JP6702587B2 - 生物粒子の精製用分離マトリックス - Google Patents
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Description
a)上に開示した任意の実施形態に係わる分離マトリックスを提供する工程と、
b)上記マトリックスを、生物粒子及び1種以上の夾雑タンパク質を含む液体に、上記夾雑タンパク質が上記マトリックスに結合するように接触させる工程と、
c)上記液体を上記マトリックスから分離し、精製された生物粒子とともに上記液体を回収する工程と、
を含む。
d)上記マトリックスを再生液に接触させることによって上記マトリックスを再生する工程と、
e)工程a)〜c)を1回以上(例えば、5回以上、10回以上又は50回以上)繰り返す工程と、
をさらに含む。再生液は有機溶媒を含まないか、又は可燃性溶媒を含むがその含有量が15重量%未満(例えば、5重量%未満、又は1重量%未満)であれば好適である。これは、処理において高価な防爆型装置及び場所を使う必要がないという点で有利である。これはまた、より環境に優しい処理を実現する。
a)複数の多孔質多糖粒子(例えば架橋アガロースゲル粒子)を提供する工程と、
b)共有結合によって上記粒子に付加した、少なくとも50、少なくとも100、又は少なくとも200マイクロモル/mlのアリル基を得るために、上記粒子をアリル化剤と反応させる工程と、
c)上記粒子を最長30分の期間にわたってハロゲンと反応させ、その後、アルカリ性水溶液と反応させる工程と、
d)複数の第1級アミンを含むリガンド前駆体を残ったアリル基と結合させる工程と、
を含む。
支持体粒子
使用した支持体粒子は高度に架橋したアガロースビーズであった。これは米国特許第6602990号に記載される方法によって調製した。なお、同明細書はその全体が参照によって本願明細書に援用されている。ビーズの体積加重平均直径(D50,v)は88μmであり、孔径分布は、分子量110kDaのデキストラン分子が細孔容積の69%を使用できるというものであった。これは、次の文献に記載される方法に従って測定したときに、ビーズにおけるデキストラン110kDaのKdが0.69であったと表現することもできる:『Handbook of Process Chromatography,A Guide to Optimization,Scale−Up and Validation』(1997)Academic Press,San Diego.Gail Sofer&Lars Hagel編。ISBN0−12−654266−X、368ページ。
中間体5803
400mL(g)の支持体粒子をゲル体積の6倍量の蒸留水で洗浄した後、ゲル体積の3倍量の50%NaOHで洗浄した。次に、ゲルを完全に吸い取り2Lの丸底フラスコに移した。50%NaOHを775mL添加して機械式翼攪拌を行い、フラスコを50℃の水浴中に浸漬した。30分後、アリルグリシジルエーテル(AGE)を128mL添加した。反応は17時間にわたって進行した。ゲルをゲル体積と同量の蒸留水、ゲル体積の5倍量のエタノール、さらにゲル体積の8倍量の蒸留水で順に洗浄した。
120mL(g)の支持体粒子をゲル体積の6倍量の蒸留水で洗浄した後、真空によって乾燥させ、250mLの丸底フラスコに移した(90.7g)。50%NaOHを149.3mL添加(11.8M)して機械式翼攪拌を行い、フラスコを50℃の水浴中に浸漬した。30分後、AGEを36mL添加した。反応は17時間にわたって進行した。ゲルをゲル体積と同量の蒸留水、ゲル体積の3倍量のエタノール、さらにゲル体積の8倍量の蒸留水で順に洗浄した。
蒸留水に入れた200mL(g)のアリル化した支持体粒子5803を、ガラスフィルタ上でゲル体積の3倍量の50%NaOH水溶液によって洗浄した。次に、ゲルを完全に吸い取り1Lの丸底フラスコに移した。50%NaOH水溶液を388mL添加して機械式翼攪拌を行い、フラスコを50℃の水浴中に浸漬した。30分後、アリルグリシジルエーテルを64mL添加すると、反応は16時間にわたって進行した。ゲルをゲル体積と同量の蒸留水、ゲル体積の5倍量のエタノール、さらにゲル体積の8倍量の蒸留水で順に洗浄した。
256mL(g)の支持体粒子をガラスフィルタ上で蒸留水によって、そして50%NaOH水溶液によって洗浄した。次に、ゲルを完全に吸い取り1Lの丸底フラスコに移した。50%NaOH水溶液を200mL添加して機械式翼攪拌を行い、フラスコを50℃の水浴中に浸漬した。30分後、AGEを200mL添加すると、反応は17時間にわたって進行した。ゲルを蒸留水、エタノール、さらに蒸留水で洗浄した。
中間体6478
192g(mL)のアリル化した支持体粒子6383を1728mLの蒸留水とともに3Lの丸底フラスコにすべて移し、機械的攪拌を行った。1000μLの臭素を200mLの水に加えた溶液を調製した。この臭素溶液(88μmのビーズの5μmのシェルに含まれるアリル基の量に相当)を300rpmの攪拌速度で約2分間かけてゆっくり添加した。20分後、ゲルをゲル体積の10倍量の蒸留水で洗浄した。
115g(mL)のアリル化した支持体粒子5840を1035mLの蒸留水とともに2Lの丸底フラスコにすべて移し、機械的攪拌を行った。408μLの臭素を100mLの水に加えた溶液を調製した。この臭素溶液(88μmビーズの5.5μmのシェルに含まれるアリルの量に相当)を250rpmの攪拌速度で約2分間かけてゆっくり添加した。Eフラスコから注ぐ際に一部の臭素が操作中に失われた。次に、プラスチックピペットを用いて添加を行った。20分後、ゲルをゲル体積の10倍量の蒸留水で洗浄した。
260g(mL)のアリル化した支持体粒子3266Aを2300mLの蒸留水とともに3Lの丸底フラスコにすべて移し、機械的攪拌を行った。3.55gの臭素を250mLの水に加えた溶液を調製した。この臭素溶液を攪拌しながらゆっくり添加した。5分後、ゲルを蒸留水で洗浄した。
80g(mL)のアリル化したコア用支持体粒子6478を、80mLの水及び3.2gの酢酸ナトリウムとともに500mLのEフラスコにすべて移した。次に、黄色い色が消えなくなるまで臭素の水溶液を添加した。ギ酸ナトリウム(約2g)を添加して過剰な臭素をなくした。ゲルはゲル体積の10倍量の蒸留水で洗浄した。
アリル及び残留アリルの滴定(不活性化したシェルの厚さを決定するため)
・ゲルを水で洗浄する。
・1.0mLのゲルを立方体で測定し、それを9mLの蒸留水とともに吸引フラスコに移す。
・臭素を水に溶かした飽和溶液を、過剰なBr2による黄色い色が消えなくなるまで添加する。
・サンプルを磁気攪拌しながら5分間、放置する。
・サンプルを磁気攪拌しながら真空(水吸引)下に置き、過剰な臭素を除去する。
・次に、フラスコを10mLの蒸留水ですすぎ、サンプルを滴定ビーカーに移す。
・アリル含有量を間接的に測定するため、濃硝酸を2、3滴、加えてから、0.1M AgNO3による滴定を開始する。
・結果はゲル1ml当たりのマイクロモル数で与えられる。
・理論上のシェル厚は、部分臭素化及び不活性化後の残留アリル含有物がシェルに囲まれたコア内にすべて存在し、かつシェルはアリル基を含まないと仮定したモデルを用いて計算される。ビーズの直径が88μmで、シェルの厚さがxμmのとき、臭素化・不活性化の前後におけるアリル含有量の比は443/(44−x)3であり、この式からxが得られる。
1,3−ジアミノ−2−プロパノールの結合
24.8gの1,3−ジアミノ−2−プロパノール(270mmol、34当量)を100mLの丸底フラスコに移した。フラスコを60℃の水浴中に沈め、75分間リガンドを溶解させた。
40mL(g)の活性アリル化コア用ベースマトリックス6478(10.56mmolアリル、1当量)を250mLの丸底フラスコにすべて移した。39.6mLのトリス(2−アミノエチル)アミン(264.3mmol、25当量)を添加し、機械式翼攪拌(200rpm)を行った。反応は17時間にわたって進行した。pHを測定すると8.8であった。ゲルをゲル体積の10倍量の蒸留水で洗浄した。
37mL(g)の活性アリル化コア用ベースマトリックス3266Bを250mLの丸底フラスコにすべて移した。分子量15kDaのポリアリルアミン(Aldrich、283215)11.3gを20mlの蒸留水+2mlの50%NaOH水溶液に溶かし、上記のフラスコに添加した。機械式翼攪拌(200rpm)を行い、50℃で17時間にわたって反応させた。ゲルを0.5M HCl、1mM HCl、及びゲル体積の10倍量の蒸留水で順に洗浄した。
・ゲルを水で洗浄する。
・ゲルを0.5M HClで3回洗浄した後、1mM HClで3回洗浄する。
・1.0mLのゲルを立方体で測定し、19mLの蒸留水とともに滴定カップに移す。
・アミン含有量を間接的に測定するため、濃硝酸を2、3滴、加えてから、0.1M AgNO3による滴定を開始する。
・結果はゲル1ml当たりのマイクロモル数で与えられる。
空の96ウェルフィルタプレートの各ウェルに6μLのゲルを充・した。プレート実験では表3に記載の方法を用いた。定温放置後の洗浄回数は、非結合タンパク質を洗い落とすのに必要な内容に応じて2回と3回の間で変動した。
280nmにおける吸光度と校正曲線から計算した濃度とによって非結合タンパク質を分析する。
プロトタイプ:ポリアリルアミン
イオン容量:210μmol/ml
タンパク質1:BSA2g/l、IP約4.7
タンパク質2:オボアルブミン2g/l、IP約4.7
緩衝系1:40mMトリス pH7.2〜8.2
緩衝系2:20mMピペラジン pH6
塩:NaCl
イオン容量:210μmol/ml
タンパク質:オボアルブミン2g/l、IP約4.7
緩衝系:20〜40mMリン酸塩 pH7〜7.5
塩:NaCl
イオン容量:210μmol/ml
タンパク質1:オボアルブミン4g/l、IP約4.7
タンパク質2:BSA4g/L、IP約4.7
緩衝系:40mMトリス pH7.2〜8.2
塩:NaCl
イオン容量:210μmol/ml
タンパク質:オボアルブミン2g/l、IP約4.7
緩衝系:40mMトリス pH7.2〜7.5
塩:NaCl
プロトタイプ:ポリアリルアミン
イオン容量:210μmol/ml
参照媒体:Capto(商標)Core700
イオン容量:40〜85μmol/ml
タンパク質:オボアルブミン3g/l、IP約4.7
緩衝系:40mMトリス pH7.2〜7.5
塩:NaCl
ポリアリルアミンを用いる場合、リガンドに対する等電点(IP)は好適に検討され、緩衝液のpHはリガンドのIPに近くない。そのためそれは帯電しない。ポリアリルアミンのIPは8.7程度である。
1,3−ジアミノ−2−プロパノールプロトタイプ及びトリス(2−アミノエチル)アミンプロトタイプでの結果
プロトタイプ:1,3−ジアミノ−2−プロパノール
リガンド密度:84μmol/ml
プロトタイプ:トリス(2−アミノエチル)アミン
リガンド密度:55μmol/ml
タンパク質溶液:オボアルブミン2g/L、IP約4.7
緩衝系1:50mMトリス pH7.4
緩衝系2:50mMリン酸塩 pH7.2
塩:NaCl
1ウェル当たりのマトリックス量:6μL
この研究はウェルのサイズが800μLの96ウェルフィルタプレートを用いて行った。プレートのすべてのウェルに20μLのマトリックスを充・し、大腸菌のホモジネートで汚染した。複数種類の再生液を用いて清浄化を行い、ビーズにまだ残留する汚染物質を、24mMジチオスレイトール(DTT)及び0.5%ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)とともに沸騰させて溶解した後、Caliper HT Protein LabChipシステムにおいてチップ電気泳動で解析した。
媒体の汚染には大腸菌ホモジネートを用いた。凍結した大腸菌ホモジネートを解凍し、ガラス繊維フィルタ、続いて0.45μmのメンブレンフィルタによって分級した。
空のフィルタプレートの各ウェルに20μLのゲルを充・した。プレート実験では表に記載した方法を用いた。1枚のプレートを各溶液で3回処理した。CIPにおける定温放置時間は15分であった。
HT Protein LabChip(商標)Kitのユーザガイド(Caliper Life Sciences Inc.、2010年11月)に従い、チップ、バッファストリップ、及び分子量マーカーを用意した。HT Protein Express 200 High Sensitivityのプログラムを実行した。
Claims (12)
- 多孔質コア体(101)とコア体(101)を覆う多孔質シェル体(102)とを有する複数の粒子(100)を含んでおり、
a)コア体(101)が、共有結合で結合したリガンド上に50マイクロモル/ml以上の第1級アミンを含んでいて、リガンド1個当たり2個以上の第1級アミンを呈し、
b)シェル体(102)が20マイクロモル/ml未満の第1級アミンしか含まない、
生物粒子の精製用の分離マトリックスであって、
該マトリックスは、10mS/cm以上の導電率を有する水性緩衝液中でマトリックス1ml当たり20mg以上のオボアルブミンを結合することができる、分離マトリックス。 - 多孔質コア体(101)とコア体(101)を覆う多孔質シェル体(102)とを有する複数の粒子(100)を含んでおり、
a)コア体(101)が、共有結合で結合したリガンド上に50マイクロモル/ml以上の第1級アミンを含んでいて、リガンド1個当たり2個以上の第1級アミンを呈し、
b)シェル体(102)が20マイクロモル/ml未満の第1級アミンしか含まない、
生物粒子の精製用の分離マトリックスであって、
a)リガンドが第2級又は第3級アミン結合を介してコア体(101)に結合する、
b)リガンドの窒素及び酸素原子含有量が20重量%以上である、
c)第1級アミン窒素の含有量が18重量%以上である、
d)第1級アミンと、窒素原子の合計量との比が、0.5以上である、
e)リガンドがトリス(2−アミノエチル)アミン及びポリアリルアミンからなる群から選択され、アミンを介して結合している、および/または
f)リガンドが、分子量1kDa以上のポリアリルアミンを含む、選択的にはポリアリルアミンが非架橋型である、分離マトリックス。 - 多孔質コア体(101)とコア体(101)を覆う多孔質シェル体(102)とを有する複数の粒子(100)を含んでおり、
a)コア体(101)が、共有結合で結合したリガンド上に50マイクロモル/ml以上の第1級アミンを含んでいて、リガンド1個当たり2個以上の第1級アミンを呈し、
b)シェル体(102)が20マイクロモル/ml未満の第1級アミンしか含まない、
生物粒子の精製用の分離マトリックスであって、
c)シェル体(102)が1〜10μmの平均厚さを有する、
d)シェル体(102)が、粒子(100)の直径又は球相当径の0.5〜6%の平均厚さを有する、
e)シェル体(102)が、球状タンパク質に対して60〜1000kDaの分子量カットオフを有する、および/または、
f)粒子(100)が実質的に球形である
分離マトリックス。 - 10mS/cm以上の導電率を有する水性緩衝液中でマトリックス1ml当たり20mg以上のオボアルブミンを結合することができる、請求項2又は3記載の分離マトリックス。
- a)リガンドが第2級又は第3級アミン結合を介してコア体(101)に結合する、
b)リガンドの窒素及び酸素原子含有量が20重量%以上である、
c)第1級アミン窒素の含有量が18重量%以上である、
d)第1級アミンと、窒素原子の合計量との比が、0.5以上である、
e)リガンドがトリス(2−アミノエチル)アミン及びポリアリルアミンからなる群から選択され、アミンを介して結合している、および/または
f)リガンドが分子量1kDa以上のポリアリルアミンを含む、選択的にはポリアリルアミンが非架橋型である、
請求項3に記載の分離マトリックス。 - a)リガンドが第2級又は第3級アミン結合を介してコア体(101)に結合する、
b)リガンドの窒素及び酸素原子含有量が20重量%以上である、
c)第1級アミン窒素の含有量が18重量%以上である、
d)第1級アミンと、窒素原子の合計量との比が、0.5以上である、
e)リガンドが、トリス(2−アミノエチル)アミン及びポリアリルアミンからなる群から選択され、アミンを介して結合している、および/または
f)リガンドが、分子量1kDa以上のポリアリルアミンを含む、選択的にはポリアリルアミンが非架橋型である、且つ
g)シェル体(102)が1〜10μmの平均厚さを有する、
h)シェル体(102)が、粒子(100)の直径又は球相当径の0.5〜6%の平均厚さを有する、
i)シェル体(102)が、球状タンパク質に対して60〜1000kDaの分子量カットオフを有する、および/または
j)粒子(100)が実質的に球形である
請求項1記載の分離マトリックス。 - 生物粒子の精製方法であって、
a)請求項1乃至請求項6のいずれか1項記載の分離マトリックスを用意する工程と、
b)前記マトリックスを、生物粒子及び1種以上の夾雑タンパク質を含む液体に、夾雑タンパク質がマトリックスに結合するように接触させる工程と、
c)液体をマトリックスから分離し、精製生物粒子とともに液体を回収する工程と、
を含む、生物粒子の精製方法。 - 液体が10mS/cm以上の導電率を有する、請求項7記載の方法。
- d)有機溶媒を15%未満の割合で含む再生液にマトリックスを接触させることによってマトリックスを再生する工程と、
e)工程a)〜c)を1回以上繰り返す工程と
をさらに含む、請求項7又は請求項8記載の方法。 - a)再生液はアルカリを含む、
b)工程d)の後のマトリックス中の残留タンパク質含有量が100μg/ml未満である、
c)生物粒子がウイルス、ウイルス様粒子、細胞、オルガネラ、及びプラスミドからなる群から選択される、
d)少なくとも40mg/ml以上の上記夾雑タンパク質がマトリックスと結合する、
e)液体は、緩衝物質を含み、選択的には、緩衝カチオン及び/又は1価の緩衝アニオンを含み、および/または
f)液体のpHは6.0〜8.5である
請求項9記載の方法。 - 夾雑タンパク質はアルブミンであり、生物粒子はインフルエンザウイルスを含み、液体は受精卵に由来する尿膜腔液を含む請求項7乃至10のいずれか1項に記載の方法。
- 請求項1乃至6のいずれか1項に係る分離マトリックスの製造方法であって、
a)複数の多孔質多糖粒子を提供する工程と、
b)共有結合によって上記粒子に結合した、少なくとも50マイクロモル/mlのアリル基を得るために、上記粒子をアリル化剤と反応させる工程と、
c)上記粒子を最長30分の期間にわたってハロゲンと反応させ、その後、アルカリ性水溶液と反応させる工程と、
d)複数の第1級アミンを含むリガンド前駆体を残ったアリル基と結合させる工程と
を含む、方法。
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