JP5818003B2 - ヒト型化抗egfr抗体可変領域の高機能性変異体 - Google Patents
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Description
[態様1]配列番号4で示されるアミノ酸配列から成る抗ヒト上皮細胞成長因子受容体1(Her1)抗体528のH鎖のヒト型化可変領域(5H)の変異体、又は、配列番号2で示されるアミノ酸配列から成る抗ヒト上皮細胞成長因子受容体1(Her1)抗体528のL鎖のヒト型化可変領域(5L)の変異体であって、CDR2内に1個〜数個のアミノ酸変異を有することを特徴とする前記変異体。
[態様2]配列番号4で示されるアミノ酸配列から成る抗ヒト上皮細胞成長因子受容体1(Her1)抗体528のH鎖のヒト型化可変領域(5H)の変異体であって、該変異体を含むFv抗体の結合係数(Ka)が抗体528のH鎖のヒト型化可変領域(5H)を含むFv抗体の8〜33倍となるような、前記変異体。
[態様3]5Hの52番目のチロシンがトリプトファンに置換している、態様1又は2記載の変異体。
[態様4]更に、55番目のセリンが置換している、態様3記載の変異体。
[態様5]55番目のセリンがトレオニン、リシン、アルギニン、アスパラギン及びグルタミンから成る群から選択されるアミノ酸に置換している、態様4記載の変異体。
[態様6]更に、63番目のリシン、65番目のリシン、及び/又は66番目のアスパラギンが置換している、態様4又は5記載の変異体。
[態様7]63番目のリシンがグルタミンに置換している、態様6記載の変異体。
[態様8]65番目のリシンがグルタミンに置換している、態様6記載の変異体。
[態様9]66番目のアスパラギンがグルタミン、リシン、又はセリンに置換している、態様6記載の変異体。
[態様10]更に、97番目のアラニンが変異している、態様6記載の変異体。
[態様11]97番目のアラニンがトレオニンに変異している、態様10記載の変異体。
[態様12]配列番号2で示されるアミノ酸配列から成る抗ヒト上皮細胞成長因子受容体1(Her1)抗体528のL鎖のヒト型化可変領域(5L)の変異体であって、該変異体を含むFv抗体の結合係数(Ka)が抗体528のL鎖のヒト型化可変領域(5L)を含むFv抗体の50〜200倍となるような、前記変異体。
[態様13]5Lにおける55番目のリシンがロイシンに、58番目のアスパラギン酸がアルギニンに、及び/又は、60番目のフェニルアラニンがセリン若しくはロイシンに置換している、態様1又は2記載の変異体。
[態様14]態様1〜13のいずれか一項に記載の変異体を構成要素として含む抗体分子。
[態様15]IgG型抗体分子、ヒト型化ダイアボディ型二重特異性抗体、高機能性二重特異性抗体、抗体分子、及び、多量体化低分子抗体から成る群から選択される、態様13記載の抗体分子。
[態様16]抗ヒト上皮細胞成長因子受容体1抗体528のL鎖のヒト型化可変領域(5L)、抗CD3抗体OKT3のL鎖のヒト型化可変領域(OL)、及び、抗CD3抗体OKT3のH鎖のヒト型化可変領域(OH)が、夫々、配列番号2,6及び8で示されるアミノ酸配列から成る、態様14又は15記載の抗体分子。
[態様17]態様14〜16のいずれか一項に記載の抗体分子を構成する一本鎖ポリペプチド。
[態様18]態様1〜13のいずれか一項に記載の変異体、又は、態様16に記載の一本鎖ポリペプチドをコードする核酸分子。
[態様19]態様14〜16のいずれか一項に記載の抗体分子を構成する2種類の一本鎖ポリペプチドを共にコードする核酸分子。
[態様20]態様18又は19記載の核酸分子を含有する複製可能なクローニングベクター又は発現ベクター。
[態様21]共発現ベクターである、態様20記載のベクター。
[態様22]プラスミドベクターである、態様20又は21記載のベクター。
[態様23]態様21ないし22のいずれか一項に記載のベクターで形質転換された宿主細胞。
[態様24]態様14〜16のいずれか一項に記載の抗体分子の製造方法であって、態様21に記載の宿主細胞を培養し、該抗体分子を構成する2種類の一本鎖ポリペプチドを発現させ、該ポリペプチドを回収・精製し、該2種類の一本鎖ポリペプチドを会合させ、形成された抗体分子を分離・回収することから成る、前記方法。
[態様25]原核細胞が大腸菌であり、2種類の一本鎖ポリペプチドを大腸菌の培養培地上清、ペリズマ画分、菌体内可溶性画分、又は、菌体内不溶性画分から回収する、態様24記載の製造方法。
[態様26]態様14〜16のいずれか一項に記載の抗体分子の製造方法であって、態様21記載の共発現ベクターで形質転換された宿主細胞を培養し該抗体分子を構成する2種類の一本鎖ポリペプチドを発現させ、該形質転換菌内でダイアボディ型二重特異性抗体を形成せしめ、形成された二重特異性抗体を分離・回収することから成る、前記方法。
[態様27] 態様14〜16のいずれか一項に記載の抗体分子を有効成分として含有することを特徴とする医薬組成物。
[態様28]腫瘍細胞を排除する、殺傷する、傷害する及び/又は減少せしめるためのものであることを特徴とする態様26記載の医薬組成物。
一方、5Lにおけるアミノ酸変異の例として、55番目のリシンが、例えば、ロイシンに、58番目のアスパラギン酸が、例えば、アルギニンに、及び/又は、60番目のフェニルアラニンがセリン若しくはロイシンに置換する例を挙げることが出来る。
まず、ヒト化型528抗体の結晶構造を分子置換法により決定した。その結果を表1及び図1に示す。こうして得られた構造に基づき、溶媒接触残基に着目、公知の位置指定変異導入法(部位特異的変異導入法)を用いて、配列番号4で示される抗ヒト上皮細胞成長因子受容体1(Her1)抗体528のH鎖のヒト型化可変領域(5H)のCDR内及び近傍に無作為に変異を導入した。それらをファージディスプレイ法に用いて、CHO細胞及びEGFRを発現提示させるように形質転換した該CHO細胞を用いて、夫々、各変異体VHを提示するファージをネガティブ選択及びポジティイブ選択した。得られた各変異体VH(「5.0.0」及び「5.11.0」等で示される)における具体的なアミノ酸変異(下線付記)及び配列番号4で示される抗体528のH鎖のヒト型化可変領域(5H)のアミノ酸(各CDRの位置を含む)を表2及び表3に示す。
これらの変異体Fvを等温滴定型熱量計(ITC)により熱力学的解析を行った。標的抗原である可溶性のEGFRを別途CHO細胞発現系と金属キレートアフィニティクロマトグラフィーによる精製により調製し、測定セルに5μMの濃度で添加し、50μMの変異体Fvを経時的に滴下した。その時の熱量変化から結合のエンタルピー(ΔH)と結合定数(Ka)を算出し、さらにそれぞれの値から自由エネルギー変化(ΔG)と結合エントロピー変化(ΔS)を算出した。その結果を表4に示す。この結果、このような変異体を含むFv抗体の結合係数(Ka)は元の抗体528のH鎖のヒト型化可変領域(5H)を含むFv抗体(h528Fv WT)の8〜33倍にまで増大していることが確認された。
実施例1で作製した各変異体VHを構成要素として含むIgG抗体を以下の要領で作製した。
まず、各変異体VHをヒト型化528 IgG発現ベクターのVH部位と入れ換え、変異体ヒト型化528 IgG発現ベクターを構築した。ヒト胎児腎細胞(HEK)を用いて一過性発現させ、プロテインAカラムクロマトグラフィーにより精製を行った。その結果、精製後の抗体収量は培養液1Lあたり約1mgであった。
更に、実施例1で作製した各変異体VHを構成要素として含むヒト型化ダイアボディ型二重特異性抗体(Ex3)変異体を特許文献1に記載の方法に準じて作製した。その結果、精製後の抗体収量は培養液1Lあたり約1 mgであった。
同様に、実施例1で作製した各変異体VHを構成要素として含む高機能性二重特異性抗体(Ex3−scDb−Fc変異体)を特許文献2に記載の方法に準じて作製した。その結果、精製後の抗体収量は培養液1Lあたり約1 mgであった。
実施例1で作製した各変異体VHを構成要素として含むLH型高機能性二重特異性抗体を以下の要領で製造した。
特許文献2の実施例1に記載の方法(第一〜三の型)に準じて上記各配列及び適当なPCRプライマーを用いてLH型高機能性二重特異性抗体(Ex3-scDb-Fc)用の発現ベクターを作製し、次いで、特許文献2の実施例2に準じてCHO細胞を宿主として用いてEx3 scDb-Fcを調製した。但し、まず、特許文献2の第一の型であるLH型高機能性二重特異性抗体(LH型Ex3 scDb)として、(5LOH)の上流にペプチドリンカーを介して(OL5H)を挿入することによって、(N末側)(OL5H)−(ペプチドリンカー)−(5LOH)(C末側)の構成を有するEx3 scDbを作製し、これに基づきEx3 scDb-Fc変異体LH型を作製した。その結果、精製後の抗体収量は培養液1Lあたり約1mgであった。
各変異体VHを含む一本鎖抗体ペプチドでペプチドリンカーが除去された一本鎖抗体(scFv)から構成される多量体化低分子抗体(二量体)を以下の概要で調製した。
発現ベクターはすでに本発明者等によって構築されているEGFR及びCD3を標的としたヒト型化diabody発現ベクター(pRA-h5HhOL、pRA-hOHh5L:国内特許登録(380790号))を基に作製した。即ち、それぞれのベクターを制限酵素NcoIとEagIで消化後、h5H部位とhOH部位を入れ換えることで、5アミノ酸リンカー(GGGGS)を有するヒト型化528scFv発現ベクターpRA-h5Hh5L(G1)を作製した。C末端側には検出のためのc-mycペプチドタグ、並びに精製のためのHis-tag (Hisx6:ヒスチジン6量体tag)が並列に導入されている。
A-Bプライマーを用いPCR法によりヒト型化5H(h5H)を、C-Dプライマーを用いヒト型化5L(h5L)をそれぞれ増幅後、得られたPCR産物を混合し、さらにA-Dプライマーを用いてPCR増幅を行った。得られたPCR産物を制限酵素NcoIとSacIIで消化し、pRAベクターに挿入することで、リンカーを含まないVH-VL型ヒト型化528scFv発現ベクターpRA-h5Hh5L(HLG0)を作製した。
一方、E-Fプライマーを用いPCR法によりh5Lを、G-Hプライマーを用いh5Hをそれぞれ増幅後、得られたPCR産物を混合し、さらにE-Hプライマーを用いてPCR増幅を行った。得られたPCR産物を制限酵素NcoIとSacIIで消化し、pRAベクターに挿入することで、リンカーを含まないVL-VH型ヒト型化528scFv発現ベクターpRA-h5Lh5H (LHG0)を作製した。
それぞれ、C末端側には検出のためのc-mycペプチドタグ、並びに精製のためのHis-tagが並列に導入されている。尚、元の抗体528のH鎖のヒト型化可変領域(5H)を含む一本鎖抗体(scFv)の塩基配列及びアミノ酸配列を配列番号9及び10で示す。
B:5H-5L-inverse:5'-GGGCTCTGGGTCATCACGATATCCGAGCTCACGGTAACCAGCG-3'〔配列番号12〕
C:5H-5L: 5'-GATATCGTGATGACCCAGAGCCC-3'〔配列番号:13〕
D:5L-SacII: 5'-NNNCCGCGGCGCGTTTAATTTCCACTTT-3'〔配列番号:14〕
E:NcoI-5L: 5'-NNNCCATGGATATTGTGATGACCCAGAG-3'〔配列番号:15〕
F:5L-5H-inverse:5'-CGCTCTGAACCAGTTGCACCTGTTTAATTTCCACTTTGGTGCCCTGGCC-3'〔配列番号:16〕
G:5L-5H: 5'-CAGGTGCAACTGGTTCAGAGCG-3'〔配列番号:17〕
H:5H-SacII: 5'-NNNCCGCGGAGCTCACGGTAACCAGCGT-3'〔配列番号:18〕
実施例2及び3で作製した本発明の各種抗体分子について、MTS assay により、ヒト扁平上皮がん細胞株であるA431細胞(ATCC No.CRL-1555)、及び、ヒト胆がん細胞株であるTFK-1(東北大学加齢医学研究所付属医用細胞資源センター ID:TKG036)の増殖が各種抗体分子によりどれほど阻害されるかを検討した。セルカウントを行い、RPMI(10 % FBS)100μLあたり細胞5×103個になるよう調整し、96穴プレートに100μLずつ分注、37℃で一晩静置した。目的蛋白質を目的濃度になるようにRPMIで希釈、前日準備したプレートに抗体蛋白質を50μLずつ分注し、T-LAK 細胞あるいは末梢血単核球(PBMC)を目的E/T 比になるようにRPMIで希釈し、50μLずつ分注し(E/T 比:effector(T-LAK細胞あるいはPBMC)/target(標的がん細胞)比)、37℃で48時間培養した。プレートの培養液を取り除き、PBS により洗浄、MTS、PMS、RPMIを加え、37℃で30〜60分インキュベートした後、プレートリーダーで490nm の吸光度を測定した。
実施例4で作製した本発明の多量体化低分子抗体について、MTS assay により、ヒト扁平上皮がん細胞株であるA431細胞(ATCC No.CRL-1555)の増殖阻害能を確認した。セルカウントを行い、RPMI(0.5 % FBS)100μLあたり細胞2×103個になるよう調整し、96穴プレートに100μLずつ分注、37℃で一晩静置した。目的蛋白質を目的濃度になるようにRPMIで希釈、前日準備したプレートに蛋白質を200μLずつ分注し、37℃で96時間培養。プレートの培養液を取り除き、PBS により洗浄、MTS、PMS、RPMIを加え、37℃で30〜60分インキュベートした後、プレートリーダーで490nm の吸光度を測定した。
(注) MTS 試薬 (CellTiter 96 AQueous Non-Radioactive Cell Proliferation Assay, Promega社製) 、PMS(CellTiter 96 AQueous Non-Radioactive Cell Proliferation Assay,Promega 社製)
更に、ヒト化型528抗体の結晶構造に基づき、溶媒接触残基に着目、公知の位置指定変異導入法(部位特異的変異導入法)を用いて、配列番号2で示される抗ヒト上皮細胞成長因子受容体1(Her1)抗体528のL鎖のヒト型化可変領域(5L)のCDR内及び近傍に無作為に変異を導入した。
尚、比較として、同様の方法で調製したマウス528Fv(m528Fv), 野生型ヒトFv(h528Fv)及び2HH11(5H変異体5.11.0を含むh528Fv)を試料として用いた。得られた結果から、本発明の各変異体VLと528のH鎖のヒト型化可変領域(VH)は野生型ヒトFv(h528Fv)に較べて結合速度が向上し、解離速度が低下してことが確認された(図10)。
この結果、このような変異体を含むFv抗体の結合係数(Ka)は元の抗体528のL鎖のヒト型化可変領域(5L)を含む野生型ヒトFv(h528Fv)の約50〜200倍に達し、マウスFv抗体(m528Fv)をも凌駕する非常に高い親和性を創出することに成功した。
Claims (20)
- 以下の構成要素を含む抗体分子:
(1)配列番号4で示されるアミノ酸配列から成る抗ヒト上皮細胞成長因子受容体1(Her1)抗体528のH鎖のヒト型化可変領域(5H)の変異体であって、5Hの52番目のチロシンがトリプトファンに置換している、該ヒト型化可変領域(5H)の変異体、及び、
(2)配列番号2で示されるアミノ酸配列から成る抗ヒト上皮細胞成長因子受容体1(Her1)抗体528のL鎖のヒト型化可変領域(5L)、又は、その変異体であって、5Lにおける55番目のリシンがロイシンに、58番目のアスパラギン酸がアルギニンに、及び/又は、60番目のフェニルアラニンがセリン若しくはロイシンに置換している、該ヒト型化可変領域(5L)の変異体。 - 更に、5Hの55番目のセリンがトレオニン、リシン、アルギニン、アスパラギン及びグルタミンから成る群から選択されるアミノ酸に置換している、請求項1記載の抗体分子。
- 更に、5Hにおいて、63番目のリシンがグルタミン、65番目のリシンがグルタミン、及び/又は66番目のアスパラギンがグルタミン、リシン、又はセリンに置換している、請求項2記載の抗体分子。
- 更に、5Hの97番目のアラニンがトレオニンに変異している、請求項3記載の抗体分子。
- 更に、配列番号6で示されるアミノ酸配列から成る抗CD3抗体OKT3のL鎖のヒト型化可変領域(OL)、及び、配列番号8で示されるアミノ酸配列から成る抗CD3抗体OKT3のH鎖のヒト型化可変領域(OH)を構成要素として含む、請求項1ないし4のいずれか一項に記載の抗体分子。
- IgG型抗体分子、又は、一本鎖抗体の多量体である、請求項1〜4記載の抗体分子。
- ヒト型化ダイアボディ型二重特異性抗体、又は、ヒト型化二重特異性抗体である、請求項5記載の抗体分子。
- 請求項1〜7のいずれか一項に記載の抗体分子を構成する、ヒト型化可変領域(5H)の変異体、及び、ヒト型化可変領域(5L)又はその変異体を含む一本鎖ポリペプチド。
- 請求項1〜7のいずれか一項に記載の抗体分子を構成する、ヒト型化可変領域(5H)の変異体を含むポリペプチドとヒト型化可変領域(5L)又はその変異体を含むポリペプチドとから成るポリペプチドの組合せ。
- 請求項8に記載の一本鎖ポリペプチドをコードする核酸分子、又は、請求項9に記載の2種類のポリペプチドの夫々をコードする核酸分子の組み合わせ。
- 請求項9に記載の抗体分子を構成する2種類のポリペプチドを共にコードする核酸分子。
- 請求項10又は11記載の核酸分子を含有する複製可能なクローニングベクター又は発現ベクター。
- 共発現ベクターである、請求項12記載のベクター。
- プラスミドベクターである、請求項12又は13記載のベクター。
- 請求項12ないし14のいずれか一項に記載のベクターで形質転換された宿主細胞。
- 請求項1〜7のいずれか一項に記載の抗体分子の製造方法であって、請求項15に記載の宿主細胞を培養し、該抗体分子を構成するポリペプチドを発現させ、該ポリペプチドを回収・精製し、該ポリペプチドを会合させ、形成された抗体分子を分離・回収することから成る、前記方法。
- 宿主細胞が大腸菌であり、ポリペプチドを大腸菌の培養培地上清、ペリズマ画分、菌体内可溶性画分、又は、菌体内不溶性画分から回収する、請求項16記載の製造方法。
- 請求項7に記載の抗体分子の製造方法であって、請求項13記載の共発現ベクターで形質転換された宿主細胞を培養し該抗体分子を構成する2種類のポリペプチドを発現させ、該形質転換菌内でヒト型化ダイアボディ型二重特異性抗体を形成せしめ、形成された二重特異性抗体を分離・回収することから成る、前記方法。
- 請求項1〜7のいずれか一項に記載の抗体分子を有効成分として含有することを特徴とする医薬組成物。
- 腫瘍細胞を排除する、殺傷する、傷害する及び/又は減少せしめるためのものであることを特徴とする請求項19記載の医薬組成物。
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