JP6837963B2 - Mir−29模倣物およびその使用 - Google Patents

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Description

本願は、2014年9月8日に出願された米国仮出願第62/047,562号への優先権の利益を主張し、その内容全体が参照によって本明細書に組み込まれる。
本発明は、in vivoにおけるmiRNA活性を増大させる合成miRNA模倣物またはpromiRに関する。詳細には、本発明は、miR−29の模倣物、ならびに、コラーゲン沈着および関連する状態、例えば線維症などの軽減におけるそれらの使用に関する。
マイクロRNA(miRNA)の遺伝学または薬理学的調節を使用して動物疾患モデルにおいて収集された機能獲得または機能喪失データに基づき、miRNAが疾患の間に重要な役割を果たすことが現在広く認められている。これらの研究は、最近の前向きな臨床的有効性データ(Janssenら、2013年)と合わせると、miRNAの妥当性、およびmiRNAが次のクラスの治療薬になることの実現可能性が裏付けられる。実際に、miRNAは小さく、既知の配列を含むということにおいて、miRNAには治療介入点として有利な点がいくつかある。さらに、単一のmiRNAによって生物学的経路内の多数の標的mRNAを制御することができるので、原理上、miRNAを調節することにより、遺伝子ネットワーク全体に影響を及ぼすこと、および複雑な疾患表現型を改変することが可能になる(van RooijおよびOlson、2012年)。
多くの試験により、抗miRと称される一本鎖miRNA阻害剤を使用した治療有効性が示されているが、miRNAの機能を回復または増大させるための試みは遅れている(van Rooijら、2012年)。現在、miRNA機能は、ウイルスによる過剰発現によってか、または合成二本鎖miRNAを使用することによって増大させることができる。これまで、所与のmiRNAのin vivoにおける活性を回復させるためにその発現を駆動するためのアデノ随伴ウイルス(AAV)の使用が肝細胞癌および肺癌(KasinskiおよびSlack、2012年;Kotaら、2009年)ならびに球脊髄性筋萎縮症(Miyazakiら、2012年)のマウスモデルにおいて有効であることが示されているが、miRNAレベルを上昇させるための、定式化されていない合成オリゴヌクレオチドに基づく手法の使用は十分に探究されていない。
マイクロRNA−29(miR−29)ファミリーは、細胞外マトリックスタンパク質を制御するそれらの能力がよく特徴付けられている(Heら、2013年)。このファミリーは、miR−29a、miR−29bおよびmiR−29cからなり、2つのバイシストロン性クラスター(miR−29a/−29b−1およびmiR−29b−2/−29c)として表され、異なるメンバー間で成熟miRNAの3’領域における配列の相同性が大きく、ミスマッチはほんのわずかである(van Rooijら、2008年)。3種のメンバーは全て、種々の型の組織線維症において低下しており、miR−29レベルを上昇させることの治療的利益が、心臓(van Rooijら、2008年)、腎臓(Qinら、2011年;Wangら、2012年;Xiaoら、2012年)、肝臓(Roderburgら、2011年;Sekiyaら、2011年;Zhangら、2012年)、肺(Cushingら、2011年;Xiaoら、2012年)および全身性硬化症(Maurerら、2010年)について示されている。
in vivoにおけるmiR−29活性を有効に増大させることができる、合成オリゴヌクレオチドmiR−29の模倣物が当技術分野において必要とされている。そのようなmiR−29模倣物またはmiR−29 promiRは、種々の組織の線維状態を処置するために有用である。
本発明は、安定性および細胞内取り込みについて改変されたmiRNA模倣物を使用して、miR−29の内在性機能を再現することができるという発見に一部基づく。例えば、肺線維症の状況におけるmiR−29b模倣物を用いた治療的処置により、ブレオマイシンにより誘導されるmiR−29の減少からの回復が起こり、肺線維症が遮断され、元に戻り、それと同時に疾患過程中に誘導されるmiR−29標的遺伝子が抑制される。同様に、miR−29b模倣物を用いて皮膚切開を処置することにより、細胞外マトリックス遺伝子および線維化プロセスに関与する他の遺伝子の発現が下方制御される。したがって、本発明は、二本鎖RNA miR−29模倣化合物を提供する。
一部の実施形態では、miR−29模倣化合物は、(a)成熟miR−29a、miR−29b、またはmiR−29c配列を含む、約23〜約26リボヌクレオチドの第1の鎖と、(b)第1の鎖と実質的に相補的な配列を含む、約22〜約23リボヌクレオチドの第2の鎖とを含み、第1の鎖は、第2の鎖に対して3’ヌクレオチド突出部を有する。ある特定の実施形態では、第1の鎖および第2の鎖は、1つまたは複数の修飾されたヌクレオチドを含有する。修飾されたヌクレオチドは、2’糖修飾、例えば、2’−アルキル(2’−O−メチル)または2’−フルオロ修飾であってよい。一実施形態では、第1の鎖は、1つまたは複数の2’−フルオロ修飾を有する。別の実施形態では、第2の鎖は、1つまたは複数の2’−O−メチル修飾を有する。一部の実施形態では、第2の鎖は、第1の鎖に対して1つ、2つ、3つ、またはそれ超のミスマッチを有する。一実施形態では、miR−29模倣化合物の第2の鎖は、第1の鎖に対して、3’末端(第2の鎖の)から4位、13位、および/または16位におけるミスマッチを含有する。
一実施形態では、miR−29模倣化合物の第2の鎖は、その3’末端においてコレステロール分子に結合している。ある特定の実施形態では、コレステロール分子は第2の鎖と少なくとも6炭素リンカーを通じて結合している。リンカーは、切断可能なリンカーであってよい。
一実施形態では、第1の鎖における3’突出部を含むヌクレオチドは、ホスホロチオエート結合によって結合している。
一実施形態では、miR−29模倣化合物は、配列番号27の配列を含む第1の鎖と、配列番号5の配列を含む第2の鎖とを含む。
別の実施形態では、miR−29模倣化合物は、配列番号19の配列を含む第1の鎖と、配列番号1の配列を含む第2の鎖とを含む。
さらに別の実施形態では、miR−29模倣化合物は、配列番号19の配列を含む第1の鎖と、配列番号15の配列を含む第2の鎖とを含む。
さらに別の実施形態では、miR−29模倣化合物は、配列番号33の配列を含む第1の鎖と、配列番号1の配列を含む第2の鎖とを含む。
さらに別の実施形態では、miR−29模倣化合物は、配列番号34の配列を含む第1の鎖と、配列番号1の配列を含む第2の鎖とを含む。
さらに別の実施形態では、miR−29模倣化合物は、配列番号35の配列を含む第1の鎖と、配列番号24の配列を含む第2の鎖とを含む。
本発明は、有効量の本明細書に記載のmiR−29模倣化合物または薬学的に許容されるその塩と、薬学的に許容される担体または希釈剤とを含む医薬組成物を提供する。ある特定の実施形態では、医薬組成物は、肺、鼻、鼻腔内または眼への送達用に製剤化され、散剤、水溶液、水性エアロゾル、点鼻剤、エアロゾル、および/または点眼剤の形態であってよい。一部の実施形態では、医薬組成物は、ネブライザー、定量用量吸入器、乾燥粉末吸入器、またはソフトミスト吸入器などの吸入システムを用いて投与される。
本発明は、細胞において細胞外マトリックス遺伝子を制御する方法であって、細胞を、本明細書に記載のmiR−29模倣化合物と接触させるステップを含む方法も包含する。一実施形態では、細胞外マトリックス遺伝子の発現または活性は、miR−29模倣化合物または組成物との接触後に低下する。一部の実施形態では、細胞外マトリックス遺伝子は、Col1a1およびCol3a1などのコラーゲン遺伝子である。細胞は、in vitro、in vivo、またはex vivoにおけるものであってよい。
本発明は、組織線維症の処置または予防を必要とする対象において組織線維症を処置または予防する方法を提供する。一実施形態では、本方法は、対象に、本明細書に記載のmiR−29模倣化合物を投与するステップを含む。ある特定の実施形態では、組織線維症は、心臓線維症、肺線維症、腎線維症、肝線維症、眼線維症、肥厚性瘢痕(hypertrophic scarring)およびケロイドを含めた皮膚線維症、手、関節もしくは腱の線維症、ペイロニー病または強皮症である。一実施形態では、組織線維症は、特発性肺線維症(IPF)である。
ある特定の実施形態では、組織線維症を処置または予防するための方法は、本明細書に記載のmiR−29模倣化合物または組成物を肺経路、経鼻経路、または鼻腔内経路によって投与するステップを含む。一実施形態では、miR−29模倣化合物または組成物を吸入によって送達する。
本発明は、細胞において非細胞外マトリックス遺伝子を制御する方法であって、細胞を、本明細書に記載のmiR−29模倣化合物と接触させるステップを含む方法も包含する。一実施形態では、非細胞外マトリックス遺伝子の発現または活性は、miR−29模倣化合物または組成物との接触後に増大する。一部の実施形態では、非細胞外マトリックス遺伝子は、Itga3またはNumbなどの遺伝子である。細胞は、in vitro、in vivo、またはex vivoにおけるものであってよい。
本発明は、miR−29アゴニストまたはmiR−29アンタゴニストを用いた処置の有効性を評価するための方法であって、miR−29アゴニストまたはmiR−29アンタゴニストを用いた処置の前に対象の細胞または線維性組織における1種または複数種の遺伝子の発現のレベルを決定するステップであって、当該1種または複数種の遺伝子が、miR−29によって調節される遺伝子のセットから選択されるステップと、miR−29アゴニストまたはmiR−29アンタゴニストを用いた処置後に対象の細胞/線維性組織における同じ1種または複数種の遺伝子の発現レベルを決定するステップと、処置の前後の発現レベルに基づいて、処置に効果があるか、効果が少ないか、または効果がないかを決定するステップとを含む方法も提供する。一実施形態では、miR−29によって調節される1種または複数種の遺伝子は、表5から選択される。
特定の実施形態では、例えば以下の項目が提供される。
(項目1)
成熟miR−29a、miR−29b、またはmiR−29c配列を含む、約23〜約26リボヌクレオチドの第1の鎖と、
前記第1の鎖と実質的に相補的な配列を含み、少なくとも1つの修飾されたヌクレオチドを有する、約22〜約23リボヌクレオチドの第2の鎖と
を含むmiR−29模倣化合物であって、前記第1の鎖が、前記第2の鎖に対して3’ヌクレオチド突出部を有する、miR−29模倣化合物。
(項目2)
前記第1の鎖が、1つまたは複数の2’フルオロヌクレオチドを有する、項目1に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目3)
前記第1の鎖が、修飾されたヌクレオチドを有さない、項目1に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目4)
前記第2の鎖内の前記少なくとも1つの修飾されたヌクレオチドが、2’−O−メチル修飾されたヌクレオチドである、項目1に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目5)
前記第2の鎖が、前記第1の鎖に対してミスマッチを1つ、2つ、または3つ有する、項目1に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目6)
前記第2の鎖が、前記第1の鎖に対して、3’末端から4位、13位、および/または16位におけるミスマッチを含有する、項目5に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目7)
前記第2の鎖が、その3’末端または5’末端においてコレステロール分子と結合している、項目1に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目8)
前記コレステロール分子が、前記第2の鎖と少なくとも6炭素リンカーを通じて結合している、項目7に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目9)
前記第1の鎖における前記3’突出部を含むヌクレオチドが、ホスホロチオエート結合によって結合している、項目1に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目10)
前記第1の鎖が、成熟miR−29b配列を含む、項目1に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目11)
前記第1の鎖が、配列番号2、18〜21、または31〜34から選択される配列を含む、項目10に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目12)
前記第2の鎖が、1、8〜17、または28〜30から選択される配列を含む、項目10に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目13)
前記第1の鎖が配列番号19の配列を含み、前記第2の鎖が配列番号1の配列を含む、項目10に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目14)
前記第1の鎖が配列番号19の配列を含み、前記第2の鎖が配列番号15の配列を含む、項目10に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目15)
前記第1の鎖が配列番号33の配列を含み、前記第2の鎖が配列番号1の配列を含む、項目10に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目16)
前記第1の鎖が配列番号34の配列を含み、前記第2の鎖が配列番号1の配列を含む、項目10に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目17)
前記第1の鎖が、成熟miR−29a配列を含む、項目1に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目18)
前記第1の鎖が、配列番号6、7または27の配列を含む、項目17に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目19)
前記第2の鎖が、配列番号3〜5から選択される配列を含む、項目18に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目20)
前記第1の鎖が配列番号27の配列を含み、前記第2の鎖が配列番号5の配列を含む、項目17に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目21)
前記第1の鎖が、成熟miR−29c配列を含む、項目1に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目22)
前記第1の鎖が、配列番号25、26、または35の配列を含む、項目21に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目23)
前記第2の鎖が、配列番号22〜24から選択される配列を含む、項目19に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目24)
前記第1の鎖が配列番号35の配列を含み、前記第2の鎖が、配列番号24の配列を含む、項目21に記載のmiR−29模倣化合物。
(項目25)
有効量の項目1に記載のmiR−29模倣化合物または薬学的に許容されるその塩と、薬学的に許容される担体または希釈剤とを含む医薬組成物。
(項目26)
吸入用組成物である、項目25に記載の医薬組成物。
(項目27)
細胞において細胞外マトリックス遺伝子を制御する方法であって、前記細胞を、項目1に記載のmiR−29模倣化合物または項目25に記載の医薬組成物と接触させるステップを含む方法。
(項目28)
前記細胞が哺乳動物細胞である、項目27に記載の方法。
(項目29)
前記細胞が線維芽細胞または上皮細胞である、項目28に記載の方法。
(項目30)
前記細胞がin vivoまたはex vivoにおけるものである、項目27に記載の方法。
(項目31)
組織線維症の処置または予防を必要とする対象において組織線維症を処置または予防する方法であって、前記対象に、項目1に記載のmiR−29模倣化合物または項目25に記載の医薬組成物を投与するステップを含む方法。
(項目32)
前記組織線維症が、心臓線維症、肺線維症、腎線維症、肝線維症、強皮症、眼線維症、皮膚線維症である、項目31に記載の方法。
(項目33)
前記皮膚線維症が、肥厚性瘢痕(hypertrophic scarring)、ケロイド、手、関節または腱の線維症、およびペイロニー病からなる群から選択される、項目32に記載の方法。
(項目34)
前記投与が吸入によるものである、項目31に記載の方法。
(項目35)
前記miR−29模倣化合物または前記医薬組成物が、定量用量吸入器、乾燥粉末吸入器、ネブライザー、加熱式気化器、ソフトミスト吸入器、温熱エアロゾル吸入器、または電気流体力学に基づく溶液ミスト化吸入器によって投与される、項目31に記載の方法。
(項目36)
miR−29アゴニストまたはmiR−29アンタゴニストを用いた処置の有効性を評価するための方法であって、前記miR−29アゴニストまたはmiR−29アンタゴニストを用いた処置の前に対象の細胞または線維性組織における1種または複数種の遺伝子の発現のレベルを決定するステップであって、前記1種または複数種の遺伝子が、miR−29によって調節される遺伝子のセットから選択されるステップと、前記miR−29アゴニストまたはmiR−29アンタゴニストを用いた処置後に前記対象の細胞/線維性組織における同じ1種または複数種の遺伝子の発現レベルを決定するステップと、前記処置の前後の前記発現レベルに基づいて、前記処置に効果があるか、効果が少ないか、または効果がないかを決定するステップとを含む方法。
(項目37)
miR−29によって調節される前記1種または複数種の遺伝子が、表5から選択される、項目36に記載の方法。
図1Aは、二本鎖miR−29模倣物設計を示す図である。二本鎖miR−29模倣物設計は、miR−29bと同一であり、3’末端上にUU突出部を有し、安定性が増大するように改変され、5’末端において化学的にリン酸化された「ガイド鎖」または「アンチセンス鎖」と、RNA誘導性サイレンシング複合体(RISC)に組み入れられるのを防止するため、ならびに安定性を増大させるために2’−O−Me修飾を含有させ、細胞内取り込みを増強するためにコレステロールと結合させた「パッセンジャー鎖」または「センス鎖」とを含有する。センス鎖には、この鎖が抗miRとして機能するのを防ぐためにいくつかのミスマッチを導入する。
図1Bは、NIH 3T3におけるトランスフェクション実験についてのグラフである。この実験から、無処理または偽処理細胞のいずれかと比較して、miR−29b模倣物の量の増加に伴ったCol1a1の用量依存的な減少が示される。Col1a1を直接標的とするsiRNAを陽性対照として共に用いた。偽に対してp<0.05、#無処理に対してp<0.05。
図1Cは、10mpk、50mpk、100mpk、または125mpkのmiR−29b模倣物を静脈内注射した4日後の種々の組織におけるmiR−29bについてのノーザンブロット分析についての図である。この分析により、全ての組織への最高用量での送達が示され、生理食塩水を注射したマウスと比較して最も有効な送達は肺および脾臓に対して起こる。U6をローディング対照として使用する。
図1Dは、miR−29b模倣のリアルタイム数量化についてのグラフである。これにより、高用量レベルでのmiR−29bのレベルの上昇が示され、肺および脾臓への送達が最も効率的である(群当たりn=4)。生理食塩水を注射した動物に対してp<0.05。
図1Eは、125mpkの模倣物を静脈内注射した1日後、2日後、4日後および7日後の種々の組織におけるmiR−29bについてのノーザンブロット分析を示す図である。この分析により、検査した全ての組織においてmiR−29b模倣物の存在が示され、肺および脾臓においてより長く検出された。U6をローディング対照として使用する。
図1Fは、miR−29b模倣のリアルタイム数量化を示すグラフである。これにより、測定した全ての組織においてmiR−29bのレベルの上昇が示され、これは肺および脾臓において最も長く維持される(群当たりn=4)。生理食塩水を注射した動物に対してp<0.05。
図2Aは、リアルタイムPCR分析についてのグラフである。この分析により、miR−29ファミリーメンバーは全てブレオマイシンに応答して減少し、一方、miR−29模倣物を用いた処置の結果、対照または生理食塩水を注射した動物のいずれかと比較してmiR−29bの検出レベルが上昇したことが示される。生理食塩水/生理食塩水に対してp<0.05。
図2Bは、リアルタイムPCR分析についてのグラフである。この分析により、特発性肺線維症(IPF)の患者の肺生検材料において、正常対照と比較して、miR−29レベルの同等の低下が示される。正常に対してp<0.05。
図2Cは、三色染色による組織学的検査についての図である。この検査により、ブレオマイシンに応答して著しい線維化反応および炎症反応が示され、これは、miR−29b模倣物を用いた処置によって鈍化した。スケールバーは100μmを示す。
図2Dは、総コラーゲン含有量についてアッセイするためのヒドロキシプロリン測定についてのグラフである。この測定により、生理食塩水を用いた処置群および対照を用いた処置群のどちらにおいてもブレオマイシンを用いた処置後に有意な増加が示され、一方、miR−29模倣物を用いた処置群では、生理食塩水を用いて処置したマウスとブレオマイシンを用いて処置したマウスの間で統計学的差異はなかった。
図2E〜Gは、気管支肺胞洗浄(BAL)液に対するサイトカイン測定についてのグラフである。この測定により、ブレオマイシンを用いて処置したマウス由来の肺からBAL液において有意に高い濃度のIL−12、IL−4およびG−CSFが検出可能であり、これは、miR−29b模倣物によって減少することが示された。(n=4)、p<0.05。 図2E〜Gは、気管支肺胞洗浄(BAL)液に対するサイトカイン測定についてのグラフである。この測定により、ブレオマイシンを用いて処置したマウス由来の肺からBAL液において有意に高い濃度のIL−12、IL−4およびG−CSFが検出可能であり、これは、miR−29b模倣物によって減少することが示された。(n=4)、p<0.05。 図2E〜Gは、気管支肺胞洗浄(BAL)液に対するサイトカイン測定についてのグラフである。この測定により、ブレオマイシンを用いて処置したマウス由来の肺からBAL液において有意に高い濃度のIL−12、IL−4およびG−CSFが検出可能であり、これは、miR−29b模倣物によって減少することが示された。(n=4)、p<0.05。
図2Hは、ブレオマイシンを用いた処置によりBAL液における免疫細胞の検出が増加し、これがmiR−29b模倣物の存在下では有意に低下したが、対照模倣物による効果はなかったことを示すグラフである。(n=4)、生理食塩水/ブレオマイシンに対してp<0.05、^対照/ブレオマイシンに対してp<0.05。
図3A〜Bは、Col1a1およびCol3a1の発現が、リアルタイムPCRによって測定したところ、ブレオマイシンを用いた処置により増加し、miR−29b模倣物の存在によってCol1a1およびCol3a1が阻害されることを示すグラフである。ベースライン条件下ではMiR−29b模倣による標的抑制に対する効果はない(n=6〜8)、p<0.05 図3A〜Bは、Col1a1およびCol3a1の発現が、リアルタイムPCRによって測定したところ、ブレオマイシンを用いた処置により増加し、miR−29b模倣物の存在によってCol1a1およびCol3a1が阻害されることを示すグラフである。ベースライン条件下ではMiR−29b模倣による標的抑制に対する効果はない(n=6〜8)、p<0.05
図3Cは、BAL液中のIGF1レベルがブレオマイシンを用いた処置後に上昇し、これが、miR−29模倣物の存在下では、生理食塩水を用いて処置したマウスおよび対照模倣物を用いて処置したマウスの両方と比較して有意に鈍化することを示すグラフである(n=4)、p<0.05。
図3Dは、免疫組織化学的検査についての図である。この検査により、ブレオマイシンを用いた処置後にIGF1のロバストな検出が実証され、これは、miR−29b模倣物を用いた処置群では生理食塩水を用いて処置したマウスまたは対照模倣物を用いて処置したマウスと比較して低下した。スケールバーは50μmを示す。
図4Aは、ヒドロキシプロリン評価についてのグラフである。この評価により、生理食塩水を用いた処置群および対照を用いた処置群のどちらにおいてもブレオマイシンを用いた処置後に有意な増加が示されたが、miR−29模倣物を用いた処置群では、生理食塩水を用いて処置したマウスとブレオマイシンを用いて処置したマウスの間で統計学的差異はなかった。P<0.05(n=8)
図4B〜Cは、Col1a1(B)およびCol3a1(C)についてのリアルタイムPCR分析についてのグラフである。この分析により、ブレオマイシンを用いた処置に伴う有意な増加が示された。miR−29b模倣物を用いた処置によりCol1a1およびCol3a1の両方がビヒクルを用いて処置した発現レベルまで正常化された。P<0.05(n=8) 図4B〜Cは、Col1a1(B)およびCol3a1(C)についてのリアルタイムPCR分析についてのグラフである。この分析により、ブレオマイシンを用いた処置に伴う有意な増加が示された。miR−29b模倣物を用いた処置によりCol1a1およびCol3a1の両方がビヒクルを用いて処置した発現レベルまで正常化された。P<0.05(n=8)
図4Dは、三色染色による組織学的検査についての図である。この検査により、ブレオマイシンに応答してロバストな線維症が示され、これは、miR−29b模倣物を用いた処置によって鈍化した。
図4E〜Fは、IPFの患者由来の初代肺線維芽細胞をビヒクルまたはTGF−βを用いて処置し、対照模倣物またはmiR−29b模倣物をトランスフェクトした。Col1a1(E)およびCol3a1(F)についてリアルタイムPCRを実施した。miR−29b模倣物を用いた処置により、どちらのコラーゲンについても用量依存的な減少が示された。 図4E〜Fは、IPFの患者由来の初代肺線維芽細胞をビヒクルまたはTGF−βを用いて処置し、対照模倣物またはmiR−29b模倣物をトランスフェクトした。Col1a1(E)およびCol3a1(F)についてリアルタイムPCRを実施した。miR−29b模倣物を用いた処置により、どちらのコラーゲンについても用量依存的な減少が示された。
図4G〜Hは、A549細胞をビヒクルまたはTGF−βを用いて処置し、対照模倣物またはmiR−29b模倣物をトランスフェクトした。Col1a1(G)およびCol3a1(H)についてリアルタイムPCRを実施した。miR−29b模倣物を用いた処置により、Col1a1およびCol3a1のどちらの発現についても量依存的な減少が示された。
図4G〜Hは、A549細胞をビヒクルまたはTGF−βを用いて処置し、対照模倣物またはmiR−29b模倣物をトランスフェクトした。Col1a1(G)およびCol3a1(H)についてリアルタイムPCRを実施した。miR−29b模倣物を用いた処置により、Col1a1およびCol3a1のどちらの発現についても量依存的な減少が示された。
図5は、miR−29b模倣物により毒性の一般的な徴候は誘導されないことを示すグラフである。アスパラギン酸トランスアミナーゼまたはアラニントランスアミナーゼ(ASTおよびALT)に変化がないことによって示される通り、MiR−29b模倣物を用いた処置によりいかなる肝毒性または腎毒性の顕性徴候も誘導されない。群当たりn=4。
図6は、漸増用量のmiR−29b模倣物によってベースライン条件下で遺伝子発現の顕性変化を誘導することはできないことを示すグラフである。リアルタイムPCR分析により、漸増用量のmiR−29b模倣物を用いて処置した4日後の異なる組織におけるCol1a1およびCol3a1についての発現は生理食塩水を注射したマウスと比較して有意に変化しないことが示される。群当たりn=4、生理食塩水の注射と比較してp<0.05。
図7は、miR−29b模倣物によりmiR−29bが特異的に増加することを示すグラフである。MiR−29b模倣により、生理食塩水を注射したマウスと比較して、miR−29aまたはmiR−29cのレベルには影響を及ぼすことなく、miR−29bのレベルが特異的に上昇する。1日目におけるmiR−29cの増加は、リアルタイムプローブのいくらかの交差反応性に起因する可能性がある。群当たりn=4。
図8は、ベースライン条件下でmiR−29b模倣物によりいかなる標的変化も誘導されないことを示すグラフである。リアルタイムPCR分析により、125mpkのmiR−29b模倣物を注射した後の示されている時点において、生理食塩水を注射したマウスと比較して、Col1a1およびCol3a1について有意な標的変化はないことが示された。群当たりn=4。
図9は、miR−29b模倣物がRAW細胞における遺伝子発現に影響を及ぼすことを示すグラフである。リアルタイムPCR分析により、miR−29b模倣物を用いた処置後に、ビヒクルまたは対照模倣物と比較してCsf3、Igf1、およびKcの発現の有意な増加が示された。ビヒクル注射と比較してp<0.05。
(図10A)図10Aは、miR29b模倣物および抗miRがマウス皮膚における遺伝子発現に影響を及ぼすことを示す図である。マイクロアレイデータのヒートマップが示されており、上方制御された遺伝子が赤色で表され、下方制御された遺伝子が青色で表されており、色の強度によりPBS対照に対する倍数変化が表されている。ヒートマップの上の部分(細かい破線の枠)は、miR−29b模倣物を用いた処置によって抑制され、抗miR−29を用いた処置によって上方制御される遺伝子を含有し、ヒートマップの下の部分(幅が広い破線の枠)は、miR−29b模倣物を用いた処置によって上方制御され、抗miR−29を用いた処置によって抑制される遺伝子を含有する。全ての倍数変化および有意値を表5に示す。(図10B)図10Bは、miR29b模倣物および抗miRがマウス皮膚における遺伝子発現に影響を及ぼすことを示すグラフである。図10Aに示されている2つの群に富化される機能性用語についてのDAVID分析(NCBI)が示されている。細胞外マトリックス、(皮膚)機能、接着/細胞シグナル伝達および細胞分化/アポトーシスの遺伝子オントロジー(GO)用語は、miR−29b模倣物を用いた処置後に負に制御される経路の上位であり、細胞(核)構造およびRNAプロセシングは、miR−29b模倣物を用いた処置後に正に制御される経路の上位である。C57BL/6マウスにおける皮膚および急性皮膚創傷のマイクロアレイ解析により、配列番号2および配列番号1を含むmiR−29b模倣物、ならびに抗miR−29(配列番号36)を用いた皮内処置による228種の遺伝子の相反制御が示される。
図11Aは、皮内miR−29b模倣物(配列番号2/配列番号1)またはPBS対照を用いて処置したマウス切開創傷の定量的リアルタイム(RT)−PCR分析についてのグラフである。データが群分けされた棒グラフとして示されており、例えば各処置群の最初の棒は右の一覧の最初の遺伝子の発現レベルを示す。RT−PCRにより、miR−29b模倣物を用いた処置によって抑制されることが以前示されたコラーゲン、他の細胞外マトリックス遺伝子および他の直接および間接的な標的遺伝子(図10a、ヒートマップの上半分)の発現が、急性皮膚創傷におけるmiR−29b模倣物を用いた処置に伴って用量依存的に減少することが確認された。****処置および遺伝子を2つの評価因子として用いた二元配置ANOVAを使用して、PBSを用いて処置した切開に対してp<0.0001。
図11Bは、定量的RT−PCRによると、miR−29b模倣物を用いた処置で抑制解除されると以前同定された遺伝子(図10A、ヒートマップの下半分)の発現がmiR−29b模倣物を用いた処置に伴って用量依存的に増加したことを示すグラフである。PBSを用いて処置した切開、処置および遺伝子を2つの評価因子として用いた二元配置ANOVAを使用して***p<0.001および****p<0.0001。miR−29b模倣物は、急性皮膚創傷におけるmiR−29標的遺伝子の発現に有意に影響を及ぼす。
図12は、miR−29模倣物の活性およびヌクレオチド修飾の影響を示すグラフである。IMR−90ヒト肺線維芽細胞におけるトランスフェクション実験により、異なるmiR−29模倣物は、コラーゲン遺伝子発現の抑制として測定される活性のレベルが異なることが示される。処置および遺伝子を2つの評価因子として用いた二元配置ANOVAを使用して、偽トランスフェクションに対してp<0.05、***p<0.001および****p<0.0001。
図13は、リンカー修飾を伴うmiR−29b模倣物のin vivo活性を示すグラフである。切開創傷を有するマウスを、コレステロール部分と第2の/センス鎖の間の結合のみが異なる種々のmiR−29b模倣物を20nmolで用いて処置した。miR−29b模倣物の活性を、5種のコラーゲン合成遺伝子の発現を測定することによって決定した。
図14は、miR−29b模倣物の活性に対する5’リン酸化の影響を示すグラフである。RAB−9皮膚線維芽細胞に、アンチセンス鎖に5’リン酸化を伴うmiR−29b模倣物(配列番号2/配列番号1)および伴わないmiR−29b模倣物(配列番号19/配列番号1)を種々の濃度でトランスフェクトした。miR−29b模倣物の活性を、3種のコラーゲン合成遺伝子の発現を測定することによって決定した。
過去10年間で、マイクロRNA(miRNA)治療薬に対する大きな熱意が生じている。この興奮の一部は、miRNAにより多数の関連するmRNAが制御されることも多いという事実に端を発する。そのように、単一のmiRNAを調節することにより、特定の疾患に関与する多数の遺伝子を並行して制御することが可能になる。多くの試験により、miRNA阻害剤を使用した治療有効性が示されているが、miRNAの機能を回復または増大させるための試みは遅れている。
miR−29ファミリーの組織線維症における明白な機能に関して注目が集まっている。この線維芽細胞において富化されるmiRNAファミリーは、線維性疾患において下方制御され、これにより、多くの細胞外マトリックス遺伝子の協調した増加が誘導される。本発明者らは、合成RNA2重鎖の投与により、in vivoにおけるmiR−29レベルを数日にわたって上昇させることができることを見いだした。さらに、これらのmiR−29模倣物をブレオマイシンにより誘導される肺線維症の間に治療的送達することにより、内在性miR−29機能が回復し、それにより、コラーゲン発現が減少し、肺線維症が遮断され、元に戻る。さらに、本発明のmiR−29模倣物を皮膚切開に投与することにより、細胞外マトリックス遺伝子および線維化プロセスに関与する他の遺伝子が下方制御される。これらのデータにより、miRNAを治療的に増加させるために有効なmiRNA模倣物の設計の実現性が支持され、また、miR−29が、コラーゲン産生の増加を伴う種々の線維状態および障害を処置するための強力な治療用miRNAであることが示される。したがって、本発明は、miR−29模倣物、組成物およびその使用を提供する。
本発明によるマイクロRNA模倣化合物は、第1の鎖と第2の鎖とを含み、第1の鎖は成熟miR−29a、miR−29bまたはmiR−29c配列を含み、第2の鎖は第1の鎖と実質的に相補的な配列を含み、また、少なくとも1つの修飾されたヌクレオチドを有する。本開示全体を通して、「microRNA模倣化合物」という用語は、「promiR−29」「miR−29アゴニスト」、「マイクロRNAアゴニスト」、「マイクロRNA模倣物」、「miRNA模倣物」または「miR−29模倣物」という用語と互換的に使用され得、「第1の鎖」という用語は、「アンチセンス鎖」または「ガイド鎖」という用語と互換的に使用され得、「第2の鎖」という用語は、「センス鎖」または「パッセンジャー鎖」という用語と互換的に使用され得、「miR−29アンタゴニスト」という用語は、「オリゴヌクレオチド阻害剤」、「抗miR−29」、「アンチセンスオリゴヌクレオチド」、「miR−29アンタゴミル」または「抗マイクロRNAオリゴヌクレオチド」という用語と互換的に使用され得る。
一実施形態では、マイクロRNA模倣化合物の第1の鎖は、成熟miR−29a、miR−29b、またはmiR−29c配列を含む約23〜約26ヌクレオチドを含み、第2の鎖は、第1の鎖と部分的に、実質的に、または完全に相補的な配列を含む約22〜約23ヌクレオチドを含む。種々の実施形態では、第1の鎖は約23、24、25、または26ヌクレオチドを含み得、第2の鎖は約22または23ヌクレオチドを含み得る。
マイクロRNA模倣化合物の第1の鎖および第2の鎖を形成するヌクレオチドは、リボヌクレオチド、デオキシリボヌクレオチド、修飾されたヌクレオチド、およびこれらの組合せを含み得る。ある特定の実施形態では、マイクロRNA模倣化合物の第1の鎖および第2の鎖は、リボヌクレオチドおよび/または修飾されたリボヌクレオチドを含む。「修飾されたヌクレオチド」という用語は、修飾されていないヌクレオチドと比較して核酸塩基および/または糖部分が修飾されているヌクレオチドを意味する。
ある特定の実施形態では、マイクロRNA模倣化合物は、配列が成熟miR−29a、miR−29b、またはmiR−29c配列の全部または一部と同一である第1の鎖またはアンチセンス鎖と、配列が第1の鎖の配列と約70%〜約100%相補的である第2の鎖またはセンス鎖とを有する。一実施形態では、miRNA模倣化合物の第1の鎖は、成熟した天然に存在するmiR−29a、miR−29b、またはmiR−29c配列の配列全体と、間の全ての整数を含めて少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、または100%同一である。ある特定の実施形態では、第1の鎖は、マウス、ヒト、またはラットmiR−29a、miR−29b、またはmiR−29c配列などの、成熟した天然に存在するmiRNAの配列と約または少なくとも約90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である。あるいは、第1の鎖は、配列アラインメントアルゴリズムおよび当技術分野で周知の方法によって比較して、成熟した天然に存在するmiRNAと共通するヌクレオチド位を20カ所、21カ所、22カ所、または23カ所含み得る。
第1の鎖が、天然に存在するヌクレオチドの代わりに、修飾されたヌクレオチドを含む場合であっても、第1の鎖の配列は成熟miR−29a、miR−29b、またはmiR−29c配列と同一であるとみなされることが理解される。例えば、成熟した天然に存在するmiRNA配列が特定の位置にシチジンヌクレオチドを含む場合、模倣化合物の第1の鎖は、対応する位置に2’−フルオロ−シチジンなどの修飾されたシチジンヌクレオチドを含んでよい、または、成熟した天然に存在するmiRNA配列が特定の位置にウリジンヌクレオチドを含む場合、模倣化合物の第1の鎖のmiRNA領域は、対応する位置に2’−フルオロ−ウリジン、2’−O−メチル−ウリジン、5−フルオロウラシル、または4−チオウラシルなどの修飾されたウリジンヌクレオチドを含んでよい。したがって、修飾されたヌクレオチドが、成熟した天然に存在するmiRNA配列に存在するヌクレオチドと同じ塩基対合能を有する限りは、第1の鎖の配列は、成熟した天然に存在するmiRNA配列と同一であるとみなされる。一部の実施形態では、第1の鎖は、5’末端残基の修飾を含んでよい。例えば、第1の鎖は、5’末端一リン酸を有してよい。一部の他の実施形態では、第1の鎖は、5’末端一リン酸を含有しない。
一部の実施形態では、マイクロRNA模倣物の第2の鎖は、第1の鎖の配列と部分的に相補的である。例えば、第2の鎖の配列は、第1の鎖の配列と、間の全ての値を含めて少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%相補的である。一部の他の実施形態では、第2の鎖は、第1の鎖の配列と実質的に相補的である。例えば、第2の鎖は、第1の鎖の配列と、間の全ての値を含めて少なくとも約85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%相補的である。さらなる一部の他の実施形態では、第2の鎖の配列は、第1の鎖と完全に相補的であってよい。ある特定の実施形態では、第2の鎖の相補的な領域の約19、20、21、22、または23ヌクレオチドが第1の鎖と相補的であってよい。
第2の鎖が、天然に存在するヌクレオチドの代わりに、修飾されたヌクレオチドを含む場合であっても、第2の鎖の配列は第1の鎖と相補的であるとみなされることが理解される。例えば、第1の鎖配列が特定の位置にグアノシンヌクレオチドを含む場合、第2の鎖は、対応する位置に2’−O−メチル−シチジンなどの修飾されたシチジンヌクレオチドを含んでよい。
一部の実施形態では、第2の鎖は、第1の鎖に対してミスマッチを約1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つ含む。すなわち、第1の鎖と第2の鎖の間で最大1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのヌクレオチドが相補的でなくてよい。一実施形態では、ミスマッチは連続しておらず、第2の鎖全体を通して分布している。別の実施形態では、ミスマッチは連続しており、バルジが創出されていてよい。一実施形態では、第2の鎖は、第1の鎖に対してミスマッチを3つ含有する。ある特定の実施形態では、miR−29a模倣物またはmiR−29c模倣物の第2の鎖は、第1の鎖に対して、3’末端(第2の鎖の)から4位、13位、および/または16位におけるミスマッチを含有する。一実施形態では、miR−29b模倣物の第2の鎖は、第1の鎖に対して、3’末端(第2の鎖の)から4位、13位、および/または16位におけるミスマッチを含有する。別の実施形態では、miR−29b模倣物の第2の鎖は、第1の鎖に対して、3’末端(第2の鎖の)から4位、9位、10位、11位、13位および/または16位におけるミスマッチを含有する。
一部の実施形態では、模倣化合物の第1の鎖および/または第2の鎖は、鎖の5’末端または3’末端に突出部を有してよい。ある特定の実施形態では、第1の鎖は、3’突出部、すなわち、第2の鎖に対して2重鎖領域を越えて伸長した一本鎖領域を含む。第1の鎖の3’突出部は、約1ヌクレオチドから約4ヌクレオチドまでにわたってよい。ある特定の実施形態では、第1の鎖の3’突出部は、1つまたは2つのヌクレオチドを含んでよい。一部の実施形態では、第1の鎖における3’突出部を含むヌクレオチドは、ホスホロチオエート結合によって結合している。第1の鎖に3’突出部を含むヌクレオチドは、リボヌクレオチド、デオキシリボヌクレオチド、修飾されたヌクレオチド、またはこれらの組合せを含んでよい。ある特定の実施形態では、第1の鎖内の3’突出部は、2つのリボヌクレオチドを含む。一実施形態では、第1の鎖の3’突出部は、ホスホロチオエート結合によって結合した2つのウリジンヌクレオチドを含む。一部の実施形態では、第1の鎖は突出部を含有しなくてよい。
一実施形態では、本発明のmiR−29模倣物の第2の/センス鎖内のヌクレオチドはホスホジエステル結合によって結合しており、第1の/アンチセンス鎖内のヌクレオチドは、3’末端の最後の3ヌクレオチドがホスホロチオエート結合によって互いと結合している以外はホスホジエステル結合によって結合している。
種々の実施形態では、本発明のmiR−29模倣物は、修飾されたヌクレオチドを含む。例えば、一実施形態では、模倣物の第1の鎖は、1つまたは複数の2’−フルオロヌクレオチドを含む。別の実施形態では、第1の鎖は、いかなる修飾されたヌクレオチドも含まなくてよい。一実施形態では、第2の鎖は、1つまたは複数の2’−O−メチル修飾されたヌクレオチドを含む。
種々の実施形態では、本発明によるmiR−29模倣物は、下の表に列挙されている第1の鎖と第2の鎖とを含む。修飾の定義は表4に示されている。これらのmiR−29模倣化合物は、その全体が参照により本明細書に組み込まれるWO2009/018493に記載されている使用および条件を含め、細胞において細胞外マトリックス遺伝子の発現を制御するため、ならびに関連する状態、例えば、組織線維症、皮膚線維症などを処置するために有用である。
ある特定の実施形態では、miR−29a模倣物は、配列番号27を含む第1の鎖と配列番号5を含む第2の鎖とを含む。他の実施形態では、miR−29a模倣物は、配列番号7を含む第1の鎖と配列番号5を含む第2の鎖とを含む。
一部の実施形態では、miR−29b模倣物は、配列番号19を含む第1の鎖と配列番号1を含む第2の鎖とを含む。一部の他の実施形態では、miR−29b模倣物は、配列番号2を含む第1の鎖と配列番号1を含む第2の鎖とを含む。さらなる一部の他の実施形態では、miR−29b模倣物は、配列番号19を含む第1の鎖と配列番号15を含む第2の鎖とを含む。さらなる一部の他の実施形態では、miR−29b模倣物は、配列番号33を含む第1の鎖と配列番号1を含む第2の鎖とを含む。さらなる一部の他の実施形態では、miR−29b模倣物は、配列番号34を含む第1の鎖と配列番号1を含む第2の鎖とを含む。さらなる一部の他の実施形態では、miR−29b模倣物は、配列番号19を含む第1の鎖と配列番号30を含む第2の鎖とを含む。
ある特定の実施形態では、miR−29c模倣物は、配列番号35を含む第1の鎖と配列番号24を含む第2の鎖とを含む。他の実施形態では、miR−29c模倣物は、配列番号26を含む第1の鎖と配列番号24を含む第2の鎖とを含む。
本発明のマイクロRNA模倣化合物に使用することができる修飾されたヌクレオチドは、塩基修飾または置換を伴うヌクレオチドを含んでよい。RNA内の天然の塩基または修飾されていない塩基は、プリン塩基であるアデニン(A)およびグアニン(G)、ならびにピリミジン塩基であるシトシン(C)およびウラシル(U)である(DNAはチミン(T)を有する)。対照的に、修飾された塩基は、複素環式塩基部分とも称され、それらとして、5−メチルシトシン(5−me−C)、5−ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、2−アミノアデニン、アデニンおよびグアニンの6−メチルおよび他のアルキル誘導体、アデニンおよびグアニンの2−プロピルおよび他のアルキル誘導体、2−チオウラシル、2−チオチミンおよび2−チオシトシン、5−ハロウラシルおよびシトシン、5−プロピニルウラシルおよびシトシンおよびピリミジン塩基の他のアルキニル誘導体、6−アゾウラシル、シトシンおよびチミン、5−ウラシル(シュードウラシル(pseudouracil))、4−チオウラシル、8−ハロ、8−アミノ、8−チオール、8−チオアルキル、8−ヒドロキシルおよび他の8−置換アデニンおよびグアニン、5−ハロ(5−ブロモ、5−トリフルオロメチルおよび他の5−置換ウラシルおよびシトシンを含む)、7−メチルグアニンおよび7−メチルアデニン、2−F−アデニン、2−アミノ−アデニン、8−アザグアニンおよび8−アザアデニン、7−デアザグアニンおよび7−デアザアデニンならびに3−デアザグアニンおよび3−デアザアデニンなどの、他の合成の核酸塩基および天然の核酸塩基が挙げられる。
一部の実施形態では、マイクロRNA模倣化合物は、修飾された糖部分を有するヌクレオチドを有してよい。代表的な修飾された糖としては、炭素環式または非環式糖、2’位、3’位または4’位のうちの1つまたは複数に置換基を有する糖、および糖の1つまたは複数の水素原子の代わりに置換基を有する糖が挙げられる。ある特定の実施形態では、糖は、2’位に置換基を有することにより修飾されたものである。追加的な実施形態では、糖は、3’位に置換基を有することにより修飾されたものである。他の実施形態では、糖は、4’位に置換基を有することにより修飾されたものである。糖は、これらの位置のうちの1つ超に修飾を有してよいこと、または、RNA分子は、1つの位置に糖修飾を伴う1つまたは複数のヌクレオチドを含んでよく、異なる位置に糖修飾を伴う1つまたは複数のヌクレオチドも含んでよいことも意図されている。
miRNA模倣化合物において意図されている糖修飾としては、これだけに限定されないが、OH;F;O−アルキル、S−アルキル、またはN−アルキル;O−アルケニル、S−アルケニル、またはN−アルケニル;O−アルキニル、S−アルキニルまたはN−アルキニル;またはO−アルキル−O−アルキルから選択される置換基が挙げられ、アルキル、アルケニルおよびアルキニルは、置換されていても置換されていなくてもよいC〜C10アルキルまたはC〜C10アルケニルおよびアルキニルであってよい。
一部の実施形態では、miRNA模倣化合物は、以下から選択される糖置換基を有する:C〜C10低級アルキル、置換低級アルキル、アルケニル、アルキニル、アルカリール、アラルキル、O−アルカリールまたはO−アラルキル、SH、SCH、Cl、Br、CN、OCN、CF、OCF、SOCH、SOCH、ONO、NO、N、NH、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルカリール、アミノアルキルアミノ、または同様の置換基。一実施形態では、修飾は、2’−メトキシエトキシ(2’−O−CHCHOCH、これは、2’−O−(2−メトキシエチル)または2’−MOEとしても公知である)、すなわち、アルコキシアルコキシ基を含む。別の修飾は、2’−ジメチルアミノオキシエトキシ、すなわち、2’−DMAOEおよび2’−ジメチルアミノエトキシエトキシとしても公知のO(CHON(CH基(同様に当技術分野において2’−O−ジメチル−アミノ−エトキシ−エチルまたは2’−DMAEOEとしても公知である)、すなわち、2’−O−CH−O−CH−N(CHを含む。
2’位(2’−)の糖置換基は、アラビノ(上)位にあってもリボ(下)位にあってもよい。1つの2’−アラビノ修飾は、2’−Fである。他の同様の修飾が糖部分の他の位置、特に3’末端ヌクレオシドまたは2’−5’結合オリゴヌクレオチド上の糖の3’位および5’末端ヌクレオチドの5’位になされてもよい。
ある特定の実施形態では、糖修飾は、2’−O−アルキル(例えば、2’−O−メチル、2’−O−メトキシエチル)、2’−ハロ(例えば、2’−フルオロ、2’−クロロ、2’−ブロモ)、および4’チオ修飾である。例えば、一部の実施形態では、miR−29a模倣化合物、miR−29b模倣化合物、またはmiR−29c模倣化合物の第1の鎖は、1つまたは複数の2’フルオロヌクレオチドを含む。別の実施形態では、模倣化合物の第1の鎖は、修飾されたヌクレオチドを有さない。さらに別の実施形態では、miR−29a模倣化合物、miR−29b模倣化合物、またはmiR−29c模倣化合物の第2の鎖は、1つまたは複数の2’−O−メチル修飾されたヌクレオチドを含む。
本発明のマイクロRNA模倣化合物の第1の鎖および第2の鎖は、1つまたは複数のホスホロチオエート結合、モルホリノ結合、またはホスホノカルボン酸結合などの骨格修飾も含んでよい(例えば、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第6,693,187号および同第7,067,641号を参照されたい)。例えば、一部の実施形態では、第1の鎖における3’突出部を含むヌクレオチドは、ホスホロチオエート結合によって結合している。
一部の実施形態では、マイクロRNA模倣化合物を、in vivoにおける送達および安定性を容易にするために、ステロイド(コレステロール)、ビタミン、脂肪酸、炭水化物または配糖体、ペプチド、または他の小分子リガンドなどの担体分子とコンジュゲートする。担体分子は、マイクロRNA模倣化合物の第2の鎖の3’末端または5’末端にリンカーまたはスペーサー基を通じて付着していることが好ましい。種々の実施形態では、担体分子は、コレステロール、コレステロール誘導体、コール酸またはコール酸誘導体である。その全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第7,202,227号に開示されている担体分子の使用も構想される。ある特定の実施形態では、担体分子はコレステロールであり、第2の鎖の3’末端または5’末端に少なくとも6炭素リンカーを通じて付着している。一実施形態では、担体分子は、第2の鎖の3’末端に、6炭素リンカーまたは9炭素リンカーを通じて付着している。一部の実施形態では、リンカーは、切断可能なリンカーである。種々の実施形態では、リンカーは、実質的に直鎖状の炭化水素部分を含む。炭化水素部分は、約3〜約15個の炭素原子を有してよく、例えばエーテル結合またはチオエーテル結合など、比較的非極性である基を通じてコレステロールとコンジュゲートすることができる。ある特定の実施形態では、炭化水素リンカー/スペーサーは、任意選択で置換されているC2〜C15飽和または不飽和炭化水素鎖(例えばアルキレンまたはアルケニレン)を含む。その全体が参照により本明細書に組み込まれる米国付与前公開第2012/0128761号に記載されている種々のリンカー/スペーサー基を本発明において使用することができる。
種々の実施形態では、本発明は、線維状態の処置、好転、または予防を必要とする対象において線維状態を処置する、好転させる、または予防する方法であって、対象に、治療有効量の本明細書に記載のmiR−29a模倣物、miR−29b模倣物、および/またはmiR−29c模倣物のうちの少なくとも1つを投与するステップを含む方法を提供する。本発明のmiR−29模倣物を使用して処置することができる線維状態としては、これだけに限定されないが、肺線維症、心臓線維症、肝線維症、腎線維症、糖尿病性線維症、骨格筋線維症、および眼線維症などの組織線維症;ならびにケロイド、皮膚硬化症、全身性硬化症(強皮症)、肥厚性瘢痕(hypertrophic scar)、手/関節/腱線維症、およびペイロニー病などの皮膚(dermal/cutaneous)線維症が挙げられる。一実施形態では、本発明のmiR−29模倣物を使用して処置される線維状態は、特発性肺線維症である。ある特定の線維状態の処置におけるmiR−29アゴニストの使用は、これによって参照により本明細書に組み込まれる米国特許第8,440,636号に記載されている。
一実施形態では、本発明のmiR−29模倣物を投与することにより、対象の細胞における1つまたは複数の細胞外マトリックス遺伝子の発現または活性が低下する。別の実施形態では、本発明のmiR−29模倣物を投与することにより、対象の細胞における1つまたは複数のコラーゲン合成遺伝子の発現または活性が低下する。さらに別の実施形態では、miR−29模倣物を投与することにより、皮膚発生、表皮発生、外胚葉発生および細胞恒常性に関与する1種または複数種の遺伝子の発現または活性が上方制御される。種々の遺伝子の発現または活性が本発明のmiR−29模倣物によって制御される対象の細胞としては、線維芽細胞および表皮細胞が挙げられる。一部の実施形態では、miR−29模倣物を投与することにより、線維症に付随する炎症反応が下方制御される。例えば、miR−29模倣物を投与することにより、線維症患者における、IL−12、IL−4、GCSF、およびTNF−αなどの炎症促進性サイトカインのレベルが低下する。miR−29模倣物を投与することにより、好中球、リンパ球、単球、およびマクロファージなどの免疫エフェクター細胞の線維性組織または臓器への浸潤も減少する。
ある特定の実施形態では、本発明は、細胞において細胞外マトリックス遺伝子を制御する方法であって、細胞を、本発明のmiR−29模倣物と接触させるステップを含む方法を提供する。一部の実施形態では、本発明は、細胞においてコラーゲン合成遺伝子を制御する方法であって、細胞を、本発明のmiR−29模倣物と接触させるステップを含む方法を提供する。処置または接触に際して、miR−29模倣物により、細胞外マトリックス遺伝子またはコラーゲン合成遺伝子の発現または活性が低下する。
本明細書で使用される場合、「対象」または「患者」という用語は、これだけに限定することなく、ヒトおよび他の霊長類(例えば、チンパンジーおよび他の類人猿およびサル種)、農場動物(例えば、ウシ、ヒツジ、ブタ、ヤギおよびウマ)、家畜哺乳動物(例えば、イヌおよびネコ)、実験動物(例えば、ウサギ、齧歯類、例えばマウス、ラット、およびモルモットなど)、ならびに鳥類(例えば、ニワトリ、シチメンチョウおよび他のキジ類の鳥類、アヒル、ガチョウなどの家禽、野鳥および猟鳥)を含めた任意の脊椎動物を指す。一部の実施形態では、対象は哺乳動物である。他の実施形態では、対象は、ヒトである。
本発明は、miR−29アゴニスト(例えば、薬物またはmiR−29模倣物)またはmiR−29アンタゴニスト(例えば、薬物または抗miR−29)を用いた処置の有効性を評価する方法も提供する。例えば、一実施形態では、治療有効性を評価するための方法は、miR−29模倣物またはmiR−29アンタゴニストを用いた処置の前に対象の細胞または線維性組織における1種または複数種の遺伝子の発現のレベルを決定するステップであって、1種または複数種の遺伝子が、miR−29によって調節される遺伝子、例えば表5に列挙されている遺伝子のセットから選択されるステップと、miR−29模倣物またはmiR−29アンタゴニストを用いた処置の後に対象の細胞/線維性組織における同じ1種または複数種の遺伝子の発現レベルを決定するステップと、処置の前後の発現レベルに基づいて、処置に効果があるか、効果が少ないか、または効果がないかを決定するステップとを含む。すなわち、一実施形態では、表5に列挙されている遺伝子は、miR−29模倣物またはmiR−29アンタゴニストによる処置の臨床的有効性についてのバイオマーカーとしての機能を果たす。一実施形態では、処置の前後の遺伝子の発現に統計的有意差があることにより、処置が有効であることが示される。別の実施形態では、処置の前後の遺伝子の発現に少なくとも1倍、1.5倍、2倍、2.5倍、3倍、3.5倍、または4倍の差異があることにより、処置が有効であることが示される。
本発明は、治療有効量の本発明による1つまたは複数のmiR−29a、miR−29b、および/またはmiR−29cのマイクロRNA模倣化合物またはその薬学的に許容される塩と、薬学的に許容される担体または賦形剤とを含む医薬組成物も提供する。
一実施形態では、医薬組成物は、治療有効量のmiR−29a模倣化合物と薬学的に許容される担体または賦形剤とを含み、ここで、模倣化合物の第1の鎖は成熟miR−29a配列を含み、第2の鎖は第1の鎖と実質的に相補的である。別の実施形態では、医薬組成物は、治療有効量のmiR−29b模倣化合物と薬学的に許容される担体または賦形剤とを含み、ここで、模倣化合物の第1の鎖は成熟miR−29b配列を含み、第2の鎖は第1の鎖と実質的に相補的である。さらに別の実施形態では、医薬組成物は、治療有効量のmiR−29c模倣化合物と薬学的に許容される担体または賦形剤とを含み、ここで、模倣化合物の第1の鎖は成熟miR−29c配列を含み、第2の鎖は第1の鎖と実質的に相補的である。
一部の実施形態では、医薬組成物は、治療有効量の本発明のマイクロRNA模倣化合物を少なくとも2つと、薬学的に許容される担体または賦形剤とを含む。例えば、医薬組成物は、miR−29a模倣物とmiR−29b模倣物の組合せ;miR−29a模倣物とmiR−29c模倣物の組合せ;またはmiR−29b模倣物とmiR−29c模倣物の組合せを含んでよい。あるいは、組成物は、同じマイクロRNAの模倣物を2つ含んでよい。さらなる一部の他の実施形態では、本発明は、治療有効量の3つの本発明のマイクロRNA模倣化合物と薬学的に許容される担体または賦形剤とを含む医薬組成物を提供する。例えば、医薬組成物は、miR−29a模倣物、miR−29b模倣物およびmiR−29c模倣物の組合せを含んでよい。
本発明によるマイクロRNA模倣化合物を少なくとも2つ含む医薬組成物では、第1の模倣化合物および第2の模倣化合物または第1の模倣化合物、第2の模倣化合物および第3の模倣化合物は等モル濃度で存在することが好ましい。他の混合比、例えば、約1:2、1:3、1:4、1:5、1:2:1、1:3:1、1:4:1、1:2:3、1:2:4なども、miR−29a模倣化合物、miR−29b模倣化合物、およびmiR−29c模倣化合物のうちの少なくとも2つを含む医薬組成物の調製に関して構想される。
一部の実施形態では、1つまたは複数の本発明のマイクロRNA模倣化合物は、同時であるが別々の組成物として投与することができ、同時にとは、模倣化合物が短い期間内、例えば、互いに約5分以内、10分以内、20分以内、または30分以内にもたらされることを指す。一部の他の実施形態では、miR−29a模倣化合物、miR−29b模倣化合物、および/またはmiR−29c模倣化合物は、別々の組成物として異なる時間に投与することができる。
本発明は、追加的な治療剤をmiR−29a模倣化合物、miR−29b模倣化合物、および/またはmiR−29c模倣化合物と一緒に投与することができる実施形態も包含する。一実施形態では、追加的な治療剤は、第2の抗線維化剤である。追加的な治療剤は、同時であるが別々の製剤として投与することもでき、逐次的に投与することもできる。他の実施形態では、追加的な治療剤は、miR−29a模倣化合物、miR−29b模倣化合物、および/またはmiR−29c模倣化合物の投与の前後の異なる時間に投与することができる。臨床的適用が意図されている場合、医薬組成物を意図された適用に適した形態に調製する。一般に、これには、発熱物質、ならびにヒトまたは動物に有害であり得る他の不純物を本質的に含まない組成物を調製することが伴う。
巨大分子の複合体、ナノカプセル、マイクロスフェア、ビーズなどのコロイド分散系、ならびに水中油エマルション、ミセル、混合ミセル、リポソームおよびエキソソームを含めた脂質に基づく系を、miR−29a模倣化合物、miR−29b模倣化合物、および/またはmiR−29c模倣化合物の送達ビヒクルとして使用することができる。一部の実施形態では、本発明のmiR−29模倣物は、リポソーム粒子に製剤化することができ、これは、次いで吸入による送達のためにエアロゾル化することができる。
本発明の核酸を標的組織に送達するために適した市販の脂肪乳剤としては、Intralipid(登録商標)、Liposyn(登録商標)、Liposyn(登録商標)II、Liposyn(登録商標)III、Nutrilipid、および他の同様の脂質乳剤が挙げられる。in vivoにおける送達ビヒクルとして使用するための好ましいコロイド系は、リポソーム(すなわち、人工膜小胞)である。そのような系の調製および使用は当技術分野において周知である。例示的な製剤は、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる、US5,981,505;US6,217,900;US6,383,512;US5,783,565;US7,202,227;US6,379,965;US6,127,170;US5,837,533;US6,747,014;およびWO03/093449にも開示されている。
ある特定の実施形態では、送達のために使用するリポソームは、米国付与前公開第20110076322号に詳しく記載されているSMARTICLES(登録商標)(Marina Biotech,Inc.)のような両性リポソームである。SMARTICLES(登録商標)の表面電荷は十分に可逆的であり、それにより、SMARTICLES(登録商標)が核酸を送達するために特に適したものになっている。SMARTICLES(登録商標)は、注射によって送達することができ、安定なままであり、また、凝集体を含まず、細胞膜を横断して核酸を送達する。
一般に、送達ビヒクルを安定化し、標的細胞による取り込みを可能とするために適切な塩および緩衝液を使用することが所望される。本発明の水性組成物は、薬学的に許容される担体または水性媒体中に溶解または分散させたmiR−29模倣物(例えば、リポソームまたは他の複合体)を含む有効量の送達ビヒクルを含む。「薬学的に許容される」または「薬理学的に許容される」という句は、動物またはヒトに投与された際に有害反応、アレルギー性反応、または他の不都合な反応を生じさせない分子実体および組成物を指す。本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される担体」は、ヒトに投与するために適した医薬品などの医薬品の製剤化における使用が許容される溶媒、緩衝液、溶液、分散媒、コーティング、抗細菌剤および抗真菌剤、等張化剤および吸収遅延剤などを含む。薬学的に活性な物質に対するそのような媒体および薬剤の使用は当技術分野において周知である。任意の従来の媒体または薬剤は、本発明の活性成分と適合しない場合を除く限りでは、治療用組成物へのその使用が意図されている。補足の活性成分も、組成物のポリヌクレオチドを不活化しないことを条件として、組成物に組み入れることができる。
一実施形態では、本発明の医薬組成物は、肺、経鼻、鼻腔内または眼への送達用に製剤化され、散剤、水溶液、水性エアロゾル、点鼻剤、エアロゾル、および/または点眼剤の形態であってよい。経鼻/鼻腔内投与用の固形製剤は、ラクトースまたはデキストランなどの賦形剤を含有してよい。経鼻/鼻腔内投与用の液体製剤は、エアロゾル、点鼻剤または定量噴霧剤の形態で使用するための水性溶液または油性溶液であってよい。肺/経鼻/鼻腔内投与用の製剤は、例えば、グリココール酸、コール酸、タウロコール酸、エトコール酸、デオキシコール酸、ケノデオキシコール酸、デヒドロコール酸、グリコデオキシコール酸、これらの酸の塩、およびシクロデキストリンなどの界面活性物質も含んでよい。
一部の実施形態では、吸入による肺/経鼻/鼻腔内投与用の製剤としては、これだけに限定されないが、乾燥粉末製剤、リポソーム製剤、ナノ懸濁製剤(nano−suspension formulation)、またはマイクロ懸濁製剤(microsuspension formulation)が挙げられる。
一部の実施形態では、肺/経鼻/鼻腔内送達用の医薬組成物は、吸入デバイスを使用して投与される。「吸入デバイス」という用語は、miR−29模倣物組成物を対象の呼吸気道に投与することができる任意のデバイスを指す。吸入デバイスとしては、定量用量吸入器(MDI)、乾燥粉末吸入器(DPI)、ジェットネブライザー、超音波ネブライザー、加熱式気化器、ソフトミスト吸入器、温熱エアロゾル吸入器、電気流体力学に基づく溶液ミスト化吸入器などのデバイスが挙げられる。吸入デバイスとしては、高効率ネブライザーも挙げられる。一部の実施形態では、ネブライザーは、ジェットネブライザー、超音波ネブライザー、脈動膜ネブライザー(pulsating membrane nebulizer)、振動メッシュまたは多数の開口部を有するプレートを含むネブライザー、振動発生装置および水性チャンバーを含むネブライザー、または、エアロゾル化した水溶液の対象の肺への吸気流を補助することを特徴とする制御デバイスを使用するネブライザーである。ネブライザー、定量用量吸入器、およびソフトミスト吸入器は、容易に吸入することができる液滴サイズを含むエアロゾルを形成することによって医薬品を送達するものである。
一部の実施形態では、高効率ネブライザーを用いて投与される組成物は、1つまたは複数のmiR−29模倣物と、例えば精製水、マンニトール、界面活性物質、ならびに塩化ナトリウムおよびナトリウムEDTAなどの塩など薬学的に許容される賦形剤または担体とを含む。
本発明の活性な組成物は、典型的な医薬調製物を含んでよい。本発明に従ったこれらの組成物の投与は、標的組織に到達可能な限りは、任意の一般的な経路によるものであってよい。この経路としては、経口、経鼻(例えば、吸入によるもの)、眼、または頬側が挙げられる。あるいは、投与は、静脈内、皮内、皮下、眼内または筋肉内注射によるものであってもよく、肺組織または心臓組織への直接注射によるものであってもよい。miRNA模倣物を含む医薬組成物は、治療剤を心臓に送達するためのカテーテル系または冠循環を隔離する系によって投与することもできる。治療剤を心臓および冠状動脈の脈管構造に送達するための種々のカテーテル系が当技術分野で公知である。本発明において使用するために適したカテーテルに基づく送達方法または冠状動脈隔離方法のいくつかの非限定的な例は、全てその全体が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第6,416,510号;米国特許第6,716,196号;米国特許第6,953,466号、WO2005/082440、WO2006/089340、米国特許出願公開第2007/0203445号、米国特許出願公開第2006/0148742号、および米国特許出願公開第2007/0060907号に開示されている。そのような組成物は、通常、本明細書に記載の薬学的に許容される組成物として投与される。
本発明の別の実施形態では、本明細書に記載のmiR−29模倣物を含む組成物は、ステント、バルーン、またはカテーテルなどの医療機器のコーティングとして製剤化することができる。対象における心臓線維症を処置する方法において特に有用であり、miR−29模倣物を使用して、金属ステントをコーティングして薬物溶出ステントを作製することができる。薬物溶出ステントは、細胞増殖および/または炎症を予防するために、狭窄したまたは疾患にかかっている動脈を広げ、化合物を放出する足場である。アゴニストまたは阻害剤を経時的に放出させるために薄いポリマーに包埋された金属ステントに模倣化合物を適用することができる。デバイスに基づく送達の方法およびデバイスをコーティングする方法は、薬物溶出ステントおよび他の埋め込み型デバイスのように、当技術分野で周知である。例えば、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第7,294,329号、同第7,273,493号、同第7,247,313号、同第7,236,821号、同第7,232,573号、同第7,156,869号、同第7,144,422号、同第7,105,018号、同第7,087,263号、同第7,083,642号、同第7,055,237号、同第7,041,127号、同第6,716,242号、および同第6,589,286号、およびWO2004/004602を参照されたい。したがって、本発明は、miR−29模倣物でコーティングしたバルーン、カテーテル、またはステントなどの医療機器を含む。
滅菌された注射用溶液は、適量の活性化合物を所望の任意の他の成分(例えば、上に列挙されている通り)と一緒に溶媒に組み入れ、その後、濾過滅菌することによって調製することができる。一般に、分散液は、種々の滅菌活性成分を、基本的な分散媒および所望の他の成分、例えば上に列挙されているものを含有する滅菌ビヒクルに組み入れることによって調製される。
本発明の組成物は、一般には、中性または塩の形態に製剤化することができる。薬学的に許容される塩としては、例えば、無機酸(例えば、塩酸またはリン酸)、または有機酸(例えば、酢酸、シュウ酸、酒石酸、マンデル酸など)に由来する酸付加塩(タンパク質の遊離のアミノ基と形成される)が挙げられる。タンパク質の遊離のカルボキシル基と形成される塩は、無機塩基(例えば、ナトリウム、カリウム、アンモニウム、カルシウム、または水酸化第二鉄)または有機塩基(例えば、イソプロピルアミン、トリメチルアミン、ヒスチジン、プロカインなど)に由来するものであってもよい。
溶液は、製剤化されたら、投薬形態(dosage formulation)と適合する様式で、かつ治療的に有効な量で投与することが好ましい。製剤は、例えば注射剤、薬物放出カプセル剤、薬物溶出ステントまたは他のコーティングされた血管デバイスなど種々の剤形で容易に投与することができる。水溶液として非経口投与するためには、例えば、一般に、溶液を適切に緩衝させ、液体希釈剤をまず例えば十分な生理食塩水またはグルコースを用いて等張性にする。そのような水溶液は、例えば、静脈内投与、筋肉内投与、皮下投与、皮内投与、眼内投与、および腹腔内投与のために使用することができる。
本発明を以下のさらなる実施例によってさらに例示し、これらの実施例は、限定するものと解釈されるべきではない。当業者は、本開示に照らして、開示されている特定の実施形態に多くの変更を行うことができ、それでもなお、本発明の主旨および範囲から逸脱することなく同様または類似の結果が得られることを理解するべきである。
本開示全体を通して参照される特許および非特許文献は全て、あらゆる目的に関してその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
(実施例1)
miR−29模倣物のin vitro活性
機能的有効性を試験するために、第1の鎖として配列番号2を含有し、第2の鎖として配列番号1を含有するmiR−29b模倣物をマウス線維芽細胞株(NIH 3T3)にトランスフェクトし、miR−29の公知の直接標的遺伝子(van Rooijら、2008年)であるコラーゲン1a1(Col1a1)発現に対する効果を、qPCRを使用して測定した。miR−29b模倣物の量を増加させることにより、無処理の細胞、偽トランスフェクト(いかなるオリゴも用いない)細胞または非標的対照(NTC)オリゴを用いて処理した細胞と比較してCol1a1の用量依存的な減少が示された。これにより、miR−29b模倣物が機能的であることが示される。Col1a1を直接標的とするsiRNAを陽性対照として使用した(図1B)。
(実施例2)
miR−29模倣物のin vivo分布、安定性およびクリアランス
miR−29模倣物のin vivoにおける適用性および分布を探究するために、マウスに、第1の鎖として配列番号2を含有し、第2の鎖として配列番号1を含有するmiR−29b模倣物を10mg/kg、50mg/kg、100mg/kg、または125mg/kgで静脈内注射し、4日後に屠殺した。
全RNAを心臓組織試料から、TRIzol(登録商標)試薬(フェノールおよびグアニジンイソチオシアネートの溶液)(Gibco/BRL)を使用することによって単離した。マイクロRNAを検出するためのノーザンブロットを以前に記載されている通り実施した(van Rooijら、2008年)。U6プローブがローディング対照としての機能を果たした(IDT)。示されている組織由来の全RNA10μgを20%アクリルアミド変性ゲルにローディングし、電気泳動により、Zeta−probe GTゲノムブロッティングメンブレン(Bio−Rad)に転写した。転写後、ブロットを架橋し、80℃で1時間加熱乾燥した。miRNA検出の感度を最大にするために、オリゴヌクレオチドプローブをStarfire Oligos Kit(IDT、Coralville、IA)およびα−32P dATP(AmershamまたはPerkin Elmer)を用いて標識した。Rapid−hyb緩衝液(Amersham)中、39℃で終夜プローブをメンブレンにハイブリダイズさせ、その後、0.1%SDSを含有する0.5×SSCを用いて39℃で10分にわたって2回洗浄した。ブロットについて感光を行い、PhosphorImager分析(GE Healthcare Life Sciences)によって数量化した。U6プローブがローディング対照としての機能を果たした(ABI)。phosphorimagerおよびImageQuant(Bio−Rad)を使用し、放射性シグナルの強度を使用して発現の倍数変化を数量化した。
リアルタイムPCR分析のために、RNAを心臓組織から、Trizol(Invitrogen)を使用して抽出し、その後、各組織試料由来のRNA1〜2μgを使用し、Super Script II逆転写酵素を製造者の仕様書(Invitrogen)に従って使用してcDNAを生成した。Taqman MicroRNAアッセイ(Applied Biosystems、ABI)を製造者の推奨に従って使用し、全RNA10〜100ngを用いてmiRNAまたは遺伝子の変化を検出した。U6をmiRNA解析についての対照として使用し、GAPDHを遺伝子分析についての対照として使用した。
多数の組織に対するノーザンブロット分析により、腎臓または肝臓試料中のmiR−29bは生理食塩水対照と比較してわずかに増加するか全く増加しないことが示された。心臓への分布は検出されたが、これはかなり変動するものと思われ、脾臓への送達は最高用量でのみ観察することができた。しかし、肺への送達は、注射の4日後に最高用量の3つ全てで観察することができた(図1C)。血漿において肝機能(トランスアミナーゼ、ALT)への影響は観察されなかった。これにより、これらのmiRNA模倣物がこれらの用量で耐容性がよいことが示される(図5)。リアルタイムPCRにより、同様の結果が実証され、生理食塩水を注射した動物と比較してmiR−29b模倣物が肺にロバストに用量依存的に分布した(図1D)。さらに、miR−29標的のリアルタイムPCR分析では、最高用量での脾臓におけるCol3a1について以外は、処置した動物におけるmRNAレベルでの制御は示されなかった(図6)。これにより、標的遺伝子が無ストレス動物では定常状態であり、模倣物は標的遺伝子が上昇した場合にそれらを低下させることか、または、機能的送達が不適切であったか不十分であったことが示唆される。
miRNA模倣物のin vivoにおける安定性に関してより多くの洞察を得るために、マウスに125mpkのmiR−29b模倣物を注射し、1日後、2日後、4日後、または7日後に屠殺した。注射の1日後に、検査した全ての組織においてノーザンブロットおよびリアルタイムPCR分析のどちらによってもロバストなmiR−29b模倣物の存在を検出することができたが、その後の組織クリアランスは著しく異なった(図1Eおよび1F)。肝臓および腎臓では、miR−29b模倣物が急速に消え、1日目の後の検出は最小であった。肺および脾臓では、miR−29b模倣物の最も著しい検出が経時的に実証され、これは少なくとも処置後4日間持続した(図1Eおよび1F)。増加は、リアルタイムPCRによって測定したところmiR−29bに特異的であり、miR−29aおよびmiR−29cレベルに対してはいかなる影響もなかった(図7)。同様に、miR−29標的のリアルタイムPCR分析では、無ストレス動物におけるmRNAレベルでの下方制御は示されなかった(図8)。
これらのデータをまとめると、定式化されていないmiR−29b模倣物により、miRNAレベルを上昇させることができ、クリアランスおよび送達効率は組織依存性であり、ベースライン条件下で遺伝子発現に対してはいかなる明白な影響もないことが示される。
(実施例3)
miR−29b模倣物によりブレオマイシンにより誘導される肺線維症が鈍化する
組織線維症の現行の処置は、大部分が炎症反応を標的とすることに依拠するものであるが、これらの処置は、疾患の進行の予防において最終的には効力がなく、これにより、新しい機構的な洞察および治療的手法の必要性が強調される(Friedmanら、2013年)。最近の試験により、肺線維症におけるmiRNAの関与が示されている(Panditら、2011年)。
miR−29b模倣物は肺に優先的に分布するので、ストレスおよびその後の標的遺伝子発現の誘導により、miR−29b模倣物を用いた処置に応答した、mRNA標的遺伝子および下流の治療効果の検出可能な変化が可能になるかどうかという問いを探究した。これを試験するために、肺線維症のブレオマイシンにより誘導されるモデルを以前に記載されている通り使用した(Panditら、2010年)。詳細には、マウスを、40%イソフルラン溶液に浸漬したペーパータオルを有するチャンバー内に入れることによって麻酔した。0.0375Uのブレオマイシン(Hospira、IL)を0.9%生理食塩水50μl中に入れて気管内に投与した。初期線維症に対するmiR−29b模倣の効果を決定するために、対照(生理食塩水を用いて処置した)およびブレオマイシンを用いて処置したマウスに、100mg/kgの、第1の鎖として配列番号2を含有し、第2の鎖として配列番号1を含有するmiR−29b模倣物、対照模倣物または同等の体積の生理食塩水を2つの時点:ブレオマイシンを用いた処置の3日後および10日後に注射し、14日目に動物を屠殺し、肺を採取した。確立された線維症に対するmiR−29b模倣の効果を決定するために、ブレオマイシンまたは生理食塩水による処置後10日目、14日目および17日目にmiR−29b模倣物を投与し、21日目にマウスを屠殺した。どちらのプロトコールにおいても、組織学的分析、ヒドロキシプロリンアッセイおよびRNA抽出のために肺を採取した。
予測通り、ブレオマイシンを用いた処置の14日後にmiR−29レベルが低下したが、miR−29b模倣物を用いた処置の結果、miR−29bの検出レベルは、リアルタイムPCRによって測定したところ、高レベルの変動を伴うが対照または生理食塩水を注射した動物のいずれかと比較して上昇した(図2A)。同様のmiR−29レベルの低下がヒトにおいて観察されるかどうかを決定するために、肺移植を受けた特発性肺線維症(IPF)の患者由来の生検材料または肺外植片の外科的残遺物から16の肺組織試料を得た。試料は、University of Pittsburgh Health Sciences Tissue Bankから入手した。特発性肺線維症(IPF)の患者の肺生検材料において、正常対照と比較したmiR−29レベルの同等の低下が観察された(図2B)。
組織学的検査に関しては、群当たり動物2匹、動物当たり2つのスライスで、肺組織切片(4μm)をMasson Trichrome(コラーゲン/結合組織)で染色した。パラフィン除去、水和、およびブロッキングの後、製造者(ABC detection system form Vector’s lab、USA)の推奨に従って免疫染色を実施した。切片を一次抗体(Igf1、PBS中1:100に希釈)と一緒に4℃で終夜インキュベートし、二次抗体(Invitrogen、USA)と一緒に室温で1時間インキュベートした。切片をヘマトキシリンで対比染色した。陰性対照として、一次抗体を非免疫血清で置き換えた。最後に、封入剤(DAKO、USA)を用いて切片を封入し、Nikon顕微鏡を使用して分析した。組織学的分析により、ブレオマイシンを用いた処置に対して明白かつロバストな線維化反応および炎症反応が示され、これは、miR−29b模倣物を用いた処置によって鈍化した(図2C)。
さらに、総コラーゲン含有量に関して、Biovision(Milpitas、CA)からのヒドロキシプロリン比色定量アッセイキットを製造者の説明書に従って用いて肺ヒドロキシプロリンを分析した。簡単に述べると、対照マウスおよび実験マウス由来の肺を一定の重量まで乾燥させ、12NのHCl中、120℃で3時間にわたって加水分解した。消化物をChloramine T試薬と反応させ、DMAB試薬で可視化した。マイクロプレートリーダーで560nmにおける吸光度を測定した。データはヒドロキシプロリンのμg数/右肺として表されている。
ヒドロキシプロリン分析により、生理食塩水を用いた処置群および対照を用いた処置群のどちらにおいてもブレオマイシンを用いた処置後に有意な増加が示されたが、miR−29模倣物を用いた処置群では生理食塩水を用いて処置したマウスとブレオマイシンを用いて処置したマウスの間に統計学的差異はなかった。これにより、miR−29b模倣物を用いた処置により、ブレオマイシンにより誘導される肺線維症が鈍化することが示される(図2D)。
自然免疫エフェクターシグナル伝達経路は、線維症を惹起することによって筋線維芽細胞分化転換の重要な駆動因子としての機能を果たす。ブレオマイシンにより誘導される肺線維症の状況におけるmiR−29b模倣物の治療効果をさらに特徴付けるために、これらのマウスに対して気管支肺胞洗浄(BAL)を実施し、Bio−Radからのヒトサイトカイン/ケモカインパネルを使用してサイトカインレベルを評価した。全手順を製造者の説明書に従って実施した。簡単に述べると、BALを5倍希釈し、96ウェルフィルタープレートでアッセイを実施した。検出ステップに関しては、試料をR−フィコエリトリンとコンジュゲートしたストレプトアビジンと一緒に30分インキュベートし、Bio−Plex懸濁液アレイシステム(Bio−Rad)で分析した。Bioplex Manager software 6.0(Bio−Rad)を使用して生データを解析した。製造者から供給されるサイトカイン標準物質を使用して試料の濃度を算出した。検出範囲を下回った分析物はデータ解釈には含めなかった。また、検出範囲を下回る特定の分析物を有する試料は中央値の算出の間排除した。
ブレオマイシンを用いて処置したマウス由来の肺からのBAL液では有意に高い濃度のIL−12、IL−4およびG−CSFが検出可能であり、これは、miR−29b模倣物を用いると低下した(図2E〜2G)。さらに、BAL液中の検出可能な免疫細胞のブレオマイシンにより誘導される増加がmiR−29b模倣物の存在下では有意に低下した(図2H)。これにより、miR−29bによる免疫応答に対する阻害効果が示され、これは、抗線維化効果の二次的なものである可能性がある。miR−29模倣にマクロファージに対する直接効果があるかどうかを決定するために、miR−29b模倣物または対照をマクロファージ細胞であるRAW264.7にトランスフェクトし、トランスフェクトの24時間後および48時間後に細胞の上清を採取した。IFN−r、IL−1B、IL−2、IL−4、IL−5、IL−6、KC、IL−10、IL−12P70、およびTNF−αを評価し、miR−29b模倣物と対照の間に有意差は観察されなかった(データは示していない)。リアルタイムPCR分析では、Tgfb1、Ctgf、FGF1、またはPDGFの発現に有意差はなかったが、Csf3、Igf1、およびKcの発現には有意差が観察された(図9およびデータは示していない)。
miR−29が多くの異なる細胞外マトリックス関連遺伝子の制御を通じて機能することは十分に検証されているので(van RooijおよびOlson、2012年)、これらの標的遺伝子のサブセットの制御を確認した。ブレオマイシンを用いた処置に伴って、生理食塩水を用いた処置群および対照を用いた処置群のどちらにおいてもCol1a1の有意な増加およびCol3a1発現の上昇の傾向が観察されたが、miR−29b模倣物の存在下では、ブレオマイシンを用いて処置したマウスにおけるCol1a1およびCol3a1の検出は有意に鈍化した(図3Aおよび3B)。興味深いことに、ブレオマイシンを用いた処置後のBAL液中のIgf1レベルの上昇は、miR−29模倣物の存在下では、生理食塩水を用いて処置したマウスおよび対照を用いて処置したマウスのどちらと比較しても有意に鈍化した(図3C)。さらに、Igf1についての免疫組織化学的検査により、miR−29b模倣物を用いて処置した群では生理食塩水または対照と比較して、ブレオマイシン後にIgf1がロバストに減少することが実証された(図3D)。
初期(3日目および10日目)miR−29模倣がブレオマイシンにより誘導される線維症を予防するために十分であることが確立された後、確立された線維症に影響を及ぼすmiR−29模倣の能力を調査した。この目的のために、miR−29b模倣物の投与をブレオマイシン後10日目に開始し、14日目および17日目に投薬を繰り返し、その後、21日目に肺を採取した。右肺のヒドロキシプロリン評価により、生理食塩水を用いて処置した肺および対照を用いて処置した肺のどちらにおいてもブレオマイシンに伴う有意な増加が示されたが、この影響はmiR−29b模倣物を用いた処置により鈍化した(図4A)。さらに、ブレオマイシンを用いた処置により、Col1a1発現およびCol3a1発現が有意に増加し、これも、miR−29b模倣物を用いた処置に伴って正常化した(図4Bおよび4C)。三色染色による組織学的評価から、この効果、および、それにより、生理食塩水を用いた処置または対照を用いた処置ではブレオマイシンにより有意な線維症が誘導され、それはmiR−29b模倣を用いると鈍化することが確証された(図4D)。
これらの観察された効果は肺線維芽細胞からのコラーゲン産生の制御により媒介されたものと考えられたが、他のコラーゲン産生細胞による効果を除外することはできなかった。この問題に取り組むために、IPF患者由来の初代線維芽細胞および肺上皮の細胞株であるA549細胞を含めた異なる肺細胞から、miR−29b模倣物の効果をin vitroにおいて評価した。予測通り、IPF患者由来の初代肺線維芽細胞ではTGF−αに応答してCol1a1およびCol3a1の増加が示された(図4Eおよび4F)。この効果は、24時間および48時間のどちらの時点でもmiR−29b模倣物を用いた処置に伴って用量依存的に鈍化した(図4E、4Fおよびデータは示していない)。同様に、A549細胞は、TGF−αに応答し、Col1a1発現およびCol3a1発現がロバストに増加する(図4Gおよび4H)。やはり、miR−29b模倣物を用いた処置により、TGF−αを用いた処置条件ならびにベースライン条件の両方においてコラーゲン誘導を遮断することができる(図4Gおよび4H)。コラーゲン誘導に対する効果は、A549細胞では、初代IPF細胞と比較してはるかにロバストである。しかし、これは、おそらくIPF患者由来の初代線維芽細胞では発現がすでに高いことに起因する。さらに、マクロファージ株であるThp−1におけるmiR−29の効果も調査したが、刺激に関係なく細胞においてコラーゲン発現を観察することはできなかった(データは示していない)。これらのデータから、miR−29b模倣により、線維芽細胞および上皮細胞におけるコラーゲンにより誘導される発現を鈍化させることが示唆される。これらのデータは、Sleeping Beauty−トランスポゾンシステムを使用したmiR−29の遺伝子移入により、ブレオマイシンにより誘導される肺線維症を予防および処置することができたことが示されたXiaoらによる論文と一致し(Xiaoら、2012年)、これにより、miR−29を増加させることの治療的潜在性がさらに強調される。
本明細書に記載のデータから、喪失したまたは下方制御されたmiRNAの機能を回復させるためにマイクロRNA模倣物を使用することの実現性が示される。しかし、適切なmiRNA機能にはRISCへの組み入れが必要であるので、合成オリゴヌクレオチド模倣物の構造的特徴の慎重な設計が必要であることに留意することが重要である。さらに、本出願におけるデータから、適切な細胞型または組織への送達により、有効なmiRNA模倣がもたらされることが示される。例えば、肺線維症の場合では、吸入経路によって直接送達することにより、従来の投与経路と比較してより良好な処置有効性がもたらされる。
(実施例4)
miR−29b模倣物により、皮膚における細胞外マトリックス産生が鈍化する
臓器線維症に加えて、いくつかの試験により、肥厚性瘢痕(hypertrophic scar)およびケロイドなどの皮膚線維症、ならびに全身性硬化症(強皮症)の皮膚および他の形態におけるmiR−29の役割が示されている。例えば、全身性硬化症の患者から得た線維芽細胞および皮膚切片では、健康な対照と比較してmiR−29aレベルの劇的な低下が示された(Maurerら、2010年)。全身性硬化症の線維芽細胞において過剰発現させると、miR−29aは、RNAレベルとタンパク質レベルの両方でI型コラーゲンおよびIII型コラーゲンの発現をロバストに低下させることができた。逆に、正常な線維芽細胞においてmiR−29を阻害した結果、これらのコラーゲンが増加した。さらに、ブレオマイシンを用いて処置した皮膚でも同様にmiR−29の有意な減少が示された。これにより、miR−29の下方制御が線維症の兆候に多数に広範に適用可能であることが示唆される(Maurerら、2010年)。これらの結果は、別の試験においてさらに検証され、健康な対照皮膚線維芽細胞にmiR−29aをトランスフェクションすることにより、コラーゲン発現が有意に下方制御された。さらに、皮膚線維芽細胞においてmiR−29aを過剰発現させることにより、分泌されるTIMP−1が減少し、コラーゲンゲル分解が増加した。これらの結果は、全身性硬化症の患者由来の線維芽細胞においても同様に検証された(Ciechomskaら、2014年)。これらの試験を合わせると、miR−29模倣には、皮膚線維症を含めた線維症の局所形態および全身性硬化症における治療的潜在性があることが示される。
皮膚におけるmiR−29アゴニズムまたはアンタゴニズムの効果を決定するために、マウス切開創傷モデルを使用した。詳細には、雄C57BL/6マウスを、吸入チャンバーを使用して2〜5%吸入イソフルランで麻酔し、全ての手順にわたってノーズコーンで1%イソフルラン下に維持した。全ての外科手技に関してブプレノルフィン(0.1mg/kg)を鎮痛薬として使用した。動物を麻酔し、シェービングおよびNair脱毛クリームの投与によって脱毛し、皮膚部位をベタジンおよびアルコールによる外科的洗浄によって切開のために調製した。マウスの背中に1〜2つの1cmの長さの皮膚切開を作出した。切開を2〜5の結節縫合で閉じ、Tegaderm transparent半密封包帯(3M)で覆った。切開創傷創出の3日後に、切開皮膚創傷を有するマウスまたは有さないマウスを、ビヒクル(PBS)、100nmolのmiR−29b模倣物(第1の鎖として配列番号2を含み、第2の鎖として配列番号1を含む)または100nmolの抗miR−29の皮内注射を用いて、オリゴヌクレオチド化合物またはビヒクル(PBS)を、切開正中線の側面のいずれかへの50μL体積での皮内注射を2回行うか、無傷の皮膚に近接して100μL体積での皮内注射を単回行うかより処置した。抗miR−29は、5’−lGs.dAs.dTs.dTs.lTs.lCs.dAs.lAs.dAs.lTs.lGs.dGs.lTs.dGs.lCs.lTs−3’(配列番号36)の配列を有し、ここで、「l」はロックドヌクレオチドを表し、「d」はデオキシリボヌクレオチドを表し、「s」はホスホロチオエート結合を表す。mRNA発現を分析するために、オリゴヌクレオチド化合物の投与の24時間後にマウスを屠殺し、処置部位(複数可)の皮膚を採取し、液体窒素でスナップ凍結した。
全RNAを皮膚から、Trizol(Invitrogen)を使用して抽出し、GAPDH、B2M、HPRT1およびPPIBを皮膚試料の遺伝子分析の対照として使用した以外は上記の通り、リアルタイムPCR分析を実施した。
マイクロアレイ解析に関しては、試料当たり1μgの全RNAを、Agilentアレイ(Mouse GE(V2)、4×44k−026655)でのマウス普遍的参照RNA(Agilent)と比較したマイクロアレイ解析のためにMOgeneに送付した。解析はArrayStudioを使用して行われ、Rソフトウェアプログラムを使用してヒートマップが作成された。
マイクロアレイ解析を使用して、PBS対照に対して正に制御される遺伝子および負に制御される遺伝子を同定した。228種の遺伝子が相反的に制御された(miR−29b模倣物と抗miR−29の間でp<0.05または倍数変化>1.5)(図10および表5)。これらのmiR−29により制御される遺伝子および他の種におけるそれらのオルソログは、miR−29アゴニストまたはmiR−29アンタゴニストを用いた処置への応答を示す翻訳バイオマーカーとして利用することができる。
2つの群に富化される機能性用語のDAVID分析(NCBI)を図10Bに示す。驚くことではないが、細胞外マトリックス、(皮膚)機能、接着/細胞シグナル伝達および細胞分化/アポトーシスの遺伝子オントロジー(GO)用語は、miR−29b模倣物を用いた処置後に負に制御される経路の上位である。細胞(核)構造およびRNAプロセシングは、miR−29b模倣物を用いた処置後に正に制御される経路の上位である。
miR−29b模倣物を用いた処置の皮膚における効果をさらに確認するために、急性切開創傷を有するマウスを、PBS、20nmol、50nmol、または100nmolのmiR−29b模倣物(第1の鎖として配列番号2を含み、第2の鎖として配列番号1を含む)の皮内注射を用いて処置した。皮膚におけるmiR−29調節の直接または間接的な標的であると同定された24種の遺伝子(19種はmiR−29b模倣物によって抑制され、抗miR−29によって上方制御されるものであり、5種はmiR−29b模倣物によって上方制御され、抗miR−29によって抑制されるものである)に対して定量的逆転写酵素PCR分析を実施した。細胞外マトリックス遺伝子(コラーゲン、ELNなど)および線維化プロセスに関与する他の遺伝子(例えば、MMP2、TGFB2)は、皮膚において、miR−29b模倣物を用いた処置によって抑制されることが示されたが(図11A)、選択された細胞表面受容体(ITGA3、LBR、NUMB、SDC4)および受容体エンドサイトーシスに関連する因子(SNX27)は、皮膚において、miR−29b模倣物を用いた処置に伴って増加することが示された(図11B)。これらの試験により、miR−29b模倣物が皮膚において局所的に処置された場合に活性であることが示され、また、臓器線維症に対する効果に加えて、miR−29模倣が種々の病因の皮膚線維症に対する有効な療法であり得ることが示唆される。これらの試験により、上記の遺伝子が、皮膚においてその発現がmiR−29b模倣物の活性と相関する翻訳バイオマーカーであることも同定された。これらの翻訳バイオマーカーは、正常な健康な志願者および皮膚強皮症の患者におけるmiR−29b模倣物の安全性および有効性を試験する臨床試験において利用することができる。
(実施例5)
miR−29模倣物の活性およびヌクレオチド修飾の影響
標的遺伝子の発現の制御におけるmiR−29a模倣物、miR−29b模倣物、およびmiR−29c模倣物の有効性を決定するために、異なるmiR−29a模倣物、miR−29b模倣物、およびmiR−29c模倣物を10nMの濃度でIMR−90ヒト肺線維芽細胞にトランスフェクトし、コラーゲン発現を定量的RT−PCRによって測定した。これらの試験により、多数のコラーゲン遺伝子の発現の抑制において、第1の鎖として配列番号27を含み、第2の鎖として配列番号5を含むmiR−29a模倣物および第1の鎖として配列番号19を含み、第2の鎖として配列番号1を含むmiR−29b模倣物が最も有効であり、第1の鎖として配列番号35を含み、第2の鎖として配列番号24を含むmiR−29c模倣物の有効性はより低いことが実証される(図12)。これらの効果は、細胞型または標的遺伝子に特異的なものである可能性があるが、3種の模倣物の細胞外マトリックス遺伝子発現を抑制する能力に実際に差異があることが示される。
同じ実験において、miR−29b模倣物の有効性に対するヌクレオチド修飾の影響も試験した。これらの試験により、第1の鎖として配列番号19を含有し、第2の鎖として配列番号1を含有するmiR−29b模倣物が、第1の鎖として配列番号19を含み、第2の鎖として配列番号30を含む、第1および第2の配列およびパターンが同じであるがセンス(パッセンジャー)鎖とコレステロールの間の化学的リンカーが異なるmiR−29b模倣物と同様に機能することが示される。2’O−メチル修飾のチェッカーボードパターンにより、miR−29模倣物(第1の鎖として配列番号31を含み、第2の鎖として配列番号28を含む模倣物および第1の鎖として配列番号32を含み、第2の鎖として配列番号29を含む模倣物)が完全に効力のないものになる。アンチセンス(第1の/ガイド)鎖の全てのC残基およびU残基の修飾(第1の鎖として配列番号33を含み、第2の鎖として配列番号1を含む模倣物)では、模倣活性が部分的に低下する。同様に、アンチセンス鎖の3’突出部の除去(第1の鎖として配列番号24を含み、第2の鎖として配列番号1を含む模倣物)では模倣活性が部分的に低下する。図12を参照されたい。
これらの試験により、特定の細胞株(IMR−90)におけるin vitro活性に基づいて、および、特定の標的遺伝子(COL1A1、COL3A1、COL4A5)を有効性の読み取りとして使用して、化合物の取り込みとは独立して、miR−29模倣化合物を層別化することが可能になり、また、これらの試験は、in vitroにおいて受動的な送達によって試験するかまたはin vivoにおいて試験する化合物を選択するための基礎として使用することができる。
(実施例6)
リンカー修飾を伴うmiR−29b模倣物のin vivo活性
切開創傷を有するマウスを、コレステロール部分と第2の/センス鎖の間の結合のみが異なる種々のmiR−29b模倣物を20nmolで用いて処置した。コレステロールとセンス鎖の間に6炭素リンカーを含有する模倣化合物(第1の鎖として配列番号19を含み、第2の鎖として配列番号1を含む模倣物)およびコレステロールとセンス鎖の間に同じ6炭素リンカーを含有するが切断可能な部分(dT.dT)によって接続された化合物(配列番号19/配列番号15)では、標的遺伝子の抑制において同様の活性が示された(図13)。図13のN/Sは、第1の鎖として配列番号19を含み、第2の鎖として配列番号1を含むmiR−29b模倣物の活性と、第1の鎖として配列番号19を含み、第2の鎖として配列番号15を含む模倣物の活性に有意差が観察されなかったことを表す。9炭素リンカーを含有するmiR−29b模倣物(配列番号19/配列番号17)および5’末端にリンカーを含有するmiR−29b模倣物(配列番号19/配列番号16)は、標的遺伝子の抑制において有効ではなかった(図13)。
(実施例7)
miR−29b模倣物の活性に対する5’リン酸化の影響
RAB−9皮膚線維芽細胞細胞(ATCC CRL−1414)に、アンチセンス鎖上の5’リン酸化を伴うmiR−29b模倣物(第1の鎖として配列番号2を含有し、第2の鎖として配列番号1を含有する模倣物)およびアンチセンス鎖上の5’リン酸化を伴わないmiR−29b模倣物(第1の鎖として配列番号19を含有し、第2の鎖として配列番号1を含有する模倣物)を種々の濃度でトランスフェクトした。2種の模倣物の活性に関して、Col1a1、Col1a2またはCol3a1の発現によって測定される標的遺伝子の抑制に有意差は観察されなかった(図14においてN/Sとして表される)。どちらのmiR−29b模倣物によっても標的遺伝子の発現がビヒクル、偽トランスフェクションまたは対照模倣物を用いた処置と比較して有意に(p<0.0001)抑制された。図14を参照されたい。
参考文献

Claims (18)

  1. 第1の鎖と、
    第2の鎖と
    を含むmiR−29模倣化合物であって、
    (a)前記第1の鎖が配列番号19の配列を含み、前記第2の鎖が配列番号1の配列を含む;
    (b)前記第1の鎖が配列番号2の配列を含み、前記第2の鎖が配列番号1の配列を含む;
    (c)前記第1の鎖が配列番号19の配列を含み、前記第2の鎖が配列番号15の配列を含む;
    (d)前記第1の鎖が配列番号33の配列を含み、前記第2の鎖が配列番号1の配列を含む;
    (e)前記第1の鎖が配列番号19の配列を含み、前記第2の鎖が配列番号30の配列を含む;
    (f)前記第1の鎖が配列番号34の配列を含み、前記第2の鎖が配列番号1の配列を含む;
    (g)前記第1の鎖が配列番号27の配列を含み、前記第2の鎖が配列番号5の配列を含む;または
    (h)前記第1の鎖が配列番号35の配列を含み、前記第2の鎖が配列番号24の配列を含む、miR−29模倣化合物。
  2. 前記第1の鎖が配列番号19の配列を含み、前記第2の鎖が配列番号1の配列を含む、請求項1に記載のmiR−29模倣化合物。
  3. 前記第1の鎖が配列番号19の配列を含み、前記第2の鎖が配列番号15の配列を含む、請求項1に記載のmiR−29模倣化合物。
  4. 前記第1の鎖が配列番号33の配列を含み、前記第2の鎖が配列番号1の配列を含む、請求項1に記載のmiR−29模倣化合物。
  5. 前記第1の鎖が配列番号34の配列を含み、前記第2の鎖が配列番号1の配列を含む、請求項1に記載のmiR−29模倣化合物。
  6. 前記第1の鎖が配列番号27の配列を含み、前記第2の鎖が配列番号5の配列を含む、請求項1に記載のmiR−29模倣化合物。
  7. 前記第1の鎖が配列番号35の配列を含み、前記第2の鎖が、配列番号24の配列を含む、請求項1に記載のmiR−29模倣化合物。
  8. 有効量の請求項1から7のいずれか一項に記載のmiR−29模倣化合物または薬学的に許容されるその塩と、薬学的に許容される担体または希釈剤とを含む医薬組成物。
  9. 吸入用組成物である、請求項8に記載の医薬組成物。
  10. 細胞において細胞外マトリックス遺伝子を制御するための、請求項1から7のいずれか一項に記載のmiR−29模倣化合物を含む組成物もしくは医薬組成物、または請求項8もしくは9に記載の医薬組成物であって、前記組成物もしくは医薬組成物は、前記細胞と接触されることを特徴とする、組成物もしくは医薬組成物
  11. 前記細胞が哺乳動物細胞である、請求項10に記載の組成物もしくは医薬組成物
  12. 前記細胞が線維芽細胞または上皮細胞である、請求項10または11に記載の組成物もしくは医薬組成物
  13. 前記細胞がin vivoまたはex vivoにおけるものである、請求項10から12のいずれか一項に記載の組成物もしくは医薬組成物
  14. 組織線維症の処置または予防を必要とする対象において組織線維症を処置または予防するための、請求項1から7のいずれか一項に記載のmiR−29模倣化合物を含む組成物もしくは医薬組成物、または請求項8もしくは9に記載の医薬組成物であって、前記組成物もしくは医薬組成物は、前記対象に投与されることを特徴とする、組成物もしくは医薬組成物
  15. 前記組織線維症が、心臓線維症、肺線維症、腎線維症、肝線維症、強皮症、眼線維症、皮膚線維症である、請求項14に記載の組成物もしくは医薬組成物
  16. 前記皮膚線維症が、肥厚性瘢痕(hypertrophic scarring)、ケロイド、手、関節または腱の線維症、およびペイロニー病からなる群から選択される、請求項15に記載の組成物もしくは医薬組成物
  17. 前記投与が吸入によるものである、請求項14から16のいずれか一項に記載の組成物もしくは医薬組成物
  18. 前記組成物もしくは医薬組成物が、定量用量吸入器、乾燥粉末吸入器、ネブライザー、加熱式気化器、ソフトミスト吸入器、温熱エアロゾル吸入器、または電気流体力学に基づく溶液ミスト化吸入器によって投与されることを特徴とする、請求項14から17のいずれか一項に記載の組成物もしくは医薬組成物
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