JP4767654B2 - 分子伝送・分子配送システムおよび分子伝送・分子配送方法 - Google Patents
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Description
Y. Hiratsuka, et al., "Controlling the Direction of Kinesin-driven Microtubule Movements along Microlithographic Tracks," Biophysical Journal, vol.81, pp.1555-1561, Sep. 2001. H. Hess, et al., "Light-controlled Molecular Shuttles Made from Motor Proteins Carrying Cargo on Engineered Surfaces," Nano Letters, vol.1, no.5, pp.235-239, 2001. K. Kato, et al., "Microtubule-cyclodextrin Conjugate: Functionalization of Motile Filament with Molecular Inclusion Ability," Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, vol.69, no.3, pp.646-648, Mar. 2005.
(a)ヌクレオチドの二本鎖形成能を利用してキャリア分子に荷物分子を積載する積載ゾーンと、
(b)目的地において、ヌクレオチドの二本鎖形成能および解離作用を利用して、前記キャリア分子から荷物分子を積み降ろす積み降ろしゾーンと
を含む。
(a)伝送路に固定されたモーター蛋白質上を滑走運動するキャリア分子に、第1の鎖長を有する第1のヌクレオチド一本鎖を含む牽引用ヌクレオチド鎖を結合し、
(b)前記第1の鎖長よりも長い第2の鎖長を有する第2のヌクレオチド一本鎖が結合された荷物分子を、前記伝送路に導入し、
(c)前記第1のヌクレオチド一本鎖と、第2のヌクレオチド一本鎖との間の二本鎖形成能を利用して、前記キャリア分子に荷物分子を積載し、
(d)前記伝送路に沿って荷物分子を目的地まで配送する。
(変形例)
図5は、微小管20に結合される牽引用ヌクレオチド鎖21の変形例を示す。上述した実施例では、一本鎖であるssDNA21を微小管に結合する例を示したが、微小管20との結合側が、二本鎖となっているDNAを結合させてもよい。図5の例では、微小管20との結合側の12塩基は二本鎖を形成し(基部二本鎖21a)、端部側の12塩基は、一本鎖となっている(端部一本鎖21b)。端部の一本鎖21bで、荷物分子30に結合したssDNA31と二本鎖の形成・解除を行うことで、荷物分子30の積み降ろしを行う。このような構成を採用して、微小管20の結合側の二本鎖の塩基数を調節することで、微小管20の本体と、荷物分子30のssDNA31と二本鎖を形成することになる端部のssDNA21bとの距離を任意に調整することが可能となる。
10 流路
11 モーター蛋白質(キネシン)
20 キャリア分子(微小管)
21 牽引用ヌクレオチド鎖
21a 基部二本鎖
21b 端部一本鎖
30A、30B 荷物分子
31A、31B 積載用一本鎖
40A、40B 積み降ろしゾーン
41A、41B 積み降ろし用一本鎖
50 積載ゾーン
Claims (11)
- ヌクレオチドの二本鎖形成能を利用してキャリア分子に荷物分子を積載する積載ゾーンと、
目的地において、ヌクレオチドの二本鎖形成能および解離作用を利用して、前記キャリア分子から荷物分子を積み降ろす積み降ろしゾーンと、
表面にモーター蛋白質が固定された伝送路と
を含み、前記キャリア分子は、前記伝送路に沿って移動し、
前記キャリア分子には、第1の鎖長を有する第1のヌクレオチド一本鎖を含む牽引用ヌクレオチド鎖が結合され、
前記荷物分子には、第1の鎖長よりも長い第2の鎖長を有する第2のヌクレオチド一本鎖が結合されており、
前記積載ゾーンで、前記第1のヌクレオチド一本鎖と、第2のヌクレオチド一本鎖の一部とが二本鎖を形成することによって、前記キャリア分子に荷物分子が積載され、
前記積み降ろしゾーンには、前記第2のヌクレオチド一本鎖と同じ鎖長の第3のヌクレオチド一本鎖が固定されている
ことを特徴とする分子伝送・分子配送システム。 - 前記積み降ろしゾーンにおいて、前記第2のヌクレオチド一本鎖のうち前記第1のヌクレオチド一本鎖と二本鎖を形成していない部分のヌクレオチド一本鎖と、前記第3のヌクレオチド一本鎖との間の二本鎖の形成をトリガとして、前記キャリア分子から荷物分子が積み降ろされることを特徴とする請求項1に記載の分子伝送・分子配送システム。
- 前記キャリア分子は、前記目的地において、当該目的地に結合された前記第2のヌクレオチド一本鎖と同じ長さの第3のヌクレオチド一本鎖と前記第2のヌクレオチド一本鎖との間の第2の二本鎖の形成、および、当該第2の二本鎖の形成をトリガとする前記第1の二本鎖の解離作用を利用して、前記キャリア分子から荷物分子を積み降ろすことを特徴とする請求項1に記載の分子伝送・分子配送システム。
- 前記キャリア分子、荷物分子、および積み降ろしゾーンに結合されるヌクレオチド鎖の少なくともひとつは、二本鎖から成る基部と、一本鎖から成る端部とを有し、
前記基部における二本鎖が解離する温度は、前記端部に形成される二本鎖が解離する温度よりも高いことを特徴とする請求項1に記載の分子伝送・分子配送システム。 - 前記キャリア分子は、微小管またはアクチンフィラメントであることを特徴とする請求項1に記載の分子伝送・分子配送システム。
- 前記キャリア分子が微小管である場合は、前記モーター蛋白質はキネシンまたはダイニンであることを特徴とする請求項5に記載の分子伝送・分子配送システム。
- 前記キャリア分子がアクチンフィラメントである場合は、前記モーター蛋白質はミオシンであることを特徴とする請求項5に記載の分子伝送・分子配送システム。
- 伝送路に固定されたモーター蛋白質上を滑走運動するキャリア分子に、第1の鎖長を有する第1のヌクレオチド一本鎖を含む牽引用ヌクレオチド鎖を結合し、
前記第1の鎖長よりも長い第2の鎖長を有する第2のヌクレオチド一本鎖が結合された荷物分子を、前記伝送路に導入し、
前記第1のヌクレオチド一本鎖と、第2のヌクレオチド一本鎖との間の二本鎖形成能を利用して、前記キャリア分子に荷物分子を積載し、
前記伝送路に沿って荷物分子を目的地まで配送し、
前記目的地に、前記第2のヌクレオチド一本鎖と同じ鎖長を有する第3のヌクレオチド一本鎖をあらかじめ固定することを特徴とする分子伝送・分子配送方法。 - 前記積み降ろしゾーンにおいて、前記第1のヌクレオチド一本鎖と二本鎖を形成していない部分の第2のヌクレオチド一本鎖と、前記第3のヌクレオチド一本鎖との間の二本鎖の形成をトリガとして、前記キャリア分子から荷物分子を積み降ろすことを特徴とする請求項8に記載の分子伝送・分子配送方法。
- 前記キャリア分子、荷物分子、および積み降ろしゾーンに結合されるヌクレオチド鎖の少なくともひとつを、二本鎖から成る基部と、一本鎖から成る端部を有する構成とし、
前記基部における二本鎖が解離する温度が、前記端部に形成される二本鎖が解離する温度よりも高くなるように塩基配列を設計することを特徴とする請求項8に記載の分子伝送・分子配送方法。 - 前記キャリア分子に結合される第1のヌクレオチド一本鎖と、前記荷物分子に結合された第1のヌクレオチド一本鎖よりも長い第2のヌクレオチド一本鎖とによる第1の二本鎖の形成により、前記キャリア分子に前記荷物分子を積載し、
前記目的地において、当該目的地に結合された前記第2のヌクレオチド一本鎖と同じ長さの第3のヌクレオチド一本鎖と前記第2のヌクレオチド一本鎖との間の第2の二本鎖の形成、および、当該第2の二本鎖の形成をトリガとする前記第1の二本鎖の解離作用を利用して、前記キャリア分子から荷物分子を積み降ろす
ことを特徴とする請求項8に記載の分子伝送・分子配送方法。
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