JP5377965B2 - 標的化された造影剤および造影剤を標的化するための方法 - Google Patents
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Description
本出願は、米国仮特許出願第60/715493号明細書(2005年、9月9日出願、現在係属中)、米国特許出願第11/530398号明細書(2006年9月8日出願、現在係属中)に基づく優先権を主張し、米国特許出願第11/457370号明細書(2006年7月13日出願、現在係属中)の一部継続出願であり、すべてそのまま参考文献として本明細書に援用される。
他で具体的に示さない限り、本明細書において使用するすべての技術的および科学的用語は、本発明が関連する当該技術分野における当業者によって一般的に理解されるのと同じ意味を有する。本発明の目的のために、以下の用語が規定される。
本発明は、調節された特性を有する新規の診断用造影剤群により、およびさらにより詳細には、組織に蓄積する種類の磁気共鳴造影剤に有用である。これらの新規の造影剤は、(a)タンパク質のような有機ポリマーである足場タンパク質および(b)常磁性および重金属イオンをキレート化することが可能な少なくとも1つの調整された金属イオン結合部位であって、足場タンパク質内の選択フォールディングポケットに取り込まれる、少なくとも1つの調整された金属イオン結合部位を含む。
(a)切断および変性に対する、生理学的環境における安定性;
(b)金属イオン部位の組込みに適切なトポロジー;
(c)磁場に対して最適化された回転相関時間(例えば、1.3〜3Tの磁場で約100ミリ秒)、例えば、より高い磁場アプリケーションをタンパク質の部位を変更することによって、調製することができる;ならびに
(d)タンパク質の緩和率が水交換率によって制限されないような水交換率。
本発明により適切な足場タンパク質は、タンパク質またはアミノ酸を含有する有機ポリマーを含む。このような足場タンパク質は、天然アミノ酸ならびに非天然アミノ酸(例えば、β−アラニン、フェニルグリシン、およびホモアルギニン)の両方を含む。アミノ酸は、L−光学異性体またはD−光学異性体のいずれかであるα−アミノ酸である場合、D−光学異性体が好適であり、当該異性体はタンパク質分解をそれほど受けない。このようなアミノ酸は遺伝子によりコードされない、よく認められるアミノ酸であるが、好ましいアミノ酸はコード可能であるものである。
1)pH変性に対する耐性およびタンパク質分解的切断に対する耐性に関して強力な安定性の提示。
2)タンパク質についての構造的情報の利用可能性。最適化された内圏、二次圏および外圏緩和ならびに金属結合特性を伴う金属結合部位の合理的な設計を可能にする構造的情報がそれほど利用できない場合、構造の推定は、タンパク質の改変を可能にすることができる。
3)生来のコンフォメーションおよびフォールディングの犠牲を伴わない変異の許容性。
4)分子サイズは、特定のアプリケーションに適切である。至適サイズは、特定の診断アプリケーションに依存することができる。例えば、緻密な構造、例えば、11〜30KDaの間の分子量、および約10〜30nsの回転相関時間は、多くの特定の診断アプリケーションについて至適サイズである。さらに、分子サイズは、循環保持時間および組織浸透性を改善することができる。例えば、より強力な生体内腎臓画像および延長された保持時間は、腎癌のような腎臓疾患を診断するための腎臓系のより詳細な撮像を可能にすることができ、また血流および血量のより正確な測定を可能にすることができる。さらに、タンパク質フレームの適切なサイズは、改善された組織浸透性および分子標的化を提供することができ、デンドリマー(dentrimers)、ナノ粒子、および超常磁性粒子のいくつかの大きなサイズの限界となり得る。
5)場合により、足場タンパク質はまた、固有の特性を有することができ、多機能性プローブの構築、および他の蛍光物質の必要性を伴わない分子画像化のためのMRI造影剤の設計を援助するためのツールとしての蛍光の使用を可能にすることができる。
金属イオン結合部位の親和性は、金属イオンの造影剤親和性を変動し得る。具体的には、金属イオン結合部位の親和性および感度は改変されるために、造影剤の緩和能および金属親和性は改変される。好ましくは、金属イオン結合部位は、金属結合親和性、選択性、緩和能、核磁気緩和分散(NMRD)プロファイル、及び水交換率を含む至適画像特性を有する。
(1)金属イオンの他の部分との至適結合特徴に基づいて、金属イオンに対する選択性および親和性を伴う金属イオン結合部位が設計され、そして新規に合理的に設計される、コンピュータによる設計手法;
(2)同定された結合部位の一次、二次、三次、および/または四次構造を変動することによって、金属イオンに対する選択性および親和性を伴う金属イオン結合部位が設計され、選択的に構築される接合方法;ならびに
(3)公知であるかまたはその後開発される他の方法、および公知であるかまたはその後開発される方法との組み合わせ。
コンピュータによる設計手法は、新規に金属イオン結合部位を設計することを重点的に取り扱う。この設計手法は、至適結合部位を構築し、設計するためのアルゴリズムを使用することを重点的に取り扱う。好ましくは、コンピュータ計算設計手法は、例えば、部位の配位構造、配位殻の水の数、リガンド型、および電荷を変動することによって、至適結合部位を作製するために使用される。
(1)金属イオン結合部位の構造的、配位、および/または三次元構造もしくはモデルを有する1つもしくはそれ以上のデータベースにアクセスすること、あるいは他の金属結合部位に対する配列相同性に基づくモデル構造を作成すること;
(2)構造データの部分から1つ以上の予備的金属イオン結合部位を作製すること;
(3)例えば、配位構造に基づいて、作製された予備的結合部位から1つもしくはそれ以上の適切な金属イオン結合部位を合理的に選択すること;ならびに
(4)選択された金属イオン結合部位を調整および調節することによって、金属イオン結合部位を作製すること。
グラフト化方法は、同定された結合部位の一次、二次、三次、および/または四次構造を改変することによって、金属イオン結合部位を設計および構築することを重点的に取り扱う。結合部位の構造を選択的に設計することによって、タンパク質を大幅に変性することなく、足場タンパク質、例えば、CD2または蛍光タンパク質に設計可能な金属イオン結合部位を得ることが可能である。グラフト化方法を使用して、ある金属イオンより別の金属イオンに対してより強力に優先する結合部位が実現可能である。このような改変は、改善されたコントラスト能力を可能にする。
金属イオンキレート化または結合は、公知またはその後開発される方法によって、開発することができる。このような方法は、当該技術分野において容易に利用可能であるタンパク質設計方法であって、存在する金属結合部位を改変して、金属結合特異性および力学的特性を変更することを含む。このような方法はまた、タンパク質リガンド残基に存在する結合部位を改変するための、またはタンパク質−造影剤と他の分子とを融合するための技術であって、他の分子/非天然アミノ酸もしくは炭水化物もしくはリン酸を含む補欠分子族を伴う金属結合部位の形成を含む。タンパク質設計のためまたは設計適切方法のための例示的な方法もまた、両方ともそれらの全体が参考として援用される、バロンデア D.P.(Barondeau DP.)およびゲッゾフ E.D.(Getzoff E.D.)、Structural Insights into Protein−Metal Ion Partnerships、Current Opinion in Chemical Biology、2004年、14:7;ならびにルー,Y(Lu,Y)、Design and Engineering of Metalloproteins Containing Unnatural Amino Acids or Non−Native Metal−Containing Cofactors、Current Opinion in Chemical Biology、2005年中に開示されている。
金属イオン結合部位は、その二次構造を実質的に損なうことなく、足場タンパク質の多数の部位に選択的に挿入される。CD2タンパク質、蛍光タンパク質(例えば、GFP、YFP、CFP、およびRFP)のようなタンパク質における組み込み部位を同定するための多くの方法が当該分野において公知であり、例えば、部位特異的変異、挿入変異、および欠失変異を含む。以下および実施例において例示されるものを含む他の方法も公知であるか、または当該分野における当業者により容易に確かめられる。
本発明により有用な標的部分は、撮像しようとする部位における造影剤の濃度を増加する、造影剤をタンパク質または他の標的に結合させる配列を含む。本発明に有用な特定の標的部分は、標的の性質および結合の特定の要件に依存する。有用な標的部分の例として、薬物、脂肪親和性または両親媒性有機分子、ポルフィリン、受容体リガンド、ステロイド、脂質、ホルモン、ペプチド、オリゴヌクレオチド(DNA、RNAもしくはそれらの化学修飾されたバージョン)、炭水化物あるいは撮像することが所望される特定の組織において十分に高い親和性で1つもしくはそれ以上の成分に結合することが公知である他の生体分子または物質が挙げられる。所定の標的部分は、他の標的部分よりも標的に対するより高い親和性を有することができることが想定される。
所定の実施例の造影剤は、標的部分が足場タンパク質に付着される任意のリンカーを含むことができる。好ましくは、リンカーは、単一または複数の結合によって共有結合する1〜30個の炭素原子を含む任意の小さなサブユニットであり、ここで、10個までの炭素原子がO、N、P、S、F、およびClで置換される。リンカーは、IEMを足場に接続するように機能する。リンカーの例として、カルボニル、エーテル、アミド、アミン、尿素、チオエーテル、アリール、リン酸、スルホンアミドなどのような官能基で置換される直鎖または分岐したアルカン、アルケン、またはアルキンを含む。所定の実施態様の好ましいリンカーは、2つもしくはそれ以上の官能性化学基を含み、それらのうち1つは足場に付着され、他のものはIEMに付着される。通常C末端でのフォールドがより少ない短いペプチドフラグメントが好まし。Fまたはアフィボディー(affibody)のようなフォールドされたドメインでは、リンカーは、タンパク質造影剤のN末端に配置される。リンカーは、造影部分および標的部分の両方がそれらの機能的特性を回復することを確実にするのに役立つように、可動性であり得る。
金属イオンは原子およびイオンであって、タンパク質またはペプチドに結合することができるそれぞれの同位元素および放射性同位元素を含む。金属イオンは可逆的または不可逆的に結合し、またこのような結合は、共有結合的または非共有結合的である。Gd3+は、MRI造影剤のための例示的な金属イオンとして本発明の好ましい実施態様において使用される一方、本発明による金属イオンは、常磁性金属イオン、遷移金属イオン、およびランタノイド系イオンを含む金属イオンを含むがこれらに限定されないことが理解される。例示的な金属イオンとして、マグネシウム、カルシウム、スカンジウム、チタン、マンガン、鉄、ホウ素、クロム、コバルト、ニッケル、銅(cooper)、亜鉛、ガリウム、ストロンチウム、イットリウム、ストロンチウム、テクネチウム、ルテニウム、インジウム、ハフニウム、タングステン、レニウム、オスミウム、およびビスマスのイオン、同位元素、ならびに/または放射性同位元素形態が挙げられるが、これらに限定されない。また、本発明による金属の放射性同位元素を使用することも可能である。常磁性金属イオンは、本発明による使用に好ましい金属イオンである。
本発明に従って調製された造影剤は、多くの従来のMRIおよび光学的造影剤と同じ様式で使用することができる。組成物は、ヒトまたは動物モデル系への静脈内投与に適合する薬学的組成物として、常法に従って、処方される。
本実施例は、ガストリン受容体ペプチド(GRP)受容体を伴う造影剤が癌細胞に結合することを実証する。3つの細胞系統におけるELISAアッセイは、ガストリン受容体ペプチド(GNQWAVGHLM)の標的部分を伴う例示的な造影剤CD2.CA1.CD2−Bom(以下を参照のこと)が、ガストリン受容体ペプチド受容体(GRPR)を発現する癌細胞に標的化されることを示している。具体的には、ELISAアッセイを、3つの細胞系統、即ち、PC−3細胞系統、SW620細胞系統、およびHCT116細胞系統に対して実施した。PC−3細胞系統およびSW620細胞系統は両方ともGRPR細胞を発現するが、SW620細胞系統はPC−3細胞系統よりGRPRを発現しない。HCT116細胞系統は、GRPRをほとんど発現せず、対照群とした。
本実施例は、GRPに連結した造影剤が受容体仲介エンドサイトーシスを起こすことを示す。造影タンパク質GST−CA1.CD2−BomのGRPR仲介内在化が観察された。造影剤の内在化は、局所Gd3+濃度を顕著に増加させた。45分間〜1時間の間後、ほとんどのGST−CA1.CD2−Bomが、受容体仲介エンドサイトーシスを介して内在化された。内在化されたGST−CA1.CD2−Bomは、膜に付着したサイトゾル側に対して蓄積するようである。しかし、GST−CA1.CD2−Bomのエンドサイトーシスは、30分後、有意なレベルでは生じなかったことが観察されている。
本実施例は、標的部分を伴う造影剤が有意な細胞障害性を示さなかったことを示す。当該技術分野において公知の実験手順によるMTTアッセイにより、細胞系統SW620、SW480およびHEK293で、設計された造影剤の細胞障害性ついて調べた。簡単に説明すると、試験細胞を、48時間、Gd3+(50μMまでの濃度を伴う)の有無で、設計された造影剤と共にインキュベートした。次いで、細胞培養培地をインキュベーションから取り出した。次いで、細胞生存率を、MTTアッセイによって分析した。野生型(w.t.)CD2およびCA1.CD2タンパク質で処置したHEK293細胞において、生存率の僅かな減少が観察された。最大50μMまでの濃度で設計した造影剤で処置した試験したすべての細胞において、有意な毒性は観察されなかった(図5を参照のこと)。
設計されたタンパク質に結合する細胞のMR撮像
PC−3、SW480、およびHCT116のような3つの同じ細胞系統で、MR画像解析を行うことができる。PC−3細胞は、懸濁液において増殖させることができる。SW480およびHCT116細胞は懸濁液において増殖させることができないため、これらの細胞を、ペトリ皿において、7ml培地あたり4×106細胞の密度で播種することができる。異なる濃度のタンパク質造影剤を伴ういくらかのペトリ皿を、それぞれの画像化実験に供する(seed)ことができる。野生型CD2のような非造影タンパク質は、負の対照として使用することができ、蛍光プローブによって誘発されるGRPペプチドは、正の対照として使用することができる。異なる時間点におけるインキュベーション後、細胞をペレット化することができる。細胞を5mlのPBSで3回洗浄し、200μlのPBSに回収することができる。細胞を800gで5分間、遠心分離して、上清を取り出すことができる。
本実験は、本発明に従って、標的化されることが可能な例示的な造影剤を示す。作製した標的化された造影剤の例を配列番号1〜13に示す。
本実施例は、蛍光タンパク質から誘導される多機能性プローブが、特定の位置に指向され得ることを実証する。図7は、例示的なプローブ(EGFP−CA1.CD2−a−Bom10)が、標的化されたマーカー(ボンベシン)を有する細胞に指向され得ることを示す。例えば、配列番号12および13を参照のこと。
Claims (5)
- a)CD2タンパク質又は緑色蛍光タンパク質由来の、金属イオンキレート部位を有する造影タンパク質と、
b)ボンベシン由来の標的部分であって、下記アミノ酸配列:
GNQWAVGHLM
を含む標的部分と
を含み、前記少なくとも1つの標的部分が、前記造影タンパク質に作動可能に連結しているかまたは取り込まれている、造影剤。 - 前記金属イオンが、常磁性金属イオンである、請求項1に記載の造影剤。
- 前記常磁性金属イオンがGd(III)、Mn(II)、Fe(II)、Fe(III)、Co(II)、Co(III)、及びNi(III)からなる群から選択される、請求項2に記載の造影剤。
- 前記造影タンパク質が磁気共鳴画像の撮像に使用される、請求項1〜3のいずれか1項に記載の造影剤。
- 前記標的部分が、特定の細胞においてエンドサイトーシスを誘導する、請求項1〜4のいずれか1項に記載の造影剤。
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