JP6587190B2 - タイトジャンクション形成制御剤及び該制御剤を含む医薬組成物 - Google Patents
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Description
[式中、L、MおよびNは、水素原子、ヒドロキシ、ハロゲン原子、低級アルキル、ヒドロキシ(低級)アルキル、低級アルカノイルオキシまたはオキソであり、ここでLおよびMの少なくとも1つは水素以外の基であり、5員環は少なくとも1つの二重結合を有していてもよく;Aは、−CH3、または−CH2OH、−COCH2OH、−COOHまたはそれらの官能性誘導体であり;Bは、単結合、−CH2−CH2−、−CH=CH−、−C≡C−、−CH2−CH2−CH2−、−CH=CH−CH2−、−CH2−CH=CH−、−C≡C−CH2−または−CH2−C≡C−であり;Zは、
ここでR4およびR5は、水素、ヒドロキシ、ハロゲン、低級アルキル、低級アルコキシまたはヒドロキシ(低級)アルキルであり、R4およびR5が同時にヒドロキシおよび低級アルコキシであることはなく;
R1は、非置換、またはハロゲン、低級アルキル、ヒドロキシ、オキソ、アリールまたは複素環基により置換された、二価の飽和または不飽和の低または中級の脂肪族炭化水素残基であり、脂肪族炭化水素中の少なくとも1つの炭素原子は所望により酸素、窒素または硫黄により置換されており;そして
Raは、非置換、またはハロゲン、オキソ、ヒドロキシ、低級アルキル、低級アルコキシ、低級アルカノイルオキシ、シクロ(低級)アルキル、シクロ(低級)アルキルオキシ、アリール、アリールオキシ、複素環基または複素環オキシ基により置換された、飽和または不飽和の低または中級の脂肪族炭化水素残基;低級アルコキシ;低級アルカノイルオキシ;シクロ(低級)アルキル;シクロ(低級)アルキルオキシ;アリール;アリールオキシ;複素環基;複素環オキシ基である]。
(3)前記化合物がクローディンの細胞内への取り込みを防ぐことでタイトジャンクションの形成を制御する上記(1)又は(2)に記載のタイトジャンクション形成制御剤。
(4)上記(1)〜(3)の何れか一に記載のタイトジャンクション形成制御剤を含む医薬組成物。
Protein Data Bank(PDB)からmLNX1p80のPDZ2ドメインのPDBファイル(PDB ID:3VQF)、化合物のデータベースZINC(http:www.zinc.docking.org)およびLigandBox(http:www.ligandbox.protein.osaka−u.ac.jp/ligandbox/)からリガンドファイル(MOL2ファイル)を入手した。タンパク質−リガンド・ドッキングソフトウェアGOLD Suiteに付属する分子ビューワーHermesを立ち上げ、GOLDのWizardを選択し、Load Proteinボタンで目的タンパク質のPDBファイルを開き、その後は、マニュアルにしたがって、操作をした。なお、mLNX1PDZ2とドッキングする化合物の検索は、入手したリガンドファイルからランダムに抽出したZINC由来の化合物約24万件、およびLigandBox由来の化合物約24万件から行った。以下に、候補化合物リストを記載する。なお、式(4)〜(32)、式(33−1)〜(33−11)、式(34−1)〜(34−14)、式(35−1)〜(35−2)、式(36−1)〜(36−2)で表す化合物はナミキ商事株式会社から購入することができる。
GE Healthcare社から購入したpGEX−6P−3プラスミドから作製したpGEX−6P3−Pプラスミド(天野剛志 他,“高効率かつ高速な融合タンパク質発現ベクターの構築法”、2006、実験医学. 24、1675−1680参照)に、mLNX1PDZ2(UniProt ID:O70263から入手したアミノ酸配列のアミノ酸番号381−467)をコードしているDNA断片(UniProtからリンクされているENA ID:AF03745.1の塩基番号1338−1598)を接続した。さらに紫外線吸収向上のため、上記mLNX1PDZ2断片の12塩基上流にチロシン残基を挿入するための3塩基(配列:TAT)を点変異により組み込んだmLNX1PDZ2のグルタチオン−S−トランスフェラーゼ(GST)融合タンパク質の発現プラスミド(pGEX−6P3−P mLNX1PDZ2+Y1)を作製し、大腸菌BL21(DE3)に形質転換し、15N標識したM9培地(1L:Na2HPO4・12H2O 17.91g, KH2PO4 2.99g、 NaCl 0.5g、 thymidine 20mg、 adenosine 20mg、 guanosine 20mg、 cytidine 20mg、 thiamine 20mg、 biotin 20mg、 10mM FeCl3 330μl、 1M MgSO4 1ml、 50mM MnCl2 1ml、 50mM CaCl2 2ml、 80% glyserol 1.4ml、 50mg/ml ampicillin 1ml、 glucose 4g, 15NH4Cl 0.5g)中で、1mM IPTGによる発現誘導後、20℃で一晩培養した。培養後、Beckman Coulter(J6−M1 Centrifuge)で遠心し(4000rpm、 15min、 4℃)、集菌した。
菌体に破砕バッファー(50mM Tris−HCl、 150mM NaCl、 pH7.0、菌体1gに対し約10ml)を加え、懸濁し、Bioruptorで超音波破砕した(on time 30sec/off time 30sec、 total 10min×4回)。破砕後、Hitachi High−Speed Refrigerated Centrifuges(himac CR22G)で遠心し(18000rpm、 20min、 4℃)、上清を回収した。上清をDEAEカラム(GE Healthcare)、GST−acceptカラム(nacalai tesque)に通し、GST融合タンパク質を樹脂に吸着させた。カラム上にPreScission protease 200μlを加え、4℃で一晩インキュベートし、GSTタグを切断した。切断後、PreScission cleavageバッファー(50 mM Tris−HCl、 150mM NaCl、 pH7.0)で目的タンパク質を溶出した。得られたタンパク質溶液は、Microsep 1K Centrifugal Devices(PALL)を用いた遠心(ROTANTA 460R)により濃縮し、AKTApriime plus(GE Healthcare)を用いてゲル濾過(50mM Tris−HCl、 100mM NaCl、 pH7.0)を行った。透析を行い、凍結乾燥により濃縮した後、NMRバッファー(20mM MOPS、 150mM NaCl、 50mM MgSO4、pH6.8)に透析し、15N−mLNX1PDZ2サンプルとした。
次に、13C/15N標識したmLNX1PDZ2サンプル(約0.9mM)を用いて、1H/15N−HSQC、HNCACB、CBCA(CO)NH、HNCA、HN(CO)CA、HN(CA)CO、HNCOスペクトルを測定し、Sparky 3.114を用いて連鎖帰属法により主鎖の帰属を行った。1H−15N HSQCスペクトル上でpeak pickを行った後、対応するピークをHNCACB、CBCA(CO)NHスペクトル上で抽出し、stripを作成した。作成したstripを並べ替えることにより帰属を行った。HNCA/HN(CO)CA、HN(CA)CO/HNCOスペクトルも同様にしてstripを作成し、帰属を確定させた。また、自動帰属ソフトウェアMARS 1.2を用いて、帰属の確認を行った。NMR測定は、Bruker社AvanceIII 600 MHz デジタルNMR装置を用いた。更に、15N標識した培地でmLNX1PDZ2の発現中に14Nアミノ酸を加えると、そのアミノ酸残基のNMRシグナルが消失する現象に基づくインバースラベル法を用いて帰属の確認を行ったところ、帰属した結果はほぼ正確であると確認できた。
<実施例1>
15N標識したmLNX1PDZ2(約0.1mM)に、式(13)の化合物(終濃度0.2mM、DMSO終濃度5%)を添加し、1H−15N HSQCスペクトルを測定した。Sparky 3.114を用いて得られたスペクトルを解析した後、シグナルの化学シフト変化から、mLNX1PDZ2と化合物の結合を確認した。なお、測定には、Bruker社AvanceIII 600 MHz デジタルNMR装置を用いた。
式(13)の化合物を添加しなかった以外は、実施例1と同様に1H−15N HSQCスペクトルを測定した。
式(13)の化合物に換え、式(14)の化合物(終濃度1.0mM、DMSO終濃度5%)を添加した以外は、実施例1と同様にスペクトル解析した。
式(13)に表す化合物に換え、式(4)〜(12)及び式(15)〜(17)に表す化合物を用いた以外は、実施例1と同様にスペクトル解析し比較例1のスペクトルと対比した。しかしながら、何れの化合物もスペクトルのシグナル変化は見られなかった。
<実施例3>
次に、NMRでmLNX1PDZ2に結合することが確認された式(13)で表される化合物について、イヌ腎臓尿細管上皮細胞を用いてタイトジャンクション形成に与える影響についてアッセイを行った。アッセイは、MDCK−II細胞(Madin−Darby Canine Kidny StrainII;本研究では神戸大学大学院医学研究科細胞生物学の古瀬幹夫教授から入手した細胞を用いたが、DSファーマバイオメディカル株式会社からも購入可能である。)を用い、下記[免疫染色]に記載されている手順で行った。また、MDCK−II細胞に関して、内在性LNX1が発現しているのか否かについても確認を行った。内在性LNX1の発現の確認は、下記[Western blotting]に記載されている手順、及び下記[免疫染色]において、化合物を添加せず、化合物添加後の48h培養をしなかった以外は[免疫染色]と同様の手順で行った。
カバーガラスを入れた6 well dishに細胞を播種し、CO2インキュベータで一晩培養した。培地をアスピレーターで吸引した後、DMEM(+10%FBS、1%Pen/Str)培地1mlと調整した式(13)で表される化合物1mlを加え(終濃度100μM、DMSO終濃度0.1%)、CO2インキュベータで48h培養した。培養後、培地をアスピレーターで吸引し、無血清DMEM培地を1ml加え、アスピレーターで吸引した(×2回)。冷メタノールを1ml加え、−20℃で20分静置した。新しい6 well dishにPBSを2ml加え、その中にカバーガラスを入れて洗浄した。PBSをP−1000ピペットマンで吸い出し、新たにPBSを1ml加えて洗浄した(×2回)。PBSを吸い出した後、ブロッキング溶液(5%スキムミルク溶液)を1ml加えて、室温で1hインキュベートした。スキムミルク溶液で希釈した100μlの一次抗体溶液の上に、固定した細胞面が下になるようにカバーガラスをかぶせ、4℃で一晩インキュベートした。翌日、6 well dishにPBSを1ml加え、その中にカバーガラスを入れて洗浄した。PBSをP−1000ピペットマンで吸い出し、新たにPBSを1ml加えて洗浄した(×2回)。スキムミルク溶液で希釈した100μlの二次抗体溶液の上に、固定した細胞面が下になるようにカバーガラスをかぶせ、室温で1hインキュベートした。6 well dishにPBSを1ml加え、その中にカバーガラスを入れて洗浄した。PBSをP−1000ピペットマンで吸い出し、新たにPBSを1ml加えて洗浄した(×2回)。封入剤10μlをスライドガラスの上に滴下し、その上にカバーガラスをかぶせた。遮光し、翌日OLYMPUS社の顕微鏡IX71を用いて検鏡した。なお、露光時間は固定して撮影した(1/5sec)。
なお、一次抗体には、Rabbit anti−Claudin−2 antibody(51−6100、invitrogen)をスキムミルク溶液で250倍に希釈したもの、及びRabbit anti−LNX1 antibody (AV473367、Sigma−Aldrich)をスキムミルク溶液で100倍に希釈したものを用いた。
また、二次抗体には、Anti−Rabbit IgG(whole molecule),F(ab’)2 fragment−Cy3 antibody(C2306、Sigma−Aldrich)をスキムミルク溶液で500倍に希釈したもの、及びAnti−Rabbit IgG(whole molecule), F(ab’)2 fragment−FITC antibody (F1262、Sigma−Aldrich)をスキムミルク溶液で200倍に希釈したものを用いた。
細胞を6well plateに播種し、CO2インキュベータで培養した。培地をアスピレーターで吸引し、PBS 1mlで洗浄した(×2回)。SDS−Sample bufferを適量加え、セルスクレーパーでかきとった。Bioruptorで2min超音波破砕した後、95℃で3min加熱し、サンプルとした。
サンプルはSDS−PAGEで分離し、そのゲルをB液(tris(hydroxymethyl)aminomethane 0.30g、 methanol 5ml、 MilliQ、 total 100ml)に浸した。PVDF膜(AE−6668、ATTO)は100%methanolに約20sec浸した後、B液中に30min以上浸透させた。濾紙(CB−06A、ATTO)はA液(tris(hydroxymethyl)aminomethane 1.82g、 methanol 2.5ml、 MilliQ、 total 50ml)に2枚、B液に1枚、C液(6−aminocaproic acid 0.26g、 tris(hydroxymethyl)aminomethane 0.15g、 methanol 2.5ml、 MilliQ、 total 50ml)に3枚浸した。コンパクトブロットAE−7500(ATTO)の陽極板に濾紙、PVDF膜、ゲルを重ねた後、陰極をセットし、通電することによりタンパク質をPVDF膜に移行させた。PVDF膜をblocking agent(5%スキムミルク、 0.1%Tween20 in PBS)に浸し、室温で1h振とうさせた。PVDF膜をblocking agentで希釈した一次抗体溶液に浸し、4℃で一晩インキュベートした。PDVF膜をwash buffer(1×TBS、0.1%Tween20)に浸し、5min振とうさせて(×4回)洗浄した後、blocking agentで希釈した二次抗体溶液に浸し、室温で1hインキュベートした。PDVF膜をwash bufferに浸し、5min振とうさせて(×4回)洗浄した。PDVF膜上にChemi−Lumi One Super(nacalai tesque)をかけ、インキュベートし、LAS−3000miniで検出した。
なお、一次抗体には、Rabbit anti−LNX1 antibody(AV473367、Sigma−Aldrich)を用い、blocking agentで1000倍に希釈したものを用いた。
また、二次抗体には、Anti−Rabbit IgG HRP(W401B、Promega)を用い、blocking agentで10000倍に希釈したものを用いた。
図10(1)は、上記〔Western blotting〕により得られた写真である。また、図10(2)は、上記〔免疫染色〕において、化合物を添加せず、添加後の48h培養をしなかった以外は同様の手順で免疫染色した写真である。
図11(1)は、実施例3で得られた免疫染色の写真である。
式(13)で表される化合物に換え、実施例4として式(14)、実施例5として式(30)、実施例6として式(33−3)、実施例7として式(34−9)で表される化合物を用いた以外は実施例3と同様の手順で免疫染色を行った。図11(2)は実施例4、図11(3)は実施例5、図11(4)は実施例6、図11(5)は実施例7で得られた免疫染色の写真である。
式(13)で表される化合物を添加しなかった以外は実施例3と同様の手順で免疫染色を行った。図11(6)は、比較例14で得られた免疫染色の写真である。
<ヒト> ID:Q8TBB1のアミノ酸番号377−463(87配列)
<マウス> ID:O70263のアミノ酸番号381−467(87配列)
<イヌ> ID:E2RBE8のアミノ酸番号381−467(87配列)
ヒト、マウス、イヌのLNX1PDZ2ドメインのアミノ酸配列(上記87配列)の相同性は、ヒトとマウスは95%、ヒトとイヌは94%、マウスとイヌは94%と非常に高かった。また、クローディンが相互作用する面に位置するアミノ酸の配列(上記87配列の18番目のグリシン〜23番目のアルギニン、及び66番目のプロリン〜74番目のグルタミン)は、ヒト、マウス、イヌで完全に一致していた。したがって、式(13)及び(14)で表される化合物は、ヒトのタイトジャンクション形成の制御にも用いることができる。
Claims (4)
- 下記式(14)、(30)及び(34−9)で表される化合物を少なくとも一種含むタイトジャンクション形成制御剤。
- 前記化合物が、式(14)で表される化合物である請求項1に記載のタイトジャンクション形成制御剤。
- 前記化合物がクローディンの細胞内への取り込みを防ぐことでタイトジャンクションの形成を制御する請求項1又は2に記載のタイトジャンクション形成制御剤。
- 請求項1〜3の何れか一項に記載のタイトジャンクション形成制御剤を含む医薬組成物。
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