JP6272892B2 - 自動特徴解析、比較、及び異常検出 - Google Patents
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Description
本願は、2012年11月9日付け出願の米国仮特許出願第61/724,813号の優先権を主張し、その開示は、参照によりここに全てが組み込まれる。
本発明は、陸軍研究所(ARO)によって与えられた認可番号W81XWH-09-1-0266による政府助成によってなされた。政府は、本発明においてある種の権利を有する。
[コントラストレベル毎の視野欠損面積の計算]
未加工の3D−CTAGデータは、体系的に評価することができ、まず、データに存在する別個のコントラスト感度レベルの数nを評価し、次に、平方度(例えば、格子点)の数における面積(面積はAiで示す、ここで、0%≦i≦100%は、パーセントコントラストレベルを示す)を評価し、そして、各コントラストレベルでの視野欠損のパーセンテージ(Ai/検査面積)を評価する。従って、パーセンテージ及び面積は、存在する最低コントラストでの健全な視野を示す最上位レベル100と伴に、コントラスト感度の関数として視野欠損を提供する。
欠損面積勾配(LAG)は、最低検査コントラストレベル(A100)での暗点面積で、最高検査コントラストレベル(Ah)での暗点面積を割ることにより計算される。次に、この面積比率に、コントラスト感度スケーリング係数を乗算し、ここで、コントラスト感度スケーリング係数は、暗点深さ(100−h)を全深さ(100)で割り、その後、二乗して縮退を除去した:((100−h)/100)2から成る。従って、完全な尺度は、(Ah/A100)×((100−h)/100)2である。保存面積勾配(PAG)は、最高検査コントラストレベル(Ah)での保存視野面積で、最低検査コントラストレベル(A100)での保存視野面積を割り、その後、上記のようなコントラスト感度スケーリング係数を乗算することにより計算され、(A100/Ah)×((100−h)/100)2である。コントラスト感度スケーリング係数を二乗しなければ、これらの2つの尺度(例えば、LAG及びPAG)において、縮退が発生する。例えば、浅い暗点は、とても広い面積比率のLAG及びPAGを与えることがあるため、そのLAG及びPAGは、十分に小さい面積比率を与える急勾配の暗点によるLAG及びPAGと一致するかもしれない。
100未満のコントラスト感度の各レベルでのデータポイントの数は、視野欠損の体積(Σ{i}Ai(100−i))を決定するために、各データポイントでのコントラスト感度における欠損によって乗算される。その後、視野欠損の体積は、視野欠損体積のパーセンテージを決定するために、視野検査体積全体で割られる。
傾斜勾配は、独立して決定され、例えば、水平方向(x)及び垂直方向(y)の両方において決定される。傾斜勾配は、コントラスト感度(例えば、100−i)の欠損を度数(Δx又はΔy)で割ったものとして定義され、ここで、度数(Δx又はΔy)は、欠損が起こる個所である。傾斜勾配は、水平方向に対しては((100−i)/Δx)、垂直方向に対しては((100−i)/Δy)である。傾斜ヒストグラムは、垂直方向又は水平方向どちらかの傾斜勾配の分布を表す。暗点の中心から計算された放射傾斜勾配は、同様の方法で処理することができる。
[暗点中心]
各検査コントラスト感度レベルでの全ての暗点データポイントのx値及びy値は、各検査コントラスト感度レベルでの暗点中心のための座標を得るために、平均化される。中心の各々は、視野全体のデータポイントと一緒に、3Dにおいてプロットされる。続いて、この中心は、平均中心を得るために、平均化される。その後、各中心から平均中心への平均距離及び距離の標準偏差が計算される。そして、各暗点に対する全中心及び平均中心は、散布図にプロットされる。
各検査コントラスト感度レベルでの暗点周辺部ポイントは、レベルの各々での非暗点ポイント(例えば、現在のレベルよりも大きいコントラスト感度レベルを持つもの)に水平的及び/又は垂直的に隣接するポイントに対して、暗点内にあるポイントのリストをスキャンニングすることにより、測定され記憶される。
波形度の測定では、各コントラスト感度レベルでの暗点周辺部を、曲率の変化として評価する。周辺部上の全ポイントには、順次番号が付される。第1ポイント(p=1)から開始し、ユークリット距離は、周辺部(p)に沿った各ポイントと、周辺部(p)のリスト(p+x)の下でユーザ定義の指標オフセット(x)であるポイントとの間で、計算される。全ユークリット距離は、平均化され、その後、ヒストグラムとして表示される。処理は、各コントラスト感度レベルにおいて、例えば、異なる2つのユーザ定義の指標オフセットを用いて、実行される。鋭いピークのヒストグラム(例えば、1つのピーク)は、滑らかな周辺部(波形のない)を持つ暗点を示し、ヒストグラム左端の方のピークは、より強い湾曲した周辺部(例えば、曲率半径の小さな周辺部)を示し、その一方で、ヒストグラム右端の方のピークは、曲率半径の大きな周辺部を示す。
変形視症による現象(例えば、欠損の代わりにアムスラーグリッド線の一直線が、歪み又はうねること)を評価するために、3Dにおいて、乱視(例えば、変形視症)及び視野欠損(例えば、暗点)の両方の自動特徴評価のため、アルゴリズムのより一般的な上位セットを、実装することができる。以下の客観的な特徴評価指標は、視野欠損を説明するために用いることができる。
見えてない位置検査での絶対#:コントラストに関係なく、見えてないアムスラーグリッド点の数。
見えてない位置検査での相対#:コントラストに関係なく、見えてない位置検査の絶対数を、利用可能な検査位置の全数で割ったものであり、[パーセント]で与えられる。
XX%コントラストでの視野障害の面積:所定のアムスラーグリッドコントラストで、見えないものとしてマークされたアムスラーグリッド点の数。
XX%コントラストでの視野障害の相対面積:所定のアムスラーグリッドコントラストで見えないものとしてマークされたアムスラーグリッド点の数を、その所定のアムスラーグリッドコントラストでの利用可能な検査位置の全数で割ったものであり、[パーセント]で与えられる。
絶対視力の丘の欠損“体積”:見えてない視野の総和面積に、測定された検査コントラストレベル(%で)の各々を乗算したものであり、[パーセント度2]で与えられる。
相対視力の丘の欠損“体積”:絶対欠損体積を、測定された検査視力の丘の全体で割ったもので、[パーセント]で与えられる。
欠損面積勾配(LAG):最高検査コントラストレベルにおいて存在する暗点面積を、最低検査コントラストレベルにおいて存在する暗点面積で割ったものに、測定した実際の暗点深さを乗算したもので、[パーセント]コントラストで与えられる。
保存面積勾配(PAG):最低検査コントラストレベルにおいて存在する保存視野面積を、最高検査コントラストレベルにおいて存在する保存視野面積で割ったものに、測定した実際の暗点深さを乗算したもので、[パーセント]コントラストで与えられる。
逆欠損面積勾配(ILAG):最低検査コントラストレベルにおいて存在する暗点面積を、最高検査コントラストレベルにおいて存在する暗点面積で割ったものに、測定した実際の暗点深さを乗算したもので、[パーセント]コントラストで与えられる。
逆保存面積勾配(IPAG):最高検査コントラストレベルにおいて存在する保存視野面積を、最低検査コントラストレベルにおいて存在する保存視野面積で割ったものに、測定した実際の暗点深さを乗算したもので、[パーセント]コントラストで与えられる。
AGFAは、オブジェクトを解析するために用いることができる。オブジェクトは、例えば、視野データセット、画像内の要石等であってよい。各オブジェクトは、全ての特徴成分値を用いて与えられる特徴(成分)ベクトルを持つ。言い換えれば、特徴ベクトルは、異なる成分を含むことができ、各成分は、特定の値を持つ。特徴成分値は、(最大値及び最小値の点で)異なる範囲であってもよい。さらに、特徴成分は、離散的又は連続的な値を持つことができる。画像内のオブジェクトを比較するために、特徴内の成分の範囲及び数から独立した特徴成分値を生成するため、それらを正規化することが必要となるかもしれない。
ある実施形態では、前のステップにおいて得られた特徴成分ベクトルによって、画像内のオブジェクトを特徴付けることができる。1つ又は複数のオブジェクトが異常であるか否かを決定付ける次の可能なステップは、そのオブジェクトを異なるグループに分類することである。一実施形態において、逐次クラスタリング方法を実施することができ、この方法によって、入力ベクトルは、実時間内の自然数のクラスタに分類される。K平均クラスタリングのような他のクラスタリングに対するこの方法の想定される利点は、ベクトルを分類するクラスタの数を、設定する必要がないことである。この方法は、ベクトルをクラスタリングするだけでなく、クラスタの自然数を決定する。
前節で説明した特徴成分ベクトルのクラスタリングによれば、画像又はデータセット内で検出される他のオブジェクトから異常であるどのオブジェクトに関する情報でも、与えることができる。異常は、特徴、又は特徴のセット又は組み合わせ(例えば、「指紋」)のいずれであってもよい。しかし、この方法によって、さらなる調査のために、異常が実際に関心のあるものか否かを決定できる必要はないかもしれない。
CоvF=U×D×V‘
ここで、CоvFは、行列FのN×N共分散行列であり、Uは、行列CоvFの固有ベクトルのN×Nユニタリ行列であり、Dは、固有値であるN対角値を有するN×Mの長方形対角行列であり、V‘は、M×Nユニタリ行列である。
視野分類目的のために、上述した方法で得られた指標は、3D−CTAG検査結果の特性である特徴ベクトルを形にするために、一緒に用いることができ、このとき、特徴ベクトルは、すなわち、視野である。結果として、視野を、例えばウェブベースの包括的な視野検査及び診断システムを用いて評価し、各特徴ベクトルを介して、(特徴ベクトルの適切な正規化後)相互に比較することができ、そして、異常を検出することができる。
1.統計的方法及び人工ニューラルネットワークを介して、病気を確率的に予測すること(例を参照すると、視野分類ニューラルネットワークへの3D−CTAG適用版が、Fink Wにおいて、「視野データ分類に適用するためのニューラルアトラクタネットワーク(Neural attractor network for application in visual field data classification)(Phys Med Biol 49(13):2799-2809、2004)」に記載され;その開示は、参照によりここに完全に組み込まれる。)
2.自律惑星探査機から派生した分類方法を用いて、経時的な患者の視野における時間的変化の定性的及び定量的の両方を示すこと(例を参照すると、「自動汎用特徴解析 AGFA(Automated Global Feature Analyzer AGFA)(Fink等ら、2005;Fink等ら、2008)」;その開示は、参照によりここに完全に組み込まれる。)
1.早期段階で見え方に影響する状態を検出及び診断することで、治療対策を適時に行えるようにすること。
2.状態への治療的処置の効率性及び有効性を経時的に監視すること。
Claims (12)
- コンピュータに実装された方法であって、
複数の物理的オブジェクトを記述する複数の物理的特徴を検出するように構成された複数のセンサを備えるセンシング及び解析デバイスを提供するステップと、
前記センシング及び解析デバイスにより、前記複数の物理的特徴に基づいて、前記複数の物理的オブジェクトを表す複数の特徴ベクトルを生成するステップであって、該複数の特徴ベクトルは、前記複数の物理的特徴を記述する複数の成分を含み、該複数の成分の各成分は、数値的範囲を有し、前記複数の物理的特徴の各物理的特徴は、各特徴ベクトル内の少なくとも1つの成分によって表される、該生成するステップと、
前記センシング及び解析デバイスにより、前記各成分の前記数値的範囲を0及び1の間の範囲に変換するステップであって、該変換は、以下の式により実行され、
前記第1の複数の特徴ベクトルの各第1の正規化特徴ベクトルのために、前記センシング及び解析デバイスにより、各第1の正規化特徴ベクトルの各物理的特徴のための前記複数の正規化成分を、前記第1の正規化特徴ベクトルの各物理的特徴のための前記全数の成分で割るステップであって、それにより第2の複数の正規化特徴ベクトルを得る、該割るステップと、
前記センシング及び解析デバイスにより、前記第2の複数の正規化特徴ベクトルを以下の式により正規化するステップであって、
前記センシング及び解析デバイスにより、前記第3の複数の正規化特徴ベクトルをクラスタリングするステップであって、それにより、複数のクラスタ正規化特徴ベクトルを得る、該クラスタリングするステップと、
前記センシング及び解析デバイスにより、前記複数のクラスタ正規化特徴ベクトルに主成分解析を適用するステップであって、それにより、距離フラグ値及び第1の評価された複数の正規化特徴ベクトルを得る、該適用するステップと、
前記センシング及び解析デバイスにより、閾値に基づいて、前記複数のクラスタ正規化特徴ベクトルの各特徴ベクトルを数えることにより、数フラグ値を計算するステップであって、それにより、第2の評価された複数の正規化特徴ベクトルを得る、該計算するステップと、
前記センシング及び解析デバイスにより、前記第1又は第2の評価された複数の正規化特徴ベクトルに基づいて、前記複数の物理的オブジェクトを解析するステップと、
を含む、方法。 - 請求項1に記載のコンピュータに実装された方法であって、該クラスタリングするステップは、
前記センシング及び解析デバイスにより、第1のパラメータt1及び第2のパラメータt2を定義するステップであって、前記第2のパラメータは、前記第1のパラメータより大きい、該定義するステップと、
前記センシング及び解析デバイスにより、クラスタcjのために、クラスタ中心Cjを計算するステップであって、ここで、jは、第1の計数パラメータである、該計算するステップと、
前記センシング及び解析デバイスにより、前記第3の複数の正規化特徴ベクトルの各特徴ベクトルと前記クラスタ中心Cjとの間の距離d(F3i,Cj)を計算するステップであって、各特徴ベクトルは、F3iと称され、iは、第2の計数パラメータである、該計算するステップと、
前記センシング及び解析デバイスにより、前記第1のパラメータt1及び前記第2のパラメータt2に基づいて、前記第3の複数の正規化特徴ベクトルの各特徴ベクトルF3iを、クラスタcjに割り当てるステップであって、該割り当てるステップは、繰り返しステップa)乃至c)を含み、該繰り返しステップa)乃至c)は、
a)前記距離d(F3i,Cj)が前記第1のパラメータt1より小さい場合、前記特徴ベクトルF3iを、前記クラスタ中心Cjを有する前記クラスタcjに割り当てる、
b)前記距離d(F3i,Cj)が前記第2のパラメータt2より大きい場合、前記特徴ベクトルF3iを、前記クラスタ中心Cjを有する前記クラスタcjに割り当てず、jをインクリメントさせ、前記特徴ベクトルF3iを、前記クラスタ中心Cjを有する前記クラスタcjに割り当てる、
c)前記距離d(F3i,Cj)が前記第1のパラメータt1より大きく前記第2のパラメータt2より小さい場合、割り当てを延期する、であって、
一度、所望の条件に到達し、各特徴ベクトルF3iがクラスタリングされれば、前記繰り返しステップa)乃至c)は止まり、それにより、複数のクラスタ正規化特徴ベクトルを得る、前記割り当てステップと、を含む方法。 - 請求項1に記載のコンピュータに実装された方法であって、前記クラスタリングするステップは、逐次クラスタリング、K平均クラスタリング、又はレベルセット解析クラスタリングにより、行われる、方法。
- 請求項1乃至3のいずれか一項に記載のコンピュータに実装された方法であって、前記複数の物理的特徴は、色、アルベド、形状、程度、斜度、密集度、サイズ、テクスチャ、マルチスペクトルデータ、ハイパースペクトルデータ、分光分析データ、生物学的汚染濃度、化学的汚染濃度、放射能汚染を含む、方法。
- 請求項1乃至4のいずれか一項に記載のコンピュータに実装された方法であって、前記解析するステップは、関心領域境界/描写、異常検出、自動車両制御、又は探査機器のためのガイダンスのために、行われる、方法。
- 請求項1乃至5のいずれか一項に記載のコンピュータに実装された方法であって、前記解析するステップは、地質、鉱業、資源配分、又は偵察のために、行われる、方法。
- 請求項1乃至3のいずれか一項に記載のコンピュータに実装された方法であって、前記解析するステップは、医療診断のために行われ、前記複数の物理的特徴は、患者固有のデータ、血液検査結果、尿/糞便検査結果、X線、CT、MRI、fMRI、超音波画像、マルチスペクトルデータ、ハイパースペクトルデータ、パルス、心拍数、眼圧、頭蓋内圧、血圧、肺容量を含む、方法。
- 請求項1乃至3のいずれか一項に記載のコンピュータに実装された方法であって、前記解析するステップは、金融市場のために行われ、前記複数の物理的特徴は、データ線上で検知された電気信号であり、前記電気信号は、株式価値、開始入札、最終入札、取引期間を通じた入札、金価格、株価指数、及び取引量を含むデータを示す、方法。
- 請求項1乃至3のいずれか一項に記載のコンピュータに実装された方法であって、前記解析するステップは、視野検査のために行われ、前記複数の物理的特徴は、暗点周辺部、波形度、見えない位置検査の絶対的数値、欠損視野面積、絶対的な視力の丘の欠損体積、欠損面積勾配、保存面積勾配、逆欠損面積勾配、及び逆保存面積勾配を含む、方法。
- 請求項1乃至9のいずれか一項に記載のコンピュータに実装された方法であって、前記MinFj及び前記MaxFjは、ユーザ定義される、方法。
- 請求項2に記載のコンピュータに実装された方法であって、前記距離は、ユークリッド距離である、方法。
- 請求項1乃至11のいずれか一項に記載のコンピュータに実装された方法であって、さらに解析するステップを含み、該解析するステップは、前記センシング及び解析デバイスにより、時間的変化に基づき、前記複数の物理的オブジェクトを解析する、方法。
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