JP5825574B2 - 気孔増加剤、ポリペプチド、植物における気孔の数および/または密度の増加方法ならびに植物の収量の増加方法 - Google Patents
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Description
(1) 植物における気孔の数および/または密度を増加させる化合物を含有してなる気孔増加剤であって、
前記化合物が、(I)配列番号:6に示されるアミノ酸配列、
(II)配列番号:6において、1または数個のアミノ酸残基の置換、欠失、付加または挿入を有し、かつ植物における気孔形成を正に制御する性質を少なくとも有するポリペプチドを構成するアミノ酸配列、
(III)配列番号:6に示されるアミノ酸配列に対して、Cost to open gap 11、Cost to extend gap 1、expect value 10、wordsize 3の条件でBLASTアルゴリズムでアライメントし算出した配列同一性が、95%以上であり、かつコードされるポリペプチドが、植物における気孔形成を正に制御する性質を少なくとも有するアミノ酸配列、および
(IV)配列番号:6に示されるアミノ酸配列をコードする核酸の相補鎖核酸とストリンジェントな条件下にハイブリダイズする核酸によりコードされ、かつコードされるポリペプチドが、植物における気孔形成を正に制御する性質を少なくとも有するアミノ酸配列
からなる群より選ばれたアミノ酸配列からなるポリペプチドである、気孔増加剤、
(2) (I)配列番号:6に示されるアミノ酸配列、
(II)配列番号:6において、1または数個のアミノ酸残基の置換、欠失、付加または挿入を有し、かつ植物における気孔形成を正に制御する性質を少なくとも有するポリペプチドを構成するアミノ酸配列、
(III)配列番号:6に示されるアミノ酸配列に対して、Cost to open gap 11、Cost to extend gap 1、expect value 10、wordsize 3の条件でBLASTアルゴリズムでアライメントし算出した配列同一性が、95%以上であり、かつコードされるポリペプチドが、植物における気孔形成を正に制御する性質を少なくとも有するアミノ酸配列、および
(IV)配列番号:6に示されるアミノ酸配列をコードする核酸の相補鎖核酸とストリンジェントな条件下にハイブリダイズする核酸によりコードされ、かつコードされるポリペプチドが、植物における気孔形成を正に制御する性質を少なくとも有するアミノ酸配列
からなる群より選ばれたアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(3) 植物に、前記(1)に記載の気孔増加剤を接触させるか、または植物において、前記(2)のポリペプチドを過剰発現させることを特徴とする、植物における気孔の数および/または密度の増加方法、
(4) 前記植物が維管束植物である、前記(3)に記載の植物における気孔の数および/または密度の増加方法、
(5) 前記(3)または(4)に記載の植物における気孔の数および/または密度の増加方法により得られる植物、ならびに
(6) 植物に、前記(1)に記載の気孔増加剤を接触させるか、または植物において、前記(2)のポリペプチドを過剰発現させることを特徴とする、植物の収量の増加方法
に関する。
本発明の気孔増加剤は、植物における気孔の数および/または密度を増加させる化合物を含有していることを特徴とする。かかる気孔増加剤によれば、未分化の表皮細胞を、気孔を構成する孔辺細胞に分化させることができるので、植物における気孔の数および/または密度を増加させることができる。ここで、「植物における気孔の数の増加」とは、少なくとも野生型の植物における気孔の数よりも多いことをいい、「植物における気孔の密度の増加」とは、野生型の植物における気孔の密度よりも高い密度を有することをいう。気孔の数および密度の測定は、例えば、顕微鏡による観察などによって行なうことができる。
(I)配列番号:6に示されるアミノ酸配列、
(II)配列番号:6において、1または数個のアミノ酸残基の置換、欠失、付加または挿入を有し、かつ植物における気孔形成を正に制御する性質を少なくとも有するポリペプチドを構成するアミノ酸配列、
(III)配列番号:6に示されるアミノ酸配列に対して、Cost to open gap 11、Cost to extend gap 1、expect value 10、wordsize 3の条件でBLASTアルゴリズムでアライメントし算出した配列同一性が、64%以上であり、かつコードされるポリペプチドが、植物における気孔形成を正に制御する性質を少なくとも有するアミノ酸配列、および
(IV)配列番号:6に示されるアミノ酸配列をコードする核酸の相補鎖核酸とストリンジェントな条件下にハイブリダイズする核酸によりコードされ、かつコードされるポリペプチドが、植物における気孔形成を正に制御する性質を少なくとも有するアミノ酸配列
からなる群より選ばれたアミノ酸配列からなるポリペプチド、前記ポリペプチドに基づく擬似化合物、前記ポリペプチドをコードする核酸に対応するプロモーターを正に制御する物質、ストマジェンの安定化に寄与する物質(例えば、ストマジェンを切断するプロテアーゼに対する阻害剤など)などが挙げられる。
本発明の植物における気孔の数および/または密度の増加方法は、植物に、前述した気孔増加剤を接触させるか、または植物において、前述したポリペプチドを過剰発現させることを特徴としている。
前述した植物における気孔の数および/または密度の増加方法により得られる植物は、野生型の植物に比べて、気孔の数および/または密度が増加している。したがって、本発明の植物によれば、二酸化炭素の吸収量が向上しているので、大気中における二酸化炭素量を低減することが可能になる。また、本発明の植物によれば、二酸化炭素の吸収量の増大によって炭素固定量が増大しているので、収量の増量などを図ることができる。
本発明の植物の収量の増加方法は、植物に、前述した気孔増加剤を接触させるか、または植物において、前述したポリペプチドを過剰発現させることを特徴としている。
植物において、本発明のポリペプチドの発現量または当該ポリペプチドをコードする核酸の量を指標として、気孔増加剤を評価することができる。具体的には、被験物質を、本発明のポリペプチドを発現する細胞または当該細胞を少なくとも保持する植物と接触させ、前記被験物質の非接触時における前記ポリペプチドの発現量に対する前記被験物質の接触時におけるポリペプチドの発現量の変化、および前記被験物質の非接触時における前記ポリペプチドをコードする核酸の量に対する前記被験物質の接触時におけるポリペプチドをコードする核酸の量の変化の少なくとも1つを測定する。
コンピュータによる遺伝子の探索(in silico screening)
シロイヌナズナのトランスクリプトームのデータベースATTED−II(ウェブページアドレス http://atted.jp/)と、プログラムとしてATTED−IIのToolにある「NetworkDrawer」とを用いてコンピュータによる遺伝子探索を行ない、TMM遺伝子、SDD1遺伝子およびEPF1遺伝子それぞれと共発現している遺伝子を検討した。遺伝子探索は、Function 3の中で[Execute]、[MR−rank method]および[top 300 genes in 22,263 genes]を選択する工程、At1g80080(TMM遺伝子)、At1g04110(SDD1遺伝子)およびAt2g20875(EPF1遺伝子)の3つの遺伝子を入力する工程、ならびに「submit」で解析する工程を行なうことにより実施した。
プライマーのデザイン
以下の実施例などに用いるプライマーおよびその塩基配列を表1に示す。
ストマジェンに対する抗体の作製
シロイナズナCol−0系統(CS60000)〔野生株〕のゲノムDNAを鋳型とし、表1に示されたプライマーP10_FおよびプライマーP10_Rを用い、ストマジェンをコードしている領域をPCRで増幅した。その後、得られたPCR産物をベクター〔pET32(Novagen社製)に由来するベクター(文献23参照)〕に挿入した。得られた構築物を、大腸菌(Escherichia coli)BL21系統に導入し、ストマジェンを発現させた。
タバコ培養細胞BY−2を用いた組み換えタンパク質の発現
ストマジェンと緑色蛍光タンパク質(以下、「GFP」という)との融合タンパク質(以下、「ストマジェン−GFP」という)およびEPF1とGFPとの融合タンパク質(以下、「EPF1−GFP」という)を、文献20に記載の方法に準じ、トマトモザイクウィルスによる発現ベクターと誘導型ウィルス感染システムを用いたタバコ培養細胞系を用いて作製した。
抗ストマジェン抗体の特異性の評価
調製例3で得られたストマジェン−GFPを含む画分およびEPF1−GFPを含む画分それぞれをSDS変性ポリアクリルアミドゲルに負荷し、SDS−PAGEを行なった。SDS−PAGE後のゲルと、抗ストマジェン抗体および抗GFP抗体それぞれとを用い、文献24に記載の方法に準じてウエスタンブロット解析を行ない、調製例2で得られた抗ストマジェン抗体の特異性を評価した。なお、抗ストマジェン抗体は、1/1000の濃度で用いた。二次抗体として、西洋ワサビペルオキシダーゼ結合型抗ウサギIgG−ヤギ抗体〔GEヘルスケア社製、商品名:NA934〕を1/5000の濃度で用いた。また、SDS−PAGE後のゲルをクマシーブリリアントブルー(CBB)で染色した。調製例2で得られた抗ストマジェン抗体の特異性を調べた結果を図2に示す。図中、矢印はストマジェン−GFPに対応するバンドの位置、アスタリスクは非特異的なバンドの位置を示す。
まず、以下のように操作を行ない、ゲートウェイ・クローニング・テクノロジー〔Gateway cloning technology{インビトロジェン(Invitrogen)}〕に基づくプラント・バイナリーベクター(Plant binary vector)を利用してストマジェン過剰発現用ベクターの作製を行なった。ストマジェンをコードするDNAを、シロイナズナCol−0系統(CS60000)のゲノムDNAを鋳型とし、表1に示されたプライマーP10_FおよびプライマーP10_Rを用いてPCRを行なうことにより得た。BPクロナーゼ〔インビトロジェン(Invitrogen)社製〕を用い、前記DNAをベクター〔インビトロジェン(Invitrogen)社製、商品名:pENTR/D−TOPO〕に導入した。その後、得られた構築物とLRクロナーゼとを用い、前記DNAを前記構築物からバイナリーベクターpB2GW7〔Gent大学VIBより供与〕に移しかえた。これにより、ストマジェン過剰発現用ベクターを得た。
人工マイクロRNAクローニング用プラスミドpRS300〔デトレフ・ウェイゲル(Detlef Weigel)博士より供与〕を鋳型とし、表1に示されたプライマーCACC_amiA、プライマーP10ami_1 miR−s、プライマーP10ami1_II miR−a、プライマーP10ami1_III miR−*s、プライマーP10ami1_IV miR*a、プライマーamiBを用いて人工マイクロRNA(amiRNA)を含むヘアピン構造を形成する配列からなるDNAを作製し、ベクター〔インビトロジェン(Invitrogen)社製、商品名:pENTR/D−TOPO〕に導入した。その後、得られた構築物とLRクロナーゼとを用い、前記DNAを前記構築物からバイナリーベクターpB2GW7〔Gent大学VIBより供与〕に移しかえた。これにより、ストマジェン発現抑制用ベクターを得た。
ストマジェン過剰発現用ベクターを導入したアグロバクテリウム(系統GV3101)を、シロイヌナズナpTMM::GFP系統〔島根大学の中川強博士より供与〕に感染させたことを除き、調製例4と同様の操作を行ない、ストマジェン過剰発現pTMM::GFP株を得た。
植物の表現型に対するストマジェンの作用の評価
シロイナズナCol−0系統(ストック番号CS60000)〔野生株〕、調製例4で得られたストマジェン過剰発現株10および調製例5で得られたストマジェン発現抑制株10(STOMAGEN-RNAi)それぞれの成熟した第1葉を採取した。つぎに、前記第1葉を、固定液(エタノール:酢酸(体積比)=9:1)で7時間以上固定し、その後、抱水クロラール水溶液(抱水クロラール:水:グリセロール(体積比)=8:2:1)で透明化した。抱水クロラールを水で除いた後、1μg/mLサフラニン水溶液〔1μgサフラニン−O/mL水〕で気孔を染色した。その後、前記第1葉の裏側表皮を、微分干渉顕微鏡〔ツアイス(Zeiss)社製、商品名:Axioskop plus顕微鏡〕を用いて観察した。試験例1において、野生株の成熟した第1葉の裏側表皮を観察した結果を示す微分干渉像を図3(a)、試験例1において、ストマジェン発現抑制株10の成熟した第1葉の裏側表皮を観察した結果を示す微分干渉像を図3(b)および試験例1において、ストマジェン過剰発現株10の成熟した第1葉の裏側表皮を観察した結果を示す微分干渉像を図3(c)に示す。図中、スケールバーは50μmを示す。
(1)ストマジェン遺伝子の発現の局在性
ストマジェン遺伝子(STOMAGEN)の開始コドン上流2kbpの領域(プロモーター領域)のDNAを、シロイナズナCol−0系統(CS60000)のゲノムDNAを鋳型とし、表1に示されたプライマーP10_prom_FおよびプライマーP10_prom_Rを用いてPCRを行なうことにより得た。BPクロナーゼ〔インビトロジェン(Invitrogen)社製〕を用い、前記DNAをベクター〔インビトロジェン(Invitrogen)社製、商品名:pENTR/D−TOPO〕に導入した。その後、得られた構築物とLRクロナーゼとを用い、前記DNAを前記構築物からベクターpBGWFS7〔Gent大学VIBより供与〕に移しかえた。前記pBGWFS7は、プロモーターのためのリポーター遺伝子としてβ−グルクロニダーゼ(GUS)遺伝子を保持している。これにより、プロモーター発現用ベクターを得た。
シロイナズナCol−0系統(ストック番号CS60000)〔野生株〕の葉と、ストマジェン遺伝子(STOMAGEN)のcDNA(306bp)を標識したプローブ(センスプローブ)または前記cDNAに対応するアンチセンス鎖を標識したプローブ(アンチセンスプローブ)とを用い、in situ ハイブリダイゼーションを行なった。in situ ハイブリダイゼーションは、文献24に記載の手法と同様の操作により行なった。試験例2において、葉原基におけるストマジェン遺伝子のアンチセンスプローブを用いたin situハイブリダイゼーション解析を行なった結果を示す顕微鏡像を図9(a)および試験例2において、葉原基におけるストマジェン遺伝子のセンスプローブを用いたin situハイブリダイゼーション解析を行なった結果を示す顕微鏡像を図9(b)に示す。
調製例5において、表1に示されたプライマーP10ami1_I miR−s、プライマーP10ami1_II miR−a、プライマーP10ami1_III miR*sおよびプライマーP10ami1_IV miR*aの代わりに、表1に示されたプライマーP10ami2_ImiR−s、プライマーP10ami2_IImiR−a、プライマーP10ami2_IIImiR*sおよびプライマーP10ami2_IVmiR*aを用いたことを除き、調製例5と同様の操作を行ない、ストマジェン発現抑制株(ami−B)を得た。なお、ストマジェン発現抑制株(ami−B)では、人工マイクロRNAであるami−Bによってストマジェンの発現が抑制されている。ストマジェン遺伝子を含む核酸におけるami−Bの標的配列の位置は、図10(a)に示されるとおりである。
調製例5において、鋳型として、人工マイクロRNAクローニング用プラスミドpRS300の代わりに、シロイナズナCol−0系統(CS60000)のゲノムDNAを用いたこと、表1に示されたプライマーCACC_amiA、プライマーP10ami_1 miR−s、プライマーP10ami1_II miR−a、プライマーP10ami1_III miR−*s、プライマーP10ami1_IV miR*aおよびプライマーamiBの代わりに、表1に示されたプライマーP10_RNAi_FおよびプライマーP10_RNAi_Rを用いたことならびにバイナリーベクターpB2GW7〔Gent大学VIBより供与〕の代わりに、ベクターpB2GWI(2)WG7〔Gent大学VIBより供与〕を用いたことを除き、調製例5と同様の操作を行ない、ストマジェン発現抑制株(dsRNA)を得た。なお、ストマジェン発現抑制株(dsRNA)では、dsRNAによってストマジェンの発現が抑制されている。ストマジェン遺伝子を含む核酸におけるdsRNAの標的配列の位置は、図10(a)に示されるとおりである。
シロイナズナCol−0系統(ストック番号CS60000)〔野生株〕、調製例5で得られたストマジェン発現抑制株(ストマジェン発現抑制株10、「ami−A」ともいう)、調製例7で得られたストマジェン発現抑制株(ami−B)および調製例8で得られたストマジェン発現抑制株(dsRNA)それぞれの成熟した第1葉を採取した。つぎに、試験例1と同様の操作を行なうことにより、前記第1葉を、固定し、透明化した後、気孔を染色した。その後、前記第1葉の裏側表皮を、微分干渉顕微鏡〔ツアイス(Zeiss)社製、商品名:Axioskop plus顕微鏡〕を用いて観察した。試験例3において、野生株、ストマジェン発現抑制株(ami−A)、ストマジェン発現抑制株(ami−B)およびストマジェン発現抑制株(dsRNA)それぞれの成熟した第1葉の裏側表皮を観察した結果を示す微分干渉像を図10(b)に示す。図10(b)中、(I)は野生株、(II)はストマジェン発現抑制株(ami−A)、(III)はストマジェン発現抑制株(ami−B)および(IV)はストマジェン発現抑制株(dsRNA)を示す。また、図10(b)中、スケールバーは50μmを示す。
シロイナズナCol−0系統(ストック番号CS60000)〔野生株〕、調製例4で得られたストマジェン過剰発現株10および調製例5で得られたストマジェン発現抑制株10それぞれの発芽後23日目の成熟した第1葉を採取した。つぎに、前記第1葉の表面を、微分干渉顕微鏡〔ツアイス(Zeiss)社製、商品名:Axioskop plus顕微鏡〕を用いて観察し、0.22mm2の正方形の範囲における気孔の数を測定した。そして、気孔密度を算出した。なお、統計解析には、統計解析ソフトRを用いた。また、試験例3と同様に操作を行なうことにより、野生株、ストマジェン過剰発現株10およびストマジェン発現抑制株10それぞれの発芽後23日目の成熟した第1葉におけるストマジェン遺伝子の相対発現量を求めた。試験例4において、気孔密度とストマジェン遺伝子の相対発現量との関係を調べた結果を図11に示す。図中、丸は野生株、三角はストマジェン発現抑制株10、四角はストマジェン過剰発現株10およびエラーバーは標準偏差を示す。
発芽後9日目(未熟期)および23日目(成熟期)それぞれのシロイナズナCol−0系統(ストック番号CS60000)の根、葉または茎から、文献24に記載の方法に従ってRNAを抽出した。また、シロイナズナCol−0系統(ストック番号CS60000)の未熟な花芽または未熟な果実から、文献24に記載の方法に従ってRNAを抽出した。
試験例2で作製されたpSTOMAGEN::GUS株の発芽後2日目、9日目または16日目の未熟な子葉および幼若葉におけるGUS活性の発現の有無を観察した。試験例6において、pSTOMAGEN::GUS株の発芽後2日目におけるストマジェン遺伝子のプロモーターの発現を解析した結果を図13(a)、試験例6において、pSTOMAGEN::GUS株の発芽後9日目におけるストマジェン遺伝子のプロモーターの発現を解析した結果を図13(b)および試験例6において、pSTOMAGEN::GUS株の発芽後16日目におけるストマジェン遺伝子のプロモーターの発現を解析した結果を図13(c)に示す。図中、「C」は子葉および「J」は幼若葉を示す。
Venusに4つのグリシンがC末端に結合したもの(Venus−G4)をコードするDNA、カボチャ2Sアルブミンのシグナルペプチド(SP)をコードするDNAおよびストップコドンを除いたストマジェン遺伝子のオープンリーディングフレームをコードするDNAそれぞれをPCRによって作製した。なお、Venusに4つのグリシンがC末端に結合したもの(Venus−G4)をコードするDNAの作製には、表1に示されたプライマーP10_F、P−V_F、プライマーP−V_RおよびプライマーVenus_Rを用いた。カボチャ2SアルブミンのシグナルペプチドをコードするDNAの作製には、プライマー2Ssp_F、2Ssp<――p10m、2Ssp――>p10mおよびP10_Rを用いた(文献22参照)。
シロイナズナCol−0系統(ストック番号CS60000)〔野生株〕、調製例4で得られたストマジェン過剰発現株10、調製例10で得られたSTOMAGEN*発現株および調製例9で得られたストマジェン−Venus発現株それぞれの発芽後23日目の第1葉を採取した。前記第1葉の表面を、微分干渉顕微鏡〔ツアイス(Zeiss)社製、商品名:Axioskop plus顕微鏡〕を用いて観察し、0.22mm2の正方形の範囲における気孔の数を測定した。そして、気孔密度を算出した。なお、統計解析には、統計解析ソフトR(ウェブアドレス http://www.R−project.org)を用いた。また、Studentの両側t検定を行なった。試験例7において、ストマジェン遺伝子の発現様式と、気孔密度との関係を調べた結果を図14に示す。図中、レーン1は野生株、レーン2はストマジェン過剰発現株10、レーン3はSTOMAGEN*発現株およびレーン4はストマジェン−Venus発現株を示す。また、図中、エラーバーは標準偏差およびアスタリスクは野生株に比較してp値が0.01未満であることを示す。
調製例9で得られたストマジェン−Venus発現株の発芽後3日目の子葉を脱塩水または0.8Mマンニトールで処理した。処理後の子葉を蛍光色素〔インビトロジェン(Invitrogen)社製、商品名:FM4−64〕で染色した。
シロイナズナCol−0系統(ストック番号CS60000)〔野生型〕または調製例9で得られたストマジェン−Venus発現株7gを破砕した産物を、溶液〔組成:50mMトリス塩酸緩衝液(pH7.5)、50mM塩化ナトリウム、1体積%CAPS液〕5mLに溶解させた。つぎに、得られた試料を、タンパク質単離用キット〔ミルテニー・バイオテック(Milteny Biotech)社製、商品名:μMACS GFP−tag protein isolation kit〕のanti−GFPビーズ200μLと混ぜた。得られた混合物を4℃で静置した。ビーズを磁性カラムに吸着させた後、ビーズについたタンパク質を前記タンパク質単離用キットに付属の緩衝溶液で溶出させた。
純度の高いストマジェン(stomagen)を得るためにタバコの培養細胞BY−2にストマジェン遺伝子(STOMAGEN)を導入した。
シロイヌナズナ〔Lti6b−GFP株〕の種子を、滅菌したB5メディウム〔日本製薬(株)製、カタログ番号:399−00621〕で維持して発芽させた。発芽後2日目のLti6b−GFP株に対して、実施例2で得られた精製組換えストマジェンをその濃度が2μMとなるように投与した。その後、Lti6b−GFP株を22℃で3日間生育させ、共焦点顕微鏡を用いて子葉の裏側表皮を観察した。対照として、ストマジェンを投与していないLti6b−GFP株を用い、前記と同様に操作を行ない、子葉の裏側表皮を観察した。実施例4において、精製組換えストマジェンを投与していないLti6b−GFP発現株の子葉の裏側表皮の共焦点顕微鏡像を図26(a)および実施例4において、精製組換えストマジェン(2μM)を投与したLti6b−GFP発現株の子葉の裏側表皮の共焦点顕微鏡像を図26(b)に示す。図中、スケールバーは50μmを示す。
配列番号:1に示されるアミノ酸配列のうち58番目〜102番目のアミノ酸残基からなるポリペプチド(45アミノ酸)を化学合成した。得られたポリペプチドを含むポリペプチド溶液(0.5mg/mL)を、溶液〔20mMトリス塩酸緩衝液(pH8.8)、50mM塩化ナトリウム〕に溶解させた。その後、得られた試料を、透析膜〔スペクトラム・ラボラトリーズ(Spectrum Laboratories)社製、商品名:Spectra/Por3MWCO、3500〕を用い、4℃で1日間、透析用水溶液〔組成:0.5mMグルタチオン(酸化型および還元型の両方、和光純薬(株)製、酸化型について、カタログ番号:077−03334、還元型について、カタログ番号:194679)、200mM L−アルギニン(pH8.0)〕に対して透析した。得られた透析産物を、溶液〔20mMトリス塩酸緩衝液(pH8.8)、50mM塩化ナトリウム〕に対して3回、1.5日間にわたって透析し、グルタチオンを除去した。これにより、合成ストマジェンを得た。なお、得られた合成ストマジェンは、SDS−PAGEにより、純度などを確認した。
シロイヌナズナ〔Lti6b−GFP株〕の種子を、滅菌したB5メディウムで維持して発芽させた。発芽後2日目のLti6b−GFP株に対して、実施例5で得られた合成ストマジェンをその濃度が300nMとなるように投与した。その後、Lti6b−GFP株を22℃で3日間生育させた。つぎに、子葉を採取し、その表面を、共焦点顕微鏡〔ツアイス(Zeiss)社製、商品名:LSM510 META顕微鏡〕を用いて観察し、0.22mm2の正方形の範囲における気孔の数を測定した。そして、気孔密度を算出した。なお、統計解析には、統計解析ソフトR(ウェブアドレス http://www.R−project.org)を用いた。なお、対照として、ストマジェンを投与していないLti6b−GFP株を用い、前記と同様に操作を行ない、気孔密度を算出した。実施例6において、合成ストマジェン量と気孔密度との関係を調べた結果を図27に示す。
Arabidopsis stock center(ABRC,米国)から取り寄せた種子(系統番号SAIL_36_B6)を発芽させ、芽生えのDNAを抽出して、表1に示されたプライマーspch SAIL_36_B6 LPおよびプライマーSAIL_36_B6_RPを用いてPCRを行うことで、SPCH遺伝子にT−DNAが挿入された個体を選抜した。これにより、SPCH遺伝子を欠損した変異体のシロイヌナズナ(spch変異株)を得た。
調製例4において、シロイヌナズナCol−0系統の代わりに調製例12で得られたspch変異株を用いたことを除き、調製例4と同様の操作を行ない、ストマジェン過剰発現spch変異株を得た。
気孔系列の形成は、SPEECHLESS(SPCH)と呼ばれるbHLH型の転写因子によって開始されると考えられている(文献13および文献14を参照)。そこで、調製例12で得られたspch変異株および調製例13で得られたストマジェン過剰発現spch変異株を用い、ストマジェンによる影響を調べた。
調製例12において、ABRCから取り寄せた種子(系統番号SAIL_36_B6)の代わりに系統番号SALK_011958を用いたこと、表1に示されたプライマーspch SAIL_36_B6 LPおよびプライマーSAIL_36_B6_RPの代わりに表1に示されたプライマーtmm SALK_011958−LPおよびプライマーSALK_011958−RPを用いたこと、を除き、調製例12と同様の操作を行ない、TMM遺伝子を欠損した変異体のシロイヌナズナ(tmm変異株)を得た。
調製例4において、シロイヌナズナCol−0系統の代わりに調製例14で得られたtmm変異株を用いたことを除き、調製例4と同様の操作を行ない、ストマジェン過剰発現tmm変異株を得た。
調製例5において、シロイヌナズナCol−0系統の代わりに調製例14で得られたtmm変異株を用いたことを除き、調製例5と同様の操作を行ない、ストマジェン発現抑制tmm変異株を得た。
SPCHは、受容体様タンパク質TMMとそのリガンド候補であるEPF1とEPF2の遺伝子発現を制御している(文献5、13、14)。TMMは、気孔の分化において葉では負に働くが、茎では正に働く(文献16)。一方、EPF1とEPF2は両方の器官で負に働く(文献4、5)。
調製例12において、ABRCから取り寄せた種子(系統番号SAIL_36_B6)の代わりに系統番号SALK_137549を用いたことならびに表1に示されたプライマーspch SAIL_36_B6 LPおよびプライマーSAIL_36_B6_RPの代わりに表1に示されたプライマーepf1SALK_137549−LPおよびプライマーSALK_137549−RPを用いたことを除き、調製例12と同様の操作を行ない、EPF1遺伝子を欠損した変異体のシロイヌナズナ(epf1変異株)を得た。
調製例5において、シロイヌナズナCol−0系統の代わりに調製例17で得られたepf1変異株を用いたことを除き、調製例5と同様の操作を行ない、ストマジェン発現抑制epf1変異株を得た。
調製例12において、ABRCから取り寄せた種子(系統番号SAIL_36_B6)の代わりに系統番号SALK_047918を用いたことならびに表1に示されたプライマーspch SAIL_36_B6 LPおよびプライマーSAIL_36_B6_RPの代わりに表1に示されたプライマーepf2SALK_047918−LPおよびプライマーSALK_047918−RPを用いたことを除き、調製例12と同様の操作を行ない、EPF2遺伝子を欠損した変異体のシロイヌナズナ(epf2変異株)を得た。
調製例5において、シロイヌナズナCol−0系統の代わりに調製例20で得られたepf2変異株を用いたことを除き、調製例5と同様の操作を行ない、ストマジェン発現抑制epf2変異株を得た。
調製例17において得られたepf1変異株と調製例19において得られたepf2変異株とのかけあわせを行ない、後代のF2世代の個体を発芽させたのちDNAを抽出し、表1に示されたプライマーepf1SALK_137549−LPおよびプライマーSALK_137549−RPならびにプライマーepf2SALK_047918−LPおよびプライマーSALK_047918−RPを用い、EPF1遺伝子およびEPF2遺伝子双方にT−DNAが挿入されている個体を選抜した。これにより、EPF1遺伝子およびEPF2遺伝子を欠損した二重変異体のシロイヌナズナ(epf2・epf2二重変異株)を得た。
調製例5において、シロイヌナズナCol−0系統の代わりに調製例21で得られたepf2・epf2二重変異株を用いたことを除き、調製例5と同様の操作を行ない、ストマジェン発現抑制epf2・epf2二重変異株を得た。
ストマジェンと、EPF1またはEPF2との「競争的結合」の可能性を調べるために、epf1変異株またはepf2変異株に対してストマジェン遺伝子の発現を抑制し、「気孔密度」と「非気孔細胞密度(気孔以外の細胞の密度)」という2つの指標を解析した。
調製例5で得られたストマジェン発現抑制株(ストマジェン発現抑制株10)、シロイナズナCol−0系統(CS60000)〔野生株〕または調製例4で得られたストマジェン過剰発現株(ストマジェン過剰発現株10)を短日条件下で9週間生育させた。
ストマジェンをコードするcDNAを、pB2GW7に導入し、ストマジェン発現用ベクターを得た。得られたストマジェン発現用ベクターを用い、文献28に記載の手法に準じて、北海道大学山田哲也博士の下で、ストマジェン過剰発現ダイズを作製した。
実施例7で得られたストマジェン過剰発現ダイズおよびダイズ(カリユタカ)〔野生株〕それぞれの葉を採取した。つぎに、葉の表面を微分干渉顕微鏡〔ツアイス(Zeiss)社製、商品名:Axioskop plus顕微鏡〕を用いて観察し、0.22mm2の正方形の範囲における気孔の数を測定した。そして、気孔密度を算出した。また、統計解析には、統計解析ソフトRを用いた。試験例13において、植物体の種類と気孔密度との関係を調べた結果を図36に示す。図中、レーン1はストマジェン過剰発現ダイズおよびレーン2は野生株を示す。
イネ〔系統「日本晴」〕の種子を、脱塩水5mLが入った容器〔50mL容、グライナー社製〕に播種した後、80μMストマジェン(実施例5で得られた合成ストマジェン)200μLを添加した。そして、種子を22℃で8日間維持した。その後、植物体を、滅菌したB5メディウム中、22℃で生育させた。播種後32日目のイネの第2葉を採取した。そして、試験例1と同様の操作を行なうことにより、前記第2葉を、固定し、透明化した後、気孔を染色した。その後、前記第2葉の裏側表皮を、微分干渉顕微鏡〔ツアイス(Zeiss)社製、商品名:Axioskop plus顕微鏡〕を用いて観察した。対照として、ストマジェンを投与していないイネを用い、前記と同様に操作を行ない、播種後32日目のイネの第2葉の裏側表皮を観察した。試験例14において、合成ストマジェンを投与したイネの第2葉の裏側表皮の微分干渉顕微鏡像を図39(a)および試験例14において、合成ストマジェンを投与していないイネの第2葉の裏側表皮の微分干渉顕微鏡像を図39(b)に示す。図中、枠で囲った部分は気孔を示す。図中、スケールバーは50μmを示す。
ダイズ(カリユタカ)の種子を、培養土を含むポットに播種、発芽させたのち第2葉期まで成育させて、実施例5で得られた合成ストマジェンを、その濃度が1μM、10μMまたは100μMとなるように茎頂に添加した。その後、一週間生育させて、微分干渉顕微鏡〔ツアイス(Zeiss)社製、商品名:Axioskop plus顕微鏡〕を用いて観察し、0.22mm2の正方形の範囲における気孔の数を測定した。そして、気孔密度を算出した。また、統計解析には、統計解析ソフトRを用いた。また、実施例5で得られた合成ストマジェンの代わりに、不活性なポリペプチド(ストマジェンのアミノ酸配列中の6つのシステイン残基がセリンに置換されたポリペプチド)を、その濃度が100μMとなるように添加したことを除き、前記と同様の操作を行ない、気孔密度を算出した。実施例8において、ストマジェン濃度と気孔密度との関係を調べた結果を図40に示す。なお、図中、白三角、白四角および白丸は、それぞれ異なる個体を示す
11Cで標識された二酸化炭素(11CO2)を含む空気を、シロイナズナCol−0系統(ストック番号CS60000)〔野生株〕または調製例5で得られたストマジェン発現抑制株(ストマジェン発現抑制株10)に与えた。その後、ポジトロンイメージング装置〔浜松ホトニクス(株)製、商品名:PETIS〕を用いて、野生株またはストマジェン発現抑制株に取り込まれた11CO2を測定した。試験例15において、野生株またはストマジェン発現抑制株に取り込まれた11CO2を測定した結果を図41に示す。図中、(a)は通常の写真、(b)はポジトロンイメージを示す。
実施例5で得られた化学合成ストマジェンを60℃で5分間(試料番号3)または90℃で5分間(試料番号4)インキュベーションした。また、実施例5で得られた化学合成ストマジェンを凍結乾燥させた(試料番号5)。
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配列番号:8は、P10_prom_Rの配列である。
配列番号:9は、P10_Fの配列である。
配列番号:10は、P10_Rの配列である。
配列番号:11は、EPF1_Fの配列である。
配列番号:12は、EPF1_Rの配列である。
配列番号:13は、GFP-CfusF Bstの配列である。
配列番号:14は、GFP-CfusR Bstの配列である。
配列番号:15は、P-V_Fの配列である。
配列番号:16は、P-V_Rの配列である。
配列番号:17は、Venus_Rの配列である。
配列番号:18は、2Ssp_Fの配列である。
配列番号:19は、2Ssp<--p10mの配列である。
配列番号:20は、2Ssp-->p10mの配列である。
配列番号:21は、P10m_Fの配列である。
配列番号:22は、CACC_amiAの配列である。
配列番号:23は、P10ami1_I miR-sの配列である。
配列番号:24は、P10ami1_II miR-aの配列である。
配列番号:25は、P10ami1_III miR*sの配列である。
配列番号:26は、P10ami1_IV miR*aの配列である。
配列番号:27は、P10ami2_ImiR-sの配列である。
配列番号:28は、P10ami2_IImiR-aの配列である。
配列番号:29は、P10ami2_IIImiR*sの配列である。
配列番号:30は、P10ami2_IVmiR*aの配列である。
配列番号:31は、amiBの配列である。
配列番号:32は、P10_RNAi_Fの配列である。
配列番号:33は、P10_RNAi_Rの配列である。
配列番号:34は、tmm SALK_011958-LPの配列である。
配列番号:35は、SALK_011958-RPの配列である。
配列番号:36は、epf1SALK_137549-LPの配列である。
配列番号:37は、SALK_137549-RPの配列である。
配列番号:38は、epf2SALK_047918-LPの配列である。
配列番号:39は、SALK_047918-RPの配列である。
配列番号:40は、spch SAIL_36_B6 LPの配列である。
配列番号:41は、SAIL_36_B6_RPの配列である。
Claims (6)
- 植物における気孔の数および/または密度を増加させる化合物を含有してなる気孔増加剤であって、
前記化合物が、(I)配列番号:6に示されるアミノ酸配列、
(II)配列番号:6において、1または数個のアミノ酸残基の置換、欠失、付加または挿入を有し、かつ植物における気孔形成を正に制御する性質を少なくとも有するポリペプチドを構成するアミノ酸配列、
(III)配列番号:6に示されるアミノ酸配列に対して、Cost to open gap 11、Cost to extend gap 1、expect value 10、wordsize 3の条件でBLASTアルゴリズムでアライメントし算出した配列同一性が、95%以上であり、かつコードされるポリペプチドが、植物における気孔形成を正に制御する性質を少なくとも有するアミノ酸配列、および
(IV)配列番号:6に示されるアミノ酸配列をコードする核酸の相補鎖核酸とストリンジェントな条件下にハイブリダイズする核酸によりコードされ、かつコードされるポリペプチドが、植物における気孔形成を正に制御する性質を少なくとも有するアミノ酸配列
からなる群より選ばれたアミノ酸配列からなるポリペプチドである、気孔増加剤。 - (I)配列番号:6に示されるアミノ酸配列、
(II)配列番号:6において、1または数個のアミノ酸残基の置換、欠失、付加または挿入を有し、かつ植物における気孔形成を正に制御する性質を少なくとも有するポリペプチドを構成するアミノ酸配列、
(III)配列番号:6に示されるアミノ酸配列に対して、Cost to open gap 11、Cost to extend gap 1、expect value 10、wordsize 3の条件でBLASTアルゴリズムでアライメントし算出した配列同一性が、95%以上であり、かつコードされるポリペプチドが、植物における気孔形成を正に制御する性質を少なくとも有するアミノ酸配列、および
(IV)配列番号:6に示されるアミノ酸配列をコードする核酸の相補鎖核酸とストリンジェントな条件下にハイブリダイズする核酸によりコードされ、かつコードされるポリペプチドが、植物における気孔形成を正に制御する性質を少なくとも有するアミノ酸配列
からなる群より選ばれたアミノ酸配列からなるポリペプチド。 - 植物に、請求項1に記載の気孔増加剤を接触させるか、または植物において、請求項2のポリペプチドを過剰発現させることを特徴とする、植物における気孔の数および/または密度の増加方法。
- 前記植物が維管束植物である、請求項3に記載の植物における気孔の数および/または密度の増加方法。
- 請求項3または4に記載の植物における気孔の数および/または密度の増加方法により得られる植物。
- 植物に、請求項1に記載の気孔増加剤を接触させるか、または植物において、請求項3のポリペプチドを過剰発現させることを特徴とする、植物の収量の増加方法。
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