JP7307481B2 - 始原生殖細胞／始原生殖細胞様細胞の維持増幅及び分化誘導方法 - Google Patents

始原生殖細胞／始原生殖細胞様細胞の維持増幅及び分化誘導方法 Download PDF

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Description

特許法第３０条第２項適用 平成２９年５月３０日 ｈｔｔｐ：／／ｅｍｂｏｊ．ｅｍｂｏｐｒｅｓｓ．ｏｒｇ／ｃｏｎｔｅｎｔ／ｅｍｂｏｊｎ１／３６／１３／１８８８．ｆｕｌｌ．ｐｄｆを通じて発表
特許法第３０条第２項適用 平成２９年６月１日 ８２ｎｄ Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ ｏｎ Ｑｕａｎｔｉａｔｉｖｅ Ｂｉｏｌｏｇｙ Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙにて発表
特許法第３０条第２項適用 平成２９年６月１７日 ＩＳＳＣＲ ２０１７ Ｂｏｓｔｏｎ Ｃｏｎｖｅｎｔｉｏｎ ａｎｄ Ｅｘｈｉｂｉｔｉｏｎ Ｃｅｎｔｅｒにて発表
特許法第３０条第２項適用 平成２９年６月２１日 ２０１７ Ｇｅｒｍｉｎａｌ Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌｏｇｙ Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ ＧＲＣ Ｔｈｅ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇにて発表
特許法第３０条第２項適用 平成２９年７月６日 ｈｔｔｐ：／／ｊｓｆｉ３５．ｕｍｉｎ．ｊｐ／ｋａｉｉｎ／ｊｓｆｉ３５＿ｓｈｏｒｏｋｕ．ｐｄｆを通じて発表
特許法第３０条第２項適用 平成２９年７月２０日 第３５回 日本受精着床学会 総会・学術講演会 米子コンベンションセンターＢｉＧ ＳＨｉＰにて発表
特許法第３０条第２項適用 平成２９年９月１９日 ｈｔｔｐ：／／ｅｍｂｏｊ．ｅｍｂｏｐｒｅｓｓ．ｏｒｇ／ｃｏｎｔｅｎｔ／ｅｍｂｏｊｎ１／３６／２１／３１００．ｆｕｌｌ．ｐｄｆを通じて発表
特許法第３０条第２項適用 平成２９年９月１９日 京都大学大学院医学研究科機能微細形態学教室にて発表
特許法第３０条第２項適用 平成２９年１０月２３日 ＡｔｔｅｎｄｅｅＨｕｂを通じて発表
特許法第３０条第２項適用 平成２９年１０月２６日 ＥＭＢＬ Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ ＥＭＢＬ Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｔｒａｉｎｉｎｇ Ｃｅｎｔｒｅにて発表
特許法第３０条第２項適用 平成２９年１１月６日 ＣｉＲＡ ２０１７ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ 京都市勧業館みやこめっせにて発表
特許法第３０条第２項適用 平成２９年１１月６日 ＣｉＲＡ ２０１７ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ、第８頁 京都大学ｉＰＳ細胞研究所にて発表
本発明は、始原生殖細胞もしくは始原生殖細胞様細胞の維持増幅方法、当該細胞からの卵子形成の誘導方法、並びにそのための試薬等に関する。
発生生物学における主要な課題は、必須の発生経路をインビトロで再構成することであり、これは、新たな実験の機会を提供するだけでなく医学的応用の基礎としても役立つものである。本発明者らは以前、アクチビンＡ及び塩基性線維芽細胞増殖因子（ｂＦＧＦ）を含むサイトカインを用いて、胚性幹細胞（「ＥＳ細胞」、「ＥＳＣ」と略記する場合がある）／人工多能性幹細胞（「ｉＰＳ細胞」、「ｉＰＳＣ」と略記する場合がある）をエピブラスト様細胞（「ＥｐｉＬＣ」と略記する場合がある）へ誘導し、その後、ＢＭＰ４を含むサイトカインを用いて、始原生殖細胞（「ＰＧＣ」と略記する場合がある）様細胞（「ＰＧＣ様細胞」、「ＰＧＣＬＣ」と略記する場合がある）へと誘導する培養系を確立した（例えば、特許文献１、非特許文献１を参照）。さらに、該ＰＧＣＬＣを新生仔マウスの卵嚢下に移植して卵子に分化させ、そこから正常な子孫を得ることに成功した（非特許文献２）。また、多能性幹細胞（「ＰＳＣ」と略記する場合がある）からＰＧＣＬＣを経て卵子をインビトロで誘導することにも成功している（非特許文献３）。
しかしながら、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣは、試験管内で増殖及び分化をコントロールすることが難しく、研究を進める上で大きな問題となっている。
フォルスコリンがＰＧＣの増殖に有効であることが報告されている（非特許文献４）。フォルスコリンはアデニル酸シクラーゼを活性化し、細胞内ｃＡＭＰレベルを上昇させる。減数分裂の休止には細胞内ｃＡＭＰレベルが関与するとされているが、フォルスコリンの添加のみで十分なｃＡＭＰレベルの上昇及びＰＧＣの増殖が起こるかについては不明のままである。
一方、卵子形成誘導については、従来法はいずれも生殖巣の体細胞を必要とするが、当該細胞から供給されるどの因子が実際に卵子形成に寄与するのかが不明であるばかりでなく、胎生期の生殖巣由来の体細胞を用いるため、ヒト等の他の動物種においてはその採取がきわめて困難であるという問題がある。
国際公開第２０１２／０２０６８７号
Ｈａｙａｓｈｉ，Ｋ．，Ｏｈｔａ，Ｈ．，Ｋｕｒｉｍｏｔｏ，Ｋ．，Ａｒａｍａｋｉ，Ｓ．＆ Ｓａｉｔｏｕ，Ｍ．Ｒｅｃｏｎｓｔｉｔｕｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｍｏｕｓｅ ｇｅｒｍ ｃｅｌｌ ｓｐｅｃｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｐａｔｈｗａｙ ｉｎ ｃｕｌｔｕｒｅ ｂｙ ｐｌｕｒｉｐｏｔｅｎｔ ｓｔｅｍ ｃｅｌｌｓ．Ｃｅｌｌ１ ４６，５１９－５３２（２０１１）． Ｈａｙａｓｈｉ，Ｋ．ｅｔ ａｌ．Ｏｆｆｓｐｒｉｎｇ ｆｒｏｍ ｏｏｃｙｔｅｓ ｄｅｒｉｖｅｄ ｆｒｏｍ ｉｎ ｖｉｔｒｏ ｐｒｉｍｏｒｄｉａｌ ｇｅｒｍ ｃｅｌｌ－ｌｉｋｅ ｃｅｌｌｓ ｉｎ ｍｉｃｅ．Ｓｃｉｅｎｃｅ ３３８，９７１－９７５（２０１２）． Ｈｉｋａｂｅ Ｏ，Ｈａｍａｚａｋｉ Ｎ，Ｎａｇａｍａｔｓｕ Ｇ，Ｏｂａｔａ Ｙ，Ｈｉｒａｏ Ｙ，Ｈａｍａｄａ Ｎ，Ｓｈｉｍａｍｏｔｏ Ｓ，Ｉｍａｍｕｒａ Ｔ，Ｎａｋａｓｈｉｍａ Ｋ，Ｓａｉｔｏｕ Ｍ，Ｈａｙａｓｈｉ Ｋ．Ｒｅｃｏｎｓｔｉｔｕｔｉｏｎ ｉｎ ｖｉｔｒｏ ｏｆ ｔｈｅ ｅｎｔｉｒｅ ｃｙｃｌｅ ｏｆ ｔｈｅ ｍｏｕｓｅ ｆｅｍａｌｅ ｇｅｒｍ ｌｉｎｅ．Ｎａｔｕｒｅ．２０１６ Ｎｏｖ １０；５３９（７６２８）：２９９－３０３． Ｆａｒｉｎｉ Ｄ，Ｓｃａｌｄａｆｅｒｒｉ ＭＬ，Ｉｏｎａ Ｓ，Ｌａ Ｓａｌａ Ｇ，Ｄｅ Ｆｅｌｉｃｉ Ｍ．Ｇｒｏｗｔｈ ｆａｃｔｏｒｓ ｓｕｓｔａｉｎ ｐｒｉｍｏｒｄｉａｌ ｇｅｒｍ ｃｅｌｌ ｓｕｒｖｉｖａｌ，ｐｒｏｌｉｆｅｒａｔｉｏｎ ａｎｄ ｅｎｔｅｒｉｎｇ ｉｎｔｏ ｍｅｉｏｓｉｓ ｉｎ ｔｈｅ ａｂｓｅｎｃｅ ｏｆ ｓｏｍａｔｉｃ ｃｅｌｌｓ．Ｄｅｖ Ｂｉｏｌ．２００５ Ｓｅｐ１；２８５（１）：４９－５６．
従って、本発明の目的は、生殖巣の体細胞を用いることなく、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣを試験管内で増殖させる培養系並びに当該細胞から卵子形成を誘導できる培養系を提供することである。
本発明者らは、上記の目的を達成すべく、マウスＥＳＣから誘導したＰＧＣＬＣを用い、約２０００の化合物ライブラリーをスクリーニングした結果、ＰＧＣＬＣの増殖を顕著に増大させた上位２５の化合物の中に、ＰＧＣの増殖を支持することが既知のフォルスコリンやレチノイン酸（ＲＡ）シグナリングアゴニストに加え、ホスホジエステラーゼ４（ＰＤＥ４）阻害薬が数多く含まれることを見出した。ＰＤＥ４阻害薬はｃＡＭＰの加水分解を阻害することで細胞内ｃＡＭＰレベルを上昇させることから、本発明者らは、該阻害薬とフォルスコリンとの併用効果について検討した。その結果、ＰＤＥ４阻害薬とフォルスコリンとは、相乗的にＰＧＣＬＣの増殖を平均で約２５倍（最大約５０倍）、Ｅ９．５のＰＧＣの増殖を平均で約８倍にまで増大させた。
さらに、本発明者らは、前記スクリーニングで同定された他の化合物をさらに併用することにより、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣの増殖効率をより改善し得るかどうかを調べた。その結果、ＰＤＥ４阻害薬とフォルスコリンに加えて、シクロスポリンＡを用いることにより、ＰＧＣＬＣ及びＰＧＣ（Ｅ９．５）の増殖を、平均でそれぞれ約５０倍及び約１６倍にまで増大させることに成功した。
しかも、いずれの場合においても、増幅中、ＰＧＣＬＣは、親のインプリントを含むすべてのゲノム領域においてＤＮＡメチロームを進行的に消去し、どちらの性でもないＰＧＣとしての特性を維持しつつ、生殖細胞におけるゲノムワイドなＤＮＡ脱メチル化を忠実に再現した。
さらに、本発明者らは、上記増幅培養したＰＧＣＬＣを用い、生殖巣体細胞の非存在下、インビトロで雌性分化を可能にする培養系の検討を行った結果、ＲＡと骨形成タンパク質（ＢＭＰ）を同時に作用させることで、卵母細胞様細胞を誘導することに成功した。この卵母細胞様細胞は卵母細胞と同様な減数分裂像を示し、網羅的遺伝子発現解析の結果、その遺伝子発現は胎生期の卵母細胞に酷似することが明らかとなった。また、この方法によれば、９０％以上のＰＧＣＬＣを卵母細胞様細胞に分化させ得ることが示された。重要なことに、本発明者らは、この雌性生殖細胞への分化誘導には、適切に増殖させたＰＧＣ／ＰＧＣＬＣで観察されるが、誘導直後のＰＧＣ／ＰＧＣＬＣでは観察されない、関連遺伝子の脱メチル化により特徴づけられる、適切な細胞のコンピテンスが必要であることを明らかにした。
本発明者らは、これらの知見に基づいて、図１５に示すような生殖細胞における雌性への性分化のメカニズムのモデルを構築し、本発明を完成するに至った。
すなわち、本発明は以下のとおりである。
［１］ＰＧＣ又は単離されたＰＳＣ由来のＰＧＣＬＣの維持増幅方法であって、ＰＧＣ又はＰＧＣＬＣをＰＤＥ４阻害薬及び／又はシクロスポリンＡの存在下で培養することを含む、方法。
［２］ＰＧＣ又はＰＧＣＬＣを、フォルスコリンをさらに含む条件下で培養することを含む、［１］に記載の方法。
［３］ＰＤＥ４阻害薬及び／又はシクロスポリンＡを含有してなる、ＰＧＣ又はＰＧＣＬＣの維持増幅用試薬。
［４］フォルスコリンを組み合わせてなる、［３］に記載の試薬。
［５］ＰＧＣ又はＰＧＣＬＣから卵母細胞を誘導する方法であって、ＰＧＣ又はＰＧＣＬＣを、ＢＭＰ及びＲＡの存在下で培養することを含む、方法。
［６］ＢＭＰがＢＭＰ２、ＢＭＰ５及びＢＭＰ７から選ばれる１以上である、［５］に記載の方法。
［７］ＢＭＰ及びＲＡを組み合わせてなる、ＰＧＣ又はＰＧＣＬＣから卵母細胞を誘導するための試薬。
［８］ＢＭＰがＢＭＰ２、ＢＭＰ５及びＢＭＰ７から選ばれる１以上である、［７］に記載の試薬。
［９］ＰＧＣ又はＰＧＣＬＣから卵母細胞を誘導する方法であって、
（ａ）ＰＧＣ又はＰＧＣＬＣをＰＤＥ４阻害薬及び／又はシクロスポリンＡの存在下で培養し、ＰＧＣ又はＰＧＣＬＣを維持増幅すること、並びに
（ｂ）工程（ａ）で得られたＰＧＣ又はＰＧＣＬＣを、ＢＭＰ及びＲＡの存在下で培養するＢＭＰ及びＲＡの存在下で培養することを含む、方法。
本発明によれば、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣから試験管内において卵子を作製できる可能性があり、不妊症に関する基礎研究への展開、生殖補助医療への応用が期待される。
図１は、ＰＧＣＬＣ増殖を刺激する化合物の同定について示す。Ａ）ＰＧＣＬＣを用いた化合物ライブラリー・スクリーニングの実験手順。Ｂ）化合物ライブラリー・スクリーニング（１０μＭ）の結果の散布図。セルアナライザーで検出した、各化合物に対するＢｌｉｍｐ１－ｍＶｅｎｕｓ（ＢＶ）シグナルの倍数差（ｄ７／ｄ１）をプロットした。陰性対照についての平均値（赤線）及び３ＳＤ（標準偏差；赤色点線）を示す。ＰＤＥ４阻害薬、ＲＡＲアゴニスト及びフォルスコリンについての結果を、オレンジ色、青色及び緑色でそれぞれ示す。Ｃ）代表的なＰＤＥ４阻害薬（ＧＳＫ２５６０６６，１０μＭ）によるＰＧＣＬＣ増殖の刺激。スクリーニングの７日目における９６ウェルプレートの温度分布図（ｈｅａｔｍａｐ ｉｍａｇｅ）（上図）について、ＧＳＫ２５６０６６を含有しているウェル（青色の四角）のＢＶ蛍光像を増幅した（左下図及び右下図）。スケールバー：（左図）１ｍｍ；（右図）１００μｍ。Ｄ）スクリーニング（１０μＭ）における上位２５化合物（＞＋３ＳＤｓ）のカテゴリーを分類している円グラフ。Ｅ）スクリーニング（１０μＭ）において、ＰＧＣＬＣ増殖／生存に悪影響を及ぼす４２６化合物（＜－３ＳＤ）のカテゴリーを分類している円グラフ。 図２は、ＰＧＣＬＣの増幅培養システムの確立について示す。Ａ）ＰＧＣＬＣ増殖におけるフォルスコリン及びロリプラムの影響。ｄ４ ＰＧＣＬＣを、基礎培地（１０％ ＫＳＲ、２．５％ ＦＣＳ及び１００ｎｇ／ｍｌ ＳＣＦを含むＧＭＥＭ）を用い、ｍ２２０－５フィーダー（ＮＣ；陰性対照）上で培養し、１０μＭのフォルスコリン（Ｆ１０）、ロリプラム（Ｒ１０）及びフォルスコリン・ロリプラムの両方（ＦＲ１０）が、ＰＧＣＬＣ増殖に及ぼす影響を調べた。ＰＧＣＬＣ数を、培養３日目（ｃ３）、５日目（ｃ５）、７日目（ｃ７）及び９日目（ｃ９）に計数した。プレートに播種された（ｐｌａｔｅｄ）ＰＧＣＬＣ数に対する、各時点でのＰＧＣＬＣ数の倍数増加の平均を、標準偏差と共に示す（ｎ＝３）。Ｂ）ＦＲ１０を含んだ、ｄ４ ＰＧＣＬＣの代表的な培養。写真（明視野（ＢＦ）、Ｂｌｉｍｐ１－ｍＶｅｎｕｓ（ＢＶ）及びＳｔｅｌｌａ－ＥＣＦＰ（ＳＣ）の像）及びＢＶＳＣ ＦＡＣＳプロット（培養液中の生存している単一細胞）を培養１日目（ｄ４ｃ１）、３日目（ｄ４ｃ３）、５日目（ｄ４ｃ５）及び７日目（ｄ４ｃ７）に取得した。スケールバーは１００μｍ。Ｃ）（左図）雄（ＢＶＳＣ Ｒ８、ＢＤＦ１－２、ＢＣＦ１－２）及び雌（Ｈ１４、Ｈ１８）のＥＳＣ株から誘導したＰＧＣＬＣのＦＲ１０による増幅。最初にプレートに播種したＰＧＣＬＣ数に対するｄ４ｃ７時点でのＰＧＣＬＣの倍数増加を、各ＥＳＣ株の各実験についてプロットした。平均値を赤色のバーで示す。（右図）左のパネルで測定したように、Ｅ９．５ＰＧＣをＦＲ１０によって増幅した。Ｄ）培養したＰＧＣＬＣ（ＢＶ：緑色）を、ｐｈａｌｌｏｉｄｉｎ（赤色）で染色した。スケールバーは２０μｍ。Ｅ）ｄ４ ＰＧＣＬＣの細胞内ｃＡＭＰ濃度の上昇に及ぼすＦＲ１０の影響。３つの独立した実験に由来する、標準偏差と共に平均値を示す。Ｆ）～Ｈ）培養されたＰＧＣＬＣｓ（Ｆ）及び雄の胚性生殖細胞（Ｇ）の細胞周期の状態。表示する細胞型の、ＦＡＣＳ分析による、細胞周期の状態についての代表的なプロットを示す。縦軸はＢｒｄＵの取り込みを表わし、横軸はＤＮＡ含有量（７ＡＡＤ）を表わす。Ｓ期、Ｇ２／Ｍ期及びＧ１期の細胞を、各集団のパーセンテージと共に、紫色、青色及び赤色で、それぞれ示す。３つの独立した実験に由来する、標準偏差と共に平均値を（Ｈ）に示す。 図３は、培養されたＰＧＣＬＣによる頑健な精子形成を示す。Ａ）Ｗ／Ｗｖ精巣（左図、未移植）、ＢＤＦ１－２（中図）又はＢＣＦ１－２（右図）ＥＳＣ株から誘導した、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣを移植後、７ヶ月。Ｂ）～Ｄ）ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ（ＢＤＦ１－２）を移植され、精子形成を示す精細管（Ｂ、Ｃ）及びその結果として得られた精子（Ｄ）。Ｅ）～Ｇ）移植を受けた精巣（Ｅ、Ｆ）及び尾部精巣上体（Ｇ）の切片のヘマトキシリン及びエオシン（ＨＥ）染色。Ｈ）～Ｋ）レシピエント・マウスの尾部精巣上体から採取した精子（Ｈ）を用いた、ｉｎ ｖｉｔｒｏ受精（ＩＶＦ）。結果として得られた２細胞胚（Ｉ）及びその子（Ｊ、Ｋ）を示す（Ｊは正常な胎盤が付いている）。Ｌ）～Ｎ）ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣｓ（ＢＤＦ１－２）を移植したレシピエントＷ／Ｗｖマウスの生殖能力。レシピエントＷ／Ｗｖマウスの生殖能力を、自然交配によって確認した（Ｌ）。（Ｍ）ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣｓを移植したレシピエントＷ／Ｗｖマウスの子供（ｌｉｔｔｅｒ）のサイズ。平均値を赤色のバーで示す。（Ｎ）ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣに由来する子供の、ＢＶ及びＳＣ導入遺伝子の遺伝子型。データ情報：スケールバーは、（Ａ）１ｍｍ；（Ｂ）２ｍｍ；（Ｃ，Ｅ）０．５ｍｍ；（Ｄ）２０μｍ；（Ｆ、Ｇ、Ｉ）１００μｍ；（Ｈ）２５μｍ。 図４は、培養されたＰＧＣＬＣのトランスクリプトーム解析を示す。Ａ）ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣｓ［Ｂｌｉｐ１－ｍＶｅｎｕｓ（ＢＶ）陽性］におけるＤＤＸ４（上図）、ＤＡＺＬ（中図）及びＯＣＴ４（底図）レベルの免疫蛍光（ＩＦ）分析を、Ｅ１３．５雄性生殖細胞と比較した。中央の列において、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣについて、緑色の点線で輪郭を描写した。デンシトメトリー［ＤＤＸ４（ｎ＝４８）、ＤＡＺＬ（ｎ＝７７）、ＯＣＴ４（ｎ＝６１）］で測定した、Ｅ１３．５雄性生殖細胞における平均レベルに対する、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣのレベルの比を、右に示す（平均を赤色のバーで示す）。スケールバーは５μｍ。Ｂ）表示する細胞のトランスクリプトームのＰＣＡ。Ｃ）、Ｄ）ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ及びＥ１３．５雄性／雌性生殖細胞における、上方（Ｃ）／下方（Ｄ）調節された遺伝子のオーバーラップを示すベン図を、ｄ６ ＰＧＣＬＣと比較した。各カテゴリーにおける遺伝子数を示す。Ｅ）ＰＧＣＬＣ培養又は生殖細胞発達（Ｅ９．５－Ｅ１３．５）の過程における、ｄ６及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ間での、発現レベル差のボックスプロット［中央値（横線）、２５ｔｈ及び７５ｔｈパーセンタイル（ボックス）並びに５ｔｈ及び９５ｔｈパーセンタイル（エラーバー）］を、ＤＥＧのｄ６ ＰＧＣＬＣｓ（ｌｏｇ２倍の差）と比較した。色が示すものは、表示の通り。Ｆ）ｄ６（ｘ軸）及びｄ４ｃ７（ｙ軸）ＰＧＣＬＣと比較した、Ｅ１３．５生殖細胞（雄性又は雌性におけるより大きい値）におけるｌｏｇ２発現レベル変化の散布図。ｄ６ ＰＧＣＬＣと比較して、ｄ４ｃ７における上方調節された遺伝子を、赤色のオープンサークル（“ｄ４ｃ７／ｄ６＞２”）で示し、ｘ＞１（即ち、ｄ６ ＰＧＣＬＣと比較して、Ｅ１３．５生殖細胞で上方調節されている）場合、Ｅ１３．５生殖細胞及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ間の倍数差によって分類される；「Ｅ１３．５で完全に活性化した」（Ｅ１３．５生殖細胞で上方調節されている、黄色）；「ｄ４ｃ７で完全に活性化した」（２倍差以内、シアン色）；及び「ｄ４ｃ７で過剰に活性化した」（Ｅ１３．５生殖細胞で下方調節されている、灰色）。代表的な遺伝子及び選択されたＧＯタームを示す。既報の「生殖系列遺伝子」（Ｗｅｂｅｒ ｅｔ ａｌ，２００７；Ｂｏｒｇｅｌ ｅｔ ａｌ，２０１０；Ｋｕｒｉｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ，２０１５）又は他の関連遺伝子を、それぞれ赤色又は青色とした。 図５は、培養されたＰＧＣＬＣのキー・エピジェネティック特性を示す。Ａ）ｄ４ｃ７ＰＧＣＬＣ［Ｂｌｉｍｐ１－ｍＶｅｎｕｓ（ＢＶ）陽性］における５ｍＣ（上図）、Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３（中図）及びＨ３Ｋ９ｍｅ２（底図）のＩＦ分析を、ＥｐｉＬＣと比較した。中央の列において、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣを、緑色の点線で輪郭を描写した。デンシトメトリー［５ｍＣ（ｎ＝４９）、Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３（ｎ＝４４）、Ｈ３Ｋ９ｍｅ２（ｎ＝４６）］で測定した、ＥｐｉＬＣにおける平均と比べた、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣの相対的レベルを、右に示す（平均を赤色のバーで示す）。スケールバーは５μｍ。Ｂ）ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣｓ（ＢＶ陽性）におけるＤＮＭＴ１、ＤＮＭＴ３Ａ、ＤＮＭＴ３Ｂ及びＵＨＲＦ１のレベルのＩＦ分析を、ＥｐｉＬＣと比較した。中央の列において、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣを、緑色の点線で輪郭を描写した。デンシトメトリー［ＤＮＭＴ１（ｎ＝５７）、ＤＮＭＴ３Ａ（ｎ＝５６）、ＤＮＭＴ３Ｂ（ｎ＝５１）、ＵＨＲＦ１（ｎ＝５５）］で測定した、ＥｐｉＬＣにおける平均と比較したときの、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣにおける相対的なレベルを、右に示す（平均を赤色のバーで示す）。スケールバーは５μｍ。Ｃ）表示された細胞型における、Ｐｒｄｍ１４（左図）及びＨｏｘｂクラスター（右図）周辺の１００－ｋｂ領域における、ＣｈＩＰ－ｓｅｑ（Ｈ３Ｋ４ｍｅ３、Ｈ３Ｋ２７ａｃ及びＨ３Ｋ２７ｍｅ３）並びに５ｍＣレベルのトラック図（ｔｒａｃｋｓ）。ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣｓは、ピンク色の陰影を付けた。転写開始部位（ＴＳＳｓ）を点線で示す。 図６は、培養されたＰＧＣＬＣにおけるＤＮＡメチル化の消去を示す。Ａ）ｄ６、ｄ４ｃ３、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣｓ並びにＥ１０．５及びＥ１３．５雄性生殖細胞における５ｍＣレベルを、ＥｐｉＬＣにおけるそれと比較した散布図。２－ｋｂの特有のゲノム領域（等高線プロット、上図）、ＩＣＲｓ及び「生殖系列遺伝子」（ｎ＝１０２）（中図）並びに反復コンセンサス配列（底図）の５ｍＣレベルを示す。後者の２つについては、プロモーターの５ｍＣレベルと一緒に示す。等高線は、１００領域の間隔で描き、黄色の点線は、原点と頂点を繋ぎ、及び傾きを示す。色が示すものは、表示の通り。Ｂ）Ｅ１０．５雄性ＰＧＣ及びｄ４ｃ３ ＰＧＣＬＣｓの間、並びにＥ１３．５雄性生殖細胞及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣの間での、５ｍＣレベルを比較した散布図。色が示すものは、Ａ）におけるものと同じ。Ｃ）ｄ６及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ間で脱メチル化されたプロモーターの定義；ｄ６においては、５ｍＣ＞２０％、ｄ４ｃ７においては、＜２０％（赤色オープンサークル、ｎ＝７，７３７）。Ｄ）プロモーターＤＮＡの脱メチル化と、ｄ６及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ間で異なって発現した遺伝子との間のオーバーラップを示すベン図。ｄ６及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣの間で、脱メチル化したプロモーターを、ＬＣＰ及び非ＬＣＰにおいて分類する。各カテゴリーにおける遺伝子数を示す。 図７は、培養されたＰＧＣＬＣにおけるヒストン修飾動態を示す。Ａ）ＥｐｉＬＣ及びｄ６ ＰＧＣＬＣ間（左図）、並びにｄ６及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ間（右図）で、ｌｏｇ２ Ｈ３Ｋ２７ａｃレベルを比較した散布図。ｄ４ｃ７及びｄ６に偏ったＨ３Ｋ２７ａｃのピークを、それぞれ、オレンジ色及びシアン色で示す。Ｂ）ペアワイズ比較におけるＨ３Ｋ２７ａｃレベルの相関係数の温度分布図。色が示すものは、表示の通り。Ｃ）ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣｓ（ｄ６においては、５ｍＣ＞２０％及びｄ４ｃ７においては、＜２０％、赤色オープンサークル）単独、並びにｄ６及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ（ｄ６及びｄ４ｃ７においては、５ｍＣ＜５％、青色オープンサークル）の両方における、プロモーター脱メチル化／非メチル化の定義。Ｄ）全遺伝子（左図、黒色）、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣにおいてのみ、プロモーターが脱メチル化された遺伝子（中図、赤色）並びにｄ６及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣの両方において、プロモーターが脱メチル化／非メチル化遺伝子（右図、青色）のＴＳＳ周辺における、ｄ６及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ間で、ｌｏｇ２ Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３レベルを比較した散布図。Ｅ）ＥＳＣ、ＥｐｉＬＣ並びにｄ６及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣにおける二価遺伝子の数。Ｆ）ＰＧＣＬＣ誘導及び増幅の間における、表示されたＧＯターム富化の推移。 図８は、培養された雌性ＰＧＣＬＣにおけるＸ染色体の再活性化を示す。Ａ）ＰＧＣＬＣ誘導の間、雌性ＰＧＣＬＣにおいて１本のＸ染色体が失われた。（左図）ＤＮＡ ＦＩＳＨによって、Ｈｕｗｅｌを染色した雌性ＥｐｉＬＣの代表的な像。ＸＸ及びＸＯ ＥｐｉＬＣを、それぞれ、青色及びオレンジ色の点線で囲い輪郭を描写した。（右図）２つの雌性ＥＳＣ株（Ｈ１４及びＨ１８）に由来し、ＰＧＣＬＣ誘導／増幅の間のＸ染色体数。スケールバーは、２５μｍ。Ｂ）Ｈｕｗｅｌ及びＨ３Ｋ２７ｍｅ３について二重染色した、培養された雌性ＰＧＣＬＣにおける、Ｘ染色体の再活性化の評価。（左図）ＨｕｗｅｌのＤＮＡ ＦＩＳＨ及びＨ３Ｋ２７ｍｅ３の免疫蛍光の代表的な像。２本のＸ染色体を保持している細胞において、Ｘ染色体の再活性化を評価した。（右図）雌性ＭＥＦ及びｄ４／ｄ４ｃ３／ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣにおける、Ｈｕｗｅｌ及びＨ３Ｋ２７ｍｅ３シグナルの分析。スケールバーは、５μｍ。Ｃ）ＰＧＣＬＣ誘導／増幅の間のエピジェネティック調節のモデル。（左図）ｉｎ ｖｉｖｏ、Ｅ９．５～Ｅ１３．５、雄性及び雌性生殖細胞の両方が、大幅に増殖し（～＞１００倍増幅）（Ｔａｍ ＆ Ｓｎｏｗ，１９８１；Ｋａｇｉｗａｄａ ｅｔ ａｌ，２０１３）、包括的にＤＮＡメチロームを消去する。その間、Ｅ１１．５あたりから、生殖腺体細胞からのシグナルを受け取り、完全に「生殖細胞系列」遺伝子を獲得し、雄性又は雌性分化を開始する［Ｓｐｉｌｌｅｒ ＆ Ｂｏｗｌｅｓ，２０１５に概説されている］。（右図）ｄ４からｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣｓにまで増幅培養する間（～２０倍増幅）、ＰＧＣＬＣは、ｉｎ ｖｉｖｏにおいて、ＰＧＣｓ／生殖細胞として、包括的にＤＮＡメチロームを消去する。しかしながら、生殖腺体細胞からのシグナルに対応する、きっかけを欠いているために、ＰＧＣＬＣは、キーとなる遺伝子周辺で、少なくとも部分的には、Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３レベルの補償的な上方調節を介して、本質的に初期の転写特性を保持しており、それゆえ、「生殖細胞系列遺伝子」、及び雄性／雌性特性を中程度に獲得する。本研究において分析した遺伝子の発現の要約、５ｍＣ、Ｈ３Ｋ４ｍｅ３及びＨ３Ｋ２７ｍｅ３レベルについての、データセットＥＶ７を参照。 図９は、雌性生殖細胞への運命決定を誘導する因子のスクリーニングを示す。Ａ（左）雌性生殖細胞の運命を誘導する因子のスクリーニングのスキーム。Ｂｌｉｍｐ１－ｍＶｅｎｕｓ（ＢＶ）；Ｓｔｅｌｌａ－ＥＣＦＰ（ＳＣ）；Ｄａｚｌ－ｔｄＴｏｍａｔｏ（ＤＴ）（ＸＹ）またはＢＶＳＣ；ｍＶＨ－ＲＦＰ（ＶＲ）（ＸＸ）ＥＳＣｓより誘導されたｄ４／ｃ０ ＰＧＣＬＣ（ＢＶ（＋）細胞）をｍ２２０フィーダー細胞上にＦＡＣＳでソートし、フォルスコリン、ロリプラムおよびＳＣＦ存在下で１０％ＫＳＲ（ＧＫ１０）および２．５％ウシ胎仔血清（ＦＣＳ）を含むＧＭＥＭで培養した（Ｏｈｔａ ｅｔ ａｌ，２０１７）。スクリーニング用のサイトカイン／化学物質はｃ３から提供された（フォルスコリン、ロリプラムおよびＳＣＦは培養を通して提供された）。（右）ＲＮＡ－Ｓｅｑ（Ｓａｓａｋｉ ｅｔ ａｌ，２０１５；Ｙａｍａｓｈｉｒｏ ｅｔ ａｌ，２０１６；Ｏｈｔａ ｅｔ ａｌ，２０１７）で測定された、ｄ４ ＰＧＣＬＣならびにＥ９．５からＥ１３．５の生殖細胞（Ｅ１２．５およびＥ１３．５の雌性生殖細胞）におけるＤａｚｌおよびＤｄｘ４の発現。２つの複製の平均を示す。Ｂ（左上）ＦＡＣＳのスキーム。ｃ７でＢＶ（＋）細胞間のＤＴレベルを解析した。（右）示された条件での培養についてのＦＡＣＳの結果。数値は示されたゲート内のＤＴ（＋）細胞のパーセンテージを示す。示されたサイトカインの濃度は５００ｎｇ／ｍｌである。（左下）スクリーニングの結果の概要。示された条件下におけるＢＶ（＋）細胞間でのＤＴ（＋）細胞のパーセンテージを示す。Ｃ、Ｄ（左）示された条件下でのｃ９細胞（ＢＶＳＣＶＲ）の代表的なＦＡＣＳプロット。上のプロットの囲まれた領域［ＳＣ（＋）細胞］は、下のプロットのＢＶおよびＶＲと分離された。Ｅ１５．５一次卵母細胞のＢＶＳＣプロットをＣに示す。（右）示された条件下でのＶＲ（＋）細胞のパーセンテージ。２つの独立した試験の平均および標準偏差（ＳＤ）を示す。Ｅ ＤＡＰＩで染色した、Ｅ１５．５胎児卵母細胞におけるＤＤＸ４およびＳＣＰ３の発現（右）、ならびにＢＶＳＣ ＥＳＣｓ（ＸＸ）から誘導されたｃ９ ＲＡＢ２細胞［ＢＶ／ＳＣ（＋）］（左）。スケールバーは２０μｍ。Ｆ ＢＶＳＣ ＥＳＣｓ（ＸＸ）から誘導されたｃ９ ＲＡＢ２細胞［左パネル：ＢＶ／ＳＣ（＋）／ＳＣＰ３（＋）卵母細胞嚢胞様構造］におけるＴＥＸ１４の発現（矢印）（挿入図は囲まれた領域を増幅したもの）、およびＥ１５．５での胎児卵母細胞におけるＴＥＸ１４の発現。スケールバーは１０μｍ。 図１０は、ＢＭＰおよびＲＡによるＰＧＣＬＣにおける雌性運命決定の誘導を示す。Ａ コントロール（左）、ＲＡ（１００ｎＭ）を用いた（中央）、ならびにＲＡ（１００ｎＭ）およびＢＭＰ２（３００ｎｇ／ｍｌ）を用いた（右）条件下でのｃ５、ｃ７およびｃ９におけるＰＧＣＬＣ培養の代表的なＦＡＣＳプロット［上：Ｂｌｉｍｐ１－ｍＶｅｎｕｓ（ＢＶ）；Ｓｔｅｌｌａ－ＥＣＦＰ（ＳＣ）の発現；下：ＢＶ；ｍＶＨ－ＲＦＰ（ＶＲ）の発現］。上パネルにおいて囲まれたＳＣ（＋）細胞を下のパネルで分析し、囲まれた領域の細胞のパーセンテージとともに示す。Ｂ ＲＡ（１００ｎＭ）およびＢＭＰ２（３００ｎｇ／ｍｌ）を用いたＰＧＣＬＣ培養中のｃ５、ｃ７およびｃ９でのＢＶ／ＳＣ（＋）細胞のＢＶＳＣ蛍光（左）およびＳＣＰ３／ＳＴＲＡ８／ＤＡＺＬの発現（右）。挿入図は左パネルの囲まれた領域を増幅したものである。スケールバーは４０μｍ（左）、１０μｍ（左、挿入図）および２０μｍ（右）。Ｃ ＩＦ解析に基づく、ｃ５、ｃ７およびｃ９でのＢＶ／ＳＣ（＋）細胞間でのＳＴＲＡ８（＋）およびＳＣＰ３（＋）細胞のパーセンテージ。２つの独立した試験の平均および標準偏差（ＳＤ）を示す。Ｄ 減数分裂前期に入ることの同時性。縦軸はコロニー数を示す。横軸はＢＶ／ＳＣ（＋）コロニー内のＳＣＰ３（＋）細胞のパーセンテージを示す。２以上の細胞からなるコロニーをカウントした。ＳＣＰ３が発現している、またはしていない代表的なコロニーのイメージを右に示す。スケールバーは２０μｍ。Ｅ コントロール培養ならびにＲＡ（１００ｎＭ）およびＢＭＰ２（３００ｎｇ／ｍｌ）を用いた培養間でのＢＶ（＋）細胞の数。１，５００ＢＶ（＋）ｄ４ ＰＧＣＬＣを培養０日目に播種した。１つのドットは５つの複製された培養ウェルの平均を表し、バーはドットの平均を示す。Ｆ ＥｄＵおよび７ＡＡＤ取り込みによって分析された、コントロール、ＲＡ（１００ｎＭ）を用いた、ならびにＲＡ（１００ｎＭ）およびＢＭＰ２（３００ｎｇ／ｍｌ）を用いた条件下で培養された、ｃ５、ｃ７およびｃ９でのＰＧＣＬＣの細胞周期。Ｇ ＲＡおよびＢＭＰ２を用いたｃ９でのＳＣＰ３／ｃＨ２ＡＸ／ＳＣＰ１発現のスプレッド分析（Ｍｅｕｗｉｓｓｅｎ ｅｔ ａｌ，１９９２；Ｙｕａｎ ｅｔ ａｌ，２０００；Ｍａｈａｄｅｖａｉａｈ ｅｔ ａｌ，２００１）により試験された減数分裂の進行。示されたステージでの細胞のパーセンテージを示す。スケールバーは２０μｍ。 図１１は、ＢＭＰおよびＲＡによるＰＧＣにおける雌性運命決定の誘導を示す。Ａ ＰＧＣ培養のスキーム。フォルスコリン、ロリプラムおよびＳＣＦを用いてｍ２２０フィーダー細胞上でＳｔｅｌｌａ－ＥＧＦＰ（ＳＧ）（＋）細胞を培養した。ＲＡ（１００ｎＭ）および／またはＢＭＰ２（３００ｎｇ／ｍｌ）はｃ０に提供された。Ｂ 示された条件下におけるｃ４でのＤＤＸ４／ＳＣＰ３／ＳＧの発現。スケールバーは２０μｍ。Ｃ ＤＤＸ４（＋）細胞間でのＳＣＰ３（＋）細胞のパーセンテージ。複製されたウェルの平均およびＳＤを示す。Ｄ Ｅ１１．５胎児卵巣培養のスキーム。ＢＭＳ４９３（１０μＭ）またはＬＤＮ１９３１１８９（５００ｎＭ）はｃ０に提供された。Ｅ 示された条件下でのｃ４におけるＤＤＸ４／ＳＣＰ３の発現。スケールバーは２０μｍ。Ｆ ＤＤＸ４（＋）細胞間でのＳＣＰ３（＋）細胞のパーセンテージ。２つの独立した試験の平均およびＳＤを示す。Ｇ 妊娠したマウスにおけるＬＤＮ１９３１１８９投与（２．５ｍｇ／ｋｇ、１２時間毎）のスキーム。Ｈ 水（対照）またはＬＤＮ１９３１１８９（Ｇ）を投与した胚性卵巣における、Ｅ１４．５でのＤＤＸ４／ＳＣＰ３の発現。スケールバーは２０μｍ。Ｉ ＤＤＸ４（＋）細胞間でのＳＣＰ３（＋）細胞のパーセンテージ。生殖腺の２つの前方および２つの後方領域における平均およびＳＤを示す。Ｊ 水（対照）またはＬＤＮ１９３１１８９（Ｇ）を投与した雌性または雄性ＶＲ（＋）細胞の、ＦＡＣＳで解析したＥ１４．５での相対ｍＶＨ－ＲＦＰ（ＶＲ）強度。対照の細胞のＶＲ強度を１００としている。Ｋ 水（対照）またはＬＤＮ１９３１１８９（Ｇ）を投与した雌性または雄性ＶＲ（＋）細胞における、ｑＰＣＲで解析したＥ１４．５での遺伝子の相対的な発現レベル。対照の細胞のレベルを１００としている。ＮＤ、不検出。 図１２は、ＰＧＣＬＣ／ＰＧＣの雌性性決定の間のトランスクリプトームを示す。Ａ 少なくとも１つのサンプル（１５，８４９の遺伝子）においてｌｏｇ２（ＲＰＭ＋１）＞２である遺伝子を用いた、示された細胞のＵＨＣ（フォード法）および主な遺伝子の発現レベルのヒートマップ。ｃｔ：ＲＡまたはＢＭＰ２を用いずに培養されたＰＧＣＬＣ。色分けを示す。Ｂ ｉｎ ｖｉｖｏ（Ｅ９．５－Ｅ１１．５ ＰＧＣ、Ｅ１２．５－Ｅ１５．５雄性および雌性生殖細胞）およびｉｎ ｖｉｔｒｏ（培養されたＰＧＣＬＣ）での生殖細胞のＰＣＡ。紫色の点線の円は、ＰＧＣ（Ｅ９．５、Ｅ１０．５、Ｅ１１．５）およびＰＧＣＬＣ（ｃ０、ｃ３、ｃ９）をクラスター化したものである。赤色の点線の円は、胎児卵母細胞（Ｅ１４．５、Ｅ１５．５雌性生殖細胞）およびｃ９ ＲＡＢ２細胞をクラスター化したものである。青、赤、ピンクおよび黄色は、それぞれ、雄性生殖細胞、雌性生殖細胞、ＲＡを用いて培養されたＰＧＣＬＣおよびＲＡＢ２を用いて培養されたＰＧＣＬＣを表す。Ｃ（上）Ｅ１４．５雄性および雌性生殖細胞（左）、ならびにＥ１４．５雌性生殖細胞およびＥ９．５生殖細胞（右）間での遺伝子発現を比較した散布図。オレンジ、緑、赤、青およびグレーのドットは、それぞれ、初期ＰＧＣ遺伝子［３１８遺伝子：ｌｏｇ２ｆｏｌｄ－ｃｈａｎｇｅ：Ｅ９．５－雄性／雌性Ｅ１４．５＞２，Ｅ９．５のｌｏｇ２（ＲＰＭ＋１）＞４］、後期生殖細胞遺伝子［２５４遺伝子：ｌｏｇ２ ｆｏｌｄ－ｃｈａｎｇｅ：雄性／雌性Ｅ１４．５－Ｅ９．５＞２、雄性／雌性Ｅ１４．５のｌｏｇ２（ＲＰＭ＋１）＞４］、胎児卵母細胞遺伝子［４７６遺伝子：ｌｏｇ２ ｆｏｌｄ－ｃｈａｎｇｅ：雌性Ｅ１４．５－雄性Ｅ１４．５＞２、雌性Ｅ１４．５－Ｅ９．５＞２、雌性Ｅ１４．５のｌｏｇ２（ＲＰＭ＋１）ａｔ＞４］、ＰＳＧ遺伝子［３２３遺伝子：ｌｏｇ２ ｆｏｌｄ－ｃｈａｎｇｅ：雄性Ｅ１４．５－雌性Ｅ１４．５＞２，雄性Ｅ１４．５－Ｅ９．５＞２、雄性Ｅ１４．５のｌｏｇ２（ＲＰＭ＋１）＞４］、および分類されていない遺伝子を示す。（左下）ｉｎ ｖｉｖｏおよびｉｎ ｖｉｔｒｏでの生殖細胞における、初期ＰＧＣ遺伝子（オレンジ）、後期生殖細胞遺伝子（緑）、胎児卵母細胞遺伝子（赤）、ＰＳＧ遺伝子（青）発現のヒートマップ。（右下）ＧＯエンリッチメント（Ｐ値が示されている）および各遺伝子クラスの主な遺伝子。Ｄ 示された細胞における胎児卵母細胞遺伝子（左）および後期生殖細胞遺伝子（右）レベルのボックスプロット［平均（横線）、２５および７５パーセンタイル（ボックス）、ならびに５および９５パーセンタイル（エラーバー）を示す］。Ｅ ＰＧＣＬＣ／ＰＧＣの女性性決定の間の主な遺伝子の発現［ｌｏｇ２（ＲＰＭ＋１）］。２つの複製の平均を示す。紫、緑およびオレンジ色で塗りつぶされた丸および赤い丸は、それぞれ、Ｅ９．５ＰＧＣ、Ｅ１４．５胎児卵母細胞、ｃ９ ＲＡＢ２細胞およびｃ９ ＲＡ細胞を表す。遺伝子名の上にある線は、（Ｃ）に示すように色分けされている。 図１３は、雌性性決定におけるＳＴＲＡ８の機能を示す。Ａ ＲＡＢ２を用いた、ｃ３、ｃ５、ｃ７およびｃ９での野生型（ＷＴ）およびＳｔｒａ８ノックアウト（ＳＫ１）ＰＧＣＬＣの代表的なＦＡＣＳプロット（ＢＶＳＣ）。Ｂ（Ａ）に示す培養中、ＦＡＣＳにより推定されたＳｔｅｌｌａ－ＥＣＦＰ（ＳＣ）（＋）細胞の数。初期ＢＶ（＋）細胞数（ｃ０）は５，０００であった。２つの独立した試験の平均およびＳＤを示す。Ｃ ＥｄＵおよび７ＡＡＤ取り込みにより分析した、コントロール（上）またはＲＡＢ２（下）を用いた条件下で培養したｃ９のＷＴおよびＰＧＣＬＣの細胞周期。Ｄ示された細胞のＰＣＡ。矢印はＷＴとＳＫ１細胞との間の違いを強調するものである。赤い点線の円は、胎児卵母細胞（Ｅ１４．５、Ｅ１５．５雌性生殖細胞）およびｃ９ ＲＡＢ２細胞をクラスター化したものである。Ｅ ＲＡＢ２を用いて培養したｃ５、ｃ７およびｃ９でのＷＴとＳＫ１細胞との間のＤＥＧの数［ｌｏｇ２（ＲＰＭ＋１）＞４，ｌｏｇ２（ｆｏｌｄ－ｃｈａｎｇｅ）＞２］。Ｆ（上）ＷＴおよびＳＫ１細胞の間での遺伝子発現の散布図の比較、ならびにＤＥＧの選択されたＧＯターム。４つの遺伝子クラスの色分けを示す。（下）ＷＴとＳＫ１ ｃ９ ＲＡＢ２細胞との間の胎児卵母細胞遺伝子または後期生殖細胞遺伝子間のＮｏｎ－ＤＥＧ［ｌｏｇ２（ｆｏｌｄ－ｃｈａｎｇｅ）＜１］およびそれらの選択されたＧＯターム。胎児卵母細胞遺伝子および後期生殖細胞遺伝子について、それぞれ、合計で、４７６個中１５３個（約３２．１％）および２５４個（約６４．６％）の遺伝子がｎｏｎ－ＤＥＧである。Ｇ 示された細胞における胎児卵母細胞遺伝子、後期生殖細胞遺伝子およびＲＡ遺伝子レベルのボックスプロット［平均（横線）、２５および７５パーセンタイル（ボックス）、ならびに５および９５パーセンタイル（エラーバー）を示す］。ｃ９ ＫＯ、ＲＡＢ２を用いたｃ９ ＳＫ１細胞；ｃ９ ＷＴ細胞、ＲＡＢ２を用いたｃ９ ＷＴ細胞。Ｈ ＲＡＢ２培養中のＷＴおよびＳＫ１細胞における主な遺伝子の発現［ｌｏｇ２（ＲＰＭ＋１）］。２つの複製の平均を示す。色分けを示す。 図１４は、雌性生殖細胞の運命決定のための細胞のコンピテンスを示す。Ａ 実験のスキーム。Ｃｔ：対照；ＲＢ：ｄ４／ｃ０またはｃ７から４８時間、ＲＡＢ２を培養。Ｂ 示された細胞のＰＣＡ。黒または赤で囲まれた黄色の円は、それぞれ、ｄ４／ｃ０、ｃ０ Ｃｔおよびｃ０ ＲＢまたはｃ７、ｃ７ Ｃｔおよびｃ７ ＲＢ細胞を表す。黒または黄色の矢印は、ＣｔまたはＲＢ培養細胞を示す。Ｃ ｃ０ ＲＢおよびＣｔ培養の間（左）、ならびにｃ７ ＲＢおよびＣｔ培養の間（右）のＤＥＧの数。Ｄ ｃ７ ＣＴ細胞と比較して、ｃ７ ＲＢ細胞においてアップレギュレーションされた２１８の遺伝子についてのＧＯターム。Ｅ ｃ０ Ｃｔ／ＲＢ（左）およびｃ７ Ｃｔ／ＲＢ（右）細胞における発現、ならびにｃ０（左）およびｃ７（右）細胞（Ｓｈｉｒａｎｅ ｅｔ ａｌ，２０１６；Ｏｈｔａ ｅｔ ａｌ，２０１７）におけるプロモーター－５ｍＣレベルとの間の関係の散布図。赤と青の円は、それぞれ、ｄ４／ｃ０とｃ７のＰＧＣＬＣの％５ｍＣの差が＞２０％（４２遺伝子）または＜２０％（１１０遺伝子）である“減数分裂”遺伝子（ＧＯ：０００７１２６）（Ｄ）を示す。赤で囲まれた黒丸は、Ｃ７ ＲＢ細胞でｌｏｇ２（ＲＰＭ＋１）＞５の遺伝子を示す。太字は、ｃ０ ＲＢ細胞でｌｏｇ２（ＲＰＭ＋１）＞５の遺伝子を示す。Ｆ 示された細胞における“減数分裂”遺伝子のレベルのボックスプロット［平均（横線）、２５および７５パーセンタイル（ボックス）、ならびに５および９５パーセンタイル（エラーバー）を示す］。＊統計的有意差［スチューデントｔ検定、Ｐ＜０．０５］。色分けは（Ｅ）と同様である。Ｇ 初期から後期（Ｅ９．５からＥ１１．５）のＰＧＣ移行中の減数分裂減数分裂（減数分裂）遺伝子の発現差異（左）とｄ４／ｃ０からｃ７ ＰＧＣＬＣ培養中のそれらの発現差、およびｃ７からｃ７ ＲＡＢ２ ＰＧＣＬＣ培養中のＰＧＣからＥ１３．５雌性生殖細胞移行期の後期（右）の関係の散布図。色分けと太字は（Ｅ）と同様である。相関係数を示す。Ｈ “減数分裂”遺伝子発現に基づく、Ｅ９．５ ＰＧＣ、Ｅ１１．５ ＰＧＣ、Ｅ１３．５雌性および雄性生殖細胞、ｄ４／ｃ０ ＰＧＣＬＣ、ｃ７ ＰＧＣＬＣおよびｃ７ ＲＡＢ２ ＰＧＣＬＣのＰＣＡ。 図１５は、マウス生殖細胞における雌性性決定機構のモデルを示す。Ａ胚盤葉からの胎児卵母細胞の分化のための、細胞運命の移行およびシグナリング要件のモデル。エピブラストからのＰＧＣ特定は、ＢＭＰシグナリングに依存する（Ｌａｗｓｏｎ ｅｔ ａｌ，１９９９；Ｓａｉｔｏｕ ｅｔ ａｌ，２００２；Ｏｈｉｎａｔａ ｅｔ ａｌ，２００９）。初期から後期にかけてのＰＧＣの成熟は、ＳＣＦおよびｃＡＭＰシグナリングを介したＰＧＣ伝播と相まって、受動的および能動的メカニズム（Ｙａｍａｇｕｃｈｉ ｅｔ ａｌ、２０１２；Ｋａｇｉｗａｄａ ｅｔ ａｌ、２０１３）によって、主なプロモーターのＤＮＡ脱メチル化に依存する。後期ＰＧＣから胎児一次卵母細胞への分化は、ＢＭＰおよびＲＡシグナリングに依存する。Ｂ ＢＭＰとＲＡシグナリングの役割のモデル。ＢＭＰおよびＲＡシグナリングは、初期ＰＧＣ遺伝子（例えば、Ｐｒｄｍ１、Ｐｒｄｍ１４、Ｔｆａｐ２ｃ、Ｐｏｕ５ｆ１、Ｓｏｘ２、ＮａｎｏｇおよびＥｓｒｒｂ）の抑制および後期の生殖細胞遺伝子（例えば、Ｄｄｘ４、Ｄａｚｌ、Ｐｉｗｉｌ２、Ｍｏｖ１０ｌ１、およびＭａｅｌ）および胎児卵母細胞遺伝子（例えば、減数分裂遺伝子としてＳｔｒａ８、Ｒｅｃ８、Ｓｙｃｐ３、Ｈｏｒｍａｄ１および卵母細胞発生遺伝子としてＦｉｇｌａ、Ｙｂｘ２、Ｓｏｈｌｈ２）のアップレギュレーションに寄与する。ＢＭＰシグナル伝達により、ＳＴＲＡ８は減数分裂遺伝子の発現を促進し、ＲＡシグナリング（ＲＡ遺伝子）によって誘導される発達遺伝子の異所性発現を阻害する。ＳＴＲＡ８は、後期生殖細胞遺伝子および卵母細胞発生遺伝子に有意な影響を及ぼさない。ＢＭＰシグナル伝達なしでは、ＳＴＲＡ８は減数分裂の遺伝子を完全にアップレギュレートすることができず、減数分裂の進入を誘導することもできない。ＢＭＰおよびＲＡシグナリングは前精原細胞遺伝子をアップレギュレートしない。 図１６は、シクロスポリンＡ（ＣｓＡ）がＰＧＣＬＣの増殖を促進可能であることを示す。Ａ）化合物ライブラリー・スクリーニング（左：１０μＭ，右：１μＭ）の結果の散布図。各化合物に対するＢＶシグナルの倍数差（ｄ７／ｄ１）をプロットした。陰性対照についての平均値（赤線）及び３ＳＤ（標準偏差；赤色点線）を示す。左の散布図は図１Ｂと同じ散布図で、ＣｓＡを示した。右の散布図は１μＭの濃度を用いて化合物ライブラリー・スクリーニングを行い、ＣｓＡを示した。Ｂ）ＰＧＣＬＣの培養系におけるＣｓＡの濃度検討。左から１０μＭ，５μＭ，１μＭ，０μＭのＣｓＡをＰＧＣＬＣに作用させ、倍数差（ｄ７／ｄ１）を示した。ＮＣ：陰性対象、ＰＣ：陽性対象（ＬＩＦ）。５μＭのＣｓＡがＰＧＣＬＣの増殖に至適であることがわかる。Ｃ）ＣｓＡの効果を調べるための実験手順。フォルスコリンおよびロリプラム（ＦＲ１０）の存在下においてＣｓＡの添加の有無の影響を調べた。Ｄ）ＰＧＣＬＣの増殖におけるＣｓＡの影響。ｄ４ ＰＧＣＬＣを、基礎培地（１０％ ＫＳＲ、２．５％ＦＣＳ及び１００ｎｇ／ｍｌ ＳＣＦを含むＧＭＥＭ）を用い、ｍ２２０－５フィーダー上で培養し、ＦＲ１０もしくはＦＲ１０にＣｓＡ（５μＭ）を添加し、ＰＧＣＬＣの増殖に及ぼす影響を調べた。ＰＧＣＬＣ数を、培養３日目（ｃ３）、５日目（ｃ５）、７日目（ｃ７）及び９日目（ｃ９）に計数した。プレートに播種された（ｐｌａｔｅｄ）ＰＧＣＬＣ数に対する、各時点でのＰＧＣＬＣ数の倍数増加の平均を、標準偏差と共に示す（ｎ＝３）。Ｅ）ＦＲ１０にＣｓＡを添加した、ｄ４ ＰＧＣＬＣの代表的な培養。写真（明視野（ＢＦ）、Ｂｌｉｍｐ１－ｍＶｅｎｕｓ（ＢＶ）及びＳｔｅｌｌａ－ＥＣＦＰ（ＳＣ）の像を培養３日目（ｄ４ｃ３）、５日目（ｄ４ｃ５）、７日目（ｄ４ｃ７）及び９日目（ｄ４ｃ９）に取得した。Ｆ）ＦＲ１０（左図）もしくはＦＲ１０にＣｓＡを添加し培養したＰＧＣＬＣｓの細胞周期の状態（中央図）。右図にＧ１期、Ｓ期、Ｇ２／Ｍ期の平均を標準偏差と共に示す（ｎ＝３）。Ｇ）ＦＲ１０（左図）もしくはＦＲ１０にＣｓＡを添加し培養したＰＧＣＬＣｓの細胞死の状態（中央図）。右図にアポトーシスを起こした細胞の平均を標準偏差と共に示す（ｎ＝３）。Ｈ）ＦＫ５０６のＰＧＣＬＣの増殖に及ぼす影響。左からそれぞれＣｓＡもしくはＦＫ５０６を１０μＭ，５μＭ，１μＭ，０μＭの濃度でＰＧＣＬＣに作用させ、倍数差（ｄ７／ｄ１）を示した。ＮＣ：陰性対象、ＰＣ：陽性対象（ＬＩＦ）。 図１７は、ＣｓＡ存在下で培養したＰＧＣＬＣの遺伝子発現、エピジェネティック特性およびｉｎ ｖｉｖｏ ＰＧＣにおけるＣｓＡの効果を示す。Ａ）表示する細胞のトランスクリプトームのＰＣＡ。Ｂ）ＣｓＡ存在下で培養したｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ［Ｂｌｉｍｐ１－ｍＶｅｎｕｓ（ＢＶ）陽性］における５ｍＣ（上図）、Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３（中図）及びＨ３Ｋ９ｍｅ２（底図）のＩＦ分析を、ＥｐｉＬＣと比較した。中央の列において、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣを、緑色の点線で輪郭を描写した。Ｃ）デンシトメトリー［ＦＲ１０：５ｍＣ（ｎ＝５３）、Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３（ｎ＝５６）、Ｈ３Ｋ９ｍｅ２（ｎ＝５１）；＋ＣｓＡ：５ｍＣ（ｎ＝５３）、Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３（ｎ＝５９）、Ｈ３Ｋ９ｍｅ２（ｎ＝５７）］で測定したｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣの蛍光量を、ＥｐｉＬＣにおける平均と比べた相対的レベルを示す（平均を赤色のバーで示す）。Ｄ）ｉｎ ｖｉｖｏ ＰＧＣにおけるＣｓＡの増殖効果。Ｅ９．５のＰＧＣをＦＲ１０もしくはＦＲ１０にＣｓＡを添加した培養液で培養し、最初にプレートに播種したＰＧＣ数に対するｄ４ｃ５時点でのＰＧＣの倍数増加を、プロットした（ｎ＝３）。 図１８は、ＣｓＡ存在下で培養されたＰＧＣＬＣによる頑健な精子形成を示す。Ａ）～Ｄ）ＣｓＡ存在下で培養したｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣを精巣へ移植し、精子形成を示す精細管（Ａ、Ｂ）及び移植を受けた精巣（Ｃ、Ｄ）の切片のヘマトキシリン及びエオシン（ＨＥ）染色。Ｅ）～Ｈ）レシピエント・マウスの精巣から採取した精子（Ｅ）を用いた顕微授精実験（ｉｎｔｒａｃｙｔｏｐｌａｓｍｉｃ ｓｐｅｒｍ ｉｎｊｅｃｔｉｏｎ；ＩＣＳＩ）。結果として得られた２細胞胚（Ｆ）及びその子（Ｇ、Ｈ）を示す（Ｇは正常な胎盤が付いている）。Ｉ）ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣに由来する子供の、ＢＶ及びＳＣ導入遺伝子の遺伝子型。ＰＣ：陽性対象。Ｊ）ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣに由来する子供の体重変化（ｎ＝１４）。生後１週間から４週間までの体重変化を示す（平均を赤色のバーで示す）。
［Ｉ］ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣの維持増幅方法
本発明は、ＰＧＣ又は単離されたＰＳＣ由来のＰＧＣＬＣのインビトロでの維持増幅方法（「本発明の方法（Ｉ）」と略記する場合がある）を提供する。当該方法は、ＰＧＣ又はＰＧＣＬＣをＰＤＥ４阻害薬及び／又はシクロスポリンＡの存在下で培養することを特徴とする。
１．ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣの製造
１－１．ＰＧＣの製造
本発明で用いられるＰＧＣは、例えばマウスの場合、例えば胎生（Ｅ）９．５～１１．５日の胚から、ＰＧＣ特異的マーカー（例、Ｂｌｉｍｐ１、Ｓｔｅｌｌａ等）の発現を指標としてＦＡＣＳ等の手法により単離することができるが、これに限定されず、当該技術分野において自体公知のいかなる方法によっても単離することができる。あるいは、より初期のマウス胚から同様に単離したＰＧＣを、下記１－２．に記載の方法により、移動期ＰＧＣに相当するステージまで培養して用いることもできる。マウス以外の哺乳動物についても、それぞれ上記マウスの胎齢に対応する胎齢の胚から、同様にして調製することができる。本明細書においては、以下、特にことわらない限り、ＰＧＣのステージをマウス胚の胎齢により代表して示すが、他の哺乳動物においては、マウス胚の胎齢にそれぞれ対応する胎齢として理解されるべきである。かかる換算は当該技術分野において周知である。
１－２．ＰＳＣからのＰＧＣＬＣの製造
本発明で用いられるＰＧＣＬＣは、単離されたＰＳＣからインビトロで誘導され、かつＰＧＣと同等の特性を有するものであればいかなるものであってもよいが、例えば、前記特許文献１及び非特許文献１に記載されるＰＧＣＬＣが挙げられる。該ＰＧＣＬＣは、単離されたＰＳＣから、以下に示す方法により、エピブラスト様細胞（ＥｐｉＬＣ）を経由して製造することができる。
ＰＧＣＬＣ製造の出発材料として使用するＰＳＣは、未分化状態を保持したまま増殖できる「自己複製能」と、三つの一次胚葉すべてに分化できる「分化多能性」とを有する、単離された未分化細胞であればいずれでもよい。ここで「単離された」とは、生体内（インビボ）から生体外（インビトロ）の状態におかれたことを意味し、必ずしも純化されている必要はない。例えば、単離されたＰＳＣとして、ｉＰＳ細胞、ＥＳ細胞、胚性生殖（ＥＧ）細胞、胚性癌（ＥＣ）細胞などが挙げられるが、好ましくはｉＰＳ細胞又はＥＳ細胞である。
本発明の方法（Ｉ）は、いずれかのＰＳＣが樹立されているか、樹立可能である、任意の哺乳動物種において適用することができる。このような哺乳動物の例として、ヒト、マウス、ラット、サル、イヌ、ブタ、ウシ、ネコ、ヤギ、ヒツジ、ウサギ、モルモット、ハムスター等が挙げられるが、好ましくはヒト、マウス、ラット、サル、イヌ等、より好ましくはヒト又はマウスである。
（１）多能性幹細胞の作製
（ｉ）ＥＳ細胞
多能性幹細胞は自体公知の方法により取得することができる。例えば、ＥＳ細胞の作製方法としては、哺乳動物の胚盤胞ステージにおける内部細胞塊を培養する方法（例えば、Ｍａｎｉｐｕｌａｔｉｎｇ ｔｈｅ Ｍｏｕｓｅ Ｅｍｂｒｙｏ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｓｅｃｏｎｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ（１９９４）を参照）、体細胞核移植によって作製された初期胚を培養する方法（Ｗｉｌｍｕｔ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，３８５，８１０（１９９７）；Ｃｉｂｅｌｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２８０，１２５６（１９９８）；入谷明ら，蛋白質核酸酵素，４４，８９２（１９９９）；Ｂａｇｕｉｓｉ ｅｔａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，１７，４５６（１９９９）；Ｗａｋａｙａｍａ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，３９４，３６９（１９９８）；Ｗａｋａｙａｍａ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，２２，１２７（１９９９）；Ｗａｋａｙａｍａ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，９６，１４９８４（１９９９）；ＲｉｄｅｏｕｔＩＩＩ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，２４，１０９（２０００））などが挙げられるが、これらに限定されない。また、ＥＳ細胞は、所定の機関より入手でき、さらには市販品を購入することもできる。例えば、ヒトＥＳ細胞株であるＨ１及びＨ９は、ウィスコンシン大学のＷｉＣｅｌｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅより入手可能であり、ＫｈＥＳ－１、ＫｈＥＳ－２及びＫｈＥＳ－３は、京都大学再生医科学研究所より入手可能である。ＥＳ細胞を体細胞核移植により作製する場合、体細胞の種類や体細胞を採取するソースは下記ｉＰＳ細胞作製の場合に準ずる。
（ｉｉ）ｉＰＳ細胞
ｉＰＳ細胞は、体細胞に核初期化物質を導入することにより作製することができる。
（ａ）体細胞ソース
ｉＰＳ細胞作製のための出発材料として用いることのできる体細胞は、哺乳動物（例えば、マウス又はヒト）由来の生殖細胞以外のいかなる細胞であってもよい。例えば、角質化する上皮細胞（例、角質化表皮細胞）、粘膜上皮細胞（例、舌表層の上皮細胞）、外分泌腺上皮細胞（例、乳腺細胞）、ホルモン分泌細胞（例、副腎髄質細胞）、代謝・貯蔵用の細胞（例、肝細胞）、境界面を構成する内腔上皮細胞（例、Ｉ型肺胞細胞）、内鎖管の内腔上皮細胞（例、血管内皮細胞）、運搬能をもつ繊毛のある細胞（例、気道上皮細胞）、細胞外マトリックス分泌用細胞（例、線維芽細胞）、収縮性細胞（例、平滑筋細胞）、血液と免疫系の細胞（例、Ｔリンパ球）、感覚に関する細胞（例、桿細胞）、自律神経系ニューロン（例、コリン作動性ニューロン）、感覚器と末梢ニューロンの支持細胞（例、随伴細胞）、中枢神経系の神経細胞とグリア細胞（例、星状グリア細胞）、色素細胞（例、網膜色素上皮細胞）、及びそれらの前駆細胞（組織前駆細胞）等が挙げられる。細胞の分化の程度に特に制限はなく、未分化な前駆細胞（体性幹細胞も含む）であっても、最終分化した成熟細胞であっても、同様に本発明における体細胞の起源として使用することができる。ここで未分化な前駆細胞としては、例えば、脂肪由来間質（幹）細胞、神経幹細胞、造血幹細胞、間葉系幹細胞、歯髄幹細胞等の組織幹細胞（体性幹細胞）が挙げられる。
体細胞を採取するソースとなる哺乳動物個体の選択は特に制限されないが、最終産物としてＧＳＣＬＣがヒト不妊などの疾患の治療に使用される場合には、移植片拒絶及び／又はＧｖＨＤを予防するという観点から、患者本人の細胞であるか、又は患者のＨＬＡ型と同一若しくは実質的に同一であるＨＬＡ型を有する他人から体細胞を採取することが好ましい。ここで「実質的に同一であるＨＬＡ型」とは、免疫抑制剤などの使用により、ドナー体細胞由来のｉＰＳ細胞から分化誘導することにより得られた細胞を患者に移植した場合に移植細胞が生着可能な程度にＨＬＡの型が一致していることをいう。例えば、主たるＨＬＡ（ＨＬＡ－Ａ、ＨＬＡ－Ｂ及びＨＬＡ－ＤＲの主要な３遺伝子座、又はさらにＨＬＡ－Ｃｗを含む４遺伝子座）が同一である場合などが挙げられる（以下同じ）。ＰＧＣ様細胞をヒトに投与（移植）しないが、例えば、患者の薬剤感受性や副作用の有無を評価するためのスクリーニング用の細胞のソースとして使用する場合には、同様に患者本人又は薬剤感受性や副作用と相関する遺伝子多型が同一である他人から体細胞を採取する必要がある。
哺乳動物から分離した体細胞は、細胞の種類に応じて、その培養に適した自体公知の培地で前培養することができる。そのような培地としては、例えば、約５～２０％の胎仔ウシ血清を含む最小必須培地（ＭＥＭ）、ダルベッコ改変イーグル培地（ＤＭＥＭ）、ＲＰＭＩ１６４０培地、１９９培地、Ｆ１２培地などが挙げられるが、それらに限定されない。核初期化物質及びｉＰＳ細胞の樹立効率改善物質と細胞との接触に際し、例えば、カチオニックリポソームなど導入試薬を用いる場合には、導入効率の低下を防ぐため、予め無血清培地に交換しておくことが好ましい場合がある。
（ｂ）核初期化物質
本発明において「核初期化物質」とは、体細胞からｉＰＳ細胞を誘導することができる物質（群）であれば、タンパク性因子又はそれをコードする核酸（ベクターに組み込まれた形態を含む）、あるいは低分子化合物等のいかなる物質から構成されてもよい。核初期化物質がタンパク性因子又はそれをコードする核酸の場合、好ましくは以下の組み合わせが例示される（以下においては、タンパク性因子の名称のみを記載する）。
（１）Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ４、ｃ－Ｍｙｃ
（２）Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ４、ｃ－Ｍｙｃ、Ｓｏｘ２（ここで、Ｓｏｘ２はＳｏｘ１、Ｓｏｘ３、Ｓｏｘ１５、Ｓｏｘ１７又はＳｏｘ１８で置換可能である。また、Ｋｌｆ４はＫｌｆ１、Ｋｌｆ２又はＫｌｆ５で置換可能である。さらに、ｃ－ＭｙｃはＴ５８Ａ（活性型変異体）、Ｎ－Ｍｙｃ又はＬ－Ｍｙｃで置換可能である。）
（３）Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ４、ｃ－Ｍｙｃ、Ｓｏｘ２、Ｆｂｘ１５、Ｎａｎｏｇ、Ｅｒａｓ、ＥＣＡＴ１５－２、ＴｃｌＩ、β－ｃａｔｅｎｉｎ（活性型変異体Ｓ３３Ｙ）
（４）Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ４、ｃ－Ｍｙｃ、Ｓｏｘ２、ＴＥＲＴ、ＳＶ４０ Ｌａｒｇｅ Ｔ ａｎｔｉｇｅｎ（以下、ＳＶ４０ＬＴ）
（５）Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ４、ｃ－Ｍｙｃ、Ｓｏｘ２、ＴＥＲＴ、ＨＰＶ１６ Ｅ６
（６）Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ４、ｃ－Ｍｙｃ、Ｓｏｘ２、ＴＥＲＴ、ＨＰＶ１６ Ｅ７
（７）Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ４、ｃ－Ｍｙｃ、Ｓｏｘ２、ＴＥＲＴ、ＨＰＶ６ Ｅ６、ＨＰＶ１６ Ｅ７
（８）Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ４、ｃ－Ｍｙｃ、Ｓｏｘ２、ＴＥＲＴ、Ｂｍｉｌ
（上記因子のさらなる情報については、ＷＯ２００７／０６９６６６を参照（但し、上記（２）の組み合わせにおいて、Ｓｏｘ２からＳｏｘ１８への置換、Ｋｌｆ４からＫｌｆ１若しくはＫｌｆ５への置換については、Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２６，１０１－１０６（２００８）を参照）。「Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ４、ｃ－Ｍｙｃ、Ｓｏｘ２」の組み合わせについては、Ｃｅｌｌ，１２６，６６３－６７６（２００６）、Ｃｅｌｌ，１３１，８６１－８７２（２００７）等も参照。「Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ２（又はＫｌｆ５）、ｃ－Ｍｙｃ、Ｓｏｘ２」の組み合わせについては、Ｎａｔ．Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ．，１１，１９７－２０３（２００９）も参照。「Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ４、ｃ－Ｍｙｃ、Ｓｏｘ２、ｈＴＥＲＴ、ＳＶ４０ＬＴ」の組み合わせについては、Ｎａｔｕｒｅ，４５１，１４１－１４６（２００８）も参照。）
（９）Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ４、Ｓｏｘ２（Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２６，１０１－１０６（２００８）を参照）
（１０）Ｏｃｔ３／４、Ｓｏｘ２、Ｎａｎｏｇ、Ｌｉｎ２８（Ｓｃｉｅｎｃｅ，３１８，１９１７－１９２０（２００７）を参照）
（１１）Ｏｃｔ３／４、Ｓｏｘ２、Ｎａｎｏｇ、Ｌｉｎ２８、ｈＴＥＲＴ、ＳＶ４０ＬＴ（Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌｓ，２６，１９９８－２００５（２００８）を参照）
（１２）Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ４、ｃ－Ｍｙｃ、Ｓｏｘ２、Ｎａｎｏｇ、Ｌｉｎ２８（Ｃｅｌｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ（２００８）６００－６０３を参照）
（１３）Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ４、ｃ－Ｍｙｃ、Ｓｏｘ２、ＳＶ４０ＬＴ（Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌｓ，２６，１９９８－２００５（２００８）も参照）
（１４）Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ４（Ｎａｔｕｒｅ ４５４：６４６－６５０（２００８）、Ｃｅｌｌ Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌ，２：５２５－５２８（２００８）を参照）
（１５）Ｏｃｔ３／４、ｃ－Ｍｙｃ（Ｎａｔｕｒｅ ４５４：６４６－６５０（２００８）を参照）
（１６）Ｏｃｔ３／４、Ｓｏｘ２（Ｎａｔｕｒｅ，４５１，１４１－１４６（２００８）、ＷＯ２００８／１１８８２０を参照）
（１７）Ｏｃｔ３／４、Ｓｏｘ２、Ｎａｎｏｇ（ＷＯ２００８／１１８８２０を参照）
（１８）Ｏｃｔ３／４、Ｓｏｘ２、Ｌｉｎ２８（ＷＯ２００８／１１８８２０を参照）
（１９）Ｏｃｔ３／４、Ｓｏｘ２、ｃ－Ｍｙｃ、Ｆｓｒｒｂ（ここで、ＥｓｓｒｒｂはＥｓｒｒｇで置換可能である。Ｎａｔ．Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ．，１１，１９７－２０３（２００９）を参照）
（２０）Ｏｃｔ３／４、Ｓｏｘ２、Ｅｓｒｒｂ（Ｎａｔ．Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ．，１１，１９７－２０３（２００９）を参照）
（２１）Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ４、Ｌ－Ｍｙｃ
（２２）Ｏｃｔ３／４、Ｎａｎｏｇ
（２３）Ｏｃｔ３／４
（２４）Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ４、ｃ－Ｍｙｃ、Ｓｏｘ２、Ｎａｎｏｇ、Ｌｉｎ２８、ＳＶ４０ＬＴ（Ｓｃｉｅｎｃｅ，３２４：７９７－８０１（２００９）を参照）
上記（１）～（２４）において、Ｏｃｔ３／４に代えて他のＯｃｔファミリーのメンバー、例えばＯｃｔ１Ａ、Ｏｃｔ６などを用いることもできる。また、Ｓｏｘ２（又はＳｏｘ１、Ｓｏｘ３、Ｓｏｘ１５、Ｓｏｘ１７、Ｓｏｘ１８）に代えて他のＳｏｘファミリーのメンバー、例えばＳｏｘ７などを用いることもできる。さらにＬｉｎ２８に代えて他のＬｉｎファミリーのメンバー、例えばＬｉｎ２８ｂなどを用いることもできる。
また、上記（１）～（２４）には該当しないが、それらのいずれかにおける構成要素をすべて含み、且つ任意の他の物質をさらに含む組み合わせも、本発明における「核初期化物質」の範疇に含まれ得る。また、核初期化の対象となる体細胞が上記（１）～（２４）のいずれかにおける構成要素の一部を、核初期化のために十分なレベルで内在的に発現している条件下にあっては、当該構成要素を除いた残りの構成要素のみの組み合わせもまた、本発明における「核初期化物質」の範疇に含まれ得る。
これらの組み合わせの中で、Ｏｃｔ３／４、Ｓｏｘ２、Ｋｌｆ４、ｃ－Ｍｙｃ、Ｎａｎｏｇ、Ｌｉｎ２８及びＳＶ４０ＬＴから選択される少なくとも１つ、好ましくは２つ以上、より好ましくは３つ以上が、好ましい核初期化物質である。
とりわけ、得られるｉＰＳ細胞を治療用途に用いることを念頭においた場合、Ｏｃｔ３／４、Ｓｏｘ２及びＫｌｆ４の３因子の組み合わせ（即ち、上記（９））が好ましい。一方、ｉＰＳ細胞を治療用途に用いることを念頭に置かない場合（例えば、創薬スクリーニング等の研究ツールとして用いる場合など）は、Ｏｃｔ３／４、Ｓｏｘ２、Ｋｌｆ４及びｃ－Ｍｙｃの４因子のほか、Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ４、ｃ－Ｍｙｃ、Ｓｏｘ２及びＬｉｎ２８の５因子か、それにＮａｎｏｇを加えた６因子（即ち、上記（１２））、さらにＳＶ４０ Ｌａｒｇｅ Ｔ加えた７因子（即ち、上記（２４））が好ましい。
さらに、上記におけるｃ－ＭｙｃをＬ－Ｍｙｃに変更した組み合わせも、好ましい核初期化物質の例として挙げられる。
上記の各核初期化物質のマウス及びヒトｃＤＮＡ配列情報は、ＷＯ２００７／０６９６６６に記載のＮＣＢＩａｃｃｅｓｓｉｏｎ ｎｕｍｂｅｒｓを参照することにより取得することができ（Ｎａｎｏｇは当該公報中では「ＥＣＡＴ４」との名称で記載されている。尚、Ｌｉｎ２８、Ｌｉｎ２８ｂ、Ｅｓｒｒｂ、Ｅｓｒｒｇ及びＬ－Ｍｙｃのマウス及びヒトｃＤＮＡ配列情報は、それぞれ下記ＮＣＢＩ ａｃｃｅｓｓｉｏｎ ｎｕｍｂｅｒｓを参照することにより取得できる。）、当業者は容易にこれらのｃＤＮＡを単離することができる。
遺伝子名 マウス ヒト
Ｌｉｎ２８ ＮＭ＿１４５８３３ ＮＭ＿０２４６７４
Ｌｉｎ２８ｂ ＮＭ＿００１０３１７７２ ＮＭ＿００１００４３１７
Ｅｓｒｒｂ ＮＭ＿０１１９３４ ＮＭ＿００４４５２
Ｅｓｒｒｇ ＮＭ＿０１１９３５ ＮＭ＿００１４３８
Ｌ－Ｍｙｃ ＮＭ＿００８５０６ ＮＭ＿００１０３３０８１
核初期化物質としてタンパク性因子を用いる場合には、得られたｃＤＮＡを適当な発現ベクターに挿入して宿主細胞に導入し、該培養細胞又はその馴化培地から組換えタンパク性因子を回収することにより調製することができる。一方、核初期化物質としてタンパク性因子をコードする核酸を用いる場合、得られたｃＤＮＡを、ウイルスベクター、プラスミドベクター、エピソーマルベクター等に挿入して発現ベクターを構築し、核初期化工程に供される。
（ｃ）核初期化物質の体細胞への導入方法
核初期化物質の体細胞への導入は、該物質がタンパク性因子である場合、自体公知の細胞へのタンパク質導入方法を用いて実施することができる。ヒトへの臨床応用を念頭におく場合、その出発材料たるｉＰＳ細胞も遺伝子操作なしに作製されたものであることが好ましい。
そのような方法としては、例えば、タンパク質導入試薬を用いる方法、タンパク質導入ドメイン（ＰＴＤ）若しくは細胞透過性ペプチド（ＣＰＰ）融合タンパク質を用いる方法、マイクロインジェクション法などが挙げられる。タンパク質導入試薬としては、カチオン性脂質をベースとしたＢｉｏＰＯＴＥＲ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｒｅａｇｅｎｔ（Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒａｐｙ Ｓｙｓｔｍｅｓ）、Ｐｒｏ－ＪｅｃｔＴＭＰｒｏｔｅｉｎ Ｔｒａｎｓｆｅｃｔｉｏｎ Ｒｅａｇｅｎｔ（ＰＩＥＲＣＥ）及びＰｒｏＶｅｃｔｉｎ（ＩＭＧＥＮＥＸ）、脂質をベースとしたＰｒｏｆｅｃｔ－１（Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ Ｓｙｓｔｅｍｓ）、膜透過性ペプチドをベースとしたＰｅｎｅｔｒａｉｎＰｅｐｔｉｄｅ（Ｑ ｂｉｏｇｅｎｅ）及びＣｈａｒｉｏｔ Ｋｉｔ（Ａｃｔｉｖｅ Ｍｏｔｉｆ）、ＨＶＪエンベロープ（不活化センダイウイルス）を利用したＧｅｎｏｍＯＮＥ（石原産業）等が市販されている。導入はこれらの試薬に添付のプロトコルに従って行うことができるが、一般的な手順は以下の通りである。核初期化物質を適当な溶媒（例えば、ＰＢＳ、ＨＥＰＥＳ等の緩衝液）に希釈し、導入試薬を加えて室温で約５～１５分程度インキュベートして複合体を形成させ、これを無血清培地に交換した細胞に添加して３７℃で１ないし数時間インキュベートする。その後培地を除去して血清含有培地に交換する。
ＰＴＤとしては、ショウジョウバエ由来のＡｎｔＰ、ＨＩＶ由来のＴＡＴ（Ｆｒａｎｋｅｌ，Ａ．ｅｔ ａｌ，Ｃｅｌｌ５５，１１８９－９３（１９８８）；Ｇｒｅｅｎ，Ｍ．＆ Ｌｏｅｗｅｎｓｔｅｉｎ，Ｐ．Ｍ．Ｃｅｌｌ ５５，１１７９－８８（１９８８））、Ｐｅｎｅｔｒａｔｉｎ（Ｄｅｒｏｓｓｉ，Ｄ．ｅｔ ａｌ，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６９，１０４４４－５０（１９９４））、Ｂｕｆｏｒｉｎ ＩＩ（Ｐａｒｋ，Ｃ．Ｂ．ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９７，８２４５－５０（２０００））、Ｔｒａｎｓｐｏｒｔａｎ（Ｐｏｏｇａ，Ｍ．ｅｔ ａｌ．ＦＡＳＥＢ Ｊ．１２，６７－７７（１９９８））、ＭＡＰ（ｍｏｄｅｌ ａｍｐｈｉｐａｔｈｉｃ ｐｅｐｔｉｄｅ）（Ｏｅｈｌｋｅ，Ｊ．ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｃｈｉｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ａｃｔａ．１４１４，１２７－３９（１９９８））、Ｋ－ＦＧＦ（Ｌｉｎ，Ｙ．Ｚ．ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７０，１４２５５－１４２５８（１９９５））、Ｋｕ７０（Ｓａｗａｄａ，Ｍ．ｅｔ ａｌ．Ｎａｔｕｒｅ ＣｅｌｌＢｉｏｌ．５，３５２－７（２００３））、Ｐｒｉｏｎ（Ｌｕｎｄｂｅｒｇ，Ｐ．ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍｕｎ．２９９，８５－９０（２００２））、ｐＶＥＣ（Ｅｌｍｑｕｉｓｔ，Ａ．ｅｔ ａｌ．Ｅｘｐ．Ｃｅｌｌ Ｒｅｓ．２６９，２３７－４４（２００１））、Ｐｅｐ－１（Ｍｏｒｒｉｓ，Ｍ．Ｃ．ｅｔ ａｌ．Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１９，１１７３－６（２００１））、Ｐｅｐ－７（Ｇａｏ，Ｃ．ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．１０，４０５７－６５（２００２））、ＳｙｎＢｌ（Ｒｏｕｓｓｅｌｌｅ，Ｃ．ｅｔ ａｌ．ＭｏＩ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．５７，６７９－８６（２０００））、ＨＮ－Ｉ（Ｈｏｎｇ，Ｆ．Ｄ．＆ Ｃｌａｙｍａｎ，Ｇ Ｌ．Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．６０，６５５１－６（２０００））、ＨＳＶ由来のＶＰ２２等のタンパク質の細胞通過ドメインを用いたものが開発されている。ＰＴＤ由来のＣＰＰとしては、１１Ｒ（Ｃｅｌｌ Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌ，４：３８１－３８４（２００９））や９Ｒ（Ｃｅｌｌ Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌ，４：４７２－４７６（２００９））等のポリアルギニンが挙げられる。
核初期化物質のｃＤＮＡとＰＴＤ若しくはＣＰＰ配列とを組み込んだ融合タンパク質発現ベクターを作製して、ベクターを用いて組換え発現させる。融合タンパク質を回収して導入に用いる。導入は、タンパク質導入試薬を添加しない以外は上記と同様にして行うことができる。
マイクロインジェクションは、先端径１μｍ程度のガラス針にタンパク質溶液を入れ、細胞に穿刺導入する方法であり、確実に細胞内にタンパク質を導入することができる。
ｉＰＳ細胞の樹立効率を重視するのであれば、核初期化物質を、タンパク性因子自体としてではなく、それをコードする核酸の形態で用いることも好ましい。該核酸はＤＮＡであってもＲＮＡであってもよく、あるいはＤＮＡ／ＲＮＡキメラであってもよく、また、該核酸は二本鎖であっても、一本鎖であってもよい。好ましくは、該核酸は二本鎖ＤＮＡ、特にｃＤＮＡである。
核初期化物質のｃＤＮＡは、宿主となる体細胞で機能し得るプロモーターを含む適当な発現ベクターに挿入される。発現ベクターとしては、例えば、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルス、センダイウイルスなどのウイルスベクター、動物細胞発現プラスミド（例、ｐＡ１－１１、ｐＸＴ１、ｐＲｃ／ＣＭＶ、ｐＲｃ／ＲＳＶ、ｐｃＤＮＡＩ／Ｎｅｏ）などが用いられ得る。
用いるベクターの種類は、得られるｉＰＳ細胞の用途に応じて適宜選択することができる。例えば、アデノウイルスベクター、プラスミドベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、センダイウイルスベクター、エピソーマルベクターなどが使用され得る。
発現ベクターにおいて使用されるプロモーターとしては、例えば、ＥＦ１αプロモーター、ＣＡＧプロモーター、ＳＲαプロモーター、ＳＶ４０プロモーター、ＬＴＲプロモーター、ＣＭＶ（サイトメガロウイルス）プロモーター、ＲＳＶ（ラウス肉腫ウイルス）プロモーター、ＭｏＭｕＬＶ（モロニーマウス白血病ウイルス）ＬＴＲ、ＨＳＶ－ＴＫ（単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ）プロモーターなどが用いられる。なかでも、ＥＦ１αプロモーター、ＣＡＧプロモーター、ＭｏＭｕＬＶ ＬＴＲ、ＣＭＶプロモーター、ＳＲαプロモーターなどが好ましい。
発現ベクターは、プロモーターの他に、所望によりエンハンサー、ポリＡ付加シグナル、選択マーカー遺伝子、ＳＶ４０複製起点などを含有していてもよい。選択マーカー遺伝子としては、例えば、ジヒドロ葉酸還元酵素遺伝子、ネオマイシン耐性遺伝子、ピューロマイシン耐性遺伝子等が挙げられる。
核初期化物質である核酸（初期化遺伝子）は、各々別個の発現ベクター上に組み込んでもよいし、１つの発現ベクターに２種類以上、好ましくは２～３種類の遺伝子を組み込んでもよい。遺伝子導入効率の高いレトロウイルスやレンチウイルスベクターを用いる場合は前者が、プラスミド、アデノウイルス、エピソーマルベクターなどを用いる場合は後者を選択することが好ましい。さらに、２種類以上の遺伝子を組み込んだ発現ベクターと、１遺伝子のみを組み込んだ別の発現ベクターとを併用することもできる。
上記において複数の初期化遺伝子を１つの発現ベクターに組み込む場合、これら複数の遺伝子は、好ましくはポリシストロニック発現を可能にする配列を介して発現ベクターに組み込むことができる。ポリシストロニック発現を可能にする配列を用いることにより、１種類の発現ベクターに組み込まれている複数の遺伝子をより効率的に発現させることが可能になる。ポリシストロニック発現を可能にする配列としては、例えば、口蹄疫ウイルスの２Ａ配列（ＰＬｏＳ ＯＮＥ ３，ｅ２５３２，２００８、Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌｓ ２５，１７０７，２００７）、ＩＲＥＳ配列（Ｕ．Ｓ．Ｐａｔｅｎｔ Ｎｏ．４，９３７，１９０）など、好ましくは２Ａ配列を用いることができる。
核初期化物質である核酸を含む発現ベクターは、ベクターの種類に応じて、自体公知の手法により細胞に導入することができる。例えば、ウイルスベクターの場合、該核酸を含むプラスミドを適当なパッケージング細胞（例、Ｐｌａｔ－Ｅ細胞）や相補細胞株（例、２９３細胞）に導入して、培養上清中に産生されるウイルスベクターを回収し、各ウイルスベクターに応じた適切な方法により、該ベクターを細胞に感染させる。例えば、ベクターとしてレトロウイルスベクターを用いる具体的手段がＷＯ２００７／６９６６６、Ｃｅｌｌ，１２６，６６３－６７６（２００６）及びＣｅｌｌ，１３１，８６１－８７２（２００７）に開示されている。ベクターとしてレンチウイルスベクターを用いる場合については、Ｓｃｉｅｎｃｅ，３１８，１９１７－１９２０（２００７）に開示がある。ｉＰＳ細胞から誘導されるＰＧＣ様細胞を不妊治療や生殖細胞の遺伝子治療などの再生医療として利用する場合、初期化遺伝子の発現（再活性化）は、ｉＰＳ細胞由来のＰＧＣ様細胞から再生された生殖細胞又は生殖組織における発癌リスクを高める可能性があるので、核初期化物質をコードする核酸は細胞の染色体に組み込まれず、一過的に発現することが好ましい。かかる観点からは、染色体への取込みが稀なアデノウイルスベクターの使用が好ましい。アデノウイルスベクターを用いる具体的手段は、Ｓｃｉｅｎｃｅ，３２２，９４５－９４９（２００８）に開示されている。また、アデノ随伴ウイルスベクターも染色体への取込み頻度が低く、アデノウイルスベクターと比べて細胞毒性や炎症惹起作用が低いので、別の好ましいベクターとして挙げられる。センダイウイルスベクターは染色体外で安定に存在することができ、必要に応じてｓｉＲＮＡにより分解除去することができるので、同様に好ましく利用され得る。センダイウイルスベクターについては、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２８２，２７３８３－２７３９１（２００７）や特許第３６０２０５８号に記載のものを用いることができる。
レトロウイルスベクターやレンチウイルスベクターを用いる場合は、いったん導入遺伝子のサイレンシングが起こったとしても、後に再活性化される可能性があるので、例えば、Ｃｒｅ／ｌｏｘＰシステムを用いて、不要となった時点で核初期化物質をコードする核酸を切り出す方法が好ましく用いられ得る。即ち、該核酸の両端にｌｏｘＰ配列を配置しておき、ｉＰＳ細胞が誘導された後で、プラスミドベクター若しくはアデノウイルスベクターを用いて細胞にＣｒｅリコンビナーゼを作用させ、ｌｏｘＰ配列に挟まれた領域を切り出すことができる。また、ＬＴＲ Ｕ３領域のエンハンサー－プロモーター配列は、挿入突然変異によって近傍の宿主遺伝子を上方制御する可能性があるので、当該配列を欠失、若しくはＳＶ４０などのポリアデニル化配列で置換した３’－自己不活性化（ＳＩＮ）ＬＴＲを使用して、切り出されずゲノム中に残存するｌｏｘＰ配列より外側のＬＴＲによる内因性遺伝子の発現制御を回避することがより好ましい。Ｃｒｅ－ｌｏｘＰシステム及びＳＩＮ ＬＴＲを用いる具体的手段は、Ｃｈａｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌｓ，２７：１０４２－１０４９（２００９）に開示されている。
一方、非ウイルスベクターであるプラスミドベクターの場合には、リポフェクション法、リポソーム法、エレクトロポレーション法、リン酸カルシウム共沈殿法、ＤＥＡＥデキストラン法、マイクロインジェクション法、遺伝子銃法などを用いて該ベクターを細胞に導入することができる。ベクターとしてプラスミドを用いる具体的手段は、例えばＳｃｉｅｎｃｅ，３２２，９４９－９５３（２００８）等に記載されている。
プラスミドベクターやアデノウイルスベクター等を用いる場合、遺伝子導入は１回以上の任意の回数（例えば、１回以上１０回以下、又は１回以上５回以下など）行うことができる。２種以上の発現ベクターを体細胞に導入する場合には、これらの全ての種類の発現ベクターを同時に体細胞に導入することが好ましいが、この場合においても、導入操作は１回以上の任意の回数（例えば、１回以上１０回以下、又は１回以上５回以下など）行うことができ、好ましくは導入操作を２回以上（たとえば３回又は４回）繰り返して行うことができる。
尚、アデノウイルスやプラスミドを用いる場合でも、導入遺伝子が染色体に組み込まれることがあるので、結局はサザンブロットやＰＣＲにより染色体への遺伝子挿入がないことを確認する必要がある。そのため、上記Ｃｒｅ－ｌｏｘＰシステムのように、いったん染色体に導入遺伝子を組み込んだ後に、該遺伝子を除去する手段を用いることは好都合であり得る。別の好ましい一実施態様においては、トランスポゾンを用いて染色体に導入遺伝子を組み込んだ後に、プラスミドベクター若しくはアデノウイルスベクターを用いて細胞に転移酵素を作用させ、導入遺伝子を完全に染色体から除去する方法が用いられ得る。好ましいトランスポゾンとしては、例えば、鱗翅目昆虫由来のトランスポゾンであるｐｉｇｇｙＢａｃ等が挙げられる。ｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンを用いる具体的手段は、Ｋａｊｉ，Ｋ．ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，４５８：７７１－７７５（２００９）、Ｗｏｌｔｊｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，４５８：７６６－７７０（２００９）に開示されている。
別の好ましい非組込み型ベクターとして、染色体外で自律複製可能なエピソーマルベクターが挙げられる。エピソーマルベクターを用いる具体的手段は、Ｙｕ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，３２４，７９７－８０１（２００９）に開示されている。必要に応じて、エピソーマルベクターの複製に必要なベクター要素の５’側及び３’側にｌｏｘＰ配列を同方向に配置したエピソーマルベクターに初期化遺伝子を挿入した発現ベクターを構築し、これを体細胞に導入することもできる。
該エピソーマルベクターとしては、例えば、ＥＢＶ、ＳＶ４０等に由来する自律複製に必要な配列をベクター要素として含むベクターが挙げられる。自律複製に必要なベクター要素としては、具体的には、複製開始点と、複製開始点に結合して複製を制御するタンパク質をコードする遺伝子であり、例えば、ＥＢＶにあっては複製開始点ｏｒｉＰとＥＢＮＡ－１遺伝子、ＳＶ４０にあっては複製開始点ｏｒｉとＳＶ４０ ｌａｒｇｅ Ｔ ａｎｔｉｇｅｎ遺伝子が挙げられる。
また、エピソーマル発現ベクターは、初期化遺伝子の転写を制御するプロモーターを含む。該プロモーターとしては、前記と同様のプロモーターが用いられ得る。また、エピソーマル発現ベクターは、前記と同様に、所望によりエンハンサー、ポリＡ付加シグナル、選択マーカー遺伝子などをさらに含有していてもよい。選択マーカー遺伝子としては、例えば、ジヒドロ葉酸還元酵素遺伝子、ネオマイシン耐性遺伝子等が挙げられる。
エピソーマルベクターは、例えばリポフェクション法、リポソーム法、エレクトロポレーション法、リン酸カルシウム共沈殿法、ＤＥＡＥデキストラン法、マイクロインジェクション法、遺伝子銃法などを用いて該ベクターを細胞に導入することができる。具体的には、例えばＳｃｉｅｎｃｅ，３２４：７９７－８０１（２００９）に記載される方法を用いることができる。
ｉＰＳ細胞から初期化遺伝子の複製に必要なベクター要素が除去されたか否かの確認は、該ベクターの一部をプローブ又はプライマーとして用い、該ｉＰＳ細胞から単離したエピソーム画分を鋳型としてサザンブロット分析又はＰＣＲ分析を行い、バンドの有無又は検出バンドの長さを調べることにより実施することができる。エピソーム画分の調製は当該分野で周知の方法を用いて行えばよく、例えば、Ｓｃｉｅｎｃｅ，３２４：７９７－８０１（２００９）に記載される方法を用いることができる。
核初期化物質が低分子化合物である場合、該物質の体細胞への導入は、該物質を適当な濃度で水性若しくは非水性溶媒に溶解し、ヒト又はマウスより単離した体細胞の培養に適した培地（例えば、約５～２０％の胎仔ウシ血清を含む最小必須培地（ＭＥＭ）、ダルベッコ改変イーグル培地（ＤＭＥＭ）、ＲＰＭＩ１６４０培地、１９９培地、Ｆ１２培地など）中に、核初期化物質濃度が体細胞において核初期化が起こるのに十分で且つ細胞毒性がみられない範囲となるように該物質溶液を添加して、細胞を一定期間培養することにより実施することができる。核初期化物質濃度は用いる核初期化物質の種類によって異なるが、約０．１ｎＭ～約１００ｎＭの範囲で適宜選択される。接触期間は細胞の核初期化が達成されるのに十分な時間であれば特に制限はないが、通常は陽性コロニーが出現するまで培地に共存させておけばよい。
（ｄ）ｉＰＳ細胞の樹立効率改善物質
従来ｉＰＳ細胞の樹立効率が低いために、近年、その効率を改善する物質が種々提案されている。よって前記核初期化物質に加え、これら樹立効率改善物質を体細胞に接触させることにより、ｉＰＳ細胞の樹立効率をより高めることが期待できる。
ｉＰＳ細胞の樹立効率改善物質としては、例えば、ヒストンデアセチラーゼ（ＨＤＡＣ）阻害剤［例えば、バルプロ酸（ＶＰＡ）（Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，２６（７）：７９５－７９７（２００８））、トリコスタチンＡ、酪酸ナトリウム、ＭＣ １２９３、Ｍ３４４等の低分子阻害薬、ＨＤＡＣに対するｓｉＲＮＡ及びｓｈＲＮＡ（例、ＨＤＡＣ１ ｓｉＲＮＡ Ｓｍａｒｔｐｏｏｌ（登録商標）（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）、ＨｕＳＨ ２９ｍｅｒ ｓｈＲＮＡ Ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｓ ａｇａｉｎｓｔ ＨＤＡＣ１（ＯｒｉＧｅｎｅ）等）等の核酸性発現阻害薬など］、ＤＮＡメチルトランスフェラーゼ阻害薬（例えば５’－ａｚａｃｙｔｉｄｉｎｅ）（Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，２６（７）：７９５－７９７（２００８））、Ｇ９ａヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害薬［例えば、ＢＩＸ－０１２９４（Ｃｅｌｌ Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌ，２：５２５－５２８（２００８））等の低分子阻害薬、Ｇ９ａに対するｓｉＲＮＡ及びｓｈＲＮＡ（例、Ｇ９ａ ｓｉＲＮＡ（ｈｕｍａｎ）（Ｓａｎｔａ Ｃｒｕｚ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ）等）等の核酸性発現阻害薬など］、Ｌ－ｃｈａｎｎｅｌ ｃａｌｃｉｕｍ ａｇｏｎｉｓｔ（例えばＢａｙｋ８６４４）（Ｃｅｌｌ Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌ，３，５６８－５７４（２００８））、ｐ５３阻害薬（例えばｐ５３に対するｓｉＲＮＡ及びｓｈＲＮＡ（Ｃｅｌｌ Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌ，３，４７５－４７９（２００８））、ＵＴＦ１（Ｃｅｌｌ Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌ，３，４７５－４７９（２００８））、Ｗｎｔ Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ（例えばｓｏｌｕｂｌｅ Ｗｎｔ３ａ）（Ｃｅｌｌ Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌ，３，１３２－１３５（２００８））、２ｉ／ＬＩＦ（２ｉはｍｉｔｏｇｅｎ－ａｃｔｉｖａｔｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎ ｋｉｎａｓｅ ｓｉｇｎａｌｌｉｎｇ及びｇｌｙｃｏｇｅｎ ｓｙｎｔｈａｓｅ ｋｉｎａｓｅ－３の阻害薬、ＰｌｏＳ Ｂｉｏｌｏｇｙ，６（１０），２２３７－２２４７（２００８））等が挙げられるが、それらに限定されない。前記で核酸性の発現阻害薬はｓｉＲＮＡ又はｓｈＲＮＡをコードするＤＮＡを含む発現ベクターの形態であってもよい。
尚、前記核初期化物質の構成要素のうち、例えばＳＶ４０ ｌａｒｇｅ Ｔ等は、体細胞の核初期化のために必須ではなく補助的な因子であるという点において、ｉＰＳ細胞の樹立効率改善物質の範疇にも含まれ得る。核初期化の機序が明らかでない現状においては、核初期化に必須の因子以外の補助的な因子について、それらを核初期化物質として位置づけるか、あるいはｉＰＳ細胞の樹立効率改善物質として位置づけるかは便宜的であってもよい。即ち、体細胞の核初期化プロセスは、体細胞への核初期化物質及びｉＰＳ細胞の樹立効率改善物質の接触によって生じる全体的事象として捉えられるので、当業者にとって両者を必ずしも明確に区別する必要性はないであろう。
ｉＰＳ細胞の樹立効率改善物質の体細胞への接触は、該物質が（ａ）タンパク性因子である場合、（ｂ）該タンパク性因子をコードする核酸である場合、あるいは（ｃ）低分子化合物である場合に応じて、それぞれ上記したように実施することができる。
ｉＰＳ細胞の樹立効率改善物質は、該物質の非存在下と比較して体細胞からのｉＰＳ細胞樹立効率が有意に改善される限り、核初期化物質と同時に体細胞に接触させてもよいし、また、どちらかを先に接触させてもよい。一実施態様において、例えば、核初期化物質がタンパク性因子をコードする核酸であり、ｉＰＳ細胞の樹立効率改善物質が化学的阻害物質である場合には、前者は遺伝子導入処理からタンパク性因子を大量発現するまでに一定期間のラグがあるのに対し、後者は速やかに細胞に作用しうることから、遺伝子導入処理から一定期間細胞を培養した後に、ｉＰＳ細胞の樹立効率改善物質を培地に添加することができる。別の実施態様において、例えば、核初期化物質とｉＰＳ細胞の樹立効率改善物質とがいずれもウイルスベクターやプラスミドベクターの形態で用いられる場合には、両者を同時に細胞に導入してもよい。
（ｅ）培養条件による樹立効率の改善
体細胞の核初期化工程において低酸素条件下で細胞を培養することにより、ｉＰＳ細胞の樹立効率をさらに改善することができる。本明細書において「低酸素条件」とは、細胞を培養する際の雰囲気中の酸素濃度が、大気中のそれよりも有意に低いことを意味する。具体的には、通常の細胞培養で一般的に使用される５～１０％ＣＯ２／９５～９０％大気の雰囲気中の酸素濃度よりも低い酸素濃度の条件が挙げられ、例えば雰囲気中の酸素濃度が１８％以下の条件が該当する。好ましくは、雰囲気中の酸素濃度は１５％以下（例、１４％以下、１３％以下、１２％以下、１１％以下など）、１０％以下（例、９％以下、８％以下、７％以下、６％以下など）、又は５％以下（例、４％以下、３％以下、２％以下など）である。また、雰囲気中の酸素濃度は、好ましくは０．１％以上（例、０．２％以上、０．３％以上、０．４％以上など）、０．５％以上（例、０．６％以上、０．７％以上、０．８％以上、０．９％以上など）、又は１％以上（例、１．１％以上、１．２％以上、１．３％以上、１．４％以上など）である。
細胞の環境において低酸素状態を創出する手法は特に制限されないが、酸素濃度の調節可能なＣＯ２インキュベーター内で細胞を培養する方法が最も容易であり、好適な例として挙げられる。酸素濃度の調節可能なＣＯ２インキュベーターは、種々の機器メーカーから販売されている（例えば、Ｔｈｅｒｍｏ ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ社、池本理化学工業、十慈フィールド、和研薬株式会社などのメーカー製の低酸素培養用ＣＯ２インキュベーターを用いることができる）。
低酸素条件下で細胞培養を開始する時期は、ｉＰＳ細胞の樹立効率が正常酸素濃度（２０％）の場合に比して改善されることを妨げない限り特に限定されない。開始時期は、体細胞への核初期化物質の接触より前であっても、後であってもよく、該接触と同時であってもよい。例えば、体細胞に核初期化物質を接触させた直後から、あるいは接触後一定期間（例えば、１ないし１０（例、２、３、４、５、６、７、８又は９）日）おいた後に低酸素条件下で培養することが好ましい。
低酸素条件下で細胞を培養する期間も、ｉＰＳ細胞の樹立効率が正常酸素濃度（２０％）の場合に比して改善されることを妨げない限り特に限定されず、例えば３日以上、５日以上、７日以上又は１０日以上で、５０日以下、４０日以下、３５日以下又は３０日以下の期間等が挙げられるが、それらに限定されない。低酸素条件下での好ましい培養期間は、雰囲気中の酸素濃度によっても変動し、当業者は用いる酸素濃度に応じて適宜当該培養期間を調整することができる。また、一実施態様において、ｉＰＳ細胞の候補コロニーの選択を、薬剤耐性を指標にして行う場合には、薬剤選択を開始する迄に低酸素条件から正常酸素濃度に戻すことが好ましい。
さらに、低酸素条件下で細胞培養を開始する好ましい時期及び好ましい培養期間は、用いられる核初期化物質の種類、正常酸素濃度条件下でのｉＰＳ細胞樹立効率などによっても変動する。
核初期化物質（及びｉＰＳ細胞の樹立効率改善物質）を接触させた後、細胞を、例えばＥＳ細胞の培養に適した条件下で培養することができる。マウス細胞の場合、通常の培地に分化抑制因子としてＬｅｕｋｅｍｉａ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｙ Ｆａｃｔｏｒ（ＬＩＦ）を添加して培養を行う。一方、ヒト細胞の場合には、ＬＩＦの代わりに塩基性線維芽細胞増殖因子（ｂＦＧＦ）及び／又は幹細胞因子（ＳＣＦ）を添加することが望ましい。また通常、細胞は、フィーダー細胞として、放射線や抗生物質で処理して細胞分裂を停止させたマウス胎仔由来の線維芽細胞（ＭＥＦ）の共存下で培養される。ＭＥＦとしては、通常ＳＴＯ細胞等がよく使われるが、ｉＰＳ細胞の誘導には、ＳＮＬ細胞（ＭｃＭａｈｏｎ，Ａ．Ｐ．＆ Ｂｒａｄｌｅｙ，Ａ．Ｃｅｌｌ ６２，１０７３－１０８５（１９９０））等がよく使われている。フィーダー細胞との共培養は、核初期化物質の接触より前から開始してもよいし、該接触時から、あるいは該接触より後（例えば１～１０日後）から開始してもよい。
ｉＰＳ細胞の候補コロニーの選択は、薬剤耐性とレポーター活性を指標とする方法と目視による形態観察による方法とが挙げられる。前者としては、例えば、分化多能性細胞において特異的に高発現する遺伝子（例えば、Ｆｂｘ１５、Ｎａｎｏｇ、Ｏｃｔ３／４など、好ましくはＮａｎｏｇ又はＯｃｔ３／４）の遺伝子座に、薬剤耐性遺伝子及び／又はレポーター遺伝子をターゲッティングした組換え体細胞を用い、薬剤耐性及び／又はレポーター活性陽性のコロニーを選択するというものである。そのような組換え体細胞としては、例えばＦｂｘ１５遺伝子座にβｇｅｏ（β－ガラクトシダーゼとネオマイシンホスホトランスフェラーゼとの融合タンパク質をコードする）遺伝子をノックインしたマウス由来のＭＥＦ（Ｔａｋａｈａｓｈｉ ＆ Ｙａｍａｎａｋａ，Ｃｅｌｌ，１２６，６６３－６７６（２００６））、あるいはＮａｎｏｇ遺伝子座に緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）遺伝子とピューロマイシン耐性遺伝子を組み込んだトランスジェニックマウス由来のＭＥＦ（Ｏｋｉｔａ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，４４８，３１３－３１７（２００７））等が挙げられる。一方、目視による形態観察で候補コロニーを選択する方法としては、例えばＴａｋａｈａｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，Ｃｅｌｌ，１３１，８６１－８７２（２００７）に記載の方法が挙げられる。レポーター細胞を用いる方法は簡便で効率的ではあるが、ｉＰＳ細胞がヒトの治療用途を目的として作製される場合、安全性の観点から目視によるコロニー選択が望ましい。核初期化物質としてＯｃｔ３／４、Ｋｌｆ４及びＳｏｘ２の３因子を用いた場合、樹立クローン数は減少するものの生じるコロニーのほとんどがＥＳ細胞と比較して遜色のない高品質のｉＰＳ細胞であることから、レポーター細胞を用いなくとも効率よくｉＰＳ細胞を樹立することが可能である。
選択されたコロニーの細胞がｉＰＳ細胞であることの確認は、上記したＮａｎｏｇ（若しくはＯｃｔ３／４）レポーター陽性（ピューロマイシン耐性、ＧＦＰ陽性など）及び目視によるＥＳ細胞様コロニーの形成によっても行い得るが、より正確性を期すために、各種ＥＳ細胞特異的遺伝子の発現を解析したり、選択された細胞をマウスに移植してテラトーマ形成を確認する等の試験を実施することもできる。
（ｉｉｉ）ナイーヴヒトＥＳ及びｉＰＳ細胞
胚盤胞期胚から誘導される従来のヒトＥＳ細胞は、マウスＥＳ細胞と非常に異なる生物学的（形態的、分子的及び機能的）特性を有する。マウス多能性幹細胞は、２つの機能的に区別される状態、即ちＬＩＦ依存的なＥＳ細胞と、ｂＦＧＦ依存的なエピブラスト幹細胞（ＥｐｉＳＣ）とで存在し得る。分子学的解析から、ヒトＥＳ細胞の多能性状態は、マウスＥＳ細胞のそれではなく、むしろマウスＥｐｉＳＣのそれに類似していることが示唆されている。最近、ＬＩＦの存在下にＯｃｔ３／４、Ｓｏｘ２、Ｋｌｆ４、ｃ－Ｍｙｃ及びＮａｎｏｇを異所的に誘導するか（Ｃｅｌｌ Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌｓ，６：５３５－５４６，２０１０参照）、ＬＩＦ並びにＧＳＫ３β及びＥＲＫ１／２経路阻害薬と組み合わせて、Ｏｃｔ３／４、Ｋｌｆ４及びＫｌｆ２を異所的に誘導する（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，オンライン公開ｄｏｉ／１０．１０７３／ｐｎａｓ．１００４５８４１０７参照）ことにより、マウスＥＳ細胞様の多能性状態にあるヒトＥＳ及びｉＰＳ細胞（ナイーヴヒトＥＳ及びｉＰＳ細胞とも呼ばれる）が樹立されている。これらのナイーヴヒトＥＳ及びｉＰＳ細胞は、それらの多能性が従来のヒトＥＳ及びｉＰＳ細胞に比べてより未熟であるため、本発明のための出発材料として好適であり得る。
（２）ＰＳＣからＥｐｉＬＣへの分化誘導
分化誘導用の基本培地としては、例えば、Ｎｅｕｒｏｂａｓａｌ培地、Ｎｅｕｒａｌ Ｐｒｏｇｅｎｉｔｏｒ Ｂａｓａｌ培地、ＮＳ－Ａ培地、ＢＭＥ培地、ＢＧＪｂ培地、ＣＭＲＬ １０６６培地、最小必須培地（ＭＥＭ）、Ｅａｇｌｅ ＭＥＭ培地、αＭＥＭ培地、ダルベッコ改変イーグル培地（ＤＭＥＭ）、Ｇｌａｓｇｏｗ ＭＥＭ培地、Ｉｍｐｒｏｖｅｄ ＭＥＭ Ｚｉｎｃ Ｏｐｔｉｏｎ培地、ＩＭＤＭ培地、Ｍｅｄｉｕｍ １９９培地、ＤＭＥＭ／Ｆ１２培地、ハム培地、ＲＰＭＩ １６４０培地、Ｆｉｓｃｈｅｒ’ｓ培地、及びこれらの混合培地などが挙げられるが、これらに限定されない。
培地は、血清含有培地又は無血清培地であり得る。好ましくは、無血清培地が使用され得る。無血清培地（ＳＦＭ）とは、未処理又は未精製の血清をいずれも含まない培地を意味し、従って、精製された血液由来成分又は動物組織由来成分（増殖因子など）を含有する培地が挙げられ得る。血清（例えば、ウシ胎児血清（ＦＢＳ）、ヒト血清など）の濃度は、０～２０％、好ましくは０～５％、より好ましくは０～２％、最も好ましくは０％（すなわち、無血清）であり得る。ＳＦＭは任意の血清代替物を含んでよく、又は含まなくてもよい。血清代替物としては、例えば、アルブミン（例えば、脂質リッチアルブミン、組換えアルブミン等のアルブミン代替物、植物デンプン、デキストラン及びタンパク質加水分解物等）、トランスフェリン（又は他の鉄輸送体）、脂肪酸、インスリン、コラーゲン前駆体、微量元素、２－メルカプトエタノール、３’－チオグリセロールあるいはこれらの均等物などを適宜含有する物質が挙げられ得る。かかる血清代替物は、例えば、ＷＯ ９８／３０６７９に記載の方法により調製できる。また、より簡便にするため、市販のものを利用できる。かかる市販の物質としては、Ｋｎｏｃｋｏｕｔ（商標）Ｓｅｒｕｍ Ｒｅｐｌａｃｅｍｅｎｔ（ＫＳＲ）、Ｃｈｅｍｉｃａｌｌｙ－ｄｅｆｉｎｅｄ Ｌｉｐｉｄ ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｅｄ、及びＧｌｕｔａｍａｘ（Ｉｎｖｉｔｏｒｏｇｅｎ）が挙げられる。
培地は、自体公知のその他の添加物を含んでもよい。本発明の方法により、原腸陥入前のエピブラスト細胞と同等のＥｐｉＬＣが製造される限り、添加物は特に限定されないが、例えば、成長因子（例えば、インスリンなど）、ポリアミン類（例えば、プトレシンなど）、ミネラル（例えば、セレン酸ナトリウムなど）、糖類（例えば、グルコースなど）、有機酸（例えば、ピルビン酸、乳酸など）、アミノ酸（例えば、非必須アミノ酸（ＮＥＡＡ）、Ｌ－グルタミンなど）、還元剤（例えば、２－メルカプトエタノールなど）、ビタミン類（例えば、アスコルビン酸、ｄ－ビオチンなど）、ステロイド（例えば、［ベータ］－エストラジオール、プロゲステロンなど）、抗生物質（例えば、ストレプトマイシン、ペニシリン、ゲンタマイシンなど）、緩衝剤（例えば、ＨＥＰＥＳなど）、栄養添加物（例えば、Ｂ２７ｓｕｐｐｌｅｍｅｎｔ、Ｎ２ ｓｕｐｐｌｅｍｅｎｔ、ＳｔｅｍＰｒｏ－Ｎｕｔｒｉｅｎｔ Ｓｕｐｐｌｅｍｅｎｔなど）を挙げることができる。各添加物は自体公知の濃度範囲で含まれることが好ましい。
本発明のＥｐｉＬＣの製造方法において、多能性幹細胞は、フィーダー細胞の存在下又は不在下にて培養されてよい。フィーダー細胞は、本発明の方法によりＥｐｉＬＣが製造され得る限り、特に限定されない。ＥＳＣ、ｉＰＳＣなどの多能性幹細胞の培養に使用するために自体公知のフィーダー細胞を使用することができる。例えば、線維芽細胞（マウス胚性線維芽細胞、マウス線維芽細胞株ＳＴＯなど）が挙げられ得る。フィーダー細胞は、自体公知の方法、例えば、放射線（ガンマ線など）、抗癌剤（マイトマイシンＣなど）での処理などにより不活性化されていることが好ましい。しかし、本発明の好ましい実施態様において、多能性幹細胞は、無フィーダー条件下で培養される。
多能性幹細胞からＥｐｉＬＣへの分化誘導用培地（培地Ａ）は、基本培地にアクチビンＡを必須の添加物として含有する。アクチビンＡの濃度は、例えば、約５ｎｇ／ｍｌ以上、好ましくは約１０ｎｇ／ｍｌ以上、より好ましくは約１５ｎｇ／ｍｌ以上、また、例えば、約４０ｎｇ／ｍｌ以下、好ましくは約３０ｎｇ／ｍｌ以下、より好ましくは２５ｎｇ／ｍｌ以下である。
培地Ａには、ｂＦＧＦ及び／又はＫＳＲがさらに含有されていることが好ましい。ｂＦＧＦ及びＫＳＲは、有効濃度範囲で存在する場合にＥｐｉＬＣの誘導効率を顕著に増大させる。ｂＦＧＦの濃度は、例えば、約５ｎｇ／ｍｌ以上、好ましくは約７．５ｎｇ／ｍｌ以上、より好ましくは約１０ｎｇ／ｍｌ以上であり、また、例えば、約３０ｎｇ／ｍｌ以下、好ましくは約２０ｎｇ／ｍｌ以下、より好ましくは約１５ｎｇ／ｍｌ以下である。ＫＳＲの濃度は、例えば、約０．１ｗ／ｗ％以上、好ましくは約０．３ｗ／ｗ％以上、より好ましくは約０．５ｗ／ｗ％以上であり、また、例えば、約５ｗ／ｗ％以下、好ましくは約３ｗ／ｗ％以下、より好ましくは約２ｗ／ｗ％以下である。
特に好ましい態様においては、培地Ａは基本培地に加えて、アクチビンＡ、ｂＦＧＦ及びＫＳＲを含有する。これらの成分の適切な濃度は、アクチビンＡについては約１０～約３０ｎｇ／ｍｌ、好ましくは約１５～約２５ｎｇ／ｍｌ、ｂＦＧＦについては約７．５～約２０ｎｇ／ｍｌ、好ましくは約１０～約１５ｎｇ／ｍｌ、ＫＳＲについては約０．３～約３ｗ／ｗ％、好ましくは約０．５～約２ｗ／ｗ％の範囲に亘って選択することができる。
培地Ａに含まれるアクチビンＡ及びｂＦＧＦは、そのソースに関して限定を受けず、任意の哺乳動物（例えば、ヒト、マウス、サル、ブタ、ラット、イヌなど）の細胞から単離及び精製されてよい。培養に供する多能性幹細胞と同種のアクチビンＡ及びｂＦＧＦを使用することが好ましい。アクチビンＡ及びｂＦＧＦは、化学的に合成されてもよく、無細胞翻訳系を用いて生化学的に合成されてもよく、或いは各タンパク質をコードする核酸を有する形質転換体から製造されてもよい。アクチビンＡ及びｂＦＧＦの組換え産物は市販されている。
多能性幹細胞をＥｐｉＬＣに誘導するために使用される培養器は、特に限定されないが、フラスコ、組織培養用フラスコ、ディッシュ、ペトリデッシュ、組織培養用ディッシュ、マルチディッシュ、マイクロプレート、マイクロウェルプレート、マルチプレート、マルチウェルプレート、マイクロスライド、チャンバースライド、シャーレ、チューブ、トレイ、培養バック、及びローラーボトルが挙げられ得る。培養器は細胞接着性であり得る。細胞接着性の培養器は、培養器表面の細胞への接着性を向上させる目的で、細胞外マトリックス（ＥＣＭ）などの任意の細胞接着用基質でコートされたものであり得る。細胞接着用基質は、多能性幹細胞又はフィーダー細胞（用いられる場合）の接着を目的とする任意の物質であり得る。細胞接着用基質としては、コラーゲン、ゼラチン、ポリ－Ｌ－リジン、ポリ－Ｄ－リジン、ポリ－Ｌ－オルニチン、ラミニン、及びフィブロネクチン並びにそれらの混合物、例えばマトリゲル、並びに溶解細胞膜調製物（ｌｙｓｅｄ ｃｅｌｌ ｍｅｍｂｒａｎｅ ｐｒｅｐａｒａｔｉｏｎｓ）が挙げられる（Ｋｌｉｍａｎｓｋａｙａ Ｉ ｅｔ ａｌ ２００５．Ｌａｎｃｅｔ ３６５：ｐ１６３６－１６４１）。
この培養において、多能性幹細胞を上記培養器上に播き、例えば、約１０４～１０５細胞／ｃｍ２、好ましくは約２～８×１０４細胞／ｃｍ２の細胞密度とし、１～１０％ＣＯ２／９９～９０％大気の雰囲気下、インキュベーター中で約３０～４０℃、好ましくは約３７℃で、３日未満、好ましくは約２日間（例えば、４８±１２時間、好ましくは４８±６時間）培養する。培養の結果、扁平なエピブラスト様構造を有する細胞が一様に現れる。
ＥｐｉＬＣへの分化の事実は、例えば、ＥｐｉＬＣ及び／又は多能性幹細胞のマーカー遺伝子の発現レベルをＲＴ－ＰＣＲにより分析することにより確認できる。本発明のＥｐｉＬＣは、Ｅ５．５～Ｅ６．０のエピブラスト様（原腸陥入前エピブラスト様）状態にある細胞を意味する。より詳細には、ＥｐｉＬＣは、以下の特性のいずれか又は両方を有する細胞として定義される：
（１）分化誘導前の多能性幹細胞に比して、Ｆｇｆ５、Ｗｎｔ３及びＤｎｍｔ３ｂから選択される少なくとも１つの遺伝子発現の上昇、
（２）分化誘導前の多能性幹細胞に比して、Ｇａｔａ４、Ｇａｔａ６、Ｓｏｘ１７及びＢｌｉｍｐ１から選択される少なくとも１つの遺伝子発現の低下。
従って、ＥｐｉＬＣへの分化の事実は、培養により得られた細胞中、Ｆｇｆ５、Ｗｎｔ３及びＤｎｍｔ３ｂから選択される少なくとも１つ、並びに／又はＧａｔａ４、Ｇａｔａ６、Ｓｏｘ１７及びＢｌｉｍｐ１から選択される少なくとも１つの発現レベルを測定し、分化誘導前の多能性幹細胞のものと発現レベルを比較することにより確認できる。
より好ましくは、本発明におけるＥｐｉＬＣは、以下の特性を有する：
（１）Ｏｃｔ３／４の持続的な遺伝子発現；
（２）分化誘導前の多能性幹細胞に比して、Ｓｏｘ２及びＮａｎｏｇの遺伝子発現の低下；
（３）分化誘導前の多能性幹細胞に比して、Ｆｇｆ５、Ｗｎｔ３及びＤｎｍｔ３ｂの遺伝子発現の上昇；及び
（４）分化誘導前の多能性幹細胞に比して、Ｇａｔａ４、Ｇａｔａ６、Ｓｏｘ１７及びＢｌｉｍｐ１の遺伝子発現の低下。
上述のとおり、好ましい態様において、本発明における培地Ａは、アクチビンＡ、ｂＦＧＦ及びＫＳＲを含有する。従って、本発明はまた、アクチビンＡ、ｂＦＧＦ及びＫＳＲを含む、多能性幹細胞からＥｐｉＬＣへの分化誘導用試薬キットも提供する。これらの成分は、水又は適当な緩衝液中に溶解した形態で提供されてもよく、凍結乾燥粉末として提供され、用時適当な溶媒に溶解して用いることもできる。また、これらの成分はそれぞれ単独の試薬としてキット化されていてもよいし、互いに悪影響を与えない限り、２種以上を混合して１つの試薬として提供することもできる。
（３）ＥｐｉＬＣからＰＧＣＬＣへの分化誘導
このようにして得られたＥｐｉＬＣをＢＭＰ４及びＬＩＦの存在下で培養することにより、ＰＧＣ様細胞へと分化誘導することができる（Ｃｅｌｌ，１３７，５７１－５８４（２００９））。従って、本発明の第二の側面は、上記（２）の方法により得られたＥｐｉＬＣを介して、多能性幹細胞からＰＧＣ様細胞を製造する方法に関する。すなわち、該方法は、
Ｉ）上記（２）に記載のいずれかの方法に従って多能性幹細胞からＥｐｉＬＣを製造する工程；及び
ＩＩ）工程Ｉ）で得られたＥｐｉＬＣをＢＭＰ４及びＬＩＦの存在下で培養する工程
を含む。
工程ＩＩ）での分化誘導用基本培地としては、工程Ｉ）で使用するために例示した基本培地が同様に好ましく使用される。正常な精子形成に貢献できるＰＧＣ様細胞が本発明の方法により製造できる限り、培地は、工程Ｉ）で使用するために例示した添加物と同じ添加物を含有してよい。
培地は、血清含有培地又は無血清培地（ＳＦＭ）であり得る。好ましくは、無血清培地が使用され得る。血清（例えば、ウシ胎児血清（ＦＢＳ）、ヒト血清など）の濃度は、０～２０％、好ましくは０～５％、より好ましくは０～２％、最も好ましくは０％（すなわち無血清）であり得る。ＳＦＭは、ＫＳＲなど任意の血清代替物を含んでよく、又は含まなくともよい。
ＥｐｉＬＣからＰＧＣ様細胞への分化誘導用培地（培地Ｂ）は、基本培地の必須添加物として、骨形成タンパク質４（ｂｏｎｅ ｍｏｒｐｈｏｇｅｎｅｔｉｃ ｐｒｏｔｅｉｎ ４）（ＢＭＰ４）及び白血病阻止因子（ｌｅｕｋｅｍｉａ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｙ ｆａｃｔｏｒ）（ＬＩＦ）を含有する。ＢＭＰ４の濃度は、例えば、約１００ｎｇ／ｍｌ以上、好ましくは約２００ｎｇ／ｍｌ以上、より好ましくは約３００ｎｇ／ｍｌ以上である。また、ＢＭＰ４の濃度は、例えば、約１，０００ｎｇ／ｍｌ以下、好ましくは約８００ｎｇ／ｍｌ以下、より好ましくは６００ｎｇ／ｍｌ以下である。ＬＩＦの濃度は、例えば、約３００Ｕ／ｍｌ以上、好ましくは約５００Ｕ／ｍｌ以上、より好ましくは約８００Ｕ／ｍｌ以上である。また、ＬＩＦの濃度は、例えば、約２，０００Ｕ／ｍｌ以下、好ましくは約１，５００Ｕ／ｍｌ以下、より好ましくは１，２００Ｕ／ｍｌ以下である。
培地Ｂは、幹細胞因子（ＳＣＦ）、骨形成タンパク質８ｂ（ＢＭＰ８ｂ）及び上皮成長因子（ＥＧＦ）から選択される少なくとも１つの添加物をさらに含有することが好ましい。ＳＣＦ、ＢＭＰ８ｂ及びＥＧＦは、有効濃度範囲で存在した場合に、ＰＧＣ様細胞がＢｌｉｍｐ１－及びＳｔｅｌｌａ－陽性状態で維持される期間を著しく延長する。ＳＣＦの濃度は、例えば、約３０ｎｇ／ｍｌ以上、好ましくは約５０ｎｇ／ｍｌ以上、より好ましくは約８０ｎｇ／ｍｌ以上である。また、ＳＣＦの濃度は、例えば、約２００ｎｇ／ｍｌ以下、好ましくは約１５０ｎｇ／ｍｌ以下、より好ましくは約１２０ｎｇ／ｍｌ以下である。ＢＭＰ８ｂの濃度は、例えば、約１００ｎｇ／ｍｌ以上、好ましくは約２００ｎｇ／ｍｌ以上、より好ましくは約３００ｎｇ／ｍｌ以上である。また、ＢＭＰ８ｂの濃度は、例えば、約１，０００ｎｇ／ｍｌ以下、好ましくは約８００ｎｇ／ｍｌ以下、より好ましくは６００ｎｇ／ｍｌ以下である。ＥＧＦの濃度は、例えば、約１０ｎｇ／ｍｌ以上、好ましくは約２０ｎｇ／ｍｌ以上、より好ましくは約３０ｎｇ／ｍｌ以上である。また、ＥＧＦの濃度は、例えば、約１００ｎｇ／ｍｌ以下、好ましくは約８０ｎｇ／ｍｌ以下、より好ましくは約６０ｎｇ／ｍｌ以下である。
特に好ましい実施態様において、培地Ｂは、基本培地に加えてＢＭＰ、ＬＩＦ、ＳＣＦ、ＢＭＰ８ｂ及びＥＧＦを含有する。これら成分の濃度は、ＢＭＰ４については約２００～８００ｎｇ／ｍｌ、好ましくは約３００～６００ｎｇ／ｍｌ、ＬＩＦについては約５００～１５００Ｕ／ｍｌ、好ましくは約８００～１，２００Ｕ／ｍｌ、ＳＣＦについては約５０～１５０ｎｇ／ｍｌ、好ましくは約８０～１２０ｎｇ／ｍｌ、ＢＭＰ８ｂについては約２００～８００ｎｇ／ｍｌ、好ましくは約３００～６００ｎｇ／ｍｌ、ＥＧＦについては約２０～８０ｎｇ／ｍｌ、好ましくは約３０～６０ｎｇ／ｍｌの範囲に亘って適宜選択され得る。
培地Ｂに含有されるＢＭＰ４、ＬＩＦ、ＳＣＦ、ＢＭＰ８ｂ及びＥＧＦは、そのソースに関して特に限定されず、任意の哺乳動物（例えば、ヒト、マウス、サル、ブタ、ラット、イヌなど）の細胞から単離及び精製されてよい。培養に供するＥｐｉＬＣと同種のＢＭＰ４、ＬＩＦ、ＳＣＦ、ＢＭＰ８ｂ及びＥＧＦを使用することが好ましい。ＢＭＰ４、ＬＩＦ、ＳＣＦ、ＢＭＰ８ｂ及びＥＧＦは、化学的に合成されてもよく、無細胞翻訳系を用いて生化学的に合成されてもよく、或いは各タンパク質をコードする核酸を有する形質転換体から製造されてもよい。ＢＭＰ４、ＬＩＦ、ＳＣＦ、ＢＭＰ８ｂ及びＥＧＦの組換え産物は市販されている。
この培養において、自体公知の細胞非接着性又は低接着性培養器にＥｐｉＬＣを播種し、例えば、約３～１０×１０４細胞／ｍＬ、好ましくは約４～８×１０４細胞／ｍＬの細胞密度とし、１～１０％ＣＯ２／９９～９０％大気の雰囲気中、インキュベーター中で約３０～４０℃、好ましくは約３７℃で、約４～１０日間、好ましくは約４～８日間、より好ましくは約４～６日間、さらに好ましくは約４日間培養する。
ＰＧＣ様細胞への分化の事実は、例えば、ＲＴ－ＰＣＲなどによりＢｌｉｍｐ１の発現を分析することによって確認できる。さらに必要に応じて、他の遺伝子や細胞表面抗原の発現を調べることもできる。他の遺伝子の例にはＳｔｅｌｌａが挙げられる。Ｂｌｉｍｐ１－及び／又はＳｔｅｌｌａ－プロモーターの制御下にある蛍光タンパク質遺伝子を有する多能性幹細胞を出発物質として使用する場合には、ＰＧＣ様細胞への分化の事実はＦＡＣＳ分析により確認できる。ヒト又は他の非マウス哺乳動物に由来するＥＳＣ又はｉＰＳＣなど、多能性幹細胞が適切なトランスジェニックレポーターを有さない場合には、ＰＧＣ様細胞の分化の事実は、ＰＧＣ様細胞に特異的に発現する１種以上の細胞表面抗原を用いて、ＦＡＣＳ分析などにより確認することが好ましい。細胞表面抗原として、好ましくはＳＳＥＡ－１及びインテグリン－β３が例示される。
前記工程Ｉ）及びＩＩ）により製造される、多能性幹細胞に由来するＰＧＣ様細胞を含む細胞集団は、ＰＧＣ様細胞の精製された集団であってよく、ＰＧＣ様細胞以外に１種以上の細胞が共存してもよい。ここで、「ＰＧＣ様細胞」は、分化誘導前のＥｐｉＬＣに比してＢｌｉｍｐ１及び／又はＳｔｅｌｌａの発現の上昇を示し、正常な精子形成に貢献でき、免疫不全マウスに移植された場合にテラトーマを形成しない細胞として定義される。上述のとおり、Ｂｌｉｍｐ１－及び／又はＳｔｅｌｌａ－プロモーターの制御下にある蛍光タンパク質遺伝子を有する多能性幹細胞を出発物質として使用してＰＧＣ様細胞を誘導する場合、セルソーターを用いて、前記工程ＩＩ）で得られた細胞集団をソーティングすることにより、Ｂｌｉｍｐ１－及び／又はＳｔｅｌｌａ－陽性ＰＧＣ様細胞を容易に単離し精製できる。ＰＧＣ様細胞は、マーカーとして、Ｂｌｉｍｐ１及びＳｔｅｌｌａとともに発現が増加する遺伝子（例、Ｎａｎｏｇ）の制御下にあるレポーターを用いてＦＡＣＳにより単離し精製することもできる。
２．ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣの維持増幅
本工程では、例えば、上記の方法により得られたＰＧＣ又はＰＧＣＬＣを、ＰＤＥ４阻害薬及び／又はシクロスポリンＡの存在下で培養する。用いるＰＧＣＬＣが不均一な細胞集団である場合、例えば、ＦＡＣＳを用いて、ＳＳＥＡ－１陽性及びインテグリン－β３陽性の細胞分画を単離して用いることができる。ＰＧＣＬＣとしては、ＥｐｉＬＣからの分化誘導開始日をｄ０として、ｄ４～ｄ１０、好ましくはｄ４～ｄ８、より好ましくはｄ４～ｄ６、さらに好ましくは約ｄ４の細胞が用いられ得る。
本工程に使用される培地は、基本培地として、ＰＳＣからＥｐｉＬＣへの分化誘導に関して例示した培地を、同様に使用することができる。培地には、血清又は血清代替物を添加することが好ましい。ここで用いられる血清又は血清代替物の種類及び添加濃度は、ＰＳＣからＥｐｉＬＣへの分化誘導に関して例示されたものが、同様に使用可能である。また、培地は、自体公知のその他の添加物を含んでもよい。そのような添加物としては、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣの維持増幅を支持し得る限り、特に制限されず、ＰＳＣからＥｐｉＬＣへの分化誘導に関して例示されたものが、同様に使用可能である。例えば、本工程に使用される培地として、１０％Ｋｎｏｃｋｏｕｔ Ｓｅｒｕｍ Ｒｅｐｌａｃｅｍｅｎｔ（ＫＳＲ）、２．５％胎仔ウシ血清（ＦＣＳ）、０．１ｍＭ ＮＥＡＡ、１ｍＭピルビン酸ナトリウム、０．１ｍＭ ２－メルカプトエタノール、１００Ｕ／ｍｌペニシリン、０．１ｍｇ／ｍｌストレプトマイシン、２ｍＭ Ｌ－グルタミンを含むＧＭＥＭ培地等が挙げられるが、これに限定されない。
上記培地に添加されるＰＤＥ４阻害薬としては、ＰＤＥ４の酵素活性、即ち、ｃＡＭＰの加水分解活性を阻害し得る物質であれば特に制限はないが、好ましくはＰＤＥ４の選択的阻害薬（ホスホジエステラーゼ（ＰＤＥ）以外の酵素だけでなく、ＰＤＥ４以外のＰＤＥｓも阻害しない）である。例えば、イブジラスト、Ｓ－（＋）－ロリプラム、ロリプラム、ＧＳＫ２５６０６６、シロミラスト等が挙げられるがこれに限定されない。
ＰＤＥ４阻害薬の濃度は、例えば、約０．１μＭ以上、好ましくは約０．５μＭ以上、より好ましくは約１μＭ以上である。また、ＰＤＥ４阻害薬の濃度は、例えば、約１００μＭ以下、好ましくは約５０μＭ以下、より好ましくは３０μＭ以下である。好ましい実施態様において、ＰＤＥ４阻害薬の濃度は、約０．５～５０μＭ、好ましくは約１～３０μＭ範囲内で適宜選択され得る。
本明細書において「シクロスポリンＡ」とは、ＩＵＰＡＣ名：ｃｙｃｌｏ｛－［（２Ｓ，３Ｒ，４Ｒ，６Ｅ）－３－Ｈｙｄｒｏｘｙ－４－ｍｅｔｈｙｌ－２－ｍｅｔｈｙｌａｍｉｎｏｏｃｔ－６－ｅｎｏｙｌ］－Ｌ－２－ａｍｉｎｏｂｕｔａｎｏｙｌ－Ｎ－ｍｅｔｈｙｌｇｌｙｃｙｌ－Ｎ－ｍｅｔｈｙｌ－Ｌ－ｌｅｕｃｙｌ－Ｌ－ｖａｌｙｌ－Ｎ－ｍｅｔｈｙｌ－Ｌ－ｌｅｕｃｙｌ－Ｌ－ａｌａｎｙｌ－Ｄ－ａｌａｎｙｌ－Ｎ－ｍｅｔｈｙｌ－Ｌ－ｌｅｕｃｙｌ－Ｎ－ｍｅｔｈｙｌ－Ｌ－ｌｅｕｃｙｌ－Ｎ－ｍｅｔｈｙｌ－Ｌ－ｖａｌｙｌ－｝にて特定される１１アミノ酸からなる環状ポリペプチドの他、自体公知のその誘導体（例えば、ＷＯ ２０１２／０５１１９４等参照）も含まれる。シクロスポリンＡは、それを産生する真菌から発酵法により単離することもできるし、周知のペプチド合成技術により有機合成することもできる。また、市販のシクロスポリンＡ（例えば、シグマ－アルドリッチ社）を使用することもできる。
シクロスポリンＡの濃度は、例えば、約０．１μＭ以上、好ましくは約０．５μＭ以上、より好ましくは約１μＭ以上である。また、シクロスポリンＡの濃度は、例えば、約１００μＭ以下、好ましくは約５０μＭ以下、より好ましくは３０μＭ以下である。好ましい実施態様において、シクロスポリンＡの濃度は、約０．５～５０μＭ、好ましくは約１～３０μＭ、より好ましくは約１～１０μＭの範囲内で適宜選択され得る。
好ましくは、本培養工程は、少なくともＰＤＥ４阻害薬を含有する培地、より好ましくは、さらにシクロスポリンＡを含有する培地を用いて実施される。
好ましい実施態様において、本培養工程はフォルスコリンをさらに含有する培地を用いて実施される。
フォルスコリンはアデニル酸シクラーゼの強力な活性化薬であり、ＰＤＥ４阻害薬とは異なる作用機序で細胞内ｃＡＭＰレベルを上昇させることから、ＰＤＥ４阻害薬と相乗的に作用して、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣの増幅効率を顕著に増大させることができる。
フォルスコリンの濃度は、例えば、約０．１μＭ以上、好ましくは約０．５μＭ以上、より好ましくは約１μＭ以上である、また、フォルスコリンの濃度は、例えば、約１００μＭ以下、好ましくは約５０μＭ以下、より好ましくは３０μＭ以下である。好ましい実施態様において、フォルスコリンの濃度は、約０．５～５０μＭ、好ましくは約１～３０μＭ範囲内で適宜選択され得る。
ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣの維持増幅用培地には、ＳＣＦがさらに含有されていることが好ましい。ＳＣＦの濃度は、例えば、約３０ｎｇ／ｍｌ以上、好ましくは約５０ｎｇ／ｍｌ以上、より好ましくは約８０ｎｇ／ｍｌ以上である。また、ＳＣＦの濃度は、例えば、約２００ｎｇ／ｍｌ以下、好ましくは約１５０ｎｇ／ｍｌ以下、より好ましくは約１２０ｎｇ／ｍｌ以下である。好ましい実施態様において、ＳＣＦの濃度は、約５０～１５０ｎｇ／ｍｌ、好ましくは約８０～１２０ｎｇ／ｍｌの範囲内で適宜選択され得る。
特に好ましい実施態様においては、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣの維持増幅用培地は、１０μＭ ＰＤＥ４阻害薬、１０μＭフォルスコリン及び１００ｎｇ／ｍｌ ＳＣＦを含有する。尚、他のＰＧＣ増殖刺激因子と併用するとＰＧＣ／ＰＧＣＬＣのＥＧＣへの脱分化を促進する可能性があるため、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣの維持増幅用培地にはＬＩＦを添加しないことが好ましい場合がある。
ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣの維持増幅方法において、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣは、フィーダー細胞の存在下又は非在下にて培養されてよい。フィーダー細胞の種類は特に限定されないが、自体公知のフィーダー細胞を使用することができる。例えば、線維芽細胞（マウス胚性線維芽細胞、マウス線維芽細胞株ＳＴＯなど）が挙げられ得る。フィーダー細胞は、自体公知の方法、例えば、放射線（ガンマ線など）、抗癌剤（マイトマイシンＣなど）での処理などにより不活性化されていることが好ましい。フィーダー細胞がＰＤＥ４阻害薬及び／又はフォルスコリンに対して脆弱である場合には、予めこれらの添加物の存在下で数世代フィーダー細胞を継代培養して、該添加物に馴化させておくことが望ましい。
ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣの維持増幅のために使用される培養器は特に限定されず、例えばＰＳＣからＥｐｉＬＣへの分化誘導において例示されたものが、同様に使用可能である。
この培養において、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣを（フィーダー細胞が予め播種された）培養器上に播き、例えば、約１０４～１０５細胞／ｃｍ２、好ましくは約２～８×１０４細胞／ｃｍ２の細胞密度とし、１～１０％ＣＯ２／９９～９０％大気の雰囲気下、インキュベーター中で約３０～４０℃、好ましくは約３７℃で、３～９日間、好ましくは４～８日間、より好ましくは５～７日間培養する。培養の結果、扁平なコロニーが形成され、Ｂｌｉｍｐ１及びＳｔｅｌｌａを強発現し続け、糸状及び葉状仮足を伴う運動性細胞の特徴を示し、移動期のＰＧＣの特性を維持する。
網羅的遺伝子発現解析の結果から、上記のようにして得られる増幅ＰＧＣＬＣは、後期ＰＧＣ（Ｅ１２．５以降）にて発現する遺伝子群（例、Ｄａｚｌ，Ｄｄｘ４，Ｐｉｗｉｌ２，Ｍａｅｌ等）の発現を上昇させずに、移動期ＰＧＣの遺伝子発現を維持する。
また、エピジェネティック解析の結果から、増幅ＰＧＣＬＣでは、すべてのゲノム領域において５－メチルシトシンが進行的に消去され、生殖巣の生殖細胞におけるゲノムワイドな脱メチル化が忠実に再現されている。即ち、本発明の方法により得られる増幅ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣは、性分化直前の生殖系列のエピジェネティックな白紙状態を再現している。
本発明の方法（Ｉ）により得られる増幅ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣは種々の目的で使用できる。例えば、レシピエント動物の精巣に移植されたＰＧＣ／ＰＧＣＬＣは、精巣での精子形成及び健常な子孫の創出に確実に貢献できるので、不妊、又は生殖組織の遺伝性疾患の治療に使用できる。
ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣの精巣への移植は、ＷＯ ２００４／０９２３５７及びＢｉｏｌ．Ｒｅｐｒｏｄ．，６９：６１２－６１６（２００３）に記載の方法において、生殖幹細胞（ｇｅｒｍｌｉｎｅ ｓｔｅｍ ｃｅｌｌｓ：ＧＳ細胞）の代わりにＰＧＣ／ＰＧＣＬＣを使用することにより実施できる。あるいは、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣをＷＯ ２００４／０９２３５７及びＢｉｏｌ．Ｒｅｐｒｏｄ．（２００３）と同様の方法で培養して、ＧＳ細胞へと分化誘導した後、精巣に移植できる。
ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣ（ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣを含む細胞集団を含む；以下同じ）は、常套手段に従って医薬上許容される担体と混合するなどして、非経口製剤、好ましくは、注射剤、懸濁剤又は点滴剤として製造される。当該非経口製剤に含まれ得る医薬上許容される担体としては、例えば、生理食塩水、ブドウ糖やその他の補助薬を含む等張液（例えば、Ｄ－ソルビトール、Ｄ－マンニトール、塩化ナトリウムなど）などの注射用の水性液を挙げることができる。本発明の剤は、例えば、緩衝剤（例えば、リン酸塩緩衝液、酢酸ナトリウム緩衝液）、無痛化剤（例えば、塩化ベンザルコニウム、塩酸プロカインなど）、安定剤（例えば、ヒト血清アルブミン、ポリエチレングリコールなど）、保存剤、酸化防止剤などと配合しても良い。
本発明の剤を水性懸濁剤として調製する場合、上記水性液の１つにＰＧＣ／ＰＧＣＬＣを約１．０×１０６～約１．０×１０７細胞／ｍＬの細胞密度となるように懸濁させる。
本発明の剤は、幹細胞の低温保存に通常使用される条件下で低温保存し、使用直前に融解することができる。
このようにして得られる製剤は、安定で低毒性であるので、ヒトなどの哺乳動物に対して安全に投与することができる。投与方法は特に限定されないが、製剤は、精細管へと、注射又は点滴により投与されることが好ましい。男性不妊患者については、例えば、１回につきＰＧＣ様細胞量として約１．０×１０５～約１×１０７細胞量の剤を、約１～２週間隔で、１又は２～１０回投与するのが通常、好都合である。
［ＩＩ］ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣからの卵母細胞の誘導方法
本発明の方法（Ｉ）により得られる増幅ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣを、ＢＭＰ及びＲＡの存在下で培養することにより、生殖巣の体細胞の非存在下で卵母細胞に分化誘導することができる。従って、本発明はまた、ＰＧＣ又はＰＧＣＬＣをＢＭＰ及びＲＡの存在下で培養することを含む、該細胞から卵母細胞を誘導する方法（「本発明の方法（ＩＩ）」と略記する場合がある）を提供する。
本発明の方法（ＩＩ）は、生殖巣の体細胞の非存在下で行われることを特徴とする。ここで「生殖巣」とは、生殖細胞とそれらを支持する体細胞からなる構造体をいう。母胎で、胎児（仔）の始原生殖細胞（ＰＧＣ）におけるオス、メスの性分化が始まる頃（マウスでは受精後１２．５日齢（Ｅ１２．５））までに形成される。ＰＧＣはオス、メス各々に特徴的な生殖巣の体細胞に包まれながら、配偶子（精子や卵子）へと分化する。従来法では、ＰＧＣが前精原細胞や卵母細胞となる時点の細胞環境を模倣すべく、この時期の生殖巣（例えば、マウスの場合、Ｅ１２．０～Ｅ１３．０、好ましくは約Ｅ１２．５）の体細胞とＰＧＣ／ＰＧＣＬＣとを共培養するが、本発明の方法（ＩＩ）では、生殖巣体細胞を必要としないので、操作が煩雑でないだけでなく、規定された条件下で卵母細胞への分化を行うことができ、さらに、ヒトをはじめとする、胎生期の生殖巣体細胞の採取が困難な動物種へも実用的に使用可能である。
本発明の方法（ＩＩ）において使用するＰＧＣ／ＰＧＣＬＣは、少なくとも後期ＰＧＣや減数分裂に重要な遺伝子群が脱メチル化された状態にあれば特に限定されないが、エピブラストやＥｐｉＬＣから誘導直後のＰＧＣ／ＰＧＣＬＣは、ゲノムの脱メチル化が不十分であるので、本発明の方法（Ｉ）により得られる増幅ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣを用いることが好ましい。例えば、ＰＤＥ４阻害薬、好ましくはさらにフォルスコリン、より好ましくはさらにＳＣＦの存在下で、例えば３日間以上、好ましくは３～９日間、より好ましくは３～８日間、さらに好ましくは３～７日間培養したＰＧＣ／ＰＧＣＬＣを用いることができる。
本発明の方法（ＩＩ）において使用される培地は、基本培地として、ＰＳＣからＥｐｉＬＣへの分化誘導に関して例示した培地を、同様に使用することができる。培地には、血清又は血清代替物を添加することが好ましい。ここで用いられる血清又は血清代替物の種類及び添加濃度は、ＰＳＣからＥｐｉＬＣへの分化誘導に関して例示されたものが、同様に使用可能である。また、培地は、自体公知のその他の添加物を含んでもよい。そのような添加物としては、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣから卵母細胞への分化を支持し得る限り、特に制限されず、ＰＳＣからＥｐｉＬＣへの分化誘導に関して例示されたものが、同様に使用可能である。例えば、本工程に使用される培地として、本発明の方法（Ｉ）と同様に、１０％Ｋｎｏｃｋｏｕｔ Ｓｅｒｕｍ Ｒｅｐｌａｃｅｍｅｎｔ（ＫＳＲ）、２．５％胎仔ウシ血清（ＦＣＳ）、０．１ｍＭ ＮＥＡＡ、１ｍＭピルビン酸ナトリウム、０．１ｍＭ ２－メルカプトエタノール、１００Ｕ／ｍｌペニシリン、０．１ｍｇ／ｍｌストレプトマイシン、２ｍＭ Ｌ－グルタミンを含むＧＭＥＭ培地等が挙げられるが、これに限定されない。
上記培地に添加されるＢＭＰとしては、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣから卵母細胞への分化を支持し得る限り特に制限はないが、例えば、ＢＭＰ２、ＢＭＰ４、ＢＭＰ５、ＢＭＰ７等が挙げられる。好ましくは、ＢＭＰ２、ＢＭＰ５又はＢＭＰ７である。ＢＭＰはいずれか１種のみを用いてもよいし、２種以上のＢＭＰを組み合わせて用いてもよい。
ＢＭＰの濃度は、例えば、約１００ｎｇ／ｍｌ以上、好ましくは約２００ｎｇ／ｍｌ以上、より好ましくは約３００ｎｇ／ｍｌ以上である。また、ＢＭＰの濃度は、例えば、約１，０００ｎｇ／ｍｌ以下、好ましくは約８００ｎｇ／ｍｌ以下、より好ましくは６００ｎｇ／ｍｌ以下である。好ましい実施態様において、ＢＭＰの濃度は、約２００～８００ｎｇ／ｍｌ、好ましくは約３００～６００ｎｇ／ｍｌの範囲内で適宜選択され得る。
ＲＡの濃度は、例えば、約１０ｎＭ以上、好ましくは約３０ｎＭ以上、より好ましくは約５０ｎＭ以上である、また、ＲＡの濃度は、例えば、約５００ｎＭ以下、好ましくは約３００μＭ以下、より好ましくは２００μＭ以下である。好ましい実施態様において、ＲＡの濃度は、約３０～３００ｎＭ、好ましくは約５０～２００ｎＭ範囲内で適宜選択され得る。
好ましい実施態様において、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣからの卵母細胞誘導用培地には、前記ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣの維持増幅用培地と同様に、ＰＤＥ４阻害薬、フォルスコリン及びＳＣＦがさらに含有されている。各添加物の濃度は、本発明の方法（Ｉ）について前記したのと同様の濃度範囲内で適宜選択され得る。
特に好ましい実施態様においては、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣからの卵母細胞誘導用培地は、５００ｎｇ／ｍｌＢＭＰ及び１００ｎＭ ＲＡを含有する。
ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣからの卵母細胞の誘導方法において、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣは、フィーダー細胞の存在下又は非在下にて培養されてよい。フィーダー細胞の種類は特に限定されないが、自体公知のフィーダー細胞を使用することができる。本培養工程に使用される培養器は特に限定されず、例えばＰＳＣからＥｐｉＬＣへの分化誘導において例示されたものが、同様に使用可能である。
この培養において、例えば、本発明の方法（Ｉ）においてＰＧＣ／ＰＧＣＬＣを維持増幅条件においてから３～９日後、好ましくは３～８日後、より好ましくは３～７日後に、培地をＢＭＰ及びＲＡを添加した培地に交換して、さらに２～７日間、好ましくは２～６日間培養を続けることができる。培養の結果、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣはＤａｚｌ陽性、Ｄｄｘ４陽性、ＳＣＰ３陽性の卵母細胞様細胞に同期して分化し、減数分裂の厚糸期まで分化する。
以下に実施例を挙げて本発明をより具体的に説明するが、本発明がこれらに限定されないことは言うまでもない。
［Ｉ］ＰＤＥ４阻害薬及び該阻害薬とフォルスコリンとの併用によるＰＧＣ／ＰＧＣＬＣの維持増幅
以下に引用する文献の詳細情報については、Ｏｈｔａ，Ｈ．ｅｔ ａｌ．，ＥＭＢＯ Ｊ．，３６（１３）：１８８８－１９０７（２０１７）を参照のこと。
＜材料と方法＞
マウス
全ての動物実験は、京都大学の倫理ガイドラインに基づき行った。ＢＶＳＣ（Ａｃｃ．Ｎｏ．ＢＶ，ＣＤＢ０４６０Ｔ；ＳＣ，ＣＤＢ０４６５Ｔ：ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｃｄｂ．ｒｉｋｅｎ．ｊｐ／ａｒｇ／ＴＧ％２０ｍｕｔａｎｔ％２０ｍｉｃｅ％２０ｌｉｓｔ．ｈｔｍｌ）及びＳｔｅｌｌａ－ＥＧＦＰトランスジェニックマウスを、以前報告されたように（Ｐａｙｅｒ ｅｔ ａｌ，２００６；Ｓｅｋｉ ｅｔ ａｌ，２００７；Ｏｈｉｎａｔａ ｅｔ ａｌ，２００８）樹立し、ほとんどＣ５７ＢＬ／６のバックグラウンドで維持した。ＷＢＢ６Ｆ１－Ｗ／Ｗｖ、Ｃ５７ＢＬ／６、ＤＢＡ／２、Ｃ３Ｈ、ＢＤＦ１、及びＩＣＲマウスを、ＳＬＣ（Ｓｈｉｚｕｏｋａ、Ｊａｐａｎ）から購入した。膣栓を確認した日の正午を胎生期（Ｅ）０．５とした。全てのマウスを、１４時間の明／１０時間の暗のサイクル下で、特定の病原体のない動物施設に収容した。
ＥＳ細胞（ＥＳＣ）の誘導と培養
ＢＶＳＣ Ｒ８、Ｈ１４、及びＨ１８は以前に報告されている（Ｈａｙａｓｈｉ ｅｔ ａｌ，２０１１，２０１２）。メスのＢＶＳＣマウス（ほとんどＣ５７ＢＬ／６のバックグラウンド）をオスのＤＢＡ／２又はＣ３Ｈマウスと交配し、ＢＤＦ１又はＢＣＦ１胚を得た。胚盤胞を、２ｉ（ＰＤ０３２５９０１，０．４μＭ：Ｓｔｅｍｇｅｎｔ、Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ、ＣＡ；ＣＨＩＲ９９０２１，３μＭ：Ｓｔｅｍｇｅｎｔ）及びＬＩＦ（１，０００Ｕ／ｍｌ；Ｍｅｒｃｋ Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）を含むＮ２Ｂ２７培地中の９６ウェルプレートのウェル中で、マウス胎児線維芽細胞（ＭＥＦ）（Ｙｉｎｇ ｅｔ ａｌ、２００８；Ｈａｙａｓｈｉ ｅｔ ａｌ、２０１１）上に播種し、培養した。増殖したコロニーを、ＴｒｙｐＬＥ（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）で解離することにより継代した。２継代まで、ＥＳＣをＭＥＦ上で維持した。その後、ポリ－Ｌ－オルニチン（０．０１％；Ｓｉｇｍａ）及びラミニン（１０ｎｇ／ｍｌ；ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）でコーティングしたディッシュ上でオスのＥＳＣを培養し、フィーダーフリーで維持した。
ＥｐｉＬＣ及びＰＧＣＬＣの誘導
ＥｐｉＬＣ及びＰＧＣＬＣの誘導を、以前報告されたように行った（Ｈａｙａｓｈｉ ｅｔ ａｌ，２０１１）。簡潔に述べると、アクチビンＡ（２０ｎｇ／ｍｌ）、ｂＦＧＦ（１２ｎｇ／ｍｌ）、及びＫＳＲ（１％）を含むＮ２Ｂ２７培地中で、ヒト血漿フィブロネクチン（１６．７ｍｇ／ｍｌ）でコーティングした１２ウェルプレートのウェル上に、１ｘ１０５個のＥＳＣを播種することにより、ＥｐｉＬＣを誘導した。サイトカインＢＭＰ４（５００ｎｇ／ｍｌ；Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）、ＬＩＦ（１，０００Ｕ／ｍｌ；Ｍｅｒｃｋ Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）、ＳＣＦ（１００ｎｇ／ｍｌ；Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）及びＥＧＦ（５０ｎｇ／ｍｌ；Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）の存在下で、無血清培地［１５％ＫＳＲを含むＧＫ１５；ＧＭＥＭ（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）、０．１ｍＭ ＮＥＡＡ，１ｍＭピルビン酸ナトリウム、０．１ｍＭ ２－メルカプトエタノール、１００Ｕ／ｍｌペニシリン、０．１ｍｇ／ｍｌストレプトマイシン、及び２ｍＭ Ｌ－グルタミン］を含む、低細胞結合Ｕ底９６ウェルプレート（Ｔｈｅｒｍｏ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）のウェルを用いて、浮遊条件下でｄ２のＥｐｉＬＣからＰＧＣＬＣを誘導した。化合物ライブラリースクリーニング用の多数のＰＧＣＬＣを調製するために、同じ培地を用いて、ＡｇｇｌｒｅＷｅｌｌ４００（ＳＴＥＭＣＥＬＬ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）でＰＧＣＬＣを誘導した。
蛍光活性化セルソーティング
以前報告されたように（Ｈａｙａｓｈｉ ｅｔ ａｌ，２０１１）、細胞凝集体からのサンプル調製を行った。ＦＡＣＳをＦＡＣＳＡｒｉａＩＩＩ（ＢＤ）セルソーターで行った。ＢＶ及びＳＣ蛍光をＦＩＴＣ及びＡｍＣｙａｎ Ｈｏｒｉｚｏｎ Ｖ５００チャネルでそれぞれ検出した。データをＦＡＣＳＤｉｖａ（ＢＤ）ソフトウェアを用いて分析した。
ｍ２２０亜系統株（ｓｕｂｌｉｎｅ）の樹立
ｍ２２０細胞株（Ｍａｊｕｍｄａｒ ｅｔ ａｌ，１９９４）を、１０％ＦＣＳを含むＤＭＥＭ中で、ゼラチンをコーティングしたプレート上で培養した。ｍ２２０細胞はマイトマイシンＣ（ＭＭＣ）処理に対して非常に脆弱であったため、ＭＭＣに対して耐性のあるｍ２２０亜系統株を樹立した。簡潔に述べると、ＦＡＣＳにより、単一のｍ２２０細胞を９６ウェルプレート（６プレート）のウェル上に播種した。播種１週間後、ウェルの約半分で細胞増殖が観察された。細胞を２つの９６ウェルプレートのそれぞれの１つのウェルに継代した後、一方のプレートをレプリカとして凍結し、他方のプレートをＭＭＣで処理した（４μｇ／ｍｌ、２時間）。ＭＭＣ処理後１０日目に、顕微鏡観察によりＭＭＣ耐性を評価した。合計で２４２個のｍ２２０亜系統株を樹立し、７個の亜系統株が高いＭＭＣ耐性を示した。主にｍ２２０－５亜系統株を実験に使用した。
細胞分析装置によるＢＶ（＋）ＰＧＣＬＣの検出
ｄ４ ＰＧＣＬＣを、ＦＡＣＳにより９６ウェルプレート中のｍ２２０－５フィーダー上に播種し、ＢＶ蛍光を細胞分析装置（Ｃｅｌｌａｖｉｓｔａ；ＳｙｎｅｎＴｅｃ）によりモニターした。ＢＶ用の蛍光写真を、以下の設定でＣｅｌｌａｖｉｓｔａ細胞分析装置により撮影した：１０×ｏｂｊｅｃｔｉｖｅｓ；ｅｘｐｏｓｕｒｅ ｔｉｍｅ：１４０μｓｅｃ；ｇａｉｎ：４×；ｂｉｎｎｉｎｇ：４×４；ｅｘｃｉｔａｔｉｏｎ：５００／２４ｎｍ；ｅｍｉｓｓｉｏｎ：５４２／２７ｎｍ。ＢＶ蛍光を、以下のアルゴリズム／属性パラメータを用いて検出した：ｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙ：１０；ｒｅｇｉｏｎ ｍｅｒｇｉｎｇ：２００；ｍｉｎ．ｇｒａｎｕｌｅ ｉｎｔｅｎｓｉｔｙ：５０；ｗｅｌｌ ｅｄｇｅ ｄｉｓｔａｎｃｅ：２００；ｃｏｎｔｒａｓｔ：１；ｓｉｚｅ：３，０００；ｉｎｔｅｎｓｉｔｙ：２５５；ｒｏｕｇｈｎｅｓｓ：５００；ｇｒａｎｕｌａｒｉｔｙ：１００；ｇｒａｎｕｌｅ ｉｎｔｅｎｓｉｔｙ：２５５；ｇｒａｎｕｌｅ ｃｏｕｎｔ：１０，０００；ｌｏｎｇｉｓｈｎｅｓｓ：１００；ｃｏｍｐａｃｔｎｅｓｓ：１。ＢＶ蛍光の検出には「細胞核」の値を用いた。
ＰＧＣＬＣ増殖のための化合物ライブラリースクリーニング
化合物ライブラリーを、１０μＭ及び１μＭの濃度でスクリーニングした。ＭＭＣで処理したｍ２２０－５細胞を含む９６ウェルプレートを使用した。各９６ウェルプレートにおいて、陰性（ＤＭＳＯのみ）及び陽性（ＬＩＦ）対照を両側に割り当て、化合物を８０ウェルに添加した。ＢＤＦ１－２ ＥＳＣから誘導した２００個のＢＶ（＋）ｄ４ ＰＧＣＬＣを、９６ウェルプレートのウェルに播種し、Ｃｅｌｌａｖｉｓｔａ細胞分析装置により培養１日目（ｃ１）、ｃ３、ｃ５及びｃ７でＢＶ蛍光を測定した。ＢＶ蛍光の検出には、「細胞核」の値を用いた。ｄ４ ＰＧＣＬＣの増殖速度は実験間でわずかに相違していたので、異なる実験からの値を最初の実験から得られた陰性対照の平均値に基づいて調整した。各化合物について、ｃ１とｃ７との間のＢＶ蛍光の倍数差（ｆｏｌｄ ｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅ）を計算し、ネガティブコントロールの平均値の３ＳＤを超える倍数差値を有する化合物を、ＰＧＣＬＣの増殖を増強するものとして同定した。
ｄ４ ＰＧＣＬＣ及びＥ９．５ＰＧＣの増幅培養
ＭＭＣで処理をしたｍ２２０－５フィーダーはフォルスコリンとロリプラムに対して脆弱であったので、ｍ２２０－５細胞をフォルスコリン及びロリプラムの両方を１０μＭ用いて３継代培養して、ＭＭＣ処理（１－２μｇ／ｍｌ、２時間）をする前にこれらの化合物に適応させた。ｄ４ ＰＧＣＬＣ又はＥ９．５ＰＧＣ（ＢＤＦ１×Ｓｔｅｌｌａ－ＥＧＦＰ）をＦＡＣＳで選別し、１０％ＫＳＲ、０．１ｍＭ ＮＥＡＡ、１ｍＭピルビン酸ナトリウム、０．１ｍＭ ２－メルカプトエタノール、１００Ｕ／ｍｌペニシリン、０．１ｍｇ／ｍｌストレプトマイシン、２ｍＭ Ｌ－グルタミン、２．５％ＦＣＳ、１００ｎｇ／ｍｌ ＳＣＦ、１０μＭフォルスコリン、及び１０μＭロリプラムを含有するＧＭＥＭ培地中で、ｍ２２０－５細胞上に播種した。培養培地の半分を２日ごとに交換した。
免疫蛍光
次の抗体を示した希釈液で使用した：ウサギ抗ＭＶＨ（１／２５０；Ａｂｃａｍ ａｂ１３８４０）；ウサギ抗ＤＡＺＬ（１／２５０；Ａｂｃａｍ ａｂ３４１３９）；マウス抗ＯＣＴ４（１／２５０；ＢＤ ６１１２０３）；マウス抗－５ｍＣ（１／５００；Ａｂｃａｍ ａｂ１０８０５）；ウサギ抗Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３（１／５００；Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ ０７－４４９）；ウサギ抗Ｈ３Ｋ９ｍｅ２（１／５００；Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ ０７－４４１）；ウサギ抗ＤＮＭＴ１（１／１００；Ｓａｎｔａ Ｃｒｕｚ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ｓｃ－２０７０１）；マウス抗ＤＮＭＴ３Ａ（１／２００；Ａｂｃａｍ ａｂ１３８８８）；マウス抗ＤＮＭＴ３Ｂ（１／２００；Ｎｏｖｕｓ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｓ ＮＢ１００－５６５１４）；ウサギ抗ＵＨＲＦ１（１／１００；Ｓａｎｔａ Ｃｒｕｚ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ｓｃ－９８８１７）；及びニワトリ抗ＧＦＰ（１／５００；Ａｂｃａｍ ａｂ１３９７０）。Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃから入手した次の二次抗体を１／５００希釈で使用した：Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ５６８ヤギ抗ウサギＩｇＧ；Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ５６８ヤギ抗マウスＩｇＧ；Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ４８８ヤギ抗ニワトリＩｇＧ。Ｆ－アクチンを染色するために、Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ５６８とコンジュゲートしたファロイジン（１／４０、Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ａ１２３８０）を使用した。
免疫蛍光染色のプロトコルは以前報告されている（Ｈａｙａｓｈｉ ｅｔ ａｌ，２０１１；Ｎａｋａｋｉ ｅｔ ａｌ，２０１３）。ＭＶＨ、ＤＡＺＬ及びＯＣＴ４染色のため、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ（ＢＤＦ１－２）をＦＡＣＳで選別し、Ｅ１３．５のオスのＰＧＣと１：１の割合で混合し、Ｃｙｔｏ Ｓｐｉｎ ４（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）を用いて、ＭＡＳでコーティングしたガラススライド上に広げた。Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ６４７とコンジュゲートしたＳＳＥＡ１抗体を用いて、ＦＡＣＳによりＥ１３．５の雄性生殖細胞（ＩＣＲ）を選別した。５ｍＣ、Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３及びＨ３Ｋ９ｍｅ２染色のために、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ（ＢＤＦ１－２）をＦＡＣＳで選別し、１：１の割合でｄ２ ＥｐｉＬＣと混合し、Ｃｙｔｏ Ｓｐｉｎ ４（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）を用いて、ＭＡＳでコーティングしたガラススライド上に広げた。画像を共焦点顕微鏡（Ｚｅｉｓｓ，ＬＳＭ７８０）でキャプチャーし、シグナル強度をＩｍａｇｅＪ（ＮＩＨ）によって解析した。
ｃＡＭＰ濃度の測定
細胞内のｃＡＭＰ濃度を、ｃＡＭＰＧｌｏ Ｍａｘ ａｓｓａｙ ｋｉｔ（Ｐｒｏｍｅｇａ）を用いて、メーカーの説明書に従い測定した。精製されたｃＡＭＰを用いた標準曲線を、Δ相対的な光量（ΔＲＬＵ）（ＲＬＵ［Ｏ ｎＭ］－ＲＬＵ［Ｘ ｎＭ］）を計算することにより作成した。各サンプルについて、１ｘ１０４ ｄ４ ＰＧＣＬＣをフォルスコリン及び／又はロリプラムで３０分間室温で前処理し、ΔＲＬＵ（ＲＬＵ［未処理サンプル］－ＲＬＵ［処理済みサンプル］）を計算した。化学的処理による細胞内のｃＡＭＰレベルの増加は、ｃＡＭＰ標準曲線から推量した。３つの生物学的複製物（ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｒｅｐｌｉｃａｔｅ）を各サンプルについて分析した。
細胞周期分析
Ｅ１３．５、Ｅ１４．５及びＥ１５．５におけるＥＳＣ、ＥｐｉＬＣ、ｄ４、ｄ４ｃ３、ｄ４ｃ５及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ（ＢＤＦ１－２）及び雄性生殖細胞の細胞周期状態を既報（Ｋａｇｉｗａｄａ ｅｔ ａｌ，２０１３）と同様にして調べた。培養細胞を標識するために、細胞をＢｒｄＵ（１０μＭ）と共に３０分間インキュベートした。生殖細胞を標識するために、メスのマウス（ＩＣＲ）をＳｔｅｌｌａ－ＥＧＦＰオスと交配させ、妊娠したメスに１ｍｇのＢｒｄＵを腹腔内注射し、３０分後に胚を回収した。培養細胞又は雄性生殖腺をＴｒｙｐＬＥ処理により単一細胞に分散させた。ＢｒｄＵの取り込みを検出するため、メーカーの説明書に従い、ＡＰＣ－ＢｒｄＵ Ｆｌｏｗ Ｋｉｔ（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）を使用した。染色されたサンプルを、ＦＡＣＳＤｉｖａ（ＢＤ）ｓｏｆｔｗａｒｅと共にＢＤ ＦＡＣＳＡｒｉａＩＩＩ（ＢＤ）を用いて分析し、ＰＧＣＬＣ又は雄性生殖細胞をそれぞれＢＶ又はＳｔｅｌｌａ－ＥＧＦＰの蛍光により同定した。３つの生物学的複製物を各サンプルについて分析した。
Ｗ／Ｗ ｖ マウスの精巣へのＰＧＣＬＣの移植
ＰＧＣＬＣをＦＡＣＳで精製した後、無作為に選択した新生仔（出生後７日）又は成体のＷ／Ｗｖマウスの精巣に、以前報告されたように（Ｃｈｕｍａ ｅｔ ａｌ、２００５）、精巣当たり１×１０４～１×１０５個の細胞を注入した。必要に応じて、免疫抑制のために抗マウスＣＤ４抗体（用量当たり５０ｍｇ、クローンＧＫ１．５；Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ）を０、２又は４日目に腹腔内注射した（Ｋａｎａｔｓｕ－Ｓｈｉｎｏｈａｒａ ｅｔ ａｌ，２００３）。妊娠を評価するため、移植後１０週のレシピエントをＢＤＦ１のメスと交配させた。以前報告されたように（Ｏｈｉｎａｔａ ｅｔ ａｌ，２００８）、ＢＶＳＣトランスジーンの子孫の遺伝子型決定を行った。ＨＥ染色のために、精巣又は精巣上体をブアン溶液で固定し、パラフィンに包埋し、切片を作成した。
体外受精
精子を精巣上体尾部から回収し、ＨＴＦ培地（Ｋｙｕｄｏ Ｃｏ．，Ｌｔｄ．）中で３７℃、１時間プレインキュベートした。ＰＭＳＧ及びｈＣＧを注入することにより過排卵させたＢＤＦ１のメスから卵子を回収し、ＨＴＦ培地中の精子と受精させた。得られた２細胞胚を、妊娠後（ｄｐｃ）０．５日目に偽妊娠ＩＣＲメスの卵管に移した。仔を１８．５ｄｐｃで帝王切開により分娩させた。
ＬａｃＺ染色
精細管をＰＢＳ中の２％パラホルムアルデヒド及び０．２％グルタルアルデヒドで４℃、１時間固定した。ＰＢＳで３回洗浄した後、精細管をＸ－ｇａｌ溶液（０．１％Ｘ－ｇａｌ、０．１％Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ－１００、１ｍＭ ＭｇＣｌ２、３ｍＭ Ｋ４［Ｆｅ（ＣＮ）６］及び３ｍＭ Ｋ３［Ｆｅ（ＣＮ）６］を含むＰＢＳ）で３７℃、２～３時間インキュベートした。
ＰＧＣＬＣにおけるＤＮＡ ＦＩＳＨ及び免疫蛍光－ＤＮＡ ＦＩＳＨ
ＥＳＣ、ＥｐｉＬＣｓ、及びメスのＭＥＦをＴｒｙｐＬＥで解離し、ｄ４、ｄ４ｃ３及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣを、ＦＡＣＳを用いて精製した。細胞サンプルをポリ－Ｌ－リシン（Ｓｉｇｍａ）でコーティングしたガラスカバースリップ上に、少量のＰＢＳ中で移し、固定前に過剰の培地を吸引することにより、カバースリップに接着させた。ＤＮＡ ＦＩＳＨのため、カバースリップ上の細胞サンプルを、３％パラホルムアルデヒド（ＰＦＡ）（ｐＨ７．４）中で１０分間固定し、０．５％Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ－１００／ＰＢＳ中で３分間、氷上で透過処理し、－２０℃で７０％エタノール中に保存した。エタノールの希釈系列で脱水した後、７０％ホルムアミド／２×ＳＳＣ（ｐＨ７．４）中で８０℃、３０分間変性させ、再度氷冷エタノール系列で脱水した。次に、Ｈｕｗｅｌ用の蛍光ＢＡＣプローブ（ＲＰ２４－１５７Ｈ１２）と３７℃で一晩ハイブリダイズさせた。カバースリップをＤＡＰＩ（１μｇ／ｍｌ）で対比染色し、Ｖｅｃｔａｓｈｉｅｌｄ（Ｖｅｃｔｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ）にマウントした。
免疫蛍光とそれに続くＤＮＡ ＦＩＳＨを、既報（Ｃｈａｕｍｅｉｌ ｅｔ ａｌ，２００４，２００８）と同様に行った。カバースリップ上の細胞サンプルを３％ＰＦＡ（ｐＨ７．４）中で、室温で１０分間固定した。０．５％Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ－１００／ＰＢＳ中で、３分間氷上で細胞の透過処理を行った。ＰＢＳで洗浄した後、調製物を１％ＢＳＡ（Ｓｉｇｍａ）／ＰＢＳ中で３０分間ブロッキングし、抗Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３（１／２００；Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）と共に４℃で一晩インキュベートし、次いでＰＢＳで３回洗浄し、Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ４８８抗ウサギの二次抗体（１／５００；Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）で、３０分間室温でインキュベートした。ＰＢＳ中で洗浄した後、調製物を室温で１０分間、４％ＰＦＡ中で固定した後、ＰＢＳで洗浄した。調製物を０．７％Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ－１００、０．１Ｍ ＨＣｌ中で、１０分間氷上でインキュベートした。次いでそれらを２×ＳＳＣ中で、１０分間、室温で２回洗浄した。最後に、調製物を８０℃で３０分間、７０％ホルムアミド／２×ＳＳＣ（ｐＨ７．４）中で変性させ、氷冷２×ＳＳＣ中に浸漬し、上記のＨｕｗｅｌ用の蛍光ＢＡＣプローブとハイブリダイズさせた。
ＲＮＡシーケンシング（ＲＮＡ－ｓｅｑ）
ＲＮＡｅａｓｙ Ｍｉｃｒｏ Ｋｉｔ（Ｑｉａｇｅｎ）を使用して、ＥＳＣ、ＥｐｉＬＣ及びＢＶ及びＳＣ二重陽性（本明細書において「ＢＶＳＣ（＋）」と略記する場合がある）のｄ４、ｄ６、ｄ４ｃ３、ｄ４ｃ５、及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ（各２つの生物学的複製物）から全ＲＮＡを精製した。以前報告されたように（Ｋｕｒｉｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ，２００６）、１０ｎｇ ＲＮＡ（１，０００細胞に当たる）をｃＤＮＡ複製法に供し、以前報告されたように（Ｎａｋａｍｕｒａ ｅｔ ａｌ，２０１５）、３’末端をＳＯＬｉＤ ５５００ｘｌ ｓｙｓｔｅｍでディープシーケンシングした。以前の研究（Ｋａｇｉｗａｄａ ｅｔ ａｌ，２０１３）で調製した、Ｅ１０．５ＰＧＣ、Ｅ１２．５及びＥ１３．５のオス／メスの生殖細胞由来の１ｎｇ ＲＮＡ、並びにＥ９．５ＰＧＣから増幅したｃＤＮＡ（各２つの生物学的複製）もまた、ＲＮＡ－ｓｅｑに供した。
クロマチン免疫沈降シーケンス（ＣｈＩＰ－ｓｅｑ）
ＣｈＩＰ－ｓｅｑを、既報（Ｋｕｒｉｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ，２０１５）と同様に実施した。簡潔に述べると、１×１０５～１×１０６ＢＶ（＋）ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣをＦＡＣＳで精製し、１０分間室温で、１％ホルマリン（Ｓｉｇｍａ）で固定し、続いて１５０ｍＭグリシンでクエンチした。固定した細胞をＰＢＳで洗浄し、１％ＳＤＳを含む溶解緩衝液に溶解し、Ｂｉｏｒｕｐｔｏｒ ＵＣＤ２５０を用いて高出力で３０秒間の１０サイクルで超音波処理した。可溶化したクロマチン画分を、Ｍ２８０ Ｄｙｎａｂｅａｄｓヒツジ抗マウスＩｇＧ（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）と複合体中の、ヒストンＨ３Ｋ４ｍｅ３、Ｈ３Ｋ２７ａｃ、又はＨ３Ｋ２７ｍｅ３に対するマウスモノクローナル抗体（Ｈａｙａｓｈｉ－Ｔａｋａｎａｋａら、２０１１）と共に４℃で一晩回転させながらインキュベートした（各２つの生物学的複製物）。洗浄後、１％ＳＤＳ及び１０ｍＭ ＤＴＴを含有する緩衝液中でクロマチンを溶出させた。溶離液を６５℃、一晩で逆架橋させ、４μｇのプロテイナーゼＫで４５℃、１時間処理し、Ｑｉａｑｕｉｃｋ ＰＣＲ ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｃｏｌｕｍｎ（Ｑｉａｇｅｎ）で精製した。次いで、ＣｈＩＰ処理したＤＮＡ及び入力ＤＮＡを、超音波処理（Ｃｏｖａｒｉｓ、Ｗｏｂｕｒｎ、ＭＡ）により約１５０ｂｐの平均サイズにせん断し、既報（Ｋｕｒｉｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ，２０１５）のＳＯＬｉＤ５５００ｘｌ ｓｙｓｔｅｍでのディープシーケンシングのためのライブラリー調製方法に供した（Ｋｕｒｉｍｏｔｏら、２０１５）。
全ゲノムのバイサルファイトシーケンシング（ｂｉｓｕｌｆｉｔｅ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ）（ＷＧＢＳ）
以前報告されたように（Ｓｈｉｒａｎｅ ｅｔ ａｌ，２０１６）ＷＧＢＳを実施した。簡潔に述べると、１５０ｍＭ ＮａＣｌ、１０ｍＭ ＥＤＴＡ、０．５％ＳＤＳ及び１ｍｇ／ｍＬプロテイナーゼＫを含有する１０ｍＭトリス－Ｃｌ（ｐＨ８．０）で、精製したＢＶ陽性のｄ４ｃ３及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ（各２つの生物学的複製物）を、５５℃で一晩振盪しながら溶解した。この溶解物を１．３２μｇ／ｍｌのＲＮａｓｅ Ａと共に３７℃で１時間インキュベートし、ＴＥで飽和したフェノールで１回、フェノール－クロロホルムで２回、クロロホルムで１回抽出した。ゲノムＤＮＡを等容量のイソプロパノールで沈殿させ、７０％エタノールで２回洗浄し、風乾した後、１０ｍＭトリス－Ｃｌ（ｐＨ８．０）に溶解した。精製したゲノムＤＮＡ（５０ｎｇ）を０．５ｎｇの非メチル化ラムダファージＤＮＡ（Ｐｒｏｍｅｇａ）でスパイクし、以前報告されたような（Ｓｈｉｒａｎｅ ｅｔ ａｌ，２０１６）Ｉｌｌｕｍｉｎａ ＨｉＳｅｑ １５００／２５００システム上でのディープシーケンシングのため、ｐｏｓｔ－ｂｉｓｕｌｆｉｔｅ ａｄａｐｔｏｒ ｔａｇｇｉｎｇ（ＰＢＡＴ）法（Ｍｉｕｒａ ｅｔ ａｌ，２０１２）を用いてバイサルファイト変換及びライブラリー構築に供した。
ＲＮＡ－ｓｅｑのデータ解析
以前に記載されたように（Ｎａｋａｍｕｒａ ｅｔ ａｌ，２０１５）、ｃｕｔａｄａｐｔ ｖ１．３（Ｍａｒｔｉｎ，２０１１）、ｔｏｐｈａｔ ｖ１．４．１／ｂｏｗｔｉｅ ｖ１．０．１（Ｋｉｍ ｅｔ ａｌ，２０１３）、及びｃｕｆｆｌｉｎｋｓ ｖ２．２．０（Ｔｒａｐｎｅｌｌ ｅｔ ａｌ，２０１２）を用いて、ＲＮＡ－ｓｅｑリードデータをマウスｍｍ１０ゲノム上にマッピングし、伸長した転写物の末端部位を有する参照遺伝子にアノテートした。発現レベルをｒｅａｄｓ ｐｅｒ ｍｉｌｌｉｏｎ－ｍａｐｐｅｄ ｒｅａｄｓ（ＲＰＭ）に対して正規化した。有意な発現レベルは、ｌｏｇ２（ＲＰＭ＋１）＞３として定義した。発現レベルの倍数変化（ｆｏｌｄ ｃｈａｎｇｅｓ）が２より大きい場合（即ち、ｌｏｇ２（ＲＰＭ＋１）の差が１より大きい場合）、遺伝子は差次的に発現されるとみなした。少なくとも１つの試料において有意に発現し、少なくとも１対の比較（１０，４３７遺伝子）で差次的に発現された遺伝子を、主成分分析（ＰＣＡ）及びｕｎｓｕｐｅｒｖｉｓｅｄ ｈｉｅｒａｒｃｈｉｃａｌ ｃｌｕｓｔｅｒｉｎｇ（ＵＨＣ）に使用した。差次的に発現される遺伝子のＧｅｎｅｏｎｔｏｌｏｇｙ（ＧＯ）（Ａｓｈｂｕｒｎｅｒ ｅｔ ａｌ，２０００）を、ＤＡＶＩＤプログラム（Ｈｕａｎｇ ｄａ ｅｔ ａｌ，２００９）を用いて分析した。
ＣｈＩＰ－ｓｅｑのデータ解析
以前報告されたように（Ｋｕｒｉｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ，２０１５）、ｂｏｗｔｉｅ ｖ１．１．２（Ｌａｎｇｍｅａｄ ｅｔ ａｌ，２００９），ｐｉｃａｒｄ－ｔｏｏｌｓ ｖ２．１．０（ｈｔｔｐ：／／ｂｒｏａｄｉｎｓｔｉｔｕｔｅ．ｇｉｔｈｕｂ．ｉｏ／ｐｉｃａｒｄ／）、ＩＧＶｔｏｏｌｓ ｖ２．３．５２（Ｒｏｂｉｎｓｏｎ ｅｔ ａｌ，２０１１）、ｓａｍｔｏｏｌｓ ｖ１．３（Ｌｉ ｅｔ ａｌ，２００９）、及びＭＡＣＳ ｖ２．１．０（Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ，２００８）を用いて、ＥＳＣ、ＥｐｉＬＣ、ｄ６ ＰＧＣＬＣ（Ｋｕｒｉｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ，２０１５）、及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣのリードデータを、マウスｍｍ１０ゲノム上にマッピングし、分析した。リードパターンをＩＧＶにより可視化した（Ｒｏｂｉｎｓｏｎ ｅｔ ａｌ、２０１１）。
近接（１ｋｂ以内）で検出されたＰ値が１０－５未満のＨ３Ｋ４ｍｅ３ピークを単一のピークとして結合し、中心からの５００ｂｐ内のピークのリード密度をＩｎｐｕｔのもので正規化した（それらの５００ｂｐ以上及び５ｋｂ以内）（ＩＰ／入力レベル）。ＴＳＳから２ｋｂ以内に位置するＩＰ／入力レベルの最も高いＨ３Ｋ４ｍｅ３ピークをＴＳＳに関連したピークとみなした。ＴＳＳに関連したＨ３Ｋ４ｍｅ３ピークのＩＰ／入力レベルは、有意な発現レベルの９５パーセンタイルを有する遺伝子に関連するものに対してさらに正規化し、Ｈ３Ｋ４ｍｅ３レベルとして定義した。
近接（１ｋｂ以内）で検出されたＰ値が１０－２０より小さいＨ３Ｋ２７ａｃピークを単一のピークとして結合した。中央から５００ｂｐ以内のピークのリード密度を、ｌｏｇ２ ＩＰ／入力レベルの平均値に対して正規化し、Ｈ３Ｋ２７ａｃレベルとして定義した。Ｈ３Ｋ２７ａｃレベルの倍数変化が２より大きい場合、Ｈ３Ｋ２７ａｃピークはｄ６－又はｄ４ｃ７に偏っていると考えた。
ＴＳＳ（１ｋｂ以内）及びＴＳＳに関連したＨ３Ｋ４ｍｅ３ピーク周辺の領域のＨ３Ｋ２７ｍｅ３のリード密度を、Ｉｎｐｕｔによって正規化し、Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３を定義するため、ｌｏｇ２（ＲＰＭ＋１）が２．５より大きく３．５より小さい発現レベルを有する遺伝子のＴＳＳの周辺のＨ３Ｋ２７ｍｅ３のＩＰ／入力レベルの平均に対して正規化した。
ＷＧＢＳのデータ分析
アダプタートリミング、マウスｍｍ１０ゲノムへのマッピング、及びＷＧＢＳデータの分析を、Ｔｒｉｍ Ｇａｌｏｒｅ！ ｖ０．４．１（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ．ｂａｂｒａｈａｍ．ａｃ．ｕｋ／ｐｒｏｊｅｃｔｓ／ｔｒｉｍ＿ｇａｌｏｒｅ／）、ｃｕｔａｄａｐｔ ｖ１．９．１、及びＢｉｓｍａｒｋ ｖ０．１５．０（Ｋｒｕｅｇｅｒ ＆ Ａｎｄｒｅｗｓ，２０１１）、ｂｏｗｔｉｅ ｖ１．１．２及びＲプログラムを使用して、既報（Ｓｈｉｒａｎｅ ｅｔ ａｌ，２０１６）と同様に実施した。バイサルファイト変換率は、陽性対照としてのラムダファージゲノムを使用して、＞９９．５％と見積もった。
以前報告したように（ＨＣＰ、ＩＣＰ及びＬＣＰ）（Ｂｏｒｇｅｌ ｅｔ ａｌ、２０１０）、プロモーターを、転写開始部位から０．９ｋｂ上流及び０．４ｋｂ下流の領域として定義し、ＧＣ含量及びＣｐＧ密度に応じて３つのカテゴリーに分類した。少なくとも５個のＣｐＧを有するプロモーターを、メチル化分析に使用した。Ｅ１２．５胚で定義されたＩＣＲの座標を、従前の刊行物（Ｔｏｍｉｚａｗａ ｅｔ ａｌ、２０１１）から得た。反復因子のメチル化分析のために、処理されたリードを反復コンセンサス配列（Ｓｈｉｒａｎｅ ｅｔ ａｌ、２０１６）にマッピングし、そして少なくとも４リードをカバーするＣｐＧ部位を使用した。ＲｅｐｅａｔＭａｓｋｅｒ（Ｓｍｉｔ、ＡＦＡ、Ｈｕｂｌｅｙ、Ｒ＆Ｇｒｅｅｎ、Ｐ．Ｒｅｐｅａｔ－Ｍａｓｋｅｒ Ｏｐｅｎ－４．０。２０１３－２０１５ ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｒｅｐｅａｔｍａｓｋｅｒ．ｏｒｇ）を使用して、リピートと重複しているユニークにマッピングされた領域を定義した。ユニークにマッピングされた全ゲノム領域の分析のために、１ｋｂの重複を有する２ｋｂのスライドウィンドウにおける５ｍＣレベルを計算した。
ユニークにマッピングされた領域のメチル化分析のために、４未満のリードと２００以上のリードをカバーしたＣｐＧ部位を除外した。従って、メチル化／非メチル化シトシンをコールするための最少配列深度は、４であった。反復因子のメチル化分析のために、処理されたリードを反復コンセンサス配列（ＲｅｐＢａｓｅ１９．０．４）にマッピングし、そして少なくとも５リードをカバーするＣｐＧ部位を使用した。
アクセッション番号
ｄ４ｃ３／ｄ４ｃ５／ｄ４ｃ ＰＧＣＬＣ及びＥ９．５／Ｅ１２．５生殖細胞のＲＮＡ配列データに関するアクセッション番号は、ＧＳＥ８７６４４（ＧＥＯデータベース）である。ＥＳＣ／ＥｐｉＬＣ／ｄ４／ｄ６ ＰＧＣＬＣ［ＢＶＳＣ（＋）］（ＧＳＥ６７２５９）及びＥ１０．５／Ｅ１１．５／Ｅ１３．５生殖細胞（ＧＳＥ７４０９４）のＲＮＡ配列データを、ＧＥＯデータベースからダウンロードした。ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣのＨ３Ｋ４ｍｅ３、Ｈ３Ｋ２７ａｃ、及びＨ３Ｋ２７ｍｅ３のＣｈＩＰ配列データに関するアクセッション番号は、ＧＳＥ８７６４５（ＧＥＯデータベース）である。
ＥＳＣ／ＥｐｉＬＣ／ｄ２／ｄ４／ｄ６ ＰＧＣＬＣ（ＧＳＥ６０２０４）のＨ３Ｋ４ｍｅ３、Ｈ３Ｋ２７ａｃ、Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３のＣｈＩＰ配列データを、ＧＥＯデータベースからダウンロードした。ｄ４ｃ３／ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣのＷＧＢＳ配列データのアクセッション番号は、ＤＲＡ００５１６６（ＤＤＢＪデータベース）である。ＥＳＣ／ＥｐｉＬＣ／ｄ２／ｄ４／ｄ６ ＰＧＣＬＣ（ＤＲＡ００３４７１）及びＥ１０．５／Ｅ１３．５ ＰＧＣ（ＤＲＡ０００６０７）のＷＧＢＳ配列データを、ＤＤＢＪデータベースからダウンロードした。
＜結果＞
ＰＧＣＬＣを増幅する化合物のスクリーニング
Ｂｌｉｍｐ１－ｍＶｅｎｕｓ及びＳｔｅｌｌａ－ＥＣＦＰ（以下、Ｂｌｉｍｐ１－ｍＶｅｎｕｓをＢＶ、Ｓｔｅｌｌａ－ＥＣＦＰをＳＣともいう）トランスジーン（Ｏｈｉｎａｔａ ｅｔ ａｌ、２００８）を有するいくつかの新規なマウス胚性幹細胞（ＥＳＣ）の雄性幹細胞株を得て、ＰＧＣＬＣの誘導および増殖に対するそれらの効率を評価した。すべてのＥＳＣ株は、アクチビンＡ（ＡｃｔＡ）及び塩基性線維芽細胞成長因子（ｂＦＧＦ）によりＥｐｉＬＣに誘導され、骨形成タンパク質４（ＢＭＰ４）、白血病抑制因子（ＬＩＦ）、幹細胞因子（ＳＣＦ）、及び上皮成長因子（ＥＧＦ）によりＢＶ陽性もしくはＢＶ及びＳＣ二重陽性（本明細書において「ＢＶ／ＢＶＳＣ（＋）」と略記する場合がある）のＰＧＣＬＣに誘導された。浮遊凝集体中のＢＶ（＋）ＰＧＣＬＣの数は、誘導の６日目（ｄ６）または８日目（ｄ８）まで増加し、その後減少した。これは、本発明者らの以前の報告（Ｈａｙａｓｈｉ ｅｔ ａｌ、２０１１）と一致する。評価した株の中で、ＢＶＳＣ ＢＤＦ１－２は、浮遊凝集体中で最も強固な誘導および増殖を示した。この株をその後のスクリーニングに用いた。
浮遊凝集物中で増殖期にあると思われるｄ４ ＰＧＣＬＣを、ＰＧＣの生存を支持することが知られている膜結合型のＳＣＦを発現するｍ２２０フィーダー（Ｄｏｌｃｉ ｅｔ ａｌ，１９９１；Ｍａｊｕｍｄａｒ ｅｔ ａｌ，１９９４）とともに、９６ウェルプレート上に播種することとした。また、細胞分析装置を用いて、ＢＶ（＋）ＰＧＣＬＣの増殖を増強する化合物をスクリーニングすることとした（図１Ａ）。ＥＳＣやＥＧＣはＢｌｉｍｐ１もしくはＢＶを発現しないか低くしか発現しないため（Ｄｕｒｃｏｖａ－Ｈｉｌｌｓ ｅｔ ａｌ，２００８；Ｏｈｉｎａｔａ ｅｔ ａｌ，２００８；Ｈａｙａｓｈｉ ｅｔ ａｌ，２０１１）、ＢＶ陽性は、ＰＧＣＬＣの増殖を、胚性生殖細胞（ＥＧＣ）へのＰＧＣＬＣ脱分化と区別すると推論された（Ｍａｔｓｕｉ ｅｔ ａｌ，１９９２）。ｍ２２０細胞は、フィーダーとしてそれらの調製に必要とされるマイトマイシンＣ（ＭＭＣ）処理に対して非常に脆弱であったので、ＭＭＣ処理に耐性を有するｍ２２０亜系統株（ｓｕｂｌｉｎｅ）をクローン化して用いた。選択された条件下で、ＰＧＣの増殖を刺激することが知られている古典的な因子であるＬＩＦ（Ｍａｔｓｕｉ ｅｔ ａｌ，１９９１）を用いて、７日間の培養後に、ＢＶ蛍光の対応する増加として、ＰＧＣＬＣの増殖を細胞分析装置により首尾よくモニタリングした。この単純な陽性対照条件下で、ＰＧＣＬＣのＥＧＣへの脱分化は、ほとんど又は全くないことが確認された。従って、７日間の培養後にＢＶ（＋）ｄ４ ＰＧＣＬＣを増幅する能力について、細胞内シグナル伝達分子／経路の多様なセットを標的とする、合計約２，０００の化合物のスクリーニングを行った。その結果、１０μＭの濃度で、陰性対照培養と比較してＢＶ（＋）細胞を有意に増幅した６３の化合物を同定した。培養１日目と７日目との間のＢＶ蛍光の倍数差（ｆｏｌｄ ｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅ）は、陰性対照の平均値の３ＳＤ（標準偏差）よりも大きかった（図１Ｂ及びＣ）。特に、上位２５のヒットした化合物のうち、５つ（２０％）はホスホジエステラーゼ４（ＰＤＥ４）に対する選択的阻害薬［イブジラスト、Ｓ－（＋）－ロリプラム、ロリプラム、ＧＳＫ２５６０６６、シロミラスト］、３つ（１２％）はレチノイン酸（ＲＡ）シグナル伝達に対するアゴニスト（アシトレチン、ＴＴＮＰＢ、レチノイン酸）であり、１つはフォルスコリンであった（図１Ｄ）。ＰＤＥ４はサイクリックＡＭＰ（ｃＡＭＰ）のＡＭＰへの加水分解を触媒し、したがってＰＤＥ４阻害薬は細胞内ｃＡＭＰレベルを増加させる（Ｐｉｅｒｒｅら、２００９；Ｋｅｒａｖｉｓ＆Ｌｕｇｎｉｅｒ、２０１２）。フォルスコリンはアデニレートシクラーゼの強力な活性化因子であり、したがって細胞内ｃＡＭＰレベルも上昇させる（Ｐｉｅｒｒｅ ｅｔ ａｌ、２００９）。ＲＡシグナル伝達およびフォルスコリンは、ＰＧＣの増殖を刺激することが知られている（Ｄｅ Ｆｅｌｉｃｉ ｅｔ ａｌ，１９９３；Ｋｏｓｈｉｍｉｚｕ ｅｔ ａｌ，１９９５）。他のＰＤＥに対する選択的阻害薬又はＰＤＥに対する非選択的阻害薬は、ＰＧＣＬＣの増殖に対して正の効果を示さなかった。図１Ｃは、培養７日目の、ＰＤＥ４阻害薬、ＧＳＫ２５６０６６の存在下でのＢＶ（＋）細胞の増殖を示し、独特の平坦な形態を有する複数のコロニーの形成を明らかにするものである。同じ化合物ライブラリーのいくつかを用いて、１μＭの濃度で同様のスクリーニングを行ったところ、同じクラスの化合物（ＰＤＥ４の選択的阻害薬、ＲＡシグナル伝達のアゴニスト、及びフォルスコリン）をＰＧＣＬＣ増殖の強力な刺激物質として同定した。
また、１０および１μＭスクリーニングからそれぞれ、ＢＶ（＋）細胞の増殖または生存に負の影響を及ぼす４２６および１７８の化合物を同定した（培養１日目と７日目との間のＢＶ蛍光の倍数減少（ｆｏｌｄ ｒｅｄｕｃｔｉｏｎｓ）は、陰性対照の平均値の３ＳＤよりも大きかった：図１ＢおよびＥ）。そのような化合物は、受容体チロシンキナーゼ（ＲＴＫ）シグナル伝達、ホスファチジルイノシトール３キナーゼ（ＰＩ３Ｋ）シグナル伝達、哺乳類ラパマイシン標的（ｍＴＯＲ）シグナル伝達、Ｊａｎｕｓキナーゼ（ＪＡＫ）シグナル伝達、およびＡＫＴシグナル伝達に対する経路［ｒｅｖｉｅｗｅｄ ｉｎ（Ｓａｉｔｏｕ ＆ Ｙａｍａｊｉ，２０１２）］のような、ＰＧＣ増殖／生存に正の影響を及ぼすことが知られているものを含む、主要なシグナル伝達経路の阻害薬、ならびに細胞周期／細胞分裂およびＤＮＡ複製／修復のための阻害薬を含む。まとめると、これらの知見は、スクリーニングがＰＧＣの増殖／生存に関連する主要な経路に影響を与える化合物を首尾よく同定したことを強く示している。
ＰＧＣＬＣ増幅に対するロリプラム及びフォルスコリンの相乗効果
ヒットした化合物の中で、ＰＤＥ４阻害薬が最も濃縮された化合物であったため（図１Ｄ）、その後の研究において、ＰＤＥ４阻害薬の１つであるロリプラムの効果に焦点を当てることにした。ロリプラムは、効率的なＰＤＥ４阻害薬として、多様な実験において再現性よく使用されている（Ｋｅｒａｖｉｓ＆Ｌｕｇｎｉｅｒ、２０１２）。ｍ２２０フィーダー上のＳＣＦの存在下でＧＭＥＭ／１０％ＫＳＲ／２．５％ＦＣＳ中のＢＶＳＣ ＢＤＦ１－２ ＥＳＣから誘導されたｄ４ ＰＧＣＬＣの増殖について、ロリプラム、フォルスコリン及びそれらの併用（異なるメカニズムにより、両方とも細胞内ｃＡＭＰ濃度を増加させる）（Ｐｉｅｒｒｅ ｅｔ ａｌ、２００９）の効果を評価した。ＬＩＦはＰＧＣ増殖の他の刺激因子とともに適用した場合、ＰＧＣＬＣのＥＧＣへの脱分化を高める可能性があるので（Ｍａｔｓｕｉ ｅｔ ａｌ，１９９２）、この培養物に含めないこととした。ロリプラム単独（１０μＭ）の効果は、比較的軽度であり、フォルスコリン単独（１０μＭ）の効果と同様であった（図２Ａ）。しかし、ロリプラムとフォルスコリンを併用すると、ｄ４ ＰＧＣＬＣの増殖を効果的に刺激した：ロリプラムとフォルスコリンの両方を１０μＭとすると（ＦＲ１０）、ｄ４ ＰＧＣＬＣは培養７日目（ｄ４ｃ７）まで少なくとも強く安定した増殖を示し、４から５回の倍加に相当する２０倍以上増加した（図２Ａ－Ｃ）。重要なことに、増幅された細胞は平らなコロニーを形成し、ＢＶＳＣを強く発現し続け、顕著な糸状仮足および鞭毛腺腫を伴う運動細胞の特徴を示したことから（図２Ｂ及びＤ）、ＦＲ１０による増幅後に移動期ＰＧＣの特性を維持していることが示唆される。
フォルスコリン及びロリプラムが実際にＰＧＣＬＣ中のｃＡＭＰ濃度を上昇させるかどうかを調べるために、フォルスコリン、ロリプラム、またはその両方に応答するＰＧＣＬＣのｃＡＭＰ濃度の増加を測定した。図２Ｅに示すように、フォルスコリンとロリプラムとは、独立して、ＰＧＣＬＣ中のｃＡＭＰ濃度を約４ｎＭ／１ｘ１０４ ｄ４ ＰＧＣＬＣに増加させた。より顕著には、フォルスコリンとロリプラムを同時に添加すると（ＦＲ１０）、ＰＧＣＬＣ中のｃＡＭＰ濃度が約４０ｎＭ／１×１０４ ｄ４ ＰＧＣＬＣ超に上昇した。
ＦＲ１０は、他の雄性及び雌性のＥＳＣ株から誘導されたＰＧＣＬＣを、培養７日目で約２０倍の平均増幅率（ａｖｅｒａｇｅ ｅｘｐａｎｓｉｏｎ ｒａｔｅ）で増幅するのに有効であった。場合によっては、ＰＧＣＬＣを約５０倍に増幅し、これは５－６回の倍加に相当した（図２Ｃ）。ＦＲ１０はまた、Ｅ９．５でのＰＧＣの増幅にも有効であったが、幾分限定された程度までであり（最大約８倍の増幅、図２Ｃ）、これは、胚から直接単離されたＥ９．５ＰＧＣとインビトロでＰＳＣから誘導されたｄ４ ＰＧＣとの間の現在の条件下での生存性の差によるものであろう。細胞周期分析は、培養７日目でＳおよびＧ２／Ｍ期のわずかな減少、及び明らかな対応する増加を伴って、培養されたＰＧＣＬＣの大部分（＞約６０％）がＳ期にあることを明らかにした（図２Ｆ及びＨ）。これは、Ｅ１３．５後のＧ０／Ｇ１期に増殖が停止し、阻止された胚生殖腺における雄生殖細胞の細胞周期特性（Ｗｅｓｔｅｒｎ ｅｔ ａｌ，２００８）とは著しく対照的である（図２Ｇ及びＨ）。これらの知見は、ロリプラムとフォルスコリンがＰＧＣＬＣの細胞周期を進行させるために相乗的に作用することを示すものであり、おそらくｃＡＭＰシグナル伝達の強固な活性化を介して起こるものである。
増幅培養されたＰＧＣＬＣの精子形成の強力な能力
次に、培養中にＦＲ１０により増幅されたＰＧＣＬＣがＰＧＣ／ＰＧＣＬＣとしての機能を維持するかどうかを評価した。この目的のために、ＢＶＳＣ ＢＤＦ１－２、ＢＣＦ１－２、又はＲ８（主にＣ５７ＢＬ／６）ＥＳＣｓから誘発されたｄ４ｃ７及びｄ４ ＰＧＣＬＣを、内因性生殖細胞を欠く新生児Ｗ／Ｗｖマウスの精巣に移植した。ＢＶＳＣ ＢＤＦ１－２又はＢＣＦ１－２ ＥＳＣから誘導されたｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ及びｄ４ ＰＧＣＬＣを移植した精巣は、移植７ヶ月後に顕著な大きさの増大を示し（図３Ａ）、精子形成の証拠を伴う多数の精細管を含み、実際に豊富な精子を産生した（図３Ｂ－Ｆ）。注目すべきことに、ＢＶＳＣ ＢＤＦ１－２又はＢＣＦ１－２ＥＳＣ由来のｄ４ｃ７及びｄ４ ＰＧＣＬＣの両方による精子形成の回復は、精子が精巣上体に輸送されるほど顕著になり、そのような精子は、明らかに正常な子孫を産生するために体外受精（ＩＶＦ）に使用される頑強な運動性を獲得した（図３Ｇ－Ｋ）。したがって、ＢＶＳＣ ＢＤＦ１－２またはＢＣＦ１－２ ＥＳＣ由来のｄ４ｃ７及びｄ４ ＰＧＣＬＣのレシピエントの雄は、自然交配によって実質的に同腹仔の大きさの子孫を産生することができ、得られた子孫は明らかに正常な成長を示した（図３Ｌ－Ｎ）。
対照的に、ＢＶＳＣ Ｒ８ ＥＳＣ由来のｄ４ｃ７又はｄ４ ＰＧＣＬＣを移植した精巣は、サイズのおだやかな増加しか示さず、精子形成を伴う精細管の数が少なくなり、得られた精子は精巣上体に達しなかった。それにもかかわらず、以前に報告したように（Ｈａｙａｓｈｉ ｅｔ ａｌ、２０１１）、得られた精子の細胞質内注入（ＩＣＳＩ）で明らかに正常な子孫を得ることができた。重要なことに、ｄ４／ｄ６ ＰＧＣＬＣ又はＰＧＣ（Ｏｈｔａら、２００４）の場合のように、いずれのＥＳＣ株から誘導されたｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣも成体精巣に定着できなかった。移植のいずれにおいても奇形腫の形成は認められなかった。まとめると、これらの知見は、培養中にＦＲ１０により増幅されたＰＧＣＬＣが本来の機能特性を忠実に維持し、ハイブリッドな遺伝的バックグラウンドを有するＰＧＣＬＣが不妊マウスの精子形成を再構成するのに十分強力であるため、レシピエントマウスが自然交配により子孫を産生することを示す。
増幅培養中のＰＧＣＬＣの転写特性
次に、増幅培養中のＰＧＣＬＣの詳細な転写特性（ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌ ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ）を決定した。第１に、免疫蛍光（ＩＦ）分析により、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣは、Ｅ１３．５の雄性生殖細胞と比較して、より高いレベルのＯＣＴ４を発現する一方で、ＰＧＣが胚性腺のコロニー形成後に徐々にアップレギュレートする主要な翻訳調節因子であるＤＤＸ４およびＤＡＺＬ（Ｆｕｊｉｗａｒａら、１９９４；Ｃｏｏｋｅら、１９９６）をより低いレベルで発現することが明らかになった（いくつかのｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣはＤＡＺＬを完全に発現するようであった）（図４Ａ）。第２に、ＲＮＡシーケンシング（ＲＮＡ－ｓｅｑ）法（Ｎａｋａｍｕｒａ ｅｔ ａｌ、２０１５、２０１６）により、培養したＰＧＣＬＣ［ＢＶＣ Ｒ８ ＥＳＣから誘導されたｄ４ｃ３、ｄ４ｃ５及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ］の転写物を決定し、それらをＥＳＣ、ＥｐｉＬＣ、ｄ４／６ ＰＧＣＬＣ、及び生殖細胞［Ｅ９．５、Ｅ１０．５及びＥ１１．５のＰＧＣ；Ｅ１２．５及びＥ１３．５の雄性／雌性生殖細胞（Ｋａｇｉｗａｄａ ｅｔ ａｌ，２０１３）］の転写物と比較した。注目すべきことに、主成分分析（ＰＣＡ）は、培養したＰＧＣＬＣをｄ４／６ＰＧＣＬＣと、次いでＥ９．５、Ｅ１０．５及びＥ１１．５ＰＧＣと、近くでクラスター化したが、Ｅ１２．５及びＥ１３．５雌雄／雌性生殖細胞とは遠く離れており（図４Ｂ）、これは、ＰＧＣＬＣは、その増幅培養中にトランスクリプトームを完全に維持することを示す。一方、ｕｎｓｕｐｅｒｖｉｓｅｄ ｈｉｅｒａｒｃｈｉｃａｌ ｃｌｕｓｔｅｒｉｎｇ（ＵＨＣ）及びＰＧＣＬＣ間のＰＣＡは、ｄ４からｄ６へ、次いでｄ４ｃ３、ｄ４ｃ５、およびｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣへのＰＧＣＬＣｓの特性の漸進的な移行を明らかにした。したがって、増幅培養中、ＰＧＣＬＣは指向性の転写変化（ｄｉｒｅｃｔｉｏｎａｌ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌ ｃｈａｎｇｅ）を起こすようであり、その初期段階は浮動集合体でも現れる。ｄ４ｃ７及びｄ６ ＰＧＣＬＣの間、ならびにＥ１３．５及びｄ６ ＰＧＣＬＣ雄性／雌性生殖細胞の間に差次的に発現される遺伝子（ＤＥＧ）を同定した。ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣは、４７８および４０９遺伝子をそれぞれアップ／ダウンレギュレートし、アップレギュレートされた遺伝子は、「細胞内シグナル伝達カスケード」及び「パターン特定プロセス」などのｇｅｎｅ ｏｎｔｏｌｏｇｙ（ＧＯ）機能的タームを有するものでエンリッチされていた。ＰＣＡと一致して、Ｅ１３．５及びｄ６ ＰＧＣＬＣ雄性／雌性生殖細胞間のＤＥＧは、数がはるかに大きかった（図４Ｃ及びＤ）。Ｅ１３．５雄性／雌性生殖細胞は、２，３８１及び１，７０５の遺伝子をそれぞれアップ／ダウンレギュレートし、これらのＤＥＧは、生殖細胞発生中の主要な発生進行を反映するＧＯタームのエンリッチメントを示した。例えば、雄性で特異的にアップレギュレートされる遺伝子は、「転写」（Ｆｏｘｏ１、Ｕｔｆ１、Ｐｏｕ６ｆ１）および「クロマチン構成」（Ｅｚｈ１、Ｐｒｍｔ５、Ｋｄｍ２ａ）でエンリッチされ、雌性で特異的にアップレギュレートされる遺伝子は、「転写の調節」（Ｇａｔａ２、Ｍｓｘ１、Ｃｄｘ２）および「配偶子世代」（Ｆｉｇｌａ、Ｎｒ６ａ１、Ｒｅｃ８）でエンリッチされ、特に、雄性及び雌性の両方において一般にアップレギュレートされる遺伝子は、「減数分裂」（Ｓｐｏ１１、Ｍａｅｌ、Ｓｙｃｐ１）、「染色体編成」（Ｅｈｍｔ１、Ｓｕｖ３９ｈ１、Ｓｍａｒｃｃ１）、および「メチル化」（Ｐｉｗｉｌ４、Ｓａｔｂ１）したがって、減数分裂およびトランスポゾン抑制のような生殖系列機能に関与する遺伝子として以前に同定され、主にＤＮＡメチル化によって体細胞で抑制されている、いわゆる「生殖系列遺伝子」に対してエンリッチされた。
ＰＧＣＬＣ間のＵＨＣおよびＰＣＡと一致して、ｄ４ｃ７及びｄ６ ＰＧＣＬＣ間のＤＥＧは、培養中にこのような状態を漸進的に獲得し（図４Ｅ）、特にｉｎ ｖｉｖｏでの胚細胞発生中に進行性のアップ／ダウンレギュレーションも示した（図４Ｅ）。それらは少数部分を構成し、その大部分はＥ１３．５およびｄ６ ＰＧＣＬＣにおける雄性／雌性生殖細胞間のＤＥＧに含まれていた（図４ＣおよびＤ）。重要なことに、これらは、性特異的制御のバイアスを示さなかった（図４Ｃ及びＤ）。ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ及びｄ６ ＰＧＣＬＣの間のＤＥＧ、ならびにＥ１３．５及びｄ６ ＰＧＣＬＣでの雄性／雌性生殖細胞間のＤＥＧの間の関係のより詳細な洞察を得るために、Ｅ１３．５及びｄ４ ＰＧＣＬＣにおける雄性／雌性生殖細胞間の発現レベル差を、Ｅ１３．５及びｄ６ ＰＧＣＬＣでの雌性／雌性生殖細胞間の発現レベル差に対してプロットした（図４Ｆ）。この分析により、ｄ６ ＰＧＣＬＣと比較して、Ｅ１３．５およびｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣでの雄性／雌性生殖細胞において一般にアップレギュレートされる３０６の遺伝子のうち、１０４の遺伝子が部分的にのみ活性化され（Ｅ１３．５－ｄ４ｃ７＞２倍）、１９７個の遺伝子が完全にｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣにおいて活性化された（－２倍＜Ｅ１３．５－ｄ４ｃ７＜２倍）（図４Ｆ）ことが明らかになった。前者はＤｄｘ４、Ｄａｚｌ、Ｂｒｄｔ、Ａｓｚ１、Ｄｍｒｔ１、Ｓｔｒａ８、Ｓｙｃｐ３、Ｓｙｃｅ１及びＳｍｃ１ｂなどの遺伝子を含み、「生殖系列遺伝子」でエンリッチされ、後者はＰｉｗｉｌ２、Ｒｐｌ１０ｌ、Ｒｐｌ３６及びＲｈｏｘ遺伝子を含んだ（図４Ｆ）。一方、ｄ６ ＰＧＣＬＣと比較して、Ｅ１３．５およびｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣでの雄性／雌性生殖細胞において一般にダウンレギュレートされる２５２の遺伝子のうち、６８の遺伝子は部分的にのみダウンレギュレートされ（Ｅ１３．５－ｄ４ｃ７＜－２倍）、１８０の遺伝子はｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣにおいて完全にダウンレギュレートされた（－２倍＜Ｅ１３．５－ｄ４ｃ７＜２倍）。これらの知見は、増幅中に、ＰＧＣＬＣは、移動期ＰＧＣの特性を本質的に維持しながら、性分化の前に胚性腺で現れる生殖細胞成熟プログラムの一部を徐々に獲得することを実証している。
増幅培養中のＰＧＣＬＣのエピジェネティック特性
培養されたＰＧＣＬＣの特性を支配するメカニズムを探索するために、それらのエピジェネティックプロファイルを決定した。ＩＦ分析により、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣは、ＥｐｉＬＣと比較して、５メチルシトロン（５ｍＣ）レベルが低いことが明らかになった（図５Ａ）。トランスクリプトーム解析の結果と一致して、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣは、ＥｐｉＬＣと比較して、同様のレベルのＤＮＭＴ１を発現したが、ＤＮＭＴ３Ａ／３Ｂ及びＵＨＲＦ１のレベルがはるかに低かった（図５Ｂ）。さらに、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣは、ＥｐｉＬＣと比較して、ヒストンＨ３リジン２７三メチル化［Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３：ポリコーム複合体２（ＰＲＣ２）による抑制を表す］レベル及びＨ３Ｋ９ジメチル化［Ｈ３Ｋ９ｍｅ２：Ｇ９Ａ／ＧＬＰによる抑制を表す］レベルが、それぞれ高く及び低かった（図５Ａ）。したがって、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣのエピジェネティック特性は、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣがｄ６ＰＧＣＬＣよりも５ｍＣレベルがはるかに低いと思われる点を除き、ｄ６ ＰＧＣＬＣのエピジェネティック特性（Ｈａｙａｓｈｉ ｅｔ ａｌ、２０１１；Ｋｕｒｉｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ、２０１５）と著しく類似しているようであった。
そこで、全ゲノムのバイサルファイトシーケンシング（ＷＧＢＳ）により、（ＢＶＳＣ Ｒ８ ＥＳＣから誘導された）ｄ４ｃ３及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣにおけるＤＮＡメチル化のゲノムワイドレベルおよび分布を定量し、また、クロマチン免疫沈降シーケンス（ＣｈＩＰ－ｓｅｑ）に続いて大規模なパラレルシーケンスにより、（ＢＶＳＣ Ｒ８またはＢＤＦ１－２ＥＳＣから誘導される）ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣにおけるＨ３Ｋ４ｍｅ３（プロモーター活性を示す）、Ｈ３Ｋ２７アセチル化（ａｃ）（活性エンハンサーを示す）、及びＨ３Ｋ２７ｍｅ３のゲノムワイドレベルおよび分布を定量し、さらに、最近報告されたＰＧＣＬＣの誘導の間の主要な細胞型（ＥＳＣｓ、ＥｐｉＬＣｓ、ならびにｄ２、ｄ４及びｄ６ ＰＧＣＬＣ）のデータ（Ｋｕｒｉｍｏｔｏら、２０１５；Ｓｈｉｒａｎｅら、２０１６）と比較して、これらのデータを分析した。バイサルファイトシーケンシングは５ｍＣ及び５－ヒドロキシメチルシトシン（５ｈｍＣ）を区別せず（Ｈａｙａｔｓｕ＆Ｓｈｉｒａｇａｍｉ、１９７９）、また、ＰＧＣＬＣの誘導の間の５ｈｍＣレベルはほとんど無視できるので（Ｓｈｉｒａｎｅ ｅｔ ａｌ、２０１６）、以下、５ｍＣと５ｈｍＣを総称して５ｍＣとする。図５Ｃは、Ｐｒｄｍ１４遺伝子座およびＨｏｘｂクラスター周辺のＷＧＢＳおよびＣｈＩＰ－ｓｅｑトラック遷移を示す。活性型（Ｈ３Ｋ４ｍｅ３およびＨ３Ｋ２７ａｃ）および抑制型（Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３）ヒストン修飾の両方が、ｄ６およびｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ間で比較的類似の分布を示した（図５Ｃ）一方で、ＩＦ分析と一致して、著しく、ＰＧＣＬＣの培養中に両座において５ｍＣがほぼ完全に消去された。これは、ＰＧＣＬＣの増幅が、ヒストン修飾を維持しながら、徐々に５ｍＣを消去するプロセスであることを示唆している。
培養したＰＧＣＬＣにおける包括的なＤＮＡメチル化消去
次に、ＰＧＣＬＣ培養中の５ｍＣレベルの動態に関するより詳細な分析を行った。ＣｐＨ（Ｈ＝Ａ、Ｃ、又はＴ）メチル化は、ＰＧＣＬＣの誘導の間制限され（Ｓｈｉｒａｎｅ ｅｔ ａｌ、２０１６）、哺乳類細胞では明確な生物学的役割を示さないことが分かっているため（Ｓｃｈｕｂｅｌｅｒ、２０１５）、ＣｐＧの５ｍＣｓに焦点を当てた。ゲノムワイドＤＮＡメチル化状態の主要なパラメータとして、ユニークな配列領域全体の５ｍＣレベルの平均を決定した（ユニークな領域：１ｋｂの重複を伴う２ｋｂのスライドウィンドウ）。プロモーター（高、中、及び低ＣｐＧ密度プロモーター：それぞれＨＣＰ、ＩＣＰ、及びＬＣＰ）（Ｗｅｂｅｒら、２００７）、反復因子のコンセンサス配列［長鎖散在反復配列１（ＬＩＮＥ１）；嚢内Ａ粒子（ＩＡＰ）；ＩＡＰ以外の内因性レトロウイルス配列（ＥＲＶ）；メジャーおよびマイナーサテライト］、およびインプリンティングされた遺伝子の刷り込み制御領域（ＩＣＲ）を別々に決定した。また、非プロモーターＣｐＧアイランド（ＣＧＩ）、エキソン、イントロン、遺伝子間領域、細胞型特異的エンハンサー（Ｋｕｒｉｍｏｔｏら、２０１５）、および「生殖系列遺伝子」のＣＧＩ（Ｗｅｂｅｒ ｅｔ ａｌ，２００７；Ｂｏｒｇｅｌ ｅｔ ａｌ，２０１０；Ｋｕｒｉｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ，２０１５）の５ｍＣレベルを決定した。
既報のとおり、ＰＧＣＬＣｓは、胚盤葉と非常に類似したＤＮＡメチロームを有するＥｐｉＬＣｓで確立された５ｍＣｓの連続希釈を示し、その結果、ｄ６ ＰＧＣＬＣｓは、平均約３７％の５ｍＣレベル（約Ｅ９．０－９．５での移動期ＰＧＣと類似していると考えられる状態）を獲得する。驚くべきことに、Ｐｒｄｍ１４遺伝子座およびＨｏｘｂ遺伝子座の分析と一致して、培養したＰＧＣＬＣにおいて、ユニークな領域、繰り返し、および別個の調節要素について異なるキネティクスで、ｄ４／ｄ６細胞の５ｍＣレベルの連続希釈が存在した。その結果、ｄ４ｃ７細胞には約６％の平均５ｍＣレベルしかなく（図６Ａ）、生殖系列サイクル全体を通じて最低の５ｍＣレベルを有するＥ１３．５生殖細胞（Ｓｅｉｓｅｎｂｅｒｇｅｒら、２０１２；Ｋｏｂａｙａｓｈｉら、２０１３）と同等のレベルであった。重要なことに、リピート、脱メチル化に耐性のある「生殖系列遺伝子」のプロモーター、及びインプリンティングされた遺伝子のＩＣＲを含む、実質的に全てのゲノムエレメントにおける５ｍＣ分布パターンは、ｄ４ｃ３ ＰＧＣＬＣとＥ１０．５ＰＧＣとの間、及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣとＥ１３．５生殖細胞の間で著しく類似していたが、一方で、類似の５ｍＣレベルを示す、ｄ４ｃ３ ＰＧＣＬＣと、２つのキナーゼ阻害剤（２ｉ）を用いて培養したＥＳＣ（Ｈａｂｉｂｉ ｅｔ ａｌ，２０１３；Ｓｈｉｒａｎｅ ｅｔ ａｌ，２０１６）との間の５ｍＣ分布パターンは、異なっていた。これは、培養したＰＧＣＬＣにおけるＤＮＡの脱メチル化は、ｉｎ ｖｉｖｏのＰＧＣにおけるメカニズムと、同じではないにしても類似したメカニズムを有しているが、インビトロで２ｉによって誘発されるメカニズムとは類似しないことを示唆している。ＤＮＡの脱メチル化を回避する「ｅｓｃａｐｅｅ」（５ｍＣ＞２０％）（Ｓｅｐｉｓｅｎｂｅｒｇｅｒ ｅｔ ａｌ，２０１２）を分析し、ｅｓｃａｐｅｅがｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣとＥ１３．５生殖細胞との間でも大きく重なっており、それらの大部分はＩＡＰの近くに存在することを見出した。従って、ｍ２２０フィーダー上でのＰＧＣＬＣの誘導及びＦＲ１０を用いたそれらの培養は、包括的にＰＧＣにおけるＤＮＡのメチル化リプログラミングを再構成した。それにもかかわらず、前記で実証したように、培養したＰＧＣＬＣは、基本的に遊走性のＰＧＣの転写状態を維持した（図４Ｂ）。
従って、プロモーターの脱メチル化がｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣにおける転写活性化に及ぼす影響を調べた。培養したＰＧＣＬＣにおける全体的なＤＮＡの脱メチル化を反映して、ｄ６ ＰＧＣＬＣとｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣとの間で７，７３７個ものプロモーターが脱メチル化された（ｄ６で５ｍＣ＞２０％、ｄ４ｃ７で＜２０％）（図６Ｃ）。ｄ６ ＰＧＣＬＣと比較してｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣでアップレギュレートされた４７８個の遺伝子のうち、９６個の遺伝子がプロモーターの脱メチル化がされており、２７個は、１０４個の部分的にアップレギュレートされた遺伝子（Ｅ１３．５－ｄ４ｃ７＞２倍）（Ｄｄｘ４、Ｄａｚｌ、Ｂｒｄｔ、Ａｓｚ１、Ｄｍｒｔ１、Ｓｔｒａ８、Ｓｙｃｐ３、Ｓｙｃｅ１、Ｓｍｃ１ｂなど）に含まれており、３４個は、完全にアップレギュレートされた１９７個の遺伝子（－２倍＜Ｅ１３．５－ｄ４ｃ７＜２倍）（Ｐｉｗｉｌ２、Ｒｐｌ１０ｌ、Ｒｐｌ３６、Ｒｈｏｘ遺伝子など）に含まれていた（図６Ｄ）。部分的に／完全にアップレギュレートされた遺伝子の中で、プロモーターが脱メチル化された遺伝子の割合は、部分的に／完全にダウンレギュレートされた遺伝子の中で、プロモーターが脱メチル化された遺伝子の割合より高かった（図６Ｄ）。プロモーターの脱メチル化自体が、培養したＰＧＣＬＣにおける限られた数だけの特異的遺伝子の活性化に部分的に寄与すると結論づける。
培養したＰＧＣＬＣの脱メチル化プロモーターにおけるＨ３Ｋ２７ｍｅ３の代償的アップレギュレーション
次に、ＰＧＣＬＣの誘導及び拡大中のＨ３Ｋ４ｍｅ３、Ｈ３Ｋ２７ａｃ及びＨ３Ｋ２７ｍｅ３の分布の動態を解析した。ＰＧＣＬＣ誘発中の主要な細胞型の場合と同様に、高レベルのＨ３Ｋ４ｍｅ３は、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣにおいてＨＣＰと主に結合し、転写開始点（ＴＳＳ）の周辺のＨ３Ｋ４ｍｅ３レベルは、関連遺伝子の発現レベルと正の相関関係があった（Ｏｈｔａ ｅｔ ｅｌ．，２０１７．図ＥＶ５Ａ及びＢ）。このことは、ｄ６ ＰＧＣＬＣとｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣとの間の転写類似性を反映しており、ゲノムにわたるＨ３Ｋ４ｍｅ３プロファイルは、ｄ６ ＰＧＣＬＣとｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣとの間で類似していた。重要なことに、エンハンサーの使用を示し、かつ異なる細胞型間（Ｃａｌｏ ＆ Ｗｙｓｏｃｋａ，２０１３）、及びＰＧＣＬＣ誘発中（Ｋｕｒｉｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ，２０１５）における、高度に動的な変化を示すＨ３Ｋ２７ａｃの分布も、ｄ６ ＰＧＣＬＣとｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣとの間で類似していた（図７Ａ及びＢ）。これは、遺伝子発現自体だけでなく、遺伝子発現の調節もＰＧＣＬＣ培養の間大いに保存されていることを示している。それにもかかわらず、ｄ６ ＰＧＣＬＣとｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣとの間の潜在的な調節性の差異を示すであろう、ｄ６ ＰＧＣＬＣ又はｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣのいずれかに特異的なＨ３Ｋ２７ａｃのピーク（ＴＳＳ及び遺伝子体から１５ｋｂ未満）を同定した。
Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３の分布パターンもまた、ｄ６ ＰＧＣＬＣとｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣとの間で非常に類似しているようであった（図７Ｃ及びＤ）。しかし重要なことに、ｄ６ ＰＧＣＬＣとｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣの間で実質的な脱メチル化を有するプロモーター（ｄ６では５ｍＣ＞２０％、ｄ４ｃ７で＜２０％、７７３７プロモーター）は、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣにおいてｄ６ ＰＧＣＬＣよりも高いＨ３Ｋ２７ｍｅ３の濃縮レベルを有する一般的な傾向を示したが、５ｍＣレベルに変化がないプロモーターはそのような傾向を示さなかった（図７Ｃ及びＤ）。ＥｐｉＬＣとｄ６ ＰＧＣＬＣとの間で実質的な脱メチル化を示したにもかかわらず、前記プロモーターはＥｐｉＬＣとｄ６ＰＧＣＬＣとの間のＨ３Ｋ２７ｍｅ３濃縮レベルの全体的な変化を示さなかった。これらの知見は、培養したＰＧＣ中の広範かつほとんど完全なプロモーターの脱メチル化が、Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３濃縮レベルの付随的なアップレギュレーションにより少なくとも部分的に代償されることを示し、これが培養したＰＧＣＬＣにおける遊走性のＰＧＣの転写状態の維持に寄与するのであろう。
適切な発生のきっかけの活性化を支える状態である（Ｖｏｉｇｔ ｅｔ ａｌ，２０１３）、Ｈ３Ｋ４ｍｅ３を活性化し、Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３を抑制する二価の（ｂｉｖａｌｅｎｔ）プロモーターを評価した（二価の定義については、材料及び方法を参照のこと）。以前の報告（Ｋｕｒｉｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ，２０１５）と一致して、二価の遺伝子の数は主要な培養細胞型間において、ＥｐｉＬＣで最大であり、ｄ６及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣは同様の数の二価の遺伝子を示した（図７Ｅ）。しかし、ｄ６ ＰＧＣＬＣとｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣの間の二価の遺伝子の重複は、比較的中程度であった（～５１９／１，０５８（～４９％））。これは、２つの異なる試料における２つのヒストン修飾の組合せのレベルを正確に比較すること対する内在する技術的な困難性に一部起因する。それにもかかわらず、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣの二価の遺伝子は、ｄ６ ＰＧＣＬＣのものと比較して、「パターン特定プロセス（ｐａｔｔｅｒｎ ｓｐｅｃｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｐｒｏｃｅｓｓ）」及び「胚の形態形成（ｅｍｂｒｙｏｎｉｃ ｍｏｒｐｈｏｇｅｎｅｓｉｓ）」などのＧＯタームにおいてより高い濃縮度を示した（図７Ｆ）。例えば、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣは、Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３の高レベルによってクラスターが抑制されていても、Ｈｏｘｃクラスターの周りで上昇したＨ３Ｋ４ｍｅ３レベルを獲得した。ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣが、エピジェネティックな「白紙状態」を示す、ゲノムワイドな５ｍＣ及びＨ３Ｋ９ｍｅ２レベル（図５Ａ及び６）（Ｋｕｒｉｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ，２０１５）の非常にレベルが低い発生の調節因子に対して、高度にバランスのとれたエピゲノムを有すると結論づける。
雌性ＰＧＣＬＣ及び雌性ＥＳＣにおけるＸ染色体の動態は、２つの活性化したＸ染色体（ＸａＸａ）を有し、雄性ＥＳＣと比較して低いゲノムワイドな５ｍＣレベルを示す（Ｚｖｅｔｋｏｖａ ｅｔ ａｌ，２００５；Ｓｈｉｒａｎｅ ｅｔ ａｌ，２０１６）。雌性ＥｐｉＬＣの大部分はＸａＸａを有し、浮遊凝集体形成の際に、Ｘの不活性化を受け、雌性ｍＰＧＣＬＣは１つのＸａと１つの不活性なＸ染色体（ＸａＸｉ）を示す（Ｈａｙａｓｈｉ ｅｔ ａｌ，２０１２；Ｓｈｉｒａｎｅ ｅｔ ａｌ，２０１６）。次に、培養での雌性ＰＧＣＬＣ増殖中のＸ染色体動態を評価した。雌性ＥＳＣは１つのＸ染色体を失ってＸＯになることがあるので（Ｒｏｂｅｒｔｓｏｎ ｅｔ ａｌ，１９８３；Ｚｖｅｔｋｏｖａ ｅｔ ａｌ，２００５）、最初に、Ｘ連鎖遺伝子のＨｕｗｅ１のＤＮＡ蛍光ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）分析によって２系統（ＢＶＳＣ Ｈ１４及びＨ１８（１２９ｓｖ／Ｃ５７ＢＬ／６バックグラウンド）のメスのＥＳＣからのＰＧＣＬＣ誘導及び増殖中において、２つのＸ染色体の維持の程度を調べた。図８Ａに示すように、２つのＸは、ＥＳＣからＥｐｉＬＣへの分化中に比較的良好に維持されたが、ＰＧＣＬＣの誘導時には、１つのＸが失われる傾向があり（ＸＯ：Ｈ１４ ｄ４ ＰＧＣＬＣ及びＨ１８ ｄ４ ＰＧＣＬＣに関して、それぞれ～６０％及び～４０％）、培養でのＰＧＣＬＣの増殖中では、ＸＸ／ＸＯ比は良好に保存されていた（ＸＯ：Ｈ１４ ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣ及びＨ１８ ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣに関して、それぞれ～６０％及び～４０％）。
次に、本発明者らは、Ｘ染色体上のＨ３Ｋ２７ｍｅ３陽性度を評価することにより、ＰＧＣＬＣの増幅中のＸａ／Ｘｉ状態を調べた。図８Ｂに示すとおり、雌性マウス胎仔フィーダー（ＭＥＦ）の約９５％が２つのＸｓを有しており、当該細胞の約９０％が１つのＸ上に単一のＨ３Ｋ２７ｍｅ３スポットを示し、それらがＸａＸｉ状態であることが示された。本発明者らは、ＸＸ ｄ４ ＰＧＣＬＣの約５０％がＸａＸｉ状態を示すのに対し、ＸＸ ｄ４ ＰＧＣＬＣの約３０％はＸ染色体上にＨ３Ｋ２７ｍｅ３スポットを示さないことを見出した（図８Ｂ）。意外なことに、少数（＜５％）のＸＸ ｄ４ｃ３及びｄ４ｃ７ ＰＧＣＬのみがＸａＸｉ状態を示し、それらの約７０％はＸ染色体上にＨ３Ｋ２７ｍｅ３スポットを示さなかった（図８Ｂ）。このことは、ＰＧＣＬＣの増幅培養の間に１つのＸｉが再活性化するか、あるいは、再活性化のプロセスにあることを示しており、ｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣがエピジェネティックな「白紙状態」を獲得するという見解とよく一致している。
［ＩＩ］ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣからの卵母細胞様細胞の誘導
以下に引用する文献の詳細情報については、Ｍｉｙａｕｃｈｉ，Ｈ．ｅｔ ａｌ．，ＥＭＢＯ Ｊ．，３６（２１）：３１００－３１１９（２０１７）を参照のこと。
＜材料と方法＞
動物
すべての動物実験は、京都大学の倫理ガイドラインの下で行った。ＢＶＳＣ（Ａｃｃ．Ｎｏ．ＢＶ、ＣＤＢ０４６０Ｔ；ＳＣ ＣＤＢ０４６５Ｔ：ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｃｄｂ．ｒｉｋｅｎ．ｊｐ／ａｒｇ／ＴＧ％２０ｍｕｔａｎｔ％２０ｍｉｃｅ％２０ｌｉｓｔ．ｈｔｍｌ）、Ｓｔｅｌｌａ－ＥＧＦＰ（ＳＧ）およびｍＶＨ－ＲＦＰ（ＶＲ）トランスジェニックマウスは、以前（Ｐａｙｅｒ ｅｔ ａｌ，２００６；Ｓｅｋｉ ｅｔ ａｌ，２００７；Ｏｈｉｎａｔａ ｅｔ ａｌ，２００８；Ｉｍａｍｕｒａ ｅｔ ａｌ，２０１０）報告されたように樹立し、主にＣ５７ＢＬ／６のバックグラウンドで維持した。ＢＶＳＣＤＴ ＥＳＣ（ＸＹ）を胚盤胞（ＩＣＲ）に注入し、その後仮親に移入することによりＤａｚｌ－ｔｄＴｏｍａｔｏ（ＤＴ）マウスを作製した。ＩＣＲマウスは、ＳＬＣ（Ｓｈｉｚｕｏｋａ、Ｊａｐａｎ）から購入した。膣栓が同定された日の正午を胎生期（Ｅ）０．５日とした。
妊娠した雌（ＩＣＲ）にＬＤＮ－１９３１８９を投与するために、ＬＤＮ－１９３１８９（ｓｍ１０５５９；Ｓｉｇｍａ－Ａｌｄｒｉｃｈ）を滅菌水に溶解し、２．５ｍｇのＬＤＮ－１９３１８９を体重１ｋｇあたりＥ１１からＥ１４まで１２時間ごとに腹腔内注射した。
ＥＳＣ培養／誘導およびＰＧＣＬＣ誘導／培養
Ｈ８ ＢＶＳＣ ＥＳＣ（ＸＸ）（Ｈａｙａｓｈｉ ｅｔ ａｌ，２０１２）、Ｒ８ ＢＶＳＣ ＥＳＣ（ＸＹ）（Ｈａｙａｓｈｉ ｅｔ ａｌ，２０１１）、Ｌ９ ＢＶＳＣＶＲ ＥＳＣ（ＸＸ）、Ｌ５ ＢＶＳＣＶＲ ＥＳＣ（ＸＹ）、ＢＶＳＣＤＴ ＥＳＣ（ＸＹ；Ｒ８のサブライン）、ＢＤＦ１－２－１ ＢＶＳＣ ＥＳＣ（ＸＹ）（Ｏｈｔａ ｅｔ ａｌ，２０１７）、およびＳｔｒａ８ノックアウトＢＶＳＣ ＥＳＣ（ＳＫ１，２，３；ＸＹ；ＢＤＦ１－２－１のサブライン）を本研究に使用した。Ｌ５およびＬ９ＢＶＳＣＶＲ ＥＳＣは、ＶＲ雌（Ｉｍａｍｕｒａ ｅｔ ａｌ，２０１０）と、ＢＶＳＣ雄（Ｏｈｉｎａｔａ ｅｔ ａｌ，２００８）との交配によって得られた胚盤胞から、以前に記載された手順に従って樹立され、フィーダーフリー条件に適合させた（Ｈａｙａｓｈｉ ｅｔ ａｌ，２０１１）。ＢＶＳＣＤＴおよびＳｔｒａ８ノックアウトＥＳＣの樹立手順は、それぞれ、以下の「ＢＶＳＣＤＴ ＥＳＣの確立」および「Ｓｔｒａ８ノックアウトＥＳＣの確立」の節に記載されている。
ＥＳＣ培養およびＰＧＣＬＣ誘導は、いくつかの変更を加えて、以前（Ｈａｙａｓｈｉ ｅｔ ａｌ、２０１１；Ｈａｙａｓｈｉ＆Ｓａｉｔｏｕ、２０１３）に記載されたように行った。ＥＳＣは、ポリ－Ｌ－オルニチン（０．０１％；Ｓｉｇｍａ）およびラミニン（３００ｎｇ／ｍｌ；ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）でコーティングしたディッシュ上またはマウス胚線維芽細胞（ＭＥＦ）上で、２ｉ＋ＬＩＦ条件下で維持した。アクチビンＡ（２０ｎｇ／ｍｌ；ＰｅｐｒｏＴｅｃｈ）、ｂＦＧＦ（１２ｎｇ／ｍｌ；Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ）およびＫＳＲ（１％；Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒを含有するＮ２Ｂ２７培地中、ヒト血漿フィブロネクチン（１６．７μｇ／ｍｌ；Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）でコーティングした１２ウェルプレートのウェル上に１．０×１０５個のＥＳＣをプレーティングすることにより、ＥｐｉＬＣを誘導した。ＥｐｉＬＣ誘導の４２～４６時間後、ＰＧＣＬＣを、低細胞結合性９６ウェルリピジュア－コーティングプレート（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）のウェル中、ＢＭＰ４（５００ｎｇ／ｍｌ；Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）、ＬＩＦ（１，０００Ｕ／ｍｌ；Ｍｅｒｃｋ Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）、ＳＣＦ（１００ｎｇ／ｍｌ；Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）およびＥＧＦ（５０ｎｇ／ｍｌ；Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）を含む２００μｌのＧＫ１５培地中に、２．０×１０３個のＥｐｉＬＣをプレーティングすることにより、浮遊条件下で誘導した。ＧＫ１５培地は、１５％ＫＳＲ、０．１ｍＭ ＮＥＡＡ、１ｍＭピルビン酸ナトリウム、０．１ｍＭ ２－メルカプトエタノール、１００Ｕ／ｍｌペニシリン、０．１ｍｇ／ｍｌストレプトマイシンおよび２ｍＭ Ｌ－グルタミンを含むＧＭＥＭ（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）で構成した。ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣ培養は以前（Ｏｈｔａ ｅｔ ａｌ，２０１７）に記載されたように行った。簡単に述べると、ｄ４ ＰＧＣＬＣ凝集体を回収し、ＰＢＳで洗浄し、ＴｒｙｐＬＥ Ｅｘｐｒｅｓｓ（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）で解離させた。次いで、それらをＤＭＥＭ／Ｆ１２＋０．１％ＢＳＡ（Ｇｉｂｃｏ）で洗浄し、細胞ストレーナー（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅ）で濾過して大きな細胞塊を除去した。次に、サンプルを遠心分離し、０．１％ＢＳＡ－ＰＢＳに再懸濁し、ＦＡＣＳ（Ａｒｉａ ＩＩＩ；ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅ）で選別した。ＢＶ（＋）細胞を、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣ増幅培地中のマイトマイシンＣ（ＭＭＣ）処理ｍ２２０フィーダー細胞上に播種した。
ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣ増幅培地は、１０％ＫＳＲ、２．５％ＦＢＳ、０．１ｍＭ ＮＥＡＡ、１ｍＭピルビン酸ナトリウム、２ｍＭ Ｌ－グルタミン、０．１ｍＭ ２－メルカプトエタノール、１００Ｕ／ｍｌペニシリン、０．１ｍｇ／ｍｌのＧＭＥＭストレプトマイシン、１０μＭフォルスコリン、および１０μＭロリプラムで構成した。培地全体をｃ３から２日ごとに交換した。雌の運命の誘導のためのサイトカイン／化合物は、ｃ３から培養の最後まで提供した。別段の指定がない限り、用いたＲＡおよびＢＭＰの濃度はそれぞれ１００ｎＭおよび３００ｎｇ／ｍｌであった。ＩＸ７３倒立顕微鏡（Ｏｌｙｍｐｕｓ）を用いて、明視野および蛍光画像を取り込んだ。
ＢＶＳＣＤＴ ＥＳＣの樹立
Ｄａｚｌ－ｔｄＴｏｍａｔｏ（ＤＴ）ノックインＥＳＣの作製のためのドナーベクターを構築するために、Ｄａｚｌの相同性アーム（それぞれ終止コドンの上流１，０４８ｂｐから及び下流１，２４７ｂｐまでの断片）を、ＰＣＲ（Ｐｒｉｍｅｒｓ）によるＲ８ ＢＶＳＣ ＥＳＣのゲノムＤＮＡから増幅し、ｐＣＲ２．１ベクター（ＴＯＰＯ ＴＡ Ｃｌｏｎｉｎｇ；Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）にサブクローニングした。ＬｏｘＰ部位に隣接するＰｇｋ－Ｐｕｒｏカセットを有するＰ２Ａ－ｔｄＴｏｍａｔｏ断片を、以前報告されたベクター（Ｓａｓａｋｉ ｅｔ ａｌ，２０１５）からＰＣＲによって増幅し、相同性アームを含有する、サブクローニングしたベクターのＤａｚｌコード配列の３’末端に、ＧｅｎｅＡｒｔ Ｓｅａｍｌｅｓｓ Ｃｌｏｎｉｎｇ＆Ａｓｓｅｍｂｌｙ Ｋｉｔ（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を用いて、インフレームで挿入した。ストップコドンは、インフレーム融合タンパク質の発現のために除去した。
Ｄａｚｌの終止コドンに隣接する配列を標的とするＴＡＬＥＮコンストラクトは、以前に記載されたようにＧｏｌｄｅｎＧａｔｅ ＴＡＬＥＮ ａｎｄ ＴＡＬ Ｅｆｆｅｃｔｏｒ ｋｉｔ（Ａｄｄｇｅｎｅ＃１０００００００１６）を用いて作製した（Ｓａｋｕｍａ ｅｔ ａｌ，２０１３；Ｓａｓａｋｉ ｅｔ ａｌ，２０１５）。ＴＡＬＥＮの活性は、一本鎖アニーリング（ＳＳＡ）アッセイによって評価した。
ドナーベクター（５μｇ）およびＴＡＬＥＮプラスミド（それぞれ１０μｇ）を、ＮＥＰＡ２１ ｔｙｐｅ ＩＩ ｅｌｅｃｔｒｏｐｏｒａｔｏｒ（Ｎｅｐａｇｅｎｅ）を用いたエレクトロポレーションによってＲ８ ＢＶＳＣ ＥＳＣに導入した。ピューロマイシン選択後に単一のコロニーを拾い、ランダムまたは標的化された組み込みをＰＣＲ（Ｐｒｉｍｅｒｓ）によって評価し、続いてサザンブロット解析によって検証した。正確なターゲティングを有する株を、Ｃｒｅリコンビナーゼを発現するプラスミドでトランスフェクションして、Ｐｇｋ－Ｐｕｒｏカセットを除去した。
Ｓｔｒａ８ノックアウトＥＳＣの確立
レポーター遺伝子ＧＳＧ－ｐ２Ａ－ｍＣｈｅｒｒｙとインフレームで融合したＣａｓ９ニッカーゼ（Ａｄｄｇｅｎｅ＃４２３３５）を発現させるベクターを作製した（用いたｍＣｈｅｒｒｙはサイレント変異、４３２Ｇ＞Ａを含んでいた）。報告されたプロトコル（Ｒａｎ ｅｔ ａｌ，２０１３ａ，ｂ）に従って、Ｓｔｒａ８のエキソン６を標的化するための２対のオリゴヌクレオチド（Ｐｒｉｍｅｒｓ）をアニールし、リン酸化し、Ｂｂｓ１（ＮＥＢ）で消化した上記ベクターに別々に連結した。ニッカーゼ活性をＳＳＡアッセイによって評価した。１対のニッカーゼプラスミド（各２００ｎｇ）を、ＮＥＰＡ２１ ｔｙｐｅ ＩＩ ｅｌｅｃｔｒｏｐｏｒａｔｏｒを用いたエレクトロポレーションによってＢＤＦ１－２－１ ＢＶＳＣ ＥＳＣに導入した。ＥＳＣをトランスフェクションの２日後に解離させ、高レベルのＣａｓ９ニッカーゼも発現することが予想される高レベルのｍＣｈｅｒｒｙを発現する単一細胞をＦＡＣＳで選別し、各ウェルが単一クローンを含有するように、９６ウェルプレートの単一ウェル中のＭＥＦ上に播種した。クローンを培養し、増殖させ、クローン中のＳｔｒａ８遺伝子座の破壊を、関連領域のＰＣＲ産物のサンガー配列決定（Ｐｒｉｍｅｒｓ）によって評価した。Ｓｔｒａ８ノックアウトは、ウェスタンブロットおよびＩＦ解析によって確認した。
ＰＧＣまたは胎児性腺のＥｘ ｖｉｖｏ培養
ＰＧＣ培養のために、Ｅ１１．５でのＳＧマウスの胎児性腺（性の識別なし）を切断しおよび解離させた。ＳＧ（＋）ＰＧＣをＦＡＣＳで選別し、ｍ２２０フィーダー細胞上にプレーティングし、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣ増幅培地で培養した。雌の運命の誘導のための試薬はｃ０から提供した。胎児性腺の培養のために、Ｅ１１．５［ＰＣＲ（Ｐｒｉｍｅｒｓ）により性が識別された］の中腎を含む胚期の卵巣を摘出し、培養液インサート（３５３０９５；ＢＤ Ｆａｌｃｏｎ）上の気液界面条件下で培養した。使用した培地は、１０％ＦＢＳ、１００Ｕ／ｍｌペニシリン、０．１ｍｇ／ｍｌストレプトマイシンおよび２ｍＭ Ｌ－グルタミンを含むＤＭＥＭであった。低分子阻害薬は、ｃ０からの培地とともに提供した。
蛍光活性化細胞選別、細胞周期解析、および細胞計数
ＦＡＣＳのためのｄ４／ｃ０ ＰＧＣＬＣの調製は、「ＥＳＣ培養／誘導およびＰＧＣＬＣ誘導／培養」に記載されている。ｉｎ ｖｉｖｏで生殖細胞を単離するために、ＢＶＳＣ、ＶＲまたはＳＧマウスの胎児性腺を切断し、ｄ４／ｃ０ ＰＧＣＬＣについて記載した手順に従ってＦＡＣＳ用に処理した。解離後、それらを１００μｇ／ｍｌのＤＮアーゼ（Ｓｉｇｍａ－Ａｌｄｒｉｃｈ）を含有する０．１％ＢＳＡ－ＤＭＥＭで洗浄して、死細胞から溶解したＤＮＡを消化し、細胞／残渣の塊の形成を防止した以外は同様の方法で培養ＰＧＣＬＣも調製した。ＢＶ／ＳＧ、ＳＣ、またはＤＴ／ＶＲの蛍光活性は、それぞれＦＩＴＣ、Ｈｏｒｉｚｏｎ Ｖ５００またはＰＥ－Ｔｅｘａｓ Ｒｅｄチャネルで検出した。ＦＡＣＳデータは、ＦｌｏｗＪｏまたはＦＡＣＳ Ｄｉｖａソフトウェアパッケージを用いて解析した。
細胞周期解析は、Ｃｌｉｃｋ－ｉＴ ＥｄＵ Ｆｌｏｗ Ｃｙｔｏｍｅｔｒｙ Ａｓｓａｙ Ｋｉｔ（Ｃ１０４２４；Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｃｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）を製造者の指示に従って使用して行った。培養したＰＧＣＬＣを１０μｇ／ｍｌのＥｄＵで３０分～２時間処理し、ＦＡＣＳにより分析した。
培養したＰＧＣＬＣをニワトリ抗ＧＦＰ抗体、続いてＡｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ６３３－ヤギ抗ニワトリ抗体で染色し、Ｃｅｌｌａｖｉｓｔａ ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔ（ＳｙｎｅｎＴｅｃ）（Ｏｈｔａ ｅｔ ａｌ，２０１７）を用いて解析した。
サイトカイン／化合物
雌の運命の誘導に関与する活性をスクリーニングするために使用されたサイトカイン／化合物は以下の通りであった（図９）：１００ｎＭオールトランスレチノイン酸、５００ｎｇ／ｍｌ ＷＮＴ４（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）、５００ｎｇ／ｍｌのＲＳＰＯ１（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）、１００ｎｇ／ｍｌ ＦＧＦ９（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ），５００ｎｇ／ｍｌ ＰｇＤ２（Ｃａｙｍａｎ），２５ｎｇ／ｍｌ アクチビンＡ，１００ｎｇ／ｍｌ ＮＯＤＡＬ（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ），５００ｎｇ／ｍｌ ＳＤＦ１（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ），５０ｎｇ／ｍｌ ｂＦＧＦ，５００ｎｇ／ｍｌ ＢＭＰ２（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ），５００ｎｇ／ｍｌ ＢＭＰ４（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ），５００ｎｇ／ｍｌ ＢＭＰ５（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ），５００ｎｇ／ｍｌ ＢＭＰ７（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ），２５０ｎｇ／ｍｌ ＷＮＴ５ａ（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）及び１，０００Ｕ／ｍｌ ＬＩＦ。シグナル阻害実験においては、ＤＭＳＯに溶解したＬＤＮ１９３１８９（＃０４－００７４；Ｓｔｅｍｇｅｎｔ）およびＢＭＳ４９３（Ｂ６６８８；Ｓｉｇｍａ－Ａｌｄｒｉｃｈ）をＡＬＫ２／３阻害薬およびＲＡＲ阻害薬としてそれぞれ使用した。
免疫蛍光（ＩＦ）分析
Ｉｍｍｕｎｏｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ（ＩＦ）分析は以前に記載されているように行った（Ｈａｙａｓｈｉ ｅｔ ａｌ、２０１２）。以下の一次抗体を用いた：ニワトリ抗ＧＦＰ（ａｂ１３９７０；Ａｂｃａｍ）、ウサギ抗ＤＤＸ４（ａｂ１３８４０；Ａｂｃａｍ）、マウス抗ＤＤＸ４（ａｂ２７５９１；Ａｂｃａｍ）、ウサギ抗ＤＡＺＬ（ａｂ３４１２９；Ａｂｃａｍ）、ヤギ抗ＤＡＺＬ（ｓｃ－２７３３３；Ｓａｎｔａ Ｃｒｕｚ）、ウサギ抗ＳＴＲＡ８（ａｂ４９６０２；Ａｂｃａｍ）、マウス抗ＳＹＣＰ３（ａｂ９７６７２；Ａｂｃａｍ）およびウサギ抗ＴＥＸ１４（ａｂ４１７３３；Ａｂｃａｍ）ＩｇＧ。以下の二次抗体を使用した：Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ４８８－ヤギ抗マウスまたはニワトリＩｇＧ；Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ５６８－ヤギ抗ウサギＩｇＧおよびＡｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ６３３－ヤギ抗マウス、抗ニワトリＩｇＧ；Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ４８８－ロバ抗マウスＩｇＧ；Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ５６８－ロバ抗ウサギＩｇＧおよびＡｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ６３３－ロバ抗ヤギＩｇＧ。ＩＦ画像を共焦点顕微鏡［ＦＶ１０００（オリンパス）またはＬＳＭ７８０（Ｚｅｉｓｓ）］を用いて取り込んだ。
胎児卵母細胞様細胞における減数分裂染色体のスプレッド解析
スプレッド調製およびＩＦ分析は、わずかな改変を伴い、以前に記載されたように、（Ｙａｍａｓｈｉｒｏ ｅｔ ａｌ、２０１６）行った。ｃ９ ＲＡＢ２細胞をＦＡＣＳで選別し、選別した細胞をＰＢＳで洗浄し、低張抽出溶液で２５℃で１時間処理した。使用した一次抗体は、以下の通りである：ヤギ抗ＳＣＰ３（１：２５０；ｓｃ－２０８４５；Ｓａｎｔａ Ｃｒｕｚ）、マウス抗γＨ２ＡＸ（１：１，０００；０５－６３６；Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）およびウサギ抗ＳＣＰ１抗体（１：２５０；ＮＢ３００－２２９；Ｎｏｖｕｓ）。使用した二次抗体は、以下の通りであった：Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ４８８－ロバ抗ヤギＩｇＧ（Ａ１１０５５；Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）、Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ５６８－ロバ抗ウサギＩｇＧ（Ａ１００４２；Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）、およびＡｌｅｘａ ６４７－ロバ抗マウスＩｇＧ（Ａ３１５７１；Ｔｈｅｒｍｏフィッシャー）。本発明者らは、ＳＹＣＰ３（＋）細胞を計数した。減数分裂段階の定義は以下の通りであった：染色体の少なくとも８０％で、細糸期：－γＨ２ＡＸ（＋）およびＳＹＣＰ１（－）；接合期：－γＨ２ＡＸ（＋）およびＳＹＣＰ１（＋）。太糸期：ＳＹＣＰ１（＋＋）。
サザンブロット解析
サザンブロット解析は以前に記載されたように行った（Ｎａｋａｋｉ ｅｔ ａｌ，２０１３）。簡単に述べると、１０μｇのゲノムＤＮＡを制限酵素で消化し、得られたＤＮＡ断片を０．９％アガロースゲルで電気泳動し、Ｈｙｂｏｎｄ Ｎ＋膜（ＲＰＮ３０３Ｂ；ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）に転写し、架橋のためにベーキングした。ｔｄＴｏｍａｔｏ用のＤＩＧ標識プローブ、およびＤａｚｌの関連領域の５つおよび３つのプライムサイド（ｐｒｉｍｅ ｓｉｄｅ）を、ＰＣＲ（ＰＣＲ ＤＩＧ Ｌａｂｅｌｉｎｇ Ｍｉｘ；Ｓｉｇｍａ－Ａｌｄｒｉｃｈ）（Ｐｒｉｍｅｒｓ）によって生成した。画像はＬＡＳ４０００（Ｆｕｊｉｆｉｌｍ）を用いて取り込んだ。
ウエスタンブロット分析
ウエスタンブロット分析のために、９０℃で５分間、ＳＤＳサンプル緩衝液［６２．５ｍＭ Ｔｒｉｓ－ＨＣｌ（ｐＨ６．８）、２％ＳＤＳ、１０％グリセロール、０．０２５％ブロモフェノールブルーおよび０．１４Ｍ－メルカプトエタノール］で５×１０４個の細胞を溶解した。リン酸化された（ｐ）ＳＭＡＤ１／５／８の検出のために、細胞を溶解前にＰｈｏｓＳＴＯＰ（Ｒｏｃｈｅ）および完全プロテアーゼ阻害薬カクテル（Ｒｏｃｈｅ）で処理した。抽出したタンパク質をＳｕｐｅｒＳｅｐ Ａｃｅ １０－２０％ゲル（Ｗａｋｏ）で分離し、ｉＢｌｏｔ２ ｄｒｙ ｂｌｏｔｔｉｎｇ ｓｙｓｔｅｍ（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）によりｉＢｌｏｔ２ ＰＶＤＦ ｔｒａｎｓｆｅｒ ｍｅｍｂｒａｎｅ（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）上にブロットし、一次抗体：ウサギ抗ＳＴＲＡ８ ＩｇＧ（ａｂ４９４０５；Ａｂｃａｍ）、マウス抗αチューブリン（Ｔ９０２６；Ｓｉｇｍａ－Ａｌｄｒｉｃｈ）、ウサギ抗－ｐＳＭＡＤ１／５／８ ＩｇＧ（＃９５１１；ＣＳＴ）、またはウサギ抗ＳＭＡＤ１ ＩｇＧ（＃９７４３Ｓ ＣＳＴ）とインキュベーションした。一次抗体は、ＨＲＰ（Ａ０５４５、Ｍ８６４２；Ｓｉｇｍａ－Ａｌｄｒｉｃｈ）と結合したヤギ抗ウサギＩｇＧまたはヒツジ抗マウスＩｇＧで検出し、続いてＣｈｅｍｉ－Ｌｕｍｉ Ｏｎｅ Ｓｕｐｅｒ（Ｎａｃａｌａｉ）を用いて検出した。化学発光画像の取り込みおよび分析は、Ｆｕｓｉｏｎ Ｓｏｌｏ ｓｙｓｔｅｍおよびＦｕｓｉｏｎ－Ｃａｐｔ ｓｏｆｔｗａｒｅ（Ｍ＆Ｓ Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓ）を用いて行った。
トランスクリプトーム解析
Ｅ１４．５およびＥ１５．５の雄性及び雌性の生殖細胞をＶＲ（＋）細胞として、培養ＰＧＣＬＣをＳＣ（＋）細胞として、ＦＡＣＳにより採取し、試料の全ＲＮＡを、ＲＮｅａｓｙ Ｍｉｃｒｏ Ｋｉｔ（７４００４；ＱＩＡＧＥＮ）を用いて、製造者の指示に従って抽出及び精製した。ｃＤＮＡ合成、ライブラリー構築、および各試料からの１ｎｇの全ＲＮＡからのＮｅｘｔｓｅｑ５００（Ｉｌｌｕｍｉｎａ）による解析を、以前に記載された方法（Ｎａｋａｍｕｒａ ｅｔ ａｌ，２０１５；Ｉｓｈｉｋｕｒａ ｅｔ ａｌ，２０１６）に従って行った。以前の研究（Ｋａｇｉｗａｄａ ｅｔ ａｌ，２０１３；Ｏｈｔａ ｅｔ ａｌ，２０１７）で調製したＥ９．５からＥ１３．５までの生殖細胞のｃＤＮＡを、Ｎｅｘｔｓｅｑ５００シーケンサーシステムによっても解析した。以前に記載されたように（Ｎａｋａｍｕｒａ ｅｔ ａｌ，２０１５）、すべての読み取りデータを発現レベルに変換した。簡単に述べると、すべての読み取りをｃｕｔａｄａｐｔ－１．３（Ｍａｒｔｉｎ、２０１１）で処理して、Ｖ１およびＶ３アダプター配列およびポリＡ配列を除去した。その結果得られた３０ｂｐ以上の読み取りは、「－ｎｏ－ｃｏｖｅｒａｇｅ－ｓｅａｒｃｈ」オプション（Ｋｉｍ ｅｔ ａｌ、２０１３）を用いて、ＴｏｐＨａｔ１．４．１／Ｂｏｗｔｉｅ１．０．１を用いてｍｍ１０ゲノムにマッピングした。マップした読み取りは、次いで、ｃｕｆｆｌｉｎｋｓ－２．２．０を、「－ｃｏｍｐａｔｉｂｌｅ－ｈｉｔｓ－ｎｏｒｍ」、「ｎｏ－ｌｅｎｇｔｈ－ｃｏｒｒｅｃｔｉｏｎ」、「－ｍａｘ－ｍｌｅ－ｉｔｅｒａｔｉｏｎｓ ５００００」、および「ｌｉｂｒａｒｙ″－ｔｙｐｅ ｆｒ－ｓｅｃｏｎｄｓｔｒａｎｄ」オプション、並びに３０エンドでの最大１０－ｋｂのｍｍ１－参照遺伝子アノテーションと共に使用して、発現レベル（ＲＰＭ）に変換した。解析された全遺伝子セットは、以前の研究（Ｉｓｈｉｋｕｒａ ｅｔ ａｌ、２０１６）と同じであった（Ｉｓｈｉｋｕｒａ ｅｔ ａｌ，２０１６）。トランスクリプトーム解析は、Ｒソフトウェアパッケージバージョン３．２．１をｇｐｌｏｔｓパッケージとＭｉｃｒｏｓｏｆｔ Ｅｘｃｅｌと共に用いて行った。最初に、未処理の発現データをｌｏｇ２（ＲＰＭ＋１）値に変換し、特記しない限り、少なくとも１つのサンプルにおいて発現値＞２を有する遺伝子を発現と定義した。ヒートマップ、クラスタリングおよびＰＣＡの構築を除いて、生物学的複製の平均値を用いることにより、データ処理（例えば、ＤＥＧの同定）を行った。ヒートマップを作成するために、ｇｐｌｏｔｓパッケージ（ｈｅａｔｍａｐ．２）を用いた。Ｇｅｎｅ Ｏｎｔｏｌｏｇｙ（ＧＯ）解析は、ＤＡＶＩＤ ６．７ウェブサイト（ｈｔｔｐｓ：／／ｄａｖｉｄ．ｎｃｉｆｃｒｆ．ｇｏｖ）を用いて行った（Ｈｕａｎｇ ｄａ ｅｔ ａｌ，２００９）。
定量的（ｑ）ＰＣＲ
ｑＰＣＲは、ＣＦＸ３８４（Ｂｉｏ－Ｒａｄ）およびＰｏｗｅｒ ＳＹＢＲ Ｇｒｅｅｎ（ＡＢＩ、Ｆｏｓｔｅｒ Ｃｉｔｙ、ＣＡ）を製造者の指示に従って用いて行った。鋳型ｃＤＮＡは「トランスクリプトーム解析」の節に記載されているように調製し、使用したプライマーはＰｒｉｍｅｒｓに列記した。
プロモーターのＤＮＡメチル化の解析
ＥＳＣ、ＥｐｉＬＣ、およびＰＧＣＬＣの全ゲノム重亜硫酸塩配列決定（ＷＧＢＳ）データは、本発明者らの以前の研究（Ｓｈｉｒａｎｅ ｅｔ ａｌ，２０１６；Ｏｈｔａ ｅｔ ａｌ，２０１７）から得られ、ＫＩＴ（－）およびＫＩＴ（＋）精原細胞のそれらは、以前の研究（Ｋｕｂｏ ｅｔ ａｌ，２０１５）から得られた。ここでは、本発明者らは転写開始点（ＴＳＳ）の９００ｂｐ上流から４００ｂｐ下流の領域としてプロモーターを定義し、ＣｐＧの平均値からすべてのパーセント５メチルシトシン値（％５ｍＣ）を算出した。読み深度（ｒｅａｄ ｄｅｐｔｈ）は、以前（Ｉｓｈｉｋｕｒａ ｅｔ ａｌ、２０１６）に記載されているように、４～２００であった。この研究における解析では、本発明者らは少なくとも１つのＣｐＧ部位を有するプロモーターを用いた。
プライマー
この研究で使用されたプライマー配列は以下の通りであった：
性タイピング：
Figure 0007307481000001
Figure 0007307481000002
アクセッション番号
本研究で用いたデータのアクセッション番号は、以下の通りである：図１２のＥ１０．５およびＥ１１．５ＰＧＣおよびＥ１３．５雌性生殖細胞のＲＮＡ－ｓｅｑデータ（ＧＥＯ：ＧＳＥ７４０９４）（Ｙａｍａｓｈｉｒｏ ｅｔ ａｌ，２０１６）、図１２のＥ９．５ ＰＧＣおよびＥ１２．５雌生殖細胞のＲＮＡｓｅｑデータ（ＧＥＯ：ＧＳＥ８７６４４）（Ｏｈｔａ ｅｔ ａｌ，２０１７）、図１２のｄ４ＰＧＣＬＣのＲＮＡ－ｓｅｑデータ（ＧＥＯ：ＧＳＥ６７２５９）（Ｓａｓａｋｉ ｅｔ ａｌ，２０１５）、ＲＮＡｓｅｑデータ、Ｅ１１．５、Ｅ１２．５およびＥ１３．５の雄性及び雌性支持細胞のマイクロアレイデータ（ＧＥＯ：ＧＳＥ２７７１５）（Ｊａｍｅｓｏｎ ｅｔ ａｌ，２０１２）、ＥＳＣ、ＥｐｉＬＣおよびｄ４ ＰＧＣＬＣのＷＧＢＳデータ（ＤＤＢＪ：ＤＲＡ００３４７１）（Ｓｈｉｒａｎｅ ｅｔ ａｌ、２０１６）、ｃ７ ＰＧＣＬＣ（ＤＤＢＪ：ＤＲＡ００５１６６）のＷＧＢＳデータ（Ｏｈｔａ ｅｔ ａｌ，２０１７）およびＰ７ ＫＩＴ－ ＳＧおよびＫＩＴ＋ ＳＧ（ＤＤＢＪ：ＤＲＡ００２４７７）のＷＧＢＳデータ（Ｋｕｂｏ ｅｔ ａｌ，２０１５）。Ｅ９．５、Ｅ１０．５およびＥ１１．５のＰＧＣ、Ｅ１２．５、Ｅ１３．５、Ｅ１４．５およびＥ１５．５の雌性および雌性生殖細胞並びに記載された条件下で培養したＰＧＣＬＣのＲＮＡ－ｓｅｑデータのアクセッション番号はＧＳＥ９４１３６（ＧＥＯデータベース）である。
＜結果＞
生殖細胞の性決定機構を解析するシステム
上記［Ｉ］にて詳述したとおり、本発明者ら幹細胞因子（ＳＣＦ）およびｃＡＭＰシグナリングのフォルスコリンおよびロリプラムの刺激因子の存在下で、ｍ２２０フィーダー細胞上で７日間の培養中に最大５０倍までＰＧＣＬＣを増殖させる系を開発した（図９Ａ）。この条件下で、ＰＧＣＬＣは、性にコミットしていない移動期／早期性腺ＰＧＣのトランスクリプトームを維持しながらＤＮＡメチロームを徐々に消去し、雄または雌の運命のいずれかにコミットしている、Ｅ１３．５の生殖細胞のパターンと同等の、ゲノム全般のＤＮＡメチル化レベル（約５％）／パターンを獲得する（Ｓｐｉｌｌｅｒ＆Ｂｏｗｌｅｓ、２０１５）。したがって、生殖細胞におけるＤＮＡメチル化の再プログラミングおよび性分化は遺伝的に分離可能であり、この条件下で培養したＰＧＣＬＣは、性分化のメカニズムを探索するためのシステムとして役立つ可能性がある。
本発明者らは、減数分裂前期への進入を特徴とする雌経路への分化に焦点を当てて、この可能性を検討した。雌経路へのＰＧＣＬＣの分化の１つの前提条件は、ＤａｚｌおよびＤｄｘ４［マウスｖａｓａホモログ（ｍＶＨ）としても知られている］のような遺伝子の発現を特徴とする後期ＰＧＣ特性の獲得であり、両方とも、ＰＧＣＬＣ／移動期ＰＧＣ中で低レベルで発現し、Ｅ１３．５までの生殖細胞において進行性の上方制御を示す（図９Ａ右）（Ｆｕｊｉｗａｒａ ｅｔ ａｌ，１９９４；Ｃｏｏｋｅ ｅｔ ａｌ，１９９６；Ｏｈｔａ ｅｔ ａｌ，２０１７）。さらに、Ｄａｚｌは生殖細胞の性分化のための「ライセンス供与」因子として機能することが提案されている（Ｌｉｎ ｅｔ ａｌ、２００８；Ｇｉｌｌ ｅｔ ａｌ、２０１１）。したがって、本発明者らは、Ｂｌｉｍｐ１（Ｐｒｄｍ１としても知られる）、Ｓｔｅｌｌａ（Ｄｐｐａ３としても知られる）、およびＤａｚｌもしくはＤｄｘ４（ｍＶＨ）の制御下で、それぞれｍＶｅｎｕｓ、ＥＣＦＰ、およびｔｄＴｏｍａｔｏもしくはＲＦＰを発現する（Ｂｌｉｍｐ１－ｍＶｅｎｕｓをＢＶ、Ｓｔｅｌｌａ－ＥＣＦＰをＳＣ、ｄａｚｌ－ｔｄＴｏｍａｔｏをＤＴ、ｍＶＨ－ＲＦＰをＶＲとそれぞれ略記する場合がある）ＥＳＣ株（ＢＶＳＣＤＴ ＥＳＣおよびＢＶＳＣＶＲ ＥＳＣ）をそれぞれ生成した（材料および方法）。Ｂｌｉｍｐ１はＰＧＣの運命決定（Ｏｈｉｎａｔａ ｅｔ ａｌ、２００５）を表し、Ｓｔｅｌｌａは確立したＰＧＣにおける発現を示す（Ｓａｉｔｏｕ ｅｔ ａｌ、２００２）一方、ＢＶおよびＳＣはそれぞれＢｌｉｍｐ１およびＳｔｅｌｌａの発現を反復する（Ｏｈｉｎａｔａ ｅｔ ａｌ、２００８）。本発明者らはまた、ＤＴおよびＶＲが、ＰＧＣ後期からＤａｚｌおよびＤｄｘ４の発現をそれぞれ反復することを確認した（Ｉｍａｍｕｒａ ｅｔ ａｌ、２０１０）。本発明者らは、培養したＰＧＣＬＣにおけるＤＴまたはＶＲの発現（雌の運命への進入およびＢＶＳＣ発現の下方制御が続く／組み合わされる）を引き起こす条件を確立しようと試みた。ＸＹ生殖細胞とＸＸ生殖細胞の両方が雌の運命をとることができるので（Ｅｖａｎｓ ｅｔ ａｌ、１９７７；Ｔａｋｅｔｏ、２０１５）、同様の結果（以下を参照されたい）を示す出発材料として、ＸＹ ＥＳＣとＸＸ ＥＳＣの両方を使用した。
本発明者らは、最初に、ＢＶＳＣＤＴ ＥＳＣ（ＸＹ）をＰＧＣＬＣに誘導し、増殖培養のために蛍光活性化細胞選別（ＦＡＣＳ）によりＢＶ陽性（＋）の４日目（ｄ４）ＰＧＣＬＣを単離した。ＰＧＣＬＣが指数関数的に増殖していた培養３日目（ｃ３）において、培養物にＲＡの存在下もしくは非存在下で性決定に影響を及ぼす可能性のあるサイトカインパネルを与え、ｃ７に、ＦＡＣＳによりＢＶもしくはＤＴ発現に及ぼすそれらの効果を評価した（培養を通してフォルスコリン、ロリプラム及びＳＣＦを与えた）（図９ＡおよびＢ）。コントロール条件（サイトカイン及びＲＡ非添加）下で、ＢＶ（＋）ｃ７ ＰＧＣＬＣは平均して、比較的低いＤＴ発現を示した（図９Ｂ）。興味深いことに、ＲＡの添加は、ＢＶ（＋）細胞集団におけるＤＴレベルを上昇させた（図９Ｂ）。特に、ＲＡとＢＭＰ（ＢＭＰ２，４，５、または７）の１つを組み合わせが、他のサイトカインは試験しなかったが、ＤＴを強く活性化し、同時にＢＶを下方制御した（図９Ｂ）。このことは、ＲＡおよびＢＭＰはＰＧＣＬＣを後期生殖細胞表現型に誘導することを示唆した。
Ｂｍｐ２は、雌の生殖細胞の運命を導き得る前顆粒膜細胞において重要な雌化因子Ｗｎｔ４に応答して強く発現する（Ｙａｏ ｅｔ ａｌ、２００４；Ｊａｍｅｓｏｎｅｔ ａｌ、２０１２）。従って、本発明者らは次に、ＢＶＳＣＶＲ ＥＳＣ（ＸＸ）から誘導された培養ＰＧＣＬＣにおいても、ＲＡおよびＢＭＰ２がＶＲを上昇させるか否かを調べた。本発明者らは、ｃ３でＲＡおよびＢＭＰ２の濃度を変化させて、ＢＶ（＋）ｄ４ ＰＧＣＬＣを培養し、ｃ９でのＢＶＳＣＶＲ発現に対するそれらの効果を調べた（図９ＣおよびＤ）。ＲＡ単独ではＢＶＳＣ発現を有意に変化させず、ＶＲを活性化しなかった（図９Ｃ）。これは、ＤａｚｌおよびＤｄｘ４発現が異なって調節されることを示唆している。注目すべきことに、ＲＡとＢＭＰ２の組み合わせ添加は、ＢＶＳＣ下方制御および確固としたＶＲ上方制御を誘導し、ＶＲ（＋）細胞誘導の割合は、ＢＭＰ用量依存的に増加した（図９Ｃ）。興味深いことに、ＢＭＰ２単独ではＢＶが下方制御されてＶＲが活性化され、ＢＶＳＣ下方制御およびＶＲ活性化の程度はＲＡ用量依存的に増加した（図９Ｄ）（下記参照）。
免疫蛍光（ＩＦ）分析により、本発明者らは、ＲＡおよびＢＭＰ２を有する培養ＰＧＣＬＣにおいて、ｃ９で、シナプトネム複合体の重要な成分および減数分裂前期のマーカーであるＤＤＸ４およびＳＣＰ３（ＳＹＣＰ３としても知られる）（Ｙｕａｎ ｅｔ ａｌ、２０００）の発現を解析した［ＢＶＳＣ ＥＳＣ（ＸＸ）から誘導して１つの蛍光チャネルを確保した］。ＢＶもしくはＳＣ陽性（本明細書において「ＢＶ／ＳＣ（＋）」と略記する場合がある）細胞は、Ｅ１５．５原卵母細胞と非常によく似た様式でＤＤＸ４およびＳＣＰ３を発現した：ＤＤＸ４は細胞質に特異的に局在し、ＳＣＰ３はシナプトネム複合体形成を示す局在化の明確なパターンを示した。さらに、ＤＤＸ４／ＳＣＰ３（＋）細胞は、卵母細胞嚢胞の形成を連想させるように相互連結しているようであった（図９Ｅ）（Ｐｅｐｌｉｎｇ＆Ｓｐｒａｄｌｉｎｇ、１９９８）。実際、嚢胞様構造は、細胞間接触部位（図９Ｆ）において特異的に、細胞質架橋マーカーであるＴＥＸ１４（Ｇｒｅｅｎｂａｕｍら、２００９；Ｌｅｉ＆Ｓｐｒａｄｌｉｎｇ、２０１６）の発現および局在を示した。ＲＡと組み合わせた場合、ＢＭＰ４，５および７はまた、ＶＲ／ＤＤＸ４およびＳＣＰ３（＋）細胞を誘導することができた。従って、ＲＡおよびＢＭＰシグナル伝達の組み合わせ作用は、培養ＰＧＣＬＣを雌の運命に導く可能性がある。
ＢＭＰとＲＡがＰＧＣＬＣを雌の運命にコミットさせる
本発明者らはさらに、ＶＲがＲＡおよびＢＭＰに対してより特異的な応答を示すので（図９ＣおよびＤ）、ＢＶＳＣＶＲ ＥＳＣ（ＸＸ）から誘導されたＰＧＣＬＣに対するＲＡおよびＢＭＰシグナル伝達の影響を調べた。ｃ３以降のＲＡおよびＢＭＰ２を用いた培養は、ｃ７でのＢＶＳＣの下方制御をもたらし、ｃ９でＢＶＳＣを有意に低下させたが、ＲＡ単独ではそうならなかった（図１０Ａ）。逆に、この条件下では、ＶＲはｃ７までに活性化され始め、ＳＣ（＋）細胞の大部分（約７０％）はｃ９でＶＲを示した（図１０Ａ）。本発明者らは、ＲＡおよびＢＭＰ２で刺激されたＰＧＣＬＣが、ＢＭＰシグナリングの直接的な下流標的である、リン酸化（ｐ）ＳＭＡＤ１／５／８を上昇させ、およびＩｄ１およびＩｄ２の発現を上昇させることを確認した（Ｈｏｌｌｎａｇｅｌｅｔ ａｌ、１９９９；Ｋｏｒｃｈｙｎｓｋｙｉ＆ｔｅｎ Ｄｉｊｋｅ、２００２；Ｌｏｐｅｚ－Ｒｏｖｉｒａ ｅｔ ａｌ、２００２）。そしてＡＬＫ２／３受容体の選択的阻害薬であるＬＤＮ１９３１８９（Ｃｕｎｙ ｅｔ ａｌ、２００８）の投与がかかる効果をブロックした。このことは、ＰＧＣＬＣがＢＭＰシグナル伝達経路を活性化する能力があることを示す（下記も参照）。
ＩＦ解析により、ＲＡおよびＢＭＰ２と培養されたＰＧＣＬＣは、重要な減数分裂誘導因子であるＳＴＲＡ８（Ｂａｌｔｕｓ ａｔ ａｌ、２００６；Ａｎｄｅｒｓｏｎ ｅｔ ａｌ、２００８；Ｄｏｋｓｈｉｎ ｅｔ ａｌ、２０１３；Ｓｏｈ ｅｔ ａｌ、２０１５）の発現を、ｃ５の早期に開始［～４０．７％／ＳＣ（＋）細胞］し、ｃ７ではＳＣ（＋）細胞の大部分（～９１．７％）がＳＴＲＡ８の発現を示し、そのうちいくつか（～２７．１％）はＳＣＰ３（＋）であった（図１０ＢおよびＣ）。注目すべきことに、ｃ９では、９０％以上のＳＣ（＋）細胞がＳＣＰ３をシナプトネーム複合体様構造形成を伴って発現し、ＳＴＲＡ８は減弱し始めた（図１０ＢおよびＣ）。興味深いことに、ＳＣＰ３は、培養中の所定の時間に異なるコロニーを含むすべてのＳＣ（＋）細胞において同調した様態で上方制御された（図１０ＢおよびＤ）。ｃ５からｃ９まで、ＳＣ（＋）細胞はＤＡＺＬに関して明確な陽性を示した（図１０Ｂ）。
減数分裂の進入は、前減数分裂期ＤＮＡ複製および４倍染色体（４Ｃ）状態での停止を特徴とする（Ｂａｌｔｕｓら、２００６）。ＲＡおよびＢＭＰ２の存在下では、ＢＶ／ＳＣ（＋）細胞はｃ５までの増殖の増強を示し、ｃ７までに増殖を停止させ、ｃ９までにそのピーク数の約半分に減少した（図１０Ｅ）。細胞周期解析により、ｃ７において、ＢＶ／ＳＣ（＋）細胞の相当部分（～４６．０％）がそれらのＤＮＡを複製している（約２３．６％）か、または４Ｃ状態（～２３．６％）かのいずれかであることを明らかになった（図１０Ｆ）。ｃ９では、意外なことに、ＢＶ／ＳＣ（＋）細胞の大多数（約５８．７％）が４Ｃ状態にあった（図１０Ｆ）。ＰＧＣＬＣを対照条件またはＲＡ単独で培養した場合はそうではなかった（図１０Ｆ）。まとめると、これらの知見は、ＲＡおよびＢＭＰ２と培養されたＰＧＣＬＣが雌の運命をとり、減数分裂前期に進入することを示している。実際、拡散解析により、減数分裂前期のＳＣ（＋）細胞が太糸期（細糸期：約５０．４％；接合期：約４７．８％；太糸期：約１．８％）まで進行したことを明らかになった（図１０Ｇ）。
本発明者らが採用した条件下では、ＲＡ単独では雌の生殖細胞運命を誘導するには不十分であった。ＲＡと培養したＰＧＣＬＣは、ＤＴ／ＤＡＺＬをある程度活性化し、ＳＴＲＡ８を上方制御した［ＢＶ／ＳＣ（＋）細胞の～７７．７％がＳＴＲＡ８を発現していた］が、ＲＡはＶＲ／ＤＤＸ４やＳＣＰ３を活性化せず（図９ＢおよびＣ、１０Ａ）、ＲＡ添加ＢＶ／ＳＣ（＋）細胞はｃ９でも減数分裂に移行せず細胞周期が回っているようであった（図１０Ｆ）。予期せぬことには、ＢＭＰ２単独では、ＲＡおよびＢＭＰ２よりも効果的ではないが、ｃ９においてＶＲおよびＳＣＰ３（＋）減数分裂細胞が誘導された（図９Ｄ）。本発明者らの培養物には、１０％のＫＳＲおよび２．５％のウシ胎児血清（ＦＣＳ）（図９Ａ）が含まれていたので、かかる成分中のＢＭＰ活性の存在は無視し得る一方、ＲＡ活性の存在（Ｈｏｒｅ ｅｔ ａｌ、２０１６）は、外因性ＢＭＰシグナル伝達に応答して雌の運命をとる能力をＰＧＣＬＣに与え得る。したがって、ＰＧＣＬＣの、ＢＭＰ２およびＲＡ受容体（ＲＡＲ）に対する阻害薬（ＢＭＳ４９３）との培養（Ｋｏｕｂｏｖａ ｅｔ ａｌ、２００６）は、ＶＲ／ＤＤＸ４の上方制御ならびにＳＣＰ３の誘導を無効にした。同様に、ＬＤＮ１９３１８９によるＢＭＰシグナル伝達の阻害は、ＲＡおよびＢＭＰ２によって誘発されるＶＲ活性化および減数分裂進入を用量依存的様式で遮断した。本発明者らは、ＰＧＣＬＣを雌経路に誘導するのに、ＲＡおよびＢＭＰシグナル伝達が必要であり、かつ十分である可能性が高く、ＲＡまたはＳＴＲＡ８単独ではかかる誘導ができないと結論付ける。
ＢＭＰとＲＡがＰＧＣを雌の運命にコミットさせる
本発明者らは次に、ＰＧＣにおける雌の性決定におけるＲＡおよびＢＭＰシグナル伝達の役割を調べた。本発明者らは、ＦＡＣＳによってＳｔｅｌｌａ－ＥＧＦＰ（ＳＧ）トランスジェニック胚（Ｐａｙｅｒ ｅｔ ａｌ、２００６；Ｓｅｋｉ ｅｔ ａｌ、２００７）からＥ１１．５でＰＧＣを単離し、ＲＡ、ＢＭＰ２、またはその両方と４日間培養した（図１１Ａ）。対照培養もＲＡ単独の培養もＳＣＰ３を誘導せず、ＳＧおよびＤＤＸ４発現にも有意に影響しなかったが、ＲＡおよびＢＭＰ２との培養は、ＳＣＰ３－陽性（＋）／ＤＤＸ４－強陽性（＋）／ＳＧ－陰性（－）の誘導を相当増加させた（～６５．６％）（図１１ＢおよびＣ）。ＢＭＰ２単独との培養も、ＳＣＰ３－陽性（＋）／ＤＤＸ４－強陽性（＋）／ＳＧ－陰性（－）細胞を誘導（～２２．９％）した（図１１ＢおよびＣ）。
本発明者らは、Ｅ１１．５で全胚卵巣の培養を行い、ＲＡまたはＢＭＰシグナル伝達の阻害薬が雌の生殖細胞運命の誘導に及ぼす影響を調べた。結果は、いずれのタイプの阻害薬も、ＳＣＰ３の発現によって表されるように、雌の生殖細胞運命への進行を抑制したことを示した（図１１Ｄ－Ｆ）。同様に、Ｅ１１．５からＥ１４．０まで１２時間ごとにＬＤＮ１９３１８９を妊娠した雌に投与することによるインビボ条件下でのＢＭＰシグナル伝達の阻害は、Ｅ１４．５での雌性生殖細胞運命への進行の重大な障害を引き起こした（図１１Ｇ－Ｉ）。本発明者らは、Ｅ１４．５でＦＡＣＳによりＬＤＮ投与胚から雌または雄のＶＲ（＋）細胞を単離し、定量的（ｑ）ＰＣＲによって雌性または雄性生殖細胞発生の重要な遺伝子の発現を、それぞれ調べた。この解析により、ＬＤＮ処理された雌性細胞が、Ｄｄｘ４、Ｄａｚｌ、Ｓｙｃｐ３、Ｐｒｄｍ９、およびＳｐｏ１１等の後期ＰＧＣ／雌性生殖細胞発生の重要な遺伝子の上方制御が示されたが、興味深いことに、出現した雄性生殖細胞発生は影響を受けなかった（図１１ＪおよびＫ）。本発明者らは、ＰＧＣおよびＰＧＣＬＣの両方が、雌の生殖細胞の運命を獲得するためにＲＡおよびＢＭＰシグナル伝達を必要とすると結論する。
ＰＧＣＬＣ／ＰＧＣの雌性別判定における転写の動態
次に、本発明者らは、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣの雌の性決定中の転写の動態を分析した。この目的のために、本発明者らは、ＰＧＣ［Ｅ９．５、Ｅ１０．５、Ｅ１１．５、Ｅ１２．５（雌）、Ｅ１２．５（雄）でのＳｔｅｌｌａ－ＥＧＦＰ（＋）細胞］（Ｋａｇｉｗａｄａ ｅｔ ａｌ、２０１３）、胎児一次卵母細胞［Ｅ１３．５でのＳｔｅｌｌａ－ＥＧＦＰ（＋）、Ｅ１４．５、Ｅ１５．５でのＤＤＸ４－ＲＦＰ（＋）］、ＰＳＧ［Ｅ１３．５でのＳｔｅｌｌａ－ＥＧＦＰ（＋）（Ｋａｇｉｗａｄａ ｅｔ ａｌ，２０１３）、Ｅ１４．５、Ｅ１５．５でのＤＤＸ４－ＲＦＰ（＋）］、コントロール条件（ｄ４／ｃ０、ｃ３、ｃ５、ｃ７、ｃ９）の下で培養したＰＧＣＬＣ、ｃ３以降（ｃ５ ＲＢ２、ｃ７ ＲＡ２、ｃ９ ＲＡ２）ＲＡとともに培養したＰＧＣＬＣ、ｃ３以降（ｃ５ ＲＡＢ２、ｃ７ ＲＡＢ２、ｃ９ ＲＡＢ２）ＲＡおよびＢＭＰ２とともに培養したＰＧＣＬＣから全ＲＮＡを単離し、ＲＮＡシーケンシング（ＲＮＡ－ｓｅｑ）（Ｎａｋａｍｕｒａ ｅｔ ａｌ、２０１５）により、そのトランスクリプトームを解析した。
教師なし階層的クラスタリング（ＵＨＣ）は、Ｅ１１．５までの性未分化ＰＧＣがｄ４ ＰＧＣＬＣと、次いでｃ３－ｃ９ ＰＧＣＬＣとおよびｃ５でのＲＡまたはＲＡＢ２刺激ＰＧＣＬＣ（ｃ５ ＲＡ、ｃ５ ＲＡＢ２）と近くにクラスタリングしていることを明らかにした（図１２Ａ）。胎児一次卵母細胞（Ｅ１４．５、Ｅ１５．５）およびＰＳＧ（Ｅ１４．５、Ｅ１５．５）はそれぞれ明確なクラスターを形成し、意外なことに、ｃ９におけるＲＡＢ２刺激ＰＧＣＬＣ（Ｒ９ｃ９）は胎児一次卵母細胞と堅固なクラスターを形成した（図１２Ａ）。性分化を開始した生殖細胞（Ｅ１２．５、Ｅ１３．５での雄および雌の生殖細胞）及びｃ７におけるＲＡＢ２刺激ＰＧＣＬＣ（ｃ７ ＲＡＢ２）およびｃ７／ｃ９におけるＲＡ刺激ＰＧＣＬＣ（ｃ７／ｃ９ＲＡ）は、性未分化のＰＧＣ／ＰＧＣＬＣと胎児一次卵母細胞／ｃ９ ＲＡＢ２細胞との間の性質を示す明確なクラスターを形成した（図１２Ａ）。一貫して、主成分分析（ＰＣＡ）は、性未分化のＰＧＣおよびｄ４／ｃ３－ｃ９ ＰＧＣＬＣを近接してクラスター化し、雌性および雄性の生殖細胞特性の発生に沿って進行する移行を強調し、雌経路に沿ってＲＡＢ２と培養したＰＧＣＬＣと、Ｅ１４．５／Ｅ１５．５において胎児の一次卵母細胞とクラスター化されたｃ９ ＲＡＢ２細胞との、並行的な進行を明らかにした（図１２Ｂ）。対照的に、ＲＡで培養したＰＧＣＬＣは、胎児卵母細胞の特性を部分的にしか獲得しなかった（図１２Ｂ）。したがって、ＲＡ およびＢＭＰ２で刺激された培養ＰＧＣＬＣは、雌性経路のトランスクリプトームの進行を反復して、胎児一次卵母細胞を形成する。
生殖細胞／ＰＧＣＬＣの性分化過程における遺伝子発現のダイナミクスの理解を促進するために、本発明者らは、これらの細胞の発生段階段階を特徴づける、４クラスの遺伝子セット、初期ＰＧＣ遺伝子（３１８遺伝子）、後期生殖細胞遺伝子（２５４遺伝子）、胎児卵母細胞遺伝子（４７６遺伝子）及びＰＳＧ遺伝子（３２３遺伝子）を定義した（図１２Ｃ）。初期のＰＧＣ遺伝子は、「細胞分化の負の調節／細胞周期の調節」（Ｐｒｄｍ１、Ｐｒｄｍ１４、Ｔｆａｐ２ｃ、Ｎａｎｏｇ、Ｓｏｘ２等）のような遺伝子オントロジー（ＧＯ）の機能的用語を有する遺伝子を多くした；後期の生殖細胞遺伝子は、「有性生殖／配偶子生成」の遺伝子（Ｄａｚｌ、Ｄｄｘ４、Ｐｉｗｉｌ２、Ｍａｅｌ、Ｍｏｖ１０１１等）を多くした；胎児卵母細胞遺伝子は、「減数分裂／雌配偶子生成」の遺伝子（Ｓｔｒａ８、Ｒｅｃ８、Ｓｙｃｐ３、Ｄｍｃ１、Ｓｙｃｐ１等）を多くした；そしてＰＳＧ遺伝子は「ｐｉＲＮＡ代謝プロセス／雄性配偶子生成」の遺伝子（Ｎａｎｏｓ２、Ｄｎｍｔ３ｌ、Ｔｄｒｄ９、Ｔｄｒｄ５、Ｐｉｗｉｌ１など）を多くした（図１２Ｃ）。
図１２ＣおよびＤに示されるように、ＲＡＢ２と培養したＰＧＣＬＣは、遅い生殖細胞および胎児卵母細胞遺伝子を徐々に獲得する一方、初期ＰＧＣ遺伝子を下方制御した。対照的に、ＲＡと培養されたＰＧＣＬＣは、かかる進行を部分的にしか示さなかった（図１２ＣおよびＤ）：例えばｃ９ ＲＡＢ２細胞は減数分裂（Ｓｔｒａ８、Ｒｅｃ８、Ｓｙｃｐ３、Ｓｙｃｐ１、Ｓｐｏ１１、Ｄｍｃ１、Ｈｏｒｍａｄ１、Ｐｒｄｍ９）（全て胎児卵母細胞中に含まれる）及び卵母細胞発生（Ｆｉｇｌａ，Ｙｂｘ２，Ｎｏｂｏｘ，Ｃｐｅｂ１）の主要遺伝子を、Ｅ１４．５／Ｅ１５．５胎児卵母細胞と同様のレベルまで上方制御した（図１２Ｅ）。対照的に、ｃ９ ＲＡ細胞は、異種細胞の状況においてもＲＡイベントに応答するＳｔｒａ８およびＲｅｃ８遺伝子を上方制御したにもかかわらず、かかる遺伝子の十分な獲得を示さなかった（Ｏｕｌａｄ－Ａｂｄｅｌｇｈａｎｉ ｅｔ ａｌ、１９９６；Ｍａｈｏｎｙ ｅｔ ａｌ、２０１１）（図１２Ｅ）。雌の生殖細胞の運命決定におけるＢＭＰシグナル伝達の役割と一致して、ＲＡＢ２と培養されたＰＧＣＬＣおよび発生中の雌の生殖細胞は、同様の様態でＢＭＰシグナル伝達の受容体および重要な標的を発現した。
本発明者らは、ｃ９ ＲＡＢ２細胞（３２３遺伝子：ＲＡ遺伝子）と比較して、ｃ９ ＲＡ細胞において上方制御された遺伝子を同定した。かかる遺伝子はまた、Ｅ１４．５／Ｅ１５．５での胎児一次卵母細胞と比較して上方制御され、「細胞接着／血管系発生／胚器官発生」のためのもの（Ｈｏｘａ５、Ｈｅｓｘ１、Ｐａｘ６、Ｌｍｘ１ｂ、Ｐｉｔｘ２、Ｄｎｍｔ３ｂ、等）に富んでいた。したがって、ＢＭＰシグナリングは、雌の経路を強く駆動するだけでなく、ＲＡによって誘発される不適切な発生プログラムを抑制するためにも重要である。
胎児一次卵母細胞の発生におけるＳＴＲＡ８の役割
本発明者らは次に、ＰＧＣＬＣからの胎児一次卵母細胞分化中のＳｔｒａ８の喪失の影響を評価した。本発明者らは、ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ９システム（Ｒａｎ ｅｔ ａｌ、２０１３ａ、ｂ）を用いていくつかの株のＳｔｒａ８－Ｋｎｏｃｋｏｕｔ ＢＶＳＣ ＥＳＣ（ＸＹ）を作製し、これらの株における標的エクソン内のフレームシフト欠失およびＳＴＲＡ８発現の喪失を確認した。３つの独立した株（Ｓｔｒａ８－ｋｎｏｃｋｏｕｔ（ＳＫ）１，２，３）は、本質的に同一の表現型を示したので、代表的な株ＳＫ１を用いて結果を提示する。野生型ＰＧＣＬＣとは異なり、ＲＡＢ２と培養したＳＫ１細胞は、ｃ７まで確固としたＢＶＳＣ発現を保持し続け、ｃ９においてのみＢＶＳＣの軽度の下方制御を示した（図１３Ａ）。野生型細胞と比較して、ＳＫ１細胞は、ＲＡＢ２に応答してそれほど効果的に増殖しなかったが、ｃ９（図１３ＢおよびＣ）でも周期プロファイルを示し続けた。このことは、それらが減数分裂前期に進むことができなかったことを示す。この知見は、Ｓｔｒａ８ノックアウト生殖細胞が減数分裂前のＤＮＡ複製を起こさず、その後除去されるという事実とよく一致している（Ｂａｌｔｕｓ ｅｔ ａｌ、２００６；Ｄｏｋｓｈｉｎ ｅｔ ａｌ、２０１３）。
本発明者らは、ＳＫ１細胞のトランスクリプトームを決定した。ＰＣＡは、ＳＫ１ ＲＡＢ２細胞が雌経路に沿って長期間に進行し、ｃ９において、Ｅ１３．５の胎児一次卵母細胞により近い野生型ｃ７細胞と同様の性質を獲得したことを明らかにした（図１３Ｄ）。野生型細胞と比較して、ＳＫ１細胞は、ｃ７以降数多くの異なる発現遺伝子（ＤＥＧ）を示し（図１３Ｅ）、ｃ９ ＳＫ１細胞において完全に上方制御されなかった遺伝子（１７８遺伝子）は、「減数分裂／細胞周期プロセス」のためのもの（Ｐｒｄｍ９、Ｓｙｃｐ３、Ｓｐｏ１１、Ｓｍｃ１ｂ、Ｍｓｈ４、Ｍｓｈ５、Ｄｍｃ１、Ｃｃｄｃ１１１、Ｐｏｌｎなど）に富んでおり（図１３Ｆ）、Ｓｔｒａ８に依存することが報告されている１２個の遺伝子（Ｓｏｈ ｅｔ ａｌ、２０１５）すべてが、ｃ９ ＳＫ１細胞において下方制御されていた。
しかし、ｃ９ ＳＫ１細胞は、Ｙｂｘ２およびＳｏｈｌｈ２等の卵母細胞発生に関連するものを含め、比較的正常な様式で３２．１％の胎児卵母細胞遺伝子（１５３／４７６遺伝子）を上方制御したことが注目される（図１３Ｆ－Ｈ）。興味深いことに、ｃ９ ＳＫ１細胞において異常に上方制御された遺伝子は、「胚性器官発達／胎児胚発生」のものに富んでおり、ｃ９ ＲＡ細胞において異常に上方制御されたＲＡ遺伝子とオーバーラップした（図１３ＦおよびＧ）。一方、ｃ９ ＳＫ１細胞は比較的正常な様式で後期生殖細胞遺伝子を獲得した［１６４／２５４遺伝子（６４．６％）］（図１３Ｆ－Ｈ）。したがって、ＳＴＲＡ８は、ＢＭＰシグナル伝達のエフェクター（複数可）と協力して、ＲＡによって誘発される不必要な発生経路を抑制することに加えて、減数分裂に関与するいくつかの遺伝子の十分な発現レベルを保証する。
ＲＡ及びＢＭＰに応答して雌の運命を誘導するための細胞のコンピテンス
骨形成タンパク質のシグナル伝達は、外胚葉／ＥｐｉＬＣをＰＧＣ／ＰＧＣＬＣへ運命決定するが、それらを雌の運命に直接的に誘導しない（Ｈａｙａｓｈｉ ｅｔ ａｌ、２０１１）。したがって、本発明者らは、ＲＡおよびＢＭＰシグナル伝達に応答して雌の運命をもたらす細胞の状況を明確にしようと試みた。本発明者らは、ｄ４／ｃ０またはｃ７のＰＧＣＬＣを、ＲＡおよびＢＭＰ２と２日間培養し、それらのトランスクリプトームを調査することによってそれらの応答を評価した（図１４ＡおよびＢ）。対照と比較して、ＲＡＢ２を伴うｃ７ ＰＧＣＬＣは、相当数のＤＥＧを示し（上昇：２１８遺伝子、低下：５６遺伝子）、減数分裂のためのものに富む遺伝子群を上方制御し、雌経路に沿って進行した（図１４ＣおよびＤ）。対照的に、ＲＡＢ２を伴うｄ４／ｃ０ ＰＧＣＬＣは、遺伝子発現において僅かな変化しか示さず（上昇：７遺伝子；低下：２遺伝子）、そして雌の運命に向かって進行しなかった（図１４ＢおよびＣ）。
本発明者らは、増幅培養の間の減数分裂のための重要な遺伝子のＤＮＡ脱メチル化が、ＲＡおよびＢＭＰ２に応答するための、ＰＧＣＬＣによるコンピテンス獲得の基礎となる可能性があると推論した。本発明者らは、プロモーターの５－メチルシトシン（５ｍＣ）レベルと、「減数分裂」に関与するものとして分類された遺伝子［ＧＯ用語：減数核分裂ＧＯ：０００７１２６］の発現レベルとの関係を解析した。かかる１５２遺伝子のうち、Ｓｔｒａ８、Ｓｐｏ１１、Ｓｙｃｐ３、Ｄｐｅｐ３、Ｄａｚｌ、Ｄｄｘ４およびＰｉｗｉｌ２を含む４２遺伝子は、ｄ４／ｃ０とｃ７の間で＞２０％のプロモーター脱メチル化を示した。一方、１１０遺伝子は、培養の間に有意なプロモーター５ｍＣレベル変化を示さず（＜２０％）、「ＤＮＡ修復」および「ＤＮＡ損傷刺激に対する応答」等の一般的な過程に関与するするもの（Ｍｌｈ１、Ｂｒｃａ２、Ｆａｎｃａ、Ｃｄｃ２０、Ｐｌｋ１など）から成っていた（図１４Ｅ）。ｄ４／ｃ０ ＰＧＣＬＣにおいて、４２遺伝子は、プロモーターの５ｍＣレベルが高く、無発現／低発現を示したが、１１０遺伝子はほとんどメチル化されておらず、様々な発現レベルを示した、その分布は、プロモーター５ｍＣレベルが低い全遺伝子の分布に類似していた（図１４ＥおよびＦ）。ｃ７ ＰＧＣＬＣにおいては、４２遺伝子は、他のほぼすべての遺伝子と同様に脱メチル化され、ＤａｚｌおよびＨｏｒｍａｄ１等の、４２遺伝子のいくつかが部分的に上方制御されたが、１１０遺伝子はメチル化されないままであり、ｄ４／ｃ０ ＰＧＣＬＣにおける発現レベル分布と同様の発現レベル分布を維持した（図１４ＥおよびＦ）。注目すべきことに、ｃ７において、ＲＡおよびＢＭＰ２に応答して、４２遺伝子が特異的かつ確固とした活性化を示したが、１１０遺伝子は軽度の上方制御しか示さなかった（図１４ＥおよびＦ）。まとめると、これらの知見は、ＰＧＣＬＣ増幅の間の、関連遺伝子のプロモーターＤＮＡ脱メチル化の進行が、かかる遺伝子の基底的な活性化または活性化に対する許容状態を誘導し、ひいては、ＲＡおよびＢＭＰのシグナル伝達に応答して完全に活性化された状態を獲得し、雌の生殖細胞の運命を形成することを示す。
この概念の、インビボでの生殖細胞発生への関連性を検証するために、本発明者らは、Ｅ９．５とＥ１１．５との間のＰＧＣの１５２遺伝子の発現における差異を、ｄ４／ｃ０とｃ７との間のＰＧＣＬＣのこれらの遺伝子の発現における差異と比較した；本発明者らは次に、Ｅ１１．５のＰＧＣとＥ１３．５の胎児一次卵母細胞との間の１５２遺伝子の差次的発現、および、ＢＭＰ２およびＲＡにより２日間刺激されたｃ７ ＰＧＣＬＣとｃ７ ＰＧＣＬＣとの間の差次的発現を比較した。図１４Ｇに示す通り、生殖細胞およびＰＧＣＬＣ発生の連続段階の間の４２遺伝子の発現の差異（上方制御）は、非常に相関した。１５２遺伝子を用いたＰＣＡは、一貫して、ｄ４／ｃ０ ＰＧＣＬＣを、Ｅ９．５ＰＧＣと近接して、ｃ７ ＰＧＣをＥ１１．５ ＰＧＣと近接して、およびＲＡＢ２と４８時間培養したｃ７ ＰＧＣＬＣをＥ１３．５雌性生殖細胞と近接してクラスタリングした（図１４Ｈ）。本発明者らは、ＰＧＣＬＣベースのインビトロ系がｉｎ ｖｉｖｏでの雌性生殖細胞運命の獲得のためのメカニズムを正確に再現すると結論する。
［ＩＩＩ］シクロスポリンＡ並びに該薬剤とＰＤＥ４阻害薬及びフォルスコリンとの併用によるＰＧＣ／ＰＧＣＬＣの維持増幅
＜材料及び方法＞
マウス、フィーダー細胞は、実施例［Ｉ］に記載のものを使用した。ＥＳＣの作製からＰＧＣＬＣへの分化誘導まで、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣの精製、免疫染色、ＰＧＣＬＣのマウス精巣への移植及びその解析、並びにＲＮＡ－ｓｅｑ及びその解析は、実施例［Ｉ］と同様にして行った。
シクロスポリンＡ（ＣｓＡ）の併用効果を調べるＰＧＣ／ＰＧＣＬＣの維持増幅培養は、１０μＭフォルスコリン及び１０μＭロリプラム（ＦＲ１０）に加えて、５μＭ ＣｓＡを培地に添加する以外は、実施例［Ｉ］と同様にして行った。
ＰＧＣＬＣの維持増幅に及ぼすＣｓＡ単独の促進効果、及び該促進効果のメカニズムを調べる実験では、ＦＲ１０に代えて、種々の濃度（１０、５、１及び０μＭ）のＣｓＡ又はＦＫ５０６（タクロリムス）を培地に添加する以外は、実施例［Ｉ］と同様にしてＰＧＣＬＣを維持培養した。
細胞周期分析
ＢｒｄＵに代えて、ＥｄＵ（１０μＭ）を用い、ＥｄＵの取り込みの検出に、Ｃｌｉｃｋ－ｉＴＴＭ Ｐｌｕｓ ＥｄＵ Ａｌｅｘａ ＦｌｕｏｒＴＭ ６４７ Ｆｌｏｗ Ｃｙｔｏｍｅｔｒｙ Ａｓｓａｙ Ｋｉｔ（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）を使用した以外は、実施例［Ｉ］と同様にして行った。
アポトーシス細胞の検出
ＦＲ１０もしくはＦＲ１０＋ＣｓＡで培養したｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣをＴｒｙｐＬＥ処理により単一細胞に分散させ、メーカーの説明書に従い、Ａｎｎｅｘｉｎ Ｖ Ａｐｏｐｔｏｓｉｓ Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ Ｋｉｔ ＡＰＣ（ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ）を用いて染色した。染色されたサンプルを、ＦＡＣＳＤｉｖａ（ＢＤ）ｓｏｆｔｗａｒｅと共にＢＤ ＦＡＣＳＡｒｉａＩＩＩ（ＢＤ）を用いて分析し、ＰＧＣＬＣはＢＶの蛍光により同定した。３つの生物学的複製物を各サンプルについて分析した。
顕微授精（ＩＣＳＩ）
実施例［Ｉ］に記載の方法によりＰＧＣＬＣを移植したマウス精巣から精子を回収し、ＰＭＳＧ及びｈＣＧを注入することにより過排卵させたＢＤＦ１のメスから回収した卵子に、マイクロマニピュレーターを用いて直接注入した。得られた２細胞胚を、妊娠後（ｄｐｃ）０．５日目に偽妊娠ＩＣＲメスの卵管に移した。仔を１８．５ｄｐｃで帝王切開により分娩させた。
＜結果＞
ＰＧＣＬＣの培養系におけるＣｓＡの効果
フォルスコリン及びＰＤＥ４阻害薬以外に、ＰＧＣＬＣの増殖を支持する化合物を探索するため、実施例［Ｉ］にて行った化合物ライブラリースクリーニングの結果を詳細に解析した。その結果、ＣｓＡがスクリーニングデータ中に３つ含まれており、その内２つが＋３ＳＤを超えていた（図１６Ａ）。ＣｓＡの効果を確認するため、異なる濃度のＣｓＡをＰＧＣＬＣに作用させたところ、５μＭのＣｓＡが最もＰＧＣＬＣを増殖させることのできる至適濃度であることが明らかとなった（図１６Ｂ）。次に、ＣｓＡがフォルスコリン及びＰＤＥ４阻害薬（ＦＲ１０）の存在下においても、ＰＧＣＬＣの増殖をさらに支持できるのかを調べたところ（図１６Ｃ）、ＣｓＡの添加により、平均して約５０倍程度にまで、ＰＧＣＬＣをより増幅させ得ることが明らかとなった（図１６Ｄ）。また、ＣｓＡにより増幅されたＰＧＣＬＣは平らなコロニーを形成し、ＢＶＳＣを強く発現していることを確認した（図１６Ｅ）。
ＰＧＣＬＣの培養系においてＣｓＡがどのような影響を及ぼすのかを調べるため、細胞周期解析（図１６Ｆ）及びアポトーシス細胞の検出（図１６Ｇ）を行った。その結果、ＣｓＡを作用させたＰＧＣＬＣは、ＦＲ１０のみを作用せたＰＧＣＬＣに比べて、Ｓ期の割合が増加し（（図１６Ｆ、右図）、アポトーシス細胞の割合の低下が認められた（図１６Ｇ、右図）。以上の結果から、ＣｓＡはＰＧＣＬＣの細胞周期を促進し、さらに、アポトーシスを抑制することにより、ＰＧＣＬＣの増殖を支持していると考えられた。
ＣｓＡは免疫抑制作用を有する化合物として知られているが、ミトコンドリアに作用してアポトーシスを抑制する効果も有することが知られている。そこで、ＣｓＡのＰＧＣＬＣ増殖効果がどちらによるものなのかを調べるため、ＦＫ５０６のＰＧＣＬＣへの影響を解析した。
ＦＫ５０６はＣｓＡと同様の作用機序で免疫抑制効果を示すが、ミトコンドリアへの影響は無い化合物であることが知られている。その結果、ＦＫ５０６はＰＧＣＬＣの増殖効果を有しないことが明らかとなった（図１６Ｈ）。以上の結果から、ＣｓＡはＰＧＣＬＣのミトコンドリアへ作用し、アポトーシスを抑制することにより、その増殖を支持することが示唆された。
ＣｓＡによる増幅培養中のＰＧＣＬＣの転写・エピジェネティック特性とｉｎ ｖｉｖｏ ＰＧＣにおけるＣｓＡの効果
次に、ＣｓＡによる増幅培養中のＰＧＣＬＣの詳細な転写特性（ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌ ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ）を、実施例［Ｉ］（図４Ｂ）と同様の方法を用いて決定した（図１７Ａ）。主成分分析（ＰＣＡ）の結果、ＦＲ１０にＣｓＡを添加して増幅したＰＧＣＬＣは、ＦＲ１０で増幅したＰＧＣＬＣと同様の遺伝子発現パターンを示すことが明らかとなった（図１７Ａ）。また、エピジェネティック特性をＩＦにより解析したところ、ＦＲ１０にＣｓＡを添加して増幅したＰＧＣＬＣは、ＦＲ１０で増幅したＰＧＣＬＣと同様のエピジェネティック特性を有することが明らかとなった（図１７Ｂ、Ｃ）。以上の結果から、ＦＲ１０にＣｓＡを添加して増幅したＰＧＣＬＣは、ＦＲ１０で増幅したＰＧＣＬＣと同様の特性を持つことが示唆された。
また、ＣｓＡがｉｎ ｖｉｖｏ ＰＧＣの増殖を支持可能かどうかを調べるため、Ｅ９．５のＰＧＣを回収し、試験管内で培養した。その結果、ＦＲ１０にＣｓＡを添加することにより、ｉｎ ｖｉｖｏ ＰＧＣを約１６倍程度にまで増幅可能であることが明らかとなった（図１７Ｄ）。以上の結果から、ＣｓＡはＰＧＣＬＣのみならず、ｉｎ ｖｉｖｏのＰＧＣの増幅も支持し得ることが明らかとなった。
ＣｓＡにより増幅培養されたＰＧＣＬＣの精子形成能
次に、ＦＲ１０＋ＣｓＡにより増幅されたＰＧＣＬＣが、ＰＧＣＬＣとしての機能を維持するかどうかを評価した。この目的のために、ＦＲ１０＋ＣｓＡで増幅したｄ４ｃ７ ＰＧＣＬＣを内因性生殖細胞を欠く新生児Ｗ／Ｗｖマウスの精巣に移植した。移植後１０週の精巣を解析したところ、精子形成の証拠を伴う多数の精細管を含み、実際に豊富な精子を産生した（図１８Ａ－Ｅ）。さらに、得られた精子を用いて顕微授精（ＩＣＳＩ）を行ったところ、正常な産仔が得られ（図１８Ｆ－Ｉ）、正常な成長を示した（図１８Ｊ）。これらの結果から、ＣｓＡで増幅したＰＧＣＬＣは、機能的な精子へと分化可能であることが明らかとなった。
本発明によれば、ＰＧＣ／ＰＧＣＬＣから試験管内において卵子を作製できる可能性がある。
従って、本発明は、不妊症に関する基礎研究への展開、生殖補助医療への応用が期待され、きわめて有用である。
本出願は、日本で出願された特願２０１７－２３１２９４（出願日：２０１７年１１月３０日）を基礎としており、ここで言及することにより、その内容は全て本明細書に包含されるものである。
［配列表］
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Claims (5)

  1. 始原生殖細胞（ＰＧＣ）又は単離された多能性幹細胞由来の始原生殖細胞様細胞（ＰＧＣＬＣ）の維持増幅方法であって、ＰＧＣ又はＰＧＣＬＣをホスホジエステラーゼ４（ＰＤＥ４）阻害薬及び／又はシクロスポリンＡの存在下で培養することを含む、方法。
  2. ＰＧＣ又はＰＧＣＬＣを、フォルスコリンをさらに含む条件下で培養することを含む、請求項１に記載の方法。
  3. ＰＤＥ４阻害薬及び／又はシクロスポリンＡを含有してなる、ＰＧＣ又はＰＧＣＬＣの維持増幅用試薬。
  4. フォルスコリンを組み合わせてなる、請求項３に記載の試薬。
  5. ＰＧＣ又はＰＧＣＬＣから卵母細胞を誘導する方法であって、
    （ａ）ＰＧＣ又はＰＧＣＬＣをＰＤＥ４阻害薬及び／又はシクロスポリンＡの存在下で培養し、ＰＧＣ又はＰＧＣＬＣを維持増幅すること、並びに
    （ｂ）工程（ａ）で得られたＰＧＣ又はＰＧＣＬＣを、ＢＭＰ及びＲＡの存在下で培養するＢＭＰ及びＲＡの存在下で培養することを含む、方法。
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