JP5273740B2 - p53の発現促進方法およびそれに用いるp53発現促進剤 - Google Patents
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Description
(A1)vegf−A遺伝子のエキソン1から転写されたRNAを分解する、siRNA、リボヌクレアーゼで分解されることによりsiRNAを遊離するsiRNA前駆体、アンチセンスおよびリボザイムからなる群から選択された少なくとも一つの結合阻害剤
(A2)vegf−A遺伝子のエキソン1からのRNAの転写を阻害する、siRNA、リボヌクレアーゼで分解されることによりsiRNAを遊離するsiRNA前駆体、アンチセンス、リボザイムおよびデコイ核酸からなる群から選択された少なくとも一つの結合阻害剤
(A3)vegf−A遺伝子のエキソン1から転写されたRNAに結合する、p53遺伝子から転写されたmRNAとは別の核酸を含む結合阻害剤
(A4)前記(A1)〜(A3)からなる群から選択された少なくとも一つの結合阻害剤をコードするDNAが挿入された発現ベクターを含む結合阻害剤
(A) 候補物質の存在下、本発明のp53mRNA結合剤と、本発明のvegf−A RNA結合剤とを接触させる工程
(B) 前記候補物質による、前記p53mRNA結合剤と前記vegf−A RNA結合剤との結合の阻害を検出する工程
(C) 前記p53mRNA結合剤と前記vegf−A RNA結合剤との結合を阻害した候補物質を、p53発現促進剤として選択する工程。
本発明のp53発現促進方法は、前述のように、細胞におけるp53遺伝子の発現を促進する方法であって、vegf−A遺伝子のエキソン1から転写されるRNAと、p53遺伝子から転写されるmRNAとの結合を阻害することにより、p53遺伝子の発現を促進することを特徴とする。この結合阻害の工程を、以下、(a)工程ともいう。
(a1)vegf−A遺伝子のエキソン1から転写されたRNAを分解する工程
(a2)vegf−A遺伝子のエキソン1からのRNAの転写を阻害する工程
(a3)vegf−A遺伝子のエキソン1から転写されたRNAに、p53遺伝子から転写されたmRNAとは別の核酸を結合させることで、前記RNAとp53遺伝子から転写されたmRNAとの結合を阻害する工程
(1)配列番号1における600番目−879番目の配列からなるRNA
(2)配列番号1における659番目−879番目の配列からなるRNA
(3)配列番号1における659番目−780番目の配列からなるRNA
(4)配列番号1における659番目−752番目の配列からなるRNA
(5)配列番号1における659番目−745番目の配列からなるRNA
(6)配列番号1における694番目−714番目の配列からなるRNA
(7)配列番号1における693番目−714番目の配列からなるRNA
(8)配列番号1における691番目−703番目の配列からなるRNA
(9)配列番号1における711番目−723番目の配列からなるRNA
(10)配列番号1における16番目−780番目の配列からなるRNA
(11)配列番号1における659番目−917番目の配列からなるRNA
(12)配列番号1における526番目−1104番目の配列からなるRNA
(13)配列番号45における526番目−1216番目の配列からなるRNA
(14)vegf mRNAにおける5’UTR RNA
(15)vegf mRNAにおけるエキソン1 RNA
(16)vegf mRNA
(17)前記(1)〜(16)のRNAにおいて、1若しくは数個の塩基が、置換、欠失、挿入または付加された塩基配列からなり、且つ、p53の発現を抑制する機能を有するRNA、または、p53mRNAと結合する機能(もしくは、ハイブリッドを形成する機能)を有するRNA
本発明のp53発現促進剤は、例えば、前述のように、vegf−A遺伝子のエキソン1から転写されるRNAと、p53遺伝子から転写されるmRNAとの結合を阻害する、下記(A1)〜(A4)からなる群から選択された少なくとも一つの結合阻害剤を含むことを特徴とする。本発明のp53発現促進剤は、「p53発現回復剤」または「p53発現維持剤」ということもできる。
(A1)vegf−A遺伝子のエキソン1から転写されたRNAを分解する、siRNA、リボヌクレアーゼで分解されることによりsiRNAを遊離するsiRNA前駆体、アンチセンスおよびリボザイムからなる群から選択された少なくとも一つの結合阻害剤
(A2)vegf−A遺伝子のエキソン1からのRNAの転写を阻害する、siRNA、リボヌクレアーゼで分解されることによりsiRNAを遊離するsiRNA前駆体、アンチセンス、リボザイムおよびデコイ核酸からなる群から選択された少なくとも一つの結合阻害剤
(A3)vegf−A遺伝子のエキソン1から転写されたRNAに結合する、p53遺伝子から転写されたmRNAとは別の核酸を含む結合阻害剤
(A4)前記(A1)〜(A3)からなる群から選択された少なくとも一つの結合阻害剤をコードするDNAが挿入された発現ベクターを含む結合阻害剤
(A1)vegf−A遺伝子のエキソン1から転写されたRNAを分解する、siRNA、リボヌクレアーゼで分解されることによりsiRNAを遊離するsiRNA前駆体、アンチセンスおよびリボザイムからなる群から選択された少なくとも一つの結合阻害剤
#1 5’−agcaaggcaaggcuccaaugcnn−3’(配列番号4)
配列番号1における塩基番号1062-1082に相補的
#2 5’−agagcagcaaggcaaggcuccnn−3’(配列番号6)
配列番号1における塩基番号1067-1087に相補的
#3 5’−cacgaccgcuuaccuuggcaunn−3’(配列番号8)
配列番号45における塩基番号1097-1117に相補的
#4 5’−uagcacuucucgcggcuccgcnn−3’(配列番号10)
配列番号1における塩基番号728-748に相補的
#5 5’−cgagcuagcacuucucgcggcnn−3’(配列番号12)
配列番号1における塩基番号733-753に相補的
#6 5’−uggacgaaaaguuucagugcgacgcnn−3’(配列番号14)
配列番号1における塩基番号644-668に相補的
#7 5’−agaaguuggacgaaaaguuucagugnn−3’(配列番号16)
配列番号1における塩基番号650-674に相補的
#8 5’−gaaguuggacgaaaaguuucagugcnn−3’(配列番号18)
配列番号1における塩基番号649-673に相補的
#9 5’−ggacgaaaaguuucagugcgacgccnn−3’(配列番号20)
配列番号1における塩基番号643-667に相補的
#10 5’−uuggacgaaaaguuucagugcgacgnn−3’(配列番号22)
配列番号1における塩基番号645-669に相補的
#11 5’−agaaguuggacgaaaaguuucagugnn−3’(配列番号61)
配列番号1における塩基番号650-674に相補的
#12 5’−aguuucagugcgacgccgcgagcccnn−3’(配列番号63)
配列番号1における塩基番号635-659相補的
#13 5’−gaagcgagaacagcccagaaguuggnn−3’(配列番号65)
配列番号1における塩基番号666-690に相補的
#14 5’−agcaaggcaaggcuccaaugcacccnn−3’(配列番号67)
配列番号1における塩基番号1058-1082に相補的
#15 5’−agagcagcaaggcaaggcuccaaugnn−3’(配列番号69)
配列番号1における塩基番号1063-1087に相補的
#16 5’−cgagcuagcacuucucgcggcuccgnn−3’(配列番号71)
配列番号1における塩基番号729-753に相補的
#17 5’−cgcggaccacggcuccuccgaagcgnn−3’(配列番号73)
配列番号1における塩基番号685-709に相補的
siRNA#1
gu or ca
センス 5’− gcauugga cuugccuugcunn−3’(配列番号3)
アンチセンス 3’−nncguaaccucggaacggaacga−5’ (配列番号4)
ac or gu
siRNA#2
gu or ca
センス 5’− ggagccuug uugcugcucunn−3’(配列番号5)
アンチセンス 3’−nnccucggaacggaacgacgaga−5’ (配列番号6)
ac or gu
siRNA#3
gu or ca
センス 5’− augccaag aagcggucgugnn−3’(配列番号7)
アンチセンス 3’−nnuacgguuccauucgccagcac−5’ (配列番号8)
ac or gu
siRNA#4
gu or ca
センス 5’− gcggagccg agaagugcuann−3’(配列番号9)
アンチセンス 3’−nncgccucggcgcucuucacgau−5’ (配列番号10)
ac or gu
siRNA#5
gu or ca
センス 5’− gccgcgag gugcuagcucgnn−3’(配列番号11)
アンチセンス 3’−nncggcgcucuucacgaucgagc−5’ (配列番号12)
ac or gu
siRNA#6
ag
センス 5’− gcgucgcacugaaacuuuucguccann−3’(配列番号13)
アンチセンス 3’−nncgcagcgugacuuugaaaagcaggu −5’(配列番号14)
ua
siRNA#7
ag
センス 5’− cacugaaacuuuucguccaacuucunn−3’(配列番号15)
アンチセンス 3’−nngugacuuugaaaagcagguugaaga −5’(配列番号16)
ua
siRNA#8
ag
センス 5’− gcacugaaacuuuucguccaacuucnn−3’(配列番号17)
アンチセンス 3’−nncgugacuuugaaaagcagguugaag −5’(配列番号18)
ua
siRNA#9
ag
センス 5’− ggcgucgcacugaaacuuuucguccnn−3’(配列番号19)
アンチセンス 3’−nnccgcagcgugacuuugaaaagcagg −5’(配列番号20)
ua
siRNA#10
ag
センス 5’− cgucgcacugaaacuuuucguccaann−3’(配列番号21)
アンチセンス 3’−nngcagcgugacuuugaaaagcagguu −5’(配列番号22)
ua
siRNA#11
センス 5’− cacugaaacuuuucguccaacuucunn−3’(配列番号60)
アンチセンス 3’−nngugacuuugaaaagcagguugaaga −5’(配列番号61)
siRNA#12
センス 5’− gggcucgcggcgucgcacugaaacunn−3’(配列番号62)
アンチセンス 3’−nncccgagcgccgcagcgugacuuuga −5’(配列番号63)
siRNA#13
センス 5’− ccaacuucugggcuguucucgcuucnn−3’(配列番号64)
アンチセンス 3’−nngguugaagacccgacaagagcgaag −5’(配列番号65)
siRNA#14
センス 5’− gggugcauuggagccuugccuugcunn−3’(配列番号66)
アンチセンス 3’−nncccacguaaccucggaacggaacga −5’(配列番号67)
siRNA#15
センス 5’− cauuggagccuugccuugcugcucunn−3’(配列番号68)
アンチセンス 3’−nnguaaccucggaacggaacgacgaga −5’(配列番号69)
siRNA#16
センス 5’− cggagccgcgagaagugcuagcucgnn−3’(配列番号70)
アンチセンス 3’−nngccucggcgcucuucacgaucgagc −5’(配列番号71)
siRNA#17
センス 5’− cgcuucggaggagccgugguccgcgnn−3’(配列番号72)
アンチセンス 3’−nngcgaagccuccucggcaccaggcgc −3’(配列番号73)
(A2)vegf−A遺伝子のエキソン1からのRNAの転写を阻害する、siRNA、リボヌクレアーゼで分解されることによりsiRNAを遊離するsiRNA前駆体、アンチセンス、リボザイムおよびデコイ核酸からなる群から選択された少なくとも一つの結合阻害剤
(A3)vegf−A遺伝子のエキソン1から転写されたRNAに結合する、p53遺伝子から転写されたmRNAとは別の核酸(デコイ核酸)からなる結合阻害剤
(D1)配列番号2における462番目−481番目の配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D2)配列番号2における462番目−482番目の配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D3)配列番号2における462番目−491番目の配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D4)配列番号2における462番目−505番目の配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D5)配列番号2における252番目−551番目の配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D6)配列番号1における694番目−714番目の配列に相補的な配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D7)配列番号1における693番目−714番目の配列に相補的な配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
5’-ccccgcgcggaccacggctcct-3’(配列番号74)
(D8)前記(D1)〜(D7)からなる群から選択された少なくとも一つの核酸において、1若しくは数個の塩基が、置換、欠失、挿入または付加された塩基配列からなり、かつ、vegf−A遺伝子のエキソン1から転写されたRNAに結合可能である核酸
(A4)前記(A1)〜(A3)からなる群から選択された少なくとも一つの結合阻害剤をコードするDNAが挿入された発現ベクターからなる結合阻害剤
本発明のアポトーシス促進方法は、細胞のアポトーシスを促進する方法であって、本発明のp53発現促進方法により、細胞内におけるp53の発現を促進することを特徴とする。
本発明の抗がん剤感受性の亢進方法は、抗がん剤に対する細胞の感受性を亢進する方法であって、本発明のp53発現促進方法により、前記細胞におけるp53の発現を促進させることを特徴とする。本発明の亢進方法は、例えば、抗がん剤による処理に先立って、目的の細胞に、本発明のp53発現促進方法を施せばよく、その他の工程は、何ら制限されない。このような処理を行うことによって、細胞の抗がん剤に対する感受性を亢進することができる。
本発明のがんの治療方法は、生体内のがん細胞に本発明のp53発現促進剤を投与する工程を含む。前記p53発現促進剤の投与対象は、特に制限されないが、例えば、ヒト、ヒトを除く哺乳類等の動物があげられる。
本発明のp53mRNA結合剤は、p53mRNAに結合可能な結合剤であって、核酸を含み、前記核酸が、配列番号1に示すvegf−A mRNAにおける694番目−714番目の配列からなるRNAを含むことを特徴とする。
(1)配列番号1における600番目−879番目の配列からなるRNA
(2)配列番号1における659番目−879番目の配列からなるRNA
(3)配列番号1における659番目−780番目の配列からなるRNA
(4)配列番号1における659番目−752番目の配列からなるRNA
(5)配列番号1における659番目−745番目の配列からなるRNA
(6)配列番号1における694番目−714番目の配列からなるRNA
(7)配列番号1における693番目−714番目の配列からなるRNA
(8)配列番号1における691番目−703番目の配列からなるRNA
(9)配列番号1における711番目−723番目の配列からなるRNA
(10)配列番号1における16番目−780番目の配列からなるRNA
(11)配列番号1における659番目−917番目の配列からなるRNA
(12)配列番号1における526番目−1104番目の配列からなるRNA
(13)配列番号45における526番目−1216番目の配列からなるRNA
(14)vegf mRNAにおける5’UTR RNA
(15)vegf mRNAにおけるエキソン1 RNA
(16)vegf mRNA
(17)前記(1)〜(16)のRNAにおいて、1若しくは数個の塩基が、置換、欠失、挿入または付加された塩基配列からなり、且つ、p53の発現を抑制する機能を有するRNA、または、p53mRNAと結合する機能(もしくは、ハイブリッドを形成する機能)を有するRNA
本発明のvegf−A mRNA結合剤は、vegf−A mRNAに結合可能な結合剤であって、核酸を含み、前記核酸が、配列番号2に示すp53mRNAにおける462番目−481番目の配列からなるRNAを含むことを特徴とする。
(I)配列番号2における462番目−481番目の配列からなるRNA
(II)配列番号2における462番目−482番目の配列からなるRNA
(III)配列番号2における462番目−491番目の配列からなるRNA
(IV)配列番号2における462番目−505番目の配列からなるRNA
(V)配列番号2における252番目−551番目の配列からなるRNA
(VI)前記(I)〜(V)からなる群から選択された少なくとも一つのRNAにおいて、1若しくは数個の塩基が、置換、欠失、挿入または付加された塩基配列からなり、かつ、vegf−Aのエキソン1から転写されたRNAに結合する機能を有するRNA
本発明のスクリーニング方法は、p53の発現を促進する発現促進剤のスクリーニング方法であって、下記(A)工程〜(C)工程を有することを特徴とする。
(A) 候補物質の存在下、本発明のp53mRNA結合剤と、本発明のvegf−A RNA結合剤とを接触させる工程
(B) 前記候補物質による、前記p53mRNA結合剤とvegf−A RNA結合剤との結合の阻害を検出する工程
(C) 前記p53mRNA結合剤とvegf−A RNA結合剤との結合を阻害した候補物質を、p53発現促進剤として選択する工程。
ヒト大腸がんHCT116細胞(親細胞、野生型p53)、ヒト大腸がんp53欠損HCT116細胞(p53-KO HCT116)、HT−29細胞およびSW480細胞;ヒト肝臓がんHepG2細胞、Hep3B細胞およびHLE細胞;ヒト胃がんAGS細胞;および、ヒト正常皮膚繊維芽細胞を使用した。これらの細胞は、10%のウシ胎児血清および/または抗生物質を含む、McCoy’s 5A培地またはDulbecco’s改変Eagle’s(DMEM)培地を使用した。
細胞への各種ベクターのトランスフェクションは、JetPEI transfection reagent(商品名、Polyplus−transfection社製)を用いて、使用説明書に従って行った。
目的細胞において、vegf mRNAに対する下記#1〜#5のsiRNAを発現させるために、各種発現ベクターを作成した。以下、これらのsiRNAをvegf siRNA、これらのsiRNAを発現するベクターをvegf siRNAベクターともいう。なお、siRNAの発現には、市販のsiRNA発現系(Invitrogen社製)を応用した。
目的の細胞を各種抗がん剤で処理した後、トリプシン/EDTAとインキュベートして、細胞懸濁液を調製した。この細胞懸濁液を遠心分離し、上清を除いた後、3.7%ホルムアルデヒド、0.5%Nonidet P40および10μg/mL Hoechst33258(Invitrogen社)を含むPBS溶液で固定および染色した。染色された核を蛍光顕微鏡で観察し、分断化した核を数えてスコア化した。一回の測定において、最小300個の細胞についてカウントを行った。
評価対象の細胞を、in situ Cell Death Detection kit(Roche Diagnostics社製)を用いて、TUNEL染色法により評価した。TUNEL陽性細胞は、顕微鏡で観察し、アポトーシス陽性細胞の割合(%)を算出した。一回の測定において、最小300個の細胞についてカウントを行った。
ウェスタンイムノブロッティングは、Huez, I. et al. Mol. Endocrinol. 15 2197-2210 (2001)、または、Masuda, K., et al. PLoS Med. 5, e94 (2008)に従って行った。一次抗体としては、抗p53抗体(DO−1またはFL−393、Santa Cruz Biotechnology社製)、抗β−actin(cloneAC−15、Sigma社製)、抗HA(Y−11、Santa Cruz Biotechnology社製)、前記Huezら(2001)に記載の抗L−VEGF(ポリクローナル抗L−VEGF抗体)を用いた。
トータルRNAは、グアニジンチオシアネート法により調製した。以下に示す各種cDNAを鋳型として、下記アンチセンスプライマー、クレノウフラグメント(New England BioLabs社製)および[α−32P]dCTPを用いて、標識化cDNAを作製した。得られた標識化cDNAを、ノーザンブロッティング用のプローブとした。
vegf mRNA用プローブ1
鋳型:ヒトvegf エキソン1−エキソン5のcDNA
アンチセンスプライマー:
5’−gtcttgctctatctttctttggtctgc−3’(配列番号47)
5’−catctctcctatgtg−3’(配列番号48)
5’−tccaggccctcgtca−3’(配列番号49)
vegf mRNA用プローブ2(実施例B用)
鋳型:ヒトvegf エキソン2−5のcDNA
アンチセンスプライマー:
5’−ttgtcttgctctatctttctttg−3’(配列番号75)
vegf IresRNA用プローブ
鋳型:ヒトvegf IresRNA(配列番号1の600−879)のcDNA
アンチセンスプライマー:
5’−gcgcacaccgccgcctcacccgtccatgagcccgg−3’(配列番号76)
p53mRNAおよび分解p53mRNA用プローブ1
鋳型:ヒトp53 全長cDNA
アンチセンスプライマー:
5’−tcagtctgagtc−3’(配列番号50)
5’−gcccacggatct−3’(配列番号51)
5’−tgatggtgagga−3’(配列番号52)
5’−cctcacaacctc−3’(配列番号53)
5’−aagatgacaggg−3’(配列番号54)
p53mRNA用プローブ2(実施例B用)
鋳型:ヒトp53 全長cDNA
アンチセンスプライマー:
5’−ttaaaagctttcagtctgagtcaggc−3’(配列番号77)
vegf−YFP mRNAおよびYFP mRNA用プローブ
鋳型:YFP cDNA(Clontech社製)
アンチセンスプライマー:
5’−ttgatcctagcagaagcaca−3’(配列番号55)
noxa mRNA用アンチセンスプローブ (配列番号56)
5’−gctctgctggagcccgcgcggggctcggttgagcgttcttgcgcg−3’
puma mRNA用アンチセンスプローブ (配列番号57)
5’−ccctctacgggctccggggagctgccctcctggcgtgcgcggg−3’
bax mRNA用アンチセンスプローブ (配列番号58)
5’−ggtggacgcatcctgaggcaccgggtccagggccagctcgggtg−3’
p21 mRNA用アンチセンスプローブ (配列番号59)
5’−ggcaggccttgctgccgcatgggttctgacggacatccccagccggttctgacat−3’
トータルRNA1μgから、SuperScriptII RNaseH(−) reverse transcriptase(Invitrogen社製)によりcDNAを合成し、前記cDNAを鋳型として、増幅目的の核酸配列に対するプライマーを用いてPCRを行った。増幅ならびにPCR産物の定量は、Applied Biosystems 7500 (Applied Biosystems社製)を用いて、メーカー推奨の方法で行った。
vegf mRNA用フォワードプライマー(配列番号78)
5’-gagccttgccttgctgctctac-3’
vegf mRNA用リバースプライマー(配列番号79)
5’-caccagggtctcgattggatg -3
p53mRNA用フォワードプライマー1(配列番号80)
5’-ctttccacgacggtgaca-3’
p53mRNA用リバースプライマー1(配列番号81)
5’-tcctccatggcagtgacc-3
bax mRNA用フォワードプライマー(配列番号82)
5’-atgttttctgacggcaacttc-3’
bax mRNA用リバースプライマー(配列番号83)
5’-atcagttccggcaccttg-3’
noxa mRNA用フォワードプライマー(配列番号84)
5’-gagatgcctgggaagaagg-3’
noxa mRNA用リバースプライマー(配列番号85)
5’-ttgagtagcacactcgacttcc-3’
p53欠損HCT116細胞に、pcDNA3.1をベースとし且つ前記ベクター配列由来のT7配列を有する各種発現ベクターと、pCMV−neo−Bamをベースとし且つ前記ベクター配列由来のT7配列を有さないp53発現ベクターとを、共導入した。共導入の12時間後、細胞をPBSで2回洗浄し、bufferAで細胞を溶解させた。前記bufferAの組成は、10mmol/L HEPES(pH7.4)、60mmol/L KCl、3mmol/L MgCl2、0.1% NP−40、1mmol/L DTT、10mmol/L ribonucleoside vanadyl complexとした。得られた細胞抽出液を、ビオチンタグの付いたアンチT7プローブとインキュベートした。前記アンチT7プローブと結合した複合体を、ストレプトアビジンでコートした磁性ビーズDynabeads M−270 streptavidin(Invitrogen社製)を用いて沈降させた。前記沈降物から回収した全RNAを、DNaseI(商品名TurboDNaseI、Ambion社製)で処理した後、ランダムヘキサマーとThermoscript RT−PCR system(Invitrogen社製)とを用いて、プロトコールに従って、逆転写反応とPCRを行った。PCR後、電気泳動によりPCR産物の増幅の有無を検証した。
アンチT7プローブ(配列番号86)
5’-CCCTATAGTGAGTCGTATTATTTaaaa-biotin-3’
vegf IresRNA用フォワードプライマー(配列番号87)
5'-GAGCCCGCGCCCGGAGGCGGGGTGG-3'
vegf IresRNA用リバースプライマー(配列番号88)
5'-GCGCACACCGCCGCCTCACCCGTCCATGAGCCCGG-3'
p53mRNA用フォワードプライマー2(配列番号89)
5'-AATATCTAGAATGGAGGAGCCGCA-3'
p53mRNA用リバースプライマー2(配列番号90)
5'-TTAAAAGCTTTCAGTCTGAGTCAGGC-3'
VEGFシグナル経路を有するヒト肝臓がんHepG2細胞は、抗がん剤に対して耐性を示す。そこで、RNA干渉によるvegf mRNAの減少が、HepG2細胞の抗がん剤耐性に与える影響を確認した。
HepG2細胞(野生型p53)に、前述のvegf siRNA#1ベクター、vegf siRNA#2ベクターおよびコントロールsiRNAベクターを、それぞれ導入した。これらの細胞を18時間培養し、vegf mRNAの発現レベルをノーザンブロッティングにより分析した。また、前記ベクター未導入のHepG2細胞についても、同様に分析を行った。また、分析の際、ローディングコントロールとして、各細胞におけるgapdh mRNAをモニターした(以下、同様)。培養は、10%ウシ胎児血清および100μg/ml(100units/ml)ストレプトマイシンを含むDMEM培地を使用し、条件は、温度37℃、5%CO2とした(以下、同様)。
前記(1)と同様に、各種組換えベクターをHepG2細胞に18時間導入した。導入細胞を、所定濃度(0、10、30μmol/L)の抗がん剤5−FUで60時間処理し、処理後の細胞について、前記アポトーシス評価1に基づいて、アポトーシス(%)を確認した。これらの結果を、図1(b)に示す。図1(b)は、所定濃度の5−FUで処理した各種細胞のアポトーシス(%)を示すグラフである(means±SD、n=3)。
HepG2細胞およびHCT116細胞において、5−FUにより誘導されるアポトーシスは、p53に依存することが知られている(Bunz, F. et al. J. Clin. Invest. 104, 263-269 (1999))。そこで、前記(1)におけるvegf mRNAの減少が、細胞内のp53経路に影響を与えているか否かを確認すべく、p53mRNAおよびp53タンパク質の発現レベルを測定した。
VEGFタンパク質またはvegf mRNAが、直接的にp53の発現の抑制に関与しているか否かを確認した。
ヒトVEGF165のコード遺伝子(vegf遺伝子)、その5’UTRならびに3’UTRに相当する配列等は、文献(J. Abraham et al. J. Biol. Chem. 266, 18, 11947-11954 (1991))に基づいて準備した。下記方法により作製したプラスミドコンストラクトの概略を、図2(a)に示す。同図に示す、プラスミドコンストラクトA(p165mSPHA3’)、B(p165mSPHA)、C(p165−3’)およびD(pVC)は、それぞれ文献(Bornes, S. et al. J. Biol. Chem. 279, 18717-18726 (2004)、Huez, I. et al. Mol. Endocrinol. 15 2197-2210 (2001))の方法を参照して構築した。
文献Bornes, S. et al. J. Biol. Chem. 279, 18717-18726 (2004)の方法を参照して、コンストラクトA(p165mSPHA3’)を作製した。コンストラクトAは、vegf遺伝子のcDNA、すなわち、5’UTRに相当するDNA配列、VEGF165タンパク質のコード配列および3’UTRに相当するDNA配列を有し、且つ、前記タンパク質コード配列の3’末端と前記3’UTR DNA配列の5’末端との間にHAタグのコード配列が付加されたDNA断片が、pSCTプラスミドベクターに挿入されている。
文献Bornes, S. et al. J. Biol. Chem. 279, 18717-18726 (2004)の方法を参照して、コンストラクトB(p165mSPHA)を作製した。コンストラクトBは、vegf遺伝子の5’UTRに相当するDNA配列およびVEGF165タンパク質のコード配列を有し、且つ、前記タンパク質コード配列の3’末端にHAタグのコード配列が付加されたDNA断片が、pSCTプラスミドベクターに挿入されている。
pSCTプラスミドベクターに下記DNA断片が挿入されたコンストラクトC(p165−3’)を作製した。前記DNA断片は、VEGF165タンパク質のコード配列およびvegf遺伝子の3’UTRに相当するDNA配列を有し、且つ、前記タンパク質コード配列の3’末端と前記3’UTR DNA配列の5’末端との間にHAタグのコード配列が付加されたDNA断片である。具体的には、前記コンストラクトA(p165mSPHA3’)を制限酵素XbaIとNgoM IVとで処理し、5’UTR部分を除去した。その後、クレノウフラグメント処理によりDNA末端を平滑化し、リガーゼを用いて平滑末端同士を連結することによって、コンストラクトCを得た。
文献Huez, I. et al. Mol. Endocrinol. 15 2197-2210 (2001)の方法を参照して、コンストラクトD(pVC)を作製した。コンストラクトDは、配列番号1の1番目〜1205番目の領域に相当するDNA配列とCATコード配列とのキメラDNAが、pSCTプラスミドベクターに挿入されている。前記配列番号1の1番目〜1205番目の領域は、vegf mRNAにおいて、5’UTRと、開始コドンatgから167塩基までの配列とを含む。
vegf遺伝子のDNA断片を挿入していない空ベクター(pSCTプラスミドベクター)を、コンストラクトmockとした。
ヒト肺がんH1299細胞(p53null)に、p53を発現するプラスミドベクターおよびエフェクターとして前記各種プラスミドコンストラクトを共導入した。前記p53を発現するプラスミドベクターを、以下、「p53発現ベクター」という。このp53発現ベクターは、pcDNA3.1ベクター(Invitrogen社)のBamHI−EcoRIサイトに、ヒトp53のタンパク質コード配列(配列番号2の252番目−1433番目)を挿入して作製した(pcDNA3.1−p53)。以下、同様である。共導入した各細胞を18時間培養し、外来性p53mRNAの発現レベルをノーザンブロッティングにより分析した。また、共導入した各細胞を24時間培養し、外来性p53タンパク質ならびに外来性VEGFタンパク質の発現レベルを、それぞれ抗p53抗体と抗HAタグ抗体を用いたウェスタンイムノブロッティングにより分析した。培養は、10%ウシ胎児血清および100μg/ml(100units/ml)ストレプトマイシンを含むDMEM培地を使用し、条件は、温度37℃、5%CO2とした(以下、同様)。
部分的に欠損した5’UTRまたは変異5’UTRを発現するコンストラクトを作製し、p53のダウンレギュレーションに関与するvegf 5’UTRの要素配列の決定を行った。
ヒトvegf遺伝子のエキソン1に相当するDNA断片、ならびに、下記各種プラスミドコンストラクトを、前記実施例A2と同様に、前述した各文献に基づいて準備した。下記方法により作製したプラスミドコンストラクトを、図3(a)に示す。
文献Huez, I. et al. Mol. Endocrinol. 15 2197-2210 (2001)の方法を参照して、コンストラクトA(pVC)を作製した。コンストラクトAは、vegf遺伝子におけるエキソン1、エキソン2およびエキソン3の一部からなるDNA配列とCATコード配列とのキメラDNAが、pSCTプラスミドベクターに挿入されている。前記DNA配列は、vegf mRNAのエキソン1(配列番号1の1−1104番目)、エキソン2(配列番号1の1105−1154番目)およびエキソン3部分配列(配列番号1の1155−1203番目)に相当する配列である。なお、このコンストラクトAは、実施例A2におけるコンストラクトDと同じである。
エキソン1を部分的に欠損するコンストラクトBを作製した。コンストラクトBは、配列番号1の555−1012番目の領域を欠損するエキソン1部分配列、エキソン2(配列番号1の1105−1154番目)およびエキソン3部分配列(配列番号1の1155−1203番目)からなるDNA配列とCATコード配列とのキメラDNAが、pSCTプラスミドベクターに挿入されている。具体的には、前記コンストラクトA(pVC)をNgOMIVで処理し、再度、ライゲーションすることでコンストラクトBを得た。
エキソン1を部分的に欠損するコンストラクトCを作製した。コンストラクトCは、配列番号1の1−744番目の領域を欠損するエキソン1部分配列、エキソン2(配列番号1の1105−1154番目)およびエキソン3部分配列(配列番号1の1155−1203番目)からなるDNA配列とCATコード配列とのキメラDNAが、pSCTプラスミドベクターに挿入されている。具体的には、前記コンストラクトA(pVC)をXbaIおよびNheIで処理し、再度、ライゲーションすることでコンストラクトCを得た。
エキソン1を部分的に欠損するコンストラクトDを作製した。コンストラクトDは、配列番号1の1−658番目の領域を欠損するエキソン1部分配列、エキソン2(配列番号1の1105−1154番目)およびエキソン3部分配列(配列番号1の1155−1203番目)からなるDNA配列とCATコード配列とのキメラDNAが、pSCTプラスミドベクターに挿入されている。具体的には、前記コンストラクトA(pVC)をXbaIおよびXmnIで処理し、リガーゼ処理によって平滑末端化した後、再度、ライゲーションすることでコンストラクトDを得た。
エキソン1を部分的に欠損するコンストラクトEを作製した。コンストラクトEは、配列番号1の1−475番目の領域および918−1175番目の領域を欠損するエキソン1部分配列、および、5’領域を欠損するエキソン3部分配列(配列番号1の1176−1203番目)からなるDNA配列とCATコード配列とのキメラDNAが、pSCTプラスミドベクターに挿入されている。具体的には、まず、前記コンストラクトA(pVC)をBamHI処理してBamHI断片を除いた後、再ライゲーションを行った(pVC−Δ1−474)。そして、このpVC−Δ1−474のSmaI−BsaBI断片を除いて再ライゲーションすることで得た。
エキソン1を部分的に欠損するコンストラクトFを作製した。コンストラクトFは、配列番号1の1−475番目の領域および746−1012番目の領域を欠損するエキソン1部分配列、エキソン2(配列番号1の1105−1154番目)およびエキソン3部分配列(配列番号1の1155−1203番目)からなるDNA配列とCATコード配列とのキメラDNAが、pSCTプラスミドベクターに挿入されている。具体的には、前記コンストラクトpVC−Δ1−474のNheI−NgOMIV断片を除き、リガーゼ処理によって平滑末端化した後、再ライゲーションすることでコンストラクトFを得た。
文献(Huez, I. et al. Mol. Endocrinol. 15 2197-2210 (2001))の方法を参照して、変異5’UTRを発現する変異エキソン1を有するコンストラクトG(pVCTTT)を作製した。コンストラクトGは、前記変異エキソン1配列およびエキソン2部分配列(配列番号1の1105−1205番目)とからなるDNA配列とCATコード配列とのキメラDNAが、pSCTプラスミドベクターに挿入されている。具体的には、5’UTRをコードするDNA配列において、CTGコドン(配列番号第1の499−501番目に対応)をTTTに変異させた。この変異導入により、pVCTTTから転写されたmRNAは、CTGコドン(配列番号第1の499−501番目)からのタンパク質産生ができない。
変異5’UTRを発現する変異エキソン1配列およびエキソン2部分配列(配列番号1の1105−1205番目)とCATコード配列とのキメラDNAを有するコンストラクトHを作製した。具体的には、CTGコドン(配列番号第1の499−501番目に対応)から翻訳が開始されるlong VEGFタンパク質(以下、「L−VEGF」という)のアミノ酸配列には影響を与えないように、エキソン1配列に変異を導入した。変異は、5’UTRをコードするDNA配列において、配列番号1の594−915番目に対応するDNA領域に対して行った。
Fragment 1(配列番号33)
5’−GCG AGC CGC GGG CAa GGa CCa GAa CCa GCa CCa GGg GGa GGa GTa GAa GGa GTa GGG GCT C−3’
Fragment 2(配列番号34)
5’−GG GCT CGa GGa GTa GCa tta AAg CTa TTt GTa CAg tta tta GGa TGc TCa CGa TTt GGg GGg GCa GTa GTa aga GCa GGa Gag GCa GAa CCa AGt GGg GCa GCa AGg AGT GCT AGC−3’
Fragment 3(配列番号35)
5’−GCT AGC TCa GGa aga GAa GAa CCa CAa CCa GAa GAa GGa GAa GAa Gag Gag GAa AAa GAg GAa GAa cgt GGa CCa CAa TGG agg tta GGa GCa aga AAa CCG GGC TC−3’
Fragment 4(配列番号36)
5’−G GGC TCA TGG ACa GGa GAa GCa GCa GTa TGt GCc Gat AGc GCa CCt GCa GCa aga GCa CCa CAa GCa tta GCC CGG GCC TCG−3’
H1299細胞(p53 null)に、前記p53発現ベクターおよびエフェクターとなる前記各種プラスミドコンストラクトを共導入した。そして、前記実施例A2と同様にして、各導入細胞を培養し、外来性p53mRNAの発現レベルおよび外来性p53タンパク質の発現レベルを分析した。あわせて、L−VEGFの発現レベルを、抗L-VEGF抗体を用いたウェスタンイムノブロッティングにより分析した。これらの結果を、図3(b)および(c)に示す。図3(b)および(c)は、上から1段目がp53mRNA、2段目がgapdh mRNAの発現をそれぞれ示すノーザンブロッティングの結果である。図3(c)において、上から3段目はp53タンパク質、4段目はL−VEGFタンパク質、5段目はβ−アクチンタンパク質の発現をそれぞれ示す。図3(b)において、Lane1「A」はコンストラクトA、Lane2「B」はコンストラクトB、Lane3「C」はコンストラクトC、Lane4「D」はコンストラクトD、Lane5「E」はコンストラクトE、Lane6「F」はコンストラクトFを、それぞれ導入した細胞である。図3(c)において、Lane1「NT」は、ベクター未導入の細胞、Lane2「mock」はコンストラクトmock、Lane3「G」はコンストラクトG、Lane4「A」はコンストラクトA、Lane「H」はコンストラクトHをそれぞれ導入した細胞である。「p53+」は、p53発現ベクターの導入を示す。なお、図3(c)において、「ns」は、抗L−VEGF抗体により検出された非特異的なバンドを示す。
本実施例では、vegf mRNAにおける5’UTRが、内在性p53発現およびp53依存性アポトーシス応答に与える影響を確認した。本実施例においては、Yellow fluorescent protein(YFP)をコードするmRNAにvegf 5’UTRが融合したキメラmRNAを発現するアデノウイルス骨格ベクターを使用した。
前記実施例A2におけるコンストラクトD(pVC)をEcoRIおよびNcoIで処理し、得られたEcoRI−NcoI断片を、pd2EYFP−N1(Clontech社製)に連結した。得られたプラスミドコンストラクトを、pVYという。また、前記実施例A3におけるコンストラクトH(pVCmut5’)をEcoRIおよびNcoIで処理し、得られたEcoRI−NcoI断片をpd2EYFP−N1(Clontech社製)に連結した。得られたプラスミドコンストラクトを、pVYmut5’という。
内在性p53mRNAの発現
HCT116細胞(親細胞、野生型p53)に、前記各組換えアデノウイルスベクターAd−VY、Ad−VYmut5’およびAd−YFPを、従来公知の方法にしたがって、それぞれ12時間感染させた。それから、感染した各細胞を、90μmol/Lの5−FUで所定時間(0、6、12時間)処理した。処理後の細胞について、内在性p53mRNA、外来性vegf−YFP mRNAおよび外来性YFP mRNAの発現レベルをノーザンブロッティングにより分析した。HCT116の培養は、10%ウシ胎児血清および100μg/ml(100units/ml)ストレプトマイシンを含むMcCoy’s 5A培地を使用し、条件は、温度37℃、5%CO2とした(以下、同様)。これらの結果を、図5(a)に示す。図5(a)は、各細胞における内在性p53mRNAの発現を示すノーザンブロッティングの結果である。同図において、上から1段目は内在性p53mRNA、2段目はvegf−YFPキメラmRNAまたはYFPmRNA、3段目はgapdh mRNAの発現をそれぞれ示す。同図において、Lane1〜3「Ad−control」は、コントロールAd−YFPの導入細胞、Lane4〜6「Ad−VEGFmut5’」は、Ad−VYmut5’の導入細胞、Lane7〜9「Ad−VEGF5’」は、Ad−VYの導入細胞の結果である。また、「5−FU」の数値は、5−FUの存在下で培養した時間(h)を示す。なお、「0h」は、5−FU未処理を意味する。
前述と同様に、各組換えアデノウイルスベクターで12時間感染させた細胞を、120μmol/Lの5−FUで所定時間(0、9、18時間)処理した。処理後の細胞について、内在性p53タンパク質の発現レベルをウェスタンイムノブロッティングにより分析した。これらの結果を、図5(b)に示す。図5(b)において、上から1段目は内在性p53タンパク質、2段目はβ−アクチンタンパク質の発現をそれぞれ示す。同図において、Lane番号は、前記図5(a)と同様である。
前述と同様に、各組換えアデノウイルスベクターで感染させた細胞を、120μmol/Lの5−FUで所定時間(0、9、18時間)処理した。処理後の細胞について、noxa mRNA、bax mRNAおよびp21 mRNAの発現レベルをノーザンブロッティングにより分析した。これらの結果を、図5(c)に示す。図5(c)において、上から1段目はnoxa mRNA、2段目はbax mRNA、3段目はp21 mRNA、4段目はgapdh mRNAの発現をそれぞれ示す。同図において、Lane番号は、前記図5(a)と同様である。
前述と同様に、各組換えアデノウイルスベクターで12時間感染させた細胞を、所定濃度(0、30、60、120μmol/L)の5−FUで60時間処理した。処理後の細胞について、前記実施例A1と同様にして、アポトーシス(%)を確認した(means±SD、n=3)。これらの結果を、図6(d)に示す。図6(d)は、5−FUの濃度変化に対する各種細胞のアポトーシスの割合(%)を示すグラフである。同図において、○が、コントロールAd−YFPの導入細胞(Ad−control)、□が、Ad−VYmut5’の導入細胞(Ad−VYmut5’)、■が、Ad−VYの導入細胞(Ad−VEGF5’)のそれぞれの結果を示す。なお、図6(e)においても同様である。
vegf 5’UTRによる、発現した内在性p53mRNAの分解の可能性を確認した。
前記実施例A4と同様にして、H1299細胞(p53ヌル)に、前記p53発現ベクターと、前記各組換えプラスミドベクターpVC、pVCmut5’または空ベクター(mock)とを共導入し、12時間培養した。各導入細胞からRNAを回収し、変性アガロースゲル電気泳動によりRNAを分離し、外来性p53mRNAおよびp53mRNA分解物をノーザンブロッティングにより検出した。これらの結果を、図7(a)に示す。図7(a)は、各細胞における外来性p53mRNAおよびその分解物を示す写真である。同図において、Lane1「mock」は空ベクターの導入細胞、Lane2「VEGFmut5’」はpVCmut5’の導入、Lane3「VEGF5’」はpVCの導入細胞のそれぞれの結果である。ブロッティングの写真の左側に、RNAマーカー(Ambion社製)のサイズ(nt)を示す。
まず、H1299(p53ヌル)に、前記p53発現ベクターと、前記各組換えプラスミドベクターpVC、pVCmut5’とを共導入し、8時間培養した。そして、各導入細胞を、終濃度50μg/mlのシクロヘキシミド存在下または非存在下で、16時間処理した。処理後の細胞について、p53mRNAの発現レベルをノーザンブロッティングにより確認した。これらの結果を、図7(b)に示す。図7(b)は、各細胞におけるp53mRNAの発現を示すノーザンブロッティングの結果である。同図において、上から1段目はp53mRNA、2段目はgapdh mRNAの発現をそれぞれ示す。同図において、Lane1および3「VEGF5’」はvegf 5’UTRを発現するpVC導入細胞、Lane2および4「VEGF mut5’」は変性5’UTRを発現するpVCmut5’導入細胞である。また、「−」および「+」は、シクロヘキシミド(CHX)の存在の有無を示す。
RNAが媒介する遺伝子サイレンシングのメカニズムとして、塩基対形成による、ターゲットRNAと制御RNAとの直接的な相互作用が知られている。そこで、vegf 5’UTRとp53mRNAとの直接相互作用を分析した。
vegf 5’UTRとp53mRNAとのヘテロ二本鎖の形成後、無細胞タンパク質合成反応(無細胞翻訳反応)を行い、翻訳プロセスがp53mRNA分解に与える影響を確認した。
前記(3)と同様にして、変異5’UTR RNAまたは5’UTRとp53mRNAとをインキュベートした。なお、前述のように、変異5’UTR RNAとp53mRNAとは、インキュベートによりヘテロ二本鎖を形成する。そして、この処理後のRNAサンプルを用いて、シクロヘキシミドの非存在下もしくは存在下(終濃度50μl/ml)、または、スクロース密度勾配遠心分離法によって調製された精製リボソームの存在下で、無細胞タンパク質合成反応を行った。無細胞タンパク質合成は、論文(Huez, I. et al. Mol. Cell. Biol. 18, 6178-6190 (1998))を参照し、あるいは、Wako PURE system(商品名、Wako Chemical社製)を用いて、その使用説明書にしたがって行った。
続いて、5’UTRが介在するp53mRNAの部分的な分解が、p53タンパク質の翻訳に与える影響を確認した。
実施例A3において、vegf 5’UTRの659番目−917番目の259ヌクレオチド(nt)の分子が、p53のダウンレギュレーションに必要であることがわかった。そこで、p53のダウンレギュレーションに関与する、vegf 5’UTRにおける要素配列のさらなる絞込みを行った。
ヒトVEGF165のコード遺伝子(vegf遺伝子)のエキソン1、ならびに、下記の各種プラスミドコンストラクトを、前記実施例A2と同様に、前述した各文献に基づいて準備した。下記コンストラクトにより発現させるvegf mRNAの領域を、図9に示す。
プラスミドベクターpSCTのXbaI−XhoI部位に、イントロンを除く完全長vegf mRNAをコードするDNAを挿入した(Bornes, S. et al. J. Biol. Chem. 279, 18717-18726 (2004))。得られたプラスミドコンストラクトをコンストラクトvegf mRNA(p165mSPHA3’)とした。なお、このプラスミドコンストラクトを導入した細胞においては、vegf165遺伝子の完全長mRNAが発現される。
IMAGE Clone(Clone ID 4153053、Open Biosystems社)を購入した。これは、vegf遺伝子のエキソン1の5’UTRにおける所定領域(16−780番目の領域)をコードするDNA断片が、プラスミドベクターpCMV−SPORT6のNotI−SalI部位に挿入されている。このプラスミドコンストラクトを、NCBIアクセッションNo.BC019867に従い、コンストラクトBC019867RNAとした。なお、このプラスミドコンストラクトを導入した細胞においては、vegf mRNA 5’UTRの16−780番目の領域が発現される。
IMAGE Clone(Clone ID 4150451、Open Biosystems社)を購入した。これは、vegf遺伝子のエキソン1の526−1104番目の領域とイントロン1の1番目−112番目の領域とをコードするDNA断片が、プラスミドベクターpCMV−SPORT6のNotI−SalI部位に挿入されている。このプラスミドコンストラクトを、NCBIアクセッションNo.BC019867に従い、コンストラクトBC011177RNAとした。なお、このプラスミドベクターを導入した細胞においては、配列番号45で示されるvegf 前駆体mRNAの526番目−1216番目の領域が発現される。
実施例A3で特定したvegf mRNA 5’UTRの659番目−917番目の領域に対して、アンチセンスオリゴDNAプローブを用いたノーザンブロッティングによる解析を行った。この結果を、図10に示す。図10は、ヒトの種々のがん細胞株における、vegfのRNA断片を示すノーザンブロッティングの結果である。同図に示すように、種々のがん細胞株において、鎖長約200〜300塩基からなる小分子RNAが存在すること、この小分子RNAはヒト正常繊維芽細胞にはほとんど発現していないことを見出した。そこで、変性アガロースゲル電気泳動法により、この小分子RNAを含む画分を分離し、常法(参考文献 Kawano, M. et al. Nucleic Acid Res. 33(3):1040-1050 (2005))により、前記小分子RNAをクローニングした。得られたRNAの塩基配列を決定したところ、vegf mRNAの5’UTRにおける600番目−879番目の領域から成るRNA産物であった。この小分子RNAを独自に、IRES−related small RNA(Ires RNA)と命名した。そして、前記クローニングにより得られたcDNAを、プラスミドベクターpcDNA3.1のXhoI−HindIII部位に再クローニングした。得られたプラスミドコンストラクトをコンストラクトvegf IresRNAとした。なお、このプラスミドコンストラクトを導入した細胞においては、vegf mRNAの5’UTRにおける600番目−879番目の領域が発現される。
図9に示すように、vegf mRNAの5’UTRにおける594−745番目の領域内に変異を有するmRNAを発現する、コンストラクトを作成した。具体的には、前記コンストラクトvegf mRNA(p165mSPHA3’)のSacII−NheI部位に、二本鎖の下記フラグメント1およびフラグメント2を、5’側からこの順序で連結させた。なお、下記センス鎖において、小文字が変異させた塩基である。このようにして得られたプラスミドコンストラクトをコンストラクトvegf mRNA変異1という。このプラスミドを導入した細胞においては、vegf 5’UTRにおける594−741番目の領域が変異している。
センス鎖(配列番号37)
5’− GGG CAa GGa CCa GAa CCa GCa CCa GGg GGa GGa GTa GAa GGa GTa GGG GCT−3’
アンチセンス鎖(配列番号38)
5’−CCTACTCCTTCTACTCCTCCCCCTGGTGCTGGTTCTGGTCCTTGCCCGC−3’
フラグメント2(vegf 5’UTRの640−745番目)
センス鎖(配列番号39)
5’−CGa GGa GTa GCa tta AAg CTa TTt GTa CAg tta tta GGa TGc TCa CGa TTt GGg GGg GCa GTa GTa aga GCa GGa Gag GCa GAa CCa AGt GGg GCa GCa AGg AGT G−3’
アンチセンス鎖(配列番号40)
5’−CTAGCACTCCTTGCTGCCCCACTTGGTTCTGCCTCTCCTGCTCTTACTACTGCCCCCCCAAATCGTGAGCATCCTAATAACTGTACAAATAGCTTTAATGCTACTCCTCGAGCC−3’
図9に示すように、vegf mRNAの5’UTRにおける746−915番目の領域内に変異を有するmRNAを発現する、コンストラクトを作成した。具体的には、前記コンストラクトvegf mRNA(p165mSPHA3’)のNheI−XmaI部位に、二本鎖の下記フラグメント3およびフラグメント4を、5’側からこの順序で連結させた。なお、下記センス鎖において、小文字が変異させた塩基である。このようにして得られたプラスミドコンストラクトをコンストラクトvegf mRNA変異2という。このプラスミドを導入した細胞においては、vegf 5’UTRにおける753−915番目の領域が変異している。
センス鎖(配列番号41)
5’−CT AGC TCa GGa aga GAa GAa CCa CAa CCa GAa GAa GGa GAa GAa GAgGAg GAa AAa Gag GAa GAa cgt GGa CCa CAa TGG agg tta GGa GCa aga AAa CCG GGC T−3’
アンチセンス鎖(配列番号42)
5’−CGGTTTTCTTGCTCCTAACCTCCATTGTGGTCCACGTTCTTCCTCTTTTTCCTCCTCTTCTTCTCCTTCTTCTGGTTGTGGTTCTTCTCTTCCTGAG−3’
フラグメント4(vegf 5’UTRの851−917番目)
センス鎖(配列番号43)
5’−CA TGG ACa GGa GAa GCa GCa GTa TGt GCc Gat AGc GCa CCt GCa GCaaga GCa CCa CAa GCa tta GC−3’
アンチセンス鎖(配列番号44)
5’−CCGGGCTAATGCTTGTGGTGCTCTTGCTGCAGGTGCGCTATCGGCACATACTGCTGCTTCTCCTGTCCATGAGCC−3’
H1299細胞(p53ヌル)に、前記p53発現ベクターおよび前記各種プラスミドコンストラクトを共導入した。そして、前記実施例A2と同様にして、各導入細胞を培養し、p53mRNAの発現レベルを分析した。これらの結果を、図11(a)および(b)に示す。図11(a)および(b)において、上から1段目はp53mRNA、2段目はgapdh mRNAのそれぞれの発現を示すノーザンブロッティングの結果である。両図において、「−」はp53発現ベクターのみを導入した細胞であり、p53mRNA発現のコントロールである(Lane1)。
マウスにvegf 5’UTRの発現細胞を移植し、in vivoにおけるがん細胞の成育の影響を確認した。
体積=(長さ×幅2)×0.5
vegf 5’UTR関連RNAが細胞に与える抗がん剤耐性能について確認した。
実施例A8において、vegf 5’UTR RNAが細胞に抗がん剤耐性を与えていることが確認された。そこで、vegf 5’UTRを標的とするsiRNAにより、発現したvegf5’UTR RNAを分解し、細胞における抗がん剤感受性の亢進を確認した。
各種siRNAによる細胞の抗がん剤感受性の亢進を確認した。
部分的に欠損したp53mRNAを発現するコンストラクトを作製し、vegf 5’UTRと相互作用する要素配列の決定を行った。
vegf IresRNAを発現する細胞の悪性形質化
vegf IresRNAが腫瘍細胞の悪性化を促進するか否かを明らかにするために、以下の実験を行った。
vegf mRNAの5’UTRにおける配列番号1に示す600番目−879番目のvegf IresRNAの全長cDNAを、プラスミドベクターpcDNA3.1(Invitrogen社製)に挿入して、vegf IresRNA発現ベクター(pcDNA−vegf Ires)を作製した。このvegf IresRNA発現ベクター(pcDNA−vegf Ires)をHCT116(親細胞、野生型p53)に導入し、vegf IresRNAを安定過剰発現する2つの細胞クローンを抗生剤G418により選択した。このようにして樹立した二つのvegf IresRNA発現細胞を、以下、vegf Ires−#1およびvegf Ires−#2という。また、mock処理として、HCT116細胞に、前記インサートを欠いたプラスミドベクターpcDNA3.1を導入し、導入された細胞クローンを前記抗生剤G418により選択した。この細胞クローンを、以下、mockという。そして、これらの細胞クローンにおけるvegf IresRNAの発現をノーザンブロッティングにより確認した。
続いて、これらのvegf IresRNA安定発現細胞株を、それぞれ、5μg/mLの抗がん剤Cisplatin存在下または非存在下で、所定時間(0、6、8、12、24時間)処理した後、定量的RT−PCRによりp53mRNAの発現レベルを分析し、ウェスタンイムノブロッティングによりp53タンパク質の発現レベルを分析した。また、mock細胞についても同様に処理して、発現レベルの分析を行った。
抗癌剤である5−FU、etopside、mitomycin C(MMC)およびcisplatinによるアポトーシスに対する各種細胞の抵抗性と、アポトーシスに対するvegf IresRNAの影響を確認した。前記(2)のvegf Ires−#1、vegf Ires−#2、mockおよびベクター未導入のHCT116(親細胞)を、5−FU(120μmol/L)、etoposide(10μmol/L)、MMC(6μg/ml)、cisplatin(5μg/ml)で60時間処理し、アポトーシスを誘導した。誘導後の細胞のアポトーシスを、前述のアポトーシス評価2の方法により検出した(means±SD、n=4)。
続いて、前記(2)のvegf Ires−#1、vegf Ires−#2およびmock(5×106細胞)を、それぞれ、胸腺を欠くヌードマウスの大腿部皮下に、27ゲージの注射針を用いて移植した。移植後、所定期間(0、5、9、13、17、21日)経過時に、形成された腫瘍の体積を実施例A7と同様にして測定した(means±SEM、n=5)。コントロールとして、発現ベクター未導入のHCT116細胞を、同様にしてマウスに移植し、腫瘍の体積を測定した。これらの結果を、図18(e)に示す。同図は、これらの細胞株を移植したマウスにおける腫瘍体積の経時的変化を示すグラフである。また、vegf Ires−#1および発現ベクター未導入のコントロールHCT116細胞(1×106個)を、それぞれヌードマウスの腹腔内に27ゲージの注射針を用いて移植し、移植後35日目に形成された腫瘍を開腹により観察した。これらの結果を、図19(f)に示す。同図は、マウスの開腹部の写真であり、矢頭は、形成された腫瘍を示す。同図において、左図は、vegf IresRNA発現細胞を移植した結果であり。右図は、コントロール細胞を移植した結果である。
vegf siRNAによる細胞の腫瘍形成能の抑制効果
vegfに対するsiRNAを発現する細胞について、生体内での腫瘍形成能に対する効果を確認した。前述の、siRNA#1を発現するvegf siRNA#1ベクターを、ヒト大腸がん由来HCT116細胞株(野生型p53)に導入し、抗生剤ブラストシジンにより選択した。得られた細胞クローンを、以下、si−vegf#1細胞株という。また、コントロールとしては、前述と同様に、脊椎動物の既知遺伝子に対して相同性のない配列(配列番号46:5’−gaaatgtactgcgcgtggagacgttttggccactgactgacgtctccacgcagtacattt−3’)の二本鎖オリゴヌクレオチドが挿入された、pcDNA6.2−GW/EmGFP−miR vector(Invitrogen社)を使用した(コントロールsiRNAベクター)。このコントロールsiRNAベクターにより、同様に、HCT16細胞株を導入し、導入された細胞を前記抗生剤により選択した。得られた細胞クローンを、以下、si−Control細胞株という。そして、前記実施例C2と同様にして、前記si−vegf#1細胞株およびsi−Control細胞株を、それぞれ、ヌードマウスの大腿部皮下に移植し、所定期間後の腫瘍体積を測定した(各n=5)。
vegf siRNAによるアポトーシス感受性の促進
(1)vegf siRNAによるvegf mRNAまたはvegf IresRNAの発現抑制
vegf siRNAが細胞のアポトーシス感受性を促進するか否かを確認した。HepG2細胞(野生型p53)に代えてHCT116(親細胞、野生型p53)を使用した以外は、前記実施例A1と同様にして、HCT116(親細胞、野生型p53)に、前述の、siRNA#1を発現するvegf siRNA#1ベクター、vegf siRNA#2ベクターを発現する#2およびコントロールsiRNAベクターを、それぞれ導入した。そして、導入18時間後の細胞について、定量的RT−PCRによりvegf mRNAおよびgapdh mRNAの発現レベル(means±SD、n=4)を、ノーザンブロッティングによりvegf IresRNAとgapdh mRNAの発現レベルを分析した。前記組換えベクター未導入のHCT116細胞についても、同様に分析を行った。定量的RT−PCRは、vegf mRNA用プライマーセットを用いた以外は、前記実施例B1と同様に行った。
p53依存的にアポトーシスを誘導する抗がん剤5−FUで、各種細胞を処理し、アポトーシスへの感受性を解析した。HCT116(親細胞)およびp53欠損細胞HCT116に、前述の、siRNA#1を発現するvegf siRNA#1ベクター、siRNA#2を発現するvegf siRNA#2ベクターおよびコントロールsiRNAベクターを、それぞれ導入した。そして、導入18時間後の細胞を、80μmol/L 5−FU存在下(+)または5−FU非存在下(−)で、60時間処理した。処理後の細胞について、前述のアポトーシス評価2に基づいて、アポトーシス陽性細胞の割合(%)を算出した(means±SD、n=4)。
前記(1)および(2)の結果から、vegf IresRNAが、p53がん抑制経路において、ネガティブに影響していると解される。そこで、vegf siRNAを導入した細胞について、内在性p53の発現レベルを確認した。具体的には、前述と同様の導入後の親細胞HCT166を、80μmol/L 5−FU存在下(+)または5−FU非存在下(−)で、8時間処理した後、定量的RT−PCRにより、p53mRNAの発現を解析した(means±SD、n=4)。また、前記導入後の細胞を、80μmol/L 5−FU存在下(+)で、所定時間(0、8、16、24時間)処理した後、前述のウェスタンイムノブロッティングにより、p53タンパク質を検出した。
vegf siRNAによるvegf IresRNAのノックダウンに起因する、5-FUで誘導されるp53mRNAの発現増加が、p53ターゲット遺伝子bax遺伝子またはnoxa遺伝子のmRNAの発現を誘導するか否かを確認した。親細胞HCT116に、前述と同様のコントロールsiRNAベクター、vegf siRNA#1ベクターまたはvegf siRNA#2ベクターを導入した細胞を、80μmol/L 5−FU存在下(+)または5−FU非存在下(−)で、24時間処理した後、定量的RT−PCRにより、bax mRNAおよびnoxa mRNAの発現を解析した(means±SD、n=4)。
HCT116(親細胞)を、p53mRNA発現をアップレギュレートする遺伝毒性のストレスに曝した。具体的には、HCT116を、5−FU(80μmol/L)、マイトマイシンC(MMC、6μg/ml)またはcisplatin(5μg/ml)で所定時間(0、6、12時間)処理した後、ノーザンブロッティングによりp53mRNA、vegf IresRNA、vegf mRNAの発現を確認した。また、HCT116をUV−Bに1分間暴露し、所定時間(6、12時間)非暴露条件下においた後、同様にして発現を確認した。
vegf IresRNAにおけるp53mRNAとの相互作用領域の同定
(1)vegf IresRNAのp53mRNA発現への影響
前記実施例B1と同様にして、vegf IresRNA発現ベクター(pcDNA−vegf Ires)を作製した。p53欠損HCT116細胞(p53ヌル)に、前記実施例A2のp53発現ベクターと前記vegf IresRNA発現ベクター(pcDNA−vegf Ires)とを共導入し、18時間後、ノーザンブロッティングによって、p53mRNAおよびvegf IresRNAの発現を確認した。さらに、mock処理として、インサートを欠いた発現プラスミドベクターpcDNA3.1と前記p53発現ベクターとを、p53欠損HCT116細胞に共導入した。この細胞クローンを以下mockという。mockについても、同様にRNA発現を確認した。
前述の結果から、vegf IresRNAが、p53mRNAの発現量を転写後に負に制御することが明らかになった。そこで、さらに、vegf IresRNAにおけるp53mRNAとの相互作用領域の同定を行った。
vegf IresRNAにおけるステムループ構造が、p53mRNAのサイレンシングに関与するか否かを以下の方法により確認した。vegf IresRNAのステムループを部分的に欠損するvegf IresRNA(del−1)およびvegf IresRNA(del−2)を発現する発現ベクター(del−1)および(del−2)を作製した。vegf IresRNAにおける欠損部分を図24(e)に示す。同図(e)には、前記図24(d)のvegf IresRNAの二次構造において、四角で囲んだ領域のみを示す。同図の左が、vegf IresRNA(del−1)であり、同図の右が、vegf IresRNA(del−2)である。vegf IresRNA(del−1)は、vegf IresRNAにおける693番目−714番目の前記領域を部分的に欠損し、具体的には、図24(e)に示すように、ステムループの根本部分を形成する691番目−703番目の領域を欠損する。また、vegf IresRNA(del−2)は、vegf IresRNAにおける711番目−718番目および721番目−723番目の領域を欠損する、具体的には、図24(e)に示すように、ステムループの先端ループ部分を欠損する、短いステムループを形成する。
del−1オリゴヌクレオチド(配列番号91)
5’-gctagcggagcccgcgcccggaggcggggtggagggggtcggggctcgcggcgtcgcactgaaacttttcgtccaacttctgggctgttctcgcttctccgcgcgggggaagccgagccgagcggagccgcgagaagtgctagc-3’
del−2オリゴヌクレオチド(配列番号92)
5’-gctagcggagcccgcgcccggaggcggggtggagggggtcggggctcgcggcgtcgcactgaaacttttcgtccaacttctgggctgttctcgcttcggaggagccgtggtccgcgcccccgagcggagccgcgagaagtgctagc-3’
vegf IresRNAが、前述のステムループ構造を介してp53mRNAに結合する可能性を確認した。まず、前述と同様にして、p53欠損HCT116に、前記RNAプルダウンアッセイで記載した前記p53発現ベクターと、各種vegf IresRNAを発現する発現ベクターとを共導入した。そして、前述のRNAプルダウンアッセイにより、PCR産物の増幅の有無を確認した。
p53デコイLNA−DNAの効果
vegf IresRNAと相互作用するp53mRNAの領域をデコイDNAとして使用し、vegf IresRNAによるp53mRNAサイレンシングならびにがん細胞の細胞死に対する効果を確認した。
野生型p53デコイ(配列番号93)
5’-ccccgcgtggcccctgcacca-3’
変異型p53デコイ(配列番号94)
5’-cccGCcCACCcGGctgGTcca-3’
vegfアンチセンスDNAの効果
p53mRNAと相互作用するvegf IresRNAの領域に相補的なアンチセンスDNAについて、vegf IresRNAによるp53mRNAサイレンシングならびにがん細胞の細胞死に対する効果を確認した。
野生型vegfアンチセンス(配列番号74)
5’-ccccgcgcggaccacggctcct-3’
変異型vegfアンチセンス(配列番号95)
5’-cccGCcCGggTcGTcCgcAccA-3’
Claims (13)
- in vitro、ex vivoまたは非ヒト動物において、がん細胞におけるp53遺伝子の発現を促進する方法であって、
結合阻害剤として、siRNA、アンチセンスおよびデコイ核酸からなる群から選択された少なくとも一つを用いて、vegf−A遺伝子のエキソン1から転写されるRNAと、p53遺伝子から転写されるmRNAとの結合を阻害することにより、p53遺伝子の発現を促進し、
前記siRNAおよび前記アンチセンスが、vegf−A遺伝子から転写されるRNAのうち下記(1)〜(13)からなる群から選択された少なくとも一つをターゲットするsiRNAおよびアンチセンスであり、
前記デコイ核酸が、下記(D1)〜(D5)および(D8)からなる群から選択された少なくとも一つの核酸であることを特徴とするp53発現促進方法。
(1)配列番号1における600番目−879番目の配列
(2)配列番号1における659番目−879番目の配列
(3)配列番号1における659番目−780番目の配列
(4)配列番号1における659番目−752番目の配列
(5)配列番号1における659番目−745番目の配列
(6)配列番号1における694番目−714番目の配列
(7)配列番号1における693番目−714番目の配列
(8)配列番号1における691番目−703番目の配列
(9)配列番号1における711番目−723番目の配列
(10)配列番号1における16番目−780番目の配列
(11)配列番号1における659番目−917番目の配列
(12)配列番号1における526番目−1104番目の配列
(13)配列番号45における526番目−1216番目の配列
(D1)配列番号2における462番目−481番目の配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D2)配列番号2における462番目−482番目の配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D3)配列番号2における462番目−491番目の配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D4)配列番号2における462番目−505番目の配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D5)配列番号2における252番目−551番目の配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D8)前記(D1)〜(D5)からなる群から選択された少なくとも一つの核酸において、1若しくは数個の塩基が、置換、欠失、挿入または付加された塩基配列からなり、かつ、vegf−A遺伝子のエキソン1から転写されたRNAに結合可能である核酸 - 前記ターゲットが、前記vegf−A遺伝子のエキソン1から転写される5’UTR RNAである、請求項1記載のp53発現促進方法。
- 前記ターゲットが、前記5’UTR RNAにおける配列番号1の600番目−879番目の配列またはその一部である、請求項2記載のp53発現促進方法。
- 前記siRNAのアンチセンス鎖が、下記(#1)〜(#17)からなる群から選択された少なくとも一つである、請求項1から3のいずれか一項に記載のp53発現促進方法。
#1 5’−agcaaggcaaggcuccaaugcnn−3’(配列番号4)
#2 5’−agagcagcaaggcaaggcuccnn−3’(配列番号6)
#3 5’−cacgaccgcuuaccuuggcaunn−3’(配列番号8)
#4 5’−uagcacuucucgcggcuccgcnn−3’(配列番号10)
#5 5’−cgagcuagcacuucucgcggcnn−3’(配列番号12)
#6 5’−uggacgaaaaguuucagugcgacgcnn−3’(配列番号14)
#7 5’−agaaguuggacgaaaaguuucagugnn−3’(配列番号16)
#8 5’−gaaguuggacgaaaaguuucagugcnn−3’(配列番号18)
#9 5’−ggacgaaaaguuucagugcgacgccnn−3’(配列番号20)
#10 5’−uuggacgaaaaguuucagugcgacgnn−3’(配列番号22)
#11 5’−agaaguuggacgaaaaguuucagugnn−3’(配列番号61)
#12 5’−aguuucagugcgacgccgcgagcccnn−3’(配列番号63)
#13 5’−gaagcgagaacagcccagaaguuggnn−3’(配列番号65)
#14 5’−agcaaggcaaggcuccaaugcacccnn−3’(配列番号67)
#15 5’−agagcagcaaggcaaggcuccaaugnn−3’(配列番号69)
#16 5’−cgagcuagcacuucucgcggcuccgnn−3’(配列番号71)
#17 5’−cgcggaccacggcuccuccgaagcgnn−3’(配列番号73) - 前記アンチセンスが、下記(D6)〜(D8)からなる群から選択された少なくとも一つの核酸である、請求項1から3のいずれか一項に記載のp53発現促進方法。
(D6)配列番号1における694番目−714番目の配列に相補的な配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D7)配列番号1における693番目−714番目の配列に相補的な配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D8)前記(D6)または(D7)の核酸において、1若しくは数個の塩基が、置換、欠失、挿入または付加された塩基配列からなり、かつ、vegf−A遺伝子のエキソン1から転写されたRNAに結合可能である核酸 - 前記アンチセンスが、配列番号74の配列からなるDNAであり、前記デコイ核酸が、配列番号93の配列からなるDNAである、請求項1記載のp53発現促進方法。
- vegf−A遺伝子のエキソン1から転写されるRNAと、p53遺伝子から転写されるmRNAとの結合を阻害する結合阻害剤として、siRNA、アンチセンス、デコイ核酸およびこれらをコードするDNAが挿入された発現ベクターからなる群から選択された少なくとも一つを含み、
前記siRNAおよび前記アンチセンスが、vegf−A遺伝子から転写されるRNAのうち下記(1)〜(13)からなる群から選択された少なくとも一つをターゲットするsiRNAおよびアンチセンスであり、
前記デコイ核酸が、下記(D1)〜(D5)および(D8)のデコイ核酸
からなる群から選択された少なくとも一つの核酸であることを特徴とするp53発現促進剤。
(1)配列番号1における600番目−879番目の配列
(2)配列番号1における659番目−879番目の配列
(3)配列番号1における659番目−780番目の配列
(4)配列番号1における659番目−752番目の配列
(5)配列番号1における659番目−745番目の配列
(6)配列番号1における694番目−714番目の配列
(7)配列番号1における693番目−714番目の配列
(8)配列番号1における691番目−703番目の配列
(9)配列番号1における711番目−723番目の配列
(10)配列番号1における16番目−780番目の配列
(11)配列番号1における659番目−917番目の配列
(12)配列番号1における526番目−1104番目の配列
(13)配列番号45における526番目−1216番目の配列
(D1)配列番号2における462番目−481番目の配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D2)配列番号2における462番目−482番目の配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D3)配列番号2における462番目−491番目の配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D4)配列番号2における462番目−505番目の配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D5)配列番号2における252番目−551番目の配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D8)前記(D1)〜(D5)からなる群から選択された少なくとも一つの核酸において、1若しくは数個の塩基が、置換、欠失、挿入または付加された塩基配列からなり、かつ、vegf−A遺伝子のエキソン1から転写されたRNAに結合可能である核酸 - 前記ターゲットが、前記vegf−A遺伝子のエキソン1から転写される5’UTR RNAである、請求項7記載のp53発現促進剤。
- 前記ターゲットが、前記5’UTR RNAにおける配列番号1における600番目−879番目の配列またはその一部である、請求項8記載のp53発現促進剤。
- 前記siRNAのアンチセンス鎖が、下記(#1)〜(#17)からなる群から選択された少なくとも一つである、請求項7から9のいずれか一項に記載のp53発現促進剤。
#1 5’−agcaaggcaaggcuccaaugcnn−3’(配列番号4)
#2 5’−agagcagcaaggcaaggcuccnn−3’(配列番号6)
#3 5’−cacgaccgcuuaccuuggcaunn−3’(配列番号8)
#4 5’−uagcacuucucgcggcuccgcnn−3’(配列番号10)
#5 5’−cgagcuagcacuucucgcggcnn−3’(配列番号12)
#6 5’−uggacgaaaaguuucagugcgacgcnn−3’(配列番号14)
#7 5’−agaaguuggacgaaaaguuucagugnn−3’(配列番号16)
#8 5’−gaaguuggacgaaaaguuucagugcnn−3’(配列番号18)
#9 5’−ggacgaaaaguuucagugcgacgccnn−3’(配列番号20)
#10 5’−uuggacgaaaaguuucagugcgacgnn−3’(配列番号22)
#11 5’−agaaguuggacgaaaaguuucagugnn−3’(配列番号61)
#12 5’−aguuucagugcgacgccgcgagcccnn−3’(配列番号63)
#13 5’−gaagcgagaacagcccagaaguuggnn−3’(配列番号65)
#14 5’−agcaaggcaaggcuccaaugcacccnn−3’(配列番号67)
#15 5’−agagcagcaaggcaaggcuccaaugnn−3’(配列番号69)
#16 5’−cgagcuagcacuucucgcggcuccgnn−3’(配列番号71)
#17 5’−cgcggaccacggcuccuccgaagcgnn−3’(配列番号73) - 前記アンチセンスが、下記(D6)〜(D8)からなる群から選択された少なくとも一つの核酸である、請求項7から9のいずれか一項に記載のp53発現促進剤。
(D6)配列番号1における694番目−714番目の配列に相補的な配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D7)配列番号1における693番目−714番目の配列に相補的な配列からなるRNA、または、前記配列において、塩基uが塩基tに置換された配列からなるDNA
(D8)前記(D6)または(D7)の核酸において、1若しくは数個の塩基が、置換、欠失、挿入または付加された塩基配列からなり、かつ、vegf−A遺伝子のエキソン1から転写されたRNAに結合可能である核酸 - 前記アンチセンスが、配列番号74の配列からなるDNAであり、前記デコイ核酸が、配列番号93の配列からなるDNAである、請求項7記載のp53発現促進剤。
- p53の発現を促進する発現促進剤のスクリーニング方法であって、
下記(A)工程〜(C)工程を有することを特徴とするスクリーニング方法。
(A) 候補物質の存在下、配列番号1に示すvegf−A mRNAにおける694番目−714番目の配列からなるp53mRNA結合剤と、配列番号2に示すp53 mRNAにおける462番目−481番目の配列からなるvegf−A RNA結合剤とを接触させる工程
(B) 前記候補物質による、前記p53mRNA結合剤と前記vegf−A RNA結合剤との結合の阻害を検出する工程
(C) 前記p53mRNA結合剤と前記vegf−A RNA結合剤との結合を阻害した候補物質を、p53発現促進剤として選択する工程。
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JPN6012067287; Biochemical and Biophysical Research Communication Vol.332,No.1, 2005, p271-278 * |
JPN6012067288; Molecular and Cellular Biology Vol.17,No.1, 1997, p389-397 * |
JPN6012067290; Cancer Research Vol.65,No.13, 2005, p5881-5889 * |
JPN6012067292; Cancer Research Vol.64,No.10, 2004, p3365-3370 * |
JPN6012067294; Cancer Research Vol.63,No.14, 2003, p3919-3922 * |
JPN6012067296; Cancer Research Vol.59,No.4, 1999, p895-900 * |
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