JP2024503454A - 胚盤胞様細胞凝集物および方法 - Google Patents
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Abstract
本発明は、ヒト多能性幹細胞(hPSCs)および栄養膜細胞の凝集物をHIPPO経路阻害剤を含む培地中で3D培養で培養することを含む、細胞の凝集および培養によって芽球様細胞または胚盤胞様構造を生成する方法;上記方法およびその使用によって得られる芽球様細胞および胚盤胞様細胞凝集物;同様に、胚盤胞の発育および着床を促進する体外受精のための胚盤胞の同様の治療;同様に、胚盤胞の発育および着床を減少させるヒト胚の同様の避妊治療を提供する。
Description
本発明は、細胞の凝集および培養による胚盤胞様構造の生成に関する。
研究されたヒト胚の数が少ないこと、およびそれらを物理的および遺伝的に実験的に操作することが困難であるため、ヒトの初期胚の発生および着床に関する理解は非常に限られている。これらの初期発生および着床メカニズムを研究するために、他の実験モデル生物、通常はマウスが使用されている。しかし現在では、形態学および関与する分子の点でヒトと他の種との間に重要な違いがあることが明らかになっており、ヒトの胚発生の研究が必要となっている。
欧州特許出願第EP2986711A1号は、少なくとも1つの栄養膜細胞(trophoblast cell)および少なくとも一つの多能性細胞を使用する芽球様細胞の生成に関する。
国際公開第2018/175691 Al号は、全能性細胞の生成に関するものである。
国際公開第2020/262531 Al号は、胚盤胞を培養することによって原始内胚葉幹細胞(primordial endoderm stem cell)を生成することを記載している。
RONGHUI Li et al., Cell, Elsevier, Vol.179(3),2019:687は、単一の幹細胞型からの胚盤胞様構造の生成を記載している。
RIVRON Nicolas C et al., Nature, MacMillan Journ. Ltd., Vol.557(7703), 2018: 106-111は、栄養膜細胞および胚性幹細胞からの胎生期3.5日目の胚盤胞の生成を記載している。
VRIJ Erik J. et al., bioRxiv, DOI:10.1101/510396は、胚様体を迅速に誘導して三次元の原始内胚葉/エピブラスト様のニッチを形成するための、タンパク質、GPCRリガンド、および小分子の組み合わせスクリーニングについて記載している。
KIME Cody et al., Stem Cell Reports, 13(3),2019:485-498は、マウス多能性幹細胞培養物から生成された誘導自己組織化3D胚盤胞様シスト(iBLC)について記載している。
要するに、研究のためのヒト胚の使用に代わるインビトロの代替手段に対する切実な必要性が依然として存在する。広く利用可能であり、簡単な遺伝子操作およびハイスループットの薬物スクリーニングに適したモデルが必要である。
したがって、本発明の目的は、そのようなモデルを提供することである。
本発明は、ヒト多能性幹細胞(hPSCs)および栄養膜細胞の凝集物を、HIPPO経路阻害剤を含む培地中で3D培養で培養することを含む、芽球様細胞または胚盤胞様細胞凝集物を生成する方法を提供する。これらの芽球様細胞は、医薬品開発におけるハイスループットの遺伝子スクリーニングまたは医薬品スクリーニングのために使用することができる。この方法は妊娠を誘発するためにも使用することができる。芽球様細胞の使用によって明らかにされる培地の成分および分子は、たとえば体外受精処置中に胚盤胞の発達および着床を改善するために、胚盤胞の挙動を調節するために使用することもできる。
本発明はさらに、HIPPO経路阻害剤、MEK阻害剤、およびTGF-β阻害剤を含む、芽球様細胞の培養に適したキットを提供する。これらの化合物の一つ以上を、ヒト多能性幹細胞(hPSC)を培養するための培地中で組み合わせることができる。
本発明はさらに、上記方法によって取得可能な芽球様細胞および胚盤胞様細胞凝集物を提供する。
少なくとも一つの液体で満たされた空洞およびエピブラスト様細胞(好ましくは、たとえばNanogおよびOct4の発現を特徴とする)およびハイポブラスト様細胞(好ましくは、たとえばGATA4の発現を特徴とする)を含む少なくとも一つの内部細胞塊を取り囲む栄養膜様細胞(好ましくは、たとえばGATA3およびCDX2の発現を特徴とする)の外側上皮単層(outer epithelial monolayer)を含み、ここで、該外側上皮単層は、NR2F2を発現する極性様栄養膜(polar-like trophoblast)を含む、芽球様細胞および胚盤胞様細胞凝集物も提供される。
本発明はさらに、Wnt阻害剤、好ましくはXAV939および/またはLF3で子宮内膜を刺激する工程、芽球様細胞または胚盤胞を刺激された子宮内膜細胞の層と接触させる工程を含む、芽球様細胞または胚盤胞を子宮内膜細胞の層に移植する潜在能力を増大させる、または試験するインビトロ法をさらに提供する; この試験方法では、栄養膜、芽球様細胞、または胚盤胞への付着、侵入、および子宮内膜細胞への分化のレベルをさらに測定する。
本発明はさらに、胚盤胞を子宮内または子宮内膜に移植する前に、Wnt阻害剤の存在下で胚盤胞を子宮内膜と接触させる工程、またはWnt阻害剤で子宮内膜を刺激する工程を含む、たとえば体外受精処置中に胚盤胞着床の確率を増大させる方法において使用するためのWnt阻害剤を提供する。
これに関連して、本発明は、胚盤胞を子宮内または子宮内膜に移植する前に、Wnt阻害剤の存在下で胚盤胞を子宮内膜と接触させる工程、またはWnt阻害剤で子宮内膜を刺激する工程を含む、たとえば体外受精処置中に胚盤胞着床の確率を増大させる方法を提供する。
また、たとえば胚盤胞を子宮内または子宮内膜に移植する前に、Wnt阻害剤の存在下で胚盤胞を子宮内膜と接触させる工程、またはWnt阻害剤で子宮内膜を刺激する工程を含む、体外受精処置中に胚盤胞移植を媒介するための医薬組成物を製造するためのWnt阻害剤の使用も提供される。
さらに、桑実胚期、または胚盤胞期から選択される初期段階の胚を成熟胚盤胞期まで、HIPPO経路阻害剤で処理する工程、および桑実胚期の胚を胚盤胞期まで成長させる工程、もしくは胚盤胞期の胚をより成熟した胚盤胞期(more mature blastocyst stage)まで成長させる工程を含む、たとえば体外受精中の胚盤胞の質を改善するための、着床に適した胚盤胞を作製する方法において使用するためのHIPPO経路阻害剤が提供される。
これに関連して、本発明は、1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、桑実胚期、または胚盤胞期から選択される初期段階の胚を成熟胚盤胞期まで、HIPPO経路阻害剤で処理する工程、および桑実胚期の胚を胚盤胞期まで成長させる工程、もしくは胚盤胞期の胚をより成熟した胚盤胞期(more mature blastocyst stage)まで成長させる工程を含む、胚盤胞の作製方法を提供する。1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、または16細胞期は、卵割期とも呼ばれる。また、たとえば、体外受精処置中の胚盤胞の発生能を改善するための、着床に適した胚盤胞を作製するための医薬組成物の製造のための、HIPPO経路阻害剤の使用も提供され、それは1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、桑実胚期、または胚盤胞期から選択される初期段階の胚を成熟胚盤胞期まで、HIPPO経路阻害剤で処理する工程、および1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期の胚を胚盤胞期まで成長させる工程、もしくは胚盤胞期の胚をより成熟した胚盤胞期(more mature blastocyst stage)まで成長させる工程を含む。
本発明のすべての態様は関連しており、一つの態様に関する特定の実施形態の開示は他の態様にも関連する。たとえば、インビトロでの芽球様細胞、または胚盤胞様細胞凝集物の処理の開示は、体外受精処置およびそれに先行する処理段階における調製のための胚盤胞の調製のためのインビボでの処理についても行うことができる。本発明の方法に関して記載された任意の化合物がキットの一部であってもよい。キットの構成要素およびキットは、本発明の方法および処理に使用することができる。
本発明は、ヒト多能性幹細胞(hPSC)から、一般に芽球様細胞と呼ばれる胚盤胞様細胞凝集物を形成する方法を含む。生体内の胚盤胞とは対照的に、芽球様細胞は大量に生成することができ、遺伝的スクリーニングおよび薬物スクリーニングに適しているが、人工の胚盤胞様細胞凝集物および芽球様細胞がヒト胚を形成またはヒト胚に発育することができないことを考慮すると、ヒト胚の操作に関連する倫理的懸念の一部が軽減される。
胚盤胞様細胞凝集物および芽球様細胞は、薬剤の安全性/有効性または妊娠初期の治療(たとえば、体外受精の処置および避妊法の改善)等の生物医学的知見にとって重要な可能性を秘めたヒト胚モデルである。
本発明の芽球様細胞は第一軸を形成することができ、そのエピブラストは極性栄養外胚葉の成熟を誘導し、その結果、ホルモン刺激された子宮内膜細胞に特異的に付着する可能性を獲得する。このようなヒト芽球様細胞は、ヒトへの移植および発生を調査するための、正確でスケーラブルで多用途かつ倫理的なモデルである。
本明細書で使用される場合、胚盤胞様細胞凝集物、胚盤胞様構造および芽球様細胞という用語は、真の胚盤胞ではなく胚盤胞をモデル化する本発明の方法によって取得可能な組織を反映するために互換的に使用される。胚盤胞という用語はそのような胚を指す。
芽球様細胞は、生物全体を形成する3つの基礎系統、すなわち栄養外胚葉、エピブラスト、およびハイポブラストを反映する組織の付随的な特異化(specification)および空間構成を含む、ヒト胚盤胞の三次元形態学的および分子的特徴を再現する。
ヒト胚盤胞の高忠実度かつ高効率モデルは、科学および医学の進歩をサポートするであろう。しかし、その予測能力は、自然な発育ペースに従って胚盤胞の細胞的特異化(cellular specification)および形態形成の順序を正確に再現する能力に依存する。正確なモデリングにより、胚盤胞期のみを反映した細胞の形成が保証されるだけでなく、着床および着床前後の発生の態様をインビトロで再現することもできる。
本発明はまた、たとえば体外受精(IVF)処置中、または妊娠の可能性を改善するために自然妊娠後の患者を治療する際に、着床の確率を改善するために調製するために(ヒト)胚盤胞を処理することについても記載する。このような処理は、ヒトの胎児またはレシピエントの母親を治療するための本質的に医学的または治療的なものであり得る。このような方法に関して、本発明はまた、治療用の化合物(たとえば、HIPPO経路阻害剤)または治療に使用するための上記化合物を含む医薬組成物の製造にも関する。ヒト胚そのもの、あるいは産業的または商業的目的でのその使用は、本発明の一部ではない可能性がある。
中心的な態様として、本発明は、ヒト多能性幹細胞(hPSC)および栄養膜細胞の凝集物を、HIPPO経路阻害剤を含む培地中で3D培養で培養することを含む、芽球様細胞または胚盤胞様細胞凝集物を生成する方法を提供する。好ましくは、ヒト多能性幹細胞(hPSC)は栄養膜細胞に囲まれているか、または栄養膜細胞に囲まれるようになる。
本発明によれば、本発明による芽球様細胞の形成は、hPSCの三次元凝集物を形成し、HIPPO経路の活性を調節することを達成し、それが胚-非胚軸の形成とともに、エピブラスト、栄養外胚葉、およびハイポブラスト様細胞の同時特異化(concomitant specification)および三次元自己組織化を引き起こす。したがって、HIPPO経路阻害剤は、芽球様細胞を生成するための本発明の中心的な態様として使用される。
本発明は、hPSCからの(i)エピブラスト様細胞、(ii)栄養外胚葉様細胞、および(iii)ハイポブラスト様細胞の3つの細胞型の同時形成の誘導、ならびにヒト胚盤胞と形態学的かつ分子的に類似した構造へのそれらの自己組織化を初めて提供し、それによって、栄養外胚葉、エピブラスト、およびハイポブラストを反映する、同時の細胞系統の分離、形態形成、および組織の成熟によって制約される3D形態学的変化を再現する。
結果として生じる芽球様細胞は、たとえばエストロゲン、プロゲステロン、cAMP、およびWnt阻害剤XAV939および/またはLF3による刺激により受容性が高められると、インビトロで子宮内膜細胞の層またはインビボで子宮の内膜細胞である子宮内膜と活発に相互作用することができる。胚盤胞と同様に、芽球様細胞の子宮内膜細胞への付着、侵入、および分化は主に極性栄養外胚葉、つまりエピブラスト細胞と隣接する栄養膜を介して起こる。着床すると、芽球様細胞の極性栄養膜が増殖、分化し、臨床妊娠を示すために使用されるホルモンであるヒト絨毛性ゴナドトロピンを産生する。
したがって、本発明の方法は、以下の用途に有用である。
1.妊娠初期の理解および管理のための遺伝子スクリーニングおよび薬物スクリーニング;
2.避妊薬および不妊治療薬の開発;
3.体外受精の培養条件の開発;
4.医薬品開発のためのインビトロ毒性/安全性アッセイ;
5.インビトロアッセイおよびインビボ移植のための特定の細胞、組織、および器官のインビトロ形成。
1.妊娠初期の理解および管理のための遺伝子スクリーニングおよび薬物スクリーニング;
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5.インビトロアッセイおよびインビボ移植のための特定の細胞、組織、および器官のインビトロ形成。
本発明は、ヒト多能性幹細胞(hPSC)および栄養膜細胞の凝集物を、HIPPO経路阻害剤を含む培地中で3D培養で培養する工程を含む。好ましくは、ヒト多能性幹細胞(hPSC)は、この方法工程において栄養膜細胞によって取り囲まれるか、またはヒト多能性幹細胞(hPSC)は、たとえば、前工程、たとえばHIPPO経路阻害剤を含む培地中で凝集したhPSCを培養する任意の工程であって、hPSCの周囲に栄養膜細胞が形成され得る工程を通じて栄養膜細胞によって取り囲まれる。
「HIPPO経路阻害剤」および「HIPPO経路アンタゴニスト」という用語は、本明細書では互換的に使用される。この用語は、HIPPO経路の活性を低下させる化合物を指す。HIPPO経路はGumbiner and Kim, Journal of Cell Science (2014) 127,709-717(参照により、本明細書に組み込まれる)でレビューされている。HIPPO経路は、Hippo-Yes関連タンパク質(YAP)が核に移動する能力に対して阻害作用を発揮する。そのような阻害作用の1つは、YAPのリン酸化によるもので、YAPが核に入るのを阻害する。したがって、細胞内のYAPリン酸化を防止または低減する化合物は、適切なHIPPO経路阻害剤である。HIPPO経路を阻害することにより、YAPに対する阻害が除去または軽減され、核内のYAPの活性が増加し、その結果、通常は細胞増殖が引き起こされる(たとえば、Gumbiner and Kimの図4を参照)。したがって、本発明のHIPPO経路阻害剤は、YAP活性化剤でもあり得、すなわち、核内のYAP活性の増加をもたらす。したがって、HIPPO経路阻害はYAP活性化を含み、HIPPO経路阻害剤はYAP活性化剤を含む。YAP活性化の例は、たとえば、YAP活性化剤として、YAPを発現する組換え核酸を使用することなどによる、細胞におけるYAPの過剰発現である。このような核酸は、YAP活性化のために、たとえばベクターを使用して細胞に投与することができる。1つのHippo経路阻害剤はXMU-MP-1であり(Triastuti et al., Br J Pharmacol. 2019;176:3956-3971)、本発明の芽球様細胞の調製方法および子宮内膜に移植するための芽球様細胞または胚盤胞の調製方法に従って低濃度で使用することが好ましい。XMU-MP-1は、非常に強力なHippo経路阻害剤である。培地中のたとえば1μM超または約2μM以上の大量のXMU-MP-1は、栄養外胚葉様細胞の形成を誘導し、限られた数の内部細胞を有する芽球様細胞、または内部細胞を有しない芽球様細胞(いわゆるtrophosphere)を形成するために使用される可能性がある。XMU-MP-1は、LPAよりも強力で長期にわたる効果を持つHippo経路の強力な阻害剤である。その結果、凝集物は大部分が栄養膜を形成し、エピブラスト細胞およびハイポブラスト細胞の形成が犠牲になる。内部細胞を伴う芽球様細胞は、培地中のXMU-MP-1の量がより少なく、たとえば約1μM以下でも形成される。Hippo経路阻害剤の濃度、Hippo阻害剤への細胞の曝露の長さ、Hippo阻害剤と追加分子の組み合わせ、および初期の細胞数を最適化することで、概して結果を制御することができる。XMU-MP-1はMST1/2の阻害剤である。本発明は、子宮内膜細胞に付着したり侵入したりする可能性のないtrophosphere(内部細胞を欠く可能性がある)を生成する方法における、XMU-MP-1またはMST1/2阻害剤の使用を提供する -この方法は、インビトロであってもよい;および/または避妊方法におけるものであってもよい。trophosphereを得るには、十分な量のXMU-MP-1、およびXMU-MP-1への細胞の曝露時間を使用し、たとえば2μM以上で4日以上の曝露を行うことができる。また、避妊薬として使用するためのMST1/2阻害剤、好ましくはXMU-MP-1も提供される。
好ましいHIPPO経路阻害剤はリゾホスファチジン酸受容体(LPAR)のリガンドであり、特に好ましくはリゾホスファチジン酸自体(LPA、たとえば1-オレオイルリゾホスファチジン酸)である。さらに好ましいHIPPO経路阻害剤およびリゾホスファチジン酸受容体のリガンドは、NAEPAまたはOEA-P(オレオイルエタノールアミドホスフェート)、N-[2-(ホスホノオキシ)エチル]-9Z-オクタデセンアミドである。これらはリゾホスファチジン酸(LPA)ミメティックである。LPARのリガンドは、LPARの活性化剤またはアゴニストであってもよい。さらなるまたは代替のLPAリガンドとして、LPAの任意の誘導体を使用することができる。LPAの誘導体は、好ましくは式1の化合物である:
式中、Rは、C8~C24-アルキル、C8~C24-アルケニル、またはC8~C24-アルキニルである。好ましくは、Rは、C9-、C10-、C11-、C12-、C13-、C14-、C15-、C16-、C17-、C18-、C19-、C20-、C21-、C22-、C23-アルケニル、-アルキル、または-アルキニルである。
好ましい化合物は、(2-ヒドロキシ-3-ホスホノオキシプロピル)(Z)-オクタデカ-9-エン酸塩である。
LPARは、好ましくはLPAR1、LPAR2、LPAR3、LPAR4、LPAR5、またはLPAR6である。特に好ましいLPARはLPAR2である。
さらなるLPARリガンドは、国際公開第2014/036038A1号(参照により本明細書に組み込まれる)に開示されているGRI977143およびその任意の誘導体である。このようなリガンドは、式2の化合物を含む:
式中、Aは、
式中、RはH、または置換もしくは非置換のフェニルであり;
R1、R2、R3、R4、R5、およびR6は独立して、H、NO2、Br、Cl、またはOCH3であり;
BはC2~C8-アルキルまたは-アルケニルである;およびCは
R1、R2、R3、R4、R5、およびR6は独立して、H、NO2、Br、Cl、またはOCH3であり;
BはC2~C8-アルキルまたは-アルケニルである;およびCは
であり、必要に応じて、F、Cl、Br、NO2、NH2、OCH3、CH3、CO2H、またはフェニルで置換されている。たとえば、化合物は、2-((9-オキソ-9H-フルオレン-2-イル)カルバモイル)安息香酸、2-((3-(1,3-ジオキソ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン-2(3H)-イル)プロピル)チオ)安息香酸、4,5-ジクロロ-2-((9-オキソ-9H-フルオレン-2-イル)カルバモイル)安息香酸または2-((9,10-ジオキソ-9,10-ジヒドロアントラセン-2-イル)カルバモイル)安息香酸であってもよい。
代替または組み合わせ可能なHIPPO経路阻害剤は、Mst1阻害剤、Mst2阻害剤、またはMst1およびMst2の組み合わせ阻害剤、たとえば、XMU-MP-1(Triastuti et al.、前出)、またはLatsキナーゼ阻害剤、たとえば、TRULI(Kastan et al., bioRxiv, 2020, doi.org/10.1101/2020.02.11.944157)であってもよい。Latsキナーゼ阻害剤は、LatsキナーゼのATP競合阻害剤であってもよい。LatsキナーゼはYAPリン酸化に関与しており(Gumbiner et al、前出)、したがってLats活性の阻害はリン酸化によるYAP不活化を減少させ、核内のYAP活性を増加させる。
HIPPO経路阻害剤は、YAP活性化剤、特にYAPリン酸化を減少または防止する、および/または細胞核へのYAPの侵入を促進するYAP活性化剤であってもよい。本発明に従って使用するためのさらに好ましいHIPPO経路阻害剤は、ベルテポルフィンである。
3D培養は、三次元すべてで組織の発生を可能にする培養である。これとは対照的に、2D培養では、細胞は表面に付着して増殖するように誘導され、上記表面から離れて増殖することは阻止されるが、そのような増殖は必ずしも排除されるわけではない。2D培養は、単層、二重層もしくは多層等の細胞層形成および/または二次元細胞増殖を誘導する可能性がある; 3D培養では通常、全方向への均等な増殖が可能であり、もちろん細胞組織はそれ自体で組織の方向性や軸を発達させることができる。2D培養における層形成は、重力および/または細胞間または表面への接着によって誘発される可能性がある。2Dおよび3D培養の条件は、表面の種類、2D培養の場合は付着表面、3D培養の場合は非付着表面、培地、欠如(2D)または存在(3D)、または足場となるゲル構造等の3Dマトリックス、たとえばハイドロゲルによって影響を受ける可能性がある。2D培養物は、付着表面としてフィーダー細胞を含む場合がある。
細胞および組織を増殖させるための培地により、阻害されずに芽球様細胞まで発生することが可能になる。培地は、一つ以上の炭水化物、アミノ酸および塩等の栄養素を含んでもよい。培地の例は、B27N2培地である(Suenwoldt et al., Front. Mol. Neurosci. 10,2017:305)。培地はインスリンを含むことが好ましい。あるいは、または組み合わせて、培地は、ホロトランスフェリン(holotransferin)、亜セレン酸塩、コルチコステロンまたはプロゲステロン、レチノール、またはそれらの組み合わせを含んでもよい。このような培地も本発明のキットとともに提供されてもよい。
本発明の方法は、ヒト多能性幹細胞(hPSC)および栄養膜細胞の凝集物を提供することを含む。hPSCは、栄養外胚葉様組織、エピブラスト様組織、およびハイポブラスト様組織に分化することができる多能性細胞である。接尾辞「様」は、組織がそれぞれ栄養外胚葉、エピブラスト、およびハイポブラストに似ているが、本発明の芽球様細胞は依然として人工構築物であるため、これらの組織は通常、生体内状況においてと同様に発生しないことを示す。しかしながら、本発明の芽球様細胞の「様」組織は、通常、生体内対応物と同様の発現マーカーを発現し、同様に同定することができる。
ヒト多能性幹細胞(hPSC)および栄養膜細胞の凝集物は、国際公開第2014/171824 A1号またはOkae et al., Cell Stem Cell 22, 2018: 50-63(両方とも引用により本明細書に組み込まれる)に開示されているような一般的な技術によって提供することができる。本発明による好ましい方法において、hPSCおよび栄養膜の凝集物は、HIPPO経路阻害剤、MEK阻害剤およびTGF-β阻害剤から選択されるいずれか一つを含む培地中で凝集したhPSCを培養することによって生成することができる。好ましくは、MEK阻害剤およびTGF-β阻害剤が使用される。好ましくは、HIPPO経路阻害剤も使用される。
特に好ましい実施形態では、(上記のような)HIPPO経路、MEK/ERK、およびTGF-βの「三重阻害」が、本発明の芽球様細胞の生成に使用される。特に、本発明の方法は、ヒト多能性幹細胞(hPSC)および栄養膜細胞の凝集物を、HIPPO経路阻害剤を含む培地中で3D培養で培養することを含む。三重阻害では、hPSCおよび栄養膜の凝集物は、MEK阻害剤およびTGF-β阻害剤を含む培地中で凝集したhPSCを培養することによって生成されることが好ましく、この段階でHIPPO経路阻害剤も含むことが特にさらに好ましい。
Hippo、TGF-β、およびMEK/ERK経路が阻害されたナイーブヒト多能性幹細胞(hPSC)は、以下に示すように、胚盤胞発生の順序およびペースに従って、3つの創始系統(>97%の栄養外胚葉、エピブラスト、および原始内胚葉)を有する芽球様細胞を効率的に(>70%)形成する。
三重阻害により、凝集した細胞の対称性が崩れ、栄養膜シストの片側に付着したまま残る、エピブラストおよび原始内胚葉細胞のユニークな内部クラスターの形成が引き起こされる。直接的な結果として、このユニークな内部クラスターの存在によってシスト内に生じる非対称性は、極性栄養膜の局所的成熟を誘導し、子宮内膜細胞への付着の向きを決定する。したがって、本発明の芽球様細胞は、栄養膜シストの片側に付着した、エピブラストおよび原始内胚葉細胞の局在型の内部クラスターを一つ有する可能性がある。
Guo et al., bioRxiv 2020, doi.org/10.1101/2020.02.04.933812に開示されているように、たとえばMEK阻害剤による、MEK(ERKとも呼ばれる)阻害は、hPSCからの栄養膜の形成を誘導するために使用することができる。栄養膜細胞を含む細胞凝集物がすでに提供されている場合は、MEK阻害は必要ない。栄養膜細胞が存在しない場合は、MEK阻害剤を使用して栄養膜細胞を形成することができる。MEK阻害剤はMAPK阻害剤、たとえばSB202190であってもよい。
MEK阻害剤は、好ましくはPD0325901である。PD0325901は、式3の化合物であってもよい:
さらなるまたは代替のMEK阻害剤は、セルメチニブ、ミルダメチニブ、トラメチニブ、U0126-EtOH、PD184352(CI-1040)、PD98059、ピマセルチブ(Pimasertib)、TAK-733、AZD8330(AR-RY704)、ビニメチニブ、PD318088、SL327、レファメチニブ、GDC-0623(G-868)、コビメチニブから選択することができる。
TGF-β阻害剤は、TGF-βI型受容体の阻害剤であってもよい。TGF-β阻害剤は、好ましくはA83-1(A83-01、A-83-01)である。A83-1は式4の化合物である:
さらなるまたは代替のTGF-β阻害剤は、SD-208、GW788388、SRI-011381、TP0427736、RepSox(E-616452、SJN 2511)、LY2109761、SB505124、BIBF-0775、LY 3200882、ガルニセルチブ(LY2157299)、バクトセルチブ(TEW-7197、EW-7197)、LY364947(HTS 466284)、SB525334、ITD-1、またはSB431542から選択することができる。SB431542が特に好ましい。
凝集したhPSC(hPSCと栄養膜細胞の凝集物を生成する上記の工程のため)は、hPSCを播種し、増殖培地中で培養することによって播種されたhPSCを凝集させることによって形成することができる。播種されるhPSCは、解離したhPSCであることが好ましい。hPSCは、たとえば、トリプシン処理により解離する。解離したhPSCは一つの結合組織に凝集しない。しかしながら、本発明の方法では、後で発生中にそれらを凝集させることができる。
本発明の芽球様細胞形成中に異なる段階および中間体を生成するためのこれらの方法工程は、たとえばhPSCと栄養膜細胞の凝集物をin situで生成することが望ましい場合、組み合わせることができる。したがって、芽球様細胞は1回の培養でhPSCから形成される。増殖と栄養供給には同じ基本培地(B27N2等)を使用することができるが、異なる工程では異なる追加の化合物が使用される。本発明の方法は、以下の工程の組み合わせを含むことができる。
(i)hPSCを播種し、増殖培地中で培養することにより播種されたhPSCを凝集させて凝集したhPSCを形成する工程、
(ii)MEK阻害剤およびTGF-β阻害剤を含む培地中で、凝集したhPSCを培養して、hPSCおよび栄養膜細胞を生成する工程;場合により、HIPPO経路阻害剤も工程(ii)で使用される;
(iii)hPSCおよび栄養膜細胞の凝集物を、HIPPO経路阻害剤を含む培地中で3D培養で培養して、芽球様細胞または胚盤胞様細胞凝集物を生成する工程。
(i)hPSCを播種し、増殖培地中で培養することにより播種されたhPSCを凝集させて凝集したhPSCを形成する工程、
(ii)MEK阻害剤およびTGF-β阻害剤を含む培地中で、凝集したhPSCを培養して、hPSCおよび栄養膜細胞を生成する工程;場合により、HIPPO経路阻害剤も工程(ii)で使用される;
(iii)hPSCおよび栄養膜細胞の凝集物を、HIPPO経路阻害剤を含む培地中で3D培養で培養して、芽球様細胞または胚盤胞様細胞凝集物を生成する工程。
本発明は、工程(i)、(ii)および(iii)の組み合わせを含むが、工程(ii)および(iii)の組み合わせも含み、後者の場合は、たとえば凝集したhPSCを提供できる場合(工程(iii)の開始点である周囲の栄養膜細胞なしで)である。
工程(iii)では、MEK阻害剤および/またはTGF-β阻害剤は使用されなくてもよい。工程(i)または工程(ii)では、HIPPO経路阻害剤を使用しなくてもよい。また、工程(i)では、代替的に、または組み合わせて、MEK阻害剤および/またはTGF-β阻害剤は使用されなくてもよい。工程(ii)において、TGF-β阻害剤およびMEK/ERK阻害剤の使用は、工程(iii)で芽球様細胞を形成するのに十分である。
凝集したhPSC(hPSCと栄養膜細胞の凝集物を生成する工程)は、好ましくは、hPSCを播種し、増殖培地中で0~64時間、または0~12時間、または工程(i)の好ましいものとしては、12~64時間培養することによって播種されたhPSCを凝集させることによって形成される。この方法はこの工程なしでも機能するため、播種されたhPSCの凝集は任意の工程である。工程(i)の好ましい実施形態では、組み合わせ可能または代替として、増殖培地はROCK阻害剤を含む。好ましいROCK阻害剤はY27632(Y-27632)である。さらなるまたは代替のROCK阻害剤は、ZINC00881524、チアゾビビン、ファスジル、(HA-1077)、GSK429286A(RHO-15)、RKI-1447、アザインドール1(TC-S 7001)、GSK269962A HCl(GSK269962B、GSK269962)、ヒドロキシファスジル (Hydroxyfasudil;HA-1100)、ネタルスジル(AR-13324)、リパスジル(K-115)、Y-39983(Y-33075)、KD025(SLx-2119)から選択してもよい。ROCK阻害剤は、播種されたhPSCの凝集を増加または改善する。
好ましくは、増殖培地中での播種されたhPSCの培養(たとえば、上述の工程(i))は、容器内で1~200個のhPSC、好ましくは20~150個のhPSC、特に好ましくは30~120個のhPSC、さらにより好ましくは30~60個のhPSCを播種する工程、および上記播種されたhPSCを増殖培地中で増殖させる工程を含む。この細胞数は、後の工程での最適な芽球様細胞形成につながる。
好ましい実施形態では、播種されたhPSCの処理および/または増殖は、2D培養環境で行われているか、または行われる(is or has been done)。2D培養は、前述のように二次元の細胞増殖を引き起こす可能性がある。
好ましくは、2D培養中(3D培養前)のhPSCは、たとえばGuo et al., Development 2017, doi: 10.1242/dev.146811に記載されているように、MEK阻害剤および/またはPKC阻害剤で処理されている。Wnt阻害剤およびSTAT活性化剤はまた、組み合わせて、または上記のように代替的に使用することもできる。
好ましい実施形態では、PKC阻害剤は、Goe6983(GOE6983)およびRo-31-8425、またはそれらの組み合わせから選択される。さらなるまたは代替のPKC阻害剤は、エンザスタウリン(LY317615)、ソトラスタウリン(AEB071)、ミトキサントロン(NSC-301739)、スタウロスポリン(CGP 41251)、ビスインドリルマレイミドI(GF109203X、GO 6850)、ビスインドリルマレイミドIX(Ro 31-8220)、LXS-196 (IDE-196)、VTX-27、ミドスタウリン(pkc412、CGP 41251)、チェレリスリン、Go6976 (PD406976)、CRT0103390から選択してもよい。
好ましい実施形態では、2D培養hPSCはさらに、Wnt阻害剤および/またはSTATアゴニストで処理されているか、またはそれらで処理される(is or have been treated)。このような処理により、よりナイーブなhPSCまたは基底状態のhPSCが生成される。このようなナイーブまたは基底状態のhSPCは、好ましくは、工程(i)の本発明の方法においてhPSCとして使用される。よりナイーブなまたは基底状態のhPSCを生成するためのこのような処理は、たとえばTakashima et al., Cell 158(6),2014:1254-1269または国際公開第2016/027099 A2号(両方とも参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。STATアゴニストは、好ましくはSTAT3アゴニスト、たとえば、LIFである。
Wnt阻害剤の例はXAV939である。XAV939は、式(5)の化合物であってもよい:
さらなるまたは代替のWnt阻害剤は、LF3、PKF118-310、Wnt3A、Adavivint (SM04690)、CCT251545、PNU-75654、IWP-2、IWP-3、IWR-1-endo、iCRT3、WIKI4、ICG-001、XAV-939 (NVP-XAV939)、LGK-974 (NVP-LGK974、WNT974)、MSAB、KYA1797K、JW55、またはそれらの組み合わせから選択してもよい。LF3および/またはXAV939が特に好ましい。本発明のすべての実施形態にとって特に好ましいWnt阻害剤は、XAV939、IWP2、PNU74654、およびLF3である。
特に好ましい実施形態では、hPSCは、たとえばGuo et al., Development 2017, doi:10.1242/dev.146811およびTakashima et al.(上記)に記載されているように、MEK、Wnt、PKCの阻害剤、およびSTATに対する阻害剤(against)またはSTATの活性化剤(たとえば、LIF)を含む培地中で前処理してもよい。PXGLと呼ばれる培地は、hPSCをよりナイーブな状態に維持する。このよりナイーブな状態により、芽球様細胞形成が改善される。hPSCをナイーブにするための多くの培養条件は当技術分野で知られており、たとえば国際公開第2016/027099 A2号に記載されている通り、本発明に従って使用することができる。
好ましい実施形態では、凝集した細胞(たとえば、上述の工程(ii))は、少なくとも1日間、好ましくは少なくとも2日間培養される。
上記の実施形態は好ましくは組み合わされ、たとえば一例において、hPSCから開始する培養は、細胞を少なくとも5日間培養することを含む:最初の0~24時間または初日は、小分子阻害剤を含まない(MEK阻害剤(たとえばPD0325901)、TGF-β阻害剤(たとえば、A83-01)、STATの活性化剤(たとえば、LIF)、およびHIPPO経路阻害剤(たとえば、LPA)を含まない)培地中で行われる(細胞の凝集を促進するROCK阻害剤、たとえばY27632を除く)これは工程(i)の例であり、工程(i)について上記で述べたことはすべてここにも当てはまる。0~24時間の間、または2日目に、MEK阻害剤(例:PD0325901)、TGF-β阻害剤(例:A83-01)、STATの活性化剤(例:LIF)、ROCK経路阻害剤、およびHIPPO経路阻害剤(例:LPA)での処理が開始される。これは工程(ii)の例であり、工程(ii)について上記で述べたことはすべてここにも当てはまる。同じ培地を3日目に使用する(工程(ii))。4日目に、細胞/凝集物を、議論された小分子阻害剤のうちのROCK経路阻害剤およびHIPPO経路阻害剤(たとえば、LPA)のみを含む培地中で培養する。たとえば、MEK阻害剤(たとえば、PD0325901)、TGF-β阻害剤(たとえば、A83-01)、STATの活性化剤(たとえば、LIF)はもう使用されない。これは工程(iii)の例であり、工程(iii)について上記で述べたことはすべてここにも当てはまる。通常、芽球様細胞は5日目に完全に形成される。この方法は、たとえば、体外受精で生じた胚盤胞の発生を促進するためにin vitroで、および/または。妊娠の最初の数週間の妊孕性を高める方法において使用することができる。Hippo阻害剤、好ましくはLPAまたはNAEPAは、胚盤胞の発生および可能性を増強するために使用することができる。また、妊孕性増強剤として使用するための、Hippo阻害剤、好ましくはLPAまたはNAEPAも提供される。Hippo阻害剤、好ましくはLPAまたはNAEPAは、受胎後1~12日、好ましくは受胎後2~9日、特に好ましくは受胎後3~7日で患者に投与することができる。
増殖条件を変更することにより、各工程の好ましい時間は変化する可能性がある。好ましい実施形態では、工程(i)は18~48時間である;好ましくは、工程(ii)は36~92時間である;好ましくは、工程(iii)は18~48時間である。これらの時間は、ステップ(i)またはステップ(i)および(ii)が行われない場合、たとえば、凝集したhPSC、またはhPSCと栄養膜細胞の凝集物が開始点として使用される場合の好ましい実施形態でもある。
hPSC(ヒト多能性幹細胞)は、好ましくはヒト全能性細胞ではない、すなわち、ヒト胚ではない。
hPSCは任意の細胞株由来のものであってもよい。 好ましくは、細胞株は、hESC H9、Shef6、HNES1、hiPSC cR-NCRM2、およびhiPSC niPSC16.2.bから選択される。
好ましくは、独立して選択された細胞、凝集したhPSCS、またはhPSCと栄養膜細胞の凝集物は、マイクロウェルに播種または配置される。マイクロウェルは細胞数を制御するために使用される場合がある。マイクロウェルは、複数の平行した芽球様細胞形成を可能にするアレイ状であってもよい。好ましくは、少なくとも2個、たとえば、3、4、5、6、7、8、9、または10個以上、たとえば50個以上の芽球様細胞が、本発明の方法によって並行して作成される。
好ましくは、3D培養、たとえば、hPSCおよび栄養膜細胞の凝集物の培養は、非接着容器内で培養することによって、好ましくはマイクロウェル内で培養することによって行われ、特に好ましくはヒドロゲルで作られた非接着表面を含むマイクロウェルによって行われる。
好ましい実施形態では、3D培養における培養、特にhPSCおよび栄養膜細胞の凝集物の培養(上述の工程(iii)等)のための培地、および/または凝集したhPSCの培養(上述の工程(ii)等)のための培地は、STAT3アゴニストをさらに含む。STAT3アゴニストは、好ましくは白血病阻害因子(LIF)である。LIFは、好ましくはヒトLIFである。
好ましい実施形態では、hPSCおよび栄養膜(たとえば、上記の工程(iii))は、少なくとも16時間、好ましくは少なくとも20時間、さらにより好ましくは少なくとも1日間、可能であれば少なくとも2日間培養される。
好ましくは、細胞、特にhPSCおよび栄養膜細胞の培養は、少なくともhPSCおよび栄養膜の凝集物から栄養外胚葉様組織、エピブラスト様組織、およびハイポブラスト様組織が形成されるまでである。あるいは、または組み合わせて、培養は、少なくとも胚-非胚軸が形成されるまで行うことができる。
あるいは、細胞、特にhPSCおよび栄養膜細胞の培養は、栄養膜の形成を促進し、エピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞の形成または維持を妨げるMST1/2阻害剤XMU-MP-1の存在下で行われ、十分な濃度のXMU-MP-1が含まれている場合、エピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞のより小さな内部クラスターを含むか、またはエピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞の内部クラスターを含まない栄養膜シストが形成されるまで行われる。これらの栄養膜シストは、XMU-MP-1-Trophosphereと呼ばれる。
本発明は、trophosphere(内部細胞を欠いている可能性がある)を生成する方法におけるXMU-MP-1またはMST1/2阻害剤の使用を提供する- この方法はインビトロでもよい;および/または避妊法における方法であってもよい。MST1/2阻害剤、好ましくはXMU-MP-1は、避妊のために使用することができる。また、避妊薬として使用するためのMST1/2阻害剤、好ましくはXMU-MP-1も提供される。MST1/2阻害剤、好ましくはXMU-MP-1は、受胎後1~9日、好ましくは受胎後2~7日、特に好ましくは受胎後3~6日で患者に投与することができる。
あるいは、細胞、特にhPSCおよび栄養膜細胞の培養は、エピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞の内部クラスターを含まない、または減少した数のエピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞を含む養膜シストが形成されるまで、エピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞の形成および維持を妨げるSTAT阻害剤SC144の存在下で行われる。これらの栄養膜シストは、SC144-Trophosphereと呼ばれる。上述のように、STATアゴニストは、本発明の方法の特定の工程で使用することができる。内部細胞による芽球様細胞形成を防止または制限するには、SC144等のSTAT阻害剤を使用することができる。STAT阻害剤、好ましくはSC144は、避妊のために使用することができる。避妊薬として使用するためのSTAT阻害剤、好ましくはSC144も提供される。STAT阻害剤、好ましくはSC144は、受胎後1~9日、好ましくは受胎後2~7日、特に好ましくは受胎後3~6日で患者に投与することができる。
栄養膜は、胚盤胞または芽球様細胞の外層を形成する細胞であり、生体内では胎盤の大部分に発達する。栄養外胚葉という用語は、胚盤胞の外層を形成する上皮嚢胞組織(epithelial cystic tissue)を指す。芽球様細胞においては、外側の組織がこのような栄養外胚葉に似ており、栄養外胚葉様組織と呼ばれる。
エピブラストは、哺乳動物の胚盤胞の内部細胞塊から生じる2つの異なる層のうちの1つである。原腸形成中に、外胚葉、中胚葉、内胚葉という3つの主要な胚葉への分化を通じて、胚そのものを導き出す。芽球様細胞では、このようなエピブラストに似た内部組織が発達しており、エピブラスト様組織と呼ばれる。
ハイポブラストは、哺乳動物の胚盤胞の内部細胞塊から生じる2つの異なる層のうちの1つである。ハイポブラストは卵黄嚢を生じ、次に卵黄嚢は絨毛膜を生じる。芽球様細胞では、このようなハイポブラストに似た内部組織が発達しており、ハイポブラスト様組織と呼ばれる。
エピブラスト様細胞、栄養膜様細胞、およびハイポブラスト様細胞の発現パターンは、図9dに示すようにクラスター化されている。エピブラスト様細胞の発現マーカーは、たとえば、TDGF1、GDF3、SUSD2、POU5F1、PRDM14、DPPA4、および/またはDNMT3Lである。栄養膜様細胞の発現マーカーは、たとえば、KRT19、CLDN4、GATA2、KRT18、および/またはHAND1である。ハイポブラスト様細胞の発現マーカーは、たとえばPDGFRA、COL4A1、COL4A2、GATA6および/またはLAMA1である。遺伝子名および遺伝子記号は、HUGO 遺伝子命名委員会(www.genenames.org)によって規定されている遺伝子のものである。発現パターンは、たとえばmRNA発現を測定することによって決定することができる。
胚-非胚軸の形成は、エピブラスト/ハイポブラストの内部凝集物を並置する栄養膜を介した胚盤胞および芽球様細胞移植として好ましい実施形態である。これらのいわゆる極性栄養膜は、NR2F2+および/またはCCR7+の発現を特徴とする。好ましくは、本発明の芽球様細胞は、NR2F2+および/またはCCR7+を発現する極性栄養膜を含む。
好ましくは、細胞、特にhPSCおよび栄養膜細胞は、少なくとも全径が少なくとも100μm、好ましくは少なくとも140μm、さらにより好ましくは180μm~220μmの三次元細胞凝集物が、一つの液体で満たされた空洞およびエピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞を含む少なくとも一つの内部細胞塊を取り囲む栄養膜様細胞の外側上皮単層によって形成されるまで培養される。本発明の芽球様細胞は、これらの特性のいずれかまたはすべてを含み得る。
さらなる実施形態では、本発明の方法によって生成された芽球様細胞は、子宮内膜細胞の層上に播種してもよい。播種は、好ましくはインビトロで行われる。芽球様細胞は、子宮内膜細胞の層の中または上に移植することができる。この着床は、人為的に阻害されない限り、芽球様細胞が自ら行うことができるプロセスである。
子宮内膜細胞の層は単層であってもよい。
好ましくは、体外受精法における子宮内膜細胞または子宮内膜は、エストロゲン、エストロン、エストリオール、エチニルエストラジオール、17α-エチニルエストラジオール、メストラノール、プロゲステロン、プロゲスチン、cAMP、およびWnt阻害剤(好ましくはXAV939、IWP2(IWP-2とも呼ばれる)、PNU-74654、およびLF3)から選択される化合物で処理されている。このような処理は、子宮内膜細胞内または子宮内膜細胞上への芽球様細胞または胚盤胞の着床に対する受容性(receptiveness)を改善する。特に好ましいのは、Wnt阻害剤、好ましくはXAV939、または上記のWnt阻害剤のいずれかによる治療である。Wnt阻害剤によるによるこの治療法は、エストロゲン、エストロン、エストリオール、エチニルエストラジオール、17α-エチニルエストラジオール、メストラノール、プロゲステロン、プロゲスチンおよび/またはcAMPによる治療と組み合わせることができる。
特に好ましいのは、芽球様細胞または胚盤胞の移植のための体外受精の過程で子宮の子宮内膜細胞の層または子宮内膜を調製するためのWntの阻害である。それは、子宮内膜細胞または子宮内膜の着床に対する受容性を高める。
子宮内膜細胞の層への芽球様細胞の播種は、着床の品質、有効性、および/または阻害に対する影響を研究するために使用することができる。一般に、本発明の方法の任意の段階を使用して、胚盤胞発生のモデルとして、または胚盤胞、あるいは能力もしくは特性のモデルとして、芽球様細胞の発生もしくは能力もしくは特性を研究することができる。
本発明の方法は、芽球様細胞形成および/または子宮内膜細胞層への芽球様細胞の移植に影響を及ぼす候補化合物および/または候補遺伝子変異、および/または温度等の環境影響を試験またはスクリーニングするために使用することができる。このような方法は、凝集物を少なくとも一つの候補化合物で処理すること、および/または凝集物に少なくとも一つの候補遺伝子改変を与えること、および本発明の方法を実施することを含んでもよい。この方法の効果は、対照比較として、それぞれ少なくとも一つの候補化合物および/または少なくとも一つの候補遺伝子変異および/または変化した環境影響を含まない方法と比較することができる。それ以外の場合、少なくとも一つの候補化合物および/または少なくとも一つの候補遺伝子変異および/または環境影響のみの効果を評価するために、対照比較は対照に一般的であるのと同様に実行される。
移植が成功し、その後の発生が起こるためには、栄養膜シストの両側に別個の組織(極性栄養膜および壁性栄養膜細胞)が形成される。これらの組織は、子宮内膜および子宮組織との相互作用中に異なる役割(たとえば、接着、増殖の誘導)を果たしていると考えられている。したがって、ヒト胚盤胞は極組織(polar tissue)を介して移植される。本発明の方法は、これらの異なる組織の発生およびそれによる着床を研究するために使用することができる。候補化合物および/または候補遺伝子変異および/または環境影響は、それらがこの組織形成またはその着床に影響を与える場合に研究することができる。
着床が成功し、その後の発生が起こるために、エピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞の内側のクラスターが、外側の栄養膜を誘導する分子を分泌する。これらの分子誘導は、栄養膜に子宮内膜および子宮組織と相互作用する能力を与えるために、様々な役割(たとえば、増殖、分化、機械的作用)を果たしていると考えられている。したがって、ヒト胚盤胞は極組織を介して移植される。本発明の方法は、栄養膜に子宮内膜および子宮組織との相互作用を与える際の分子誘導因子の役割を研究するために使用することができる。候補分子誘導物質および/または候補遺伝子変異および/または環境影響は、それらがこれらの分子誘導物質および栄養膜またはその移植に対するそれらの効果に影響を与える場合に研究することができる。
本発明はまた、本発明の方法により取得可能な芽球様細胞も提供する。本発明は、少なくとも一つの液体で満たされた空洞およびエピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞を含む少なくとも一つの内部細胞塊を取り囲む栄養膜様細胞の外側上皮単層を含む芽球様細胞を提供し、ここで該外側上皮単層は、NR2F2を発現する極性栄養膜(polar trophoblast)を含む。上述の特性、細胞型、組織型のいずれも、液体で満たされた空洞等の本発明の芽球様細胞の一部であってもよく、固定化された細胞がなくてもよい。それはまた、播種された細胞を含まなくてもよく、あるいは播種された細胞を含んでもよい。
本発明はさらに、芽球様細胞の培養に適したキットを提供する。上述の任意の成分またはそれらの組み合わせがキットに含まれていてもよい。キットは、好ましくは、HIPPO経路阻害剤、MEK阻害剤、および/またはTGF-β阻害剤を含んでもよい。これらの化合物は、ヒト多能性幹細胞(hPSC)用の培地中で組み合わせることが好ましい。化合物は、上記のいずれの工程でも使用することができる。キットは、好ましくは、Wnt阻害剤、たとえばXAV-939をさらに含む。上述の阻害剤のいずれも使用することができ、示された好ましい阻害剤も本発明のキットに好ましい。特に好ましいHIPPO経路阻害剤はLPAである。
キットは、それぞれMEK阻害剤、PKC阻害剤、Wnt阻害剤、およびTGF-β阻害剤の好ましい例として、PD0325901(MEK阻害剤)、Go6983(PKC阻害剤)、XAV-939(Wnt阻害剤)、A83-01(TGF-β阻害剤)、またはそれらの組み合わせから選択される任意の化合物を含み得る。
キットはまた、ROCK阻害剤を含んでもよい。
キットはまた、LIF、IGF-1、IL-6、IL-11、FGF2、FGF4、またはそれらの組み合わせから選択される任意の増殖因子を含んでもよい。LIFは、上述のように使用してもよい。IGF-1および/またはIL-6および/またはIL-11および/またはFGF2および/またはFGF4は、段階(i)、(ii)、(iii)、またはそれらの組み合わせのいずれか一つにおいて、本発明の培地における凝集細胞の増殖を改善するために使用してもよい。
キットには、上記のような培地も記載していてもよい。特に好ましくは、キットはインスリンを含む。
上で論じたように、本発明は、Wnt阻害剤の使用により、子宮内膜細胞の層への芽球様細胞の着床が改善されることを示した。したがって、本発明は、芽球様細胞または胚盤胞を子宮内膜細胞の層に着床する可能性を増大させるインビトロの方法を提供し、この方法は、該芽球様細胞または胚盤胞をWnt阻害剤、好ましくはXAV939で処理する工程、および該芽球様細胞または胚盤胞を子宮内膜細胞の層と接触させる工程を含む。この方法はまた、上記と同様の少なくとも一つの候補化合物および/または少なくとも一つの候補遺伝子変異および/または環境影響を試験して、着床時、または着床後の芽球様細胞の発生、または着床後の子宮内膜細胞に対するそれらの影響を、たとえば少なくとも一つの候補化合物および/または少なくとも一つの候補遺伝子変異および/または環境影響等を含まない対照と比較して試験するために使用することもできる。
Wnt阻害剤の使用による改善は、体外受精(IVF)法の際に、生体内および/またはインビトロで使用することもできる。
Wnt阻害剤、好ましくはXAV939の存在下で胚盤胞を子宮内膜と接触させることを含む、体外受精中の胚盤胞着床の確率を増加させる方法において使用するためのWnt阻害剤が提供される;好ましくはここで、子宮内膜は局所的に、全身的に、または胚盤胞と一緒にWnt阻害剤と接触される。これに関連して、本発明は、Wnt阻害剤の存在下で胚盤胞を子宮内膜と接触させる工程を含む、体外受精中の胚盤胞着床の確率を高める方法を提供する。また、Wnt阻害剤の存在下で胚盤胞を子宮内膜と接触させる工程を含む、体外受精中の胚盤胞着床を媒介するための医薬組成物を製造するためのWnt阻害剤の使用も提供される。
体外受精は子宮内膜と胚を接触させることを含んでおり、胚はインビトロで胚盤胞期まで成長している可能性がある。インビトロでの成長中、または胚盤胞と子宮内膜との接触中もしくは接触直後に、着床の確率を高めるために胚盤胞または子宮内膜にWnt阻害剤が投与される。
また、議論されたHIPPO経路阻害剤は、芽球様細胞に関して上で議論されたのと同様に、体外受精または妊娠の確率を改善する。体外受精の場合、妊娠の確率を高めるため、または一般的に胚盤胞の調製のため、上記胚盤胞または任意のその前の段階、たとえば1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期の胚をHIPPO経路阻害剤で処理することができる。本発明は、1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期、または胚盤胞期から選択される初期段階の胚を成熟胚盤胞期まで、HIPPO経路阻害剤で、特に好ましくはNAEPAまたはリゾホスファチジン酸(LPA)受容体のリガンドで、さらにより好ましくはLPAで、処理する工程、および1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期の胚を胚盤胞期まで成長させる工程、もしくは胚盤胞期の胚を、より可能性のある(more potent)もしくはより成熟した胚盤胞期(more mature blastocyst stage)まで成長させる工程を含む、体外受精に適した、または妊娠の確率を高めるのに適した胚盤胞を作製する方法に使用するためのHIPPO経路阻害剤を提供する。それに関して、本発明は、1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期、または胚盤胞期から選択される初期段階の胚を、可能性のある(potent)もしくは成熟胚盤胞期まで、HIPPO経路阻害剤で処理する工程、および1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期の胚を胚盤胞期まで成長させる工程、または胚盤胞期の胚を、より可能性のある(more potent)もしくはより成熟した胚盤胞期まで成長させる工程を含む、初期段階で胚を処理することを含む、体外受精に適した、または妊娠の確率を高めるのに適した胚盤胞を作製する方法を提供する。また、体外受精に適した、または妊娠の確率を増大させるのに適した胚盤胞を生成するための医薬組成物を製造するためのHIPPO経路阻害剤の使用であって、1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期、または胚盤胞期から選択される初期段階の胚を、可能性のある(potent)もしくは成熟胚盤胞期まで、HIPPO経路阻害剤で処理する工程、および1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期の胚を胚盤胞期まで成長させる工程、または胚盤胞期の胚を、より可能性のある(more potent)もしくはより成熟した胚盤胞期まで成長させる工程を含む、HIPPO経路阻害剤の使用も提供される。たとえば、Hippo阻害剤は、たとえば受胎後数日かつ着床前(たとえば0~12日目、または1~12日目、好ましくは6~9日目)にHIPPO経路阻害剤を服用することにより、子宮内での胚盤胞の発育を改善することにより妊娠の確率を高めるために患者が使用することができる可能性がある。上述したように、妊娠の確率を高めるために、Hippo阻害剤、好ましくはLPAまたはNAEPAを、受胎後0~12日目、好ましくは受胎後2~9日、特に好ましくは受胎後3~7日で患者に投与することができる。妊娠の確率は、本発明に従って胚盤胞の発育を促進することによって増大し、これにより、より高い着床能力を発達させ、従って、妊娠に至る可能性がある。Hippo阻害剤は子宮内に投与してもよい。
前段落の代替として、またはそれに追加して、芽球様細胞の上清または培養物は、体外受精処置に適した、または体外受精処置中に、または妊娠の確率を高めるのに適した胚盤胞を作製するこの方法において、HIPPO経路阻害剤の代わりにまたはそれに追加して使用することができる。欧州特許公開第2471538 A1号に示されているように、胚盤胞培養上清はLPAを生成することにより胚盤胞移植における妊娠を促進し、同様のことが芽球様細胞上清でも可能である。したがって、本発明はまた、体外受精処置に適した、または妊娠の確率を増大させるのに適した胚盤胞を作製する方法において使用するための、本発明の芽球様細胞の培養上清を提供し、ここでこの方法は1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期、または胚盤胞期から選択される初期段階の胚を、成熟胚盤胞期まで、HIPPO経路阻害剤で、特に好ましくはリゾホスファチジン酸(LPA)受容体のリガンドで、さらにより好ましくはLPAで、処理する工程、および1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期の胚を胚盤胞期まで成長させる工程、または胚盤胞期の胚を、より成熟した胚盤胞期まで成長させる工程を含む。さらに提供されるのは、芽球様細胞培養上清を使用して体外受精を目的とした胚盤胞を培養する、または体外受精のために芽球様細胞培地上清を子宮腔内に移す、または体外受精によってであれ、自然妊娠の確率を高めるためであれ、妊娠の確率を高めるための方法である。胚盤胞は、上記子宮に移植され、子宮腔内の芽球様細胞培地上清またはその成分と接触することができる。芽球様細胞の上清または培養物は、受胎後1~12日、好ましくは受胎(卵細胞の受精)後2~9日、特に好ましくは受胎後3~7日後に患者に投与することができ、妊娠の確率を増大させる。妊娠の確率は、本発明に従って胚盤胞の発育を促進することによって増大し、これにより、より高い着床能力を発達させ、従って、妊娠に至る可能性がある。芽球様細胞の上清または培養物を子宮に投与してもよい。
また、本発明の芽球様細胞を培養する工程、および培養物、好ましくは培養物の上清から上記LPAを収集する工程を含む、LPAの製造方法も提供される。本発明の芽球様細胞は、欧州特許公開第2471538 A1号に記載されているLPA産生胚盤胞と同様の特性を有するため、欧州特許公開第2471538 A1号に胚盤胞について記載されているのと同じ使用が本発明の芽球様細胞で可能である。
生成されるLPAは、LPA-C16:0、LPA-C16:1、LPA-C18:0、LPA-C18:1、LPA-C18:2、またはそれらの組み合わせのいずれかであってもよい。これらのLPAのいずれも、本発明のHIPPO経路阻害剤として使用することができる。
Wnt阻害剤またはHippo経路阻害剤等の本明細書に記載の任意の活性薬剤は、たとえば、(1)インビボでおよび全身的に、または(2)子宮への移植前に胚を活性薬剤に曝露することによってインビトロで、または(3)子宮移植の際に分子を胚と同時移植することにより、子宮内で投与することができる。全身投与は、たとえば、経口的(たとえば、トローチ(pastille)、錠剤、トローチ(troche)、トローチ(lozenge)、丸剤、ガム、散剤、または飲料液剤(drinking solution))、非経口的(たとえば、注射、たとえば静脈内、または経皮パッチとして)であってもよい。芽球様細胞の上清または培養物は、好ましくは、(2)子宮への移植前に胚を活性薬剤に曝露することによってインビトロで、または(3)子宮移植時に分子を胚と同時移植することによって子宮内で投与される。
投与は、医薬担体、賦形剤、ベクター、添加剤、またはそれらの組み合わせのうちのいずれか一つを含む製剤中で行うことができる。「担体」という用語は、希釈剤を指し、たとえば、水、生理食塩水、賦形剤、またはビヒクルであり、これらと一緒に組成物を投与することができる。固体または流体組成物の場合、医薬組成物中の担体または添加剤は、SiO2、TiO2、微結晶セルロース、ポリビニルピロリドン(ポリビドンまたはポビドン)、トラガカントゴム、ゼラチン、デンプン、ラクトースまたはラクトース一水和物、アルギン酸、 トウモロコシ(コーン)デンプン等の結合剤;ステアリン酸マグネシウムまたはラウリル硫酸ナトリウム等の潤滑剤または界面活性剤;コロイド状二酸化ケイ素等の流動促進剤;スクロースおよびサッカリン等の甘味料を含んでもよい。好ましくは、製剤は、たとえばクエン酸、酢酸、フマル酸、塩酸、リンゴ酸、硝酸、リン酸、プロピオン酸、硫酸、酒石酸、またはそれらの組み合わせから選択される緩衝剤またはpH調整剤を含む。
「より可能性のある、またはより成熟した胚盤胞期(more potent or more mature blastocyst stage)」という表現は、HIPPO経路阻害剤による発生および成熟の改善を指す。この改善は、本発明に従って使用されるHIPPO経路阻害剤の欠如を除き、同じ条件下で維持または増殖された対照または比較としての胚盤胞に対するものである。
以下の番号が付けられた実施形態は、本発明によれば好ましいものである。
1.ヒト多能性幹細胞(hPSC)および栄養膜細胞の凝集物を、HIPPO経路阻害剤を含む培地中で3D培養で培養することを含む、芽球様細胞または胚盤胞様細胞凝集物を生成する方法。
2.hPSCおよび栄養膜の凝集物が、MEK阻害剤およびTGF-β阻害剤、好ましくはHIPPO経路阻害剤も含む培地中で凝集したhPSCを培養することによって生成される、1に記載の方法。
3.凝集したhPSCが、hPSCを播種すること、増殖培地中で培養すること、好ましくは0~64時間、または12~64時間増殖培地中で培養することによって播種されたhPSCを凝集させることによって形成される、および/または好ましくは、ここで増殖培地はROCK阻害剤を含み、特に好ましくはROCK阻害剤はY27632である、2に記載の方法。
4.播種されたhPSCが、3D培養の前に、好ましくは2D培養中に、MEK阻害剤および/またはPKC阻害剤で処理されており、好ましくはWnt阻害剤および/またはSTATアゴニストをさらに含み、好ましくはここで処理は2D培養中である、3に記載の方法。
5.PKC阻害剤がGoe6983およびRo-31-8425から選択される、4に記載の方法。
6.HIPPO経路阻害剤が、リゾホスファチジン酸(LPA)受容体のリガンド、好ましくはLPAおよび/またはNAEPA、またはベルテポルフィンである;および/またはMEK阻害剤はPD0325901である;および/またはTGF-β阻害剤はA83-1またはSB431542である、1~5のいずれか1つに記載の方法。
7.実施形態2に記載の3D培養で培養するための培地および/または凝集したhPSCを培養するための培地が、STAT3アゴニスト、好ましくは白血病抑制因子(LIF)をさらに含む、1~6のいずれか1つに記載の方法。
8.3D培養が、非付着性容器内で培養することにより、好ましくはマイクロウェル内で培養することにより、特に好ましくはヒドロゲルで作られた非付着性表面を含むマイクロウェル内で培養することによる、1~7のいずれか1つに記載の方法。
9.実施形態3の増殖培地中でのhPSCの培養が、1~200個のhPSC、好ましくは20~150個のhPSC、特に好ましくは30~120個のhPSC、さらにより好ましくは30~60個のhPSCを容器内に入れ、上記播種したhPSCを増殖培地中で増殖させることを含む、3~8のいずれか1つに記載の方法。
10.hPSCおよび栄養膜を少なくとも1日間、好ましくは少なくとも2日間培養する、1~9のいずれか1つに記載の方法。
11.実施形態2に記載の凝集細胞を少なくとも1日間、好ましくは少なくとも2日間培養する、2~10のいずれか一つに記載の方法。
12.hPSCおよび栄養膜の凝集物から少なくとも栄養外胚葉様組織、エピブラスト様組織、およびハイポブラスト様組織が形成されるまで、好ましくはさらに少なくとも胚-非胚軸が形成されるまで細胞を培養することを含む、1~11のいずれか1つに記載の方法。
13.液体で満たされた空洞およびエピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞を含む少なくとも一つの内部細胞塊を取り囲む栄養膜様細胞の外側上皮単層によって形成される、全径が少なくとも100μm、好ましくは少なくとも140μm、さらにより好ましくは180μm~220μmの三次元細胞凝集物が形成されるまで細胞を培養することを含む、1~12のいずれか1項に記載の方法。
14.芽球様細胞を子宮内膜細胞上に播種する工程、および芽球様細胞を子宮内膜細胞内または子宮内膜細胞上に着床させる工程をさらに含む、1~13のいずれか1つに記載の方法。
15.子宮内膜細胞が、エストロゲン、エストロン、エストリオール、エチニルエストラジオール、17α-エチニルエストラジオール、メストラノール、プロゲステロン、プロゲスチン、cAMP、およびWnt阻害剤(好ましくはXAV939、IWP-2、PNU-74654、および/またはLF3)から選択される化合物で処理されている、14記載の方法。
16.少なくとも一つの候補化合物で処理する工程、および/または少なくとも一つの候補遺伝子改変を有する凝集物を提供する工程、および実施形態1~15のいずれか一つに記載の方法を実施する工程を含む、芽球様細胞形成および/または子宮内膜細胞の層への芽球様細胞の移植に影響を与える候補化合物および/または候補遺伝子変異を試験またはスクリーニングするための、1~15のいずれか一つに記載の方法。
17.HIPPO経路阻害剤、MEK阻害剤、およびTGF-β阻害剤を含む、芽球様細胞の培養に適したキット;好ましくはヒト多能性幹細胞(hPSC)用の培地に組み込まれている。
18.1~16のいずれか一つに記載の方法により得られる芽球様細胞。
19.少なくとも一つの液体で満たされた空洞およびエピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞を含む少なくとも一つの内部細胞塊を取り囲む栄養膜様細胞の外側上皮単層を含み、ここで、該外側上皮単層は、NR2F2を発現する極性栄養膜(polar trophoblast)を含む、芽球様細胞。
20.芽球様細胞または胚盤胞をWnt阻害剤、好ましくはXAV939、IWP-2、PNU-74654、および/またはLF3で処理する工程、および該芽球様細胞または胚盤胞を子宮内膜細胞の層と接触させる工程を含む、芽球様細胞または胚盤胞を子宮内膜細胞の層に移植する潜在能力を増大させるインビトロ法。
21.たとえば体外受精中または自然妊娠中に、胚盤胞着床の確率を増大させる方法において使用するためのWnt阻害剤であって、Wnt阻害剤の存在下で胚盤胞を子宮内膜と接触させる工程、または胚盤胞の非存在下で子宮内膜細胞をWnt阻害剤、好ましくはXAV939、IWP-2、PNU-74654、および/またはLF3で刺激する工程を含むWnt阻害剤;ここで好ましくは、子宮内膜は局所的に、全身的に、または胚盤胞と一緒にWnt阻害剤と接触される、Wnt阻害剤。
22.体外受精に適した、または妊娠の確率を増大させるのに適した胚盤胞を作製する方法において使用するためのHIPPO経路阻害剤であって、1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期、または胚盤胞期から選択される初期段階の胚を成熟胚盤胞期まで、HIPPO経路阻害剤で、特に好ましくはNAEPAまたはリゾホスファチジン酸(LPA)受容体のリガンドで、さらにより好ましくはLPAで、処理する工程、および1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期の胚を胚盤胞期まで成長させる工程、もしくは胚盤胞期の胚をより成熟した胚盤胞期(more mature blastocyst stage)まで成長させる工程を含む、使用のためのHIPPO経路阻害剤。
23.体外受精に適した、または妊娠の確率を増加させるのに適した胚盤胞を作製する方法において使用するための、実施形態18または19に記載の芽球様細胞の培養上清であって、1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期、または胚盤胞期から選択される初期段階の胚を成熟胚盤胞期まで、芽球様細胞の培養由来の上清で処理する工程、および1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期の胚を胚盤胞期まで成長させる工程、もしくは胚盤胞期の胚をより成熟した胚盤胞期まで成長させる工程を含む、芽球様細胞の培養上清。
24.実施形態18または19に記載の芽球様細胞を培養し、培養物、好ましくは培養上清から上記LPAを収集することを含む、LPAを産生する方法。
25.MST1/2阻害剤、好ましくはXMU-MP-1、および/またはSTAT阻害剤、好ましくはSC144の存在下でhPSCを培養する工程を含む、trophosphereを形成する方法。
26.実施形態1から16のいずれか一つに記載のようにさらに実行される、25に記載の方法。
27.MST1/2阻害剤、好ましくはXMU-MP-1、および/またはSTAT阻害剤、好ましくはSC144を患者に投与すること、および/または胚にインビボでMST1/2阻害剤、好ましくはXMU-MP-1、および/またはSTAT阻害剤、好ましくはSC144を接触させることを含む、避妊方法。
28.MST1/2阻害剤、好ましくはXMU-MP-1、および/またはSTAT阻害剤、好ましくはSC144が、受胎後1~9日後、好ましくは受胎後2~7日後、特に好ましくは受胎後3~6日後に患者に投与される、27に記載の方法。
29.好ましくは実施形態27または28による、避妊方法に使用するための、MST1/2阻害剤、好ましくはXMU-MP-1、および/またはSTAT阻害剤、好ましくはSC144。
30.避妊薬の製造に使用するための、MST1/2阻害剤、好ましくはXMU-MP-1、および/またはSTAT阻害剤、好ましくはSC144。
1.ヒト多能性幹細胞(hPSC)および栄養膜細胞の凝集物を、HIPPO経路阻害剤を含む培地中で3D培養で培養することを含む、芽球様細胞または胚盤胞様細胞凝集物を生成する方法。
2.hPSCおよび栄養膜の凝集物が、MEK阻害剤およびTGF-β阻害剤、好ましくはHIPPO経路阻害剤も含む培地中で凝集したhPSCを培養することによって生成される、1に記載の方法。
3.凝集したhPSCが、hPSCを播種すること、増殖培地中で培養すること、好ましくは0~64時間、または12~64時間増殖培地中で培養することによって播種されたhPSCを凝集させることによって形成される、および/または好ましくは、ここで増殖培地はROCK阻害剤を含み、特に好ましくはROCK阻害剤はY27632である、2に記載の方法。
4.播種されたhPSCが、3D培養の前に、好ましくは2D培養中に、MEK阻害剤および/またはPKC阻害剤で処理されており、好ましくはWnt阻害剤および/またはSTATアゴニストをさらに含み、好ましくはここで処理は2D培養中である、3に記載の方法。
5.PKC阻害剤がGoe6983およびRo-31-8425から選択される、4に記載の方法。
6.HIPPO経路阻害剤が、リゾホスファチジン酸(LPA)受容体のリガンド、好ましくはLPAおよび/またはNAEPA、またはベルテポルフィンである;および/またはMEK阻害剤はPD0325901である;および/またはTGF-β阻害剤はA83-1またはSB431542である、1~5のいずれか1つに記載の方法。
7.実施形態2に記載の3D培養で培養するための培地および/または凝集したhPSCを培養するための培地が、STAT3アゴニスト、好ましくは白血病抑制因子(LIF)をさらに含む、1~6のいずれか1つに記載の方法。
8.3D培養が、非付着性容器内で培養することにより、好ましくはマイクロウェル内で培養することにより、特に好ましくはヒドロゲルで作られた非付着性表面を含むマイクロウェル内で培養することによる、1~7のいずれか1つに記載の方法。
9.実施形態3の増殖培地中でのhPSCの培養が、1~200個のhPSC、好ましくは20~150個のhPSC、特に好ましくは30~120個のhPSC、さらにより好ましくは30~60個のhPSCを容器内に入れ、上記播種したhPSCを増殖培地中で増殖させることを含む、3~8のいずれか1つに記載の方法。
10.hPSCおよび栄養膜を少なくとも1日間、好ましくは少なくとも2日間培養する、1~9のいずれか1つに記載の方法。
11.実施形態2に記載の凝集細胞を少なくとも1日間、好ましくは少なくとも2日間培養する、2~10のいずれか一つに記載の方法。
12.hPSCおよび栄養膜の凝集物から少なくとも栄養外胚葉様組織、エピブラスト様組織、およびハイポブラスト様組織が形成されるまで、好ましくはさらに少なくとも胚-非胚軸が形成されるまで細胞を培養することを含む、1~11のいずれか1つに記載の方法。
13.液体で満たされた空洞およびエピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞を含む少なくとも一つの内部細胞塊を取り囲む栄養膜様細胞の外側上皮単層によって形成される、全径が少なくとも100μm、好ましくは少なくとも140μm、さらにより好ましくは180μm~220μmの三次元細胞凝集物が形成されるまで細胞を培養することを含む、1~12のいずれか1項に記載の方法。
14.芽球様細胞を子宮内膜細胞上に播種する工程、および芽球様細胞を子宮内膜細胞内または子宮内膜細胞上に着床させる工程をさらに含む、1~13のいずれか1つに記載の方法。
15.子宮内膜細胞が、エストロゲン、エストロン、エストリオール、エチニルエストラジオール、17α-エチニルエストラジオール、メストラノール、プロゲステロン、プロゲスチン、cAMP、およびWnt阻害剤(好ましくはXAV939、IWP-2、PNU-74654、および/またはLF3)から選択される化合物で処理されている、14記載の方法。
16.少なくとも一つの候補化合物で処理する工程、および/または少なくとも一つの候補遺伝子改変を有する凝集物を提供する工程、および実施形態1~15のいずれか一つに記載の方法を実施する工程を含む、芽球様細胞形成および/または子宮内膜細胞の層への芽球様細胞の移植に影響を与える候補化合物および/または候補遺伝子変異を試験またはスクリーニングするための、1~15のいずれか一つに記載の方法。
17.HIPPO経路阻害剤、MEK阻害剤、およびTGF-β阻害剤を含む、芽球様細胞の培養に適したキット;好ましくはヒト多能性幹細胞(hPSC)用の培地に組み込まれている。
18.1~16のいずれか一つに記載の方法により得られる芽球様細胞。
19.少なくとも一つの液体で満たされた空洞およびエピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞を含む少なくとも一つの内部細胞塊を取り囲む栄養膜様細胞の外側上皮単層を含み、ここで、該外側上皮単層は、NR2F2を発現する極性栄養膜(polar trophoblast)を含む、芽球様細胞。
20.芽球様細胞または胚盤胞をWnt阻害剤、好ましくはXAV939、IWP-2、PNU-74654、および/またはLF3で処理する工程、および該芽球様細胞または胚盤胞を子宮内膜細胞の層と接触させる工程を含む、芽球様細胞または胚盤胞を子宮内膜細胞の層に移植する潜在能力を増大させるインビトロ法。
21.たとえば体外受精中または自然妊娠中に、胚盤胞着床の確率を増大させる方法において使用するためのWnt阻害剤であって、Wnt阻害剤の存在下で胚盤胞を子宮内膜と接触させる工程、または胚盤胞の非存在下で子宮内膜細胞をWnt阻害剤、好ましくはXAV939、IWP-2、PNU-74654、および/またはLF3で刺激する工程を含むWnt阻害剤;ここで好ましくは、子宮内膜は局所的に、全身的に、または胚盤胞と一緒にWnt阻害剤と接触される、Wnt阻害剤。
22.体外受精に適した、または妊娠の確率を増大させるのに適した胚盤胞を作製する方法において使用するためのHIPPO経路阻害剤であって、1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期、または胚盤胞期から選択される初期段階の胚を成熟胚盤胞期まで、HIPPO経路阻害剤で、特に好ましくはNAEPAまたはリゾホスファチジン酸(LPA)受容体のリガンドで、さらにより好ましくはLPAで、処理する工程、および1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期の胚を胚盤胞期まで成長させる工程、もしくは胚盤胞期の胚をより成熟した胚盤胞期(more mature blastocyst stage)まで成長させる工程を含む、使用のためのHIPPO経路阻害剤。
23.体外受精に適した、または妊娠の確率を増加させるのに適した胚盤胞を作製する方法において使用するための、実施形態18または19に記載の芽球様細胞の培養上清であって、1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期、または胚盤胞期から選択される初期段階の胚を成熟胚盤胞期まで、芽球様細胞の培養由来の上清で処理する工程、および1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期の胚を胚盤胞期まで成長させる工程、もしくは胚盤胞期の胚をより成熟した胚盤胞期まで成長させる工程を含む、芽球様細胞の培養上清。
24.実施形態18または19に記載の芽球様細胞を培養し、培養物、好ましくは培養上清から上記LPAを収集することを含む、LPAを産生する方法。
25.MST1/2阻害剤、好ましくはXMU-MP-1、および/またはSTAT阻害剤、好ましくはSC144の存在下でhPSCを培養する工程を含む、trophosphereを形成する方法。
26.実施形態1から16のいずれか一つに記載のようにさらに実行される、25に記載の方法。
27.MST1/2阻害剤、好ましくはXMU-MP-1、および/またはSTAT阻害剤、好ましくはSC144を患者に投与すること、および/または胚にインビボでMST1/2阻害剤、好ましくはXMU-MP-1、および/またはSTAT阻害剤、好ましくはSC144を接触させることを含む、避妊方法。
28.MST1/2阻害剤、好ましくはXMU-MP-1、および/またはSTAT阻害剤、好ましくはSC144が、受胎後1~9日後、好ましくは受胎後2~7日後、特に好ましくは受胎後3~6日後に患者に投与される、27に記載の方法。
29.好ましくは実施形態27または28による、避妊方法に使用するための、MST1/2阻害剤、好ましくはXMU-MP-1、および/またはSTAT阻害剤、好ましくはSC144。
30.避妊薬の製造に使用するための、MST1/2阻害剤、好ましくはXMU-MP-1、および/またはSTAT阻害剤、好ましくはSC144。
本開示全体を通して、冠詞「a」、「an」、および「the」は、本明細書では、冠詞の文法的対象の一つまたは複数(すなわち、少なくとも一つ)を指すために使用される。
本明細書で使用される場合、「約」、「実質的な」、または「実質的に」等の近似の言葉は、これらに限定されないが、そのように変更された場合、必ずしも絶対的または完全であるとは限らないが、当業者にとってはその状態が存在するものとして呼ぶのに十分に近いとみなされる状態を指す。記載がどの程度変化するかは、どの程度大きな変更を導入して、変更された特徴が未修正の特徴の必要な特性および能力を依然として有するものとして当業者に認識させることができるかによって決まる。一般に、前述の議論の対象となるが、「約」等の類義語によって修飾される本明細書の数値は、記載された値から、たとえば±10%異なる場合がある。
本明細書で使用される場合、「含む(comprising)」(および「含む(comprise)」および「含む(comprises)」等の含むの任意の形式)、「有する(having)」(および「有する(have)」および「有する(has)」等の有するの任意の形式)、または「含む(including)」(および「含む(includes)」および「含む(include)」等の任意の形式)、または「含む(containing)」(および「含む(contains)」および「含む(contain)」等の任意の形式)という語は包括的または無制限であり、追加の言及されていない要素または方法工程を除外するものではない。「含む(comprising)」という表現は、その要素の特定の値の数値範囲と組み合わせて要素について使用される場合、要素がその範囲に限定されることを意味するが、「含む(comprising)」は依然として他の要素の任意の存在に関連する。たとえば、範囲を有する要素には、その範囲外の量でのその要素の存在を除外するという暗黙の条件が適用される場合がある。本明細書で使用される場合、「から本質的になる(consisting essentially of)」という表現は、特定の整数または工程、ならびに請求された発明の性質または機能に実質的に影響を与えないものを必要とする。本明細書で使用される場合、「からなる(consisting)」という限定された用語は、列挙された要素のみが存在することを示すために使用される。
本発明を以下の実施例によってさらに説明するが、本発明のこれらの実施形態に限定されるものではない。
実施例
実施例1:hPSCの凝集物の形成。
芽球様細胞の形成は、最適な数のhPSCの凝集に依存する。これは、非接着性ヒドロゲルで作られ、たとえば200マイクロメートルの多数のマイクロウェルを含むマイクロウェルアレイ上に特定の数のhPSCを播種することによって達成することができる(図1A)。ヒト芽球様細胞が20~100個の細胞の凝集物から優先的に形成され、これが空洞を形成することができる凝集物の形成に有利であることを観察した(図1B)。この現象は、空洞を形成する構造の数、およびユニークな液体で満たされた空洞およびエピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞で構成される内部細胞塊を取り囲む栄養膜様細胞の外側上皮単層によって形成される、全径が180~220マイクロメートルの三次元構造として定義される芽球様細胞の数を測定することによって定量化する。凝集物の分子刺激のタイミングも、この凝集物内の細胞の特異化(specification)および自己組織化のレベルを決定する。B27N2培地中で細胞を最初に凝集させ、24~48時間後にA83-1、PD0325901、LIFを含むB27N2培地に培地を交換することで、凝集物が3つの細胞型、およびエピブラスト細胞およびハイポブラスト細胞の単一の内部細胞クラスターを含む、外側の栄養膜シストを形成するには十分であることを観察した。これらの条件下では、ヒト芽球様細胞は5日以内に形成される(図1B)。
実施例1:hPSCの凝集物の形成。
芽球様細胞の形成は、最適な数のhPSCの凝集に依存する。これは、非接着性ヒドロゲルで作られ、たとえば200マイクロメートルの多数のマイクロウェルを含むマイクロウェルアレイ上に特定の数のhPSCを播種することによって達成することができる(図1A)。ヒト芽球様細胞が20~100個の細胞の凝集物から優先的に形成され、これが空洞を形成することができる凝集物の形成に有利であることを観察した(図1B)。この現象は、空洞を形成する構造の数、およびユニークな液体で満たされた空洞およびエピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞で構成される内部細胞塊を取り囲む栄養膜様細胞の外側上皮単層によって形成される、全径が180~220マイクロメートルの三次元構造として定義される芽球様細胞の数を測定することによって定量化する。凝集物の分子刺激のタイミングも、この凝集物内の細胞の特異化(specification)および自己組織化のレベルを決定する。B27N2培地中で細胞を最初に凝集させ、24~48時間後にA83-1、PD0325901、LIFを含むB27N2培地に培地を交換することで、凝集物が3つの細胞型、およびエピブラスト細胞およびハイポブラスト細胞の単一の内部細胞クラスターを含む、外側の栄養膜シストを形成するには十分であることを観察した。これらの条件下では、ヒト芽球様細胞は5日以内に形成される(図1B)。
実施例2:小分子または遺伝学的アプローチのいずれかの使用によるHIPPO経路の阻害。
HIPPO経路の活性は芽球様細胞形成に不可欠である。HIPPO経路活性の阻害剤である小分子LPAまたはNAEPAを使用してhPSC凝集物を刺激すると、固形の細胞凝集物から、単一の液体で満たされた空洞を含むシスト構造への移行が引き起こされる。この液体で満たされた空洞は、CDX2およびGATA3を含む、栄養外胚葉マーカーを発現する細胞で裏打ちされており、NANOGおよびOCT4を含むエピブラストのマーカーを発現する細胞、およびGATA4を含むハイポブラストのマーカーを発現する細胞の単一クラスターで構成される。芽球様細胞を形成するためにHIPPO経路の活性を調節する必要性は、YAP 特異的阻害剤であるベルテポルフィンによるhPSC凝集物の処理時に観察される効果によっても評価される。この小分子は空洞の形成を完全に阻止する(1μM)(図2C)。ヒト芽球様細胞形成におけるHIPPO経路の役割に従って、HIPPO経路エフェクターYAPは外側の栄養外胚葉様細胞の核に移行するが、内側の細胞クラスターの核には移行しない(図2E)。最後に、野生型および構成的活性型YAP(YAP 5SA)の過剰発現は、芽球様細胞形成の初期段階(2日目)における空洞の形成を促進する(図2D)。逆に、HIPPO標的遺伝子の活性化を阻害することが知られているTEAD結合部位 (YAP S94A)に変異を伴うYAPの過剰発現は、空洞形成についてプラスの効果を示さない。したがって、小分子を使用して生成されたデータと一致して、栄養外胚葉プログラムの遺伝的活性化および胞胚腔様空洞の形成には、HIPPO経路の調節が必要である。
HIPPO経路の活性は芽球様細胞形成に不可欠である。HIPPO経路活性の阻害剤である小分子LPAまたはNAEPAを使用してhPSC凝集物を刺激すると、固形の細胞凝集物から、単一の液体で満たされた空洞を含むシスト構造への移行が引き起こされる。この液体で満たされた空洞は、CDX2およびGATA3を含む、栄養外胚葉マーカーを発現する細胞で裏打ちされており、NANOGおよびOCT4を含むエピブラストのマーカーを発現する細胞、およびGATA4を含むハイポブラストのマーカーを発現する細胞の単一クラスターで構成される。芽球様細胞を形成するためにHIPPO経路の活性を調節する必要性は、YAP 特異的阻害剤であるベルテポルフィンによるhPSC凝集物の処理時に観察される効果によっても評価される。この小分子は空洞の形成を完全に阻止する(1μM)(図2C)。ヒト芽球様細胞形成におけるHIPPO経路の役割に従って、HIPPO経路エフェクターYAPは外側の栄養外胚葉様細胞の核に移行するが、内側の細胞クラスターの核には移行しない(図2E)。最後に、野生型および構成的活性型YAP(YAP 5SA)の過剰発現は、芽球様細胞形成の初期段階(2日目)における空洞の形成を促進する(図2D)。逆に、HIPPO標的遺伝子の活性化を阻害することが知られているTEAD結合部位 (YAP S94A)に変異を伴うYAPの過剰発現は、空洞形成についてプラスの効果を示さない。したがって、小分子を使用して生成されたデータと一致して、栄養外胚葉プログラムの遺伝的活性化および胞胚腔様空洞の形成には、HIPPO経路の調節が必要である。
実施例3:栄養外胚葉様、エピブラスト様、およびハイポブラスト様組織の同時特異化および形態形成。
化学阻害剤SC-144の処理によるLIF-STAT経路の阻害は、エピブラスト様細胞/ハイポブラスト様細胞の内部クラスターを形成しない単層の空洞形成凝集物の形成を誘導した。外側栄養外胚葉細胞の系統特異化の成熟もSC-144処理によって損なわれ、これは芽球様細胞形成における3つの系統間の細胞間コミュニケーションの重要な役割を示している。
化学阻害剤SC-144の処理によるLIF-STAT経路の阻害は、エピブラスト様細胞/ハイポブラスト様細胞の内部クラスターを形成しない単層の空洞形成凝集物の形成を誘導した。外側栄養外胚葉細胞の系統特異化の成熟もSC-144処理によって損なわれ、これは芽球様細胞形成における3つの系統間の細胞間コミュニケーションの重要な役割を示している。
実施例4:胚-非胚軸の自発的形成。
ヒトの後期胚盤胞では、エピブラストに隣接する極栄養外胚葉が転写因子NR2F2の発現を開始し、子宮への着床を媒介する領域を標識する。同様に、インビトロ培養すると、芽球様細胞の栄養外胚葉様組織は、NR2F2の発現を特徴とする別個の領域を自発的に形成する。逆に、液体で満たされた空洞の反対側の壁性栄養外胚葉はNR2F2を発現しない(図3H)。したがって、胚盤胞と同様に、芽球様細胞は着床を媒介する領域を自発的に形成し、軸を形成することができる。
ヒトの後期胚盤胞では、エピブラストに隣接する極栄養外胚葉が転写因子NR2F2の発現を開始し、子宮への着床を媒介する領域を標識する。同様に、インビトロ培養すると、芽球様細胞の栄養外胚葉様組織は、NR2F2の発現を特徴とする別個の領域を自発的に形成する。逆に、液体で満たされた空洞の反対側の壁性栄養外胚葉はNR2F2を発現しない(図3H)。したがって、胚盤胞と同様に、芽球様細胞は着床を媒介する領域を自発的に形成し、軸を形成することができる。
実施例5:子宮内膜細胞の、着床の窓を模倣した受容細胞への分化。
インビトロで胚盤胞の着床をモデル化するために、オルガノイド由来の子宮内膜細胞を2D培養プレートに堆積させ、着床時に子宮の内側を覆う細胞に分化させる分子で刺激できる条件(いわゆる着床の窓、WOI)を定義した。ホルモン(エストラジオール、プロゲステロン)と同様に、複数の小分子を使用したWntシグナル伝達経路の阻害が、WOI中に高度に発現される遺伝子の発現の上方制御を誘導することを発見した(図6)。XAV939とともに培養した子宮内膜細胞のRTqPCRを使用して見られるように、Wntの阻害によりPAEP、SPP1、LIF、およびDPP4の発現が増加する。免疫蛍光を使用して示されるように、刺激された子宮内膜細胞はタンパク質レベルでもPAEPを発現し、EdUの取り込みによって見られるように、細胞は増殖している。子宮内膜細胞は、免疫蛍光を使用して見られるように、アセチル化αチューブリンを特異的に発現する繊毛細胞の亜集団、およびFOXA2を特異的に発現する腺細胞も含む。
インビトロで胚盤胞の着床をモデル化するために、オルガノイド由来の子宮内膜細胞を2D培養プレートに堆積させ、着床時に子宮の内側を覆う細胞に分化させる分子で刺激できる条件(いわゆる着床の窓、WOI)を定義した。ホルモン(エストラジオール、プロゲステロン)と同様に、複数の小分子を使用したWntシグナル伝達経路の阻害が、WOI中に高度に発現される遺伝子の発現の上方制御を誘導することを発見した(図6)。XAV939とともに培養した子宮内膜細胞のRTqPCRを使用して見られるように、Wntの阻害によりPAEP、SPP1、LIF、およびDPP4の発現が増加する。免疫蛍光を使用して示されるように、刺激された子宮内膜細胞はタンパク質レベルでもPAEPを発現し、EdUの取り込みによって見られるように、細胞は増殖している。子宮内膜細胞は、免疫蛍光を使用して見られるように、アセチル化αチューブリンを特異的に発現する繊毛細胞の亜集団、およびFOXA2を特異的に発現する腺細胞も含む。
実施例6:受容性子宮内膜オルガノイドへのヒト芽球様細胞の移植。
EPC/XAV939処理子宮内膜細胞上にヒト芽球様細胞が堆積すると、芽球様細胞が付着し、その細胞が子宮内膜層に侵入する(図7)。付着および侵入すると、芽球様細胞は多能性転写因子Oct4の発現を維持する。子宮内膜細胞がEPC/XAV939で刺激されない場合、芽球様細胞はほとんど付着することができず、子宮内膜層に侵入することができない。芽球様細胞がエピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞の内部クラスター(SC144-Trophospheres、XMU-MP-1-Trophospheres)を形成することがほとんどできない場合、それらは子宮内膜層に付着して侵入することがほとんどできない。着床後の栄養膜細胞層を反映するヒト栄養膜幹細胞から形成された凝集物(Okae et al. 2018)は、子宮内膜層に付着して侵入することができない。
EPC/XAV939処理子宮内膜細胞上にヒト芽球様細胞が堆積すると、芽球様細胞が付着し、その細胞が子宮内膜層に侵入する(図7)。付着および侵入すると、芽球様細胞は多能性転写因子Oct4の発現を維持する。子宮内膜細胞がEPC/XAV939で刺激されない場合、芽球様細胞はほとんど付着することができず、子宮内膜層に侵入することができない。芽球様細胞がエピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞の内部クラスター(SC144-Trophospheres、XMU-MP-1-Trophospheres)を形成することがほとんどできない場合、それらは子宮内膜層に付着して侵入することがほとんどできない。着床後の栄養膜細胞層を反映するヒト栄養膜幹細胞から形成された凝集物(Okae et al. 2018)は、子宮内膜層に付着して侵入することができない。
実施例7:拡張方法。
ヒトナイーブ多能性幹細胞の培養
実験は次のhPSC株を使用して行った; hESC株:H9、Shef6およびHNES1.hiPSC株:cR-NCRM2およびniPSC 16.2.b。ナイーブ状態のH9およびH9-GFP株は、高島康弘の研究室から提供された。他のナイーブhESCおよびhiPSCは、Austin Smithの研究室から提供された。ナイーブhPSCを、PXGL培地中のガンマ線照射マウス胎児線維芽細胞(MEF)のフィーダー層を含むゼラチンコートプレート上で培養した。PXGL培地は、PD0325901(1μM、MedChemExpress、HY-10254)、XAV-939(1μM、MedChemExpress、HY-15147)、Goe 6983(2μM、MedChemExpress、HY-13689)、およびヒト白血病抑制因子(hLIF、10ng/ml、自社製)を補充したN2B27基本培地を使用して調製される。N2B27基本培地は、DMEM/F12(50%、自社製)、Neurabasal(商標)培地(50%、自社製)、N2サプリメント(Thermo Fisher Science、17502048)、B-27サプリメント(Thermo Fisher Science、17504044)、GultaMAX(商標)サプリメント(Thermo Fisher Science、35050-038)、非必須アミノ酸、2-メルカプトエタノール(100μM、Thermo Fisher Science、31350010)、およびウシ血清アルブミン溶液(0.45%、Sigma-Aldrich、A7979-50ML)を含んでいた。細胞は、3~4日ごとに単一細胞としてルーチン的に継代した。
ヒトナイーブ多能性幹細胞の培養
実験は次のhPSC株を使用して行った; hESC株:H9、Shef6およびHNES1.hiPSC株:cR-NCRM2およびniPSC 16.2.b。ナイーブ状態のH9およびH9-GFP株は、高島康弘の研究室から提供された。他のナイーブhESCおよびhiPSCは、Austin Smithの研究室から提供された。ナイーブhPSCを、PXGL培地中のガンマ線照射マウス胎児線維芽細胞(MEF)のフィーダー層を含むゼラチンコートプレート上で培養した。PXGL培地は、PD0325901(1μM、MedChemExpress、HY-10254)、XAV-939(1μM、MedChemExpress、HY-15147)、Goe 6983(2μM、MedChemExpress、HY-13689)、およびヒト白血病抑制因子(hLIF、10ng/ml、自社製)を補充したN2B27基本培地を使用して調製される。N2B27基本培地は、DMEM/F12(50%、自社製)、Neurabasal(商標)培地(50%、自社製)、N2サプリメント(Thermo Fisher Science、17502048)、B-27サプリメント(Thermo Fisher Science、17504044)、GultaMAX(商標)サプリメント(Thermo Fisher Science、35050-038)、非必須アミノ酸、2-メルカプトエタノール(100μM、Thermo Fisher Science、31350010)、およびウシ血清アルブミン溶液(0.45%、Sigma-Aldrich、A7979-50ML)を含んでいた。細胞は、3~4日ごとに単一細胞としてルーチン的に継代した。
準備刺激された多能性ESCの培養
準備刺激されたH9細胞を、ビトロネクチンXF(STEMCELL Technologies、07180)でコーティングされたプレート(1.0μg/cm2)上で、Essential 8培地を使用して培養した。
準備刺激されたH9細胞を、ビトロネクチンXF(STEMCELL Technologies、07180)でコーティングされたプレート(1.0μg/cm2)上で、Essential 8培地を使用して培養した。
マイクロウェルアレイ
直径200μmのマイクロウェルからなるマイクロウェルアレイを96ウェルプレートにインプリントした。
直径200μmのマイクロウェルからなるマイクロウェルアレイを96ウェルプレートにインプリントした。
芽球様細胞およびtrophosphereの誘導
ナイーブhPSCまたは準備刺激されたhPSCの培養物をAccutase(商標)(Biozym、B423201)で37℃で5分間処理し、続いてピペットを使用して穏やかに機械的に解離させた。遠心分離後、細胞ペレットをY-27632(10μM、MedChemExpress、HY-10583)を補充したPXGL培地に再懸濁した。MEFを排除するために、細胞懸濁液をゼラチンでコーティングしたプレートに移し、37℃で70分間インキュベートした。MEF排除後、CountessTM自動セルカウンター(Thermo Fisher Scientific)およびトリパンブルー染色を使用して細胞数を測定し、細胞生存率を評価した。次いで細胞を10μM Y-27632を含むN2B27培地(凝集培地)に再懸濁し、3.0×104個の細胞を96ウェルプレートのウェルに含まれるマイクロウェルアレイ上に播種した。細胞株に応じて、またその凝集傾向に基づいて、0~24時間の範囲で、細胞をマイクロウェル内で凝集物を形成させた。続いて、凝集培地を、PALLY培地-PD0325901(1μM)、A 83-01(1μM、Med-ChemExpress、HY-10432)、hLIF (10ng/ml)、1-オレオイルリゾホスファチジン酸ナトリウム塩(LPA)、(500nM、Tocris、3854)およびY-27632(10μM)を補充したN2B27に交換した。PALLY培地は24時間ごとに更新した。48時間後、PALLY培地を500nM LPAおyび10μM Y-27632を含む N2B27 培地に交換した。96時間時点で、芽球様細胞はB6段階のヒト胚盤胞との形態学的類似性に基づいて、一つの内部細胞塊を含む全径150~250μmの単層シストからなる構造として定義される。また、形態を超えて、芽球様細胞が胚盤胞発生の連続的かつタイムリーな方法で3つの胚盤胞細胞系統のアナログを形成することを検証した。芽球様細胞は高効率で再現性よく形成され、PXGL培養条件でのリセット後の継代数に基づく差異は観察されなかった。芽球様細胞形成の収率に対するLPA、NAEPA(Sigma-Aldrich、N0912)およびベルテポルフィン(Selleck Chemicals Llc、S1786)の影響は、0~96時間後まで毎日分子を添加したPALY培地でナイーブhPSC凝集物を培養することによって評価された。ベルテポルフィン処理は光に暴露せずに行った。aPKC阻害剤CRT0103390(Kathy Niakanの研究室からのギフト)の効果は、2μM CRT0103390を補充したPALLY培地でナイーブhPSC凝集物を毎日0~96時間培養することによって評価された。trophosphereの形成は、2μM XMU-MP-1(Med Chem Express、HY-100526)または3μM SC-144(Axon、2324)を補充した PALLY培地でナイーブhPSC凝集物を毎日0~96時間後まで培養することによって誘導した。BSA濃度は、芽球様細胞およびtrophosphereの形成に使用される個々の細胞株に対して0~0.3%の範囲内で滴定された。
ナイーブhPSCまたは準備刺激されたhPSCの培養物をAccutase(商標)(Biozym、B423201)で37℃で5分間処理し、続いてピペットを使用して穏やかに機械的に解離させた。遠心分離後、細胞ペレットをY-27632(10μM、MedChemExpress、HY-10583)を補充したPXGL培地に再懸濁した。MEFを排除するために、細胞懸濁液をゼラチンでコーティングしたプレートに移し、37℃で70分間インキュベートした。MEF排除後、CountessTM自動セルカウンター(Thermo Fisher Scientific)およびトリパンブルー染色を使用して細胞数を測定し、細胞生存率を評価した。次いで細胞を10μM Y-27632を含むN2B27培地(凝集培地)に再懸濁し、3.0×104個の細胞を96ウェルプレートのウェルに含まれるマイクロウェルアレイ上に播種した。細胞株に応じて、またその凝集傾向に基づいて、0~24時間の範囲で、細胞をマイクロウェル内で凝集物を形成させた。続いて、凝集培地を、PALLY培地-PD0325901(1μM)、A 83-01(1μM、Med-ChemExpress、HY-10432)、hLIF (10ng/ml)、1-オレオイルリゾホスファチジン酸ナトリウム塩(LPA)、(500nM、Tocris、3854)およびY-27632(10μM)を補充したN2B27に交換した。PALLY培地は24時間ごとに更新した。48時間後、PALLY培地を500nM LPAおyび10μM Y-27632を含む N2B27 培地に交換した。96時間時点で、芽球様細胞はB6段階のヒト胚盤胞との形態学的類似性に基づいて、一つの内部細胞塊を含む全径150~250μmの単層シストからなる構造として定義される。また、形態を超えて、芽球様細胞が胚盤胞発生の連続的かつタイムリーな方法で3つの胚盤胞細胞系統のアナログを形成することを検証した。芽球様細胞は高効率で再現性よく形成され、PXGL培養条件でのリセット後の継代数に基づく差異は観察されなかった。芽球様細胞形成の収率に対するLPA、NAEPA(Sigma-Aldrich、N0912)およびベルテポルフィン(Selleck Chemicals Llc、S1786)の影響は、0~96時間後まで毎日分子を添加したPALY培地でナイーブhPSC凝集物を培養することによって評価された。ベルテポルフィン処理は光に暴露せずに行った。aPKC阻害剤CRT0103390(Kathy Niakanの研究室からのギフト)の効果は、2μM CRT0103390を補充したPALLY培地でナイーブhPSC凝集物を毎日0~96時間培養することによって評価された。trophosphereの形成は、2μM XMU-MP-1(Med Chem Express、HY-100526)または3μM SC-144(Axon、2324)を補充した PALLY培地でナイーブhPSC凝集物を毎日0~96時間後まで培養することによって誘導した。BSA濃度は、芽球様細胞およびtrophosphereの形成に使用される個々の細胞株に対して0~0.3%の範囲内で滴定された。
ヒト芽球様細胞からの細胞株の誘導
前のセクションで記載したように、96時間培養した芽球様細胞を用いて誘導実験を行った。芽球様細胞は、ガンマ線照射されたMEFのフィーダー層を備えた、ゼラチンでコーティングされた96ウェルプレートに個別に移植された。ナイーブhPSCはPXGL培地で誘導された。hTSCはヒト栄養膜幹細胞(hTSC)培地で誘導された(Okae, H. et al. Cell Stem Cell 22, 50-63.e6 (2018))。フィーダー上で24時間培養した後、芽球様細胞が付着し、1週間以内にコロニーが形成された。芽球様細胞移植後3継代後に誘導が成功したとみなされた。免疫蛍光アッセイでは、ナイーブhPSCをGeltrex(登録商標)(0.5μL/cm2)でコーティングしたカバーガラスに移し、hTSCをフィブロネクチンでコーティングしたカバースリップ(5μg/ml、Sigma Aldrich、08012)に移した。
前のセクションで記載したように、96時間培養した芽球様細胞を用いて誘導実験を行った。芽球様細胞は、ガンマ線照射されたMEFのフィーダー層を備えた、ゼラチンでコーティングされた96ウェルプレートに個別に移植された。ナイーブhPSCはPXGL培地で誘導された。hTSCはヒト栄養膜幹細胞(hTSC)培地で誘導された(Okae, H. et al. Cell Stem Cell 22, 50-63.e6 (2018))。フィーダー上で24時間培養した後、芽球様細胞が付着し、1週間以内にコロニーが形成された。芽球様細胞移植後3継代後に誘導が成功したとみなされた。免疫蛍光アッセイでは、ナイーブhPSCをGeltrex(登録商標)(0.5μL/cm2)でコーティングしたカバーガラスに移し、hTSCをフィブロネクチンでコーティングしたカバースリップ(5μg/ml、Sigma Aldrich、08012)に移した。
栄養膜オルガノイドの形成
オルガノイド形成は、芽球様細胞由来hTSC株を用いて行った。オルガノイドは、いくつかの改変を加えて、以前に記載されているように(Turco, M. Y. et al. Nature 564, 263-267 (2018))培養した。1×トリプシンを37℃で5分間使用して、hTSCのコロニーを単一細胞に解離させた。遠心分離後、200,000個の細胞を150μlのマトリゲル(Corning、356231)に再懸濁した。ウェルあたり20μlの液滴を、予熱した48ウェル細胞培養プレートに配置し、逆さまにしてインキュベーターに20分間置いた。オルガノイドを250μlのTOM培地(Advanced DMEM-F12、N2サプリメント、B27サプリメントマイナスビタミンa、PenStrep、N-アセチル-L-システイン(1.25mM)、L-グルタミン(2mM)、A83-01(500nM)、CHIR99021(1.5uM)、組換えヒトEGF(50ng/ml)、10% R-Spondin 1馴化培地、組換えヒトFGF2(100ng/ml)、組換えヒトHGF(50ng/ml)、PGE2(2.5.μM))中で培養した。培地は一日おきに交換した。SCT形成のためにオルガノイドを7日目までTOM培地で維持した。
オルガノイド形成は、芽球様細胞由来hTSC株を用いて行った。オルガノイドは、いくつかの改変を加えて、以前に記載されているように(Turco, M. Y. et al. Nature 564, 263-267 (2018))培養した。1×トリプシンを37℃で5分間使用して、hTSCのコロニーを単一細胞に解離させた。遠心分離後、200,000個の細胞を150μlのマトリゲル(Corning、356231)に再懸濁した。ウェルあたり20μlの液滴を、予熱した48ウェル細胞培養プレートに配置し、逆さまにしてインキュベーターに20分間置いた。オルガノイドを250μlのTOM培地(Advanced DMEM-F12、N2サプリメント、B27サプリメントマイナスビタミンa、PenStrep、N-アセチル-L-システイン(1.25mM)、L-グルタミン(2mM)、A83-01(500nM)、CHIR99021(1.5uM)、組換えヒトEGF(50ng/ml)、10% R-Spondin 1馴化培地、組換えヒトFGF2(100ng/ml)、組換えヒトHGF(50ng/ml)、PGE2(2.5.μM))中で培養した。培地は一日おきに交換した。SCT形成のためにオルガノイドを7日目までTOM培地で維持した。
2D栄養膜の分化
芽球様細胞由来hTSCの分化は、いくつかの改変を加えて、以前に記載されているように(Okae, H. et al. Cell Stem Cell 22, 50-63.e6 (2018))行った。実験前に、hTSC株をフィブロネクチンコーティング(5μg/ml、Sigma Aldrich、08012)に少なくとも3継代適応させた。EVTおよびSCTの分化のために、細胞を37℃で5分間TrypLEで解離させ、細胞を12ウェルプレート上に55,000細胞/ウェルの密度で播種した。SCT分化のために、プレートを10μg/mlのフィブロネクチンでプレコートし、SCT培地(0.1mM 2-メルカプトエタノール、0.5%ペニシリン-ストレプトマイシン、1%ITS-Xサプリメント、7.5mM A83-01、2.5mM Y27632、4%ノックアウト血清代替物、および2 mMフォルスコリンを補充したDMEM/F12)中で3日間培養した。EVT分化のために、プレートをマトリゲルでプレコートし、細胞をEVT培地(0.1mM 2-メルカプトエタノール、0.5%ペニシリン-ストレプトマイシン、1%ITS-Xサプリメント、2%マトリゲル、7.5mM A83-01、2.5mM Y27632、4%ノックアウト血清代替物、および100ng/ml NRG1を補充したDMEM/F12)で培養した。3日後、培地を、0.5%マトリゲルを含み、NRG1を含まないEVT培地に交換した。細胞を6日目まで培養した。
芽球様細胞由来hTSCの分化は、いくつかの改変を加えて、以前に記載されているように(Okae, H. et al. Cell Stem Cell 22, 50-63.e6 (2018))行った。実験前に、hTSC株をフィブロネクチンコーティング(5μg/ml、Sigma Aldrich、08012)に少なくとも3継代適応させた。EVTおよびSCTの分化のために、細胞を37℃で5分間TrypLEで解離させ、細胞を12ウェルプレート上に55,000細胞/ウェルの密度で播種した。SCT分化のために、プレートを10μg/mlのフィブロネクチンでプレコートし、SCT培地(0.1mM 2-メルカプトエタノール、0.5%ペニシリン-ストレプトマイシン、1%ITS-Xサプリメント、7.5mM A83-01、2.5mM Y27632、4%ノックアウト血清代替物、および2 mMフォルスコリンを補充したDMEM/F12)中で3日間培養した。EVT分化のために、プレートをマトリゲルでプレコートし、細胞をEVT培地(0.1mM 2-メルカプトエタノール、0.5%ペニシリン-ストレプトマイシン、1%ITS-Xサプリメント、2%マトリゲル、7.5mM A83-01、2.5mM Y27632、4%ノックアウト血清代替物、および100ng/ml NRG1を補充したDMEM/F12)で培養した。3日後、培地を、0.5%マトリゲルを含み、NRG1を含まないEVT培地に交換した。細胞を6日目まで培養した。
ヒト着床前胚の培養
ヒト胚をメーカーの指示に従って解凍した(Cook Medical:Sydney IVF Thawing kit(緩慢冷却法用)、Vitrolife: RapidWarmCleaveまたはRapidWarmBlast(ガラス化法用))。8細胞期で凍結したヒト胚を、ミネラルオイル(Origio:流動パラフィン)下のノンシーケンシャル培地(Vitrolife G2 plus)を含む12ウェルディッシュ(Vitrolife:Embryoslide Ibidi)に5% O2/6% CO2中37℃で、5分間ロードした。
ヒト胚をメーカーの指示に従って解凍した(Cook Medical:Sydney IVF Thawing kit(緩慢冷却法用)、Vitrolife: RapidWarmCleaveまたはRapidWarmBlast(ガラス化法用))。8細胞期で凍結したヒト胚を、ミネラルオイル(Origio:流動パラフィン)下のノンシーケンシャル培地(Vitrolife G2 plus)を含む12ウェルディッシュ(Vitrolife:Embryoslide Ibidi)に5% O2/6% CO2中37℃で、5分間ロードした。
プラスミド構築
hYAP1、hYAP1 5SA、およびhYAP1 5SA+S94AのcDNA配列を、それぞれpQCXIH-Myc-YAP、pQCXIH-Myc-YAP-5SA、pQCXIH-Myc-YAP-S94Aプラスミドから増幅した。これらのYAPプラスミドは、Kunliang Guanからのギフトであった(Addgeneプラスミド#33091、#33093、および#33094)(Zhao, B. et al. Genes Dev.21,2747-2761(2007))。個々のcDNA配列をpDONR211にクローニングし、続いてGateway (invitrogen)クローニング戦略を使用してPB-TAC-ERP2にクローニングした。PB-TAC-ERP2は、Knut Woltjen (Addgeneプラスミド#80478) からのギフトであった(Kim, S.-I. et al. Methods Mol. Biol. 1357,111-131(2016))。
hYAP1、hYAP1 5SA、およびhYAP1 5SA+S94AのcDNA配列を、それぞれpQCXIH-Myc-YAP、pQCXIH-Myc-YAP-5SA、pQCXIH-Myc-YAP-S94Aプラスミドから増幅した。これらのYAPプラスミドは、Kunliang Guanからのギフトであった(Addgeneプラスミド#33091、#33093、および#33094)(Zhao, B. et al. Genes Dev.21,2747-2761(2007))。個々のcDNA配列をpDONR211にクローニングし、続いてGateway (invitrogen)クローニング戦略を使用してPB-TAC-ERP2にクローニングした。PB-TAC-ERP2は、Knut Woltjen (Addgeneプラスミド#80478) からのギフトであった(Kim, S.-I. et al. Methods Mol. Biol. 1357,111-131(2016))。
ヒトナイーブPSCにおける細胞トランスフェクション
pCAG-PBase(5μg)およびPB-TAC-YAP1-ERP(5μg)を、NEPA21エレクトロポレーション(Nepa Gene Co. Ltd)によって、単一細胞懸濁液中の5×104細胞にトランスフェクトした。エレクトロポレーションされたナイーブhPSCを、Y-27632(10μM)を含むPXGL培地を含むGeltrex(0.5μL/cm2、Thermo Fisher Science、A1413302)でコーティングされた6ウェルプレート上にプレーティングした。ピューロマイシン(0.5μg/ml、Sigma-aldrich、P7255)を1日目から3~4日目までPXGL培地に添加して、形質転換細胞を選択した。pCAG-PBaseはKnut Woltjenからのギフトであった。
pCAG-PBase(5μg)およびPB-TAC-YAP1-ERP(5μg)を、NEPA21エレクトロポレーション(Nepa Gene Co. Ltd)によって、単一細胞懸濁液中の5×104細胞にトランスフェクトした。エレクトロポレーションされたナイーブhPSCを、Y-27632(10μM)を含むPXGL培地を含むGeltrex(0.5μL/cm2、Thermo Fisher Science、A1413302)でコーティングされた6ウェルプレート上にプレーティングした。ピューロマイシン(0.5μg/ml、Sigma-aldrich、P7255)を1日目から3~4日目までPXGL培地に添加して、形質転換細胞を選択した。pCAG-PBaseはKnut Woltjenからのギフトであった。
ナイーブhPSC凝集物におけるYAPの過剰発現
ナイーブhPSC凝集物は、上のセクションで説明したように、ドキシサイクリン誘導性カセットと統合されたナイーブH9細胞株から形成された。凝集物を、100ng/mlのドキシサイクリンとともに、LPA濃度を低下させた(5nM)PALLY培地中で0時間~48時間培養した。LPA濃度が高いと、YAP1バリアントの遺伝的過剰発現の影響が遮蔽された。空洞形成が発生した凝集物の数を72時間後に計測した。
ナイーブhPSC凝集物は、上のセクションで説明したように、ドキシサイクリン誘導性カセットと統合されたナイーブH9細胞株から形成された。凝集物を、100ng/mlのドキシサイクリンとともに、LPA濃度を低下させた(5nM)PALLY培地中で0時間~48時間培養した。LPA濃度が高いと、YAP1バリアントの遺伝的過剰発現の影響が遮蔽された。空洞形成が発生した凝集物の数を72時間後に計測した。
単一細胞RNA配列ライブラリの調製およびシーケンシング
TE細胞の過剰表現を避けるために、芽球様細胞を収集、解離し、それぞれ栄養膜細胞および原始内胚葉を標識するTROP2およびPDGFRaに対する抗体を使用して細胞懸濁液を染色した。96時間の時点では、上記の形態学的基準に従って、解離前に芽球様細胞をマイクロウェルアレイから選択的に採取した。細胞を、Smart-seq2用の溶解バッファーを含む384ウェルプレートにFACSで分類し、すぐに凍結した。抗体染色は、特定の数のTROP2+、PDGFRa+、およびダブルネガティブ細胞を収集するために利用した。隣接する(abuted)FACSゲート(DiVa 9.0.1)はスペクトル全体をカバーし、芽球様細胞は排除されなかった。MEF上で培養したH9ナイーブ細胞をSUSD2に対する抗体を使用して染色し、FACSで分類した。死細胞はDAPI染色により除外した。Smart-seq2ライブラリは、マイナーな最適化を加えて前述のように生成された(Picelli, S. et al. Nat. Protoc. 9, 171-181 (2014))。Maxima H Minus逆転写酵素(3U/反応、Thermo Fisher Science、EP0751)をcDNA合成に使用した。調製したライブラリは、Illumina Novaseq機器を50 bpペアエンドモードで使用して、S1またはSPフローセル上で配列決定した。
TE細胞の過剰表現を避けるために、芽球様細胞を収集、解離し、それぞれ栄養膜細胞および原始内胚葉を標識するTROP2およびPDGFRaに対する抗体を使用して細胞懸濁液を染色した。96時間の時点では、上記の形態学的基準に従って、解離前に芽球様細胞をマイクロウェルアレイから選択的に採取した。細胞を、Smart-seq2用の溶解バッファーを含む384ウェルプレートにFACSで分類し、すぐに凍結した。抗体染色は、特定の数のTROP2+、PDGFRa+、およびダブルネガティブ細胞を収集するために利用した。隣接する(abuted)FACSゲート(DiVa 9.0.1)はスペクトル全体をカバーし、芽球様細胞は排除されなかった。MEF上で培養したH9ナイーブ細胞をSUSD2に対する抗体を使用して染色し、FACSで分類した。死細胞はDAPI染色により除外した。Smart-seq2ライブラリは、マイナーな最適化を加えて前述のように生成された(Picelli, S. et al. Nat. Protoc. 9, 171-181 (2014))。Maxima H Minus逆転写酵素(3U/反応、Thermo Fisher Science、EP0751)をcDNA合成に使用した。調製したライブラリは、Illumina Novaseq機器を50 bpペアエンドモードで使用して、S1またはSPフローセル上で配列決定した。
単一細胞RNA配列データ解析
Smart-Seqトランスクリプトームシーケンシング実験は、Ensembl GRCh38リリース103のゲノム配列および遺伝子アノテーションを参照として使用して分析した。
Smart-Seqトランスクリプトームシーケンシング実験は、Ensembl GRCh38リリース103のゲノム配列および遺伝子アノテーションを参照として使用して分析した。
遺伝子発現の定量化のために、最初にtrim-galore v0.6.6を使用してRNA配列リードをトリミングし、その後、hisat2 v2.2.1を使用してヒトゲノム(Ensembl GRCh38 release 103)にアラインメントした。遺伝子内の一意にマッピングされたリードは、パラメータ-s no.を指定した htseq-count v0.13.5を使用して定量化した。TPM推定値は、パラメータ-single-cell-priorを指定したRSEM v1.3.3を使用して取得した。
さらなる分析は、Seurat v4.0.1を使用したR v4.0.3で実行した。細胞ごとの品質管理メトリクスの初期評価および中央値絶対偏差アルゴリズムを使用した外れ値の特定に基づいて、検出された遺伝子が2000個以下、またはミトコンドリア遺伝子の割合が12.5%以上の細胞を除外した。少なくとも5つの細胞で検出された遺伝子のみを保持した。カウントデータは対数正規化し、変動性の高い上位3000個を選択し、Seuratの NormalizeData、FindVariableFeature、およびScaleDataデータ関数を使用して細胞全体にわたる遺伝子ごとの発現値の標準化を行った。標準化された可変性の高い特徴に基づく主成分分析(PCA)が線形次元削減に使用され、次元削減されたデータに基づいてshared nearest neighbor (SNN)グラフが構築され、グラフは、デフォルト設定でSeuratのRunPCA、FindNeighbors、およびFindClustersを使用し、様々な解像度でSNNモジュール最適化ベースのクラスタリング アルゴリズムを使用して分割された。クラスターマーカー遺伝子は、FindAllMarkers関数を使用したWilcox尤度比検定で特定された。視覚化にはUniform Manifold Approximation and Projection (UMAP)が使用された。
複数のソースからのSmart-Seq実験を統合するために、前述の手順に従った(Zhao, C. et al. doi:10.1101/2021.05.07.442980)。E-MTAB-3929(胎生期3日目から7日目までのヒト着床前胚)からの公開データPetropoulos, S. et al. Cell vol. 167 285 (2016))、GSE109555(インビトロ培養胚盤胞)がダウンロードされ、カーネギー ステージ7胚からのデータは著者の厚意により提供された(Tyser, R. C. V. et al. bioRxiv (2020) doi:10.1101/2020.07.21.213512)。GSE109555の場合、著者の指示(https://github.com/WRui/Post_Implantation)に従ってUMIおよびCB情報に対応するための適応を含む、芽球様細胞について記載したのと同じプロトコルを使用して、すべてのデータを前処理して遺伝子ごとのリード数を取得した。GSE109555では、元の刊行物に記載されている3184個の高品質単一細胞からランダムにサブサンプリングした1000個の細胞を使用した。造血性内皮前駆細胞および赤芽球に属する細胞を除外した。細胞ごとの品質管理指標を評価した後、検出された遺伝子の数が2000を超え、かつミトコンドリア遺伝子の割合が12.5%未満の細胞を保持した。どのデータセットでも少なくとも5つの細胞で検出された遺伝子を保持した。対数正規化は、scranパッケージv1.18.7のcomputeSumFactorsを使用して実行し、バッチごとのスケーリング正規化は、batchelor v1.6.3のmulti-BatchNormを使用して実行した。データセットは、対数正規化されたバッチ調整された式の値を使用するSeuratWrappers v0.3.0経由のfastMNNアプローチを使用して整列した。次に、MNNの低次元座標を、Uniform Manifold Approximation and Projection (UMAP)によるクラスタリングおよび視覚化に使用した。
ヒト栄養膜幹細胞の培養および凝集物形成
実験は有馬隆博研究室から提供されたヒト胚盤胞由来hTSC株bTS5を用いて行った。細胞は、前述のように、ラミニン511(5μg/ml、BioLamina、LN511)でコーティングされたプレート上でhTSC培地中で培養した。hTSCの凝集物は以下のように形成した。Accutase(商標)を37℃で5分間使用して、コロニーを単一細胞に解離させた。細胞を10μM Y-27632を含むhTSC培地に再懸濁し、3.0×104個の細胞を96ウェルプレートのウェルにインプリントされたマイクロウェルアレイに播種した。同じ培地(Okae, H. et al. Cell Stem Cell 22, 50-63.e6 (2018))を毎日更新した。72時間後、凝集物を特性評価および移植実験の両方に使用した。
実験は有馬隆博研究室から提供されたヒト胚盤胞由来hTSC株bTS5を用いて行った。細胞は、前述のように、ラミニン511(5μg/ml、BioLamina、LN511)でコーティングされたプレート上でhTSC培地中で培養した。hTSCの凝集物は以下のように形成した。Accutase(商標)を37℃で5分間使用して、コロニーを単一細胞に解離させた。細胞を10μM Y-27632を含むhTSC培地に再懸濁し、3.0×104個の細胞を96ウェルプレートのウェルにインプリントされたマイクロウェルアレイに播種した。同じ培地(Okae, H. et al. Cell Stem Cell 22, 50-63.e6 (2018))を毎日更新した。72時間後、凝集物を特性評価および移植実験の両方に使用した。
子宮内膜オルガノイド培養
凍結保存されたヒト子宮内膜オルガノイドは、協力協定の枠組みの中でホセイン・バハーヴァンド研究室(ロイアン研究所)から提供された。ヒト子宮内膜オルガノイドは、いくつかの改変を加えて以前に記載されたプロトコル(Boretto, M. et al. Development 144, 1775-1786 (2017))に従って健康なヒトのドナーから樹立された。簡単に説明すると、オルガノイドは、1×N2サプリメント、1×B27サプリメント、1×インスリン-トランスフェリン-を-セレン(自社)、グルタマックス(1μM)、N-アセチルシステイン(1.25mM、Sigma-Aldrich、A7250)、ニコチンアミド(2.5 mM、Sigma-Aldrich、72340)、EGF(50 ng/ml、Peprotech、100-47)、bFGF (2 ng/ml、Peprotech、100-18B)、HGF(10 ng/ml、Peprotech、315-23)、FGF10(10 ng/ml、Peprotech、100-26)、A83-01(500nM)、および SB202190(10μM、Tocris、1264)を補充した 10% Rspo1馴化培地(自社製)および10%ノギンFc馴化培地(Heijmans, J. et al. Cell Rep. 3, 1128-1139 (2013))で構成されるヒト子宮内膜拡大培地で培養した。アポトーシスを防ぐために、継代後の最初の2日間にY-27632(10μM)を使用した。培地を2日ごとに交換し、オルガノイドをTrypLEで継代し、その後7~9日ごとに機械的解離を行った。
凍結保存されたヒト子宮内膜オルガノイドは、協力協定の枠組みの中でホセイン・バハーヴァンド研究室(ロイアン研究所)から提供された。ヒト子宮内膜オルガノイドは、いくつかの改変を加えて以前に記載されたプロトコル(Boretto, M. et al. Development 144, 1775-1786 (2017))に従って健康なヒトのドナーから樹立された。簡単に説明すると、オルガノイドは、1×N2サプリメント、1×B27サプリメント、1×インスリン-トランスフェリン-を-セレン(自社)、グルタマックス(1μM)、N-アセチルシステイン(1.25mM、Sigma-Aldrich、A7250)、ニコチンアミド(2.5 mM、Sigma-Aldrich、72340)、EGF(50 ng/ml、Peprotech、100-47)、bFGF (2 ng/ml、Peprotech、100-18B)、HGF(10 ng/ml、Peprotech、315-23)、FGF10(10 ng/ml、Peprotech、100-26)、A83-01(500nM)、および SB202190(10μM、Tocris、1264)を補充した 10% Rspo1馴化培地(自社製)および10%ノギンFc馴化培地(Heijmans, J. et al. Cell Rep. 3, 1128-1139 (2013))で構成されるヒト子宮内膜拡大培地で培養した。アポトーシスを防ぐために、継代後の最初の2日間にY-27632(10μM)を使用した。培地を2日ごとに交換し、オルガノイドをTrypLEで継代し、その後7~9日ごとに機械的解離を行った。
子宮内膜オルガノイドおよびOFEL培養のホルモン刺激
子宮内膜オルガノイドは、前のセクションで記載したように継代した。解離した細胞を、Y-27632(10μM)を補充したマトリゲルに再懸濁し、細胞懸濁液を48ウェルプレートに堆積させ、子宮内膜拡張培地で2日間培養した。オルガノイドを最初にE2(10 nM、Sigma-Aldrich、E2758)で2日間刺激し、続いてE2(10 nM)、P4(1μM、Sigma-Aldrich、P8783)、およびcAMP(250μM、Biolog、B 007)をXAV939(10μM)(それぞれEPCまたはEPCX)の有無にかかわらず4日間投与した。OFEL培養では、氷冷DMEM/F12と機械的なピペッティングを使用してマトリゲル液滴からオルガノイドを回収した。TrypLEを使用してオルガノイドを解離し、機械的に粉砕して単一細胞を生成し、96ウェルガラス底プレート(Cellvis、P96-1.5H-N)に1ウェルあたり3~4.5×104細胞の密度で播種し、刺激を与えながら2~3日間培養した。避妊処理のために、レボノルゲストレル(LNG)(10μM、Sigma-Aldrich、PHR1850)をホルモン刺激の2日後に培地に毎日添加し、実験の終了まで続けた。
子宮内膜オルガノイドは、前のセクションで記載したように継代した。解離した細胞を、Y-27632(10μM)を補充したマトリゲルに再懸濁し、細胞懸濁液を48ウェルプレートに堆積させ、子宮内膜拡張培地で2日間培養した。オルガノイドを最初にE2(10 nM、Sigma-Aldrich、E2758)で2日間刺激し、続いてE2(10 nM)、P4(1μM、Sigma-Aldrich、P8783)、およびcAMP(250μM、Biolog、B 007)をXAV939(10μM)(それぞれEPCまたはEPCX)の有無にかかわらず4日間投与した。OFEL培養では、氷冷DMEM/F12と機械的なピペッティングを使用してマトリゲル液滴からオルガノイドを回収した。TrypLEを使用してオルガノイドを解離し、機械的に粉砕して単一細胞を生成し、96ウェルガラス底プレート(Cellvis、P96-1.5H-N)に1ウェルあたり3~4.5×104細胞の密度で播種し、刺激を与えながら2~3日間培養した。避妊処理のために、レボノルゲストレル(LNG)(10μM、Sigma-Aldrich、PHR1850)をホルモン刺激の2日後に培地に毎日添加し、実験の終了まで続けた。
インビトロ移植アッセイ
コンフルエントなOFELは、OFELをDMEM/F12で2回洗浄し、IVC培地を添加することにより(Xiang, L. et al. Nature 577, 537-542 (2020))、芽球様細胞、trophosphere、ナイーブhPSC、またはhTSC凝集物の堆積の少なくとも2時間前に移植アッセイ用に準備した。次に、倒立顕微鏡下でマウスピペットを使用して構造をOFEL上に転写した。24~48時間後、培地を除去し、ウェルをPBSで洗浄し、4%ホルムアルデヒドを使用して室温で30分間固定し、続いて免疫蛍光染色のために処理した。付着した構造の割合は、移動した構造全体の割合としてレポートされた。
コンフルエントなOFELは、OFELをDMEM/F12で2回洗浄し、IVC培地を添加することにより(Xiang, L. et al. Nature 577, 537-542 (2020))、芽球様細胞、trophosphere、ナイーブhPSC、またはhTSC凝集物の堆積の少なくとも2時間前に移植アッセイ用に準備した。次に、倒立顕微鏡下でマウスピペットを使用して構造をOFEL上に転写した。24~48時間後、培地を除去し、ウェルをPBSで洗浄し、4%ホルムアルデヒドを使用して室温で30分間固定し、続いて免疫蛍光染色のために処理した。付着した構造の割合は、移動した構造全体の割合としてレポートされた。
移植後条件におけるヒト芽球様細胞のインビトロ培養
マウスピペットを使用してヒト芽球様細胞を選択し、CMRL1066培地で洗浄し、以下のように若干の変更を加えてサル胚盤胞培養物(Ma, H. et al. Science 366, (2019).)から適合させた、予め平衡化した培地を含むマトリゲルでコーティングした懸濁培養プレートまたは96ウェルプレートに移した。初日は、培養培地は10%(v/v) FBS、1mM l-グルタミン(Gibco)、1×N2サプリメント、1×B27サプリメント、1mM ピルビン酸ナトリウム(Sigma)、および10μM Y27632を補充したCMRL1066であった。24時間後、培地の半分を5%マトリゲルを含む新しい培地と交換した。48時間後、培地の50%を、20%(v/v) FBSおよび5%マトリゲルを補充した新しい培地と交換した。72時間後、培地の半分を、30%(v/v) KSRおよび5%マトリゲルを補充した新しい培地と交換した。その後、培地の半分を毎日交換し、芽球様細胞を最大6日間培養した。上述したように、4%PFAを用いたインビトロ培養の4日および6日後に、培養物を染色のために固定した。
マウスピペットを使用してヒト芽球様細胞を選択し、CMRL1066培地で洗浄し、以下のように若干の変更を加えてサル胚盤胞培養物(Ma, H. et al. Science 366, (2019).)から適合させた、予め平衡化した培地を含むマトリゲルでコーティングした懸濁培養プレートまたは96ウェルプレートに移した。初日は、培養培地は10%(v/v) FBS、1mM l-グルタミン(Gibco)、1×N2サプリメント、1×B27サプリメント、1mM ピルビン酸ナトリウム(Sigma)、および10μM Y27632を補充したCMRL1066であった。24時間後、培地の半分を5%マトリゲルを含む新しい培地と交換した。48時間後、培地の50%を、20%(v/v) FBSおよび5%マトリゲルを補充した新しい培地と交換した。72時間後、培地の半分を、30%(v/v) KSRおよび5%マトリゲルを補充した新しい培地と交換した。その後、培地の半分を毎日交換し、芽球様細胞を最大6日間培養した。上述したように、4%PFAを用いたインビトロ培養の4日および6日後に、培養物を染色のために固定した。
比較例のヒト着床前胚
体外受精治療の余剰として研究に提供されたヒト胚の使用は、承認番号RE13-010およびRE18-010で、フランスの胚研究監視委員会:Agence de la Biomedecineによって許可された。この研究で使用されたすべてのヒト着床前胚は、Agence de la Biomedecineの承認番号AG110126AMPに基づいて、研究のために胚を収集することが認可されているフランスのナント大学病院の生殖補助医療ユニットから入手され、そこで培養された。使用された胚は、当初、明確な生殖目的を持った生殖補助サイクルの状況で作成され、その後、患者が生殖ニーズを満たしたり、単一遺伝子性疾患の存在が検査で陽性となった後に、自発的に研究のために提供されたものである。
体外受精治療の余剰として研究に提供されたヒト胚の使用は、承認番号RE13-010およびRE18-010で、フランスの胚研究監視委員会:Agence de la Biomedecineによって許可された。この研究で使用されたすべてのヒト着床前胚は、Agence de la Biomedecineの承認番号AG110126AMPに基づいて、研究のために胚を収集することが認可されているフランスのナント大学病院の生殖補助医療ユニットから入手され、そこで培養された。使用された胚は、当初、明確な生殖目的を持った生殖補助サイクルの状況で作成され、その後、患者が生殖ニーズを満たしたり、単一遺伝子性疾患の存在が検査で陽性となった後に、自発的に研究のために提供されたものである。
RNA抽出、cDNA合成、およびqRT-PCR
RNeasyミニキット(Qiagen、74106)を使用してRNAを抽出し、Superscript III(Invitrogen、18080093)酵素を使用してcDNA合成を行った。qPCR反応は、CFX384 Touch Real-Time PCR Detection System(Bio-rad)上でGoTaq(登録商標) qPCR Master Mix (Promega、A6001)を使用して実行した。定量化は、比較サイクル閾値(Ct)法を適用することにより、Microsoft Office Excelを使用して実行した。相対発現レベルはGAPDHに対して正規化した。
RNeasyミニキット(Qiagen、74106)を使用してRNAを抽出し、Superscript III(Invitrogen、18080093)酵素を使用してcDNA合成を行った。qPCR反応は、CFX384 Touch Real-Time PCR Detection System(Bio-rad)上でGoTaq(登録商標) qPCR Master Mix (Promega、A6001)を使用して実行した。定量化は、比較サイクル閾値(Ct)法を適用することにより、Microsoft Office Excelを使用して実行した。相対発現レベルはGAPDHに対して正規化した。
CGβ検出のためのELISAアッセイ
付着していないまたは付着している芽球様細胞を含むウェルからの培地を収集し、遠心分離して破片を除去し、使用するまで-80℃で保管した。上清は、CGβ標準と並行して、メーカーの指示に従ってCGβ ELISA(Abcam、ab178633)に供した。
付着していないまたは付着している芽球様細胞を含むウェルからの培地を収集し、遠心分離して破片を除去し、使用するまで-80℃で保管した。上清は、CGβ標準と並行して、メーカーの指示に従ってCGβ ELISA(Abcam、ab178633)に供した。
リガンド-受容体解析
極性TEおよび子宮内膜上皮細胞の間の推定上の受容体-リガンド相互作用を予測するために、Cellinkerウェブプラットフォームを使用した。後期TEのNR2F2モジュール内の遺伝子、極性TEの濃縮遺伝子、刺激されたOFEL中で上方制御された遺伝子とともに、月経周期の第4相への移行を標識する子宮内膜上皮細胞の遺伝子モジュールを、データベース内でリガンドおよび受容体を検索するためのクエリとして使用した。
極性TEおよび子宮内膜上皮細胞の間の推定上の受容体-リガンド相互作用を予測するために、Cellinkerウェブプラットフォームを使用した。後期TEのNR2F2モジュール内の遺伝子、極性TEの濃縮遺伝子、刺激されたOFEL中で上方制御された遺伝子とともに、月経周期の第4相への移行を標識する子宮内膜上皮細胞の遺伝子モジュールを、データベース内でリガンドおよび受容体を検索するためのクエリとして使用した。
免疫組織化学
試料を4%ホルムアルデヒドで室温で30分間固定した。固定後、ホルムアルデヒド溶液を除去し、試料をPBSで少なくとも3回洗浄した。次いで、PBS中の0.3%トリトン-X100および10%正常ロバ血清を使用して、試料を少なくとも60分間透過処理し、ブロックした。次いで、試料を、フレッシュなブロッキング/透過化溶液で希釈した一次抗体とともに4℃で一晩インキュベートした。試料を、0.1%トリトン-X100を含むPBS(PBST)で少なくとも3回、それぞれ10分間洗浄した。次に、洗浄バッファーを、PBSTで室温、暗所で30分間希釈した核染色色素(nuclear dye)Hoechst-33342(2Dまたは3D試料でそれぞれ1:500または1:300、Life Technologies、H3570)とともにAlexafluorタグ付き二次抗体(AbcamまたはThermofisher Scientific)と入れ替えた。次いで、試料をPBSTで3回、それぞれ10分間洗浄した。ヒト胚盤胞の場合、試料はGardnerおよびSchoolcraftが提案した等級付けシステムに従ってB4またはB6段階、またはB3またはB4+72時間のインビトロ培養で固定した。胚を4%パラホルムアルデヒドを用いて室温で10分間固定し、PBS/BSAで洗浄した。0.2% Triton-x100および10% FBSを含むPBS中で胚を室温で60分間透過処理し、ブロックした。試料を一次抗体とともに4℃で一晩インキュベートした。二次抗体とのインキュベーションを、ヘキスト対比染色とともに室温で2時間実施した。試料を、イメージングのためにガラス底マイクロスライド(Ibidi、81507)のウェル内のPBSにマウントした。EdU染色は、メーカーの指示に従ってClick-iT EdU Alexa Fluor 64 イメージングキット(Thermo Scientific、C10640)を使用して行った。
試料を4%ホルムアルデヒドで室温で30分間固定した。固定後、ホルムアルデヒド溶液を除去し、試料をPBSで少なくとも3回洗浄した。次いで、PBS中の0.3%トリトン-X100および10%正常ロバ血清を使用して、試料を少なくとも60分間透過処理し、ブロックした。次いで、試料を、フレッシュなブロッキング/透過化溶液で希釈した一次抗体とともに4℃で一晩インキュベートした。試料を、0.1%トリトン-X100を含むPBS(PBST)で少なくとも3回、それぞれ10分間洗浄した。次に、洗浄バッファーを、PBSTで室温、暗所で30分間希釈した核染色色素(nuclear dye)Hoechst-33342(2Dまたは3D試料でそれぞれ1:500または1:300、Life Technologies、H3570)とともにAlexafluorタグ付き二次抗体(AbcamまたはThermofisher Scientific)と入れ替えた。次いで、試料をPBSTで3回、それぞれ10分間洗浄した。ヒト胚盤胞の場合、試料はGardnerおよびSchoolcraftが提案した等級付けシステムに従ってB4またはB6段階、またはB3またはB4+72時間のインビトロ培養で固定した。胚を4%パラホルムアルデヒドを用いて室温で10分間固定し、PBS/BSAで洗浄した。0.2% Triton-x100および10% FBSを含むPBS中で胚を室温で60分間透過処理し、ブロックした。試料を一次抗体とともに4℃で一晩インキュベートした。二次抗体とのインキュベーションを、ヘキスト対比染色とともに室温で2時間実施した。試料を、イメージングのためにガラス底マイクロスライド(Ibidi、81507)のウェル内のPBSにマウントした。EdU染色は、メーカーの指示に従ってClick-iT EdU Alexa Fluor 64 イメージングキット(Thermo Scientific、C10640)を使用して行った。
顕微鏡検査および画像解析
位相差画像は、Thermo Fisher Scientific EVOS細胞イメージングシステムおよび倒立広視野顕微鏡Axio VertA1を使用して取得した。芽球様細胞または空洞化構造の数を各ウェルについて手動で計数した。96時間後、前のセクションで記載したように、形態学的パラメータに基づいて芽球様細胞が定義される。蛍光画像およびタイムラプス画像は、横河W1スピニングディスクを備えたオリンパスIX83顕微鏡(ソフトウェア:CellSense2.3、カメラ:浜松Orca Flash(登録商標)4.0)または横河W1スピニングディスクを備えたNikon Eclipse Ti E倒立顕微鏡(ソフトウェア:Visiview 4.5.0.7、カメラ:Andor Ixon Ultra 888 EMCCD)で取得した。共焦点画像を解析し、FIJI 1.53kまたは Bitplane Imaris 9.7.0ソフトウェアを使用して表示画像をエクスポートした。細胞計数には、Bitplane Imarisソフトウェアを使用した。ボクセルのサイズおよび蛍光強度に合わせて細胞数パラメータを設定し、Imarisのスポット機能を使用して各画像の全体的な細胞数データを取得した。芽球様細胞内の大きな空洞はイメージングフィールドの深さを増し、深くに位置する細胞からの信号が低下することに留意されたい。したがって、図8Hの計数データは、特に栄養外胚葉細胞の場合、過小評価された値である可能性がある。NR2F2軸を形成する芽球様細胞の割合の定量化は手動で行わった。そうするために、NR2F2発現を検出するために染色された芽球様細胞を、共焦点スピニングディスク顕微鏡を使用して画像化した。映像はFIJIの3Dプロジェクト機能を利用して投影した。NR2F2発現がその極側半分に限定されており、壁側半分では発現がない、または発現レベルが低い場合、芽球様細胞は軸を有すると分類された。NR2F2発現の反転パターンは反転軸として分類された。極側半分および壁側半分の両方にNR2F2発現がある芽球様細胞は、軸を有しないと分類された。ヒト胚盤胞の共焦点免疫蛍光画像は、Nikon共焦点顕微鏡および20×Mimまたは 25×Silicon対物レンズを使用して取得された。厚さ1μmの光学切片を採取した。画像は、Fiji(http://fiji.sc)および Volocity 6.3視覚化ソフトウェアを使用して処理した。Volocityソフトウェアを使用して核を検出し、計数した。
位相差画像は、Thermo Fisher Scientific EVOS細胞イメージングシステムおよび倒立広視野顕微鏡Axio VertA1を使用して取得した。芽球様細胞または空洞化構造の数を各ウェルについて手動で計数した。96時間後、前のセクションで記載したように、形態学的パラメータに基づいて芽球様細胞が定義される。蛍光画像およびタイムラプス画像は、横河W1スピニングディスクを備えたオリンパスIX83顕微鏡(ソフトウェア:CellSense2.3、カメラ:浜松Orca Flash(登録商標)4.0)または横河W1スピニングディスクを備えたNikon Eclipse Ti E倒立顕微鏡(ソフトウェア:Visiview 4.5.0.7、カメラ:Andor Ixon Ultra 888 EMCCD)で取得した。共焦点画像を解析し、FIJI 1.53kまたは Bitplane Imaris 9.7.0ソフトウェアを使用して表示画像をエクスポートした。細胞計数には、Bitplane Imarisソフトウェアを使用した。ボクセルのサイズおよび蛍光強度に合わせて細胞数パラメータを設定し、Imarisのスポット機能を使用して各画像の全体的な細胞数データを取得した。芽球様細胞内の大きな空洞はイメージングフィールドの深さを増し、深くに位置する細胞からの信号が低下することに留意されたい。したがって、図8Hの計数データは、特に栄養外胚葉細胞の場合、過小評価された値である可能性がある。NR2F2軸を形成する芽球様細胞の割合の定量化は手動で行わった。そうするために、NR2F2発現を検出するために染色された芽球様細胞を、共焦点スピニングディスク顕微鏡を使用して画像化した。映像はFIJIの3Dプロジェクト機能を利用して投影した。NR2F2発現がその極側半分に限定されており、壁側半分では発現がない、または発現レベルが低い場合、芽球様細胞は軸を有すると分類された。NR2F2発現の反転パターンは反転軸として分類された。極側半分および壁側半分の両方にNR2F2発現がある芽球様細胞は、軸を有しないと分類された。ヒト胚盤胞の共焦点免疫蛍光画像は、Nikon共焦点顕微鏡および20×Mimまたは 25×Silicon対物レンズを使用して取得された。厚さ1μmの光学切片を採取した。画像は、Fiji(http://fiji.sc)および Volocity 6.3視覚化ソフトウェアを使用して処理した。Volocityソフトウェアを使用して核を検出し、計数した。
統計および再現性
方法および図の凡例に特に記載がない限り、すべての実験は少なくとも3回の生物学的反復で行った。統計分析は、Graphpad prism 8.1.1 (330)を使用して実行した。
方法および図の凡例に特に記載がない限り、すべての実験は少なくとも3回の生物学的反復で行った。統計分析は、Graphpad prism 8.1.1 (330)を使用して実行した。
実施例8:三重阻害(Hippo/ERK/TGF)。
胚盤胞は、受胎産物である3つの創始系統(the conceptus 3 founding lineages)、すなわちエピブラスト(EPI、胚)、栄養外胚葉(TE、胚体外)、および原始内胚葉(PrE、胚体外)を生成することによって3~4日以内に形成される(図8a)。末梢細胞はHippo経路を阻害することでTEになる。また、ナイーブhPSC(PXGL中で培養)は、TGF-βおよびERK経路の阻害により効率的にTEアナログを形成する。したがって、本発明者らは、非接着ヒドロゲルマイクロウェル内でナイーブhPSCを凝集させ、これらの3つの経路を阻害した(図8bおよび図12a~c)。LIF(STAT活性化剤)およびY-27632(ROCK阻害剤)を含む既知組成培地中でリゾホスファチジン酸(LPA、Hippo経路阻害剤),A83-01(TGF-βファミリー受容体阻害剤)およびPD0325901(ERK阻害剤)に曝露した場合、胚盤胞様構造が効率的に形成され(図8c~e、>70%、150<φ<250μm、拡張方法における完全な形態計測基準を参照)、そして一貫して形成された(図12d、>20継代)。LPAは効率を大幅に向上させた(図12b~d)。5日以内に、細胞数(47+/-9個から129+/-27個)および全体のサイズ(65μmから200μm)は、5~7日目の胚盤胞(段階B3~6)の範囲と同様に増加した(図12e、f)。TE細胞アナログ(GATA2+/GATA3+/CDX2+/TROP2+)は、膨張と収縮のサイクルを経験しながら(図12n)、形成され、増殖し(図8f~hおよび図12g~l)、接着結合(上皮カドヘリン(CDH1))が確立され、頂端底極性(apical-basal polarity;aPKC局在)および緊密な結合(ZO-1+、図8iおよび図12m)が形成された。驚くべきことに、すべての胚盤胞様構造は、EPI(OCT4+;平均=27+/-13個の細胞;全細胞の26%)およびPrE(GATA4+/SOX17+/PDGFRa+平均 =7+/-5個の細胞;全細胞の7%)(図8f~hおよび図12i、j、l)を反映するユニークな内部細胞塊を分離し、これは細胞凝集物形成後の対称性の破壊を示している。複数の系統のナイーブhESC(Shef6、H9、HNES1)およびhiPSC(niPSC 16.2.b、cR-NCRM2)は、同等の高い効率でそのような構造を形成した(図8eおよび図12o)が、移植後のEPIを反映する準備刺激されたhPSCは形成しなかった(図12p)。ヒト細胞に基づく空洞を有する芽球様細胞の発生には、Hippo経路の阻害(たとえばLPAによる)、MEK/ERK(たとえばPD0325901による)、およびTGF-b(たとえばA83-01による)の三重阻害が必要であった(図22)。図23は、代替TGF-b阻害剤(SB431542)も機能することを示している。
胚盤胞は、受胎産物である3つの創始系統(the conceptus 3 founding lineages)、すなわちエピブラスト(EPI、胚)、栄養外胚葉(TE、胚体外)、および原始内胚葉(PrE、胚体外)を生成することによって3~4日以内に形成される(図8a)。末梢細胞はHippo経路を阻害することでTEになる。また、ナイーブhPSC(PXGL中で培養)は、TGF-βおよびERK経路の阻害により効率的にTEアナログを形成する。したがって、本発明者らは、非接着ヒドロゲルマイクロウェル内でナイーブhPSCを凝集させ、これらの3つの経路を阻害した(図8bおよび図12a~c)。LIF(STAT活性化剤)およびY-27632(ROCK阻害剤)を含む既知組成培地中でリゾホスファチジン酸(LPA、Hippo経路阻害剤),A83-01(TGF-βファミリー受容体阻害剤)およびPD0325901(ERK阻害剤)に曝露した場合、胚盤胞様構造が効率的に形成され(図8c~e、>70%、150<φ<250μm、拡張方法における完全な形態計測基準を参照)、そして一貫して形成された(図12d、>20継代)。LPAは効率を大幅に向上させた(図12b~d)。5日以内に、細胞数(47+/-9個から129+/-27個)および全体のサイズ(65μmから200μm)は、5~7日目の胚盤胞(段階B3~6)の範囲と同様に増加した(図12e、f)。TE細胞アナログ(GATA2+/GATA3+/CDX2+/TROP2+)は、膨張と収縮のサイクルを経験しながら(図12n)、形成され、増殖し(図8f~hおよび図12g~l)、接着結合(上皮カドヘリン(CDH1))が確立され、頂端底極性(apical-basal polarity;aPKC局在)および緊密な結合(ZO-1+、図8iおよび図12m)が形成された。驚くべきことに、すべての胚盤胞様構造は、EPI(OCT4+;平均=27+/-13個の細胞;全細胞の26%)およびPrE(GATA4+/SOX17+/PDGFRa+平均 =7+/-5個の細胞;全細胞の7%)(図8f~hおよび図12i、j、l)を反映するユニークな内部細胞塊を分離し、これは細胞凝集物形成後の対称性の破壊を示している。複数の系統のナイーブhESC(Shef6、H9、HNES1)およびhiPSC(niPSC 16.2.b、cR-NCRM2)は、同等の高い効率でそのような構造を形成した(図8eおよび図12o)が、移植後のEPIを反映する準備刺激されたhPSCは形成しなかった(図12p)。ヒト細胞に基づく空洞を有する芽球様細胞の発生には、Hippo経路の阻害(たとえばLPAによる)、MEK/ERK(たとえばPD0325901による)、およびTGF-b(たとえばA83-01による)の三重阻害が必要であった(図22)。図23は、代替TGF-b阻害剤(SB431542)も機能することを示している。
実施例9:胚盤胞アナログのみの形成。
単一細胞トランスクリプトーム解析により、胚盤胞様構造が、GATA2/GATA3(TE)、POU5F1/KLF17(EPI)、およびGATA4/SOX17(PrE)を含む3つの創始系統に特異的な遺伝子によって特徴づけられる3つの主要なトランスクリプトーム状態(図9a、b、および図13a)を形成することが示された(図9c、d、および図13b)。胚盤胞、インビトロ培養胚盤胞、および原腸形成段階の胚由来の細胞との比較により、細胞は転写的に胚盤胞の状態と類似しており、着床後の状態とは異なることが明らかになった(図9e、fおよび図13c~g)。高解像度クラスタリング分析(×50)により、移植後の組織(GABRP、ISL1、APLNR、CRABP2)を思わせる(reminiscent)遺伝子発現パターンを有する非胚盤胞様細胞の1つのクラスターが単離され(図14a~c)、それは羊膜(非神経外胚葉とアノテートされている)および中胚葉と転写的に類似しているように見えた(図14d~j)。この亜集団は細胞の3%未満を構成した(図14i)。注目すべきことに、ナイーブhPSC培養物は同様に分化した細胞の5.6%を含んでいた(図14i)。バルクRNAシーケンシング分析は、単離された栄養膜アナログ(フローサイトメトリーによるTROP2+)が、ナイーブhPSCと移植後様栄養膜細胞(hTSC)との間の中間トランスクリプトームを有することを示した(図15a)。さらに、栄養膜は、胚盤胞段階のTE転写物(ESRRB、GRHL1、OVOL1、GATA2、GATA3、TBX3、KRT19、CGA、CGB5、CGB7)に富んでいたが、一部の着床後マーカー(SIGLEC6、DPP4)には富んでいなかった(図15b、c)。単離されたEPIアナログ(TROP2-/PDGFRa-)のトランスクリプトームは、ナイーブhPSCのトランスクリプトームに似ており(図15a)、胚盤胞期EPIに特異的なマーカー(KLF17、ATG2A、SUSD2、TFCP2L1、ZFP57、DPPA2、UTF1、 PRDM14)に富んでおり、準備刺激されたhPSCのトランスクリプトームとは異なっていた(図15a、d)。最後に、単離されたPrEアナログ(PDGFRa+)は、ナイーブhPSCと胚体外内胚葉細胞株(nEND細胞)との間の中間トランスクリプトームを有し(図15a)、胚盤胞段階のPrEマーカー(初期胚盤胞:GATA6、MSX2、HNF4A。後期胚盤胞:PDGFRA、GATA4、SOX17、HNF1B、FOXA2)、および胚盤胞と同様に下方制御されたEPI遺伝子(ARGFX、PRDM14、SOX2、NANOG、DPPA2、POU5F1)に富んでいた(図15e)。胚盤胞は幹細胞株を確立する能力を有する。同様に、胚盤胞様構造により、第2世代胚盤胞様構造(図16b、c)を形成することができるナイーブhPSC(NANOG+/SOX2+/OCT4+/KLF17+)(図16a)、ならびに合胞体栄養細胞(SCT)および絨毛外栄養膜(EVT)(3~6日、図16e~j)への迅速な分化能力を備えたhTSC(CDX2-/GATA3+/CK7+)(図16d)の新規誘導が可能になった。注目すべきことに、ヒト胚盤胞からのPrE細胞株の誘導はこれまでに報告されていない。全体として、このモデルは形態学的に胚盤胞に似ており(拡張方法の判定基準を参照)、胚盤胞段階を転写的に反映し、胚盤胞の連続的かつタイムリーな方法で発生する3つの系統のアナログを生成したため、発明者らはそれらを芽球様細胞と呼んだ。
単一細胞トランスクリプトーム解析により、胚盤胞様構造が、GATA2/GATA3(TE)、POU5F1/KLF17(EPI)、およびGATA4/SOX17(PrE)を含む3つの創始系統に特異的な遺伝子によって特徴づけられる3つの主要なトランスクリプトーム状態(図9a、b、および図13a)を形成することが示された(図9c、d、および図13b)。胚盤胞、インビトロ培養胚盤胞、および原腸形成段階の胚由来の細胞との比較により、細胞は転写的に胚盤胞の状態と類似しており、着床後の状態とは異なることが明らかになった(図9e、fおよび図13c~g)。高解像度クラスタリング分析(×50)により、移植後の組織(GABRP、ISL1、APLNR、CRABP2)を思わせる(reminiscent)遺伝子発現パターンを有する非胚盤胞様細胞の1つのクラスターが単離され(図14a~c)、それは羊膜(非神経外胚葉とアノテートされている)および中胚葉と転写的に類似しているように見えた(図14d~j)。この亜集団は細胞の3%未満を構成した(図14i)。注目すべきことに、ナイーブhPSC培養物は同様に分化した細胞の5.6%を含んでいた(図14i)。バルクRNAシーケンシング分析は、単離された栄養膜アナログ(フローサイトメトリーによるTROP2+)が、ナイーブhPSCと移植後様栄養膜細胞(hTSC)との間の中間トランスクリプトームを有することを示した(図15a)。さらに、栄養膜は、胚盤胞段階のTE転写物(ESRRB、GRHL1、OVOL1、GATA2、GATA3、TBX3、KRT19、CGA、CGB5、CGB7)に富んでいたが、一部の着床後マーカー(SIGLEC6、DPP4)には富んでいなかった(図15b、c)。単離されたEPIアナログ(TROP2-/PDGFRa-)のトランスクリプトームは、ナイーブhPSCのトランスクリプトームに似ており(図15a)、胚盤胞期EPIに特異的なマーカー(KLF17、ATG2A、SUSD2、TFCP2L1、ZFP57、DPPA2、UTF1、 PRDM14)に富んでおり、準備刺激されたhPSCのトランスクリプトームとは異なっていた(図15a、d)。最後に、単離されたPrEアナログ(PDGFRa+)は、ナイーブhPSCと胚体外内胚葉細胞株(nEND細胞)との間の中間トランスクリプトームを有し(図15a)、胚盤胞段階のPrEマーカー(初期胚盤胞:GATA6、MSX2、HNF4A。後期胚盤胞:PDGFRA、GATA4、SOX17、HNF1B、FOXA2)、および胚盤胞と同様に下方制御されたEPI遺伝子(ARGFX、PRDM14、SOX2、NANOG、DPPA2、POU5F1)に富んでいた(図15e)。胚盤胞は幹細胞株を確立する能力を有する。同様に、胚盤胞様構造により、第2世代胚盤胞様構造(図16b、c)を形成することができるナイーブhPSC(NANOG+/SOX2+/OCT4+/KLF17+)(図16a)、ならびに合胞体栄養細胞(SCT)および絨毛外栄養膜(EVT)(3~6日、図16e~j)への迅速な分化能力を備えたhTSC(CDX2-/GATA3+/CK7+)(図16d)の新規誘導が可能になった。注目すべきことに、ヒト胚盤胞からのPrE細胞株の誘導はこれまでに報告されていない。全体として、このモデルは形態学的に胚盤胞に似ており(拡張方法の判定基準を参照)、胚盤胞段階を転写的に反映し、胚盤胞の連続的かつタイムリーな方法で発生する3つの系統のアナログを生成したため、発明者らはそれらを芽球様細胞と呼んだ。
実施例10:Hippo阻害。
ヒトの胚盤胞系統の分離に関する知識は限られている(図10a)。しかし、Hippo経路の阻害は、頂端ドメインの獲得時に末梢細胞で起こり、栄養膜の特異化に必要である(図17a)。発明者らは、芽球様細胞がこのメカニズムを採用するかどうかを試験した。驚くべきことに、非定型プロテインキナーゼC(aPKC)およびF-アクチン発現ドメインは、核内にHippo下流エフェクターYAP1も蓄積する外側細胞で同時整列しているように見えた(図17b、c)。YAP1の核位置はGATA2/3発現と相関し、NANOG発現とは対照的であり、TEアナログに限定されるようになった(図10bおよび図17d、e)。aPKC阻害剤(CRT0103390)は、YAP1核蓄積を大幅に防止し、GATA3+細胞数を減少させ、芽球様細胞形成を防止した(図17f~h)。逆に、Hippo経路を阻害するLPA受容体のリガンド(LPAおよびNAEPA)は芽球様細胞形成を増強した(図10cおよび図17i)。Hippo経路の阻害によりYAP1が核に入ることができるようになるため、遺伝子操作されたYAP1のレベルと機能が形態形成に影響を与えるかどうかを試験した。野生型または構成的活性型のYAP1(5SA)の過剰発現は、空洞形成を促進した(図10d)。YAP1転写因子とTEAD転写因子間の相互作用は、下流の遺伝子制御に必要である。したがって、TEAD結合部位(S94A)に変異を含むYAP1の過剰発現は空洞形成に影響を与えず(図10dおよび図17j)、YAP1-TEAD相互作用を破壊する薬剤であるベルテポルフィンは芽球様細胞形成を防止した(図17k)。空洞の形態形成は、複数の液体で満たされた空洞の見かけ上の癒合を通じて発生した(図17l)。ヒト胚盤胞で最も高度に発現される水トランスポーターであるアクアポリン3(AQP3)は、最初はすべての細胞で観察され(36時間)、その後TEアナログに限定された(96時間)(図17m)。したがって、ヒトの胚盤胞と同様に、芽球様細胞の栄養膜の特異化および形態形成は、aPKC、Hippo経路の阻害、YAP1の核移行、およびそのTEAD転写因子に結合する能力に依存する。
ヒトの胚盤胞系統の分離に関する知識は限られている(図10a)。しかし、Hippo経路の阻害は、頂端ドメインの獲得時に末梢細胞で起こり、栄養膜の特異化に必要である(図17a)。発明者らは、芽球様細胞がこのメカニズムを採用するかどうかを試験した。驚くべきことに、非定型プロテインキナーゼC(aPKC)およびF-アクチン発現ドメインは、核内にHippo下流エフェクターYAP1も蓄積する外側細胞で同時整列しているように見えた(図17b、c)。YAP1の核位置はGATA2/3発現と相関し、NANOG発現とは対照的であり、TEアナログに限定されるようになった(図10bおよび図17d、e)。aPKC阻害剤(CRT0103390)は、YAP1核蓄積を大幅に防止し、GATA3+細胞数を減少させ、芽球様細胞形成を防止した(図17f~h)。逆に、Hippo経路を阻害するLPA受容体のリガンド(LPAおよびNAEPA)は芽球様細胞形成を増強した(図10cおよび図17i)。Hippo経路の阻害によりYAP1が核に入ることができるようになるため、遺伝子操作されたYAP1のレベルと機能が形態形成に影響を与えるかどうかを試験した。野生型または構成的活性型のYAP1(5SA)の過剰発現は、空洞形成を促進した(図10d)。YAP1転写因子とTEAD転写因子間の相互作用は、下流の遺伝子制御に必要である。したがって、TEAD結合部位(S94A)に変異を含むYAP1の過剰発現は空洞形成に影響を与えず(図10dおよび図17j)、YAP1-TEAD相互作用を破壊する薬剤であるベルテポルフィンは芽球様細胞形成を防止した(図17k)。空洞の形態形成は、複数の液体で満たされた空洞の見かけ上の癒合を通じて発生した(図17l)。ヒト胚盤胞で最も高度に発現される水トランスポーターであるアクアポリン3(AQP3)は、最初はすべての細胞で観察され(36時間)、その後TEアナログに限定された(96時間)(図17m)。したがって、ヒトの胚盤胞と同様に、芽球様細胞の栄養膜の特異化および形態形成は、aPKC、Hippo経路の阻害、YAP1の核移行、およびそのTEAD転写因子に結合する能力に依存する。
実施例11:適切な発生順序
胚盤胞では、栄養膜が最初に出現し(5~6日目、GATA2+/DAB2+)、PrE細胞が最後に出現する(6~7日目、GATA6+/ADM+)。この順序は、PKCおよびHippoシグナル伝達に関連する転写レベル(AKAP12、CAPZB、ULK4、MOB1a、AMOT、AMOTL2、LATS2、TEAD1)を変化させながら、最初に栄養膜が形成される芽球様細胞で再現される(<24時間、DAB2+、CDX2+、およびGATA2+/3+、図10eおよび図18a)。タンパク質レベルでは、初期TE様細胞は最初にYAP1核/GATA2+(24時間)、次にCDX2+/GATA3+を出現させたが、一方でKLF17/OCT4発現は維持したがNANOG発現は維持しなかった(60時間)(図18b~d)。その後、OCT4は検出できなくなった(図8gおよび図12i)。SMAD、ERK、Notch、およびWntシグナル伝達経路に関連する遺伝子は、このプロセス中に調節された(図18e、f)。最後に、極性栄養膜アナログは、OVOL1、GREM2、CCR7、SP6、およびNR2F2の発現(図10fおよび図18g~j)、NR2F2およびCCR7の上方制御、およびCDX2の下方制御(10fおよび図18h、j)によって特徴づけられるように成熟した。EPIアナログのトランスクリプトームは、コア胚盤胞マーカー(POU5F1、NANOG、KLF17、SUSD2、KLF4、ARGFX、GDF3)(図10eおよび図18k、l)を維持しながら、Nodal(NODAL、LEFTY1/2)、およびmTORシグナル伝達関連遺伝子(LAMTOR1/4/5、XBP1、SEC13、MLST8)ならびにX染色体活性化関連遺伝子XACTの制御を特徴とする時間経過に伴う進行(overtime progression)を経た(図18k~m)。その後、PrEアナログが出現し(<60時間)、GATA4、OTX2、およびSOX17が検出された(72時間)(図10eおよび図18n~p)。初期のPrEマーカー遺伝子(GATA6、LBH、ADM、およびLAMA1)はPrEアナログ間で均一に発現したが、一部の後期PrEマーカー遺伝子(CTSE、APOA1、PITX2、およびSLCO2A1)は亜集団でのみ発現し、このことは後期胚盤胞状態への進行を示唆している(図18q)。96時間までに、成熟PrEアナログはSMAD(NODAL、BMP2/6、GDF3、ID1/2)およびWntシグナル伝達関連転写物(WNT3、RSPO3、LBH)を制御しており、細胞外マトリックス組織、内皮および上皮の分化を制御する転写物(LAMA1、LAMB1、LAMC1、COL4A1/2)に富んでいた(図18q、r)。全体として、芽球様細胞系統は胚盤胞発生の順序に従って特異化し、進行した。
胚盤胞では、栄養膜が最初に出現し(5~6日目、GATA2+/DAB2+)、PrE細胞が最後に出現する(6~7日目、GATA6+/ADM+)。この順序は、PKCおよびHippoシグナル伝達に関連する転写レベル(AKAP12、CAPZB、ULK4、MOB1a、AMOT、AMOTL2、LATS2、TEAD1)を変化させながら、最初に栄養膜が形成される芽球様細胞で再現される(<24時間、DAB2+、CDX2+、およびGATA2+/3+、図10eおよび図18a)。タンパク質レベルでは、初期TE様細胞は最初にYAP1核/GATA2+(24時間)、次にCDX2+/GATA3+を出現させたが、一方でKLF17/OCT4発現は維持したがNANOG発現は維持しなかった(60時間)(図18b~d)。その後、OCT4は検出できなくなった(図8gおよび図12i)。SMAD、ERK、Notch、およびWntシグナル伝達経路に関連する遺伝子は、このプロセス中に調節された(図18e、f)。最後に、極性栄養膜アナログは、OVOL1、GREM2、CCR7、SP6、およびNR2F2の発現(図10fおよび図18g~j)、NR2F2およびCCR7の上方制御、およびCDX2の下方制御(10fおよび図18h、j)によって特徴づけられるように成熟した。EPIアナログのトランスクリプトームは、コア胚盤胞マーカー(POU5F1、NANOG、KLF17、SUSD2、KLF4、ARGFX、GDF3)(図10eおよび図18k、l)を維持しながら、Nodal(NODAL、LEFTY1/2)、およびmTORシグナル伝達関連遺伝子(LAMTOR1/4/5、XBP1、SEC13、MLST8)ならびにX染色体活性化関連遺伝子XACTの制御を特徴とする時間経過に伴う進行(overtime progression)を経た(図18k~m)。その後、PrEアナログが出現し(<60時間)、GATA4、OTX2、およびSOX17が検出された(72時間)(図10eおよび図18n~p)。初期のPrEマーカー遺伝子(GATA6、LBH、ADM、およびLAMA1)はPrEアナログ間で均一に発現したが、一部の後期PrEマーカー遺伝子(CTSE、APOA1、PITX2、およびSLCO2A1)は亜集団でのみ発現し、このことは後期胚盤胞状態への進行を示唆している(図18q)。96時間までに、成熟PrEアナログはSMAD(NODAL、BMP2/6、GDF3、ID1/2)およびWntシグナル伝達関連転写物(WNT3、RSPO3、LBH)を制御しており、細胞外マトリックス組織、内皮および上皮の分化を制御する転写物(LAMA1、LAMB1、LAMC1、COL4A1/2)に富んでいた(図18q、r)。全体として、芽球様細胞系統は胚盤胞発生の順序に従って特異化し、進行した。
実施例12:子宮内膜細胞との特異的な相互作用(distinct interaction)
ヒト胚盤胞は、極性TEの受容期の(receptive)子宮内膜への対置および付着を介して、子宮内(7~9日目)で着床を開始する(図11a、左)。発明者らは、芽球様細胞がこの相互作用をモデル化することができるかどうか疑問に考えた。発明者らは、子宮内膜オルガノイド(Boretto, M. et al. Development 144,1775-1786(2017))を2Dで播種して、芽球様細胞の堆積を促進するオープンフェイス子宮内膜層(OFEL)を形成した(図11a、右)。亜集団は、繊毛上皮細胞を標識するアセチル化αチューブリン(図19a)および腺上皮細胞を標識するFOXA2(図19b)について陽性であった。エストロゲン(E2)およびプロゲステロン(P4)への曝露およびWnt阻害により、着床の窓が開く。したがって、OFELは、分泌期中期の子宮内膜を特徴づける遺伝子の発現を上方制御し(図19c~e)、増殖を減少させる(図19e、f)ことによって、E2、P4、cAMP、およびXAV939に応答した。注目すべきことに、非刺激OFEL上に堆積した芽球様細胞は付着しなかったが、一方、芽球様細胞は、子宮内で起こるように、子宮内膜細胞に付着し、次いで反発する(repulse)ことによって、刺激されたOFELと相互作用した(図11b及び図19g、h)。避妊薬レボノルゲストレルは芽球様細胞の付着を障害した(図19i)。発明者らは、ヒトの芽球様細胞はホルモンによって受容性が高められた子宮内膜と相互作用することができると結論付けた。
ヒト胚盤胞は、極性TEの受容期の(receptive)子宮内膜への対置および付着を介して、子宮内(7~9日目)で着床を開始する(図11a、左)。発明者らは、芽球様細胞がこの相互作用をモデル化することができるかどうか疑問に考えた。発明者らは、子宮内膜オルガノイド(Boretto, M. et al. Development 144,1775-1786(2017))を2Dで播種して、芽球様細胞の堆積を促進するオープンフェイス子宮内膜層(OFEL)を形成した(図11a、右)。亜集団は、繊毛上皮細胞を標識するアセチル化αチューブリン(図19a)および腺上皮細胞を標識するFOXA2(図19b)について陽性であった。エストロゲン(E2)およびプロゲステロン(P4)への曝露およびWnt阻害により、着床の窓が開く。したがって、OFELは、分泌期中期の子宮内膜を特徴づける遺伝子の発現を上方制御し(図19c~e)、増殖を減少させる(図19e、f)ことによって、E2、P4、cAMP、およびXAV939に応答した。注目すべきことに、非刺激OFEL上に堆積した芽球様細胞は付着しなかったが、一方、芽球様細胞は、子宮内で起こるように、子宮内膜細胞に付着し、次いで反発する(repulse)ことによって、刺激されたOFELと相互作用した(図11b及び図19g、h)。避妊薬レボノルゲストレルは芽球様細胞の付着を障害した(図19i)。発明者らは、ヒトの芽球様細胞はホルモンによって受容性が高められた子宮内膜と相互作用することができると結論付けた。
実施例13:エピブラストはゲートキープ相互作用を示す(signal)。
ヒト胚盤胞は、EPIとの接触によって規定される極性栄養外胚葉を介して子宮内膜に付着する。同様に、芽球様細胞はこの領域を介して付着を開始した(図11c、dおよび図20a~c)。発明者らは、次に、trophosphere(EPIを含まない)を形成することにより、極性/EPI界面の重要性を試験した。IL6は極性TEで高度に発現され、その受容体(IL6R、GP130)およびエフェクター(STAT3)の転写物がEPIに豊富に存在する(図20d)。EPIにおけるSTATシグナル伝達の役割と一致して、芽球様細胞形成効率はLIF濃度とともに増加した(図9e)一方、GP130阻害剤(SC144)の添加によりtrophosphereが得られた(図11eおよび図20f)。HippoキナーゼMST1/2の強力な阻害剤(XMU-MP-1)の存在によってもtrophosphereが得られた(図11eおよび図20g)。これらのtrophosphereのトランスクリプトームは、それぞれ初期胚盤胞栄養膜および後期胚盤胞栄養膜を反映していた(図20h、i)。両方のtrophosphereタイプはOFELに付着することができず(図11e)、移植後の栄養膜細胞層(CDX2-/CK7+)を反映するhTSCの凝集物またはナイーブhPSCの凝集物も同様であった(図11eおよび図20j、k)。発明者らは、EPIからのシグナルが極性栄養膜の成熟を確実にし、それによって子宮内膜細胞との相互作用が可能になると結論づけた。トランスクリプトーム分析および子宮内データに基づいて、発明者らは、子宮内膜細胞の刺激および極性栄養膜の成熟により転写物がより豊富になる分子のいくつかのペアを提唱する(図20l)。これらは、胚盤胞と子宮の間のファーストタッチを仲介する可能性がある。全体として、我々は、成熟がEPI誘導に依存する着床前の極性様状態が、胚盤胞と子宮内膜との相互作用をゲートキープしていると結論付けた。
ヒト胚盤胞は、EPIとの接触によって規定される極性栄養外胚葉を介して子宮内膜に付着する。同様に、芽球様細胞はこの領域を介して付着を開始した(図11c、dおよび図20a~c)。発明者らは、次に、trophosphere(EPIを含まない)を形成することにより、極性/EPI界面の重要性を試験した。IL6は極性TEで高度に発現され、その受容体(IL6R、GP130)およびエフェクター(STAT3)の転写物がEPIに豊富に存在する(図20d)。EPIにおけるSTATシグナル伝達の役割と一致して、芽球様細胞形成効率はLIF濃度とともに増加した(図9e)一方、GP130阻害剤(SC144)の添加によりtrophosphereが得られた(図11eおよび図20f)。HippoキナーゼMST1/2の強力な阻害剤(XMU-MP-1)の存在によってもtrophosphereが得られた(図11eおよび図20g)。これらのtrophosphereのトランスクリプトームは、それぞれ初期胚盤胞栄養膜および後期胚盤胞栄養膜を反映していた(図20h、i)。両方のtrophosphereタイプはOFELに付着することができず(図11e)、移植後の栄養膜細胞層(CDX2-/CK7+)を反映するhTSCの凝集物またはナイーブhPSCの凝集物も同様であった(図11eおよび図20j、k)。発明者らは、EPIからのシグナルが極性栄養膜の成熟を確実にし、それによって子宮内膜細胞との相互作用が可能になると結論づけた。トランスクリプトーム分析および子宮内データに基づいて、発明者らは、子宮内膜細胞の刺激および極性栄養膜の成熟により転写物がより豊富になる分子のいくつかのペアを提唱する(図20l)。これらは、胚盤胞と子宮の間のファーストタッチを仲介する可能性がある。全体として、我々は、成熟がEPI誘導に依存する着床前の極性様状態が、胚盤胞と子宮内膜との相互作用をゲートキープしていると結論付けた。
実施例14:ポストステージのモデリング(13日目)。
芽球様細胞の形態は、着床前培養(peri-implantation culture)条件において2日間安定であった(図21a)。臨床妊娠は、絨毛性ゴナドトロピンβ(CGβ)ホルモンの検出によって特徴付けられる。付着すると、芽球様細胞は、標準的な妊娠検査およびELISAを使用して検出可能なレベルでCGβを発現する栄養膜を形成した(図11fおよび図21b)。NR2F2+極性栄養膜アナログは、着床前遺伝子サイトケラチン7(CK7)を上方制御しながら増殖し、CDX2発現を減少させた(図21c、d)。一部の栄養膜は、それぞれCGβおよびHLA-Gを発現するSCTおよびEVTにさらに分化した(図21e、f)。EPIアナログは、OCT4、SOX2を維持し、準備刺激された多能性マーカーCD24を上方制御し(図11gおよび図21g)、EPI上皮化中と同様に皮質F-アクチンをパターン化し、一部の芽球様細胞はF-アクチン/PODXL+/aPKC+が豊富な原始羊膜様腔(pro-amniotic-like cavity)を形成した(図11gおよび図21h)。また、EPIアナログの周辺の亜集団は、SOX2またはTFAP2CとともにCDX2を発現し、これは初期の羊膜アナログを示唆した(図21i、j)。PrEアナログは、OTX2の限定された発現によって特徴づけられた(図18o、21k)。長期培養(最大6日間)すると、3つの系統は13日目に相当する時間まで一貫して増殖した(図11hおよび図21l、m)が、胚盤胞と同様に、それらの組織はその発生段階を反映していなかった。
芽球様細胞の形態は、着床前培養(peri-implantation culture)条件において2日間安定であった(図21a)。臨床妊娠は、絨毛性ゴナドトロピンβ(CGβ)ホルモンの検出によって特徴付けられる。付着すると、芽球様細胞は、標準的な妊娠検査およびELISAを使用して検出可能なレベルでCGβを発現する栄養膜を形成した(図11fおよび図21b)。NR2F2+極性栄養膜アナログは、着床前遺伝子サイトケラチン7(CK7)を上方制御しながら増殖し、CDX2発現を減少させた(図21c、d)。一部の栄養膜は、それぞれCGβおよびHLA-Gを発現するSCTおよびEVTにさらに分化した(図21e、f)。EPIアナログは、OCT4、SOX2を維持し、準備刺激された多能性マーカーCD24を上方制御し(図11gおよび図21g)、EPI上皮化中と同様に皮質F-アクチンをパターン化し、一部の芽球様細胞はF-アクチン/PODXL+/aPKC+が豊富な原始羊膜様腔(pro-amniotic-like cavity)を形成した(図11gおよび図21h)。また、EPIアナログの周辺の亜集団は、SOX2またはTFAP2CとともにCDX2を発現し、これは初期の羊膜アナログを示唆した(図21i、j)。PrEアナログは、OTX2の限定された発現によって特徴づけられた(図18o、21k)。長期培養(最大6日間)すると、3つの系統は13日目に相当する時間まで一貫して増殖した(図11hおよび図21l、m)が、胚盤胞と同様に、それらの組織はその発生段階を反映していなかった。
考察。
このモデルの忠実度、効率、拡張性、多用途性により、ヒトの胚盤胞の発生および着床の研究は重要である。本発明の芽球様細胞は、治療標的の同定を補助し、前臨床モデリングに貢献する(たとえば、候補LPA/NAEPA等の体外受精培地補体、または候補SC144等の避妊薬)。ヒト発生学のつり合い(利益と害のバランス)および補完性(道徳的に最も問題の少ない手段を使用して目標を追求すること)を考慮すると、芽球様細胞は胚を使用した研究を補完する倫理的な機会となる。
このモデルの忠実度、効率、拡張性、多用途性により、ヒトの胚盤胞の発生および着床の研究は重要である。本発明の芽球様細胞は、治療標的の同定を補助し、前臨床モデリングに貢献する(たとえば、候補LPA/NAEPA等の体外受精培地補体、または候補SC144等の避妊薬)。ヒト発生学のつり合い(利益と害のバランス)および補完性(道徳的に最も問題の少ない手段を使用して目標を追求すること)を考慮すると、芽球様細胞は胚を使用した研究を補完する倫理的な機会となる。
驚くべきことに、3つの阻害剤によるhPSC凝集物の刺激は、栄養膜細胞の形成を引き起こすだけでなく、空間的に組織化された栄養膜、エピブラスト、および原始内胚葉細胞の同時形成も引き起こす。これら3種類の細胞の自発的組織化は、外層および液体で満たされた内腔を形成する栄養膜シストの形成、ならびに栄養膜シストの片側に付着したままの、エピブラストおよび原始内胚葉細胞のユニークな内部クラスターの形成によって特徴づけられる。直接的な結果として、このユニークな内部クラスターの存在によってシスト内に生じた非対称性は、極性栄養膜の局所的成熟を誘導し、子宮内膜細胞への付着の向きを決定する。
Claims (17)
- ヒト多能性幹細胞(hPSCs)および栄養膜細胞(trophoblast cells)の凝集物を、HIPPO経路阻害剤を含む培地中で3D培養で培養することを含む、芽球様細胞または胚盤胞様細胞凝集物を生成する方法であって、ここで該hPSCおよび栄養膜(trophoblasts)の凝集物は、MEK阻害剤およびTGF-β阻害剤を含む培地中で凝集したhPSCを培養することによって生成される、方法。
- 前記hPSCおよび栄養膜の凝集物が、HIPPO経路阻害剤をさらに含む培地中で凝集したhPSCを培養することによって生成される、請求項1に記載の方法。
- 前記凝集したhPSCが、hPSCを播種すること、および該播種されたhPSCを増殖培地中で培養することによって、好ましくは増殖培地中で0~64時間、特に好ましくは12~64時間培養することによって凝集させることによって形成され、および/または好ましくは、増殖培地はROCK阻害剤を含み、特に好ましくはROCK阻害剤はY27632である、請求項1または請求項2に記載の方法。
- 前記播種されたhPSCが、好ましくはWnt阻害剤および/またはSTATアゴニストをさらに含むMEK阻害剤および/またはPKC阻害剤で処理されており、好ましくは2D培養で処理される、請求項3に記載の方法。
- 前記PKC阻害剤がGoe6983およびRo-31-8425から選択される、請求項4に記載の方法。
- 前記HIPPO経路阻害剤が、リゾホスファチジン酸(LPA)受容体のリガンド、好ましくはLPAもしくはNAEPA、またはベルテポルフィンである;および/または前記MEK阻害剤がPD0325901である;および/または前記TGF-β阻害剤がA83-1またはSB431542である、請求項1~5のいずれか一項に記載の方法。
- 少なくとも、前記hPSCおよび栄養膜の凝集物から栄養外胚葉様組織、エピブラスト様組織、およびハイポブラスト様組織が形成されるまで、好ましくはさらに少なくとも胚-非胚軸が形成されるまで、細胞を培養する工程;および/または少なくとも液体で満たされた空洞およびエピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞を含む少なくとも一つの内部細胞塊を取り囲む栄養膜様細胞の外側上皮単層によって形成される、少なくとも100μm、好ましくは少なくとも140μm、さらに好ましくは180μm~220μmの全径を有する三次元細胞凝集物が形成されるまで細胞を培養する工程を含む、請求項1~6のいずれか一項に記載の方法。
- エストロゲン、エストロン、エストリオール、エチニルエストラジオール、17α-エチニルエストラジオール、メストラノール、プロゲステロン、プロゲスチン、cAMP、およびWnt-阻害剤、好ましくはXAV939、IWP-2、PNU-74654、またはLF3から選択される化合物で子宮内膜細胞を刺激する工程、および刺激された子宮内膜細胞の層上に芽球様細胞を播種して、芽球様細胞が子宮内膜細胞の層に付着および侵入することができるようにする工程をさらに含む、請求項1~7のいずれか一項に記載の方法。
- 芽球様細胞の形成および/または子宮内膜細胞の層への芽球様細胞の移植に影響を与える候補化合物および/または候補遺伝子変異を試験またはスクリーニングするための、前記凝集物を少なくとも一つの候補化合物で処理すること、および/または前記凝集物に少なくとも一つの候補遺伝子改変を与えること、および請求項1~8のいずれか一項に記載の方法を実行することを含む、請求項1~8のいずれか一項に記載の方法。
- HIPPO経路阻害剤、MEK阻害剤、およびTGF-β阻害剤を含む;好ましくは、ヒト多能性幹細胞(hPSC)用の培地と組み合わせる、芽球様細胞の培養に適したキット。
- 請求項1~9のいずれか一項に記載の方法により得られる芽球様細胞。
- 少なくとも一つの液体で満たされた空洞およびエピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞を含む少なくとも一つの内部細胞塊を取り囲む栄養膜様細胞の外側上皮単層を含み、ここで、該外側上皮単層は、NR2F2を発現する極性栄養膜(polar trophoblast)を含む、請求項11に記載の芽球様細胞。
- 少なくとも一つの液体で満たされた空洞およびエピブラスト様細胞およびハイポブラスト様細胞を含む少なくとも一つの内部細胞塊を取り囲む栄養膜様細胞の外側上皮単層を含み、ここで、該外側上皮単層は、NR2F2を発現する極性栄養膜(polar trophoblast)を含む、芽球様細胞。
- 芽球様細胞または胚盤胞をWnt阻害剤、好ましくはXAV939、IWP-2、PNU-74654、および/またはLF3で処理する工程、および該芽球様細胞または胚盤胞を子宮内膜細胞の層と接触させる工程を含む、芽球様細胞または胚盤胞を子宮内膜細胞の層に移植する潜在能力を増大させるインビトロ法。
- Wnt阻害剤、好ましくはXAV939、IWP-2、PNU-74654、および/またはLF3の存在下で前記胚盤胞を子宮内膜と接触させる工程を含む、または胚盤胞を子宮内膜に移植する前に、Wnt阻害剤で子宮内膜を刺激する工程を含む;好ましくはここで該子宮内膜は、局所的に、全身的に、または胚盤胞と一緒にWnt阻害剤と接触される、胚盤胞着床の確率を増大させる方法において使用するためのWnt阻害剤。
- 1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期、または胚盤胞期から選択される初期段階の胚を成熟胚盤胞期まで、HIPPO経路阻害剤で、特に好ましくはNAEPAまたはリゾホスファチジン酸(LPA)受容体のリガンドで、さらにより好ましくはLPAで、処理する工程、および1細胞期、2細胞期、4細胞期、8細胞期、もしくは16細胞期、または桑実胚期の胚を胚盤胞期まで成長させる工程、もしくは胚盤胞期の胚をより成熟した胚盤胞期(more mature blastocyst stage)まで成長させる工程を含む、胚盤胞の作製方法。
- MST1/2阻害剤、好ましくはXMU-MP-1、および/またはSTAT阻害剤、好ましくはSC144を患者に投与する工程、および/または胚をインビボでMST1/2阻害剤、好ましくはXMU-MP-1、および/またはSTAT阻害剤、好ましくはSC144と接触させる工程を含む、避妊方法。
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