JP6723195B2 - プロリンリッチペプチドの構造模倣物およびその使用 - Google Patents
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Description
X=Oおよび/またはSであり、
A、B=環架橋であり、
Y1=H、アルキル、フルオロアルキル、アリールおよび/またはヘテロアリールであり、
Z1、Z2=H、カルボニル、OH、O−アルキル、O−アシル、N−R1R2(ここで、R1および/またはR2=H、アルキル、アシル、スルホニルである)、アルキル、アシル、フルオロアルキル、アリールおよび/またはヘテロアリールであり、
R1=アルキル、アシル、アルコキシカルボニル、アリールオキシカルボニルおよび/またはアミノカルボニル(CONH2、CONHR、CONH−ペプチジル、(Rを有する))であり、
R2=H、アルキル、アリール、アルキルカルボニル、アリールカルボニル、アルコキシカルボニル、アミノカルボニル、アリールオキシカルボニル、アルキルスルホニル、アリールスルホニル、アミノアシルおよび/またはペプチジルである)
を提供することにより解決される。
1)胃腸管および血清中のタンパク質分解に起因する低い代謝的安定性;
2)細胞に侵入する低い能力;
3)主に高分子量に起因する経口摂取後の不十分な吸収;
4)肝臓および腎臓を介する迅速な排出;ならびに
5)異なる受容体との相互作用に起因する、選択性の欠如。
プロリンは、第2アミノ酸のみであるので、20個の天然に生じるアミノ酸の中で特別な位置を占める。アミド窒素に対するα側鎖の環化に起因して、ねじれ角φ=(−65±15°)は5員環の成分として相対的に制限され、このことは、したがって、ペプチドが少しの回転自由度を有することを意味する。窒素の二重アルキル化は、他の共通のアミドプロトンが(ペプチド骨格において)欠失する結果を生じ、このため、プロリンは、水素架橋ドナーのための候補ではなく、他方で、カルボニル基は特に電子においてリッチであり、このため、他のアミノ酸を用いた場合より良い水素架橋受容体である。これらの幾何学的および電子的特性に起因して、プロリンは、α−ヘリックス(「α−ヘリックスブレーカー」)を安定化できず、また、β−ひだ折れ構造(「β−ひだ折れシートブレーカー」)を形成せず、代わりに、それは好ましくは、他の典型的に二次構造、いわゆるβ−ターンおよびポリプロリンヘリックス(PPIIヘリックス)において出くわす。
プロリンリッチアミノ酸配列は、多くの場合、多タンパク質複合体に関与し、細胞内シグナル伝達プロセスに関して形成および/または溶解されるタンパク質内に出くわす。それらの中のこれらのタンパク質は、プロリンが排他的または優勢的に(多くの場合、連続した4個以上のプロリン単位で)存在するそれらの表面上に配列を示す。
Z1、Z2は構造1に示され、構造式2の図の構造に示され、
X=−CH2−、−O−、−S−および/または−NH−Rであり、
R1、R2=アルキル、アシル、ヘタリールおよび/またはスルホニルである)
を有する。
X=−CH2−、−O−および/または−S−であり、
R=NH−R’’、−O−R’’(ここで、R’’=ペプチジル、置換アルキルおよび/またはヘタリールである)であり、
R’=アシル、ペプチジルおよび/またはスルホニルである)
を有する。
Ac−SFE−[2−Cl−F]−p−PP−TEDEL−NH2(配列番号6−[2−Cl−F]−p−PP−配列番号7)、
Ac−SFE−[2−Cl−F]−PP−p−TEDEL−NH2、
Ac−SFE−[2−Cl−F]−p−x−TEDEL−NH2および
Ac−SFE−[2−Cl−F]−p−p−TEDEL−NH2
からなる群から選択され、ここで、pは本発明に係る化合物を示し、xは構造86を示し、2−Cl−Fは2−Cl−フェニルアラニンを示す。本発明のさらなる好ましい実施形態において、ペプチドはp=構造85として特徴付けられる。
配列番号1:PxxPxxP
配列番号2:PPxPPxPPx
配列番号3:SFEFPPPPTEDEL
配列番号4:FPPPP
配列番号5:FPPPPT
配列番号6:SFE
配列番号7:TEDEL
配列番号8:PPPPTEDEL
第三者(J.Org.Chem.,2006,71,97−102)により2006年に公開されているこの合成を、ほとんどの部分を変化させずに借用した。公開されたプロトコルは、主要な問題に遭遇せずに最初にマルチグラムスケールに従うことができる(スキーム41)。
クロラールによるL−プロリンの保護の結果、所望の生成物103を生じ、それを82%の収率でジアステレオマーとして得た。次いでホルミル化し、それはまた、66%の良好な収率で実施できる。純粋なジアステレオマーとしてアルデヒド104を得るために、とりわけ、投薬ポンプを使用してギ酸メチルを非常にゆっくり加えることが必要であった。アルデヒド104の正確な構成および絶対配置をx線結晶構造解析により確認した。
Nystedメチレン化を使用して、67%の収率で所望のオレフィン105を得ることができた(スキーム43)。
続いて、メチルエステル106への再保護反応を61%の満足のいく収率で達成した。メチルエステルを開裂するために、より良いプロトコルを使用して、86%の収率で遊離酸107を得た。
第2の成分、100型のトランス−5−ビニル−プロリンエステルを合成するために、本発明者らは、本発明者の独自の研究室で開発されている合成を当てにした(スキーム45)。
まず、定量的収率でBoc2O、トリエチルアミンおよびDMAP、CおよびN末端を使用して50gのL−プロリン102を保護した。保護プロリン108の電気化学的酸化は、48×56mmの電極面積および240mAの一定の電流強度を用いて46g(170mmol)のスケールで実施できる。酸化生成物の精製により、収率の多くの損失が生じ、このため、これをさらに直接反応させ、ニトリル110へのシアン化後まで精製を延期した。これは、1.1eqのTMSCNを滴下することによりDCM中のTMSOTfの1vol%溶液で実施し、2段階にわたって、81%の収率でシアン化物110のシス−トランス−異性体混合物(d.r.:2.9:1、シス:トランス)を得た。次いで水素化後、ピリジン、酢酸および水(2:1:1)の混合物中のラニーニッケルを用いて水素雰囲気下で80℃にて18gのスケールで行い、51%の収率でアルデヒド111を得た。NaH2PO2の代わりに水素雰囲気の使用は公知の方法の明らかな改良を表す。塩基としてKHMDSを使用している間、ウィッティヒ反応により、88%の収率で所望の生成物112が生じた(d.r.:1.7:1、シス:トランス)。DCM中のTMSOTfを用いた脱保護およびその後のカラムクロマトグラフィーによるジアステレオマーの分離の結果、33%の収率で必要とされるトランス構成プロリン113、および49%の収率でシス−エピマー114(示さず)を生じた。
環閉鎖メタセシスにより三環117を調製するために、グラブス触媒、生成II(30mol%)をジペプチド115に最初に加え(スキーム53)、その物質をマイクロ波中で、7時間50℃(300W)で加熱した。所望の生成物117を54%の収率で得た。さらに、22%の遊離体115を再び単離できる。環閉鎖メタセシスの成功は、オレフィン信号の変化により1H−NMRスペクトルにおいて明確に実証され得る。さらに、三環117の構造および構成はx線回折により実証され得る。
ジクロロメタン中の過剰なトリフルオロ酢酸(99%)を、酸によるBoc保護基およびtert−ブチルエステルの結合開裂のために115に加えた。次いでその物質を室温にて撹拌した(スキーム54)。続いて、ショッテン・バウマン条件下で、残渣をFmoc保護最終産物85に移した。前記産物は顕著な極性を示したが、それにも関わらず、pH約1で水相からジクロロメタンで抽出され得、続いて、シリカゲル上でのカラムクロマトグラフィーにより精製され得る。非結晶質の弱い白色の固体物質(85%)として85を得、そのNMRスペクトルは予想値と一致した(600MHz 1H−NMRスペクトル(MeOH−d4)、60:40回転異性体混合物について図15を参照のこと)。
85の結晶構造と、PPII構造におけるディプロリンモチーフおよびX(ここで、Xは既知のPPII−模倣アミノ酸を示す)の結晶構造との比較を図4に示す(図4)。
今までEVH1ドメインについて記載された実験は存在せず、以下にまとめて示され得る複数の重要な発見を導いたので、これらの結果は特に注目すべきであり、したがって、以下のさらなる研究についての基礎を与える。
1)固相ペプチド合成の標準的なカップリング条件(DIC/HOBt)下で異なる試験ペプチド内に合成的に調製した三環85の挿入を問題なく達成した。
2)EVH1受容体にPPIIヘリックスを結合する場合の反応構造の予測は、リガンドペプチドIの十分な結合親和性ならびに/または十分に一致した三環85の生物学的に必要とされる構造および実際の構造により確認される。
3)リガンドの局所的な構造の予めの固定により予想される有益なエントロピー効果は、天然のペプチド配列と比較して見出される高い結合親和性に基づいてそれ自体で確認するようである。他方で、幾何学的固定はまた、リガンドおよびドメインタンパク質の収束、それによる結合形成を防がない。
EVH1ドメインに対する結合
例として合成化合物85を用いて、リガンドペプチドを、部分的または完全に置換したプロリン配列により合成し、次いでEVH1ドメイン(p=成分85)とのそれらの相互作用について試験した。模倣物85の挿入に起因して、ドメインに対するリガンドペプチドの結合親和性を増加できたことが見出された。全てのプロリンを相互接続した85の成分およびPPII−模倣化合物86と置き換えた場合、その結果は、天然ペプチドのものと比較してかなり向上した親和性を有するリガンドペプチドである。
86:
Ac−SFE−[2Cl−F]−PP−x−TEDEL−NH2 Kd=0.77uM
Ac−SFE−[2−Cl−F]−x−x−TEDEL−NH2 Kd=0.86uM
Ac−SFE−[2−Cl−F]−p−x−TEDEL−NH2 Kd=0.37uM
Ac−[2−Cl−F]−p−x−OH Kd=3uM
本発明に係る化合物を組み込むことにより、タンパク質間の相互作用に対する阻害剤としてのそれらの活性についての必須条件としてEVH1阻害剤の細胞内への変化した取り込みが生じた。蛍光標識したActA由来ペプチドNBD−SFEFPPPTEDEL−NH2と対照的に、対応するペプチドNBD−SFE−[2−Cl−F]−px−TEDEL−NH2が、MDA−MB−231細胞において明確に高い濃度で検出され得ることが実証され得る(図5)。
ガラス機器は、プロパンガスバーナーで加熱した0.2〜2mbarの最終圧力で油ポンプ真空において真空/アルゴン二重コック装置で3回排気し、続いてアルゴンで通気した。使い捨てシリンジ、カニューレ、移送カニューレを保存し、アセトンから湿らせ、80℃にて乾燥キャビネット内に入れた。1013〜10mbarの圧力および40℃の水浴温度にて、Buchi社による真空回転エバポレーター中で溶媒を除去した。
s=一重項
d=二重項
t=三重項
q=四重項
sept=七重項
m=多重項
s=四級C原子
d=三級C原子
t=二級C原子
q=一級C原子
M(C7H8Cl3NO2):244.50gmol−1。
[α]20 D:34.3°(c=0.970、ベンゼン).
融点:109.6°.
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ=1.78−1.64(m,1H,H4’),1.96−1.85(m,1H,H4),2.13−2.02(m,1H,H3’),2.26−2.13(m,1H,H3),3.15−3.06(m,1H,H5’),3.39(ddd,J10.9,7.8,6.0,1H,H5),4.09(dd,J8.9,4.6,1H,H2),5.14(s,1H,H7).
13C−NMR(100MHz,CDCl3:δ=25.32(t,C4),29.91(t,C3),57.87(t,C5),62.38(t,C2),100.62(s,C8),103.60(d,C7),175.43(s,C6).
IR(FT−ATR):〜ν=2958(m),2920(w),2893(w),2866(w),1784(s),1725(m),1449(w),1373(w),1359(w),1322(m),1283(m),1270(m),1243(m),1174(s),1107(s),1083(m),1043(w),1001(s),958(s),913(w),898(m),838(s),813(s),790(s),744(s).
M(C8H8Cl3NO3):272.51gmol−1.
DC:Rf=0.13(EtOAc/CyHex1:4).
[α]25 D:29.9°(c=0.520,CHCl3).
融点:84.8°C.
1H−NMR(300MHz,CDCl3):δ=2.00−1.77(m,2H,H4),2.44−2.20(m,2H,H3),3.31(dt,J11.6,6.0,1H,H5’),3.52(ddd,J11.4,7.7,6.3,1H,H5),5.16(s,1H,H7),9.59(s,1H,H9).
13C−NMR(75MHz,CDCl3:δ=25.47(t,C4),33.84(t,C3),58.94(t,C5),78.01(s,C2),99.92(s,C8),102.36(d,C7),169.27(s,C6),193.43(d,C9).
GC−MS:m/z=272([M]+,1),242([M]+−CHO,20),117(24),96(59),68(35),41(100).
IR(FT−ATR):〜ν=3017(w),2914(w),2846(w),1807(m),1729(w),1456(w),1353(w),1319(w),1272(w),1213(m),1190(w),11343(w),1107(w),1058(w),1020(w),993(w),972(w),929(w),839(w),816(w),747(s),667(m).
M(C9H10Cl3NO2):270.54gmol−1.
DC:Rf=0.17(EtOAc/CyHex1:10).
[α]22D:49.9°(c=0.660,CHCl3).
融点:84.8°C.
1H−NMR(300MHz,CDCl3):δ=2.00−1.77(m,2H,H4),2.44−2.20(m,2H,H3),3.31(dt,J11.6,6.0,1H,H5’),3.52(ddd,J11.4,7.7,6.3,1H,H5),5.16(s,1H,H7),9.59(s,1H,H9).
13C−NMR(75MHz,CDCl3:δ=25.47(t,C4),33.84(t,C3),58.94(t,C5),78.01(s,C2),99.92(s,C8),102.36(d,C7),169.27(s,C6),193.43(d,C9).
GC−MS:m/z=272([M]+,1),242([M]+−CHO,20),117(24),96(59),68(35),41(100).
IR(FT−ATR):〜ν=3017(w),2914(w),2846(w),1807(m),1729(w),1456(w),1353(w),1319(w),1272(w),1213(m),1190(w),11343(w),1107(w),1058(w),1020(w),993(w),972(w),929(w),839(w),816(w),747(s),667(m).
M(C13H21NO4):255.31gmol−1.
DC:Rf=0.20(EtOAc/CyHex1:4).
[α]22 D:62.5°(c=0.455,CHCl3).
1H−NMR(300MHz,CDCl3):δ=1.38(Ψ−d,J28.5(Ψ),9H,H10),1.90−1.74(m,2H,H4),2.03−1.91(m,1H,H3’),2.25−2.08(m,1H,H3),3.67−3.46(m,2H,H5),3.71(Ψ−d,J1.7(Ψ),3H,H7),5.02(Ψ−dd,J17.0,4.6(Ψ),1H,H12’),5.13(Ψ−dd,J10.5,4.2(Ψ),1H,H12),6.30(Ψ−ddd,J17.2,10.5,3.8(Ψ),1H).
13C−NMR(75MHz,CDCl3:δ=22.76/21.87(t,C4),28.38/28.18(q,C10),39.19/37.93(t,C3),47.99/47.82(t,C5),52.39/52.20(q,C7),69.45/69.30(s,C2),79.97/79.72(s,C9),113.08/112.96(t,C12),137.15/136.39(d,C11),153.55/153.44(s,C8),173.72(s,C6).
GC−MS:m/z=196([M]+−C2H3O2,13),140(75),96(63),56(100).
IR(FT−ATR):〜ν=3085(w),2974(m),2876(w),1742(s),1696(s),1641(w),1476(w),1453(w),1432(w),1387(s),1364(s),1289(w),1258(s),1214(m),1165(s),1122(s),1071(m),1021(w),989(w),959(w),933(w),921(w),881(w),857(w),784(w),770(w),741(w),663(w).
HR−MS:(ESI,C13H21NNaO4):278.137±0.003u(278.1368u).
M(C12H19NO4):241.28gmol−1.
[α]23 D:−25.8°(c=0.490,CHCl3).
融点:134.4°C.
1H−NMR(300MHz,CDCl3):δ=1.34(Ψ−d,J29.3(Ψ),9H,H9),2.04−1.68(m,3H,H4,H3’),2.42−2.13(m,1H,H3),3.66−3.32(m,2H,H5),5.20−4.87(m,2H,H11),6.29−6.00(m,1H,H10),10.22(s,1H,COOH).
13C−NMR(75MHz,CDCl3:δ=21.71/22.56(t,C4),27.93/28.19(q,C9),37.82/39.16(t,C3),47.68/48.26(t,C5),69.18/70.15(s,C2),80.51/80.81(s,C8),113.02/114.02(t,C11),136.15/136.48(d,C10),153.53/154.84(s,C7),175.90/178.08(s,C6).
IR(FT−ATR):〜ν=2968(m,br),2875(m),2620(w),1727(s),1690(w),1634(s),1550(w),1475(m),1449(m),1418(s),1393(s),1366(s),1349(m),1248(s),1214(w),1158(s),1122(m),1078(m),1013(w),996(w),982(m),942(m),884(m),852(s),774(s),755(w),719(s).
HR−MS:(ESI,C12H19NNaO4):264.121±0.003u(264.1212u).
M(C14H25NO4):271.35gmol−1.
DC:Rf=0.12(EtOAc/CyHex1:9).
[α]20 D:−53.1°(c=0.670,CHCl3).
1H−NMR(300MHz,CDCl3):δ=1.51−1.25(m,18H,H8,H11),1.94−1.67(m,3H,H4,H3),2.24−1.94(m,1H,H3’),3.54−3.17(m,2H,H5),4.10(Ψ−ddd,J25.5(Ψ),8.6,2.9,1H,H2).
13C−NMR(75MHz,CDCl3:δ=24.05/23.26(t,C4),28.21/27.84(q,C8,C11),30.74/29.73(t,C3),46.35/46.15(t,C5),59.52(d,C2),79.40/79.20(s,C10),80.61(s,C7),154.14/153.79(s,C9),172.12(s,C6).
GC−MS:m/z=271([M]+,1),170([M]+−C5H9O2,15),142(9),114(95),57(100),19(26).
IR(FT−ATR):〜ν=2973(s),2928(m),2880(w),1738(s),1697(s),1476(m),1454(m),1396(s),1364(s),1289(m),1252(s),1215(s),1148(s),1085(s),1028(w),978(m),939(m),917(m),895(m),851(m),840(m),797(w),770(m).
M(C15H27NO5):301.38gmol−1.
DC:Rf=0.43(EtOAc/CyHex1:7).
1H−NMR(300MHz,CDCl3):δ=1.59−1.23(m,18H,H8,H11),2.45−1.62(m,4H,H3,H4),3.63−3.20(m,3H,H12),4.29−3.96(m,1H,H2),5.34−4.99(m,1H,H5).
13C−NMR(75MHz,CDCl3:δ=28.23/28.15/27.92/27.82(C8,C11),30.82/29.79(t,C3),32.89/32.17(t,C4),32.89/32.17(t,C4),60.24/59.93/59.83/59.62(d,C2),80.90/80.69/80.36/80.27(s,C7,C10),89.22/88.34(d,C5),154.43/154.21/153.81(s,C9),171.73/171.67/171.59(s,C6).
GC−MS:m/z=301([M]+,1),200([M]+−C5H9O2,22),172(8),144(32),100(80),57(100),29(14).
IR(FT−ATR):〜ν=2975(s),2928(s),2825(w),1738(s),1699(s),1476(m),1455(m),1364(s),1327(s),1252(s),1157(s),1084(s),1024(m),987(s),939(s),911(s),885(s),841(s),797(s),772(s),729(m).
M(C15H24N2O4):296.36gmol−1.
trans−DC:Rf=0.33(EtOAc/CyHex1:9).
trans−[α]20 D:−88.6°(c=0.550,CHCl3).
trans−融点:106.3°C.
trans−1H−NMR(300MHz,CDCl3):δ=1.48−1.32(m,18H,H8,H11),2.53−1.97(m,4H,H3,H4),4.20(Ψ−dd,J26.2(Ψ),7.91H,H2),4.61(Ψ−dd,J30.2(Ψ),7.2,1H,H5).
trans−13C−NMR(75MHz,CDCl3:δ=28.04/27.81(q,C8,C11),29.60/28.59/28.46(t,C3,C4),47.59/47.48(d,C5),59.52/59.41(d,C2),81.84/81.78/81.70/81.49(s,C7,C10),118.82/118.75(s,C12),152.77/152.48(s,C9),170.79/170.70(s,C6).
trans−GC−MS:m/z=255([M]+,1),199(5),154([M]+−C5H9O2,100).
trans−IR(FT−ATR):〜ν=2973(m),2928(w),2238(w),1734(s),1704(s),1473(w),1455,1364(s),1323(m),1306(m),1252(m),1225(s),1144(s),1119(s),1061(m),1034(w),987(w),914(m),842(m),820(w),773(m),756(w).
trans−HR−MS:(ESI,C15H24N2NaO4):319.163±0.001u(319.1634u).
cis−DC:Rf=0.27(EtOAc/CyHex1:9).
cis−[α]20 D:19.2°(c=0.420,CHCl3).
cis−融点:81.3°C.
cis−1H−NMR(300MHz,CDCl3):δ=1.63−1.33(m,18H,H8,H10),2.47−2.00(m,4H,H3,H4),4.16(Ψ−td,J14.2(Ψ),6.7,6.7,1H,H2),4.55(Ψ−td,J39.1(Ψ),5.7,5.7,1H,H5).
cis−13C−NMR(75MHz,CDCl3:δ=28.14/27.84(q,C8,C11),30.39/29.71/29.64/28.57(t,C3,C4),47.52(d,C5),60.24/60.19(d,C2),82.01/81.91/81.62(s,C7,C10),118.38/118.09(s,C12),152.50/152.25(s,C9),170.53/170.30(s,C6).
cis−GC−MS:m/z=255([M]+,1),199(5),154([M]+−C5H9O2,100).
cis−IR(FT−ATR):〜ν=2976(s),2982(m),2880(w),2238(w),1738(s),1697(s),1473(m),1455(m),1384(s),1364(s),1286(s),1255(s),1215(s),1150(s),1116(s),1072(s),1028(m),986(m),950(m),935(m),905(m),878(m),842(s),769(s).
cis−HR−MS:(ESI,C15H24N2NaO4):319.163±0.001u(319.1634u).
M(C15H25NO5):299.36gmol−1.
DC:Rf=0.27(EtOAc/CyHex1:4).
1H−NMR(300MHz,CDCl3):δ=1.50−1.34(m,18H,H8,H11),2.25−1.83(m,4H,H3,H4),4.53−3.84(m,2H,H2,H5),9.65−9.45(m,1H,H12).
13C−NMR(75MHz,CDCl3:δ=29.94/29.20/29.00/28.27/26.29/26.17/25.24/24.56(t,C3,C4),28.14/27.90(q,C8,C11),60.52/60.38/60.29(d,C5),65.28(d,C2),81.63/81.54/81.45/81.35/81.23/81.00/80.77(s,C7,C10),154.12/153.93/153.55/153.15(s,C9),171.54/171.42/171.26(s,C6),200.99/200.11(s,C12).
GC−MS:m/z=299([M]+,1),270([M]+−CO,5),198([M]+−C5H9O2,2),170(27),142(8),114(100),98(41),57(75),39(25).
IR(FT−ATR):〜ν=2976(s),2926(m),2873(w),2806(w),2713(w),1730(s),1695(s),1476(m),1455(m),1383(s),1364(s),1290(m),1253(s),1220(s),1148(s),1123(s),1090(s),1010(m),979(m),913(m),843(m),796(w),771(m).
M(C16H27NO4):297.39gmol−1.
DC:Rf=0.27(EtOAc/CyHex1:9).
1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ=1.50−1.32(m,18H,H8,H11),2.19−1.59(m,4H,H3,H4),4.58−4.01(m,2H,H2,H5),5.44−4.92(m,2H,H13),5.95−5.60(m,1H,H12).
13C−NMR(100MHz,CDCl3:δ=28.32/27.98(q,C8,C11),31.54/30.86/29.92/29.00/27.33(t,C3,C4),61.00/60.53/60.34/60.17/59.61/59.36(d,C2,C5),80.85/79.86/79.78/79.72(s,C7,C10),114.93/114.78/114.59/113.82/113.64(t,C13),139.21/138.97/138.63/138.50/138.06(d,C12),153.73/153.58(s,C9),172.09/172.03/171.97(s,C6).
GC−MS:m/z=297([M]+,1),196([M]+−C5H9O2,168(10),140(100),114(2),96
(70),79(5),57(72),39(27).
IR(FT−ATR):〜ν=2975(s),2933(m),2880(w),1737(s),1697(s),1640(w),1477
(m),1455(m),1385(s),1363(s),1323(m),1290(m),1255(m),1213(m),1150(s),
1106(s),1066(w),1023(w),988(w),957(w),912(m),873(w),856(w),843(w),770(w).
HR−MS:(ESI,C16H27NNaO4):320.183±0.001u(320.1838u).
M(C11H19NO2):197.27gmol−1.
trans−DC:Rf=0.35(DCM/MeOH25:1).
trans−[α]20 D:−28.9°(c=0.715,CHCl3).
trans−1H−NMR(300MHz,CDCl3):δ=1.42(s,9H,H8),1.58−1.45(m,1H,H4’),1.96−1.70(m,2H,H3,H4),2.25−2.10(m,1H,H3’),2.70(s,1H,NH),3.77−3.65(m,2H,H2,H5),4.97(d,J10.2,1H,H10),5.13(dd,J17.1,0.9,1H,H10’),5.76(ddd,J17.1,10.1,7.0,1H,H9).
trans−13C−NMR(75MHz,CDCl3:δ=28.00(q,C8),29.60,31.79(t,C3,C4),59.79,60.89(d,C2,C5),81.01(s,C7),114.50(t,C10),140.89(d,C9),174.90(s,C6).
trans−GC−MS:m/z=197([M]+,1),96([M]+−C5H9O2,100),79(12),57(22),
41(32),19(10).
trans−IR(FT−ATR):〜ν=3346(w),3076(w),2974(s),2932(m),2872(w),1723(s),1641(w),1604(w),1591(w),1477(m),1456(m)1391(s),1366(s),1339(m),1226(s),1153(s),1029(m),991(s),916(s),846(s),808(m),754(m)721(w),692(w),677(w).
trans−HR−MS:(ESI,C11H20NO2):198.149±0.002u(198.1494u).
cis−DC:Rf=0.27(DCM/MeOH25:1).
cis−[α]20 D:−25.1°(c=1.475,CHCl3).
cis−1H−NMR(400MHz,CDCl3):δ=1.44(s,9H,H8),2.28−1.82(m,4H,H3,H4),2.22(s,1H,NH),3.59(dd,J14.3,7.21H,H5),3.67(dd,J8.7,5.21H,H2),5.03(d,J10.3,1H,H10),5.17(d,J17.1,1H,H10’)5.85(ddd,J17.2,10.2,7.1,1H,H9).
cis−13C−NMR(100MHz,CDCl3:δ=28.02(q,C8),31.87,30.37(t,C3,C4),60.70(d,C2),62.23(d,C5),81.13(s,C7),115.20(t,C10),139.97(d,C9),174.33(s,C6).
cis−GC−MS:m/z=197([M]+,1),96([M]+−C5H9O2,100),79(12),57(22),
41(32),19(10).
cis−IR(FT−ATR):〜ν=3360(w,br),2977(s),2926(m),2873(w),1727(s),1636(w),1473(w),1453(m),1426(w),1390(m),1366(s),1283(m),1246(s),1225(s),1154(s),1100(m),1030(w),992(m),917(m),848(s),769(w),753(w),740(w).
cis−HR−MS:(ESI,C11H20NO2):198.149±0.001u(198.1494u).
M(C23H36N2O5):420.54gmol−1.
DC:Rf=0.33(EtOAc/CyHex1:3).
[α]20 D:−15.6°(c=1.010,CHCl3).
1H−NMR(600MHz,CDCl3):δ=1.45−1.34(m,18H,H8,H20),1.64−1.57(m,1H,H4’),1.73−1.64(m,1H,H3’),1.85−1.73(m,2H,H16),2.09−2.01(m,1H,H3),2.26−2.13(m,2H,H4,H15’),2.34−2.26(m,1H,H15),3.47−3.36(m,1H,H17’),3.59−3.47(m,1H,H17),4.37−4.26(m,0.5H,H2),4.71(s,0.5H,H5),4.80−4.74(m,0.5H,H2),4.82(s,0.5H,H5),5.10−4.95(m,3H,H10’,H12),5.20−5.10(m,1H,H10),5.83−5.63(m,1H,H9),6.69−6.55(m,1H,H13).
13C−NMR(150MHz,CDCl3:δ=22.41,21.63(t,C16),25.08,24.85(t,C3),28.27,27.86(q,C8,C20),31.30,30.69(t,C4),36.78,35.93(t,C15),48.31,48.02(t,C17),59.97,59.69(d,C5),61.80,61.60(d,C2),70.71,70.15(s,C14),80.83,80.66(s,C7,C19),112.15(t,C12),114.62(t,C10),139.75,138.56(d,C9),140.08,140.02(d,C13),154.27,154.04(s,C18),171.40(s,C11),171.08(s,C6).
IR(FT−ATR):〜ν=3073(w),2973(m),2926(w),2880(1),1735(s),1693(s),1634(s),1477(w),1455(w),1380(s),1363(s),1300(w),1255(m),1217(m),1149(s),1075(w),992(w),917(w),850(w),769(w),663(w).
HR−MS:(ESI,C23H36N2NaO5):443.253±0.002u(443.2522u).
M(C21H32N2O5):392.49gmol−1.
DC:Rf=0.30(EtOAc/CyHex1:1).
[α]20 D:−138.7°(c=0.265,CHCl3).
融点:128.0°C.
1H−NMR(600MHz,CDCl3,回転異性体混合物;Rot1:Rot2:1.5:1):回転異性体1:δ=1.30(s,9H,H18),1.44(s,9H,H8),1.56−1.48(m,1H,H4’),1.91−1.75(m,3H,H3’,H13’,H14’),2.04−1.96(m,1H,H14),2.14−2.10(m,1H,H4),2.27−2.20(m,1H,H13),2.45−2.36(m,1H,H3),3.50−3.41(m,1H,H15’),3.78−3.72(m,1H,H15),4.22−4.16(m,1H,H5),4.46(t,J8.8,1H,H2),5.72(dd,J9.9,1.4,1H,H10),5.79(dd,J9.8,2.8,1H,H9);回転異性体2:δ=1.40(s,9H,H18),1.43(s,9H,H8),1.75−1.69(m,1H,H4’),1.91−1.75(m,3H,H3’,H13’,H14’),2.04−1.96(m,1H,H14),2.10−2.05(m,1H,H4),2.27−2.20(m,1H,H13),2.45−2.36(m,1H,H3),3.50−3.41(m,1H,H15’),3.71−3.65(m,1H,H15),4.22−4.16(m,1H,H5),4.56(t,J8.6,1H,H2),5.80(dd,J9.6,1.4,1H,H10),5.88(dd,J9.8,2.7,1H,H9).
13C−NMR(150MHz,CDCl3,回転異性体混合物):δ=22.80,22.49(t,C14),28.21,28.14(t,C3),28.52,28.32,27.99(q,C8,C18),31.30,31.14(t,C4),39.43,38.15(t,C13),48.26,47.98(t,C15),57.84,57.62(d,C2),58.64,58.52(d,C5),64.28,64.00(s,C11),79.63,79.39(s,C17),81.33,81.08(s,C7),122.46,121.41(d,C10),134.03,133.37(d,C9),154.21,154.07(s,C16),168.05,167.93(s,C12),171.54,171.25(s,C6).
IR(FT−ATR):〜ν=2972(s),2929(m),2873(m),1735(s),1696(s),1659(s),1477
(m),1432(s),1383(s),1364(s),1293(m),1255(s),1211(s),1149(s),1078(w),
1034(w),1004(m),959(w),928(w),884(w),870(w),843(w),803(w),786(w),770(w),734(w),702(w).
M(C27H26N2O5):458.51gmol−1.
DC:Rf=0.20(DCM/MeOH15:1).
融点:
1H−NMR(600MHz,MeOD,回転異性体混合物;rot1:rot21:1):δ=回転異性体1:δ=1.66−1.55(m,1H,H4’),2.03−1.77(m,4H,H3’,H11’,H12),2.16−2.08(m,1H,H4),2.34−2.28(m,1H,H11),2.42−2.35(m,1H,H3),3.54−3.45(m,1H,H13’),3.71−3.61(m,1H,H13),4.33−4.16(m,3H,H5,H15’,H16),4.41(t,J8.7,1H,H2),4.54(dd,J10.9,6.0,1H,H15),5.69(dd,J10.0,2.4,1H,H7),5.87(dd,J10.0,1.1,1H,H8),7.32−7.26(m,2H,H19),7.40−7.34(m,2H,H20),7.63−7.50(m,2H,H18),7.79−7.72(m,2H,H21);回転異性体2:1.24−1.15(m,1H,H4’),2.03−1.77(m,5H,H3’,H4,H11’,H12),2.28−2.23(m,1H,H3),2.34−2.29(m,1H,H11),3.54−3.45(m,1H,H13’),3.71−3.61(m,1H,H13),4.03(t,J5.6,1H,H16),4.17−4.11(m,1H,H5),4.33−4.17(m,3H,H2,H15),5.48(dd,J9.8,2.6,1H,H7),5.58(d,J9.9,1H,H8),7.32−7.26(m,2H,H19),7.40−7.34(m,2H,H20),7.63−7.50(m,2H,H18),7.79−7.72(m,2H,H21).
13C−NMR(150MHz,MeOD,回転異性体混合物):δ=24.19/23.25(t,C12),29.53/29.45(t,C3),32.09/32.05(t,C4),40.35/39.46(t,C11),48.34(d,C16),49.90/49.43(t,C13),60.64/60.13(d,C5),61.52/61.31(d,C2),65.75/65.72(s,C9),68.42/67.85(t,C15),121.00/120.93(d,C21),124.58/124.35(d,C8),126.13/126.09/125.97/125.77(d,C18),128.12/128.04/127.99(d,C19),128.80/128.73(d,C20),132.77/131.64(d,C7),142.57/142.51(s,C22),145.51/145.36,145.05/145.01(s,C17),156.69/155.97(s,C14),170.20/170.10(s,C10),180.14/179.96(s,C6).
abs. 絶対
Eq. 当量
Ar アリール
ATR 減衰全内部反射
9−BBN 9−ボラビシクロノナン
ber. 算出した
Bn ベンジル
Boc tert−ブトキシカルボニル
Boc2O ジ−tert−ブチルジカルボネート(Boc無水物)
CH シクロヘキサン
Cy シクロヘキシル
DC 薄層クロマトグラフィー、TLC
DCE ジクロロエタン(1,2−)
DCM ジクロロメタン
DIBAL−H 水素化ジイソブチルアルミニウム
DIC ジイソプロピルカルボジイミド
DIP 直接注入プローブ(質量分析)
DIPEA ジイソプロピルエチルアミン
DMAP 4−N,N−ジメチルアミノピリジン
DMF N,N−ジメチルホルムアミド
DMP 2,2−ジメトキシプロパン
DMS ジメチルスルフィド
DMSO ジメチルスルホキシド
dr ジアステレオマー比
EE 酢酸エチル
ee 鏡像体過剰率
EI 電子[衝突]イオン化
ESI 静電スプレーイオン化
Et エチル
Et2O ジエチルエーテル
EtOH エタノール
EVH1 ENA−VASP−ホモロジー1ドメイン
FGI 官能基反転
Fmoc フルオレニル−9−メトキシカルボニル
FMP 分子薬理学のための研究施設(Berlin−Buch)
GC−MS 質量分析に関連するガスクロマトグラフィー
gef. 実測値
ges. 飽和
HPLC 高速液体クロマトグラフィー
HRMS 高分解能質量分析
IR 赤外分光法
konz. 濃縮した
LiHMDS リチウム−ヘキサメチルジシラジド
M モル質量
MCPBA メタクロロ過安息香酸
Me メチル
MeOH メタノール
Ms メシル(メタンスルホニル)
MS 質量分析
MTBE メチル−tert−ブチルエーテル
NaHMDS ナトリウム−ヘキサメチルジシラジド
NME N−メチルフェドリン
NMR 核磁気共鳴スペクトル
NOE 核オーバーハウザー効果
o オルト
Ph フェニル
PPII ポリプロリンヘリックスII型
POM−Cl ピバル酸クロロメチル(chloromethyl pivaloate)
PPTS ピリジニウム−para−トルエンスルホネート
RCM 環閉鎖メタセシス
Rf 保持因子
[Ru]II Grubbs II 触媒81
[Ru]gr Blechert 82による修飾(グリーン)Grubbs Hoveyda触媒
s 二次
Smp. 融点
Su スクシンイミド
TBAF フッ化テトラブチルアンモニウム
TBS tert−ブチルジメチルシリル
t−Bu tert−ブチル
Tf トリフルオロメタンスルホニル(Trifluormethansulfonyl)
TFA トリフルオロ酢酸(trifluoroascetic acid)
THF テトラヒドロフラン
TMEDA テトラメチルエチレンジアミン
TMS トリメチルシリル
TMSOTf トリメチルシリルトリフルオロメタンスルホネート
TPS tert−ブチルジフェニルシリル
Ts トシル(para−トルエンスルホニル)
TsOH para−トルエンスルホン酸
Z ベンジルオキシカルボニル−(また、Cbz)
Claims (13)
- 一般式(3)
(式中、
X2=−CH2−であり、
R=ペプチジル、NH−R’’、−O−R’’(ここで、R’’は、置換アルキル、
またはヘタリールであり、Rがペプチジルのとき、該ペプチジルのN末端は、式(3)のC原子に結合する。)
R’=アシル、ペプチジル、アルキルスルホニル、またはアリールスルホニルであり、R’がペプチジルのとき、該ペプチジルのC末端は、式(3)のN原子に結合する。)
に対応することを特徴とする、化合物。 - 薬学的に許容可能な担体物質と組み合わされる、請求項1に記載の化合物を含む薬剤。
- 前記薬学的に許容可能な担体物質が、充填剤、増量剤、結合剤、湿潤剤、溶解遅延剤、崩壊剤、吸収促進剤、保湿剤、吸収剤および潤滑充填剤からなる群から選択されることを特徴とする、請求項2に記載の薬剤。
- RおよびR’の少なくとも1つがペプチジルである、請求項1に記載の1つまたは複数の式(3)の化合物を含むペプチド。
- 請求項4に記載の1つまたは複数の化合物、および以下の構造86
- 前記ペプチドが、
Ac−SFE−[2−Cl−F]−p−PP−TEDEL−NH2、
Ac−SFE−[2−Cl−F]−PP−p−TEDEL−NH2、
Ac−SFE−[2−Cl−F]−p−x−TEDEL−NH2および
Ac−SFE−[2−Cl−F]−p−p−TEDEL−NH2
からなる群から選択され、
ここで、
p=請求項1に記載の化合物であり、請求項1の式(3)におけるRおよびR’はペプチジルであり、
x=請求項5に記載の構造86であり、
2−Cl−F=2−Cl−フェニルアラニンである、
請求項5に記載のペプチド。 - p=構造85
- 細菌感染疾患ならびに神経変性疾患および/または腫瘍疾患を含む群から選択される、ポリプロリンヘリックス構造により媒介される、細胞内シグナル変換プロセスの修飾に関連する疾患の治療に使用される請求項2に記載の薬剤。
- 細菌疾患が、レジオネラ菌、連鎖球菌、ブドウ球菌、クレブシエラ菌、ヘモフィルスインフルエンザ、リケッチア(紅斑熱)、マイコバクテリウム、マイコプラズマ、ウレアプラズマ、ナイセリア(髄膜炎、ウォーターハウスフリードリヒセン症候群(Waterhouse−Friedrichsen syndrome)、淋病)、シュードモナス、ボルデテラ(百日咳)、コリネバクテリア(ジフテリア)、クラミジア、カンピロバクター(下痢)、大腸菌、プロテウス、サルモネラ菌、赤痢菌、エルシニア属、ビブリオ科、腸球菌、クロストリジウム、ボレリア菌、梅毒トレポネーマ、ブルセラ菌、フランシセラ属および/またはレプトスピラ属、特にリステリア菌を含む群から選択される、細菌により引き起こされることを特徴とする、請求項8に記載の薬剤。
- リステリア菌が、L.モノサイトゲネスSv1/2a、L.モノサイトゲネスSv4b F2365、L.モノサイトゲネスSv4b H7858、178コンティグ、L.モノサイトゲネスSv1/2a F6854、133コンティグ、L.モノサイトゲネスSv4b、L.モノサイトゲネスSv4a、L.イノキュアSv6a、L.ウェルシメリ(welshimeri)Sv6b、L.シーリゲリ(seeligeri)Sv1/2bおよび/またはL.イバノビ(ivanovii)Sv5を含む群から選択されることを特徴とする、請求項9に記載の薬剤。
- 神経変性疾患が、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病および/または筋萎縮性側索硬化症(ALS)を含む群から選択されることを特徴とする、請求項8に記載の薬剤。
- 腫瘍疾患が、癌腫、肉腫、神経内分泌腫瘍、血液腫瘍(hemo−oncological tumor)、新生物発生腫瘍(dysontogenetic tumor)および/または混合腫瘍であることを特徴とする、請求項8に記載の薬剤。
- 腫瘍疾患が、首および喉の腫瘍、内部の鼻の腫瘍を含む鼻および耳の領域の腫瘍、副鼻腔、咽頭、唇、口腔、咽頭、喉頭、下咽頭、耳、唾液腺および傍神経節腫の腫瘍、非小細胞気管支癌を含む肺の腫瘍、小細胞気管支癌、縦隔の腫瘍、食道、胃、膵臓、肝臓、胆嚢および胆嚢管、小腸、結腸および直腸癌および肛門癌を含む胃腸管の腫瘍、腎臓、尿管、膀胱、前立腺、尿道、ペニスおよび睾丸の腫瘍を含む泌尿生殖器の腫瘍、子宮頸部、膣、外陰部、子宮体部の腫瘍、悪性絨毛性疾患、卵巣癌、卵管の腫瘍(tuba faloppii)を含む、婦人科腫瘍、腹腔の腫瘍、乳癌、甲状腺、副甲状腺、副腎皮質の腫瘍を含む内分泌器官の腫瘍、内分泌膵臓腫瘍、カルチノイド腫瘍およびカルチノイド症候群、多発性内分泌新生物、骨および軟部組織肉腫、中皮腫、皮膚腫瘍、皮膚黒色腫および眼内黒色腫を含む黒色腫、中枢神経系の腫瘍、網膜芽細胞腫を含む小児腫瘍、ウィルムス腫瘍、神経線維腫症、神経芽細胞腫、ユーイング肉腫腫瘍ファミリー、横紋筋肉腫、非ホジキンリンパ腫を含むリンパ腫、皮膚T細胞リンパ腫、中枢神経系の原発性リンパ腫、ホジキン疾患、急性白血病を含む白血病、慢性骨髄性およびリンパ性白血病、形質細胞腫瘍、骨髄異形成症候群、腫瘍随伴症候群、既知の原発腫瘍のない転移(CUP症候群)、腹膜癌腫症、カポジ肉腫などのエイズ関連の悪性腫瘍を含む免疫抑制により誘導される悪性腫瘍、エイズ関連リンパ腫、中枢神経系のエイズ関連リンパ腫、エイズ関連ホジキン病およびエイズ関連肛門性器腫瘍、移植関連悪性腫瘍、脳転移、肺転移、肝転移、骨転移、胸膜転移および心膜転移を含む転移した腫瘍、ならびに悪性腹水を含む群から選択されることを特徴とする、請求項8〜11のいずれか一項に記載の薬剤。
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