JP2024500786A - Clrn1関連難聴及び/または視力低下を治療するための組成物及び方法 - Google Patents

Clrn1関連難聴及び/または視力低下を治療するための組成物及び方法 Download PDF

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Abstract

本開示は、プロモーターに作動可能に連結されたコード配列を含む構築物であって、コード配列が、クラリン1タンパク質をコードする、構築物を提供する。例示的な構築物には、AAV構築物が含まれる。また、難聴及び/または重度難聴の治療のために開示された構築物を使用する方法も提供される。また、視力低下の治療のために開示された構築物を使用する方法も提供される。【選択図】図1

Description

関連出願の相互参照
本願は、2020年12月29日に出願された米国仮特許出願第63/131,413号の優先権を主張し、その全内容は参照により本明細書に援用される。
難聴は、伝音性(外耳道または中耳から発生する)、感音性(内耳または聴神経から発生する)、または混合型であり得る。非症候性重度難聴のほとんどの形態は、内耳中の構造への損傷によって引き起こされる永久的難聴に関連するが(感音性重度難聴)、一部の形態は、中耳における変化(伝音性難聴)を伴い得る。ヒトの感音性難聴の大多数は、蝸牛内にあるコルチ器の有毛細胞の異常(有毛細胞の機能不良)によって引き起こされる。有毛細胞は出生時に異常である場合もあれば、個体の一生の間に(例えば、騒音性外傷または感染の結果)損傷を受ける場合もある。
視覚障害または視力障害としても知られる視力低下は、例えば、眼鏡などの手段によって矯正できない程度まで見る能力が低下することである。視力低下の原因は非常に多様であり、目に影響を与える状態から脳内の視覚処理中枢に影響を与える状態にまで及ぶ。例えば、アッシャーIII型症候群または網膜色素変性症に罹患している患者における視力低下は、網膜の光感知細胞が徐々に劣化し、最終的に萎縮するにつれて発生する。視力低下の他の例としては、糖尿病性網膜症、緑内障、加齢黄斑変性症、及び白内障が挙げられる。
本開示は、難聴に関連する疾患または状態が、例えば、特定の遺伝子産物の置換または付加を介して治療され得るという認識を提供する。本開示はさらに、内耳細胞の発生、機能、及び/または維持に関与する遺伝子産物が、有毛細胞及び/または支持細胞(例えば、支持有毛細胞)の喪失に関連する疾患または状態の治療に有用であり得ることを提供する。したがって、本開示は、支持細胞及び有毛細胞などの内耳細胞の発生、機能、及び/または維持に関与する遺伝子産物の発現をもたらす組成物を投与するため、及び/または難聴、または難聴に関連する疾患もしくは状態の治療におけるそのような組成物を使用するために提供する。いくつかの実施形態では、遺伝子産物は、CLRN1遺伝子またはその特徴的部分によってコードされ得る。いくつかの実施形態では、遺伝子産物は、クラリン1タンパク質またはその特徴的部分であり得る。
本開示は、視力低下に関連する疾患または状態が、例えば、特定の遺伝子産物の置換または付加を介して治療され得るという認識をさらに提供する。本開示はさらに、眼細胞の発生、機能、及び/または維持に関与する遺伝子産物が、眼細胞及び/または支持細胞(例えば、支持有毛細胞)の喪失に関連する疾患または状態の治療に有用であり得ることを提供する。したがって、本開示は、支持細胞などの眼細胞の発生、機能、及び/または維持に関与する遺伝子産物の発現をもたらす組成物を投与するため、及び/または視力低下、または視力低下に関連する疾患もしくは状態の治療におけるそのような組成物を使用するために提供する。いくつかの実施形態では、遺伝子産物は、CLRN1遺伝子またはその特徴的部分によってコードされ得る。いくつかの実施形態では、遺伝子産物は、クラリン1タンパク質またはその特徴的部分であり得る。
本開示はさらに、AAV粒子が、内耳細胞の発生、機能、及び/または維持に関与する遺伝子産物の発現をもたらす組成物の投与、及び/または難聴、難聴に関連する疾患もしくは状態の治療に有用であり得ることを提供する。本開示はさらに、AAV粒子が、眼細胞の発生、機能、及び/または維持に関与する遺伝子産物の発現をもたらす組成物の投与、及び/または視力低下、視力低下に関連する疾患もしくは状態の治療に有用であり得ることを提供する。本明細書に記載のとおり、AAV粒子は、(i)AAVポリヌクレオチド構築物(例えば、組換えAAVポリヌクレオチド構築物)、及び(ii)キャプシドタンパク質を含むキャプシドを含む。いくつかの実施形態では、AAVポリヌクレオチド構築物は、CLRN1遺伝子またはその特徴的部分を含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のAAV粒子は、rAAV-CLRN1またはrAAV-CLRN1粒子と呼ばれる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のAAV粒子は、rAAV Anc80-CLRN1またはrAAV Anc80-CLRN1粒子と呼ばれる。
本開示はさらに、CLRN1遺伝子またはその特徴的部分を含むポリヌクレオチド構築物を含む組成物を提供する。いくつかの実施形態では、構築物は、コード配列に作動可能に付着された調節エレメントをさらに含み得る。特定の実施形態では、含まれる調節エレメントにより、生理学的に好適なレベルで組織特異的発現が容易になる。
また、本明細書に記載の構築物及び組成物を投与する方法も本明細書に提供される。特定の実施形態では、投与は、外科的介入及び治療用構築物を含むrAAV粒子の送達を伴う。特定の実施形態では、AAV粒子は、蝸牛窓膜を通過させる外科的導入によって、それを必要とする対象の内耳に送達され得る。いくつかの実施形態では、介入の有効性は、確立された試験を通じて決定され、測定値は、対照または参照測定値と比較する。
定義
本開示の範囲は、添付の特許請求の範囲によって定義され、本明細書に記載の特定の実施形態によって限定されるものでない。当業者は、本明細書を読んで、そのような記載された実施形態と等価であり得るか、さもなければ特許請求の範囲内にあり得る様々な修正を認識するであろう。一般に、本明細書で使用される用語は、別段の明確な指示がない限り、当技術分野で理解されている意味に従う。特定の用語の明示的な定義を以下に示す。本明細書全体での特定の例におけるこれらの用語及び他の用語の意味は、文脈から当業者には明らかであろう。
請求項要素を修飾するために請求項で「第1」、「第2」、「第3」などの序数の用語を使用すること自体は、ある請求項要素が別の請求項要素よりも、方法の実施を行うあらゆる優先順位、優先権、または順序が高いことを意味するものではないが、特定の名前を有する1つの請求項要素を同じ名前を有する別の要素(ただし、序数の用語の使用のため)と区別するための標識としてのみ使用される。
本明細書で使用される冠詞「a」及び「an」は、反対に明確に示されない限り、複数の指示対象を含むと理解されるべきである。群の1つ以上の要素の間に「または」を含む請求項または記載は、その反対が示されるか、または別途文脈から明白でない限り、1つ、2つ以上、または全ての群要素が、所与の製品または過程において存在するか、用いられるか、または別途関連している場合に、満たされると考えられる。いくつかの実施形態では、本発明は、群の正確に1つのメンバーが、所与の産物または過程において存在するか、それらにおいて用いられるか、または別途それらに関連している。いくつかの実施形態では、2つ以上、または全ての群メンバーが、所与の産物または過程において存在するか、それらにおいて用いられるか、または別途それらに関連している。本開示は、別段の指示がない限り、または矛盾または不一致が生じることが当業者に明らかでない限り、列挙された請求項の1つ以上からの1つ以上の制限、要素、条項、記述用語などが、同じ基本請求項(または、関連する任意の他の請求項)に依存する別の請求項に導入されるすべての変形、組み合わせ、順列を包含することが理解される。要素が、列挙(例えば、マーカッシュ群または同様の形式)として提示される場合、要素の各亜群も開示され、いずれの要素(複数可)もこの群から除去され得ることが理解されるべきである。一般的に、実施形態または態様が特定の要素、特徴などを「含む」として称される場合、特定の実施形態または態様が、かかる要素、特徴など「からなるか」、または「本質的になる」ことが理解されるべきである。簡潔さを目的として、これらの実施形態は、いずれの場合も、本明細書において非常に多くの言語で具体的に記載されているわけではない。特定の除外が明細書に記載されているかに関係なく、任意の実施形態または態様が特許請求の範囲から明示的に除外され得ることも理解されるべきである。
本明細書を通して、ポリヌクレオチドまたはポリペプチドが一連の文字(例えば、ポリヌクレオチドの場合、それぞれアデノシン、シチジン、グアノシン、及びチミジンを表すA、C、G、及びT)によって表されるときは常に、そのようなポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、左から右へ、5’から3’またはN末端からC末端の順で提示される。
投与:本明細書で使用される場合、「投与」という用語は、典型的には、対象またはシステムへの剤の送達を達成するための、対象またはシステムへの組成物の投与を指す。いくつかの実施形態では、剤は、組成物であるか、または組成物に含まれる。いくつかの実施形態では、剤は、組成物またはその1つ以上の成分の代謝を介して生成される。当業者は、適切な状況において、対象、例えばヒトへの投与に利用され得る様々な経路を認識するであろう。例えば、いくつかの実施形態では、投与は、全身的または局所的であり得る。いくつかの実施形態では、全身投与は、静脈内であり得る。いくつかの実施形態では、投与は局所的であり得る。局所投与は、例えば、蝸牛窓膜からまたは鼓室階への注射、内リンパを介した階中膜注射、canalostomy後の外リンパ及び/または内リンパによる蝸牛外リンパへの送達を伴い得る。局所投与はまた、例えば、眼内注射(例えば、硝子体注射、硝子体内注射、網膜下注射、脈絡膜上注射(例えば、Orbit(商標)Subretinal Delivery System(OrbitSDS)(Gyroscope Therapeutics)を使用)、または網膜注射)による眼への送達を伴い得る。例えば、Ochakovski et al.,「Retinal Gene Therapy:Surgical Vector Delivery in the Translation to Clinical Trials」,Front.Neurosci.April 3,2017またはNinel Z Gregori and Janet Louise Davidによる「OCT-Assisted Delivery of Luxturna」、https://www.aao.org/clinical-video/oct-assisted-delivery-of-luxturna(July 19,2018)を参照、これらのそれぞれの開示は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、投与は、単回用量のみを伴い得る。いくつかの実施形態では、投与は、固定数の用量の適用を伴い得る。いくつかの実施形態では、投与は、間欠的(例えば、時間的に分けられた複数の用量)及び/または周期的(例えば、共通の時間間隔で分けられた個々の用量)の投薬を伴い得る。いくつかの実施形態では、投与は、少なくとも選択された期間にわたる連続投薬(例えば、灌流)を伴い得る。
対立遺伝子:本明細書で使用される場合、「対立遺伝子」という用語は、特定の多型ゲノム遺伝子座の2つ以上の既存の遺伝子バリアントのうちの1つを指す。
改善:本明細書で使用される場合、「改善」という用語は、対象の状態の予防、軽減もしくは緩和、または状態の改善を指す。改善には、疾患、障害または状態の完全な回復または完全な予防を含む場合があるが、必須ではない。
アミノ酸:本明細書で使用する「アミノ酸」という用語は、最も広い意味で、例えば、1つ以上のペプチド結合の形成を通じて、ポリペプチド鎖に組み込むことができる任意の化合物及び/または物質を指す。いくつかの実施形態では、アミノ酸は、一般構造、例えば、HN-C(H)(R)-COOHを有する。いくつかの実施形態では、アミノ酸は、天然アミノ酸である。いくつかの実施形態では、アミノ酸は、非天然アミノ酸である。いくつかの実施形態では、アミノ酸は、D-アミノ酸である。いくつかの実施形態では、アミノ酸は、L-アミノ酸である。「標準アミノ酸」とは、天然に存在するペプチド中に一般的に見られる20の標準L-アミノ酸のうちのいずれかを指す。「非標準アミノ酸」とは、合成的に調製されたか天然源から得られたかに関係なく、標準アミノ酸以外の任意のアミノ酸を指す。いくつかの実施形態では、ポリペプチド中のカルボキシ末端アミノ酸及び/またはアミノ末端アミノ酸を含むアミノ酸は、上記の一般的な構造と比較して、構造修飾を含むことができる。例えば、いくつかの実施形態では、アミノ酸は、一般的な構造と比較して、メチル化、アミド化、アセチル化、peg化、グリコシル化、リン酸化、及び/または置換(例えば、アミノ基、カルボン酸基、1つ以上のプロトン、及び/またはヒドロキシル基)によって修飾され得る。いくつかの実施形態では、そのような修飾は、他の点では同一の非修飾アミノ酸を含むポリペプチドと比較して例えば、修飾されたアミノ酸を含むポリペプチドの循環半減期を変化させることができる。いくつかの実施形態では、そのような修飾は、他の点では同一の非修飾アミノ酸を含むポリペプチドと比較して、修飾アミノ酸を含むポリペプチドの関連する活性を有意に変化させない。
およそまたは約:本明細書で使用する場合、用語「およそ」または「約」は、述べられた基準値と類似する値など、目的の1つ以上の値に適用され得る。いくつかの実施形態では、用語「およそ」または「約」は、別途記載のない限りまたは別途文脈から明らかでない限り(かかる数が可能な値の100%を超え得る場合を除く)、述べられた基準値の±10%(上回るまたは下回る)に含まれる値の範囲を指す。例えば、いくつかの実施形態では、用語「およそ」または「約」は、参照値の10%以内、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、またはそれ未満の範囲の値を包含する。
関連する:本明細書で使用される用語「関連する」は、一方の存在、レベル及び/または形態が他方のものと相関している場合、互いに「関連する」として2つの事象またはエンティティを表す。例えば、特定のエンティティ(例えば、ポリペプチド、遺伝子シグネチャー、代謝産物、微生物など)は、その存在、レベル及び/または形態が、疾患、障害、または状態の発生率及び/または感受性と相関する場合(例えば、関連集団全体において)、特定の疾患、障害、または状態と関連していると考えられる。いくつかの実施形態では、2つ以上のエンティティは、直接的または間接的に相互作用する場合、互いに物理的に「関連」しており、それにより、互いに物理的に近接している、及び/または近接したままである。いくつかの実施形態では、互いに物理的に関連する2つ以上のエンティティが互いに共有結合により連結している。いくつかの実施形態では、互いに物理的に結合している2つ以上のエンティティは、互いに共有結合により連結していないが、例えば、水素結合、ファンデルワールス相互作用、疎水性相互作用、磁性、及びそれらの組み合わせによって非共有結合により結合している。
生物学的活性:本明細書で使用される場合、「生物学的活性」という用語は、目的の剤またはエンティティによって達成される観察可能な生物学的効果または結果を指す。例えば、いくつかの実施形態では、特異的結合相互作用は、生物学的活性である。いくつかの実施形態では、生物学的経路または事象の調節(例えば、誘導、増強、または阻害)は、生物学的活性である。いくつかの実施形態では、生物学的活性の存在または程度は、目的の生物学的経路または事象によって産生される直接的または間接的な産物の検出により判定される。
特徴的部分:本明細書で使用される「特徴的部分」という用語は、最も広い意味で、その存在(または非存在)が物質の特定の特徴、属性、または活性の存在(または非存在)と相関する物質の部分を指す。いくつかの実施形態では、物質の特徴的部分は、特定の特徴、属性、または活性を共有するが、特定の特徴、属性、または活性を共有しないものに見られない、所与の物質及び関連物質に見られる部分である。いくつかの実施形態では、特徴的部分は、無傷の物質と少なくとも1つの機能的特徴を共有する。例えば、いくつかの実施形態では、タンパク質またはポリペプチドの「特徴的部分」は、共にタンパク質またはポリペプチドの特徴である、アミノ酸の連続ストレッチ、またはアミノ酸の連続ストレッチの集合体を含むものである。いくつかの実施形態では、そのような連続ストレッチのそれぞれは、一般に、少なくとも2、5、10、15、20、50、またはそれ以上のアミノ酸を含む。一般に、物質(例えば、タンパク質、抗体など)の特徴的部分は、上記で指定された配列及び/または構造上の同一性に加えて、少なくとも1つの機能的特徴を関連する無傷物質と共有するものである。いくつかの実施形態では、特徴的部分は、生物学的活性であり得る。
特徴的配列:本明細書で使用される場合、「特徴的配列」という用語は、ポリペプチドまたは核酸のファミリーのすべてのメンバー中に見られる配列であり、したがって、当業者は、これらをファミリーのメンバーを定義するために使用することができる。
特徴的配列エレメント:本明細書で使用される場合、語句「特徴的配列エレメント」は、ポリマー中(例えば、ポリペプチドまたは核酸中)に見られる、そのポリマーの特徴的部分を表す配列エレメントを指す。いくつかの実施形態では、特徴的配列エレメントの存在は、ポリマーの特定の活性または特性の存在またはレベルと相関する。いくつかの実施形態では、特徴的配列エレメントの存在(または非存在)は、特定のポリマーを、そのようなポリマーの特定のファミリーまたはグループのメンバー(またはメンバーではない)として定義する。特徴的配列エレメントは、典型的には、少なくとも2つの単量体(例えば、アミノ酸またはヌクレオチド)を含む。いくつかの実施形態では、特徴的配列エレメントは、少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、またはそれ以上の単量体(例えば、隣接して連結した単量体)を含む。いくつかの実施形態では、特徴的配列エレメントは、配列エレメントを共有するポリマー間で長さが変動してもしなくてもよい1つ以上のスペーサー領域によって離間された隣接単量体の少なくとも第1及び第2ストレッチを含む。
併用療法:本明細書で使用される「併用療法」という用語は、対象が2つ以上の治療レジメン(例えば、2つ以上の治療剤)に同時にさらされる状況を指す。いくつかの実施形態では、2つ以上の剤が同時に投与されてもよい。いくつかの実施形態では、2つ以上の剤が逐次投与されてもよい。いくつかの実施形態では、2つ以上の剤が、重複する投薬レジメンで投与されてもよい。
同等の:本明細書で使用される用語「同等の」は、2つ以上の剤、エンティティ、状況、一連の条件、対象、集団などを指し、これらは、互いに同一ではない可能性があるが、それらの間での比較が可能になるように十分に類似しているため、当業者は、観察された相違または類似性に基づいて、合理的に結論を導き得ることを理解するであろう。いくつかの実施形態では、同等の一連の剤、エンティティ、状況、一連の条件、対象、集団などは、複数の実質的に同一の特徴及び1つまたは少数の様々な特徴により特徴付けられる。当業者は、文脈において、2つ以上のそのような剤、エンティティ、状況、一連の条件、対象、集団などについて、任意の所与の状況においてどの程度の同一性が同等であると見なされるために必要とされるかを理解するであろう。例えば、当業者であれば、異なる一連の環境、刺激、剤、エンティティ、状況、一連の条件、対象、集団などの下で、またはこれらの一連のものにより得られた結果または観察された現象の相違が、変動する特徴の変動によって引き起こされるか、変動を示す妥当な結論を保証するために、実質的に同一の特徴の十分な数及び種類によって特徴付けられたときに、一連の剤、エンティティ、状況、一連の条件、対象、集団などが、互いに同等であることを理解するであろう。
構築物:本明細書で使用される場合、「構築物」という用語は、少なくとも1つの異種ポリヌクレオチドを担持することができるポリヌクレオチドを含む組成物を指す。いくつかの実施形態では、構築物は、プラスミド、トランスポゾン、コスミド、人工染色体(例えば、ヒト人工染色体(HAC)、酵母人工染色体(YAC)、細菌人工染色体(BAC)、またはP1由来人工染色体(PAC))またはウイルス構築物、及び任意のGateway(登録商標)プラスミドであり得る。構築物は、例えば、発現のために十分なシス作用性エレメントを含み得、発現のための他のエレメントは、宿主霊長類細胞によって、またはin vitro発現系で供給され得る。構築物は、適切な制御エレメントに結合された際に複製可能な任意の遺伝子エレメント(例えば、プラスミド、トランスポゾン、コスミド、人工染色体、またはウイルス構築物など)を含み得る。したがって、いくつかの実施形態では、「構築物」は、クローニング及び/または発現構築物及び/またはウイルス構築物(例えば、アデノ随伴ウイルス(AAV)構築物、アデノウイルス構築物、レンチウイルス構築物、またはレトロウイルス構築物)を含み得る。
保存的:本明細書で使用される場合、「保存的」という用語は、類似の化学的性質(例えば、電荷または疎水性)を有する側鎖R基を有する別のアミノ酸残基によるアミノ酸残基の置換などの保存的アミノ酸置換を表す例を指す。一般に、保存的アミノ酸置換は、例えば、受容体がリガンドに結合する能力など、タンパク質の目的の機能特性を実質的に変化させない。同様の化学的性質を有する側鎖を有するアミノ酸の基の例としては、以下が挙げられる:脂肪族側鎖、例えば、グリシン(Gly,G)、アラニン(Ala,A)、バリン(Val,V)、ロイシン(Leu,L)、及びイソロイシン(Ile,I);脂肪族ヒドロキシル側鎖、例えば、セリン(Ser,S)及びスレオニン(Thr,T);アミド含有側鎖、例えば、アスパラギン(Asn,N)及びグルタミン(Gln,Q);芳香族側鎖、例えば、フェニルアラニン(Phe,F)、チロシン(Tyr,Y)、及びトリプトファン(Trp,W);塩基性側鎖、例えば、リジン(Lys,K)、アルギニン(Arg,R)、及びヒスチジン(His,H);酸性側鎖、例えば、アスパラギン酸(Asp,D)及びグルタミン酸(Glu,E);及び硫黄含有側鎖、例えばシステイン(Cys,C)及びメチオニン(Met,M)。保存的アミノ酸置換基としては、例えば、バリン/ロイシン/イソロイシン(Val/Leu/Ile、V/L/I)、フェニルアラニン/チロシン(Phe/Tyr、F/Y)、リジン/アルギニン(Lys/Arg、K/R)、アラニン/バリン(Ala/Val、A/V)、グルタミン酸/アスパラギン酸(Glu/Asp、E/D)、及びアスパラギン/グルタミン(Asn/Gln、N/Q)が挙げられる。いくつかの実施形態では、保存的アミノ酸置換は、例えば、アラニンスキャニング変異誘発において使用されるように、タンパク質中の任意の天然残基のアラニンによる置換であり得る。いくつかの実施形態では、PAM250対数尤度行列において正の値を有する保存的置換が行われる。これは、Gonnet,G.H.et al.,1992,Science 256:1443-1445に開示されており、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、置換は、PAM250対数尤度行列において負でない値を有する適度に保存的な置換である。当業者であれば、異なる種由来の同じタンパク質間で保存されていないアミノ酸の変化(例えば、置換、付加、欠失など)が、タンパク質の機能に対する効果を有する可能性が低いため、これらのアミノ酸を変異のために選択するべきであることを理解するであろう。異なる種由来の同じタンパク質間で保存されているアミノ酸は、これらの変異がタンパク質の機能の変化をもたらす可能性が高いため、変化(例えば、欠失、付加、置換など)させるべきではない。

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対照:本明細書で使用する場合、用語「対照」は、それに対して結果が比較される標準である対照という当該技術分野で既知の意味を指す。典型的には、対照は、変数についての結論を出すためにかかる変数を分離することによって実験における完全性を増強するために使用される。いくつかの実施形態では、対照は、比較物を提供するために試験反応またはアッセイと同時に行われる反応またはアッセイである。例えば、1つの実験において、「試験」(すなわち、試験される変数)が適用される。第2の実験では、「対照」において、試験される変数が適用されない。いくつかの実施形態において、対照は、既存対照(例えば、既に実施された試験もしくはアッセイ、または既に知られている量もしくは結果の)である。いくつかの実施形態では、対照は、印刷または別の方法で保存された記録であるか、またはそれを含む。いくつかの実施形態では、対照は、陽性対照である。いくつかの実施形態では、対照は、陰性対照である。
決定する、測定すること、評価すること、判定すること、アッセイすること、及び分析すること:本明細書で使用する用語「決定すること」、「測定すること」、「評価すること」、判定すること」、「アッセイすること」、及び「分析すること」は、任意の形態の測定を指すために交換可能に使用することができ、ある要素が存在するか否かを判断することを含む。これらの用語には、定量的及び/または定性的決定の両方が含まれる。アッセイは、相対的または絶対的であり得る。例えば、いくつかの実施形態では、「の存在についてアッセイすること」は、存在するものの量を決定すること、及び/またはそれが存在するか存在しないかを決定することであり得る。
操作された:一般に、本明細書で使用される「操作された」という用語は、人の手によって操作されている態様を指す。例えば、細胞または生物は、その遺伝情報が改変されるように操作された場合(例えば、以前は存在しなかった新しい遺伝物質が、例えば、形質転換、交配、体細胞ハイブリダイゼーション、トランスフェクション、形質導入、または他のメカニズムによって導入された場合、または以前に存在した遺伝物質が、例えば、置換または欠失変異によって、または交配プロトコルによって改変されたかまたは除去された場合)、「操作された」と見なされる。一般的な慣行であり、当業者に理解されるように、操作されたポリヌクレオチドまたは細胞の子孫は、実際の操作が以前のエンティティに対して行われたとしても、典型的には依然として「操作された」と呼ばれる。
賦形剤:本明細書で使用される場合、「賦形剤」という用語は、例えば、所望の稠度または安定化効果を提供するかまたはこれらに寄与するために、医薬組成物中に含まれ得る不活性(例えば、非治療)剤を指す。いくつかの実施形態では、好適な薬学的賦形剤としては、例えば、デンプン、グルコース、ラクトース、スクロース、ゼラチン、麦芽、コメ、小麦粉、チョーク、シリカゲル、ステアリン酸ナトリウム、モノステアリン酸グリセロール、タルク、塩化ナトリウム、乾燥脱脂乳、グリセロール、プロピレン、グリコール、水、エタノールなどが挙げられ得る。
発現:本明細書で使用される核酸配列の「発現」という用語は、核酸配列からの任意の遺伝子産物(例えば転写物、例えばmRNA、例えばポリペプチドなど)の生成を指す。いくつかの実施形態では、遺伝子産物は、転写物であり得る。いくつかの実施形態では、遺伝子産物は、ポリペプチドであり得る。いくつかの実施形態では、核酸配列の「発現」は、以下のうちの1つ以上を指す:(1)DNA配列からのRNA鋳型の産生(例えば、転写による);(2)RNA転写物のプロセシング(例えば、スプライシング、編集、5’キャップ形成、及び/または3’末端形成による);(3)ポリペプチドまたはタンパク質へのRNAの翻訳;及び/または(4)ポリペプチドまたはタンパク質の翻訳後修飾。
機能的:本明細書で使用される場合、「機能的」という用語は、特徴付けられる特性及び/または活性を呈する形態で存在するものを示す。例えば、いくつかの実施形態では、「機能的」生体分子は、特徴付けられる特性及び/または活性を呈する形態の生体分子である。いくつかのそのような実施形態では、機能的生体分子は、「非機能的」型が「機能的」分子と同じまたは同等の特性及び/または活性を呈さないという点で、非機能的である別の生体分子と比較して特徴付けられる。生体分子は、1つの機能、2つの機能(すなわち、二機能性)、または多くの機能(すなわち、多機能性)を有し得る。
遺伝子:本明細書で使用される用語「遺伝子」は、遺伝子産物(例えば、ポリペプチド産物などのRNA産物)をコードする染色体中のDNA配列を指す。いくつかの実施形態では、遺伝子は、コード配列(すなわち、特定の産物をコードする配列)を含む。いくつかの実施形態では、遺伝子は、非コード配列を含む。いくつかの特定の実施形態では、遺伝子は、コード(例えば、エクソン)及び非コード(例えば、イントロン)配列の両方を含み得る。いくつかの実施形態では、遺伝子は、1つ以上の調節配列(例えば、プロモーター、エンハンサーなど)及び/または例えば、遺伝子発現の1つ以上の態様(例えば、細胞型特異的発現、誘導性発現など)を制御し得るかまたは影響を与え得るイントロン配列を含み得る。本明細書で使用される「遺伝子」という用語は、一般に、ポリペプチドまたはそのフラグメントをコードする核酸の一部を指す。この用語は、文脈から当業者には明らかであるように、調節配列を任意に包含することができる。この定義は、「遺伝子」という用語の非タンパク質コード発現ユニットへの適用を除外することを意図するものではなく、ほとんどの場合、本明細書で使用される用語は、ポリペプチドをコードする核酸を指すことを明確にすることを意図している。いくつかの実施形態では、遺伝子はポリペプチドをコードし得るが、そのポリペプチドは機能的でなくてもよく、例えば、遺伝子バリアントは、野生型遺伝子と比較して同じように、またはまったく機能しないポリペプチドをコードし得る。いくつかの実施形態では、遺伝子は、いくつかの実施形態では、しきい値レベルを超えて毒性であり得る転写物をコードし得る。いくつかの実施形態では、遺伝子は、ポリペプチドをコードし得るが、そのポリペプチドは、機能的でなくてもよく、及び/またはしきい値レベルを超えて毒性であり得る。
難聴:本明細書で使用される「難聴」という用語は、生体が部分的または完全に聞くことができないことに対して使用され得る。いくつかの実施形態では、難聴は、後天性であり得る。いくつかの実施形態では、難聴は、遺伝であり得る。いくつかの実施形態では、難聴は、遺伝的であり得る。いくつかの実施形態では、難聴は、疾患または外傷(例えば、身体的外傷、難聴をもたらす1つ以上の剤による治療など)の結果であり得る。いくつかの実施形態では、難聴は、1つ以上の既知の遺伝的原因及び/または症候群によるものであり得る。いくつかの実施形態では、難聴は、病因が不明であり得る。いくつかの実施形態では、難聴は、補聴器または他の治療の使用によって軽減される場合もあれば、軽減されない場合もある。
異種:本明細書で使用される場合、用語「異種」は、別の領域及び/または別の分子と比較して、特定の分子の1つ以上の領域に関して使用され得る。例えば、いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドドメインは、ポリペプチドドメインが、(例えば、同じポリペプチド内に)天然には一緒に存在しないことを指す。例えば、ヒトの手によって生成された融合タンパク質内では、あるポリペプチドからのポリペプチドドメインが、異なるポリペプチドからのポリペプチドドメインに融合され得る。このような融合タンパク質では、2つのポリペプチドドメインは、天然には一緒に存在しないため、互いに「異種」と見なされる。
同一性:本明細書で使用される場合、「同一性」という用語は、ポリマー分子間、例えば、核酸分子(例えば、DNA分子及び/またはRNA分子)間、及び/またはポリペプチド分子間の全体的な関連性を指す。いくつかの実施形態では、ポリマー分子は、その配列が少なくとも25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または99%同一である場合、互いに「実質的に同一」であるとみなされる。2つの核酸またはポリペプチド配列のパーセント同一性の計算は、例えば、最適な比較目的で2つの配列をアラインさせることによって行うことができる(例えば、最適なアライメントのために第1及び第2の配列の一方または両方にギャップを導入し、同一でない配列は、比較目的では無視できる)。いくつかの実施形態では、比較目的でアラインされた配列長は、参照配列長の少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、または実質的に100%であり、次いで、対応する位置のヌクレオチドを比較する。第1の配列中の位置が、第2の配列中の対応する位置と同じ残基(例えば、ヌクレオチドまたはアミノ酸)によって占められている場合、2つの分子(すなわち、第1及び第2)は、その位置で同一である。2つの配列間の同一性パーセントは、2つの配列の最適なアラインメントのために導入する必要があるギャップ数及び各ギャップ長を考慮して、比較対象の2つの配列が共有する同一位置の数の関数である。配列の比較及び2つの配列間の同一性パーセントの決定は、数学的アルゴリズムを使用して達成され得る。例えば、2つのヌクレオチド配列間の同一性パーセントは、Meyers and Millerのアルゴリズムを使用して決定することができ(CABIOS,1989,4:11-17,その全体が参照により本明細書に組み込まれる)、これは、ALIGNプログラム(バージョン2.0)に組み込まれている。いくつかの実施形態では、ALIGNプログラムで行われる核酸配列比較は、PAM120重量残基テーブル、ギャップ長ペナルティ12及びギャップペナルティ4を使用する。
改善する、増加する、増強する、阻害する、または減少させる:本明細書で使用される用語「改善する」、「増加する」、「増強する」、「阻害する」、「減少させる」、またはそれらの文法上の等価物は、ベースラインまたは他の参照測定値に対して、相対的な値を示す。いくつかの実施形態では、値は、ベースラインまたは他の参照測定値との統計的有意差である。いくつかの実施形態では、適切な参照測定値は、(例えば、それらの前及び/または後に)特定の剤または治療の存在がないまたは適切な比較参照物質の存在下での他の同等の条件下での(例えば、1つの個体における)特定のシステムでの測定値であるか、またはそれを含み得る。いくつかの実施形態では、適切な参照測定値は、関連する剤または治療の存在下で、特定の方法で応答することが知られているまたは予想される同等のシステムでの測定値であるか、またはそれを含み得る。いくつかの実施形態では、適切な参照は、負の参照である。いくつかの実施形態では、適切な参照は、正の参照である。
核酸:本明細書で使用される場合、「核酸」という用語は、その最も広い意味で、オリゴヌクレオチド鎖に組み込まれる、または組み込むことができる任意の化合物及び/または物質を指す。いくつかの実施形態では、核酸は、ホスホジエステル連結を介してオリゴヌクレオチド鎖に組み込まれる、または組み込まれ得る化合物及び/または物質である。文脈から明らかなように、いくつかの実施形態では、「核酸」は、個々の核酸残基(例えば、ヌクレオチド及び/またはヌクレオシド)を指す。いくつかの実施形態では、「核酸」は、個々の核酸残基を含むオリゴヌクレオチド鎖を指す。いくつかの実施形態では、「核酸」は、RNAであるか、またはRNAを含む。いくつかの実施形態では、「核酸」は、DNAであるか、またはDNAを含む。いくつかの実施形態では、核酸は、1つ以上の天然の核酸残基であるか、それらを含むか、またはそれらからなる。いくつかの実施形態では、核酸は、1つ以上の核酸類似体であるか、それらを含むか、またはそれらからなる。いくつかの実施形態では、核酸類似体は、ホスホジエステル主鎖を利用しないという点で核酸とは異なる。あるいは、またはさらに、いくつかの実施形態では、核酸は、ホスホジエステル結合ではなく、1つまたは複数のホスホロチオエート及び/または5’-N-ホスホラミダイト結合を有する。いくつかの実施形態では、核酸は、1つ以上の天然ヌクレオシド(例えば、アデノシン、チミジン、グアノシン、シチジン、ウリジン、デオキシアデノシン、デオキシチミジン、デオキシグアノシン、及びデオキシシチジン)であるか、それらを含むか、またはそれらからなる。いくつかの実施形態では、核酸は、1つ以上のヌクレオシド類似体(例えば、2-アミノアデノシン、2-チオチミジン、イノシン、ピロロ-ピリミジン、3-メチルアデノシン、5-メチルシチジン、C-5プロピニル-シチジン、C-5プロピニル-ウリジン、2-アミノアデノシン、C5-ブロモウリジン、C5-フルオロウリジン、C5-ヨードウリジン、C5-プロピニル-ウリジン、C5-プロピニル-シチジン、C5-メチルシチジン、2-アミノアデノシン、7-デアザアデノシン、7-デアザグアノシン、8-オキソアデノシン、8-オキソグアノシン、0(6)-メチルグアニン、2-チオシチジン、メチル化塩基、インタカレート塩基、及びそれらの組み合わせ)であるか、これらを含むか、これらからなる。いくつかの実施形態では、核酸は、天然の核酸中のものと比較して、1つ以上の修飾糖(例えば、2’-フルオロリボース、リボース、2’-デオキシリボース、アラビノース、及びヘキソース)を含む。いくつかの実施形態では、核酸は、RNAまたはタンパク質などの機能的遺伝子産物をコードするヌクレオチド配列を有する。いくつかの実施形態では、核酸は、1つ以上のイントロンを含む。いくつかの実施形態では、核酸は、天然源からの単離、相補的鋳型をベースにした重合による酵素的合成(in vivoまたはin vitro)、組換え細胞または系における複製、及び化学合成のうちの1つ以上によって調製される。いくつかの実施形態では、核酸は、少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、20、225、250、275、300、325、350、375、400、425、450、475、500、600、700、800、900、1000、1500、2000、2500、3000、3500、4000、4500、5000、またはそれ以上の残基長である。いくつかの実施形態では、核酸は、部分的または全体的に一本鎖である。いくつかの実施形態では、核酸は、部分的または全体的に二本鎖である。いくつかの実施形態では、核酸は、ポリペプチドをコードする、またはポリペプチドをコードする配列に相補的な少なくとも1つのエレメントを含むヌクレオチド配列を有する。いくつかの実施形態では、核酸は、酵素活性を有する。
作動可能に連結:本明細書で使用される場合、記載されている構成要素が、それらの意図される様式でそれらが機能することを可能にする関係にある並置を指す。機能的エレメントに「作動可能に連結された」制御エレメントは、制御エレメントと適合する条件下で機能エレメントの発現及び/または活性が達成されるように結合される。いくつかの実施形態では、「作動可能に連結された」制御エレメントは、目的のコーディングエレメントと隣接している(例えば、共有結合により連結されている)。いくつかの実施形態では、制御エレメントは、目的の機能的エレメントに対してトランスで、または別の方法で作用する。いくつかの実施形態では、「作動可能に連結された」という用語は、調節配列と異種核酸配列との間の機能的連結を指し、異種核酸配列の発現をもたらす。例えば、第1の核酸配列は、第1の核酸配列が第2の核酸配列との機能的関係へと配置されるとき、第2の核酸配列と「作動可能に連結される」。いくつかの実施形態では、例えば、機能的連結は、転写制御を含み得る。例えば、プロモーターは、そのプロモーターがコード配列の転写または発現に影響を及ぼす場合、コード配列に作動可能に連結される。作動可能に連結されるDNA配列は、互いに隣接しており、例えば、2つのタンパク質コード領域を繋げることが必要な場合、同じリーディングフレームにある。
医薬組成物:本明細書で使用される場合、「医薬組成物」という用語は、活性剤が1つ以上の薬学的に許容される担体と一緒に製剤化される組成物を指す。いくつかの実施形態では、活性剤は、関連する集団に投与された場合に所定の治療効果を達成する統計的に有意な確率を示す治療レジメンでの投与に適した単位用量で存在する。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、例えば投与するため、例えば、水性もしくは非水性溶液もしくは懸濁液である、例えば、注射用製剤に適合させたもの、または外耳道に投与するように設計された液滴など、固体または液体形態で投与するために特別に製剤化され得る。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、特定の臓器もしくは区画への注射、例えば耳への直接注射、または全身への注射、例えば静脈内注射による投与用に製剤化され得る。いくつかの実施形態では、製剤は、ドレンチ(水性または非水性の溶液または懸濁液)、錠剤、ボーラス、粉末、顆粒、ペースト、カプセル、粉末などであるか、またはそれらを含み得る。いくつかの実施形態では、活性剤は、単離された、精製された、または純粋な化合物であるか、またはそれらを含み得る。
薬学的に許容される:本明細書で使用される場合、例えば、本明細書で開示される医薬組成物を製剤化するために使用される担体、希釈剤、または賦形剤に関して使用され得る「薬学的に許容される」という用語は、担体、希釈剤、または賦形剤は、組成物の他の成分と適合性があり、そのレシピエントに有害ではないことを意味する。
薬学的に許容される担体:本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される担体」という用語は、主題化合物をある器官または身体の部分から、別の器官もしくは身体の部分に搬送または輸送することに関与する液体または固体の充填剤、希釈剤、賦形剤、または溶媒封入材料などの薬学的に許容される材料、組成物、またはビヒクルを意味する。各々の担体は、製剤の他の成分と適合し、かつ患者に有害でないという意味において「許容可能」でなければならない。薬学的に許容される担体として機能し得る材料のいくつかの例としては、ラクトース、グルコース及びスクロースなどの糖、トウモロコシデンプン及びジャガイモデンプンなどのデンプン、カルボキシメチルセルロースナトリウム、エチルセルロース及び酢酸セルロースなどのセルロース及びその誘導体;粉末トラガント;麦芽、ゼラチン、タルク;ココアバター及び坐剤ワックスなどの賦形剤;落花生油、綿実油、紅花油、ごま油、オリーブ油、とうもろこし油、大豆油などの油;プロピレングリコールなどのグリコール、グリセリン、ソルビトール、マンニトール、ポリエチレングリコールなどのポリオール;オレイン酸エチル、ラウリン酸エチルなどのエステル類;寒天;水酸化マグネシウム及び水酸化アルミニウムなどの緩衝剤;アルギン酸;発熱物質非含有水;等張生理食塩水、リンゲル液;エチルアルコール及びpH酸緩衝液、ポリエステル、ポリカーボネート及び/またはポリ無水物;ならびに医薬品製剤中に使用される他の非毒性適合物質が挙げられる。
ポリアデニル化:本明細書で使用される「ポリアデニル化」は、ポリアデニリル部分またはその修飾バリアントがメッセンジャーRNA分子へ共有結合により連結することを指す。真核生物の場合、ほとんどのメッセンジャーRNA(mRNA)分子は、3’末端でポリアデニル化される。いくつかの実施形態では、3’ポリ(A)テールは、酵素であるポリアデニル酸ポリメラーゼの作用によってプレmRNAに付加されるアデニンヌクレオチドの長い配列(例えば、50、60、70、100、200、500、1000、2000、3000、4000、または5000)である。高等真核生物では、ポリ(A)テールが特定の配列であるポリアデニル化シグナルまたは「ポリ(A)配列」を含む転写産物に付加され得る。ポリ(A)テール及びそれに結合したタンパク質は、エキソヌクレアーゼによる分解からmRNAを保護するのを助ける。ポリアデニル化は、転写終結、mRNAの核外への搬出、及び翻訳にも影響を及ぼし得る。典型的には、ポリアデニル化は、DNAをRNAに転写した直後に核内で生じるが、加えて、細胞質内でもさらに後に生じ得る。転写が終結した後、mRNA鎖は、RNAポリメラーゼに関連するエンドヌクレアーゼ複合体の作用によって切断され得る。切断部位は、切断部位付近にある塩基配列AAUAAAの存在によって特徴付けられ得る。mRNAが切断された後、アデノシン残基が切断部位の空いている3’末端に付加され得る。本明細書で使用される場合、「ポリ(A)配列」とは、mRNAのエンドヌクレアーゼ切断及び切断されたmRNAの3’末端への一連のアデノシンの付加を誘発する配列である。
ポリペプチド:本明細書で使用される場合、「ポリペプチド」という用語は、典型的にはペプチド結合によって連結される残基(例えば、アミノ酸)の任意のポリマー鎖を指す。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、天然に存在するアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、天然に存在しないアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ヒトの手の作用によって設計される及び/または生成されるように操作されたアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、天然アミノ酸、非天然アミノ酸、またはその両方を含むか、またはそれらからなり得る。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ポリペプチドのN末端、ポリペプチドのC末端、またはそれらの任意の組み合わせにおいて、1つ以上のペンダント基または他の修飾、例えば、1つ以上のアミノ酸側鎖の修飾または結合を含み得る。いくつかの実施形態では、そのようなペンダント基または修飾は、アセチル化、アミド化、脂質化、メチル化、peg化など、例えば、それらの組み合わせなどであり得る。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、L-アミノ酸、D-アミノ酸、またはその両方を含むことができ、当技術分野で知られている様々なアミノ酸修飾または類似体のいずれかを含むことができる。いくつかの実施形態では、有用な修飾は、例えば、末端アセチル化、アミド化、メチル化などであるか、またはそれらを含み得る。いくつかの実施形態では、タンパク質は、天然アミノ酸、非天然アミノ酸、合成アミノ酸、及びそれらの組み合わせを含み得る。「ペプチド」という用語は、一般に、約100アミノ酸未満、約50アミノ酸未満、20アミノ酸未満、または10アミノ酸未満の長さを有するポリペプチドを指すために使用される。いくつかの実施形態では、タンパク質は、抗体、抗体フラグメント、その生物学的活性部分、及び/またはその特徴的部分である。
ポリヌクレオチド:本明細書で使用される「ポリヌクレオチド」という用語は、核酸の任意のポリマー鎖を指す。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、RNAであるか、またはRNAを含む。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、DNAであるか、またはDNAを含む。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、1つ以上の天然の核酸残基であるか、それらを含むか、またはそれらからなる。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、1つ以上の核酸類似体であるか、それらを含むか、またはそれらからなる。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチド類似体は、ホスホジエステル主鎖を利用しないという点で核酸とは異なる。あるいは、またはさらに、いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、ホスホジエステル結合ではなく、1つ以上のホスホロチオエート及び/または5’-N-ホスホラミダイト結合を有する。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、1つ以上の天然ヌクレオシド(例えば、アデノシン、チミジン、グアノシン、シチジン、ウリジン、デオキシアデノシン、デオキシチミジン、デオキシグアノシン、及びデオキシシチジン)であるか、それらを含むか、またはそれらからなる。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、1つ以上のヌクレオシド類似体(例えば、2-アミノアデノシン、2-チオチミジン、イノシン、ピロロ-ピリミジン、3-メチルアデノシン、5-メチルシチジン、C-5プロピニル-シチジン、C-5プロピニル-ウリジン、2-アミノアデノシン、C5-ブロモウリジン、C5-フルオロウリジン、C5-ヨードウリジン、C5-プロピニル-ウリジン、C5-プロピニル-シチジン、C5-メチルシチジン、2-アミノアデノシン、7-デアザアデノシン、7-デアザグアノシン、8-オキソアデノシン、8-オキソグアノシン、0(6)-メチルグアニン、2-チオシチジン、メチル化塩基、インタカレート塩基、及びそれらの組み合わせ)であるか、これらを含むか、これらからなる。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、天然の核酸中のものと比較して、1つ以上の修飾糖(例えば、2’-フルオロリボース、リボース、2’-デオキシリボース、アラビノース、及びヘキソース)を含む。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、RNAまたはタンパク質などの機能的遺伝子産物をコードするヌクレオチド配列を有する。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、1つ以上のイントロンを含む。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、天然源からの単離、相補的鋳型をベースにした重合による酵素的合成(in vivoまたはin vitro)、組換え細胞または系における複製、及び化学合成のうちの1つ以上によって調製される。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、20、225、250、275、300、325、350、375、400、425、450、475、500、600、700、800、900、1000、1500、2000、2500、3000、3500、4000、4500、5000、またはそれ以上の残基長である。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、部分的または全体的に一本鎖である。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、部分的または全体的に二本鎖である。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、ポリペプチドをコードする、またはポリペプチドをコードする配列の相補体である少なくとも1つのエレメントを含むヌクレオチド配列を有する。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、酵素活性を有する。
タンパク質:本明細書で使用される「タンパク質」は、ポリペプチド(すなわち、ペプチド結合によって互いに連結された少なくとも2つのアミノ酸の鎖)を指す。タンパク質は、アミノ酸以外の部分(例えば、糖タンパク質、プロテオグリカンであってよい)を含み得、かつ/またはさもなければ処理もしくは修飾され得る。当業者は、「タンパク質」が、細胞によって産生される(シグナル配列を有する、または有さない)完全なポリペプチド鎖であり得るか、またはその特徴的部分であり得ることを理解する。当業者は、タンパク質が、例えば、1つ以上のジスルフィド結合によって連結されるか、または他の手段によって会合される2つ以上のポリペプチド鎖を含む場合があり得ることをさらに理解する。
組換え:本明細書で使用される場合、「組換え」という用語は、組換え手段によって設計、操作、調製、発現、作出、製造、及び/または単離されたポリペプチドを指すことを意図している。例えば、宿主細胞にトランスフェクトされた組換え発現構築物を使用して発現されるポリペプチド;組換えコンビナトリアルヒトポリペプチドライブラリーから単離されたポリペプチド;ポリペプチドまたは1つ以上の構成成分(複数可)、部分(複数可)、エレメント(複数可)、またはドメイン(複数可)をコードする及び/またはその発現を指示する1つ以上の遺伝子、または遺伝子構成成分を発現するようにトランスジェニックであるか、または操作されている動物(例えば、マウス、ウサギ、ヒツジ、魚、など)から単離されたポリペプチド;及び/または選択された核酸配列エレメントを互いにスプライシングまたはライゲーションすること、選択された配列エレメントを化学的に合成すること、及び/またはポリペプチド、またはその1つ以上の成分(複数可)、部分(複数可)、エレメント(複数可)、またはドメイン(複数可)の発現をコード化及び/または指示する核酸を生成することを含む任意の他の手段によって調製、発現、作出または単離されたポリペプチドが挙げられる。いくつかの実施形態では、そのような選択された配列エレメントのうちの1つ以上が自然界に見出される。いくつかの実施形態では、そのような選択された配列エレメントのうちの1つ以上がin silicoで設計される。いくつかの実施形態では、1つ以上のそのような選択された配列エレメントは、例えば、目的の供給源生物(例えば、ヒト、マウスなど)の生殖細胞系中など、天然または合成供給源からの既知の配列エレメントの(例えば、in vivoまたはin-vitroにおける)変異誘発の結果生じる。
参照:本明細書で使用される場合、「参照」という用語は、比較が行われる標準または対照を表す。例えば、いくつかの実施形態では、目的の剤、動物、個体、集団、サンプル、配列または値を、参照または対照の剤、動物、個体、集団、サンプル、配列または値と比較する。いくつかの実施形態では、目的の試験または決定と実質的に同時に、参照または対照を試験及び/または決定する。いくつかの実施形態では、参照または対照は、有形の媒体において任意に具現化された過去の参照または対照である。典型的には、当業者に理解されるように、参照または対照は、判定中のものと同等の条件または環境下で決定されるかまたは特徴付けられる。当業者は、特定の可能な参照または対照への依存及び/または比較を正当化するのに十分な類似性が存在する場合を理解するであろう。いくつかの実施形態では、参照は、負の対照参照である。いくつかの実施形態では、参照は、正の対照参照である。
調節エレメント:本明細書で使用される用語「調節エレメント」または「調節配列」は、1つ以上の特定の遺伝子の発現を何らかの方法で調節するDNAの非コード領域を指す。いくつかの実施形態では、そのような遺伝子は、所与の調節エレメントに接近しているか、またはその「近傍」にある。いくつかの実施形態では、そのような遺伝子は、所与の調節エレメントからかなり離れて位置する。いくつかの実施形態では、調節エレメントは、1つ以上の遺伝子の転写を損なうかまたは増強する。いくつかの実施形態では、調節エレメントは、調節される遺伝子に対してシスに位置し得る。いくつかの実施形態では、調節エレメントは、調節される遺伝子に対してトランスに位置し得る。例えば、いくつかの実施形態では、調節配列は、調節配列に作動可能に連結された遺伝子産物の発現を調節する核酸配列を指す。いくつかのそのような実施形態では、この配列は、遺伝子産物の発現を調節するエンハンサー配列及び他の調節エレメントであり得る。
サンプル:本明細書で使用される場合、「サンプル」という用語は、典型的には、目的の供給源から得られるかまたは由来する材料のアリコートを指す。いくつかの実施形態では、目的の供給源は、生物学的または環境的供給源である。いくつかの実施形態では、目的の供給源は、微生物(例えば、ウイルス)、植物、または動物(例えば、ヒト)などの細胞または生物であるか、またはそれらを含み得る。いくつかの実施形態では、目的の供給源は、生物学的組織または体液であるか、またはそれらを含む。いくつかの実施形態では、生物学的組織または体液は、羊水、房水、腹水、胆汁、骨髄、血液、母乳、脳脊髄液、耳垢、乳び、チャイム(chime)、射精液、内リンパ液、滲出液、糞便、胃酸、胃液、リンパ、粘液、心膜液、外リンパ、腹腔液、胸膜液、膿、粘膜分泌物、唾液、皮脂、精液、血清、恥垢、痰、滑液、汗、涙、尿、膣分泌物、硝子体液、嘔吐、及び/またはその組み合わせまたは成分(複数可)であり得るか、またはそれらを含んでもよい。いくつかの実施形態では、生体液は、細胞内液、細胞外液、血管内液(血漿)、間質液、リンパ液、及び/または経細胞液であり得るか、またはそれを含み得る。いくつかの実施形態では、生体液は、植物滲出液であるか、またはそれを含み得る。いくつかの実施形態では、生物学的組織またはサンプルは、例えば、吸引、生検(例えば、細針または組織生検)、スワブ(例えば、口腔、鼻、皮膚、または膣スワブ)、スクレイピング、手術、洗い流しまたは洗浄(例えば、気管支肺胞、管、鼻、眼、口腔、子宮、膣、または他の洗い流しまたは洗浄)によって得ることができる。いくつかの実施形態では、生物学的サンプルは、個体から得られた細胞であるか、またはそれを含む。いくつかの実施形態では、サンプルは、任意の適切な手段によって目的の供給源から直接得られる「一次サンプル」である。いくつかの実施形態では、文脈から明らかなように、用語「サンプル」は、一次サンプルを処理することによって(例えば、一次サンプルの1つ以上の成分を除去することによって、及び/または1つ以上の剤を一次サンプルに添加することによって)得られる調製物を指す。例えば、半透膜によるろ過。そのような「処理されたサンプル」は、例えば、サンプルから抽出された、または核酸の増幅または逆転写、特定の成分の単離及び/または精製などの1つ以上の技術に一次サンプルを供することによって得られた核酸またはタンパク質を含み得る。
対象:本明細書で使用される「対象」という用語は、生物、典型的には哺乳動物(例えば、ヒト、いくつかの実施形態では、出生前のヒト形態など)を指す。いくつかの実施形態では、対象は、関連する疾患、障害または状態に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、疾患、障害、または状態に罹患しやすい。いくつかの実施形態では、対象は、疾患、障害または状態の1つ以上の症状または特徴を示す。いくつかの実施形態では、対象は、疾患、障害、または状態のいかなる症状もしくは特徴も示さない。いくつかの実施形態では、対象は、疾患、障害、または状態に対する感受性またはリスクに特徴的な1つ以上の特徴を有するヒトである。いくつかの実施形態では、対象は、患者である。いくつかの実施形態では、対象は、診断及び/または治療法が施される、及び/または施されてきた個体である。
実質的に:本明細書で使用される場合、「実質的に」という用語は、目的の特徴または特性の全体またはほぼ全体の範囲または程度を呈する定性的条件を指す。当業者は、生物学的及び化学的現象が、たとえあったとしても、完了に至ること、及び/または完了するまで進行すること、または絶対的結果を達成もしくは回避することはめったにないことを理解するであろう。したがって、「実質的に」という用語は、多くの生物学的及び化学的現象に固有の潜在的な完全性の欠如を捉えるために本明細書で使用される。
治療:本明細書で使用される場合、用語「治療」(「治療する」または「治療すること」ともいう)は、特定の疾患、障害、及び/または状態の1つ以上の症状、特徴、及び/または原因を部分的または完全に軽減する、改善する、除去する、逆転させる、緩和させる、阻害する、発症を遅延させる、その重症度を軽減する、及び/または発生率を低下させる治療法の任意の投与を指す。いくつかの実施形態では、そのような治療は、関連疾患、障害、及び/もしくは状態の兆候を示さない対象、ならびに/または疾患、障害、及び/または状態の初期徴候のみを示す対象の治療であってよい。代替的にまたは付加的に、そのような治療は、関連疾患、障害、及び/または状態のうちの1つ以上の確立された徴候を示す対象の治療であってよい。いくつかの実施形態では、治療は、関連する疾患、障害、及び/または状態を患っていると診断された対象の治療であり得る。いくつかの実施形態では、治療は、所与の疾患、障害、及び/または状態の発症リスクの増加と統計的に相関する1つ以上の感受性因子を有することが知られている対象のものであり得る。
バリアント:本明細書で使用される場合、「バリアント」という用語は、何らかの形で別のバージョンとは異なる何か、例えば遺伝子配列の型を指す。バリアントであるかを判断するには、典型的には、参照型が選択され、バリアントはその参照型とは異なる。いくつかの実施形態では、バリアントは、野生型配列と同じまたは異なる(例えば、増加または減少した)レベルの活性または機能を有することができる。例えば、いくつかの実施形態では、バリアントは、例えば阻害性核酸、例えばmiRNAによる分解に抵抗するように、例えば、コドン最適化されている場合、野生型配列と比較して改善された機能を有することができる。そのようなバリアントは、本明細書では機能獲得バリアントと呼ばれる。いくつかの実施形態では、バリアントは、活性もしくは機能性の低下もしくは消失、または負の結果をもたらす活性の変化を有する(例えば、細胞死につながる慢性脱分極をもたらす電気活性の増加)。このようなバリアントは、本明細書では機能喪失バリアントと呼ばれる。例えば、いくつかの実施形態では、CLRN1遺伝子配列は、機能的タンパク質をコードし、CLRN1遺伝子を含むゲノムを有する種のメンバーの大部分中に存在する野生型配列である。いくつかのそのような実施形態では、機能獲得バリアントは、野生型CLRN1遺伝子配列と比較して、1つ以上のヌクレオチドの相違を含むCLRN1の遺伝子配列であり得る。いくつかの実施形態では、機能獲得バリアント、その対応する野生(例えば、非コドン最適化)型よりも改善された特性(例えば、分解に対する感受性が低い、例えば、miRNA媒介分解に対する感受性が低い)を有し得る転写産物またはポリペプチドをコードするコドン最適化配列である。いくつかの実施形態では、機能喪失バリアントは、野生型転写産物及び/またはポリペプチドと比較して、何らかの形で欠陥がある(例えば、機能の低下、機能しない)転写産物またはポリペプチドをもたらす1つ以上の変化を有する。例えば、いくつかの実施形態では、CLRN1配列における変異は、非機能的またはそうでなければ欠陥のあるクラリン1タンパク質をもたらす。
Aは、単純化させた内因性AAVゲノムを示す。Bは、CLRN1遺伝子を発現することができる単純化させた組換えAAV(rAAV)構築物を示す。 CLRN1遺伝子を含む例示的なrAAV構築物を示す。 CLRN1遺伝子を含む例示的なrAAV構築物を示す。 CLRN1遺伝子を含む例示的なrAAV構築物を示す。 CLRN1遺伝子を含む例示的なrAAV構築物を示す。 CLRN1遺伝子を含む例示的なrAAV構築物を示す。 CLRN1遺伝子を含む例示的なrAAV構築物を示す。 眼の網膜構造の例示的な概略図を示す。 ヒトの耳の代表的な解剖学的構造の概略図である。 内耳の概略図であり、左側の前庭系と右側の蝸牛(鼓室階、前庭階)との間の外リンパ液の連続性を示している。Aは、コイル状の蝸牛の概略図である。示されている蝸牛の回転数は、マウスの内耳の代表的なものを示す。Bは、蝸牛の断面を示す模式図である。概略図では、鼓室階及び前庭階が外リンパで満たされ、中階は、内リンパで満たされている(Talaei2019、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。 本明細書に記載の投与方法の略図である。Aは、本明細書に記載の送達デバイスの画像を含む(例えば、WO2021/242926を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。図示の送達デバイスは、挿入深さをガイドするストッパーを備え、蝸牛窓膜を通して注入される流体を蝸牛内投与することを目的としている。Bは、鼓室階から前庭階へ(蝸牛頂点における蝸牛孔での連通を介して)注射され、その後、前庭窓内の送達デバイスのアブミ骨底内に設置した小孔を通って蝸牛から出る流体の予想される流れを示す画像を含む(Talei 2019、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。 蝸牛窓膜送達を介した新生児マウスにおける天然に存在するAAV血清型及びAAV Anc80バリアントのin vivo蝸牛形質導入を示す代表的な蛍光画像を含む。マウス(P1)に、増強されたGFP(eGFP)をコードする構築物を含む様々なAAVキャプシド(AAV1、AAV2、AAV8、AAV6[図示せず]、及びAAV Anc80)を注射した。ファロイジンを使用してアクチンを標識した。eGFP陽性内有毛細胞(IHC)及び外有毛細胞(OHC)の定量化では、増強されたGFPをコードする構築物(rAAV Anc80-eGFP)を含むrAAV Anc80の送達後に、基部から頂点まで約90~100%の形質導入効率が示された(Landegger 2017、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。 蝸牛窓膜送達を介した新生児マウスにおけるrAAV Anc80粒子のin-vivo前庭形質導入を示す代表的な蛍光画像を含む。マウス(P1)にAAV Anc80-eGFPを注射した。ファロイジン染色を使用してアクチンを標識した。形質導入は、Aの卵形嚢のI型及びII型有毛細胞の両方中、ならびにBの半規管稜の細胞中で観察された(Landegger 2017、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。 後半規管送達を介した成体マウスにおけるrAAV Anc80粒子のin-vivo蝸牛形質導入を示す代表的な蛍光画像を含む。マウス(7週齢)にrAAV Anc80-eGFP粒子を注射した。Aは、注射された中間蝸牛軸部分の低倍率画像を含み、これは、(I)と称するIHC、(O)と称するOHC、(SL)と称するらせん縁、(RM)と称するライスネル膜、及び(SG)と称するらせん神経節中でのeGFPシグナルを示す。B1は、蝸牛の先端領域からのコルチ器の高倍率図を含む。B2は、蝸牛の中央領域からのコルチ器の高倍率図を含む。eGFP陽性細胞の定量化では、IHCの約100%が形質導入されたのに対し、OHC形質導入は頂点から底部にかけて減少したことが示された。Cは、eGFPシグナルがらせん神経節内の細胞のサブセット(ニューロン及びサテライトグリア細胞)中で検出されたことを示す低倍率図である(Suzuki 2017、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。 後半規管送達を介した成体マウスにおけるrAAV Anc80-eGFPのin-vivo前庭形質導入を示す代表的な蛍光画像を含む。マウス(7週齢)にrAAV Anc80-eGFPを注射した。A1及びA2は、卵形嚢及び球形嚢の両方におけるeGFPシグナルを示す、前庭を通る断面の低倍率図を含む。Bは、支持細胞及び有毛細胞におけるeGFP発現を示す、前庭末端器官(卵形嚢)を通る高倍率断面図を含む。Cは、支持細胞及び有毛細胞におけるeGFP発現を示す、前庭末端器官(膨大部稜)を通る高倍率断面図を含む。白塗り矢印は、形質導入された支持細胞の例を示す(有毛細胞は、示されていない)(Suzuki 2017、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。 成体マウスのrAAV Anc80バリアントと比較して、内耳開窓術(canal fenestration)による蝸牛窓膜送達を介して、天然に存在するAAV2血清型のin-vivo蝸牛及び前庭形質導入を示す代表的な蛍光画像を含む。マウス(生後4週間)に、eGFPをコードする異なるAAV粒子(AAV2及びrAAV Anc80をここに示し、AAV1、AAV8、及びAAV9は示さない)を注射した。AAV2と比較して、rAAV Anc80媒介形質導入は、IHC及びOHC形質導入に匹敵する率を示した(A1対A2)が、らせん神経節細胞(B1対B2)及び球形嚢の有毛細胞(C1対C2:マウント全体、D1対D2:切片)ではより広い形質導入を示した(Omichi 2020、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。 本明細書に記載の例示的なrAAV-CLRN1構築物の形質導入を用いた、CLRN1タンパク質のHEK細胞の発現を示すウエスタンブロットを含む。レーンは、図の上部に沿って示し、タンパク質の予測サイズは、図の左側に示す。「+」を記したレーンは、PNGaseF処理を示す。レーン1:予め染色したPageRuler(商標)タンパク質ラダー。レーン2:非トランスフェクト/陰性対照。レーン3:非トランスフェクト/陰性対照(+)。レーン4:感染多重度(MOI)6.7x10のrAAV-CLRN1野生型(wt)粒子による形質導入。レーン5:感染多重度(MOI)6.7x10のrAAV-CLRN1wt粒子(+)による形質導入。レーン6:感染多重度(MOI)1.3x10のrAAV Anc80-CLRN1wt粒子による形質導入。レーン7:感染多重度(MOI)1.3x10のrAAV Anc80-CLRN1wt粒子(+)による形質導入。レーン8:感染多重度(MOI)2.3x10のrAAV Anc80-CLRN1wt粒子による形質導入。レーン9:感染多重度(MOI)2.3x10のrAAV Anc80-CLRN1wt粒子(+)による形質導入。レーン10:感染多重度(MOI)2.3x10のrAAV Anc80-CLRN1-コドン修飾粒子による形質導入。レーン11:感染多重度(MOI)2.3x10のrAAV Anc80-CLRN1-コドン修飾粒子(+)による形質導入。バンドは、CLRN1「iso1」またはアイソフォームAがグリコシル化または脱グリコシル化されているか否かも示す。 Aは、本明細書に開示されるクラリン1タンパク質を含むrAAV Anc80粒子(rAAV Anc80-CLRN1)による野生型(WT)新生児(P2)マウスの蝸牛外植片の形質導入後の蝸牛外植片中でのRNA発現のグラフ表示である。RNA発現分析を示し、rAAV Anc80-CLRN1粒子(配列番号64による構築物)を受けた外植片の細胞中でのCLRN1をコードするmRNAの発現を実証する。ビヒクルを受けた外植片(「モック」)では発現は検出されなかった。結果は、平均的な発現を示す。Bは、CLRN1タンパク質発現WT新生マウスを示す蛍光画像を示す。 本開示の態様による、流体を内耳に送達するためのデバイスの斜視図を示す。 本開示の態様による、曲げ針サブアセンブリの側面図を示す。 本開示の態様による、流体を内耳に送達するためのデバイスの斜視図を示す。 本開示の態様による、デバイスの遠位端に連結された曲げ針サブアセンブリの斜視図を示す。
難聴
一般に、耳は、外耳、中耳、内耳、聴覚神経(聴神経)、及び聴覚系(耳から脳に移動するときの音を処理する)を含むものとして記載され得る。耳は、音を感知するのみでなく、平衡感覚を維持する助けにもなる。したがって、いくつかの実施形態では、内耳の障害は、難聴、耳鳴り、めまい、平衡失調、またはそれらの組み合わせを引き起こし得る。
難聴は、遺伝的要因、環境的要因、または遺伝的要因と環境的要因との組み合わせの結果であり得る。耳鳴り-聴覚系での幻聴(リンリン音、ブンブン音、チューチュー音、ハミング音、またはビート音)を有するヒトの約半数は、特定の音の周波数及び音量範囲に対して過敏であるか、許容範囲が減少している。これは、聴覚過敏(hyperacusis(また、hyperacousisとしても綴られる))としても知られている。様々な非症候性及び症候性難聴が当業者に知られている(例えば、それぞれアッシャー症候群、DFNB4、及びペンドレッド症候群)。聴力障害または難聴の環境的原因としては、例えば、特定の投薬、出生前または出生後の特定の感染症、及び/または長期にわたる大きな騒音への曝露が挙げられ得る。いくつかの実施形態では、難聴は、騒音、耳毒性剤、老人性難聴、疾患、感染、または耳の特定の部分に影響を与えるがんに起因し得る。いくつかの実施形態では、虚血性損傷は、病態生理学的メカニズムを介して難聴を引き起こし得る。いくつかの実施形態では、内因性異常、例えば、蝸牛の解剖学的構造または生理学において重要な役割を果たす遺伝子への先天性変異、または支持細胞及び/または有毛細胞における遺伝的または解剖学的変化が、難聴の原因または一因となり得る。
難聴及び/または重度難聴は、最も一般的なヒトの感覚障害の1つであり、多くの理由で生じ得る。いくつかの実施形態では、対象は難聴を持って、または聴力を持たずに生まれ得るが、他の対象は、時間の経過とともに緩徐に聴力を喪失し得る。およそ3,600万人の米国成人においてある程度の難聴が報告されており、60歳を超えると3名に1名、85歳を超えると半数のヒトが難聴を経験している。1,000名の小児のうちおよそ1.5名が極度の難聴を持って生まれ、さらに1,000名の小児のうち別の2~3名が一部難聴を持って生まれる(Smith et al.,2005,Lancet 365:879-890、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。これらの症例の半分超は、遺伝的基盤に起因している(Di Domenico,et al.,2011,J.Cell. Physiol.226:2494-2499、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。
難聴の治療は現在、軽度から重度の難聴に対する聴力増幅及び重度から極度の難聴に対する人工内耳で構成されている(Kral and O’Donoghue,2010,N.Engl.J.Med.363:1438-1450,その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。この分野での近年の研究では、老人性難聴、騒音による損傷、感染症、及び耳毒性など、最も一般的な形態の難聴に適用できる蝸牛有毛細胞の再生に焦点を当てている。聴力の問題の原因を修復及び/または緩和できる遺伝子療法などの効果的な治療が依然として必要とされている(例えば、WO2018/039375、WO2019/165292、及びWO2020/097372を参照、それぞれが参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。
いくつかの実施形態では、非症候性難聴及び/または重度難聴は、他の徴候及び症状と関連していない。いくつかの実施形態では、症候性難聴及び/または重度難聴は、身体の他の部分の異常と関連して発生する。遺伝性難聴及び/または重度難聴の症例のおよそ70%~80%は、非症候性であり、残りの症例は、多くの場合、特定の遺伝的症候群によって引き起こされる。非症候性重度難聴及び/または難聴は、様々な遺伝パターンを有し得、あらゆる年齢で発生し得る。非症候性重度難聴及び/または難聴の種類は、一般的に遺伝パターンに従って命名される。例えば、常染色体優性形態は、DFNA、常染色体劣性形態は、DFNB、X連鎖形態は、DFNと称される。また、各種類には、最初に説明された順に番号が付けられている。例えば、DFNA1は、最初に記述された常染色体優性型の非症候性重度難聴であった。遺伝的に原因となる難聴及び/または重度難聴の症例の75%~80%は、常染色体劣性パターンで遺伝する。これは、各細胞中の遺伝子の両方のコピーが変異を有することを意味する(例えば、アッシャー症候群)。通常、常染色体劣性難聴及び/または重度難聴を有する個体の各親は、変異遺伝子の1つのコピーの保因者であるが、この形態の難聴の影響は受けない。非症候性難聴及び/または重度難聴症例の別の20%~25%は、常染色体優性であり、これは、各細胞中の改変された遺伝子の1つのコピーが、結果として重度難聴及び/または難聴となるのに十分であることを意味する。常染色体優性重度難聴及び/または難聴を有するヒトは、ほとんどの場合、重度難聴及び/または難聴を有する親から遺伝子の改変されたコピーを受け継いでいる。重度難聴及び/または難聴の症例の1~2%がX連鎖型の遺伝パターンを示す。これは、この状態の原因となる変異遺伝子がX染色体(2つの性染色体のうちの1つ)上に位置していることを意味する。X連鎖型非症候性難聴及び/または重度難聴の男性は、同じ遺伝子変異のコピーを受け継ぐ女性よりも、生涯の早期により重度の難聴を発症する傾向がある。X連鎖遺伝の特徴は、父親がX連鎖形質を息子に渡すことができないことである。ミトコンドリアDNAの変化に起因するミトコンドリア非症候性重度難聴は、米国では症例の1%未満で生じる。改変ミトコンドリアDNAは、母親からすべての息子及び娘に受け継がれる。このタイプの重度難聴は、父親からは遺伝しない。症候性及び非症候性重度難聴及び/または難聴の原因は複雑である。研究者は、改変したときに、症候性及び/または非症候性重度難聴及び/または難聴に関連する30を超える遺伝子を特定した。しかし、これらの遺伝子の一部は、完全に特徴が明らかになっていない。同じ遺伝子中での異なる変異は、様々な種類の重度難聴及び/または難聴に関連している可能性があり、いくつかの遺伝子は、症候性及び非症候性の両方の重度難聴及び/または難聴に関連している。
いくつかの実施形態では、重度難聴及び/または難聴は、伝音性(外耳道または中耳から発生する)、感音性(内耳または聴神経から発生する)、または混合型であり得る。いくつかの実施形態では、非症候性重度難聴及び/または難聴は、内耳中の構造への損傷によって引き起こされる永久的難聴(感音性重度難聴)に関連する。いくつかの実施形態では、感音性難聴は、有毛細胞機能の不良に起因し得る。いくつかの実施形態では、感音性聴覚障害は、第8脳神経(前庭蝸牛神経)または脳の聴覚部分に関与する。いくつかのそのような実施形態では、脳の聴覚中枢のみが影響を受ける。このような状況では、皮質性重度難聴が発生する可能性があり、音は通常のしきい値で聞こえ得るが、知覚される音の質が非常に低く、発話を理解できない。中耳中での変化に起因する難聴は、伝音性難聴と呼ばれる。非症候性重度難聴及び/または難聴のいくつかの形態は、混合性難聴と呼ばれる内耳及び中耳の両方中の変化を伴う。小児が発話を習得する前に存在する難聴及び/または重度難聴は、言語習得前または先天性に分類できる。発話の発達後に生じる難聴及び/または重度難聴は、言語習得後として分類することができる。症候性または非症候性難聴に関連するほとんどの常染色体劣性遺伝子座は、言語習得前の重度から極度の難聴を引き起こす。
当業者に知られているように、有毛細胞は、脊椎動物の耳の聴覚系及び前庭系の両方に対する感覚受容体である。有毛細胞は、環境中での動きを感知し、哺乳動物では、有毛細胞は、耳の蝸牛内のコルチ器中にある。哺乳動物の耳には、内有毛細胞及び外有毛細胞の2種類の有毛細胞があることが知られている。外有毛細胞は、有毛細胞束の機械的動きまたは有毛細胞体の電気駆動による動きのいずれかを通じて、低レベルの音の周波数を増幅できる。内有毛細胞は、蝸牛液の振動を、聴神経が脳に伝達する電気信号に変換する。いくつかの実施形態では、有毛細胞は、出生時に異常であり得るか、個体の生涯の間に損傷を受け得る。いくつかの実施形態では、外有毛細胞は再生され得る。いくつかの実施形態では、内有毛細胞は、疾患または損傷後に再生することができない。いくつかの実施形態では、感音性難聴は、有毛細胞中の異常によるものである。
当業者に知られているように、有毛細胞は、単独では発生せず、それらの機能は、まとめて支持細胞と呼ぶことができる多種多様な細胞によって支持されている。支持細胞は、数多くの機能を果たし、これらに限定されないが、ヘンセン細胞、ダイテルス細胞、柱細胞、クラウジス細胞、内指節細胞、及び境界細胞など、複数の細胞型が挙げられる。いくつかの実施形態では、感音性難聴は、支持細胞中の異常によるものである。いくつかの実施形態では、支持細胞は、出生時に異常であり得るか、個体の生涯の間に損傷を受け得る。いくつかの実施形態では、支持細胞は再生され得る。いくつかの実施形態では、特定の支持細胞は、再生できない場合がある。
視力低下
目は、動物に視覚を提供し、視覚的な詳細を受け取って処理し、視覚とは関係のないいくつかの光応答機能を可能にする視覚系の器官である。一般に、目は光を検出し、ニューロンの電気化学インパルスに変換する。哺乳動物などの高等生物では、目は複雑な光学系であり、周囲環境から光を収集し、ダイヤフラムを介してその強度を調節し、水晶体の調整式アセンブリを介して画像を形成し、この画像を一連の電気信号に変換し、これらの信号を、視神経を介して視覚野及び脳の他の領域に目をつなぐ複雑な神経経路を介して脳に伝達させる。眼の解剖学的構造としては、一般に、角膜、瞳孔、虹彩、水晶体、前眼房、後眼房、涙液、角膜縁、毛様体筋、懸垂靭帯、硝子体房、強膜、脈絡膜、網膜、黄斑/中心窩、視神経、及び盲点が挙げられる。
視力低下は、遺伝的要因、環境的要因、または遺伝的要因と環境的要因との組み合わせの結果であり得る。視力低下とは、目のかすみ、曇り、複視、盲点、夜間視力の低下、及び周辺視の低下(トンネル視)など、見る能力のあらゆる低下である。視力低下は、片眼または両眼に影響を与える可能性があり、徐々にまたは突然発生する可能性があり、部分的または完全であり得る。視力障害または視力低下の環境的原因には、例えば、特定の投薬、出生前または出生後の特定の感染症、及び/または物体と眼との物理的接触への曝露が挙げられ得る。いくつかの実施形態では、内因性異常、例えば、眼の解剖学的構造または生理学において重要な役割を果たす遺伝子への先天性変異、または支持細胞及び/または眼細胞における遺伝的または解剖学的変化が、難聴の原因または一因となり得る。
視力低下は、ヒトの感覚障害の1つであり、多くの理由で生じ得る。いくつかの実施形態では、対象は視力低下を持って、または視力を持たずに生まれ得るが、他の対象は、時間の経過とともに緩徐に視力を喪失し得る。およそ2,690万人の米国成人ではある程度の視力低下が報告され、65歳以上の780万人の米国成人が、重大な視力低下を経験していることが報告されている。
網膜色素変性症は、網膜細胞(例えば、光受容細胞)の劣化による視力低下を引き起こす遺伝性障害である。通常、網膜の桿体細胞が最初に影響を受け、初期の夜盲(夜盲症)と周辺視の漸進的な低下につながる。他の場合では、黄斑中の錐体細胞の早期変性が起こり、中心視の低下につながる。場合によっては、中心窩視力が損なわれ、「ドーナツ視力」につながる。中心視及び周辺視は無傷であるが、視力が損なわれている中心領域の周りに輪が存在する。
網膜色素変性症の症状としては、夜間に見えにくいこと及び周辺視(側視)の低下が挙げられる。周辺視が悪化するにつれて、ヒトは、「トンネル視」を経験し得る。完全な失明の可能性はあるが、一般的ではない。症状の発症は一般に緩徐であり、多くの場合、小児期に発症する。網膜炎は一般に、ヒトの両親から受け継がれる。50を超える遺伝子中の変異が関与している。根底にあるメカニズムには、目の奥にある桿体型光受容細胞の進行性低下が含まれる。この後、一般的に錐体光受容細胞が喪失する。診断は、暗色の色素沈着を見つける網膜の検査によって行われる。他の裏付けとなる検査としては、網膜電図、視野検査、または遺伝子検査が挙げられ得る(例えば、「Facts About Retinitis Pigmentosa」.National Eye Institute.May 2014、2020年4月18日に検索、その内容全体が本明細書に組み込まれる)。
現在、網膜色素変性症の治療法はない。この問題に対処するための取組には、ロービジョンエイドの使用、携帯用照明の使用、または歩行訓練(orientation and mobility training)が含まれ得る。ビタミンAパルミテートのサプリメントは、悪化を遅らせるのに有用であり得る。人工視覚システムは、重度疾患を有する特定のヒトの選択肢となり得る。網膜色素変性症は、4,000人に1人が罹患していると推定されている(例えば、「Facts About Retinitis Pigmentosa」.National Eye Institute.May 2014、2020年4月18日に検索、その内容全体が本明細書に組み込まれる、及びOpenshaw,Amanda(Feb 2008),「Understanding Retinitis Pigmentosa」,University of Michigan Kellogg Eye Center.2017年8月29日のオリジナルからアーカイブ、その内容全体が参照により本明細書に組み込まれる、を参照)。
当業者に知られているように、眼は様々な細胞型から構成されている。眼と脳をつなぐ視神経中にある細胞は、電気信号を脳に伝え、脳が信号を画像として理解できるようにする細胞である。網膜細胞(例えば、光受容細胞)は目の奥に位置し、光を電気信号に変換する。他の細胞としては、ヒトが色及び形状を知覚できるようにする桿体細胞及び錐体細胞が挙げられる。眼中でのCLRN1の発現は、眼の以下の例示的な層及び/または細胞において以下のように同定した。
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アッシャー症候群
アッシャー症候群は、聴覚及び視覚の両方に影響を与える状態である。アッシャー症候群も平衡に影響を与え得る。アッシャー症候群のいくつかの主要症状は、重度難聴または難聴、及び網膜色素変性症などの眼疾患である。
アッシャー症候群の重度難聴または難聴は、内耳内の有毛細胞(音受容細胞)の異常な発達によって引き起こされ得る。小児のアッシャー症候群では、一般的に、アッシャー症候群のタイプに応じて、中等度から極度の難聴を持って出生する。一般的ではないが、アッシャー症候群による難聴は、思春期中またはそれ以降に現れる。アッシャー症候群は、前庭有毛細胞、重力と頭の動きを検出する感覚細胞の異常な発達により、深刻な平衡感覚の問題を引き起こし得る。
網膜色素変性症は、最初は夜盲症と、網膜中の細胞の進行性変性による周辺視の低下を引き起こす。これは、目の奥にある光に敏感な組織であり、視覚にとって重要である。網膜色素変性症が進行すると、中心視のみが残るまで視野が狭くなり、この状態をトンネル視と称する。黄斑中の嚢胞及び白内障(水晶体の混濁)は、アッシャー症候群のヒトの中心視の早期低下を引き起こし得る。
アッシャー症候群は、100,000名あたりおよそ4~17名が罹患しており、全遺伝性の重度難聴-失明症例の約50%を占める。この状態は、すべての重度難聴児の3~6%を占め、さらに耳の聞こえない小児の別の3~6%を占めると考えられている(例えば、Boughman,J.A.,et al.(1983),「Usher syndrome:definition and estimate of prevalence from two high-risk populations」,Journal of Chronic Diseases,36(8),595-603;Kimberling,W.,et al.(2010),「Frequency of Usher syndrome in two pediatric populations:implications for genetic screening of deaf and hard of hearing children」,Genetics in Medicine,12(8),512-516;Berson,E.L.(1998),「Treatment of retinitis pigmentosa with vitamin A」,Digital Journal of Ophthalmology,4(7)を参照、これらの開示は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。
アッシャー症候群は、遺伝であり、これは、遺伝子を介して親から子供に受け継がれることを意味する。ヒトは、それぞれの親から1つずつ、2つの遺伝子のコピーを受け継ぐ。遺伝子は、時に改変するかまたは変異する。変異した遺伝子は、細胞の異常な発達または作用を引き起こし得る。
アッシャー症候群は、常染色体劣性障害として遺伝する。「常染色体」とは、男性及び女性が同じように障害を有する可能性があり、いずれかの性別の子供にも同じようにそれを受け渡す可能性があることを意味する。「劣性」とは、子供が同じ欠陥遺伝子のコピーを2つ(それぞれの親から1つずつ)受け継いだ場合にのみ、この状態が発生することを意味する。1つ異常なアッシャー遺伝子を有するヒトは、この障害を有しないが、50%の確率で異常な遺伝子を各子供に受け渡す保因者である。
アッシャー症候群の診断には、患者の病歴、ならびに聴力、平衡感覚、及び視力の検査に関する適切な質問が含まれる。治療の奏効を改善するには、早期診断が重要である。眼科専門医は、網膜色素変性症の徴候について網膜を検査するために、散瞳薬を使用できる。視野検査は、周辺視を測定し、アッシャー症候群の診断を補助し得る。網膜電図は、網膜内の眼の光感受性細胞の電気的応答を測定する。光コヒーレンストモグラフィーは、黄斑嚢胞性変化の判定に有用であり得る。ビデオ眼振検査は、平衡感覚の問題を示し得る不随意眼球運動を測定する。聴覚検査では、様々な範囲の周波数において聴覚感度を測定する。
アッシャー症候群には、I型、II型、III型の3つのタイプがある。アッシャー症候群III型のヒトは、生まれつき重度難聴ではないが、進行性難聴を経験し、ほぼ半数が平衡感覚障害を有する。例えば、小児アッシャー症候群III型は、出生時の聴力は正常で、平衡感覚は正常から正常に近く、これらが、年齢とともに低下し得る。聴力及び視力の低下は様々である。アッシャー症候群III型の小児は、多くの場合、思春期までに難聴を発症し、成人期の中盤から後半までに補聴器を必要とする。夜盲症も通常、思春期中に始まる。10代後半から20代前半にかけて盲点が現れる。法的盲も中年までに発生する。
遺伝子検査は、アッシャー症候群の診断を援助し得る。例えば、CLRN1遺伝子中の変異は、アッシャー症候群III型に関連付けられている。CLRN1は、内耳及び網膜の発達及び維持に重要なタンパク質であるクラリン1をコードする。しかし、このタンパク質の機能、及びクラリン1中での変異がどのようにして難聴及び視力低下を引き起こすかについては、理解が進んでいない。
現在、アッシャー症候群には治癒法がない。治療には、聴覚、視覚、平衡感覚の問題の対処が含まれる。早期診断は、難聴及び視力低下の重症度、ならびに子供の年齢及び能力を考慮した教育プログラムの調整を助ける。治療及び伝達サービスとしては、補聴器、聴覚支援デバイス、人工内耳、聴覚(聴力)訓練、及び/またはアメリカ手話の習得が挙げられ得る。自立生活訓練としては、平衡間隔の問題に対する歩行訓練、ブライユ点字指導、ロービジョンサービスが挙げられ得る。
National Eye Institute及びFoundation Fighting Blindnessによって支援されている長期臨床試験の結果によれば、ビタミンAは、網膜色素変性症の進行を遅らせ得る。この研究に基づくと、一般的形態の網膜色素変性症を有する成人は、パルミチン酸形態のビタミンAを毎日15,000IU(国際単位)補給することで恩恵が得られ得る。
CLRN1
CLRN1遺伝子は、内耳の有毛細胞(例えば、内耳有毛細胞、外耳有毛細胞)及び網膜中に発現するタンパク質である「クラリン1」(CLRN1)をコードする。
例えば、CLRN1遺伝子は、サイトゾルN末端、複数のヘリックス膜貫通ドメイン、及び小胞体膜保持シグナルTKGHをC末端に含むタンパク質をコードする。CLRN1は、有毛細胞及び/眼細胞機能に必要であり、神経活性化に関連すると考えられている(例えば、Geng et al.,「Usher syndrome IIIA gene clarin-1 is essential for hair cell function and associated neural activation」Hum Mol Genet.2009 Aug 1;18(15):2748-60.doi:10.1093/hmg/ddp210.Epub 2009 May 3(その内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)を参照;また例えば、Dinculescu et al.,「AAV-mediated Clarin-1 expression in the mouse retina: implications for USH3A gene therapy」PLoS One.2016;11(2):e0148874,2016年2月16日にオンラインで公開(その内容全体が参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
ヒトCLRN1遺伝子は、染色体3q25.1に位置している。少なくとも8個のエクソン(エクソン0、0b、1、1b、2、2b、3a、及び3bと呼ばれる)を含み、約47キロベース(kb)を含む(例えば、Vastinsalo et al.(2011)Eur J Hum Genet 19(1):30-35(その全体が参照により本明細書に組み込まれる);NCBIアクセッション番号NG_009168.1(その全体が参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントがこの遺伝子について同定されている(例えば、NCBI Gene ID:7401を参照(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる))。
CLRN1遺伝子中の様々な変異は、アッシャー症候群III型(例えば、アッシャー症候群III型A(MIM番号606397;Fields et al.(2002)Am J Hum Genet 71:607-617(その全体が参照により本明細書に組み込まれる);及びJoensuu et al.(2001)Am J Hum Genet 69:673-684を参照(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる))及び網膜色素変性症(例えば、Khan et al.(2011)Ophthalmology 118:1444-1448を参照(その全体が参照により本明細書に組み込まれる))と関連付けられている。アッシャー症候群III型を引き起こす変異は、主にCLRN1のエクソン3内で見つかる。アッシャー症候群III型重度難聴は、CLRN1欠損マウスを生成することによってモデル化することができる(例えば、Geng et al.(2017)Sci Rep 7(1):13480を参照(その全体が参照により本明細書に組み込まれる))。アッシャー症候群III型に関連する例示的なCLRN1変異としては、T528G、M120K、M44K、N48K、及びC40Gが挙げられる。
網膜色素変性症に関連する例示的なCLRN1変異としては、L154W及びP31Lが挙げられる(例えば、Khan et al.(2011)Ophthalmology 118:1444-1448を参照(その全体が参照により本明細書に組み込まれる))。
難聴を有する対象において検出されたCLRN1遺伝子中のさらなる例示的な変異、及びCLRN1をコードする核酸の配列決定を行う方法は、例えば、Fields et al.(2002)Am J Hum Genet 71:607-617,Joensuu et al.(2001)Am J Hum Genet 69:673-684,Adato et al.(2002)Europ J Hum Genet 10:339-350,Aller et al.(2004),Clin Genet 66:525-529に記載されており、これらのそれぞれは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。遺伝子中の変異を検出する方法は、当技術分野で周知されている。このような技法の非限定的な例としては、リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)、PCR、シークエンシング、サザンブロット法、及びノーザンブロット法が挙げられる。
クラリン1は、有毛細胞と呼ばれる内耳中の感覚細胞など、身体のいくつかの領域で発見されている。これらの細胞は、音及び動きの信号を脳に伝達するのに役立つ。このタンパク質は、眼の裏側を覆う光感知組織である網膜中でも活性化されている。クラリン1の機能は明らかになっていないが、試験では、クラリン1は内耳内及び網膜内の神経細胞(ニューロン)間のコミュニケーションに関与していることが示唆されている。クラリン1は、細胞間コミュニケーションが生じるニューロン間の接合部であるシナプスの発達及び機能に重要であり得る。CLRN1遺伝子の他の名称としては、USH3、USH3A、USH3A_Human、アッシャー症候群3A、及びアッシャー症候群3型タンパク質が挙げられる。
CLRN1中の変異は、難聴及び重度難聴と関連付けられている(例えば、Albert et al.,Eur.J.Hum.Genet.14:773-779,2006;及びQing et al.,Genet.Test Mol.Biomarkers 19(1):52-58,2015を参照、その各々は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。CLRN1遺伝子中の変異は、クラリン1の構造または機能を改変させ、その内因性機能を破壊させる。難聴に関連するCLRN1中の変異がいくつか報告されている。例えば、点変異A123D、N48K、Y176X、及びL54PがUSH3患者において報告されている(例えば、Isosomppi et al.,「Disease-causing mutations in the CLRN1 gene alter normal CLRN1 protein trafficking to the plasma membrane」Molecular vision 15(191-121):1806-18,2009年9月発行を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。遺伝子中の変異を検出する方法は、当技術分野で周知されている。このような技法の非限定的な例としては、リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)、PCR、サンガーシーケンシング、次世代シーケンシング、サザンブロット法、及びノーザンブロット法が挙げられる。
CLRN1遺伝子及びコードされているクラリン1タンパク質中の変異は、アッシャー症候群III型と関連している。アッシャー症候群III型は、進行性感音性難聴、前庭機能障害、及び網膜色素変性症を特徴とする常染色体劣性疾患である。アッシャー症候群III型(USH3[MIM#276902])は、アッシャー症候群の臨床的サブタイプの中で独特であり、言語習得後の進行性難聴、及び網膜色素変性症(RP)の遅発性発症、及び前庭機能の進行性喪失を示している(例えば、Kimberling WJ,Orten D,Pieke-Dahl S(2000)Genetic heterogeneity of Usher syndrome.Adv Otorhinolaryngol 56:11-18を参照(その内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる))。疾患遺伝子座は、元来、マーカーWI-17533と486D12SP6の間の約700kbの領域である染色体3q25にマッピングされた(例えば、Joensuu et al.1996を参照、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。近年の刊行物(例えば、Joensuu T,Blanco G,Pakarinen L,Sistonen P,Kaariainen H,Brown S,Chapelle A,Sankila EM(1996)Refined mapping of the Usher syndrome type III locus on chromosome 3,exclusion of candidate genes,and identification of the putative mouse homologous region.Genomics 38:255-263を参照(その内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる))では、USH3遺伝子座は、推定創始者変異のフィンランドの保因者におけるハプロタイプ及び連鎖不平衡分析によって、107G19CA7とD3S3625との間の250kbの領域に割り当てられた。
野生型CLRN1は、トランスフェクトされたBHK-21細胞の原形質膜に局在する糖タンパク質である。変異体CLRN1タンパク質は、誤って局在している。USH3の病因の一部は、細胞内輸送の欠陥、及び変異体CLRN1タンパク質の安定性の低下に関連し得ることが示唆されている(例えば、Isosomppi et al.,「Disease-causing mutations in the CLRN1 gene alter normal CLRN1 protein trafficking to the plasma membrane」Molecular vision 15(191-121):1806-18,2009年9月発行を参照(その全体が参照により本明細書に組み込まれる))。
CLRN1ポリヌクレオチド
とりわけ、本開示は、ポリヌクレオチド、例えばCLRN1遺伝子またはその特徴的部分を含むポリヌクレオチド、ならびにそのようなポリヌクレオチドを含む組成物、及びそのようなポリヌクレオチド及び/または組成物を利用する方法を提供する。
いくつかの実施形態では、CLRN1遺伝子またはその特徴的部分を含むポリヌクレオチドは、DNAまたはRNAであり得る。いくつかの実施形態では、DNAは、ゲノムDNAまたはcDNAであり得る。いくつかの実施形態では、RNAは、mRNAであり得る。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、CLRN1遺伝子のエクソン及び/またはイントロンを含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子産物は、CLRN1遺伝子またはその特徴的部分を含むポリヌクレオチドから発現する。いくつかの実施形態では、そのようなポリヌクレオチドの発現は、1つ以上の制御エレメント(例えば、プロモーター、エンハンサー、スプライス部位、ポリアデニル化部位、翻訳開始部位など)を利用することができる。したがって、いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるポリヌクレオチドは、1つ以上の制御エレメントを含むことができる。
いくつかの実施形態では、CLRN1遺伝子は、哺乳動物CLRN1遺伝子である。いくつかの実施形態では、CLRN1遺伝子は、マウスCLRN1遺伝子である。いくつかの実施形態では、CLRN1遺伝子は、霊長類CLRN1遺伝子である。いくつかの実施形態では、CLRN1遺伝子は、ヒトCLRN1遺伝子である。いくつかの実施形態では、CLRN1遺伝子は、ヒトCLRN1アイソフォームである。ヒトCLRN1アイソフォームバリアントは、例えば、Vastinsalo et al.(2011)Eur J Hum Genet 19(1):30-35(その全体が参照により本明細書に組み込まれる)に記載され、NCBIアクセッション番号NG_009168.1であり、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。例示的なヒトCLRN1 cDNA配列は、配列番号1、配列番号2、配列番号3、または配列番号4の配列であるか、またはその配列を含む。例示的なヒトCLRN1ゲノムDNA配列は、配列番号5内に見出される。非翻訳領域を含む例示的なヒトCLRN1 cDNA配列は、配列番号6、7、8、または9の配列であるか、またはその配列を含む。
例示的なヒトCLRN1 cDNAコード配列(アイソフォームA)(配列番号1)
ATGCCAAGCCAACAGAAGAAAATCATTTTTTGCATGGCCGGAGTGTTCAGTTTTGCATGTGCCCTCGGAGTTGTGACAGCCTTGGGGACACCGTTGTGGATCAAAGCCACTGTCCTCTGCAAAACGGGAGCTCTGCTCGTCAATGCCTCAGGGCAGGAGCTGGACAAGTTTATGGGTGAAATGCAGTACGGGCTTTTCCACGGAGAGGGTGTGAGGCAGTGTGGGTTGGGAGCAAGGCCCTTTCGGTTCTCATTTTTTCCAGATTTGCTCAAAGCAATCCCAGTGAGCATCCACGTCAATGTCATTCTCTTCTCTGCCATCCTTATTGTGTTAACCATGGTGGGGACAGCCTTCTTCATGTACAATGCTTTTGGAAAACCTTTTGAAACTCTGCATGGTCCCCTAGGGCTGTACCTTTTGAGCTTCATTTCAGGCTCCTGTGGCTGTCTTGTCATGATATTGTTTGCCTCTGAAGTGAAAATCCATCACCTCTCAGAAAAAATTGCAAATTATAAAGAAGGGACTTATGTCTACAAAACGCAAAGTGAAAAATATACCACCTCATTCTGGGTCATTTTCTTTTGCTTTTTTGTTCATTTTCTGAATGGGCTCCTAATACGACTTGCTGGATTTCAGTTCCCTTTTGCAAAATCTAAAGACGCAGAAACAACTAATGTAGCTGCAGATCTAATGTAC
例示的なヒトCLRN1 cDNAコード配列(アイソフォームC)(配列番号2)
ATGCAGGCCCTGCAGCAGCAACCAGTTTTTCCAGATTTGCTCAAAGCAATCCCAGTGAGCATCCACGTCAATGTCATTCTCTTCTCTGCCATCCTTATTGTGTTAACCATGGTGGGGACAGCCTTCTTCATGTACAATGCTTTTGGAAAACCTTTTGAAACTCTGCATGGTCCCCTAGGGCTGTACCTTTTGAGCTTCATTTCAGGCTCCTGTGGCTGTCTTGTCATGATATTGTTTGCCTCTGAAGTGAAAATCCATCACCTCTCAGAAAAAATTGCAAATTATAAAGAAGGGACTTATGTCTACAAAACGCAAAGTGAAAAATATACCACCTCATTCTGGCTGACTAAAGGCCACAGCTGA
例示的なヒトCLRN1 cDNAコード配列(アイソフォームD)(配列番号3)
ATGCCAAGCCAACAGAAGAAAATCATTTTTTGCATGGCCGGAGTGTTCAGTTTTGCATGTGCCCTCGGAGTTGTGACAGCCTTGGGGACACCGTTGTGGATCAAAGCCACTGTCCTCTGCAAAACGGGAGCTCTGCTCGTCAATGCCTCAGGGCAGGAGCTGGACAAGTTTATGGGTGAAATGCAGTACGGGCTTTTCCACGGAGAGGGTGTGAGGCAGTGTGGGTTGGGAGCAAGGCCCTTTCGGTTCTCATTTTTTCCAGATTTGCTCAAAGCAATCCCAGTGAGCATCCACGTCAATGTCATTCTCTTCTCTGCCATCCTTATTGTGTTAACCATGGTGGGGACAGCCTTCTTCATGTACAATGCTTTTGGAAAACCTTTTGAAACTCTGCATGGTCCCCTAGGGCTGTACCTTTTGAGCTTCATTTCAGTTGCCCTTTGGCTGCCAGCTACCAGGCACCAGGCTCAAGGCTCCTGTGGCTGTCTTGTCATGATATTGTTTGCCTCTGAAGTGAAAATCCATCACCTCTCAGAAAAAATTGCAAATTATAAAGAAGGGACTTATGTCTACAAAACGCAAAGTGAAAAATATACCACCTCATTCTGGGTCATTTTCTTTTGCTTTTTTGTTCATTTTCTGAATGGGCTCCTAATACGACTTGCTGGATTTCAGTTCCCTTTTGCAAAATCTAAAGACGCAGAAACAACTAATGTAGCTGCAGATCTAATGTACTGA
例示的なヒトCLRN1 cDNAコード配列(アイソフォームE)(配列番号4)
ATGCCAAGCCAACAGAAGAAAATCATTTTTTGCATGGCCGGAGTGTTCAGTTTTGCATGTGCCCTCGGAGTTGTGACAGCCTTGGGGACACCGTTGTGGATCAAAGCCACTGTCCTCTGCAAAACGGGAGCTCTGCTCGTCAATGCCTCAGGGCAGGAGCTGGACAAGTTTATGGGTGAAATGCAGTACGGGCTTTTCCACGGAGAGGGTGTGAGGCAGTGTGGGTTGGGAGCAAGGCCCTTTCGGTTCTCATGCTATTTTCTTGACCCCTTCATGGGACTCCCAACAGGGGTACCCCATTTACTCAGCCTGCCCTGCTCAACCTCTTGCAGGAGGGAGCACACGAGTGAACGAGTGCAGGAACCAGCTGGCTGCTTTAGTGCTGTGAGGAGTAAACTCCATGCAGGCCCTGCAGCAGCAACCAGTTTTTCCAGATTTGCTCAAAGCAATCCCAGTGAGCATCCACGTCAATGTCATTCTCTTCTCTGCCATCCTTATTGTGTTAACCATGGTGGGGACAGCCTTCTTCATGTACAATGCTTTTGGAAAACCTTTTGA
例示的なヒトCLRN1 cDNAコード配列(コドン最適化)(配列番号19)
ATGCCTAGCCAGCAGAAGAAAATCATCTTCTGCATGGCCGGCGTGTTCAGCTTCGCCTGTGCTCTGGGAGTTGTGACAGCCCTGGGAACCCCTCTGTGGATCAAAGCCACAGTGCTGTGCAAGACAGGCGCCCTGCTGGTTAATGCCTCTGGCCAAGAGCTGGACAAGTTCATGGGCGAGATGCAGTACGGCCTGTTCCATGGCGAAGGCGTCAGACAGTGTGGCCTGGGAGCCAGACCTTTCAGATTCAGCTTCTTCCCAGACCTGCTGAAGGCTATCCCCGTGTCCATCCACGTGAACGTGATCCTGTTCAGCGCCATCCTGATCGTGCTGACAATGGTCGGAACCGCCTTCTTCATGTACAACGCCTTCGGCAAGCCCTTCGAGACACTGCATGGACCTCTGGGCCTGTACCTGCTGAGCTTTATCAGCGGCAGCTGTGGCTGCCTGGTCATGATTCTGTTCGCCAGCGAAGTGAAGATCCACCACCTGAGCGAGAAGATCGCCAACTACAAAGAGGGCACCTACGTCTACAAGACCCAGTCCGAGAAGTACACCACCAGCTTTTGGGTTATCTTCTTCTGTTTCTTCGTGCACTTCCTGAACGGCCTGCTGATCAGACTGGCCGGCTTCCAGTTTCCATTCGCCAAGAGCAAGGACGCCGAAACCACAAACGTGGCCGCCGATCTGATGTAC
例示的なヒトCLRN1ゲノムDNA配列(配列番号5)
AGGAGATACTTGAAGGCAGTTTGAAAGACTTGTTTTACAGATTCTTAGTCCAAAGATTTCCAATTAGGGAGAAGAAGCAGCAGAAAAGGAGAAAAGCCAAGTATGAGTGATGATGAGGCCTTCATCTACTGACATTTAACCTGGCGAGAACCGTCGATGGTGAAGTTGCCTTTTCAGCTGGGAGCTGTCCGTTCAGCTTCCGTAATAAATGCAGTCAAAGAGGCAGTCCCTTCCCATTGCTCACAAAGGTCTTGTTTTTGAACCTCGCCCTCACAGAAGCCGTTTCTCATCATGCCAAGCCAACAGAAGAAAATCATTTTTTGCATGGCCGGAGTGTTCAGTTTTGCATGTGCCCTCGGAGTTGTGACAGCCTTGGGGACACCGTTGTGGATCAAAGCCACTGTCCTCTGCAAAACGGGAGCTCTGCTCGTCAATGCCTCAGGGCAGGAGCTGGACAAGTTTATGGGTGAAATGCAGTACGGGCTTTTCCACGGAGAGGGTGTGAGGCAGTGTGGGTTGGGAGCAAGGCCCTTTCGGTTCTCATGTAAGTAGCAATTGCATTTGAGTTATTTAATGCTTTAGGCAGACTCTTCCCAGTGTTGCGAGGAATTATATTTGAGAATTTTGCCGTGTTTACTGCAGGACTTTTTAAATCGGTGTGAACCATATGAAAAACCTATGACTCTGAGCAATTTCTTCTTCCTAGTTTTTATTATTTTATACTTGCTTTTTATTATAATATAGAGTTAATTCATTGTTACATAATTAAGGTTTTTGGAAATATTGGCAATTAAGATGCTTAAGTATTAATATTTATGTAAAAAATTATGGAGTCTTTTTAAAAAAGTAAACTTGGGGAAATAGGAAAGCTGTAAAGAATGATCTTTATGCTTTTTGTTCTTTATAAAAAGAACCAAGGTCATGGGCTCCGTATTTAACCAGGTTGCCACCTTTCTCATGATTTTGTTTCCTGCTCCCCACTCCCTCCCATTATTCCTGCTAAGACCTTTCCTGCTGCTAAATATTCAGTTTTCATTTTTAACTAATTTGGAATCATTTGGCTATAGAAATTTAAAATGATCTGCTGTGCTAACTGGGAAAGAAATGGATGCCTATTTAGTATAGAACATTTTAAACTGATTGACCTGCAAATCATGTAGAGAATATGAGAGAGATTTTCTTGTTGTGATTTTTGTGAAATGGAAGTGTAATCCACAGTATTTATAACCTGTTTATCTTAAGAAGAGAATTTTTAAAAATTACCATGTGAATAGGCAACTCATTAAATGAAAATTAATAGGAAGTCATTTGTTATATCTCTTACAACACACATTCAGAAGTTATTATTATTTCAGAAGGGCTGGTTTGGAACAACCTTATGAAGACACAGTCAGTAAATTACTGCATAAATCACTCTTCAGGAAAGGAGGTTACCAACTGAAGCATTTAAAATGAATTATTATTTTGCCCAGGTTTTTTTTTTCTTTCTAGTATAGGTAGAAGGCTAAATTAATTGAATTTATTATTAACATATGCAGTGCCTAATTAAATTTCAGTGCTGGTCTATTTATATTTCTGCAACATTCCTTATATCTTCTTAGCAGTCATTGGACACCAACCTTCAGCTCACATAGGTTACTAAGTGATATGAATTTTCATAGGGCTCCAGAAAATTTCCAAGAATTGGTTGTTAGCTTTTTAATTGATGAAGTGGATACCAGTTCTTTTCACTGAATGGCTTTTATTCATTAAGGTAATGGGGCTGTTAGAGTTGCTTAGTTTTCCTGGGGAAGGGGAAGGAAGAAAACAAAGCAGAATGTCATGTGATATGCAACTGTATTAAAAAACCGAAAAGGAAAAAAGTTGAGAGAGATGATTTAACCGTGAGTCACCGGCAGCCAAAGCGTGAGTAAAGCTTCTCACAGATGAATTTAGACAAAAGCGGAGAAGGTACTGGTGAATTTTCTGGAGCCTTTACATTTTCTACAGTGAAATGGAGATAAACTTTACTCATGCCATAGGACATGTTTCAAAACAATAATAAGATGTTTTCTGAACACTTACTACATACTAAGCACTTTATATGCTTTGTCTCATTTAATCCTTACACAGCCACATTCTTCTGGGGTTTAGCGAATGATTTTTGTGGTTGTGTCCTATGCTTGTCCTGTCTAAGGATGAAGTTGTTCTAATTGGGTGCCCCTCCTTTTGCTTTCTGTGAGGACTTGCAGAACTGGTGGGGTTTAAACAGTACCCTCACTTATCTCACAGAATTTCATTAGCTCCCAGATACCCCTGACATTCTCCCCCTAGCCTAGTGAAGAAAATCTTCCATTTACTTGTTCATTCTGCAGTGACAGCTCCATCAATATACAATAGACTATACATATTAAGTGTACTGTATATACTATACATGTTAAAAATCTCATTCATTTTGGTGAGGCCCAGCTAAGAATACTTACAGTAGAGCTTTTTTTTTTTTCCTAAGCATAAAAGTATCTTTTTCAATGCAGCATGAGACAGAGTTGGGAAAACCAAAATAAATAGATCCAATGGACTCCCCAAAGAGGATAATATTCATTTAAATAAACACCCCTCTCAGTGTTAAAACTTTCTAATCAACATGCCTTTGGGACACATTGCACCCTCAAAGTTTACACTCCCATTGCAACGCAGCTTTGTGGTTCACGTTTTTTCCATTCAGAATGTCATTACCCTGTCAATGATGTTTCATCAACGTTTGCTTGGATGAGAATCCTCTGATATTCTTCCTGATAGAAATGTATAAGCCCTGTTCATATAAATGAATAAAAGATCTAACCTTACTTTCTCAGTAGTGGCTTCCTTGGAGCAAAAAGCAGGGACCTCCAGAGAGCTCAGGTGGATGACTCTTTTCTGTTTCTTCCAGAGCTCAACTTACAATTAGTGCACAATTCATTTCCCAGAATGTCTTCTTTCTTATTGTGCCTTTAGAAAGTTATTAAGCAAACATTTGAATTCACAGAATCTTACCAGTGTAAGAGGAATGGAAAAGGTAACTTATCAAGGTAACAATCACTTCGTGGCCAGTTTTTTCGGCTCACTGCAACTACCCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAAAGACAGGGTTTCACCATGTGGGCCAGGCTGGTCTCATGGCAAGTTTTCTTTGTGTTGTCATGTTATTATCAATTAATAGGAATTTATATTTCAGTTCTGTTAGGTGGATAAACACTATTTTGCATACCTAAATGTTTCATTTATATCAGCACTGGCCAATAAAAATATACTATAAGCAGGCCGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACTTTTGGGAGGCCAACACTTTGGGAGGACACAGGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACCTGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGCGGGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCACGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCTCGCCACTGCACTCCAGCCTTGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATTACAAGCCACAAGCCACATATGTACTTTTAAATGTCCTAGTAGCCATATTAGAAAACAAAAGTAAAAAGGAATAGATGAAATTAATTTTAATGATTTTTTTAAACCCAAGATATCCAAAATATTATCATTTTAACATATAATTAAAAATTTATTGAGATGTTTTACATTGTTTTTTTTTTTCTTGACGCTGTCTTGGAAATCTAGAGTGTATTTTACATTTACATTACATCTAATTCAGTCTAGCCACATTTCACATGCTCATTTTTTTGTGTGTGGTTTTATGGAGCAGAGAGTTTAATAGGCAAGAAAGAAAAGAGAAGGCAGAAGAAAATGGCTCCCCTGTACAGAGACGCGGGGGTGGGGCGCTCCAAAGCCAAAAGAGGAGGTCCCTAAGTATGGTAGACACCAGCCAGGAATATATGCAGTGTCTGGAGGAGGGGATGTCTGATTTGCATAGGGTCACATGCTCATTTTTATGGCTACTGTATTGGTCAGTACAGATTTAGATGGGGATTTGCTCTGAACAAGTTGGTGATTGATGGTGTTCATATTTTAATTGAATTTTTCCTGGGTTCTGCTGTACACTTGTATGTGTGTTAGTTTCATGTGCAATGCTTGTGTCACTTTTAAAACCCAGATATATGGCATAACATGAGAATGAAAAATGGACCAGAAAAATAGTTTGGCAATGTAGTCATGTTTGTTCCTATTAAATGTTCCCTATTGACCACTCTATCTCTTTTAATTATAACAAGAATCTGCCCTGCCAGCATGCCCAGTTACGCTGGGAAAACTTCTGCCTCATTTACTCTGGCTGATTCTCATCCACTTATGGGTCAGTGGTTCATTTTCTAGAGGTCACCAGCATTCATACCTAGCATACAATTTCATTCATTATAATGAAGGAATGTTTTCCCTTCAAAGAGACACAACTAGTGGGCTTAATTTTTCTTGATATGTCACCTGTAAAATTTTAATGATGATGTTTAAACTCTAAATGTAGCCATCAAGACAAAAACTGCAAATTTTGAGCCTCAGTGTGTGTGGGTGGGTTTCTGTTTCGGTAATTTGAAACATTGCAGAATATCATCAAAATATGATACCCAAGAATCATATGGTATCAATCATTCCTAGATATACTGATCTATTCATTGCCAAGATAGTTCAATGAGCTGGCAAAAACATATGGAATTATTTTCTTAAAATGTGAAAAATAAAATTTAACCAATCATGTATCACAGCTTGCAACTTTAGTCATACTTTGAAAAGCATTTTAATTTGGACCTCATGAT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TATAGTGTCTCGAGTACTAATATGCAATTATGAAAATTATATTAAATCTGGGATTATGACGGTATCACTGTATCATCTTGGTCTTGTTCTGGCTGTCACCAAGCATGACCCAGGTCAACTT





TTTTTTTCCCCTGAATTACCCATCAAATTGATCTGCAGCTGACTAAAGGCCACAGCTGAGCCTGGAACTGACCCTTCCTTCATCCTCAACCTGCTGTCCTCCAGAAAGCACCAAGGAAAAAGCAGAGAATGACAGCAAACAGATCACTAGGCCTCTGACCACAGGTGCTGAGTACTCAGCAGCCCTCATATAATAGGTTTGAAAGTACTCCTTAAAATAAAACACTGTTTCCCTTTGGAACTATTTACAAGGATGAAACAACCGTATACCTGAGAAATAACTTGCTCTGGTGTCAATTCGCTATTCGCCAGCAGACATCAGAACACACCGAGTTTCCAGATGCTGGTTTTTCCCCTTAAATCAGGAAATACACCTGGACAATTTCTAGAAGACTACAATTCAGTCTAGCCACAAAGGGGATTTTTTTTTTTTGGTAACAGGCTAGAGCCCGGTTCTGTAAGTCTTTAGCTGAAATGGTCCAGTACAAAAGCACTGGAAATGAGTGGGCTAGGAGGACAAGGACCGTCTCCTGCGTGAGGAGTTGGTTGGAGGTCCCCAAGGCCAGGTACCCCCTGCACTCTTATTGGATTCCTCTCTGTCTTCTTGGAGTTTTGAAAAACTCCTTCGAACACCAGGCTTTTTTCTTTAGAAAACAAGTCTCCAATCGTTCTCTGTTCCGTAGAAAGAGAAAGAAAACCTGGAGCAGCTGCTGAAAAATCTAATGAGGAACTAAGAGGCAAACCCACCA
非翻訳領域を含む例示的なヒトCLRN1 cDNA配列(アイソフォームA)(配列番号6)
ACAGAAGCCGTTTCTCATCATGCCAAGCCAACAGAAGAAAATCATTTTTTGCATGGCCGGAGTGTTCAGTTTTGCATGTGCCCTCGGAGTTGTGACAGCCTTGGGGACACCGTTGTGGATCAAAGCCACTGTCCTCTGCAAAACGGGAGCTCTGCTCGTCAATGCCTCAGGGCAGGAGCTGGACAAGTTTATGGGTGAAATGCAGTACGGGCTTTTCCACGGAGAGGGTGTGAGGCAGTGTGGGTTGGGAGCAAGGCCCTTTCGGTTCTCATTTTTTCCAGATTTGCTCAAAGCAATCCCAGTGAGCATCCACGTCAATGTCATTCTCTTCTCTGCCATCCTTATTGTGTTAACCATGGTGGGGACAGCCTTCTTCATGTACAATGCTTTTGGAAAACCTTTTGAAACTCTGCATGGTCCCCTAGGGCTGTACCTTTTGAGCTTCATTTCAGGCTCCTGTGGCTGTCTTGTCATGATATTGTTTGCCTCTGAAGTGAAAATCCATCACCTCTCAGAAAAAATTGCAAATTATAAAGAAGGGACTTATGTCTACAAAACGCAAAGTGAAAAATATACCACCTCATTCTGGGTCATTTTCTTTTGCTTTTTTGTTCATTTTCTGAATGGGCTCCTAATACGACTTGCTGGATTTCAGTTCCCTTTTGCAAAATCTAAAGACGCAGAAACAACTAATGTAGCTGCAGATCTAATGTACTGAAAGGCAAACCTTTCTATAATTTTACAAGGGAGTAGACTTGCTTTGGTCACTTTTAGATGTGGTTAATTTTGCATATCCTTTTAGTCTGCATATATTAAAGCATCAGGACCCTTCGTGACAATGTTTACAAATTACGTACTAAGGATACAGGCTGGAAAGTAAGGGAAGCAGAAGGAAGGCTTTGAAAAGTTGTTTTATCTGGTGGGAAATTGCTTGACCCAGGTAGTCAAAGGCAGTTGACTAGAATCGACAAATTGTTACTCCATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATGTCTTCCTATCAAAAAGATATCAAAGGCACATGGAATATATTTTAATAAAAACAAATAATATCTCTAATATATCCACACATTTGTTGCCAGATTTCAGAAAACTGAGCTGCAATCGCTTTCCTAAAACAGTAGTGTATTAAATGAACATCTATAAAATGTATCAACACACATTTTAAAAAATTTGTTTAAAGTATACTCTTAGGCCAGGCGTGGTGACTCACACCTGTAATTCCAGCACTTCAGGAGGCCAAGGTGGGAAGATCATTTGAGTTCAGGAGTTCGAGTTACAGCCTGGGCAATAAAGTGAGACCCTGTCACTAACAAAATTAAAAAATAAAATAAATATAAAATATAGGCTTTAAAAAAGCATAGTCTTATTAACCATGTCTGTTGGTCAAAATCTGCAAACTCTAAAAGAAGAAAAGAAGAAAAAACCAAGCTTAGGGTATTTTTCCTCCCGTGCCTGAGTCCCAATTACATTCACGACAGTACTTTCAATGAACATAATTGTTAGGACCACTGAGGAATCATGAAAAATGATCTCTGCTTAGTACATTTGATGCAAAATGACTTATTAGGGGCTGTTTTTCTAGCTATAGTGTCTCGAGTACTAATATGCAATTATGAAAATTATATTAAATCTGGGATTATGACGGTATCACTGTATCATCTTGGTCTTGTTCTGGCTGTCACCAAGCATGACCCAGGTCAACTTTTTTTTTCCCCTGAATTACCCATCAAATTGATCTGCAGCTGACTAAAGGCCACAGCTGAGCCTGGAACTGACCCTTCCTTCATCCTCAACCTGCTGTCCTCCAGAAAGCACCAAGGAAAAAGCAGAGAATGACAGCAAACAGATCACTAGGCCTCTGACCACAGGTGCTGAGTACTCAGCAGCCCTCATATAATAGGTTTGAAAGTACTCCTTAAAATAAAACACTGTTTCCCTTTGGAACTATTTACAAGGATGAAACAACCGTATACCTGAGAAATAACTTGCTCTGGTGTCAATTCGCTATTCGCCAGCAGACATCAGAACACACCGAGTTTCCAGATGCT
非翻訳領域を含む例示的なヒトCLRN1 cDNA配列(アイソフォームC)(配列番号7)
TGCCTCCCCACCATTCACCAGGCTCCACTGCACTGGCTCATTCCTGCCTCAGTTGTGCTTCTTTTCCCTGGAAAGTTCTTTCTGTAGATCTTTAAAGGGTGATTTCCTTCTCAACATTCAGGTGTCAGCTCGTTTCACTTTCCTGACCATGCCCATCCACTCAGAGATCACTCAAAATCCCATTACCCTATTTTATTTCTCCATCATATGTATCACTATCTGAAACTATCTTGTTGTTGATGCAGGCTATTTTCTTGACCCCTTCATGGGACTCCCAACAGGGGTACCCCATTTACTCAGCCTGCCCTGCTCAACCTCTTGCAGGAGGGAGCACACGAGTGAACGAGTGCAGGAACCAGCTGGCTGCTTTAGTGCTGTGAGGAGTAAACTCCATGCAGGCCCTGCAGCAGCAACCAGTTTTTCCAGATTTGCTCAAAGCAATCCCAGTGAGCATCCACGTCAATGTCATTCTCTTCTCTGCCATCCTTATTGTGTTAACCATGGTGGGGACAGCCTTCTTCATGTACAATGCTTTTGGAAAACCTTTTGAAACTCTGCATGGTCCCCTAGGGCTGTACCTTTTGAGCTTCATTTCAGGCTCCTGTGGCTGTCTTGTCATGATATTGTTTGCCTCTGAAGTGAAAATCCATCACCTCTCAGAAAAAATTGCAAATTATAAAGAAGGGACTTATGTCTACAAAACGCAAAGTGAAAAATATACCACCTCATTCTGGCTGACTAAAGGCCACAGCTGAGCCTGGAACTGACCCTTCCTTCATCCTCAACCTGCTGTCCTCCAGAAAGCACCAAGGAAAAAGCAGAGAATGACAGCAAACAGATCACTAGGCCTCTGACCACAGGTGCTGAGTACTCAGCAGCCCTCATATAATAGGTTTGAAAGTACTCCTTAAAATAAAACACTGTTTCCCTTTGGAACTATTTACAAGGATGAAACAACCGTATACCTGAGAAATAACTTGCTCTGGTGTCAATTCGCTATTCGCCAGCAGACATCAGAACACACCGAGTTTCCAGATGCTGGTTTTTCCCCTTAAATCAGGAAATACACCTGGACAATTTCTAGAAGACTACAATTCAGTCTAGCCACAAAGGGGATTTTTTTTTTTTGGTAACAGGCTAGAGCCCGGTTCTGTAAGTCTTTAGCTGAAATGGTCCAGTACAAAAGCACTGGAAATGAGTGGGCTAGGAGGACAAGGACCGTCTCCTGCGTGAGGAGTTGGTTGGAGGTCCCCAAGGCCAGGTACCCCCTGCACTCTTATTGGATTCCTCTCTGTCTTCTTGGAGTTTTGAAAAACTCCTTCGAACACCAGGCTTTTTTCTTTAGAAAACAAGTCTCCAATCGTTCTCTGTTCCGTAGAAAGAGAAAGAAAACCTGGAGCAGCTGCTGAAAAATCTAATGAGGAACTAAGAGGCAAACCCACCA
非翻訳領域を含む例示的なヒトCLRN1 cDNA配列(アイソフォームD)(配列番号8)
AGGAGATACTTGAAGGCAGTTTGAAAGACTTGTTTTACAGATTCTTAGTCCAAAGATTTCCAATTAGGGAGAAGAAGCAGCAGAAAAGGAGAAAAGCCAAGTATGAGTGATGATGAGGCCTTCATCTACTGACATTTAACCTGGCGAGAACCGTCGATGGTGAAGTTGCCTTTTCAGCTGGGAGCTGTCCGTTCAGCTTCCGTAATAAATGCAGTCAAAGAGGCAGTCCCTTCCCATTGCTCACAAAGGTCTTGTTTTTGAACCTCGCCCTCACAGAAGCCGTTTCTCATCATGCCAAGCCAACAGAAGAAAATCATTTTTTGCATGGCCGGAGTGTTCAGTTTTGCATGTGCCCTCGGAGTTGTGACAGCCTTGGGGACACCGTTGTGGATCAAAGCCACTGTCCTCTGCAAAACGGGAGCTCTGCTCGTCAATGCCTCAGGGCAGGAGCTGGACAAGTTTATGGGTGAAATGCAGTACGGGCTTTTCCACGGAGAGGGTGTGAGGCAGTGTGGGTTGGGAGCAAGGCCCTTTCGGTTCTCATTTTTTCCAGATTTGCTCAAAGCAATCCCAGTGAGCATCCACGTCAATGTCATTCTCTTCTCTGCCATCCTTATTGTGTTAACCATGGTGGGGACAGCCTTCTTCATGTACAATGCTTTTGGAAAACCTTTTGAAACTCTGCATGGTCCCCTAGGGCTGTACCTTTTGAGCTTCATTTCAGTTGCCCTTTGGCTGCCAGCTACCAGGCACCAGGCTCAAGGCTCCTGTGGCTGTCTTGTCATGATATTGTTTGCCTCTGAAGTGAAAATCCATCACCTCTCAGAAAAAATTGCAAATTATAAAGAAGGGACTTATGTCTACAAAACGCAAAGTGAAAAATATACCACCTCATTCTGGGTCATTTTCTTTTGCTTTTTTGTTCATTTTCTGAATGGGCTCCTAATACGACTTGCTGGATTTCAGTTCCCTTTTGCAAAATCTAAAGACGCAGAAACAACTAATGTAGCTGCAGATCTAATGTACTGAAAGGCAAACCTTTCTATAATTTTACAAGGGAGTAGACTTGCTTTGGTCACTTTTAGATGTGGTTAATTTTGCATATCCTTTTAGTCTGCATATATTAAAGCATCAGGACCCTTCGTGACAATGTTTACAAATTACGTACTAAGGATACAGGCTGGAAAGTAAGGGAAGCAGAAGGAAGGCTTTGAAAAGTTGTTTTATCTGGTGGGAAATTGCTTGACCCAGGTAGTCAAAGGCAGTTGACTAGAATCGACAAATTGTTACTCCATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATGTCTTCCTATCAAAAAGATATCAAAGGCACATGGAATATATTTTAATAAAAACAAATAATATCTCTAATATATCCACACATTTGTTGCCAGATTTCAGAAAACTGAGCTGCAATCGCTTTCCTAAAACAGTAGTGTATTAAATGAACATCTATAAAATGTATCAACACACATTTTAAAAAATTTGTTTAAAGTATACTCTTAGGCCAGGCGTGGTGACTCACACCTGTAATTCCAGCACTTCAGGAGGCCAAGGTGGGAAGATCATTTGAGTTCAGGAGTTCGAGTTACAGCCTGGGCAATAAAGTGAGACCCTGTCACTAACAAAATTAAAAAATAAAATAAATATAAAATATAGGCTTTAAAAAAGCATAGTCTTATTAACCATGTCTGTTGGTCAAAATCTGCAAACTCTAAAAGAAGAAAAGAAGAAAAAACCAAGCTTAGGGTATTTTTCCTCCCGTGCCTGAGTCCCAATTACATTCACGACAGTACTTTCAATGAACATAATTGTTAGGACCACTGAGGAATCATGAAAAATGATCTCTGCTTAGTACATTTGATGCAAAATGACTTATTAGGGGCTGTTTTTCTAGCTATAGTGTCTCGAGTACTAATATGCAATTATGAAAATTATATTAAATCTGGGATTATGACGGTATCACTGTATCATCTTGGTCTTGTTCTGGCTGTCACCAAGCATGACCCAGGTCAACTTTTTTTTTCCCCTGAATTACCCATCAAATTGATCTGCAGCTGACTAAAGGCCACAGCTGAGCCTGGAACTGACCCTTCCTTCATCCTCAACCTGCTGTCCTCCAGAAAGCACCAAGGAAAAAGCAGAGAATGACAGCAAACAGATCACTAGGCCTCTGACCACAGGTGCTGAGTACTCAGCAGCCCTCATATAATAGGTTTGAAAGTACTCCTTAAAATAAAACACTGTTTCCCTTTGGAACTATTTACAAGGATGAAACAACCGTATACCTGAGAAATAACTTGCTCTGGTGTCAATTCGCTATTCGCCAGCAGACATCAGAACACACCGAGTTTCCAGATGCT
非翻訳領域を含む例示的なヒトCLRN1 cDNA配列(アイソフォームE(配列番号9)
ACAGAAGCCGTTTCTCATCATGCCAAGCCAACAGAAGAAAATCATTTTTTGCATGGCCGGAGTGTTCAGTTTTGCATGTGCCCTCGGAGTTGTGACAGCCTTGGGGACACCGTTGTGGATCAAAGCCACTGTCCTCTGCAAAACGGGAGCTCTGCTCGTCAATGCCTCAGGGCAGGAGCTGGACAAGTTTATGGGTGAAATGCAGTACGGGCTTTTCCACGGAGAGGGTGTGAGGCAGTGTGGGTTGGGAGCAAGGCCCTTTCGGTTCTCATGCTATTTTCTTGACCCCTTCATGGGACTCCCAACAGGGGTACCCCATTTACTCAGCCTGCCCTGCTCAACCTCTTGCAGGAGGGAGCACACGAGTGAACGAGTGCAGGAACCAGCTGGCTGCTTTAGTGCTGTGAGGAGTAAACTCCATGCAGGCCCTGCAGCAGCAACCAGTTTTTCCAGATTTGCTCAAAGCAATCCCAGTGAGCATCCACGTCAATGTCATTCTCTTCTCTGCCATCCTTATTGTGTTAACCATGGTGGGGACAGCCTTCTTCATGTACAATGCTTTTGGAAAACCTTTTGAAACTCTGCATGGTCCCCTAGGGCTGTACCTTTTGAGCTTCATTTCAGGCTCCTGTGGCTGTCTTGTCATGATATTGTTTGCCTCTGAAGTGAAAATCCATCACCTCTCAGAAAAAATTGCAAATTATAAAGAAGGGACTTATGTCTACAAAACGCAAAGTGAAAAATATACCACCTCATTCTGGGTCATTTTCTTTTGCTTTTTTGTTCATTTTCTGAATGGGCTCCTAATACGACTTGCTGGATTTCAGTTCCCTTTTGCAAAATCTAAAGACGCAGAAACAACTAATGTAGCTGCAGATCTAATGTACTGAAAGGCAAACCTTTCTATAATTTTACAAGGGAGTAGACTTGCTTTGGTCACTTTTAGATGTGGTTAATTTTGCATATCCTTTTAGTCTGCATATATTAAAGCATCAGGACCCTTCGTGACAATGTTTACAAATTACGTACTAAGGATACAGGCTGGAAAGTAAGGGAAGCAGAAGGAAGGCTTTGAAAAGTTGTTTTATCTGGTGGGAAATTGCTTGACCCAGGTAGTCAAAGGCAGTTGACTAGAATCGACAAATTGTTACTCCATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATGTCTTCCTATCAAAAAGATATCAAAGGCACATGGAATATATTTTAATAAAAACAAATAATATCTCTAATATATCCACACATTTGTTGCCAGATTTCAGAAAACTGAGCTGCAATCGCTTTCCTAAAACAGTAGTGTATTAAATGAACATCTATAAAATGTATCAACACACATTTTAAAAAATTTGTTTAAAGTATACTCTTAGGCCAGGCGTGGTGACTCACACCTGTAATTCCAGCACTTCAGGAGGCCAAGGTGGGAAGATCATTTGAGTTCAGGAGTTCGAGTTACAGCCTGGGCAATAAAGTGAGACCCTGTCACTAACAAAATTAAAAAATAAAATAAATATAAAATATAGGCTTTAAAAAAGCATAGTCTTATTAACCATGTCTGTTGGTCAAAATCTGCAAACTCTAAAAGAAGAAAAGAAGAAAAAACCAAGCTTAGGGTATTTTTCCTCCCGTGCCTGAGTCCCAATTACATTCACGACAGTACTTTCAATGAACATAATTGTTAGGACCACTGAGGAATCATGAAAAATGATCTCTGCTTAGTACATTTGATGCAAAATGACTTATTAGGGGCTGTTTTTCTAGCTATAGTGTCTCGAGTACTAATATGCAATTATGAAAATTATATTAAATCTGGGATTATGACGGTATCACTGTATCATCTTGGTCTTGTTCTGGCTGTCACCAAGCATGACCCAGGTCAACTTTTTTTTTCCCCTGAATTACCCATCAAATTGATCTGCAGCTGACTAAAGGCCACAGCTGAGCCTGGAACTGACCCTTCCTTCATCCTCAACCTGCTGTCCTCCAGAAAGCACCAAGGAAAAAGCAGAGAATGACAGCAAACAGATCACTAGGCCTCTGACCACAGGTGCTGAGTACTCAGCAGCCCTCATATAATAGGTTTGAAAGTACTCCTTAAAATAAAACACTGTTTCCCTTTGGAACTATTTACAAGGATGAAACAACCGTATACCTGAGAAATAACTTGCTCTGGTGTCAATTCGCTATTCGCCAGCAGACATCAGAACACACCGAGTTTCCAGATGCT
本開示で、ポリヌクレオチド配列に対する特定の変化が、その発現またはポリヌクレオチドによってコードされるタンパク質に影響を与えないことが認識される。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、1つ以上のサイレント変異を有するCLRN1遺伝子を含む。いくつかの実施形態では、本開示は、1つ以上のサイレント変異を有するCLRN1遺伝子、例えば、配列番号1、2、3、4、5、6、または7とは異なる配列を有するCLRN1遺伝子を含むポリヌクレオチドを提供するが、機能的なCLRN1遺伝子と同じアミノ酸配列をコードしている。いくつかの実施形態では、本開示は、1つ以上の変異(例えば、機能的なCLRN1遺伝子から産生されたものと比較した場合に異なるアミノ酸配列)を含むアミノ酸配列をコードする配列番号1、2、3、4、5、6、または7とは異なる配列を有するCLRN1遺伝子を含むポリヌクレオチドを提供し、ここで、1つ以上の変異は、保存的アミノ酸置換である。いくつかの実施形態では、本開示は、1つ以上の変異(例えば、機能的なCLRN1遺伝子から産生されたものと比較した場合に異なるアミノ酸配列)を含むアミノ酸配列をコードする配列番号1、2、3、4、5、6、または7とは異なる配列を有するCLRN1遺伝子を含むポリヌクレオチドを提供し、ここで、1つ以上の変異は、CLRN1遺伝子またはコードされたクラリン1タンパク質の特徴的部分内にない。いくつかの実施形態では、本開示によるポリヌクレオチドは、配列番号1、2、3、4、5、6、または7の配列と少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、または少なくとも99%同一であるCLRN1遺伝子を含む。いくつかの実施形態では、本開示によるポリヌクレオチドは、配列番号1、2、3、4、5、6、または7の配列と同一であるCLRN1遺伝子を含む。当技術分野で理解できるように、配列番号1、2、3、4、5、6、または7を最適化(例えば、コドン最適化)して、動物、例えば哺乳動物、例えば、ヒトにおける発現の増加または最適化を達成することができる。
CLRN1遺伝子によってコードされるポリペプチド
とりわけ、本開示は、CLRN1遺伝子またはその特徴的部分によってコードされるポリペプチドを提供する。いくつかの実施形態では、CLRN1遺伝子は、哺乳動物CLRN1遺伝子である。いくつかの実施形態では、CLRN1遺伝子は、マウスCLRN1遺伝子である。いくつかの実施形態では、CLRN1遺伝子は、霊長類CLRN1遺伝子である。いくつかの実施形態では、CLRN1遺伝子は、ヒトCLRN1遺伝子である。
いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、クラリン1タンパク質またはその特徴的部分を含む。いくつかの実施形態では、クラリン1タンパク質またはその特徴的部分は、哺乳動物のクラリン1タンパク質またはその特徴的部分、例えば、霊長類のクラリン1タンパク質またはその特徴的部分である。いくつかの実施形態では、クラリン1タンパク質またはその特徴的部分は、ヒトクラリン1タンパク質またはその特徴的部分である。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるポリペプチドは、翻訳後修飾を含む。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるクラリン1タンパク質またはその特徴的部分は、翻訳後修飾を含む。いくつかの実施形態では、翻訳後修飾は、これらに限定されないが、グリコシル化(例えば、N結合型グリコシル化、O結合型グリコシル化)、リン酸化、アセチル化、アミド化、ヒドロキシル化、メチル化、ユビキチン化、硫酸化、及び/またはそれらの組み合わせを含むことができる。
例示的なヒトクラリン1タンパク質配列は、配列番号10、11、12、または13の配列であるか、またはその配列を含む。c末端フラグタグを有する例示的なヒトクラリン1タンパク質配列は、配列番号14の配列であるか、またはその配列を含む。
例示的なヒトクラリン1タンパク質配列(アイソフォームA)(配列番号10)
MPSQQKKIIFCMAGVFSFACALGVVTALGTPLWIKATVLCKTGALLVNASGQELDKFMGEMQYGLFHGEGVRQCGLGARPFRFSFFPDLLKAIPVSIHVNVILFSAILIVLTMVGTAFFMYNAFGKPFETLHGPLGLYLLSFISGSCGCLVMILFASEVKIHHLSEKIANYKEGTYVYKTQSEKYTTSFWVIFFCFFVHFLNGLLIRLAGFQFPFAKSKDAETTNVAADLMY
例示的なヒトクラリン1タンパク質配列(アイソフォームC)(配列番号11)
MQALQQQPVFPDLLKAIPVSIHVNVILFSAILIVLTMVGTAFFMYNAFGKPFETLHGPLGLYLLSFISGSCGCLVMILFASEVKIHHLSEKIANYKEGTYVYKTQSEKYTTSFWLTKGHS
例示的なヒトクラリン1タンパク質配列(アイソフォームD)(配列番号12)
MPSQQKKIIFCMAGVFSFACALGVVTALGTPLWIKATVLCKTGALLVNASGQELDKFMGEMQYGLFHGEGVRQCGLGARPFRFSFFPDLLKAIPVSIHVNVILFSAILIVLTMVGTAFFMYNAFGKPFETLHGPLGLYLLSFISVALWLPATRHQAQGSCGCLVMILFASEVKIHHLSEKIANYKEGTYVYKTQSEKYTTSFWVIFFCFFVHFLNGLLIRLAGFQFPFAKSKDAETTNVAADLMY
例示的なヒトクラリン1タンパク質配列(アイソフォームE)(配列番号13)
MPSQQKKIIFCMAGVFSFACALGVVTALGTPLWIKATVLCKTGALLVNASGQELDKFMGEMQYGLFHGEGVRQCGLGARPFRFSCYFLDPFMGLPTGVPHLLSLPCSTSCRREHTSERVQEPAGCFSAVRSKLHAGPAAATSFSRFAQSNPSEHPRQCHSLLCHPYCVNHGGDSLLHVQCFWKTF
C末端フラグタグを有する例示的なヒトクラリン1タンパク質配列(アイソフォームA)(配列番号14)
MPSQQKKIIFCMAGVFSFACALGVVTALGTPLWIKATVLCKTGALLVNASGQELDKFMGEMQYGLFHGEGVRQCGLGARPFRFSFFPDLLKAIPVSIHVNVILFSAILIVLTMVGTAFFMYNAFGKPFETLHGPLGLYLLSFISGSCGCLVMILFASEVKIHHLSEKIANYKEGTYVYKTQSEKYTTSFWVIFFCFFVHFLNGLLIRLAGFQFPFAKSKDAETTNVAADLMYGSRADYKDHDGDYKDHDIDYKDDDDK
本開示は、本明細書に記載のポリペプチド(例えば、クラリン1またはその特徴的部分を含む)のアミノ酸配列における特定の変異が、ポリペプチドの発現、折り畳み、または活性に影響を与えないことを認識する。いくつかの実施形態では、ポリペプチド(例えば、クラリン1またはその特徴的部分など)は、1つ以上の変異を含み、1つ以上の変異は、保存的アミノ酸置換である。いくつかの実施形態では、本開示によるポリペプチドは、配列番号8、9、10、または11の配列と、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、または少なくとも99%同一であるクラリン1またはその特徴的部分を含む。いくつかの実施形態では、本開示によるポリペプチドは、配列番号8、9、10、または11の配列と同一であるクラリン1またはその特徴的部分を含む。いくつかの実施形態では、本開示によるポリペプチドは、配列番号14の配列と、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、または少なくとも99%同一であるクラリン1またはその特徴的部分を含む。いくつかの実施形態では、本開示によるポリペプチドは、配列番号14の配列と同一であるクラリン1タンパク質またはその特徴的部分を含む。
構築物
とりわけ、本開示は、本明細書に記載のいくつかのポリヌクレオチドがポリヌクレオチド構築物であることを提供する。本開示によるポリヌクレオチド構築物は、CLRN1遺伝子またはその特徴的部分を含むポリヌクレオチドを組み込むコスミド、プラスミド(例えば、裸のまたはリポソームに含まれている)及びウイルス構築物(例えば、レンチウイルス、レトロウイルス、アデノウイルス、及びアデノ随伴ウイルス構築物)など、当技術分野で知られているすべてのものを含む。当業者は、本明細書に記載のポリヌクレオチドのいずれかを作製するために、好適な構築物及び細胞を選択することができる。いくつかの実施形態では、構築物は、プラスミド(すなわち、細胞の内部で自律的に複製することができる環状DNA分子)である。いくつかの実施形態では、構築物は、コスミド(例えば、pWEまたはsCosシリーズ)であり得る。
いくつかの実施形態では、構築物は、ウイルス構築物である。いくつかの実施形態では、ウイルス構築物は、レンチウイルス、レトロウイルス、アデノウイルス、またはアデノ随伴ウイルス構築物である。いくつかの実施形態では、構築物は、アデノ随伴ウイルス(AAV)構築物である(例えば、Asokan et al.,Mol.Ther.20:699-7080,2012を参照(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる))。いくつかの実施形態では、ウイルス構築物は、アデノウイルス構築物である。いくつかの実施形態では、ウイルス構築物はまた、アルファウイルスに基づくかまたは由来し得る。アルファウイルスとしては、シンドビス(及びVEEV)ウイルス、アウラウイルス、ババンキウイルス、バーマーフォレストウイルス、ベバルウイルス、Cabassouウイルス、チクングニアウイルス、東部ウマ脳炎ウイルス、エバーグレイズウイルス、フォートモーガンウイルス、ゲタウイルス、ハイランズJウイルス、Kyzylagachウイルス、マヤロウイルス、Me Triウイルス、Middelburgウイルス、モッソダスペドラスウイルス、ムカンボウイルス、Ndumuウイルス、オニョンニョンウイルス、Pixunaウイルス、リオネグロウイルス、ロスリバーウイルス、サケ膵臓病ウイルス、セムリキ森林ウイルス、ミナミゾウアザラシウイルス、Tonateウイルス、Trocaraウイルス、Unaウイルス、ベネズエラ馬脳炎ウイルス、西部馬脳炎ウイルス、及びワタロアウイルスが挙げられる。一般に、そのようなウイルスのゲノムは、宿主細胞の細胞質内で翻訳され得る非構造タンパク質(例えば、レプリコン)及び構造タンパク質(例えば、キャプシド及びエンベロープ)をコードする。ロスリバーウイルス、シンドビスウイルス、セムリキ森林ウイルス(SFV)、及びベネズエラ馬脳炎ウイルス(VEEV)はすべて、コード配列送達用のウイルス構築物を発生させるのに使用されている。偽型ウイルスは、アルファウイルスのエンベロープ糖タンパク質とレトロウイルスのキャプシドとを組み合わせることによって形成され得る。アルファウイルス構築物の例は、米国公開番号20150050243、20090305344、及び20060177819に見出すことができ、構築物及びそれらの作製方法は、刊行物のそれぞれの全体を参照することにより本明細書に組み込まれる。
本明細書で提供される構築物は、異なるサイズであってもよい。いくつかの実施形態では、構築物は、プラスミドであり、最大約1kb、最大約2kb、最大約3kb、最大約4kb、最大約5kb、最大約6kb、最大約7kb、最大約8kb、最大約9kb、最大約10kb、最大約11kb、最大約12kb、最大約13kb、最大約14kb、または最大約15kbの全長を含み得る。いくつかの実施形態では、構築物は、プラスミドであり、約1kb~約2kb、約1kb~約3kb、約1kb~約4kb、約1kb~約5kb、約1kb~約6kb、約1kb~約7kb、約1kb~約8kb、約1kb~約9kb、約1kb~約10kb、約1kb~約11kb、約1kb~約12kb、約1kb~約13kb、約1kb~約14kb、または約1kb~約15kbの範囲の全長を有し得る。
いくつかの実施形態では、構築物は、ウイルス構築物であり、最大10kbのヌクレオチドの総数を有し得る。いくつかの実施形態では、ウイルス構築物は、約1kb~約2kb、1kb~約3kb、約1kb~約4kb、約1kb~約5kb、約1kb~約6kb、約1kb~約7kb、約1kb~約8kb、約1kb~約9kb、約1kb~約10kb、約2kb~約3kb、約2kb~約4kb、約2kb~約5kb、約2kb~約6kb、約2kb~約7kb、約2kb~約8kb、約2kb~約9kb、約2kb~約10kb、約3kb~約4kb、約3kb~約5kb、約3kb~約6kb、約3kb~約7kb、約3kb~約8kb、約3kb~約9kb、約3kb~約10kb、約4kb~約5kb、約4kb~約6kb、約4kb~約7kb、約4kb~約8kb、約4kb~約9kb、約4kb~約10kb、約5kb~約6kb、約5kb~約7kb、約5kb~約8kb、約5kb~約9kb、約5kb~約10kb、約6kb~約7kb、約6kb~約8kb、約6kb~約9kb、約6kb~約10kb、約7kb~約8kb、約7kb~約9kb、約7kb~約10kb、約8kb~約9kb、約8kb~約10kb、または約9kb~約10kbの範囲のヌクレオチドの総数を有する。
いくつかの実施形態では、構築物は、レンチウイルス構築物であり、最大8kbのヌクレオチドの総数を有し得る。いくつかの例では、レンチウイルス構築物は、約1kb~約2kb、約1kb~約3kb、約1kb~約4kb、約1kb~約5kb、約1kb~約6kb、約1kb~約7kb、約1kb~約8kb、約2kb~約3kb、約2kb~約4kb、約2kb~約5kb、約2kb~約6kb、約2kb~約7kb、約2kb~約8kb、約3kb~約4kb、約3kb~約5kb、約3kb~約6kb、約3kb~約7kb、約3kb~約8kb、約4kb~約5kb、約4kb~約6kb、約4kb~約7kb、約4kb~約8kb、約5kb~約6kb、約5kb~約7kb、約5kb~約8kb、約6kb~約8kb、約6kb~約7kb、または約7kb~約8kbのヌクレオチドの総数を有し得る。
いくつかの実施形態では、構築物は、アデノウイルス構築物であり、最大8kbのヌクレオチドの総数を有し得る。いくつかの実施形態では、アデノウイルス構築物は、約1kb~約2kb、約1kb~約3kb、約1kb~約4kb、約1kb~約5kb、約1kb~約6kb、約1kb~約7kb、約1kb~約8kb、約2kb~約3kb、約2kb~約4kb、約2kb~約5kb、約2kb~約6kb、約2kb~約7kb、約2kb~約8kb、約3kb~約4kb、約3kb~約5kb、約3kb~約6kb、約3kb~約7kb、約3kb~約8kb、約4kb~約5kb、約4kb~約6kb、約4kb~約7kb、約4kb~約8kb、約5kb~約6kb、約5kb~約7kb、約5kb~約8kb、約6kb~約7kb、約6kb~約8kb、または約7kb~約8kbの範囲内のヌクレオチドの総数を有し得る。
本明細書に記載される構築物はいずれも、制御配列、例えば、転写開始配列、転写終結配列、プロモーター配列、エンハンサー配列、RNAスプライシング配列、ポリアデニル化(ポリ(A))配列、Kozakコンセンサス配列、及び/または転写前もしくは転写後の調節エレメント及び/または制御エレメントを収容し得る追加の非翻訳領域の群から選択される制御配列をさらに含み得る。いくつかの実施形態では、プロモーターは、ネイティブプロモーター、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、及び/または組織特異的プロモーターであり得る。これらの制御配列の非限定的な例が本明細書に記載される。
例示的な構築物成分
逆方向末端反復配列(ITR)
構築物のAAV由来配列は、典型的には、シス作用性5’及び3’ITRを含む(例えば、B.J.Carter,「Handbook of Parvoviruses」,ed.,P.Tijsser,CRC Press,pp.155 168(1990)を参照、これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。概して、ITRは、ヘアピンを形成できる。ヘアピンを形成する能力は、ITRの自己プライミング能力に寄与し、プライマーゼに依存することなく第2のDNA鎖の合成が可能になる。ITRは、AAV粒子内のAAV構築物の効率的なキャプシド形成も補助し得る。
本開示のrAAV粒子(例えば、AAV2/Anc80粒子)は、コード配列(例えば、CLRN1遺伝子)と、5’及び3’AAV ITR配列に隣接する関連エレメントとを含むrAAV構築物を含み得る。いくつかの実施形態では、ITRは、約145個の核酸であるか、またはその核酸を含む。いくつかの実施形態では、ITRをコードする配列のすべてまたは実質的にすべてが使用される。AAV ITR配列は、現在同定されている哺乳動物AAV型などの任意の既知のAAVから得ることができる。いくつかの実施形態では、ITRは、AAV2 ITRである。
本開示で使用される構築物分子の例は、導入遺伝子を含む「シス作用性」構築物であり、選択された導入遺伝子配列及び関連する調節エレメントは、5’または「左」及び3’または「右」AAV ITR配列に隣接している。5’及び左の指定は、構築物全体に対するITR配列の位置を指し、センス方向で左から右に読む。例えば、いくつかの実施形態では、5’または左ITRは、構築物がセンス方向に直線的に描写されている場合、所与の構築物の(ポリアデニル化配列とは対照的に)プロモーターに最も近いITRである。同時に、3’及び右の指定は、構築物全体に対するITR配列の位置を指し、センス方向で左から右に読む。例えば、いくつかの実施形態では、3’または右ITRは、構築物がセンス方向に直線的に描写されている場合、所与の構築物の(プロモーター配列とは対照的に)ポリアデニル化配列に最も近いITRである。本明細書で提供されるITRは、センス鎖に従って5’から3’の順序で示される。したがって、当業者は、センス方向からアンチセンス方向に変換する場合、5’または「左」配向ITRを3’または「右」ITRとして描写できることを理解するであろう。さらに、所与のセンスITR配列(例えば、5’/左AAV ITR)をアンチセンス配列(例えば、3’/右ITR配列)に変換することは、十分に当業者の能力の範囲内である。当業者は、5’/左または3’/右ITR、またはそのアンチセンスバージョンのいずれかとして使用するために、所与のITR配列を修飾する方法を理解するであろう。
例えば、ITR(例えば、5’ITR)は、配列番号15、17、20、または21による配列を有することができる。いくつかの実施形態では、ITR(例えば、3’ITR)は、配列番号16、18、20、または22による配列を有することができる。いくつかの実施形態では、ITRは、当技術分野で知られているように、1つ以上の修飾、例えば短縮、欠失、置換または挿入を含む。いくつかの実施形態では、ITRは、145未満のヌクレオチド、例えば、127、130、134、または141のヌクレオチドを含む。例えば、いくつかの実施形態では、ITRは、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、または145のヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、ITR(例えば、5’ITR)は、配列番号15による配列を有することができる。いくつかの実施形態では、ITR(例えば、5’ITR)は、配列番号17による配列を有することができる。いくつかの実施形態では、ITR(例えば、5’ITR)は、配列番号20による配列を有することができる。いくつかの実施形態では、ITR(例えば、5’ITR)は、配列番号21による配列を有することができる。いくつかの実施形態では、ITR(例えば、3’ITR)は、配列番号16による配列を有することができる。いくつかの実施形態では、ITR(例えば、3’ITR)は、配列番号18による配列を有することができる。いくつかの実施形態では、ITR(例えば、3’ITR)は、配列番号20による配列を有することができる。いくつかの実施形態では、ITR(例えば、3’ITR)は、配列番号22による配列を有することができる。
5’AAV ITR配列の非限定的な例は、配列番号15、17、20または21である。3’AAV ITR配列の非限定的な例は、配列番号16、18、20または22である。いくつかの実施形態では、本開示のrAAV構築物は、5’AAV ITR及び/または3’AAV ITRを含む。いくつかの実施形態では、ITR(例えば、5’ITR)は、配列番号17による配列を有することができる。いくつかの実施形態では、5’AAV ITR配列は、配列番号20による配列を有することができる。いくつかの実施形態では、5’AAV ITR配列は、配列番号21による配列を有することができる。いくつかの実施形態では、3’AAV ITR配列は、配列番号16である。いくつかの実施形態では、3’AAV ITR配列は、配列番号18である。いくつかの実施形態では、3’AAV ITR配列は、配列番号20である。いくつかの実施形態では、3’AAV ITR配列は、配列番号22である。いくつかの実施形態では、5’及び3’AAV ITR(例えば、配列番号15、17、もしくは21、または16、18、20、もしくは22)は、コード配列の一部、例えば、CLRN1遺伝子(例えば、配列番号1、2、3、または4)のすべてまたは一部に隣接する。これらのITR配列を修飾する能力は、当業者が備えている技能の範囲内である(例えば、テキスト、例えば、Sambrook et al.「Molecular Cloning.A Laboratory Manual」,2d ed.,Cold Spring Harbor Laboratory,New York(1989);及びK.Fisher et al.,J Virol.,70:520 532(1996)を参照、これらのそれぞれは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。いくつかの実施形態では、5’ITR配列は、配列番号15、17、20、または21によって表される5’ITR配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。いくつかの実施形態では、3’ITR配列は、配列番号16、18、20、または22によって表される3’ITR配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。
例示的5’AAV ITR(配列番号15)
TTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCT
例示的3’AAV ITR(配列番号16)
AGGAACCCCTAGTGATGGAGTTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGGGCGACCAAAGGTCGCCCGACGCCCGGGCTTTGCCCGGGCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAA
例示的5’AAV ITR(配列番号17)
CTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCT
例示的3’AAV ITR(配列番号18)
AGGAACCCCTAGTGATGGAGTTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGGGCGACCAAAGGTCGCCCGACGCCCGGGCTTTGCCCGGGCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAG
例示的5’AAV ITR(配列番号20)
CTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCT
例示的5’AAV ITR(配列番号21)
TTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGGGCGACCAAAGGTCGCCCGACGCCCGGGCTTTGCCCGGGCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCT
例示的3’AAV ITR(配列番号22)
AGGAACCCCTAGTGATGGAGTTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAA
プロモーター
いくつかの実施形態では、構築物(例えば、rAAV構築物)は、プロモーターを含む。「プロモーター」という用語は、作動可能に連結された遺伝子(例えば、CLRN1遺伝子)の転写を促進及び/または開始することができる酵素/タンパク質によって認識されるDNA配列を指す。例えば、プロモーターは、典型的には、例えば、RNAポリメラーゼ及び/または任意の関連因子が結合し、そこから転写を開始することができるヌクレオチド配列を指す。したがって、いくつかの実施形態では、構築物(例えば、rAAV構築物)は、本明細書に記載の非限定的な例のプロモーターのうちの1つに作動可能に連結されたプロモーターを含む。
いくつかの実施形態では、プロモーターは、誘導性プロモーター、構成的プロモーター、哺乳動物細胞プロモーター、ウイルスプロモーター、キメラプロモーター、操作されたプロモーター、組織特異的プロモーター、または当該技術分野で既知の任意の他の種類のプロモーターである。いくつかの実施形態では、プロモーターは、RNAポリメラーゼIIプロモーター、例えば、哺乳動物RNAポリメラーゼIIプロモーターなどである。いくつかの実施形態において、プロモーターは、RNAポリメラーゼIIIプロモーターであり、限定されるものではないが、HIプロモーター、ヒトU6プロモーター、マウスU6プロモーター、またはブタU6プロモーターがこれに含まれる。概して、プロモーターは、内耳細胞または眼細胞内で転写を促進することができるプロモーターである。いくつかの実施形態では、プロモーターは、蝸牛特異的プロモーターまたは蝸牛指向性プロモーターである。いくつかの実施形態では、プロモーターは、有毛細胞特異的プロモーター、または支持細胞特異的プロモーターである。
様々なプロモーターが当技術分野で知られており、これらは、本明細書で使用することができる。本明細書で使用され得るプロモーターの非限定的な例としては、ヒトEF1α、ヒトサイトメガロウイルス(CMV)(米国特許第5,168,062号、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)、ヒトユビキチンC(UBC)、マウスホスホグリセリン酸キナーゼ1、ポリオーマアデノウイルス、シミアンウイルス40(SV40)、β-グロビン、β-アクチン、α-フェトプロテイン、γ-グロビン、β-インターフェロン、γ-グルタミルトランスフェラーゼ、マウス乳癌ウイルス(MMTV)、ラウス肉腫ウイルス、ラットインスリン、グリセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ、メタロチオネインII(MT II)、アミラーゼ、カテプシン、MIムスカリン受容体、レトロウイルスLTR(例えば、ヒトT細胞性白血病ウイルスHTLV)、AAV ITR、インターロイキン-2、コラゲナーゼ、血小板由来成長因子、アデノウイルス5 E2、ストロメリシン、マウスMX遺伝子、グルコース制御タンパク質(GRP78及びGRP94)、α-2-マクログロブリン、ビメンチン、MHCクラスI遺伝子H-2 b、HSP70、プロリフェリン、腫瘍壊死因子、甲状腺刺激ホルモンα遺伝子、免疫グロブリン軽鎖、T細胞受容体、HLA DQa及びDQ、インターロイキン-2受容体、MHCクラスII、MHCクラスII HLA-DRa、筋クレアチンキナーゼ、プレアルブミン(トランスチレチン)、エラスターゼI、アルブミン遺伝子、c-fos、c-HA-ras、神経細胞接着分子(NCAM)、H2B(TH2B)ヒストン、ラット成長ホルモン、ヒト血清アミロイド(SAA)、トロポニンI(TN I)、デュシェンヌ筋ジストロフィー、ヒト免疫不全ウイルス、ならびにテナガザル白血病ウイルス(GALV)プロモーターが挙げられる。プロモーターのさらなる例が当技術分野で知られている。例えば、Lodish,Molecular Cell Biology,Freeman and Company,New York 2007を参照、これらのそれぞれは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態において、プロモーターは、CMV最初期プロモーターである。いくつかの実施形態では、プロモーターは、CAGプロモーターまたはCAG/CBAプロモーターである。いくつかの実施形態では、プロモーターは、配列番号14を含むか、または配列番号14からなる。いくつかの実施形態では、プロモーターは、配列番号15を含むか、または配列番号15からなる。特定の実施形態では、プロモーターは、配列番号16に例示されるCMV/CBAエンハンサー/プロモーター構築物を含む。特定の実施形態では、プロモーターは、配列番号17に例示されるCMV/CBAエンハンサー/プロモーター構築物を含む。特定の実施形態では、プロモーターは、配列番号43に例示されるCAGプロモーターまたはCMV/CBA/SV-40エンハンサー/プロモーター構築物を含む。特定の実施形態では、プロモーターは、配列番号44に例示されるCAGプロモーターまたはCMV/CBA/SV-40エンハンサー/プロモーター構築物を含む。いくつかの実施形態では、プロモーター配列は、配列番号14または15によって表されるプロモーター配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。いくつかの実施形態では、エンハンサー-プロモーター配列は、配列番号16、17、43、または44によって表されるエンハンサー-プロモーター配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。
「構成的」プロモーターという用語は、タンパク質(例えば、クラリン1タンパク質)をコードする核酸に作動可能に連結された際に、ほとんどまたは全ての生理的条件下で、細胞中での核酸からのRNAの転写を引き起こすヌクレオチド配列を指す。
構成的プロモーターの例としては、限定されるものではないが、レトロウイルスラウス肉腫ウイルス(RSV)LTRプロモーター、サイトメガロウイルス(CMV)プロモーター(例えば、Boshart et al,Cell 41:521-530,1985を参照、これは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)、SV40プロモーター、ジヒドロ葉酸レダクターゼプロモーター、ベータ-アクチンプロモーター、ホスホグリセロールキナーゼ(PGK)プロモーター、及びEF1-アルファプロモーター(Invitrogen)が挙げられる。
誘導性プロモーターは遺伝子発現の調節を可能にし、外来的に供給される化合物、温度などの環境因子、または特定の生理的状態の存在(例えば、急性期、細胞の特定の分化状態、もしくは複製中の細胞中でのみ)によって制御され得る。誘導性プロモーター及び誘導系は、様々な市販の供給源(限定されるものではないが、Invitrogen、Clontech、及びAriadを含む)から入手可能である。誘導性プロモーターのさらなる例が当技術分野で知られている。
外来的に供給される化合物によって調節される誘導性プロモーターの例としては、亜鉛誘導性ヒツジメタロチオネイン(MT)プロモーター、デキサメタゾン(Dex)誘導性マウス乳癌ウイルス(MMTV)プロモーター、T7ポリメラーゼプロモーター系(WO98/10088,その全体が参照により本明細書に組み込まれる);エクジソン昆虫プロモーター(例えば、No et al,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.93:3346-3351,1996を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)、テトラサイクリン抑制系(例えば、Gossen et al,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.89:5547-5551,1992を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)、テトラサイクリン誘導系(例えば、Gossen et al,Science 268:1766-1769,1995;及びHarvey et al,Curr.Opin.Chem.Biol.2:512-518,1998を参照、その各々が、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)、RU486誘導性システム(例えば、Wang et al,Nat.Biotech.15:239-243,1997;及びWang et al,Gene Ther.4:432-441,1997,これらのそれぞれは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)、及びラパマイシン誘導性システム(例えば、Magari et al.J Clin.Invest.100:2865-2872,1997を参照,その全体が参照により本明細書に組み込まれる)が挙げられる。
「組織特異的」プロモーターという用語は、ある特定の細胞タイプ及び/または組織内でのみ活性であるプロモーターを指す(例えば、特定の遺伝子の転写は、組織特異的プロモーターに結合する転写調節及び/または制御タンパク質を発現する細胞内でのみ生じる)。
いくつかの実施形態では、調節及び/または制御配列は、組織特異的遺伝子発現能を付与する。いくつかの場合において、組織特異的調節及び/または制御配列は、組織特異的方式で転写を誘導する組織特異的転写因子を結合する。
いくつかの実施形態では、組織特異的プロモーターは、蝸牛特異的プロモーターである。いくつかの実施形態では、組織特異的プロモーターは、蝸牛有毛細胞特異的プロモーターである。蝸牛有毛細胞特異的プロモーターの非限定的な例としては、限定されるものではないが、ATOH1プロモーター、POU4F3プロモーター、LHX3プロモーター、MYO7Aプロモーター、MYO6プロモーター、α9ACHRプロモーター、及びα10ACHRプロモーターが挙げられる。いくつかの実施形態では、プロモーターは、PRESTINプロモーターまたはONCOMODプロモーター等の蝸牛有毛細胞特異的プロモーターである。(例えば、Zheng et al.,Nature 405:149-155,2000;Tian et al.Dev.Dyn.23 l:199-203,2004;及びRyan et al.,Adv.Otorhinolaryngol.66:99-115,2009を参照、これらのそれぞれは、参照により全体が本明細書に組み込まれる。)
いくつかの実施形態では、組織特異的プロモーターは、耳細胞特異的プロモーターである。いくつかの実施形態では、組織特異的プロモーターは、内耳細胞特異的プロモーターである。内耳非感覚細胞特異的プロモーターの非限定的な例としては、これらに限定されないが、GJB2、GJB6、SLC26A4、TECTA、DFNA5、COCH、NDP、SYN1、GFAP、PLP、TAK1、またはSOX21が挙げられる。いくつかの実施形態では、蝸牛非感覚細胞特異的プロモーターは、内耳支持細胞特異的プロモーターであり得る。内耳支持細胞特異的プロモーターの非限定的な例としては、これらに限定されないが、SOX2、FGFR3、PROX1、GLAST1、LGR5、HES1、HES5、NOTCH1、JAG1、CDKN1A、CDKN1B、SOX10、P75、CD44、HEY2、LFNG、またはS100bが挙げられる。
いくつかの実施形態では、組織特異的プロモーターは、眼細胞特異的プロモーターである。眼細胞特異的プロモーターの非限定的な例としては、これらに限定されないが、RPE65、RLBP1、VMD2、IRBP、GNAT2、PR1.7、PR2.1、HB569、CAR、GRK1、RK、B-PDE、GRM6、Nefh、Tyh1、SYN、GFAP、または他のオプシンまたはロドプシンプロモーターが挙げられる。眼細胞特異的プロモーターの非限定的な例、及びそのようなプロモーターを説明する例示的な内容は、以下のとおりである。
Figure 2024500786000004

Figure 2024500786000005
いくつかの実施形態では、提供されるAAV構築物は、CAG、CBA、CMV、またはCB7プロモーターから選択されるプロモーター配列を含む。本明細書に記載の治療組成物のいずれかのいくつかの実施形態では、第1または唯一のAAV構築物は、蝸牛及び/または内耳特異的プロモーターから選択される少なくとも1つのプロモーター配列をさらに含む。
特定の実施形態では、プロモーターは、配列番号23に記載のCBAプロモーターである。いくつかの実施形態では、エンハンサー-プロモーター配列は、配列番号23によって表されるエンハンサー-プロモーター配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。
例示的なCBAプロモーター(配列番号23)
GTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCG
例示的なCBAプロモーター(配列番号24)
GTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCG
特定の実施形態では、プロモーターは、配列番号25で表されるCMV/CBAエンハンサー/プロモーターである。いくつかの実施形態では、エンハンサー-プロモーター配列は、配列番号25によって表されるエンハンサー-プロモーター配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。
例示的なCMV/CBAエンハンサー/プロモーター(配列番号25)
GACATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGACTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGGTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCG
例示的なCMV/CBAエンハンサー/プロモーター(配列番号26)
GACATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGACTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGGTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCG
例示的なCAGエンハンサー/プロモーター(配列番号27)
GACATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGACTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGGTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCGGGAGTCGCTGCGTTGCCTTCGCCCCGTGCCCCGCTCCGCGCCGCCTCGCGCCGCCCGCCCCGGCTCTGACTGACCGCGTTACTCCCACAGGTGAGCGGGCGGGACGGCCCTTCTCCTCCGGGCTGTAATTAGCGCTTGGTTTAATGACGGCTCGTTTCTTTTCTGTGGCTGCGTGAAAGCCTTAAAGGGCTCCGGGAGGGCCCTTTGTGCGGGGGGGAGCGGCTCGGGGGGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGTGGGGAGCGCCGCGTGCGGCCCGCGCTGCCCGGCGGCTGTGAGCGCTGCGGGCGCGGCGCGGGGCTTTGTGCGCTCCGCGTGTGCGCGAGGGGAGCGCGGCCGGGGGCGGTGCCCCGCGGTGCGGGGGGGCTGCGAGGGGAACAAAGGCTGCGTGCGGGGTGTGTGCGTGGGGGGGTGAGCAGGGGGTGTGGGCGCGGCGGTCGGGCTGTAACCCCCCCCTGCACCCCCCTCCCCGAGTTGCTGAGCACGGCCCGGCTTCGGGTGCGGGGCTCCGTGCGGGGCGTGGCGCGGGGCTCGCCGTGCCGGGCGGGGGGTGGCGGCAGGTGGGGGTGCCGGGCGGGGCGGGGCCGCCTCGGGCCGGGGAGGGCTCGGGGGAGGGGCGCGGCGGCCCCCGGAGCGCCGGCGGCTGTCGAGGCGCGGCGAGCCGCAGCCATTGCCTTTTATGGTAATCGTGCGAGAGGGCGCAGGGACTTCCTTTGTCCCAAATCTGTGCGGAGCCGAAATCTGGGAGGCGCCGCCGCACCCCCTCTAGCGGGCGCGGGGCGAAGCGGTGCGGCGCCGGCAGGAAGGAAATGGGCGGGGAGGGCCTTCGTGCGTCGCCGCGCCGCCGTCCCCTTCTCCCTCTCCAGCCTCGGGGCTGTCCGCGGGGGGACGGCTGCCTTCGGGGGGGACGGGGCAGGGCGGGGTTCGGCTTCTGGCGTGTGACCGGCGGCTCTAGAGCCTCTGCTAACCATGTTCATGCCTTCTTCTTTTTCCTACAG
例示的なCAGエンハンサー/プロモーター(配列番号28)
GACATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGACTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGGTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCGGGAGTCGCTGCGTTGCCTTCGCCCCGTGCCCCGCTCCGCGCCGCCTCGCGCCGCCCGCCCCGGCTCTGACTGACCGCGTTACTCCCACAGGTGAGCGGGCGGGACGGCCCTTCTCCTCCGGGCTGTAATTAGCGCTTGGTTTAATGACGGCTCGTTTCTTTTCTGTGGCTGCGTGAAAGCCTTAAAGGGCTCCGGGAGGGCCCTTTGTGCGGGGGGGAGCGGCTCGGGGGGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGTGGGGAGCGCCGCGTGCGGCCCGCGCTGCCCGGCGGCTGTGAGCGCTGCGGGCGCGGCGCGGGGCTTTGTGCGCTCCGCGTGTGCGCGAGGGGAGCGCGGCCGGGGGCGGTGCCCCGCGGTGCGGGGGGGCTGCGAGGGGAACAAAGGCTGCGTGCGGGGTGTGTGCGTGGGGGGGTGAGCAGGGGGTGTGGGCGCGGCGGTCGGGCTGTAACCCCCCCCTGCACCCCCCTCCCCGAGTTGCTGAGCACGGCCCGGCTTCGGGTGCGGGGCTCCGTGCGGGGCGTGGCGCGGGGCTCGCCGTGCCGGGCGGGGGGTGGCGGCAGGTGGGGGTGCCGGGCGGGGCGGGGCCGCCTCGGGCCGGGGAGGGCTCGGGGGAGGGGCGCGGCGGCCCCCGGAGCGCCGGCGGCTGTCGAGGCGCGGCGAGCCGCAGCCATTGCCTTTTATGGTAATCGTGCGAGAGGGCGCAGGGACTTCCTTTGTCCCAAATCTGTGCGGAGCCGAAATCTGGGAGGCGCCGCCGCACCCCCTCTAGCGGGCGCGGGGCGAAGCGGTGCGGCGCCGGCAGGAAGGAAATGGGCGGGGAGGGCCTTCGTGCGTCGCCGCGCCGCCGTCCCCTTCTCCCTCTCCAGCCTCGGGGCTGTCCGCGGGGGGACGGCTGCCTTCGGGGGGGACGGGGCAGGGCGGGGTTCGGCTTCTGGCGTGTGACCGGCGGCTCTAGAGCCTCTGCTAACCATGTTCATGCCTTCTTCTTTTTCCTACAG
特定の実施形態では、プロモーターは、配列番号29で表される内因性ヒトATOH1エンハンサー-プロモーターである。いくつかの実施形態では、エンハンサー-プロモーター配列は、配列番号29によって表されるエンハンサー-プロモーター配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。
例示的なヒトATOH1エンハンサー-プロモーター(配列番号29)
CTATGGAGTTTGCATAACAAACGTTTGGCAGCTCGCTCTCTTACACTCCATTAACAAGCTGTAACATATAGCTGCAGGTTGCTATAATCTCATTAATATTTTGGAAACTTGAATATTGAGTATTTCTGAGTGCTCATTCCCCATATGCCAGCCACTTCTGCCATGCTGACTGGTTCCTTTCTCTCCATTATTAGCAATTAGCTTCTTACCTTCCAAAGTCAGATCCAAGGTATCCAAGATACTAGCAAAGGAATCAACTATGTGTGCAAGTTAAGCATGCTTAATATCACCCAAACAAACAAAGAGGCAGCATTTCTTAAAGTAATGAAGATAGATAAATCGGGTTAGTCCTTTGCGACACTGCTGGTGCTTTCTAGAGTTTTATATATTTTAAGCAGCTTGCTTTATATTCTGTCTTTGCCTCCCACCCCACCAGCACTTTTATTTGTGGAGGGTTTTGGCTCGCCACACTTTGGGAAACTTATTTGATTTCACGGAGAGCTGAAGGAAGATCATTTTTGGCAACAGACAAGTTTAAACACGATTTCTATGGGACATTGCTAACTGGGGCCCCTAAGGAGAAAGGGGAAACTGAGCGGAGAATGGGTTAAATCCTTGGAAGCAGGGGAGAGGCAGGGGAGGAGAGAAGTCGGAGGAGTATAAAGAAAAGGACAGGAACCAAGAAGCGTGGGGGTGGTTTGCCGTAATGTGAGTGTTTCTTAATTAGAGAACGGTTGACAATAGAGGGTCTGGCAGAGGCTCCTGGCCGCGGTGCGGAGCGTCTGGAGCGGAGCACGCGCTGTCAGCTGGTGAGCGCACTCTCCTTTCAGGCAGCTCCCCGGGGAGCTGTGCGGCCACATTTAACACCATCATCACCCCTCCCCGGCCTCCTCAACCTCGGCCTCCTCCTCGTCGACAGCCTTCCTTGGCCCCCACCAGCAGAGCTCACAGTAGCGAGCGTCTCTCGCCGTCTCCCGCACTCGGCCGGGGCCTCTCTCCTCCCCCAGCTGCGCAGCGGGAGCCGCCACTGCCCACTGCACCTCCCAGCAACCAGCCCAGCACGCAAAGAAGCTGCGCAAAGTTAAAGCCAAGCAATGCCAAGGGGAGGGGAAGCTGGAGGCGGGCTTTGAGTGGCTTCTGGGCGCCTGGCGGGTCCAGAATCGCCCAGAGCCGCCCGCGGTCGTGCACATCTGACCCGAGTCAGCTTGGGCACCAGCCGAGAGCCGGCTCCGCACCGCTCCCGCACCCCAGCCGCCGGGGTGGTGACACACACCGGAGTCGAATTACAGCCCTGCAATTAACATATGAATCTGACGAATTTAAAAGAAGGAAAAAAAAAAAAAAACCTGAGCAGGCTTGGGAGTCCTCTGCACACAAGAACTTTTCTCGGGGTGTAAAAACTCTTTGATTGGCTGCTCGCACGCGCCTGCCCGCGCCCTCCATTGGCTGAGAAGACACGCGACCGGCGCGAGGAGGGGGTTGGGAGAGGAGCGGGGGGAGACTGAGTGGCGCGTGCCGCTTTTTAAAGGGGCGCAGCGCCTTCAGCAACCGGAGAAGCATAGTTGCACGCGACCTGGTGTGTGATCTCCGAGTGGGTGGGGGAGGGTCGAGGAGGGAAAAAAAAATAAGACGTTGCAGAAGAGACCCGGAAAGGGCCTTTTTTTTGGTTGAGCTGGTGTCCCAGTGCTGCCTCCGATCCTGAGCCTCCGAGCCTTTGCAGTGCAA
特定の実施形態では、プロモーターは、配列番号30または31で表される内因性ヒトSLC26A4即時プロモーターである。特定の実施形態では、プロモーターは、配列番号32、33または34で表される内因性ヒトSLC26A4エンハンサー-プロモーターである。いくつかの実施形態では、エンハンサー-プロモーター配列は、配列番号30、31、32、33、または34によって表されるプロモーターまたはエンハンサー-プロモーター配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。特定の実施形態では、プロモーターは、配列番号32、33、または34内に含まれるヒトSLC26A4内因性エンハンサー-プロモーター配列である。
例示的なヒトSLC26A4即時プロモーター(配列番号30)
CTGCCTTCTGAGAGCGCTATAAAGGCAGCGGAAGGGTAGTCCGCGGGGCATTCCGGGCGG
例示的なヒトSLC26A4即時プロモーター(配列番号31)
CTCTAGGCGGGCTCTGCTCTTCTTTAAGGAGTCCCACAGGGCCTGGCCCGCCCCTGACCT
例示的なヒトSLC26A4エンハンサー-プロモーター(配列番号32)
TAAAGAGTTGTGAGTTGTGTAGGTGAGTTGCCATGGAGCTACAAATATGAGTTGATATTCTGAAATCCTAGACAGCCATCTCCAAGGTTAAGAAAAATCCTTATGCACTCACTTGCAAAGATATCCACAGCATGCTCTTAATGGAGAAAAACAAAGCCTTAGATCAAATATGTAAAGTAATTTTTAGTTTTTTGAAAAGGTATGTTTGGGCTATAGATAAATCTGTTCAAAAAACATGAGAGAAGATAATAATGGTTGAAAGGAGACACAGTGCTTGCCCTCAAGAAGTTTTTGTCTAGTGAGGGAGAGAGAACTTGTATGTAAATAAAATTGTGTTACTAAGGTAGATAGTGAGAAGTAACTTAAGAGAGGATCAGATAAGGTATTAAGAGAATACAGAAAAGGGTCTGGATTAATTCTGAACAGCATCAAAGAATGTTCTTGCAAGAGATAGTGTTTTCACCAGATCTTGAAGGTATGGATGAGGGTATACAGAGTGAGTATATTCAGATTCTACTTTAAAACAAATACTTTCCTCTGTTGTAGTGGAGTTGAGCTATACATCCAACAATAATGAAAAAATACACGCATATATACATATATGGAGAGAGATACATATTTTAGTACATGTAGCAATTGATTAATAAATGTACAGTTTAAGTCGCATGCAAAACCTTGGAGTGATAGCAAACTTCATTGTAGGATGTTTAGCAGCATCTCTGGTCTCTACTCACTAGATCCCAATAGCATCTCCCTAGGTGTGACAACCAAAAATGTCTCCAGGCATTGACCTCTGGAGGCAAAAAAAGCCCTTTATTAAGAACCAGTGGTATACATAAGTAAAACATACACAAGAGATTCCTCCCCTCTTCTCTGTATGTGAATAAAAATTGCAAAGTTCATGACCTGGATTTTCCTTTTAGGTTTCTTCTTTAGTGGTTCTTAACTTCATTGGGTGAAGTAAGCCTTTGAAGATCTGTTGAAAGCTGTTGACTCATTCACTTCTCAGGAAAACGCACATGCTGACTACCATTTCAGAGAATTTGCATCAGGGTTCTCTGGGGAGGAGTTCTGAGTTCTGTTTCCAGGAGCTCGTAGAATTGTCATGGTCTGCATATGCAAGGCAGGTGGATTACGGAAGGTTGATGTACAGAGGTCTGTATTTTGGAGCCTCTTCTGTATTTACTTCAGAACACTAACAATCAGGCGAGAATGTTCTGGTTTATCAAACCCTTCCTTCTGCCTTTCATCTTAACCATGCATTAGTTTTAACAAAGTTCATCCCAACAGAAGACAAAACACTGATGAGGTAGGATAGCTCCAGCTCCTCCTCCCTCTCTTCTAGTCTTGATTTCCATGTAGTCCAGTTTATTCCTTCCCTGATTGTCCAGGAGAATGAGAAAAAGAAAAAACAGAGTCTAGTGGGTAAGAAAGGGCCACCTGGACGGCTTGATTTGGATTGTGAAATAAAACACACACACATGCACACGTAGAATAAGTGGCTAAAATCTGAGTAAATCGTGAACTCTCTGTATCCTCCACCCATTGAATACTCCTAAAAGACTTTCTAGAAATTCAAGGACTTATTAATATAGAAACCTGGCCATTGTTCCTCTTCTCCTCCCCATGTGGTATGAGAGCACCTGTGGCAGGCTCCCAGAGACCACGGACCTCTTCCTCTAGGCGGGCTCTGCTCTTCTTTAAGGAGTCCCACAGGGCCTGGCCCGCCCCTGACCTCGCAACCCTTGAGATTAGTAACGGGATGAGTGAGGATCCGGGTGGCCCCTGCGTGGCAGCCAGTAAGAGTCTCAGCCTTCCCGGTTCGGGAAAGGGGAAGAATGCAGGAGGGGTAGGATTTCTTTCCTGATAGGATCGGTTGGGAAAGACCGCAGCCTGTGTGTGTCTTTCCCTTCGACCAAGGTGTCTGTTGCTCCGTAAATAAAACGTCCCACTGCCTTCTGAGAGCGCTATAAAGGCAGCGGAAGGGTAGTCCGCGGGGC
例示的なヒトSLC26A4エンハンサー-プロモーター(配列番号33)
GGCTGCTCGGAAAACAGGACGAGGGGAGAGACTTGCTCAATAAGCTGAAAGTTCTGCCCCCGAGAGGGCTGCGACAGCTGCTGGAATGTGCCTGCAGCGTCCGCCTCTTGGGGACCCGCGGAGCGCGCCCTGACGGTTCCACGCCTGGCCCGGGGGTCTGCACCTCTCCTCCAGTGCGCACCTGGAGCTGCGTCCCGGGTCAGGTGCGGGGAGGGAGGGAATCTCAGTGTCCCCTTCCAGCCTTGCAAGCGCCTTTGGCCCCTGCCCCAGCCCCTCGGTTTGGGGGAGATTTCAGAACGCGGACAGCGCCCTGGCTGCGGGCCATAGGGGACTGGGTGGAACTCGGGAAGCCCCCAGAGCAGGGGCTTACTCGCTTCAAGTTTGGGGAACCCCGGGCAGCGGGTGCAGGCCACGAGACCCGAAGGTTCTCAGGTGCCCCCCTGCAGGCTGGCCGTGCGCGCCGTGGGGCGCTTGTCGCGAGCGCCGAGGGCTGCAGGACGCGGACCAGACTCGCGGTGCAGGGGGGCCTGGCTGCAGCTAACAGGTGATCCCGTTCTTTCTGTTCCTCGCTCTTCCCCTCCGATCGTCCTCGCTTACCGCGTGTCCTCCCTCCTCGCTGTCCTCTGGCTCGCAGGTCATGGCAGCGCCAGGCGGCAGGTCGGAGCCGCCGCAGCTCCCCGAGTACAGCTGCAGCTACATGGTGTCGCGGCCGGTCTACAGCGAGCTCGCTTTCCAGCAACAGCACGAGCGGCGCCTGCAGGAGCGCAAGACGCTGCGGGAGAGCCTGGCCAAGTGCTGCAGGTAGCGGCCGCGCGGGCCTGCGTAGAGAGAAGCGGAGCGGGGCGTCCACGCCTTGGGGAGGGAAGGGCGTCCCCAGCGGGCGAGAGTGGGGTGCGGGCGGCGGAGCCCCTGGGCGCCAGCTGCTTCTCCCAGAGGCCCGACTTTCGGTCTCCGGTCCTCCACGCCGCCCTTCTGGTGGGAGGGTGGCTCCATCAGTCTCGGGCCCGAAATGAACTTACCTGGGAAACTCGCCTTTGGGGAGAGTGGGTTCTAGGAGCCCCGTCTCTCTTTTTCCTCTCTGAAGGAAACTTGGAGTGCCTCTTGGGGTACAGTGGGTCCCTGTTGCCTTCTTGGGAGCTTGTTTAAATGAAATGAATAGGGAAACCCAGCTCTTGACCAGGAGGAGTCCTTGAAACACTCAAGCTAAGTAGGCGGGCTACCATTCAGTTAGAGACCAGGATGCAAGCTAGAACCCAGGGGAGCGCGGGGTGTGCCAAGTACTTCATCAGCAGGCTGTGGGACCCCTGGGGAAAGCCACCCTCAGTCTCTAAACCCAAACATGCCGTAACTAGATGTCACAAACATAAAGAAATTAGAGTTTCTAAAACCTTTCATTATAG
例示的なヒトSLC26A4エンハンサー-プロモーター(配列番号34)
CGGAAGGTTGATGTACAGAGGTCTGTATTTTGGAGCCTCTTCTGTATTTACTTCAGAACACTAACAATCAGGCGAGAATGTTCTGGTTTATCAAACCCTTCCTTCTGCCTTTCATCTTAACCATGCATTAGTTTTAACAAAGTTCATCCCAACAGAAGACAAAACACTGATGAGGTAGGATAGCTCCAGCTCCTCCTCCCTCTCTTCTAGTCTTGATTTCCATGTAGTCCAGTTTATTCCTTCCCTGATTGTCCAGGAGAATGAGAAAAAGAAAAAACAGAGTCTAGTGGGTAAGAAAGGGCCACCTGGACGGCTTGATTTGGATTGTGAAATAAAACACACACACATGCACACGTAGAATAAGTGGCTAAAATCTGAGTAAATCGTGAACTCTCTGTATCCTCCACCCATTGAATACTCCTAAAAGACTTTCTAGAAATTCAAGGACTTATTAATATAGAAACCTGGCCATTGTTCCTCTTCTCCTCCCCATGTGGTATGAGAGCACCTGTGGCAGGCTCCCAGAGACCACGGACCTCTTCCTCTAGGCGGGCTCTGCTCTTCTTTAAGGAGTCCCACAGGGCCTGGCCCGCCCCTGACCTCGCAACCCTTGAGATTAGTAACGGGATGAGTGAGGATCCGGGTGGCCCCTGCGTGGCAGCCAGTAAGAGTCTCAGCCTTCCCGGTTCGGGAAAGGGGAAGAATGCAGGAGGGGTAGGATTTCTTTCCTGATAGGATCGGTTGGGAAAGACCGCAGCCTGTGTGTGTCTTTCCCTTCGACCAAGGTGTCTGTTGCTCCGTAAATAAAACGTCCCACTGCCTTCTGAGAGCGCTATAAAGGCAGCGGAAGGGTAGTCCGCGGGGCATTCCGGGCGGGGCGCGAGCAGAGACAGGTGAGTT
特定の実施形態では、プロモーターは、配列番号35で表されるヒトLGR5エンハンサー-プロモーターである。いくつかの実施形態では、エンハンサー-プロモーター配列は、配列番号35によって表されるエンハンサー-プロモーター配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。いくつかの実施形態では、プロモーターは、配列番号35内に含まれるヒトLGR5内因性エンハンサー-プロモーター配列である。
例示的なヒトLGR5エンハンサー-プロモーター(配列番号35)
AGGGCTATTTGTACCTCAACGAGGGCTTCTCTCCAAGAAAGCCCTGAATCCTTTTCCTCCTTTTTCCTGCAGATTCACTATAGGACACTTTTTGAAGCAAGAGCATGCATTTTCCCCCTGGCGCTCTGCAGCGGTTCTCAGAGCCCAGTGTCACTCACATAGGTGGGACTGCTCTCAGTTCAGAGAGCGCTGGGACACTTAAGATGAAAAGTCCCTGGAAGTTAGCAAACAGCCATCTGTCACTCTGGCATCGATTTACTAAAAGTGACTTCTAGGGTATTCTAAACCACTTTTAAAAAACAAATGAGTCACTTCGACTTCCTCACCCCGCAAGAGATAGGAAGGCAGCAGTGGAGTGCTCGCTCAGGAGCTGTATTTGTTTAGCGATTAGCCTAGAGCTTTGATTTTAGGGCAAAAGCGAGCCAGACAGTGCGGCAGACGTAAGGATCAAAAAGGCCACCTATCATTCGCCGGGGACGCCTGCCTCCTTACCCTGATAACGTAACTATTTCTCTGCATAGGATTTTAGTTTTTGTGTTTTTGTTTTGTTTTATTCTGTTTAATCACTTCAAGTATCTCATCCATTATTTGAAGCGGGCTCGGAGGAAACGTGCCGCATCCTCCAGTCCTTGTGCGTCTGTTTAGGTCTCTCCGAAGCAGGTCCCTCTCGACTCTTAGATCTGGGTCTCCAGCACGCATGAAGGGGTAAGGGTGGGGGGGTCCCCTATTCCGGCGCGCGGCGTTGAGCACTGAATCTTCCAGGCGGAGGCTCAGTGGGAGCGCCGAGAACTCGCCAGTACCGCGCGCTGCCTGCTGCCTGCTGCCTCCCAGCCCAGGACTTGGGAAAGGAGGGAGGGGACAAGTGGAGGGAAAGTGGGGCCGGGCGGGGGGTGCCTGGGAAGCCAGGCTGCGCTGACGTCACTGGGCGCGCAATTCGGGCTGGAGCGCTTTAAAAAACGAGCGTGCAAGCAGAGATGCTGCTCCACACCGCTCAGGCCGCGAGCAGCAGCAAGGCGCACCGCCACTGTCGCCGCTGCAGCCAGGGCTGCTCCGAAGGCCGGCGTGGCGGCAACCGGCACCTCTGTCCCCGCCGCGCTTCTCCTCGCCGCCCACGCCGTGGGGTCAGGAACGCGGCGTCTGGCGCTGCAGACGCCCGCTGAGTTGCAGAAGCCCACGGAGCGGCGCCCGGCGCGCCACGGCCCGTAGCAGTCCGGTGCTGCTCTCCGCCCGCGTCCGGCTCGTGGCCCCCTACTTCGGGCACCGACCGGT
特定の実施形態では、プロモーターは、配列番号36で表されるヒトSYN1エンハンサー-プロモーターである。いくつかの実施形態では、エンハンサー-プロモーター配列は、配列番号36によって表されるエンハンサー-プロモーター配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。いくつかの実施形態では、プロモーターは、配列番号36内に含まれるヒトSYN1内因性エンハンサー-プロモーター配列である。
例示的なヒトSYN1エンハンサー-プロモーター(配列番号36)
TGCGTATGAGTGCAAGTGGGTTTTAGGACCAGGATGAGGCGGGGTGGGGGTGCCTACCTGACGACCGACCCCGACCCACTGGACAAGCACCCAACCCCCATTCCCCAAATTGCGCATCCCCTATCAGAGAGGGGGAGGGGAAACAGGATGCGGCGAGGCGCGTGCGCACTGCCAGCTTCAGCACCGCGGACAGTGCCTTCGCCCCCGCCTGGCGGCGCGCGCCACCGCCGCCTCAGCACTGAAGGCGCGCTGACGTCACTCGCCGGTCCCCCGCAAACTCCCCTTCCCGGCCACCTTGGTCGCGTCCGCGCCGCCGCCGGCCCAGCCGGACCGCACCACGCGAGGCGCGAGATAGGGGGGCACGGGCGCGACCATCTGCGCTGCGGCGCCGGCGACTCAGCGCTGCCTCAGTCTGCGGTGGGCAGCGGAGGAGTCGTGTCGTGCCTGAGAGCGCAGTCGAGAA
特定の実施形態では、プロモーターは、配列番号37で表されるヒトGFAPエンハンサー-プロモーターである。いくつかの実施形態では、エンハンサー-プロモーター配列は、配列番号37によって表されるエンハンサー-プロモーター配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。いくつかの実施形態では、プロモーターは、配列番号37内に含まれるヒトGFAP内因性エンハンサー-プロモーター配列である。
例示的なヒトGFAPエンハンサー-プロモーター(配列番号37)
CCCACCTCCCTCTCTGTGCTGGGACTCACAGAGGGAGACCTCAGGAGGCAGTCTGTCCATCACATGTCCAAATGCAGAGCATACCCTGGGCTGGGCGCAGTGGCGCACAACTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCTGATGTGGAAGGATCACTTGAGCCCAGAAGTTCTAGACCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCCTATCTCTACAAAAAAAGTTAAAAAATCAGCCACGTGTGGTGACACACACCTGTAGTCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGTGAGGGGATCACTTAAGGCTGGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGTCGTGGTTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGTGAGACCCTGTCTCAAAAGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACATATCCTGGTGTGGAGTAGGGGACGCTGCTCTGACAGAGGCTCGGGGGCCTGAGCTGGCTCTGTGAGCTGGGGAGGAGGCAGACAGCCAGGCCTTGTCTGCAAGCAGACCTGGCAGCATTGGGCTGGCCGCCCCCCAGGGCCTCCTCTTCATGCCCAGTGAATGACTCACCTTGGCACAGACACAATGTTCGGGGTGGGCACAGTGCCTGCTTCCCGCCGCACCCCAGCCCCCCTCAAATGCCTTCCGAGAAGCCCATTGAGCAGGGGGCTTGCATTGCACCCCAGCCTGACAGCCTGGCATCTTGGGATAAAAGCAGCACAGCCCCCTAGGGGCTGCCCTTGCTGTGTGGCGCCACCGGCGGTGGAGAACAAGGCTCTATTCAGCCTGTGCCCAGGAAAGGGGATCAGGGGATGCCCAGGCATGGACAGTGGGTGGCAGGGGGGGAGAGGAGGGCTGTCTGCTTCCCAGAAGTCCAAGGACACAAATGGGTGAGGGGACTGGGCAGGGTTCTGACCCTGTGGGACCAGAGTGGAGGGCGTAGATGGACCTGAAGTCTCCAGGGACAACAGGGCCCAGGTCTCAGGCTCCTAGTTGGGCCCAGTGGCTCCAGCGTTTCCAAACCCATCCATCCCCAGAGGTTCTTCCCATCTCTCCAGGCTGATGTGTGGGAACTCGAGGAAATAAATCTCCAGTGGGAGACGGAGGGGTGGCCAGGGAAACGGGGCGCTGCAGGAATAAAGACGAGCCAGCACAGCCAGCTCATGTGTAACGGCTTTGTGGAGCTGTCAAGGCCTGGTCTCTGGGAGAGAGGCACAGGGAGGCCAGACAAGGAAGGGGTGACCTGGAGGGACAGATCCAGGGGCTAAAGTCCTGATAAGGCAAGAGAGTGCCGGCCCCCTCTTGCCCTATCAGGACCTCCACTGCCACATAGAGGCCATGATTGACCCTTAGACAAAGGGCTGGTGTCCAATCCCAGCCCCCAGCCCCAGAACTCCAGGGAATGAATGGGCAGAGAGCAGGAATGTGGGACATCTGTGTTCAAGGGAAGGACTCCAGGAGTCTGCTGGGAATGAGGCCTAGTAGGAAATGAGGTGGCCCTTGAGGGTACAGAACAGGTTCATTCTTCGCCAAATTCCCAGCACCTTGCAGGCACTTACAGCTGAGTGAGATAATGCCTGGGTTATGAAATCAAAAAGTTGGAAAGCAGGTCAGAGGTCATCTGGTACAGCCCTTCCTTCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGAGACAAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGGCGCAAACACAGCTCACTGCAGCCTCAACCTACTGGGCTCAAGCAATCCTCCAGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGCCACCCCACTCAGCCCTTTCCTTCCTTTTTAATTGATGCATAATAATTGTAAGTATTCATCATGGTCCAACCAACCCTTTCTTGACCCACCTTCCTAGAGAGAGGGTCCTCTTGCTTCAGCGGTCAGGGCCCCAGACCCATGGTCTGGCTCCAGGTACCACCTGCCTCATGCAGGAGTTGGCGTGCCCAGGAAGCTCTGCCTCTGGGCACAGTGACCTCAGTGGGGTGAGGGGAGCTCTCCCCATAGCTGGGCTGCGGCCCAACCCCACCCCCTCAGGCTATGCCAGGGGGTGTTGCCAGGGGCACCCGGGCATCGCCAGTCTAGCCCACTCCTTCATAAAGCCCTCGCATCCCAGGAGCGAGCAGAGCCAGAGCAGGTTGGAGAGGAGACGCATCACCTCCGCTGCTCGC
エンハンサー
いくつかの例では、構築物は、エンハンサー配列を含み得る。「エンハンサー」という用語は、目的のタンパク質(例えば、クラリン1タンパク質)をコードする核酸の転写レベルを増加させることができるヌクレオチド配列を指す。エンハンサー配列(概して、50~1500bp長)は、概して、転写関連タンパク質(例えば、転写因子)にさらなる結合部位を提供することによって転写レベルを増加させる。いくつかの実施形態において、エンハンサー配列はイントロン配列内に見いだされる。プロモーター配列とは異なり、エンハンサー配列は、(例えば、プロモーターと比較して)転写開始部位からはるかに遠く離れて作用することができる。エンハンサーの非限定的な例としては、RSVエンハンサー、CMVエンハンサー、及び/またはSV40エンハンサーが挙げられる。いくつかの実施形態では、構築物は、配列番号38によって例示されるCMVエンハンサーを含む。いくつかの実施形態では、エンハンサー配列は、配列番号38によって表されるエンハンサー配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。いくつかの実施形態では、SV-40由来のエンハンサーは、配列番号39によって例示されるSV-40 Tイントロン配列である。いくつかの実施形態では、エンハンサー配列は、配列番号39によって表されるエンハンサー配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。
例示的なCMVエンハンサー(配列番号38)
GACATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGACTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGG
例示的なSV-40合成イントロン(配列番号39)
GGAGTCGCTGCGTTGCCTTCGCCCCGTGCCCCGCTCCGCGCCGCCTCGCGCCGCCCGCCCCGGCTCTGACTGACCGCGTTACTCCCACAGGTGAGCGGGCGGGACGGCCCTTCTCCTCCGGGCTGTAATTAGCGCTTGGTTTAATGACGGCTCGTTTCTTTTCTGTGGCTGCGTGAAAGCCTTAAAGGGCTCCGGGAGGGCCCTTTGTGCGGGGGGGAGCGGCTCGGGGGGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGTGGGGAGCGCCGCGTGCGGCCCGCGCTGCCCGGCGGCTGTGAGCGCTGCGGGCGCGGCGCGGGGCTTTGTGCGCTCCGCGTGTGCGCGAGGGGAGCGCGGCCGGGGGCGGTGCCCCGCGGTGCGGGGGGGCTGCGAGGGGAACAAAGGCTGCGTGCGGGGTGTGTGCGTGGGGGGGTGAGCAGGGGGTGTGGGCGCGGCGGTCGGGCTGTAACCCCCCCCTGCACCCCCCTCCCCGAGTTGCTGAGCACGGCCCGGCTTCGGGTGCGGGGCTCCGTGCGGGGCGTGGCGCGGGGCTCGCCGTGCCGGGCGGGGGGTGGCGGCAGGTGGGGGTGCCGGGCGGGGCGGGGCCGCCTCGGGCCGGGGAGGGCTCGGGGGAGGGGCGCGGCGGCCCCCGGAGCGCCGGCGGCTGTCGAGGCGCGGCGAGCCGCAGCCATTGCCTTTTATGGTAATCGTGCGAGAGGGCGCAGGGACTTCCTTTGTCCCAAATCTGTGCGGAGCCGAAATCTGGGAGGCGCCGCCGCACCCCCTCTAGCGGGCGCGGGGCGAAGCGGTGCGGCGCCGGCAGGAAGGAAATGGGCGGGGAGGGCCTTCGTGCGTCGCCGCGCCGCCGTCCCCTTCTCCCTCTCCAGCCTCGGGGCTGTCCGCGGGGGGACGGCTGCCTTCGGGGGGGACGGGGCAGGGCGGGGTTCGGCTTCTGGCGTGTGACCGGCGGCTCTAGAGCCTCTGCTAACCATGTTCATGCCTTCTTCTTTTTCCTACAG
隣接非翻訳領域、5’UTR及び3’UTR
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の構築物のいずれも、5’UTRまたは3’UTRなどの非翻訳領域(UTR)を含むことができる。遺伝子のUTRは、転写されるが翻訳はされない。5’UTRは、転写開始部位で開始し、開始コドンまで継続するが開始コドンは含まない。3’UTRは、終止コドン直後から開始し、転写終結シグナルまで続く。UTRの調節及び/または制御機能は、クラリン1タンパク質の発現を増強するかまたは別の方法で調節するために、本明細書に記載の構築物、組成物、キット、または方法のいずれかに組み込むことができる。
天然の5’UTRは、翻訳開始に関与する配列を含む。いくつかの実施形態では、5’UTRは、リボソームが多くの遺伝子の翻訳を開始するプロセスにおいて関与することが一般に知られているKozak配列などの配列を含むことができる。Kozak配列は、コンセンサス配列CCR(A/G)CCAUGGを有し、ここで、Rは、開始コドン(AUG)の3塩基上流のプリン(AまたはG)であり、開始コドンの後には別の「G」が続く。5’UTRはまた、伸長因子の結合に関与する二次構造を形成することが知られている。
いくつかの実施形態では、5’UTRが、本明細書に記載される構築物のうちのいずれかに含まれる。5’UTRの非限定的な例(以下の遺伝子:アルブミン、血清アミロイドA、アポリポタンパク質A/B/E、トランスフェリン、アルファフェトプロテイン、エリスロポエチン、及び第VIII因子からのものを含む)を使用して、核酸分子(例えば、mRNA)の発現を増強することができる。
いくつかの実施形態において、蝸牛内の細胞によって転写されるmRNAからの5’UTRが、本明細書に記載される任意の構築物、組成物、キット、及び方法に含まれ得る。いくつかの実施形態では、5’UTRは、内因性CLRN1遺伝子座に由来し、配列番号40によって例示される内因性配列のすべてまたは一部を含み得る。いくつかの実施形態では、5’UTR配列は、配列番号40によって表される5’UTR配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。
3’UTRは、目的の遺伝子の終止コドンの3’のすぐ近くに見出される。いくつかの実施形態において、蝸牛内の細胞によって転写されるmRNAからの3’UTRが、本明細書に記載される任意の構築物、組成物、キット、及び方法に含まれ得る。いくつかの実施形態では、3’UTRは、内因性CLRN1遺伝子座に由来し、配列番号41によって例示される内因性配列のすべてまたは一部を含み得る。いくつかの実施形態では、3’UTR配列は、配列番号41によって表される3’UTR配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。
3’UTRは、それらの中に埋め込まれたアデノシン及びウリジン(RNA形態で)またはチミジン(DNA形態で)のストレッチを有することが知られている。これらのAUリッチシグネチャーは、高い回転率を有する遺伝子内で特に広く見られる。これらの配列特徴及び機能的特性に基づいて、AUリッチエレメント(ARE)は以下の3つのクラスに分離することができる(例えば、Chen et al.,Mal.Cell.Biol.15:5777-5788,1995;Chen et al.,Mal.Cell Biol.15:2010-2018,1995,これらのそれぞれは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、を参照):クラスI AREは、Uリッチ領域内にいくつかの分散したAUUUAモチーフのコピーを含む。例えば、c-Myc及びMyoD mRNAは、クラスI AREを含む。クラスII AREは、2つ以上の重複するUUAUUUA(U/A)(U/A)九量体を有する。GM-CSF及びTNF-アルファmRNAは、クラスII AREを含む例である。クラスIII AREはそれほど十分に定義されていない。これらのUリッチ領域には、AUUUAモチーフを含まないが、十分に研究されているこのクラスの2つの例は、c-Jun及びmyogenin mRNAである。
AREに結合するほとんどのタンパク質はメッセンジャーを不安定にすることが知られており、一方ELAVファミリーのメンバー、とりわけHuRはmRNAの安定性を増加させることが実証されている。HuRは、これら3つのクラス全てのAREに結合する。HuR特異的結合部位を核酸分子の3’UTRに導入操作することにより、HuR結合、ひいてはin vivoでのメッセージの安定化がもたらされよう。
いくつかの実施形態では、3’UTR AREの導入、除去、または修飾を用いて、クラリン1タンパク質をコードするmRNAの安定性を調節することができる。他の実施形態では、AREを除去するか、または変異させて、クラリン1タンパク質の細胞内安定性を増加させ、ひいてはその翻訳及び生産を増加させることができる。
他の実施形態では、非ARE配列が5’または3’UTRに組み込まれてもよい。いくつかの実施形態において、イントロンまたはイントロン配列の部分は、本明細書で提供される任意の構築物、組成物、キット、及び方法におけるポリヌクレオチドの隣接領域に組み込まれ得る。イントロン配列の組み込みは、タンパク質産生及びmRNAレベルを増加させ得る。
例示的な5’UTR配列(配列番号40)
AGGAGATACTTGAAGGCAGTTTGAAAGACTTGTTTTACAGATTCTTAGTCCAAAGATTTCCAATTAGGGAGAAGAAGCAGCAGAAAAGGAGAAAAGCCAAGTATGAGTGATGATGAGGCCTTCATCTACTGACATTTAACCTGGCGAGAACCGTCGATGGTGAAGTTGCCTTTTCAGCTGGGAGCTGTCCGTTCAGCTTCCGTAATAAATGCAGTCAAAGAGGCAGTCCCTTCCCATTGCTCACAAAGGTCTTGTTTTTGAACCTCGCCCTCACAGAAGCCGTTTCTCATC
例示的な3’UTR配列(配列番号41)
AAGGCAAACCTTTCTATAATTTTACAAGGGAGTAGACTTGCTTTGGTCACTTTTAGATGTGGTTAATTTTGCATATCCTTTTAGTCTGCATATATTAAAGCATCAGGACCCTTCGTGACAATGTTTACAAATTACGTACTAAGGATACAGGCTGGAAAGTAAGGGAAGCAGAAGGAAGGCTTTGAAAAGTTGTTTTATCTGGTGGGAAATTGCTTGACCCAGGTAGTCAAAGGCAGTTGACTAGAATCGACAAATTGTTACTCCATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATGTCTTCCTATCAAAAAGATATCAAAGGCACATGGAATATATTTTAATAAAAACAAATAATATCTCTAATATATCCACACATTTGTTGCCAGATTTCAGAAAACTGAGCTGCAATCGCTTTCCTAAAACAGTAGTGTATTAAATGAACATCTATAAAATGTATCAACACACATTTTAAAAAATTTGTTTAAAGTATACTCTTAGGCCAGGCGTGGTGACTCACACCTGTAATTCCAGCACTTCAGGAGGCCAAGGTGGGAAGATCATTTGAGTTCAGGAGTTCGAGTTACAGCCTGGGCAATAAAGTGAGACCCTGTCACTAACAAAATTAAAAAATAAAATAAATATAAAATATAGGCTTTAAAAAAGCATAGTCTTATTAACCATGTCTGTTGGTCAAAATCTGCAAACTCTAAAAGAAGAAAAGAAGAAAAAACCAACGTTAGGGTATTTTTCCTCCCGTGCCTGAGTCCCAATTACATTCACGACAGTACTTTCAATGAACATAATTGTTAGGACCACTGAGGAATCATGAAAAATGATCTCTGCTTAGTACATTTGATGCAAAATGACTTATTAGGGGCTGTTTTTCTAGCTATAGTGTCTCGAGTACTAATATGCAATTATGAAAATTATATTAAATCTGGGATTATGACGGTATCACTGTATCATCTTGGTCTTGTTCTGGCTGTCACCAAGCATGACCCAGGTCAACTTTTTTTTTCCCCTGAATTACCCATCAAATTGATCTGCAGCTGACTAAAGGCCACAGCTGAGCCTGGAACTGACCCTTCCTTCATCCTCAACCTGCTGTCCTCCAGAAAGCACCAAGGAAAAAGCAGAGAATGACAGCAAACAGATCACTAGGCCTCTGACCACAGGTGCTGAGTACTCAGCAGCCCTCATATAATAGGTTTGAAAGTACTCCTTAAAATAAAACACTGTTTCCCTTTGGAACTATTTACAAGGATGAAACAACCGTATACCTGAGAAATAACTTGCTCTGGTGTCAATTCGCTATTCGCCAGCAGACATCAGAACACACCGAGTTTCCAGATGCT
内部リボソーム侵入部位(IRES)
いくつかの実施形態では、クラリン1タンパク質をコードする構築物は、内部リボソーム侵入部位(IRES)を含み得る。IRESは、複合的な二次構造を形成しており、この構造により、IRESの位置からすぐ下流のmRNAを用いて任意の位置から翻訳開始を生じさせることができる(例えば、Pelletier and Sonenberg,Mal.Cell.Biol.8(3):1103-1112,1988を参照)。
当業者に知られているIRES配列はいくつか存在し、このような配列としては、例えば、口蹄疫ウイルス(FMDV)、脳心筋炎ウイルス(EMCV)、ヒトライノウイルス(HRV)、コオロギ麻痺病ウイルス、ヒト免疫不全ウイルス(HIV)、A型肝炎ウイルス(HAV)、C型肝炎ウイルス(HCV)、及びポリオウイルス(PV)からのIRES配列が挙げられる(例えば、Alberts,Molecular Biology of the Cell,Garland Science,2002;及びHellen et al.,Genes Dev.15(13):1593-612,2001を参照、その各々は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。
いくつかの実施形態では、クラリン1タンパク質またはクラリン1タンパク質のC末端部分をコードする構築物に組み込まれるIRES配列は、口蹄疫ウイルス(FMDV)2A配列である。口蹄疫ウイルス2A配列は、ポリタンパク質の切断を媒介することが示されている小分子ペプチド(およそ18アミノ酸の長さ)である(Ryan,MD et al.,EMBO 4:928-933,1994;Mattion et al.,J Virology 70:8124-8127,1996;Furler et al.,Gene Therapy 8:864-873,2001;及びHalpin et al.,Plant Journal 4:453-459,1999,その各々は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。2A配列の切断活性は、プラスミド及び遺伝子療法構築物(AAV及びレトロウイルス)を含む人工系で過去に実証されている(例えば、Ryan et al.,EMBO 4:928-933,1994;Mattion et al.,J Virology 70:8124-8127,1996;Furler et al.,Gene Therapy 8:864-873,2001;及びHalpin et al.,Plant Journal 4:453-459,1999;de Felipe et al.,Gene Therapy 6:198-208,1999;de Felipe et al.,Human Gene Therapy I I:1921-1931,2000;及びKlump et al.,Gene Therapy 8:811-817,2001,その各々は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。
IRESは、AAV構築物中で利用できる。いくつかの実施形態では、クラリン1タンパク質のC末端部分をコードする構築物は、ポリヌクレオチド内部リボソーム侵入部位(IRES)を含み得る。いくつかの実施形態では、IRESは、複数の構築物を含む組成物の一部であり得る。いくつかの実施形態では、IRESは、単一の遺伝子転写産物から2つ以上のポリペプチドを産生するために使用される。
スプライス部位
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される構築物のいずれも、転写中に生じるRNAプロセシング中に機能するスプライスドナー及び/またはスプライスアクセプター配列を含むことができる。いくつかの実施形態では、スプライス部位は、トランススプライシングに関与する。
例示的なスプライスドナーイントロン(配列番号:配列番号42)
GTAAGTATCAAGGTTACAAGACAGGTTTAAGGAGACCAATAGAAACTGGGCTTGTCGAGACAGAGAAGACTCTTGCGTTTCT
例示的なスプライスアクセプターイントロン(配列番号:配列番号43)
GATAGGCACCTATTGGTCTTACTGACATCCACTTTGCCTTTCTCTCCACAG
ポリアデニル化配列
いくつかの実施形態では、本明細書に提供される構築物は、ポリアデニル化(ポリ(A))シグナル配列を含み得る。真核生物のほとんどの新生mRNAは、それらの3’末端に、ポリ(A)テールを有し、このポリ(A)テールは、ポリ(A)シグナル配列によって駆動される一次転写産物の切断及び共役したポリアデニル化反応を含む複合プロセス中に付加される(例えば、Proudfoot et al.,Cell 108:501-512,2002を参照、これは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。ポリ(A)テールは、mRNA安定性及び移行性を付与する(例えば、Molecular Biology of the Cell,Third Edition by B.Alberts et al.,Garland Publishing,1994を参照、これは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。いくつかの実施形態では、ポリ(A)シグナル配列は、コード配列に対して3’に位置する。
本明細書で使用されるとき、「ポリアデニル化」は、メッセンジャーRNA分子への、ポリアデニリル(polyadenylyl)部分、またはその修飾バリアントの共有結合を指す。真核生物の場合、ほとんどのメッセンジャーRNA(mRNA)分子は、3’末端でポリアデニル化される。3’ポリ(A)テールは、酵素であるポリアデニル酸ポリメラーゼの作用によってプレmRNAに付加されるアデニンヌクレオチドの長い配列(例えば、50、60、70、100、200、500、1000、2000、3000、4000、または5000)である。いくつかの実施形態では、ポリ(A)テールは、特定の配列、例えば、ポリ(A)シグナルを含む転写産物に付加される。ポリ(A)テール及び関連タンパク質は、mRNAをエキソヌクレアーゼによる分解から保護するのを助ける。ポリアデニル化は、転写終結、核からのmRNAの搬出、及び翻訳にも関与する。ポリアデニル化シグナルは、典型的には、DNAのRNAへの転写直後に核内で生じるが、より後で細胞質においても生じ得る。転写が終結した後、mRNA鎖は、RNAポリメラーゼに関連するエンドヌクレアーゼ複合体の作用によって切断される。切断部位は通常、切断部位付近にある塩基配列AAUAAAの存在によって特徴付けられる。mRNAが切断された後、アデノシン残基が切断部位の空いている3’末端に付加される。
本明細書で使用されるとき、「ポリ(A)シグナル配列」または「ポリアデニル化シグナル配列」は、mRNAのエンドヌクレアーゼ切断及び切断されたmRNAの3’末端への一連のアデノシンの付加を誘発する配列である。
使用され得るポリ(A)シグナル配列はいくつか存在し、このような配列としては、ウシ成長ホルモン(bGH)(Woychik et al.,Proc.Natl.Acad Sci.US.A.81(13):3944-3948,1984;米国特許第5,122,458号を参照,これらのそれぞれは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)、マウス-β-グロビン、マウス-α-グロビン(例えば、Orkin et al.,EMBO J 4(2):453-456,1985;Thein et al.,Blood 71(2):313-319,1988を参照,これらのそれぞれは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)、ヒトコラーゲン、ポリオーマウイルス(例えば、Batt et al.,Mal.Cell Biol.15(9):4783-4790,1995を参照,その全体が参照により本明細書に組み込まれる)、単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ遺伝子(HSV TK)、IgG重鎖遺伝子ポリアデニル化シグナル(US2006/0040354,その全体が参照により本明細書に組み込まれる)、ヒト成長ホルモン(hGH)(例えば、Szymanski et al.,Mal.Therapy 15(7):1340-1347,2007を参照,その全体が参照により本明細書に組み込まれる)、SV40ポリ(A)部位の群、例えば、SV40後期及び初期ポリ(A)部位(例えば、Schek et al.,Mal.Cell Biol.12(12):5386-5393,1992,その全体が参照により本明細書に組み込まれる)に由来するものが挙げられる。
ポリ(A)シグナル配列は、AATAAAであり得る。AATAAA配列は、ATTAAA、AGTAAA、CATAAA、TATAAA、GATAAA、ACTAAA、AATATA、AAGAAA、AATAAT、AAAAAA、AATGAA、AATCAA、AACAAA、AATCAA、AATAAC、AATAGA、AATTAA、またはAATAAGを含めた、AATAAAに対して相同性を有し、かつポリアデニル化をシグナル伝達することが可能な他のヘキサヌクレオチド配列と置換されてもよい(例えば、WO06/12414を参照、これは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
いくつかの実施形態では、ポリ(A)シグナル配列は、合成ポリアデニル化部位であり得る(例えば、Levitt el al,Genes Dev.3(7):1019-1025,1989に基づくPromegaのpCl-neo発現構築物を参照、これは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。いくつかの実施形態では、ポリ(A)シグナル配列は、可溶性ニューロピリン-1(sNRP)(AAATAAAATACGAAATG)のポリアデニル化シグナルである(例えば、WO05/073384を参照、これは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。いくつかの実施形態では、ポリ(A)シグナル配列は、SV40ポリ(A)部位を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、ポリ(A)シグナル配列は、配列番号45を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、ポリ(A)シグナル配列は、bGHpAを含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、ポリ(A)シグナルは、配列番号44を含むか、またはそれからなる。ポリ(A)シグナル配列の追加の例は、当技術分野で知られている。いくつかの実施形態では、ポリ(A)配列は、配列番号44または45によって表されるポリ(A)配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。
例示的なbGHポリ(A)シグナル配列(配列番号44)
CTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCCCACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGGGTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCTGGGGATGCGGTGGGCTCTATGG
例示的なSV40ポリ(A)シグナル配列(配列番号45)
AACTTGTTTATTGCAGCTTATAATGGTTACAAATAAAGCAATAGCATCACAAATTTCACAAATAAAGCATTTTTTTCACTGCATTCTAGTTGTGGTTTGTCCAAACTCATCAATGTATCTTA
追加の配列
いくつかの実施形態では、本開示の構築物は、T2Aエレメントまたは配列を含み得る。いくつかの実施形態では、本開示の構築物は、1つ以上のクローニング部位を含み得る。いくつかのそのような実施形態では、クローニング部位は、対象への投与のために製造する前に完全に除去されなくてもよい。いくつかの実施形態では、クローニング部位は、リンカー配列として、またはKozak部位の一部としてなどの機能的役割を有し得る。当業者には理解されるように、クローニング部位は、それらの所望の機能を保持しながら、一次配列が大幅に異なり得る。いくつかの実施形態では、構築物は、クローニング部位の任意の組み合わせを含み得、例示的なクローニング部位は、配列番号46~56によって表される。
例示的なクローニング部位A(配列番号46)
TTGTCGACGCGGCCGCACGCGT
例示的なクローニング部位B(配列番号47)
CTCCTGGGCAACGTGCTGGTTATTGTGACCGGTCGCTAGCCACC
例示的なクローニング部位C(配列番号48)
TAAGAGCTCGCTGATCAGCCTCGA
例示的なクローニング部位D(配列番号49)
AAGCTTGAATTCAGCTGACGTGCCTCGGACCGTCCTAGG
例示的なクローニング部位E(配列番号50)
GCGGCCGCACGCGT
例示的なクローニング部位F(配列番号51)
CTCCTGGGCAACGTGCTGGTTATTGTGACCGGTGCCACC
例示的なクローニング部位G(配列番号52)
TAAGAGCTCGCTGATCAGCCTCGA
例示的なクローニング部位H(配列番号53)
AAGCTTGAATTCAGCTGACGTGCCTCGGACCGCT
例示的なクローニング部位I(配列番号54)
CTCCTGGGCAACGTGCTGGTTATTGTGACCGGT
例示的なクローニング部位J(配列番号55)
GCCACC
例示的なクローニング部位K(配列番号56)
TAAGAGCTC
不安定化ドメイン
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される任意の構築物は、任意選択で、タンパク質発現を一時的に調節するための不安定化ドメイン(「不安定化配列」)をコードする配列を含み得る。不安定化配列の非限定的な例としては、FK506配列、ジヒドロ葉酸レダクターゼ(DHFR)配列、または他の例示的な不安定化配列をコードする配列が挙げられる。
安定化リガンドの不在下では、不安定化配列に作動可能に連結されたタンパク質配列は、ユビキチン化によって分解される。これに対し、安定化リガンドの存在下ではタンパク質分解が阻害され、それにより、不安定化配列に作用可能に結合したタンパク質配列が活性に発現することが可能になる。タンパク質発現の安定化における陽性対照として、タンパク質発現は従来的な手段によって検出することができ、このような手段には、酵素、放射線撮影、比色、蛍光、または他の分光撮影アッセイ;蛍光標識細胞分取(FACS)アッセイ;免疫学的アッセイ(例えば、酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)、放射免疫測定法(RIA)、及び免疫組織化学法)が含まれる。
不安定化配列のさらなる例が当技術分野で知られている。いくつかの実施形態において、不安定化配列は、FK506-及びラパマイシン結合タンパク質(FKBP12)配列であり、安定化リガンドはShield-1(Shld1)である(例えば、Banaszynski et al.(2012)Cell 126(5):995-1004を参照、これは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。いくつかの実施形態において、不安定化配列はDHFR配列であり、安定化リガンドはトリメトプリム(TMP)である(例えば、Iwamoto et al.(2010)Chem Biol 17:981-988を参照、これは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
いくつかの実施形態において、不安定化配列は、FKBP12配列であり、対象細胞(例えば、支持蝸牛外有毛細胞)内でFKBP12遺伝子を担持するAAV構築物の存在が、ウエスタンブロッティングによって検出される。いくつかの実施形態において、不安定化配列は、本明細書に記載される任意のAAV構築物の時間特異的活性を検証するのに使用することができる。
例示的なDHFR不安定化アミノ酸配列(配列番号57)
MISLIAALAVDYVIGMENAMPWNLPADLAWFKRNTLNKPVIMGRHTWESIGRPLPGRKNIILSSQPSTDDRVTWVKSVDEAIAACGDVPEIMVIGGGRVIEQFLPKAQKLYLTHIDAEVEGDTHFPDYEPDDWESVFSEFHDADAQNSHSYCFEILERR
例示的なDHFR不安定化ヌクレオチド配列(配列番号58)
GGTACCATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATTACGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCTGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCGAGTACGGACGATCGCGTAACGTGGGTGAAGTCGGTGGATGAAGCCATCGCGGCGTGTGGTGACGTACCAGAAATCATGGTGATTGGCGGCGGTCGCGTTATTGAACAGTTCTTGCCAAAAGCGCAAAAACTGTATCTGACGCATATCGACGCAGAAGTGGAAGGCGACACCCATTTCCCGGATTACGAGCCGGATGACTGGGAATCGGTATTCAGCGAATTCCACGATGCTGATGCGCAGAACTCTCACAGCTATTGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGATAA
例示的な不安定化ドメイン(配列番号59)
ATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATTACGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCTGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCGAGTACGGACGATCGCGTAACGTGGGTGAAGTCGGTGGATGAAGCCATCGCGGCGTGTGGTGACGTACCAGAAATCATGGTGATTGGCGGCGGTCGCGTTATTGAACAGTTCTTGCCAAAAGCGCAAAAACTGTATCTGACGCATATCGACGCAGAAGTGGAAGGCGACACCCATTTCCCGGATTACGAGCCGGATGACTGGGAATCGGTATTCAGCGAATTCCACGATGCTGATGCGCAGAACTCTCACAGCTATTGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGA
例示的なFKBP12不安定化ペプチドアミノ酸配列(配列番号60)
MGVEKQVIRPGNGPKPAPGQTVTVHCTGFGKDGDLSQKFWSTKDEGQKPFSFQIGKGAVIKGWDEGVIGMQIGEVARLRCSSDYAYGAGGFPAWGIQPNSVLDFEIEVLSVQ
レポーター配列またはエレメント
いくつかの実施形態では、本明細書に提供される構築物は、任意に、レポーターポリペプチド及び/またはタンパク質をコードする配列(「レポーター配列」)を含み得る。レポーター配列の非限定的な例としては、β-ラクタマーゼ、β-ガラクトシダーゼ(LacZ)、アルカリホスファターゼ、チミジンキナーゼ、緑色蛍光タンパク質(GFP)、赤色蛍光タンパク質、mCherry蛍光タンパク質、黄色蛍光タンパク質、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ(CAT)、及びルシフェラーゼをコードするDNA配列が挙げられる。レポーター配列の追加の例は、当該技術分野で既知である。レポーター配列の発現を駆動する制御エレメントに関連付けられた際、レポーター配列は、酵素、放射線撮影、比色、蛍光、または他の分光撮影アッセイ;蛍光標識細胞分取(FACS)アッセイ;免疫学的アッセイ(例えば、酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)、放射免疫測定法(RIA)、及び免疫組織化学法)を含めた従来の手段によって検出可能なシグナルを提供することができる。
いくつかの実施形態では、レポーター配列は、LacZ遺伝子であり、哺乳類細胞(例えば、蝸牛有毛細胞)における、LacZ遺伝子を担持する構築物の存在が、ベータ-ガラクトシダーゼ活性に関するアッセイによって検出される。レポーターは、蛍光タンパク質(例えば、緑色蛍光タンパク質)またはルシフェラーゼである場合、哺乳類細胞(例えば、蝸牛有毛細胞)における、蛍光タンパク質またはルシフェラーゼを担持する構築物の存在が、蛍光技法(例えば、蛍光顕微鏡法またはFACS)により、またはルミノメーター(例えば、分光光度計またはIVIS撮像装置)において光生産により測定されてもよい。いくつかの実施形態では、レポーター配列を用いて、本明細書に記載される構築物のうちのいずれかの組織特異的標的化能力及び組織特異的プロモーター調節及び/または制御活性を検証することができる。
いくつかの実施形態では、レポーター配列は、FLAGタグ(例えば、3xFLAGタグ)であり、哺乳類細胞(例えば、内耳細胞、例えば蝸牛有毛または支持細胞、例えば、眼細胞)における、FLAGタグを担持する構築物の存在は、タンパク質結合または検出アッセイ(例えば、ウエスタンブロット、免疫組織化学、ラジオイムノアッセイ(RIA)、質量分析)によって検出される。例示的な3xFLAGタグ配列は、配列番号61として提供される。
例示的な3xFLAGタグ配列(配列番号61)
GGATCCCGGGCTGACTACAAAGACCATGACGGTGATTATAAAGATCATGACATCGACTACAAGGATGACGATGACAAG
AAV粒子
とりわけ、本開示は、本明細書に記載のCLRN1遺伝子またはその特徴的部分をコードする構築物、及び本明細書に記載のキャプシドを含むAAV粒子を提供する。いくつかの実施形態では、AAV粒子は、構築物株及びキャプシド株を示す血清型を有すると説明することができる。例えば、いくつかの実施形態では、AAV粒子は、AAV2キャプシドと、特徴的なAAV2逆末端反復(ITR)を含む構築物とを有するAAV2と記載されてもよい。いくつかの実施形態では、AAV粒子は、キャプシド及び構築物が異なるAAV株に由来する偽型として記載されてもよく、例えば、AAV2/9は、AAV2 ITR及びAAV9キャプシドを利用する構築物を含むAAV粒子を指す。
AAV構築物
本開示は、CLRN1遺伝子またはその特徴的部分を含むポリヌクレオチド構築物を提供する。本明細書に記載のいくつかの実施形態では、CLRN1遺伝子またはその特徴的部分を含むポリヌクレオチドは、AAV粒子に含めることができる。
いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチド構築物は、天然に存在するAAVゲノム構築物に由来するまたはその構築物から修飾された1つ以上の成分を含む。いくつかの実施形態では、AAV構築物に由来する配列は、AAV1構築物、AAV2構築物、AAV3構築物、AAV4構築物、AAV5構築物、AAV6構築物、AAV7構築物、AAV8構築物、AAV9構築物、AAV2.7m8構築物、AAV8BP2構築物、AAV293構築物、またはAAV Anc80構築物である。いくつかの実施形態では、rAAV Anc80キャプシドは、rAAV Anc80L65キャプシドである。本明細書で使用され得るさらなる例示的なAAV構築物が当技術分野で知られている(例えば、Kanaan et al.,Mol.Ther.Nucleic Acids 8:184-197,2017;Li et al.,Mol.Ther.16(7):1252-1260,2008;Adachi et al.,Nat.Commun.5:3075,2014;Isgrig et al.,Nat.Commun.10(1):427,2019;及びGao et al.,J.Virol.78(12):6381-6388,2004を参照;その各々は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。
いくつかの実施形態では、提供される構築物は、コード配列、例えば、CLRN1遺伝子またはその特徴的部分、1つ以上の調節及び/または制御配列、ならびに任意に5’及び3’AAV由来の逆方向末端反復(ITR)を含む。5'及び3'AAV由来のITRが利用されるいくつかの実施形態では、ポリヌクレオチド構築物は、組換えAAV(rAAV)構築物と称され得る。いくつかの実施形態では、提供されるrAAV構築物は、AAVキャプシドにパッケージングされて、AAV粒子を形成する。
いくつかの実施形態では、AAV由来配列(ポリヌクレオチド構築物に含まれる)は、典型的にはシス作用性5’及び3’ITR配列を含む(例えば、B.J.Carter,「Handbook of Parvoviruses」,ed.,P.Tijsser,CRC Press,pp.155 168,1990を参照、これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。典型的なAAV2由来ITR配列は、約145ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、典型的なITR配列の少なくとも80%(例えば、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%)が、本明細書で提供される構築物に組み込まれる。これらのITR配列を修飾する能力は、当業者が備えている技能の範囲内である(例えば、テキスト、例えば、Sambrook et al.「Molecular Cloning.A Laboratory Manual」,2d ed.,Cold Spring Harbor Laboratory,New York(1989);及びK.Fisher et al.,J Virol.,70:520 532(1996)を参照、これらのそれぞれは、参照によりその全体が組み込まれる)。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のコード配列及び/または構築物のいずれも、5’及び3’AAV ITR配列と隣接する。AAV ITR配列は、本明細書で同定されたAAV型を含む任意の既知のAAVから得ることができる。
いくつかの実施形態では、本開示に従って、当技術分野で公知のパターンで記載される(例えば、Asokan et al.,Mol.Ther.20:699-7080,2012を参照、これらは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)ポリヌクレオチド構築物は、典型的には、コード配列またはその一部、少なくとも1つの及び/または制御配列、及び任意に5’及び3’AAV逆方向末端反復(ITR)から構成される。いくつかの実施形態では、提供される構築物は、キャプシドにパッケージングされて、AAV粒子を作出することができる。AAV粒子は、選択された標的細胞に送達され得る。いくつかの実施形態では、提供される構築物は、目的のポリペプチド、タンパク質、機能性RNA分子(例えば、miRNA、miRNA阻害剤)、または他の遺伝子産物をコードする、構築物配列とは異種の核酸配列(例えば、阻害性核酸配列)である追加の任意のコード配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸コード配列は、標的組織の細胞におけるコード配列の転写、翻訳、及び/または発現を可能にする方式で、構成成分に作動可能に連結される及び/または構成成分を制御する。
図1Aに示すとおり、未修飾AAV内因性ゲノムは、ITRが隣接する2つのオープンリーディングフレーム「cap」及び「rep」を含む。図1Bに示すとおり、例示的なrAAV構築物は、コード領域、例えばコード配列(例えば、CLRN1遺伝子)に隣接するITRを同様に含む。いくつかの実施形態では、rAAV構築物はまた、プラスミド構築物でトランスフェクトされた細胞または本開示によって産生されたウイルスに感染した細胞におけるその転写、翻訳及び/または発現を可能にする方式でコード配列に作動可能に連結された従来の制御エレメントを含む。いくつかの実施形態では、rAAV構築物は、プロモーター(図1Bに示される)、エンハンサー、非翻訳領域(例えば、5’UTR、3’UTR)、Kozak配列、内部リボソーム侵入部位(IRES)、スプライシング部位(例えば、アクセプター部位、ドナー部位)、ポリアデニル化部位(図1Bに示される)、またはそれらの任意の組み合わせを任意に含む。そのような追加のエレメントは、本明細書においてさらに記載する。
いくつかの実施形態では、構築物は、rAAV構築物である。いくつかの実施形態では、rAAV構築物は、少なくとも500bp、少なくとも1kb、少なくとも1.5kb、少なくとも2kb、少なくとも2.5kb、少なくとも3kb、少なくとも3.5kb、少なくとも4kb、または少なくとも4.5kbを含み得る。いくつかの実施形態では、AAV構築物は、最大7.5kb、最大7kb、最大6.5kb、最大6kb、最大5.5kb、最大5kb、最大4.5kb、最大4kb、最大3.5kb、最大3kb、または最大2.5kbを含み得る。いくつかの実施形態では、AAV構築物は、約1kb~約2kb、約1kb~約3kb、約1kb~約4kb、約1kb~約5kb、約2kb~約3kb、約2kb~約4kb、約2kb~約5kb、約3kb~約4kb、約3kb~約5kb、または約4kb~約5kbを含み得る。
本明細書に記載の構築物のいずれも、調節及び/または制御配列、例えば、転写開始配列、転写終結配列、プロモーター配列、エンハンサー配列、RNAスプライシング配列、ポリアデニル化(ポリ(A))配列、Kozakコンセンサス配列、及び/またはそれらの任意の組み合わせの群から選択される制御配列をさらに含むことができる。いくつかの実施形態では、プロモーターは、ネイティブプロモーター、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、及び/または組織特異的プロモーターであり得る。これらの制御配列の非限定的な例が本明細書に記載される。
AAVキャプシド
本開示は、AAVキャプシドにパッケージングされた1つ以上のポリヌクレオチド構築物を提供する。いくつかの実施形態では、AAVキャプシドは、AAV2、3、4、5、6、7、8、9、10、rh8、rh10、rh39、rh43、またはAnc80血清型のAAVキャプシドまたはその1つ以上のハイブリッドからのものであるか、またはそれらに由来する。いくつかの実施形態では、AAVキャプシドは、AAV祖先血清型からのものである。いくつかの実施形態では、AAVキャプシドは、祖先(Anc)AAVキャプシドである。Ancキャプシドは、進化的確率及び進化モデリングを使用して構築された構築物配列から作出され、推定祖先配列を決定する。したがって、Ancキャプシド/構築物配列が自然界に存在していたかは不明である。例えば、いくつかの実施形態では、AAVキャプシドは、Anc80キャプシド(例えば、Anc80L65キャプシド)である。
いくつかの実施形態では、AAVキャプシドは、配列番号62を含む鋳型ヌクレオチドコード配列を使用して作出される。いくつかの実施形態では、キャプシドは、配列番号63によって表されるポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、キャプシドは、配列番号63によって表されるポリペプチドと少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%の配列同一性を有するポリペプチドを含む。
本明細書で提供されるように、AAVキャプシド及びAAV構築物(例えば、AAV ITRを含む)の任意の組み合わせが、本開示の組換えAAV(rAAV)粒子において使用され得る。例えば、野生型またはバリアントAAV2 ITR及びAnc80キャプシド、野生型またはバリアントAAV2 ITR及びAAV6キャプシドなど。本開示のいくつかの実施形態では、AAV粒子は、AAV2成分から完全に構成される(例えば、キャプシド及びITRは、AAV2血清型である)。いくつかの実施形態では、AAV粒子は、AAV2/6、AAV2/8またはAAV2/9粒子(例えば、AAV2 ITRを有するAAV構築物を有するAAV6、AAV8またはAAV9キャプシド)である。本開示のいくつかの実施形態では、AAV粒子は、コード配列の一部、例えばCLRN1遺伝子またはその特徴的部分(例えば、配列番号1、2、3、または4)に隣接するAAV2 ITRを有するAAV構築物(例えば、配列番号15~22)をキャプシド化するAnc80キャプシドを含む(例えば、配列番号63のポリペプチドを含む)AAV2/Anc80粒子である。他のAAV粒子は、当技術分野で知られており、例えば、Sharma et al.,Brain Res Bull.2010 Feb 15;81(2-3):273に記載されており、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、キャプシド配列は、それぞれ配列番号62または63によって表されるキャプシドヌクレオチドまたはアミノ酸配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示されるプラットフォーム送達アプローチでは、現在の天然ウイルスの進化系統を再現する祖先AAV(AAVAnc)キャプシドとして知られる合成AAVキャプシドのライブラリを組み合わせる。いくつかの実施形態では、これらのAAVキャプシドは、産物候補を蝸牛に直接送達するために、新規の低侵襲投与処置と結合させる。いくつかの実施形態では、送達アプローチでは、このライブラリからのAAV Anc80キャプシドバリアント(例えば、Anc80L65)を利用する。いくつかの実施形態では、そのようなキャプシドを利用してrAAV粒子を作出し、そのような粒子は、本明細書に記載の構築物、例えば、本明細書に記載のCLRN1タンパク質をコードするCLRN1 cDNAを含む構築物を加えて作出し、rAAV Anc80-CLRN1を作出する。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物は、その配列が祖先配列の再構築によって推測された、合理的に設計された合成AAVキャプシドであるAAV Anc80キャプシドを含む。祖先配列の再構築は、天然アデノ随伴ウイルスから入手可能な配列情報を使用し、系統発生的及び統計的予測の結果として、様々な中間進化ノードでの配列の祖先状態を同定する。AAV Anc80の作出中に、9つのノードが再構築され、AAV系統のin silico由来配列がde novoで合成され、特徴付けを行った。これにより、広く研究されているAAV血清型1、2、8、及び9の推定祖先であるAnc80ライブラリノード(Anc80Lib)が同定された。その後、Anc80Libタンパク質配列は、逆翻訳され、遺伝子合成によって生成され、個々のクローンを、パッケージング、感染性、及び生物学的特性について、個別に評価した。いくつかの実施形態では、これらの結果に基づいて、65番目のAnc80Libクローン(Anc80L65)であるAAV Anc80を、さらなる特徴付けのために選択した。AAV Anc80キャプシドバリアントは、独特の組成を有する。AAV8及びAAV2の配列は、AAVAnc80とそれぞれおよそ9%及び12%のみ異なるが、AAV Anc80の構造モデリングでは、その粒子の外表面の約20%が、既知の循環AAVから、キャプシド表面全体に分散するように異なっていることを示している(例えば、Zinn2015を参照、これは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。
いくつかの実施形態では、in-vivoでの遺伝子療法粒子としてのAAVAnc80の性能が特徴付けられており、AAV Anc80を含むrAAV粒子は、広く適用可能な遺伝子療法粒子として作用する可能性が実証されている。いくつかの実施形態では、マウス及び非ヒト霊長類(NHP)において実施した試験では、全身毒性の明らかな徴候なく、静脈内注射後に肝臓を標的とする場合、AAV Anc80がAAV8と同様の形質導入効率を有することを示した(例えば、Zinn 2015;Murillo 2019を参照、その各々が参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。さらに、いくつかの実施形態では、AAV Anc80は、マウス前眼部(Wang 2017、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)、マウス及びNHP網膜(例えば、Zinn 2015;Carvalho 2018を参照、その各々は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)、マウス骨格筋(例えば、Zinn 2015を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)、全身及び実質内送達によるマウス中枢神経系(CNS)(Hudry 2018、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)、及びマウス腎臓(例えば、Ikeda 2018を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)の向性及び効率的な形質導入を示した。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組成物(例えば、rAAV-CLRN1を含む)は、AAV Anc80キャプシドを含む。いくつかの実施形態では、rAAV Anc80キャプシドは、rAAV Anc80L65キャプシドである。いくつかの実施形態では、AAV Anc80キャプシドは、蝸牛及び前庭細胞に対して高い形質導入効率を示す。いくつかの実施形態では、AAV Anc80キャプシドは、眼細胞に対して高い形質導入効率を示す。
AAV Anc80は、祖先配列の再構築によって推測された、合理的に設計されたAAVキャプシドである(例えば、Zinn 2015を参照、これは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。祖先配列の再構築は、天然AAVから入手可能な配列情報を使用し、系統発生的及び統計的予測の結果として、様々な中間進化ノードでの配列の祖先状態を同定する。文献に記載のとおり、AAV系統全体のin silico由来配列のde novo合成及び特徴付けにより、広く試験が行われているAAV血清型1、2、8、及び9の推定祖先であるAnc80ライブラリ(Anc80Lib)ノードが特定された。その後のAnc80Lib配列の評価により、65番目のAnc80Libクローン(Anc80L65)であるAAV Anc80のさらなる特徴付けを行った。これらの試験では、AAV Anc80キャプシドバリアントが、AAV8と同様の形質導入効率を有する安定かつ機能的なAAVバリアントをもたらす異なる外部表面粒子分布を有する特徴的な組成を有することが示された(例えば、Zinn 2015を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。哺乳動物の内耳におけるAAV Anc80の最初に報告された使用では、蝸牛及び前庭有毛細胞における高い形質導入効率が明らかになった(例えば、Landegger 2017を参照、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。その後の複数の独立した調査により、他のAAV血清型と比較して、AAV Anc80の蝸牛及び前庭細胞の形質導入効率が増加していることが確認された。様々な年齢のマウス(例えば、Landegger 2017;Tao 2018;Yoshimura 2018;及びOmichi 2020を参照、その各々は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)及び非ヒト霊長類(例えば、Andres-Mateos 2019を参照、その全体が本明細書に組み込まれる)では、AAV Anc80は、複数の他のAAVキャプシドと比較して、より高い形質導入効率及びより広い向性を有する。
AAV粒子を使用した遺伝子療法は、次のようないくつかの理由から、内耳障害の有望な治療モダリティである:(1)聴覚及び前庭の感覚上皮を含む内耳は、中枢神経系内と同様に免疫監視の改変を有する(Fujioka 2014、その全体が参照により本明細書に組み込まれる);(2)コルチ蝸牛器の感覚細胞及び支持細胞は、有糸分裂後であり、AAVの単回投与後の長期発現可能性が認められる;(3)複数の投与経路による成人及び小児の両方でのrAAV送達に関する総合的な臨床経験は、特に局所送達及び/または低用量から中用量での送達ビヒクルとしてのAAVの強力な安全性プロファイルを示唆している。
20年より前の最初の臨床試験から始まり、rAAV粒子は、全身投与のために最大およそ1E15vg以上の用量で、数十の臨床試験の何百人もの参加者に投与されてきた(例えば、Flotte 1996;Flotte 2013;Parente 2018;及びWang 2019を参照、その各々は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。AAV粒子がin vivo遺伝子導入に使用された治験の数は着実に増加している。安全性プロファイルは、広範囲の標的組織への高効率の形質導入と共に、rAAV粒子をin vivo遺伝子療法の最適なプラットフォームとして確立した(例えば、Wang 2019を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。rAAV技術は、診療所において、様々な状態、例えば、凝固障害、遺伝性失明、及び神経変性疾患などでの適用の奏効が得られている(例えば、Colella 2018;及びWang 2019を参照、その各々は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。
rAAV粒子製品(alipogenet iparvovec;Glybera(登録商標))は、2012年にリポタンパク質リパーゼ欠乏症の治療のために欧州医薬品庁(European Medicines Agency、EMA)によって最初に承認された。その後、以下の2つのrAAV製品、確認された両アレル性RPE65変異関連網膜ジストロフィーの治療用のvoretigene neparvovec-rzyl(Luxturna(登録商標))と、SMN1遺伝子中の両アレル変異を伴う脊髄性筋萎縮症(SMA)の治療用のonasemnogene abeparvovec-xioi(Zolgensma(登録商標))が、それぞれ2017年及び2019年に米国食品医薬品局(U.S.Food and Drug Administration、FDA)によって承認された。voretigene neparvovec-rzyl(Luxturna(登録商標))は、疾患が遺伝子RPE65中の変異によって引き起こされる場合、遺伝性網膜ジストロフィーによる視力低下の治療用としてもEMAによって承認された。
いくつかの実施形態では、rAAV粒子を含む薬物及び生物製剤は、それらを外リンパに送達することによって、内耳中の多くの標的細胞に到達することができる。外リンパは、脳脊髄液(CSF)と組成が非常に似ており(例えば、Lysaght 2011を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)、脳脊髄液(CSF)と拡散的につながっている流体である。外リンパは、蝸牛及び前庭系の感覚細胞、神経細胞、及び支持細胞のほとんどを浸し、内耳の骨迷路に収容されている(図11及び12)。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物、例えばrAAV-CLRN1が送達される蝸牛の外リンパ腔は、蝸牛孔を介して蝸牛らせんの頂点で互いにつながっている鼓室階及び前庭階の2つの階または通路を含む。内耳の多くの細胞は、組織内の間隙を介して外リンパ液と流体でつながっている。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示されるのは、本明細書に開示の組成物、例えば、rAAV-CLRN1を、アブミ骨底内に小孔が配置されている蝸牛窓膜を通して内耳の外リンパ液に送達するための、蝸牛内投与のための単回使用滅菌送達デバイスである。いくつかの実施形態では、この蝸牛内投与アプローチにおいて、本明細書に開示の組成物、例えば、rAAV-CLRN1は、前庭窓内のアブミ骨底に小孔を有する蝸牛窓膜を通して鼓室階に投与され、これにより、組成物は、鼓室階を通り、次に蝸牛孔での接続を介して前庭階を通って灌流され、アブミ骨底中の小孔への流体経路をたどる(図11)。いくつかの実施形態では、注入ポートとは異なる小孔の存在により、蝸牛の長さに沿った薬物のより均一な分布が可能になり、内耳内でのさらなる流体圧力の有害な蓄積が防止される。いくつかの実施形態では、この二重の窓、注入及びベンティング技術を使用した前庭細胞の形質導入によって明らかであるように、この送達アプローチはまた、本明細書に開示の組成物、例えば注入物の前庭系への拡散が可能になる。いくつかの実施形態では、プロセス全体は、外耳道を介した比較的非外傷性のアプローチを用いて対象において達成することができる。図9を参照。また、外科的投与処置に関する追加情報については実施例を参照されたい。
マウスにおけるAAV Anc80形質導入に関する複数の試験が公開されている。動物モデルにおける内耳への遺伝子送達のために、異なるタイプのウイルスベクター(例えば、アデノウイルスベクター、単純ヘルペスウイルスベクター)が考慮されてきた(Chen 2001;Wenzel 2007;Husseman 2009、その各々は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。しかし、ノックアウト及びノックインマウスモデルにおける聴覚、蝸牛、及び前庭機能の回復など、許容可能な安全性プロファイル及び長期にわたる導入遺伝子発現を考えると、rAAV粒子は、蝸牛に直接遺伝子を送達するための有望なツールであると考えられる(例えば、Akil 2012;Kim 2016;Pan 2017;Akil 2019;Al-Moyed 2019;Gyorgy 2019を参照、その各々は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。新生児マウスと成体マウスの両方で、異なる外科的アプローチ及び用量を使用して、いくつかのAAV血清型が内耳に送達されている(例えばAkil 2012;Askew 2015;Chien 2016;Landegger 2017;Suzuki 2017;Tao 2018;Yoshimura 2018;Akil 2019;Al-Moyed 2019;Gyorgy 2019;Kim 2019;Omichi 2020を参照、その各々は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。蝸牛及び前庭器官の異なる細胞型におけるGFP発現によって判定される形質導入効率は、マウスの生後年齢、粒子を送達するための方法の使用、及び評価される血清型またはキャプシドバリアントによって異なる。
いくつかの実施形態では、AAV Anc80バリアントは、他のAAVキャプシドと比較して、新生児マウス及び成体マウスにおいて、蝸牛及び前庭感覚細胞(有毛細胞)ならびに蝸牛及び前庭器官の付属細胞の高効率標的化を示した(例えば、Landegger 2017;Suzuki 2017;Omichi 2020を参照、その各々は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。Anc80新生児向性及び遺伝子導入効率は、生後1日目(P1)に蝸牛窓投与によって注射したC57BL/6マウスにおいてin vivoで評価した(例えば、Landegger 2017を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。以前の試験と一致して、AAV2、AAV6、及びAAV8は、低い割合のIHCを標的とし、AAV1はより高い効率でIHCを形質導入できたが、OHC形質導入は最小限であった。対照的に、AAV Anc80(1.7E9vg/蝸牛)は、蝸牛または聴覚機能にいかなる有害な影響を与えることなく、IHCのほぼ100%及びOHCの約90%を形質導入することができた(図12)(例えば、Landegger 2017を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。いくつかの実施形態では、前庭系において、AAV Anc80は、前庭機能に影響を与えることなく、卵形嚢のI型及びII型有毛細胞ならびに半規管稜の細胞を形質導入した(図13)(例えば、Landegger 2017を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
後半規管を介した異なる投与経路を使用して、AAV Anc80向性及び遺伝子導入効率を成体(7週齢)CBA/CaJマウスで評価した(例えば、Suzuki 2017を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。AAV Anc80(9.6E8vg/蝸牛)は、正常の蝸牛及び聴覚機能を維持しながら、蝸牛の長さ全体でのおよそ100%のIHC、及びかなりの割合のOHC、らせん縁及びライスネル膜の細胞、及び蝸牛軸の細胞(例えば、らせん神経節ニューロン及びサテライトグリア細胞)(図14)などの蝸牛の感覚細胞及び付属細胞を標的とした(例えば、Suzuki 2017を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。前庭系の複数の細胞タイプ、例えば、有毛細胞のサブセット、及び卵形嚢及び半規管稜、及び球形嚢中での実質的に100%の支持細胞(図15)も形質導入され、すべて前庭機能に有害な影響はなかった(例えば、Suzuki 2017を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
最近では、成体(4週)C3H/FeJマウスにおけるAAV Anc80 in vivo形質導入は、本明細書で利用される(後半規管開窓による蝸牛窓膜送達を介して)送達経路を使用して評価し、自然に発生する血清型AAV1、AAV2、AAV8、及びAAV9による形質導入と直接比較した(例えば、Omichi 2020を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。すべての粒子は、対照のような(注射されていない)ABRしきい値によって実証されるように、聴覚機能に悪影響を与えることなく、ある程度の形質導入が生じた。AAV Anc80(5.5E9vg/蝸牛)は、蝸牛長に沿って実質的に100%のIHCを形質導入し、蝸牛の位置に応じてOHCのおよそ27~66%を形質導入した(図16)。AAV Anc80と比較して、AAV2(3.68E9vg/蝸牛)によるOHCの形質導入効率がわずかに高いにもかかわらず、AAV Anc80では、蝸牛内での球形嚢及びらせん神経節ニューロンのeGFP陽性有毛細胞によって明らかに示されるように、AAV2よりも顕著に広い向性が維持された。これらの同じ細胞型において、AAV2は、ほとんどまたは全く形質導入を生じなかった(図16)(例えば、Omichi 2020を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
いくつかの実施形態では、AAV Anc80が、新生児から成体のマウスにおいて、蝸牛IHC及びOHC、支持細胞、蝸牛らせん神経節の細胞、卵形嚢、球形嚢、及び膨大部稜の前庭有毛細胞、ならびに蝸牛及び前庭支持/付属細胞などの広範囲の内耳細胞型を標的とする能力が、例えば、AAV Anc80が内耳障害に対する遺伝子療法アプローチの開発を推し進め得ることを示唆している。
例示的なAAV Anc80キャプシドDNA配列(配列番号62)
ATGGCTGCCGATGGTTATCTTCCAGATTGGCTCGAGGACAACCTCTCTGAGGGCATTCGCGAGTGGTGGGACTTGAAACCTGGAGCCCCGAAACCCAAAGCCAACCAGCAAAAGCAGGACGACGGCCGGGGTCTGGTGCTTCCTGGCTACAAGTACCTCGGACCCTTCAACGGACTCGACAAGGGGGAGCCCGTCAACGCGGCGGACGCAGCGGCCCTCGAGCACGACAAGGCCTACGACCAGCAGCTCAAAGCGGGTGACAATCCGTACCTGCGGTATAACCACGCCGACGCCGAGTTTCAGGAGCGTCTGCAAGAAGATACGTCTTTTGGGGGCAACCTCGGGCGAGCAGTCTTCCAGGCCAAGAAGCGGGTTCTCGAACCTCTCGGTCTGGTTGAGGAAGGCGCTAAGACGGCTCCTGGAAAGAAGAGACCGGTAGAGCAATCACCCCAGGAACCAGACTCCTCTTCGGGCATCGGCAAGAAAGGCCAGCAGCCCGCGAAGAAGAGACTCAACTTTGGGCAGACAGGCGACTCAGAGTCAGTGCCCGACCCTCAACCACTCGGAGAACCCCCCGCAGCCCCCTCTGGTGTGGGATCTAATACAATGGCAGCAGGCGGTGGCGCTCCAATGGCAGACAATAACGAAGGCGCCGACGGAGTGGGTAACGCCTCAGGAAATTGGCATTGCGATTCCACATGGCTGGGCGACAGAGTCATCACCACCAGCACCCGAACCTGGGCCCTCCCCACCTACAACAACCACCTCTACAAGCAAATCTCCAGCCAATCGGGAGCAAGCACCAACGACAACACCTACTTCGGCTACAGCACCCCCTGGGGGTATTTTGACTTTAACAGATTCCACTGCCACTTCTCACCACGTGACTGGCAGCGACTCATCAACAACAACTGGGGATTCCGGCCCAAGAGACTCAACTTCAAGCTCTTCAACATCCAGGTCAAGGAGGTCACGACGAATGATGGCACCACGACCATCGCCAATAACCTTACCAGCACGGTTCAGGTCTTTACGGACTCGGAATACCAGCTCCCGTACGTCCTCGGCTCTGCGCACCAGGGCTGCCTGCCTCCGTTCCCGGCGGACGTCTTCATGATTCCTCAGTACGGGTACCTGACTCTGAACAATGGCAGTCAGGCCGTGGGCCGTTCCTCCTTCTACTGCCTGGAGTACTTTCCTTCTCAAATGCTGAGAACGGGCAACAACTTTGAGTTCAGCTACACGTTTGAGGACGTGCCTTTTCACAGCAGCTACGCGCACAGCCAAAGCCTGGACCGGCTGATGAACCCCCTCATCGACCAGTACCTGTACTACCTGTCTCGGACTCAGACCACGAGTGGTACCGCAGGAAATCGGACGTTGCAATTTTCTCAGGCCGGGCCTAGTAGCATGGCGAATCAGGCCAAAAACTGGCTACCCGGGCCCTGCTACCGGCAGCAACGCGTCTCCAAGACAGCGAATCAAAATAACAACAGCAACTTTGCCTGGACCGGTGCCACCAAGTATCATCTGAATGGCAGAGACTCTCTGGTAAATCCCGGTCCCGCTATGGCAACCCACAAGGACGACGAAGACAAATTTTTTCCGATGAGCGGAGTCTTAATATTTGGGAAACAGGGAGCTGGAAATAGCAACGTGGACCTTGACAACGTTATGATAACCAGTGAGGAAGAAATTAAAACCACCAACCCAGTGGCCACAGAACAGTACGGCACGGTGGCCACTAACCTGCAATCGTCAAACACCGCTCCTGCTACAGGGACCGTCAACAGTCAAGGAGCCTTACCTGGCATGGTCTGGCAGAACCGGGACGTGTACCTGCAGGGTCCTATCTGGGCCAAGATTCCTCACACGGACGGACACTTTCATCCCTCGCCGCTGATGGGAGGCTTTGGACTGAAACACCCGCCTCCTCAGATCCTGATTAAGAATACACCTGTTCCCGCGAATCCTCCAACTACCTTCAGTCCAGCTAAGTTTGCGTCGTTCATCACGCAGTACAGCACCGGACAGGTCAGCGTGGAAATTGAATGGGAGCTGCAGAAAGAAAACAGCAAACGCTGGAACCCAGAGATTCAATACACTTCCAACTACAACAAATCTACAAATGTGGACTTTGCTGTTGACACAAATGGCGTTTATTCTGAGCCTCGCCCCATCGGCACCCGTTACCTCACCCGTAATCTG
例示的なAAV Anc80L65キャプシドアミノ酸配列(配列番号63)
MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWDLKPGAPKPKANQQKQDDGRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLRYNHADAEFQERLQEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEGAKTAPGKKRPVEQSPQEPDSSSGIGKKGQQPAKKRLNFGQTGDSESVPDPQPLGEPPAAPSGVGSNTMAAGGGAPMADNNEGADGVGNASGNWHCDSTWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASTNDNTYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTTNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFEFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTQTTSGTAGNRTLQFSQAGPSSMANQAKNWLPGPCYRQQRVSKTANQNNNSNFAWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMATHKDDEDKFFPMSGVLIFGKQGAGNSNVDLDNVMITSEEEIKTTNPVATEQYGTVATNLQSSNTAPATGTVNSQGALPGMVWQNRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPPTTFSPAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSTNVDFAVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL*
例示的なAAV Anc80足場アミノ酸配列(配列番号XX)
MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWDLKPGAPKPKANQQKQDDGRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLRYNHADAEFQERLQEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEGAKTAPGKKRPVEQSPQEPDSSSGIGKKGQQPAXKRLNFGQTGDSESVPDPQPLGEPPAAPSGVGSNTMXAGGGAPMADNNEGADGVGNASGNWHCDSTWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGXSTNDNTYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKXLNFKLFNIQVKEVTTNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFXFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTQTTSGTAGNRXLQFSQAGPSSMANQAKNWLPGPCYRQQRVSKTXNQNNNSNFAWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMATHKDDEDKFFPMSGVLIFGKQGAGNSNVDLDNVMITXEEEIKTTNPVATEXYGTVATNLQSX10NTAPATGTVNSQGALPGMVWQX11RDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPPTTFSPAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSTNVDFAVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL

Figure 2024500786000006
組成物
とりわけ、本開示は、組成物を提供する。いくつかの実施形態では、組成物は、本明細書に記載の構築物を含む。いくつかの実施形態では、組成物は、本明細書に記載の1つ以上の構築物を含む。いくつかの実施形態では、組成物は、本明細書に記載の複数の構築物を含む。いくつかの実施形態では、組成物中に複数の構築物が含まれる場合、構築物はそれぞれ異なる。
いくつかの実施形態では、組成物は、本明細書に記載のAAV粒子を含む。いくつかの実施形態では、組成物は、本明細書に記載の1つ以上のAAV粒子を含む。いくつかの実施形態では、組成物は、本明細書に記載の複数のAAV粒子を含む。いくつかの実施形態では、組成物中に複数のAAV粒子が含まれる場合、AAV粒子はそれぞれ異なる。
いくつかの実施形態では、組成物は、クラリン1タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、組成物は、細胞を含む。
いくつかの実施形態では、組成物は、医薬組成物であるか、または医薬組成物を含む。
1つのAAV構築物組成物
いくつかの実施形態では、本開示は、1つの構築物から構成されるAAV粒子を含む組成物またはシステムを提供する。いくつかのそのような実施形態において、1つの構築物は、CLRN1遺伝子の機能的(例えば、野生型または他の機能的、例えば、コドン最適化された)コピーをコードするポリヌクレオチドを送達し得る。いくつかの実施形態では、構築物は、rAAV構築物であるかまたはrAAV構築物を含む。本明細書に記載のいくつかの実施形態では、1つのrAAV構築物は、標的細胞(例えば、内耳細胞、例えば眼細胞)中に全長CLRN1メッセンジャーRNAまたはその特徴的タンパク質を発現することができる。いくつかの実施形態では、1つの構築物(例えば、本明細書に記載の構築物のいずれか)は、機能的クラリン1タンパク質(例えば、機能的クラリン1タンパク質を生成する任意の構築物)をコードする配列を含み得る。いくつかの実施形態では、1つの構築物(例えば、本明細書に記載の構築物のいずれか)は、機能的クラリン1タンパク質(例えば、機能的クラリン1タンパク質を生成する任意の構築物)をコードする配列及び任意に追加のポリペプチド配列(例えば、調節配列及び/またはレポーター配列)を含み得る。
いくつかの実施形態では、1つの構築物組成物またはシステムは、本明細書に記載の例示的な構築物成分のいずれかまたはすべてを含み得る。いくつかの実施形態では、例示的な1つの構築物は、配列番号64によって表される。いくつかの実施形態では、例示的な1つの構築物は、配列番号64によって表される配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。当業者は、構築物が、コドン最適化、新規であるが機能的に同等の導入(例えば、サイレント変異)、レポーター配列の付加、及び/または他の日常的な修飾などの追加の修飾を受け得ることを認識するであろう。
いくつかの実施形態では、1つの構築物組成物またはシステムは、本明細書に記載の例示的な構築物成分のいずれかまたはすべてを含み得る。いくつかの実施形態では、例示的な1つの構築物は、配列番号68によって表される。いくつかの実施形態では、例示的な1つの構築物は、配列番号68によって表される配列と少なくとも85%、90%、95%、98%、または99%同一である。当業者は、構築物が、コドン最適化、新規であるが機能的に同等の導入(例えば、サイレント変異)、レポーター配列の付加、及び/または他の日常的な修飾などの追加の修飾を受け得ることを認識するであろう。
いくつかの実施形態では、例示的な構築物は、配列番号21によって例示される5’ITR、任意に配列番号46によって例示されるクローニング部位、配列番号38によって例示されるCMVエンハンサー、配列番号23によって例示されるCBAプロモーター、配列番号39によって例示されるキメライントロン、任意に配列番号54によって例示されるクローニング部位、任意に配列番号40によって例示される5’UTR、配列番号1によって例示されるCLRN1コード領域、任意に配列番号41によって例示される3’UTR、配列番号44によって例示されるポリ(A)部位、任意に配列番号49によって例示されるクローニング部位、及び配列番号22によって例示される3’ITRを含む(以下の表1を参照)。

Figure 2024500786000007
いくつかの実施形態では、例示的な構築物は、配列番号21によって例示される5’ITR、任意に配列番号46によって例示されるクローニング部位、配列番号38によって例示されるCMVエンハンサー、配列番号23によって例示されるCBAプロモーター、配列番号39によって例示されるキメライントロン、任意に配列番号54によって例示されるクローニング部位、任意に配列番号40によって例示される5’UTR、配列番号19によって例示されるCLRN1コード領域、任意に配列番号41によって例示される3’UTR、配列番号44によって例示されるポリ(A)部位、任意に配列番号49によって例示されるクローニング部位、及び配列番号22によって例示される3’ITRを含む(以下の表2を参照)。
Figure 2024500786000008
例示的な1つの構築物配列1(配列番号64)
TTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGGGCGACCAAAGGTCGCCCGACGCCCGGGCTTTGCCCGGGCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCTTTGTCGACGCGGCCGCACGCGTGACATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGACTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGGTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCGGGAGTCGCTGCGTTGCCTTCGCCCCGTGCCCCGCTCCGCGCCGCCTCGCGCCGCCCGCCCCGGCTCTGACTGACCGCGTTACTCCCACAGGTGAGCGGGCGGGACGGCCCTTCTCCTCCGGGCTGTAATTAGCGCTTGGTTTAATGACGGCTCGTTTCTTTTCTGTGGCTGCGTGAAAGCCTTAAAGGGCTCCGGGAGGGCCCTTTGTGCGGGGGGGAGCGGCTCGGGGGGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGTGGGGAGCGCCGCGTGCGGCCCGCGCTGCCCGGCGGCTGTGAGCGCTGCGGGCGCGGCGCGGGGCTTTGTGCGCTCCGCGTGTGCGCGAGGGGAGCGCGGCCGGGGGCGGTGCCCCGCGGTGCGGGGGGGCTGCGAGGGGAACAAAGGCTGCGTGCGGGGTGTGTGCGTGGGGGGGTGAGCAGGGGGTGTGGGCGCGGCGGTCGGGCTGTAACCCCCCCCTGCACCCCCCTCCCCGAGTTGCTGAGCACGGCCCGGCTTCGGGTGCGGGGCTCCGTGCGGGGCGTGGCGCGGGGCTCGCCGTGCCGGGCGGGGGGTGGCGGCAGGTGGGGGTGCCGGGCGGGGCGGGGCCGCCTCGGGCCGGGGAGGGCTCGGGGGAGGGGCGCGGCGGCCCCCGGAGCGCCGGCGGCTGTCGAGGCGCGGCGAGCCGCAGCCATTGCCTTTTATGGTAATCGTGCGAGAGGGCGCAGGGACTTCCTTTGTCCCAAATCTGTGCGGAGCCGAAATCTGGGAGGCGCCGCCGCACCCCCTCTAGCGGGCGCGGGGCGAAGCGGTGCGGCGCCGGCAGGAAGGAAATGGGCGGGGAGGGCCTTCGTGCGTCGCCGCGCCGCCGTCCCCTTCTCCCTCTCCAGCCTCGGGGCTGTCCGCGGGGGGACGGCTGCCTTCGGGGGGGACGGGGCAGGGCGGGGTTCGGCTTCTGGCGTGTGACCGGCGGCTCTAGAGCCTCTGCTAACCATGTTCATGCCTTCTTCTTTTTCCTACAGCTCCTGGGCAACGTGCTGGTTATTGTGACCGGTAGGAGATACTTGAAGGCAGTTTGAAAGACTTGTTTTACAGATTCTTAGTCCAAAGATTTCCAATTAGGGAGAAGAAGCAGCAGAAAAGGAGAAAAGCCAAGTATGAGTGATGATGAGGCCTTCATCTACTGACATTTAACCTGGCGAGAACCGTCGATGGTGAAGTTGCCTTTTCAGCTGGGAGCTGTCCGTTCAGCTTCCGTAATAAATGCAGTCAAAGAGGCAGTCCCTTCCCATTGCTCACAAAGGTCTTGTTTTTGAACCTCGCCCTCACAGAAGCCGTTTCTCATCGCCACCATGCCAAGCCAACAGAAGAAAATCATTTTTTGCATGGCCGGAGTGTTCAGTTTTGCATGTGCCCTCGGAGTTGTGACAGCCTTGGGGACACCGTTGTGGATCAAAGCCACTGTCCTCTGCAAAACGGGAGCTCTGCTCGTCAATGCCTCAGGGCAGGAGCTGGACAAGTTTATGGGTGAAATGCAGTACGGGCTTTTCCACGGAGAGGGTGTGAGGCAGTGTGGGTTGGGAGCAAGGCCCTTTCGGTTCTCATTTTTTCCAGATTTGCTCAAAGCAATCCCAGTGAGCATCCACGTCAATGTCATTCTCTTCTCTGCCATCCTTATTGTGTTAACCATGGTGGGGACAGCCTTCTTCATGTACAATGCTTTTGGAAAACCTTTTGAAACTCTGCATGGTCCCCTAGGGCTGTACCTTTTGAGCTTCATTTCAGGCTCCTGTGGCTGTCTTGTCATGATATTGTTTGCCTCTGAAGTGAAAATCCATCACCTCTCAGAAAAAATTGCAAATTATAAAGAAGGGACTTATGTCTACAAAACGCAAAGTGAAAAATATACCACCTCATTCTGGGTCATTTTCTTTTGCTTTTTTGTTCATTTTCTGAATGGGCTCCTAATACGACTTGCTGGATTTCAGTTCCCTTTTGCAAAATCTAAAGACGCAGAAACAACTAATGTAGCTGCAGATCTAATGTACTAAGAGCTCAAGGCAAACCTTTCTATAATTTTACAAGGGAGTAGACTTGCTTTGGTCACTTTTAGATGTGGTTAATTTTGCATATCCTTTTAGTCTGCATATATTAAAGCATCAGGACCCTTCGTGACAATGTTTACAAATTACGTACTAAGGATACAGGCTGGAAAGTAAGGGAAGCAGAAGGAAGGCTTTGAAAAGTTGTTTTATCTGGTGGGAAATTGCTTGACCCAGGTAGTCAAAGGCAGTTGACTAGAATCGACAAATTGTTACTCCATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATGTCTTCCTATCAAAAAGATATCAAAGGCACATGGAATATATTTTAATAAAAACAAATAATATCTCTAATATATCCACACATTTGTTGCCAGATTTCAGAAAACTGAGCTGCAATCGCTTTCCTAAAACAGTAGTGTATTAAATGAACATCTATAAAATGTATCAACACACATTTTAAAAAATTTGTTTAAAGTATACTCTTAGGCCAGGCGTGGTGACTCACACCTGTAATTCCAGCACTTCAGGAGGCCAAGGTGGGAAGATCATTTGAGTTCAGGAGTTCGAGTTACAGCCTGGGCAATAAAGTGAGACCCTGTCACTAACAAAATTAAAAAATAAAATAAATATAAAATATAGGCTTTAAAAAAGCATAGTCTTATTAACCATGTCTGTTGGTCAAAATCTGCAAACTCTAAAAGAAGAAAAGAAGAAAAAACCAACGTTAGGGTATTTTTCCTCCCGTGCCTGAGTCCCAATTACATTCACGACAGTACTTTCAATGAACATAATTGTTAGGACCACTGAGGAATCATGAAAAATGATCTCTGCTTAGTACATTTGATGCAAAATGACTTATTAGGGGCTGTTTTTCTAGCTATAGTGTCTCGAGTACTAATATGCAATTATGAAAATTATATTAAATCTGGGATTATGACGGTATCACTGTATCATCTTGGTCTTGTTCTGGCTGTCACCAAGCATGACCCAGGTCAACTTTTTTTTTCCCCTGAATTACCCATCAAATTGATCTGCAGCTGACTAAAGGCCACAGCTGAGCCTGGAACTGACCCTTCCTTCATCCTCAACCTGCTGTCCTCCAGAAAGCACCAAGGAAAAAGCAGAGAATGACAGCAAACAGATCACTAGGCCTCTGACCACAGGTGCTGAGTACTCAGCAGCCCTCATATAATAGGTTTGAAAGTACTCCTTAAAATAAAACACTGTTTCCCTTTGGAACTATTTACAAGGATGAAACAACCGTATACCTGAGAAATAACTTGCTCTGGTGTCAATTCGCTATTCGCCAGCAGACATCAGAACACACCGAGTTTCCAGATGCTCTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCCCACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGGGTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCTGGGGATGCGGTGGGCTCTATGGAAGCTTGAATTCAGCTGACGTGCCTCGGACCGTCCTAGGAGGAACCCCTAGTGATGGAGTTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAA
例示的な1つの構築物配列2(配列番号68)
TTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGGGCGACCAAAGGTCGCCCGACGCCCGGGCTTTGCCCGGGCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCTTTGTCGACGCGGCCGCACGCGTGACATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGACTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGGTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCGGGAGTCGCTGCGTTGCCTTCGCCCCGTGCCCCGCTCCGCGCCGCCTCGCGCCGCCCGCCCCGGCTCTGACTGACCGCGTTACTCCCACAGGTGAGCGGGCGGGACGGCCCTTCTCCTCCGGGCTGTAATTAGCGCTTGGTTTAATGACGGCTCGTTTCTTTTCTGTGGCTGCGTGAAAGCCTTAAAGGGCTCCGGGAGGGCCCTTTGTGCGGGGGGGAGCGGCTCGGGGGGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGTGGGGAGCGCCGCGTGCGGCCCGCGCTGCCCGGCGGCTGTGAGCGCTGCGGGCGCGGCGCGGGGCTTTGTGCGCTCCGCGTGTGCGCGAGGGGAGCGCGGCCGGGGGCGGTGCCCCGCGGTGCGGGGGGGCTGCGAGGGGAACAAAGGCTGCGTGCGGGGTGTGTGCGTGGGGGGGTGAGCAGGGGGTGTGGGCGCGGCGGTCGGGCTGTAACCCCCCCCTGCACCCCCCTCCCCGAGTTGCTGAGCACGGCCCGGCTTCGGGTGCGGGGCTCCGTGCGGGGCGTGGCGCGGGGCTCGCCGTGCCGGGCGGGGGGTGGCGGCAGGTGGGGGTGCCGGGCGGGGCGGGGCCGCCTCGGGCCGGGGAGGGCTCGGGGGAGGGGCGCGGCGGCCCCCGGAGCGCCGGCGGCTGTCGAGGCGCGGCGAGCCGCAGCCATTGCCTTTTATGGTAATCGTGCGAGAGGGCGCAGGGACTTCCTTTGTCCCAAATCTGTGCGGAGCCGAAATCTGGGAGGCGCCGCCGCACCCCCTCTAGCGGGCGCGGGGCGAAGCGGTGCGGCGCCGGCAGGAAGGAAATGGGCGGGGAGGGCCTTCGTGCGTCGCCGCGCCGCCGTCCCCTTCTCCCTCTCCAGCCTCGGGGCTGTCCGCGGGGGGACGGCTGCCTTCGGGGGGGACGGGGCAGGGCGGGGTTCGGCTTCTGGCGTGTGACCGGCGGCTCTAGAGCCTCTGCTAACCATGTTCATGCCTTCTTCTTTTTCCTACAGCTCCTGGGCAACGTGCTGGTTATTGTGACCGGTAGGAGATACTTGAAGGCAGTTTGAAAGACTTGTTTTACAGATTCTTAGTCCAAAGATTTCCAATTAGGGAGAAGAAGCAGCAGAAAAGGAGAAAAGCCAAGTATGAGTGATGATGAGGCCTTCATCTACTGACATTTAACCTGGCGAGAACCGTCGATGGTGAAGTTGCCTTTTCAGCTGGGAGCTGTCCGTTCAGCTTCCGTAATAAATGCAGTCAAAGAGGCAGTCCCTTCCCATTGCTCACAAAGGTCTTGTTTTTGAACCTCGCCCTCACAGAAGCCGTTTCTCATCGCCACCATGCCTAGCCAGCAGAAGAAAATCATCTTCTGCATGGCCGGCGTGTTCAGCTTCGCCTGTGCTCTGGGAGTTGTGACAGCCCTGGGAACCCCTCTGTGGATCAAAGCCACAGTGCTGTGCAAGACAGGCGCCCTGCTGGTTAATGCCTCTGGCCAAGAGCTGGACAAGTTCATGGGCGAGATGCAGTACGGCCTGTTCCATGGCGAAGGCGTCAGACAGTGTGGCCTGGGAGCCAGACCTTTCAGATTCAGCTTCTTCCCAGACCTGCTGAAGGCTATCCCCGTGTCCATCCACGTGAACGTGATCCTGTTCAGCGCCATCCTGATCGTGCTGACAATGGTCGGAACCGCCTTCTTCATGTACAACGCCTTCGGCAAGCCCTTCGAGACACTGCATGGACCTCTGGGCCTGTACCTGCTGAGCTTTATCAGCGGCAGCTGTGGCTGCCTGGTCATGATTCTGTTCGCCAGCGAAGTGAAGATCCACCACCTGAGCGAGAAGATCGCCAACTACAAAGAGGGCACCTACGTCTACAAGACCCAGTCCGAGAAGTACACCACCAGCTTTTGGGTTATCTTCTTCTGTTTCTTCGTGCACTTCCTGAACGGCCTGCTGATCAGACTGGCCGGCTTCCAGTTTCCATTCGCCAAGAGCAAGGACGCCGAAACCACAAACGTGGCCGCCGATCTGATGTACTAAGAGCTCAAGGCAAACCTTTCTATAATTTTACAAGGGAGTAGACTTGCTTTGGTCACTTTTAGATGTGGTTAATTTTGCATATCCTTTTAGTCTGCATATATTAAAGCATCAGGACCCTTCGTGACAATGTTTACAAATTACGTACTAAGGATACAGGCTGGAAAGTAAGGGAAGCAGAAGGAAGGCTTTGAAAAGTTGTTTTATCTGGTGGGAAATTGCTTGACCCAGGTAGTCAAAGGCAGTTGACTAGAATCGACAAATTGTTACTCCATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATGTCTTCCTATCAAAAAGATATCAAAGGCACATGGAATATATTTTAATAAAAACAAATAATATCTCTAATATATCCACACATTTGTTGCCAGATTTCAGAAAACTGAGCTGCAATCGCTTTCCTAAAACAGTAGTGTATTAAATGAACATCTATAAAATGTATCAACACACATTTTAAAAAATTTGTTTAAAGTATACTCTTAGGCCAGGCGTGGTGACTCACACCTGTAATTCCAGCACTTCAGGAGGCCAAGGTGGGAAGATCATTTGAGTTCAGGAGTTCGAGTTACAGCCTGGGCAATAAAGTGAGACCCTGTCACTAACAAAATTAAAAAATAAAATAAATATAAAATATAGGCTTTAAAAAAGCATAGTCTTATTAACCATGTCTGTTGGTCAAAATCTGCAAACTCTAAAAGAAGAAAAGAAGAAAAAACCAACGTTAGGGTATTTTTCCTCCCGTGCCTGAGTCCCAATTACATTCACGACAGTACTTTCAATGAACATAATTGTTAGGACCACTGAGGAATCATGAAAAATGATCTCTGCTTAGTACATTTGATGCAAAATGACTTATTAGGGGCTGTTTTTCTAGCTATAGTGTCTCGAGTACTAATATGCAATTATGAAAATTATATTAAATCTGGGATTATGACGGTATCACTGTATCATCTTGGTCTTGTTCTGGCTGTCACCAAGCATGACCCAGGTCAACTTTTTTTTTCCCCTGAATTACCCATCAAATTGATCTGCAGCTGACTAAAGGCCACAGCTGAGCCTGGAACTGACCCTTCCTTCATCCTCAACCTGCTGTCCTCCAGAAAGCACCAAGGAAAAAGCAGAGAATGACAGCAAACAGATCACTAGGCCTCTGACCACAGGTGCTGAGTACTCAGCAGCCCTCATATAATAGGTTTGAAAGTACTCCTTAAAATAAAACACTGTTTCCCTTTGGAACTATTTACAAGGATGAAACAACCGTATACCTGAGAAATAACTTGCTCTGGTGTCAATTCGCTATTCGCCAGCAGACATCAGAACACACCGAGTTTCCAGATGCTCTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCCCACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGGGTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCTGGGGATGCGGTGGGCTCTATGGAAGCTTGAATTCAGCTGACGTGCCTCGGACCGTCCTAGGAGGAACCCCTAGTGATGGAGTTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAA
複数のAAV構築物組成物
本開示は、タンパク質(例えば、クラリン1タンパク質)をコードするいくつかのコード配列が、コード配列を複数の部分に分割することによって送達され得、それらはそれぞれ異なる構築物に含まれることを認識する。いくつかの実施形態では、少なくとも2つの異なる構築物(例えば、2、3、4、5、または6)を含む組成物またはシステムが本明細書では提供される。いくつかの実施形態では、少なくとも2つの異なる構築物の各々は、コード領域の異なる部分をコードする(例えば、標的タンパク質、例えば、内耳標的タンパク質、例えば、眼標的タンパク質、例えば、クラリン1タンパク質をコードする)コード配列を含み、コードされた部分のそれぞれが、少なくとも10のアミノ酸(例えば、少なくとも約10のアミノ酸、少なくとも約20のアミノ酸、少なくとも約30のアミノ酸、少なくとも約60のアミノ酸、少なくとも約70のアミノ酸、少なくとも約80のアミノ酸、少なくとも約90のアミノ酸、少なくとも約100のアミノ酸、少なくとも約110のアミノ酸、少なくとも約120のアミノ酸、少なくとも約130のアミノ酸、少なくとも約140のアミノ酸、少なくとも約150のアミノ酸、少なくとも約160のアミノ酸、少なくとも約170のアミノ酸、少なくとも約180のアミノ酸、少なくとも約190のアミノ酸、少なくとも約200のアミノ酸、少なくとも約210のアミノ酸、少なくとも約220のアミノ酸、少なくとも約230のアミノ酸、少なくとも約240のアミノ酸、少なくとも約250のアミノ酸、少なくとも約260のアミノ酸、少なくとも約270のアミノ酸、少なくとも約280のアミノ酸、少なくとも約290のアミノ酸、少なくとも約300のアミノ酸、少なくとも約310のアミノ酸、少なくとも約320のアミノ酸、少なくとも約330のアミノ酸、少なくとも約340のアミノ酸、少なくとも約350のアミノ酸、少なくとも約360のアミノ酸、少なくとも約370のアミノ酸、少なくとも約380のアミノ酸、少なくとも約390のアミノ酸、少なくとも約400のアミノ酸、少なくとも約410のアミノ酸、少なくとも約420のアミノ酸、少なくとも約430のアミノ酸、少なくとも約440のアミノ酸、少なくとも約450のアミノ酸、少なくとも約460のアミノ酸、少なくとも約470のアミノ酸、少なくとも約480のアミノ酸、少なくとも約490のアミノ酸、少なくとも約500のアミノ酸、少なくとも約510のアミノ酸、少なくとも約520のアミノ酸、少なくとも約530のアミノ酸、少なくとも約540のアミノ酸、少なくとも約550のアミノ酸、少なくとも約560のアミノ酸、少なくとも約570のアミノ酸、少なくとも約580のアミノ酸、少なくとも約590のアミノ酸、少なくとも約600のアミノ酸、少なくとも約610のアミノ酸、少なくとも約620のアミノ酸、少なくとも約630のアミノ酸、少なくとも約640のアミノ酸、少なくとも約650のアミノ酸、少なくとも約660のアミノ酸、少なくとも約670のアミノ酸、少なくとも約680のアミノ酸、少なくとも約690のアミノ酸、少なくとも約700のアミノ酸、少なくとも約710のアミノ酸、少なくとも約720のアミノ酸、少なくとも約730のアミノ酸、少なくとも約740のアミノ酸、少なくとも約750のアミノ酸、少なくとも約760のアミノ酸、少なくとも約770のアミノ酸、少なくとも約780のアミノ酸、少なくとも約790のアミノ酸、少なくとも約800のアミノ酸、少なくとも約810のアミノ酸、または少なくとも約820のアミノ酸))であり、ここで、コードされた部分の各々のアミノ酸配列は、任意に、コードされた部分の異なる1つのアミノ酸配列と部分的に重複し得る。少なくとも2つの異なる構築物のうちの1つの構築物が、活性標的タンパク質をコードしない。対象細胞(例えば、動物細胞、例えば、霊長類細胞、例えば、ヒト細胞)に導入されたとき、少なくとも2つの異なる構築物が互いに相同組換えを受け、ここで、組換え核酸は、活性標的タンパク質(例えば、CLRN1遺伝子またはその特徴的部分によってコードされる遺伝子産物)をコードする。いくつかの実施形態では、核酸構築物のうちの1つは、標的タンパク質(例えば、内耳標的タンパク質、例えば、クラリン1タンパク質)の一部をコードするコード配列を含むことができ、ここで、コードされる部分は最大約820アミノ酸(例えば、最大約10のアミノ酸、最大約20のアミノ酸、最大約30のアミノ酸、最大約60のアミノ酸、最大約70のアミノ酸、最大約80のアミノ酸、最大約90のアミノ酸、最大約100のアミノ酸、最大約110のアミノ酸、最大約120のアミノ酸、最大約130のアミノ酸、最大約140のアミノ酸、最大約150のアミノ酸、最大約160のアミノ酸、最大約170のアミノ酸、最大約180のアミノ酸、最大約190のアミノ酸、最大約200のアミノ酸、最大約210のアミノ酸、最大約220のアミノ酸、最大約230のアミノ酸、最大約240のアミノ酸、最大約250のアミノ酸、最大約260のアミノ酸、最大約270のアミノ酸、最大約280のアミノ酸、最大約290のアミノ酸、最大約300のアミノ酸、最大約310のアミノ酸、最大約320のアミノ酸、最大約330のアミノ酸、最大約340のアミノ酸、最大約350のアミノ酸、最大約360のアミノ酸、最大約370のアミノ酸、最大約380のアミノ酸、最大約390のアミノ酸、最大約400のアミノ酸、最大約410のアミノ酸、最大約420のアミノ酸、最大約430のアミノ酸、最大約440のアミノ酸、最大約450のアミノ酸、最大約460のアミノ酸、最大約470のアミノ酸、最大約480のアミノ酸、最大約490のアミノ酸、最大約500のアミノ酸、最大約510のアミノ酸、最大約520のアミノ酸、最大約530のアミノ酸、最大約540のアミノ酸、最大約550のアミノ酸、最大約560のアミノ酸、最大約570のアミノ酸、最大約580のアミノ酸、最大約590のアミノ酸、最大約600のアミノ酸、最大約610のアミノ酸、最大約620のアミノ酸、最大約630のアミノ酸、最大約640のアミノ酸、最大約650のアミノ酸、最大約660のアミノ酸、最大約670のアミノ酸、最大約680のアミノ酸、最大約690のアミノ酸、最大約700のアミノ酸、最大約710のアミノ酸、最大約720のアミノ酸、最大約730のアミノ酸、最大約740のアミノ酸、最大約750のアミノ酸、最大約760のアミノ酸、最大約770のアミノ酸、最大約780のアミノ酸、最大約790のアミノ酸、最大約800のアミノ酸、最大約810のアミノ酸、または最大約820のアミノ酸)である。
いくつかの実施形態では、構築物の少なくとも1つは、標的ゲノムDNA(例えば、内耳標的ゲノムDNA、例えば、CLRN1ゲノムDNA)の2つの隣接エクソンにまたがるヌクレオチド配列を含み、2つの隣接エクソン間に天然に生じるイントロン配列を欠く。
いくつかの実施形態では、構築物のそれぞれのコードされた部分のアミノ酸配列は、コードされた部分の異なるもののアミノ酸配列と部分的にすら重複しない。いくつかの実施形態では、構築物のコードされた部分のアミノ酸配列は、異なる構築物のコードされた部分のアミノ酸配列と部分的に重複する。いくつかの実施形態では、各構築物のコードされた部分のアミノ酸配列は、少なくとも1つの異なる構築物のコードされた部分のアミノ酸配列と部分的に重複する。いくつかの実施形態では、重複するアミノ酸配列は、約10のアミノ酸残基~約300のアミノ酸の間、またはこの範囲の下位範囲のいずれかである(例えば、長さ、約10アミノ酸、約20アミノ酸、約30アミノ酸、約60アミノ酸、約70アミノ酸、約80アミノ酸、約90アミノ酸、約100アミノ酸、約110アミノ酸、約120アミノ酸、約130アミノ酸、約140アミノ酸、約150アミノ酸、約160アミノ酸、約170アミノ酸、約180アミノ酸、約190アミノ酸、約200アミノ酸、約210アミノ酸、約220アミノ酸、約230アミノ酸、約240アミノ酸、約250アミノ酸、約260アミノ酸、約270アミノ酸、約280アミノ酸、約290アミノ酸、約300アミノ酸、約310アミノ酸、約320アミノ酸、約330アミノ酸、約340アミノ酸、約350アミノ酸、約360アミノ酸、約370アミノ酸、約380アミノ酸、約390アミノ酸、約400アミノ酸、約410アミノ酸、約420アミノ酸、約430アミノ酸、約440アミノ酸、約450アミノ酸、約460アミノ酸、約470アミノ酸、約480アミノ酸、約490アミノ酸、約500アミノ酸、約510アミノ酸、約520アミノ酸、約530アミノ酸、約540アミノ酸、約550アミノ酸、約560アミノ酸、約570アミノ酸、約580アミノ酸、約590アミノ酸、約600アミノ酸、約610アミノ酸、約620アミノ酸、約630アミノ酸、約640アミノ酸、約650アミノ酸、約660アミノ酸、約670アミノ酸、約680アミノ酸、約690アミノ酸、約700アミノ酸、約710アミノ酸、約720アミノ酸、約730アミノ酸、約740アミノ酸、約750アミノ酸、約760アミノ酸、約770アミノ酸、約780アミノ酸、約790アミノ酸、約800アミノ酸、約810アミノ酸、または約820アミノ酸)。
いくつかの例では、所望の遺伝子産物(例えば、治療用遺伝子産物)は、少なくとも2つの異なる構築物によってコードされる。いくつかの実施形態では、少なくとも2つの異なる構築物のそれぞれは、イントロンの異なるセグメントを含み、ここで、イントロンは、標的ゲノムDNA(例えば、内耳細胞標的ゲノムDNAまたは眼細胞標的ゲノムDNA(例えば、CLRN1ゲノムDNA))中に存在するイントロン(例えば、本明細書に記載の配列番号5の例示的なイントロンのいずれか)のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、異なるイントロンセグメントが重複する。いくつかの実施形態では、異なるイントロンセグメントは、最大約12,000ヌクレオチド長(例えば、最大約100ヌクレオチド、最大約200ヌクレオチド、最大約300ヌクレオチド、最大約600ヌクレオチド、最大約700ヌクレオチド、最大約800ヌクレオチド、最大約900ヌクレオチド、最大約1,000ヌクレオチド、最大約1,100ヌクレオチド、最大約1,200ヌクレオチド、最大約1,300ヌクレオチド、最大約1,400ヌクレオチド、最大約1,500ヌクレオチド、最大約1,600ヌクレオチド、最大約1,700ヌクレオチド、最大約1,800ヌクレオチド、最大約1,900ヌクレオチド、最大約2,000ヌクレオチド、最大約2,100ヌクレオチド、最大約2,200ヌクレオチド、最大約2,300ヌクレオチド、最大約2,400ヌクレオチド、最大約2,500ヌクレオチド、最大約2,600ヌクレオチド、最大約2,700ヌクレオチド、最大約2,800ヌクレオチド、最大約2,900ヌクレオチド、最大約3,000ヌクレオチド、最大約3,100ヌクレオチド、最大約3,200ヌクレオチド、最大約3,300ヌクレオチド、最大約3,400ヌクレオチド、最大約3,500ヌクレオチド、最大約3,600ヌクレオチド、最大約3,700ヌクレオチド、最大約3,800ヌクレオチド、最大約3,900ヌクレオチド、最大約4,000ヌクレオチド、最大約4,100ヌクレオチド、最大約4,200ヌクレオチド、最大約4,300ヌクレオチド、最大約4,400ヌクレオチド、最大約4,500ヌクレオチド、最大約4,600ヌクレオチド、最大約4,700ヌクレオチド、最大約4,800ヌクレオチド、最大約4,900ヌクレオチド、最大約5,000ヌクレオチド、最大約5,100ヌクレオチド、最大約5,200ヌクレオチド、最大約5,300ヌクレオチド、最大約5,400ヌクレオチド、最大約5,500ヌクレオチド、最大約5,600ヌクレオチド、最大約5,700ヌクレオチド、最大約5,800ヌクレオチド、最大約5,900ヌクレオチド、最大約6,000ヌクレオチド、最大約6,100ヌクレオチド、最大約6,200ヌクレオチド、最大約6,300ヌクレオチド、最大約6,400ヌクレオチド、最大約6,500ヌクレオチド、最大約6,600ヌクレオチド、最大約6,700ヌクレオチド、最大約6,800ヌクレオチド、最大約6,900ヌクレオチド、最大約7,000ヌクレオチド、最大約7,100ヌクレオチド、最大約7,200ヌクレオチド、最大約7,300ヌクレオチド、最大約7,400ヌクレオチド、最大約7,500ヌクレオチド、最大約7,600ヌクレオチド、最大約7,700ヌクレオチド、最大約7,800ヌクレオチド、最大約7,900ヌクレオチド、最大約8,000ヌクレオチド、最大約8,100ヌクレオチド、最大約8,200ヌクレオチド、最大約8,300ヌクレオチド、最大約8,400ヌクレオチド、最大約8,500ヌクレオチド、最大約8,600ヌクレオチド、最大約8,700ヌクレオチド、最大約8,800ヌクレオチド、最大約8,900ヌクレオチド、最大約9,000ヌクレオチド、最大約9,100ヌクレオチド、最大約9,200ヌクレオチド、最大約9,300ヌクレオチド、最大約9,400ヌクレオチド、最大約9,500ヌクレオチド、最大約9,600ヌクレオチド、最大約9,700ヌクレオチド、最大約9,800ヌクレオチド、最大約9,900ヌクレオチド、最大約10,000ヌクレオチド、最大約10,100ヌクレオチド、最大約10,200ヌクレオチド、最大約10,300ヌクレオチド、最大約10,400ヌクレオチド、最大約10,500ヌクレオチド、最大約10,600ヌクレオチド、最大約10,700ヌクレオチド、最大約10,800ヌクレオチド、最大約10,900ヌクレオチド、最大約11,000ヌクレオチド、最大約11,100ヌクレオチド、最大約11,200ヌクレオチド、最大約11,300ヌクレオチド、最大約11,400ヌクレオチド、最大約11,500ヌクレオチド、最大約11,600ヌクレオチド、最大約11,700ヌクレオチド、最大約11,800ヌクレオチド、最大約11,900ヌクレオチド、または最大約12,000ヌクレオチド)、配列が重複する。いくつかの実施形態では、異なる構築物のうちのいずれか2つにおいて重複しているヌクレオチド配列は、標的遺伝子(例えば、内耳細胞標的遺伝子または眼細胞標的遺伝子(例えば、CLRN1遺伝子))の1つ以上のエクソンの一部または全部(例えば、本明細書に記載の配列番号5の例示的なエクソンのうちのいずれか1つ以上)を含み得る。
いくつかの実施形態では、組成物またはシステムは、2つ、3つ、4つ、または5つの異なる構築物であるか、またはそれらを含む。組成物中の異なる構築物の数が2である組成物では、2つの異なる構築物の1つ目は、タンパク質(例えばクラリン1タンパク質)のN末端部分をコードするコード配列を含むことができ、これは、リード部分、第1の構築物、または5’部分(例えば、内耳細胞タンパク質のN末端部分、例えば、眼細胞タンパク質のN末端部分、例えば、クラリン1タンパク質のN末端部分)と称され得る。いくつかの例では、標的遺伝子のN末端部分は、少なくとも約10アミノ酸長(例えば、少なくとも約10アミノ酸、少なくとも約20アミノ酸、少なくとも約30アミノ酸、少なくとも約60アミノ酸、少なくとも約70アミノ酸、少なくとも約80アミノ酸、少なくとも約90アミノ酸、少なくとも約100アミノ酸、少なくとも約110アミノ酸、少なくとも約120アミノ酸、少なくとも約130アミノ酸、少なくとも約140アミノ酸、少なくとも約150アミノ酸、少なくとも約160アミノ酸、少なくとも約170アミノ酸、少なくとも約180アミノ酸、少なくとも約190アミノ酸、少なくとも約200アミノ酸、少なくとも約210アミノ酸、少なくとも約220アミノ酸、少なくとも約230アミノ酸、少なくとも約240アミノ酸、少なくとも約250アミノ酸、少なくとも約260アミノ酸、少なくとも約270アミノ酸、少なくとも約280アミノ酸、少なくとも約290アミノ酸、少なくとも約300アミノ酸、少なくとも約310アミノ酸、少なくとも約320アミノ酸、少なくとも約330アミノ酸、少なくとも約340アミノ酸、少なくとも約350アミノ酸、少なくとも約360アミノ酸、少なくとも約370アミノ酸、少なくとも約380アミノ酸、少なくとも約390アミノ酸、少なくとも約400アミノ酸、少なくとも約410アミノ酸、少なくとも約420アミノ酸、少なくとも約430アミノ酸、少なくとも約440アミノ酸、少なくとも約450アミノ酸、少なくとも約460アミノ酸、少なくとも約470アミノ酸、少なくとも約480アミノ酸、少なくとも約490アミノ酸、少なくとも約500アミノ酸、少なくとも約510アミノ酸、少なくとも約520アミノ酸、少なくとも約530アミノ酸、少なくとも約540アミノ酸、少なくとも約550アミノ酸、少なくとも約560アミノ酸、少なくとも約570アミノ酸、少なくとも約580アミノ酸、少なくとも約590アミノ酸、少なくとも約600アミノ酸、少なくとも約610アミノ酸、少なくとも約620アミノ酸、少なくとも約630アミノ酸、少なくとも約640アミノ酸、少なくとも約650アミノ酸、少なくとも約660アミノ酸、少なくとも約670アミノ酸、少なくとも約680アミノ酸、少なくとも約690アミノ酸、少なくとも約700アミノ酸、少なくとも約710アミノ酸、少なくとも約720アミノ酸、少なくとも約730アミノ酸、少なくとも約740アミノ酸、少なくとも約750アミノ酸、少なくとも約760アミノ酸、少なくとも約770アミノ酸、少なくとも約780アミノ酸、少なくとも約790アミノ酸、少なくとも約800アミノ酸、少なくとも約810アミノ酸、または少なくとも約820アミノ酸)である。いくつかの例において、第1の構築物は、プロモーター(例えば、本明細書に記載されるまたは当技術分野で知られている任意のプロモーター)及びKozak配列(例えば、本明細書に記載されるまたは当技術分野で知られている任意の例示的なKozak配列)の一方または両方を含む。いくつかの例において、第1の構築物は、誘導性プロモーター、構成的プロモーター、または組織特異的プロモーターであるプロモーターを含む。いくつかの例では、2つの異なる構築物の2つ目は、タンパク質のC末端部分をコードするコード配列を含み、これは、末端部分、第2の構築物、または3’部分(例えば、内耳細胞標的タンパク質のC末端部分、例えば、眼細胞標的タンパク質のC末端部分、例えばクラリン1タンパク質のC末端部分)と称され得る。いくつかの例では、標的タンパク質のC末端部分は、少なくとも約10アミノ酸長(例えば、少なくとも約10アミノ酸、少なくとも約20アミノ酸、少なくとも約30アミノ酸、少なくとも約60アミノ酸、少なくとも約70アミノ酸、少なくとも約80アミノ酸、少なくとも約90アミノ酸、少なくとも約100アミノ酸、少なくとも約110アミノ酸、少なくとも約120アミノ酸、少なくとも約130アミノ酸、少なくとも約140アミノ酸、少なくとも約150アミノ酸、少なくとも約160アミノ酸、少なくとも約170アミノ酸、少なくとも約180アミノ酸、少なくとも約190アミノ酸、少なくとも約200アミノ酸、少なくとも約210アミノ酸、少なくとも約220アミノ酸、少なくとも約230アミノ酸、少なくとも約240アミノ酸、少なくとも約250アミノ酸、少なくとも約260アミノ酸、少なくとも約270アミノ酸、少なくとも約280アミノ酸、少なくとも約290アミノ酸、少なくとも約300アミノ酸、少なくとも約310アミノ酸、少なくとも約320アミノ酸、少なくとも約330アミノ酸、少なくとも約340アミノ酸、少なくとも約350アミノ酸、少なくとも約360アミノ酸、少なくとも約370アミノ酸、少なくとも約380アミノ酸、少なくとも約390アミノ酸、少なくとも約400アミノ酸、少なくとも約410アミノ酸、少なくとも約420アミノ酸、少なくとも約430アミノ酸、少なくとも約440アミノ酸、少なくとも約450アミノ酸、少なくとも約460アミノ酸、少なくとも約470アミノ酸、少なくとも約480アミノ酸、少なくとも約490アミノ酸、少なくとも約500アミノ酸、少なくとも約510アミノ酸、少なくとも約520アミノ酸、少なくとも約530アミノ酸、少なくとも約540アミノ酸、少なくとも約550アミノ酸、少なくとも約560アミノ酸、少なくとも約570アミノ酸、少なくとも約580アミノ酸、少なくとも約590アミノ酸、少なくとも約600アミノ酸、少なくとも約610アミノ酸、少なくとも約620アミノ酸、少なくとも約630アミノ酸、少なくとも約640アミノ酸、少なくとも約650アミノ酸、少なくとも約660アミノ酸、少なくとも約670アミノ酸、少なくとも約680アミノ酸、少なくとも約690アミノ酸、少なくとも約700アミノ酸、少なくとも約710アミノ酸、少なくとも約720アミノ酸、少なくとも約730アミノ酸、少なくとも約740アミノ酸、少なくとも約750アミノ酸、少なくとも約760アミノ酸、少なくとも約770アミノ酸、少なくとも約780アミノ酸、少なくとも約790アミノ酸、少なくとも約800アミノ酸、少なくとも約810アミノ酸、または少なくとも約820アミノ酸)である。いくつかの例において、第2の構築物はさらに、ポリ(A)配列を含む。
組成物中の異なる構築物の数が2であるいくつかの例では、2つの構築物のうちの1つによってコードされるN末端部分は、内耳細胞標的タンパク質または眼細胞標的タンパク質(例えば、配列番号10、11、12、13、または14)のアミノ酸1位から約アミノ酸820位、またはこの範囲の任意の下位範囲を含む部分(例えば、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸10位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸20位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸30位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸60位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸70位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸80位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸90位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸100位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸110位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸120位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸130位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸140位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸150位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸160位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸170位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸180位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸190位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸200位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸210位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸220位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸230位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸240位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸250位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸260位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸270位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸280位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸290位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸300位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸310位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸320位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸330位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸340位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸350位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸360位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸370位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸380位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸390位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸400位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸410位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸420位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸430位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸440位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸450位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸460位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸470位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸480位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸490位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸500位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸510位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸520位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸530位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸540位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸550位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸560位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸570位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸580位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸590位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸600位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸610位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸620位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸630位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸640位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸650位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸660位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸670位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸680位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸690位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸700位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸710位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸720位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸730位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸740位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸750位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸760位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸770位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸780位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸790位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸800位、アミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸810位、またはアミノ酸1位~少なくとも約アミノ酸820位)の部分を含むことができる。組成物中の異なる構築物の数が2であるいくつかの例では、前駆体内耳細胞標的タンパク質または眼細胞標的タンパク質のN末端部分は、内耳細胞標的タンパク質または眼細胞標的タンパク質(例えば、配列番号10、11、12、13、または14)の最大アミノ酸1位からアミノ酸820位、またはこの範囲の任意の下位範囲を含む部分(例えば、アミノ酸1位~最大約アミノ酸10位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸20位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸30位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸60位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸70位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸80位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸90位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸100位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸110位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸120位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸130位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸140位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸150位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸160位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸170位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸180位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸190位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸200位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸210位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸220位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸230位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸240位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸250位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸260位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸270位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸280位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸290位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸300位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸310位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸320位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸330位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸340位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸350位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸360位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸370位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸380位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸390位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸400位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸410位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸420位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸430位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸440位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸450位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸460位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸470位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸480位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸490位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸500位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸510位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸520位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸530位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸540位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸550位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸560位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸570位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸580位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸590位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸600位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸610位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸620位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸630位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸640位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸650位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸660位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸670位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸680位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸690位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸700位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸710位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸720位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸730位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸740位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸750位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸760位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸770位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸780位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸790位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸800位、アミノ酸1位~最大約アミノ酸810位、またはアミノ酸1位~最大約アミノ酸820位)を含むことができる。
組成物中の異なる構築物の数が2であるいくつかの例では、2つの構築物のうちの1つによってコードされるC末端部分は、内耳細胞標的タンパク質または眼細胞標的タンパク質(例えば、配列番号10、11、12、13、または14)の最終アミノ酸(例えば、約アミノ酸820位)から約アミノ酸1位、またはこの範囲の任意の下位範囲を含む部分(例えば、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸10位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸20位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸30位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸60位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸70位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸80位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸90位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸100位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸110位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸120位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸130位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸140位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸150位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸160位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸170位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸180位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸190位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸200位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸210位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸220位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸230位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸240位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸250位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸260位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸270位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸280位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸290位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸300位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸310位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸320位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸330位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸340位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸350位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸360位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸370位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸380位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸390位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸400位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸410位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸420位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸430位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸440位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸450位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸460位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸470位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸480位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸490位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸500位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸510位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸520位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸530位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸540位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸550位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸560位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸570位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸580位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸590位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸600位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸610位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸620位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸630位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸640位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸650位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸660位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸670位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸680位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸690位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸700位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸710位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸720位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸730位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸740位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸750位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸760位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸770位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸780位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸790位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸800位、アミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸810位、またはアミノ酸820位~少なくとも約アミノ酸820位)を含むことができる。組成物中の異なる構築物の数が2であるいくつかの例では、前駆体内耳細胞標的タンパク質または眼細胞標的タンパク質のC末端部分は、内耳細胞標的タンパク質または眼細胞標的タンパク質(例えば、配列番号10、11、12、13、または14)の最終アミノ酸(例えば、約アミノ酸820位)から約アミノ酸1位、またはこの範囲の任意の下位範囲を含む部分(例えば、アミノ酸820位~最大約アミノ酸10位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸20位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸30位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸60位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸70位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸80位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸90位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸100位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸110位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸120位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸130位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸140位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸150位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸160位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸170位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸180位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸190位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸200位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸210位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸220位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸230位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸240位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸250位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸260位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸270位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸280位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸290位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸300位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸310位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸320位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸330位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸340位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸350位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸360位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸370位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸380位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸390位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸400位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸410位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸420位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸430位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸440位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸450位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸460位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸470位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸480位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸490位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸500位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸510位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸520位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸530位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸540位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸550位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸560位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸570位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸580位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸590位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸600位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸610位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸620位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸630位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸640位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸650位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸660位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸670位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸680位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸690位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸700位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸710位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸720位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸730位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸740位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸750位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸760位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸770位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸780位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸790位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸800位、アミノ酸820位~最大約アミノ酸810位、またはアミノ酸820位~最大約アミノ酸820、またはそれらの間の任意の長さの配列)の部分を含み得る。
いくつかの実施形態では、スプライス部位は、トランススプライシングに関与する。いくつかの実施形態では、スプライスドナー部位(例えば、Trapani et al.EMBO Mol.Med.6(2):194-211,2014を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)は、N末端構築物中のコード配列に続く。C末端構築物中では、CLRN1のコード配列の直前にスプライスアクセプター部位をサブクローニングすることができる。いくつかの実施形態では、コード配列内にサイレント変異を導入することができ、これにより、制限消化のための追加の部位を生成する。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される構築物のいずれも、症候性及び/または非症候性難聴に関連する症状を改善するために動物に投与するのに好適である組成物に含めることができる。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される構築物のいずれも、視力低下に関連する症状を改善するために動物に投与するのに好適である組成物に含めることができる。
医薬組成物
とりわけ、本開示は、医薬組成物を提供する。いくつかの実施形態では、本明細書で提供される組成物は、症候性及び/または非症候性難聴に関連する症状を改善するために動物に投与するのに好適である。いくつかの実施形態では、本明細書で提供される組成物は、視力低下に関連する症状を改善するために動物に投与するのに好適である。
いくつかの実施形態では、本開示の医薬組成物は、例えば、本明細書に記載のポリヌクレオチド、例えば、1つ以上の構築物を含み得る。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、本明細書に記載のとおり、1つ以上のAAV粒子、例えば、1つ以上のAAV血清型キャプシドによってカプセル化された1つ以上のrAAV構築物を含み得る。
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、1つ以上の薬学的または生理学的に許容される担体、希釈剤、または賦形剤を含み得る。本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される担体」という用語には、薬剤投与に適合する溶媒、分散媒、コーティング、抗菌剤、抗真菌剤などが含まれる。また、補助的な活性化合物も、本明細書に記載される任意の組成物に組み込むことができる。このような組成物は、1つ以上の緩衝液(例えば、中性緩衝食塩水、リン酸緩衝食塩水など);1つ以上の炭水化物(例えば、グルコース、マンノース、スクロース、及びデキストラン);マンニトール;1つ以上のタンパク質、ポリペプチド、もしくはアミノ酸(例えば、グリシン);1つ以上の酸化防止剤;1つ以上のキレート剤(例えば、EDTAもしくはグルタチオン);及び/または1つ以上の防腐剤を含み得る。いくつかの実施形態では、製剤は、例えば、注射液、注射用ゲル、薬物放出カプセルなどの剤形である。
いくつかの実施形態では、本開示の組成物は、静脈内投与用に製剤化される。いくつかの実施形態では、本開示の組成物は、蝸牛内投与用に製剤化される。いくつかの実施形態では、治療用組成物は、脂質ナノ粒子、ポリマーナノ粒子、ミニサークルDNA及び/またはCELiD DNAを含むように製剤化される。
いくつかの実施形態において、治療用組成物は合成外リンパ液を含むように製剤化される。例えば、いくつかの実施形態では、合成外リンパ溶液は、20~200mMのNaCl;1~5mMのKCl;0.1~10mMのCaCl2;1~10mMのグルコース;及び2~50mMのHEPESをpH約6~約9で含む。いくつかの実施形態では、治療用組成物は、生理学的に好適な溶液を含むように製剤化される。例えば、いくつかの実施形態では、生理学的に好適な溶液は、8.10mMのリン酸二ナトリウム、1.5mMのリン酸一カリウム、2.7mMの塩化カリウム、172mMの塩化ナトリウム、及び0.001%のプルロニック酸F68)の最終濃度に調製された、プルロン酸F68を含む市販の1xPBSを含む。いくつかの実施形態では、代替のプルロン酸が利用される。いくつかの実施形態では、代替のイオン濃度が利用される。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の医薬組成物のいずれかは、本明細書に記載の核酸または構築物のいずれかの哺乳動物細胞(例えば、リポソームまたはカチオン性脂質)への侵入を促進する1つ以上の剤をさらに含んでもよい。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の構築物のいずれも、天然及び/または合成ポリマーを使用して製剤化することができる。本明細書に記載の組成物のうちのいずれかに含まれ得るポリマーの非限定的な例としては、これらに限定されないが、DYNAMIC POLYCONJUGATE(登録商標)(Arrowhead Research Corp.,Pasadena,Calif)、Mirus Bio(Madison、Wis.)及びRoche Madison(Madison、Wis.)の製剤、PhaseRX ポリマー製剤、例えば、限定するものではないが、SMARTT POLYMER TECHNOLOGY(登録商標)(PhaseRX,Seattle,Wash.)、Vical(San Diego,Calif.)のDMRI/DOPE、ポロキサマー、VAXFECTIN(登録商標)アジュバント、Calando Pharmaceuticals(Pasadena, Calif.)のキトサン、シクロデキストリン、デンドリマー及びポリ(乳酸-co-グリコール酸)(PLGA)ポリマー、RONDEL(商標)(RNAi/オリゴヌクレオチドナノ粒子送達)ポリマー(Arrowhead Research Corporation,Pasadena,Calif.)、及びpH応答性コブロックポリマー、例えば、これに限定されないが、PhaseRX(Seattle,Wash.)製のものなどを挙げることができる。これらのポリマーのうちの多くは、哺乳類細胞へのin vivoでのオリゴヌクレオチドの送達において有効性を実証した(例えば、deFougerolles,Human Gene Ther.19:125-132,2008、Rozema et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.104:12982-12887,2007、Rozema et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.104:12982-12887,2007、Hu-Lieskovan et al.,Cancer Res.65:8984-8982,2005、Heidel et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.104:5715-5721,2007を参照、その各々は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
いくつかの実施形態において、組成物は、医薬的に許容される担体(例えば、リン酸緩衝食塩水、食塩水、または静菌水)を含む。溶液は、製剤化されると、薬用量処方に適合する方式で、かつ治療的に有効であるような量で投与される。製剤は、例えば、注射液、注射用ゲル、薬物放出カプセルなどの様々な剤形で容易に投与される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される組成物は、例えば、その意図される投与経路に適合するように製剤化することができる。意図される投与経路の非限定的な例としては、局所投与(例えば、蝸牛内投与)がある。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される送達アプローチは、内耳細胞の形質導入のための合成AAVキャプシド(例えば、AAV Anc80)、及び/または直接蝸牛への標的送達のためのデバイスを含む。特定の実施形態では、本開示は、内耳細胞の形質導入に適した方法及び組成物を提供する。いくつかの実施形態では、内耳細胞の形質導入は、蝸牛におけるCLRN1タンパク質の長期にわたる発現を最小限の全身曝露で可能にすることができる。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される送達アプローチは、眼細胞の形質導入のための合成AAVキャプシド(例えば、AAV Anc80)、及び/または直接眼への標的送達のためのデバイスを含む。特定の実施形態では、本開示は、眼細胞の形質導入に適した方法及び組成物を提供する。いくつかの実施形態では、眼細胞の形質導入は、眼におけるCLRN1タンパク質の長期にわたる発現を最小限の全身曝露で可能にすることができる。
いくつかの実施形態では、提供される組成物は、1つの核酸構築物を含む。いくつかの実施形態では、提供される組成物は、2つ以上の異なる構築物を含む。いくつかの実施形態では、組成物は、クラリン1タンパク質及び/またはその機能的特徴部分をコードするコード配列を含む1つの核酸構築物を含む。いくつかの実施形態では、組成物は、クラリン1タンパク質及び/またはその機能的特徴部分をコードするコード配列を含む1つの核酸構築物を含み、これは、哺乳動物細胞に導入されたときに、そのコード配列が哺乳動物細胞のゲノムに組み込まれる。いくつかの実施形態では、組成物は、少なくとも2つの異なる構築物、例えば、クラリン1タンパク質の異なる部分をコードするコード配列を含む構築物を含み、これらの構築物を組み合わせて、哺乳動物細胞において、活性クラリン1タンパク質(例えば、完全長のクラリン1タンパク質)をコードする配列を生成することができ、それによって、それを必要とする対象において、関連する症候性または非症候性感音性難聴を治療する。
また、本明細書に記載される任意の組成物を含むキットも提供される。いくつかの実施形態において、キットは、固体組成物(例えば、本明細書に記載される少なくとも2つの異なる構築物を含む凍結乾燥組成物)と、凍結乾燥組成物を可溶化させるための液体とを含み得る。いくつかの実施形態において、キットは、本明細書に記載される任意の組成物を含む充填済みシリンジを含み得る。
いくつかの実施形態において、キットは、(例えば、水性組成物、例えば、水性医薬組成物として製剤化された)本明細書に記載される任意の組成物を含むバイアルを含む。
いくつかの実施形態において、キットは、本明細書に記載される任意の方法を実施するための説明書を含み得る。
遺伝子改変細胞
本開示はまた、本明細書に記載の核酸、構築物または組成物のいずれかを含む細胞(例えば動物細胞、例えば哺乳動物細胞、例えば霊長類細胞、例えばヒト細胞)も提供する。いくつかの実施形態では、動物細胞は、ヒト細胞(例えば、ヒト支持細胞またはヒト有毛細胞)である。他の実施形態では、動物細胞は、非ヒト哺乳動物(例えば、サル細胞、ネコ科細胞、イヌ科細胞など)である。当業者は、本明細書に記載の核酸及び構築物を任意の動物細胞(例えば、獣医学的介入に好適である任意の動物の支持細胞または有毛細胞)に導入できることを理解するであろう。構築物及び構築物を動物細胞に導入するための方法の非限定的な例が本明細書に記載される。
いくつかの実施形態では、動物細胞は、内耳の任意の細胞、例えば、有毛及び/または支持細胞であり得る。そのような細胞の非限定的な例としては、ヘンセン細胞、ダイテルス細胞、内リンパ嚢及び管の細胞、球形嚢、卵形嚢、及び膨大部の移行細胞、内有毛細胞及び外有毛細胞、らせん靭帯細胞、らせん神経節細胞、らせん隆起細胞、外部球形細胞、辺縁細胞、中間細胞、基底細胞、内柱細胞、外柱細胞、クラウジス細胞、内境界細胞、内指節細胞、または血管条の細胞が挙げられる。
いくつかの実施形態において、動物細胞は、蝸牛の特異的細胞である。いくつかの実施形態において、動物細胞は、有毛細胞である。いくつかの実施形態では、動物細胞は、蝸牛内有毛細胞または蝸牛外有毛細胞である。いくつかの実施形態では、動物細胞は、蝸牛内有毛細胞である。いくつかの実施形態では、動物細胞は、蝸牛外有毛細胞である。
いくつかの実施形態では、動物細胞は、眼の任意の細胞、例えば、支持細胞であり得る。そのような細胞の非限定的な例としては、桿体細胞、錐体細胞、色素細胞、水平細胞、双極細胞、アマクリン細胞、神経節細胞、光受容細胞、ミュラー細胞、または網膜細胞が挙げられる。
いくつかの実施形態では、動物細胞は、眼の特異的細胞である。いくつかの実施形態において、動物細胞は、眼細胞である。いくつかの実施形態において、動物細胞は、網膜細胞である。
いくつかの実施形態において、動物細胞は、in vitroである。いくつかの実施形態では、動物細胞は、動物、例えば霊長類及び/またはヒトに内因的に存在する細胞型のものである。いくつかの実施形態において、動物細胞は、動物から得られ、ex vivoで培養された自家細胞である。
方法
難聴
とりわけ、本開示は、方法を提供する。いくつかの実施形態では、方法は、本明細書に記載の組成物を対象の内耳(例えば、蝸牛)に導入することを含む。例えば、本明細書では、いくつかの実施形態では、対象(例えば動物、例えば哺乳動物、例えば霊長類、例えばヒト)の内耳(例えば、蝸牛)に治療有効量の本明細書に記載の任意の組成物を投与することを含む方法が提供される。任意のこれらの方法のいくつかの実施形態では、対象は、欠陥がある内耳細胞標的遺伝子(例えば、遺伝子によってコードされる支持及び/または聴覚細胞標的タンパク質の発現及び/または活性の減少をもたらす変異を有する支持及び/または聴覚細胞標的遺伝子)を有すると過去に特定されている。任意のこれらの方法のいくつかの実施形態はさらに、導入または投与ステップの前に、対象が欠陥のある内耳細胞標的遺伝子を有することを判定することをさらに含む。任意のこれらの方法のいくつかの実施形態は、対象において内耳細胞標的遺伝子における変異を検出することをさらに含み得る。任意のこれらの方法のいくつかの実施形態は、対象が非症候性または症候性感音性難聴を有すると特定するか、または診断することをさらに含み得る。
いくつかの実施形態では、本明細書では、対象、例えば動物、例えば哺乳動物、例えば霊長類、例えばヒトの内耳内における内耳細胞標的遺伝子欠損(例えば、CLRN1の欠損)を修正する方法が提供される。いくつかの実施形態では、方法は、治療有効量の本明細書に記載の組成物のいずれかを対象の内耳に投与することを含み、ここで、投与することは、対象の内耳の任意の細胞サブセットにおける内耳細胞標的遺伝子欠損を修復及び/または改善する。いくつかの実施形態では、内耳標的細胞は、有毛細胞などの感覚細胞、及び/または支持細胞などの非感覚細胞、及び/または内耳細胞のすべてまたは任意のサブセットであり得る。
また、対象(例えば、動物、例えば哺乳動物、例えば霊長類、例えばヒト)の内耳細胞の任意のサブセット中の内耳細胞標的タンパク質の発現レベルを増加させる方法であって、本方法は、治療有効量の本明細書に記載の組成物のいずれかを対象の内耳に投与することを含み、投与することが、対象の内耳の任意の細胞サブセット中での内耳細胞標的タンパク質(例えば、クラリン1タンパク質)の発現レベルの増加をもたらす、方法も本明細書に提供される。いくつかの実施形態では、内耳標的細胞は、有毛細胞などの感覚細胞、及び/または支持細胞などの非感覚細胞、及び/または内耳細胞のすべてまたは任意のサブセットであり得る。
また、本明細書では、欠陥のある内耳細胞標的遺伝子を有すると特定された対象(例えば、動物、例えば哺乳動物、例えば霊長類、例えばヒト)における難聴、例えば、非症候性感音性難聴または症候性感音性難聴を治療する方法であって、治療有効量の本明細書に記載の組成物のいずれかを対象の内耳に投与することを含む、方法も提供される。本明細書に提供される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態では、対象は、アッシャー症候群III型を有する。
また、本明細書では、内耳障害を有すると特定または診断された対象におけるシナプスを回復する及び/またはらせん神経節神経を維持する方法であって、治療有効量の本明細書に記載の組成物のいずれかを対象の内耳に投与することを含む、方法も提供される。
アッシャー症候群III型を有する対象、例えば哺乳動物、例えばヒト、例えば患者の治療のために、本明細書に開示の組成物、例えばrAAV-CLRN1を投与することを含む方法も本明細書に提供される。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物は、外科的送達によって、例えば蝸牛に送達される。
また、本明細書では、前庭水管のサイズを縮小する方法、及び/または前庭水管を適切なサイズに回復させる方法も提供される。また、本明細書では、内耳障害を有すると特定または診断された対象における内リンパのpHを適切及び/または許容レベルまで回復させる方法であって、治療有効量の本明細書に記載される任意の組成物を対象の内耳に投与することを含む、方法も提供される。
また、本明細書では、治療有効量の本明細書に記載の任意の組成物を対象の内耳に投与することを含む方法も提供される。
また、本明細書では、難聴(例えば、非症候性感音性難聴または症候性感音性難聴)を治療するための外科的方法も提供される。いくつかの実施形態では、方法は、対象の蝸牛に第1の切開点にて第1の切開を導入するステップと、治療有効量の本明細書に提供される組成物のうちのいずれかを蝸牛内投与するステップとを含む。いくつかの実施形態では、組成物は、第1の切開点にて対象に投与される。いくつかの実施形態では、組成物は、第1の切開の中へとまたはそれを通して対象に投与される。
本明細書に記載される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態では、本明細書に記載される組成物のうちのいずれかは、蝸牛の前庭窓膜の中へとまたはそれを通して対象に投与される。本明細書に記載される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態では、本明細書に記載される組成物のうちのいずれかは、蝸牛の蝸牛窓膜の中へとまたはそれを通して対象に投与される。本明細書に記載される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態では、組成物は、蝸牛窓膜に複数の切開点を作出することができる医療デバイスを用いて投与される。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、複数のマイクロニードルを含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、略円形の第1の面を含む複数のマイクロニードルを含み、各マイクロニードルが少なくとも約10ミクロンの直径を有する。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、組成物を保有可能な基部及び/またはリザーバーを含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、組成物を移送可能な内腔を個々に含む複数の中空マイクロニードルを含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、少なくとも部分真空を生成するための手段を含む。
いくつかの実施形態では、本開示の技術を使用して、難聴を有するか、または難聴のリスクを有する対象を治療する。例えば、いくつかの実施形態では、対象は、CLRN1の少なくとも1つの病原性バリアントに起因する常染色体劣性難聴を有する。当業者は、CLRN1中の多くの異なる変異が病原性バリアントをもたらし得ることを理解するであろう。いくつかのそのような実施形態では、病原性バリアントは、難聴を引き起こすか、または引き起こすリスクがある。
いくつかの実施形態では、難聴を経験している対象を評価して、難聴を引き起こし得る1つ以上の変異が存在し得るか、及び存在し得る場所を決定する。いくつかのそのような実施形態では、CLRN1遺伝子産物または機能の状態が(例えば、タンパク質または配列決定分析を介して)評価される。本明細書に記載の方法のいずれかのいくつかの実施形態では、対象または動物は、哺乳動物であり、いくつかの実施形態では、哺乳動物は、家畜、農場動物、動物園動物、非ヒト霊長類、またはヒトである。本明細書に記載される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態では、動物、対象または哺乳動物は、成体、ティーンエイジャー、若齢個体、幼齢個体、幼児期個体、乳児期個体、または新生児期個体である。本明細書に記載される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態では、動物、対象または哺乳動物の年齢は、1~5、1~10、1~20、1~30、1~40、1~50、1~60、1~70、1~80、1~90、1~100、1~110、2~5、2~10、10~20、20~30、30~40、40~50、50~60、60~70、70~80、80~90、90~100、100~110、10~30、10~40、10~50、10~60、10~70、10~80、10~90、10~100、10~110、20~40、20~50、20~60、20~70、20~80、20~90、20~100、20~110、30~50、30~60、30~70、30~80、30~90、30~100、40~60、40~70、40~80、40~90、40~100、50~70、50~80、50~90、50~100、60~80、60~90、60~100、70~90、70~100、70~110、80~100、80~110、または90~110歳である。本明細書に記載される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態では、対象または哺乳動物の月齢は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、または11ヶ月である。
本明細書に記載の方法のいずれかのいくつかの実施形態では、方法は、それを必要とする対象において、少なくとも10日、少なくとも15日、少なくとも20日、少なくとも25日、少なくとも30日、少なくとも35日、少なくとも40日、少なくとも45日、少なくとも50日、少なくとも55日、少なくとも60日、少なくとも65日、少なくとも70日、少なくとも75日、少なくとも80日、少なくとも85日、少なくとも100日、少なくとも105日、少なくとも110日、少なくとも115日、少なくとも120日、少なくとも5ヶ月、少なくとも6ヶ月、少なくとも7ヶ月、少なくとも8ヶ月、少なくとも9ヶ月、少なくとも10ヶ月、少なくとも11ヶ月、または少なくとも12ヶ月の間、聴力の改善(例えば、本明細書に記載の聴力の改善を決定するための測定基準のいずれか)をもたらす。
いくつかの実施形態において、対象(例えば、動物、例えば、哺乳動物、例えば、ヒト)は、症候性または非症候性感音性難聴を有するか、または発症するリスクがある。いくつかの実施形態では、対象(例えば、動物、例えば、哺乳動物、例えば、ヒト)は、CLRN1遺伝子における変異を有すると以前に特定されている。いくつかの実施形態では、対象(例えば、動物、例えば、哺乳動物、例えば、ヒト)は、本明細書に記載されているか、または症候性または非症候性感音性難聴に関連することが当技術分野で知られているCLRN1遺伝子中の変異のうちのいずれかを有する。
いくつかの実施形態では、対象(例えば、動物、例えば、哺乳動物、例えば、ヒト)は、CLRN1遺伝子中の変異の保因者であると(例えば、遺伝子検査を介して)特定されている。いくつかの実施形態では、対象(例えば動物、例えば哺乳動物、例えばヒト)は、CLRN1遺伝子中に突然変異を有すると特定され、症候性または非症候性感音性難聴と診断されている。いくつかの実施形態では、対象(例えば動物、例えば哺乳動物、例えばヒト)は、症候性または非症候性感音性難聴を有すると特定されている。
いくつかの実施形態において、対象(例えば、動物、例えば、哺乳動物、例えば、ヒト)は、難聴のリスクがある(例えば、遺伝子変異、例えば、CLRN1変異の保因者であるリスクがある)と特定されている。いくつかのそのような実施形態において、対象(例えば、動物、例えば、哺乳動物、例えば、ヒト)は、難聴の特定のリスク因子または難聴のリスク(例えば、既知の親保因者、罹患した兄弟、または難聴の症状)を有し得る。いくつかのこのような実施形態では、対象(例えば、動物、例えば、哺乳動物、例えば、ヒト)は、以前に特定されていない(すなわち、公開されていない、または知られていないCLRN1のバリアント)CLRN1遺伝子中の変異の保因者であると(例えば、遺伝子検査を介して)特定されている。いくつかのそのような実施形態では、同定された変異は、新規であり得(すなわち、以前に文献に記載されていない)、難聴を患っている、または難聴になりやすい対象のための治療方法は、特定の患者の変異(複数可)に合わせて個別化される。
いくつかの実施形態では、症候性または非症候性感音性難聴の治療奏効は、当該技術分野で既知の従来の機能聴力検査のうちのいずれかを用いて対象において判定することができる。機能聴力検査の非限定的な例は、種々の種類の聴力測定アッセイ(例えば、純音検査、語音検査、中耳の検査、聴性脳幹反応、及び耳音響放射)である。
本明細書で提供される任意の方法のいくつかの実施形態では、本明細書に記載の任意の組成物の2回以上の用量が、対象の蝸牛に導入されるかまたは投与される。これらの方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態は、組成物の第1の用量を対象の蝸牛に導入または投与することと、第1の用量の導入または投与の後に対象の聴力機能を評価することと、組成物の追加の用量を、(例えば、当該技術分野で既知の任意の聴力検査を用いて判定したときに)正常な範囲の聴力機能を有しないことが見出された対象の蝸牛に投与することとを含み得る。
本明細書で提供される任意の方法のいくつかの実施形態において、組成物は、蝸牛内投与用に製剤化することができる。本明細書に記載される任意の方法のいくつかの実施形態において、本明細書に記載される組成物は、蝸牛内投与または局所投与を介して投与することができる。本明細書に記載される任意の方法のいくつかの実施形態において、組成物は、医療デバイス(例えば、本明細書に記載される任意の例示的な医療デバイス)の使用によって投与される。
いくつかの実施形態において、蝸牛内投与は、本明細書に記載されるまたは当技術分野で知られている任意の方法を用いて実施することができる。例えば、いくつかの実施形態では、組成物は、以下の外科的技法を用いて、蝸牛に投与または導入することができる。まず、0度、2.5mm硬性内視鏡での可視化を用いて、外耳道を清浄にし、ラウンドナイフを用いておよそ5mmの外耳道鼓膜弁の輪郭を鋭く線引きする。次いで、外耳道鼓膜弁を挙上し、後方から中耳に進入する。鼓索神経を特定して分割し、キュレットを用いて、上鼓室側壁の(scutal)骨を除去して、蝸牛窓膜を露出させる。投与または導入された組成物の頂部への分布を強化するために、手術用レーザを用いて、前庭窓に小さな2mmの開窓を作製して、組成物の経蝸牛窓膜注入の際に外リンパ置換を可能にしてもよい。次いで、微量注入デバイスをプライミングし、術野に至らしめる。デバイスを蝸牛窓へと操縦し、先端を蝸牛窓の骨質突出部内に設置して、マイクロニードル(複数可)による膜の穿通を可能にする。フットペダルを連動させて、組成物を測定された一定量で注入できるようにする。次いで、デバイスを後退させ、蝸牛窓及びアブミ骨底をゼルフォームパッチで封止する。
本明細書に提供されるいずれかの方法のいくつかの実施形態では、対象は、症候性または非症候性感音性難聴を有するか、またはそれを発症するリスクがある。本明細書で提供されるいずれかの方法のいくつかの実施形態では、対象は、支持細胞及び/または有毛細胞中に発現し得る遺伝子である内耳細胞標的遺伝子中に変異を有することが以前に特定されている。
本明細書で提供される任意の方法のいくつかの実施形態において、対象は、(例えば、遺伝子検査を介して)内耳細胞標的遺伝子中の変異の保因者であると特定されている。本明細書で提供される任意の方法のいくつかの実施形態では、対象は、内耳細胞標的遺伝子中に変異を有すると特定され、難聴(例えば、非症候性感音性難聴または症候性感音性難聴、例えば、ペンドレッド症候群またはDFNB4)であると診断されている。本明細書に記載される任意の方法のいくつかの実施形態において、対象は、難聴(例えば、非症候性感音性難聴または症候性感音性難聴)を有すると特定されている。いくつかの実施形態において、難聴(例えば、非症候性感音性難聴または症候性感音性難聴)の治療奏効は、当技術分野で知られている任意の従来的な機能聴力検査を用いて対象において判定することができる。機能聴力検査の非限定的な例としては、様々なタイプの聴力測定アッセイ(例えば、純音検査、語音検査、中耳の検査、聴性脳幹反応、及び耳音響放射)が挙げられる。
いくつかの実施形態において、対象細胞は、in vitroである。いくつかの実施形態において、対象細胞は、最初に対象から得られ、ex vivoで培養される。いくつかの実施形態において、対象細胞は、内耳細胞標的遺伝子に欠陥があると過去に判定されている。いくつかの実施形態において、対象細胞は、有毛細胞標的遺伝子に欠陥があると過去に判定されている。いくつかの実施形態において、対象細胞は、支持細胞標的遺伝子に欠陥があると過去に判定されている。
これらの方法のいくつかの実施形態では、治療、例えば、本明細書に記載の組成物の1回または2回以上の投与の後に、活性内耳細胞標的タンパク質(例えば、クラリン1タンパク質)の発現が増加する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の活性内耳標的タンパク質(例えば、クラリン1タンパク質)の発現の増加は、例えば、本明細書に記載の任意の構築物(複数可)を含む組成物の導入前の内耳細胞標的タンパク質の発現レベルと比較して、対照レベルに対するものである。
標的タンパク質(例えば、クラリン1タンパク質)の発現及び/または活性を検出する方法は、当技術分野で知られている。いくつかの実施形態では、内耳細胞標的タンパク質の発現レベルは、直接検出され得る(例えば、内耳細胞標的タンパク質または標的mRNAの検出)。標的RNAまたはタンパク質(例えば、CLRN1遺伝子産物及び/またはクラリン1タンパク質またはその機能的特徴部分)の発現及び/または活性を直接検出するために使用され得る技法の非限定的な例としては、リアルタイムPCR、ウエスタンブロット法、免疫沈降法、免疫組織化学法、質量分析法、または免疫蛍光法が挙げられる。いくつかの実施形態において、内耳細胞標的タンパク質の発現は、(例えば、機能聴力検査により)間接的に検出することができる。
いくつかの実施形態において、本明細書に開示される組成物の安全性及び忍容性は、難聴において判定され得る。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される組成物、例えば、rAAV-CLRN1の安全性及び忍容性は、本明細書に開示の対象において判定され得る。
投与
本明細書では、難聴(例えば、非症候性感音性難聴または症候性感音性難聴)を治療するための治療的送達システムが提供される。一態様では、治療的送達システムは、i)それを必要とする対象の内耳の蝸牛窓膜に1つ以上の切開を作出することができる医療デバイスと、ii)有効用量の組成物(例えば、本明細書に記載される組成物のうちのいずれか)とを含む。いくつかの実施形態では、医療デバイスは、複数のマイクロニードルを含む。
また、本明細書では、難聴(例えば、非症候性感音性難聴または症候性感音性難聴)を治療するための外科的方法も提供される。いくつかの実施形態では、方法は、対象の蝸牛に第1の切開点にて第1の切開を導入するステップと、治療有効量の本明細書に提供される組成物のうちのいずれかを蝸牛内投与するステップとを含む。いくつかの実施形態では、組成物は、第1の切開点にて対象に投与される。いくつかの実施形態では、組成物は、第1の切開の中へとまたはそれを通して対象に投与される。
本明細書に提供されるいずれかの方法のいくつかの実施形態では、本明細書に記載される組成物のうちのいずれかは、蝸牛の前庭窓膜の中へとまたはそれを通して対象に投与される。本明細書に提供されるいずれかの方法のいくつかの実施形態では、本明細書に記載される組成物のうちのいずれかは、蝸牛の蝸牛窓膜の中へとまたはそれを通して対象に投与される。本明細書に提供される任意の方法のいくつかの実施形態において、組成物は、蝸牛窓膜に複数の切開を作出することができる医療デバイスを用いて投与される。いくつかの実施形態では、医療デバイスは、複数のマイクロニードルを含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、略円形の第1の面を含む複数のマイクロニードルを含み、各マイクロニードルが少なくとも約10ミクロンの直径を有する。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、組成物を保有可能な基部及び/またはリザーバーを含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、組成物を移送可能な内腔を個々に含む複数の中空マイクロニードルを含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、少なくとも部分真空を生成するための手段を含む。
いくつかの実施形態において、本明細書に開示される方法のうちのいずれかは、難聴を有する対象、例えば哺乳動物、例えばヒト、例えば患者における安全性及び忍容性を判定するための用量漸増研究を含む。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物、例えばrAAV-CLRN1は、本明細書に開示される投薬レジメンで投与される。いくつかの実施形態では、投薬レジメンは、例えば本明細書に開示される組成物、例えば、rAAV-CLRN1の、例えば本明細書に記載される用量の片側または両側の蝸牛内投与を含む。いくつかの実施形態では、投薬レジメンは、蝸牛あたり少なくとも0.01mL、少なくとも0.02mL、少なくとも0.03mL、少なくとも0.04mL、少なくとも0.05mL、少なくとも0.06mL、少なくとも0.07mL、少なくとも0.08mL、少なくとも0.09mL、少なくとも0.10mL、少なくとも0.11mL、少なくとも0.12mL、少なくとも0.13mL、少なくとも0.14mL、少なくとも0.15mL、少なくとも0.16mL、少なくとも0.17mL、少なくとも0.18mL、少なくとも0.19mL、または少なくとも0.20mLの容量での送達を含む。いくつかの実施形態では、投薬レジメンは、蝸牛あたり最大0.30mL、最大0.25mL、最大0.20mL、最大0.15mL、最大0.14mL、最大0.13mL、最大0.12mL、最大0.11mL、最大0.10mL、最大0.09mL、最大0.08mL、最大0.07mL、最大0.06mL、または最大0.05mLの容量での送達を含む。いくつかの実施形態では、投薬レジメンは、集団に応じて、蝸牛あたり約0.05mL、約0.06mL、約0.07mL、約0.08mL、約0.09mL、約0.10mL、約0.11mL、約0.12mL、約0.13mL、約0.14mL、または約0.15mLの容量での送達を含む。いくつかの実施形態では、投薬レジメンは、蝸牛あたり少なくとも0.01mL、少なくとも0.02mL、少なくとも0.03mL、少なくとも0.04mL、少なくとも0.05mL、少なくとも0.06mL、少なくとも0.07mL、少なくとも0.08mL、少なくとも0.09mL、少なくとも0.10mL、少なくとも0.11mL、少なくとも0.12mL、少なくとも0.13mL、少なくとも0.14mL、少なくとも0.15mL、少なくとも0.16mL、少なくとも0.17mL、少なくとも0.18mL、少なくとも0.19mL、または少なくとも0.20mLの容量での送達を含む。いくつかの実施形態では、投薬レジメンは、蝸牛あたり最大0.30mL、最大0.25mL、最大0.20mL、最大0.15mL、最大0.14mL、最大0.13mL、最大0.12mL、最大0.11mL、最大0.10mL、最大0.09mL、最大0.08mL、最大0.07mL、最大0.06mL、または最大0.05mLの容量での送達を含む。いくつかの実施形態では、投薬レジメンは、集団に応じて、蝸牛あたり約0.05mL、約0.06mL、約0.07mL、約0.08mL、約0.09mL、約0.10mL、約0.11mL、約0.12mL、約0.13mL、約0.14mL、または約0.15mLの容量での送達を含む。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法は、難聴を有する対象、例えば、18~80歳の対象に蝸牛内注射を介して投与される、本明細書に開示される組成物、例えば、rAAV-CLRN1の漸増用量の安全性及び忍容性を評価する。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法は、難聴を有する対象、例えば、18~80歳の対象に眼内注射を介して投与される、本明細書に開示される組成物、例えば、rAAV-CLRN1の漸増用量の安全性及び忍容性を評価する。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法のいずれかは、本明細書に開示される組成物、例えばrAAV-CLRN1の安全性及び忍容性の評価を含む。いくつかの実施形態では、難聴を治療するための本明細書に開示される組成物、例えばrAAV-CLRN1の有効性の評価は、無作為化され、制御された設定で行われる(同時の非介入観察アームを使用する)。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法のいずれかは、本明細書に開示される組成物、例えばrAAV-CLRN1の安全性及び忍容性の評価を含む。いくつかの実施形態では、視力低下を治療するための本明細書に開示される組成物、例えばrAAV-CLRN1の有効性の評価は、無作為化され、制御された設定で行われる(同時の非介入観察アームを使用する)。
デバイス及び外科的方法
本開示は、とりわけ、いくつかの実施形態において、重度難聴及び他の聴力関連疾患、障害、及び状態を治療するために使用され得る技術(例えば、システム、方法、デバイスなど)を提供する。そのような技術の例は、例えば、WO2017223193及びWO2019084145にも含まれており、これらの各々は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、例えば、本開示は、難聴(例えば、非症候性感音性難聴)を治療するための治療的送達システムを提供する。いくつかのそのような実施形態では、治療的送達システムは、(i)対象の内耳の蝸牛窓膜内に1つまたは複数の切開を作出できる医療デバイスと、(ii)有効用量の組成物(例えば、本明細書に記載の任意の組成物)と、を含み得る。いくつかの実施形態では、医療デバイスは、複数のマイクロニードルを含む。
AAV構築物は、内耳の標的細胞において全長聴覚ポリペプチドメッセンジャーRNAを構成することができる。いくつかの実施形態では、本開示は、外科的方法を実施するための手段を提供し、方法は、有効用量の本開示の治療用組成物を、それを必要とするヒト対象に蝸牛内投与するステップを含む。治療用組成物は、a)蝸牛窓膜に1つまたは複数の切開を作出するための手段と、b)有効用量の治療用組成物と、を含む医療デバイスを使用することによって、投与することができる。
本開示は、とりわけ、難聴の治療(例えば、予防、回復、緩和、減衰)のための外科的方法を提供する。一態様では、方法は、以下のステップを含む:ヒト対象の蝸牛に、第1の切開点にて第1の切開を導入するステップと、有効用量の、本明細書に提供される治療用組成物(本明細書に記載の任意の組成物)を蝸牛内投与するステップとを含む。一実施形態では、治療用組成物(例えば、本明細書に記載の任意の組成物)は、第1の切開点にて対象に投与される。いくつかの実施形態では、治療用組成物は、第1の切開の中へとまたはそれを通して対象に投与される。一実施形態では、治療用組成物は、蝸牛の前庭窓膜の中または前庭窓膜を通して対象に投与される。一実施形態では、治療用組成物は、蝸牛の蝸牛窓膜の中または蝸牛窓膜を通して対象に投与される。
例えば、いくつかの実施形態では、治療用組成物は、蝸牛窓膜に複数の切開を作出することができる医療デバイスを使用することによって投与される。いくつかの実施形態では、医療デバイスは、複数のマイクロニードルを含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、略円形の第1の面を含む複数のマイクロニードルを含み、各マイクロニードルが少なくとも約10ミクロンの直径を含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、治療用組成物を保有可能な基部及び/またはリザーバーを含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、治療用組成物を移送可能な内腔を個々に含む複数の中空マイクロニードルを含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、少なくとも部分真空を生成するための手段を含む。
蝸牛への導入方法
本開示では、とりわけ、哺乳動物(例えば、ヒト)の蝸牛に、治療有効量の本明細書に記載される任意の組成物またはシステムを導入する方法も提供される。また、哺乳動物(例えば、ヒト)の蝸牛における細胞(例えば有毛細胞、例えば外有毛細胞、例えば内耳細胞、例えば脊髄神経節ニューロン(SGN))における機能性CLRN1タンパク質の発現を増加させる方法も提供され、本方法は、治療有効量の本明細書に記載の任意の組成物を対象の蝸牛に導入することを含む。
また、欠陥のある(すなわち機能しない)CLRN1遺伝子産物を有すると特定された対象(例えば、ヒト)における難聴を治療する方法も提供される。いくつかのそのような実施形態では、方法は、治療有効量の本明細書に記載の任意の組成物を対象の蝸牛に投与することを含む。いくつかの実施形態では、治療方法は、(例えば、本明細書に記載の任意の組成物が対象に投与されるのと実質的に同時に)対象に人工内耳を施すことをさらに含んでもよい。
いくつかの実施形態では、治療方法は、本明細書に記載の任意の組成物の2回以上の用量を投与することを含む。いくつかのそのような実施形態では、組成物は、哺乳動物または対象の蝸牛に導入または投与される。いくつかの実施形態では、治療方法は、対象の蝸牛に初回用量の組成物を導入または投与することと、初回用量の導入または投与後に対象の聴力機能を判定することと、対象が正常範囲内の聴力機能を有していないことが判明した場合(例えば、当技術分野で知られている任意の聴力検査を使用して判定された場合)、対象の蝸牛に組成物の少なくとも1回の追加用量を投与することと、を含む。
いくつかの実施形態では、治療方法は、蝸牛内投与を含む。本明細書に記載される任意の方法のいくつかのこうした実施形態では、組成物は、医療デバイス(例えば、本明細書に記載の任意の例示的な医療デバイス)の使用を介して投与される。いくつかの実施形態において、蝸牛内投与は、本明細書に記載されるまたは当技術分野で知られているとおりに実施することができる。例えば、いくつかの実施形態において、組成物は、以下の外科的技法を用いて、蝸牛に投与または導入することができる。まず、0度、2.5mm硬性内視鏡での可視化を用いて、外耳道を清浄にし、ラウンドナイフを用いておよそ5mmの外耳道鼓膜弁の輪郭を鋭く線引きする。次いで、外耳道鼓膜弁を挙上し、後方から中耳に進入する。鼓索神経を特定して分割し、キュレットを用いて、上鼓室側壁の(scutal)骨を除去して、蝸牛窓膜を露出させる。投与または導入された組成物の頂部への分布を強化するために、手術用レーザを用いて、前庭窓に小さな2mmの開窓を作製して、組成物の経蝸牛窓膜注入の際に外リンパ置換を可能にしてもよい。次いで、微量注入デバイスをプライミングし、術野に至らしめる。デバイスを蝸牛窓へと操縦し、先端を蝸牛窓の骨質突出部内に設置して、マイクロニードル(複数可)による膜の穿通を可能にする。フットペダルを連動させて、組成物を測定された一定量で注入できるようにする。次いで、デバイスを後退させ、蝸牛窓及びアブミ骨底をゼルフォームパッチで封止する。当業者は、蝸牛内投与の他の変化形態または方法が利用可能であることを理解するであろう。いくつかの実施形態では、任意のそのような許容可能な方法を使用して、本明細書に記載のとおり、1つ以上の組成物を送達し、及び/または1以上の対象を治療することができる。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示の方法のいずれかで使用される例示的なデバイスが、図19~22に記載されている。図19には、流体を内耳に送達するための例示的なデバイス10を示す。デバイス10は、ローレット加工ハンドル12、及び伸縮式ハイポチューブ針支持体24に結合する遠位ハンドル接着剤14(例えば、Loctite 4014などのエポキシ)を含む。ローレット加工ハンドル12(またはハンドル部分)は、把持を強化するために、カーリング特徴及び/または溝を含むことができる。ローレット加工ハンドル12(またはハンドル部分)は、約5mm~約15mmの厚さ、または約5mm~約12mmの厚さ、または約6mm~約10mmの厚さ、または約6mm~約9mmの厚さ、または約7mm~約8mmの厚さであり得る。ローレット加工ハンドル12(またはハンドル部分)は、使用中に流体がデバイス10を通過できるように中空であってもよい。デバイス10は、ローレット加工ハンドル12の近位端18に近位ハンドル接着剤16と、デバイス10の遠位端20にストッパー28(図20に示す)を有する針サブアセンブリ26(図20に示す)と、ストレインリリーフ機構22と、を備える。ストレインリリーフ機構22は、サントプレーン材料、ペバックス材料、ポリウレタン材料、シリコーン材料、ナイロン材料、及び/または熱可塑性エラストマーから構成され得る。伸縮式ハイポチューブ針支持体24は、内部に配置された曲げ針38(図20に示す)を取り囲み、支持する。
ここでも図20を参照し、ストッパー28は、熱可塑性材料またはプラスチックポリマー(UV硬化ポリマーなど)、ならびに他の好適な材料から構成され得、曲げ針38が外耳道に過度に挿入されるのを防ぐため(例えば、曲げ針38が側壁または他の内耳構造に挿入されるのを防ぐため)に使用され得る。デバイス10はまた、ローレット加工ハンドル12と、伸縮式ハイポチューブ針支持体24に結合された遠位ハンドル接着剤14との間に配置されたテーパー部分23を含み得る。ローレット加工ハンドル12(またはハンドル部分)は、ハンドル部分12の遠位端にテーパー部分23を含んでもよい。デバイス10はまた、デバイス10の近位端16に流体接続されたチューブ36を含むことができ、これは、デバイスを上流構成要素(例えば、ポンプ、シリンジ、及び/またはいくつかの実施形態では、制御システム及び/または電源(図示せず)に結合することができる上流構成要素)に接続する流体入口ラインとして機能する。いくつかの実施形態では、曲げ針38(図20に示される)は、遠位端20から、伸縮式ハイポチューブ針支持体24を通って、テーパー部分23を通って、ローレット加工ハンドル12を通って、及びストレインリリーフ機構22を通って延在し、チューブ36に直接流体接続する。他の実施形態では、曲げ針38は、ローレット加工ハンドルの中空内部と流体接続し(例えば、伸縮式ハイポチューブ針支持体24を介して)、次いで、近位端16でチューブ36と流体接続する。曲げ針38がデバイス10の内部に完全に延在していない実施形態では、接触領域(例えば、重なり合う入れ子になったハイポチューブ42の間)、公差、及び/またはインターフェース構成要素間の密封材は、デバイス10(比較的低い圧力(例えば、約1パスカル~約50Pa、または約2Pa~約20Pa、または約3Pa~約10Pa)で作動する)からの治療液の漏出を防止するのに十分であるものとする。
図20は、本開示の実施形態の態様による、曲げ針サブアセンブリ26の側面図を示す。曲げ針サブアセンブリ26は、曲げ部分32を有する針38を含む。曲げ針サブアセンブリ26はまた、曲げ部分32に結合されたストッパー28を含んでもよい。曲げ部分32は、耳の膜(例えば、RWM)を穿刺するためのデバイス10の遠位端20に傾斜先端34を含む。針38、曲げ部分32、及び傾斜頂部34は、流体がそこを通って流れることができるように中空である。曲げ部分32の角度46(図22に示すとおり)は、変動し得る。ストッパー28の形状は、円筒形、ディスク形状、環形状、ドーム形状、及び/または他の好適な形状であってもよい。ストッパー28は、曲げ部分32上の適所に成形することができる。例えば、ストッパー28は、接着剤または圧縮嵌合を使用して、曲げ部分32の周りに同心円状に位置付けることができる。接着剤の例としては、UV硬化接着剤(Dymax 203A-CTH-F-Tなど)、エラストマー接着剤、熱硬化性接着剤(エポキシまたはポリウレタンなど)、またはエマルジョン接着剤(ポリ酢酸ビニルなど)が挙げられる。ストッパー28は、傾斜先端34が所望の挿入深さで耳に挿入されるように、曲げ部分32の周りに同心円状に嵌合する。曲げ針38は、インクリメンタル成形及び他の好適な技術を使用して、ストレートニードルから形成することができる。
図21には、流体を内耳に送達するための例示的なデバイス10の斜視図を示す。チューブ36の長さは、約1300mm(図21の寸法11)~約1600mm、または約1400mm~約1500mm、または約1430mm~約1450mmであり得る。ストレインリリーフ機構22は、長さが約25mm~約30mm(図21の寸法15)、または長さが約20mm~約35mmであり得る。ハンドル12は、長さ約155.4mm(図21の寸法13)、または約150mm~約160mm、または約140mm~約170mmであり得る。伸縮式ハイポチューブ針支持体24は、2つ以上の入れ子式ハイポチューブ、例えば、3つの入れ子式ハイポチューブ42A、42B、及び42C、または4つの入れ子式ハイポチューブ42A、42B、42C、及び42Dを有し得る。ハイポチューブ42A、42B、42C及び先端アセンブリ26の全長(図21の寸法17)は、約25mm~約45mm、または約30mm~約40mm、または約35mmであり得る。さらに、伸縮式ハイポチューブ針支持体24は、約36mm、または約25mm~45mm、または約30mm~約40mmの長さを有し得る。3つの入れ子式ハイポチューブ42A、42B、及び42Cは各々、長さがそれぞれ3.5mm、8.0mm、及び19.8mm、±約20%である。伸縮式ハイポチューブ針支持体24の最も内側の入れ子式ハイポチューブ(または最も狭い部分)は、針38の周りに同心円状に配置され得る。
図22は、本開示の実施形態の態様による、デバイス10の遠位端20に連結された曲げ針サブアセンブリ26の斜視図を示す。図22に示すとおり、曲げ針サブアセンブリ26は、曲げ部分32に結合された針38を含み得る。他の実施形態では、曲げ針38は、単一の針(例えば、所望の角度46を含むように曲げられるストレートニードル)であってもよい。針38は、33ゲージ針であってもよく、または約32~約34、または約31~35のゲージを含んでもよい。より細かいゲージでは、チューブ36がよじれるまたは損傷することがないように注意する必要がある。針38を内耳に安全かつ正確に配置するために針38をハンドル12に取り付けてもよい。図22に示すとおり、曲げ針サブアセンブリ26はまた、曲げ部分32の周りに配置されたストッパー28を含んでもよい。図22は、曲げ部分32は、耳の膜(例えば、RWM)を穿刺するために傾斜先端34を含み得ることを示す。ストッパー28は、約0.5mm、または約0.4mm~約0.6mm、または約0.3mm~約0.7mmの高さ48を有し得る。曲げ部分32は、約1.45mm、または約1.35mm~約1.55mm、または約1.2mm~約1.7mmの長さ52を有し得る。他の実施形態では、曲げ部分32は、ストッパー28の遠位端と傾斜先端34の遠位端との距離が、約0.5mm~約1.7mm、または約0.6mm~約1.5mm、または約0.7mm~約1.3mm、または約0.8mm~約1.2mmであるような、2.0mmを超える長さを有することができる。図22は、ストッパー28が、円筒形、ディスク形状、及び/またはドーム形状である形状を有し得ることを示している。当業者は、他の形状を使用できることを理解するであろう。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される送達アプローチは、内耳細胞の形質導入のための合成AAVキャプシド(例えば、AAV Anc80)、及び/または直接蝸牛への標的送達のためのデバイスを含む。特定の実施形態では、本開示は、内耳細胞の形質導入に適した方法及び組成物を提供する。
本明細書に記載される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態では、本明細書に記載される組成物のうちのいずれかは、蝸牛の前庭窓膜の中へとまたはそれを通して対象に投与される。本明細書に記載される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態では、本明細書に記載される組成物のうちのいずれかは、蝸牛の蝸牛窓膜の中へとまたはそれを通して対象に投与される。本明細書に記載される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態では、組成物は、蝸牛窓膜に複数の切開を作出することができる医療デバイスを用いて投与される。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、複数のマイクロニードルを含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、略円形の第1の面を含む複数のマイクロニードルを含み、各マイクロニードルが少なくとも約10ミクロンの直径を有する。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、組成物を保有可能な基部及び/またはリザーバーを含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、組成物を移送可能な内腔を個々に含む複数の中空マイクロニードルを含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、少なくとも部分真空を生成するための手段を含む。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示されるのは、本明細書に開示の組成物、例えば、rAAV-CLRN1を、アブミ骨底内に小孔が配置されている蝸牛窓膜を通して内耳の外リンパ液に送達するための、蝸牛内投与のための単回使用滅菌送達デバイスである。いくつかの実施形態では、この蝸牛内投与アプローチにおいて、本明細書に開示の組成物、例えば、rAAV-CLRN1は、前庭窓内のアブミ骨底に小孔を有する蝸牛窓膜を通して鼓室階に投与され得、これにより、組成物は、鼓室階を通り、次に蝸牛孔での接続を介して前庭階を通って灌流され、アブミ骨底中の小孔への流体経路をたどる(図11A~図11B)。
対象を治療する方法
本開示は、とりわけ、本明細書に記載の技術を使用して、難聴を特徴とするアッシャー症候群III型に罹患している、またはそのリスクがある対象の基礎疾患及び/または症状が治療され得ることを提供する。
いくつかの実施形態では、方法は、本明細書に記載の構築物(例えば、rAAV構築物)、粒子(例えば、rAAV粒子)、または本明細書に記載の組成物を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、方法は、治療方法である。いくつかの実施形態では、対象は、難聴を特徴とするアッシャー症候群III型に罹患しているか、またはそのリスクがある対象である。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の構築物(例えば、rAAV構築物)、粒子(例えば、rAAV粒子)、または本明細書に記載の組成物を対象に投与することは、難聴を特徴とするアッシャー症候群III型に関連する1つ以上の症状を緩和及び/または改善し得る。症状としては、例えば、難聴、有毛細胞の変性、内耳液の生化学的環境の変化、迷路内タンパク質の上昇、内リンパ水腫、蝸牛開口部閉塞、迷路内出血、蝸牛血管供給の混乱、耳鳴り、めまい、難治性頭痛、顔面神経障害、三叉神経障害、顔面麻痺、顔面感覚異常、水頭症、小脳ヘルニア、及び/または死亡が挙げられ得る。
いくつかの実施形態では、難聴を特徴とするアッシャー症候群III型は、遺伝子突然変異(例えば、欠失突然変異、フレームシフト突然変異、ナンセンス突然変異、低形態突然変異、超形態突然変異、新形態突然変異、異常過剰発現、異常過少発現など)に関連する。いくつかの実施形態では、難聴を特徴とするアッシャー症候群III型に罹患しているか、またはそのリスクがある対象は、CLRN1遺伝子中に変異を有し得、これは、本明細書に記載のとおりに特徴付けられ得る。
いくつかの実施形態では、対象は、本明細書に記載の技術(例えば、リアルタイムPCR、定量的リアルタイムPCR、ウエスタンブロット法、免疫沈降法、免疫組織化学法、質量分析法、または免疫蛍光法、遺伝子及び/またはタンパク質の発現の間接的な表現型決定(例えば、機能聴力検査、ABR、DPOAEなどによる)など)により、治療前、治療中、及び/または治療後、遺伝的及び/または症状的に特徴付けられる。いくつかの実施形態では、難聴を特徴とするアッシャー症候群III型に罹患しているか、またはそのリスクがある対象は、組織サンプリング(例えば、1つ以上の内耳細胞を含む、例えば、1つ以上の有毛細胞及び/または1つ以上の支持細胞を含む)によって特徴付けられた関連疾患状態を有し得る。いくつかの実施形態では、組織は、形態学的分析によって評価して、本明細書に記載の任意の技術(例えば方法論、例えば組成物、例えば構築物を含む組成物、及び/または粒子など)の適用前、適用中、適用後に有毛細胞及び/または支持細胞の形態を決定する。いくつかのそのような実施形態では、標準免疫組織化学的または組織学的分析が実施され得る。いくつかの実施形態では、細胞がin-vitroまたはex-vivoで使用される場合、追加の免疫細胞化学的または免疫組織化学的分析が実施され得る。いくつかの実施形態では、1つ以上のタンパク質または転写産物の1つ以上のアッセイ(例えば、ウエスタンブロット、ELISA、ポリメラーゼ連鎖反応)を、対象またはin-vitro細胞集団からの1つ以上のサンプルに対して実施し得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の構築物(例えば、rAAV構築物)、粒子(例えば、rAAV粒子)、または本明細書に記載の組成物を対象に投与することにより、本明細書に記載の技術による治療前に実施された免疫組織化学検査と比較した場合、または対照集団と比較した場合、患者の免疫組織化学的評価(例えば、上記の試験)を改善する。
アッシャー症候群III型の症状を改善するための対象の治療
いくつかの実施形態では、難聴を特徴とするアッシャー症候群III型に罹患しているか、またはそのリスクある対象は、聴力機能によって特徴付けられる治療レジメンを受けることができる。いくつかの実施形態では、治療レジメンの機能性は、聴力機能によって特徴付けられ、そのような聴力機能は、本明細書に記載の組成物及び方法による治療前、治療後、及び/または治療中に聴性脳幹反応測定(ABR)を使用して個体において判定される。いくつかの実施形態では、治療レジメンの機能性は、聴力機能によって特徴付けられ、そのような聴力機能は、本明細書に記載の組成物及び方法による治療前、治療後、及び/または治療中に歪成分耳音響放射検査(DPOAE)を測定することによって個体において判定される。いくつかのそのような実施形態では、聴力測定値は、対象の片耳または両耳から取得される。いくつかのそのような実施形態では、記録は、同じ対象の以前の記録及び/または例えば、難聴対正常な聴力として定義される許容聴力範囲を定義するために使用される、そのような応答測定値の既知のしきい値と比較する。いくつかの実施形態では、対象は、任意の治療を受ける前に記録されたABR及び/またはDPOAE測定値を有する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の1つ以上の技術で治療された対象は、治療前と比較して、治療後にABR及び/またはDPOAE測定値の改善を有することになる。いくつかの実施形態では、ABR及び/またはDPOAE測定値は、治療が行われた後、及び治療後の定期的なフォローアップ間隔で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の技術を用いた治療は、本明細書に記載の技術を用いた治療の前に実施された試験と比較した場合、または対照集団と比較した場合に、患者の試験評価(例えば、上記の試験)を改善する。
難聴及び回復の評価
いくつかの実施形態では、聴力機能は、聴性脳幹反応測定(ABR)を使用して判定される。基準と比較したABRしきい値の減少、ABRしきい値の存在(例えば、検出)、及び/または正常なABR形態は、聴力の改善を示す。いくつかの実施形態では、聴力は、歪成分耳音響放射検査(DPOAE)を測定することによって試験される。基準と比較したDPOAEしきい値の減少、DPOAEしきい値の存在(例えば、検出)、及び/または正常なDPOAE形態は、聴力の改善を示す。いくつかのそのような実施形態では、測定値は、対象の片耳または両耳から取得される。いくつかのそのような実施形態では、記録は、同じ対象の以前の記録及び/または例えば、難聴対正常な聴力として定義される許容聴力範囲を定義するために使用される、そのような応答測定値の既知のしきい値と比較する。いくつかの実施形態では、対象は、任意の治療を受ける前に記録されたABR及び/またはDPOAE測定値を有する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の1つ以上の技術で治療された対象は、治療前と比較して、治療後にABR及び/またはDPOAE測定値の改善を有することになる。いくつかの実施形態では、ABR及び/またはDPOAE測定値は、治療が行われた後、及び治療後の定期的なフォローアップ間隔で行われる。
いくつかの実施形態では、聴力機能は、語音パターン認識を使用して判定されるか、言語療法士によって判定される。いくつかの実施形態では、聴力機能は、純音検査法によって判定される。いくつかの実施形態では、聴力機能は、骨導検査法によって判定される。いくつかの実施形態では、聴力機能は、音響放射検査法によって判定される。いくつかの実施形態では、聴力機能は、ティンパノメトリーによって判定される。いくつかの実施形態では、聴力機能は、当技術分野で知られている聴覚分析の任意の組み合わせによって判定される。いくつかのそのような実施形態では、測定は全体論的に、及び/または対象の片方または両方の耳から行われる。いくつかのそのような実施形態では、記録及び/または専門的な分析は、同じ対象の以前の記録及び/または分析、及び/または例えば、難聴対正常な聴力として定義される許容聴力範囲を定義するために使用される、そのような応答測定値の既知のしきい値と比較する。いくつかの実施形態では、対象は、任意の治療を受ける前に、語音パターン認識、純音検査、骨導検査、音響放射検査及び/またはティンパノメトリー測定及び/または分析を受ける。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の1つ以上の技術により治療された対象は、治療前と比較して、治療後に語音パターン認識、純音検査、骨導検査、音響放射検査及び/またはティンパノメトリー測定の改善を有する。いくつかの実施形態では、語音パターン認識、純音検査、骨導検査、音響放射検査、及び/またはティンパノメトリー測定が、治療が行われた後、及び治療後の定期的なフォローアップ間隔で行われる。
疾患状態を特徴付ける方法
「CLRN1遺伝子における変異」という用語は、コンセンサス機能クラリン1タンパク質と比較して1つもしくは複数のアミノ酸の欠失、1つもしくは複数のアミノ酸置換、及び1つもしくは複数のアミノ酸挿入のうちの1つもしくは複数を有するクラリン1タンパク質の生産をもたらす、及び/または変異を有しない哺乳類細胞におけるコードされたクラリン1タンパク質の発現されたレベルと比較して、哺乳類細胞におけるコードされたクラリン1タンパク質の発現されたレベルの減少をもたらす、既知のコンセンサス機能CLRN1遺伝子における修飾を指す。いくつかの実施形態において、変異は、1つ以上のアミノ酸(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、またはそれ以上のアミノ酸)の欠失を有するクラリン1タンパク質の産生をもたらし得る。いくつかの実施形態では、変異は、CLRN1遺伝子におけるフレームシフトをもたらし得る。「フレームシフト」という用語は、当該技術分野で、コード配列のリーディングフレームのシフトをもたらす、コード配列における任意の変異を包含することが知られている。いくつかの実施形態において、フレームシフトは、機能しないタンパク質をもたらし得る。いくつかの実施形態において、点変異は、ナンセンス変異(すなわち、遺伝子のエクソンにおいて未成熟終止コドンをもたらす)であり得る。ナンセンス変異は、機能的である場合も、そうでない場合もある短縮型タンパク質(対応するコンセンサス機能的タンパク質と比較して)の生産をもたらし得る。いくつかの実施形態では、変異は、CLRN1 mRNAもしくはクラリン1タンパク質、またはmRNA及びタンパク質の両方の発現の喪失(またはレベルの減少)をもたらし得る。いくつかの実施形態では、変異は、コンセンサス機能クラリン1タンパク質と比較して1つ以上の生物学的活性(機能)の喪失または減少を有する、変化したクラリン1タンパク質の産生をもたらし得る。
いくつかの実施形態では、変異は、1つ以上のヌクレオチドのCLRN1遺伝子への挿入である。いくつかの実施形態では、変異は、クラリン1遺伝子の調節及び/または制御配列、すなわち、コード配列ではない遺伝子の一部分にある。いくつかの実施形態では、調節及び/または制御配列における変異は、プロモーターまたはエンハンサー領域にあり得、CLRN1遺伝子の適切な転写を防止または低減し得る。いくつかの実施形態では、変異は、クラリン1タンパク質またはCLRN1遺伝子と相互作用することが知られている既知の異種遺伝子内にある。
CLRN1 mRNA及び/またはクラリン1タンパク質の遺伝子型決定及び/または発現もしくは活性を検出する方法は、当技術分野で公知である(例えば、Ito et al.,World J Otorhinolaryngol.2013 May 28;3(2):26-34、及びRoesch et al.,Int J Mol Sci.2018 Jan;19(1):209を参照、これらの各々は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。いくつかの実施形態では、CLRN1 mRNAまたはクラリン1タンパク質の発現レベルは、直接検出することができる(例えば、クラリン1タンパク質の検出、CLRN1 mRNAの検出など)。CLRN1の発現及び/または活性を直接検出するために使用され得る技法の非限定的な例としては、リアルタイムPCR、定量的リアルタイムPCR、ウエスタンブロット法、免疫沈降法、免疫組織化学法、質量分析法、または免疫蛍光法が挙げられる。いくつかの実施形態では、CLRN1及び/またはクラリン1タンパク質の発現は、間接的に検出することができる(例えば、機能聴力検査、ABR、DPOAEなどにより)。
いくつかの実施形態では、組織サンプル(例えば、1つ以上の内耳細胞を含む、例えば、1つ以上の有毛細胞及び/または1つ以上の支持細胞を含む)は、本明細書に記載の任意の剤(例えば、組成物、例えば、構築物を含む組成物、及び/または粒子など)の投与前及び投与後に、眼細胞及び/または有毛細胞及び/または支持細胞の形態を決定するために、形態学的分析によって評価され得る。いくつかのそのような実施形態では、標準免疫組織化学的または組織学的分析が実施され得る。いくつかの実施形態では、細胞がin vitroまたはex vivoで使用される場合、追加の免疫細胞化学的または免疫組織化学的分析が実施され得る。いくつかの実施形態では、1つ以上のタンパク質または転写産物の1つ以上のアッセイ(例えば、ウエスタンブロット、ELISA、ポリメラーゼ連鎖反応)を、対象またはin vitro細胞集団からの1つ以上のサンプルに対して実施し得る。
難聴、耳鳴り、めまい、及び症状の回復の評価
いくつかの実施形態では、聴力機能は、本明細書に記載の組成物及び方法による治療前、治療後、及び/または治療中に聴性脳幹反応測定(ABR)を使用して個体において決定される。いくつかの実施形態では、聴力機能は、本明細書に記載の組成物及び方法による治療前、治療後、及び/または治療中に歪成分耳音響放射検査(DPOAE)を測定することによって個体において判定される。いくつかのそのような実施形態では、測定値は、対象の片耳または両耳から取得される。いくつかのそのような実施形態では、記録は、同じ対象の以前の記録及び/または例えば、難聴対正常な聴力として定義される許容聴力範囲を定義するために使用される、そのような応答測定値の既知のしきい値と比較する。いくつかの実施形態では、対象は、任意の治療を受ける前に記録されたABR及び/またはDPOAE測定値を有する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の1つ以上の技術で治療された対象は、治療前と比較して、治療後にABR及び/またはDPOAE測定値の改善を有することになる。いくつかの実施形態では、ABR及び/またはDPOAE測定値は、治療が行われた後、及び治療後の定期的なフォローアップ間隔で行われる。
いくつかの実施形態では、聴力機能は、語音パターン認識を使用して判定されるか、言語療法士によって判定される。いくつかの実施形態では、聴力機能は、純音検査法によって判定される。いくつかの実施形態では、聴力機能は、骨導検査法によって判定される。いくつかの実施形態では、聴力機能は、音響放射検査法によって判定される。いくつかの実施形態では、聴力機能は、ティンパノメトリーによって判定される。いくつかの実施形態では、聴力機能は、当技術分野で知られている聴覚分析の任意の組み合わせによって判定される。いくつかのそのような実施形態では、測定は全体論的に、及び/または対象の片方または両方の耳から行われる。いくつかのそのような実施形態では、記録及び/または専門的な分析は、同じ対象の以前の記録及び/または分析、及び/または例えば、難聴対正常な聴力として定義される許容聴力範囲を定義するために使用される、そのような応答測定値の既知のしきい値と比較する。いくつかの実施形態では、対象は、任意の治療を受ける前に、語音パターン認識、純音検査、骨導検査、音響放射検査及び/またはティンパノメトリー測定及び/または分析を受ける。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の1つ以上の技術により治療された対象は、治療前と比較して、治療後に語音パターン認識、純音検査、骨導検査、音響放射検査及び/またはティンパノメトリー測定の改善を有する。いくつかの実施形態では、語音パターン認識、純音検査、骨導検査、音響放射検査、及び/またはティンパノメトリー測定が、治療が行われた後、及び治療後の定期的なフォローアップ間隔で行われる。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法のいずれも、聴性行動測定評価を含む。いくつかの実施形態では、聴性行動測定評価は、適切なマスキングを伴う空気及び骨曲線による純音聴力測定、語音聴力検査、静寂下での語音、または騒音下での語音を含む。いくつかの実施形態では、聴性行動測定評価は、聴性脳幹反応試験による電気生理学的聴力測定を含む。いくつかの実施形態では、聴性行動測定評価は、標準化された質問票を含む:HHIA:成人のための聴覚ハンディキャップインベントリ(Hearing Handicap Inventory for Adults)、DHI:めまいハンディキャップインベントリ(Dizziness Handicap Inventory)、THI:耳鳴りハンディキャップインベントリ(Tinnitus Handicap Inventory)、PANQOL:ペン聴覚神経腫生活の質(QoL)(Penn Acoustic Neuroma Quality of Life)。
本明細書に開示される方法のいずれかのいくつかの実施形態では、安全性及び有効性は、耳、前庭、及び全身の有害事象、ならびに血液学、臨床化学、及び/または尿検査パラメータの評価によって監視され得る。本明細書に開示される方法のいずれかのいくつかの実施形態では、判定が行われる追加のパラメータとしては、血液中のCLRN1タンパク質レベル、及び耳スワブ、鼻スワブ、唾液、及び血液中の構築物DNAが挙げられる。本明細書に開示される方法のいずれかのいくつかの実施形態では、キャプシド及び導入遺伝子産物に対する潜在的な体液性免疫応答の評価のために血液を収集してもよい。
ABR検査は、動物の蝸牛、蝸牛神経、及び脳幹が各音刺激に反応するかを測定し、多くの場合、耳の健康状態の尺度として使用される。この同じ基本的な検査は、病院で新生児の聴力を検査するために一般的に使用されており、実験動物で使用される標準聴力検査である。いくつかの実施形態では、ABR検査は、マウスにケタミン/キシラジン麻酔薬のIP用量を注射して、動き及び筋肉アーチファクトを最小限に抑え、測定電極の配置を助けることを含む。いくつかの実施形態では、ABR検査(DPOAEにより同時に両方の耳で行う場合)が完了するまでにおよそ45分要するため、麻酔薬の追加投与が必要になる場合がある。いくつかの実施形態では、麻酔薬の初回用量は、ケタミン(100mg/kg)及びキシラジン(10mg/kg)IP、及び必要に応じて、最初のケタミン用量の1/4~1/2からなるケタミンのみの追加投与からなる。いくつかの実施形態では、獣医師の推奨に基づいて、キシラジンの再投与は行われない。いくつかの実施形態では、皮膚表面を通る経皮記録電極は、3つの標準位置(耳間で等距離にある頭蓋骨の頂点、試験対象耳の耳介の後ろの乳様突起上、及びアース電極用の反対側の耳介の後ろの乳様突起上)に配置される。いくつかの実施形態では、刺激は、10~80dB SPLから5-dBステップで上昇させて、低(8kHz)、中(16kHz)、及び高(32kHz)周波数の純音ピップ刺激(0.1ms上昇下降、持続時間1.5ms)から構成される。いくつかの実施形態では、刺激は、30/秒の速度で提示され、アーチファクトのない平均512個が各刺激レベルで取得される。いくつかの実施形態では、ABRは、群に応じて、2~3の別の時点;ベースライン及び最終4~6週で収集した。動物のサブセットも術後3週間で検査した。いくつかの実施形態では、動物の脳幹が確実に処理できる各刺激周波数の最低強度(しきい値)を測定することに加えて、しきい値を超える刺激に応答した波Iの振幅を測定して、蝸牛の有毛細胞から聴神経への情報の求心性の流れの完全性を判定した。いくつかの実施形態では、ABRしきい値は、動物の耳を通過し、脳幹によって処理される最低レベルの音に関する重要な情報をもたらすことができ、ABR波Iの振幅におけるしきい値超過応答は、内有毛細胞の底と聴神経樹状突起との間のリボンシナプス接続の完全性の代用としての使用が増加している。
DPOAEは、蝸牛の外有毛細胞の動きによって生成される音であり、トランスデューサーとマイクとの組み合わせを使用して外耳道で非侵襲的に測定される。いくつかの実施形態では、誘発されたDPOAEのサイズは、外有毛細胞機能の有用な尺度である。この同じ基本的な検査も、病院で新生児の聴力を検査するために一般的に使用されており、実験動物で使用される標準聴力検査である。いくつかの実施形態では、2つの原音(f1及びf2)が耳に提示され、刺激周波数及び歪み周波数で蝸牛流体に圧力変化を引き起こす機械的振動を生成する。いくつかの実施形態では、これらの圧力変化は、耳を逆方向に駆動し、中耳、次いで鼓膜を活性化して、外耳道で音を生成する。いくつかの実施形態では、DPOAEは、ABRで使用されるのと同じ試験周波数(8、16、32kHz)で、ABRの麻酔下で収集する。いくつかの実施形態では、f2は、8、16、及び32kHzを中心とし、f1=f2×0.8+10dBである。いくつかの実施形態では、各周波数において、音は、10~80dB SPLから5dBずつ上昇させて提示する。いくつかの実施形態では、DPOAEは、外有毛細胞機能を判定し、したがって、典型的には、歪成分放射応答の振幅として測定される、応答の強度のしきい値超過の判定として使用される。いくつかの実施形態では、3つすべての試験周波数が使用される。いくつかの実施形態では、試験された周波数ごとに信頼できる歪成分応答を得ることができない場合があり、そのような場合、適切に分析が行われてもよい。
生物学的サンプル中のCLRN1タンパク質濃度の評価
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法は、本明細書に記載の組成物による治療前、治療中、及び/または治療後に、個体からの1つ以上の生物学的サンプル中のCLRN1タンパク質濃度を評価することを含む。
これらの方法のいくつかの実施形態では、治療、例えば、本明細書に記載の組成物の1回または2回以上の投与の後に、CLRN1タンパク質の発現が増加する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の活性CLRN1タンパク質の発現の増加は、対照レベルに対して比較したときのもの、例えば、本明細書に記載の任意の構築物(複数可)を含む組成物の導入前のCLRN1タンパク質の発現レベルと比較したものである。
標的RNA及び/またはタンパク質の発現及び/または活性を検出する方法は、当技術分野で知られている。いくつかの実施形態では、内耳細胞標的タンパク質の発現レベルは、直接検出され得る(例えば、内耳細胞標的タンパク質または標的mRNAの検出)。標的RNA及び/またはタンパク質の発現及び/または活性を直接検出するために使用され得る技法の非限定的な例としては、リアルタイムPCR、ウエスタンブロット法、免疫沈降法、免疫組織化学法、質量分析法、または免疫蛍光法が挙げられる。いくつかの実施形態において、内耳細胞標的タンパク質の発現は、(例えば、機能聴力検査により)間接的に検出することができる。
いくつかの実施形態では、rAAV粒子の体内分布及び/または排出分析が実施される。いくつかの実施形態では、cDNAを送達する、例えばCLRN1タンパク質を発現するように設計されたrAAV-CLRN1複製欠損rAAV粒子を含む組成物が本明細書に開示される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のrAAV粒子は、アッシャー症候群III型を有する対象、例えばヒト、例えば患者を治療するために使用される。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物は、蝸牛内経路を介して投与される。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物は、低用量のrAAV粒子で投与される(例えば、ベクターゲノムqPCR分析によって測定される)。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物は、身体の局所領域に投与される。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される組成物は、限定された血管の広がり及び全身への曝露をもたらすと予想される。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物は、蝸牛においてより高いレベルの構築物配列をもたらす。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物は、収集された他のほとんどの組織及び体液において、低いが検出可能なレベルをもたらす。いくつかの実施形態では、構築物配列のレベルは、一般に全体で6ヶ月減少した。いくつかの実施形態では、構築物配列のレベルは、血液サンプル中、経時的に、例えば、本明細書に開示される組成物の蝸牛内投与後1ヶ月で減少する。
本明細書に開示される方法のいずれかのいくつかの実施形態では、生体内分布及び排出に関連する体液(例えば、血液、血清、尿、唾液、鼻及び耳のスワブ、及びCSF液)が収集及び/または評価される。本明細書に開示される方法のいずれかのいくつかの実施形態では、非標的組織が収集及び/または評価される。いくつかの実施形態では、キャプシドバリアントは向性を決定すると予想される。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物は、キャプシドバリアント、例えば、AAV Anc80キャプシドバリアントを含む。いくつかの実施形態では、例えば、同一の投与経路を介して、同一の粒子製剤中で、及び/または同等またはより低い粒子用量でのキャプシドバリアントを含む本明細書に開示される組成物の送達では、生体内分布と排出パターンに差異が生じることは予想されていない。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物、例えばrAAV-CLRN1は、約2E12総vg/蝸牛未満のレベルで投与される。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物の用量は、例えば、容量及びrAAV粒子濃度の制限に対応するものである。
対照的に、rAAV粒子を使用した臨床試験では、全身投与経路を介して1E14vg/kg超が送達され、場合によっては生後6ヶ月未満の参加者に送達された(AveXis 2019、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。比較的低用量のrAAV粒子を使用した他の局所送達では、標的領域を超えた広範な生体内分布、例えば全身、または広範なrAAV粒子排出(排泄;一般にqPCRなどの方法による基礎となる構築物DNA濃度の測定)は報告されていない。例えば、Luxturna(登録商標)を両側に7.5E11vg/眼の用量で送達させた場合、眼の標的領域を超えた低レベルの分布(具体的には、粒子が注入された眼の視神経、視交叉、脾臓、及び肝臓、ならびに散発的に試験動物のリンパ節)が報告されている。同様に、第3相臨床試験では、参加者の45%の涙にrAAV粒子が一時的に低レベルで排出された。また、1.5E11vg/眼の用量で両側に送達されたLuxturna(登録商標)の網膜下投与直後の数日間、参加者の10%の血清(全血ではない)サンプルでも低レベルで検出された(例えば、Russell 2017;Spark Therapeutics 2017を参照、その各々は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法のいずれかは、例えば、検証済みのqPCR法を使用して、蝸牛への片側投与後の経時的な血液(例えば、血清及び全血)中のrAAV粒子配列の分布を評価することを含む。いくつかの実施形態では、追加の試験片(例えば、外耳道スワブ、鼻スワブ、唾液、及び尿)が、対象からの排出の評価のために収集される。いくつかの実施形態では、試験片は、少なくとも3つの連続した陰性サンプルが得られるまで対象から収集する。
いくつかの実施形態では、難聴と相関するタンパク質は、本明細書に記載の組成物及び/または方法による治療前、治療中、及び/または治療後に測定される。特定の実施形態では、そのような難聴関連タンパク質としては、μ-クリスタリン(CRYM)、低密度リポタンパク質受容体関連タンパク質2(LRP2)、免疫グロブリン(Ig)γ-4鎖C領域、Igκ鎖C領域、補体C3、免疫グロブリン重鎖定常γ3、及び/またはケモカイン受容体-4(CXCR4)が挙げられる。
いくつかの実施形態では、AAVキャプシド及び/または粒子に対する免疫原性が測定される。全身適用と比較して比較的低用量で局所領域に送達されたAAVキャプシド及び/または粒子に対する免疫原性では、概して、免疫応答の特定のパターンは得られなかった。重要なことに、体液性及び細胞性免疫学的モニタリングの両方により観察された応答(例えば、それぞれ酵素結合免疫吸着アッセイ[ELISA]/中和抗体[NAb]及び酵素結合免疫吸着スポット[ELISPOT]アッセイによる)は、若干の免疫学的保護を提供する投与経路(ROA)(複数可)(例えば、脳への直接投与)に関して、主に臨床的相関がなかった。
本明細書に開示される方法のいずれかのいくつかの実施形態では、蝸牛内ROAは、例えば、非特許の蝸牛水管を有する種(例えば、NHP及びヒト)において、同様のレベルの保護を提供することが予想される。本明細書に開示される方法のいずれかのいくつかの実施形態では、対象は、本明細書に開示される組成物、例えば、rAAV-CLRN1の投与の3日前から開始して、およそ17日間、免疫調節レジメン、例えば全身経口コルチコステロイドの短い周術期コースを受ける。いくつかの実施形態では、免疫調節レジメンは、外科的投与処置に関連する炎症を軽減する。いくつかの実施形態では、免疫調節レジメンは、キャプシド(例えば、AAV Anc80)または基礎となる構築物(例えば、導入遺伝子産物、例えば、CLRN1タンパク質)のいずれかに対する免疫反応の可能性をさらに低下させることもできる。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される任意の方法は、本明細書に開示される組成物の投与に応答する体液性免疫(例えば、抗体応答)を評価することをさらに含む。いくつかの実施形態では、蝸牛内ROAを介して送達される場合の、本明細書に開示される組成物の形質導入に対する、例えば血清NAbレベルによって測定される既存の免疫の効果を評価する。いくつかの実施形態では、既存のNAbレベルは、蝸牛内投与経路によって送達されるAAV粒子の形質導入を阻害しない。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される任意の方法は、AAVキャプシド及び/または導入遺伝子産物(例えば、タンパク質)の両方に対する潜在的な全身液性応答について血清を評価することをさらに含む。いくつかの実施形態では、全身液性応答の評価に応答して、本明細書に開示される組成物、例えばrAAV-CLRN1の両側蝸牛内投与の治療間隔を広げることができる。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される任意の方法は、例えば、局所投与経路(ROA)、例えば、蝸牛内投与を介して送達されるrAAV粒子からのAAV粒子、キャプシド、及び/または構築物(例えば、基礎となる導入遺伝子)産物のいずれかに対する細胞傷害性T細胞応答をもたらさない。例えば、Luxturna(登録商標)のラベルには、臨床的に有意な細胞傷害性T細胞応答を有する対象はいないことが記載されている(Spark Therapeutics 2017、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。単離陽性インターフェロンガンマ(IFN-ガンマ)ELISPOTアッセイ結果は、臨床開発プログラム中に得られた(Bennett 2012、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)が、臨床プログラムでは、臨床的炎症反応は観察されず、用量制限毒性は見られなかったため、これらの単離された結果の重要性は不明である。
特定の実施形態では、本明細書に記載の組成物または組成物の産物のいずれかの薬物動態を測定し、収集する。本明細書に開示される方法のいずれかのいくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物は局所投与される。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物の局所送達により、任意の1つ以上の有害なオフターゲット効果の可能性を低下させる。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物の局所送達は、いかなる有害なオフターゲット効果ももたらさない。本明細書に開示される方法のいずれかのいくつかの実施形態では、対象は、血清中のCLRN1タンパク質(例えば、電気化学発光アッセイを使用して)、バイタルサイン、尿検査、及び/または臨床化学を監視することによってフォローアップを受ける。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物を投与された対象を監視することで、早期の介入及び/または任意のオフターゲット効果の最小化が可能になる。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組成物の投与後、CLRN1タンパク質測定のために血清を収集し、分析することができる。いくつかの実施形態では、そのような測定は、組成物投与前(ベースライン)、投与後2週目、及び適切な期間で月ごと(例えば、3ヶ月、6ヶ月、1年、2年、3年、4年、または5年より長い)に行うことができる。いくつかの実施形態では、CLRN1タンパク質は、ベースラインで、または本明細書に記載のビヒクルまたは低用量のrAAV-CLRN1粒子のいずれかの蝸牛内送達を受けた個体における投与後の任意の時点で、個体の血清中に検出されない。いくつかの実施形態では、高用量のrAAV-CLRN1で、本明細書に記載の方法によって本明細書に記載の組成物を投与された個体は、血清中のCLRN1タンパク質を、検出限界または定量限界未満のレベル、または報告された生物学的活性範囲未満のレベルで検出することができる(11ng/mL~27ng/mL[Genentech 2017、その全体が参照により本明細書に組み込まれる])。
本明細書に開示される任意の方法のいくつかの実施形態において、方法は、(例えば、本明細書に記載される電気化学発光アッセイ)を使用して、CLRN1タンパク質の存在について血清を収集及び/または評価することを含む。
産生方法
AAVシステムは、一般に当技術分野で周知である(例えば、Kelleher and Vos,Biotechniques,17(6):1110-17(1994);Cotten et al.,P.N.A.S.U.S.A.,89(13):6094-98(1992);Curiel,NatImmun,13(2-3):141-64(1994);Muzyczka,Curr Top Microbiol Immunol,158:97-129(1992);及びAsokan A,et al.,Mol.Ther.,20(4):699-708(2012)を参照、これらの各々は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。AAV構築物を生成及び使用するための方法は、例えば、米国特許第5,139,941号、第4,797,368号、及びPCT出願US2019/060328に記載されており、これらの各々は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
ウイルス構築物を得るための方法は、当技術分野で知られている。例えば、AAV構築物を産生するために、この方法は典型的には、AAVキャプシドタンパク質またはそのフラグメントをコードする核酸配列;機能的なrep遺伝子;AAV逆方向末端反復配列(ITR)及びコード配列で構成される組換えAAV構築物;及び/または組換えAAV構築物のAAVキャプシドタンパク質へのパッケージングが可能になるのに十分なヘルパー機能を含む宿主細胞を培養することを含む。
いくつかの実施形態では、AAVキャプシド内にAAV構築物をパッケージングするために宿主細胞内で培養される成分は、トランスで宿主細胞に提供され得る。あるいは、任意の1つ以上の成分(例えば、組換えAAV構築物、rep配列、cap配列、及び/またはヘルパー機能)は、当業者に既知の方法を使用して、1つ以上のそのような成分を含むように操作された安定した宿主細胞によって提供され得る。いくつかの実施形態では、そのような安定な宿主細胞は、誘導性プロモーターの制御下にあるそのような成分(複数可)を含む。いくつかの実施形態では、そのような成分(複数可)は、構成的プロモーターの制御下にあってもよい。いくつかの実施形態では、選択された安定な宿主細胞は、構成的プロモーターの制御下にある選択された成分(複数可)及び1つ以上の誘導性プロモーターの制御下にある他の選択された成分(複数可)を含み得る。例えば、HEK293細胞(構成的プロモーターの制御下でE1ヘルパー機能を含む)に由来するが、誘導性プロモーターの制御下でrep及び/またはcapタンパク質を含む安定な宿主細胞を生成することができる。他の安定な宿主細胞は、当業者によって通常の方法を使用して生成され得る。
本開示のAAVを産生するために必要な組換えAAV構築物、rep配列、cap配列、及びヘルパー機能は、任意の適切な遺伝エレメント(例えば、構築物)を使用して、パッケージング宿主細胞に送達され得る。選択された遺伝エレメントは、例えば、核酸操作の当技術分野で知られている任意の好適な方法によって送達され得、遺伝子工学、組換え工学、及び合成技術を含む(例えば、Sambrook et al,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Press,Cold Spring Harbor,N.Y.,を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。同様に、AAV粒子を生成する方法はよく知られており、任意の好適な方法を本開示と共に使用することができる(例えば、K.Fisher et al,J.Virol.,70:520-532(1993)及び米国特許第5,478,745号を参照、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。
いくつかの実施形態では、組換えAAVは、三重トランスフェクション法を用いて産生され得る(例えば、米国特許第6,001,650号に記載のとおり、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。いくつかの実施形態では、組換えAAVは、AAV粒子、AAVヘルパー機能構築物、及びアクセサリー機能構築物にパッケージングされる組換えAAV構築物(コード配列を含む)で宿主細胞をトランスフェクトすることによって産生される。AAVヘルパー機能構築物は、生産的なAAV複製及びキャプシド化のためにトランスで機能する「AAVヘルパー機能」配列(例えば、rep及びcap)をコードする。いくつかの実施形態では、AAVヘルパー機能構築物は、任意の検出可能な野生型AAV粒子(すなわち、機能的rep及びcap遺伝子を含むAAV粒子)を生成することなく、効率的なAAV構築物産生を支持する。本開示での使用に好適である構築物の非限定的な例としては、pHLP19(例えば、米国特許第6,001,650号を参照、これは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)及びpRep6cap6構築物(例えば、米国特許第6,156,303号を参照、これは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)が挙げられる。アクセサリー機能構築物は、AAVが複製に依存する非AAV由来のウイルス及び/または細胞機能(例えば、「アクセサリー機能」)のヌクレオチド配列をコードする。アクセサリー機能としては、これらに限定されないが、AAV遺伝子転写の活性化、段階特異的AAV mRNAスプライシング、AAV DNA複製、cap発現産物の合成、及びAAVキャプシドアセンブリに関与する部分など、AAV複製に必要な機能が挙げられ得る。ウイルスベースのアクセサリー機能は、アデノウイルス、ヘルペスウイルス(単純ヘルペスウイルス1型以外)、及びワクシニアウイルスなどの任意の既知のヘルパーウイルスに由来し得る。
対象への送達に好適であるAAVウイルス構築物を生成及び単離するためのさらなる方法は、例えば、米国特許第7,790,449号;米国特許第7,282,199号;WO2003/042397;WO2005/033321、WO2006/110689;及び米国特許第7,588,772号に記載されており、これらのそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。1つのシステムでは、産生細胞株に、ITRが隣接するコード配列をコードする構築物、ならびにrep及びcapをコードする構築物(複数可)を一過性にトランスフェクトさせる。別のシステムでは、rep及びcapを安定して供給するパッケージング細胞株に、ITRが隣接するコード配列をコードする構築物を一過性にトランスフェクトさせる。これらのシステムのそれぞれで、AAV粒子は、ヘルパーアデノウイルスまたはヘルペスウイルスの感染に応答して産生され、AAVは、汚染ウイルスから分離される。他のシステムでは、AAVを回復するためにヘルパーウイルスに感染する必要はなく、ヘルパー機能(すなわち、アデノウイルスE1、E2a、VA、及びE4またはヘルペスウイルスUL5、UL8、UL52、及びUL29、及びヘルペスウイルスポリメラーゼ)も、システムによってトランスで供給される。このようなシステムでは、ヘルパー機能をコードする構築物を細胞に一過性にトランスフェクトすることによってヘルパー機能を供給することができるか、または、ヘルパー機能をコードする遺伝子を安定に含むように細胞を操作することができ、その発現は、転写または転写後レベルで制御され得る。
いくつかの実施形態では、精製後のウイルス構築物力価が決定される。いくつかの実施形態では、力価は、定量的PCRを使用して決定される。特定の実施形態では、構築物に特異的なTaqManプローブを利用して、構築物レベルを決定する。特定の実施形態では、TaqManプローブは、配列番号65によって表され、順方向及び逆方向増幅プライマーは、それぞれ配列番号66及び67によって例示される。
構築物の定量化のための例示的なTaqManプローブ(配列番号65)
/56-FAM/TAATTCCAA/ZEN/CCAGCAGAGTCAGGGC/3IABkFQ/
構築物の定量化のための例示的な順方向qPCRプライマー(配列番号66)
GATACAGCTAGAGTCCTGATTGC
構築物の定量化のための例示的な逆方向qPCRプライマー(配列番号67)
GATCTGCCAAGTACCTCACTATG
本明細書に記載のとおり、いくつかの実施形態では、本開示のウイルス構築物は、アデノ随伴ウイルス(AAV)構築物である。AAV1、AAV2、AAV3(例えば、AAV3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、及びAAV Anc80、ならびにそれらのバリアントなど、いくつかのAAV血清型が特徴付けられている。いくつかの実施形態では、AAV粒子は、AAV2/6、AAV2/8、AAV2/9、またはAAV2/Anc80粒子である(例えば、AAV6、AAV8、AAV9、またはAnc80キャプシドを有する、及びAAV2 ITRを有する構築物)。他のAAV粒子及び構築物は、例えば、Sharma et al.,Brain Res Bull.2010 Feb 15;81(2-3):273に記載されており、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。一般に、任意のAAV粒子を使用して、本明細書に記載のコード配列を送達することができる。しかしながら、血清型は、異なる向性を有し、例えば、それらは異なる組織に優先的に感染する。いくつかの実施形態では、AAV構築物は、自己相補的AAV構築物である。
本開示は、とりわけ、AAVベースの構築物を作製する方法を提供する。いくつかの実施形態では、そのような方法は、宿主細胞の使用を含む。いくつかの実施形態では、宿主細胞は、哺乳類細胞である。宿主細胞は、AAVヘルパー構築物、AAVミニ遺伝子プラスミド、アクセサリー機能構築物、及び/または組換えAAVの産生に関連する他のトランスファーDNAのレシピエントとして使用され得る。この用語には、トランスフェクトされた元の細胞の子孫が含まれる。したがって、本明細書で使用される「宿主細胞」は、外因性DNA配列でトランスフェクトされた細胞を指す場合がある。1つの親細胞の子孫は、天然の偶発的または意図的な変異のために、形態またはゲノムまたは全DNA補体が元の親と必ずしも完全に同一ではあり得ないことが理解される。
対象への送達に好適であるAAV粒子を生成及び単離するためのさらなる方法は、例えば、米国特許第7,790,449号;米国特許第7,282,199号;WO2003/042397;WO2005/033321、WO2006/110689;及び米国特許第7,588,772号に記載されており、これらのそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。1つのシステムでは、産生細胞株に、ITRが隣接するコード配列をコードする構築物、ならびにrep及びcapをコードする構築物(複数可)を一過性にトランスフェクトさせる。別のシステムでは、rep及びcapを安定して供給するパッケージング細胞株に、ITRが隣接するコード配列をコードする構築物を一過性にトランスフェクトさせる。これらのシステムのそれぞれで、AAV粒子は、ヘルパーアデノウイルスまたはヘルペスウイルスの感染に応答して産生され、AAV粒子は、汚染ウイルスから分離される。他のシステムでは、AAV粒子を回復するためにヘルパーウイルスに感染する必要はなく、ヘルパー機能(すなわち、アデノウイルスE1、E2a、VA、及びE4またはヘルペスウイルスUL5、UL8、UL52、及びUL29、及びヘルペスウイルスポリメラーゼ)も、システムによってトランスで供給される。このようなシステムでは、ヘルパー機能をコードする構築物を細胞に一過性にトランスフェクトすることによってヘルパー機能を供給することができるか、または、ヘルパー機能をコードする遺伝子を安定に含むように細胞を操作することができ、その発現は、転写または転写後レベルで制御され得る。
さらに別のシステムでは、ITR及びrep/cap遺伝子が隣接するコード配列が、バキュロウイルスベースの構築物による感染によって昆虫宿主細胞に導入される。このような産生システムは、当技術分野で知られている(例えば、概して、Zhang et al.,2009,Human Gene Therapy 20:922-929を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。これら及び他のAAV産生システムの作製及び使用方法はまた、米国特許第5,139,941号;同第5,741,683号;同第6,057,152号;同第6,204,059号;同第6,268,213号;同第6,491,907号;同第6,660,514号;同第6,951,753号;同第7,094,604号;同第7,172,893号;同第7,201,898号;同第7,229,823号;及び同第7,439,065号に記載されており、これらのそれぞれは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
視力低下
とりわけ、本開示は、方法を提供する。いくつかの実施形態では、方法は、本明細書に記載の組成物を対象の眼に導入することを含む。例えば、本明細書では、いくつかの実施形態では、対象(例えば動物、例えば哺乳動物、例えば霊長類、例えばヒト)の眼に治療有効量の本明細書に記載の任意の組成物を投与することを含む方法が提供される。任意のこれらの方法のいくつかの実施形態では、対象は、欠陥がある眼細胞標的遺伝子(例えば、遺伝子によってコードされる支持及び/または視覚細胞標的タンパク質の発現及び/または活性の減少をもたらす変異を有する支持及び/または視覚細胞標的遺伝子)を有すると過去に特定されている。任意のこれらの方法のいくつかの実施形態はさらに、導入または投与ステップの前に、対象が欠陥のある眼細胞標的遺伝子を有することを判定することをさらに含む。任意のこれらの方法のいくつかの実施形態は、対象において眼細胞標的遺伝子における変異を検出することをさらに含み得る。任意のこれらの方法のいくつかの実施形態は、対象が視力低下を有すると特定するか、または診断することをさらに含み得る。
いくつかの実施形態では、本明細書では、対象、例えば動物、例えば哺乳動物、例えば霊長類、例えばヒトの眼内における眼細胞標的遺伝子欠損(例えば、CLRN1の欠損)を修正する方法が提供される。いくつかの実施形態では、方法は、治療有効量の本明細書に記載の組成物のいずれかを対象の眼に投与することを含み、ここで、投与することは、対象の眼の任意の細胞サブセットにおける眼細胞標的遺伝子欠損を修復及び/または改善する。いくつかの実施形態では、眼標的細胞は、眼細胞などの感覚細胞、及び/または支持細胞などの非感覚細胞、及び/または眼細胞のすべてまたは任意のサブセットであり得る。
また、対象(例えば、動物、例えば哺乳動物、例えば霊長類、例えばヒト)の眼細胞の任意のサブセット中の眼細胞標的タンパク質の発現レベルを増加させる方法であって、本方法は、治療有効量の本明細書に記載の組成物のいずれかを対象の眼に投与することを含み、投与することが、対象の眼の任意の細胞サブセット中での眼細胞標的タンパク質(例えば、クラリン1タンパク質)の発現レベルの増加をもたらす、方法も本明細書に提供される。いくつかの実施形態では、眼標的細胞は、眼細胞などの感覚細胞、及び/または支持細胞などの非感覚細胞、及び/または眼細胞のすべてまたは任意のサブセットであり得る。
また、本明細書では、欠陥のある眼細胞標的遺伝子を有すると特定された対象(例えば、動物、例えば哺乳動物、例えば霊長類、例えばヒト)における、例えば、網膜色素変性症によって引き起こされる視力低下を治療する方法であって、治療有効量の、本明細書に記載の組成物のいずれかを対象の眼に投与することを含む、方法も提供される。本明細書に提供される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態では、対象は、アッシャー症候群III型を有する。本明細書に提供される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態では、対象は、網膜色素変性症を有する。本明細書に提供される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態では、対象は、ヒトである。本明細書に提供される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態は、投与ステップの前に、対象が欠陥のあるCLRN1遺伝子を有することを判定することをさらに含む。
また、本明細書では、眼障害を有すると特定または診断された対象におけるシナプスを回復する及び/またはらせん神経節神経を維持する方法であって、本明細書に記載される任意の組成物の治療有効量を対象の眼に投与することを含む、方法も提供される。
また、本明細書では、治療有効量の本明細書に記載の任意の組成物を対象の眼に投与することを含む方法も提供される。
アッシャー症候群III型を有する対象、例えば哺乳動物、例えばヒト、例えば患者の治療のために、本明細書に開示の組成物、例えばrAAV-CLRN1を投与することを含む方法も本明細書に提供される。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物は、外科的送達によって、例えば眼に送達される。
また、視力低下を特徴とするアッシャー症候群III型または網膜色素変性症を治療するための外科的方法も本明細書で提供される。いくつかの実施形態では、方法は、対象の眼に第1の切開点にて第1の切開を導入するステップと、治療有効量の本明細書に提供される組成物のうちのいずれかを眼内投与するステップとを含む。いくつかの実施形態では、組成物は、第1の切開点にて対象に投与される。いくつかの実施形態では、組成物は、第1の切開の中へとまたはそれを通して対象に投与される。
本明細書に記載される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態では、本明細書に記載されるいずれかの組成物は、網膜の中へとまたは網膜を通して対象に投与される。本明細書に記載される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態では、組成物は、網膜に複数の切開を作出することができる医療デバイスを用いて投与される。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、複数のマイクロニードルを含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、略円形の第1の面を含む複数のマイクロニードルを含み、各マイクロニードルが少なくとも約10ミクロンの直径を有する。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、組成物を保有可能な基部及び/またはリザーバーを含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、組成物を移送可能な内腔を個々に含む複数の中空マイクロニードルを含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、少なくとも部分真空を生成するための手段を含む。
本明細書に記載の任意の方法のいくつかの実施形態では、本明細書に記載の任意の組成物は、例えば、以下によって記載されているように、硝子体内注射または網膜下注射を介して対象に投与される;Ochakovski et al.,「Retinal Gene Therapy:Surgical Vector Delivery in the Translation to Clinical Trials」,Front.Neurosci.April 3,2017、その内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。本明細書に記載の方法のいずれかのいくつかの実施形態では、以下に記載のとおり、本明細書に記載の任意の組成物を対象に投与する;「OCT-Assisted Delivery of Luxturna」 by Ninel Z Gregori and Janet Louise David,https://www.aao.org/clinical-video/oct-assisted-delivery-of-luxturna(July 19,2018)、これらの内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。本明細書に記載の方法のいずれかのいくつかの実施形態では、本明細書に記載の任意の組成物は、脈絡膜上送達を介して(例えば、Orbit(商標)網膜下送達システム(Orbit SDS)(Gyroscope Therapeutics)を使用して)対象に投与される。
いくつかの実施形態では、本開示の技術を使用して、視力低下を有するか、または視力低下のリスクを有する対象を治療する。例えば、いくつかの実施形態では、対象は、CLRN1の少なくとも1つの病原性バリアントに起因する常染色体劣性視力低下を有する。当業者は、CLRN1中の多くの異なる変異が病原性バリアントをもたらし得ることを理解するであろう。いくつかのそのような実施形態では、病原性バリアントは、視力低下を引き起こすか、または引き起こすリスクがある。
いくつかの実施形態では、視力低下を経験している対象を評価して、視力低下を引き起こし得る1つ以上の変異が存在し得るか、及び存在し得る場所を決定する。いくつかのそのような実施形態では、CLRN1遺伝子産物または機能の状態が(例えば、タンパク質または配列決定分析を介して)評価される。本明細書に記載の方法のいずれかのいくつかの実施形態では、対象または動物は、哺乳動物であり、いくつかの実施形態では、哺乳動物は、家畜、農場動物、動物園動物、非ヒト霊長類、またはヒトである。本明細書に記載される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態では、動物、対象または哺乳動物は、成体、ティーンエイジャー、若齢個体、幼齢個体、幼児期個体、乳児期個体、または新生児期個体である。本明細書に記載される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態では、動物、対象または哺乳動物の年齢は、1~5、1~10、1~20、1~30、1~40、1~50、1~60、1~70、1~80、1~90、1~100、1~110、2~5、2~10、10~20、20~30、30~40、40~50、50~60、60~70、70~80、80~90、90~100、100~110、10~30、10~40、10~50、10~60、10~70、10~80、10~90、10~100、10~110、20~40、20~50、20~60、20~70、20~80、20~90、20~100、20~110、30~50、30~60、30~70、30~80、30~90、30~100、40~60、40~70、40~80、40~90、40~100、50~70、50~80、50~90、50~100、60~80、60~90、60~100、70~90、70~100、70~110、80~100、80~110、または90~110歳である。本明細書に記載される方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態では、対象または哺乳動物の月齢は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、または11ヶ月である。
本明細書に記載の方法のいずれかのいくつかの実施形態では、方法は、それを必要とする対象において、少なくとも10日、少なくとも15日、少なくとも20日、少なくとも25日、少なくとも30日、少なくとも35日、少なくとも40日、少なくとも45日、少なくとも50日、少なくとも55日、少なくとも60日、少なくとも65日、少なくとも70日、少なくとも75日、少なくとも80日、少なくとも85日、少なくとも100日、少なくとも105日、少なくとも110日、少なくとも115日、少なくとも120日、少なくとも5ヶ月、少なくとも6ヶ月、少なくとも7ヶ月、少なくとも8ヶ月、少なくとも9ヶ月、少なくとも10ヶ月、少なくとも11ヶ月、または少なくとも12ヶ月の間、視力の改善(例えば、本明細書に記載の視力の改善を決定するための測定基準のいずれか)をもたらす。
いくつかの実施形態において、対象(例えば、動物、例えば、哺乳動物、例えば、ヒト)は、視力低下を有するか、または発症するリスクがある。いくつかの実施形態では、対象(例えば、動物、例えば、哺乳動物、例えば、ヒト)は、CLRN1遺伝子における変異を有すると以前に特定されている。いくつかの実施形態では、対象(例えば、動物、例えば、哺乳動物、例えば、ヒト)は、本明細書に記載されているか、または視力低下に関連することが当技術分野で知られているCLRN1遺伝子中の変異のうちのいずれかを有する。
いくつかの実施形態において、対象(例えば、動物、例えば、哺乳動物、例えば、ヒト)は、視力低下のリスクがある(例えば、遺伝子変異、例えば、CLRN1変異の保因者であるリスクがある)と特定されている。いくつかのそのような実施形態において、対象(例えば、動物、例えば、哺乳動物、例えば、ヒト)は、視力低下の特定のリスク因子または視力低下のリスク(例えば、既知の親保因者、罹患した兄弟、または視力低下の症状)を有し得る。いくつかのこのような実施形態では、対象(例えば、動物、例えば、哺乳動物、例えば、ヒト)は、以前に特定されていない(すなわち、公開されていない、または知られていないCLRN1のバリアント)CLRN1遺伝子中の変異の保因者であると(例えば、遺伝子検査を介して)特定されている。いくつかのそのような実施形態では、同定された変異は、新規であり得(すなわち、以前に文献に記載されていない)、視力低下を患っている、または視力低下になりやすい対象のための治療方法は、特定の患者の変異(複数可)に合わせて個別化される。いくつかの実施形態では、対象(例えば動物、例えば哺乳動物、例えばヒト)は、CLRN1遺伝子中に突然変異を有すると特定され、視力低下と診断されている。いくつかの実施形態では、対象(例えば動物、例えば哺乳動物、例えばヒト)は、視力低下を有すると特定されている。
いくつかの実施形態では、視力低下の治療の奏効は、当技術分野で既知の従来の機能視力検査のいずれかを使用して対象において判定することができる。機能視力検査の非限定的な例としては、様々な種類の視力アッセイ(例えば、眼筋検査、視力検査、屈折評価、視野検査、色覚検査、及び網膜検査)である。
本明細書で提供される任意の方法のいくつかの実施形態では、本明細書に記載の任意の組成物の2回以上の用量が、対象の眼に導入されるかまたは投与される。これらの方法のうちのいずれかのいくつかの実施形態は、組成物の初回用量を対象の眼に導入または投与することと、初回用量の導入または投与後に対象の視力機能を評価することと、組成物の追加の用量を、(例えば、当該技術分野で既知の任意の視力検査を用いて判定したときに)正常な範囲内の視力機能を有しないことが見出された対象の眼に投与することと、を含み得る。
本明細書で提供される任意の方法のいくつかの実施形態において、組成物は、眼内投与用に製剤化することができる。本明細書に記載の方法のいずれかのいくつかの実施形態では、本明細書に記載の組成物は、眼内投与、硝子体内投与、網膜下投与、脈絡膜上送達、または局所投与によって投与することができる。本明細書に記載される任意の方法のいくつかの実施形態において、組成物は、医療デバイス(例えば、本明細書に記載される任意の例示的な医療デバイス)の使用によって投与される。
いくつかの実施形態では、眼内投与は、本明細書に記載の方法または当技術分野で知られている方法のいずれかを使用して行うことができる。例えば、いくつかの実施形態では、組成物は、以下の外科的技法を使用して眼に投与または導入することができる。
顕微鏡に統合された術中光コヒーレンストモグラフィー(OCT)は、ウイルス注射の前に小さなプレブレブ(pre-bleb)を作製するために使用される(例えば、必要に応じて網膜下色素上皮(RPE)注射または脈絡膜上注射を避けるため)。まず、フィネスループを使用して硝子体を染色及び除去し、柔らかいシリコンチップで持ち上げる。次に、平衡塩溶液を網膜下腔に注射し、OCTスキャンを行って中心窩の菲薄化を確認する。ブレブが作成されると、25ゲージのノーデュエルボアカニューレを使用してvoretigeneを導入する。その後、過度の伸展及び黄斑円孔の形成を避けるために、中心窩を注意深く監視する必要がある。強膜のへこみは、周辺の破損を除外するために使用できる。最後に、ウイルスを除去するために空気流体交換が使用される(例えば、「OCT-Assisted Delivery of Luxturna」 by Ninel Z Gregori and Janet Louise David,https://www.aao.org/clinical-video/oct-assisted-delivery-of-luxturna(July 19,2018)を参照、これらの内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。
別の例として、本明細書に記載のように、Orbit(商標)網膜下送達システム(Orbit SDS)(Gyroscope Therapeutics)は、記載の組成物を脈絡膜上注射によって眼に投与または導入するのに使用することができる。例えば、「Orbit Subretinal Delivery System Instructions for Use June 2020」,https://www.orbitsds.com/wp-content/uploads/2020/08/AW1009028-Rev.-D-US-IFU-No-Cut-Lines.pdfを参照、その内容全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
本明細書に提供されるいずれかの方法のいくつかの実施形態では、対象は、視力低下を有するか、または視力低下を発症するリスクがある。本明細書で提供されるいずれかの方法のいくつかの実施形態では、対象は、支持細胞及び/または眼細胞中に発現し得る遺伝子である眼細胞標的遺伝子中に変異を有することが以前に特定されている。
本明細書で提供される任意の方法のいくつかの実施形態において、対象は、(例えば、遺伝子検査を介して)眼細胞標的遺伝子中の変異の保因者であると特定されている。本明細書で提供される任意の方法のいくつかの実施形態では、対象は、眼細胞標的遺伝子中に変異を有すると特定され、視力低下(例えば、アッシャー症候群III型)と診断されている。本明細書に記載の方法のいずれかのいくつかの実施形態では、対象は、視力低下(例えば、アッシャー症候群III型)を有すると特定されている。いくつかの実施形態では、視力低下(例えば、アッシャー症候群III型)の治療の奏効は、当技術分野で知られている従来の機能視力検査のいずれかを使用して対象において判定することができる。機能視力検査の非限定的な例としては、様々な種類の視力アッセイ(例えば、眼筋検査、視力検査、屈折評価、視野検査、色覚検査、及び網膜検査)が挙げられる。
いくつかの実施形態において、対象細胞は、in vitroである。いくつかの実施形態において、対象細胞は、最初に対象から得られ、ex vivoで培養される。いくつかの実施形態において、対象細胞は、眼標的遺伝子に欠陥があると過去に判定されている。いくつかの実施形態において、対象細胞は、眼細胞標的遺伝子に欠陥があると過去に判定されている。いくつかの実施形態において、対象細胞は、支持細胞標的遺伝子に欠陥があると過去に判定されている。
これらの方法のいくつかの実施形態では、治療、例えば、本明細書に記載の組成物の1回または2回以上の投与の後に、活性眼細胞標的タンパク質(例えば、クラリン1タンパク質)の発現が増加する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の活性眼標的タンパク質(例えば、クラリン1タンパク質)の発現の増加は、例えば、本明細書に記載の任意の構築物(複数可)を含む組成物の導入前の眼細胞標的タンパク質の発現レベルと比較して、対照レベルに対するものである。
標的タンパク質(例えば、クラリン1タンパク質)の発現及び/または活性を検出する方法は、当技術分野で知られている。いくつかの実施形態では、眼細胞標的タンパク質の発現レベルは、直接検出され得る(例えば、眼細胞標的タンパク質または標的mRNAの検出)。標的RNAまたはタンパク質(例えば、CLRN1遺伝子産物及び/またはクラリン1タンパク質またはその機能的特徴部分)の発現及び/または活性を直接検出するために使用され得る技法の非限定的な例としては、リアルタイムPCR、ウエスタンブロット法、免疫沈降法、免疫組織化学法、質量分析法、または免疫蛍光法が挙げられる。いくつかの実施形態において、眼細胞標的タンパク質の発現は、(例えば、機能視力検査により)間接的に検出することができる。
いくつかの実施形態において、本明細書に開示される組成物の安全性及び忍容性は、視力低下において判定され得る。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される組成物、例えば、rAAV-CLRN1の安全性及び忍容性は、本明細書に開示の対象において判定され得る。
投与
本明細書では、視力低下を特徴とするアッシャー症候群III型を治療するための治療的送達システムが提供される。一態様では、治療的送達システムは、i)それを必要とする対象の眼に1つまたは複数の切開を作出することができる医療デバイスと、ii)有効用量の組成物(例えば、本明細書に記載される組成物のうちのいずれか)とを含む。いくつかの実施形態では、医療デバイスは、複数のマイクロニードルを含む。
視力低下を特徴とする網膜色素変性症を治療するための治療的送達システムも、本明細書で提供される。一態様では、治療的送達システムは、i)それを必要とする対象の眼に1つまたは複数の切開を作出することができる医療デバイスと、ii)有効用量の組成物(例えば、本明細書に記載される組成物のうちのいずれか)とを含む。いくつかの実施形態では、医療デバイスは、複数のマイクロニードルを含む。
また、視力低下を特徴とするアッシャー症候群III型または網膜色素変性症を治療するための外科的方法も本明細書で提供される。いくつかの実施形態では、方法は、対象の眼に第1の切開点にて第1の切開を導入するステップと、治療有効量の本明細書に提供される組成物のうちのいずれかを眼内投与するステップとを含む。いくつかの実施形態では、組成物は、第1の切開点にて対象に投与される。いくつかの実施形態では、組成物は、第1の切開の中へとまたはそれを通して対象に投与される。
本明細書に提供されるいずれかの方法のいくつかの実施形態では、本明細書に記載される組成物のうちのいずれかは、眼の中へとまたはそれを通して対象に投与される。本明細書に提供される任意の方法のいくつかの実施形態において、組成物は、眼に複数の切開を作出することができる医療デバイスを用いて投与される。いくつかの実施形態では、医療デバイスは、複数のマイクロニードルを含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、略円形の第1の面を含む複数のマイクロニードルを含み、各マイクロニードルが少なくとも約10ミクロンの直径を有する。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、組成物を保有可能な基部及び/またはリザーバーを含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、組成物を移送可能な内腔を個々に含む複数の中空マイクロニードルを含む。いくつかの実施形態において、医療デバイスは、少なくとも部分真空を生成するための手段を含む。
いくつかの実施形態において、本明細書に開示される方法のうちのいずれかは、視力低下を有する対象、例えば哺乳動物、例えばヒト、例えば患者における安全性及び忍容性を判定するための用量漸増研究を含む。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物、例えばrAAV-CLRN1は、本明細書に開示される投薬レジメンで投与される。いくつかの実施形態では、投薬レジメンは、例えば本明細書に開示される組成物、例えば、rAAV-CLRN1の、例えば本明細書に記載される用量の眼内投与を含む。いくつかの実施形態では、投薬レジメンは、眼あたり少なくとも0.01mL、少なくとも0.02mL、少なくとも0.03mL、少なくとも0.04mL、少なくとも0.05mL、少なくとも0.06mL、少なくとも0.07mL、少なくとも0.08mL、少なくとも0.09mL、少なくとも0.10mL、少なくとも0.11mL、少なくとも0.12mL、少なくとも0.13mL、少なくとも0.14mL、少なくとも0.15mL、少なくとも0.16mL、少なくとも0.17mL、少なくとも0.18mL、少なくとも0.19mL、または少なくとも0.20mLの容量での送達を含む。いくつかの実施形態では、投薬レジメンは、眼あたり最大0.30mL、最大0.25mL、最大0.20mL、最大0.15mL、最大0.14mL、最大0.13mL、最大0.12mL、最大0.11mL、最大0.10mL、最大0.09mL、最大0.08mL、最大0.07mL、最大0.06mL、または最大0.05mLの容量での送達を含む。いくつかの実施形態では、投薬レジメンは、集団に応じて、眼あたり約0.05mL、約0.06mL、約0.07mL、約0.08mL、約0.09mL、約0.10mL、約0.11mL、約0.12mL、約0.13mL、約0.14mL、または約0.15mLの容量での送達を含む。いくつかの実施形態では、投薬レジメンは、眼あたり少なくとも0.01mL、少なくとも0.02mL、少なくとも0.03mL、少なくとも0.04mL、少なくとも0.05mL、少なくとも0.06mL、少なくとも0.07mL、少なくとも0.08mL、少なくとも0.09mL、少なくとも0.10mL、少なくとも0.11mL、少なくとも0.12mL、少なくとも0.13mL、少なくとも0.14mL、少なくとも0.15mL、少なくとも0.16mL、少なくとも0.17mL、少なくとも0.18mL、少なくとも0.19mL、または少なくとも0.20mLの容量での送達を含む。いくつかの実施形態では、投薬レジメンは、眼あたり最大0.30mL、最大0.25mL、最大0.20mL、最大0.15mL、最大0.14mL、最大0.13mL、最大0.12mL、最大0.11mL、最大0.10mL、最大0.09mL、最大0.08mL、最大0.07mL、最大0.06mL、または最大0.05mLの容量での送達を含む。いくつかの実施形態では、投薬レジメンは、集団に応じて、眼あたり約0.05mL、約0.06mL、約0.07mL、約0.08mL、約0.09mL、約0.10mL、約0.11mL、約0.12mL、約0.13mL、約0.14mL、または約0.15mLの容量での送達を含む。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法は、視力低下を有する対象、例えば、18~80歳の対象に眼内注射を介して投与される、本明細書に開示される組成物、例えば、rAAV-CLRN1の漸増用量の安全性及び忍容性を評価する。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法のいずれかは、本明細書に開示される組成物、例えばrAAV-CLRN1の安全性及び忍容性の評価を含む。いくつかの実施形態では、視力低下を治療するための本明細書に開示される組成物、例えばrAAV-CLRN1の有効性の評価は、無作為化され、制御された設定で行われる(同時の非介入観察アームを使用する)。
対象を治療する方法
本開示は、とりわけ、本明細書に記載の技術を使用して、視力低下を特徴とするアッシャー症候群III型または網膜色素変性症に罹患している、またはそのリスクがある対象の基礎疾患及び/または症状が治療され得ることを提供する。
いくつかの実施形態では、方法は、本明細書に記載の構築物(例えば、rAAV構築物)、粒子(例えば、rAAV粒子)、または本明細書に記載の組成物を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、方法は、治療方法である。いくつかの実施形態では、対象は、視力低下を特徴とするアッシャー症候群III型または網膜色素変性症に罹患しているか、またはそのリスクがある対象である。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の構築物(例えば、rAAV構築物)、粒子(例えば、rAAV粒子)、または本明細書に記載の組成物を対象に投与することは、視力低下を特徴とするアッシャー症候群III型または網膜色素変性症に関連する1つ以上の症状を緩和及び/または改善し得る。症状としては、例えば、視力低下、周辺視力の低下、中心視力の低下、または眼細胞の変性が挙げられ得る。
いくつかの実施形態では、視力低下は、遺伝子突然変異(例えば、欠失突然変異、フレームシフト突然変異、ナンセンス突然変異、低形態突然変異、超形態突然変異、新形態突然変異、異常過剰発現、異常過少発現など)に関連する。いくつかの実施形態では、アッシャー症候群III型または網膜色素変性症に罹患しているか、またはそのリスクがある対象は、CLRN1遺伝子中に変異を有し得、これは、本明細書に記載のとおりに特徴付けられ得る。
いくつかの実施形態では、対象は、本明細書に記載の技術(例えば、リアルタイムPCR、定量的リアルタイムPCR、ウエスタンブロット法、免疫沈降法、免疫組織化学法、質量分析法、または免疫蛍光法、遺伝子及び/またはタンパク質の発現の間接的な表現型決定(例えば、機能視力検査、眼筋検査、視力検査、屈折評価、視野検査、色覚検査、及び網膜検査など)により、治療前、治療中、及び/または治療後、遺伝的及び/または症状的に特徴付けられる。いくつかの実施形態では、視力低下に罹患しているか、またはそのリスクがある対象は、組織サンプリング(例えば、1つ以上の眼細胞を含む、例えば、1つ以上の眼細胞及び/または1つ以上の支持細胞を含む)によって特徴付けられた関連疾患状態を有し得る。いくつかの実施形態では、組織は、形態学的分析によって評価して、本明細書に記載の任意の技術(例えば方法論、例えば組成物、例えば構築物を含む組成物、及び/または粒子など)の適用前、適用中、適用後に眼細胞及び/または支持細胞の形態を決定する。いくつかのそのような実施形態では、標準免疫組織化学的または組織学的分析が実施され得る。いくつかの実施形態では、細胞がin-vitroまたはex-vivoで使用される場合、追加の免疫細胞化学的または免疫組織化学的分析が実施され得る。いくつかの実施形態では、1つ以上のタンパク質または転写産物の1つ以上のアッセイ(例えば、ウエスタンブロット、ELISA、ポリメラーゼ連鎖反応)を、対象またはin-vitro細胞集団からの1つ以上のサンプルに対して実施し得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の構築物(例えば、rAAV構築物)、粒子(例えば、rAAV粒子)、または本明細書に記載の組成物を対象に投与することにより、本明細書に記載の技術による治療前に実施された免疫組織化学検査と比較した場合、または対照集団と比較した場合、患者の免疫組織化学的評価(例えば、上記の試験)を改善する。
アッシャー症候群III型または網膜色素変性症の症状を改善するための対象の治療
いくつかの実施形態では、視力低下を特徴とするアッシャーIII型症候群に罹患しているか、またはそのリスクある対象は、視覚機能によって特徴付けられる治療レジメンを受けることができる。いくつかの実施形態では、治療レジメンの機能性は、視覚機能によって特徴付けられ、そのような視覚機能は、本明細書に記載の組成物及び方法による治療前、治療後、及び/または治療中に、眼視力検査(例えば、機能視力検査、眼筋検査、視力検査、屈折評価、視野検査、色覚検査、及び網膜検査など)を使用して、個体において判定される。いくつかの実施形態では、治療レジメンの機能性は、視覚機能によって特徴付けられ、そのような視覚機能は、本明細書に記載の組成物及び方法による治療前、治療後、及び/または治療中に本明細書に記載の視力を測定することによって個体において判定される。いくつかのそのような実施形態では、視力測定値は、対象の片眼または両眼から取得される。いくつかのそのような実施形態では、測定値は、同じ対象の以前の記録、及び/または、例えば、視力低下対正常な視力として定義される許容可能な視力範囲を定義するために使用されるそのような応答測定値に関する既知の測定値と比較する。いくつかの実施形態では、対象は、任意の治療を受ける前に記載された測定値を取得する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の1つ以上の技術で治療された対象は、治療前と比較して、治療後に視力測定値の改善を有することになる。いくつかの実施形態では、視力測定値は、治療が行われた後、及び治療後の定期的なフォローアップ間隔で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の技術を用いた治療は、本明細書に記載の技術を用いた治療の前に実施された試験と比較した場合、または対照集団と比較した場合に、患者の試験評価(例えば、上記の試験)を改善する。
いくつかの実施形態では、視力低下を特徴とする網膜色素変性症に罹患しているか、またはそのリスクのある対象は、視覚機能によって特徴付けられる治療レジメンを受けることができる。いくつかの実施形態では、治療レジメンの機能性は、視覚機能によって特徴付けられ、そのような視覚機能は、本明細書に記載の組成物及び方法による治療前、治療後、及び/または治療中に、眼視力検査(例えば、機能視力検査、眼筋検査、視力検査、屈折評価、視野検査、色覚検査、及び網膜検査などにより)を使用して、個体において判定される。いくつかの実施形態では、治療レジメンの機能性は、視覚機能によって特徴付けられ、そのような視覚機能は、本明細書に記載の組成物及び方法による治療前、治療後、及び/または治療中に本明細書に記載の視力を測定することによって個体において判定される。いくつかのそのような実施形態では、視力測定値は、対象の片眼または両眼から取得される。いくつかのそのような実施形態では、測定値は、同じ対象の以前の記録、及び/または、例えば、視力低下対正常な視力として定義される許容可能な視力範囲を定義するために使用されるそのような応答測定値に関する既知の測定値と比較する。いくつかの実施形態では、対象は、任意の治療を受ける前に記載された測定値を取得する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の1つ以上の技術で治療された対象は、治療前と比較して、治療後に視力測定値の改善を有することになる。いくつかの実施形態では、視力測定値は、治療が行われた後、及び治療後の定期的なフォローアップ間隔で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の技術を用いた治療は、本明細書に記載の技術を用いた治療の前に実施された試験と比較した場合、または対照集団と比較した場合に、患者の試験評価(例えば、上記の試験)を改善する。
視力低下及び回復の評価
いくつかの実施形態では、視覚機能は、網膜電図、視野検査、または遺伝子検査などの測定を使用して決定される。いくつかの実施形態では、対象の眼の網膜は、網膜をより広く鮮明に見ることを可能にするツールである検眼鏡を使用して検査される。いくつかの実施形態では、測定値は、対象の片眼または両眼から取得される。いくつかのそのような実施形態では、測定値は、同じ対象の以前の試験及び/または例えば視力低下対当技術分野で正常な視力として定義されているものを定義するために使用される既知の参照測定値と比較する。いくつかの実施形態では、対象は、任意の治療を受ける前に実施される測定値を受ける。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の1つ以上の技術で治療された対象は、治療前と比較して、治療後に実施した測定値の改善を有することになる。いくつかの実施形態では、測定値は、治療が行われた後、及び治療後の定期的なフォローアップ間隔で行われる。
疾患状態を特徴付ける方法
「CLRN1遺伝子における変異」という用語は、コンセンサス機能クラリン1タンパク質と比較して1つもしくは複数のアミノ酸の欠失、1つもしくは複数のアミノ酸置換、及び1つもしくは複数のアミノ酸挿入のうちの1つもしくは複数を有するクラリン1タンパク質の生産をもたらす、及び/または変異を有しない哺乳類細胞におけるコードされたクラリン1タンパク質の発現されたレベルと比較して、哺乳類細胞におけるコードされたクラリン1タンパク質の発現されたレベルの減少をもたらす、既知のコンセンサス機能CLRN1遺伝子における修飾を指す。いくつかの実施形態において、変異は、1つ以上のアミノ酸(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、またはそれ以上のアミノ酸)の欠失を有するクラリン1タンパク質の産生をもたらし得る。いくつかの実施形態では、変異は、CLRN1遺伝子におけるフレームシフトをもたらし得る。「フレームシフト」という用語は、当該技術分野で、コード配列のリーディングフレームのシフトをもたらす、コード配列における任意の変異を包含することが知られている。いくつかの実施形態において、フレームシフトは、機能しないタンパク質をもたらし得る。いくつかの実施形態において、点変異は、ナンセンス変異(すなわち、遺伝子のエクソンにおいて未成熟終止コドンをもたらす)であり得る。ナンセンス変異は、機能的である場合も、そうでない場合もある短縮型タンパク質(対応するコンセンサス機能的タンパク質と比較して)の生産をもたらし得る。いくつかの実施形態では、変異は、CLRN1 mRNAもしくはクラリン1タンパク質、またはmRNA及びタンパク質の両方の発現の喪失(またはレベルの減少)をもたらし得る。いくつかの実施形態では、変異は、コンセンサス機能クラリン1タンパク質と比較して1つ以上の生物学的活性(機能)の喪失または減少を有する、変化したクラリン1タンパク質の産生をもたらし得る。
いくつかの実施形態では、変異は、1つ以上のヌクレオチドのCLRN1遺伝子への挿入である。いくつかの実施形態では、変異は、クラリン1遺伝子の調節及び/または制御配列、すなわち、コード配列ではない遺伝子の一部分にある。いくつかの実施形態では、調節及び/または制御配列における変異は、プロモーターまたはエンハンサー領域にあり得、CLRN1遺伝子の適切な転写を防止または低減し得る。いくつかの実施形態では、変異は、クラリン1タンパク質またはCLRN1遺伝子と相互作用することが知られている既知の異種遺伝子内にある。
CLRN1 mRNA及び/またはクラリン1タンパク質の遺伝子型決定及び/または発現もしくは活性を検出する方法は、当技術分野で公知である(例えば、Ito et al.,World J Otorhinolaryngol.2013 May 28;3(2):26-34、及びRoesch et al.,Int J Mol Sci.2018 Jan;19(1):209を参照、これらの各々は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。いくつかの実施形態では、CLRN1 mRNAまたはクラリン1タンパク質の発現レベルは、直接検出することができる(例えば、クラリン1タンパク質の検出、CLRN1 mRNAの検出など)。CLRN1の発現及び/または活性を直接検出するために使用され得る技法の非限定的な例としては、リアルタイムPCR、定量的リアルタイムPCR、ウエスタンブロット法、免疫沈降法、免疫組織化学法、質量分析法、または免疫蛍光法が挙げられる。いくつかの実施形態では、CLRN1及び/またはクラリン1タンパク質の発現は、間接的に(例えば、機能視力検査、眼筋検査、視力検査、屈折評価、視野検査、色覚検査、及び網膜検査などを通じて)検出することができる。
生物学的サンプル中のCLRN1タンパク質濃度の評価
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法は、本明細書に記載の組成物による治療前、治療中、及び/または治療後に、個体からの1つ以上の生物学的サンプル中のCLRN1タンパク質濃度を評価することを含む。
これらの方法のいくつかの実施形態では、治療、例えば、本明細書に記載の組成物の1回または2回以上の投与の後に、CLRN1タンパク質の発現が増加する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の活性CLRN1タンパク質の発現の増加は、対照レベルに対して比較したときのもの、例えば、本明細書に記載の任意の構築物(複数可)を含む組成物の導入前のCLRN1タンパク質の発現レベルと比較したものである。
標的RNA及び/またはタンパク質の発現及び/または活性を検出する方法は、当技術分野で知られている。いくつかの実施形態では、眼標的タンパク質の発現レベルは、直接検出され得る(例えば、眼細胞標的タンパク質または標的mRNAの検出)。標的RNA及び/またはタンパク質の発現及び/または活性を直接検出するために使用され得る技法の非限定的な例としては、リアルタイムPCR、ウエスタンブロット法、免疫沈降法、免疫組織化学法、質量分析法、または免疫蛍光法が挙げられる。いくつかの実施形態において、眼細胞標的タンパク質の発現は、(例えば、機能視力検査により)間接的に検出することができる。
いくつかの実施形態では、rAAV粒子の体内分布及び/または排出分析が実施される。いくつかの実施形態では、cDNAを送達する、例えばCLRN1タンパク質を発現するように設計されたrAAV-CLRN1複製欠損rAAV粒子を含む組成物が本明細書に開示される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のrAAV粒子は、アッシャー症候群III型を有する対象、例えばヒト、例えば患者を治療するために使用される。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物は、眼内経路を介して投与される。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物は、低用量のrAAV粒子で投与される(例えば、ベクターゲノムqPCR分析によって測定される)。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物は、身体の局所領域に投与される。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される組成物は、限定された血管の広がり及び全身への曝露をもたらすと予想される。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物は、眼においてより高いレベルの構築物配列をもたらす。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物は、収集された他のほとんどの組織及び体液において、低いが検出可能なレベルをもたらす。いくつかの実施形態では、構築物配列のレベルは、一般に全体で6ヶ月減少した。いくつかの実施形態では、構築物配列のレベルは、血液サンプル中、経時的に、例えば、本明細書に開示される組成物の眼内投与後1ヶ月で減少する。
本明細書に開示される方法のいずれかのいくつかの実施形態では、生体内分布及び排出に関連する体液(例えば、血液、血清、尿、唾液、鼻及び耳のスワブ、及びCSF液)が収集及び/または評価される。本明細書に開示される方法のいずれかのいくつかの実施形態では、非標的組織が収集及び/または評価される。いくつかの実施形態では、キャプシドバリアントは向性を決定すると予想される。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物は、キャプシドバリアント、例えば、AAV Anc80キャプシドバリアントを含む。いくつかの実施形態では、例えば、同一の投与経路を介して、同一の粒子製剤中で、及び/または同等またはより低い粒子用量でのキャプシドバリアントを含む本明細書に開示される組成物の送達では、生体内分布と排出パターンに差異が生じることは予想されていない。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物、例えばrAAV-CLRN1は、約2E12総vg/蝸牛未満のレベルで投与される。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物の用量は、例えば、容量及びrAAV粒子濃度の制限に対応するものである。
対照的に、rAAV粒子を使用した臨床試験では、全身投与経路を介して1E14vg/kg超が送達され、場合によっては生後6ヶ月未満の参加者に送達された(AveXis 2019、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。比較的低用量のrAAV粒子を使用した他の局所送達では、標的領域を超えた広範な生体内分布、例えば全身、または広範なrAAV粒子排出(排泄;一般にqPCRなどの方法による基礎となる構築物DNA濃度の測定)は報告されていない。例えば、Luxturna(登録商標)を両側に7.5E11vg/眼の用量で送達させた場合、眼の標的領域を超えた低レベルの分布(具体的には、粒子が注入された眼の視神経、視交叉、脾臓、及び肝臓、ならびに散発的に試験動物のリンパ節)が報告されている。同様に、第3相臨床試験では、参加者の45%の涙にrAAV粒子が一時的に低レベルで排出された。また、1.5E11vg/眼の用量で両側に送達されたLuxturna(登録商標)の網膜下投与直後の数日間、参加者の10%の血清(全血ではない)サンプルでも低レベルで検出された(例えば、Russell 2017;Spark Therapeutics 2017を参照、その各々は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法のいずれかは、例えば、検証済みのqPCR法を使用して、蝸牛への片側投与後の経時的な血液(例えば、血清及び全血)中のrAAV粒子配列の分布を評価することを含む。いくつかの実施形態では、追加の試験片(例えば、外耳道スワブ、鼻スワブ、唾液、及び尿)が、対象からの排出の評価のために収集される。いくつかの実施形態では、試験片は、少なくとも3つの連続した陰性サンプルが得られるまで対象から収集する。
いくつかの実施形態では、視力低下と相関するタンパク質は、本明細書に記載の組成物及び/または方法による治療前、治療中、及び/または治療後に測定される。
いくつかの実施形態では、AAVキャプシド及び/または粒子に対する免疫原性が測定される。全身適用と比較して比較的低用量で局所領域に送達されたAAVキャプシド及び/または粒子に対する免疫原性では、概して、免疫応答の特定のパターンは得られなかった。重要なことに、体液性及び細胞性免疫学的モニタリングの両方により観察された応答(例えば、それぞれ酵素結合免疫吸着アッセイ[ELISA]/中和抗体[NAb]及び酵素結合免疫吸着スポット[ELISPOT]アッセイによる)は、若干の免疫学的保護を提供する投与経路(ROA)(複数可)(例えば、脳への直接投与)に関して、主に臨床的相関がなかった。
本明細書に開示される方法のいずれかのいくつかの実施形態では、眼内ROAは、同様のレベルの保護を提供することが予想される。本明細書に開示される方法のいずれかのいくつかの実施形態では、対象は、本明細書に開示される組成物、例えば、rAAV-CLRN1の投与の3日前から開始して、およそ17日間、免疫調節レジメン、例えば全身経口コルチコステロイドの短い周術期コースを受ける。いくつかの実施形態では、免疫調節レジメンは、外科的投与処置に関連する炎症を軽減する。いくつかの実施形態では、免疫調節レジメンは、キャプシド(例えば、AAV Anc80)または基礎となる構築物(例えば、導入遺伝子産物、例えば、CLRN1タンパク質)のいずれかに対する免疫反応の可能性をさらに低下させることもできる。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される任意の方法は、本明細書に開示される組成物の投与に応答する体液性免疫(例えば、抗体応答)を評価することをさらに含む。いくつかの実施形態では、眼内ROAを介して送達される場合の、本明細書に開示される組成物の形質導入に対する、例えば血清NAbレベルによって測定される既存の免疫の効果を評価する。いくつかの実施形態では、既存のNAbレベルは、眼内投与経路によって送達されるAAV粒子の形質導入を阻害しない。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される任意の方法は、AAVキャプシド及び/または導入遺伝子産物(例えば、タンパク質)の両方に対する潜在的な全身液性応答について血清を評価することをさらに含む。いくつかの実施形態では、全身液性応答の評価に応答して、本明細書に開示される組成物、例えばrAAV-CLRN1の両側眼内投与の治療間隔を広げることができる。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される任意の方法は、例えば、局所投与経路(ROA)、例えば、眼内投与を介して送達されるrAAV粒子からのAAV粒子、キャプシド、及び/または構築物(例えば、基礎となる導入遺伝子)産物のいずれかに対する細胞傷害性T細胞応答をもたらさない。例えば、Luxturna(登録商標)のラベルには、臨床的に有意な細胞傷害性T細胞応答を有する対象はいないことが記載されている(Spark Therapeutics 2017、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。単離陽性インターフェロンガンマ(IFN-ガンマ)ELISPOTアッセイ結果は、臨床開発プログラム中に得られた(例えば、Bennett 2012参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)が、臨床プログラムでは、臨床的炎症反応は観察されず、用量制限毒性は見られなかったため、これらの単離された結果の重要性は不明である。
特定の実施形態では、本明細書に記載の組成物または組成物の産物のいずれかの薬物動態を測定し、収集する。本明細書に開示される方法のいずれかのいくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物は局所投与される。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物の局所送達により、任意の1つ以上の有害なオフターゲット効果の可能性を低下させる。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物の局所送達は、いかなる有害なオフターゲット効果ももたらさない。本明細書に開示される方法のいずれかのいくつかの実施形態では、対象は、血清中のCLRN1タンパク質(例えば、電気化学発光アッセイを使用して)、バイタルサイン、尿検査、及び/または臨床化学を監視することによってフォローアップを受ける。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される組成物を投与された対象を監視することで、早期の介入及び/または任意のオフターゲット効果の最小化が可能になる。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組成物の投与後、CLRN1タンパク質測定のために血清を収集し、分析することができる。いくつかの実施形態では、そのような測定は、組成物投与前(ベースライン)、投与後2週目、及び適切な期間で月ごと(例えば、3ヶ月、6ヶ月、1年、2年、3年、4年、または5年より長い)に行うことができる。いくつかの実施形態では、CLRN1タンパク質は、ベースラインで、または本明細書に記載のビヒクルまたは低用量のrAAV-CLRN1粒子のいずれかの眼内送達を受けた個体における投与後の任意の時点で、個体の血清中に検出されない。いくつかの実施形態では、高用量のrAAV-CLRN1で、本明細書に記載の方法によって本明細書に記載の組成物を投与された個体は、血清中のCLRN1タンパク質を、検出限界または定量限界未満のレベル、または報告された生物学的活性範囲未満のレベルで検出することができる(11ng/mL~27ng/mL[例えば、Genentech 2017を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる])。
本明細書に開示される任意の方法のいくつかの実施形態において、方法は、(例えば、本明細書に記載される電気化学発光アッセイ)を使用して、CLRN1タンパク質の存在について血清を収集及び/または評価することを含む。
産生方法
AAVシステムは、一般に当技術分野で周知である(例えば、Kelleher and Vos,Biotechniques,17(6):1110-17(1994);Cotten et al.,P.N.A.S.U.S.A.,89(13):6094-98(1992);Curiel,NatImmun,13(2-3):141-64(1994);Muzyczka,Curr Top Microbiol Immunol,158:97-129(1992);及びAsokan A,et al.,Mol.Ther.,20(4):699-708(2012)を参照、これらの各々は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。AAV構築物を生成及び使用するための方法は、例えば、米国特許第5,139,941号、第4,797,368号、及びPCT出願US2019/060328に記載されており、これらの各々は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
ウイルス構築物を得るための方法は、当技術分野で知られている。例えば、AAV構築物を産生するために、この方法は典型的には、AAVキャプシドタンパク質またはそのフラグメントをコードする核酸配列;機能的なrep遺伝子;AAV逆方向末端反復配列(ITR)及びコード配列で構成される組換えAAV構築物;及び/または組換えAAV構築物のAAVキャプシドタンパク質へのパッケージングが可能になるのに十分なヘルパー機能を含む宿主細胞を培養することを含む。
いくつかの実施形態では、AAVキャプシド内にAAV構築物をパッケージングするために宿主細胞内で培養される成分は、トランスで宿主細胞に提供され得る。あるいは、任意の1つ以上の成分(例えば、組換えAAV構築物、rep配列、cap配列、及び/またはヘルパー機能)は、当業者に既知の方法を使用して、1つ以上のそのような成分を含むように操作された安定した宿主細胞によって提供され得る。いくつかの実施形態では、そのような安定な宿主細胞は、誘導性プロモーターの制御下にあるそのような成分(複数可)を含む。いくつかの実施形態では、そのような成分(複数可)は、構成的プロモーターの制御下にあってもよい。いくつかの実施形態では、選択された安定な宿主細胞は、構成的プロモーターの制御下にある選択された成分(複数可)及び1つ以上の誘導性プロモーターの制御下にある他の選択された成分(複数可)を含み得る。例えば、HEK293細胞(構成的プロモーターの制御下でE1ヘルパー機能を含む)に由来するが、誘導性プロモーターの制御下でrep及び/またはcapタンパク質を含む安定な宿主細胞を生成することができる。他の安定な宿主細胞は、当業者によって通常の方法を使用して生成され得る。
本開示のrAAVを産生するために必要な組換えAAV構築物、rep配列、cap配列、及びヘルパー機能は、任意の適切な遺伝エレメント(例えば、構築物)を使用して、パッケージング宿主細胞に送達され得る。選択された遺伝エレメントは、例えば、核酸操作の当技術分野で知られている任意の好適な方法によって送達され得、遺伝子工学、組換え工学、及び合成技術を含む(例えば、Sambrook et al,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Press,Cold Spring Harbor,N.Y.,を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。同様に、AAV粒子を生成する方法はよく知られており、任意の好適な方法を本開示と共に使用することができる(例えば、K.Fisher et al,J.Virol.,70:520-532(1993)及び米国特許第5,478,745号を参照、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。
いくつかの実施形態では、組換えAAVは、三重トランスフェクション法を用いて産生され得る(例えば、米国特許第6,001,650号に記載のとおり、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。いくつかの実施形態では、組換えAAVは、AAV粒子、AAVヘルパー機能構築物、及びアクセサリー機能構築物にパッケージングされる組換えAAV構築物(コード配列を含む)で宿主細胞をトランスフェクトすることによって産生される。AAVヘルパー機能構築物は、生産的なAAV複製及びキャプシド化のためにトランスで機能する「AAVヘルパー機能」配列(例えば、rep及びcap)をコードする。いくつかの実施形態では、AAVヘルパー機能構築物は、任意の検出可能な野生型AAV粒子(すなわち、機能的rep及びcap遺伝子を含むAAV粒子)を生成することなく、効率的なAAV構築物産生を支持する。本開示での使用に好適である構築物の非限定的な例としては、pHLP19(例えば、米国特許第6,001,650号を参照、これは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)及びpRep6cap6構築物(例えば、米国特許第6,156,303号を参照、これは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)が挙げられる。アクセサリー機能構築物は、AAVが複製に依存する非AAV由来のウイルス及び/または細胞機能(例えば、「アクセサリー機能」)のヌクレオチド配列をコードする。アクセサリー機能としては、これらに限定されないが、AAV遺伝子転写の活性化、段階特異的AAV mRNAスプライシング、AAV DNA複製、cap発現産物の合成、及びAAVキャプシドアセンブリに関与する部分など、AAV複製に必要な機能が挙げられ得る。ウイルスベースのアクセサリー機能は、アデノウイルス、ヘルペスウイルス(単純ヘルペスウイルス1型以外)、及びワクシニアウイルスなどの任意の既知のヘルパーウイルスに由来し得る。
対象への送達に好適であるAAVウイルス構築物を生成及び単離するためのさらなる方法は、例えば、米国特許第7,790,449号;米国特許第7,282,199号;WO2003/042397;WO2005/033321、WO2006/110689;及び米国特許第7,588,772号に記載されており、これらのそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。1つのシステムでは、産生細胞株に、ITRが隣接するコード配列をコードする構築物、ならびにrep及びcapをコードする構築物(複数可)を一過性にトランスフェクトさせる。別のシステムでは、rep及びcapを安定して供給するパッケージング細胞株に、ITRが隣接するコード配列をコードする構築物を一過性にトランスフェクトさせる。これらのシステムのそれぞれで、AAV粒子は、ヘルパーアデノウイルスまたはヘルペスウイルスの感染に応答して産生され、AAVは、汚染ウイルスから分離される。他のシステムでは、AAVを回復するためにヘルパーウイルスに感染する必要はなく、ヘルパー機能(すなわち、アデノウイルスE1、E2a、VA、及びE4またはヘルペスウイルスUL5、UL8、UL52、及びUL29、及びヘルペスウイルスポリメラーゼ)も、システムによってトランスで供給される。このようなシステムでは、ヘルパー機能をコードする構築物を細胞に一過性にトランスフェクトすることによってヘルパー機能を供給することができるか、または、ヘルパー機能をコードする遺伝子を安定に含むように細胞を操作することができ、その発現は、転写または転写後レベルで制御され得る。
いくつかの実施形態では、精製後のウイルス構築物力価が決定される。いくつかの実施形態では、力価は、定量的PCRを使用して決定される。特定の実施形態では、構築物に特異的なTaqManプローブを利用して、構築物レベルを決定する。特定の実施形態では、TaqManプローブは、配列番号65によって表され、順方向及び逆方向増幅プライマーは、それぞれ配列番号66及び67によって例示される。
構築物の定量化のための例示的なTaqManプローブ(配列番号65)
/56-FAM/TAATTCCAA/ZEN/CCAGCAGAGTCAGGGC/3IABkFQ/
構築物の定量化のための例示的な順方向qPCRプライマー(配列番号66)
GATACAGCTAGAGTCCTGATTGC
構築物の定量化のための例示的な逆方向qPCRプライマー(配列番号67)
GATCTGCCAAGTACCTCACTATG
本明細書に記載のとおり、いくつかの実施形態では、本開示のウイルス構築物は、アデノ随伴ウイルス(AAV)構築物である。AAV1、AAV2、AAV3(例えば、AAV3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、及びAAV Anc80、ならびにそれらのバリアントなど、いくつかのAAV血清型が特徴付けられている。いくつかの実施形態では、AAV粒子は、AAV2/6、AAV2/8、AAV2/9、またはAAV2/Anc80粒子である(例えば、AAV6、AAV8、AAV9、またはAnc80キャプシドを有する、及びAAV2 ITRを有する構築物)。他のAAV粒子及び構築物は、例えば、Sharma et al.,Brain Res Bull.2010 Feb 15;81(2-3):273に記載されており、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。一般に、任意のAAV粒子を使用して、本明細書に記載のコード配列を送達することができる。しかしながら、血清型は、異なる向性を有し、例えば、それらは異なる組織に優先的に感染する。いくつかの実施形態では、AAV構築物は、自己相補的AAV構築物である。
本開示は、とりわけ、AAVベースの構築物を作製する方法を提供する。いくつかの実施形態では、そのような方法は、宿主細胞の使用を含む。いくつかの実施形態では、宿主細胞は、哺乳類細胞である。宿主細胞は、AAVヘルパー構築物、AAVミニ遺伝子プラスミド、アクセサリー機能構築物、及び/または組換えAAVの産生に関連する他のトランスファーDNAのレシピエントとして使用され得る。この用語には、トランスフェクトされた元の細胞の子孫が含まれる。したがって、本明細書で使用される「宿主細胞」は、外因性DNA配列でトランスフェクトされた細胞を指す場合がある。1つの親細胞の子孫は、天然の偶発的または意図的な変異のために、形態またはゲノムまたは全DNA補体が元の親と必ずしも完全に同一ではあり得ないことが理解される。
対象への送達に好適であるAAV粒子を生成及び単離するためのさらなる方法は、例えば、米国特許第7,790,449号;米国特許第7,282,199号;WO2003/042397;WO2005/033321、WO2006/110689;及び米国特許第7,588,772号に記載されており、これらのそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。1つのシステムでは、産生細胞株に、ITRが隣接するコード配列をコードする構築物、ならびにrep及びcapをコードする構築物(複数可)を一過性にトランスフェクトさせる。別のシステムでは、rep及びcapを安定して供給するパッケージング細胞株に、ITRが隣接するコード配列をコードする構築物を一過性にトランスフェクトさせる。これらのシステムのそれぞれで、AAV粒子は、ヘルパーアデノウイルスまたはヘルペスウイルスの感染に応答して産生され、AAV粒子は、汚染ウイルスから分離される。他のシステムでは、AAV粒子を回復するためにヘルパーウイルスに感染する必要はなく、ヘルパー機能(すなわち、アデノウイルスE1、E2a、VA、及びE4またはヘルペスウイルスUL5、UL8、UL52、及びUL29、及びヘルペスウイルスポリメラーゼ)も、システムによってトランスで供給される。このようなシステムでは、ヘルパー機能をコードする構築物を細胞に一過性にトランスフェクトすることによってヘルパー機能を供給することができるか、または、ヘルパー機能をコードする遺伝子を安定に含むように細胞を操作することができ、その発現は、転写または転写後レベルで制御され得る。
さらに別のシステムでは、ITR及びrep/cap遺伝子が隣接するコード配列が、バキュロウイルスベースの構築物による感染によって昆虫宿主細胞に導入される。このような産生システムは、当技術分野で知られている(例えば、概して、Zhang et al.,2009,Human Gene Therapy 20:922-929を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。これら及び他のAAV産生システムの作製及び使用方法はまた、米国特許第5,139,941号;同第5,741,683号;同第6,057,152号;同第6,204,059号;同第6,268,213号;同第6,491,907号;同第6,660,514号;同第6,951,753号;同第7,094,604号;同第7,172,893号;同第7,201,898号;同第7,229,823号;及び同第7,439,065号に記載されており、これらのそれぞれは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本開示は、以下の実験例を参照することによりさらに詳述される。これらの実施例は、例示の目的で提供されるに過ぎず、別段の明記がない限り、限定することを意図するものではない。したがって、本開示は、決して以下の実施例に限定されるものとして解釈されるべきでなく、むしろ、本明細書に提供される教示の結果として明白となる、ありとあらゆる変形形態を包含するように解釈されるできである。
当業者は、前述の説明及び以下の実施例、ならびに当技術分野で知られていることを使用して、本開示の技術を作成及び利用できると考えられる。
実施例1:ウイルス構築物の構築
この実施例は、本明細書に記載のウイルス構築物の生成についての説明を提供する。組換えAAV(rAAV)粒子を、Xiao et al.J.Virol.73(5):3994-4003,1999(その全体が参照により本明細書に組み込まれる)により使用されるようなアデノウイルス不含法(adenovirus-free method)を用いたトランスフェクションにより生成した。AAV ITRを含むcisプラスミド、AAV Rep及びCap遺伝子を含むtransプラスミド、及びアデノウイルスゲノムの必須領域を含むヘルパープラスミドを、HEK293細胞に同時トランスフェクトした。rAAV構築物は、記載されている構築物を使用して、1つの構築物戦略の下でヒトクラリン1を発現した。AAV Anc80キャプシドは、独自のrAAVクラリン1タンパク質をコードする構築物をカプセル化するために調製された。
当業者は、この実施例に従って同様の構築物を作成できることを容易に理解するであろう。例えば、哺乳動物、霊長類、またはヒトのクラリン1を1つ、二重、または複数の構築物戦略の下で発現するrAAV構築物を生成することができる。AAV血清型1、2、3、4、5、6、7、8、9、rh8、rh10、rh39、rh43、及びAnc80は、各々、以下を試験するために、4組のクラリン1構築物をカプセル化するように調整され得る:(i)コンカテマー化トランスプライシング戦略、(ii)ハイブリッドイントロン-相同組換え-トランスプライシング戦略、(iii)エクソン相同組換え戦略、(Pryadkina et al.,Meth.Clin.Devel.2:15009,2015によってまとめられているとおり、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)、(iv)1つの構築物戦略。
実施例2:ウイルスの産生及び精製
マルチレベル細胞工場で成長させたHEK293細胞の一過性トランスフェクションにより、デュアルAAVベクターを作製した。細胞は、血清型6キャプシドタンパク質をコードするウイルス産生のためのヘルパープラスミドで共形質導入された。細胞ライセートの精製は、イオジキサノール密度勾配超遠心法によって行い、その後FPLCアフィニティークロマトグラフィーによる2回目の精製及び濃縮ステップを行った(例えば、Asai et al.2015)Nat.Neurosci.18 1584-1593;及び Tereshchenko et al.2014 Neurobiol.Dis.65 35-42を参照;そのそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。トランススプライシングアプローチでは、5’ベクターは、約2.8x10形質導入ユニット/μLの濃度を達成した。3’ベクターは、約1.4x10形質導入単位/μLに達した。ハイブリッドアプローチでは、両方のウイルスを同じ溶液で同時に精製し、わずかに高いウイルス力価に達した。
実施例3:ウイルス粒子の生成及び精製
この実施例では、ウイルス構築物の精製について説明する。組換えAAV(rAAV)は、Pryadkina et al.,Mol.Ther.2:15009,2015(その全体が参照により本明細書に組み込まれる)により記載されているとおり、標準トリプルトランスフェクションプロトコールを使用して生産し、(例えば、2回の連続塩化セシウム(CsCl)密度勾配によって)精製した。2回目の遠心分離終了時に、CsCl密度勾配管から11の500μL画分を回収し、1xPBS中での透析により精製した。画分をドットブロットによって分析して、rAAVゲノムを含有する画分を決定した。各調製物のウイルスゲノム数(vg)を、AAV構築物ゲノムのITR領域に対応するプライマー及びプローブを用いて、定量的リアルタイムPCRベースの力価測定法によって決定した(例えば、Bartoli et al.Gene.Ther.13:20-28,2006を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。当業者は、この実施例に従って代替の産生及び/または精製プロセスを実施できることを容易に理解するであろう。例えば、rAAV粒子は、当技術分野で知られている様々なカラムクロマトグラフィー法を使用して精製することができ、及び/またはウイルスゲノムは、代替プライマーセットを使用して定量化することができる。
実施例4:ウイルス粒子の製剤化
この実施例は、rAAV粒子及び生理学的に許容される溶液を含む組成物の調製に関する。rAAVを産生し、力価4.4512vg/mLまで精製し、次に、生理学的に許容される溶液で6x10、1.3x10、1.8x10、4.5x10、及び1.3x1010vg/mLの希釈で調製した(例えば、8.10mMのリン酸二ナトリウム、1.5mMのリン酸一カリウム、2.7mMの塩化カリウム、172mMの塩化ナトリウム、及び0.001%のプルロン酸F68の最終濃度に調製された、プルロン酸F68を含む市販の1xPBS)。
当業者は、この実施例に従って別の製剤を調製できることを容易に理解するであろう。例えば、rAAV粒子を別の力価まで精製し、別の希釈度で調製し、別の好適な溶液に懸濁させることができる。例えば、rAAVを生成し、定量化させた力価まで精製し、生理学的に許容される溶液(例えば、NaCl、120mM;KCl、3.5mM;CaCl2、1.5mM;グルコース、5.5mM;HEPES、20mMを含む人工外リンパ、NaOHで滴定して、そのpHを7.5に調整する(総Na濃度130mM)、Chen et al.,J Controlled Rel.110:1-19,2005に記載のとおり、これは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)で適切な希釈で調製することができる。
実施例5:内耳への組成物の好適な送達のためのデバイスの説明
この実施例は、内耳へのrAAV粒子の送達に好適であるデバイスに関する。rAAV粒子を含む組成物は、蝸牛窓膜(RWM)を一貫して安全に穿通するように設計された特殊なマイクロカテーテルを使用して、対象の蝸牛に送達させる。マイクロカテーテルは、送達処置を実施する外科医が、外耳道を介して中耳腔に進入し、マイクロカテーテルの末端をRWMに接触させることができるような形状である。マイクロカテーテルの遠位端は、約10ミクロン~約1,000ミクロンの直径を有する少なくとも1つのマイクロニードルを備えてもよく、これは、記載のrAAV粒子構築物(例えば、本開示のrAAV構築物を含む)が、内耳を損傷しない速度(例えば、生理学的に許容される速度、例えばおよそ30μL/分~およそ90μL/分の速度)で、鼓室階の蝸牛外リンパに入ることができるようになるのに十分であるが、外科的修復なしで治癒するように十分に小さい穿孔をRWM内に生じさせる。マイクロニードル(複数可)に近位の、マイクロカテーテルの残りの部分には、定義された力価(例えば、およそ1x1012~5x1013vg/mL)のrAAV/人工外リンパ製剤が充填される。マイクロカテーテルの近位端は、およそ30μL~およそ100μLの精確な低容量注入を可能にするマイクロマニピュレータに連結される。
本実施例はまた、rAAV粒子を含む組成物が、蝸牛窓膜(RWM)を一貫して安全に穿通するように設計された特殊なマイクロカテーテルを使用して、対象の蝸牛に送達されることを記載しており、これは、「Devices,systems,and methods for delivering fluid to the inner ear」に記載されており、例えば、WO2021/242926を参照、その内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
実施例6:眼への組成物の好適な送達のためのデバイスの説明
また、この実施例は、眼へのrAAV粒子の送達に好適であるデバイスに関する。rAAV粒子を含む組成物は、網膜を一貫して安全に穿通するように設計された特殊なマイクロカテーテルを使用して、対象の眼に送達させる。マイクロカテーテルは、送達手順を実施する外科医が、眼に進入し、マイクロカテーテルの末端を網膜に接触させることができるような形状となっている。マイクロカテーテルの遠位端は、約10ミクロン~約1,000ミクロンの直径を有する少なくとも1つのマイクロニードルを備えてもよく、これは、記載のrAAV粒子構築物(例えば、本開示のrAAV構築物を含む)が、内耳を損傷しない速度(例えば、生理学的に許容される速度、例えばおよそ30μL/分~およそ90μL/分の速度)で、眼に入ることができるようになるのに十分であるが、外科的修復なしで治癒するように十分に小さい穿孔を網膜内に生じさせる。マイクロニードル(複数可)に近位の、マイクロカテーテルの残りの部分には、定義された力価(例えば、およそ1x1012~5x1013vg/mL)のrAAV/人工外リンパ製剤が充填される。マイクロカテーテルの近位端は、およそ30μL~およそ100μLの精確な低容量注入を可能にするマイクロマニピュレータに連結される。
とりわけ、本実施例は、顕微鏡に統合された術中光コヒーレンストモグラフィー(OCT)を使用して、ウイルス注射前に小さなプレブレブを作製し、RPE下または脈絡膜上注射を回避することを記載している。まず、フィネスループを使用して硝子体を染色及び除去し、柔らかいシリコンチップで持ち上げる。次に、平衡塩溶液を網膜下腔に注射し、OCTスキャンを行って中心窩の菲薄化を確認する。ブレブが作成されると、25ゲージのノーデュエルボアカニューレを使用してvoretigeneを導入する。その後、過度の伸展及び黄斑円孔の形成を避けるために、中心窩を注意深く監視する必要がある。強膜のへこみは、周辺の破損を除外するために使用できる。最後に、空気流体交換を使用してウイルスを除去する。例えば、「OCT-Assisted Delivery of Luxturna」 by Ninel Z Gregori and Janet Louise David,https://www.aao.org/clinical-video/oct-assisted-delivery-of-luxturna(July 19,2018)を参照、これらの内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
別の例として、Orbit(商標)網膜下送達システム(Orbit SDS)(Gyroscope Therapeutics)は、記載の組成物を眼に投与または導入するのに使用することができる(「Orbit Subretinal Delivery System Instructions for Use June 2020」,https://www.orbitsds.com/wp-content/uploads/2020/08/AW1009028-Rev.-D-US-IFU-No-Cut-Lines.pdfを参照、その内容全体が参照により本明細書に組み込まれる)。要約すると、最初に、デバイスを配置するために眼の部位の準備を行う。次に、ブレードを使用して強膜切開を作出し、脈絡膜を露出させる。切開は、脈絡膜に隣接して約3mm長であり得る。次に、組成物を眼に流す針を前進させるためにデバイスを配置する。フレキシブルカニューレは、鉗子を使用して眼に挿入する。挿入前に、網膜下送達デバイス本体を眼に対してスライドさせて、余分なたるみを与え、眼の曲率への接線経路を維持する。有溝鉗子(toothed forceps)で強膜切開の後唇の中心を把持し、眼から引き離しながら、フレキシブルカニューレを強膜切開点に挿入し、遠位先端から5mmにある最初のハッシュマークまで前進させて、停止させる。
実施例7:細胞株から産生させたCLRN1タンパク質の発現
この実施例は、例示的な構築物の形質導入及び/またはトランスフェクション、及び本明細書に記載の例示的なタンパク質の発現に関する。
本明細書に記載のとおり、細胞株(例えば、HEK239FT)に2種類の例示的なrAAV Anc80-CLRN1粒子(rAAV Anc80-CLRN1wt粒子及びrAAV Anc80-CLRN1コドン最適化粒子)を形質導入した。トランスフェクションイベントでは、HEK293FT細胞を24ウェルプレート形式、培養量500μL、1.5E5細胞/ウェルで一晩、播種した。およそ800ngのCLRN1構築物(実施例1に記載)を、ジェットプライムトランスフェクション試薬(Polyplus-transfection(登録商標)SA)を使用して細胞にトランスフェクトした。形質導入イベントでは、HEK293FT細胞を、それぞれ6.7x10、1.3x10、または2.3x10のMOIで培地に添加した(示すとおりPNGase F処理により)2μMエトポシド(Fisher Scientific 34120525MG)、例示的なrAAV Anc80-CLRN1粒子(実施例1に記載)の存在下で、培養量50μLの96ウェルプレート形式で4x10細胞/ウェルで6時間播種した。形質導入細胞については、各サンプルの処置後72時間で上清を回収した。タンパク質発現分析のために、30μLのサンプルを4~12%Bis-Trisタンパク質ゲルの個々のウェルにロードし、当技術分野で知られている標準的なウエスタンブロッティング処置を実施した。一次検出プローブとして試験抗CLRN1抗体(CLRN1ポリクローナルAb Thermofisher AB2042)、及び二次検出プローブとして抗ヒトIgGを用いて、蛍光リーダーを使用して、バンディングパターンを判定した(図17参照)。グリコシル化CLRN1アイソフォームA及び脱グリコシル化CLRN1アイソフォームAのバンドを示す(図17を参照)。
実施例8:CLRN1タンパク質産生のex-vivo実証
この例は、in-vitroまたはex-vivoで成長させた哺乳動物の蝸牛外植片においてCLRN1タンパク質を発現するrAAV構築物の導入及び発現分析に関する。蝸牛外植片培養モデルは、蝸牛の感覚有毛細胞及び非感覚支持細胞の形態及び分子特性を模倣する信頼性の高い実験システムを提供し、in-vivoで見られる固有の細胞環境内でのrAAV粒子の伝達及び発現を調べることができる。
構築物rAAV-CLRN1(実施例1に記載)を含むrAAV(例えば、rAAV Anc80)粒子によって形質導入されたWT新生児マウス蝸牛外植片からのCLRN1タンパク質発現のex vivo評価が、本明細書に記載される。これらの実験では、コルチ器が解剖され、カバーガラス上に置かれ、その後、ビヒクルまたは様々な範囲の用量のrAAV粒子で3~4日間インキュベートした。例えば、rAAV Anc80-CLRN1粒子は、1.0x1010vg/外植片または3.0x1010vg/外植片で形質導入させた。
外植片を採取し、GAPDH(ハウスキーピング対照)及びCLRN1タンパク質コードヌクレオチド(CLRN1をコードするmRNA産物)のTaqmanプライマープローブを用いた定量的リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応(qRT-PCR)を使用するリボ核酸(RNA)発現分析のために溶解させた(図18A)。
CLRN1 RNAは、rAAV Anc80-CLRN1粒子を受けた外植片では検出されたが、モックでは検出されなかった(図18A)。これらのデータは、CLRN1タンパク質をコードする構築物を含むrAAV Anc80-CLRN1粒子をex-vivoにおいてWTマウス蝸牛に投与することにより、形質導入細胞からヒトCLRN1 RNAが発現することを示唆している。図18Bは、外植片におけるCLRN1タンパク質の発現を示す蛍光画像を示す。
例示的な実施形態
実施形態1.プロモーターに作動可能に連結されたコード配列を含む構築物であって、前記コード配列が、クラリン1タンパク質をコードする、前記構築物。
実施形態2.前記コード配列が、CLRN1遺伝子である、実施形態1に記載の構築物。
実施形態3.前記CLRN1遺伝子が、霊長類CLRN1遺伝子である、実施形態2に記載の構築物。
実施形態4.前記CLRN1遺伝子が、ヒトCLRN1遺伝子である、実施形態2または3に記載の構築物。
実施形態5.前記ヒトCLRN1遺伝子が、配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、または配列番号19による核酸配列を含む、実施形態4に記載の構築物。
実施形態6.前記ヒトCLRN1遺伝子が、配列番号1による核酸配列を含む、実施形態4または5に記載の構築物。
実施形態7.前記ヒトCLRN1遺伝子が、配列番号19による核酸配列を含む、実施形態4または5に記載の構築物。
実施形態8前記クラリン1タンパク質が、霊長類クラリン1タンパク質である、実施形態1に記載の構築物。
実施形態9.前記クラリン1タンパク質が、ヒトクラリン1タンパク質である、実施形態1または8に記載の構築物。
実施形態10.前記クラリン1タンパク質が、配列番号10によるアミノ酸配列を含む、実施形態9に記載の構築物。
実施形態11.前記プロモーターが、誘導性プロモーター、構成的プロモーター、または組織特異的プロモーターである、請求項1~10のいずれか1項に記載の構築物。
実施形態12.前記プロモーターが、内耳細胞特異的プロモーターである、実施形態1~11のいずれか1項に記載の構築物。
実施形態13.前記内耳細胞特異的プロモーターが、GJB2プロモーター、GJB6プロモーター、CLRN1プロモーター、TECTAプロモーター、DFNA5プロモーター、COCHプロモーター、NDPプロモーター、SYN1プロモーター、GFAPプロモーター、PLPプロモーター、TAK1プロモーター、SOX21プロモーター、SOX2プロモーター、FGFR3プロモーター、PROX1プロモーター、GLAST1プロモーター、LGR5プロモーター、HES1プロモーター、HES5プロモーター、NOTCH1プロモーター、JAG1プロモーター、CDKN1Aプロモーター、CDKN1Bプロモーター、SOX10プロモーター、P75プロモーター、CD44プロモーター、HEY2プロモーター、LFNGプロモーター、またはS100bプロモーターである、実施形態12に記載の構築物。
実施形態14.前記プロモーターが、眼細胞特異的プロモーターである、実施形態1~11のいずれか1項に記載の構築物。
実施形態15.前記眼細胞特異的プロモーターが、CLRN1プロモーター、RPE65プロモーター、RLBP1プロモーター、VMD2プロモーター、IRBPプロモーター、GNAT2プロモーター、PR1.7プロモーター、PR2.1プロモーター、HB569プロモーター、CARプロモーター、GRK1プロモーター、RKプロモーター、B-PDEプロモーター、GRM6プロモーター、Nefhプロモーター、Tyh1プロモーター、SYNプロモーター、GFAPプロモーター、または他のオプシンもしくはロドプシンプロモーターである、実施形態14に記載の構築物。
実施形態16.前記プロモーターが、CAGプロモーター、CBAプロモーター、CMVプロモーター、またはCB7プロモーターである、実施形態1~15のいずれか1項に記載の構築物。
実施形態17.前記プロモーターが、配列番号23による核酸配列を含む、実施形態12または14に記載の構築物。
実施形態18.ポリアデニル化配列をさらに含む、実施形態1~17のいずれか1項に記載の構築物。
実施形態19.前記ポリアデニル化配列が、ATTAAA、AGTAAA、CATAAA、TATAAA、GATAAA、ACTAAA、AATATA、AAGAAA、AATAAT、AAAAAA、AATGAA、AATCAA、AACAAA、AATCAA、AATAAC、AATAGA、AATTAA、またはAATAAGである、実施形態18に記載の構築物。
実施形態20.前記ポリアデニル化配列が、配列番号44または配列番号45による配列を含む、実施形態18に記載の構築物。
実施形態21.前記ポリアデニル化配列が、配列番号44による配列を含む、実施形態18に記載の構築物。
実施形態22.2つのAAV逆方向末端反復(ITR)をさらに含み、前記2つのAAV ITRが、前記コード配列及びプロモーターに隣接する、実施形態1~21のいずれか1項に記載の構築物。
実施形態23.前記2つのAAV ITRが、AAV2 ITRであるか、またはAAV2 ITRに由来する、実施形態22に記載の構築物。
実施形態24.前記2つのAAV ITRが、
配列番号21による核酸配列を含む5’ITR及び配列番号22による核酸配列を含む3’ITRを含む、実施形態22に記載の構築物。
実施形態25.前記構築物が、配列番号64による核酸配列を含む、実施形態1に記載の構築物。
実施形態26.前記構築物が、配列番号68による核酸配列を含む、実施形態1に記載の構築物。
実施形態27.実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物を含むAAV粒子。
実施形態28.AAVキャプシドをさらに含み、前記AAVキャプシドが、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV-rh8、AAV-rh10、AAV-rh39、AAV-rh43またはAAV Anc80キャプシドであるか、これらに由来する、実施形態27に記載のAAV粒子。
実施形態29.前記AAVキャプシドが、AAV Anc80キャプシドである、実施形態28に記載のAAV粒子。
実施形態30.実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物を含む組成物。
実施形態31.実施形態27~29のいずれか1項に記載のAAV粒子を含む組成物。
実施形態32.前記組成物が、医薬組成物である、実施形態30または31に記載の組成物。
実施形態33.薬学的に許容される担体をさらに含む、実施形態32に記載の組成物。
実施形態34.実施形態30または31のいずれか1項に記載の組成物を含むex vivo細胞。
実施形態35.ex vivo細胞に、
(i)実施形態22~26のいずれか1項に記載の構築物と、
(ii)AAV Rep遺伝子、AAV Cap遺伝子、AAV VA遺伝子、AAV E2a遺伝子、及びAAV E4遺伝子を集合的に含む1つ以上のヘルパープラスミドと、
をトランスフェクトすることを含む方法。
実施形態36.実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載の粒子、または実施形態32もしくは33に記載の組成物を対象の内耳に導入することを含む、方法。
実施形態37.実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載の粒子、または実施形態32もしくは33に記載の組成物を対象の内耳に導入することを含む、治療する方法。
実施形態38.アッシャー症候群III型を治療する方法であって、
実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載の粒子、または実施形態32もしくは33に記載の組成物を対象の内耳に導入することを含む、前記方法。
実施形態39.難聴を治療する方法であって、
実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載の粒子、または実施形態32もしくは33に記載の組成物を対象の内耳に導入することを含む、前記方法。
実施形態40.重度難聴を治療する方法であって、
実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載の粒子、または実施形態32もしくは33に記載の組成物を対象の内耳に導入することを含む、前記方法。
実施形態41.実施形態32または33の組成物が、前記対象の蝸牛に導入される、実施形態36~40のいずれか1項に記載の方法。
実施形態42.実施形態32または33の組成物が蝸牛窓膜注射によって導入される、実施形態36~41のいずれか1項に記載の方法。
実施形態43.前記対象の聴力レベルを測定することをさらに含む、実施形態36~42のいずれか1項に記載の方法。
実施形態44.聴力レベルが、聴性脳幹反応(ABR)試験を実施することによって測定される、実施形態43に記載の方法。
実施形態45.前記対象の前記聴力レベルを参照聴力レベルと比較することをさらに含む、実施形態43または44に記載の方法。
実施形態46.前記参照聴力レベルは、公表されたかまたは過去の参照聴力レベルである、実施形態45に記載の方法。
実施形態47.前記対象の前記聴力レベルが、実施形態32または33に記載の組成物が導入された後に測定され、前記参照聴力レベルが、実施形態32または33に記載の組成物が導入される前に測定された前記対象の聴力レベルである、実施形態45に記載の方法。
実施形態48.前記対象中のクラリン1タンパク質のレベルを測定することをさらに含む、実施形態36~47のいずれか1項に記載の方法。
実施形態49.前記クラリン1タンパク質のレベルが、前記対象の前記内耳で測定される、実施形態48に記載の方法。
実施形態50.前記クラリン1タンパク質のレベルが、前記対象の前記蝸牛で測定される、実施形態48または49に記載の方法。
51.前記対象における前記クラリン1タンパク質のレベルを参照クラリン1タンパク質レベルと比較することをさらに含む、実施形態48~50のいずれか1項に記載の方法。
実施形態52.前記参照聴力レベルは、公表されたかまたは過去の参照クラリン1タンパク質レベルである、実施形態49に記載の方法。
実施形態53.前記対象中の前記クラリン1タンパク質レベルが、実施形態32または33に記載の組成物が導入された後に測定され、前記参照クラリン1タンパク質レベルが、実施形態32または33に記載の組成物が導入される前に測定された前記対象のクラリン1タンパク質レベルである、実施形態45に記載の方法。
実施形態54.実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載の粒子、または実施形態32もしくは33に記載の組成物を対象の眼に導入することを含む、方法。
実施形態55.実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載の粒子、または実施形態32もしくは33に記載の組成物を対象の眼に導入することを含む、治療する方法。
実施形態56.アッシャー症候群III型を治療する方法であって、
実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載の粒子、または実施形態32もしくは33に記載の組成物を対象の眼に導入することを含む、前記方法。
実施形態57.視力低下を治療する方法であって、
実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載の粒子、または実施形態32もしくは33に記載の組成物を対象の眼に導入することを含む、前記方法。
実施形態58.網膜色素変性症を治療する方法であって、
実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載の粒子、または実施形態32もしくは33に記載の組成物を対象の眼に導入することを含む、前記方法。
実施形態59.実施形態32または33の組成物が眼注射によって導入される、実施形態54~59のいずれか1項に記載の方法。
実施形態60.前記対象の視力レベルを測定することをさらに含む、実施形態54~59のいずれか1項に記載の方法。
実施形態61.聴力レベルが、視力検査を実施することによって測定される、実施形態60に記載の方法。
実施形態62.前記対象の前記視力レベルを参照視力レベルと比較することをさらに含む、実施形態60または61に記載の方法。
実施形態63.前記参照視力レベルは、公表されたかまたは過去の参照視力レベルである、実施形態62に記載の方法。
実施形態64.前記対象の前記視力レベルが、実施形態32または33に記載の組成物が導入された後に測定され、前記参照視力レベルが、実施形態32または33に記載の組成物が導入される前に測定された前記対象の視力レベルである、実施形態62に記載の方法。
実施形態65.前記対象中のクラリン1タンパク質レベルを測定することをさらに含む、実施形態54~64のいずれか1項に記載の方法。
実施形態66.前記クラリン1タンパク質のレベルが、前記対象の前記眼で測定される、実施形態65に記載の方法。
実施形態67.前記対象における前記クラリン1タンパク質のレベルを参照クラリン1タンパク質レベルと比較することをさらに含む、実施形態65または66に記載の方法。
実施形態68.前記参照視力レベルは、公表されたかまたは過去の参照クラリン1タンパク質レベルである、実施形態67に記載の方法。
実施形態69.前記対象中の前記クラリン1タンパク質レベルが、実施形態32または33に記載の組成物が導入された後に測定され、前記参照クラリン1タンパク質レベルが、実施形態32または33に記載の組成物が導入される前に測定された前記対象のクラリン1タンパク質レベルである、実施形態68に記載の方法。
実施形態70.難聴に罹患しているか、またはそのリスクのある対象における難聴の治療のための実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載のAAV粒子、または実施形態30~33のいずれか1項に記載の組成物の使用。
実施形態71.難聴の治療のための医薬品の製造における、実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載のAAV粒子、または実施形態30~33のいずれか1項に記載の組成物の使用。
実施形態72.視力低下に罹患しているか、またはそのリスクのある対象における視力低下の治療のための実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載のAAV粒子、または実施形態30~33のいずれか1項に記載の組成物の使用。
実施形態73.視力低下の治療のための医薬品の製造における、実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載のAAV粒子、または実施形態30~33のいずれか1項に記載の組成物の使用。
実施形態74.アッシャー症候群III型に罹患しているか、またはそのリスクのある対象におけるアッシャー症候群III型の治療のための実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載のAAV粒子、または実施形態30~33のいずれか1項に記載の組成物の使用。
実施形態75.網膜色素変性症に罹患しているか、またはそのリスクのある対象における網膜色素変性症の治療のための実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載のAAV粒子、または実施形態30~33のいずれか1項に記載の組成物の使用。
実施形態76.アッシャー症候群III型の治療のための医薬品の製造における、実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載のAAV粒子、または実施形態30~33のいずれか1項に記載の組成物の使用。
実施形態77.網膜色素変性症の治療のための医薬品の製造における、実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載のAAV粒子、または実施形態30~33のいずれか1項に記載の組成物の使用。
実施形態78.医薬品としての使用するため実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載のAAV粒子、または実施形態30~33のいずれか1項に記載の組成物。
実施形態79.難聴の治療において使用するための、実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載のAAV粒子、または実施形態30~33のいずれか1項に記載の組成物。
実施形態80.視力低下の治療において使用するための、実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載のAAV粒子、または実施形態30~33のいずれか1項に記載の組成物。
実施形態81.アッシャー症候群III型の治療において使用するための、実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載のAAV粒子、または実施形態30~33のいずれか1項に記載の組成物。
実施形態82.網膜色素変性症の治療において使用するための、実施形態1~26のいずれか1項に記載の構築物、実施形態27~29のいずれか1項に記載のAAV粒子、または実施形態30~33のいずれか1項に記載の組成物。
実施形態83.実施形態30~33のいずれか1項に記載の組成物を含むキット。
実施形態84.前記組成物がデバイス中に予め装填されている、実施形態83に記載のキット。
実施形態85.前記デバイスが、マイクロカテーテルである、実施形態84に記載のキット。
実施形態86.前記マイクロカテーテルが、外耳道を介して中耳腔に進入し、前記マイクロカテーテルの末端をRWMに接触させることができるような形状となっている、実施形態85に記載のキット。
実施形態87.前記マイクロカテーテルの遠位端が、10~1,000ミクロンの直径を有する少なくとも1つのマイクロニードルから構成される、実施形態85または86に記載のキット。
実施形態88.デバイスをさらに含む、実施形態83~87のいずれか1項に記載のキット。
実施形態89.前記デバイスが、図21~24に記載のデバイスであるか、またはWO2021/242926に記載のデバイスである、実施形態88に記載のキット。
実施形態90.前記デバイスが、曲げ部分及び傾斜先端を含む針を含む、実施形態89に記載のキット。

Claims (38)

  1. プロモーターに作動可能に連結されたコード配列を含む構築物であって、前記コード配列が、クラリン1タンパク質をコードする、前記構築物。
  2. 前記コード配列が、CLRN1遺伝子である、請求項1に記載の構築物。
  3. 前記CLRN1遺伝子が、ヒトCLRN1遺伝子である、請求項2に記載の構築物。
  4. 前記クラリン1タンパク質が、ヒトクラリン1タンパク質である、請求項1~3のいずれか1項に記載の構築物。
  5. 前記プロモーターが、誘導性プロモーター、構成的プロモーター、または組織特異的プロモーターである、請求項1~4のいずれか1項に記載の構築物。
  6. 前記プロモーターが、内耳細胞特異的プロモーターであり、前記内耳細胞特異的プロモーターが、GJB2プロモーター、GJB6プロモーター、CLRN1プロモーター、TECTAプロモーター、DFNA5プロモーター、COCHプロモーター、NDPプロモーター、SYN1プロモーター、GFAPプロモーター、PLPプロモーター、TAK1プロモーター、SOX21プロモーター、SOX2プロモーター、FGFR3プロモーター、PROX1プロモーター、GLAST1プロモーター、LGR5プロモーター、HES1プロモーター、HES5プロモーター、NOTCH1プロモーター、JAG1プロモーター、CDKN1Aプロモーター、CDKN1Bプロモーター、SOX10プロモーター、P75プロモーター、CD44プロモーター、HEY2プロモーター、LFNGプロモーター、またはS100bプロモーターであってもよい、請求項1~5のいずれか1項に記載の構築物。
  7. 前記プロモーターが、眼細胞特異的プロモーターであり、前記眼細胞特異的プロモーターが、CLRN1プロモーター、RPE65プロモーター、RLBP1プロモーター、VMD2プロモーター、IRBPプロモーター、GNAT2プロモーター、PR1.7プロモーター、PR2.1プロモーター、HB569プロモーター、CARプロモーター、GRK1プロモーター、RKプロモーター、B-PDEプロモーター、GRM6プロモーター、Nefhプロモーター、Tyh1プロモーター、SYNプロモーター、GFAPプロモーター、または他のオプシンもしくはロドプシンプロモーターであってもよい、請求項1~5のいずれか1項に記載の構築物。
  8. 前記プロモーターが、CAGプロモーター、CBAプロモーター、CMVプロモーター、またはCB7プロモーターである、請求項1~5のいずれか1項に記載の構築物。
  9. ポリアデニル化配列をさらに含む、請求項1~8のいずれか1項に記載の構築物。
  10. 2つのAAV逆方向末端反復(ITR)をさらに含み、前記2つのAAV ITRが、前記コード配列及びプロモーターに隣接する、請求項1~9のいずれか1項に記載の構築物。
  11. 前記構築物が、配列番号64または68による核酸配列を含む、請求項1に記載の構築物。
  12. 請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物を含むAAV粒子。
  13. AAVキャプシドをさらに含み、前記AAVキャプシドが、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV-rh8、AAV-rh10、AAV-rh39、AAV-rh43またはAAV Anc80キャプシドであるか、これらに由来する、請求項12に記載のAAV粒子。
  14. 請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物または請求項12もしくは13に記載のAAV粒子を含む、組成物。
  15. 前記組成物が、医薬組成物である、請求項14に記載の組成物。
  16. 請求項14または15のいずれか1項に記載の組成物を含むex vivo細胞。
  17. ex vivo細胞に、
    (i)請求項10または11に記載の構築物と、
    (ii)AAV Rep遺伝子、AAV Cap遺伝子、AAV VA遺伝子、AAV E2a遺伝子、及びAAV E4遺伝子を集合的に含む1つ以上のヘルパープラスミドと、
    をトランスフェクトすることを含む方法。
  18. 請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物を対象の内耳または眼に導入することを含む、方法。
  19. 請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物を対象の内耳または眼に導入することを含む、治療する方法。
  20. アッシャー症候群III型を治療する方法であって、
    請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物を対象の内耳または眼に導入することを含む、前記方法。
  21. 難聴を治療する方法であって、
    請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物を対象の内耳に導入することを含む、前記方法。
  22. 重度難聴を治療する方法であって、
    請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物を対象の内耳に導入することを含む、前記方法。
  23. 視力低下を治療する方法であって、
    請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物を対象の眼に導入することを含む、前記方法。
  24. 網膜色素変性症を治療する方法であって、
    請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物を対象の眼に導入することを含む、前記方法。
  25. 難聴に罹患しているか、またはそのリスクのある対象における難聴の治療のための請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物の使用。
  26. 難聴の治療のための医薬品の製造における、請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物の使用。
  27. 視力低下に罹患しているか、またはそのリスクのある対象における視力低下の治療のための請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物の使用。
  28. 視力低下の治療のための医薬品の製造における、請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物の使用。
  29. アッシャー症候群III型に罹患しているか、またはそのリスクのある対象におけるアッシャー症候群III型の治療の請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物の使用。
  30. アッシャー症候群III型の治療のための医薬品の製造における、請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物の使用。
  31. 網膜色素変性症に罹患しているか、またはそのリスクのある対象において、網膜色素変性症を治療するための請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物の使用。
  32. 網膜色素変性症を治療するための医薬品の製造における、請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物の使用。
  33. 医薬品として用いられる請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物。
  34. 難聴の治療に用いられる、請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物。
  35. 視力低下の治療に用いられる請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物。
  36. アッシャー症候群III型の治療に用いられる、請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物。
  37. 網膜色素変性症の治療に用いられる、請求項1~11のいずれか1項に記載の構築物、請求項12もしくは13に記載のAAV粒子、または請求項14もしくは15に記載の組成物。
  38. 請求項14または15に記載の組成物を含むキット。
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0173552B1 (en) 1984-08-24 1991-10-09 The Upjohn Company Recombinant dna compounds and the expression of polypeptides such as tpa
US5168062A (en) 1985-01-30 1992-12-01 University Of Iowa Research Foundation Transfer vectors and microorganisms containing human cytomegalovirus immediate-early promoter-regulatory DNA sequence
US4797368A (en) 1985-03-15 1989-01-10 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Adeno-associated virus as eukaryotic expression vector
US5139941A (en) 1985-10-31 1992-08-18 University Of Florida Research Foundation, Inc. AAV transduction vectors
US5436146A (en) 1989-09-07 1995-07-25 The Trustees Of Princeton University Helper-free stocks of recombinant adeno-associated virus vectors
US6268213B1 (en) 1992-06-03 2001-07-31 Richard Jude Samulski Adeno-associated virus vector and cis-acting regulatory and promoter elements capable of expressing at least one gene and method of using same for gene therapy
US5478745A (en) 1992-12-04 1995-12-26 University Of Pittsburgh Recombinant viral vector system
US5869305A (en) 1992-12-04 1999-02-09 The University Of Pittsburgh Recombinant viral vector system
US6204059B1 (en) 1994-06-30 2001-03-20 University Of Pittsburgh AAV capsid vehicles for molecular transfer
US6093570A (en) 1995-06-07 2000-07-25 The University Of North Carolina At Chapel Hill Helper virus-free AAV production
US5741683A (en) 1995-06-07 1998-04-21 The Research Foundation Of State University Of New York In vitro packaging of adeno-associated virus DNA
US6001650A (en) 1995-08-03 1999-12-14 Avigen, Inc. High-efficiency wild-type-free AAV helper functions
JP2001500015A (ja) 1996-09-06 2001-01-09 トラステイーズ・オブ・ザ・ユニバーシテイ・オブ・ペンシルベニア T7ポリメラーゼを利用する組換えアデノ随伴ウイルスの誘導可能な製造方法
US6548286B1 (en) 1997-04-14 2003-04-15 Cell Genesys, Inc. Methods for increasing the efficiency of recombinant AAV product
US6156303A (en) 1997-06-11 2000-12-05 University Of Washington Adeno-associated virus (AAV) isolates and AAV vectors derived therefrom
EP1080218A1 (en) 1998-05-27 2001-03-07 University of Florida Method of preparing recombinant adeno-associated virus compositions by using an iodixanol gradient
US6491907B1 (en) 1998-11-10 2002-12-10 The University Of North Carolina At Chapel Hill Recombinant parvovirus vectors and method of making
WO2001091803A2 (en) 2000-06-01 2001-12-06 University Of North Carolina At Chapel Hill Methods and compounds for controlled release of recombinant parvovirus vectors
EP1399183B1 (en) 2001-05-31 2010-06-30 Novartis Vaccines and Diagnostics, Inc. Chimeric alphavirus replicon particles
EP1432791B2 (en) 2001-09-06 2013-10-23 Alphavax, Inc. Alphavirus replicon vector systems
ATE520707T1 (de) 2001-11-13 2011-09-15 Univ Pennsylvania Verfahren für den nachweis und/oder die identifikation von sequenzen des adeno- assoziierten virus (aav) sowie isolation von dadurch identifizierten, neuen sequenzen
EP2359869B1 (en) 2001-12-17 2018-12-26 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Adeno-associated virus (AAV) serotype 8 sequences, vectors containing same and uses therefor
AU2003274397A1 (en) 2002-06-05 2003-12-22 University Of Florida Production of pseudotyped recombinant aav virions
EP2298926A1 (en) 2003-09-30 2011-03-23 The Trustees of The University of Pennsylvania Adeno-associated virus (AAV) clades, sequences, vectors containing same, and uses thereof
WO2005073384A2 (en) 2004-01-28 2005-08-11 Research Development Foundation Human soluble neuropilin-1 primary polyadenylation signal and uses thereof
WO2006012414A2 (en) 2004-07-20 2006-02-02 Critical Therapeutics, Inc. Novel polyadenylation signal for use in expression vectors
EP3409296A1 (en) 2005-04-07 2018-12-05 The Trustees of the University of Pennsylvania Method of increasing the function of an aav vector
WO2007120542A2 (en) 2006-03-30 2007-10-25 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Aav capsid library and aav capsid proteins
US9506041B2 (en) 2012-03-26 2016-11-29 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Dept. Of Health And Human Services Delivery of packaged RNA to mammalian cells
GB201518979D0 (en) 2015-10-27 2015-12-09 Univ Leuven Kath Treatment of hepatic steatosis related oligo-ovulation
EP3474941A1 (en) 2016-06-22 2019-05-01 The Charles Stark Draper Laboratory, Inc. A system for inner ear drug delivery via trans-round window membrane injection
CN110225975A (zh) 2016-08-23 2019-09-10 阿库斯股份有限公司 用于治疗人受试者中非年龄相关的听力损害的组合物和方法
WO2019084145A1 (en) 2017-10-25 2019-05-02 The Charles Stark Draper Laboratory Inc. APPARATUS AND METHOD FOR DRUG DELIVERY ACROSS THE ROUND WINDOW MEMBRANE
CA3091676A1 (en) 2018-02-22 2019-08-29 Akouos, Inc. Compositions and methods for treating non-age-associated hearing impairment in a human subject
WO2019200016A1 (en) * 2018-04-10 2019-10-17 President And Fellows Of Harvard College Aav vectors encoding clarin-1 or gjb2 and uses thereof
EP3880826A4 (en) 2018-11-07 2022-08-24 Akouos, Inc. USE OF ADENO-ASSOCIATED VIRAL VECTORS TO CORRECT GENE DEFECTS/EXPRESS PROTEINS IN CILIATE AND SUPPORTING CELLS IN THE INNER EAR
BR112022023974A2 (pt) 2020-05-27 2022-12-20 Akouos Inc Dispositivos, sistemas e métodos para entregar fluido para o ouvido interno

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