JP6886023B2 - 試料処理システムおよび方法 - Google Patents
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Description
本出願は、2016年12月30日に出願された米国仮特許出願第62/440,847の優先権を主張し、その内容の全ては参照により本明細書に組み込まれる
本開示は、血液および他の生物流体などの様々な流体試料、ならびに組織試料と使用するための試料処理システムに関する。
例として、以下の説明は、本明細書にて開示するシステムおよび方法の特徴の多くを例示するために、血球を含む流体を基板の表面に適用することに焦点を当てる。しかし、方法およびシステムはこの適用のみに限定されないことが理解されるべきである。それと反対に、既に説明したように、方法およびシステムは、細胞を含有する流体、および細胞を含有しない流体を含む、幅広い範囲の流体を、制御された方法で基板の表面に塗布するために使用され得る。基板表面への細胞を含有する溶液の塗布、および堆積した試料の細胞ベースの分析を行うことの以下の説明は、決して、方法およびシステムをそのような試料の処理に限定するように解釈されるべきではない。
試料3の一貫性のある、信頼性の高い処理を達成するために、特に、1つまたは複数の染色剤が試料3に塗布される(たとえば、単一の染色剤が試料に複数回塗布される、または複数の染色剤のそれぞれが、1回または複数回、試料に塗布される)場合、試料処理に使用される流体は、間隙92からの流体の漏出が最小である間に試料3に塗布されるべきである。上で説明したように、(180ミクロンと200ミクロンとの間、たとえば約190ミクロンの厚さを有する)間隙92を染色剤流体のような処理流体で充填するために、ポンプ圧と毛管力との組み合わせが使用される。毛管力は、基板とプラットフォームの上部表面との間の間隙92内に流体を維持し、基板の縁部により区切られて、間隙92からの流体の漏出を制限している。
本明細書において開示するシステムに加えて、上で説明した複合プラットフォームが、組織試料および/または生物学的流体の自動検査用に設計されるシステムを含む、他の試料処理システムとともに使用され得る。上記の複合プラットフォームと互換性のあるシステムの例が、たとえば、その開示内容の全てが参照により本明細書に組み込まれる米国特許出願公開第2013/0203100号明細書に開示されている。
試料の再現可能な、高品質の処理を達成するために、基板2と、プラットフォーム60Aおよび60Bとの間での高度のアライメントを維持することが重要となり得る。上で説明したように、比較的小さなミスアライメントですら、間隙92からの流体の漏出、および不均一な試料処理(たとえば、非均質的な試料染色)につながり得る。図1を参照すると、基板アーム10Aおよび10Bが、基板2をプラットフォーム60Aおよび60Bに対する位置へと回転させる。それに応じて、基板アーム10Aおよび10Bのミスアライメントは、間隙92へと分注される流体の量と、アーム10A/10Bのミスアライメントにより期待値と異なる、プラットフォーム60A/60Bと基板2との間の間隙92の容積との間の体積の不一致につながる。これが起こると、基板2とプラットフォーム60A/60Bの表面との非平行の相対配向により、流体が間隙に入る際に、間隙92内での流体メニスカスの流動が非対称になり、局所的に間隙92の厚さが大きくなりすぎ、基板2の縁部において、間隙92内での流体閉じ込めの促進に役立っているメニスカスの安定性が弱まる。これらの効果は、染色および他の処理のアーチファクトにつながり得る。
上で説明したように、基板2とプラットフォーム60A/60Bとの間の間隙92を制御することは、試料を処理する再現性に影響を及ぼすため、本明細書にて開示するシステムおよび方法の重要な態様である。名目上、試料処理の間、間隙92は、基板2の表面およびプラットフォーム60A/60Bにより境界付けされる領域の体積に一致する、精密に計測された体積の流体で充填される。間隙92の容積が間隙へと分注される流体の量よりも大きい場合に生じ得るエアポケットが、間隙92内に存在しないことが重要である。エアポケットが存在する場合、染色剤のような流体が間隙92中を不均一に流動し、試料に不均一に塗布され得る。その後に染色された試料が分析されると、試料の画像中のアーチファクトが不均一の染色から生じ得るし、これらのアーチファクトは、試料に行われる定量測定を不正確にし得る。
試料3の性質に応じて、様々な多数の処理段階が、検査のために試料を調製するために処理シーケンスの全体の一部として行われ得る。そのような段階の例を以下において説明する。しかし、幅広い種類の様々な処理段階および段階の組み合わせが、本明細書において例として具体的に説明されていない段階を含め、本明細書において開示するシステムを使用して行われ得ることが理解されるべきである。
流体管52A〜55Aおよび52B〜55Bは、試料処理の間、固定剤をプラットフォーム60Aおよび60B、間隙92、基板2、ならびに試料3に送達するために位置決めされ得る。使用され得る固定剤は、生体試料を腐敗から保護するための化学物質を含み、そのような固定剤は、試料中に生じる生物学的反応を遅らせ、試料の機械的強度および安定性を上昇させ得る。限定されないが、メタノール、エタノール、イソプロパノール、アセトン、ホルムアルデヒド、グルタルアルデヒド、EDTA、界面活性剤、金属塩、金属イオン、尿素、およびアミノ化合物を含む様々な固定剤が使用され得る。
システム1は、また、1つまたは複数の染色段階にて、1つまたは複数の染料または染色剤を基板に固定された試料に塗布するように構成される管およびポートを含む。試料の染色により、顕微鏡または他の撮像装置下で視認または撮像される際に、試料のコントラストが増加する。ロマノフスキー染色剤、ならびに/またはヘマトキシリンおよびエオシン、フルオレセイン、抗体を使用するチアジン染色剤、核酸プローブ、および/もしくは金属塩および金属イオンを含む他の染料または染色剤が、使用され得る。
既に参照したように、真空または他の吸引源220および/または221(たとえば真空キャニスタまたはポンプ)が、残りの流体を、基板2、間隙92、およびプラットフォーム60Aから、固定段階および染色段階中に、または固定段階と染色段階との間に、排出し得る。図1を参照すると、1つまたは複数の廃棄物管は、ブロック80Aの側部82Aおよび84Aに接続され得る。廃棄物または真空管50Aおよび51Aは、流体および微粒子状物質を、プラットフォーム60A、間隙92、および基板2から、廃棄物容器またはシステム1と分離した他の位置へと引き込むために使用される。図2を参照して、廃棄物管51Aおよび51Bは、廃棄物管の遠位端部にて、分離した真空源220および221、ならびに廃棄物容器230および231に接続されてもよい。代替的に、2つ以上の廃棄物管は、図4に示すように、単一の真空源、および同じ廃棄物容器に接続され得る。廃棄物管50Aおよび50Bは、図3に示すように、それぞれバルブ90Aおよび90Bを通して延びてもよい。
1つまたは複数の洗浄段階において、洗浄液は、試料処理の間、システム1を用いて塗布され得る。たとえば、固定段階と固定段階との間、染色段階と染色段階との間、および/または固定段階と染色段階との間に、基板2上の試料3、間隙92、ならびにプラットフォーム60Aおよび/または60Bから、残ったおよび/または余分な流体を除去することが望ましい場合がある。本システムおよび方法に対応している洗浄液としては、蒸留水、緩衝液、有機溶剤、および緩衝作用のある、または緩衝作用のない水性溶剤と有機溶剤との混合物が含まれる。
ある特定の実施形態における試料処理は、任意に、固定、染色、および/または洗浄段階中に、固定剤、染色剤、および/または洗浄液を間隙92、試料3を含む基板2、ならびにプラットフォーム60Aおよび/または60Bの全体に亘り分散させるための1つまたは複数の撹拌段階を含んでもよい。図3に示すアクチュエータ30Aおよび/または30Bは、基板2の位置をプラットフォーム60Aおよび/または60Bに対し変更させるための移動の微調整を提供し得る。撹拌は、試料3を処理するために使用される流体のいずれにも要求されない。しかし、いくつかの実施形態では、撹拌は、間隙が充填される際に、間隙92内の流体を混合/均質化するために、および特定の処理段階に続いて、流体の、間隙92からの排出に使用され得る。
ある特定の実施形態では、制御システム5は、システム1に取り付けられる乾燥機4を使用して試料3を乾燥し得る。たとえば、乾燥機4は、空気の流れを、試料3を横切るように導き得る。概して、システム1は、空気の温度、流速、適用される気流の持続時間、および試料3を乾燥させるための試料処理の間の(1つまたは複数の)段階を変化させるために制御され得る。たとえば、染色段階を完了した後に、乾燥機4は、華氏約120度の空気の流れを、毎分10リットルの速度で7秒間、試料3を横切るように導き得る。他の空気温度(たとえば華氏300度までの周囲温度)、空気流速(たとえば毎分1リットル〜毎分10リットル)、および空気流動期間(たとえば数秒〜数分)も使用され得る。
多数の実施形態を説明した。それにもかかわらず、本開示の精神および範囲から逸脱することなく様々な変形例が実施され得ることが理解されるであろう。それに応じて、他の実施形態は、以下の特許請求項の範囲の範囲内である。
Claims (53)
- 基板上で試料を調製するための装置であって、
前記装置は、
第1の位置と第2の位置との間で基板を移動させるように構成される基板ハンドラと、
前記基板が前記第2の位置にあるときに、前記基板に面するように位置決めされるプラットフォームと
を備え、
前記プラットフォームは、
水接触角が40度以下である親水性材料から形成される第2の表面を有する流体送達領域と、
前記基板が前記第2の位置にあるときに前記基板に面する第1の表面であって、水接触角が100度以上である疎水性材料から形成される第1の表面と
を備え、
前記プラットフォームは、前記基板が前記第2の位置にあるときに前記第2の表面に流体が送達されるように構成される、
装置。 - 前記プラットフォームは、前記親水性材料で形成される第1の部材と、前記第1の表面を形成するために前記第1の部材の少なくとも一部の上に配置される前記疎水性材料の層とを備える、請求項1記載の装置。
- 前記第1の表面により画定される平面に対し垂直の方向に測定される前記疎水性材料の層の厚さは、100ミクロン以下である、請求項2記載の装置。
- 前記疎水性材料の層の前記厚さは、5ミクロン以下である、請求項3記載の装置。
- 前記親水性材料は、雲母、ガラス、およびガラスセラミック複合材料からなる群から選択される少なくとも1つの材料を含む、請求項1記載の装置。
- 前記親水性材料は、金属および金属酸化物からなる群から選択される少なくとも1つの材料を含む、請求項1記載の装置。
- 前記親水性材料は、前記疎水性材料の酸化生成物を含む、請求項1記載の装置。
- 前記疎水性材料は、ポリジメチルアクリルアミド、ポリジメチルシロキサン、ポリオレフィン、およびフルオロポリマーからなる群から選択される少なくとも1つの材料を含む、請求項1記載の装置。
- 少なくとも1つのスペーサをさらに備え、前記少なくとも1つのスペーサは、前記基板が前記第2の位置にあるときに、前記基板が前記少なくとも1つのスペーサに接触し、前記第1の表面上の任意の2つの位置についての、前記基板と前記第1の表面との間の最も近い距離の最大変動が10ミクロン以下であるように、前記第1の表面上に位置決めされる、請求項1記載の装置。
- 前記第2の表面上に位置決めされる流体出口ポートをさらに備える、請求項1記載の装置。
- 前記流体送達領域は、短手方向および前記短手方向に直交する長手方向を有し、前記流体送達領域の短手方向の中心を通って、前記流体送達領域の長手方向に沿って延びる中心軸を有し、前記流体出口ポートの中心は、前記流体送達領域の中心軸から、前記中心軸に直交する方向に沿って変位される、請求項10記載の装置。
- 前記第2の表面上で、前記流体送達領域の中心軸を挟んだ両側に位置決めされる第1の流体入口ポートおよび第2の流体入口ポートをさらに備え、前記第1の流体入口ポートおよび前記第2の流体入口ポートのそれぞれにおいて、
前記流体入口ポートの中心と前記流体出口ポートとの間で流動軸が延び、
前記流動軸と前記流体送達領域の前記中心軸との間の角度が、αである、
請求項10記載の装置。 - 前記第2の表面上で、前記中心軸を挟んだ両側に位置決めされる第3の流体入口ポートおよび第4の流体入口ポートをさらに備え、前記第3の流体入口ポートおよび前記第4の流体入口ポートのそれぞれにおいて、
前記流体入口ポートの中心と前記流体出口ポートとの間で流動軸が延び、
前記流動軸と前記流体送達領域の前記中心軸との間の角度が、βである、
請求項12記載の装置。 - αは、15度以下である、請求項12記載の装置。
- αは、10度以下である、請求項14記載の装置。
- βは、10度以下である、請求項13記載の装置。
- βは、6度以下である、請求項16記載の装置。
- αは、βよりも大きい、請求項13記載の装置。
- 前記プラットフォームの上部表面に対し垂直の方向に沿って測定される、前記第1の表面に対する前記流体送達領域の最大深さは、200ミクロン以下である、請求項1記載の装置。
- 前記最大深さは、150ミクロン以下である、請求項19記載の装置。
- 前記疎水性材料の前記水接触角と前記親水性材料の前記水接触角との間の差異は、50度以上である、請求項1記載の装置。
- 前記疎水性材料の前記水接触角と前記親水性材料の前記水接触角との間の差異は、70度以上である、請求項21記載の装置。
- 前記第2の表面は、平面状である、請求項12記載の装置。
- 前記流体送達領域は、前記第1の表面中に凹部を形成してなり、前記凹部は、前記第1の表面と前記第2の表面との間に延びる側壁表面を備える、請求項23記載の装置。
- 隣り合う側壁表面の各組は、前記表面のなす角度が90度よりも大きいように方向付けされる、請求項24記載の装置。
- 隣り合う側壁表面の各組は、丸みを帯びたフィレットに沿って一体化する、請求項25記載の装置。
- 前記凹部は、
平行な第1の側壁表面および第2の側壁表面と、
前記第1の側壁表面および前記第2の側壁表面に直交する第3の側壁表面と、
前記第3の側壁表面と、前記第1の側壁表面および前記第2の側壁表面との間にそれぞれ延びる第4の側壁表面および第5の側壁表面と、
前記第1の側壁表面および前記第2の側壁表面からそれぞれ延び、交差する第6の側壁表面および第7の側壁表面と、
を備える、請求項24記載の装置。 - 前記凹部の底部表面は、上面視で七角形の形状を有し、前記凹部の前記側壁表面の少なくともいくつかは、異なる長さを有する、請求項27記載の装置。
- 前記第1、第2、第3、および第4の流体入口ポートは、前記第6の側壁表面および前記第7の側壁表面よりも、前記第3の側壁表面により近く位置決めされる、請求項27記載の装置。
- 流体送達のプラットフォームであって、
前記プラットフォームは、
第1の表面と、
前記第1の表面から延び、基板に接触して前記基板と前記第1の表面との間で一定の間隔を維持するように構成される少なくとも1つのスペーサと
を備え、
前記第1の表面は、第1の材料を含み、
第2の表面は、前記第1の表面中に凹部の底部を形成し、前記第1の材料とは異なる第2の材料を含み、
前記第1の材料の水接触角と、前記第2の材料の水接触角との間の差異は、50度以上であり、
前記プラットフォームは、前記基板が前記少なくとも1つのスペーサに接触しているときに前記第2の表面に流体が送達されるように構成される、
プラットフォーム。 - 前記水接触角の間の差異は、70度以上である、請求項30記載のプラットフォーム。
- 前記第1の材料の前記水接触角は、100度以上である、請求項30記載のプラットフォーム。
- 前記第2の材料の前記水接触角は、40度以下である、請求項30記載のプラットフォーム。
- 前記第1の材料は、ポリジメチルアクリルアミド、ポリジメチルシロキサン、ポリオレフィン、およびフルオロポリマーからなる群から選択される少なくとも1つの材料を含む、請求項30記載のプラットフォーム。
- 前記第2の材料は、雲母、ガラス、およびガラスセラミック複合材料からなる群から選択される少なくとも1つの材料を含む、請求項30記載のプラットフォーム。
- 前記第2の材料は、金属および金属酸化物からなる群から選択される少なくとも1つの材料を含む、請求項30記載のプラットフォーム。
- 前記第2の材料は、前記第1の材料の酸化生成物を含む、請求項30記載のプラットフォーム。
- 前記第1の表面は、前記第2の材料の基板の上に配置される前記第1の材料の層により形成され、前記第1の表面により画定される平面に対し垂直の方向に測定される、前記第1の材料の層の厚さは、100ミクロン以下である、請求項30記載のプラットフォーム。
- 前記第1の材料の層の厚さは、5ミクロン以下である、請求項38記載のプラットフォーム。
- 前記第1の表面の反対に、および前記プラットフォームと支持基部との間に位置決めされる1つまたは複数の変形可能部材をさらに備える、請求項30記載のプラットフォーム。
- 前記1つまたは複数の変形可能部材は、ばね、エラストマ材料、金属材料、ポリマー材料、ゴム材料、発泡材料、磁気サスペンション要素、電磁サスペンション要素、液圧サスペンション要素、空圧サスペンション要素のうちの少なくとも1つを含む、請求項40記載のプラットフォーム。
- 流体送達のプラットフォームであって、
前記プラットフォームは、
第1の表面と、
前記第1の表面に形成され、第2の表面により形成される底部を有する凹部であって、前記凹部が、短手方向および前記短手方向に直交する長手方向を有し、前記凹部の短手方向の中心を通って、前記凹部の長手方向に沿って延びる中心軸を有する凹部と、
前記プラットフォームの上部表面から延び、基板に接触して前記基板と前記第1の表面との間で一定の間隔を維持するように構成される少なくとも1つのスペーサと、
前記第2の表面に沿って位置決めされる流体出口ポートであって、前記流体出口ポートの中心は、前記凹部の中心軸に沿って配置される、流体出口ポートと、
前記第2の表面に沿って、前記中心軸を挟んだ両側に位置決めされる第1の流体入口ポートおよび第2の流体入口ポートと、
前記第2の表面に沿って、前記中心軸を挟んだ両側に位置決めされる第3の流体入口ポートおよび第4の流体入口ポートと、
を備え、
前記第1の流体入口ポートおよび前記第2の流体入口ポートのそれぞれにおいて、
前記流体入口ポートの中心と前記流体出口ポートとの間で流動軸が延び、前記流動軸と前記凹部の前記中心軸との間の角度は、αであり、
前記第3の流体入口ポートおよび前記第4の流体入口ポートのそれぞれにおいて、
前記流体入口ポートの中心と前記流体出口ポートとの間で流動軸が延び、前記流動軸と前記凹部の前記中心軸との間の角度は、βであり、
αは、βよりも大きい、
プラットフォーム。 - 前記第1の流体入口ポートおよび前記第2の流体入口ポートのそれぞれは、それぞれの流動軸に沿って、前記流体出口ポートから距離a1に位置し、前記第3の流体入口ポートおよび前記第4の流体入口ポートのそれぞれは、それぞれの流動軸に沿って、前記流体出口ポートから距離b1に位置し、a1は、b1よりも大きい、請求項42記載のプラットフォーム。
- αは、15度以下である、請求項42記載のプラットフォーム。
- αは、10度以下である、請求項44記載のプラットフォーム。
- βは、10度以下である、請求項42記載のプラットフォーム。
- βは、6度以下である、請求項46記載のプラットフォーム。
- 前記凹部は、
平行な第1の側壁表面および第2の側壁表面と、
前記第1の側壁表面および前記第2の側壁表面に直交する第3の側壁表面と、
前記第3の側壁表面と、前記第1の側壁表面および前記第2の側壁表面との間にそれぞれ延びる第4の側壁表面および第5の側壁表面と、
前記第1の側壁表面および前記第2の側壁表面からそれぞれ延び、交差する第6の側壁表面および第7の側壁表面と、
を備える、
請求項42記載のプラットフォーム。 - 前記第2の表面は、上面視で七角形の形状を有し、前記凹部の前記側壁表面の少なくともいくつかは、異なる長さを有する、請求項48記載のプラットフォーム。
- 前記第1、第2、第3、および第4の流体入口ポートは、前記第6の側壁表面および前記第7の側壁表面よりも、前記第3の側壁表面により近く位置決めされる、請求項42記載のプラットフォーム。
- 前記第1の表面の反対に、および前記プラットフォームと支持基部との間に位置決めされる1つまたは複数の変形可能部材をさらに備える、請求項42記載のプラットフォーム。
- 前記1つまたは複数の変形可能部材は、ばね、エラストマ材料、金属材料、ポリマー材料、ゴム材料、発泡材料、磁気サスペンション要素、電磁サスペンション要素、液圧サスペンション要素、空圧サスペンション要素のうちの少なくとも1つを含む、請求項51記載のプラットフォーム。
- 流体を基板に塗布する方法であって、
前記基板を、流体送達システムのプラットフォームに対して、前記基板が前記プラットフォームに面し、前記基板が前記プラットフォームから所定の間隙だけ分離されるように、位置決めすることであって、
前記プラットフォームは、
前記基板が前記プラットフォームに面する際に前記基板に面する第1の表面であって、水接触角が100度以上である疎水性材料から形成される第1の表面と、
水接触角が40度以下である親水性材料から形成される第2の表面を備える流体送達領域と、
前記第2の表面上に位置決めされる複数の流体入口ポートと、
前記第2の表面上に位置決めされる流体出口ポートと
を備える、
前記基板を位置決めすることと、
前記流体を前記複数の流体入口ポートを通して送達することにより前記間隙を前記流体で充填し、それによって前記基板を前記流体と接触させることと、
前記流体出口ポートを通して前記流体を排出することにより、前記流体を前記間隙から除去することと
を含む、
方法。
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