JP5937601B2 - 動的構造化文書コーパスの構造化探索 - Google Patents
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Description
・テキスト「penicillin allergy」に遭遇することに応答して、患者が、目下、ペニシリンアレルギーを持っていないことをこうしたテキストがたとえ示さない(たとえば、患者の母親がペニシリンアレルギーを持っていたことをテキストが示す場合がある)ときでも偽陽性を生成し、また、
・患者が、目下、ペニシリンアレルギーを持っていることを、「penicillin allergy」(たとえば、「PN allergy」)以外のテキストが示すことを認めることに失敗することによって、偽陰性を生成する場合があるからである。
(1)選択(たとえば、ペニシリンに対してアレルギー性があり、かつ、30歳と40歳との間である、文書コーパス内で表される全ての患者を見出すこと)、および、
(2)予測(たとえば、こうしたそれぞれの患者について、患者のカレントメディケーションを論じる、患者についての文書(複数可)の部分(複数可)を取出すこと)
を含む。
・フリーフォームテキスト探索、
・文書(たとえば、「Penicillin in Allergy Section(アレルギーセクション内のペニシリン)」)内のある概念(たとえば、セクション)に制限されたフリーフォームテキスト探索、
・コーディング(アノテーション)探索、たとえば、
−オントロジーからの特定のコードの存在または非存在についての探索、
−コードの一般化の存在についての探索(たとえば、コード「Neoplasm(新生物)」についての探索は、タイプ「Neoplasm」のコードと、オントロジーで表現されるISA関係によって「Neoplasm」コードに関連するオントロジー内の任意のコードの両方にマッチングすることができる)、
−所与の範囲(たとえば、否定、極性(たとえば、「possible(たぶん)」および「likely(おそらく)」)、時間、または対象の範囲)内のコード(またはコードの一般化)についての探索、
−コンプレックスアノテーションについての探索であって、マッチングされる値(複数可)だけでなく、その値(複数可)に対してマッチングされる複雑なアノテーション内のコンポーネント(複数可)(サブコード(複数可))をもクエリが指定する、探索。たとえば、「allergy」コンプレックスアノテーションでは、クエリは、「allergy」アノテーションの「allergen」フィールド(アブアノテーション)内の「penicillin」についての探索を指定するであろう。
・ヘッダ(たとえば、患者名、患者年齢、処置する内科医(複数可)、文書タイプ、文章表題)内のコンテキスト情報に関して実施されるコンテキスト情報探索、たとえば、
−範囲探索(たとえば、訪問日時、患者年齢)、
−フリーフォームテキスト探索(たとえば、患者名、文書表題)、
−コーデッド情報(たとえば、文書タイプ、受診の理由)についての探索であって、クエリ用語を拡張するために、オントロジーを使用することによって一般化されることができる、探索。たとえば、「note(メモ)」タイプの文書についての探索は、タイプ「note」の文書と、そのタイプが「note」のサブタイプである文書の両方についての探索に一般化されることができる。
である。
・選択用語(たとえば、「CurrentMedication」セクション)によって識別される、各マッチング文書のあるセクション、
・各マッチング文書内のあるタイプのコーディング(たとえば、タイプ「<allergy>」のコーディング)、
・各マッチング文書についてのコンテキスト情報(たとえば、患者名、患者年齢、処置する内科医)、
・全てのマッチング文書のセットからの集約情報(たとえば、全てのマッチのカウント、マッチのファセット)
である。
Claims (28)
- 少なくとも1つの非一時的なコンピュータ可読媒体上に有形に記憶されたコンピュータプログラム命令を実行する少なくとも1つのコンピュータプロセッサによって実施される方法であって、
システムであって、
文書コーパス内で第1のタイプのアノテーションを生成するために前記文書コーパス内のテキストを構文解析するように適合された第1の自然言語処理コンポーネントと、
第2のタイプのアノテーションを生成し、前記第2のタイプのアノテーションを前記文書コーパスに追加するために前記文書コーパス内のテキストを構文解析するように適合された第2の自然言語処理コンポーネントと、
第2のタイプのアノテーションではなく、前記第1のタイプのアノテーションの構造化探索を実施するように適合された探索コンポーネントと
を備える、システムと共に使用するためのものであり、
(A)前記文書コーパス内で前記第2のタイプの第1のアノテーションを識別すること、
(B)前記第2のタイプのアノテーションの構造化探索を前記探索コンポーネントが実施することを可能にするように、前記探索コンポーネントを修正することであって、それにより、修正探索コンポーネントを生成する、修正すること、
(C)前記第2のタイプのアノテーションを参照する用語を含むクエリを受信すること、および、
(D)前記クエリを使用して前記文書コーパスに関する探索を実施するために前記修正探索コンポーネントを使用することを含み、
前記(A)は、
(A1)前記文書コーパス内で前記第2のタイプの第1のアノテーションを生成するために第2のタイプの前記アノテーションに対応する概念を表す文書コーパス内のテキストを認識することと、
(A2)前記認識されたテキストを前記第2のタイプの前記第1のアノテーションに関連づけること
を含む方法。 - (A)は、前記文書コーパスに対する前記第1のアノテーションの追加を検出することを含む請求項1に記載の方法。
- (A)の前に、前記文書コーパスは、前記第2のタイプのいずれのアノテーションも含まず、
(B)は、前記文書コーパスに対する前記第2のタイプの前記第1のアノテーションの追加の検出に応答して前記探索コンポーネントを修正することを含む請求項2に記載の方法。 - (F)(A)の前に、前記第2のタイプのアノテーションを生成するためにテキストを構文解析するように適合された前記第2の自然言語処理コンポーネントを前記システムに追加することをさらに含み、
(B)は、前記システムに対する前記第2の自然言語処理コンポーネントの追加に応答して前記探索コンポーネントを修正することを含む請求項3に記載の方法。 - (B)は、前記少なくとも1つのコンピュータプロセッサによって自動的に実施される請求項1に記載の方法。
- (B)は、人間ユーザによって手動で実施される請求項1に記載の方法。
- 前記探索コンポーネントは、前記第1のタイプのアノテーションの構造化探索、テキストの非構造化探索、ならびに、テキストと前記第1のタイプのアノテーションの混合探索を実施するように適合される請求項1に記載の方法。
- (B)は、前記第2のタイプのアノテーションの定義を含むように、前記第1のタイプのアノテーションの定義を含むクエリ言語定義を修正することを含む請求項1に記載の方法。
- 前記システムは、クエリ定式化ユーザインタフェースであって、前記クエリをユーザが定式化するのを支援するように適合された、クエリ定式化ユーザインタフェースをさらに含み、
(E)前記クエリ定式化ユーザインタフェースを自動的に修正することであって、それにより、前記クエリ定式化ユーザインタフェースが、前記第2のアノテーションを参照する用語を含むように前記クエリを前記ユーザが定式化するのを支援することを可能にする、修正することをさらに含む請求項1に記載の方法。 - (B)は、前記第2のタイプのアノテーションの定義を含むように、前記第1のタイプのアノテーションの定義を含むクエリ言語定義を修正することを含む請求項9に記載の方法。
- 前記文書コーパスは、前記第2のタイプの複数のアノテーションを含み、(D)は、
(D)(1)前記第2のアノテーションを参照するクエリの用語を使用して前記文書コーパス内で前記第2のタイプのアノテーションに関する選択を実施するために前記探索コンポーネントを使用することを含む請求項1に記載の方法。 - コンピュータプログラム命令が有形に記憶されている非一時的なコンピュータ可読媒体であって、前記コンピュータプログラム命令は、システムと共に使用するための方法を実施するために少なくとも1つのコンピュータプロセッサによって実行可能であり、前記システムは、
文書コーパス内で第1のタイプのアノテーションを生成するために前記文書コーパス内のテキストを構文解析するように適合された第1の自然言語処理コンポーネントと、
第2のタイプのアノテーションを生成し、前記第2のタイプのアノテーションを前記文書コーパスに追加するために前記文書コーパス内のテキストを構文解析するように適合された第2の自然言語処理コンポーネントと、
第2のタイプのアノテーションではなく、前記第1のタイプのアノテーションの構造化探索を実施するように適合された探索コンポーネントと
を備え、
前記方法は、
(A)前記文書コーパス内で前記第2のタイプの第1のアノテーションを識別すること、
(B)前記第2のタイプのアノテーションの構造化探索を前記探索コンポーネントが実施することを可能にするように、前記探索コンポーネントを修正することであって、それにより、修正探索コンポーネントを生成する、修正すること、
(C)前記第2のタイプのアノテーションを参照する用語を含むクエリを受信すること、および、
(D)前記クエリを使用して前記文書コーパスに関する探索を実施するために前記修正探索コンポーネントを使用することを含み、
前記(A)は、
(A1)前記文書コーパス内で前記第2のタイプの第1のアノテーションを生成するために第2のタイプの前記アノテーションに対応する概念を表す文書コーパス内のテキストを認識することと、
(A2)前記認識されたテキストを前記第2のタイプの前記第1のアノテーションに関連づけること
を含むコンピュータ可読媒体。 - (A)は、前記文書コーパスに対する前記第1のアノテーションの追加を検出することを含む請求項12に記載のコンピュータ可読媒体。
- (A)の前に、前記文書コーパスは、前記第2のタイプのいずれのアノテーションも含まず、
(B)は、前記文書コーパスに対する前記第2のタイプの前記第1のアノテーションの追加の検出に応答して前記探索コンポーネントを修正することを含む請求項13に記載のコンピュータ可読媒体。 - (F)(A)の前に、前記第2のタイプのアノテーションを生成するためにテキストを構文解析するように適合された前記第2の自然言語処理コンポーネントを前記システムに追加することをさらに含み、
(B)は、前記システムに対する前記第2の自然言語処理コンポーネントの追加に応答して前記探索コンポーネントを修正することを含む請求項14に記載のコンピュータ可読媒体。 - (B)は、前記少なくとも1つのコンピュータプロセッサによって自動的に実施される請求項12に記載のコンピュータ可読媒体。
- (B)は、人間ユーザによって手動で実施される請求項12に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記探索コンポーネントは、前記第1のタイプのアノテーションの構造化探索、テキストの非構造化探索、ならびに、テキストと前記第1のタイプのアノテーションの混合探索を実施するように適合される請求項12に記載のコンピュータ可読媒体。
- (B)は、前記第2のタイプのアノテーションの定義を含むように、前記第1のタイプのアノテーションの定義を含むクエリ言語定義を修正することを含む請求項12に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記システムは、クエリ定式化ユーザインタフェースであって、前記クエリをユーザが定式化するのを支援するように適合された、クエリ定式化ユーザインタフェースをさらに含み、
(F)前記クエリ定式化ユーザインタフェースを自動的に修正することであって、それにより、前記クエリ定式化ユーザインタフェースが、前記第2のアノテーションを参照する用語を含むように前記クエリを前記ユーザが定式化するのを支援することを可能にする、修正することをさらに含む請求項12に記載のコンピュータ可読媒体。 - (B)は、前記第2のタイプのアノテーションの定義を含むように、前記第1のタイプのアノテーションの定義を含むクエリ言語定義を修正することを含む請求項20に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記文書コーパスは、前記第2のタイプの複数のアノテーションを含み、(D)は、
(D)(1)前記第2のアノテーションを参照するクエリの用語を使用して前記文書コーパス内で前記第2のタイプのアノテーションに関する選択を実施するために前記探索コンポーネントを使用することを含む請求項12に記載のコンピュータ可読媒体。 - 少なくとも1つの非一時的なコンピュータ可読媒体上に有形に記憶されたコンピュータプログラム命令を実行する少なくとも1つのコンピュータプロセッサによって実施される方法であって、
システムであって、
文書コーパス内で第1のタイプのアノテーションを生成するために前記文書コーパス内のテキストを構文解析するように適合された第1の自然言語処理コンポーネントと、
第2のタイプのアノテーションではなく、前記第1のタイプのアノテーションの構造化探索を実施するように適合された探索コンポーネントと
を備える、システムと共に使用するためのものであり、
(A)前記第2のタイプのアノテーションを生成するためにテキストを構文解析するように適合された第2の自然言語処理コンポーネントの前記システムに対する追加を検出すること、
(B)前記第2のタイプのアノテーションの構造化探索を前記探索コンポーネントが実施することを可能にするように、前記検出に応答して前記探索コンポーネントを修正することであって、それにより、修正探索コンポーネントを生成する、修正すること、
(C)前記第2のタイプのアノテーションを参照する用語を含むクエリを受信すること、および、
(D)前記クエリを使用し前記文書コーパスに関する探索を実施するために前記修正探索コンポーネントを使用することを含む方法。 - 前記文書コーパスは、(B)が実施される時間に、前記第2のタイプのいずれのアノテーションも含まない請求項23に記載の方法。
- (A)は、前記システムに対して前記第2の自然言語処理コンポーネントを追加することを含む請求項23に記載の方法。
- コンピュータプログラム命令が有形に記憶されている非一時的なコンピュータ可読媒体であって、前記コンピュータプログラム命令は、システムと共に使用するための方法を実施するために少なくとも1つのコンピュータプロセッサによって実行可能であり、前記システムは、
文書コーパス内で第1のタイプのアノテーションを生成するために前記文書コーパス内のテキストを構文解析するように適合された第1の自然言語処理コンポーネントと、
第2のタイプのアノテーションではなく、前記第1のタイプのアノテーションの構造化探索を実施するように適合された探索コンポーネントと
を備え、
前記方法は、
(A)前記第2のタイプのアノテーションを生成するためにテキストを構文解析するように適合された第2の自然言語処理コンポーネントの前記システムに対する追加を検出すること、
(B)前記第2のタイプのアノテーションの構造化探索を前記探索コンポーネントが実施することを可能にするように、前記検出に応答して前記探索コンポーネントを修正することであって、それにより、修正探索コンポーネントを生成する、修正すること、
(C)前記第2のタイプのアノテーションを参照する用語を含むクエリを受信すること、および、
(D)前記クエリを使用して文書コーパスに関する探索を実施するために前記修正探索コンポーネントを使用することを含むコンピュータ可読媒体。 - 前記文書コーパスは、(B)が実施される時間に、前記第2のタイプのいずれのアノテーションも含まない請求項26に記載のコンピュータ可読媒体。
- (A)は、前記システムに対して前記第2の自然言語処理コンポーネントを追加することを含む請求項26に記載のコンピュータ可読媒体。
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