
態様1から14のいずれかに記載の蛍光色素を含む、炭水化物-色素コンジュゲート。
態様20
色素が、態様11および以下に示される式6-H、6-Me、8-H、15、23aおよび23b
態様21
態様1から14のいずれかに記載の色素のうちの1つもしくは複数、または態様19または20に記載の炭水化物コンジュゲートの1つもしくは複数を含む、キットまたは組成物。
態様22
一般式BおよびCを有する、水中での477~510nmの吸収極大、0または-6までの正味電荷、535~560nmの発光極大を有する蛍光アミノピレン色素、特に、化合物7-R、13a、13b、15、16、18、23aおよび23bを合成するための方法であって、アリールハロゲンの置換チオアルキル官能基への交換反応と、それに続く、スルホンへの酸化および場合により、ヒドロキシル部におけるリン酸化を含む、方法。
態様23
一般式AおよびDを有する、-4、-6およびそれよりも大きい正味電荷のリン酸化蛍光アミノピレンまたはアミノアクリドン色素、特に化合物6-Rおよび8-Rを合成するための方法であって、アミノアルコールのスルファミド化と、それに続く、ヒドロキシル部におけるリン酸化を含む、方法。
一般材料および方法
1.1.1 調製方法
別途記述されない限り、反応は、アルゴン雰囲気下で実施した。溶媒は、Reag.PhEur純度標準(p.a.)を満たした。市販の物質は、さらなる精製なしに使用し、Sigma Aldrich、Acros Organics、Alfa Aesar、ABCR、Merck Millipore、Carbolution Chemicalsなどから購入した。
1.1.2.1 薄層クロマトグラフィー(TLC)
順相TLCは、シリカゲル60 F254(Merck Millipore)で実施した。TLCについては、逆相シリカゲル60 RP-18 F254(Merck Millipore)を使用した。分取TLCは、10×2.5cmの濃縮ゾーンを有するHPTLCシリカゲル60 F254(Merck Millipore)で実施した。化合物は、TLCプレートをUV光(254または366nm)に曝露することによって検出した。アミンは、ニンヒドリン溶液(EtOH中0.5%)を使用することによって検出した。
粒径40~63μmのシリカゲル60を、Merck Milliporeから購入した。逆相カラムクロマトグラフィーは、POLYGOPREP(登録商標)60~50 C18(Macherey Nagel)で実施した。非活性化シリカゲル60を、MP Biomedicalから購入した。市販のカートリッジを用い、自動化Isolera(商標)One system(Biotage GmbH)で日常的な分離を実施した。
1.1.3.1 吸収分光
吸収スペクトルは、二重ビームUV-vis分光光度計(Varian、シリーズ4000)で記録した。吸収スペクトルの決定のために、パス長1cmの石英セルを使用した。発光スペクトルおよび蛍光量子収率は、Quantaurus-QY Absolute PL量子収率分光計C11347(Quantaurus QY)またはCary Eclipse蛍光分光計(Varian)で得た。
NMRスペクトルは、Agilent 400MR DD2分光計で記録した。すべてのスペクトルは、CDCl3中のCHCl3(7.26ppm)、CD3OD中のCHD2OD(3.31ppm)、(CD3)2CO中のCHD2COCD3(2.05ppm)またはDMSO-d6中のDMSO-d5の残留プロトンのシグナルを使用し、内部標準としてテトラメチルシラン(δ=0.00ppm)を参照する。シグナルの多重度は、以下の通り記載される:s=一重項、br.s=広幅一重項、d=二重項、t=三重項、q=四重項、m=多重項。カップリング定数nJx,yは、単位Hzで示され、nは、結合核xおよびy間の結合数である。13C-シグナルは、HSQCによる間接検出によって明らかにし、H原子に結合した炭素原子の共鳴のみを記録した。
エレクトロスプレーイオン化(ESI)による低分解能質量スペクトル(ESI-MS)は、Varian 500-MS分光計で得た。高分解能質量スペクトル(ESI-HRMS)は、Bruker micro TOF(ESI-TOF-MS)分光計で得た。
HPLC系(Knauer):10mLポンプヘッドを備えるSmartline pump1000(2×)、UV検出器2500、カラムサーモスタット4000、混合チャンバー、分析用の20または50μLループおよび分取カラム用の500μLループを備える注入バルブ;6ポート-3チャネル切り替えバルブ;分析カラム:Eurospher-100 C18 5μm(別途述べない限り)またはKinetex C18 100、5μm、250×4.6mm、流れ1.2mL/分;分取カラム:Kinetex C18 100、5μm、250×21mm、流れ10mL 分/mL、溶媒A:水+0.1% v/vトリフルオロ酢酸(TFA);溶媒B:MeCN+0.1% v/v TFA(別途述べない限り)。分取規模でのリン酸化色素の単離および精製については、0.05~0.1MのEt3N*H2CO3緩衝液(pH=8~8.9;Sigma-Aldrichまたは1M水性Et3Nおよび固体CO2の蒸発によって得たCO2ガスから研究室内で調製)を含有するアセトニトリル-水系。
蛍光アクリドン色素およびその前駆体の合成
2-ニトロアクリジン-9(10H)-オン(1-H)
N,N-(2-ヒドロキシエチル)-2-ニトロ-9-オキソ-9,10-ジヒドロアクリジン-7-スルホンアミド(4-H)
N,N’-(2-ヒドロキシエチル)-2-ニトロ-9-オキソ-9,10-ジヒドロアクリジン-7-スルホンアミドO,O’-ジホスフェート(5-H)
2-アミノ-N,N-(2-ヒドロキシエチル)-9-オキソ-9,10-ジヒドロアクリジン-7-スルホンアミドO,O’-ジホスフェート(6-H)
蛍光1-アミノピレン色素およびその前駆体の合成
3-アミノピレン-1,6,8-トリスルホン酸三ナトリウム塩(APTS)を、Z.Sharrett、S.Gamsey、L.Hirayama、B.Vilozny、J.T.Suri、R.A.Wessling、B Singaram、Org.Biomol.Chem.2009、7、1461~1470によって記載の通りにNa2SO4の存在下で1-アミノピレンおよび20%オレウムから調製した。
2,2,2-トリフルオロ-N-[3,6,8-トリス(ブロモ)ピレン-1-イル]-アセトアミド(12)
3,6,8-トリス[(3-ヒドロキシプロピル)スルホニル]-ピレン-1-アミン(13b)
スルホアルキルスルホニル置換1-アミノピレン誘導体23aおよびその相同体23bの合成は、トリブロモ置換前駆体12におけるSHおよびSO3H官能基を含有するシントンとのハロゲン交換(上記スキーム11を参照されたい)に続いて、スルホンへの酸化を含んだ。
グリカンの還元的アミノ化
本発明の化合物を使用したグリカンの還元的アミノ化については、8-アミノピレン-1,3,6-トリスルホン酸三ナトリウム塩(APTS)およびボラン系還元剤を用いたN-グリカンの蛍光標識のための従来技術のプロトコール(Bigge JC、Patel TP、Bruce JA、Goulding PN、Charles SM、Parekh RB、Analytical Biochemistry 1995、230、229~238;Ruhaak LR、Hennig R、Huhn C、Borowiak M、Dolhain RJEM、Deelder AM、Rapp E、Wuhrer M、Journal of Proteome Research 2010、9、6655~6664)またはその変形例に従うことができる。
Claims (16)
- 少なくとも1つのアルキルスルホニル基を有する、式C
n=1~12;
R1および/またはR2は、互いに独立しており、
H、重水素、アルキルまたは重水素置換アルキル(アルキル基の1個、いくつかまたはすべてのH原子は重水素原子で交換されることができる)、または置換C 2 ~C 12 アルキル基であり;
R1---R2は、4、5、6または7員非芳香族炭素環を形成してもよく、この炭素環は、環の炭素原子の1つに結合したさらなる第一級アミノ基NH 2 、第二級アミノ基NHR a (式中、R a =C 1 ~C 6 アルキル)、またはヒドロキシル基OHを有する;または、R1---R2は、4、5、6または7員非芳香族複素環(この複素環にはO、NまたはSなどのさらなるヘテロ原子が含まれる)を形成してもよく;
ヒドロキシアルキル基(CH2)mOH(式中、m=2~12、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する);R1またはR2基のうちの一方は、カーボネートまたはカルバメート誘導体(CH2)mOCOOR4または(CH2)mNHCOOR4(式中、m=1~12、R4=メチル、エチル、2-クロロエチル、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリル、フェニル基または置換フェニル基、2-ピリジルまたは4-ピリジルである);
(CH2)mNRaRb(式中、m=2~12;直鎖状または分枝状アルキル鎖を有し;Ra、Rbは、互いに独立しており、Hまたは置換されていてもよいC1~C4アルキル基(単数又は複数)であってもよい)であってもよく、
R1またはR2基のうちの一方は、アルキルアジド基(CH2)mN3(式中、m=2~6、直鎖状または分枝状アルキル鎖を有する)であってもよく;
R1またはR2基のうちの一方は、(CH2)nCOOR5(式中、n=1~5、直鎖状または分枝状アルキル鎖(CH2)nを有し、R5は、H、直鎖状または分枝状C1~C6アルキル、CH2CN、2-および4-ニトロフェニル、2,3,5,6-テトラフルオロフェニル、ペンタクロロフェニル、ペンタフルオロフェニル、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリルから選択される)であってもよく;
R1またはR2のうちの一方は、アリールヒドラジンAr-NR 6 NH 2 (式中、Arは全ピレン残基であり、R 6 =Hまたはアルキル)を形成する第一級アミノ基であってもよく;または
R1またはR2基のうちの一方は、アリールヒドロキシルアミンAr-NR 7 OH(式中、Arは全ピレン残基であり、R 7 =Hまたはアルキル)を形成するヒドロキシ基であってもよく;または
R1またはR2基のうちの一方は、アルキルオキシアミノ基(CH2)nONH2(式中、n=1~12)であってもよく;
さらに、R1もしくはR2のうちの一方は、(CH2)nCONHR6(式中、n=1~12、R6=H、C1~C6アルキル、(CH2)mN3、(CH2)m-N-マレイミド、(CH2)m-NHCOCH2X(式中、X=BrもしくはI)、m=2~6、(CH2)nおよびR6中に直鎖状もしくは分枝状アルキル鎖を有する)であってもよく;またはR1もしくはR2のうちの一方は、CH2-C6H4-NH2、COC6H4-NH2、CONHC6H4-NH2もしくはCSNHC6H4-NH2(C6H4は、1,2-、1,3-もしくは1,4-フェニレンである)、COC5H3N-NH2もしくはCH2-C5H3N-NH2(C5H3Nは、ピリジン-2,4-ジイル、ピリジン-2,5-ジイル、ピリジン-2,6-ジイルもしくはピリジン-3,5-ジイルである)を表してもよく;
X=SH、COOH、SO3H、OSO3H、OP(O)(OH)2、OP(O)(OH)Ra(式中、Ra=置換されていてもよいC1~C4アルキル)、P(O)(OH)2、P(O)(OH)Ra(式中、Ra=置換されていてもよいC1~C4アルキル)であり;
ただし、式Cによって表されるすべての化合物において、塩基性条件下、すなわち7<pH<14で、残基Xに3または6つの負荷電基が存在し、これらの負荷電基は、以下:SH、COOH、SO3H、OSO3H、OP(O)(OH)2、OP(O)(OH)Ra(Ra=C1~C4アルキルまたは置換C1~C4アルキル)、P(O)(OH)2、P(O)(OH)Ra(式中、Ra=C1~C4アルキルまたは置換C1~C4アルキル)から選択されるイオン化可能基の少なくとも部分的に脱プロトン化された残基を表す]
またはその塩を有する、蛍光色素。 - Xが、各出現において、SO 3 Hであり、nが、1~12である、請求項1に記載の蛍光色素。
- 式CのR 1 および/またはR 2 は、互いに独立しており、
H、重水素、アルキルまたは重水素置換アルキル(アルキル基の1個、いくつかまたはすべてのH原子は重水素原子で交換されることができる)である、請求項1に記載の蛍光色素。 - 式CのR1および/またはR2は、互いに独立しており、4,6-ジハロ-1,3,5-トリアジニル(C3N3X2)(Xは、ハロゲンである)、2-、3-もしくは4-アミノベンゾイル(COC6H4NH2)、N-[(2-,N-[(3-またはN-[(4-アミノフェニル)ウレイド基(NHCONHC6H4NH2)、N-[(2-,N-[(3-またはN-[(4-アミノフェニル)チオウレイド基(NHCSNHC6H4NH2)、または一般式(CH2)m1COOR3、(CH2)m1OCOOR3、(CH2)n1COOR3もしくは(CO)m1(CH2)m2(CO)n1(NH)n2(CO)n3(CH2)n4COOR3の結合カルボン酸残基およびその反応性エステル(式中、整数m1、m2およびn1、n2、n3、n4は、独立して、それぞれ1~12および0~12の範囲であり、鎖(CH2)m/nは、直鎖状、分枝状、飽和、不飽和、部分もしくは完全重水素化であるおよび/またはN、OもしくはSを含有する炭素環もしくは複素環に含まれ、R3は、H、Dまたは求核反応性脱離基であり、これらに限定されないが、N-スクシンイミジル、スルホ-N-スクシンイミジル、1-オキシベンゾトリアゾリル、シアノメチル、ポリハロゲノアルキル、ポリハロゲノフェニル、2-または4-ニトロフェニルを含む)を表す、請求項1に記載の蛍光色素。
- 以下の式
- 負荷電スルホン酸基および/またはリン酸基、ならびに無機または有機カチオンから選択される対イオンを含み、ならびに/または正荷電基もしくは式Cの色素の窒素部N(R1)R2に形成された電荷移動錯体を、強鉱酸、有機酸もしくはルイス酸のアニオンから選択される対イオンと共に含む、請求項1から5のいずれか一項に記載の蛍光色素塩。
- ヒドラジンN(R)NH2、ヒドロキシルアミンN(R)OHまたはアミノオキシONH2基(式中、Rは、H、アルキル、ヘテロアルキル、アルケニルまたはペルフルオロアルキルである)から選択される、炭水化物-反応性基が、式Cの色素の窒素部N(R 1 )R 2 に、二価または多価のリンカーLを介して連結される、
リンカーLは、少なくとも1個の炭素原子を含み、任意の出現において、C 1 ~C 12 の範囲の長さの直鎖状または分枝状の、アルキル、ヘテロアルキル、ペルフルオロアルキル、アルキルオキシ、単一または複数のジフルオロメチル(CF 2 )、アルケンまたはアルキン部分を任意の組合せで含んでもよく;または、リンカーLは、カルボニル(CH 2 CO、CF 2 CO)部分、1,3,5-トリアジンの残基を含んでもよい、請求項1から6のいずれか一項に記載の蛍光色素。 - 還元的アミノ化に、および還元糖、すなわち、グリカンを含む遊離形態のまたはセミアセタールとしてのアルデヒド基を有するモノマー、オリゴマーまたはポリマー炭水化物との縮合における、請求項1から7のいずれか一項に記載の蛍光色素およびその塩の使用。
- アミノ酸、ペプチド、一次および二次抗体、単一ドメイン抗体、ドセタキセル、アビジン、ストレプトアビジンおよびそれらの変形を含むタンパク質、アプタマー、ヌクレオチド、核酸、毒素、脂質、2-デオキシ-2-アミノグルコースおよび他の2-デオキシ-2-アミノアミノピラノシド、グリカンを含む炭水化物、ビオチンならびに他の低分子、すなわち、1500Da未満の分子質量を有する分子のための蛍光標識としての、請求項1から7のいずれか一項に記載の蛍光色素およびその塩の使用。
- 分析物へのコンジュゲーションのための蛍光試薬としての、請求項1から7のいずれか一項に記載の蛍光色素およびその塩の使用であって、コンジュゲーションが、任意の化学実体、ペプチド、タンパク質、炭水化物、核酸、毒素および脂質とカップリングした、アミン、カルボン酸、アルデヒド、アルコール、芳香族化合物、複素環、色素、アミノ酸、アミノ酸残基を含む、化学実体または物質との少なくとも1つの共有化学結合または少なくとも1つの分子錯体の形成を含む、使用。
- 請求項1から7のいずれか一項に記載の蛍光色素を含む、炭水化物-色素コンジュゲート。
- 色素が、以下に示される式15、23aおよび23b
- 請求項1から7のいずれか一項に記載の色素のうちの1つもしくは複数、または請求項11または12に記載の炭水化物コンジュゲートの1つもしくは複数を含む、キットまたは組成物。
- 請求項1で定義される一般式Cを有する、水中での477~510nmの吸収極大、0または-6までの正味電荷、535~560nmの発光極大を有する蛍光アミノピレン色素を合成するための方法であって、アリールハロゲンの置換チオアルキル官能基への交換反応と、それに続く、スルホンへの酸化を含む、方法。
- ヒドロキシル部におけるリン酸化のステップをさらに含む、請求項14に記載の方法。
- 蛍光アミノピレン色素が、式15、23aおよび23bの化合物からなる群から選択される、請求項14に記載の方法。
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
PCT/EP2019/051396 WO2020151804A1 (en) | 2019-01-21 | 2019-01-21 | Sulfonated 2(7)-aminoacridone and 1-aminopyrene dyes and their use as fluorescent tags, in particular for carbohydrate analysis |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2022524276A JP2022524276A (ja) | 2022-05-02 |
JPWO2020151804A5 JPWO2020151804A5 (ja) | 2023-04-17 |
JP7326453B2 true JP7326453B2 (ja) | 2023-08-15 |
Family
ID=65228528
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2021542325A Active JP7326453B2 (ja) | 2019-01-21 | 2019-01-21 | スルホン化2(7)-アミノアクリドンおよび1-アミノピレン色素ならびに特に炭水化物分析のための、蛍光タグとしてのそれらの使用 |
Country Status (8)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20220107325A1 (ja) |
EP (1) | EP3914650A1 (ja) |
JP (1) | JP7326453B2 (ja) |
CN (1) | CN113631663A (ja) |
AU (1) | AU2019425177B2 (ja) |
CA (1) | CA3127235A1 (ja) |
SG (1) | SG11202107950XA (ja) |
WO (1) | WO2020151804A1 (ja) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP7464609B2 (ja) | 2019-01-21 | 2024-04-09 | マックス-プランク-ゲゼルシャフト・ツア・フェルデルング・デア・ヴィッセンシャフテン・エー・ファオ | 炭水化物および炭水化物混合組成物パターンの自動化高性能同定のための先進的方法、ならびにそのためのシステム、ならびに新しい蛍光色素に基づく、そのための多波長蛍光検出システムの較正のための方法 |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2009112791A1 (en) | 2008-03-14 | 2009-09-17 | Assaymetrics Limited | Fluorogenic peptides and their method of production |
WO2012027717A2 (en) | 2010-08-27 | 2012-03-01 | The Texas A&M University System | Flourescence labeling reagents and uses thereof |
US20140377875A1 (en) | 2011-08-26 | 2014-12-25 | The Texas A&M University System | Fluorescent pi markers for isoelectric focusing separations and fluorescent labeling |
Family Cites Families (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH03502333A (ja) * | 1988-11-14 | 1991-05-30 | ダウベン ロバート エム | 蛍光イムノアッセイ、及びそれに使用する蛍光化合物とトレーサー |
JPH05504363A (ja) * | 1990-12-22 | 1993-07-08 | グリコ,インコーポレイテッド | 2―アミノアクリドンを用いての炭水化物の分析 |
GB0113435D0 (en) | 2001-06-04 | 2001-07-25 | Amersham Pharm Biotech Uk Ltd | Acridone derivatives as labels for fluorescence detection of target materials |
EP1940965B1 (en) | 2005-10-28 | 2014-03-26 | Almac Sciences (Scotland) Limited | Novel fluorescent dyes and uses thereof |
GB0906318D0 (en) | 2009-04-09 | 2009-05-20 | Glysure Ltd | Fluorophore and fluorescent sensor compound containing same |
-
2019
- 2019-01-21 AU AU2019425177A patent/AU2019425177B2/en active Active
- 2019-01-21 WO PCT/EP2019/051396 patent/WO2020151804A1/en unknown
- 2019-01-21 CN CN201980094346.3A patent/CN113631663A/zh active Pending
- 2019-01-21 EP EP19701605.8A patent/EP3914650A1/en active Pending
- 2019-01-21 US US17/424,415 patent/US20220107325A1/en active Pending
- 2019-01-21 SG SG11202107950XA patent/SG11202107950XA/en unknown
- 2019-01-21 CA CA3127235A patent/CA3127235A1/en active Pending
- 2019-01-21 JP JP2021542325A patent/JP7326453B2/ja active Active
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2009112791A1 (en) | 2008-03-14 | 2009-09-17 | Assaymetrics Limited | Fluorogenic peptides and their method of production |
WO2012027717A2 (en) | 2010-08-27 | 2012-03-01 | The Texas A&M University System | Flourescence labeling reagents and uses thereof |
US20140377875A1 (en) | 2011-08-26 | 2014-12-25 | The Texas A&M University System | Fluorescent pi markers for isoelectric focusing separations and fluorescent labeling |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
BLAZQUEZら,ACRIDONE HETEROCYCLES AS FLUORESCENT SENSORS FOR ANIONS,HETEROCYCLES,2006年,Vol. 69,pp. 73-81 |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP7464609B2 (ja) | 2019-01-21 | 2024-04-09 | マックス-プランク-ゲゼルシャフト・ツア・フェルデルング・デア・ヴィッセンシャフテン・エー・ファオ | 炭水化物および炭水化物混合組成物パターンの自動化高性能同定のための先進的方法、ならびにそのためのシステム、ならびに新しい蛍光色素に基づく、そのための多波長蛍光検出システムの較正のための方法 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CA3127235A1 (en) | 2020-07-30 |
WO2020151804A1 (en) | 2020-07-30 |
JP2022524276A (ja) | 2022-05-02 |
CN113631663A (zh) | 2021-11-09 |
SG11202107950XA (en) | 2021-08-30 |
US20220107325A1 (en) | 2022-04-07 |
AU2019425177B2 (en) | 2023-01-12 |
EP3914650A1 (en) | 2021-12-01 |
AU2019425177A1 (en) | 2021-08-12 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CA2613386A1 (en) | Cyanine dyes and methods of use in biological applications | |
WO2000075237A2 (en) | pH SENSITIVE CYANINE DYES AS REACTIVE FLUORESCENT REAGENTS | |
EP3341377B1 (en) | Polyfluoreno[4,5-cde]oxepine conjugates and their use in methods of analyte detection | |
EP2761296A1 (en) | Rapid fluorescence tagging of glycans and other biomolecules with enhanced ms signals | |
EP3137573B1 (en) | New chromophoric structures for lanthanide chelates field of the invention | |
US20210395606A1 (en) | Chromophoric structures for macrocyclic lanthanide chelates | |
Renault et al. | Deeper insight into protease-sensitive “covalent-assembly” fluorescent probes for practical biosensing applications | |
CA2336904A1 (en) | Novel fluorescent lanthanide chelates | |
JP7326453B2 (ja) | スルホン化2(7)-アミノアクリドンおよび1-アミノピレン色素ならびに特に炭水化物分析のための、蛍光タグとしてのそれらの使用 | |
CN110914259B (zh) | 新型水溶性单支化和双支化的络合剂及相应的镧系元素络合物 | |
EP1394219A1 (en) | PH sensitive cyanine dyes as reactive fluorescent reagents | |
JP7464609B2 (ja) | 炭水化物および炭水化物混合組成物パターンの自動化高性能同定のための先進的方法、ならびにそのためのシステム、ならびに新しい蛍光色素に基づく、そのための多波長蛍光検出システムの較正のための方法 | |
US20230040324A1 (en) | Aminoacridine and aminopyrene dyes and their use as fluorescent tags, in particular for carbohydrate analysis | |
EP3469370B1 (en) | Background blockers for binding assays |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20210924 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20220920 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20221005 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20230105 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20230306 |
|
A524 | Written submission of copy of amendment under article 19 pct |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A524 Effective date: 20230404 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20230710 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20230802 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 7326453 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |