JP6349721B2 - 試料分析チップ - Google Patents
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この手法を用いれば、複数種の検体を同じ試薬で同時に処理をしたり、また逆に一種類の検体に同時に複数の処理を施したりすることができ、所要時間や手間を大幅に減らすことが可能である。
このとき、前記初期反応部と前記拡散制御部との間に設けられた壁部をさらに備えてもよいし、前記拡散制御部と前記流路部との間に設けられたすり切り部をさらに備えてもよい。
図1は、本実施形態の試料分析チップ1を示す図であり、上からそれぞれ平面図、正面図、および底面図である。図2は、試料分析チップ1の分解斜視図である。図1および図2に示すように、試料分析チップ1は、サンプル液が収容される空間が形成された本体2と、本体2に接合されて収容空間の蓋となる蓋部3とを備えている。
なお、本発明における「透明」及び「光透過性」とは、検出光の波長領域での平均透過率が70%以上であるものとする。可視光領域(波長350〜780nm)において光透過性を有する材料を用いれば、チップ内の試料状態の視認が容易であるが、本発明に資料可能な材料はこれに限られない。
初期反応部21は、上側の径が大きい略円錐台状に形成されており、内部空間にサンプル液が貯留されて一段階目の生化学反応が行われる。初期反応部21内には、一段階目の生化学反応に用いられる薬品等が配置されてもよい。
試料分析チップ1は、流路部22が形成された本体2に、蓋部3を貼り合わせることで作製することができる。
また、試薬の固定方法として、熱溶融性物質を使用することも出来る。試薬上に溶融した熱溶融性物質を滴下することで、試薬を覆うように熱溶融性物質が配置され、試薬が固定される。 熱溶融性物質としては、使用する温度で固化−液化を起こすこと、反応や送液に悪影響を与えないこと、熱溶融性物質がサンプル液と入れ替わりを起こすことができること等の条件を満たせば、使用要求に合ったものを適宜選択することができる。例えば生化学反応を行う等の場合は、市販の専用のワックスを利用することができる。その他の利用形態では、パラフィンワックスを使用することができる。所望の温度で溶融するように、融点の異なる複数のワックスを混合して使用することもできる。
本体や蓋部に樹脂コーティング層を形成する際、樹脂コーティング層の下地としてアンカー層を形成することによりレーザを用いた融着が可能である。アンカー層にレーザ波長光を吸収するカーボンブラック(光吸収性材料)を練り込んでおくと、レーザ光を照射することにより発熱して樹脂コーティング層を溶融接着することができる。あるいは、アンカー層にカーボンブラックを添加することに代えて、樹脂コーティング層にカーボンブラックを添加したり、樹脂コーティング層の表面を黒色に塗装したりしてもよい。例えば波長900nm程度の赤外光フォトダイオードレーザーの光を照射することによっても樹脂コーティング層を効率良く溶融することができる。レーザ溶着は、熱溶着と異なり、チップを加熱する必要がないことから、チップやチップに固定されている試薬に殆ど影響を与えずに貼り合せをすることができる。
使用者は、ピペット等にサンプル液を取り、ピペット等の先端部を注入口31に差し込んで試料分析チップ1内にサンプル液を注入する。サンプル液は初期反応部21に貯留される。
次に、使用者は、初期反応部21に必要な薬品等を供給し、サンプル液に対して一段階目の生化学反応を行う。薬品等は、上述のように、あらかじめ初期反応部21内に配置しておいてもよいし、サンプル液と前後して注入口31から供給してもよい。また、試料分析チップ1を遠心分離器に設置し、軽く回転させることにより、攪拌しながら一段階目の生化学反応を行ってもよい。
一段階目の生化学反応が、混合するだけでは開始されない、例えばPCR反応の様なものである場合、必要において初期反応部21に対し熱処理等を行ってもよい。熱処理をかけるための機構としては、例えばカートリッジヒーター、電熱線、ペルチェ素子等があげられる。
また、初期反応部21が平面視中央部に配置され、流路部22が平面視において初期反応部21の周囲に設けられているため、平面視における中心軸線を中心に回転させることで、初期反応部21から流路部22、さらに計量部23からウェル24に、遠心力を利用して好適にサンプル液を送り込むことができる。
一段階目の生化学反応が終了するまでの手順は第一実施形態と同様である。一段階目の生化学反応が終了したら、使用者は、サンプル液の蒸発やコンタミネーション等を防止するための蓋溶液を注入口31からに試料分析チップ51内に供給する。蓋溶液には特に制限はないが、例えばミネラルオイル、シリコンオイルの様な安定した物質であり、かつ比重がサンプル溶液よりも小さい溶液が好ましい。また、蓋溶液が一段階目の生化学反応を阻害しないものであれば、より早い段階で試料分析チップ51内に供給されてもよい。
次に、初期反応部21の軸線を中心に試料分析チップ51を回転させると、サンプル液102および蓋溶液101は、遠心力により初期反応部61の内面を伝って上方に移動し、拡散制御部62に到達する。拡散制御部62の傾斜角が初期反応部61の傾斜角よりも小さく、サンプル液102は蓋溶液101よりも比重が大きいため、サンプル液102に作用する遠心力は蓋溶液101に作用する遠心力よりも大きくなる。その結果、図6に示すように、拡散制御部62においては、サンプル液102の方が蓋溶液101よりも径方向外側に移動して先に流路部22に到達するようにサンプル液の挙動が制御され、図7に示すように、計量部23がサンプル液102で満たされる。
さらに、初期反応部61と流路部22との間に拡散制御部62が設けられているため、蓋溶液を用いた場合でも、まずサンプル液を好適に流路部に移動させ、その後に蓋溶液でウェルを好適に封止することができる。
図12に示す変形例では、拡散制御部62に複数の環状の溝62aが同心状に形成されている。このようにすると、拡散制御部62上を流れる液体は、溝62a内に入るときに加速し、溝62aから出る際に減速する。この繰り返しにより、液体が周方向に好適に分散して、各計量部23に均等に供給される。
このような機能を発揮する形状は、環状の溝に限られず、螺旋状の溝、さらには上述の壁部やすり切り部のような形状であってもよい。また、これらの形状は、周方向にわたらず、間隔を置いて断続的に設けられてもよい。さらには、図13に示す変形例のような複数の突起62bや、複数の凹部が設けられてもよい。図13には、複数の突起62bが環状かつ同心状に並んだ例を示しているが、突起や凹部はランダムに形成されてもよい。
試料分析チップを回転させた際に遠心力で内側面61bを上る液体は、フィン82のうち、初期反応部61の底面61aに対向する面と当たり、加速される。これにより、液体を好適に流路部22に移動させることができる。
なお、内側面61bに形成する加速部の形状はフィンに限られず、例えば螺旋状の溝等であってもよい。また、本実施形態の加速部には該当しなくなるが、攪拌補助の機能のみ発揮させるために、内側面61b上にフィンに代えて突起や凹部等を設けてもよい。
図19に示す変形例の試料分析チップにおける本体121では、下端部まで達しない複数の切り込み122aを有する壁部122に囲まれた領域が初期反応部123となっており、流路部124と初期反応部123とが略同じ高さに位置している。このような形状とすると、図21に示すように、本体121の下面が平坦に近くなるため、取り扱いが容易となる。
参考として、図20に本体121の平面図を、図22に断面図をそれぞれ示す。
本発明の試料分析チップは、例えば、DNA、たんぱく質等の試料において生化学物質の検出や分析に用いることができる。
ヒトゲノムの中には、その約0.1%に個人特有の塩基配列の違いが存在する。これは、SNP(Single Nucleotide Polymorphism)と呼ばれており、生殖細胞変異のひとつである。SNPの特定方法の一つとして、例えば蛍光を用いたPCR‐PHFA(PCR−Preferential Homoduplex Formation Assay)法が利用されている。PCR‐PHFA法は検出変異部位を増幅するPCR工程と、増幅断片と対応プローブによる競合的鎖置換反応工程から成り立っている。当該方法によれば、蛍光試薬の発光差によって変異を検出するが、本発明の試料分析チップを用いると、各ウェルに均等にサンプル液を分配することができ、正確なSNPs検出を行うことが出来る。また上記以外のSNP検出方法としてインベーダー法(登録商標)、Taqman PCR法等についても同様に本発明の試料分析チップを用いることが可能である。
がん細胞に特徴的な変異、また分子標的薬に抵抗性を示す変異は、そのほとんどが体細胞変異である。生殖細胞変異(SNPなど)の場合、どの細胞でも共通の変異が見られるのに対し、体細胞変異では変異を起こした細胞でのみ変異がみられ、変異を起こしていない細胞(通常は正常細胞)では変異は見られない。
21、61、115、116、123 初期反応部
22、124 流路部
23、124a 計量部
24、124b ウェル
61b 内側面
62 拡散制御部
65 壁部
67 すり切り部
81 加速部
82 フィン(加速部)
102 サンプル液
X (初期反応部の)軸線
Claims (6)
- サンプル液を注入し、生化学反応を行うための試料分析チップであって、
前記サンプル液を貯留可能な初期反応部と、
平面視において前記初期反応部の周囲に前記初期反応部と接続して設けられ、複数のウェルを有する流路部と、
前記初期反応部に設けられ、前記初期反応部から前記流路部に向かって移動する前記サンプル液を加速する加速部と、
を備え、
前記初期反応部は、正面視において前記流路部よりも下方に向かって突出するように設けられ、
前記流路部は、前記初期反応部の上端部と接続して設けられ、
前記加速部は、前記初期反応部の内側面に設けられ、前記初期反応部の平面視における中心を通りかつ平面視における平面に対して垂直方向に延びる軸線に対して角度をなすように斜めに形成されたフィンを有する、
試料分析チップ。 - 前記複数のウェルのそれぞれと連通して設けられた、所定の容積を有する複数の計量部をさらに備える、請求項1に記載の試料分析チップ。
- 前記初期反応部と前記流路部との間に設けられ、前記初期反応部から前記流路部に移動する前記サンプル液の挙動を制御する拡散制御部をさらに備える、請求項1または2に記載の試料分析チップ。
- 前記初期反応部と前記拡散制御部との間に設けられた壁部をさらに備える、請求項3に記載の試料分析チップ。
- 前記拡散制御部と前記流路部との間に設けられたすり切り部をさらに備える、請求項3または4に記載の試料分析チップ。
- 前記加速部は、前記初期反応部の底部から突出するように形成されている、請求項1に記載の試料分析チップ。
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