CN116249787A - 用g蛋白偶联受体75(gpr75)抑制剂治疗肥胖症 - Google Patents
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Abstract
本公开提供了治疗患有肥胖症的受试者的方法,鉴定具有增加的发展肥胖症的风险的受试者的方法,检测人G蛋白偶联受体75变体核酸分子和变体多肽的方法,以及GPR75变体核酸分子和变体多肽。
Description
对序列表的引用
本申请包括以电子形式作为文本文件提交的序列列表,其命名为18923804802SEQ,创建于2021年6月20日,大小为533千字节。所述序列表以引用的方式并入本文。
技术领域
本公开总体涉及用G蛋白偶联受体75(GPR75)抑制剂治疗患有肥胖症的受试者,鉴定具有增加的发展肥胖症的风险的受试者的方法,检测GPR75变体核酸分子和变体多肽的方法,以及GPR75变体核酸分子和GPR75变体多肽。
背景技术
肥胖症及其心脏代谢并发症,尤其是2型糖尿病和冠状动脉疾病,在全球造成了显著的发病率和死亡率。对于安全且有效的减重方法存在大量未得到满足的医疗需求。
对饮食和身体活动的生活方式干预是用于管理肥胖症和超重的首选,但功效可能有限,并且体重反弹是常见的。减肥手术对于严重肥胖或高危患者的体重减轻可能非常有效,但其使用受到其侵入性质、成本、围手术期不良事件(包括围手术期死亡)的风险的限制。虽然少数药物已在减重方面展示出功效,但用于治疗肥胖症的药物疗法受限于大多数药物诱导的适度体重减轻、一些剂的副作用概况、禁忌症、低依从性和治疗障碍(包括处方不足)。
GPR75是G蛋白偶联受体家族的成员。GPR是在配体结合后激活鸟嘌呤-核苷酸结合蛋白的细胞表面受体。GPR75受趋化因子CCL5/RANTES激活。GPR75可能与异源三聚体Gq蛋白偶联,并在激活后刺激肌醇三磷酸的产生和钙动员。与CCL5/RANTES一起,GPR75可通过涉及PI3、Akt和MAP激酶的下游信号传导途径的激活而在神经元存活中起作用。CCL5/RANTES也可通过该受体的激活调控胰岛细胞的胰岛素分泌。
发明内容
本公开提供了治疗患有肥胖症的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用G蛋白偶联受体75(GPR75)抑制剂。在一些实施方案中,受试者是GPR75参考或对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子是杂合的。
本公开还提供了治疗体重过重的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用GPR75抑制剂。在一些实施方案中,受试者是GPR75参考或对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子是杂合的。
本公开还提供了治疗BMI升高的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用GPR75抑制剂。在一些实施方案中,受试者是GPR75参考或对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子是杂合的。
本公开还提供了治疗体脂质量、百分比或体积升高的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用GPR75抑制剂。在一些实施方案中,受试者是GPR75参考或对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子是杂合的。
本公开还提供了治疗食物摄入过量的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用GPR75抑制剂。在一些实施方案中,受试者是GPR75参考或对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子是杂合的。
本公开还提供了治疗受试者以预防体重增加或维持体重减轻的方法,所述方法包括向所述受试者施用GPR75抑制剂。在一些实施方案中,受试者是GPR75参考或对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子是杂合的。
本公开还提供了用治疗或抑制肥胖症的治疗剂治疗受试者的方法,其中所述受试者是肥胖的,所述方法包括以下步骤:通过以下方式确定所述受试者是否具有编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子:从所述受试者获得或已经获得生物样品;以及对所述生物样品进行或已经进行了序列分析以确定所述受试者是否具有包含所述GPR75错义变体核酸分子的基因型;以及将治疗或抑制肥胖症的所述治疗剂和/或GPR75抑制剂以标准剂量施用或继续施用给作为GPR75参考的受试者;以及将治疗或抑制肥胖症的所述治疗剂和/或GPR75抑制剂以与标准剂量相同或低于标准剂量的量施用或继续施用给GPR75错义变体核酸分子杂合的受试者;其中具有编码预测的功能丧失性GPR75多肽的所述GPR75错义变体核酸分子的基因型的存在指示所述受试者具有降低的发展肥胖症的风险。
本公开还提供了鉴定具有增加的发展肥胖症的风险的受试者的方法,其中所述方法包括:确定或已经确定在获自所述受试者的生物样品中存在或不存在编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子;其中:当所述受试者是GPR75参考时,则所述受试者具有增加的发展肥胖症的风险;并且当所述受试者对于GPR75错义变体核酸分子是杂合的或纯合的时,则所述受试者具有降低的发展肥胖症的风险。
本公开还提供了检测受试者中的人GPR75变体核酸分子的方法,所述方法包括测定获自所述受试者的样品以确定所述样品中的核酸分子是否是:包含下述核苷酸序列的基因组核酸分子:在对应于根据SEQ ID NO:1或其补体的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;具有下述核苷酸序列的mRNA分子:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;或由mRNA分子产生的cDNA分子,其中所述cDNA分子具有下述核苷酸序列:在对应于根据SEQ IDNO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
本公开还提供了检测人GPR75 Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs或Cys400fs变体多肽的存在的方法,其包括对获自受试者的样品进行测定以确定所述样品中的GPR75蛋白是否包含SEQ ID NO:56、SEQ ID NO:57、SEQ ID NO:58、SEQ IDNO:59、SEQ ID NO:60或SEQ ID NO:108。
本公开还提供了分离的包含至少约15个核苷酸的改变特异性探针或改变特异性引物,其中所述改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码人GPR75多肽的核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,其中所述部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置5,540-5,546;根据SEQ ID NO:11或其互补序列的位置539-545;根据SEQ ID NO:16或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:21或其互补序列的位置361-367;根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置600-606;根据SEQ ID NO:35或其互补序列的位置539-545;根据SEQ ID NO:40或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:45或其互补序列的位置361-367;或根据SEQ ID NO:50或其互补序列的位置600-606;根据SEQ IDNO:5或其互补序列的位置5,920-5,923;根据SEQ ID NO:14或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:19或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置741-744;根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置980-983;根据SEQ ID NO:38或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:43或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:48或其互补序列的位置741-744;或根据SEQ ID NO:53或其互补序列的位置980-983;或根据SEQID NO:6或其互补序列的位置6,411;根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410;根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232;根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471;根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410;根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232;或根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471;根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置5,831;根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830;根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731;根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652;根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891;根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830;根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731;根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652;或根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891。
本公开还提供了分子复合物,其包含与包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子杂交的改变特异性引物或改变特异性探针,其中所述改变特异性引物或所述改变特异性探针与下述核苷酸杂交:在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置5,539-5,540的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:5或其互补序列的位置5,919-5,920的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置的鸟嘌呤。
本公开还提供了分子复合物,其包含与包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子杂交的改变特异性引物或改变特异性探针,其中所述改变特异性引物或所述改变特异性探针与下述核苷酸杂交:在对应于根据SEQ ID NO:11或其互补序列的位置538-539的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:16或其互补序列的位置439-440的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:21或其互补序列的位置360-361的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置599-600的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:14或其互补序列的位置918-919的位置的核苷酸;在对应于根据SEQID NO:19或其互补序列的位置819-820的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置740-741的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置979-980的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:30或其互补序列的位置1,471的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的鸟嘌呤。
本公开还提供了分子复合物,其包含与包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子杂交的改变特异性引物或改变特异性探针,其中所述改变特异性引物或所述改变特异性探针与下述核苷酸杂交:在对应于根据SEQ ID NO:35或其互补序列的位置538-539的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:40或其互补序列的位置439-440的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:45或其互补序列的位置360-361的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:50或其互补序列的位置599-600的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:38或其互补序列的位置918-919的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:43或其互补序列的位置819-820的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:48或其互补序列的位置740-741的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:53或其互补序列的位置979-980的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:104或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤。
本公开还提供分离的核酸分子,其包含编码人GPR75多肽或其互补序列的核苷酸序列,其中所述多肽包含:从对应于根据SEQ ID NO:56的位置110的位置开始的移码,从对应于根据SEQ ID NO:59的位置236的位置开始的移码,或从对应于根据SEQ ID NO:60的位置400的位置开始的移码。
本公开还提供分离的基因组核酸分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
本公开还提供了分离的mRNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入。
本公开还提供了分离的cDNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
本公开还提供了分离的人GPR75多肽,其具有与以下序列至少约90%同一的氨基酸序列:SEQ ID NO:56,其中所述多肽在对应于根据SEQ ID NO:55的位置110至540的位置缺乏氨基酸;SEQ ID NO:59,其中所述多肽在对应于根据SEQ ID NO:55的位置236至540的位置缺乏氨基酸;或SEQ ID NO:60,其中所述多肽在对应于根据SEQ ID NO:55的位置400至540的位置缺乏氨基酸。
本公开还提供了治疗或抑制肥胖症的治疗剂,其用于治疗受试者的肥胖症,所述受试者具有:具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ IDNO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;或具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
本公开还提供了GPR75抑制剂,其用于治疗受试者的肥胖症,所述受试者具有:具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ IDNO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;或具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
附图说明
并入本说明书并构成其一部分的附图说明了本公开的若干特征。
本专利或申请文件含有至少一张彩绘附图。在提出请求和支付必要费用后,将由专利局提供具有彩色附图的本专利或专利申请公布的副本。
图1示出了包括在全外显子组关联研究中的个体的基线特点。缩写:UKB,英国生物样本库;GHS,格伊辛格卫生系统(Geisinger Health System);MCPS,墨西哥城市前瞻性研究(Mexico City Prospective Study);SD,标准偏差;N,参与者数目;WHO,世界卫生组织(World Health Organization);IQR,四分位数间距;kg/m2,千克/平方米;mg/dL,毫克/分升;mmHg,毫米汞柱。
图2示出了UKB、GHS和MCPS队列中GPR75与体质指数的关联结果。缩写:CI,置信区间;SD,标准偏差;BMI,体质指数;AAF,替代等位基因频率;RR,参考-参考基因型;RA,参考-替代杂合基因型;AA,替代-替代纯合基因型;pLOF,预测的功能丧失;UKB,英国生物样本库;GHS,格伊辛格卫生系统MyCode研究(Geisinger Health System MyCode study);MCPS,墨西哥城市前瞻性研究(Mexico City Prospective Study)。
图3示出了在全外显子组基因负荷分析中GPR75与体质指数的关联。该表报告了GPR75基因的关联统计,对其而言罕见的pLOF变体的基因负荷在统计显著性的全外显子组水平上与体质指数相关(p<3.6×10-7)。对来自UKB、GHS和MCPS研究的645,626名参与者进行了分析。根据基因组参考联合会的人类构造38(Genome Reference Consortium HumanBuild 38),基因组坐标反映染色体和碱基对中的物理位置。缩写:CI,置信区间;SD,标准偏差;BMI,体质指数;AAF,替代等位基因频率;RR,参考-参考基因型;RA,参考-替代杂合基因型;AA,替代-替代纯合基因型;pLOF,预测的功能丧失;错义(1/5),经由电脑模拟预测算法预测5个中有至少1个是有害的错义变体;错义(5/5),经由电脑模拟预测算法预测5个中有5个是有害的错义变体。
图4示出了GPR75中与人类中较低体质指数相关的蛋白质截短变体。图A示出了GPR75蛋白及其结构域的线性模型(顶部;胞内结构域和胞外结构域以黄色表示,跨膜结构域以橙色表示),通过外显子组测序发现的46个预测的功能丧失性变体在GPR75蛋白上的分布(中间)和每种变体的杂合携带者中以标准化单位表示的BMI的分布(底部)。在底部子图中,水平蓝色条示出非携带者中的平均BMI,而水平红色条示出在GPR75中具有任何预测的功能丧失性遗传变体的携带者中的总体协变量调节的平均BMI。图B示出了在发现和附加队列中GPR75中预测的功能丧失性变体与BMI的关联的元分析。缩写:CI,置信区间;RR,参考-参考基因型;RA,参考-替代杂合基因型;AA,替代-替代纯合基因型;DHS,达拉斯心脏研究(Dallas Heart Study);SINAI,西奈山生物群系队列(Mount Sinai BioMe cohort);DUKE,杜克导管插入术遗传学队列(Duke Catheterization Genetics cohort);TAICHI,来自台湾元芯片联盟(Taiwan Metabochip Consortium)的中国台湾人;PMBB,宾夕法尼亚大学医学院生物样本库(University of Pennsylvania Medicine BioBank);MALMO,马尔默饮食和癌症研究(Diet and Cancer Study);AFR,非洲血统;AMR;美国血统;EAS,东亚血统;EUR,欧洲血统;SAS,南亚血统。MCPS包括美国混血个体。
图5示出了年龄和性别亚组内GPR75 pLOF变体与体质指数的关联。缩写:置信区间,CI;标准偏差,SD;体质指数,BMI;替代等位基因频率,AAF;P值,p;参考-参考基因型,RR;参考-替代基因型,RA;替代-替代基因型,AA;千克/平方米,kg/m2;预测的功能丧失,pLOF。
图6示出了GPR75 pLOF变体与肥胖风险的关联。缩写:OR,优势比;CI,置信区间;P值,p;AAF,替代等位基因频率;参考-参考基因型,RR;参考-替代基因型,RA;替代-替代基因型,AA;pLOF,预测的功能丧失。结果来自于UKB、GHS和MCPS研究的元分析。
图7示出了在GPR75或MC4R中具有预测的功能丧失性变体的携带者和非携带者的体质指数类别的分布。在UKB、GHS和MCPS队列中根据世界卫生组织的分类,在GPR75中具有预测的功能丧失性遗传变体的杂合携带者(顶部)、非携带者(中间)和在MC4R中具有预测的功能丧失性遗传变体的杂合携带者(底部)在体质指数类别中的分布。
图8示出了UKB中GPR75 pLOF变体与10岁时自我报告比平均更瘦的对比体型的关联。缩写:预测的功能丧失,pLOF;英国生物样本库,UKB;替代等位基因频率,AAF;置信区间,CI;优势比,OR;P值,p;参考-参考基因型,RR;参考-替代基因型,RA;替代-替代基因型,AA。
图9示出了GPR75和MC4R中的pLOF变体与通过生物电阻抗估计的体脂和瘦体质量指数的关联。在英国生物样本库研究的423,418名参与者中进行了关联分析,这些参与者接受了全外显子组测序和生物电阻抗测量。缩写:pLOF,预测的功能丧失;kg,千克;CI,置信区间。
图10示出了在UKB、GHS和MCPS研究中GPR75中的pLOF遗传变体与心脏代谢表型的关联。缩写:P值,p;SD,标准偏差;CI,置信区间;pLOF,预测的功能丧失;AAF,替代等位基因频率;RR,参考-参考基因型;RA,参考-替代杂合基因型;AA,替代-替代纯合基因型;血红蛋白A1C,HbA1c;天冬氨酸转氨酶,AST;丙氨酸转氨酶,ALT;高密度脂蛋白胆固醇,HDL-C;低密度脂蛋白胆固醇,LDL-C;毫克/分升,mg/dL;毫米汞柱,mmHg;单位/升,U/L。
图11示出了GPR75、ASB3和GPR75-ASB3基因。该图示出了GPR75、GPR75-ASB3和ASB3基因的基因模型和染色体位置。GPR75与GPR75-ASB3通读基因共有含非编码序列的外显子1。含有其整个编码序列的GPR75的外显子2是GPR75基因独有的,不是与任何其他基因共有的。ASB3和GPR75-ASB3彼此共有几个外显子,但不与GPR75共有。基础表示来自Ensembl区域图(版本85)。
图12示出了通过外显子组测序鉴定的GPR75预测的功能丧失性变体。该表列出了通过有助于基因负荷分析的外显子组测序发现的GPR75基因中的预测的功能丧失性(pLOF)变体。低于0.3的插补INFO评分值通常被认为质量极低。缩写:染色体、位置、参考、替代,CPRA;替代等位基因频率,AAF;互补DNA,cDNA;人类基因组变异协会,HGVS。
图13示出ASB3或GPR75-ASB3中罕见的非同义变体的负荷与BMI无关联。缩写:替代等位基因频率,AAF;置信区间,CI;标准偏差,SD;体质指数,BMI;千克/平方米,kg/m2;P值,p;参考-参考基因型,RR;参考-替代基因型,RA;替代-替代基因型,AA;预测的功能丧失,pLOF。
图14示出了对于ASB3、GPR75-ASB3和该区域中的常见变体基因型在调节之后GPR75中pLOF变体的负荷与BMI的关联。缩写:置信区间,CI;标准偏差,SD;体质指数,BMI;千克/平方米,kg/m2;P值,p;替代等位基因频率,AAF;参考-参考基因型,RR;参考-替代基因型,RA;替代-替代基因型,AA;预测的功能丧失,pLOF。*标准协变量包括来自GWAS分析的所有精细定位的常见变体,包括ASB3附近的rs59428052。
图15示出了GPR75基因座处与BMI相关的常见变体。该表报告了26种常见变体的列表,这些变体在欧洲人GPR75任一侧500kb范围内的全基因组范围统计显著性阈值(p<5×10-8)下与BMI相关。将变体标注为最近的基因,并且无论它们与eQTL前哨或非同义编码变体是否处于LD(R^2>0.8)。在GPR75基因座处,在混血美国人中没有常见变体与BMI在全基因组意义上相关。缩写:染色体、位置、参考、替代,CPRA;替代等位基因频率,AAF;因果关联的后验概率,PPA;连锁不平衡,LD;表达数量性状基因座,eQTL。
图16示出了GPR75基因座处的常见变体与BMI的关联。在左侧图中示出了在来自UKB和GHS的欧洲血统个体中常见插补变体的GWAS分析结果,并且在右侧图中示出了在来自MCPS队列的混血美国人中的GWAS分析结果。在左侧图中突出显示了欧洲个体GWAS中的前哨变体(rs59428052)。在混血美国人中不存在全基因组的显著关联(p<5x10-8)。
图17示出了敏感性分析中GPR75中的pLOF遗传变体与体质指数的关联。该表报告了一次排除一个遗传变体的留一法(leave-one-out)分析,以及在个体变体分析中排除与较低BMI相关的变体的分析(底行)。缩写:CI,置信区间;SD,标准偏差;BMI,体质指数;p,P值;pLOF,预测的功能丧失。
图18示出了在个体变体分析中GPR75中与BMI相关的预测的功能丧失性变体。该表报告了GPR75 pLOF变体的关联统计,这些变体包括在基因负荷分析中并且还在反方差加权元分析中单独与BMI相关,p<0.05。缩写:AAF,替代等位基因频率;CI,置信区间;SD,标准偏差;BMI,体质指数;P值,p;移码,fs;pLOF,预测的功能丧失。
图19示出GPR75中两种预测的功能丧失性遗传变体的体外表达研究。图A示出了测量GPR75 mRNA水平的定量逆转录聚合酶链式反应实验的结果。相对于β-肌动蛋白基因计算GPR75的表达。值表示3个技术重复的平均值和标准偏差,代表对每种条件进行的3个生物重复实验中的1个。图B示出了GPR75蛋白水平的蛋白质印迹(Western blotting)分析。GPR75Ala110fs和Gln234*蛋白产物分别对应于14kDa和25kDa的预测分子量。结果代表3个生物重复。图C示出了描述GPR75的细胞定位的免疫荧光染色实验。顶部图像示出了通过膜透化实现的胞内染色,而底部图像示出了质膜定位(非透化细胞膜)。图D示出了对GPR75的细胞表面表达的流式细胞术分析。鉴定的细胞群以活的HA-TAG GPR75阳性细胞的百分比(%)呈现。值表示每种条件4个生物重复的平均值及其标准偏差。所有实验均在用绿色荧光蛋白对照质粒(对照)、GPR75-野生型(GPR75)、GPR75-Ala110fs或GPR75-Gln234*质粒转染的HEK293细胞中进行。缩写:SSC,侧向散射;HA,血凝素标签。
图20示出了GPR75中N端截短遗传变体对比C端截短遗传变体与BMI的关联。缩写:CI,置信区间;SD,标准偏差;BMI,体质指数;p,p值;AAF,替代等位基因频率;RR,参考-参考基因型;RA,参考-替代杂合基因型;AA,替代-替代纯合基因型;kg/m2,千克/平方米。
图21示出了GPR75 WT(指定为HIST和WT)和纯合子敲除(指定为KO)雄性(上图)和雌性(下图)小鼠的平均体重。
图22示出了与野生型相比,雄性纯合子敲除(指定为KO)的身体组成的百分比差异。BMC,骨矿物质含量;BMD,骨矿物质密度;P,p值。
图23示出了GPR75 WT(HIST和WT)和纯合子敲除(指定为KO)雄性小鼠的平均脂肪体积和脂肪体积百分比。
图24示出了具有Gpr75基因缺失的小鼠在高脂饮食期间的体重增加和代谢表型。图A示出了在14周高脂饮食攻击期间每周体重增加;图B示出了在高脂饮食攻击之前和之后空腹血糖的变化;图C示出了14周高脂饮食攻击结束时的葡萄糖耐量试验的结果;图D示出了在14周高脂饮食攻击结束时的血浆胰岛素。每张图示出了Gpr75+/+(WT)、Gpr75+/-(HET)和Gpr75-/-(KO)小鼠的结果。每个组和分析中包括的小鼠数目在圆括号中。结果呈现为平均值±标准偏差。缩写:ns,非统计学显著;通过双因素ANOVA与Tukey多重比较检验确定,*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001,****p<0.0001。
图25示出了小鼠实验中的血浆瘦素、脂联素和瘦素-脂联素比率。图A示出了高脂饮食攻击后Gpr75+/+(WT)、Gpr75+/-(HET)和Gpr75-/-(KO)小鼠中的血浆瘦素水平,表示为与野生型(设为1)相比的倍数差异。野生型小鼠的绝对水平(平均值±标准偏差)为208±42pg/mL。图B示出了高脂饮食攻击后Gpr75+/+(WT)、Gpr75+/-(HET)和Gpr75-/-(KO)小鼠中的血浆脂联素水平,表示为与野生型(设为1)相比的倍数差异。野生型小鼠的绝对水平(平均值±标准偏差)为3,911±1,656ng/mL。图C示出了Gpr75+/+(WT)、Gpr75+/-(HET)和Gpr75-/-(KO)中以比率单位表示的瘦素与脂联素比率。在x轴标记中每个组和分析中包括的小鼠数目在圆括号中。结果呈现为平均值±标准偏差。ns,非统计学显著;通过双因素ANOVA与Tukey多重比较检验确定,*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001,****p<0.0001。
图26示出了在高脂饮食小鼠实验中测量的体重、脂肪质量、瘦体质量、骨质量和血糖水平。在维持饲料饮食时(第0周和第-1周)以及在9周高脂饮食饲喂(HFD)期间,Gpr75+/+、Gpr75+/-和Gpr75-/-小鼠(分别为黑色圆圈、红色正方形和蓝色三角形)的体重(图A)、脂肪质量(图B,顶部)、瘦体质量(图B,中间)、骨质量(图B,底部)和血糖水平(图C)。*,Gpr75-/-对比Gpr75+/+小鼠,P<0.05。#,Gpr75+/-对比Gpr75+/+小鼠,P<0.05。$,对于各自的基因型,最后的高脂饮食数据点对比在高脂饮食饲喂之前以饲料饮食获得的第一个数据点,P<0.05。
图27示出了饲料饲喂的雌性Gpr75敲除小鼠不具胰岛素抗性并且表现出改善的葡萄糖耐量。
具体实施方式
在整个说明书和权利要求书中使用与本公开的多个方面相关的各种术语。除非另有说明,否则将为此类术语给予本领域中的普通含义。其他具体定义的术语应以与本文提供的定义一致的方式解释。
除非另外明确说明,否则决不意图将本文陈述的任何方法或方面解释为要求以特定顺序执行其步骤。因此,在权利要求书或说明书中,当方法权利要求没有确切地说明步骤是限于特定顺序时,在任何方面决非意图推断顺序。这适用于任何可能的非表达解释基础,包括相对于步骤排列或操作流程的逻辑事项、从语法组织或标点中得到的普通含义或者在说明书中描述的方面的编号或类型。
如本文所用,除非上下文另外明确指出,否则单数形式“一”、“一种(个)”和“所述(该)”包括复数指代物。
如本文所用,术语“约”意指所列举的数值是近似值并且小的变化不会显著影响所公开的实施方案的实践。在使用数值的情况下,除非上下文另外指示,否则术语“约”意指数值可变化±10%并仍然在所公开的实施方案的范围内。
如本文所用,在特定实施方案中,根据需要,术语“包含”可替换为“由……组成”或“基本上由……组成”。
如本文所用,关于核酸分子或多肽的术语“分离的”意指核酸分子或多肽处于不同于其天然环境的条件下,诸如远离血液和/或动物组织。在一些实施方案中,分离的核酸分子或多肽基本上不含其他核酸分子或其他多肽,特别是动物来源的其他核酸分子或多肽。在一些实施方案中,核酸分子或多肽可以是高度纯化的形式,即纯度大于95%或纯度大于99%。当在此语境中使用时,术语“分离的”不排除存在呈替代物理形式(诸如二聚体或可替代地磷酸化或衍生化形式)的相同核酸分子或多肽。
如本文所用,术语“核酸”、“核酸分子”、“核酸序列”、“多核苷酸”或“寡核苷酸”可包括任何长度的核苷酸的聚合物形式,可包括DNA和/或RNA,并且可以是单链的、双链的或多链的。核酸的一条链也指它的互补链。
如本文所用,术语“受试者”包括任何动物,包括哺乳动物。哺乳动物包括但不限于农场动物(诸如例如,马、牛、猪)、伴侣动物(诸如例如,狗、猫)、实验室动物(诸如例如,小鼠、大鼠、兔)和非人灵长类动物(诸如例如,猿和猴)。在一些实施方案中,受试者是人。在一些实施方案中,受试者是在医生护理下的患者。
根据本公开,已经鉴定了GPR75基因中与受试者中发展肥胖症、体重过重、BMI升高、体脂质量、百分比或体积升高和/或食物摄入过量的风险降低相关的变体。例如,已观察到使人GPR75参考(参见SEQ ID NO:1)中位置5,540-5,546的CCAGTAG七核苷酸缺失,或使人GPR75参考(参见SEQ ID NO:1)中位置5,557的鸟嘌呤核苷酸变为腺嘌呤,或使人GPR75参考(参见SEQ ID NO:1)中位置5,911的胞嘧啶核苷酸变为胸腺嘧啶,或使人GPR75参考(参见SEQ ID NO:1)中位置5,920-5,923的AAAG四核苷酸缺失,或在人GPR75参考(参见SEQ IDNO:1)中的位置6,411插入胸腺嘧啶核苷酸的遗传改变指示具有此类改变的人可能具有降低的发展肥胖症、体重过重、BMI升高、体脂质量、百分比或体积升高和/或食物摄入过量的风险。据信没有GPR75基因或蛋白的变体与肥胖症、体重、BMI、体脂质量、百分比或体积和/或瘦体质量、百分比或体积具有任何已知的关联。总之,本文所述的遗传分析令人惊讶地指示GPR75基因且尤其是GPR75基因中的变体,与降低的发展肥胖症的风险相关,与较低的体重、较低的BMI、较低的体脂质量、百分比或体积和/或较低的瘦体质量、百分比或体积相关。因此,可以治疗具有增加的发展肥胖症、体重过重、BMI升高、体脂质量、百分比或体积升高和/或食物摄入过量的风险的作为GPR75参考的受试者,从而预防肥胖症,减轻其症状和/或阻遏症状的发展。因此,本公开提供了利用对受试者中此类变体的鉴定来鉴定此类受试者中发展肥胖症、体重过重、BMI升高、体脂质量、百分比或体积升高和/或食物摄入过量的风险或对该风险进行分层,或将受试者诊断为具有增加的发展肥胖症、体重过重、BMI升高、体脂质量、百分比或体积升高和/或食物摄入过量的风险,使得可以相应地治疗处于风险中的受试者或患有活动性疾病的受试者。另外,本公开提供分离的GPR75变体基因组核酸分子、变体mRNA分子和变体cDNA分子。本文还提供了GPR75功能丧失性变体核酸分子,发现这些核酸分子与降低的发展肥胖症、体重过重、BMI升高、体脂质量、百分比或体积升高和/或食物摄入过量的风险相关。
GPR75基因中可能与降低的发展肥胖症、体重过重、BMI升高、体脂质量、百分比或体积升高和/或食物摄入过量的风险相关的其他错义变体包含(根据GRCh38/hg38(2013年12月)人类基因组组装)(并且因此可以包括在本文所述的任何实施方案中):在2号染色体位置53,854,656处胞嘧啶取代胸腺嘧啶,引起在对应于根据SEQ ID NO:55的位置34的位置精氨酸置换谷氨酰胺;在2号染色体位置53,854,330处丙氨酸取代鸟嘌呤,引起在对应于根据SEQ ID NO:55的位置143的位置色氨酸置换精氨酸;在2号染色体位置53,854,321处胞嘧啶取代胸腺嘧啶,引起在对应于根据SEQ ID NO:55的位置146的位置缬氨酸置换甲硫氨酸;在2号染色体位置53,854,191处鸟嘌呤取代胞嘧啶,引起在对应于根据SEQ ID NO:55的位置189的位置丝氨酸置换半胱氨酸;在2号染色体位53,853,780处鸟嘌呤取代丙氨酸,引起在对应于根据SEQ ID NO:55的位置326的位置苏氨酸置换异亮氨酸;在2号染色体位置53,853,634处腺嘌呤取代胸腺嘧啶,引起在对应于根据SEQ ID NO:55的位置375的位置亮氨酸置换异亮氨酸;以及在2号染色体位置53,853,181处胸腺嘧啶取代胞嘧啶,引起在对应于根据SEQ ID NO:55的位置526的位置赖氨酸置换谷氨酸。
GPR75基因中的其他变体可与受试者中增加的发展肥胖症、体重过重、BMI升高、体脂质量、百分比或体积升高和/或食物摄入过量的风险相关,并且可以认为它们是功能获得性(GOF)变体。此类GOF可包括(根据GRCh38/hg38(2013年12月)人类基因组组装):在2号染色体位置53,854,437处胸腺嘧啶取代腺嘌呤,引起在对应于根据SEQ ID NO:55的位置107的位置酪氨酸置换苯丙氨酸;和在2号染色体位置53,853,697处腺嘌呤取代鸟嘌呤,引起在对应于根据SEQ ID NO:55的位置354的位置苯丙氨酸置换亮氨酸。因此,可以用GPR75抑制剂治疗具有任一变体的受试者。可通过检测GOF变体的存在来评估此类受试者发展肥胖症、体重过重、BMI升高、体脂质量、百分比或体积升高和/或食物摄入过量的风险。
出于本公开的目的,可以将任何特定人类分类为具有三种GPR75基因型之一:i)GPR75参考;ii)对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子是杂合的;或iii)对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子是纯合的。当人没有GPR75错义变体核酸分子的拷贝时,人是GPR75参考。当人具有编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子的单个拷贝时,人对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子是杂合的。如本文所用,GPR75错义变体核酸分子是编码具有部分功能丧失、完全功能丧失、预测的部分功能丧失或预测的完全功能丧失的GPR75多肽的任何GPR75核酸分子(诸如基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)。具有有部分功能丧失(或预测的部分功能丧失)的GPR75多肽的人是GPR75亚等位基因的。GPR75预测的功能丧失性变体核酸分子可以是编码GPR75 Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs或Cys400fs的任何核酸分子。GPR75错义变体核酸分子也可以是编码Lys404*和Ser219fs的任何核酸分子,或者可以是c.-110+1G>A。当人具有GPR75错义变体核酸分子的两个拷贝时,人对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子是纯合的。
对于基因分型或确定为GPR75参考的受试者,此类受试者具有增加的发展肥胖症、体重过重、BMI升高、体脂质量、百分比或体积升高和/或食物摄入过量的风险。对于基因分型或确定为GPR75参考或对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子是杂合的受试者,此类受试者可以用GPR75抑制剂治疗。
在本文所述的任何实施方案中,GPR75错义变体核酸分子可以是编码具有部分功能丧失、完全功能丧失、预测的部分功能丧失或预测的完全功能丧失的GPR75多肽的任何GPR75核酸分子(诸如例如基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)。例如,GPR75错义变体核酸分子可以是编码GPR75 Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs或Cys400fs的任何核酸分子。GPR75错义变体核酸分子也可以是编码Lys404*和Ser219fs的任何核酸分子,或者可以是c.-110+1G>A。
GPR75错义变体核酸分子还包括但不限于2:53853134:T:G、2:53853135:T:G、2:53853136:A:C、2:53853200:GGT:G、2:53853245:GT:G、2:53853256:G:A、2:53853352:G:A、2:53853354:CCA:C、2:53853382:TG:T、2:53853502:T:A、2:53853535:G:A、2:53853547:T:A、2:53853560:G:GA、2:53853641:GTT:G、2:53853680:CAATTCAAACTGG T:C、2:53853692:G:T、2:53853730:G:A、2:53853771:G:C、2:53853853:G:A、2:53853877:G:A、2:53853926:G:T、2:53853927:T:TA、2:53853946:G:GT、2:53853967:TGG:T、2:53854009:G:A、2:53854037:A:AG、2:53854045:ACTTT:A、2:53854051:T:A、2:53854057:G:A、2:53854078:G:A、2:53854099:CAG:C、2:53854135:CAT:C、2:53854137:TAGAG:T、2:53854306:G:A、2:53854380:G:C、2:53854409:A:AG、2:53854421:ACTACTGG:A、2:53854474:C:A、2:53854476:C:CA、2:53854485:AG:A、2:53854644:TG:T、2:53854685:TC:T、2:53854695:G:T、2:53854740:TG:T、2:53854755:A:G和2:53859827:C:T(根据GRC h38/hg38(2013年12月)人类基因组组装)。
在本文所述的任何实施方案中,GPR75预测的功能丧失性多肽可以是具有部分功能丧失、完全功能丧失、预测的部分功能丧失或预测的完全功能丧失的任何GPR75多肽。在本文所述的任何实施方案中,GPR75预测的功能丧失性多肽可以是本文所述的任何GPR75多肽,包括例如GPR75 Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs或Cys400fs。GPR75预测的功能丧失性多肽也可以是Lys404*或Ser219fs。
在本文所述的任何实施方案中,受试者可以是肥胖的,或具有过重的体重、升高的BMI、升高的体脂质量、百分比或体积和/或过量的食物摄入。在本文所述的任何实施方案中,受试者可以是肥胖的。在本文所述的任何实施方案中,受试者可具有过重的体重。在本文所述的任何实施方案中,受试者可具有升高的BMI。在本文所述的任何实施方案中,受试者可具有升高的体脂质量、百分比或体积。在本文所述的任何实施方案中,受试者可具有过量的食物摄入。
肥胖症的症状包括但不限于过量体脂积聚(特别是在腰部周围)、呼吸急促、出汗增加、打鼾、不能应对突然的身体活动、每天感觉非常疲劳、背部和关节疼痛、皮肤问题(因皮肤褶皱中积聚水分)。
本公开提供了治疗患有肥胖症的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用GPR75抑制剂。在一些实施方案中,受试者是GPR75参考或对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子是杂合的。
本公开还提供了治疗体重过重的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用GPR75抑制剂。在一些实施方案中,受试者是GPR75参考或对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子是杂合的。
本公开还提供了治疗BMI升高的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用GPR75抑制剂。在一些实施方案中,受试者是GPR75参考或对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子是杂合的。
本公开还提供了治疗体脂质量、百分比或体积升高的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用GPR75抑制剂。在一些实施方案中,受试者是GPR75参考或对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子是杂合的。
本公开还提供了治疗食物摄入过量的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用GPR75抑制剂。在一些实施方案中,受试者是GPR75参考或对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子是杂合的。
本公开还提供了治疗受试者以预防体重增加或维持体重减轻的方法,所述方法包括向所述受试者施用GPR75抑制剂。在一些实施方案中,受试者是GPR75参考或对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子是杂合的。
在本文所述的其中用GPR75抑制剂治疗受试者的任何实施方案中,受试者可以是GPR75参考(即,受试者没有编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子的拷贝)。在本文所述的其中用GPR75抑制剂治疗受试者的任何实施方案中,受试者对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子可以是杂合的(即,受试者仅具有参考GPR75核酸分子的单个拷贝)。不需要在施用GPR75抑制剂时确定受试者的基因型。
在一些实施方案中,GPR75抑制剂包含抑制性核酸分子。抑制性核酸分子的示例包括但不限于反义核酸分子、小干扰RNA(siRNA)和短发夹RNA(shRNA)。此类抑制性核酸分子可以设计成靶向GPR75核酸分子(诸如mRNA分子)的任何区域。在一些实施方案中,反义RNA、siRNA或shRNA与GPR75基因组核酸分子或mRNA分子内的序列杂交,并降低受试者细胞中GPR75多肽的表达。在一些实施方案中,GPR75抑制剂包含与GPR75基因组核酸分子或mRNA分子杂交并降低受试者细胞中GPR75多肽的表达的反义RNA。在一些实施方案中,反义核酸分子包含SEQ ID NO:109-529中所示的核苷酸序列或由SEQ ID NO:109-529中所示的核苷酸序列组成。在一些实施方案中,GPR75抑制剂包含与GPR75基因组核酸分子或mRNA分子杂交并降低受试者细胞中GPR75多肽的表达的siRNA。在一些实施方案中,siRNA分子包含SEQ IDNO:530-1457中所示的核苷酸序列(有义链和反义链对)或由所述核苷酸序列组成(即,SEQID NO:530和SEQ ID NO:531,例如分别形成siRNA分子的有义链和反义链;与SEQ ID NO:530-1457中所示的其余siRNA分子的有义链和反义链一样)。在一些实施方案中,GPR75抑制剂包含与GPR75基因组核酸分子或mRNA分子杂交并降低受试者细胞中GPR75多肽的表达的shRNA。合适的GPR75特异性siRNA和shRNA公开于例如Garcia等人,Circ.Res.,2017,120,1776-1788。
本文公开的抑制性核酸分子可包括RNA、DNA或RNA和DNA两者。抑制性核酸分子还可与异源核酸序列(诸如载体中的异源核酸序列)或异源标记连接或融合。例如,本文公开的抑制性核酸分子可在包含抑制性核酸分子和异源核酸序列的载体内或作为包含抑制性核酸分子和异源核酸序列的外源供体序列。抑制性核酸分子也可以与异源标记连接或融合。标记可以是直接可检测的(诸如例如,荧光团)或间接可检测的(诸如例如,半抗原、酶或荧光团淬灭剂)。此类标记可以通过光谱学、光化学、生物化学、免疫化学或化学手段检测。此类标记包括例如放射性标记、颜料、染料、色原、自旋标记和荧光标记。标记也可以是例如化学发光物质;含金属的物质;或酶,其中发生依赖于酶的信号次级产生。术语“标记”还可以指“标签”或半抗原,其可以选择性地结合至缀合的分子,使得随后与底物一起添加时,缀合的分子用于产生可检测的信号。例如,生物素可作为标签与辣根过氧化物酶(HRP)的抗生物素蛋白或链霉抗生物素蛋白缀合物一起使用以与标签结合,并且可使用量热底物(诸如例如四甲基联苯胺(TMB))或荧光底物检查以检测HRP的存在。可用作标签来有助于纯化的示例性标记包括但不限于myc、HA、FLAG或3XFLAG、6XHis或聚组氨酸、谷胱甘肽-S-转移酶(GST)、麦芽糖结合蛋白、表位标签或免疫球蛋白的Fc部分。许多标记包括例如颗粒,荧光团,半抗原,酶以及其量热、荧光和化学发光底物和其他标记。
公开的抑制性核酸分子可包括例如核苷酸或非天然或修饰的核苷酸,诸如核苷酸类似物或核苷酸替代物。此类核苷酸包括含有修饰的碱基、糖或磷酸酯基团的核苷酸,或者在其结构中掺入有非天然部分的核苷酸。非天然核苷酸的示例包括但不限于双脱氧核苷酸、生物素酰化、胺化、脱胺化、烷基化、苄基化和荧光团标记的核苷酸。
本文公开的抑制性核酸分子还可包含一种或多种核苷酸类似物或取代。核苷酸类似物是含有对碱基、糖或磷酸酯部分进行修饰的核苷酸。对碱基部分的修饰包括但不限于A、C、G和T/U以及不同的嘌呤或嘧啶碱基(诸如例如假尿苷、尿嘧啶-5-基、次黄嘌呤-9-基(I)和2-氨基腺嘌呤-9-基)的天然和合成修饰。修饰的碱基包括但不限于5-甲基胞嘧啶(5-me-C)、5-羟甲基胞嘧啶、黄嘌呤、次黄嘌呤、2-氨基腺嘌呤、腺嘌呤和鸟嘌呤的6-甲基和其他烷基衍生物、腺嘌呤和鸟嘌呤的2-丙基和其他烷基衍生物、2-硫尿嘧啶、2-硫代胸腺嘧啶和2-硫代胞嘧啶、5-卤代尿嘧啶和胞嘧啶、5-丙炔基尿嘧啶和胞嘧啶、6-偶氮尿嘧啶、胞嘧啶和胸腺嘧啶、5-尿嘧啶(假尿嘧啶)、4-硫代尿嘧啶、8-卤代、8-氨基、8-硫代、8-硫代烷基、8-羟基和其他8-取代的腺嘌呤和鸟嘌呤、5-卤代(诸如例如,5-溴)、5-三氟甲基和其他5-取代的尿嘧啶和胞嘧啶、7-甲基鸟嘌呤、7-甲基腺嘌呤、8-氮杂鸟嘌呤、8-氮杂腺嘌呤、7-脱氮鸟嘌呤、7-脱氮腺嘌呤、3-脱氮鸟嘌呤和3-脱氮腺嘌呤。
核苷酸类似物还可包括对糖部分的修饰。对糖部分的修饰包括但不限于核糖和脱氧核糖的天然修饰以及合成修饰。糖修饰包括但不限于在2’位置处的以下修饰:OH;F;O-、S-或N-烷基;O-、S-或N-烯基;O-、S-或N-炔基;或O-烷基-O-烷基,其中烷基、烯基和炔基可以是取代或未取代的C1-10烷基或C2-10烯基和C2-10炔基。示例性的2’糖修饰还包括但不限于-O[(CH2)nO]mCH3、-O(CH2)nOCH3、-O(CH2)nNH2、-O(CH2)nCH3、-O(CH2)n-ONH2和-O(CH2)n ON[(CH2)nCH3)]2,其中n和m独立地为1至约10。在2'位置处的其他修饰包括但不限于C1-10烷基、取代的低级烷基、烷芳基、芳烷基、O-烷芳基或O-芳烷基、SH、SCH3、OCN、Cl、Br、CN、CF3、OCF3、SOCH3、SO2CH3、ONO2、NO2、N3、NH2、杂环烷基、杂环烷芳基、氨基烷基氨基、聚烷基氨基、取代的甲硅烷基、RNA切割基团、报告基团、嵌入剂、用于改善寡核苷酸的药代动力学特性的基团,或用于改善寡核苷酸的药效学特性的基团,以及具有类似特性的其他取代基。还可在糖上的其他位置上做出类似的修饰,具体地在3'末端核苷酸上或在2'-5'连接的寡核苷酸中的糖的3'位置和5'末端核苷酸的5'位置。修饰的糖还可包括在桥环氧处含有修饰的糖,诸如CH2和S。核苷酸糖类似物还可具有糖模拟物,诸如环丁基部分代替呋喃戊糖。
核苷酸类似物还可在磷酸酯部分处进行修饰。修饰的磷酸酯部分包括但不限于那些可被修饰以使两个核苷酸之间的键联含有以下的部分:硫代磷酸酯、手性硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯、磷酸三酯、氨基烷基磷酸三酯、甲基和其他烷基膦酸酯(包括3'-亚烷基膦酸酯和手性膦酸酯、亚膦酸酯)、磷酰胺(包括3'-氨基磷酰胺和氨基烷基磷酰胺、硫代磷酰胺)、硫代烷基膦酸酯、硫代烷基磷酸三酯和硼代磷酸盐。两个核苷酸之间的这些磷酸酯或修饰的磷酸酯键联可通过3'-5'键联或2'-5'键联,并且所述键联可含有反转的极性诸如3'-5'至5'-3'或2'-5'至5'-2'。还包括各种盐、混合盐以及游离酸形式。核苷酸替代物还包括肽核酸(PNA)。
在一些实施方案中,反义核酸分子是间隙子(gapmer),由此在5'末端和3'末端的前1至7个核苷酸各自具有2'-甲氧基乙基(2'-MOE)修饰。在一些实施方案中,在5'末端和3'末端的前五个核苷酸各自具有2'-MOE修饰。在一些实施方案中,在5'末端和3'末端的前1至7个核苷酸是RNA核苷酸。在一些实施方案中,在5'末端和3'末端的前五个核苷酸是RNA核苷酸。在一些实施方案中,核苷酸之间的每个骨架连键是硫代磷酸酯连键。
在一些实施方案中,siRNA分子具有末端修饰。在一些实施方案中,反义链的5'末端被磷酸化。在一些实施方案中,使用不能水解的5'-磷酸酯类似物,诸如5'-(E)-乙烯基-膦酸酯。
在一些实施方案中,siRNA分子具有骨架修饰。在一些实施方案中,已经证实连接连续核糖核苷的修饰的磷酸二酯基团会增强siRNA的稳定性和体内生物利用度。磷酸二酯连键的非酯类基团(-OH、=O)可用硫、硼或乙酸酯置换以产生硫代磷酸酯、硼代磷酸酯和膦酰乙酸酯连键。另外,用磷酸三酯取代磷酸二酯基团可通过消除它们的负电荷促进siRNA的细胞摄取和在血清组分上的保留。在一些实施方案中,siRNA分子具有糖修饰。在一些实施方案中,糖被去质子化(由核酸外切酶和核酸内切酶催化反应),由此2'-羟基可充当亲核试剂并攻击磷酸二酯键中相邻的磷。此类替代物包括2’-O-甲基、2’-O-甲氧基乙基和2’-氟修饰。
在一些实施方案中,siRNA分子具有碱基修饰。在一些实施方案中,碱基可以被修饰的碱基诸如假尿苷、5'-甲基胞苷、N6-甲基腺苷、肌苷和N7-甲基鸟苷取代。
在一些实施方案中,siRNA分子与脂质缀合。脂质可以缀合至siRNA的5'端或3'端以通过使其与血清脂蛋白缔合来改善它们的体内生物利用度。代表性的脂质包括但不限于胆固醇和维生素E,以及脂肪酸诸如棕榈酸酯和生育酚。
在一些实施方案中,代表性siRNA具有下式:
有义链:mN*mN*/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/
i2FN/*mN*/32FN/
反义链:/52FN/*/i2FN/*mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/
i2FN/mN/i2FN/mN*N*N
其中:“N”是碱基;“2F”是2'-F修饰;“m”是2'-O-甲基修饰,“I”是内部碱基;并且“*”是硫代磷酸酯骨架连键。
本公开还提供了包含本文公开的抑制性核酸分子中的任一种或多种的载体。在一些实施方案中,载体包含本文公开的抑制性核酸分子中的任一种或多种和异源核酸。载体可以是能够转运核酸分子的病毒或非病毒载体。在一些实施方案中,载体是质粒或粘粒(诸如例如,另外的DNA区段可以连接到其中的环状双链DNA)。在一些实施方案中,载体是病毒载体,其中另外的DNA区段可连接到病毒基因组中。表达载体包括但不限于质粒、粘粒、逆转录病毒、腺病毒、腺相关病毒(AAV)、植物病毒(诸如花椰菜花叶病毒和烟草花叶病毒)、酵母人工染色体(YAC)、爱泼斯坦-巴尔(EBV)来源的附加体和本领域已知的其他表达载体。
本公开还提供了包含本文公开的抑制性核酸分子中的任一种或多种的组合物。在一些实施方案中,组合物是药物组合物。在一些实施方案中,组合物包含载剂和/或赋形剂。载剂的示例包括但不限于聚(乳酸)(PLA)微球、聚(D,L-乳酸-共乙醇酸)(PLGA)微球、脂质体、胶束、反胶束、脂质螺旋物和脂质微管。载剂可包括缓冲盐溶液,诸如PBS、HBSS等。
在一些实施方案中,GPR75抑制剂包含核酸酶剂或DNA结合蛋白,所述核酸酶剂在识别序列处诱导一个或多个切口或双链断裂,所述DNA结合蛋白与GPR75基因组核酸分子内的识别序列结合。识别序列可位于GPR75基因的编码区内,或位于影响基因表达的调控区内。所述DNA结合蛋白或核酸酶剂的识别序列可位于内含子、外显子、启动子、增强子、调控区或任何非蛋白质编码区中。识别序列可包括或接近GPR75基因的起始密码子。例如,所述识别序列可位于距起始密码子约10、约20、约30、约40、约50、约100、约200、约300、约400、约500或约1,000个核苷酸处。作为另一个示例,可以使用两种或更多种核酸酶剂,每种核酸酶剂均靶向包括或接近起始密码子的核酸酶识别序列。作为另一个实例,可以使用两种核酸酶剂,一种靶向包括或接近起始密码子的核酸酶识别序列,一种靶向包括或接近终止密码子的核酸酶识别序列,其中核酸酶剂的切割可以导致两个核酸酶识别序列之间的编码区的缺失。在本文公开的方法和组合物中可以使用向所需识别序列诱导切口或双链断裂的任何核酸酶剂。与所需识别序列结合的任何DNA结合蛋白均可用于本文公开的方法和组合物中。
用于本文的合适的核酸酶剂和DNA结合蛋白包括但不限于锌指蛋白或锌指核酸酶(ZFN)对、转录激活因子样效应物(TALE)蛋白或转录激活因子样效应物核酸酶(TALEN),或成簇的规则散布的短回文重复(CRISPR)/CRISPR相关(Cas)系统。识别序列的长度可以变化,并且包括例如对于锌指蛋白或ZFN对为约30-36bp、对于每个ZFN为约15-18bp、对于TALE蛋白或TALEN为约36bp和对于CRISPR/Cas引导RNA为约20bp的识别序列。
在一些实施方案中,CRISPR/Cas系统可用于修饰细胞内的GPR75基因组核酸分子。本文公开的方法和组合物可通过利用CRISPR复合物(包含与Cas蛋白复合的引导RNA(gRNA))采用CRISPR-Cas系统用于GPR75核酸分子的定点切割。
Cas蛋白通常包含至少一个可与gRNA相互作用的RNA识别或结合结构域。Cas蛋白还可以包含核酸酶结构域(诸如例如DNA酶或RNA酶结构域)、DNA结合结构域、解旋酶结构域、蛋白-蛋白相互作用结构域、二聚化结构域和其他结构域。合适的Cas蛋白包括例如野生型Cas9蛋白和野生型Cpf1蛋白(诸如例如,FnCpf1)。Cas蛋白可具有完全切割活性以在GPR75基因组核酸分子中产生双链断裂,或者它可以是在GPR75基因组核酸分子中产生单链断裂的切口酶。Cas蛋白另外实例包括但不限于Cas1、Cas1B、Cas2、Cas3、Cas4、Cas5、Cas5e(CasD)、Cas6、Cas6e、Cas6f、Cas7、Cas8a1、Cas8a2、Cas8b、Cas8c、Cas9(Csn1或Csx12)、Cas10、Cas10d、CasF、CasG、CasH、Csy1、Csy2、Csy3、Cse1(CasA)、Cse2(CasB)、Cse3(CasE)、Cse4(CasC)、Csc1、Csc2、Csa5、Csn2、Csm2、Csm3、Csm4、Csm5、Csm6、Cmr1、Cmr3、Cmr4、Cmr5、Cmr6、Csb1、Csb2、Csb3、Csx17、Csx14、Csx10、Csx16、CsaX、Csx3、Csx1、Csx15、Csf1、Csf2、Csf3、Csf4和Cu1966及其同源物或修饰型式。Cas蛋白也可以可操作地连接至异源多肽为融合蛋白。例如,Cas蛋白可以与切割结构域、表观遗传修饰结构域、转录激活结构域或转录阻遏结构域融合。Cas蛋白可以以任何形式提供。例如,Cas蛋白可以以蛋白质的形式提供,诸如与gRNA复合的Cas蛋白。可替代地,Cas蛋白可以以编码Cas蛋白的核酸分子的形式提供,诸如RNA或DNA。
在一些实施方案中,可以通过使细胞与Cas蛋白和一种或多种gRNA接触来产生GPR75基因组核酸分子的靶向遗传修饰,所述gRNA与在GPR75基因组核酸分子中的靶基因组基因座内的一种或多种gRNA识别序列杂交。例如,gRNA识别序列可以位于SEQ ID NO:1的区域内。所述gRNA识别序列还可以包含或接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546、5,557、5,911、5,920-5,923或6,411。例如,所述gRNA识别序列可以位于距对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546、5,557、5,911、5,920-5,923或6,411的位置的约1000、约500、约400、约300、约200、约100、约50、约45、约40、约35、约30、约25、约20、约15、约10或约5个核苷酸处。所述gRNA识别序列可包含或接近GPR75基因组核酸分子的起始密码子或GPR75基因组核酸分子的终止密码子。例如,所述gRNA识别序列可位于距起始密码子或终止密码子的约10、约20、约30、约40、约50、约100、约200、约300、约400、约500或约1,000个核苷酸处。
GPR75基因组核酸分子中靶基因组基因座内的gRNA识别序列位于原型间隔区邻近基序(PAM)序列附近,PAM序列是紧随Cas9核酸酶靶向的DNA序列之后的2-6个碱基对的DNA序列。规范的PAM是序列5'-NGG-3',其中“N”是任何核碱基,接着是两个鸟嘌呤(“G”)核碱基。gRNA可将Cas9转运至基因组中的任何位置用于基因编辑,但在除了Cas9识别PAM的位点之外的任何位点都不会发生编辑。另外,5'-NGA-3'可以是人类细胞高效的非规范PAM。一般地,PAM在gRNA靶向的DNA序列下游约2-6个核苷酸处。PAM可以侧接gRNA识别序列。在一些实施方案中,所述gRNA识别序列可以在3'末端被PAM侧接。在一些实施方案中,所述gRNA识别序列可以在5'末端被PAM侧接。例如,Cas蛋白的切割位点可以在PAM序列上游或下游约1个至约10个、约2个至约5个碱基对,或3个碱基对处。在一些实施方案中(诸如当使用来自酿脓链球菌(S.pyogenes)的Cas9或密切相关的Cas9时),非互补链的PAM序列可以是5'-NGG-3',其中N是任何DNA核苷酸并且紧接靶DNA的非互补链的gRNA识别序列的3'。如此,互补链的PAM序列将是5'-CCN-3',其中N是任何DNA核苷酸,并且紧接靶DNA的互补链的gRNA识别序列的5'。
gRNA是与Cas蛋白结合并将Cas蛋白靶向GPR75基因组核酸分子内的特定位置的RNA分子。示例性gRNA是有效指导Cas酶结合以切割GPR75基因组核酸分子的gRNA,其中所述gRNA包含DNA靶向区段,其与GPR75基因组核酸分子内的gRNA识别序列杂交,所述gRNA识别序列包含或接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546、5,557、5,911、5,920-5,923或6,411。例如,可以选择gRNA,使其与位于距对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546、5,557、5,911、5,920-5,923或6,411的位置的约5、约10、约15、约20、约25、约30、约35、约40、约45、约50、约100、约200、约300、约400、约500或约1,000个核苷酸处的gRNA识别序列杂交。其他示例性gRNA包含DNA靶向区段,其与GPR75基因组核酸分子内存在的gRNA识别序列杂交,所述gRNA识别序列包含或接近起始密码子或终止密码子。例如,可以选择gRNA,使其与位于距起始密码子约5、约10、约15、约20、约25、约30、约35、约40、约45、约50、约100、约200、约300、约400、约500或约1,000个核苷酸处或者位于距终止密码子约5、约10、约15、约20、约25、约30、约35、约40、约45、约50、约100、约200、约300、约400、约500或约1,000个核苷酸处的gRNA识别序列杂交。合适的gRNA可包含约17至约25个核苷酸、约17至约23个核苷酸、约18至约22个核苷酸或约19至约21个核苷酸。在一些实施方案中,gRNA可包含20个核苷酸。
位于人GPR75参考基因内的合适的gRNA识别序列的示例在表1中作为SEQ ID NOS:61-98列出。
表1:一种或多种GPR75变异附近的引导RNA识别序列
Cas蛋白和gRNA形成复合物,并且Cas蛋白切割靶GPR75基因组核酸分子。Cas蛋白可在gRNA的DNA靶向区段将与之结合的靶GPR75基因组核酸分子中存在的核酸序列内或外的位点处切割核酸分子。例如,CRISPR复合物(包含与gRNA识别序列杂交并与Cas蛋白复合的gRNA)的形成可导致在gRNA的DNA靶向区段将与之结合的GPR75基因组核酸分子中存在的核酸序列中或附近(诸如例如,距所述核酸序列1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、50个或更多个碱基对以内)一条或两条链的切割。
此类方法可产生例如其中SEQ ID NO:1的区域被破坏,起始密码子被破坏,终止密码子被破坏或编码序列被破坏或缺失的GPR75基因组核酸分子。任选地,细胞可以进一步与一种或多种另外的gRNA接触,所述另外的gRNA与GPR75基因组核酸分子中靶基因组基因座内另外的gRNA识别序列杂交。通过使所述细胞与一种或多种另外的gRNA(诸如例如,与第二gRNA识别序列杂交的第二gRNA)接触,由Cas蛋白切割可产生两个或更多个双链断裂或者两个或更多个单链断裂。
在一些实施方案中,GPR75抑制剂包含小分子。在一些实施方案中,GPR75抑制剂是CCL5(RANTES)的抑制剂,包括但不限于[44AANA47]-RANTES和Met-CCL5(参见,Braunersreuther等人,Arteriosclerosis,Thrombosis和Vasc.Biol.,2008,28,1090-1096;Proudfoot等人,J.Biol.Chem.,1999,274,32478-32485;和Matsui等人,J.Neroimmunol.,2002,128,16-22)。在一些实施方案中,GPR75抑制剂是GPR75和20-羟基二十碳四烯酸(20-HETE)之间相互作用的抑制剂,所述酸包括但不限于脂肪酸类似物、末端炔属脂肪酸、末端二溴脂肪酸、磺化脂肪酸、TS-011、Het0016、5,14,20-HEDE、5,14,20-HEDGE、6,15,20-HEDE、17-ODYA、DDMS、DDBB、2,5,8,11,14,17-六氧杂十九烷-19-基-20-羟基二十碳6(z),15(z)二烯酸(20-sola)和6(z),15(z)羟基二十碳-6,15-二烯酰胺-二烯酸(aaa)(参见,Miyata等人,Br.J.Pharmacol.,2001,133,325-329;Miyata等人,J.Pharmacol.Exp.Ther.,2005,314,77-85;Pandey等人,J.Pharmacol.Exp.Ther.,2017,363,412-418;和Savas等人,J.Biol.Chem.,2016,291,16904-16919)。在一些实施方案中,GPR75抑制剂是PCT公布WO 2017/156164中描述的任何拮抗剂。在一些实施方案中,GPR75抑制剂是GPR75和20-HETE(一种封闭性抗体)之间相互作用的抑制剂。
在一些实施方案中,所述治疗方法还包括检测来自所述受试者的生物样品中不存在编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子。如本公开通篇所用,“GPR75错义变体核酸分子”是编码具有部分功能丧失、完全功能丧失、预测的部分功能丧失或预测的完全功能丧失的GPR75多肽的任何GPR75核酸分子(诸如例如,基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)。
本公开还提供了用治疗或抑制肥胖症的治疗剂治疗受试者的方法,其中所述受试者是肥胖的。在一些实施方案中,所述方法包括通过以下方式确定受试者是否具有编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子:从所述受试者获得或已经获得生物样品,并且对所述生物样品进行或已经进行了序列分析以确定所述受试者是否具有包含所述GPR75错义变体核酸分子的基因型。当受试者是GPR75参考时,将治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂以标准剂量施用或继续施用给受试者。当受试者对于GPR75错义变体核酸分子是杂合的时,将治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂以与标准剂量相同或低于标准剂量的量施用或继续施用给受试者。具有编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子的基因型的存在指示受试者具有降低的发展肥胖症的风险。在一些实施方案中,受试者是GPR75参考。在一些实施方案中,受试者对于编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子是杂合的。
对于基因分型或确定为GPR75参考或对于GPR75错义变体核酸分子是杂合的受试者,此类受试者可以用如本文所述的GPR75抑制剂治疗。
检测来自受试者的生物样品中存在或不存在GPR75错义变体核酸分子的和/或确定受试者是否具有GPR75错义变体核酸分子可通过本文所述的任何方法进行。在一些实施方案中,这些方法可以在体外进行。在一些实施方案中,这些方法可以原位进行。在一些实施方案中,这些方法可以在体内进行。在这些实施方案中的任一项中,核酸分子可存在于从受试者获得的细胞内。
在一些实施方案中,当受试者是GPR75参考时,还以标准剂量量向受试者施用治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂。在一些实施方案中,当受试者对于GPR75错义变体核酸分子是杂合的时,还以与标准剂量相同或低于标准剂量的剂量向受试者施用治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂。
在一些实施方案中,所述治疗方法还包括检测来自所述受试者的生物样品中不存在GPR75预测的功能丧失性多肽。在一些实施方案中,当受试者没有GPR75预测的功能丧失性多肽时,还以标准剂量向受试者施用治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂。在一些实施方案中,当受试者具有GPR75预测的功能丧失性多肽时,还以与标准剂量相同或低于标准剂量的剂量向受试者施用治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂。
本公开还提供了用治疗或抑制肥胖症的治疗剂治疗受试者的方法,其中所述受试者是肥胖的。在一些实施方案中,所述方法包括通过以下方式确定受试者是否具有GPR75预测的功能丧失性多肽:从所述受试者获得或已经获得生物样品,并且对所述生物样品进行或已经进行测定以确定所述受试者是否具有GPR75预测的功能丧失性多肽。当受试者没有GPR75预测的功能丧失性多肽时,将治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂以标准剂量施用或继续施用给受试者。当受试者具有GPR75预测的功能丧失性多肽时,将治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂以与标准剂量相同或低于标准剂量的量施用或继续施用给受试者。GPR75预测的功能丧失性多肽的存在指示受试者具有降低的发展肥胖症的风险。在一些实施方案中,受试者具有GPR75预测的功能丧失性多肽。在一些实施方案中,受试者没有GPR75预测的功能丧失性多肽。
检测来自受试者的生物样品中存在或不存在GPR75预测的功能丧失性多肽和/或确定受试者是否具有GPR75预测的功能丧失性多肽可通过本文所述的任何方法进行。在一些实施方案中,这些方法可以在体外进行。在一些实施方案中,这些方法可以原位进行。在一些实施方案中,这些方法可以在体内进行。在这些实施方案中的任一个中,多肽可存在于从受试者获得的细胞内。
治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂的示例包括但不限于西布曲明(sibutramine)、奥利司他(orlistat)、芬特明(phentermine)、氯卡色林(lorcaserin)、纳曲酮(naltrexone)、利拉鲁肽(liraglutide)、安非拉酮(diethylpropion)、安非他酮(bupropion)、二甲双胍(metformin)、普兰林肽(pramlintide)、托吡酯(topiramate)和唑尼沙胺(zonisamide)或其任何组合。治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂的示例还包括但不限于西布曲明、奥利司他、芬特明和托吡酯、氯卡色林、安非他酮和纳曲酮、利拉鲁肽、芬特明和安非拉酮、安非他酮、二甲双胍、普兰林肽、托吡酯和唑尼沙胺或其任何组合。
在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂是GLP1R激动剂,包括但不限于或/>(艾塞那肽)、/>或/>(利拉鲁肽)、/>或/>(利西拉肽)、/>(阿必鲁肽)、(达拉鲁肽)和/>(司美格鲁肽)或其任何组合。在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂是/>(艾塞那肽)。在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂是/>(艾塞那肽)。在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂是/>(利拉鲁肽)。在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂是/>(利拉鲁肽)。在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂是/>(利西拉肽)。在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂是/>(利西拉肽)。在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂是/>(阿必鲁肽)。在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂是/>(达拉鲁肽)。在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂是/>(司美格鲁肽)。在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂选自艾塞那肽、利拉鲁肽、利西拉肽、阿必鲁肽、达拉鲁肽和司美格鲁肽或其任何组合。在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂是艾塞那肽。在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂是利拉鲁肽。在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂是利西拉肽。在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂是阿必鲁肽。在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂是达拉鲁肽。在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或BMI增加的治疗剂是司美格鲁肽。
在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或降低BMI的治疗剂是黑皮质素4受体(MC4R)激动剂。在一些实施方案中,MC4R激动剂包含蛋白质、肽、核酸分子或小分子。在一些实施方案中,所述蛋白质是MC4R的肽类似物。在一些实施方案中,所述肽是塞美拉肽(setmelanotide)。在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症和/或降低BMI的治疗剂是塞美拉肽和以下中的一种或多种的组合:西布曲明、奥利司他、芬特明、氯卡色林、纳曲酮、利拉鲁肽、安非拉酮、安非他酮、二甲双胍、普兰林肽、托吡酯和唑尼沙胺。在一些实施方案中,MC4R激动剂是包含氨基酸序列His-Phe-Arg-Trp的肽。在一些实施方案中,小分子是1,2,3R,4-t四氢异喹啉-3-羧酸。在一些实施方案中,MC4R激动剂是ALB-127158(a)。
在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂的剂量对于GPR75错义变体核酸分子杂合的受试者(即低于标准剂量)与作为GPR75参考的受试者(其可接受标准剂量)相比可减少约10%、约20%、约30%、约40%、约50%、约60%、约70%、约80%或约90%。在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂的剂量可减少约10%、约20%、约30%、约40%或约50%。另外,在对于GPR75错义变体核酸分子是杂合的受试者中治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂的剂量与作为GPR75参考的受试者相比,可以较低频率施用。
治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂的施用可以在一天、两天、三天、五天、一周、两周、三周、一个月、五周、六周、七周、八周、两个月或三个月后重复。重复施用可以是相同剂量或不同剂量。施用可重复一次、两次、三次、四次、五次、六次、七次、八次、九次、十次或更多次。例如,根据某些剂量方案,受试者可接受较长时间段的治疗,诸如例如6个月、1年或更长时间。
治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂的施用可通过任何合适的途径进行,包括但不限于肠胃外、静脉内、口服、皮下、动脉内、颅内、鞘内、腹膜内、局部、鼻内或肌内。用于施用的药物组合物希望是无菌的且基本上等渗的,并且在GMP条件下制造。药物组合物可以单位剂型(即,单次施用的剂量)提供。可使用一种或多种生理学和药学上可接受的载剂、稀释剂、赋形剂或助剂来配制药物组合物。制剂取决于所选择的施用途径。术语“药学上可接受的”意指载剂、稀释剂、赋形剂或辅助剂与制剂的其他成分相容,并且对其接受者基本上无害。
在一些实施方案中,治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂(诸如本文公开的任何抑制性核酸分子)经鞘内施用(即,引入脊髓的蛛网膜下腔或引入椎管中,使得治疗剂可到达受试者的脑脊髓液,或引入鞘内的解剖空间或潜在空间中,作为非限制性示例包括脑或脊髓的蛛网膜)。在一些实施方案中,鞘内施用引起治疗剂作用于(但不限于)皮质、小脑、纹状体、颈椎、腰椎或胸椎。鞘内施用的治疗剂可最终作用于整个中枢神经系统中的靶标。在一些实施方案中,鞘内施用是进入小脑延髓池或通过腰部范围或区域。在一些实施方案中,鞘内施用至腰部范围或区域导致治疗剂递送至远端椎管。鞘内施用的示例性方法描述于例如Lazorthes等人,Advances in Drug Delivery Systems and Applicationsin Neurosurgery,143-192。在一些实施方案中,鞘内施用是通过注射、通过团注注射、通过导管或通过泵进行的。在一些实施方案中,鞘内施用是通过腰椎穿刺。在一些实施方案中,泵是渗透泵。在一些实施方案中,将泵植入到椎管的蛛网膜下腔中,腹部皮肤下面或胸壁后面。在一些实施方案中,鞘内施用是通过用于治疗物质的鞘内递送系统,所述鞘内递送系统包括含有一定体积的治疗剂的贮器和配置成递送贮器中所含的治疗物质的至少一部分的泵。在一些实施方案中,鞘内施用是通过间歇或连续接近植入的鞘内药物递送装置(IDDD)。在一些实施方案中,治疗物质是抑制性核酸分子。在一些实施方案中,鞘内施用的核酸分子的量的范围为约10μg至约2mg、约50μg至约1500μg或约100μg至约1000μg。在一些实施方案中,治疗剂置于药物组合物内。在一些实施方案中,药物组合物不包含防腐剂。
如本文所用,术语“治疗(treat)”、“治疗(treating)”和“治疗(treatment)”以及“预防(prevent)”、“预防(preventing)”和“预防(prevention)”分别是指引发所需生物反应,诸如治疗效果和预防效果。在一些实施方案中,在施用所述药剂或包含所述药剂的组合物后,治疗效果包括以下的一种或多种:肥胖症的降低/减轻,肥胖症的严重程度的降低/减轻(诸如例如,降轻或抑制发展或肥胖症),症状和肥胖症相关效应的降低/减轻,延迟症状和肥胖症相关效应的发作,减轻肥胖症相关效应的症状的严重程度,减轻急性发作的严重程度,减少症状和肥胖症相关效应的数目,减少症状和肥胖症相关效应的潜伏期,症状和肥胖症相关效应的改善,减少继发性症状,减少继发性感染,预防肥胖症复发,降低复发发作的次数或频率,增加症状发作间隔的潜伏期,增加持续进展的时间,加快缓解,诱导缓解,加强缓解,加速恢复,或增加替代治疗剂的功效或降低对替代治疗剂的抗性,和/或增加受影响宿主动物的存活时间。预防作用可包括在治疗方案施用后完全或部分避免/抑制或延迟肥胖症发展/进展(诸如例如,完全或部分避免/抑制或延迟),或增加受影响宿主动物的存活时间。肥胖症的治疗涵盖治疗已经被诊断为患有处于任何临床阶段或表现的任何形式的肥胖症的受试者,延迟肥胖症的症状或体征的发作或演变或加重或恶化,和/或预防和/或减轻肥胖症的严重程度。
本公开还提供了鉴定具有增加的发展肥胖症、体重过重、BMI升高、体脂质量、百分比或体积升高和/或食物摄入过量的风险的受试者的方法。在一些实施方案中,所述方法包括确定或已经确定获自受试者的生物样品中存在或不存在编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子(诸如基因组核酸分子、mRNA分子和/或cDNA分子)。当受试者缺少GPR75错义变体核酸分子时(即,受试者基因型分类为GPR75参考)时,则受试者具有增加的发展肥胖症的风险。当受试者具有GPR75错义变体核酸分子(即,受试者对于GPR75错义变体核酸分子是杂合或纯合的)时,则受试者具有降低的发展肥胖症的风险。
具有GPR75错义变体核酸分子的单个拷贝比没有GPR75错义变体核酸分子的拷贝更能保护受试者免于发展肥胖症。不期望受限于任何特定的理论或作用机制,据信GPR75错义变体核酸分子的单个拷贝(即,对于GPR75错义变体核酸分子是杂合的)保护受试者免于发展肥胖症,并且还据信具有GPR75错义变体核酸分子的两个拷贝(即,对于GPR75错义变体核酸分子是纯合的)相对于具有单个拷贝的受试者可更能保护受试者免于发展肥胖症。因此,在一些实施方案中,GPR75错义变体核酸分子的单个拷贝可能不具完全保护性,而是可能部分或不完全地保护受试者免于发展肥胖症。虽然不希望受任何特定理论束缚,但可能存在涉及肥胖症发展的其他因子或分子,其仍存在于具有GPR75错义变体核酸分子的单个拷贝的受试者中,因此导致对肥胖发展的保护不太完全。
在来自受试者的样品中确定受试者是否具有GPR75错义变体核酸分子的和/或确定受试者是否具有GPR75错义变体核酸分子可通过本文所述的任何方法进行。在一些实施方案中,这些方法可以在体外进行。在一些实施方案中,这些方法可以原位进行。在一些实施方案中,这些方法可以在体内进行。在这些实施方案中的任一项中,核酸分子可存在于从受试者获得的细胞内。
在一些实施方案中,当受试者被鉴定为具有增加的发展肥胖症的风险时,受试者进一步如本文所述用治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂治疗。例如,当受试者是GPR75参考,并因此具有增加的发展肥胖症的风险时,向受试者施用GPR75抑制剂。在一些实施方案中,还向此类受试者施用治疗或抑制肥胖症的治疗剂。在一些实施方案中,当受试者对于GPR75错义变体核酸分子是杂合的时,以与标准剂量相同或低于标准剂量的剂量向受试者施用治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂。在一些实施方案中,受试者是GPR75参考。在一些实施方案中,受试者对于GPR75错义变体核酸分子是杂合的。
本公开还提供了检测来自受试者的生物样品中GPR75错义基因组变体核酸分子,和/或来自受试者的生物样品中GPR75错义变体mRNA分子,和/或由来自受试者的生物样品中的mRNA分子产生的GPR75错义变体cDNA分子的存在或不存在的方法。应理解,群体内的基因序列和由此类基因编码的mRNA分子可因多态性(诸如单核苷酸多态性)而变化。本文提供的GPR75变体基因组核酸分子、GPR75变体mRNA分子和GPR75变体cDNA分子的序列仅是示例性序列。GPR75变体基因组核酸分子、变体mRNA分子和变体cDNA分子的其他序列也是可能的。
生物样品可来源于来自受试者的任何细胞、组织或生物流体。生物样品可以包括任何临床相关的组织,诸如骨髓样品、肿瘤活组织检查、细针抽吸物或体液样品,体液诸如血液、龈沟液、血浆、血清、淋巴、腹水、囊液或尿。在一些情况下,样品包括口腔拭子。本文公开的方法中使用的生物样品可以基于测定形式、检测方法的性质和用作样品的组织、细胞或提取物而变化。生物样品可根据所采用的测定进行不同处理。例如,当检测任何GPR75变体核酸分子时,可采用设计用于分离或富集生物样品的基因组DNA的初步处理。多种技术可用于此目的。当检测任何GPR75变体mRNA分子的水平时,可使用不同的技术富集生物样品的mRNA分子。可以使用各种方法来检测mRNA分子的存在或水平或特定变体基因组DNA基因座的存在。
在一些实施方案中,检测受试者中的人GPR75错义变体核酸分子包括对获自受试者的生物样品进行测定或基因分型以确定生物样品中的GPR75基因组核酸分子,和/或生物样品中的GPR75 mRNA分子,和/或从生物样品中的mRNA分子产生的GPR75 cDNA分子是否包含导致功能丧失(部分或完全)或预测会导致功能丧失(部分或完全)的一种或多种变异。
在一些实施方案中,检测受试者中GPR75错义变体核酸分子(诸如例如,基因组核酸分子、mRNA分子和/或由mRNA分子产生的cDNA分子)存在或不存在的方法包括对获自受试者的生物样品进行测定。所述测定确定生物样品中的核酸分子是否包含特定核苷酸序列。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸(对于基因组核酸分子而言);在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,或在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸(对于mRNA分子而言);在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸(对于cDNA分子而言)。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置的腺嘌呤(对于基因组核酸分子而言);在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQID NO:22的位置378的位置的腺嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置的腺嘌呤(对于mRNA分子而言);在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置的腺嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置的腺嘌呤(对于cDNA分子而言)。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置的胸腺嘧啶(对于基因组核酸分子而言);在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置的尿嘧啶(对于mRNA分子而言);在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置的胸腺嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971的位置的胸腺嘧啶(对于cDNA分子而言)。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸(对于基因组核酸分子而言);在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,或在对应于根据SEQ ID NO:10的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸(对于mRNA分子而言);在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ IDNO:33的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,或在对应于根据SEQ ID NO:34的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸(对于cDNA分子而言)。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置的胸腺嘧啶的插入(对于基因组核酸分子而言);在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置的尿嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置的尿嘧啶的插入(对于mRNA分子而言);在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置的胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置的胸腺嘧啶的插入(对于cDNA分子而言)。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置的鸟嘌呤(对于基因组核酸分子而言);在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤(对于mRNA分子而言);在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:106或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤(对于cDNA分子而言)。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
在一些实施方案中,生物样品包含细胞或细胞裂解物。此类方法还可包括例如从受试者获得包含GPR75基因组核酸分子或mRNA分子的生物样品,并且如果包含mRNA,则任选地将mRNA逆转录成cDNA。此类测定可包括例如确定特定GPR75核酸分子的这些位置的同一性。在一些实施方案中,所述方法是体外方法。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括对生物样品中GPR75基因组核酸分子、GPR75 mRNA分子或GPR75cDNA分子的核苷酸序列的至少一部分测序,其中所测序的部分包含导致功能丧失(部分或完全)或预测会导致功能丧失(部分或完全)的一种或多种变异。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括对以下的至少一部分测序:i)生物样品中GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列,其中所测序的部分包含对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置5,540-5,546的位置;ii)生物样品中GPR75 mRNA分子的核苷酸序列,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:11或其互补序列的位置539-545;根据SEQ ID NO:16或其互补序列的位置440-446;根据SEQ IDNO:21或其互补序列的位置361-367;或根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置600-606;和/或iii)由生物样品中的mRNA产生的GPR75 cDNA分子的核苷酸序列,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:35或其互补序列的位置539-545;根据SEQ IDNO:40或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:45或其互补序列的位置361-367;或根据SEQ ID NO:50或其互补序列的位置600-606。当生物样品中的GPR75核酸分子的所测序的部分包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失;ii)在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ IDNO:9的位置361-367的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失,或在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失;或iii)在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,或在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失时,则生物样品中的GPR75核酸分子是GPR75错义变体核酸分子。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括对以下的至少一部分测序:i)生物样品中GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列,其中所测序的部分包含对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置;ii)生物样品中GPR75 mRNA分子的核苷酸序列,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556;根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457;根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378;或根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617;和/或iii)由生物样品中的mRNA产生的GPR75 cDNA分子的核苷酸序列,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556;根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457;根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378;或根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617。当生物样品中的GPR75核酸分子的所测序的部分包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置的腺嘌呤;ii)在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置的腺嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置的腺嘌呤;或iii)在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置的腺嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置的腺嘌呤时,则生物样品中的GPR75核酸分子是GPR75错义变体核酸分子。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括对以下的至少一部分测序:i)生物样品中GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列,其中所测序的部分包含对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置;ii)生物样品中GPR75 mRNA分子的核苷酸序列,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910;根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811;根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732;或根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971;和/或iii)由生物样品中的mRNA产生的GPR75 cDNA分子的核苷酸序列,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910;根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811;根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732;或根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971。当生物样品中的GPR75核酸分子的所测序的部分包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置的胸腺嘧啶;ii)在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置的尿嘧啶;或iii)在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置的腺为胸腺嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971的位置的胸腺嘧啶时,则生物样品中的GPR75核酸分子是GPR75错义变体核酸分子。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括对以下的至少一部分测序:i)生物样品中GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列,其中所测序的部分包含对应于根据SEQ ID NO:5或其互补序列的位置5,920-5,923的位置;ii)生物样品中GPR75 mRNA分子的核苷酸序列,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:14或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:19或其互补序列的位置820-823;根据SEQ IDNO:24或其互补序列的位置741-744;或根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置980-983;和/或iii)由生物样品中的mRNA产生的GPR75 cDNA分子的核苷酸序列,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:38或其互补序列的位置919-922;根据SEQ IDNO:43或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:48或其互补序列的位置741-744;或根据SEQ ID NO:53或其互补序列的位置980-983。当生物样品中的GPR75核酸分子的所测序的部分包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923的位置的AAAG四核苷酸缺失;ii)在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸缺失,或在对应于根据SEQ ID NO:10的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸缺失;或iii)在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸缺失,或在对应于根据SEQID NO:34的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸缺失时,则生物样品中的GPR75核酸分子是GPR75错义变体核酸分子。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括对以下的至少一部分测序:i)生物样品中GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列,其中所测序的部分包含对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置;ii)生物样品中GPR75 mRNA分子的核苷酸序列,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410;根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232;或根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471。和/或iii)由生物样品中的mRNA产生的GPR75 cDNA分子的核苷酸序列,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410;根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232;或根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471。当生物样品中的GPR75核酸分子的所测序的部分包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置的胸腺嘧啶的插入;ii)在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置的尿嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置的尿嘧啶的插入;或iii)在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置的胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置的胸腺嘧啶的插入时,则生物样品中的GPR75核酸分子是GPR75错义变体核酸分子。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括对以下的至少一部分测序:i)生物样品中GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列,其中所测序的部分包含对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置;ii)生物样品中GPR75 mRNA分子的核苷酸序列,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830;根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731;根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652;或根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891;和/或iii)由生物样品中的mRNA产生的GPR75 cDNA分子的核苷酸序列,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830;根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731;根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652;或根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891。当生物样品中的GPR75核酸分子的所测序的部分包含:i)在对应于根据SEQ IDNO:99的位置5,831的位置的鸟嘌呤;ii)在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ IDNO:102的位置652的位置的鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:103的位置891的位置的鸟嘌呤;或iii)在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQID NO:105的位置731的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106的位置652的位置的鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置的鸟嘌呤时,则生物样品中的GPR75核酸分子是GPR75错义变体核酸分子。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括对生物样品中GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列的至少一部分测序,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置5,540-5,546;根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557;根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911;根据SEQ ID NO:5或其互补序列的位置5,920-5,923;根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411;或根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831。当生物样品中GPR75核酸分子的所测序的部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQID NO:3的位置5,557的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置的胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置的鸟嘌呤时,则生物样品中的GPR75核酸分子是GPR75错义变体核酸分子。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括对生物样品中GPR75mRNA分子的核苷酸序列的至少一部分测序,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:11或其互补序列的位置539-545;根据SEQ ID NO:16或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:21或其互补序列的位置361-367;根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置600-606;根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556;根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457;根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378;根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617;根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910;根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811;根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732;根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971;根据SEQ ID NO:14或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:19或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置741-744;根据SEQID NO:29或其互补序列的位置980-983;根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410;根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232;根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471;根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830;根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731;根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652;根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891。当生物样品中的GPR75核酸分子的所测序的部分:在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:8的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ IDNO:25的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:102的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103的位置891的位置处包含鸟嘌呤时,则生物样品中的GPR75核酸分子是GPR75错义变体核酸分子。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括对由生物样品中的mRNA分子产生的GPR75 cDNA分子的核苷酸序列的至少一部分测序,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:35或其互补序列的位置539-545;根据SEQ ID NO:40或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:45或其互补序列的位置361-367;根据SEQID NO:50或其互补序列的位置600-606;根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556;根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457;根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378;根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617;根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910;根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811;根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732;根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971;根据SEQ ID NO:38或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:43或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:48或其互补序列的位置741-744;根据SEQ ID NO:53或其互补序列的位置980-983;根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410;根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:49、其互补序列的位置1,232;根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471;根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830;根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731;根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652;或根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891。当生物样品中的GPR75核酸分子的所测序的部分:在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:36的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQID NO:51的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ IDNO:104的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置处包含鸟嘌呤时,则生物样品中的GPR75核酸分子是GPR75错义变体核酸分子。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:a)使生物样品与和GPR75的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触:i)接近对应于根据SEQ ID NO:2的位置5,540-5,546的位置的基因组核酸分子;ii)接近对应于以下位置的位置的mRNA分子:根据SEQID NO:11的位置539-545,根据SEQ ID NO:16的位置440-446,根据SEQ ID NO:21的位置361-367,或根据SEQ ID NO:26的位置600-606;和/或iii)接近对应于以下位置的位置的cDNA分子:根据SEQ ID NO:35的位置539-545,根据SEQ ID NO:40的位置440-446,根据SEQID NO:45的位置361-367,或根据SEQ ID NO:50的位置600-606;b)使所述引物至少延伸通过GPR75的核苷酸序列的下述位置:i)对应于根据SEQ ID NO:2的位置5,540-5,546的基因组核酸分子;ii)对应于以下位置的mRNA分子:根据SEQ ID NO:11的位置539-545,根据SEQID NO:16的位置440-446,根据SEQ ID NO:21的位置361-367,或根据SEQ ID NO:26的位置600-606;和/或iii)对应于以下位置的cDNA分子:根据SEQ ID NO:35的位置539-545,根据SEQ ID NO:40的位置440-446,根据SEQ ID NO:45的位置361-367,或根据SEQ ID NO:50的位置600-606;并且c)确定所述引物的延伸产物是否包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失;ii)在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失,或在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失;或iii)在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ IDNO:33的位置361-367的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,或在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:a)使生物样品与和GPR75的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触:i)接近对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置的基因组核酸分子;ii)接近对应于以下位置的位置的mRNA分子:根据SEQ IDNO:12的位置556,根据SEQ ID NO:17的位置457,根据SEQ ID NO:22的位置378,根据SEQ IDNO:27的位置617,和/或iii)接近对应于以下位置的位置的cDNA分子:根据SEQ ID NO:36的位置556,根据SEQ ID NO:41的位置457,根据SEQ ID NO:46的位置378,或根据SEQ ID NO:51的位置617;b)使所述引物至少延伸通过GPR75的核苷酸序列的下述位置:i)对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的基因组核酸分子;ii)对应于以下位置的mRNA分子:根据SEQ IDNO:12的位置556,根据SEQ ID NO:17的位置457,根据SEQ ID NO:22的位置378,或根据SEQID NO:27的位置617;和/或iii)对应于以下位置的cDNA分子:根据SEQ ID NO:36的位置556,根据SEQ ID NO:41的位置457,根据SEQ ID NO:46的位置378,或根据SEQ ID NO:51的位置617;并且c)确定所述引物的延伸产物是否包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置的腺嘌呤;ii)在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置的腺嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置的腺嘌呤;或iii)在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置的腺嘌呤,或在对应于根据SEQID NO:51的位置617的位置的腺嘌呤。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:a)使生物样品与和GPR75的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触:i)接近对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置的基因组核酸分子;ii)接近对应于以下位置的位置的mRNA分子:根据SEQ IDNO:13的位置910,根据SEQ ID NO:18的位置811,根据SEQ ID NO:23的位置732,或根据SEQID NO:28的位置971;和/或iii)接近对应于以下位置的位置的cDNA分子:根据SEQ ID NO:37的位置910,根据SEQ ID NO:42的位置811,根据SEQ ID NO:47的位置732,或根据SEQ IDNO:52的位置971;b)使所述引物至少延伸通过GPR75的核苷酸序列的下述位置:i)对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的基因组核酸分子;ii)对应于以下位置的mRNA分子:根据SEQID NO:13的位置910,根据SEQ ID NO:18的位置811,根据SEQ ID NO:23的位置732,或根据SEQ ID NO:28的位置971;和/或iii)对应于以下位置的cDNA分子:根据SEQ ID NO:37的位置910,根据SEQ ID NO:42的位置811,根据SEQ ID NO:47的位置732,或根据SEQ ID NO:52的位置971;并且c)确定所述引物的延伸产物是否包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置的胸腺嘧啶;ii)在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置的尿嘧啶;或iii)在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置的胸腺嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971的位置的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:a)使生物样品与和GPR75的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触:i)接近对应于根据SEQ ID NO:5的位置5,920-5,923的位置的基因组核酸分子;ii)接近对应于以下位置的位置的mRNA分子:根据SEQID NO:14的位置919-922,根据SEQ ID NO:19的位置820-823,根据SEQ ID NO:24的位置741-744,或根据SEQ ID NO:29的位置980-983;和/或iii)接近对应于以下位置的位置的cDNA分子:根据SEQ ID NO:38的位置919-922,根据SEQ ID NO:43的位置820-823,根据SEQID NO:48的位置741-744,或根据SEQ ID NO:53的位置980-983;b)使所述引物至少延伸通过GPR75的核苷酸序列的下述位置:i)对应于根据SEQ ID NO:5的位置5,920-5,923的基因组核酸分子;ii)对应于以下位置的mRNA分子:根据SEQ ID NO:14的位置919-922,根据SEQID NO:19的位置820-823,根据SEQ ID NO:24的位置741-744,或根据SEQ ID NO:29的位置980-983;和/或iii)对应于以下位置的cDNA分子:根据SEQ ID NO:38的位置919-922,根据SEQ ID NO:43的位置820-823,根据SEQ ID NO:48的位置741-744,或根据SEQ ID NO:53的位置980-983;并且c)确定所述引物的延伸产物是否包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923的位置的AAAG四核苷酸缺失;ii)在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸缺失,或在对应于根据SEQ ID NO:10的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸缺失;或iii)在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸缺失,或在对应于根据SEQ ID NO:34的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸缺失。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:a)使生物样品与和GPR75的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触:i)接近对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置的基因组核酸分子;ii)接近对应于以下位置的位置的mRNA分子:根据SEQ IDNO:15的位置1,410,根据SEQ ID NO:20的位置1,311,根据SEQ ID NO:25的位置1,232,或根据SEQ ID NO:30的位置1,471;和/或iii)接近对应于以下位置的位置的cDNA分子:根据SEQID NO:39的位置1,410,根据SEQ ID NO:44的位置1,311,根据SEQ ID NO:49的位置1,232,或根据SEQ ID NO:54的位置1,471;b)使所述引物至少延伸通过GPR75的核苷酸序列的下述位置:i)对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的基因组核酸分子;ii)对应于以下位置的mRNA分子:根据SEQ ID NO:15的位置1,410,根据SEQ ID NO:20的位置1,311,根据SEQ IDNO:25的位置1,232,或根据SEQ ID NO:30的位置1,471;和/或iii)对应于以下位置的cDNA分子:根据SEQ ID NO:39的位置1,410,根据SEQ ID NO:44的位置1,311,根据SEQ ID NO:49的位置1,232,或根据SEQ ID NO:54的位置1,471;并且c)确定所述引物的延伸产物是否包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置的胸腺嘧啶的插入;ii)在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置的尿嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置的尿嘧啶的插入;或iii)在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置的胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置的胸腺嘧啶的插入。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:a)使生物样品与和GPR75的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触:i)接近对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置的基因组核酸分子;ii)接近对应于以下位置的位置的mRNA分子:根据SEQ IDNO:100的位置830;根据SEQ ID NO:101的位置731;根据SEQ ID NO:102的位置652;或根据SEQ ID NO:103的位置891;和/或iii)接近对应于以下位置的位置的cDNA分子:根据SEQ IDNO:104的位置830;根据SEQ ID NO:105的位置731;根据SEQ ID NO:106的位置652;或根据SEQ ID NO:107的位置891;b)使所述引物至少延伸通过GPR75的核苷酸序列的下述位置:i)接近对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置的基因组核酸分子;ii)接近对应于以下位置的位置的mRNA分子:根据SEQ ID NO:100的位置830;根据SEQ ID NO:101的位置731;根据SEQ ID NO:102的位置652;或根据SEQ ID NO:103的位置891;和/或iii)接近对应于以下位置的位置的cDNA分子:根据SEQ ID NO:104的位置830;根据SEQ ID NO:105的位置731;根据SEQ ID NO:106的位置652;或根据SEQ ID NO:107的位置891;并且c)确定所述引物的延伸产物是否包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置的鸟嘌呤;ii)在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤;或iii)在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤;或在对应于根据SEQID NO:107或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤。
一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:a)使所述生物样品与和GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触,所述部分接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2的位置5,540-5,546,根据SEQ ID NO:3的位置5,557,根据SEQ ID NO:4的位置5,911,根据SEQ ID NO:5的位置5,920-5,923,根据SEQ ID NO:6的位置6,411,或根据SEQ ID NO:99的位置5,831;b)使所述引物至少延伸通过GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2的位置5,540-5,546,根据SEQID NO:3的位置5,557,根据SEQ ID NO:4的位置5,911,根据SEQ ID NO:5的位置5,920-5,923,根据SEQ ID NO:6的位置6,411,或根据SEQ ID NO:99的位置5,831;并且c)确定所述引物的延伸产物是否:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQID NO:4的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:a)使所述生物样品与和GPR75 mRNA分子的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触,所述部分接近对应于以下位置的位置:根据SEQ IDNO:11的位置539-545,根据SEQ ID NO:16的位置440-446,根据SEQID NO:21的位置361-367,根据SEQ ID NO:26的位置600-606,根据SEQ ID NO:12的位置556,根据SEQ ID NO:17的位置457,根据SEQ ID NO:22的位置378,根据SEQ ID NO:27的位置617,根据SEQ ID NO:13的位置910,根据SEQ ID NO:18的位置811,根据SEQ ID NO:23的位置732,根据SEQ ID NO:28的位置971,根据SEQ ID NO:14的位置919-922,根据SEQ IDNO:19的位置820-823,根据SEQ ID NO:24的位置741-744,根据SEQ ID NO:29的位置980-983,根据SEQ ID NO:15的位置1,410,根据SEQ ID NO:20的位置1,311,根据SEQ ID NO:25的位置1,232,根据SEQ ID NO:30的位置1,471;根据SEQ ID NO:100的位置830;根据SEQ IDNO:101的位置731;根据SEQ ID NO:102的位置652;或根据SEQ ID NO:103的位置891;b)使所述引物至少延伸通过GPR75 mRNA分子的核苷酸序列的对应于以下位置的位置:根据SEQID NO:11的位置539-545,根据SEQ ID NO:16的位置440-446,根据SEQ ID NO:21的位置361-367,根据SEQ ID NO:26的位置600-606,根据SEQ ID NO:12的位置556,根据SEQ IDNO:17的位置457,根据SEQ ID NO:22的位置378,根据SEQ ID NO:27的位置617,根据SEQ IDNO:13的位置910,根据SEQ ID NO:18的位置811,根据SEQ ID NO:23的位置732,根据SEQ IDNO:28的位置971,根据SEQ ID NO:14的位置919-922,根据SEQ ID NO:19的位置820-823,根据SEQ ID NO:24的位置741-744,根据SEQ ID NO:29的位置980-983,根据SEQ ID NO:15的位置1,410,根据SEQ ID NO:20的位置1,311,根据SEQ ID NO:25的位置1,232,根据SEQ IDNO:30的位置1,471,根据SEQ ID NO:100的位置830,根据SEQ ID NO:101的位置731,根据SEQ ID NO:102的位置652,或根据SEQ ID NO:103的位置891;并且c)确定所述引物的延伸产物是否:在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQID NO:9的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:102的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:103的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:a)使所述生物样品与和GPR75 cDNA分子的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触,所述部分接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:35的位置539-545,根据SEQ ID NO:40的位置440-446,根据SEQID NO:45的位置361-367,根据SEQ ID NO:50的位置600-606,根据SEQ ID NO:36的位置556,根据SEQ ID NO:41的位置457,根据SEQ ID NO:46的位置378,根据SEQ ID NO:51的位置617,根据SEQ ID NO:37的位置910,根据SEQ ID NO:42的位置811,根据SEQ IDNO:47的位置732,根据SEQ ID NO:52的位置971,根据SEQ ID NO:38的位置919-922,根据SEQ ID NO:43的位置820-823,根据SEQ ID NO:48的位置741-744,根据SEQ ID NO:53的位置980-983,根据SEQ ID NO:39的位置1,410,根据SEQ ID NO:44的位置1,311,根据SEQ ID NO:49的位置1,232,根据SEQ ID NO:54的位置1,471,根据SEQ ID NO:104的位置830,根据SEQ ID NO:105的位置731,根据SEQ ID NO:106的位置652,或根据SEQ ID NO:107的位置891;b)使所述引物至少延伸通过GPR75 cDNA分子的核苷酸序列的对应于以下位置的位置:根据SEQ IDNO:35的位置539-545,根据SEQ ID NO:40的位置440-446,根据SEQ ID NO:45的位置361-367,根据SEQ ID NO:50的位置600-606,根据SEQ ID NO:36的位置556,根据SEQ ID NO:41的位置457,根据SEQ ID NO:46的位置378,根据SEQ ID NO:51的位置617,根据SEQ ID NO:37的位置910,根据SEQ ID NO:42的位置811,根据SEQ ID NO:47的位置732,根据SEQ IDNO:52的位置971,根据SEQ ID NO:38的位置919-922,根据SEQ ID NO:43的位置820-823,根据SEQ ID NO:48的位置741-744,根据SEQ ID NO:53的位置980-983,根据SEQ ID NO:39的位置1,410,根据SEQ ID NO:44的位置1,311,根据SEQ ID NO:49的位置1,232,根据SEQ IDNO:54的位置1,471,根据SEQ ID NO:104的位置830,根据SEQ ID NO:105的位置731,根据SEQ ID NO:106的位置652,或根据SEQ ID NO:107的位置891;并且c)确定所述引物的延伸产物是否:在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ IDNO:37的位置910的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ IDNO:54的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
在一些实施方案中,测定包括对整个核酸分子进行测序。在一些实施方案中,仅分析GPR75基因组核酸分子。在一些实施方案中,仅分析GPR75 mRNA。在一些实施方案中,仅分析从GPR75 mRNA获得的GPR75 cDNA。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:a)扩增编码人GPR75多肽的核酸分子的至少一部分,其中所扩增的部分包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置的CCAGTAG七核苷酸的缺失;ii)在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置的CCAGUAG七核苷酸的缺失;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置的CCAGUAG七核苷酸的缺失;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置的CCAGUAG七核苷酸的缺失;或在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置的CCAGUAG七核苷酸的缺失;和/或iii)在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置的CCAGTAG七核苷酸的缺失;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置的CCAGTAG七核苷酸的缺失;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置的CCAGTAG七核苷酸的缺失;或在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置的CCAGTAG七核苷酸的缺失;b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:i)在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;ii)在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;和/或iii)在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;并且d)检测所述可检测标记。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括a)扩增编码人GPR75多肽的核酸分子的至少一部分,其中所扩增的部分包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置的腺嘌呤;ii)在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置的腺嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置的腺嘌呤;和/或iii)在对应于根据SEQ IDNO:36或其互补序列的位置556的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置的腺嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置的腺嘌呤;b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置的腺嘌呤;ii)在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置的腺嘌呤;或在对应于根据SEQ IDNO:27或其互补序列的位置617的位置的腺嘌呤;和/或iii)在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置的腺嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置的腺嘌呤;并且d)检测所述可检测标记。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括a)扩增编码人GPR75多肽的核酸分子的至少一部分,其中所扩增的部分包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置的胸腺嘧啶;ii)在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置的尿嘧啶;和/或iii)在对应于根据SEQ IDNO:37或其互补序列的位置910的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置的胸腺嘧啶;b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置的胸腺嘧啶;ii)在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置的尿嘧啶;和/或iii)在对应于根据SEQ IDNO:37或其互补序列的位置910的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置的胸腺嘧啶;并且d)检测所述可检测标记。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:a)扩增编码人GPR75多肽的核酸分子的至少一部分,其中所扩增的部分包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置的AAAG四核苷酸的缺失;ii)在对应于根据SEQID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸的缺失;在对应于根据SEQ IDNO:8或其互补序列的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸的缺失;在对应于根据SEQ IDNO:9或其互补序列的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸的缺失;或在对应于根据SEQ IDNO:10或其互补序列的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸的缺失;和/或iii)在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸的缺失;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸的缺失;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸的缺失;或在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸的缺失;b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:i)在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;ii)在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;和/或iii)在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;并且d)检测所述可检测标记。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括a)扩增编码人GPR75多肽的核酸分子的至少一部分,其中所扩增的部分包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置的胸腺嘧啶的插入;ii)在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置的尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置的尿嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置的尿嘧啶的插入;和/或iii)在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置的胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置的胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置的胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置的胸腺嘧啶的插入;b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置的胸腺嘧啶的插入;ii)在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置的尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置的尿嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置的尿嘧啶的插入;和/或iii)在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置的胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置的胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置的胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置的胸腺嘧啶的插入;并且d)检测所述可检测标记。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括a)扩增编码人GPR75多肽的核酸分子的至少一部分,其中所扩增的部分包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置的鸟嘌呤;ii)在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤;和/或iii)在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤;b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列包含:i)在对应于根据SEQ IDNO:99或其互补序列的位置5,831的位置的鸟嘌呤;ii)在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤;和/或iii)在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:105或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤;并且d)检测所述可检测标记。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:a)扩增编码人GPR75多肽的核酸分子的至少一部分,其中所扩增的部分:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1、其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;或b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;并且d)检测所述可检测标记。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:a)扩增编码人GPR75多肽的核酸分子的至少一部分,其中所扩增的部分:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:a)扩增编码人GPR75多肽的核酸分子的至少一部分,其中所扩增的部分:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且d)检测所述可检测标记。
在一些实施方案中,核酸分子是mRNA,并且确定步骤还包括在扩增步骤之前将mRNA逆转录成cDNA。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:使生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:i)在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;ii)在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;和/或iii)在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;并且检测所述可检测标记。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:使生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置的腺嘌呤;ii)在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置的腺嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置的腺嘌呤;和/或iii)在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:46或其互补序列的位置378的位置的腺嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置的腺嘌呤;并且检测所述可检测标记。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:使生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置的胸腺嘧啶;ii)在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置的尿嘧啶;和/或iii)在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置的胸腺嘧啶;并且检测所述可检测标记。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:使生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:i)在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;ii)在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;和/或iii)在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;并且检测所述可检测标记。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:使生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置的胸腺嘧啶的插入;ii)在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置的尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置的尿嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ IDNO:30或其互补序列的位置1,471的位置的尿嘧啶的插入;和/或iii)在对应于根据SEQ IDNO:39或其互补序列的位置1,410的位置的胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置的胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置的胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置的胸腺嘧啶的插入;并且检测所述可检测标记。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:使生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列包含:i)在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置的鸟嘌呤;ii)在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤;和/或iii)在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤;并且检测所述可检测标记。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:使生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:5或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ IDNO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;并且检测所述可检测标记。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:使生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且检测所述可检测标记。
在一些实施方案中,所述确定步骤、检测步骤或序列分析包括:使生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且检测所述可检测标记。
改变特异性聚合酶链反应技术可用于检测核酸序列中的突变,诸如SNP。因为当与模板存在错配时,DNA聚合酶将不延伸,所以可使用改变特异性引物。
在一些实施方案中,样品中的核酸分子是mRNA并且在扩增步骤之前将mRNA逆转录成cDNA。在一些实施方案中,核酸分子存在于从受试者获得的细胞内。
在一些实施方案中,所述测定包括使生物样品与引物或探针,诸如改变特异性引物或改变特异性探针接触,所述引物或探针在严格条件下与GPR75变体基因组序列、变体mRNA序列或变体cDNA序列特异性杂交,而不与相应的GPR75参考序列特异性杂交,并且确定是否已经发生杂交。
在一些实施方案中,测定包括RNA测序(RNA-Seq)。在一些实施方案中,测定还包括,诸如通过逆转录酶聚合酶链反应(RT-PCR),将mRNA逆转录成cDNA。
在一些实施方案中,所述方法利用足够核苷酸长度的探针和引物与靶核苷酸序列结合,并特异性检测和/或鉴定包含GPR75变体基因组核酸分子、变体mRNA分子或变体cDNA分子的多核苷酸。杂交条件或反应条件可由操作人员确定以达到此结果。核苷酸长度可以是足以用于所选择的检测方法(包括本文所述或例示的任何测定)的任何长度。此类探针和引物可在高严格杂交条件下与靶核苷酸序列特异性地杂交。探针和引物可具有与靶核苷酸序列内连续核苷酸的完全核苷酸序列同一性,但可通过常规方法设计不同于靶核苷酸序列并保留特异性地检测和/或鉴定靶核苷酸序列的能力的探针。探针和引物可与靶核酸分子的核苷酸序列具有约80%、约85%、约90%、约91%、约92%、约93%、约94%、约95%、约96%、约97%、约98%、约99%或约100%的序列同一性或互补性。
在一些实施方案中,为了确定生物样品中的GPR75核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)或其互补序列是否包含下述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸(基因组核酸分子),在对应于根据SEQID NO:7的位置539-545的位置缺失CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置缺失CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置缺失CCAGUAG七核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置缺失CCAGUAG七核苷酸(对于mRNA分子而言);在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置缺失CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置缺失CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失;或在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置缺失CCAGTAG七核苷酸(对于cDNA分子而言),所述生物样品可以经受使用引物对的扩增方法,所述引物对包括:第一引物,其来源于邻近以下的5’侧翼序列:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ IDNO:9的位置361-367的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,或在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失;和第二引物,其来源于邻近以下的3’侧翼序列:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,或在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,以产生指示存在以下的复制子:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置的CCAGUAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ IDNO:31的位置539-545的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失,或在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置的CCAGTAG七核苷酸缺失。在一些实施方案中,扩增子的长度范围可从引物对加上一个核苷酸碱基对的组合长度至任何可通过DNA扩增方案产生的扩增子的长度。此距离的范围可从一个核苷酸碱基对至扩增反应的极限或约两万个核苷酸碱基对。任选地,引物对侧接的区域包括下述位置:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置缺失CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置缺失CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置缺失CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置缺失CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置缺失CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置缺失CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置缺失CCAGTAG七核苷酸,或在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置缺失CCAGTAG七核苷酸;以及在下述位置的每一侧的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个核苷酸,所述位置:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置缺失CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置缺失CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置缺失CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置缺失CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置缺失CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置缺失CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置缺失CCAGTAG七核苷酸,或在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置缺失CCAGTAG七核苷酸。
在一些实施方案中,为了确定生物样品中的GPR75核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)或其互补序列是否包含下述核苷酸序列,其包含:在对应于根据SEQID NO:3的位置5,557的位置的腺嘌呤(基因组核酸分子),在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置的腺嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置的腺嘌呤(对于mRNA分子而言);在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置的腺嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置的腺嘌呤(对于cDNA分子而言),所述生物样品可以经受使用引物对的扩增方法,所述引物对包括:第一引物,其来源于邻近以下的5’侧翼序列:在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ IDNO:12的位置556的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置的腺嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置的腺嘌呤;和第二引物,其来源于邻近以下的3’侧翼序列:在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQID NO:36的位置556的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置的腺嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置的腺嘌呤,以产生指示在编码以下的位置存在SNP的复制子:在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ IDNO:22的位置378的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置的腺嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置的腺嘌呤。在一些实施方案中,扩增子的长度范围可从引物对加上一个核苷酸碱基对的组合长度至任何可通过DNA扩增方案产生的扩增子的长度。此距离的范围可从一个核苷酸碱基对至扩增反应的极限或约两万个核苷酸碱基对。任选地,引物对侧接的区域包括下述位置,其包含:在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQID NO:17的位置457的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置的腺嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置的腺嘌呤;以及在下述位置的每一侧的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个核苷酸,所述位置处包含:在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ IDNO:27的位置617的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置的腺嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置的腺嘌呤。
在一些实施方案中,为了确定生物样品中的GPR75核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)或其互补序列是否包含下述核苷酸序列,其包含:在对应于根据SEQID NO:4的位置5,911的位置的胸腺嘧啶(基因组核酸分子),在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置的尿嘧啶(对于mRNA分子而言);在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:47的位置732的位置的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971的位置的胸腺嘧啶(对于cDNA分子而言),所述生物样品可以经受使用引物对的扩增方法,所述引物对包括:第一引物,其来源于邻近以下的5’侧翼序列:在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置的胸腺嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971的位置的胸腺嘧啶;和第二引物,其来源于邻近以下的3’侧翼序列:在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ IDNO:42的位置811的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置的胸腺嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971的位置的胸腺嘧啶,以产生指示在编码以下的位置存在SNP的复制子:在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ IDNO:47的位置732的位置的胸腺嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971的位置的胸腺嘧啶。在一些实施方案中,扩增子的长度范围可从引物对加上一个核苷酸碱基对的组合长度至任何可通过DNA扩增方案产生的扩增子的长度。此距离的范围可从一个核苷酸碱基对至扩增反应的极限或约两万个核苷酸碱基对。任选地,引物对侧接的区域包括下述位置,其包含:在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ IDNO:13的位置910的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置的胸腺嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971的位置的胸腺嘧啶;以及在下述位置的每一侧的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个核苷酸,所述位置处包含:在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ IDNO:42的位置811的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置的胸腺嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971的位置的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,为了确定生物样品中的GPR75核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)或其互补序列是否包含下述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸(基因组核酸分子),在对应于根据SEQ IDNO:7的位置919-922的位置缺失AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置缺失AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置缺失AAAG四核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:10的位置980-983的位置缺失AAAG四核苷酸(对于mRNA分子而言);在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置缺失AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置缺失AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置缺失AAAG四核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:34的位置980-983的位置缺失AAAG四核苷酸(对于cDNA分子而言),所述生物样品可以经受使用引物对的扩增方法,所述引物对包括:第一引物,其来源于邻近以下的5’侧翼序列:在对应于根据SEQ IDNO:1的位置5,920-5,923的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸缺失,或在对应于根据SEQ ID NO:34的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸缺失;和第二引物,其来源于邻近以下的3’侧翼序列:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸缺失,或在对应于根据SEQ ID NO:34的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸缺失,以产生指示存在以下的复制子:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ IDNO:9的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸缺失,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸缺失,或在对应于根据SEQID NO:34的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸缺失。在一些实施方案中,扩增子的长度范围可从引物对加上一个核苷酸碱基对的组合长度至任何可通过DNA扩增方案产生的扩增子的长度。此距离的范围可从一个核苷酸碱基对至扩增反应的极限或约两万个核苷酸碱基对。任选地,引物对侧接的区域包括下述位置:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置缺失AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置缺失AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置缺失AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置980-983的位置缺失AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置缺失AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置缺失AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置缺失AAAG四核苷酸,或在对应于根据SEQ ID NO:34的位置980-983的位置缺失AAAG四核苷酸;以及在下述位置的每一侧的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个核苷酸,所述位置:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置缺失AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置缺失AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置缺失AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQID NO:10的位置980-983的位置缺失AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置缺失AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置缺失AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置缺失AAAG四核苷酸,或在对应于根据SEQ ID NO:34的位置980-983的位置缺失AAAG四核苷酸。
在一些实施方案中,为了确定生物样品中的GPR75核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)或其互补序列是否包含下述核苷酸序列,其包含:在对应于根据SEQID NO:6的位置6,411的位置的胸腺嘧啶的插入(基因组核酸分子),在对应于根据SEQ IDNO:15的位置1,410的位置的尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置的尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置的尿嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置的尿嘧啶的插入(对于mRNA分子而言);在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置的胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置的胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置的胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置的胸腺嘧啶的插入(对于cDNA分子而言),所述生物样品可以经受使用引物对的扩增方法,所述引物对包括:第一引物,其来源于邻近以下的5’侧翼序列:在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置的胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置的胸腺嘧啶的插入;和第二引物,其来源于邻近以下的3’侧翼序列:在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置的胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置的胸腺嘧啶的插入,以产生指示存在以下的复制子:在对应于根据SEQID NO:6的位置6,411的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ IDNO:30的位置1,471的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置的胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQID NO:54的位置1,471的位置的胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,扩增子的长度范围可从引物对加上一个核苷酸碱基对的组合长度至任何可通过DNA扩增方案产生的扩增子的长度。此距离的范围可从一个核苷酸碱基对至扩增反应的极限或约两万个核苷酸碱基对。任选地,引物对侧接的区域包括下述位置,其包含:在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ IDNO:25的位置1,232的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ IDNO:49的位置1,232的位置的胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置的胸腺嘧啶的插入;以及在下述位置的每一侧的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个核苷酸,所述位置处包含:在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQID NO:44的位置1,311的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置的胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置的胸腺嘧啶的插入。
在一些实施方案中,为了确定生物样品中的GPR75核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)或其互补序列是否包含下述核苷酸序列,其包含:在对应于根据SEQID NO:99的位置5,831的位置的鸟嘌呤(基因组核酸分子),在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:102的位置652的位置的鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:103的位置891的位置的鸟嘌呤(对于mRNA分子而言);在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ IDNO:106的位置652的位置的鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置的鸟嘌呤(对于cDNA分子而言),所述生物样品可以经受使用引物对的扩增方法,所述引物对包括:第一引物,其来源于邻近以下的5’侧翼序列:在对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:102的位置652的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:103的位置891的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ IDNO:104的位置830的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106的位置652的位置的鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置的鸟嘌呤;和第二引物,其来源于邻近以下的3’侧翼序列:在对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQID NO:102的位置652的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:103的位置891的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106的位置652的位置的鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置的鸟嘌呤,以产生指示存在以下的复制子:在对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置的鸟嘌呤的插入,在对应于根据SEQ IDNO:100的位置830的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:102的位置652的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:103的位置891的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106的位置652的位置的鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置的鸟嘌呤。在一些实施方案中,扩增子的长度范围可从引物对加上一个核苷酸碱基对的组合长度至任何可通过DNA扩增方案产生的扩增子的长度。此距离的范围可从一个核苷酸碱基对至扩增反应的极限或约两万个核苷酸碱基对。任选地,引物对侧接的区域包括下述位置,其包含:在对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置的鸟嘌呤的插入,在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:102的位置652的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:103的位置891的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQID NO:105的位置731的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106的位置652的位置的鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置的鸟嘌呤;以及在下述位置的每一侧的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个核苷酸,所述位置处包含:在对应于根据SEQID NO:99的位置5,831的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ IDNO:102的位置652的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:103的位置891的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106的位置652的位置的鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置的鸟嘌呤。
可由mRNA和/或cDNA序列产生类似的扩增子。PCR引物对可以例如通过使用意图用于此目的的计算机程序衍生自已知的序列,所述计算机程序诸如Vector NTI版本10的PCR引物分析工具(Informax Inc.,Bethesda Md.);PrimerSelect(DNASTAR Inc.,Madison,Wis.);以及Primer3(版本0.4.0.COPYRGT.,1991,Whitehead Institute for BiomedicalResearch,Cambridge,Mass.)。另外,所述序列可以视觉的方式被扫描,并且引物可使用已知的指导进行手动鉴定。
核酸测序技术的例示性示例包括但不限于链终止子(Sanger)测序和染料终止子测序。其他方法涉及除了测序以外的核酸杂交方法,其包括使用针对纯化的DNA、扩增的DNA和固定细胞制品的标记的引物或探针(荧光原位杂交(FISH))。在一些方法中,靶核酸分子可以在检测之前或同时扩增。核酸扩增技术的例示性示例包括但不限于聚合酶链反应(PCR)、连接酶链反应(LCR)、链置换扩增反应(SDA)以及基于核酸序列的扩增反应(NASBA)。其他方法包括但不限于连接酶链反应、链置换扩增反应和嗜热SDA(tSDA)。
在杂交技术中,可采用严格条件,使得探针或引物特异性地与其靶标杂交。在一些实施方案中,在严格条件下的多核苷酸引物或探针将与其靶序列杂交,其程度可检测地比与其他非靶序列的杂交程度大,诸如相对于背景至少2倍、至少3倍、至少4倍或更多,包括相对于背景超过10倍。在一些实施方案中,在严格条件下的多核苷酸引物或探针将与其靶核苷酸序列杂交,其程度可检测地比与其他核苷酸序列的杂交大至少2倍。在一些实施方案中,在严格条件下的多核苷酸引物或探针将与其靶核苷酸序列杂交,其程度可检测地比与其他核苷酸序列的杂交大至少3倍。在一些实施方案中,在严格条件下的多核苷酸引物或探针将与其靶核苷酸序列杂交,其程度可检测地比与其他核苷酸序列的杂交大至少4倍。在一些实施方案中,在严格条件下的多核苷酸引物或探针将与其靶核苷酸序列杂交,其程度可检测地比与其他核苷酸序列的杂交大相对于背景超过10倍。严格条件是序列依赖性的并且在不同的环境中将是不同的。
促进DNA杂交的适当严格条件,例如在约45℃的6X氯化钠/柠檬酸钠(SSC),接着在50℃下的2X SSC洗涤,是已知的或可以在Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley&Sons,N.Y.(1989),6.3.1-6.3.6中找到。通常,用于杂交和检测的严格条件将是下述那些条件:在pH 7.0至8.3下盐浓度小于约1.5M Na+离子,通常为约0.01至1.0M Na+离子浓度(或其他盐),且对于短探针(诸如例如10至50个核苷酸)而言温度为至少约30℃而对于较长探针(诸如例如大于50个核苷酸)而言温度为至少约60℃。严格条件还可通过添加去稳定剂诸如甲酰胺来实现。任选地,洗涤缓冲液可包含约0.1%至约1% SDS。杂交持续时间通常小于约24小时,一般为约4至约12小时。洗涤时间的持续时间将至少是足以达到平衡的时间长度。
本公开还提供检测人GPR75预测的功能丧失性多肽的存在的方法,其包括对获自受试者的生物样品进行测定以确定受试者中的GPR75多肽是否含有致使多肽具有功能丧失(部分或完全)或预测的功能丧失(部分或完全)的一种或多种变异。GPR75预测的功能丧失性多肽可以是本文所述的任何GPR75变体多肽。在一些实施方案中,所述方法检测GPR75Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs或Cys400fs的存在。在一些实施方案中,所述方法检测Lys404*、Ser219fs或c.-110+1G>A的存在。
在一些实施方案中,所述方法包括对获自受试者的样品进行测定以确定样品中的GPR75多肽是否包含根据SEQ ID NO:56的氨基酸110-130。在一些实施方案中,所述方法包括对获自受试者的样品进行测定以确定样品中的GPR75多肽是否在对应于根据SEQ ID NO:57的位置116的位置处包含苏氨酸。在一些实施方案中,所述方法包括对获自受试者的样品进行测定以确定样品中的GPR75多肽是否终止于对应于根据SEQ ID NO:58的位置233的位置。在一些实施方案中,所述方法包括对获自受试者的样品进行测定以确定样品中的GPR75多肽是否包含根据SEQ ID NO:59的氨基酸236-239。在一些实施方案中,所述方法包括对获自受试者的样品进行测定以确定样品中的GPR75多肽是否包含根据SEQ ID NO:60的氨基酸400-425。在一些实施方案中,所述方法包括对获自受试者的样品进行测定以确定样品中的GPR75多肽是否在对应于根据SEQ ID NO:108的位置207的位置处包含半胱氨酸。
在一些实施方案中,所述检测步骤包括对所述多肽的至少一部分进行测序,所述部分包含对应于根据SEQ ID NO:56或SEQ ID NO:55的位置110-130中的任一个或多个的位置。在一些实施方案中,所述检测步骤包括对所述多肽的至少一部分进行测序,所述部分包含对应于根据SEQ ID NO:57或SEQ ID NO:55的位置116的位置。在一些实施方案中,所述检测步骤包括对多肽的至少一部分进行测序,所述部分包含对应于根据SEQ ID NO:55的位置234-540中的任一个的位置。在一些实施方案中,所述检测步骤包括对所述多肽的至少一部分进行测序,所述部分包含对应于根据SEQ ID NO:59或SEQ ID NO:55的位置236-239中的任一个或多个的位置。在一些实施方案中,所述检测步骤包括对所述多肽的至少一部分进行测序,所述部分包含对应于根据SEQ ID NO:60或SEQ ID NO:55的位置400-425中的任一个或多个的位置。在一些实施方案中,所述检测步骤包括对所述多肽的至少一部分进行测序,所述部分包含对应于根据SEQ ID NO:108的位置207的位置。
在一些实施方案中,所述检测步骤包括用于检测多肽的存在的免疫测定法,所述多肽包含对应于根据SEQ ID NO:56或SEQ ID NO:55的位置110-130中的任一个或多个的位置。在一些实施方案中,所述检测步骤包括用于检测多肽的存在的免疫测定法,所述多肽包含对应于根据SEQ ID NO:57或SEQ ID NO:55的位置116的位置。在一些实施方案中,所述检测步骤包括用于检测多肽的存在的免疫测定法,所述多肽包含对应于根据SEQ ID NO:55的位置234-540中的任一个或多个的位置。在一些实施方案中,所述检测步骤包括用于检测多肽的存在的免疫测定法,所述多肽包含对应于根据SEQ ID NO:59或SEQ ID NO:55的位置236-239中的任一个或多个的位置。在一些实施方案中,所述检测步骤包括用于检测多肽的存在的免疫测定法,所述多肽包含对应于根据SEQ ID NO:60或SEQ ID NO:55的位置400-425中的任一个或多个的位置。在一些实施方案中,所述检测步骤包括用于检测多肽的存在的免疫测定法,所述多肽包含对应于根据SEQ ID NO:108或SEQ ID NO:55的位置207的位置。
在一些实施方案中,当所述受试者不具有GPR75预测的功能丧失性多肽时,所述受试者具有增加的发展肥胖症或体重过重、BMI升高、体脂质量、百分比或体积升高和/或食物摄入过量中的任一种的风险。在一些实施方案中,当所述受试者具有GPR75预测的功能丧失性多肽时,所述受试者具有降低的发展肥胖症或体重过重、BMI升高、体脂质量、百分比或体积升高和/或食物摄入过量中的任一种的风险。
本公开还提供了与GPR75变体基因组核酸分子、GPR75变体mRNA分子和/或GPR75变体cDNA分子(诸如本文公开的基因组变体核酸分子、mRNA变体分子和cDNA变体分子中的任一种)杂交的分离的核酸分子。在一些实施方案中,所述分离的核酸分子与GPR75核酸分子的一部分杂交,所述部分包括对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2的位置5,540-5,546,根据SEQ ID NO:11的位置539-545,根据SEQ ID NO:16的位置440-446,根据SEQ IDNO:21的位置361-367,根据SEQ ID NO:26的位置600-606,根据SEQ ID NO:35的位置539-545,根据SEQ ID NO:40的位置440-446,根据SEQ ID NO:45的位置361-367,或根据SEQ IDNO:50的位置600-606。
在一些实施方案中,所述分离的核酸分子与GPR75核酸分子的一部分杂交,所述部分包括对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:3的位置5,557,根据SEQ ID NO:12的位置556,根据SEQ ID NO:17的位置457,根据SEQ ID NO:22的位置378,根据SEQ ID NO:27的位置617,根据SEQ ID NO:36的位置556,根据SEQ ID NO:41的位置457,根据SEQ ID NO:46的位置378,或根据SEQ ID NO:51的位置617。
在一些实施方案中,所述分离的核酸分子与GPR75核酸分子的一部分杂交,所述部分包括对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:4的位置5,911,根据SEQ ID NO:13的位置910,根据SEQ ID NO:18的位置811,根据SEQ ID NO:23的位置732,根据SEQ ID NO:28的位置971,根据SEQ ID NO:37的位置910,根据SEQ ID NO:42的位置811,根据SEQ ID NO:47的位置732,或根据SEQ ID NO:52的位置971。
在一些实施方案中,所述分离的核酸分子与GPR75核酸分子的一部分杂交,所述部分包括对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:5的位置5,920-5,923,根据SEQ ID NO:14的位置919-922,根据SEQ ID NO:19的位置820-823,根据SEQ ID NO:24的位置741-744,根据SEQ ID NO:29的位置980-983,根据SEQ ID NO:38的位置919-922,根据SEQ ID NO:43的位置820-823,根据SEQ ID NO:48的位置741-744,或根据SEQ ID NO:53的位置980-983。
在一些实施方案中,所述分离的核酸分子与GPR75核酸分子的一部分杂交,所述部分包括对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:6的位置6,411,根据SEQ ID NO:15的位置1,410,根据SEQ IDNO:20的位置1,311,根据SEQ ID NO:25的位置1,232,根据SEQ ID NO:30的位置1,471,根据SEQ ID NO:39的位置1,410,根据SEQ ID NO:44的位置1,311,根据SEQID NO:49的位置1,232,或根据SEQ ID NO:54的位置1,471。
在一些实施方案中,所述分离的核酸分子与GPR75核酸分子的一部分杂交,所述部分包括对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:99的位置5,831,根据SEQ ID NO:100的位置830,根据SEQ ID NO:101的位置731,根据SEQ ID NO:102的位置652,根据SEQ ID NO:103的位置891,根据SEQ ID NO:104的位置830,根据SEQ ID NO:105的位置731,根据SEQ IDNO:106的位置652,或根据SEQ ID NO:107的位置891。
在一些实施方案中,此类分离的核酸分子包含至少约5个、至少约8个、至少约10个、至少约11个、至少约12个、至少约13个、至少约14个、至少约15个、至少约16个、至少约17个、至少约18个、至少约19个、至少约20个、至少约21个、至少约22个、至少约23个、至少约24个、至少约25个、至少约30个、至少约35个、至少约40个、至少约45个、至少约50个、至少约55个、至少约60个、至少约65个、至少约70个、至少约75个、至少约80个、至少约85个、至少约90个、至少约95个、至少约100个、至少约200个、至少约300个、至少约400个、至少约500个、至少约600个、至少约700个、至少约800个、至少约900个、至少约1000个、至少约2000个、至少约3000个、至少约4000个或至少约5000个核苷酸或者由其组成。在一些实施方案中,此类分离的核酸分子包含至少约5个、至少约8个、至少约10个、至少约11个、至少约12个、至少约13个、至少约14个、至少约15个、至少约16个、至少约17个、至少约18个、至少约19个、至少约20个、至少约21个、至少约22个、至少约23个、至少约24个或至少约25个核苷酸或者由其组成。在一些实施方案中,分离的核酸分子包含至少约18个核苷酸或者由其组成。在一些实施方案中,分离的核酸分子包含至少约15个核苷酸或者由其组成。在一些实施方案中,分离的核酸分子包含约10个至约35个、约10个至约30个、约10个至约25个、约12个至约30个、约12个至约28个、约12个至约24个、约15个至约30个、约15个至约25个、约18个至约30个、约18个至约25个、约18个至约24个,或约18个至约22个核苷酸或者由其组成。在一些实施方案中,分离的核酸分子包含约18个至约30个核苷酸或者由其组成。在一些实施方案中,分离的核酸分子包含至少约15个核苷酸到至少约35个核苷酸或者由其组成。
在一些实施方案中,此类分离的核酸分子在严格条件下与GPR75变体核酸分子(诸如基因组核酸分子、mRNA分子和/或cDNA分子)杂交。此类核酸分子可用作,例如如本文所述或例示的探针、引物、改变特异性探针或改变特异性引物,并且包括但不限于引物、探针、反义RNA、shRNA和siRNA,其中每一个都在本文其他各处被更详细地描述,并且可在本文所述的任何方法中使用。
在一些实施方案中,分离的核酸分子与核酸分子的至少约15个连续核苷酸杂交,所述核酸分子与GPR75变体基因组核酸分子、GPR75变体mRNA分子和/或GPR75变体cDNA分子至少约70%、至少约75%、至少约80%、至少约85%、至少约90%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%、至少约99%或100%相同。在一些实施方案中,分离的核酸分子包含约15个至约100个核苷酸或约15个至约35个核苷酸或者由其组成。在一些实施方案中,分离的核酸分子包含约15个至约100个核苷酸或者由其组成。在一些实施方案中,分离的核酸分子由约15至约35个核苷酸组成或包含约15至约35个核苷酸。
在一些实施方案中,分离的改变特异性探针或改变特异性引物包含至少约15个核苷酸,其中所述改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码人GPR75多肽的核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,其中所述部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置5,540-5,546;根据SEQ ID NO:11或其互补序列的位置539-545;根据SEQ ID NO:16或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:21或其互补序列的位置361-367;根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置600-606;根据SEQ ID NO:35或其互补序列的位置539-545;根据SEQ ID NO:40或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:45或其互补序列的位置361-367;或根据SEQ ID NO:50或其互补序列的位置600-606。
在一些实施方案中,分离的改变特异性探针或改变特异性引物包含至少约15个核苷酸,其中所述改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码人GPR75多肽的核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,其中所述部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557;根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556;根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457;根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378;根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617;根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556;根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457;根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378;或根据SEQ IDNO:51或其互补序列的位置617。在一些实施方案中,所述改变特异性探针或改变特异性引物包含与核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,所述部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557-5,559;根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556-558;根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457-459;根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378-380;根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617-619;根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556-558;根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457-459;根据SEQID NO:46或其互补序列的位置378-380;或根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617-619。
在一些实施方案中,分离的改变特异性探针或改变特异性引物包含至少约15个核苷酸,其中所述改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码人GPR75多肽的核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,其中所述部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911;根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910;根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811;根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732;根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971;根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910;根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811;根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732;或根据SEQ IDNO:52或其互补序列的位置971。在一些实施方案中,所述改变特异性探针或改变特异性引物包含与核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,所述部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911-5,913;根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910-912;根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811-813;根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732-734;根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971-973;根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910-912;根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811-813;根据SEQID NO:47或其互补序列的位置732-734;或根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971-973。
在一些实施方案中,分离的改变特异性探针或改变特异性引物包含至少约15个核苷酸,其中所述改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码人GPR75多肽的核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,其中所述部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:5或其互补序列的位置5,920-5,923;根据SEQ ID NO:14或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:19或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置741-744;根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置980-983;根据SEQ ID NO:38或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:43或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:48或其互补序列的位置741-744;或根据SEQ ID NO:53或其互补序列的位置980-983。
在一些实施方案中,分离的改变特异性探针或改变特异性引物包含至少约15个核苷酸,其中所述改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码人GPR75多肽的核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,其中所述部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411;根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410;根据SEQ IDNO:20或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232;根据SEQID NO:30或其互补序列的位置1,471;根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410;根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232;或根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471。
在一些实施方案中,分离的改变特异性探针或改变特异性引物包含至少约15个核苷酸,其中所述改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码人GPR75多肽的核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,其中所述部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831;根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830;根据SEQ IDNO:101或其互补序列的位置731;根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652;根据SEQ IDNO:103或其互补序列的位置891;根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830;根据SEQ IDNO:105或其互补序列的位置731;根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652;或根据SEQID NO:107或其互补序列的位置891。
在一些实施方案中,所述改变特异性探针和改变特异性引物包含DNA。在一些实施方案中,所述改变特异性探针或改变特异性引物包含RNA。
在一些实施方案中,本文所述的探针和引物(包括改变特异性探针和改变特异性引物)具有与本文所公开的核酸分子中的任一种或其互补序列特异性杂交的核苷酸序列。在一些实施方案中,所述探针或引物在严格条件下与本文所公开的核酸分子中的任一种特异性地杂交。
在一些实施方案中,引物,包括改变特异性引物,可用于第二代测序或高通量测序中。在一些情况下,可修饰引物,包括改变特异性引物。具体地说,引物可包含在例如大规模平行签名测序(MPSS)、聚合酶克隆测序(Polony sequencing)和454焦磷酸测序的不同步骤中使用的各种修饰。可在所述过程的几个步骤中使用修饰的引物,包括在克隆步骤中使用生物素酰化的引物,以及在珠粒装载步骤和检测步骤中使用荧光标记的引物。通常使用双端测序标签文库进行聚合酶克隆测序,其中每个DNA模板分子的长度为约135bp。在珠粒装载步骤和乳液PCR(emulsion PCR)中使用生物素酰化的引物。在检测步骤中使用荧光标记的简并九聚体寡核苷酸。衔接子可含有用于将DNA文库固定到链酶亲和素包被的珠粒上的5'-生物素标签。
本文所述的探针和引物可用于检测本文公开的GPR75变体基因组核酸分子、GPR75变体mRNA分子和/或GPR75变体cDNA分子中的任一种内的核苷酸变异。本文所述的引物可用于扩增GPR75变体基因组核酸分子、GPR75变体mRNA分子或GPR75变体cDNA分子或其片段。
在本公开的上下文中,“特异性杂交”意指探针或引物(诸如例如,改变特异性探针或改变特异性引物)不与编码GPR75参考基因组核酸分子、GPR75参考mRNA分子和/或GPR75参考cDNA分子的核酸序列杂交。
在一些实施方案中,探针(诸如例如,改变特异性探针)包含标记。在一些实施方案中,所述标记是荧光标记、放射性标记或生物素。
本公开还提供了包含本文所公开的探针中的任一种或多种所附接的基质的支持物。固体支持物是分子(诸如本文所公开的探针中的任一种)可与之缔合的固态基质或支持物。固体支持物的一种形式是阵列。固体支持物的另一种形式是阵列检测器。阵列检测器是多种不同的探针以阵列、网格或其他组织化模式与其偶联的固体支持物。固态基质的一种形式是微量滴定皿,诸如标准96孔类型。在一些实施方案中,可采用通常每孔含有一个阵列的多孔玻璃载片。
本公开还提供了分子复合物,其包含以下或由以下组成:本文所述的G蛋白偶联受体75核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)中的任一种或其互补序列及本文所述的改变特异性引物或改变特异性探针中的任一种。在一些实施方案中,分子复合物中的GPR75核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)或其互补序列是单链的。在一些实施方案中,GPR75核酸分子是本文所述的基因组核酸分子中的任一种。在一些实施方案中,GPR75核酸分子是本文所述的mRNA分子中的任一种。在一些实施方案中,GPR75核酸分子是本文所述的cDNA分子中的任一种。在一些实施方案中,分子复合物包含以下或由以下组成:本文所述的GPR75核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)中的任一种或其互补序列及本文所述的改变特异性引物中的任一种。在一些实施方案中,分子复合物包含以下或由以下组成:本文所述的GPR75核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)中的任一种或其互补序列及本文所述的改变特异性探针中的任一种。
在一些实施方案中,分子复合物包含以下或由以下组成:与包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子杂交的改变特异性引物或改变特异性探针,其中所述改变特异性引物或所述改变特异性探针在以下位置处与所述基因组核酸分子杂交:在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置5,539-5,540的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ IDNO:3或其互补序列的位置5,557的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置的胸腺嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:5或其互补序列的位置5,919-5,920的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置的胸腺嘧啶处;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置的鸟嘌呤处。
在一些实施方案中,分子复合物包含改变特异性引物或改变特异性探针或由改变特异性引物或改变特异性探针组成,所述改变特异性引物或改变特异性探针在以下密码子处与基因组核酸分子杂交:在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557-5,559的位置的ACT密码子,在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911-5,913的位置的TAA密码子,或在对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,830-5,832的位置的TGT密码子。
在一些实施方案中,分子复合物包含改变特异性引物或改变特异性探针或由改变特异性引物或改变特异性探针组成,所述改变特异性引物或改变特异性探针与包含SEQ IDNO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6或SEQ ID NO:99的基因组核酸分子杂交。
在一些实施方案中,分子复合物包含以下或由以下组成:与包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子杂交的改变特异性引物或改变特异性探针,其中所述改变特异性引物或所述改变特异性探针在以下位置处与所述mRNA分子杂交:在对应于根据SEQ ID NO:11或其互补序列的位置538-539的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:16或其互补序列的位置439-440的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:21或其互补序列的位置360-361的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置599-600的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQID NO:22或其互补序列的位置378的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:14或其互补序列的位置918-919的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:19或其互补序列的位置819-820的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置740-741的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置979-980的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQID NO:25、其互补序列的位置1,232的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤处;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤处。
在一些实施方案中,分子复合物包含改变特异性引物或改变特异性探针或由改变特异性引物或改变特异性探针组成,所述改变特异性引物或改变特异性探针在以下密码子处与mRNA分子杂交:在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556-558的位置的ACU密码子,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457-459的位置的ACU密码子,在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378-380的位置的ACU密码子,在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617-619的位置的ACU密码子;在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910-912的位置的UAA密码子,在对应于根据SEQID NO:18的位置811-813的位置的UAA密码子,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732-734的位置的UAA密码子,在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971-973的位置的UAA密码子,在对应于根据SEQ ID NO:100的位置829-831的位置的UGU密码子,在对应于根据SEQ ID NO:101的位置730-732的位置的UGU密码子,在对应于根据SEQ ID NO:102的位置651-653的位置的UGU密码子,或在对应于根据SEQ ID NO:103的位置890-892的位置的UGU密码子。
在一些实施方案中,分子复合物包含改变特异性引物或改变特异性探针或由改变特异性引物或改变特异性探针组成,所述改变特异性引物或改变特异性探针与包含以下的mRNA分子杂交:SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ IDNO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ IDNO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:101、SEQID NO:102或SEQ ID NO:103。
在一些实施方案中,分子复合物包含以下或由以下组成:与包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子杂交的改变特异性引物或改变特异性探针,其中所述改变特异性引物或所述改变特异性探针在以下位置处与cDNA分子杂交:在对应于根据SEQ ID NO:35或其互补序列的位置538-539的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:40或其互补序列的位置439-440的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:45或其互补序列的位置360-361的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:50或其互补序列的位置599-600的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQ IDNO:46或其互补序列的位置378的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置的胸腺嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置的胸腺嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置的胸腺嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置的胸腺嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:38或其互补序列的位置918-919的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:43或其互补序列的位置819-820的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:48或其互补序列的位置740-741的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:53或其互补序列的位置979-980的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置的胸腺嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置的胸腺嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置的胸腺嘧啶处;在对应于根据SEQ IDNO:54或其互补序列的位置1,471的位置的胸腺嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤处;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤处。
在一些实施方案中,分子复合物包含改变特异性引物或改变特异性探针或由改变特异性引物或改变特异性探针组成,所述改变特异性引物或改变特异性探针在以下密码子处与cDNA分子杂交:在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556-558的位置的ACT密码子,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457-459的位置的ACT密码子,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378-380的位置的ACT密码子,在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617-619的位置的ACT密码子;在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910-912的位置的TAA密码子,在对应于根据SEQID NO:42的位置811-813的位置的TAA密码子,在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732-734的位置的TAA密码子,在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971-973的位置的TAA密码子,在对应于根据SEQ ID NO:104的位置829-831的位置的TGT密码子,在对应于根据SEQ ID NO:105的位置730-732的位置的TGT密码子,在对应于根据SEQ ID NO:106的位置651-653的位置的TGT密码子,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置890-892的位置的TGT密码子。
在一些实施方案中,分子复合物包含改变特异性引物或改变特异性探针或由改变特异性引物或改变特异性探针组成,所述改变特异性引物或改变特异性探针与包含以下的cDNA分子杂交:SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ IDNO:45、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:47、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:50、SEQ IDNO:51、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:53或SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:105、SEQID NO:106或SEQ ID NO:107。
在一些实施方案中,分子复合物包含含有标记的改变特异性探针或改变特异性引物。在一些实施方案中,所述标记是荧光标记、放射性标记或生物素。在一些实施方案中,分子复合物还包含非人聚合酶。
本公开还提供了包含编码人GPR75变体多肽的核苷酸序列的分离的核酸分子。在一些实施方案中,GPR75变体多肽包含从对应于根据SEQ ID NO:56或其互补序列的位置110的位置开始的移码。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:56具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且包含从对应于根据SEQ ID NO:56的位置110的位置开始的移码的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:56具有至少约90%序列同一性,并且包含从对应于根据SEQID NO:56的位置110的位置开始的移码的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:56具有至少约92%序列同一性,并且包含从对应于根据SEQ ID NO:56的位置110的位置开始的移码的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:56具有至少约94%序列同一性,并且包含从对应于根据SEQ ID NO:56的位置110的位置开始的移码的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:56具有至少约96%序列同一性,并且包含从对应于根据SEQ ID NO:56的位置110的位置开始的移码的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:56具有至少约98%序列同一性,并且包含从对应于根据SEQ ID NO:56的位置110的位置开始的移码的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,所述核酸分子编码包含SEQ ID NO:56的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,所述核酸分子编码由SEQ ID NO:56组成的GPR75变体多肽。这些核酸分子中的每一个编码在对应于根据SEQ ID NO:55的位置110-540的位置处缺少氨基酸的GPR75多肽。在一些实施方案中,这些核酸分子中的每一个编码在对应于根据SEQ ID NO:56的位置110-130的位置处包含氨基酸的GPR75多肽。
在一些实施方案中,GPR75变体多肽在对应于根据SEQ ID NO:57或其互补序列的位置116的位置处包含苏氨酸。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:57具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:57的位置116的位置处包含苏氨酸的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:57具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:57的位置116的位置处包含苏氨酸的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:57具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:57的位置116的位置处包含苏氨酸的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:57具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:57的位置116的位置处包含苏氨酸的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:57具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:57的位置116的位置处包含苏氨酸的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:57具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:57的位置116的位置处包含苏氨酸的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,所述核酸分子编码包含SEQ ID NO:57的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,所述核酸分子编码由SEQ ID NO:57组成的GPR75变体多肽。
在一些实施方案中,GPR75变体多肽终止于对应于根据SEQ ID NO:58或其互补序列的位置233的位置。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:58具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且终止于对应于根据SEQ ID NO:58的位置233的位置的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:58具有至少约90%序列同一性,并且终止于对应于根据SEQ ID NO:58的位置233的位置的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:58具有至少约92%序列同一性,并且终止于对应于根据SEQ ID NO:58的位置233的位置的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:58具有至少约94%序列同一性,并且终止于对应于根据SEQ ID NO:58的位置233的位置的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:58具有至少约96%序列同一性,并且终止于对应于根据SEQ ID NO:58的位置233的位置的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:58具有至少约98%序列同一性,并且终止于对应于根据SEQ ID NO:58的位置233的位置的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,所述核酸分子编码包含SEQ ID NO:58的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,所述核酸分子编码由SEQ ID NO:58组成的GPR75变体多肽。
在一些实施方案中,GPR75变体多肽包含从对应于根据SEQ IDNO:59或其互补序列的位置236的位置开始的移码。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:59具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且包含从对应于根据SEQ IDNO:59的位置236的位置开始的移码的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:59具有至少约90%序列同一性,并且包含从对应于根据SEQ ID NO:59的位置236的位置开始的移码的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:59具有至少约92%序列同一性,并且包含从对应于根据SEQ ID NO:59的位置236的位置开始的移码的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:59具有至少约94%序列同一性,并且包含从对应于根据SEQ ID NO:59的位置236的位置开始的移码的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:59具有至少约96%序列同一性,并且包含从对应于根据SEQ ID NO:59的位置236的位置开始的移码的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:59具有至少约98%序列同一性,并且包含从对应于根据SEQ ID NO:59的位置236的位置开始的移码的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,所述核酸分子编码包含SEQ IDNO:59的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,所述核酸分子编码由SEQ ID NO:59组成的GPR75变体多肽。这些核酸分子中的每一个编码在对应于根据SEQ ID NO:55的位置236-540的位置处缺少氨基酸的GPR75多肽。在一些实施方案中,这些核酸分子中的每一个编码在对应于根据SEQ ID NO:59的位置236-239的位置处包含氨基酸的GPR75多肽。
在一些实施方案中,GPR75变体多肽包含从对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置400的位置开始的移码。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ IDNO:60具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且包含从对应于根据SEQID NO:60的位置400的位置开始的移码的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:60具有至少约90%序列同一性,并且包含从对应于根据SEQ ID NO:60的位置400的位置开始的移码的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:60具有至少约92%序列同一性,并且包含从对应于根据SEQ ID NO:60的位置400的位置开始的移码的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:60具有至少约94%序列同一性,并且包含从对应于根据SEQ ID NO:60的位置400的位置开始的移码的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:60具有至少约96%序列同一性,并且包含从对应于根据SEQ ID NO:60的位置400的位置开始的移码的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ IDNO:60具有至少约98%序列同一性,并且包含从对应于根据SEQ ID NO:60的位置400的位置开始的移码的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,所述核酸分子编码包含SEQ ID NO:60的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,所述核酸分子编码由SEQ ID NO:60组成的GPR75变体多肽。这些核酸分子中的每一个编码在对应于根据SEQ ID NO:55的位置400-540的位置处缺少氨基酸的GPR75多肽。在一些实施方案中,这些核酸分子中的每一个编码在对应于根据SEQ ID NO:60的位置400-425的位置处包含氨基酸的GPR75多肽。
在一些实施方案中,GPR75变体多肽在对应于根据SEQ ID NO:108或其互补序列的位置207的位置处包含半胱氨酸。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ IDNO:108具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ IDNO:108的位置207的位置处包含半胱氨酸的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:108具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:108的位置207的位置处包含半胱氨酸的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:108具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:108的位置207的位置处包含半胱氨酸的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:108具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:108的位置207的位置处包含半胱氨酸的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQ ID NO:108具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:108的位置207的位置处包含半胱氨酸的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,分离的核酸分子编码具有与SEQID NO:108具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:108的位置207的位置处包含半胱氨酸的氨基酸序列的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,所述核酸分子编码包含SEQ ID NO:108的GPR75变体多肽。在一些实施方案中,所述核酸分子编码由SEQ IDNO:108组成的GPR75变体多肽。
GPR75参考基因组核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。也参见ENSG00000119737.6,hg38 chr2:53,852,912-53,859,967。参考SEQ ID NO:1,位置5,540-5,546是CCAGTAG七核苷酸。参考SEQ ID NO:1,位置5,557是鸟嘌呤。参考SEQ ID NO:1,位置5,911是胞嘧啶。参考SEQ ID NO:1,位置5,920-5,923是AAAG四核苷酸。参考SEQ ID NO:1,位置6,411是胞嘧啶。参考SEQ ID NO:1,位置5,831是腺嘌呤。
存在GPR75的一种变体基因组核酸分子,其中在位置5,540-5,546(参考SEQ IDNO:1)的CCAGTAG七核苷酸缺失。这种GPR75参考基因组核酸分子的核苷酸序列如SEQ IDNO:2所示。
存在GPR75的另一种变体基因组核酸分子,其中在位置5,557(参考SEQ ID NO:1)的鸟嘌呤被腺嘌呤置换。这种GPR75参考基因组核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示。
存在GPR75的另一种变体基因组核酸分子,其中在位置5,911(参考SEQ ID NO:1)的胞嘧啶被胸腺嘧啶置换。这种GPR75参考基因组核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示。
存在GPR75的另一种变体基因组核酸分子,其中在位置5,920-5,923(参考SEQ IDNO:1)的AAAG四核苷酸缺失。这种GPR75参考基因组核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示。
存在GPR75的另一种变体基因组核酸分子,在位置6,411(参考SEQ ID NO:1)插入胸腺嘧啶。这种GPR75参考基因组核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示。
存在GPR75的另一种变体基因组核酸分子,其中在位置5,831(参考SEQ ID NO:1)的腺嘌呤被鸟嘌呤置换。这种GPR75参考基因组核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:99所示。
存在GPR75的另一种变体基因组核酸分子,其中2号染色体上位置53,853,547处(根据GRCh38/hg38(2013年12月)人类基因组组装)的胸腺嘧啶被腺嘌呤置换,得到Lys404*。参考SEQ ID NO:1,变异是AAG变为TAG(在编码链上的位置6,421-6,423的密码子处)。关于本文所述的任何变体的本文所述的每种方法也可以用这种另外的变体(即基因组分子、mRNA分子和cDNA分子)进行。
存在GPR75的另一种变体基因组核酸分子,其中从2号染色体上位置53,854,099(根据GRCh38/hg38(2013年12月)人类基因组组装)开始的CAG被胞嘧啶置换,得到Ser219fs。参考SEQ ID NO:1,变异是GTC(在编码链上的位置5,869-5,871处)变为G。关于本文所述的任何变体的本文所述的每种方法也可以用这种另外的变体(即基因组分子、mRNA分子和cDNA分子)进行。
存在GPR75的另一种变体基因组核酸分子,其中在2号染色体上的位置53,859,827处(根据GRCh38/hg38(2013年12月)人类基因组组装)的胞嘧啶被胸腺嘧啶置换(cDNA命名为c.-110+1G>A),其是起始密码子上游110个碱基处的剪接供体位点变异。参考SEQ ID NO:1,变异是G(在编码链上的位置141处)变为A。关于本文所述的任何变体的本文所述的每种方法也可以用这种另外的变体(即基因组分子、mRNA分子和cDNA分子)进行。
本公开还提供了包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成的分离的基因组核酸分子。在一些实施方案中,所述基因组核酸分子的核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。一个示例如SEQ ID NO:2所示。
在一些实施方案中,所述基因组核酸分子的核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸。一个示例如SEQ ID NO:5所示。
在一些实施方案中,所述基因组核酸分子的核苷酸序列包含在对应于根据SEQ IDNO:1或其互补序列的位置6,411的位置的胸腺嘧啶的插入。一个示例如SEQ ID NO:6所示。
在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:2具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:2具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:2具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:2具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:2具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:2具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。
在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:5具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:5具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:5具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:5具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:5具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:5具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸。
在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:6具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:6具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:6具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:6具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:6具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:6具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:99具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ IDNO:99具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:99具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:99具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:99具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:99具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤。
在本文中,如果对序列同一性百分比进行参考,则较高的序列同一性百分比相对于较低的序列同一性百分比是优选的。
在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含SEQ ID NO:2。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子由SEQ ID NO:2组成。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含SEQ ID NO:3。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子由SEQ ID NO:3组成。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含SEQ ID NO:4。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子由SEQ ID NO:4组成。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含SEQ IDNO:5。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子由SEQ ID NO:5组成。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含SEQ ID NO:6。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子由SEQ ID NO:6组成。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含SEQ ID NO:99。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子由SEQ ID NO:99组成。
在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含少于完整的基因组DNA序列。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含本文公开的任何GPR75基因组核酸分子的至少约15个、至少约20个、至少约25个、至少约30个、至少约35个、至少约40个、至少约45个、至少约50个、至少约60个、至少约70个、至少约80个、至少约90个、至少约100个、至少约200个、至少约300个、至少约400个、至少约500个、至少约600个、至少约700个、至少约800个、至少约900个、至少约1000个、至少约2000个、至少约3000个、至少约4000个、至少约5000个、至少约6000个、至少约7000个、至少约8000个、至少约9000个或至少约10000个连续核苷酸或由其组成。在一些实施方案中,分离的基因组核酸分子包含本文公开的任何GPR75基因组核酸分子的至少约1000个至至少约2000个连续核苷酸或由其组成。在一些实施方案中,这些分离的基因组核酸分子在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,这些分离的基因组核酸分子在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,这些分离的基因组核酸分子在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
GPR75参考mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:7所示。参考SEQ ID NO:7,位置539-545是CCAGUAG七核苷酸。参考SEQ ID NO:7,位置566是鸟嘌呤。参考SEQ ID NO:7,位置910是胞嘧啶。参考SEQ ID NO:7,位置919-922是AAAG四核苷酸。参考SEQ ID NO:7,位置1,410是胞嘧啶。参考SEQ ID NO:7,位置830是腺嘌呤。
另一种GPR75参考mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:8所示。参考SEQ ID NO:8,位置440-446是CCAGUAG七核苷酸。参考SEQ ID NO:8,位置457是鸟嘌呤。参考SEQ ID NO:8,位置811是胞嘧啶。参考SEQ ID NO:8,位置820-823是AAAG四核苷酸。参考SEQ ID NO:8,位置1,311是胞嘧啶。参考SEQ ID NO:8,位置731是腺嘌呤。
另一种GPR75参考mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:9所示。参考SEQ ID NO:9,位置361-367是CCAGUAG七核苷酸。参考SEQ ID NO:9,位置378是鸟嘌呤。参考SEQ ID NO:9,位置732是胞嘧啶。参考SEQ ID NO:9,位置741-744是AAAG四核苷酸。参考SEQ ID NO:9,位置1,232是胞嘧啶。参考SEQ ID NO:9,位置652是腺嘌呤。
另一种GPR75参考mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:10所示。参考SEQ ID NO:10,位置600-606是CCAGUAG七核苷酸。参考SEQ ID NO:10,位置617是鸟嘌呤。参考SEQ IDNO:10,位置971是胞嘧啶。参考SEQ ID NO:10,位置980-983是AAAG四核苷酸。参考SEQ IDNO:10,位置1,471是胞嘧啶。参考SEQ ID NO:10,位置891是腺嘌呤。
存在GPR75的一种变体mRNA分子,其中在位置539-545(参考SEQ ID NO:7)的CCAGUAG七核苷酸缺失。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:11所示。
存在GPR75的另一种变体mRNA分子,其中在位置440-446(参考SEQ ID NO:8)的CCAGUAG七核苷酸缺失。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:16所示。
存在GPR75的另一种变体mRNA分子,其中在位置361-367(参考SEQ ID NO:9)的CCAGUAG七核苷酸缺失。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:21所示。
存在GPR75的另一种变体mRNA分子,其中在位置600-606(参考SEQ ID NO:10)的CCAGUAG七核苷酸缺失。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:26所示。
存在GPR75的一种变体mRNA分子,其中在位置556(参考SEQ ID NO:7)的鸟嘌呤被腺嘌呤置换。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:12所示。
存在GPR75的另一种变体mRNA分子,其中在位置457(参考SEQ ID NO:8)的鸟嘌呤被腺嘌呤置换。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:17所示。
存在GPR75的另一种变体mRNA分子,其中在位置378(参考SEQ ID NO:9)的鸟嘌呤被腺嘌呤置换。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:22所示。
存在GPR75的另一种变体mRNA分子,其中在位置617(参考SEQ ID NO:10)的鸟嘌呤被腺嘌呤置换。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:27所示。
存在GPR75的一种变体mRNA分子,其中在位置910(参考SEQ ID NO:7)的胞嘧啶被尿嘧啶置换。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:13所示。
存在GPR75的另一种变体mRNA分子,其中在位置811(参考SEQ ID NO:8)的胞嘧啶被尿嘧啶置换。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:18所示。
存在GPR75的另一种变体mRNA分子,其中在位置732(参考SEQ ID NO:9)的胞嘧啶被尿嘧啶置换。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:23所示。
存在GPR75的另一种变体mRNA分子,其中在位置971(参考SEQ ID NO:10)的胞嘧啶被尿嘧啶置换。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:28所示。
存在GPR75的一种变体mRNA分子,其中在位置919-922(参考SEQ ID NO:7)的AAAG四核苷酸缺失。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:14所示。
存在GPR75的另一种变体mRNA分子,其中在位置820-823(参考SEQ ID NO:8)AAAG四核苷酸缺失。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:19所示。
存在GPR75的另一种变体mRNA分子,其中在位置741-744(参考SEQ ID NO:9)AAAG四核苷酸缺失。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:24所示。
存在GPR75的另一种变体mRNA分子,其中在位置980-983(参考SEQ ID NO:10)的AAAG四核苷酸缺失。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:29所示。
存在GPR75的变体mRNA分子,其中在位置1,410(参考SEQ ID NO:7)插入尿嘧啶。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:15所示。
存在GPR75的另一种变体mRNA分子,其中在位置1,311(参考SEQ ID NO:8)插入尿嘧啶。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:20所示。
存在GPR75的另一种变体mRNA分子,其中在位置1,232(参考SEQ ID NO:9)插入尿嘧啶。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:25所示。
存在GPR75的另一种变体mRNA分子,其中在位置1,471(参考SEQ ID NO:10)插入尿嘧啶。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:30所示。
存在GPR75的一种变体mRNA分子,其中在位置830(参考SEQ ID NO:7)的腺嘌呤被鸟嘌呤置换。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:100所示。
存在GPR75的另一种变体mRNA分子,其中在位置731(参考SEQ ID NO:8)的腺嘌呤被鸟嘌呤置换。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:101所示。
存在GPR75的另一种变体mRNA分子,其中在位置652(参考SEQ ID NO:9)的腺嘌呤被鸟嘌呤置换。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:102所示。
存在GPR75的另一种变体mRNA分子,其中在位置891(参考SEQ ID NO:10)的腺嘌呤被鸟嘌呤置换。这种GPR75变体mRNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:103所示。
本公开还提供了分离的mRNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。一个示例如SEQ ID NO:11所示。
本公开还提供了分离的mRNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。一个示例如SEQ ID NO:16所示。
本公开还提供了分离的mRNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。一个示例如SEQ ID NO:21所示。
本公开还提供了分离的mRNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。一个示例如SEQ ID NO:26所示。
本公开还提供了分离的mRNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少的AAAG四核苷酸。一个示例如SEQ ID NO:14所示。
本公开还提供了分离的mRNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸。一个示例如SEQ ID NO:19所示。
本公开还提供了分离的mRNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸。一个示例如SEQ ID NO:24所示。
本公开还提供了分离的mRNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸。一个示例如SEQ ID NO:29所示。
本公开还提供了分离的mRNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入。
本公开还提供了分离的mRNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入。
本公开还提供了分离的mRNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入。
本公开还提供了分离的mRNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入。
在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:11具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ IDNO:11具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:11具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:11具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:11具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:11具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。
在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:16具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ IDNO:16具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:16具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:16具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:16具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:16具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。
在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:21具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ IDNO:21具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:21具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:21具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:21具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:21具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。
在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:26具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ IDNO:26具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:26具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:26具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:26具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:26具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸。
在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:14具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:14具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:14具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:14具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:14具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:14具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸。
在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:19具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:19具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:19具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQIDNO:8或其互补序列的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:19具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:19具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:19具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸。
在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:24具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:24具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:24具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:24具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:24具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:24具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸。
在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:29具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:29具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:29具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:29具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:29具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:29具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸。
在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:15具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:15具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:15具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:15具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:15具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ IDNO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:15具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入。
在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:20具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:20具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ IDNO:20具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:20具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:20具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ IDNO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:20具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入。
在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:25具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:25具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:25具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:25具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:25具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ IDNO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:25具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入。
在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:30具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:30具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:30具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:30具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:30具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ IDNO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:30具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入。
在本文中,如果对序列同一性百分比进行参考,则较高的序列同一性百分比相对于较低的序列同一性百分比是优选的。
在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含SEQ ID NO:11。在一些实施方案中,分离的mRNA分子由SEQ ID NO:11组成。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含SEQ ID NO:16。在一些实施方案中,分离的mRNA分子由SEQ ID NO:16组成。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含SEQ ID NO:21。在一些实施方案中,分离的mRNA分子由SEQ ID NO:21组成。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含SEQ ID NO:26。在一些实施方案中,分离的mRNA分子由SEQ ID NO:26组成。
在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含SEQ ID NO:14。在一些实施方案中,分离的mRNA分子由SEQ ID NO:14组成。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含SEQ ID NO:19。在一些实施方案中,分离的mRNA分子由SEQ ID NO:19组成。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含SEQ ID NO:24。在一些实施方案中,分离的mRNA分子由SEQ ID NO:24组成。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含SEQ ID NO:29。在一些实施方案中,分离的mRNA分子由SEQ ID NO:29组成。
在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含SEQ ID NO:15。在一些实施方案中,分离的mRNA分子由SEQ ID NO:15组成。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含SEQ ID NO:20。在一些实施方案中,分离的mRNA分子由SEQ ID NO:20组成。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含SEQ ID NO:25。在一些实施方案中,分离的mRNA分子由SEQ ID NO:25组成。在一些实施方案中,分离的mRNA分子包含SEQ ID NO:30。在一些实施方案中,分离的mRNA分子由SEQ ID NO:30组成。
GPR75参考cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:31所示。参考SEQ ID NO:31,位置539-545是CCAGTAG七核苷酸。参考SEQ ID NO:31,位置556是鸟嘌呤。参考SEQ ID NO:31,位置910是胞嘧啶。参考SEQ ID NO:31,位置919-922是AAAG四核苷酸。参考SEQ ID NO:31,位置1,410是胞嘧啶。参考SEQ ID NO:31,位置830是腺嘌呤。
另一种GPR75参考cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:32所示。参考SEQ ID NO:32,位置440-446是CCAGTAG七核苷酸。参考SEQ ID NO:32,位置457是鸟嘌呤。参考SEQ IDNO:32,位置811是胞嘧啶。参考SEQ ID NO:32,位置820-823是AAAG四核苷酸。参考SEQ IDNO:32,位置1,311是胞嘧啶。参考SEQ ID NO:32,位置731是腺嘌呤。
另一种GPR75参考cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:33所示。参考SEQ ID NO:33,位置361-367是CCAGTAG七核苷酸。参考SEQ ID NO:33,位置378是鸟嘌呤。参考SEQ IDNO:33,位置732是胞嘧啶。参考SEQ ID NO:33,位置741-744是AAAG四核苷酸。参考SEQ IDNO:33,位置1,232是胞嘧啶。参考SEQ ID NO:33,位置652是腺嘌呤。
另一种GPR75参考cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:34所示。参考SEQ ID NO:34,位置600-606是CCAGTAG七核苷酸。参考SEQ ID NO:34,位置617是鸟嘌呤。参考SEQ IDNO:34,位置971是胞嘧啶。参考SEQ ID NO:34,位置980-983是AAAG四核苷酸。参考SEQ IDNO:34,位置1,471是胞嘧啶。参考SEQ ID NO:34,位置891是腺嘌呤。
存在GPR75的一种变体cDNA分子,其中在位置539-545(参考SEQ ID NO:31)的CCAGTAG七核苷酸缺失。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:35所示。
存在GPR75的另一种变体cDNA分子,其中在位置440-446(参考SEQ ID NO:32)的CCAGTAG七核苷酸缺失。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:40所示。
存在GPR75的另一种变体cDNA分子,其中在位置361-367(参考SEQ ID NO:33)的CCAGTAG七核苷酸缺失。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:45所示。
存在GPR75的另一种变体cDNA分子,其中在位置600-606(参考SEQ ID NO:34)的CCAGTAG七核苷酸缺失。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:50所示。
存在GPR75的一种变体cDNA分子,其中在位置556(参考SEQ ID NO:31)的鸟嘌呤被腺嘌呤置换。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:36所示。
存在GPR75的另一种变体cDNA分子,其中在位置457(参考SEQ ID NO:32)的鸟嘌呤被腺嘌呤置换。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:41所示。
存在GPR75的另一种变体cDNA分子,其中在位置378(参考SEQ ID NO:33)的鸟嘌呤被腺嘌呤置换。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:46所示。
存在GPR75的另一种变体cDNA分子,其中在位置617(参考SEQ ID NO:34)的鸟嘌呤被腺嘌呤置换。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:51所示。
存在GPR75的一种变体cDNA分子,其中在位置910(参考SEQ ID NO:31)的胞嘧啶被胸腺嘧啶置换。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:37所示。
存在GPR75的另一种变体cDNA分子,其中在位置811(参考SEQ ID NO:32)的胞嘧啶被胸腺嘧啶置换。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:42所示。
存在GPR75的另一种变体cDNA分子,其中在位置732(参考SEQ ID NO:33)的胞嘧啶被胸腺嘧啶置换。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:47所示。
存在GPR75的另一种变体cDNA分子,其中在位置971(参考SEQ ID NO:34)的胞嘧啶被胸腺嘧啶置换。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:52所示。
存在GPR75的一种变体cDNA分子,其中在位置919-922(参考SEQ ID NO:31)的AGCC四核苷酸缺失。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:38所示。
存在GPR75的另一种变体cDNA分子,其中在位置820-823(参考SEQ ID NO:32)AGCC四核苷酸缺失。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:43所示。
存在GPR75的另一种变体cDNA分子,其中在位置741-744(参考SEQ ID NO:33)AGCC四核苷酸缺失。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:48所示。
存在GPR75的另一种变体cDNA分子,其中在位置980-983(参考SEQ ID NO:34)AGCC四核苷酸缺失。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:53所示。
存在GPR75的一种变体cDNA分子,其中在位置1,410插入胸腺嘧啶。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:39所示。
存在GPR75的另一种变体cDNA分子,其中在位置1,311插入胸腺嘧啶。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:44所示。
存在GPR75的另一种变体cDNA分子,其中在位置1,232插入胸腺嘧啶。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ IDNO:49所示。
存在GPR75的另一种变体cDNA分子,其中在位置1,471插入胸腺嘧啶。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:54所示。
存在GPR75的一种变体cDNA分子,其中在位置830(参考SEQ ID NO:31)的腺嘌呤被鸟嘌呤置换。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:104所示。
存在GPR75的另一种变体cDNA分子,其中在位置731(参考SEQ ID NO:32)的腺嘌呤被鸟嘌呤置换。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:105所示。
存在GPR75的另一种变体cDNA分子,其中在位置652(参考SEQ ID NO:33)的腺嘌呤被鸟嘌呤置换。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:106所示。
存在GPR75的另一种变体cDNA分子,其中在位置891(参考SEQ ID NO:34)的腺嘌呤被鸟嘌呤置换。这种GPR75变体cDNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:107所示。
本公开还提供了分离的cDNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。一个示例如SEQ ID NO:35所示。
本公开还提供了分离的cDNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。一个示例如SE ID NO:40所示。
本公开还提供了分离的cDNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:43或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。一个示例如SE ID NO:45所示。
本公开还提供了分离的cDNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。一个示例如SE ID NO:50所示。
本公开还提供了分离的cDNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸。一个示例如SE ID NO:38所示。
本公开还提供了分离的cDNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸。一个示例如SE ID NO:43所示。
本公开还提供了分离的cDNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸。一个示例如SE ID NO:48所示。
本公开还提供了分离的cDNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸。一个示例如SE ID NO:53所示。
本公开还提供了分离的cDNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
本公开还提供了分离的cDNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
本公开还提供了分离的cDNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
本公开还提供了分离的cDNA分子,其包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列或由所述核苷酸序列组成,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:35具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ IDNO:35具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:35具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:35具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:35具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:35具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。
在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:40具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ IDNO:40具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:40具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:40具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:40具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:40具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。
在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:45具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ IDNO:45具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:45具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:45具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:45具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:45具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。
在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:50具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ IDNO:50具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:50具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:50具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:50具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQID NO:50具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。
在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:38具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:38具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:38具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:38具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:38具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:38具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置的AAAG四核苷酸。
在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:43具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:43具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:43具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:43具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:43具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:43具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置的AAAG四核苷酸。
在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:48具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:48具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:48具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:48具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:48具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:48具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置的AAAG四核苷酸。
在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:53具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:53具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:53具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:53具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:53具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:53具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置的AAAG四核苷酸。
在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:39具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:39具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:39具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:39具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:39具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:39具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:44具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:44具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:44具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:44具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:44具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:44具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:49具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:49具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:49具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:49具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:49具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:49具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:54具有至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:54具有至少约90%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:54具有至少约92%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:54具有至少约94%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:54具有至少约96%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含下述核苷酸序列或由下述核苷酸序列组成:与SEQ ID NO:54具有至少约98%序列同一性,并且在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
在本文中,如果对序列同一性百分比进行参考,则较高的序列同一性百分比相对于较低的序列同一性百分比是优选的。
在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含SEQ ID NO:35。在一些实施方案中,分离的cDNA分子由SEQ ID NO:35组成。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含SEQ ID NO:40。在一些实施方案中,分离的cDNA分子由SEQ ID NO:40组成。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含SEQ ID NO:45。在一些实施方案中,分离的cDNA分子由SEQ ID NO:45组成。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含SEQ ID NO:50。在一些实施方案中,分离的cDNA分子由SEQ ID NO:50组成。
在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含SEQ ID NO:38。在一些实施方案中,分离的cDNA分子由SEQ ID NO:38组成。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含SEQ ID NO:43。在一些实施方案中,分离的cDNA分子由SEQ ID NO:43组成。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含SEQ ID NO:48。在一些实施方案中,分离的cDNA分子由SEQ ID NO:48组成。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含SEQ ID NO:53。在一些实施方案中,分离的cDNA分子由SEQ ID NO:53组成。
在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含SEQ ID NO:39。在一些实施方案中,分离的cDNA分子由SEQ ID NO:39组成。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含SEQ ID NO:44。在一些实施方案中,分离的cDNA分子由SEQ ID NO:44组成。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含SEQ ID NO:49。在一些实施方案中,分离的cDNA分子由SEQ ID NO:49组成。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含SEQ ID NO:54。在一些实施方案中,分离的cDNA分子由SEQ ID NO:54组成。
在一些实施方案中,所述分离的mRNA分子或cDNA分子包含少于完整的mRNA或cDNA序列。在一些实施方案中,分离的mRNA分子或cDNA分子包含本文公开的任何GPR75 mRNA分子或cDNA分子的至少约5个、至少约8个、至少约10个、至少约12个、至少约15个、至少约20个、至少约25个、至少约30个、至少约35个、至少约40个、至少约45个、至少约50个、至少约60个、至少约70个、至少约80个、至少约90个、至少约100个、至少约200个、至少约300个、至少约400个、至少约500个、至少约600个、至少约700个、至少约800个、至少约900个、至少约1000个、至少约1100个、至少约1200个、至少约1300个、至少约1400个、至少约1500个、至少约1600个、至少约1700个、至少约1800个、至少约1900个或至少约2000个连续核苷酸或由其组成。在一些实施方案中,分离的mRNA分子或cDNA分子包含本文公开的任何GPR75 mRNA分子或cDNA分子的至少约400个至至少约500个连续核苷酸或由其组成。在一些实施方案中,分离的cDNA分子包含本文公开的任何GPR75 mRNA分子或cDNA分子的至少约1000个至至少约2000个连续核苷酸或由其组成。
在一些实施方案中,这些分离的mRNA分子包含在对应于根据SEQ ID NO:11的位置539-545的位置的UAUCCCG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:16的位置440-446的位置的UAUCCCG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:21的位置361-367的位置的UAUCCCG七核苷酸,或在对应于根据SEQ ID NO:26的位置600-606的位置的UAUCCCG七核苷酸。在一些实施方案中,这些分离的mRNA分子包含在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置的腺嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置的腺嘌呤。在一些实施方案中,这些分离的mRNA分子包含在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置的尿嘧啶。在一些实施方案中,这些分离的mRNA分子包含在对应于根据SEQ ID NO:14的位置919-922的位置的AGCC四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:19的位置820-823的位置的AGCC四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:24的位置741-744的位置的AGCC四核苷酸,或在对应于根据SEQ ID NO:29的位置980-983的位置的AGCC四核苷酸。在一些实施方案中,这些分离的mRNA分子包含在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置的尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置的尿嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置的尿嘧啶的插入。在一些实施方案中,这些分离的mRNA分子包含在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:102的位置652的位置的鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:103的位置891的位置的鸟嘌呤。
在一些实施方案中,这些分离的cDNA分子包含在对应于根据SEQ ID NO:35的位置539-545的位置的TATCCCG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:40的位置440-446的位置的TATCCCG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:45的位置361-367的位置的TATCCCG七核苷酸,或在对应于根据SEQ ID NO:50的位置600-606的位置的TATCCCG七核苷酸。在一些实施方案中,这些分离的cDNA分子包含在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置的腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置的腺嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置的腺嘌呤。在一些实施方案中,这些分离的cDNA分子包含在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置的胸腺嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971的位置的胸腺嘧啶。在一些实施方案中,这些分离的cDNA分子包含在对应于根据SEQ ID NO:38的位置919-922的位置的AGCC四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:43的位置820-823的位置的AGCC四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:48的位置741-744的位置的AGCC四核苷酸,或在对应于根据SEQ ID NO:53的位置980-983的位置的AGCC四核苷酸。在一些实施方案中,这些分离的cDNA分子包含在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置的胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置的胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置的胸腺嘧啶的插入。在一些实施方案中,这些分离的cDNA分子包含在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置的鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106的位置652的位置的鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置的鸟嘌呤。
基因组核酸分子、mRNA分子和cDNA分子可来自任何生物体。例如,基因组核酸分子、mRNA分子和cDNA分子可以是人的或来自另一种生物体(诸如非人哺乳动物、啮齿动物、小鼠或大鼠)的直向同源物。应理解,群体内的基因序列可因多态性(诸如单核苷酸多态性)而变化。本文提供的示例仅为示例性序列。其他序列也是可能的。
本公开还提供了本文公开的分离的基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子中的任一种的片段。在一些实施方案中,所述片段包含本文公开的任何核酸分子或其任何互补序列的至少约5个、至少约8个、至少约10个、至少约11个、至少约12个、至少约13个、至少约14个、至少约15个、至少约16个、至少约17个、至少约18个、至少约19个、至少约20个、至少约21个、至少约22个、至少约23个、至少约24个、至少约25个、至少约30个、至少约35个、至少约40个、至少约45个、至少约50个、至少约55个、至少约60个、至少约65个、至少约70个、至少约75个、至少约80个、至少约85个、至少约90个、至少约95个或至少约100个连续残基或由其组成。在一些实施方案中,所述片段包含本文公开的任何核酸分子或其任何互补序列的至少约20个、至少约25个、至少约30个或至少约35个连续残基或由其组成。就这一点而言,较长的片段相对于较短的片段是优选的。此类片段可以用作,例如如本文所述或例示的探针、引物、改变特异性探针或改变特异性引物,并且包括但不限于引物、探针、反义RNA、shRNA和siRNA,其中每一个都在其他各处被更详细地描述。
本文还提供了可与所公开的核酸分子相互作用的功能性多核苷酸。功能性多核苷酸的示例包括但不限于反义分子、适体、核酶、三链体形成分子以及外部引导序列。功能性多核苷酸可充当靶分子所具有的特定活性的效应物、抑制剂、调节剂和刺激剂,或者功能性多核苷酸可具有独立于任何其他分子的从头活性。
本文公开的分离的核酸分子可包括RNA、DNA或RNA和DNA两者。分离的核酸分子还可与异源核酸序列(诸如载体中的异源核酸序列)或异源标记连接或融合。例如,本文所公开的分离的核酸分子可在包含分离的核酸分子和异源核酸序列的载体内或作为包含分离的核酸分子和异源核酸序列的外源供体序列。分离的核酸分子还可与异源标记连接或融合。标记可以是直接可检测的(诸如例如,荧光团)或间接可检测的(诸如例如,半抗原、酶或荧光团淬灭剂)。此类标记可以通过光谱学、光化学、生物化学、免疫化学或化学手段检测。此类标记包括例如放射性标记、颜料、染料、色原、自旋标记和荧光标记。标记也可以是例如化学发光物质;含金属的物质;或酶,其中发生依赖于酶的信号次级产生。术语“标记”还可以指“标签”或半抗原,其可以选择性地结合至缀合的分子,使得随后与底物一起添加时,缀合的分子用于产生可检测的信号。例如,生物素可作为标签与辣根过氧化物酶(HRP)的抗生物素蛋白或链霉抗生物素蛋白缀合物一起使用以与标签结合,并且可使用量热底物(诸如例如四甲基联苯胺(TMB))或荧光底物检查以检测HRP的存在。可用作标签来有助于纯化的示例性标记包括但不限于myc、HA、FLAG或3XFLAG、6XHis或聚组氨酸、谷胱甘肽-S-转移酶(GST)、麦芽糖结合蛋白、表位标签或免疫球蛋白的Fc部分。许多标记包括例如颗粒,荧光团,半抗原,酶以及其量热、荧光和化学发光底物和其他标记。
所公开的核酸分子可包括例如核苷酸或非天然或修饰的核苷酸,诸如核苷酸类似物或核苷酸替代物。此类核苷酸包括含有修饰的碱基、糖或磷酸酯基团的核苷酸,或者在其结构中掺入有非天然部分的核苷酸。非天然核苷酸的示例包括但不限于双脱氧核苷酸、生物素酰化、胺化、脱胺化、烷基化、苄基化和荧光团标记的核苷酸。
本文公开的核酸分子还可包含一种或多种核苷酸类似物或取代。核苷酸类似物是含有对碱基、糖或磷酸酯部分进行修饰的核苷酸。对碱基部分的修饰包括但不限于A、C、G和T/U以及不同的嘌呤或嘧啶碱基(诸如例如假尿苷、尿嘧啶-5-基、次黄嘌呤-9-基(I)和2-氨基腺嘌呤-9-基)的天然和合成修饰。修饰的碱基包括但不限于5-甲基胞嘧啶(5-me-C)、5-羟甲基胞嘧啶、黄嘌呤、次黄嘌呤、2-氨基腺嘌呤、腺嘌呤和鸟嘌呤的6-甲基和其他烷基衍生物、腺嘌呤和鸟嘌呤的2-丙基和其他烷基衍生物、2-硫代尿嘧啶、2-硫代胸腺嘧啶和2-硫代胞嘧啶、5-卤代尿嘧啶和胞嘧啶、5-丙炔基尿嘧啶和胞嘧啶、6-偶氮尿嘧啶、胞嘧啶和胸腺嘧啶、5-尿嘧啶(假尿嘧啶)、4-硫代尿嘧啶、8-卤代、8-氨基、8-硫代、8-硫代烷基、8-羟基和其他8-取代的腺嘌呤和鸟嘌呤、5-卤代(诸如例如,5-溴)、5-三氟甲基和其他5-取代的尿嘧啶和胞嘧啶、7-甲基鸟嘌呤、7-甲基腺嘌呤、8-氮杂鸟嘌呤、8-氮杂腺嘌呤、7-脱氮鸟嘌呤、7-脱氮腺嘌呤、3-脱氮鸟嘌呤和3-脱氮腺嘌呤。
核苷酸类似物还可包括对糖部分的修饰。对糖部分的修饰包括但不限于核糖和脱氧核糖的天然修饰以及合成修饰。糖修饰包括但不限于在2’位置处的以下修饰:OH;F;O-、S-或N-烷基;O-、S-或N-烯基;O-、S-或N-炔基;或O-烷基-O-烷基,其中烷基、烯基和炔基可以是取代或未取代的C1-10烷基或C2-10烯基和C2-10炔基。示例性的2’糖修饰还包括但不限于-O[(CH2)nO]mCH3、-O(CH2)nOCH3、-O(CH2)nNH2、-O(CH2)nCH3、-O(CH2)n-ONH2和-O(CH2)nON[(CH2)nCH3)]2,其中n和m独立地为1至约10。在2'位置处的其他修饰包括但不限于C1-10烷基、取代的低级烷基、烷芳基、芳烷基、O-烷芳基或O-芳烷基、SH、SCH3、OCN、Cl、Br、CN、CF3、OCF3、SOCH3、SO2CH3、ONO2、NO2、N3、NH2、杂环烷基、杂环烷芳基、氨基烷基氨基、聚烷基氨基、取代的甲硅烷基、RNA切割基团、报告基团、嵌入剂、用于改善寡核苷酸的药代动力学特性的基团,或用于改善寡核苷酸的药效学特性的基团,以及具有类似特性的其他取代基。还可在糖上的其他位置上做出类似的修饰,具体地在3'末端核苷酸上或在2'-5'连接的寡核苷酸中的糖的3'位置和5'末端核苷酸的5'位置。修饰的糖还可包括在桥环氧处含有修饰的糖,诸如CH2和S。核苷酸糖类似物还可具有糖模拟物,诸如环丁基部分代替呋喃戊糖。
核苷酸类似物还可在磷酸酯部分处进行修饰。修饰的磷酸酯部分包括但不限于那些可被修饰以使两个核苷酸之间的键联含有以下的部分:硫代磷酸酯、手性硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯、磷酸三酯、氨基烷基磷酸三酯、甲基和其他烷基膦酸酯(包括3'-亚烷基膦酸酯和手性膦酸酯、亚膦酸酯)、磷酰胺(包括3'-氨基磷酰胺和氨基烷基磷酰胺、硫代磷酰胺)、硫代烷基膦酸酯、硫代烷基磷酸三酯和硼代磷酸盐。两个核苷酸之间的这些磷酸酯或修饰的磷酸酯键联可通过3'-5'键联或2'-5'键联,并且所述键联可含有反转的极性诸如3'-5'至5'-3'或2'-5'至5'-2'。还包括各种盐、混合盐以及游离酸形式。核苷酸替代物还包括肽核酸(PNA)。
本公开还提供了包含本文公开的核酸分子中的任一种或多种的载体。在一些实施方案中,载体包含本文所公开的核酸分子中的任一种或多种和异源核酸。载体可以是能够转运核酸分子的病毒或非病毒载体。在一些实施方案中,载体是质粒或粘粒(诸如例如,另外的DNA区段可以连接到其中的环状双链DNA)。在一些实施方案中,载体是病毒载体,其中另外的DNA区段可连接到病毒基因组中。表达载体包括但不限于质粒、粘粒、逆转录病毒、腺病毒、腺相关病毒(AAV)、植物病毒(诸如花椰菜花叶病毒和烟草花叶病毒)、酵母人工染色体(YAC)、爱泼斯坦-巴尔(EBV)来源的附加体和本领域已知的其他表达载体。
哺乳动物宿主细胞表达的期望调控序列可包括例如指导哺乳动物细胞中的高水平多肽表达的病毒元件,诸如来源于逆转录病毒LTR、巨细胞病毒(CMV)(诸如例如,CMV启动子/增强子)、猿猴病毒40(SV40)(诸如例如,SV40启动子/增强子)、腺病毒(诸如例如,腺病毒主要晚期启动子(AdMLP))和多瘤病毒的启动子和/或增强子以及强哺乳动物启动子诸如天然免疫球蛋白和肌动蛋白启动子。在细菌细胞或真菌细胞(诸如例如,酵母细胞)中表达多肽的方法也是众所周知的。启动子可以是例如组成型活性启动子、条件型启动子、诱导型启动子、时间限制型启动子(诸如例如,发育调控型启动子)或空间限制型启动子(诸如例如,细胞特异性或组织特异性启动子)。
核酸分子内的核苷酸序列或多肽内的氨基酸序列的特定链段之间的百分比同一性(或百分比互补性)可以常规地使用BLAST程序(基本局部比对检索工具)和PowerBLAST程序(Altschul等人,J.Mol.Biol.,1990,215,403-410;Zhang和Madden,Genome Res.,1997,7,649-656)或通过使用Gap程序(Wisconsin序列分析包,Unix版本8,Genetics ComputerGroup,University Research Park,Madison Wis.),使用默认设置确定,该程序使用Smith和Waterman的算法(Adv.Appl.Math.,1981,2,482-489)。在本文中,如果对序列同一性百分比进行参考,则较高的序列同一性百分比相对于较低的序列同一性百分比是优选的。
本公开还提供了包含本文所公开的分离的核酸分子、基因组核酸分子、mRNA分子和/或cDNA分子中的任一种或多种的组合物。在一些实施方案中,组合物是药物组合物。在一些实施方案中,组合物包含载剂和/或赋形剂。载剂的示例包括但不限于聚(乳酸)(PLA)微球、聚(D,L-乳酸-共乙醇酸)(PLGA)微球、脂质体、胶束、反胶束、脂质螺旋物和脂质微管。载剂可包括缓冲盐溶液,诸如PBS、HBSS等。
如本文所用,当在特定核苷酸或核苷酸序列或位置的编号的上下文中使用时,短语“对应于”或其语法变型是指当特定核苷酸或核苷酸序列与参考序列(诸如例如,SEQ IDNO:1、SEQ ID NO:7或SEQ ID NO:31)比较时指定参考序列的编号。换言之,特定聚合物的残基(诸如例如,核苷酸或氨基酸)编号或残基(诸如例如,核苷酸或氨基酸)位置相对于参考序列来指定,而非通过残基在特定核苷酸或核苷酸序列内的实际数值位置来指定。例如,特定核苷酸序列可以通过引入缺口以优化两个序列之间的残基匹配而与参考序列比对。在这些情况下,虽然存在缺口,但是对特定核苷酸或核苷酸序列中的残基的编号是相对于其所比对的参考序列来进行的。
例如,包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列的核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,意指如果将GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列与SEQ ID NO:1的序列比对,则GPR75序列在对应于SEQID NO:1的位置5,540-5,546的位置具有CCAGTAG七核苷酸残基的缺失。这同样适用于包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子(其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ IDNO:7的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸)和包含编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子(其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸)。换言之,这些短语是指编码GPR75多肽的核酸分子,其中基因组核酸分子具有根据SEQ ID NO:1缺少CCAGTAG七核苷酸,并因此在SEQ ID NO:2的位置5,540-5,546包含与TATCCCG核苷酸同源的核苷酸的核苷酸序列(或者其中所述mRNA分子具有根据SEQ ID NO:7缺少CCAGUAG七核苷酸,并因此在SEQ ID NO:11的位置539-545包含与UAUCCCG七核苷酸残基同源的核苷酸的核苷酸序列,或者其中所述cDNA分子具有根据SEQ ID NO:31缺少CCAGTAG七核苷酸,并因此在SEQ ID NO:35的位置539-545包含与TATCCCG残基同源的残基的核苷酸序列)。本文中,此类序列也称为“具有Ala110fs改变的GPR75序列”或“具有Ala110fs变异的GPR75序列”,指基因组核酸分子。同样可以对于本文公开的所有其他分子进行。
如本文所述,GPR75基因组核酸分子内对应于例如根据SEQ ID NO:2的位置5,540-5,546的位置可通过在特定GPR75核酸分子的核苷酸序列与SEQ ID NO:2的核苷酸序列之间进行序列比对来鉴定。存在多种计算算法,可用于进行序列比对,以鉴定对应于例如SEQ IDNO:2中的位置5,540-5,546的核苷酸位置。例如,通过使用NCBI BLAST算法(Altschul等人,Nucleic Acids Res.,1997,25,3389-3402)或CLUSTALW软件(Sievers和Higgins,MethodsMol.Biol.,2014,1079,105-116),可以进行序列比对。然而,序列还可手动地进行比对。
GPR75参考多肽的氨基酸序列如SEQ ID NO:55所示。参考SEQ ID NO:55,GPR75参考多肽长度为540个氨基酸。参考SEQ ID NO:55,位置110是丙氨酸呤。参考SEQ ID NO:55,位置116是丙氨酸呤。参考SEQ ID NO:55,位置207是酪氨酸。参考SEQ ID NO:55,位置234是谷氨酰胺。参考SEQ ID NO:55,位置236是精氨酸。参考SEQ ID NO:55,位置400是半胱氨酸。
存在一种GPR75变体多肽(SEQ ID NO:56;Ala110fs),其中位置110(参考SEQ IDNO:55)的丙氨酸由于基础mRNA分子中的移码突变而改变,产生截短的130个氨基酸的多肽。参考SEQ ID NO:56,位置110-130的核苷酸不同于SEQ ID NO:55相同位置的相应核苷酸。
存在另一种GPR75变体多肽(SEQ ID NO:57;Ala116Thr),其中位置116(参考SEQID NO:55)的丙氨酸被苏氨酸取代,产生540个氨基酸的多肽。
存在另一种GPR75变体多肽(SEQ ID NO:58;Gln234Stop),其中位置234(参考SEQID NO:55)的谷氨酰胺由于基础mRNA分子中在氨基酸位置234处引入终止密码子的突变而改变,产生截短的233个氨基酸的多肽。
存在另一种GPR75变体多肽(SEQ ID NO:59;Arg236fs),其中位置236(参考SEQ IDNO:55)的精氨酸由于基础mRNA分子中的移码突变而改变,产生截短的239个氨基酸的多肽。参考SEQ ID NO:59,位置236-239的核苷酸不同于SEQ ID NO:55相同位置的相应核苷酸。
存在另一种GPR75变体多肽(SEQ ID NO:60;Cys400fs),其中位置400(参考SEQ IDNO:55)的半胱氨酸由于基础mRNA分子中的移码突变而改变,产生截短的425个氨基酸的多肽。参考SEQ ID NO:60,位置400-425的核苷酸不同于SEQ ID NO:55相同位置的相应核苷酸。
存在另一种GPR75变体多肽(SEQ ID NO:108;Tyr207Cys),其中位置207(参考SEQID NO:55)的酪氨酸被半胱氨酸取代,产生540个氨基酸的多肽。
本公开还提供了分离的人GPR75多肽,其具有与SEQ ID NO:56至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%相同,并且在对应于根据SEQ ID NO:56的位置110-130的位置处包含核苷酸的氨基酸序列。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽具有与SEQ ID NO:56至少约90%相同,并且在对应于根据SEQ ID NO:56的位置110-130的位置处包含核苷酸的氨基酸序列。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽具有与SEQ ID NO:56至少约92%相同,并且在对应于根据SEQ ID NO:56的位置110-130的位置处包含核苷酸的氨基酸序列。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽具有与SEQ ID NO:56至少约94%相同,并且在对应于根据SEQ ID NO:56的位置110-130的位置处包含核苷酸的氨基酸序列。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽具有与SEQ ID NO:56至少约96%相同,并且在对应于根据SEQ ID NO:56的位置110-130的位置处包含核苷酸的氨基酸序列。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽具有与SEQ ID NO:56至少约98%相同,并且在对应于根据SEQ ID NO:56的位置110-130的位置处包含核苷酸的氨基酸序列。在一些实施方案中,这些GPR75多肽在对应于根据SEQ IDNO:55的位置110-540的位置处缺少氨基酸。
本公开还提供了分离的人GPR75多肽,其具有与SEQ ID NO:59至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%相同,并且在对应于根据SEQ ID NO:59的位置236-239的位置处包含核苷酸的氨基酸序列。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽具有与SEQ ID NO:59至少约90%相同,并且在对应于根据SEQ ID NO:59的位置236-239的位置处包含核苷酸的氨基酸序列。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽具有与SEQ ID NO:59至少约92%相同,并且在对应于根据SEQ ID NO:59的位置236-239的位置处包含核苷酸的氨基酸序列。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽具有与SEQ ID NO:59至少约94%相同,并且在对应于根据SEQ ID NO:59的位置236-239的位置处包含核苷酸的氨基酸序列。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽具有与SEQ ID NO:59至少约96%相同,并且在对应于根据SEQ ID NO:59的位置236-239的位置处包含核苷酸的氨基酸序列。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽具有与SEQ ID NO:59至少约98%相同,并且在对应于根据SEQ ID NO:59的位置236-239的位置处包含核苷酸的氨基酸序列。在一些实施方案中,这些GPR75多肽在对应于根据SEQ IDNO:55的位置236-540的位置处缺少氨基酸。
本公开还提供了分离的人GPR75多肽,其具有与SEQ ID NO:60至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%相同,并且在对应于根据SEQ ID NO:60的位置400-425的位置处包含核苷酸的氨基酸序列。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽具有与SEQ ID NO:60至少约90%相同,并且在对应于根据SEQ ID NO:60的位置400-425的位置处包含核苷酸的氨基酸序列。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽具有与SEQ ID NO:60至少约92%相同,并且在对应于根据SEQ ID NO:60的位置400-425的位置处包含核苷酸的氨基酸序列。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽具有与SEQ ID NO:60至少约94%相同,并且在对应于根据SEQ ID NO:60的位置400-425的位置处包含核苷酸的氨基酸序列。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽具有与SEQ ID NO:60至少约96%相同,并且在对应于根据SEQ ID NO:60的位置400-425的位置处包含核苷酸的氨基酸序列。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽具有与SEQ ID NO:60至少约98%相同,并且在对应于根据SEQ ID NO:60的位置400-425的位置处包含核苷酸的氨基酸序列。在一些实施方案中,这些GPR75多肽在对应于根据SEQ IDNO:55的位置400-540的位置处缺少氨基酸。
在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽的氨基酸序列包含SEQ ID NO:56或由SEQID NO:56组成。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽的氨基酸序列包含SEQ ID NO:56。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽的氨基酸序列由SEQ ID NO:56组成。
在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽的氨基酸序列包含SEQ ID NO:59或由SEQID NO:59组成。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽的氨基酸序列包含SEQ ID NO:59。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽的氨基酸序列由SEQ ID NO:59组成。
在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽的氨基酸序列包含SEQ ID NO:60或由SEQID NO:60组成。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽的氨基酸序列包含SEQ ID NO:60。在一些实施方案中,分离的人GPR75多肽的氨基酸序列由SEQ ID NO:60组成。
在一些实施方案中,分离的多肽包含与本文公开的任何GPR75多肽的至少约8个、至少约10个、至少约15个、至少约20个、至少约25个、至少约30个、至少约35个、至少约40个、至少约45个、至少约50个、至少约60个、至少约70个、至少约80个、至少约90个、至少约100个、至少约150个、至少约200个、至少约250个、至少约300个、至少约350个、至少约400个、至少约450个、至少约500个、至少约550个或至少约600个连续氨基酸至少约70%、至少约75%、至少约80%、至少约85%、至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%、至少约99%或100%同一的氨基酸序列或由所述氨基酸序列组成。在一些实施方案中,分离的多肽包含与本文公开的任何GPR75多肽的至少约8个、至少约10个、至少约15个、至少约20个、至少约25个、至少约30个、至少约35个、至少约40个、至少约45个、至少约50个、至少约60个、至少约70个、至少约80个、至少约90个、至少约100个、至少约150个、至少约200个、至少约250个、至少约300个、至少约350个、至少约400个、至少约450个、至少约500个、至少约550个或至少约600个连续氨基酸至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%、至少约99%或100%同一的氨基酸序列或由所述氨基酸序列组成。
本文公开的分离的多肽可包含天然存在的GPR75多肽的氨基酸序列,或者可包含非天然存在的序列。在一些实施方案中,由于保守氨基酸取代,天然存在的序列可以不同于非天然存在的序列。例如,除了保守氨基酸取代外,该序列可以是相同的。
在一些实施方案中,所述分离的多肽包含非天然或修饰的氨基酸或肽类似物。例如,存在许多D-氨基酸或具有与天然存在的氨基酸不同的官能取代基的氨基酸。
本公开还提供了编码本文公开的多肽中的任一种的核酸分子。这包括与特定多肽序列相关的所有简并序列(即,具有编码一种特定多肽序列的序列的所有核酸以及编码所公开的蛋白质序列的变体和衍生物的所有核酸,包括简并核酸)。因此,虽然每个特定核酸序列可能未在本文中写出,但是实际上每一个序列均通过公开的多肽序列在本文中公开并描述。
本公开还提供了包含本文公开的核酸分子中的任一种或多种和/或多肽中的任一种或多种的组合物。在一些实施方案中,所述组合物包含载剂。载剂的示例包括但不限于聚(乳酸)(PLA)微球、聚(D,L-乳酸-共乙醇酸)(PLGA)微球、脂质体、胶束、反胶束、脂质螺旋物和脂质微管。
本公开还提供了产生本文公开的任何GPR75多肽或其片段的方法。此类GPR75多肽或其片段可以通过任何合适的方法产生。
本公开还提供了包含本文公开的核酸分子中的任一种或多种和/或多肽中的任一种或多种的细胞。所述细胞可以是体外的、离体的或体内的。核酸分子可以连接到启动子和其他调控序列,所以它们被表达从而产生编码的蛋白质。
在一些实施方案中,所述细胞是全能细胞或多能细胞,诸如例如胚胎干(ES)细胞,诸如啮齿动物ES细胞、小鼠ES细胞或大鼠ES细胞。在一些实施方案中,所述细胞是原代体细胞或不是原代体细胞的细胞。所述细胞可以来自任何来源。例如,所述细胞可以是真核细胞、动物细胞、植物细胞或真菌(诸如例如,酵母)细胞。此类细胞可以是鱼类细胞或禽类细胞,或者此类细胞可以是哺乳动物细胞,诸如人细胞、非人哺乳动物细胞、啮齿动物细胞、小鼠细胞或大鼠细胞。哺乳动物包括但不限于人、非人灵长类、猴、猿、猫、狗、马、公牛、鹿、野牛、绵羊、啮齿动物(诸如例如,小鼠、大鼠、仓鼠、豚鼠)、家畜(诸如例如,牛类,诸如母牛、小牛等;羊类,诸如绵羊、山羊等;和猪类,诸如猪和公猪)。术语“非人动物”排除人。
所附序列表中列出的核苷酸序列和氨基酸序列是使用核苷酸碱基的标准字母缩写和氨基酸的三字母代码示出的。所述核苷酸序列遵循从序列的5'端开始并且前进(即在每一行中从左到右)到3'端的标准惯例。仅示出了每一个核苷酸序列的一条链,但应理解的是,互补链是通过对所展示链的任何参考而被包括在内的。氨基酸序列遵循从序列的氨基末端开始并且前进(即在每一行中从左到右)到羧基末端的标准惯例。
本公开还提供了治疗或抑制肥胖症的治疗剂,其用于治疗受试者的肥胖症(或用于制备用于治疗肥胖症的药物),其中所述受试者具有编码本文所述的人GPR75多肽的基因组核酸分子、mRNA分子和/或cDNA分子中的任一种。治疗或抑制肥胖症的治疗剂可以是本文所述的治疗或抑制肥胖症的治疗剂中的任一种。
在一些实施方案中,所述受试者包含:i)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;ii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;或iii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。
在一些实施方案中,所述受试者包含:具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。
在一些实施方案中,所述受试者包含:i)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;ii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置的腺嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置的腺嘌呤;或iii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置的腺嘌呤。
在一些实施方案中,所述受试者包含:具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤。
在一些实施方案中,所述受试者包含:i)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;ii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:23或其互补序列的位置732的位置的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置的尿嘧啶;或iii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ IDNO:52或其互补序列的位置971的位置的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,所述受试者包含:具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,991的位置处包含胸腺嘧啶;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;或GPR75多肽,其在对应于根据SEQ ID NO:58的位置234的位置处包含终止密码子。
在一些实施方案中,所述受试者包含:i)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;ii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;或iii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸。
在一些实施方案中,所述受试者包含:具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;或具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸。
在一些实施方案中,所述受试者包含:i)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;ii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置的尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置的尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置的尿嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置的尿嘧啶的插入;或iii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ IDNO:39或其互补序列的位置1,410的位置的胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置的胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置的胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置的胸腺嘧啶的插入。
在一些实施方案中,所述受试者包含:具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;或具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
在一些实施方案中,所述受试者包含:i)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;ii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:102或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤;或iii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤。
在一些实施方案中,所述受试者包含:具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;或GPR75多肽,其在对应于根据SEQ ID NO:108的位置207的位置处包含半胱氨酸。
本公开还提供了用于治疗受试者的肥胖症(或用于制备用于治疗肥胖症的药物)的GPR75抑制剂,其中所述受试者具有编码本文所述的人GPR75多肽的基因组核酸分子、mRNA分子和/或cDNA分子中的任一种。GPR75抑制剂可以是本文所述的GPR75抑制剂中的任一种。
在一些实施方案中,所述受试者包含:i)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;ii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;或iii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。
在一些实施方案中,所述受试者包含:具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸。
在一些实施方案中,所述受试者包含:i)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;ii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置的腺嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置的腺嘌呤;或iii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置的腺嘌呤。
在一些实施方案中,所述受试者包含:具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤。
在一些实施方案中,所述受试者包含:i)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;ii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置的尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:23或其互补序列的位置732的位置的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置的尿嘧啶;或iii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ IDNO:52或其互补序列的位置971的位置的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,所述受试者包含:具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,991的位置处包含胸腺嘧啶;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;或GPR75多肽,其在对应于根据SEQ ID NO:58的位置234的位置处包含终止密码子。
在一些实施方案中,所述受试者包含:i)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;ii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;或iii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸。
在一些实施方案中,所述受试者包含:具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;或具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸。
在一些实施方案中,所述受试者包含:i)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;ii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置的尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置的尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置的尿嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置的尿嘧啶的插入;或iii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ IDNO:39或其互补序列的位置1,410的位置的胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置的胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置的胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置的胸腺嘧啶的插入。
在一些实施方案中,所述受试者包含:具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;或具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
在一些实施方案中,所述受试者包含:i)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;ii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:102或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤;或iii)具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤。
在一些实施方案中,所述受试者包含:具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;或GPR75多肽,其在对应于根据SEQ ID NO:108的位置207的位置处包含半胱氨酸。
以上或以下所引用的所有专利文献、网站、其他出版物、登录号等均出于所有目的以引用的方式整体并入,其程度犹如每个单独项目均具体地且单独地被指示为以引用的方式如此并入一样。如果序列的不同版本在不同时间与登录号相关,则意指在本申请的有效申请日与登录号相关的版本。有效申请日意指实际申请日或优先权申请的申请日中较早的日期,如适用,请参考登录号。同样,如果出版物、网站等的不同版本在不同时间公布,除非另外指示,否则指的是在申请的有效申请日最近公布的版本。本公开的任何特征、步骤、元件、实施方案或方面可与任何其他特征、步骤、元件、实施方案或方面结合使用,除非另有明确指示。尽管为了清楚和理解的目的已经通过说明和示例对本公开的内容进行了一些详细的描述,但显而易见的是,在所附权利要求的范围内可以实施某些变动和修改。
呈现了以下代表性实施方案:
实施方案1.一种治疗患有肥胖症的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用G蛋白偶联受体75(GPR75)抑制剂。
实施方案2.一种治疗体重过重的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用GPR75抑制剂。
实施方案3.一种治疗BMI升高的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用GPR75抑制剂。
实施方案4.一种治疗体脂质量、百分比或体积升高的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用GPR75抑制剂。
实施方案5.一种治疗食物摄入过量的受试者或预防体重增加或维持体重减轻的方法,所述方法包括向所述受试者施用GPR75抑制剂。
实施方案6.根据实施方案1-5中任一项所述的方法,其中所述GPR75抑制剂包含与GPR75 mRNA杂交的反义核酸分子、小干扰RNA(siRNA)或短发夹RNA(shRNA)。
实施方案7.根据实施方案1至5中任一项所述的方法,其中所述GPR75抑制剂包含Cas蛋白和与GPR75基因组核酸分子内的引导RNA(gRNA)识别序列杂交的gRNA。
实施方案8.根据实施方案7所述的方法,其中所述Cas蛋白质是Cas9或Cpf1。
实施方案9.根据实施方案7或实施方案8所述的方法,其中所述gRNA识别序列包括或接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546、根据SEQ ID NO:1的位置5,557、根据SEQ ID NO:1的位置5,911、根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923、根据SEQID NO:1的位置6,411或根据SEQ ID NO:1的位置5,831。
实施方案10.根据实施方案7或实施方案8所述的方法,其中所述gRNA识别序列位于距对应于以下位置的位置约1000、约500、约400、约300、约200、约100、约50、约45、约40、约35、约30、约25、约20、约15、约10或约5个核苷酸处:根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546、根据SEQ ID NO:1的位置5,557、根据SEQ ID NO:1的位置5,911、根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923、根据SEQ ID NO:1的位置6,411或根据SEQ ID NO:1的位置5,831。
实施方案11.根据实施方案7或实施方案8所述的方法,其中原型间隔区邻近基序(PAM)序列是所述gRNA识别序列下游的约2至约6个核苷酸。
实施方案12.根据实施方案7至11中任一项所述的方法,其中所述gRNA包含约17至约23个核苷酸。
实施方案13.根据实施方案7至11中任一项所述的方法,其中所述gRNA识别序列包含根据SEQ ID NO:61-98中任一个的核苷酸序列。
实施方案14.根据实施方案1至13中任一项所述的方法,所述方法还包括检测来自所述受试者的生物样品中不存在编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子。
实施方案15.根据实施方案14所述的方法,所述方法还包括将治疗或抑制肥胖症的治疗剂以标准剂量施用给作为GPR75参考的受试者。
实施方案16.根据实施方案14所述的方法,所述方法还包括将治疗或抑制肥胖症的治疗剂以与标准剂量相同或低于标准剂量的剂量施用给GPR75错义变体核酸分子杂合的受试者。
实施方案17.根据实施方案14至16中任一项所述的方法,其中所述GPR75错义变体核酸分子是编码Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs或Cys400fs的核酸分子。
实施方案18.根据实施方案17所述的方法,其中所述GPR75错义变体核酸分子是:
具有下述核苷酸序列的基因组核酸分子:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:6的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;
具有下述核苷酸序列的mRNA分子:在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于SEQ ID NO:10的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:102的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ IDNO:103的位置891的位置处包含鸟嘌呤;或
由mRNA分子产生的cDNA分子,其中所述cDNA分子具有下述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ IDNO:32的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ IDNO:42的位置811的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于SEQ ID NO:34的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案19.根据实施方案14至18中任一项所述的方法,其中所述检测步骤在体外进行。
实施方案20.根据实施方案14至19中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括对所述生物样品中所述GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列的至少一部分测序,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546;根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557;根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911;根据SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923;根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411;或根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831;
其中当所述生物样品中的所述GPR75基因组核酸分子的所测序的部分:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQID NO:3的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;则所述生物样品中的所述GPR75基因组核酸分子是GPR75错义变体核酸分子。
实施方案21.根据实施方案14至19中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括对所述生物样品中所述GPR75 mRNA分子的核苷酸序列的至少一部分测序,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:11或其互补序列的位置539-545;根据SEQID NO:16或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:21或其互补序列的位置361-367;根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置600-606;根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556;根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457;根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378;根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617;根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910;根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811;根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732;根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971;根据SEQ ID NO:14或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:19或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置741-744;根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置980-983;根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410;根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232;根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471;根据SEQ IDNO:100或其互补序列的位置830;根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731;根据SEQ IDNO:102或其互补序列的位置652;根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891;
其中当所述生物样品中的所述GPR75 mRNA分子的所测序的部分:在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103的位置891的位置处包含鸟嘌呤时,则所述生物样品中的所述GPR75 mRNA分子是GPR75错义变体mRNA分子。
实施方案22.根据实施方案14至19中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括对由所述生物样品中的mRNA分子产生的GPR75cDNA分子的核苷酸序列的至少一部分测序,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:35或其互补序列的位置539-545;根据SEQ ID NO:40或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:45或其互补序列的位置361-367;根据SEQ ID NO:50或其互补序列的位置600-606;根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556;根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457;根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378;根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617;根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910;根据SEQ IDNO:42或其互补序列的位置811;根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732;根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971;根据SEQ ID NO:38或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:43或其互补序列的位置820-823;根据SEQ IDNO:48或其互补序列的位置741-744;根据SEQ ID NO:53或其互补序列的位置980-983;根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410;根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232;根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471;根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830;根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731;根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652;或根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891;
其中当所述生物样品中的所述GPR75 cDNA分子的所测序的部分:在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:106的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置处包含鸟嘌呤时,则所述生物样品中的所述GPR75 cDNA分子是GPR75错义变体cDNA分子。
实施方案23.根据实施方案14至19中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
a)使所述生物样品与和所述GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触,所述部分接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2的位置5,540-5,546,根据SEQ ID NO:3的位置5,557,根据SEQ ID NO:4的位置5,911,根据SEQ ID NO:5的位置5,920-5,923,根据SEQ ID NO:6的位置6,411,或根据SEQ ID NO:99的位置5,831;
b)使所述引物至少延伸通过所述GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2的位置5,540-5,546,根据SEQ ID NO:3的位置5,557,根据SEQ ID NO:4的位置5,911,根据SEQ ID NO:5的位置5,920-5,923,根据SEQ ID NO:6的位置6,411,或根据SEQ ID NO:99的位置5,831;并且
c)确定所述引物的延伸产物是否:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案24.根据实施方案14至19中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
a)使所述生物样品与和GPR75 mRNA分子的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触,所述部分接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:11的位置539-545,根据SEQ ID NO:16的位置440-446,根据SEQ ID NO:21的位置361-367,根据SEQ ID NO:26的位置600-606,根据SEQ ID NO:12的位置556,根据SEQ ID NO:17的位置457,根据SEQ ID NO:22的位置378,根据SEQ ID NO:27的位置617,根据SEQ ID NO:13的位置910,根据SEQ ID NO:18的位置811,根据SEQ ID NO:23的位置732,根据SEQ ID NO:28的位置971,根据SEQ ID NO:14的位置919-922,根据SEQ ID NO:19的位置820-823,根据SEQ ID NO:24的位置741-744,根据SEQ ID NO:29的位置980-983,根据SEQ ID NO:15的位置1,410,根据SEQ ID NO:20的位置1,311,根据SEQ ID NO:25的位置1,232,根据SEQ ID NO:30的位置1,471,根据SEQ ID NO:100的位置830,根据SEQ ID NO:101的位置731,根据SEQ ID NO:102的位置652,或根据SEQID NO:103的位置891;
b)使所述引物至少延伸通过GPR75 mRNA分子的核苷酸序列的对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:11的位置539-545,根据SEQ ID NO:16的位置440-446,根据SEQ IDNO:21的位置361-367,根据SEQ ID NO:26的位置600-606,根据SEQ ID NO:12的位置556,根据SEQ ID NO:17的位置457,根据SEQ ID NO:22的位置378,根据SEQ ID NO:27的位置617,根据SEQ ID NO:13的位置910,根据SEQ ID NO:18的位置811,根据SEQ ID NO:23的位置732,根据SEQ ID NO:28的位置971,根据SEQ ID NO:14的位置919-922,根据SEQ ID NO:19的位置820-823,根据SEQ ID NO:24的位置741-744,根据SEQ ID NO:29的位置980-983,根据SEQ ID NO:15的位置1,410,根据SEQ ID NO:20的位置1,311,根据SEQ ID NO:25的位置1,232,根据SEQ ID NO:30的位置1,471,根据SEQ ID NO:100的位置830,根据SEQ ID NO:101的位置731,根据SEQ ID NO:102的位置652,或根据SEQ ID NO:103的位置891;并且
c)确定所述引物的延伸产物是否:在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ IDNO:10的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ IDNO:101的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:102的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQID NO:103的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案25.根据实施方案14至19中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
a)使所述生物样品与和所述GPR75 cDNA分子的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触,所述部分接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:35的位置539-545,根据SEQID NO:40的位置440-446,根据SEQ ID NO:45的位置361-367,根据SEQ ID NO:50的位置600-606,根据SEQ ID NO:36的位置556,根据SEQ ID NO:41的位置457,根据SEQ ID NO:46的位置378,根据SEQ ID NO:51的位置617,根据SEQ ID NO:37的位置910,根据SEQ ID NO:42的位置811,根据SEQ ID NO:47的位置732,根据SEQ ID NO:52的位置971,根据SEQ IDNO:38的位置919-922,根据SEQ ID NO:43的位置820-823,根据SEQ ID NO:48的位置741-744,根据SEQ ID NO:53的位置980-983,根据SEQ ID NO:39的位置1,410,根据SEQ ID NO:44的位置1,311,根据SEQ ID NO:49的位置1,232,根据SEQ ID NO:54的位置1,471,根据SEQID NO:104的位置830,根据SEQ ID NO:105的位置731,根据SEQ ID NO:106的位置652,或根据SEQ ID NO:107的位置891;
b)使所述引物至少延伸通过GPR75 cDNA分子的核苷酸序列的对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:35的位置539-545,根据SEQ ID NO:40的位置440-446,根据SEQ IDNO:45的位置361-367,根据SEQ ID NO:50的位置600-606,根据SEQ ID NO:36的位置556,根据SEQ ID NO:41的位置457,根据SEQ ID NO:46的位置378,根据SEQ ID NO:51的位置617,根据SEQ ID NO:37的位置910,根据SEQ ID NO:42的位置811,根据SEQ ID NO:47的位置732,根据SEQ ID NO:52的位置971,根据SEQ ID NO:38的位置919-922,根据SEQ ID NO:43的位置820-823,根据SEQ ID NO:48的位置741-744,根据SEQ ID NO:53的位置980-983,根据SEQ ID NO:39的位置1,410,根据SEQ ID NO:44的位置1,311,根据SEQ ID NO:49的位置1,232,根据SEQ ID NO:54的位置1,471,根据SEQ ID NO:104的位置830,根据SEQ ID NO:105的位置731,根据SEQ ID NO:106的位置652,或根据SEQ ID NO:107的位置891;并且
c)确定所述引物的延伸产物是否:在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ IDNO:52的位置971的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案26.根据实施方案20至25中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括对整个核酸分子进行测序。
实施方案27.根据实施方案14至19中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
a)扩增编码人GPR75多肽的所述核酸分子的至少一部分,其中所述部分:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤
b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;
c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;并且
d)检测所述可检测标记。
实施方案28.根据实施方案14至19中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
a)扩增编码人GPR75多肽的所述核酸分子的至少一部分,其中所述部分:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ IDNO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;
b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;
c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且
d)检测所述可检测标记。
实施方案29.根据实施方案14至19中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
a)扩增编码人GPR75多肽的所述核酸分子的至少一部分,其中所述部分:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;
b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;
c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ IDNO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且
d)检测所述可检测标记。
实施方案30.根据实施方案29所述的方法,其中所述样品中的所述核酸分子是mRNA,并且在所述扩增步骤之前将所述mRNA逆转录成cDNA。
实施方案31.根据实施方案14至19中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
使所述生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;并且
检测所述可检测标记。
实施方案32.根据实施方案14至19中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
使所述生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ IDNO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且
检测所述可检测标记。
实施方案33.根据实施方案14至19中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
使所述生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且
检测所述可检测标记。
实施方案34.一种用治疗或抑制肥胖症的治疗剂治疗受试者的方法,其中所述受试者是肥胖的,所述方法包括以下步骤:
通过以下方式确定所述受试者是否具有编码预测的功能丧失性GPR75多肽的G蛋白偶联受体75(GPR75)错义变体核酸分子:
从所述受试者获得或已经获得生物样品;以及
对所述生物样品进行或已经进行了序列分析以确定所述受试者是否具有包含所述GPR75错义变体核酸分子的基因型;以及
将治疗或抑制肥胖症的所述治疗剂和/或GPR75抑制剂以标准剂量施用或继续施用给作为GPR75参考的受试者;以及
将治疗或抑制肥胖症的所述治疗剂和/或GPR75抑制剂以与标准剂量相同或低于标准剂量的量施用或继续施用给GPR75错义变体核酸分子杂合的受试者;
其中具有编码预测的功能丧失性GPR75多肽的所述GPR75错义变体核酸分子的基因型的存在指示所述受试者具有降低的发展肥胖症的风险。
实施方案35.根据实施方案34所述的方法,其中所述受试者是GPR75参考,并且以标准剂量向所述受试者施用或继续施用治疗或抑制肥胖症的所述治疗剂和/或GPR75抑制剂。
实施方案36.根据实施方案34所述的方法,其中所述受试者对于GPR75错义变体核酸分子是杂合的,并且以与标准剂量相同或低于标准剂量的量向所述受试者施用或继续施用治疗或抑制肥胖症的所述治疗剂和/或GPR75抑制剂。
实施方案37.根据实施方案34至36中任一项所述的方法,其中所述GPR75错义变体核酸分子是编码Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs或Cys400fs的核酸分子。
实施方案38.根据实施方案37所述的方法,其中所述GPR75错义变体核酸分子是:
具有下述核苷酸序列的基因组核酸分子:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ IDNO:6的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;
具有下述核苷酸序列的mRNA分子:在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于SEQ ID NO:10的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:102的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQID NO:103的位置891的位置处包含鸟嘌呤;或
由mRNA分子产生的cDNA分子,其中所述cDNA分子具有下述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ IDNO:32的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ IDNO:42的位置811的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于SEQ ID NO:34的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案39.根据实施方案34至38中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括对所述生物样品中所述GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列的至少一部分测序,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置5,540-5,546;根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557;根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911;根据SEQ ID NO:5或其互补序列的位置5,920-5,923;根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411;或根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831;
其中当所述生物样品中GPR75基因组核酸分子的所测序的部分:在对应于根据SEQID NO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ IDNO:99的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤时,则所述生物样品中的GPR75基因组核酸分子是GPR75错义变体基因组核酸分子。
实施方案40.根据实施方案34至38中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括对所述生物样品中所述GPR75 mRNA分子的核苷酸序列的至少一部分测序,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:11或其互补序列的位置539-545;根据SEQID NO:16或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:21或其互补序列的位置361-367;根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置600-606;根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556;根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457;根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378;根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617;根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910;根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811;根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732;根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971;根据SEQ ID NO:14或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:19或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置741-744;根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置980-983;根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410;根据SEQ ID NO:20、其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232;或根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471;根据SEQ IDNO:100或其互补序列的位置830;根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731;根据SEQ IDNO:102或其互补序列的位置652;或根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891;
其中当所述生物样品中的所述GPR75 mRNA分子的所测序的部分:在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:13的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103的位置891的位置处包含鸟嘌呤时,则所述生物样品中的所述GPR75 mRNA分子是GPR75错义变体mRNA分子。
实施方案41.根据实施方案34至38中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括对所述生物样品中所述GPR75 cDNA分子的核苷酸序列的至少一部分测序,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:35或其互补序列的位置539-545;根据SEQID NO:40或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:45或其互补序列的位置361-367;根据SEQ ID NO:50或其互补序列的位置600-606;根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556;根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457;根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378;根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617;根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910;根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811;根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732;根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971;根据SEQ ID NO:38或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:43或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:48或其互补序列的位置741-744;根据SEQ ID NO:53或其互补序列的位置980-983;根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410;根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232;根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471;根据SEQ IDNO:104或其互补序列的位置830;根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731;根据SEQ IDNO:106或其互补序列的位置652;或根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891;
其中当所述生物样品中的所述GPR75 cDNA分子的所测序的部分:在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:106的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置处包含鸟嘌呤时,则所述生物样品中的所述GPR75 cDNA分子是GPR75错义变体cDNA分子。
实施方案42.根据实施方案34至38中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括:
a)使所述生物样品与和所述GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触,所述部分接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2的位置5,540-5,546,根据SEQ ID NO:3的位置5,557,根据SEQ ID NO:4的位置5,911,根据SEQ ID NO:5的位置5,920-5,923,根据SEQ ID NO:6的位置6,411,或根据SEQ ID NO:99的位置5,831;
b)使所述引物至少延伸通过GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2的位置5,540-5,546,根据SEQ ID NO:3的位置5,557,根据SEQ IDNO:4的位置5,911,根据SEQ ID NO:5的位置5,920-5,923,根据SEQ ID NO:6的氨基酸6,411,根据SEQ ID NO:6的位置6,411,或根据SEQ ID NO:99的位置5,831;并且
c)确定所述引物的延伸产物是否:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案43.根据实施方案34至38中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括:
a)使所述生物样品与和GPR75 mRNA分子的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触,所述部分接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:11的位置539-545,根据SEQ ID NO:16的位置440-446,根据SEQ ID NO:21的位置361-367,根据SEQ ID NO:26的位置600-606,根据SEQ ID NO:12的位置556,根据SEQ ID NO:17的位置457,根据SEQ ID NO:22的位置378,根据SEQ ID NO:27的位置617,根据SEQ ID NO:13的位置910,根据SEQ ID NO:18的位置811,根据SEQ ID NO:23的位置732,根据SEQ ID NO:28的位置971,根据SEQ ID NO:14的位置919-922,根据SEQ ID NO:19的位置820-823,根据SEQ ID NO:24的位置741-744,根据SEQ ID NO:29的位置980-983,根据SEQ ID NO:15的位置1,410,根据SEQ ID NO:20的位置1,311,根据SEQ ID NO:25的位置1,232,根据SEQ ID NO:30的位置1,471,根据SEQ ID NO:100的位置830,根据SEQ ID NO:101的位置731,根据SEQ ID NO:102的位置652,或根据SEQID NO:103的位置891;
b)使所述引物至少延伸通过GPR75 mRNA分子的核苷酸序列的对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:11的位置539-545,根据SEQ ID NO:16的位置440-446,根据SEQ IDNO:21的位置361-367,根据SEQ ID NO:26的位置600-606,根据SEQ ID NO:12的位置556,根据SEQ ID NO:17的位置457,根据SEQ ID NO:22的位置378,根据SEQ ID NO:27的位置617,根据SEQ ID NO:13的位置910,根据SEQ ID NO:18的位置811,根据SEQ ID NO:23的位置732,根据SEQ ID NO:28的位置971,根据SEQ ID NO:14的位置919-922,根据SEQ ID NO:19的位置820-823,根据SEQ ID NO:24的位置741-744,根据SEQ ID NO:29的位置980-983,根据SEQ ID NO:15的位置1,410,根据SEQ ID NO:20的位置1,311,根据SEQ ID NO:25的位置1,232,根据SEQ ID NO:30的位置1,471,根据SEQ ID NO:100的位置830,根据SEQ ID NO:101的位置731,根据SEQ ID NO:102的位置652,或根据SEQ ID NO:103的位置891;并且
c)确定所述引物的延伸产物是否:在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ IDNO:10的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ IDNO:102的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQID NO:103的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案44.根据实施方案34至38中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括:
a)使所述生物样品与和所述GPR75 cDNA分子的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触,所述部分接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:35的位置539-545,根据SEQID NO:40的位置440-446,根据SEQ ID NO:45的位置361-367,根据SEQ ID NO:50的位置600-606,根据SEQ ID NO:36的位置556,根据SEQ ID NO:41的位置457,根据SEQ ID NO:46的位置378,根据SEQ ID NO:51的位置617,根据SEQ ID NO:37的位置910,根据SEQ ID NO:42的位置811,根据SEQ ID NO:47的位置732,根据SEQ ID NO:52的位置971,根据SEQ IDNO:38的位置919-922,根据SEQ ID NO:43的位置820-823,根据SEQ ID NO:48的位置741-744,根据SEQ ID NO:53的位置980-983,根据SEQ ID NO:39的位置1,410,根据SEQ ID NO:44的位置1,311,根据SEQ ID NO:49的位置1,232,根据SEQ ID NO:54的位置1,471,根据SEQID NO:104的位置830,根据SEQ ID NO:105的位置731,根据SEQ ID NO:106的位置652,或根据SEQ ID NO:107的位置891;
b)使所述引物至少延伸通过GPR75 cDNA分子的核苷酸序列的对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:35的位置539-545,根据SEQ ID NO:40的位置440-446,根据SEQ IDNO:45的位置361-367,根据SEQ ID NO:50的位置600-606,根据SEQ ID NO:36的位置556,根据SEQ ID NO:41的位置457,根据SEQ ID NO:46的位置378,根据SEQ ID NO:51的位置617,根据SEQ ID NO:37的位置910,根据SEQ ID NO:42的位置811,根据SEQ ID NO:47的位置732,根据SEQ ID NO:52的位置971,根据SEQ ID NO:38的位置919-922,根据SEQ ID NO:43的位置820-823,根据SEQ ID NO:48的位置741-744,根据SEQ ID NO:53的位置980-983,根据SEQ ID NO:39的位置1,410,根据SEQ ID NO:44的位置1,311,根据SEQ ID NO:49的位置1,232,根据SEQ ID NO:54的位置1,471,根据SEQ ID NO:104的位置830,根据SEQ ID NO:105的位置731,根据SEQ ID NO:106的位置652,或根据SEQ ID NO:107的位置891;并且
c)确定所述引物的延伸产物是否:在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ IDNO:52的位置971的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案45.根据实施方案39至44中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括对整个核酸分子进行测序。
实施方案46.根据实施方案34至38中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括:
a)扩增编码人GPR75多肽的所述核酸分子的至少一部分,其中所述部分:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;
b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;
c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;并且
d)检测所述可检测标记。
实施方案47.根据实施方案34至38中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括:
a)扩增编码人GPR75多肽的所述核酸分子的至少一部分,其中所述部分:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;
b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;
c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且
d)检测所述可检测标记。
实施方案48.根据实施方案34至38中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括:
a)扩增编码人GPR75多肽的所述核酸分子的至少一部分,其中所述部分:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;
b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;
c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ IDNO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且
d)检测所述可检测标记。
实施方案49.根据实施方案48所述的方法,其中所述样品中的所述核酸分子是mRNA,并且在所述扩增步骤之前将所述mRNA逆转录成cDNA。
实施方案50.根据实施方案34至38中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括:
使所述生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;并且
检测所述可检测标记。
实施方案51.根据实施方案34至38中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括:
使所述生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ IDNO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且
检测所述可检测标记。
实施方案52.根据实施方案34至38中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括:
使所述生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且
检测所述可检测标记。
实施方案53.根据实施方案34至52中任一项所述的方法,其中所述核酸分子存在于从所述受试者获得的细胞内。
实施方案54.根据实施方案34-53中任一项所述的方法,其中所述GPR75抑制剂包含与GPR75 mRNA杂交的反义核酸分子、小干扰RNA(siRNA)或短发夹RNA(shRNA)。
实施方案55.根据实施方案34至53中任一项所述的方法,其中所述GPR75抑制剂包含Cas蛋白和与GPR75基因组核酸分子内的引导RNA(gRNA)识别序列杂交的gRNA。
实施方案56.根据实施方案55所述的方法,其中所述Cas蛋白质是Cas9或Cpf1。
实施方案57.根据实施方案55或实施方案56所述的方法,其中所述gRNA识别序列包括或接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546、根据SEQ IDNO:1的位置5,557、根据SEQ ID NO:1的位置5,911、根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923、根据SEQ ID NO:1的位置6,411或根据SEQ ID NO:1的位置5,831。
实施方案58.根据实施方案55或实施方案56所述的方法,其中所述gRNA识别序列位于距对应于以下位置的位置约1000、约500、约400、约300、约200、约100、约50、约45、约40、约35、约30、约25、约20、约15、约10或约5个核苷酸处:根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546、根据SEQ ID NO:1的位置5,557、根据SEQ ID NO:1的位置5,911、根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923、根据SEQ ID NO:1的位置6,411或根据SEQ ID NO:1的位置5,831。
实施方案59.根据实施方案55或实施方案56所述的方法,其中原型间隔区邻近基序(PAM)序列是所述gRNA识别序列下游的约2至6个核苷酸。
实施方案60.根据实施方案55至59中任一项所述的方法,其中所述gRNA包含约17至约23个核苷酸。
实施方案61.根据实施方案55至60中任一项所述的方法,其中所述gRNA识别序列包含根据SEQ ID NO:61-98中任一个的核苷酸序列。
实施方案62.一种鉴定具有增加的发展肥胖症的风险的受试者的方法,其中所述方法包括:
确定或已经确定在获自所述受试者的生物样品中存在或不存在编码预测的功能丧失性GPR75多肽的G蛋白偶联受体75(GPR75)错义变体核酸分子;
其中:
当所述受试者是GPR75参考时,则所述受试者具有增加的发展肥胖症的风险;并且
当所述受试者对于GPR75错义变体核酸分子是杂合的或对于GPR75错义变体核酸分子是纯合的时,则所述受试者具有降低的发展肥胖症的风险。
实施方案63.根据实施方案62所述的方法,其中所述GPR75错义变体核酸分子是编码Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs或Cys400fs的核酸分子。
实施方案64.根据实施方案63所述的方法,其中所述GPR75错义变体核酸分子是:
具有下述核苷酸序列的基因组核酸分子:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ IDNO:6的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;
具有下述核苷酸序列的mRNA分子:在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于SEQ ID NO:10的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:102的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ IDNO:103的位置891的位置处包含鸟嘌呤;或者
由mRNA分子产生的cDNA分子,其中所述cDNA分子具有下述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ IDNO:32的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ IDNO:42的位置811的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于SEQ ID NO:34的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案65.根据实施方案62至64中任一项所述的方法,其中所述确定步骤在体外进行。
实施方案66.根据实施方案62至64中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括对所述生物样品中所述GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列的至少一部分测序,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置5,540-5,546;根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557;根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911;根据SEQ ID NO:5或其互补序列的位置5,920-5,923;根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411;或根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831;
其中当所述生物样品中GPR75基因组核酸分子的所测序的部分:在对应于根据SEQID NO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ IDNO:99的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤时,则所述生物样品中的GPR75基因组核酸分子是GPR75错义变体基因组核酸分子。
实施方案67.根据实施方案62至66中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括对所述生物样品中所述GPR75 mRNA分子的核苷酸序列的至少一部分测序,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:11或其互补序列的位置539-545;根据SEQID NO:16或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:21或其互补序列的位置361-367;根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置600-606;根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556;根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457;根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378;根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617;根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910;根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811;根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732;根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971;根据SEQ ID NO:14或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:19或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置741-744;根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置980-983;根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410;根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232;根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471;根据SEQ IDNO:100或其互补序列的位置830;根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731;根据SEQ IDNO:102或其互补序列的位置652;或根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891;
其中当所述生物样品中的所述GPR75 mRNA分子的所测序的部分:在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103的位置891的位置处包含鸟嘌呤;则所述生物样品中的所述GPR75 mRNA分子是GPR75错义变体基因组核酸分子。
实施方案68.根据实施方案62至66中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括对所述生物样品中所述GPR75 cDNA分子的核苷酸序列的至少一部分测序,其中所测序的部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:35或其互补序列的位置539-545;根据SEQID NO:40或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:45或其互补序列的位置361-367;根据SEQ ID NO:50或其互补序列的位置600-606;根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556;根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457;根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378;根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617;根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910;根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811;根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732;根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971;根据SEQ ID NO:38或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:43或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:48或其互补序列的位置741-744;根据SEQ ID NO:53或其互补序列的位置980-983;根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410;根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232;根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471;根据SEQ IDNO:104或其互补序列的位置830;根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731;根据SEQIDNO:106或其互补序列的位置652;或根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891;
其中当所述生物样品中的所述GPR75 cDNA分子的所测序的部分:在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:106的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置处包含鸟嘌呤;则所述生物样品中的所述GPR75 cDNA分子是GPR75错义变体cDNA分子。
实施方案69.根据实施方案62至66中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括:
a)使所述生物样品与和所述GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触,所述部分接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2的位置5,540-5,546,根据SEQ ID NO:3的位置5,557,根据SEQ ID NO:4的位置5,911,根据SEQ ID NO:5的位置5,920-5,923,根据SEQ ID NO:6的位置6,411,或对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置;
b)使所述引物至少延伸通过GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2的位置5,540-5,546,根据SEQ ID NO:3的位置5,557,根据SEQ IDNO:4的位置5,911,根据SEQ ID NO:5的位置5,920-5,923,根据SEQ ID NO:6的位置6,411,或对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置;并且
c)确定所述引物的延伸产物是否:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案70.根据实施方案62至66中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括:
a)使所述生物样品与和GPR75 mRNA分子的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触,所述部分接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:11的位置539-545,根据SEQ ID NO:16的位置440-446,根据SEQ ID NO:21的位置361-367,根据SEQ ID NO:26的位置600-606,根据SEQ ID NO:12的位置556,根据SEQ ID NO:17的位置457,根据SEQ ID NO:22的位置378,根据SEQ ID NO:27的位置617,根据SEQ ID NO:13的位置910,根据SEQ ID NO:18的位置811,根据SEQ ID NO:23的位置732,根据SEQ ID NO:28的位置971,根据SEQ ID NO:14的位置919-922,根据SEQ ID NO:19的位置820-823,根据SEQ ID NO:24的位置741-744,根据SEQ ID NO:29的位置980-983,根据SEQ ID NO:15的位置1,410,根据SEQ ID NO:20的位置1,311,根据SEQ ID NO:25的位置1,232,根据SEQ ID NO:30的位置1,471,根据SEQ ID NO:100的位置830,根据SEQ ID NO:101的位置731,根据SEQ ID NO:102的位置652,或根据SEQID NO:103的位置891;
b)使所述引物至少延伸通过GPR75 mRNA分子的核苷酸序列的对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:11的位置539-545,根据SEQ ID NO:16的位置440-446,根据SEQ IDNO:21的位置361-367,根据SEQ ID NO:26的位置600-606,根据SEQ ID NO:12的位置556,根据SEQ ID NO:17的位置457,根据SEQ ID NO:22的位置378,根据SEQ ID NO:27的位置617,根据SEQ ID NO:13的位置910,根据SEQ ID NO:18的位置811,根据SEQ ID NO:23的位置732,根据SEQ ID NO:28的位置971,根据SEQ ID NO:14的位置919-922,根据SEQ ID NO:19的位置820-823,根据SEQ ID NO:24的位置741-744,根据SEQ ID NO:29的位置980-983,根据SEQ ID NO:15的位置1,410,根据SEQ ID NO:20的位置1,311,根据SEQ ID NO:25的位置1,232,根据SEQ ID NO:30的位置1,471,根据SEQ ID NO:100的位置830,根据SEQ ID NO:101的位置731,根据SEQ ID NO:102的位置652,或根据SEQ ID NO:103的位置891;并且
c)确定所述引物的延伸产物是否:在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ IDNO:10的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:102的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQID NO:103的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案71.根据实施方案62至66中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括:
a)使所述生物样品与和所述GPR75 cDNA分子的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触,所述部分接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:35的位置539-545,根据SEQID NO:40的位置440-446,根据SEQ ID NO:45的位置361-367,根据SEQ ID NO:50的位置600-606,根据SEQ ID NO:36的位置556,根据SEQ ID NO:41的位置457,根据SEQ ID NO:46的位置378,根据SEQ ID NO:51的位置617,根据SEQ ID NO:37的位置910,根据SEQ ID NO:42的位置811,根据SEQ ID NO:47的位置732,根据SEQ ID NO:52的位置971,根据SEQ IDNO:38的位置919-922,根据SEQ ID NO:43的位置820-823,根据SEQ ID NO:48的位置741-744,根据SEQ ID NO:53的位置980-983,根据SEQ ID NO:39的位置1,410,根据SEQ ID NO:44的位置1,311,根据SEQ ID NO:49的位置1,232,根据SEQ ID NO:54的位置1,471,根据SEQID NO:104的位置830,根据SEQ ID NO:105的位置731,根据SEQ ID NO:106的位置652,或根据SEQ ID NO:107的位置891;
b)使所述引物至少延伸通过GPR75 cDNA分子的核苷酸序列的对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:35的位置539-545,根据SEQ ID NO:40的位置440-446,根据SEQ IDNO:45的位置361-367,根据SEQ ID NO:50的位置600-606,根据SEQ ID NO:36的位置556,根据SEQ ID NO:41的位置457,根据SEQ ID NO:46的位置378,根据SEQ ID NO:51的位置617,根据SEQ ID NO:37的位置910,根据SEQ ID NO:42的位置811,根据SEQ ID NO:47的位置732,根据SEQ ID NO:52的位置971,根据SEQ ID NO:38的位置919-922,根据SEQ ID NO:43的位置820-823,根据SEQ ID NO:48的位置741-744,根据SEQ ID NO:53的位置980-983,根据SEQ ID NO:39的位置1,410,根据SEQ ID NO:44的位置1,311,根据SEQ ID NO:49的位置1,232,根据SEQ ID NO:54的位置1,471,根据SEQ ID NO:104的位置830,根据SEQ ID NO:105的位置731,根据SEQ ID NO:106的位置652,或根据SEQ ID NO:107的位置891;并且
c)确定所述引物的延伸产物是否:在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ IDNO:52的位置971的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案72.根据实施方案67至71中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括对整个核酸分子进行测序。
实施方案73.根据实施方案62至66中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括:
a)扩增编码人GPR75多肽的所述核酸分子的至少一部分,其中所述部分:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;
b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;
c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;并且
d)检测所述可检测标记。
实施方案74.根据实施方案62至66中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括:
a)扩增编码人GPR75多肽的所述核酸分子的至少一部分,其中所述部分:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ IDNO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;
b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;
c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且
d)检测所述可检测标记。
实施方案75.根据实施方案62至66中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括:
a)扩增编码人GPR75多肽的所述核酸分子的至少一部分,其中所述部分:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;
b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;
c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ IDNO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且
d)检测所述可检测标记。
实施方案76.根据实施方案75所述的方法,其中所述样品中的所述核酸分子是mRNA,并且在所述扩增步骤之前将所述mRNA逆转录成cDNA。
实施方案77.根据实施方案62至66中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
使所述生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;并且
检测所述可检测标记。
实施方案78.根据实施方案62至66中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
使所述生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ IDNO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且
检测所述可检测标记。
实施方案79.根据实施方案62至66中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
使所述生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且
检测所述可检测标记。
实施方案80.根据实施方案62至79中任一项所述的方法,其中所述受试者是GPR75参考,并且以标准剂量向所述受试者施用治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂。
实施方案81.根据实施方案62至79中任一项所述的方法,其中所述受试者对于GPR75错义变体核酸分子是杂合的,并且以与标准剂量相同或低于标准剂量的量向所述受试者施用治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂。
实施方案82.一种检测受试者中的人G蛋白偶联受体75(GPR75)变体核酸分子的方法,其包括测定获自所述受试者的样品以确定所述样品中的核酸分子是否是:
包含下述核苷酸序列的基因组核酸分子:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;
具有下述核苷酸序列的mRNA分子:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ IDNO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ IDNO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;或者
由mRNA分子产生的cDNA分子,其中所述cDNA分子具有下述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ IDNO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案83.根据实施方案82所述的方法,其中所述方法是体外方法。
实施方案84.根据实施方案82或实施方案83所述的方法,其中所述测定包括对所述核酸分子的至少一部分测序,其中所测序的部分:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案85.根据实施方案82或实施方案83所述的方法,其中所述测定包括对所述核酸分子的至少一部分测序,其中所测序的部分:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案86.根据实施方案82或实施方案83所述的方法,其中所述测定包括对所述核酸分子的至少一部分测序,其中所测序的部分:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49、其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案87.根据实施方案82或实施方案83所述的方法,其中所述测定包括:
a)使所述样品与和所述GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触,所述部分接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2的位置5,540-5,546,根据SEQ ID NO:3的位置5,557,根据SEQ ID NO:4的位置5,911,根据SEQ ID NO:5的位置5,920-5,923,根据SEQ ID NO:6的位置6,411,或根据SEQ ID NO:99的位置5,831;
b)使所述引物至少延伸通过所述GPR75基因组核酸分子的核苷酸序列对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2的位置5,540-5,546,根据SEQ ID NO:3的位置5,557,根据SEQ ID NO:4的位置5,911,根据SEQ ID NO:5的位置5,920-5,923,根据SEQ ID NO:6的位置6,411,或根据SEQ ID NO:99的位置5,831;并且
c)确定所述引物的延伸产物是否:在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案88.根据实施方案82或实施方案83所述的方法,其中所述测定包括:
a)使所述生物样品与和所述GPR75 mRNA分子的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触,所述部分接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:11的位置539-545,根据SEQID NO:16的位置440-446,根据SEQ ID NO:21的位置361-367,根据SEQ ID NO:26的位置600-606,根据SEQ ID NO:12的位置556,根据SEQ ID NO:17的位置457,根据SEQ ID NO:22的位置378,根据SEQ ID NO:27的位置617,根据SEQ ID NO:13的位置910,根据SEQ ID NO:18的位置811,根据SEQ ID NO:23的位置732,根据SEQ ID NO:28的位置971,根据SEQ IDNO:14的位置919-922,根据SEQ ID NO:19的位置820-823,根据SEQ ID NO:24的位置741-744,根据SEQ ID NO:29的位置980-983,根据SEQ ID NO:15的位置1,410,根据SEQ ID NO:20的位置1,311,根据SEQ ID NO:25的位置1,232,根据SEQ ID NO:30的位置1,471,根据SEQID NO:100的位置830,根据SEQ ID NO:101的位置731,根据SEQ ID NO:102的位置652,或根据SEQ ID NO:103的位置891;
b)使所述引物至少延伸通过GPR75 mRNA分子的核苷酸序列的对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:11的位置539-545,根据SEQ ID NO:16的位置440-446,根据SEQ IDNO:21的位置361-367,根据SEQ ID NO:26的位置600-606,根据SEQ ID NO:12的位置556,根据SEQ ID NO:17的位置457,根据SEQ ID NO:22的位置378,根据SEQ ID NO:27的位置617,根据SEQ ID NO:13的位置910,根据SEQ ID NO:18的位置811,根据SEQ ID NO:23的位置732,根据SEQ ID NO:28的位置971,根据SEQ ID NO:14的位置919-922,根据SEQ ID NO:19的位置820-823,根据SEQ ID NO:24的位置741-744,根据SEQ ID NO:29的位置980-983,根据SEQ ID NO:15的位置1,410,根据SEQ ID NO:20的位置1,311,根据SEQ ID NO:25的位置1,232,根据SEQ ID NO:30的位置1,471,根据SEQ ID NO:100的位置830,根据SEQ ID NO:101的位置731,根据SEQ ID NO:102的位置652,或根据SEQ ID NO:103的位置891;并且
c)确定所述引物的延伸产物是否:在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:12的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:27的位置617的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ IDNO:10的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:102的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQID NO:103的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案89.根据实施方案82或实施方案83所述的方法,其中所述测定包括:
a)使所述样品与和所述GPR75 cDNA分子的核苷酸序列的一部分杂交的引物接触,所述部分接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:35的位置539-545,根据SEQ ID NO:40的位置440-446,根据SEQ ID NO:45的位置361-367,根据SEQ ID NO:50的位置600-606,根据SEQ ID NO:36的位置556,根据SEQ ID NO:41的位置457,根据SEQ ID NO:46的位置378,根据SEQ ID NO:51的位置617,根据SEQ ID NO:37的位置910,根据SEQ ID NO:42的位置811,根据SEQ ID NO:47的位置732,根据SEQ ID NO:52的位置971,根据SEQ ID NO:38的位置919-922,根据SEQ ID NO:43的位置820-823,根据SEQ ID NO:48的位置741-744,根据SEQ ID NO:53的位置980-983,根据SEQ ID NO:39的位置1,410,根据SEQ ID NO:44的位置1,311,根据SEQ ID NO:49的位置1,232,根据SEQ ID NO:54的位置1,471,根据SEQ ID NO:104的位置830,根据SEQ ID NO:105的位置731,根据SEQ ID NO:106的位置652,或根据SEQID NO:107的位置891;
b)使所述引物至少延伸通过GPR75 cDNA分子的核苷酸序列的对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:35的位置539-545,根据SEQ ID NO:40的位置440-446,根据SEQ IDNO:45的位置361-367,根据SEQ ID NO:50的位置600-606,根据SEQ ID NO:36的位置556,根据SEQ ID NO:41的位置457,根据SEQ ID NO:46的位置378,根据SEQ ID NO:51的位置617,根据SEQ ID NO:37的位置910,根据SEQ ID NO:42的位置811,根据SEQ ID NO:47的位置732,根据SEQ ID NO:52的位置971,根据SEQ ID NO:38的位置919-922,根据SEQ ID NO:43的位置820-823,根据SEQ ID NO:48的位置741-744,根据SEQ ID NO:53的位置980-983,根据SEQ ID NO:39的位置1,410,根据SEQ ID NO:44的位置1,311,根据SEQ ID NO:49的位置1,232,或根据SEQ ID NO:54的位置1,471,根据SEQ ID NO:104的位置830,根据SEQ ID NO:105的位置731,根据SEQ ID NO:106的位置652,或根据SEQ ID NO:107的位置891;并且
c)确定所述引物的延伸产物是否:在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:47的位置732的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ IDNO:52的位置971的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案90.根据实施方案84至89中任一项所述的方法,其中所述测定包括对整个核酸分子进行测序。
实施方案91.根据实施方案82或实施方案83所述的方法,其中所述测定包括:
a)扩增编码人GPR75多肽的所述核酸分子的至少一部分,其中所述部分:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831;
b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;
c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;并且
d)检测所述可检测标记。
实施方案92.根据实施方案82或实施方案83所述的方法,其中所述测定包括:
a)扩增编码人GPR75多肽的所述核酸分子的至少一部分,其中所述部分:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ IDNO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;
b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;
c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且
d)检测所述可检测标记。
实施方案93.根据实施方案82或实施方案83所述的方法,其中所述测定包括:
a)扩增编码人GPR75多肽的所述核酸分子的至少一部分,其中所述部分:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;
b)用可检测标记来标记所扩增的核酸分子;
c)使标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ IDNO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且
d)检测所述可检测标记。
实施方案94.根据实施方案93所述的方法,其中所述样品中的所述核酸分子是mRNA,并且在所述扩增步骤之前将所述mRNA逆转录成cDNA。
实施方案95.根据实施方案82或实施方案83所述的方法,其中所述测定包括:
使所述生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;并且
检测所述可检测标记。
实施方案96.根据实施方案82或实施方案83所述的方法,其中所述测定包括:
使所述生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ IDNO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且
检测所述可检测标记。
实施方案97.根据实施方案82或实施方案83所述的方法,其中所述测定包括:
使所述生物样品中的核酸分子与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所扩增的核酸分子的核酸序列杂交的核苷酸序列,所扩增的核酸分子的核酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;并且
检测所述可检测标记。
实施方案98.根据实施方案82至97中任一项所述的方法,其中所述核酸分子存在于从所述受试者获得的细胞内。
实施方案99.一种检测人G蛋白偶联受体75(GPR75)Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs或Cys400fs变体多肽的存在的方法,其包括对获自受试者的样品进行测定以确定所述样品中的GPR75蛋白是否包含SEQ ID NO:56、SEQ ID NO:57、SEQ ID NO:58、SEQ ID NO:59、SEQ ID NO:60或SEQ ID NO:108。
实施方案100.根据实施方案99所述的方法,其中所述测定包括对所述多肽进行测序。
实施方案101.根据实施方案99所述的方法,其中所述测定是免疫测定。
实施方案102.一种分离的包含至少约15个核苷酸的改变特异性探针或改变特异性引物,其中所述改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,其中所述部分包含对应于以下位置的位置:
根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置5,540-5,546;根据SEQ ID NO:11或其互补序列的位置539-545;根据SEQ ID NO:16或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:21或其互补序列的位置361-367;根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置600-606;根据SEQID NO:35或其互补序列的位置539-545;根据SEQ ID NO:40或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:45或其互补序列的位置361-367;或根据SEQ ID NO:50或其互补序列的位置600-606;
根据SEQ ID NO:5或其互补序列的位置5,920-5,923;根据SEQ ID NO:14或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:19或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置741-744;根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置980-983;根据SEQID NO:38或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:43或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:48或其互补序列的位置741-744;或根据SEQ ID NO:53或其互补序列的位置980-983;或
根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411;根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410;根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232;根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471;根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410;根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232;或根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471。
实施方案103.根据实施方案102所述的改变特异性探针或改变特异性引物,其包含与核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,所述部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置5,540-5,546;根据SEQ ID NO:5或其互补序列的位置5,920-5,923;或根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411。
实施方案104.根据实施方案102所述的改变特异性探针或改变特异性引物,其包含与核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,所述部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:11或其互补序列的位置539-545;根据SEQ ID NO:16或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:21或其互补序列的位置361-367;根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置600-606;根据SEQ ID NO:14或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:19或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置741-744;根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置980-983;根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410;根据SEQID NO:20或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232;或根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471。
实施方案105.根据实施方案102所述的改变特异性探针或改变特异性引物,其包含与核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,所述部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:35或其互补序列的位置539-545;根据SEQ ID NO:40或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:45或其互补序列的位置361-367;根据SEQ ID NO:50或其互补序列的位置600-606;根据SEQ ID NO:38或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:43或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:48或其互补序列的位置741-744;根据SEQ ID NO:53或其互补序列的位置980-983;根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410;根据SEQID NO:44或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232;或根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471。
实施方案106.根据实施方案102至105中任一项所述的改变特异性探针或改变特异性引物,其中所述改变特异性探针或改变特异性引物包含DNA。
实施方案107.根据实施方案102至105中任一项所述的改变特异性探针或改变特异性引物,其中所述改变特异性探针或改变特异性引物包含RNA。
实施方案108.根据实施方案102至107中任一项所述的改变特异性探针或改变特异性引物,其中所述改变特异性探针或改变特异性引物包含标记。
实施方案109.根据实施方案108所述的改变特异性探针或改变特异性引物,其中所述标记是荧光标记、放射性标记或生物素。
实施方案110.一种包含基质的支持物,根据实施方案102至109中任一项所述的改变特异性探针或改变特异性引物附接于所述基质。
实施方案111.根据实施方案110所述的支持物,其中所述支持物是微阵列。
实施方案112.一种分子复合物,其包含与包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子杂交的改变特异性引物或改变特异性探针,其中所述改变特异性引物或所述改变特异性探针在以下位置处与所述基因组核酸分子杂交:在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置5,539-5,540的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置的胸腺嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:5或其互补序列的位置5,919-5,920的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置的胸腺嘧啶处;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置的鸟嘌呤处。
实施方案113.根据实施方案112所述的分子复合物,其中所述基因组核酸分子包含SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6或SEQ ID NO:99。
实施方案114.一种分子复合物,其包含与包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列的mRNA分子杂交的改变特异性引物或改变特异性探针,其中所述改变特异性引物或所述改变特异性探针在以下位置处与所述mRNA分子杂交:在对应于根据SEQ IDNO:11或其互补序列的位置538-539的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:16或其互补序列的位置439-440的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:21或其互补序列的位置360-361的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置599-600的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQID NO:22或其互补序列的位置378的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:14或其互补序列的位置918-919的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:19或其互补序列的位置819-820的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置740-741的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置979-980的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤处;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤处。
实施方案115.根据实施方案114所述的分子复合物,其中所述mRNA分子包含SEQID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQID NO:23、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQID NO:29、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:102或SEQ ID NO:103。
实施方案116.一种分子复合物,其包含与包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列的cDNA分子杂交的改变特异性引物或改变特异性探针,其中所述改变特异性引物或所述改变特异性探针与下述核苷酸杂交:在对应于根据SEQ ID NO:35或其互补序列的位置538-539的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:40或其互补序列的位置439-440的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:45或其互补序列的位置360-361的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:50或其互补序列的位置599-600的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:41或其互补序列的位置457的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:38或其互补序列的位置918-919的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:43或其互补序列的位置819-820的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:48或其互补序列的位置740-741的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:53或其互补序列的位置979-980的位置的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤。
实施方案117.根据实施方案116所述的分子复合物,其中所述cDNA分子包含SEQID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:46、SEQID NO:47、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:50、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:52、SEQID NO:53或SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:106或SEQ ID NO:107。
实施方案118.根据实施方案112至117中任一项所述的分子复合物,其中所述改变特异性探针或改变特异性引物包含标记。
实施方案119.根据实施方案118所述的分子复合物,其中所述标记是荧光标记、放射性标记或生物素。
实施方案120.根据实施方案112至119中任一项所述的分子复合物,其还包含非人聚合酶。
实施方案121.一种分离的核酸分子,其包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列或其互补序列,其中所述多肽包含:从对应于根据SEQ ID NO:56的位置110的位置开始的移码,从对应于根据SEQ ID NO:59的位置236的位置开始的移码,或从对应于根据SEQ ID NO:60的位置400的位置开始的移码。
实施方案122.根据实施方案121所述的分离的核酸分子或其互补序列,其中所述核酸分子编码GPR75多肽,所述多肽具有与以下序列至少约90%同一的氨基酸序列:SEQ IDNO:56,其中所述多肽包含从对应于根据SEQ ID NO:56的位置110的位置开始的移码;SEQID NO:59,其中所述多肽包含从对应于根据SEQ ID NO:59的位置236的位置开始的移码;或SEQ ID NO:60,其中所述多肽包含从对应于根据SEQ ID NO:60的位置400的位置开始的移码。
实施方案123.根据实施方案121所述的核酸分子或其互补序列,其中所述多肽包含SEQ ID NO:56、SEQ ID NO:59或SEQ ID NO:60。
实施方案124.一种载体,所述载体包含根据实施方案121至123中任一项所述的分离的核酸分子或其互补序列。
实施方案125.根据实施方案124所述的载体,其中所述载体是质粒。
实施方案126.根据实施方案124所述的载体,其中所述载体是病毒。
实施方案127.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含根据实施方案121至123中任一项所述的分离的核酸分子或其互补序列。
实施方案128.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含根据实施方案124至126中任一项所述的载体。
实施方案129.根据实施方案127或实施方案128所述的宿主细胞,其中所述核苷酸序列可操作地连接到在所述宿主细胞中有活性的启动子。
实施方案130.根据实施方案129所述的宿主细胞,其中所述启动子是外源启动子。
实施方案131.根据实施方案129或实施方案130所述的宿主细胞,其中所述启动子是诱导型启动子。
实施方案132.根据实施方案127至131中任一项所述的宿主细胞,其中所述宿主细胞是细菌细胞、酵母细胞、昆虫细胞或哺乳动物细胞。
实施方案133.一种组合物,所述组合物包含根据实施方案121至123中任一项所述的分离的核酸分子或其互补序列和载剂。
实施方案134.一种组合物,所述组合物包含根据实施方案124至126中任一项所述的载体和载剂。
实施方案135.一种分离的基因组核酸分子,其包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
实施方案136.根据实施方案135所述的分离的基因组核酸分子或其互补序列,其中所述核苷酸序列与以下序列具有至少90%的序列同一性:SEQ ID NO:2,并且在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;SEQ ID NO:5,并且在对应于根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;或SEQ ID NO:6,在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
实施方案137.根据实施方案136所述的分离的基因组核酸分子或其互补序列,其中所述核酸分子包含SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6。
实施方案138.一种载体,所述载体包含根据实施方案135至137中任一项所述的分离的基因组核酸分子或其互补序列。
实施方案139.根据实施方案138所述的载体,其中所述载体是质粒。
实施方案140.根据实施方案138所述的载体,其中所述载体是病毒。
实施方案141.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含根据实施方案135至137中任一项所述的分离的基因组核酸分子或其互补序列。
实施方案142.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含根据实施方案138至140中任一项所述的载体。
实施方案143.根据实施方案141或实施方案142所述的宿主细胞,其中所述核苷酸序列可操作地连接到在所述宿主细胞中有活性的启动子。
实施方案144.根据实施方案143所述的宿主细胞,其中所述启动子是外源启动子。
实施方案145.根据实施方案143或实施方案144所述的宿主细胞,其中所述启动子是诱导型启动子。
实施方案146.根据实施方案141至145中任一项所述的宿主细胞,其中所述宿主细胞是细菌细胞、酵母细胞、昆虫细胞或哺乳动物细胞。
实施方案147.一种组合物,所述组合物包含根据实施方案135至137中任一项所述的分离的基因组核酸分子或其互补序列和载剂。
实施方案148.一种组合物,所述组合物包含根据实施方案138至140中任一项所述的载体和载剂。
实施方案149.一种分离的mRNA分子,其包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入。
实施方案150.根据实施方案149所述的分离的mRNA分子或其互补序列,其中所述核苷酸序列与以下序列具有至少90%的序列同一性:SEQ ID NO:11,并且在对应于根据SEQID NO:7的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;SEQ ID NO:16,并且在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;SEQ ID NO:21,并且在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;SEQ ID NO:26,并且在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;SEQ ID NO:14,并且在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;SEQ ID NO:19,并且在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;SEQ ID NO:24,并且在对应于根据SEQ ID NO:9的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;SEQ IDNO:29,并且在对应于根据SEQ ID NO:10的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;SEQID NO:15,并且在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;SEQID NO:20,并且在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;SEQID NO:25,并且在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;或SEQ ID NO:30,并且在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入。
实施方案151.根据实施方案149所述的分离的mRNA分子或其互补序列,其中所述核酸分子包含SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:29或SEQ ID NO:30。
实施方案152.一种载体,所述载体包含根据实施方案149至151中任一项所述的分离的mRNA分子或其互补序列。
实施方案153.根据实施方案152所述的载体,其中所述载体是质粒。
实施方案154.根据实施方案152所述的载体,其中所述载体是病毒。
实施方案155.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含根据实施方案149至151中任一项所述的分离的mRNA分子或其互补序列。
实施方案156.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含根据实施方案152至154中任一项所述的载体。
实施方案157.根据实施方案155或实施方案156所述的宿主细胞,其中所述核苷酸序列可操作地连接到在所述宿主细胞中有活性的启动子。
实施方案158.根据实施方案157所述的宿主细胞,其中所述启动子是外源启动子。
实施方案159.根据实施方案157或实施方案158所述的宿主细胞,其中所述启动子是诱导型启动子。
实施方案160.根据实施方案155至159中任一项所述的宿主细胞,其中所述宿主细胞是细菌细胞、酵母细胞、昆虫细胞或哺乳动物细胞。
实施方案161.一种组合物,所述组合物包含根据实施方案149至151中任一项所述的分离的mRNA分子或其互补序列和载剂。
实施方案162.一种组合物,所述组合物包含根据实施方案152至154中任一项所述的载体和载剂。
实施方案163.一种分离的cDNA分子,其包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
实施方案164.根据实施方案163所述的分离的cDNA分子或其互补序列,其中所述核苷酸序列与以下序列具有至少90%的序列同一性:SEQ ID NO:35,并且在对应于根据SEQID NO:31的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;SEQ ID NO:40,并且在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;SEQ ID NO:45,并且在对应于根据SEQ ID NO:33的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;SEQ ID NO:50,并且在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;SEQ ID NO:38,并且在对应于根据SEQ ID NO:31的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;SEQ IDNO:43,并且在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;SEQID NO:48,并且在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;SEQ ID NO:53,并且在对应于根据SEQ IDNO:34的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;SEQ ID NO:39,并且在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;SEQ ID NO:44,并且在对应于根据SEQ ID NO:44的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;SEQ ID NO:49,并且在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或SEQ ID NO:54,并且在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
实施方案165.根据实施方案163所述的分离的cDNA分子或其互补序列,其中所述核酸分子包含SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:50、SEQ ID NO:53或SEQ ID NO:54。
实施方案166.一种载体,所述载体包含根据实施方案163至165中任一项所述的cDNA分子或其互补序列。
实施方案167.根据实施方案166所述的载体,其中所述载体是质粒。
实施方案168.根据实施方案166所述的载体,其中所述载体是病毒。
实施方案169.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含根据实施方案163至165中任一项所述的cDNA分子或其互补序列。
实施方案170.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含根据实施方案166至168中任一项所述的载体。
实施方案171.根据实施方案169或实施方案170所述的宿主细胞,其中所述核苷酸序列可操作地连接到在所述宿主细胞中有活性的启动子。
实施方案172.根据实施方案171所述的宿主细胞,其中所述启动子是外源启动子。
实施方案173.根据实施方案171或实施方案172所述的宿主细胞,其中所述启动子是诱导型启动子。
实施方案174.根据实施方案169至173中任一项所述的宿主细胞,其中所述宿主细胞是细菌细胞、酵母细胞、昆虫细胞或哺乳动物细胞。
实施方案175.一种组合物,所述组合物包含根据实施方案163至165中任一项所述的cDNA分子或其互补序列和载剂。
实施方案176.一种组合物,所述组合物包含根据实施方案166至168中任一项所述的载体和载剂。
实施方案177.一种分离的人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽,其具有与以下序列至少约90%同一的氨基酸序列:SEQ ID NO:56,其中所述多肽在对应于根据SEQ ID NO:55的位置110至540的位置缺乏氨基酸;SEQ ID NO:59,其中所述多肽在对应于根据SEQ ID NO:55的位置236至540的位置缺乏氨基酸;或SEQ ID NO:60,其中所述多肽在对应于根据SEQID NO:55的位置400至540的位置缺乏氨基酸。
实施方案178.根据实施方案177所述的多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:56、SEQ ID NO:59或SEQ ID NO:60。
实施方案179.根据实施方案177或实施方案178所述的多肽,其中所述多肽与异源分子融合。
实施方案180.根据实施方案179所述的多肽,其中所述异源分子包含免疫球蛋白Fc结构域、肽纯化标签、荧光蛋白或转导结构域。
实施方案181.根据实施方案177至180中任一项所述的多肽,其中所述多肽连接至标记。
实施方案182.根据实施方案181所述的多肽,其中所述标记是荧光标记或放射性标记。
实施方案183.根据实施方案181所述的多肽,其中所述标记包括聚乙二醇、聚唾液酸或乙醇酸。
实施方案184.一种组合物,所述组合物包含根据实施方案177至183中任一项所述的多肽和载剂或赋形剂。
实施方案185.一种宿主细胞,所述宿主细胞表达实施方案177至183中任一项所述的多肽。
实施方案186.一种产生根据实施方案177至183中任一项所述的多肽的方法,所述方法包括培养包含编码所述多肽的核酸分子的宿主细胞,由此所述宿主细胞表达所述多肽,并且回收所表达的多肽。
实施方案187.根据实施方案186所述的方法,其中所述核酸分子在异源启动子的控制下。
实施方案188.根据实施方案186或实施方案187所述的方法,其中所述核酸分子在诱导型启动子的控制下。
实施方案189.一种分离的核酸分子或其互补序列,其包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列,其中所述多肽:在对应于根据SEQ ID NO:57的位置116的位置处包含苏氨酸,在对应于根据SEQ ID NO:58的位置233的位置终止,或在对应于根据SEQID NO:99的位置207的位置处包含半胱氨酸。
实施方案190.根据实施方案189所述的分离的核酸分子或其互补序列,其中所述核酸分子编码GPR75多肽,所述多肽具有与以下序列至少约90%同一的氨基酸序列:SEQ IDNO:57,其中所述多肽在对应于根据SEQ ID NO:57的位置116的位置处包含苏氨酸;SEQ IDNO:58,其中所述多肽在对应于根据SEQ ID NO:58的位置233的位置终止;或SEQ ID NO:99,其中所述多肽在对应于根据SEQ ID NO:99的位置207的位置处包含半胱氨酸。
实施方案191.根据实施方案189所述的核酸分子或其互补序列,其中所述多肽包含SEQ ID NO:57、SEQ ID NO:58或SEQ ID NO:99。
实施方案192.一种载体,所述载体包含根据实施方案189至191中任一项所述的分离的核酸分子或其互补序列。
实施方案193.根据实施方案192所述的载体,其中所述载体是质粒。
实施方案194.根据实施方案192所述的载体,其中所述载体是病毒。
实施方案195.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含根据实施方案189至191中任一项所述的分离的核酸分子或其互补序列。
实施方案196.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含根据实施方案192至194中任一项所述的载体。
实施方案197.根据实施方案195或实施方案196所述的宿主细胞,其中所述核苷酸序列可操作地连接到在所述宿主细胞中有活性的启动子。
实施方案198.根据实施方案197所述的宿主细胞,其中所述启动子是外源启动子。
实施方案199.根据实施方案197或实施方案198所述的宿主细胞,其中所述启动子是诱导型启动子。
实施方案200.根据实施方案195至199中任一项所述的宿主细胞,其中所述宿主细胞是细菌细胞、酵母细胞、昆虫细胞或哺乳动物细胞。
实施方案201.一种组合物,所述组合物包含根据实施方案189至191中任一项所述的分离的核酸分子或其互补序列和载剂。
实施方案202.一种组合物,所述组合物包含根据实施方案192至194中任一项所述的载体和载剂。
实施方案203.一种分离的mRNA分子,其包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案204.根据实施方案203所述的分离的mRNA分子或其互补序列,其中所述核苷酸序列与以下序列具有至少90%的序列同一性:SEQ ID NO:12,并且在对应于根据SEQID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;SEQ ID NO:17,并且在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;SEQ ID NO:22,并且在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;SEQ ID NO:27,并且在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;SEQ ID NO:13,并且在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;SEQ ID NO:18,并且在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;SEQ IDNO:23,并且在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;SEQID NO:28,并且在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;SEQ ID NO:100,并且在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;SEQ ID NO:101,并且在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;SEQ ID NO:102,并且在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或SEQ ID NO:103,并且在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案205.根据实施方案203所述的分离的mRNA分子或其互补序列,其中所述核酸分子包含SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:102或SEQ ID NO:103。
实施方案206.一种载体,所述载体包含根据实施方案203至205中任一项所述的分离的mRNA分子或其互补序列。
实施方案207.根据实施方案206所述的载体,其中所述载体是质粒。
实施方案208.根据实施方案206所述的载体,其中所述载体是病毒。
实施方案209.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含根据实施方案203至205中任一项所述的分离的mRNA分子或其互补序列。
实施方案210.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含根据实施方案206至208中任一项所述的载体。
实施方案211.根据实施方案209或实施方案210所述的宿主细胞,其中所述核苷酸序列可操作地连接到在所述宿主细胞中有活性的启动子。
实施方案212.根据实施方案211所述的宿主细胞,其中所述启动子是外源启动子。
实施方案213.根据实施方案211或实施方案212所述的宿主细胞,其中所述启动子是诱导型启动子。
实施方案214.根据实施方案209至213中任一项所述的宿主细胞,其中所述宿主细胞是细菌细胞、酵母细胞、昆虫细胞或哺乳动物细胞。
实施方案215.一种组合物,所述组合物包含根据实施方案203至205中任一项所述的分离的mRNA分子或其互补序列和载剂。
实施方案216.一种组合物,所述组合物包含根据实施方案206至208中任一项所述的载体和载剂。
实施方案217.一种分离的cDNA分子,其包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ IDNO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案218.根据实施方案217所述的分离的cDNA分子或其互补序列,其中所述核苷酸序列与以下序列具有至少90%的序列同一性:SEQ ID NO:36,并且在对应于根据SEQID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;SEQ ID NO:41,并且在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;SEQ ID NO:46,并且在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;SEQ ID NO:51,并且在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;SEQ ID NO:37,并且在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;SEQ ID NO:42,并且在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;SEQID NO:47,并且在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;SEQ ID NO:52,并且在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;SEQ ID NO:104,并且在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;SEQ ID NO:105,并且在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;SEQ ID NO:106,并且在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或SEQ ID NO:107,并且在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案219.根据实施方案217所述的分离的cDNA分子或其互补序列,其中所述核酸分子包含SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:47、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:106或SEQ ID NO:107。
实施方案220.一种载体,所述载体包含根据实施方案217至219中任一项所述的分离的cDNA分子或其互补序列。
实施方案221.根据实施方案220所述的载体,其中所述载体是质粒。
实施方案222.根据实施方案220所述的载体,其中所述载体是病毒。
实施方案223.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含根据实施方案217至219中任一项所述的分离的cDNA分子或其互补序列。
实施方案224.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含根据实施方案220至222中任一项所述的载体。
实施方案225.根据实施方案223或实施方案224所述的宿主细胞,其中所述核苷酸序列可操作地连接到在所述宿主细胞中有活性的启动子。
实施方案226.根据实施方案225所述的宿主细胞,其中所述启动子是外源启动子。
实施方案227.根据实施方案225或实施方案226所述的宿主细胞,其中所述启动子是诱导型启动子。
实施方案228.根据实施方案223至227中任一项所述的宿主细胞,其中所述宿主细胞是细菌细胞、酵母细胞、昆虫细胞或哺乳动物细胞。
实施方案229.一种组合物,所述组合物包含根据实施方案217至219中任一项所述的分离的cDNA分子或其互补序列和载剂。
实施方案230.一种组合物,所述组合物包含根据实施方案220至222中任一项所述的载体和载剂。
实施方案231.一种分离的基因组核酸分子,其包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置的鸟嘌呤。
实施方案232.根据实施方案231所述的分离的基因组核酸分子或其互补序列,其中所述核苷酸序列与以下序列具有至少90%的序列同一性:SEQ ID NO:3,并且在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;SEQ ID NO:4,并且在对应于根据SEQ IDNO:4的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;或SEQ ID NO:99,并且在对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案233.根据实施方案231所述的分离的基因组核酸分子或其互补序列,其中所述核酸分子包含SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4或SEQ ID NO:99。
实施方案234.一种载体,所述载体包含根据实施方案231至233中任一项所述的分离的基因组核酸分子或其互补序列。
实施方案235.根据实施方案234所述的载体,其中所述载体是质粒。
实施方案236.根据实施方案234所述的载体,其中所述载体是病毒。
实施方案237.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含根据实施方案231至233中任一项所述的分离的基因组核酸分子或其互补序列。
实施方案238.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含根据实施方案234至236中任一项所述的载体。
实施方案239.根据实施方案237或实施方案238所述的宿主细胞,其中所述核苷酸序列可操作地连接到在所述宿主细胞中有活性的启动子。
实施方案240.根据实施方案239所述的宿主细胞,其中所述启动子是外源启动子。
实施方案241.根据实施方案239或实施方案240所述的宿主细胞,其中所述启动子是诱导型启动子。
实施方案242.根据实施方案237至241中任一项所述的宿主细胞,其中所述宿主细胞是细菌细胞、酵母细胞、昆虫细胞或哺乳动物细胞。
实施方案243.一种组合物,所述组合物包含根据实施方案231至233中任一项所述的分离的基因组核酸分子或其互补序列和载剂。
实施方案244.一种组合物,所述组合物包含根据实施方案234至236中任一项所述的载体和载剂。
实施方案245.一种分离的人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽,其具有与以下序列至少约90%同一的氨基酸序列:SEQ ID NO:57,其中所述多肽在对应于根据SEQ ID NO:57的位置116的位置处包含苏氨酸;SEQ ID NO:58,其中所述多肽在对应于根据SEQ ID NO:58的位置233的位置终止;或SEQ ID NO:99,其中所述多肽在对应于根据SEQ ID NO:99的位置207的位置处包含半胱氨酸。
实施方案246.根据实施方案245所述的多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:57、SEQ ID NO:58或SEQ ID NO:99。
实施方案247.根据实施方案245或实施方案246所述的多肽,其中所述多肽与异源分子融合。
实施方案248.根据实施方案247所述的多肽,其中所述异源分子包含免疫球蛋白Fc结构域、肽纯化标签、荧光蛋白或转导结构域。
实施方案249.根据实施方案245至248中任一项所述的多肽,其中所述多肽连接至标记。
实施方案250.根据实施方案249所述的多肽,其中所述标记是荧光标记或放射性标记。
实施方案251.根据实施方案249所述的多肽,其中所述标记包括聚乙二醇、聚唾液酸或乙醇酸。
实施方案252.一种组合物,所述组合物包含根据实施方案245至251中任一项所述的多肽和载剂或赋形剂。
实施方案253.一种宿主细胞,所述宿主细胞表达实施方案245至251中任一项所述的多肽。
实施方案254.一种产生根据实施方案245至251中任一项所述的多肽的方法,所述方法包括培养包含编码所述多肽的核酸分子的宿主细胞,由此所述宿主细胞表达所述多肽,并且回收所表达的多肽。
实施方案255.根据实施方案254所述的方法,其中所述核酸分子在异源启动子的控制下。
实施方案256.根据实施方案254或实施方案255所述的方法,其中所述核酸分子在诱导型启动子的控制下。
实施方案257.一种治疗或抑制肥胖症的治疗剂,其用于治疗受试者的肥胖症,所述受试者具有:
具有编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;
具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ IDNO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;或
具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案258.一种G蛋白偶联受体75(GPR75)抑制剂,其用于治疗受试者的肥胖症,所述受试者具有:
具有编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;
具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ IDNO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;或
具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ IDNO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
实施方案259.根据实施方案258所述的GPR75抑制剂,所述抑制剂是与GPR75 mRNA杂交的反义核酸分子、小干扰RNA(siRNA)或短发夹RNA(shRNA)。
实施方案260.根据实施方案258所述的GPR75抑制剂,所述抑制剂包含Cas蛋白和与GPR75基因组核酸分子内的引导RNA(gRNA)识别序列杂交的gRNA。
实施方案261.根据实施方案260所述的GPR75抑制剂,其中所述Cas蛋白为Cas9或Cpf1。
实施方案262.根据实施方案260或实施方案261所述的GPR75抑制剂,其中所述gRNA识别序列包括或接近以下位置:根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546、根据SEQ IDNO:1的位置5,557、根据SEQ ID NO:1的位置5,911、根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923、根据SEQ ID NO:1的位置6,411或根据SEQ ID NO:1的位置5,831。
实施方案263.根据实施方案260或实施方案261所述的GPR75抑制剂,其中所述gRNA识别序列位于距对应于以下位置的位置约1000、约500、约400、约300、约200、约100、约50、约45、约40、约35、约30、约25、约20、约15、约10或约5个核苷酸处:根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546、根据SEQ ID NO:1的位置5,557、根据SEQ ID NO:1的位置5,911、根据SEQID NO:1的位置5,920-5,923、根据SEQ ID NO:1的位置6,411或根据SEQ ID NO:1的位置5,831。
实施方案264.根据实施方案260或实施方案261所述的GPR75抑制剂,其中原型间隔区邻近基序(PAM)序列是所述gRNA识别序列下游的约2至约6个核苷酸。
实施方案265.根据实施方案260至264中任一项所述的GPR75抑制剂,其中所述gRNA包含约17至约23个核苷酸。
实施方案266.根据实施方案260至265中任一项所述的GPR75抑制剂,其中所述gRNA识别序列包含根据SEQ ID NO:61-98中任一个的核苷酸序列。
提供以下实施例来更详细地描述实施方案。它们意图说明但不限制所要求保护的实施方案。以下实施例向本领域普通技术人员提供对于如何制备和评价本文所述的化合物、组合物、制品、设备和/或方法的公开和描述,并且旨在纯粹为示例性并非旨在限制任何权利要求的范围。已努力确保有关数字(诸如例如,量、温度等)的准确性,但应考虑某些误差和偏差。除非另外指示,否则份数是重量份,温度是以℃计或处于环境温度,并且压力处于或接近大气压。
实施例
实施例1:材料和方法
参与队列
在英国(UK)生物样本库(UKB)队列中(Sudlow等人,PLoS Med 12,2015,e1001779),在来自格伊辛格卫生医疗系统(GHS)的MyCode社区健康倡议队列中(Carey等人,Genet.Med.,2016,18,906-913)以及在墨西哥市前瞻性研究(Mexico CityProspective Study,MCPS)中(Tapia-Conyer等人,Int.J.Epidemiol.,2006,35,243-249)进行发现遗传关联研究。UKB是2006-2010年间通过英国22家检测中心招募的40至69岁人群的基于群体的队列研究。总共包括428,719名具有可用的全外显子组测序数据和临床表型数据的欧洲血统参与者(图1)。英国生物样本库获得涵盖英国在内的西北多中心研究伦理委员会(North West Multi-centre Research Ethics Committee,MREC;11/NW/0382)的批准。GHS MyCode研究是2007-2019年从宾夕法尼亚州中部和东部(Central and EasternPennsylvania,USA)招募的患者的基于健康系统的队列。总共包括121,061名具有可用的全基因组测序和临床表型数据的欧洲血统参与者(图1)。GHS MyCode研究受格伊辛格机构审查委员会(Geisinger Institutional Review Board,2006-0258)批准。MCPS是1998-2004年从墨西哥市的两个邻近市区招募的年龄≥35岁的人群的队列研究。MCPS中参与者的研究设计和临床特征已在先前的出版物中有详细描述(Tapia-Conyer等人,Int.J.Epidemiol.,2006,35,243-249;和Alegre-Diaz等人,N.Engl.J.Med.,2016,375,1961-1971)。总共包括95,846名具有可用的全外显子组测序数据和临床表型数据的美国混血个体(图1)。MCPS研究受墨西哥卫生部,墨西哥国家科学技术委员会(Mexican Ministry of Health,theMexican National Council for Science and Technology)和牛津大学(University ofOxford)批准。
在未包括在发现集合中的另外91,328个外显子组中进一步估计GPR75预测功能丧失性(pLOF)变体与BMI的关联。这些包括来自英国生物样本库的非欧洲血统参与者(UKB,N=12,321)(Sudlow等人,PLoS Med 12,2015,e1001779),以及西奈山生物群落队列(MountSinai BioMe cohort)中的参与者(SINAI,N=21,143)、宾夕法尼亚大学医学生物样本库(University of Pennsylvania Medicine BioBank)中的参与者(PMBB;N=7,519)、杜克大学导管遗传学(Duke Catheterization Genetics,CATHGEN)队列中的参与者(DUKE;N=8,171)(Kraus等人,J.Cardiovasc.Transl.Res.,2015,8,449-457)、来自台湾Metabochip联盟的中国台湾人(TAICHI;N=11,223)(Assimes等人,PLoS One 11,2016,e0138014)、达拉斯心脏研究中的参与者(DHS;N=2,088)(Victor等人,Am.J.Cardiol.,2004,93,1473-1480)和马尔默饮食与癌症研究中的参与者(MALMO;N=28,863)(Berglund等人,J.Intern.Med.,1993,233,45-51)。所有研究均受相关伦理委员会批准并且参与者提供了参与这些研究的知情同意书。
表型定义
体质指数基于一次研究访视时进行的人体测量按照体重(以千克计)除以身高(以米计)的平方来计算。基线访视时测量的BMI是UKB和MCPS的结果变量,而GHS数据库中存在的临床遭遇的中值BMI是与先前研究一致的GHS的结果变量(Dewey等人,Science,2016,354)。BMI分类是基于世界卫生组织分类(World Health Organization classification,WHO,Obesity and overweight,2020)定义的。BMI值通过逆标准正态函数转换,应用于每个血统分组内并单独应用于男性和女性中。计算170cm高的人的体重差异。在UKB队列中通过生物电阻抗测量全身和区域内身体瘦体质和脂肪质量、百分比和体表归一化指数。在基线访视时,UKB还通过提问多选题收集了关于10岁时对比体型的自我报告信息:“当您10岁时,与平均相比,您将自己描述为:较瘦,较丰满,平均水平上下,不知道,不愿回答?”。
基因型数据
如先前详细描述的那样进行高覆盖率全外显子组测序(Dewey等人,Science,2016,354;和Van Hout等人,Nature,2020,586,749-756)并总结如下。将NimbleGen探针(VCRome;对于GHS队列的一部分)或可从Integrated DNA Technologies获得的xGen设计的经修饰型式(IDT;对于GHS的其余部分和其他队列),用于外显子组的靶序列捕获。在文库制备期间向每个DNA片段添加独特的6碱基对(bp)条形码(VCRome)或10bp条形码(IDT)以促进多重外显子组捕获和测序。在进行外显子组捕获之前合并等量样品。使用Illumina v4HiSeq 2500(对于GHS队列的一部分)或NovaSeq(对于GHS的其余部分和其他队列)仪器上的75bp配对末端读段进行测序。测序的覆盖深度(即,覆盖基因组靶区中的每个核苷酸的序列读段的数目)足以在96%的VCRome样品中提供对85%的靶碱基的大于20x覆盖,并且在99%的IDT样品中提供对90%的靶碱基的20x覆盖。数据处理步骤包括使用Illumina软件进行样品分用(de-multiplexing),与GRCh38人类基因组参考序列进行比对,包括生成二进制比对和作图文件(BAM),处理BAM文件(例如,标记重复读段和其他读段作图评价)。变体调用和注释是基于GRCh38人类基因组参考序列和使用snpEff软件的Ensembl v85基因定义的。然后通过选择对于每个基因最有害的功能效应类别,将涉及具有注释的起始和终止的蛋白编码转录物的snpEff预测组合成单个功能影响预测。这些注释的等级(从最有害到最不有害)是移码、停止增加、停止丧失、剪接受体、剪接供体、停止丧失、框内插入缺失、错义、其他注释。预测的LOF遗传变体包括:a)导致移码的插入或缺失,b)导致引入提前终止密码子或转录起始位点或终止位点损失的插入、缺失或单核苷酸变体,和c)供体或受体剪接位点的变体。针对可能的功能影响根据使用SIFT(Kumar等人,Nat.Protoc.,2009,4,1073-1081)、Polyphen2_HDIV和Polyphen2_HVAR(Adzhubei等人,Nat.Methods,2010,7,248-249)、LRT(Chun等人,Genome Res.,2009,19,1553-1561)和MutationTaster(Schwarz等人,Nat.Methods,2010,7,575-576)预测有害性的计算机预测算法对错义变体进行分类。对于每个基因,每个变体的替代等位基因频率(AAF)和功能注释确定包含在这7次基因负荷暴露中:1)AAF<1%的pLOF变体;2)通过5/5算法预测为有害的,AAF<1%的pLOF或错义变体;3)通过5/5算法预测为有害的,AAF<0.1%的pLOF或错义变体;4)通过至少1/5算法预测为有害的,AAF<1%的pLOF或错义变体;5)通过至少1/5算法预测为有害的,AAF<0.1%的pLOF或错义变体;6)AAF<1%的pLOF或任何错义;以及7)AAF<0.1%的pLOF或任何错义变体。
如先前所述(Bycroft等人,Nature,2018,562,203-209)在UKB中进行SNP阵列基因分型。在GHS中,使用Omni表达外显子组阵列(OMNI)和全局筛选阵列(GSA)进行基因分型。在MCPS中,使用GSA阵列进行基因分型。
GPR75变体的体外研究
对以下两种GPR75 pLOF遗传变体(Ala110fs和Gln234*)进行体外验证研究,这两种遗传变体:a)单独与较低BMI相关(p<0.05),并且b)具有至少10个杂合携带者。简言之,使用Fugene 6(Promega)在HEK293细胞中瞬时转染编码N端HA标记的野生型、Ala110fs和Gln234*GPR75的pcDNA 3.1质粒。HEK293和HEK293T细胞系购自ATCC并保持在瑞泽恩组织培养中心(Regeneron Tissue Culture Core)。通过STR谱分析证实它们的同一性。体外测定包括通过Taqman和蛋白质印迹的mRNA和蛋白质分析,以及通过荧光激活细胞分选和免疫荧光的蛋白质定位。
细胞培养、质粒和细胞转染:将HEK293细胞保持在补充有10%胎牛血清和抗生素(50单位/mL青霉素和50μg/mL链霉素;Thermo Fisher Scientific)的杜尔贝科改良伊格尔培养基(Dulbecco’s modified Eagle’s medium)中。编码N端HA标记的GPR75野生型、Ala110fs和Gln234*的pcDNA 3.1质粒由GenScript(USA)合成。用含有编码HA标记的GPR75野生型、Ala110fs和Gln234*的cDNA的质粒以及绿色荧光蛋白对照质粒,使用FuGENE 6(Promega),根据制造商的方案(Promega文献:#TM350),以1μg DNA:5μl FuGENE转染试剂的比率瞬时转染大约60-70%融合的细胞。48小时后,用1x DPBS(Thermo FisherScientific)洗涤细胞并收集细胞用于下游分析。
蛋白质印记:将转染过的HEK293收集在RIPA缓冲液中进行细胞裂解,并且每个样品上样5-10μg蛋白质。使用以下一抗:HA(小鼠单克隆抗体,Sigma cat.目录号H3663)和GAPDH 14C10(兔mAb,Cell Signaling目录号2118)。使用适当的LI-COR二级IRDye抗体(抗兔(926-32211)和抗小鼠(926-32210)),使用LI-COR Odyssey红外成像系统(LI-COR,Lincoln,NE)检测和定量免疫印迹。
流式细胞术:将细胞用1x DPBS(目录号14190144)洗涤一次。添加细胞解离缓冲液(目录号13150016)并将细胞在37℃下孵育3分钟。将细胞重悬于培养基中并以200xg离心5分钟。将细胞用DPBS洗涤两次,重悬于DPBS中,等分并在室温下用活/死蓝可固定的活力染料(Live/Dead Blue Fixable Viability Dye,Thermo Fisher Scientific)在无光下染色15分钟。将细胞用DPBS洗涤两次-将所有洗涤液以400xg离心5分钟并且全部在黑暗中染色。将细胞用人Fc封闭剂(BD Biosciences)在MACS缓冲液(Miltenyi Biotec)中在4℃下处理15分钟,并用alexa fluor抗HA.11表位标签抗体(目录号682404)在MACS缓冲液中以1:100稀释度在4℃下染色30分钟。将细胞用MACS缓冲液洗涤并用CytoFix(BD Biosciences)在4℃下固定15分钟。将细胞用MACS缓冲液洗涤两次,过滤并在CytoFLEX(Beckman Coulter)上进行FACS。使用FlowJo 10.6.2(Becton Dickinson&Company)分析数据。
免疫荧光测定:对于免疫荧光测定,将细胞以14,000个细胞/孔的密度接种到具有玻璃底(同上,目录号80827)的开放8孔μ载片(腔室载片)上。在转染后48小时,将细胞在冰冷的4% PFA中在室温(RT)下固定10分钟并用冰冷的1x DPBS洗涤3次(所有后续洗涤步骤均在冰冷的1x DPBS中进行3次,每次洗涤5分钟)。使用10%正常驴血清(NDS)(JacksonImmunoresearch Laboratories,#017-000-121)封闭未透化的细胞1小时,而透化的细胞在具有0.1% Triton X-100的10%NDS中封闭;这些随后分别用作非透化细胞和透化细胞的染色缓冲液。将细胞与1:500(非透化)或1:3000(透化)抗HA抗体(Sigma,目录号H3663)一起在室温下孵育1小时,洗涤,然后与1:1000alexa fluor594缀合的抗小鼠二抗(ThermoFisher Scientific,目录号A-21203)一起孵育1小时。然后将孔洗涤,并用含DAPI(CellSignaling,#8961)的金抗褪色试剂固定载片。使用Zeiss共聚焦LSM880对载片成像。
定量实时聚合酶链反应:使用TRIzol试剂并按照制造商的说明书(Thermo FisherScientific)从转染过的HEK293中提取RNA。使用MagMAXTMTurboTMDNA酶缓冲液和TURBO DNA酶(Ambion,Life Technologies)去除基因组DNA。使用VILOTM主混合物(ThermoFisher Scientific)将mRNA(高达2μg)逆转录成cDNA。使用QuantStudio 6Flex实时PCR系统(Thermo Fisher Scientific),用PowerUp SYBR绿色主混合物(Thermo FisherScientific)扩增GPR75cDNA。将ACTINB管家基因用作内部对照基因以归一化cDNA输入差异。相对于ACTINB管家基因计算GPR75的表达。
引物序列如下:
GPR75-正向:5’-GCTTGTGGCCCAAGTCATTC-3’(SEQ ID NO:1458)
GPR75-反向:5’-GAGTGTTGATGGGGGTCGAG-3’(SEQ ID NO:1459)
ACTINB-正向:5’-CACCATTGGCAATGAGCGGTTC-3’(SEQ ID NO:1460)
ACTINB-反向:5’-AGGTCTTTGCGGATGTCCACGT-3’(SEQ ID NO:1461)
小鼠模型
遗传工程化的Gpr75-/-小鼠品系使用Regeneron的技术(Valenzuela等人,Nat.Biotechnol.,2003,21,652-659;和Poueymirou等人,Nat.Biotechnol.,2007,25,91-99)产生。简言之,靶向C57Bl/6NTac胚胎干细胞以消融整个Gpr75基因座,紧接在内源ATG后开始并结束于Gpr75终止密码子处。使用经修饰的细菌人工染色体(BAC)靶向构建体实现消融,使得BAC Gpr75序列被含有处于人UBC(泛素)启动子控制下的新霉素抗性基因的自缺失、侧接loxP的lacZ报告子盒置换。工程化缺失使得lacZ报告子插入紧接在内源ATG之后的框内。将该构建体电穿孔到C57Bl/6NTac胚胎干细胞中。用新霉素选择后,通过TaqMan分析鉴定正确靶向的克隆物并将其显微注射到8细胞SwissWebster胚胎(Charles River Laboratories)中,产生完全来源于注射的经修饰的胚胎干细胞的F0/>(Poueymirou等人,Nat.Biotechnol.,2007,25,91-99)。
杂合Gpr75-/+小鼠繁殖以生成年龄匹配的野生型Gpr75+/+、杂合Gpr75-/+和敲除Gpr75-/-同窝幼崽,将这些同窝幼崽用于实验。将雄性和雌性小鼠圈养在静态笼中(4只/笼),自由获取食物和水,并饲喂对照饲料或高脂饮食(HFD;Envigo,#TD.03584,Huntingdon,UK)14周。对照饮食由以下组分组成,其量以千卡百分比(kcal)表示:13.4%脂肪、58.0%碳水化合物和28.7%蛋白质。HFD由以下千卡百分比的组分组成:58.4%脂肪、26.6%碳水化合物和15.0%蛋白质。
在饮食饲喂期之前和饮食饲喂期结束时禁食过夜后测量空腹血糖。在实验结束时进行腹膜内葡萄糖耐量试验。接着是过夜的禁食期,通过腹膜内注射向每只小鼠施用葡萄糖(2g/kg)。刮擦每只小鼠尾部的尖端以抽取血液。在0分钟、30分钟、60分钟、90分钟和120分钟收集血样,并使用Contour血糖监测系统(Bayer,Whippany,NJ)测量葡萄糖。在这些测量之后,将血液收集在毛细管中并用于胰岛素测量。将血液以2,000rpm离心15分钟以分离血浆。使用超敏小鼠胰岛素ELISA试剂盒(Crystal Chem.#90080,Elk Grove Village,IL)按照制造商的说明书定量血浆胰岛素水平。通过ELISA根据制造商的说明书(Abcam,Cambridge,MA;对于瘦素和脂联素,分别为#ab100718和#ab108785)测量瘦素和脂联素的血浆水平。
统计:将Graph Pad Prism版本9软件用于统计分析。使用重复测量双因素ANOVA,接着通过Tukey事后多重比较检验确定平均值差异的显著性。p值<0.05被认为是显著的。
在单独的小鼠队列中进行另外的高脂饮食和饲料饮食实验以进一步表征饮食诱导的肥胖症模型中的身体组成和响应。
统计学分析
概述:通过使用BOLT-LMM v2.3.4(Loh等人,Nat.Genet.,2018,50,906-908)或REGENIE v1.0(Mbatchou等人,Nat.Genet.,2021)拟合混合效应回归模型估计遗传变体或其基因负荷与BMI的关联。这些方法通过使用来自跨基因组的基因型估计多基因评分来说明相关性和群体结构。然后,以多基因评分连同其他协变量为条件,估计遗传变体或其负荷的关联。为了确保罕见的编码变体或基因负荷关联在统计学上不依赖于BMI相关的常见遗传变体,如下所述,对于通过对常见等位基因与BMI的全基因组关联进行精细作图所鉴定的前哨常见变体(AAF≥1%)进一步调整外显子组关联分析。使用逆方差加权元分析合并跨越队列的结果。
通过外显子组测序鉴定的罕见非同义变体的负荷与BMI的关联:在本研究的初步分析中,通过使用BOLT-LMM v2.3.4(Loh等人,Nat.Genet.,2018,50,906-908)或REGENIEv1.0(Mbatchou等人,Nat.Genet.,2021)拟合针对近似基因组亲缘矩阵的多基因评分进行调整的混合效应回归模型来估计每个基因中罕见非同义变体的负荷与BMI的关联。针对年龄、年龄2、性别、年龄-按-性别计的相互作用项、实验批次相关协变量和遗传主成分对分析进一步调整。确保罕见变体的关联不依赖于近旁性状相关的常见等位基因对于在集中于外显子组变异的研究中正确的因果变体和基因归因是必要的(Mahajan等人,Nat.Genet.,2018,50,559-571)。为了确保负荷关联在统计学上不依赖于BMI相关的常见遗传变体,对于通过对常见等位基因与BMI的全基因组关联进行精细定位所鉴定的常见变体调整外显子组关联分析(参见,GWAS of common variants and fine-mapping)。与先前的类似研究(Do等人,Nature,2015,518,102-106;和Flannick等人,Nature,2019,570,71-76)一致,基因负荷分析的统计显著性的全外显子组水平定义为p<3.6×10-07,对于20,000个基因和七个变体选择模型的Bonferroni校正。
罕见非同义单个变体的分析:在二次分析中,估计通过外显子组测序鉴定的个别罕见非同义变体(次要等位基因频率<1%且次要等位基因计数>25)与BMI的关联。使用与基因负荷分析相同的分析方法,包括针对通过精细定位鉴定的BMI相关的常见变体进行调整。优选该步骤以确认这些罕见变体的关联的非条件依赖性特性(Mahajan等人,Nat.Genet.,2018,50,559-571)。在该分析中,将统计阈值用于p<5×10-08的关联,在该分析中测试的~1,000,000个罕见非同义变体的Bonferroni校正,也是GWAS中使用的全基因组显著性的常规阈值(C.Wellcome Trust Case Control,Nature,2007,447,661-678)。
常见变体的GWAS和精细定位:通过进行全基因组关联研究来鉴定BMI相关的常见变体,所述全基因组关联研究包括超过1200万使用单倍型参考联盟面板(HaplotypeReference Consortium panel)(Mc Carthy等人,Nat.Genet.,2016,48,1279-1283)或TOPMed插补服务器(参见,万维网“imputation.biodatacatalyst.nhlbi.nih.gov/#!pages/hom e;v1.5.7)输入的常见至低频率遗传变体。在GHS研究中,分别在用Illumina人类Omni表达外显子组阵列(Illumina Human Omni Expres s Exome array,OMNI集合)和全局筛选阵列(GSA集合)进行基因分型的样品中单独进行插补。然后在两个GHS集合中合并来自插补变体的剂量数据,以获得用于关联分析的组合数据集。通过使用BOLT-LMM v2.3.4(Loh等人,Nat.Genet.,2018,50,906-908)或REGEN IE v1.0(Mbatchou等人,Nat.Genet.,2021)拟合混合效应线性回归模型,在GHS、UKB和MCPS队列中单独地进行全基因组关联分析。然后通过逆方差加权元分析组合来自UKB和GHS分析的结果,以在发现队列的欧洲子集中获得全基因组元分析。为了鉴定由常见变体驱动的非条件依赖性遗传关联,使用FINEMAP软件在p<5×10-08的全基因组显著性阈值下对带有与BMI相关的遗传变体的基因组区域进行精细定位(Benner等人,Bioinformatics,2016,32,1493-1501)。使用来自全基因组关联分析中包括的精确个体集合的遗传数据来估计连锁不平衡。在欧洲血统GHS和UKB队列的元分析中以及在MCP S队列的美国混血分析中单独进行精细作图。精细定位鉴定独立的常见变体信号,并为分配给给定独立信号的变体分配因果关联后验概率(PPA)。对于精细作图的每个基因座,鉴定95%可信变体集合,即捕获95%因果关联后验概率的最小变体集合。前哨变体也定义为在每个给定的独立信号处具有最高因果关联后验概率的变体。
在UKB研究中生成BMI的全基因组多基因评分:捕获由于超过250万常见变体引起倾向于较高BMI的多基因评分使用LDpred软件(Vilhjalmsson等人,Am.J.Hum.Genet.,2015,97,576-592)生成,根据独立数据集中先前的大型全基因组关联研究的结果,rho参数值为1(Adzhubei等人,Nat.Methods,2010,7,248-249)。
GPR75预测的功能丧失性变体的全表型组分析:在GHS和UKB研究中,对GPR75中的pLOF变体与数百种连续性状或疾病结果的关联进行全表型组分析。为了提高效力,使用METAL软件进行逆方差加权元分析(Willer等人,Bioinformatics,2010,26,2190-2191),以组合GHS和UKB之间的关联结果,以获得两项研究的疾病结果。为了最小化由少量变体携带者引起的假阳性关联的风险,排除了≤25个个体携带GPR75 pLOF遗传变体的结果,所述结果是基于具有连续性状的非缺失表型的个体或基于二元疾病结果的受影响个体确定的。在这些排除后,2,173个结果的结果可用。为了控制所进行的统计检验的次数,如果关联p值满足2,173次检验的Bonferroni校正,即p<2.3×10-5(对应于0.05的p值阈值除以2,173次统计检验),则认为关联是统计显著的。
连续性状和疾病结果如下所述定义。在UKB研究中,对于连续性状,将在其中一次UKB访视期间测量的生物标志物、成像变量或其他连续性状的值或它们在给定研究访视内或跨研究访视的平均值用作结果。对于二元疾病结果,病例状态定义需要适用以下的一个或多个标准:a)在数字问卷调查或与受过培训的护士面谈时自我报告的疾病状态或药物使用情况,或b)来自使用ICD-10编码系统编码的英国国家卫生服务医院事件统计数据库(UKNational Health Service Hospital Episode Statistics database)的住院病人的EHR。对于每个二元结果,对照是没有任何病例定义标准的个体。在GHS研究中,对于二元疾病结果,病例状态定义需要适用以下的一个或多个标准:1)ICD-10诊断代码的问题列表条目,2)住院治疗-出院ICD-10诊断代码,或3)在单独的日历日2次单独的门诊访视输入的就诊ICD-10诊断代码。对照是没有任何病例定义标准的个体。如果个体的相关ICD-10代码仅与一次门诊就诊相关,则将个体排除。对于连续性状,通过去除非生理实验室的值、无效或污染样本以及超过5x正常上限的那些进行数据清理。然后得出每名患者随访期间的最小、中位和最大实验室结果值,并用作结果。
实施例2:GPR75中的功能丧失与较低BMI、较低体脂和防止肥胖相关
在645,626名个体(实施例1)中进行高覆盖全外显子组测序,所述个体包括来自英国生物样本库队列的428,719名欧洲血统个体(UKB;图1),来自基于美国的格伊辛格卫生系统的MyCode社区健康倡议队列的121,061名欧洲血统个体(GHS;图1)以及来自墨西哥市前瞻性研究的95,846名美国混血个体(MCPS;图1)。
在这三个队列的全外显子组元分析中,GPR75基因中罕见pLOF变体的负荷与较低的BMI在统计学显著性全外显子组水平相关(逆方差加权(IVW)元分析p<3.6×10-07,对于20,000个基因和7个变体选择模型的Bonferroni校正(实施例1))。
GPR75中的预测功能丧失性变体在每10,000个测序的人中的~4个中观察到,在群体间具有相似的频率(图2),并且携带者状态与0.34标准偏差的较低BMI相关,对应于1.8kg/m2的较低BMI或大约5.3kg或12lbs的较低体重(图3和图4A)。
在发现元分析的每个组成队列中(图2),以及在年龄和性别亚组内(图5),与较低BMI的关联是方向性一致的和统计学显著的。GPR75pLOF变体与较低BMI的关联在组合分析中得到进一步证实,所述组合分析包括未包括在发现集合中的另外91,328名个体(在发现队列和另外的队列的元分析中BMI的标准偏差(SD)单位中的每个等位基因β,-0.34,95%置信区间(CI),-0.45,-0.22,p=6.9×10-09;图4B)。这种与较低BMI的强烈关联伴随着与防止肥胖的相应关联。在UKB、GHS和MCPS队列的元分析中,GPR75 pLOF变体的杂合携带者与非携带者相比肥胖优势低54%(图6;每个等位基因的优势比,0.46,95%置信区间,0.31,0.67,p=6.9×10-05),并且它们在BMI类别间的分布显著向较低BMI类别偏移(图7)。在UKB中,GPR75 pLOF携带者与非携带者相比,更有可能自我报告比10岁时的平均对比体型更瘦(图8)。
在UKB中使用生物阻抗进行的身体组成分析显示,与较低BMI的关联由与较低的全身脂肪质量和较低的体脂百分比的关联驱动(图9)。在GPR75 pLOF变体的非诊断性全表型组分析(实施例1)中,在针对所进行的统计检验的次数进行校正后(测试的2,173种表型;Bonferroni校正的p值阈值,p<2.3×10-05),未观察到与常见诊断或测量的连续性状的统计学显著关联,反映了这些变体的罕见性和严格的多重检验校正。
代谢性状的详细分析揭示了与较高的高密度脂蛋白胆固醇名义上显著的关联(IVW元分析p<0.05),这与有利的代谢图谱一致(图10)。GPR75中pLOF的携带者与非携带者相比2型糖尿病优势较低(63,492个病例和549,961个对照;每个等位基因的优势比,0.92;95%置信区间,0.59,1.45;p=0.73;图10),但差异在统计学上不显著。从T2D知识门户中包括的多达20,791个2型糖尿病病例和24,440个对照询问外显子组测序关联统计数据(www.t2d.hugeamp.org/;2021年1月8日访问),并且类似地在GPR75 pLOF变体携带者中在数字上观察到2型糖尿病的较低优势(2型糖尿病的优势比,0.52,95% CI,0.14至1.97;p=0.30;替代等位基因频率,0.03%)。由于GPR75中pLOF变体的罕见性并且考虑到BMI与2型糖尿病之间的遗传关系,估计数百万人将会需要测序以检测p<0.05的关联(图10)。对作为血糖水平的连续生物标志物的HbA1c的分析得到类似结果(图10)。
实施例3:罕见的蛋白质截短变体与低脂肪的关联可以确信地归因于GPR75基因
检查了GPR75中的pLOF变体的BMI关联的基因组背景。含有非翻译序列的GPR75的第一个且最小外显子包括在GPR75和推定的GPR75-ASB3通读基因中,所述通读基因具有近旁的锚蛋白重复序列和含有SOCS盒的蛋白3(ASB3;图11)。第二个且最终GPR75外显子(含有GPR75的整个翻译区)不与任何其他基因或转录物共用(图11)。进行了许多分析以确保pLOF变体的关联可以坚定地归因于GPR75基因。首先,GPR75中的46种pLOF变体中促成与较低BMI的关联的45种位于外显子2中(图12),其是GPR75基因独有的(图11)。因此,GPR75中pLOF变体的负荷基因型没有连锁不平衡(LD;R2<0.0001),有pLOF的负荷基因型影响GPR75-ASB3通读基因或ASB3基因。其次,在大型外显子组测序元分析中估计ASB3或GPR75-ASB3通读基因中的罕见编码变体的负荷与BMI的关联。在具有不同变体注释和等位基因频率纳入标准的多个统计模型中,ASB3或GPR75-ASB3中的罕见非同义变体的负荷与BMI没有关联(图13),包括ASB3或GPR75-ASB3中的pLOF变体缺乏关联(图13)。最后,估计了以ASB3和GPR75-ASB3基因型为条件的GPR75中的罕见pLOF变体的负荷与BMI的关联。通过针对ASB3和GPR75-ASB3基因型进行调整,GPR75pLOF变体与较低BMI的关联不受影响(图14)。因此,GPR75中的罕见pLOF变体与较低BMI的关联可以确信地归因于GPR75基因。
还探索了基因座中是否存在共同的变体关联。在GPR75周围的1Mb窗口中(基因的任一侧500kb),在欧洲人中插补的常见变体的GWAS中有26种常见变体在统计显著性的全基因组水平上与BMI相关(IVW元分析,p<5×10-08)(图15和图16),而在混血美国人中没有全基因组的显著关联(图16)。这26种变体全部精细定位至由rs59428052引导的信号(G-等位基因频率,14.7%;因果关联的后验概率,30.4%;每个等位基因β以BMI的SD单位计,-0.015;95%置信区间,-0.020至-0.010;p=1.3×10-09),其是最靠近ASB3且在GPR75下游大约200kb的基因间变体。rs59428052变体不与任何eQTL信号共定位,也不是在与GTEx v8中的任何前哨eQTL处于LD的基因座处另外25种变体中的任一种(R2>0.8)(图14)。26种变体中的两种与ASB3和GPR75-ASB3(rs36020289)中的错义变体一起处于LD中,这不影响GPR75转录物(图14)。
通过针对该区域中与BMI相关的26种常见变体进行调整来进行形式条件分析,并确定GPR75中的pLOF变体与较低BMI的关联保持不变(图14)。因此,GPR75中的罕见pLOF变体与较低BMI的关联与欧洲人基因座处与BMI相关的26种常见变体中的任一种无关。
总之,基因座处的人类遗传分析表明:a)GPR75中的罕见pLOF变体与较低BMI相关,具有大的效应关联,b)pLOF关联归因于GPR75而非其他近旁转录物,cc)信号不依赖于该区域中的BMI相关常见变体,以及d)在欧洲人中通过GWAS精细作图在该区域中发现的小效应基因间常见变体信号与GPR75没有明显联系。
实施例4:GPR75中与下体肥胖相关的功能丧失性变体引起截短的GPR75受体的细胞内滞留。
GPR75中的pLOF变体与较低BMI的关联是由于预测在不同位置处截短GPR75的多个独立的罕见pLOF变体(图4A和图12)。由于它们的罕见性,在分析中通过外显子组测序发现的46种罕见pLOF变体中没有变体通过阵列-基因分型或插补得到很好地确定(图12)。留一法(leave-one-out)分析显示负荷信号对于一次排除一种pLOF变体是稳健的(图17)。GPR75中的46种罕见pLOF变体中,有5种变体单独在统计学显著性的标称水平与较低BMI相关(IVW元分析p<0.05;Ala110fs;Ser219fs;Gln234*;Cys400fs;Lys404*;图18),而没有变体与较高BMI相关。当从分析中排除这些变异位点的所有5个变体位点时,剩余的pLOF变体集合仍然与较低BMI相关(图17)。
在体外表达的单独与BMI相关的pLOF变体中,两种最常见的变体(次要等位基因计数≥10)显示它们引起截短受体的细胞保留,可能导致完全功能丧失(图19)。
预测功能拷贝的丧失(即单倍体不足)或破坏受体多聚体的截短蛋白的产生(即显性负效应)可以解释GPR75截短与较低BMI的关联。假设在单倍体不足的情况下,GPR75的早期N端截短将导致比最后一个胞内结构域内的C端截短更大的表型影响。在最终胞内结构域之前引起GPR75截短的遗传变体与-2.1kg/m2的较低BMI相关(IVW元分析p=4.1×10-07),相比而言在最终结构域内产生截短的变体与-1.4kg/m2的较低BMI相关(IVW元分析p=0.012)(图20)。这种差异对于在最终C端结构域的最后100个氨基酸内的截短甚至更明显(图20)。
实施例5:高脂饮食诱导的肥胖症中的Gpr75缺失及其在小鼠中的血糖后果
GPR75-KO雄性小鼠与野生型相比展示出低7%的体重(图21)。相比之下,在雌性小鼠中没有观察到显著差异(图21)。GPR75-KO小鼠的更详细的身体组成分析汇总于图22中。与野生型相比,Gpr75 KO小鼠具有低24%的脂肪体积和脂肪百分比(图22和图23),这是统计学上显著的差异。
在高脂饮食(HFD)诱导的肥胖症的小鼠模型中,Gpr75的实验缺失防止体重增加及其相关的葡萄糖和胰岛素代谢异常(图24)。当置于HFD上14周时,Gpr75+/+小鼠的重量大约翻倍。体重从平均(标准偏差)20.9(2.1)变为43.3(6.5)克(体重变化,+22.4克)。相比之下,具有Gpr75遗传缺失的小鼠以等位基因-剂量依赖性方式增加较少的体重(对于Gpr75+/-小鼠,体重变化+16.9克,与野生型的体重变化差异为-5.5克或-25%;对于Gpr75-/-小鼠,体重变化+12.6克,与野生型的体重变化差异-9.8克或-44%;图24A)。在Gpr75+/+小鼠中随HFD看到的空腹血糖升高在Gpr75-/+和Gpr75-/-小鼠中以等位基因剂量依赖性方式降低(图24B)。在Gpr75中具有遗传缺失的小鼠也对HFD诱导的葡萄糖耐量和胰岛素敏感性的损伤具有抗性(图24C和图24D)。在14周HFD结束时,Gpr75-/-和Gpr75+/-小鼠中的血浆瘦素水平与野生型小鼠相比较低(图25A),而Gpr75+/-和Gpr75-/-小鼠与野生型相比脂联素水平较高,导致瘦素与脂联素的比率为野生型的1/2和1/10(图25B和图25C)。
在一组不同的实验中的进一步分析研究了Gpr75+/+、Gpr75+/-和Gpr75-/-小鼠在维持饲料饮食时或从第0周开始转变为60%高脂饮食持续9周后,除了体重以外,Gpr75的遗传缺陷对身体组成和血糖水平的影响。每周检查体重。在第-1周、第4周和第8周测量血糖水平。在第0周、第5周和第9周通过微计算机断层扫描(mCT)定量脂肪质量、瘦体质量和骨质量。
在从饲料转变为高脂饮食饲喂之前,10至15周龄的雄性Gpr75+/+、Gpr75+/-和Gpr75-/-小鼠在体重(第0周,图26的图A)、瘦体质量(第0周,图26的图B)、骨质量(第0周,图26的图B)或血糖水平(第-1周,图26的图C)方面没有表现出差异。然而,Gpr75-/-小鼠与Gpr75+/+和Gpr75+/-小鼠相比,表现出脂肪质量显著减少(图26的图B)。高脂饮食饲喂9周后,Gpr75+/+、Gpr75+/-和Gpr75-/-小鼠相对于它们在第0周时的体重增加了体重(图26的图A)。转变为高脂饮食饲喂后,Gpr75-/-小鼠的体重显著低于Gpr75+/+小鼠,从高脂饮食饲喂1周开始直至高脂饮食饲喂9周(图26的图A)。另外,Gpr75+/-小鼠的体重显著低于Gpr75+/+小鼠,从高脂饮食饲喂4周开始到至9周(图26的图A)。总之,Gpr75+/-和Gpr75-/-小鼠随着高脂饮食饲喂显示体重增加减少。
通过mCT对身体组成的评估揭示,在高脂饮食饲喂9周后Gpr75+/+、Gpr75+/-和Gpr75-/-小鼠相对于第0周增加了脂肪质量。在高脂饮食饲喂后5周和9周时,Gpr75-/-和Gpr75+/-小鼠相对于Gpr75+/+小鼠,表现出较少的脂肪质量(图26的图B)。在高脂饮食饲喂5周和9周后,瘦体质量和骨质量(图26的图B)在Gpr75+/+、Gpr75+/-和Gpr75-/-小鼠中没有显著差异。总之,Gpr75-/-和Gpr75+/-小鼠显示脂肪质量的增加随高脂饲喂而减少。
高脂饮食饲喂8周后,Gpr75+/+、Gpr75+/-和Gpr75-/-小鼠显示血糖水平相对于在第-1周饲料饮食饲喂时它们的血糖水平显著增加(图26的图C)。高脂饮食饲喂4周后,在Gpr75+/+、Gpr75+/-和Gpr75-/-小鼠之间没有观察到血糖水平的差异(图26的图C)。然而,在高脂饮食饲喂8周后,Gpr75-/-和Gpr75+/-小鼠表现出比Gpr75+/+小鼠显著更低的血糖水平(图26的图C)。这些数据表明Gpr75+/-和Gpr75-/-小鼠显示出对与高脂饮食饲喂相关的高血糖症的保护作用。
实施例6:饲料饲喂的雌性Gpr75敲除小鼠不具胰岛素抗性并且表现出改善的葡萄糖耐量。
对13周龄雌性Gpr75+/+、Gpr75+/-和Gpr75-/-小鼠进行口服葡萄糖耐量测试。动物在上午7点禁食4小时,然后在上午11点经口服灌胃给予2g/kg剂量的右旋糖(Hospira,Inc,NDC 0409-6658-02))。在右旋糖施用后0分钟、15分钟、30分钟、60分钟和120分钟,使用AlphaTRAK2血糖仪(Zoetis,目录号71676-01)和测试条(Zoetis,目录号71681-01)进行葡萄糖测量。结果示于图27中。
根据前面的描述,除了本文描述的那些以外,对所描述的主题的各种修改对于本领域技术人员来说将是显而易见的。此类修改也旨在落入所附权利要求书的范围内。本申请中引用的每篇参考文献(包括但不限于期刊文章、美国和非美国专利、专利申请公布、国际专利申请公布、基因库登录号等)均以引用的方式并出于所有目的整体并入本文。
Claims (69)
1.一种治疗患有肥胖症、体重过重、BMI升高、体脂质量、百分比或体积升高或食物摄入过量的受试者或预防体重增加或维持体重减轻的方法,所述方法包括向所述受试者施用GPR75抑制剂。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述GPR75抑制剂包含抑制性核酸分子。
3.根据权利要求2所述的方法,其中所述抑制性核酸分子是与GPR75 mRNA杂交的反义核酸分子、小干扰RNA(siRNA)或短发夹RNA(shRNA)。
4.根据权利要求1所述的方法,其中所述GPR75抑制剂包含Cas蛋白和与GPR75基因组核酸分子内的引导RNA(gRNA)识别序列杂交的gRNA。
5.根据权利要求4所述的方法,其中所述Cas蛋白是Cas9或Cpf1。
6.根据权利要求4或权利要求5所述的方法,其中所述gRNA识别序列包括或接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546、根据SEQ ID NO:1的位置5,557、根据SEQ ID NO:1的位置5,911、根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923、根据SEQ IDNO:1的位置6,411或根据SEQ ID NO:1的位置5,831。
7.根据权利要求4至6中任一项所述的方法,其中所述gRNA包含约17至约23个核苷酸。
8.根据权利要求4至8中任一项所述的方法,其中所述gRNA识别序列包含根据SEQ IDNO:61-98中任一项的核苷酸序列。
9.根据权利要求1至8中任一项所述的方法,所述方法还包括检测来自所述受试者的生物样品中不存在编码预测的功能丧失性GPR75多肽的GPR75错义变体核酸分子。
10.根据权利要求9所述的方法,所述方法还包括将治疗或抑制肥胖症的治疗剂以标准剂量量施用给作为GPR75参考的受试者。
11.根据权利要求9所述的方法,所述方法还包括将治疗或抑制肥胖症的治疗剂以与标准剂量量相同或低于标准剂量量的剂量量施用给GPR75错义变体核酸分子杂合的受试者。
12.根据权利要求9至11中任一项所述的方法,其中所述GPR75错义变体核酸分子是编码Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs或Cys400fs的核酸分子。
13.一种用治疗或抑制肥胖症的治疗剂治疗受试者的方法,其中所述受试者是肥胖的,所述方法包括以下步骤:
通过以下方式确定所述受试者是否具有编码预测的功能丧失性GPR75多肽的G蛋白偶联受体75(GPR75)错义变体核酸分子:
从所述受试者获得或已经获得生物样品;以及
对所述生物样品进行或已经进行了序列分析以确定所述受试者是否具有包含所述GPR75错义变体核酸分子的基因型;以及
将治疗或抑制肥胖症的所述治疗剂和/或GPR75抑制剂以标准剂量量施用或继续施用给作为GPR75参考的受试者;以及
将治疗或抑制肥胖症的所述治疗剂和/或GPR75抑制剂以与标准剂量量相同或低于标准剂量量的量施用或继续施用给GPR75错义变体核酸分子杂合的受试者;
其中具有编码预测的功能丧失性GPR75多肽的所述GPR75错义变体核酸分子的基因型的存在指示所述受试者具有降低的发展肥胖症的风险。
14.根据权利要求13所述的方法,其中所述受试者是GPR75参考,并且以标准剂量量向所述受试者施用或继续施用治疗或抑制肥胖症的所述治疗剂和/或GPR75抑制剂。
15.根据权利要求13所述的方法,其中所述受试者对于GPR75错义变体核酸分子是杂合的,并且以与标准剂量量相同或低于标准剂量量的量向所述受试者施用或继续施用治疗或抑制肥胖症的所述治疗剂和/或GPR75抑制剂。
16.根据权利要求13至15中任一项所述的方法,其中所述GPR75错义变体核酸分子是编码Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs或Cys400fs的核酸分子。
17.根据权利要求16所述的方法,其中所述GPR75错义变体核酸分子是:
具有下述核苷酸序列的基因组核酸分子:在对应于根据SEQ IDNO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;
具有下述核苷酸序列的mRNA分子:在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:12的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQID NO:27的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQID NO:9的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于SEQ ID NO:10的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ IDNO:30的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ IDNO:100的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ IDNO:101的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ IDNO:102的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ IDNO:103的位置891的位置处包含鸟嘌呤;或
由mRNA分子产生的cDNA分子,其中所述cDNA分子具有下述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ IDNO:33的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ IDNO:47的位置732的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ IDNO:52的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:31的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于SEQ ID NO:34的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ IDNO:44的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
18.根据权利要求13所述的方法,其中所述GPR75抑制剂包含抑制性核酸分子。
19.根据权利要求18所述的方法,其中所述抑制性核酸分子是与GPR75 mRNA杂交的反义核酸分子、小干扰RNA(siRNA)或短发夹RNA(shRNA)。
20.根据权利要求13所述的方法,其中所述GPR75抑制剂包含Cas蛋白和与GPR75基因组核酸分子内的引导RNA(gRNA)识别序列杂交的gRNA。
21.根据权利要求20所述的方法,其中所述Cas蛋白是Cas9或Cpf1。
22.根据权利要求20或权利要求21所述的方法,其中所述gRNA识别序列包括或接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546、根据SEQ ID NO:1的位置5,557、根据SEQ ID NO:1的位置5,911、根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923、根据SEQ IDNO:1的位置6,411或根据SEQ ID NO:1的位置5,831。
23.根据权利要求20至22中任一项所述的方法,其中所述gRNA包含约17至约23个核苷酸。
24.根据权利要求20至23中任一项所述的方法,其中所述gRNA识别序列包含根据SEQID NO:61-98中任一项的核苷酸序列。
25.一种鉴定具有增加的发展肥胖症的风险的受试者的方法,其中所述方法包括:
确定或已经确定在获自所述受试者的生物样品中存在或不存在编码预测的功能丧失性GPR75多肽的G蛋白偶联受体75(GPR75)错义变体核酸分子;
其中:
当所述受试者是GPR75参考时,则所述受试者具有增加的发展肥胖症的风险;并且
当所述受试者对于GPR75错义变体核酸分子是杂合的或对于GPR75错义变体核酸分子是纯合的时,则所述受试者具有降低的发展肥胖症的风险。
26.根据权利要求25所述的方法,其中所述GPR75错义变体核酸分子是编码Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs或Cys400fs的核酸分子。
27.根据权利要求26所述的方法,其中所述GPR75错义变体核酸分子是:
具有下述核苷酸序列的基因组核酸分子:在对应于根据SEQ IDNO:1的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:3的位置5,557的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:4的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQID NO:1的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:6的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入,或在对应于根据SEQ ID NO:99的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;
具有下述核苷酸序列的mRNA分子:在对应于根据SEQ ID NO:7的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:10的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:12的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQID NO:27的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13的位置910的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18的位置811的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置732的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQID NO:9的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于SEQ ID NO:10的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:30的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:100的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:101的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:102的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:103的位置891的位置处包含鸟嘌呤;或
由mRNA分子产生的cDNA分子,其中所述cDNA分子具有下述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ IDNO:33的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:51的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37的位置910的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:42的位置811的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ IDNO:47的位置732的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ IDNO:52的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:31的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于SEQ ID NO:34的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ IDNO:44的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:54的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:104的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:105的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
28.根据权利要求25至27中任一项所述的方法,其中所述受试者是GPR75参考,并且以标准剂量量向所述受试者施用治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂。
29.根据权利要求25至27中任一项所述的方法,其中所述受试者对于GPR75错义变体核酸分子是杂合的,并且以与标准剂量量相同或低于标准剂量量的量向所述受试者施用治疗或抑制肥胖症的治疗剂和/或GPR75抑制剂。
30.一种检测受试者中的人G蛋白偶联受体75(GPR75)变体核酸分子的方法,其包括测定获自所述受试者的样品以确定所述样品中的核酸分子是否是:
包含以下核苷酸序列的基因组核酸分子:在对应于根据SEQ IDNO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;
具有以下核苷酸序列的mRNA分子:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ IDNO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ IDNO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983处的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ IDNO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入,在对应于根据SEQ IDNO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;
由mRNA分子产生的cDNA分子,其中所述cDNA分子具有以下核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ IDNO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶,在对应于根据SEQID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸,在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ IDNO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入,在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ IDNO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤,在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤,或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
31.一种检测人G蛋白偶联受体75(GPR75)Ala110fs、Ala116Thr、Tyr207Cys、Gln234Stop、Arg236fs或Cys400fs变体多肽的存在的方法,其包括对获自受试者的样品进行测定以确定所述样品中的GPR75蛋白是否包含SEQ ID NO:56、SEQ ID NO:57、SEQ IDNO:58、SEQ ID NO:59、SEQ ID NO:60或SEQ ID NO:108。
32.一种分离的包含至少约15个核苷酸的改变特异性探针或改变特异性引物,其中所述改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,其中所述部分包含对应于以下位置的位置:
根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置5,540-5,546;根据SEQ ID NO:11或其互补序列的位置539-545;根据SEQ ID NO:16或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:21或其互补序列的位置361-367;根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置600-606;根据SEQ IDNO:35或其互补序列的位置539-545;根据SEQ ID NO:40或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:45或其互补序列的位置361-367;或根据SEQ ID NO:50或其互补序列的位置600-606;
根据SEQ ID NO:5或其互补序列的位置5,920-5,923;根据SEQ ID NO:14或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:19或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置741-744;根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置980-983;根据SEQ IDNO:38或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:43或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:48或其互补序列的位置741-744;或根据SEQ ID NO:53或其互补序列的位置980-983;或
根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411;根据SEQ IDNO:15或其互补序列的位置1,410;根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232;根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471;根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410;根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232;或根据SEQ IDNO:54或其互补序列的位置1,471。
33.根据权利要求32所述的改变特异性探针或改变特异性引物,其包含与核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,所述核苷酸序列的一部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置5,540-5,546;根据SEQ ID NO:5或其互补序列的位置5,920-5,923;或根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411。
34.根据权利要求32所述的改变特异性探针或改变特异性引物,其包含与核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,所述核苷酸序列的一部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:11或其互补序列的位置539-545;根据SEQ ID NO:16或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:21或其互补序列的位置361-367;根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置600-606;根据SEQ ID NO:14或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:19或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置741-744;根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置980-983;根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410;根据SEQID NO:20或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232;或根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471。
35.根据权利要求32所述的改变特异性探针或改变特异性引物,其包含与核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,所述核苷酸序列的一部分包含对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:35或其互补序列的位置539-545;根据SEQ ID NO:40或其互补序列的位置440-446;根据SEQ ID NO:45或其互补序列的位置361-367;根据SEQ ID NO:50或其互补序列的位置600-606;根据SEQ ID NO:38或其互补序列的位置919-922;根据SEQ ID NO:43或其互补序列的位置820-823;根据SEQ ID NO:48或其互补序列的位置741-744;根据SEQ ID NO:53或其互补序列的位置980-983;根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410;根据SEQID NO:44或其互补序列的位置1,311;根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232;或根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471。
36.一种分子复合物,其包含与包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子杂交的改变特异性引物或改变特异性探针,其中所述改变特异性引物或所述改变特异性探针在以下位置处与所述基因组核酸分子杂交:在对应于根据SEQIDNO:2或其互补序列的位置5,539-5,540的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置的胸腺嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:5或其互补序列的位置5,919-5,920的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置的胸腺嘧啶处;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处的鸟嘌呤处。
37.根据权利要求36所述的分子复合物,其中所述基因组核酸分子包含SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6或SEQ ID NO:99。
38.一种分子复合物,其包含与包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列的mRNA分子杂交的改变特异性引物或改变特异性探针,其中所述改变特异性引物或所述改变特异性探针在以下位置处与所述mRNA分子杂交:在对应于根据SEQ ID NO:11或其互补序列的位置538-539的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ IDNO:16或其互补序列的位置439-440的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:21或其互补序列的位置360-361的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置599-600的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置的腺嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ IDNO:18或其互补序列的位置811的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置732的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:14或其互补序列的位置918-919的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:19或其互补序列的位置819-820的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置740-741的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置979-980的位置的核苷酸处;在对应于根据SEQ IDNO:15或其互补序列的位置1,410的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置的尿嘧啶处;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置的鸟嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置的鸟嘌呤处;在对应于根据SEQ ID NO:102或其互补序列的位置652的位置的鸟嘌呤处;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置的鸟嘌呤处。
39.根据权利要求38所述的分子复合物,其中所述mRNA分子包含SEQ ID NO:11、SEQ IDNO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ IDNO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ IDNO:23、SEQ IDNO:24、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ IDNO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ IDNO:30、SEQ IDNO:100、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:102或SEQ ID NO:103。
40.一种分子复合物,其包含与包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列的cDNA分子杂交的改变特异性引物或改变特异性探针,其中所述改变特异性引物或所述改变特异性探针与以下各项杂交:在对应于根据SEQ ID NO:35或其互补序列的位置538-539的位置处的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:40或其互补序列的位置439-440的位置处的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:45或其互补序列的位置360-361的位置处的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:50或其互补序列的位置599-600的位置处的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQID NO:47或其互补序列的位置732的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:52或其互补序列的位置971的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:38或其互补序列的位置918-919的位置处的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:43或其互补序列的位置819-820的位置处的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:48或其互补序列的位置740-741的位置处的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:53或其互补序列的位置979-980的位置处的核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQIDNO:44或其互补序列的位置1,311的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处的鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处的鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处的鸟嘌呤。
41.根据权利要求40所述的分子复合物,其中所述cDNA分子包含SEQ ID NO:35、SEQ IDNO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41、SEQ IDNO:42、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:46、SEQ IDNO:47、SEQ IDNO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:50、SEQ IDNO:51、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:53或SEQ IDNO:54、SEQ IDNO:104、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:106或SEQ ID NO:107。
42.一种经分离的核酸分子,其包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列或其互补序列,其中所述多肽包含:从对应于根据SEQ ID NO:56的位置110的位置处开始的移码,从对应于根据SEQ ID NO:59的位置236的位置处开始的移码,或从对应于根据SEQID NO:60的位置400的位置处开始的移码。
43.一种经分离的基因组核酸分子,其包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;或在对应于根据SEQ ID NO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
44.根据权利要求43所述的经分离的基因组核酸分子或其互补序列,其中所述核酸分子包含SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5或SEQ IDNO:6。
45.一种经分离的mRNA分子,其包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入。
46.根据权利要求45所述的经分离的mRNA分子或其互补序列,其中所述核酸分子包含SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:14、SEQ IDNO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ IDNO:21、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:29或SEQ ID NO:30。
47.一种经分离的cDNA分子,其包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入。
48.根据权利要求47所述的经分离的cDNA分子或其互补序列,其中所述核酸分子包含SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:38、SEQ IDNO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ IDNO:45、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:50、SEQ ID NO:53或SEQ ID NO:54。
49.一种经分离的人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽,其具有与以下序列至少约90%同一的氨基酸序列:SEQ ID NO:56,其中所述多肽在对应于根据SEQ ID NO:55的位置110至540的位置处缺乏氨基酸;SEQ ID NO:59,其中所述多肽在对应于根据SEQ ID NO:55的位置236至540的位置处缺乏氨基酸;或SEQ ID NO:60,其中所述多肽在对应于根据SEQ ID NO:55的位置400至540的位置处缺乏氨基酸。
50.根据权利要求49所述的多肽,其中所述多肽包含SEQ IDNO:56、SEQ ID NO:59或SEQID NO:60。
51.一种经分离的核酸分子或其互补序列,其包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列,其中所述多肽:在对应于根据SEQ ID NO:57的位置116的位置处包含苏氨酸,在对应于根据SEQ ID NO:58的位置233的位置处终止,或在对应于根据SEQ ID NO:99的位置207的位置处包含半胱氨酸。
52.根据权利要求51所述的核酸分子或其互补序列,其中所述多肽包含SEQ ID NO:57、SEQ ID NO:58或SEQ ID NO:99。
53.一种经分离的mRNA分子,其包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
54.根据权利要求53所述的经分离的mRNA分子或其互补序列,其中所述核酸分子包含SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:17、SEQ IDNO:22、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:18、SEQ IDNO:23、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:101、SEQ IDNO:102或SEQ ID NO:103。
55.一种经分离的cDNA分子,其包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
56.根据权利要求55所述的经分离的cDNA分子或其互补序列,其中所述核酸分子包含SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:41、SEQ IDNO:46、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:42、SEQ IDNO:47、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:105、SEQ IDNO:106或SEQ ID NO:107。
57.一种经分离的基因组核酸分子,其包含编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列,其中所述核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处的腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处的鸟嘌呤。
58.根据权利要求57所述的经分离的基因组核酸分子或其互补序列,其中所述核酸分子包含SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4或SEQ IDNO:99。
59.一种经分离的人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽,其具有与以下序列至少约90%同一的氨基酸序列:SEQ ID NO:57,其中所述多肽在对应于根据SEQ ID NO:57的位置116的位置处包含苏氨酸;SEQ ID NO:58,其中所述多肽在对应于根据SEQ ID NO:58的位置233的位置处终止;或SEQ ID NO:99,其中所述多肽在对应于根据SEQ ID NO:99的位置207的位置处包含半胱氨酸。
60.根据权利要求59所述的多肽,其中所述多肽包含SEQ IDNO:57、SEQ ID NO:58或SEQID NO:99。
61.一种治疗或抑制肥胖症的治疗剂,其用于治疗受试者的肥胖症,所述受试者具有:
具有编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;
具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;或
具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ IDNO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
62.一种G蛋白偶联受体75(GPR75)抑制剂,其用于治疗受试者的肥胖症,所述受试者具有:
具有编码人G蛋白偶联受体75(GPR75)多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,540-5,546的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:3或其互补序列的位置5,557的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:4或其互补序列的位置5,911的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:1或其互补序列的位置5,920-5,923的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:6或其互补序列的位置6,411的位置处包含胸腺嘧啶的插入;或在对应于根据SEQ ID NO:99或其互补序列的位置5,831的位置处包含鸟嘌呤;
具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:8或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGUAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:12或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:17或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:13或其互补序列的位置910的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:18或其互补序列的位置811的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:23或其互补序列的位置732的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置971的位置处包含尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:7或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:8或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:9或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:10或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:15或其互补序列的位置1,410的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:20或其互补序列的位置1,311的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置1,232的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:30或其互补序列的位置1,471的位置处包含尿嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:100或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:101或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:102或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:103或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤;或
具有编码人GPR75多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置539-545的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ IDNO:32或其互补序列的位置440-446的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置361-367的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置600-606的位置处缺少CCAGTAG七核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:36或其互补序列的位置556的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:41或其互补序列的位置457的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:46或其互补序列的位置378的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:51或其互补序列的位置617的位置处包含腺嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:37或其互补序列的位置910的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:42或其互补序列的位置811的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:47或其互补序列的位置732的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQID NO:52或其互补序列的位置971的位置处包含胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:31或其互补序列的位置919-922的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:32或其互补序列的位置820-823的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:33或其互补序列的位置741-744的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:34或其互补序列的位置980-983的位置处缺少AAAG四核苷酸;在对应于根据SEQ ID NO:39或其互补序列的位置1,410的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ IDNO:44或其互补序列的位置1,311的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:49或其互补序列的位置1,232的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:54或其互补序列的位置1,471的位置处包含胸腺嘧啶的插入;在对应于根据SEQ ID NO:104或其互补序列的位置830的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ IDNO:105或其互补序列的位置731的位置处包含鸟嘌呤;在对应于根据SEQ ID NO:106或其互补序列的位置652的位置处包含鸟嘌呤;或在对应于根据SEQ ID NO:107或其互补序列的位置891的位置处包含鸟嘌呤。
63.根据权利要求62所述的方法,其中所述GPR75抑制剂包含抑制性核酸分子。
64.根据权利要求63所述的方法,其中所述抑制性核酸分子是与GPR75 mRNA杂交的反义核酸分子、小干扰RNA(siRNA)或短发夹RNA(shRNA)。
65.根据权利要求62所述的方法,其中所述GPR75抑制剂包含Cas蛋白和与GPR75基因组核酸分子内的引导RNA(gRNA)识别序列杂交的gRNA。
66.根据权利要求65所述的方法,其中所述Cas蛋白是Cas9或Cpf1。
67.根据权利要求65或权利要求66所述的方法,其中所述gRNA识别序列包括或接近对应于以下位置的位置:根据SEQ ID NO:1的位置5,540-5,546、根据SEQ ID NO:1的位置5,557、根据SEQ ID NO:1的位置5,911、根据SEQ ID NO:1的位置5,920-5,923、根据SEQ IDNO:1的位置6,411或根据SEQ ID NO:1的位置5,831。
68.根据权利要求65至67中任一项所述的方法,其中所述gRNA包含约17至约23个核苷酸。
69.根据权利要求65至69中任一项所述的方法,其中所述gRNA识别序列包含根据SEQID NO:61-98中任一项的核苷酸序列。
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