JP7041628B2 - リポ多糖に特異的に結合する抗体分子-薬物コンジュゲートおよびその使用 - Google Patents
リポ多糖に特異的に結合する抗体分子-薬物コンジュゲートおよびその使用 Download PDFInfo
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Description
この出願は、2015年11月10日に出願された米国仮出願第62/253,345号および2016年8月16日に出願された米国仮出願第62/375,800号の利益を主張する。上述の出願の内容は、それらの全体が参考として本明細書に援用される。
本出願は、ASCIIフォーマットで電子的に提出され、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる配列表を含有する。2016年11月10日に作成された、前記ASCIIコピーは、P2029-7003WO_SL.txtと名付けられ、89,456バイトのサイズである。
a) 異なる属、種、および/または亜種(例えば、Enterobacteriaceae(例えば、Klebsiella、Enterobacter、Shigella、Escherichia、Salmonella、またはCitrobacter、例えば、汎耐性Enterobacteriaceae)に由来する1種または複数の細菌、Pseudomonasに由来する1種または複数の細菌、Acinetobacterに由来する1種または複数の細菌、またはこれらの任意の組み合わせ)の、1種または複数の(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10種、またはこれを超える)グラム陰性菌に、高アフィニティー、例えば、約100nM未満、典型的に、約10nMであり、より典型的に、約10~0.01nM、約5~0.01nM、約3~0.05nM、約1~0.1nM、またはこれより強い、例えば、約80、70、60、50、40、30、20、10、8、6、4、3、2、1、0.5、0.2、0.1、0.05、または0.01nM未満の解離定数(KD)で結合する、
b) 高アフィニティーで、例えば、約100nM未満、典型的に、約10nM未満、より典型的に、約10~0.01nM、約5~0.01nM、約3~0.05nM、約1~0.1nM未満またはより強く、例えば、約80、70、60、50、40、30、20、10、8、6、4、3、2、1、0.5、0.2、0.1、0.05または0.01nM未満の解離定数(KD)でリポ多糖(LPS)に結合する、
c) 例えば、本明細書に記載の方法によって、例えば、ADCの最小阻止濃度(MIC)を測定することで決定した場合に、異なる属、種および/または亜種(例えば、1または複数の本明細書に記載のグラム陰性細菌)の1または複数の(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれより多くの)グラム陰性細菌を阻害する、
d) 例えば、本明細書に記載の方法によって測定した場合に、例えば、モル濃度に基づいて、抗微生物性ペプチド単独と比べてより低いMIC、例えば、高くとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、200、500、1,000分の1であるMICで異なる属、種および/または亜種(例えば、1または複数の本明細書に記載のグラム陰性細菌)の1または複数の(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれより多くの)グラム陰性細菌を阻害する、
e) 例えば、本明細書に記載の方法によって、例えば、最小殺菌濃度(MBC)を測定することで決定した場合に、異なる属、種および/または亜種(例えば、1または複数の本明細書に記載のグラム陰性細菌)の1または複数の(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれより多くの)グラム陰性細菌の生存率を低減する、
f) 例えば、本明細書に記載の方法によって測定した場合に、例えば、モル濃度に基づいて、抗微生物性ペプチド単独と比べてより低いMBC、例えば、高くとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、200、500、1,000分の1であるMBCで異なる属、種および/または亜種(例えば、1または複数の本明細書に記載のグラム陰性細菌)の1または複数の(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれより多くの)グラム陰性細菌の生存率を低減する、
g) 例えば、本明細書に記載されるように例えば、OPAアッセイによって決定されるオプソニン食作用活性(OPA)を呈する、
h) LPS上のエピトープ、例えば、表1または8に記載の抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6によって認識されるエピトープと同じまたは類似のエピトープに特異的に結合する、
i) 表1または8に記載の抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6と同じまたは類似の結合親和性または特異性、あるいは両方を示す、
j) 表1または8に記載の抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6を含むADCと同じまたは類似の結合親和性または特異性、あるいは両方を示す、
k) 表1または8に記載の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域を含む抗体分子と同じまたは類似の結合親和性または特異性、あるいは両方を示す、
l) 表1または8に記載の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域を含むADCと同じまたは類似の結合親和性または特異性、あるいは両方を示す、
m) 表1または8に記載の1または複数の(例えば、2または3の)重鎖CDRおよび/または1または複数の(例えば、2または3の)軽鎖CDR、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6の1または複数の(例えば、2または3の)重鎖CDRおよび/または1または複数の(2または3の)軽鎖CDRを含む抗体分子と同じまたは類似の結合親和性または特異性、あるいは両方を示す、
n) 表1または8に記載の1または複数の(例えば、2または3の)重鎖CDRおよび/または1または複数の(例えば、2または3の)軽鎖CDR、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6の1または複数の(例えば、2または3の)重鎖CDRおよび/または1または複数の(2または3の)軽鎖CDRを含むADCと同じまたは類似の結合親和性または特異性、あるいは両方を示す、
o) 表1または8に示されるアミノ酸配列を含む抗体分子と同じまたは類似の結合親和性または特異性、あるいは両方を示す、
p) 表1または8に示されるアミノ酸配列を含むADCと同じまたは類似の結合親和性または特異性、あるいは両方を示す、
q) 第2の抗体分子のグラム陰性細菌、LPS、または両方との結合を阻害、例えば、競合的に阻害し、第2の抗体分子は、表1または8から選択される抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6である、
r) 第2の抗体分子を含む第2のADCのグラム陰性細菌、LPS、または両方との結合を阻害、例えば、競合的に阻害し、第2の抗体分子は、表1または8から選択される抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6、
s) 第2の抗体分子、第2の抗体分子は、表1または8から選択される抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6と同じまたは重複するエピトープに結合する、
t) 第2の抗体分子を含む第2のADC、第2の抗体分子は、表1または8から選択される抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6と同じまたは重複するエピトープに結合する、
u) グラム陰性細菌、LPS、または両方に対する結合について第2の抗体分子と競合し、第2の抗体分子は、表1または8から選択される抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6、
v) グラム陰性細菌、LPS、または両方に対する結合について第2のADCを含む第2のADCと競合し、第2の抗体分子は、表1または8から選択される抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6、
w) 表1または8から選択される抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6の1または複数の生物学的特性を有する、
x) 表1または8から選択される抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6を含むADCの1または複数の生物学的特性を有する、
y) 表1または8から選択される抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6を含むADCの1または複数の薬物動態学的特性を有する、
z) 第1の属、種、または亜種(例えば、Pseudomonas)に由来するグラム陰性菌の生存率を、第2の属、種、または亜種(例えば、E.coli、Klebsiella種、またはこれらの両方)に由来するグラム陰性菌の生存率の低減と比較して、高選択性で、例えば、本明細書で記載される混合型微生物殺滅アッセイにより決定される殺滅%において、例えば、少なくとも2、5、10、20、50、100、200、500、または1000倍高く低減する、
aa) 高アフィニティーで、例えば、約200pMまたはそれ未満、例えば、約150pMまたはそれ未満、約120pMまたはそれ未満、約100pMまたはそれ未満、約80pMまたはそれ未満、約60pMまたはそれ未満、あるいは約40pMまたはそれ未満、例えば、約40pM~約120pM、約50pM~110pM、約60pM~100pM、約40pM~80pMまたは80pM~120pMのアビディティーEC50で1または複数のP.aeruginosa株(例えば、表7に記載の1または複数のP.aeruginosa株)に結合する、または
bb) 異なる属、種、および/または亜種の、1種または複数の(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10種、またはこれを超える)グラム陰性菌(例えば、本明細書で記載される1種または複数のグラム陰性菌、例えば、P.aeruginosa)を、in vivoにおいて阻害する特性、例えば、動物モデル、例えば、本明細書で記載されるマウス急性肺炎モデルを使用して決定される細菌負荷において、例えば、少なくとも、2、5、10、20、50、100、200、500、1000倍、またはこれを超える低減する、
のうちの、1個または複数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27個、または全て)を有するADCを提示する。
a) 異なる属、種、および/または亜種(例えば、Enterobacteriaceae(例えば、Klebsiella、Enterobacter、Shigella、Escherichia、Salmonella、またはCitrobacter、例えば、汎耐性Enterobacteriaceae)に由来する1種または複数の細菌、Pseudomonasに由来する1種または複数の細菌、Acinetobacterに由来する1種または複数の細菌、またはこれらの任意の組み合わせ)の、1種または複数の(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10種、またはこれを超える)グラム陰性菌に、高アフィニティー、例えば、約100nM未満、典型的に、約10nMであり、より典型的に、約10~0.01nM、約5~0.01nM、約3~0.05nM、約1~0.1nM、またはこれより強い、例えば、約80、70、60、50、40、30、20、10、8、6、4、3、2、1、0.5、0.2、0.1、0.05、または0.01nM未満の解離定数(KD)で結合する、
b) 高アフィニティーで、例えば、約100nM未満、典型的に、約10nM未満、より典型的に、約10~0.01nM、約5~0.01nM、約3~0.05nM、約1~0.1nM未満またはより強く、例えば、約80、70、60、50、40、30、20、10、8、6、4、3、2、1、0.5、0.2、0.1、0.05または0.01nM未満の解離定数(KD)でリポ多糖(LPS)に結合する、
c) 例えば、本明細書に記載のように、例えば、OPAアッセイによって決定されるオプソニン食作用活性(OPA)を呈する、
d) LPS上のエピトープ、例えば、表1または8に記載の抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6によって認識されるエピトープと同じまたは類似のエピトープに特異的に結合する、
e) 表1または8に記載の抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6と同じまたは類似の結合親和性または特異性、あるいは両方を示す、
f) 表1または8に記載の抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6を含むADCと同じまたは類似の結合親和性または特異性、あるいは両方を示す、
g) 表1または8に記載の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6に記載の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域を含む抗体分子と同じまたは類似の結合親和性または特異性、あるいは両方を示す、
h) 表1または8に記載の1または複数の(例えば、2または3の)重鎖CDRおよび/または1または複数の(例えば、2または3の)軽鎖CDR、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6の1または複数の(例えば、2または3の)重鎖CDRおよび/または1または複数の(2または3の)軽鎖CDRを含む抗体分子と同じまたは類似の結合親和性または特異性、あるいは両方を示す、
i) 表1または8に示されるアミノ酸配列を含む抗体分子と同じまたは類似の結合親和性または特異性、あるいは両方を示す、
j) 第2の抗体分子のグラム陰性細菌、LPS、または両方との結合を阻害、例えば、競合的に阻害し、第2の抗体分子は、表1または8から選択される抗体分子、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6である、
k) 第2の抗体分子と同じまたは重複するエピトープに結合し、第2の抗体分子は、表1または8から選択される抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6である、
l) グラム陰性細菌、LPS、または両方に対する結合について第2の抗体分子と競合し、第2の抗体分子は、表1または8から選択される抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6である、
m) 表1または8から選択される抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6の1または複数の生物学的特性を有する、
n) 表1または8から選択される抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6の1または複数の生物学的特性を有する、
o) 表1または8から選択される抗体分子、例えば、mAb001(例えば、ヒト化mAb001)、A001-25、hWN01、hWNv1、3E7、3G1、2C7または3D6の1または複数の薬物動態学的特性を有する、または
p) 高アフィニティーで、例えば、約200pMまたはそれ未満、例えば、約150pM未満またはそれ未満、約120pMまたはそれ未満、約100pMまたはそれ未満、約80pMまたはそれ未満、約60pMまたはそれ未満、あるいは約40pMまたはそれ未満、例えば、約40pM~約120pM、約50pM~110pM、約60pM~100pM、約40pM~80pMまたは80pM~120pMのアビディティーEC50で1または複数のP.aeruginosa株(例えば、表7に記載の1または複数のP.aeruginosa株)に結合する、
のうちの1個または複数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15個、または全て)を有する抗体分子を提示する。
重鎖可変領域は、以下:抗体mAb001またはヒト化mAb001のHCDR1(例えば、配列番号108)のアミノ酸配列から1、2または3以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含むHCDR1;抗体mAb001またはヒト化mAb001のHCDR2(例えば、配列番号109、145または146のいずれか)のアミノ酸配列から1、2または3以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含むHCDR2;あるいは抗体mAb001またはヒト化mAb001のHCDR3(例えば、配列番号107)のアミノ酸配列から1、2または3以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含むHCDR3のうちの1つ、2つまたは全てを含み、
重鎖可変領域は、以下:抗体mAb001またはヒト化mAb001のHCDR1(例えば、配列番号105)のアミノ酸配列から1、2または3以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含むHCDR1;抗体mAb001またはヒト化mAb001のHCDR2(例えば、配列番号106)のアミノ酸配列から1、2または3以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含むHCDR2;あるいは抗体mAb001またはヒト化mAb001のHCDR3(例えば、配列番号107)のアミノ酸配列から1、2または3以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含むHCDR3のうちの1つ、2つまたは全てを含み、
軽鎖可変領域は、以下:抗体mAb001またはヒト化mAb001のLCDR1(例えば、配列番号110、138、140または144のいずれか)のアミノ酸配列から1、2または3以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含むLCDR1;抗体mAb001またはヒト化mAb001のLCDR2(例えば、配列番号111、139、141、142または143のいずれか)のアミノ酸配列から1、2または3以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含むLCDR2;あるいは抗体mAb001またはヒト化mAb001のLCDR3(例えば、配列番号112)のアミノ酸配列から1、2または3以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含むLCDR3のうちの1つ、2つまたは全てを含む。
(i)ソルターゼ、例えば、本明細書で記載されるソルターゼと、
(ii)本明細書で記載される抗体分子、本明細書で記載される抗微生物性ペプチド、またはこれらの両方と
を含む反応混合物を特徴とする。
本発明の実施形態において、例えば以下の項目が提供される。
(項目1)
a)リポ多糖(LPS)に結合する抗体分子と;b)抗微生物性ペプチドとを含む抗体分子-薬物コンジュゲート(ADC)。
(項目2)
前記ADCまたは抗体分子が、重鎖可変領域(VH)を含み、前記VHは3つの重鎖相補性決定領域(HCDR1、HCDR2およびHCDR3)を含み、前記VHは、:
(a)配列番号108のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号109、145または146のいずれかのアミノ酸配列を含むHCDR2;および配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3、または
(b)配列番号105のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号106のアミノ酸配列を含むHCDR2;および配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3を含む、項目1に記載のADC。
(項目3)
前記ADCまたは抗体分子がVHを含み、前記VHは3つの重鎖相補性決定領域(HCDR1、HCDR2およびHCDR3)を含み、前記VHは、
(a)(i)配列番号108のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号109のアミノ酸配列を含むHCDR2;および配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3、
(a)(ii)配列番号108のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号145のアミノ酸配列を含むHCDR2;および配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3、
(a)(iii)配列番号108のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号146のアミノ酸配列を含むHCDR2;および配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3、または
(b)配列番号105のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号106のアミノ酸配列を含むHCDR2;および配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3を含む、項目1または2に記載のADC。
(項目4)
前記ADCまたは抗体分子が、軽鎖可変領域(VL)を含み、VLは3つの軽鎖相補性決定領域(LCDR1、LCDR2およびLCDR3)を含み、前記VLは、:配列番号110、138、140または144のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111、139、141、142または143のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3を含む、項目1から3のいずれかに記載のADC。
(項目5)
前記ADCまたは抗体分子がVLを含み、VLは3つの軽鎖相補性決定領域(LCDR1、LCDR2およびLCDR3)を含み、前記VLは、:
(i)配列番号110のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(ii)配列番号138のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号139のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(iii)配列番号138のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(iv)配列番号140のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(v)配列番号110のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号141のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(vi)配列番号110のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号142のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(vii)配列番号138のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号143のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(viii)配列番号138のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号139のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(ix)配列番号144のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号142のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、または
(x)配列番号138のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号142のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3を含む、項目1から4のいずれかに記載のADC。
(項目6)
前記ADCまたは抗体分子が、VHおよびVLを含み、前記VHは3つの重鎖相補性決定領域(HCDR1、HCDR2およびHCDR3)を含み、前記VLは3つの軽鎖相補性決定領域(LCDR1、LCDR2およびLCDR3)を含み、前記ADCまたは抗体分子は、:
(a)配列番号108のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号109、145または146のいずれかのアミノ酸配列を含むHCDR2;配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3;配列番号110、138、140または144のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111、139、141、142または143のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、または
(b)配列番号105のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号106のアミノ酸配列を含むHCDR2;配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3;配列番号110、138、140または144のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111、139、141、142または143のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3を含む、項目1から5のいずれかに記載のADC。
(項目7)
前記ADCまたは抗体分子が、VHおよびVLを含み、前記VHは3つの重鎖相補性決定領域(HCDR1、HCDR2およびHCDR3)を含み、前記VLは3つの軽鎖相補性決定領域(LCDR1、LCDR2およびLCDR3)を含み、
前記VHは:
(a)(i)配列番号108のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号109のアミノ酸配列を含むHCDR2;および配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3、
(a)(ii)配列番号108のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号145のアミノ酸配列を含むHCDR2;および配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3、
(a)(iii)配列番号108のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号146のアミノ酸配列を含むHCDR2;および配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3、または
(b)配列番号105のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号106のアミノ酸配列を含むHCDR2;および配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3を含み、
前記VLは、:
(i)配列番号110のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(ii)配列番号138のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号139のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(iii)配列番号138のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(iv) 配列番号140のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(v)配列番号110のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号141のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(vi)配列番号110のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号142のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(vii)配列番号138のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号143のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(viii)配列番号138のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号139のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(ix)配列番号144のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号142のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、または
(x)配列番号138のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号142のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3を含む、項目1から6のいずれかに記載のADC。
(項目8)
前記ADCまたは抗体分子がVHを含み、前記VHは、配列番号103または115~118のいずれかのアミノ酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、96、97、98、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含む、項目1から7のいずれかに記載のADC。
(項目9)
前記ADCまたは抗体分子がVHを含み、前記VHは、配列番号103または115~118のいずれかのアミノ酸配列を含む、項目1から8のいずれかに記載のADC。
(項目10)
前記ADCまたは抗体分子がVLを含み、前記VLは、配列番号104または119~137のいずれかのアミノ酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、96、97、98、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含む、項目1から9のいずれかに記載のADC。
(項目11)
前記ADCまたは抗体分子がVLを含み、前記VLは、配列番号104または119~137のいずれかのアミノ酸配列を含む、項目1から10のいずれかに記載のADC。
(項目12)
前記ADCまたは抗体分子は、VHおよびVLを含み、前記VHは、配列番号103または115~118のいずれかのアミノ酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、96、97、98、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含み、前記VLは、配列番号104または119~137のいずれかのアミノ酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、96、97、98、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含む、項目1から11のいずれかに記載のADC。
(項目13)
前記ADCまたは前記抗体分子が、VHおよびVLを含み、前記VHが、配列番号103または115~118のうちのいずれかのアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号104または119~137のうちのいずれかのアミノ酸配列を含む、項目1から12のいずれかに記載のADC。
(項目14)
前記抗体分子が、モノクローナル抗体分子、ヒト化抗体分子、単離抗体分子、または合成抗体分子である、項目1から13のいずれかに記載のADC。
(項目15)
前記ADCまたは前記抗体分子が、2つのVHおよび2つのVLを含む、項目1から14のいずれかに記載のADC。
(項目16)
前記ADCまたは前記抗体分子が、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4の重鎖定常領域をさらに含む、項目1から15のいずれかに記載のADC。
(項目17)
前記ADCまたは前記抗体分子が、カッパ鎖またはラムダ鎖の軽鎖定常領域をさらに含む、項目1から16のいずれかに記載のADC。
(項目18)
前記ADCまたは前記抗体分子が、Fab、F(ab’)2、Fv、または単鎖Fv断片(scFv)を含む、項目1から14のいずれかに記載のADC。
(項目19)
前記ADCまたは前記抗体分子が、前記LPSのコア五糖領域に結合し、前記コア五糖領域が、1つまたは複数のKdo残基と、1つまたは複数のHep残基とを含む、項目1から18のいずれかに記載のADC。
(項目20)
前記ADCまたは前記抗体分子が、1種または複数のグラム陰性菌に結合する、項目1から19のいずれかに記載のADC。
(項目21)
前記1種または複数のグラム陰性菌が、Klebsiella、Enterobacter、Shigella、Escherichia、Salmonella、Yersinia、もしくはCitrobacterの種から選択される、Enterobacteriaceaeの種、Pseudomonasの種、Acinetobacterの種、またはこれらの任意の組み合わせである、項目20に記載のADC。
(項目22)
前記ADCまたは前記抗体分子が、Klebsiella pneumonia、Enterobacter cancerogenous、Enterobacter cloacae、Enterobacter hormaechei、Enterobacter asburiae、Shigella boydii、Shigella dysenteriae、Shigella flexneri、Shigella sonnei、Escherichia coli、Escherichia fergusonii、Salmonella choleraesuis、Salmonella enteritidis、Salmonella virchow、Salmonella paratyphi B、Salmonella typhimurium、Salmonella paratyphi A、Salmonella typhi、Salmonella bongori、Citrobacter sedlakii、Citrobacter braakii、Citrobacter werkmanii、Citrobacter freundii、Citrobacter youngae、Citrobacter amalonaticus、Yersinia enterocolitica、Yersinia frederiksenii、Yersinia pestis、Yersinia pseudotuberculosis、Pseudomonas aeruginosa、Acinetobacter baumanniiのうちの1種または複数あるいはその任意の組み合わせに結合する、項目1から21のいずれかに記載のADC。
(項目23)
前記ADCまたは前記抗体分子が、1種または複数の抗生物質耐性菌または多剤耐性(MDR)菌に結合する、項目1から22のいずれかに記載のADC。
(項目24)
前記ADCまたは前記抗体分子が、ELISA法により測定される、約10nM未満のK D で、LPSに結合する、項目1から23のいずれかに記載のADC。
(項目25)
前記ADCまたは前記抗体分子が、細菌に対するオプソニン食作用活性を有する、項目1から24のいずれかに記載のADC。
(項目26)
前記抗体分子を、前記抗微生物性ペプチドと融合させた、項目1から25のいずれかに記載のADC。
(項目27)
前記抗体分子が、(a)前記抗微生物性ペプチドと融合させたVHであって、前記抗微生物性ペプチドに対してN末端側もしくはC末端側にあるVH;(b)前記抗微生物性ペプチドと融合させたVLであって、前記抗微生物性ペプチドに対してN末端側もしくはC末端側にあるVL;または(c)(a)および(b)の両方を含む、項目1から26のいずれかに記載のADC。
(項目28)
前記VHまたは前記VLのC末端を、定常領域、リンカー、またはこれらの両方を介して間接的に、前記抗微生物性ペプチドのN末端と融合させた、項目27に記載のADC。
(項目29)
前記抗体分子を、ソルターゼにより、前記抗微生物性ペプチドと融合させた、項目1から28のいずれかに記載のADC。
(項目30)
前記ADCまたは抗微生物性ペプチドが、配列番号67~80、94~102、147~156、158~159または163~164のいずれかのアミノ酸配列から1、2、3、4または5以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも80、85、90、95、96、97、98、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含む、項目1から29のいずれかに記載のADC。
(項目31)
前記ADCまたは前記抗微生物性ペプチドは、配列番号67~80、94~102、147~156、158~159または163~164のいずれかのアミノ酸配列を含む、項目1から30のいずれかに記載のADC。
(項目32)
前記抗微生物性ペプチドが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35またはそれより多くのD-アミノ酸を含むか、または前記抗微生物性ペプチドにおけるアミノ酸残基の少なくとも10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%または100%が、D-アミノ酸である、項目1から31のいずれかに記載のADC。
(項目33)
前記抗微生物性ペプチドが、第1のシステイン残基および第2のシステイン残基を含み、前記第1のシステイン残基を、前記第2のシステイン残基へと架橋した、項目1から32のいずれかに記載のADC。
(項目34)
少なくとも2つ、3つ、または4つの抗微生物性ペプチドを含む、項目1から33のいずれかに記載のADC。
(項目35)
定常領域、リンカー、またはこれらの両方を介して間接的に、VHまたはVLと各々融合させた、少なくとも2つ、3つ、または4つの、同一であるか、または実質的に同一である、抗微生物性ペプチドを含む、項目1から34のいずれかに記載のADC。
(項目36)
(a)モル濃度に基づいて、高くても、前記抗微生物性ペプチド単独の最小阻止濃度(MIC)の2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、30、40、50、60、70、80、90、もしくは100分の1である、グラム陰性菌に対するMIC;
(b)モル濃度に基づいて、高くても、前記抗微生物性ペプチド単独の最小殺菌濃度(MBC)の2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、30、40、50、60、70、80、90、もしくは100分の1である、グラム陰性菌に対するMBC;または
(c)(a)および(b)の両方
を有する、項目1から35のいずれかに記載のADC。
(項目37)
(a)モル濃度に基づいて、高くても、グラム陽性菌に対するMICの2、5、10、20、50、100、200、500、もしくは1000分の1である、グラム陰性菌に対するMIC;
(b)モル濃度に基づいて、高くても、グラム陽性菌に対するMBCの2、5、10、20、50、100、200、500、もしくは1000分の1である、グラム陰性菌に対するMBC;または
(c)(a)および(b)の両方
を有する、項目1から36のいずれかに記載のADC。
(項目38)
前記抗微生物性ペプチドが、以下:Klebsiella、Enterobacter、Shigella、Escherichia、Salmonella、Yersinia、またはCitrobacterの1種または複数の種から選択されるEnterobacteriaceaeの少なくとも1つの種、(b)Pseudomonasの少なくとも1つの種、または(c)Acinetobacterの少なくとも1つの種、のうちの2、3種、または全てに対する抗微生物活性を有する、項目1から37のいずれかに記載のADC。
(項目39)
前記抗微生物性ペプチドが、
(a)Escherichia coli、Pseudomonas aeruginosa、もしくはこれらの両方について、100、90、80、70、60、50、40、30、20、10、もしくは5μg/ml未満のMIC;
(b)Escherichia coli、Pseudomonas aeruginosa、もしくはこれらの両方について、100、90、80、70、60、50、40、30、20、10、もしくは5μg/ml未満のMBC;または
(c)(a)および(b)の両方
を有する、項目1から38のいずれかに記載のADC。
(項目40)
前記抗微生物性ペプチドが、グラム陰性菌について、4:1を超える、PLC:MICの比を有し、前記PLCが、赤血球溶血アッセイにより決定される、項目1から39のいずれかに記載のADC。
(項目41)
項目1から40のいずれかに記載のADCと、薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
(項目42)
被験体における細菌感染を処置または防止する方法における使用のための、項目1から40のいずれかに記載のADC、または項目41に記載の医薬組成物。
(項目43)
前記細菌感染が、グラム陰性菌と関連する、項目42に記載の使用のためのADCまたは組成物。
(項目44)
前記ADCが、1~10mg/kgの用量で投与される、項目42または43に記載の使用のためのADCまたは組成物。
(項目45)
前記ADCが、静脈内投与、皮下投与、もしくは鼻腔内投与、または吸入により投与される、項目42から44のいずれかに記載の使用のためのADCまたは組成物。
(項目46)
前記ADCが、前記細菌感染と関連する症状の発症の前に、またはその発症の後で投与される、項目42から45のいずれかに記載の使用のためのADCまたは組成物。
(項目47)
前記被験体が、肺炎、尿路感染(UTI)、敗血症、髄膜炎、下痢、軟部組織感染、皮膚感染、菌血症、呼吸器系感染、心内膜炎、腹腔内感染、敗血症性関節炎、骨髄炎、CNS感染、眼感染、胆嚢炎、胆管炎、髄膜炎、腸チフス、食中毒、胃腸炎、腸熱、細菌性赤痢、血液流感染、腹腔内敗血症、脳膿瘍、髄膜炎、敗血症(例えば、新生児敗血症)、関節感染、骨感染、消化管感染、または創傷感染のうちの1つまたは複数を有する、項目42から46のいずれかに記載の使用のためのADCまたは組成物。
(項目48)
前記細菌感染が、病院感染または院内感染である、項目42から47のいずれかに記載の使用のためのADCまたは組成物。
(項目49)
前記被験体が、ヒトまたは動物である、項目42から48のいずれかに記載の使用のためのADCまたは組成物。
(項目50)
前記被験体が、免疫無防備状態の患者または医療従事者である、項目42から49のいずれかに記載の使用のためのADCまたは組成物。
(項目51)
前記被験体が、HIV感染またはAIDS、がん、固形臓器移植、幹細胞移植、鎌状赤血球症または無脾症、先天性免疫不全症、慢性炎症性状態、人工内耳、栄養失調、または脳脊髄液漏出を有するか、またはその危険性がある、項目42から50のいずれかに記載の使用のためのADCまたは組成物。
(項目52)
前記被験体が、18歳またはこれより若齢、15歳またはこれより若齢、12歳またはこれより若齢、9歳またはこれより若齢、あるいは6歳またはこれより若齢、あるいは少なくとも60歳、少なくとも65歳、少なくとも70歳、少なくとも75歳、または少なくとも80歳である、項目42から51のいずれかに記載の使用のためのADCまたは組成物。
(項目53)
前記方法が、前記被験体に、第2の抗微生物剤または抗微生物治療を投与するステップをさらに含む、項目42から52のいずれかに記載の使用のためのADCまたは組成物。
(項目54)
前記第2の抗微生物剤または抗微生物治療が、抗生物質治療またはファージ治療を含む、項目53に記載の使用のためのADCまたは組成物。
(項目55)
前記抗生物質が、アミノグリコシド、アンサマイシン、カルバセフェム、カルバペネム、セファロスポリン、糖ペプチド、リンコサミド、リポペプチド、マクロライド、モノバクタム、ニトロフラン、オキサゾリジノン、ペニシリン、ペニシリンの組み合わせ、ポリペプチド、キノロンもしくはフルオロキノロン、スルホンアミド、テトラサイクリン、またはマイコバクテリアに対する薬物から選択される、項目54に記載の使用のためのADCまたは組成物。
(項目56)
前記抗生物質が、アミカシン、ゲンタマイシン、カナマイシン、ネオマイシン、ネチルマイシン、トブラマイシン、パロモマイシン、ストレプトマイシン、スペクチノマイシン、ゲルダナマイシン、ハービマイシン、またはリファキシミン、ロラカルベフ、エルタペネム、ドリペネム、イミペネム/シラスタチン、メロペネム、セファドロキシル、セファゾリン、セファロチン、セファロシン(cefalothin)、セファレキシン、セファクロル、セファマンドール、セフォキシチン、セフプロジル、セフロキシム、セフィキシム、セフジニル、セフジトレン、セフォペラゾン、セフォタキシム、セフポドキシム、セフタジジム、セフチブテン、セフチゾキシム、セフトリアキソン、セフェピム、セフタロリンフォサミル、セフトビプロール、テイコプラニン、バンコマイシン、テラバンシン、ダルババンシン、オリタバンシン、クリンダマイシン、リンコマイシン、ダプトマイシン、アジスロマイシン、クラリスロマイシン、ジリスロマイシン、エリスロマイシン、ロキシスロマイシン、トロレアンドマイシン、テリスロマイシン、スピラマイシン、アズトレオナム、フラゾリドン、ニトロフラントイン、リネゾリド、ポシゾリド(posizolid)、ラデゾリド(radezolid)、トレゾリド、アモキシシリン、アンピシリン、アズロシリン、カルベニシリン、クロキサシリン、ジクロキサシリン、フルクロキサシリン、メズロシリン、メチシリン、ナフシリン、オキサシリン、ペニシリンg、ペニシリンv、ピペラシリン、ペニシリンg、テモシリン、チカルシリン、アモキシシリン/クラブラネート、アンピシリン/スルバクタム、ピペラシリン/タゾバクタム、チカルシリン/クラブラネート、バシトラシン、コリスチン、ポリミキシンb、シプロフロキサシン、エノキサシン、ガチフロキサシン、ゲミフロキサシン、レボフロキサシン、ロメフロキサシン、モキシフロキサシン、ナリジクス酸、ノルフロキサシン、オフロキサシン、トロバフロキサシン、グレパフロキサシン、スパルフロキサシン、テマフロキサシン、マフェニド、スルファセタミド、スルファジアジン、銀スルファジアジン、スルファジメトキシン、スルファメチゾール、スルファメトキサゾール、スルファニリミド、スルファサラジン、スルフイソキサゾール、トリメトプリム-スルファメトキサゾール(コトリモキサゾール)、スルホンアミドクリソイジン、デメクロサイクリン、ドキシサイクリン、ミノサイクリン、オキシテトラサイクリン、テトラサイクリン、クロファジミン、ダプソン、カプレオマイシン、サイクロセリン、エタンブトール、エチオナミド、イソニアジド、ピラジナミド、リファンピン、リファブチン、リファペンチン、ストレプトマイシン、アルスフェナミン、クロラムフェニコール、ホスホマイシン、フシジン酸、メトロニダゾール、ムピロシン、プラテンシマイシン、キヌプリスチン/ダルホプリスチン、チアンフェニコール、チゲサイクリン、チニダゾール、またはトリメトプリムから選択される、項目54または55に記載の使用のためのADCまたは組成物。
(項目57)
前記抗生物質が、レボフロキサシン、シプロフロキサシン、ゲンタマイシン、セフトリアキソン、オフロキサシン、アミカシン、トブラマイシン、アズトレオナム、またはイミペネム/シラスタチンから選択される、項目54から56のいずれかに記載の使用のためのADCまたは組成物。
(項目58)
前記第2の抗微生物剤または抗微生物治療が、前記ADCを投与する前に、前記ADCの投与と共時的に、または前記ADCを投与した後で投与される、項目53から57のいずれかに記載の使用のためのADCまたは組成物。
(項目59)
細菌感染を阻害または低減する方法であって、細胞を、項目1から40のいずれかに記載のADC、または項目41に記載の医薬組成物と、前記細菌感染を阻害または低減するのに有効な量で接触させるステップを含む、方法。
(項目60)
前記ADCまたは前記医薬組成物を、in vitro、ex vivo、またはin
vivoにおいて、前記細胞と接触させる、項目59に記載の方法。
(項目61)
項目1から40のいずれかに記載のADC、または項目41に記載の医薬組成物と;前記ADCまたは前記医薬組成物の使用のための指示とを含む、キット。
(項目62)
項目1から40のいずれかに記載のADC、または項目41に記載の医薬組成物を含む、容器。
(項目63)
(a)項目1から40のいずれかに記載のADCの抗体分子のVH、VL、もしくはこれらの両方;
(b)項目1から40のいずれかに記載のADCの抗微生物性ペプチド;
(c)(a)および(b)の両方;または
(d)項目1から40のいずれかに記載のADC
をコードする核酸分子。
(項目64)
項目63に記載の核酸分子を含むベクター。
(項目65)
項目63に記載の核酸分子、または項目64に記載のベクターを含む細胞。
(項目66)
ADCを生成する方法であって、項目65に記載の細胞を、ADCの生成を可能とする条件下で培養し、これにより、前記ADCを生成するステップを含む、方法。
(項目67)
ADCを生成する方法であって、ソルターゼの存在下、ソルターゼ媒介性反応が生じることを可能とする条件下で、LPSに結合する抗体分子を、抗微生物性ペプチドと、任意選択で、ソルターゼドナー配列とを含むペプチドと接触させ、これにより、前記ADCを生成するステップを含む、方法。
(項目68)
前記抗体分子が、ソルターゼ認識配列、リンカー配列、またはこれらの両方を含むソルターゼアクセプター配列を含む、項目67に記載の方法。
(項目69)
前記ソルターゼアクセプター配列が、(GS) 6 LPETGGG(配列番号24)またはP(G 4 S) 2 LPETGGSG(配列番号26)のアミノ酸配列を含む、項目68に記載の方法。
(項目70)
細菌感染を処置または防止する方法であって、細菌感染の処置または防止を必要とする被験体に、項目1から40のいずれかに記載のADC、または項目41に記載の医薬組成物を、前記細菌感染を処置または防止するのに有効な量で投与するステップを含む、方法。
(項目71)
細菌感染を処置または防止するための医薬の製造における、項目1から40のいずれかに記載のADCの使用。
(項目72)
LPSに結合する抗体分子であって、前記抗体分子は、VHおよびVLを含み、前記VHは3つの重鎖相補性決定領域(HCDR1、HCDR2およびHCDR3)を含み、前記VLは3つの軽鎖相補性決定領域(LCDR1、LCDR2およびLCDR3)を含み、前記ADCまたは抗体分子は、:
(a)配列番号108のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号109、145または146のいずれかのアミノ酸配列を含むHCDR2;配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3;配列番号110、138、140または144のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111、139、141、142または143のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のアミノ酸配列を含むLCDR3、または
(b)配列番号105のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号106のアミノ酸配列を含むHCDR2;配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3;配列番号110、138、140または144のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111、139、141、142または143のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のアミノ酸配列を含むLCDR3を含む、抗体分子。
(項目73)
前記VHが、配列番号103または115~118のいずれかのアミノ酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、96、97、98、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含み、前記VLは、配列番号104または119~137のいずれかのアミノ酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも80、85、90、95、96、97、98、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含む、項目72に記載の抗体分子。
(項目74)
配列番号67~80、94~102、147~156、158~159または163~164のいずれかのアミノ酸配列から1、2、3、4または5以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、96、97、98、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含む、抗微生物性ペプチド。
(項目75)
項目72または73に記載の抗体分子と同じエピトープ、または実質的に同じエピトープに結合する抗体分子。
(項目76)
項目72または73に記載の抗体分子と結合について競合する抗体分子。
(項目77)
抗微生物性ペプチドとカップリングさせた、項目75または76に記載の抗体分子。
表1は、例示的な抗体分子の、重鎖可変領域(VH)、軽鎖可変領域(VL)、重鎖CDR(HCDR)、および軽鎖CDR(LCDR)のアミノ酸配列を描示する。ChothiaシステムおよびKabatシステムに従い規定される重鎖CDRおよび軽鎖CDRを示す。
本明細書では、細菌、例えば、グラム陰性菌、例えば、グラム陰性菌の外膜上のリポ多糖に、高度なアフィニティーおよび特異性で結合する、抗体分子および抗体分子-薬物コンジュゲート(ADC)が開示される。本明細書で開示されるADCは、抗体分子および抗微生物性ペプチド(AMP)を含みうる。有利には、抗微生物性ペプチド単独と比較して、本明細書に記載のADCは、1つまたは複数の特性を改善しうる、例えば、抗微生物性ペプチドが、異なる属、種、および/または亜種の、1種または複数の細菌(例えば、グラム陰性菌)を阻害するか、またはこれらの生存率を低減する能力が改善されている。抗体分子、ADC、または抗微生物性ペプチドをコードする核酸分子、発現ベクター、宿主細胞、組成物(例えば、医薬組成物)、キット、および抗体分子、ADC、および抗微生物性ペプチドを作製するための方法もまた提示される。本明細書で開示される抗体分子、ADC、抗微生物性ペプチドおよび医薬組成物を使用して(単独で、または他の薬剤もしくは治療的モダリティーと組み合わせて)、例えば、グラム陰性菌により引き起こされる、細菌感染または関連障害および状態を処置、防止、および/または診断することができる。
本明細書で使用される冠詞である「1つの(a)」および「1つの(an)」とは、1つまたは1つを超える(例えば、少なくとも1つの)、冠詞の文法的目的語を指す。
本明細書では、例えば、グラム陰性菌の外膜上のリポ多糖(LPS)に結合しうる、抗体分子および抗体分子-薬物コンジュゲート(ADC)が開示される。ある実施形態では、抗体分子またはADCは、LPSのコア五糖領域に結合する。理論により束縛されることを望まないが、ある実施形態では、少なくとも部分的に、以下の特性:高密度、種内で保存的であること、アクセス可能であること、または接着に不可欠であることのうちの1または複数を有するため、コアLPS領域をターゲティングすると考えられる(RaetzおよびWhitfield Annu. Rev. Biochem. 2002;71:635~700;de KievitおよびLam J Bacteriol. 1994;176(23):7129-39;Schmenglerら、Eur J Cell Biol. 2010;89(1):25-33;Pierら、Am J Respir Crit Care Med. 1996;154(4 Pt 2):S175-82)。
本明細書では、細菌(例えば、グラム陰性菌)および/またはリポ多糖(LPS)に結合する抗体分子が開示される。本明細書で開示される抗体分子-薬物コンジュゲート(ADC)は、本明細書で開示される抗体分子を含みうる。
VHは、以下:表8に記載のVH(例えば、配列番号115~118のいずれか)のHCDR1のアミノ酸配列から1、2または3以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含むHCDR1;表8に記載のVH(例えば、配列番号115~118のいずれか)のHCDR2のアミノ酸配列から1、2または3以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含むHCDR2;あるいは表8に記載のVH(例えば、配列番号115~118のいずれか)のHCDR3のアミノ酸配列から1、2または3以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含むHCDR3のうちの1つ、2つまたは全てを含み、
VLは、以下:表8に記載のVL(例えば、配列番号119~137のいずれか)のLCDR1のアミノ酸配列から1、2または3以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含むLCDR1;表8に記載のVL(例えば、配列番号119~137のいずれか)のLCDR2のアミノ酸配列から1、2または3以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含むLCDR2;あるいは表8に記載のVL(例えば、配列番号119~137のいずれか)のLCDR3のアミノ酸配列から1、2または3以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含むLCDR3のうちの1つ、2つまたは全てを含む。
配列番号103および104;配列番号103および119;配列番号103および120;配列番号103および121;配列番号103および122;配列番号103および123;配列番号103および124;配列番号103および125;配列番号103および126;配列番号103および127;配列番号103および128;配列番号103および129;配列番号103および130;配列番号103および131;配列番号103および132;配列番号103および133;配列番号103および134;配列番号103および135;配列番号103および136;配列番号103および137;配列番号115および104;配列番号115および119;配列番号115および120;配列番号115および121;配列番号115および122;配列番号115および123;配列番号115および124;配列番号115および125;配列番号115および126;配列番号115および127;配列番号115および128;配列番号115および129;配列番号115および130;配列番号115および131;配列番号115および132;配列番号115および133;配列番号115および134;配列番号115および135;配列番号115および136;配列番号115および137;配列番号116および104;配列番号116および119;配列番号116および120;配列番号116および121;配列番号116および122;配列番号116および123;配列番号116および124;配列番号116および125;配列番号116および126;配列番号116および127;配列番号116および128;配列番号116および129;配列番号116および130;配列番号116および131;配列番号116および132;配列番号116および133;配列番号116および134;配列番号116および135;配列番号116および136;配列番号116および137;配列番号117および104;配列番号117および119;配列番号117および120;配列番号117および121;配列番号117および122;配列番号117および123;配列番号117および124;配列番号117および125;配列番号117および126;配列番号117および127;配列番号117および128;配列番号117および129;配列番号117および130;配列番号117および131;配列番号117および132;配列番号117および133;配列番号117および134;配列番号117および135;配列番号117および136;配列番号117および137;配列番号118および104;配列番号118および119;配列番号118および120;配列番号118および121;配列番号118および122;配列番号118および123;配列番号118および124;配列番号118および125;配列番号118および126;配列番号118および127;配列番号118および128;配列番号118および129;配列番号118および130;配列番号118および131;配列番号118および132;配列番号118および133;配列番号118および134;配列番号118および135;配列番号118および136;または配列番号118および137が挙げられる。
VHは、以下:配列番号108のアミノ酸配列を含むHCDR1;YISSDGDSX1YYPDX2X3KG(配列番号165)のアミノ酸配列を含むHCDR2(ここで、X1はIまたはTであり;X2はNまたはSであり;X3はIまたはVである);または配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3のうちの1つ、2つまたは全てを含み、
VLは、以下:RASESX1FGHGISPX2H(配列番号166)のアミノ酸配列を含むLCDR1(ここで、X1はVまたはIであり;X2はMまたはLである);RASX1X2KX3(配列番号167)のアミノ酸配列を含むLCDR2(ここで、X1はNまたはSであり;X2はLまたはRであり;X3はF、TまたはSである);または配列番号112のアミノ酸配列を含むLCDR3のうちの1つ、2つまたは全てを含む。
VHは、配列番号108のアミノ酸配列を含むHCDR1;YISSDGDSX1YYPDX2X3KG(配列番号165)のアミノ酸配列を含むHCDR2(ここで、X1はIまたはTであり;X2はNまたはSであり;X3はIまたはVである);および配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3を含み、
VLは、RASESX1FGHGISPX2H(配列番号166)のアミノ酸配列を含むLCDR1(ここで、X1はVまたはIであり;X2はMまたはLである);RASX1X2KX3(配列番号167)のアミノ酸配列を含むLCDR2(ここで、X1はNまたはSであり;X2はLまたはRであり;X3はF、TまたはSである);および配列番号112のアミノ酸配列を含むLCDR3を含む。
本明細書で使用される「抗微生物性ペプチド」という用語は、抗微生物活性、例えば、抗菌活性を有するペプチドを指す。理論により束縛されることを望まないが、ある実施形態では、抗微生物性ペプチドは、多数の微生物、例えば、細菌に対する広域スペクトル活性と共に、可変的な長さ、配列、および構造を有することが可能であり、任意選択で、耐性の誘導が低レベルでありうると考えられる。ある実施形態では、抗微生物性ペプチドは、抗菌ペプチドである。
例えば、抗体分子は、Enterobacteriaceae(例えば、Klebsiella、Enterobacter、Shigella、Escherichia、Salmonella、Yersinia、またはCitrobacter、例えば、汎耐性Enterobacteriaceae)に由来する、異なる種、亜種、および/もしくは株の、1もしくは複数の細菌、Pseudomonasに由来する、異なる種、亜種、および/もしくは株の、1もしくは複数の細菌、Acinetobacterに由来する、異なる種、亜種、および/もしくは株の、1もしくは複数の細菌、またはこれらの任意の組み合わせを阻害し、かつ/またはその生存率を低減することが可能である。ある実施形態では、抗微生物性ペプチドは、Klebsiella pneumonia(例えば、Klebsiella pneumoniae subsp. ozaenae、Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniaeまたはKlebsiella pneumoniae subsp. rhinoscleromatis)、Enterobacter cancerogenous、Enterobacter cloacae、Enterobacter hormaechei、Enterobacter asburiae、Shigella boydii、Shigella dysenteriae、Shigella flexneri、Shigella sonnei、Escherichia coli(例えば、Escherichia coli ATCC 11775、Escherichia coli ATCC 25922、Escherichia coli ATCC 35401またはEscherichia coli ATCC 43895)、Escherichia fergusonii、Salmonella choleraesuis、Salmonella choleraesuis subsp. indica、Salmonella enteritidis、Salmonella virchow、Salmonella paratyphi B、Salmonella typhimurium、Salmonella paratyphi A、Salmonella typhi、Salmonella choleraesuis subsp. arizonae、Salmonella choleraesuis subsp. diarizonae、Salmonella choleraesuis subsp. houtenae、Salmonella bongori、Citrobacter sedlakii、Citrobacter braakii、Citrobacter werkmanii、Citrobacter freundii、Citrobacter youngae、Citrobacter amalonaticus、Yersinia enterocolitica、Yersinia frederiksenii、Yersinia pestis、Yersinia pseudotuberculosisあるいはこれらの任意の組み合わせを阻害するか、またはその生存率を低減することが可能である。
RGLRRLGRKIAHGVKKYGPTVLRIIRIAG(配列番号68)、GGGRGLRRLGRKIAHGVKKYGPTVLRIIRIAG(配列番号80)、GGGGRFKRFRKKFKKLFKKLSPVIPLLHLG(配列番号101)、またはGRFKRFRKKFKKLFKKLSPVIPLLHLG(配列番号102)のアミノ酸配列を含む。
RGLRRLGRKIAHGVKKYGPTVLRIIRIAG(配列番号68)、GGGRGLRRLGRKIAHGVKKYGPTVLRIIRIAG(配列番号80)、GGGGRFKRFRKKFKKLFKKLSPVIPLLHLG(配列番号101)、またはGRFKRFRKKFKKLFKKLSPVIPLLHLG(配列番号102)のアミノ酸配列を含むペプチドを含む。
本明細書で使用される「抗体分子-薬物コンジュゲート」またはADCという用語は、非抗体部分、例えば、治療剤または標識、例えば、抗微生物性ペプチドとカップリングさせた抗体分子を指す。抗体分子は、非抗体部分と、直接的にカップリングさせることもでき、例えば、リンカーを介して、間接的にカップリングさせることもできる。
抗体分子は、VHおよびVLを含み、VHは3つの重鎖相補性決定領域(HCDR1、HCDR2およびHCDR3)を含み、VLは3つの軽鎖相補性決定領域(LCDR1、LCDR2およびLCDR3)を含み、ADCまたは抗体分子は:
(a) 配列番号108のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号109、145または146のいずれかのアミノ酸配列を含むHCDR2;配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3;配列番号110、138、140または144のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111、139、141、142または143のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、または
(b) 配列番号105のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号106のアミノ酸配列を含むHCDR2;配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3;配列番号110、138、140または144のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111、139、141、142または143のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3を含み、
抗微生物性ペプチドは:
(i) 配列番号101のアミノ酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9または10以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも80%、85%、90%、95%、97%または100%の相同性を有するアミノ酸配列;
(ii) 配列番号147のアミノ酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9または10以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも80%、85%、90%、95%、97%または100%の相同性を有するアミノ酸配列;
(iii) 配列番号152のアミノ酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9または10以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも80%、85%、90%、95%、97%または100%の相同性を有するアミノ酸配列;
(iv) 配列番号153のアミノ酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9または10以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも80%、85%、90%、95%、97%または100%の相同性を有するアミノ酸配列;
(v) 配列番号154のアミノ酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9または10以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも80%、85%、90%、95%、97%または100%の相同性を有するアミノ酸配列;
(vi) 配列番号156のアミノ酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9または10以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも80%、85%、90%、95%、97%または100%の相同性を有するアミノ酸配列;
(vii) 配列番号163のアミノ酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9または10以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも80%、85%、90%、95%、97%または100%の相同性を有するアミノ酸配列;または
(viii) 配列番号164のアミノ酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9または10以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも80%、85%、90%、95%、97%または100%の相同性を有するアミノ酸配列
を含むかまたはからなる。
本明細書で記載される抗体分子および抗体分子-薬物コンジュゲート(ADC)の候補物質を、例えば、in vitroにおいて、オプソニン食作用アッセイにより、それらのオプソニン食作用活性について評価することができる。
本明細書で記載される抗微生物性ペプチドおよび抗体分子-薬物コンジュゲート(ADC)の候補物質を、例えば、in vitroにおいて、最小阻止濃度(MIC)を決定することにより、それらの微生物阻害活性について評価することができる。
本明細書で記載される抗体分子、抗体分子-薬物コンジュゲート(ADC)、および抗微生物性ペプチドを、例えば、多様な動物モデルを使用して、in vivoにおいて評価することができる。例えば、動物モデルを使用して、細菌感染の低減または阻害における、本明細書で記載される抗体分子、抗菌ペプチド、または抗体分子-薬物コンジュゲートの有効性について調べることができる。動物モデルはまた、例えば、副作用について調べ、抗体分子、抗菌ペプチド、または抗体分子-薬物コンジュゲートの濃度を、in situで測定し、対照条件下における、細菌感染と、細菌との相関を裏付けるのにも使用することができる。
一部の態様では、本開示は、薬学的に許容される担体と併せて製剤化される、本明細書で記載される抗体分子、抗体分子-薬物コンジュゲート(ADC)、または抗微生物性ペプチドを含む組成物、例えば、薬学的に許容される組成物を提示する。
本開示はまた、本明細書で記載される抗体分子(例えば、抗体分子の重鎖可変領域および軽鎖可変領域ならびにCDR)、抗体分子-薬物コンジュゲート(例えば、抗体分子-薬物コンジュゲートの重鎖可変領域および軽鎖可変領域ならびにCDR)、または抗微生物性ペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸も特徴とする。
本明細書ではさらに、本明細書で記載される抗体分子、抗体分子-薬物コンジュゲート(ADC)、または抗微生物性ペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むベクターも提示される。一部の実施形態では、ベクターは、本明細書で記載される抗体分子をコードするヌクレオチドを含む。一部の実施形態では、ベクターは、本明細書で記載されるヌクレオチド配列を含む。ベクターは、ウイルス、プラスミド、コスミド、ラムダファージ、または酵母人工染色体(YAC)を含むがこれらに限定されない。
本開示はまた、本明細書で記載される抗体分子、抗菌ペプチド、または抗体分子-薬物コンジュゲートをコードする核酸を含む宿主細胞も提示する。例えば、宿主細胞は、表2の核酸、またはこれと実質的に相同な配列(例えば、これと、少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはこれを超えて同一であり、および/または本明細書で記載されるストリンジェンシーの条件下でハイブリダイズすることが可能な配列)、または前記核酸のうちの1つの部分を含みうる。加えて、宿主細胞は、表1、3、6A~6B、または8に記載されるアミノ酸配列、これと実質的に相同な配列(例えば、これと、少なくとも約80%、85%、90%、95%、99%、またはこれを超えて同一な配列)、または前記配列のうちの1つの部分をコードする核酸を含みうる。
本明細書で開示される抗体分子、抗体分子-薬物コンジュゲート(ADC)、または抗微生物性ペプチドのほか、本明細書で開示される医薬組成物は、in vitro、ex vivo、およびin vivoにおける、治療的、予防的、および/または診断的有用性を有する。
グラム陰性菌は、細菌の外膜上に、リポ多糖(LPS)を提示する。理論により束縛されることを望まないが、ある実施形態では、本明細書で記載される抗体分子、抗体分子-薬物コンジュゲート(ADC)、または抗微生物性ペプチドは、少なくとも部分的に、LPSへの結合により、グラム陰性菌を阻害するか、またはその生存率を低減しうる。
抗体分子、抗体分子-薬物コンジュゲート(ADC)、および抗微生物性ペプチドは、他の治療と組み合わせて使用することができる。例えば、組み合わせ療法は、1つまたは複数のさらなる治療剤、例えば、抗菌剤(抗生物質または他の抗菌抗体を含む)、ワクチン、または免疫応答を増強する薬剤と共に共製剤化され、かつ/または共投与される、抗体分子、ADC、または抗微生物性ペプチドを含みうる。他の実施形態では、抗体分子、抗菌ペプチド、または抗体分子-薬物コンジュゲートを、静脈内水分補給(intravenous hydration)、解熱剤(アセトアミノフェンなど)、または輸血など、他の治療的処置モダリティーと組み合わせて投与する。有利には、このような組み合わせ療法は、投与される治療剤の低投与量を用い、これにより、多様な単剤療法と関連する、可能な毒性または合併症を回避しうる。
一部の態様では、本開示は、in vitro(例えば、血液試料中など、生物学的試料中)またはin vivo(例えば、被験体におけるin vivoイメージング)において、細菌の存在を検出するための診断法を提示する。方法は、(i)試料を、本明細書で記載される抗体分子または抗体分子-薬物コンジュゲート(ADC)と接触させるか、または被験体に、抗体分子またはADCを投与するステップと;(任意選択で)(ii)基準試料、例えば、対照試料(例えば、血漿または血液など、対照の生物学的試料)または対照の被験体を、本明細書で記載される抗体分子またはADCと接触させるステップと;(iii)抗体分子またはADCと、試料もしくは被験体、または対照試料もしくは対照の被験体との間の複合体の形成を検出するステップとを含み、ここで試料または被験体における複合体の形成の、対照試料または対照の被験体と比べた変化、例えば、統計学的に有意な変化が、試料中の細菌の存在を指し示す。抗体分子またはADCは、結合した抗体または結合しなかった抗体の検出を容易とするように、検出可能な物質で、直接的に標識することもでき、間接的に標識することもできる。適切な、検出可能な物質は、上記で記載し下記でより詳細に記載するような、多様な酵素、補欠分子族、蛍光材料、発光材料、および放射性材料を含む。
候補抗体分子を、in vitroにおいて、複数のグラム陰性菌に対する、オプソニン食作用による殺滅活性について評価した。オプソニン食作用アッセイ(OPA)により、抗体分子が、補体および好中球の存在下で、細菌をオプソニン化する能力について評価する。細菌のオプソニン化とは、in vivoにおいて、抗体が細菌を死滅させることが示されている、主要な経路である。このアッセイにおける活性は、in vivoにおける、抗体分子の選択およびさらなる評価に必須である。
略述すると、以下のアッセイの構成要素:
補体(C’):特異的な被験細菌株により吸着される正常ヒト血清;
好中球:健常成人ドナーに由来する、新鮮なヒト血液;
細菌:E.coli ATCC株25922;
陽性対照:各被験細菌に対する、オプソニン性ポリクローナルIgG(pAb);
スクリーニング:抗体分子を、0.1μg/ml~25μg/mlで、OPAについてスクリーニングした
を用いた。
最小阻止濃度(MIC)アッセイは、CLSI(文献:M07-A9、M100-24)により公表されている標準および慣例に基づき実施した。MICを使用して、培養液微量希釈を使用して、被験化合物について、いくつかの微生物種に対する最小阻止濃度を決定した。アッセイは、富栄養培養液の存在下で、化合物を、細菌と混合し、細菌の増殖を、少なくとも80%低下させる、化合物の最小濃度を測定する。アッセイでは、化合物を、細菌株の大型パネルに対して、同時に調べうるように、96ウェルプレート/ハイスループットフォーマットを使用することができる。各被験株について、阻害性標準物質が公表されており、CSLI文献において公表されている標準物質についての結果は、公表値の2倍以内に収まるはずであり、その後の試験においても、2倍を超えては変動しないはずである。
1日目に、アッセイで使用される全ての株を、-80℃の保存から取り出し、氷上で解凍し、10μlの接種ループを使用して、適切な寒天プレートへと継代培養した。全てのプレートを、37℃で一晩にわたり静置した。代替的に、株は、一晩後の新鮮な寒天プレートから継代培養することもでき、1週間未満冷蔵した寒天プレートから継代培養することもできる。
2日目に、一晩後のプレート全てを、均質性および適切なコロニー形状について検討した。全ての株を、10μlの接種ループを使用して、適切な寒天プレートへと継代培養した。全てのプレートを、37℃で一晩にわたり静置した。
3日目に、一晩後のプレート全てを、均質性および適切なコロニー形状について検討した。被験化合物および標準物質について、マザープレートを調製した。96ウェルポリプロピレンプレート内では、50倍濃度(所望される最高の最終アッセイ濃度の50倍)の化合物40μlを、列1(プレート1枚当たり8つの化合物)に入れた。20μlの希釈剤を、列2~12に入れた。列2~11では、プレートにわたり、20μlを、20μlへと移した(希釈率を倍加させた)。列12は、増殖対照として使用した。希釈剤は、化合物の溶解度に応じて変動しうる(一般的な希釈剤は、水、DMSO、および0.1N HClであった)。
例示的なADC(ペプチド2を重鎖のC末端に融合させた、抗Pseudomonas抗体)の、細菌への結合および阻害に対する効果について調べた。本実施例では、細菌株ATCC 27853を利用した。例示的なADCは、FACSによって決定して、抗体単独と同様の、細菌の表面への結合を表した(データは示さない)。表5に示す通り、ADCは、ペプチド単独と比べて、約10倍の活性の増強を示した。ADCはまた、オプソニン食作用活性も保持した。さらに、この実験では、グラム陽性菌の殺滅は、観察されなかったので、ADCは、グラム陰性病原体に対する特異性も裏付けた。
例示的な抗体であるhWN01およびhWNv1は、WN1 222-5の構造ガイド操作によりデザインした(Di Padovaら、Infect Immun.、1993年、61巻(9号):3863~3872頁)。抗体であるhWN01およびhWNv1は、LPSの保存的コアグリカンをターゲティングするが、これらをヒト生殖細胞系列の配列と類似させ、K.pneumoniaeへの結合を改善するように操作した。図2に示す通り、hWN01は、ピコモル濃度(pM)におけるE.coliへの結合と、ナノモル濃度(nM)におけるK.pneumoniae株への結合とを示した。加えて、hWN01およびhWNv1は、ヒト生殖細胞系列の配列と類似し、発現も改善されている。
LPSのコアをターゲティングする、広域反応性の抗体を同定するために、CD-1マウスを、E.coli J5-OMPワクチン(10μg)およびヒルトノール(hiltonol)アジュバント(10μg)で免疫化した。マウスに、免疫原-アジュバントミックスを、3週間にわたり毎週、腹腔内投与し、この時点で、免疫化されたマウスに由来する血清を、全細胞ELISAにより、複数の病原体に対する、それらの力価について評価した。E.coliおよびK.pneumoniaeに対して最高の力価を伴うマウスを、融合のために選択した。脾臓細胞の、骨髄腫パートナー細胞との融合を実施し、クローン発生のために、96ウェルへと播種した。2週間後、ハイブリドーマを、E.coli J5 LPSを認識するそれらの能力についてスクリーニングした。全細胞ELISAによるとE.coli、K.pneumoniae、およびS.typhimuriumに結合する、1つのこのようなクローンは、mAb A001-25である。mAb A001-25は、LPSの保存的コアグリカンをターゲティングする。図3に示す通り、A001-25は、ピコモル濃度(pM)における、E.coliおよびK.pneumoniaeへの強力な結合を有する。モデル化された構造に基づく構造評価は、アフィニティー増強のための経路を指し示した。
候補抗微生物性ペプチドを、細菌に対するそれらの阻害活性、およびそれらの溶血活性について調べた。細胞傷害活性または溶血活性が低いと共に、培養液中、マウス血清中、およびヒト血清中で、E.coliおよびPseudomonasの両方に対する殺滅活性が高いペプチドを、リード候補物質として優先した。結果を、表6Aに示す。阻害活性または殺菌活性が強く、赤血球の溶血が弱く、標的外毒性が低い抗微生物性ペプチドを、さらなる解析のために選択した。
Pae: P. aeruginosa; Eco: E. coli; Sau: S. aureus; Kpn: K. pneumoniae
本実施例は、ペプチドステープリングにより、例示的なαヘリックス型抗微生物性ペプチドの効力および安定性が改善されたことを示す。化学的架橋によるペプチドステープリング工程を、図4に例示した。ステープリングの前および後において、抗微生物性ペプチドの阻害活性を決定した。例示的なペプチドのMICが、160μg/mlであるのに対し、ステープリングされたペプチドのMICは、10μg/mlである。例示的なステープリング法については、例えば、Alexanderら、J. Am. Chem. Soc.、2013年、135巻(16号)、5946~5949頁において記載されている。
ソルターゼライゲーションは、ソルターゼ認識配列と、ソルターゼドナー配列との間に、天然のペプチド結合を形成する。ソルターゼA五重変異体を使用して、ペプチドである、GGGRGLRRLGRKIAHGVKKYGPTVLRIIRIAG(配列番号80)の、(GS)6LPETGGG(配列番号24)を含有する抗体重鎖のC末端、およびP(G4S)2LPETGGSG(配列番号26)を含有する軽鎖への定量的付加を達成した(Chenら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、2011年、108巻(28号):11399~11404頁)。GGGの配列は、ソルターゼドナードメインであり、RGLRRLGRKIAHGVKKYGPTVLRIIRIAG(配列番号68)の配列は、抗微生物性ペプチドドメインである。
例示的なADCを、混合型微生物殺滅アッセイを使用して、標的細菌に対する選択性について評価した。図11A~11Dに示す通り、PseudomonasをターゲティングするADCの殺滅活性は、抗体単独、ペプチド単独、または抗体とペプチドとの組み合わせと比較して、E.coliおよびKlebsiella種に対するより、Pseudomonas種に対して優先的であった。
多剤耐性株を含む、P.aeruginosaへの、例示的なADC(mAb001を含む)の結合について調べた。図12および表7に示す通り、例示的なADCは、P.aeruginosaへの強い結合を示した。例示的なADCは、P.aeruginosaについて、高度に選択的である(データは示さない)。結合は、LPSコア特異的である。
例示的なADC(mAb001を含む)の、細菌表面への結合について検討した。結合は、イムノゴールドによる二次標識化を使用する、電子顕微鏡により視覚化した。図13に示す通り、例示的なADCは、細菌表面に結合する。表面結合の増強を、他の標的と比較して観察した。
例示的な抗LPS抗体分子(mAb001)の、in vivoにおける活性について、マウス急性肺炎モデルで調べた。
例示的な抗微生物性ペプチドを使用して、ステープリングの、安定性および非特異的結合(NSB)に対する効果について検討した。図15A~15Bに示す通り、T=0およびT=60分のいずれにおける血清測定値も、ステープリングされたAMPの量の、ステープリングされていないバージョンと比べた増大を示す。このデータは、定量的なものであり、LS/MS上で生成された。増大は、ステープリングされた化合物によるNSBの低減に帰せられた。図15Cは、最適化されていないペイロードと、最適化されたペイロードとの差違を例示する。ペイロードは、血清中の安定性に基づき選択することができる。非特異的結合を低減し、かつ/またはプロテアーゼの安定性を増強したペイロードを、選択することができる。
細胞ベースの比色アッセイを、内毒素シグナルであるLPSを検出および定量化するために使用した。このアッセイは、哺乳動物の内毒素センサーである、Toll様受容体(TLR)4の活性化に基づく(Beutlerら、Curr Top Microbiol Immunol.、2002年、270巻:109~20頁)。TLR4は、グラム陰性菌に由来するLPSを認識し、NF-κBを活性化させる。HEK-Blue(商標)4細胞(InvivoGen)など、LPSに対して感受性となるように操作された細胞は、ヒトTLR4およびNF-κB誘導性分泌型胎児性アルカリホスファターゼ(SEAP)レポーター遺伝子を安定的に発現する。LPSの存在は、NF-κBの活性化をもたらす、HEK-Blue(商標)4細胞により検出することができる。色シグナルをもたらすSEAP検出媒体である、QUANTI-Blue(商標)(InvivoGen)を使用して、NF-kBの活性化を、620~655nmで検出することができる。吸光度は、存在する内毒素の量と正比例するので、HEK-Blue(商標)内毒素標準物質(InvivoGen)の系列希釈を使用して得られる検量線から、内毒素の濃度を測定することができる。
例示的なADCを、それらの微生物殺滅活性について調べた。
例示的な化合物を、多剤耐性P.aeruginosa株に対する、それらの微生物殺滅活性について調べた。
例示的な化合物を、異なる細菌に対する、それらの殺滅選択性について調べた。
要求される全プレート=(アッセイ試験管の数×時点の数)+t=0における対照(3~4)
例示的なADC(mAb001-conj2)の、in vivoにおける活性について、マウス急性肺炎モデルで調べた。
例示的なADCのバイオアベイラビリティーを、マウスモデルにおいて研究した。6週齢の雄C57/BL6マウスを使用した。各群には、4匹のマウスを組み入れた。mAb001およびmAb001-P297を、静脈内注射により、5mg/kgで投与した。データは、投与の24時間後および120時間後に回収した。ヒトIgGは、ELISAにより定量化した。
リン酸化グリカンは、全てのP.aeruginosa株内の、鍵となる保存的モチーフを表す。LPSは、PAC557株から調製した。NMR解析は、複数のグリコフォーム、外側コアにおける、可変性のO-アセチル化、および高リン酸化L,D-マンノヘプトース単位を明らかにした。
ヒト血清中の抗微生物性ペプチドの安定性に対する、D-アミノ酸の効果について研究した。本研究では、例示的な抗微生物性ペプチドであるP297を使用した。(D)-P297は、全てD-アミノ酸を含有し、(L)-P297は、全てL-アミノ酸を含有する。残りの無傷ペプチドの百分率を、ヒト血清の非存在下で、または2%、5%、もしくは10%のヒト血清の存在下で、60分間にわたり測定した。図20~21に示す通り、(L)-P297は、迅速に(かつ、ある特定の試験条件下で完全に)分解し、(D)-P297は、(L)-P297より、大幅に安定であった。
本明細書で言及される全ての刊行物、特許、および受託番号は、各個別の刊行物または特許が、参照により組み込まれることが、具体的、かつ、個別に指し示された場合と同じ程度に、参照によりそれらの全体において本明細書に組み込まれる。
本明細書の組成物および方法の具体的な実施形態について論じてきたが、上記の明細書は、例示的なものであり、限定的なものではない。本明細書および下記の特許請求の範囲を検討すれば、当業者には、本発明の多くの変化形が明らかとなるであろう。本発明の全範囲は、特許請求の範囲を、それらの均等物の全範囲と共に参照し、本明細書を、このような変化形と共に参照することにより決定されるものとする。
Claims (28)
- a)リポ多糖(LPS)に結合する抗体分子と;b)抗微生物性ペプチドとを含む抗体分子-薬物コンジュゲート(ADC)であって、
前記抗体分子は、重鎖可変領域(VH)を含み、前記VHは3つの重鎖相補性決定領域(HCDR1、HCDR2およびHCDR3)を含み、前記VHは、
(a)配列番号108のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号109、145または146のいずれかのアミノ酸配列を含むHCDR2;および配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3、または
(b)配列番号105のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号106のアミノ酸配列を含むHCDR2;および配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3を含み、
前記抗体分子は、軽鎖可変領域(VL)を含み、VLは3つの軽鎖相補性決定領域(LCDR1、LCDR2およびLCDR3)を含み、前記VLは、配列番号110、138、140または144のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111、139、141、142または143のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3を含む、ADC。 - 前記VHが、
(a)(i)配列番号108のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号109のアミノ酸配列を含むHCDR2;および配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3、
(a)(ii)配列番号108のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号145のアミノ酸配列を含むHCDR2;および配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3、
(a)(iii)配列番号108のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号146のアミノ酸配列を含むHCDR2;および配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3、または
(b)配列番号105のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号106のアミノ酸配列を含むHCDR2;および配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3を含む、かつ/または
前記VLが、
(i)配列番号110のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(ii)配列番号138のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号139のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(iii)配列番号138のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(iv)配列番号140のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(v)配列番号110のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号141のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(vi)配列番号110のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号142のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(vii)配列番号138のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号143のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(viii)配列番号138のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号139のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、
(ix)配列番号144のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号142のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3、または
(x)配列番号138のアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号142のアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR3を含む、
請求項1に記載のADC。 - 前記VHが、配列番号103または115~118のいずれかのアミノ酸配列、あるいは配列番号103または115~118のいずれかのアミノ酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、96、97、98、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含む、かつ/または
前記VLが、配列番号104または119~137のいずれかのアミノ酸配列、あるいは配列番号104または119~137のいずれかのアミノ酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、96、97、98、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含む、請求項1または2に記載のADC。 - 前記抗体分子が、以下:
(i)モノクローナル抗体分子、ヒト化抗体分子、単離抗体分子、または合成抗体分子である、
(ii)2つのVHおよび2つのVLを含む、
(iii)IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4の重鎖定常領域をさらに含む、
(iv)カッパ鎖またはラムダ鎖の軽鎖定常領域をさらに含む、
(v)Fab、F(ab’)2、Fv、または単鎖Fv断片(scFv)を含む、
(vi)前記LPSのコア五糖領域に結合し、前記コア五糖領域が、1つまたは複数のKdo残基と、1つまたは複数のHep残基とを含む、
(vii)1種または複数のグラム陰性菌に結合し、必要に応じて、前記1種または複数のグラム陰性菌は、Klebsiella、Enterobacter、Shigella、Escherichia、Salmonella、Yersinia、もしくはCitrobacterの種から選択される、Enterobacteriaceaeの種、Pseudomonasの種、Acinetobacterの種、またはこれらの任意の組み合わせである、
(viii)Klebsiella pneumonia、Enterobacter cancerogenous、Enterobacter cloacae、Enterobacter hormaechei、Enterobacter asburiae、Shigella boydii、Shigella dysenteriae、Shigella flexneri、Shigella sonnei、Escherichia coli、Escherichia fergusonii、Salmonella choleraesuis、Salmonella enteritidis、Salmonella virchow、Salmonella paratyphi B、Salmonella typhimurium、Salmonella paratyphi A、Salmonella typhi、Salmonella bongori、Citrobacter sedlakii、Citrobacter braakii、Citrobacter werkmanii、Citrobacter freundii、Citrobacter youngae、Citrobacter amalonaticus、Yersinia enterocolitica、Yersinia frederiksenii、Yersinia pestis、Yersinia pseudotuberculosis、Pseudomonas aeruginosa、Acinetobacter baumanniiのうちの1種または複数あるいはその任意の組み合わせに結合する、
(ix)1種または複数の抗生物質耐性菌または多剤耐性(MDR)菌に結合する、
(x)ELISA法により測定される、約10nM未満のKDで、LPSに結合する、あるいは
(xi)細菌に対するオプソニン食作用活性を有する、
のうちの1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個または全てを有する、請求項1から3のいずれかに記載のADC。 - 前記抗体分子が、以下:
(i)前記抗微生物性ペプチドと融合されている、
(ii)(a)前記抗微生物性ペプチドと融合させたVHであって、前記抗微生物性ペプチドに対してN末端側もしくはC末端側にあるVH;(b)前記抗微生物性ペプチドと融合させたVLであって、前記抗微生物性ペプチドに対してN末端側もしくはC末端側にあるVL;または(c)(a)および(b)の両方を含み、必要に応じて、前記VHまたは前記VLのC末端は、定常領域、リンカー、またはこれらの両方を介して間接的に、前記抗微生物性ペプチドのN末端と融合されている、
(iii)ソルターゼにより、前記抗微生物性ペプチドと融合されている、
(iv)配列番号67~80、94~102、147~156、158~159または163~164のいずれかのアミノ酸配列、あるいは配列番号67~80、94~102、147~156、158~159または163~164のいずれかのアミノ酸配列から1、2、3、4または5以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも80、85、90、95、96、97、98、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含む、
(v)1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35またはそれより多くのD-アミノ酸を含むか、または前記抗微生物性ペプチドにおけるアミノ酸残基の少なくとも10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%または100%が、D-アミノ酸である、あるいは
(vi)第1のシステイン残基および第2のシステイン残基を含み、前記第1のシステイン残基は、前記第2のシステイン残基へと架橋されている、
のうちの1個、2個、3個、4個、5個または全てを有する、請求項1から4のいずれかに記載のADC。 - 少なくとも2つ、3つ、または4つの抗微生物性ペプチドを含む、かつ/または定常領域、リンカー、またはこれらの両方を介して間接的に、VHまたはVLと各々融合させた、少なくとも2つ、3つ、または4つの、同一であるか、または実質的に同一である、抗微生物性ペプチドを含む、請求項1から5のいずれかに記載のADC。
- (i)(a)モル濃度に基づいて、高くても、前記抗微生物性ペプチド単独の最小阻止濃度(MIC)の2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、30、40、50、60、70、80、90、もしくは100分の1である、グラム陰性菌に対するMIC;
(b)モル濃度に基づいて、高くても、前記抗微生物性ペプチド単独の最小殺菌濃度(MBC)の2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、30、40、50、60、70、80、90、もしくは100分の1である、グラム陰性菌に対するMBC;または
(c)(a)および(b)の両方、および/または
(ii)(a)モル濃度に基づいて、高くても、グラム陽性菌に対するMICの2、5、10、20、50、100、200、500、もしくは1000分の1である、グラム陰性菌に対するMIC;
(b)モル濃度に基づいて、高くても、グラム陽性菌に対するMBCの2、5、10、20、50、100、200、500、もしくは1000分の1である、グラム陰性菌に対するMBC;または
(c)(a)および(b)の両方
を有する、請求項1から6のいずれかに記載のADC。 - 前記抗微生物性ペプチドが、以下:
(i)以下:Klebsiella、Enterobacter、Shigella、Escherichia、Salmonella、Yersinia、またはCitrobacterの1種または複数の種から選択されるEnterobacteriaceaeの少なくとも1つの種、(b)Pseudomonasの少なくとも1つの種、または(c)Acinetobacterの少なくとも1つの種、のうちの2、3種、または全てに対する抗微生物活性を有する、
(ii)(a)Escherichia coli、Pseudomonas aeruginosa、もしくはこれらの両方について、100、90、80、70、60、50、40、30、20、10、もしくは5μg/ml未満のMIC;(b)Escherichia coli、Pseudomonas aeruginosa、もしくはこれらの両方について、100、90、80、70、60、50、40、30、20、10、もしくは5μg/ml未満のMBC;または(c)(a)および(b)の両方を有する、
(iii)(a)Escherichia coli、Pseudomonas aeruginosa、もしくはこれらの両方について、100、90、80、70、60、50、40、30、20、10、もしくは5μg/ml未満のMIC;
(b)Escherichia coli、Pseudomonas aeruginosa、もしくはこれらの両方について、100、90、80、70、60、50、40、30、20、10、もしくは5μg/ml未満のMBC;または(c)(a)および(b)の両方を有する、あるいは
(iv)グラム陰性菌について、4:1を超える、PLC:MICの比を有し、前記PLCは、赤血球溶血アッセイにより決定される、
のうちの1個、2個、3個または全てを有する、請求項1から7のいずれかに記載のADC。 - 前記抗微生物性ペプチドが、配列番号67~80、94~102、147~156、158~159または163~164のいずれかのアミノ酸配列から1、2、3、4または5以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、96、97、98、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含む、請求項1から8のいずれかに記載のADC。
- 請求項1から9のいずれかに記載のADCと、薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
- 被験体における細菌感染を処置または防止する方法における使用のための請求項10に記載の医薬組成物であって、必要に応じて、前記細菌感染は、グラム陰性菌と関連する、かつ/または病院感染または院内感染である、使用のための組成物。
- 請求項11に記載の使用のための組成物であって、
前記ADCが、以下:
(i)1~10mg/kgの用量で、
(ii)静脈内、皮下、もしくは鼻腔内、または吸入により、あるいは
(iii)前記細菌感染と関連する症状の発症の前に、またはその発症の後で、
のうちの1個、2個または全てに従って使用される、かつ/または
前記被験体が、以下:
(i)肺炎、尿路感染(UTI)、敗血症、髄膜炎、下痢、軟部組織感染、皮膚感染、菌血症、呼吸器系感染、心内膜炎、腹腔内感染、敗血症性関節炎、骨髄炎、CNS感染、眼感染、胆嚢炎、胆管炎、髄膜炎、腸チフス、食中毒、胃腸炎、腸熱、細菌性赤痢、血液流感染、腹腔内敗血症、脳膿瘍、髄膜炎、敗血症(例えば、新生児敗血症)、関節感染、骨感染、消化管感染、または創傷感染のうちの1つまたは複数を有する、
(ii)ヒトまたは動物である、
(iii)免疫無防備状態の患者または医療従事者である、
(iv)HIV感染またはAIDS、がん、固形臓器移植、幹細胞移植、鎌状赤血球症または無脾症、先天性免疫不全症、慢性炎症性状態、人工内耳、栄養失調、または脳脊髄液漏出を有するか、またはその危険性がある、あるいは
(v)18歳またはこれより若齢、15歳またはこれより若齢、12歳またはこれより若齢、9歳またはこれより若齢、あるいは6歳またはこれより若齢、あるいは少なくとも60歳、少なくとも65歳、少なくとも70歳、少なくとも75歳、または少なくとも80歳である、
のうちの1個、2個、3個、4個または全てを有する、使用のための組成物。 - 第2の抗微生物剤または抗微生物治療を使用することをさらに含む、請求項11または12に記載の使用のための組成物であって、
必要に応じて、前記第2の抗微生物剤または抗微生物治療は、抗生物質治療またはファージ治療を含み、
必要に応じて、前記抗生物質は、アミノグリコシド、アンサマイシン、カルバセフェム、カルバペネム、セファロスポリン、糖ペプチド、リンコサミド、リポペプチド、マクロライド、モノバクタム、ニトロフラン、オキサゾリジノン、ペニシリン、ペニシリンの組み合わせ、ポリペプチド、キノロンもしくはフルオロキノロン、スルホンアミド、テトラサイクリン、またはマイコバクテリアに対する薬物から選択され、
必要に応じて、前記抗生物質は、アミカシン、ゲンタマイシン、カナマイシン、ネオマイシン、ネチルマイシン、トブラマイシン、パロモマイシン、ストレプトマイシン、スペクチノマイシン、ゲルダナマイシン、ハービマイシン、またはリファキシミン、ロラカルベフ、エルタペネム、ドリペネム、イミペネム/シラスタチン、メロペネム、セファドロキシル、セファゾリン、セファロチン、セファロシン(cefalothin)、セファレキシン、セファクロル、セファマンドール、セフォキシチン、セフプロジル、セフロキシム、セフィキシム、セフジニル、セフジトレン、セフォペラゾン、セフォタキシム、セフポドキシム、セフタジジム、セフチブテン、セフチゾキシム、セフトリアキソン、セフェピム、セフタロリンフォサミル、セフトビプロール、テイコプラニン、バンコマイシン、テラバンシン、ダルババンシン、オリタバンシン、クリンダマイシン、リンコマイシン、ダプトマイシン、アジスロマイシン、クラリスロマイシン、ジリスロマイシン、エリスロマイシン、ロキシスロマイシン、トロレアンドマイシン、テリスロマイシン、スピラマイシン、アズトレオナム、フラゾリドン、ニトロフラントイン、リネゾリド、ポシゾリド(posizolid)、ラデゾリド(radezolid)、トレゾリド、アモキシシリン、アンピシリン、アズロシリン、カルベニシリン、クロキサシリン、ジクロキサシリン、フルクロキサシリン、メズロシリン、メチシリン、ナフシリン、オキサシリン、ペニシリンg、ペニシリンv、ピペラシリン、ペニシリンg、テモシリン、チカルシリン、アモキシシリン/クラブラネート、アンピシリン/スルバクタム、ピペラシリン/タゾバクタム、チカルシリン/クラブラネート、バシトラシン、コリスチン、ポリミキシンb、シプロフロキサシン、エノキサシン、ガチフロキサシン、ゲミフロキサシン、レボフロキサシン、ロメフロキサシン、モキシフロキサシン、ナリジクス酸、ノルフロキサシン、オフロキサシン、トロバフロキサシン、グレパフロキサシン、スパルフロキサシン、テマフロキサシン、マフェニド、スルファセタミド、スルファジアジン、銀スルファジアジン、スルファジメトキシン、スルファメチゾール、スルファメトキサゾール、スルファニリミド、スルファサラジン、スルフイソキサゾール、トリメトプリム-スルファメトキサゾール(コトリモキサゾール)、スルホンアミドクリソイジン、デメクロサイクリン、ドキシサイクリン、ミノサイクリン、オキシテトラサイクリン、テトラサイクリン、クロファジミン、ダプソン、カプレオマイシン、サイクロセリン、エタンブトール、エチオナミド、イソニアジド、ピラジナミド、リファンピン、リファブチン、リファペンチン、ストレプトマイシン、アルスフェナミン、クロラムフェニコール、ホスホマイシン、フシジン酸、メトロニダゾール、ムピロシン、プラテンシマイシン、キヌプリスチン/ダルホプリスチン、チアンフェニコール、チゲサイクリン、チニダゾール、またはトリメトプリムから選択され、
必要に応じて、前記抗生物質は、レボフロキサシン、シプロフロキサシン、ゲンタマイシン、セフトリアキソン、オフロキサシン、アミカシン、トブラマイシン、アズトレオナム、またはイミペネム/シラスタチンから選択され、
必要に応じて、前記第2の抗微生物剤または抗微生物治療は、前記ADCを使用する前、前記ADCの使用と共時、または前記ADCを使用した後の使用である、
使用のための組成物。 - 細菌感染の阻害または低減における使用のための請求項10に記載の医薬組成物であって、必要に応じて、前記ADCまたは前記医薬組成物は、in vitro、ex vivo、またはin vivoにおいて使用される、医薬組成物。
- 請求項1から9のいずれかに記載のADC、または請求項10に記載の医薬組成物と;前記ADCまたは前記医薬組成物の使用のための指示とを含む、キット。
- 請求項1から9のいずれかに記載のADC、または請求項10に記載の医薬組成物を含む、容器。
- (a)請求項1から9のいずれかに記載のADCの抗体分子のVH、VL、もしくはこれらの両方;
(b)請求項1から9のいずれかに記載のADCの抗微生物性ペプチド;
(c)(a)および(b)の両方;または
(d)請求項1から9のいずれかに記載のADC
をコードする核酸分子。 - 請求項17に記載の核酸分子を含むベクター。
- 請求項17に記載の核酸分子、または請求項18に記載のベクターを含む細胞。
- ADCを生成する方法であって、
請求項19に記載の細胞を、ADCの生成を可能とする条件下で培養するステップ、または
ソルターゼの存在下、ソルターゼ媒介性反応が生じることを可能とする条件下で、LPSに結合する抗体分子を、抗微生物性ペプチドと、任意選択で、ソルターゼドナー配列とを含むペプチドと接触させるステップであって、必要に応じて、前記抗体分子が、ソルターゼ認識配列、リンカー配列、またはこれらの両方を含むソルターゼアクセプター配列を含み、必要に応じて、前記ソルターゼアクセプター配列が、(GS)6LPETGGG(配列番号24)またはP(G4S)2LPETGGSG(配列番号26)のアミノ酸配列を含む、ステップ
を含み、
これにより、前記ADCを生成する、方法。 - 細菌感染を処置または防止するための医薬の製造における、請求項1から9のいずれかに記載のADCの使用であって、必要に応じて、前記細菌感染が、グラム陰性菌と関連する、かつ/または病院感染または院内感染である、使用。
- 前記ADCが、以下:
(i)1~10mg/kgの用量で、
(ii)静脈内、皮下、もしくは鼻腔内、または吸入により、あるいは
(iii)前記細菌感染と関連する症状の発症の前に、またはその発症の後で
のうちの1個、2個または全てに従って使用される、かつ/または
前記被験体が、以下:
(i)肺炎、尿路感染(UTI)、敗血症、髄膜炎、下痢、軟部組織感染、皮膚感染、菌血症、呼吸器系感染、心内膜炎、腹腔内感染、敗血症性関節炎、骨髄炎、CNS感染、眼感染、胆嚢炎、胆管炎、髄膜炎、腸チフス、食中毒、胃腸炎、腸熱、細菌性赤痢、血液流感染、腹腔内敗血症、脳膿瘍、髄膜炎、敗血症(例えば、新生児敗血症)、関節感染、骨感染、消化管感染、または創傷感染のうちの1つまたは複数を有する、
(ii)ヒトまたは動物である、
(iii)免疫無防備状態の患者または医療従事者である、
(iv)HIV感染またはAIDS、がん、固形臓器移植、幹細胞移植、鎌状赤血球症または無脾症、先天性免疫不全症、慢性炎症性状態、人工内耳、栄養失調、または脳脊髄液漏出を有するか、またはその危険性がある、あるいは
(V)18歳またはこれより若齢、15歳またはこれより若齢、12歳またはこれより若齢、9歳またはこれより若齢、あるいは6歳またはこれより若齢、あるいは少なくとも60歳、少なくとも65歳、少なくとも70歳、少なくとも75歳、または少なくとも80歳である、
のうちの1個、2個、3個、4個または全てを有する、請求項21に記載の使用。 - 前記医薬が第2の抗微生物剤または抗微生物治療と組み合わせて用いるための医薬である、請求項21または22に記載の使用であって、
必要に応じて、前記第2の抗微生物剤または抗微生物治療は、抗生物質治療またはファージ治療を含み、
必要に応じて、前記抗生物質は、アミノグリコシド、アンサマイシン、カルバセフェム、カルバペネム、セファロスポリン、糖ペプチド、リンコサミド、リポペプチド、マクロライド、モノバクタム、ニトロフラン、オキサゾリジノン、ペニシリン、ペニシリンの組み合わせ、ポリペプチド、キノロンもしくはフルオロキノロン、スルホンアミド、テトラサイクリン、またはマイコバクテリアに対する薬物から選択され、
必要に応じて、前記抗生物質は、アミカシン、ゲンタマイシン、カナマイシン、ネオマイシン、ネチルマイシン、トブラマイシン、パロモマイシン、ストレプトマイシン、スペクチノマイシン、ゲルダナマイシン、ハービマイシン、またはリファキシミン、ロラカルベフ、エルタペネム、ドリペネム、イミペネム/シラスタチン、メロペネム、セファドロキシル、セファゾリン、セファロチン、セファロシン(cefalothin)、セファレキシン、セファクロル、セファマンドール、セフォキシチン、セフプロジル、セフロキシム、セフィキシム、セフジニル、セフジトレン、セフォペラゾン、セフォタキシム、セフポドキシム、セフタジジム、セフチブテン、セフチゾキシム、セフトリアキソン、セフェピム、セフタロリンフォサミル、セフトビプロール、テイコプラニン、バンコマイシン、テラバンシン、ダルババンシン、オリタバンシン、クリンダマイシン、リンコマイシン、ダプトマイシン、アジスロマイシン、クラリスロマイシン、ジリスロマイシン、エリスロマイシン、ロキシスロマイシン、トロレアンドマイシン、テリスロマイシン、スピラマイシン、アズトレオナム、フラゾリドン、ニトロフラントイン、リネゾリド、ポシゾリド(posizolid)、ラデゾリド(radezolid)、トレゾリド、アモキシシリン、アンピシリン、アズロシリン、カルベニシリン、クロキサシリン、ジクロキサシリン、フルクロキサシリン、メズロシリン、メチシリン、ナフシリン、オキサシリン、ペニシリンg、ペニシリンv、ピペラシリン、ペニシリンg、テモシリン、チカルシリン、アモキシシリン/クラブラネート、アンピシリン/スルバクタム、ピペラシリン/タゾバクタム、チカルシリン/クラブラネート、バシトラシン、コリスチン、ポリミキシンb、シプロフロキサシン、エノキサシン、ガチフロキサシン、ゲミフロキサシン、レボフロキサシン、ロメフロキサシン、モキシフロキサシン、ナリジクス酸、ノルフロキサシン、オフロキサシン、トロバフロキサシン、グレパフロキサシン、スパルフロキサシン、テマフロキサシン、マフェニド、スルファセタミド、スルファジアジン、銀スルファジアジン、スルファジメトキシン、スルファメチゾール、スルファメトキサゾール、スルファニリミド、スルファサラジン、スルフイソキサゾール、トリメトプリム-スルファメトキサゾール(コトリモキサゾール)、スルホンアミドクリソイジン、デメクロサイクリン、ドキシサイクリン、ミノサイクリン、オキシテトラサイクリン、テトラサイクリン、クロファジミン、ダプソン、カプレオマイシン、サイクロセリン、エタンブトール、エチオナミド、イソニアジド、ピラジナミド、リファンピン、リファブチン、リファペンチン、ストレプトマイシン、アルスフェナミン、クロラムフェニコール、ホスホマイシン、フシジン酸、メトロニダゾール、ムピロシン、プラテンシマイシン、キヌプリスチン/ダルホプリスチン、チアンフェニコール、チゲサイクリン、チニダゾール、またはトリメトプリムから選択され、
必要に応じて、前記抗生物質は、レボフロキサシン、シプロフロキサシン、ゲンタマイシン、セフトリアキソン、オフロキサシン、アミカシン、トブラマイシン、アズトレオナム、またはイミペネム/シラスタチンから選択され、
必要に応じて、前記第2の抗微生物剤または抗微生物治療は、前記ADCが用いられる前、前記ADCを用いるのと共時、または前記ADCが用いられた後に用いられるものである、
使用。 - LPSに結合する抗体分子であって、前記抗体分子は、VHおよびVLを含み、前記VHは3つの重鎖相補性決定領域(HCDR1、HCDR2およびHCDR3)を含み、前記VLは3つの軽鎖相補性決定領域(LCDR1、LCDR2およびLCDR3)を含み、前記ADCまたは抗体分子は、
(a)配列番号108のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号109、145または146のいずれかのアミノ酸配列を含むHCDR2;配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3;配列番号110、138、140または144のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111、139、141、142または143のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のアミノ酸配列を含むLCDR3、または
(b)配列番号105のアミノ酸配列を含むHCDR1;配列番号106のアミノ酸配列を含むHCDR2;配列番号107のアミノ酸配列を含むHCDR3;配列番号110、138、140または144のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR1;配列番号111、139、141、142または143のいずれかのアミノ酸配列を含むLCDR2;および配列番号112のアミノ酸配列を含むLCDR3を含む、抗体分子。 - 前記VHが、配列番号103または115~118のいずれかのアミノ酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも85、90、95、96、97、98、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含み、前記VLは、配列番号104または119~137のいずれかのアミノ酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15以下のアミノ酸残基だけ異なるか、またはこれと少なくとも80、85、90、95、96、97、98、99または100%の相同性を有するアミノ酸配列を含む、請求項24に記載の抗体分子。
- 請求項24または25に記載の抗体分子と同じエピトープに結合する抗体分子。
- 請求項24または25に記載の抗体分子と結合について競合する抗体分子。
- 抗微生物性ペプチドとカップリングさせた、請求項26または27に記載の抗体分子。
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