JP7315244B2 - Clec12a発現癌を標的にするための組成物および方法 - Google Patents

Clec12a発現癌を標的にするための組成物および方法 Download PDF

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Description

関連出願の相互参照
本出願は、2018年1月9日に出願された米国特許仮出願第62/615,096号、2018年4月9日に出願された同第62/654,621号、2018年4月9日に出願された同第62/654,623号、2018年9月12日に出願された同第62/730,390号、2018年9月12日に出願された同第62/730,397号、2018年11月15日に出願された同第62/767,859号、および2018年11月15日に出願された同第62/767,865号の利益を主張し、これらは全て参照によりそれらの全体が本明細書に援用される。
配列表
本出願は、2019年1月6日に作成された「320103-2040配列表_ST25」と題するASCII.txtファイルとして電子形式で出願された配列表を含む。配列表の内容は、その全体が本明細書に援用される。
手術、放射線治療、および化学療法は、白血病、固形腫瘍、および転移を含む癌の治療のための標準的に受け入れられた手法である。身体の免疫系を直接的または間接的に利用して癌を縮小または根絶する免疫療法(生物学的療法、生物療法、または生物学的反応修飾物質療法と呼ばれることもある)は、従来の癌治療の補助として長年研究されてきた。ヒト免疫系は、癌治療のための未開発資源であり、免疫系の構成要素が適切に利用されれば、有効な治療を開発することができると考えられる。
CLEC12A発現癌の標的治療のための組成物および方法が開示される。例えば、ハイブリドーマ1F3、1F8、1G3、2A10、3F12、4E3、4E10、5B2、5F10、6C7、9A2、11C7、11H1および12D6由来の抗CLEC12Aモノクローナル抗体が本明細書に提供される。これらの抗体の1つまたは複数の抗原結合領域を少なくとも含む組換え抗体、ヒト化抗体、および/またはキメラ抗体も開示される。
また、CLEC12A発現悪性細胞を破壊するために、T細胞を関与させることができる多特異性多価抗体も本明細書に開示される。例えば、抗体は、二重特異性T細胞誘導体(T-cell engager)であり得る。抗体は、融合ポリペプチド、例えば、以下の式を有する融合ポリペプチドから改変することができる。
I-VI-VT-VT、
T-VT-VI-VI、
T-VT-VI-VI、
I-VI-VT-VT、
I-VI-VT-VT、
T-VT-VI-VI、
式中、「VI」は、免疫細胞抗原に特異的な軽鎖可変ドメインであり、
「VT」は、CLEC12Aに特異的な重鎖可変ドメインであり、
「VT」は、CLEC12Aに特異的な軽鎖可変ドメインであり、
「VI」は、免疫細胞抗原に特異的な重鎖可変ドメインであり、
「-」は、ペプチドリンカーまたはペプチド結合からなる。
免疫細胞抗原は、ヒトNK細胞、T細胞、単球、マクロファージまたは顆粒球上で発現される細胞表面分子であってもよい。例えば、細胞表面分子は、抗原CD2、CD3、CD16、CD64、CD89、NKp30、NKp44、NKp46、NKp80(KLR-F1)、NKG2C、またはNKG2Dであり得る。
また、開示される融合ポリペプチドをコードする単離された核酸、ならびに発現制御配列に作動可能に結合されたこの単離された核酸を含有する核酸ベクターも開示される。また、これらのベクターでトランスフェクトされた細胞、および開示された融合ポリペプチドを産生するためのこれらの細胞の使用も開示される。
薬学的に許容される担体中に本明細書に開示する分子を含む医薬組成物もまた開示される。また、対象に治療上有効量の開示される医薬組成物を投与することを伴う、対象において癌を治療するための方法も開示される。一部の場合、癌は、任意のCLEC12A発現悪性腫瘍であり得る。一部の場合、癌は、骨髄異形成症候群、急性骨髄性白血病、または混合表現型(bi-phenotypic)白血病を含む。
また、CLEC12A発現癌を標的化し、死滅させるために、養子細胞移植とともに使用することができるキメラ抗原受容体(CAR)ポリペプチドも開示される。開示されるCARポリペプチドは、CLEC12A発現癌細胞に結合することができる抗CLEC12A結合剤を外部ドメインに含有する。また、開示されるCARポリペプチドを発現するための、遺伝子改変の免疫エフェクター細胞も開示される。
抗CLEC12A結合剤は、一部の実施形態では、CLEC12Aに特異的に結合する抗体断片である。例えば、抗原結合ドメインは、CLEC12Aに特異的に結合する抗体のFabまたは単鎖可変断片(scFv)であり得る。抗CLEC12A結合剤は、一部の実施形態では、CLEC12Aに特異的に結合するアプタマーである。例えば、抗CLEC12A結合剤は、CLEC12Aに結合する能力に基づいてランダム配列プールから選択されるペプチドアプタマーであってもよい。また、抗CLEC12A結合剤は、CLEC12Aの天然リガンド、またはCLEC12Aに結合することができるその変異体および/または断片であってもよい。
一部の実施形態では、開示される抗体またはCARの抗CLEC12A領域は、ハイブリドーマ1F3、1F8、1G3、2A10、3F12、4E3、4E10、5B2、5F10、6C7、9A2、11C7、11H1、12D6、またはこれらの組み合わせに由来する。一部の実施形態では、抗CLEC12A領域(例えば、scFv)は、CDR1、CDR2およびCDR3配列を有する可変重(V)ドメインおよびCDR1、CDR2およびCDR3配列を有する可変軽(V)ドメインを含むことができる。
一部の実施形態では、VドメインのCDR1配列は、アミノ酸配列GFTFSSFA(配列番号1)、SFAVS(配列番号2)、またはSHDMS(配列番号3)を含み、VドメインのCDR2配列は、アミノ酸配列ISSGGAYT(配列番号4)、TISSGGAYTFYKDSVKGRFT(配列番号5)、またはYISGGGTNIYYSDTVKGRFT(配列番号6)を含み、VドメインのCDR3配列は、アミノ酸配列ARHSGYDGYYLYAMDY(配列番号7)、HSGYDGYYLYAMDY(配列番号8)、またはPNYNYGGSWFAY(配列番号9)を含み、VのCDR1配列は、アミノ酸配列SSVHY(配列番号10)、ASSSVHYMH(配列番号11)、またはSASSSVHYMH(配列番号12)を含み、VドメインのCDR2配列は、アミノ酸配列DTSX(配列番号13)、またはDTSKLAS(配列番号14)を含
み、VドメインのCDR3配列は、アミノ酸配列QQWTSNPPT(配列番号15)を含む。
一部の実施形態では、抗CLEC12A Vドメインは、アミノ酸配列ELILVESGGGLVKPGGSLKLSCAVSGFTFSSFAMSWVRQTPEKRLEWVATISSGGAYTFYKDSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLRSEDSAMYYCARHSGYDGYYLYAMDYWGQGTSVTVSS(配列番号16、1F3H8)を含む。
したがって、一部の実施形態では、抗CLEC12A Vドメインは、次の核酸配列によってコードされる:
GAACTAATACTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGAAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAGTCTCTGGATTCACTTTCAGTTCCTTTGCCATGTCTTGGGTTCGCCAGACTCCGGAGAAGAGGCTGGAGTGGGTCGCAACCATTAGTAGTGGTGGAGCTTACACCTTCTATAAAGACAGTGTGAAGGGGCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAATACCCTGTACCTGCAAATGAGCAGTCTGAGGTCTGAGGACTCGGCCATGTATTACTGTGCAAGACATAGCGGCTATGATGGTTACTACCTCTATGCTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACCTCAGTCACCGTCTCCTCA(配列番号17、1F3H8)。
一部の実施形態では、抗CLEC12A Vドメインは、アミノ酸配列GVQCELILVESGGGLVKPGGSLKLSCAVSGFTFSSFAVSWVRQTPEKRLEWVATISSGGAYTFYKDSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLRSEDSAMYYCARHSGYDGYYLYAMDYWGQGTSVTVSS(配列番号18、1F3A10)を含む。
したがって、一部の実施形態では、抗CLEC12A Vドメインは、次の核酸配列によってコードされる:
GGTGTCCAGTGTGAACTAATACTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGAAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAGTCTCTGGATTCACTTTCAGTTCCTTTGCCGTGTCCTGGGTTCGCCAGACTCCGGAGAAGAGGCTGGAGTGGGTCGCAACCATTAGTAGTGGTGGAGCTTACACCTTCTATAAAGACAGTGTGAAGGGGCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAATACCCTGTACCTGCAAATGAGCAGTCTGAGGTCTGAGGACTCGGCCATGTATTACTGTGCAAGACATAGCGGCTATGATGGTTACTACCTCTATGCTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACCTCAGTCACCGTCTCCTCA(配列番号19、1F3A10)。
一部の実施形態では、抗CLEC12A Vドメインは、アミノ酸配列EVQLEESGGGLVQPGGSLKVSCAVSGLAFSSHDMSWVRQTPEKRLEWVAYISGGGTNIYYSDTVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLKSEDTAIYYCARPNYNYGGSWFAYWGQGTLVTVSA(配列番号20、1F3F3)を含む。
したがって、一部の実施形態では、抗CLEC12A Vドメインは、次の核酸配列によってコードされる:
GAGGTGCAGCTGGAGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGCAGC
CGGGAGGGTCCCTGAAAGTCTCCTGTGCAGTTTCCGGACTCGCTTTCAGCAGCCATGACATGTCTTGGGTTCGCCAGACTCCGGAGAAGCGGCTGGAGTGGGTCGCATACATTAGTGGAGGTGGTACTAATATCTATTATTCAGACACTGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAACACCCTGTACCTGCAAATGAGCAGTCTGAAGTCTGAAGACACAGCCATTTATTACTGTGCAAGACCCAATTATAATTACGGCGGTTCCTGGTTTGCTTACTGGGGCCAAGGGACTCTGGTCACTGTCTCTGCA(配列番号21、1F3F3)。
一部の実施形態では、抗CLEC12A Vドメインは、アミノ酸配列QIVLTQSPEIMSASPGEKVTMTCSASSSVHYMHWYQQKSGTSPKRWIYDTSKLASGVPGRFSGSGSGTSYSLTISSMESEDAATYYCQQWTSNPPTFGGGTKLEIK(配列番号22、1F3H8、1F3F3、1F3A10)を含む。
したがって、一部の実施形態では、抗CLEC12A Vドメインは、次の核酸配列によってコードされる:
CAAATTGTTCTCACCCAGTCTCCAGAAATCATGTCTGCATCTCCAGGGGAGAAGGTCACCATGACCTGCAGTGCCAGCTCAAGTGTACATTACATGCACTGGTACCAGCAGAAGTCAGGCACCTCCCCCAAAAGATGGATTTATGACACATCCAAACTGGCTTCTGGAGTCCCTGGTCGCTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGGACCTCTTACTCTCTCACAATCAGCAGCATGGAGTCTGAAGATGCTGCCACTTATTACTGCCAGCAGTGGACTAGTAACCCACCCACGTTCGGAGGGGGGACCAAGCTGGAAATTAAACG(配列番号23、1F3H8、1F3F3、1F3A10)。
重鎖および軽鎖は、好ましくはリンカーによって分離される。scFv抗体に好適なリンカーは当該技術分野で既知である。一部の実施形態では、リンカーは、アミノ酸配列GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号24)を含む。scFvは、式NH-V-リンカー-V-COOHまたはNH-V-リンカー-V-COOHを有し得る。
一部の実施形態では、抗CLEC12A scFvは、次のアミノ酸配列を含む:
ELILVESGGGLVKPGGSLKLSCAVSGFTFSSFAMSWVRQTPEKRLEWVATISSGGAYTFYKDSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLRSEDSAMYYCARHSGYDGYYLYAMDYWGQGTSVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSQIVLTQSPEIMSASPGEKVTMTCSASSSVHYMHWYQQKSGTSPKRWIYDTSKLASGVPGRFSGSGSGTSYSLTISSMESEDAATYYCQQWTSNPPTFGGGTKLEIK(配列番号25、1F3H8)。
一部の実施形態では、抗CLEC12A scFvは、次のアミノ酸配列を含む:
GVQCELILVESGGGLVKPGGSLKLSCAVSGFTFSSFAVSWVRQTPEKRLEWVATISSGGAYTFYKDSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLRSEDSAMYYCARHSGYDGYYLYAMDYWGQGTSVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSQIVLTQSPEIMSASPGEKVTMTCSASSSVHYMHWYQQKSGTSPKRWIYDTSKLASGVPGRFSGSGSGTSYSLTISSMESEDAATYYCQQWTSNPPTFGGGTKLEIK(配列番号26、1F3A10)。
一部の実施形態では、抗CLEC12A scFvは、次のアミノ酸配列を含む:
EVQLEESGGGLVQPGGSLKVSCAVSGLAFSSHDMSWVRQTPEKRLEWVAYISGGGTNIYYSDTVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLKSEDTAIYYCARPNYNYGGSWFAYWGQGTLVTVSAGGGGSGGGGSGGGGSQIVLTQSPEIMSASPGEKVTMTCSASSSVHYMHWYQQKSGTSPKRWIYDTSKLASGVPGRFSGSGSGTSYSLTISSMESEDAATYYCQQWTSNPPTFGGGTKLEIK(配列番号27、1F3F3)。
一部の実施形態では、抗CLEC12A scFvは、次のアミノ酸配列を含む:
QIVLTQSPEIMSASPGEKVTMTCSASSSVHYMHWYQQKSGTSPKRWIYDTSKLASGVPGRFSGSGSGTSYSLTISSMESEDAATYYCQQWTSNPPTFGGGTKLEIKGGGGSGGGGSGGGGSELILVESGGGLVKPGGSLKLSCAVSGFTFSSFAMSWVRQTPEKRLEWVATISSGGAYTFYKDSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLRSEDSAMYYCARHSGYDGYYLYAMDYWGQGTSVTVSS(配列番号28)。
一部の実施形態では、抗CLEC12A scFvは、次のアミノ酸配列を含む:
QIVLTQSPEIMSASPGEKVTMTCSASSSVHYMHWYQQKSGTSPKRWIYDTSKLASGVPGRFSGSGSGTSYSLTISSMESEDAATYYCQQWTSNPPTFGGGTKLEIKGGGGSGGGGSGGGGSGVQCELILVESGGGLVKPGGSLKLSCAVSGFTFSSFAVSWVRQTPEKRLEWVATISSGGAYTFYKDSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLRSEDSAMYYCARHSGYDGYYLYAMDYWGQGTSVTVSS(配列番号29)。
一部の実施形態では、抗CLEC12A scFvは、次のアミノ酸配列を含む:
QIVLTQSPEIMSASPGEKVTMTCSASSSVHYMHWYQQKSGTSPKRWIYDTSKLASGVPGRFSGSGSGTSYSLTISSMESEDAATYYCQQWTSNPPTFGGGTKLEIKGGGGSGGGGSGGGGSEVQLEESGGGLVQPGGSLKVSCAVSGLAFSSHDMSWVRQTPEKRLEWVAYISGGGTNIYYSDTVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLKSEDTAIYYCARPNYNYGGSWFAYWGQGTLVTVSA(配列番号30)。
他のCARと同様に、開示されるポリペプチドはまた、膜貫通ドメインおよび免疫エフェクター細胞を活性化することができる内部ドメインを含有することができる。例えば、内部ドメインは、シグナル伝達ドメインと、1つまたは複数の共刺激シグナル伝達領域とを含有することができる。
一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ゼータ(CD3ζ)シグナル伝達ドメインである。一部の実施形態では、共刺激シグナル伝達領域は、CD28、4-1BB、またはこれらの組み合わせの細胞質ドメインを含む。場合によっては、共刺激シグナル伝達領域は、1つまたは複数の細胞内シグナル伝達および/または共刺激分子の1、2、3、または4個の細胞質ドメインを含有する。一部の実施形態では、共刺激シグナル伝達領域は、シグナル伝達を増強するCD28および/または4-1BBの細胞質ドメイン内に1つまたは複数の変異を含有する。
一部の実施形態では、CARポリペプチドは、不完全な内部ドメインを含有する。例えば、CARのポリペプチドは、細胞内シグナル伝達ドメインまたは共刺激ドメインのみを含有することができるが、両方は含有しない。これらの実施形態では、免疫エフェクター細胞は、それと、欠損ドメインを含有する第2のCARポリペプチド(または内因性T細胞受容体)の両方がそれぞれの抗原に結合しない限り、活性化されない。したがって、一部の実施形態では、CARポリペプチドはCD3ゼータ(CD3ζ)シグナル伝達ドメインを含有するが、共刺激シグナル伝達領域(CSR)を含有しない。他の実施形態では、CARポリペプチドは、CD28、4-1BB、またはこれらの組み合わせの細胞質ドメインを含有するが、CD3ゼータ(CD3ζ)シグナル伝達ドメイン(SD)を含有しない。
また、開示されるCARポリペプチドをコードする単離された核酸配列、これらの単離された核酸を含有するベクター、およびこれらのベクターを含有する細胞も開示される。例えば、細胞は、アルファ-ベータT細胞、ガンマ-デルタT細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、ナチュラルキラーT(NKT)細胞、B細胞、自然リンパ球細胞(ILC)、サイトカイン誘導キラー(CIK)細胞、細胞傷害性Tリンパ球(CTL)、リンホカイン活性化キラー(LAK)細胞、および制御性T細胞からなる群から選択される、免疫エフェクター細胞であり得る。
一部の実施形態では、細胞は、CARの抗原結合ドメインがCLEC12Aに結合するときに抗腫瘍免疫を示す。
また、開示されるCLEC12A特異的なCARで遺伝子改変された有効量の免疫エフェクター細胞を対象に投与することを伴う、CLEC12A発現癌を有する対象において抗腫瘍免疫を提供する方法も開示される。
本発明の1つまたは複数の実施形態の詳細は、付属の図面および以下の説明に記載される。本発明の他の特徴、目的、および利点は、説明および図面から、および特許請求の範囲から明らかであろう。
図1A~1Dは、標的細胞として使用したCLEC12A(CHO-CLEC12A)を過剰発現するCHO細胞を示す。抗CLEC12A CARを発現するガンマレトロウイルスを、健康なPBMCから単離した初代T細胞に形質導入した。各CARの形質導入効率は、mCherry発現のフローサイトメトリー分析によって決定した(図1Aおよび1B)。CAR陽性細胞を、1:1(図1C)または1:5(図1D)のいずれかのエフェクター対標的比で標的細胞に添加した。UT=非形質導入、MFI=蛍光強度の中央値。 同上。 同上。 図2A~2Iは、抗CLEC12A CARの免疫表現型を示す。PBMCから単離された健康なT細胞を、抗CLEC12A CARで形質導入した。抗原刺激なしで1週間培養した後、CD3、CD4、CD8、PD1、CCR7、およびCD45RAについて細胞を染色し、フローサイトメーターでデータを収集した。形質導入効率は、mCherry発現に基づいて決定した(図2Aおよび2B)。CD4、CD8、およびPD1発現について、生きたCAR陽性のT細胞を分析した(図2C~2H)。また、T細胞のサブセットも、CCR7およびCD45RA発現に基づいて分析した(図2I)。EFF=エフェクター、EM=エフェクターメモリー、CM=セントラルメモリー、N=未処理。 同上。 同上。 同上。 同上。 同上。 同上。 同上。 同上。 図3A~3Fは、抗CLEC12A CARのCD4およびCD8免疫表現型を示す。CD4およびCD8 T細胞を、PD1(図3Aおよび3B、3Dおよび3E)の発現について、およびT細胞のサブセット(図3Cおよび3F)について分析した。EFF=エフェクター、EM=エフェクターメモリー、CM=セントラルメモリー、N=未処理。 同上。 同上。 同上。 同上。 同上。
CLEC12A発現癌上の腫瘍関連抗原(TAA)を特異的に認識することができる、二重特異性抗体およびキメラ抗原受容体(CAR)が本明細書に開示される。また、これらのCARを発現するように改変されたT細胞またはナチュラルキラー(NK)細胞などの免疫エフェクター細胞も開示される。したがって、開示される抗体および免疫エフェクター細胞を使用して、CLEC12A発現癌を有する対象において抗腫瘍免疫を提供するための方法も開示される。
抗体
本開示の組成物および方法に使用することができる抗体としては、任意のクラスの全免疫グロブリン(すなわち、無傷の抗体)、その断片、および少なくとも抗体の抗原結合可変ドメインを含有する合成タンパク質が挙げられる。可変ドメインは、抗体間で配列が異なり、その特定の抗原に対する各特定の抗体の結合および特異性に使用される。しかしながら、可変性は、通常、抗体の可変ドメインを通じて均等に分布していない。典型的には、軽鎖および重鎖可変ドメインの両方において相補性決定領域(CDR)または超可変領域と呼ばれる3つのセグメントに濃縮される。可変ドメインのより高度に保存された部分は、フレームワーク(FR)と呼ばれる。天然の重鎖および軽鎖の可変ドメインは、それぞれ4つのFR領域を含み、主にβシートの立体配置をとり、3つのCDRによって連結され、CDRは、ループを形成してβシート構造を連結し、場合によっては、その一部を形成する。各鎖中のCDRは、FR領域によって近接して一緒に保持され、他方の鎖からのCDRとともに、抗体の抗原結合部位の形成に寄与する。
免疫化時、内因性免疫グロブリン産生の非存在下で、ヒト抗体の完全なレパートリーを産生することが可能なトランスジェニック動物(例えば、マウス)を用いることができる。例えば、キメラおよび生殖系列変異マウスにおける抗体重鎖連結領域(J(H))遺伝子のホモ接合型欠失が、内因性抗体産生の完全な阻害をもたらすことが記載されている。そのような生殖系列変異マウスにおけるヒト生殖系列免疫グロブリン遺伝子アレイの移動は、抗原チャレンジ時にヒト抗体の産生をもたらす(例えば、Jakobovits et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:2551-255(1993)、Jakobovits et al.,Nature,362:255-258(1993)、Bruggemann et al.,Year in Immuno.,7:33(1993)を参照)。ヒト抗体はまた、ファージディスプレイライブ
ラリ内で産生され得る(Hoogenboom et al.,J.Mol.Biol.,227:381(1991)、Marks et al.,J.Mol.Biol.,222:581(1991))。CoteらおよびBoernerらの技術は、ヒトモノクローナル抗体の調製にも利用可能である(Cole et al.,Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy,Alan R.Liss,p.77(1985)、Boerner et al.,J.Immunol.,147(1):86-95(1991))。
任意選択的に、抗体は、他の種で生成され、ヒトにおける投与のために「ヒト化」される。非ヒト(例えば、マウス)抗体のヒト化形態は、非ヒト免疫グロブリンに由来する最小配列を含有するキメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖またはその断片(Fv、Fab、Fab’、F(ab’)2または抗体の他の抗原結合サブ配列など)である。ヒト化抗体としては、レシピエント抗体の相補性決定領域(CDR)由来の残基が、所望の特異性、親和性、および能力を有するマウス、ラット、またはウサギ等の非ヒト種(ドナー抗体)のCDR由来の残基に置き換えられたヒト免疫グロブリン(レシピエント抗体)が挙げられる。場合によっては、ヒト免疫グロブリンのFvフレームワーク残基は、対応する非ヒト残基によって置換される。ヒト化抗体はまた、レシピエント抗体にも、インポートされるCDR中もしくはフレームワーク配列中にも見出されない残基を含んでもよい。一般に、ヒト化抗体は、少なくとも1つ、典型的には2つの可変ドメインを実質的に全て含み、CDR領域の全てまたは実質的に全てが非ヒト免疫グロブリンのものに対応し、FR領域の全てまたは実質的に全てがヒト免疫グロブリンコンセンサス配列のものである。ヒト化抗体はまた、最適には、免疫グロブリン定常領域(Fc)の少なくとも一部、典型的には、ヒト免疫グロブリンの少なくとも一部を含む(Jones et al.,Nature,321:522-525(1986)、Riechmann et al.,Nature,332:323-327(1988)、およびPresta,Curr.Op.Struct.Biol.,2:593-596(1992))。
非ヒト抗体をヒト化するための方法は、当該技術分野で既知である。一般に、ヒト化抗体は、非ヒトである供給源からそこに導入される1つまたは複数のアミノ酸残基を有する。これらの非ヒトアミノ酸残基は、典型的には、「インポート」可変ドメインから得られる「インポート」残基と称されることが多い。抗体ヒト化技術は、一般に、抗体分子の1つまたは複数のポリペプチド鎖をコードするDNA配列を操作するための組換えDNA技術の使用を伴う。ヒト化は、本質的に、Winterおよび共同研究者の方法に従って、げっ歯類のCDRまたはCDR配列を、ヒト抗体の対応する配列に置き換えることによって行うことができる(Jones et al.,Nature,321:522-525(1986)、Riechmann et al.,Nature,332:323-327(1988)、Verhoeyen et al.,Science,239:1534-1536(1988))。したがって、非ヒト抗体(またはその断片)のヒト化形態は、キメラ抗体または断片(米国特許第4,816,567号)であり、実質的に無傷のヒト可変ドメイン未満が、非ヒト種由来の対応する配列によって置換されている。実際には、ヒト化抗体は、典型的には、いくつかのCDR残基およびおそらくいくつかのFR残基が、げっ歯類抗体中の類似部位からの残基によって置換されているヒト抗体である。
また、生理活性を有する抗体の断片も開示される。断片は、他の配列に結合しているか否かにかかわらず、特定の領域または特定のアミノ酸残基の挿入、欠失、置換、または他の選択された修飾を含むが、ただし、断片の活性は、非修飾抗体または抗体断片と比較して著しく変化または障害されない。
本開示の抗原タンパク質に特異的な単鎖抗体の産生にも適合させることができる。単鎖
抗体の産生方法は、当業者に既知である。単鎖抗体は、短いペプチドリンカーを使用して重鎖および軽鎖の可変ドメインを一緒に融合することによって生成することができ、それによって、一分子上に抗原結合部位を再構成することができる。1つの可変ドメインのC末端が、15~25個のアミノ酸ペプチドまたはリンカーを介して他方の可変ドメインのN末端に繋がれた単鎖抗体可変断片(scFv)は、抗原結合または結合の特異性を著しく妨害することがないように開発されている。リンカーは、重鎖および軽鎖が、それらの適切な立体構造の配向で、一緒に結合することできるように選択される。
二価単鎖可変断片(di-scFv)は、2つのscFvを連結することによって改変することができる。これは、2つのV領域および2つのV領域を有する単一のペプチド鎖を産生することによって行うことができ、タンデム型scFvが得られる。また、scFvは、2つの可変領域を一緒に折り畳むには短すぎるリンカーペプチド(約5個のアミノ酸)を用いて設計することができ、scFvを強制的に二量体化する。このタイプは、ダイアボディとして知られている。ダイアボディは、対応するscFvよりも最大40倍低い解離定数を有することが示されており、それらがそれらの標的に対してはるかに高い親和性を有していることを意味する。さらに短いリンカー(1つまたは2つのアミノ酸)は、三量体(トリアボディまたはトリボディ)の形成につながる。テトラボディも生産されている。それらは、ダイアボディよりも標的に対してさらに高い親和性を示す。
CD3およびCLEC12Aに選択的に結合するように設計された二重特異性抗体は、非特異性T細胞の活性化およびサイトカインストームを引き起こすことがある。CD3およびCLEC12Aに選択的に結合するように設計された二重特異性ダイアボディは、腎クリアランス閾値よりも少ない分子量(55~60kD)を有し、急速な排除をもたらすことがある。そうであるから、ダイアボディは、持続注入によって投与されなければならない。開示される四価二重特異性抗体は、顕著に伸長した薬物動態(PK)を伴う腎ろ過閾値よりも大きい分子量(例えば、105~110kD)を有し得る。
T細胞にCLEC12A発現悪性細胞を破壊させ得る多価の改変抗体を形成することが可能な、融合ポリペプチドが提供される。改変抗体は、例えば、少なくとも1つのscFv、少なくとも1つのFab断片、少なくとも1つのFv断片等を含んでもよい。それは、二価、三価、四価等であってもよい。多価抗体は、多特異性であり、例えば、二重特異性、三重特異性、四重特異性等である。多価抗体は、ダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ等の任意の形態であってもよい。
二価および二重特異性抗体は、抗体可変ドメインのみを使用して構築することができる。かなり効率的で比較的単純な方法は、VドメインとVドメインとの間のリンカー配列を、それらが折り畳んで互いに結合することができないほど短くすることである。リンカー長を3~12残基に減少させることで、scFv分子の単量体の立体配置を防ぎ、60kDaの非共有結合性scFv二量体「ダイアボディ」の形成との分子間VH-VL対合を助ける。また、ダイアボディ型式は、短いリンカーによって別の抗体のVLドメインに結合された1つの抗体からのVHドメインからなる2つの単鎖融合産物の非共有結合性の会合によって得られる、組換え二重特異性抗体の生成に使用され得る。リンカー長をさらに、3つの残基以下に減少させると、三量体(「トリアボディ」、約90kDa)または四量体(「テトラボディ」、約120kDa)が形成され得る。改変抗体、特に単一ドメイン断片の総説については、Holliger and Hudson,2005,Nature Biotechnology,23:1126-1136を参照されたい。そのような改変抗体の全ては、本明細書に提供される融合ポリペプチドにおいて使用され得る。四価Tandab(登録商標)は、実質的に、WO1999/057150A3またはUS2006/0233787に記載されているように調製されてもよく、これらは、Tandab(登録商標)分子の製造方法の教示のために参照により援用される。
改変抗体の抗原認識部位または可変領域全体は、任意の目的の抗原(例えば、CLEC12A)に対する1つまたは複数の親抗体に由来し得る。親抗体は、天然に存在する抗体または抗体断片、天然に存在する抗体から適合される抗体または抗体断片、目的の抗原に特異的であることが知られている抗体または抗体断片の配列を使用して新たに構築される抗体、を含むことができる。親抗体に由来し得る配列としては、重鎖および/または軽鎖可変領域および/またはCDR、フレームワーク領域またはその他の部分が挙げられる。
多価多特異性抗体は、2つ以上の可変領域を含む重鎖および/または1つまたは複数の可変領域を含む軽鎖を含有してもよく、少なくとも2つの可変領域は、同じ抗原上の異なるエピトープを認識する。
融合ポリペプチド、または融合ポリペプチド自体に含めるための候補改変抗体は、様々な既知のアッセイを使用して活性についてスクリーニングされ得る。例えば、結合特異性を決定するためのスクリーニングアッセイは、当該技術分野で周知であり、通常実施される。かかるアッセイの包括的な考察については、Harlow et al.(Eds.),ANTIBODIES:A LABORATORY MANUAL; Cold Spring Harbor Laboratory; Cold Spring Harbor,N.Y.,1988,Chapter 6を参照されたい。
医薬組成物
薬学的に許容される担体中に開示される分子を含む医薬組成物もまた開示される。医薬担体は、当業者に既知である。これらは、最も典型的には、生理的pHにおける滅菌水、食塩水、および緩衝溶液などの溶液を含む、ヒトへの薬物投与のための標準的な担体であろう。例えば、好適な担体およびそれらの製剤は、Remington: The Science and Practice of Pharmacy(21 ed.) ed.PP.Gerbino,Lippincott Williams & Wilkins,Philadelphia,PA.2005に記載されている。典型的には、製剤中に適量の薬学的に許容される塩を使用して、製剤を等張性にする。薬学的に許容される担体の例としては、限定されないが、食塩水、リンゲル液、およびデキストロース溶液が挙げられる。溶液のpHは、好ましくは約5~約8、より好ましくは約7~約7.5である。溶液には、RNA分解酵素が含まれないようにすべきである。さらなる担体としては、抗体を含有する固体疎水性ポリマーの半透性マトリックス等の徐放性調製物が挙げられ、マトリックスは、成形品、例えば、フィルム、リポソームまたは微小粒子の形態である。当業者には明白であろうが、例えば、投与される組成物の投与経路および濃度に応じて、ある特定の担体がより好ましいことがある。
医薬組成物は、選択される分子に加えて、担体、増粘剤、希釈剤、緩衝液、防腐剤、表面活性剤等を含んでもよい。また、医薬組成物は、抗菌剤、抗炎症剤、麻酔剤等の1つまたは複数の活性成分を含んでもよい。
非経口投与のための調製物としては、滅菌水溶液または非水溶液、懸濁液、および乳剤が挙げられる。非水性溶媒の例は、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール、オリーブオイル等の植物油、およびオレイン酸エチル等の注射可能な有機エステルである。水性担体としては、生理食塩水および緩衝培地を含む水、アルコール/水溶液、乳剤または懸濁液が挙げられる。非経口媒体としては、塩化ナトリウム溶液、リンゲルデキストロース、デキストロースおよび塩化ナトリウム、乳酸リンゲル、または不揮発油が挙げられる。静脈内媒体は、流体および栄養補給剤、電解質補給剤(リンゲルデキストロースに基づくものなど)等を含む。防腐剤および他の添加剤もまた、例えば、抗菌剤、抗酸化剤、キレート剤、および不活性ガス等が存在し得る。
組成物のいくつかは、潜在的に、薬学的に許容される酸または塩基付加塩として投与することができ、塩酸、臭化水素酸、過塩素酸、硝酸、チオシアン酸、硫酸、およびリン酸などの無機酸、ならびにギ酸、酢酸、プロピオン酸、グリコール酸、乳酸、ピルビン酸、シュウ酸、マロン酸、コハク酸、マレイン酸、およびフマル酸などの有機酸、との反応によって、または水酸化ナトリウム、水酸化アンモニウム、水酸化カリウムなどの無機塩基、ならびにモノ-、ジ-、トリアルキルおよびアリールアミン、および置換エタノールアミンなどの有機塩基、との反応によって形成される。
治療方法
治療上有効量の開示される医薬組成物を対象に投与することによって、対象においてCLEC12A発現癌を治療するための方法も開示される。本方法は、対象に、フルダラビン、シタラビン、シクロホスファミド、イダルビシン、ダウノルビシン等の化学療法、またはイムブルビカ、ミドスタウリン、イデラリシブ等の標的阻害剤、またはPD1もしくはPDL1阻害剤等の免疫剤を投与することをさらに含むことができる。
医薬組成物を含む開示される組成物は、局所または全身治療が所望されるかどうか、および治療される領域に応じて、いくつかの方法で投与され得る。例えば、開示される組成物は、静脈内、腹腔内、筋肉内、皮下、体腔内、または経皮的に投与することができる。組成物は、経口的に、非経口的に(例えば、静脈内投与)、筋肉内注射によって、腹腔内注射によって、経皮的に、体外的に、点眼的に、膣内に、直腸に、鼻腔内に、局所的に等、局所鼻腔内投与または吸入による投与等を含めて、投与され得る。
組成物の経口投与は、使用される場合、概して、注射によって特徴付けられる。注射剤は、液体溶液または懸濁液のいずれか、注射前の液体中の懸濁液の溶液に適した固体形態、または乳剤として、従来の形態で調製することができる。非経口投与のための改訂された手法は、一定の投与量が維持されるように、緩やかな放出または持続的な放出システムの使用を伴う。
本明細書に開示される組成物を、CLEC12A発現癌の危険性がある患者または対象に、予防的に投与することができる。したがって、本方法は、本明細書に開示される組成物の投与前に、CLEC12A発現癌の危険性がある対象を特定することをさらに含むことができる。
必要とされる組成物の正確な量は、対象の種、年齢、体重および全身状態、治療されるアレルギー障害の重症度、使用される特定の核酸またはベクター、その投与方法等に応じて、対象によって異なる。したがって、組成物ごとに正確な量を指定することは不可能である。しかしながら、適切な量は、本明細書に教示される通常の実験のみを用いて当業者によって決定され得る。例えば、組成物を投与するための有効な投与量およびスケジュールは、経験的に決定することができ、かかる決定を行うことは、当該技術分野の技術内である。組成物の投与のための投与量範囲は、症状の障害が影響を受ける所望の効果をもたらすのに十分に大きなものである。投与量は、望ましくない交差反応、アナフィラキシー反応などの有害な副作用を引き起こすほど多くてはならない。一般に、投与量は、患者の年齢、状態、性別および疾患の程度、投与経路、または他の薬物がレジメンに含まれるかどうかによって異なり、当業者によって決定することができる。投与量は、任意の禁忌の場合、個々の医師によって調整することができる。投与量は様々であり得、1日1回または複数回の用量の投与で、1日または数日間投与することができる。所与のクラスの医薬製品に対する適切な投与量についてのガイダンスは、文献中に見出すことができる。単独で使用される開示される組成物の典型的な1日の投与量は、上に記載の要因に応じて、1日当たり約1μg/kgから最大100mg/kg体重以上の範囲であり得る。
一部の実施形態では、分子は、体重1kg当たり約0.1ng~約100g、体重1kg当たり約10ng~約50g、体重1kg当たり約100ng~約1g、体重1kg当たり約1μg~約100mg、体重1kg当たり約1μg~約50mg、体重1kg当たり約1mg~約500mg、および体重1kg当たり約1mg~約50mgの非経口投与に相当する用量で投与される。あるいは、治療有効量を達成するために投与されるレナリドミドを含有する分子の量は、体重1kg当たり約0.1ng、1ng、10ng、100ng、1μg、10μg、100μg、1mg、2mg、3mg、4mg、5mg、6mg、7mg、8mg、9mg、10mg、11mg、12mg、13mg、14mg、15mg、16mg、17mg、18mg、19mg、20mg、30mg、40mg、50mg、60mg、70mg、80mg、90mg、100mg、500mg、またはそれ以上である。
CLEC12A特異的キメラ抗原受容体(CAR)
CARは、一般に、リンパ球活性化に関与する膜貫通シグナル伝達モチーフを有するモノクローナル抗体(mAb)の単鎖可変断片(scFv)由来の抗原認識ドメインを組み込む(Sadelain M,et al.Nat Rev Cancer 2003 3:35-45)。CLEC12A特異的CARに対する抗腫瘍活性を増強するために、免疫エフェクター細胞内で発現することができるCLEC12A特異的キメラ抗原受容体(CAR)が、本明細書に開示される。
開示されるCARは、概して、外部ドメイン、膜貫通ドメイン、および内部ドメインの3つのドメインで構成される。外部ドメインは、CLEC12A結合領域を含み、抗原認識に関与する。また、任意選択的にシグナルペプチド(SP)を含有して、CARをグリコシル化し、免疫エフェクター細胞の細胞膜に繋留することができる。膜貫通ドメイン(TD)は、その名の通り、外部ドメインを内部ドメインに接続し、細胞によって発現されると、細胞膜内に存在する。内部ドメインは、抗原認識後に免疫エフェクター細胞に活性化シグナルを伝達するCARの役目を果たす部分である。例えば、内部ドメインは、シグナル伝達ドメイン(ISD)および共刺激シグナル伝達領域(CSR)を含有することができる。
「シグナル伝達ドメイン(SD)」は、概して、免疫受容体チロシン系活性化モチーフ(ITAM)を含有し、ITAMがリン酸化されると、シグナル伝達カスケードが活性化される。用語「共刺激シグナル伝達領域(CSR)」は、CD28、41BB、およびICOS等の共刺激タンパク質受容体由来の細胞内シグナル伝達ドメインを指し、T細胞受容体によるT細胞活性化を増強することができる。
一部の実施形態では、内部ドメインは、SDまたはCSRを含むが、両方は含有しない。これらの実施形態では、開示されるCARを含有する免疫エフェクター細胞は、欠失しているドメインを含有する別のCAR(またはT細胞受容体)もまたそのそれぞれの抗原に結合する場合にのみ、活性化される。
一部の実施形態では、開示されるCARは式:
SP-CLEC12A-HG-TM-CSR-SD、または
SP-CLEC12A-HG-TM-SD-CSR、によって定義され、
式中、「SP」は、任意選択的なシグナルペプチドを表し、
「CLEC12A」は、CLEC12A結合領域を表し、
「HG」は、任意選択的なヒンジドメインを表し、
「TM」は、膜貫通ドメインを表し、
「CSR」は、1つまたは複数の共刺激シグナル伝達領域を表し、
「SD」は、シグナル伝達ドメインを表し、
「-」は、ペプチド結合またはリンカーを表す。
追加のCAR構築物は、例えば、Fresnak AD,et al.Engineered T cells: the promise and challenges of cancer immunotherapy.Nat Rev Cancer.2016 Aug 23;16(9):566-81に記載されており、これらのCARモデルの教示のために、その全体が参照により援用される。
例えば、CARは、トラック(TRUCK)、普遍型CAR(Universal CAR)、自己駆動型CAR(Self-driving CAR)、装甲型CAR(Armored CAR)、自己破壊型CAR(Self-destruct CAR)、条件型CAR(Conditional CAR)、標識型CAR(Marked CAR)、タンデム型CAR(TanCAR)、デュアル型CAR(Dual CAR)、または安全型(sCAR)であり得る。
トラック(TRUCK、T cells redirected for universal cytokine killing)は、キメラ抗原受容体(CAR)および抗腫瘍サイトカインを共発現する。サイトカインの発現は、恒常的であり得る、またはT細胞活性化によって誘導され得る。CARの特異性によって標的化されると、炎症促進性サイトカインが局所産生されて、腫瘍部位に内因性免疫細胞が補充され、抗腫瘍応答が増強され得る。
普遍型の同種CAR T細胞は、内因性T細胞受容体(TCR)および/または主要組織適合複合体(MHC)分子を発現しなくなるように改変され、それによって、移植片対宿主病(GVHD)または拒絶をそれぞれ防ぐ。
自己駆動型CARは、腫瘍リガンドに結合するCARおよびケモカイン受容体を共発現し、それによって、腫瘍ホーミングを増強する。
免疫抑制に耐性であるように改変されたCAR T細胞(装甲型CAR)は、免疫チェックポイントスイッチ受容体とともに、種々の免疫チェックポイント分子(例えば、細胞傷害性Tリンパ球関連抗原4(CTLA4)またはプログラム細胞死タンパク質1(PD1))を発現しなくなるように遺伝子改変されてもよく、または免疫チェックポイントシグナル伝達を遮断するモノクローナル抗体とともに投与されてもよい。
自己破壊型CARは、エレクトロポレーションによって送達されるRNAを使用して、CARをコードするように設計され得る。あるいは、T細胞の誘導性アポトーシスは、遺伝子改変リンパ球におけるチミジンキナーゼへのガンシクロビル結合、または最近記載された小分子ダイマライザーによるヒトカスパーゼ9の活性化システムに基づいて達成され得る。
条件型CAR T細胞は、デフォルトでは、回路を完全にする小分子を添加するまで無応答であるか、またはスイッチ「オフ」され、シグナル1とシグナル2の両方の完全な伝達が可能になり、それによって、CAR T細胞を活性化する。あるいは、T細胞を改変して、標的抗原に向けてその後に投与される二次抗体に対して親和性を有する、アダプター特異的受容体を発現させてもよい。
標識型CAR T細胞は、既存のモノクローナル抗体剤が結合するCARと腫瘍エピトープを発現する。容認できない副作用の設定において、モノクローナル抗体の投与は、C
AR T細胞を除去し、さらなるオフ腫瘍効果なしに症状を緩和する。
タンデム型CAR(TanCAR) T細胞は、細胞内共刺激ドメイン(複数可)およびCD3ζドメインに融合した異なる親和性を有する2つの連結された単鎖可変断片(scFv)からなる単一のCARを発現する。タンデム型CAR T細胞の活性化は、標的細胞が両方の標的を共発現するときのみ、起こる。
デュアル型CAR T細胞は、異なるリガンド結合標的を有する2つの別個のCARを発現し、一方のCARは、CD3ζドメインのみを含み、他方のCARは、共刺激ドメイン(複数可)のみを含む。デュアル型CAR T細胞の活性化は、腫瘍上の両方の標的の共発現を必要とする。
安全型CAR(sCAR)は、細胞内阻害ドメインに融合した細胞外scFvからなる。標準型CARを共発現する安全型CAR T細胞は、標準型CARの標的を有するが安全型CARの標的を欠く標的細胞に遭遇したときにのみ、活性化される。
開示されるCARの抗原認識ドメインは、通常、scFvである。しかし、多くの代替物がある。天然のT細胞受容体(TCR)αおよびβ単鎖由来の抗原認識ドメインが記載されており、単純な外部ドメイン(例えば、HIV感染細胞を認識するCD4外部ドメイン)、および連結サイトカイン(サイトカイン受容体を有する細胞の認識につながる)のようなより新奇な認識成分を有している。実際に、所与の標的に高い親和性で結合するほとんどのものが、抗原認識領域として使用され得る。
内部ドメインは、CARの役目を果たす部分であり、抗原認識によって免疫エフェクター細胞にシグナルが伝達された後、免疫エフェクター細胞の正常なエフェクター機能のうちの少なくとも1つを活性化する。例えば、T細胞のエフェクター機能は、サイトカインの分泌を含む細胞溶解活性またはヘルパー活性であり得る。したがって、内部ドメインは、T細胞受容体(TCR)および任意選択的な共受容体の「細胞内シグナル伝達ドメイン」を含んでもよい。通常、細胞内シグナル伝達ドメイン全体を用いることができるが、多くの場合、鎖全体を用いる必要はない。細胞内シグナル伝達ドメインの切断部分が使用される範囲では、そのような切断部分は、エフェクター機能のシグナルを伝達する限り、無傷の鎖の代わりに使用されてもよい。
刺激型の様式で作用するTCR複合体の一次活性化を調節する細胞質シグナル伝達配列は、免疫受容体チロシン系活性化モチーフ(ITAM)として知られているシグナル伝達モチーフを含有し得る。細胞質シグナル伝達配列を含有するITAMの例としては、CD8、CD3ζ、CD3δ、CD3γ、CD3ε、CD32(FcγRIIa)、DAP10、DAP12、CD79a、CD79b、FcγRIγ、FcγRIIIγ、FcεRIβ(FCERIB)、およびFcεRIγ(FCERIG)に由来するものが挙げられる。
特定の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ゼータ(CD3ζ)(TCRゼータ、GenBank受託番号BAG36664.1)である。T細胞受容体T3ゼータ鎖、またはCD247(表面抗原分類247)としても知られる、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ(CD3ζ)鎖は、ヒトにおいてCD247遺伝子によってコードされるタンパク質である。
第1世代CARは、典型的には、内因性TCRからのシグナルの一次伝達物質であるCD3ζ鎖由来の細胞内ドメインを有していた。第2世代CARは、様々な共刺激タンパク質受容体(例えば、CD28、41BB、ICOS)からの細胞内シグナル伝達ドメイン
を、CARの内部ドメインに付加して、T細胞に追加のシグナルを提供する。前臨床の研究では、第2世代のCARの設計により、T細胞の抗腫瘍活性が改善することが示されている。さらに最近では、第3世代CARは、複数のシグナル伝達ドメインを組み合わせることで、効力がさらに強化されている。これらのCARで移植されたT細胞は、共刺激受容体/リガンド相互作用とは無関係に、向上した増殖、活性化、持続性、および腫瘍根絶効率を示している(Imai C,et al.Leukemia 2004 18:676-84、Maher J,et al.Nat Biotechnol 2002 20:70-5)。
例えば、CARの内部ドメインは、それ自体によってCD3ζシグナル伝達ドメインを含むように設計され、または、本発明のCARの文脈において、有用な任意の他の所望の細胞質ドメイン(複数可)と組み合わせて設計され得る。例えば、CARの細胞質ドメインは、CD3ζ鎖部分および共刺激シグナル伝達領域を含むことができる。共刺激シグナル伝達領域は、共刺激分子の細胞内ドメインを含むCARの一部を指す。共刺激分子は、抗原に対するリンパ球の効率的な応答に必要な抗原受容体またはそのリガンド以外の細胞表面分子である。そのような分子の例としては、CD27、CD28、4-1BB(CD137)、OX40、CD30、CD40、ICOS、リンパ球機能関連抗原-1(LFA-1)、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7-H3、およびCD83、CD8、CD4、b2c、CD80、CD86、DAP10、DAP12、MyD88、BTNL3、およびNKG2Dと特異的に結合するリガンド、が挙げられる。したがって、CARは、共刺激シグナル伝達エレメントとして主にCD28が例示されるが、他の共刺激エレメントを、単独でまたは他の共刺激シグナル伝達エレメントと組み合わせて使用することができる。
一部の実施形態では、CARはヒンジ配列を含む。ヒンジ配列は、抗体の柔軟性を促進するアミノ酸の短い配列である(例えば、Woof et al.,Nat.Rev.Immunol.,4(2):89-99(2004)を参照)。ヒンジ配列は、抗原認識部分(例えば、抗CLEC12A scFv)と膜貫通ドメインとの間に配置してもよい。ヒンジ配列は、任意の好適な分子に由来するか、またはそれから得られる任意の好適な配列であり得る。一部の実施形態では、例えば、ヒンジ配列はCD8a分子またはCD28分子に由来する。
膜貫通ドメインは、天然源または合成源のいずれかに由来し得る。供給源が天然である場合、ドメインは、任意の膜結合タンパク質または膜貫通タンパク質に由来し得る。例えば、膜貫通領域は、T細胞受容体、CD28、CD3ε、CD45、CD4、CD5、CD8(例えば、CD8α、CD8β)、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、またはCD154、KIRDS2、OX40、CD2、CD27、LFA-1(CD11a、CD18)、ICOS(CD278)、4-1BB(CD137)、GITR、CD40、BAFFR、HVEM(LIGHTR)、SLAMF7、NKp80(KLRF1)、CD160、CD19、IL2Rβ、IL2Rγ、IL7Rα、ITGA1、VLA1、CD49a、ITGA4、IA4、CD49D、ITGA6、VLA-6、CD49f、ITGAD、CD11d、ITGAE、CD103、ITGAL、CD11a、LFA-1、ITGAM、CD11b、ITGAX、CD11c、ITGB1、CD29、ITGB2、CD18、LFA-1、ITGB7、TNFR2、DNAM1(CD226)、SLAMF4(CD244、2B4)、CD84、CD96(Tactile)、CEACAM1、CRTAM、Ly9(CD229)、CD160(BY55)、PSGL1、CD100(SEMA4D)、SLAMF6(NTB-A、Ly108)、SLAM(SLAMF1、CD150、IPO-3)、BLAME(SLAMF8)、SELPLG(CD162)、LTBR、およびPAG/Cbp、のα、βまたはゼータ鎖に由来してもよい(すなわち、少な
くともその膜貫通領域を含む)。あるいは、膜貫通ドメインは合成であってもよく、この場合、それは主に、ロイシンおよびバリンのような疎水性残基を含む。場合によっては、合成膜貫通ドメインの各末端に、フェニルアラニン、トリプトファン、およびバリンのトリプレットが見出されるであろう。2~10アミノ酸長のような短いオリゴまたはポリペプチドリンカーは、膜貫通ドメインとCARのエンドプラズムドメインとの間に連結を形成し得る。
一部の実施形態では、CARは2つ以上の膜貫通ドメインを有し、これは同じ膜貫通ドメインの反復か、または異なる膜貫通ドメインであり得る。
一部の実施形態では、CARは、WO2015/039523に記載の多鎖CARであり、本教示のために参照により援用される。多鎖CARは、異なる膜貫通ポリペプチドにおいて、別個の細胞外リガンド結合ドメインおよびシグナル伝達ドメインを含むことができる。シグナル伝達ドメインは、膜近傍の位置で組み立てられるように設計することができ、自然な受容体により近い柔軟なアーキテクチャを形成することで、最適なシグナル伝達を与える。例えば、多鎖CARは、FCERIα鎖の一部およびFCERIβ鎖の一部を含むことができ、それによって、FCERI鎖がともに自発的に二量体化して、CARを形成する。
以下の表1、2、および3は、開示されるCAR中で生じ得る、CLEC12A結合領域、共刺激シグナル伝達領域、および細胞内シグナル伝達ドメインの、いくつかの例示的な組み合わせを提示する。
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一部の実施形態では、抗CLEC12A結合剤は、単鎖可変断片(scFv)抗体である。抗CLEC12A scFvの親和性/特異性は、重鎖(V)および軽鎖(V)における相補性決定領域(CDR)内の特異的配列によって大きく駆動される。各VおよびV配列は、3つのCDR(CDR1、CDR2、CDR3)を有する。
一部の実施形態では、抗CLEC12A結合剤は、モノクローナル抗体などの天然抗体に由来する。場合によっては、抗体はヒト型である。場合によっては、抗体は、ヒトに投与されるときに、免疫原性を低くするように変更される。例えば、変更は、最も近いヒト生殖系列配列に対応させるための、フレームワークアミノ酸のキメル化、ヒト化、CDR移植、脱免疫化、および変異からなる群から選択される1つまたは複数の技術を含む。
また、CLEC12Aおよび少なくとも1つの追加の腫瘍抗原を標的とする二重特異性CARも開示される。また、腫瘍抗原などの異なる抗原に結合する別のCARと組み合わせてのみ働くように設計されたCARも開示される。例えば、これらの実施形態では、開示されるCARの内部ドメインは、シグナル伝達ドメイン(SD)または共刺激シグナル
伝達領域(CSR)のみを含有することができるが、両方は含有しない。第2のCAR(または内因性T細胞)は、それが活性化された場合、欠損しているシグナルを提供する。例えば、開示されるCARがSDを含有するがCSRを含有しない場合、このCARを含有する免疫エフェクター細胞は、CSRを含有する別のCAR(またはT細胞)がそのそれぞれの抗原に結合する場合にのみ、活性化される。同様に、開示されるCARがCSRを含有するがSDを含有しない場合、このCARを含有する免疫エフェクター細胞は、SDを含有する別のCAR(またはT細胞)がそのそれぞれの抗原に結合する場合にのみ、活性化される。
腫瘍抗原は、免疫応答、特にT細胞媒介性免疫応答を誘発する腫瘍細胞によって産生されるタンパク質である。追加の抗原結合ドメインは、腫瘍抗原の抗体または天然リガンドであり得る。追加の抗原結合ドメインの選択は、治療される特定の種類の癌に依存するであろう。腫瘍抗原は、当該技術分野で周知であり、例えば、神経膠腫関連抗原、癌胎児性抗原(CEA)、EGFRvIII、IL-llRa、IL-13Ra、EGFR、FAP、B7H3、Kit、CA LX、CS-1、MUC1、BCMA、bcr-abl、HER2、β-ヒト絨毛性ゴナドトロピン、アルファフェトプロテイン(AFP)、ALK、CD19、CD123、サイクリンBl、レクチン反応性AFP、Fos関連抗原1、ADRB3、チログロブリン、EphA2、RAGE-1、RUl、RU2、SSX2、AKAP-4、LCK、OY-TESl、PAX5、SART3、CLL-1、フコシルGM1、GloboH、MN-CA IX、EPCAM,、EVT6-AML、TGS5、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素、ポリシアル酸、PLAC1、RUl、RU2(AS)、腸カルボキシルエステラーゼ、lewisY、sLe、LY6K、mut hsp70-2、M-CSF、MYCN、RhoC、TRP-2、CYPIBI、BORIS、プロスターゼ、前立腺特異的抗原(PSA)、PAX3、PAP、NY-ESO-1、LAGE-la、LMP2、NCAM、p53、p53変異体、Ras変異体、gplOO、プロステイン、OR51E2、PANX3、PSMA、PSCA、Her2/neu、hTERT、HMWMAA、HAVCR1、VEGFR2、PDGFR-β、サバイビンおよびテロメラーゼ、レグマイン、HPV E6,E7、精子タンパク質17、SSEA-4、チロシナーゼ、TARP、WT1、前立腺癌腫瘍抗原-1(PCTA-1)、ML-IAP、MAGE、MAGE-A1、MAD-CT-1、MAD-CT-2、メランA/MART1、XAGE1、ELF2M、ERG(TMPRSS2 ETS融合遺伝子)、NA17、好中球エラスターゼ、肉腫転位ブレイクポイント、NY-BR-1、ephnnB2、CD20、CD22、CD24、CD30、TIM3、CD38、CD44v6、CD97、CD171、CD179a、アンドロゲン受容体、FAP、インスリン増殖因子(IGF)-I、IGFII、IGF-I受容体、GD2、o-アセチル-GD2、GD3、GM3、GPRC5D、GPR20、CXORF61、葉酸受容体(FRa)、葉酸受容体β、ROR1、Flt3、TAG72、TN Ag、Tie2、TEM1、TEM7R、CLDN6、TSHR、UPK2、およびメソテリンが挙げられる。好ましい実施形態では、腫瘍抗原は、葉酸受容体(FRa)、メソテリン、EGFRvIII、IL-13Ra、CD123、CD19、TIM3、BCMA、GD2、CLL-1、CA-IX、MUCl、HER2、およびこれらの任意の組み合わせからなる群から選択される。
腫瘍抗原の非限定的な例としては、以下が挙げられる:チロシナーゼ、TRP-1、TRP-2等の分化抗原およびMAGE-1、MAGE-3、BAGE、GAGE-1、GAGE-2、pi 5等の腫瘍特異的多系統抗原;CEA等の過剰発現胎児性抗原;p53、Ras、HER-2/neu等の過剰発現癌遺伝子および変異腫瘍抑制遺伝子;BCR-ABL、E2A-PRL、H4-RET、IGH-IGK、MYL-RAR等の染色体転位から生じる固有の腫瘍抗原;ならびにエプスタインバーウイルス抗原EBVAおよびヒトパピローマウイルス(HPV)抗原E6およびE7等のウイルス抗原。その他の大
きなタンパク質系抗原としては、TSP-180、MAGE-4、MAGE-5、MAGE-6、RAGE、NY-ESO、pl85erbB2、pl80erbB-3、c-met、nm-23H1、PSA、CA19-9、CA72-4、CAM17.1、NuMa、K-ras、β-カテニン、CDK4、Mum-1、p15、p16、43-9F、5T4、791Tgp72、α-フェトプロテイン、β-HCG、BCA225、BTAA、CA125、CA15-3\CA27.29\BCAA、CA195、CA242、CA-50、CAM43、CD68\P1、CO-029、FGF-5、G250、Ga733\EpCAM、HTgp-175、M344、MA-50、MG7-Ag、MOV18、NB/70K、NY-CO-1、RCASl、SDCCAG16、TA-90\Mac-2結合タンパク質\シクロフィリンC-関連タンパク質、TAAL6、TAG72、TLP、TPS、GPC3、MUC16、LMP1、EBMA-1、BARF-1、CS1、CD319、HER1、B7H6、L1CAM、IL6、およびMETが挙げられる。
核酸およびベクター
また、開示される免疫エフェクター細胞においてCLEC12A特異的CARの発現を可能にする、開示されるCLEC12A特異的CARをコードするポリヌクレオチドおよびポリヌクレオチドベクターも開示される。
開示されるCARをコードする核酸配列およびその領域は、例えば、遺伝子を発現する細胞からのライブラリをスクリーニングすること、遺伝子を含むことが知られているベクターから誘導すること、またはそれらを含有する細胞および組織から直接単離することなど、標準的な技術を使用して、当該技術分野で既知の組換え方法を使用して得ることができる。あるいは、対象遺伝子は、クローニングするのではなく、合成的に産生することができる。
CARをコードする核酸の発現は、典型的には、CARポリペプチドをコードする核酸をプロモーターに作動可能に連結し、構築物を発現ベクターに組み込むことによって達成される。典型的なクローニングベクターは、所望の核酸配列の発現の調節に有用な転写および翻訳ターミネーター、開始配列、およびプロモーターを含有する。
開示される核酸は、いくつかの種類のベクターにクローニングすることができる。例えば、核酸は、限定されないが、プラスミド、ファージミド、ファージ誘導体、動物ウイルス、およびコスミドを含むベクターにクローニングされ得る。特に興味深いベクターは、発現ベクター、複製ベクター、プローブ生成ベクター、および配列決定ベクターを含む。
さらに、発現ベクターは、ウイルスベクターの形態で細胞に提供されてもよい。ウイルスベクター技術は、当該技術分野で周知であり、例えば、Sambrook et al.(2001,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory,New York)、ならびに他のウイルス学および分子生物学のマニュアルに記載されている。ベクターとして有用なウイルスは、限定されないが、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルス、およびレンチウイルスが含まれる。一般に、好適なベクターは、少なくとも1つの生物において機能的な複製開始点、プロモーター配列、簡便な制限エンドヌクレアーゼ部位、および1つまたは複数の選択可能なマーカーを含有する。一部の実施形態では、ポリヌクレオチドベクターは、レンチウイルスまたはレトロウイルスベクターである。
哺乳動物細胞への遺伝子導入のために、いくつかのウイルス系システムが開発されている。例えば、レトロウイルスは、遺伝子送達システムのための簡便なプラットフォームを
提供する。選択された遺伝子は、当該技術分野で既知の技術を使用して、ベクターに挿入され、レトロウイルス粒子にパッケージングされ得る。次いで、組換えウイルスを単離し、インビボまたはエクスビボのいずれかで、対象の細胞に送達することができる。
好適なプロモーターの一例は、最初期サイトメガロウイルス(CMV)プロモーター配列である。このプロモーター配列は、動作可能に連結された任意のポリヌクレオチド配列の高レベルの発現を駆動することが可能な強力な恒常的プロモーター配列である。好適なプロモーターの別の例は、伸長成長因子-1α(EF-1α)である。しかしながら、他の恒常的プロモーター配列も使用することができ、サルウイルス40(SV40)初期プロモーター、MND(骨髄増殖性肉腫ウイルス)プロモーター、マウス乳癌ウイルス(MMTV)、ヒト免疫不全ウイルス(HIV)長い末端反復(LTR)プロモーター、MoMuLVプロモーター、トリ白血病ウイルスプロモーター、エプスタインバーウイルス最初期プロモーター、ラウス肉腫ウイルスプロモーター、ならびに、限定されないが、アクチンプロモーター、ミオシンプロモーター、ヘモグロビンプロモーター、およびクレアチンキナーゼプロモーターを含むヒト遺伝子プロモーターなどが挙げられるが、これらに限定されない。プロモーターは、代替的には誘導性プロモーターであり得る。誘導性プロモーターの例としては、限定されないが、メタロチオネインプロモーター、グルココルチコイドプロモーター、プロゲステロンプロモーター、およびテトラサイクリンプロモーターが挙げられる。
追加のプロモーター要素、例えば、エンハンサーは、転写開始の頻度を調節する。典型的には、これらは、開始部位の30~110bp上流の領域に位置するが、いくつかのプロモーターは、開始部位の下流にも機能的要素を含有することが最近示されている。プロモーター要素間の間隔は、しばしば柔軟であるため、要素が互いに対して反転または移動しても、プロモーター機能は保持される。
CARのポリペプチドまたはその一部の発現を評価するために、細胞内に導入される発現ベクターは、選択可能なマーカー遺伝子もしくはレポーター遺伝子のいずれか、またはその両方を含有することもでき、ウイルスベクターを介したトランスフェクションまたは感染に供する細胞の集団からの発現細胞の同定および選択を容易にすることができる。他の態様では、選択可能なマーカーを、別個のDNA片上に保有し、共トランスフェクションの手順で使用してもよい。選択可能なマーカーおよびレポーター遺伝子の両方には、宿主細胞における発現を可能にするために、適切な調節配列を隣接させてもよい。有用な選択マーカーとしては、例えば、抗生物質耐性遺伝子が挙げられる。
レポーター遺伝子は、潜在的にトランスフェクトされた細胞を同定し、調節配列の機能性を評価するために使用される。一般に、レポーター遺伝子は、レシピエント生物または組織に存在しないか、またはそれらによって発現されない遺伝子であり、その発現が、いくつかの容易に検出可能な特性、例えば、酵素活性によって顕在化するポリペプチドをコードする遺伝子である。レポーター遺伝子の発現は、DNAがレシピエント細胞に導入された後の好適な時間にアッセイされる。好適なレポーター遺伝子としては、ルシフェラーゼ、β-ガラクトシダーゼ、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ、分泌型アルカリホスファターゼ、または緑色蛍光タンパク質遺伝子をコードする遺伝子が挙げられる。好適な発現系はよく知られており、既知の技術を使用して調製することができ、または商業的に入手することができる。一般に、レポーター遺伝子の最高レベルの発現を示す最小の5’隣接領域を有する構築物は、プロモーターとして同定される。かかるプロモーター領域は、レポーター遺伝子に連結することができ、プロモーター駆動の転写を調節する能力について薬剤を評価するために使用することができる。
細胞に遺伝子を導入し、発現する方法は、当該技術分野で既知である。発現ベクターの
文脈において、ベクターは、当該技術分野の任意の方法によって、宿主細胞、例えば、哺乳類、細菌、酵母、または昆虫細胞に容易に導入され得る。例えば、発現ベクターは、物理的、化学的、または生物学的手段によって宿主細胞に導入することができる。
宿主細胞にポリヌクレオチドを導入するための物理的方法は、リン酸カルシウム沈殿、リポフェクション、微粒子銃、マイクロインジェクション、エレクトロポレーション等を含む。ベクターおよび/または外因性核酸を含む細胞を産生するための方法は、当該技術分野で周知である。例えば、Sambrook et al.(2001,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory,New York)を参照されたい。
目的のポリヌクレオチドを宿主細胞に導入するための生物学的方法は、DNAおよびRNAベクターの使用を含む。ウイルスベクター、特にレトロウイルスベクターは、遺伝子を哺乳類、例えばヒト細胞に挿入するための最も広く使用される方法となっている。
宿主細胞にポリヌクレオチドを導入するための化学手段としては、巨大分子複合体、ナノカプセル、マイクロスフィア、ビーズ、および水中油乳剤、ミセル、混合ミセル、およびリポソームを含む脂質系等のコロイド分散系が挙げられる。インビトロおよびインビボで送達媒体として使用するための例示的なコロイド系は、リポソーム(例えば、人工膜小胞)である。
非ウイルス性送達系が利用される場合、例示的な送達媒体はリポソームである。別の態様では、核酸は、脂質と会合し得る。脂質に関連する核酸は、リポソームの水性内部にカプセル化され、リポソームの脂質二重層内に分散され、リポソームおよびオリゴヌクレオチドの両方に会合する連結分子を介してリポソームに結合され、リポソームに封入され、リポソームと複合体化され、脂質を含有する溶液中に分散され、脂質と混合され、脂質と組み合わされ、脂質中に懸濁液として含有され、ミセルを含有するか、またはミセルと複合体化され、またはそれ以外の方法で脂質と会合され得る。脂質、脂質/DNAまたは脂質/発現ベクター関連組成物は、溶液中の任意の特定の構造に限定されない。例えば、それらは、ミセルとして二重層構造で、または「崩壊した」構造で存在してもよい。これらはまた、溶液中に単純に散在してもよく、おそらく、サイズまたは形状が均一ではない凝集体を形成する。脂質は、天然または合成の脂質であり得る脂肪性物質である。例えば、脂質には、細胞質内で天然に発生する脂肪滴、ならびに脂肪酸、アルコール、アミン、アミノアルコール、およびアルデヒド等の長鎖脂肪族炭化水素およびその誘導体を含有する化合物のクラスが含まれる。使用に好適な脂質は、商業的供給元から得ることができる。例えば、ジミリストイルホスファチジルコリン(「DMPC」)は、Sigma,St.Louis,Mo.から得ることができ、リン酸ジセチル(「DCP」)は、K&K Laboratories(Plainview,N.Y.)から得ることができ、コレステロール(「Choi」)は、Calbiochem-Behringから得ることができ、ジミリスチルホスファチジルグリセロール(「DMPG」)および他の脂質は、Avanti Polar Lipids,Inc,(Birmingham,Ala.)から得ることができる。
免疫エフェクター細胞
また、開示されるCAR(本明細書では「CAR-T細胞」とも称される)を発現するように改変される免疫エフェクター細胞も開示される。これらの細胞は、好ましくは、治療される対象から得られる(すなわち、自己細胞である)。しかしながら、一部の実施形態では、免疫エフェクター細胞株またはドナーエフェクター細胞(同種)が使用される。免疫エフェクター細胞は、いくつかの供給源から得ることができ、末梢血単核細胞、骨髄、リンパ節組織、臍帯血、胸腺組織、感染部位からの組織、腹水、胸水、脾臓組織、およ
び腫瘍が含まれる。免疫エフェクター細胞は、Ficoll(商標)分離等の当業者に既知の任意の数の技術を使用して、対象から採取された血液から得ることができる。例えば、個体の循環血液からの細胞は、アフェレーシスによって得ることができる。一部の実施形態では、免疫エフェクター細胞は、例えば、PERCOLL(商標)勾配を介した遠心分離によって、または対向流遠心溶出によって、赤血球を溶解させ、単球を枯渇させることによって末梢血リンパ球から単離される。免疫エフェクター細胞の特定のサブ集団は、陽性または陰性選択技術によってさらに単離され得る。例えば、免疫エフェクター細胞は、例えば、所望の免疫エフェクター細胞の陽性選択に十分な期間、抗体結合ビーズとインキュベートすることによって、陽性選択細胞に固有の表面マーカーに対する抗体の組み合わせを使用して単離され得る。あるいは、免疫エフェクター細胞集団の濃縮は、陰性選択細胞に固有の表面マーカーに対する抗体の組み合わせを使用して、陰性選択によって達成することができる。
一部の実施形態では、免疫エフェクター細胞は、感染症および異物に対する身体の防御に関与する任意の白血球を含む。例えば、免疫エフェクター細胞は、リンパ球、単球、マクロファージ、樹状細胞、マスト細胞、好中球、好塩基球、好酸球、またはこれらの任意の組み合わせを含むことができる。例えば、免疫エフェクター細胞は、Tリンパ球を含むことができる。
T細胞またはTリンパ球は、細胞表面上のT細胞受容体(TCR)の存在によって、B細胞およびナチュラルキラー細胞(NK細胞)等の他のリンパ球と区別することができる。それらは胸腺で成熟するのでT細胞と呼ばれる(ただし、扁桃腺でも成熟するものもある)。T細胞のいくつかのサブセットがあり、それぞれ異なる機能を有する。
Tヘルパー細胞(T細胞)は、B細胞の形質細胞およびメモリーB細胞への成熟、ならびに細胞傷害性T細胞およびマクロファージの活性化を含む、免疫学的プロセスにおいて他の白血球を支援する。これらの細胞は、CD4糖タンパク質をそれらの表面に発現するため、CD4+T細胞としても知られている。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞(APC)の表面上で発現されるMHCクラスII分子によって、ペプチド抗原が提示されると活性化される。活性化すると、急速に分裂し、能動免疫応答を調節または補助するサイトカインと呼ばれる小さなタンパク質を分泌する。これらの細胞は、T1、T2、T3、T17、T9、またはTFHを含むいくつかのサブタイプのうちの1つに分化することができ、異なるサイトカインを分泌して、異なるタイプの免疫応答を促進する。
細胞傷害性T細胞(T細胞、またはCTL)は、ウイルス感染細胞および腫瘍細胞を破壊し、移植拒絶にも関与する。これらの細胞は、CD8糖タンパク質をそれらの表面に発現するため、CD8T細胞としても知られている。これらの細胞は、全ての有核細胞の表面に存在するMHCクラスI分子に付随する抗原に結合することによって、それらの標的を認識する。IL-10、アデノシンおよび制御性T細胞によって分泌される他の分子を介して、CD8+細胞をアネルギー状態へと不活性化することができ、これにより自己免疫疾患を防ぐ。
メモリーT細胞は、感染が解消した後も長期間持続する、抗原特異的T細胞のサブセットである。それらは、同族の抗原に再曝露すると、多数のエフェクターT細胞に迅速に広がり、したがって、免疫系に過去の感染に対する「記憶」を提供する。メモリー細胞は、CD4またはCD8のいずれかであり得る。メモリーT細胞は、典型的には、細胞表面タンパク質CD45ROを発現する。
制御性T細胞(Treg細胞)は、以前はサプレッサーT細胞として知られており、免疫学的寛容の維持に重要である。それらの主な役割は、免疫反応の終了に向けてT細胞媒
介性免疫をシャットダウンし、胸腺における陰性選択のプロセスから逃れた自己反応性T細胞を抑制することである。2つの主要なクラスのCD4reg細胞-内在性Treg細胞および適応性Treg細胞-が記載されている。
ナチュラルキラーT(NKT)細胞(ナチュラルキラー(NK)細胞と混同されないように)は、適応免疫系と自然免疫系とを橋渡しする。主要組織適合複合体(MHC)分子によって提示されるペプチド抗原を認識する従来のT細胞とは異なり、NKT細胞は、CD1dという分子によって提示される糖脂質抗原を認識する。
一部の実施形態では、T細胞は、CD4+細胞の混合物を含む。他の実施形態では、T細胞は、細胞表面の発現に基づいて、1つまたは複数のサブセットについて濃縮される。例えば、場合によっては、Tは、細胞傷害性CD8Tリンパ球である。一部の実施形態では、T細胞はγδT細胞を含み、α鎖およびβ鎖の代わりに、1つのγ鎖および1つのδ鎖を有する異なるT細胞受容体(TCR)を有する。
ナチュラルキラー(NK)細胞は、ウイルス感染細胞および形質転換細胞を死滅させることができ、自然免疫系の重要な細胞サブセットを構成するCD56CD3大型顆粒リンパ球である(Godfrey J,et al.Leuk Lymphoma 2012 53:1666-1676)。細胞傷害性CD8Tリンパ球とは異なり、NK細胞は、事前の感作を必要とせず、腫瘍細胞に対して細胞傷害性を発揮し、MHC-I陰性細胞を根絶することもできる(Narni-Mancinelli E,et al.Int Immunol 2011 23:427-431)。NK細胞は、サイトカインストーム(Morgan RA,et al.Mol Ther 2010 18:843-851)、腫瘍溶解症候群(Porter DL,et al.N Engl J Med 2011 365:725-733)、およびオンターゲット・オフ腫瘍効果の潜在的に致死的な合併症を回避できるため、より安全なエフェクター細胞である。NK細胞は、癌細胞のキラーとして周知の役割を有しており、NK細胞の障害は、MMの進行にとって重要であると広く記述されている(Godfrey J,et al.Leuk Lymphoma 2012 53:1666-1676; Fauriat C,et
al.Leukemia 2006 20:732-733)が、NK細胞媒介性抗MM活性を増強する可能性がある手段は、開示されるCAR以前ではほぼ未調査であった。
エプスタインバーウイルス(EBV)誘発性リンパ増殖性疾患(EBV-LPD)は、特に、GVHDを予防または治療するためにある特定のT細胞反応性Abを受けた患者において、同種造血細胞移植(HCT)のレシピエントの罹患率および死亡率の有意な原因となっている。EBV特異的T細胞の養子移植による予防および治療、ならびにその後のEBV関連リンパ増殖に対する免疫の長期的な回復は、骨髄移植のこの一律に致命的な合併症の管理において、プラスの結果をもたらしている。したがって、一部の実施形態では、開示される免疫エフェクター細胞は、同種または自己EBV特異的細胞傷害性Tリンパ球(CTL)である。例えば、これは、自己または同種のドナー由来のPBMCを単離し、単球およびNK細胞の枯渇によってT細胞についてそれらを濃縮することを含み得る。例えば、ドナーは、EBV血清陽性ドナーであってもよい。これらのT細胞を、次いで、自己EBV血清陽性または形質転換リンパ球で刺激することができる。EBV抗原としては、LMP-1、LMP-2A、およびLMP-2B、ならびにEBNA-1、EBNA-2、EBNA-3A、EBNA-3B、EBNA-3CおよびEBNA-LP等の潜伏膜タンパク質(LMP)およびEBV核抗原(EBNA)タンパク質が挙げられる。これらの方法は、例えば、Barker et al.,Blood 2010 116(23):5045-49、Doubrovina,et al.,Blood 2012 119(11):2644-56、Koehne,et al.Blood 2002 99(5):1730-40、およびSmith et al.Cancer Res
2012 72(5):1116-25に記載されており、これらの教示のために、参照により援用される。
治療方法
開示されるCARを発現する免疫エフェクター細胞は、CLEC12A発現癌細胞に対する抗腫瘍免疫応答を誘発することができる。開示されるCAR修飾免疫エフェクター細胞によって誘発される抗腫瘍免疫応答は、能動または受動免疫応答であってもよい。加えて、CAR媒介性免疫応答は、CLEC12Aに特異的な免疫応答をCAR修飾免疫エフェクター細胞が誘導する養子免疫療法の手法の一部であり得る。
キメラ抗原受容体を発現する免疫エフェクター細胞の養子移植は、有望な抗癌治療である。患者の免疫エフェクター細胞の収集後、細胞は、開示されるCLEC12A特異的CARを発現するように遺伝子改変され、次いで患者に注入して戻され得る。
開示されるCAR修飾免疫エフェクター細胞は、単独で投与されても、あるいは希釈剤と組み合わせて、および/またはIL-2、IL-15もしくは他のサイトカインもしくは細胞集団などの他の成分と組み合わせて、医薬組成物として投与されてもよい。手短に、医薬組成物は、1つまたは複数の薬学的または生理学的に許容される担体、希釈剤または賦形剤と組み合わせて、本明細書に記載の標的細胞集団を含んでもよい。かかる組成物は、中性緩衝食塩水、リン酸緩衝食塩水などの緩衝液、グルコース、マンノース、ショ糖またはデキストラン、マンニトールなどの炭水化物、タンパク質、ポリペプチドまたはグリシンなどのアミノ酸、酸化防止剤、EDTAまたはグルタチオンなどのキレート剤、アジュバント(例えば、水酸化アルミニウム)、および防腐剤を含んでもよい。本開示の方法で使用する組成物は、一部の実施形態では、静脈内投与用に製剤化される。医薬組成物は、MMを適切に治療する任意の様式で投与され得る。投与の量および頻度は、患者の状態、および患者の疾患の重症度などの要因によって決定されるが、適切な投与量は、臨床治験によって決定され得る。
「免疫学的有効量」、「抗腫瘍有効量」、「腫瘍阻害有効量」、または「治療量」が示されるとき、投与される本発明の組成物の正確な量は、患者(対象)の年齢、体重、腫瘍サイズ、感染もしくは転移の程度、および状態の個体差を考慮して、医師によって決定することができる。本明細書に記載のT細胞を含む医薬組成物は、10~10細胞/kg体重、例えば10~10細胞/kg体重の投与量で、それらの範囲内の全ての整数値を含めて、投与されてもよいと概して述べることができる。T細胞組成物は、これらの投与量で複数回投与されてもよい。細胞は、免疫療法において一般に知られている注入技術を使用することによって投与することができる(例えば、Rosenberg et al.,New Eng.J.of Med.319:1676,1988を参照)。特定の患者に対する最適な投与量および治療レジメンは、疾患の兆候について患者をモニターし、それに応じて治療を調整することによって、医療分野の当業者により、容易に決定することができる。
ある特定の実施形態では、活性化T細胞を対象に投与し、その後、再採血し(またはアフェレーシスを行い)、開示された方法に従ってT細胞をそれから活性化し、これらの活性化および増殖されたT細胞を患者に再注入することが望まし場合がある。この処理は、数週間ごとに複数回行うことができる。ある特定の実施形態では、T細胞は、10cc~400ccの採血から活性化され得る。ある特定の実施形態では、T細胞は、20cc、30cc、40cc、50cc、60cc、70cc、80cc、90cc、または100ccの採血から活性化される。この反復採血/反復再注入プロトコールを使用することは、ある特定のT細胞集団を選択するのに役立ち得る。
開示される組成物の投与は、注射、輸液、または移植を含む、任意の簡便な様式で行われ得る。本明細書に記載の組成物は、皮下、皮内、腫瘍内、節内、髄内、筋肉内、静脈内(i.v.)注射によって、または腹腔内に患者に投与され得る。一部の実施形態では、開示される組成物は、皮内または皮下注射によって患者に投与される。一部の実施形態では、開示される組成物は、静脈内注射によって投与される。また、組成物は、腫瘍、リンパ節、または感染部位に直接注射され得る。
ある特定の実施形態では、開示されるCAR修飾免疫エフェクター細胞は、限定されないが、サリドマイド、デキサメタゾン、ボルテゾミブ、およびレナリドミドを含む任意の数の関連する治療様式と併せて(例えば、前に、同時に、または後で)患者に投与される。さらなる実施形態では、CAR修飾免疫エフェクター細胞は、化学療法、放射線、シクロスポリン、アザチオプリン、メトトレキサート、ミコフェノール酸、およびFK506等の免疫抑制剤、抗体、または、キャンパスなどの他の免疫除去剤、抗CD3抗体、または他の抗体療法、シトキサン、フルダラビン、シクロスポリン、FK506、ラパマイシン、ミコフェノール酸、ステロイド、FR901228、サイトカイン、および照射と組み合わせて使用されてもよい。一部の実施形態では、CAR修飾免疫エフェクター細胞は、骨髄移植、フルダラビンなどの化学療法剤のいずれかを使用したT細胞アブレーション療法、外照射療法(XRT)、シクロホスファミド、またはOKT3もしくはキャンパス等の抗体と併せて(例えば、前に、同時に、または後で)、患者に投与される。別の実施形態では、本発明の細胞組成物は、CD20と反応する薬剤、例えば、リツキサンのようなB細胞アブレーション療法の後に、投与される。例えば、一部の実施形態では、対象は、高用量化学療法による標準的な治療、続いて末梢血幹細胞移植を受けることができる。特定の実施形態では、移植後、対象は、本発明の増殖された免疫細胞の注入を受ける。追加の実施形態では、増殖された細胞は、手術前または手術後に投与される。
本開示の方法の癌は、制御されない成長、浸潤、または転移を経験している対象における任意のCLEC12A発現細胞であり得る。CLEC12Aを発現する癌としては、前立腺癌、卵巣癌、肺の腺癌、乳癌、子宮内膜癌、胃癌、大腸癌、および膵癌、が挙げられる。CLEC12Aは、Jurkat細胞でも見出されている。一部の態様では、癌は胆嚢癌、外分泌腺癌、またはアポクリン腺癌である。場合によっては、癌は、骨髄異形成症候群、急性骨髄性白血病、または混合表現型白血病を含む。
一部の態様では、癌は、放射線療法が現在使用されている任意の新生物または腫瘍であり得る。あるいは、癌は、標準的な方法を用いた放射線治療に十分に感受性がない新生物または腫瘍であり得る。したがって、癌は、肉腫、リンパ腫、白血病、細胞腫、芽細胞腫、または生殖細胞腫瘍であってもよい。開示される組成物が治療に使用され得る癌の代表的な、ただし非限定的なリストとしては、リンパ腫、B細胞リンパ腫、T細胞リンパ腫、菌状息肉症、ホジキン病、骨髄性白血病、膀胱癌、脳癌、神経系癌、頭頸部癌、頭頸部扁平上皮癌、腎癌、小細胞肺癌および非小細胞肺癌等の肺癌、神経芽細胞腫/膠芽細胞腫、卵巣癌、膵癌、前立腺癌、皮膚癌、肝癌、黒色腫、口腔・咽頭・喉頭および肺の扁平上皮癌、子宮内膜癌、子宮頸癌、子宮頸癌、乳癌、上皮癌、腎癌、泌尿生殖器癌、肺癌、食道癌、頭頸部癌、大腸癌、血液癌、精巣癌、結腸および直腸癌、前立腺癌、および膵癌が挙げられる。
開示されるCARは、細胞傷害性または細胞分裂阻害効果を有する任意の化合物、部分または基と組み合わせて使用することができる。薬物部分としては、マイクロチューブル阻害剤、有糸分裂阻害剤、トポイソメラーゼ阻害剤、またはDNAインターカレーターとして機能し得る化学療法剤、特に癌治療に使用されるものが含まれる。
開示されるCARは、チェックポイント阻害剤と組み合わせて使用することができる。
2つの既知の抑制性チェックポイント経路は、細胞傷害性Tリンパ球抗原-4(CTLA-4)およびプログラム死1(PD-1)受容体を介したシグナル伝達を伴う。これらのタンパク質は、T細胞機能のすべての段階にわたって重要な役割を果たす共シグナル伝達分子のCD28-B7ファミリーのメンバーである。PD-1受容体(CD279としても知られる)は、活性化T細胞の表面に発現される。そのリガンド、PD-L1(B7-H1、CD274)およびPD-L2(B7-DC、CD273)は、樹状細胞またはマクロファージ等のAPCの表面に発現される。PD-L1は、主なリガンドであり、一方、PD-L2は、はるかに制限された発現パターンを有する。リガンドがPD-1に結合すると、抑制性シグナルがT細胞に伝達され、サイトカイン産生を低減し、T細胞増殖を抑制する。チェックポイント阻害剤としては、PD-1(ニボルマブ(BMS-936558またはMDX1106)、CT-011、MK-3475)、PD-L1(MDX-1105(BMS-936559)、MPDL3280A、MSB0010718C)、PD-L2(rHIgM12B7)、CTLA-4(イピリムマブ(MDX-010)、トレメリムマブ(CP-675,206))、IDO、B7-H3(MGA271)、B7-H4、TIM3、LAG-3(BMS-986016)、が挙げられるが、これらに限定されない。
プログラム死1(PD-1)に対するヒトモノクローナル抗体および抗PD-1抗体を単独でまたは他の免疫療法剤と組み合わせて使用して癌を治療するための方法は、米国特許第8,008,449号に記載されており、これらの抗体について参照により援用される。抗PD-L1抗体およびそれについての使用は、米国特許第8,552,154号に記載されており、これらの抗体について参照により援用される。抗PD-1抗体または抗PD-L1抗体を含む抗癌剤は、米国特許第8,617,546号に記載されており、これらの抗体について参照により援用される。
一部の実施形態では、PDL1阻害剤は、BMS-936559(Bristol-Myers Squibb)またはMPDL3280A(Roche)等のPDL1に特異的に結合する抗体を含む。一部の実施形態では、PD1阻害剤は、ランブロリズマブ(Merck)、ニボルマブ(Bristol-Myers Squibb)、またはMEDI4736(AstraZeneca)等のPD1に特異的に結合する抗体を含む。PD-1に対するヒトモノクローナル抗体および抗PD-1抗体を単独で、または他の免疫療法剤と組み合わせて使用して癌を治療するための方法は、米国特許第8,008,449号に記載されており、これらの抗体について参照により援用される。抗PD-L1抗体およびそれについての使用は、米国特許第8,552,154号に記載されており、これらの抗体について参照により援用される。抗PD-1抗体または抗PD-L1抗体を含む抗癌剤は、米国特許第8,617,546号に記載されており、これらの抗体について参照により援用される。
開示されるCARは、他の癌免疫療法と組み合わせて使用することができる。免疫療法には、2つの異なる種類があり、受動免疫療法は、患者において免疫応答を開始する必要はなく、免疫系の成分を用いて、癌細胞に対する標的細胞毒性活性を誘導し、一方、能動免疫療法は、内因性免疫応答を能動的に誘発する。受動的戦略は、特異的抗原に応答してB細胞によって産生されるモノクローナル抗体(mAb)の使用を含む。1970年代のハイブリドーマ技術の開発と腫瘍特異的抗原の同定により、免疫系によって腫瘍細胞を特異的に標的化して破壊することができるmAbの製剤開発が可能になった。これまで、mAbは、免疫療法にとって最大の成功例であり、2012年のベストセラー抗癌剤のトップ3はmAbであった。その中には、非ホジキンリンパ腫(NHL)などのB細胞悪性腫瘍の表面で高度に発現するCD20タンパク質に結合するリツキシマブ(リツキサン、Genentech)がある。リツキシマブは、NHLおよび慢性リンパ球性白血病(CLL)を化学療法と組み合わせて治療するため、FDAによって承認されている。別の重要
なmAbは、トラスツズマブ(ハーセプチン、Genentech)であり、HER2(ヒト上皮増殖因子受容体2)の発現を標的とすることによって、HER2陽性乳癌の治療に革命をもたらした。
最適な「キラー」CD8 T細胞応答を生成するには、T細胞受容体活性化に加えて共刺激も必要であり、これは、OX40(CD134)および4-1BB(CD137)を含む腫瘍壊死因子受容体ファミリーメンバーの連結を通じて提供することができる。OX40が特に興味深いのは、活性化(アゴニスト)抗OX40 mAbによる治療が、T細胞分化および細胞溶解機能を増強して、様々な腫瘍に対する抗腫瘍免疫の向上をもたらすためである。
一部の実施形態では、かかる追加の治療剤は、メトトレキサート、6-メルカプトプリン、6-チオグアニン、シタラビン、フルダラビン、5-フルオロウラシル、ダカルバジン、ヒドロキシ尿素、アスパラギナーゼ、ゲムシタビンまたはクラドリビン等の代謝拮抗剤から選択され得る。
一部の実施形態では、かかる追加の治療剤は、メクロレタミン、チオテパ、クロラムブシル、メルファラン、カルムスチン(BSNU)、ロムスチン(CCNU)、シクロホスファミド、ブスルファン、ジブロモマンニトール、ストレプトゾトシン、ダカルバジン(DTIC)、プロカルバジン、マイトマイシンC等のアルキル化剤、シスプラチンおよびカルボプラチン等の他の白金誘導体など、から選択され得る。
一部の実施形態では、かかる追加の治療剤は、タキサン類、例えば、ドセタキセル、およびパクリタキセル、ならびにビンカアルカロイド類、例えば、ビンデシン、ビンクリスチン、ビンブラスチン、およびビノレルビン等の有糸分裂阻害剤から選択され得る。
一部の実施形態では、かかる追加の治療剤は、トポテカンまたはイリノテカン等のトポイソメラーゼ阻害剤、またはエトポシドおよびテニポシド等の細胞分裂阻害剤から選択され得る。
一部の実施形態では、そのような追加の治療剤は、成長因子阻害剤、例えばErbBl(EGFR)阻害剤(例えば、ザルツムマブ、セツキシマブ、パニツムマブもしくはニモツズマブ、または他のEGFR阻害剤、例えば、ゲフィチニブもしくはエルロチニブ)、ErbB2(HER2/neu)の別の阻害剤(例えば、HER2抗体、例えば、トラスツズマブ、トラスツズマブ-DMlもしくはペルツズマブ)、またはEGFRおよびHER2の両方の阻害剤、例えば、ラパチニブ)から選択され得る。
一部の実施形態では、かかる追加の治療剤は、イマチニブ(グリベック、Gleevec STI571)またはラパチニブ等のチロシンキナーゼ阻害剤から選択され得る。
したがって、一部の実施形態では、開示される抗体は、オファツムマブ、ザノリムマブ、ダラツムマブ、ラニビズマブ、ニモツズマブ、パニツムマブ、hu806、ダクリズマブ(ゼナパックス)、バシリキシマブ(シムレクト)、インフリキシマブ(レミケード)、アダリムマブ(ヒュミラ)、ナタリズマブ(タイサブリ)、オマリズマブ(ゾレア)、エファリズマブ(ラプティバ)、および/またはリツキシマブと組み合わせて使用される。
一部の実施形態では、上に記載の疾患を治療するためのCARと組み合わせて使用する治療剤は、抗癌サイトカイン、ケモカイン、またはそれらの組み合わせであってもよい。好適なサイトカインおよび成長因子の例としては、IFNy、IL-2、IL-4、IL
-6、IL-7、IL-10、IL-12、IL-13、IL-15、IL-18、IL-23、IL-24、IL-27、IL-28a、IL-28b、IL-29、KGF、IFNa(例えば、INFa2b)、IFN、GM-CSF、CD40L、Flt3リガンド、幹細胞因子、アンセスチム、およびTNFaが挙げられる。好適なケモカインとしては、ヒトCXCおよびC-CケモカインファミリーからのIP-10、MCP-3、MIG、およびSDF-la等のGlu-Leu-Arg(ELR)-陰性ケモカインが含まれ得る。好適なサイトカインとしては、サイトカイン誘導体、サイトカイン変異体、サイトカイン断片、およびサイトカイン融合タンパク質が挙げられる。
一部の実施形態では、上に記載の疾患を治療するためのCARと組み合わせて使用する治療剤は、細胞周期調節/アポトーシス調節剤(または「調節剤」)であり得る。細胞周期調節/アポトーシス調節因子は、(i)cdc-25(NSC663284など)、(ii)細胞周期を過剰刺激するサイクリン依存性キナーゼ(フラボピリドールなど(L868275、HMR1275)、7-ヒドロキシスタウロスポリン(UCN-01、KW-2401)、およびロスコビチン(R-ロスコビチン、CYC202))、ならびに(iii)テロメラーゼ修飾因子(BIBR1532、SOT-095、GRN163、ならびに、例えば、US6,440,735およびUS6,713,055に記載の組成物など)、のような細胞周期調節/アポトーシス調節因子を標的として調節する分子含んでもよい。アポトーシス経路を妨害する分子の非限定的な例としては、TNF関連アポトーシス誘導リガンド(TRAIL)/apoptosis-2リガンド(Apo-2L)、TRAIL受容体を活性化する抗体、IFN、およびアンチセンスBcl-2が挙げられる。
一部の実施形態では、上に記載の疾患を治療するためのCARと組み合わせて使用するための治療剤は、抗アンドロゲン療法および抗エストロゲン療法に有用な薬剤等のホルモン調節剤であってもよい。そのようなホルモン調節剤の例は、タモキシフェン、イドキシフェン、フルベストラント、ドロロキシフェン、トレミフェン、ラロキシフェン、ジエチルスチルベストロール、エチニルエストラジオール/エスチニル、抗アンドロゲン(フルタミド/エウレキシンなど)、プロゲスチン(ヒドロキシプロゲステロンカプロン酸塩、メドロキシ-プロゲステロン/プロベラ、メゲストロール酢酸塩/メゲスなど)、副腎皮質ホルモン(ヒドロコルチゾン、プレドニゾンなど)、黄体化ホルモン放出ホルモン(およびそれらの類似体ならびにブセレリンおよびゴセレリンなどの他のLHRHアゴニスト)、アロマターゼ阻害剤(アナストロゾール/アリミデックス、アミノグルテチミド/シタドレン、エキセメスタンなど)、またはホルモン阻害剤(オクトレオチド/サンドスタチンなど)である。
一部の実施形態では、上に記載の障害を治療するためのCARと組み合わせて使用するための治療剤は、抗癌核酸または抗癌阻害RNA分子であってもよい。
上に記載の併用投与は、同時的、個別的、または逐次的であり得る。同時投与の場合、薬剤は、1つの組成物として、または、必要に応じて別個の組成物として、投与され得る。
一部の実施形態では、開示されるCARは、放射線療法と組み合わせて投与される。放射線療法は、患者への放射線照射、または放射線医薬品の随伴的な投与を含み得る。放射線源は、治療される患者の外部または内部のいずれかであり得る(放射線治療は、例えば、外照射療法(EBRT)または近接照射療法(BT)の形態であり得る)。かかる方法の実践において使用され得る放射性元素としては、例えば、ラジウム、セシウム-137、イリジウム-192、アメリシウム-241、金-198、コバルト-57、銅-67、テクネチウム-99、ヨウ素-123、ヨウ素-131、およびインジウム-111が
挙げられる。
一部の実施形態では、開示されるCARは、手術と組み合わせて投与される。
CAR-T細胞は、いくつかの方法で設計されてもよく、腫瘍細胞傷害性および特異性を増強し、腫瘍免疫抑制を避け、宿主拒絶を回避し、それらの治療上の半減期を延長する。例えば、トラック(TRUCK、T-cells Redirected for Universal Cytokine Killing)T細胞は、CARを有するが、また、腫瘍殺傷を促進するIL-12等のサイトカインを放出するようにも改変される。これらの細胞は、腫瘍環境に局在すると、CARの活性化時に分子搭載物を放出するように設計されるため、これらのCAR-T細胞は、「装甲型CAR」とも呼ばれることがある。癌療法としてのいくつかのサイトカインは、臨床前および臨床の両方で調査されており、同様にCAR-T療法のトラック形態に組み込まれる場合にも有用であることが証明され得る。これらの中には、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-10、IL-12、IL-13、IL-15、IL-18、M-CSF、GM-CSF、IFN-α、IFN-γ、TNF-α、TRAIL、FLT3リガンド、リンホタクチン、およびTGF-β(Dranoff 2004)が含まれる。「自己駆動型」または「ホーミング」CAR-T細胞は、それらのCARに加えてケモカイン受容体を発現するように改変される。ある特定のケモカインは、腫瘍内で上方制御され得るため、ケモカイン受容体の組み込みは、養子T細胞への腫瘍輸送およびそれによる浸潤を補助し、それによってCAR-Tの特異性および機能性の両方を増強する(Moon 2011)。また、普遍型CAR-T細胞は、CARを有するが、内因性TCR(T細胞受容体)またはMHC(主要組織適合複合体)タンパク質を発現しないように改変される。養子T細胞療法のシグナル伝達レパートリーからこれらの2つのタンパク質を除去することによって、それぞれ、移植片対宿主病および拒絶を防ぐ。装甲型CAR-T細胞は、それらが腫瘍免疫抑制および腫瘍誘発CAR-T機能低下を回避できることから、さらにそのように名付けられている。これらの特定のCAR-Tは、CARを有し、チェックポイント阻害剤を発現しないように改変され得る。あるいは、これらのCAR-Tは、チェックポイントシグナル伝達を遮断するモノクローナル抗体(mAb)と同時投与することができる。抗PDL1抗体の投与は、CAR TIL(腫瘍浸潤リンパ球)の殺傷能力を有意に回復させた。PD1-PDL1およびCTLA-4-CD80/CD86シグナル伝達経路が調査されているが、LAG-3、Tim-3、IDO-1、2B4、およびKIRを含む装甲型CAR-Tの設計において、他の免疫チェックポイントシグナル伝達分子を標的とすることが可能である。TILの他の細胞内阻害剤としては、ホスファターゼ(SHP1)、ユビキチンリガーゼ(すなわち、cbl-b)、およびキナーゼ(すなわち、ジアシルグリセロールキナーゼ)が挙げられる。装甲型CAR-Tは、また、腫瘍分泌型サイトカインの効果からそれらを保護するか、またはそれらに耐性を持たせる、タンパク質または受容体を発現するように改変され得る。例えば、TGF-β受容体の二重陰性形態で形質導入されるCTL(細胞傷害性Tリンパ球)は、リンパ腫分泌型TGF-βによる免疫抑制に耐性がある。これらの形質導入細胞は、それらの対照相手と比較した場合、インビボでの抗腫瘍活性の顕著な増加を示した。
タンデム型およびデュアル型CAR-T細胞は、それらが2つの異なる抗原結合ドメインを有する点において独特である。タンデム型CARは、細胞内共刺激ドメインおよび刺激ドメインと結合し、細胞外環境に面する、2つの連続した抗原結合ドメインを含有する。デュアル型CARは、1つの細胞外抗原結合ドメインが細胞内共刺激ドメインに結合し、2つめの異なる細胞外抗原結合ドメインが細胞内刺激ドメインに結合されるように改変される。刺激ドメインおよび共刺激ドメインは、2つの別個の抗原結合ドメイン間で分割されるため、デュアル型CARは、「分割型CAR(split CAR)」とも称される。タンデム型およびデュアル型CARの両方の設計において、T細胞内のCAR回路の
シグナル伝達を可能にするには、両方の抗原結合ドメインの結合が必要である。これらの2つのCAR設計は、異なる別個の抗原に対する結合親和性を有するため、それらは、「二重特異性」CARとも称される。
「生きている治療薬」の形態としてのCAR-T細胞に対する1つの主な懸念は、インビボでのそれらの操作性およびそれらの潜在的な免疫刺激副作用である。CAR-T療法をより良く制御し、望ましくない副作用を防ぐために、オフスイッチ、安全機構、および条件的制御機構を含む様々な特徴が改変される。例えば、自己破壊型および標識型/タグ型CAR-T細胞の両方は、CAR発現T細胞の除去を促進する「オフスイッチ」を有するように改変される。自己破壊型CAR-Tは、CARを含有するが、外因性分子の投与で誘導が可能なアポトーシス促進性の自殺遺伝子または「除去遺伝子」も発現するように改変される。HSV-TK(単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ)、Fas、iCasp9(誘導性カスパーゼ9)、CD20、MYC TAG、および切断EGFR(内皮増殖因子受容体)を含む様々な自殺遺伝子が、この目的のために用いられてもよい。例えば、HSKは、プロドラッグのガンシクロビル(GCV)を、複製中のDNAに組み込まれるGCV三リン酸に変換して、最終的に細胞死をもたらす。iCasp9は、低分子AP1903に結合するFK506結合タンパク質の成分を含有するキメラタンパク質であり、カスパーゼ9の二量体化およびアポトーシスをもたらす。標識型/タグ型CAR-T細胞は、CARを有するが、選択マーカーを発現するようにも改変される細胞である。この選択マーカーに対するmAbの投与は、CAR-T細胞の除去を促進する。切断EGFRは、抗EGFR mAbによるそのような標的化可能抗原の1つであり、セツキシマブの投与は、CAR-T細胞の除去を促進するように働く。これらの特徴を有するように生成されたCARは、「スイッチ可能型CAR(switchable CAR)」としてsCAR、および「調節可能型CAR(regulatable CAR)」としてRCAR、とも称される。「抑制型CAR(inhibitory CAR)」(iCAR)とも呼ばれる「安全型CAR」は、2つの抗原結合ドメインを発現するように改変される。これらの細胞外ドメインのうちの1つは、腫瘍関連抗原に対するもので、細胞内共刺激ドメインおよび刺激ドメインに結合する。しかしながら、第2の細胞外抗原結合ドメインは、正常組織に特異的であり、CTLA4、PD1、またはCD45などの細胞内チェックポイントドメインに結合する。iCARに、複数の細胞内阻害ドメインを組み込むことも可能である。これらの阻害ドメインを提供し得るいくつかの阻害分子としては、B7-H1、B7-1、CD160、PIH、2B4、CEACAM(CEACAM-1、CEACAM-3、および/またはCEACAM-5)、LAG-3、TIGIT、BTLA、LAIR1、およびTGFβ-R、が挙げられる。正常組織の存在下、この第2の抗原結合ドメインを刺激すると、CARを阻害するように働くであろう。この二重抗原特異性のため、iCARも二重特異性CAR-T細胞の一形態であることに留意されたい。安全型CAR-Tの改変は、腫瘍組織に対するCAR-T細胞の特異性を増強し、ある特定の正常組織が標準型CARでオフターゲット効果をもたらす可能性のある非常に低いレベルの腫瘍関連抗原を発現し得る状況において、有利である(Morgan 2010)。条件型CAR-T細胞は、細胞内共刺激ドメインおよび別個の細胞内共刺激物質に結合された細胞外抗原結合ドメインを発現する。共刺激ドメイン配列および刺激ドメイン配列は、外因性分子の投与の際に、得られるタンパク質が細胞内で集まって、CAR回路を完成するように改変される。このように、CAR-T活性化は、調節が可能で、おそらく、特定の患者に対して「微調整」またはパーソナライズもされ得る。デュアル型CARの設計と同様に、条件型CARでも、不活性時に刺激ドメインと共刺激ドメインが物理的に分離しており、このような理由から、これらもまた、「分離型CAR(split CAR)」と称される。
一部の実施形態では、これらの改変された特徴のうちの2つ以上を組み合わせて、強化された多機能CAR-Tを作製することができる。例えば、トラックのようにサイトカイ
ンも放出するデュアル型または条件型CAR設計のいずれかを有するCAR-T細胞を生成することが可能である。一部の実施形態では、デュアル型-条件型CAR-T細胞は、それぞれ、それらのそれぞれの共刺激ドメインに結合する2つの異なる癌抗原に対する2つの別個の抗原結合ドメインを有する2つのCARを発現するように作製され得る。共刺激ドメインは、活性化分子が投与された後にのみ、刺激ドメインとともに機能的になる。このCAR-T細胞が有効であるためには、癌が両方の癌抗原を発現し、活性化分子が患者に投与される必要があり、それによって、デュアル型および条件型CAR-T細胞の両方の特徴が組み込まれる。
典型的には、CAR-T細胞はα-βT細胞を使用して作製されるが、γ-δT細胞を使用してもよい。一部の実施形態では、記載のCAR構築物、ドメイン、およびCAR-T細胞を生成するために使用される改変された特徴は、同様に、NK(ナチュラルキラー)細胞、B細胞、マスト細胞、骨髄由来貪食細胞、およびNKT細胞、を含む他のタイプのCAR発現免疫細胞の生成に用いられ得る。あるいは、CAR発現細胞は、T細胞およびNK細胞の両方の特性を有するように生成され得る。追加の実施形態では、CARで形質導入されるものは、自己または同種であり得る。
CARの発現には、いくつかの異なる方法を使用することができ、レトロウイルス形質導入(γ-レトロウイルスを含む)、レンチウイルス形質導入、トランスポソン/トランスポサーゼ(Sleeping BeautyおよびPiggyBac系)、ならびにメッセンジャーRNA導入媒介遺伝子発現が含まれる。CAR-T細胞を改変する可能性に関して、遺伝子編集(遺伝子挿入または遺伝子欠失/破壊)も同様に重要性が増してきている。CRISPR-Cas9、ZFN(Znフィンガーヌクレアーゼ)、およびTALEN(転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ)系は、それらを介してCAR-T細胞を生成することができる、3つの潜在的な方法である。
定義
用語「アミノ酸配列」は、アミノ酸残基を表す略称、文字、記号または単語のリストを指す。本明細書で使用されるアミノ酸の略称は、アミノ酸の従来の1文字コードであり、以下のように表される。A.アラニン、B.アスパラギンまたはアスパラギン酸、C.システイン、D.アスパラギン酸、E.グルタミン酸、グルタミン酸、F.フェニルアラニン、G.グリシン、H.ヒスチジン、I.イソロイシン、K.リジン、L.ロイシン、M.メチオニン、N.アスパラギン、P.プロリン、Q.グルタミン、R.アルギニン、S.セリン、T.スレオニン、V.バリン、W.トリプトファン、Y.チロシン、Z.グルタミンまたはグルタミン酸。
用語「抗体」は、免疫グロブリン、特異的結合能力を維持するその誘導体、および免疫グロブリン結合ドメインと相同またはほぼ相同である結合ドメインを有するタンパク質を指す。これらのタンパク質は、天然源に由来し得るか、もしくは部分的または完全に合成されて産生され得る。抗体は、モノクローナルまたはポリクローナルであり得る。抗体は、任意の種からの任意の免疫グロブリンのクラスのメンバーであってもよく、任意のヒトのクラス:IgG、IgM、IgA、IgD、およびIgEを含む。例示的な実施形態では、本明細書に記載の方法および組成物とともに使用される抗体は、IgGクラスの誘導体である。「抗体」という用語には、無傷の免疫グロブリン分子に加えて、それらの免疫グロブリン分子の断片またはポリマー、および標的抗原に選択的に結合するヒトまたはヒト化バージョンの免疫グロブリン分子も含まれる。
用語「抗体断片」は、全長未満の抗体の任意の誘導体を指す。例示的な実施形態では、抗体断片は、全長の抗体の特異的結合能力の少なくとも有意な部分を保持する。抗体断片の例としては、限定されないが、Fab、Fab’、F(ab’)2、scFv、Fv、
dsFvダイアボディ、Fc、およびFd断片が挙げられる。抗体断片は、任意の方法によって産生され得る。例えば、抗体断片は、無傷の抗体の断片化によって酵素的または化学的に産生されてもよく、部分抗体配列をコードする遺伝子から組換えて産生されてもよく、または完全にもしくは部分的に合成されて産生されてもよい。抗体断片は、任意選択的に、単鎖抗体断片であってもよい。あるいは、断片は、例えばジスルフィド結合によって一緒に連結される、複数の鎖を含んでもよい。断片は、任意選択的に多分子複合体であってもよい。機能性抗体断片は、典型的には、少なくとも約50アミノ酸を含み、より典型的には、少なくとも約200アミノ酸を含む。
用語「抗原結合部位」は、抗原上のエピトープに特異的に結合する抗体の領域を指す。
用語「アプタマー」は、特定の標的分子に結合するオリゴ核酸またはペプチド分子を指す。これらの分子は、一般に、ランダム配列のプールから選択される。選択されたアプタマーは、固有の三次構造に適応し、高い親和性および特異性で標的分子を認識することができる。「核酸アプタマー」は、DNAまたはRNAオリゴ核酸であり、その立体構造を介して標的分子に結合し、それによって、そのような分子の機能を阻害または抑制する。核酸アプタマーは、DNA、RNA、またはそれらの組み合わせによって構成され得る。「ペプチドアプタマー」は、一定の足場タンパク質内に挿入された可変ペプチド配列を有する組み合わせタンパク質分子である。ペプチドアプタマーの同定は、典型的には、厳しい酵母ダイハイブリッド条件下で行われ、これは、選択されたペプチドアプタマーが細胞内文脈において安定して発現され、正しく折り畳まれる可能性を高める。
「担体」という用語は、化合物または組成物と組み合わせて、その意図された用途または目的のために、化合物または組成物の調製、保存、投与、送達、有効性、選択性、または任意の他の特徴を補助または促進する、化合物、組成物、物質、または構造を意味する。例えば、担体を選択して、活性成分の任意の分解を最小限に抑え、対象における任意の有害な副作用を最小限に抑えることができる。
用語「キメラ分子」は、それらの天然状態で別個に存在する2つ以上の分子を結合することによって生成される単一分子を指す。単一のキメラ分子は、その構成分子の全ての所望の機能を有する。キメラ分子の一種は、融合タンパク質である。
用語「改変抗体」は、抗体断片を少なくとも含む組換え分子を指し、抗体の重鎖および/または軽鎖の可変ドメインに由来する抗原結合部位を含み、任意選択的に、Igクラス(例えば、IgA、IgD、IgE、IgG、IgMおよびIgY)のいずれかに由来する抗体の可変ドメインおよび/または定常ドメインの全体または一部を含み得る。
用語「エピトープ」は、抗体が優先的かつ特異的に結合する抗原の領域を指す。モノクローナル抗体は、分子的に定義され得る分子の単一の特異的エピトープに優先的に結合する。本発明において、複数のエピトープは、多特異性抗体によって認識することができる。
用語「融合タンパク質」は、1つのポリペプチドのアミノ末端と別のポリペプチドのカルボキシル末端との間に形成されるペプチド結合を介して、2つ以上のポリペプチドを結合することによって形成されるポリペプチドを指す。融合タンパク質は、構成ポリペプチドの化学カップリングによって形成され、または単一の連続した融合タンパク質をコードする核酸配列からの単一のポリペプチドとして発現され得る。単鎖融合タンパク質は、単一の連続したポリペプチド骨格を有する融合タンパク質である。融合タンパク質は、分子生物学における従来の技術を使用して調製することができ、2つの遺伝子をインフレームで単一の核酸に結合して、次いで、融合タンパク質が産生される条件下で、適切な宿主細
胞で核酸を発現させる。
用語「Fab断片」は、酵素パパインによる抗体の切断によって生成される抗原結合部位を含む抗体の断片を指し、H鎖間ジスルフィド結合のN末端側のヒンジ領域が切断されて、1つの抗体分子から2つのFab断片が生成される。
用語「F(ab’)2断片」は、H鎖間ジスルフィド結合のC末端側のヒンジ領域で切断する、酵素ペプシンで抗体分子を切断することによって生成される、2つの抗原結合部位を含有する抗体の断片を指す。
用語「Fc断片」は、その重鎖の定常ドメインを含む抗体の断片を指す。
用語「Fv断片」は、その重鎖および軽鎖の可変ドメインを含む抗体の断片を指す。
「遺伝子構築物」は、ベクター、プラスミド、ウイルスゲノム等のような核酸を指し、ポリペプチドの「コード配列」を含むか、または、そうでなければ、生物学的に活性なRNA(例えば、アンチセンス、デコイ、リボザイム等)に転写可能であり、細胞、例えば、ある特定の実施形態では哺乳動物細胞、にトランスフェクトすることができ、構築物でトランスフェクトされた細胞において、コード配列の発現を引き起こし得る。遺伝子構築物は、コード配列、ならびにイントロン配列、ポリアデニル化部位、複製開始点、マーカー遺伝子などに作動可能に連結された1つまたは複数の調節要素、を含んでもよい。
用語「同一性」は、2つの核酸分子またはポリペプチド間の配列同一性を指す。同一性は、比較のためにアラインメントされ得る各配列中の位置を比較することによって決定することができる。比較される配列中の位置が同じ塩基によって占有されていれば、分子は、その位置において同一である。核酸またはアミノ酸の配列間の類似性または同一性の程度は、核酸配列によって共有される位置において同一のまたは一致するヌクレオチドの数の関数である。様々なアラインメントアルゴリズムおよび/またはプログラムを使用して2つの配列間の同一性を計算することができ、それにはFASTAまたはBLASTが含まれ、GCG配列解析パッケージ(University of Wisconsin,Madison,Wis.)の一部として利用可能で、例えば、デフォルト設定で使用することができる。例えば、本明細書に記載される特定のポリペプチドと少なくとも70%、85%、90%、95%、98%または99%の同一性を有し、好ましくは、実質的に同じ機能を示し、ならびにそのようなポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが考慮される。別段の指示がない限り、類似性スコアはBLOSUM62の使用に基づく。BLASTPが使用される場合、類似性パーセントは、BLASTPポジティブスコアに基づき、配列同一性パーセントは、BLASTP同一性スコアに基づく。BLASTP「同一性」は、同一である高スコア配列対における総残基の数および割合を示し、BLASTP「ポジティブ」は、アラインメントスコアがポジティブ値を有し、互いに類似している残基の数および割合を示す。本明細書に開示されるアミノ酸配列と、これらの程度の同一性もしくは類似性、または任意の中間程度の同一性もしくは類似性を有するアミノ酸配列は、本開示によって考慮され、包含される。類似するポリペプチドのポリヌクレオチド配列は、遺伝コードを使用して推定され、従来の手段によって、特に遺伝コードを使用してそのアミノ酸配列を逆翻訳することによって、得ることができる。
用語「リンカー」は、当該技術分野で周知であり、2つのポリペプチド等の2つの化合物を結合する分子または分子のグループを指す。リンカーは、単一の連結分子から構成されてもよく、または連結分子およびスペーサー分子を含んでもよく、連結分子および化合物を特定の距離で分離することが意図されている。
用語「多価抗体」は、2つ以上の抗原認識部位を含む抗体または改変抗体を指す。例えば、「二価」抗体は、2つの抗原認識部位を有するのに対し、「四価」抗体は、4つの抗原認識部位を有する。用語「単一特異性」、「二重特異性」、「三重特異性」、「四重特異性」等は、多価抗体に存在する異なる抗原認識部位の特異性の数(抗原認識部位の数とは対照的に)を指す。例えば、「単一特異性」抗体の抗原認識部位は、すべて同じエピトープに結合する。「二重特異性」抗体は、第1のエピトープに結合する少なくとも1つの抗原認識部位と、第1のエピトープとは異なる第2のエピトープに結合する少なくとも1つの抗原認識部位を有する。「多価単一特異性」抗体は、すべて同じエピトープに結合する複数の抗原認識部位を有する。「多価二重特異性」抗体は、複数の抗原認識部位を有し、そのうちのいくつかは第1のエピトープに結合し、そのうちのいくつかは第1のエピトープとは異なる第2のエピトープに結合する。
用語「核酸」は、1つのヌクレオチドの3’位で別のヌクレオチドの5’末端にリン酸基によって連結された、単一のヌクレオチドまたは2つ以上のヌクレオチドを含む、天然または合成分子を指す。核酸は長さによって限定されず、したがって、核酸は、デオキシリボ核酸(DNA)またはリボ核酸(RNA)を含むことができる。
「に作動可能に連結された」という用語は、別の核酸配列との核酸の機能関係を指す。プロモーター、エンハンサー、転写および翻訳停止部位、ならびに他のシグナル配列は、他の配列に作動可能に連結された核酸配列の例である。例えば、DNAの転写調節エレメントへの作動可能な連結は、DNAとプロモーターとの間の物理的および機能的関係を指し、DNAを特異的に認識し、結合し、転写するRNAポリメラーゼによって、そのようなDNAの転写が、プロモーターから開始されるようになる。
用語「ペプチド」、「タンパク質」、および「ポリペプチド」は、互換的に使用され、1つのアミノ酸のカルボキシル基によって別のアミノ酸のアルファアミノ基に連結された2つ以上のアミノ酸を含む天然または合成分子を指す。
「薬学的に許容される」という用語は、健全な医学的判断の範囲内で、過度の毒性、刺激、アレルギー反応、または他の問題もしくは合併症が無く、合理的なベネフィット/リスク比に見合った、ヒトおよび動物の組織と接触して使用するのに適している化合物、材料、組成物、および/または剤形を指す。
用語「ポリペプチド断片」または「断片」は、特定のポリペプチドに関して使用される場合、参照ポリペプチド自体と比較して、アミノ酸残基が欠失しているが、残りのアミノ酸配列が参照ポリペプチドの配列と通常同一であるポリペプチドを指す。そのような欠失は、参照ポリペプチドのアミノ末端またはカルボキシ末端、または代替的に両方で起こり得る。断片は、典型的には、少なくとも約5、6、8もしくは10個のアミノ酸長、少なくとも約14個のアミノ酸長、少なくとも約20、30、40、もしくは50個のアミノ酸長、少なくとも約75個のアミノ酸長、または少なくとも約100、150、200、300、500個もしくはそれ以上のアミノ酸長である。断片は、参照ポリペプチドの生物学的活性のうちの1つまたは複数を保持し得る。種々の実施形態では、断片は、参照ポリペプチドの酵素活性および/または相互作用部位を含んでもよい。別の実施形態では、断片は、免疫原的な特性を有し得る。
「タンパク質ドメイン」という用語は、タンパク質の一部、タンパク質の複数の部分、または構造的完全性を示すタンパク質全体を指し、この決定は、タンパク質の一部、タンパク質の複数の部分、またはタンパク質全体のアミノ酸組成に基づいてよい。
用語「単鎖可変断片またはscFv」は、重鎖ドメインおよび軽鎖ドメインが連結され
るFv断片を指す。1つまたは複数のscFv断片は、1つまたは複数の抗原認識部位を有する抗体構築物を形成するために、他の抗体断片(重鎖または軽鎖の定常ドメイン等)に連結されてもよい。
本明細書で使用される「スペーサー」は、融合タンパク質を含むタンパク質を結合するペプチドを指す。一般に、スペーサーは、タンパク質を結合する以外で、またはそれらの間にある最小距離もしくは他の空間関係を維持する以外で、特異的な生物学的活性を有しない。しかしながら、スペーサーの構成アミノ酸は、分子の折り畳み、正味電荷、または疎水性などの、分子のある特性に影響を与えるように選択してもよい。
本明細書で使用される「特異的に結合する」という用語は、ポリペプチド(抗体を含む)または受容体を指す場合、タンパク質および他の生体物質の異種集団において、タンパク質またはポリペプチドまたは受容体の存在を決定付ける結合反応を指す。したがって、指定された条件(例えば、抗体の場合の免疫アッセイ条件)では、特定のリガンドまたは抗体が、試料中に存在する他のタンパク質と、またはリガンドもしくは抗体が生物中で接触し得る他のタンパク質と、有意な量で結合しないとき、その特定の「標的」に「特異的に結合する」(例えば、抗体が内皮抗原に、特異的に結合する)。一般に、第2の分子に「特異的に結合する」第1の分子は、その第2の分子と、約10-1を超える(例えば、10-1、10-1、10-1、10-1、1010-1、1011-1、および1012-1以上)親和性定数(Ka)を有する。
本明細書で使用される「特異的に送達する」という用語は、分子が特定の標的分子またはマーカーを有する細胞または組織と優先的に結合し、その標的分子を欠く細胞または組織とは結合しないことを指す。もちろん、分子と非標的細胞または組織との間で、ある程度の非特異的相互作用が起こり得ることは認識されている。しかしながら、特異的送達は、標的分子の特異的認識を通じて媒介されるものとして区別され得る。典型的には、特異的送達は、送達分子と標的分子を有する細胞との間で、送達分子と標的分子を欠く細胞との間よりもはるかに強い結合をもたらす。
用語「対象」は、投与または治療の標的である任意の個体を指す。対象は、脊椎動物、例えば、哺乳動物であり得る。したがって、対象は、ヒトまたは動物の患者であり得る。用語「患者」は、臨床医、例えば医師、の治療下にある対象を指す。
用語「治療上有効」は、疾患または障害の1つまたは複数の原因または症状を寛解するのに十分な量で使用される組成物の量を指す。そのような寛解には、縮減または変更が必要であるだけで、必ずしも除去される必要はない。
「形質転換」および「トランスフェクション」という用語は、核酸、例えば発現ベクターを、当該細胞の染色体DNAに核酸を導入することを含め、レシピエント細胞に導入することを意味する。
用語「治療」は、疾患、病態、または障害を治癒、寛解、安定化、または予防することを意図した患者の医療管理を指す。この用語は、能動的治療、すなわち、疾患、病態、または障害の改善に特異的に向けられた治療を含み、また、原因的治療、すなわち、関連する疾患、病態、または障害の原因の除去に向けられた治療を含む。加えて、この用語は、緩和的治療、すなわち、疾患、病態、または障害の治癒ではなく症状の緩和のために設計された治療、予防的治療、すなわち、関連する疾患、病態、または障害の発症を最小限にすること、または部分的もしくは完全に阻害することに向けられた治療、および支持的治療、すなわち、関連する疾患、病態、または障害の改善に向けられた別の特定の療法を補完するために用いられる治療を含む。
「変異体」という用語は、保存的アミノ酸置換、非保存的アミノ酸置換(すなわち、縮重変異体)、ペプチドまたは参照配列に対して60%、70%、80%、90%、95%、96%、97%、98%、99%の配列同一性を有するペプチドのC末端に添加されるアミノ酸をコードする各コドン(すなわち、DNAおよびRNA)のゆらぎ位置内の置換、を有するアミノ酸またはペプチド配列を指す。
用語「ベクター」は、ベクター配列が連結された別の核酸を細胞内に輸送することができる核酸配列を指す。用語「発現ベクター」は、細胞による発現に好適な形態の(例えば、転写制御エレメントに連結された)遺伝子構築物を含有する任意のベクター(例えば、プラスミド、コスミド、またはファージ染色体)を含む。
本発明のいくつかの実施形態が説明されている。しかしながら、本発明の主旨および範囲から逸脱することなく、種々の変更が行われ得ることを理解されたい。したがって、他の実施形態は、以下の特許請求の範囲内である。
実施例1:CLEC12Aハイブリドーマのスクリーニング
一次スクリーニングから選択されるハイブリドーマをサブクローニングした。ELISAプレートを、DPBS(LONZA、カタログ#17-512F、ロット#0000615334)で1ug/mlに希釈したCLEC12A抗原(Thermo Fisher、カタログ#11896H07H50、ロット#LCL07JL0401)を用いて、室温で1時間コーティングし、次いで、100ul/ウェルの1%BSA/DPBSを用いて、室温で1時間ブロックした。次いで、モノクローナルハイブリドーマ由来の上清を、コーティングされたプレートに添加した(50ul/ウェル)。ヤギ抗マウスIg-HRP(1010-05)を、TBST中で1:4000、50ul/ウェル、室温で45分間、続いて、ABTS/H2O2を10分間、使用して抗体を検出した。クローン1F3、1F8、1G3、2A10、3F12、4E3、4E10、5B2、5F10、6C7、9A2、11C7、11H1、および12D6は、CLEC12Aへの陽性結合を示した。
図1A~1Dは、標的細胞として使用したCLEC12A(CHO-CLEC12A)を過剰発現するCHO細胞を示す。抗CLEC12A CARを発現するガンマレトロウイルスを、健康なPBMCから単離した初代T細胞に形質導入した。各CARの形質導入効率は、mCherry発現のフローサイトメトリー分析によって決定した(図1Aおよび1B)。CAR陽性細胞を、1:1(図1C)または1:5(図1D)のいずれかのエフェクター対標的比で標的細胞に添加した。UT=非形質導入、MFI=蛍光強度の中央値。
図2A~2Iは、抗CLEC12A CARの免疫表現型を示す。PBMCから単離された健康なT細胞を、抗CLEC12A CARで形質導入した。抗原刺激なしで1週間培養した後、CD3、CD4、CD8、PD1、CCR7、およびCD45RAについて細胞を染色し、フローサイトメーターでデータを収集した。形質導入効率は、mCherry発現に基づいて決定した(図2Aおよび2B)。CD4、CD8、およびPD1発現について、生きたCAR陽性のT細胞を分析した(図2C~2H)。また、T細胞のサブセットも、CCR7およびCD45RA発現に基づいて分析した(図2I)。EFF=エフェクター、EM=エフェクターメモリー、CM=セントラルメモリー、N=未処理。
図3A~3Fは、抗CLEC12A CARのCD4およびCD8の免疫表現型を示す。CD4およびCD8 T細胞を、PD1(図3Aおよび3B、3Dおよび3E)の発現
について、およびT細胞のサブセット(図3Cおよび3F)について分析した。EFF=エフェクター、EM=エフェクターメモリー、CM=セントラルメモリー、N=未処理。
別段の定義がない限り、本明細書で使用される全ての技術用語および科学用語は、開示された発明が属する技術分野の当業者によって一般的に理解されるものと同じ意味を有する。本明細書に引用される出版物およびそれらが引用される材料は、参照により具体的に援用される。
当業者は、本明細書に記載される本発明の特定の実施形態との多くの同等物を認識するか、または通常の実験だけを使用して確認することができるであろう。そのような同等物は、以下の特許請求の範囲によって包含されることが意図される。

Claims (18)

  1. CLEC12A抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン、細胞内シグナル伝達ドメイン、および共刺激シグナル伝達領域を含み、
    前記CLEC12A抗原結合ドメインが、CLEC12Aに特異的に結合する抗体の単鎖可変断片(scFv)であり、前記scFvが、CDR1、CDR2およびCDR3配列を有する重鎖可変(V )ドメイン、ならびにCDR1、CDR2およびCDR3配列を有する軽鎖可変(V )ドメインを含み、
    (a)前記V ドメインの前記CDR1配列が、配列番号1のアミノ酸配列を含み、前記V ドメインの前記CDR2配列が、配列番号4のアミノ酸配列を含み、前記V ドメインの前記CDR3配列が、配列番号8のアミノ酸配列を含み、前記V ドメインの前記CDR1配列が、配列番号10のアミノ酸配列を含み、前記V ドメインの前記CDR2配列が、配列番号13のアミノ酸配列を含み、および前記V ドメインの前記CDR3配列が、配列番号15のアミノ酸配列を含む;または、
    (b)前記V ドメインの前記CDR1配列が、配列番号2のアミノ酸配列を含み、前記V ドメインの前記CDR2配列が、配列番号4のアミノ酸配列を含み、前記V ドメインの前記CDR3配列が、配列番号8のアミノ酸配列を含み、前記V ドメインの前記CDR1配列が、配列番号10のアミノ酸配列を含み、前記V ドメインの前記CDR2配列が、配列番号13のアミノ酸配列を含み、および前記V ドメインの前記CDR3配列が、配列番号15のアミノ酸配列を含む;または、
    (c)前記V ドメインの前記CDR1配列が、配列番号3のアミノ酸配列を含み、前記V ドメインの前記CDR2配列が、配列番号6のアミノ酸配列を含み、前記V ドメインの前記CDR3配列が、配列番号9のアミノ酸配列を含み、前記V ドメインの前記CDR1配列が、配列番号10のアミノ酸配列を含み、前記V ドメインの前記CDR2配列が、配列番号13のアミノ酸配列を含み、および前記V ドメインの前記CDR3配列が、配列番号15のアミノ酸配列を含む、キメラ抗原受容体(CAR)ポリペプチド。
  2. 前記V ドメインが配列番号16のアミノ酸配列を含み、且つ前記V ドメインが配列番号22のアミノ酸配列を含む;または
    前記V ドメインが配列番号18のアミノ酸配列を含み、且つ前記V ドメインが配列番号22のアミノ酸配列を含む;または
    前記V ドメインが配列番号20のアミノ酸配列を含み、且つ前記V ドメインが配列番号22のアミノ酸配列を含む、請求項1に記載のポリペプチド。
  3. 前記共刺激シグナル伝達領域が、CD27、CD28、4-1BB、OX40、CD30、CD40、PD-1、ICOS、リンパ球機能関連抗原-1(LFA-1)、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7-H3、CD83と特異的に結合するリガンド、およびこれらの任意の組み合わせからなる群から選択される共刺激分子の細胞質ドメインを含む、請求項1又は2に記載のポリペプチド。
  4. 前記CARポリペプチドが、式
    SP-CLEC12A-HG-TM-CSR-ISD、または
    SP-CLEC12A-HG-TM-ISD-CSR
    によって定義され、式中、「SP」は、シグナルペプチドを表し、
    「CLEC12A」は、CLEC12A結合領域を表し、
    「HG」は、任意選択的なヒンジドメインを表し、
    「TM」は、膜貫通ドメインを表し、
    「CSR」は、共刺激シグナル伝達領域を表し、
    「ISD」は、細胞内シグナル伝達ドメインを表し、
    「-」は、二価リンカーを表す、請求項1~のいずれか一項に記載のポリペプチド。
  5. 前記細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3ゼータ(CD3ζ)シグナル伝達ドメインを含む、請求項1~のいずれか一項に記載のポリペプチド。
  6. 請求項1~のいずれか一項に記載の組換えポリペプチドをコードする単離された核酸
  7. 請求項に記載の単離された核酸を含むベクター。
  8. 請求項に記載のベクターを含む細胞。
  9. 前記細胞が、αβT細胞、γδT細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、ナチュラルキラーT(NKT)細胞、B細胞、自然リンパ球細胞(ILC)、サイトカイン誘導キラー(CIK)細胞、細胞傷害性Tリンパ球(CTL)、リンホカイン活性化キラー(LAK)細胞、制御性T細胞、またはこれらの任意の組み合わせからなる群から選択される、請求項に記載の細胞。
  10. 前記細胞が、前記CARの前記抗原結合ドメインがCLEC12Aに結合するときに、抗腫瘍免疫を示す、請求項に記載の細胞。
  11. 請求項1に記載のキメラ抗原受容体(CAR)ポリペプチドを含む、細胞。
  12. 前記細胞が、自己または同種のエプスタインバーウイルス(EBV)特異的細胞傷害性リンパ球である、請求項11に記載の細胞。
  13. CLEC12A発現癌を有する対象において抗癌免疫を提供する方法において使用するための、請求項1~のいずれか一項に記載のCARポリペプチドを発現するように遺伝子改変された免疫エフェクター細胞であって、前記方法は、前記対象に有効量の、前記免疫エフェクター細胞を投与することによって、哺乳動物における抗腫瘍免疫を提供することを含む、免疫エフェクター細胞
  14. 前記免疫エフェクター細胞が、T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、細胞傷害性Tリンパ球(CTL)、および制御性T細胞、からなる群から選択される、請求項13に記載の免疫エフェクター細胞
  15. 前記免疫エフェクター細胞が、自己または同種のエプスタインバーウイルス(EBV)特異的細胞傷害性リンパ球である、請求項13または14に記載の免疫エフェクター細胞
  16. 前記対象にチェックポイント阻害剤投与と組み合わせて投与される、請求項1315のいずれか一項に記載の免疫エフェクター細胞
  17. 前記チェックポイント阻害剤が、抗PD-1抗体、抗PD-L1抗体、抗CTLA-4抗体、またはこれらの組み合わせを含む、請求項16に記載の免疫エフェクター細胞
  18. 前記癌が、骨髄異形成症候群、急性骨髄性白血病、または混合表現型(bi-phenotypic)白血病を含む、請求項1317のいずれか一項に記載の免疫エフェクター細胞
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