JP2023546369A - N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)から誘導された化合物およびオリゴヌクレオチド - Google Patents
N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)から誘導された化合物およびオリゴヌクレオチド Download PDFInfo
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Abstract
N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)から誘導された化合物、修飾オリゴヌクレオチド、ならびにタンパク質機能を調節する方法、ならびに被験体における疾患、障害、および症状を処置する方法が、本明細書中に提供される。本発明は、化合物、例えば本明細書中に記載されるもののいずれか、修飾オリゴヌクレオチド、ならびにタンパク質機能を調節する方法、ならびに被験体における疾患、障害、および症状を標的化する方法に関する。これらの方法は、本明細書中に開示される化合物および修飾オリゴヌクレオチドを含み得る。
Description
関連出願
本願は、2021年10月1日に出願された米国仮出願第63/251,580号、2021年1月25日に出願された米国仮出願第63/141,300号、2020年12月29日に出願された米国仮出願第63/131,317号、および2020年10月9日に出願された米国仮出願第63/089,936号、ならびに2021年2月5日に出願された米国仮出願第63/146,276号、および2020年11月13日に出願された米国仮出願第63/113,801号に対する優先権を主張する。これらの米国仮出願の各々は、本明細書中に参考として援用される。
本願は、2021年10月1日に出願された米国仮出願第63/251,580号、2021年1月25日に出願された米国仮出願第63/141,300号、2020年12月29日に出願された米国仮出願第63/131,317号、および2020年10月9日に出願された米国仮出願第63/089,936号、ならびに2021年2月5日に出願された米国仮出願第63/146,276号、および2020年11月13日に出願された米国仮出願第63/113,801号に対する優先権を主張する。これらの米国仮出願の各々は、本明細書中に参考として援用される。
背景
治療、予防、または診断の用途において化合物を使用する際に、これらの化合物が特定の位置(例えば、所望の細胞(複数可))に送達されて、治療もしくは予防の効果を増強すること、または診断の目的に有利になることがしばしば望ましい。このことは、治療用化合物をインビボで送達することを試みる場合に頻繁である。さらに、化合物を特定の位置に効率的に送達することができることにより、その化合物の投与により引き起こされ得る意図されない結果(例えば、オフターゲット効果)を制限するか、または潜在的に排除することができる。治療用、予防用、または診断用の化合物などの化合物の、インビボでの所望の位置への送達を容易にするための1つのストラテジーは、この化合物を、ターゲッティングリガンドに結合または付着させることによるものである。
治療、予防、または診断の用途において化合物を使用する際に、これらの化合物が特定の位置(例えば、所望の細胞(複数可))に送達されて、治療もしくは予防の効果を増強すること、または診断の目的に有利になることがしばしば望ましい。このことは、治療用化合物をインビボで送達することを試みる場合に頻繁である。さらに、化合物を特定の位置に効率的に送達することができることにより、その化合物の投与により引き起こされ得る意図されない結果(例えば、オフターゲット効果)を制限するか、または潜在的に排除することができる。治療用、予防用、または診断用の化合物などの化合物の、インビボでの所望の位置への送達を容易にするための1つのストラテジーは、この化合物を、ターゲッティングリガンドに結合または付着させることによるものである。
ターゲッティングリガンドを使用して標的化され得る化合物の1つのクラスは、オリゴマー化合物である。標的核酸に少なくとも部分的に相補的であるヌクレオチド配列を含むオリゴマー化合物は、インビトロでとインビボでとの両方で、その標的の機能および活性を変化させることが示されている。標的核酸(例えば、mRNA)を含む細胞に送達される場合、オリゴマー化合物は、この標的の発現を調節して、この標的核酸の変化した転写または翻訳をもたらすことが示されている。特定の例において、このオリゴマー化合物は、核酸標的を阻害すること、および/またはこの標的核酸の分解を誘発することによって、その遺伝子の発現を減少させ得る。
標的核酸がmRNAである場合、発現を阻害するオリゴマー化合物がこのmRNA標的の発現を調節し得る1つの機構は、RNA干渉を介するものである。RNA干渉とは、RNAまたはRNA様分子(例えば、化学修飾されたRNA分子)が分解によって遺伝子発現をサイレンスにすることを可能にする、生物学的プロセスである。さらに、一本鎖RNA、および修飾ヌクレオチドもまた含み得、かつ1つまたはそれより多くの非ホスホジエステル結合を有し得るRNA様分子はまた、標的mRNAなどの標的核酸の発現も変化させ得る。
ターゲッティングリガンドを使用して標的化され得る化合物の別のクラスは、低分子化合物である。低分子化合物(例えば、約1000ダルトンまたはそれより小さい分子量を有する有機化合物)は、その標的に局在する場合、代表的に、この標的の機能および/または活性を変化させ、その結果、疾患および/または疾患症状が調節または改善されるか、あるいは代表的に、診断マーカーとして有用であることが示されている。化合物を特定の位置により効率的に送達することにより、この化合物の投与により引き起こされ得る望ましくない結果(例えば、オフターゲット効果)を制限するか、または潜在的に排除することができ、そして診断用化合物の改善された局在を提供することができる。
発明の簡単な要旨
本発明は、化合物(例えば、本明細書中に記載されるもののいずれか)、修飾オリゴヌクレオチド、ならびにタンパク質機能を調節する方法、ならびに被験体における疾患、障害、および症状を標的化する方法に関する。これらの方法は、本明細書中に開示される化合物および修飾オリゴヌクレオチドを含み得る。
本発明は、化合物(例えば、本明細書中に記載されるもののいずれか)、修飾オリゴヌクレオチド、ならびにタンパク質機能を調節する方法、ならびに被験体における疾患、障害、および症状を標的化する方法に関する。これらの方法は、本明細書中に開示される化合物および修飾オリゴヌクレオチドを含み得る。
好ましい可変の選択肢に関して以下で議論される本発明の実施形態は、単独で、あるいは各組み合わせが本明細書中に明示的に列挙されるかのように、1つもしくはそれより多くの実施形態または本発明の好ましい可変の選択肢と組み合わせて、採用され得ることが理解される。
1つの局面において、式(I-a)、(I-b)、(I-c)、および(I-d)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物:
が提供され、式(I-a)、(I-b)、(I-c)、および(I-d)において:
は環Aであり、ここで各環Aは独立して、必要に応じて置換されたカルボシクリル、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
は環Bであり、ここで各環Bは独立して、必要に応じて置換されたアリール、または必要に応じて置換されたヘテロアリールであり;
各nは独立して、0、1、2、3、または4であり;
各Yは独立して、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換アミノ、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
各Zは独立して、必要に応じて置換されたアルキル基、必要に応じて置換されたアルケニル基、必要に応じて置換されたアルキニル基、またはエチレングリコールであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、アルキルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
R2およびR5は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;
R3およびR6は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
各R4は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcである。
各nは独立して、0、1、2、3、または4であり;
各Yは独立して、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換アミノ、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
各Zは独立して、必要に応じて置換されたアルキル基、必要に応じて置換されたアルケニル基、必要に応じて置換されたアルキニル基、またはエチレングリコールであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、アルキルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
R2およびR5は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;
R3およびR6は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
各R4は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcである。
特定の実施形態において、この化合物は、式(I-a)の化合物である。
特定の実施形態において、この化合物は、式(I-b)の化合物である。
特定の実施形態において、この化合物は、式(I-c)の化合物である。
特定の実施形態において、この化合物は、式(I-d)の化合物である。
特定の実施形態において、R2とR3とは同じである。
特定の実施形態において、環Aは、必要に応じて置換されたカルボシクリルである。特定の実施形態において、環Aは、必要に応じて置換されたヘテロシクリルである。
特定の実施形態において、特定の実施形態において、環Bは、必要に応じて置換されたアリールである。特定の実施形態において、環Bは、必要に応じて置換されたヘテロアリールである。
別の局面において、式(II-a)、(II-b)、および(II-c)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物:
が本明細書中で提供され、式(II-a)、(II-b)、および(II-c)において:
各nは独立して、0、1、2、3、または4であり;
各Yは独立して、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
各Zは独立して、必要に応じて置換されたアルキル基、必要に応じて置換されたアルケニル基、必要に応じて置換されたアルキニル基、またはエチレングリコールであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
R5、R6、R7、およびR8は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、ウラシル、イノシン(I)、または核酸塩基改変体である。
各nは独立して、0、1、2、3、または4であり;
各Yは独立して、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
各Zは独立して、必要に応じて置換されたアルキル基、必要に応じて置換されたアルケニル基、必要に応じて置換されたアルキニル基、またはエチレングリコールであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
R5、R6、R7、およびR8は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、ウラシル、イノシン(I)、または核酸塩基改変体である。
特定の実施形態において、この化合物は、式(II-a)の化合物である。
特定の実施形態において、この化合物は、式(II-b)の化合物である。
特定の実施形態において、この化合物は、式(II-c)の化合物である。
特定の実施形態において、R5、R6、R7、およびR8のうちの3つは各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり、そして残りの1つのR5、R6、R7、またはR8は独立して、H、アルキル、アルケニル、アルキニル、ハロゲン、置換アミン、チオール、またはアミドである。特定の実施形態において、R5、R6、R7、およびR8のうちの2つは各々、同じである。特定の実施形態において、R5、R6、R7、およびR8のうちの3つは各々、同じである。特定の実施形態において、R5、R6、R7、およびR8のうちの3つは各々、同じであり、そして残りの1つのR5、R6、R7、またはR8は独立して、H、アルキル、アルケニル、アルキニル、ハロゲン、置換アミン、チオール、またはアミドである。
特定の実施形態において、R9はHである。特定の実施形態において、R9は、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、またはウラシルである。
別の局面において、式(III-a)および(III-b)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物:
が本明細書中で提供され、式(III-a)および(III-b)において:
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、アルキルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
各R2は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;
各R3は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
各R4は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc;アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcである。
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、アルキルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
各R2は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;
各R3は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
各R4は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc;アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcである。
特定の実施形態において、この化合物は、式(III-a)の化合物である。
特定の実施形態において、この化合物は、式(III-b)の化合物である。
別の局面において、式:
の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物が本明細書中で提供され、ここで:
各nは独立して、0および10を含めた整数0~10であり;
各mは独立して、0および10を含めた整数0~10であり;そして
塩基は、アデノシン、ウラシル、チミン、シトシン、イノシン、またはグアノシンである。
各nは独立して、0および10を含めた整数0~10であり;
各mは独立して、0および10を含めた整数0~10であり;そして
塩基は、アデノシン、ウラシル、チミン、シトシン、イノシン、またはグアノシンである。
別の局面において、式(IV-a)、(IV-b)、(IV-c)、および(IV-d):
の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物が本明細書中で提供され、
式(IV-a)、(IV-b)、(IV-c)、および(IV-d)において:
n1は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n2は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n3は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n4は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
各Xは独立して、H、アルキル-GalNAc、またはPEG-GalNAcであり;そして
各Yは独立して、H、アルキル-GalNAc、またはPEG-GalNAcである。
式(IV-a)、(IV-b)、(IV-c)、および(IV-d)において:
n1は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n2は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n3は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n4は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
各Xは独立して、H、アルキル-GalNAc、またはPEG-GalNAcであり;そして
各Yは独立して、H、アルキル-GalNAc、またはPEG-GalNAcである。
1つの局面において、本明細書中に開示される化合物のいずれかを含む修飾オリゴヌクレオチドが、本明細書中で提供される。特定の実施形態において、この修飾オリゴヌクレオチドは、siRNA、miRNA、ADAR動員分子、ADARターゲッティング分子、ガイドRNA、またはアンチセンス核酸を含む。いくつかの実施形態において、この修飾オリゴヌクレオチドは:(i)ヘテロシクリルが、酸素である1個のみのヘテロ原子を含む、(ii)ヘテロシクリルが、Sである少なくとも1個のヘテロ原子を含む;または(iii)ヘテロシクリルが窒素ヘテロ原子を含まない、本明細書中に開示される化合物のいずれかを含む。いくつかの実施形態において、この修飾オリゴヌクレオチドは、環Aが、シクロペンチルでも、ピロリジニルでも、ピペリジニルでも、モルホリニルでもない、本明細書中に開示される化合物のいずれかを含む。いくつかの実施形態において、この修飾オリゴヌクレオチドは:(i)ヘテロアリールが窒素ヘテロ原子を含まない;(ii)ヘテロアリールが、酸素である1個のみのヘテロ原子を含む;または(iii)ヘテロアリールが、硫黄である1個のみのヘテロ原子を含む、本明細書中に開示される化合物のいずれかを含む。いくつかの実施形態において、この修飾オリゴヌクレオチドは、環Aが、フェニルでも、ピリジニルでも、1,3-ピリミジニルでも、1,4-ピリミジニルでも、1-キノリニルでも、9H-プリニルでもない、本明細書中に開示される化合物のいずれかを含む。
別の局面において、式(V)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物:
が本明細書中で提供され、式(V)において:
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、またはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、
であり;
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である。
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、またはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である。
別の局面において、式(V-a)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物:
が本明細書中で提供され、式(V-a)において:
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、ウラシル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、ヘテロアリール、または核酸塩基同配体であり;
R2は、H、OH、O-保護基(PG)、
、リンカー、アジド、カルボン酸、またはアミンであり;
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
WおよびQは各々独立して、O、NH、CH2、またはCH2Oであり;
S1およびS2は各々独立して、C(R7)またはNであり、ここでR7の各例は独立して、H、アルキル、ヘテロアルキル、またはハロゲンであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である。
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、ウラシル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、ヘテロアリール、または核酸塩基同配体であり;
R2は、H、OH、O-保護基(PG)、
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
WおよびQは各々独立して、O、NH、CH2、またはCH2Oであり;
S1およびS2は各々独立して、C(R7)またはNであり、ここでR7の各例は独立して、H、アルキル、ヘテロアルキル、またはハロゲンであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である。
別の局面において、式(V-b)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物:
が本明細書中で提供され、式(V-b)において:
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、ウラシル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、ヘテロアリール、または核酸塩基同配体であり;
R2はオリゴヌクレオチドであり;
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L3は、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、O、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、またはホスフェートであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
WおよびQは各々独立して、O、NH、CH2、またはCH2Oであり;
S1およびS2は各々独立して、C(R7)またはNであり、ここでR7の各例は独立して、H、アルキル、ヘテロアルキル、またはハロゲンであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である。
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、ウラシル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、ヘテロアリール、または核酸塩基同配体であり;
R2はオリゴヌクレオチドであり;
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L3は、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、O、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、またはホスフェートであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
WおよびQは各々独立して、O、NH、CH2、またはCH2Oであり;
S1およびS2は各々独立して、C(R7)またはNであり、ここでR7の各例は独立して、H、アルキル、ヘテロアルキル、またはハロゲンであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である。
特定の実施形態において、R3、R4、R5、およびR6は同じである。特定の実施形態において、R3、R5、およびR6は同じである。特定の実施形態において、R3またはR4はHである。
特定の実施形態において、L1およびL2は同じである。
特定の実施形態において、L1およびL2は各々独立して、アルキルであり;R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;そしてR6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcである。
特定の実施形態において、L1およびL2は各々独立して、アルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;そしてR6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcである。
特定の実施形態において、R4はHである。
特定の実施形態において、L1およびL2は各々独立して、アルキルであり;
R3は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4はHであり;R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;そしてR6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcである。
特定の実施形態において、L1およびL2は各々独立して、アルキルであり;
R3は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4はHであり;R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;そしてR6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcである。
特定の実施形態において、L1およびL2は各々独立して、アルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;R3は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;R4はHであり;R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;そしてR6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcである。
特定の実施形態において、R3は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAcであり;R4はHであり;R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAcであり;そしてR6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAcである。
特定の実施形態において、R3は、-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;R4はHであり;R5は、-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;そしてR6は、-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcである。
特定の実施形態において、j、m、およびnは各々独立して、4および10を含めた整数4~10である。特定の実施形態において、j、m、およびnは各々同じであり、4および10を含めた整数4~10である。
特定の実施形態において、R1はHである。特定の実施形態において、R1は、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、またはウラシルである。特定の実施形態において、R1はアデニンである。特定の実施形態において、R1はグアニンである。特定の実施形態において、R1はチミンである。特定の実施形態において、R1はシトシンである。特定の実施形態において、R1はウラシルである。
特定の実施形態において、本明細書中に開示される化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物のいずれかは、化学反応における試薬として使用され得る。
別の局面において、式(VI)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物:
が本明細書中で提供され、式(VI)において:
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、またはウラシルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である。
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、またはウラシルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である。
別の局面において、式VIの化合物を含む修飾オリゴヌクレオチドが、本明細書中で提供される。特定の実施形態において、この修飾オリゴヌクレオチドは、siRNA、miRNA、ADAR動員分子、ADARターゲッティング分子、ガイドRNA、またはアンチセンス核酸を含む。
1つの局面において、式(VII)の部分、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
を含むオリゴヌクレオチドが本明細書中で提供され、式(VII)において:
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、またはウラシルであり;
R2は結合であり;
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である。
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、またはウラシルであり;
R2は結合であり;
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である。
特定の実施形態において、このオリゴヌクレオチドは、siRNA、miRNA、ADAR動員分子、ADARターゲッティング分子、ガイドRNA、またはアンチセンス核酸を含む。
1つの局面において、本明細書中に開示される化合物のいずれか、および薬学的に受容可能なキャリアを含有する組成物が、本明細書中で提供される。
別の局面において、被験体におけるタンパク質機能を調節するための方法が、本明細書中で提供され、この方法は、本明細書中に開示される化合物のいずれかの、この被験体への投与を包含する。
別の局面において、被験体における疾患、障害、またはその症状を処置または改善するための方法が、本明細書中で提供され、この方法は、本明細書中に開示される化合物のいずれかの、この被験体への投与を包含する。
別の局面において、式(I-a)、(I-b)、(I-c)、および(I-d)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物:
が本明細書中で提供され、式(I-a)、(I-b)、(I-c)、および(I-d)において:
は環Aであり、ここで各環Aは独立して、必要に応じて置換されたカルボシクリル、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
は環Bであり、ここで各Bは独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリールであり;
各nは独立して、0、1、2、3、または4であり;
各Yは独立して、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換アミノ、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
各Zは独立して、必要に応じて置換されたアルキル基、必要に応じて置換されたアルケニル基、必要に応じて置換されたアルキニル基、またはエチレングリコールであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、アルキルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
R2およびR5は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;
R3およびR6は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
各R4は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcである。
各nは独立して、0、1、2、3、または4であり;
各Yは独立して、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換アミノ、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
各Zは独立して、必要に応じて置換されたアルキル基、必要に応じて置換されたアルケニル基、必要に応じて置換されたアルキニル基、またはエチレングリコールであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、アルキルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
R2およびR5は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;
R3およびR6は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
各R4は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcである。
別の局面において、式(IV-a)および(IV-d):
の化合物ならびにその塩、溶媒和物、および水和物が本明細書中で提供され、
式(IV-a)および(IV-d)において:
n1は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n2は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n3は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n4は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
各Xは独立して、H、アルキル-GalNAc、またはPEG-GalNAcであり;そして
各Yは独立して、H、アルキル-GalNAc、またはPEG-GalNAcである。
式(IV-a)および(IV-d)において:
n1は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n2は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n3は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n4は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
各Xは独立して、H、アルキル-GalNAc、またはPEG-GalNAcであり;そして
各Yは独立して、H、アルキル-GalNAc、またはPEG-GalNAcである。
別の局面において、式(VIII)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物が提供され:
式(VIII)において:
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、
であり;
Z1は、
であり;
Z2は、
であり;
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である。
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、
Z1は、
Z2は、
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である。
別の局面において、式(VIII-a)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物が提供され:
式(VIII-a)において:
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、OH、O-保護基(PG)、
、リンカー、アジド、カルボン酸、アミン、またはホスフェートであり;
X1は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Z1は、
であり;
Z2は、
であり;
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である。
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、OH、O-保護基(PG)、
X1は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Z1は、
Z2は、
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である。
別の局面において、式(VIII-b)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物が提供され:
式(VIII-b)において:
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、OH、O-保護基(PG)、
、リンカー、アジド、カルボン酸、アミン、またはホスフェートであり;
X1は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
X2は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Z1は、
であり;
Z2は、
であり;
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である。
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、OH、O-保護基(PG)、
X1は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
X2は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Z1は、
Z2は、
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である。
別の局面において、式(IX)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物が提供され:
式(IX)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
いくつかの実施形態において、この化合物は、式(IX-a)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であり、式(IX-a)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、OH、O-保護基(PG)、
、リンカー、アジド、カルボン酸、またはアミンであり;
Y1は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y2は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、OH、O-保護基(PG)、
Y1は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y2は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
別の局面において、式(X)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物が提供され:
式(X)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
いくつかの実施形態において、この化合物は、式(X-a)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であり、式(X-a)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、OH、O-保護基(PG)、
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、OH、O-保護基(PG)、
、リンカー、アジド、カルボン酸、またはアミンであり;
Y1は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y2は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4、およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
Y1は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y2は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4、およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
いくつかの実施形態において、R9はウラシルである。いくつかの実施形態において、R9は、保護基を含むウラシルである。特定の実施形態において、R9は、ベンゾイル保護基を含むウラシルである。いくつかの実施形態において、R9はシトシンである。いくつかの実施形態において、R9は、保護基を含むシトシンである。特定の実施形態において、R9は、アシル保護基を含むシトシンである。特定の実施形態において、R9は、ベンゾイル保護基を含むシトシンである。いくつかの実施形態において、R9はアデニンである。いくつかの実施形態において、R9は、保護基を含むアデニンである。特定の実施形態において、R9は、ベンゾイル保護基を含むアデニンである。いくつかの実施形態において、R9はグアニンである。いくつかの実施形態において、R9は、保護基を含むグアニンである。いくつかの実施形態において、R9は、ジメチルアセテート保護基を含むグアニンである。
いくつかの実施形態において、Y1はOである。いくつかの実施形態において、Y2はOである。特定の実施形態において、Y1とY2との両方がOである。いくつかの実施形態において、Y3はCOである。いくつかの実施形態において、Y4はCOである。特定の実施形態において、Y3とY4との両方がCOである。特定の実施形態において、Y1およびY2はOであり、そしてY3およびY4はCOである。
いくつかの実施形態において、n3は1である。いくつかの実施形態において、n3は3である。いくつかの実施形態において、n3は5である。いくつかの実施形態において、n3は7である。いくつかの実施形態において、n4は1である。いくつかの実施形態において、n4は3である。いくつかの実施形態において、n4は5である。いくつかの実施形態において、n4は7である。いくつかの実施形態において、n5は1である。いくつかの実施形態において、n5は3である。いくつかの実施形態において、n5は5である。いくつかの実施形態において、n5は7である。特定の実施形態において、n3、n4、およびn5のうちの2つは1である。特定の実施形態において、n3、n4、およびn5の3つ全てが1である。
いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。
別の局面において、本開示は、式(XXIX)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
を提供し、式(XXIX)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、OH、O-保護基(PG)、
、リンカー、アジド、カルボン酸、またはアミンであり;
Y1は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y2は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、OH、O-保護基(PG)、
Y1は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y2は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。
別の局面において、式(XI)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物が提供され:
式(XI)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
別の局面において、式(XI-a)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物が提供され:
式(XI-a)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
別の局面において、式(XII)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物が提供され:
式(XII)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
別の局面において、式(XII-a)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物が提供され:
式(XII-a)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
別の局面において、式(XIII)の部分、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物を含むオリゴヌクレオチドが提供され:
式(XIII)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は結合であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は結合であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
別の局面において、式(XIII-a)の部分、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物を含むオリゴヌクレオチドが提供され:
式(XIII-a)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列への結合であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列への結合であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
別の局面において、式(XIV)の部分、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物を含むオリゴヌクレオチドが提供され:
式(XIV)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は結合であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は結合であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
別の局面において、式(XIV-a)の部分、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物を含むオリゴヌクレオチドが提供され:
式(XIV-a)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列への結合であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列への結合であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
別の局面において、式(XV)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物が提供され:
式(XV)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
別の局面において、式(XV-a)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物が提供され:
式(XV-a)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
別の局面において、式(XVI)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物が提供され:
式(XVI)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
別の局面において、式(XVI-a)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物が提供され:
式(XVI-a)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
いくつかの実施形態において、R9はウラシルである。いくつかの実施形態において、R9はシトシンである。いくつかの実施形態において、R9はアデニンである。いくつかの実施形態において、R9はグアニンである。
いくつかの実施形態において、Y1はOである。いくつかの実施形態において、Y2はOである。特定の実施形態において、Y1とY2との両方がOである。いくつかの実施形態において、Y3はCOである。いくつかの実施形態において、Y4はCOである。特定の実施形態において、Y3とY4との両方がCOである。特定の実施形態において、Y1およびY2はOであり、そしてY3およびY4はCOである。
いくつかの実施形態において、n3は1である。いくつかの実施形態において、n3は3である。いくつかの実施形態において、n3は5である。いくつかの実施形態において、n3は7である。いくつかの実施形態において、n4は1である。いくつかの実施形態において、n4は3である。いくつかの実施形態において、n4は5である。いくつかの実施形態において、n4は7である。いくつかの実施形態において、n5は1である。いくつかの実施形態において、n5は3である。いくつかの実施形態において、n5は5である。いくつかの実施形態において、n5は7である。特定の実施形態において、n3、n4、およびn5のうちの2つが1である。特定の実施形態において、n3、n4、およびn5の3つ全てが1である。
いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。
別の局面において、式(XXX)の化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物が提供され:
式(XXX)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
別の局面において、式(XVII)の部分、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物を含むオリゴヌクレオチドが提供され:
式(XVII)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Rはオリゴヌクレオチドであり;
R’は、OまたはSであり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Rはオリゴヌクレオチドであり;
R’は、OまたはSであり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
別の局面において、式(XVII-a)の部分、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物を含むオリゴヌクレオチドが提供され:
式(XVII-a)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチドへの結合であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチドへの結合であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
別の局面において、式(XVIII)の部分、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物を含むオリゴヌクレオチドが提供され:
式(XVIII)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は結合であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は結合であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
別の局面において、式(XVIII-a)の部分、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物を含むオリゴヌクレオチドが提供され:
式(XVIII-a)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチドへの結合であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチドへの結合であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2である。
いくつかの実施形態において、R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルである。いくつかの実施形態において、R9は修飾核酸塩基である。いくつかの実施形態において、R9は、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、または必要に応じて置換されたヘテロアリールである。
別の局面において、式(XIX)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物が提供され:
式(XIX)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
であり;
X1は、
であり;そして
X2は、H、アルキル、または保護基(PG)である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
X1は、
X2は、H、アルキル、または保護基(PG)である。
別の局面において、式(XX)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物が提供され:
式(XX)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
であり;
X2は、H、ハロゲン、OH、O-アルキル、O-ヘテロアルキル、またはO-保護基(PG)であり;
X3は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
X4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
X2は、H、ハロゲン、OH、O-アルキル、O-ヘテロアルキル、またはO-保護基(PG)であり;
X3は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
X4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
別の局面において、式(XXI)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物が提供され:
式(XXI)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
であり;
X2は、H、ハロゲン、OH、O-アルキル、O-ヘテロアルキル、または保護基(PG)であり;
X3は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
X4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
X2は、H、ハロゲン、OH、O-アルキル、O-ヘテロアルキル、または保護基(PG)であり;
X3は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
X4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
別の局面において、式(XXII)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物が提供され:
式(XXII)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
であり;
X2は、H、ハロゲン、OH、O-アルキル、O-ヘテロアルキル、またはO-保護基(PG)であり;
X3は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
X2は、H、ハロゲン、OH、O-アルキル、O-ヘテロアルキル、またはO-保護基(PG)であり;
X3は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
別の局面において、式(XXIII)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物が提供され:
式(XXIII)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
であり;
X2は、H、ハロゲン、OH、O-アルキル、O-ヘテロアルキル、またはO-保護基(PG)であり;
X3は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
X4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
X2は、H、ハロゲン、OH、O-アルキル、O-ヘテロアルキル、またはO-保護基(PG)であり;
X3は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
X4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
いくつかの実施形態において、この化合物は:
またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は:
またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は:
またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は:
またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は:
またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は:
またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は:
またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は:
またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。
別の局面において、式(XXIV)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物が提供され:
式(XXIV)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
X2は、H、アルキル、または保護基(PG)であり;
X5は、H、保護基(PG)、または
であり;そして
X6は、
である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
X2は、H、アルキル、または保護基(PG)であり;
X5は、H、保護基(PG)、または
X6は、
別の局面において、式(XXV)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物が提供され:
式(XXV)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
X2は、H、OH、O-アルキル、アルキル、ヘテロアルキル、ハロゲン、またはO-保護基(PG)であり;
X5は、H、OH、O-保護基(PG)、または
であり;
X7は、Oであり;
X8は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
X2は、H、OH、O-アルキル、アルキル、ヘテロアルキル、ハロゲン、またはO-保護基(PG)であり;
X5は、H、OH、O-保護基(PG)、または
X7は、Oであり;
X8は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である。
いくつかの実施形態において、この化合物は:
またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は:
またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、本明細書中に提供される化合物のいずれかは、オリゴヌクレオチドに結合し得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に提供される化合物のいずれかは、脱保護され得(例えば、GalNAc中の酸素原子上のアセチル基が除去され得)、そしてオリゴヌクレオチドに結合し得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に提供される化合物のいずれか、または本明細書中に提供される化合物のいずれかを含むオリゴヌクレオチドは、薬学的に受容可能なキャリアを含有する組成物中に提供され得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に提供される化合物、オリゴヌクレオチド、または組成物のいずれかは、被験体に、被験体におけるタンパク質機能を調節するための方法において投与され得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に提供される化合物、オリゴヌクレオチド、または組成物のいずれかは、被験体に、被験体における疾患、障害、またはその症状を処置または改善するための方法において投与され得る。いくつかの実施形態において、この疾患、障害、またはその症状は、肝臓の疾患、障害、またはその症状である。
別の局面において、本開示は、本明細書中の実施例、例えば実施例1~23を含めた、本明細書中に記載される1つまたはそれより多くの化合物および化学変換を含む、本明細書中に提供される化合物のいずれかを作製するための方法を提供する。
別の局面において、本開示は、式(XXVI)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物であって:
式(XXVI)において:
各nは独立して、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイト、OH、NH2、NHRa、N3、C(=O)OH、C(=O)X、CN、SH、SSH、SO2X、C(=O)NHNH2、NHNH2、C(=S)NHNH2、C(=S)NH2、NHOH、C(=O)CH2Xマロニル、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、-OP(=S)X、-C(=O)H、-C(=O)Ra、-N=C=O、-N=C=NRa、-N=C=S、CHX、-OP(=O)OH、ホスファン、アルコキシホスファン、-C(Ra)2、マイケルアクセプター、タンパク質、または肝細胞を調節するため、もしくは肝臓の疾患を処置するための治療剤であり、ここでXは脱離基であり;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
であり;
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルである、化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物;
ならびにこのような化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物を含有する組成物、これらを含む処置の方法、およびこれらを含む作製の方法を提供する。
各nは独立して、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイト、OH、NH2、NHRa、N3、C(=O)OH、C(=O)X、CN、SH、SSH、SO2X、C(=O)NHNH2、NHNH2、C(=S)NHNH2、C(=S)NH2、NHOH、C(=O)CH2Xマロニル、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、-OP(=S)X、-C(=O)H、-C(=O)Ra、-N=C=O、-N=C=NRa、-N=C=S、CHX、-OP(=O)OH、ホスファン、アルコキシホスファン、-C(Ra)2、マイケルアクセプター、タンパク質、または肝細胞を調節するため、もしくは肝臓の疾患を処置するための治療剤であり、ここでXは脱離基であり;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルである、化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物;
ならびにこのような化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物を含有する組成物、これらを含む処置の方法、およびこれらを含む作製の方法を提供する。
本発明の1つの局面において、各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトである。
本発明の1つの局面において、各R1は独立して、OH、NH2、NHRa、N3、C(=O)OH、C(=O)X、CN、SH、SSH、SO2X、C(=O)NHNH2、NHNH2、C(=S)NHNH2、C(=S)NH2、NHOH、C(=O)CH2Xマロニル、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、-OP(=S)X、-C(=O)H、-C(=O)Ra、-N=C=O、-N=C=NRa、-N=C=S、CHX、-OP(=O)OH、ホスファン、アルコキシホスファン、または-C(Ra)2であり、ここでXは脱離基である。
本発明の1つの局面において、各R1は独立して、マイケルアクセプター、タンパク質、または肝細胞を調節するため、もしくは肝臓の疾患を処置するための治療剤である。
別の局面において、式(XXVI-a)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物であって:
式(XXVI-a)において:
各nは独立して、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
L1、L2、およびL3の各々は独立して、存在しないか、C(=O)、またはC(=O)NHであり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイト、OH、NH2、NHRa、N3、CH2N3、C(=O)OH、C(=O)X、CN、SH、SSH、SO2X、C(=O)NHNH2、NHNH2、C(=S)NHNH2、C(=S)NH2、NHOH、C(=O)CH2Xマロニル、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、-OP(=S)X、-C(=O)H、-C(=O)Ra、-N=C=O、-N=C=NRa、-N=C=S、CHX、-OP(=O)OH、ホスフェート、ホスファン、アルコキシホスファン、-C(Ra)2、マイケルアクセプター、タンパク質、または肝細胞を調節するため、もしくは肝臓の疾患を処置するための治療剤であり、ここでXは脱離基であるか;あるいはR1は、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルにより結合したオリゴヌクレオチドを含み;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
であり;
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルである、化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物;
ならびにこのような化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物を含有する組成物、これらを含む処置の方法、およびこれらを含む作製の方法が提供される。
各nは独立して、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
L1、L2、およびL3の各々は独立して、存在しないか、C(=O)、またはC(=O)NHであり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイト、OH、NH2、NHRa、N3、CH2N3、C(=O)OH、C(=O)X、CN、SH、SSH、SO2X、C(=O)NHNH2、NHNH2、C(=S)NHNH2、C(=S)NH2、NHOH、C(=O)CH2Xマロニル、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、-OP(=S)X、-C(=O)H、-C(=O)Ra、-N=C=O、-N=C=NRa、-N=C=S、CHX、-OP(=O)OH、ホスフェート、ホスファン、アルコキシホスファン、-C(Ra)2、マイケルアクセプター、タンパク質、または肝細胞を調節するため、もしくは肝臓の疾患を処置するための治療剤であり、ここでXは脱離基であるか;あるいはR1は、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルにより結合したオリゴヌクレオチドを含み;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルである、化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物;
ならびにこのような化合物、ならびにその塩、溶媒和物、および水和物を含有する組成物、これらを含む処置の方法、およびこれらを含む作製の方法が提供される。
いくつかの実施形態において、R9は、必要に応じて置換された窒素含有ヘテロシクリルである。いくつかの実施形態において、R9は、必要に応じて置換されたピリミジニルである。いくつかの実施形態において、R9は、4H-1λ2,3λ2-ピリミジン-2,4-ジオンである。特定の実施形態において、R9は、
である。
いくつかの実施形態において、Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換された窒素含有ヘテロシクリルまたは必要に応じて置換された窒素含有ヘテロアリールである。いくつかの実施形態において、Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換された1,2,3-トリアゾリルである。いくつかの実施形態において、Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換された1λ2,2,3-トリアゾール-4-イルである。特定の実施形態において、Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、
である。
いくつかの実施形態において、R5、R6、およびR7のうちの2つは、それぞれ同じである。いくつかの実施形態において、R5およびR6は、それぞれ同じである。いくつかの実施形態において、R5、R6、およびR7のうちの3つは、それぞれ同じである。いくつかの実施形態において、oは、R5、R6、およびR7の各々において同じである。特定の実施形態において、oは、R5およびR6の各々において同じである。特定の実施形態において、R5、R6、およびR7の3つ全ては、
である。特定の実施形態において、R5、R6、およびR7の3つ全ては、
である。
本発明のいくつかの実施形態において、各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトである。本発明のいくつかの実施形態において、各R1は独立して、OH、NH2、NHRa、N3、C(=O)OH、C(=O)X、CN、SH、SSH、SO2X、C(=O)NHNH2、NHNH2、C(=S)NHNH2、C(=S)NH2、NHOH、C(=O)CH2Xマロニル、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、-OP(=S)X、-C(=O)H、-C(=O)Ra、-N=C=O、-N=C=NRa、-N=C=S、CHX、-OP(=O)OH、ホスファン、アルコキシホスファン、または-C(Ra)2であり、ここでXは脱離基である。本発明のいくつかの実施形態において、各R1は独立して、マイケルアクセプター、タンパク質、または肝細胞を調節するため、もしくは肝臓の疾患を処置するための治療剤である。特定の実施形態において、R1は、
である。特定の実施形態において、R1はホスフェートである。特定の実施形態において、R1はCH2N3である。
別の局面において、式(XXVII)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物が提供され:
式(XXVII)において、
各nは独立して、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
であり;
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;そして
R2は、H、保護基(PG)、
であり;
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルである。
各nは独立して、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;そして
R2は、H、保護基(PG)、
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルである。
いくつかの実施形態において、R9は、必要に応じて置換された窒素含有ヘテロシクリルである。いくつかの実施形態において、R9は、必要に応じて置換されたジヒドロピリミジニル、必要に応じて置換されたテトラヒドロピリミジニル、または必要に応じて置換されたヘキサヒドロピリミジニルである。いくつかの実施形態において、R9は、4H-1λ2,3λ2-ピリミジン-2,4-ジオンである。特定の実施形態において、R9は、
である。
いくつかの実施形態において、Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換された窒素含有ヘテロシクリル、または必要に応じて置換された窒素含有ヘテロアリールである。いくつかの実施形態において、Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換された1,2,3-トリアゾリルである。いくつかの実施形態において、Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換された1λ2,2,3-トリアゾール-4-イルである。特定の実施形態において、Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、
である。
いくつかの実施形態において、R5、R6、およびR7のうちの2つは、それぞれ同じである。いくつかの実施形態において、R5およびR6は、それぞれ同じである。いくつかの実施形態において、R5、R6、およびR7のうちの3つは、それぞれ同じである。いくつかの実施形態において、oは、R5、R6、およびR7の各々において同じである。特定の実施形態において、oは、R5およびR6の各々において同じである。
いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。
別の局面において、本開示は、式(XXVIII)の部分、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
を含む修飾オリゴヌクレオチドを提供し、式(XXVIII)において:
各nは独立して、0、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
であり;そして
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
Lは、結合、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、ホスフェート、またはチオール-マイケル付加体であり;
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルである。
各nは独立して、0、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
Lは、結合、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、ホスフェート、またはチオール-マイケル付加体であり;
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルである。
別の局面において、本開示は、式(XXIX)の部分、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
を含むオリゴヌクレオチドを提供し、式(XXIX)において:
各nは独立して、0、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
であり;
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
Lは、結合、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、ホスフェート、またはチオール-マイケル付加体であり;
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルである。
各nは独立して、0、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)(OH)-O-、P(=O)(SH)-O、P(=S)(SH)-O、-O-P(=O)(OH)-O-、-O-P(=O)(SH)-O-、-O-P(=S)(SH)-O-、-O-P(=O)(OH)-、-O-P(=O)(SH)-、-O-P(=S)(SH)-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
Lは、結合、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、ホスフェート、またはチオール-マイケル付加体であり;
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルである。
いくつかの実施形態において、このオリゴヌクレオチドは、siRNA、miRNA、ADAR動員分子、ADARターゲッティング分子、ガイドRNA、またはアンチセンス核酸を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に提供される化合物またはオリゴヌクレオチド、あるいはその塩、溶媒和物または水和物のいずれかは、化学反応における試薬として使用され得る。
本明細書中に提供される化合物のいずれか、および薬学的に受容可能なキャリアを含有する、組成物もまた本明細書中で提供される。
本明細書中に開示される化合物のいずれかを作製する方法が、本明細書中でさらに提供され、この方法は、本明細書中の実施例、例えば実施例1~23を含めた、本明細書中に記載される化合物および化学変換のうちの1つまたはそれより多くを含む。
いくつかの実施形態において、この化合物は、式(XXXI)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であり、式(XXXI)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、O-保護基(PG)、
、リンカー、アジド、カルボン酸、またはアミンであり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、C(O)NH、C(O)-NH-CH2-C(O)-NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、C(O)NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y5は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
Y6は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、O-保護基(PG)、
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、C(O)NH、C(O)-NH-CH2-C(O)-NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、C(O)NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y5は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
Y6は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。
いくつかの実施形態において、この化合物は、式(XXXII)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であり、式(XXXII)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、O-保護基(PG)、または
、リンカー、アジド、カルボン酸、またはアミンであり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、C(O)NH、C(O)-NH-CH2-C(O)-NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、C(O)NH、C(O)-NH-CH2-C(O)-NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y5は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
Y6は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
Y7は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、O-保護基(PG)、または
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、C(O)NH、C(O)-NH-CH2-C(O)-NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、C(O)NH、C(O)-NH-CH2-C(O)-NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y5は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
Y6は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
Y7は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物である。
いくつかの実施形態において、この化合物は、式(XXXII-a)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であり、式(XXXII-a)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、O-保護基(PG)、または
、リンカー、アジド、カルボン酸、またはアミンであり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、C(O)NH、C(O)-NH-CH2-C(O)-NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、C(O)NH、C(O)-NH-CH2-C(O)-NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y5は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
Y6は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
Y7は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、O-保護基(PG)、または
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、C(O)NH、C(O)-NH-CH2-C(O)-NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、C(O)NH、C(O)-NH-CH2-C(O)-NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y5は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
Y6は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
Y7は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。
いくつかの実施形態において、この化合物は、式(XXXIII)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であり、式(XXXIII)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、O-保護基(PG)、または
、リンカー、アジド、カルボン酸、またはアミンであり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、C(O)NH、C(O)-NH-CH2-C(O)-NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、C(O)NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y5は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
Y6は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4、n5、n6、n7、およびn8の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、O-保護基(PG)、または
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、C(O)NH、C(O)-NH-CH2-C(O)-NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、C(O)NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y5は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
Y6は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4、n5、n6、n7、およびn8の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。
いくつかの実施形態において、この化合物は、式(XXXIV)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であり、式(XXXIV)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、O-保護基(PG)、
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、O-保護基(PG)、
、リンカー、アジド、カルボン酸、またはアミンであり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、C(O)NH、C(O)-NH-CH2-C(O)-NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、C(O)NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y5は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
Y6は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
n1、n2、およびn3の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、C(O)NH、C(O)-NH-CH2-C(O)-NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、C(O)NH、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y5は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
Y6は、CO、C(O)NH、OC(O)NH、またはOCH2C(O)NHであり;
n1、n2、およびn3の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。
いくつかの実施形態において、この化合物は、式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である。
1つの局面において、本明細書中の化合物は、1つまたはそれより多くのGalNAc部分を有し、このGalNAc部分が:
である、本明細書中に図示される式のいずれかの化合物である。
1つの局面において、本明細書中の化合物は、1つまたはそれより多くのアセチル化GalNAc部分を有し、このアセチル化GalNAc部分が:
である、本明細書中に図示される式のいずれかの化合物である。
1つの局面において、本明細書中の化合物は、1つまたはそれより多くの保護された(PG)GalNAc部分を有し、この保護されたGalNAc部分が:
である、本明細書中に図示される式のいずれかの化合物である。
1つの局面において、本明細書中のオリゴヌクレオチド含有化合物は、1つまたはそれより多くのGalNAc部分を有し、このGalNAc部分が:
である、本明細書中に図示される式のいずれかの化合物である。
1つの局面において、本明細書中のオリゴヌクレオチド含有化合物は、1つまたはそれより多くのアセチル化GalNAc部分を有し、このアセチル化GalNAc部分が:
である、本明細書中に図示される式のいずれかの化合物である。
1つの局面において、本明細書中のオリゴヌクレオチド含有化合物は、1つまたはそれより多くの保護された(PG)GalNAc部分を有し、この保護されたGalNAc部分が:
である、本明細書中に図示される式のいずれかの化合物である。
全ての遊離ヒドロキシ基をこのGalNAc部分に有する化合物は、当該分野において公知である化学合成技術(例えば、脱保護;保護基(PG)の除去)を使用して、例えば、このGalNAc構造の酸素原子上のアセチル部分の選択的脱アセチルを行い、同時にこのGalNAc構造の窒素原子に結合したアセチル基をインタクトなままにすることにより、得られる。
詳細な説明
定義
本発明がより容易に理解され得る目的で、特定の用語を簡便なためにここで最初に定義する。
定義
本発明がより容易に理解され得る目的で、特定の用語を簡便なためにここで最初に定義する。
本明細書中で使用される場合、障害を「処置する」との用語は、その障害および/またはその障害を引き起こし得る状態を、改善、軽減および/または管理することを包含する。用語「処置する」および「処置」とは、疾患および/またはそれに付随する症状を緩和するかまたはやわらげる方法をいう。本開示によれば、「処置する」は、障害を遮断すること、阻害すること、減衰させること、障害から保護すること、調節すること、その影響を逆転させること、および例えば障害の有害な影響の発生を減少させることを包含する。本明細書中で使用される場合、「阻害する」は、予防すること、減少させること、および進行を止めることを包含する。
用語「単離された」、「精製された」、または「生物学的に純粋な」とは、その生成状態で見出される場合に通常付随する成分を実質的に、または本質的に含まない、材料をいう。純度および均質性は代表的に、ポリアクリルアミドゲル電気泳動または高速液体クロマトグラフィー(HPLC)などの分析科学技術を使用して決定される。特に、特定の実施形態において、化合物またはオリゴヌクレオチドは、少なくとも85%純粋、より好ましくは、少なくとも90%純粋、より好ましくは、少なくとも95%純粋、そして最も好ましくは、少なくとも99%純粋である。
用語「投与」または「投与する」は、化合物(複数可)またはオリゴヌクレオチド(複数可)の意図される機能を実施するように、これらを被験体に導入する経路を包含する。使用され得る投与経路の例としては、注射(皮下、静脈内、非経口、腹腔内、鞘内)、局所、経口、吸入、直腸および経皮が挙げられる。
用語「有効量」は、必要な投薬量および期間において、所望の結果を達成するために有効である量を包含する。化合物またはオリゴヌクレオチドの有効量は、被験体の疾患状態、年齢、および体重、ならびに化合物またはオリゴヌクレオチドが被験体において所望の応答を惹起する能力などの要因に従って変わり得る。投薬レジメンは、最適な治療応答を提供するように調節され得る。有効量はまた、阻害剤化合物またはオリゴヌクレオチドの任意の毒性または有害な影響(例えば、副作用)に、治療上有益な効果が勝る量である。
語句「全身投与」、「全身投与される」、「末梢投与」および「末梢投与される」とは、本明細書中で使用される場合、化合物(複数可)、オリゴヌクレオチド(複数可)、薬物、また他の物質が患者の全身に入り、従って、代謝などのプロセスに供されるような、これらの物質の投与を意味する。
用語「治療有効量」とは、処置される状態または障害の症状のうちの1つまたはそれより多くの発症をある程度予防するか、または緩和するために十分な、投与される化合物またはオリゴヌクレオチドの量をいう。
化合物またはオリゴヌクレオチドの治療有効量(すなわち、有効投薬量)は、約0.005μg/kgから約200mg/kgまで、好ましくは約0.01mg/kg~約200mg/kg、より好ましくは約0.015mg/kg~約30mg/kg体重の範囲であり得る。他の実施形態において、治療有効量は、約1.0pMから約10μMまでの範囲であり得る。当業者は、特定の要因が、被験体を効果的に処置するために必要とされる投薬量に影響を与え得ることを理解し、これらの要因としては、疾患または障害の重篤度、以前の処置、被験体の一般的な健康状態および/または年齢、ならびに存在する他の疾患が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、治療有効量の化合物またはオリゴヌクレオチドでの被験体の処置は、単一の処置を含み得るか、または好ましくは、一連の処置を含み得る。一例において、被験体は、約0.005μg/kg~約200mg/kg体重の範囲の化合物またはオリゴヌクレオチドで、約1~10週間、好ましくは2~8週間、より好ましくは約3~7週間、そしてなおさらに好ましくは約4週間、5週間、または6週間にわたって1日1回、処置される。別の例において、被験体は、慢性の状態または疾病の環境では、数年間にわたり毎日処置され得る。処置のために使用される化合物またはオリゴヌクレオチドの有効な投薬量は、特定の処置の経過にわたって増減し得ることもまた理解される。
用語「キラル」とは、鏡像パートナーの重ね合わせられない特性を有する分子をいい、一方で、用語「アキラル」とは、それらの鏡像パートナーに重ね合わせられる分子をいう。
用語「ジアステレオマー」とは、2つまたはそれより多くの非対称中心を有する立体異性体であって、これらの分子が互いの鏡像ではない異性体をいう。
用語「エナンチオマー」とは、互いの重ね合わせられない鏡像である化合物の、2つの立体異性体をいう。2つのエナンチオマーの当モル混合物は、「ラセミ混合物」または「ラセミ体」と呼ばれる。
用語「異性体」または「立体異性体」とは、同一の化学的構成を有するが、空間中での原子または基の配置が異なる化合物をいう。
用語「プロドラッグ」は、インビボで代謝され得る部分を有する化合物を包含する。一般に、プロドラッグは、インビボでエステラーゼまたは他の機構によって、活性薬物に代謝される。プロドラッグの例およびそれらの使用は、当該分野において周知である(例えば、Berge et al.(1977)”Pharmaceutical Salts”,J.Pharm.Sci.66:1-19を参照のこと)。プロドラッグは、化合物の最終的な単離および精製の間にインサイチュで調製され得るか、または遊離酸形態もしくはヒドロキシルとして精製された化合物を適切なエステル化剤と別に反応させることによって調製され得る。ヒドロキシル基は、カルボン酸での処理によって、エステルに転換され得る。プロドラッグ部分の例としては、置換および非置換の、分枝状または非分枝状の、低級アルキルエステル部分(例えば、プロピオン酸エステル)、低級アルケニルエステル、ジ-低級アルキル-アミノ低級アルキルエステル(例えば、ジメチルアミノエチルエステル)、アクリルアミノ低級アルキルエステル(例えば、アセチルオキシメチルエステル)、アシルオキシ低級アルキルエステル(例えば、ピバロイルオキシメチルエステル)、アリールエステル(フェニルエステル)、アリール-低級アルキルエステル(例えば、ベンジルエステル)、置換された(例えば、メチル、ハロ、またはメトキシ置換基で)アリールおよびアリール-低級アルキルエステル、アミド、低級アルキルアミド、ジ-低級アルキルアミド、およびヒドロキシアミドが挙げられる。好ましいプロドラッグ部分は、プロピオン酸エステルおよびアシルエステルである。インビボで他の機構により活性形態に転換されるプロドラッグもまた包含される。ある局面において、本開示の化合物は、本明細書中の式のいずれかのプロドラッグである。
用語「被験体」とは、例えば、哺乳動物(霊長類(例えば、ヒト)、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ウマ、イヌ、ネコ、ウサギ、ラット、およびマウスなどが挙げられるが、これらに限定されない)などの動物をいう。特定の実施形態において、被験体はヒトである。
用語「a」、「an」、および「the」は、特許請求の範囲を含めて本願において使用される場合、「1またはそれより多く」をいう。従って、例えば、「サンプル(a sample)」への言及は、その文脈が明瞭に逆ではない限り(例えば、複数のサンプル)、複数のサンプルを包含する、などである。
本明細書および特許請求の範囲全体にわたって、語「含む(comprise)」、「含む(comprises)」および「含む(comprising)」は、その文脈がそうではないことを要求する場合を除いて、排他的ではない意味で使用される。
本明細書中で使用される場合、用語「約」は、値をいう場合、いくつかの実施形態においては±20%、いくつかの実施形態においては±10%、いくつかの実施形態においては±5%、いくつかの実施形態においては±1%、いくつかの実施形態においては±0.5%、そしていくつかの実施形態においては±0.1%の、特定される量からの変動を含むことを意味する。このような変動は、開示される方法を実施するため、または開示される組成物を採用するために適切である。
本明細書中で使用される場合、用語「アルキル」とは、1個~20個の炭素原子を含む、直鎖または分枝鎖の炭化水素基をいう。この範囲内の炭素原子の特定される数としては、例えば、C1~C12アルキル(1個~12個の炭素原子を有する)およびC1~C4アルキル(1個~4個の炭素原子を有する)が挙げられる。用語「低級アルキル」とは、C1~C6アルキル鎖をいう。アルキル基の例としては、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、tert-ブチル、およびn-ペンチルが挙げられる。アルキル基は、1つまたはそれより多くの置換基で必要に応じて置換され得る。
用語「ハロアルキル」とは、1個またはそれより多くのハロ置換基により置換されたアルキル基をいう。ハロアルキル基の例としては、フルオロメチル、ジフルオロメチル、トリフルオロメチル、ブロモメチル、クロロメチル、および2,2,2-トリフルオロエチルが挙げられる。
用語「アルケニル」とは、直鎖であっても分枝鎖であってもよく、2個~12個の炭素原子および少なくとも1つの炭素-炭素二重結合を含む、不飽和炭化水素鎖をいう。アルケニル基は、1つまたはそれより多くの置換基で必要に応じて置換され得る。
用語「アリールアルケニル」とは、直鎖であっても分枝鎖であってもよく、2個~12個の炭素原子および少なくとも1つの炭素-炭素二重結合を含み、そのアルケニル単位のsp2混成炭素のうちの1つまたはそれより多くがアリール部分に結合している、不飽和炭化水素鎖をいう。アルケニル基は、1つまたはそれより多くの置換基で必要に応じて置換され得る。
用語「アルキニル」とは、直鎖であっても分枝鎖であってもよく、2個~12個の炭素原子および少なくとも1つの炭素-炭素三重結合を含む、不飽和炭化水素鎖をいう。アルキニル基は、1つまたはそれより多くの置換基で必要に応じて置換され得る。
用語「アリールアルキニル」とは、直鎖であっても分枝鎖であってもよく、2個~12個の炭素原子および少なくとも1つの炭素-炭素三重結合を含み、そのアルキニル単位のsp混成炭素のうちの1つまたはそれより多くがアリール部分に結合している、不飽和炭化水素鎖をいう。アルキニル基は、1つまたはそれより多くの置換基で必要に応じて置換され得る。
アルケニル基およびアルキニル基のそれぞれsp2またはsp炭素は、必要に応じて、そのアルケニル基およびアルキニル基の結合点であり得る。
用語「アルコキシ」とは、-O-アルキル置換基をいう。
本明細書中で使用される場合、用語「ハロゲン」、「hal」または「ハロ」は、-F、-Cl、-Brまたは-Iを意味する。
用語「アルキルチオ」とは、-S-アルキル置換基をいう。
用語「アルコキシアルキル」とは、-アルキル-O-アルキル置換基をいう。
用語「ハロアルコキシ」とは、1個またはそれより多くのハロ置換基により置換された-O-アルキルをいう。ハロアルコキシ基の例としては、トリフルオロメトキシ、および2,2,2-トリフルオロエトキシが挙げられる。
用語「ハロアルコキシアルキル」とは、-アルキル-O-アルキル’をいい、ここでアルキル’は、1個またはそれより多くのハロ置換基により置換されている。
用語「ハロアルキルアミノカルボニル」とは、-C(O)-アミノ-アルキルをいい、ここでアルキルは、1個またはそれより多くのハロ置換基により置換されている。
用語「ハロアルキルチオ」とは、1個またはそれより多くのハロ置換基により置換された-S-アルキルをいう。ハロアルキルチオ基の例としては、トリフルオロメチルチオ、および2,2,2-トリフルオロエチルチオが挙げられる。
用語「ハロアルキルカルボニル」とは、1個またはそれより多くのハロ置換基により置換された-C(O)-アルキルをいう。ハロアルキルカルボニル基の例としては、トリフルオロアセチルが挙げられる。
用語「シクロアルキル」とは、少なくとも1個の飽和環を有するか、または少なくとも1個の非芳香環(この非芳香環はいくらかの不飽和度を有し得る)を有する、炭化水素の3員~8員の単環式、または7員~14員の二環式の環系をいう。シクロアルキル基は、1つまたはそれより多くの置換基で必要に応じて置換され得る。1つの実施形態において、シクロアルキル基の各環のうちの0個、1個、2個、3個、または4個の原子は、置換基によって置換されていてもよい。シクロアルキル基の代表的な例としては、シクロプロピル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロブチル、シクロヘプチル、シクロペンテニル、シクロペンタジエニル、シクロヘキセニルおよびシクロヘキサジエニルなどが挙げられる。
用語「シクロアルコキシ」とは、-O-シクロアルキル置換基をいう。
用語「シクロアルコキシアルキル」とは、-アルキル-O-シクロアルキル置換基をいう。
用語「シクロアルキルアルコキシ」とは、-O-アルキル-シクロアルキル置換基をいう。
用語「シクロアルキルアミノカルボニル」とは、-C(O)-NH-シクロアルキル置換基をいう。
用語「アリール」とは、炭化水素の単環式、二環式または三環式の芳香環系をいう。アリール基は、1つまたはそれより多くの置換基で必要に応じて置換され得る。1つの実施形態において、アリール基の各環の0個、1個、2個、3個、4個、5個または6個の原子は、置換基によって置換されていてもよい。アリール基の例としては、フェニル、ナフチル、アントラセニル、フルオレニル、インデニル、およびアズレニルなどが挙げられる。
用語「アリールオキシ」とは、-O-アリール置換基をいう。
用語「アリールアルコキシ」とは、-O-アルキル-アリール置換基をいう。
用語「アリールアルキルチオ」とは、-S-アルキル-アリール置換基をいう。
用語「アリールチオアルキル」とは、-アルキル-S-アリール置換基をいう。
用語「アリールアルキルアミノカルボニル」とは、-C(O)-アミノ-アルキル-アリール置換基をいう。
用語「アリールアルキルスルホニル」とは、-S(O)2-アルキル-アリール置換基をいう。
用語「アリールアルキルスルフィニル」とは、-S(O)-アルキル-アリール置換基をいう。
用語「アリールオキシアルキル」とは、-アルキル-O-アリール置換基をいう。
用語「アルキルアリール」とは、-アリール-アルキル置換基をいう。
用語「アリールアルキル」とは、-アルキル-アリール置換基をいう。
用語「ヘテロアリール」とは、単環式の場合には1個~4個の環ヘテロ原子、二環式の場合には1個~6個のヘテロ原子、または三環式の場合には1個~9個のヘテロ原子を有し、これらのヘテロ原子は、O、N、またはSから選択され、そして残りの環原子は炭素である(他に記載されない限り、適切な水素原子を有する)、芳香族の5員~8員の単環式、8員~12員の二環式、または11員~14員の三環式の環系をいう。ヘテロアリール基は、1つまたはそれより多くの置換基で必要に応じて置換され得る。1つの実施形態において、ヘテロアリール基の各環の0個、1個、2個、3個、または4個の原子は、置換基によって置換されていてもよい。ヘテロアリール基の例としては、ピリジル、フラニル、チエニル、ピロリル、オキサゾリル、オキサジアゾリル、イミダゾリル チアゾリル、イソオキサゾリル、キノリニル、ピラゾリル、イソチアゾリル、ピリダジニル、ピリミジニル、ピラジニル、トリアジニル、イソキノリニル、およびインダゾリルなどが挙げられる。
用語「ヘテロアリールアルキル」とは、-アルキル-ヘテロアリール置換基をいう。
用語「ヘテロアリールオキシ」とは、-O-ヘテロアリール置換基をいう。
用語「ヘテロアリールアルコキシ」とは、-O-アルキル-ヘテロアリール置換基をいう。
用語「ヘテロアリールオキシアルキル」とは、-アルキル-O-ヘテロアリール置換基をいう。
用語「窒素含有ヘテロアリール」とは、単環式の場合には1個~4個の環窒素ヘテロ原子、二環式の場合には1個~6個の環窒素ヘテロ原子、または三環式の場合には1個~9個の環窒素ヘテロ原子を有する、ヘテロアリール基をいう。
用語「ヘテロシクロアルキル」とは、単環式の場合には1個~3個のヘテロ原子、二環式の場合には1個~6個のヘテロ原子、または三環式の場合には1個~9個のヘテロ原子を含み、これらのヘテロ原子は、O、N、S、B、PまたはSiから選択され、非芳香環系が完全飽和である、非芳香族の3員~8員の単環式、7員~12員の二環式、または10員~14員の三環式環系をいう。ヘテロシクロアルキル基は、1つまたはそれより多くの置換基で必要に応じて置換され得る。1つの実施形態において、ヘテロシクロアルキル基の各環の0個、1個、2個、3個、または4個の原子は、置換基によって置換されていてもよい。代表的なヘテロシクロアルキル基としては、ピペリジニル、ピペラジニル、テトラヒドロピラニル、モルホリニル、チオモルホリニル、1,3-ジオキソラン、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロチエニル、およびチイレニルなどが挙げられる。
用語「ヘテロシクロアルキルアルキル」とは、-アルキル-ヘテロシクロアルキル置換基をいう。
用語「アルキルアミノ」とは、1個または2個のアルキル基でさらに置換されたアミノ置換基をいう。用語「アミノアルキル」とは、1個またはそれより多くのアミノ基でさらに置換されたアルキル基をいう。用語「ヒドロキシアルキル」または「ヒドロキシルアルキル」とは、1個またはそれより多くのヒドロキシル基でさらに置換されたアルキル基をいう。アルキルアミノ、アミノアルキル、メルカプトアルキル、ヒドロキシアルキル、メルカプトアルコキシ、スルホニルアルキル、スルホニルアリール、アルキルカルボニル、およびアルキルカルボニルアルキルの、アルキル部分またはアリール部分は、1個またはそれより多くの置換基で必要に応じて置換され得る。
用語「核酸塩基」とは、ヌクレオシドを形成する窒素含有生物学的化合物をいう。これらとしては、プリン塩基およびピリミジン塩基が挙げられる。5つの核酸塩基アデニン(A)、シトシン(C)、グアニン(G)、チミン(T)、およびウラシル(U)は、主要な(primary)または標準的な(canonical)核酸塩基と称される。核酸塩基が式の定義に列挙される場合、これは、記載される式に共有結合している部分をいう。
用語「修飾核酸塩基」とは、核酸塩基の誘導体をいう。修飾核酸塩基の例としては、キサンチン、ヒポキサンチン、7-メチルグアニン、5,6-ジヒドロウラシル、5-メチルシトシン、5-ヒドロキシメチルシトシン、プリン、2,6-ジアミノプリン、および6,8-ジアミノプリンが挙げられるが、これらに限定されない。修飾核酸塩基が式の定義に列挙される場合、これは、記載される式に共有結合している部分をいう。
本明細書中の方法において有用な酸および塩基は、当該分野において公知である。酸触媒は、任意の酸性化学物質であり、これらは本質的に、無機物(例えば、塩酸、硫酸、硝酸、三塩化アルミニウム)であっても有機物(例えば、ショウノウスルホン酸、p-トルエンスルホン酸、酢酸、三フッ化イッテルビウム)であってもよい。酸は、化学反応を容易にするために、触媒量または化学量論量のいずれかで有用である。塩基は、任意の塩基性化学物質であり、これらは本質的に、無機物(例えば、重炭酸ナトリウム、水酸化カリウム)であっても有機物(例えば、トリエチルアミン、ピリジン)であってもよい。塩基は、化学反応を容易にするために、触媒量または化学量論量のいずれかで有用である。
アルキル化剤とは、問題の官能基(例えば、アルコールの酸素原子、アミノ基の窒素原子)のアルキル化を起こすことが可能な、任意の試薬である。アルキル化剤は、本明細書中で引用される参考文献を含めて当該分野において公知であり、そしてハロゲン化アルキル(例えば、ヨウ化メチル、臭化ベンジル、もしくは塩化物)、アルキル硫酸エステル(例えば、硫酸メチル)、または当該分野において公知である他のアルキル基と脱離基との組み合わせ物が挙げられる。脱離基とは、反応中(例えば、脱離反応、置換反応)に分子から外れることができる任意の安定な種であり、そして本明細書中で引用される参考文献を含めて当該分野において公知であり、そしてハロゲン化物(例えば、I-、Cl-、Br-、F-)、ヒドロキシ、アルコキシ(例えば、-OMe、-O-t-Bu)、アシルオキシ陰イオン(例えば、-OAc、-OC(O)CF3)、スルホネート(例えば、メシル、トシル)、アセトアミド(例えば、-NHC(O)Me)、カルバメート(例えば、N(Me)C(O)Ot-Bu)、ホスホネート(例えば、-OP(O)(OEt)2)、水またはアルコール(プロトン性条件)などが挙げられる。
特定の実施形態において、任意の基(例えば、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、ヘテロアラルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキルなど)の上の置換基は、その基の任意の原子に存在し得、ここで置換され得る任意の基(例えば、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、ヘテロアラルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキルなど)は、それぞれが水素原子を置き換える1個またはそれより多くの置換基(同じであっても異なっていてもよい)で必要に応じて置換され得る。適切な置換基の例としては、アルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アラルキル、ヘテロアラルキル、アリール、ヘテロアリール、ハロゲン、ハロアルキル、シアノ、ニトロ、アルコキシ、アリールオキシ、ヒドロキシル、ヒドロキシルアルキル、オキソ(すなわち、カルボニル)、カルボキシル、ホルミル、アルキルカルボニル、アルキルカルボニルアルキル、アルコキシカルボニル、アルキルカルボニルオキシ、アリールオキシカルボニル、ヘテロアリールオキシ、ヘテロアリールオキシカルボニル、チオ、メルカプト、メルカプトアルキル、アリールスルホニル、アミノ、アミノアルキル、ジアルキルアミノ、アルキルカルボニルアミノ、アルキルアミノカルボニル、アルコキシカルボニルアミノ、アルキルアミノ、アリールアミノ、ジアリールアミノ、アルキルカルボニル、またはアリールアミノ置換アリール;アリールアルキルアミノ、アラルキルアミノカルボニル、アミド、アルキルアミノスルホニル、アリールアミノスルホニル、ジアルキルアミノスルホニル、アルキルスルホニルアミノ、アリールスルホニルアミノ、イミノ、カルボキサミド、カルバミド、カルバミル、チオウレイド、チオシアナト、スルホアミド、スルホニルアルキル、スルホニルアリール、メルカプトアルコキシ、N-ヒドロキシアミジニル、またはN’-アリール、N’’-ヒドロキシアミジニルが挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態において、任意の基の上の置換基としては、アルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アラルキル、ヘテロアラルキル、アリール、ヘテロアリール、ハロゲン、ハロアルキル、シアノ、ニトロ、アルコキシ、アリールオキシ、ヒドロキシル、ヒドロキシルアルキル、オキソ(すなわち、カルボニル)、カルボキシル、ホルミル、アルキルカルボニル、アルキルカルボニルアルキル、アルコキシカルボニル、アルキルカルボニルオキシ、チオカルボニル、チオ、メルカプト、メルカプトアルキル、アリールスルホニル、アミノ、アミノアルキル、ジアルキルアミノ、アルキルカルボニルアミノ、アルキルアミノカルボニル、アルコキシカルボニルアミノ、アルキルアミノ、アリールアミノ、ジアリールアミノ、アルキルカルボニル、またはアリールアミノ置換アリール;アリールアルキルアミノ、アラルキルアミノカルボニル、またはアミドが挙げられる。特定の実施形態において、任意の基の上の置換基としては、アルキル、ハロゲン、ハロアルキル、シアノ、ニトロ、アルコキシ、ヒドロキシル、ヒドロキシルアルキル、カルボキシル、ホルミル、アルキルカルボニル、アルコキシカルボニル、アルキルカルボニルオキシ、チオ、メルカプト、メルカプトアルキル、アミノ、アミノアルキル、ジアルキルアミノ、アルキルカルボニルアミノ、アルキルアミノカルボニル、またはアルキルアミノが挙げられる。
用語「保護基」または「保護部分」とは、化合物、その誘導体、またはその結合体上の他の官能基を反応させる間、特定の官能基を遮断または保護するために一般的に使用される、置換基をいい、そして窒素原子に結合している場合の窒素保護基、または酸素原子に結合している場合の酸素保護基が挙げられる。窒素保護基および酸素保護基は、当該分野において周知であり、そして本明細書中に参考として援用されるProtecting Groups in Organic Synthesis, T.W.Greene and P.G.M.Wuts,3rd edition,John Wiley & Sons,1999に詳細に記載されるものが挙げられる。
特定の実施形態において、窒素原子上に存在する置換基は、窒素保護基(アミノ保護基とも称される)である。窒素保護基としては、-OH、-ORaa、-N(Rcc)2、-C(=O)Raa、-C(=O)N(Rcc)2、-CO2Raa、-SO2Raa、-C(=NRcc)Raa、-C(=NRcc)ORaa、-C(=NRcc)N(Rcc)2、-SO2N(Rcc)2、-SO2Rcc、-SO2ORcc、-SORaa、-C(=S)N(Rcc)2、-C(=O)SRcc、-C(=S)SRcc、C1~10アルキル(例えば、アラルキル、ヘテロアラルキル)、C2~10アルケニル、C2~10アルキニル、C3~10カルボシクリル、3員~14員のヘテロシクリル、C6~14アリール、および5員14員のヘテロアリール基が挙げられるが、これらに限定されず、ここでアルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アラルキル、アリール、およびヘテロアリールの各は独立して、0個、1個、2個、3個、4個、または5個のRdd基で置換されており、そしてRaa、Rbb、およびRccの各々は独立して、アルキル、シクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールであり、これらの各々は、1個~3個の独立したRddで必要に応じて置換され得、そして各Rddは独立して、アルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アラルキル、ヘテロアラルキル、アリール、ヘテロアリール、ハロゲン、ハロアルキル、シアノ、ニトロ、アルコキシ、アリールオキシ、ヒドロキシル、ヒドロキシルアルキル、オキソ(すなわち、カルボニル)、カルボキシル、ホルミル、アルキルカルボニル、アルキルカルボニルアルキル、アルコキシカルボニル、アルキルカルボニルオキシ、アリールオキシカルボニル、ヘテロアリールオキシ、ヘテロアリールオキシカルボニル、チオ、メルカプト、メルカプトアルキル、アリールスルホニル、アミノ、アミノアルキル、ジアルキルアミノ、アルキルカルボニルアミノ、アルキルアミノカルボニル、アルコキシカルボニルアミノ、アルキルアミノ、アリールアミノ、ジアリールアミノ、アルキルカルボニル、またはアリールアミノ置換アリール;アリールアルキルアミノ、アラルキルアミノカルボニル、アミド、アルキルアミノスルホニル、アリールアミノスルホニル、ジアルキルアミノスルホニル、アルキルスルホニルアミノ、アリールスルホニルアミノ、イミノ、カルバミド、カルバミル、チオウレイド、チオシアナト、スルホアミド、スルホニルアルキル、スルホニルアリール、またはメルカプトアルコキシである。窒素保護基は、当該分野において周知であり、そして本明細書中に参考として援用されるProtecting Groups in Organic Synthesis,T.W.Greene and P.G.M.Wuts,3rd edition,John Wiley & Sons,1999に詳細に記載されるものが挙げられる。
アミド窒素保護基(例えば、-C(=O)Raa)としては、ホルムアミド、アセトアミド、クロロアセトアミド、トリクロロアセトアミド、トリフルオロアセトアミド、フェニルアセトアミド、3-フェニルプロパンアミド、ピコリンアミド、3-ピリジルカルボキサミド、N-ベンゾイルフェニルアラニル誘導体、ベンズアミド、p-フェニルベンズアミド、o-ニトロフェニルアセトアミド、o-ニトロフェノキシアセトアミド、アセトアセトアミド、(N’-ジチオベンジルオキシアシルアミノ)アセトアミド、3-(p-ヒドロキシフェニル)プロパンアミド、3-(o-ニトロフェニル)プロパンアミド、2-メチル-2-(o-ニトロフェノキシ)プロパンアミド、2-メチル-2-(o-フェニルアゾフェノキシ)プロパンアミド、4-クロロブタンアミド、3-メチル-3-ニトロブタンアミド、o-ニトロシンナミド、N-アセチルメチオニン、o-ニトロベンズアミド、およびo-(ベンゾイルオキシメチル)ベンズアミドが挙げられるが、これらに限定されない。
カルバメート窒素保護基(例えば、-C(=O)ORaa)としては、カルバミン酸メチル、カルバミン酸エチル、カルバミン酸9-フルオレニルメチル(Fmoc)、カルバミン酸9-(2-スルホ)フルオレニルメチル、カルバミン酸9-(2,7-ジブロモ)フルオレニルメチル、カルバミン酸2,7-ジ-t-ブチル-[9-(10,10-ジオキソ-10,10,10,10-テトラヒドロチオキサンチル)]メチル(DBD-Tmoc)、カルバミン酸4-メトキシフェナシル(Phenoc)、カルバミン酸2,2,2-トリクロロエチル(Troc)、カルバミン酸2-トリメチルシリルエチル(Teoc)、カルバミン酸2-フェニルエチル(hZ)、カルバミン酸1-(1-アダマンチル)-1-メチルエチル(Adpoc)、カルバミン酸1,1-ジメチル-2-ハロエチル、カルバミン酸1,1-ジメチル-2,2-ジブロモエチル(DB-t-BOC)、カルバミン酸1,1-ジメチル-2,2,2-トリクロロエチル(TCBOC)、カルバミン酸1-メチル-1-(4-ビフェニリル)エチル(Bpoc)、カルバミン酸1-(3,5-ジ-t-ブチルフェニル)-1-メチルエチル(t-Bumeoc)、カルバミン酸2-(2’-および4’-ピリジル)エチル(Pyoc)、カルバミン酸2-(N,N-ジシクロヘキシルカルボキサミド)エチル、カルバミン酸t-ブチル(BOC)、カルバミン酸1-アダマンチル(Adoc)、カルバミン酸ビニル(Voc)、カルバミン酸アリル(Alloc)、カルバミン酸1-イソプロピルアリル(Ipaoc)、カルバミン酸シンナミル(Coc)、カルバミン酸4-ニトロシンナミル(Noc)、カルバミン酸8-キノリル、カルバミン酸N-ヒドロキシピペリジニル、カルバミン酸アルキルジチオ、カルバミン酸ベンジル(Cbz)、カルバミン酸p-メトキシベンジル(Moz)、カルバミン酸p-ニトロベンジル、カルバミン酸p-ブロモベンジル、カルバミン酸p-クロロベンジル、カルバミン酸2,4-ジクロロベンジル、カルバミン酸4-メチルスルフィニルベンジル(Msz)、カルバミン酸9-アントリルメチル、カルバミン酸ジフェニルメチル、カルバミン酸2-メチルチオエチル、カルバミン酸2-メチルスルホニルエチル、カルバミン酸2-(p-トルエンスルホニル)エチル、カルバミン酸[2-(1,3-ジチアニル)]メチル(Dmoc)、カルバミン酸4-メチルチオフェニル(Mtpc)、カルバミン酸2,4-ジメチルチオフェニル(Bmpc)、カルバミン酸2-ホスホニオエチル(Peoc)、カルバミン酸2-トリフェニルホスホニオイソプロピル(Ppoc)、カルバミン酸1,1-ジメチル-2-シアノエチル、カルバミン酸m-クロロ-p-アシルオキシベンジル、カルバミン酸p-(ジヒドロキシボリル)ベンジル、カルバミン酸5-ベンゾイソオキサゾリルメチル、カルバミン酸2-(トリフルオロメチル)-6-クロモニルメチル(Tcroc)、カルバミン酸m-ニトロフェニル、カルバミン酸3,5-ジメトキシベンジル、カルバミン酸o-ニトロベンジル、カルバミン酸3,4-ジメトキシ-6-ニトロベンジル、カルバミン酸フェニル(o-ニトロフェニル)メチル、カルバミン酸t-アミル、チオカルバミン酸S-ベンジル、カルバミン酸p-シアノベンジル、カルバミン酸シクロブチル、カルバミン酸シクロヘキシル、カルバミン酸シクロペンチル、カルバミン酸シクロプロピルメチル、カルバミン酸p-デシルオキシベンジル、カルバミン酸2,2-ジメトキシアシルビニル、カルバミン酸o-(N,N-ジメチルカルボキサミド)ベンジル、カルバミン酸1,1-ジメチル-3-(N,N-ジメチルカルボキサミド)プロピル、カルバミン酸1,1-ジメチルプロピニル、カルバミン酸ジ(2-ピリジル)メチル、カルバミン酸2-フラニルメチル、カルバミン酸2-ヨードエチル、カルバミン酸イソボルニル、カルバミン酸イソブチル、カルバミン酸イソニコチニル、カルバミン酸p-(p’-メトキシフェニルアゾ)ベンジル、カルバミン酸1-メチルシクロブチル、カルバミン酸1-メチルシクロヘキシル、カルバミン酸1-メチル-1-シクロプロピルメチル、カルバミン酸1-メチル-1-(3,5-ジメトキシフェニル)エチル、カルバミン酸1-メチル-1-(p-フェニルアゾフェニル)エチル、カルバミン酸1-メチル-1-フェニルエチル、カルバミン酸1-メチル-1-(4-ピリジル)エチル、カルバミン酸フェニル、カルバミン酸p-(フェニルアゾ)ベンジル、カルバミン酸2,4,6-トリ-t-ブチルフェニル、カルバミン酸4-(トリメチルアンモニウム)ベンジル、およびカルバミン酸2,4,6-トリメチルベンジルが挙げられるが、これらに限定されない。
スルホンアミド窒素保護基(例えば、-S(=O)2Raa)としては、p-トルエンスルホンアミド(Ts)、ベンゼンスルホンアミド、2,3,6,-トリメチル-4-メトキシベンゼンスルホンアミド(Mtr)、2,4,6-トリメトキシベンゼンスルホンアミド(Mtb)、2,6-ジメチル-4-メトキシベンゼンスルホンアミド(Pme)、2,3,5,6-テトラメチル-4-メトキシベンゼンスルホンアミド(Mte)、4-メトキシベンゼンスルホンアミド(Mbs)、2,4,6-トリメチルベンゼンスルホンアミド(Mts)、2,6-ジメトキシ-4-メチルベンゼンスルホンアミド(iMds)、2,2,5,7,8-ペンタメチルクロマン-6-スルホンアミド(Pmc)、メタンスルホンアミド(Ms)、β-トリメチルシリルエタンスルホンアミド(SES)、9-アントラセンスルホンアミド、4-(4’,8’-ジメトキシナフチルメチル)ベンゼンスルホンアミド(DNMBS)、ベンジルスルホンアミド、トリフルオロメチルスルホンアミド、およびフェナシルスルホンアミドが挙げられるが、これらに限定されない。
他の窒素保護基としては、フェノチアジニル-(10)-アシル誘導体、N’-p-トルエンスルホニルアミノアシル誘導体、N’-フェニルアミノチオアシル誘導体、N-ベンゾイルフェニルアラニル誘導体、N-アセチルメチオニン誘導体、4,5-ジフェニル-3-オキサゾリン-2-オン、N-フタルイミド、N-ジチアスクシンイミド(Dts)、N-2,3-ジフェニルマレイミド、N-2,5-ジメチルピロール、N-1,1,4,4-テトラメチルジシリルアザシクロペンタン付加体(STABASE)、5-置換1,3-ジメチル-1,3,5-トリアザシクロヘキサン-2-オン、5-置換1,3-ジベンジル-1,3,5-トリアザシクロヘキサン-2-オン、1-置換3,5-ジニトロ-4-ピリドン、N-メチルアミン、N-アリルアミン、N-[2-(トリメチルシリル)エトキシ]メチルアミン(SEM)、N-3-アセトキシプロピルアミン、N-(1-イソプロピル-4-ニトロ-2-オキソ-3-ピロオリン-3-イル)アミン(N-(1-isopropyl-4-nitro-2-oxo-3-pyroolin-3-yl)amine)、第四級アンモニウム塩、N-ベンジルアミン、N-ジ(4-メトキシフェニル)メチルアミン、N-5-ジベンゾスベリルアミン、N-トリフェニルメチルアミン(Tr)、N-[(4-メトキシフェニル)ジフェニルメチル]アミン(MMTr)、N-9-フェニルフルオレニルアミン(PhF)、N-2,7-ジクロロ-9-フルオレニルメチレンアミン、N-フェロセニルメチルアミノ(Fcm)、N-2-ピコリルアミノN’-オキシド、N-1,1-ジメチルチオメチレンアミン、N-ベンジリデンアミン、N-p-メトキシベンジリデンアミン、N-ジフェニルメチレンアミン、N-[(2-ピリジル)メシチル]メチレンアミン、N-(N’,N’-ジメチルアミノメチレン)アミン、N,N’-イソプロピリデンジアミン、N-p-ニトロベンジリデンアミン、N-サリチリデンアミン、N-5-クロロサリチリデンアミン、N-(5-クロロ-2-ヒドロキシフェニル)フェニルメチレンアミン、N-クロロヘキシリデンアミン、N-(5,5-ジメチル-3-オキソ-1-シクロヘキセニル)アミン、N-ボラン誘導体、N-ジフェニルボロン酸誘導体、N-[フェニル(ペンタアシルクロミウム-またはタングステン)アシル]アミン、N-銅キレート、N-亜鉛キレート、N-ニトロアミン、N-ニトロソアミン、アミンN-オキシド、ジフェニルホスフィンアミド(Dpp)、ジメチルチオホスフィンアミド(Mpt)、ジフェニルチオホスフィンアミド(Ppt)、ジアルキルホスホロアミデート、ジベンジルホスホロアミデート、ジフェニルホスホロアミデート、ベンゼンスルフェンアミド、o-ニトロベンゼンスルフェンアミド(Nps)、2,4-ジニトロベンゼンスルフェンアミド、ペンタクロロベンゼンスルフェンアミド、2-ニトロ-4-メトキシベンゼンスルフェンアミド、トリフェニルメチルスルフェンアミド、および3-ニトロピリジンスルフェンアミド(Npys)が挙げられるが、これらに限定されない。
特定の実施形態において、酸素原子上に存在する置換基は、酸素保護基(ヒドロキシル保護基とも称される)である。酸素保護基としては、-Raa、-N(Rbb)2、-C(=O)SRaa、-C(=O)Raa、-CO2Raa、-C(=O)N(Rbb)2、-C(=NRbb)Raa、-C(=NRbb)ORaa、-C(=NRbb)N(Rbb)2、-S(=O)Raa、-SO2Raa、-Si(Raa)3、-P(Rcc)2、-P(Rcc)3、-P(=O)2Raa、-P(=O)(Raa)2、-P(=O)(ORcc)2、-P(=O)2N(Rbb)2、およぼい-P(=O)(NRbb)2が挙げられるが、これらに限定されず、ここでRaa、Rbb、およびRccは、本明細書中で定義されるとおりである。酸素保護基は、当該分野において周知であり、そして本明細書中に参考として援用されるProtecting Groups in Organic Synthesis,T.W.Greene and P.G.M.Wuts,3rd edition,John Wiley & Sons,1999に詳細に記載されるものが挙げられる。
例示的な酸素保護基としては、メチル、メトキシメチル(MOM)、メチルチオメチル(MTM)、t-ブチルチオメチル、(フェニルジメチルシリル)メトキシメチル(SMOM)、ベンジルオキシメチル(BOM)、p-メトキシベンジルオキシメチル(PMBM)、(4-メトキシフェノキシ)メチル(p-AOM)、グアイアコールメチル(GUM)、t-ブトキシメチル、4-ペンテニルオキシメチル(POM)、シロキシメチル、2-メトキシエトキシメチル(MEM)、2,2,2-トリクロロエトキシメチル、ビス(2-クロロエトキシ)メチル、2-(トリメチルシリル)エトキシメチル(SEMOR)、テトラヒドロピラニル(THP)、3-ブロモテトラヒドロピラニル、テトラヒドロチオピラニル、1-メトキシシクロヘキシル、4-メトキシテトラヒドロピラニル(MTHP)、4-メトキシテトラヒドロチオピラニル、4-メトキシテトラヒドロチオピラニルS,S-ジオキシド、1-[(2-クロロ-4-メチル)フェニル]-4-メトキシピペリジン-4-イル(CTMP)、1,4-ジオキサン-2-イル、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロチオフラニル、2,3,3a,4,5,6,7,7a-オクタヒドロ-7,8,8-トリメチル-4,7-メタノベンゾフラン-2-イル、1-エトキシエチル、1-(2-クロロエトキシ)エチル、1-メチル-1-メトキシエチル、1-メチル-1-ベンジルオキシエチル、1-メチル-1-ベンジルオキシ-2-フルオロエチル、2,2,2-トリクロロエチル、2-トリメチルシリルエチル、2-(フェニルセレニル)エチル、t-ブチル、アリル、p-クロロフェニル、p-メトキシフェニル、2,4-ジニトロフェニル、ベンジル(Bn)、p-メトキシベンジル、3,4-ジメトキシベンジル、o-ニトロベンジル、p-ニトロベンジル、p-ハロベンジル、2,6-ジクロロベンジル、p-シアノベンジル、p-フェニルベンジル、2-ピコリル、4-ピコリル、3-メチル-2-ピコリルN-オキシド、ジフェニルメチル、p,p’-ジニトロベンズヒドリル、5-ジベンゾスベリル、トリフェニルメチル、α-ナフチルジフェニルメチル、p-メトキシフェニルジフェニルメチル、ジ(p-メトキシフェニル)フェニルメチル、トリ(p-メトキシフェニル)メチル、4-(4’-ブロモフェナシルオキシフェニル)ジフェニルメチル、4,4’,4”-トリス(4,5-ジクロロフタルイミドフェニル)メチル、4,4’,4”-トリス(レブリノイルオキシフェニル)メチル、4,4’,4”-トリス(ベンゾイルオキシフェニル)メチル、3-(イミダゾール-1-イル)ビス(4’,4”-ジメトキシフェニル)メチル、1,1-ビス(4-メトキシフェニル)-1’-ピレニルメチル、9-アントリル、9-(9-フェニル)キサンテニル、9-(9-フェニル-10-オキソ)アントリル、1,3-ベンゾジスルフラン-2-イル、ベンゾイソチアゾリルS,S-ジオキシド、トリメチルシリル(TMS)、トリエチルシリル(TES)、トリイソプロピルシリル(TIPS)、ジメチルイソプロピルシリル(IPDMS)、ジエチルイソプロピルシリル(DEIPS)、ジメチルtヘキシルシリル、t-ブチルジメチルシリル(TBDMS)、t-ブチルジフェニルシリル(TBDPS)、トリベンジルシリル、トリ-p-キシリルシリル、トリフェニルシリル、ジフェニルメチルシリル(DPMS)、t-ブチルメトキシフェニルシリル(TBMPS)、ホルメート、ベンゾイルホルメート、アセテート、クロロアセテート、ジクロロアセテート、トリクロロアセテート、トリフルオロアセテート、メトキシアセテート、トリフェニルメトキシアセテート、フェノキシアセテート、p-クロロフェノキシアセテート、3-フェニルプロピオネート、4-オキソペンタノエート(レブリネート)、4,4-(エチレンジチオ)ペンタノエート(レブリノイルジチオアセタール)、ピバロエート、アダマントエート、クロトネート、4-メトキシクロトネート、ベンゾエート、p-フェニルベンゾエート、2,4,6-トリメチルベンゾエート(メシトエート(mesitoate))、t-ブチル=カーボネート(BOC)、アルキル=メチル=カーボネート、9-フルオレニルメチル=カーボネート(Fmoc)、アルキル=エチル=カーボネート、アルキル=2,2,2-トリクロロエチル=カーボネート(Troc)、2-(トリメチルシリル)エチル=カーボネート(TMSEC)、2-(フェニルスルホニル)=エチル=カーボネート(Psec)、2-(トリフェニルホスホニオ)=エチル=カーボネート(Peoc)、アルキル=イソブチル=カーボネート、アルキル=ビニル=カーボネート アルキル=アリル=カーボネート、アルキル=p-ニトロフェニル=カーボネート、アルキル=ベンジル=カーボネート、アルキル=p-メトキシベンジル=カーボネート、アルキル=3,4-ジメトキシベンジル=カーボネート、アルキル=o-ニトロベンジル=カーボネート、アルキル=p-ニトロベンジル=カーボネート、アルキル=S-ベンジル=チオカーボネート、4-エトキシ-1-ナフチル=カーボネート、ジチオ炭酸メチル、2-ヨードベンゾエート、4-アジドブチレート、4-ニトロ-4-メチルペンタノエート、o-(ジブロモメチル)ベンゾエート、2-ホルミルベンゼンスルホネート、2-(メチルチオメトキシ)エチル、4-(メチルチオメトキシ)ブチレート、2-(メチルチオメトキシメチル)ベンゾエート、2,6-ジクロロ-4-メチルフェノキシアセテート、2,6-ジクロロ-4-(1,1,3,3-テトラメチルブチル)フェノキシアセテート、2,4-ビス(1,1-ジメチルプロピル)フェノキシアセテート、クロロジフェニルアセテート、イソブチレート、モノスクシネート(monosuccinoate)、(E)-2-メチル-2-ブテノエート、o-(メトキシアシル)ベンゾエート、α-ナフトエート、ニトレート、アルキル=N,N,N’,N’-テトラメチルホスホロジアミデート、アルキル=N-フェニルカルバメート、ボレート、ジメチルホスフィノチオイル、アルキル=2,4-ジニトロフェニルスルフェネート、スルフェート、メタンスルホネート(メシレート)、ベンジルスルホネート、およびトシレート(Ts)が挙げられるが、これらに限定されない。
特定の実施形態において、硫黄原子上に存在する置換基は、硫黄保護基(チオール保護基とも称される)である。硫黄保護基としては、-Raa、-N(Rbb)2、-C(=O)SRaa、-C(=O)Raa、-CO2Raa、-C(=O)N(Rbb)2、-C(=NRbb)Raa、-C(=NRbb)ORaa、-C(=NRbb)N(Rbb)2、-S(=O)Raa、-SO2Raa、-Si(Raa)3、-P(Rcc)2、-P(Rcc)3、-P(=O)2Raa、-P(=O)(Raa)2、-P(=O)(ORcc)2、-P(=O)2N(Rbb)2、および-P(=O)(NRbb)2が挙げられるが、これらに限定されず、ここでRaa、Rbb、およびRccは、本明細書中で定義されるとおりである。硫黄保護基は、当該分野において周知であり、そして本明細書中に参考として援用されるProtecting Groups in Organic Synthesis,T.W.Greene and P.G.M.Wuts,3rd edition,John Wiley & Sons,1999に詳細に記載されるものが挙げられる。
「マイケルアクセプター」とは、α,β-不飽和求電子試薬、例えば、α,β-不飽和カルボニル誘導体またはα,β-不飽和ニトリルなどであるがこれらに限定されないものを意味する。
マイケルアクセプターの定義の文脈内で、以下のことが理解されるべきである:「求電子試薬」とは、電子対を受容し得ることを意味する;「α,β-不飽和求電子試薬」とは、α,β-不飽和カルボニル誘導体、α,β-不飽和ニトリル、α,β-不飽和スルホン、またはニトロ基などであるがこれに限定されない強力な電子吸引基で置換された他のビニル誘導体が挙げられるが、これらに限定されない化合物のクラスを意味する;「α,β-不飽和カルボニル誘導体」とは、α,β-不飽和ケトン、キノン、もしくはこれらの誘導体、α,β-不飽和アルデヒド、α,β-不飽和カルボン酸誘導体、例えば、エステル、アミド、置換アミド、もしくはマレイミドまたはこれらの誘導体などであるがこれに限定されないものが挙げられるが、これらに限定されない化合物のクラスを意味する。マイケルアクセプターの代表的な例としては、アクリロニトリル、アクリルアミド、アクリル酸メチル、アクリル酸エチル、メタクリル酸メチル、アクリル酸2-エチルヘキシル、クロトンアルデヒド、メチルビニルケトン、およびアクロレインが挙げられるが、これらに限定されない。
「核酸と反応し得るマイケルアクセプターまたは求電子試薬」としては、核酸と不都合に相互作用するような種、例えば、核酸求核試薬との潜在的に遺伝子毒性である反応に関与し得る種が挙げられる。
チオール-マイケル付加体を形成するための、マイケルアクセプターの有機チオールとの反応は、文書で十分に示された反応である(Chem.Commun.2005,669-671およびこれに引用される研究)。この反応は、水および有機溶媒中で進行することが示されている。酸性触媒と塩基性触媒との両方が、チオール-マイケル付加体の形成を容易にし、そして副反応を最小にするために、使用されている。
1つの局面において、本明細書中に記載される化合物は、オリゴマー化合物である。本明細書中で使用される場合、「オリゴマー化合物」とは、約10~50個のヌクレオチドまたはヌクレオチド塩基対を含むヌクレオチド配列である。いくつかの実施形態において、オリゴマー化合物は、細胞内の発現された標的核酸または標的遺伝子のコード配列に対して少なくとも部分的に相補的である、核酸塩基配列を有する。いくつかの実施形態において、これらのオリゴマー化合物は、遺伝子を発現する細胞に送達されると、その基礎にある遺伝子の発現を阻害することが可能である。遺伝子発現は、インビトロまたはインビボで阻害され得る。「オリゴマー化合物」としては、オリゴヌクレオチド、一本鎖オリゴヌクレオチド、一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチド、ショート干渉RNA(short interfering RNA)(siRNA)、二本鎖RNA(dsRNA)、マイクロRNA(miRNA)、短ヘアピンRNA(short hairpin RNA)(shRNA)、リボザイム、および干渉RNA(interfering RNA)分子が挙げられるが、これらに限定されない。
本明細書中で使用される場合、「核酸」(例えば、ポリヌクレオチド、オリゴヌクレオチド、ヌクレオチドのポリマー)は、限定されないが、リボ核酸(例えば、リボヌクレオシドから構成される)、デオキシリボ核酸(例えば、デオキシリボヌクレオシドから構成される)、修飾核酸(例えば、修飾核酸塩基、糖、および/またはリン酸基から構成される)、あるいはこれらの組み合わせから構成され得る。いくつかの実施形態において、核酸はリボ核酸(RNA)を含む。いくつかの実施形態において、核酸はデオキシリボ核酸(DNA)を含む。いくつかの実施形態において、核酸は修飾(例えば、修飾核酸塩基、修飾糖、または修飾ホスフェート)を含む。
核酸は、一本鎖であっても二本鎖であってもよい。いくつかの実施形態において、核酸は、一本鎖(例えば、ssRNA、ssDNA、ssRNA/DNAハイブリッド(例えば、リボヌクレオシド(修飾または非修飾)とデオキシリボヌクレオシド(修飾または非修飾)との両方から構成される一本鎖核酸)である。いくつかの実施形態において、核酸は二本鎖である(例えば、2つの一本鎖核酸から構成される)。
いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも2(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、またはそれより長い)ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも5ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも10ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも20ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも30ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも40ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも50ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも60ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも70ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも80ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも90ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも100ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも150ヌクレオチド長である。
いくつかの実施形態において、核酸は、150(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150)ヌクレオチド長に等しいかまたはこれより短い。いくつかの実施形態において、核酸は、150ヌクレオチド長に等しいかまたはこれより短い。いくつかの実施形態において、核酸は、100ヌクレオチド長に等しいかまたはこれより短い。いくつかの実施形態において、核酸は、90ヌクレオチド長に等しいかまたはこれより短い。いくつかの実施形態において、核酸は、80ヌクレオチド長に等しいかまたはこれより短い。いくつかの実施形態において、核酸は、70ヌクレオチド長に等しいかまたはこれより短い。いくつかの実施形態において、核酸は、60ヌクレオチド長に等しいかまたはこれより短い。いくつかの実施形態において、核酸は、50ヌクレオチド長に等しいかまたはこれより短い。いくつかの実施形態において、核酸は、40ヌクレオチド長に等しいかまたはこれより短い。いくつかの実施形態において、核酸は、30ヌクレオチド長に等しいかまたはこれより短い。いくつかの実施形態において、核酸は、20ヌクレオチド長に等しいかまたはこれより短い。いくつかの実施形態において、核酸は、10ヌクレオチド長に等しいかまたはこれより短い。いくつかの実施形態において、核酸は、5ヌクレオチド長に等しいかまたはこれより短い。
いくつかの実施形態において、核酸は、約5ヌクレオチド長~約150ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、核酸は、約10ヌクレオチド長~約100ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、核酸は、約20ヌクレオチド長~約90ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、核酸は、約30ヌクレオチド長~約80ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、核酸は、約40ヌクレオチド長~約70ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、核酸は、約50ヌクレオチド長~約60ヌクレオチド長である。
いくつかの実施形態において、核酸は治療用核酸である。治療用核酸は、例えば、限定されないが、低分子干渉RNA(small interfering RNA)(siRNA)、マイクロRNA(miRNA)、ADAR動員分子、ADAR標的化部分、ガイドRNA、アンチセンス核酸、またはこれらの組み合わせを含み得る。
用語「マイクロRNA」および「miRNA」とは、本明細書中で交換可能に使用され得る場合、mRNAの安定性と翻訳との両方に影響を与えることによって、多細胞生物における遺伝子発現の翻訳後調節に関与する、短い(例えば、約20~約24ヌクレオチド長の)非コードリボ核酸(RNA)をいう。miRNAは、RNAポリメラーゼIIによって、キャップされポリアデニル化された一次転写産物(pri-miRNA)の、タンパク質をコードしていてもコードしていなくてもよい一部分として、転写される。この一次転写産物は、DroshaリボヌクレアーゼIII酵素により切断されて、およそ70ヌクレオチド長のステム-ループ前駆体miRNA(pre-miRNA)を生成し、これは、RNAi経路においてさらにプロセシングされる。この経路の一部として、このpre-miRNAは、細胞質Dicerリボヌクレアーゼにより切断されて、成熟miRNAおよびアンチセンスmiRNAスター(miRNA*)生成物を生成する。この成熟miRNAは、RNA誘導サイレンシング複合体(RISC)に組み込まれ、これは、miRNAとの不完全な塩基対合(すなわち、部分的な相補性)を介して標的mRNAを認識し、そして最も一般的には、この標的mRNAの転写阻害または不安定化をもたらす。この機構は、最も頻繁には、この標的mRNAの3’非翻訳領域(UTR)でのmiRNAの結合を介して見られ、これは、遺伝子発現を、翻訳を阻害すること(例えば、翻訳のためのリボソームの接近を遮断することによって)、または転写産物の分解を直接引き起こすことのいずれかによって、減少させ得る。この用語(すなわち、miRNA)は、本明細書中で、主題のmiRNAの任意の形態(例えば、前駆体、一次、および/または成熟miRNA)に対して使用され得る。
用語「低分子干渉RNA」および「siRNA」とは、本明細書中で交換可能に使用され得る場合、RNA干渉(RNAi)において有用な、約20~約24ヌクレオチド長(miRNAとおよそ類似)の非コード二本鎖RNA(dsRNA)分子として存在するRNA分子をいう。siRNAはしばしば、リン酸化5’末端およびヒドロキシル化3’末端を有することが見出され、この3’末端は代表的に、逆平行鎖(例えば、dsRNA分子の相補鎖)の5’末端を超える2ヌクレオチドの突出部を有する。siRNAは、最も頻繁には、これらが相補的である標的配列(例えば、標的遺伝子配列)の結合を介して、特定の遺伝子の発現を妨害し、そしてmRNAの分解を促進し(例えば、容易にし、誘発し、開始させ)、これによって、翻訳を防止(例えば、阻害、サイレンシング、妨害)することが見出されている。RISC複合体への組込みおよび分離の後に、siRNAはこれらの標的mRNAに塩基対形成(例えば、完全に相補的)してこれを切断し、これによって、この標的mRNAが翻訳テンプレートとして使用されることを防止する。本明細書中で上で議論されたように、RNAi経路の一部でもあるmiRNA負荷RISC複合体は、細胞質mRNAを潜在的な相補性(例えば、部分的な相補性)に関して走査する。
用語「ADAR動員分子」とは、本明細書中で使用され得る場合、リボ核酸に作用するアデノシンデアミナーゼ(ADAR)酵素の、核酸の周囲の場所での濃度を増大するように構成された、核酸をいう。いくつかの実施形態において、増大した濃度は、このADAR動員分子が存在しない、所与の場所での濃度と比較したものである。いくつかの実施形態において、ADAR動員分子は二本鎖RNA二重鎖を含む。
用語「ADAR標的化部分」とは、本明細書中で使用され得る場合、ADAR分子を所望の位置(例えば、場所)に方向付けるように構成された核酸をいう。本明細書中で使用される場合、用語「方向付ける」とは、ADARの濃度を、ADAR標的化部分の非存在下での濃度と比較して、望ましい位置において増大させることをいう。いくつかの実施形態において、ADAR標的化部分は、核酸の配列および/または特性を(例えば、核酸塩基、糖、ホスフェート、または他の成分への改変によって)変化させることによって、望ましい位置を制御するように構成され得る。いくつかの実施形態において、ADAR標的化部分は、ADAR動員分子および一本鎖ガイド核酸を含む。いくつかの実施形態において、ADAR標的化部分は、二本鎖RNA二重鎖および一本鎖ガイド核酸を含む。
用語「一本鎖ガイド核酸」とは、本明細書中で使用され得る場合、標的配列に少なくとも部分的に相補的である特定の配列を含む、一本鎖の核酸をいう。いくつかの実施形態において、この標的配列は、ADAR濃度を調節するために望ましい場所に、またはそこに隣接して、またはその近隣に、存在する。いくつかの実施形態において、相補性のレベルは、一本鎖ガイド核酸の標的配列への結合(例えば、アニーリング)を容易にするために十分である。
用語「アンチセンス分子」とは、本明細書中で使用され得る場合、標的核酸配列に相補的なヌクレオチドの配列を合成するかまたは含む、オリゴヌクレオチド(例えば、ヌクレオチドのポリマー)をいう。例えば、RNA(例えば、mRNA、miRNA)に関して、鎖は5’-AAGGUCCU-3’と読まれ得、一方でアンチセンス分子は、3’-UUCCAGGA-5’と読まれる。RNAを標的とするアンチセンス分子の場合、これらは、種々の方法で発現を調節し得る。例えば、鎖は、mRNAを標的とし得(これによって、翻訳を遮断し得、そしてこのmRNA転写産物の分解を促進し得る)、または別の方法で、これらの鎖は、miRNAを標的とし得る(これによって、遮断miRNAがmRNAを標的とすること、およびこのmRNAからの翻訳の促進もしくは回復を阻害し得、そしてこの遮断miRNAの分解を促進し得る)。
いくつかの実施形態において、核酸は、GalNAc部分に結合する。GalNAc(N-アセチルガラクトサミン)とは、ガラクトースのアミノ糖誘導体である。いくつかの実施形態において、GalNAc部分は、構造
を含む。いくつかの実施形態において、GalNAc部分は、構造
を含む。GalNAc部分は、種々の組織および細胞の受容体に対して親和性を有する部分である。この方法で、GalNAc部分は、積荷(cargo)(例えば、核酸)の、このような組織および受容体への標的化を容易にし得る。いくつかの実施形態において、GalNAc部分は、核酸を方向付けるために有用である。いくつかの実施形態において、GalNAc部分は、核酸をある場所に方向付ける。いくつかの実施形態において、GalNAc部分は組織を標的にする。いくつかの実施形態において、この組織は肝臓である。いくつかの実施形態において、GalNAc部分は細胞受容体を標的にする。いくつかの実施形態において、細胞受容体は、アシアロ糖タンパク質受容体である。いくつかの実施形態において、肝細胞上のアシアロ糖タンパク質受容体である。
いくつかの実施形態において、核酸は、1個より多くのGalNAc部分に結合する。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも2つのGalNAc部分(例えば、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、またはこれより多く)に結合する。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも3つのGalNAc部分に結合する。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも5つのGalNAc部分に結合する。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも1つ~約10のGalNAc部分に結合する。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも1つ~約8つのGalNAc部分に結合する。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも1つ~約6つのGalNAc部分に結合する。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも1つ~約4つのGalNAc部分に結合する。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも1つ~約2つのGalNAc部分に結合する。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも1つ~10のGalNAc部分に結合する。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも1つ~8つのGalNAc部分に結合する。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも1つ~6つのGalNAc部分に結合する。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも1つ~4つのGalNAc部分に結合する。いくつかの実施形態において、核酸は、少なくとも1つ~2つのGalNAc部分に結合する。
いくつかの実施形態において、核酸は、GalNAc部分に、この核酸の5’末端および/または3’末端のいずれかを介して結合する(例えば、接続する、付着する、関連する)。いくつかの実施形態において、核酸は、GalNAc部分に、この核酸の5’末端を介して結合する。いくつかの実施形態において、核酸は、GalNAc部分に、この核酸の3’末端を介して結合する。いくつかの実施形態において、核酸は、GalNAc部分に、この核酸の5’末端と3’末端との両方を介して結合する。いくつかの実施形態において、核酸は、GalNAc部分に、この核酸の内側部分で結合する。
いくつかの局面において、本開示は、本明細書中に開示される、核酸およびGalNAcを含む組成物を作製する方法に関する。
別の局面において、本発明は、本明細書中の化合物の式の結合体を提供する。1つの実施形態において、これらの結合体は、タンパク質、核酸、低分子、大分子、治療剤、診断剤、画像化剤、または標的化剤である部分に共有結合した、本発明の式の部分を含む。
本明細書中に開示される結合体は、任意の利用可能な方法を使用して製造され得る。薬剤部分(例えば、タンパク質、核酸、低分子、大分子、治療剤、診断剤、画像化剤、または標的化剤)を有する化合物の式の部分に関連する場合、これらの部分は、直接、または間接的に(例えば、リンカー部分を介して;すなわち、このリンカーは、この化合物の式の部分と薬剤部分との各々に共有結合する;本明細書中のいくつかの式において、「-L-」)、連結され得る。例えば、化合物の式および薬剤は、互いに直接(例えば、1つもしくはそれより多くの共有結合によって)関連し得るか、または1つもしくはそれより多くのリンカーによって関連し得る。
「治療剤」は、肝細胞を調節するため、あるいは肝臓の疾患、例えばウイルス性肝炎、肝線維症、非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)、非アルコール性脂肪肝疾患(NAFLD)、希少疾病、代謝病、肥満症、心血管疾患 ヘモクロマトーシス、サラセミア、肝外傷、アルコール性肝疾患、または肝臓の遺伝性疾患を処置するための治療剤であり得、オリゴヌクレオチド、低分子、またはペプチドが挙げられ、例えば、ウルソジオール、メチクロチアジド、ピオグリタゾン、メタドキシン、サイスタダン、オンダンセトロン、シリマリン、ラミブジン、アデホビル、テノホビルジソプロキシル、テノホビルアラフェナミド、テルビブジン、エンテカビル、およびコール酸が挙げられるが、これらに限定されない。
任意の適切なリンカーが、本発明に従って使用され得る。リンカーは、アミド結合、エステル結合、ジスルフィド結合などを形成するために使用され得る。リンカーは、炭素原子またはヘテロ原子(例えば、窒素、酸素、硫黄など)を含み得る。代表的に、リンカーは、1原子~50原子の長さ、1原子~40原子の長さ、1原子~25原子の長さ、1原子~20原子の長さ、1原子~15原子の長さ、1原子~10原子の長さ、または1原子~5原子の長さである。リンカーは、水素原子、アルキル、アルケニル、アルキニル、アミノ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、トリアルキルアミノ、ヒドロキシル、アルコキシ、ハロゲン、アリール、複素環式、芳香族複素環式、シアノ、アミド、カルバモイル、カルボン酸、エステル、チオエーテル、アルキルチオエーテル、チオール、およびウレイド基が挙げられるが、これらに限定されない種々の置換基で置換され得る。当業者によって理解されるように、これらの基の各々は、さらに置換されてもよい。このリンカーは、脂肪族リンカーまたはヘテロ脂肪族リンカーであり得る。例えば、このリンカーは、ポリアルキルリンカーであり得る。このリンカーは、ポリエーテルリンカーであり得る。このリンカーは、ポリエチレンリンカー、例えばPEGであり得る。このリンカーは、短いペプチド鎖、例えば、1~10アミノ酸長、例えば、1、2、3、4、または5アミノ酸長、核酸、アルキル鎖などであり得る。
本開示の化合物およびオリゴヌクレオチドは、有機合成の分野において公知である手段によって作製され得る。反応条件を最適化するため、および必要であれば競合する副生成物を最小にするための方法は、当該分野において公知である。反応の最適化およびスケールアップは、高速並行合成設備およびコンピュータ制御マイクロリアクターを、有利に利用し得る(例えば、Design And Optimization in Organic Synthesis,2nd Edition,Carlson R,Ed,2005;Elsevier Science Ltd.;Jaehnisch,K et al,Angew.Chem.Int.Ed.Engl.2004 43:406;およびこれらの中の参考文献)。さらなる反応スキームおよびプロトコルは、当業者によって、市販の構造検索可能なデータベースソフトウェア、例えば、SciFinder(登録商標)(アメリカ化学会のCAS部門)およびCrossFire Beilstein(登録商標)(Elsevier MDL)の使用によって、またはGoogle(登録商標)などのインターネット検索エンジンもしくは米国特許商標庁テキストデータベースなどのキーワードデータベースを使用する適切なキーワード検索によって、決定され得る。
当業者によって理解され得るように、本明細書中の式の化合物およびオリゴヌクレオチドを合成する方法は、本明細書中のスキームおよび実施例を含めて、当業者に明らかである。従って、種々の合成工程は、所望の化合物およびオリゴヌクレオチドを得るために、代替の配列または順序で行われ得る。さらに、本明細書中に記載される溶媒、温度、反応時間などは、説明の目的のみであり、当業者は、反応条件のバリエーションが、所望の本開示の化合物およびオリゴヌクレオチドを生成し得ることを認識する。
本明細書中の化合物およびオリゴヌクレオチドはまた、結合の回転がこの特定の結合の周りで制限されている、例えば、環または二重結合の存在により制限されている、結合(例えば、炭素-炭素結合)を含み得る。従って、全てのシス/トランスおよびE/Z異性体は、明示的に本開示に含まれる。本明細書中の化合物およびオリゴヌクレオチドはまた、複数の互変異性形態で表され得、このような例において、本開示は、単一の互変異性形態のみが表される場合でさえも、本明細書中に記載される化合物およびオリゴヌクレオチドの全ての互変異性形態を明示的に包含する。このような本明細書中の化合物およびオリゴヌクレオチドの全てのこのような異性体の形態は、明示的に本開示に含まれる。本明細書中に記載される化合物およびオリゴヌクレオチドの全ての結晶形態および多型は、明示的に本開示に含まれる。本開示の化合物およびオリゴヌクレオチドを含有する抽出物および画分もまた、実施される。用語「異性体」は、ジアステレオ異性体、エナンチオマー、位置異性体、構造異性体、回転異性体、および互変異性体などを包含することが意図される。1つまたはそれより多くのステレオジェン(stereogenic)中心を含む化合物およびオリゴヌクレオチド、例えばキラル化合物に関しては、本開示の方法は、エナンチオマー富化化合物、ラセミ体、またはジアステレオマーの混合物を用いて行われ得る。本明細書中に記載される化合物の全ての異性体は、本開示に明示的に包含される。
好ましいエナンチオマー富化化合物は、50%またはそれより高いエナンチオマー過剰率を有し、より好ましくは、この化合物は、60%、70%、80%、90%、95%、98%、もしくは99%またはそれより高いエナンチオマー過剰率を有する。好ましい実施形態において、本開示のキラル化合物の1つのエナンチオマーまたはジアステレオマーのみが、細胞または被験体に投与される。
処置の方法
1つの局面において、障害もしくは疾患を罹患しているか、または障害もしくは疾患に罹患しやすい被験体を処置する方法が提供され、この方法は、この被験体に、有効量の、本明細書中の式(例えば、式I~XXXIV)のいずれかの化合物、オリゴヌクレオチド、または薬学的組成物を投与する工程を包含する。
1つの局面において、障害もしくは疾患を罹患しているか、または障害もしくは疾患に罹患しやすい被験体を処置する方法が提供され、この方法は、この被験体に、有効量の、本明細書中の式(例えば、式I~XXXIV)のいずれかの化合物、オリゴヌクレオチド、または薬学的組成物を投与する工程を包含する。
別の局面において、障害もしくは疾患を罹患しているか、または障害もしくは疾患に罹患しやすい被験体を処置する方法が提供され、この被験体は、タンパク質の機能の調節の必要があると識別されており、この方法は、この必要がある被験体に、有効量の、本明細書中の式(例えば、式I~XXXIV)のいずれかの化合物、オリゴヌクレオチド、または薬学的組成物を投与する工程を包含し、その結果、この被験体はこの障害を処置される。
1つの局面において、被験体におけるタンパク質機能を調節する方法が提供され、この方法は、この被験体を、本明細書中の式(例えば、式I~XXXIV)のいずれかの化合物またはオリゴヌクレオチドと、タンパク質機能を調節するための十分な量および条件下で接触させる工程を包含する。
1つの実施形態において、この調節は阻害である。
いくつかの実施形態において、被験体における肝臓細胞を処置するための方法が提供され、この方法は、肝臓細胞を処置することを必要とする被験体に、有効量の、本明細書中の式(例えば、式I~XXXIV)のいずれかの化合物、オリゴヌクレオチド、または薬学的組成物を、肝臓細胞を標的化するための十分な量および条件下で投与する工程を包含する。
特定の実施形態において、疾患、障害、またはその症状を処置する方法が提供され、この障害は、がん、増殖性疾患、神経変性疾患、自己免疫性もしくは炎症性の障害、感染症、代謝障害、血液学的障害、または心血管疾患である。
特定の実施形態において、障害または疾患は、がんまたは増殖性疾患である。特定の実施形態において、このがんまたは増殖性疾患は、癌腫、白血病、芽細胞腫、リンパ腫、骨髄腫、もしくは黒色腫、またはこれらの組み合わせを含む。特定の実施形態において、障害または疾患は、多発性骨髄腫、黒色腫、乳がん、膵臓がん、卵巣がん、前立腺がん、肝細胞がん、腎臓がん、白血病、T細胞リンパ腫、骨がん、グリア芽細胞腫、神経芽細胞腫、口腔扁平上皮癌、尿路上皮がん、肺がん、子宮頸部がん、結腸がん、頭頚部扁平上皮癌、バーキットリンパ腫、食道がん、ホジキンリンパ腫、膀胱がん、もしくは胃がん、またはこれらの組み合わせである。
特定の実施形態において、障害または疾患は、関節リウマチ、脊椎関節炎、乾癬性関節炎、多発性硬化症、全身性エリテマトーデス、炎症性腸疾患、対宿主性移植片病、移植拒絶、線維性疾患、クローン病、1型糖尿病、湿疹、乾癬、敗血症、気道過敏性、潰瘍性大腸炎、またはこれらの組み合わせである。
特定の実施形態において、傷害または疾患は、てんかん、注意欠陥障害、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンティングトン病、筋萎縮性側索硬化症、脊髄性筋萎縮症、本態性振せん、中枢神経系外傷、多発性硬化症、シャルコー・マリー・ツース(MCT)、末梢神経障害、もしくは脳虚血、またはこれらの組み合わせである。
特定の実施形態において、障害または疾患は、ウイルス、真菌、もしくは細菌、またはこれらの組み合わせによって引き起こされる感染症である。
特定の実施形態において、障害または疾患は、メタボリック症候群、糖尿病、肥満症、高血圧、心不全、常染色体優性遺伝型嚢胞腎(ADPKD)における嚢胞成長、またはこれらの組み合わせである。
特定の実施形態において、障害または疾患は、心臓血管ストレス、圧過負荷、慢性虚血、梗塞-再灌流傷害、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、末梢動脈疾患、心不全、肥大、アンギナ、不整脈、高コレステロール血症、アテローム性動脈硬化症、もしくは発作、またはこれらの組み合わせである。
特定の実施形態において、障害または疾患は、肝臓の疾患である。
特定の実施形態において、被験体は、哺乳動物であり、好ましくは、霊長類またはヒトである。
別の実施形態において、本明細書中の式(例えば、式I~XXXIV)のいずれかの化合物またはオリゴヌクレオチドの有効量が上に記載されたとおりである、上に記載された方法が提供される。
別の実施形態において、本明細書中の式(例えば、式I~XXXIV)のいずれかの化合物またはオリゴヌクレオチドが、静脈内、筋肉内、皮下、脳室内、経口、または局所で投与される、上に記載された方法が提供される。
他の実施形態において、本明細書中の式(例えば、式I~XXXIV)のいずれかの化合物またはオリゴヌクレオチドが、単独で、または1つもしくはそれより多くの他の治療剤と組み合わせて投与される、上に記載された方法が提供される。さらなる実施形態において、この追加の治療剤は、抗がん剤、抗真菌剤、心臓血管剤、抗炎症剤、化学療法剤、抗血管新生剤、細胞傷害剤、抗増殖剤、代謝病剤、眼科(ophthalmologic)疾患剤、中枢神経系(CNS)疾患剤、泌尿器疾患剤、または胃腸疾患剤である。
本開示の別の目的は、本明細書中に記載される化合物またはオリゴヌクレオチド(例えば、式I~XXXIVの化合物またはオリゴヌクレオチド)の、障害または疾患の処置において使用するための医薬の製造における使用である。本開示の別の目的は、本明細書中に記載される化合物またはオリゴヌクレオチド(例えば、式I~XXXIVの化合物またはオリゴヌクレオチド)の、障害または疾患の処置における使用のための使用である。本開示の別の目的は、本明細書中に記載される化合物またはオリゴヌクレオチド(例えば、式I~XXXIVの化合物またはオリゴヌクレオチド)の、農園(agricultural)または農業(agrarian)の環境における障害または疾患の処置または予防において使用するための農薬組成物の製造における使用である。
薬学的組成物
1つの局面において、本明細書中の式(例えば、式I~XXXIV)のいずれかの化合物またはオリゴヌクレオチドおよび薬学的に受容可能なキャリアを含有する薬学的組成物が提供される。
1つの局面において、本明細書中の式(例えば、式I~XXXIV)のいずれかの化合物またはオリゴヌクレオチドおよび薬学的に受容可能なキャリアを含有する薬学的組成物が提供される。
本明細書中に記載される、化合物、オリゴヌクレオチド、または組成物は、1つまたはそれより多くの追加の治療剤(例えば、治療的および/または予防的に活性な薬剤)と組み合わせて投与され得る。これらの化合物、オリゴヌクレオチド、または組成物は、これらの活性(例えば、疾患を処置することを必要とする被験体の疾患を処置する、疾患を予防することを必要とする被験体の疾患を予防する、および/または疾患を発症する危険性を低下させることを必要とする被験体の疾患を発症する危険性を低下させる活性(例えば、効能および/または効力))を改善する、バイオアベイラビリティを改善する、安全性を改善する、薬物抵抗性を低下させる、代謝を低下および/または改変する、排出を阻害する、ならびに/あるいは被験体または細胞における分布を改変する、追加の治療剤と組み合わせて投与され得る。採用される治療は、同じ障害に関して望まれる効果を達成し得、そして/または異なる効果を達成してもよいこともまた理解される。特定の実施形態において、本明細書中に記載される薬学的組成物は、本明細書中に記載される化合物またはオリゴヌクレオチドおよび追加の治療剤を含有して、この化合物またはオリゴヌクレオチドと、追加の治療剤とのうちの一方を含有するが、両方は含有しない薬学的組成物に存在しない、相乗効果を示す。
化合物、オリゴヌクレオチド、または組み合わせ物は、1つまたはそれより多くの追加の治療剤と同時に、その前に、またはその後に投与され得、これは例えば、併用療法として有用であり得る。治療剤は、治療的に活性な薬剤を含有する。治療剤はまた、予防的に活性な薬剤を含有する。治療剤は、薬物化合物(例えば、米国食品医薬品局によって、連邦規則集(CFR)に与えられるように、ヒトおよび獣医学での使用が承認された化合物)などの有機低分子、ペプチド、タンパク質、炭水化物、単糖、オリゴ糖、多糖、核タンパク質、ムコタンパク質、リポタンパク質、合成ポリペプチドまたはタンパク質、タンパク質に結合した低分子、糖タンパク質、ステロイド、核酸、DNA、RNA、ヌクレオチド、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、アンチセンスオリゴヌクレオチド、脂質、ホルモン、ビタミン、および細胞を含有する。特定の実施形態において、追加の治療剤は、疾患(例えば、がん、増殖性疾患、神経変性疾患、自己免疫性または炎症性の障害、感染症、代謝障害、血液学的障害、心血管疾患)を処置および/または予防するために有用な治療剤である。各追加の治療剤は、この治療剤のために決定された用量および/または時間スケジュールで投与され得る。これらの追加の治療剤はまた、互いと一緒に、および/または本明細書中に記載される化合物もしくは組成物と一緒に、単一の用量で、または異なる用量で別々に、投与され得る。レジメンにおいて採用するための特定の組み合わせは、本明細書中に記載される化合物と追加の治療剤(複数可)との適合性、ならびに/あるいは達成することが望まれる治療効果および/または予防効果を考慮する。一般に、組み合わせ物中の追加の治療剤(複数可)は、個別に利用されるレベルを越えないレベルで利用されることが予測される。いくつかの実施形態において、併用して利用されるレベルは、個別に利用されるレベルより低い。
追加の治療剤としては、抗増殖剤、抗がん剤、抗血管新生剤、抗炎症剤、および免疫抑制剤が挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態において、追加の治療剤は免疫療法である。特定の実施形態において、追加の治療剤は抗増殖剤である。特定の実施形態において、追加の治療剤は抗がん剤である。特定の実施形態において、抗がん剤としては、エピジェネティックまたは転写モジュレーター(例えば、DNAメチルトランスフェラーゼ阻害剤、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤(HDAC阻害剤)、リジンメチルトランスフェラーゼ阻害剤)、抗有糸分裂薬(例えば、タキサンおよびビンカアルカロイド)、細胞シグナル伝達経路阻害剤(例えば、チロシンプロテインキナーゼ阻害剤)、タンパク質安定性のモジュレーター(例えば、プロテアソーム阻害剤)、Hsp90阻害剤、糖質コルチコイド、オール-トランスレチノイン酸、抗エストロゲン(例えば、タモキシフェン、ラロキシフェン、およびメゲストロール)、LHRHアゴニスト(例えば、ゴセレリン(goscrclin)およびロイプロリド)、抗アンドロゲン(例えば、フルタミドおよびビカルタミド)、光ダイナミック療法(例えば、ヴェルトポルフィン(vertoporfin)(BPD-MA)、フタロシアニン、光増感剤Pc4、およびデメトキシ-ハイポクレリンA(demethoxy-hypocrellin A)(2BA-2-DMHA))、ナイトロジェンマスタード(例えば、シクロホスファミド、イホスファミド、トロホスファミド、クロラムブシル、エストラムスチン、およびメルファラン)、ニトロソウレア(例えば、カルムスチン(BCNU)およびロムスチン(CCNU))、アルキルスルホネート(例えば、ブスルファンおよびトレオスルファン)、トリアゼン(例えば、ダカルバジン、テモゾロミド)、白金含有化合物(例えば、シスプラチン、カルボプラチン、オキサリプラチン)、ビンカアルカロイド(例えば、ビンクリスチン、ビンブラスチン、ビンデシン、およびビノレルビン)、タキソイド(例えば、パクリタキセルまたはパクリタキセル等価物、例えば、ナノ粒子アルブミン結合パクリタキセル(アブラキサン)、ドコサヘキサン酸結合パクリタキセル(DHA-パクリタキセル、タクサオプレキシン(Taxoprexin))、ポリグルタメート結合パクリタキセル(PG-パクリタキセル、パクリタキセルポリグルメクス(paclitaxel poliglumex)、CT-2103、XYOTAX)、腫瘍活性化プロドラッグ(TAP)ANG1005(3分子のパクリタキセルに結合したAngiopep-2)、パクリタキセル-EC-1(erbB2認識ペプチドEC-1に結合したパクリタキセル)、およびグルコース結合パクリタキセル、例えば、2’-パクリタキセル=メチル=2-グルコピラノシル=スクシネート;ドセタキセル、タキソール)、エピポドフィリン(epipodophyllins)(例えば、エトポシド、リン酸エトポシド、テニポシド、トポテカン、9-アミノカンプトテシン、カンプトイリノテカン(camptoirinotecan)、イリノテカン、クリスナトール、マイトマイシンC(mytomycin C))、代謝拮抗物質、DHFR阻害剤(例えば、メトトレキサート、ジクロロメトトレキサート、トリメトレキサート、エダトレキサート)、IMPデヒドロゲナーゼ阻害剤(例えば、ミコフェノール酸、チアゾフリン(tiazofurin)、リバビリン、およびEICAR)、リボヌクレオチドレダクターゼ阻害剤(例えば、ヒドロキシウレアおよびデフェロキサミン)、ウラシルアナログ(例えば、5-フルオロウラシル(5-FU)、フロクスウリジン、ドキシフルリジン、ラルチトレキセド(ratitrexed)、テガフール-ウラシル、カペシタビン)、シトシンアナログ(例えば、シタラビン(ara C)、シトシンアラビノシド、およびフルダラビン)、プリンアナログ(例えば、メルカプトプリンおよびチオグアニン)、ビタミンD3アナログ(例えば、EB 1089、CB 1093、およびKH 1060)、イソプレン化阻害剤(例えば、ロバスタチン)、ドパミン作用性神経毒(例えば、1-メチル-4-フェニルピリジニウムイオン)、細胞周期阻害剤(例えば、スタウロスポリン)、アクチノマイシン(例えば、アクチノマイシンD、ダクチノマイシン)、ブレオマイシン(例えば、ブレオマイシンA2、ブレオマイシンB2、ペプロマイシン)、アントラサイクリン(例えば、ダウノルビシン、ドキソルビシン、ペグ化リポソームドキソルビシン、イダルビシン、エピルビシン、ピラルビシン、ゾルビシン、ミトキサントロン)、MDR阻害剤(例えば、ベラパミル)、Ca2+ ATPアーゼ阻害剤(例えば、タプシガルジン)、サリドマイド、レナリドミド、ポマリドミド、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、アキシチニブ(AG013736)、ボスチニブ(SKI-606)、セジラニブ(cediranib)(RECENTINTM、AZD2171)、ダサチニブ(SPRYCEL(登録商標)、BMS-354825)、エルロチニブ(TARCEVA(登録商標))、ゲフィチニブ(イレッサ(登録商標))、イマチニブ(グリベック(登録商標)、CGP57148B、STI-571)、ラパチニブ(TYKERB(登録商標)、TYVERB(登録商標))、レスタウルチニブ(CEP-701)、ネラチニブ(neratinib)(HKI-272)、ニロチニブ(TASIGNA(登録商標))、セマクサニブ(semaxanib)(セマキシニブ(semaxinib)、SU5416)、スニチニブ(SUTENT(登録商標)、SU11248)、トセラニブ(toceranib)(PALLADIA(登録商標))、バンデタニブ(ZACTIMA(登録商標)、ZD6474)、バタラニブ(vatalanib)(PTK787、PTK/ZK)、トラスツズマブ(ハーセプチン(登録商標))、ベバシズマブ(AVASTIN(登録商標))、リツキシマブ(リツキサン(登録商標))、セツキシマブ(アービタックス(登録商標))、パニツムマブ(VECTIBIX(登録商標))、ラニビズマブ(ルセンティス(登録商標))、ニロチニブ(TASIGNA(登録商標))、ソラフェニブ(NEXAVAR(登録商標))、エベロリムス(AFINITOR(登録商標))、アレムツズマブ(CAMPATH(登録商標))、ゲムツズマブオゾガマイシン(マイロターグ(登録商標))、テムシロリムス(TORISEL(登録商標))、ENMD-2076、PCI-32765、AC220、乳酸ドビチニブ(dovitinib lactate)(TKI258、CHIR-258)、BIBW 2992(TOVOKTM)、SGX523、PF-04217903、PF-02341066、PF-299804、BMS-777607、ABT-869、MP470、BIBF 1120(VARGATEF(登録商標))、AP24534、JNJ-26483327、MGCD265、DCC-2036、BMS-690154、CEP-11981、チボザニブ(tivozanib)(AV-951)、OSI-930、MM-121、XL-184、XL-647、および/またはXL228)、プロテアソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ(ベルケード)、イキサゾミブ(ixazomib)(NINLARO))、mTOR阻害剤(例えば、ラパマイシン、テムシロリムス(CCI-779)、エベロリムス(RAD-001)、リダフォロリムス、AP23573(Ariad)、AZD8055(AstraZeneca)、BEZ235(Novartis)、BGT226(Norvartis)、XL765(Sanofi Aventis)、PF-4691502(Pfizer)、GDC0980(Genentech)、SF1126(Semafoe)およびOSI-027(OSI))、オブリメルセン、ゲムシタビン、カルミノマイシン、ロイコボリン、ペメトレキセド、シクロホスファミド、ダカルバジン、プロカルバジン(procarbizine)、プレドニゾロン、デキサメタゾン、カンパテシン(campathecin)、プリカマイシン、アスパラギナーゼ、アミノプテリン、メトプテリン、ポルフィロマイシン、メルファラン、ロイロシジン(leurosidine)、ロイロシン(leurosine)、クロラムブシル、トラベクテジン、プロカルバジン、ディスコデルモライド(discodermolide)、カルミノマイシン、アミノプテリン、およびヘキサメチルメラミンが挙げられるが、これらに限定されない。
特定の実施形態において、追加の治療剤は、免疫療法である。特定の実施形態において、この免疫療法は、がんの処置において有用である。例示的な免疫療法としては、T細胞療法、インターフェロン、サイトカイン(例えば、腫瘍壊死因子、インターフェロンα、インターフェロンγ)、ワクチン、造血成長因子、モノクローナル血清療法、免疫増強薬および/または免疫調節薬(immunodulatory agent)(例えば、IL-1、2、4、6、または12)、免疫細胞成長因子(例えば、GM-CSF)ならびに抗体が挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態において、免疫療法は、T細胞療法である。特定の実施形態において、このT細胞療法は、キメラ抗原受容体T細胞(CAR-T)である。特定の実施形態において、免疫療法は、抗体である。特定の実施形態において、この抗体は、抗PD-1抗体、抗PD-L1抗体、抗CTLA-4抗体、抗TIM3抗体、抗OX40抗体、抗GITR抗体、抗LAG-3抗体、抗CD137抗体、抗CD27抗体、抗CD28抗体、抗CD28H抗体、抗CD30抗体、抗CD39抗体、抗CD40抗体、抗CD47抗体、抗CD48抗体、抗CD70抗体、抗CD73抗体、抗CD96抗体、抗CD160抗体、抗CD200抗体、抗CD244抗体、抗ICOS抗体、抗TNFRSF25抗体、抗TMIGD2抗体、抗DNAM1抗体、抗BTLA抗体、抗LIGHT抗体、抗TIGIT抗体、抗VISTA抗体、抗HVEM抗体、抗Siglec抗体、抗GAL1抗体、抗GAL3抗体、抗GAL9抗体、抗BTNL2(ブチロフィリン(butrophylins))抗体、抗B7-H3抗体、抗B7-H4抗体、抗B7-H5抗体、抗B7-H6抗体、抗KIR抗体、抗LIR抗体、抗ILT抗体、抗MICA抗体、抗MICB抗体、抗NKG2D抗体、抗NKG2A抗体、抗TGFβ抗体、抗TGFβR抗体、抗CXCR4抗体、抗CXCL12抗体、抗CCL2抗体、抗IL-10抗体、抗IL-13抗体、抗IL-23抗体、抗ホスファチジルセリン抗体、抗ニューロピリン抗体(anti-neuropilin antibody)、抗GalCer抗体、抗HER2抗体、抗VEGFA抗体、抗VEGFR抗体、抗EGFR抗体、または抗Tie2抗体である。特定の実施形態において、この抗体は、ペムブロリズマブ、ニボルマブ、ピディリズマブ(pidilizumab)、イピリムマブ、トレメリムマブ(tremelimumab)、デュルバルマブ(durvalumab)、アテゾリズマブ(atezolizumab)、アベルマブ(avelumab)、PF-06801591、ウトミルマブ(utomilumab)、PDR001、PBF-509、MGB453、LAG525、AMP-224、INCSHR1210、INCAGN1876、INCAGN1949、サマリズマブ(samalizumab)、PF-05082566、ウレルマブ、リリルマブ(lirilumab)、ルリズマブ(lulizumab)、BMS-936559、BMS-936561、BMS-986004、BMS-986012、BMS-986016、BMS-986178、IMP321、IPH2101、IPH2201、バリルマブ(varilumab)、ウロクプルマブ(ulocuplumab)、モナリズマブ(monalizumab)、MEDI0562、MEDI0680、MEDI1873、MEDI6383、MEDI6469、MEDI9447、AMG228、AMG820、CC-90002、CDX-1127、CGEN15001T、CGEN15022、CGEN15029、CGEN15049、CGEN15027、CGEN15052、CGEN15092、CX-072、CX-2009、CP-870893、ルカツムマブ、ダセツズマブ(dacetuzumab)、Chi Lob 7/4、RG6058、RG7686、RG7876、RG7888、TRX518、MK-4166、MGA271、IMC-CS4、エマクツズマブ(emactuzumab)、トラスツズマブ、ペルツズマブ、オビヌツズマブ、カビラリズマブ(cabiralizumab)、マルゲツキシマブ(margetuximab)、エノブリツズマブ(enoblituzumab)、モガムリズマブ、パニツムマブ、カルルマブ(carlumab)、ベバシズマブ、リツキシマブ、またはセツキシマブである。
特定の実施形態において、本明細書中に記載される化合物、オリゴヌクレオチド、または薬学的組成物は、外科手術、放射線療法、および移植(例えば、幹細胞移植、骨髄移植)が挙げられるがこれらに限定されない、抗がん療法と併用して投与され得る。
特定の実施形態において、追加の治療剤は、Akt阻害剤、アルキル化剤、アンドロゲン受容体アンタゴニスト、抗エストロゲン、Bcl-2阻害剤、BRAFキナーゼ阻害剤、BTK阻害剤、CAR-T細胞、抗CD38抗体、CDK阻害剤、抗CTLA-4抗体、ERK/MAPK阻害剤、ファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤、IL-6阻害剤、免疫調節剤、腫瘍免疫療法薬、JAK2/FLT3阻害剤、キネシン紡錘体タンパク質阻害剤、MEK阻害剤、抗PD-1抗体、抗PD-L1抗体、PI3K阻害剤、プロテアソーム阻害剤、放射線(感作剤)、放射性同位体(感作剤)、合成レチノイド(AM80)、タキサン、チロシンキナーゼ阻害剤、VDRアゴニスト、VEGF阻害剤、腫瘍溶解性ウイルス、およびこれらの組み合わせからなる群より選択される。特定の実施形態において、追加の治療剤は、オールトランスレチノイン酸(tetinoic acid)(ATRA)、三酸化ヒ素、ベルベリン、ベバシズマブ、ボルテゾミブ、カバジタキセル、カルフィルゾミブ(carfilzomib)、シスプラチン、クラリスロマイシン、シクロホスファミド、シタラビン、ダラザレックス、デキサメタゾン、ドセタキセル、エロツズマブ、エンザルタミド、エピルビシン、フルオロウラシル(5-FU)、ゲフィチニブ、塩酸ゲムシタビン、イブルチニブ、イデラリシブ、インダツキシマブ(indatuximab)、イキサゾミブ、ラブタンシン(ravtansine)、イピリムマブ、レナリドミド、ロナファルニブ(lonafarnib)、メトトレキサート、nab-パクリタキセル、ニボルマブ、パクリタキセル、パクリチニブ、ポマリドミド、ソラフェニブ、テモゾロミド、サリドマイド、ベムラフェニブ、およびビンクリスチンからなる群より選択される。
1つの局面において、有効量の本明細書中の式(例えば、式I~XXXIV)のいずれかの化合物またはオリゴヌクレオチドを、単位剤形で、この化合物またはオリゴヌクレオチドを、がん、増殖性疾患、神経変性疾患、自己免疫性または炎症性の障害、感染症、代謝障害、血液学的障害、および心血管疾患が挙げられる疾患もしくは障害に罹患しているかまたはこれらの疾患もしくは障害を罹患しやすい被験体に投与するための指示書と一緒に含む、キットが提供される。他の実施形態において、この疾患、障害、またはその症状は、癌腫、白血病、芽細胞腫、リンパ腫、骨髄腫、または黒色腫である。他の実施形態において、この疾患、障害、またはその症状は、多発性骨髄腫、黒色腫、乳がん、膵臓がん、卵巣がん、前立腺がん、肝細胞がん、腎臓がん、白血病、T細胞リンパ腫、骨がん、グリア芽細胞腫、神経芽細胞腫、口腔扁平上皮癌、尿路上皮がん、肺がん、子宮頸部がん、結腸がん、頭頚部扁平上皮癌、バーキットリンパ腫、食道がん、ホジキンリンパ腫、膀胱がん、または胃がんである。他の実施形態において、この疾患、障害、またはその症状は、関節リウマチ、脊椎関節炎、乾癬性関節炎、多発性硬化症、全身性エリテマトーデス、炎症性腸疾患、対宿主性移植片病、移植拒絶、線維性疾患、クローン病、1型糖尿病、湿疹、乾癬、敗血症、気道過敏性、または潰瘍性大腸炎である。他の実施形態において、この疾患、障害、またはその症状は、てんかん、注意欠陥障害、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンティングトン病、筋萎縮性側索硬化症、脊髄性筋萎縮症、本態性振せん、中枢神経系外傷、多発性硬化症、シャルコー・マリー・ツース(MCT)、末梢神経障害、または脳虚血である。他の実施形態において、この疾患、障害、またはその症状は、ウイルス、真菌、または細菌によって引き起こされる感染症である。他の実施形態において、この疾患、障害、またはその症状は、メタボリック症候群、糖尿病、肥満症、高血圧、心不全、または常染色体優性遺伝型嚢胞腎(ADPKD)における嚢胞成長である。他の実施形態において、この疾患、障害、またはその症状は、心臓血管ストレス、圧過負荷、慢性虚血、梗塞-再灌流傷害、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、末梢動脈疾患、心不全、肥大、アンギナ、不整脈、高コレステロール血症、アテローム性動脈硬化症、または発作である。
用語「薬学的に受容可能な塩」または「薬学的に受容可能なキャリア」とは、本明細書中に記載される化合物に見られる特定の置換基に依存して酸または塩基の比較的非毒性のものを用いて調製される、活性化合物の塩を包含することを意味する。本開示の化合物が比較的酸性の官能基を含む場合、塩基付加塩は、中性形態のこのような化合物を、十分な量の所望の塩基と、ニートでまたは適切な不活性溶媒中でのいずれかで、接触させることにより得られ得る。薬学的に受容可能な塩基付加塩の例としては、ナトリウム、カリウム、カルシウム、アンモニウム、有機アミノ、またはマグネシウムの塩、あるいは類似の塩が挙げられる。本開示の化合物が比較的塩基性の官能基を含む場合、酸付加塩は、中性形態のこのような化合物を、十分な量の所望の酸と、ニートでまたは適切な不活性溶媒中でのいずれかで、接触させることにより得られ得る。薬学的に受容可能な酸付加塩の例としては、例えば塩酸、臭化水素酸、硝酸、炭酸、一水素炭酸、リン酸、一水素リン酸、二水素リン酸、硫酸、一水素硫酸、ヨウ化水素酸、または亜リン酸などの無機酸から誘導された塩、ならびに例えば酢酸、プロピオン酸、イソ酪酸、マレイン酸、マロン酸、安息香酸、コハク酸、スベリン酸、フマル酸、乳酸、マンデル酸、フタル酸、ベンゼンスルホン酸、p-トリルスルホン酸、クエン酸、酒石酸、およびメタンスルホン酸などの比較的非毒性の有機酸から誘導された塩が挙げられる。例えばアルギン酸などのアミノ酸の塩、および例えばグルクロン酸またはガラクツロン酸などの有機酸の塩もまた、含まれる(例えば、Berge et al.,Journal of Pharmaceutical Science 66:1-19(1977)を参照のこと)。本開示の特定の特殊な化合物は、塩基性官能基と酸性官能基との両方を含み、これによって、これらの化合物は、塩基付加塩または酸付加塩のいずれかに転換されることが可能である。当業者に公知である他の薬学的に受容可能なキャリアは、本開示のために適切である。
中性形態の化合物およびオリゴヌクレオチドは、その塩を塩基または酸と接触させ、そして親化合物またはオリゴヌクレオチドを従来の様式で単離することによって、再生され得る。化合物またはオリゴヌクレオチドの親形態は、極性溶媒中での溶解度などの特定の物性がその種々の塩形態と異なるが、その他の点では、これらの塩は、本開示の目的で、その化合物の親形態と等価である。
塩形態に加えて、本開示は、プロドラッグ形態にある化合物を提供する。本明細書中に記載される化合物のプロドラッグは、生理学的条件下で容易に化学変化を起こして、本開示の化合物を提供する化合物である。さらに、プロドラッグは、エキソビボの環境で、化学的方法または生化学的方法によって、本開示の化合物に転換され得る。例えば、プロドラッグは、適切な酵素または化学試薬と一緒に経皮パッチレザバに入れられると、本開示の化合物にゆっくりと転換され得る。
本開示の特定の化合物は、非溶媒和形態で、および水和物形態を含めた溶媒和形態で、存在し得る。一般に、溶媒和形態は、非溶媒和形態と等価であり、そして本開示の範囲内に包含されることが意図される。本開示の特定の化合物は、複数の結晶形態または非晶質形態で存在し得る。一般に、全ての物理的形態は、本開示により想定される使用に関して等価であり、そして本開示の範囲内であることが意図される。
本開示はまた、有効量の本明細書中に記載される化合物、および薬学的に受容可能なキャリアを含有する薬学的組成物を提供する。1つの実施形態において、本明細書中の式(例えば、式I~XXXIV)のいずれかの化合物またはオリゴヌクレオチドは、薬学的に受容可能な製剤、例えば、化合物の徐放を被験体に、この薬学的に受容可能な製剤がこの被験体に投与された後に少なくとも12時間、24時間、36時間、48時間、1週間、2週間、3週間、または4週間にわたり提供する薬学的に受容可能な製剤を使用して、被験体に投与される。
本開示の薬学的組成物中の活性成分の実際の投薬レベルおよび投与の時間経過は、特定の患者、組成物、および投与経路に関して望まれる治療応答を達成するために有効な量の活性成分を、この患者に対して毒性(または認容不可能に毒性)ではないように得るように、変更され得る。
使用において、本開示による少なくとも1つの化合物またはオリゴヌクレオチドは、薬学的有効量で、その必要がある被験体に、薬学的キャリア中で、静脈内、筋肉内、皮下、もしくは脳室内注射により、または経口投与もしくは局所塗布により、投与される。本開示によれば、本開示の化合物またはオリゴヌクレオチドは、単独で、または第二の異なる治療剤と一緒に、投与され得る。「と一緒に」とは、共に、実質的に同時に、または逐次を意味する。1つの実施形態において、本開示の化合物またはオリゴヌクレオチドは、急性投与される。従って、本開示の化合物またはオリゴヌクレオチドは、短期間の処置にわたり、例えば、約1日~約1週間にわたり投与され得る。別の実施形態において、本開示の化合物またはオリゴヌクレオチドは、慢性障害を改善するために、より長期間にわたり、例えば、処置されるべき状態に依存して約1週間~数ヶ月間にわたり、投与され得る。
「薬学的有効量」とは、本明細書中で使用される場合、処置されるべき状態を有意にポジティブに改変するために十分に高いが、妥当な医学的判断の範囲内で、重篤な副作用を(合理的な利益/危険比で)回避するために十分に低い、本開示の化合物またはオリゴヌクレオチドの量を意味する。本開示の化合物またはオリゴヌクレオチドの薬学的有効量は、達成されるべき具体的な目的、処置される患者の年齢および身体状態、根底にある疾患の重篤度、処置の持続期間、同時に行われる治療の性質、および採用される具体的な化合物により異なる。例えば、小児または新生児に投与される治療有効量の本開示の化合物またはオリゴヌクレオチドは、妥当な医学的判断に従って、非例的に減少させられる。従って、本開示の化合物またはオリゴヌクレオチドの有効量は、所望の効果を提供する最少量である。
本開示の決定された事実上の利点は、化合物またはオリゴヌクレオチドが、従来の様式で、例えば、静脈内、筋肉内、皮下、経口、もしくは脳室内の注射経路により、またはクリームもしくはゲル中での局所塗布により、投与され得ることである。投与経路に依存して、本開示の化合物またはオリゴヌクレオチドを含む活性成分は、材料内にコーティングされて、この化合物またはオリゴヌクレオチドを、この化合物またはオリゴヌクレオチドを不活性化させ得る酵素、酸および他の自然条件の作用から保護することを必要とし得る。本開示の化合物またはオリゴヌクレオチドを、非経口投与以外の様式により投与する目的で、この化合物またはオリゴヌクレオチドは、不活性化を防止するために、材料によりコーティングされ得るか、または材料と一緒に投与され得る。
化合物またはオリゴヌクレオチドは、非経口投与または腹腔内投与され得る。分散物もまた、例えば、グリセロール、液体ポリエチレングリコール、およびこれらの混合物、ならびに油中で、調製され得る。
薬学的キャリアとして働き得る物質のいくつかの例は、糖、例えばラクトース、グルコースおよびスクロース;デンプン、例えばコーンスターチおよびジャガイモデンプン;セルロースおよびその誘導体、例えばカルボキシメチルセルロースナトリウム、エチルセルロースおよび酢酸セルロース;粉末トラガカント;麦芽;ゼラチン;滑石;ステアリン酸;ステアリン酸マグネシウム;硫酸カルシウム;植物油、例えば落花生油、綿実油、ゴマ油、オリーブ油、トウモロコシ油、およびカカオ(theobroma)の油;ポリオール、例えばプロピレングリコール、グリセリン、ソルビトール、マンニトール、およびポリエチレングリコール;寒天;アルギン酸;パイロジェンフリー水;等張生理食塩水;およびリン酸緩衝溶液;脱脂粉乳;ならびに薬学的製剤において使用される他の非毒性の適合性物質、例えばビタミンC、エストロゲンおよびエキナセアである。湿潤剤および滑沢剤、例えばラウリル硫酸ナトリウム、ならびに着色剤、矯味矯臭剤、滑沢剤、添加物、打錠剤、安定剤、酸化防止剤、および防腐剤もまた、存在し得る。例えばクレマフォア、およびβ-シクロデキストリンが挙げられる可溶化剤もまた、本明細書中の薬学的組成物において使用され得る。
本開示の活性化合物またはオリゴヌクレオチド(またはそのプロドラッグ)を含有する薬学的組成物は、従来の混合、溶解、顆粒化、糖衣作製ゲル化、乳化、カプセル化、捕捉、または凍結乾燥のプロセスによって、製造され得る。これらの組成物は、従来の様式で、1種またはそれより多くの生理学的に受容可能なキャリア、希釈剤、添加物、または活性化合物の、薬学的に使用され得る調製物への加工を容易にする補助剤を使用して、製剤化され得る。
本開示の主題の薬学的組成物は、例えば局所、眼、経口、頬、全身、鼻、注射、経皮、直腸、膣などを含めた事実上任意の投与形式に適した形態、または吸入もしくは通気による投与に適した形態を採り得る。
局所投与のためには、活性化合物(複数可)またはプロドラッグ(複数可)は、液剤、ゲル、軟膏剤、クリーム、および懸濁剤として製剤化され得る。
全身用製剤としては、注射、例えば皮下、静脈内、筋肉内、鞘内、または腹腔内注射による投与のために設計された製剤、および経皮、経粘膜、経口、または肺投与のために設計された製剤が挙げられる。
有用な注射可能な調製物としては、活性化合物(複数可)またはオリゴヌクレオチド(複数可)の、水性または油性のビヒクル中の滅菌懸濁物、溶液、またはエマルジョンが挙げられる。組成物はまた、製剤化用薬剤、例えば、懸濁化剤、安定剤および/または分散剤を含有し得る。注射のための製剤は、単位剤形(例えば、アンプルまたは複数用量容器)中に存在し得、そして添加された防腐剤を含有し得る。
あるいは、注射可能な製剤は、使用前に、滅菌パイロジェンフリー水、緩衝液、およびブドウ糖溶液などが挙げられるがこれらに限定されない適切なビヒクルで再構成するための粉末形態で提供され得る。この目的で、活性化合物(複数可)またはオリゴヌクレオチド(複数可)は、当該分野において公知である技術、例えば凍結乾燥により乾燥され得、そして使用前に再構成され得る。
経粘膜投与のために、通過するべき障壁のために適切な浸透剤が、製剤中で使用される。このような浸透剤は、当該分野において公知である。
経口投与のために、薬学的組成物は、薬学的に受容可能な添加物、例えば結合剤(例えば、アルファ化トウモロコシデンプン、ポリビニルピロリドン、もしくはヒドロキシプロピルメチルセルロース);充填剤(例えば、ラクトース、微結晶性セルロースもしくはリン酸水素カルシウム);滑沢剤(例えば、ステアリン酸マグネシウム、滑石、もしくはシリカ);崩壊剤(例えば、ジャガイモデンプンもしくはグリコール酸デンプンナトリウム);または湿潤剤(例えば、ラウリル硫酸ナトリウム)を用いて、従来の手段により調製された、例えば、ロゼンジ、錠剤、またはカプセル剤の形態を採り得る。これらの錠剤は、例えば糖または腸溶コーティングで、当該分野において周知である方法によりコーティングされ得る。
経口投与のための液体調製物は、例えば、エリキシル、液剤、シロップ、もしくは懸濁液の形態を採り得るか、またはこれらは、使用前に水もしくは他の適切なビヒクルで構築するための乾燥製品として提供され得る。このような液体調製物は、従来の手段によって、薬学的に受容可能な添加剤、例えば懸濁化剤(例えば、ソルビトールシロップ、セルロース誘導体、または水素化食用脂肪);乳化剤(例えば、レクチンまたはアカシア);非水性ビヒクル(例えば、アーモンド油、油状エステル、エチルアルコール、または分画食用油);および防腐剤(例えば、p-ヒドロキシ安息香酸メチルもしくはp-ヒドロキシ安息香酸プロピル、またはソルビン酸)を用いて、調製され得る。これらの調製物はまた、緩衝塩、防腐剤、矯味矯臭剤、着色剤および甘味剤を、必要に応じて含有し得る。
経口投与のための調製物は、周知であるように、活性化合物またはプロドラッグの制御された放出を与えるように、適切に製剤化され得る。
頬投与のために、組成物は、従来の様式で製剤化された、錠剤またはロゼンジの形態を採り得る。
直腸および膣の投与経路のために、活性化合物(複数可)またはオリゴヌクレオチド(複数可)は、従来の坐剤基剤、例えばカカオ脂または他のグリセリドを含有する、液剤(保持浣腸のため)、坐剤、または軟膏剤として製剤化され得る。
鼻投与、または吸入もしくは通気による投与のために、活性化合物(複数可)、オリゴヌクレオチド(複数可)、またはプロドラッグ(複数可)は、エアロゾルスプレーの形態で、加圧パックまたはネブライザから、適切な推進剤、例えばジクロロジフルオロメタン、トリクロロフルオロメタン、ジクロロテトラフルオロエタン、フルオロカーボン、二酸化炭素、または他の適切な気体を用いて、好都合に送達され得る。加圧エアロゾルの場合、その投薬単位は、計量された量を送達するためのバルブを提供することによって、決定され得る。吸入器または通気器において使用するためのカプセルおよびカートリッジ(例えば、ゼラチンから構成されたカプセルおよびカートリッジ)は、化合物またはオリゴヌクレオチドと、ラクトースまたはデンプンなどの適切な粉末基剤との粉末混合物を収容して配合され得る。
市販の鼻スプレーデバイスを使用する鼻投与のために適切な水性懸濁製剤の具体例は、以下の成分を含む:活性化合物またはプロドラッグ(0.5~20mg/ml);ベンザルコニウムクロリド(0.1~0.2mg/mL);ポリソルベート80(TWEEN(登録商標)80;0.5~5mg/ml);カルボキシメチルセルロースナトリウムまたは微結晶性セルロース(1~15mg/ml);フェニルエタノール(1~4mg/ml);およびデキストロース(20~50mg/ml)。最終懸濁物のpHは、約pH5からpH7までの範囲に調整され得、約pH5.5のpHが代表的である。
眼投与のために、活性化合物(複数可)、オリゴヌクレオチド(複数可)、またはプロドラッグ(複数可)は、眼への投与のために適切な液剤、エマルジョン、および懸濁液などとして製剤化され得る。化合物を眼に投与するために適切な種々のビヒクルが、当該分野において公知である。具体的な非限定的な例は、米国特許第6,261,547号;米国特許第6,197,934号;米国特許第6,056,950号;米国特許第5,800,807号;米国特許第5,776,445号;米国特許第5,698,219号;米国特許第5,521,222号;米国特許第5,403,841号;米国特許第5,077,033号;米国特許第4,882,150号;および米国特許第4,738,851号に記載されており、これらの各々は、その全体が本明細書中に参考として援用される。
長期送達のために、活性化合物(複数可)、オリゴヌクレオチド(複数可)、またはプロドラッグ(複数可)は、移植または筋肉内注射による投与のためのデポー調製物として製剤化され得る。活性成分は、適切なポリマー材料もしくは疎水性材料(例えば、受容可能な油中のエマルジョン)またはイオン交換樹脂を用いて、あるいは溶解度が低い誘導体として、例えば溶解度が低い塩として、製剤化され得る。あるいは、経皮吸収のために活性化合物(複数可)またはオリゴヌクレオチド(複数可)をゆっくりと放出する接着ディスクまたはパッチとして製造された経皮送達系が使用され得る。この目的で、浸透増強剤が、活性化合物(複数可)またはオリゴヌクレオチド(複数可)の経皮浸透を容易にするために使用され得る。適切な経皮パッチは、例えば、米国特許第5,407,713号;米国特許第5,352,456号;米国特許第5,332,213号;米国特許第5,336,168号;米国特許第5,290,561号;米国特許第5,254,346号;米国特許第5,164,189号;米国特許第5,163,899号;米国特許第5,088,977号;米国特許第5,087,240号;米国特許第5,008,110号;および米国特許第4,921,475号に記載されており、これらの各々は、その全体が本明細書中に参考として援用される。
あるいは、他の薬学的送達系が採用され得る。リポソームおよびエマルジョンは、活性化合物(複数可)、オリゴヌクレオチド(複数可)、またはプロドラッグ(複数可)を送達するために使用され得る送達ビヒクルの周知の例である。ジメチルスルホキシド(DMSO)などの特定の有機溶媒もまた採用され得る。
薬学的組成物は、所望であれば、活性化合物(複数可)またはオリゴヌクレオチド(複数可)を含有する1つまたはそれより多くの単位剤形を収容し得るパックまたはディスペンサーデバイス内に提供され得る。このパックは、例えば、金属またはプラスチック箔、例えばブリスターパックを備え得る。パックまたはディスペンサーデバイスは、投与のための指示書を伴い得る。
本開示の活性化合物(複数可)、オリゴヌクレオチド(複数可)、またはプロドラッグ(複数可)、あるいはその組成物は、一般に、意図される結果を達成するために有効な量で、例えば、処置される特定の疾患を処置または予防するために有効な量で、使用される。化合物(複数可)およびオリゴヌクレオチド(複数可)は、治療利益を達成するために得治療的に、または予防利益を達成するために予防的に、投与され得る。治療利益とは、根底にある処置されている障害の根絶もしくは改善、および/または根底にある障害に関連する症状のうちの1つもしくはそれより多くの根絶もしくは改善であって、それによって、根底にある障害を患者が依然として罹患しているかもしれないにかかわらず、この患者が感覚または状態の改善を報告するものを意味する。治療利益はまた、改善が実現されるか否かにかかわらず、疾患の進行を止めるかまたは遅らせることを包含する。
予防投与のために、化合物またはオリゴヌクレオチドは、以前に記載された疾患のうちの1つを発症する危険がある患者に投与され得る。疾患を発症する危険がある患者とは、適切な医療専門家またはグループにより規定される、危険がある患者の指定された群に患者を入れる特徴を有する患者であり得る。危険がある患者とはまた、根底にある疾患の発症が起こり得る背景に、通常または日常的にいる、患者であり得る。換言すれば、危険がある患者とは、疾患または疾病を引き起こす条件に通常もしくは日常的に曝されている患者、または限定された時間にわたり実際に曝され得る患者である。あるいは、予防投与は、根底にある障害を有すると診断された患者において、症状の発症を回避するために与えられ得る。
投与される化合物の量は、例えば、処置されている特定の適応症、投与様式、所望の利益が予防であるか治療であるか、処置されている適応症の重篤度ならびに患者の年齢および体重、特定の活性化合物のバイオアベイラビリティなどが挙げられる、種々の要因に依存する。有効な投薬量の決定は、十分に当業者の能力の範囲内である。
有効な投薬量は、最初はインビトロアッセイから推定され得る。例えば、動物において使用するための初期投薬量は、例えばインビトロ真菌MICまたはMFCおよび他のインビトロアッセイなどの、インビトロアッセイなどで測定された特定の化合物のIC50またはそれより高い、活性化合物の循環血液中または血清中濃度を達成するように製剤化され得る。特定の化合物のバイオアベイラビリティを考慮して、このような循環血液中または血清中濃度を達成するように投薬量を計算することは、十分に当業者の能力の範囲内である。指針として、「General Principles」,:Goodman and Gilman’s The Pharmaceutical Basis of Therapeutics,Chapter 1,pp.1-112,13th ed.,McGraw-Hillおよびそこに引用される参考文献を参照のこと。これらは本明細書中に参考として援用される。
初期投薬量はまた、動物モデルなどのインビボデータから推定され得る。上に記載された種々の疾患を処置または予防するための化合物の効力を試験するために有用な動物モデルは、当該分野において周知である。
投薬量は、代表的に、約0.0001または0.001または0.01mg/kg/日から、約100mg/kg/日の範囲であるが、他の要因のうちでもとりわけ、化合物またはオリゴヌクレオチドの活性、そのバイオアベイラビリティ、投与様式、および上で議論された種々の要因に依存して、より高くてもより低くてもよい。投薬の量および間隔は、化合物(複数可)またはオリゴヌクレオチド(複数可)の、治療効果または予防効果を維持するために十分な血漿中レベルを提供するように、個々に調節され得る。局所投与または選択的取り込み、例えば局部的な局所投与の場合、活性化合物(複数可)またはオリゴヌクレオチド(複数可)の有効な局所濃度は、血漿中濃度に関連しないかもしれない。当業者は、過度の実験を行うことなく、有効な局所投薬量を最適化することができる。
化合物(複数可)およびオリゴヌクレオチド(複数可)は、とりわけ処置される適応症および処方する医師の判断に依存して、1日1回、1日あたり少数回もしくは数回、または1日あたり複数回でさえ、投与され得る。
好ましくは、化合物(複数可)およびオリゴヌクレオチド(複数可)は、実質的な毒性を引き起こすことなく、治療利益または予防利益を提供する。化合物(複数可)およびオリゴヌクレオチド(複数可)の毒性は、標準的な薬学的手順を使用して決定され得る。毒性と治療(または予防)効果との間の用量比は、治療指数である。高い治療指数を示す化合物(複数可)およびオリゴヌクレオチド(複数可)が好ましい。
本明細書中の可変物の任意の定義における化学基の列挙の記載は、任意の単一の基として、または列挙された基の組み合わせ物としての、その可変物の定義を包含する。本明細書中の可変物に関する実施形態の記載は、任意の単一の実施形態として、または他の任意の実施形態もしくはその部分と組み合わせての、その実施形態を包含する。本明細書中の実施形態の記載は、任意の単一の実施形態として、または他の任意の実施形態もしくはその部分と組み合わせての、その実施形態を包含する。
本明細書中に記載される本発明がより完全に理解され得る目的で、以下の実施例が記載される。本願に記載される実施例は、本明細書中に提供される化合物、薬学的組成物、および方法を説明するために与えられるのであり、これらの範囲をいかなる方法でも限定すると解釈されるべきではない。
一般的な実験手順
本明細書中のスキーム中の構造における可変物の定義は、本明細書中に図示される式の対応する位置のものと同等である。
本明細書中のスキーム中の構造における可変物の定義は、本明細書中に図示される式の対応する位置のものと同等である。
一般的な略語:
ACN アセトニトリル
br 幅広
d 二重線
DCM ジクロロメタン
dd 二重線の二重線
dba ジベンジリデンアセトン
DFAA 無水ジフルオロ酢酸
DIPEA ジイソプロピルエチルアミン
DMF ジメチルホルムアミド
DMSO ジメチルスルホキシド
dppf 1,1’-フェロセンジイル-ビス(ジフェニルホスフィン)
EtOAc 酢酸エチル
h 時間
HRMS 高分解能質量分析
HPLC 高速液体クロマトグラフィー
LCMS 液体クロマトグラフィーおよび質量分析
MS 質量分析
MW マイクロ波
m 多重線
MeOH メタノール
min 分
mL ミリリットル
m/z 質量対電荷比
NMP N-メチル-2-ピロリドン
NMR 核磁気共鳴
ppm パーツパーミリオン
rtまたはRT 室温
s 一重線
t 三重線
TFAA 無水トリフルオロ酢酸
TLC 薄層クロマトグラフィー
ACN アセトニトリル
br 幅広
d 二重線
DCM ジクロロメタン
dd 二重線の二重線
dba ジベンジリデンアセトン
DFAA 無水ジフルオロ酢酸
DIPEA ジイソプロピルエチルアミン
DMF ジメチルホルムアミド
DMSO ジメチルスルホキシド
dppf 1,1’-フェロセンジイル-ビス(ジフェニルホスフィン)
EtOAc 酢酸エチル
h 時間
HRMS 高分解能質量分析
HPLC 高速液体クロマトグラフィー
LCMS 液体クロマトグラフィーおよび質量分析
MS 質量分析
MW マイクロ波
m 多重線
MeOH メタノール
min 分
mL ミリリットル
m/z 質量対電荷比
NMP N-メチル-2-ピロリドン
NMR 核磁気共鳴
ppm パーツパーミリオン
rtまたはRT 室温
s 一重線
t 三重線
TFAA 無水トリフルオロ酢酸
TLC 薄層クロマトグラフィー
2-(3-フェノキシプロピル)マロン酸(1)
NaH(1.91g、47.8mmol、1.2当量)のTHF(50mL)中の撹拌溶液に、室温でマロン酸ジメチル(10g、75.68mmol、1.9当量)を注意深く滴下により添加した。添加すると、この反応混合物は濃厚な懸濁物になった。THF(10mL)をこの反応物に添加し、そしてこれを1時間撹拌した。ベンジル3-ブロモプロピルエーテル(9.126g、39.8mmol、1当量)をこの反応物に添加し、そしてこの反応混合物を85℃まで加熱した。5時間撹拌した後に、この反応物を室温まで冷却し、EtOAc(100ml)で希釈し、そして水(100mL)で洗浄した。その水相をEtOAc(100mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、そして濃縮した。その残渣を、ヘキサン中0~50%のEtOAcを使用するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、10.5gの1(94%)を透明な油状物として得た。生成物をLCMSおよびNMRにより確認した。HPLC:rt=4.996分。
NaH(1.91g、47.8mmol、1.2当量)のTHF(50mL)中の撹拌溶液に、室温でマロン酸ジメチル(10g、75.68mmol、1.9当量)を注意深く滴下により添加した。添加すると、この反応混合物は濃厚な懸濁物になった。THF(10mL)をこの反応物に添加し、そしてこれを1時間撹拌した。ベンジル3-ブロモプロピルエーテル(9.126g、39.8mmol、1当量)をこの反応物に添加し、そしてこの反応混合物を85℃まで加熱した。5時間撹拌した後に、この反応物を室温まで冷却し、EtOAc(100ml)で希釈し、そして水(100mL)で洗浄した。その水相をEtOAc(100mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、そして濃縮した。その残渣を、ヘキサン中0~50%のEtOAcを使用するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、10.5gの1(94%)を透明な油状物として得た。生成物をLCMSおよびNMRにより確認した。HPLC:rt=4.996分。
2-(3-フェノキシプロピル)マロン酸(2)
化合物1(10.5g、37.5mmol、1当量)のTHF/H2O(1:1、100mL)中の撹拌溶液に、LiOHを添加した。この反応物を一晩撹拌し、次いで1NのHClでpH=2まで酸性にした。この混合物をEtOAc(100mL×2)で抽出し、Na2SO4で乾燥させ、そして濃縮して、8.9gの粗生成物2(93%)を白色固体として得、これを精製せずに次の工程で使用した。HPLC:rt=3.592分。
化合物1(10.5g、37.5mmol、1当量)のTHF/H2O(1:1、100mL)中の撹拌溶液に、LiOHを添加した。この反応物を一晩撹拌し、次いで1NのHClでpH=2まで酸性にした。この混合物をEtOAc(100mL×2)で抽出し、Na2SO4で乾燥させ、そして濃縮して、8.9gの粗生成物2(93%)を白色固体として得、これを精製せずに次の工程で使用した。HPLC:rt=3.592分。
2-(3-(((ベンジルオキシ)カルボニル)アミノ)プロピル)マロン酸ジメチル(2)
NaH(1.1g、27.6mmol、1.5当量)のDMF(15mL)中の撹拌溶液に、室温でDMF(5mL)中のマロン酸ジメチル(3.64g、27.6mmol、1.5当量)を滴下により注意深く添加した。添加すると、この反応混合物は濃厚な懸濁物になった。DMF(5mL)をこの反応物に添加し、そしてこれを室温で1時間撹拌した。DMF(5mL)中の出発物質1(5.0g、18.4mmol、1当量)をこの反応物に添加し、そしてこの反応混合物を75℃まで加熱した。75℃で5時間撹拌した後に、この反応物を室温まで冷却した。この反応混合物をEtOAc(100ml)で希釈し、そして水(100mL)で洗浄した。その水相をEtOAc(100mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、そして濃縮した。その残渣を、ヘキサン中0~40%のEtOAcを使用するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、3.6gの生成物2(60%)を透明な油状物として得た。生成物をLCMSおよびNMRにより確認した。HPLC:rt=4.518。
NaH(1.1g、27.6mmol、1.5当量)のDMF(15mL)中の撹拌溶液に、室温でDMF(5mL)中のマロン酸ジメチル(3.64g、27.6mmol、1.5当量)を滴下により注意深く添加した。添加すると、この反応混合物は濃厚な懸濁物になった。DMF(5mL)をこの反応物に添加し、そしてこれを室温で1時間撹拌した。DMF(5mL)中の出発物質1(5.0g、18.4mmol、1当量)をこの反応物に添加し、そしてこの反応混合物を75℃まで加熱した。75℃で5時間撹拌した後に、この反応物を室温まで冷却した。この反応混合物をEtOAc(100ml)で希釈し、そして水(100mL)で洗浄した。その水相をEtOAc(100mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、そして濃縮した。その残渣を、ヘキサン中0~40%のEtOAcを使用するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、3.6gの生成物2(60%)を透明な油状物として得た。生成物をLCMSおよびNMRにより確認した。HPLC:rt=4.518。
2-(3-(((ベンジルオキシ)カルボニル)アミノ)プロピル)マロネート酸(2-(3-(((benzyloxy)carbonyl)amino)propyl)malonatic acid)(3)
化合物2(3.6g、11.13mmol、1当量)のTHF/H2O(1:1、50mL)中の撹拌溶液に、LiOH(0.8g、33.4mmol、3当量)を添加した。この反応物を一晩撹拌し、次いで1NのHClでpH=2まで酸性にした。この混合物をEtOAc(60mL×2)で抽出し、Na2SO4で乾燥させ、そして濃縮して、3.3gの粗生成物3(100%)を透明油状物として得、これを精製せずに次の工程で使用した。HPLC:rt=3.40分。
化合物2(3.6g、11.13mmol、1当量)のTHF/H2O(1:1、50mL)中の撹拌溶液に、LiOH(0.8g、33.4mmol、3当量)を添加した。この反応物を一晩撹拌し、次いで1NのHClでpH=2まで酸性にした。この混合物をEtOAc(60mL×2)で抽出し、Na2SO4で乾燥させ、そして濃縮して、3.3gの粗生成物3(100%)を透明油状物として得、これを精製せずに次の工程で使用した。HPLC:rt=3.40分。
実施例3
アルコール1(5.0g、10.27mmol、1当量)、Na2CO3(7.619g、71.888mmol、7当量)、およびテトラブチルアンモニウムブロミド(0.132g、0.411mmol、0.04当量)を、CH2Cl2(125mL)およびH2O(250mL)の二相混合物に溶解させた。塩化ベンゾイル(1.550mL、13.351mmol、1.3当量)をこの反応物に添加し、そしてこの反応混合物を一晩激しく撹拌した。この反応混合物をDCMで抽出した。その有機相を無水Na2SO4で乾燥させ、濾過し、そして減圧下でエバポレートした。その残渣を1,2-ジクロロエタン(30mL)に溶解させ、そして60℃で20分間加熱した。この溶液を室温で一晩撹拌し、その溶媒を減圧下で除去し、そしてその残渣を、ヘキサン中0~40%のEtOAcの勾配を使用するシリカゲルでのカラムクロマトグラフィーにより精製して、3.4g(51%)の生成物(2)を固体として得た。LCMS:ESI+ m/z=591.1[M+H]+。
TBSCl(666mg、4.4mmol、1.2当量)を固体として、ジオール(4)(1.8g、3.7mmol、1当量)およびイミダゾール(501mg、7.4mmol、2当量)のDMF(18mL)中の溶液に0℃で一度に添加した。この反応混合物を室温で2.5時間撹拌し、酢酸エチルで希釈し、次いで撹拌冷水(200mL)に注いだ。その有機層を水(2×200mL)、次いでブライン(150mL)で洗浄した。その有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、次いで減圧下で濃縮した。得られた残渣を、ヘキサン中0~25%の酢酸エチルを使用するシリカゲル(50g)でのフラッシュカラムクロマトグラフィーにより精製して、アルコール5(1.94g、87%)を油状物として得た。LCMS:ESI+ m/z=625.2[M+Na]+。
実施例5
非対称三分岐(tri-antennary)3’-トリアゾールGalNAc-リンカーの合成:
非対称三分岐(tri-antennary)3’-トリアゾールGalNAc-リンカーの合成:
本開示の範囲内に入る例示的な化合物を、以下のスキームに従って合成することができた:
中間体2(INT-2)。
INT-1(8.5g、12.94mmol、1当量)のEtOAc(200mL)およびTFA(3mL)中の溶液に、アルゴン下でPd/C(1.377g、10wt%、1.294mmol、0.1当量)を添加した。この丸底フラスコをH2ガスでフラッシュし、次いで、この懸濁物をH2(1atm)下で一晩撹拌した。その触媒をセライトで濾別し、そしてその濾液を濃縮した。得られた残渣を、DCM中0~20%のMeOHの勾配を使用するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、INT-2(5.9g、74%)を得た。
中間体3(INT-3)。
INT-2(3.5g、5.649mmol、1当量)および3-アジドプロピオン酸(0.975g、8.474mmol、1.5当量)のDCM(50mL)中の溶液に、0℃で、HATU(3.222g、8.474mmol、1.5当量)、次いでDIPEA(9.84mL、56.492mmol、10当量)を滴下により、順番に添加した。この反応物を0℃で5分間、次いで室温で1時間撹拌した。この反応を水の添加によりクエンチし、そしてその生成物をDCMとH2Oとの間で分配した。その水相をDCMで抽出し、合わせた有機層をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、そして濃縮した。得られた残渣を、EtOAc中0~10%のMeOHの勾配を使用するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、INT-3(3.27g、93%)を得た。
中間体5(INT-5)。
INT-4(1g、1.832mmol、1当量)の、0℃の無水DMF(15ml)中の撹拌溶液に、NaH 60w%(220mg 5.495mmol、3当量)を添加した。この反応混合物を0℃で30分間撹拌し、次いで臭化プロパルギル(0.68mL、4.579mmol、2.5当量)を滴下により添加し、そしてこの混合物を室温で12時間撹拌した。この反応混合物を水(20mL)でクエンチし、酢酸エチル(3×50mL)で抽出し、乾燥させ(Na2SO4)、次いで濃縮した。得られた残渣を、溶出液としてヘキサン中0~50%の酢酸エチルの勾配を使用するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、INT-5(919mg 80%)を固体として得た。LCMS ESI+:m/z=683[M+Na]+。
中間体6(INT-6)。
INT-5(400mg、0.606mmol、1.00当量)のDCM(10mL)中の溶液に、室温で、TFA(0.1mL、1.33mmol、2.20当量)およびEt3SiH(0.1mL、0.667mmol、1.1当量)を順番に添加した。この反応混合物を室温で5時間撹拌し、次いでDCM(50mL)で希釈した。その有機相をNaHCO3(50mL)、次いでブライン(50mL)で洗浄し、乾燥させ(Na2SO4)、濾過し、そして濃縮した。得られた残渣を、ヘキサン中0~100%のEtOAcの勾配を使用するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、INT-6(200mg、50%)を固体として得た。LCMS ESI+:m/z=359[M+H]+。
中間体7(INT-7)。
INT-6(8mg、0.022mmol、1当量)およびINT-3(62mg、0.101mmol、4.5)のTHF(1mL)中の撹拌混合物に、0℃でCuSO4・5H2O(17mg、0.067mmol、3当量)の水(0.25mL)中の溶液を添加し、その後、アスコルビン酸ナトリウム(15mg、0.078mmol、3.5当量)の水(0.25mL)中の溶液を添加した。この混合物を室温で1時間撹拌し、水性飽和NaHCO3(10mL)で希釈し、次いでDCM(2×20mL)で抽出した。その有機相を合わせ、ブライン(20mL)で洗浄し、乾燥させ(Na2SO4)、濾過し、そして濃縮した。得られた粗製残渣を、DCM中0~30%のMeOHの勾配を使用するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、INT-7(20mg 40%)を固体として得た。LCMS ESI+:m/z=2239[M+Na]+。
実施例6。
INT-7(70mg、0.032mmol、1当量)のDCM(10ml)中の溶液に、0℃で、ジイソプロピルエチルアミン(0.013mL、0.076mmol、2.4当量)、その後、シアノエチル=N,N-ジイソプロピルクロロホスホロアミダイト(0.008mL、0.038mmol、1.2当量)を滴下により、順番に添加した。この反応混合物を室温で2時間撹拌し、次いでさらなるジイソプロピルエチルアミン(0.013mL、0.076mmol、2.4当量)、その後、シアノエチル=N,N-ジイソプロピルクロロホスホロアミダイト(0.008mL、0.038mmol、1.2当量)を滴下により添加した。この混合物を室温で24時間撹拌し、飽和NaHCO3水溶液(20mL)で希釈し、そしてその生成物をDCM(2×50mL)で抽出した。その有機相を乾燥させ(Na2SO4)、濾過し、そして濃縮した。得られた残渣を、DCM中0~30%のMeOHの勾配を使用するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、実施例6(10mg、26%)を固体として得た。LCMS ESI+:m/z=2439[M+Na]+。1Hおよび31P NMRは、所望の生成物の構造と一致する。
アルコール1(10.0g、20.54mmol、1当量)、Na2CO3(15.239g、143.776mmol、7当量)およびテトラブチルアンモニウムブロミド(0.265g、0.822mmol、0.04当量)を、CH2Cl2(200mL)およびH2O(400mL)の二相混合物中で撹拌した。塩化ベンゾイル(3.099mL、26.71mmol、1.3当量)をこの反応物に添加し、そしてこの反応混合物を6時間激しく撹拌した。この反応混合物をCH2Cl2で希釈した。その水相を分離し、そしてDCMで抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4で乾燥させ、濾過し、そして減圧下でエバポレートした。その残渣を1,2-ジクロロエタン(50mL)に溶解させ、そして60℃で20分間加熱した。次いで、この溶液を室温で一晩撹拌した。その溶媒を減圧下で除去し、そしてその残渣を、ヘキサン中0~30%のEtOAcを用いるシリカゲルでのカラムクロマトグラフィーにより精製して、7.3g(60%)の生成物2を白色固体として得た。化合物3は、主要な副生成物である。
工程2:得られた残渣を、無水トルエン(20mL)からの濃縮により共沸により乾燥させた。得られた残渣をDMF(21mL)に溶解させ、0℃まで冷却し、次いでブロモ酢酸t-ブチル(1.52mL、10.3mmol、2.5当量)および水素化ナトリウム(鉱油中60%の分散物、329mg、8.2mmol、2当量)を添加した。この反応混合物を氷浴に入れておいて、ゆっくりと昇温させた。2時間後、この反応混合物をメタノール(0.5mL)でクエンチし、次いで撹拌している酢酸エチル-ヘキサン(4:1、150mL)および10%の飽和塩化ナトリウム水溶液(200mL)に即座に注いだ。その有機層を10%の飽和塩化ナトリウム水溶液(2×100mL)で、および飽和塩化ナトリウム水溶液(100mL)で洗浄した。その水層を別に酢酸エチル-ヘキサン(4:1、100mL)で1回抽出した。合わせた有機抽出物を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、そして減圧下で濃縮した。
工程3:得られた残渣をTHF(25mL)に溶解させ、0℃まで冷却し、次いでTBAF(THF中1.0M、10mL、10mmol、2.5当量)を添加し、次いでその氷水浴を外した。30分後、この反応混合物を撹拌している飽和重炭酸ナトリウム水溶液(100mL)およびDCM(100mL)に注いだ。その水層をDCM(2×100mL)で抽出した。最後の有機層を、後の抽出のためにとっておいた。合わせた最初の2つの有機抽出物を水(100mL)で、および飽和塩化ナトリウム水溶液(100mL)で洗浄した。その水層を別に、とっておいたDCM層で抽出した。合わせた有機抽出物を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、そして減圧下で濃縮した。
工程4:得られた残渣を、無水トルエン(20mL)からの濃縮により共沸により乾燥させた。得られた残渣をDMF(15mL)に溶解させ、そして0℃まで冷却し、その後、イミダゾール(559mg、8.2mmol、2当量)およびTBSCl(619mg、4.1mmol、1当量)を添加した。その氷水浴を外し、そして反応物を室温で撹拌した。1.5時間後、さらなるイミダゾール(303mg、4.5mmol、1当量)およびTBSCl(325mg、2.2mmol、0.5当量)を添加した。さらに30分後、この反応混合物を、撹拌している酢酸エチル-ヘキサン(5:1、150mL)および冷水(150mL)に注いだ。その有機層を水(2×150mL)で、および飽和塩化ナトリウム水溶液(150mL)で洗浄した。その水層を別に酢酸エチル-ヘキサン(5:1、100mL)で1回抽出した。合わせた有機抽出物を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、そして減圧下で濃縮した。得られた残渣(5g)を、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(50g、60μm、ヘキサン中の酢酸エチル、0%[2CV]、0→8%[5CV]、8→15%[8CV]、15%[7CV]、15→30%[5CV]、30%[5CV])により精製して、アルコール(2.25g、90%)を無色油状物として得た。
アルコール12(1.033g、0.444mmol、1当量)およびジイソプロピルエチルアミン(0.46mL、2.666mmol、6当量)のDCM(10mL)中の撹拌溶液に、2-シアノエチル=N,N-ジイソプロピルクロロホスホロアミダイト(0.29mL 1.33mmol、3当量)を滴下により添加した。この反応混合物を室温で1時間撹拌した。反応混合物を飽和NaHCO3水溶液(50mL)でクエンチした。DCM(100ml)で抽出し、ブライン(100mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、そしてエバポレートした粗生成物を、(1%のEt3N-DCMで予め平衡化させた)Biotageシリカゲルカラム(25g 20μm)に装填し、そして1%のEt3Nを添加剤として含有する0~10%のMeOH/DCMを使用するフラッシュクロマトグラフィーにより精製した。純粋な画分を合わせ、濃縮し、そして高真空下で乾燥させて、ホスホロアミダイト13(1.01g、90%)をベージュの固体として得た。HPLCによれば純度91%、P31-NMR、質量(m/z 2546 M-1+ Na)、およびH1-NMRは、生成物と対応する。
参考による援用
本願全体にわたり引用される全ての参考文献(文献の参考文献、発行された特許、公開された特許出願、および同時係属中の特許出願を含む)の内容は、その全体が本明細書中に参考として明示的に援用される。
本願全体にわたり引用される全ての参考文献(文献の参考文献、発行された特許、公開された特許出願、および同時係属中の特許出願を含む)の内容は、その全体が本明細書中に参考として明示的に援用される。
均等物
当業者は、本明細書中に開示される本発明の特定の実施形態の多くの均等物を認識するか、または慣用的な実験にすぎないものを使用して確認することができる。このような均等物は、以下の特許請求の範囲に包含されることを意図される。
当業者は、本明細書中に開示される本発明の特定の実施形態の多くの均等物を認識するか、または慣用的な実験にすぎないものを使用して確認することができる。このような均等物は、以下の特許請求の範囲に包含されることを意図される。
実施形態
本発明のさらなる実施形態には、以下のものが含まれる:
本発明のさらなる実施形態には、以下のものが含まれる:
1. 式(I-a)、(I-b)、(I-c)、もしくは(I-d)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(I-a)、(I-b)、(I-c)、および(I-d)において:
は環Aであり、ここで各環Aは独立して、必要に応じて置換されたカルボシクリル、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
は環Bであり、ここで各環Bは独立して、必要に応じて置換されたアリール、または必要に応じて置換されたヘテロアリールであり;
各nは独立して、0、1、2、3、または4であり;
各Yは独立して、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換アミノ、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Zは独立して、必要に応じて置換されたアルキル基、必要に応じて置換されたアルケニル基、必要に応じて置換されたアルキニル基、またはエチレングリコールであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、アルキルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
R2およびR5は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;
R3およびR6は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
各R4は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
各nは独立して、0、1、2、3、または4であり;
各Yは独立して、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換アミノ、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Zは独立して、必要に応じて置換されたアルキル基、必要に応じて置換されたアルケニル基、必要に応じて置換されたアルキニル基、またはエチレングリコールであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、アルキルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
R2およびR5は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;
R3およびR6は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
各R4は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
2. 式(I-a)を有する、実施形態1の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
3. R2とR3とが同じである、実施形態1または2の化合物。
4. 式(I-c)を有する、実施形態1の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
5. A環が、必要に応じて置換されたカルボシクリルである、実施形態1~4のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
6. 環Aが、必要に応じて置換されたヘテロシクリルである、実施形態1~4のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
7. 式(I-b)を有する、実施形態1の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
8. R2とR3とが同じである、実施形態1または7の化合物。
9. 式(I-d)を有する、実施形態1の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
10. 環Bが、必要に応じて置換されたアリールである、実施形態1または7~9のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
11. 環Bが、必要に応じて置換されたヘテロアリールである、実施形態1、または7~9のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
12. 式(II-a)、(II-b)、もしくは(II-c)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(II-a)、(II-b)、および(II-c)において:
各nは独立して、0、1、2、3、または4であり;
各Yは独立して、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Zは独立して、必要に応じて置換されたアルキル基、必要に応じて置換されたアルケニル基、必要に応じて置換されたアルキニル基、またはエチレングリコールであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
R5、R6、R7、およびR8は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、ウラシル、イノシン(I)、または核酸塩基改変体である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
各nは独立して、0、1、2、3、または4であり;
各Yは独立して、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Zは独立して、必要に応じて置換されたアルキル基、必要に応じて置換されたアルケニル基、必要に応じて置換されたアルキニル基、またはエチレングリコールであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
R5、R6、R7、およびR8は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、ウラシル、イノシン(I)、または核酸塩基改変体である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
13. 式(II-a)を有する、実施形態12の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
14. 式(II-b)を有する、実施形態12の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
15. 式(II-c)を有する、実施形態12の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
16. R5、R6、R7、およびR8のうちの3つが各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり、そして残りの1つのR5、R6、R7、またはR8は独立して、H、アルキル、アルケニル、アルキニル、ハロゲン、置換アミン、チオール、またはアミドである、実施形態12~15のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
17. R5、R6、R7、およびR8のうちの2つが各々、同じである、実施形態12~16のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
18. R5、R6、R7、およびR8のうちの3つが各々、同じである、実施形態12~16のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
19. R5、R6、R7、およびR8のうちの3つが各々、同じであり、そして残りの1つのR5、R6、R7、またはR8は独立して、H、アルキル、アルケニル、アルキニル、ハロゲン、置換アミン、チオール、またはアミドである、実施形態12~16のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
20. R9がHである、実施形態12~19のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
21. R9が、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、またはウラシルである、実施形態12~19のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
22. 式(III-a)もしくは(III-b)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(III-a)および(III-b)において:
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、アルキルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
各R2は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;
各R3は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
各R4は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc;アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、アルキルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
各R2は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;
各R3は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
各R4は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc;アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
23. 式(III-a)を有する、実施形態22の化合物またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
24. 式(III-b)を有する、実施形態22の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
25. 式:
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物であって、
式中:
各nは独立して、0および10を含めた整数0~10であり;
各mは独立して、0および10を含めた整数0~10であり;そして
塩基は、アデノシン、ウラシル、チミン、シトシン、イノシン、またはグアノシンである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
25. 式:
式中:
各nは独立して、0および10を含めた整数0~10であり;
各mは独立して、0および10を含めた整数0~10であり;そして
塩基は、アデノシン、ウラシル、チミン、シトシン、イノシン、またはグアノシンである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
26. 式(IV-a)、(IV-b)、(IV-c)、もしくは(IV-d):
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物であって、
式(IV-a)、(IV-b)、(IV-c)、もしくは(IV-d)において:
n1は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n2は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n3は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n4は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
各Xは独立して、H、アルキル-GalNAc、またはPEG-GalNAcであり;そして
各Yは独立して、H、アルキル-GalNAc、またはPEG-GalNAcである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
式(IV-a)、(IV-b)、(IV-c)、もしくは(IV-d)において:
n1は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n2は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n3は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n4は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
各Xは独立して、H、アルキル-GalNAc、またはPEG-GalNAcであり;そして
各Yは独立して、H、アルキル-GalNAc、またはPEG-GalNAcである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
27. 実施形態1~26のいずれか1つの化合物を含む修飾オリゴヌクレオチド。
28. 上記オリゴヌクレオチドが、siRNA、miRNA、ADAR動員分子、ADARターゲッティング分子、ガイドRNA、またはアンチセンス核酸を含む、実施形態27の修飾オリゴヌクレオチド。
29. 式(V)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(V)において:
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、またはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、
であり;
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、またはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
30. R3、R4、R5、およびR6が同じである、実施形態29の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
31. R3、R5、およびR6が同じである、実施形態29または30の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
32. R3またはR4がHである、実施形態29~31のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
33. L1とL2とが同じである、実施形態29~32のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
34.
L1およびL2が各々独立して、アルキルであり;
R3が、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4が、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcである、
実施形態29~33のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
L1およびL2が各々独立して、アルキルであり;
R3が、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4が、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcである、
実施形態29~33のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
35.
L1およびL2が各々独立して、アルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3が、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4が、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcである、
実施形態29~34のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
L1およびL2が各々独立して、アルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3が、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4が、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcである、
実施形態29~34のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
36. R4がHである、実施形態29~35のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
37.
L1およびL2は各々独立して、アルキルであり;
R3が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4がHであり;
R5が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcである、
実施形態29~36のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
L1およびL2は各々独立して、アルキルであり;
R3が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4がHであり;
R5が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcである、
実施形態29~36のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
38.
L1およびL2が各々独立して、アルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4がHであり;
R5が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcである、
実施形態29~37のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
L1およびL2が各々独立して、アルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4がHであり;
R5が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcである、
実施形態29~37のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
39.
R3が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAcであり;
R4がHであり;
R5が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAcであり;
R6が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAcである、
実施形態29~38のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R3が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAcであり;
R4がHであり;
R5が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAcであり;
R6が、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAcである、
実施形態29~38のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
40.
R3が、-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4がHであり;
R5が、-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6が、-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcである、
実施形態29~39のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R3が、-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4がHであり;
R5が、-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6が、-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcである、
実施形態29~39のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
41. j、m、およびnが各々独立して、4および10を含めた整数4~10である、実施形態29~40のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
42. j、m、およびnが各々同じであり、4および10を含めた整数4~10である、実施形態29~41のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
43. R1がHである、実施形態29~42のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
44. R1が、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、またはウラシルである、実施形態29~43のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
45. R1がアデニンである、実施形態29~44のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
46. R1がグアニンである、実施形態29~45のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
47. R1がチミンである、実施形態29~46のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
48. R1がシトシンである、実施形態29~47のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
49. R1がウラシルである、実施形態29~48のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
50. R2がHである、実施形態29~49のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
51. R2が保護基(PG)である、実施形態29~50のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
52. PGが酸素保護基である、実施形態29~51のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
54. 化学反応における試薬として使用するための、実施形態29~53のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
55. 式(VI)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(VI)において:
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、またはウラシルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、またはウラシルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
56. 実施形態55の化合物を含む修飾オリゴヌクレオチドであって、上記オリゴヌクレオチドが、siRNA、miRNA、ADAR動員分子、ADARターゲッティング分子、ガイドRNA、またはアンチセンス核酸を含む、修飾オリゴヌクレオチド。
57. 式(VII)の部分、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
を含むオリゴヌクレオチドであって、式(VII)において:
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、またはウラシルであり;
R2は結合であり;
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である、
オリゴヌクレオチド。
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、またはウラシルであり;
R2は結合であり;
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である、
オリゴヌクレオチド。
58. 上記オリゴヌクレオチドが、siRNA、miRNA、ADAR動員分子、ADARターゲッティング分子、ガイドRNA、またはアンチセンス核酸を含む、実施形態29の化合物。
59. 実施形態1~58のいずれかの化合物、および薬学的に受容可能なキャリアを含有する組成物。
60. 被験体におけるタンパク質機能を調節するための方法であって、実施形態1~58のいずれかの化合物の、上記被験体への投与を包含する、方法。
61. 被験体における疾患、障害、またはその症状を処置または改善するための方法であって、実施形態1~58のいずれかの化合物の、上記被験体への投与を包含する、方法。
62. 式(I-a)もしくは(I-c)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(I-a)および(I-c)において:
は環Aであり、各環Aは独立して、必要に応じて置換されたカルボシクリルであり;各nは独立して、0、1、2、3、または4であり;
各Yは独立して、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換アミノ、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Zは独立して、必要に応じて置換されたアルキル基、必要に応じて置換されたアルケニル基、必要に応じて置換されたアルキニル基、またはエチレングリコールであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、アルキルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
R2およびR5は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;
R3およびR6は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
各R4は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
各Yは独立して、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換アミノ、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Zは独立して、必要に応じて置換されたアルキル基、必要に応じて置換されたアルケニル基、必要に応じて置換されたアルキニル基、またはエチレングリコールであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、アルキルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
R2およびR5は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;
R3およびR6は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
各R4は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
63. 環Aがシクロペンチルではない、実施形態62の化合物。
64. 式(I-a)もしくは(I-c)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(I-a)および(I-c)において:
は環Aであり、各環Aは独立して、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
各nは独立して、0、1、2、3、または4であり;
各Yは独立して、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換アミノ、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Zは独立して、必要に応じて置換されたアルキル基、必要に応じて置換されたアルケニル基、必要に応じて置換されたアルキニル基、またはエチレングリコールであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、アルキルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
R2およびR5は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;
R3およびR6は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
各R4は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
各nは独立して、0、1、2、3、または4であり;
各Yは独立して、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換アミノ、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Zは独立して、必要に応じて置換されたアルキル基、必要に応じて置換されたアルケニル基、必要に応じて置換されたアルキニル基、またはエチレングリコールであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、アルキルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
R2およびR5は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;
R3およびR6は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
各R4は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
65. 環Aが、(i)酸素である1個のみのヘテロ原子を含む、(ii)Sである少なくとも1個のヘテロ原子を含む、または(iii)窒素原子を含まない、実施形態64の化合物。
66. 環Aが、オキセタニル、テトラヒドロフラニル、またはテトラヒドロピラニルである、実施形態64または65の化合物。
67. 環Aがテトラヒドロフラニルである、実施形態64~66のいずれか1つの化合物。
68. 環Aが、ピロリジニルでも、ピペリジニルでも、モルホリニルでもない、実施形態64の化合物。
69. 式(I-b)もしくは(I-d)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(I-b)および(I-d)において:
は環Bであり、各環Bは独立して、必要に応じて置換されたアリールであり;
各nは独立して、0、1、2、3、または4であり;
各Yは独立して、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換アミノ、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Zは独立して、必要に応じて置換されたアルキル基、必要に応じて置換されたアルケニル基、必要に応じて置換されたアルキニル基、またはエチレングリコールであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、アルキルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
R2およびR5は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;
R3およびR6は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
各R4は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
各nは独立して、0、1、2、3、または4であり;
各Yは独立して、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換アミノ、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Zは独立して、必要に応じて置換されたアルキル基、必要に応じて置換されたアルケニル基、必要に応じて置換されたアルキニル基、またはエチレングリコールであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、アルキルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
R2およびR5は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;
R3およびR6は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
各R4は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
70. 環Bがフェニルではない、実施形態69の化合物。
71. 式(I-b)もしくは(I-d)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(I-b)および(I-d)において:
は環Bであり、ここで各Bは独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリールであり;
各nは独立して、0、1、2、3、または4であり;
各Yは独立して、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換アミノ、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Zは独立して、必要に応じて置換されたアルキル基、必要に応じて置換されたアルケニル基、必要に応じて置換されたアルキニル基、またはエチレングリコールであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、アルキルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
R2およびR5は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;
R3およびR6は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
各R4は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
各nは独立して、0、1、2、3、または4であり;
各Yは独立して、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換アミノ、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Zは独立して、必要に応じて置換されたアルキル基、必要に応じて置換されたアルケニル基、必要に応じて置換されたアルキニル基、またはエチレングリコールであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、アルキルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイトであり;
R2およびR5は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、ポリエチレングリコール-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;
R3およびR6は各々独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcであり;そして
各R4は独立して、必要に応じて置換されたアルキル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルケニル-O-GalNAc、必要に応じて置換されたアルキニル-O-GalNAc、アルキル-S(=O)-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)2-アルキル-GalNAc、アルキル-S(=O)-NH-アルキル、アルキル-S(=O)2-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-P P(=O)(-O-)-NH-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(=O)(-O-)-O-アルキル-GalNAc、アルキル-O-P(-O-)(=S)-O-アルキル-GalNAc、またはアルキル-O-P(-S-)(=S)-O-アルキル-GalNAcである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
72. 環Bは、ピリジニルでも、1,3-ピリミジニルでも、1,4-ピリミジニルでも、1-キノリニルでも、9H-プリニルでもない、実施形態71の化合物。
73. 式(IV-a)もしくは(IV-d):
の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物であって、
式(IV-a)および(IV-d)において:
n1は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n2は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n3は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n4は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
各Xは独立して、H、アルキル-GalNAc、またはPEG-GalNAcであり;そして
各Yは独立して、H、アルキル-GalNAc、またはPEG-GalNAcである
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
式(IV-a)および(IV-d)において:
n1は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n2は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n3は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
n4は独立して、1および10を含めた整数1~10であり;
各Xは独立して、H、アルキル-GalNAc、またはPEG-GalNAcであり;そして
各Yは独立して、H、アルキル-GalNAc、またはPEG-GalNAcである
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
74. 実施形態1~26のいずれか1つの化合物を含む修飾オリゴヌクレオチドであって、(i)ヘテロシクリルが、酸素である1個のみのヘテロ原子を含む、(ii)ヘテロシクリルが、Sである少なくとも1個のヘテロ原子を含む;または(iii)ヘテロシクリルが窒素ヘテロ原子を含まない、修飾オリゴヌクレオチド。
75. 上記オリゴヌクレオチドが、siRNA、miRNA、ADAR動員分子、ADARターゲッティング分子、ガイドRNA、またはアンチセンス核酸を含む、実施形態74の修飾オリゴヌクレオチド。
76. 環Aが、シクロペンチルでも、ピロリジニルでも、ピペリジニルでも、モルホリニルでもない、実施形態27または28の修飾オリゴヌクレオチド。
77. 実施形態1~26のいずれか1つの化合物を含む修飾オリゴヌクレオチドであって、(i)ヘテロアリールが窒素ヘテロ原子を含まない;(ii)ヘテロアリールが、酸素である1個のみのヘテロ原子を含む;または(iii)ヘテロアリールが、硫黄である1個のみのヘテロ原子を含む、修飾オリゴヌクレオチド。
78. 上記オリゴヌクレオチドが、siRNA、miRNA、ADAR動員分子、ADARターゲッティング分子、ガイドRNA、またはアンチセンス核酸を含む、実施形態77の修飾オリゴヌクレオチド。
79. 環Bが、フェニルでも、ピリジニルでも、1,3-ピリミジニルでも、1,4-ピリミジニルでも、1-キノリニルでも、9H-プリニルでもない、実施形態27または28の修飾オリゴヌクレオチド。
80. 式(VIII)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(VIII)において:
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、
であり;
Z1は、
であり;
Z2は、
であり;
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
80. 式(VIII)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
R1は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、
Z1は、
Z2は、
L1は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
L2は、アルキル、またはアルキル-C(=O)-NH-アルキルであり;
R3は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)j-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R4は、H、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)k-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R5は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)m-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
R6は、-C=(O)-NH-(CH2CH2O)n-GalNAc、または-C(=O)-NH-アルキル-NH-C(=O)-アルキル-O-GalNAcであり;
jは、1および10を含めた整数1~10であり;
kは、1および10を含めた整数1~10であり;
mは、1および10を含めた整数1~10であり;そして
nは、1および10を含めた整数1~10である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
81. 式(IX)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(IX)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
82. 式(X)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(X)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
83.
またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である、実施形態81の化合物。
84.
またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である、実施形態82の化合物。
85. 式(XI)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(XI)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
86. 式(XII)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(XII)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
87. 式(XIII)の部分、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
を含むオリゴヌクレオチドであって、式(XIII)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は結合であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は結合であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
88. 式(XIV)の部分、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
を含むオリゴヌクレオチドであって、式(XIV)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は結合であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
オリゴヌクレオチド。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は結合であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
オリゴヌクレオチド。
89. 式(XV)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(XV)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
90. 式(XVI)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(XVI)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
91. 式(XVII)の部分、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
を含むオリゴヌクレオチドであって、式(XVII)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は結合であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
オリゴヌクレオチド。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は結合であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
オリゴヌクレオチド。
92. 式(XVIII)の部分、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
を含むオリゴヌクレオチドであって、式(XVIII)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は結合であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
オリゴヌクレオチド。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は結合であり;
Y1は、Oであり;
Y2は、Oであり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、1、2、3、4、5、または6であり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
オリゴヌクレオチド。
93. R9が、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルである、実施形態80~82または85~92のいずれかの化合物。
94. R9が修飾核酸塩基である、実施形態80~82または85~92のいずれかの化合物。
95. R9が、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、または必要に応じて置換されたヘテロアリールである、実施形態80~82または85~92のいずれかの化合物。
96. 実施形態80~95のいずれかの化合物、および薬学的に受容可能なキャリアを含有する組成物。
97. 被験体におけるタンパク質機能を調節するための方法であって、実施形態80~95のいずれかの化合物または実施形態96の組成物の、上記被験体への投与を包含する、方法。
98. 被験体における疾患、障害、またはその症状を処置または改善するための方法であって、実施形態80~95のいずれかの化合物または実施形態96の組成物の、上記被験体への投与を包含する、方法。
99. 上記疾患、障害、またはその症状が、肝臓の疾患、障害、またはその症状である、実施形態98の方法。
100. 実施形態80~95のいずれかの化合物を作製するための方法であって、実施例1~4を含めた本明細書中に記載される1つまたはそれより多くの化合物および化学変換を含む、方法。
101. 式(XIX)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(XIX)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
であり;
X1は、
であり;そして
X2は、H、アルキル、または保護基(PG)である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
X1は、
X2は、H、アルキル、または保護基(PG)である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
102. 式(XX)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(XX)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
であり;
X2は、H、アルキル、または保護基(PG)であり;
X3は、Oであり;
X4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
X2は、H、アルキル、または保護基(PG)であり;
X3は、Oであり;
X4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
103. 式(XXI)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(XXI)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
であり;
X2は、H、アルキル、または保護基(PG)であり;
X3は、Oであり;
X4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
X2は、H、アルキル、または保護基(PG)であり;
X3は、Oであり;
X4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
104. 式(XXII)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(XXII)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
であり;
X2は、H、アルキル、または保護基(PG)であり;
X3は、Oであり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
X2は、H、アルキル、または保護基(PG)であり;
X3は、Oであり;
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
105. 式(XXIII)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(XXIII)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
であり;
X2は、H、アルキル、または保護基(PG)であり;
X3は、Oであり;
X4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、保護基(PG)、または
X2は、H、アルキル、または保護基(PG)であり;
X3は、Oであり;
X4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
106.
またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である、実施形態102の化合物。
107.
またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である、実施形態103の化合物。
108.
またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である、実施形態104の化合物。
109.
またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である、実施形態105の化合物。
110. 式(XXIV)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(XXIV)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
X2は、H、アルキル、または保護基(PG)であり;
X5は、H、保護基(PG)、または
であり;そして
X6は、
である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
X2は、H、アルキル、または保護基(PG)であり;
X5は、H、保護基(PG)、または
X6は、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
111. 式(XXV)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(XXV)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
X2は、H、アルキル、または保護基(PG)であり;
X5は、H、保護基(PG)、または
であり;
X7は、Oであり;
X8は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、もしくは必要に応じて置換されたヘテロアリールを含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
X2は、H、アルキル、または保護基(PG)であり;
X5は、H、保護基(PG)、または
X7は、Oであり;
X8は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、または6である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
112.
またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物である、実施形態111の化合物。
113. 実施形態101~112のいずれか1つの化合物を含むオリゴヌクレオチド。
114. 実施形態101~112のいずれか1つの化合物、または実施形態113のオリゴヌクレオチド、および薬学的に受容可能なキャリアを含有する組成物。
115. 被験体におけるタンパク質機能を調節するための方法であって、実施形態101~112のいずれか1つの化合物、実施形態113のオリゴヌクレオチド、または実施形態114の組成物の、上記被験体への投与を包含する、方法。
116. 被験体における疾患、障害、またはその症状を処置または改善するための方法であって、実施形態101~112のいずれか1つの化合物、実施形態113のオリゴヌクレオチド、または実施形態114の組成物の投与を包含する、方法。
117. 上記疾患、障害、またはその症状が、肝臓の疾患、障害、またはその症状である、実施形態116の方法。
118. 実施形態101~112のいずれか1つの化合物を作製するための方法であって、実施例5を含めた本明細書中に記載される1つまたはそれより多くの化合物および化学変換を含む、方法。
119. 式(I)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(I)において:
各nは独立して、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイト、OH、NH2、NHRa、N3、C(=O)OH、C(=O)X、CN、SH、SSH、SO2X、C(=O)NHNH2、NHNH2、C(=S)NHNH2、C(=S)NH2、NHOH、C(=O)CH2Xマロニル、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、-OP(=S)X、-C(=O)H、-C(=O)Ra、-N=C=O、-N=C=NRa、-N=C=S、CHX、-OP(=O)OH、ホスファン、アルコキシホスファン、-C(Ra)2、マイケルアクセプター、タンパク質、または肝細胞を調節するため、もしくは肝臓の疾患を処置するための治療剤であり、ここでXは脱離基であり;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
であり;
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
各nは独立して、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
各R1は独立して、アルキル-O-ホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホロアミダイト、必要に応じて置換されたアルキニルホスホロアミダイト、OH、NH2、NHRa、N3、C(=O)OH、C(=O)X、CN、SH、SSH、SO2X、C(=O)NHNH2、NHNH2、C(=S)NHNH2、C(=S)NH2、NHOH、C(=O)CH2Xマロニル、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、-OP(=S)X、-C(=O)H、-C(=O)Ra、-N=C=O、-N=C=NRa、-N=C=S、CHX、-OP(=O)OH、ホスファン、アルコキシホスファン、-C(Ra)2、マイケルアクセプター、タンパク質、または肝細胞を調節するため、もしくは肝臓の疾患を処置するための治療剤であり、ここでXは脱離基であり;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
120. R9が、必要に応じて置換された窒素含有ヘテロシクリルである、実施形態119の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
121. R9が、必要に応じて置換されたピリミジニルである、実施形態119の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
122. R9が、4H-1λ2,3λ2-ピリミジン-2,4-ジオンである、実施形態119の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
123. R9が、
である、実施形態119の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
124. Het1、Het2、およびHet3の各々が独立して、必要に応じて置換された窒素含有ヘテロシクリル、または必要に応じて置換された窒素含有ヘテロアリールである、実施形態119~123のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
125. Het1、Het2、およびHet3の各々が独立して、必要に応じて置換された1,2,3-トリアゾリルである、実施形態119~123のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
126. Het1、Het2、およびHet3の各々が独立して、必要に応じて置換された1λ2,2,3-トリアゾール-4-イルである、実施形態119~123のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
127. Het1、Het2、およびHet3の各々が独立して、
である、実施形態119~123のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
128. R5、R6、およびR7のうちの2つが、それぞれ同じである、実施形態119~127のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
129. R5およびR6が、それぞれ同じである、実施形態119~127のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
130. R5、R6、およびR7のうちの3つが、それぞれ同じである、実施形態119~127のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
131. oが、R5、R6、およびR7の各々において同じである、実施形態119~130のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
132. oが、R5およびR6の各々において同じである、実施形態119~130のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
133. R1が、アルキル-O-ホスホンアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホンアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホンアミダイトである、実施形態119~132のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
135. 式(II)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(II)において、
各nは独立して、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
であり;
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;そして
R2は、H、保護基(PG)、
であり;
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
各nは独立して、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;そして
R2は、H、保護基(PG)、
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルである、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
136. R2がHである、実施形態135の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
137. R2が保護基(PG)である、実施形態135の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
139. R9が、必要に応じて置換された窒素含有ヘテロシクリルである、実施形態135~138のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
140. R9が、必要に応じて置換されたジヒドロピリミジニル、必要に応じて置換されたテトラヒドロピリミジニル、または必要に応じて置換されたヘキサヒドロピリミジニルである、実施形態135~138のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
141. R9が、4H-1λ2,3λ2-ピリミジン-2,4-ジオンである、実施形態135~138のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
142. R9が、
である、実施形態135~138のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
143. Het1、Het2、およびHet3の各々が独立して、必要に応じて置換された窒素含有ヘテロアリールである、実施形態135~142のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
144. Het1、Het2、およびHet3の各々が独立して、必要に応じて置換された1,2,3-トリアゾリルである、実施形態135~142のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
145. Het1、Het2、およびHet3の各々が独立して、必要に応じて置換された1λ2,2,3-トリアゾール-4-イルである、実施形態135~142のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
146. Het1、Het2、およびHet3の各々が独立して、
である、実施形態135~142のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
147. R5、R6、およびR7のうちの2つが、それぞれ同じである、実施形態135~146のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
148. R5およびR6が、それぞれ同じである、実施形態135~146のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
149. R5、R6、およびR7のうちの3つが、それぞれ同じである、実施形態135~146のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
150. oが、R5、R6、およびR7の各々において同じである、実施形態135~146のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
151. oが、R5およびR6の各々において同じである、実施形態135~146のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
153. 式(III)の部分、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
を含む修飾オリゴヌクレオチドであって、式(III)において:
各nは独立して、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
であり;そして
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
Lは、結合、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、またはチオール-マイケル付加体であり;
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルである、
修飾オリゴヌクレオチド。
各nは独立して、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
Lは、結合、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、またはチオール-マイケル付加体であり;
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルである、
修飾オリゴヌクレオチド。
154. R9が、必要に応じて置換された窒素含有ヘテロシクリルである、実施形態153の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
155. R9が、必要に応じて置換されたジヒドロピリミジニル、必要に応じて置換されたテトラヒドロピリミジニル、または必要に応じて置換されたヘキサヒドロピリミジニルである、実施形態153の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
156. R9が、4H-1λ2,3λ2-ピリミジン-2,4-ジオンである、実施形態153の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
157. R9が、
である、実施形態153の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
158. Het1、Het2、およびHet3の各々が独立して、必要に応じて置換された窒素含有ヘテロアリールである、実施形態153~157のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
159. Het1、Het2、およびHet3の各々が独立して、必要に応じて置換された1,2,3-トリアゾリルである、実施形態153~157のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
160. Het1、Het2、およびHet3の各々が独立して、必要に応じて置換された1λ2,2,3-トリアゾール-4-イルである、実施形態153~157のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
161. Het1、Het2、およびHet3の各々が独立して、
である、実施形態153~157のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
162. R5、R6、およびR7のうちの2つが、それぞれ同じである、実施形態153~161のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
163. R5およびR6が、それぞれ同じである、実施形態153~161のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
164. R5、R6、およびR7のうちの3つが、それぞれ同じである、実施形態153~161のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
165. oが、R5、R6、およびR7の各々において同じである、実施形態153~164のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
166. oが、R5およびR6の各々において同じである、実施形態153~164のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
167. 上記オリゴヌクレオチドが、siRNA、miRNA、ADAR動員分子、ADARターゲッティング分子、ガイドRNA、またはアンチセンス核酸を含む、実施形態153~166のいずれか1つの修飾オリゴヌクレオチド。
168. 化学反応における試薬として使用するための、実施形態119~167のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
169. 式(IV)の部分、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
を含むオリゴヌクレオチドであって、式(IV)において:
各nは独立して、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
であり;
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
Lは、結合、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、またはチオール-マイケル付加体であり;
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルである、
オリゴヌクレオチド。
各nは独立して、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
Lは、結合、O、CH2、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、またはチオール-マイケル付加体であり;
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルである、
オリゴヌクレオチド。
170. 上記オリゴヌクレオチドが、siRNA、miRNA、ADAR動員分子、ADARターゲッティング分子、ガイドRNA、またはアンチセンス核酸を含む、実施形態169のオリゴヌクレオチド。
171. R9が、必要に応じて置換された窒素含有ヘテロシクリルである、実施形態169のオリゴヌクレオチド、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
172. R9が、必要に応じて置換されたジヒドロピリミジニル、必要に応じて置換されたテトラヒドロピリミジニル、または必要に応じて置換されたヘキサヒドロピリミジニルである、実施形態169のオリゴヌクレオチド、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
173. R9が、4H-1λ2,3λ2-ピリミジン-2,4-ジオンである、実施形態169のオリゴヌクレオチド、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
174. R9が、
である、実施形態169のオリゴヌクレオチド、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
175. Het1、Het2、およびHet3の各々が独立して、必要に応じて置換された窒素含有ヘテロアリールである、実施形態169~174のいずれかのオリゴヌクレオチド、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
176. Het1、Het2、およびHet3の各々が独立して、必要に応じて置換された1,2,3-トリアゾリルである、実施形態169~174のいずれかのオリゴヌクレオチド、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
177. Het1、Het2、およびHet3の各々が独立して、必要に応じて置換された1λ2,2,3-トリアゾール-4-イルである、実施形態169~174のいずれかのオリゴヌクレオチド、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
178. Het1、Het2、およびHet3の各々が独立して、
である、実施形態169~174のいずれかのオリゴヌクレオチド、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
179. R5、R6、およびR7のうちの2つが、それぞれ同じである、実施形態169~178のいずれかのオリゴヌクレオチド、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
180. R5およびR6が、それぞれ同じである、実施形態169~178のいずれかのオリゴヌクレオチド、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
181. R5、R6、およびR7のうちの3つが、それぞれ同じである、実施形態169~178のいずれかのオリゴヌクレオチド、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
182. oが、R5、R6、およびR7の各々において同じである、実施形態169~181のいずれかのオリゴヌクレオチド、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
183. oが、R5およびR6の各々において同じである、実施形態169~81のいずれかのオリゴヌクレオチド、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
184. 実施例1である、化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
185. INT-1、INT-2、INT-3、INT-4、INT-5、INT-6、またはINT-7のうちの1つである、化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
186. INT-5またはINT-6のうちの1つである、化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
187. INT-7である、化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
188. 実施形態119~187のいずれかの化合物、および薬学的に受容可能なキャリアを含有する組成物。
189. 被験体におけるタンパク質機能を調節するための方法であって、実施形態119~187のいずれかの化合物の、上記被験体への投与を包含する、方法。
190. 被験体における疾患、障害、またはその症状を処置または改善するための方法であって、実施形態119~187のいずれかの化合物の、上記被験体への投与を包含する、方法。
191. 式(V)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
を作製する方法であって、式(V)において:
各nは独立して、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
であり;
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
ここでR2は、
、肝細胞を調節するため、または肝臓の疾患を処置するための治療剤であり;
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルであり;
上記方法は、R2がHである(そして残りの可変物が上で定義されたとおりである)式(V)の化合物を、式
の試薬と反応させる工程を包含し、式中、LGは脱離基である(例えば、ハロゲン化物、-OS(O)2R、-OS(O)2OR、-OC(O)Rなどである;(ここでRは、各々が必要に応じて置換され得るアルキル、アリールアルキル、アリールである))、方法。
各nは独立して、1、2、3、4、または5であり;
各mは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各oは独立して、0、1、2、3、4、5、または6であり;
各Y1は独立して、O、CH(Ra)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
各Y2は独立して、O、CH(Rb)、S、S(=O)、S(=O)2、NH、置換N基、NHC(=O)、C(=O)NH、P(=O)2-O-、P(=O)(=S)-O、P(=S)2-O、-O-P(=O)2-O-、-O-P(=O)(=S)-O-、-O-P(=S)2-O-、-O-P(=O)2-、-O-P(=O)(=S)-、-O-P(=S)2-であり;
Het1、Het2、およびHet3の各々は独立して、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
R5、R6、およびR7の各々は独立して、
R9は、必要に応じて置換されたヘテロシクリルであり;
ここでR2は、
各Raは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;
各Rbは独立して、H、アルキル、ハロ、ORc、またはSRcであり;そして
各Rcは独立して、Hまたはアルキルであり;
上記方法は、R2がHである(そして残りの可変物が上で定義されたとおりである)式(V)の化合物を、式
192. 上記試薬が、3-((クロロ(ジイソプロピルアミノ)ホスファニル)オキシ)プロパンニトリル(3-((chloro(diisopropylamino)phosphaneyl)oxy)propanenitrile)である、実施形態191の方法。
193. 式INT-7の化合物を作製する方法であって、INT-6の化合物をINT-3の化合物と反応させる工程を包含する、方法。
194. 銅触媒をさらに含む、実施形態193の方法。
195. CuSO4・5H2Oをさらに含む、実施形態193の方法。
196. アスコルビン酸ナトリウムをさらに含む、実施形態195の方法。
197. 各R1が独立して、アルキル-O-ホスホンアミダイト、必要に応じて置換されたアルケニルホスホンアミダイト、または必要に応じて置換されたアルキニルホスホンアミダイトである、実施形態119~133のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
198. 各R1が独立して、OH、NH2、NHRa、N3、C(=O)OH、C(=O)X、CN、SH、SSH、SO2X、C(=O)NHNH2、NHNH2、C(=S)NHNH2、C(=S)NH2、NHOH、C(=O)CH2Xマロニル、アルキル、アルケニル、ジエニル、アルキニル、ヘテロアルキル、-OP(=S)X、-C(=O)H、-C(=O)Ra、-N=C=O、-N=C=NRa、-N=C=S、CHX、-OP(=O)OH、ホスファン、アルコキシホスファン、または-C(Ra)2であり、ここでXは脱離基である、実施形態119~133のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
199. 各R1が独立して、マイケルアクセプター、タンパク質、または肝細胞を調節するため、もしくは肝臓の疾患を処置するための治療剤である、実施形態119~133のいずれかの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
200. 式(IX-a)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(IX-a)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、OH、O-保護基(PG)、
、リンカー、アジド、カルボン酸、またはアミンであり;
Y1は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y2は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、OH、O-保護基(PG)、
Y1は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y2は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
201. R9が、保護基を含むウラシルである、実施形態200の化合物。
202. R9が、ベンゾイル保護基を含むウラシルである、実施形態200または201の化合物。
203. R2がO-保護基(PG)である、実施形態200~202のいずれか1つの化合物。
205. Y1がOである、実施形態200~204のいずれか1つの化合物。
206. Y2がOである、実施形態200~205のいずれか1つの化合物。
207. Y1とY2との両方がOである、実施形態200~206のいずれか1つの化合物。
208. Y3がCOである、実施形態200~207のいずれか1つの化合物。
209. Y4がCOである、実施形態200~208のいずれか1つの化合物。
210. Y3およびY4がCOである、実施形態200~209のいずれか1つの化合物。
211. Y1およびY2がOであり、そしてY3およびY4がCOである、実施形態200~210のいずれか1つの化合物。
212. n3が3である、実施形態200~211のいずれか1つの化合物。
213. n4が3である、実施形態200~212のいずれか1つの化合物。
214. n5が3である、実施形態200~213のいずれか1つの化合物。
215. 上記化合物が、式(IX-b):
の化合物であり、式(IX-b)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、OH、O-保護基(PG)、
、リンカー、アジド、カルボン酸、またはアミンであり;
Y1は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y2は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;そして
n1は、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である
、実施形態200の化合物。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、OH、O-保護基(PG)、
Y1は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y2は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;そして
n1は、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である
、実施形態200の化合物。
216. 式(XV-a)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
であって、式(XV-a)において:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
217. Y1がOである、実施形態216の化合物。
218. Y2がOである、実施形態216または217の化合物。
219. Y1とY2との両方がOである、実施形態216~218のいずれか1つの化合物。
220. Y3がCOである、実施形態216~219のいずれか1つの化合物。
221. Y4がCOである、実施形態216~220のいずれか1つの化合物。
222. Y3とY4との両方がCOである、実施形態216~221のいずれか1つの化合物。
223. Y1およびY2がOであり、そしてY3およびY4がCOである、実施形態216~222のいずれか1つの化合物。
224. n3が3である、実施形態216~223のいずれか1つの化合物。
225. n4が3である、実施形態216~224のいずれか1つの化合物。
226. n5が3である、実施形態216~225のいずれか1つの化合物。
227. 上記オリゴヌクレオチドが、siRNA、miRNA、ADAR動員分子、ADARターゲッティング分子、ガイドRNA、またはアンチセンス核酸を含む、実施形態216~226のいずれか1つの化合物。
228. 化学反応における試薬として使用するための、実施形態200~227のいずれか1つの化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
229. 実施形態200~227のいずれか1つの化合物、および薬学的に受容可能なキャリアを含有する組成物。
230. 被験体におけるタンパク質機能を調節するための方法であって、実施形態200~227のいずれか1つの化合物、または実施形態229の組成物の、上記被験体への投与を包含する、方法。
231. 被験体における疾患、障害、またはその症状を処置または改善するための方法であって、実施形態200~227のいずれか1つの化合物、または実施形態229の組成物の、上記被験体への投与を包含する、方法。
232. 上記疾患、障害、またはその症状が、肝臓の疾患、障害、またはその症状である、実施形態231の方法。
233. 実施形態200~229のいずれかの化合物を作製するための方法であって、実施例1~23を含めた本明細書中に記載される1つまたはそれより多くの化合物および化学変換を含む、方法。
Claims (38)
- 式(IX-a)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、OH、O-保護基(PG)、
Y1は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y2は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。 - R9が、保護基を含むウラシルである、請求項1に記載の化合物。
- R9が、ベンゾイル保護基を含むウラシルである、請求項1または2に記載の化合物。
- R2がO-保護基(PG)である、請求項1~3のいずれか1項に記載の化合物。
- Y1がOである、請求項1~5のいずれか1項に記載の化合物。
- Y2がOである、請求項1~6のいずれか1項に記載の化合物。
- Y1とY2との両方がOである、請求項1~7のいずれか1項に記載の化合物。
- Y3がCOである、請求項1~8のいずれか1項に記載の化合物。
- Y4がCOである、請求項1~9のいずれか1項に記載の化合物。
- Y3およびY4がCOである、請求項1~10のいずれか1項に記載の化合物。
- Y1およびY2がOであり、そしてY3およびY4がCOである、請求項1~11のいずれか1項に記載の化合物。
- n3が3である、請求項1~12のいずれか1項に記載の化合物。
- n4が3である、請求項1~13のいずれか1項に記載の化合物。
- n5が3である、請求項1~14のいずれか1項に記載の化合物。
- 前記化合物が、式(IX-b):
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
R2は、H、OH、O-保護基(PG)、
Y1は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y2は、O、必要に応じて置換されたNH、CH2、またはCH2Oであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;そして
n1は、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である、
請求項1に記載の化合物。 - 前記化合物が、式:
- 前記化合物が、式:
- 式(XV-a)の化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物:
R9は、H、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシル、または各々が保護基(PG)、修飾核酸塩基、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたカルボシクリル、必要に応じて置換されたヘテロシクリル、もしくは核酸塩基同配体を含むアデニン、グアニン、チミン、シトシン、もしくはウラシルであり;
Lは、結合、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、トリアゾール、テトラゾール、アミド、逆アミド、カルバメート、カーボネート、尿素、アルキル、またはヘテロアルキルであり;
R2は、オリゴヌクレオチド配列であり;
Y1は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y2は、O、CH2、CH2O、または必要に応じて置換されたNHであり;
Y3は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
Y4は、CO、SO2、P(O)O、CH2-O-C(O)、CH2-NH-C(O)、CH2-NH-SO2、またはCH2であり;
n2は、0、1、2、3、4、5、または6であり;そして
n1、n3、n4およびn5の各々は独立して、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である、
化合物、またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。 - Y1がOである、請求項19に記載の化合物。
- Y2がOである、請求項19または20に記載の化合物。
- Y1とY2との両方がOである、請求項19~21のいずれか1項に記載の化合物。
- Y3がCOである、請求項19~22のいずれか1項に記載の化合物。
- Y4がCOである、請求項19~23のいずれか1項に記載の化合物。
- Y3とY4との両方がCOである、請求項19~24のいずれか1項に記載の化合物。
- Y1およびY2がOであり、そしてY3およびY4がCOである、請求項19~25のいずれか1項に記載の化合物。
- n3が3である、請求項19~26のいずれか1項に記載の化合物。
- n4が3である、請求項19~27のいずれか1項に記載の化合物。
- n5が3である、請求項19~28のいずれか1項に記載の化合物。
- 前記オリゴヌクレオチドが、siRNA、miRNA、ADAR動員分子、ADARターゲッティング分子、ガイドRNA、またはアンチセンス核酸を含む、請求項19~31のいずれか1項に記載の化合物。
- 化学反応における試薬として使用するための、請求項1~32のいずれか1項に記載の化合物またはその塩、溶媒和物、もしくは水和物。
- 請求項1~32のいずれか1項に記載の化合物、および薬学的に受容可能なキャリアを含有する組成物。
- 被験体におけるタンパク質機能を調節するための方法であって、請求項1~32のいずれか1項に記載の化合物、または請求項34に記載の組成物の、前記被験体への投与を包含する、方法。
- 被験体における疾患、障害、またはその症状を処置または改善するための方法であって、請求項1~32のいずれか1項に記載の化合物、または請求項34に記載の組成物の、前記被験体への投与を包含する、方法。
- 前記疾患、障害、またはその症状が、肝臓の疾患、障害、またはその症状である、請求項36に記載の方法。
- 請求項1~32のいずれか1項に記載の化合物を作製するための方法であって、実施例1~23を含めた本明細書中に記載される1つまたはそれより多くの化合物および化学変換を含む、方法。
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