JP6389163B2 - フィロウイルスコンセンサス抗原、核酸構築物、およびそれから作製されるワクチン、ならびにその使用方法 - Google Patents

フィロウイルスコンセンサス抗原、核酸構築物、およびそれから作製されるワクチン、ならびにその使用方法 Download PDF

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Description

発明の分野
本発明は、免疫応答を誘導するため、およびフィロウイルス感染を予防するため、および/またはフィロウイルスに感染した、具体的には、マールブルグウイルス、エボラウイルス・スーダン、およびエボラウイルス・ザイールによる感染に感染した個体を治療するためのワクチンに関する。本発明は、コンセンサスフィロウイルスタンパク質、具体的には、マールブルグウイルス、エボラウイルス・スーダン、およびエボラウイルス・ザイールフィロウイルスタンパク質、ならびにそれらをコードする核酸分子に関する。
発明の背景
フィロウイルス科は、2つの多岐的な属、マールブルグウイルス(MARV)およびエボラウイルス(EBOV)を含有する、非分割型の一本鎖RNAウイルスである。この各々からのメンバーは、深刻で高度に致死的な出血熱病を引き起こす可能性があり、それに対する治療または認可されたワクチンは存在しない(Bradfute S.B.,et al.(2011)Filovirus vaccines.Hum Vaccin 7:701−711、Falzarano D.,et al.(2011)Progress in filovirus vaccine development:evaluating the potential for clinical use.Expert Rev Vaccines 10:63−77、Fields B.N.,et al.(2007)Fields’virology.Philadelphia:Lippincott Williams&Wilkins.2v.(xix,3091,I−3086p.)、Richardson J.S.,et al.(2009)Enhanced protection against Ebola virus mediated by an improved adenovirus−based vaccine.PLoS One 4:e5308、およびTowner J.S.,et al.(2006)Marburgvirus genomics and association with a large hemorrhagic fever outbreak in Angola.J Virol 80:6497−6516)。
最大90%の致命率のため、これらは世界保健機関によって「人類にとって最も有毒な既知のウイルス性疾患のうちの1つ」として記載されている。アメリカ疾病予防管理センターは、一部には武器として利用された場合の国家の安全に対するその潜在的脅威のため、これらを「カテゴリA生物テロ薬剤」と分類している(Burki T.K.(2011)USA focuses on Ebola vaccine but research gaps remain.Lancet 378:389)。これらの「優先度の高い」薬剤は、理論上、容易に伝染し、高い致死率をもたらし、公衆衛生上の 大きな衝撃およびパニックを引き起こし、公衆衛生の備えに対する特別な行動を要する可能性がある(CDC(2011)Bioterrorism Agents/Diseases.Atlanta:Centers for Disease Control and Prevention)。
出血熱病は、保菌者状態を伴わない急性感染性であるが、ただし汚染された体液、血液、および組織との直接接触によってヒトおよび非ヒト霊長類に容易に伝染可能である(Feldmann H.,et al.(2003)Ebola virus:from discovery to vaccine.Nat Rev Immunol 3:677−685)。発生状況において、医療機器の再使用、資源の限られた医療施設、および予防対策の遅れは、疾患の伝染を上昇させ、医療機関における感染を増幅させる。
これらの人畜共通病原体の自然宿主は、アフリカコウモリおよびブタである可能性が高く(Kobinger G.P.,et al.(2011)Replication,pathogenicity,shedding,and transmission of Zaire ebolavirus in pigs.J Infect Dis 204:200−208)、後者はより感染を増幅させる宿主である可能性があり、発生開始時にウイルスが初めに出現する様式は、感染した動物と接触したヒトを通じて生じると考えられている。フィリピン、潜在的にヨーロッパ、また主にアフリカにおけるこの疾患の予測不可能な流行の浮上は更に、大きな公衆衛生上の問題を構成する(Outbreak news.(2009)Ebola Reston in pigs and humans,Philippines.Wkly Epidemiol Rec 84:49−50)。
齧歯動物の前臨床研究における実験を含む、防御効果および広範なCTLを誘導するワクチンの能力を決定するために、実験が実施されている。Fenimore PW,et al.(2012).Designing and testing broadly−protective filoviral vaccines optimized for cytotoxic T−lymphocyte epitope coverage.PLoS ONE 7:e44769、Hensley LE,et al.(2010).Demonstration of cross−protective vaccine immunity against an emerging pathogenic Ebolavirus Species.PLoS Pathog 6:el000904、Zahn R,et al(2012).Ad35 and ad26 vaccine vectors induce potent and cross−reactive antibody and T−cell responses to multiple filovirus species.PLoS ONE 7:e44115、Geisbert TW,Feldmann H(2011).Recombinant vesicular stomatitis virus−based vaccines against Ebola and Marburg virus infections.J Infect Dis 204 Suppl 3:S1075−1081、およびGrant−Klein RJ,Van Deusen NM,Badger CV,Hannaman D,Dupuy LC,Schmaljohn CS(2012).A multiagent filovirus DNA vaccine delivered by intramuscular electroporation completely protects mice from ebola and Marburg virus challenge.Hum Vaccin Immunother 8、Grant−Klein RJ,Altamura LA,Schmaljohn CS(2011).Progress in recombinant DNA−derived vaccines for Lassa virus and filoviruses.Virus Res 162: 148−161)。
ワクチン誘導適応免疫応答は、多数の前臨床動物モデルにおいて記載されている(Blaney JE,et al.(2011).Inactivated or live−attenuated bivalent vaccines that confer protection against rabies and Ebola viruses.J Virol 85:10605−10616、Dowling W,et al.(2007).Influences of glycosylation on antigenicity,immunogenicity,and protective efficacy of ebola virus GP DNA vaccines.J Virol 81:1821−1837、Jones SM,et al.(2005).Live attenuated recombinant vaccine protects nonhuman primates against Ebola and Marburg viruses.Nat Med 11:786−790、Kalina WV,Warfield KL,Olinger GG,Bavari S(2009).Discovery of common marburgvirus protective epitopes in a BALB/c mouse model.Virol J 6:132、Kobinger GP,et al.(2006).Chimpanzee adenovirus vaccine protects against Zaire Ebola virus.Virology 346:394−401、Olinger GG,et al.(2005).Protective cytotoxic T−cell responses induced by Venezuelan equine encephalitis virus replicons expressing Ebola virus proteins.J Virol 79:14189−14196、Rao M,Bray M,Alving CR,Jahrling P,Matyas GR(2002).Induction of immune responses in mice and monkeys to Ebola virus after immunization with liposome−encapsulated irradiated Ebola virus: protection in mice requires CD4(+) T cells.J Virol 76:9176−9185、Rao M,Matyas GR,Grieder F,Anderson K,Jahrling PB,Alving CR(1999).Cytotoxic T lymphocytes to Ebola Zaire virus are induced in mice by immunization with liposomes containing lipid A.Vaccine 17:2991−2998、Richardson JS,et al.(2009).Enhanced protection against Ebola virus mediated by an improved adenovirus−based vaccine.PLoS One 4:e5308、Vanderzanden L,et al(1998).DNA vaccines expressing either the GP or NP genes of Ebola virus protect mice from lethal challenge.Virology 246:134−144、Warfield KL,et al.(2005).Induction of humoral and CD8+ T cell responses are required for protection against lethal Ebola virus infection.J Immunol 175:1184−1191、Jones SM,et al.(2007).Assessment of a vesicular stomatitis virus−based vaccine by use of the mouse model of Ebola virus hemorrhagic fever.J Infect Dis 196 Suppl2:S404−412 Grant−Klein RJ,Van Deusen NM,Badger CV,Hannaman D,Dupuy LC,Schmaljohn CS(2012).A multiagent filovirus DNA vaccine delivered by intramuscular electroporation completely protects mice from ebola and Marburg virus challenge.Hum Vaccin Immunother 8.、Geisbert TW,et al.(2010).Vector choice determines immunogenicity and potency of genetic vaccines against Angola Marburg virus in nonhuman primates.J Virol 84:10386−10394)。ウイルスワクチンは有望であり、主に組み換えアデノウイルスおよび水胞性口炎ウイルスを含む。組み換えDNAおよびAg共役型ウイルス様粒子(VLP)ワクチンなどの非感染性戦略もまた、実証されたレベルの前臨床有効性を有し、概してウイルスベースプラットフォームより安全であると考えられている。ウイルス特異性Abは、受動的に適用される場合、感染前かまたは感染直後かに適用されるときに防御となり得る(Gupta M,Mahanty S,Bray M,Ahmed R,Rollin PE(2001).Passive transfer of antibodies protects immunocompetent and imunodeficient mice against lethal Ebola virus infection without complete inhibition of viral replication.J Virol 75:4649−4654、Marzi A,et al.(2012).Protective efficacy of neutralizing monoclonal antibodies in a nonhuman primate model of Ebola hemorrhagic fever.PLoS ONE 7:e36192、Parren PW,Geisbert TW,Maruyama T,Jahrling PB,Burton DR(2002).Pre− and postexposure prophylaxis of Ebola virus infection in an animal model by passive transfer of a neutralizing human antibody.J Virol 76:6408−6412、Qiu X,et al.(2012).Ebola GP−Specific Monoclonal Antibodies Protect Mice and Guinea Pigs from Lethal Ebola Virus Infection.PLoSNegl Trop Dis 6: el575、Wilson JA,et al.(2000).Epitopes involved in antibody−mediated protection from Ebola virus.Science 287:1664−1666、Sullivan NJ,et al.(2011).CD8(+)cellular immunity mediates rAd5 vaccine protection against Ebola virus infection of nonhuman primates.Nat Med 17:1128−1131、Bradfute SB,Warfield KL,Bavari S(2008).Functional CD8+ T cell responses in lethal Ebola virus infection.J Immunol 180:4058−4066、Warfield KL,Olinger GG(2011).Protective role of cytotoxic T lymphocytes in filovirus hemorrhagic fever.J Biomed Biotechnol 2011:984241)。T細胞はまた、ノックアウトマウスにおいて実施された研究、NHPにおける枯渇研究、および有効性が養子移入CD8+T細胞の溶解機能に大きく関連したマウス養子移入研究を基に、防御を提供することが示されている。しかしながら、防御ワクチンによって駆動されるようなこの応答の関連分析はほとんど報告されていない。
対策の発展は最終的には、防御的免疫相関物およびそれらが感染中にいかに調節されるかについての向上された理解を必要とするであろう。これは、フィロウイルス性疾患に罹患した感染個体が早期の免疫応答を行うことができないときに、困難であると分かる。これらの動きの速い出血熱病は、ウイルス特異性Ab応答の欠失によって示されるような免疫調節異常、および総T細胞数の著しい低減をもたらし、制御されていないウイルス複製ならびに多臓器感染および不全につながる。反対に、エボラウイルス(EBOV)疾患の生存者は、早期で一時的なIgM応答を示し、その後直ちにウイルス特異性IgGおよびCTLのレベルの増加が続く。これらの観察は、液性および細胞媒介免疫応答が、疾患への防御の付与に貢献することを示唆している。これらのデータはまた、致死的攻撃への防御に対するワクチン誘導適応免疫の寄与を実証する多数の前臨床有効性研究によっても支持されている。しかしながら、山のような証拠は、防御の提供におけるT細胞の決定的役割を実証しており、有効性はCD8+T細胞の機能的表現型に大きく関連している。これらの最近の研究は、防御の提供におけるT細胞の重要性を強調しているが、それらの明確な寄与は特徴付けられておらず、議論の余地が残るままである。更に、防御ワクチンによって駆動されるこの応答の詳細な分析はほとんど報告されていない。
発明の概要
コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列、コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列、およびマールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む組成物が提供される。コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列は、配列番号1(ZEBOV CON)、配列番号1のフラグメント、配列番号1に相同なアミノ酸配列、または配列番号1に相同なアミノ酸配列のフラグメントであってもよい。配列番号1に相同なアミノ酸配列は、典型的には配列番号1に95%以上、96%以上、97%以上、99%以上、または99%以上相同である。配列番号1のフラグメントまたは配列番号1に相同なアミノ酸配列のフラグメントは、典型的には600個以上、630個以上、または660個以上のアミノ酸である。コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列は、配列番号2(SUDV CON)、配列番号2のフラグメント、配列番号2に相同なアミノ酸配列、または配列番号2に相同なアミノ酸配列のフラグメントであってもよい。配列番号1に相同なアミノ酸配列は、典型的には配列番号2に95%以上、96%以上、97%以上、99%以上、または99%以上相同である。配列番号2のフラグメントまたは配列番号2に相同なアミノ酸配列のフラグメントは、典型的には600個以上、630個以上、または660個以上のアミノ酸である。マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列は、配列番号3(MARV ANG)、配列番号3のフラグメント、配列番号3に相同なアミノ酸配列、または配列番号3に相同なアミノ酸配列のフラグメントであってもよい。配列番号3に相同なアミノ酸配列は、典型的には配列番号3に95%以上、96%以上、97%以上、99%以上、または99%以上相同である。配列番号3のフラグメントまたは配列番号3に相同なアミノ酸配列のフラグメントは、典型的には600個以上、637個以上、または670個以上のアミノ酸である。アミノ酸配列は所望により、IgEリーダーなどのリーダー配列を含んでもよい。
コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列、コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列、マールブルグマールブルグウイルス第1のコンセンサスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列、マールブルグマールブルグウイルス第2のコンセンサスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列、およびマールブルグマールブルグウイルス第3のコンセンサスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む組成物も、提供される。コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列は、配列番号1(ZEBOV CON)、配列番号1のフラグメント、配列番号1に相同なアミノ酸配列、または配列番号1に相同なアミノ酸配列のフラグメントであってもよい。配列番号1に相同なアミノ酸配列は、典型的には配列番号1に95%以上、96%以上、97%以上、99%以上、または99%以上相同である。配列番号1のフラグメントまたは配列番号1に相同なアミノ酸配列のフラグメントは、典型的には600個以上、630個以上、または660個以上のアミノ酸である。コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列は、配列番号2(SUDV CON)、配列番号2のフラグメント、配列番号2に相同なアミノ酸配列、または配列番号2に相同なアミノ酸配列のフラグメントであってもよい。配列番号1に相同なアミノ酸配列は、典型的には配列番号2に95%以上、96%以上、97%以上、99%以上、または99%以上相同である。配列番号2のフラグメントまたは配列番号2に相同なアミノ酸配列のフラグメントは、典型的には600個以上、630個以上、または660個以上のアミノ酸である。マールブルグマールブルグウイルス第1のコンセンサスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列は、配列番号4(MARV RAV)、配列番号4のフラグメント、配列番号4に相同なアミノ酸配列、または配列番号4に相同なアミノ酸配列のフラグメントであってもよい。配列番号4に相同なアミノ酸配列は、典型的には配列番号4に95%以上、96%以上、97%以上、99%以上、または99%以上相同である。配列番号4のフラグメントまたは配列番号4に相同なアミノ酸配列のフラグメントは、典型的には600個以上、637個以上、または670個以上のアミノ酸である。マールブルグマールブルグウイルス第2のコンセンサスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列は、配列番号5(MARV OZO)、配列番号5のフラグメント、配列番号5に相同なアミノ酸配列、または配列番号5に相同なアミノ酸配列のフラグメントであってもよい。配列番号5に相同なアミノ酸配列は、典型的には配列番号4に95%以上、96%以上、97%以上、99%以上、または99%以上相同である。配列番号5のフラグメントまたは配列番号5に相同なアミノ酸配列のフラグメントは、典型的には600個以上、637個以上、または670個以上のアミノ酸である。マールブルグマールブルグウイルス第3のコンセンサスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列は、配列番号6(MARV MUS)、配列番号6のフラグメント、配列番号6に相同なアミノ酸配列、または配列番号6に相同なアミノ酸配列のフラグメントであってもよい。配列番号6に相同なアミノ酸配列は、典型的には配列番号6に95%以上、96%以上、97%以上、99%以上、また99%以上相同である。配列番号6フラグメントまたは配列番号6に相同なアミノ酸配列のフラグメントは、典型的には600個以上、637個以上、または670個以上のアミノ酸である。アミノ酸配列は所望により、IgEリーダーなどのリーダー配列を含んでもよい。幾つかの実施形態では、組成物は更に、マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む。マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列は、配列番号3(MARV ANG)、配列番号3のフラグメント、配列番号3に相同なアミノ酸配列、または配列番号3に相同なアミノ酸配列のフラグメントであってもよい。配列番号3に相同なアミノ酸配列は、典型的には配列番号3に95%以上、96%以上、97%以上、99%以上、または99%以上相同である。配列番号3のフラグメントまたは配列番号3に相同なアミノ酸配列のフラグメントは、典型的には600個以上、637個以上、または670個以上のアミノ酸である。アミノ酸配列は所望により、IgEリーダーなどのリーダー配列を含んでもよい。
コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列、およびコンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む組成物も提供される。コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列は、配列番号1(ZEBOV CON)、配列番号1のフラグメント、配列番号1に相同なアミノ酸配列、または配列番号1に相同なアミノ酸配列のフラグメントであってもよい。配列番号1に相同なアミノ酸配列は、典型的には配列番号1に95%以上、96%以上、97%以上、99%以上、または99%以上相同である。配列番号1のフラグメントまたは配列番号1に相同なアミノ酸配列のフラグメントは、典型的には600個以上、630個以上、または660個以上のアミノ酸である。コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列は、配列番号2(SUDV CON)、配列番号2のフラグメント、配列番号2に相同なアミノ酸配列、または配列番号2に相同なアミノ酸配列のフラグメントであってもよい。配列番号1に相同なアミノ酸配列は、典型的には配列番号2に95%以上、96%以上、97%以上、99%以上、または99%以上相同である。配列番号2のフラグメントまたは配列番号2に相同なアミノ酸配列のフラグメントは、典型的には600個以上、630個以上、または660個以上のアミノ酸である。アミノ酸配列は所望により、IgEリーダーなどのリーダー配列を含んでもよい。
コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列、コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列、およびマールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む組成物が提供される。コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列は、配列番号64、配列番号64のフラグメント、配列番号64に相同な核酸配列、または配列番号64に相同なヌクレオチド配列のフラグメントであってもよい。配列番号64に相同な核酸酸配列は、典型的には配列番号64に95%以上、96%以上、97%以上、99%以上、または99%以上相同である。配列番号64のフラグメントまたは配列番号64に相同なアミノ酸配列のフラグメントは典型的には、配列番号64によってコードされるコンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原の600個以上、630個以上、または660個以上のアミノ酸をコードする。コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列は、配列番号65、配列番号65のフラグメント、配列番号65に相同な核酸配列、または配列番号65に相同なヌクレオチド配列のフラグメントであってもよい。配列番号65に相同な核酸配列は、典型的には配列番号65に95%以上、96%以上、97%以上、99%以上、または99%以上相同である。配列番号65のフラグメントまたは配列番号65に相同なアミノ酸配列のフラグメントは典型的には、配列番号65によってコードされるコンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原の600個以上、630個以上、または660個以上のアミノ酸をコードする。マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列は、配列番号66、配列番号66のフラグメント、配列番号66に相同な核酸配列、または配列番号66に相同なヌクレオチド配列のフラグメントであってもよい。配列番号66に相同な核酸配列は、典型的には配列番号66に95%以上、96%以上、97%以上、99%以上、または99%以上相同である。配列番号66のフラグメントまたは配列番号66に相同なアミノ酸配列のフラグメントは典型的には、配列番号66によってコードされるマールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原の600個以上、630個以上、または670個以上のアミノ酸をコードする。核酸配列は所望により、免疫原をコードする配列に連結されるIgEリーダーなどのリーダー配列をコードする配列を含んでもよい。
異なる核酸配列のそれぞれは、単一の核酸分子上にあってもよく、それぞれ別の核酸分子上または様々な順列にあってもよい。核酸分子は、プラスミドであってもよい。
組成物は、電気穿孔を用いた個体への送達のために製剤化されてもよい。
組成物は、IL−12、IL−15、およびIL−28からなる群から選択される1個以上のタンパク質をコードする核酸配列を更に含んでもよい。
組成物は、フィロウイルスに対する免疫応答を誘導する方法において使用されてもよい。フィロウイルスは、マールブルグウイルス、エボラウイルス・スーダン、およびエボラウイルス・ザイールからなる群から選択されてもよい。
治療的に有効な量の組成物を個体に投与することを含む、フィロウイルスと診断された個体を治療する方法が提供される。フィロウイルスは、マールブルグウイルス、エボラウイルス・スーダン、およびエボラウイルス・ザイールからなる群から選択されてもよい。
個体のフィロウイルス感染を予防する方法が提供される。方法は、個体に予防的に有効な量の組成物を投与することを含む。フィロウイルスは、マールブルグウイルス、エボラウイルス・スーダン、およびエボラウイルス・ザイールからなる群から選択されてもよい。
コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原、第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、および第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原からなる群から選択される2個以上のタンパク質を含む組成物が提供される。
図1A〜1Cは、実施例1における多価ワクチン構築戦略および発現実験について述べる。図1Aは、MGP(上)、SGP(右下)、およびZGP(左下)に関する系統樹を示す。有意な支持値が、ブートストラップ解析によって検証され、(*)で示される。コンセンサス戦略が、ZGPおよびSGP免疫原(CONワクチン)に適用された。スケールバーは一部位あたりのアミノ酸の距離を表し、解析は、MEGAバージョン5ソフトウエアを用いて行った。GPトランス遺伝子は、商業的に合成され、遺伝的に最適化され、改変されたpVAX1哺乳動物発現ベクターへとサブクローニングされた。抗原発現は、HEK293T細胞のその後の形質移入をウエスタン免疫ブロット法およびFACSによって解析した。ウエスタン免疫ブロット法の結果が図1Bに示され、FACSの結果が図1Cに示される。比較対照のため、MGP、SGP、またはZGPを発現するrVSVを各GP 標本と同時に実施し、種特異性抗GP1 mAbを検出のために使用した。大きさが示される(kDa)。FACSのために、形質移入細胞は、マウス由来GP特異性血清試薬で間接的に染色され、その後広範囲に洗浄され、ヤギ抗マウスIgGおよびMHCクラスIが続いた。ウエスタン免疫ブロット法およびFACS実験は、少なくとも3回反復され、同様の結果が得られた。無根系統樹に関する有意性は、最大公算法によって決定され、ブートストラップ解析によって検証され、有意な支持値(≧80%;1,000ブートストラップ複製)は、MEGAバージョン5ソフトウエアによって決定された。 図1A〜1Cは、実施例1における多価ワクチン構築戦略および発現実験について述べる。図1Aは、MGP(上)、SGP(右下)、およびZGP(左下)に関する系統樹を示す。有意な支持値が、ブートストラップ解析によって検証され、(*)で示される。コンセンサス戦略が、ZGPおよびSGP免疫原(CONワクチン)に適用された。スケールバーは一部位あたりのアミノ酸の距離を表し、解析は、MEGAバージョン5ソフトウエアを用いて行った。GPトランス遺伝子は、商業的に合成され、遺伝的に最適化され、改変されたpVAX1哺乳動物発現ベクターへとサブクローニングされた。抗原発現は、HEK293T細胞のその後の形質移入をウエスタン免疫ブロット法およびFACSによって解析した。ウエスタン免疫ブロット法の結果が図1Bに示され、FACSの結果が図1Cに示される。比較対照のため、MGP、SGP、またはZGPを発現するrVSVを各GP 標本と同時に実施し、種特異性抗GP1 mAbを検出のために使用した。大きさが示される(kDa)。FACSのために、形質移入細胞は、マウス由来GP特異性血清試薬で間接的に染色され、その後広範囲に洗浄され、ヤギ抗マウスIgGおよびMHCクラスIが続いた。ウエスタン免疫ブロット法およびFACS実験は、少なくとも3回反復され、同様の結果が得られた。無根系統樹に関する有意性は、最大公算法によって決定され、ブートストラップ解析によって検証され、有意な支持値(≧80%;1,000ブートストラップ複製)は、MEGAバージョン5ソフトウエアによって決定された。 図1A〜1Cは、実施例1における多価ワクチン構築戦略および発現実験について述べる。図1Aは、MGP(上)、SGP(右下)、およびZGP(左下)に関する系統樹を示す。有意な支持値が、ブートストラップ解析によって検証され、(*)で示される。コンセンサス戦略が、ZGPおよびSGP免疫原(CONワクチン)に適用された。スケールバーは一部位あたりのアミノ酸の距離を表し、解析は、MEGAバージョン5ソフトウエアを用いて行った。GPトランス遺伝子は、商業的に合成され、遺伝的に最適化され、改変されたpVAX1哺乳動物発現ベクターへとサブクローニングされた。抗原発現は、HEK293T細胞のその後の形質移入をウエスタン免疫ブロット法およびFACSによって解析した。ウエスタン免疫ブロット法の結果が図1Bに示され、FACSの結果が図1Cに示される。比較対照のため、MGP、SGP、またはZGPを発現するrVSVを各GP 標本と同時に実施し、種特異性抗GP1 mAbを検出のために使用した。大きさが示される(kDa)。FACSのために、形質移入細胞は、マウス由来GP特異性血清試薬で間接的に染色され、その後広範囲に洗浄され、ヤギ抗マウスIgGおよびMHCクラスIが続いた。ウエスタン免疫ブロット法およびFACS実験は、少なくとも3回反復され、同様の結果が得られた。無根系統樹に関する有意性は、最大公算法によって決定され、ブートストラップ解析によって検証され、有意な支持値(≧80%;1,000ブートストラップ複製)は、MEGAバージョン5ソフトウエアによって決定された。 図2A〜2Hは、MARVおよびZEBOV攻撃に対する完全な防御が観察された、施例1における実験結果を示す。動物の生存データが、図2Aおよび図2Eに示される。図2Aは、三価ワクチン接種を受けた動物はMARV攻撃後に生存したが、一方対照動物は10日目までに全て死亡したことを示す。図2Eは、三価ワクチン接種を受けた動物は、ZEBOV攻撃後に生存したが、一方対照動物は7日目までに全て死亡したことを示す。ワクチン接種を受けたMARVにより攻撃されたものに関して、ワクチン接種を受けた動物および対照動物に関する体重における変化%のデータが図2Bに示される。y軸は、図2Fに示される通り体重における変化を示す。薄い実線は、三価ワクチン接種を受けた動物に関するものである。薄い破線は、TriAVE、三価ワクチン接種を受けた動物の平均結果に関するものである。濃い実線は、対照動物に関するものである。濃い破線は、対照AVE、対照動物の平均結果に関するものである。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜9日目からグラフ上で減少しており、10日目までに動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。ワクチン接種を受けたZEBOVにより攻撃されたものに関して、ワクチン接種を受けた動物および対照動物に関する体重における変化%のデータが、図2Fに示される。y軸は、体重における変化をパーセントで示す。薄い実線は、三価ワクチン接種を受けた動物に関するものである。薄い破線は、TriAVE、三価ワクチン接種を受けた動物の平均結果に関するものである。濃い実線は、対照動物に関するものである。濃い破線は、対照AVE、対照動物の平均結果に関するものである。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜6日目からグラフ上で減少しており、8日目の前に動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。(gpMARVに関してn=3、gpZEBOVに関してn=6)。第1(1X)および第2の(2X)免疫化の前(Pre)および後に、結合Ab(図2Cおよび図2G)およびNAb(図2Dおよび図2H)が、ワクチン接種を受けた動物に由来する血清において測定された。解析は、プール血清において行われた(図2H)。*p<0.1、***p<0.001、****p<0.0001。 図2A〜2Hは、MARVおよびZEBOV攻撃に対する完全な防御が観察された、施例1における実験結果を示す。動物の生存データが、図2Aおよび図2Eに示される。図2Aは、三価ワクチン接種を受けた動物はMARV攻撃後に生存したが、一方対照動物は10日目までに全て死亡したことを示す。図2Eは、三価ワクチン接種を受けた動物は、ZEBOV攻撃後に生存したが、一方対照動物は7日目までに全て死亡したことを示す。ワクチン接種を受けたMARVにより攻撃されたものに関して、ワクチン接種を受けた動物および対照動物に関する体重における変化%のデータが図2Bに示される。y軸は、図2Fに示される通り体重における変化を示す。薄い実線は、三価ワクチン接種を受けた動物に関するものである。薄い破線は、TriAVE、三価ワクチン接種を受けた動物の平均結果に関するものである。濃い実線は、対照動物に関するものである。濃い破線は、対照AVE、対照動物の平均結果に関するものである。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜9日目からグラフ上で減少しており、10日目までに動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。ワクチン接種を受けたZEBOVにより攻撃されたものに関して、ワクチン接種を受けた動物および対照動物に関する体重における変化%のデータが、図2Fに示される。y軸は、体重における変化をパーセントで示す。薄い実線は、三価ワクチン接種を受けた動物に関するものである。薄い破線は、TriAVE、三価ワクチン接種を受けた動物の平均結果に関するものである。濃い実線は、対照動物に関するものである。濃い破線は、対照AVE、対照動物の平均結果に関するものである。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜6日目からグラフ上で減少しており、8日目の前に動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。(gpMARVに関してn=3、gpZEBOVに関してn=6)。第1(1X)および第2の(2X)免疫化の前(Pre)および後に、結合Ab(図2Cおよび図2G)およびNAb(図2Dおよび図2H)が、ワクチン接種を受けた動物に由来する血清において測定された。解析は、プール血清において行われた(図2H)。*p<0.1、***p<0.001、****p<0.0001。 図2A〜2Hは、MARVおよびZEBOV攻撃に対する完全な防御が観察された、施例1における実験結果を示す。動物の生存データが、図2Aおよび図2Eに示される。図2Aは、三価ワクチン接種を受けた動物はMARV攻撃後に生存したが、一方対照動物は10日目までに全て死亡したことを示す。図2Eは、三価ワクチン接種を受けた動物は、ZEBOV攻撃後に生存したが、一方対照動物は7日目までに全て死亡したことを示す。ワクチン接種を受けたMARVにより攻撃されたものに関して、ワクチン接種を受けた動物および対照動物に関する体重における変化%のデータが図2Bに示される。y軸は、図2Fに示される通り体重における変化を示す。薄い実線は、三価ワクチン接種を受けた動物に関するものである。薄い破線は、TriAVE、三価ワクチン接種を受けた動物の平均結果に関するものである。濃い実線は、対照動物に関するものである。濃い破線は、対照AVE、対照動物の平均結果に関するものである。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜9日目からグラフ上で減少しており、10日目までに動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。ワクチン接種を受けたZEBOVにより攻撃されたものに関して、ワクチン接種を受けた動物および対照動物に関する体重における変化%のデータが、図2Fに示される。y軸は、体重における変化をパーセントで示す。薄い実線は、三価ワクチン接種を受けた動物に関するものである。薄い破線は、TriAVE、三価ワクチン接種を受けた動物の平均結果に関するものである。濃い実線は、対照動物に関するものである。濃い破線は、対照AVE、対照動物の平均結果に関するものである。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜6日目からグラフ上で減少しており、8日目の前に動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。(gpMARVに関してn=3、gpZEBOVに関してn=6)。第1(1X)および第2の(2X)免疫化の前(Pre)および後に、結合Ab(図2Cおよび図2G)およびNAb(図2Dおよび図2H)が、ワクチン接種を受けた動物に由来する血清において測定された。解析は、プール血清において行われた(図2H)。*p<0.1、***p<0.001、****p<0.0001。 図2A〜2Hは、MARVおよびZEBOV攻撃に対する完全な防御が観察された、実施例1における実験結果を示す。動物の生存データが、図2Aおよび図2Eに示される。図2Aは、三価ワクチン接種を受けた動物はMARV攻撃後に生存したが、一方対照動物は10日目までに全て死亡したことを示す。図2Eは、三価ワクチン接種を受けた動物は、ZEBOV攻撃後に生存したが、一方対照動物は7日目までに全て死亡したことを示す。ワクチン接種を受けたMARVにより攻撃されたものに関して、ワクチン接種を受けた動物および対照動物に関する体重における変化%のデータが図2Bに示される。y軸は、図2Fに示される通り体重における変化を示す。薄い実線は、三価ワクチン接種を受けた動物に関するものである。薄い破線は、TriAVE、三価ワクチン接種を受けた動物の平均結果に関するものである。濃い実線は、対照動物に関するものである。濃い破線は、対照AVE、対照動物の平均結果に関するものである。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜9日目からグラフ上で減少しており、10日目までに動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。ワクチン接種を受けたZEBOVにより攻撃されたものに関して、ワクチン接種を受けた動物および対照動物に関する体重における変化%のデータが、図2Fに示される。y軸は、体重における変化をパーセントで示す。薄い実線は、三価ワクチン接種を受けた動物に関するものである。薄い破線は、TriAVE、三価ワクチン接種を受けた動物の平均結果に関するものである。濃い実線は、対照動物に関するものである。濃い破線は、対照AVE、対照動物の平均結果に関するものである。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜6日目からグラフ上で減少しており、8日目の前に動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。(gpMARVに関してn=3、gpZEBOVに関してn=6)。第1(1X)および第2の(2X)免疫化の前(Pre)および後に、結合Ab(図2Cおよび図2G)およびNAb(図2Dおよび図2H)が、ワクチン接種を受けた動物に由来する血清において測定された。解析は、プール血清において行われた(図2H)。*p<0.1、***p<0.001、****p<0.0001。 図2A〜2Hは、MARVおよびZEBOV攻撃に対する完全な防御が観察された、実施例1における実験結果を示す。動物の生存データが、図2Aおよび図2Eに示される。図2Aは、三価ワクチン接種を受けた動物はMARV攻撃後に生存したが、一方対照動物は10日目までに全て死亡したことを示す。図2Eは、三価ワクチン接種を受けた動物は、ZEBOV攻撃後に生存したが、一方対照動物は7日目までに全て死亡したことを示す。ワクチン接種を受けたMARVにより攻撃されたものに関して、ワクチン接種を受けた動物および対照動物に関する体重における変化%のデータが図2Bに示される。y軸は、図2Fに示される通り体重における変化を示す。薄い実線は、三価ワクチン接種を受けた動物に関するものである。薄い破線は、TriAVE、三価ワクチン接種を受けた動物の平均結果に関するものである。濃い実線は、対照動物に関するものである。濃い破線は、対照AVE、対照動物の平均結果に関するものである。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜9日目からグラフ上で減少しており、10日目までに動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。ワクチン接種を受けたZEBOVにより攻撃されたものに関して、ワクチン接種を受けた動物および対照動物に関する体重における変化%のデータが、図2Fに示される。y軸は、体重における変化をパーセントで示す。薄い実線は、三価ワクチン接種を受けた動物に関するものである。薄い破線は、TriAVE、三価ワクチン接種を受けた動物の平均結果に関するものである。濃い実線は、対照動物に関するものである。濃い破線は、対照AVE、対照動物の平均結果に関するものである。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜6日目からグラフ上で減少しており、8日目の前に動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。(gpMARVに関してn=3、gpZEBOVに関してn=6)。第1(1X)および第2の(2X)免疫化の前(Pre)および後に、結合Ab(図2Cおよび図2G)およびNAb(図2Dおよび図2H)が、ワクチン接種を受けた動物に由来する血清において測定された。解析は、プール血清において行われた(図2H)。*p<0.1、***p<0.001、****p<0.0001。 図2A〜2Hは、MARVおよびZEBOV攻撃に対する完全な防御が観察された、実施例1における実験結果を示す。動物の生存データが、図2Aおよび図2Eに示される。図2Aは、三価ワクチン接種を受けた動物はMARV攻撃後に生存したが、一方対照動物は10日目までに全て死亡したことを示す。図2Eは、三価ワクチン接種を受けた動物は、ZEBOV攻撃後に生存したが、一方対照動物は7日目までに全て死亡したことを示す。ワクチン接種を受けたMARVにより攻撃されたものに関して、ワクチン接種を受けた動物および対照動物に関する体重における変化%のデータが図2Bに示される。y軸は、図2Fに示される通り体重における変化を示す。薄い実線は、三価ワクチン接種を受けた動物に関するものである。薄い破線は、TriAVE、三価ワクチン接種を受けた動物の平均結果に関するものである。濃い実線は、対照動物に関するものである。濃い破線は、対照AVE、対照動物の平均結果に関するものである。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜9日目からグラフ上で減少しており、10日目までに動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。ワクチン接種を受けたZEBOVにより攻撃されたものに関して、ワクチン接種を受けた動物および対照動物に関する体重における変化%のデータが、図2Fに示される。y軸は、体重における変化をパーセントで示す。薄い実線は、三価ワクチン接種を受けた動物に関するものである。薄い破線は、TriAVE、三価ワクチン接種を受けた動物の平均結果に関するものである。濃い実線は、対照動物に関するものである。濃い破線は、対照AVE、対照動物の平均結果に関するものである。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜6日目からグラフ上で減少しており、8日目の前に動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。(gpMARVに関してn=3、gpZEBOVに関してn=6)。第1(1X)および第2の(2X)免疫化の前(Pre)および後に、結合Ab(図2Cおよび図2G)およびNAb(図2Dおよび図2H)が、ワクチン接種を受けた動物に由来する血清において測定された。解析は、プール血清において行われた(図2H)。*p<0.1、***p<0.001、****p<0.0001。 図2A〜2Hは、MARVおよびZEBOV攻撃に対する完全な防御が観察された、実施例1における実験結果を示す。動物の生存データが、図2Aおよび図2Eに示される。図2Aは、三価ワクチン接種を受けた動物はMARV攻撃後に生存したが、一方対照動物は10日目までに全て死亡したことを示す。図2Eは、三価ワクチン接種を受けた動物は、ZEBOV攻撃後に生存したが、一方対照動物は7日目までに全て死亡したことを示す。ワクチン接種を受けたMARVにより攻撃されたものに関して、ワクチン接種を受けた動物および対照動物に関する体重における変化%のデータが図2Bに示される。y軸は、図2Fに示される通り体重における変化を示す。薄い実線は、三価ワクチン接種を受けた動物に関するものである。薄い破線は、TriAVE、三価ワクチン接種を受けた動物の平均結果に関するものである。濃い実線は、対照動物に関するものである。濃い破線は、対照AVE、対照動物の平均結果に関するものである。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜9日目からグラフ上で減少しており、10日目までに動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。ワクチン接種を受けたZEBOVにより攻撃されたものに関して、ワクチン接種を受けた動物および対照動物に関する体重における変化%のデータが、図2Fに示される。y軸は、体重における変化をパーセントで示す。薄い実線は、三価ワクチン接種を受けた動物に関するものである。薄い破線は、TriAVE、三価ワクチン接種を受けた動物の平均結果に関するものである。濃い実線は、対照動物に関するものである。濃い破線は、対照AVE、対照動物の平均結果に関するものである。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜6日目からグラフ上で減少しており、8日目の前に動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。(gpMARVに関してn=3、gpZEBOVに関してn=6)。第1(1X)および第2の(2X)免疫化の前(Pre)および後に、結合Ab(図2Cおよび図2G)およびNAb(図2Dおよび図2H)が、ワクチン接種を受けた動物に由来する血清において測定された。解析は、プール血清において行われた(図2H)。*p<0.1、***p<0.001、****p<0.0001。 図2A〜2Hは、MARVおよびZEBOV攻撃に対する完全な防御が観察された、実施例1における実験結果を示す。動物の生存データが、図2Aおよび図2Eに示される。図2Aは、三価ワクチン接種を受けた動物はMARV攻撃後に生存したが、一方対照動物は10日目までに全て死亡したことを示す。図2Eは、三価ワクチン接種を受けた動物は、ZEBOV攻撃後に生存したが、一方対照動物は7日目までに全て死亡したことを示す。ワクチン接種を受けたMARVにより攻撃されたものに関して、ワクチン接種を受けた動物および対照動物に関する体重における変化%のデータが図2Bに示される。y軸は、図2Fに示される通り体重における変化を示す。薄い実線は、三価ワクチン接種を受けた動物に関するものである。薄い破線は、TriAVE、三価ワクチン接種を受けた動物の平均結果に関するものである。濃い実線は、対照動物に関するものである。濃い破線は、対照AVE、対照動物の平均結果に関するものである。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜9日目からグラフ上で減少しており、10日目までに動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。ワクチン接種を受けたZEBOVにより攻撃されたものに関して、ワクチン接種を受けた動物および対照動物に関する体重における変化%のデータが、図2Fに示される。y軸は、体重における変化をパーセントで示す。薄い実線は、三価ワクチン接種を受けた動物に関するものである。薄い破線は、TriAVE、三価ワクチン接種を受けた動物の平均結果に関するものである。濃い実線は、対照動物に関するものである。濃い破線は、対照AVE、対照動物の平均結果に関するものである。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜6日目からグラフ上で減少しており、8日目の前に動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。(gpMARVに関してn=3、gpZEBOVに関してn=6)。第1(1X)および第2の(2X)免疫化の前(Pre)および後に、結合Ab(図2Cおよび図2G)およびNAb(図2Dおよび図2H)が、ワクチン接種を受けた動物に由来する血清において測定された。解析は、プール血清において行われた(図2H)。*p<0.1、***p<0.001、****p<0.0001。 図3A〜3Cは、中和Abの誘導を実証する実施例1の結果を示す。B細胞応答が、2つのワクチン接種のそれぞれの後に20日間、40μgのE−DNAワクチン接種注射の間に3週間あけて、マウス(n=5/群)において評価された。図3Aは、ELISAによって測定したワクチン接種を受けた(実線)マウスまたは出血前(点線)マウスからの血清GP特異性IgG応答を示す。データが図3Bに要約される。本研究ではSGPは利用可能でなかったため、pEBOS免疫付与およびpEBOZ免疫付与された動物からの全応答をスクロース精製したZGPに対して測定した。pMARV免疫付与されたマウスからのIgG応答が、MARV−Ozolin GPに対して、または負の対照スクロース精製したNipah Gタンパク質を用いて測定され、血清標本の中和活性が、BSL−4の施設にてZEBOV−EGFP、SUDV−Boniface、およびMARV−Angolaに対して測定され、NAb価が図3Cに示される。SUDV−Bonifaceに対するNAbは、CV−1細胞における細胞変性効果(CPE)に基づいて分析され、MARV−Angolaに対するNAbは、免疫蛍光分析を用いて分析された。平均が図3Bおよび図3Cに示され、エラーバーは標準誤差を表す。群解析が、マッチされた両側独立t検定によって完了された。実験は、少なくとも2回反復され、同様の結果が得られ、*p<0.1、**p<0.01、***p<0.001である。 図3A〜3Cは、中和Abの誘導を実証する実施例1の結果を示す。B細胞応答が、2つのワクチン接種のそれぞれの後に20日間、40μgのE−DNAワクチン接種注射の間に3週間あけて、マウス(n=5/群)において評価された。図3Aは、ELISAによって測定したワクチン接種を受けた(実線)マウスまたは出血前(点線)マウスからの血清GP特異性IgG応答を示す。データが図3Bに要約される。本研究ではSGPは利用可能でなかったため、pEBOS免疫付与およびpEBOZ免疫付与された動物からの全応答をスクロース精製したZGPに対して測定した。pMARV免疫付与されたマウスからのIgG応答が、MARV−Ozolin GPに対して、または負の対照スクロース精製したNipah Gタンパク質を用いて測定され、血清標本の中和活性が、BSL−4の施設にてZEBOV−EGFP、SUDV−Boniface、およびMARV−Angolaに対して測定され、NAb価が図3Cに示される。SUDV−Bonifaceに対するNAbは、CV−1細胞における細胞変性効果(CPE)に基づいて分析され、MARV−Angolaに対するNAbは、免疫蛍光分析を用いて分析された。平均が図3Bおよび図3Cに示され、エラーバーは標準誤差を表す。群解析が、マッチされた両側独立t検定によって完了された。実験は、少なくとも2回反復され、同様の結果が得られ、*p<0.1、**p<0.01、***p<0.001である。 図3A〜3Cは、中和Abの誘導を実証する実施例1の結果を示す。B細胞応答が、2つのワクチン接種のそれぞれの後に20日間、40μgのE−DNAワクチン接種注射の間に3週間あけて、マウス(n=5/群)において評価された。図3Aは、ELISAによって測定したワクチン接種を受けた(実線)マウスまたは出血前(点線)マウスからの血清GP特異性IgG応答を示す。データが図3Bに要約される。本研究ではSGPは利用可能でなかったため、pEBOS免疫付与およびpEBOZ免疫付与された動物からの全応答をスクロース精製したZGPに対して測定した。pMARV免疫付与されたマウスからのIgG応答が、MARV−Ozolin GPに対して、または負の対照スクロース精製したNipah Gタンパク質を用いて測定され、血清標本の中和活性が、BSL−4の施設にてZEBOV−EGFP、SUDV−Boniface、およびMARV−Angolaに対して測定され、NAb価が図3Cに示される。SUDV−Bonifaceに対するNAbは、CV−1細胞における細胞変性効果(CPE)に基づいて分析され、MARV−Angolaに対するNAbは、免疫蛍光分析を用いて分析された。平均が図3Bおよび図3Cに示され、エラーバーは標準誤差を表す。群解析が、マッチされた両側独立t検定によって完了された。実験は、少なくとも2回反復され、同様の結果が得られ、*p<0.1、**p<0.01、***p<0.001である。 図4A〜4Dは、ワクチン接種によって生成される広範なT細胞応答を示す指す。図4Aにおいて、H−2b(薄いバー)およびH−2d(濃いバー)マウス(n=5/群)は、pMARVか、pEBOSか、またはpEBOZ DNAかで2回免疫付与され、IFNγ応答が、IFNγ ELISPOT分析によって測定された。第2の免疫化後8日目に採取した脾細胞が、個々のGPペプチド(9個のアミノ酸による15mer重複)の存在下でインキュベートされ、結果が、積み上げバーグラフに示される。エピトープ含有ペプチドが確認され(平均≧10スポットかつ≧80%応答率)、フローサイトメトリーによって確証され、総活性化IFNγ+およびCD44+CD4+および/またはCD8+T細胞の集団において特徴付けされ(表1〜6)、正の誘導物質のペプチド数が、バーの上に示される。CD4+エピトープ単独を含有するペプチド、CD8+エピトープ単独を含有するペプチド(*)、ならびに両CD4+およびCD8+エピトープを含有するペプチド(**)が計数される。推定上の共通および/または部分エピトープが、連続した正のペプチド応答に関して検索された(表1〜6)。 図4A〜4Dは、ワクチン接種によって生成される広範なT細胞応答を示す指す。図4Bは、図1Aに示されるMARV、SUDV、およびZEBOVウイルスからのGP配列を比較するアミノ酸類似性プロットを示す。 図4A〜4Dは、ワクチン接種によって生成される広範なT細胞応答を示す指す。図4Cは、ZEBOV GP(GenBank #VGP_EBOZM)内の推定上のドメインを示す図である。SP、シグナルペプチド;RB、受容体結合;MUC、ムチン様領域;FC、フューリン開裂部位;TM、膜貫通領域。 図4A〜4Dは、ワクチン接種によって生成される広範なT細胞応答を示す指す。図4Dでは、合計の亜優勢(濃い塗り潰し)および免疫優勢(薄い塗り潰し)T細胞エピトープ応答が、各ワクチンによって生成された総IFNγ応答のパーセンテージとして示される。実験は、少なくとも2回反復され、同様の結果が得られた。 図5A〜5Dは、中和AbおよびCTLを誘導する防御的「単一投与」ワクチン接種を評価する実験からのデータを示す。H−2kマウス(n=10/群)が、BSL−4の施設内で、pEBOZ E−DNAで一度筋肉内にワクチン接種を受け、次いで攻撃後28日目に1,000LD50のmZEBOVを受けた。マウスは、毎日体重測定され、疾患進行についてモニタリングされた。動物生存データは、図5Aにある。ワクチン接種を受けた動物は、攻撃を生き延びたが、それに対し対照動物は7日目までに死亡した。図5Bは、攻撃された動物における体重の変化%に関するデータを示す。免疫付与された動物のデータが薄い実線として示され、免疫付与された動物に関する平均データが薄い破線として示される。対照動物のデータが濃い実線として示され、対照動物に関する平均データが濃い破線として示される。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で約85%〜120%の範囲内で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜6日目からグラフ上で減少しており、7日目までに動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。攻撃前に測定したNAb、データが図5Cに示される。FACSによって測定した単一投与pEBOZ免疫化後のT細胞応答が、合計のCD44+/IFNγ+CD4+(濃い色)またはCD8+(薄い色)細胞の平均%として図5Dに要約される。Thl型エフェクターマーカーが評価され(TNFおよびT−bet)、CD44+/IFNγ+CD4+およびCD8+T細胞に関するデータが、総T細胞データと比較され、それは以下の通りであった。総細胞に関して:TNF2.9±0.8、Tbet13.0±1.1。CD4+/CD44+/IFNγ+細胞に関して:TNF61.4±3.1、Tbet72.6±2.0。CD8+/CD44+/IFNγ+細胞に関して:TNF33.0±3.3、Tbet992.1±1.4(*p<0.1、***p<0.001、****p<0.0001)。群解析がマッチされた両側独立t検定によって完了され、生存曲線がログランク(マンテル・コックス)検定によって解析された。実験は2回実施され、同様の結果が得られ、エラーバーは標準誤差を表す。 図5A〜5Dは、中和AbおよびCTLを誘導する防御的「単一投与」ワクチン接種を評価する実験からのデータを示す。H−2kマウス(n=10/群)が、BSL−4の施設内で、pEBOZ E−DNAで一度筋肉内にワクチン接種を受け、次いで攻撃後28日目に1,000LD50のmZEBOVを受けた。マウスは、毎日体重測定され、疾患進行についてモニタリングされた。動物生存データは、図5Aにある。ワクチン接種を受けた動物は、攻撃を生き延びたが、それに対し対照動物は7日目までに死亡した。図5Bは、攻撃された動物における体重の変化%に関するデータを示す。免疫付与された動物のデータが薄い実線として示され、免疫付与された動物に関する平均データが薄い破線として示される。対照動物のデータが濃い実線として示され、対照動物に関する平均データが濃い破線として示される。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で約85%〜120%の範囲内で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜6日目からグラフ上で減少しており、7日目までに動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。攻撃前に測定したNAb、データが図5Cに示される。FACSによって測定した単一投与pEBOZ免疫化後のT細胞応答が、合計のCD44+/IFNγ+CD4+(濃い色)またはCD8+(薄い色)細胞の平均%として図5Dに要約される。Thl型エフェクターマーカーが評価され(TNFおよびT−bet)、CD44+/IFNγ+CD4+およびCD8+T細胞に関するデータが、総T細胞データと比較され、それは以下の通りであった。総細胞に関して:TNF2.9±0.8、Tbet13.0±1.1。CD4+/CD44+/IFNγ+細胞に関して:TNF61.4±3.1、Tbet72.6±2.0。CD8+/CD44+/IFNγ+細胞に関して:TNF33.0±3.3、Tbet992.1±1.4(*p<0.1、***p<0.001、****p<0.0001)。群解析がマッチされた両側独立t検定によって完了され、生存曲線がログランク(マンテル・コックス)検定によって解析された。実験は2回実施され、同様の結果が得られ、エラーバーは標準誤差を表す。 図5A〜5Dは、中和AbおよびCTLを誘導する防御的「単一投与」ワクチン接種を評価する実験からのデータを示す。H−2kマウス(n=10/群)が、BSL−4の施設内で、pEBOZ E−DNAで一度筋肉内にワクチン接種を受け、次いで攻撃後28日目に1,000LD50のmZEBOVを受けた。マウスは、毎日体重測定され、疾患進行についてモニタリングされた。動物生存データは、図5Aにある。ワクチン接種を受けた動物は、攻撃を生き延びたが、それに対し対照動物は7日目までに死亡した。図5Bは、攻撃された動物における体重の変化%に関するデータを示す。免疫付与された動物のデータが薄い実線として示され、免疫付与された動物に関する平均データが薄い破線として示される。対照動物のデータが濃い実線として示され、対照動物に関する平均データが濃い破線として示される。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で約85%〜120%の範囲内で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜6日目からグラフ上で減少しており、7日目までに動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。攻撃前に測定したNAb、データが図5Cに示される。FACSによって測定した単一投与pEBOZ免疫化後のT細胞応答が、合計のCD44+/IFNγ+CD4+(濃い色)またはCD8+(薄い色)細胞の平均%として図5Dに要約される。Thl型エフェクターマーカーが評価され(TNFおよびT−bet)、CD44+/IFNγ+CD4+およびCD8+T細胞に関するデータが、総T細胞データと比較され、それは以下の通りであった。総細胞に関して:TNF2.9±0.8、Tbet13.0±1.1。CD4+/CD44+/IFNγ+細胞に関して:TNF61.4±3.1、Tbet72.6±2.0。CD8+/CD44+/IFNγ+細胞に関して:TNF33.0±3.3、Tbet992.1±1.4(*p<0.1、***p<0.001、****p<0.0001)。群解析がマッチされた両側独立t検定によって完了され、生存曲線がログランク(マンテル・コックス)検定によって解析された。実験は2回実施され、同様の結果が得られ、エラーバーは標準誤差を表す。 図5A〜5Dは、中和AbおよびCTLを誘導する防御的「単一投与」ワクチン接種を評価する実験からのデータを示す。H−2kマウス(n=10/群)が、BSL−4の施設内で、pEBOZ E−DNAで一度筋肉内にワクチン接種を受け、次いで攻撃後28日目に1,000LD50のmZEBOVを受けた。マウスは、毎日体重測定され、疾患進行についてモニタリングされた。動物生存データは、図5Aにある。ワクチン接種を受けた動物は、攻撃を生き延びたが、それに対し対照動物は7日目までに死亡した。図5Bは、攻撃された動物における体重の変化%に関するデータを示す。免疫付与された動物のデータが薄い実線として示され、免疫付与された動物に関する平均データが薄い破線として示される。対照動物のデータが濃い実線として示され、対照動物に関する平均データが濃い破線として示される。薄い実線および薄い破線は、攻撃後の日においてグラフ上で約85%〜120%の範囲内で安定したままであり、ワクチン接種を受けた動物間で有意な体重減少を示していない。濃い実線および濃い破線は、攻撃後0〜6日目からグラフ上で減少しており、7日目までに動物が疾患により死亡したことを示すダガーで終止している。攻撃前に測定したNAb、データが図5Cに示される。FACSによって測定した単一投与pEBOZ免疫化後のT細胞応答が、合計のCD44+/IFNγ+CD4+(濃い色)またはCD8+(薄い色)細胞の平均%として図5Dに要約される。Thl型エフェクターマーカーが評価され(TNFおよびT−bet)、CD44+/IFNγ+CD4+およびCD8+T細胞に関するデータが、総T細胞データと比較され、それは以下の通りであった。総細胞に関して:TNF2.9±0.8、Tbet13.0±1.1。CD4+/CD44+/IFNγ+細胞に関して:TNF61.4±3.1、Tbet72.6±2.0。CD8+/CD44+/IFNγ+細胞に関して:TNF33.0±3.3、Tbet992.1±1.4(*p<0.1、***p<0.001、****p<0.0001)。群解析がマッチされた両側独立t検定によって完了され、生存曲線がログランク(マンテル・コックス)検定によって解析された。実験は2回実施され、同様の結果が得られ、エラーバーは標準誤差を表す。 実施例1に開示されるGP特異性T細胞ゲーティングを示す。 図7Aは、実施例1におけるワクチン接種実験は、強固なT細胞を生成したことを示す。 図7Bは、実施例1におけるワクチン接種実験は、強固なT細胞を生成したことを示す。 図8Aは、実施例1に開示される「単一投与」ワクチン接種によるT細胞誘導を示す。 図8Bは、実施例1に開示される「単一投与」ワクチン接種によるT細胞誘導を示す。
好ましい態様の詳細な説明
本発明の一態様において、コンセンサス抗原は、以下のうちの1つ以上を有することを含む、改善された転写および翻訳を提供することが望ましい:転写を増加するための低いGC含有量のリーダー配列、mRNA安定およびコドン最適化、シス作用配列モチーフ(すなわち、内部TATA−ボックス)を可能な限り排除すること。
本発明の幾つかの態様において、以下のうちの少なくとも1つを有することを含む、多数の菌株のわたる広範囲の免疫応答を生成するコンセンサス抗原を生成することが望ましい:全ての利用可能な全長配列の組み込み、それぞれの位置に最も一般的に生じるアミノ酸を利用するコンピューター生成配列、および菌株間の交差反応性の増加。
フィロウイルス科における多様性は、比較的高い。最高ヒト死亡率の原因となる複数の種に対する防御を提供するのに理想的となる普遍的で広範に反応性のフィロウイルスワクチンの開発に向けて、多大な努力がなされている。しかしながらこれは、フィロウイルス科の相対的に高レベルの多様性のため、困難である。EBOVは現在、ザイールエボラウイルス(ZEBOV)、スーダンエボラウイルス(SUDV)、レストンエボラウイルス(RESTV)、ブンディブギョエボラウイルス(BDBV)、およびタイフォレストエボラウイルス(TAFV;以前はコートジボワールエボラウイルス)の5つの別個の種に分類され、最初の2つは最高致命率の原因となり、武器としての利用の候補となる可能性が最も高い。多様性は、マールブルグウイルス(MARV)においてはより低く、また最大90%の致死率であり得る。現在、1つの分類種、マールブルグマールブルグウイルス(以前はビクトリア湖マールブルグウイルス)しか存在しないが、近年の改正は、これはラビンウイルス(Ravn virus)(RAVV)を含む2つのウイルスを含有することを提示している。多価ワクチン開発の複雑さに加え、MARVおよびEBOVは高度に分岐しており、ヌクレオチドレベルで約67%分岐が存在する。更に、フィロウイルスGPにおける系統発生的多様性も非常に高い(全体で82%)。これらは、2007のBDBVの最近の出現によって実証される通り、フィロウイルスのエンベロープする潜在力を示唆している。したがって、フィロウイルス科における相対的な分岐のため、我々は、有効な多価フィロウイルスワクチンの開発は免疫原性成分の混合物を必要とする可能性が高いという仮説をたてた。
マールブルグマールブルグウイルス(MARV)、ザイールエボラウイルス(ZEBOV)、およびスーダンエボラウイルス(SUDV)に対する合成多価フィロウイルスDNAワクチンが開発された。新規の多価フィロウイルスワクチンは、多剤併用アプローチを適用し、マールブルグマールブルグウイルス(MARV)、スーダンエボラウイルス(SUDV)、またはザイールエボラウイルス(ZEBOV)のエンベロープ糖タンパク質(GP)遺伝子をコードする3つのDNAプラスミドを含んだ。フィロウイルスワクチン候補として、増強されたDNA(DNA)ベースのプラットフォームは、近年の遺伝子最適化および送達技術における進歩による多くの利点を示す(Bagarazzi ML,et al.(2012)。Immunotherapy Against HPV16/18 Generates Potent TH1 and Cytotoxic Cellular Immune Responses.Sci Transl Med 4:155ral38、Kee ST,Gehl J,W.LE(2011).Clinical Aspects of Electroporation,Springer,New York,NY.、Hirao LA,et al.(2011).Multivalent smallpox DNA vaccine delivered by intradermal electroporation drives protective immunity in nonhuman primates against lethal monkeypox challenge.J Infect Dis 203:95−102)。したがって、各GPは、遺伝的に最適化され、改変された哺乳動物発現ベクターへとサブクローニングされ、次にインビボ電気穿孔(EP)を用いて送達された。
前臨床有効性研究が、齧歯動物に適合したウイルスを用いてモルモットおよびマウスにおいて実施され、マウスT細胞応答が、本明細書に記載される新規の改変された分析を用いて大規模に分析された。T細胞応答は大規模に分析され、本明細書に記載されるエピトープ特定および特徴付けのための新規の方法の使用も含まれた。このモデルは、既存のプラットフォームに適用することが可能な防御的免疫相関物を研究するための重要な前臨床ツールを提供する。
前臨床齧歯動物研究におけるワクチン接種は、非常に有力で誘発された強固な中和抗体(NAb)およびThl型マーカーを発現するCTLであり、MARVおよびZEBOV攻撃に対して完全に防御された。本明細書に記載される新規の改変された分析(Shedlock DJ,et al.(2012).Vaccination with synthetic constructs expressing cytomegalovirus immunogens is highly T cell immunogenic in mice.Hum Vaccin Immunother 8:1668−1681)を用いて大規模に解析された総合的な T細胞解析は、大規模な細胞毒性Tリンパ球、エピトープ幅、およびThl型マーカー発現を示した。総じて、2つの異なるマウス遺伝的バックグラウンドからの52個の新規のT細胞エピトープが確認され(20のMARVエピトープのうち19、16のSUDVのうち15、および22のZEBOVのうち18)、それらの対応する糖タンパク質(GP)の高度に保存された領域で主として生じた。これらのデータは、今日までで、前臨床糖タンパク質エピトープの最も総合的な報告を表している。
最高ヒト死亡率の原因となる多数の種に対する防御を提供するための戦略の開発において、我々はMARV、SUDV、およびZEBOVに焦点を当てた。その相対的な分岐のため、我々は、多価フィロウイルスワクチンの開発は、将来発生する株および/または種に応じて素早く容易に適合され得る成分の混合物を必要とするであろうという仮説をたてた。EBOVの全体の多様性は約33%であるが、アミノ酸同一性は、SUDVおよびZEBOVを別々に解析すると、大幅に増加する(それぞれの種において約94%同一性)。したがって、図1Aに示される通り、最も致死的なEBOVに対する適用範囲のため、2つの成分戦略、1つはSUDVに、もう1つはZEBOVに対するプラスミドGPワクチンが設計された。それぞれの種におけるGP多様性が比較的低いため(SUDVに関して5.6%、およびZEBOVに関して7.1%)、これまでにインフルエンザおよびHIVの分岐株における防御を増強することが示されている戦略である、種間適用範囲を増大させる、コンセンサス免疫原を開発した。これらのGP配列は、Vector NTIソフトウエア(Invitrogen,CA,米国)を用いた整列によって判定した際、報告されている全ての発生配列(GenBank)に関して一致した。非コンセンサス残基、SUDV(95、203、261、および472)およびZEBOV(314、377、430、および440)における各4個のアミノ酸が、それぞれGuluおよびMbomo/Mbanzaに重みをかけた。Guluは、フィロウイルス科流行の最高ヒト死亡率の原因であるため選択され(n=425)、一方、Mbomo/Mbanzaは、公開されている配列データに伴い直近の最も致死的な流行であるため選択された。SUDV(SUDV CONワクチン)およびZEBOV(ZEBOV CONワクチン)に関するコンセンサスGPは、系統発生的に中間の、親として整列された株であった。
図1Aのタンパク質の同定は、次の通りである。MARV Durba(05DRC99)’99:ABE27085;Uganda(01Uga07)’07:ACT79229;Durba(07DRC99)’99:ABE27078;Ozolin’75:VGP_MABVO;Musoke’80:VGP_MABVM;Popp’67:VGP_MABVP;Leiden’08:AEW11937;Angola’05:VGP_MABVA;Ravn’87:VGP_MABVR;Durba(09DRC99)’99;ABE27092;Uganda(02Uga07)’07:ACT79201。SUDV:Boniface’76:VGP_EBOSB;Maleo’79:VGP_EBOSM;Yambio’04:ABY75325;Gulu’00:VGP_EBOSU。ZEBOV:Booue’96:AAL25818;Mayibout’96:AEK25495;Mekouka’94:AAC57989,VGP_EBOG4;Kikwit’95:VGP_EBOZ5;Yambuku(Ekron)’76:VGP_EBOEC;Yambuku(Mayinga)’76:VGP_EBOZM;Kasai’08:AER59712;Kassai’07:AER59718;Etoumbi’05:ABW34742;Mbomo/Mbandza’03:ABW34743。
本明細書に提供される配列リストは、以下のものを含む66の配列のリストを含有する。
配列番号1は、コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原である、ZEBOV CONのアミノ酸配列である。
配列番号2は、コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原である、SUDV CONのアミノ酸配列である。
配列番号3は、MARVまたはMARV ANGのアミノ酸配列であり、マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質およびマールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列であり。
配列番号4は、第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原である、MARV CON1のアミノ酸配列である。
配列番号5は、第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原である、MARV CON2のアミノ酸配列である。
配列番号6は、第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原である、MARV CON3のアミノ酸配列である。
配列番号7〜25は、MARV ANGに由来するペプチドである。
配列番号26〜41は、SUDV CONに由来するペプチドである。
配列番号42〜62は、ZEBOV CONに由来するペプチドである。
配列番号63は、IgEシグナルペプチドの配列: MDWTWILFLVAAATRVHSである。
配列番号64は、コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする、プラスミドpEBOZ内のヌクレオチド配列挿入物である。
配列番号65は、コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする、プラスミドpEBOS内のヌクレオチド配列挿入物である。
配列番号66は、マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質をコードする、プラスミド pMARZ ANG内のヌクレオチド配列挿入物である。
幾つかの実施形態では、戦略は、3つのフィロウイルス免疫原:MARV、SUDV、およびZEBOVに関するコード配列を採用する。MARV免疫原は、Angola2005単離物の糖タンパク質である。SUDVおよびZEBOVに関しては、コンセンサス糖タンパク質配列が設計された。
幾つかの実施形態では、戦略は、5つのフィロウイルス免疫原に関するコード配列を採用する。3つのMARV免疫原が提供される。3つのクラスターに由来するコンセンサス糖タンパク質Ozolin、Musoke、またはRavnが設計された。これらの3つのMARV免疫原はともに、設計したSUDVおよびZEBOVコンセンサス糖タンパク質配列の免疫応答に関する標的である。
幾つかの実施形態では、戦略は、6つのフィロウイルス免疫原に関するコード配列を採用する。4つのMARV免疫原が提供される。3つのクラスターに由来する3つのコンセンサス糖タンパク質が設計された。これらの3つのMARV免疫原はともに、設計したSUDVおよびZEBOVコンセンサス糖タンパク質配列の免疫応答に関する標的であり、MARV免疫原は、Angola2005単離物の糖タンパク質である。
フィロウイルスワクチンの候補として、DNAワクチンは、高速で安価な大規模生産、室温での安定性、および輸送の容易さを含む多数の利点を示し、それらは全て、このプラットフォームを経済的および地理的観点から更に増強する。プラスミドの合成性質のため、Ag配列は、新たな出現種に反応して素早くまた容易に改変することができ、ならびに/または追加のワクチン成分および/もしくは発生状況中の迅速な応答のための治療計画を含むように拡大することができる。例えば、本明細書のMARV戦略は、他の系統発生クラスターに関するコンセンサスMARV GP(MGP)免疫原をコードする追加のプラスミドの共投与によって、より大きい対応範囲へ容易に拡大することができる。
「第1世代」DNAワクチンは免疫原性が不十分であったが、近年の技術進歩は、臨床試験においてそれらの免疫原性を劇的に改善している。プラスミドDNAベクターおよびそれらのコードされたAg遺伝子の最適化は、インビボ免疫原性の増加につながった。細胞取り込みおよびその後のAg発現は、高度に濃縮されたプラスミドワクチン製剤をインビボ電気穿孔によって投与するときに実質的に増幅され、これはワクチン接種部位内に短い矩形波電気パルスを用いて一時的に透過性になった細胞内にプラスミドを駆動する技術である。理論上、DNAプラスミドの混合物は、任意の数の多様なAgに対する高度に特殊化された免疫応答を方向付けるために組み立てることができる。免疫は、種特異性サイトカイン遺伝子をコードするプラスミド分子アジュバントとの共送達、およびAgアミノ酸配列の「コンセンサス工学」によって、特定の株に対してバイアスワクチン誘導免疫を促進するように更に方向付けることができる。この戦略は、インフルエンザウイルスおよびHIVの分岐株において防御を増強することが示されている。一部にはこれらの技術進歩によって、これらのDNAワクチンを含む免疫化治療計画は、高度に多用途であり、非常にカスタマイズ可能である。
1.定義。
本明細書において使用される用語法は、特定の実施形態を記載するだけの目的であり、限定的であることを意図しない。明細書および添付の特許請求の範囲で使用されるとき、単数形「a」、「an」、および「the」は、特に文脈から明白に示されない限り、複数の対象を含む。
本明細書における数値範囲の列挙では、同じ程度の正確さでその間に介在するそれぞれの数が、明確に考慮される。例えば、6〜9の範囲では、7および8の数が6および9に加えて考慮され、6.0〜7.0の範囲では、6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、および7.0の数が明確に考慮される。
a.アジュバント
「アジュバント」は、本明細書で使用されるとき、本明細書に記載されるDNAプラスミドワクチンに添加されて、DNAプラスミドおよび以下に記載されるコード核酸配列によりコードされる1つ以上のコンセンサスフィロウイルス免疫原の抗原性を増強する任意の分子を意味し得る。
b.抗体
「抗体」は、IgG、IgM、IgA、IgD、もしくはIgEの部類の抗体、またはFab、F(ab′)2、Fdが含まれるそのフラグメント、フラグメント、もしくは誘導体、ならびに一本鎖抗体、二特異性抗体、二重特異性抗体、二官能性抗体、およびその誘導体を意味し得る。抗体は、哺乳動物の血清試料から単離された抗体、ポリクローナル抗体、親和精製抗体、または所望のエピトープもしくはそれから誘導される配列に対して十分な結合特異性を示すそれらの混合物であり得る。
c.コード配列
「コード配列」または「コードする核酸」は、本明細書で使用されるとき、タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸(RNAまたはDNA分子)を意味し得る。コード配列は、核酸が投与される個体または哺乳動物の細胞において発現を指示することができるプロモーターおよびポリアデニル化シグナルを含む、調節エレメントに機能的に結合している開始および終結シグナルを更に含み得る。幾つかの実施形態では、コード配列は所望により、N末端メチオニンまたはIgEもしくはIgGシグナルペプチドなどのシグナルペプチドをコードする開始コドンを更に含んでもよい。
d.補体
「補体」または「相補」は、本明細書で使用されるとき、核酸が、核酸分子のヌクレオチドまたはヌクレオチド類縁体の間のワトソン・クリック(例えば、A−T/UおよびC−G)またはフーグスティーン塩基対を意味し得ることを意味する。
e.コンセンサスまたはコンセンサス配列
「コンセンサス」または「コンセンサス配列」は、本明細書で使用するとき、特定のフィロウイルス抗原の複数の亜型の整列の回析に基づいて構築され、複数の特定のフィロウイルス抗原の亜型または血清型に対する広範な免疫を誘導するために使用することができる、合成核酸配列、または対応するポリペプチド配列を意味し得る。
コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原は、配列番号1、配列番号1のフラグメント、配列番号1の変種、および配列番号1の変種のフラグメントを指す。(ZEBOVまたはZEBOV CONまたはZEBOV CONワクチン)。配列番号1のコード配列を含むプラスミドは、pZEBOVまたはpEBOZと称することができる。コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原に関するコード配列としては、配列番号64、配列番号64のフラグメント、配列番号64の変種、および配列番号64の変種のフラグメントが挙げられる。プラスミドpEBOZは、配列番号64を含む。
コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原は、配列番号2、配列番号2のフラグメント、配列番号2の変種、および配列番号2の変種のフラグメントを指す。(SUDVまたはSUDV CONまたはSUDV CONワクチン)配列番号2のコード配列を含むプラスミドは、pSUDVまたはpEBOSと称することができる。コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原に関するコード配列としては、配列番号65、配列番号65のフラグメント、配列番号65の変種、および配列番号65の変種のフラグメントが挙げられる。プラスミドpEBOSは、配列番号65を含む。
マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質は、コンセンサスでないが、単離物に由来するタンパク質配列である。それは配列、配列番号3を有する。マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原は、配列番号3、配列番号3のフラグメント、配列番号3の変種、および配列番号3の変種のフラグメントを指す。(MARVまたはMARV ANGまたはMARV ANGまたはMARV ANG ワクチン)配列番号3のコード配列を含むプラスミドは、pMARVまたはpMARV−ANGと称することができる。マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原に関するコード配列としては、配列番号66、配列番号66のフラグメント、配列番号66の変種、および配列番号66の変種のフラグメントが挙げられる。プラスミドpMARV ANGは、配列番号66を含む。
第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原は、配列番号4、配列番号4のフラグメント、配列番号4の変種、および配列番号4の変種のフラグメントを指す。配列番号4は、ラビンクラスターコンセンサス(Ravn,Durba(09DRC99)およびUganda(02Uga07Y)に由来するマールブルグマールブルグウイルスコンセンサス配列である。(MARV CON1またはMARV−RAV CONまたはMARV−RAV CONワクチン)配列番号4のコード配列を含むプラスミドは、pMARV−RAVと称することができる。
第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原は、配列番号5、配列番号5のフラグメント、配列番号5の変種、および配列番号5の変種のフラグメントを指す。配列番号5は、オゾリン(Ozolin)クラスターコンセンサス(Ozolin,Uganda(01Uga07)、およびDurba(05および07DRC99))に由来するマールブルグマールブルグウイルスコンセンサス配列である。(MARV CON2またはMARV−OZO CONまたはMARV−OZO CON ワクチン)配列番号5のコード配列を含むプラスミドは、pMARV−OZOと称することもできる。
第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原は、配列番号6、配列番号6のフラグメント、配列番号6の変種、および配列番号6の変種のフラグメントを指す。配列番号6は、ムソーク(Musoke)クラスターコンセンサス(Musoke、Popp、およびLeiden)に由来するマールブルグマールブルグウイルスコンセンサス配列である。(MARV CON1またはMARV−MUS CONまたはMARV−MUS CONワクチン)配列番号6のコード配列を含むプラスミドは、pMARV−MUSと称することができる。
f.定電流
「定電流」は、本明細書で使用されるとき、組織または前記組織を画定する細胞が、その組織に送達される電気パルスの持続時間にわたって受ける、または経験する電流を定義すること。電気パルスは、本明細書に記載されている電気穿孔装置から送達される。この電流は、前記組織に電気バルスの寿命にわたって一定のアンペア数で留まり、それは、本明細書において提供される電気穿孔装置が、好ましくは瞬時のフィードバックを有するフィードバック要素を有するからである。フィードバック要素は、パルスの持続時間の全体にわたって組織(または細胞)の抵抗を測定すること、ならびに電流が同じ組織において電気パルスの全体にわたって(数マイクロ秒台)、およびパルス毎に一定のままであるように、電気穿孔装置に電気エネルギー出力を変更させる(例えば、電圧を増加させる)ことができる。幾つかの実施形態において、フィードバック要素は、制御装置を含む。
g.電流フィードバックまたはフィードバック
「電流フィードバック」または「フィードバック」は、本明細書で使用されるとき、交換可能に使用することができ、提供される電気穿孔装置の能動的応答を意味することができ、それは、電極の間の組織中の電流を測定すること、および電流を一定レベルに維持するため、EP装置により送達されたエネルギー出力をそれに応じて変えることを含む。この一定レベルは、パルス系列または電気処理を開始する前に、使用者により予め設定される。フィートバックは、電気穿孔装置の電気穿孔構成要素、例えば制御装置により達成することができ、それは、その電気回路が、電極の間の組織中の電流を連続的にモニターすること、ならびにモニターされた電流(または組織内の電流)を比較して、電流を予め設定する、およびモニターされた電流を予め設定されたレベルに維持するためにエネルギー出力調整を連続的に行うことができるからである。フィードバックループは、アナログ閉ループフィートバックであるので、瞬時であり得る。
h.分散電流
「分散電流」は、本明細書で使用されるとき、本明細書に記載されている電気穿孔装置の様々な針電極配列から送達される電流のパターンを意味し得、パターンは、電気穿孔される組織の任意の領域における電気穿孔関連熱ストレスの発生を最小限にする、または排除する。
i.電気穿孔
「電気穿孔」、「電気透過処理(electro−permeabilization)」または「電気動力学的促進(electro−kinetic enhancement)」(「EP」)は、本明細書で交換可能に使用されるとき、生体膜内の微視的経路(細孔)を誘導するための膜貫通電界パルスの使用を意味し得、それらの存在は、プラスミド、オリゴヌクレオチド、siRNA、薬剤、イオン、および水のような生体分子が細胞膜の一方の側から他方の側に通過することを可能にする。
j.フィードバック機構
「フィードバック機構」は、本明細書で使用されるとき、ソフトウエアまたはハードウエア(もしくはファームウエア)のいずれかにより実施されるプロセスを意味し得、このプロセスは、所望の組織のインピーダンスを(エネルギーパルスの送達の前、間、および/または後に)受信し、現在の値、好ましくは電流と比較し、送達されるエネルギーのパルスを調整して、予め設定された値を達成する。フィードバック機構は、アナログ閉ループ回路により実施することができる。
k.フラグメント
「フラグメント」は、特定のフィロウイルス抗原を認識することによってフィロウイルスに対する哺乳動物における免疫応答を誘発することが可能な、フィロウイルス免疫原のポリペプチドフラグメントを意味し得る。フィロウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原は所望により、位置1のシグナルペプチドおよび/またはメチオニン、本明細書に記載されるコンセンサス配列に98%以上相同なタンパク質、本明細書に記載されるコンセンサス配列に99%以上相同なタンパク質、ならびに本明細書に記載されるコンセンサス配列に100%同一なタンパク質を含んでもよく、いずれの場合も位置1にシグナルペプチドおよび/またはメチオニンを伴っても伴わなくてもよい。フラグメントは、例えば、シグナルペプチド、例えば、IgEシグナルペプチドまたはIgGシグナルペプチドなどの免疫グロブリンシグナルペプチドなどに連結される、フィロウイルス免疫原のフラグメントを含んでも含まなくてもよい。
ZEBOV CON、SUDV CON、MARV ANG、MARV−RAV CON、MARV−OZO CON、もしくはMARV−MUS CON、またはそれらの変種のうちのいずれのフラグメントも、いずれの場合も位置1にシグナルペプチドおよび/またはメチオニンを伴って、または伴わずに、特定の全長ZEBOV CON、SUDV CON、MARV ANG、MARV−RAV CON、MARV−OZO CON、もしくはMARV−MUS CON、またはそれらの変種の長さの20%以上、25%以上、30%以上、35%以上、40%以上、45%以上、50%以上、55%以上、60%以上、65%以上、70%以上、75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、91%以上、92%以上、93%以上、94%以上、95%以上、96%以上、97%以上、98%以上、99%以上の割合(%)を含んでもよい。フラグメントは、配列ZEBOV CON、SUDV CON、MARV ANG、MARV−RAV CON、MARV−OZO CON、またはMARV−MUS CONに100%同一なフラグメントポリペプチドを指し、いずれの場合も位置1にシグナルペプチドおよび/またはメチオニンを伴うまたは伴わない。フラグメントはまた、変種、すなわち、配列ZEBOV CON、SUDV CON、MARV ANG、MARV−RAV CON、MARV−OZO CON、またはMARV−MUS CONに95%以上、98%以上、または99%以上相同なポリペプチドのフラグメントを指し、いずれの場合も位置1にシグナルペプチドおよび/またはメチオニンを伴うまたは伴わない。フラグメントは、配列番号1〜6に記載されるフィロウイルス免疫原に98%以上相同な、99%以上相同な、または100%同一なポリペプチドのフラグメントを含んでもよく、それに加えて、相同性パーセントを算出するときに含まれない免疫グロブリンシグナルペプチドなどのシグナルペプチドを含んでもよい。幾つかの実施形態では、配列番号1〜6のフラグメントは、例えば、IgEシグナルペプチドまたはIgGシグナルペプチドなどの免疫グロブリンシグナルペプチドなどのシグナルペプチドに連結される。フラグメントは、N末端メチオニンを含む配列番号1〜6のフラグメントを含んでもよい。フラグメントはまた、配列番号1〜6に開示される配列に95%以上、98%以上、または99%以上相同なポリペプチドのフラグメントを指す。シグナルペプチドシス(signal peptide sis)が存在する場合、 それは相同性パーセントの算出の際に含まれない。
幾つかの実施形態では、配列番号1〜6またはその変種のフラグメントは、配列番号1〜6またはその変種のいずれかの10、15、20、30、40、50、75、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、610、620、630、640、650、660、670個以上の連続したアミノ酸を含んでもよい。幾つかの実施形態では、配列番号1〜6またはその変種のフラグメントは、配列番号1〜6またはその変種のいずれかの15、20、30、40、50、75、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、610、620、630、640、650、660、670、675個以下の連続したアミノ酸を含んでもよい。
「フラグメント」はまた、フィロウイルス免疫抗原をコードする核酸配列のフラグメント、特定のフィロウイルス抗原を認識することによってフィロウイルスに対する哺乳動物における免疫応答を誘発することができる、フィロウイルス免疫原のフラグメントをコードする核酸フラグメントを意味し得る。フィロウイルス免疫原またはその変種をコードする核酸フラグメントのフラグメントは、いずれの場合も位置1にシグナルペプチドおよび/またはメチオニンを伴って、または伴わずに、フィロウイルス免疫原またはその変種をコードする特定の全長核酸配列の長さの20%以上、25%以上、30%以上、35%以上、40%以上、45%以上、50%以上、55%以上、60%以上、65%以上、70%以上、75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、91%以上、92%以上、93%以上、94%以上、95%以上、96%以上、97%以上、98%以上、99%以上の割合(%)を含んでもよい。フラグメントは、配列番号1〜6に記載されるフィロウイルス免疫原に98%以上相同な、99%以上相同な、または100%同一なポリペプチドをコードするヌクレオチド配列のフラグメントを含んでもよく、それに加えて、相同性パーセントを算出するときに含まれない免疫グロブリンシグナルペプチドなどのシグナルペプチドを含んでもよい。幾つかの実施形態では、配列番号1〜6のフラグメントをコードするヌクレオチド配列のフラグメントは、例えば、IgEシグナルペプチドまたはIgGシグナルペプチドなどの免疫グロブリンシグナルペプチドなどのシグナルペプチドに連結される。シグナルペプチドシスのコード配列は存在する、それは相同性パーセントの算出の際に含まれない。幾つかの実施形態では、配列番号1〜6またはその変種のフラグメントをコードするヌクレオチド配列のフラグメントは、配列番号1〜6またはその変種のいずれかの10、15、20、30、40、50、75、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、610、620、630、640、650、660、670個以上の連続したアミノ酸をコードする配列を含んでもよい。幾つかの実施形態では、配列番号1〜6またはその変種のフラグメントをコードするヌクレオチド配列のフラグメントは、配列番号1〜6またはその変種のいずれかの15、20、30、40、50、75、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、610、620、630、640、650、660、670、675個以下の連続したアミノ酸をコードする配列を含んでもよい。
幾つかの実施形態では、フラグメントは、配列番号64のフラグメント、配列番号65、または配列番号66である。配列番号64、配列番号65、または配列番号66のフラグメントは、いずれの場合も位置1にシグナルペプチドおよび/またはメチオニンを伴ってまたは伴わずに、フィロウイルス免疫原またはその変種をコードする特定の全長核酸配列の長さの20%以上、25%以上、30%以上、35%以上、40%以上、45%以上、50%以上、55%以上、60%以上、65%以上、70%以上、75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、91%以上、92%以上、93%以上、94%以上、95%以上、96%以上、97%以上、98%以上、99%以上の割合を含んでもよい。配列番号64、配列番号64、または配列番号66のフラグメントは、配列番号64、配列番号65、または配列番号66によってコードされるフィロウイルス免疫原に98%以上相同な、99%以上相同な、または100%同一なポリペプチドをコードするヌクレオチド配列のフラグメントを含んでもよく、それに加えて、相同性パーセントを算出するときに含まれない免疫グロブリンシグナルペプチドなどのシグナルペプチドを含んでもよい。配列番号64、配列番号65、または配列番号66のフラグメントは、配列番号64、配列番号65、もしくは配列番号66、またはそれらの変種の10、15、20、30、40、50、75、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、610、620、630、640、650、660、670個以上の連続したアミノ酸をコードする配列を含んでもよい。配列番号64、配列番号65、または配列番号66のフラグメントは、配列番号64、配列番号65、もしくは配列番号66、またはそれらの変種の15、20、30、40、50、75、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、610、620、630、640、650、660、670、675個以下の連続したアミノ酸をコードする配列を含んでもよい。
is.同一
「同一」または「同一性」は、2つ以上の核酸またはポリペプチド配列の文脈において本明細書で使用されるとき、配列が、特定の領域にわたって同じである残基の特定の率(%)を有することを意味し得る。率(%)は、2つの配列を最適に整列すること、2つの配列を特定の領域にわたって比較すること、同一残基が両方の配列に発生してマッチした位置の数を生じる、位置の数を決定すること、マッチした位置の数を、特定の領域内の位置の総数で割ること、および結果に100を掛けて、配列同一性の率(%)を生じることによって、計算することができる。2つの配列が異なる長さである、または整列が1つ以上の付着末端を生じ、特定の比較領域が、単一配列のみを含む場合、単一配列の残基は、計算の分母に含まれるが、分子には含まれない。DNAおよびRNAを比較すると、チミン(T)およびウラシル(U)は、同等であると考慮することができる。同一性は、手作業により、またはBLASTもしくはBLAST2.0のようなコンピューター配列アルゴリズムを使用して実施することができる。
m.インピーダンス
「インピーダンス」は、本明細書で使用されるとき、フィードバック機構を考察する場合に使用することができ、オームの法則に従って電流値に変換することができ、したがって、予め設定された電流との比較を可能にする。
n.免疫応答
「免疫応答」は、本明細書で使用されるとき、提供されたDNAプラスミドワクチンを介した1つ以上のフィロウイルスコンセンサス抗原の導入に応答した宿主の免疫系、例えば、哺乳動物の免疫系の活性化を意味し得る。免疫応答は、細胞性もしくは液性応答、またはその両方の形態であり得る。
o.核酸
「核酸」または「オリゴヌクレオチド」または「ポリヌクレオチド」は、本明細書で使用されるとき、一緒に共有結合している少なくとも2つのヌクレオチドを意味し得る。一本鎖の描写は、相補鎖の配列も定義する。したがって、核酸は、描写される一本鎖の相補鎖も包含する。核酸の多くの変種を、所定の核酸と同じ目的で使用することができる。したがって、核酸は、実質的に同一の核酸およびその相補体も包含する。一本鎖は、厳密なハイブリッド形成条件下で標的配列とハイブリッド形成することができるプローブを提供する。したがって、核酸は、厳密ハイブリッド形成条件下でハイブリッド形成するプローブも包含する。
核酸は、一本鎖もしくは二本鎖であり得る、または二本鎖と一本鎖の配列の両方の部分を含有し得る。核酸は、ゲノムおよびcDNAの両方のDNA、RNA、またはハイブリッドであり得、ここで核酸は、デオキシリボ−およびリボ−ヌクレオチドの組み合わせ、ならびにウラシル、アデニン、チミン、シトシン、グアニン、イノシン、キサンチン ヒポキサンチン、イソシトシン、およびイソグアニンを含む塩基の組み合わせを含有し得る。核酸は、化学合成法により、または組み換え法により得ることができる。
p.機能的に連結する
「機能的に連結する」は、本明細書で使用されるとき、遺伝子の発現が、空間的に連結しているプロモーターの制御下にあることを意味し得る。プロモーターは、その制御下の遺伝子の5′(上流)または3′(下流)に位置することができる。プロモーターと遺伝子との間隔は、プロモーターが誘導される遺伝子における、プロモーターと、それが制御する遺伝子との間隔とほぼ同じであり得る。当該技術において知られているように、この間隔の変動は、プロモーター機能を失うことなく適応され得る。
q.プロモーター
「プロモーター」は、本明細書で使用されるとき、細胞において核酸の発現を付与する、活性化する、または増強することができる合成的または天然に誘導される分子を意味し得る。プロモーターは、1つ以上の特定の転写調節配列を含み、発現を更に増強すること、ならびに/またはその空間的発現および/もしくは時間的発現を変更することができる。プロモーターは、遠位エンハンサーまたはリプレッサー要素も含むことができ、これらは、転写の開始部位から数千塩基対まで位置することができる。プロモーターは、ウイルス、細菌、真菌、植物、昆虫、および動物を含む供給源から誘導することができる。プロモーターは、遺伝子成分の発現を構造的に、あるいは発現が生じる細胞、組織、もしくは臓器に関して、または発現が生じる発生段階に関して、または生理的ストレス、病原体、金属イオン、もしくは誘導剤のような外部刺激に応答して、差別的に調節することができる。プロモーターの代表例には、バクテリオファージT7プロモーター、バクテリオファージT3プロモーター、SP6プロモーター、lacオペレータープロモーター、tacプロモーター、SV40後期プロモーター、SV40初期プロモーター、RSV−LTRプロモーター、CMV IEプロモーター、SV40初期プロモーターまたはSV40後期プロモーター、およびCMV IEプロモーターが含まれる。
r.厳密なハイブリッド形成条件
「厳密なハイブリッド形成条件」は、本明細書で使用されるとき、核酸の複合混合物におけるように、第1の核酸配列(例えば、プローブ)が第2の核酸配列(例えば、標的)とハイブリッド形成する条件を意味し得る。厳密な条件は、配列依存性であり、異なる状況において異なる。厳密な条件は、確定されたイオン強度のpHで特定の配列の熱融点(Tm)よりも約5〜10℃低くなるように選択することができる。Tmは、標的に相補的なプローブの50%が標的配列と平衡(標的配列がTmで過剰に存在するので、50%のプローブが平衡を占める)にハイブリッド形成する(確定されたイオン強度、pH、および核濃度下での)温度であり得る。厳密な条件は、塩濃度が、pH7.0〜8.3で約0.01〜1.0Mのナトリウムイオン濃度のような約1.0M未満のナトリウムイオン(または他の塩)であり、温度が、短プローブ(例えば、約10〜50個のヌクレオチド)では少なくとも約30℃、長プローブ(例えば、約50個を超えるヌクレオチド)では少なくとも約60℃であるものであり得る。厳密な条件は、ホルムアミドのような不安定化剤の添加により達成することもできる。選択的または特定的なハイブリッド形成では、陽性シグナルは、バックグラウンドハイブリッド形成の少なくとも2〜10倍であり得る。例示的な厳密なハイブリッド形成条件には、以下が含まれる:50%ホルムアミド、5×SSC、および1%SDS、42℃でのインキュベーション、または5×SSC、1%SDS、65℃でのインキュベーションと、0.2×SSCでの洗浄および65℃での0.1%SDS。
s.実質的に相補的
「実質的に相補的」は、本明細書で使用されるとき、第1の配列が第2の配列の補体と、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個、25個、30個、35個、40個、45個、50個、55個、60個、65個、70個、75個、80個、85個、90個、95個、100個、またはそれ以上のヌクレオチドもしくはアミノ酸の領域にわたって、少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、または99%同一であること、あるいは2つの配列が厳密なハイブリッド形成条件下でハイブリッド形成することを意味し得る。
t.実質的に同一
「実質的に同一」は、本明細書で使用されるとき、第1の配列および第2の配列が、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個、25個、30個、35個、40個、45個、50個、55個、60個、65個、70個、75個、80個、85個、90個、95個、100個、またはそれ以上のヌクレオチドもしくはアミノ酸の領域にわたって、あるいは第1の配列が第2の配列の補体と実質的に相補的である場合、核酸に関して、少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、または99%同一であることを意味し得る。
u.変種
「変種」は、核酸に関して本明細書で使用されるとき、(i)基準ヌクレオチド配列の一部もしくはフラグメント、(ii)基準ヌクレオチド配列の補体もしくはその一部、(iii)基準核酸もしくはその補体と実質的に同一である核酸、または(iv)厳密な条件下、基準核酸、その補体もしくはそれと実質的に同一の配列とハブリッド形成する核酸を意味する。
「変種」は、ペプチドまたはポリペプチドに関して、アミノ酸の挿入、欠失、または保存置換によりアミノ酸配列が異なるが、少なくとも1つの生物学的活性を保持する。変種は、少なくとも1つの生物学的活性を保持するアミノ酸配列を有する基準タンパク質と実質的に同一であるアミノ酸配列を有するタンパク質も意味し得る。アミノ酸の保存置換、すなわち、アミノ酸を同様の特性(例えば、親水性、荷電領域の程度および分布)の異なるアミノ酸と代えることは、典型的には僅かな修正を伴って、当該技術において認識されている。これらの僅かな修正は、部分的には、当該技術において理解されているようにアミノ酸の疎水性親水性指標を考慮することにより確認することができる。Kyte et al.,J.Mol.Biol.157:105−132(1982)。アミノ酸の疎水性親水性指標は、その疎水性および電荷の考慮に基づいている。同様の疎水性親水性指標のアミノ酸を置換して、依然としてタンパク質機能を保持できることは、当該技術において知られている。1つの態様において、±2の疎水性親水性指標を有するアミノ酸が置換される。アミノ酸の親水性を使用して、タンパク質が生物学的活性を保持することをもたらす置換を明らかにすることもできる。ペプチドの文脈におけるアミノ酸の親水性の考慮は、抗原性および免疫原性と十分相関することが報告されている有用な測度である、ペプチドの最大局所平均親水性の計算を可能にする。米国特許第4,554,101号は参照により完全に本明細書に組み込まれる。同様の親水性値を有するアミノ酸の置換は、ペプチドが生物学的活性、例えば免疫原性を保持することをもたらすことができ、このことは当該技術において理解されている。置換は、互いに±2以内の親水性値を有するアミノ酸で実施することができる。アミノ酸の疎水性指標と親水性値の両方は、そのアミノ酸の特定の側鎖により影響を受ける。その観察と一致して、生物学的機能に匹敵するアミノ酸置換は、疎水性、親水性、電荷、大きさ、および他の特性により明らかなように、アミノ酸、特にこれらのアミノ酸の側鎖の相対的な類似性に依存していることが理解される。変種は好ましくは、配列番号1〜6に95%以上、96%以上、97%以上、98%以上、または99%以上まで相同である。
同じ特定のアミノ酸配列をコードする核酸配列に関する「変種」は、異なるコドンの使用によってヌクレオチド配列が異なる。配列番号64、配列番号65、または配列番号66によってコードされるアミノ酸配列と同じアミノ酸配列をコードする配列番号64、配列番号65、または配列番号66の変種は、任意の度合いの相同性であってよく、好ましくは80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、96%以上、97%以上、98%以上、または99%以上であってよい。変種はまた、少なくとも1つの生物学的活性を保持するアミノ酸配列を伴う基準タンパク質に実質的に同一なアミノ酸配列を有する配列番号64、配列番号65、または配列番号66によってコードされるタンパク質の変種であるタンパク質をコードする、配列番号64、配列番号65、または配列番号66の変種であってもよく、典型的には、アミノ酸配列は95%以上、96%以上、97%以上、98%以上、または99%以上まで相同である。
v.ベクター
本明細書で使用される「ベクター」は、複製の起点を含有する核酸配列を意味し得る。ベクターは、プラスミド、バクテリオファージ、細菌人工染色体、または酵母人工染色体であり得る。ベクターは、DNAまたはRNAベクターであり得る。ベクターは、自己複製染色体外ベクター、または宿主ゲノムに組み込まれるベクターのいずれかであり得る。
2.タンパク質
特定のフィロウイルス抗原の複数の亜型または血清型に対する広範な免疫を誘導するために使用することができるフィロウイルス免疫原が、本明細書に提供される。コンセンサスフィロウイルス抗原はそれぞれ、マールブルグウイルスフィロウイルス糖タンパク質MARV RAV免疫原のコンセンサスアミノ酸配列、マールブルグウイルスフィロウイルス糖タンパク質MARV OZO免疫原のコンセンサスアミノ酸配列、マールブルグウイルスフィロウイルス糖タンパク質MARV MUS免疫原のコンセンサスアミノ酸配列、マールブルグウイルスフィロウイルス糖タンパク質MARV ANG免疫原の単離アミノ酸配列、ザイールエボラウイルス糖タンパク質ZEBOV免疫原のコンセンサスアミノ酸配列、およびスーダンエボラウイルス糖タンパク質SUDV免疫原のコンセンサスアミノ酸配列を含んでもよい。幾つかの実施形態では、免疫原は、例えば、IgEシグナルペプチドまたはIgGシグナルペプチドなどの免疫グロブリンタンパク質などの異なるタンパク質に由来するシグナルペプチドを含んでもよい。
免疫原に関するアミノ酸配列は、配列番号1〜6、それらの変種、ならびに配列番号1〜6のフラグメントおよびそれらの変種を含んでもよく、所望により、例えば、IgEまたはIgGシグナルペプチドなどのシグナルペプチドを含んでもよい。
3.タンパク質をコードするコード配列
本明細書に記載されるタンパク質をコードするコード配列は、定められた方法を用いて生成することができる。コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列、コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列、マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む組成物が提供され、第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列、第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列、および第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を、開示されるアミノ酸配列に基づいて生成することができる。
核酸配列は、全長コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、全長コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、全長マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原、全長第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、全長第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、または全長第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードすることができる。核酸配列は、配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、または配列番号6をコードする配列を含んでもよい。核酸配列は、配列番号64、配列番号65、または配列番号66を含んでもよい。核酸配列は所望により、例えば、IgEまたはIgGシグナルペプチドなどのシグナルペプチドをコードするコード配列を含んでもよい。
核酸配列は、全長コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のフラグメント、全長コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のフラグメント、全長マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原のフラグメント、全長第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のフラグメント、全長第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のフラグメント、または全長第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のフラグメントをコードすることができる。核酸配列は、配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、または配列番号6のフラグメントをコードする配列を含んでもよい。核酸配列は、配列番号64、配列番号65、または配列番号66のフラグメントを含んでもよい。フラグメントの大きさは、「フラグメント」と題する節に記載される通りに本明細書に開示される。酸配列は所望により、例えば、IgEまたはIgGシグナルペプチドなどのシグナルペプチドをコードするコード配列を含んでもよい。
核酸配列は、全長コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原に相同なタンパク質、全長コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原に相同なタンパク質、全長マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原に相同なタンパク質、全長第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原に相同なタンパク質、全長第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原に相同なタンパク質、または全長第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原に相同なタンパク質をコードしてもよい。核酸配列は、配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、または配列番号6に相同なタンパク質をコードする配列を含んでもよい。核酸配列は、配列番号64、配列番号65、または配列番号66に相同であってもよい。相同性の度合いは、変種の節にあるものなどの通りに本明細書に述べられる。核酸配列は所望により、例えば、IgEまたはIgGシグナルペプチドなどのシグナルペプチドをコードするコード配列を含んでもよい。
核酸配列は、全長コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のフラグメントに相同なタンパク質、全長コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のフラグメントに相同なタンパク質、全長 マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原のフラグメントに相同なタンパク質、全長第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のフラグメントに相同なタンパク質、全長第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のフラグメントに相同なタンパク質、または全長第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のフラグメントに相同なタンパク質をコードしてもよい。核酸配列は、配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、または配列番号6のフラグメントに相同なタンパク質をコードする配列を含んでもよい。核酸配列は、配列番号64、配列番号65、または配列番号66に相同なフラグメントを含んでもよい。相同性の度合いは、変種の章にあるものなどの通りに本明細書に述べられる。核酸配列は所望により、例えば、IgEまたはIgGシグナルペプチドなどのシグナルペプチドをコードするコード配列を含んでもよい。
配列番号64は、コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする、プラスミドpEBOZ内のヌクレオチド配列挿入物である。
配列番号65は、コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする、プラスミドpEBOS内のヌクレオチド配列挿入物である。
配列番号66は、マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質をコードする、プラスミド pMARZ ANG内のヌクレオチド配列挿入物である。
4.プラスミド
プラスミドは、合成の、フィロタンパク質に対する免疫応答を誘発することができるコンセンサス抗原をコードするコード配列を含む、上述に開示される様々な免疫原のうちの1つ以上をコードする核酸配列を含んでもよい。
単一のプラスミドは、単一のフィロタンパク質免疫原に関するコード配列、2つのフィロタンパク質免疫原に関するコード配列、3つのフィロタンパク質免疫原に関するコード配列、4つのフィロタンパク質免疫原に関するコード配列、5つのフィロタンパク質免疫原に関するコード配列、または6つのフィロタンパク質免疫原に関するコード配列を含有してもよい。単一のプラスミドは、併せて製剤化することができる単一のフィロタンパク質免疫原に関するコード配列を含有してもよい。幾つかの実施形態では、プラスミドは、IL−12、IL−15、および/またはIL−28をコードするコード配列を含んでもよい。
プラスミドは、コード配列の上流にあり得る開始コドン、およびコード配列の下流にあり得る終止コドンを更に含むことができる。開始および終結コドンは、抗原コード配列と共にフレーム内にあり得る。
プラスミドは、コード配列に機能的に結合しているプロモーターも含むことができる。コード配列と機能的に結合しているプロモーターは、シミアンウイルス40(SV40)のプロモーター、マウス乳癌ウイルス(MMTV)プロモーター、ウシ免疫不全ウイルス(BIV)長末端反復(LTR)プロモーターのようなヒト免疫不全ウイルス(HIV)プロモーター、モロニーウイルスプロモーター、トリ白血病ウイルス(ALV)プロモーター、サイトメガウイルス(CMV)プロモーター、例はCMV最初期プロモーター、エプスタイン・バーウイルス(EBV)プロモーター、またはラウス肉腫ウイルス(RSV)プロモーターであり得る。プロモーターは、また、ヒトアクチン、ヒトミオシン、ヒトヘモグロビン、ヒト筋肉クレアチン、またはヒトメタロチオネインのようなヒト遺伝子からのプロモーターであり得る。プロモーターは、また、天然または合成の筋肉または皮膚特異的プロモーターのような組織特異的プロモーターであり得る。そのようなプロモーターの例は、米国特許出願公開第20040175727号に記載されており、その内容はその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
プラスミドは、コード配列の下流にあり得るポリアデニル化シグナルを含むこともできる。ポリアデニル化シグナルは、SV40ポリアデニル化シグナル、LTRポリアデニル化シグナル、ウシ成長ホルモン(bGH)ポリアデニル化シグナル、ヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル、またはヒトβグロブリンポリアデニル化シグナルであり得る。SV40ポリアデニル化シグナルは、pCEP4プラスミド(Invitrogen,San Diego,CA)からのポリアデニル化シグナルであり得る。
プラスミドは、コード配列の上流にエンハンサーを含むこともできる。エンハンサーは、ヒトアクチン、ヒトミオシン、ヒトヘモグロビン、ヒト筋肉クレアチン、またはCMV、FMDV、RSV、もしくはEBVのうちの1つのようなウイルスエンハンサーであり得る。ポリヌクレオチド機能の増強は、米国特許第5,939,972号、同第5,962,428号、および国際公開公報第94/016737号に記載されており、それぞれの内容は参照により完全に組み込まれる。
プラスミドは、プラスミド染色体外性を維持し、かつ細胞内にプラスミドの複数のコピーを産生するため、哺乳類の複製の起点を含むこともできる。プラスミドは、エプスタイン・バーウイルスの複製の起点を含むことができるInvitrogen(San Diego,CA)からのpVAX1、pCEP4、またはpREP4、および組み込みなしで高コピーエピソーム複製を生じることができる核抗原EBNA−1コード領域であり得る。プラスミドの主鎖は、pAV0242であり得る。プラスミドは、複製欠損アデノウイルス型5(Ad5)プラスミドであり得る。
プラスミはド、プラスミドが投与される細胞における遺伝子発現に十分に適切であり得る調節配列を含むこともできる。コード配列は、宿主細胞におけるコード配列のより効率的な転写を可能にし得るコドンを含むことができる。
コード配列は、Igリーダー配列を含むこともできる。リーダー配列は、コード配列の5′であり得る。この配列でコードされるコンセンサス抗原は、N末端Igリーダー、続いてコンセンサス抗原タンパク質を含むことができる。N末端Igリーダーは、IGEまたはIgGであり得る。
プラスミドは、エシェリキア・コリ(大腸菌)におけるタンパク質産生に使用することができるpSE420(Invitrogen,San Diego,Calif)であり得る。プラスミドは、酵母のサッカロマイセス・セレビシエ株におけるタンパク質産生に使用することができるpYES2(Invitrogen,San Diego,Calif)でもあり得る。プラスミドは、昆虫細胞におけるタンパク質産生に使用することができる、MAXBAC(商標)完全バキュロウイルス発現系(Invitrogen,SanDiego,Calif.)でもあり得る。プラスミドは、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞のような哺乳類細胞におけるタンパク質産生に使用することができる、pcDNA IまたはpcDNA3(Invitrogen,San Diego,Calif.)でもあり得る。
5.組成物
核酸分子を含む組成物が提供される。組成物は、単一のプラスミドのような単一の核酸分子の複数のコピー、2つ以上の異なるプラスミドのような2つ以上の異なる核酸分子の複数のコピーを含むことができる。例えば、組成物は、複数の2、3、4、5、6、7、8、9、もしくは10個、またはそれ以上の異なる核酸分子を含むことができる。そのような組成物は、複数の、2、3、4、5、6個、またはそれ以上の異なるプラスミドを含むことができる。
組成物は、1つ以上のコンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質、第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、および第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原からなる群から選択される単一のフィロタンパク質免疫原に関するコード配列を集合的に含有する、例えば、プラスミドなどの核酸分子を含むことができる。
組成物は、コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原およびコンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原;またはコンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、およびマールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質;またはコンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、および第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原;またはコンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質、第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、および第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原の組み合わせをコードする核酸配列を含む。各フィロタンパク質免疫原に関する各コード配列は、好ましくは別々のプラスミド上に含まれる。したがって、コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原およびコンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む組成物は、単一のプラスミド上にあることができるが、好ましくは2つの別々のプラスミド上にある。コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、およびマールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質をコードする核酸配列を含む組成物は、単一のプラスミド上にあってもよく、または任意の順列で2つのプラスミド上にあってもよいが、好ましくは3つの分離したプラスミド上にある。コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、および第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む組成物は、単一のプラスミド上にあってもよく、または任意の順列で2つのプラスミド上にあってもよく、または任意の順列で3つのプラスミド上にあってもよく、または任意のパームエイションで4つのプラスミド上にあってもよいが、好ましくは5つの分離したプラスミド上にある。同様に、コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、および第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む組成物は、単一のプラスミド上にあってもよく、または任意の順列で2つのプラスミド上にあってもよく、または任意の順列で3つのプラスミド上にあってもよく、または任意のパームエイションで4つのプラスミド上にあってもよいが、好ましくは5つの分離したプラスミド上にある。
6.ワクチン
哺乳動物においてフィロウイルス、具体的には、マールブルグウイルス、エボラウイルス・スーダン、および/またはエボラウイルス・ザイールに対して免役応答を生成することができるワクチンが、本明細書に提供される。ワクチンは、上で考察されたそれぞれのプラスミドを含むことができる。ワクチンは、複数のプラスミドまたはそれらの組み合わせを含むことができる。ワクチンは、治療または予防免疫応答を誘導するために提供され得る。
ワクチンは、コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原およびコンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸分子を送達するために使用されてもよい。ワクチンは、コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、およびマールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質をコードする核酸分子を送達するために使用されてもよい。ワクチンは、コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、および第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸分子を送達するために使用されてもよい。ワクチンは、コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質、第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原、および第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸分子を送達するために使用されてもよい。ワクチンは好ましくは、プラスミドを含む組成物である。
ワクチンは、薬学的に許容される賦形剤を更に含むことができる。薬学的に許容される賦形剤は、ビヒクル、アジュバント、担体、または希釈剤としての機能分子であり得る。薬学的に許容される賦形剤は、免疫刺激複合体(ISCOMS)のような界面活性剤、フロイント不完全アジュバント、モノホスホリル脂質Aを含むLPS類縁体、ムラミルペプチド、キノン類縁体、スクアレンおよびスクアレンのような小胞、ヒアルロン酸、脂質、リポソーム、カルシウムイオン、ウイルス粒子、ポリアニオン、ポリカチオン、もしくはナノ粒子が含まれ得る形質移入促進剤、または他の既知の形質移入促進剤であり得る。
形質移入促進剤は、ポリ−L−グルタミン酸(LGS)を含むポリアニオン、ポリカチオン、または脂質である。形質移入促進剤は、ポリ−L−グルタミン酸であり、より好ましくは、ポリ−L−グルタミン酸は6mg/ml未満の濃度でワクチンに存在する。形質移入促進剤は、免疫刺激複合体(ISCOMS)のような界面活性剤、フロイント不完全アジュバント、モノホスホリル脂質Aを含むLPS類縁体、ムラミルペプチド、キノン類縁体、ならびにスクアレンおよびスクアレンのような小胞を含むことができ、ヒアルロン酸を遺伝子構築物と一緒に投与に使用することもできる。幾つかの実施形態において、DNAプラスミドワクチンは、脂質、レクチンリポソーム、もしくはDNAリポソーム混合物(例えば、国際公報第09324640号を参照すること)のような当該技術において既知の他のリポソームを含むリポソーム、カルシウムイオン、ウイルス粒子、ポリアニオン、ポリカチオン、もしくはナノ粒子のような形質移入促進剤、または他の既知の形質移入促進剤を含むこともできる。好ましくは、形質移入促進剤は、ポリ−L−グルタミン酸(LGS)を含むポリアニオン、ポリカチオン、または脂質である。ワクチン中の形質移入剤の濃度は、4mg/ml未満、2mg/ml未満、1mg/ml未満、0.750mg/ml未満、0.500mg/ml未満、0.250mg/ml未満、0.100mg/ml未満、0.050mg/ml未満、または0.010mg/ml未満である。
薬学的に許容される賦形剤は1つ以上のアジュバントであり得る。アジュバントは、ワクチンにおいて、同じもしくは代替的なプラスミドに発現される、または上記のプラスミドと組み合わされたタンパク質として送達される、他の遺伝子であり得る。1つ以上のアジュバントは、CCL20、α−インターフェロン(IFN−α)、β−インターフェロン(IFN−β)、γ−インターフェロン、血小板由来増殖因子(PDGF)、TNFα、TNFβ、GM−CSF、上皮増殖因子(EGF)、皮膚T細胞誘引性ケモカイン(CTACK)、胸腺上皮発現ケモカイン(TECK)、粘膜関連上皮ケモカイン(MEC)、IL−12、欠失されたシグナル配列をコードするシグナル配列またはコード配列を有し、かつIgEからのもののような異なるシグナルペプチド、またはIgEからのもののような異なるシグナルペプチドをコードするコード配列を任意に含むIL−15を含む、IL−15、IL−28、MHC、CD80、CD86、IL−1、IL−2、IL−4、IL−5、IL−6、IL−10、IL−18、MCP−1、MIP−1α、MIP−1β、IL−8、L−セレクチン、P−セレクチン、E−セレクチン、CD34、GlyCAM−1、MadCAM−1、LFA−1、VLA−1、Mac−1、pl50.95、PECAM、ICAM−1、ICAM−2、ICAM−3、CD2、LFA−3、M−CSF、G−CSF、IL−18の突然変異形態、CD40、CD40L、血管増殖因子、線維芽細胞増殖因子、IL−7、神経増殖因子、血管内皮増殖因子、Fas、TNF受容体、Flt、Apo−1、p55、WSL−1、DR3、TRAMP、Apo−3、AIR、LARD、NGRF、DR4、DR5、KILLER、TRAIL−R2、TRICK2、DR6、カスパーゼICE、Fos、c−jun、Sp−1、Ap−1、Ap−2、p38、p65Rel、MyD88、IRAK、TRAF6、IkB、不活性NIK、SAP K、SAP−1、JNK、インターフェロン応答遺伝子、NFkB、Bax、TRAIL、TRAILrec、TRAILrecDRC5、TRAIL−R3、TRAIL−R4、RANK、RANK LIGAND、Ox40、Ox40 LIGAND、NKG2D、MICA、MICB、NKG2A、NKG2B、NKG2C、NKG2E、NKG2F、TAP1、TAP2、およびこれらの機能性フラグメント、またはこれらの組み合わせからなる群から選択されるタンパク質および/またはタンパク質をコードする核酸分子であり得る。幾つかの実施形態において、アジュバントは、CCL−20、IL−12、IL−15、IL−28、CTACK、TECK、MEC、またはRANTESからなる群から選択される1つ以上のタンパク質および/またはタンパク質をコードする核酸分子であり得る。IL−12の構築物および配列の例は、PCT出願第PTC/US1997/019502号、ならびに対応する米国特許出願第08/956,865号および2011年12月12日に出願の米国特許仮出願第61/569600号に開示されており、これらはそれぞれ参照により本明細書に組み込まれる。IL−15の構築物および配列の例は、PCT出願第PCT/US04/18962号および対応する米国特許出願第10/560,650号、ならびにPCT出願第PCT/US07/00886号および対応する米国特許出願第12/160,766号、ならびにPCT出願第PCT/US10/048827号に開示されており、これらはそれぞれ参照により本明細書に組み込まれる。IL−28の構築物および配列の例は、PCT出願第PTC/US09/039648号および対応する米国特許出願第12/936,192号に開示されており、これらはそれぞれ参照により本明細書に組み込まれる。RANTESおよび他の構築物および配列の例は、PCT出願第PTC/US1999/004332号および対応する米国特許出願第09/622452号に開示されており、これらはそれぞれ参照により本明細書に組み込まれる。RANTESの構築物および配列の他の例は、PCT出願番号PTC/US11/024098号に開示されており、これは参照により本明細書に組み込まれる。RANTESおよび他の構築物および配列の例は、PCT出願第PTC/US1999/004332号および対応する米国特許出願第09/622452号に開示されており、これらはそれぞれ参照により本明細書に組み込まれる。RANTESの構築物および配列の他の例は、PCT出願番号PTC/US11/024098号に開示されており、これは参照により本明細書に組み込まれる。ケモカインのCTACK、TECK、およびMECの構築物および配列の例は、PCT出願第PTC/US2005/042231号および対応する米国特許出願第11/719/646号に開示されており、これらはそれぞれ参照により本明細書に組み込まれる。OX40および他の免疫調節剤の例は、米国特許出願第10/560,653号に開示されており、これは参照により本明細書に組み込まれる。DR5および他の免疫調節剤の例は、米国特許出願第09/622452号に開示されており、これは参照により本明細書に組み込まれる。
ワクチンは、1994年4月1日に出願の米国特許出願第021/579号に記載されている遺伝子ワクチン促進剤を更に含むことができる。
ワクチンは、約1ナノグラムから100ミリグラム、約1マイクログラムから約10ミリグラム、または好ましくは約0.1マイクログラムから約10ミリグラム、またはより好ましくは約1ミリグラムから約2ミリグラムの量でコンセンサス抗原およびプラスミドを含むことができる。幾つかの好ましい実施形態において、本発明による薬学的組成物は、約5ナノグラムから約1000マイクログラムのDNAを含む。幾つかの好ましい実施形態において、薬学的組成物は、約10ナノグラムから約800マイクログラムのDNAを含有する。幾つかの好ましい実施形態において、薬学的組成物は、約0.1〜約500マイクログラムのDNAを含有する。幾つかの好ましい実施形態において、薬学的組成物は、約1〜約350マイクログラムのDNAを含有する。幾つかの好ましい実施形態において、薬学的組成物は、約25〜約250マイクログラム、約100〜約200マイクログラム、約1ナノグラムから100ミリグラム、約1マイクログラムから約10ミリグラム、約0.1マイクログラムから約10ミリグラム、約1ミリグラムから約2ミリグラム、約5ナノグラムから約1000マイクログラム、約10ナノグラムから約800マイクログラム、約0.1〜約500マイクログラム、約1〜約350マイクログラム、約25〜約250マイクログラム、約100〜約200マイクログラムのコンセンサス抗原およびそのプラスミドを含有する。
ワクチンは、使用される投与様式に従って製剤化することができる。注射用ワクチンの薬学的組成物は、滅菌、発熱物質無含有、および粒子無含有であり得る。等張製剤または液剤を使用することができる。等張のための添加剤には、塩化ナトリウム、デキストロース、マンニトール、ソルビトール、およびラクトースが含まれ得る。ワクチンは、血管収縮剤を含むことができる。等張液剤には、リン酸緩衝食塩水が含まれ得る。ワクチンは、ゼラチンおよびアルブミンを含む安定剤を更に含むことができる。安定化は、製剤が室温または周囲温度で長時間安定であることを可能にし得、例えば、ワクチン製剤へのLGS、またはポリカチオンもしくはポリアニオンであり得る。
7.ワクチンの送達方法
それらに対する免疫応答が誘導され得るフィロウイルス、具体的には、マールブルグウイルス、エボラウイルス・スーダン、および/またはエボラウイルス・ザイールの特に有効な免疫原となるエピトープを含む、コンセンサス抗原の遺伝子構築物およびタンパク質を提供するためのワクチンを送達するため方法が、本明細書において提供される。ワクチンを送達する、またはワクチン接種の方法は、治療的および予防的な免疫応答を誘導するために提供することができる。ワクチン接種プロセスは、フィロウイルス、具体的には、マールブルグウイルス、エボラウイルス・スーダン、および/またはエボラウイルス・ザイールに対する免疫応答を哺乳動物において生成することができる。ワクチンを個体に送達して、哺乳動物の免疫系の活性を調節し、免疫応答を増強することができる。ワクチンの送達は、細胞内で発現し、細胞の表面に送達され、その時点で免疫系が認識し、細胞性、液性、または細胞性および液性の応答を誘導する核酸分子としてのコンセンサス抗原の形質移入であり得る。ワクチンの送達は、上記に考察されたワクチンを哺乳動物に投与することによって、フィロウイルス、具体的には、マールブルグウイルス、エボラウイルス・スーダン、および/またはエボラウイルス・ザイールに対する免疫応答を哺乳動物に誘導または誘発するために使用することができる。
哺乳動物の細胞へのワクチンおよびプラスミドの送達によって、形質移入細胞が発現し、ワクチンから注入されたそれぞれのプラスミドへコンセンサス抗原を分泌する。これらのタンパク質は、免疫系により外来性であると認識され、これらに対して抗体が作製される。これらの抗体は、免疫系によって維持され、続くフィロウイルス、具体的には、マールブルグウイルス、エボラウイルス・スーダン、および/またはエボラウイルス・ザイールによる感染への有効な応答を可能にする。
ワクチンを哺乳動物に投与して、免疫応答を哺乳動物に誘発することができる。哺乳動物は、ヒト、霊長類、非ヒト霊長類、ウシ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、アンテロープ、バイソン、スイギュウ、バイソン、ウシ科、シカ、ハリネズミ、ゾウ、ラマ、アルパカ、マウス、ラット、およびニワトリであり得る。
a.併用治療
ワクチンは、CCL20、α−インターフェロン、γ−インターフェロン、血小板由来増殖因子(PDGF)、TNFα、TNFβ、GM−CSF、上皮増殖因子(EGF)、皮膚T細胞誘引性ケモカイン(CTACK)、胸腺上皮発現ケモカイン(TECK)、粘膜関連上皮ケモカイン(MEC)、IL−12、欠失されたシグナル配列を有し、かつIgEシグナルペプチドのような異なるシグナルペプチド任意に含むIL−15を含む、IL−15、MHC、CD80、CD86、IL−28、IL−1、IL−2、IL−4、IL−5、IL−6、IL−10、IL−18、RANTES、MCP−1、MIP−1α、MIP−1β、IL−8、L−セレクチン、P−セレクチン、E−セレクチン、CD34、GlyCAM−1、MadCAM−1、LFA−1、VLA−1、Mac−1、pl50.95、PECAM、ICAM−1、ICAM−2、ICAM−3、CD2、LFA−3、M−CSF、G−CSF、IL−18の突然変異形態、CD40、CD40L、血管増殖因子、線維芽細胞増殖因子、IL−7、神経増殖因子、血管内皮増殖因子、Fas、TNF受容体、Flt、Apo−1、p55、WSL−1、DR3、TRAMP、Apo−3、AIR、LARD、NGRF、DR4、DR5、KILLER、TRAIL−R2、TRICK2、DR5、カスパーゼICE、Fos、c−jun、Sp−1、Ap−1、Ap−2、p38、p65Rel、MyD88、IRAK、TRAF6、IkB、不活性NIK、SAP K、SAP−1、JNK、インターフェロン応答遺伝子、NFkB、Bax、TRAIL、TRAILrec、TRAILrecDRC5、TRAIL−R3、TRAIL−R4、RANK、RANK LIGAND、Ox40、Ox40 LIGAND、NKG2D、MICA、MICB、NKG2A、NKG2B、NKG2C、NKG2E、NKG2F、TAP1、TAP2、およびこれらの機能性フラグメント、またはこれらの組み合わせをコードする、他のタンパク質および/または遺伝子と組み合わせて投与され得る幾つかの実施形態において、ワクチンは、以下の核酸分子および/またはタンパク質の1つ以上と組み合わせて投与され、核酸分子は、CCL20、IL−12、IL−15、IL−28、CTACK、TECK、MEC、およびRANTES、またはこれら機能性のフラグメントの1つ以上をコードするコード配列を含む核酸分子からなる群から選択され、タンパク質は、CCL02、IL−12タンパク質、IL−15タンパク質、IL−28タンパク質、CTACKタンパク質、TECKタンパク質、MEKタンパク質、もしくはRANTESタンパク質、またはこれらの機能性フラグメントからなる群から選択される。
ワクチンは、経口、非経口、舌下、経皮、直腸内、経粘膜、局所、吸入、口腔内投与、胸膜内、静脈内、動脈内、腹腔内、皮下、筋肉内、鼻腔内、鞘内、および関節内、またはこれらの組み合わせを含む異なる経路で投与することができる。獣医学的使用では、組成物を、通常の獣医学の診療に適切に許容される製剤として投与することができる。獣医師は、特定の動物に最も適した投与レジメンおよび投与経路を容易に決定することができる。ワクチンは、伝統的なシリンジ、無針注射装置、「微粒子銃」、または電気穿孔(「EP」)、「流体力学法」、もしくは超音波のような他の物理的方法により投与することができる。
ワクチンのプラスミドは、インビボ電気穿孔を用いるおよび用いないDNA注入(DNAワクチン接種とも呼ばれる)、組み換えアデノウイルス、組み換えアデノウイルス関連ウイルス、および組み換えワクシニアのようなリポソーム仲介、ナノ粒子促進組み換えベクターを含む幾つかの周知の技術により哺乳動物に送達することができる。コンセンサス抗原は、DNA注入を介し、インビボ電気穿孔を伴って送達することができる。
b.電気穿孔
ワクチンのプラスミドの電気穿孔を介したワクチンの投与は、細胞膜に可逆的細孔を形成させるのに有効なエネルギーパルスを、哺乳動物の所望の組織に送達すように構成され得る電気穿孔装置を使用して達成することができ、好ましくは、エネルギーパルスは、使用者により予め設定された電流入力に類似した定電流である。電気穿孔装置は、電気穿孔構成要素および電極アセンブリーまたはハンドルアセンブリーを含むことができる。電気穿孔構成要素は、制御装置、電流波形発生器、インピーダンス試験器、波形自動記録器、入力要素、状況報告要素、通信ポート、記憶装置構成要素、電源、および電源スイッチが含まれる、電気穿孔装置の様々な要素の1つ以上を含み、組み込むことができる。電気穿孔は、インビボ電気穿孔装置、例えば、CELLECTRA EPシステム(VGX Pharmaceuticals,Blue Bell,PA)またはElgen電気穿孔機(Genetronics,San Diego,CA)を使用することにより達成され、プラスミドによる細胞の形質移入を促進することができる。
電気穿孔構成要素は、電気穿孔装置の1つの要素として機能することができ、他の要素は、電気穿孔構成要素と通信する別個の要素(または構成要素)である。電気穿孔構成要素は、電気穿孔装置の1つを超える要素として機能することができ、これも、電気穿孔構成要素から離れている電気穿孔装置の他の要素と通信し得る。電気機械的または機械的な装置の一部として存在する電気穿孔装置の要素は、1つの装置として、または互いに通信する別個の要素として機能し得る要素として限定されることはない。電気穿孔構成要素は、所望の組織に定電流を生じるエネルギーパルスを送達することができ得、フィードバック機構を含む。電極アセンブリーは、空間を開けて配置された複数の電極を有する電極配列を含むことができ、ここで電極アセンブリーは、電気穿孔構成要素からのエネルギーパルスを受け取り、これを、電極を介して所望の組織に送達する。複数の電極の少なくとも1つは、エネルギーパルスの送達の間は中性であり、所望の組織においてインピーダンスを測定し、インピーダンスを電気穿孔構成要素に通信する。フィードバック機構は、測定されたインピーダンスを受け取ることができ、電気穿孔構成要素により送達されたエネルギーパルスを調整して、定電流を維持することができる。
複数の電極が、分散パターンでエネルギーパルスを送達することができる。複数の電極は、プログラム化シーケンスによる電極の制御を介する分散パターンでエネルギーパルスを送達することができ、プログラム化シーケンスは、使用者により電気穿孔構成要素に入力される。プログラム化シーケンスは、シーケンスで送達された複数のパルスを含むことができ、複数のパルスのそれぞれのパルスは、インピーダンスを測定する1つの中性電極を有する少なくとも2つの活性電極により送達され、後から続く複数のパルスは、インピーダンスを測定する1つの中性電極を有する少なくとも2つの活性電極のうちの異なる1つにより送達される。
フィードバック機構は、ハードウエアまたはソフトウエアのいずれかにより実施することができる。フィードバック機構は、アナログ閉ループ回路により実施することができる。フィードバックは、50μs、20μs、10μs、または1μs毎に発生するが、好ましくはリアルタイムフィードバックまたは瞬時(すなわち、応答時間を決定する利用可能な技術により決定される、実質的な瞬時)である。中性電極は、所望の組織においてインピーダンスを測定し、インピーダンスをフィードバック機構に通信することができ、フィードバック機構は、インピーダンス応答し、エネルギーパルスを調整して、予め設定された電流と類似した値に定電流を維持する。フィードバック機構は、エネルギーパルスの送達の間に定電流を連続的または瞬時に維持することができる。
本発明のDNAワクチンの送達を促進することができる電気穿孔装置および電気穿孔法の例には、Draghia−Akli,et al.による米国特許第7,245,963号、Smith,et al.による米国特許公開第2005/0052630号に記載されたものが含まれ、これらの内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。DNAワクチンの送達の促進に使用することができる他の電気穿孔装置および電気穿孔法には、2006年10月17日出願の米国特許仮出願第60/852,149号および2007年10月10日出願の同第60/978,982号の特許法119条(e)に基づく利益を主張する、2007年10月17日出願の同時係属および共有の米国特許出願第11/874072号において提供されたものが含まれ、これらは全て、その全体が参照により組み込まれる。
Draghia−Akliらによる米国特許第7,245,963号は、身体または植物内の選択された組織の細胞への生体分子の導入を促進するためのモジュール式電極システムおよびこれらの使用を記載する。モジュール式電極システムは、複数の針電極、皮下注射針、プログラム可能定電流パルス制御装置から複数の針電極へ導電性インクを提供する電気コネクタ、および電源を含むことができる。操作者は、支持構造に装填された複数の針電極をつかみ、それらを身体または植物の選択された組織の中にしっかりと挿入することができる。次に生体分子が、選択された組織内に皮下注射針を介して送達される。プログラム可能定電流パルス制御装置を作動し、定電流電気パルスを複数の針電極に適用する。適用される定電流電気パルスは、複数の電極の間の細胞への生体分子の導入を促進する。米国特許第7,245,963号の全ての内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
Smithらにより提出された米国特許公開第2005/0052630号は、身体または植物内の選択された組織の細胞への生体分子の導入を効果的に促進するために使用され得る電気穿孔装置を記載する。電気穿孔装置は、動作がソフトウエアまたはファームウエアにより特定される動電学的装置(「EKD装置」)を含む。EKD装置は、電極配列の間に一連のプログラム可能定電流パルスパターンを、使用者の制御およびパルスパラメーターの入力に基づいて生成し、電流波形データの記憶および取得を可能にする。電気穿孔装置は、また、針電極の配列を有する交換可能な電極ディスク、注入針の中央注入チャンネル、および取り外し可能なガイドディスクを含む。米国特許公開第2005/0052630号の全ての内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
米国特許第7,245,963号および米国特許公開第2005/0052630号に記載されている電極配列および方法を、筋肉のような組織のみならず、他の組織または臓器の中にも深く侵入するように適合させることができる。電極配列の構成のため、(選択された生体分子を送達する)注入針も、標的臓器の中に完全に挿入され、注入は、電極により予め描かれた領域内の標的組織に対して垂直に施用される。米国特許第7,245,963号および米国特許公開第2005/0052630号に記載されている電極は、好ましくは長さが20mmであり、ゲージが21である。
加えて、電気穿孔装置およびその使用を組み込む幾つかの実施形態において考慮されるように、以下の特許:1993年12月28日発行の米国特許第5,273,525号、2000年8月29日発行の米国特許第6,110,161号、2001年7月17日発行の同第6,261,281号、および2005年10月25日発行の同第6,958,060号、ならびに2005年9月6日発行の米国特許第6,939,862号に記載される電気穿孔装置が存在する。更に、様々な装置のいずれかを使用したDNAの送達に関する2004年2月24日発行の米国特許第6,697,669号、およびDNAを注入する方法を対象とする2008年2月5日発行の米国特許第7,328,064号に提供された主題を網羅する特許が、本明細書において考慮される。上記の特許は、その全体が参照により組み込まれる。
c.DNAプラスミドの調製方法
本明細書で考察されているDNAワクチンを含むDNAプラスミドを調製する方法が、本明細書において提供される。DNAプラスミドは、哺乳類発現プラスミドへの最終サブクローニングステップの後、当該技術において既知の方法を使用して、大規模発酵タンク中の細胞培養物への接種に使用することができる。
本発明のEP装置で使用されるDNAプラスミドは、既知の装置および技術の組み合わせを使用して製剤化および製造することができるが、好ましくは、これらは2007年5月23日出願の契約対象同時継続米国特許仮出願第60/939,792号に記載されている最適化プラスミド製造技術を使用して製造される。幾つかの例において、これらの研究に使用されたDNAプラスミドを、10mg/mL以上の濃度で製剤化することができる。製造技術は、また、契約対象特許である2007年7月3日出願の米国特許第7,238,522号に記載されているものを含む、米国特許出願第60/939792号に記載されているものに加えて、当業者に一般的に既知の様々な装置およびプロトコールを含む、または組み込む。上で参照された出願および特許である米国特許出願第60/939,792号および米国特許第7,238,522号は、それぞれその全体が本明細書に組み込まれる。
本発明は以下の実施例において更に説明される。これらの実施例は、本発明の好ましい実施形態を示しているが、例示のためにのみ提示されていることが理解されるべきである。上記の考察およびこれらの実施例から、当業者は、本発明の本質的な特長を確認することができ、本発明の精神および範囲から逸脱することなく、本発明の様々な変更および修正を行って様々な用途および条件に適合させることができる。したがって、本明細書において示され、記載されているものに加えて、本発明の様々な変更が、前記の記載から当業者には明白となるであろう。そのような変更も、添付の特許請求の範囲の範囲内であることが意図される。
実施例1
方法
プラスミドワクチン構築
pMARV、pEBOS、およびpEBOZプラスミドDNA構築物は、全長GPタンパク質をコードする。アミノ酸コンセンサス戦略を、pEBOSおよびpEBOZのために使用し、一方2005Angola発生株に由来する型マッチ配列(GenBank #VGP_MABVR)を、pMARVのために使用した(Towner JS,et al.(2006).Marburgvirus genomics and association with a large hemorrhagic fever outbreak in Angola.J Virol 80:6497−6516)。コンセンサス配列を、主流のZEBOVおよびSUDV GPアミノ酸配列の整列、およびそれぞれに関するコンセンサスの生成によって決定した。各ワクチンGP遺伝子を、ヒトにおける発現において遺伝的に最適化し(タンパク質発現を増強するためのコドン最適化およびRNA最適化を含む(GenScript,Piscataway,NJ))、商業的に合成し、次にサイトメガロウイルス初期(CMV)プロモーターの制御下で改変されたpVAX1哺乳動物の発現ベクター(Invitrogen,Carlsbad,CA)へとサブクローニングした(GenScript,Piscataway,NJ)。改変は、2A>C、3C>T、4T>G、241C>G、1,942C>T、2,876A>−、3,277C>T、および3,753G>Cを含む。系統発生分析を、MEGAバージョン5ソフトウエアを用いてClustalWによる多重整列によって実施した。別法として、MARV間のGP多様性は、比較において遥かに高かったため(約70%の同一性)、コンセンサス戦略は適用されなかった。MARVの対応範囲のため、我々は、アンゴラにおける2005発生に由来するMGP配列(GenBank #VGP_MABVR)が、今日までで最大規模かつ最も致命的なMARV発生の唯一の原因であったため、その利用を選択した。この配列は、Musoke、Popp、およびLeiden(10.6%分岐)、またはUganda(01Uga07)、Durba(05DRC99および07DRC99)、およびOzolin(10.3%分岐)を含む、関連株の最も近いクラスターのいずれかからも10%超分岐した。全体として、3つのプラスミド戦略は、我々の新規の三価多価フィロウイルスワクチン戦略の基盤を形成した。
形質移入および免疫ブロット
ヒト胎児性腎臓(HEK)293T細胞を培養し、形質移入し、採取した。手短に述べると、細胞は、10%FBS、1%Pen−strep、ピルビン酸ナトリウム、およびL−グルタミンと共にDMEM中で成長させた。細胞を、150mmコーニング皿内で培養し、5%CO2を伴う37°インキュベーター内で一晩、70%集密まで成長させた。皿を、製造者プロトコールに従って、Calphos(商標)Mammalian Transfection Kitプロトコル(Clonetech)かまたはLipofectamine(商標)2000試薬(Invitrogen)かを用いて10〜25μgのフィロウイルス科pDNAで形質移入し、次に24〜48時間インキュベートした。細胞を、冷たいPBSで採取し、遠心分離および洗浄した後、ウエスタン免疫ブロットまたはFACS解析のためにペレット化した。標準ウエスタンブロットを使用し、GP1検出のためにGP特異性MAbを生成した。ウエスタン免疫ブロット法実験からのデータが、図1Bに示される。FACS解析からのデータが、図1Cに示される。
動物、ワクチン接種、および攻撃
成体メスC57BL/6(H−2b)、BALB/cJ(H−2d)、およびBl0.Br(H−2k)マウスを、The Jackson Laboratory(Bar Harbor,ME)から購入し、一方ハートレイ系モルモットをCharles River(Wilmington,MA)から購入した。全ての動物実験は、UPenn IACUC and School of Medicine Animal Facility、またはNML Institutional Animal Care Committee of the PHAC and the Canadian Council on Animal Care guidelines for housing and care of laboratory animalsに従って行い、上述の機関による関連チェックおよび認可後に、Guide for the Care and Use of Laboratory Animals of NIHにおける推奨事項に従って実施した。UPennおよびNMLは、動物の福祉に関するNIHポリシー、Animal Welfare Act、および他の全ての該当の連邦法、州法、および現地法に適合する。
マウスを、水中で再懸濁した40μgのプラスミドによる筋肉内針注射によって免疫付与し、一方モルモットは、3つの別個のワクチン接種部位にそれぞれ200μg、皮内に免疫付与した。ワクチン接種の直後に、同一部位にEPを続けた。手短に述べると、3又のCELLECTRA(登録商標)adaptive constant currentMinimally Invasive Deviceを、皮内に約2mm挿入した(Inovio Pharmaceuticals,Inc.,Blue Bell,PA)。矩形波パルスを、26ゲージ固体ステンレス鋼電極からなる三角3電極アレイを通じて送達し、0.1Ampの2つの一定電流パルスを、1秒の遅延によって分離し52m秒/パルス送達した。
致死的攻撃試験のために、攻撃は、齧歯動物に適合したZEBOVおよびMARVに限定した。モルモットを、1,000LD50のモルモットに適合したZEBOV(21.3FFU/動物)(Richardson JS,Abou MC,Tran KN,Kumar A,Sahai BM,Kobinger GP(2011).Impact of systemic or mucosal immunity to adenovirus on ad−based Ebola virus vaccine efficacy in guinea pigs.J Infect Dis 204 Suppl 3:S1032−1042)、または1,000LD50MARV−Angola(681 TCID50/動物)による腹腔内注射による最終ワクチン接種の28日後に攻撃した。手短に述べると、モルモット適合したMARVを、非近交系の成体メスハートレイ系モルモットにおける野生型MARV−Angolaの連続継代によって作製した。植菌の7日後、動物を安楽死させ、肝臓を採取し、均質化した。この均等質を、次にナイーブ成体モルモットに腹腔内注入し、動物が体重減少し、毛艶を失い、モルモットにおけるEBOV適応と同様の感染にかかるまでプロセスを反復した。マウス致死的試験のために(Kobinger GP,et al.(2006).Chimpanzee adenovirus vaccine protects against Zaire Ebola virus.Virology 346:394−401)、マウス に、200μlの1,000LD50(10 FFU/動物)のマウス適合したZEBOVを腹腔内注入した。全ての動物を、毎日体重測定し、認可されたスコアシートを用いて少なくともマウスに関して18日間、モルモットに関して22日間、疾患進行に関してモニタリングした。全ての感染作業は、NML、PHACにおける「バイオセーフティーレベル4」(BSL4)の施設内で実施した。
ELISAおよび中和分析
抗体(Ab)価を、スクロース精製したMARV Ozolin GPもしくはZGPか、または負の対照スクロース精製したNipah Gタンパク質かで1:2,000の濃度でコーティングした96ウエルELISAプレートを用いて決定した。手短に述べると、プレートを次に、4℃で18時間インキュベートし、PBSおよび0.1%Tween−20で洗浄し、100μl/標本の血清を三連で試験した(5%スキムミルクおよび0.5%Tween−20を伴うPBS中で1:100、1:400、1:1,600、および1:6,400の希釈)。湿潤容器中で37℃にて1時間インキュベーションした後、プレートを洗浄し、次に100μlのヤギ抗マウスIgG−共役HRP抗体(Cedarlane)を添加し(1:2,000希釈)、湿潤容器中で更に37℃で1時間インキュベートした。洗浄後、100μlのABST(2,2’−アジノ−ビス(3−エチルベンチアゾリン−6−スルホン酸)およびペルオキシダーゼ基質(Cedarlane)を添加して、Ab結合を可視化した。再び湿潤容器中で、プレートを37℃で30分間インキュベートし、次にその後405nmで読み取った。正の結合結果を、負の対照血清から正の対照を減じ、3標準偏差超とすることによって特徴付けした。
ZEBOV中和分析を実施した。手短に述べると、免疫付与したマウスおよびモルモットに由来する血清を、56℃で45分間不活性化し、各標本の一連の希釈物(50μlのDMEM中で、マウスに関して1:20、1:40など、またモルモットに関して1:50)をEGFPレポーター遺伝子(ZEBOV−EGFP)(100形質導入単位/ウエル、EGFP発現に従う)を発現する同体積のZEBOVと混合し、37℃で90分間インキュベートした。次に、混合物を96ウエル平底プレート内の準密集(sub−confluent)VeroE6上に移し、室温にて5〜10分間インキュベートした。対照ウエルを、血清または非免疫血清の添加を伴わずに、同量のZEBOV−EGFPウイルスで感染させた。次に、20%FBSを補充した100μlのDMEMを各ウエルに添加し、プレートを5%CO2中で37℃で48時間インキュベートした。
別法として、MARV−Angola368の中和を、免疫蛍光分析を用いて評価した。正常ウサギ抗MARV Abおよび二次ヤギ抗ウサギIgG FITC共役Abを、検出のために用いた。SUDV Bonifaceに対する中和Ab(NAb)を、CV−1細胞上の細胞変性効果(CPE)に基づいて分析した。細胞を、等部の免疫付与した血清およびSUDV Bonifaceを用いて10日間インキュベートし、その後10%緩衝ホルマリンで24時間固定し、光学顕微鏡下で検査した。EGFPおよびFITCに陽性の細胞を、各ウエル内で計数し、対照と比較して緑色細胞の数において50%超の低減を示す標本希釈を、NAbに関して陽性スコア化した。別法として、SUDV−Bonifaceに対するNAbを、CV−1細胞上の細胞変性効果(CPE)に基づいて分析した。全ての感染作業は、NML、PHACのBSL4実験室内で実施した。
脾細胞単離
マウスを、最終免疫化の8〜11日後に屠殺し、脾臓を採取した。手短に述べると、脾臓を、10%FBS、1XAnti−anti(Invitrogen)、および1X β−ME(Invitrogen)を補充したRPMI 1640培地(Mediatech Inc.,Manassas,VA)中に定置した。脾細胞を、Stomacher machine(Seward Laboratory Systems Inc.,Bohemia,NY)を用いた脾臓の機械的分裂によって単離し、得られた産生物を、40μm細胞濾過器(BD Falcon)を用いて濾過した。細胞を次に、RBCの溶解のためにACK溶解緩衝液(Lonza,Switzerland)で5分間処理し、PBS中で洗浄し、次にELISPOTまたはFACS分析での使用のためにRPMI培地中に再懸濁した。
ELISPOT分析
標準IFNγ ELISPOT分析を実施した。手短に述べると、96ウエルプレート(Millipore,Billerica,MA)を、抗マウスIFN−γ捕捉抗体でコーティングし、4℃で24時間インキュベートした(R&D Systems,Minneapolis,MN)。翌日、プレートをPBSで洗浄し、次にブロッキング緩衝液(PBS中の1%BSAおよび5%スクロース)で2時間ブロッキングした。脾細胞(1〜2x105細胞/ウエル)を、三連で定置し、RPMI 1640(負の対照)か、Con A(正の対照)か、またはGPペプチドかのいずれかの存在下で、個別に(9個のアミノ酸による15mer重複、およびそれらのそれぞれのGPの長さにわたる)、または全てプールして(最終で2.5μg/ml)、5%CO2内で37℃にて一晩刺激した。刺激の18〜24時間後、プレートをPBS中で洗浄し、次にビオチン化抗マウスIFN−γ mAb(R&D Systems,Minneapolis,MN)で4℃で24時間インキュベートした。次に、プレートを再びPBS中で洗浄し、ストレプトアビジンアルカリホスファターゼ(MabTech,Sweden)を各ウエルに添加し、室温で2時間インキュベートした。最後に、プレートを再びPBSで洗浄し、次にBCIP/NBT Plus基質(MabTech)を、スポット現像のために各ウエルに5〜30分間添加した。目視上で現像プロセスが完了すると直ちに、プレートを蒸留水で濯ぎ、次に室温にて一晩乾燥した。スポットを、自動ELISPOTリーダー(Cellular Technology Ltd.,Shaker Heights,OH)を用いて計数した。
T細胞幅の総合的解析のため、標準IFNγ ELISPOTを、Shedlock DJら(2012).(上記に同じ)にこれまでに記載されている通りに本明細書において改変した。亜優勢および免疫優勢T細胞エピトープの特定および測定を、全体またはマトリックスペプチドプールに対するものとして個々のペプチドで脾細胞を刺激することによって評価した。標本保存を目的としたペプチドプーリングの伝統的手順、例えば、マトリックスアレイプールの使用は、複数のエピトープを示すペプチドを含有するプール内の総機能性応答は分析の分解能を効率的に低下させる、即ち、より低規模のものを「かき消す」ため、分析感度の低減をもたらす。したがって、改変されたELISPOTを、各GP免疫原にわたる個々のペプチド(9個のアミノ酸による15mer重複、最終で2.5μg/ml)で実施した。T細胞エピトープを含有するペプチドを確認し(平均≧10IFNγ+スポットかつ≧80%動物応答率、表1〜6に要約される)、次に機能におよび表現型についてFACSによって確証した。共通または部分エピトープは確認されず、FACSデータまたはウエブベースエピトープ予測ソフト上も、連続したペプチド内部に保存されたCD4+またはCD8+T細胞エピトープの存在を示唆しなかった。ここで、可能性のある共通/部分T細胞エピトープに、改変されたELISPOT分析によって確認された連続したペプチド応答の全事例に関して対応した。細胞を、連続したペプチドの各々で、また直接比較のために組み合わせて対にして個別に刺激し、組み合わされた応答が2つの個々の応答のいずれかより大きくなかった場合に「共通/部分」として定義した。また、ペプチドを生成するための「9個のアミノ酸による15mer重複」アルゴリズムは、CD8 T細胞エピトープの完全な範囲に向かってバイアスがかかり、それは15アミノ酸より長いクラスII拘束性エピトープの性質のためにCD4 T細胞応答を過小評価する可能性があるため、本明細書におけるエピトープ応答は、完全に総合的ではない可能性があるということに留意すべきである。最後に、アミノ酸類似性プロットを、ベクターNTIソフトウエアを用いて生成し、結果を図4Bに示す。
フローサイトメトリー
脾細胞を、96ウエルプレート(lxl06細胞/ウエル)に添加し、個々のペプチドか、または「最小ペプチドプール」(最終2.5μg/ml)かのいずれかで5〜6時間刺激した。個々のペプチド刺激を、改変されたELISPOTによって確認された全ペプチド(表1〜6)の機能的確証および表現型特徴付けのために使用した。まず、脾細胞および形質移入293Tを、LIVE/DEAD(登録商標)Fixable Violet Dead Cell Stain Kit(Invitrogen)で予備染色した。脾細胞に関して、細胞を、CD19(V450;クローン1D3)、CD4(PE−Cy7;クローンRM4−5)、CD8α(APC−Cy7;クローン53−6.7)、およびCD44(PE−Cy5;クローンIM7)(BD Biosciences,San Jose,CA)に関して表面染色し、PBS+1%FBS中で3回洗浄し、BD Cytofix/Cytoperm(商標)キットで透過化し、次にIFNγ(APC;クローンXMG1.2)、TNF(FITC;クローンMP6−XT22)、CD3(PE−cy5.5;クローン145−2C11)、およびT−bet(PE;クローン4B10)(eBioscience,San Diego,CA)で細胞内を染色した。形質移入293T細胞におけるGP発現を、形質移入の24時間後に評価した。各々がその対応するDNAワクチンまたはpVAX1空ベクター対照で3回免疫付与されたH−2bマウスに由来する血清をプールすることによって産生された指示されたマウス由来GP特異性ポリクローナル血清試薬(1:200希釈)を含有するPBS+1%FBS中で4℃にて30分間インキュベートした後、間接染色を実施した。細胞を、次にFITC複合体化ヤギ抗マウスIgG(BioLegend,San Diego,CA)で染色し、大規模に洗浄し、次にMHCクラスIに関して染色した(HLA−ABC;PE−Cy7;クローンG46−2.6;BD)。全細胞を、1%パラホルムアルデヒド中で固定した。全データを、LSRII flow cytometer(BD)を用いて収集し、FlowJoソフトウエア(Tree Star,Ashland,OR)を用いて解析した。脾細胞を、CD3+CD44+、CD4+、またはCD8+であり、B細胞マーカーCD19および生存率判定染料に関して負である、活性化したIFNγ産生T細胞に関してゲーティングした。
図6は、GP特異性T細胞ゲーティングを示す。ELISPOTによって確認されたT細胞エピトープを含有するペプチドに関する機能解析および表現型解析を、総リンパ球、CD19に関して負であった、生きた(LD)CD3+細胞およびLIVE−DEAD(ダンプチャネル)、一倍体(singlet)(細胞二倍体(cell doublet)を除く)、CD4+およびCD8+細胞、活性化された細胞(CD44+)、ならびにペプチド特異性IFNγ産生T細胞のFACS ゲーティングによって実施した。
統計解析
無根系統樹に関する有意性を、最大公算法によって決定し、ブートストラップ解析によって検証し、有意な支持値(≧80%、1,000ブートストラップ複製)を、MEGAバージョン5ソフトウエアによって決定した。群解析を、マッチされた両側独立t検定によって完了し、生存曲線をログランク(マンテル・コックス)検定によって解析した。全ての値は、平均±標準誤差であり、統計解析はGraphPad Prism(La Jolla,CA)によって実施した。
結果
ワクチン構築および発現
系統発生分析は、EBOV GPにおける相対的保存を示し(SUDVに関して94.4%、およびZEBOVに関して92.9%)、MARV GP(MGP)は、より分岐していた(約70%保存)。したがって、主流のZEBOVおよびSUDV GPアミノ酸配列の整列によって決定されるコンセンサス戦略が、EBOV GPに対して適用され、一方MARVに関しては、最大規模かつ最も致命的なMARV発生の唯一の原因であった2005Angola発生配列を採用する型マッチ戦略が使用された。各GPトランス遺伝子が、遺伝的に最適化され、商業的に合成され、次に改変されたpVAX1哺乳動物発現ベクターへとサブクローニングされた。全体として、3つのプラスミド戦略は、我々の新規の多価フィロウイルスワクチン戦略の基盤を形成した。
HEK293T細胞が、各プラスミドで別々に形質移入され、GP発現が、ウエスタン免疫ブロット法およびFACSによって評価された。約130kDaタンパク質が、検出のための種特異性抗GP1 mAbを用いて形質移入の48時間後に採取した細胞溶解物中でそれぞれに関して観察された。結果が図1Bに示される。比較対照として、それぞれのGPを発現する組み換え水胞性口炎ウイルス(rVSV)を、同時進行するレーンに投入した。次に、細胞表面上のGP発現を、形質移入の24時間後に、FACSによるGP特異性または対照ポリクローナル血清による間接染色によって解析した。結果が図1Cに示される。細胞表面発現が、全ワクチンプラスミドに関して検出されたが、一方非特異性結合はほとんど観察されなかった。対照血清はGP形質移入細胞と反応せず、また正の血清もpVAX1形質移入細胞と反応しなかった(pEBOZに関するデータが示される)。EBOV GPに関して予測された通り、細胞表面発現は、表面MHCクラスIおよびβ1−インテグリンの認識を立体的に閉塞させた(Francica JR,Varela−Rohena A,Medvec A,Plesa G,Riley JL,Bates P(2010)。Steric shielding of surface epitopes and impaired immune recognition induced by the ebola virus glycoprotein.PLoS Pathog 6:e1001098)。
MARVおよびZEBOV攻撃に対する完全な防御
防御効果を決定するため、モルモット前臨床攻撃モデルを採用した。前臨床免疫原性および有効性試験を、モルモットおよびマウスモデルを用いて本明細書で実施した。モルモット前臨床モデルは、フィロウイルスワクチン開発のためのスクリーニングおよび「概念実証」ツールとして広く使用されている。MARVおよびEBOVの一次単離物は、モルモットに非致死性の疾病を引き起こすが、この宿主の少数継代は、フィロウイルスに感染した霊長類において見られるものに類似の病理学的特徴を伴う致死性疾患を引き起こし得る変種の選択をもたらす。同様に、マウスは、フィロウイルスワクチン開発のために広く使用されているが、しかしながら、モルモットモデルと異なり、免疫およびT細胞応答を評価するための免疫検出試薬が、広く利用可能である。マウス適合したZEBOV(mZEBOV)による感染は、標的臓器内の高レベルのウイルス、ならびにEBOV感染した霊長類において見出されるものと同種の肝臓および脾臓における病理学的変化によって特徴付けられる疾患をもたらす。
モルモット(n=24)が、200μgの各プラスミド(pEBOZ、pEBOS、およびpMARV)により3つの別個のワクチン接種部位にて、またはpVAX1空ベクター対照(n=9)により、2回皮内に免疫付与され、次に1ヵ月後に同じワクチンにより追加免疫付与された。動物は、第2の免疫化の28日後に、BSL−4の施設内で1,000LD50のモルモット適合したMARV−アンゴラ(gpMARV)(n=9)またはZEBOV(gpZEBOV)(n=15)で攻撃され、次に毎日観察および体重測定された。結果が図2A〜2Hに示される。ワクチン接種を受けた動物は、完全に防御されたが、一方対照ワクチン接種を受けた動物は、攻撃の10日後までにgpMARVで死亡し(n=3、P=0.0052)、または攻撃の7日後までにgpZEBOVで死亡した(n=6、P=0.0008)(図2Aおよび図2E)。加えて、ワクチン接種を受けた動物は、体重減少から防御された(図2Bおよび図2F、P<0.0001)。ワクチン誘導Abは、プール血清におけるGP特異性Abが結合(図2Cおよび図2G)および中和(図2Dおよび図2H)力価において著しい増加を示したため、防御に貢献した可能性がありそうである。実験は、BSL−4の施設内で実施され、2回反復され、同様の結果を得、図A〜2H内のエラーバーは標準誤差を表す。群解析がマッチされた両側独立t検定によって完了され、生存曲線がログランク(マンテル・コックス)検定によって解析された。
プラスミドワクチンは高度に免疫原性であった
防御的DNAワクチン(プラスミドpEBOZ、pEBOS、およびpMARV、三価DNAワクチンとも称する)によって引き起こされた免疫相関物をより良く特徴付けるため、フィロウイルスワクチン開発のためのスクリーニングおよび「概念実証」ツールとして広く使用されており、広範な免疫検出試薬が利用可能であるマウスモデルを次に採用した。まず、B細胞応答を、2つのワクチン接種のそれぞれの後に20日間、40μgのそれぞれの一価DNAワクチンの注射の間に3週間あけて、H−2dマウス(n=5/群)において評価した。これらの実験からのデータが、図3A〜3Cに示される。図3Aおよび図3Bに示される通り、出血前対照標本においてGP特異性IgGはほとんど観察されなかったが、ワクチン接種後には全動物において著しい増加が検出された。精製されたSGPは利用可能ではなかったため、精製されたZGPを代わりに使用した。SUDVワクチン接種を受けたマウスにおけるIgGはZGPに結合し、ワクチン誘導Ab生成能力、および異種種間認識能力を実証している。加えて、セロコンバージョンが、僅か1回の免疫化後にワクチン接種を受けた動物の100%に生じ、その後、応答は同様の強化によって著しく増加された。AVE逆数エンドポイント希釈力価は、pMARV免疫付与されたマウスにおいて22.1倍、またpEBOSおよびpEBOZワクチン接種を受けた動物においてそれぞれ3.4倍および8.6倍強化された。次に、標本は、BSL−4の施設内でZEBOV、SUDV−Boniface、およびMARV−Angolaの中和に関して分析された。中和分析の結果が図3Cに示される。NAb価における著しい増加が、全動物においてワクチン接種後に検出された。
2つの異なる遺伝的バックグラウンドからのマウス(H−2dおよびH−2b、n=5/群)が、40μgのそれぞれのプラスミドpEBOZ、pEBOS、およびpMARVで免疫付与され、2週間後に同様に追加免疫付与され、次に8日後にT細胞解析のために屠殺した。脾細胞がマトリックスプールに対するものとして個々のペプチドを用いて刺激される総合的なワクチン誘導T細胞応答を評価するための新規の改変されたELISPOT分析からの結果が、図4Aに示される。DNAワクチン接種は、T細胞エピトープの多様性を認識する強固なIFNγ+応答を誘導した(表1〜6)。全ての正のエピトープ含有ペプチドは、続いてゲーティングされ(図6を参照)、確証され、FACSによって更に特徴付けされた。この改変されたELISPOTアプローチは、対照ウエルからのバックグラウンド応答が低かったため、極めて感度が高いと証明された(H−2bにおいて7.2±0.2IFNγ産生SFC/106脾細胞、およびH−2dマウスにおいて9.2±0.5)。図4Aに示される結果は、これらのそれぞれの株において、pMARVによるワクチン接種は、H−2bマウスにおいて9個、またH−2dにおいて11個の測定可能なエピトープを誘導し、pEBOSは9個および8個を誘導し、またpEBOZは10個および12個を生成したことを明らかにした。pMARV免疫付与されたH−2bマウスに由来するエピトープ9個のうち5個(55.6%)はCD8+であり、それらはELISPOTとFACS確証および表現型解析との双方によって測定した際に総MGP特異性IFNγ+応答の約57.3%を占めた。同様に、pEBOS免疫付与されたH−2bおよびH−2dマウスにおいて、確証されたエピトープのそれぞれ僅か33%および38%がCD8拘束性であった。しかしながら、これらのエピトープは、総応答の約50〜90%を含み、CD8+T細胞応答は、双方のマウス株において約56%であると見積もられ、一方FACSは、H−2bおよびH−2dマウスにおいてそれぞれ51%および90%であると見積もられた。総CD8+応答は、pEBOZ−ワクチン接種を受けた動物においてより低く、33%〜57%の間と測定された(ELISPOTにより双方の株に関して33%、またFACSにより、H−2bおよびH−2dマウスに関してそれぞれ6%および57%)。
単一の免疫優勢エピトープが、pEBOSを受容する双方のマウス株において検出され、免疫優勢エピトープは、最も高い亜優勢エピトープより少なくとも2倍IFNγ応答を生成すると概ね定義された。pMARVは、4つのH−2b拘束性免疫優勢CD8+エピトープをペプチドMGP25-39(#5)、MGP67-81(#12)、MGP181-195(#31)、およびMGP385-399(#65)内に誘導し、また1つのH−2d拘束性CD4+エピトープMGP151-171(#27)内にを誘導した。これらのエピトープのうちの4つは、MARV GP1の高度に保存された領域内に生じ、図4Bおよび図4Cに示される通り、これらのうちの3つは推定上の受容体結合ドメイン内に位置したが、1つだけは可変ムチン様領域(MGP385-399(#65))内に生じた。pEBOSは、H−2bおよびH−2dマウスにおいて、どちらもGP1の高度に保存された領域内に、それぞれSUDV GP(SGP)19-33(#4)およびSGP241-255(#41)内に生じるCD8+エピトープを刺激した。しかしながら、pEBOZ免疫化は、受容体結合ドメインおよびムチン様領域内にそれぞれ生じる、H−2dマウスにおける3つの免疫優勢エピトープ(ZEBOV GP受容体結合ドメイン(GP)139-153(#24)に位置するCD8拘束性エピトープ、ならびに2つのCD4拘束性エピトープZGP175-189(#30)およびZGP391-405(#66))を示した。ただ1つの免疫優勢エピトープがH−2bマウスにおいて定義され、それはCD4+とCD8+エピトープ(#89)との双方を含有し、GP2の高度に保存された領域内に生じた。総じて、多様なエピトープヒエラルキーが、それぞれのワクチン群において一貫し、再現可能であった。更に、図4Dに示される通り、亜優勢応答は、総応答のうちのかなりの割合を占め、改変されたELISPOT分析によって測定した際、総平均亜優勢応答は、pMARV、pEBOS、およびpEBOZ免疫付与されたH−2bマウスにおいてそれぞれ約12%、62%、および74%であり、一方H−2dマウスにおける応答はそれぞれ47%、50%、および34%であった。
最後に、総GP特異性T細胞応答が、確証されたエピトープを含む確認されたペプチドのみを含有する最小ペプチドプールによる刺激を用いてFACSによって測定された。ワクチン接種を受けた動物のそれぞれにおいて強固な応答が検出され、それはほとんどの場合、活性化されたCD4+およびCD8+T細胞の双方を含んだ。応答は、対照ペプチド(h−Clip)ではIFNγ産生はほとんど観察されず、またELISPOTデータと非常に相関があったため、GP特異性であった。FACSによって測定した際に免疫化が顕著なCTLを誘導しなかった唯一の事例は、pMARVによるワクチン接種を受けたH−2dマウスであり、CD8拘束性であると確証されたELISPOTによって確認されたエピトープはなかった。総じて、これらのデータは、ワクチンプラスミドのそれぞれは、マウスにおいて高度に免疫原性であり、GPの高度に保存された領域内の免疫優勢エピトープを含むT細胞エピトープの多様なアレイを認識する、強固なGP特異性T細胞応答をもたらしたことを示す。更に、本明細書において特徴付けされた高度に多様な亜優勢T細胞応答は、エピトープ同定用の従来のマトリックスアレイペプチドプールを用いていた場合に見落とされていた可能性がある。
T細胞応答が、FACSによってそれぞれの対応するGPに関して正と確認された全ペプチドを含む最少ペプチドプールに対する反応性に関して測定された。図7Aは、代表的な動物から示されたDNAワクチン誘導T細胞応答を示し、IFNγ産生CD4+(右)およびCD8+(左)細胞がゲーティングされる。FACSプロットが示される。h−CLIPペプチドによるインキュベーションは、負の対照(対照)として機能した。図7Bは合計のCD44+/IFNγ+CD4+またはCD8+細胞の平均%としてまとめた図7Aにおけるゲーティングされた細胞の結果を示し、エラーバーは標準誤差を表す。実験は、少なくとも2回反復され、同様の結果を得た。
マウスにおける「単一投与」防御
次に、ZEBOV攻撃に対するワクチン有効性が、前臨床マウスにおいて評価された。マウスは、強いNAb誘導のため、1回のみワクチン接種を受け、防御データが観察された。マウス(H−2k、n=10/群)は、40μgのpEBOZ DNAで免疫付与され、防御が、1,000LD50のマウス適合したZEBOV(mZEBOV)による攻撃によって、28日後にBSL4の施設の施設内で評定された。全ての対照動物は攻撃後7日目までに感染により死亡したが、図5Aは、DNAワクチン接種を受けたマウスは、完全に防御されたことを示す(P=0.0002)。それに加えて、図5Bに示される通り、対照マウスは、死亡までに進行性の体重損失を見せた(P<0.0001)。
「単一投与」モデルにおけるDNA誘導防御のメカニズムをよりよく理解するために、次にNAbおよびT細胞生成が評価された。NAbが、ワクチン接種の25日後、攻撃の3日前に評価され、図5Cに示される通り、有意な増加(P<0.0001)が、全てのワクチン接種を受けた動物(n=10/群)において検出された。逆数エンドポイント希釈力価は、19〜42、27.3±2.5の範囲であった。
次に、ZGP特異性T細胞の生成を評価し、pEBOZ単独かまたは三価製剤かのいずれかで免疫付与したマウスにおける応答を比較するために本解析の範囲を増加させた。IFN−γ産生(n=5)を、全ZGPペプチドプールを用いてFACSによって11日後に評価した。データが、図5Dに示される。IFNγ−産生T細胞が、全動物において検出され、また対照ペプチドによる刺激はサイトカイン産生を誘導しなかったため、ZGPペプチドに関して特異的であった。一価または三価製剤のいずれによる免疫化は、強固なIFNγ T細胞応答を誘導し、それらを比較すると有意差はなかった(P=0.0920)。
CTLは、ウイルスに感染した細胞の除去において重要であり得るため(Warfield KL,et al.(2005).Induction of humoral and CD8+ T cell responses are required for protection against lethal Ebola virus infection.J Immunol 175:1184−1191、Kalina WV,Warfield KL,Olinger GG,Bavari S(2009).Discovery of common marburgvirus protective epitopes in a BALB/c mouse model.Virol J 6:132、Olinger GG,et al.(2005).Protective cytotoxic T−cell responses induced by venezuelan equine encephalitis virus replicons expressing Ebola virus proteins.J Virol 79:14189−14196、Sullivan NJ,et al.(2011).CD8(+)cellular immunity mediates rAd5 vaccine protection against Ebola virus infection of nonhuman primates.Nat Med 17:1128−1131、およびGeisbert TW,et al.(2010).Vector choice determines immunogenicity and potency of genetic vaccines against Angola Marburg virus in nonhuman primates.J Virol 84:10386−10394)、追加のエフェクターサイトカイン、TNF、ならびにThl型CTL免疫および細胞毒性と相互に関連があることが知られている発達抑制因子、T−box転写因子TBX21(T−bet)の産生が測定され、結果は次の通りであった。総細胞に関して:TNF2.9±0.8、Tbet13.0±1.1。CD4+/CD44+/IFNγ+細胞に関して:TNF61.4±3.1、Tbet72.6±2.0。CD8+/CD44+/IFNγ+細胞に関して:TNF33.0±3.3、Tbet992.1±1.4(*p<0.1、***p<0.001、****p<0.0001)。我々は、活性化されたCD4+およびCD8+T細胞のそれぞれ約61%および約33%が、IFNγに加えてTNFも産生することを見出した。更に、IFNγ産生T細胞は、高レベルのT−betを発現した。CD8+およびCD4+T細胞のうちのそれぞれ約73%および92%はCD44+であり、ZGPペプチド刺激後にIFNγを産生した。
図8Aおよび8Bは、「単一投与」ワクチン接種によるT細胞誘導を示す。単一のpEBOZ免疫化、または別々の部位の3つのワクチンプラスミドによる単一の三価ワクチン接種後の、FACSによって測定した際のH−2kマウスにおけるT細胞応答が示され(a)、総CD44+/IFNγ+CD4+(紫)またはCD8+(オレンジ)細胞の平均%として要約される(b)。疑似カラーFACSプロットは代表動物に由来し、IFNγ産生CD4+(右)およびCD8+(左)細胞がゲーティングされる。h−CLIPペプチドによるインキュベーションは、負の対照(対照)として機能した。実験は2回実施され、同様の結果が得られ、エラーバーは標準誤差、nsは有意差無しを表す。
考察
我々は、前臨床齧歯動物免疫原性および有効性研究における多価フィロウイルスワクチンの開発および評定について報告する。gpMARVおよびgpZEBOVによる攻撃に対する完全な防御がモルモットにおける2つのDNAワクチン単一投与の後に観察され、またmZEBOVに対して、マウスにおける「単一投与」DNAワクチンの後に観察された。今日までに、モルモットの遺伝的 ワクチン接種は、裸のDNAの注射を含むか(Sullivan NJ,Sanchez A,Rollin PE,Yang ZY,Nabel GJ(2000).Development of a preventive vaccine for Ebola virus infection in primates.Nature 408:605−609)か、または遺伝子銃によって送達されてきたが(Dowling W,et al.(2006).The influences of glycosylation on the antigenicity,immunogenicity,and protective efficacy of Ebola virus GP DNA vaccines.J Virol 81:1821−1837、Vanderzanden L,et al.(1998).DNA vaccines expressing either the GP or NP genes of Ebola virus protect mice from lethal challenge.Virology 246:134−144、およびRiemenschneider J,et al(2003).Comparison of individual and combination DNA vaccines for B. anthracis,Ebola virus,Marburg virus and Venezuelan equine encephalitis virus.Vaccine 21:4071−4080)、しかしながら、いずれの方法も完全な防御を達成するまでに少なくとも3つのワクチン接種を必要とした。本明細書における改善された防御は、単一のDNAワクチン接種が、遺伝子銃投与後の防御された動物における力価に匹敵する規模のGP特異性IgG結合剤力価を生成したため、強固なAbの誘導に起因する可能性がある。DNAワクチン接種は、単一の投与後にそれぞれ3.85および2.18log10のZGPおよびMGP特異性Ab価を誘導し、対して3つの遺伝子銃ワクチン接種後は2.7および3.0であった。モルモットにおける代替的「単一投与」防御戦略との比較に関して、Ag共役型ウイルス様粒子(VLP)プラットフォームは、DNAワクチン接種後に観察されたものより僅かに高いAb価を生成した(Swenson DL,Warfield KL,Negley DL,Schmaljohn A,Aman MJ,Bavari S(2005).Virus−like particles exhibit potential as a pan−filovirus vaccine for both Ebola and Marburg viral infections.Vaccine 23:3033−3042)。更に、組み換えアデノウイルス(rAd)アプローチは、単一のDNAワクチン接種からのものより低いZGP特異性 NAb 価を誘導した(53逆数エンドポイント希釈力価、対して本明細書では88)(Kobinger GP,et al.(2006).Chimpanzee adenovirus vaccine protects against Zaire Ebola virus.Virology 346:394−401)。rVSVによるワクチン接種(Jones SM,et al(2007).Assessment of a vesicular stomatitis virus−based vaccine by use of the mouse model of Ebola virus hemorrhagic fever.J Infect Dis 196 Suppl 2:S404−412)は、現在のプラットフォームと同様のZGP特異性Ab価を生成した。総じて、これらのデータは、DNA ワクチン接種が、非複製ウイルスプラットフォームに匹敵する結合Abおよび中和Abを誘導可能であったこと、またこれらのデータが、本明細書における強いモルモット生存データを説明するのに部分的に役立ち得ることを実証する。
防御的DNAワクチン接種によるNAbの生成は、トランス遺伝子発現成熟GP構造により利益を得た可能性がある。インビボ形質移入研究は、ワクチンコードされたGPが、高度に発現され、翻訳後に開裂され(図1B)、細胞表面に移動し、細胞表面分子の免疫検出を立体的に閉塞させた(図1C)ことを確証した。したがって、本明細書において形成されたワクチン免疫原が、さもなくば感染中にビリオン集合に機能性である、ヘテロ三量体スパイクに成熟したという可能性は非常に高かった。これは、後に配座依存性Nabの誘導に決定的となるウイルス学的に関連のある中和決定基の生成および表示に重要な可能性がある(Dowling W,et al.(2007).Influences of glycosylation on antigenicity,immunogenicity,and protective efficacy of ebola virus GP DNA vaccines.J Virol 81:1821−1837;Shedlock DJ,Bailey MA,Popernack PM,Cunningham JM,Burton DR,Sullivan NJ(2010).Antibody−mediated neutralization of Ebola virus can occur by two distinct mechanisms.Virology 401:228−235)。したがって、この観点から、天然のアンカー構造の発現は、NAbを生成する能力において可溶性の誘導体に勝る可能性がある(Sullivan NJ,et al.(2006).Immune protection of nonhuman primates against Ebola virus with single low−dose adenovirus vectors encoding modified GPs.PLoS Med 3:el77、Xu L,et al.(1998).Immunization for Ebola virus infection.Nat Med 4:37−42)。
防御ワクチンによって駆動された際のT細胞応答をよりよく特徴付けするために、マウスにおける免疫原性および有効性研究を実施し、DNAワクチン接種によるmZEBOVに対する「単一投与」完全防御を決定した(図5A〜5D)。現在、このモデルにおいて完全な防御を付与する最も有効なプラットフォームは、アジュバントを伴う(Warfield KL,et al.(2005).Induction of humoral and CD8+ T cell responses are required for protection against lethal Ebola virus infection.J Immunol 175:1184−1191、Warfield KL,Swenson DL,Olinger GG,Kalina WV,Aman MJ,Bavari S(2007).Ebola virus−like particle−based vaccine protects nonhuman primates against lethal Ebola virus challenge.J Infect Dis 196 Suppl 2:S430−437)、または伴わない(Sun Y,et al.(2009).Protection against lethal challenge by Ebola virus−like particles produced in insect cells.Virology 383:12−21)VLP、rAdワクチン接種((Kobinger GP,et al.(2006)SUPRA、Choi JH,et al.(2012).A single sublingual dose of an adenovirus−based vaccine protects against lethal Ebola challenge in mice and guinea pigs.Mol Pharm 9:156−167、Richardson JS,et al.(2009).Enhanced protection against Ebola virus mediated by an improved adenovirus−based vaccine.PLoS One 4:e5308)、またはrRABVワクチン接種(Blaney JE,et al.(2011).Inactivated or live−attenuated bivalent vaccines that confer protection against rabies and Ebola viruses.J Virol 85:10605−10616)である。しかしながら、T細胞応答の特徴付けは、これらの研究では非常に限定されており、ZGPT細胞エピトープを含有するようにこれまでに記載されている2つ(Warfield KL,(2007)上記に同じ)または1つ(Warfield KL,et al.(2005)上記に同じ)のいずれかによる脾細胞刺激に限られていた(Warfield KL,et al.(2005)上記に同じ、Olinger GG,et al.(2005)上記に同じ、Kobinger GP,et al.(2006)上記に同じ、Sun Y,et al.(2009).Choi,JH,et al.(2012)。本明細書において、我々は、新規の改変されたT細胞分析によって大々的に解析した防御ワクチン接種による強固で広範なCTLの誘導を報告する(図4Aおよび表1〜6)。合計で、52の新規のT細胞エピトープが確認され、GPの高度に保存された領域内に主として生じる多数の免疫優勢エピトープが含まれた。確認された合計22のZGPエピトープのうち、僅か4つがこれまでに報告されている。更に、20のMGPのうち僅か1つ(Kalina WV,Warfield KL,Olinger GG,Bavari S(2009).Discovery of common marburgvirus protective epitopes in a BALB/c mouse model.Virol J 6:132)、および16のSGPエピトープのうち僅か1つが、これまでに記載されていた。したがって、これは、2つの異なるマウス遺伝的バックグラウンドにおける複数のフィロウイルスからのGPエピトープを記述する前臨床GPエピトープの今日までの最も総合的な報告である。
これらの分析から得られる別の新しい発見は、ワクチン誘導亜優勢T細胞応答の評価であり、これは12%〜74%の間の広範囲にわたる総T細胞応答の著しい割合を含んだ(図4D)ことが示されている。これは、亜優勢応答が防御に著しく寄与し得るため、特に重要であり得る。したがって、これは将来的に、防御に対する亜優勢および免疫優勢エピトープT細胞応答の特異的寄与を決定するために有益であると判明するかもしれない。留意すべきことに、これらの応答は、エピトープ特定用の従来のマトリックスアレイペプチドプールを用いていた場合に見落とされていた可能性がある。したがって、先行研究における限定されたエピトープ検出は、より低レベルのワクチン誘導免疫、より感受性の低い標準分析の使用、ならびに/または免疫優勢CD8+エピトープの検出を好むペプチド配列および/もしくはアルゴリズムの使用に直接関連していた可能性がある。
フィロウイルスに対する防御の免疫相関物には議論の余地が残るが、この高度に免疫原性のアプローチによって生成されたデータは、防御ワクチンによって駆動されるT細胞免疫を研究する独特の機会を提供する。本明細書におけるDNAワクチン接種は、強いZGP特異性T細胞を誘導し、その大部分は、高レベルのT−betを発現するThl型多機能CTLによって特徴付けられ、またヒトにおけるT細胞 細胞毒性と相関があることも示された。主に液性免疫応答およびCD4+T細胞に偏る細胞性免疫を生成することが可能なこれまでの独立型DNAワクチンプラットフォームは、NHPおよび診療所において有力なCD8+T細胞を誘導することが近年実証されているインビボEP送達から利益を得ている可能性があることは、明らかである。主に液性免疫応答およびCD4+T細胞に偏る細胞性免疫を生成することが可能なこれまでの独立型DNAワクチンプラットフォームは、NHPおよび診療所において有力なCD8+T細胞を誘導することが近年実証されているインビボEP送達から利益を得ている可能性があることは、明らかである。したがって、本明細書におけるデータは、NHP免疫原性および有効性研究における独立型の様式またはプライムブースト様式として、このアプローチと一致する。このアプローチは、フィロウイルス科の生物学的に脅威である状況および発生中の素早い応答のために、迅速および安価に改変ならびに/または生産することができる、魅力的なワクチン接種戦略を提供する。それに加えて、このモデルアプローチは、フィロウイルス性疾患に対する防御的免疫相関物を研究するための重要なツールを提供し、また将来的な戦略を導くために既存のプラットフォームに適用することが可能である。
実施例2
3つのプラスミドを含む三価ワクチンが提供される。第1のプラスミドは、ZEBOV CON、配列番号1に基づき、ザイールエボラウイルスコンセンサス免疫原のN末端にIgEシグナルペプチドを含むように改変された、ザイールエボラウイルスコンセンサス免疫原をコードする核酸配列を含む。第2のプラスミドは、SUDV CON、配列番号2に基づき、スーダンエボラウイルスコンセンサス免疫原のN末端にIgEシグナルペプチドを含むように改変された、スーダンエボラウイルスコンセンサス免疫原をコードする核酸配列を含む。第3のプラスミドは、MARV ANG、配列番号3に基づき、マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ免疫原のN末端にIgEシグナルペプチドを含むように改変された、マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ(MARV)免疫原をコードする核酸配列を含む。
実施例3
5プラスミドのワクチンが提供される。第1のプラスミドは、ZEBOV CON、配列番号1である、ザイールエボラウイルスコンセンサス免疫原をコードする核酸配列を含む。第2のプラスミドは、SUDV CON、配列番号2である、スーダンエボラウイルスコンセンサス免疫原をコードする核酸配列を含む。第3のプラスミドは、マールブルグマールブルグウイルスRavn、Durba(09DRC99)、およびUganda(02Uga07Y)を用い、配列番号4、マールブルグマールブルグウイルス・ラビンクラスターコンセンサス(MARV−RAV CON)をコードする核酸配列を含む。第4のプラスミドは、Ozolin、Uganda(01Uga07)、およびDurba(05および07DRC99)を用い、配列番号5、マールブルグマールブルグウイルス・オゾリンクラスターコンセンサス(MARV−OZO CON)をコードする核酸配列を含む。第5のプラスミドは、(Musoke、Popp、およびLeiden)を用い、配列番号6、マールブルグマールブルグウイルス・ムソーククラスターコンセンサス(MARV−MUS CON)をコードする核酸配列を含む。
実施例4
5プラスミドのワクチンが提供される。第1のプラスミドは、ZEBOV CON、配列番号1に基づき、ザイールエボラウイルスコンセンサス免疫原のN末端にIgEシグナルペプチドを含むように改変された、ザイールエボラウイルスコンセンサス免疫原をコードする核酸配列を含む。第2のプラスミドは、SUDV CON、配列番号2に基づき、スーダンエボラウイルスコンセンサス免疫原のN末端にIgEシグナルペプチドを含むように改変された、スーダンエボラウイルスコンセンサス免疫原をコードする核酸配列を含む。第3のプラスミドは、マールブルグマールブルグウイルスRavn、Durba(09DRC99)およびUganda(02Uga07Y)を用い、配列番号4、マールブルグマールブルグウイルス・ラビンクラスターコンセンサス(MARV−RAV CON)に基づき、コンセンサスマールブルグマールブルグウイルス−Rav免疫原のN末端にIgEシグナルペプチドを含むように改変された、マールブルグマールブルグウイルスRavコンセンサスをコードする核酸配列を含む。第4のプラスミドは、Ozolin、Uganda(01Uga07)、およびDurba(05および07DRC99)を用い、配列番号5、マールブルグマールブルグウイルス・オゾリンクラスターコンセンサス(MARV−OZO CON)に基づき、コンセンサスマールブルグマールブルグウイルス−Ozo免疫原のN末端にIgEシグナルペプチドを含むように改変された、マールブルグマールブルグウイルスOzoコンセンサスをコードする核酸配列を含む。第5のプラスミドは、(Musoke、Popp、およびLeiden)を用い、配列番号6、マールブルグマールブルグウイルス・ムソーククラスターコンセンサス(MARV−MUS CON)に基づき、コンセンサスマールブルグマールブルグウイルス−Mus免疫原のN末端にIgEシグナルペプチドを含むように改変された、マールブルグマールブルグウイルスMusコンセンサスをコードする核酸配列を含む。
実施例5
6プラスミドのワクチンが提供される。第1のプラスミドは、ZEBOV CON、配列番号1である、ザイールエボラウイルスコンセンサス免疫原をコードする核酸配列を含む。第2のプラスミドは、SUDV CON、配列番号2である、スーダンエボラウイルスコンセンサス免疫原をコードする核酸配列を含む。第3のプラスミドは、マールブルグマールブルグウイルスRavn、Durba(09DRC99)、およびUganda(02Uga07Y)を用い、配列番号4、マールブルグマールブルグウイルス・ラビンクラスターコンセンサス(MARV−RAV CON)をコードする核酸配列を含む。第4のプラスミドは、Ozolin、Uganda(01Uga07)、およびDurba(05および07DRC99)を用い、配列番号5、マールブルグマールブルグウイルス・オゾリンクラスターコンセンサス(MARV−OZO CON)をコードする核酸配列を含む。第5のプラスミドは、(Musoke、Popp、およびLeiden)を用い、配列番号6、マールブルグマールブルグウイルス・ムソーククラスターコンセンサス(MARV−MUS CON)をコードする核酸配列を含む。第6のプラスミドは、配列番号3、マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005単離物糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む。
実施例6
5プラスミドのワクチンが提供される。第1のプラスミドは、ZEBOV CON、配列番号1に基づき、ザイールエボラウイルスコンセンサス免疫原のN末端にIgEシグナルペプチドを含むように改変された、ザイールエボラウイルスコンセンサス免疫原をコードする核酸配列を含む。第2のプラスミドは、SUDV CON、配列番号2に基づき、スーダンエボラウイルスコンセンサス免疫原のN末端にIgEシグナルペプチドを含むように改変された、スーダンエボラウイルスコンセンサス免疫原をコードする核酸配列を含む。第3のプラスミドは、マールブルグマールブルグウイルスRavn、Durba(09DRC99)およびUganda(02Uga07Y)を用い、配列番号4、マールブルグマールブルグウイルス・ラビンクラスターコンセンサス(MARV−RAV CON)に基づき、コンセンサスマールブルグマールブルグウイルス−Rav免疫原のN末端にIgEシグナルペプチドを含むように改変された、マールブルグマールブルグウイルスRavコンセンサスをコードする核酸配列を含む。第4のプラスミドは、Ozolin、Uganda(01Uga07)、およびDurba(05および07DRC99)を用い、配列番号5、マールブルグマールブルグウイルス・オゾリンクラスターコンセンサス(MARV−OZO CON)に基づき、コンセンサスマールブルグマールブルグウイルス−Ozo免疫原のN末端にIgEシグナルペプチドを含むように改変された、マールブルグマールブルグウイルスOzoコンセンサスをコードする核酸配列を含む。第5のプラスミドは、(Musoke、Popp、およびLeiden)を用い、配列番号6、マールブルグマールブルグウイルス・ムソーククラスターコンセンサス(MARV−MUS CON)に基づき、コンセンサスマールブルグマールブルグウイルス−Mus免疫原のN末端にIgEシグナルペプチドを含むように改変された、マールブルグマールブルグウイルスMusコンセンサスをコードする核酸配列を含む。第6のプラスミドは、MARV ANG、配列番号3に基づき、マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ免疫原のN末端にIgEシグナルペプチドを含むように改変された、マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005単離物糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む。
「エピトープ含有ペプチド」が、IFNγ ELISPOTによって確認され(≧10SFC/106脾細胞かつ≧80%応答率)、次にFACSによって確証された(≧3〜5xl04 CD3+細胞が獲得された)。それぞれに関する応答が、FACSによって更に特徴付けされた(CD3+/CD44+/IFNγ+細胞によるCD4および/CD8の発現)。予想されたCD8+エピトープに下線が引かれ(IEDBによる最良コンセンサス%ランク)、これまでに記載されたエピトープが参照される。免疫優勢エピトープが表示される(*)。
「エピトープ含有ペプチド」が、IFNγ ELISPOTによって確認され(≧10SFC/106脾細胞かつ≧80%応答率)、次にFACSによって確証された(≧3〜5xl04 CD3+細胞が獲得された)。それぞれに関する応答が、FACSによって更に特徴付けされた(CD3+/CD44+/IFNγ+細胞によるCD4および/CD8の発現)。予想されたCD8+エピトープに下線が引かれ(IEDBによる最良コンセンサス%ランク)、これまでに記載されたエピトープが参照される。免疫優勢エピトープが表示される(*)。
「エピトープ含有ペプチド」が、IFNγ ELISPOTによって確認され(≧10SFC/106脾細胞かつ≧80%応答率)、次にFACSによって確証された(≧3〜5xl04 CD3+細胞が獲得された)。それぞれに関する応答が、FACSによって更に特徴付けされた(CD3+/CD44+/IFNγ+細胞によるCD4および/CD8の発現)。予想されたCD8+エピトープに下線が引かれ(IEDBによる最良コンセンサス%ランク)、これまでに記載されたエピトープが参照される。免疫優勢エピトープが表示される(*)。
「エピトープ含有ペプチド」が、IFNγ ELISPOTによって確認され(≧10SFC/106脾細胞かつ≧80%応答率)、次にFACSによって確証された(≧3〜5xl04 CD3+細胞が獲得された)。それぞれに関する応答が、FACSによって更に特徴付けされた(CD3+/CD44+/IFNγ+細胞によるCD4および/CD8の発現)。予想されたCD8+エピトープに下線が引かれ(IEDBによる最良コンセンサス%ランク)、これまでに記載されたエピトープが参照される。免疫優勢エピトープが表示される(*)。
「エピトープ含有ペプチド」が、IFNγ ELISPOTによって確認され(≧10SFC/106脾細胞かつ≧80%応答率)、次にFACSによって確証された(≧3〜5xl04 CD3+細胞が獲得された)。それぞれに関する応答が、FACSによって更に特徴付けされた(CD3+/CD44+/IFNγ+細胞によるCD4および/CD8の発現)。予想されたCD8+エピトープに下線が引かれ(IEDBによる最良コンセンサス%ランク)、これまでに記載されたエピトープが参照される。免疫優勢エピトープが表示される(*)。
「エピトープ含有ペプチド」が、IFNγ ELISPOTによって確認され(≧10SFC/106脾細胞かつ≧80%応答率)、次にFACSによって確証された(≧3〜5xl04 CD3+細胞が獲得された)。それぞれに関する応答が、FACSによって更に特徴付けされた(CD3+/CD44+/IFNγ+細胞によるCD4および/CD8の発現)。予想されたCD8+エピトープに下線が引かれ(IEDBによる最良コンセンサス%ランク)、これまでに記載されたエピトープが参照される。免疫優勢エピトープが表示される(*)。

Claims (26)

  1. 以下の核酸配列を有する核酸分子を含む組成物であって、
    a)コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列であって、前記コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列が、配列番号1(ZEBOV CON)、およびIgEシグナルペプチドに連結される配列番号1(ZEBOV CON)からなる群から選択される、核酸配列と、
    b)コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列であって、前記コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質のアミノ酸配列が、配列番号2(SUDV CON)、およびIgEシグナルペプチドに連結される配列番号2(SUDV CON)からなる群から選択される、核酸配列と、
    c)マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列であって、前記マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列が、配列番号3(MARV)、IgEシグナルペプチドに連結される配列番号3(MARV)、配列番号3に95%同一のアミノ酸配列、およびIgEシグナルペプチドに連結される配列番号3に95%同一のアミノ酸配列からなる群から選択される、核酸配列と、を含む、組成物。
  2. 前記コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む第1のプラスミドと、前記コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む第2のプラスミドと、前記マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む第3のプラスミドと、を含む、請求項1に記載の組成物。
  3. a)ンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列は、配列番号64に95%同一の核酸配列を含み
    b)ンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質をコードする核酸配列は、配列番号65に95%同一の核酸配列を含み
    c)ールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列は、配列番号66に95%同一の核酸配列を含む、請求項1に記載の組成物。
  4. a)コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列が配列番号64を含み、
    b)コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列が配列番号65を含み、
    c)マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列が配列番号66を含む、請求項3に記載の組成物。
  5. ールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原の前記アミノ酸配列は、配列番号3(MARV)、およびIgEシグナルペプチドに連結される配列番号3(MARV)からなる群から選択される、請求項に記載の組成物。
  6. 以下の核酸配列を有する核酸分子を含む組成物であって、
    i)コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列であって、前記コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列が、配列番号1(ZEBOV CON)、およびIgEシグナルペプチドに連結される配列番号1(ZEBOV CONからなる群から選択される、核酸配列と、
    ii)コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列であって、前記コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質のアミノ酸配列が、配列番号2(SUDV CON)、およびIgEシグナルペプチドに連結される配列番号2(SUDV CONからなる群から選択される、核酸配列と、
    iii)第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列であって、前記第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列が、配列番号4(MARV CON1)、およびIgEシグナルペプチドに連結される配列番号4(MARV CON1)からなる群から選択される、核酸配列と、
    iv)第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列であって、前記第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列が、配列番号5(MARV CON2)、およびIgEシグナルペプチドに連結される配列番号5(MARV CON2)からなる群から選択される、核酸配列と、
    v)第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列であって、前記第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列が、配列番号6(MARV CON3)、およびIgEシグナルペプチドに連結される配列番号6(MARV CON3)らなる群より選択される、核酸配列と、を含む、組成物。
  7. 前記コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む第1のプラスミドと、前記コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む第2のプラスミドと、前記第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む第3のプラスミドと、前記第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む第4のプラスミドと、前記第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む第5のプラスミドと、を含む、請求項に記載の組成物。
  8. vi)マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列であって、前記マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列が、配列番号3(MARV)、およびIgEシグナルペプチドに連結される配列番号3(MARVから選択される、核酸配列を更に含む、請求項に記載の組成物。
  9. 前記コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む第1のプラスミドと、前記コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む第2のプラスミドと、前記第1のコンセンサスマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む第3のプラスミドと、前記第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む第4のプラスミドと、前記第3のコンセンサスマールブルグマールブルグイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む第5のプラスミドと、マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む第6のプラスミドと、を含む、請求項に記載の組成物。
  10. i)コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列は、配列番号64に95%同一の核酸配列を含み
    ii)コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質をコードする核酸配列は、配列番号65に95%同一の核酸配列を含む、請求項に記載の組成物。
  11. i)コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列は、配列番号64を含み、
    ii)コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列は、配列番号65を含む、請求項10に記載の組成物。
  12. vi)マールブルグマールブルグイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列が配列番号66に95%同一の核酸配列を含む、請求項10に記載の組成物。
  13. vi)マールブルマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列が配列番号66を含む、請求項12に記載の組成物。
  14. 以下の核酸配列を有する核酸分子を含む組成物であって、コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列であって、前記コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列が、配列番号1(ZEBOV CON)、およびIgEシグナルペプチドに連結される配列番号1(ZEBOV CONからなる群から選択される、核酸配列と、
    コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列であって、前記コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質のアミノ酸配列が、配列番号2(SUDV CON)、およびIgEシグナルペプチドに連結される配列番号2(SUDV CONからなる群から選択される、核酸配列と、を含む、組成物。
  15. 前記コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む第1のプラスミドと、前記コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列を含む第2のプラスミドと、を含む、請求項14に記載の組成物。
  16. i)コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列は、配列番号64に95%同一の核酸配列を含み
    ii)コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質をコードする核酸配列は、配列番号65に95%同一の核酸配列を含む、請求項14に記載の組成物。
  17. i)コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列は、配列番号64を含み
    ii)コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原をコードする核酸配列が、配列番号65を含む、請求項16に記載の組成物。
  18. 電気穿孔を用いた個体への送達のために製剤化される、請求項1〜17のいずれか一項に記載の組成物。
  19. IL−12、IL−15、およびIL−28からなる群から選択される1個以上のタンパク質をコードする核酸配列を更に含む、請求項1〜17のいずれか一項に記載の組成物。
  20. フィロウイルスに対する免疫応答を誘導するための請求項1〜17のいずれか一項に記載の組成物であって、個体に免疫応答を誘導するのに有効な量で投与さる、組成物。
  21. 請求項20に記載の組成物であって、フィロウイルスがマールブルグウイルス、エボラウイルス・スーダン、およびエボラウイルス・ザイールからなる群から選択される、組成物。
  22. フィロウイルスと診断された個体を治療するための請求項1〜17のいずれか一項に記載の組成物であって、治療上有効な量が個体に投与される、組成物。
  23. 請求項22に記載の組成物であって、フィロウイルスがマールブルグマールブルグウイルス、エボラウイルス・スーダン、およびエボラウイルス・ザイールからなる群から選択される、組成物。
  24. 個体のフィロウイルス感染を予防するための請求項1〜17のいずれか一項に記載の組成物であって、予防的に有効な量で個体に投与される、組成物。
  25. 請求項24に記載の組成物であって、フィロウイルスがマールブルグマールブルグウイルス、エボラウイルス・スーダン、およびエボラウイルス・ザイールからなる群から選択される、組成物。
  26. コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原であって、前記コンセンサスザイールエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列が、配列番号1(ZEBOV CON)、およびIgEシグナルペプチドに連結される配列番号1(ZEBOV CON)からなる群から選択される、免疫原、
    コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原であって、前記コンセンサススーダンエボラウイルスエンベロープ糖タンパク質のアミノ酸配列が、配列番号2(SUDV CON)、およびIgEシグナルペプチドに連結される配列番号2(SUDV CON)からなる群から選択される、免疫原、
    マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原であって、前記マールブルグマールブルグウイルスアンゴラ2005エンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列が、配列番号3(MARV)、およびIgEシグナルペプチドに連結される配列番号3(MARV)からなる群から選択される、免疫原、
    第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原であって、前記第1のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列が、配列番号4(MARV CON1)、およびIgEシグナルペプチドに連結される配列番号4(MARV CON1)からなる群から選択される、免疫原、
    第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原であって、前記第2のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列が、配列番号5(MARV CON2)、およびIgEシグナルペプチドに連結される配列番号5(MARV CON2)からなる群から選択される、免疫原、ならびに
    第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原であって、前記第3のコンセンサスマールブルグマールブルグウイルスエンベロープ糖タンパク質免疫原のアミノ酸配列が、配列番号6(MARV CON3)、およびIgEシグナルペプチドに連結される配列番号6(MARV CON)からなる群から選択される、免疫原
    からなる群から選択される、2個以上のタンパク質を含む、組成物。
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