JP6302560B2 - ポリエチレングリコール部分を含む化合物を用いて支持体に細胞を固定化する方法 - Google Patents
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Description
a)下記の化合物またはその塩を用意する:
親水性ドメインに結合した1以上の疎水性ドメインを含み、好ましくはそれらからなり、
1以上の疎水性ドメインは親水性ドメインに共有結合しており、
1以上の疎水性ドメインはそれぞれ、線状脂質、ステロイドまたは疎水性ビタミンを含み、親水性ドメインはポリエチレングリコール(PEG)部分を含む
化合物であって、連結基を含む化合物;
b)化合物が細胞の膜と相互作用できる条件下で細胞をその化合物と接触させ、それにより連結基を細胞の表面に固定化する;そして
c)細胞に固定化された連結基を、その連結基を結合できる支持体と接触させ、それにより細胞を支持体に固定化する
ことを含む。
用語“固体支持体”は、液相中の試薬と不均一反応により相互作用する固相材料を表わす。固体支持体の使用は化学、生化学、医薬および分子生物学の分野で周知である。解決すべき技術的課題に応じて多数のタイプの固体支持体が開発されている。本発明に関してこれらのいずれかを使用できる。たとえば、本発明方法に使用する固体支持体は、シリカ、酢酸セルロース、ニトロセルロース、ナイロン、ポリエステル、ポリエーテルスルホン、ポリオレフィン、もしくはポリフッ化ビニリデン、またはその組合わせの成分を含むことができる。さらなる適切な固体支持体にはコントロールドポアガラス、ガラスプレートまたはスライドガラス、ポリスチレン、および活性デキストランが含まれるが、これらに限定されない。他の観点において、合成有機ポリマー、たとえばポリアクリルアミド、ポリメタクリレートおよびポリスチレンも例示的な支持体表面である。さらに、多糖類、たとえばセルロースおよびデキストランは支持体表面のさらなる例示である。他の支持体表面、たとえば繊維も作動可能である。
本発明方法に使用できる化合物の細胞固定化の基本原理は、本発明方法に使用できる化合物の末端疎水性部分が目的細胞膜の脂質二重層内へ固着(anchor)することであると仮定される。次いで細胞を、たとえばその後、特異的に修飾された表面に付着させ、所望により視覚化および/または検出のために標識することができる。疎水性部分に応じて、特定の細胞への優先的または排他的な結合を達成することもできる。
安定化効果、特に剪断保護効果は、特に本発明方法に使用できる化合物の疎水性部分としてのコレステロール、ミリスチン酸およびステアリン酸について証明される(参照:実施例5)。
連結基は、化合物を表面または支持体、特に固体支持体に可逆的もしくは不可逆的に、および/または共有結合もしくは非共有結合により固定化するのに適した部分である。好ましい態様において、連結基は抗体もしくは抗原結合性抗体フラグメント、受容体もしくはその結合部位、受容体に対するリガンド、酵素もしくはその結合部位、酵素に対する基質、タグ結合部位、タグ、または官能基である。
ストレプトアビジンへのビオチンの結合、または抗体もしくは抗原結合性抗体フラグメントの結合は、非共有結合性かつ可逆的である。固体支持体への非共有結合を用いるそのような連結基は、細胞をさらに使用するために、たとえば動物モデルに投与するために、再び離脱させることを意図する場合に好ましい。
脂質は、脂肪、ろう、ステロール、脂溶性疎水性ビタミン、たとえばビタミンA、D、EおよびK、脂肪酸のモノグリセリド、ジグリセリド、トリグリセリド、ならびにリン脂質から選択される疎水性小分子である。
本発明方法に使用できる化合物は、1以上の疎水性ドメイン、親水性ドメイン、および連結基を含み、好ましくはそれらからなる。
実施例に示すように、本発明方法に使用する化合物を細胞と接触させる。固定化は好ましくは生細胞または生存可能性のある細胞について行なわれるので、細胞は一般に、好ましくは緩衝化されたおよび/または栄養素を含有する水溶液中に存在し、たとえば細胞はPBSまたは培地に懸濁されている。本発明方法に使用する化合物を、たとえば溶液の形で、たとえば水溶液として、ピペッティングなど当技術分野で既知の方法により細胞に添加することができる。
一般に、接触は約1℃〜45℃、好ましくは10℃〜30℃、より好ましくは22℃〜38℃の温度で行なわれる。好ましくは、細胞の生存性に影響を及ぼさない温度が選択される。
同様に、細胞を化合物と共に、結合させるのに十分な時間、インキュベートすることが好ましい。一般に、細胞を化合物と共に、1分〜3日間、好ましくは5分〜24時間、よりいっそう好ましくは10分〜8時間、インキュベートすることが好ましい。
そのような条件により化合物は細胞の膜と相互作用することができる。それにより、連結基が細胞に固定化される。
好ましい態様において、本発明は、化合物が下記の化合物またはその塩である本発明方法に関する:
1以上の疎水性ドメインおよび親水性ドメインを含み、好ましくはそれらからなり、
1以上の疎水性ドメインは親水性ドメインに共有結合しており、
1以上の疎水性ドメインはそれぞれ、線状脂質、ステロイドまたは疎水性ビタミンを含み、
親水性ドメインは式(I)の化合物を含み:
X1−[A1−(L1)n]k1−Z−[A2−(L1)n]k2−X2 (I)
{式中:
Zは、1〜100、好ましくは1〜50、より好ましくは4〜30の−O−CH2−CH2−部分を含む線状ポリエチレングリコール(PEG)部分であり、その際、ポリエチレングリコール部分は2つの−O−CH2−CH2−部分を連結する1以上のスペーサー部分SPを含んでもよく、線状PEG部分は一端または両端にリンカー部分L3を含んでもよく、
各L1は、互いに独立して選択されるリンカー部分であり、
各nは、0または1のいずれかであり、互いに独立して選択され、
A1およびA2は、互いに独立して選択される2官能性または3官能性の部分であり、ただし、少なくとも1つのA1またはA2は3官能性であり、
k1およびk2は、0〜10の整数であり、互いに独立して選択され、ただし、k1およびk2のうち少なくとも1つは0ではなく、
X1およびX2は、独立して水素または保護基から選択され、
L3は、独立して、1〜10個のC原子を含む線状アルキルまたはアルケニル鎖から選択され、それは(i)1〜3個のN、OまたはS原子により中断されていてもよく、および/または(ii)1〜4個のヒドロキシル、カルボニル、アミノまたはチオール基により置換されていてもよい}、
1以上の疎水性ドメインは、親水性ドメインに3官能性ドメインを介して共有結合しており、
化合物はさらに連結基を含む。
本明細書における一般的理解のために、“疎水性部分”は“疎水性ドメイン”に含まれ、それの主要部を形成し、よってその疎水性を決定する。
線状脂質、ステロイドまたは疎水性ビタミンは、3官能性部分に直接に、またはリンカーL2を介して結合していてもよい。線状脂質、ステロイドまたは疎水性ビタミンが3官能性部分に直接結合している化合物の例は、化合物ミリスチン酸−ミリスチン酸−(スペーサーC18)7−Fluos−ビオチン−TEGである。線状脂質、ステロイドまたは疎水性ビタミンがリンカーL2を介して3官能性部分に結合している化合物の例は、化合物コレステリル−TEG−コレステリル−TEG−(スペーサーC18)7−Fluos−ビオチン−TEGである。この後者の例においてTEG(テトラエチレングリコール)がリンカーL2である。
本発明によれば、“コレステロール−二重リンカー分子”は、2つの疎水性部分を含み、それらが両方ともコレステロールである、本発明方法に有用な化合物であると理解される。したがって、“ミリスチン酸−三重リンカー分子”は、3つの疎水性部分を含み、それらがすべてミリスチン酸である化合物であると理解される。
本発明方法に使用する化合物は、例において大部分がこのモジュール型の模式的様式で記載される。
本発明によれば、“ビオチン−TEG”はリンカーTEGを介して3官能性部分A2に結合したビオチン部分であると理解される。
よりいっそう模式的様式で、“コレステリル−TEG−コレステリル−TEG−(スペーサーC18)7−Fluos−ビオチン−TEG”は構造“5’−XXYYYYYYYFZ−3’”のものであると記載することができ、その際、YはPEG+スペーサー部分であり、Xは3官能性リンカーを介して親水性部分に結合した疎水性部分であり、Fは蛍光標識フルオレセインであり、Zは連結基(ビオチン)である。5’および3’は、ヌクレオチドと同様に、実施例に示す自動合成による合成の方向を示す。
実験の部に記載する本発明方法に使用する化合物において、そうではないと明確に指摘しなければ、L1が存在し(n=1)、それはホスフェートである。
特に、コレステロール−二重リンカー分子、ミリスチン酸−二重または三重リンカー分子、およびステアリン酸−二重リンカー分子は、白血球および種々の培養細胞系を用いる定量的細胞固定化を達成するのに適切であることが見出された。さらに、コレステロール−二重リンカーとミリスチン酸−二重リンカー分子の組合わせは、単一の二重リンカー分子と比較してある細胞タイプの弱い固定化率増大を示す。
さらに、親水性ドメインに共有結合した2または3つの疎水性分子を含む本発明方法に有用な化合物は、細胞への緊密な結合を示し、それはおそらく協同結合効果の利用によるものであろう。細胞へのそのような分子の結合は、疎水性分子を1つだけ含む化合物を用いる結合または固定化と比較して100〜1000倍強い。
本発明方法に有用な化合物の親水性ドメインはPEG部分を含み、したがってフレキシブルである。
この親水性ドメインは、目的細胞の周囲で細胞を安全に包埋するのに必要なフレキシブルフォールディングを行なうことができ、それにより細胞の形態および機能を存続させるために重要な細胞フレンドリーなヒドロゲル様環境を生成する。
他の塩類も可能であり、当業者に知られている。 好ましくは、細胞の生存性または機能に全くまたは実質的に影響を及ぼさない塩類を使用する。
−(L3)n2−[O−CH2−CH2]y−(SP)n1]m−[O−CH2−CH2]y1−(L3)n2−
式中:
SPは、スペーサー部分であり、
各スペーサー部分SPは互いに独立して選択され、
各n1は、0または1のいずれかであり、m個の部分それぞれについて独立して選択され、
各n2は、0または1のいずれかであり、互いに独立して選択され、
mは、1から100、好ましくは1から50、より好ましくは4から30の整数であり、
yは、1から100、好ましくは1から50、より好ましくは4から30の整数であり、
y1は、0から30、好ましくは0から10、より好ましくは0から4の整数であり、
ただし、y*m+y1≦100であり、
L3は、前記に定めたものである。
例から分かるように、n1は一般に、本発明方法に有用な化合物において常に0であり、あるいは本発明方法に有用な化合物において常に1である。
n1=0の例示的化合物は、コレステリル−TEG−コレステリル−TEG−PEG2000−Fluos−ビオチン−TEGである。
y1=0の例示的化合物は、コレステリル−TEG−スペーサーC12−コレステリル−TEG−(スペーサーC18)7−Fluos−ビオチン−TEGである。
y1=1の例示的化合物は、5’−コレステリルTEG−コレステリルTEG−(スペーサーC18)7−スペーサーC3−dT−ビオチンTEG−3’である。
本発明のさらなる好ましい態様において、スペーサー部分SPは互いに独立してホスフェートおよび2官能性部分からなる群から選択される。
本発明による2官能性部分は本発明方法に使用する化合物の合成前に2つの官能基を含む部分であると理解される。したがって、そのような2官能性部分は線状化合物の合成に適切である。適切な2官能性基は、好ましくは下記のものからなる群から選択される:ホスフェート基、カルバメート基、アミド基、核酸塩基を含む部分、よりいっそう好ましくはdT、および1〜10個のC原子、特に1、2、3、4、5、6、7、8、9または10個の原子を含む線状アルキル基であって、末端C原子に、特に、独立してアミン、カルボニル、ヒドロキシル、チオール、炭酸基から選択される官能基を含むアルキル鎖。末端官能基をもつ適切な線状アルキル基の例は、ジアミノアルキル部分、たとえばH2N−(CH2)5−NH2またはヒドロキシル−カルボニル部分、たとえば−C(O)−(CH2)4−O−である。
(a)飽和もしくは不飽和脂肪酸、および/または
(b)8から26個のC原子、好ましくは12から22個のC原子、より好ましくは14から18個のC原子をもつ脂肪酸
である。
飽和脂肪酸の例は、カプリル酸、カプリン酸、ラウリン酸、ミリスチン酸、パルミチン酸、ステアリン酸、アラキジン酸、ベヘン酸、リグノセリン酸、およびセロチン酸である。
ステロイドは、互いに連結した特徴的配列の4つのシクロアルカン環を含むタイプの有機化合物である。ステロイドのコアは17個の炭素原子からなり、それらが互いに結合して4つの縮合環の形をとる:3つのシクロヘキサン環(環A、BおよびCと表記する)および1つのシクロペンタン環(D環)。ステロイドは、この4環コアに結合する官能基およびそれらの環の酸化状態により変異する。ステロールは特殊な形のステロイドであり、位置3のヒドロキシル基およびコレスタンから誘導された骨格をもつ。
(a)ステロイドはステロールである、または
(b)ステロイドは、コレステロール;ステロイドホルモン、好ましくは生殖腺ステロイド、より好ましくはアンドロゲン、たとえば同化ステロイド、アンドロステンジオン、デヒドロエピアンドロステロン、ジヒドロテストステロン、またはテストステロン、エストロゲン、たとえばエストラジオール、エストリオール、またはエストロン;黄体ホルモン物質、たとえばプロゲステロンまたはプロゲスチン、コルチコステロイド、特にグルココルチコイドまたはミネラルコルチコイド;エクジステロイド(ecdysteroid)、たとえばエクジステロン(ecdysterone);フィトステロール;ブラシノステロイド(brassinosteroid);ホパノイド(hopanoid);およびエルゴステロールからなる群から選択される、
より好ましくは、ステロイドはコレステロールである、または
(c)疎水性ビタミンはα−トコフェロールである。
本発明のさらなる好ましい態様において、親水性ドメインに共有結合している2以上の疎水性ドメインは異なるかまたは同一である。
本発明のさらなる好ましい態様において、疎水性ドメイン(単数または複数)は3官能性部分A1にリンカー部分L2を介して共有結合した線状脂質、ステロイドまたは疎水性ビタミンを含み、好ましくはそれからなる。
リンカーL2は、独立して、疎水性部分を親水性部分に共有結合させるのに適したいずれかのリンカー部分であり、そのリンカーは疎水性部分とそれぞれA1またはA2との間に50、30もしくは20原子またはそれ未満の長さをもつ。
−[O−CH2−CH2]y2−(SP)n]m1−
{式中:
SPおよびnは前記に定めたものであり、好ましくはn=0であり、
y2は、1から30、好ましくは3から10の整数であり、
m1は、1から10、好ましくは1から3の整数である}
からなる群から選択され、
より好ましくは、線状脂質、ステロイドまたは疎水性ビタミンはリンカー部分テトラエチレングリコール(TEG)またはホスフェートを介して3官能性部分A1に結合している。
本発明の特に好ましい態様において、疎水性ドメイン(単数または複数)は、3官能性部分(単数または複数)A1のみを介して、または前記のドメインX1−[A1−(L1)n]k1を介して、その親水性ドメインに共有結合している。そのような態様に、本発明方法に使用する化合物のさらなる好ましい態様も適用される。そのような化合物において、疎水性ドメインは専ら分子の一方の末端部に位置し、これに対し、さらなる基、たとえば連結基(単数または複数)、および所望により標識部分(単数または複数)は、そこから空間的に離れた他方の末端部に位置する。
本発明方法に使用する化合物がdT部分を2官能性部分A2として含む場合、k2は好ましくは3、4、5または6である。
本発明方法のさらなる好ましい態様において、工程a)の化合物はさらに標識部分を含む。したがって、本発明のさらなる好ましい態様において、化合物は標識部分および連結基を含む。
好ましい1態様において、標識部分は下記のものから選択される:(a)色原体、化学発光性グループ(たとえば、アクリジニウムエステルまたはジオキセタン)、電気化学発光性化合物、色素、蛍光色素(たとえば、フルオレセイン、クマリン、ローダミン、オキサジン、レゾルフィン、シアニン、およびその誘導体)、発光性金属錯体、たとえばルテニウムまたはユーロピウムの錯体、および放射性同位体からなる群から選択される直接標識化部分;(b)あるいは間接検出系の一方のパートナー、好ましくは標識部分が下記のものからなる群から選択される結合対のメンバーのうちの一方であるもの:(i)ハプテンまたは抗原/抗体、(ii)ビオチンまたはビオチンアナログ、たとえばアミノビオチン、イミノビオチンまたはデスチオビオチン/アビジンまたはストレプトアビジン、(iii)糖/レクチン、(iv)核酸または核酸アナログ/相補的核酸、および(v)受容体または受容体フラグメント/リガンド、たとえばステロイドホルモン受容体/ステロイドホルモン。
好ましい態様において、標識部分は直接標識化のための標識部分であり、よりいっそう好ましくは標識部分は蛍光性部分または色素である。
本発明の特に好ましい態様において、疎水性ドメイン(単数または複数)は親水性ドメインに3官能性部分(単数または複数)A1のみを介して(または前記のドメインX1−[A1−(L1)n]k1を介して)共有結合しており、連結基および所望により標識部分は部分[A2−(L1)n]k2−X2に結合している。これにより、細胞膜内への挿入のための疎水性ドメインと固定化および所望により標識化のための部分との空間的分離が確実になる。
本発明の他の好ましい態様において、1以上の部分(単数または複数)A2は標識部分であり、より好ましくは部分A2は核酸塩基を含む部分であり、よりいっそう好ましくは実施例に記載する特定の化合物の場合のように、部分A2はdTである。
そのような態様において、本発明方法に使用する化合物はフルオレセインおよびdTを含むことができる。
よりいっそう好ましい態様において、連結基は3官能性部分A2を介して共有結合しており、標識部分は3官能性部分A2を介して共有結合している。
本発明のいっそうさらなる特に好ましい態様において、疎水性ドメイン(単数または複数)は親水性ドメインに3官能性部分(単数または複数)A1のみを介して(または前記のドメインX1−[A1−(L1)n]k1を介して)共有結合しており、連結基が部分[A2−(L1)n]k2−X2に結合しているが、標識部分は結合していない。
本発明のよりいっそう好ましい態様において、本発明方法に使用する化合物は標識部分および連結基を含み、その際、標識部分は蛍光標識であり、および/または連結基はビオチンである。
本発明のさらなる好ましい態様において、部分A1およびA2は、独立して、下記のものから選択される:ホスフェート基、カルバメート基、アミド基、核酸塩基を含む部分、よりいっそう好ましくはdT、および1〜10個のC原子を有する線状アルキル基であって末端C−原子に、特に、独立してアミン、カルボニル、ヒドロキシル、チオール、炭酸基から選択される官能基を含むアルキル鎖からなる群から選択される2官能性基;ならびに1〜10個のC原子を有し、少なくとも1つの−OH、−SH、および/または少なくとも1つの−NH2基を含み、好ましくはリジン、セリン、セリノール、−O−CH2−CH((CH2)4−NH2)−CH2−、グリセロール、および1,3 ジアミノグリセロール部分から選択される3官能性部分。
−[O−CH2−CH2]y2−(SP)n]m1−
{式中:
SPおよびnは前記に定めたものであり、好ましくはn=0であり、
y2は、1から30、好ましくは3から10の整数であり、
m1は、1から10、好ましくは1から3の整数である}
からなる群から選択される。
本発明方法に有用な他の化合物を当技術分野で知られている方法に従って同様に製造できる。
好ましい1態様において、1種類より多い前記化合物を含む組成物を使用できる。
したがって、1態様において、本発明は、細胞を支持体に固定化するための方法に関するものであって、その方法は、
a)下記の化合物またはその塩を含む組成物を用意する:
親水性ドメインに結合した1以上の疎水性ドメインを含み、好ましくはそれらからなり、
1以上の疎水性ドメインは親水性ドメインに共有結合しており、
1以上の疎水性ドメインはそれぞれ、線状脂質、ステロイドまたは疎水性ビタミンを含み、親水性ドメインはポリエチレングリコール(PEG)部分を含む
化合物であって、連結基を含む化合物;
b)化合物が細胞の膜と相互作用できる条件下で、前記化合物を含む組成物と細胞を接触させ、それにより連結基を細胞の表面に固定化する;そして
c)細胞に固定化された連結基を、その機能性ドメインを結合できる表面と接触させ、それにより細胞を表面に固定化する
ことを含む。
(i)異なる化合物は少なくともそれらの疎水性ドメインにおいて異なり、
(ii)異なる化合物は標識部分を含む。
本発明はさらに、本発明方法に有用な少なくとも1種類の化合物が少なくとも1つの細胞、好ましくは生細胞に結合したものを含む組成物に関する。そのような組成物は、それぞれ細胞の固定化および所望により検出に有用である。
さらなる態様において、本発明は、本発明方法に有用な1種類またはそれ以上の化合物を含む組成物を使用する本発明方法に関する。
したがって、他の態様において、本発明は、本発明方法に有用な少なくとも3種類の異なる化合物を含む組成物を使用する本発明方法に関するものであり、その際、異なる化合物は少なくともそれらの疎水性ドメインにおいて異なり、異なる化合物は標識部分を含む。
より好ましい態様において、少なくとも1種類の化合物の疎水性ドメインが飽和脂肪酸、殊にミリスチン酸、ステアリン酸またはベヘン酸、特にミリスチン酸を含み、好ましくはそれからなり、および/または少なくとも1種類の化合物の疎水性ドメインがステロイド、特にコレステロール、または疎水性ビタミン、特にα−トコフェロールを含み、好ましくはそれからなる。
本発明方法に使用する水溶液は、好ましくは緩衝化されている。たとえば、溶液はリン酸緩衝化生理食塩水(PBS)、トリス、および/またはHepes緩衝液であってもよい。
なおさらなる態様において、本発明は、細胞を固定化するための、前記に開示した少なくとも1種類の化合物または組成物を含むキットの使用に関する。
したがって、他の態様において、本発明は目的細胞を含む細胞集団を支持体に固定化する方法に関するものであって、その方法は、
a)下記の化合物またはその塩を含む組成物を用意する:
親水性ドメインに結合した1以上の疎水性ドメインを含み、好ましくはそれらからなり、
1以上の疎水性ドメインは親水性ドメインに共有結合しており、
1以上の疎水性ドメインはそれぞれ、線状脂質、ステロイドまたは疎水性ビタミンを含み、親水性ドメインはポリエチレングリコール(PEG)部分を含む
化合物であって、連結基を含む化合物;
b)化合物が細胞の膜と相互作用できる条件下で細胞集団をその化合物と接触させ、それにより細胞の表面に連結基を固定化する;
c)細胞に固定化された連結基を、その連結基を結合できる表面と接触させ、それにより細胞をその表面に固定化する;そして
d)表面に固定化された目的細胞を所望により検出する
ことを含む。
この本発明方法には、細胞を表面に固定化するための前記の本発明方法のものと同じ態様が適用される。したがって、適切な化合物を含む組成物も前記のように使用できる。
よりいっそう好ましくは、細胞は懸濁状態の細胞であり、および/または細胞は動物細胞またはヒト細胞、特に脊椎動物細胞、殊に哺乳動物細胞である。
本発明のさらなる態様において、さらに標識部分を含む本発明方法に有用な化合物を用いる。これにより細胞集団自体の検出が可能になり、その細胞集団と比較した目的細胞についての情報を得ることが可能になる。
したがって、本発明のさらなる態様において、1つの希少細胞の特性分析はさらなる工程e)として、たとえば細胞表面マーカーの検出により実施される。
本発明のなおさらなる態様において、本方法は、工程e)固定化された細胞を用いる細胞の機能アッセイの実施をさらに含む。
好ましい1態様において、本発明の方法は in vitro 法である。
本発明の方法はラボ・オン・チップ(lab on a chip)として実施できる:2〜50個のような少数の細胞または単一細胞の細胞形態または細胞機能を調べるために、本発明方法に有用な化合物を支持体または表面に選択的かつ系統的にスポットすることができる。このスポッティングによって少数の細胞または単一細胞をそのようなスポット上にターゲティッド固定化することができる。これよりその支持体または表面(チップ)で直接に分子分析できる。
したがって、本発明はまた、本発明方法の固定化に際して、または工程a)以前の培養に際して、少なくとも1つの細胞を安定化するための、本発明方法の使用に関する。
フローサイトメトリーは特定の細胞集団を分離するためにごく一般的に用いられる方法である。このプロセスに際して、細胞は流速に応じた高い剪断応力を受ける。本発明方法に有用な化合物はこの剪断応力を低減する。
異なる表現型をもつ細胞集団を、磁性ビーズに結合した特異的抗体により分離することができる。このプロセスに際して、細胞はビーズのサイズに応じた高い剪断応力を受ける。本発明方法に有用な化合物はこの剪断応力を低減する。
すべての抗体の一般構造がきわめて類似するが、特定抗体の固有の特性は前記に詳述したように可変(V)領域により決定される。より具体的には、それぞれ軽鎖(VL)上に3つ、重鎖(VH)上に3つの可変ループが、抗原への結合、すなわちそれの抗原特異性に関与する。これらのループは相補性決定領域(CDR)と呼ばれる。VHとVLの両ドメインからのCDRが抗原−結合部位に寄与するので、最終的な抗原特異性を決定するのは重鎖と軽鎖の組合わせであって、いずれか単独ではない。
タグは、バイオテクノロジーにおける認識のために用いられるペプチドモチーフである。周知のタグは、Ni2+−カラムに結合させることができるHis−タグ(6×ヒスチジン)である。
レクチンは、糖部分に対して高特異的な炭水化物結合性タンパク質である。適切なレクチンとして、コンカナバリンAを使用でき、これはα−D−マンノシルおよびα−D−グルコシル残基、分岐α−マンノシド型(mannosidic)構造体(高α−マンノースタイプ、またはハイブリッドタイプ、および二アンテナ型複合体(biantennary complex)タイプのN−グリカンに結合する。
本発明方法に有用な下記の化合物を合成した:
本発明方法に有用な例示的化合物および合成副産物の化学構造を図6AおよびBに示す。
本発明のビオチン−PEG−Lys−(C18)2の合成を図6Cに示す。
F)本発明方法に有用なさらなる化合物および参照化合物ならびにその中間体の構造
本発明方法に有用な化合物および参照化合物の合成のために下記の中間体を用いた:
コレステリル−TEG−CE−PA(GlenResearch 10−1975),
ミリスチン酸−CE−PA(社内製造),
ビオチン−TEG−CE−PA(GlenResearch 10−1955),
ビオチン−dT−CE−PA(GlenResearch 10−1038),
dT−CE−PA(GlenResearch 10−1030),
対称doubler−CE−PA(GlenResearch 10−1920),
PEG−200−CED−PA(ChemGenes CLP−2119),
6−フルオレセイン−CE−PA(GlenResearch 10−1964)および
universal−CPG(Proligo 1000A M401010)
本発明方法に有用なさらなる化合物および参照化合物ならびに中間体の構造を図12に示す。
下記を以下の化合物のモジュール型記載に適用する:
X=疎水性部分,Y=PEG2000,Z=ビオチン−TEG,F=Fluos=フルオレセイン
下記の実験において細胞の回収率を決定した。
下記に示すように、異なるインキュベーション時間、実験を実施した:
化合物ビオチン−PEG−lys−(C14)2について下記の回収率が決定された:
M=2708,90g/mol
5,4mg/10ml EtOH
c=n/V=m/M*V
c=5,4g/(2708,9g/mol*10 l)=1,99 10e−4mol/l
1,99*10e−4mol/l=7,96nmol/4μl
4μl=4,5*10e6細胞
→1,77nmol/10e6細胞
この実験における回収率:85,72%
実施例4:本発明方法に有用な1つの疎水性部分を含む化合物と2つの疎水性部分を含む化合物との比較
この実験の目的:ストレプトアビジン−コートした表面への本発明方法に有用な異なる分子を用いる白血球固定化の試験。特に、単一コレステロール−分子および異なる二重リンカー分子(すなわち、2つの疎水性部分を含むもの)の性能を試験した。詳細には、ストレプトアビジン−コートした表面への異なるリンカー分子を用いる白血球(WBC)の固定化を、12−ウェルプレートで試験した:300000 WBC/ウェル。これに続いて、細胞の固定化および洗浄の後の細胞回収率をCellavista計測器(10xNuclei Operator s9s5)により測定した。
本発明方法に有用な化合物が細胞の安定化および固定化に及ぼす効果を判定した。
A)異なる分子を用いた遠心分離および細胞固定化の後のWBC回収率
図14に示すように、分子プローブHH1749*、HH1750*およびHH1755*(* ビオチン−PEG−リジン−(C18)2)は遠心分離後の回収率に関して異なる性能を示す:分子の濃度が高いほど、遠心分離後の細胞回収率は高くなる。遠心分離特性:10分、300×g。図15から分かるように、分子プローブHH1749*、HH1750*およびHH1755*は、異なる濃度での細胞固定化率に関して異なる性能を示す。リンカー濃度が高いほど、細胞固定化率は高くなる。
図16から分かるように、分子AおよびB(A:コレステリル−TEG−コレステリル−TEG−(スペーサーC18)7−Fluos−ビオチン−TEG;B:ビオチン−PEG−リジン−(C18)2)は遠心分離後の回収率に関して異なる性能を示す。分子濃度が高いほど、遠心分離後の細胞回収率は高くなる。分子Bは3.5時間以内は細胞を固定化できる。遠心分離特性:10分、300×g。A:コレステリル−TEG−コレステリル−TEG−(スペーサーC18)7−Fluos−ビオチン−TEG。B:ビオチン−PEG−リジン−(C18)2。
図17から分かるように、分子濃度が高いほど、遠心分離後の細胞回収率は高くなる。さらに、細胞安定化は実験者とは無関係である。遠心分離特性:10分、300×g。分子:コレステリル−TEG−コレステリル−TEG−(スペーサーC18)7−Fluos−ビオチン−TEG。
第1実験の結果を図18に示す。下記の分子を試験した:
・ 1234: 5’−(コレステリル−TEG)2−スペーサーC18−dT−ビオチン−TEG−3’
・ 1248: 3’−(コレステリル−TEG)2−PEG2000−Fluos−ビオチン−TEG−5’ INVERS 1254: 3’−(コレステリル−TEG)2−スペーサーC18−Fluos−ビオチン−TEG−5’ INVERS
・ 1255: 3’−(ミリスチン酸)2−PEG2000−dT−ビオチン−TEG−5’ INVERS
・ すべての分子が2時間以内は細胞を固定化できる
・ PBS中におけるWBCは300×gで20分間の遠心分離に際して損傷を受ける
・ 分子1234は最良の性能を示し、化合物1255および1254がそれに続く。
これに関する第2実験の結果を図19に示す。下記の分子を試験した:
1255: 3’−(ミリスチン酸)2−PEG2000−dT−ビオチン−TEG−5’ INVERS 1234: 5’−(コレステリル−TEG)2−スペーサーC18−dT−ビオチン−TEG−3’
1248: 3’−(コレステリル−TEG)2−PEG2000−Fluos−ビオチン−TEG−5’ INVERS
1254: 3’−(コレステリル−TEG)2−スペーサーC18−Fluos−ビオチン−TEG−5’ INVERS
結果は下記のとおりである:
・ すべての分子が2時間以内は細胞を固定化できる
・ PBS中におけるWBCは500×gで20分間の遠心分離に際して損傷を受ける
・ 分子1234は最良の性能を示し、分子1255および1254がそれに続く。
・ 1255: 3’−(ミリスチン酸)2−PEG2000−dT−ビオチン−TEG−5’ INVERS
・ 1234: 5’−(コレステリル−TEG)2−スペーサーC18−dT−ビオチン−TEG−3’
・ 1248: 3’−(コレステリル−TEG)2−PEG2000−Fluos−ビオチン−TEG−5’ INVERS
・ 1254: 3’−(コレステリル−TEG)2−スペーサーC18−Fluos−ビオチン−TEG−5’ INVERS
結果は下記のとおりである:
・ すべての分子が2時間以内は細胞を固定化できる
・ PBS中におけるWBCは1000×gで20分間の遠心分離に際して損傷を受ける
遠心分離特性:20分、500×g。
この実験の結果を図21に示す。下記の分子を試験した:
・ 1255: 3’−(ミリスチン酸)2−PEG2000−dT−ビオチン−TEG−5’ INVERS
・ 1234: 5’−(コレステリル−TEG)2−スペーサーC18−dT−ビオチン−TEG−3’
・ 1248: 3’−(コレステリル−TEG)2−PEG2000−Fluos−ビオチン−TEG−5’ INVERS
・ 1254: 3’−(コレステリル−TEG)2−スペーサーC18−Fluos−ビオチン−TEG−5’ INVERS
結果は下記のとおりである:
・ ジャーカット培養細胞は、PBS中および異なる分子を用いた遠心分離プロセスに際して5.5時間以内は安定である
遠心分離特性:20分、500×g。
これに関する第1実験の結果を図22AおよびBに示す。
3官能性リンカー部分が異なる、本発明方法に有用な異なる化合物を用いて、WST−1増殖キット(RAS)を用いる細胞生存性試験を実施した。
これに関する第2実験の結果を図23AおよびBに示す。本発明方法に有用な被験分子(No.1244および1274)は、4.5時間のリンカーインキュベーション時間中に細胞形態に影響を及ぼさないことが見出された。
この実験の結果を図24に示す。下記のことが見出された:
・ 本発明方法に有用な分子を添加しない場合、細胞は4.5時間のインキュベーション時間中に離散する
・ インキュベーション時間中に残った細胞の細胞形態は影響を受けていない。
この実験の結果を図25に示す。本発明方法に有用な下記の分子を試験した:
・ 1234: 5’−(コレステリル−TEG)2−スペーサーC18−dT−ビオチン−TEG−3’
・ 1255: 3’−(ミリスチン酸)2−PEG2000−dT−ビオチン−TEG−5’ INVERS
下記のことが見出された:
・ MDA−MB468培養細胞は、PBS中における、および本発明方法に有用な異なる分子を用いた遠心分離プロセスに際して、5時間以内は安定である
遠心分離特性:20分、500×g。
出発物質として5’−(コレステリル−TEG)2−PEG2000−Fluos−ビオチン_TEG−3’ INVERS(14530pmol/μl)(社内参照No.:29.891250)、およびストレプトアビジン処理したMTP(Microcoat)、12ウェルプレートを用いた。
−EDTA−全血59.423 6.400 WBC/μl(Ambulanz Roche)
細胞溶解緩衝液:100mM NH4Cl+5mM Hepes+0,5mM KHCO3+0,1mM EDTA−K
Ca 1×8mlの全血を細胞溶解緩衝液と共に50ml Falconチューブに充填し、室温で10分間インキュベートした。
250gで15分間遠心分離し、ペレットをPBSで再懸濁し、50mlまでPBSを充填し、250gで15分間遠心分離し、50mlまでPBSを充填した。
1:37.100のWBC/μl
− プレート上での実験のデザインを以下に説明する(参照:図2):
3×12ウェル MTP:本発明方法に有用な化合物によるWBCの処理:
4×判定:
横列A:200μlのPBSを導入し、それぞれ1nmolの化合物をそれに添加し、混合し、約30分間インキュベートし、PBSで2回洗浄し、800μlのPBSを導入し、300.000のWBC(非処理)を添加した;
横列B:800μlのPBSを導入し、300.000のWBC(非処理)を添加した;
横列C:1ml中の10×10^6のWBCを10nmolの本発明方法に有用な化合物と共に10分間インキュベートし、それぞれ800μlのPBS/ウェル、300.000の処理済みWBCを導入した。
−第3プレートを150分後に測定した。
計算した結果を図3に示す。これらの結果を表わすグラフを図4に示す。実験のプレートを図5に示す。
Claims (16)
- 細胞を支持体に固定化するための方法であって、
a)下記の化合物またはその塩を用意する:
親水性ドメインに結合した1以上の疎水性ドメインを含みまたはそれらからなり、
該1以上の疎水性ドメインは該親水性ドメインに共有結合しており、
該1以上の疎水性ドメインはそれぞれ、線状脂質、ステロイドまたは疎水性ビタミンを含み、親水性ドメインはポリエチレングリコール(PEG)部分を含む
化合物であって、該化合物は連結基を含む;そして、
該親水性ドメインは式(I)の化合物を含み:
X1−[A1−(L1) n ] k1 −Z−[A2−(L1) n ] k2 −X2 (I)
{式中:
Zは、1〜100、1〜50、または4〜30の−O−CH 2 −CH 2 −部分を含む線状ポリエチレングリコール(PEG)部分であり、ここで、該ポリエチレングリコール部分は2つの−O−CH 2 −CH 2 −部分を連結する1以上のスペーサー部分SPを含んでもよく、そして該線状PEG部分は一端または両端にリンカー部分L3を含んでもよく、
各L1は、互いに独立して選択されるリンカー部分であり、
各nは、0または1のいずれかであり、互いに独立して選択され、
A1およびA2は、互いに独立して選択される2官能性または3官能性の部分であり、
ただし、少なくとも1つのA1またはA2は3官能性であり、
k1およびk2は、0〜10の整数であり、互いに独立して選択される、ただし、k1およびk2のうち少なくとも1つは0ではなく、
X1およびX2は、独立して水素または保護基から選択され、
L3は、独立して、1〜10個のC原子を含む線状アルキルまたはアルケニル鎖から選択され、それは(i)1〜3個のN、OまたはS原子により中断されていてもよく、および/または(ii)1〜4個のヒドロキシル、カルボニル、アミノまたはチオール基により置換されていてもよい}、
該1以上の疎水性ドメインは、該親水性ドメインに3官能性ドメインを介して共有結合し、
b)該化合物が細胞の膜と相互作用できる条件下で細胞を該化合物と接触させ、それにより該連結基を該細胞の表面に固定化する;そして
c)細胞に固定化された該連結基を、該連結基を結合できる支持体と接触させ、それにより該細胞を支持体に固定化する
ことを含む、前記方法。 - 式(I)中のZは、下記の構造:
−(L3)n2−[O−CH2−CH2]y−(SP)n1]m−[O−CH2−CH2]y1−(L3)n2
{式中:
SPは、スペーサー部分であり、
各スペーサー部分SPは互いに独立して選択され、
各n1は、0または1のいずれかであり、m個の部分それぞれについて独立して選択され、
各n2は、0または1のいずれかであり、互いに独立して選択され、
mは、1から100、1から50、または4から30の整数であり、
yは、1から100、1から50、または4から30の整数であり、
y1は、0から30、0から10、または0から4の整数であり、
ただし、y*m+y1≦100であり、
L3は、独立して、1〜10個のC原子を含む線状アルキルまたはアルケニル鎖から選択され、それは(i)1〜3個のN、OまたはS原子により中断されていてもよく、および/または(ii)1〜4個のヒドロキシル、カルボニルまたはチオール基により置換されていてもよい}
を有する、請求項1に記載の方法。 - (a)n1はm個の部分−[O−CH2−CH2]y−(SP)n1]−について同一である、および/または
(b)y1は0である、および/または
(c)yは4、5または6であり、n1は1である、または
(d)yは4、5または6であり、n1は1である、および/または
(e)スペーサー部分SPは、互いに独立して、ホスフェートおよび2官能性部分からなる群から選択される、および/または
(f)n2は両方とも0である、または
(g)一方または両方のn2=1であり、L3は1〜10個のC原子をもつアルキル基であり、それはアミド基、カルボニル基、カルバメートおよび/またはNH基を含んでもよい、
請求項2に記載の方法。 - (a)X1またはX2は疎水性ドメインにより置き換えられている、および/または
(b)連結基はビオチンである、
請求項1〜3のいずれか1項に記載の方法。 - 前記線状脂質は、
(a)飽和または不飽和脂肪酸である、および/または
(b)8から26個のC原子または12から22個のC原子を有する脂肪酸であり、または
(c)オレイン酸、ミリスチン酸、ステアリン酸およびベヘン酸からなる群から選択される、
請求項1〜4のいずれか1項に記載の方法。 - (a)前記ステロイドはステロールである、または
(b)前記ステロイドは、コレステロール;ステロイドホルモン、アンドロゲン、同化ステロイド、アンドロステンジオン、デヒドロエピアンドロステロン、ジヒドロテストステロン、テストステロン、エストロゲン、エストラジオール、エストリオール、またはエストロン;黄体ホルモン物質、プロゲステロン、プロゲスチン、コルチコステロイド、グルココルチコイド、またはミネラルコルチコイド;エクジステロイド、またはエクジステロン;フィトステロール;ブラシノステロイド;ホパノイド;およびエルゴステロールからなる群から選択され、または
(c)前記疎水性ビタミンはα−トコフェロールである、
請求項1〜4のいずれか1項に記載の方法。 - (a)1、2、3または4つの疎水性ドメインが親水性ドメインに共有結合しており、および/または
(b)親水性ドメインに共有結合している2以上の疎水性ドメインが異なるかまたは同一である、
請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。 - 前記疎水性ドメインは
(a)線状脂質、ステロイドまたは疎水性ビタミンからなる、または
(b)3官能性部分A1にリンカー部分L2を介して共有結合した線状脂質、ステロイドまたは疎水性ビタミンを含み、該L2は下記のものを含み、またはそれからなる:ホスフェート基、部分
−[O−CH2−CH2]y2−(SP)n]−
{式中:
SPおよびnは前記に定めたものであり、y2は1から30または3から10の整数であり、m1は1から10の整数である}、グリセロール部分、カルバメート基、アミド基、1〜10個のC原子を有する線状アルキル基:そのアルキル鎖は末端C原子に官能基を含み、それは1、2、3、4または5つの部分R1により置換されていてもよく、ここで、R1は独立してC1−C4アルキル、C1−C4ヒドロキシアルキル、C1−C4アミノアルキル、C1−C4シアノアルキル、ヒドロキシル、チオール、アミノまたはカルボニル部分である、
請求項1〜7のいずれか1項に記載の方法。 - 前記L2は、ホスフェート、アミド、カルバメート、エステル基、および部分
−[O−CH 2 −CH 2 ] y2 −(SP) n ] m1 −
{式中:
SPおよびnは前記に定めたものであり、
y2は、1から30または3から10の整数であり、
m1は、1から10または1から3の整数である}
からなる群から選択される、請求項8に記載の方法。 - 前記の線状脂質、ステロイドまたは疎水性ビタミンは、リンカー部分テトラエチレングリコール(TEG)またはホスフェートを介して3官能性部分A1に結合している、請求項8または9に記載の方法。
- (a)k1は、1、2、3、4または5である、および/または
(b)前記疎水性ドメインは、3官能性部分A1のみを介して親水性ドメインに共有結合している、および/または
(c)k2は、1、2、3、4、5または6である、
請求項1〜10のいずれか1項に記載の方法。 - (a)化合物はさらに標識部分を含み、および/または
1以上の部分A2は標識部分であり、および/または
(b)連結基は3官能性部分A2を介して共有結合している、
請求項1〜11のいずれか1項に記載の方法。 - (a)リンカーL1は、独立してホスフェート、アミド、カルバメートおよびエステル基からなる群から選択される、および/または
(b)部分A1およびA2は、独立して、下記のものから選択される:ホスフェート基、カルバメート基、アミド基、核酸塩基を含む部分、dT、および1〜10個のC原子を有する線状アルキル基であって末端C−原子に官能基を含むアルキル鎖からなる群から選択される2官能性基;ならびに1〜10個のC原子を有し、少なくとも1つの−OH、−SH、および/または少なくとも1つの−NH2基を含む3官能性部分、および/または
(c)リンカーL2は、独立してホスフェート、アミド、カルバメート、エステル基、
および部分
−[O−CH2−CH2]y2−(SP)n]m1−
{式中:
SPおよびnは前記に定めたものであり、
y2は、1から30の整数であり、
m1は、1から10の整数である}
からなる群から選択される、
請求項1〜12のいずれか1項に記載の方法。 - 前記化合物またはその塩の1種類以上を含む組成物を用意する、請求項1〜13のいずれか1項に記載の方法。
- 目的細胞を含む細胞集団を支持体に固定化する方法であって、
a)請求項1〜13のいずれか1項において定義される化合物を用意する;
b)該化合物が細胞の膜と相互作用できる条件下で細胞集団を該化合物と接触させ、それにより該細胞の表面に連結基を固定化する;
c)細胞に固定化された該連結基を、該連結基を結合できる支持体と接触させ、それにより該細胞を該支持体に固定化し、そして該支持体に固定化された目的細胞を所望により検出する
ことを含む、前記方法。 - 前記細胞が懸濁状態の細胞であり、および/または該細胞が動物もしくはヒトの細胞、脊椎動物細胞、または哺乳動物細胞である、請求項1〜15のいずれか1項に記載の方法。
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