JP6892579B2 - ヘモグロビン障害を診断し、血液細胞を監視するためのバイオチップ - Google Patents
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Description
本願は、2014年7月30日出願の米国仮出願第62/030,964号の優先権を主張するものであり、その内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
定義
本発明の理解を容易にするために、いくつかの用語を以下に定義する。本明細書で定義される用語は、本発明に関連する分野の当業者によって一般的に理解される意味を有する。「a」、「an」及び「その」などの用語は、単数の実体だけでなく複数の実体も指すことを意図し、特定の実施例が説明のために使用することができる一般的なクラスも含む。この用語は、本明細書では、本発明の特定の実施形態を記載するために使用されるが、その用法は、特許請求の範囲で概説される場合を除き、本発明を限定するものではない。
SCDは、ヘモグロビン遺伝子中の単一変異に起因し得る遺伝性の血液障害であると考えられている。「鎌状」ヘモグロビンに起因する貧血は、1910年に米国で最初に臨床的に記載され、変異した遺伝性鎌状ヘモグロビン分子が1949年に特定された。Herrick J.、「重度の貧血の場合の特有の細長い鎌状赤血球小体(Peculiar elongated and sickle−shaped red Blood cell Corpuscles in a case of severe anemia)」、Archives of Internal Medicine 1910;及びPaulingら、「鎌状赤血球貧血、分子病(Sickle cell anemia, a molecular disease)」、Science 109:443 1949。
全ての脊椎動物では、白い血液の魚(コオリウオ科)を除いて、酸素は、RBCによって肺から組織に運ばれているため、この細胞はほぼ全ての生理学的プロセスに不可欠なプレーヤーである。心血管系が血液の流通を担当していているが、組織及び臓器への酸素並びに栄養の供給を保証するのは微小毛細血管ネットワークであるため、毛細血管におけるRBC輸送の研究は特に重要である。全身循環における全体的な圧力降下の約80%が、微小循環で起こる。微小循環の血流は、内因性のRBC生体力学的特性、すなわち変形能及び接着に依存している。狭い毛細血管を通過するので、RBCの圧搾により、この細胞の全周が血管壁接着分子に暴露され、これにより、太い血管に比べて、微小血管はRBC接着の有害な影響をより受けやすくなる。多くの疾患状態でRBCの変形能及び接着が損なわれ、微小毛細血管ネットワークにおける血流の閉塞を生じさせている。
本明細書に記載のいくつかの実施形態は、対象からのヘモグロビンタンパク質を正確に識別し、定量化する電気泳動バイオチップ及びシステムに関する。該電気泳動バイオチップは、異常ヘモグロビン症、サラセミア、鎌状赤血球症、鎌状赤血球貧血、先天性赤血球形成異常性貧血、及び軽度の慢性貧血などのヘモグロビン障害を検出するためのシステムで使用することができる。
本明細書に記載の他の実施形態は、血液細胞の変形能及び単一細胞レベルでの微小血管模倣表面への接着の同時調査のためのマイクロ流体バイオチップシステム並びに分析方法に関する。いくつかの実施形態において、該マイクロ流体バイオチップ装置又はシステムは、臨床的に意味のある方法で疾患の重症度、今後の疼痛発作、治療反応、及び治療有効性を監視するために対象の赤血球及び白血球の膜特性、細胞特性並びに接着特性を定量化することができる。一実施形態において、血液細胞は、鎌状赤血球症(SCD)の進行についてスクリーニング及び/又は監視されている患者の全血に由来する。
実施例1
該HemeChip技術は、SCDの診断において臨床施設が直面する課題に、新規かつ革新的なソリューションを提供する。わずか10分で、該HemeChipは酢酸セルロース電気泳動を使用して、ヘモグロビンの基本的な種類:A、A2、S、C及びFを示すバンドに5マイクロリットル未満の血液を分離する。実行し、各チップを作るコストは、$2.00未満であり、該HemeChipシステムは、使いやすく、輸送が簡単である。さらに、チップのシンプルなデザインは、大量生産に容易である。該HemeChip技術は、SCDを診断するために、正確で、効率的で、迅速かつ安価な方法を提供する。
HemeChipの材料
厚さ1.5mmのポリ(メチルメタクリレート)(PMMA)シートを、McMaster−Carr(Elmhurst,IL)から購入し、1/32”厚のPMMAシートをePlastics(San Diego,CA)から購入した。3Mの光学的に透明な両面接着(DSA)(タイプ8142)を、iTapeStore(Scotch Plains,NJ)から購入した。1×トリス/ホウ酸/EDTA(TBE)緩衝液(pH8.3)を、脱イオン水(MilliQ Academic,Billerica,MA)で希釈した10×TBE緩衝液(Invitrogen(商標),Carlsbad,CA)から作製した。酢酸セルロース膜を、Apacorから購入し、VWRインターナショナルLLC(Radnor,PA)によって分配した。300Vの電源を、VWRインターナショナルLLC(モデル302、Radnor,PA)から購入した。ポンソーS染色、ヘモグロビンAFSC対照、及びスーパーZマイクロアプリケーターを、Helena Laboratories(Beaumont,TX)から購入した。氷酢酸を、Fisher Scientific(Waltham,MA)から購入した。黒鉛電極(0.9mm)をAmazon(Seattle,WA)から購入した。ブラック1/8”直径ドットをMark−It(Tonawanda,NY)から購入した。
該HemeChipを、1.5mm及び1/32”厚のPMMAシートを用いて製造する。5層のPMMA(50mm×25mm)があり、これらの層を、DSAを使用して組み立てる(図1A)。発明者らは、個々のPMMA層及びこれらの層を接着するためのDSA層を作製するために、VersaLASERシステム(Universal Laser Systems社、Scottsdale,AZ)、レーザー微細加工システムを用いた。該HemeChipの上部層及び底部層は、1/32”厚のPMMAシートで作られており、層の残りの部分は、厚さ1.5mmのPMMAシートで作られている。DSAは、50μmの厚さを有している。実験用の酢酸セルロース紙も、VersaLASERシステムを用いて切断する(39mm×9mm)。発明者らはまた、PMMAと類似の製造方法を用いて、該HemeChipためのサンプルローディングユニットを作製した。このユニットを、血液サンプルアプリケーションの断面積及び再現性の分析を介して、手による手動スタンプと比較した。
施設内倫理委員会(IRB)の承認の下で、廃棄され、非特定化された患者の血液サンプルを、大学病院の血液学及び腫瘍学部門(Cleveland,OH)から入手した。血液サンプルを、EDTA抗凝固剤(BD,Franklin Lakes,NJ)を含有するバキュテイナー管に収集した。全血サンプルを、10℃で静置保存し、重力により血漿及びヘマトクリットに分離させた。各サンプルのヘマトクリットを1:5の比率で脱イオン水と混合し、赤血球を溶解するために15分間氷のブロックの上に置いた。調製したサンプルを、10℃で個々の密封したマイクロチューブ内に保存し、使用前に穏やかに混合した。サンプルを使用し、受け取った日から2週間まで保存した。もう1つの方法として、全血サンプルは、1%サポニン+TBE緩衝液を用いてチップ上で溶解することができる。
毛細管現象によって完全に飽和するまで、該HemeChipのサンプルローディングポートを介してピペットを用いて40μLの1×TBEバッファーに酢酸セルロース紙を浸した。過剰な緩衝液を放置して乾燥させるか、又は紙全体に5分間再分布させた。1μL未満の調整した血液サンプルを、サンプルローディングポートを介してマイクロアプリケーターを用いてこの紙の上にスタンプした。約200μLの1×TBEバッファーを各バッファーポートにピペットで移した。グラファイト電極(長さ1インチ)は、バッファーポートに垂直に配置した。該HemeChipを、コンパクトな電源を使用して、8分間、250Vの定電圧及び5mAの最大電流で運転した。必要に応じて、ポンソーS染色(25μL)を、この紙の上にピペットで移し、5分間浸した。5%酢酸洗浄液を用いて、ヘモグロビンバンドが見え、この紙が元の白色に戻るまで染色を除去した。4つのブラック1/8”直径ドットを、モバイル及びWebベースの画像処理ソフトウェアと共に使用するために各コーナーに配置した。
40mmのf/2.8G AF−S DX Micro NIKKORレンズ(Tokyo,Japan)搭載のNikon D3200カメラを用いて、各HemeChipのクローズアップ写真を撮影した。追加のプラグインを使用することなく、Windows用のImagejバージョン1.48を使用して画像を処理した。各画像には、紙のみをトリミングし、分析のために使用した。減算バックグラウンド機能を用いて、この紙から滑らかで連続的なバックグラウンドノイズを除去するために、半径25ピクセルの「ローリングボール」アルゴリズムを適用した。プロットプロファイル、表面プロット、及びゲルプロットツールを用いて、ヘモグロビンバンドを可視化し、定量化した。プロットプロファイルツールは、紙に沿って相対的なピクセル強度を提供し、各種類のヘモグロビンバンドに対応するピークを識別するために使用した。各ピークの下の面積を、ゲルプロットツールを使用して計算し、相対的なヘモグロビンの割合を表した。各ピークの領域を、ガスクロマトグラフィーで一般に使用されているバリー・ツー・バリー法(valley−to−valley method)を用いて輪郭を描いた。ヘモグロビンバンドの3D表面プロファイルを、表面プロットツールを用いて取得した。バンド距離を、プロファイルプロット上の各頂点の座標を識別するために、MATLABで計算した。これらは、Image Jから得られたHemeChipの長さ対ピクセル比を用いてピクセルからmmに変換した。同じ手順を用いて、標準的なベンチトップ電気泳動セットアップからのヘモグロビンの結果を定量化した。
該HemeChip、HPLC、及びベンチトップ電気泳動から得られたヘモグロビンの割合を分析し、バー及び相関プロットを用いて比較した。該HemeChip実験に用いたのと同じ血液サンプルのHbC/A2、HbF、HbS、及びHbA0のヘモグロビンの識別をBio−Rad社のバリアントII装置(Bio−Rad,Montreal,QC,Canada)を用いて、大学病院ケース医療センターコア研究所の高速液体クロマトグラフィー(HPLC)によって実施した。サンプルを、発明者らの研究室の伝統的なベンチトップ型電気泳動セットアップ(Helena Laboratories Model G4063000,Beaumont,TX)も用いて分析した。
画像処理アルゴリズム:この実施例では、画像処理アルゴリズムを、MATLABソフトウェアを使用して開発する。簡単に説明すると、このアルゴリズムは、最初にカラー画像を読み取り、基準点を検出し、チップ及びチャネルの画像の大きさを較正する。次いで、このアルゴリズムは、チャネルの中央に配置された基準線に沿ってピクセルごとに赤、青、及び緑の値の変化を識別する。この識別は、チャネル内の赤みを帯びた領域に対応するピーク値の検出をもたらす。赤みを帯びた領域が決定すると、各領域の面積及び開始点からの変位を計算する。この面積及び距離を用いて、ヘモグロビン疾患の種類を決定する。
異なるヘモグロビンの種類のバンドの移動距離を、一方向分散分析(ANOVA)検定を用いて(Minitab 16ソフトウェア、Minitab社、State College,PA)を統計的に評価した。該HemeChipとHPLCで測定したヘモグロビン濃度間の相関及び一致を、ピアソン・プロダクトモーメント相関係数及びブランドアルトマン分析を用いて評価した。ブランドアルトマン分析における一致の限界を、平均値の差±1.96倍の差の標準偏差として定義した。統計的有意性は、全検定について95%の信頼レベル(p<0.05)に設定した。受信者動作特性曲線を利用して、該HemeChipでの移動距離に基づいて、異なるヘモグロビン表現型の差別化を評価した。感度を#真陽性/(#真陽性+#偽陰性)として計算し、特異性を#真陰性/(#真陰性+#偽陽性)として計算した。本研究で得られたHemeChipデータは、平均値±標準偏差として報告する。図中のエラーバーは標準偏差を表す。
HemeChipの設計及び運用
この技術の基礎は、ヘモグロビン電気泳動であり、簡単に説明する。ヘモグロビンの種類のC、A2、S、F、及びA0は、6.5〜9.0の範囲のpHを有する緩衝液中で正味の負電荷を有する。発明者らは、1×トリス/ホウ酸塩/EDTA(TBE)緩衝液を使用して、8.3のpHで電気伝導度に必要なイオンを提供する。ヘモグロビンの全体的な負の正味電荷は、電界に置かれたときに、ヘモグロビンを正電極に向かって移動させる。ヘモグロビンの移動度の違いは、図1Cに示すように、ふるい媒体である酢酸セルロース内で生じる分離を可能にする。HbA0は、最高の移動度を有しており、最も遠くに移動する。対照的に、HbC/A2は、最も低い移動度を有し、最小距離を移動する。本論文では、発明者らは、類似の移動度によりHbC及びHbA2を一緒のグループにする。
得られたヘモグロビンバンドを、デジタルカメラを用いて撮影した。次いで、それらを可視化し、ImageJで様々なツールを用いて定量化した。発明者らは、酢酸セルロース紙の長さに沿ってヘモグロビンバンドの強度プロファイルをプロットした(図3、ii)。各プロットの原点は、サンプル適用点の中心に対応する。各ピークは、ヘモグロビンバンドを示し、各ピークの下の面積は、そのバンドのヘモグロビンの相対量を表す。発明者らは、サンプル中の他のヘモグロビンバンドの量に対する割合としてヘモグロビンの量を表した(図3、iv)。3D表面プロットも用いて、酢酸セルロース紙全体でヘモグロビンバンドを可視化した(図3、iii)。発明者らは、この方法を用いて、合計43回の実験で12の血液サンプルを分析した。これらのサンプルには、以下のものを含めた:2×HbSS、1×HbSS HPFH、1×臍帯血(高HbF)、3×HbSC、及び5×HbSA。該HemeChipの結果を、HPLC(Bio−RAD社VARIANT(商標)IIヘモグロビン試験システム)及び従来のベンチトップ電気泳動(Helena LaboratoriesモデルG4063000,Beaumont,TX)に対して評価した。
該HemeChipの診断有効性を評価するために、発明者らは、合計43の実験により、12の血液サンプルについてHPLCから得られた割合とヘモグロビンの割合を比較した。これらのサンプルには、以下のものを含めた:2×HbSS、1×HbSS HPFH、1×臍帯血(高HbF)、3×HbSC、及び5×HbSA。図4A〜Eは、該HemeChip対HPLCヘモグロビンパーセントの相関プロットを示す。各データポイントは、単一のサンプルからの平均ヘモグロビンの割合を表す。実線の対角線は、各データセットの傾向線を表す。発明者らは、2つの方法の一致を評価するために、ピアソン積率相関係数(PCC)を使用した。ヘモグロビンの種類のC/A2、S、F、及びA0は、p<0.001(PCCHbC/A2−0.99、PCCHbS−0.99、PCCHbF−0.99、PCCHbA0−0.96)と高い正の相関を示した。組み合わせたヘモグロビンの種類の全てについて高い正の相関も観察された(p<0.001、PCC=0.99)(図4E)。
マイクロ流体バイオチップの作製
PMMAトップ部分は、VersaLASERシステム(Universal Laser Systems社、Scottsdale,AZ)を用いて、入口及び出口(直径0.61mmで26メートル離れている)を切断することにより調製する。両面接着(DSA)フィルム(iTapestore,Scotch Plains,NJ)を、PMMA部分及び28×4mmのチャネルのサイズに合わせてカットする。次いで、DSAを、DSA膜の輪郭の間に入口及び出口を含むようにPMMA上部に接着させる。次いで、金シールガラススライドを、マイクロ流体チャネルを形成するために、PMMA−DSA構造で組み立てる。
GMBSストック溶液を、0.25mLのDMSOに25mgのGMBSを溶解することによって調製し、ストック溶液をエタノールで希釈して、0.28%のv/vのGMBS作業溶液を取得した。FNをPBSで希釈し、(1:10)FN作業溶液を作製する。BSA溶液を、1mLのPBSに3mgの凍結乾燥BSAを溶解することによって調製する。
廃棄され、非特定化された患者の血液サンプルを、治験審査委員会(IRB)の承認の下で大学病院の血液学及び腫瘍学部門から取得した。血液サンプルを、EDTAを含有する紫色のキャップバキュテイナー管に収集した。実験に使用する前に、血液サンプルを、周囲の空気への暴露を最小限にするために密封したマイクロチューブ及び密封した注射器に等分した。チャネルを通して血液を流し、以後のFCSBフロー手順を、New Era NE−300シリンジポンプシステム(Farmingdale,NY)を使用して適用する。血液サンプルを、マイクロチャネルへの注入前及びその間に1mLの使い捨て注射器に密封して、直立させる。次に、チャネルが血液で満たされるまで、血液をマイクロチャネルに28.5μL/分で導入し、次いで、15μLの血液サンプルを2.85μL/分の流速で注入する。次に、注射器を変更し、10μL/分の流速で120μLのFCSBをチャネルに導入し、非接着細胞を除去する。チャネル内の接着RBCを、倒立蛍光顕微鏡(オリンパスIΧ83)及び蛍光顕微鏡カメラ(EXi Blue EXI−BLU−R―F−M―14−C)を用いて可視化する。リアルタイム顕微鏡撮影及び高解像度ビデオを7fpsレートで記録している間に、RBCの剥離がマイクロチャネル表面から観察されるまで、段階的に増加する制御された流体流動を適用する。
この研究で、オリンパスセルセンス生細胞撮像及び解析ソフトウェア搭載のオリンパスIX83倒立電動顕微鏡を用いて、リアルタイム顕微鏡記録を取得する。オリンパス(20×/0.45 ph2及び40×/0.75 ph3)長作動距離対物レンズを、マイクロチャネル内の単一RBCの位相コントラスト撮像のために利用する(図9A)。ビデオを7fpsで記録し、さらなる処理及び分析のための単一フレーム画像に変換する。細胞の寸法は、Adobe Photoshopソフトウェア(San Jose,CA)を用いることによって分析する。
接着RBC上の流速を、矩形チャネル内の圧力駆動流を説明する式3及び式4を用いて計算する:
本研究で得られたデータを、平均±平均の標準誤差として報告する。細胞のアスペクト比、アスペクト比の変化(変形能)、流速、剪断応力、及び抗力を、多重比較のためのフィッシャーのポストホック検定と共に分散分析(ANOVA)を使用して統計的に評価する(1グループ当たりn=3〜6の血液サンプル)(Minitab 16ソフトウェア、Minitab社、State College,PA)。統計的有意性を、全ての試験について95%の信頼レベル(p<0.05)に設定する。図中のエラーバーは、平均の標準誤差を表す。
この実施例では、フィブロネクチン(FN)官能化ガラス表面を含む少なくとも1つのエッチングされたマイクロチャネルを含むマイクロ流体バイオチップについて説明する。該バイオチップは、さらに、エッチングされた入口ポート及びエッチングされた出口ポートを有するポリ(メチルメタクリレート)プラスチックトップを含む。さらに上部には、マイクロチャネルの輪郭及び幅(例えば、約50μm)を画定する両面接着フィルムを真ん中に含む(図9A及び13C)。さらに、該マイクロ流体システムは、高解像度生単細胞の画像記録及び分析のためのオリンパスIΧ83倒立電動顕微鏡ステージ上に配置してもよい。
Claims (9)
- 電気泳動システムであって、
ハウジングの一部を通って広がる電気泳動ストリップを含むハウジングであって、前記電気泳動ストリップが血液サンプルを受容するように構成される、ハウジング;
前記血液サンプルを前記電気泳動ストリップに導入するための手段;
前記電気泳動ストリップの長さに沿って電界を発生させるための第1の電極及び第2の電極であって、前記発生した電界が、前記電気泳動ストリップに導入される前記血液サンプルのヘモグロビン変異体を、前記電気泳動ストリップ上の1つ以上のバンドに移動および分離させるように誘導する、第1の電極および第2の電極;
携帯可能な撮像システムであって、前記撮像システムはカメラおよびソフトウェアアプリケーションを備え、前記撮像システムは前記発生した電界によって生じた前記電気泳動ストリップ中の前記血液サンプルのヘモグロビン変異体の前記1つ以上のバンドを検出するように構成され、かつヘモグロビン変異体を識別するために、1つ以上のバンド移動を可視化しかつ定量化するように構成され、かつ識別された前記ヘモグロビン変異体を基に、ヘモグロビン障害の診断結果を生成してユーザに表示するように構成される、撮像システム、
を備える、電気泳動システム。 - 前記ハウジングが、前記電気泳動ストリップならびに前記血液サンプルの前記ヘモグロビン変異体の移動および分離を可視化するように構成された光学的に透明な領域を備える、請求項1に記載の電気泳動システム。
- 前記光学的に透明な領域が、光学的に透明なガラスまたはプラスチックを含む、請求項2に記載の電気泳動システム。
- 前記カメラが、前記ヘモグロビン変異体の移動に対応する1つ以上のバンドを撮像するために使用され、前記ソフトウェアアプリケーションが、スクリーニング決定もしくは診断を支援するために前記バンドの種類及び/又は密度を分割し、計数し、並びに定量化する、請求項3に記載の電気泳動システム。
- 前記第1の電極及び第2の電極によって印加される電圧が、1V〜400Vの範囲内である、請求項1に記載の電気泳動システム。
- 前記電気泳動ストリップに導入される前記サンプルが、10マイクロリットル未満である、請求項1に記載の電気泳動システム。
- 前記ハウジングが、上部キャップ、底部キャップ、及び前記上部キャップと底部キャップとの間に介在する空洞を含み、前記空洞が前記電気泳動ストリップを備える、請求項1に記載の電気泳動システム。
- ヘモグロビン変異体を検出するのに使用するための電気泳動システムであって、
ハウジングの一部を通って広がる電気泳動ストリップを備えるハウジングであって、前記電気泳動ストリップはアルカリ緩衝液で飽和された酢酸セルロースのストリップであり、前記電気泳動ストリップが血液サンプルを受容するように構成される、ハウジング;
前記血液サンプルを前記電気泳動ストリップに導入するための手段;
前記電気泳動ストリップの長さに沿って電界を発生させるための第1の電極および第2の電極であって、前記発生した電界が、前記電気泳動ストリップに導入される前記血液サンプル中のヘモグロビン変異体を、前記電気泳動ストリップ上の1つ以上のバンドに移動および分離するように誘導する、第1の電極および第2の電極;
携帯可能な撮像システムであって、前記撮像システムはカメラおよびソフトウェアアプリケーションを備え、前記撮像システムは前記発生した電界によって生じた前記電気泳動ストリップ中の前記サンプルの構成成分の前記1つ以上のバンドを検出するように構成され、かつヘモグロビン変異体を識別するために、1つ以上のバンド移動を可視化しかつ定量化するように構成され、かつ識別された前記ヘモグロビン変異体を基に、ヘモグロビン障害の診断結果を生成してユーザに表示するように構成される、撮像システム、
を備える、電気泳動システム。 - 前記ハウジングが、前記電気泳動ストリップおよび前記ヘモグロビンの移動を可視化するように構成された、光学的に透明な領域を含む、請求項8に記載の電気泳動システム。
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