JP2023531935A - Gタンパク質共役受容体75(gpr75)阻害剤による肥満の治療 - Google Patents
Gタンパク質共役受容体75(gpr75)阻害剤による肥満の治療 Download PDFInfo
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Abstract
本開示は、肥満を有する対象を治療する方法、肥満を発症するリスクが高い対象を識別する方法、ヒトGタンパク質共役受容体75バリアント核酸分子及びバリアントポリペプチドを検出する方法、ならびにGPR75バリアント核酸分子及びバリアントポリペプチドを提供する。
Description
配列表への参照
本出願は、2021年6月20日に作成された、18923804802SEQという名称で533キロバイトのサイズのテキストファイルとして電子出願された配列表を含む。この配列表は参照により本明細書に組み込まれる。
本出願は、2021年6月20日に作成された、18923804802SEQという名称で533キロバイトのサイズのテキストファイルとして電子出願された配列表を含む。この配列表は参照により本明細書に組み込まれる。
本開示は、概して、肥満を有する対象のGタンパク質共役受容体75(GPR75)阻害剤による治療、肥満を発症するリスクが高い対象を識別する方法、GPR75バリアント核酸分子及びバリアントポリペプチドを検出する方法、ならびにGPR75バリアント核酸分子及びGPR75バリアントポリペプチドに関する。
肥満及びその心血管・代謝合併症、特に2型糖尿病及び冠動脈疾患は、世界的に著しい罹患率及び死亡率の原因となっている。安全で効果的な体重減少アプローチに対する相当なアンメットメディカルニーズが存在する。
食事及び身体活動に対する生活様式への介入が、肥満及び体重過多を管理するための第1の選択肢であるが、有効性が限られている場合があり、体重が元に戻るのが一般的である。肥満手術は、重度肥満患者または高リスク患者の体重減少に極めて有効であり得るが、その侵襲的性質、費用、周術期死亡を含む周術期の有害事象のリスクにより、その使用は制限されている。いくつかの薬物は体重低減効果を示しているが、肥満治療のための薬物療法は、大半の薬物によって誘導される若干の体重減少、一部の薬剤の副作用プロファイル、禁忌、服薬遵守率の低さ、及び過少処方を含む治療への障壁によって制限されている。
GPR75は、Gタンパク質共役受容体ファミリーのメンバーである。GPRは、リガンドが結合するとグアニンヌクレオチド結合タンパク質を活性化する、細胞表面受容体である。GPR75は、ケモカインCCL5/RANTESによって活性化される。GPR75は、おそらくはヘテロ三量体Gqタンパク質に共役しており、活性化されるとイノシトール三リン酸の産生及びカルシウムの動員を刺激する。GPR75は、CCL5/RANTESとともに、PI3、Akt、及びMAPキナーゼを含む下流のシグナル伝達経路の活性化を通じて、ニューロンの生存に役割を果たしている可能性がある。CCL5/RANTESはまた、この受容体の活性化を通じて、膵島細胞によるインスリン分泌を調節することができる。
本開示は、肥満を有する対象を治療する方法を提供し、本方法は、Gタンパク質共役受容体75(GPR75)阻害剤を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象は、GPR75参照であるか、または予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である。
本開示はまた、過体重を有する対象を治療する方法を提供し、本方法は、GPR75阻害剤を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象は、GPR75参照であるか、または予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である。
本開示はまた、BMIが上昇している対象を治療する方法を提供し、本方法は、GPR75阻害剤を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象は、GPR75参照であるか、または予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である。
本開示はまた、体脂肪量、体脂肪率、または体脂肪体積が上昇した対象を治療する方法を提供し、本方法は、GPR75阻害剤を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象は、GPR75参照であるか、または予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である。
本開示はまた、過剰に食物を摂取している対象を治療する方法を提供し、本方法は、GPR75阻害剤を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象は、GPR75参照であるか、または予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である。
本開示はまた、体重増加を予防するか、または体重減少を維持するために対象を治療する方法を提供し、本方法は、GPR75阻害剤を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象は、GPR75参照であるか、または予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である。
本開示はまた、肥満を治療または抑制する治療剤で対象を治療する方法を提供し、ここで、対象は肥満であり、本方法は、対象から生体試料を得るまたは得たことと、対象がGPR75ミスセンスバリアント核酸分子を含む遺伝子型を有するか否かを判定するために生体試料で配列解析を実施するまたは実施したことと、によって、対象が予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子を有するか否かを判定するステップと、GPR75参照である対象に、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤を標準投与量で投与する、または投与し続けるステップと、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である対象に、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤を標準投与量と同じかまたはそれより少ない量で投与する、または投与し続けるステップと、を含み、ここで、予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子を有する遺伝子型の存在は、対象が肥満を発症するリスクが低減していることを示している。
本開示はまた、肥満を発症するリスクが高い対象を識別する方法を提供し、本方法は、対象から得た生体試料において、予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子の有無を判定すること、または判定したことを含み、ここで、対象がGPR75参照である場合、対象は肥満を発症するリスクが高く、対象がGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性またはホモ接合性である場合、対象は肥満を発症するリスクが低い。
本開示はまた、対象におけるヒトGPR75バリアント核酸分子を検出する方法を提供し、当該方法は、対象から得た試料をアッセイして、試料中の核酸分子が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、もしくは配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列を含むゲノム核酸分子、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列を有するmRNA分子、またはmRNA分子から生成されたcDNA分子であって、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列を有するcDNA分子であるか否かを判定することを含む方法を提供する。
本開示はまた、ヒトGPR75 Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs、またはCys400fsバリアントポリペプチドの存在を検出する方法であって、対象から得た試料でアッセイを実施し、試料中のGPR75タンパク質が、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、または配列番号108を含むか否かを判定することを含む方法を提供する。
本開示はまた、少なくとも約15ヌクレオチドを含む、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーを提供し、この変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含み、この一部分は、配列番号2に記載の5,540~5,546位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号11に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号16に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号21に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号26に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号35に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号40に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号45に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号50に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号5に記載の5,920~5,923位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号14に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号19に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号24に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号29に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号38に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号43に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号48に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号53に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号6に記載の6,411位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号61に記載の5,831位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号100に記載の830位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号101に記載の731位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号102に記載の652位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号103に記載の891位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号104に記載の830位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号105に記載の731位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号106に記載の652位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号107に記載の891位に対応する位置もしくはその相補体を含む。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むゲノム核酸分子とハイブリダイズした変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含む分子複合体を提供し、この変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブは、配列番号2に記載の5,539~5,540位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号5に記載の5,919~5,920位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体とハイブリダイズしている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むmRNA分子とハイブリダイズした変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含む分子複合体を提供し、この変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブは、配列番号11に記載の538~539位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号16に記載の439~440位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号21に記載の360~361位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号26に記載の599~600位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、配列番号14に記載の918~919位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号19に記載の819~820位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号24に記載の740~741位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号29に記載の979~980位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体とハイブリダイズしている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むcDNA分子とハイブリダイズした変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含む分子複合体を提供し、この変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブは、配列番号35に記載の538~539位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号40に記載の439~440位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号45に記載の360~361位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号50に記載の599~600位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号38に記載の918~919位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号43に記載の819~820位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号48に記載の740~741位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号53に記載の979~980位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体とハイブリダイズしている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子またはその相補体を提供し、このポリペプチドは、配列番号56に記載の110位に対応する位置から始まるフレームシフト、配列番号59に記載の236位に対応する位置から始まるフレームシフト、または配列番号60に記載の400位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたゲノム核酸分子を提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、または配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたmRNA分子を提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含むか、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含むか、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含むか、または配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたcDNA分子を提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含むか、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含むか、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含むか、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む。
本開示はまた、配列番号56と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有する単離されたヒトGPR75ポリペプチドであって、配列番号55に記載の110~540位に対応する位置のアミノ酸を欠いている、単離されたヒトGPR75ポリペプチド、配列番号59と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有する単離されたヒトGPR75ポリペプチドであって、配列番号55に記載の236~540位に対応する位置のアミノ酸を欠いている、単離されたヒトGPR75ポリペプチド、または配列番号60と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有する単離されたヒトGPR75ポリペプチドであって、配列番号55に記載の400~540位に対応する位置のアミノ酸を欠いている、単離されたヒトGPR75ポリペプチドを提供する。
本開示はまた、対象の肥満の治療に使用するための肥満を治療または抑制する治療剤を提供し、当該対象は、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、もしくは配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、ゲノム核酸分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、mRNA分子、またはヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、cDNA分子を有する対象の肥満の処置に使用するための肥満を処置または抑制する治療剤を提供する。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、もしくは配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、ゲノム核酸分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、mRNA分子、またはヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、cDNA分子を有する対象の肥満の処置に使用するためのGPR75阻害剤を提供する。
本明細書に組み込まれるとともに、本明細書の一部を構成する添付図面は、本開示のいくつかの特徴を例示する。
本特許または出願書類は、カラーで作成された少なくとも1つの図面を含む。カラー図面(複数可)を含む本特許または特許出願公開の複写は、要請及び必要な料金の支払いにより特許庁より提供されよう。
本特許または出願書類は、カラーで作成された少なくとも1つの図面を含む。カラー図面(複数可)を含む本特許または特許出願公開の複写は、要請及び必要な料金の支払いにより特許庁より提供されよう。
本開示の態様に関する様々な用語が、本明細書及び特許請求の範囲全体を通して使用される。特に明記しない限り、このような用語には、当該技術分野における通常の意味を付与するものとする。具体的に定義されているその他の用語は、本明細書に示されている定義と一致する形で解釈されるものとする。
別段に明示的な定めのない限り、本明細書に示されているいずれの方法または態様も、そのステップを特定の順序で実施する必要があるものとして解釈するようには意図されていない。したがって、ステップを特定の順序に限定すべきことが、特許請求の範囲または説明において、方法の請求項によって具体的に定められていない場合には、いかなる点においても、順序が推測されるようには意図されていない。このことは、ステップもしくは作業フローの手筈に関する論理事項、文法構成もしくは句読法に由来する一般的意味、または本明細書に記載されている態様の数もしくは種類を含め、あらゆる考え得る非明示的な解釈基準についても同様である。
本明細書で使用される場合、文脈上明らかに別段に示されている場合を除き、「a」、「an」及び「the」という単数形には、複数の参照対象が含まれる。
本明細書で使用される場合、「約」という用語は、記載された数値が概算であり、小さな変動が開示された実施形態の実践に有意に影響を及ぼさないことを意味する。数値が使用される場合、文脈によって別段に示されていない限り、「約」という用語は、数値が±10%変動し、開示された実施形態の範囲内に留まることができることを意味する。
本明細書で使用される場合、「約」という用語は、記載された数値が概算であり、小さな変動が開示された実施形態の実践に有意に影響を及ぼさないことを意味する。数値が使用される場合、文脈によって別段に示されていない限り、「約」という用語は、数値が±10%変動し、開示された実施形態の範囲内に留まることができることを意味する。
本明細書で使用する場合、「含む」という用語は、特定の実施形態では、所望に応じて、「からなる」または「から本質的になる」と置き換えてよい。
本明細書で使用される場合、核酸分子またはポリペプチドに関して、「単離された」という用語は、核酸分子またはポリペプチドが、例えば、血液及び/または動物組織から離れて、その本来の環境以外の状態にあることを意味する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子またはポリペプチドは、他の核酸分子または他のポリペプチド、特に動物起源の他の核酸分子またはポリペプチドを実質的に含まない。いくつかの実施形態では、核酸分子またはポリペプチドは、高度に精製された形態、すなわち、95%を超える純度または99%を超える純度であり得る。この文脈で使用される場合、「単離された」という用語は、二量体または代わりにリン酸化もしくは誘導体化された形態などの代替の物理的形態における同じ核酸分子またはポリペプチドの存在を排除しない。
本明細書で使用される場合、核酸分子またはポリペプチドに関して、「単離された」という用語は、核酸分子またはポリペプチドが、例えば、血液及び/または動物組織から離れて、その本来の環境以外の状態にあることを意味する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子またはポリペプチドは、他の核酸分子または他のポリペプチド、特に動物起源の他の核酸分子またはポリペプチドを実質的に含まない。いくつかの実施形態では、核酸分子またはポリペプチドは、高度に精製された形態、すなわち、95%を超える純度または99%を超える純度であり得る。この文脈で使用される場合、「単離された」という用語は、二量体または代わりにリン酸化もしくは誘導体化された形態などの代替の物理的形態における同じ核酸分子またはポリペプチドの存在を排除しない。
本明細書で使用される場合、「核酸」、「核酸分子」、「核酸配列」、「ポリヌクレオチド」、または「オリゴヌクレオチド」という用語は、任意の長さのヌクレオチドのポリマー形態を含むことができ、DNA及び/またはRNAを含むことができ、一本鎖、二本鎖、または多重鎖であることができる。核酸の一方の鎖はその相補体も指す。
本明細書で使用される場合、「対象」という用語には、哺乳動物を含む任意の動物が含まれる。哺乳動物としては、家畜(例えば、ウマ、ウシ、ブタなど)、伴侶動物(例えば、イヌ、ネコなど)、実験動物(例えば、マウス、ラット、ウサギなど)、ならびに非ヒト霊長類(例えば、類人猿及びサルなど)が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、対象は、ヒトである。いくつかの実施形態では、対象は、医師の管理下にある患者である。
対象の肥満、過体重、BMI上昇、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積の上昇、及び/または過剰食物摂取の発症リスクの減少に関連するGPR75遺伝子のバリアントが、本開示に従って同定されている。例えば、ヒトGPR75参照の5,540~5,546位(配列番号1を参照されたい)のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠失させる遺伝子変化、またはヒトGPR75参照の5,557位(配列番号1を参照されたい)のグアニンヌクレオチドをアデニンに、もしくはヒトGPR75参照の5,911位(配列番号1を参照されたい)のチロシンヌクレオチドをチミンに変える遺伝子変化、またはヒトGPR75参照の5,920~5,923位(配列番号1を参照されたい)のAAAGテトラヌクレオチドを欠失させる遺伝子変化、またはヒトGPR75参照の6,411位(配列番号1を参照されたい)にチミンヌクレオチドを挿入する遺伝子変化は、そのような変化を有するヒトが、肥満、過体重、BMI上昇、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積の上昇、及び/または過剰食物摂取の発症リスクが減少し得ることを示すことが認められている。肥満、体重、BMI、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積、及び/または体除脂肪量、体除脂肪率、もしくは体除脂肪体積と何らかの既知の関連性を有するGPR75遺伝子またはタンパク質のバリアントは存在しないと考えられている。総じて、本明細書に記載の遺伝子解析は、驚くべきことに、GPR75遺伝子、特にGPR75遺伝子のバリアントが、肥満を発症するリスクの減少に関連し、体重の低下、BMIの低下、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積の低下、及び/または体除脂肪量、体除脂肪率、もしくは体除脂肪体積の低下に関連することを示している。したがって、肥満、過体重、BMI上昇、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積の上昇、及び/または過剰食物摂取を発症するリスクが高い、GPR75参照である対象を、肥満が予防されるように、その症状が低減されるように、及び/または症状の発症が抑制されるように、治療することができる。したがって、本開示は、対象のそのようなバリアントの同定を活用して、肥満、過体重、BMI上昇、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積の上昇、及び/または過剰食物摂取を発症するそのような対象のリスクを同定もしくは層別化し、あるいは肥満、過体重、BMI上昇、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積の上昇、及び/または過剰食物摂取を発症するリスクが高いと対象を診断して、リスクのある対象または活動性疾患を有する対象をそれに応じて治療することができるようにする、方法を提供する。更に、本開示は、単離されたGPR75バリアントゲノム核酸分子、バリアントmRNA分子、及びバリアントcDNA分子を提供する。本明細書では、肥満、過体重、BMI上昇、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積の上昇、及び/または過剰食物摂取の発症リスクの減少と関連することが見出された、GPR75の機能喪失バリアント核酸分子も更に提供される。
肥満、過体重、BMI上昇、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積の上昇、及び/または過剰食物摂取の発症リスクの減少と関連し得る、GPR75遺伝子の更なるミスセンスバリアントには、(GRCh38/hg38(2013年12月)ヒトゲノムアセンブリに準拠した)第2染色体の53,854,656位におけるチミンのシトシンでの置換により生じる、配列番号55に記載の34位に対応する位置におけるグルタミンのアルギニンでの置き換え、第2染色体の53,854,330位におけるグアニンのアラニンでの置換により生じる、配列番号55に記載の143位に対応する位置におけるアルギニンのトリプトファンでの置き換え、第2染色体の53,854,321位におけるチミンのシトシンでの置換により生じる、配列番号55に記載の146位に対応する位置におけるメチオニンのバリンでの置き換え、第2染色体の53,854,191位におけるシトシンのグアニンでの置換により生じる、配列番号55に記載の189位に対応する位置におけるシステインのセリンでの置き換え、第2染色体の53,853,780位におけるアラニンのグアニンでの置換により生じる、配列番号55に記載の326位に対応する位置におけるイソロイシンのトレオニンでの置き換え、第2染色体の53,853,634位におけるチミンのアデニンでの置換により生じる、配列番号55に記載の375位に対応する位置におけるイソロイシンのロイシンでの置き換え、及び第2染色体の53,853,181位におけるシトシンのチミンでの置換により生じる、配列番号55に記載の526位に対応する位置におけるグルタミン酸のリジンでの置き換えが含まれる(したがって、本明細書に記載の実施形態のいずれにも含まれ得る)。
GPR75遺伝子の更なるバリアントは、対象の肥満、過体重、BMI上昇、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積の上昇、及び/または過剰食物摂取を発症するリスクの増加に関連する場合があり、これらは機能獲得(GOF)バリアントと見なされる場合がある。そのようなGOFには、第2染色体の53,854,437位におけるアデニンのチミンでの置換により生じる、配列番号55に記載の107位に対応する位置におけるフェニルアラニンのチロシンでの置き換え、及び第2染色体の53,853,697位におけるグアニンのアデニンでの置換により生じる、配列番号55に記載の354位に対応する位置におけるロイシンのフェニルアラニンでの置き換えが(GRCh38/hg38(2013年12月)ヒトゲノムアセンブリに準拠して)含まれ得る。したがって、いずれかのバリアントを有する対象を、GPR75阻害剤で治療することができる。そのような対象は、肥満、過体重、BMI上昇、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積の上昇、及び/または過剰食物摂取を発症するリスクについて、GOFバリアントの存在を検出することによって評価することができる。
本開示の目的のために、任意の特定のヒトを、3つのGPR75遺伝子型、すなわち、i)GPR75参照、ii)予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性、またはiii)予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてホモ接合性、のうちの1つを有すると分類することができる。ヒトがGPR75ミスセンスバリアント核酸分子のコピーを有していない場合、そのヒトはGPR75参照である。ヒトが予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子の単一コピーを有する場合、そのヒトは、予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である。本明細書で使用される場合、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子は、部分的な機能喪失、完全な機能喪失、予測される部分的な機能喪失、または予測される完全な機能喪失を有するGPR75ポリペプチドをコードする任意のGPR75核酸分子(例えば、ゲノム核酸分子、mRNA分子、またはcDNA分子)である。部分的な機能喪失(または予測される部分的な機能喪失)を有するGPR75ポリペプチドを有するヒトは、GPR75について低形質性である。GPR75の予測される機能喪失バリアント核酸分子は、GPR75 Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs、またはCys400fsをコードする任意の核酸分子であり得る。GPR75ミスセンスバリアント核酸分子はまた、Lys404*及びSer219fsをコードする任意の核酸分子であり得るか、またはc.-110+1G>Aであり得る。ヒトがGPR75ミスセンスバリアント核酸分子の2つのコピーを有する場合、そのヒトは、予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてホモ接合性である。
GPR75参照であると遺伝子型決定されているかまたは判定されている対象については、そのような対象は、肥満、過体重、BMI上昇、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積の上昇、及び/または過剰食物摂取を発症するリスクが高い。GPR75参照、または予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性のいずれかであると遺伝子型決定されているかまたは判定されている対象については、そのような対象をGPR75阻害剤で治療することができる。
本明細書に記載の実施形態のいずれにおいても、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子は、部分的な機能喪失、完全な機能喪失、予測される部分的な機能喪失、または予測される完全な機能喪失を有するGPR75ポリペプチドをコードする任意のGPR75核酸分子(例えば、ゲノム核酸分子、mRNA分子、またはcDNA分子など)であり得る。例えば、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子は、GPR75 Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs、またはCys400fsをコードする任意の核酸分子であり得る。GPR75ミスセンスバリアント核酸分子はまた、Lys404*及びSer219fsをコードする任意の核酸分子であり得るか、またはc.-110+1G>Aであり得る。
GPR75ミスセンスバリアント核酸分子には、2:53853134:T:G、2:53853135:T:G、2:53853136:A:C、2:53853200:GGT:G、2:53853245:GT:G、2:53853256:G:A、2:53853352:G:A、2:53853354:CCA:C、2:53853382:TG:T、2:53853502:T:A、2:53853535:G:A、2:53853547:T:A、2:53853560:G:GA、2:53853641:GTT:G、2:53853680:CAATTCAAACTGGT:C、2:53853692:G:T、2:53853730:G:A、2:53853771:G:C、2:53853853:G:A、2:53853877:G:A、2:53853926:G:T、2:53853927:T:TA、2:53853946:G:GT、2:53853967:TGG:T、2:53854009:G:A、2:53854037:A:AG、2:53854045:ACTTT:A、2:53854051:T:A、2:53854057:G:A、2:53854078:G:A、2:53854099:CAG:C、2:53854135:CAT:C、2:53854137:TAGAG:T、2:53854306:G:A、2:53854380:G:C、2:53854409:A:AG、2:53854421:ACTACTGG:A、2:53854474:C:A、2:53854476:C:CA、2:53854485:AG:A、2:53854644:TG:T、2:53854685:TC:T、2:53854695:G:T、2:53854740:TG:T、2:53854755:A:G、及び2:53859827:C:T(GRCh38/hg38(2013年12月)ヒトゲノムアセンブリに準拠)も含まれるが、これらに限定されない。
本明細書に記載の実施形態のいずれにおいても、GPR75の予測される機能喪失ポリペプチドは、部分的な機能喪失、完全な機能喪失、予測される部分的な機能喪失、または予測される完全な機能喪失を有する任意のGPR75ポリペプチドであり得る。本明細書に記載の実施形態のいずれにおいても、GPR75の予測される機能喪失ポリペプチドは、例えば、GPR75 Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs、またはCys400fsを含む、本明細書に記載のGPR75ポリペプチドのいずれかであり得る。GPR75の予測される機能喪失ポリペプチドはまた、Lys404*またはSer219fsであり得る。
本明細書に記載の実施形態のいずれにおいても、対象は、肥満であり得るか、または過体重、BMI上昇、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積が上昇し得るか、及び/または過剰に食物を摂取している可能性がある。本明細書に記載の実施形態のいずれにおいても、対象は、肥満であり得る。本明細書に記載の実施形態のいずれにおいても、対象は、過体重を有し得る。本明細書に記載の実施形態のいずれにおいても、対象は、BMI上昇を有し得る。本明細書に記載の実施形態のいずれにおいても、対象は、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積が上昇し得る。本明細書に記載の実施形態のいずれにおいても、対象は、過剰に食物を摂取している可能性がある。
肥満の症状としては、過剰な体脂肪の蓄積(特に腰周囲)、息切れ、発汗の増加、いびき、突発的な身体活動への対処ができないこと、毎日のひどい疲労感、背部・関節痛、皮膚の問題(皮膚のひだに蓄積する水分によるもの)が挙げられるが、これらに限定されない。
本開示は、肥満を有する対象を治療する方法を提供し、本方法は、GPR75阻害剤を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象は、GPR75参照であるか、または予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である。
本開示はまた、過体重を有する対象を治療する方法を提供し、本方法は、GPR75阻害剤を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象は、GPR75参照であるか、または予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である。
本開示はまた、BMIが上昇している対象を治療する方法を提供し、本方法は、GPR75阻害剤を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象は、GPR75参照であるか、または予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である。
本開示はまた、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積が上昇した対象を治療する方法を提供し、本方法は、GPR75阻害剤を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象は、GPR75参照であるか、または予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である。
本開示はまた、過剰に食物を摂取している対象を治療する方法を提供し、本方法は、GPR75阻害剤を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象は、GPR75参照であるか、または予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である。
本開示はまた、体重増加を予防するか、または体重減少を維持するために対象を治療する方法を提供し、本方法は、GPR75阻害剤を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象は、GPR75参照であるか、または予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である。
対象がGPR75阻害剤で治療される本明細書に記載の実施形態のいずれにおいても、対象は、GPR75参照であり得る(すなわち、対象は、予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子のコピーを有していない)。対象がGPR75阻害剤で治療される本明細書に記載の実施形態のいずれにおいても、対象は、予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性であり得る(すなわち、対象は、参照GPR75核酸分子の単一コピーのみを有する)。GPR75阻害剤の投与時に対象の遺伝子型を判定する必要はない。
いくつかの実施形態では、GPR75阻害剤は、阻害性核酸分子を含む。阻害性核酸分子の例としては、アンチセンス核酸分子、低分子干渉RNA(siRNA)、及びショートヘアピンRNA(shRNA)が挙げられるが、これらに限定されない。そのような阻害性核酸分子は、mRNA分子などのGPR75核酸分子の任意の領域を標的とするように設計され得る。いくつかの実施形態では、アンチセンスRNA、siRNA、またはshRNAは、GPR75ゲノム核酸分子またはmRNA分子内の配列とハイブリダイズして、対象の細胞におけるGPR75ポリペプチドの発現を低下させる。いくつかの実施形態では、GPR75阻害剤は、GPR75ゲノム核酸分子またはmRNA分子とハイブリダイズして、対象の細胞におけるGPR75ポリペプチドの発現を低下させるアンチセンスRNAを含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス核酸分子は、配列番号109~529に示されるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、GPR75阻害剤は、GPR75ゲノム核酸分子またはmRNA分子とハイブリダイズして、対象の細胞におけるGPR75ポリペプチドの発現を低下させるsiRNAを含む。いくつかの実施形態では、siRNA分子は、配列番号530~1457に示されるヌクレオチド配列(センス鎖とアンチセンス鎖の対)(すなわち、例えば、siRNA分子のセンス鎖及びアンチセンス鎖をそれぞれ形成する配列番号530及び配列番号531。配列番号530~1457に示される残りのsiRNA分子のセンス鎖及びアンチセンス鎖についても同様)を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、GPR75阻害剤は、GPR75ゲノム核酸分子またはmRNA分子とハイブリダイズして、対象の細胞におけるGPR75ポリペプチドの発現を低下させるshRNAを含む。好適なGPR75特異的siRNA及びshRNAは、例えば、Garcia et al.,Circ.Res.,2017,120,1776-1788に開示されている。
本明細書に開示される阻害性核酸分子は、RNA、DNA、またはRNAとDNAの両方を含み得る。阻害性核酸分子はまた、異種核酸配列(例えば、ベクター内のもの)または異種標識と連結または融合させることもできる。例えば、本明細書で開示される阻害性核酸分子は、阻害性核酸分子と異種核酸配列とを含むベクター内に、またはそれらを含む外来性ドナー配列として、存在してもよい。阻害性核酸分子は、異種標識に連結または融合させることもできる。標識は、直接検出可能(例えば、フルオロフォアなど)であり得るか、または間接的に検出可能(例えば、ハプテン、酵素、またはフルオロフォアクエンチャーなど)であり得る。そのような標識は、分光学的、光化学的、生化学的、免疫化学的、または化学的な手段によって検出可能であり得る。そのような標識には、例えば、放射標識、顔料、色素、色原体、スピン標識、及び蛍光標識が含まれる。標識は、例えば、化学発光物質、金属含有物質、または酵素でもあり得、酵素の場合、酵素依存性の二次的シグナル発生が生じる。「標識」という用語はまた、コンジュゲート分子に選択的に結合することができ、そのコンジュゲート分子が、後で基質とともに加えた際に検出可能なシグナルを発生させるために使用されるようにする「タグ」またはハプテンを指し得る。例えば、ビオチンは、タグとして、西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)のアビジンコンジュゲートまたはストレプトアビジンコンジュゲートとともに使用し、このタグに結合させて、HRPの存在を検出するために、発色基質(例えば、テトラメチルベンジジン(TMB)など)または蛍光発生基質を使用して調べることができる。精製を容易にするためにタグとして使用することができる例示的な標識としては、myc、HA、FLAG、または3XFLAG、6XHisもしくはポリヒスチジン、グルタチオン-S-トランスフェラーゼ(GST)、マルトース結合タンパク質、エピトープタグ、または免疫グロブリンのFc部分が挙げられるが、これらに限定されない。多くの標識には、例えば、粒子、フルオロフォア、ハプテン、酵素及び酵素の発色基質、蛍光発生基質、ならびに化学発光基質、ならびに他の標識が含まれる。
開示されている阻害性核酸分子は、例えば、ヌクレオチドアナログまたは代用ヌクレオチドなどの、ヌクレオチドまたは非天然もしくは修飾ヌクレオチドを含み得る。そのようなヌクレオチドには、修飾された塩基、糖、もしくはリン酸基を含有するか、またはその構造に非天然部分が組み込まれたヌクレオチドが含まれる。非天然ヌクレオチドの例としては、ジデオキシヌクレオチド、ビオチン化ヌクレオチド、アミノ化ヌクレオチド、脱アミノ化ヌクレオチド、アルキル化ヌクレオチド、ベンジル化ヌクレオチド、及びフルオロフォア標識化ヌクレオチドが挙げられるが、これらに限定されない。
本明細書に開示される阻害性核酸分子はまた、1つ以上のヌクレオチドアナログまたは置換を含み得る。ヌクレオチドアナログは、塩基部分、糖部分、またはリン酸部分のいずれかに対する修飾を含有するヌクレオチドである。塩基部分に対する修飾としては、A、C、G、及びT/U、ならびに様々なプリン塩基またはピリミジン塩基、例えば、シュードウリジン、ウラシル-5-イル、ヒポキサンチン-9-イル(I)、及び2-アミノアデニン-9-イルなどの、天然及び合成による修飾が挙げられるが、これらに限定されない。修飾塩基としては、5-メチルシトシン(5-me-C)、5-ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、2-アミノアデニン、アデニン及びグアニンの6-メチル誘導体及び他のアルキル誘導体、アデニン及びグアニンの2-プロピル誘導体及び他のアルキル誘導体、2-チオウラシル、2-チオチミン、ならびに2-チオシトシン、5-ハロウラシル及びシトシン、5-プロピニルウラシル及びシトシン、6-アゾウラシル、シトシン及びチミン、5-ウラシル(シュードウラシル)、4-チオウラシル、8-ハロ、8-アミノ、8-チオール、8-チオアルキル、8-ヒドロキシル及び他の8-置換アデニン及びグアニン、5-ハロ(例えば、5-ブロモなど)、5-トリフルオロメチル、及び他の5-置換ウラシル及びシトシン、7-メチルグアニン、7-メチルアデニン、8-アザグアニン、8-アザアデニン、7-デアザグアニン、7-デアザアデニン、3-デアザグアニン、ならびに3-デアザアデニンが挙げられるが、これらに限定されない。
ヌクレオチドアナログにはまた、糖部分の修飾も含まれ得る。糖部分に対する修飾としては、リボース及びデオキシリボースの天然修飾ならびに合成修飾が挙げられるが、これらに限定されない。糖修飾としては、2’位における、OH;F;O-、S-、もしくはN-アルキル;O-、S-、もしくはN-アルケニル;O-、S-もしくはN-アルキニル;またはO-アルキル-O-アルキルという修飾であって、アルキル、アルケニル、及びアルキニルが、置換または非置換の、C1~10アルキルまたはC2~10アルケニル、及びC2~10アルキニルであり得る修飾が挙げられるが、これらに限定されない。例示的な2’糖修飾としてはまた、-O[(CH2)nO]mCH3、-O(CH2)nOCH3、-O(CH2)nNH2、-O(CH2)nCH3、-O(CH2)n-ONH2、及び-O(CH2)nON[(CH2)nCH3)]2(式中、n及びmは独立して1~約10である)が挙げられるが、これらに限定されない。2’位における他の修飾としては、C1~10アルキル、置換低級アルキル、アルカリル、アラルキル、O-アルカリルもしくはO-アラルキル、SH、SCH3、OCN、Cl、Br、CN、CF3、OCF3、SOCH3、SO2CH3、ONO2、NO2、N3、NH2、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルカリル、アミノアルキルアミノ、ポリアルキルアミノ、置換シリル、RNA切断基、レポーター基、インターカレーター、オリゴヌクレオチドの薬物動態学的特性を改善するための基、またはオリゴヌクレオチドの薬力学的特性を改善するための基、及び同様の特性を有する他の置換基が挙げられるが、これらに限定されない。同様の修飾はまた、糖の他の位置、特に、3’末端ヌクレオチド上または2’-5’で結合したオリゴヌクレオチド内の糖の3’位、及び5’末端ヌクレオチドの5’位でも行われ得る。修飾糖には、CH2及びSなど、環の架橋酸素での修飾を含有するものも含まれ得る。ヌクレオチド糖アナログはまた、ペントフラノシル糖に代わるシクロブチル部分などの糖模倣物を有し得る。
ヌクレオチドアナログはまた、リン酸部分でも修飾され得る。修飾リン酸部分としては、2つのヌクレオチド間の結合が、ホスホロチオエート、キラルホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホトリエステル、アミノアルキルホスホトリエステル、メチル及び他のアルキルホスホネート(3’-アルキレンホスホネート及びキラルホスホネートを含む)、ホスフィネート、ホスホロアミダート(3’-アミノホスホロアミダート及びアミノアルキルホスホロアミダートを含む)、チオノホスホロアミダート、チオノアルキルホスホロアミダート、チオノアルキルホスホトリエステル、及びボラノホスフェートを含有するように修飾され得るものが挙げられるが、これらに限定されない。2つのヌクレオチド間のこれらのリン酸または修飾リン酸結合は、3’-5’結合または2’-5’結合を介することができ、結合は、3’-5’が5’-3’に、または2’-5’が5’-2’にというように、反転した極性を含有し得る。様々な塩、混合塩、及び遊離酸形態も含まれ得る。代用ヌクレオチドとしては、ペプチド核酸(PNA)も挙げられる。
いくつかの実施形態では、アンチセンス核酸分子はギャップマーであり、それにより、5’末端及び3’末端の最初の1~7ヌクレオチドがそれぞれ2’-メトキシエチル(2’-MOE)修飾を有する。いくつかの実施形態では、5’末端及び3’末端の最初の5ヌクレオチドは、それぞれ2’-MOE修飾を有する。いくつかの実施形態では、5’末端及び3’末端の最初の1~7ヌクレオチドは、RNAヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、5’末端及び3’末端の最初の5ヌクレオチドは、RNAヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ヌクレオチド間の骨格結合のそれぞれは、ホスホロチオエート結合である。
いくつかの実施形態では、siRNA分子は、末端修飾を有する。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖の5’末端は、リン酸化されている。いくつかの実施形態では、5’-(E)-ビニル-ホスホネートなどの加水分解することができない5’-ホスフェートアナログが使用される。
いくつかの実施形態では、siRNA分子は、骨格修飾を有する。いくつかの実施形態では、連続したリボースヌクレオシドを連結する修飾ホスホジエステル基は、siRNAの安定性及びin vivoバイオアベイラビリティを高めることが示されている。ホスホジエステル結合の非エステル基(-OH、=O)を、硫黄、ホウ素、またはアセテートに置き換えて、ホスホロチオエート結合、ボラノホスフェート結合、及びホスホノアセテート結合を得ることができる。加えて、ホスホジエステル基のホスホトリエステルでの置換は、siRNAの負電荷を除去することにより、siRNAの細胞への取り込み及び血清成分への保持を促進することができる。いくつかの実施形態では、siRNA分子は、糖修飾を有する。いくつかの実施形態では、糖は脱プロトン化され(エキソヌクレアーゼ及びエンドヌクレアーゼによって触媒される反応)、それにより2’-ヒドロキシルが求核剤として作用し、ホスホジエステル結合内の隣接するリンを攻撃することができる。そのような代替物には、2’-O-メチル、2’-O-メトキシエチル、及び2’-フルオロ修飾が含まれる。
いくつかの実施形態では、siRNA分子は、塩基修飾を有する。いくつかの実施形態では、塩基は、シュードウリジン、5’-メチルシチジン、N6-メチルアデノシン、イノシン、及びN7-メチルグアノシンなどの修飾塩基で置換することができる。
いくつかの実施形態では、siRNA分子は、脂質にコンジュゲートされる。脂質をsiRNAの5’末端または3’末端にコンジュゲートさせて、脂質と血清リポタンパク質との会合を可能にすることにより、in vivoバイオアベイラビリティを向上させることができる。代表的な脂質としては、コレステロール及びビタミンE、ならびにパルミテート及びトコフェロールなどの脂肪酸が挙げられるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、代表的なsiRNAは、以下の式を有する。
センス:mN*mN*/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/*mN*/32FN/
アンチセンス:/52FN/*/i2FN/*mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN*N*N
(ここで、「N」は塩基であり、「2F」は2’-F修飾であり、「m」は2’-O-メチル修飾であり、「I」は内部塩基であり、「*」は、ホスホロチオエート骨格結合である)。
センス:mN*mN*/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/*mN*/32FN/
アンチセンス:/52FN/*/i2FN/*mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN*N*N
(ここで、「N」は塩基であり、「2F」は2’-F修飾であり、「m」は2’-O-メチル修飾であり、「I」は内部塩基であり、「*」は、ホスホロチオエート骨格結合である)。
本開示はまた、本明細書に開示される阻害性核酸分子のうちのいずれか1つ以上を含むベクターも提供する。いくつかの実施形態では、ベクターは、本明細書に開示される阻害性核酸分子のうちのいずれか1つ以上及び異種核酸を含む。ベクターは、核酸分子を輸送することができるウイルスベクターまたは非ウイルスベクターであり得る。いくつかの実施形態では、ベクターは、プラスミドまたはコスミドである(例えば、中に追加のDNAセグメントをライゲートすることができる環状二本鎖DNAなど)。いくつかの実施形態では、ベクターはウイルスベクターであり、追加のDNAセグメントは、ウイルスゲノム内にライゲートすることができる。発現ベクターとしては、プラスミド、コスミド、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、植物ウイルス(カリフラワーモザイクウイルス及びタバコモザイクウイルスなど)、酵母人工染色体(YAC)、エプスタイン-バー(EBV)由来エピソーム、ならびに当該技術分野で公知の他の発現ベクターが挙げられるが、これらに限定されない。
本開示はまた、本明細書に開示される阻害性核酸分子のうちのいずれか1つ以上を含む組成物も提供する。いくつかの実施形態では、組成物は、医薬組成物である。いくつかの実施形態では、組成物は、担体及び/または賦形剤を含む。担体の例としては、ポリ(乳酸)(PLA)ミクロスフェア、D,L-乳酸・グリコール酸共重合体(PLGA)マイクロスフィア、リポソーム、ミセル、逆ミセル、脂質コクリエート、及び脂質マイクロチューブルが挙げられるが、これらに限定されない。担体は、PBS、HBSSなどのような緩衝塩溶液を含み得る。
いくつかの実施形態では、GPR75阻害剤は、認識配列(複数可)における1つ以上のニックもしくは二本鎖切断を誘導するヌクレアーゼ剤、またはGPR75ゲノム核酸分子内の認識配列に結合するDNA結合タンパク質を含む。認識配列は、GPR75遺伝子のコード領域内、または遺伝子の発現に影響を及ぼす制御領域内に位置し得る。DNA結合タンパク質またはヌクレアーゼ剤の認識配列は、イントロン、エクソン、プロモーター、エンハンサー、制御領域、または任意の非タンパク質コード領域に位置し得る。認識配列は、GPR75遺伝子の開始コドンを含み得るかまたはこれに近接し得る。例えば、認識配列は、開始コドンから約10、約20、約30、約40、約50、約100、約200、約300、約400、約500、または約1,000ヌクレオチドに位置し得る。別の例として、それぞれが開始コドンを含むかまたはそれに近接するヌクレアーゼ認識配列を標的とする2つ以上のヌクレアーゼ剤を使用することができる。別の例として、1つが開始コドンを含むかまたはこれに近接するヌクレアーゼ認識配列を標的とし、1つが終止コドンを含むかまたはこれに近接するヌクレアーゼ認識配列を標的とする、2つのヌクレアーゼ剤を使用することができ、これらのヌクレアーゼ剤による切断により、2つのヌクレアーゼ認識配列間のコード領域を欠失させることができる。所望の認識配列にニックまたは二本鎖切断を誘導する任意のヌクレアーゼ剤を、本明細書に開示される方法及び組成物において使用することができる。所望の認識配列に結合する任意のDNA結合タンパク質を、本明細書に開示される方法及び組成物において使用することができる。
本明細書で使用するのに好適なヌクレアーゼ剤及びDNA結合タンパク質としては、ジンクフィンガータンパク質またはジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)対、転写活性化因子様エフェクター(TALE)タンパク質または転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN)、またはクラスター化された規則的に散在する短いパリンドローム反復(CRISPR)/CRISPR関連(Cas)系が挙げられるが、これらに限定されない。認識配列の長さは異なることができ、例えば、ジンクフィンガータンパク質またはZFN対については約30~36bp、各ZFNについては約15~18bp、TALEタンパク質またはTALENについては約36bp、及びCRISPR/CasガイドRNAについては約20bpである認識配列が含まれる。
いくつかの実施形態では、CRISPR/Cas系を使用して、細胞内のGPR75ゲノム核酸分子を修飾することができる。本明細書で開示される方法及び組成物は、GPR75核酸分子の部位特異的切断のためにCRISPR複合体(Casタンパク質と複合体化したガイドRNA(gRNA)を含む)を利用することによってCRISPR-Cas系を用いることができる。
Casタンパク質は、一般に、gRNAと相互作用することができる少なくとも1つのRNA認識ドメインまたはRNA結合ドメインを含む。Casタンパク質はまた、ヌクレアーゼドメイン(例えば、DNaseまたはRNaseドメインなど)、DNA結合ドメイン、ヘリカーゼドメイン、タンパク質-タンパク質相互作用ドメイン、二量体化ドメイン、及び他のドメインを含み得る。好適なCasタンパク質としては、例えば、野生型Cas9タンパク質及び野生型Cpf1タンパク質(例えば、FnCpf1など)が挙げられる。Casタンパク質は、GPR75ゲノム核酸分子に二本鎖切断を作り出すための完全な切断活性を有し得るか、またはGPR75ゲノム核酸分子に一本鎖切断を作り出すニッカーゼであり得る。Casタンパク質の更なる例としては、Cas1、Cas1B、Cas2、Cas3、Cas4、Cas5、Cas5e(CasD)、Cas6、Cas6e、Cas6f、Cas7、Cas8a1、Cas8a2、Cas8b、Cas8c、Cas9(Csn1またはCsx12)、Cas10、Cas10d、CasF、CasG、CasH、Csy1、Csy2、Csy3、Cse1(CasA)、Cse2(CasB)、Cse3(CasE)、Cse4(CasC)、Csc1、Csc2、Csa5、Csn2、Csm2、Csm3、Csm4、Csm5、Csm6、Cmr1、Cmr3、Cmr4、Cmr5、Cmr6、Csb1、Csb2、Csb3、Csx17、Csx14、Csx10、Csx16、CsaX、Csx3、Csx1、Csx15、Csf1、Csf2、Csf3、Csf4、及びCu1966、ならびにそれらのホモログまたは修飾型が挙げられるが、これらに限定されない。Casタンパク質は、融合タンパク質として異種ポリペプチドに作動可能に連結させることもできる。例えば、Casタンパク質を、切断ドメイン、エピジェネティック修飾ドメイン、転写活性化ドメイン、または転写抑制因子ドメインに融合させることができる。Casタンパク質は、任意の形態で提供することができる。例えば、Casタンパク質を、タンパク質、例えばgRNAと複合体化したCasタンパク質の形態で提供することができる。あるいは、Casタンパク質を、Casタンパク質をコードする核酸分子、例えばRNAまたはDNAの形態で提供することができる。
いくつかの実施形態では、GPR75ゲノム核酸分子の標的とする遺伝子修飾は、Casタンパク質と、GPR75ゲノム核酸分子の標的ゲノム遺伝子座内の1つ以上のgRNA認識配列とハイブリダイズする1つ以上のgRNAとに細胞を接触させることによって、生じさせることができる。例えば、gRNA認識配列は、配列番号1の領域内に位置し得る。gRNA認識配列はまた、配列番号1に記載の5,540~5,546、5,557、5,911、5,920~5,923、または6,411位に対応する位置を含み得るか、またはその位置に近接し得る。例えば、gRNA認識配列は、配列番号1に記載の5,540~5,546、5,557、5,911、5,920~5,923、または6,411位に対応する位置から約1000、約500、約400、約300、約200、約100、約50、約45、約40、約35、約30、約25、約20、約15、約10、または約5ヌクレオチドに位置し得る。gRNA認識配列は、GPR75ゲノム核酸分子の開始コドンまたはGPR75ゲノム核酸分子の終止コドンを含み得るか、またはそれらに近接し得る。例えば、gRNA認識配列は、開始コドンまたは終止コドンから約10、約20、約30、約40、約50、約100、約200、約300、約400、約500、または約1,000ヌクレオチドに位置し得る。
GPR75ゲノム核酸分子の標的ゲノム遺伝子座内のgRNA認識配列は、Cas9ヌクレアーゼが標的とするDNA配列の直後にある2~6塩基対のDNA配列であるプロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)配列の近傍に位置する。カノニカルなPAMは、配列5’-NGG-3’であり、ここで、「N」は、任意の核酸塩基であり、その後に2つのグアニン(「G」)核酸塩基が続く。gRNAは、遺伝子編集のためにCas9をゲノム内のどこにでも輸送することができるが、Cas9がPAMを認識する部位以外の部位では編集は生じ得ない。加えて、5’-NGA-3’は、ヒト細胞にとって極めて効率的な非カノニカルなPAMであり得る。一般的に、PAMは、gRNAが標的とするDNA配列の下流の約2~6ヌクレオチドである。PAMは、gRNA認識配列に隣接し得る。いくつかの実施形態では、gRNA認識配列は、3’末端でPAMに隣接し得る。いくつかの実施形態では、gRNA認識配列は、5’末端でPAMに隣接し得る。例えば、Casタンパク質の切断部位は、PAM配列の上流または下流の約1~約10、約2~約5塩基対、または3塩基対であり得る。いくつかの実施形態(例えば、S.pyogenesに由来するCas9または近縁のCas9を使用する場合)では、非相補鎖のPAM配列は、5’-NGG-3’(ここで、Nは任意のDNAヌクレオチドである)であり得、標的DNAの非相補鎖のgRNA認識配列の直近の3’側である。したがって、相補鎖のPAM配列は、5’-CCN-3’(ここで、Nは、任意のDNAヌクレオチドである)であり得、標的DNAの相補鎖のgRNA認識配列の直近の5’側である。
gRNAは、Casタンパク質に結合し、Casタンパク質をGPR75ゲノム核酸分子内の特定の位置に標的化するRNA分子である。例示的なgRNAは、Cas酵素を、GPR75ゲノム核酸分子に結合しこれを切断するように誘導するのに有効なgRNAであり、gRNAは、配列番号1に記載の5,540~5,546、5,557、5,911、5,920~5,923、または6,411位に対応する位置を含むかまたはこれに近接するGPR75ゲノム核酸分子内のgRNA認識配列とハイブリダイズするDNA標的化セグメントを含む。例えば、gRNAは、配列番号1に記載の5,540~5,546、5,557、5,911、5,920~5,923、または6,411位に対応する位置から約5、約10、約15、約20、約25、約30、約35、約40、約45、約50、約100、約200、約300、約400、約500、または約1,000ヌクレオチドに位置するgRNA認識配列とハイブリダイズするように選択され得る。他の例示的なgRNAは、開始コドンまたは終止コドンを含むかまたはこれに近接するGPR75ゲノム核酸分子内に存在するgRNA認識配列とハイブリダイズするDNA標的化セグメントを含む。例えば、gRNAは、開始コドンから約5、約10、約15、約20、約25、約30、約35、約40、約45、約50、約100、約200、約300、約400、約500、もしくは約1,000ヌクレオチドに位置するgRNA認識配列と、または終止コドンから約5、約10、約15、約20、約25、約30、約35、約40、約45、約50、約100、約200、約300、約400、約500、もしくは約1,000ヌクレオチドに位置するgRNA認識配列と、ハイブリダイズするように選択され得る。好適なgRNAは、約17~約25ヌクレオチド、約17~約23ヌクレオチド、約18~約22ヌクレオチド、または約19~約21ヌクレオチドを含み得る。いくつかの実施形態では、gRNAは、20ヌクレオチドを含み得る。
ヒトGPR75参照遺伝子内に位置する好適なgRNA認識配列の例を、配列番号61~98として表1に示す。
Casタンパク質及びgRNAは、複合体を形成し、Casタンパク質は、標的GPR75ゲノム核酸分子を切断する。Casタンパク質は、gRNAのDNA標的化セグメントが結合する標的GPR75ゲノム核酸分子に存在する核酸配列の内部または外部の部位で核酸分子を切断することができる。例えば、CRISPR複合体(gRNA認識配列とハイブリダイズし、Casタンパク質と複合体化しているgRNAを含む)の形成は、gRNAのDNA標的化セグメントが結合するGPR75ゲノム核酸分子に存在する核酸配列内またはその近傍(例えば、その核酸配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、50、もしくはそれ以上の塩基対内など)で一方または両方の鎖の切断をもたらし得る。
そのような方法は、例えば、配列番号1の領域が破壊されている、開始コドンが破壊されている、終止コドンが破壊されている、またはコード配列が破壊されているもしくは欠失している、GPR75ゲノム核酸分子をもたらし得る。任意選択で、GPR75ゲノム核酸分子の標的ゲノム遺伝子座内の追加のgRNA認識配列とハイブリダイズする1つ以上の追加のgRNAに、細胞を更に接触させることができる。1つ以上の追加のgRNA(例えば、第2のgRNA認識配列とハイブリダイズする第2のgRNAなど)に細胞を接触させることによって、Casタンパク質による切断により、2箇所以上の二本鎖切断または2箇所以上の一本鎖切断を作り出すことができる。
いくつかの実施形態では、GPR75阻害剤は、小分子を含む。いくつかの実施形態では、GPR75阻害剤は、CCL5(RANTES)の阻害剤であり、限定されないが、[44AANA47]-RANTES及びMet-CCL5(Braunersreuther et al.,Arteriosclerosis,Thrombosis,and Vasc.Biol.,2008,28,1090-1096、Proudfoot et al.,J.Biol.Chem.,1999,274,32478-32485、及びMatsui et al.,J.Neroimmunol.,2002,128,16-22を参照されたい)が含まれる。いくつかの実施形態では、GPR75阻害剤は、GPR75と20-ヒドロキシエイコサテトラエン酸(20-HETE)との間の相互作用の阻害剤であり、限定されないが、脂肪酸アナログ、末端アセチレン脂肪酸、末端ジブロモ脂肪酸、スルホン化脂肪酸、TS-011、Het0016、5,14,20-HEDE、5,14,20-HEDGE、6,15,20-HEDE、17-ODYA、DDMS、DDBB、2,5,8,11,14,17-ヘキサオキサノナデカン-19-イル-20-ヒドロキシエイコサ6(z),15(z)-ジエノエート(20-sola)、及び6(z),15(z)ヒドロキシエイコサ-6,15-ジエンアミド-ジエン酸(aaa)が含まれる(Miyata et al.,Br.J.Pharmacol.,2001,133,325-329、Miyata et al.,J.Pharmacol.Exp.Ther.,2005,314,77-85、Pandey et al.,J.Pharmacol.Exp.Ther.,2017,363,412-418、及びSavas et al.,J.Biol.Chem.,2016,291,16904-16919を参照されたい)。いくつかの実施形態では、GPR75阻害剤は、PCT公開WO2017/156164に記載されているアンタゴニストのいずれかである。いくつかの実施形態では、GPR75阻害剤は、GPR75と20-HETEとの間の相互作用の阻害剤であり、遮断抗体である。
いくつかの実施形態では、治療方法は、対象からの生体試料における予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子の非存在を検出することを更に含む。本開示全体を通して使用される場合、「GPR75ミスセンスバリアント核酸分子」は、部分的な機能喪失、完全な機能喪失、予測される部分的な機能喪失、または予測される完全な機能喪失を有するGPR75ポリペプチドをコードする任意のGPR75核酸分子(例えば、ゲノム核酸分子、mRNA分子、またはcDNA分子など)である。
本開示はまた、肥満を治療または抑制する治療剤で対象を治療する方法であって、対象が肥満である、方法を提供する。いくつかの実施形態では、本方法は、対象が予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子を有するか否かを判定することを含み、それは、対象から生体試料を得るまたは得たことと、対象がGPR75ミスセンスバリアント核酸分子を含む遺伝子型を有するか否かを判定するために生体試料で配列解析を実施するまたは実施したこととによる。対象がGPR75参照である場合、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤は、標準投与量で対象に投与されるか、または投与され続ける。対象がGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である場合、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤は、標準投与量と同じかまたはそれより少ない量で対象に投与されるか、または投与され続ける。予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子を有する遺伝子型の存在は、対象が肥満を発症するリスクが低減していることを示している。いくつかの実施形態では、対象は、GPR75参照である。いくつかの実施形態では、対象は、予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である。
GPR75参照、またはGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性のいずれかであると遺伝子型決定されているかまたは判定されている対象については、そのような対象を、本明細書に記載されているようにGPR75阻害剤で治療することができる。
対象からの生体試料におけるGPR75ミスセンスバリアント核酸分子の有無を検出すること、及び/または対象がGPR75ミスセンスバリアント核酸分子を有するか否かを判定することは、本明細書に記載の方法のいずれかによって行うことができる。いくつかの実施形態では、これらの方法は、in vitroで行うことができる。いくつかの実施形態では、これらの方法は、in situで行うことができる。いくつかの実施形態では、これらの方法は、in vivoで行うことができる。これらの実施形態のいずれかでは、核酸分子は、対象から得た細胞内に存在し得る。
いくつかの実施形態では、対象がGPR75参照である場合、対象はまた、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤を、標準投与量で投与される。いくつかの実施形態では、対象がGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である場合、対象はまた、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤を、標準投与量と同じかまたはそれより少ない投与量で投与される。
いくつかの実施形態では、治療方法は、対象からの生体試料におけるGPR75の予測される機能喪失ポリペプチドの非存在を検出することを更に含む。いくつかの実施形態では、対象がGPR75の予測される機能喪失ポリペプチドを有していない場合、対象はまた、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤を、標準投与量で投与される。いくつかの実施形態では、対象がGPR75の予測される機能喪失ポリペプチドを有する場合、対象はまた、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤を、標準投与量と同じかまたはそれより少ない投与量で投与される。
本開示はまた、肥満を治療または抑制する治療剤で対象を治療する方法であって、対象が肥満である、方法を提供する。いくつかの実施形態では、本方法は、対象がGPR75の予測される機能喪失ポリペプチドを有するか否かを判定することを含み、それは、対象から生体試料を得るまたは得たことと、対象がGPR75の予測される機能喪失ポリペプチドを有するか否かを判定するために生体試料でアッセイを実施するまたは実施したこととによる。対象がGPR75の予測される機能喪失ポリペプチドを有していない場合、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤は、標準投与量で対象に投与されるか、または投与され続ける。対象がGPR75の予測される機能喪失ポリペプチドを有する場合、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤は、標準投与量と同じかまたはそれより少ない量で対象に投与されるか、または投与され続ける。GPR75の予測される機能喪失ポリペプチドの存在は、対象が肥満を発症するリスクが低減していることを示している。いくつかの実施形態では、対象は、GPR75の予測される機能喪失ポリペプチドを有する。いくつかの実施形態では、対象は、GPR75の予測される機能喪失ポリペプチドを有していない。
対象からの生体試料におけるGPR75の予測される機能喪失ポリペプチドの有無を検出すること、及び/または対象がGPR75の予測される機能喪失ポリペプチドを有するか否かを判定することは、本明細書に記載の方法のいずれかによって行うことができる。いくつかの実施形態では、これらの方法は、in vitroで行うことができる。いくつかの実施形態では、これらの方法は、in situで行うことができる。いくつかの実施形態では、これらの方法は、in vivoで行うことができる。これらの実施形態のいずれかでは、ポリペプチドは、対象から得た細胞内に存在し得る。
肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤の例としては、シブトラミン、オルリスタット、フェンテルミン、ロルカセリン、ナルトレキソン、リラグルチド、ジエチルプロピオン、ブプロピオン、メトホルミン、プラムリンチド、トピラマート、及びゾニサミド、またはそれらの任意の組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない。また、肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤の例としては、シブトラミン、オルリスタット、フェンテルミン及びメトホルミン、ロルカセリン、ブプロピオン及びナルトレキソン、リラグルチド、フェンテルミン及びジエチルプロピオン、ブプロピオン、メトホルミン、プラムリンチド、トピラマート、ならびにゾニサミド、またはそれらの任意の組み合わせも挙げられるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤は、BYETTA(登録商標)もしくはBYDUREON(登録商標)(エキセナチド)、VICTOZA(登録商標)もしくはSAXENDA(登録商標)(リラグルチド)、LYXUMIA(登録商標)もしくはADLYXIN(商標)(リキシセナチド)、TANZEUM(登録商標)(アルビグルチド)、TRULICITY(登録商標)(デュラグルチド)、及びOZEMPIC(登録商標)(セマグルチド)、またはそれらの任意の組み合わせを含むがこれらに限定されない、GLP1Rアゴニストである。いくつかの実施形態では、肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤は、BYETTA(登録商標)(エキセナチド)である。いくつかの実施形態では、肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤は、BYETTA(登録商標)(エキセナチド)である。いくつかの実施形態では、肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤は、VICTOZA(登録商標)(リラグルチド)である。いくつかの実施形態では、肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤は、SAXENDA(登録商標)(リラグルチド)である。いくつかの実施形態では、肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤は、LYXUMIA(登録商標)(リキシセナチド)である。いくつかの実施形態では、肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤は、ADLYXIN(商標)(リキシセナチド)である。いくつかの実施形態では、肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤は、TANZEUM(登録商標)(アルビグルチド)である。いくつかの実施形態では、肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤は、TRULICITY(登録商標)(デュラグルチド)である。いくつかの実施形態では、肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤は、OZEMPIC(登録商標)(セマグルチド)である。いくつかの実施形態では、肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤は、エキセナチド、リラグルチド、リキシセナチド、アルビグルチド、デュラグルチド、及びセマグルチド、またはそれらの任意の組み合わせから選択される。いくつかの実施形態では、肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤は、エキセナチドである。いくつかの実施形態では、肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤は、リラグルチドである。いくつかの実施形態では、肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤は、リキシセナチドである。いくつかの実施形態では、肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤は、アルビグルチドである。いくつかの実施形態では、肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤は、デュラグルチドである。いくつかの実施形態では、肥満及び/またはBMI増加を治療または抑制する治療剤は、セマグルチドである。
いくつかの実施形態では、肥満を治療もしくは抑制する及び/またはBMIを低減させる治療剤は、メラノコルチン4受容体(MC4R)アゴニストである。いくつかの実施形態では、MC4Rアゴニストは、タンパク質、ペプチド、核酸分子、または小分子を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、MC4Rのペプチドアナログである。いくつかの実施形態では、ペプチドは、セトメラノチドである。いくつかの実施形態では、肥満を治療もしくは抑制する及び/またはBMIを低減させる治療剤は、セトメラノチドと、シブトラミン、オルリスタット、フェンテルミン、ロルカセリン、ナルトレキソン、リラグルチド、ジエチルプロピオン、ブプロピオン、メトホルミン、プラムリンチド、トピラマート、及びゾニサミドのうちの1つ以上との組み合わせである。いくつかの実施形態では、MC4Rアゴニストは、アミノ酸配列His-Phe-Arg-Trpを含むペプチドである。いくつかの実施形態では、小分子は、1,2,3R,4-テトラヒドロイソキノリン-3-カルボン酸である。いくつかの実施形態では、MC4Rアゴニストは、ALB-127158(a)である。
いくつかの実施形態では、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤の用量は、GPR75参照である(標準投与量を受けてよい)対象と比較して、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である対象については、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、または約90%低減させることができる(すなわち、標準投与量よりも少ない)。いくつかの実施形態では、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤の用量は、約10%、約20%、約30%、約40%、または約50%低減させることができる。加えて、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である対象の肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤の用量は、GPR75参照である対象と比較して、低い頻度で投与することができる。
肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤の投与は、例えば、1日後、2日後、3日後、5日後、1週間後、2週間後、3週間後、1か月後、5週間後、6週間後、7週間後、8週間後、2か月後、または3か月後に反復することができる。反復投与は、同じ用量であっても、または異なる用量であってもよい。投与は、1回、2回、3回、4回、5回、6回、7回、8回、9回、10回、またはそれ以上反復することができる。例えば、ある特定の投与量レジメンに従って、対象は、例えば、6か月、1年、またはそれ以上などの長期間にわたって治療を受けることができる。
肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤の投与は、非経口、静脈内、経口、皮下、動脈内、頭蓋内、髄腔内、腹腔内、局所、鼻腔内、または筋肉内が含まれるがこれらに限定されない任意の好適な経路で行うことができる。投与用の医薬組成物は、無菌であり、実質的に等張であり、GMP条件下で製造されることが望ましい。医薬組成物は、単位剤形(すなわち、単回投与の投与量)で提供することができる。医薬組成物は、1つ以上の生理学的及び薬学的に許容される担体、希釈剤、賦形剤、または補助剤を使用して製剤化することができる。製剤は、選択した投与経路に依存する。「薬学的に許容される」という用語は、担体、希釈剤、賦形剤、または補助剤が、製剤の他の成分と適合し、そのレシピエントに実質的に有害ではないことを意味する。
いくつかの実施形態では、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤(例えば、本明細書で開示される阻害性核酸分子のいずれか)は、髄腔内投与(すなわち、治療剤が対象の脳脊髄液に到達され得るように、脊髄のくも膜下腔もしくは脊柱管へと導入すること、または鞘内部の解剖学的空間もしくは潜在的空間(非限定的な例として、脳もしくは脊髄のくも膜を含む)へと導入すること)される。いくつかの実施形態では、髄腔内投与により、限定されないが、皮質、小脳、線条体、頸椎、腰椎、または胸椎に治療剤が作用する。髄腔内投与された治療剤は、最終的に中枢神経系全体にわたり、標的に作用し得る。いくつかの実施形態では、髄腔内投与は、大槽内への、または腰部区域もしくは領域付近へのものである。いくつかの実施形態では、腰部区域もしくは領域への髄腔内投与により、治療剤が遠位脊柱管に送達される。髄腔内投与の例示的な方法は、例えば、Lazorthes et al.,Advances in Drug Delivery Systems and Applications in Neurosurgery,143-192に記載されている。いくつかの実施形態では、髄腔内投与は、注射、ボーラス注射、カテーテル、またはポンプによるものである。いくつかの実施形態では、髄腔内投与は、腰椎穿刺によるものである。いくつかの実施形態では、ポンプは、浸透圧ポンプである。いくつかの実施形態では、ポンプは、脊柱管のくも膜下腔、腹部の皮膚の下、または胸壁の背部に埋め込まれる。いくつかの実施形態では、髄腔内投与は、一定量の治療剤を含有するリザーバと、リザーバに含まれる治療物質の少なくとも一部を送達するように構成されたポンプとを含む、治療物質の髄腔内送達システムによるものである。いくつかの実施形態では、髄腔内投与は、埋め込み型髄腔内薬物送達デバイス(IDDD)への断続的または連続的なアクセスを介するものである。いくつかの実施形態では、治療物質は、阻害性核酸分子である。いくつかの実施形態では、髄腔内投与される核酸分子の量は、約10μg~約2mg、約50μg~約1500μg、または約100μg~約1000μgの範囲である。いくつかの実施形態では、治療剤は、医薬組成物内に配置される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、防腐剤を含まない。
本明細書で使用される場合、「治療する」、「治療すること」、及び「治療」ならびに「予防する」、「予防すること」、及び「予防」という用語は、それぞれ、治療効果及び予防効果などの所望の生物学的応答を引き出すことを指す。いくつかの実施形態では、治療効果は、薬剤または薬剤を含む組成物の投与後の、肥満の減少/低減、肥満の重症度低下/低減(例えば、肥満の発症の低減もしくは抑制など)、症状及び肥満に関連する影響の減少/低減、症状及び肥満に関連する影響の発症遅延、肥満に関連する影響の症状の重症度低減、急性エピソードの重症度低減、症状及び肥満に関連する影響の数の低減、症状及び肥満に関連する影響の潜伏期短縮、症状及び肥満に関連する影響の改善、二次的症状の低減、二次感染の低減、肥満の再発予防、再発エピソードの回数もしくは頻度の減少、症候性エピソード間の潜伏期延長、持続的進行までの時間の延長、寛解の促進、寛解の誘導、寛解の増大、回復の加速、または代替的治療法の有効性の増大もしくはそれに対する抵抗性の低下、及び/または罹患宿主動物の生存期間の延長のうちの1つ以上を含む。予防効果は、治療プロトコルの投与後の、肥満の発症/進行の完全もしくは部分的な回避/抑制もしくは遅延(例えば、完全もしくは部分的な回避/抑制もしくは遅延など)、または罹患宿主動物の生存期間の延長を含み得る。肥満の治療には、任意の臨床病期または臨床症状で何らかの形態の肥満を有するとすでに診断された対象の治療、肥満の症状または徴候の発症または進展または増悪または悪化の遅延、及び/または肥満の重症度の予防及び/または低減が包含される。
本開示はまた、肥満、過体重、BMI上昇、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積の上昇、及び/または過剰食物摂取を発症するリスクが高い対象を識別する方法も提供する。いくつかの実施形態では、本方法は、対象から得た生体試料において、予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子(ゲノム核酸分子、mRNA分子、及び/またはcDNA分子など)の有無を判定すること、または判定したことを含む。対象がGPR75ミスセンスバリアント核酸分子を欠いている(すなわち、対象が遺伝子型決定でGPR75参照に分類される)場合、対象は肥満を発症するリスクが高い。対象がGPR75ミスセンスバリアント核酸分子を有する(すなわち、対象がGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性またはホモ接合性である)場合、対象は肥満を発症するリスクが低い。
対象は、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子の単一コピーを有することにより、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子のコピーを有していないことよりも肥満の発症から保護される。いかなる特定の理論または作用機序に限定されることを意図するものではないが、対象は、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子の単一コピー(すなわち、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性)により、肥満の発症から保護されると考えられており、また、対象は、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子の2つのコピーを有する(すなわち、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてホモ接合性である)ことにより、単一コピーを有する対象と比較して、肥満の発症から更に保護され得るとも考えられている。したがって、いくつかの実施形態では、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子の単一コピーにより、対象は、肥満の発症から完全に保護され得るわけではないが、代わりに部分的または不完全に保護され得る。いかなる特定の理論にも束縛されることを望むわけではないが、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子の単一コピーを有する対象に依然として存在する、肥満の発症に関与する追加の因子または分子があり、そのために、肥満の発症の完全な保護に及ばない可能性がある。
対象からの生体試料において対象がGPR75ミスセンスバリアント核酸分子を有するか否かを判定すること、及び/または対象がGPR75ミスセンスバリアント核酸分子を有するか否かを判定することは、本明細書に記載の方法のいずれかによって行うことができる。いくつかの実施形態では、これらの方法は、in vitroで行うことができる。いくつかの実施形態では、これらの方法は、in situで行うことができる。いくつかの実施形態では、これらの方法は、in vivoで行うことができる。これらの実施形態のいずれかでは、核酸分子は、対象から得た細胞内に存在し得る。
いくつかの実施形態では、対象が肥満を発症するリスクが高いと識別されると、対象は更に、本明細書に記載されているように、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤で治療される。例えば、対象がGPR75参照であり、それ故肥満を発症するリスクが高い場合、対象は、GPR75阻害剤を投与される。いくつかの実施形態では、そのような対象はまた、肥満を治療または抑制する治療剤を投与される。いくつかの実施形態では、対象がGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である場合、対象は、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤を、標準投与量と同じかまたはそれより少ない投与量で投与される。いくつかの実施形態では、対象は、GPR75参照である。いくつかの実施形態では、対象は、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である。
本開示はまた、対象からの生体試料中のGPR75ミスセンスゲノムバリアント核酸分子、及び/または対象からの生体試料中のGPR75ミスセンスバリアントmRNA分子、及び/または対象からの生体試料中のmRNA分子から生成されたGPR75ミスセンスバリアントcDNA分子の有無を検出する方法も提供する。集団内の遺伝子配列、及びそのような遺伝子によってコードされるmRNA分子は、一塩基多型などの多型のために異なり得ることを理解されたい。GPR75バリアントゲノム核酸分子、GPR75バリアントmRNA分子、及びGPR75バリアントcDNA分子について本明細書で提供する配列は、例示的な配列にすぎない。GPR75バリアントゲノム核酸分子、バリアントmRNA分子、及びバリアントcDNA分子について他の配列も可能である。
生体試料は、対象からの任意の細胞、組織、または生体液に由来し得る。生体試料は、骨髄試料、腫瘍生検標本、細針吸引標本、または体液(血液、歯肉溝滲出液、血漿、血清、リンパ、腹水、嚢胞液、もしくは尿など)の試料などの任意の臨床的に関連する組織を含んでよい。場合によっては、試料は、口腔スワブを含む。本明細書に開示される方法において使用する生体試料は、アッセイ形式、検出方法の性質、及び試料として使用する組織、細胞、または抽出物に基づいて異なり得る。生体試料は、採用されるアッセイに応じて異なる処理を行うことができる。例えば、任意のGPR75バリアント核酸分子を検出する場合、ゲノムDNAについて生体試料を単離するまたは濃縮するように設計した予備処理を採用することができる。この目的では、様々な技術を使用することができる。任意のGPR75バリアントmRNA分子のレベルを検出する場合、様々な技術を使用してmRNA分子を含む生体試料を濃縮することができる。mRNA分子の存在もしくはレベル、または特定のバリアントゲノムDNA遺伝子座の存在を検出するために、様々な方法を使用することができる。
いくつかの実施形態では、対象におけるヒトGPR75ミスセンスバリアント核酸分子を検出することは、生体試料中のGPR75ゲノム核酸分子、及び/または生体試料中のGPR75 mRNA分子、及び/または生体試料中のmRNA分子から生成されたGPR75 cDNA分子が、機能喪失(部分的もしくは完全)を引き起こす、または機能喪失(部分的もしくは完全)を引き起こすと予測される1つ以上の変異を含むか否かを判定するために、対象から得た生体試料をアッセイするまたは遺伝子型決定することを含む。
いくつかの実施形態では、対象におけるGPR75ミスセンスバリアント核酸分子(例えば、ゲノム核酸分子、mRNA分子、及び/またはmRNAから生成されたcDNA分子など)の有無を検出する方法は、対象から得た生体試料でアッセイを実施することを含む。アッセイは、生体試料中の核酸分子が特定のヌクレオチド配列を含むか否かを判定する。
いくつかの実施形態では、ヌクレオチド配列は、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか(ゲノム核酸分子の場合);配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、または配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか(mRNA分子の場合);配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、または配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている(cDNA分子の場合)。
いくつかの実施形態では、ヌクレオチド配列は、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニン(ゲノム核酸分子の場合);配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニン、または配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニン(mRNA分子の場合);配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニン、または配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニン(cDNA分子の場合)を含む。
いくつかの実施形態では、ヌクレオチド配列は、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミン(ゲノム核酸分子の場合);配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシル、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシル、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシル、または配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシル(mRNA分子の場合);配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミン、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミン、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミン、または配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミン(cDNA分子の場合)を含む。
いくつかの実施形態では、ヌクレオチド配列は、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか(ゲノム核酸分子の場合);配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、または配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか(mRNA分子の場合);配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、または配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている(cDNA分子の場合)。
いくつかの実施形態では、ヌクレオチド配列は、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入(ゲノム核酸分子の場合);配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入、または配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入(mRNA分子の場合);配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入(cDNA分子の場合)を含む。
いくつかの実施形態では、ヌクレオチド配列は、配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体(ゲノム核酸分子の場合);配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体(mRNA分子の場合);配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体(cDNA分子の場合)を含む。
いくつかの実施形態では、ヌクレオチド配列は、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含むか、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含むか、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含むか、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む。
いくつかの実施形態では、ヌクレオチド配列は、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含むか、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含むか、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含むか、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含むか、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含むか、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含むか、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含むか、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含むか、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含むか、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含むか、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含むか、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含むか、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含むか、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含むか、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含むか、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む。
いくつかの実施形態では、ヌクレオチド配列は、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含むか、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含むか、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含むか、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含むか、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含むか、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含むか、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含むか、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含むか、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いているか、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含むか、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含むか、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含むか、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含むか、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含むか、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含むか、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含むか、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む。
いくつかの実施形態では、生体試料は、細胞または細胞溶解物を含む。そのような方法は、例えば、GPR75ゲノム核酸分子またはmRNA分子を含む生体試料を対象から得ること、及びmRNAである場合、任意選択でmRNAをcDNAに逆転写することを更に含み得る。そのようなアッセイは、例えば、特定のGPR75核酸分子のそれらの位置の識別を判定することを含み得る。いくつかの実施形態では、その方法は、in vitro法である。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、生体試料中のGPR75ゲノム核酸分子、GPR75 mRNA分子、またはGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することを含み、配列決定された部分は、機能喪失(部分的もしくは完全)を引き起こす、または機能喪失(部分的もしくは完全)を引き起こすと予測される1つ以上の変異を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、i)生体試料中のGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号2に記載の5,540~5,546位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ii)生体試料中のGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号11に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号16に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号21に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号26に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び/またはiii)生体試料中のmRNAから生成されたGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号35に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号40に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号45に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号50に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、を含む。生体試料中のGPR75核酸分子の配列決定された部分が、i)配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、ii)配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、もしくは配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、またはiii)配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、もしくは配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失を含む場合、生体試料中のGPR75核酸分子は、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子である。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、i)生体試料中のGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ii)生体試料中のGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号12に記載の556位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号17に記載の457位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号22に記載の378位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号27に記載の617位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び/またはiii)生体試料中のmRNAから生成されたGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号36に記載の556位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号41に記載の457位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号46に記載の378位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号51に記載の617位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、を含む。生体試料中のGPR75核酸分子の配列決定された部分が、i)配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニン、ii)配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニン、もしくは配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニン、またはiii)配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニン、もしくは配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む場合、生体試料中のGPR75核酸分子は、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子である。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、i)生体試料中のGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ii)生体試料中のGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号13に記載の910位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号18に記載の811位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号23に記載の732位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号28に記載の971位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び/またはiii)生体試料中のmRNAから生成されたGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号37に記載の910位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号42に記載の811位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号47に記載の732位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号52に記載の971位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、を含む。生体試料中のGPR75核酸分子の配列決定された部分が、i)配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミン、ii)配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシル、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシル、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシル、もしくは配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシル、またはiii)配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミン、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミン、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミン、もしくは配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含む場合、生体試料中のGPR75核酸分子は、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子である。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、i)生体試料中のGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号5に記載の5,920~5,923位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ii)生体試料中のGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号14に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号19に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号24に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号29に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び/またはiii)生体試料中のmRNAから生成されたGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号38に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号43に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号48に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号53に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、を含む。生体試料中のGPR75核酸分子の配列決定された部分が、i)配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、ii)配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、もしくは配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、またはiii)配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、もしくは配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失を含む場合、生体試料中のGPR75核酸分子は、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子である。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、i)生体試料中のGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ii)生体試料中のGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号30に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び/またはiii)生体試料中のmRNAから生成されたGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号54に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、を含む。生体試料中のGPR75核酸分子の配列決定された部分が、i)配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入、ii)配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入、もしくは配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入、またはiii)配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入、もしくは配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含む場合、生体試料中のGPR75核酸分子は、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子である。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、i)生体試料中のGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号99に記載の5,831位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ii)生体試料中のGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号100に記載の830位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号101に記載の731位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号102に記載の652位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び/またはiii)生体試料中のmRNAから生成されたGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号104に記載の830位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号105に記載の731位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号106に記載の652位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、を含む。生体試料中のGPR75核酸分子の配列決定された部分が、i)配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニン、ii)配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニン、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニン、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニン、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニン、またはiii)配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニン、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニン、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニン、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む場合、生体試料中のGPR75核酸分子は、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子である。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、生体試料中のGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号2に記載の5,540~5,546位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号5に記載の5,920~5,923位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置もしくはその相補体を含む、配列決定すること、を含む。生体試料中のGPR75核酸分子の配列決定された部分が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニン、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミン、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含む場合、生体試料中のGPR75核酸分子は、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子である。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、生体試料中のGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することを含み、配列決定された部分は、配列番号11に記載の539~545位に対応する位置またはその相補体、配列番号16に記載の440~446位に対応する位置またはその相補体、配列番号21に記載の361~367位に対応する位置またはその相補体、配列番号26に記載の600~606位に対応する位置またはその相補体、配列番号12に記載の556位に対応する位置またはその相補体、配列番号17に記載の457位に対応する位置またはその相補体、配列番号22に記載の378位に対応する位置またはその相補体、配列番号27に記載の617位に対応する位置またはその相補体、配列番号13に記載の910位に対応する位置またはその相補体、配列番号18に記載の811位に対応する位置またはその相補体、配列番号23に記載の732位に対応する位置またはその相補体、配列番号28に記載の971位に対応する位置またはその相補体、配列番号14に記載の919~922位に対応する位置またはその相補体、配列番号19に記載の820~823位に対応する位置またはその相補体、配列番号24に記載の741~744位に対応する位置またはその相補体、配列番号29に記載の980~983位に対応する位置またはその相補体、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置またはその相補体、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置またはその相補体、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置またはその相補体、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置またはその相補体、配列番号100に記載の830位に対応する位置またはその相補体、配列番号101に記載の731位に対応する位置またはその相補体、配列番号102に記載の652位に対応する位置またはその相補体、配列番号103に記載の891位に対応する位置またはその相補体を含む。生体試料中のGPR75核酸分子の配列決定された部分が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む場合、生体試料中のGPR75核酸分子は、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子である。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、生体試料中のmRNAから生成されたGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することを含み、配列決定された部分は、配列番号35に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号40に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号45に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号50に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号36に記載の556位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号41に記載の457位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号46に記載の378位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号51に記載の617位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号37に記載の910位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号42に記載の811位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号47に記載の732位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号52に記載の971位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号38に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号43に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号48に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号53に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置、その相補体、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号104に記載の830位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号105に記載の731位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号106に記載の652位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号107に記載の891位に対応する位置もしくはその相補体を含む。生体試料中のGPR75核酸分子の配列決定された部分が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む場合、生体試料中のGPR75核酸分子は、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子である。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、a)i)配列番号2に記載の5,540~5,546位に対応する位置に近接するGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ii)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、もしくは配列番号26に記載の600~606位に対応する位置に近接するGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の一部分、及び/またはiii)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、もしくは配列番号50に記載の600~606位に対応する位置に近接するGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに、生体試料を接触させることと、b)i)配列番号2に記載の5,540~5,546位に対応するGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ii)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、もしくは配列番号26に記載の600~606位に対応するGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の位置、及び/またはiii)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、もしくは配列番号50に記載の600~606位に対応するGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の位置を少なくとも介してプライマーを伸長させることと、c)プライマーの伸長産物が、i)配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、ii)配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、もしくは配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、またはiii)配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、もしくは配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失を含むか否かを判定することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、a)i)配列番号3に記載の5,557位に対応する位置に近接するGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ii)配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位に対応する位置に近接するGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の一部分、及び/またはiii)配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、もしくは配列番号51に記載の617位に対応する位置に近接するGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに、生体試料を接触させることと、b)i)配列番号3に記載の5,557位に対応するGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ii)配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、もしくは配列番号27に記載の617位に対応するGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の位置、及び/またはiii)配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、もしくは配列番号51に記載の617位に対応するGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の位置を少なくとも介してプライマーを伸長させることと、c)プライマーの伸長産物が、i)配列番号3に記載の5,557位に対応するアデニン、ii)配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニン、もしくは配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニン、またはiii)配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニン、もしくは配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否かを判定することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、a)i)配列番号4に記載の5,911位に対応する位置に近接するGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ii)配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、もしくは配列番号28に記載の971位に対応する位置に近接するGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の一部分、及び/またはiii)配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、もしくは配列番号52に記載の971位に対応する位置に近接するGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに、生体試料を接触させることと、b)i)配列番号4に記載の5,911位に対応するGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ii)配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、もしくは配列番号28に記載の971位に対応するGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の位置、及び/またはiii)配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、もしくは配列番号52に記載の971位に対応するGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の位置を少なくとも介してプライマーを伸長させることと、c)プライマーの伸長産物が、i)配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミン、ii)配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシル、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシル、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシル、もしくは配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシル、またはiii)配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミン、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミン、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミン、もしくは配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含むか否かを判定することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、a)i)配列番号5に記載の5,920~5,923位に対応する位置に近接するGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ii)配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、もしくは配列番号29に記載の980~983位に対応する位置に近接するGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の一部分、及び/またはiii)配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、もしくは配列番号53に記載の980~983位に対応する位置に近接するGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに、生体試料を接触させることと、b)i)配列番号5に記載の5,920~5,923位に対応するGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ii)配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、もしくは配列番号29に記載の980~983位に対応するGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の位置、及び/またはiii)配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、もしくは配列番号53に記載の980~983位に対応するGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の位置を少なくとも介してプライマーを伸長させることと、c)プライマーの伸長産物が、i)配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、ii)配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、もしくは配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、またはiii)配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、もしくは配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失を含むか否かを判定することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、a)i)配列番号6に記載の6,411位に対応する位置に近接するGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ii)配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、もしくは配列番号30に記載の1,471位に対応する位置に近接するGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の一部分、及び/またはiii)配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、もしくは配列番号54に記載の1,471位に対応する位置に近接するGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに、生体試料を接触させることと、b)i)配列番号6に記載の6,411位に対応するGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ii)配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、もしくは配列番号30に記載の1,471位に対応するGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の位置、及び/またはiii)配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、もしくは配列番号54に記載の1,471位に対応するGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の位置を少なくとも介してプライマーを伸長させることと、c)プライマーの伸長産物が、i)配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入、ii)配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入、もしくは配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入、またはiii)配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入、もしくは配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否かを判定することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、a)i)配列番号99に記載の5,831位に対応する位置に近接するGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ii)配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置に近接するGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の一部分、及び/またはiii)配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置に近接するGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに、生体試料を接触させることと、b)i)配列番号99に記載の5,831位に対応する位置に近接するGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ii)配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置に近接するGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の位置、及び/またはiii)配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置に近接するGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の位置を少なくとも介してプライマーを伸長させることと、c)プライマーの伸長産物が、i)配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、ii)配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、またはiii)配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含むか否かを判定することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、a)配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号3に記載の5,557位、配列番号4に記載の5,911位、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号6に記載の6,411位、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置に近接するGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに生体試料を接触させることと、b)配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号3に記載の5,557位、配列番号4に記載の5,911位、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号6に記載の6,411位、または配列番号99に記載の5,831位に対応するGPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置を少なくとも介してプライマーを伸長させることと、c)プライマーの伸長産物が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含むか否かを判定することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、a)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、または配列番号103に記載の891位に対応する位置に近接するGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに生体試料を接触させることと、b)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、または配列番号103に記載の891位に対応するGPR75 mRNA分子のヌクレオチド配列の位置を少なくとも介してプライマーを伸長させることと、c)プライマーの伸長産物が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか否か、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、a)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、配列番号50に記載の600~606位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、配列番号51に記載の617位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、配列番号52に記載の971位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、配列番号53に記載の980~983位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、配列番号54に記載の1,471位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応する位置に近接するGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに生体試料を接触させることと、b)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、配列番号50に記載の600~606位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、配列番号51に記載の617位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、配列番号52に記載の971位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、配列番号53に記載の980~983位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、配列番号54に記載の1,471位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応するGPR75 cDNA分子のヌクレオチド配列の位置を少なくとも介してプライマーを伸長させることと、c)プライマーの伸長産物が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか否か、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む。
いくつかの実施形態では、アッセイは、核酸分子全体を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、GPR75ゲノム核酸分子のみが解析される。いくつかの実施形態では、GPR75 mRNAのみが解析される。いくつかの実施形態では、GPR75 mRNAから得たGPR75 cDNAのみが解析される。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、a)ヒトGPR75ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、増幅した部分が、i)配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体の欠失、ii)配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体の欠失、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体の欠失、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体の欠失、もしくは配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体の欠失、及び/またはiii)配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体の欠失、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体の欠失、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体の欠失、もしくは配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体の欠失を含む、増幅することと、b)増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、c)標識した核酸分子を変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブが、i)配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、ii)配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、もしくは配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、及び/またはiii)配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、もしくは配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている増幅した核酸分子の核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、d)検出可能な標識を検出することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、a)ヒトGPR75ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、増幅した部分が、i)配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、ii)配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、及び/またはiii)配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、もしくは配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、増幅することと、b)増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、c)標識した核酸分子を変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブが、i)配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、ii)配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、もしくは配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、及び/またはiii)配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、もしくは配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む増幅した核酸分子の核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、d)検出可能な標識を検出することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、a)ヒトGPR75ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、増幅した部分が、i)配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、ii)配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、もしくは配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、及び/またはiii)配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、もしくは配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、増幅することと、b)増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、c)標識した核酸分子を変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブが、i)配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、ii)配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、もしくは配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、及び/またはiii)配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、もしくは配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む増幅した核酸分子の核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、d)検出可能な標識を検出することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、a)ヒトGPR75ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、増幅した部分が、i)配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体の欠失、ii)配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体の欠失、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体の欠失、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体の欠失、もしくは配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体の欠失、及び/またはiii)配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体の欠失、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体の欠失、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体の欠失、もしくは配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体の欠失を含む、増幅することと、b)増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、c)標識した核酸分子を変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブが、i)配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、ii)配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、もしくは配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、及び/またはiii)配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、もしくは配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている増幅した核酸分子の核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、d)検出可能な標識を検出することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、a)ヒトGPR75ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、増幅した部分が、i)配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、ii)配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入、及び/またはiii)配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、もしくは配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、増幅することと、b)増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、c)標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブが、i)配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、ii)配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入、もしくは配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入、及び/またはiii)配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、もしくは配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む増幅した核酸分子の核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、d)検出可能な標識を検出することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、a)ヒトGPR75ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、増幅した部分が、i)配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、ii)配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、及び/またはiii)配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、増幅することと、b)増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、c)標識した核酸分子を変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブが、i)配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、ii)配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、及び/またはiii)配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む増幅した核酸分子の核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、d)検出可能な標識を検出することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、a)ヒトGPR75ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、増幅した部分が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、増幅することと、b)増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、c)標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む増幅した核酸分子の核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、d)検出可能な標識を検出することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、a)ヒトGPR75ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、増幅した一部分が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、増幅することと、b)増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、c)標識した核酸分子を変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む増幅した核酸分子の核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、a)ヒトGPR75ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、増幅した一部分が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、増幅することと、b)増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、c)標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む増幅した核酸分子の核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、d)検出可能な標識を検出することと、を含む。
いくつかの実施形態では、核酸分子はmRNAであり、判定ステップは、増幅ステップの前にmRNAをcDNAに逆転写することを更に含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、生体試料中の核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブが、i)配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、ii)配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、もしくは配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、及び/またはiii)配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、もしくは配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている増幅した核酸分子のヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、検出可能な標識を検出することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、生体試料中の核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブが、i)配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、ii)配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、もしくは配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、及び/またはiii)配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、もしくは配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている増幅した核酸分子のヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、検出可能な標識を検出することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、生体試料中の核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブが、i)配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、ii)配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、もしくは配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、及び/またはiii)配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、もしくは配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、検出可能な標識を検出することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、生体試料中の核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブが、i)配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、ii)配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、もしくは配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、及び/またはiii)配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、もしくは配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、検出可能な標識を検出することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、生体試料中の核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブが、i)配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、ii)配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、もしくは配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、及び/またはiii)配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、もしくは配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている増幅した核酸分子のヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、検出可能な標識を検出することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、生体試料中の核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブが、i)配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、ii)配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入、もしくは配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入、及び/またはiii)配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、もしくは配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、検出可能な標識を検出することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、生体試料中の核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブが、i)配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、ii)配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、及び/またはiii)配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、検出可能な標識を検出することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、生体試料中の核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号2に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号5に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、検出可能な標識を検出することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、生体試料中の核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、検出可能な標識を検出することと、を含む。
いくつかの実施形態では、判定ステップ、検出ステップ、または配列解析は、生体試料中の核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させることと、検出可能な標識を検出することと、を含む。
変化特異的ポリメラーゼ連鎖反応技術を使用して、核酸配列中のSNPなどの突然変異を検出することができる。鋳型とのミスマッチが存在する場合はDNAポリメラーゼが伸長しなくなるため、変化特異的プライマーを使用することができる。
いくつかの実施形態では、試料中の核酸分子はmRNAであり、増幅ステップの前にmRNAをcDNAに逆転写する。いくつかの実施形態では、核酸分子は、対象から得た細胞内に存在する。
いくつかの実施形態では、アッセイは、生体試料を、ストリンジェントな条件下でGPR75バリアントゲノム配列、バリアントmRNA配列、またはバリアントcDNA配列と特異的にハイブリダイズし、対応するGPR75参照配列とはハイブリダイズしないプライマーまたはプローブ、例えば変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブと接触させることと、ハイブリダイゼーションが生じたか否かを判定することと、を含む。
いくつかの実施形態では、アッセイは、RNAシーケンシング(RNA-Seq)を含む。いくつかの実施形態では、アッセイはまた、例えば逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)によって、mRNAをcDNAに逆転写することも含む。
いくつかの実施形態では、本方法は、標的ヌクレオチド配列に結合し、GPR75バリアントゲノム核酸分子、バリアントmRNA分子、またはバリアントcDNA分子を含むポリヌクレオチドを特異的に検出及び/または同定するのに十分なヌクレオチド長のプローブ及びプライマーを利用する。ハイブリダイゼーション条件または反応条件は、この結果を達成するように作業者が決定することができる。このヌクレオチド長は、本明細書に記載または例示される任意のアッセイを含む選択した検出方法での使用に十分な、いかなる長さであってもよい。そのようなプローブ及びプライマーは、高いストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で標的ヌクレオチド配列と特異的にハイブリダイズすることができる。プローブ及びプライマーは、標的ヌクレオチド配列内の連続したヌクレオチドの完全なヌクレオチド配列同一性を有し得るが、プローブは、標的ヌクレオチド配列とは異なり、かつ、標的ヌクレオチド配列を特異的に検出及び/または同定する能力を保持しているものを従来の方法で設計することができる。プローブ及びプライマーは、標的核酸分子のヌクレオチド配列に対して、約80%、約85%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%、または100%の配列同一性または相補性を有し得る。
いくつかの実施形態では、生体試料内のGPR75核酸分子(ゲノム核酸分子、mRNA分子、もしくはcDNA分子)またはその相補体が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているヌクレオチド配列(ゲノム核酸分子)、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、または配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失(mRNA分子の場合);配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、または配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失(cDNA分子の場合)を含むか否かを判定するために、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、または配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失に隣接する5’隣接配列に由来する第1のプライマーと、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、または配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失に隣接する3’隣接配列に由来する第2のプライマーとを含むプライマー対を使用した増幅方法に生体試料を供して、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、または配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失の存在を示すアンプリコンを生成することができる。いくつかの実施形態では、アンプリコンの長さは、プライマー対に1ヌクレオチド塩基対を合わせた長さからDNA増幅プロトコルにより生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの範囲であってよい。この距離は、1ヌクレオチド塩基対から増幅反応の限界、または約2万ヌクレオチド塩基対までの範囲であることができる。任意選択で、プライマー対は、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている位置、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、または配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失と、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている位置、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失、または配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドの欠失の各側の少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、またはそれ以上のヌクレオチドと、を含む領域に隣接する。
いくつかの実施形態では、生体試料内のGPR75核酸分子(ゲノム核酸分子、mRNA分子、もしくはcDNA分子)またはその相補体が、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニン(ゲノム核酸分子)、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニン、または配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニン(mRNA分子の場合);配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニン、または配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニン(cDNA分子の場合)を含むヌクレオチド配列を含むか否かを判定するために、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニン、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニン、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニン、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニン、または配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンに隣接する5’隣接配列に由来する第1のプライマーと、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニン、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニン、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニン、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニン、または配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンに隣接する3’隣接配列に由来する第2のプライマーとを含むプライマー対を使用した増幅方法に生体試料を供して、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニン、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニン、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニン、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニン、または配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンをコードする位置のSNPの存在を示すアンプリコンを生成することができる。いくつかの実施形態では、アンプリコンの長さは、プライマー対に1ヌクレオチド塩基対を合わせた長さからDNA増幅プロトコルにより生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの範囲であってよい。この距離は、1ヌクレオチド塩基対から増幅反応の限界、または約2万ヌクレオチド塩基対までの範囲であることができる。任意選択で、プライマー対は、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニン、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニン、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニン、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニン、または配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む位置と、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニン、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニン、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニン、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニン、または配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む位置の各側の少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、またはそれ以上のヌクレオチドと、を含む領域に隣接する。
いくつかの実施形態では、生体試料内のGPR75核酸分子(ゲノム核酸分子、mRNA分子、もしくはcDNA分子)またはその相補体が、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミン(ゲノム核酸分子)、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシル、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシル、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシル、または配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシル(mRNA分子の場合);配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミン、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミン、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミン、または配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミン(cDNA分子の場合)を含むヌクレオチド配列を含むか否かを判定するために、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミン、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシル、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシル、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシル、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシル、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミン、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミン、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミン、または配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンに隣接する5’隣接配列に由来する第1のプライマーと、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミン、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシル、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシル、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシル、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシル、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミン、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミン、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミン、または配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンに隣接する3’隣接配列に由来する第2のプライマーとを含むプライマー対を使用した増幅方法に生体試料を供して、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミン、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシル、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシル、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシル、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシル、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミン、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミン、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミン、または配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンをコードする位置のSNPの存在を示すアンプリコンを生成することができる。いくつかの実施形態では、アンプリコンの長さは、プライマー対に1ヌクレオチド塩基対を合わせた長さからDNA増幅プロトコルにより生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの範囲であってよい。この距離は、1ヌクレオチド塩基対から増幅反応の限界、または約2万ヌクレオチド塩基対までの範囲であることができる。任意選択で、プライマー対は、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミン、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシル、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシル、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシル、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシル、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミン、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミン、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミン、または配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含む位置と、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミン、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシル、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシル、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシル、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシル、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミン、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミン、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミン、または配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含む位置の各側の少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、またはそれ以上のヌクレオチドと、を含む領域に隣接する。
いくつかの実施形態では、生体試料内のGPR75核酸分子(ゲノム核酸分子、mRNA分子、もしくはcDNA分子)またはその相補体が、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているヌクレオチド配列(ゲノム核酸分子)、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、または配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失(mRNA分子の場合);配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、または配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失(cDNA分子の場合)を含むか否かを判定するために、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、または配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失に隣接する5’隣接配列に由来する第1のプライマーと、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、または配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失に隣接する3’隣接配列に由来する第2のプライマーとを含むプライマー対を使用した増幅方法に生体試料を供して、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、または配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失の存在を示すアンプリコンを生成することができる。いくつかの実施形態では、アンプリコンの長さは、プライマー対に1ヌクレオチド塩基対を合わせた長さからDNA増幅プロトコルにより生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの範囲であってよい。この距離は、1ヌクレオチド塩基対から増幅反応の限界、または約2万ヌクレオチド塩基対までの範囲であることができる。任意選択で、プライマー対は、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている位置、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、または配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失と、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている位置、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失、または配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドの欠失の各側の少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、またはそれ以上のヌクレオチドと、を含む領域に隣接する。
いくつかの実施形態では、生体試料内のGPR75核酸分子(ゲノム核酸分子、mRNA分子、もしくはcDNA分子)またはその相補体が、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入(ゲノム核酸分子)、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入、または配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入(mRNA分子の場合);配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入(cDNA分子の場合)を含むヌクレオチド配列を含むか否かを判定するために、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入に隣接する5’隣接配列に由来する第1のプライマーと、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入に隣接する3’隣接配列に由来する第2のプライマーとを含むプライマー対を使用した増幅方法に生体試料を供して、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入の存在を示すアンプリコンを生成することができる。いくつかの実施形態では、アンプリコンの長さは、プライマー対に1ヌクレオチド塩基対を合わせた長さからDNA増幅プロトコルにより生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの範囲であってよい。この距離は、1ヌクレオチド塩基対から増幅反応の限界、または約2万ヌクレオチド塩基対までの範囲であることができる。任意選択で、プライマー対は、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含む位置と、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含む位置の各側の少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、またはそれ以上のヌクレオチドと、を含む領域に隣接する。
いくつかの実施形態では、生体試料内のGPR75核酸分子(ゲノム核酸分子、mRNA分子、もしくはcDNA分子)またはその相補体が、配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニン(ゲノム核酸分子)、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニン、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニン、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニン、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニン(mRNA分子の場合);配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニン、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニン、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニン、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニン(cDNA分子の場合)を含むヌクレオチド配列を含むか否かを判定するために、配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニン、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニン、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニン、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニン、配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニン、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニン、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニン、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニン、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンに隣接する5’隣接配列に由来する第1のプライマーと、配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニン、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニン、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニン、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニン、配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニン、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニン、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニン、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニン、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンに隣接する3’隣接配列に由来する第2のプライマーとを含むプライマー対を使用した増幅方法に生体試料を供して、配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンの挿入、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニン、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニン、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニン、配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニン、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニン、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニン、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニン、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンの存在を示すアンプリコンを生成することができる。いくつかの実施形態では、アンプリコンの長さは、プライマー対に1ヌクレオチド塩基対を合わせた長さからDNA増幅プロトコルにより生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの範囲であってよい。この距離は、1ヌクレオチド塩基対から増幅反応の限界、または約2万ヌクレオチド塩基対までの範囲であることができる。任意選択で、プライマー対は、配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンの挿入、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニン、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニン、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニン、配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニン、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニン、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニン、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニン、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む位置と、配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニン、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニン、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニン、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニン、配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニン、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニン、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニン、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニン、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む位置の各側の少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、またはそれ以上のヌクレオチドと、を含む領域に隣接する。
同様のアンプリコンを、mRNA配列及び/またはcDNA配列から作製することができる。PCRプライマー対は、既知の配列から、例えば、Vector NTIバージョン10(Informax Inc.,Bethesda Md.)、PrimerSelect(DNASTAR Inc.,Madison,Wis.)、及びPrimer3(バージョン0.4.0.COPYRGT.,1991,Whitehead Institute for Biomedical Research,Cambridge,Mass.)におけるPCRプライマー解析ツールなどの、その目的のために意図されたコンピュータプログラムを使用することにより、誘導することができる。加えて、配列は、既知のガイドラインを使用して、目視で精査し、プライマーを手作業で特定することができる。
核酸シーケンシング技術の実例としては、連鎖停止(サンガー)シーケンシング及びダイターミネーターシーケンシングが挙げられるが、これらに限定されない。他の方法には、精製DNA、増幅DNA、及び固定細胞標本に対する標識プライマーまたはプローブの使用(蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH))を含む、シーケンシング以外の核酸ハイブリダイゼーション法が含まれる。いくつかの方法では、標的核酸分子を、検出の前に、検出と同時に増幅することができる。核酸増幅技術の実例としては、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、リガーゼ連鎖反応(LCR)、鎖置換型増幅法(SDA)、及び核酸配列ベースの増幅法(NASBA)が挙げられるが、これらに限定されない。他の方法としては、リガーゼ連鎖反応、鎖置換型増幅法、及び高温SDA(tSDA)が挙げられるが、これらに限定されない。
ハイブリダイゼーション技術では、プローブまたはプライマーがその標的と特異的にハイブリダイズするように、ストリンジェントな条件が用いられ得る。いくつかの実施形態では、ストリンジェントな条件下でのポリヌクレオチドのプライマーまたはプローブは、その標的配列と、他の非標的配列よりも高く検出可能な程度で、例えば、バックグラウンドに対して少なくとも2倍、少なくとも3倍、少なくとも4倍、またはそれ以上(バックグラウンドに対して10倍超を含む)でハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、ストリンジェントな条件下でのポリヌクレオチドのプライマーまたはプローブは、その標的ヌクレオチド配列と、他のヌクレオチド配列よりも少なくとも2倍高く検出可能な程度でハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、ストリンジェントな条件下でのポリヌクレオチドのプライマーまたはプローブは、その標的ヌクレオチド配列と、他のヌクレオチド配列よりも少なくとも3倍高く検出可能な程度でハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、ストリンジェントな条件下でのポリヌクレオチドのプライマーまたはプローブは、その標的ヌクレオチド配列と、他のヌクレオチド配列よりも少なくとも4倍高く検出可能な程度でハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、ストリンジェントな条件下でのポリヌクレオチドのプライマーまたはプローブは、その標的ヌクレオチド配列と、他のヌクレオチド配列よりも高く検出可能な程度(バックグラウンドに対して10倍超)でハイブリダイズする。ストリンジェントな条件は配列依存的であり、状況によって異なる。
DNAハイブリダイゼーションを促進する適切なストリンジェンシー条件、例えば、約45℃での6×塩化ナトリウム/クエン酸ナトリウム(SSC)、その後の50℃での2×SSCの洗浄は、公知であるか、またはCurrent Protocols in Molecular Biology,John Wiley & Sons,N.Y.(1989),6.3.1-6.3.6に見出すことができる。典型的には、ハイブリダイゼーション及び検出のためのストリンジェントな条件は、塩濃度が、pH7.0~8.3においてNa+イオン約1.5M未満、典型的にはNa+イオン濃度(またはその他の塩)約0.01~1.0Mであり、温度が、短いプローブ(例えば10~50ヌクレオチドなど)では少なくとも約30℃、それよりも長いプローブ(例えば50ヌクレオチド超など)では少なくとも約60℃である条件となる。ストリンジェントな条件は、ホルムアミドなどの脱安定化剤を添加することにより達成することもできる。任意選択で、洗浄緩衝液は、約0.1%~約1%のSDSを含んでもよい。ハイブリダイゼーションの持続時間は一般に、約24時間未満、通常は約4~約12時間である。洗浄の持続期間は、少なくとも、平衡に達するのに十分な長さの時間である。
本開示はまた、ヒトGPR75の予測される機能喪失ポリペプチドの存在を検出する方法であって、対象から得た生体試料でアッセイを実施し、対象のGPR75ポリペプチドが、ポリペプチドが機能喪失(部分的もしくは完全)または予測される機能喪失(部分的もしくは完全)を有する原因となる1つ以上の変異を含むか否かを判定することを含む方法を提供する。GPR75の予測される機能喪失ポリペプチドは、本明細書に記載されているGPR75バリアントポリペプチドのいずれかであり得る。いくつかの実施形態では、本方法は、GPR75 Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs、またはCys400fsの存在を検出する。いくつかの実施形態では、本方法は、Lys404*、Ser219fs、またはc.-110+1G>Aの存在を検出する。
いくつかの実施形態では、本方法は、対象から得た試料でアッセイを実施して、試料中のGPR75ポリペプチドが配列番号56に記載のアミノ酸110~130を含むか否かを判定することを含む。いくつかの実施形態では、本方法は、対象から得た試料でアッセイを実施して、試料中のGPR75ポリペプチドが配列番号57に記載の116位に対応する位置のトレオニンを含むか否かを判定することを含む。いくつかの実施形態では、本方法は、対象から得た試料でアッセイを実施して、試料中のGPR75ポリペプチドが配列番号58に記載の233位に対応する位置で終止するか否かを判定することを含む。いくつかの実施形態では、本方法は、対象から得た試料でアッセイを実施して、試料中のGPR75ポリペプチドが配列番号59に記載のアミノ酸236~239を含むか否かを判定することを含む。いくつかの実施形態では、本方法は、対象から得た試料でアッセイを実施して、試料中のGPR75ポリペプチドが配列番号60に記載のアミノ酸400~425を含むか否かを判定することを含む。いくつかの実施形態では、本方法は、対象から得た試料でアッセイを実施して、試料中のGPR75ポリペプチドが配列番号108に記載の207位に対応する位置のシステインを含むか否かを判定することを含む。
いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号56または配列番号55に記載の110~130位のいずれか1つ以上に対応する位置を含むポリペプチドの少なくとも一部分を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号57または配列番号55に記載の116位に対応する位置を含むポリペプチドの少なくとも一部分を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号55に記載の234~540位のいずれかに対応する位置を含むポリペプチドの少なくとも一部分を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号59または配列番号55に記載の236~239位のいずれか1つ以上に対応する位置を含むポリペプチドの少なくとも一部分を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号60または配列番号55に記載の400~425位のいずれか1つ以上に対応する位置を含むポリペプチドの少なくとも一部分を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号108に記載の207位に対応する位置を含むポリペプチドの少なくとも一部分を配列決定することを含む。
いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号56または配列番号55に記載の110~130位のいずれか1つ以上に対応する位置を含むポリペプチドの存在を検出するためのイムノアッセイを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号57または配列番号55に記載の116位に対応する位置を含むポリペプチドの存在を検出するためのイムノアッセイを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号55に記載の234~540位のいずれかに対応する位置を含むポリペプチドの存在を検出するためのイムノアッセイを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号59または配列番号55に記載の236~239位のいずれか1つ以上に対応する位置を含むポリペプチドの存在を検出するためのイムノアッセイを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号60または配列番号55に記載の400~425位のいずれか1つ以上に対応する位置を含むポリペプチドの存在を検出するためのイムノアッセイを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号108または配列番号55に記載の207位に対応する位置を含むポリペプチドの存在を検出するためのイムノアッセイを含む。
いくつかの実施形態では、対象がGPR75の予測される機能喪失ポリペプチドを有していない場合、対象は、肥満、あるいは過体重、BMI上昇、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積の上昇及び/または過剰食物摂取のいずれかを発症するリスクが高い。いくつかの実施形態では、対象がGPR75の予測される機能喪失ポリペプチドを有する場合、対象は、肥満、あるいは過体重、BMI上昇、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積の上昇及び/または過剰食物摂取のいずれかを発症するリスクが低い。
本開示はまた、GPR75バリアントゲノム核酸分子、GPR75バリアントmRNA分子、及び/またはGPR75バリアントcDNA分子(例えば、本明細書で開示されるゲノムバリアント核酸分子、mRNAバリアント分子、及びcDNAバリアント分子のいずれか)とハイブリダイズする単離された核酸分子も提供する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、または配列番号50に記載の600~606位に対応する位置を含むGPR75核酸分子の一部分とハイブリダイズする。
いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号3に記載の5,557位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、または配列番号51に記載の617位に対応する位置を含むGPR75核酸分子の一部分とハイブリダイズする。
いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号4に記載の5,911位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、または配列番号52に記載の971位に対応する位置を含むGPR75核酸分子の一部分とハイブリダイズする。
いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、または配列番号53に記載の980~983位に対応する位置を含むGPR75核酸分子の一部分とハイブリダイズする。
いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号6に記載の6,411位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置を含むGPR75核酸分子の一部分とハイブリダイズする。
いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号99に記載の5,831位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、配列番号103に記載の891位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応する位置を含むGPR75核酸分子の一部分とハイブリダイズする。
いくつかの実施形態では、そのような単離された核酸分子は、少なくとも約5、少なくとも約8、少なくとも約10、少なくとも約11、少なくとも約12、少なくとも約13、少なくとも約14、少なくとも約15、少なくとも約16、少なくとも約17、少なくとも約18、少なくとも約19、少なくとも約20、少なくとも約21、少なくとも約22、少なくとも約23、少なくとも約24、少なくとも約25、少なくとも約30、少なくとも約35、少なくとも約40、少なくとも約45、少なくとも約50、少なくとも約55、少なくとも約60、少なくとも約65、少なくとも約70、少なくとも約75、少なくとも約80、少なくとも約85、少なくとも約90、少なくとも約95、少なくとも約100、少なくとも約200、少なくとも約300、少なくとも約400、少なくとも約500、少なくとも約600、少なくとも約700、少なくとも約800、少なくとも約900、少なくとも約1000、少なくとも約2000、少なくとも約3000、少なくとも約4000、または少なくとも約5000ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、そのような単離された核酸分子は、少なくとも約5、少なくとも約8、少なくとも約10、少なくとも約11、少なくとも約12、少なくとも約13、少なくとも約14、少なくとも約15、少なくとも約16、少なくとも約17、少なくとも約18、少なくとも約19、少なくとも約20、少なくとも約21、少なくとも約22、少なくとも約23、少なくとも約24、または少なくとも約25ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、少なくとも約18ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、少なくとも約15ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約10~約35、約10~約30、約10~約25、約12~約30、約12~約28、約12~約24、約15~約30、約15~約25、約18~約30、約18~約25、約18~約24、または約18~約22ヌクレオチドからなるかまたはそれを含む。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約18~約30ヌクレオチドからなるかまたはそれを含む。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、少なくとも約15ヌクレオチド~少なくとも約35ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、そのような単離された核酸分子は、ストリンジェントな条件下でGPR75バリアント核酸分子(例えば、ゲノム核酸分子、mRNA分子、及び/またはcDNA分子)とハイブリダイズする。そのような核酸分子は、例えば、本明細書に記載または例示されているようなプローブ、プライマー、変化特異的プローブ、または変化特異的プライマーとして使用することができ、これには、各々が本明細書の他の箇所で詳述されているプライマー、プローブ、アンチセンスRNA、shRNA、及びsiRNAが限定されることなく含まれ、それらは、本明細書に記載される方法のいずれにおいても使用することができる。
いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、GPR75バリアントゲノム核酸分子、GPR75バリアントmRNA分子、及び/またはGPR75バリアントcDNA分子と少なくとも約70%、少なくとも約75%、少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、または100%同一である核酸分子の少なくとも約15の連続するヌクレオチドとハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約15~約100ヌクレオチド、もしくは約15~約35ヌクレオチドからなるかまたはそれを含む。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約15~約100ヌクレオチドからなるかまたはそれを含む。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約15~約35ヌクレオチドからなるかまたはそれを含む。
いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約15ヌクレオチドを含み、この変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含み、この一部分は、配列番号2に記載の5,540~5,546位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号11に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号16に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号21に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号26に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号35に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号40に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号45に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号50に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体を含む。
いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約15ヌクレオチドを含み、この変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含み、この一部分は、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号12に記載の556位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号17に記載の457位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号22に記載の378位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号27に記載の617位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号36に記載の556位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号41に記載の457位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号46に記載の378位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号51に記載の617位に対応する位置もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号3に記載の5,557~5,559位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号12に記載の556~558位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号17に記載の457~459位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号22に記載の378~380位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号27に記載の617~619位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号36に記載の556~558位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号41に記載の457~459位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号46に記載の378~380位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号51に記載の617~619位に対応する位置もしくはその相補体を含むヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約15ヌクレオチドを含み、この変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含み、この一部分は、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号13に記載の910位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号18に記載の811位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号23に記載の732位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号28に記載の971位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号37に記載の910位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号42に記載の811位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号47に記載の732位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号52に記載の971位に対応する位置もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号4に記載の5,911~5,913位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号13に記載の910~912位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号18に記載の811~813位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号23に記載の732~734位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号28に記載の971~973位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号37に記載の910~912位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号42に記載の811~813位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号47に記載の732~734位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号52に記載の971~973位に対応する位置もしくはその相補体を含むヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約15ヌクレオチドを含み、この変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含み、この一部分は、配列番号5に記載の5,920~5,923位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号14に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号19に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号24に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号29に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号38に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号43に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号48に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号53に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体を含む。
いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約15ヌクレオチドを含み、この変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含み、この一部分は、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体を含む。
いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約15ヌクレオチドを含み、この変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含み、この一部分は、配列番号99に記載の5,831位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号100に記載の830位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号101に記載の731位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号102に記載の652位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号103に記載の891位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号104に記載の830位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号105に記載の731位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号106に記載の652位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号107に記載の891位に対応する位置もしくはその相補体を含む。
いくつかの実施形態では、変化特異的プローブ及び変化特異的プライマーは、DNAを含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブ及び変化特異的プライマーは、RNAを含む。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプローブ及びプライマー(変化特異的プローブ及び変化特異的プライマーを含む)は、本明細書に開示される核酸分子のいずれか、またはその相補体と特異的にハイブリダイズするヌクレオチド配列を有する。いくつかの実施形態では、プローブ及びプライマーは、本明細書に開示される核酸分子のいずれかとストリンジェントな条件下で特異的にハイブリダイズする。
いくつかの実施形態では、変化特異的プライマーを含め、プライマーは、第二世代シーケンシングまたはハイスループットシーケンシングで使用することができる。場合によっては、変化特異的プライマーを含め、プライマーは、修飾することができる。特に、プライマーは、例えば、超並列シグネチャーシーケンシング(MPSS)、Polonyシーケンシング、及び454パイロシーケンシングの様々なステップにおいて使用される様々な修飾を含み得る。修飾プライマーは、クローニングステップにおけるビオチン化プライマー、ならびにビーズ充填ステップ及び検出ステップにおいて使用される蛍光標識プライマーを含め、プロセスのうちのいくつかのステップにおいて使用することができる。Polonyシーケンシングは、一般に、DNA鋳型の各分子が約135bp長であるペアエンドタグライブラリを使用して実施される。ビオチン化プライマーは、ビーズ充填ステップ及びエマルションPCRにて使用される。蛍光標識した縮重ノナマーオリゴヌクレオチドは、検出ステップにて使用される。アダプターは、ストレプトアビジンでコートしたビーズ上へのDNAライブラリの固定用に5’-ビオチンタグを含み得る。
本明細書に記載のプローブ及びプライマーを使用して、本明細書で開示されるGPR75バリアントゲノム核酸分子、GPR75バリアントmRNA分子、及び/またはGPR75バリアントcDNA分子のいずれかの範囲内でヌクレオチド変異を検出することができる。本明細書に記載のプライマーを使用して、GPR75バリアントゲノム核酸分子、GPR75バリアントmRNA分子、もしくはGPR75バリアントcDNA分子、またはそれらの断片を増幅することができる。
本開示との関連において、「特異的にハイブリダイズする」とは、プローブまたはプライマー(例えば、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーなど)が、GPR75参照ゲノム核酸分子、GPR75参照mRNA分子、及び/またはGPR75参照cDNA分子をコードする核酸配列とはハイブリダイズしないことを意味する。
いくつかの実施形態では、プローブ(例えば、変化特異的プローブなど)は標識を含む。いくつかの実施形態では、標識は、蛍光標識、放射標識、またはビオチンである。
本開示はまた、本明細書に開示されるプローブのうちのいずれか1つ以上が結合している基質を含む支持体も提供する。固体支持体は、本明細書に開示されるプローブのいずれかなどの分子が会合することのできる固体状態の基質または支持体である。固体支持体の一形態は、アレイである。固体支持体の別の形態は、アレイ検出器である。アレイ検出器は、複数の異なるプローブが、アレイ状、格子状、または他の組織化されたパターンで連結されている固体支持体である。固体状態の基質の一形態は、標準的な96ウェル型などのマイクロタイターディッシュである。いくつかの実施形態では、ウェルあたり1アレイが通常含まれているマルチウェルスライドガラスを用いることができる。
本開示はまた、本明細書に開示されるプローブのうちのいずれか1つ以上が結合している基質を含む支持体も提供する。固体支持体は、本明細書に開示されるプローブのいずれかなどの分子が会合することのできる固体状態の基質または支持体である。固体支持体の一形態は、アレイである。固体支持体の別の形態は、アレイ検出器である。アレイ検出器は、複数の異なるプローブが、アレイ状、格子状、または他の組織化されたパターンで連結されている固体支持体である。固体状態の基質の一形態は、標準的な96ウェル型などのマイクロタイターディッシュである。いくつかの実施形態では、ウェルあたり1アレイが通常含まれているマルチウェルスライドガラスを用いることができる。
本開示はまた、本明細書に記載のGタンパク質共役受容体75核酸分子(ゲノム核酸分子、mRNA分子、もしくはcDNA分子)またはその相補体のいずれかと、本明細書に記載の変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブのいずれかとを含むかまたはそれらからなる分子複合体も提供する。いくつかの実施形態では、分子複合体中のGPR75核酸分子(ゲノム核酸分子、mRNA分子、もしくはcDNA分子)またはその相補体は、一本鎖である。いくつかの実施形態では、GPR75核酸分子は、本明細書に記載のゲノム核酸分子のいずれかである。いくつかの実施形態では、GPR75核酸分子は、本明細書に記載のmRNA分子のいずれかである。いくつかの実施形態では、GPR75核酸分子は、本明細書に記載のcDNA分子のいずれかである。いくつかの実施形態では、分子複合体は、本明細書に記載のGPR75核酸分子(ゲノム核酸分子、mRNA分子、もしくはcDNA分子)またはその相補体のいずれかと、本明細書に記載の変化特異的プライマーのいずれかとを含むかまたはそれらからなる。いくつかの実施形態では、分子複合体は、本明細書に記載のGPR75核酸分子(ゲノム核酸分子、mRNA分子、もしくはcDNA分子)またはその相補体のいずれかと、本明細書に記載の変化特異的プローブのいずれかとを含むかまたはそれらからなる。
いくつかの実施形態では、分子複合体は、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むゲノム核酸分子とハイブリダイズした変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含むかまたはそれからなり、この変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブは、配列番号2に記載の5,539~5,540位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体において、配列番号5に記載の5,919~5,920位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体において、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、ゲノム核酸分子とハイブリダイズしている。
いくつかの実施形態では、分子複合体は、配列番号3に記載の5,557~5,559位に対応する位置のACTコドン、配列番号4に記載の5,911~5,913位に対応する位置のTAAコドン、または配列番号99に記載の5,830~5,832位に対応する位置のTGTコドンにおいてゲノム核酸分子とハイブリダイズしている変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、分子複合体は、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、または配列番号99を含むゲノム核酸分子とハイブリダイズした変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、分子複合体は、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むmRNA分子とハイブリダイズした変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含むかまたはそれからなり、この変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブは、配列番号11に記載の538~539位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号16に記載の439~440位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号21に記載の360~361位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号26に記載の599~600位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号14に記載の918~919位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号19に記載の819~820位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号24に記載の740~741位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号29に記載の979~980位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシル、その相補体において、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、mRNA分子とハイブリダイズしている。
いくつかの実施形態では、分子複合体は、配列番号12に記載の556~558位に対応する位置のACUコドン、配列番号17に記載の457~459位に対応する位置のACUコドン、配列番号22に記載の378~380位に対応する位置のACUコドン、配列番号27に記載の617~619位に対応する位置のACUコドン、配列番号13に記載の910~912位に対応する位置のUAAコドン、配列番号18に記載の811~813位に対応する位置のUAAコドン、配列番号23に記載の732~734位に対応する位置のUAAコドン、配列番号28に記載の971~973位に対応する位置のUAAコドン、配列番号100に記載の829~831位に対応する位置のUGUコドン、配列番号101に記載の730~732位に対応する位置のUGUコドン、配列番号102に記載の651~653位に対応する位置のUGUコドン、または配列番号103に記載の890~892位に対応する位置のUGUコドンにおいてmRNA分子とハイブリダイズしている変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、分子複合体は、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号100、配列番号101、配列番号102、または配列番号103を含むmRNA分子とハイブリダイズした変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、分子複合体は、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むcDNA分子とハイブリダイズした変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含むかまたはそれからなり、この変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブは、配列番号35に記載の538~539位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号40に記載の439~440位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号45に記載の360~361位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号50に記載の599~600位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体において、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体において、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体において、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体において、配列番号38に記載の918~919位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号43に記載の819~820位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号48に記載の740~741位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号53に記載の979~980位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体において、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体において、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体において、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体において、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、cDNA分子とハイブリダイズしている。
いくつかの実施形態では、分子複合体は、配列番号36に記載の556~558位に対応する位置のACTコドン、配列番号41に記載の457~459位に対応する位置のACTコドン、配列番号46に記載の378~380位に対応する位置のACTコドン、配列番号51に記載の617~619位に対応する位置のACTコドン、配列番号37に記載の910~912位に対応する位置のTAAコドン、配列番号42に記載の811~813位に対応する位置のTAAコドン、配列番号47に記載の732~734位に対応する位置のTAAコドン、配列番号52に記載の971~973位に対応する位置のTAAコドン、配列番号104に記載の829~831位に対応する位置のTGTコドン、配列番号105に記載の730~732位に対応する位置のTGTコドン、配列番号106に記載の651~653位に対応する位置のTGTコドン、または配列番号107に記載の890~892位に対応する位置のTGTコドンにおいてcDNA分子とハイブリダイズしている変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、分子複合体は、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、または配列番号54、配列番号104、配列番号105、配列番号106、または配列番号107を含むcDNA分子とハイブリダイズした変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、分子複合体は、標識を含む変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーを含む。いくつかの実施形態では、標識は、蛍光標識、放射標識、またはビオチンである。いくつかの実施形態では、分子複合体は、非ヒトポリメラーゼを更に含む。
本開示はまた、ヒトGPR75バリアントポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を提供する。いくつかの実施形態では、GPR75バリアントポリペプチドは、配列番号56に記載の110位に対応する位置またはその相補体から始まるフレームシフトを含む。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号56に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号56に記載の110位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号56に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号56に記載の110位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号56に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号56に記載の110位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号56に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号56に記載の110位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号56に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号56に記載の110位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号56に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号56に記載の110位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号56を含むGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号56からなるGPR75バリアントポリペプチドをコードする。これらの核酸分子の各々は、配列番号55に記載の110~540位に対応する位置のアミノ酸を欠いているGPR75ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、これらの核酸分子の各々は、配列番号56に記載の110~130位に対応する位置のアミノ酸を含むGPR75ポリペプチドをコードする。
いくつかの実施形態では、GPR75バリアントポリペプチドは、配列番号57に記載の116位に対応する位置のトレオニンまたはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号57に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号57に記載の116位に対応する位置のトレオニンを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号57に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号57に記載の116位に対応する位置のトレオニンを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号57に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号57に記載の116位に対応する位置のトレオニンを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号57に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号57に記載の116位に対応する位置のトレオニンを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号57に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号57に記載の116位に対応する位置のトレオニンを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号57に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号57に記載の116位に対応する位置のトレオニンを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号57を含むGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号57からなるGPR75バリアントポリペプチドをコードする。
いくつかの実施形態では、GPR75バリアントポリペプチドは、配列番号58に記載の233位に対応する位置またはその相補体で終止する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号58に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号58に記載の233位に対応する位置で終止する、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号58に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号58に記載の233位に対応する位置で終止する、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号58に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号58に記載の233位に対応する位置で終止する、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号58に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号58に記載の233位に対応する位置で終止する、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号58に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号58に記載の233位に対応する位置で終止する、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号58に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号58に記載の233位に対応する位置で終止する、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号58を含むGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号58からなるGPR75バリアントポリペプチドをコードする。
いくつかの実施形態では、GPR75バリアントポリペプチドは、配列番号59に記載の236位に対応する位置またはその相補体から始まるフレームシフトを含む。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号59に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号59に記載の236位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号59に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号59に記載の236位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号59に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号59に記載の236位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号59に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号59に記載の236位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号59に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号59に記載の236位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号59に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号59に記載の236位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号59を含むGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号59からなるGPR75バリアントポリペプチドをコードする。これらの核酸分子の各々は、配列番号55に記載の236~540位に対応する位置のアミノ酸を欠いているGPR75ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、これらの核酸分子の各々は、配列番号59に記載の236~239位に対応する位置のアミノ酸を含むGPR75ポリペプチドをコードする。
いくつかの実施形態では、GPR75バリアントポリペプチドは、配列番号60に記載の400位に対応する位置またはその相補体から始まるフレームシフトを含む。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号60に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号60に記載の400位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号60に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号60に記載の400位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号60に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号60に記載の400位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号60に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号60に記載の400位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号60に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号60に記載の400位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号60に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号60に記載の400位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号60を含むGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号60からなるGPR75バリアントポリペプチドをコードする。これらの核酸分子の各々は、配列番号55に記載の400~540位に対応する位置のアミノ酸を欠いているGPR75ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、これらの核酸分子の各々は、配列番号60に記載の400~425位に対応する位置のアミノ酸を含むGPR75ポリペプチドをコードする。
いくつかの実施形態では、GPR75バリアントポリペプチドは、配列番号108に記載の207位に対応する位置のシステインまたはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号108に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号108に記載の207位に対応する位置のシステインを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号108に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号108に記載の207位に対応する位置のシステインを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号108に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号108に記載の207位に対応する位置のシステインを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号108に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号108に記載の207位に対応する位置のシステインを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号108に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号108に記載の207位に対応する位置のシステインを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号108に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号108に記載の207位に対応する位置のシステインを含む、アミノ酸配列を有するGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号108を含むGPR75バリアントポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号108からなるGPR75バリアントポリペプチドをコードする。
GPR75参照ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列は、配列番号1に示されている。ENSG00000119737.6、hg38 chr2:53,852,912-53,859,967も参照されたい。配列番号1を参照すると、5,540~5,546位はCCAGTAGヘプタヌクレオチドである。配列番号1を参照すると、5,557位はグアニンである。配列番号1を参照すると、5,911位はシトシンである。配列番号1を参照すると、5,920~5,923位はAAAGテトラヌクレオチドである。配列番号1を参照すると、6,411位はシトシンである。配列番号1を参照すると、5,831位はアデニンである。
GPR75のバリアントゲノム核酸分子が存在し、(配列番号1を参照すると)5,540~5,546位のCCAGTAGヘプタヌクレオチドが欠失している。このGPR75バリアントゲノム核酸分子のヌクレオチド配列は、配列番号2に示されている。
GPR75の別のバリアントゲノム核酸分子が存在し、(配列番号1を参照すると)5,557位のグアニンがアデニンに置き換えられている。このGPR75バリアントゲノム核酸分子のヌクレオチド配列は、配列番号3に示されている。
GPR75の別のバリアントゲノム核酸分子が存在し、(配列番号1を参照すると)5,911位のシトシンがチミンに置き換えられている。このGPR75バリアントゲノム核酸分子のヌクレオチド配列は、配列番号4に示されている。
GPR75の別のバリアントゲノム核酸分子が存在し、(配列番号1を参照すると)5,920~5,923位のAAAGテトラヌクレオチドが欠失している。このGPR75バリアントゲノム核酸分子のヌクレオチド配列は、配列番号5に示されている。
GPR75の別のバリアントゲノム核酸分子が存在し、(配列番号1を参照すると)6,411位にチミンが挿入されている。このGPR75バリアントゲノム核酸分子のヌクレオチド配列は、配列番号6に示されている。
GPR75の別のバリアントゲノム核酸分子が存在し、(配列番号1を参照すると)5,831位のアデニンがグアニンに置き換えられている。このGPR75バリアントゲノム核酸分子のヌクレオチド配列は、配列番号99に示されている。
GPR75の別のバリアントゲノム核酸分子が存在し、第2染色体の53,853,547位(GRCh38/hg38(2013年12月)ヒトゲノムアセンブリに準拠)のチミンがアデニンに置き換えられて、Lys404*となっている。配列番号1を参照すると、この変異は、(コード鎖の6,421~6,423位のコドンにおける)AAGからTAGである。本明細書に記載のバリアントのいずれかに関する本明細書に記載の方法の各々は、この追加のバリアント(すなわち、ゲノム分子、mRNA分子、及びcDNA分子)でも同様に行うことができる。
GPR75の別のバリアントゲノム核酸分子が存在し、第2染色体の53,854,099位(GRCh38/hg38(2013年12月)ヒトゲノムアセンブリに準拠)から始まるCAGがシトシンに置き換えられて、Ser219fsとなっている。配列番号1を参照すると、この変異は、(コード鎖の5,869~5,871位における)GTCからGである。本明細書に記載のバリアントのいずれかに関する本明細書に記載の方法の各々は、この追加のバリアント(すなわち、ゲノム分子、mRNA分子、及びcDNA分子)でも同様に行うことができる。
GPR75の別のバリアントゲノム核酸分子が存在し、第2染色体の53,859,827位(GRCh38/hg38(2013年12月)ヒトゲノムアセンブリに準拠)のシトシンがチミンに置き換えられており(c.-110+1G>Aと指定されたcDNAを有する)、これは開始コドンの110塩基上流にあるスプライスドナー部位変異である。配列番号1を参照すると、この変異は、(コード鎖の141位における)GからAである。本明細書に記載のバリアントのいずれかに関する本明細書に記載の方法の各々は、この追加のバリアント(すなわち、ゲノム分子、mRNA分子、及びcDNA分子)でも同様に行うことができる。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる、単離されたゲノム核酸分子を提供する。いくつかの実施形態では、ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列は、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている。一例は、配列番号2に示されている。
いくつかの実施形態では、ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列は、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている。一例は、配列番号5に示されている。
いくつかの実施形態では、ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列は、配列番号1に記載の6,411位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む。一例は、配列番号6に示されている。
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号2に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号2に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号2に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号2に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号2に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号2に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号5に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号5に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号5に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号5に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号5に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号5に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号6に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号6に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号6に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号6に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号6に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号6に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号99に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンまたはその相補体を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号99に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンまたはその相補体を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号99に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンまたはその相補体を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号99に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンまたはその相補体を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号99に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンまたはその相補体を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号99に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンまたはその相補体を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号2を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号2からなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号3を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号3からなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号4を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号4からなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号5を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号5からなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号6を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号6からなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号99を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号99からなる。
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号2を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号2からなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号3を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号3からなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号4を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号4からなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号5を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号5からなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号6を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号6からなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号99を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号99からなる。
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ゲノムDNA配列全体よりも少ない配列を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、本明細書に開示されるGPR75ゲノム核酸分子のいずれかの、少なくとも約15、少なくとも約20、少なくとも約25、少なくとも約30、少なくとも約35、少なくとも約40、少なくとも約45、少なくとも約50、少なくとも約60、少なくとも約70、少なくとも約80、少なくとも約90、少なくとも約100、少なくとも約200、少なくとも約300、少なくとも約400、少なくとも約500、少なくとも約600、少なくとも約700、少なくとも約800、少なくとも約900、少なくとも約1000、少なくとも約2000、少なくとも約3000、少なくとも約4000、少なくとも約5000、少なくとも約6000、少なくとも約7000、少なくとも約8000、少なくとも約9000、または少なくとも約10000の連続するヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、本明細書に開示されるGPR75ゲノム核酸分子のいずれかの、少なくとも約1000~少なくとも約2000の連続するヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、これらの単離されたゲノム核酸分子は、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている。いくつかの実施形態では、これらの単離されたゲノム核酸分子は、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている。いくつかの実施形態では、これらの単離されたゲノム核酸分子は、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含む。
GPR75参照mRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号7に示されている。配列番号7を参照すると、539~545位はCCAGUAGヘプタヌクレオチドである。配列番号7を参照すると、566位はグアニンである。配列番号7を参照すると、910位はシトシンである。配列番号7を参照すると、919~922位はAAAGテトラヌクレオチドである。配列番号7を参照すると、1,410位はシトシンである。配列番号7を参照すると、830位はアデニンである。
別のGPR75参照mRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号8に示されている。配列番号8を参照すると、440~446位はCCAGUAGヘプタヌクレオチドである。配列番号8を参照すると、457位はグアニンである。配列番号8を参照すると、811位はシトシンである。配列番号8を参照すると、820~823位はAAAGテトラヌクレオチドである。配列番号8を参照すると、1,311位はシトシンである。配列番号8を参照すると、731位はアデニンである。
別のGPR75参照mRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号9に示されている。配列番号9を参照すると、361~367位はCCAGUAGヘプタヌクレオチドである。配列番号9を参照すると、378位はグアニンである。配列番号9を参照すると、732位はシトシンである。配列番号9を参照すると、741~744位はAAAGテトラヌクレオチドである。配列番号9を参照すると、1,232位はシトシンである。配列番号9を参照すると、652位はアデニンである。
別のGPR75参照mRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号10に示されている。配列番号10を参照すると、600~606位はCCAGUAGヘプタヌクレオチドである。配列番号10を参照すると、617位はグアニンである。配列番号10を参照すると、971位はシトシンである。配列番号10を参照すると、980~983位はAAAGテトラヌクレオチドである。配列番号10を参照すると、1,471位はシトシンである。配列番号10を参照すると、891位はアデニンである。
GPR75のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号7を参照すると)539~545位のCCAGUAGヘプタヌクレオチドが欠失している。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号11に示されている。
GPR75の別のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号8を参照すると)440~446位のCCAGUAGヘプタヌクレオチドが欠失している。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号16に示されている。
GPR75の別のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号9を参照すると)361~367位のCCAGUAGヘプタヌクレオチドが欠失している。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号21に示されている。
GPR75の別のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号10を参照すると)600~606位のCCAGUAGヘプタヌクレオチドが欠失している。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号26に示されている。
GPR75のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号7を参照すると)556位のグアニンがアデニンに置き換えられている。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号12に示されている。
GPR75の別のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号8を参照すると)457位のグアニンがアデニンに置き換えられている。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号17に示されている。
GPR75の別のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号9を参照すると)378位のグアニンがアデニンに置き換えられている。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号22に示されている。
GPR75の別のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号10を参照すると)617位のグアニンがアデニンに置き換えられている。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号27に示されている。
GPR75のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号7を参照すると)910位のシトシンがウラシルに置き換えられている。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号13に示されている。
GPR75の別のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号8を参照すると)811位のシトシンがウラシルに置き換えられている。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号18に示されている。
GPR75の別のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号9を参照すると)732位のシトシンがウラシルに置き換えられている。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号23に示されている。
GPR75の別のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号10を参照すると)971位のシトシンがウラシルに置き換えられている。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号28に示されている。
GPR75のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号7を参照すると)919~922位のAAAGテトラヌクレオチドが欠失している。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号14に示されている。
GPR75の別のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号8を参照すると)820~823位のAAAGテトラヌクレオチドが欠失している。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号19に示されている。
GPR75の別のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号9を参照すると)741~744位のAAAGテトラヌクレオチドが欠失している。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号24に示されている。
GPR75の別のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号10を参照すると)980~983位のAAAGテトラヌクレオチドが、欠失したものに置き換えられている。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号29に示されている。
GPR75のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号7を参照すると)1,410位にウラシルが挿入されている。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号15に示されている。
GPR75の別のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号8を参照すると)1,311位にウラシルが挿入されている。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号20に示されている。
GPR75の別のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号9を参照すると)1,232位にウラシルが挿入されている。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号25に示されている。
GPR75の別のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号10を参照すると)1,471位にウラシルが挿入されている。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号30に示されている。
GPR75のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号7を参照すると)830位のアデニンがグアニンに置き換えられている。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号100に示されている。
GPR75の別のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号8を参照すると)731位のアデニンがグアニンに置き換えられている。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号101に示されている。
GPR75の別のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号9を参照すると)652位のアデニンがグアニンに置き換えられている。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号102に示されている。
GPR75の別のバリアントmRNA分子が存在し、(配列番号10を参照すると)891位のアデニンがグアニンに置き換えられている。このGPR75バリアントmRNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号103に示されている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたmRNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている。一例は、配列番号11に示されている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたmRNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている。一例は、配列番号16に示されている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたmRNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている。一例は、配列番号21に示されている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたmRNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている。一例は、配列番号26に示されている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたmRNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている。一例は、配列番号14に示されている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたmRNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている。一例は、配列番号19に示されている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたmRNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている。一例は、配列番号24に示されている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたmRNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている。一例は、配列番号29に示されている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたmRNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたmRNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたmRNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたmRNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む。
いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号11に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号11に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号11に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号11に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号11に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号11に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号16に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号16に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号16に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号16に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号16に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号16に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号7に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号21に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号21に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号21に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号21に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号21に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号21に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号26に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号26に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号26に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号26に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号26に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号26に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号14に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号14に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号14に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号14に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号14に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号14に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号19に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号19に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号19に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号19に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号19に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号19に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号24に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号24に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号24に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号24に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号24に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号24に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号29に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号29に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号29に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号29に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号29に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号29に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号15に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号15に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号15に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号15に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号15に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号15に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号20に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号20に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号20に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号20に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号20に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号20に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号25に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号25に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号25に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号25に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号25に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号25に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号30に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号30に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号30に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号30に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号30に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号30に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号11を含む。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号11からなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号16を含む。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号16からなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号21を含む。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号21からなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号26を含む。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号26からなる。
いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号11を含む。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号11からなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号16を含む。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号16からなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号21を含む。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号21からなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号26を含む。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号26からなる。
いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号14を含む。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号14からなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号19を含む。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号19からなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号24を含む。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号24からなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号29を含む。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号29からなる。
いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号15を含む。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号15からなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号20を含む。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号20からなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号25を含む。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号25からなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号30を含む。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子は、配列番号30からなる。
GPR75参照cDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号31に示されている。配列番号31を参照すると、539~545位はCCAGTAGヘプタヌクレオチドである。配列番号31を参照すると、556位はグアニンである。配列番号31を参照すると、910位はシトシンである。配列番号31を参照すると、919~922位はAAAGテトラヌクレオチドである。配列番号31を参照すると、1,410位はシトシンである。配列番号31を参照すると、830位はアデニンである。
別のGPR75参照cDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号32に示されている。配列番号32を参照すると、440~446位はCCAGTAGヘプタヌクレオチドである。配列番号32を参照すると、457位はグアニンである。配列番号32を参照すると、811位はシトシンである。配列番号32を参照すると、820~823位はAAAGテトラヌクレオチドである。配列番号32を参照すると、1,311位はシトシンである。配列番号32を参照すると、731位はアデニンである。
別のGPR75参照cDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号33に示されている。配列番号33を参照すると、361~367位はCCAGTAGヘプタヌクレオチドである。配列番号33を参照すると、378位はグアニンである。配列番号33を参照すると、732位はシトシンである。配列番号33を参照すると、741~744位はAAAGテトラヌクレオチドである。配列番号33を参照すると、1,232位はシトシンである。配列番号33を参照すると、652位はアデニンである。
別のGPR75参照cDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号34に示されている。配列番号34を参照すると、600~606位はCCAGTAGヘプタヌクレオチドである。配列番号34を参照すると、617位はグアニンである。配列番号34を参照すると、971位はシトシンである。配列番号34を参照すると、980~983位はAAAGテトラヌクレオチドである。配列番号34を参照すると、1,471位はシトシンである。配列番号34を参照すると、891位はアデニンである。
GPR75のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号31を参照すると)539~545位のCCAGTAGヘプタヌクレオチドが欠失している。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号35に示されている。
GPR75の別のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号32を参照すると)440~446位のCCAGTAGヘプタヌクレオチドが欠失している。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号40に示されている。
GPR75の別のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号33を参照すると)361~367位のCCAGTAGヘプタヌクレオチドが欠失している。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号45に示されている。
GPR75の別のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号34を参照すると)600~606位のCCAGTAGヘプタヌクレオチドが欠失している。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号50に示されている。
GPR75のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号31を参照すると)556位のグアニンがアデニンに置き換えられている。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号36に示されている。
GPR75の別のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号32を参照すると)457位のグアニンがアデニンに置き換えられている。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号41に示されている。
GPR75の別のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号33を参照すると)378位のグアニンがアデニンに置き換えられている。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号46に示されている。
GPR75の別のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号34を参照すると)617位のグアニンがアデニンに置き換えられている。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号51に示されている。
GPR75のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号31を参照すると)910位のシトシンがチミンに置き換えられている。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号37に示されている。
GPR75の別のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号32を参照すると)811位のシトシンがチミンに置き換えられている。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号42に示されている。
GPR75の別のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号33を参照すると)732位のシトシンがチミンに置き換えられている。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号47に示されている。
GPR75の別のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号34を参照すると)971位のシトシンがチミンに置き換えられている。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号52に示されている。
GPR75のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号31を参照すると)919~922位のAGCCテトラヌクレオチドが欠失している。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号38に示されている。
GPR75の別のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号32を参照すると)820~823位のAGCCテトラヌクレオチドが欠失している。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号43に示されている。
GPR75の別のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号33を参照すると)741~744位のAGCCテトラヌクレオチドが欠失している。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号48に示されている。
GPR75の別のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号34を参照すると)980~983位のAGCCテトラヌクレオチドが、欠失したものに置き換えられている。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号53に示されている。
GPR75のバリアントcDNA分子が存在し、1,410位にチミンが挿入されている。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号39に示されている。
GPR75の別のバリアントcDNA分子が存在し、1,311位にチミンが挿入されている。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号44に示されている。
GPR75の別のバリアントcDNA分子が存在し、1,232位にチミンが挿入されている。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号49に示されている。
GPR75の別のバリアントcDNA分子が存在し、1,471位にチミンが挿入されている。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号54に示されている。
GPR75のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号31を参照すると)830位のアデニンがグアニンに置き換えられている。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号104に示されている。
GPR75の別のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号32を参照すると)731位のアデニンがグアニンに置き換えられている。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号105に示されている。
GPR75の別のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号33を参照すると)652位のアデニンがグアニンに置き換えられている。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号106に示されている。
GPR75の別のバリアントcDNA分子が存在し、(配列番号34を参照すると)891位のアデニンがグアニンに置き換えられている。このGPR75バリアントcDNA分子のヌクレオチド配列は、配列番号107に示されている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたcDNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている。一例は、配列番号35に示されている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたcDNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている。一例は、配列番号40に示されている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたcDNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号43に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている。一例は、配列番号45に示されている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたcDNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている。一例は、配列番号50に示されている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたcDNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている。一例は、配列番号38に示されている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたcDNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている。一例は、配列番号43に示されている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたcDNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている。一例は、配列番号48に示されている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたcDNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている。一例は、配列番号53に示されている。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたcDNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたcDNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたcDNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む。
本開示はまた、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたcDNA分子も提供し、このヌクレオチド配列は、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む。
いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号35に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号35に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号35に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号35に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号35に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号35に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号40に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号40に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号40に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号40に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号40に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号40に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号45に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号45に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号45に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号45に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号45に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号45に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号50に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号50に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号50に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号50に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号50に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号50に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号38に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号38に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号38に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号38に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号38に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号38に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号43に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号43に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号43に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号43に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号43に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号43に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号48に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号48に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号48に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号48に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号48に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号48に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号53に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号53に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号53に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号53に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号53に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号53に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号39に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号39に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号39に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号39に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号39に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号39に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号44に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号44に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号44に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号44に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号44に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号44に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号49に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号49に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号49に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号49に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号49に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号49に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号54に対して少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有し、かつ配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号54に対して少なくとも約90%の配列同一性を有し、かつ配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号54に対して少なくとも約92%の配列同一性を有し、かつ配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号54に対して少なくとも約94%の配列同一性を有し、かつ配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号54に対して少なくとも約96%の配列同一性を有し、かつ配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号54に対して少なくとも約98%の配列同一性を有し、かつ配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンまたはその相補体の挿入を含む、ヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる。
本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号35を含む。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号35からなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号40を含む。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号40からなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号45を含む。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号45からなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号50を含む。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号50からなる。
いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号35を含む。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号35からなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号40を含む。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号40からなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号45を含む。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号45からなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号50を含む。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号50からなる。
いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号38を含む。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号38からなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号43を含む。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号43からなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号48を含む。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号48からなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号53を含む。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号53からなる。
いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号39を含む。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号39からなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号44を含む。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号44からなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号49を含む。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号49からなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号54を含む。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、配列番号54からなる。
いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子またはcDNA分子は、mRNA配列またはcDNA配列全体よりも少ない配列を含む。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子またはcDNA分子は、本明細書に開示されるGPR75 mRNA分子またはcDNA分子のいずれかの、少なくとも約5、少なくとも約8、少なくとも約10、少なくとも約12、少なくとも約15、少なくとも約20、少なくとも約25、少なくとも約30、少なくとも約35、少なくとも約40、少なくとも約45、少なくとも約50、少なくとも約60、少なくとも約70、少なくとも約80、少なくとも約90、少なくとも約100、少なくとも約200、少なくとも約300、少なくとも約400、少なくとも約500、少なくとも約600、少なくとも約700、少なくとも約800、少なくとも約900、少なくとも約1000、少なくとも約1100、少なくとも約1200、少なくとも約1300、少なくとも約1400、少なくとも約1500、少なくとも約1600、少なくとも約1700、少なくとも約1800、少なくとも約1900、または少なくとも約2000の連続するヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたmRNA分子またはcDNA分子は、本明細書に開示されるGPR75 mRNA分子またはcDNA分子のいずれかの、少なくとも約400~少なくとも約500の連続するヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたcDNA分子は、本明細書に開示されるGPR75 mRNA分子またはcDNA分子のいずれかの、少なくとも約1000~少なくとも約2000の連続するヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、これらの単離されたmRNA分子は、配列番号11に記載の539~545位に対応する位置のUAUCCCGヘプタヌクレオチド、配列番号16に記載の440~446位に対応する位置のUAUCCCGヘプタヌクレオチド、配列番号21に記載の361~367位に対応する位置のUAUCCCGヘプタヌクレオチド、または配列番号26に記載の600~606位に対応する位置のUAUCCCGヘプタヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、これらの単離されたmRNA分子は、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニン、または配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む。いくつかの実施形態では、これらの単離されたmRNA分子は、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシル、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシル、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシル、または配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含む。いくつかの実施形態では、これらの単離されたmRNA分子は、配列番号14に記載の919~922位に対応する位置のAGCCテトラヌクレオチド、配列番号19に記載の820~823位に対応する位置のAGCCテトラヌクレオチド、配列番号24に記載の741~744位に対応する位置のAGCCテトラヌクレオチド、または配列番号29に記載の980~983位に対応する位置のAGCCテトラヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、これらの単離されたmRNA分子は、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入、または配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含む。いくつかの実施形態では、これらの単離されたmRNA分子は、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニン、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニン、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニン、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む。
いくつかの実施形態では、これらの単離されたcDNA分子は、配列番号35に記載の539~545位に対応する位置のTATCCCGヘプタヌクレオチド、配列番号40に記載の440~446位に対応する位置のTATCCCGヘプタヌクレオチド、配列番号45に記載の361~367位に対応する位置のTATCCCGヘプタヌクレオチド、または配列番号50に記載の600~606位に対応する位置のTATCCCGヘプタヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、これらの単離されたcDNA分子は、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニン、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニン、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニン、または配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む。いくつかの実施形態では、これらの単離されたcDNA分子は、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミン、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミン、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミン、または配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含む。いくつかの実施形態では、これらの単離されたcDNA分子は、配列番号38に記載の919~922位に対応する位置のAGCCテトラヌクレオチド、配列番号43に記載の820~823位に対応する位置のAGCCテトラヌクレオチド、配列番号48に記載の741~744位に対応する位置のAGCCテトラヌクレオチド、または配列番号53に記載の980~983位に対応する位置のAGCCテトラヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、これらの単離されたcDNA分子は、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含む。いくつかの実施形態では、これらの単離されたcDNA分子は、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニン、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニン、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニン、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む。
ゲノム核酸分子、mRNA分子、及びcDNA分子は、任意の生物からのものであり得る。例えば、ゲノム核酸分子、mRNA分子、及びcDNA分子は、ヒトであり得るか、または非ヒト哺乳動物、げっ歯類、マウス、もしくはラットなどの別の生物からのオルソログであり得る。集団内の遺伝子配列は、一塩基多型などの多型のために異なり得ることを理解されたい。本明細書で提供される例は、例示的な配列にすぎない。他の配列もまた可能である。
本開示はまた、本明細書に開示される単離されたゲノム核酸分子、mRNA分子、またはcDNA分子のいずれかの断片も提供する。いくつかの実施形態では、断片は、本明細書に開示される核酸分子のいずれかの、少なくとも約5、少なくとも約8、少なくとも約10、少なくとも約11、少なくとも約12、少なくとも約13、少なくとも約14、少なくとも約15、少なくとも約16、少なくとも約17、少なくとも約18、少なくとも約19、少なくとも約20、少なくとも約21、少なくとも約22、少なくとも約23、少なくとも約24、少なくとも約25、少なくとも約30、少なくとも約35、少なくとも約40、少なくとも約45、少なくとも約50、少なくとも約55、少なくとも約60、少なくとも約65、少なくとも約70、少なくとも約75、少なくとも約80、少なくとも約85、少なくとも約90、少なくとも約95、もしくは少なくとも約100の連続する残基、またはその任意の相補体を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、断片は、本明細書に開示される核酸分子のいずれかの、少なくとも約20、少なくとも約25、少なくとも約30、もしくは少なくとも約35の連続する残基、またはその任意の相補体を含むかまたはそれからなる。これに関して、より長い断片が短いものよりも好ましい。そのような断片は、例えば、本明細書に記載または例示されているようなプローブ、プライマー、変化特異的プローブ、または変化特異的プライマーとして使用することができ、これには、各々が本明細書の他の箇所で詳述されているプライマー、プローブ、アンチセンスRNA、shRNA、及びsiRNAが限定されることなく含まれる。
本明細書ではまた、開示されている核酸分子と相互作用することができる機能性ポリヌクレオチドも提供される。機能性ポリヌクレオチドの例としては、アンチセンス分子、アプタマー、リボザイム、三重鎖形成分子、及び外部ガイド配列が挙げられるが、これらに限定されない。機能性ポリヌクレオチドは、標的分子が有する特定の活性のエフェクター、阻害物質、調節因子、及び刺激物質として作用し得るか、または機能性ポリヌクレオチドは、他のいかなる分子とも独立して、デノボ活性を有し得る。
本明細書に開示される単離された核酸分子は、RNA、DNA、またはRNAとDNAの両方を含み得る。単離された核酸分子はまた、異種核酸配列(例えば、ベクター内のもの)または異種標識と連結または融合させることもできる。例えば、本明細書で開示される単離された核酸分子は、単離された核酸分子と異種核酸配列とを含むベクター内に、またはそれらを含む外来性ドナー配列として、存在してもよい。単離された核酸分子は、異種標識に連結または融合させることもできる。標識は、直接検出可能(例えば、フルオロフォアなど)であり得るか、または間接的に検出可能(例えば、ハプテン、酵素、またはフルオロフォアクエンチャーなど)であり得る。そのような標識は、分光学的、光化学的、生化学的、免疫化学的、または化学的な手段によって検出可能であり得る。そのような標識には、例えば、放射標識、顔料、色素、色原体、スピン標識、及び蛍光標識が含まれる。標識は、例えば、化学発光物質、金属含有物質、または酵素でもあり得、酵素の場合、酵素依存性の二次的シグナル発生が生じる。「標識」という用語はまた、コンジュゲート分子に選択的に結合することができ、そのコンジュゲート分子が、後で基質とともに加えた際に検出可能なシグナルを発生させるために使用されるようにする「タグ」またはハプテンを指し得る。例えば、ビオチンは、タグとして、西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)のアビジンコンジュゲートまたはストレプトアビジンコンジュゲートとともに使用し、このタグに結合させて、HRPの存在を検出するために、発色基質(例えば、テトラメチルベンジジン(TMB)など)または蛍光発生基質を使用して調べることができる。精製を容易にするためにタグとして使用することができる例示的な標識としては、myc、HA、FLAG、または3XFLAG、6XHisもしくはポリヒスチジン、グルタチオン-S-トランスフェラーゼ(GST)、マルトース結合タンパク質、エピトープタグ、または免疫グロブリンのFc部分が挙げられるが、これらに限定されない。多くの標識には、例えば、粒子、フルオロフォア、ハプテン、酵素及び酵素の発色基質、蛍光発生基質、ならびに化学発光基質、ならびに他の標識が含まれる。
開示されている核酸分子は、例えば、ヌクレオチドアナログまたは代用ヌクレオチドなどの、ヌクレオチドまたは非天然もしくは修飾ヌクレオチドを含み得る。そのようなヌクレオチドには、修飾された塩基、糖、もしくはリン酸基を含有するか、またはその構造に非天然部分が組み込まれたヌクレオチドが含まれる。非天然ヌクレオチドの例としては、ジデオキシヌクレオチド、ビオチン化ヌクレオチド、アミノ化ヌクレオチド、脱アミノ化ヌクレオチド、アルキル化ヌクレオチド、ベンジル化ヌクレオチド、及びフルオロフォア標識化ヌクレオチドが挙げられるが、これらに限定されない。
本明細書に開示される核酸分子はまた、1つ以上のヌクレオチドアナログまたは置換を含み得る。ヌクレオチドアナログは、塩基部分、糖部分、またはリン酸部分のいずれかに対する修飾を含有するヌクレオチドである。塩基部分に対する修飾としては、A、C、G、及びT/U、ならびに様々なプリン塩基またはピリミジン塩基、例えば、シュードウリジン、ウラシル-5-イル、ヒポキサンチン-9-イル(I)、及び2-アミノアデニン-9-イルなどの、天然及び合成による修飾が挙げられるが、これらに限定されない。修飾塩基としては、5-メチルシトシン(5-me-C)、5-ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、2-アミノアデニン、アデニン及びグアニンの6-メチル誘導体及び他のアルキル誘導体、アデニン及びグアニンの2-プロピル誘導体及び他のアルキル誘導体、2-チオウラシル、2-チオチミン、ならびに2-チオシトシン、5-ハロウラシル及びシトシン、5-プロピニルウラシル及びシトシン、6-アゾウラシル、シトシン及びチミン、5-ウラシル(シュードウラシル)、4-チオウラシル、8-ハロ、8-アミノ、8-チオール、8-チオアルキル、8-ヒドロキシル及び他の8-置換アデニン及びグアニン、5-ハロ(例えば、5-ブロモなど)、5-トリフルオロメチル、及び他の5-置換ウラシル及びシトシン、7-メチルグアニン、7-メチルアデニン、8-アザグアニン、8-アザアデニン、7-デアザグアニン、7-デアザアデニン、3-デアザグアニン、ならびに3-デアザアデニンが挙げられるが、これらに限定されない。
ヌクレオチドアナログにはまた、糖部分の修飾も含まれ得る。糖部分に対する修飾としては、リボース及びデオキシリボースの天然修飾ならびに合成修飾が挙げられるが、これらに限定されない。糖修飾としては、2’位における、OH;F;O-、S-、もしくはN-アルキル;O-、S-、もしくはN-アルケニル;O-、S-もしくはN-アルキニル;またはO-アルキル-O-アルキルという修飾であって、アルキル、アルケニル、及びアルキニルが、置換または非置換の、C1~10アルキルまたはC2~10アルケニル、及びC2~10アルキニルであり得る修飾が挙げられるが、これらに限定されない。例示的な2’糖修飾としてはまた、-O[(CH2)nO]mCH3、-O(CH2)nOCH3、-O(CH2)nNH2、-O(CH2)nCH3、-O(CH2)n-ONH2、及び-O(CH2)nON[(CH2)nCH3)]2(式中、n及びmは独立して1~約10である)が挙げられるが、これらに限定されない。2’位における他の修飾としては、C1~10アルキル、置換低級アルキル、アルカリル、アラルキル、O-アルカリルもしくはO-アラルキル、SH、SCH3、OCN、Cl、Br、CN、CF3、OCF3、SOCH3、SO2CH3、ONO2、NO2、N3、NH2、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルカリル、アミノアルキルアミノ、ポリアルキルアミノ、置換シリル、RNA切断基、レポーター基、インターカレーター、オリゴヌクレオチドの薬物動態学的特性を改善するための基、またはオリゴヌクレオチドの薬力学的特性を改善するための基、及び同様の特性を有する他の置換基が挙げられるが、これらに限定されない。同様の修飾はまた、糖の他の位置、特に、3’末端ヌクレオチド上または2’-5’で結合したオリゴヌクレオチド内の糖の3’位、及び5’末端ヌクレオチドの5’位でも行われ得る。修飾糖には、CH2及びSなど、環の架橋酸素での修飾を含有するものも含まれ得る。ヌクレオチド糖アナログはまた、ペントフラノシル糖に代わるシクロブチル部分などの糖模倣物を有し得る。
ヌクレオチドアナログはまた、リン酸部分でも修飾され得る。修飾リン酸部分としては、2つのヌクレオチド間の結合が、ホスホロチオエート、キラルホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホトリエステル、アミノアルキルホスホトリエステル、メチル及び他のアルキルホスホネート(3’-アルキレンホスホネート及びキラルホスホネートを含む)、ホスフィネート、ホスホロアミダート(3’-アミノホスホロアミダート及びアミノアルキルホスホロアミダートを含む)、チオノホスホロアミダート、チオノアルキルホスホロアミダート、チオノアルキルホスホトリエステル、及びボラノホスフェートを含有するように修飾され得るものが挙げられるが、これらに限定されない。2つのヌクレオチド間のこれらのリン酸または修飾リン酸結合は、3’-5’結合または2’-5’結合を介することができ、結合は、3’-5’が5’-3’に、または2’-5’が5’-2’にというように、反転した極性を含有し得る。様々な塩、混合塩、及び遊離酸形態も含まれ得る。代用ヌクレオチドとしては、ペプチド核酸(PNA)も挙げられる。
本開示はまた、本明細書に開示される核酸分子のうちのいずれか1つ以上を含むベクターも提供する。いくつかの実施形態では、ベクターは、本明細書に開示される核酸分子のうちのいずれか1つ以上及び異種核酸を含む。ベクターは、核酸分子を輸送することができるウイルスベクターまたは非ウイルスベクターであり得る。いくつかの実施形態では、ベクターは、プラスミドまたはコスミドである(例えば、中に追加のDNAセグメントをライゲートすることができる環状二本鎖DNAなど)。いくつかの実施形態では、ベクターはウイルスベクターであり、追加のDNAセグメントは、ウイルスゲノム内にライゲートすることができる。発現ベクターとしては、プラスミド、コスミド、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、植物ウイルス(カリフラワーモザイクウイルス及びタバコモザイクウイルスなど)、酵母人工染色体(YAC)、エプスタイン-バー(EBV)由来エピソーム、ならびに当該技術分野で公知の他の発現ベクターが挙げられるが、これらに限定されない。
哺乳動物宿主細胞の発現に所望される制御配列としては、例えば、レトロウイルスLTR、サイトメガロウイルス(CMV)(例えば、CMVプロモーター/エンハンサーなど)、シミアンウイルス40(SV40)(例えば、SV40プロモーター/エンハンサーなど)、アデノウイルス(例えば、アデノウイルス主要後期プロモーター(AdMLP)など)、ポリオーマに由来するプロモーター及び/またはエンハンサーなどの、哺乳動物細胞での高レベルのポリペプチド発現を導くウイルスエレメント、ならびに天然免疫グロブリン及びアクチンプロモーターなどの強力な哺乳動物プロモーターを挙げることができる。細菌細胞または真菌細胞(例えば、酵母細胞など)でポリペプチドを発現させる方法も周知である。プロモーターは、例えば、構成的活性型プロモーター、条件付きプロモーター、誘導性プロモーター、時間的に制限されたプロモーター(例えば、発生的に制御されたプロモーターなど)、または空間的に制限されたプロモーター(例えば、細胞特異的または組織特異的プロモーターなど)であり得る。
核酸分子内のヌクレオチド配列またはポリペプチド内のアミノ酸配列の特定の区間の間での同一性パーセント(または相補性パーセント)は、BLASTプログラム(塩基局所的アラインメント検索ツール)及びPowerBLASTプログラム(Altschul et al.,J.Mol.Biol.,1990,215,403-410、Zhang and Madden,Genome Res.,1997,7,649-656)を使用して、または、SmithとWatermanのアルゴリズム(Adv.Appl.Math.,1981,2,482-489)を使用するデフォルト設定を使用したGapプログラム(Wisconsin Sequence Analysis Package,Version 8 for Unix,Genetics Computer Group,University Research Park,Madison Wis.)を使用することにより、日常的に決定することができる。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
本開示はまた、本明細書に開示される単離された核酸分子、ゲノム核酸分子、mRNA分子、及び/またはcDNA分子のうちのいずれか1つ以上を含む組成物も提供する。いくつかの実施形態では、組成物は、医薬組成物である。いくつかの実施形態では、組成物は、担体及び/または賦形剤を含む。担体の例としては、ポリ(乳酸)(PLA)ミクロスフェア、D,L-乳酸・グリコール酸共重合体(PLGA)マイクロスフィア、リポソーム、ミセル、逆ミセル、脂質コクリエート、及び脂質マイクロチューブルが挙げられるが、これらに限定されない。担体は、PBS、HBSSなどのような緩衝塩溶液を含み得る。
本明細書で使用される場合、「に対応する」という語句またはその文法的変形は、特定のヌクレオチドまたはヌクレオチドの配列もしくは位置の番号付けの文脈で使用される場合、その特定のヌクレオチドまたはヌクレオチド配列を参照配列(例えば、配列番号1、配列番号7、または配列番号31など)と比較する際の、指定された参照配列の番号付けを指す。換言すれば、特定のポリマーの残基(例えば、ヌクレオチドまたはアミノ酸など)の番号または残基(例えば、ヌクレオチドまたはアミノ酸など)の位置は、特定のヌクレオチドまたはヌクレオチド配列内における残基の実際の位置番号によってではなく、参照配列を基準として指定される。例えば、特定のヌクレオチド配列は、ギャップを導入して、2つの配列間の残基一致度を最適化することによって、参照配列にアラインメントすることができる。これらの場合では、ギャップは存在するが、特定のヌクレオチドまたはヌクレオチド配列における残基の番号付けは、それがアラインメントしている参照配列を基準として行われる。
例えば、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、ヌクレオチド配列が配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている核酸分子とは、GPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列を配列番号1の配列にアラインメントした場合に、GPR75配列が、配列番号1の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチド残基を欠失していることを意味する。同じことが、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているmRNA分子、及びヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているcDNA分子についても適用される。換言すれば、これらの語句は、GPR75ポリペプチドをコードする核酸分子であって、そのゲノム核酸分子が、配列番号1に記載のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている故に配列番号2の5,540~5,546位のTATCCCGヌクレオチドに対して相同であるヌクレオチドを含むヌクレオチド配列を有する(または、そのmRNA分子が、配列番号7に記載のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている故に配列番号11の539~545位のUAUCCCGヘプタヌクレオチド残基に対して相同であるヌクレオチドを含むヌクレオチド配列を有する、もしくはそのcDNA分子が、配列番号31に記載のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている故に配列番号35の539~545位のTATCCCG残基に対して相同である残基を含むヌクレオチド配列を有する)、核酸分子を指す。本明細書において、このような配列は、ゲノム核酸分子を参照して、「Ala110fs変化を伴うGPR75配列」または「Ala110fs変異を伴うGPR75配列」とも称される。同じことが、本明細書に開示される他の全ての分子についても行われ得る。
本明細書に記載されているように、配列番号2に記載の5,540~5,546位に対応するGPR75ゲノム核酸分子内の位置は、例えば、特定のGPR75核酸分子のヌクレオチド配列と配列番号2のヌクレオチド配列との間で配列アラインメントを実施することによって特定することができる。例えば、配列番号2の5,540~5,546位に対応するヌクレオチドの位置を特定するための配列アラインメントを実施するために使用することができる様々なコンピュータアルゴリズムが存在する。例えば、NCBI BLASTアルゴリズム(Altschul et al.,Nucleic Acids Res.,1997,25,3389-3402)またはCLUSTALWソフトウェア(Sievers and Higgins,Methods Mol.Biol.,2014,1079,105-116)を使用することによって、配列アラインメントを実施することができる。しかしながら、配列を手作業でアラインメントすることもできる。
GPR75参照ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号55に示されている。配列番号55を参照すると、GPR75参照ポリペプチドは540アミノ酸長である。配列番号55を参照すると、110位はアラニンである。配列番号55を参照すると、116位はアラニンである。配列番号55を参照すると、207位はチロシンである。配列番号55を参照すると、234位はグルタミンである。配列番号55を参照すると、236位はアルギニンである。配列番号55を参照すると、400位はシステインである。
GPR75バリアントポリペプチドが存在し(配列番号56、Ala110fs)、(配列番号55を参照すると)110位のアラニンが、基となるmRNA分子のフレームシフト突然変異により変化して、トランケートされた130アミノ酸のポリペプチドとなっている。配列番号56を参照すると、110~130位のヌクレオチドは、配列番号55の同じ位置の対応するヌクレオチドとは異なっている。
別のGPR75バリアントポリペプチドが存在し(配列番号57、Ala116Thr)、(配列番号55を参照すると)116位のアラニンがトレオニンに置き換えられて、540アミノ酸のポリペプチドとなっている。
別のGPR75バリアントポリペプチドが存在し(配列番号58、Gln234Stop)、(配列番号55を参照すると)234位のグルタミンが、アミノ酸234位で終止コドンを導入する、基となるmRNA分子の突然変異により変化して、トランケートされた233アミノ酸のポリペプチドとなっている。
別のGPR75バリアントポリペプチドが存在し(配列番号59、Arg236fs)、(配列番号55を参照すると)236位のアルギニンが、基となるmRNA分子のフレームシフト突然変異により変化して、トランケートされた239アミノ酸のポリペプチドとなっている。配列番号59を参照すると、236~239位のヌクレオチドは、配列番号55の同じ位置の対応するヌクレオチドとは異なっている。
別のGPR75バリアントポリペプチドが存在し(配列番号60、Cys400fs)、(配列番号55を参照すると)400位のシステインが、基となるmRNA分子のフレームシフト突然変異により変化して、トランケートされた425アミノ酸のポリペプチドとなっている。配列番号60を参照すると、400~425位のヌクレオチドは、配列番号55の同じ位置の対応するヌクレオチドとは異なっている。
別のGPR75バリアントポリペプチドが存在し(配列番号108、Tyr207Cys)、(配列番号55を参照すると)207位のチロシンがシステインに置き換えられて、540アミノ酸のポリペプチドとなっている。
本開示はまた、配列番号56と少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%同一であり、かつ配列番号56に記載の110~130位に対応する位置のヌクレオチドを含む、アミノ酸配列を有する単離されたヒトGPR75ポリペプチドも提供する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドは、配列番号56と少なくとも約90%同一であり、かつ配列番号56に記載の110~130位に対応する位置のヌクレオチドを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドは、配列番号56と少なくとも約92%同一であり、かつ配列番号56に記載の110~130位に対応する位置のヌクレオチドを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドは、配列番号56と少なくとも約94%同一であり、かつ配列番号56に記載の110~130位に対応する位置のヌクレオチドを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドは、配列番号56と少なくとも約96%同一であり、かつ配列番号56に記載の110~130位に対応する位置のヌクレオチドを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドは、配列番号56と少なくとも約98%同一であり、かつ配列番号56に記載の110~130位に対応する位置のヌクレオチドを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、これらのGPR75ポリペプチドは、配列番号55に記載の110~540位に対応する位置のアミノ酸を欠いている。
本開示はまた、配列番号59と少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%同一であり、かつ配列番号59に記載の236~239位に対応する位置のヌクレオチドを含む、アミノ酸配列を有する単離されたヒトGPR75ポリペプチドも提供する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドは、配列番号59と少なくとも約90%同一であり、かつ配列番号59に記載の236~239位に対応する位置のヌクレオチドを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドは、配列番号59と少なくとも約92%同一であり、かつ配列番号59に記載の236~239位に対応する位置のヌクレオチドを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドは、配列番号59と少なくとも約94%同一であり、かつ配列番号59に記載の236~239位に対応する位置のヌクレオチドを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドは、配列番号59と少なくとも約96%同一であり、かつ配列番号59に記載の236~239位に対応する位置のヌクレオチドを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドは、配列番号59と少なくとも約98%同一であり、かつ配列番号59に記載の236~239位に対応する位置のヌクレオチドを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、これらのGPR75ポリペプチドは、配列番号55に記載の236~540位に対応する位置のアミノ酸を欠いている。
本開示はまた、配列番号60と少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%同一であり、かつ配列番号60に記載の400~425位に対応する位置のヌクレオチドを含む、アミノ酸配列を有する単離されたヒトGPR75ポリペプチドも提供する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドは、配列番号60と少なくとも約90%同一であり、かつ配列番号60に記載の400~425位に対応する位置のヌクレオチドを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドは、配列番号60と少なくとも約92%同一であり、かつ配列番号60に記載の400~425位に対応する位置のヌクレオチドを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドは、配列番号60と少なくとも約94%同一であり、かつ配列番号60に記載の400~425位に対応する位置のヌクレオチドを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドは、配列番号60と少なくとも約96%同一であり、かつ配列番号60に記載の400~425位に対応する位置のヌクレオチドを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドは、配列番号60と少なくとも約98%同一であり、かつ配列番号60に記載の400~425位に対応する位置のヌクレオチドを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、これらのGPR75ポリペプチドは、配列番号55に記載の400~540位に対応する位置のアミノ酸を欠いている。
いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号56を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号56を含む。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号56からなる。
いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号59を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号59を含む。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号59からなる。
いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号60を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号60を含む。いくつかの実施形態では、単離されたヒトGPR75ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号60からなる。
いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、本明細書に開示されるGPR75ポリペプチドのいずれかの、少なくとも約8、少なくとも約10、少なくとも約15、少なくとも約20、少なくとも約25、少なくとも約30、少なくとも約35、少なくとも約40、少なくとも約45、少なくとも約50、少なくとも約60、少なくとも約70、少なくとも約80、少なくとも約90、少なくとも約100、少なくとも約150、少なくとも約200、少なくとも約250、少なくとも約300、少なくとも約350、少なくとも約400、少なくとも約450、少なくとも約500、少なくとも約550、または少なくとも約600の連続するアミノ酸と、少なくとも約70%、少なくとも約75%、少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、または100%同一のアミノ酸配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、本明細書に開示されるGPR75ポリペプチドのいずれかの、少なくとも約8、少なくとも約10、少なくとも約15、少なくとも約20、少なくとも約25、少なくとも約30、少なくとも約35、少なくとも約40、少なくとも約45、少なくとも約50、少なくとも約60、少なくとも約70、少なくとも約80、少なくとも約90、少なくとも約100、少なくとも約150、少なくとも約200、少なくとも約250、少なくとも約300、少なくとも約350、少なくとも約400、少なくとも約450、少なくとも約500、少なくとも約550、または少なくとも約600の連続するアミノ酸と、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、または100%同一のアミノ酸配列を含むかまたはそれからなる。
本明細書に開示される単離されたポリペプチドは、天然に存在するGPR75ポリペプチドのアミノ酸配列を含むことができ、または天然に存在しない配列を含むことができる。いくつかの実施形態では、天然に存在する配列は、保存的アミノ酸置換によって天然に存在しない配列とは異なり得る。例えば、配列は、保存的アミノ酸置換を除いて同一であり得る。
いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、非天然または修飾された、アミノ酸またはペプチドアナログを含む。例えば、D-アミノ酸、または天然に存在するアミノ酸とは異なる機能性置換基を有するアミノ酸が数多く存在する。
本開示はまた、本明細書に開示されるポリペプチドのいずれかをコードする核酸分子も提供する。これには、特定のポリペプチド配列に関連する、全ての縮重配列(すなわち、1つの特定のポリペプチド配列をコードする配列を有する全ての核酸、ならびにタンパク質配列の開示されているバリアント及び誘導体をコードする縮重核酸を含む全ての核酸)が含まれる。したがって、各々の特定の核酸配列は本明細書中に記載されない場合があるが、事実上、ありとあらゆる配列が、開示されているポリペプチド配列を通じて本明細書に開示及び記載される。
本開示はまた、本明細書に開示される核酸分子のいずれか1つ以上及び/またはポリペプチドのいずれか1つ以上を含む組成物を提供する。いくつかの実施形態では、組成物は、担体を含む。担体の例としては、ポリ(乳酸)(PLA)ミクロスフェア、D,L-乳酸・グリコール酸共重合体(PLGA)マイクロスフィア、リポソーム、ミセル、逆ミセル、脂質コクリエート、及び脂質マイクロチューブルが挙げられるが、これらに限定されない。
本開示はまた、本明細書に開示されるGPR75ポリペプチドのいずれかまたはその断片を生成する方法も提供する。このようなGPR75ポリペプチドまたはその断片は、任意の好適な方法によって生成することができる。
本開示はまた、本明細書に開示される核酸分子のいずれか1つ以上及び/またはポリペプチドのいずれか1つ以上を含む細胞を提供する。細胞は、in vitro、ex vivo、またはin vivoであり得る。核酸分子は、それらが発現され、コードされたタンパク質が生成されるように、プロモーター及び他の制御配列に連結させることができる。
いくつかの実施形態では、細胞は、例えば、胚性幹(ES)細胞(例えば、げっ歯類ES細胞、マウスES細胞、またはラットES細胞)などの全能性細胞または多能性細胞である。いくつかの実施形態では、細胞は、初代体細胞であるか、または初代体細胞ではない細胞である。細胞は、あらゆる供給源からのものであり得る。例えば、細胞は、真核細胞、動物細胞、植物細胞、または真菌(例えば、酵母など)細胞であり得る。そのような細胞は、魚類細胞もしくは鳥類細胞であり得、またはそのような細胞は、ヒト細胞、非ヒト哺乳動物細胞、げっ歯類細胞、マウス細胞、もしくはラット細胞などの哺乳動物細胞であり得る。哺乳動物としては、ヒト、非ヒト霊長類、サル、類人猿、ネコ、イヌ、ウマ、雄ウシ、シカ、バイソン、ヒツジ、げっ歯類(例えば、マウス、ラット、ハムスター、モルモットなど)、家畜(例えば、雌ウシ、去勢雄ウシなどのウシ種、ヒツジ、ヤギなどのヒツジ種、及びブタ及びイノシシなどのブタ種)が挙げられるが、これらに限定されない。「非ヒト動物」という用語では、ヒトは除外される。
添付の配列表に列挙されているヌクレオチド配列及びアミノ酸配列は、ヌクレオチド塩基については標準的な文字による略称、及びアミノ酸については3文字表記を使用して示されている。ヌクレオチド配列は、配列の5’末端から始まり3’末端へと(すなわち、各行において左から右に)進む標準的慣例に従う。各ヌクレオチド配列の片方の鎖のみが示されているが、示されている鎖を参照することによって相補鎖が含まれるものと理解される。アミノ酸配列は、配列のアミノ末端から始まりカルボキシ末端へと(すなわち、各行において左から右に)進む標準的慣例に従う。
本開示はまた、対象の肥満の治療に使用するための(または肥満を治療するための薬剤の調製における使用のための)肥満を治療または抑制する治療剤を提供し、対象は、本明細書に記載のヒトGPR75ポリペプチドをコードするゲノム核酸分子、mRNA分子、及び/またはcDNA分子のいずれかを有する。肥満を治療または抑制する治療剤は、本明細書に記載の肥満を治療または抑制する治療剤のいずれかであり得る。
いくつかの実施形態では、対象は、i)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、ゲノム核酸分子、ii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、もしくは配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、mRNA分子、またはiii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、もしくは配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ゲノム核酸分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、mRNA分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、i)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、ゲノム核酸分子、ii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、もしくは配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、mRNA分子、またはiii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンまたはその相補体を含む、ゲノム核酸分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンまたはその相補体を含む、mRNA分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンまたはその相補体を含む、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、i)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、ゲノム核酸分子、ii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、もしくは配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、mRNA分子、またはiii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、もしくは配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号4に記載の5,991位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、ゲノム核酸分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、mRNA分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、cDNA分子、または配列番号58に記載の234位に対応する位置に終止コドンを含むGPR75ポリペプチドを含む。
いくつかの実施形態では、対象は、i)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、ゲノム核酸分子、ii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、もしくは配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、mRNA分子、またはiii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、もしくは配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、ゲノム核酸分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、mRNA分子、またはヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、i)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、ゲノム核酸分子、ii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入、もしくは配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、mRNA分子、またはiii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、もしくは配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、ゲノム核酸分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、mRNA分子、またはヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、i)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、ゲノム核酸分子、ii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、mRNA分子、またはiii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、ゲノム核酸分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、mRNA分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、cDNA分子、または配列番号108に記載の207位に対応する位置のシステインを含むGPR75ポリペプチドを含む。
本開示はまた、対象の肥満の治療に使用するための(または肥満を治療するための薬剤の調製における使用のための)GPR75阻害剤を提供し、対象は、本明細書に記載のヒトGPR75ポリペプチドをコードするゲノム核酸分子、mRNA分子、及び/またはcDNA分子のいずれかを有する。GPR75阻害剤は、本明細書に記載のGPR75阻害剤のいずれかであり得る。
いくつかの実施形態では、対象は、i)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、ゲノム核酸分子、ii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、もしくは配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、mRNA分子、またはiii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、もしくは配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、ゲノム核酸分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、mRNA分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドまたはその相補体を欠いている、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、i)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、ゲノム核酸分子、ii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、もしくは配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、mRNA分子、またはiii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンまたはその相補体を含む、ゲノム核酸分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンまたはその相補体を含む、mRNA分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンまたはその相補体を含む、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、i)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、ゲノム核酸分子、ii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体、もしくは配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、mRNA分子、またはiii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、もしくは配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号4に記載の5,991位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、ゲノム核酸分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、mRNA分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、cDNA分子、または配列番号58に記載の234位に対応する位置に終止コドンを含むGPR75ポリペプチドを含む。
いくつかの実施形態では、対象は、i)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、ゲノム核酸分子、ii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、もしくは配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、mRNA分子、またはiii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、もしくは配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、ゲノム核酸分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、mRNA分子、またはヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、i)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、ゲノム核酸分子、ii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入、もしくは配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、mRNA分子、またはiii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、もしくは配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、ゲノム核酸分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、mRNA分子、またはヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、i)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、ゲノム核酸分子、ii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、mRNA分子、またはiii)ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、cDNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、ゲノム核酸分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、mRNA分子、ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、cDNA分子、または配列番号108に記載の207位に対応する位置のシステインを含むGPR75ポリペプチドを含む。
上記または以下で引用されている特許文献、ウェブサイト、他の刊行物、アクセッション番号などは全て、個々の項目各々が、あらゆる目的のためにその全体が参照により組み込まれることが具体的かつ個別に示されているのと同程度に、そのように参照により組み込まれる。異なるバージョンの配列が異なる時点でアクセッション番号に関連付けられている場合、本出願の有効出願日におけるアクセッション番号に関連付けられているバージョンを意図するものとする。有効出願日とは、該当する場合、そのアクセッション番号について言及している実際の出願日と、優先権主張出願の出願日のうちの早い方を意味する。同様に、異なるバージョンの刊行物、ウェブサイトなどが異なる時期に公開されている場合、特に明記しない限り、本出願の有効出願日時点で最後に公開されたバージョンを意図するものとする。本開示の任意の特徴、ステップ、要素、実施形態、または態様は、特に具体的に明記しない限り、他の任意の特徴、ステップ、要素、実施形態、または態様と組み合わせて使用することができる。本開示を、明確化及び理解を目的として、例示及び例としてある程度詳細に説明してきたが、ある特定の変更及び修正が添付の特許請求の範囲内で実施され得ることは明らかであろう。
代表的な実施形態を以下に示す。
実施形態1.肥満を有する対象を治療する方法であって、Gタンパク質共役受容体75(GPR75)阻害剤を対象に投与することを含む、前記方法。
実施形態1.肥満を有する対象を治療する方法であって、Gタンパク質共役受容体75(GPR75)阻害剤を対象に投与することを含む、前記方法。
実施形態2.過体重を有する対象を治療する方法であって、GPR75阻害剤を対象に投与することを含む、前記方法。
実施形態3.BMIが上昇している対象を治療する方法であって、GPR75阻害剤を対象に投与することを含む、前記方法。
実施形態3.BMIが上昇している対象を治療する方法であって、GPR75阻害剤を対象に投与することを含む、前記方法。
実施形態4.体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積が上昇している対象を治療する方法であって、GPR75阻害剤を対象に投与することを含む、前記方法。
実施形態5.過剰に食物を摂取している対象を治療する、または体重増加を予防するために、もしくは体重減少を維持するために対象を治療する方法であって、GPR75阻害剤を対象に投与することを含む、前記方法。
実施形態5.過剰に食物を摂取している対象を治療する、または体重増加を予防するために、もしくは体重減少を維持するために対象を治療する方法であって、GPR75阻害剤を対象に投与することを含む、前記方法。
実施形態6.前記GPR75阻害剤が、GPR75 mRNAとハイブリダイズする、アンチセンス核酸分子、低分子干渉RNA(siRNA)、またはショートヘアピンRNA(shRNA)を含む、実施形態1~5のいずれか1つに記載の方法。
実施形態7.前記GPR75阻害剤が、Casタンパク質と、GPR75ゲノム核酸分子内のガイドRNA(gRNA)認識配列とハイブリダイズするgRNAと、を含む、実施形態1~5のいずれか1つに記載の方法。
実施形態8.前記Casタンパク質が、Cas9またはCpf1である、実施形態7に記載の方法。
実施形態9.前記gRNA認識配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位、配列番号1に記載の5,557位、配列番号1に記載の5,911位、配列番号1に記載の5,920~5,923位、配列番号1に記載の6,411位、または配列番号1に記載の5,831位に対応する位置を含むかまたはこれに近接する、実施形態7または実施形態8に記載の方法。
実施形態9.前記gRNA認識配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位、配列番号1に記載の5,557位、配列番号1に記載の5,911位、配列番号1に記載の5,920~5,923位、配列番号1に記載の6,411位、または配列番号1に記載の5,831位に対応する位置を含むかまたはこれに近接する、実施形態7または実施形態8に記載の方法。
実施形態10.前記gRNA認識配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位、配列番号1に記載の5,557位、配列番号1に記載の5,911位、配列番号1に記載の5,920~5,923位、配列番号1に記載の6,411位、または配列番号1に記載の5,831位に対応する位置から約1000、約500、約400、約300、約200、約100、約50、約45、約40、約35、約30、約25、約20、約15、約10、または約5ヌクレオチドに位置する、実施形態7または実施形態8に記載の方法。
実施形態11.プロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)配列が、前記gRNA認識配列の下流の約2~約6ヌクレオチドである、実施形態7または実施形態8に記載の方法。
実施形態12.前記gRNAが、約17~約23ヌクレオチドを含む、実施形態7~11のいずれか1つに記載の方法。
実施形態12.前記gRNAが、約17~約23ヌクレオチドを含む、実施形態7~11のいずれか1つに記載の方法。
実施形態13.前記gRNA認識配列が、配列番号61~98のいずれか1つに記載のヌクレオチド配列を含む、実施形態7~11のいずれか1つに記載の方法。
実施形態14.前記対象からの生体試料における予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子の非存在を検出することを更に含む、実施形態1~13のいずれか1つに記載の方法。
実施形態14.前記対象からの生体試料における予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子の非存在を検出することを更に含む、実施形態1~13のいずれか1つに記載の方法。
実施形態15.GPR75参照である対象に、肥満を治療または抑制する治療剤を標準投与量で投与することを更に含む、実施形態14に記載の方法。
実施形態16.GPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である対象に、肥満を治療または抑制する治療剤を標準投与量と同じかまたはそれより少ない投与量で投与することを更に含む、実施形態14に記載の方法。
実施形態16.GPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である対象に、肥満を治療または抑制する治療剤を標準投与量と同じかまたはそれより少ない投与量で投与することを更に含む、実施形態14に記載の方法。
実施形態17.前記GPR75ミスセンスバリアント核酸分子が、Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs、またはCys400fsをコードする核酸分子である、実施形態14~16のいずれか1つに記載の方法。
実施形態18.前記GPR75ミスセンスバリアント核酸分子が、
配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含む、もしくは配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、
配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有するmRNA分子、または
mRNA分子から生成されたcDNA分子であって、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有するcDNA分子である、実施形態17に記載の方法。
配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含む、もしくは配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、
配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有するmRNA分子、または
mRNA分子から生成されたcDNA分子であって、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有するcDNA分子である、実施形態17に記載の方法。
実施形態19.前記検出ステップが、in vitroで行われる、実施形態14~18のいずれか1つに記載の方法。
実施形態20.前記検出ステップが、前記生体試料中の前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することを含み、前記配列決定された部分が、配列番号2もしくは配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号5もしくは配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置もしくはその相補体を含み、
前記生体試料中の前記GPR75ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む場合、前記生体試料中の前記GPR75ゲノム核酸分子は、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子である、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
実施形態20.前記検出ステップが、前記生体試料中の前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することを含み、前記配列決定された部分が、配列番号2もしくは配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号5もしくは配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置もしくはその相補体を含み、
前記生体試料中の前記GPR75ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む場合、前記生体試料中の前記GPR75ゲノム核酸分子は、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子である、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
実施形態21.前記検出ステップが、前記生体試料中の前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することを含み、前記配列決定された部分が、配列番号11に記載の539~545位に対応する位置またはその相補体、配列番号16に記載の440~446位に対応する位置またはその相補体、配列番号21に記載の361~367位に対応する位置またはその相補体、配列番号26に記載の600~606位に対応する位置またはその相補体、配列番号12に記載の556位に対応する位置またはその相補体、配列番号17に記載の457位に対応する位置またはその相補体、配列番号22に記載の378位に対応する位置またはその相補体、配列番号27に記載の617位に対応する位置またはその相補体、配列番号13に記載の910位に対応する位置またはその相補体、配列番号18に記載の811位に対応する位置またはその相補体、配列番号23に記載の732位に対応する位置またはその相補体、配列番号28に記載の971位に対応する位置またはその相補体、配列番号14に記載の919~922位に対応する位置またはその相補体、配列番号19に記載の820~823位に対応する位置またはその相補体、配列番号24に記載の741~744位に対応する位置またはその相補体、配列番号29に記載の980~983位に対応する位置またはその相補体、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置またはその相補体、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置またはその相補体、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置またはその相補体、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置またはその相補体、配列番号100に記載の830位に対応する位置またはその相補体、配列番号101に記載の731位に対応する位置またはその相補体、配列番号102に記載の652位に対応する位置またはその相補体、配列番号103に記載の891位に対応する位置またはその相補体を含み、
前記生体試料中の前記GPR75 mRNA分子の前記配列決定された部分が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む場合、前記生体試料中の前記GPR75 mRNA分子が、GPR75ミスセンスバリアントmRNA分子である、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
前記生体試料中の前記GPR75 mRNA分子の前記配列決定された部分が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む場合、前記生体試料中の前記GPR75 mRNA分子が、GPR75ミスセンスバリアントmRNA分子である、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
実施形態22.前記検出ステップが、前記生体試料中のmRNA分子から生成された前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することを含み、前記配列決定された部分が、配列番号35に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号40に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号45に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号50に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号36に記載の556位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号41に記載の457位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号46に記載の378位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号51に記載の617位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号37に記載の910位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号42に記載の811位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号47に記載の732位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号52に記載の971位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号38に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号43に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号48に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号53に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号104に記載の830位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号105に記載の731位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号106に記載の652位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号107に記載の891位に対応する位置もしくはその相補体を含み、
前記生体試料中の前記GPR75 cDNA分子の前記配列決定された部分が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む場合、前記生体試料中の前記GPR75 cDNA分子が、GPR75ミスセンスバリアントcDNA分子である、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
前記生体試料中の前記GPR75 cDNA分子の前記配列決定された部分が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む場合、前記生体試料中の前記GPR75 cDNA分子が、GPR75ミスセンスバリアントcDNA分子である、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
実施形態23.前記検出ステップが、
a)配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号3に記載の5,557位、配列番号4に記載の5,911位、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号6に記載の6,411位、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置に近接する前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記生体試料を接触させることと、
b)配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号3に記載の5,557位、配列番号4に記載の5,911位、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号6に記載の6,411位、または配列番号99に記載の5,831位に対応する前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の位置を少なくとも介して前記プライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
a)配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号3に記載の5,557位、配列番号4に記載の5,911位、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号6に記載の6,411位、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置に近接する前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記生体試料を接触させることと、
b)配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号3に記載の5,557位、配列番号4に記載の5,911位、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号6に記載の6,411位、または配列番号99に記載の5,831位に対応する前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の位置を少なくとも介して前記プライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
実施形態24.前記検出ステップが、
a)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、または配列番号103に記載の891位に対応する位置に近接する前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記生体試料を接触させることと、
b)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、または配列番号103に記載の891位に対応する前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の位置を少なくとも介して前記プライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか否か、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
a)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、または配列番号103に記載の891位に対応する位置に近接する前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記生体試料を接触させることと、
b)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、または配列番号103に記載の891位に対応する前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の位置を少なくとも介して前記プライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか否か、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
実施形態25.前記検出ステップが、
a)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、配列番号50に記載の600~606位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、配列番号51に記載の617位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、配列番号52に記載の971位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、配列番号53に記載の980~983位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、配列番号54に記載の1,471位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応する位置に近接する前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記生体試料を接触させることと、
b)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、配列番号50に記載の600~606位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、配列番号51に記載の617位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、配列番号52に記載の971位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、配列番号53に記載の980~983位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、配列番号54に記載の1,471位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応する前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の位置を少なくとも介して前記プライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか否か、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
a)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、配列番号50に記載の600~606位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、配列番号51に記載の617位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、配列番号52に記載の971位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、配列番号53に記載の980~983位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、配列番号54に記載の1,471位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応する位置に近接する前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記生体試料を接触させることと、
b)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、配列番号50に記載の600~606位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、配列番号51に記載の617位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、配列番号52に記載の971位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、配列番号53に記載の980~983位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、配列番号54に記載の1,471位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応する前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の位置を少なくとも介して前記プライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか否か、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
実施形態26.前記検出ステップが、前記核酸分子全体を配列決定することを含む、実施形態20~25のいずれか1つに記載の方法。
実施形態27.前記検出ステップが、
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
実施形態27.前記検出ステップが、
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
実施形態28.前記検出ステップが、
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
実施形態29.前記検出ステップが、
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
実施形態30.前記試料中の前記核酸分子がmRNAであり、前記増幅ステップの前に前記mRNAをcDNAに逆転写する、実施形態29に記載の方法。
実施形態31.前記検出ステップが、
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
実施形態31.前記検出ステップが、
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
実施形態32.前記検出ステップが、
前記生体試料中の核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
前記生体試料中の核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
実施形態33.前記検出ステップが、
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態14~19のいずれか1つに記載の方法。
実施形態34.肥満を治療または抑制する治療剤で対象を治療する方法であって、前記対象が肥満であり、
前記対象が、予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGタンパク質共役受容体75(GPR75)ミスセンスバリアント核酸分子を有するか否かを、
前記対象から生体試料を得るまたは得たことと、
前記対象が前記GPR75ミスセンスバリアント核酸分子を含む遺伝子型を有するか否かを判定するために前記生体試料で配列解析を実施するまたは実施したことと、によって、判定するステップと、
GPR75参照である対象に、前記肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤を標準投与量で投与する、または投与し続けるステップと、
GPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である対象に、前記肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤を標準投与量と同じかまたはそれより少ない量で投与する、または投与し続けるステップと、を含み、
ここで、予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードする前記GPR75ミスセンスバリアント核酸分子を有する遺伝子型の存在が、前記対象が肥満を発症するリスクが低減していることを示している、前記方法。
前記対象が、予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGタンパク質共役受容体75(GPR75)ミスセンスバリアント核酸分子を有するか否かを、
前記対象から生体試料を得るまたは得たことと、
前記対象が前記GPR75ミスセンスバリアント核酸分子を含む遺伝子型を有するか否かを判定するために前記生体試料で配列解析を実施するまたは実施したことと、によって、判定するステップと、
GPR75参照である対象に、前記肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤を標準投与量で投与する、または投与し続けるステップと、
GPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である対象に、前記肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤を標準投与量と同じかまたはそれより少ない量で投与する、または投与し続けるステップと、を含み、
ここで、予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードする前記GPR75ミスセンスバリアント核酸分子を有する遺伝子型の存在が、前記対象が肥満を発症するリスクが低減していることを示している、前記方法。
実施形態35.前記対象がGPR75参照であり、前記対象が、前記肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤を、標準投与量で投与されるか、または投与され続ける、実施形態34に記載の方法。
実施形態36.前記対象が、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性であり、前記対象が、前記肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤を、標準投与量と同じかまたはそれより少ない量で投与されるか、または投与され続ける、実施形態34に記載の方法。
実施形態37.前記GPR75ミスセンスバリアント核酸分子が、Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs、またはCys400fsをコードする核酸分子である、実施形態34~36のいずれか1つに記載の方法。
実施形態38.前記GPR75ミスセンスバリアント核酸分子が、
配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含む、もしくは配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、
配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、もしくは配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有するmRNA分子、または
mRNA分子から生成されたcDNA分子であって、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有する、前記cDNA分子である、実施形態37に記載の方法。
配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含む、もしくは配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、
配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、もしくは配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有するmRNA分子、または
mRNA分子から生成されたcDNA分子であって、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有する、前記cDNA分子である、実施形態37に記載の方法。
実施形態39.前記配列解析が、前記生体試料中の前記GPR75ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することを含み、前記配列決定された部分が、配列番号2に記載の5,540~5,546位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号5に記載の5,920~5,923位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置もしくはその相補体を含み、
前記生体試料中の前記GPR75ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含む場合、前記生体試料中の前記GPR75ゲノム核酸分子が、GPR75ミスセンスバリアントゲノム核酸分子である、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
前記生体試料中の前記GPR75ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含む場合、前記生体試料中の前記GPR75ゲノム核酸分子が、GPR75ミスセンスバリアントゲノム核酸分子である、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
実施形態40.前記配列解析が、前記生体試料中の前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することを含み、前記配列決定された部分が、配列番号11に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号16に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号21に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号26に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号12に記載の556位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号17に記載の457位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号22に記載の378位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号27に記載の617位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号13に記載の910位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号18に記載の811位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号23に記載の732位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号28に記載の971位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号14に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号19に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号24に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号29に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置、その相補体、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号30に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号100に記載の830位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号101に記載の731位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号102に記載の652位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号103に記載の891位に対応する位置もしくはその相補体を含み、
前記生体試料中の前記GPR75 mRNA分子の前記配列決定された部分が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む場合、前記生体試料中の前記GPR75 mRNA分子が、GPR75ミスセンスバリアントmRNA分子である、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
前記生体試料中の前記GPR75 mRNA分子の前記配列決定された部分が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む場合、前記生体試料中の前記GPR75 mRNA分子が、GPR75ミスセンスバリアントmRNA分子である、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
実施形態41.前記配列解析が、前記生体試料中の前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することを含み、前記配列決定された部分が、配列番号35に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号40に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号45に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号50に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号36に記載の556位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号41に記載の457位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号46に記載の378位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号51に記載の617位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号37に記載の910位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号42に記載の811位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号47に記載の732位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号52に記載の971位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号38に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号43に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号48に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号53に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号104に記載の830位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号105に記載の731位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号106に記載の652位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号107に記載の891位に対応する位置もしくはその相補体を含み、
前記生体試料中の前記GPR75 cDNA分子の前記配列決定された部分が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む場合、前記生体試料中の前記GPR75 cDNA分子が、GPR75ミスセンスバリアントcDNA分子である、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
前記生体試料中の前記GPR75 cDNA分子の前記配列決定された部分が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む場合、前記生体試料中の前記GPR75 cDNA分子が、GPR75ミスセンスバリアントcDNA分子である、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
実施形態42.前記配列解析が、
a)配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号3に記載の5,557位、配列番号4に記載の5,911位、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号6に記載の6,411位、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置に近接する前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記生体試料を接触させることと、
b)配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号3に記載の5,557位、配列番号4に記載の5,911位、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号6に記載の6,411位、配列番号6に記載の6,411位、または配列番号99に記載の5,831位に対応する前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の位置を少なくとも介して前記プライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
a)配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号3に記載の5,557位、配列番号4に記載の5,911位、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号6に記載の6,411位、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置に近接する前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記生体試料を接触させることと、
b)配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号3に記載の5,557位、配列番号4に記載の5,911位、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号6に記載の6,411位、配列番号6に記載の6,411位、または配列番号99に記載の5,831位に対応する前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の位置を少なくとも介して前記プライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
実施形態43.前記配列解析が、
a)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、または配列番号103に記載の891位に対応する位置に近接する前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記生体試料を接触させることと、
b)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、または配列番号103に記載の891位に対応する前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を少なくとも介して前記プライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか否か、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
a)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、または配列番号103に記載の891位に対応する位置に近接する前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記生体試料を接触させることと、
b)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、または配列番号103に記載の891位に対応する前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を少なくとも介して前記プライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか否か、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
実施形態44.前記配列解析が、
a)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、配列番号50に記載の600~606位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、配列番号51に記載の617位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、配列番号52に記載の971位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、配列番号53に記載の980~983位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、配列番号54に記載の1,471位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応する位置に近接する前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記生体試料を接触させることと、
b)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、配列番号50に記載の600~606位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、配列番号51に記載の617位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、配列番号52に記載の971位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、配列番号53に記載の980~983位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、配列番号54に記載の1,471位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応する前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を少なくとも介して前記プライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか否か、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
a)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、配列番号50に記載の600~606位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、配列番号51に記載の617位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、配列番号52に記載の971位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、配列番号53に記載の980~983位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、配列番号54に記載の1,471位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応する位置に近接する前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記生体試料を接触させることと、
b)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、配列番号50に記載の600~606位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、配列番号51に記載の617位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、配列番号52に記載の971位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、配列番号53に記載の980~983位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、配列番号54に記載の1,471位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応する前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を少なくとも介して前記プライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか否か、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
実施形態45.前記配列解析が、前記核酸分子全体を配列決定することを含む、実施形態39~44のいずれか1つに記載の方法。
実施形態46.前記配列解析が、
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含む、増幅した核酸分子の核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
実施形態46.前記配列解析が、
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含む、増幅した核酸分子の核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
実施形態47.配列解析が、
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
実施形態48.配列解析が、
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
実施形態49.前記試料中の前記核酸分子がmRNAであり、前記増幅ステップの前に前記mRNAをcDNAに逆転写する、実施形態48に記載の方法。
実施形態50.前記配列解析が、
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
実施形態50.前記配列解析が、
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
実施形態51.配列解析が、
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
実施形態52.前記配列解析が、
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態34~38のいずれか1つに記載の方法。
実施形態53.前記核酸分子が、前記対象から得た細胞内に存在する、実施形態34~52のいずれか1つに記載の方法。
実施形態54.前記GPR75阻害剤が、GPR75 mRNAとハイブリダイズする、アンチセンス核酸分子、低分子干渉RNA(siRNA)、またはショートヘアピンRNA(shRNA)を含む、実施形態34~53のいずれか1つに記載の方法。
実施形態54.前記GPR75阻害剤が、GPR75 mRNAとハイブリダイズする、アンチセンス核酸分子、低分子干渉RNA(siRNA)、またはショートヘアピンRNA(shRNA)を含む、実施形態34~53のいずれか1つに記載の方法。
実施形態55.前記GPR75阻害剤が、Casタンパク質と、GPR75ゲノム核酸分子内のガイドRNA(gRNA)認識配列とハイブリダイズするgRNAと、を含む、実施形態34~53のいずれか1つに記載の方法。
実施形態56.前記Casタンパク質が、Cas9またはCpf1である、実施形態55に記載の方法。
実施形態57.前記gRNA認識配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位、配列番号1に記載の5,557位、配列番号1に記載の5,911位、配列番号1に記載の5,920~5,923位、配列番号1に記載の6,411位、または配列番号1に記載の5,831位に対応する位置を含むかまたはこれに近接する、実施形態55または実施形態56に記載の方法。
実施形態57.前記gRNA認識配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位、配列番号1に記載の5,557位、配列番号1に記載の5,911位、配列番号1に記載の5,920~5,923位、配列番号1に記載の6,411位、または配列番号1に記載の5,831位に対応する位置を含むかまたはこれに近接する、実施形態55または実施形態56に記載の方法。
実施形態58.前記gRNA認識配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位、配列番号1に記載の5,557位、配列番号1に記載の5,911位、配列番号1に記載の5,920~5,923位、配列番号1に記載の6,411位、または配列番号1に記載の5,831位に対応する位置から約1000、約500、約400、約300、約200、約100、約50、約45、約40、約35、約30、約25、約20、約15、約10、または約5ヌクレオチドに位置する、実施形態55または実施形態56に記載の方法。
実施形態59.プロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)配列が、前記gRNA認識配列の下流の約2~6ヌクレオチドである、実施形態55または実施形態56に記載の方法。
実施形態60.前記gRNAが、約17~約23ヌクレオチドを含む、実施形態55~59のいずれか1つに記載の方法。
実施形態61.前記gRNA認識配列が、配列番号61~98のいずれか1つに記載のヌクレオチド配列を含む、実施形態55~60のいずれか1つに記載の方法。
実施形態61.前記gRNA認識配列が、配列番号61~98のいずれか1つに記載のヌクレオチド配列を含む、実施形態55~60のいずれか1つに記載の方法。
実施形態62.肥満を発症するリスクが高い対象を特定する方法であって、
前記対象から得た生体試料において、予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGタンパク質共役受容体75(GPR75)ミスセンスバリアント核酸分子の有無を判定すること、または判定したことを含み、
ここで、
前記対象がGPR75参照である場合、前記対象は肥満を発症するリスクが高く、
前記対象がGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性であるかまたはGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてホモ接合性である場合、前記対象は、肥満を発症するリスクが低い、方法。
前記対象から得た生体試料において、予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGタンパク質共役受容体75(GPR75)ミスセンスバリアント核酸分子の有無を判定すること、または判定したことを含み、
ここで、
前記対象がGPR75参照である場合、前記対象は肥満を発症するリスクが高く、
前記対象がGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性であるかまたはGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてホモ接合性である場合、前記対象は、肥満を発症するリスクが低い、方法。
実施形態63.前記GPR75ミスセンスバリアント核酸分子が、Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs、またはCys400fsをコードする核酸分子である、実施形態62に記載の方法。
実施形態64.前記GPR75ミスセンスバリアント核酸分子が、
配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含む、もしくは配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、
配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有するmRNA分子、または
mRNA分子から生成されたcDNA分子であって、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有する、前記cDNA分子である、実施形態63に記載の方法。
配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含む、もしくは配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、
配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有するmRNA分子、または
mRNA分子から生成されたcDNA分子であって、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有する、前記cDNA分子である、実施形態63に記載の方法。
実施形態65.前記判定ステップが、in vitroで行われる、実施形態62~64のいずれか1つに記載の方法。
実施形態66.前記判定ステップが、前記生体試料中の前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することを含み、前記配列決定された部分が、配列番号2に記載の5,540~5,546位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号5に記載の5,920~5,923位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置もしくはその相補体を含み、
前記生体試料中の前記GPR75ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含む場合、前記生体試料中の前記GPR75ゲノム核酸分子が、GPR75ミスセンスバリアントゲノム核酸分子である、実施形態62~64のいずれか1つに記載の方法。
実施形態66.前記判定ステップが、前記生体試料中の前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することを含み、前記配列決定された部分が、配列番号2に記載の5,540~5,546位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号5に記載の5,920~5,923位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置もしくはその相補体を含み、
前記生体試料中の前記GPR75ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含む場合、前記生体試料中の前記GPR75ゲノム核酸分子が、GPR75ミスセンスバリアントゲノム核酸分子である、実施形態62~64のいずれか1つに記載の方法。
実施形態67.前記判定ステップが、前記生体試料中の前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することを含み、前記配列決定された部分が、配列番号11に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号16に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号21に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号26に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号12に記載の556位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号17に記載の457位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号22に記載の378位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号27に記載の617位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号13に記載の910位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号18に記載の811位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号23に記載の732位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号28に記載の971位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号14に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号19に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号24に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号29に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号100に記載の830位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号101に記載の731位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号102に記載の652位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号103に記載の891位に対応する位置もしくはその相補体を含み、
前記生体試料中の前記GPR75 mRNA分子の前記配列決定された部分が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む場合、前記生体試料中の前記GPR75 mRNA分子が、GPR75ミスセンスバリアントゲノム核酸分子である、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
前記生体試料中の前記GPR75 mRNA分子の前記配列決定された部分が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含むか、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む場合、前記生体試料中の前記GPR75 mRNA分子が、GPR75ミスセンスバリアントゲノム核酸分子である、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
実施形態68.前記判定ステップが、前記生体試料中の前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することを含み、前記配列決定された部分が、配列番号35に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号40に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号45に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号50に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号36に記載の556位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号41に記載の457位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号46に記載の378位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号51に記載の617位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号37に記載の910位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号42に記載の811位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号47に記載の732位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号52に記載の971位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号38に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号43に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号48に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号53に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号104に記載の830位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号105に記載の731位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号106に記載の652位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号107に記載の891位に対応する位置もしくはその相補体を含み、
前記生体試料中の前記GPR75 cDNA分子の前記配列決定された部分が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む場合、前記生体試料中の前記GPR75 cDNA分子が、GPR75ミスセンスバリアントcDNA分子である、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
前記生体試料中の前記GPR75 cDNA分子の前記配列決定された部分が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含むか、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む場合、前記生体試料中の前記GPR75 cDNA分子が、GPR75ミスセンスバリアントcDNA分子である、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
実施形態69.前記判定ステップが、
a)配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号3に記載の5,557位、配列番号4に記載の5,911位、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号6に記載の6,411位、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置、に対応する位置に近接する前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに生体試料を接触させることと、
b)配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号3に記載の5,557位、配列番号4に記載の5,911位、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号6に記載の6,411位、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置、に対応する前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を少なくとも介してプライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
a)配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号3に記載の5,557位、配列番号4に記載の5,911位、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号6に記載の6,411位、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置、に対応する位置に近接する前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに生体試料を接触させることと、
b)配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号3に記載の5,557位、配列番号4に記載の5,911位、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号6に記載の6,411位、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置、に対応する前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を少なくとも介してプライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
実施形態70.前記判定ステップが、
a)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、または配列番号103に記載の891位に対応する位置に近接する前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに生体試料を接触させることと、
b)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、または配列番号103に記載の891位に対応する前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を少なくとも介してプライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか否か、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
a)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、または配列番号103に記載の891位に対応する位置に近接する前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに生体試料を接触させることと、
b)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、または配列番号103に記載の891位に対応する前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を少なくとも介してプライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか否か、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
実施形態71.前記判定ステップが、
a)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、配列番号50に記載の600~606位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、配列番号51に記載の617位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、配列番号52に記載の971位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、配列番号53に記載の980~983位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、配列番号54に記載の1,471位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応する位置に近接する前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記生体試料を接触させることと、
b)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、配列番号50に記載の600~606位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、配列番号51に記載の617位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、配列番号52に記載の971位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、配列番号53に記載の980~983位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、配列番号54に記載の1,471位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応する前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を少なくとも介してプライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか否か、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
a)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、配列番号50に記載の600~606位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、配列番号51に記載の617位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、配列番号52に記載の971位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、配列番号53に記載の980~983位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、配列番号54に記載の1,471位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応する位置に近接する前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記生体試料を接触させることと、
b)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、配列番号50に記載の600~606位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、配列番号51に記載の617位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、配列番号52に記載の971位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、配列番号53に記載の980~983位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、配列番号54に記載の1,471位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応する前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を少なくとも介してプライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか否か、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
実施形態72.前記判定ステップが、前記核酸分子全体を配列決定することを含む、実施形態67~71のいずれか1つに記載の方法。
実施形態73.前記判定ステップが、
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
実施形態73.前記判定ステップが、
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
実施形態74.前記判定ステップが、
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
実施形態75.前記判定ステップが、
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
実施形態76.前記試料中の前記核酸分子がmRNAであり、前記増幅ステップの前に前記mRNAをcDNAに逆転写する、実施形態75に記載の方法。
実施形態77.検出ステップが、
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
実施形態77.検出ステップが、
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
実施形態78.検出ステップが、
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
実施形態79.検出ステップが、
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態62~66のいずれか1つに記載の方法。
実施形態80.前記対象が、GPR75参照であり、前記対象が、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤を、標準投与量で投与される、実施形態62~79のいずれか1つに記載の方法。
実施形態81.前記対象が、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性であり、前記対象が、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤を、標準投与量と同じかまたはそれより少ない量で投与される、実施形態62~79のいずれか1つに記載の方法。
実施形態82.対象におけるヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)バリアント核酸分子を検出する方法であって、前記対象から得た試料をアッセイして、前記試料中の核酸分子が、
配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、もしくは配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列を含むゲノム核酸分子、
配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列を有するmRNA分子、または
mRNA分子から生成されたcDNA分子であって、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列を有する、前記cDNA分子であるか否かを判定することを含む、方法。
配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、もしくは配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列を含むゲノム核酸分子、
配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列を有するmRNA分子、または
mRNA分子から生成されたcDNA分子であって、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列を有する、前記cDNA分子であるか否かを判定することを含む、方法。
実施形態83.前記方法が、in vitro法である、実施形態82に記載の方法。
実施形態84.前記アッセイが、前記核酸分子の少なくとも一部分を配列決定することを含み、前記配列決定された部分が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
実施形態84.前記アッセイが、前記核酸分子の少なくとも一部分を配列決定することを含み、前記配列決定された部分が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
実施形態85.前記アッセイが、前記核酸分子の少なくとも一部分を配列決定することを含み、前記配列決定された部分が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
実施形態86.前記アッセイが、前記核酸分子の少なくとも一部分を配列決定することを含み、前記配列決定された部分が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミン、その相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
実施形態87.前記アッセイが、
a)配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号3に記載の5,557位、配列番号4に記載の5,911位、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号6に記載の6,411位、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置に近接する前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記試料を接触させることと、
b)配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号3に記載の5,557位、配列番号4に記載の5,911位、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号6に記載の6,411位、または配列番号99に記載の5,831位に対応する前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を少なくとも介して前記プライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
a)配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号3に記載の5,557位、配列番号4に記載の5,911位、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号6に記載の6,411位、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置に近接する前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記試料を接触させることと、
b)配列番号2に記載の5,540~5,546位、配列番号3に記載の5,557位、配列番号4に記載の5,911位、配列番号5に記載の5,920~5,923位、配列番号6に記載の6,411位、または配列番号99に記載の5,831位に対応する前記GPR75ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を少なくとも介して前記プライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
実施形態88.前記アッセイが、
a)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、または配列番号103に記載の891位に対応する位置に近接する前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記試料を接触させることと、
b)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、または配列番号103に記載の891位に対応する前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を少なくとも介して前記プライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか否か、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
a)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、または配列番号103に記載の891位に対応する位置に近接する前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記試料を接触させることと、
b)配列番号11に記載の539~545位、配列番号16に記載の440~446位、配列番号21に記載の361~367位、配列番号26に記載の600~606位、配列番号12に記載の556位、配列番号17に記載の457位、配列番号22に記載の378位、配列番号27に記載の617位、配列番号13に記載の910位、配列番号18に記載の811位、配列番号23に記載の732位、配列番号28に記載の971位、配列番号14に記載の919~922位、配列番号19に記載の820~823位、配列番号24に記載の741~744位、配列番号29に記載の980~983位、配列番号15に記載の1,410位、配列番号20に記載の1,311位、配列番号25に記載の1,232位、配列番号30に記載の1,471位、配列番号100に記載の830位、配列番号101に記載の731位、配列番号102に記載の652位、または配列番号103に記載の891位に対応する前記GPR75 mRNA分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を少なくとも介して前記プライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含むか否か、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか否か、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか否か、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
実施形態89.前記アッセイが、
a)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、配列番号50に記載の600~606位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、配列番号51に記載の617位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、配列番号52に記載の971位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、配列番号53に記載の980~983位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、配列番号54に記載の1,471位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応する位置に近接する前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記試料を接触させることと、
b)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、配列番号50に記載の600~606位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、配列番号51に記載の617位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、配列番号52に記載の971位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、配列番号53に記載の980~983位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、または配列番号54に記載の1,471位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応する前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を少なくとも介して前記プライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか否か、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
a)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、配列番号50に記載の600~606位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、配列番号51に記載の617位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、配列番号52に記載の971位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、配列番号53に記載の980~983位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、配列番号54に記載の1,471位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応する位置に近接する前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の一部分とハイブリダイズするプライマーに前記試料を接触させることと、
b)配列番号35に記載の539~545位、配列番号40に記載の440~446位、配列番号45に記載の361~367位、配列番号50に記載の600~606位、配列番号36に記載の556位、配列番号41に記載の457位、配列番号46に記載の378位、配列番号51に記載の617位、配列番号37に記載の910位、配列番号42に記載の811位、配列番号47に記載の732位、配列番号52に記載の971位、配列番号38に記載の919~922位、配列番号43に記載の820~823位、配列番号48に記載の741~744位、配列番号53に記載の980~983位、配列番号39に記載の1,410位、配列番号44に記載の1,311位、配列番号49に記載の1,232位、または配列番号54に記載の1,471位、配列番号104に記載の830位、配列番号105に記載の731位、配列番号106に記載の652位、または配列番号107に記載の891位に対応する前記GPR75 cDNA分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を少なくとも介して前記プライマーを伸長させることと、
c)前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含むか否か、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含むか否か、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか否か、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含むか否か、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含むか否か、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含むか否か、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含むか否かを判定することと、を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
実施形態90.前記アッセイが、前記核酸分子全体を配列決定することを含む、実施形態84~89のいずれか1つに記載の方法。
実施形態91.アッセイが、
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、または配列番号99に記載の5,831位もしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
実施形態91.アッセイが、
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入、または配列番号99に記載の5,831位もしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
実施形態92.前記アッセイが、
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
実施形態93.アッセイが、
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
a)前記ヒトGPR75ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅することであって、前記一部分が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅することと、
b)前記増幅した核酸分子を検出可能な標識で標識することと、
c)前記標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
d)前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
実施形態94.前記試料中の前記核酸分子がmRNAであり、前記増幅ステップの前に前記mRNAをcDNAに逆転写する、実施形態93に記載の方法。
実施形態95.アッセイが、
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
実施形態95.アッセイが、
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
実施形態96.アッセイが、
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
実施形態97.アッセイが、
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
前記生体試料中の前記核酸分子を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させることと、
前記検出可能な標識を検出することと、を含む、実施形態82または実施形態83に記載の方法。
実施形態98.前記核酸分子が、前記対象から得た細胞内に存在する、実施形態82~97のいずれか1つに記載の方法。
実施形態99.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs、またはCys400fsバリアントポリペプチドの存在を検出する方法であって、対象から得た試料でアッセイを実施し、前記試料中のGPR75タンパク質が、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、または配列番号108を含むか否かを判定することを含む、前記方法。
実施形態99.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs、またはCys400fsバリアントポリペプチドの存在を検出する方法であって、対象から得た試料でアッセイを実施し、前記試料中のGPR75タンパク質が、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、または配列番号108を含むか否かを判定することを含む、前記方法。
実施形態100.前記アッセイが、前記ポリペプチドを配列決定することを含む、実施形態99に記載の方法。
実施形態101.前記アッセイが、イムノアッセイである、実施形態99に記載の方法。
実施形態101.前記アッセイが、イムノアッセイである、実施形態99に記載の方法。
実施形態102.少なくとも約15ヌクレオチドを含む単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーであって、前記変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーが、ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含み、前記一部分が、
配列番号2に記載の5,540~5,546位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号11に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号16に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号21に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号26に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号35に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号40に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号45に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号50に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、
配列番号5に記載の5,920~5,923位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号14に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号19に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号24に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号29に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号38に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号43に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号48に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号53に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、または
配列番号6に記載の6,411位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号54に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体を含む、前記変化特異的プローブまたは変化特異的プライマー。
配列番号2に記載の5,540~5,546位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号11に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号16に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号21に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号26に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号35に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号40に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号45に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号50に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、
配列番号5に記載の5,920~5,923位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号14に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号19に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号24に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号29に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号38に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号43に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号48に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号53に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、または
配列番号6に記載の6,411位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号54に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体を含む、前記変化特異的プローブまたは変化特異的プライマー。
実施形態103.配列番号2に記載の5,540~5,546位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号5に記載の5,920~5,923位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号6に記載の6,411位に対応する位置もしくはその相補体を含むヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含む、実施形態102に記載の変化特異的プローブまたは変化特異的プライマー。
実施形態104.配列番号11に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号16に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号21に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号26に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号14に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号19に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号24に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号29に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号30に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体を含むヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含む、実施形態102に記載の変化特異的プローブまたは変化特異的プライマー。
実施形態105.配列番号35に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号40に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号45に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号50に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号38に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号43に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号48に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号53に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体を含むヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含む、実施形態102に記載の変化特異的プローブまたは変化特異的プライマー。
実施形態106.前記変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーが、DNAを含む、実施形態102~105のいずれか1つに記載の変化特異的プローブまたは変化特異的プライマー。
実施形態107.前記変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーが、RNAを含む、実施形態102~105のいずれか1つに記載の変化特異的プローブまたは変化特異的プライマー。
実施形態108.前記変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーが、標識を含む、実施形態102~107のいずれか1つに記載の変化特異的プローブまたは変化特異的プライマー。
実施形態109.前記標識が、蛍光標識、放射標識、またはビオチンである、実施形態108に記載の変化特異的プローブまたは変化特異的プライマー。
実施形態110.実施形態102~109のいずれか1つに記載の変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーが結合している基質を含む、支持体。
実施形態110.実施形態102~109のいずれか1つに記載の変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーが結合している基質を含む、支持体。
実施形態111.前記支持体が、マイクロアレイである、実施形態110に記載の支持体。
実施形態112.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むゲノム核酸分子とハイブリダイズした変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含む分子複合体であって、前記変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブが、配列番号2に記載の5,539~5,540位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体において、配列番号5に記載の5,919~5,920位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体において、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、前記ゲノム核酸分子とハイブリダイズしている、分子複合体。
実施形態112.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むゲノム核酸分子とハイブリダイズした変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含む分子複合体であって、前記変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブが、配列番号2に記載の5,539~5,540位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体において、配列番号5に記載の5,919~5,920位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体において、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、前記ゲノム核酸分子とハイブリダイズしている、分子複合体。
実施形態113.前記ゲノム核酸分子が、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、または配列番号99を含む、実施形態112に記載の分子複合体。
実施形態114.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むmRNA分子とハイブリダイズした変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含む分子複合体であって、前記変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブが、配列番号11に記載の538~539位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号16に記載の439~440位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号21に記載の360~361位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号26に記載の599~600位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号14に記載の918~919位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号19に記載の819~820位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号24に記載の740~741位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号29に記載の979~980位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、前記mRNA分子とハイブリダイズしている、前記分子複合体。
実施形態114.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むmRNA分子とハイブリダイズした変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含む分子複合体であって、前記変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブが、配列番号11に記載の538~539位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号16に記載の439~440位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号21に記載の360~361位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号26に記載の599~600位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号14に記載の918~919位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号19に記載の819~820位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号24に記載の740~741位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号29に記載の979~980位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、前記mRNA分子とハイブリダイズしている、前記分子複合体。
実施形態115.前記mRNA分子が、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号100、配列番号101、配列番号102、または配列番号103を含む、実施形態114に記載の分子複合体。
実施形態116.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むcDNA分子とハイブリダイズした変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含む分子複合体であって、前記変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブが、配列番号35に記載の538~539位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号40に記載の439~440位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号45に記載の360~361位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号50に記載の599~600位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号38に記載の918~919位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号43に記載の819~820位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号48に記載の740~741位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号53に記載の979~980位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体とハイブリダイズしている、前記分子複合体。
実施形態117.前記cDNA分子が、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、または配列番号54、配列番号104、配列番号105、配列番号106、または配列番号107を含む、実施形態116に記載の分子複合体。
実施形態118.前記変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーが、標識を含む、実施形態112~117のいずれか1つに記載の分子複合体。
実施形態119.前記標識が、蛍光標識、放射標識、またはビオチンである、実施形態118に記載の分子複合体。
実施形態119.前記標識が、蛍光標識、放射標識、またはビオチンである、実施形態118に記載の分子複合体。
実施形態120.非ヒトポリメラーゼを更に含む、実施形態112~119のいずれか1つに記載の分子複合体。
実施形態121.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子またはその相補体であって、前記ポリペプチドが、配列番号56に記載の110位に対応する位置から始まるフレームシフト、配列番号59に記載の236位に対応する位置から始まるフレームシフト、または配列番号60に記載の400位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、前記単離された核酸分子またはその相補体。
実施形態121.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子またはその相補体であって、前記ポリペプチドが、配列番号56に記載の110位に対応する位置から始まるフレームシフト、配列番号59に記載の236位に対応する位置から始まるフレームシフト、または配列番号60に記載の400位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、前記単離された核酸分子またはその相補体。
実施形態122.前記核酸分子が、配列番号56と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有するGPR75ポリペプチドであって、配列番号56に記載の110位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、前記GPR75ポリペプチド、配列番号59と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有するGPR75ポリペプチドであって、配列番号59に記載の236位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、前記GPR75ポリペプチド、または配列番号60と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有するGPR75ポリペプチドであって、配列番号60に記載の400位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、前記GPR75ポリペプチドをコードする、実施形態121に記載の単離された核酸分子またはその相補体。
実施形態123.前記ポリペプチドが、配列番号56、配列番号59、または配列番号60を含む、実施形態121に記載の核酸分子またはその相補体。
実施形態124.実施形態121~123のいずれか1つに記載の単離された核酸分子またはその相補体を含む、ベクター。
実施形態124.実施形態121~123のいずれか1つに記載の単離された核酸分子またはその相補体を含む、ベクター。
実施形態125.前記ベクターが、プラスミドである、実施形態124に記載のベクター。
実施形態126.前記ベクターが、ウイルスである、実施形態124に記載のベクター。
実施形態126.前記ベクターが、ウイルスである、実施形態124に記載のベクター。
実施形態127.実施形態121~123のいずれか1つに記載の単離された核酸分子またはその相補体を含む、宿主細胞。
実施形態128.実施形態124~126のいずれか1つに記載のベクターを含む、宿主細胞。
実施形態128.実施形態124~126のいずれか1つに記載のベクターを含む、宿主細胞。
実施形態129.前記ヌクレオチド配列が、前記宿主細胞内で活性なプロモーターに作動可能に連結されている、実施形態127または実施形態128に記載の宿主細胞。
実施形態130.前記プロモーターが、外来性プロモーターである、実施形態129に記載の宿主細胞。
実施形態130.前記プロモーターが、外来性プロモーターである、実施形態129に記載の宿主細胞。
実施形態131.前記プロモーターが、誘導性プロモーターである、実施形態129または実施形態130に記載の宿主細胞。
実施形態132.前記宿主細胞が、細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞、または哺乳動物細胞である、実施形態127~131のいずれか1つに記載の宿主細胞。
実施形態132.前記宿主細胞が、細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞、または哺乳動物細胞である、実施形態127~131のいずれか1つに記載の宿主細胞。
実施形態133.実施形態121~123のいずれか1つに記載の単離された核酸分子またはその相補体と、担体と、を含む、組成物。
実施形態134.実施形態124~126のいずれか1つに記載のベクターと、担体と、を含む、組成物。
実施形態134.実施形態124~126のいずれか1つに記載のベクターと、担体と、を含む、組成物。
実施形態135.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたゲノム核酸分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、または配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、前記単離されたゲノム核酸分子。
実施形態136.前記ヌクレオチド配列が、配列番号2に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号5に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、または配列番号6に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含む、実施形態135に記載の単離されたゲノム核酸分子またはその相補体。
実施形態137.前記核酸分子が、配列番号2、配列番号5、または配列番号6を含む、実施形態136に記載の単離されたゲノム核酸分子またはその相補体。
実施形態138.実施形態135~137のいずれか1つに記載の単離されたゲノム核酸分子またはその相補体を含む、ベクター。
実施形態138.実施形態135~137のいずれか1つに記載の単離されたゲノム核酸分子またはその相補体を含む、ベクター。
実施形態139.前記ベクターが、プラスミドである、実施形態138に記載のベクター。
実施形態140.前記ベクターが、ウイルスである、実施形態138に記載のベクター。
実施形態140.前記ベクターが、ウイルスである、実施形態138に記載のベクター。
実施形態141.実施形態135~137のいずれか1つに記載の単離されたゲノム核酸分子またはその相補体を含む、宿主細胞。
実施形態142.実施形態138~140のいずれか1つに記載のベクターを含む、宿主細胞。
実施形態142.実施形態138~140のいずれか1つに記載のベクターを含む、宿主細胞。
実施形態143.前記ヌクレオチド配列が、前記宿主細胞内で活性なプロモーターに作動可能に連結されている、実施形態141または実施形態142に記載の宿主細胞。
実施形態144.前記プロモーターが、外来性プロモーターである、実施形態143に記載の宿主細胞。
実施形態144.前記プロモーターが、外来性プロモーターである、実施形態143に記載の宿主細胞。
実施形態145.前記プロモーターが、誘導性プロモーターである、実施形態143または実施形態144に記載の宿主細胞。
実施形態146.前記宿主細胞が、細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞、または哺乳動物細胞である、実施形態141~145のいずれか1つに記載の宿主細胞。
実施形態146.前記宿主細胞が、細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞、または哺乳動物細胞である、実施形態141~145のいずれか1つに記載の宿主細胞。
実施形態147.実施形態135~137のいずれか1つに記載の単離されたゲノム核酸分子またはその相補体と、担体と、を含む、組成物。
実施形態148.実施形態138~140のいずれか1つに記載のベクターと、担体と、を含む、組成物。
実施形態148.実施形態138~140のいずれか1つに記載のベクターと、担体と、を含む、組成物。
実施形態149.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたmRNA分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、単離されたmRNA分子。
実施形態150.前記ヌクレオチド配列が、配列番号11に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号16に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号21に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号26に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号14に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号19に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号24に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号29に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号15に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号20に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、配列番号25に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含むか、または、配列番号30に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、実施形態149に記載の単離されたmRNA分子またはその相補体。
実施形態151.前記核酸分子が、配列番号11、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号29、または配列番号30を含む、実施形態149に記載の単離されたmRNA分子またはその相補体。
実施形態152.実施形態149~151のいずれか1つに記載の単離されたmRNA分子またはその相補体を含む、ベクター。
実施形態153.前記ベクターが、プラスミドである、実施形態152に記載のベクター。
実施形態153.前記ベクターが、プラスミドである、実施形態152に記載のベクター。
実施形態154.前記ベクターが、ウイルスである、実施形態152に記載のベクター。
実施形態155.実施形態149~151のいずれか1つに記載の単離されたmRNA分子またはその相補体を含む、宿主細胞。
実施形態155.実施形態149~151のいずれか1つに記載の単離されたmRNA分子またはその相補体を含む、宿主細胞。
実施形態156.実施形態152~154のいずれか1つに記載のベクターを含む、宿主細胞。
実施形態157.前記ヌクレオチド配列が、前記宿主細胞内で活性なプロモーターに作動可能に連結されている、実施形態155または実施形態156に記載の宿主細胞。
実施形態157.前記ヌクレオチド配列が、前記宿主細胞内で活性なプロモーターに作動可能に連結されている、実施形態155または実施形態156に記載の宿主細胞。
実施形態158.前記プロモーターが、外来性プロモーターである、実施形態157に記載の宿主細胞。
実施形態159.前記プロモーターが、誘導性プロモーターである、実施形態157または実施形態158に記載の宿主細胞。
実施形態159.前記プロモーターが、誘導性プロモーターである、実施形態157または実施形態158に記載の宿主細胞。
実施形態160.前記宿主細胞が、細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞、または哺乳動物細胞である、実施形態155~159のいずれか1つに記載の宿主細胞。
実施形態161.実施形態149~151のいずれか1つに記載の単離されたmRNA分子またはその相補体と、担体と、を含む、組成物。
実施形態161.実施形態149~151のいずれか1つに記載の単離されたmRNA分子またはその相補体と、担体と、を含む、組成物。
実施形態162.実施形態152~154のいずれか1つに記載のベクターと、担体と、を含む、組成物。
実施形態163.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたcDNA分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、前記単離されたcDNA分子。
実施形態163.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたcDNA分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、前記単離されたcDNA分子。
実施形態164.前記ヌクレオチド配列が、配列番号35に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号40に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号45に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号50に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いているか、配列番号38に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号43に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号48に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号53に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いているか、配列番号39に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号44に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、配列番号49に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含むか、または配列番号54に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含む、実施形態163に記載の単離されたcDNA分子またはその相補体。
実施形態165.前記核酸分子が、配列番号35、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号53、または配列番号54を含む、実施形態163に記載の単離されたcDNA分子またはその相補体。
実施形態166.実施形態163~165のいずれか1つに記載のcDNA分子またはその相補体を含む、ベクター。
実施形態167.前記ベクターが、プラスミドである、実施形態166に記載のベクター。
実施形態167.前記ベクターが、プラスミドである、実施形態166に記載のベクター。
実施形態168.前記ベクターが、ウイルスである、実施形態166に記載のベクター。
実施形態169.実施形態163~165のいずれか1つに記載のcDNA分子またはその相補体を含む、宿主細胞。
実施形態169.実施形態163~165のいずれか1つに記載のcDNA分子またはその相補体を含む、宿主細胞。
実施形態170.実施形態166~168のいずれか1つに記載のベクターを含む、宿主細胞。
実施形態171.前記ヌクレオチド配列が、前記宿主細胞内で活性なプロモーターに作動可能に連結されている、実施形態169または実施形態170に記載の宿主細胞。
実施形態171.前記ヌクレオチド配列が、前記宿主細胞内で活性なプロモーターに作動可能に連結されている、実施形態169または実施形態170に記載の宿主細胞。
実施形態172.前記プロモーターが、外来性プロモーターである、実施形態171に記載の宿主細胞。
実施形態173.前記プロモーターが、誘導性プロモーターである、実施形態171または実施形態172に記載の宿主細胞。
実施形態173.前記プロモーターが、誘導性プロモーターである、実施形態171または実施形態172に記載の宿主細胞。
実施形態174.前記宿主細胞が、細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞、または哺乳動物細胞である、実施形態169~173のいずれか1つに記載の宿主細胞。
実施形態175.実施形態163~165のいずれか1つに記載のcDNA分子またはその相補体と、担体と、を含む、組成物。
実施形態175.実施形態163~165のいずれか1つに記載のcDNA分子またはその相補体と、担体と、を含む、組成物。
実施形態176.実施形態166~168のいずれか1つに記載のベクターと、担体と、を含む、組成物。
実施形態177.配列番号56と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有する単離されたヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドであって、配列番号55に記載の110~540位に対応する位置のアミノ酸を欠いている、前記単離されたヒトGPR75ポリペプチド、配列番号59と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有する単離されたGPR75ポリペプチドであって、配列番号55に記載の236~540位に対応する位置のアミノ酸を欠いている、前記単離されたヒトGPR75ポリペプチド、または配列番号60と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有する単離されたGPR75ポリペプチドであって、配列番号55に記載の400~540位に対応する位置のアミノ酸を欠いている、前記単離されたヒトGPR75ポリペプチド。
実施形態177.配列番号56と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有する単離されたヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドであって、配列番号55に記載の110~540位に対応する位置のアミノ酸を欠いている、前記単離されたヒトGPR75ポリペプチド、配列番号59と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有する単離されたGPR75ポリペプチドであって、配列番号55に記載の236~540位に対応する位置のアミノ酸を欠いている、前記単離されたヒトGPR75ポリペプチド、または配列番号60と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有する単離されたGPR75ポリペプチドであって、配列番号55に記載の400~540位に対応する位置のアミノ酸を欠いている、前記単離されたヒトGPR75ポリペプチド。
実施形態178.前記ポリペプチドが、配列番号56、配列番号59、または配列番号60を含む、実施形態177に記載のポリペプチド。
実施形態179.前記ポリペプチドが、異種分子に融合されている、実施形態177または実施形態178に記載のポリペプチド。
実施形態179.前記ポリペプチドが、異種分子に融合されている、実施形態177または実施形態178に記載のポリペプチド。
実施形態180.前記異種分子が、免疫グロブリンFcドメイン、ペプチド精製タグ、蛍光タンパク質、または形質導入ドメインを含む、実施形態179に記載のポリペプチド。
実施形態181.前記ポリペプチドが、標識に連結されている、実施形態177~180のいずれか1つに記載のポリペプチド。
実施形態182.前記標識が、蛍光標識または放射標識である、実施形態181に記載のポリペプチド。
実施形態182.前記標識が、蛍光標識または放射標識である、実施形態181に記載のポリペプチド。
実施形態183.前記標識が、ポリエチレングリコール、ポリシアル酸、またはグリコール酸を含む、実施形態181に記載のポリペプチド。
実施形態184.実施形態177~183のいずれか1つに記載のポリペプチドと、担体または賦形剤と、を含む、組成物。
実施形態184.実施形態177~183のいずれか1つに記載のポリペプチドと、担体または賦形剤と、を含む、組成物。
実施形態185.実施形態177~183のいずれか1つに記載のポリペプチドを発現する、宿主細胞。
実施形態186.実施形態177~183のいずれか1つに記載のポリペプチドを生成する方法であって、前記ポリペプチドをコードする核酸分子を含む宿主細胞を培養し、それにより前記宿主細胞に前記ポリペプチドを発現させ、前記発現させたポリペプチドを回収することを含む、前記方法。
実施形態186.実施形態177~183のいずれか1つに記載のポリペプチドを生成する方法であって、前記ポリペプチドをコードする核酸分子を含む宿主細胞を培養し、それにより前記宿主細胞に前記ポリペプチドを発現させ、前記発現させたポリペプチドを回収することを含む、前記方法。
実施形態187.前記核酸分子が、異種プロモーターの制御下にある、実施形態186に記載の方法。
実施形態188.前記核酸分子が、誘導性プロモーターの制御下にある、実施形態186または実施形態187に記載の方法。
実施形態188.前記核酸分子が、誘導性プロモーターの制御下にある、実施形態186または実施形態187に記載の方法。
実施形態189.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子またはその相補体であって、前記ポリペプチドが、配列番号57に記載の116位に対応する位置のトレオニンを含むか、配列番号58に記載の233位に対応する位置で終止するか、または配列番号99に記載の207位に対応する位置のシステインを含む、前記単離された核酸分子またはその相補体。
実施形態190.前記核酸分子が、配列番号57と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有するGPR75ポリペプチドであって、配列番号57に記載の116位に対応する位置のトレオニンを含む、前記GPR75ポリペプチド、配列番号58と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有するGPR75ポリペプチドであって、配列番号58に記載の233位に対応する位置で終止する、前記GPR75ポリペプチド、または配列番号99と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有するGPR75ポリペプチドであって、配列番号99に記載の207位に対応する位置のシステインを含む、前記GPR75ポリペプチドをコードする、実施形態189に記載の単離された核酸分子またはその相補体。
実施形態191.前記ポリペプチドが、配列番号57、配列番号58、または配列番号99を含む、実施形態189に記載の核酸分子またはその相補体。
実施形態192.実施形態189~191のいずれか1つに記載の単離された核酸分子またはその相補体を含む、ベクター。
実施形態192.実施形態189~191のいずれか1つに記載の単離された核酸分子またはその相補体を含む、ベクター。
実施形態193.前記ベクターが、プラスミドである、実施形態192に記載のベクター。
実施形態194.前記ベクターが、ウイルスである、実施形態192に記載のベクター。
実施形態194.前記ベクターが、ウイルスである、実施形態192に記載のベクター。
実施形態195.実施形態189~191のいずれか1つに記載の単離された核酸分子またはその相補体を含む、宿主細胞。
実施形態196.実施形態192~194のいずれか1つに記載のベクターを含む、宿主細胞。
実施形態196.実施形態192~194のいずれか1つに記載のベクターを含む、宿主細胞。
実施形態197.前記ヌクレオチド配列が、前記宿主細胞内で活性なプロモーターに作動可能に連結されている、実施形態195または実施形態196に記載の宿主細胞。
実施形態198.前記プロモーターが、外来性プロモーターである、実施形態197に記載の宿主細胞。
実施形態198.前記プロモーターが、外来性プロモーターである、実施形態197に記載の宿主細胞。
実施形態199.前記プロモーターが、誘導性プロモーターである、実施形態197または実施形態198に記載の宿主細胞。
実施形態200.前記宿主細胞が、細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞、または哺乳動物細胞である、実施形態195~199のいずれか1つに記載の宿主細胞。
実施形態200.前記宿主細胞が、細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞、または哺乳動物細胞である、実施形態195~199のいずれか1つに記載の宿主細胞。
実施形態201.実施形態189~191のいずれか1つに記載の単離された核酸分子またはその相補体と、担体と、を含む、組成物。
実施形態202.実施形態192~194のいずれか1つに記載のベクターと、担体と、を含む、組成物。
実施形態202.実施形態192~194のいずれか1つに記載のベクターと、担体と、を含む、組成物。
実施形態203.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたmRNA分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記単離されたmRNA分子。
実施形態204.前記ヌクレオチド配列が、配列番号12に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含むか、配列番号17に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含むか、配列番号22に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含むか、配列番号27に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含むか、配列番号13に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含むか、配列番号18に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含むか、配列番号23に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含むか、配列番号28に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含むか、配列番号100に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含むか、配列番号101に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含むか、配列番号102に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含むか、または配列番号103に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、実施形態203に記載の単離されたmRNA分子またはその相補体。
実施形態205.前記核酸分子が、配列番号12、配列番号17、配列番号22、配列番号27、配列番号13、配列番号18、配列番号23、配列番号28、配列番号100、配列番号101、配列番号102、または配列番号103を含む、実施形態203に記載の単離されたmRNA分子またはその相補体。
実施形態206.実施形態203~205のいずれか1つに記載の単離されたmRNA分子またはその相補体を含む、ベクター。
実施形態207.前記ベクターが、プラスミドである、実施形態206に記載のベクター。
実施形態207.前記ベクターが、プラスミドである、実施形態206に記載のベクター。
実施形態208.前記ベクターが、ウイルスである、実施形態206に記載のベクター。
実施形態209.実施形態203~205のいずれか1つに記載の単離されたmRNA分子またはその相補体を含む、宿主細胞。
実施形態209.実施形態203~205のいずれか1つに記載の単離されたmRNA分子またはその相補体を含む、宿主細胞。
実施形態210.実施形態206~208のいずれか1つに記載のベクターを含む、宿主細胞。
実施形態211.前記ヌクレオチド配列が、前記宿主細胞内で活性なプロモーターに作動可能に連結されている、実施形態209または実施形態210に記載の宿主細胞。
実施形態211.前記ヌクレオチド配列が、前記宿主細胞内で活性なプロモーターに作動可能に連結されている、実施形態209または実施形態210に記載の宿主細胞。
実施形態212.前記プロモーターが、外来性プロモーターである、実施形態211に記載の宿主細胞。
実施形態213.前記プロモーターが、誘導性プロモーターである、実施形態211または実施形態212に記載の宿主細胞。
実施形態213.前記プロモーターが、誘導性プロモーターである、実施形態211または実施形態212に記載の宿主細胞。
実施形態214.前記宿主細胞が、細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞、または哺乳動物細胞である、実施形態209~213のいずれか1つに記載の宿主細胞。
実施形態215.実施形態203~205のいずれか1つに記載の単離されたmRNA分子またはその相補体と、担体と、を含む、組成物。
実施形態215.実施形態203~205のいずれか1つに記載の単離されたmRNA分子またはその相補体と、担体と、を含む、組成物。
実施形態216.実施形態206~208のいずれか1つに記載のベクターと、担体と、を含む、組成物。
実施形態217.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたcDNA分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記単離されたcDNA分子。
実施形態217.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたcDNA分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記単離されたcDNA分子。
実施形態218.前記ヌクレオチド配列が、配列番号36に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含むか、配列番号41に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含むか、配列番号46に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含むか、配列番号51に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含むか、配列番号37に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含むか、配列番号42に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含むか、配列番号47に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含むか、配列番号52に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含むか、配列番号104に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含むか、配列番号105に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含むか、配列番号106に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含むか、または配列番号107に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、実施形態217に記載の単離されたcDNA分子またはその相補体。
実施形態219.前記核酸分子が、配列番号36、配列番号41、配列番号46、配列番号51、配列番号37、配列番号42、配列番号47、配列番号52、配列番号104、配列番号105、配列番号106、または配列番号107を含む、実施形態217に記載の単離されたcDNA分子またはその相補体。
実施形態220.実施形態217~219のいずれか1つに記載の単離されたcDNA分子またはその相補体を含む、ベクター。
実施形態221.前記ベクターが、プラスミドである、実施形態220に記載のベクター。
実施形態221.前記ベクターが、プラスミドである、実施形態220に記載のベクター。
実施形態222.前記ベクターが、ウイルスである、実施形態220に記載のベクター。
実施形態223.実施形態217~219のいずれか1つに記載の単離されたcDNA分子またはその相補体を含む、宿主細胞。
実施形態223.実施形態217~219のいずれか1つに記載の単離されたcDNA分子またはその相補体を含む、宿主細胞。
実施形態224.実施形態220~222のいずれか1つに記載のベクターを含む、宿主細胞。
実施形態225.前記ヌクレオチド配列が、前記宿主細胞内で活性なプロモーターに作動可能に連結されている、実施形態223または実施形態224に記載の宿主細胞。
実施形態225.前記ヌクレオチド配列が、前記宿主細胞内で活性なプロモーターに作動可能に連結されている、実施形態223または実施形態224に記載の宿主細胞。
実施形態226.前記プロモーターが、外来性プロモーターである、実施形態225に記載の宿主細胞。
実施形態227.前記プロモーターが、誘導性プロモーターである、実施形態225または実施形態226に記載の宿主細胞。
実施形態227.前記プロモーターが、誘導性プロモーターである、実施形態225または実施形態226に記載の宿主細胞。
実施形態228.前記宿主細胞が、細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞、または哺乳動物細胞である、実施形態223~227のいずれか1つに記載の宿主細胞。
実施形態229.実施形態217~219のいずれか1つに記載の単離されたcDNA分子またはその相補体と、担体と、を含む、組成物。
実施形態229.実施形態217~219のいずれか1つに記載の単離されたcDNA分子またはその相補体と、担体と、を含む、組成物。
実施形態230.実施形態220~222のいずれか1つに記載のベクターと、担体と、を含む、組成物。
実施形態231.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたゲノム核酸分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記単離されたゲノム核酸分子。
実施形態231.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたゲノム核酸分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記単離されたゲノム核酸分子。
実施形態232.前記ヌクレオチド配列が、配列番号3に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含むか、配列番号4に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含むか、または配列番号99に対して少なくとも90%の配列同一性を有し、かつ配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含む、実施形態231に記載の単離されたゲノム核酸分子またはその相補体。
実施形態233.前記核酸分子が、配列番号3、配列番号4、または配列番号99を含む、実施形態231に記載の単離されたゲノム核酸分子またはその相補体。
実施形態234.実施形態231~233のいずれか1つに記載の単離されたゲノム核酸分子またはその相補体を含む、ベクター。
実施形態234.実施形態231~233のいずれか1つに記載の単離されたゲノム核酸分子またはその相補体を含む、ベクター。
実施形態235.前記ベクターが、プラスミドである、実施形態234に記載のベクター。
実施形態236.前記ベクターが、ウイルスである、実施形態234に記載のベクター。
実施形態236.前記ベクターが、ウイルスである、実施形態234に記載のベクター。
実施形態237.実施形態231~233のいずれか1つに記載の単離されたゲノム核酸分子またはその相補体を含む、宿主細胞。
実施形態238.実施形態234~236のいずれか1つに記載のベクターを含む、宿主細胞。
実施形態238.実施形態234~236のいずれか1つに記載のベクターを含む、宿主細胞。
実施形態239.前記ヌクレオチド配列が、前記宿主細胞内で活性なプロモーターに作動可能に連結されている、実施形態237または実施形態238に記載の宿主細胞。
実施形態240.前記プロモーターが、外来性プロモーターである、実施形態239に記載の宿主細胞。
実施形態240.前記プロモーターが、外来性プロモーターである、実施形態239に記載の宿主細胞。
実施形態241.前記プロモーターが、誘導性プロモーターである、実施形態239または実施形態240に記載の宿主細胞。
実施形態242.前記宿主細胞が、細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞、または哺乳動物細胞である、実施形態237~241のいずれか1つに記載の宿主細胞。
実施形態242.前記宿主細胞が、細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞、または哺乳動物細胞である、実施形態237~241のいずれか1つに記載の宿主細胞。
実施形態243.実施形態231~233のいずれか1つに記載の単離されたゲノム核酸分子またはその相補体と、担体と、を含む、組成物。
実施形態244.実施形態234~236のいずれか1つに記載のベクターと、担体と、を含む、組成物。
実施形態244.実施形態234~236のいずれか1つに記載のベクターと、担体と、を含む、組成物。
実施形態245.配列番号57と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有する単離されたヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドであって、配列番号57に記載の116位に対応する位置のトレオニンを含む、前記単離されたヒトGPR75ポリペプチド、配列番号58と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有する単離されたヒトGPR75ポリペプチドであって、配列番号58に記載の233位に対応する位置で終止する、前記単離されたヒトGPR75ポリペプチド、または配列番号99と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有する単離されたヒトGPR75ポリペプチドであって、配列番号99に記載の207位に対応する位置のシステインを含む、前記単離されたヒトGPR75ポリペプチド。
実施形態246.前記ポリペプチドが、配列番号57、配列番号58、または配列番号99を含む、実施形態245に記載のポリペプチド。
実施形態247.前記ポリペプチドが、異種分子に融合されている、実施形態245または実施形態246に記載のポリペプチド。
実施形態247.前記ポリペプチドが、異種分子に融合されている、実施形態245または実施形態246に記載のポリペプチド。
実施形態248.前記異種分子が、免疫グロブリンFcドメイン、ペプチド精製タグ、蛍光タンパク質、または形質導入ドメインを含む、実施形態247に記載のポリペプチド。
実施形態249.ポリペプチドが、標識に連結されている、実施形態245~248のいずれか1つに記載のポリペプチド。
実施形態250.前記標識が、蛍光標識または放射標識である、実施形態249に記載のポリペプチド。
実施形態250.前記標識が、蛍光標識または放射標識である、実施形態249に記載のポリペプチド。
実施形態251.前記標識が、ポリエチレングリコール、ポリシアル酸、またはグリコール酸を含む、実施形態249に記載のポリペプチド。
実施形態252.実施形態245~251のいずれか1つに記載のポリペプチドと、担体または賦形剤と、を含む、組成物。
実施形態252.実施形態245~251のいずれか1つに記載のポリペプチドと、担体または賦形剤と、を含む、組成物。
実施形態253.実施形態245~251のいずれか1つに記載のポリペプチドを発現する、宿主細胞。
実施形態254.実施形態245~251のいずれか1つに記載のポリペプチドを生成する方法であって、前記ポリペプチドをコードする核酸分子を含む宿主細胞を培養し、それにより前記宿主細胞に前記ポリペプチドを発現させ、前記発現させたポリペプチドを回収することを含む、前記方法。
実施形態254.実施形態245~251のいずれか1つに記載のポリペプチドを生成する方法であって、前記ポリペプチドをコードする核酸分子を含む宿主細胞を培養し、それにより前記宿主細胞に前記ポリペプチドを発現させ、前記発現させたポリペプチドを回収することを含む、前記方法。
実施形態255.前記核酸分子が、異種プロモーターの制御下にある、実施形態254に記載の方法。
実施形態256.前記核酸分子が、誘導性プロモーターの制御下にある、実施形態254または実施形態255に記載の方法。
実施形態256.前記核酸分子が、誘導性プロモーターの制御下にある、実施形態254または実施形態255に記載の方法。
実施形態257.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、もしくは配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記ゲノム核酸分子、
ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記mRNA分子、または
ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記cDNA分子を有する、対象の肥満の治療に使用するための、肥満を治療または抑制する治療剤。
ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記mRNA分子、または
ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記cDNA分子を有する、対象の肥満の治療に使用するための、肥満を治療または抑制する治療剤。
実施形態258.ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、もしくは配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記ゲノム核酸分子、
ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記mRNA分子、または
ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記cDNA分子を有する対象の肥満の治療に使用するための、Gタンパク質共役受容体75(GPR75)阻害剤。
ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記mRNA分子、または
ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記cDNA分子を有する対象の肥満の治療に使用するための、Gタンパク質共役受容体75(GPR75)阻害剤。
実施形態259.GPR75 mRNAとハイブリダイズする、アンチセンス核酸分子、低分子干渉RNA(siRNA)、またはショートヘアピンRNA(shRNA)である、実施形態258に記載のGPR75阻害剤。
実施形態260.Casタンパク質と、GPR75ゲノム核酸分子内のガイドRNA(gRNA)認識配列とハイブリダイズするgRNAと、を含む、実施形態258に記載のGPR75阻害剤。
実施形態261.前記Casタンパク質が、Cas9またはCpf1である、実施形態260に記載のGPR75阻害剤。
実施形態262.前記gRNA認識配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位、配列番号1に記載の5,557位、配列番号1に記載の5,911位、配列番号1に記載の5,920~5,923位、配列番号1に記載の6,411位、または配列番号1に記載の5,831位を含むかまたはこれに近接する、実施形態260または実施形態261に記載のGPR75阻害剤。
実施形態262.前記gRNA認識配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位、配列番号1に記載の5,557位、配列番号1に記載の5,911位、配列番号1に記載の5,920~5,923位、配列番号1に記載の6,411位、または配列番号1に記載の5,831位を含むかまたはこれに近接する、実施形態260または実施形態261に記載のGPR75阻害剤。
実施形態263.前記gRNA認識配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位、配列番号1に記載の5,557位、配列番号1に記載の5,911位、配列番号1に記載の5,920~5,923位、配列番号1に記載の6,411位、または配列番号1に記載の5,831位に対応する位置から約1000、約500、約400、約300、約200、約100、約50、約45、約40、約35、約30、約25、約20、約15、約10、または約5ヌクレオチドに位置する、実施形態260または実施形態261に記載のGPR75阻害剤。
実施形態264.プロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)配列が、前記gRNA認識配列の下流の約2~約6ヌクレオチドである、実施形態260または実施形態261に記載のGPR75阻害剤。
実施形態265.前記gRNAが、約17~約23ヌクレオチドを含む、実施形態260~264のいずれか1つに記載のGPR75阻害剤。
実施形態266.前記gRNA認識配列が、配列番号61~98のいずれか1つに記載のヌクレオチド配列を含む、実施形態260~265のいずれか1つに記載のGPR75阻害剤。
実施形態266.前記gRNA認識配列が、配列番号61~98のいずれか1つに記載のヌクレオチド配列を含む、実施形態260~265のいずれか1つに記載のGPR75阻害剤。
以下の実施例は、実施形態をより詳細に説明するために提供される。これらは、特許請求する実施形態を例示することを意図しており、それを限定することを意図していない。以下の実施例は、本明細書に記載される化合物、組成物、物品、デバイス及び/または方法がどのように作製され評価されるかについての開示及び説明を当業者に提供するものであり、実施例は、単に例示的なものであるように意図されており、あらゆる特許請求の範囲を限定するようには意図されていない。数字(例えば、量、温度など)については、正確さを確保するための努力がなされているが、ある程度の誤差及び偏差が考慮され得る。別段に示されていない限り、部は、重量部であり、温度は、℃または周囲温度であり、圧力は、大気圧または大気圧近傍である。
実施例1:材料及び方法
参加コホート
遺伝子関連探索研究を、英国(UK)Biobank(UKB)コホート(Sudlow et al.,PLoS Med 12,2015,e1001779)、Geisinger Health System(GHS)のMyCode Community Health Initiativeコホート(Carey et al.,Genet.Med.,2016,18,906-913)、及びMexico City Prospective Study(MCPS)(Tapia-Conyer et al.,Int.J.Epidemiol.,2006,35,243-249)において実施した。UKBは、2006~2010年に、英国の22箇所の試験センターを通じて募集された40歳~69歳の人々の集団ベースのコホート研究である。利用可能な全エクソームシーケンシング及び臨床表現型データを有する、合計428,719名のヨーロッパ系の参加者が含まれていた(図1)。UK Biobankは、英国を包括するNorth West Multi-centre Research Ethics Committee(MREC、11/NW/0382)の承認を受けている。GHS MyCode研究は、2007~2019年に募集された中部及び東部ペンシルベニア州(米国)の患者の医療システムに基づくコホートである。利用可能な全エクソームシーケンシング及び臨床表現型データがある、合計121,061名のヨーロッパ系の参加者が含まれていた(図1)。GHS MyCode研究は、Geisinger Institutional Review Boardによって承認された(2006-0258)。MCPSは、1998~2004年にメキシコシティの隣接する2つの都市地区から募集された35歳以上の人々のコホート研究である。MCPSにおける研究デザイン及び参加者の臨床的特徴は、既刊の刊行物(Tapia-Conyer et al.,Int.J.Epidemiol.,2006,35,243-249、及びAlegre-Diaz et al.,N.Engl.J.Med.,2016,375,1961-1971)に詳述されている。利用可能な全エクソームシーケンシング及び臨床表現型データを有する、合計95,846名の混血米国系個体が含まれていた(図1)。MCPS研究は、Mexican Ministry of Health、Mexican National Council for Science and Technology、及びUniversity of Oxfordによって承認された。
参加コホート
遺伝子関連探索研究を、英国(UK)Biobank(UKB)コホート(Sudlow et al.,PLoS Med 12,2015,e1001779)、Geisinger Health System(GHS)のMyCode Community Health Initiativeコホート(Carey et al.,Genet.Med.,2016,18,906-913)、及びMexico City Prospective Study(MCPS)(Tapia-Conyer et al.,Int.J.Epidemiol.,2006,35,243-249)において実施した。UKBは、2006~2010年に、英国の22箇所の試験センターを通じて募集された40歳~69歳の人々の集団ベースのコホート研究である。利用可能な全エクソームシーケンシング及び臨床表現型データを有する、合計428,719名のヨーロッパ系の参加者が含まれていた(図1)。UK Biobankは、英国を包括するNorth West Multi-centre Research Ethics Committee(MREC、11/NW/0382)の承認を受けている。GHS MyCode研究は、2007~2019年に募集された中部及び東部ペンシルベニア州(米国)の患者の医療システムに基づくコホートである。利用可能な全エクソームシーケンシング及び臨床表現型データがある、合計121,061名のヨーロッパ系の参加者が含まれていた(図1)。GHS MyCode研究は、Geisinger Institutional Review Boardによって承認された(2006-0258)。MCPSは、1998~2004年にメキシコシティの隣接する2つの都市地区から募集された35歳以上の人々のコホート研究である。MCPSにおける研究デザイン及び参加者の臨床的特徴は、既刊の刊行物(Tapia-Conyer et al.,Int.J.Epidemiol.,2006,35,243-249、及びAlegre-Diaz et al.,N.Engl.J.Med.,2016,375,1961-1971)に詳述されている。利用可能な全エクソームシーケンシング及び臨床表現型データを有する、合計95,846名の混血米国系個体が含まれていた(図1)。MCPS研究は、Mexican Ministry of Health、Mexican National Council for Science and Technology、及びUniversity of Oxfordによって承認された。
GPR75の予測される機能喪失(pLOF)バリアントとBMIとの関連を、探索セットに含まれていない追加の91,328エクソームにおいて更に推定した。これらには、UK Biobankの非ヨーロッパ系の参加者(UKB、N=12,321)(Sudlow et al.,PLoS Med 12,2015,e1001779)、ならびにMount Sinai BioMeコホート(SINAI、N=21,143)、University of Pennsylvania Medicine BioBank(PMBB、N=7,519)、Duke Catheterization Genetics(CATHGEN)コホート(DUKE、N=8,171)(Kraus et al.,J.Cardiovasc.Transl.Res.,2015,8,449-457)、Taiwan Metabochipコンソーシアムの台湾系中国人(TAICHI、N=11,223)(Assimes et al.,PLoS One 11,2016,e0138014)、Dallas Heart Study(DHS、N=2,088)(Victor et al.,Am.J.Cardiol.,2004,93,1473-1480)、及びMalmo Diet and Cancer Study(MALMO、N=28,863)(Berglund et al.,J.Intern.Med.,1993,233,45-51)の参加者が含まれていた。全ての研究は関連する倫理委員会によって承認され、参加者はこれらの研究への参加に関するインフォームドコンセントを提供した。
表現型定義
研究来院のうちの1回で採取した人体測定値に基づいて、体重(キログラム)を身長(メートル)の2乗で除してボディマス指数を算出した。ベースライン来院時に測定したBMIは、UKB及びMCPSのアウトカム変数であり、GHSデータベース中に存在する臨床診療からのBMI中央値は、先行研究に一致するGHSのアウトカム変数であった(Dewey et al.,Science,2016,354)。BMIカテゴリは、World Health Organizationの分類(WHO,Obesity and overweight,2020)に基づいて定義した。BMI値を、逆標準正規関数(inverse standard normal function)によって変換し、各系統群内で男性及び女性に別々に適用した。身長170cmの人に対する体重差を算出した。UKBコホートでは、全身及び局所の体除脂肪及び体脂肪の量、率、及び体表面の正規化指数を生体電気インピーダンスによって測定した。ベースライン来院時、UKBはまた、「10歳のとき、平均と比較して自分自身を次のどれだと思っていましたか:痩せている、太っている、ほぼ平均、わからない、答えたくない」という多肢選択式の質問を行うことで、10歳時の比較による体格に関する自己申告型の情報も収集した。
研究来院のうちの1回で採取した人体測定値に基づいて、体重(キログラム)を身長(メートル)の2乗で除してボディマス指数を算出した。ベースライン来院時に測定したBMIは、UKB及びMCPSのアウトカム変数であり、GHSデータベース中に存在する臨床診療からのBMI中央値は、先行研究に一致するGHSのアウトカム変数であった(Dewey et al.,Science,2016,354)。BMIカテゴリは、World Health Organizationの分類(WHO,Obesity and overweight,2020)に基づいて定義した。BMI値を、逆標準正規関数(inverse standard normal function)によって変換し、各系統群内で男性及び女性に別々に適用した。身長170cmの人に対する体重差を算出した。UKBコホートでは、全身及び局所の体除脂肪及び体脂肪の量、率、及び体表面の正規化指数を生体電気インピーダンスによって測定した。ベースライン来院時、UKBはまた、「10歳のとき、平均と比較して自分自身を次のどれだと思っていましたか:痩せている、太っている、ほぼ平均、わからない、答えたくない」という多肢選択式の質問を行うことで、10歳時の比較による体格に関する自己申告型の情報も収集した。
遺伝子型データ
高カバレッジの全エクソームシーケンシングを、過去に詳述されている通り(Dewey et al.,Science,2016,354、及びVan Hout et al.,Nature,2020,586,749-756)、また以下に要約するように実施した。NimbleGenプローブ(VCRome、GHSコホートの一部に対して)またはIntegrated DNA Technologiesから入手可能なxGen設計の改変版(IDT、GHSの残り及び他のコホートに対して)を、エクソームの標的配列捕捉に使用した。多重化したエクソーム捕捉及び配列決定を容易にするために、一意の6塩基対(bp)バーコード(VCRome)または10bpバーコード(IDT)を、ライブラリの調製中に各DNA断片に添加した。エクソーム捕捉の前に、等量の試料をプールした。Illumina v4 HiSeq 2500機器で(GHSコホートの一部に対して)、またはNovaSeq機器で(GHSの残り及び他のコホートに対して)、75bpのペアエンドリードを使用して配列決定を実施した。配列決定は、96%のVCRome試料中の標的塩基の85%にわたる20倍超のカバレッジ、及び99%のIDT試料中の標的塩基の90%にわたる20倍超のカバレッジを提供するのに十分なカバレッジ深度(すなわち、ゲノムの標的領域中の各ヌクレオチドをカバーするシーケンスリードの数)を有していた。データ処理ステップには、Illuminaソフトウェアを使用した試料の脱多重化、バイナリのアラインメント及びマッピングファイル(BAM)の生成を含むGRCh38ヒトゲノム参照配列へのアラインメント、BAMファイルの処理(例えば、重複リードのマーキング及び他のリードマッピング評価)が含まれた。バリアントのコーリング及びアノテーションは、snpEffソフトウェアを使用したGRCh38ヒトゲノム参照配列及びEnsembl v85遺伝子定義に基づくものであった。次に、各遺伝子について最も有害な機能的効果クラスを選択することにより、アノテーションされた開始及び終止を有するタンパク質コード転写物に関係するsnpEff予測を組み合わせて、単一の機能的影響予測とした。これらのアノテーションの階層(最も有害なものから順に)は、フレームシフト、ストップゲイン、ストップロス、スプライスアクセプター、スプライスドナー、ストップロスト、インフレームインデル、ミスセンス、他のアノテーションであった。予測されるLOF遺伝子バリアントには、a)フレームシフトを生じさせる挿入または欠失、b)未成熟終止コドンの導入または転写開始部位もしくは停止部位の喪失を生じさせる、挿入、欠失、または一塩基バリアント、及びc)ドナースプライス部位またはアクセプタースプライス部位のバリアントが含まれた。可能性のある機能的影響について、SIFT(Kumar et al.,Nat.Protoc.,2009,4,1073-1081)、Polyphen2_HDIV及びPolyphen2_HVAR(Adzhubei et al.,Nat.Methods,2010,7,248-249)、LRT(Chun et al.,Genome Res.,2009,19,1553-1561)、ならびにMutationTaster(Schwarz et al.,Nat.Methods,2010,7,575-576)を使用し、有害性を予測したin silico予測アルゴリズムの数に従ってミスセンスバリアントを分類した。各遺伝子について、代替アレル頻度(AAF)及び各バリアントの機能的アノテーションにより、これら7つの遺伝子負荷曝露:1)AAF<1%であるpLOFバリアント、2)AAF<1%である、5つ中5つのアルゴリズムにより有害であると予測されたpLOFまたはミスセンスバリアント、3)AAF<0.1%である、5つ中5つのアルゴリズムにより有害であると予測されたpLOFまたはミスセンスバリアント、4)AAF<1%である、5つ中少なくとも1つのアルゴリズムにより有害であると予測されたpLOFまたはミスセンスバリアント、5)AAF<0.1%である、5つ中少なくとも1つのアルゴリズムにより有害であると予測されたpLOFまたはミスセンスバリアント、6)AAF<1%である、pLOFまたは任意のミスセンス、及び7)AAF<0.1%である、pLOFまたは任意のミスセンスバリアントへ包含することを決定した。
高カバレッジの全エクソームシーケンシングを、過去に詳述されている通り(Dewey et al.,Science,2016,354、及びVan Hout et al.,Nature,2020,586,749-756)、また以下に要約するように実施した。NimbleGenプローブ(VCRome、GHSコホートの一部に対して)またはIntegrated DNA Technologiesから入手可能なxGen設計の改変版(IDT、GHSの残り及び他のコホートに対して)を、エクソームの標的配列捕捉に使用した。多重化したエクソーム捕捉及び配列決定を容易にするために、一意の6塩基対(bp)バーコード(VCRome)または10bpバーコード(IDT)を、ライブラリの調製中に各DNA断片に添加した。エクソーム捕捉の前に、等量の試料をプールした。Illumina v4 HiSeq 2500機器で(GHSコホートの一部に対して)、またはNovaSeq機器で(GHSの残り及び他のコホートに対して)、75bpのペアエンドリードを使用して配列決定を実施した。配列決定は、96%のVCRome試料中の標的塩基の85%にわたる20倍超のカバレッジ、及び99%のIDT試料中の標的塩基の90%にわたる20倍超のカバレッジを提供するのに十分なカバレッジ深度(すなわち、ゲノムの標的領域中の各ヌクレオチドをカバーするシーケンスリードの数)を有していた。データ処理ステップには、Illuminaソフトウェアを使用した試料の脱多重化、バイナリのアラインメント及びマッピングファイル(BAM)の生成を含むGRCh38ヒトゲノム参照配列へのアラインメント、BAMファイルの処理(例えば、重複リードのマーキング及び他のリードマッピング評価)が含まれた。バリアントのコーリング及びアノテーションは、snpEffソフトウェアを使用したGRCh38ヒトゲノム参照配列及びEnsembl v85遺伝子定義に基づくものであった。次に、各遺伝子について最も有害な機能的効果クラスを選択することにより、アノテーションされた開始及び終止を有するタンパク質コード転写物に関係するsnpEff予測を組み合わせて、単一の機能的影響予測とした。これらのアノテーションの階層(最も有害なものから順に)は、フレームシフト、ストップゲイン、ストップロス、スプライスアクセプター、スプライスドナー、ストップロスト、インフレームインデル、ミスセンス、他のアノテーションであった。予測されるLOF遺伝子バリアントには、a)フレームシフトを生じさせる挿入または欠失、b)未成熟終止コドンの導入または転写開始部位もしくは停止部位の喪失を生じさせる、挿入、欠失、または一塩基バリアント、及びc)ドナースプライス部位またはアクセプタースプライス部位のバリアントが含まれた。可能性のある機能的影響について、SIFT(Kumar et al.,Nat.Protoc.,2009,4,1073-1081)、Polyphen2_HDIV及びPolyphen2_HVAR(Adzhubei et al.,Nat.Methods,2010,7,248-249)、LRT(Chun et al.,Genome Res.,2009,19,1553-1561)、ならびにMutationTaster(Schwarz et al.,Nat.Methods,2010,7,575-576)を使用し、有害性を予測したin silico予測アルゴリズムの数に従ってミスセンスバリアントを分類した。各遺伝子について、代替アレル頻度(AAF)及び各バリアントの機能的アノテーションにより、これら7つの遺伝子負荷曝露:1)AAF<1%であるpLOFバリアント、2)AAF<1%である、5つ中5つのアルゴリズムにより有害であると予測されたpLOFまたはミスセンスバリアント、3)AAF<0.1%である、5つ中5つのアルゴリズムにより有害であると予測されたpLOFまたはミスセンスバリアント、4)AAF<1%である、5つ中少なくとも1つのアルゴリズムにより有害であると予測されたpLOFまたはミスセンスバリアント、5)AAF<0.1%である、5つ中少なくとも1つのアルゴリズムにより有害であると予測されたpLOFまたはミスセンスバリアント、6)AAF<1%である、pLOFまたは任意のミスセンス、及び7)AAF<0.1%である、pLOFまたは任意のミスセンスバリアントへ包含することを決定した。
SNPアレイの遺伝子型決定を、過去に説明されている通り(Bycroft et al.,Nature,2018,562,203-209)、UKBで実施した。GHSでは、Human Omni Express Exomeアレイ(OMNI)及びGlobal Screeningアレイ(GSA)を使用して遺伝子型決定を実施した。MCPSでは、GSAアレイを使用して遺伝子型決定を実施した。
GPR75バリアントのin vitro試験
in vitro検証試験を、a)BMI低下とそれぞれ関連しており(p<0.05)、かつb)少なくとも10名のヘテロ接合性保有者がいた、2つのGPR75 pLOF遺伝子バリアント(Ala110fs及びGln234*)について実施した。簡潔に述べると、N末端にHAタグを付した、野生型、Ala110fs、及びGln234* GPR75をコードするpcDNA3.1プラスミドを、Fugene6(Promega)を使用してHEK293細胞に一過性にトランスフェクトした。HEK293及びHEK293T細胞株をATCCから購入し、Regeneron Tissue Culture Core内で維持した。STRプロファイリングによってそれらの同一性を確認した。in vitroアッセイには、Taqman及びウエスタンブロッティングによるmRNA及びタンパク質解析、ならびに蛍光活性化細胞選別及び免疫蛍光によるタンパク質局在化を含めた。
in vitro検証試験を、a)BMI低下とそれぞれ関連しており(p<0.05)、かつb)少なくとも10名のヘテロ接合性保有者がいた、2つのGPR75 pLOF遺伝子バリアント(Ala110fs及びGln234*)について実施した。簡潔に述べると、N末端にHAタグを付した、野生型、Ala110fs、及びGln234* GPR75をコードするpcDNA3.1プラスミドを、Fugene6(Promega)を使用してHEK293細胞に一過性にトランスフェクトした。HEK293及びHEK293T細胞株をATCCから購入し、Regeneron Tissue Culture Core内で維持した。STRプロファイリングによってそれらの同一性を確認した。in vitroアッセイには、Taqman及びウエスタンブロッティングによるmRNA及びタンパク質解析、ならびに蛍光活性化細胞選別及び免疫蛍光によるタンパク質局在化を含めた。
細胞培養、プラスミド、及び細胞トランスフェクション:HEK293細胞を、10%ウシ胎児血清及び抗生物質(50単位/mLペニシリン及び50μg/mLストレプトマイシン、Thermo Fisher Scientific)を補充したダルベッコ改変イーグル培地中で維持した。N末端にHAタグを付したGPR75野生型、Ala110fs、及びGln234*をコードするpcDNA3.1プラスミドをGenScript(USA)によって合成した。およそ60~70%コンフルエントな細胞に、HAタグを付したGPR75野生型、Ala110fs、及びGln234*をコードするcDNAを含むプラスミド、ならびに緑色蛍光タンパク質対照プラスミドを、製造業者のプロトコル(Promega Literature:#TM350)に従ってFuGENE6(Promega)を使用して、DNA1μg:FuGENEトランスフェクション試薬5μlの比率で一過性にトランスフェクトした。48時間後、細胞を1×DPBS(Thermo Fisher Scientific)で洗浄し、下流解析用に収集した。
ウエスタンブロッティング:トランスフェクトしたHEK293を、細胞溶解用にRIPA緩衝液中に収集して、試料あたり5~10μgのタンパク質をロードした。次の一次抗体を使用した:HA(マウスモノクローナル、Sigmaカタログ番号H3663)及びGAPDH 14C10(ウサギmAb、Cell Signalingカタログ番号2118)。LI-COR Odyssey Infrared Imaging System(LI-COR,Lincoln,NE)を使用し、適切なLI-COR IRDye二次抗体(抗ウサギ(926-32211)及び抗マウス(926-32210))を使用して、免疫ブロットを検出及び定量化した。
フローサイトメトリー:細胞を1×DPBS(カタログ番号14190144)で1回洗浄した。Cell Dissociation Buffer(カタログ番号13150016)を添加して、細胞を37℃で3分間インキュベートした。細胞を培地に再懸濁させ、200×gで5分間遠心分離した。細胞をDPBSで2回洗浄し、DPBSに再懸濁させ、分注し、Live/Dead Blue Fixable Viability Dye(Thermo Fisher Scientific)を用いて、室温、照明なしで15分間染色した。細胞をDPBSで2回洗浄し、全ての洗浄物を400×gで5分間遠心分離して、全て暗所で染色した。細胞をMACS緩衝液(Miltenyi Biotec)中のヒトFc Block(BD Biosciences)で、15分間4℃で処理し、MACS緩衝液で1:100に希釈したalexa fluor抗HA.11エピトープタグ抗体(カタログ番号682404)を用いて30分間4℃で染色した。細胞をMACS緩衝液で洗浄し、CytoFix(BD Biosciences)を用いて15分間4℃で固定した。細胞をMACS緩衝液で2回洗浄し、濾過して、CytoFLEX(Beckman Coulter)でFACSを実施した。FlowJo 10.6.2(Becton Dickinson & Company)を使用してデータを解析した。
免疫蛍光アッセイ:免疫蛍光アッセイ用に、ガラス底を備えた開放型の8ウェルμ-Slide(チャンバースライド)(Ibidi、カタログ番号80827)に、細胞を14,000細胞/ウェルの密度で播種した。トランスフェクションの48時間後に、細胞を氷冷4%PFAで室温にて10分間固定し、氷冷1×DPBSで3回洗浄した(全ての後続の洗浄ステップは、氷冷1×DPBSで3回、洗浄1回あたり5分間で行った)。透過処理されていない細胞を、10%正常ロバ血清(NDS)(Jackson Immunoresearch Laboratories、#017-000-121)を使用して1時間ブロッキングし、透過処理された細胞を、0.1%Triton X-100を含む10%NDSでブロッキングした。その後、これらを非透過処理細胞及び透過処理細胞の染色緩衝液としてそれぞれ使用した。細胞を1:500(非透過処理)または1:3000(透過処理)の抗HA抗体(Sigma、カタログ番号H3663)とともに室温にて1時間インキュベートし、洗浄して、次いで1:1000のalexa fluor 594コンジュゲート抗マウス二次抗体(Thermo Fisher Scientific、カタログ番号A-21203)とともに1時間インキュベートした。次に、ウェルを洗浄し、スライドをProLong(登録商標)Gold Antifade Reagent with DAPI(Cell Signaling、#8961)を用いてマウントした。Zeiss共焦点LSM880を使用してスライドをイメージングした。
定量的リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応:TRIzol試薬を使用し、製造業者(Thermo Fisher Scientific)の指示に従って、トランスフェクトしたHEK293からRNAを抽出した。MagMAX(商標)Turbo(商標)DNase Buffer及びTURBO DNase(Life TechnologiesのAmbion)を使用して、ゲノムDNAを取り出した。SuperScript(登録商標)VILO(商標)Master Mix(ThermoFisher Scientific)を使用して、mRNA(最大2μg)をcDNAに逆転写した。QuantStudio 6 Flex Real-Time PCR System(Thermo Fisher Scientific)を使用して、PowerUp SYBR Green Master Mix(Thermo Fisher Scientific)を用いてGPR75 cDNAを増幅した。ACTINBハウスキーピング遺伝子を内部対照遺伝子として使用して、cDNAインプットの差異を正規化した。GPR75の発現量を、ACTINBハウスキーピング遺伝子に対して算出した。
プライマー配列は以下の通りであった。
GPR75-フォワード:5’-GCTTGTGGCCCAAGTCATTC-3’(配列番号1458)
GPR75-リバース:5’-GAGTGTTGATGGGGGTCGAG-3’(配列番号1459)
ACTINB-フォワード:5’-CACCATTGGCAATGAGCGGTTC-3’(配列番号1460)
ACTINB-リバース:5’-AGGTCTTTGCGGATGTCCACGT-3’(配列番号1461)
マウスモデル
遺伝子操作したGpr75-/-マウス系統を、RegeneronのVelociGene(商標)技術(Valenzuela et al.,Nat.Biotechnol.,2003,21,652-659、及びPoueymirou et al.,Nat.Biotechnol.,2007,25,91-99)を使用して作製した。簡潔に述べると、C57Bl/6NTac胚性幹細胞を、内因性ATGの直後から始まりGpr75終止コドンで終了する、Gpr75遺伝子座全体の切除の標的とした。切除は、改変細菌人工染色体(BAC)を標的とするコンストラクトを使用して、ヒトUBC(ユビキチン)プロモーターの制御下で、BAC Gpr75配列がネオマイシン耐性遺伝子を含有する自己欠失型のloxP導入lacZレポーターカセットに置き換えられるように行った。lacZレポーターが内因性ATGの直後にインフレームで挿入されるように、欠失を操作した。このコンストラクトをC57Bl/6NTac胚性幹細胞にエレクトロポレーションした。ネオマイシンで選択した後、正しく標的化されたクローンをTaqMan解析で同定し、8細胞期Swiss Webster胚(Charles River Laboratories)にマイクロインジェクションして、注入した改変胚性幹細胞に完全に由来するF0 VelociMouse(商標)を得た(Poueymirou et al.,Nat.Biotechnol.,2007,25,91-99)。
GPR75-フォワード:5’-GCTTGTGGCCCAAGTCATTC-3’(配列番号1458)
GPR75-リバース:5’-GAGTGTTGATGGGGGTCGAG-3’(配列番号1459)
ACTINB-フォワード:5’-CACCATTGGCAATGAGCGGTTC-3’(配列番号1460)
ACTINB-リバース:5’-AGGTCTTTGCGGATGTCCACGT-3’(配列番号1461)
マウスモデル
遺伝子操作したGpr75-/-マウス系統を、RegeneronのVelociGene(商標)技術(Valenzuela et al.,Nat.Biotechnol.,2003,21,652-659、及びPoueymirou et al.,Nat.Biotechnol.,2007,25,91-99)を使用して作製した。簡潔に述べると、C57Bl/6NTac胚性幹細胞を、内因性ATGの直後から始まりGpr75終止コドンで終了する、Gpr75遺伝子座全体の切除の標的とした。切除は、改変細菌人工染色体(BAC)を標的とするコンストラクトを使用して、ヒトUBC(ユビキチン)プロモーターの制御下で、BAC Gpr75配列がネオマイシン耐性遺伝子を含有する自己欠失型のloxP導入lacZレポーターカセットに置き換えられるように行った。lacZレポーターが内因性ATGの直後にインフレームで挿入されるように、欠失を操作した。このコンストラクトをC57Bl/6NTac胚性幹細胞にエレクトロポレーションした。ネオマイシンで選択した後、正しく標的化されたクローンをTaqMan解析で同定し、8細胞期Swiss Webster胚(Charles River Laboratories)にマイクロインジェクションして、注入した改変胚性幹細胞に完全に由来するF0 VelociMouse(商標)を得た(Poueymirou et al.,Nat.Biotechnol.,2007,25,91-99)。
ヘテロ接合性Gpr75-/+マウスを交配させて、実験に使用した同齢の野生型Gpr75+/+、ヘテロ接合性Gpr75-/+、及びノックアウトGpr75-/-同腹仔を作製した。雄及び雌マウスを静的ケージに収容し(4匹/ケージ)、食餌及び水を自由に摂取させ、対照固形飼料または高脂肪飼料(HFD;Envigo、#TD.03584、Huntingdon,UK)のいずれかを14週間にわたり給餌した。対照飼料は、キロカロリー(kcal)%で表す量の次の成分で構成されていた:脂質13.4%、炭水化物58.0%、及びタンパク質28.7%。HFDは、次の成分(キロカロリー%)で構成されていた:脂質58.4%、炭水化物26.6%、及びタンパク質15.0%。
空腹時血糖を、飼料給餌期間の前及び終了時に一晩絶食させた後に測定した。実験終了時に腹腔内糖負荷試験を実施した。一晩の断食期間に続いて、グルコース(2g/kg)を腹腔内注射により各マウスに投与した。各マウスの尾部の先端を引っ掻き、採血した。血液試料を0、30、60、90、及び120分時点で収集し、Contour血糖モニタリングシステム(Bayer,Whippany,NJ)を使用してグルコースを測定した。これらの測定の後、血液をキャピラリーチューブに収集し、インスリン測定に使用した。血液を2,000rpmで15分間遠心分離し、血漿を分離した。Ultra-Sensitive Mouse Insulin ELISAキット(Crystal Chem.#90080、Elk Grove Village,IL)を使用して、製造業者の指示に従って血漿インスリンレベルを定量化した。レプチン及びアディポネクチンの血漿レベルを、製造業者の指示に従ってELISAによって測定した(レプチン及びアディポネクチンについて、それぞれAbcam、Cambridge,MA、#ab100718及び#ab108785)。
統計:Graph Pad Prismバージョン9ソフトウェアを統計解析に使用した。平均値の差異の有意性は、反復測定二元ANOVA、続いてテューキーの事後多重比較検定を使用して求めた。p値<0.05を有意であると見なした。
飼料誘発性肥満モデルにおける体組成及び応答を更に特徴付けるために、マウスの別のコホートで追加の高脂肪飼料及び固形飼料実験を行った。
統計解析
概要:遺伝子バリアントまたはそれらの遺伝子負荷とBMIとの関連を、BOLT-LMM v2.3.4(Loh et al.,Nat.Genet.,2018,50,906-908)またはREGENIE v1.0(Mbatchou et al.,Nat.Genet.,2021)を使用して混合効果回帰モデルをフィッティングさせることによって推定した。これらのアプローチは、ゲノム全体からの遺伝子型を使用して多遺伝子スコアを推定することにより、関連性及び集団構造について説明するものである。次に、遺伝子バリアントまたはそれらの負荷の関連を、他の共変量とともにその多遺伝子スコアを条件として推定する。稀なコーディングバリアントまたは遺伝子負荷の関連が、BMIに関連する一般的な遺伝子バリアントと統計学的に独立していることを確実にするために、以下に説明するように、共通アレルとBMIとのゲノムワイド関連をファインマッピングすることによって同定したセンチネルコモンバリアント(AAF≧1%)について、エクソーム関連解析を更に調整した。逆分散加重メタアナリシスを使用して、コホート全体の結果をプールした。
統計解析
概要:遺伝子バリアントまたはそれらの遺伝子負荷とBMIとの関連を、BOLT-LMM v2.3.4(Loh et al.,Nat.Genet.,2018,50,906-908)またはREGENIE v1.0(Mbatchou et al.,Nat.Genet.,2021)を使用して混合効果回帰モデルをフィッティングさせることによって推定した。これらのアプローチは、ゲノム全体からの遺伝子型を使用して多遺伝子スコアを推定することにより、関連性及び集団構造について説明するものである。次に、遺伝子バリアントまたはそれらの負荷の関連を、他の共変量とともにその多遺伝子スコアを条件として推定する。稀なコーディングバリアントまたは遺伝子負荷の関連が、BMIに関連する一般的な遺伝子バリアントと統計学的に独立していることを確実にするために、以下に説明するように、共通アレルとBMIとのゲノムワイド関連をファインマッピングすることによって同定したセンチネルコモンバリアント(AAF≧1%)について、エクソーム関連解析を更に調整した。逆分散加重メタアナリシスを使用して、コホート全体の結果をプールした。
エクソームシーケンシングによって同定した稀な非同義バリアントの負荷とBMIとの関連:本研究の主要解析では、各遺伝子の稀な非同義バリアントの負荷とBMIとの関連を、BOLT-LMM v2.3.4(Loh et al.,Nat.Genet.,2018,50,906-908)またはREGENIE v1.0(Mbatchou et al.,Nat.Genet.,2021)を使用して、ゲノム血縁マトリックスに近似する多遺伝子スコアについて調整した混合効果回帰モデルをフィッティングさせることによって推定した。年齢、年齢2、性別、年齢×性別の相互作用項、実験バッチ関連共変量、及び遺伝的主成分について、解析を更に調整した。エクソームの変異に焦点を当てた研究における正確な原因バリアント及び遺伝子の帰属には、稀なバリアントの関連が、近い形質に関連する共通アレルから独立していることを確実にすることが不可欠である(Mahajan et al.,Nat.Genet.,2018,50,559-571)。負荷の関連がBMIに関連する一般的な遺伝子バリアントから統計学的に独立していることを確実にするために、共通アレルとBMIとのゲノムワイドな関連をファインマッピングすることによって同定した一般的なバリアントについて、エクソームワイド関連解析を調整した(一般的なバリアントのGWAS及びファインマッピングを参照されたい)。過去の類似研究(Do et al.,Nature,2015,518,102-106、及びFlannick et al.,Nature,2019,570,71-76)に沿って、遺伝子負荷解析のエクソームワイドレベルの統計学的有意性を、p<3.6×10-07(20,000個の遺伝子及び7つのバリアント選択モデルに対するボンフェローニ補正)として定義した。
稀な非同義単一バリアントの解析:二次解析では、エクソームシーケンシングによって同定した個々の稀な非同義バリアント(マイナーアレル頻度が<1%かつマイナーアレルカウントが>25)とBMIとの関連を推定した。ファインマッピングによって同定したBMIに関連する一般的なバリアントについての調整を含めて、遺伝子負荷解析と同じ解析アプローチを使用した。このステップは、これらの稀なバリアントの関連の条件付き独立の性質を確認するのに好ましい(Mahajan et al.,Nat.Genet.,2018,50,559-571)。この解析では、関連について、p<5×10-08(本解析で検定したおよそ1,000,000個の稀な非同義バリアントに対するボンフェローニ補正)という統計学的閾値を使用した。これは、GWASで使用されるゲノムワイドの有意性の慣習的な閾値でもある(C.Wellcome Trust Case Control,Nature,2007,447,661-678)。
一般的なバリアントのGWAS及びファインマッピング:BMIに関連する一般的なバリアントを、Haplotype Reference Consortiumパネル(McCarthy et al.,Nat.Genet.,2016,48,1279-1283)またはTOPMed Imputation Server(ワールドワイドウェブの「imputation.biodatacatalyst.nhlbi.nih.gov/#!pages/home」、v1.5.7を参照されたい)を使用してインピュテーションした1,200万を超える一般的~低頻度の遺伝子バリアントを含むゲノムワイド関連研究を実施することにより同定した。GHS研究では、Illumina Human Omni Express Exomeアレイ(OMNIセット)及びGlobal Screeningアレイ(GSAセット)で遺伝子型決定した試料において、インピュテーションを別々に実施した。次に、インピュテーションしたバリアントの量のデータ(dosage data)を2つのGHSセット間でマージして、関連解析用の結合データセットを得た。BOLT-LMM v2.3.4(Loh et al.,Nat.Genet.,2018,50,906-908)またはREGENIE v1.0(Mbatchou et al.,Nat.Genet.,2021)を使用して混合効果線形回帰モデルをフィッティングさせることによって、GHS、UKB、及びMCPSコホートにおいてゲノムワイド関連解析を別個に実施した。次に、UKB及びGHS解析の結果を逆分散加重メタアナリシスによって組み合わせて、探索コホートのヨーロッパ人サブセットにおけるゲノムワイドメタアナリシスを得た。一般的なバリアントによって駆動される条件付きで独立した遺伝子関連シグナルを同定するために、FINEMAPソフトウェアを使用して、p<5×10-08というゲノムワイドな有意性閾値でBMIに関連する遺伝子バリアントを保有するゲノム領域でのファインマッピングを実施した(Benner et al.,Bioinformatics,2016,32,1493-1501)。ゲノムワイド関連解析に含めた個体の正確なセットからの遺伝子データを使用して、連鎖不平衡を推定した。ファインマッピングを、ヨーロッパ系のGHS及びUKBコホートのメタアナリシスと、MCPSコホートにおける混血米国系の解析とで別々に実施した。ファインマッピングは、独立した一般的なバリアントのシグナルを同定し、所与の独立したシグナルに対応付けたバリアントの因果関係の事後確率(PPA)を与える。ファインマッピングした各遺伝子座について、95%信頼できるバリアントセット、すなわち因果関係の95%の事後確率を捉えるバリアントの最小セットを同定した。また、所与の独立したシグナルの各々における因果関係の事後確率が最も高いバリアントとして、センチネルバリアントも定義した。
UKB研究におけるBMIのゲノムワイド多遺伝子スコアの作成:独立したデータセットでのこれまでの大規模ゲノムワイド関連研究(Adzhubei et al.,Nat.Methods,2010,7,248-249)の結果から、rhoパラメータ値1を用いてLDpredソフトウェア(Vilhjalmsson et al.,Am.J.Hum.Genet.,2015,97,576-592)を使用して、250万超の一般的なバリアントに起因する高BMIの素因を捉える多遺伝子スコアを作成した。
GPR75の予測される機能喪失バリアントのフェノームワイド解析:GPR75のpLOFバリアントと、GHS及びUKB研究における数百の連続形質または疾患アウトカムとの関連のフェノームワイド解析を実施した。検出力を高めるために、METALソフトウェア(Willer et al.,Bioinformatics,2010,26,2190-2191)を使用して逆分散加重メタアナリシスを実施して、GHS及びUKB全体にわたる関連の結果を、両研究で入手可能な疾患アウトカムについて組み合わせた。バリアント保有者が少数であることに起因する偽陽性関連のリスクを最小限に抑えるために、連続形質に関する表現型が欠落していない個体に基づいて、または疾患バイナリアウトカムに罹患した個体に基づいて決定したGPR75 pLOF遺伝子バリアントを保有する25名以下の個体のアウトカムを除外した。これらの除外後、結果は、2,173のアウトカムについて利用可能であった。実施する統計学的検定の数を制御するために、関連p値が2,173回の検定に対するボンフェローニ補正、すなわちp<2.3×10-5(2,173回の統計学的検定で除した0.05のp値閾値に相当する)を満たす場合、関連を統計学的に有意であると見なした。
連続形質及び疾患アウトカムを下記の通り定義した。UKB研究では、連続形質について、UKB来院のうちの1回の間に測定されたバイオマーカー、イメージング変数、もしくは他の連続形質の値、または所与の研究来院内もしくは研究来院間内でのそれらの平均を、アウトカムとして使用した。疾患バイナリアウトカムについては、症例状態の定義には、次の基準のうちの1つ以上を適用する必要があった:a)デジタル質問票での、もしくは訓練された看護師による面接での、自己申告された疾患状態もしくは薬剤の使用、またはb)ICD-10コーディングシステムを使用してコード化されたUK National Health Service Hospital Episode Statisticsデータベースの入院診療のEHR。バイナリアウトカムの各々について、対照は、症例定義のいずれの基準も有していない個体であった。GHS研究では、疾患バイナリアウトカムについて、症例状態の定義には、次の基準のうちの1つ以上を適用する必要があった:1)ICD-10診断コードの問題リストの入力項目、2)入院患者の入院-退院時のICD-10診断コード、または3)別の暦日での2回の別々の外来受診について入力した診療時のICD-10診断コード。対照は、症例定義のいずれの基準も有していない個体であった。個体が、1回の外来診療のみと関連付けられた関連ICD-10コードを有している場合、その個体は除外した。連続形質については、非生理学的臨床検査値、無効なまたは汚染された標本、及び基準値上限の5倍を超えるものを除去することにより、データクリーニングを実施した。次に、追跡調査期間にわたる臨床検査結果の最小値、中央値、及び最大値を各患者について導出し、アウトカムとして使用した。
実施例2:GPR75における機能喪失は、BMI低下、体脂肪低下、及び肥満に対する保護と関連する
高カバレッジの全エクソームシーケンシングを、英国Biobankコホートのヨーロッパ系個体428,719名(UKB、図1)、米国を拠点とするGeisinger Health SystemからのMyCode Community Health Initiativeコホートのヨーロッパ系個体121,061名(GHS、図1)、及びMexico City Prospective Studyの混血米国系個体95,846名(MCPS、図1)を含む、645,626名の個体で実施した(実施例1)。
高カバレッジの全エクソームシーケンシングを、英国Biobankコホートのヨーロッパ系個体428,719名(UKB、図1)、米国を拠点とするGeisinger Health SystemからのMyCode Community Health Initiativeコホートのヨーロッパ系個体121,061名(GHS、図1)、及びMexico City Prospective Studyの混血米国系個体95,846名(MCPS、図1)を含む、645,626名の個体で実施した(実施例1)。
これら3つのコホートにわたるエクソームワイドメタアナリシスでは、GPR75遺伝子における稀なpLOFバリアントの負荷は、エクソームワイドレベルの統計学的有意性でBMI低下と関連していた(逆分散加重(IVW)メタアナリシス p<3.6×10-07、20,000個の遺伝子及び7つのバリアント選択モデルに対するボンフェローニ補正(実施例1))。
GPR75における予測される機能喪失バリアントが、集団間で類似した頻度で、配列解析した10,000名あたりおよそ4名において認められ(図2)、保有状態は、1.8kg/m2のBMI低下に相当する0.34標準偏差のBMI低下、または約5.3kgもしくは12ポンドの体重低下と関連していた(図3及び図4A)。
BMI低下との関連は、探索メタアナリシスの各構成コホート(図2)、ならびに年齢及び性別のサブグループ内(図5)において方向性が一致しており、統計学的に有意であった。GPR75 pLOFバリアントとBMI低下との関連を、探索セットに含まれていない追加の個体91,328名を含む複合解析で更に実証した(探索のメタアナリシス及び追加のコホートにおけるBMIの標準偏差(SD)単位のアレルごとのベータ-0.34、95%信頼区間(CI)-0.45,-0.22、p=6.9×10-09、図4B)。BMI低下とのこの強い関連は、肥満に対する保護との対応する関連を伴うものであった。UKB、GHS、及びMCPSコホートのメタアナリシスにおいて、GPR75 pLOFバリアントのヘテロ接合性保有者は、非保有者と比較して肥満のオッズが54%低下しており(図6、アレルごとのオッズ比0.46、95%信頼区間0.31,0.67、p=6.9×10-05)、これら保有者のBMIカテゴリ間の分布は、より低いBMIのカテゴリへと劇的に移行した(図7)。UKBでは、GPR75 pLOF保有者は、非保有者と比較して、10歳時に比較による平均的体格よりも痩せていたと自己申告する可能性が高かった(図8)。
UKBにおける生体インピーダンスを用いた体組成解析では、BMI低下との関連は、全身の体脂肪量の低下及び体脂肪率の低下との関連によって引き起こされることが示された(図9)。GPR75 pLOFバリアントの非依存的(agnostic)フェノームワイド解析(実施例1)では、これらのバリアントの希少性及び厳密な多重検定補正を反映して、実施した統計学的検定数の補正(2,173の表現型を検定、ボンフェローニ補正p値閾値p<2.3×10-05)後に、多く見られる診断または測定した連続形質との統計学的に有意な関連は認められなかった。
代謝形質の詳細な解析により、高比重リポタンパク質コレステロールがより高いこととの名目上有意な関連(IVWメタアナリシス p<0.05)が明らかとなり、これは、良好な代謝プロファイルに一致する(図10)。GPR75におけるpLOFの保有者は、非保有者と比較して2型糖尿病のオッズが低かった(症例63,492例及び対照549,961例、アレルごとのオッズ比0.92、95%信頼区間0.59,1.45、p=0.73、図10)が、その差異は統計学的に有意ではなかった。エクソームシーケンシング関連統計を、T2D Knowledge Portal(ワールドワイドウェブの「t2d.hugeamp.org/」、2021年1月8日にアクセス)に含まれる最大20,791例の2型糖尿病症例及び24,440例の対照から調査したところ、GPR75 pLOFバリアントの保有者における2型糖尿病の数値的に低いオッズが同様に認められた(2型糖尿病のオッズ比0.52、95%CI 0.14~1.97、p=0.30、代替アレル頻度0.03%)。GPR75におけるpLOFバリアントの希少性に起因して、またBMIと2型糖尿病との遺伝的関係を考慮すると、p<0.05での関連を検出するためには、何百万人もの人々の配列を決定する必要があることが推定される(図10)。血糖レベルの連続的バイオマーカーであるHbA1cの解析により、同様の結果が得られた(図10)。
実施例3:稀なタンパク質トランケーションバリアントの脂肪蓄積の低下との関連は、GPR75遺伝子に高い確度で起因している可能性がある
GPR75におけるpLOFバリアントのBMIに関連するゲノムコンテキストを調査した。非翻訳配列を含有するGPR75の最初で最小のエクソンは、GPR75と、近傍にアンキリンリピート及びSOCSボックス含有3(ASB3、図11)がある推定GPR75-ASB3リードスルー遺伝子の両方に含まれる。第2かつ最後のGPR75エクソン(GPR75の翻訳領域全体を含有する)は、他のいかなる遺伝子または転写物とも共有されていない(図11)。pLOFバリアントの関連がGPR75遺伝子に確実に起因し得ることを確保するために、いくつかの解析を行った。第1に、BMI低下との関連に寄与したGPR75における46個のpLOFバリアントのうち45個がエクソン2に位置していたが(図12)、これはGPR75遺伝子に専有されている(図11)。したがって、GPR75におけるpLOFバリアントの負荷遺伝子型は、GPR75-ASB3リードスルー遺伝子またはASB3遺伝子に影響を与えるpLOFバリアントの負荷遺伝子型との連鎖不平衡を有していなかった(LD、R2<0.0001)。第2に、大規模なエクソームシーケンシングメタアナリシスにおいて、ASB3における、またはGPR75-ASB3リードスルー遺伝子における稀なコーディングバリアントの負荷とBMIとの関連を推定した。ASB3またはGPR75-ASB3における稀な非同義バリアントの負荷については、ASB3またはGPR75-ASB3のいずれかにおけるpLOFバリアントの関連の欠如を含めた、様々なバリアントアノテーション及びアレル頻度の包含基準(図13)を用いた複数の統計モデルにわたって、BMIとの関連はなかった(図13)。最後に、ASB3及びGPR75-ASB3遺伝子型を条件とするGPR75における稀なpLOFバリアントの負荷について、BMIとの関連を推定した。GPR75 pLOFバリアントとBMI低下との関連は、ASB3及びGPR75-ASB3遺伝子型の調整の影響を受けなかった(図14)。したがって、GPR75の稀なpLOFバリアントのBMI低下との関連は、GPR75遺伝子に高い確度で起因している可能性がある。
GPR75におけるpLOFバリアントのBMIに関連するゲノムコンテキストを調査した。非翻訳配列を含有するGPR75の最初で最小のエクソンは、GPR75と、近傍にアンキリンリピート及びSOCSボックス含有3(ASB3、図11)がある推定GPR75-ASB3リードスルー遺伝子の両方に含まれる。第2かつ最後のGPR75エクソン(GPR75の翻訳領域全体を含有する)は、他のいかなる遺伝子または転写物とも共有されていない(図11)。pLOFバリアントの関連がGPR75遺伝子に確実に起因し得ることを確保するために、いくつかの解析を行った。第1に、BMI低下との関連に寄与したGPR75における46個のpLOFバリアントのうち45個がエクソン2に位置していたが(図12)、これはGPR75遺伝子に専有されている(図11)。したがって、GPR75におけるpLOFバリアントの負荷遺伝子型は、GPR75-ASB3リードスルー遺伝子またはASB3遺伝子に影響を与えるpLOFバリアントの負荷遺伝子型との連鎖不平衡を有していなかった(LD、R2<0.0001)。第2に、大規模なエクソームシーケンシングメタアナリシスにおいて、ASB3における、またはGPR75-ASB3リードスルー遺伝子における稀なコーディングバリアントの負荷とBMIとの関連を推定した。ASB3またはGPR75-ASB3における稀な非同義バリアントの負荷については、ASB3またはGPR75-ASB3のいずれかにおけるpLOFバリアントの関連の欠如を含めた、様々なバリアントアノテーション及びアレル頻度の包含基準(図13)を用いた複数の統計モデルにわたって、BMIとの関連はなかった(図13)。最後に、ASB3及びGPR75-ASB3遺伝子型を条件とするGPR75における稀なpLOFバリアントの負荷について、BMIとの関連を推定した。GPR75 pLOFバリアントとBMI低下との関連は、ASB3及びGPR75-ASB3遺伝子型の調整の影響を受けなかった(図14)。したがって、GPR75の稀なpLOFバリアントのBMI低下との関連は、GPR75遺伝子に高い確度で起因している可能性がある。
また、遺伝子座に一般的なバリアントの関連があるか否かも調査した。GPR75の周囲1Mbのウィンドウ(遺伝子の両側500kb)内に、BMIに関連する26個の一般的なバリアントが、ヨーロッパ人のインピュテーションした一般的なバリアントのGWASにゲノムワイドレベルの統計学的有意性で存在したが(IVWメタアナリシス、p<5×10-08)(図15及び図16)、一方、混血米国人においてはゲノムワイドの有意な関連はなかった(図16)。これら26個のバリアントを全て、ASB3に最も近く、かつGPR75のおよそ200kb下流の遺伝子間バリアントであるrs59428052によってもたらされるシグナルに対してファインマッピングした(Gアレル頻度14.7%、因果関係の事後確率30.4%、BMIのSD単位でのアレルごとのベータ-0.015、95%信頼区間-0.020~-0.010、p=1.3×10-09)。GTEx v8において、rs59428052バリアントは、いずれのeQTLシグナルとも共局在せず、遺伝子座にある別の25個のバリアントのいずれも、いずれのセンチネルeQTLともLDになかった(R2>0.8)(図14)。26個のバリアントのうち2つが、ASB3及びGPR75-ASB3におけるミスセンスバリアント(rs36020289)とLDにあり、これはGPR75転写物には影響を及ぼさない(図14)。
この領域のBMIに関連する26個の一般的なバリアントについて調整する形式的な条件付き解析を実施したところ、GPR75におけるpLOFバリアントとBMI低下との関連に依然として変化がないことが明らかとなった(図14)。したがって、GPR75における稀なpLOFバリアントのBMI低下との関連は、ヨーロッパ人の遺伝子座にあるBMIに関連する26個の一般的なバリアントのいずれとも無関係である。
要約すると、遺伝子座でのヒト遺伝子解析により、a)GPR75における稀なpLOFバリアントは、大きな効果の関連を伴ってBMI低下と関連していること、b)pLOFの関連はGPR75に起因しており、他の近傍の転写物に起因しないこと、c)シグナルは、その領域内のBMIに関連する一般的なバリアントとは無関係であること、及びd)ヨーロッパ人のGWASファインマッピングによってその領域で見出された小さな効果の遺伝子間の一般的なバリアントのシグナルには、GPR75との明確なつながりはないことが示される。
実施例4:体脂肪蓄積の低下に関連するGPR75における機能喪失バリアントにより、トランケートされたGPR75受容体が細胞内で保持される
GPR75におけるpLOFバリアントのBMI低下との関連は、異なる位置でGPR75をトランケートすると予測された複数の独立した稀なpLOFバリアントによるものであった(図4A及び図12)。解析においてエクソームシーケンシングによって見出された46個の稀なpLOFバリアントのいずれも、その希少性に起因して、アレイ遺伝子型決定またはインピュテーションによって十分に確認されなかった(図12)。Leave-one-out解析により、一度に1つのpLOFバリアントの除外に対して、負荷シグナルが強力であることが示された(図17)。GPR75の46個の稀なpLOFバリアントのうち5つは、名目上のレベルの統計学的有意性でBMI低下と個別に関連しており(IVWメタアナリシス p<0.05、Ala110fs、Ser219fs、Gln234*、Cys400fs、Lys404*、図18)、一方、高BMIと関連するものはなかった。これらの5つのバリアント部位を全て解析から除外したところ、pLOFバリアントの残りのセットは依然としてBMI低下と関連していた(図17)。
GPR75におけるpLOFバリアントのBMI低下との関連は、異なる位置でGPR75をトランケートすると予測された複数の独立した稀なpLOFバリアントによるものであった(図4A及び図12)。解析においてエクソームシーケンシングによって見出された46個の稀なpLOFバリアントのいずれも、その希少性に起因して、アレイ遺伝子型決定またはインピュテーションによって十分に確認されなかった(図12)。Leave-one-out解析により、一度に1つのpLOFバリアントの除外に対して、負荷シグナルが強力であることが示された(図17)。GPR75の46個の稀なpLOFバリアントのうち5つは、名目上のレベルの統計学的有意性でBMI低下と個別に関連しており(IVWメタアナリシス p<0.05、Ala110fs、Ser219fs、Gln234*、Cys400fs、Lys404*、図18)、一方、高BMIと関連するものはなかった。これらの5つのバリアント部位を全て解析から除外したところ、pLOFバリアントの残りのセットは依然としてBMI低下と関連していた(図17)。
in vitroで発現させたBMIと個別に関連するpLOFバリアントの中で最も高頻度の2つ(マイナーアレルカウント≧10)により、完全な機能喪失を招く可能性があるトランケートされた受容体が細胞中で保持されることが示された(図19)。
機能的コピーの喪失(すなわち、ハプロ不全)または受容体多量体を破壊するトランケートされたタンパク質の産生(すなわち、ドミナントネガティブ効果)により、GPR75のトランケーションとBMI低下との関連の説明がつく可能性があると予測されている。ハプロ不全の場合、GPR75の早期のN末端トランケーションは、最後の細胞内ドメイン内のC末端トランケーションよりも表現型へより大きな影響をもたらすという仮説が立てられている。最終細胞内ドメインの前にGPR75のトランケーションをもたらす遺伝子バリアントは、最終ドメイン内のトランケーションをもたらすバリアントの-1.4kg/m2のBMI低下(IVWメタアナリシス p=0.012)と比較して、-2.1kg/m2のBMI低下と関連していた(IVWメタアナリシス p=4.1×10-07)(図20)。この差異は、最終のC末端ドメインの最後の100アミノ酸内のトランケーションについて更に顕著であった(図20)。
実施例5:マウスにおける、高脂肪飼料誘発性肥満におけるGpr75欠失及びその血糖への影響
GPR75-KO雄マウスは、野生型と比較して7%少ない体重を示した(図21)。対照的に、雌マウスでは有意差は認められなかった(図21)。GPR75-KOマウスのより詳細な体組成解析を図22に要約する。Gpr75 KOマウスは、野生型と比較して脂肪体積及び脂肪率が24%低く(図22及び図23)、統計学的有意差があった。
GPR75-KO雄マウスは、野生型と比較して7%少ない体重を示した(図21)。対照的に、雌マウスでは有意差は認められなかった(図21)。GPR75-KOマウスのより詳細な体組成解析を図22に要約する。Gpr75 KOマウスは、野生型と比較して脂肪体積及び脂肪率が24%低く(図22及び図23)、統計学的有意差があった。
高脂肪飼料(HFD)誘発性肥満のマウスモデルでは、Gpr75の実験的欠失により、体重増加とそれに関連するグルコース及びインスリンの代謝異常が防止された(図24)。HFDを14週間与えた場合、Gpr75+/+マウスの体重はおよそ2倍となった。体重は、平均(標準偏差)が20.9(2.1)グラムから43.3(6.5)グラムに変化した(体重変化+22.4グラム)。対照的に、Gpr75の遺伝子欠失を有するマウスは、アレル量(allele-dose)依存的に体重増加が少なかった(Gpr75+/-マウスについては、体重変化+16.9グラム、野生型との体重変化の差-5.5グラムまたは-25%、Gpr75-/-マウスについては、体重変化+12.6グラム、野生型との体重変化の差-9.8グラムまたは-44%、図24A)。Gpr75+/+マウスのHFDで見られる空腹時血糖の上昇は、Gpr75-/+マウス及びGpr75-/-マウスにおいてアレル量依存的に低減した(図24B)。Gpr75に遺伝子欠失を有するマウスはまた、耐糖能及びインスリン感受性のHFD誘発性障害に対して抵抗性であった(図24C及び図24D)。14週間のHFDの終了時、血漿レプチンレベルは、Gpr75-/-マウス及びGPR75+/-マウスにおいて野生型マウスと比較してより低く(図25A)、一方でアディポネクチンレベルは、GPR75+/-マウス及びGPR75-/-マウスにおいて野生型と比較してより高く、その結果レプチン対アディポネクチン比が2倍及び10倍低かった(図25B及び図25C)。
実験の別個のセットにおける更なる解析により、固形飼料で維持した、または0週目から9週間にわたり60%の高脂肪飼料に切り替えた後のGPR75+/+マウス、Gpr75+/-マウス、及びGpr75-/-マウスにおいて、体重に加えて、体組成及び血糖値に対するGpr75の遺伝的欠乏の影響を試験した。体重を毎週検査した。-1、4、及び8週目に血糖値を測定した。0、5、及び9週目に、脂肪量、除脂肪量、及び骨量をマイクロコンピュータ断層撮影(mCT)で定量化した。
固形飼料から高脂肪飼料の給餌への切り替え前に、10~15週齢の雄Gpr75+/+マウス、Gpr75+/-マウス、及びGpr75-/-マウスは、体重(0週目、図26、パネルA)、除脂肪量(0週目、図26、パネルB)、骨量(0週目、図26、パネルB)、または血糖値(-1週目、図26、パネルC)に差を示さなかった。しかしながら、GPR75-/-マウスは、Gpr75+/+マウス及びGpr75+/-マウスと比較した場合、脂肪量の有意な低減を示した(図26、パネルB)。高脂肪飼料を9週間給餌した後、Gpr75+/+マウス、Gpr75+/-マウス、及びGpr75-/-マウスは、0週目の体重と比較して体重が増加した(図26、パネルA)。高脂肪飼料給餌への切り替え後のGpr75-/-マウスの体重は、1週間の高脂肪飼料給餌から9週間の高脂肪飼料給餌にわたって、Gpr75+/+マウスよりも有意に低かった(図26、パネルA)。加えて、Gpr75+/-マウスの体重は、4週間の高脂肪飼料給餌から9週間のマウスにわたって、Gpr75+/+マウスよりも有意に低かった(図26、パネルA)。要約すると、Gpr75+/-マウス及びGpr75-/-マウスは、高脂肪飼料の給餌による体重増加の低減を示す。
mCTによる体組成の評価により、高脂肪飼料を9週間給餌した後、Gpr75+/+マウス、Gpr75+/-マウス、及びGpr75-/-マウスは、脂肪量が0週目と比較して増加したことが明らかとなった。高脂肪飼料の給餌後5週間及び9週間で、Gpr75-/-マウス及びGPR75+/-マウスは、Gpr75+/+マウスと比較して脂肪量の低下を示した(図26、パネルB)。除脂肪量及び骨量(図26、パネルB)は、高脂肪飼料を5週間及び9週間給餌した後に、Gpr75+/+マウス、Gpr75+/-マウス、及びGpr75-/-マウスの間で有意差はなかった。要約すると、Gpr75-/-マウス及びGpr75+/-マウスは、高脂肪の給餌による脂肪量増加の低減を示す。
高脂肪飼料を8週間給餌した後、Gpr75+/+マウス、Gpr75+/-マウス、及びGpr75-/-マウスは、-1週目の固形飼料給餌での血糖値と比較して、血糖値の有意な上昇を示した(図26、パネルC)。高脂肪飼料を4週間給餌した後では、Gpr75+/+マウス、Gpr75+/-マウス、及びGpr75-/-マウスの間で血糖値の差異は認められなかった(図26、パネルC)。しかしながら、高脂肪飼料を8週間給餌した後では、Gpr75-/-マウス及びGpr75+/-マウスは、GPR75+/+マウスよりも有意に低い血糖値を示した(図26、パネルC)。これらのデータは、Gpr75+/-マウス及びGpr75-/-マウスが、高脂肪飼料の給餌に伴う高血糖症からの保護を示すことを示唆している。
実施例6:固形飼料を給餌した雌GPR75ノックアウトマウスは、インスリン抵抗性ではなく、耐糖能の改善を示す
13週齢の雌Gpr75+/+マウス、Gpr75+/-マウス、及びGpr75-/-マウスに対して、経口糖負荷試験を実施した。動物を午前7時から4時間絶食させ、次に、午前11時に経口強制飼養で用量2g/kgのデキストロース(Hospira,Inc、NDC 0409-6658-02)を与えた。AlphaTRAK2グルコースメーター(Zoetis、カタログ番号71676-01)及びテストストリップ(Zoetis、カタログ番号71681-01)を使用して、デキストロース投与の0、15、30、60、及び120分後にグルコース測定値を採取した。結果を図27に示す。
13週齢の雌Gpr75+/+マウス、Gpr75+/-マウス、及びGpr75-/-マウスに対して、経口糖負荷試験を実施した。動物を午前7時から4時間絶食させ、次に、午前11時に経口強制飼養で用量2g/kgのデキストロース(Hospira,Inc、NDC 0409-6658-02)を与えた。AlphaTRAK2グルコースメーター(Zoetis、カタログ番号71676-01)及びテストストリップ(Zoetis、カタログ番号71681-01)を使用して、デキストロース投与の0、15、30、60、及び120分後にグルコース測定値を採取した。結果を図27に示す。
本明細書に記載されているものに加えて、記載されている主題の様々な修正が、前述の説明から当業者には明らかとなるであろう。そのような修正はまた、添付の特許請求の範囲内に入ることが意図される。本出願で引用された各参照文献(雑誌論文、米国及び米国以外の特許、特許出願公開、国際特許出願公開、遺伝子バンクアクセッション番号などを含むがこれらに限定されない)は、あらゆる目的のためにその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
Claims (69)
- 肥満、過体重、BMI上昇、体脂肪量、体脂肪率、もしくは体脂肪体積が上昇している、または過剰に食物を摂取している対象を治療する、あるいは
体重増加を予防するために、または体重減少を維持するために対象を治療する方法であって、
GPR75阻害剤を前記対象に投与することを含む、前記方法。 - 前記GPR75阻害剤が、阻害性核酸分子を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記阻害性核酸分子が、GPR75 mRNAとハイブリダイズする、アンチセンス核酸分子、低分子干渉RNA(siRNA)、またはショートヘアピンRNA(shRNA)である、請求項2に記載の方法。
- 前記GPR75阻害剤が、Casタンパク質と、GPR75ゲノム核酸分子内のガイドRNA(gRNA)認識配列とハイブリダイズするgRNAと、を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記Casタンパク質が、Cas9またはCpf1である、請求項4に記載の方法。
- 前記gRNA認識配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位、配列番号1に記載の5,557位、配列番号1に記載の5,911位、配列番号1に記載の5,920~5,923位、配列番号1に記載の6,411位、または配列番号1に記載の5,831位に対応する位置を含むかまたはこれに近接する、請求項4または請求項5に記載の方法。
- 前記gRNAが、約17~約23ヌクレオチドを含む、請求項4~6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記gRNA認識配列が、配列番号61~98のいずれか1つに記載のヌクレオチド配列を含む、請求項4~8のいずれか1項に記載の方法。
- 前記対象からの生体試料における予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGPR75ミスセンスバリアント核酸分子の非存在を検出することを更に含む、請求項1~8のいずれか1項に記載の方法。
- GPR75参照である対象に、肥満を治療または抑制する治療剤を標準投与量で投与することを更に含む、請求項9に記載の方法。
- GPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である対象に、肥満を治療または抑制する治療剤を標準投与量と同じかまたはそれより少ない投与量で投与することを更に含む、請求項9に記載の方法。
- 前記GPR75ミスセンスバリアント核酸分子が、Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs、またはCys400fsをコードする核酸分子である、請求項9~11のいずれか1項に記載の方法。
- 肥満を治療または抑制する治療剤で対象を治療する方法であって、
前記対象が肥満であり、
前記対象が、予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGタンパク質共役受容体75(GPR75)ミスセンスバリアント核酸分子を有するか否かを、
前記対象から生体試料を得るまたは得たことと、
前記対象が前記GPR75ミスセンスバリアント核酸分子を含む遺伝子型を有するか否かを判定するために前記生体試料で配列解析を実施するまたは実施したことと、
によって、判定するステップと、
GPR75参照である対象に、肥満を治療もしくは抑制する前記治療剤及び/またはGPR75阻害剤を標準投与量で投与する、または投与し続けるステップと、
GPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性である対象に、肥満を治療もしくは抑制する前記治療剤及び/またはGPR75阻害剤を標準投与量と同じかまたはそれより少ない量で投与する、または投与し続けるステップと、を含み、
ここで、予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードする前記GPR75ミスセンスバリアント核酸分子を有する遺伝子型の存在が、前記対象が肥満を発症するリスクが低減していることを示している、前記方法。 - 前記対象がGPR75参照である場合、前記対象が、肥満を治療もしくは抑制する前記治療剤及び/またはGPR75阻害剤を、標準投与量で投与されるか、または投与され続ける、請求項13に記載の方法。
- 前記対象が、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性であり、前記対象が、肥満を治療もしくは抑制する前記治療剤及び/またはGPR75阻害剤を、標準投与量と同じかまたはそれより少ない量で投与されるか、または投与され続ける、請求項13に記載の方法。
- 前記GPR75ミスセンスバリアント核酸分子が、Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs、またはCys400fsをコードする核酸分子である、請求項13~15のいずれか1項に記載の方法。
- 前記GPR75ミスセンスバリアント核酸分子が、
配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含む、もしくは配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、
配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、もしくは配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有するmRNA分子、または
mRNA分子から生成されたcDNA分子であって、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有する前記cDNA分子
である、請求項16に記載の方法。 - 前記GPR75阻害剤が、阻害性核酸分子を含む、請求項13に記載の方法。
- 前記阻害性核酸分子が、GPR75 mRNAとハイブリダイズする、アンチセンス核酸分子、低分子干渉RNA(siRNA)、またはショートヘアピンRNA(shRNA)である、請求項18に記載の方法。
- 前記GPR75阻害剤が、Casタンパク質と、GPR75ゲノム核酸分子内のガイドRNA(gRNA)認識配列とハイブリダイズするgRNAと、を含む、請求項13に記載の方法。
- 前記Casタンパク質が、Cas9またはCpf1である、請求項20に記載の方法。
- 前記gRNA認識配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位、配列番号1に記載の5,557位、配列番号1に記載の5,911位、配列番号1に記載の5,920~5,923位、配列番号1に記載の6,411位、または配列番号1に記載の5,831位に対応する位置を含むかまたはこれに近接する、請求項20または請求項21に記載の方法。
- 前記gRNAが、約17~約23ヌクレオチドを含む、請求項20~22のいずれか1項に記載の方法。
- 前記gRNA認識配列が、配列番号61~98のいずれか1つに記載のヌクレオチド配列を含む、請求項20~23のいずれか1項に記載の方法。
- 肥満を発症するリスクが高い対象を同定する方法であって、
前記対象から得た生体試料において、予測される機能喪失GPR75ポリペプチドをコードするGタンパク質共役受容体75(GPR75)ミスセンスバリアント核酸分子の有無を判定すること、または判定したことを含み、
ここで、
前記対象がGPR75参照である場合、前記対象が肥満を発症するリスクが高く、
前記対象がGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性であるかまたはGPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてホモ接合性である場合、前記対象が肥満を発症するリスクが低い、前記方法。 - 前記GPR75ミスセンスバリアント核酸分子が、Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs、またはCys400fsをコードする核酸分子である、請求項25に記載の方法。
- 前記GPR75ミスセンスバリアント核酸分子が、
配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンを含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンの挿入を含む、もしくは配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、
配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルを含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルの挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンを含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有するmRNA分子、または
mRNA分子から生成されたcDNA分子であって、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドを欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンを含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンを含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンを含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンを含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンを含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドを欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンの挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンを含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンを含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンを含む、ヌクレオチド配列を有する前記cDNA分子
である、請求項26に記載の方法。 - 前記対象が、GPR75参照であり、前記対象が、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤を、標準投与量で投与される、請求項25~27のいずれか1項に記載の方法。
- 前記対象が、GPR75ミスセンスバリアント核酸分子についてヘテロ接合性であり、前記対象が、肥満を治療もしくは抑制する治療剤及び/またはGPR75阻害剤を、標準投与量と同じかまたはそれより少ない量で投与される、請求項25~27のいずれか1項に記載の方法。
- 対象におけるヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)バリアント核酸分子を検出する方法であって、前記対象から得た試料をアッセイして、前記試料中の核酸分子が、
配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、もしくは配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列を含むゲノム核酸分子、
配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列を有するmRNA分子、または
mRNA分子から生成されたcDNA分子であって、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列を有する前記cDNA分子
であるか否かを判定することを含む、前記方法。 - ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs、またはCys400fsバリアントポリペプチドの存在を検出する方法であって、
対象から得た試料でアッセイを実施し、前記試料中のGPR75タンパク質が、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、または配列番号108を含むか否かを判定することを含む、前記方法。 - 少なくとも約15ヌクレオチドを含む単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーであって、
前記変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーが、ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含み、前記一部分が、
配列番号2に記載の5,540~5,546位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号11に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号16に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号21に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号26に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号35に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号40に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号45に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号50に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、
配列番号5に記載の5,920~5,923位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号14に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号19に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号24に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号29に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号38に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号43に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号48に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号53に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、または
配列番号6に記載の6,411位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、もしくは配列番号54に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体
を含む、前記変化特異的プローブまたは変化特異的プライマー。 - 配列番号2に記載の5,540~5,546位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号5に記載の5,920~5,923位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号6に記載の6,411位に対応する位置もしくはその相補体を含むヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含む、請求項32に記載の変化特異的プローブまたは変化特異的プライマー。
- 配列番号11に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号16に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号21に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号26に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号14に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号19に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号24に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号29に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号30に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体を含むヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含む、請求項32に記載の変化特異的プローブまたは変化特異的プライマー。
- 配列番号35に記載の539~545位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号40に記載の440~446位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号45に記載の361~367位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号50に記載の600~606位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号38に記載の919~922位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号43に記載の820~823位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号48に記載の741~744位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号53に記載の980~983位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置もしくはその相補体、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置もしくはその相補体、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置もしくはその相補体を含むヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含む、請求項32に記載の変化特異的プローブまたは変化特異的プライマー。
- ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むゲノム核酸分子とハイブリダイズした変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含む分子複合体であって、
前記変化特異的プライマーまたは前記変化特異的プローブが、配列番号2に記載の5,539~5,540位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体において、配列番号5に記載の5,919~5,920位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体において、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、前記ゲノム核酸分子とハイブリダイズしている、前記分子複合体。 - 前記ゲノム核酸分子が、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、または配列番号99を含む、請求項36に記載の分子複合体。
- ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むmRNA分子とハイブリダイズした変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含む分子複合体であって、
前記変化特異的プライマーまたは前記変化特異的プローブが、配列番号11に記載の538~539位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号16に記載の439~440位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号21に記載の360~361位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号26に記載の599~600位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体において、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号14に記載の918~919位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号19に記載の819~820位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号24に記載の740~741位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号29に記載の979~980位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体において、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体において、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体において、前記mRNA分子とハイブリダイズしている、前記分子複合体。 - 前記mRNA分子が、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号100、配列番号101、配列番号102、または配列番号103を含む、請求項38に記載の分子複合体。
- ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むcDNA分子とハイブリダイズした変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含む分子複合体であって、
前記変化特異的プライマーまたは前記変化特異的プローブが、配列番号35に記載の538~539位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号40に記載の439~440位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号45に記載の360~361位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号50に記載の599~600位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号38に記載の918~919位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号43に記載の819~820位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号48に記載の740~741位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号53に記載の979~980位に対応する位置のヌクレオチドもしくはその相補体、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体とハイブリダイズしている、前記分子複合体。 - 前記cDNA分子が、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、または配列番号54、配列番号104、配列番号105、配列番号106、または配列番号107を含む、請求項40に記載の分子複合体。
- ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子またはその相補体であって、
前記ポリペプチドが、配列番号56に記載の110位に対応する位置から始まるフレームシフト、配列番号59に記載の236位に対応する位置から始まるフレームシフト、または配列番号60に記載の400位に対応する位置から始まるフレームシフトを含む、前記単離された核酸分子またはその相補体。 - ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたゲノム核酸分子であって、
前記ヌクレオチド配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、または配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、前記単離されたゲノム核酸分子。 - 前記核酸分子が、配列番号2、配列番号5、または配列番号6を含む、請求項43に記載の単離されたゲノム核酸分子またはその相補体。
- ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたmRNA分子であって、
前記ヌクレオチド配列が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、前記単離されたmRNA分子。 - 前記核酸分子が、配列番号11、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号29、または配列番号30を含む、請求項45に記載の単離されたmRNA分子またはその相補体。
- ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたcDNA分子であって、
前記ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、または配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、前記単離されたcDNA分子。 - 前記核酸分子が、配列番号35、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号53、または配列番号54を含む、請求項47に記載の単離されたcDNA分子またはその相補体。
- 配列番号56と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有する単離されたヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドであって、配列番号55に記載の110~540位に対応する位置のアミノ酸を欠いている、前記単離されたヒトGPR75ポリペプチド、
配列番号59と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有する単離されたGPR75ポリペプチドであって、配列番号55に記載の236~540位に対応する位置のアミノ酸を欠いている、前記単離されたヒトGPR75ポリペプチド、または
配列番号60と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有する単離されたGPR75ポリペプチドであって、配列番号55に記載の400~540位に対応する位置のアミノ酸を欠いている、前記単離されたヒトGPR75ポリペプチド。 - 前記ポリペプチドが、配列番号56、配列番号59、または配列番号60を含む、請求項49に記載のポリペプチド。
- ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子またはその相補体であって、
前記ポリペプチドが、配列番号57に記載の116位に対応する位置のトレオニンを含むか、配列番号58に記載の233位に対応する位置で終止するか、または配列番号99に記載の207位に対応する位置のシステインを含む、前記単離された核酸分子またはその相補体。 - 前記ポリペプチドが、配列番号57、配列番号58、または配列番号99を含む、請求項51に記載の核酸分子またはその相補体。
- ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたmRNA分子であって、
前記ヌクレオチド配列が、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記単離されたmRNA分子。 - 前記核酸分子が、配列番号12、配列番号17、配列番号22、配列番号27、配列番号13、配列番号18、配列番号23、配列番号28、配列番号100、配列番号101、配列番号102、または配列番号103を含む、請求項53に記載の単離されたmRNA分子またはその相補体。
- ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたcDNA分子であって、
前記ヌクレオチド配列が、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、または配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記単離されたcDNA分子。 - 前記核酸分子が、配列番号36、配列番号41、配列番号46、配列番号51、配列番号37、配列番号42、配列番号47、配列番号52、配列番号104、配列番号105、配列番号106、または配列番号107を含む、請求項55に記載の単離されたcDNA分子またはその相補体。
- ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたゲノム核酸分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体、または配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記単離されたゲノム核酸分子。
- 前記核酸分子が、配列番号3、配列番号4、または配列番号99を含む、請求項57に記載の単離されたゲノム核酸分子またはその相補体。
- 配列番号57と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有する単離されたヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドであって、配列番号57に記載の116位に対応する位置のトレオニンを含む、前記単離されたヒトGPR75ポリペプチド、
配列番号58と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有する単離されたヒトGPR75ポリペプチドであって、配列番号58に記載の233位に対応する位置で終止する、前記単離されたヒトGPR75ポリペプチド、または
配列番号99と少なくとも約90%同一であるアミノ酸配列を有する単離されたヒトGPR75ポリペプチドであって、配列番号99に記載の207位に対応する位置のシステインを含む、前記単離されたヒトGPR75ポリペプチド。 - 前記ポリペプチドが、配列番号57、配列番号58、または配列番号99を含む、請求項59に記載のポリペプチド。
- ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、もしくは配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記ゲノム核酸分子、
ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記mRNA分子、または
ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記cDNA分子
を有する、対象の肥満の治療に使用するための、肥満を治療または抑制する治療剤。 - ヒトGタンパク質共役受容体75(GPR75)ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号3に記載の5,557位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号4に記載の5,911位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号1に記載の5,920~5,923位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号6に記載の6,411位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、もしくは配列番号99に記載の5,831位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記ゲノム核酸分子、
ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するmRNA分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号7に記載の539~545位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の440~446位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の361~367位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の600~606位に対応する位置のCCAGUAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号12に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号17に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号22に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号27に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号13に記載の910位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号18に記載の811位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号23に記載の732位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号28に記載の971位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体を含む、配列番号7に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号8に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号9に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号10に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号15に記載の1,410位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号20に記載の1,311位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号25に記載の1,232位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号30に記載の1,471位に対応する位置のウラシルもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号100に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号101に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号102に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号103に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記mRNA分子、または
ヒトGPR75ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するcDNA分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号31に記載の539~545位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の440~446位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の361~367位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の600~606位に対応する位置のCCAGTAGヘプタヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号36に記載の556位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号41に記載の457位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号46に記載の378位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号51に記載の617位に対応する位置のアデニンもしくはその相補体を含む、配列番号37に記載の910位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号42に記載の811位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号47に記載の732位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号52に記載の971位に対応する位置のチミンもしくはその相補体を含む、配列番号31に記載の919~922位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号32に記載の820~823位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号33に記載の741~744位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号34に記載の980~983位に対応する位置のAAAGテトラヌクレオチドもしくはその相補体を欠いている、配列番号39に記載の1,410位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号44に記載の1,311位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号49に記載の1,232位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号54に記載の1,471位に対応する位置のチミンもしくはその相補体の挿入を含む、配列番号104に記載の830位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号105に記載の731位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、配列番号106に記載の652位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、もしくは配列番号107に記載の891位に対応する位置のグアニンもしくはその相補体を含む、前記cDNA分子
を有する、対象の肥満の治療に使用するための、Gタンパク質共役受容体75(GPR75)阻害剤。 - 前記GPR75阻害剤が、阻害性核酸分子を含む、請求項62に記載の方法。
- 前記阻害性核酸分子が、GPR75 mRNAとハイブリダイズする、アンチセンス核酸分子、低分子干渉RNA(siRNA)、またはショートヘアピンRNA(shRNA)である、請求項63に記載の方法。
- 前記GPR75阻害剤が、Casタンパク質と、GPR75ゲノム核酸分子内のガイドRNA(gRNA)認識配列とハイブリダイズするgRNAと、を含む、請求項62に記載の方法。
- 前記Casタンパク質が、Cas9またはCpf1である、請求項65に記載の方法。
- 前記gRNA認識配列が、配列番号1に記載の5,540~5,546位、配列番号1に記載の5,557位、配列番号1に記載の5,911位、配列番号1に記載の5,920~5,923位、配列番号1に記載の6,411位、または配列番号1に記載の5,831位に対応する位置を含むかまたはこれに近接する、請求項65または請求項66に記載の方法。
- 前記gRNAが、約17~約23ヌクレオチドを含む、請求項65~67のいずれか1項に記載の方法。
- 前記gRNA認識配列が、配列番号61~98のいずれか1つに記載のヌクレオチド配列を含む、請求項65~69のいずれか1項に記載の方法。
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