JP4502052B2 - 重金属高蓄積性の形質転換体および重金属汚染の浄化法 - Google Patents
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Description
1.微生物由来の重金属トランスポーター遺伝子とシンタキシン(SNARE)遺伝子とを導入した形質転換植物。
2.微生物由来の重金属トランスポーター遺伝子がmerC遺伝子、merE遺伝子およびmerF遺伝子からなる群より選ばれる遺伝子である上記1記載の形質転換植物。
3.シンタキシン(SNARE)遺伝子がSYP121遺伝子およびAtVAM3遺伝子からなる群より選ばれる遺伝子である上記1または2記載の形質転換植物。
4.上記1〜3のいずれかに記載の形質転換植物を用いて、媒体中の重金属を吸収蓄積させることを含む、重金属汚染媒体を浄化する方法。
5.重金属汚染媒体が重金属汚染土壌である上記4記載の方法。
6.重金属が水銀、有機水銀またはカドミウムである、上記4または5記載の方法。
7.merE遺伝子およびmerF遺伝子からなる群より選ばれる重金属トランスポーター遺伝子を導入した形質転換微生物を用いて、無機水銀及び/又は有機水銀を含有する媒体を浄化することを特徴とする水銀の浄化方法。
8.有機水銀がメチル水銀である上記7記載の方法。
9.merE遺伝子を導入した形質転換微生物。
本発明の形質転換植物に導入するシンタキシン遺伝子は、細胞内小胞輸送に関与するシンタキシンをコードする遺伝子であり、例えば、SYP121、AtVAM3、SYP111などが例示できる。好ましくは、植物細胞中で細胞膜や液胞膜への局在化に関与するSYP121またはAtVAM3遺伝子が使用される。これらの遺伝子は例えば、植物シロイヌナズナのゲノムから得ることができる。例えば、Arabidopsis thalianaから、これらの遺伝子の既知配列 (GenBank データベース Accession No.NM-112015, U88045)に基づいて合成したプライマーを用いて遺伝子工学的手法により単離することができる。また、各遺伝子の既知塩基配列の情報をもとに化学的に合成することもできる。
形質転換する植物は、土壌や湖沼、河川などで生育しうる植物であれば特に限定されず、ユリノキ(Yellow poplar)、カラシナ (Brassica juncea)やタバコ (Nicotiana tabacum)などの植物が例示される。
(1) 膜貫通型蛋白質をコードするmerE遺伝子導入Escherichia coliの作製
(1-1) 微生物由来の各水銀耐性遺伝子のpKF19Kベクターへの組換え
Escherichia coli由来のプラスミドR100上の膜貫通型蛋白質遺伝子(merE )(GenBank accession No. AF071413)、Pseudomonas strain K-62 由来のプラスミドpMR26 上の水銀調節遺伝子(merR-o/p)(GenBank accession No. D83080)、水銀輸送遺伝子(merT)(GenBank accession No. D83080)及び水銀結合遺伝子(merP)(GenBank accession No. D83080)を、pKF19Kベクターへ図1に示すような組み合わせで組換えた。
Upper primerとしてUPstmerR(5' AACTGCAGCTAAGCTGTGGAAGCCCCTG 3') (配列番号1)
Lower primerとしてLXbamerP(5' GCTCTAGAGCGATGCTGCCGTTA 3') (配列番号2)
Upper primerのUPstmerRはPstIサイト(5' CTGCAG 3') およびmerRのコーディング部位(5' CTAAGCTGTGGAAGCCCCTG 3') から構成される。Lower primerのLXbamerPはMerPの下流域の塩基配列およびXbaIサイト(5' TCTAGA 3')から構成される。従って、得られた1.2 kbのmerR-o/p-merT-merP遺伝子断片は5 ’末端にPstIサイトを、3 ’末端にXbaIサイトを持つことになる。次にこの1.2 kbのmerR-o/p-merT-merP遺伝子断片をpKF19Kベクター (宝酒造) に組換える操作を説明する。用いたpKF19Kベクターはカナマイシン耐性遺伝子にダブルアンバー変異(Km’am2)を持つpUC 系ベクターであり、Oligonucleotide-directed Dual Amber (ODA )法Site-directed Mutagenesis に利用することができるベクターである。このpKF19KベクターをPstIとXbaIで消化し、ここに先の1.2 kbのmerR-o/p-merT-merP遺伝子断片を挿入して得られた組換えプラスミドをpTP4と命名した。その構造の詳細は図2に図式化した。
(1-2) 遺伝子組換えpKF19KベクターのE. coli への形質転換
上記1-1 により作成した組換えプラスミドpR2 、pTP4、pTPE21、pPE62 を常法に従ってそれぞれE.coli XL1-Blue へ形質転換した。
(1-3) 上記操作によって水銀輸送遺伝子(merT)、水銀結合遺伝子(merP)、および膜蛋白質遺伝子(merE)を組み合わせてもつ、merT-merP 遺伝子組換え大腸菌(pTP4)、 merT-merP-merE 遺伝子組換え大腸菌(pTPE21)、 merP-merE遺伝子組換え大腸菌(pPE62 )を作製した。
(2) 作製した遺伝子組換え大腸菌での重金属耐性の評価、重金属取り込み活性の評価
(2-1) 遺伝子組換え大腸菌での重金属耐性の評価
上記で得られた遺伝子組換え大腸菌について、無機水銀(HgCl2)と有機水銀の一種であるメチル水銀(CH3HgCl)に対する耐性評価をInhibition Zone 法(阻止円法)を用いて行った。各大腸菌をLB培地で対数増殖期まで培養し、培養液中の細胞数が1×108 cells になるよう計算してLBプレート上に培養液を塗布した。次にこのプレート上に直径6mm のペーパーディスクを置き、そこに種々の濃度のHgCl2 (50,100,150,300,600nmol/10μL)、あるいはCH3HgCl (10,20,30,60,120nmol/10 μL )を滴下した。37℃で一晩平板培養した後、生じた阻止円の直径(ペーパーディスクの直径6mm を差し引いた値)を測定した。この結果を図3に示した。コントロールであるpR2 に比べ感受性が高い場合、水銀による毒性影響を受けていると考えられる。本実施例では大腸菌に水銀耐性遺伝子を組み込んでいないため、水銀取り込みと毒性影響は比例すると考えられる。このことから、感受性の強さで水銀取り込み活性の有無を推測することが可能である。
(2-2) 遺伝子組換え大腸菌での重金属取り込み活性の評価
遺伝子組換え大腸菌について、各々無機水銀(HgCl2)と有機水銀の一種であるメチル水銀(CH3HgCl)に対する取り込み活性の評価を行った。各組換えプラスミドを形質転換した大腸菌をLB培地で対数増殖期まで培養し、培養液のOD600 値が1.00になるよう集菌し、100 μg/mL chloramphenicol および100 μM EDTA・2Na を含むLB培地に再懸濁した。無機水銀では、この再懸濁液500 μL に10μM HgCl2 を添加して、一定時間37℃で反応させた後、集菌して同様の新しい培地で3 回洗浄・再懸濁した。この懸濁液に硝酸(HNO3)1mL を加えて90℃で1時間灰化した溶液中の無機水銀量をフレームレス還元気化原子吸光光度法で測定した(図4A)。一方、メチル水銀では再懸濁液500 μL に5 μM の14CH3HgCl(比活性:2.11GBq/mmol)を添加して、一定時間37℃で反応させた後、0.45μm ガラスフィルターにて急速吸引濾過し、フィルターを同様の新しい培地で3回洗浄後、フィルターに残存する放射活性を液体シンチレーションカウンターを用いて測定した(図4B)。
(1) 膜貫通型蛋白質をコードするmer 遺伝子導入Escherichia coliの作製
(1-1) 微生物由来の各水銀耐性遺伝子のpR2 プラスミドへの組換え
Escherichia coli由来のプラスミドR100上の膜貫通型蛋白質遺伝子 [merE (GenBank accession No. AF07143)、merC (GenBank accession No.AF07143)]、Pseudomonas fluorescens 由来のプラスミドpMER327/419 上の膜貫通型蛋白質遺伝子(merF)(GenBank accession No. X73112)、Pseudomonas strain K-62 由来のプラスミドpMR26 上の水銀輸送遺伝子(merT)(GenBank accession No. D83080)を、pR2 プラスミドへ図5に示す組み合わせで組換えた。pR2 プラスミドは実施例1の(1-1) 記載した方法で、Pseudomonas strain K-62 由来のプラスミドpMR26 上の水銀調節遺伝子(merR-o/p)をpKF19Kベクターに組換えたものである。
Upper primerとしてUKpnmerE(5' GGGGTACCATGAACGCCCCTGACAAACT 3') (配列番号3)
Lower primerとしてLEcomerE(5' CGGAATTCTCATGATCCGCCCCGGAAGGC 3') (配列番号4)
Upper primerのUKpnmerEはKpnIサイト(5' GGTACC 3')およびmerEのコーディング部位(5' ATGAACGCCCCTGACAAACT 3')から構成される。Lower primerのLEcomerEはMerEの下流域の塩基配列およびEcoRI サイト(5' GAATTC 3')から構成される。従って、得られた0.3 kbのmerR-o/p-merE 遺伝子断片は5 ’末端にKpnIサイトを、3'末端にEcoRI サイトを持つことになる。
(1-2) 遺伝子組換えpR2 プラスミドのE.coliへの形質転換
上記で作成した組換えプラスミドpR2 、pE4 、pF17、pT5 、pC7 を常法に従ってそれぞれE.coli XL1-Blue へ形質転換した。
(1-3) 上記操作によって膜蛋白質遺伝子(merE、merF、merT、merC)を組み合わせてもつ、merE遺伝子組換え大腸菌(pE4 )、 merF 遺伝子組換え大腸菌(pF17)、 merT 遺伝子組換え大腸菌(pT5 )、 merC 遺伝子組換え大腸菌(pC7 )を作製した。
(2) 作製した遺伝子組換え大腸菌での重金属耐性の評価、重金属取り込み活性の評価
(2-1) 遺伝子組換え大腸菌での重金属耐性の評価
上記(1-2) で得られた遺伝子組換え大腸菌について、無機水銀(HgCl2)と有機水銀の一種であるメチル水銀(CH3HgCl)に対する耐性評価をInhibition Zone 法(阻止円法)を用いて、実施例1の(2-1) と同様にして行った。
(2-2) 遺伝子組換え大腸菌での重金属取り込み活性の評価
遺伝子組換え大腸菌について、各々有機水銀の一種であるメチル水銀(CH3HgCl)に対する取り込み活性の評価を実施例1の(2-2) と同様にして行った。
(1) 重金属トランスポーター遺伝子 (merC, merE, merF) とシンタキシン遺伝子SYP121, AtVAM3) との融合遺伝子の植物ベクターCaMV35S-sGFP(S65T)-NOS3 ’への組換え
(1-1) プライマーの作成
merC:U-BglII-merC: 5 ’GAAGATCTCTGATGACACGCATTGCC3 ’ (配列番号5)
L-Kpn I-merC: 5 ’GGGGTACCTCACAAGCGCTTGGCGGG3 ’ (配列番号6)
merC-SYP121 :U-Sal I-merC: 5 ’ACGCGTCGACATGGGACTGATGACACG3’ (配列番号7)
L-Sal I-merC: 5 ’ACGCGTCGACCAAGCGCTTGGCGGGGAG3 ’ (配列番号8)
merC-AtVAM3 :U-BspE I-merC: 5’GCTCCGGACTGATGACACGCATTGCC3 ’ (配列番号9)
L-BspE I-merC: 5’GCTCCGGACAAGCGCTTGGCGGGGAG3 ’ (配列番号10)
merE:U-BglII-merE: 5 ’GAAGATCTATGAACGCCCCTGACAAA3 ’ (配列番号11)
L-Kpn I-merE: 5 ’GGGGTACCTCATGATCCGCCCCGGAA3 ’ (配列番号12)
merE-SYP121 :U-BsrG I-merE: 5'ACGCGTCGACATGAACGCCCCTGACAAACT3'(配列番号13)
L-BsrG I-merE: 5’ACGCGTCGACTGATCCGCCCCGGAAGGCGC3' (配列番号14)
merE-AtVAM3 :U-BspE I-merE: 5’GCTCCGGAATGAACGCCCCTGACAAA3 ’ (配列番号15)
L-BspE I-merE: 5’GCTCCGGATGATCCGCCCCGGAAGGC3 ’ (配列番号16)
merF:U-BglII-merF: 5 ’GAAGATCTATGAAAGACCCGAAGAC3’ (配列番号17) L-Kpn I-merF: 5 ’GGGGTACCTCATTTTTTTACTCCATTG3’ (配列番号18)
merF-SYP121 :U-Sal I-merF: 5 ’ACGCGTCGACATGAAAGACCCGAAGACACTG3'(配列番号19)
L-Sal I-merF: 5 ’ACGCGTCGACTTTTTTTACTCCATTGAAT3’ (配列番号20)
(1-2)PCR法による重金属トランスポーター遺伝子の増幅
merC及び merE はプラスミド Tn 21(摂南大学薬学部の芳生秀光教授より譲渡)、merFはプラスミド pUC18F (The University of Birmingham のDr. Jon L. Hobman より譲渡) をそれぞれ鋳型とし、上記(1-1) に記載したプライマーを用いて、PCR 法に従い遺伝子を増幅させた。
(1-3) 重金属トランスポーター遺伝子の精製
PCR 溶液にPB緩衝液 500μL を加え、軽く撹拌した。この溶液を、エッペンドルフチューブにセットした QIAquick spin column に移し、室温で 13000rpm 、30秒間遠心分離した。この column を新しいエッペンドルフチューブにセットし、PE緩衝液 750μL をのせた。次に、室温で 13000 rpm、30秒間遠心分離し、columnを新しいエッペンドルフチューブにセットした。この column に EB 緩衝液 50 μL をのせ、室温で 13000 rpm、30秒間遠心分離し、得られたろ液を DNA試料溶液とした。
(1-4)Agarose gel電気泳動による遺伝子の検出
得られた DNA試料溶液を、0.8 % agarose gel を支持体とした agarose gel電気泳動法を用いて分離分析した。泳動後、agarose gel を1 mg/mL エチジウムブロマイド溶液に浸し、紫外線照射下で DNAを検出した。
(1-5) 遺伝子フラグメントの調製
上記(1-3) で精製した DNA試料溶液を制限酵素 Bgl II とKpn I 、BsrGI 、SalIまたは BspEIで4 時間、37℃で消化させた。この反応溶液に1/10容量の ethanolを加え、-80 ℃で15分放置した。次に、4 ℃で 15000 rpm、10分間遠心分離し、得られた DNA沈殿を70 % ethanolで洗浄後、減圧乾燥した。この DNA沈殿を精製水50μL に溶解し、遺伝子フラグメントとした。
(1-6) ベクターの調製
以下で使用するプラスミド CaMV35S-sGFP (S65T)-NOS3 ’、CaMV35S-sGFP (S65T)-SYP121、およびCaMV35S-sGFP (S65T)-AtVAM3 (京都府立大学人間環境学部の佐藤雅彦准教授より譲渡) は、それぞれ、pUC 系プラスミド、これにSYP121遺伝子を導入したプラスミド、およびAtVAM3遺伝子を導入したプラスミドである。
(1-7) ライゲーション
各遺伝子フラグメントと各ベクターをそれぞれ混和した。次に、ligation kit (Quick Ligation Kit、New England Biolabs)を用いて室温で 15 分反応させることにより、各遺伝子フラグメントと各ベクターをそれぞれ連結させた。
(1-8) 形質転換
大腸菌 XL1-Blue Subcloning-Grade Competent Cells (STRATAGENE,LaJolla,CA.,USA) に、上記(1-7) で作成した DNA溶液を加え、30分間氷冷した。次に、この溶液を42℃で30秒間保温後、5 分間氷冷した。さらに、 SOC培地を加えて、37℃で50分間振とう培養した。この培養液を ampicillin 含有 LB 寒天培地に塗布し、37℃で一晩培養してコロニーを得た。
(1-9) プライマーの作成
プラスミド CaMV35S-sGFP (S65T)-NOS3 ’、CaMV35S-sGFP (S65T)-SYP121及び CaMV35S-sGFP (S65T)-AtVAM3 上に存在するプロモーター CaMV35S遺伝子の塩基配列をもとに、primer 35Sを、ターミネータ Tnos3’遺伝子の塩基配列をもとに、primer Tnos をそれぞれ作成した。
Primer Tnos :5 ’CCCATCTCATAAATATCGTCATG3’ (配列番号22)
(1-10)ダイレクトPCR 法による遺伝子の確認
ダイレクトPCR は、目的の鋳型遺伝子のかわりに、上記(1-8) で得られた大腸菌のコロニーを鋳型として用いる方法である。また、コロニーのダイレクトPCR において、以下のプライマーの組合せを用いることにより、挿入された遺伝子の向きの確認を行った。プライマーの組合せの例は、primer 35S及び primer Tnos、primer 35S及びクローニングに用いたLower primer、primer Tnos 及びクローニングに用いたUpper primer、または35S 及びクローニングに用いたUpper primerである。反応溶液の組成は、PCR reaction buffer 2 μL 、2.5 mM dNTP 混合液 1.6μL 、10 pM primer upper及び lower各1 μL 、Taq DNA polymerase 0.2μL に精製水を加えて全量を20μL とした。この溶液に爪楊枝に付けたコロニーを懸濁させた後、94℃にて30秒(熱変性)加温し、94℃にて 60 秒(熱変性)、次いで55℃にて60秒(アニーリング)、72℃にて90秒(相補鎖 DNAの伸長合成)のサイクルを30回繰り返し反応させた。
(1-11)遺伝子の確認
上記(1-10)で確認された遺伝子において、得られたコロニーを5 mL LB 培地に植菌し、37℃で一晩振倒培養した。培養後、菌液をエッペンドルフチューブに分注し、室温で10000 rpm 、1 分間遠心分離した。上清を除去し、得られた菌体に QIAprep Spin Miniprep Kit (QIAGEN) の P1 緩衝液 250μL を加え攪拌後、P2緩衝液 250μL を添加し転倒混和した。この溶液を 4℃で14000 rpm 、10分間遠心分離した。得られた上清を QIAprep column に移し、室温で 13000 rpm、30秒間遠心分離した。次に、この column に PB 緩衝液 500μL を加え column に DNAを吸着させ、室温で 13000 rpm、30秒間遠心分離した。さらに、この column にPE緩衝液 750μL を加え、室温で 13000 rpm、30秒間遠心分離することにより徐タンパク質作業を行った。columnのみを室温で 13000 rpm、30秒間遠心分離した後、columnを新しいエッペンドルフチューブにセットした。この column に EB 緩衝液 50 μL を加え、室温で1 分間精置した。静置後、columnを室温で 13000 rpm、30秒間遠心分離し、エッペンドルフチューブに DNA溶液を得た。この DNA溶液を DNA試料溶液とし、agarose gel 電気泳動法により遺伝子の検出を行った。
(1-12)組換えプラスミドの塩基配列の確認
上記(1-11)で得られたプラスミド 10 μL 、3.2 pmolのプライマー 1μL 、Big Dye 8 μL を加え、全量を20μL としPCR 法に従い遺伝子を増幅させた。96℃にて30秒(熱変性)、次いで50℃にて15秒(アニーリング)、60℃にて4 分(相補鎖 DNAの伸長合成)のサイクルを25回繰り返し反応させ、これをPCR 溶液とした。PCR 溶液に、Sodium Acetate 2μL 、ethanol 50μL を加え、氷上で10分放置した。次に、4 ℃で 15000 rpm、20分間遠心分離し、得られた DNA沈殿を70 % ethanolで洗浄後、減圧乾燥した。この DNA沈殿をTemplate Suppression Reagent 25 μL に溶解し、95℃で2 分間、氷上に2 分間、それぞれ放置した後、シークエンス用tubeに移し、これを反応溶液とした。
(2) 組換えプラスミドのシロイヌナズナ培養細胞への形質転換
2 g のシロイヌナズナ培養細胞をenzyme solution 25 mL 中で30℃、1 〜2 時間培養し、フィルターろ過した。次に25 mL のsolution Aでプロトプラストを2 回洗浄した。さらに1 mLのMaMgで再懸濁し、100 mLのプロトプラスト溶液に、上記で作成した各組換えプラスミド20μgと 50 μgの carrier DNAを加え、400 mLのDNA uptake solution を加えた。このプラスミドを氷上20分放置し、dilution solution 10 mL を加え希釈した。プロトプラストは 0.4 M mannitol 含有 MS 培地 4 mL で再懸濁し、23℃で16時間穏やかに振とうした。
(3) シロイヌナズナ培養細胞における GFP−重金属トランスポーターまたはSYP121, AtVAM3融合タンパク質の蛍光観察
GFP 融合タンパク質の発現を観察する前処理として、0.4 M mannitol及び200 μM Brefeldin A を含む培地で、細胞を2 時間培養した。 細胞の蛍光観察は、コンフォーカル顕微鏡を用いて行った。
(4) 結果
重金属トランスポーター遺伝子の植物ベクターへの組換えプラスミドの構築については、上に記載した各鋳型と各プライマーの組合せで、各重金属トランスポーター遺伝子を増幅させ、merC、merEおよびmerF遺伝子を、それぞれベクターCaMV35S-sGFP (S65T)-NOS3’のBgl IIとKpn I サイトに組換え、プラスミド pGC3 、pGE18 及び pGF7 と命名した。これらのプラスミドマップは図9に示した。merC、 merE または merF 遺伝子を SYP121 をもつベクターCaMV35S-sGFP (S65T)-NOS3’の SalI サイトに組換え、それぞれプラスミド pCS121.28、pES121.3及び pFS121.3 と命名した。これらのプラスミドマップは図10に示した。merCまたは merE 遺伝子は AtVAM3 をもつベクターCaMV35S-sGFP (S65T)-NOS3’の BspEIサイトに組換え、それぞれプラスミド pCV9 及び pEV12と命名した。これらのプラスミドマップは図11に示した。図9〜11に示したプラスミドの外来遺伝子は上述したように PCR産物である。PCR 反応の途中においては DNA増幅時に鋳型と異なる DNA塩基が挿入されている可能性がある。そこで、PCR による DNA増幅が正しく行われたことを確認するため、これらのプラスミドの外来遺伝子の塩基配列をシークエンスした。その結果、クローニングしたDNA の塩基配列は正常であることを確認した。
(1)merC, merC-SYP121, merC-AtVAM3, merE, merE-SYP121, merF, merF-SYP121 のバイナリーベクター pMAT137への組換え
(1-1) プライマーの作成
merC:U-Not-merC : 5’AAGGAAAAAAGCGGCCGCATGGGACTGATGACAC 3’ (配列番号23)
L-Xba-merC : 5’GCTCTAGATCACAAGCGCTTGGCG 3’ (配列番号24)
merC-SYP121 :U-Not-merC : 5'AAGGAAAAAAGCGGCCGCATGGGACTGATGACAC 3' (配列番号23)
L-Spe-SYP121: 5 ’GACTAGTTCAACGCAATAGACGCCTTG 3 ’ (配列番号25)
merC-AtVAM3 :U-Not-merC : 5'AAGGAAAAAAGCGGCCGCATGGGACTGATGACAC 3' (配列番号23)
L-Xba-AtVAM3: 5 ’GCTCTAGATCAAGCTGCGAGTACTAT 3’ (配列番号26)
merE : U-Not-merE : 5 ’AAGGAAAAAAGCGGCCGCATGAACGCCCCTGACAAACT 3'(配列番号27)
L-Xba-merE : 5 ’GCTCTAGATCATGATCCGCCCCGGAAGG 3’ (配列番号28)
merE-SYP121 : U-Not-merE : 5’AAGGAAAAAAGCGGCCGCATGAACGCCCCTGACAAACT 3'(配列番号 27)
L-Spe-SYP121: 5 ’GACTAGTTCAACGCAATAGACGCCTTG 3 ’ (配列番号25)
merF : U-Not-merF: 5’AAGGAAAAAAGCGGCCGCATGAAAGACCCGAAGACACTG 3 ’ (配列番号29)
L-Xba-merF: 5’GCTCTAGATCATTTTTTTACTCCATTGAAT3 ’ (配列番号30)
merF-SYP121 : U-Not-merF: 5 ’AAGGAAAAAAGCGGCCGCATGAAAGACCCGAAGACACTG 3' (配列番 号29)
L-Spe-SYP121: 5 ’GACTAGTTCAACGCAATAGACGCCTTG 3 ’ (配列番号25)
(1-2)PCR法による遺伝子の増幅
実施例3の(1-12)で得られたplasmid を鋳型とし、上記プライマーを用いて、PCR 法に従い遺伝子を増幅させた。
(1-3) 遺伝子の精製
PCR 溶液にPB緩衝液 500μL を加え、軽く撹拌した。この溶液を、エッペンドルフチューブにセットした QIAquick spin column に移し、室温で 13000 rpm、30秒間遠心分離した。この column を新しいエッペンドルフチューブにセットし、PE緩衝液 750μL をのせた。次に、室温で 13000 rpm、30秒間遠心分離し、columnを新しいエッペンドルフチューブにセットした。この column に EB 緩衝液 50 μL をのせ、室温で 13000 rpm、30秒間遠心分離し、得られたろ液を DNA試料溶液とした。
(1-4) Agarose gel 電気泳動法による遺伝子フラグメントの検出
得られた DNA試料溶液を、0.8 % agarose gel を支持体とした agarose gel電気泳動法を用いて分離分析した。泳動後、agarose gel を1mg/mLエチジウムブロマイド溶液に浸し、紫外線照射下で DNAを検出した。
(1-5) 遺伝子フラグメントの調製
上記(1-3) で精製した DNA試料溶液を制限酵素Not I 及び Xba IまたはSpe I で4 時間、37℃で消化させた。この反応溶液に1/10容量の ethanolを加え、-80 ℃で15分放置した。次に、4 ℃で 15000 rpm、10分間遠心分離し、得られた DNA沈殿を 70 % ethanol で洗浄後、減圧乾燥した。この DNA沈殿を精製水 50 μL に溶解し、遺伝子フラグメントとした。
(1-6) ベクター pMAT137の調製
バイナリーベクター pMAT137 (京都府立大学人間環境学部の佐藤雅彦准教授より譲渡) は制限酵素Not I 及び Xba Iで1 時間、37℃で消化させた。次に、DNA 切断部位の3 ’末端リン酸基を Bacterial alkaline phosphatase 処理により除去した。
(1-7) ライゲーション
遺伝子フラグメントとベクターを混和した。次に、ligation kitを用いて室温で 15 分反応させることにより、遺伝子フラグメントとベクターを連結させた。
(1-8) 形質転換
大腸菌 XL1-Blue Subcloning-Grade Competent Cellsに、上記(1-7) で作成した遺伝子フラグメントを加え、30分間氷冷した。次に、この溶液を42℃で30秒間保温後、5 分間氷冷した。さらに、SOC 培地を加えて、37℃で50分間振とう培養した。この培養液を kanamycin含有 LB 寒天培地に塗布し、37℃で一晩培養してコロニーを得た。
(1-9) ダイレクトPCR 法による遺伝子の確認
ダイレクトPCR は、目的の鋳型遺伝子のかわりに、上記で得られた大腸菌のコロニーを鋳型として用いる方法である。また、コロニーのダイレクトPCR において、以下のプライマーの組合せを用いることにより、挿入された遺伝子の向きの確認を行った。プライマーの組合せの例は、primer 35S及び primer Tnos、primer 35S及びクローニングに用いたLower primer、primer Tnos 及びクローニングに用いたUpper primer、または35S 及びクローニングに用いたUpper primerである。反応溶液の組成は、PCR reaction buffer 2 μL 、2.5 mM dNTP 混合液 1.6μL 、10 pM primer upper及び lower各1 μL 、Taq DNA polymerase 0.2μL に精製水を加えて全量を20μL とした。この溶液に爪楊枝に付けたコロニーを懸濁させた後、94℃にて30秒(熱変性)加温し、94℃にて 60 秒(熱変性)、次いで55℃にて60秒(アニーリング)、72℃にて90秒(相補鎖 DNAの伸長合成)のサイクルを30回繰り返し反応させた。
(1-10)遺伝子の確認
上記(1-9) で確認された遺伝子において、実施例3の(1-11)記載の方法に従ってDNA 溶液を得た。この DNA溶液を DNA試料溶液とし、agarose gel 電気泳動法により遺伝子の検出を行った。
(1-11)組換えプラスミドの塩基配列の確認
実施例3の(1-12)と同様の操作を行い外来遺伝子の塩基配列を決定した。
(4) 組換えプラスミドのアグロバクテリウムへの形質転換及びシロイヌナズナへのアグロバクテリウムの感染
上記(1-11)で得られたプラスミドを用い、インプランタイノベーションズ(株)によるシロイヌナズナ形質転換受託システムを利用し、merC, merC-SYP121, merC-AtVAM3, merE, merE-SYP121, merF またはmerF-SYP121 を組換えたシロイヌナズナの T1 種子をそれぞれ得た。
(5) トランスジェニックシロイヌナズナの作出
上記(4) で得られたT1種子を殺菌液に分散させ、10分置き、滅菌精製水で3 回洗浄した。次に、選択培地のシャーレに少量の水とともに種子を蒔いた。パラフィルムで封をし、4 ℃に数日置いた。その後、22℃に移し発芽させた。その後、図16及び図17に示したスキームに従い、T2種子、T3種子、T4種子を得た。
(6) トランスジェニックシロイヌナズナにおける各遺伝子の発現
(6-1) 遺伝子組換えシロイヌナズナにおける各遺伝子の確認
作出した遺伝子組換えシロイヌナズナ(T1, T2, T3)の苗木約15株の葉から、常法に従って、それぞれゲノムDNA を抽出した。得られたゲノムDNA をそれぞれ鋳型として、常法に従ってPCR 反応を行い、予期したDNA の増幅断片が検出できた株を、遺伝子組換え植物とした。この時に用いるプライマーは、組換えたmerC遺伝子、merE遺伝子、merF遺伝子、SYP121遺伝子、AtVAM3遺伝子それぞれに特異的な塩基配列を複数ヶ所選んで作成した。内部標準としてはNPTII を用いた。
(6-2) 遺伝子組換えシロイヌナズナにおける各遺伝子のmRNAの発現
作出した遺伝子組換えシロイヌナズナ(T1, T2, T3)の苗木約15株の葉から、常法に従って、それぞれtotal RNA を抽出した。得られた total RNAを鋳型として、常法に従って逆転写反応を行い、cDNAを得た。このcDNAをそれぞれ鋳型として、常法に従ってPCR 反応を行い、予期したDNA の増幅断片が検出できた株は、目的のmRNAを発現している遺伝子組換え植物とした。この時に用いるプライマーは、組換えたmerC遺伝子、merE遺伝子、merF遺伝子、SYP121遺伝子、AtVAM3遺伝子それぞれに特異的な塩基配列を複数ヶ所選んで作成した。内部標準としてはβ-actinを用いた。
(6-3) 遺伝子組換えシロイヌナズナにおける各融合タンパク質の発現
作出した遺伝子組換えシロイヌナズナ(T1, T2, T3)の苗木約15株の葉から、常法に従って、それぞれタンパク質を抽出した。得られたタンパク質を用い、ウエスタンブロット法に従って目的のタンパク質の発現を調べた。MerC, MerE, MerFは常法に従って精製し、ウサギに免疫した。二度の追加免疫の後、全血採血して得られた血清をProteinAにより精製し、それぞれ抗MerC抗体、抗MerE抗体、抗MerF抗体とした。
(7) トランスジェニックシロイヌナズナの水銀蓄積及び水銀耐性の評価
上記(5) で得られたT1, T2, T3種子をそれぞれ種々の濃度の無機水銀を含む選択培地に蒔いた。人工気象器 (サンヨー製インキュベーターMLR-351)内(22℃)で約2週間育成後、生重量を測定することで水銀耐性を評価した。また、同様の条件で育成後、還元気化原子吸光光度法により、生重量あたり総水銀量を測定することで、水銀蓄積量を評価した。
(8) トランスジェニックシロイヌナズナのカドニウム蓄積の評価
上記(5) で得られたT3種子を選択培地に蒔いた。人工気象器内で約2週間育成後、1/10濃度の液体培地中で一晩水耕栽培した。終濃度10μM 109Cd2+ を添加し、16時間後の植物内への 109Cd2+の取り込み量はガンマシンチレーションカウンター (アロカARC-380CL)を用いて評価した。
(9) 結果
バイナリーベクターpMAT137 への遺伝子組換えについては、上記(1) に記載した各鋳型と各プライマーの組合せで、各遺伝子(merC, merC-SYP121, merC-AtVAM3, merE, merE-SYP121, merF, merF-SYP121)を増幅させた。(1) に記載の操作に従い、merC, merC-SYP121, merC-AtVAM3, merE, merE-SYP121, merF または merF-SYP121遺伝子はベクター pMAT137のXba I サイトに組換え、それぞれプラスミド pMAC5、pMAC121.1 、pMACV1、pMAE8 、pMAES121.9、pMAF30、及び pMAFS121.10と命名した。これらのプラスミドマップは図18から図20に示した。これらのプラスミドの外来遺伝子は上述したように PCR産物である。PCR 反応の途中においては DNA増幅時に鋳型と異なる DNA塩基が挿入されている可能性がある。そこで、これらのプラスミドの外来遺伝子の塩基配列をシークエンスした。その結果、クローニングしたDNA の塩基配列は正常であることを確認した。これらの遺伝子組換えプラスミドを用いて、インプランタイノベーションズ(株)によるシロイヌナズナ形質転換受託システムを利用し、merC, merC-SYP121, merC-AtVAM3, merE, merE-SYP121, merF またはmerF-SYP121 を組換えたシロイヌナズナの T1 種子をそれぞれ得た。得られた種の中から約1000から5000個の種を消毒し、無菌操作にて選択培地に種子を蒔いた。遺伝子組換えクローンと非組換えクローンの選抜は、選択培地にはカナマイシンを添加しており、これにより遺伝子を組換えたクローンのみが発芽し、その後大きく成長することを指標に遺伝子組換え体を選抜した。図16にはその一例を示した。非組換えクローンであっても発芽はするが、その後生育が止まってしまう。一方、目的の遺伝子組換えクローンは、他よりも明らかに大きな地上茎が観察された(図16)。これらの遺伝子組換えクローンを土に移し、T2種子を収穫した。さらに図17に示した操作に従って、T3, T4種子をそれぞれ収穫するとともに、それぞれの段階での植物体を用いて、ゲノムPCR により目的遺伝子のゲノムへの組換え、RT-PCRにより各遺伝子の発現をmRNAレベル、ウエスタンブロッティングよりタンパク質レベルをそれぞれ確認した。さらにその植物体を用いて、重金属耐性及び蓄積性について検討した。
Claims (8)
- merE遺伝子およびmerF遺伝子からなる群より選ばれる微生物由来の重金属トランスポーター遺伝子と、シンタキシン(SNARE)遺伝子とを導入した水銀高蓄積性の形質転換植物。
- シンタキシン(SNARE)遺伝子がSYP121遺伝子およびAtVAM3遺伝子からなる群より選ばれる遺伝子である請求項1記載の形質転換植物。
- 請求項1または2記載の形質転換植物を用いて、媒体中の無機水銀及び/又は有機水銀を吸収蓄積させることを含む、無機水銀及び/又は有機水銀汚染媒体を浄化する方法。
- 媒体が土壌である、請求項3記載の方法。
- merE遺伝子を導入した形質転換細胞を用いて、無機水銀及び/又は有機水銀を該細胞に吸収させることを含む、無機水銀及び/又は有機水銀を含有する媒体を浄化する方法。
- 有機水銀がメチル水銀である請求項5記載の方法。
- merF遺伝子を導入した形質転換細胞を用いて、有機水銀を該細胞に吸収させることを含む、有機水銀を含有する媒体を浄化する方法。
- 有機水銀がメチル水銀である請求項7記載の方法。
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