JP7102406B2 - エキソソームの亜集団の定量および神経変性障害の診断 - Google Patents
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Description
本出願は、その全体が出典明示により本明細書に組み込まれる、2016年11月16日に出願された米国仮特許出願第62/422,889号の優先権を主張する。
本発明は、エキソソームの亜集団を定量するための方法および神経変性障害(例えばアルツハイマー病)のための診断および予後判定方法に関する。本発明はまた、エキソソームの亜集団を定量するための組成物並びにアルツハイマー病および他の神経変性障害を治療することにおいて有用な組成物および方法を提供する。
対象から生体試料を得ること;エキソソームに特異的な抗体を試料に適用すること、ここでエキソソームの存在は抗体-エキソソーム複合体を作製する;抗体-エキソソーム複合体を単離すること;抗体-エキソソーム複合体における1以上のバイオマーカーのレベルをアッセイすること;および1以上のバイオマーカーのレベルに基づいて対象における神経変性障害を診断する、もしくは予後判定する、神経変性障害のリスクがある対象を同定する、または治療レジメンを処方する、または神経変性障害を有する対象における治療による利益を予想すること、を含む方法を提供する。いくつかの実施形態では、抗体-エキソソーム複合体は固相上に作製される。さらなる他の実施形態では、該方法は、抗体-エキソソーム複合体からエキソソームを放出させることをさらに含む。或る実施形態では、固相は非磁性ビーズ、磁性ビーズ、アガロース、またはセファロースである。他の実施形態では、エキソソームは抗体-エキソソーム複合体を3.5-1.5間の低pHにさらすことにより放出される。さらなる他の実施形態では、放出されたエキソソームは、高pH溶液を加えることにより中和される。他の実施形態では、放出されたエキソソームは、放出されたエキソソームを溶解液とインキュベートすることにより溶解される。さらに他の実施形態では、溶解液はプロテアーゼおよびホスファターゼについての阻害剤を含有する。他の実施形態では、1以上のバイオマーカーのレベルは、エキソソームの数またはエキソソームバイオマーカーの値により正規化される。或る実施形態では、抗体はポリクローナルまたはモノクローナル抗体である。他の実施形態では、抗体は、モノクローナルNCAM抗体である。他の実施形態では、抗体は、モノクローナル抗ヒトNCAM抗体である。さらなる他の態様では、抗体は、モノクローナルCD171抗体である。他の態様では、抗体は、モノクローナル抗ヒトCD171抗体である。他の態様では、抗体は、モノクローナルCD9抗体である。他の態様では、抗体は、モノクローナルCD63抗体である。他の態様では、抗体は、モノクローナルCD81抗体である。他の態様では、抗体はニューロン特異的エノラーゼ抗体である。他の態様では、抗体は、モノクローナルSNAP25抗体である。他の態様では、抗体は、モノクローナルEAAT1抗体である。他の態様では、抗体は、モノクローナルOMGP抗体である。他の態様では、抗体は、モノクローナルニューロン特異的エノラーゼ抗体である。いくつかの実施形態では、エキソソームは、ニューロン由来のエキソソーム、アストロサイト由来のエキソソーム、オリゴデンドロサイト由来のエキソソーム、およびミクログリア由来のエキソソームからなる群から選択される。さらなる他の実施形態では、生体試料は、全血、血清、血漿、尿、間質液、腹水、子宮頸部スワブ、涙、唾液、頬スワブ、皮膚、脳組織、および脳脊髄液からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、神経変性障害は、以下からなる群から選択される:アルツハイマー病(AD)、血管疾患性認知症、前頭側頭型認知症(FTD)、大脳皮質基底核変性症(CBD)、進行性核上性麻痺(PSP)、レビー小体型認知症、神経原線維変化優位型老年期認知症、ピック病(PiD)、嗜銀顆粒病、筋萎縮性側索硬化症(ALS)、他の運動ニューロン疾患、グアムパーキンソン認知症複合、FTDP-17、リティコ-ボディグ病、多発性硬化症、外傷性脳損傷(TBI)、およびパーキンソン病。他の実施形態では、1以上のバイオマーカーのレベルは1以上のバイオマーカーのタンパク質、mRNA、またはmiRNAレベルである。
本発明は、アルツハイマー病および他の神経変性障害のための、バイオマーカーならびに診断方法および予後判定方法を提供する。本発明はまた、生体試料におけるエキソソームレベルを定量するためのバイオマーカーを提供する。バイオマーカーおよびエキソソームレベルは対象から得られた生体試料において決定される。いくつかの実施形態では、本発明の生体試料は、血液から得ることができる。いくつかの実施形態では、約1-10mlの血液が対象から採血される。他の実施形態では、約10-50mlの血液が対象から採血される。血液は、腕、脚、または中心静脈カテーテルを介してアクセス可能な血液を含む、身体の任意の適切な領域から採血できる。いくつかの実施形態では、血液は、処置または活動の後に収集される。例えば、血液は、健康診断の後に収集できる。また、収集のタイミングは、試料中に存在するエキソソームの数および/または組成を増加するように調整することができる。例えば、血液は、血管拡張を誘導する運動または処置の後に収集できる。
試料は、ポジティブセレクション、ネガティブセレクション、またはポジティブセレクションおよびネガティブセレクションの組み合わせを通して、エキソソームについて濃縮され得る。いくつかの実施形態では、エキソソームは直接捕捉される。他の実施形態では、血液細胞が捕捉され、エキソソームは残りの生体試料から収集される。いくつかの実施形態では、生体試料中で濃縮されたエキソソームは、ニューロン由来のエキソソーム、アストロサイト由来のエキソソーム、オリゴデンドロサイト由来のエキソソーム、およびミクログリア由来のエキソソームである。
本発明は、対象における神経変性障害を診断する、もしくは予後判定する、神経変性障害のリスクがある対象を同定する、または治療レジメンを処方する、または神経変性障害を有する対象における治療による利益を予想する方法を提供する。
バイオマーカーレベルは神経変性障害(例えばアルツハイマー病)を有するまたは有するリスクがある対象から得られる生体試料においてアッセイされる。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ドーパミン、セロトニン、GABA、グルタミン酸、オピオイド、オレキシン、アドレナリン、ノルアドレナリン、アセチルコリン、および/またはドーパミントランスポーターについての受容体である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、SNAP25、EAAT1、OMGP、DR1、SR2A、SR2C、GABAB1、GluR-1、KOR、OR、および/またはDATである。他の既知の神経変性障害バイオマーカーは本発明のバイオマーカーと組み合わせて使用されてもよい。かかるバイオマーカーの例は、出典明示により組み込まれる米国特許出願公報第2015/0119278号内容に提供される。
本発明の方法は、対象における神経変性障害を診断もしくは予後判定する、神経変性障害のリスクのある対象を同定する、および/または、治療レジメンを処方もしくは神経変性障害を有する対象における治療の利益を予測するために、臨床アッセイにおいて用いられてもよい。臨床アッセイ性能は、アッセイの感度、特異度、ROC曲線下面積(AUC)、精度、陽性適中率(PPV)、および陰性適中率(NPV)を決定することによって評価できる。本明細書中に開示されているものは、対象における神経変性障害を診断もしくは予後判定する、神経変性障害のリスクのある対象を同定する、または、治療レジメンを処方もしくは神経変性障害を有する対象における治療の利益を予測するためのアッセイである。
本発明の方法において有用な組成物は、神経変性障害に関連するバイオマーカーを特に認識する組成物であり、当該バイオマーカーは、SNAP25、EAAT1、OMGP、DR1、SR2A、SR2C、GABAB1、GluR-1、KOR、OR、およびDATである。さらに他の実施形態では、組成物は、ペプチド、核酸、抗体および低分子からなる群から選択される。
本発明は、対象からの生体試料におけるSNAP25、EAAT1、OMGP、DR1、SR2A、SR2C、GABAB1、GluR-1、KOR、OR、および/またはDATを検出すること、および神経変性障害を治療する有効量の組成物を対象に投与することを含む、対象における神経変性障害を治療する方法を提供する。いくつかの実施形態では、神経変性障害は、以下からなる群から選択される:アルツハイマー病(AD)、血管疾患性認知症、前頭側頭型認知症(FTD)、大脳皮質基底核変性症(CBD)、進行性核上性麻痺(PSP)、レビー小体型認知症、神経原線維変化優位型老年期認知症、ピック病(PiD)、嗜銀顆粒病、筋萎縮性側索硬化症(ALS)、他の運動ニューロン疾患、グアムパーキンソン認知症複合、FTDP-17、リティコ-ボディグ病、多発性硬化症、外傷性脳損傷(TBI)、およびパーキンソン病。他の実施形態では、生体試料は、全血、血清、血漿、尿、間質液、腹水、子宮頸部スワブ、涙、唾液、頬スワブ、皮膚、脳組織、および脳脊髄液からなる群から選択される。
本発明の別の態様は、対象における神経変性障害を検出またはモニタリングするためのキットを包含する。様々な構成要素を有する種々のキットが、本発明により企図されている。一般的に言うと、キットは対象から得られる生体試料におけるにおける1つ以上のバイオマーカーを定量するための手段を含む。別の実施形態では、キットは生体試料を収集するための手段、生体試料中の1つ以上のバイオマーカーを定量する手段、およびキットの内容物の使用のための説明書を含む。特定の実施形態では、キットは生体試料中のエキソソームを濃縮または単離するための手段を含む。さらなる態様では、エキソソームを濃縮または単離するための手段は、生体試料からエキソソームを濃縮または単離するために必要な試薬を含む。特定の態様では、キットは、バイオマーカーまたはエキソソームの特定のタイプ(例えばニューロン由来のエキソソーム)の量を定量するための手段を含む。さらなる態様では、バイオマーカーの量を定量するための手段は、バイオマーカーの量を検出するために必要な試薬を含む。
エキソソームの特定の亜集団は以下のように生体試料から単離され、定量される。ELISAアッセイはホワイトELISAプレート(Coster,Corning,NY)、ELISAコーテイングバッファ、およびELISA洗浄バッファ(BioLegend,San Diego,CA)を使用して実施した。抗体は、抗CD81(BD Pharmigen,San Jose、CA)、抗CD63(Sino Biological,North Wales、PA)、および抗SNAP25(Santa Cruz Biotechnology,Dallas TX)を含んだ。ビオチン化抗体は、抗CD81(LS Bio,Seattle、WA、およびMBL,Nagoya,Aichi,Japan)、抗CD171(eBioscience,San Diego、CA)、および抗SNAP25(Thermo Fisher Waltham、MA)を含んだ。EAAT1およびOMGP(Bioss抗体,Woburn、MA)に対する非コンジュゲートおよびビオチン化抗体もまた利用した。追加の材料には、正常マウスIgG(Santa Cruz Biotechnology,Dallas TX)、ExoQuick(System Biosciences,Palo Alto、CA)、ヒト血漿(Innovative Research,Novi、MI;Precision Med,San Diego、CA;BioReclamation IVT,Chestertown、MD)、tween-20(Sigma-Aldrich,St.Louis、MO)、EZ-Link Sulfo-NHS-ビオチン、Zebraスピンカラム、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)、10%ウシ血清アルブミン(BSA)、ブロッカーカゼイン、ストレプトアビジン(SA)Poly-HRP、HRP基質スーパーシグナル(Thermo Fisher)、ヒト神経芽腫細胞系(SK-N-SH、RIKEN BRC,Tsukuba,Ibaraki,Japan)、およびN2サプリメント(Wako Pure Chemicals Industries.,Osaka,Japan)を含んだ。
血漿試料を抗CD81または抗CD63抗体が以前に固定化されたELISAウェルにアプライした。未結合物質を除去した後、各ウェルを様々なビオチン化抗体にさらし、続いてSAポリ-HRP反応させ、化学発光シグナルを生じさせた。我々のスクリーニング試験の例として図6に示されるように、我々は最初に、抗CD81が抗CD63よりも良好な結果を示すことを見出した。多くのモノクローナル抗体の中で、我々は非常に強力な抗SNAP25および抗CD171抗体を見出した。エピトープ-エピトープ変動を避けるために、我々はEAAT1およびOMGPに対するポリクローナル抗体を使用し、かつ両抗体が抗CD81固定化ウェル上の血漿試料に非常に反応性であることを見出した。我々はまた、抗SNAP25、CD171、EAAT1、およびOMGPを固定化することにより抗体の組み合わせを切り替え、ビオチン化抗CD81でプローブした。結果は全く同等であったが、抗EAAT1およびOMGP固定化ウェルは、シグナル-ノイズ比を高めることによりわずかに優れた性能を示した。したがって、我々は、全エキソソーム(TE)(抗CD81プローブ)の定量のための抗CD81固定化ストリップならびにADEおよびODEの定量のための2種のNDE[抗SNAP25(sNDE)および抗CD171(cNDE)]、および抗EAAT1およびOMGP固定化ストリップ(抗CD81プローブ)を使用した。
エキソソームの特定の亜集団は以下のように生体試料から単離され、定量された。ELISAアッセイはホワイトELISAプレート(Coster,Corning,NY)、ELISAコーテイングバッファ、およびELISA洗浄バッファ(BioLegend,San Diego,CA)を使用して実施した。様々な抗体およびコントロールマウスIgGをELISAプレート上に固定化した。プールしたヒト血漿をELISAプレートにアプライした後、キャプチャーされたエキソソームを抗CD81抗体(BD Pharmigen,San Jose、CA)とインキュベートした。
Claims (6)
- 生体試料において二重陽性であるエキソソームを検出することを含む方法であって、前記エキソソームがCD81、CD63、およびCD9からなる群から選択される1以上のエキソソームバイオマーカーについて陽性であり、かつ前記エキソソームがドーパミン受容体(DR1)について陽性であり、それにより、前記試料における脳由来のエキソソームのレベルを定量する、方法。
- 付着された少なくとも1つのキャプチャー試薬を含む固体支持体上で前記エキソソームを捕捉することをさらに含み、ここで、前記キャプチャー試薬がCD81、CD63、CD9からなる群からの少なくとも1つのバイオマーカーに結合する、請求項1に記載の方法。
- 付着された少なくとも1つのキャプチャー試薬を含む固体支持体上で前記エキソソームを捕捉することをさらに含み、ここで、前記キャプチャー試薬がDR1に結合する、請求項1に記載の方法。
- 前記生体試料が、全血、血清、血漿、尿、間質液、腹水、子宮頸部スワブ、涙、唾液、頬スワブ、皮膚、脳組織、および脳脊髄液からなる群から選択される、請求項1に記載の方法。
- 前記エキソソームが、ニューロン由来のエキソソーム、アストロサイト由来のエキソソーム、オリゴデンドロサイト由来のエキソソーム、およびミクログリア由来のエキソソームからなる群から選択される、請求項1に記載の方法。
- 前記ニューロン由来のエキソソームが、シナプス前ドーパミン作動性ニューロン由来のエキソソーム、シナプス後ドーパミン作動性、セロトニン作動性、GABA作動性、グルタミン酸作動性、およびオピオイドニューロン由来のエキソソームからなる群から選択される、請求項5に記載の方法。
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