JP2810888B2 - プローブ - Google Patents
プローブInfo
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Description
【０００１】
【産業上の利用分野】本発明は、ヒトＶＮＴＲ配列及び
その用途に関する。本発明のヒトＶＮＴＲ配列は、親子
鑑定や犯罪捜査等における個人識別に利用することがで
きる。
その用途に関する。本発明のヒトＶＮＴＲ配列は、親子
鑑定や犯罪捜査等における個人識別に利用することがで
きる。
【０００２】
【従来の技術】染色体ＤＮＡは生物種ごとに固有の塩基
配列を持つが、詳細に見ると同一種内でも個体間でわず
かに違いが見られる。これはＤＮＡ多型と呼ばれるが、
この多型が制限酵素の認識部位に出現した場合には制限
酵素による切断断片の大きさ（長さ）の違いとしてサザ
ンブロット法等により容易に検出することができるの
で、特に制限断片長多型（ｒｅｓｔｒｉｃｔｉｏｎ ｆ
ｒａｇｍｅｎｔ ｌｅｎｇｔｈ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉ
ｓｍ、ＲＦＬＰ）と呼ばれる。従って、この制限断片長
多型を利用して、個人の識別が可能であり、親子鑑定や
犯罪捜査における個人識別に利用されている。動物ＤＮ
Ａのタンパク質非コード領域中には、繰り返し頻度が変
化し易い直列型繰り返し配列が存在する。この配列を含
む制限断片は繰り返し配列の反復回数の違いにより、制
限断片長の多型を示す。この型のものはＶＮＴＲ（ｖａ
ｒｉａｂｌｅ ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ ｔａｎｄｅｍ ｒ
ｅｐｅａｔ）と呼ばれ（Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３５，１６
１６（１９８７））、個人識別などのＤＮＡ診断におい
て有力なマーカーとなっている。従来よりマーカーとし
て利用できる制限断片長多型を示すＶＮＴＲは多数知ら
れているが、同時利用できるマーカーの数が増えれば、
それだけ検査の精度は高まるので有効である。
配列を持つが、詳細に見ると同一種内でも個体間でわず
かに違いが見られる。これはＤＮＡ多型と呼ばれるが、
この多型が制限酵素の認識部位に出現した場合には制限
酵素による切断断片の大きさ（長さ）の違いとしてサザ
ンブロット法等により容易に検出することができるの
で、特に制限断片長多型（ｒｅｓｔｒｉｃｔｉｏｎ ｆ
ｒａｇｍｅｎｔ ｌｅｎｇｔｈ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉ
ｓｍ、ＲＦＬＰ）と呼ばれる。従って、この制限断片長
多型を利用して、個人の識別が可能であり、親子鑑定や
犯罪捜査における個人識別に利用されている。動物ＤＮ
Ａのタンパク質非コード領域中には、繰り返し頻度が変
化し易い直列型繰り返し配列が存在する。この配列を含
む制限断片は繰り返し配列の反復回数の違いにより、制
限断片長の多型を示す。この型のものはＶＮＴＲ（ｖａ
ｒｉａｂｌｅ ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ ｔａｎｄｅｍ ｒ
ｅｐｅａｔ）と呼ばれ（Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３５，１６
１６（１９８７））、個人識別などのＤＮＡ診断におい
て有力なマーカーとなっている。従来よりマーカーとし
て利用できる制限断片長多型を示すＶＮＴＲは多数知ら
れているが、同時利用できるマーカーの数が増えれば、
それだけ検査の精度は高まるので有効である。
【０００３】
【発明が解決しようとする課題】従って、本発明の目的
は、制限断片長多型を示す新規なＶＮＴＲ配列を有する
プローブを提供することである。
は、制限断片長多型を示す新規なＶＮＴＲ配列を有する
プローブを提供することである。
【０００４】
【課題を解決するための手段】本願発明者らは、鋭意研
究の結果、ヒトの第６染色体中にＲＦＬＰを示す新規な
ＶＮＴＲ配列を見出し、本発明を完成した。
究の結果、ヒトの第６染色体中にＲＦＬＰを示す新規な
ＶＮＴＲ配列を見出し、本発明を完成した。
【０００５】すなわち本発明は、ヒト６番染色体のｑ２
７の位置に存在し、ＭｓｐＩ、ＲｓａＩ、ＴａｑＩ、Ｂ
ｇｌII、ＰｓｔＩ、ＰｖｕIIにより制限断片長多型を示
し、ＭｓｐＩにより４．４ｋｂから１．８ｋｂの間に少
くとも９個の対立遺伝子が存在し、ＲｓａＩに関して
５．５ｋｂから１．７ｋｂの間に少くとも１１個の対立
遺伝子が存在し、ＴａｑＩに関して８．５ｋｂから２．
６ｋｂの間に少くとも１２個の対立遺伝子が存在し、Ｂ
ｇｌIIに関して１０ｋｂから２．１ｋｂの間に少なくと
も１２個の対立遺伝子が存在し、ＰｓｔＩに関して５．
２ｋｂから０．５ｋｂの間に少くとも１１個の対立遺伝
子が存在し、ＰｖｕIIに関して１０ｋｂから２．３ｋｂ
の間に少くとも１０個の対立遺伝子が存在し、 ATGGCTCACAGAACTAACAAAACCTAGCGGATGGAACCGC CCTTCACAGTAGCACAGAGTGGGGCTCCAGGAAGCCAACT TCTCTCTGGCATGGGCACCTCAGGGGCACTTGGTGCGGCC CCTGCCTTCTCCCAGGAAGGCCCCCTCCTCCTGCCCTCCC CGCTGACTCAAGCCGGGATGGACTCAGAAGGACATGCCAG CTCTGCTTCCGATGCTGACTGTGTGGCCACCTCCACCGCC CTCTCTGTTTTTCCTCACTCAGTATCCCCCTTCCCCTTGC CCAGCCTCCTGCCTTAGTCTGTGTGGTGGAAAGGGGGGAA GGAAGCTTTGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGAGGCCAGGCTC CGCTGCAGCTCCCAGCCAGGCAGTGCAGACATTAAGGAGG ・・・ CCATGGAGGCTGATCTGCCCCCTCTGCCCAGCATCCTCCA GCCCCGCACCGGCATCTTTCCCAGCGCAGTTCCCCCTCAC TAGCCTGTGGCCAGGATCACATGGAGTCATTTTCTGAGGC ACTCGGTGGAGTTTCTGCCGGTGGAAGACACCGCAGAAAC ACCCATTACTTGTTAGTTTTCAGGATTTAGCTGTTTCTCC TGCCTGGGGAGGTGGTGGCGCTGGCAGTGGGAGCATGGAG CCGGAAGCCTGGCCCGCACTCCTCCCGGGCTGCCCTCATC CC （ただし、上記配列中、「・・・」は、 RWGGRRRTGGGGRCCY （ただし、この配列中、ＲはＧ又はＡ、ＷはＴ又はＡ、
ＹはＣ又はＴを示す）で示される配列が１回以上繰り返
していることを意味する）で示される塩基配列を有する
ヒトＶＮＴＲ配列を有するプローブを提供する。
７の位置に存在し、ＭｓｐＩ、ＲｓａＩ、ＴａｑＩ、Ｂ
ｇｌII、ＰｓｔＩ、ＰｖｕIIにより制限断片長多型を示
し、ＭｓｐＩにより４．４ｋｂから１．８ｋｂの間に少
くとも９個の対立遺伝子が存在し、ＲｓａＩに関して
５．５ｋｂから１．７ｋｂの間に少くとも１１個の対立
遺伝子が存在し、ＴａｑＩに関して８．５ｋｂから２．
６ｋｂの間に少くとも１２個の対立遺伝子が存在し、Ｂ
ｇｌIIに関して１０ｋｂから２．１ｋｂの間に少なくと
も１２個の対立遺伝子が存在し、ＰｓｔＩに関して５．
２ｋｂから０．５ｋｂの間に少くとも１１個の対立遺伝
子が存在し、ＰｖｕIIに関して１０ｋｂから２．３ｋｂ
の間に少くとも１０個の対立遺伝子が存在し、 ATGGCTCACAGAACTAACAAAACCTAGCGGATGGAACCGC CCTTCACAGTAGCACAGAGTGGGGCTCCAGGAAGCCAACT TCTCTCTGGCATGGGCACCTCAGGGGCACTTGGTGCGGCC CCTGCCTTCTCCCAGGAAGGCCCCCTCCTCCTGCCCTCCC CGCTGACTCAAGCCGGGATGGACTCAGAAGGACATGCCAG CTCTGCTTCCGATGCTGACTGTGTGGCCACCTCCACCGCC CTCTCTGTTTTTCCTCACTCAGTATCCCCCTTCCCCTTGC CCAGCCTCCTGCCTTAGTCTGTGTGGTGGAAAGGGGGGAA GGAAGCTTTGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGAGGCCAGGCTC CGCTGCAGCTCCCAGCCAGGCAGTGCAGACATTAAGGAGG ・・・ CCATGGAGGCTGATCTGCCCCCTCTGCCCAGCATCCTCCA GCCCCGCACCGGCATCTTTCCCAGCGCAGTTCCCCCTCAC TAGCCTGTGGCCAGGATCACATGGAGTCATTTTCTGAGGC ACTCGGTGGAGTTTCTGCCGGTGGAAGACACCGCAGAAAC ACCCATTACTTGTTAGTTTTCAGGATTTAGCTGTTTCTCC TGCCTGGGGAGGTGGTGGCGCTGGCAGTGGGAGCATGGAG CCGGAAGCCTGGCCCGCACTCCTCCCGGGCTGCCCTCATC CC （ただし、上記配列中、「・・・」は、 RWGGRRRTGGGGRCCY （ただし、この配列中、ＲはＧ又はＡ、ＷはＴ又はＡ、
ＹはＣ又はＴを示す）で示される配列が１回以上繰り返
していることを意味する）で示される塩基配列を有する
ヒトＶＮＴＲ配列を有するプローブを提供する。
【０００６】上述のように、本発明は、上記した特徴を
有するｃＣＩ６−１１１と命名したヒトＶＮＴＲ配列を
有するプローブを提供したものである。なお、本発明に
おいて、例えば、「ＭｓｐＩに関して４．４ｋｂから
１．８ｋｂの間に少くとも９個の対立遺伝子が存在す
る」とは、下記説明から明らかなように、ＭｓｐＩで消
化した場合に、４．４ｋｂから１．８ｋｂの範囲内のサ
イズを有する、サイズの異なる制限断片が少なくとも９
種類存在するという意味である。
有するｃＣＩ６−１１１と命名したヒトＶＮＴＲ配列を
有するプローブを提供したものである。なお、本発明に
おいて、例えば、「ＭｓｐＩに関して４．４ｋｂから
１．８ｋｂの間に少くとも９個の対立遺伝子が存在す
る」とは、下記説明から明らかなように、ＭｓｐＩで消
化した場合に、４．４ｋｂから１．８ｋｂの範囲内のサ
イズを有する、サイズの異なる制限断片が少なくとも９
種類存在するという意味である。
【０００７】上記ヒトＶＮＴＲ配列は、後述の実施例に
おいて示すように、公知の方法（Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ．Ｇ
ｅｎｅｔ．４８，２５８（１９９１）； Ｇｅｎｏｍｉ
ｃｓ９，５３６（１９９１））により、ヒト６番染色体
を分析し、発見されたＶＮＴＲマーカーをクローニング
して得られたものである。
おいて示すように、公知の方法（Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ．Ｇ
ｅｎｅｔ．４８，２５８（１９９１）； Ｇｅｎｏｍｉ
ｃｓ９，５３６（１９９１））により、ヒト６番染色体
を分析し、発見されたＶＮＴＲマーカーをクローニング
して得られたものである。
【０００８】本発明のヒトＶＮＴＲ配列は、そのＤＮＡ
鎖をプローブとして利用することにより個体識別等に用
いることができる。その利用方法は従来法と全く同様で
あり、該ＤＮＡ鎖に周知の方法により標識を付すことに
より、サザンブロット法におけるプローブとして利用で
きる。また試料を予め遺伝子増幅法により増幅し、この
ようにして増幅したＤＮＡを検出するプローブとしても
利用できる。
鎖をプローブとして利用することにより個体識別等に用
いることができる。その利用方法は従来法と全く同様で
あり、該ＤＮＡ鎖に周知の方法により標識を付すことに
より、サザンブロット法におけるプローブとして利用で
きる。また試料を予め遺伝子増幅法により増幅し、この
ようにして増幅したＤＮＡを検出するプローブとしても
利用できる。
【０００９】
【発明の効果】本発明により新規なヒトＶＮＴＲ配列を
有するプローブが提供された。本発明は、個体識別等を
従来よりも高精度に行なうことに寄与する。
有するプローブが提供された。本発明は、個体識別等を
従来よりも高精度に行なうことに寄与する。
【００１０】
【実施例】ヒト第６染色体のみを含むヒト×マウス雑種
細胞Ａ９（ｎｅｏ６／ｔ）よりＤＮＡを抽出し、制限酵
素Ｓａｕ３ＡＩにて部分的に切断した後、ショ糖密度勾
配遠心を行ない、３５−４２ｋｂ分画を分取した。３５
−４２ｋｂＤＮＡ断片は、Ｋｌｅｎｏｗ酵素を用い、ｄ
ＣＴＰ、ｄＴＴＰにて部分的に挿入した。
細胞Ａ９（ｎｅｏ６／ｔ）よりＤＮＡを抽出し、制限酵
素Ｓａｕ３ＡＩにて部分的に切断した後、ショ糖密度勾
配遠心を行ない、３５−４２ｋｂ分画を分取した。３５
−４２ｋｂＤＮＡ断片は、Ｋｌｅｎｏｗ酵素を用い、ｄ
ＣＴＰ、ｄＴＴＰにて部分的に挿入した。
【００１１】コスミドベクターはｐＷＥＸ１５を用い
た。これはｐＷＥ１５（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａ
ｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８４，２１６０（１９８７））の
ＢａｍＨＩ部位をＫｌｅｎｏｗ酵素を用いて挿入した
後、リンカー（５´−ＣＣＴＣＧＣＧＡＧＧ−３´）を
用いて制限酵素ＸｈｏＩの認識部位に変換したものであ
る。ｐＷＥＸ１５は制限酵素ＸｈｏＩにて切断した後、
Ｋｌｅｎｏｗ酵素を用い、ｄＣＴＰ、ｄＴＴＰにて部分
的に挿入した。
た。これはｐＷＥ１５（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａ
ｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８４，２１６０（１９８７））の
ＢａｍＨＩ部位をＫｌｅｎｏｗ酵素を用いて挿入した
後、リンカー（５´−ＣＣＴＣＧＣＧＡＧＧ−３´）を
用いて制限酵素ＸｈｏＩの認識部位に変換したものであ
る。ｐＷＥＸ１５は制限酵素ＸｈｏＩにて切断した後、
Ｋｌｅｎｏｗ酵素を用い、ｄＣＴＰ、ｄＴＴＰにて部分
的に挿入した。
【００１２】３５−４２ｋｂＤＮＡ断片とベクターＤＮ
Ａ（ｐＷＥＸ１５）を６６ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐ
Ｈ７．５）、６．６ｍＭ ＭｇＣｌ2 、０．１ｍＭ Ａ
ＴＰ、１０ｍＭ ＤＴＴ、Ｔ４ＤＮＡリガーゼ存在下１
６℃で１晩ライゲーションを行ないｉｎ ｖｉｔｒｏ
ｐａｃｋａｇｉｎｇ ｅｘｔｒａｃｔｓ （Ｇｉｇａｐ
ａｃｋ Ｇｏｌｄ）を用い、パッケージングを行なっ
た。
Ａ（ｐＷＥＸ１５）を６６ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐ
Ｈ７．５）、６．６ｍＭ ＭｇＣｌ2 、０．１ｍＭ Ａ
ＴＰ、１０ｍＭ ＤＴＴ、Ｔ４ＤＮＡリガーゼ存在下１
６℃で１晩ライゲーションを行ないｉｎ ｖｉｔｒｏ
ｐａｃｋａｇｉｎｇ ｅｘｔｒａｃｔｓ （Ｇｉｇａｐ
ａｃｋ Ｇｏｌｄ）を用い、パッケージングを行なっ
た。
【００１３】コスミドクローンを５０μｇ／ｍｌアンピ
シリンを含むＬＢアガープレート上に、１０−１５コロ
ニー／ｃｍ2 の密度になるように合計１６０，０００個
まいた。32Ｐ標識したヒトＤＮＡをプローブとしてコロ
ニーハイブリダイゼーションを行ない、ヒトＤＮＡを含
んでいるコロニーを選択し、９６穴マイクロプレートに
保存した。
シリンを含むＬＢアガープレート上に、１０−１５コロ
ニー／ｃｍ2 の密度になるように合計１６０，０００個
まいた。32Ｐ標識したヒトＤＮＡをプローブとしてコロ
ニーハイブリダイゼーションを行ない、ヒトＤＮＡを含
んでいるコロニーを選択し、９６穴マイクロプレートに
保存した。
【００１４】各々のコスミドクローンから自動プラスミ
ド抽出システム（ＰＩ−１００）を用いてＤＮＡ抽出し
た。このＤＮＡをｒａｎｄｏｍ ｈｅｘａｎｕｃｌｅｏ
ｔｉｄｅ−ｐｒｉｍｉｎｇ法（Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅ
ｍ．１３７，２６６（１９８４））にて32Ｐ標識し、プ
ローブとした。
ド抽出システム（ＰＩ−１００）を用いてＤＮＡ抽出し
た。このＤＮＡをｒａｎｄｏｍ ｈｅｘａｎｕｃｌｅｏ
ｔｉｄｅ−ｐｒｉｍｉｎｇ法（Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅ
ｍ．１３７，２６６（１９８４））にて32Ｐ標識し、プ
ローブとした。
【００１５】互いに無関係な６人のヒトより抽出したＤ
ＮＡを各々制限酵素ＭｓｐＩ、ＴａｑＩ、ＲｓａＩ、Ｂ
ｇｌII、ＰｓｔＩ、ＰｖｕIIにて切断し、サザンブロッ
トした。
ＮＡを各々制限酵素ＭｓｐＩ、ＴａｑＩ、ＲｓａＩ、Ｂ
ｇｌII、ＰｓｔＩ、ＰｖｕIIにて切断し、サザンブロッ
トした。
【００１６】プレハイブリダイゼーションは１０％ＳＤ
Ｓ−７％ポリエチレングリコール（８０００）、２００
μｇ／ｍｌヒト胎盤ＤＮＡを含む溶液にて６５℃１晩行
なった。ハイブリダイゼーションは32Ｐ標識したＤＮＡ
プローブにて６５℃１６〜２４ｈｒ行なった。ハイブリ
ダイゼーション後、フィルターを０．１×ＳＳＣ−０．
１％ＳＤＳ溶液で６５℃２回洗浄後、Ｋｏｄａｋ ＸＡ
Ｒフィルムを用い、オートラジオグラフィーを行なっ
た。
Ｓ−７％ポリエチレングリコール（８０００）、２００
μｇ／ｍｌヒト胎盤ＤＮＡを含む溶液にて６５℃１晩行
なった。ハイブリダイゼーションは32Ｐ標識したＤＮＡ
プローブにて６５℃１６〜２４ｈｒ行なった。ハイブリ
ダイゼーション後、フィルターを０．１×ＳＳＣ−０．
１％ＳＤＳ溶液で６５℃２回洗浄後、Ｋｏｄａｋ ＸＡ
Ｒフィルムを用い、オートラジオグラフィーを行なっ
た。
【００１７】ＲＦＬＰを示したコスミドクローンについ
ては、ビオチン標識プローブによる蛍光ｉｎ ｓｉｔｕ
ハイブリダイゼーションを行ない、染色体上の位置を決
定した。染色体標本は７０％ホルムアミド−２×ＳＳＣ
溶液中で７０℃２分間処理した後、７０％エタノール中
に入れ５分間、さらに１００％エタノール中に入れ５分
間静置し脱水した。
ては、ビオチン標識プローブによる蛍光ｉｎ ｓｉｔｕ
ハイブリダイゼーションを行ない、染色体上の位置を決
定した。染色体標本は７０％ホルムアミド−２×ＳＳＣ
溶液中で７０℃２分間処理した後、７０％エタノール中
に入れ５分間、さらに１００％エタノール中に入れ５分
間静置し脱水した。
【００１８】コスミドＤＮＡは、ニックトランスレーシ
ョンにより、ビオチン１６−ｄＵＴＰ標識した。超音波
処理したニシン精子ＤＮＡ、Ｅ．ｃｏｌｉ ｔＲＮＡを
各々２０μｇ加え、エタノール沈殿した後、ホルムアミ
ド溶液に溶解し、５−１０倍量のヒト胎盤ＤＮＡを加え
７５℃、１０分間変性した。ビオチン標識したプローブ
を染色体標本上に滴下し、３７℃で１晩ハイブリダイゼ
ーションを行なった。
ョンにより、ビオチン１６−ｄＵＴＰ標識した。超音波
処理したニシン精子ＤＮＡ、Ｅ．ｃｏｌｉ ｔＲＮＡを
各々２０μｇ加え、エタノール沈殿した後、ホルムアミ
ド溶液に溶解し、５−１０倍量のヒト胎盤ＤＮＡを加え
７５℃、１０分間変性した。ビオチン標識したプローブ
を染色体標本上に滴下し、３７℃で１晩ハイブリダイゼ
ーションを行なった。
【００１９】標本は５０％ホルムアミド−１×ＳＳＣ、
２×ＳＳＣで各々３７℃１回洗浄した後、１×ＳＳＣで
室温で１５分間洗浄した。４×ＳＳＣ、１５μｇＦＩＴ
Ｃ−アビジン／ｍｌ、１％ＢＳＡ溶液下、３７℃で４５
分間処理し、４×ＳＳＣ、４×ＳＳＣ−０．１％Ｔｒｉ
ｔｏｎＸ、４×ＳＳＣで各々１０分間室温で洗浄した。
２×ＳＳＣで各々３７℃１回洗浄した後、１×ＳＳＣで
室温で１５分間洗浄した。４×ＳＳＣ、１５μｇＦＩＴ
Ｃ−アビジン／ｍｌ、１％ＢＳＡ溶液下、３７℃で４５
分間処理し、４×ＳＳＣ、４×ＳＳＣ−０．１％Ｔｒｉ
ｔｏｎＸ、４×ＳＳＣで各々１０分間室温で洗浄した。
【００２０】標本はｐｒｏｐｉｄｉｕｍ ｉｏｄｉｄｅ
処理した後、顕微鏡にて観察した。
処理した後、顕微鏡にて観察した。
【００２１】ＶＮＴＲを示したコスミドについては、Ｔ
７ Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ Ｋｉｔ（Ｐｈａｒｍａｃｉ
ａ）を用い、塩基配列の決定を行なった。
７ Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ Ｋｉｔ（Ｐｈａｒｍａｃｉ
ａ）を用い、塩基配列の決定を行なった。
【００２２】結果 ｃＣＩ６−１１１をプローブとしてハイブリダイズした
時の結果を図１に示した。ＭｓｐＩにおいては４．４ｋ
ｂから１．８ｋｂの間に９個の対立遺伝子が存在し、６
例中４例で異型接合性を示した。ＲｓａＩにおいては
５．５ｋｂ１．７ｋｂの間に１１個の対立遺伝子が存在
し、６例中６例で異型接合性を示した。ＴａｑＩにおい
ては８．５ｋｂから２．６ｋｂの間に１２個の対立遺伝
子が存在し、６例中６例で異型接合性を示した。Ｂｇｌ
IIにおいては１０ｋｂから２．１ｋｂの間に１２個の対
立遺伝子が存在し、６例中６例で異型接合性を示した。
ＰｓｔＩにおいては、５．２ｋｂから０．５ｋｂの間に
１１個の対立遺伝子が存在し、６例中６例で異型接合性
を示した。ＰｖｕIIにおいては、１０ｋｂから２．３ｋ
ｂの間に１０個の対立遺伝子が存在し、６例中６例で異
型接合性を示した。
時の結果を図１に示した。ＭｓｐＩにおいては４．４ｋ
ｂから１．８ｋｂの間に９個の対立遺伝子が存在し、６
例中４例で異型接合性を示した。ＲｓａＩにおいては
５．５ｋｂ１．７ｋｂの間に１１個の対立遺伝子が存在
し、６例中６例で異型接合性を示した。ＴａｑＩにおい
ては８．５ｋｂから２．６ｋｂの間に１２個の対立遺伝
子が存在し、６例中６例で異型接合性を示した。Ｂｇｌ
IIにおいては１０ｋｂから２．１ｋｂの間に１２個の対
立遺伝子が存在し、６例中６例で異型接合性を示した。
ＰｓｔＩにおいては、５．２ｋｂから０．５ｋｂの間に
１１個の対立遺伝子が存在し、６例中６例で異型接合性
を示した。ＰｖｕIIにおいては、１０ｋｂから２．３ｋ
ｂの間に１０個の対立遺伝子が存在し、６例中６例で異
型接合性を示した。
【００２３】ｃＣＩ６−１１１についてはシーケンシン
グを行ない、繰り返し領域の塩基配列を決定した（図
２）。繰り返し領域の共通配列は下記に示した。
グを行ない、繰り返し領域の塩基配列を決定した（図
２）。繰り返し領域の共通配列は下記に示した。
【００２４】
【化１】
【図１】ｃＣＩ６−１１１をプローブとしてハイブリダ
イズした時の結果を示すオートラジオグラムの模式図。
イズした時の結果を示すオートラジオグラムの模式図。
【図２】ｃＣＩ６−１１１の繰り返し領域の塩基配列を
示す図。
示す図。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (58)調査した分野(Int.Cl.6，ＤＢ名) C12Q 1/68 C12N 15/09 ZNA
Claims (1)
- 【請求項１】 ヒト６番染色体のｑ２７の位置に存在
し、ＭｓｐＩ、ＲｓａＩ、ＴａｑＩ、ＢｇｌII、Ｐｓｔ
Ｉ、ＰｖｕIIにより制限断片長多型を示し、ＭｓｐＩに
関して４．４ｋｂから１．８ｋｂの間に少くとも９個の
対立遺伝子が存在し、ＲｓａＩに関して５．５ｋｂから
１．７ｋｂの間に少くとも１１個の対立遺伝子が存在
し、ＴａｑＩに関して８．５ｋｂから２．６ｋｂの間に
少くとも１２個の対立遺伝子が存在し、ＢｇｌIIに関し
て１０ｋｂから２．１ｋｂの間に少なくとも１２個の対
立遺伝子が存在し、ＰｓｔＩに関して５．２ｋｂから
０．５ｋｂの間に少くとも１１個の対立遺伝子が存在
し、ＰｖｕIIに関して１０ｋｂから２．３ｋｂの間に少
くとも１０個の対立遺伝子が存在し、 ATGGCTCACAGAACTAACAAAACCTAGCGGATGGAACCGC CCTTCACAGTAGCACAGAGTGGGGCTCCAGGAAGCCAACT TCTCTCTGGCATGGGCACCTCAGGGGCACTTGGTGCGGCC CCTGCCTTCTCCCAGGAAGGCCCCCTCCTCCTGCCCTCCC CGCTGACTCAAGCCGGGATGGACTCAGAAGGACATGCCAG CTCTGCTTCCGATGCTGACTGTGTGGCCACCTCCACCGCC CTCTCTGTTTTTCCTCACTCAGTATCCCCCTTCCCCTTGC CCAGCCTCCTGCCTTAGTCTGTGTGGTGGAAAGGGGGGAA GGAAGCTTTGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGAGGCCAGGCTC CGCTGCAGCTCCCAGCCAGGCAGTGCAGACATTAAGGAGG ・・・ CCATGGAGGCTGATCTGCCCCCTCTGCCCAGCATCCTCCA GCCCCGCACCGGCATCTTTCCCAGCGCAGTTCCCCCTCAC TAGCCTGTGGCCAGGATCACATGGAGTCATTTTCTGAGGC ACTCGGTGGAGTTTCTGCCGGTGGAAGACACCGCAGAAAC ACCCATTACTTGTTAGTTTTCAGGATTTAGCTGTTTCTCC TGCCTGGGGAGGTGGTGGCGCTGGCAGTGGGAGCATGGAG CCGGAAGCCTGGCCCGCACTCCTCCCGGGCTGCCCTCATC CC （ただし、上記配列中、「・・・」は、 RWGGRRRTGGGGRCCY （ただし、この配列中、ＲはＧ又はＡ、ＷはＴ又はＡ、
ＹはＣ又はＴを示す）で示される配列が１回以上繰り返
していることを意味する）で示される塩基配列を有する
ヒトＶＮＴＲ配列を有するプローブ。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP7337988A JP2810888B2 (ja) | 1995-12-01 | 1995-12-01 | プローブ |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP7337988A JP2810888B2 (ja) | 1995-12-01 | 1995-12-01 | プローブ |
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| JPH08224100A JPH08224100A (ja) | 1996-09-03 |
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ID=18313891
Family Applications (1)
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Country Status (1)
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-
1995
- 1995-12-01 JP JP7337988A patent/JP2810888B2/ja not_active Expired - Fee Related
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|---|---|
| JPH08224100A (ja) | 1996-09-03 |
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