JP6296752B2 - Method, apparatus, program and recording medium for determining dosage of antidiabetic drug - Google Patents
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Description
本発明は、糖尿病治療薬の投与量を判定する方法に関し、より詳細には、糖尿病患者の遺伝情報に基づいて、治療薬の投与量を判定する方法に関する。 The present invention relates to a method for determining a dosage of a therapeutic drug for diabetes, and more particularly, to a method for determining a dosage of a therapeutic drug based on genetic information of a diabetic patient.
従来から、ある疾患に対して薬物治療を行ううえで、あるひとつの薬剤が、同じ疾患を有するすべての患者に対して同様に作用するわけではないことが知られている。これを受けて、近年では、患者の遺伝的特徴に合わせて最も効率的な薬物投与を行うという、ゲノム薬理学およびオーダーメード医療の機運が高まっている。ゲノム薬理学によると、薬剤の効果が有効に作用するか否かは、患者自身が有する遺伝的背景に基づいて決まると考えられている。このようなゲノム薬理学の機運の高まりを受けて、今後は、それぞれの患者を薬剤に対するレスポンダとノンレスポンダとに識別することにより、それぞれの患者に応じた最適な薬剤の投与判定および投与計画を行うことが期待されている。 Conventionally, it has been known that, when a drug treatment is performed for a certain disease, a single drug does not act on all patients having the same disease in the same manner. In response to this, in recent years, the momentum of genomic pharmacology and custom-made medical care, which provides the most efficient drug administration according to the genetic characteristics of patients, has been increasing. According to genomic pharmacology, it is considered that whether or not the effect of a drug works effectively is determined based on the genetic background of the patient himself. In response to the growing momentum of genomic pharmacology, in the future, by identifying each patient as a responder and non-responder for the drug, the optimal drug dosing determination and dosing plan for each patient will be determined. Is expected to do.
下記特許文献1には、薬剤の選択方法が開示されている。特許文献1の選択方法によると、前立腺肥大症患者ごとの遺伝的背景に基づいて、複数の交感神経遮断薬の中から、患者に応じた最適な薬剤を選択することができる。 Patent Document 1 below discloses a method for selecting a drug. According to the selection method of Patent Document 1, an optimal drug corresponding to a patient can be selected from a plurality of sympathetic nerve blockers based on the genetic background for each patient with benign prostatic hyperplasia.
このように、患者の遺伝的背景に基づいた薬剤選択の機運が高まっており、下記特許文献1に示されるように、一部の疾患については薬剤選択の方法が提案されている。しかしながら、種々の疾患のうち、近年の生活習慣病の増加により患者数も増大している糖尿病については、薬剤の治療効果と遺伝因子との関連性について、未だ十分に報告がなされていないのが実情である。 Thus, the momentum of drug selection based on the genetic background of patients is increasing, and as shown in Patent Document 1 below, drug selection methods have been proposed for some diseases. However, among the various diseases, for diabetes whose number of patients has increased due to the recent increase in lifestyle-related diseases, the relationship between the therapeutic effect of drugs and genetic factors has not been sufficiently reported yet. It is a fact.
本発明は、上記課題を解決するためになされたものであり、その目的は、糖尿病治療薬の投与の要否および投与量について、患者毎の遺伝的背景に基づいたより適切な判定を行うことにある。 The present invention has been made in order to solve the above-mentioned problems, and its purpose is to make a more appropriate determination based on the genetic background of each patient regarding the necessity and dose of administration of a therapeutic drug for diabetes. is there.
本発明者は、上記目的を達成するために鋭意検討を進めていたところ、種々の遺伝子多型のうち、酸化ストレス関連性遺伝子多型p22phox C242Tアレル、糖化関連性遺伝子多型AR(Aldose reductase)-106Tアレル、または感染防御関連性遺伝子多型CD14(cluster of differentiation 14)-159Tアレルと、糖尿病患者の血中HbA1c値の変化値との間に、単相関で有意な差が生じていることを見出し、これら3つのいずれかの遺伝子多型を有する2型糖尿病患者に、糖尿病治療薬であるピオグリタゾンが有効であることを見出した。インスリン感受性に関連するPPAR-r (Pro12Ala)、レジスチン(C-420G)、PGC-1(G1564A)、およびIRS-1(G3494A)、sEH(G860A)遺伝子多型については、糖尿病患者の血中HbA1c値の変化値との間に有意な関連性が認められないことを見出した。 The inventor has been diligently studying to achieve the above object, and among various gene polymorphisms, oxidative stress-related gene polymorphism p22phox C242T allele, glycation-related gene polymorphism AR (Aldose reductase) -106T allele, or infection-related gene polymorphism CD14 (cluster of differentiation 14) -159T allele and a significant difference in the blood HbA1c level of diabetic patients It was found that pioglitazone, which is a therapeutic agent for diabetes, is effective in patients with type 2 diabetes having any of these three gene polymorphisms. For PPAR-r (Pro12Ala), resistin (C-420G), PGC-1 (G1564A), and IRS-1 (G3494A), sEH (G860A) gene polymorphisms related to insulin sensitivity, blood HbA1c in diabetic patients It was found that there was no significant association with the value change.
また、本発明者は、この知見をもとに、糖尿病患者の現在の血中HbA1c値と、p22phox C242Tアレルの有無およびAR-106Tアレルの有無とにより、所定の期間(6ヶ月)経過後の血中HbA1c値の低下度の推定が可能であることを見出し、推定に用いる回帰式を見出した。2型糖尿病患者の多く(約39%)はp22phox C242TアレルまたはAR-106Tアレルを有しており、ピオグリタゾンが有効症例であることを見出した。 In addition, based on this finding, the present inventor determined that the blood HbA1c level in diabetic patients, the presence or absence of the p22phox C242T allele and the presence or absence of the AR-106T allele, after a predetermined period (6 months) had elapsed. We found that it was possible to estimate the degree of decrease in blood HbA1c level, and found a regression equation for estimation. Many patients with type 2 diabetes (about 39%) have the p22phox C242T allele or AR-106T allele and found that pioglitazone is an effective case.
すなわち、本発明は、以下に示す態様を含むものである。 That is, the present invention includes the following aspects.
本発明に係る第1の判定方法は、
演算部と記録部とを備える装置において、糖尿病治療薬の投与量を判定する方法であって、
前記記録部が、取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録するステップと、
前記演算部が、取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別するステップと、
前記演算部が、前記特定の遺伝子多型の存在の有無および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の投与量を判定するステップと、
を含み、
前記臨床データが、前記被験者の血中HbA1c値を含み、前記特定の遺伝子多型が、p22phoxのC242T遺伝子多型と、アルドース還元酵素(Aldose reductase)の106T遺伝子多型とを含む、判定方法である。
The first determination method according to the present invention is:
In a device comprising a calculation unit and a recording unit, a method for determining the dosage of a therapeutic agent for diabetes,
The recording unit records the obtained genetic polymorphism information and clinical data of the subject;
The operation unit identifies whether or not a specific genetic polymorphism exists in the acquired genetic polymorphism information;
A step of determining the dosage of a therapeutic agent for diabetes based on the presence / absence of the specific gene polymorphism and the clinical data;
Including
In the determination method, the clinical data includes a blood HbA1c value of the subject, and the specific gene polymorphism includes a C242T gene polymorphism of p22phox and a 106T gene polymorphism of aldose reductase (Aldose reductase). is there.
また、本発明に係る第1の判定装置は、
演算部と記録部とを備え、糖尿病治療薬の投与量を判定する装置であって、
前記記録部が、取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録し、
前記演算部が、取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別し、
前記演算部が、前記特定の遺伝子多型の存在の有無および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の投与量を判定し、
前記臨床データが、前記被験者の血中HbA1c値を含み、前記特定の遺伝子多型が、p22phoxのC242T遺伝子多型と、アルドース還元酵素(Aldose reductase)の106T遺伝子多型とを含む、判定装置である。
Moreover, the 1st determination apparatus which concerns on this invention is
An apparatus that includes a calculation unit and a recording unit, and that determines a dose of a therapeutic agent for diabetes,
The recording unit records the obtained genetic polymorphism information and clinical data,
The arithmetic unit identifies whether a specific genetic polymorphism exists in the acquired genetic polymorphism information,
The arithmetic unit determines the dosage of a therapeutic drug for diabetes based on the presence or absence of the specific gene polymorphism and the clinical data,
In the determination apparatus, the clinical data includes a blood HbA1c value of the subject, and the specific gene polymorphism includes a C242T gene polymorphism of p22phox and a 106T gene polymorphism of aldose reductase. is there.
また、本発明に係る判定プログラムは、
糖尿病治療薬の投与量を判定するプログラムであって、
コンピュータに、
取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録する機能と、
取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別する機能と、
前記特定の遺伝子多型の存在の有無および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の投与量を判定する機能と、
を実現させ、
前記臨床データが、前記被験者の血中HbA1c値を含み、前記特定の遺伝子多型が、p22phoxのC242T遺伝子多型と、アルドース還元酵素(Aldose reductase)の106T遺伝子多型とを含む、判定プログラムである。
Moreover, the determination program according to the present invention includes:
A program for determining the dosage of an antidiabetic drug,
On the computer,
A function to record the acquired genetic polymorphism information and clinical data;
A function for identifying whether or not a specific genetic polymorphism exists in the obtained genetic polymorphism information;
A function of determining the dosage of a therapeutic agent for diabetes based on the presence or absence of the specific gene polymorphism and the clinical data;
Realized,
In the determination program, the clinical data includes a blood HbA1c value of the subject, and the specific gene polymorphism includes a C242T gene polymorphism of p22phox and a 106T gene polymorphism of aldose reductase. is there.
また、本発明に係る判定プログラムを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体は、
糖尿病治療薬の投与量を判定するプログラムを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体であって、
コンピュータに、
取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録する機能と、
取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別する機能と、
前記特定の遺伝子多型の存在の有無および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の投与量を判定する機能と、
を実現させ、
前記臨床データが、前記被験者の血中HbA1c値を含み、前記特定の遺伝子多型が、p22phoxのC242T遺伝子多型と、アルドース還元酵素(Aldose reductase)の106T遺伝子多型とを含む、判定プログラムを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体である。
Further, a computer-readable recording medium on which the determination program according to the present invention is recorded,
A computer-readable recording medium storing a program for determining a dosage of a therapeutic drug for diabetes,
On the computer,
A function to record the acquired genetic polymorphism information and clinical data;
A function for identifying whether or not a specific genetic polymorphism exists in the obtained genetic polymorphism information;
A function of determining the dosage of a therapeutic agent for diabetes based on the presence or absence of the specific gene polymorphism and the clinical data;
Realized,
The determination program, wherein the clinical data includes a blood HbA1c value of the subject, and the specific gene polymorphism includes a C242T gene polymorphism of p22phox and a 106T gene polymorphism of aldose reductase A recorded computer-readable recording medium.
また、本発明に係る第2の判定方法は、
糖尿病治療薬の投与量を判定する方法であって、
被験者の遺伝子多型情報および臨床データを取得するステップと、
取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別するステップと、
前記特定の遺伝子多型の存在の有無および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の投与量を判定するステップと、
を含み、
前記臨床データが、前記被験者の血中HbA1c値を含み、前記特定の遺伝子多型が、p22phoxのC242T遺伝子多型と、アルドース還元酵素(Aldose reductase)の106T遺伝子多型とを含む、判定方法である。
The second determination method according to the present invention is as follows.
A method for determining the dosage of a therapeutic agent for diabetes,
Obtaining genetic polymorphism information and clinical data of the subject;
Identifying whether a specific genetic polymorphism exists in the obtained genetic polymorphism information;
Determining the dosage of a therapeutic agent for diabetes based on the presence or absence of the specific gene polymorphism and the clinical data;
Including
In the determination method, the clinical data includes a blood HbA1c value of the subject, and the specific gene polymorphism includes a C242T gene polymorphism of p22phox and a 106T gene polymorphism of aldose reductase (Aldose reductase). is there.
また、本発明に係る第2の判定装置は、
糖尿病治療薬の投与量を判定する装置であって、
取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録する手段と、
取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別する手段と、
前記特定の遺伝子多型の存在の有無および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の投与量を判定する手段と、
を備え、
前記臨床データが、前記被験者の血中HbA1c値を含み、前記特定の遺伝子多型が、p22phoxのC242T遺伝子多型と、アルドース還元酵素(Aldose reductase)の106T遺伝子多型とを含む、判定装置である。
Moreover, the second determination apparatus according to the present invention includes:
A device for determining the dosage of a therapeutic agent for diabetes,
Means for recording the obtained genetic polymorphism information and clinical data;
Means for identifying whether or not a specific genetic polymorphism exists in the obtained genetic polymorphism information;
Means for determining the dosage of a therapeutic agent for diabetes based on the presence or absence of the specific gene polymorphism and the clinical data;
With
In the determination apparatus, the clinical data includes a blood HbA1c value of the subject, and the specific gene polymorphism includes a C242T gene polymorphism of p22phox and a 106T gene polymorphism of aldose reductase. is there.
本発明によると、糖尿病薬の治療効果と関連性が見出された特定の遺伝子多型が、患者の遺伝子多型情報内に含まれているか否かを識別することで、糖尿病治療薬の投与の要否および投与量について、患者毎の遺伝的背景に基づいたより適切な判定を行うことができる。 According to the present invention, it is possible to administer an antidiabetic drug by identifying whether or not a specific genetic polymorphism found to be related to the therapeutic effect of the antidiabetic drug is included in the genetic polymorphism information of the patient. Therefore, more appropriate determination can be made based on the genetic background of each patient.
以下、本発明の実施の形態を、添付の図面を参照して詳細に説明する。なお、以下の説明および図面において、同じ符号は同じまたは類似の構成要素を示すこととし、よって、同じまたは類似の構成要素に関する説明を省略する。 Hereinafter, embodiments of the present invention will be described in detail with reference to the accompanying drawings. In the following description and drawings, the same reference numerals indicate the same or similar components, and thus descriptions of the same or similar components are omitted.
以下の説明において、「遺伝子多型」とは、同一集団内において、一つの遺伝子座に2種類以上の対立遺伝子(アレル)が存在する遺伝子の多様性を意味する。具体的には、ある集団において一定の頻度以上で存在する遺伝子の変異を示す。ここでいう遺伝子の変異は、RNAとして転写される領域に限定されるものではなく、プロモーター、エンハンサー等の制御領域などを含むヒトゲノム上で特定しうるすべてのDNAにおける変異を含むものである。ヒトゲノムDNAの99.9%は各個人間で共通しており、残る0.1%がこのような多様性の原因となり、特定の疾患に対する感受性、薬物や環境因子に対する反応性の個人差として関与し得る。遺伝子多型があっても表現型に差が出るとは限らない。なお、SNP(一塩基多型)も遺伝子多型の一種であるが、本発明が対象とする遺伝子多型はこれに限られない。 In the following description, “gene polymorphism” refers to the diversity of genes in which two or more alleles (alleles) exist at one locus in the same population. Specifically, it indicates a mutation of a gene that exists at a certain frequency or more in a certain population. The gene mutation referred to here is not limited to the region transcribed as RNA, but includes mutations in all DNAs that can be identified on the human genome including regulatory regions such as promoters and enhancers. 99.9% of human genomic DNA is common among individuals, and the remaining 0.1% is responsible for such diversity, and is involved in individual differences in susceptibility to specific diseases, responsiveness to drugs and environmental factors. obtain. A genetic polymorphism does not always make a difference in phenotype. SNP (single nucleotide polymorphism) is a kind of gene polymorphism, but the gene polymorphism targeted by the present invention is not limited to this.
図1は、本発明に係る糖尿病治療薬の投与量を判定する装置(以下、判定装置と記す)を含むシステム全体を示すブロック図である。図1に示すように、システムは、病院1に設置された採血手段11およびコンピュータ12と、分析機関2に設置された遺伝子多型解析用アレイ21およびコンピュータ22と、サービス提供機関3に設置された判定装置31とを備えている。ここで、コンピュータ12、22、および判定装置31は、インターネットなどの通信回線4に接続されている。
FIG. 1 is a block diagram showing the entire system including a device for determining the dose of a therapeutic drug for diabetes according to the present invention (hereinafter referred to as a determination device). As shown in FIG. 1, the system is installed in blood collection means 11 and
判定装置31は、CPU32と、メモリ33と、ハードディスクなどの記録部34と、外部との通信を行う通信インタフェース(以下、I/Fと記す)部35と、キーボードなどの操作部36と、液晶ディスプレイなどの表示部37と、入出力I/F部38と、各部間でデータを交換するための内部バス39とを備えている。記録部34には、糖尿病薬の治療効果に関連性を有することが見出された特定の遺伝子多型の情報が、参照テーブルとして予め記録されている。
The determination device 31 includes a
判定装置31による投与量判定処理についての詳細は後述する。判定装置31を含むシステム全体の動作を説明すると、次の通りである。 Details of the dose determination processing by the determination device 31 will be described later. The operation of the entire system including the determination device 31 will be described as follows.
まず、病院1において、採血手段11によって被験者の遺伝子(ゲノム)を抽出可能な検体(以下、被験試料と記す)が採取される。このとき、臨床データ(被験者ID、性別、採血情報(現在および過去のHbA1c値を含む)、既往歴、身体所見、糖尿病治療薬のこれまでの投与経過など)がコンピュータ12の記録部に記録される。被験試料は、分析機関2に提供され、遺伝子多型解析用アレイ21を用いて分析され、遺伝子型を有する遺伝子多型が検出される。遺伝子多型解析用アレイ21は、遺伝子多型を検出するためのプローブを高密度に整列させて、シリコンウェハーやガラススライド等の支持体上に固定化したものであり、プローブとしては、特定の疾患(本発明では、糖尿病)に関連する遺伝子多型を特異的に認識して捕捉するものであればよい。
First, in the hospital 1, a specimen (hereinafter referred to as a test sample) from which a subject's gene (genome) can be extracted is collected by the blood collection means 11. At this time, clinical data (subject ID, gender, blood collection information (including current and past HbA1c values), past history, physical findings, past administration of antidiabetic drugs, etc.) are recorded in the recording unit of the
本発明では、遺伝子多型解析用アレイ21を用いて検出する遺伝子多型には、判定に用いるp22phox C242TおよびAR-106Tが少なくとも含まれていれば良く、本発明が目的とする糖尿病治療薬の投与量判定以外の他の検査を行う関係で、これら以外の遺伝子多型が含まれていても良い。遺伝子多型解析用アレイ21を用いて検出する遺伝子多型の一例を表1に示す。
In the present invention, the gene polymorphism to be detected using the
検出された遺伝子多型情報は、一旦コンピュータ22の記録手段に記録され、その後通信回線4を介してサービス提供機関3の判定装置31に送信される。判定装置31は、通信I/F部35を介して分析機関2のコンピュータ22から遺伝子多型情報を受信し、記録部34に記録する。また、判定装置31は、病院1のコンピュータ12から臨床データを受信して、記録部34に記録する。
The detected genetic polymorphism information is once recorded in the recording means of the
その後、判定装置31は、受信した遺伝子多型情報が、予め記録部34に記録しておいた参照テーブルに含まれているか否かを検索し、その結果に応じて治療薬の投与の要否および投与量を判定する。判定後、判定装置31は、判定結果を、通信回線4を介して病院1のコンピュータ12に送信する。コンピュータ12によって受信された判定結果は、臨床データ(少なくとも被験者ID)と関連させて、コンピュータ12の記録部に記録され、適宜呼び出されて利用(例えば、被験者に提示)される。判定結果を送信する病院1のコンピュータ12を特定する情報は、例えば、病院1のコンピュータ12から、臨床データに含めて送信すればよい。
Thereafter, the determination device 31 searches whether or not the received genetic polymorphism information is included in the reference table previously recorded in the recording unit 34, and the necessity of administration of the therapeutic drug is determined according to the result. And determine the dose. After the determination, the determination device 31 transmits the determination result to the
上記の被験試料の分析に関して、被験者の遺伝子型を検出する方法であればいかなる方法も使用することができる。一般的な方法としては、被験者の血液、痰、皮膚、気管支肺胞洗浄液、その他の体液、あるいは組織等、DNAを含むものを被験試料として用いる。解析方法としては多くの方法が知られており、例えばシークエンス法、PCR法、ASP−PCR法、TaqMan法、インベーダーアッセイ法、MALDI−TOF/MS法、分子ビーコン法、ライゲーション法などを例示することができる(Clin.Chem.43:1114−1120,1997)。なお、シークエンス法とは、遺伝子多型を含むDNA領域を直接にシークエンスする方法である。PCR法においては、遺伝子多型に特異的なプライマーを用いて、ある遺伝子多型のみを特異的に増幅する。PCR法においては、最も3’側に遺伝子多型の核酸を配置するのが一般的であるが、Allele Specific Primer(ASP)−PCR法のように、3’末端側から2番目に遺伝子多型を有するプライマーを配置する方法などのように、遺伝子多型をプライマーのどの領域に置くか、また、検出する遺伝子以外にどのような核酸配列を入れるかなど、プライマーのデザインには、遺伝子多型を識別できる限り特に制限はない。TaqMan法において蛍光色素と消光物質により両端を標識したアレル特異的プローブを標的部位にハイブリダイズさせて、この部位を含む領域を増幅するように設計したプライマーでPCR反応を行う。プライマーからのPCR反応がこのアレル特異的プローブがハイブリダイズした領域に達すると、Taqポリメラーゼの5プライムヌクレアーゼ活性によりハイブリダイズしたプローブの5’末端に存在する蛍光色素が切断され、消光物質から離れることにより蛍光が生ずる。この手法により、アレル特異的プローブがどの程度ハイブリダイズしていたかがわかる。インベーダーアッセイ法においては、鋳型の遺伝子多型部位から5’側に特異的配列を持ち、3’側にフラップ配列を持つアレルプローブと、鋳型の遺伝子多型部位からの3’側の特異的配列を有するインベーダープローブ、さらに、フラップ配列に相補的な配列を含むFRETプローブとの3種類のオリゴヌクレオチドを使い、TaqMan法と同様の原理にてどのアレルプローブがハイブリズダイズしたかを特定できる。MALDI−TOF/MS法においては、遺伝子多型部位に隣接するプライマーを作成してこの領域を増幅させた後、遺伝子多型部位の1塩基のみをddNTPを用いて増幅する。ついで、MALDI−TOF/MSを用いて、付加したddNTPの種類を識別することにより遺伝子多型を同定する。Hybrigene法などのDNAチップ法と総称される方法においては、アレイ上に遺伝子多型を含むオリゴヌクレオチドプローブを配置し、PCR増幅させたサンプルDNAとのハイブリダイゼーションを検出する。 Any method can be used for analyzing the test sample as long as it is a method for detecting the genotype of the subject. As a general method, a sample containing DNA, such as a subject's blood, sputum, skin, bronchoalveolar lavage fluid, other body fluid, or tissue, is used as a test sample. Many methods are known as analysis methods, for example, sequencing method, PCR method, ASP-PCR method, TaqMan method, invader assay method, MALDI-TOF / MS method, molecular beacon method, ligation method, etc. (Clin. Chem. 43: 1114-1120, 1997). The sequencing method is a method for directly sequencing a DNA region containing a gene polymorphism. In the PCR method, only a certain gene polymorphism is specifically amplified using primers specific to the gene polymorphism. In the PCR method, it is common to place the polymorphic nucleic acid on the 3′-most side, but the genetic polymorphism is second from the 3′-end side as in the Allele Specific Primer (ASP) -PCR method. In the primer design, such as where to place the gene polymorphism in the primer, and what kind of nucleic acid sequence other than the gene to be detected There is no particular limitation as long as it can be identified. In the TaqMan method, an allele-specific probe labeled at both ends with a fluorescent dye and a quenching substance is hybridized to a target site, and a PCR reaction is performed with primers designed to amplify a region containing this site. When the PCR reaction from the primer reaches the region where this allele-specific probe is hybridized, the fluorescent dye present at the 5 ′ end of the hybridized probe is cleaved by the 5-prime nuclease activity of Taq polymerase, leaving the quencher. Causes fluorescence. By this method, it can be seen how much the allele-specific probe has been hybridized. In the invader assay method, an allele probe having a specific sequence 5 ′ from the gene polymorphic site of the template and a flap sequence on the 3 ′ side, and a specific sequence 3 ′ from the gene polymorphic site of the template It is possible to specify which allele probe has hybridized using the same principle as the TaqMan method, using three types of oligonucleotides: an invader probe having a FRET probe and a FRET probe containing a sequence complementary to a flap sequence. In the MALDI-TOF / MS method, a primer adjacent to a gene polymorphic site is prepared and this region is amplified, and then only one base of the gene polymorphic site is amplified using ddNTP. Subsequently, gene polymorphism is identified by identifying the kind of added ddNTP using MALDI-TOF / MS. In a method generically called a DNA chip method such as the Hybridene method, an oligonucleotide probe containing a gene polymorphism is placed on an array, and hybridization with sample DNA amplified by PCR is detected.
図2は、判定装置31が行う判定処理を示すフローチャートである。以下、図2のフローチャートに従って、判定装置31による投与量判定処理を具体的に説明する。なお、以下においては、特に断らない限り、CPU32が行う処理として記載する。また、CPU32は、メモリ33を、ワーク領域や、処理途中のデータを一時記憶する領域として使用し、必要に応じて処理途中および処理結果のデータを記録部34に記録する。
FIG. 2 is a flowchart illustrating the determination process performed by the determination device 31. Hereinafter, according to the flowchart of FIG. 2, the dose determination process by the determination apparatus 31 is demonstrated concretely. In the following description, the processing performed by the
ステップS1では、判定に用いる被験者の遺伝子多型情報および臨床データを取得する。 In step S1, genetic polymorphism information and clinical data of a subject used for determination are acquired.
まず、分析機関2から通信回線4経由で遺伝子多型情報を取得し、記録部34に記録する。遺伝子多型情報は、遺伝子型を有する遺伝子多型毎に付与した遺伝子多型コードとして伝送および記録され、データ形式は、例えば、依頼元の病院毎に付与した病院コードおよび被験者毎に付与した被験者IDの組の各々に、複数の遺伝子多型コードgi(i=1〜n)が対応付けられた形式である。また、病院1から通信回線4経由で被験者の臨床データを取得し、依頼元の病院コードを付与したうえで記録部34に記録する。臨床データのデータ形式は、例えば、性別については、男性の場合変数SEX=1とし、女性の場合SEX=2として臨床データに記録する。既往歴や身体所見についても、それぞれの病名または症状について、システム上で使用する変数名を予め決定しておき、病歴有りまたは症状有りの場合に値を1とし、病歴無しまたは症状無しの場合に値を0として、変数名と値とをセットにして臨床データに記録する。例えば、既往歴[前立腺腫瘍]=0や、身体所見[下腿浮腫]=1として臨床データに記録する。
First, genetic polymorphism information is acquired from the analysis organization 2 via the
ステップS2では、ステップS1において取得した被験者の遺伝子多型情報内に、特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別する。 In step S2, it is identified whether or not a specific genetic polymorphism exists in the genetic polymorphism information of the subject obtained in step S1.
具体的には、一つの{病院コード,被験者ID}について、複数の遺伝子多型コードgi(i=1〜n)を記録部34から読み出し、読み出した遺伝子多型コードgiが、予め記録部34に記録しておいた参照テーブルに含まれているか否かを識別する。参照テーブルには、糖尿病薬の治療効果に関連性を有することが見出された特定の遺伝子多型の情報が予め記録されており、本実施形態では、具体的には、p22phox C242T遺伝子多型およびAR-106T遺伝子多型が遺伝子多型コードの形式で記録されている。 Specifically, for one {hospital code, subject ID}, a plurality of gene polymorphism codes g i (i = 1 to n) are read from the recording unit 34, and the read gene polymorphism codes g i are recorded in advance. Whether it is included in the reference table recorded in the section 34 is identified. In the reference table, information on a specific gene polymorphism found to be related to the therapeutic effect of a diabetic drug is recorded in advance. Specifically, in this embodiment, the p22phox C242T gene polymorphism is recorded. And AR-106T gene polymorphisms are recorded in the form of genetic polymorphism codes.
例えば、記録部34から遺伝子多型コードg1を読み出し、この遺伝子多型コードg1が参照テーブルに含まれているか否かを識別する。含まれていれば、この遺伝子多型コードg1に対応するフラグに値「1」(true)を設定する(フラグは予め「0」(false)に初期化されているとする)。この識別処理を、複数の遺伝子多型コードgi(i=1〜n)のすべてについて実行する。 For example, it reads out the polymorphism encoding g 1 from the recording unit 34, identifies whether this polymorphism code g 1 is included in the reference table. If it is included, a value “1” (true) is set in the flag corresponding to the genetic polymorphism code g 1 (assuming that the flag is initialized to “0” (false) in advance). This identification process is executed for all of the plurality of gene polymorphism codes g i (i = 1 to n).
ステップS3では、ステップS2にて記録したフラグの値に基づいて判断し、フラグの値がすべて「0」(false)、すなわち、被験者の遺伝子多型情報内に、参照テーブルに記載した特定の遺伝子多型が存在していなかった場合には、この時点で治療薬投与の必要性がないと判断し、ステップS4の処理を行わずにステップS5に移行する。いずれかのフラグの値が「1」(true)であれば、所定の判定式を用いるステップS4の処理に移行する。 In step S3, determination is made based on the flag value recorded in step S2, and all the flag values are “0” (false), that is, the specific gene described in the reference table in the genetic polymorphism information of the subject. If the polymorphism does not exist, it is determined that there is no need to administer the therapeutic agent at this point, and the process proceeds to step S5 without performing the process of step S4. If the value of any one of the flags is “1” (true), the process proceeds to step S4 using a predetermined determination formula.
ステップS4では、ステップS2にて記録したフラグの値とステップS1にて取得した臨床データとを用い、所定の判定式に基づいて治療薬投与の要否および投与量を判定する。 In step S4, the necessity of the therapeutic drug administration and the dosage are determined based on a predetermined determination formula using the flag value recorded in step S2 and the clinical data acquired in step S1.
まず、ステップS4で用いる判定式について説明する。判定式には、血中HbA1c値の変化量dHbA1cを目的変数とし、現在の血中HbA1c値とp22phoxC242Tアレルの有無およびAR-106Tアレルの有無とを説明変数とし、糖尿病患者データの集合を重回帰分析することによって決定された回帰式を用いる。回帰式の値の計算には、ステップS2にて識別した、特定の遺伝子多型の有無の情報であるフラグの値と、ステップS1にて取得した被験者の臨床データ(現在の血中HbA1c値)とを使用する。血中HbA1c値の変化量dHbA1cを求める回帰式は次の通りである。 First, the determination formula used in step S4 will be described. In the judgment formula, the amount of change in blood HbA1c value dHbA1c is the objective variable, and the current blood HbA1c value and the presence or absence of the p22phoxC242T allele and the presence or absence of the AR-106T allele are explanatory variables. Use regression equations determined by analysis. For calculation of the value of the regression equation, the flag value, which is information indicating the presence or absence of the specific gene polymorphism, identified in step S2, and the clinical data of the subject obtained in step S1 (current blood HbA1c value) And use. The regression equation for obtaining the change amount dHbA1c of the blood HbA1c value is as follows.
dHbA1c=a*HbA1c+b*p22phox+c*AR+d (式1)
ここで、HbA1cは現在の血中HbA1c値(単位%、NGSP国際標準値)であり、p22phoxおよびARはそれぞれ、p22phox C242Tアレルの有無およびAR-106Tアレルの有無であり、「1」または「0」の値をとる。定数a,b,c,dは、重回帰分析によって決定される偏回帰係数である。重回帰分析については周知であるので説明を省略する。
dHbA1c = a * HbA1c + b * p22phox + c * AR + d (Formula 1)
Here, HbA1c is the current blood HbA1c value (unit%, NGSP international standard value), and p22phox and AR are the presence or absence of the p22phox C242T allele and the presence or absence of the AR-106T allele, respectively, “1” or “0” ”. The constants a, b, c, and d are partial regression coefficients determined by multiple regression analysis. Since multiple regression analysis is well known, description thereof is omitted.
定数a,b,c,dを決定するために行った重回帰分析の結果の一例を表2に示す。表2に示す例では、定数a=−0.4384、b=−0.6728、c=−0.3187、d=2.9624である。 Table 2 shows an example of the results of the multiple regression analysis performed to determine the constants a, b, c, and d. In the example shown in Table 2, constants a = −0.4384, b = −0.6728, c = −0.3187, d = 2.9624.
(式1)により求めた変化量dHbA1cから、第1の期間(3ヶ月)経過後の血中HbA1c値の推定値HbA1c(3m)と、第2の期間(6ヶ月)経過後の血中HbA1c値の推定値HbA1c(6m)とをそれぞれ求めると次の通りである。 From the amount of change dHbA1c calculated by (Equation 1), the estimated value HbA1c (3m) of blood HbA1c after the first period (3 months) and blood HbA1c after the second period (6 months) have passed. The respective estimated values HbA1c (6m) are calculated as follows.
HbA1c(3m)=HbA1c+0.5*dHbA1c (式2)
HbA1c(6m)=HbA1c+1.0*dHbA1c (式3)
(式2)および(式3)により求められる血中HbA1c値は、被験者に糖尿病治療薬を投与した際に、どの程度血中HbA1c値が変化するのかを推定するための指標となる。
HbA1c (3m) = HbA1c + 0.5 * dHbA1c (Formula 2)
HbA1c (6m) = HbA1c + 1.0 * dHbA1c (Formula 3)
The blood HbA1c value obtained by (Expression 2) and (Expression 3) is an index for estimating how much the blood HbA1c value changes when a therapeutic drug for diabetes is administered to a subject.
次に、ステップS4において行う具体的な判定手順について、以下に一例を説明する。図3は、判定装置31が行うステップS4の判定処理を示すフローチャートである。以下に説明する判定手順の一例では、現在の血中HbA1c値を含む臨床データと、回帰式から得られた、所定の期間(3ヶ月および6ヶ月)経過後の血中HbA1c値の推定値HbA1c(3m),HbA1c(6m)とを参照して、治療薬の投与量を判定する。 Next, an example of the specific determination procedure performed in step S4 will be described below. FIG. 3 is a flowchart showing the determination process of step S4 performed by the determination apparatus 31. In an example of the determination procedure described below, clinical data including the current blood HbA1c value, and an estimated value of the blood HbA1c value after a predetermined period (3 months and 6 months) obtained from the regression equation HbA1c (3m) and HbA1c (6m), the therapeutic drug dose is determined.
ステップS41では、被験者が投薬対象から除外されるべきか否かを判定する。例えば、被験者の性別が男性であり、かつ前立腺腫瘍の既往歴が有る場合には、ステップS42にて治療薬の投与の必要が無いと判定した後、ステップS4の判定処理を終了する。条件に当てはまる場合には、ステップS43に移行する。 In step S41, it is determined whether or not the subject should be excluded from the medication target. For example, if the subject's gender is male and there is a history of prostate tumor, it is determined in step S42 that there is no need to administer a therapeutic agent, and then the determination process in step S4 ends. If the condition is met, the process proceeds to step S43.
ステップS43では、現在の血中HbA1c値が所定の第1のしきい値(例えば8.0)以上であるか否かを判定する。条件に当てはまる場合には、(式1)〜(式3)に基づいてHbA1c(3m)およびHbA1c(6m)を計算してステップS44に移行し、当てはまらない場合には、後述するステップS48に移行する。 In step S43, it is determined whether or not the current blood HbA1c value is greater than or equal to a predetermined first threshold value (eg, 8.0). If the conditions are met, HbA1c (3m) and HbA1c (6m) are calculated based on (Equation 1) to (Equation 3) and the process proceeds to step S44. If not, the process proceeds to step S48 described later. To do.
ステップS44では、治療薬を所定の第1の量(例えば、15mg)で投与するか否かを判定する。判定条件は次の2つであり、(1)性別が女性であるか、あるいは、(2)HbA1c(3m)が所定の第2のしきい値(例えば、7.0)未満であるか、である。(1)または(2)のいずれかの条件を満たしている場合には、ステップS45にて、治療薬を第1の量で投与すると判定した後、後述するステップS48に移行し、どちらの条件も満たさない場合には、ステップS46に移行する。 In step S44, it is determined whether or not the therapeutic agent is to be administered in a predetermined first amount (for example, 15 mg). The judgment conditions are the following two: (1) gender is female, or (2) HbA1c (3m) is less than a predetermined second threshold (for example, 7.0), It is. If either of the conditions (1) or (2) is satisfied, it is determined in step S45 that the therapeutic agent is to be administered in the first amount, and then the process proceeds to step S48 to be described later. If not, the process proceeds to step S46.
ステップS46では、治療薬を所定の第2の量(例えば、30mg)で投与するか否かを判定する。判定条件は、HbA1c(3m)が第2のしきい値(7.0)以上であり、かつ、HbA1c(6m)が第2のしきい値(7.0)未満、である。条件を満たしている場合には、ステップS47にて、治療薬を第2の量で投与すると判定した後、後述するステップS48に移行し、条件を満たさない場合にはそのままステップS48に移行する。 In step S46, it is determined whether or not the therapeutic agent is to be administered in a predetermined second amount (for example, 30 mg). The determination condition is that HbA1c (3m) is equal to or greater than the second threshold value (7.0), and HbA1c (6m) is less than the second threshold value (7.0). If the condition is satisfied, it is determined in step S47 that the therapeutic agent is to be administered in the second amount, and then the process proceeds to step S48 described later. If the condition is not satisfied, the process proceeds to step S48 as it is.
ステップS48では、治療薬投与中のこれまでの臨床データの経過情報に基づいて、治療薬の投与量を増量すべきか否かを判定する。薬剤増量の判定条件は、例えば、これまでの治療薬の投与量が第1の量(15mg)であり、かつ、第1の量での治療薬の投与期間が通算で6ヶ月を越えており、かつ、被験者の身体所見に「下腿浮腫」等の副作用の発現が無い場合に、ステップS49にて、治療薬の投与量を第2の量に増量すると判定した後、ステップS4の判定処理を終了する。 In step S48, it is determined whether or not the dose of the therapeutic drug should be increased based on the progress information of the clinical data so far during the therapeutic drug administration. The criteria for determining the drug increase are, for example, that the dose of the therapeutic agent so far is the first amount (15 mg), and the administration period of the therapeutic agent in the first amount has exceeded 6 months in total. In addition, when there is no side effect such as “crus edema” in the physical findings of the subject, it is determined in step S49 that the dose of the therapeutic agent is increased to the second amount, and then the determination process in step S4 is performed. finish.
ステップS5では、すべての{病院コード,被験者ID}について処理が終了したか否かを判断し、終了したと判断するまでステップS2〜S4の処理を繰り返す。 In step S5, it is determined whether or not the process has been completed for all {hospital code, subject ID}, and the processes in steps S2 to S4 are repeated until it is determined that the process has been completed.
すべての{病院コード,被験者ID}について処理が終了したと判断すれば、ステップS6において、ステップS3またはS4にて判定した治療薬投与の要否および投与量についての情報と、被験者IDとを対応させて、通信回線4を介して、依頼元の病院コードに対応するコンピュータ12に送信する。
If it is determined that the processing has been completed for all {hospital code, subject ID}, in step S6, the information on necessity / dose of the therapeutic agent determined in step S3 or S4 and the dose correspond to the subject ID. Then, the data is transmitted to the
以上の処理によって、判定装置31による一連の投与量判定処理が完了する。なお、上記説明した判定処理は、汎用コンピュータを使用して、ハードディスクまたはCD−ROM等のコンピュータ読み取り可能な記録媒体に記録されているコンピュータプログラムを読み出し、または通信回線を介してコンピュータプログラムを取得し、それをCPUが実行することによって行うことも可能である。 With the above processing, a series of dose determination processing by the determination device 31 is completed. Note that the determination process described above uses a general-purpose computer to read a computer program recorded on a computer-readable recording medium such as a hard disk or a CD-ROM, or obtain a computer program via a communication line. It can also be performed by the CPU executing it.
以上、本発明を特定の実施の形態によって説明したが、本発明は上記した実施の形態に限定されるものではない。 As mentioned above, although this invention was demonstrated by specific embodiment, this invention is not limited to above-described embodiment.
上記実施の形態では、糖尿病薬の治療効果に関連性を有することが見出された特定の遺伝子多型の情報として、p22phox C242T遺伝子多型およびAR-106T遺伝子多型を用いているが、判定に用いる遺伝子多型は、これら2つの遺伝子多型に加えてCD14-159T遺伝子多型を用いてもよい。感染防御関連性遺伝子多型であるCD14-159Tについても、糖尿病患者の血中HbA1c値の変化値との間に単相関で有意な差が生じていることが、本発明者によって見出されている。このCD14-159T遺伝子多型を判定に用いる場合は、(式1)の回帰式の説明変数としてCD14-159Tアレルの有無を追加したうえで、新たな回帰式を用いて重回帰分析を行い、新たに偏回帰係数を決定すればよい。 In the above embodiment, p22phox C242T gene polymorphism and AR-106T gene polymorphism are used as information on specific gene polymorphisms found to be related to the therapeutic effect of diabetes drugs. In addition to these two gene polymorphisms, the CD14-159T gene polymorphism may be used. The present inventor has also found that there is a single-correlated significant difference between the change in blood HbA1c level in diabetic patients with respect to CD14-159T, which is an infection defense-related gene polymorphism. Yes. When using this CD14-159T gene polymorphism for determination, after adding the presence or absence of the CD14-159T allele as an explanatory variable of the regression equation of (Equation 1), a multiple regression analysis is performed using a new regression equation, What is necessary is just to newly determine a partial regression coefficient.
また、上記実施形態のステップS41またはS48において例示した既往歴の有無および身体所見の有無は一例であり、判定に考慮すべき既往歴や身体所見について新たな報告がなされた場合には、それに応じて判定基準に適宜追加または変更を行えばよい。 In addition, the presence / absence of the past history and the presence / absence of physical findings exemplified in step S41 or S48 of the above embodiment are merely examples, and if a new report is made on the past history or physical findings to be considered in the determination, Thus, the determination criteria may be added or changed as appropriate.
また、本発明の装置は、上記した判定処理を実現可能である限り、必要に応じて他の構成を適宜追加または他の構成に置き換えた装置とすることができる。例えば、表示部37および操作部36に代えて、これらが一体化されたタッチパネル式の構成として実現されてもよい。
In addition, as long as the above-described determination process can be realized, the apparatus of the present invention can be an apparatus in which other configurations are appropriately added or replaced with other configurations as necessary. For example, instead of the display unit 37 and the
また、上記実施の形態では、判定に用いる被験者の遺伝子多型情報および臨床データを、通信回線4を介して取得しているが、データの取得経路はこれに限定されず、判定に用いるデータ等を何らかの記録手段(例えば、個人毎に付与したICカード、メモリカードなどの携帯型記録手段)に記録しておき、これからデータ等を適宜読み出して使用してもよい。
In the above embodiment, the genetic polymorphism information and clinical data of the subject used for the determination are acquired via the
また、分析機関から取得した個人の遺伝子多型情報および臨床データを、サービス提供機関のデータベースに個人IDと対応させて記録しておき、各個人に個人IDを通知しておけば、個人IDの連絡を受けるだけで、データベースに記録されている対応する遺伝子多型情報および臨床データを用いて、再度の投与量判定処理が可能となる。 In addition, the individual's genetic polymorphism information and clinical data acquired from the analysis organization are recorded in the database of the service provider in correspondence with the individual ID, and if the individual ID is notified to each individual, the individual ID By just receiving the communication, the dose determination process can be performed again using the corresponding gene polymorphism information and clinical data recorded in the database.
また、上記実施の形態では、図2および図3に示す判定処理をCPU32が行う処理として記載しているが、CPU32が行う処理をそれぞれの機能に分類して、各機能毎に専用の電子回路を作製し、これら電子回路が図2および図3の判定処理を分担して実行してもよい。 Moreover, in the said embodiment, although the determination process shown in FIG. 2 and FIG. 3 is described as a process which CPU32 performs, the process which CPU32 performs is classified into each function, and a dedicated electronic circuit for every function These electronic circuits may share and execute the determination processing of FIG. 2 and FIG.
また、上記実施の形態では、図2および図3に示す判定処理をCPU32が行う処理として記載しているが、処理に用いるデータが例えば紙データ等で可視化されている限り、判定処理にて行う演算処理および識別処理は適宜人間が行ってもよい。 Moreover, in the said embodiment, although the determination process shown in FIG.2 and FIG.3 is described as a process which CPU32 performs, as long as the data used for a process are visualized by paper data etc., it performs by a determination process. The calculation process and the identification process may be appropriately performed by a human.
以下、実験例の説明を通じて本発明をさらに具体的に説明する。ただし、本発明は以下の実験例により何ら限定されるものではない。 Hereinafter, the present invention will be described more specifically through description of experimental examples. However, the present invention is not limited to the following experimental examples.
・調査内容
以下の実験例では、糖尿病治療薬であるピオグリタゾンと種々の遺伝子多型との関連性を調査した。具体的には、インスリン感受性改善薬であるピオグリタゾンを6ヶ月投与した際の、被験者のHbA1c値の変化と、種々の臨床データおよびインスリン感受性関連遺伝子多型との関連性を調査し、ピオグリタゾンの血糖管理効果に影響を及ぼす遺伝因子および臨床データを同定した。
In the following experimental examples, the relationship between pioglitazone, a therapeutic drug for diabetes, and various gene polymorphisms was investigated. Specifically, we investigated the relationship between changes in HbA1c levels in subjects after 6 months of administration of pioglitazone, an insulin sensitivity-improving drug, and various clinical data and insulin sensitivity-related gene polymorphisms. Genetic factors and clinical data affecting management effects were identified.
・被験者
神奈川県および大阪府の各1病院に通院している、ピオグリタゾンを新規に15mg〜30mg投与する2型糖尿病患者、合計137名(男性91名、女性46名、年齢60.7±10.8歳)を対象とした。2型糖尿病患者の判定は、世界保健機構(WHO)の判定基準に基づいて行った。すべての被験者には、本研究の趣旨および内容を十分に説明した後、書面にてインフォームド・コンセントを得た。
・ Subjects: Type 137 diabetic patients who are newly administered 15 mg to 30 mg of pioglitazone who are admitted to one hospital each in Kanagawa Prefecture and Osaka Prefecture, a total of 137 (91 men, 46 women, age 60.7 ± 10. 8 years old). The determination of patients with type 2 diabetes was performed based on the criteria of the World Health Organization (WHO). All subjects were given written informed consent after fully explaining the purpose and content of this study.
・関連性を調査した遺伝子多型
被験者の概要を表3に示す。関連性を調査した遺伝子多型については、実施形態の説明中の表1に示した通りである。
-Table 3 shows a summary of genetic polymorphism subjects for which the association was investigated . The genetic polymorphism for which the association was investigated is as shown in Table 1 in the description of the embodiment.
・調査結果
表1に示す種々の遺伝子多型のうち、酸化ストレス関連性遺伝子多型p22phox C242Tアレル、糖化関連性遺伝子多型AR(Aldose reductase)-106Tアレル、または感染防御関連性遺伝子多型CD14(cluster of differentiation 14)-159Tアレルと、糖尿病患者の血中HbA1c値の変化値との間に、単相関で有意な差が生じていることを見出した。CD14の遺伝子多型と臨床データとの関係についての調査結果を表4に、p22phoxの遺伝子多型と臨床データとの関係についての調査結果を表5に、ARの遺伝子多型と臨床データとの関係についての調査結果を表6に示す。これら表4〜表6について、血中HbA1c値の変化値ΔHbA1cのp値に着目すると、CD14の遺伝子多型についてはp=0.0097であり、p22phoxの遺伝子多型についてはp=0.004であり、ARの遺伝子多型についてはp=0.001であり、何れにケースについてもp値は十分に低く、血中HbA1c値の変化値ΔHbA1cの値が統計学的に有意であると判断された。
・ Survey results Among the various gene polymorphisms shown in Table 1, oxidative stress-related gene polymorphism p22phox C242T allele, glycation-related gene polymorphism AR (Aldose reductase) -106T allele, or infection defense-related gene polymorphism CD14 It was found that there was a single correlation significant difference between the (cluster of differentiation 14) -159T allele and the change in the blood HbA1c level in diabetic patients. The results of the survey on the relationship between CD14 gene polymorphism and clinical data are shown in Table 4, the results of the study on the relationship between p22phox gene polymorphism and clinical data are shown in Table 5, and the relationship between the AR gene polymorphism and clinical data are shown in Table 5. Table 6 shows the results of the survey on the relationship. In these Tables 4 to 6, focusing on the change value ΔHbA1c in blood HbA1c, p = 0.0097 for the CD14 gene polymorphism and p = 0.004 for the p22phox gene polymorphism. In the case of AR polymorphism, p = 0.001. In any case, the p-value is sufficiently low, and the change in the blood HbA1c value ΔHbA1c is determined to be statistically significant. It was done.
一方、インスリン感受性に関連するPPAR-r (Pro12Ala)、レジスチン(C-420G)、PGC-1(G1564A)、およびIRS-1(G3494A)、sEH(G860A)遺伝子多型については、糖尿病患者の血中HbA1c値の変化値との間に有意な関連性が認められなかった。 On the other hand, PPAR-r (Pro12Ala), resistin (C-420G), PGC-1 (G1564A), IRS-1 (G3494A), and sEH (G860A) gene polymorphisms related to insulin sensitivity There was no significant association with changes in the medium HbA1c level.
次に、表4および表5の結果を参照して、ピオグリタゾン投与後6ヶ月経過後の被験者の血中HbA1c値を推定するために、重回帰分析により、血中HbA1c値の変化量dHbA1cを求める回帰式を決定した。説明変数には、被験者の現在の血中HbA1c値と、p22phox C242Tアレルの有無と、AR-106Tアレルの有無とを用いた。回帰式については、実施形態の説明中の(式1)に示した通りであり、重回帰分析の結果については、実施形態の説明中の表2に示した通りである。(式1)の回帰式により求めた変化量dHbA1cから、(式3)により6ヶ月経過後の血中HbA1c値の推定値を求めることができ、(式2)により3ヶ月経過後の血中HbA1c値の推定値を求めることができた。 Next, referring to the results in Tables 4 and 5, in order to estimate the blood HbA1c value of the subject 6 months after pioglitazone administration, the change dHbA1c in the blood HbA1c value is obtained by multiple regression analysis. A regression equation was determined. As explanatory variables, the current blood HbA1c value of the subject, the presence or absence of the p22phox C242T allele, and the presence or absence of the AR-106T allele were used. The regression equation is as shown in (Equation 1) in the description of the embodiment, and the result of the multiple regression analysis is as shown in Table 2 in the description of the embodiment. From the amount of change dHbA1c obtained from the regression equation of (Equation 1), the estimated value of blood HbA1c after 6 months can be obtained by (Equation 3), and after 3 months by (Equation 2) The estimated value of HbA1c value could be obtained.
1 病院
2 分析機関
3 サービス提供機関
4 通信回線
11 採血手段
12、22 コンピュータ
21 遺伝子多型解析用アレイ
31 判定装置
32 CPU
33 メモリ
34 記録部
35 通信インタフェース部
36 操作部
37 表示部
38 入出力インタフェース部
39 内部バス
DESCRIPTION OF SYMBOLS 1 Hospital 2 Analysis organization 3
33 Memory 34
Claims (10)
前記記録部が、取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録するステップと、
前記演算部が、取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別するステップと、
前記演算部が、前記特定の遺伝子多型の存在の有無および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の投与量を判定するステップと、
を含み、
前記臨床データが、前記被験者の血中HbA1c値を含み、前記特定の遺伝子多型が、p22phoxのC242T遺伝子多型と、アルドース還元酵素(Aldose reductase)の106T遺伝子多型とを含み、
前記糖尿病が2型糖尿病であり、前記糖尿病治療薬がピオグリタゾンである、判定方法。 In a device comprising a calculation unit and a recording unit, a method for determining the dosage of a therapeutic agent for diabetes,
The recording unit records the obtained genetic polymorphism information and clinical data of the subject;
The operation unit identifies whether or not a specific genetic polymorphism exists in the acquired genetic polymorphism information;
A step of determining the dosage of a therapeutic agent for diabetes based on the presence / absence of the specific gene polymorphism and the clinical data;
Including
The clinical data includes blood HbA1c value of the subject, the particular genetic polymorphism, see contains the C242T polymorphism of p22phox, and 106T polymorphisms aldose reductase (aldose reductase),
The method for determining, wherein the diabetes is type 2 diabetes and the therapeutic agent for diabetes is pioglitazone .
前記回帰式が、血中HbA1c値の変化量dHbA1cを目的変数とし、前記被験者の前記血中HbA1c値と前記p22phox C242Tアレルの有無および前記AR-106Tアレルの有無とを説明変数として、糖尿病患者データの集合を重回帰分析して得られた式である、請求項1に記載の判定方法。 In the determining step, the calculation unit calculates an estimated value of the blood HbA1c value after elapse of a predetermined period of time for the subject using a regression equation determined in advance by multiple regression analysis,
Diagnosis patient data, wherein the regression equation uses the change in blood HbA1c value dHbA1c as an objective variable, and the subject's blood HbA1c value and the presence or absence of the p22phox C242T allele and the presence or absence of the AR-106T allele as explanatory variables The determination method according to claim 1, wherein the determination is a formula obtained by performing multiple regression analysis on the set.
前記判定するステップが、
前記演算部が、前記被験者の前記性別が男性であり、かつ、前記被験者の前記既往歴に所定の既往歴があると判断する場合に、前記被験者を前記糖尿病治療薬の投薬対象から除外するステップと、
前記演算部が、前記被験者の前記血中HbA1c値が第1のしきい値以上であると判断する場合に、前記血中HbA1c値についての、第1の期間経過後の第1の推定値および第2の期間経過後の第2の推定値をそれぞれ計算するステップと、
前記演算部が、前記被験者の前記性別が女性であるか、あるいは、前記血中HbA1c値の前記第1の推定値が第2のしきい値未満であると判断する場合に、前記糖尿病治療薬を第1の量で投与すると決定するステップと、
前記演算部が、前記血中HbA1c値の前記第1の推定値が前記第2のしきい値以上であり、かつ、前記血中HbA1c値の前記第2の推定値が前記第2のしきい値未満であると判断する場合に、前記糖尿病治療薬を第2の量で投与すると決定するステップとを含む、請求項2に記載の判定方法。 The clinical data further includes gender and medical history of the subject;
The step of determining comprises
A step of excluding the subject from the subject of the diabetes therapeutic agent when the arithmetic unit determines that the gender of the subject is male and the subject has a predetermined history. When,
When the calculation unit determines that the blood HbA1c value of the subject is greater than or equal to a first threshold value, a first estimated value after the first period has elapsed with respect to the blood HbA1c value and Calculating each second estimate after the second period has elapsed;
When the arithmetic unit determines that the gender of the subject is female or the first estimated value of the blood HbA1c value is less than a second threshold value, the therapeutic agent for diabetes Determining to administer a first amount;
The arithmetic unit has the first estimated value of the blood HbA1c value equal to or greater than the second threshold value, and the second estimated value of the blood HbA1c value is the second threshold value. The method according to claim 2, further comprising a step of determining that the antidiabetic agent is administered in a second amount when it is determined that the value is less than the value.
前記演算部が、前記糖尿病治療薬投与中の、これまでの前記被験者の前記臨床データの経過情報に基づいて、前記糖尿病治療薬の投与量を、前記第2の量に増量するか否かを判定するステップを含む、請求項3に記載の判定方法。 The step of determining further comprises:
Whether the calculation unit increases the dose of the antidiabetic agent to the second amount based on the clinical data progress information of the subject so far during the administration of the antidiabetic agent. The determination method according to claim 3, comprising a determination step.
dHbA1c=a×HbA1c+b×p22phox+c×AR+d (式1)
の形式で表され、ここで、定数a、b、c、dは、前記重回帰分析により決定される偏回帰係数である、請求項2〜5のいずれかに記載の判定方法。 The regression equation is
dHbA1c = a × HbA1c + b × p22phox + c × AR + d (Formula 1)
6. The determination method according to claim 2, wherein constants a, b, c, and d are partial regression coefficients determined by the multiple regression analysis.
前記記録部が、取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録し、
前記演算部が、取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別し、
前記演算部が、前記特定の遺伝子多型の存在の有無および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の投与量を判定し、
前記臨床データが、前記被験者の血中HbA1c値を含み、前記特定の遺伝子多型が、p22phoxのC242T遺伝子多型と、アルドース還元酵素(Aldose reductase)の106T遺伝子多型とを含み、
前記糖尿病が2型糖尿病であり、前記糖尿病治療薬がピオグリタゾンである、判定装置。 An apparatus that includes a calculation unit and a recording unit, and that determines a dose of a therapeutic agent for diabetes,
The recording unit records the obtained genetic polymorphism information and clinical data,
The arithmetic unit identifies whether a specific genetic polymorphism exists in the acquired genetic polymorphism information,
The arithmetic unit determines the dosage of a therapeutic drug for diabetes based on the presence or absence of the specific gene polymorphism and the clinical data,
The clinical data includes blood HbA1c value of the subject, the particular genetic polymorphism, see contains the C242T polymorphism of p22phox, and 106T polymorphisms aldose reductase (aldose reductase),
The determination apparatus in which the diabetes is type 2 diabetes and the antidiabetic agent is pioglitazone .
コンピュータに、
取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録する機能と、
取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別する機能と、
前記特定の遺伝子多型の存在の有無および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の投与量を判定する機能と、
を実現させ、
前記臨床データが、前記被験者の血中HbA1c値を含み、前記特定の遺伝子多型が、p22phoxのC242T遺伝子多型と、アルドース還元酵素(Aldose reductase)の106T遺伝子多型とを含み、
前記糖尿病が2型糖尿病であり、前記糖尿病治療薬がピオグリタゾンである、判定プログラム。 A program for determining the dosage of an antidiabetic drug,
On the computer,
A function to record the acquired genetic polymorphism information and clinical data;
A function for identifying whether or not a specific genetic polymorphism exists in the obtained genetic polymorphism information;
A function of determining the dosage of a therapeutic agent for diabetes based on the presence or absence of the specific gene polymorphism and the clinical data;
Realized,
The clinical data includes blood HbA1c value of the subject, the particular genetic polymorphism, see contains the C242T polymorphism of p22phox, and 106T polymorphisms aldose reductase (aldose reductase),
A determination program in which the diabetes is type 2 diabetes and the therapeutic agent for diabetes is pioglitazone .
コンピュータに、
取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録する機能と、
取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別する機能と、
前記特定の遺伝子多型の存在の有無および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の投与量を判定する機能と、
を実現させ、
前記臨床データが、前記被験者の血中HbA1c値を含み、前記特定の遺伝子多型が、p22phoxのC242T遺伝子多型と、アルドース還元酵素(Aldose reductase)の106T遺伝子多型とを含み、
前記糖尿病が2型糖尿病であり、前記糖尿病治療薬がピオグリタゾンである、判定プログラムを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体。 A computer-readable recording medium storing a program for determining a dosage of a therapeutic drug for diabetes,
On the computer,
A function to record the acquired genetic polymorphism information and clinical data;
A function for identifying whether or not a specific genetic polymorphism exists in the obtained genetic polymorphism information;
A function of determining the dosage of a therapeutic agent for diabetes based on the presence or absence of the specific gene polymorphism and the clinical data;
Realized,
The clinical data includes blood HbA1c value of the subject, the particular genetic polymorphism, see contains the C242T polymorphism of p22phox, and 106T polymorphisms aldose reductase (aldose reductase),
A computer-readable recording medium recording a determination program in which the diabetes is type 2 diabetes and the antidiabetic agent is pioglitazone .
取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録する手段と、
取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別する手段と、
前記特定の遺伝子多型の存在の有無および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の投与量を判定する手段と、
を備え、
前記臨床データが、前記被験者の血中HbA1c値を含み、前記特定の遺伝子多型が、p22phoxのC242T遺伝子多型と、アルドース還元酵素(Aldose reductase)の106T遺伝子多型とを含み、
前記糖尿病が2型糖尿病であり、前記糖尿病治療薬がピオグリタゾンである、判定装置。 A device for determining the dosage of a therapeutic agent for diabetes,
Means for recording the obtained genetic polymorphism information and clinical data;
Means for identifying whether or not a specific genetic polymorphism exists in the obtained genetic polymorphism information;
Means for determining the dosage of a therapeutic agent for diabetes based on the presence or absence of the specific gene polymorphism and the clinical data;
With
The clinical data includes blood HbA1c value of the subject, the particular genetic polymorphism, see contains the C242T polymorphism of p22phox, and 106T polymorphisms aldose reductase (aldose reductase),
The determination apparatus in which the diabetes is type 2 diabetes and the antidiabetic agent is pioglitazone .
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