JP2023521803A - ウイルス核酸の検出用製品及びその検出方法 - Google Patents
ウイルス核酸の検出用製品及びその検出方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2023521803A JP2023521803A JP2022562080A JP2022562080A JP2023521803A JP 2023521803 A JP2023521803 A JP 2023521803A JP 2022562080 A JP2022562080 A JP 2022562080A JP 2022562080 A JP2022562080 A JP 2022562080A JP 2023521803 A JP2023521803 A JP 2023521803A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- weight
- composition
- agent
- acid
- substantially free
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title claims abstract description 165
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title claims abstract description 164
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title claims abstract description 164
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 120
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 title claims description 72
- 238000001514 detection method Methods 0.000 title abstract description 28
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims abstract description 291
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 88
- 230000003196 chaotropic effect Effects 0.000 claims abstract description 79
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims abstract description 79
- 239000003172 expectorant agent Substances 0.000 claims abstract description 69
- 229940066491 mucolytics Drugs 0.000 claims abstract description 69
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 claims abstract description 65
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 claims abstract description 62
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 claims abstract description 55
- PWKSKIMOESPYIA-BYPYZUCNSA-N L-N-acetyl-Cysteine Chemical compound CC(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O PWKSKIMOESPYIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims abstract description 46
- 238000003860 storage Methods 0.000 claims abstract description 43
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 42
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 36
- 239000000872 buffer Substances 0.000 claims abstract description 29
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 claims abstract description 23
- ZJYYHGLJYGJLLN-UHFFFAOYSA-N guanidinium thiocyanate Chemical compound SC#N.NC(N)=N ZJYYHGLJYGJLLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 22
- 241001678559 COVID-19 virus Species 0.000 claims abstract description 19
- 150000001298 alcohols Chemical class 0.000 claims abstract description 15
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 209
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 claims description 102
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 74
- -1 poly(vinylsulfonic acid) Polymers 0.000 claims description 52
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims description 42
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims description 34
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims description 34
- 201000003176 Severe Acute Respiratory Syndrome Diseases 0.000 claims description 32
- 239000006172 buffering agent Substances 0.000 claims description 31
- KSAVQLQVUXSOCR-UHFFFAOYSA-M sodium lauroyl sarcosinate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCC(=O)N(C)CC([O-])=O KSAVQLQVUXSOCR-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 30
- SGHZXLIDFTYFHQ-UHFFFAOYSA-L Brilliant Blue Chemical compound [Na+].[Na+].C=1C=C(C(=C2C=CC(C=C2)=[N+](CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C=2C(=CC=CC=2)S([O-])(=O)=O)C=CC=1N(CC)CC1=CC=CC(S([O-])(=O)=O)=C1 SGHZXLIDFTYFHQ-UHFFFAOYSA-L 0.000 claims description 22
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 claims description 20
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 20
- 230000000844 anti-bacterial effect Effects 0.000 claims description 19
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 claims description 19
- GVJHHUAWPYXKBD-UHFFFAOYSA-N (±)-α-Tocopherol Chemical compound OC1=C(C)C(C)=C2OC(CCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C)(C)CCC2=C1C GVJHHUAWPYXKBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 18
- XYFCBTPGUUZFHI-UHFFFAOYSA-N Phosphine Chemical compound P XYFCBTPGUUZFHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 18
- 238000011109 contamination Methods 0.000 claims description 17
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 claims description 16
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 16
- 241000711573 Coronaviridae Species 0.000 claims description 15
- ZGTMUACCHSMWAC-UHFFFAOYSA-L EDTA disodium salt (anhydrous) Chemical compound [Na+].[Na+].OC(=O)CN(CC([O-])=O)CCN(CC(O)=O)CC([O-])=O ZGTMUACCHSMWAC-UHFFFAOYSA-L 0.000 claims description 15
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 claims description 15
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 claims description 15
- 239000008367 deionised water Substances 0.000 claims description 15
- 229910021641 deionized water Inorganic materials 0.000 claims description 15
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 claims description 14
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 14
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 claims description 14
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 claims description 14
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 claims description 14
- 239000004365 Protease Substances 0.000 claims description 13
- 239000003086 colorant Substances 0.000 claims description 11
- 239000000049 pigment Substances 0.000 claims description 11
- 239000003161 ribonuclease inhibitor Substances 0.000 claims description 11
- 108020000999 Viral RNA Proteins 0.000 claims description 10
- 235000010323 ascorbic acid Nutrition 0.000 claims description 10
- 229960005070 ascorbic acid Drugs 0.000 claims description 10
- 239000011668 ascorbic acid Substances 0.000 claims description 10
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 claims description 10
- GLEVLJDDWXEYCO-UHFFFAOYSA-N Trolox Chemical compound O1C(C)(C(O)=O)CCC2=C1C(C)=C(C)C(O)=C2C GLEVLJDDWXEYCO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 229930003427 Vitamin E Natural products 0.000 claims description 9
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 claims description 9
- 239000001055 blue pigment Substances 0.000 claims description 9
- GRWZHXKQBITJKP-UHFFFAOYSA-L dithionite(2-) Chemical compound [O-]S(=O)S([O-])=O GRWZHXKQBITJKP-UHFFFAOYSA-L 0.000 claims description 9
- WIGCFUFOHFEKBI-UHFFFAOYSA-N gamma-tocopherol Natural products CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCC1CCC2C(C)C(O)C(C)C(C)C2O1 WIGCFUFOHFEKBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 229910000073 phosphorus hydride Inorganic materials 0.000 claims description 9
- 238000004321 preservation Methods 0.000 claims description 9
- 150000003573 thiols Chemical class 0.000 claims description 9
- 235000019165 vitamin E Nutrition 0.000 claims description 9
- 229940046009 vitamin E Drugs 0.000 claims description 9
- 239000011709 vitamin E Substances 0.000 claims description 9
- 230000000510 mucolytic effect Effects 0.000 claims description 8
- 229920002971 Heparan sulfate Polymers 0.000 claims description 7
- HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N Heparin Chemical compound OC1C(NC(=O)C)C(O)OC(COS(O)(=O)=O)C1OC1C(OS(O)(=O)=O)C(O)C(OC2C(C(OS(O)(=O)=O)C(OC3C(C(O)C(O)C(O3)C(O)=O)OS(O)(=O)=O)C(CO)O2)NS(O)(=O)=O)C(C(O)=O)O1 HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 239000000022 bacteriostatic agent Substances 0.000 claims description 7
- 230000001332 colony forming effect Effects 0.000 claims description 7
- 229960002897 heparin Drugs 0.000 claims description 7
- 229920000669 heparin Polymers 0.000 claims description 7
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 claims description 7
- ZTWTYVWXUKTLCP-UHFFFAOYSA-N vinylphosphonic acid Chemical compound OP(O)(=O)C=C ZTWTYVWXUKTLCP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- NLVXSWCKKBEXTG-UHFFFAOYSA-N vinylsulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)C=C NLVXSWCKKBEXTG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 239000003899 bactericide agent Substances 0.000 claims description 6
- 101710141795 Ribonuclease inhibitor Proteins 0.000 claims description 5
- 229940122208 Ribonuclease inhibitor Drugs 0.000 claims description 5
- 102100037968 Ribonuclease inhibitor Human genes 0.000 claims description 5
- 239000012459 cleaning agent Substances 0.000 claims description 2
- 239000012569 microbial contaminant Substances 0.000 claims description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 abstract description 58
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 abstract description 53
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 abstract description 35
- 238000005070 sampling Methods 0.000 abstract description 18
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 abstract description 12
- 238000002156 mixing Methods 0.000 abstract description 12
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 abstract description 8
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 abstract description 6
- 239000000969 carrier Substances 0.000 abstract description 4
- 239000000975 dye Substances 0.000 abstract description 2
- YUJLIIRMIAGMCQ-CIUDSAMLSA-N Ser-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YUJLIIRMIAGMCQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 abstract 1
- JIWBIWFOSCKQMA-LTKCOYKYSA-N all-cis-octadeca-6,9,12,15-tetraenoic acid Chemical compound CC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCC(O)=O JIWBIWFOSCKQMA-LTKCOYKYSA-N 0.000 abstract 1
- 235000019441 ethanol Nutrition 0.000 description 119
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 75
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 64
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 59
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 59
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 56
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 43
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 33
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 32
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 31
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 31
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 26
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 26
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 24
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 23
- 230000000120 cytopathologic effect Effects 0.000 description 22
- 108700004121 sarkosyl Proteins 0.000 description 22
- 229940045885 sodium lauroyl sarcosinate Drugs 0.000 description 21
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 20
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 18
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 17
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 17
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 17
- 238000007481 next generation sequencing Methods 0.000 description 16
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 16
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 15
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 15
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 15
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 15
- 229960004308 acetylcysteine Drugs 0.000 description 14
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 14
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 14
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 13
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 13
- 230000000087 stabilizing effect Effects 0.000 description 13
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 12
- 150000004683 dihydrates Chemical class 0.000 description 12
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 12
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 12
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 12
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 12
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 11
- 230000008569 process Effects 0.000 description 11
- 239000000047 product Substances 0.000 description 11
- ZRALSGWEFCBTJO-UHFFFAOYSA-N Guanidine Chemical compound NC(N)=N ZRALSGWEFCBTJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 239000003398 denaturant Substances 0.000 description 10
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 9
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 9
- 230000006870 function Effects 0.000 description 9
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 9
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 description 9
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 9
- 239000012139 lysis buffer Substances 0.000 description 9
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 9
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 description 9
- 206010036790 Productive cough Diseases 0.000 description 8
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 8
- 238000007480 sanger sequencing Methods 0.000 description 8
- 210000003802 sputum Anatomy 0.000 description 8
- 208000024794 sputum Diseases 0.000 description 8
- LXAHHHIGZXPRKQ-UHFFFAOYSA-N 5-fluoro-2-methylpyridine Chemical compound CC1=CC=C(F)C=N1 LXAHHHIGZXPRKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 108020000946 Bacterial DNA Proteins 0.000 description 7
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 7
- 238000007847 digital PCR Methods 0.000 description 7
- 238000013504 emergency use authorization Methods 0.000 description 7
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 7
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 7
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 description 7
- 208000036142 Viral infection Diseases 0.000 description 6
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 6
- 238000002493 microarray Methods 0.000 description 6
- 230000002335 preservative effect Effects 0.000 description 6
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 6
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 6
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 description 6
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 241001115402 Ebolavirus Species 0.000 description 5
- CHJJGSNFBQVOTG-UHFFFAOYSA-N N-methyl-guanidine Natural products CNC(N)=N CHJJGSNFBQVOTG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- GRYLNZFGIOXLOG-UHFFFAOYSA-N Nitric acid Chemical compound O[N+]([O-])=O GRYLNZFGIOXLOG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- PZBFGYYEXUXCOF-UHFFFAOYSA-N TCEP Chemical compound OC(=O)CCP(CCC(O)=O)CCC(O)=O PZBFGYYEXUXCOF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 230000000845 anti-microbial effect Effects 0.000 description 5
- 230000003385 bacteriostatic effect Effects 0.000 description 5
- 239000011928 denatured alcohol Substances 0.000 description 5
- SWSQBOPZIKWTGO-UHFFFAOYSA-N dimethylaminoamidine Natural products CN(C)C(N)=N SWSQBOPZIKWTGO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 5
- 229960004198 guanidine Drugs 0.000 description 5
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 5
- 229910017604 nitric acid Inorganic materials 0.000 description 5
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 5
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 5
- PWKSKIMOESPYIA-SCSAIBSYSA-N (2s)-2-acetamido-3-sulfanylpropanoic acid Chemical compound CC(=O)N[C@H](CS)C(O)=O PWKSKIMOESPYIA-SCSAIBSYSA-N 0.000 description 4
- BMYNFMYTOJXKLE-UHFFFAOYSA-N 3-azaniumyl-2-hydroxypropanoate Chemical compound NCC(O)C(O)=O BMYNFMYTOJXKLE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 4
- LZZYPRNAOMGNLH-UHFFFAOYSA-M Cetrimonium bromide Chemical compound [Br-].CCCCCCCCCCCCCCCC[N+](C)(C)C LZZYPRNAOMGNLH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- PIICEJLVQHRZGT-UHFFFAOYSA-N Ethylenediamine Chemical compound NCCN PIICEJLVQHRZGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N N-Butanol Chemical compound CCCCO LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M Sodium laurylsulphate Chemical group [Na+].CCCCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- ZMZDMBWJUHKJPS-UHFFFAOYSA-M Thiocyanate anion Chemical compound [S-]C#N ZMZDMBWJUHKJPS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 208000028227 Viral hemorrhagic fever Diseases 0.000 description 4
- 239000004599 antimicrobial Substances 0.000 description 4
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-N carbonic acid Chemical compound OC(O)=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 4
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 4
- ZMZDMBWJUHKJPS-UHFFFAOYSA-N hydrogen thiocyanate Natural products SC#N ZMZDMBWJUHKJPS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000000463 material Substances 0.000 description 4
- 238000007479 molecular analysis Methods 0.000 description 4
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 4
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 4
- BDERNNFJNOPAEC-UHFFFAOYSA-N propan-1-ol Chemical compound CCCO BDERNNFJNOPAEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 4
- 239000008213 purified water Substances 0.000 description 4
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 4
- 241000894007 species Species 0.000 description 4
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 4
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 4
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 4
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 4
- 101150010738 CYP2D6 gene Proteins 0.000 description 3
- 238000007400 DNA extraction Methods 0.000 description 3
- 241000711950 Filoviridae Species 0.000 description 3
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 3
- XMEKHKCRNHDFOW-UHFFFAOYSA-N O.O.[Na].[Na] Chemical compound O.O.[Na].[Na] XMEKHKCRNHDFOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000002123 RNA extraction Methods 0.000 description 3
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 3
- 241001115374 Tai Forest ebolavirus Species 0.000 description 3
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 3
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 3
- 235000012745 brilliant blue FCF Nutrition 0.000 description 3
- 239000004161 brilliant blue FCF Substances 0.000 description 3
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 3
- 230000008859 change Effects 0.000 description 3
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 3
- 239000003638 chemical reducing agent Substances 0.000 description 3
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 3
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 3
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 3
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 3
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 3
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 3
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 3
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 3
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 3
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 3
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 3
- PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N guanidinium chloride Chemical compound [Cl-].NC(N)=[NH2+] PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000036541 health Effects 0.000 description 3
- VLTRZXGMWDSKGL-UHFFFAOYSA-N perchloric acid Chemical compound OCl(=O)(=O)=O VLTRZXGMWDSKGL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 3
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 3
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 3
- NLKNQRATVPKPDG-UHFFFAOYSA-M potassium iodide Chemical compound [K+].[I-] NLKNQRATVPKPDG-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 3
- 238000011160 research Methods 0.000 description 3
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 3
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 3
- 238000000870 ultraviolet spectroscopy Methods 0.000 description 3
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 3
- 108020004465 16S ribosomal RNA Proteins 0.000 description 2
- RNMCCPMYXUKHAZ-UHFFFAOYSA-N 2-[3,3-diamino-1,2,2-tris(carboxymethyl)cyclohexyl]acetic acid Chemical compound NC1(N)CCCC(CC(O)=O)(CC(O)=O)C1(CC(O)=O)CC(O)=O RNMCCPMYXUKHAZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N Ammonia chloride Chemical compound [NH4+].[Cl-] NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091093088 Amplicon Proteins 0.000 description 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 2
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 2
- 241000884921 Bundibugyo ebolavirus Species 0.000 description 2
- 208000025721 COVID-19 Diseases 0.000 description 2
- 241000439488 Cuevavirus Species 0.000 description 2
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 2
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 2
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 2
- 239000003109 Disodium ethylene diamine tetraacetate Substances 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 2
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 2
- 101000619564 Homo sapiens Putative testis-specific prion protein Proteins 0.000 description 2
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 2
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 2
- 241001115401 Marburgvirus Species 0.000 description 2
- 239000012901 Milli-Q water Substances 0.000 description 2
- QPCDCPDFJACHGM-UHFFFAOYSA-N N,N-bis{2-[bis(carboxymethyl)amino]ethyl}glycine Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(=O)O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O QPCDCPDFJACHGM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 2
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 description 2
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 2
- 108091093037 Peptide nucleic acid Proteins 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- BELBBZDIHDAJOR-UHFFFAOYSA-N Phenolsulfonephthalein Chemical compound C1=CC(O)=CC=C1C1(C=2C=CC(O)=CC=2)C2=CC=CC=C2S(=O)(=O)O1 BELBBZDIHDAJOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229920002675 Polyoxyl Polymers 0.000 description 2
- 102100022208 Putative testis-specific prion protein Human genes 0.000 description 2
- 238000010240 RT-PCR analysis Methods 0.000 description 2
- 241001115394 Reston ebolavirus Species 0.000 description 2
- 102100037486 Reverse transcriptase/ribonuclease H Human genes 0.000 description 2
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 241001115376 Sudan ebolavirus Species 0.000 description 2
- 108020005202 Viral DNA Proteins 0.000 description 2
- 241001115400 Zaire ebolavirus Species 0.000 description 2
- 230000032683 aging Effects 0.000 description 2
- 239000008365 aqueous carrier Substances 0.000 description 2
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 2
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 2
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 2
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 2
- 239000012531 culture fluid Substances 0.000 description 2
- 210000004748 cultured cell Anatomy 0.000 description 2
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 2
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 2
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 2
- 235000019301 disodium ethylene diamine tetraacetate Nutrition 0.000 description 2
- SYELZBGXAIXKHU-UHFFFAOYSA-N dodecyldimethylamine N-oxide Chemical compound CCCCCCCCCCCC[N+](C)(C)[O-] SYELZBGXAIXKHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229950007919 egtazic acid Drugs 0.000 description 2
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 2
- DEFVIWRASFVYLL-UHFFFAOYSA-N ethylene glycol bis(2-aminoethyl)tetraacetic acid Chemical group OC(=O)CN(CC(O)=O)CCOCCOCCN(CC(O)=O)CC(O)=O DEFVIWRASFVYLL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 239000012091 fetal bovine serum Substances 0.000 description 2
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 2
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 2
- 238000005227 gel permeation chromatography Methods 0.000 description 2
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 2
- RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N glutathione Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- ZRALSGWEFCBTJO-UHFFFAOYSA-O guanidinium Chemical compound NC(N)=[NH2+] ZRALSGWEFCBTJO-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 2
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000004677 hydrates Chemical class 0.000 description 2
- XMBWDFGMSWQBCA-UHFFFAOYSA-N hydrogen iodide Chemical compound I XMBWDFGMSWQBCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940071870 hydroiodic acid Drugs 0.000 description 2
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 2
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 2
- 230000000415 inactivating effect Effects 0.000 description 2
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 2
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 2
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 2
- 238000011835 investigation Methods 0.000 description 2
- ZXEKIIBDNHEJCQ-UHFFFAOYSA-N isobutanol Chemical compound CC(C)CO ZXEKIIBDNHEJCQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 210000000214 mouth Anatomy 0.000 description 2
- 210000003097 mucus Anatomy 0.000 description 2
- MGFYIUFZLHCRTH-UHFFFAOYSA-N nitrilotriacetic acid Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CC(O)=O MGFYIUFZLHCRTH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 2
- 150000002894 organic compounds Chemical class 0.000 description 2
- 229940049954 penicillin Drugs 0.000 description 2
- 229960003330 pentetic acid Drugs 0.000 description 2
- 210000003800 pharynx Anatomy 0.000 description 2
- 235000011007 phosphoric acid Nutrition 0.000 description 2
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 2
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 2
- 235000019833 protease Nutrition 0.000 description 2
- 235000019419 proteases Nutrition 0.000 description 2
- 230000005180 public health Effects 0.000 description 2
- 230000000241 respiratory effect Effects 0.000 description 2
- 238000005185 salting out Methods 0.000 description 2
- 238000007789 sealing Methods 0.000 description 2
- 238000013207 serial dilution Methods 0.000 description 2
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 2
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 2
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000004611 spectroscopical analysis Methods 0.000 description 2
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 2
- 235000011149 sulphuric acid Nutrition 0.000 description 2
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 2
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 2
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 2
- 210000003501 vero cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 2
- 238000007482 whole exome sequencing Methods 0.000 description 2
- CMCBDXRRFKYBDG-UHFFFAOYSA-N 1-dodecoxydodecane Chemical class CCCCCCCCCCCCOCCCCCCCCCCCC CMCBDXRRFKYBDG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 1-palmitoyl-2-arachidonoyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCC IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 0.000 description 1
- IEORSVTYLWZQJQ-UHFFFAOYSA-N 2-(2-nonylphenoxy)ethanol Chemical compound CCCCCCCCCC1=CC=CC=C1OCCO IEORSVTYLWZQJQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AJTVSSFTXWNIRG-UHFFFAOYSA-N 2-[bis(2-hydroxyethyl)amino]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+](CCO)CCS([O-])(=O)=O AJTVSSFTXWNIRG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BZXMNFQDWOCVMU-UHFFFAOYSA-N 2-[dodecanoyl(methyl)amino]acetic acid;sodium Chemical class [Na].CCCCCCCCCCCC(=O)N(C)CC(O)=O BZXMNFQDWOCVMU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NEWKHUASLBMWRE-UHFFFAOYSA-N 2-methyl-6-(phenylethynyl)pyridine Chemical compound CC1=CC=CC(C#CC=2C=CC=CC=2)=N1 NEWKHUASLBMWRE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DVLFYONBTKHTER-UHFFFAOYSA-N 3-(N-morpholino)propanesulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)CCCN1CCOCC1 DVLFYONBTKHTER-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WOVKYSAHUYNSMH-RRKCRQDMSA-N 5-bromodeoxyuridine Chemical compound C1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C(Br)=C1 WOVKYSAHUYNSMH-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- APKFDSVGJQXUKY-KKGHZKTASA-N Amphotericin-B Natural products O[C@H]1[C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](C)O[C@H]1O[C@H]1C=CC=CC=CC=CC=CC=CC=C[C@H](C)[C@@H](O)[C@@H](C)[C@H](C)OC(=O)C[C@H](O)C[C@H](O)CC[C@@H](O)[C@H](O)C[C@H](O)C[C@](O)(C[C@H](O)[C@H]2C(O)=O)O[C@H]2C1 APKFDSVGJQXUKY-KKGHZKTASA-N 0.000 description 1
- 101100272788 Arabidopsis thaliana BSL3 gene Proteins 0.000 description 1
- 239000007992 BES buffer Substances 0.000 description 1
- NLZUEZXRPGMBCV-UHFFFAOYSA-N Butylhydroxytoluene Chemical compound CC1=CC(C(C)(C)C)=C(O)C(C(C)(C)C)=C1 NLZUEZXRPGMBCV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000031404 Chromosome Aberrations Diseases 0.000 description 1
- 241000494545 Cordyline virus 2 Species 0.000 description 1
- 229920000858 Cyclodextrin Polymers 0.000 description 1
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 1
- 108010053770 Deoxyribonucleases Proteins 0.000 description 1
- 102000016911 Deoxyribonucleases Human genes 0.000 description 1
- AHCYMLUZIRLXAA-SHYZEUOFSA-N Deoxyuridine 5'-triphosphate Chemical compound O1[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)C[C@@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 AHCYMLUZIRLXAA-SHYZEUOFSA-N 0.000 description 1
- 201000011001 Ebola Hemorrhagic Fever Diseases 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 108091092584 GDNA Proteins 0.000 description 1
- 108010024636 Glutathione Proteins 0.000 description 1
- HSRJKNPTNIJEKV-UHFFFAOYSA-N Guaifenesin Chemical compound COC1=CC=CC=C1OCC(O)CO HSRJKNPTNIJEKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 240000004836 Justicia adhatoda Species 0.000 description 1
- 239000007836 KH2PO4 Substances 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- 239000004201 L-cysteine Substances 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 229930182816 L-glutamine Natural products 0.000 description 1
- 208000032420 Latent Infection Diseases 0.000 description 1
- 241001124569 Lycaenidae Species 0.000 description 1
- 239000007993 MOPS buffer Substances 0.000 description 1
- QWZLBLDNRUUYQI-UHFFFAOYSA-M Methylbenzethonium chloride Chemical compound [Cl-].CC1=CC(C(C)(C)CC(C)(C)C)=CC=C1OCCOCC[N+](C)(C)CC1=CC=CC=C1 QWZLBLDNRUUYQI-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 208000025370 Middle East respiratory syndrome Diseases 0.000 description 1
- 241000127282 Middle East respiratory syndrome-related coronavirus Species 0.000 description 1
- 102000001621 Mucoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108010093825 Mucoproteins Proteins 0.000 description 1
- BACYUWVYYTXETD-UHFFFAOYSA-N N-Lauroylsarcosine Chemical compound CCCCCCCCCCCC(=O)N(C)CC(O)=O BACYUWVYYTXETD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 238000010222 PCR analysis Methods 0.000 description 1
- 208000037581 Persistent Infection Diseases 0.000 description 1
- 229920001214 Polysorbate 60 Polymers 0.000 description 1
- 108010001267 Protein Subunits Proteins 0.000 description 1
- 102000002067 Protein Subunits Human genes 0.000 description 1
- 241000589517 Pseudomonas aeruginosa Species 0.000 description 1
- 108091081062 Repeated sequence (DNA) Proteins 0.000 description 1
- GBFLZEXEOZUWRN-VKHMYHEASA-N S-carboxymethyl-L-cysteine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CSCC(O)=O GBFLZEXEOZUWRN-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 description 1
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 1
- ATJFFYVFTNAWJD-UHFFFAOYSA-N Tin Chemical compound [Sn] ATJFFYVFTNAWJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000007731 Tolu balsam tree Species 0.000 description 1
- 235000007423 Tolu balsam tree Nutrition 0.000 description 1
- RHQDFWAXVIIEBN-UHFFFAOYSA-N Trifluoroethanol Chemical compound OCC(F)(F)F RHQDFWAXVIIEBN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000700618 Vaccinia virus Species 0.000 description 1
- 206010052428 Wound Diseases 0.000 description 1
- 208000027418 Wounds and injury Diseases 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 230000001154 acute effect Effects 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 229960005174 ambroxol Drugs 0.000 description 1
- JBDGDEWWOUBZPM-XYPYZODXSA-N ambroxol Chemical compound NC1=C(Br)C=C(Br)C=C1CN[C@@H]1CC[C@@H](O)CC1 JBDGDEWWOUBZPM-XYPYZODXSA-N 0.000 description 1
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000019270 ammonium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 229960001040 ammonium chloride Drugs 0.000 description 1
- APKFDSVGJQXUKY-INPOYWNPSA-N amphotericin B Chemical compound O[C@H]1[C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](C)O[C@H]1O[C@H]1/C=C/C=C/C=C/C=C/C=C/C=C/C=C/[C@H](C)[C@@H](O)[C@@H](C)[C@H](C)OC(=O)C[C@H](O)C[C@H](O)CC[C@@H](O)[C@H](O)C[C@H](O)C[C@](O)(C[C@H](O)[C@H]2C(O)=O)O[C@H]2C1 APKFDSVGJQXUKY-INPOYWNPSA-N 0.000 description 1
- 229960003942 amphotericin b Drugs 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 239000003125 aqueous solvent Substances 0.000 description 1
- 238000000429 assembly Methods 0.000 description 1
- 230000000712 assembly Effects 0.000 description 1
- UREZNYTWGJKWBI-UHFFFAOYSA-M benzethonium chloride Chemical compound [Cl-].C1=CC(C(C)(C)CC(C)(C)C)=CC=C1OCCOCC[N+](C)(C)CC1=CC=CC=C1 UREZNYTWGJKWBI-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000003613 bile acid Chemical class 0.000 description 1
- 229960000074 biopharmaceutical Drugs 0.000 description 1
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 239000001045 blue dye Substances 0.000 description 1
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 1
- 210000001185 bone marrow Anatomy 0.000 description 1
- 229910021538 borax Inorganic materials 0.000 description 1
- KGBXLFKZBHKPEV-UHFFFAOYSA-N boric acid Chemical compound OB(O)O KGBXLFKZBHKPEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000010354 butylated hydroxytoluene Nutrition 0.000 description 1
- 239000007978 cacodylate buffer Substances 0.000 description 1
- LLSDKQJKOVVTOJ-UHFFFAOYSA-L calcium chloride dihydrate Chemical compound O.O.[Cl-].[Cl-].[Ca+2] LLSDKQJKOVVTOJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 1
- UUDRLGYROXTISK-UHFFFAOYSA-N carbamimidoylazanium;iodide Chemical compound I.NC(N)=N UUDRLGYROXTISK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004399 carbocisteine Drugs 0.000 description 1
- 239000004359 castor oil Substances 0.000 description 1
- 235000019438 castor oil Nutrition 0.000 description 1
- 239000006143 cell culture medium Substances 0.000 description 1
- 230000032823 cell division Effects 0.000 description 1
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 1
- 230000006037 cell lysis Effects 0.000 description 1
- 210000003855 cell nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 210000003850 cellular structure Anatomy 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 238000001311 chemical methods and process Methods 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 231100000005 chromosome aberration Toxicity 0.000 description 1
- 230000003749 cleanliness Effects 0.000 description 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 230000005757 colony formation Effects 0.000 description 1
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 1
- 239000000306 component Substances 0.000 description 1
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 1
- 239000013068 control sample Substances 0.000 description 1
- 239000002537 cosmetic Substances 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- 229960003964 deoxycholic acid Drugs 0.000 description 1
- 229940119679 deoxyribonucleases Drugs 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 208000037771 disease arising from reactivation of latent virus Diseases 0.000 description 1
- BNIILDVGGAEEIG-UHFFFAOYSA-L disodium hydrogen phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].OP([O-])([O-])=O BNIILDVGGAEEIG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229910000397 disodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019800 disodium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 1
- 229960000533 dornase alfa Drugs 0.000 description 1
- 108010067396 dornase alfa Proteins 0.000 description 1
- 230000009977 dual effect Effects 0.000 description 1
- 230000002900 effect on cell Effects 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 1
- 229960003262 erdosteine Drugs 0.000 description 1
- QGFORSXNKQLDNO-UHFFFAOYSA-N erdosteine Chemical compound OC(=O)CSCC(=O)NC1CCSC1=O QGFORSXNKQLDNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- 210000003608 fece Anatomy 0.000 description 1
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 1
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 1
- 210000004051 gastric juice Anatomy 0.000 description 1
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 1
- 210000004907 gland Anatomy 0.000 description 1
- 229960003180 glutathione Drugs 0.000 description 1
- ZEMPKEQAKRGZGQ-XOQCFJPHSA-N glycerol triricinoleate Natural products CCCCCC[C@@H](O)CC=CCCCCCCCC(=O)OC[C@@H](COC(=O)CCCCCCCC=CC[C@@H](O)CCCCCC)OC(=O)CCCCCCCC=CC[C@H](O)CCCCCC ZEMPKEQAKRGZGQ-XOQCFJPHSA-N 0.000 description 1
- 239000008187 granular material Substances 0.000 description 1
- 230000005484 gravity Effects 0.000 description 1
- 229960002146 guaifenesin Drugs 0.000 description 1
- 229960000789 guanidine hydrochloride Drugs 0.000 description 1
- 238000012165 high-throughput sequencing Methods 0.000 description 1
- 230000007446 host cell death Effects 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 1
- 239000012678 infectious agent Substances 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 238000007689 inspection Methods 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 230000002147 killing effect Effects 0.000 description 1
- 230000006651 lactation Effects 0.000 description 1
- 238000012177 large-scale sequencing Methods 0.000 description 1
- 239000000787 lecithin Substances 0.000 description 1
- 229940067606 lecithin Drugs 0.000 description 1
- 235000010445 lecithin Nutrition 0.000 description 1
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 1
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 1
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 1
- 210000002751 lymph Anatomy 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- DHRRIBDTHFBPNG-UHFFFAOYSA-L magnesium dichloride hexahydrate Chemical compound O.O.O.O.O.O.[Mg+2].[Cl-].[Cl-] DHRRIBDTHFBPNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 229960001913 mecysteine Drugs 0.000 description 1
- MCYHPZGUONZRGO-VKHMYHEASA-N methyl L-cysteinate Chemical compound COC(=O)[C@@H](N)CS MCYHPZGUONZRGO-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 229960002285 methylbenzethonium chloride Drugs 0.000 description 1
- 238000010208 microarray analysis Methods 0.000 description 1
- 230000003278 mimic effect Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 239000003607 modifier Substances 0.000 description 1
- 229910000402 monopotassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019796 monopotassium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000001673 myroxylon balsanum l. absolute Substances 0.000 description 1
- IFYDWYVPVAMGRO-UHFFFAOYSA-N n-[3-(dimethylamino)propyl]tetradecanamide Chemical compound CCCCCCCCCCCCCC(=O)NCCCN(C)C IFYDWYVPVAMGRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SQMWSBKSHWARHU-SDBHATRESA-N n6-cyclopentyladenosine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C2=NC=NC(NC3CCCC3)=C2N=C1 SQMWSBKSHWARHU-SDBHATRESA-N 0.000 description 1
- 230000001613 neoplastic effect Effects 0.000 description 1
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 1
- 229920000847 nonoxynol Polymers 0.000 description 1
- VIKNJXKGJWUCNN-XGXHKTLJSA-N norethisterone Chemical compound O=C1CC[C@@H]2[C@H]3CC[C@](C)([C@](CC4)(O)C#C)[C@@H]4[C@@H]3CCC2=C1 VIKNJXKGJWUCNN-XGXHKTLJSA-N 0.000 description 1
- 238000002414 normal-phase solid-phase extraction Methods 0.000 description 1
- 210000001331 nose Anatomy 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 238000001821 nucleic acid purification Methods 0.000 description 1
- 230000005257 nucleotidylation Effects 0.000 description 1
- QYSGYZVSCZSLHT-UHFFFAOYSA-N octafluoropropane Chemical compound FC(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)F QYSGYZVSCZSLHT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940066429 octoxynol Drugs 0.000 description 1
- 229920002113 octoxynol Polymers 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 230000005789 organism growth Effects 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-O oxonium Chemical compound [OH3+] XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 239000003002 pH adjusting agent Substances 0.000 description 1
- 239000006174 pH buffer Substances 0.000 description 1
- 210000001819 pancreatic juice Anatomy 0.000 description 1
- 210000003681 parotid gland Anatomy 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 230000007918 pathogenicity Effects 0.000 description 1
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 1
- VLTRZXGMWDSKGL-UHFFFAOYSA-M perchlorate Inorganic materials [O-]Cl(=O)(=O)=O VLTRZXGMWDSKGL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 1
- 230000002974 pharmacogenomic effect Effects 0.000 description 1
- 238000002205 phenol-chloroform extraction Methods 0.000 description 1
- 229960003531 phenolsulfonphthalein Drugs 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 150000004713 phosphodiesters Chemical class 0.000 description 1
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 1
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 1
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 description 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 1
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 1
- 229950008882 polysorbate Drugs 0.000 description 1
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 1
- 239000001508 potassium citrate Substances 0.000 description 1
- 229960002635 potassium citrate Drugs 0.000 description 1
- QEEAPRPFLLJWCF-UHFFFAOYSA-K potassium citrate (anhydrous) Chemical compound [K+].[K+].[K+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O QEEAPRPFLLJWCF-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 235000011082 potassium citrates Nutrition 0.000 description 1
- GNSKLFRGEWLPPA-UHFFFAOYSA-M potassium dihydrogen phosphate Chemical compound [K+].OP(O)([O-])=O GNSKLFRGEWLPPA-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229960004839 potassium iodide Drugs 0.000 description 1
- 235000007715 potassium iodide Nutrition 0.000 description 1
- 239000003761 preservation solution Substances 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 1
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 description 1
- 229940024999 proteolytic enzymes for treatment of wounds and ulcers Drugs 0.000 description 1
- 238000012175 pyrosequencing Methods 0.000 description 1
- 238000013102 re-test Methods 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 210000003079 salivary gland Anatomy 0.000 description 1
- 239000012488 sample solution Substances 0.000 description 1
- HFHDHCJBZVLPGP-UHFFFAOYSA-N schardinger α-dextrin Chemical compound O1C(C(C2O)O)C(CO)OC2OC(C(C2O)O)C(CO)OC2OC(C(C2O)O)C(CO)OC2OC(C(O)C2O)C(CO)OC2OC(C(C2O)O)C(CO)OC2OC2C(O)C(O)C1OC2CO HFHDHCJBZVLPGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000000582 semen Anatomy 0.000 description 1
- 239000004065 semiconductor Substances 0.000 description 1
- 238000011896 sensitive detection Methods 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 238000007841 sequencing by ligation Methods 0.000 description 1
- 238000004513 sizing Methods 0.000 description 1
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 1
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- NRHMKIHPTBHXPF-TUJRSCDTSA-M sodium cholate Chemical compound [Na+].C([C@H]1C[C@H]2O)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC([O-])=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 NRHMKIHPTBHXPF-TUJRSCDTSA-M 0.000 description 1
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 1
- NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K sodium citrate Chemical compound O.O.[Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 229960001790 sodium citrate Drugs 0.000 description 1
- 235000011083 sodium citrates Nutrition 0.000 description 1
- FHHPUSMSKHSNKW-SMOYURAASA-M sodium deoxycholate Chemical compound [Na+].C([C@H]1CC2)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC([O-])=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 FHHPUSMSKHSNKW-SMOYURAASA-M 0.000 description 1
- IHQKEDIOMGYHEB-UHFFFAOYSA-M sodium dimethylarsinate Chemical compound [Na+].C[As](C)([O-])=O IHQKEDIOMGYHEB-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 235000010339 sodium tetraborate Nutrition 0.000 description 1
- XZTJQQLJJCXOLP-UHFFFAOYSA-M sodium;decyl sulfate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O XZTJQQLJJCXOLP-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000012430 stability testing Methods 0.000 description 1
- 239000008223 sterile water Substances 0.000 description 1
- 210000003670 sublingual gland Anatomy 0.000 description 1
- 210000001913 submandibular gland Anatomy 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 210000004243 sweat Anatomy 0.000 description 1
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 210000001138 tear Anatomy 0.000 description 1
- 230000036962 time dependent Effects 0.000 description 1
- 229940088660 tolu balsam Drugs 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- BSVBQGMMJUBVOD-UHFFFAOYSA-N trisodium borate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]B([O-])[O-] BSVBQGMMJUBVOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GPRLSGONYQIRFK-MNYXATJNSA-N triton Chemical compound [3H+] GPRLSGONYQIRFK-MNYXATJNSA-N 0.000 description 1
- 229960000281 trometamol Drugs 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- 244000052613 viral pathogen Species 0.000 description 1
- 230000003313 weakening effect Effects 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1003—Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
- C12Q1/701—Specific hybridization probes
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Virology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Oncology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
【課題】核酸保存組成物並びにその製造及び使用方法、特にＣＯＶＩＤ－１９ウイルスの検出を目的とする。【解決手段】組成物は、キャリア、カオトロピック剤、緩衝剤、キレート剤、界面活性剤、アルコール、酸、及び粘液溶解薬を包含する。水溶液としての組成物には、キャリアとして水を包含する可能性がある。好ましい実施態様は、水、グアニジンチオシアン酸塩、Ｔｒｉｓ、ＥＤＴＡ、ＳＬＳ、ＳＤＡ ３Ｃ、ＨＣｌ及びＮ－アセチル－Ｌ－システインを包含する。いくつかの実施態様は、視覚的指標として有色色素を包含する。キットは、生体試料採取装置の一部に配置される組成物を包含する。製造方法は、これら構成成分を混合することで水溶液などの混合物にすることを包含する。使用方法は、核酸を含む生体試料を提供することと、生体試料を組成物に接触させることを包含する。ＣＯＶＩＤ－１９ウイルスの検出を実証している。組成物はまた、その後の分析のためにヒト核酸を保存及び安定化もする。【選択図】図１Ａ
Description
本開示は、核酸の保存及び分析に関する。とりわけ、本開示は、さらなる分析のためにウイルス核酸を生体試料中に保存するための組成物及びその方法、そして特に、さらなる分析のためにウイルス核酸を唾液中に保存するための組成物及びその方法に関する。
ウイルス株の検出、分析、定量化及び／又は測定に最近関心が高まってきており、ウイルス株としては、コロナウイルスであって、例として、重症急性呼吸器症候群（すなわちＳＡＲＳ）関連のコロナウイルスＳＡＲＳ－ＣｏＶ（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２であって、新型コロナウイルス感染症（ＣＯＶＩＤ－１９）並びにその英国及び／又は南アフリカ変異形などの原因であることが知られているもの）、中東呼吸器症候群（ＭＥＲＳ）コロナウイルス（ＭＥＲＳ－ＣｏＶ）などを包含するコロナウイルスや、重症ウイルス性出血熱（ＶＨＦ）の原因であることで知られているフィロウイルス（フィロウイルス科）であって、例として、クエバウイルス（Ｃｕｅｖａｖｉｒｕｓ）、マールブルグウイルス及びエボラウイルス、並びにそれらの種／亜型（例えば、ザイールエボラウイルス、スーダンエボラウイルス、タイフォレストエボラウイルス、旧コートジボワールエボラウイルス）、ブンディブギョエボラウイルス）、レストンエボラウイルス）、及びボンバリエボラウイルス）を包含するフィロウイルスがあげられる。
ウイルス核酸は、細胞及び／又は無細胞ウイルス核酸を包含する生体試料から抽出される可能性がある。抽出されたウイルス核酸は、感染及び／又は疾患の検出、定量化及び／又は診断を包含する様々な分析目的に使用される可能性がある。唾液からのウイルス核酸の抽出は特に有用な可能性がある。というのも、唾液試料の採取が比較的非侵襲性なためである。唾液試料を包含する、ウイルス核酸を含有する生体試料は多くの場合、特殊な核酸分析として適切に処理される必要がある。ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、核酸シーケンシング（例えば、次世代シーケンシング（ＮＧＳ））などの分析技術は、用いられる特定のプラットフォームによって決まる特定の処理又は前処理段階を必要とする場合がある。時として、ウイルス核酸を含有する生体試料は、その試料又は核酸を安定化するために処理が必要な場合がある。安定化溶液が多くの場合、核酸を含有する生体試料に添加されることで、その分析が実行され得るまで核酸の一部の生存を確実にする。
従来の安定化溶液は、ある種の生体試料及び／又はある種の分析技術若しくはそれを実行するための装置には最適ではない場合がある。例として、ある種の次世代シークエンサーにおいて最適又は好適な分析のために処方された安定化溶液は、その他の次世代シークエンサー又はＰＣＲ装置における分析には最適ではない又はふさわしくないかまたその逆も同様である場合がある。時として、不適切な製剤は、分析上の人工産物及び／又は高いバックグラウンド信号（又はノイズ）を生成する又は引き起こす場合がある。既存の安定化溶液はまた、ウイルス核酸を保存するか又は微生物（例えば、細菌、真菌）の成長若しくは生存を制御するのに不十分な場合もある。唾液などの生体試料は多くの場合、１以上の微生物（例えば、細菌、真菌など）を包含する及び／又はそれらで汚染されている。前記微生物は、ウイルス株の核酸を阻害するか又はそれと共に検出される場合がある核酸を含有している。保存溶液は、細菌若しくは真菌の核酸を意図せず安定化するか又はさらには微生物の成長を容認する場合もある。同様に、生体試料は、生体試料中のウイルス株の核酸を阻害するか又はそれと共に検出されることのある生体試料（例えば、ヒト試料）の対象、宿主又は供給源に関する核酸を含有している場合もある。既存の安定化溶液は、ある種の分析技術又は装置において宿主とウイルス性病原菌とを区別する場合に次善である場合がある。さらに、生体試料は、生体試料中の標的ウイルス株の核酸を阻害するか又はそれと共に検出されることのある非標的ウイルスの核酸を含有している場合もある。
したがって、様々な分析技術及び装置、及び／又は既存の製品と比較してより優れたウイルス核酸の全収率及び試料品質を提供する溶液に好適な万能の核酸安定化溶液がいまだ必要とされている。
本開示の実施態様は、当該技術分野における前述の又は他の課題の１以上を解決するものであり、実施態様が、核酸の保存、安定化及び／又は組成物の調製、組成物を含むキット、並びにそれらの製造及び使用方法を含むものである。例として、本開示のいくつかの実施態様は、核酸を生体試料中で保存、安定化及び／又は調製するための組成物を包含する。組成物は、様々な分析技術及び装置における使用に好適である可能性がある。組成物は、その後の分析のために大量の核酸をもたらす可能性がある。例えば、組成物は、その後の分析のために、大量のウイルス核酸（例えば、ＤＮＡ、ＲＮＡ）、好ましくは及び／又は場合によって少量の微生物（例えば、細菌、真菌）の核酸（例えば、ＤＮＡ、ＲＮＡ）をもたらす可能性がある。組成物は、溶液又は水性（例えば、水溶性）の、場合により（淡い）青又は黄色の液体であって、ウイルス核酸（ＤＮＡ及び／又はＲＮＡ）の安定化及び／又は細菌汚染の予防及び／又は長期貯蔵において使用するのに好適な液体である可能性がある。
本開示の実施態様は、核酸保存組成物であって、含水キャリア、カオトロピック剤、緩衝剤、キレート剤、界面活性剤、アルコール、任意の酸、及び粘液溶解薬を含む核酸保存組成物を包含する。一実施態様はさらに、視覚的指標も包含する可能性がある。いくつかの実施態様において、含水キャリアは、水、好ましくは濾過水、純水、蒸留水及び／又は脱イオン水であるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、カオトロピック剤は、グアニジン及び／又はチオシアン酸塩、好ましくはグアニジンチオシアン酸塩であるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、緩衝剤は、トリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン（Ｔｒｉｓ）、好ましくはＴｒｉｓ－ＨＣｌ、より好ましくはＴｒｉｚｍａ（登録商標）塩基であるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、キレート剤は、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）、好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩、より好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム（塩）二水和物であるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、界面活性剤は、ラウロイルサルコシンナトリウム塩（ＳＬＳ）であるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、アルコールは、エタノール、好ましくは特別変性アルコール（ＳＤＡ）、又はエタノールとイソプロパノールとの混合物、より好ましくはエタノール約９５体積％とイソプロパノール約５体積％の混合物（つまり、ＳＤＡ ３Ｃ）であるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、任意の酸は、塩酸であるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、粘液溶解薬は、Ｎ－アセチル－Ｌ－システインであるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、視覚的指標は、色素（例えば、青色１号（ＦＤ＆Ｃ Ｂｌｕｅ Ｎｏ．１））のような着色剤であるか又はそれを含む可能性がある。
本開示の実施態様は、ウイルス核酸保存組成物であって、カオトロピック剤（例えば、グアニジンチオシアン酸塩）約４３．９２重量％、緩衝剤（例えば、Ｔｒｉｓ）約２．６５重量％、キレート剤（例えば、ＥＤＴＡ（二ナトリウム）二水和物）約１．０３重量％、界面活性剤（ｓｕｒｆａｃｔａｎｔ ｏｒ ｄｅｔｅｒｇｅｎｔ）（例えば、ＳＬＳ）約０．２７９重量％（若しくは、その３０％溶液約０．９３重量％）、アルコール（例えば、エタノール、又はＳＤＡ ３Ｃなどのエタノールとイソプロパノールの混合物）約１７．７３重量％、粘液溶解薬（例えば、Ｎ－アセチル－Ｌ－システイン）約０．０９３重量％、必要に応じて酸（例えば、塩酸）約０．４重量％又はｐＨ約７．８～８．４、好ましくはｐＨ８．０～８．１にするのに足る量の酸、及び／又はキャリア（例えば、濾過水、純水、蒸留水及び／又は脱イオン水を含む含水キャリア）約３４．１２重量％、キャリア３２．７８重量％、若しくは１００％にするのに足る量のキャリアを含むウイルス核酸保存組成物を包含する。実施態様はさらに、視覚的指標（例えば、食用青色１号（ＦＤ＆Ｃ Ｂｌｕｅ Ｎｏ．１））約０．０００３７重量％又はそれと等価の物（例えば、３７重量％溶液若しくは視覚的指標の濃縮物を約０．０００３７重量％、０．２重量％溶液若しくは視覚的指標の濃縮物（例えば、水中）を約０．１８５重量％など）を包含することも可能である。
１以上の実施態様は、カオトロピック剤（例えば、グアニジンチオシアン酸塩）（約）４３．９２±１０重量％、緩衝剤（例えば、Ｔｒｉｓ）（約）２．６５±１０重量％、キレート剤（例えば、ＥＤＴＡ（二ナトリウム）二水和物）（約）１．０３±１０重量％、界面活性剤（例えば、ＳＬＳ）（約）０．２７９±１０重量％（若しくは、その３０％溶液を（約）０．９３±１０重量％）、アルコール（例えば、エタノール、又はＳＤＡ ３Ｃなどのエタノールとイソプロパノールの混合物）（約）１７．７３±１０重量％、粘液溶解薬（例えば、Ｎ－アセチル－Ｌ－システイン）（約）０．０９３±１０重量％、必要に応じて酸（例えば、塩酸）（約）０．４±１０重量％又はｐＨ約７．２～９．５にするのに足る量の酸、及び／又はキャリア（例えば、濾過水、純水、蒸留水及び／又は脱イオン水を含む含水キャリア）（約）３４．１２±１０重量％、キャリア３２．７８±１０重量％、若しくは１００％にするのに足る量のキャリアを含むことが可能である。実施態様はさらに、視覚的指標（例えば、食用青色１号）（約）０．０００３７±１０重量％又はそれと等価の物（例えば、３７重量％溶液若しくは視覚的指標の濃縮物を（約）０．０００３７±１０重量％、０．２重量％溶液若しくは視覚的指標の濃縮物（例えば、水中）を（約）０．１８５±１０重量％など）を含むことも可能である。いくつかの実施態様において、各構成成分の量±１０％はさらに（列挙した量に限定され）±９％であり、好ましくは±８％であり、より好ましくは±７％であり、さらにより好ましくは±６％であり、さらにより好ましくは±５％であり、さらにより好ましくは±４％であり、さらにより好ましくは±３％であり、さらにより好ましくは±２％であり、さらにより好ましくは±１％である。
１以上の実施態様は、カオトロピック剤２０～５０重量％、緩衝剤０．１～５重量％、キレート剤０．０５～２．５重量％、界面活性剤０．０１～５重量％、アルコール５～２５重量％、粘液溶解薬０．００５～０．２５重量％、酸０．００５～５重量％若しくはｐＨ約７．２～９．５にするのに足る量の酸、及び／又はキャリア１０～６０重量％若しくは１００％にするのに足る量のキャリアを包含することも可能である。実施態様は、視覚的指標０．００００５～０．５重量％（又は０．０００１～５重量％視覚的指標の濃縮物（例えば、水中）を０．０１～２．５重量％）を包含することが可能である。
１以上の実施態様において、組成物は、ｐＨ約８．０若しくは約８．１、又はｐＨ７．１～９．５、ｐＨ７．２～９．５、ｐＨ７．２～９．０、ｐＨ７．２～８．８、ｐＨ７．３～８．７、ｐＨ７．４～８．６、ｐＨ７．５～８．５、ｐＨ７．６～８．４、ｐＨ７．７～８．３、ｐＨ７．８～８．２、ｐＨ７．８～８．４、ｐＨ７．９～８．３、又はこれら範囲の値のうちの任意の値若しくは範囲を有することが可能である。
１以上の実施態様は（実質上）、（追加の又は任意の）抗菌（例えば、殺菌及び／又は静菌）剤（例えば、アルコール、カオトロピック剤、界面活性剤及び／又は粘液溶解薬を除いて又はそれら以外）を有さない可能性があるる。１以上の実施態様は（実質上）、（追加の又は任意の）リボヌクレアーゼ阻害剤、又は（例えば、カオトロピック剤を除くか若しくはそれ以外の）リボヌクレアーゼの阻害剤を有さない可能性がある。１以上の実施態様は（実質上）、（任意の）プロテアーゼを有さない可能性がある。
いくつかの実施態様は、核酸の安定化方法を包含する。方法は、核酸を含有する生体試料を提供すること、及び本開示の組成物を前記生体試料と混合することを包含することが可能である。方法はまた、当該技術分野で既知の他の加工工程を包含することも可能である。本開示の実施態様は、核酸（例えば、ウイルスＤＮＡ又はウイルスＲＮＡなどのウイルス核酸）を安定化する方法を包含する。実施態様は、核酸を含有する生体試料を本開示の組成物と接触させることを含む。実施態様において、生体試料はヒトの（又は哺乳類の）唾液を含む。
いくつかの実施態様は、生体試料保存キットを包含する。キットは、試料採取装置と核酸保存組成物を含むことが可能である。試料採取装置は、溶液区画を含むことが可能である。核酸保存組成物は、溶液区画内に配置することが可能である。本開示の実施態様は、試料採取装置の一部に配置される本開示の組成物を含むキットを包含する。
いくつかの実施態様は、本開示の組成物の製造方法を包含する。方法は、本開示の構成成分を混合することを包含することが可能である。方法はまた、当該技術分野で既知の他の製造工程を包含することも可能である。本開示の実施態様は、核酸安定化組成物の製造方法を包含する。実施態様は、キャリアを入手することと、前記キャリアに本開示の組成物の構成成分又は成分を添加することを含む。
驚くべきことにそして予想外にも、本開示の実施態様は、ウイルス核酸の保存、検出及び／又は分析に関連して、並びに特にヒトの若しくは非ヒト動物の（哺乳動物の）唾液試料などの唾液試料からのヒト核酸の保存、検出及び／又は分析に関連して使用することが可能である。本開示の様々な実施態様は、ウイルス株の保存、検出、及び／又は分析に関連して使用することが可能であり、ウイルス株としては、コロナウイルス株であって、例えば、重症急性呼吸器症候群（すなわちＳＡＲＳ）関連のコロナウイルスであるＳＡＲＳ－ＣｏＶ（例としては、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２であって、新型コロナウイルス感染症（ＣＯＶＩＤ－１９）並びにその英国及び／又は南アフリカ変異形）などの原因となることが知られているもの）、中東呼吸器症候群（ＭＥＲＳ）コロナウイルス（ＭＥＲＳ－ＣｏＶ）などのコロナウイルス株や、フィロウイルス（フィロウイルス科）であって、重症ウイルス性出血熱（ＶＨＦ）の原因となることが知られているものであり、例として、クエバウイルス（Ｃｕｅｖａｖｉｒｕｓ）、マールブルグウイルス、及びエボラウイルス並びにそれらの種／亜型（例えば、ザイールエボラウイルス、スーダンエボラウイルス、タイフォレストエボラウイルス、旧コートジボワールエボラウイルス）、ブンディブギョエボラウイルス）、レストンエボラウイルス）、及びボンバリエボラウイルス）などを包含するフィロウイルスがあげられる。本開示の実施態様は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、すなわちＣＯＶＩＤ－１９を引き起こす新規コロナウイルスからの核酸の保存、検出、及び／又は分析に関連して有効であることがここに示されている。
本開示の実施態様は、したがって、本明細書に記載の、ウイルスデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）及び／又はウイルスリボ核酸（ＲＮＡ）の保存組成物、方法、キットなどを包含することが可能である。組成物及び方法は、分解及び／又は減少に備えてウイルス核酸を保存することが可能である。組成物及び方法は、高収量のウイルス核酸を提供する及び／又はもたらすことが可能である。組成物及び方法は、ウイルス核酸の保存後の、定性的な及び／又は定量的な検査、分析及び／又は測定と整合性のある及び／又はそれに対応する手法でウイルス核酸を保存することが可能である。
実際、本明細書に記載の様々な態様及び／又は実施態様であって、組成物、方法、キット及びそれらに関連した結果、データ、利点などを包含するものは、ウイルス核酸の保存、検出及び／又は分析に応用できる可能性がある。というのも、それらは、先に記載及び／又は開示したようにヒト核酸の保存、検出及び／又は分析を目的としているためである。
さらに、本開示の実施態様は、唾液試料、例えばヒトの若しくは非ヒト動物の（哺乳動物の）唾液試料などからの、ウイルス核酸の保存、検出及び／又は分析に関連して使用することが可能である。その上、本開示の実施態様は、驚くべきことにそして予想外にも、唾液試料、例えばヒトの若しくは非ヒト動物の（哺乳動物の）唾液試料などからの、ウイルス核酸及びヒト核酸の両方の保存、検出及び／又は分析に関連して使用するのに有用である可能である。いくつかの実施態様において、（代表的なウイルス検出方法に関連して使用されるような）鼻、口、咽頭などのスワブよりもむしろ本開示の実施態様は、喀出された唾液試料、例えば喀出されたヒト唾液試料などからのウイルス核酸の保存、検出及び分析に関連して使用することが可能である。しかしながら、鼻、口、咽頭などのスワブから成るか又はそれから採取された生体試料についても本明細書において検討されることが分かる。少なくとも１実施態様において、ウイルスＤＮＡ／ＲＮＡの収量、検出、定量化などは、例えば核酸の保存組成物及び／又は方法論を包含する本開示の実施態様を踏まえて喀出された唾液を用いると、より有効である可能性がある。
本開示の代表的な実施態様のさらなる特徴及び利点は、以降の本明細書に記載されており、そしてその一部は、記述から明白であるか、又はそのような代表的な実施態様の実行によって得られる場合もある。その様な実施態様の特徴及び利点は、添付の請求項で具体的に示唆される機器及び組み合わせを用いて実現される及び分かる場合がある。これら及びその他の特徴は、以降の記述及び添付の請求項からより十分に明らかとなるか、又は以降に記載されるような代表的な実施態様の実行によって分かる場合もある。
本開示の前記及び他の利点及び特徴が入手され得る手法を説明するために、先に簡単に説明した実施をより具体的に説明することは、その特定の実施を参照して与えられるものであって、それが添付の図面に例証されている。さらなる理解を目的として、同様の構成要素は、全ての図を通じて同様の参照番号で表している。これらの図面は本発明の代表的な実施のみを表しまたその結果として本発明の範囲を限定すべきではないと考えると解釈すれば、本発明は、添付の図面を用いることにより、さらに明確な限定及び詳細について記載及び説明されよう。
本開示の様々な実施態様を詳細に記載する前に、本開示は、具体的に例示されたシステム、方法、及び／又は製品の特定のパラメータ及び記述に限定されるものではなく、それらが実施態様ごとに異なる場合があると理解されるべきである。そのため、本開示の特定の実施態様は、具体的な特徴（例えば、構造、パラメータ、特性、工程、構成成分、成分、構成要素、要素、部品及び／又は部位など）を参照して詳述されているが、記述は例証であって、本開示の範囲及び／又は請求項に記載の本発明を限定するものではないと解釈すべきである。加えて、本明細書中で使用する用語は、実施態様の説明を目的とするものであって、本開示及び／又は請求項に記載の本発明の範囲を必ずしも限定するものではない。
この発明を実施するための形態は複数の項に分かれているが、各項の見出し及び内容はそれぞれ独立した記述及び実施態様であることを意図するものではない。むしろ、発明を実施するための形態内の各項の内容は、ある項の要素が他の項に関連する及び／又は情報を与え得る包括的な全体として解釈及び理解されることを目的としている。その結果、ある項に具体的に開示される実施態様はまた、別の項における追加の及び／又は代替の実施態様に関連する及び／又はそれとしても役立つ場合がある。
［定義された用語の要約リスト］
ここまで及びこれ以降に記載の説明及び添付の請求項の範囲及び内容の理解の助けとなるために、厳選したいくつかの用語をこのすぐあとに定義する。別段の定義がなければ、本明細書で使用される科学技術用語はいずれも、本開示に関連する当業者によって一般に理解されるものと同じ意味を有する。
ここまで及びこれ以降に記載の説明及び添付の請求項の範囲及び内容の理解の助けとなるために、厳選したいくつかの用語をこのすぐあとに定義する。別段の定義がなければ、本明細書で使用される科学技術用語はいずれも、本開示に関連する当業者によって一般に理解されるものと同じ意味を有する。
本明細書で使用するとき、移行句「から本質的になる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ ｅｓｓｅｎｔｉａｌｌｙ ｏｆ）」とは、請求項の範囲が、請求項に記載の特定の材料又は工程及び請求項に記載の発明の「基本的かつ新規の特徴には実質上影響を及ぼさないもの」を包含するものと解釈されるべきであることを意味する。Ｉｎ ｒｅ Ｈｅｒｚ、 ５３７ Ｆ．２ｄ ５４９、 ５５１－５２、 １９０ Ｕ．Ｓ．Ｐ．Ｑ．４６１、 ４６３ （ＣＣＰＡ １９７６）（原文重視）を参照し、さらにはＭＰＥＰ § ２１１１．０３も参照のこと。したがって、用語「から本質的になる」は、本開示の請求項で使用する場合、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」と同義であると解釈すべきではないことを意図する。
用語「ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２」は、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス２を指す。ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２は、ＣＯＶＩＤ－１９の原因となるウイルスである。
用語「ＣＰＥ」は、細胞変性効果、すなわち、ウイルス感染症から生じる宿主細胞内での構造的変化を指す。ＣＰＥは、感染ウイルスが宿主細胞の溶解（分解）を引き起こしたとき又は細胞が繁殖不能なために溶解せずに死んだときに生じる。
用語「ＲＴ－ＰＣＲ」は逆転写ポリメラーゼ連鎖反応を示し、ＲＮＡ抽出によるウイルス抽出（例えば、（ビーズによる）核酸抽出を使用）の後に定量ＰＣＲ（ダブル標識プローブ法を使用）が、好ましくはＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス転写産物などの核酸の検出のために行われる。
本明細書で使用するとき、用語「核酸」は、ＤＮＡかＲＮＡかＤＮＡ－ＲＮＡハイブリッドか、単鎖か二本鎖か、センスかアンチセンスかに関わらず、天然起源又は合成のオリゴヌクレオチド又はポリヌクレオチドを指し、これは、ワトソン－クリック塩基対形成によって相補的核酸とハイブリッド形成することが可能である。本発明の核酸はさらに、ヌクレオチド類似体（例えば、ＢｒｄＵ、ｄＵＴＰ、７－デアザ－ｄＧＴＰ）、及びヌクレオチド間の非ホスホジエステル結合（例えば、ペプチド核酸（ＰＮＡ）又はチオジエステル結合）を含むことも可能である。とりわけ、核酸は、限定されないが、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ｃＤＮＡ、ｇＤＮＡ、ｓｓＤＮＡ、ｄｓＤＮＡ又はこれらの任意の組み合わせを包含する可能性がある。ある代表的な核酸への例示的な言及は、必要に応じて、他の核酸への言及と判断される場合がある。
用語「試料」、「生体試料」などは、動物、動物の組織又は臓器、細胞（対象内の細胞か、対象から直接採取した細胞か、又は培養で維持された細胞若しくは培養細胞株からの細胞かのいずれか）、細胞溶解物（つまり、溶解物画分）又は細胞抽出物、細胞由来の１以上の分子を含有する溶液、又はウイルス素材（例えば、ポリペプチド又は核酸）、又は天然若しくは非天然起源の核酸を含有する溶液であって、本明細書に記載の通り検査されるか又は検査可能であるものを指す。試料はまた、１以上の細胞、細胞成分又は核酸を含有する体液又は排出物であってもよく、核酸としては、限定されないが、細胞、細胞核又は無細胞核酸があげられる。
「体液」とは、天然起源の流体を意味し、例としては、限定されないが、動物（例えば、ヒトの又は非ヒト動物若しくは哺乳動物）からの液体、半固体、通気された液体、液気混合物などがあげられる。そのような体液としては、唾液、痰、血清、血漿、血液、尿、粘液、汗、涙若しくはその他の眼の流体、耳の流体、膿汁（例えば、水ぶくれ若しくは傷からのもの）、胃液、便の流体、膵液、精液、授乳産物若しくは測定（ｍｅｎｓｕｒａｔｉｏｎ）からの産物、脊髄液、骨髄液、又はリンパ液を挙げることができるが、これらに限定されない。
「痰」とは、哺乳動物の鼻又は口腔に含まれる又はそこから排出された粘液状物質を意味する。痰は、本明細書で使用するとき、一般には唾液と肺を包含する気道からの排出物とを包含する。
「唾液」とは、耳下腺、顎下腺及び舌下線を包含する唾液腺のいずれかからの分泌物又は分泌物の組み合わせ、場合により頬腺からの分泌物と混合されたものを意味する。
「ムコイド」とは、ムチンを含有する任意の体液を意味する。
「ムチン」とは、それを分泌する細胞周囲の環境の粘度を高める任意のムコタンパク質を意味する。
本明細書で使用するとき、値に関する「約」という用語は、規定値はたはそれによって表される量の±１０％を意味する。例えば、本開示全体を通じて、用語「約」は、構成成分若しくは成分の％濃度又は組成（例えば、混合物中の、例としては流体若しくは液体混合物、水性混合物、溶液などにおける、場合により若しくは好ましくは重量％、質量体積％、体積％などとして測定されるものにおける）と関連して使用される。このような例において、用語「約」及び／又は「±１０％」は、記載されたパーセントの±１０％ポイントとは対照的に、規定された数値の±１０％を意味する及び／又は包含する。ほんの一例として、構成成分又は成分の２０重量％が全混合物１００ｍＬ当たりの構成成分又は成分２０ｇを表す場合、用語「約」及び／又は「±１０％」は、１８ｇ～２２ｇまでの記載された範囲（すなわち、１８重量％～２２重量％まで）を意味する及び／又は包含するものであって、１０重量％～３０重量％の範囲ではない。いわゆる「約」の値及び／又は±１０％に関する代替案には、規定値の±１％、±２％、±３％、±４％、±５％、±６％、±７％、±８％、又は±９％があげられ、これらはそれぞれ、用語「約」又は本明細書中の±１０％の使用に適した代替案又は代用と想定される。
本明細書で使用するとき、用語「およそ」及び「実質的に」は、規定量に近いある（又は任意の）量（例えば、今なお所望の機能を果たすもの又は（所望の若しくは期待される）結果を出すもの）を表す又は意味する。例えば、用語「およそ」及び「実質的に」は、規定量の１０％、５％、１％、０．１％、０．０１％又はその他のパーセントの範囲内であるか又はそれ未満の量を指す場合がある。本明細書で使用するとき、用語「実質的に有さない」とは、（１）検出不能若しくは数量化不能な量、（２）当業者が一般に検出可能若しくは数量化可能な量を表すと考える量以下、及び／又は（３）当業者が一般に機能的である若しくは（所望の若しくは期待される）結果を出し得ると考える量以下（例えば、１０％、５％、１％、０．１％、０．０１％又はその他のパーセント未満）を意味する。
「足る量（Ｑｕａｎｔｕｍ ｓａｔｉｓ）」（「ｑ．ｓ．」又は「ｑｓ」とも表現される）は、必要なだけの量を意味する。したがって、「１００％に足る量（ｑｓ １００％）」、「１００％に足る量で提供される」又は「１００％にするのに足る量（ｑｓ ｔｏ １００％）」の構成成分又は成分は、構成成分又は成分が、組成物を完成するために又は（記載されているされていないにかかわらず、全ての構成成分の）全体を１００％に至らしめるために十分な量で提供又は包含されることを示す。また一方、「１００％に足る量」、「１００％に足る量で提供される」又は「１００％にするのに足る量」の（最終）構成成分又は成分は、混合物が、「１００％に足る量」の構成成分の直前に列挙又は記載された構成成分から成る、から本質的に成る又はのみを含有することを示すものではない。言いかえると、「１００％に足る量」及び同様の用語は、残部が何であろうと、残部の供給源を示す変更可能な表現であることを意味する。
「アルコール」とは、ヒドロキシル基を含有する水混和性有機化合物を意味し、例としては、ヒドロキシル含有有機化合物の水混和性混合物があげられる。
「水溶性」とは、水を３０（体積又は重量）％以上含有する媒質又は物質を意味する。
「水溶液」とは、水を３０体積％以上含有する溶液又は懸濁液を意味する。
「変性剤」とは、それが添加されるものの自然状態を変える物質を意味する。
「カオトロピック剤」とは、カオトロピック活性を与える分子を意味する。当業者には、カオトロピック活性を与える分子は、水分子間の水素結合を分断させ、その結果、疎水性効果を弱めることによって（溶液中の）他の分子、主に高分子（タンパク質、核酸）の自然状態の安定性に影響を及ぼし得るものと理解されている。したがって、カオトロピック活性を与える分子は、タンパク質変性活性を有する（タンパク質変性剤である）場合がある。
「抗菌剤」とは、生物の成長速度を、それが含まれていない生物の成長速度と比較して低下させる物質又は物質群を意味する。生物の成長速度の低下は、少なくとも５％であり、より望ましくは少なくとも１０％であり、さらにより望ましくは少なくとも２０％、５０％又は７５％であり、そして最も望ましくは９０％又はそれを超える場合がある。この定義は、生物の生存能力、毒性又は病原性に影響を与える物質にまで及ぶ。抗菌剤は、天然（例えば、細菌又は他の供給源に由来する）、合成又は組み換えである可能性がある。抗菌剤は、静菌性であるか、殺菌性であるか、又はその両方である可能性がある。抗菌剤は、それが阻害された細胞の生存能力に影響を与えずに細胞分裂を阻害する場合は、静菌性である。抗菌剤は、それが細胞死を引き起こす場合は、殺菌性である。細胞死は、液状の成長媒質中での細胞増殖の欠如（例えば、濁りの欠如）又は固体表面上で細胞増殖の欠如（例えば、寒天培養基上でのコロニー形成の欠如）によって通常検出される。当業者は、所定の濃度で静菌性の物質又は物質群がさらに高濃度では殺菌性であり得ることを理解している。ある静菌性物質は、どの濃度でも殺菌性ではない。
本明細書で使用するとき、「アセチルシステイン」又は「Ｎ－アセチルシステイン」（ＮＡＣ）にはあらゆる形態のアセチルシステインが包含され、例としては、Ｎ－アセチル－Ｌ－システイン、Ｎ－アセチル－Ｄ－システイン、及びラセミ体Ｎ－アセチルシステイン、又はＮ－アセチル－Ｌ－システインとＮ－アセチル－Ｄ－システインとの（ラセミ体）混合物があげられる。ある形態のアセチルシステインへの言及は、任意の形態のアセチルシステインへの具体的な言及を裏付ける。
本明細書で使用するとき、用語「組成物」は、製品、製剤、及び混合物、並びに装置、器具、アセンブリー、キットなどを包含する。同様に、用語「方法」は、過程、手順、工程などを包含する。
本開示の様々な態様は、システム、方法及び／又は製品を包含しており、１以上の実施態様又は実施と関連して解説される場合があるが、それらは事実上例示である。本明細書で使用するとき、用語「実施態様」及び「実施」は、「例、事例又は実例の役割を果たすこと」を意味しており、必ずしも、本明細書に開示される他の態様よりも好ましい又は有利なものと解釈すべきではない。加えて、本開示又は本発明の「実施」への言及は、その１以上の実施態様への具体的な言及を包含し、また逆の場合も同様であるが、本発明の範囲を限定することなく具体例を提供することを意図するものであって、それはその記述よりもむしろ添付の請求項によって示唆される。
本明細書で使用するとき、本開示又は本明細書に開示される実施態様の「特徴」とは、性質、構成成分、成分、要素、部分、部位、（方法の）手順、又は検討中の主題の他の態様を指す。
本開示全体を通じて使用するとき、「可能性がある（ｃａｎ）」及び「場合がある（ｍａｙ）」という語は、強制的な意味（すなわり、違いないという意味）よりもむしろ許容的な意味（すなわち、可能性を有しているという意味）で使用される。さらに、用語「包含する（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」、「有している（ｈａｖｉｎｇ）」、「含む（ｉｎｖｏｌｖｉｎｇ）」、「含有する（ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ）」、「で特徴づけられる（ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚｅｄ ｂｙ）」、これらの変形語（例えば、「包含する（ｉｎｃｌｕｄｅｓ）」、「有する（ｈａｓ）」、及び「含む（ｉｎｖｏｌｖｅｓ）」、「含有する（ｃｏｎｔａｉｎｓ）」など）、並びに請求項を包含する本明細書で使用されるのと同様の用語は、包括的及び／又は変更可能であるものとし、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」及びその変形語（例えば、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅ、ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」）という語と同じ意味を有するものとするが、具体例として、付加的な列挙されていない要素又は方法の工程を排除するものではない。
本明細書で使用するとき、語「又は（ｏｒ）」は、特定のリストのうちの任意の１構成要素を意味するものであるが、さらにはそのリストの構成要素の任意の組み合わせも包含する。
本明細書及び添付の請求項で使用するとき、単数形の冠詞（ａ、ａｎ及びｔｈｅ）はそれぞれ、その内容について別段の明確な指示がない限り、単数形と複数形の指示対象の両方を考慮し、包含し、そして明確に開示する。例えば、「タンパク質」への言及は、１つのタンパク質のみならず２以上のタンパク質をも考慮し及び明確に開示する。同様に、複数の指示対象の使用は、必ずしも、そのような指示対象を複数必要とするものではなく、その内容について別段の明確な指示がない限り、２以上のそのような指示対象のみならず１つの指示対象をも考慮し、包含し、そして明確に開示する。
注目すべきは、本開示の実施態様は、本明細書に記載の２以上の特徴の組み合わせを１以上含むことが可能であるということである。本明細書で使用するとき、「特徴」及び同様の用語は、例えば組成物、成分、構成成分、要素、構成要素、部分、部位、システム、方法、構造、パラメータ、特性などを包含することが可能である。実施態様は、本開示の他の態様又は実施態様を包含する、本開示中の他のどこかに記載した、特徴、選択肢及び／又は可能性のうちいずれかを包含することが可能である。さらに注目すべきは、本明細書中に記載される前記の、以下の及び／又はその他の特徴はそれぞれ、本開示の特徴的な実施態様を表すということである。特徴はさらに、別の１以上の特徴と任意の好適な組み合わせ及び／又は順序で、それらとともに包含されるか又はそれらの間で実行される１以上の付加的な特徴の有無にかかわらず、組み合わせることで新規な実施態様を形成することも可能であり、これら実施態様はそれぞれ本開示において想到されるものである。このような特徴の任意の２以上のこのような組み合わせは、本開示の特徴的な実施態様を表している。したがって、本開示は、本明細書に詳述される代表的な実施態様の具体的な組み合わせに限定されるものではなく、また本開示の具体的な実施態様に関連するある特徴の開示は、それら特徴の応用又は包含を具体的な実施態様に限定すると解釈されるべきではない。
加えて、特徴が特定の実施態様において必要であると記載されている場合を除いて、様々な実施態様に記載される特徴は任意である可能性があり、また本開示の他の実施態様に包含されない場合もある。さらに、特徴が別の特徴と組み合わせる必要があると記載されている場合を除いて、本明細書中の任意の特徴は、本明細書に開示される同じ又は異なる実施態様のどの特徴と組み合わされてもよい。同じく、本明細書に記載の任意の方法に列挙される及び／又は請求項に列挙される任意の工程は、任意の適した順序で実行することができ、また別途（明確に又は暗黙的に）記載のない限り、記載及び／又は列挙される順序に必ずしも限定されない。しかしながら、このような工程は、本開示のいくつかの実施態様では特定の順序で行われる必要がある可能性もある。
２以上の値又は値の範囲（例えば、ある値未満、ある値を超える、少なくともある値、及び／又はある値まで、及び／又は２つの列挙された値の間）が開示又は列挙されている場合、開示された値又は値の範囲内に属する任意の具体的な値又は値の範囲は、本明細書においても同じように具体的に開示及び考慮されることが分かる。したがって、代表的な計測値（例えば、長さ、幅、厚さなど）の開示、すなわち、約１０ユニット以下又は０～１０ユニットの間というのは、（ｉ）０ユニット及び／又は１０ユニットを包含する０～１０ユニットの間の９ユニット、５ユニット、１ユニット、若しくはその他の値の測定値、及び／又は（ｉｉ）９ユニット～１ユニットの間、８ユニット～２ユニットの間、６ユニット～４ユニットの間、及び／又は０～１０ユニットの間の値のその他の範囲の測定値といった、特定の開示を具体例として包含する。
理解の手助けをするために、同様の参照記号（すなわち、構成成分及び／又は要素の同様の名称）を、可能であれば、本開示の異なる実施態様と共通している同様の要素を示すために使用している。同じように、同様の構成要素、又は同様の機能を有する構成要素も、可能であれば、同様の参照番号記号を付ける。特殊な言語を本明細書で使用して、代表的な実施態様を説明することがある。それでもやはり、それによって本開示の範囲を限定するものではないことが分かる。どちらかといえば、代表的な実施態様を説明するために用いられる言語は、単なる例示であって、そして（このような言語が本明細書において必要不可欠なものと明白に記載されている場合を除いて）本開示の範囲を限定するものと解釈されるべきではないと考えられる。
最近まで、従来のウイルス検査方法は、試料を採取するために主に血液又は鼻咽頭スワブ手段に依存していた。これらの不愉快な及び／又は侵襲的な生体試料採取方法は、長いスワブを鼻の中の、試料が位置する咽喉の背後まで挿入することを遂行及び包含するために、専門の又は訓練を受けた医療技術者を必要とする。（２０２０年）４月中旬に、米国食品医薬品局（ＦＤＡ）は、本開示の実施態様を踏まえてウイルス核酸保存組成物を含有する本開示の唾液試料採取装置（「ＳＤＮＡ－１０００」と称されるもの）を排他的に使用する唾液系の検査に緊急使用許可（ＥＵＡ）を与えた。ＳＤＮＡ－１０００は、使いやすくそして自己投与可能な装置であって、非侵襲的な唾液採取を目的としている。ＳＤＮＡ－１０００唾液採取装置（ＳＤＮＡ－１０００）は、独力で使用して、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２リボ核酸（ＲＮＡ）を含有する疑いのある未処理の唾液検体を採取する、安定化する及び輸送中保持することを目的としている。多くの異なるスワブ採取とは対照的に、ＳＤＮＡ－１０００を用いた唾液試料採取は、受動的に唾を吐くといった単純な自己採取のおかげで患者にとってより容易でそしてより心地よいことが証明された。ＳＤＮＡ－１０００は、追加の採取装備又は医療従事者との直接交流を必要とせず、唾液採取は、医療専門家が試料採取を施行する必要がある場合に要求されるマスク、ガウン、手袋及び他の個人用保護具（ＰＰＥ）の必要性を効率よく減らすものである。ウイルス感染症に対して自宅での生体試料の自己採取という新時代を開拓することと、増大する利点を記したリストにＳＤＮＡ－１０００唾液採取装置及び関連する核酸保存組成物の使用を追加することによって、本開示のウイルス核酸保存料を用いてＳＤＮＡ－１０００唾液採取装置内に採取したときにＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２生ウイルスの１００％中和を評価及び実証する研究を行った。
世界的なパンデミックという注目を浴びて、ＣＯＶＩＤ－１９は、検査の必要性が１０００倍増加したのと同時に、不可欠な生体試料採取装備及びＰＰＥへの需要が増加したことをたやすく証明した。生体試料の採取のとき、その後輸送するとき、及びウイルス検査のために試料を処理するときに現場サポートのために衣服が緩んで暴露するリスクは、常に深刻な汚染を受けやすい。検査装備及びＰＰＥがなくなり始めると、試料採取中にウイルスへ暴露する恐れが医療チームのみならずあまねく一般人にも拡大した。検査装備の欠乏は、検査を広範に適用させる能力に直接影響を与えただけでなく、暴露する可能性のある人を、無症状のまま、未検査のまま、診断未確定のまま、また直接的に密接に接触した人へ更に感染する潜在的なリスクに気付いていないままにも放置した。検討中の生体試料採取課題に対する実行可能な解決策をもたらすために、３つのことを行う必要があることが極めて明白となった。第一に、解決策には、既に極めて少数の供給要素を組み込まないわけにはいかなかった。第二に、衣服が緩んで露出する恐れを無くすと同時に、供給歪みを緩和する形を提供する必要があった。第三に、解決策は、患者を検査へ送る代わりに、検査を患者へ送る手段を提供する必要があった。
本開示の実施態様は、ウイルス核酸保存及び分析のための非侵襲的な唾液試料採取を可能にする。本開示の実施態様は、唾液試料の採取、ウイルス核酸（例えば、分子解析用ＲＮＡ）の保存、生ウイルスの不活性化、及び分子検査のために生体試料を研究所へ安全に輸送することにおいて有効であることが本明細書に示されている。実施態様はさらに、高純度、高収量及び／又は低いアーチファクト結果を包含する、高い品質分析結果ももたらす。
唾液は、ＣＯＶＩＤ－１９分子検出用の認可された好ましい試料採取方法である。ラトガース臨床ゲノミクス研究所（ＲＣＧＬ）、現在のＩｎｆｉｎｉｔｙ ＢｉｏｌｏｇｉＸは、ＦＤＡの緊急使用許可（ＦＤＡ ＥＵＡ＃２０００９０）を２０２０年４月１０日に受け取ったが、これは、本発明の組成物を有する唾液採取装置を排他的に使用して採取された唾液の、ＣＯＶＩＤ－１９の分析及び検出のための第１の使用を許可するものである。具体的には、２０２０年２月４日に、（連邦食品医薬品化粧品）法第５６４条（ｂ）（１）（ｃ）に基づき、保健社会福祉省（ＨＨＳ）長官が、国の安全又は外国に住む米国国民の健康及び安全に大きな影響を及ぼす可能性を有する公衆衛生上の緊急事態であって、またＣＯＶＩＤ－１９を引き起こすウイルスを伴う公衆衛生上の緊急事態が存すると断定した。その結果、前記法第５６４条に準じ、そしてこのような断定に基づいて、保健社会福祉省長官は２０２０年３月２４日に、前記法第５６４条（ａ）に基づいて発行された許可条件に従って、ＣＯＶＩＤ－１９の大流行中に医療機器の緊急使用許可を与える状況にあると宣言した。ＦＤＡは、確認された適応症に本発明の組成物を含有する製品の緊急使用を許可する中で入手可能な全科学情報を考慮した。ＦＤＡの許可プロセスは、ＳＤＮＡ－１０００採取チューブの分離線まで喀出する（すなわち、吐き出す）ことによって必要最低限量の唾液の採取を義務付けている。本発明の保存組成物（法）は、分子解析のために参照試験所までの輸送を目的としてＣＯＶＩＤ－１９ウイルスの不活性化とウイルス核酸（例えば、ＲＮＡ）の保存を提供する。
具体例としては、研究所に到着後、ウイルスＲＮＡを唾液試料から（例えば、ウイルスＲＮＡの精製に最適化されたビーズによる核酸抽出法を使用して）抽出することが可能である。分子解析用の唾液を使用する場合に独自の調査から、抽出及び精製の必須工程が最適な精度に要求される必要な感度上昇をもたらすことが分かった。ウイルスＲＮＡを多重ＲＴ－ＰＣＲにかけることで、例えば、患者が能動感染しているかどうかそして直接的に密接に接触した人への感染リスクを潜在的に有する恐れがあるかどうかを確定するのに用いられる３つの独立したウイルス転写物を定性的に同定することが可能である。
ＣＯＶＩＤ－１９用唾液採取に関する科学的利点、安全性の利点及び経験的な利点を考慮すると、ある任意の患者によってもたらされる潜在的な感染性物質が採取からと研究所までの両方の輸送において安全であることと、物質が研究所に到着した後の取り扱いにおいて安全であることを確かめることも重要である。現在、全スワブ採取物は、感染性ウイルスが試料を取り扱う人へ感染する可能性を保つ環境を維持するウイルス性の又は普遍的な移動媒体に入れている。これはまた、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２が非常に強いウイルスであるので、ドライスワブと非保存の唾液に対する配慮でもある。一方、本開示による本発明の保存組成物を含むＳＤＮＡ－１０００装置を用いた唾液採取は、感染性コロナウイルスを完全に不活性化することで、採取装置からのサンプリング及び抽出のためのより安全な研究室体験及びより着実なオートメーションプロセスを可能にする。
本開示は、前述のウイルスの不活性化要求を裏付ける一連の研究について記載している。ウイルスの不活性化は、感染力の直接の測度として細胞変性効果（ＣＰＥ）とＲＴ－ＰＣＲを用いたウイルス転写産物の検出の両方を測定することによって確定した。ＣＯＶＩＤ－１９の活性及び感染力は、ヒトでのウイルス感染を裏付ける環境を模倣する細胞の支持細胞層に照らして、初期臨床試料（ｐｒｉｍａｒｙ ｃｌｉｎｉｃａｌ ｓａｍｐｌｅ）を評価することによって測定される。この種類の調査を行うために、インタクトで複製可能なＣＯＶＩＤ－１９ウイルスを培養し、そしてＢＳＬ３実験室環境で実験に使用する。ウイルスを本発明の保存料に暴露させて臨床唾液試料採取を模倣体験する。保存料は、カオトロピック剤、例えば、培養した真核細胞を殺す可能性のあるものを包含する成分を含有する。それに応じて、Ａｍｉｃｏｎフィルターを用いた透析手順を使用することで、指示細胞（Ｖｅｒｏ）を破壊しそして最終的には試料採取後の潜在的な感染の測定を阻害する緩衝液成分を除去した。保存料中の細胞毒性成分を除去するために使用した手法は公開されており（Ｂｕｒｔｏｎ ＪＥ、 ｅｔ ａｌ．、 Ｔｈｅ ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ａ ｎｏｎ－ｄｅｎａｔｕｒｉｎｇ ｄｅｔｅｒｇｅｎｔ ａｎｄ ａ ｇｕａｎｉｄｉｎｉｕｍ－ｂａｓｅｄ ｉｎａｃｔｉｖａｔｉｏｎ ａｇｅｎｔ ｏｎ ｔｈｅ ｖｉａｂｉｌｉｔｙ ｏｆ Ｅｂｏｌａ ｖｉｒｕｓ ｉｎ ｍｏｃｋ ｃｌｉｎｉｃａｌ ｓｅｒｕｍ ｓａｍｐｌｅｓ．Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ．２０１７ Ｄｅｃ；２５０：３４－４０）、またそれ単独で細胞培養に有毒である緩衝液中でのウイルス活性を測定する有効な手法として本明細書で実証した。
ＣＯＶＩＤ－１９ウイルスを培養して、保存料を含まない培養液／唾液（実験対照）又は本開示の本発明の保存料を含む培養液／唾液のどちらかに添加した。加えて、さらなる対照として、培養液／唾液と保存料を生ウイルスを添加せずに検査した。様々な濃度のウイルスを培養液／唾液と保存料の両方へ添加して、高ウイルス価を重視しながら様々なウイルス添加量での活動性感染を模擬体験することで、ウイルスを不活性化する保存の可能性を最も高い感染状態で正確に検査した。試料は調製後それぞれ、濾過する（ことで細胞増殖阻害構成成分を除去する）か、又はそのままの状態で一連の限界希釈においてＶｅｒｏ細胞培養液に加えるかのいずれかの条件に従った。
培養液は、透析済みとそのままの試料の条件（ウイルス単独、ウイルス＋培養液／唾液、ウイルス＋本発明の保存料）で処理した後、細胞を７２時間培養し、そして細胞変性効果（ＣＰＥ）とＲＴ－ＰＣＲ分析の両方を受けさせた。最初の分析後、細胞を継代培養しそして７２時間後に再検査することで、持続感染状況と同様のタイムコースを模擬体験した。培養液は全て、その次のタイムポイントの終わりに両方の分析で検査した。
細胞変性効果分析（ＣＰＥ）は、ウイルス感染によって引き起こされる宿主細胞への構造的変化の測定である。感染は、ウイルス感染に応じて細胞が複製できないために宿主細胞の溶解又は宿主細胞の死を引き起こす可能性がある。これらの結果はどちらもＣＰＥと判断され、各培養液の病理学検査によって手採点される。ＲＴ－ＰＣＲ分析は、与えられた試料中のウイルスＲＮＡ転写産物の測定である。この分析プロセスは、試料中のウイルスの溶解後にＲＮＡ抽出する必要がある。ＲＮＡを続いて、定性的にそして場合により定量的に（ｑＰＣＲによって）測定することで、当該試料がＣＯＶＩＤ－１９に暴露されたことがあるかどうかそして感染しているかどうかを見極めることが可能である。組み合わせると、これら測定は、試料採取シナリオに応じてウイルス活性及び感染力の完全で高感度の判定を提供する。以下の表１を参照のこと。
この調査結果からは、ＣＰＥ情報とＲＴ－ＰＣＲのどちらからもＳＤＮＡ－１０００溶解緩衝液の存在下ではウイルス増殖の証拠なしとの結論がうまく得られた。以下の表１を参照のこと。ＳＤＮＡ－１０００溶解緩衝液と混合した任意の試料においてＣＰＥが全くないことは、Ｖｅｒｏ培養細胞中でのウイルス活性の６桁（１０の６乗の桁）超の低下を立証している。さらに、細胞培養数日にわたってウイルス負荷の増加がないこと（ＲＴ－ＰＣＲにより測定するとき）は、ＳＤＮＡ保存料への暴露後にＣＯＶＩＤ－１９の増殖がない又は感染がないことを示す。ＳＤＮＡ－１０００保存料自体は支持細胞に対して毒性があることから、ウイルスの不活性化研究を行うために緩衝液成分の透析が必要なことが確認された。生ウイルスを混入したＰＢＳ／培養液／唾液対照は、保存料中の細胞毒性成分を除去するのに使用される同様の透析手順を行った後でＣＰＥ及びＲＴ－ＰＣＲによって測定したとき、いずれも感染力を保持していた。このデータは、ＳＤＮＡ－１０００保存料の存在下でのＣＯＶＩＤ－１９ウイルスの完全不活性化を裏付けている。
ＳＤＮＡ－１０００唾液採取装置中でのウイルスの不活性化は、ＣＯＶＩＤ－１９感染の検出において最も着実でかつ最も安全な生体材料採取手段を生み出し、そしてウイルス感染の診断のために自宅で生体試料の自己採取をするという新時代の方法を導くものである。
ＳＤＮＡ－１０００で採取して本開示の本発明の組成物と共に保存した唾液を、分子解析用のＣＯＶＩＤ－１９検出の一次供給源として用いることにはいくつかの利点がある。次の要約は、重要な利点を強調している。第一に、無痛ＳＤＮＡ－１０００唾液採取システムは、検査を行う人々に対する全ての感染リスクを軽減する。というのも、このシステムは、スワブによる採取を行うような医療専門家と密に接触する必要がないためである。第二に、これらの採取に必要とされる検査装備とＰＰＥの両方の世界的な不足を直接緩和するとの条件で、従来のスワブ採取の利用と比べて個人用保護具（ＰＰＥ）の使用／必要を９０％超削減する。第三に、唾液は、分子検査を容易にするより強い生体材料である。唾液の採取にＳＤＮＡ－１０００を用いると試料の変異性が低下すると同時に、感度を最大にそして検査精度を最適な状態にする。最後に、ＳＤＮＡ－１０００装置は、感染性ＣＯＶＩＤ－１９ウイルスを完全に不活性化するものであって、大部分の侵襲的なスワブ試料採取と比べたときにより改善された無痛の患者体験を提供するのみならず、より安全な実験室体験も同時に提供する。本開示の本発明の組成物を用いたＳＤＮＡ－１０００装置の、周囲温度でウイルスの不活性化を実現させる能力は、層流キャビネットで費やす時間を減らし、そして最終的には、試料処理過程の一番初めで自動化の活用を促進するといった実験プロセスの効率性を向上させる。
［代表的な実施態様］
実施態様に関する以降の記述には、本開示の１以上の実施態様に関する開示を包含する。したがって、いくつかの実施態様は、本発明の範囲を逸脱しない範囲で、以降の実施例に開示された特徴を包含する可能性がある。言い換えると、以降の実施例に開示される特徴は、本明細書に開示される任意の１以上の実施態様にも包含される及び／又は組み込まれる可能性がある。
実施態様に関する以降の記述には、本開示の１以上の実施態様に関する開示を包含する。したがって、いくつかの実施態様は、本発明の範囲を逸脱しない範囲で、以降の実施例に開示された特徴を包含する可能性がある。言い換えると、以降の実施例に開示される特徴は、本明細書に開示される任意の１以上の実施態様にも包含される及び／又は組み込まれる可能性がある。
［組成物］
本開示のいくつかの実施態様は組成物を包含する。組成物は、痰又は唾液を、精製及び分析のために、生きた核酸供給源として提供することが可能である。組成物は、核酸の化学的安定化、デオキシリボヌクレアーゼを包含するヌクレアーゼの阻害、及び微生物の増殖といった有利な特性を提供する。唾液試料中の核酸の化学的安定化は、緩衝液、酸、キレート剤、粘液溶解薬、カオトロピック剤、界面活性剤、及びアルコールを使用することで達成される可能性がある。
本開示のいくつかの実施態様は組成物を包含する。組成物は、痰又は唾液を、精製及び分析のために、生きた核酸供給源として提供することが可能である。組成物は、核酸の化学的安定化、デオキシリボヌクレアーゼを包含するヌクレアーゼの阻害、及び微生物の増殖といった有利な特性を提供する。唾液試料中の核酸の化学的安定化は、緩衝液、酸、キレート剤、粘液溶解薬、カオトロピック剤、界面活性剤、及びアルコールを使用することで達成される可能性がある。
本開示の組成物は、生体試料、例えばムチン含有体液と混合したときに、室温で周囲条件下において長時間核酸を保存することが可能である。試料はさらに冷蔵保存も可能であるが、核酸の回収及び精製の前に試料を冷凍する必要はない。本開示のある組成物の特性は、（ａ）核酸を化学的に安定化すること、（ｂ）唾液中に含まれ得るヌクレアーゼを阻害すること、及び（ｃ）タンパク質分解酵素や、オリゴ－又はポリヌクレオチドを精製／増殖するのに使用される他の試薬と親和性があることである。
［キャリア］
少なくとも１実施態様において、組成物はキャリアを包含する可能性がある。このましくは、キャリアは液体キャリア又は溶媒であり、より好ましくは含水キャリア又は水性溶媒であり、なおさらに好ましくは水である可能性がある。最も好ましくは、キャリアは、純水、濾過水（例えば、０．２ミクロンフィルターでろ過したもの）、蒸留水、及び／又は脱イオン水であるか又はそれを含む可能性がある。したがって、組成物はキャリアを包含する可能性がある。キャリアは、例えば、濾過水、純水、蒸留水、又は脱イオン水などの水であるか又はそれを含む可能性がある。
少なくとも１実施態様において、組成物はキャリアを包含する可能性がある。このましくは、キャリアは液体キャリア又は溶媒であり、より好ましくは含水キャリア又は水性溶媒であり、なおさらに好ましくは水である可能性がある。最も好ましくは、キャリアは、純水、濾過水（例えば、０．２ミクロンフィルターでろ過したもの）、蒸留水、及び／又は脱イオン水であるか又はそれを含む可能性がある。したがって、組成物はキャリアを包含する可能性がある。キャリアは、例えば、濾過水、純水、蒸留水、又は脱イオン水などの水であるか又はそれを含む可能性がある。
いくつかの実施態様において、組成物は、１００％にするに足る量のキャリアを包含する可能性がある。いくつかの実施態様において、組成物は、好ましくは１０～６０重量％、好ましくは１５～５５重量％、より好ましくは２０～５０重量％、なおさらに好ましくは２５～４５重量％、なおさらに好ましくは２８～４０重量％、なおさらに好ましくは３０～３５重量％、なおさらに好ましくは３１～３４重量％、なおさらに好ましくは３２～３３重量％（又はこれら範囲内の任意の値若しくは値の範囲）のキャリアを包含する可能性がある。最も好ましくは、組成物は、（約）３２．６０２重量％の水を包含する可能性がある。
［カオトロピック剤］
組成物は、１以上のカオトロピック剤を包含する可能性がある。１以上の実施態様において、カオトロピック剤は、タンパク質変性剤である可能性がある。いくつかの実施態様において、カオトロピック剤は、塩化グアニジウム及び／又はグアニジンチオシアン酸塩からなる群より選択することが可能である。したがって、少なくとも１実施態様において、組成物はカオトロピック剤を包含する可能性がある。好ましくは、カオトロピック剤は、グアニジン（又はグアジニウム）又はその好適な塩であるか又はそれを含む可能性がある。より好ましくは、カオトロピック剤は、グアニジンチオシアン酸塩であるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、カオトロピック剤はチオシアン酸塩であるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、カオトロピック剤は、グアニジンイソチアシアン酸塩、塩化グアニジン、グアニジン塩酸塩及びヨウ化グアニジウムなどであるか又はそれを含む可能性がある。
組成物は、１以上のカオトロピック剤を包含する可能性がある。１以上の実施態様において、カオトロピック剤は、タンパク質変性剤である可能性がある。いくつかの実施態様において、カオトロピック剤は、塩化グアニジウム及び／又はグアニジンチオシアン酸塩からなる群より選択することが可能である。したがって、少なくとも１実施態様において、組成物はカオトロピック剤を包含する可能性がある。好ましくは、カオトロピック剤は、グアニジン（又はグアジニウム）又はその好適な塩であるか又はそれを含む可能性がある。より好ましくは、カオトロピック剤は、グアニジンチオシアン酸塩であるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、カオトロピック剤はチオシアン酸塩であるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、カオトロピック剤は、グアニジンイソチアシアン酸塩、塩化グアニジン、グアニジン塩酸塩及びヨウ化グアニジウムなどであるか又はそれを含む可能性がある。
いくつかの実施態様において、カオトロピック剤は、乾燥型、固形、粉末形状、無水型、及び／又は顆粒形状であるか、それを有するか、それを含むか、又はその形態で提供される可能性がある。いくつかの実施態様において、カオトロピック剤は、少なくとも及び／又は最大及び／又はおよそ９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．１％、９９．２％、９９．３％、９９．４％、９９．５％、９９．６％、９９．７％、９９．８％、又は９９．９％の純度（ＣｏＡなどの好適な物質アッセイによって測定される場合）を有する可能性がある。いくつかの実施態様において、カオトロピック剤は、任意の好適な濃度を有する貯蔵液（例えば、水中の貯蔵溶液）の形態で含むか又はそれである（それで提供される）可能性がある。いくつかの実施態様において、カオトロピック剤は、溶液中のカオトロピック剤の濃度（ＣｏＡなどの好適な物質アッセイによって測定される場合）に実質上対応する純度を有する可能性がある。
いくつかの実施態様において、組成物は、２０～５０重量％、好ましくは２５～４９重量％、より好ましくは３０～４８重量％、なおさらに好ましくは３５～４７重量％、なおさらに好ましくは４０～４６重量％、なおさらに好ましくは４２～４５重量％、なおさらに好ましくは４３～４４重量％又はこれらの値の範囲内の任意の値若しくは範囲のカオトロピック剤（例えば、グアニジンチオシアン酸塩）を包含する可能性がある。最も好ましくは、組成物は、（約）４３．９２重量％のグアニジンチオシアン酸塩を包含する可能性がある。カオトロピック剤（例えば、グアニジンチオシアン酸塩）は、組成物中に約４３．９２重量％で、又は約３５重量％～約５０重量％の範囲で、好ましくは約４０重量％～約４６重量％の範囲で、より好ましくは約４２重量％～約４５重量％の範囲で、なおさらに好ましくは約４３重量％～約４４重量％の範囲で包含される可能性がある。
［緩衝剤］
組成物は、１以上の緩衝剤（又は緩衝液、ｐＨ緩衝液など）を包含する可能性がある。緩衝剤の例としては、トリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン（Ｔｒｉｓ（トリス）、トリス塩基、２－アミノ－２－（ヒドロキシメチル）－１，３－プロパンジオール、ＴＨＡＭ、トロメタモールとしても知られているもの）、又はその好適な製剤（例えば、トリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン塩酸塩、又はＴｒｉｓ－ＨＣｌ）、Ｔｒｉｚｍａ（登録商標）塩基（例えば、トリスの４０重量％貯蔵水溶液）、ＨＥＰＥＳ、ＢＥＳ、ＭＯＰＳ、ＨＥＰＥＳ、ＴＡＥ、ＴＢＥ、リン酸緩衝液、ホウ酸ナトリウム緩衝液、カコジル酸ナトリウム緩衝液などがあげられるが、これらに限定されない。好ましくは、緩衝剤は、トリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン（Ｔｒｉｓ）であるかそれを含む可能性がある。より好ましくは、緩衝剤は、Ｔｒｉｓ－ＨＣｌであるか又はそれを含む可能性がある。より好ましくは、緩衝剤は、Ｔｒｉｚｍａ（登録商標）塩基であるか又はそれを含む可能性がある。
組成物は、１以上の緩衝剤（又は緩衝液、ｐＨ緩衝液など）を包含する可能性がある。緩衝剤の例としては、トリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン（Ｔｒｉｓ（トリス）、トリス塩基、２－アミノ－２－（ヒドロキシメチル）－１，３－プロパンジオール、ＴＨＡＭ、トロメタモールとしても知られているもの）、又はその好適な製剤（例えば、トリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン塩酸塩、又はＴｒｉｓ－ＨＣｌ）、Ｔｒｉｚｍａ（登録商標）塩基（例えば、トリスの４０重量％貯蔵水溶液）、ＨＥＰＥＳ、ＢＥＳ、ＭＯＰＳ、ＨＥＰＥＳ、ＴＡＥ、ＴＢＥ、リン酸緩衝液、ホウ酸ナトリウム緩衝液、カコジル酸ナトリウム緩衝液などがあげられるが、これらに限定されない。好ましくは、緩衝剤は、トリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン（Ｔｒｉｓ）であるかそれを含む可能性がある。より好ましくは、緩衝剤は、Ｔｒｉｓ－ＨＣｌであるか又はそれを含む可能性がある。より好ましくは、緩衝剤は、Ｔｒｉｚｍａ（登録商標）塩基であるか又はそれを含む可能性がある。
いくつかの実施態様において、緩衝剤は、乾燥型、固形、粉末形状、無水型、及び／又は顆粒形状であるか、それを有するか、それを含むか、又はその形態で提供される可能性がある。いくつかの実施態様において、緩衝剤は、少なくとも及び／又は最大及び／又はおよそ９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．１％、９９．２％、９９．３％、９９．４％、９９．５％、９９．６％、９９．７％、９９．８％、又は９９．９％の純度（ＣｏＡなどの好適な物質アッセイによって測定される場合）を有する可能性がある。いくつかの実施態様において、緩衝剤は、任意の好適な濃度を有する貯蔵液（例えば、水中の貯蔵溶液）の形態（例えば、Ｔｒｉｓの約４０重量％貯蔵水溶液）で含むか又はそれである（それで提供される）可能性がある。いくつかの実施態様において、緩衝剤は、溶液中の緩衝剤の濃度（ＣｏＡなどの好適な物質アッセイによって測定される場合）に実質上対応する純度を有する可能性がある。
緩衝剤は、約２．６５重量％、又は約０．１重量％～約５重量％、好ましくは約重量０．５％～約４．５重量％、より好ましくは約０．７５重量％～約４重量％、なおさらに好ましくは約１重量％～約３．５重量％、なおさらに好ましくは約１．５重量％～約３．２５重量％、なおさらに好ましくは約２重量％～約３重量％、なおさらに好ましくは約２．５重量％～約２．８重量％の範囲で組成物中に包含される可能性がある。いくつかの実施態様において、組成物は、１～５重量％、好ましくは１．２５～４．５重量％、より好ましくは１．５～４重量％、なおさらに好ましくは１．７５～３．７５重量％、なおさらに好ましくは２～３．５重量％、なおさらに好ましくは２．２５～３重量％、なおさらに好ましくは２．５～２．７５重量％又はこれらの値の範囲内の任意の値若しくは範囲の緩衝剤（例えば、Ｔｒｉｓ）を包含する可能性がある。最も好ましくは、組成物は、（約）２．６５重量％のＴｒｉｓを包含する可能性がある。
［キレート剤］
少なくとも１実施態様において、組成物はキレート剤（キレーター）を包含する可能性がある。好ましくは、キレート剤は、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）又はその好適な塩及び／又はその水和物であるか又はそれを含む可能性がある。より好ましくは、キレート剤は、ＥＤＴＡ二ナトリウム塩であるか又はそれを含むか、又はそれとして提供される可能性がある。なおさらに好ましくは、キレート剤は、ＥＤＴＡ二ナトリウム（塩）二水和物であるか又はそれを含むか、又はそれとして提供される可能性がある。少なくとも１実施態様において、キレート剤は、エチレングリコール－ビス－（β－アミノエチルエーテル）－Ｎ、Ｎ、Ｎ’、Ｎ’－四酢酸（ＥＧＴＡ）、ニトリロ三酢酸（ＮＴＡ）、エチレンジアミン（又は１，２－ジアミノエタン）などであるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、キレート剤は、対イオン（例えば、ナトリウム）を含む、包含する、又はそれと共に提供される。少なくとも１実施態様において、キレート剤は、水和物（例えば、二水和物）を含む、包含する、又はそれとして提供される。
少なくとも１実施態様において、組成物はキレート剤（キレーター）を包含する可能性がある。好ましくは、キレート剤は、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）又はその好適な塩及び／又はその水和物であるか又はそれを含む可能性がある。より好ましくは、キレート剤は、ＥＤＴＡ二ナトリウム塩であるか又はそれを含むか、又はそれとして提供される可能性がある。なおさらに好ましくは、キレート剤は、ＥＤＴＡ二ナトリウム（塩）二水和物であるか又はそれを含むか、又はそれとして提供される可能性がある。少なくとも１実施態様において、キレート剤は、エチレングリコール－ビス－（β－アミノエチルエーテル）－Ｎ、Ｎ、Ｎ’、Ｎ’－四酢酸（ＥＧＴＡ）、ニトリロ三酢酸（ＮＴＡ）、エチレンジアミン（又は１，２－ジアミノエタン）などであるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、キレート剤は、対イオン（例えば、ナトリウム）を含む、包含する、又はそれと共に提供される。少なくとも１実施態様において、キレート剤は、水和物（例えば、二水和物）を含む、包含する、又はそれとして提供される。
組成物は、１以上のキレート剤を包含する可能性がある。組成物のキレート剤は、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）、シクロヘキサンジアミン四酢酸（ＣＤＴＡ）、ジエチレントリアミン五酢酸（ＤＴＰＡ）、テトラアザシクロドデカン四酢酸（ＤＯＴＡ）、テトラアザシクロテトラデカン四酢酸（ＴＥＴＡ）、デスフェリオキシミン（ｄｅｓｆｅｒｒｉｏｘｉｍｉｎｅ）、ニトリロ三酢酸（ＮＴＡ）、エチレンジアミン（又は１，２－ジアミノエタン）、あるいはそのキレーター誘導体、塩及び／又は水和物からなる群より選択される可能性がある。好ましくは、キレート剤は、ＥＤＴＡ（例えば、ＥＤＴＡ二ナトリウム塩、好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム（塩）二水和物）であるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、キレート剤は、対イオン（例えば、ナトリウム）を含む、包含する、又はそれと共に提供される。少なくとも１実施態様において、キレート剤は、水和物（例えば、二水和物）を含む、包含する、又はそれとして提供される。
いくつかの実施態様において、キレート剤は、乾燥型、固形、粉末形状、無水型、及び／又は顆粒形状であるか、それを有するか、それを含むか、又はその形態で提供される可能性がある。いくつかの実施態様において、キレート剤は、少なくとも及び／又は最大及び／又はおよそ９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．１％、９９．２％、９９．３％、９９．４％、９９．５％、９９．６％、９９．７％、９９．８％、又は９９．９％の純度（ＣｏＡなどの好適な物質アッセイによって測定される場合）を有する可能性がある。いくつかの実施態様において、キレート剤は、任意の好適な濃度を有する貯蔵液（例えば、水中の貯蔵溶液）の形態で含むか又はそれである（それで提供される）可能性がある。いくつかの実施態様において、キレート剤は、溶液中のキレート剤の濃度（ＣｏＡなどの好適な物質アッセイによって測定される場合）に実質上対応する純度を有する可能性がある。
キレート剤（例えば、ＥＤＴＡ）は、組成物中に約０．８１重量％で、又は約１．０２９重量％で、又は約０．０５重量％～約２．５重量％の範囲で、好ましくは約０．１量％～約２重量％の範囲で、より好ましくは約０．５重量％～約１重量％の範囲で、なおさらに好ましくは約０．７５重量％～約０．９重量％の範囲で包含される可能性がある。いくつかの実施態様において、組成物は、０．０５～２．５重量％、好ましくは０．１～２．２５重量％、より好ましくは０．２５～２重量％、なおさらに好ましくは０．５～１．７５重量％、なおさらに好ましくは０．６～１．５重量％、なおさらに好ましくは０．７～１．２５重量％、なおさらに好ましくは０．７５～１重量％、又はこれらの値の範囲内の任意の値若しくは範囲）のキレート剤（例えば、ＥＤＴＡ）を包含する可能性がある。最も好ましくは、組成物は、ＥＤＴＡ（約）０．８１重量％、又はＥＤＴＡ（例えば、無水物、又は二ナトリウム塩二水和物）（約）１．０２９重量％を包含する可能性がある。
［界面活性剤］
少なくとも１実施態様において、組成物は界面活性剤を含む可能性がある。好ましくは、界面活性剤は、ラウロイルサルコシンの塩であるか又はそれを含む可能性がある。より好ましくは、界面活性剤は、ラウロイルサルコシンナトリウム塩（ＳＬＳ）であるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、界面活性剤は、ドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）、ポリソルベート（Ｔｗｅｅｎ（商標））、ラウリルジメチルアミンオキサイド、臭化セチルトリメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ）、ポリエトキシル化アルコール類、ポリオキシエチレンソルビタン、オクトキシノール（Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ１００（商標））、Ｎ、Ｎ－ジメチルドデシルアミン－Ｎ－オキサイド、臭化ヘキサデシルトリメチルアンモニム（ＨＴＡＢ）、ポリオキシル（１０）ラウリルエーテル（ｐｏｌｙｏｘｙｌ １０ ｌａｕｒｙｌ ｅｔｈｅｒ）、胆汁酸塩（デオキシコール酸ナトリウム、コール酸ナトリウム）、ポリオキシルヒマシ油（ｐｏｌｙｏｘｙｌ ｃａｓｔｏｒ ｏｉｌ）（Ｃｒｅｍｏｐｈｏｒ（商標））、ノニルフェノールエトキシレート（Ｔｅｒｇｉｔｏｌ（商標））、シクロデキスウトリン、レシチン、塩化メチルベンゼトニウム（Ｈｙａｍｉｎｅ（商標））などからなる群より選択される１以上の構成成分であるか又はそれを含む可能性がある。組成物は、界面活性剤、例としては、尿素、過塩素酸塩、デシル硫酸（ナトリウム）塩（ＳＤＳ）、及び／又はラウロイルサルコシン（ナトリウム）塩（ＳＬＳ）、好ましくはラウロイルサルコシンナトリウム（ＳＬＳ）を包含する可能性がある。いくつかの実施態様において、ＳＬＳは、ＳＤＳ又はその他の（より溶解度の小さい）界面活性剤よりも好ましいことがある。
少なくとも１実施態様において、組成物は界面活性剤を含む可能性がある。好ましくは、界面活性剤は、ラウロイルサルコシンの塩であるか又はそれを含む可能性がある。より好ましくは、界面活性剤は、ラウロイルサルコシンナトリウム塩（ＳＬＳ）であるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、界面活性剤は、ドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）、ポリソルベート（Ｔｗｅｅｎ（商標））、ラウリルジメチルアミンオキサイド、臭化セチルトリメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ）、ポリエトキシル化アルコール類、ポリオキシエチレンソルビタン、オクトキシノール（Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ１００（商標））、Ｎ、Ｎ－ジメチルドデシルアミン－Ｎ－オキサイド、臭化ヘキサデシルトリメチルアンモニム（ＨＴＡＢ）、ポリオキシル（１０）ラウリルエーテル（ｐｏｌｙｏｘｙｌ １０ ｌａｕｒｙｌ ｅｔｈｅｒ）、胆汁酸塩（デオキシコール酸ナトリウム、コール酸ナトリウム）、ポリオキシルヒマシ油（ｐｏｌｙｏｘｙｌ ｃａｓｔｏｒ ｏｉｌ）（Ｃｒｅｍｏｐｈｏｒ（商標））、ノニルフェノールエトキシレート（Ｔｅｒｇｉｔｏｌ（商標））、シクロデキスウトリン、レシチン、塩化メチルベンゼトニウム（Ｈｙａｍｉｎｅ（商標））などからなる群より選択される１以上の構成成分であるか又はそれを含む可能性がある。組成物は、界面活性剤、例としては、尿素、過塩素酸塩、デシル硫酸（ナトリウム）塩（ＳＤＳ）、及び／又はラウロイルサルコシン（ナトリウム）塩（ＳＬＳ）、好ましくはラウロイルサルコシンナトリウム（ＳＬＳ）を包含する可能性がある。いくつかの実施態様において、ＳＬＳは、ＳＤＳ又はその他の（より溶解度の小さい）界面活性剤よりも好ましいことがある。
いくつかの実施態様において、界面活性剤は、乾燥型、固形、粉末形状、無水型、及び／又は顆粒形状であるか、それを有するか、それを含むか、又はその形態で提供される可能性がある。いくつかの実施態様において、界面活性剤は、少なくとも及び／又は最大及び／又はおよそ９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．１％、９９．２％、９９．３％、９９．４％、９９．５％、９９．６％、９９．７％、９９．８％、又は９９．９％の純度（ＣｏＡなどの好適な物質アッセイによって測定される場合）を有する可能性がある。いくつかの実施態様において、界面活性剤は、任意の好適な濃度（例えば、約１０重量％、１５重量％、２０重量％、２５重量％、２８重量％、２９重量％、３０重量％、３２重量％、３５重量％、４０重量％、又は４５重量％の水溶液（例えば、水中の溶液））を有する貯蔵液（例えば、水中の貯蔵溶液）の形態で含むか又はそれである（それで提供される）可能性がある。いくつかの実施態様において、界面活性剤は、溶液中の界面活性剤の濃度（例えば、約３０重量％）に実質上対応する純度（ＣｏＡなどの好適な物質アッセイによって測定される場合）を有する可能性がある。
いくつかの実施態様において、界面活性剤（例えば、ＳＬＳ）は、組成物中に約０．２７９重量％で包含する可能性がある。いくつかの実施態様において、界面活性剤は、約０．０１重量％～約５重量％、好ましくは約重量０．０２５％～約２．５重量％、より好ましくは約０．０５重量％～約２重量％、なおさらに好ましくは約０．０７５重量％～約１．５重量％、なおさらに好ましくは約０．１重量％～約１重量％、なおさらに好ましくは約０．１５重量％～約０．５重量％、なおさらに好ましくは約０．２重量％～約０．４重量％、なおさらに好ましくは約０．２５重量％～約０．３重量％の範囲で組成物中に包含される可能性がある。いくつかの実施態様は、０．０１重量％～５重量％、好ましくは０．０２５重量％～２．５重量％、より好ましくは０．０５重量％～２重量％、なおさらに好ましくは０．０７５重量％～１．５重量％、なおさらに好ましくは０．１重量％～１重量％、なおさらに好ましくは０．１５重量％～０．５重量％、なおさらに好ましくは０．２重量％～０．４重量％、なおさらに好ましくは０．２５重量％～０．３重量％、最も好ましくは０．２７９重量％の界面活性剤又はＳＬＳを包含する。少なくとも１実施態様において、界面活性剤（例えば、ＳＬＳ）は、組成物中に約３０重量％の貯蔵（水）溶液を約０．９３重量％、又はそれと等価で包含されることが可能である。
［アルコール］
少なくとも１実施態様において、組成物はアルコールを包含する可能性がある。好ましくは、アルコールは、エタノールであるか又はそれを含む可能性がある。より好ましくは、アルコールは、エタノールと１以上の追加の化学物質又は構成成分との混合物であるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、１以上の追加の化学物質又は構成成分は、イソプロパノールであるか又はそれを含む可能性がある。なおさらに好ましくは、アルコールは、エタノールとイソプロパノールとの混合物であるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、１以上の追加の化学物質又は構成成分は、メタノール、プロパノール、ブタノール、イソブタノールなどであるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、アルコールは、特別変性アルコール（ＳＤＡ）であるか又はそれを含む可能性がある。より好ましくは、アルコールは、エタノール約９５体積％とイソプロパノール約５体積％との混合物を含むことが当業者に知られているようなＳＤＡ ３Ｃであるか又はそれを含む可能性がある。組成物は、アルコール、例としては、エタノール、メタノール、プロパノール及び／又はイソプロパノール、好ましくは特別変性アルコール（ＳＤＡ）、又はエタノールと、メタノール、ｎ－プロパノール、イソプロパノール、ｎ－ブタノール、トリフルオロエタノール、フェノール若しくは２，６－ジ－ｔｅｒｔ－ブチル－４－メチルフェノールなどの別のアルコールとの混合物、より好ましくはエタノールとイソプロパノールとの混合物、なおさらに好ましくはエタノールとイソプロパノールなどの１以上の追加の化学物質又は構成成分との混合物を包含することが可能である。
少なくとも１実施態様において、組成物はアルコールを包含する可能性がある。好ましくは、アルコールは、エタノールであるか又はそれを含む可能性がある。より好ましくは、アルコールは、エタノールと１以上の追加の化学物質又は構成成分との混合物であるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、１以上の追加の化学物質又は構成成分は、イソプロパノールであるか又はそれを含む可能性がある。なおさらに好ましくは、アルコールは、エタノールとイソプロパノールとの混合物であるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、１以上の追加の化学物質又は構成成分は、メタノール、プロパノール、ブタノール、イソブタノールなどであるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、アルコールは、特別変性アルコール（ＳＤＡ）であるか又はそれを含む可能性がある。より好ましくは、アルコールは、エタノール約９５体積％とイソプロパノール約５体積％との混合物を含むことが当業者に知られているようなＳＤＡ ３Ｃであるか又はそれを含む可能性がある。組成物は、アルコール、例としては、エタノール、メタノール、プロパノール及び／又はイソプロパノール、好ましくは特別変性アルコール（ＳＤＡ）、又はエタノールと、メタノール、ｎ－プロパノール、イソプロパノール、ｎ－ブタノール、トリフルオロエタノール、フェノール若しくは２，６－ジ－ｔｅｒｔ－ブチル－４－メチルフェノールなどの別のアルコールとの混合物、より好ましくはエタノールとイソプロパノールとの混合物、なおさらに好ましくはエタノールとイソプロパノールなどの１以上の追加の化学物質又は構成成分との混合物を包含することが可能である。
いくつかの実施態様において、界面活性剤は、乾燥型、固形、粉末形状、無水型、及び／又は顆粒形状であるか、それを有するか、それを含むか、又はその形態で提供される可能性がある。いくつかの実施態様において、アルコールは、液体、含水及び／又は溶液の形態であるか、それを有するか、それを含むか、又はその形態で提供される可能性がある。いくつかの実施態様において、アルコールは、任意の好適な濃度のアルコール（例えば、水中のアルコール）を有する貯蔵液（例えば、水中の貯蔵溶液）の形態で含むか又はそれである（それで提供される）可能性がある。いくつかの実施態様において、アルコールは、実質上純粋であるか、又は実質上純粋アルコールの混合物である可能性がある。いくつかの実施態様において、アルコールは、少なくとも及び／又は最大及び／又はおよそ９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．１％、９９．２％、９９．３％、９９．４％、９９．５％、９９．６％、９９．７％、９９．８％、又は９９．９％（又は純粋なエチルアルコール、２００プルーフ）の純度（ＣｏＡなどの好適な物質アッセイによって測定される場合）を有する可能性がある。
いくつかの実施態様では、アルコールは、エタノール約９５体積％とイソプロパノール約５体積％との又はこれらを含む混合物又は貯蔵液であるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様では、アルコールは、エタノール約９０～９９体積％とイソプロパノール約１～１０体積％との又はこれらを含む混合物又は貯蔵液であるか又はそれを含む可能性がある。ある実施態様において、アルコールは、エタノール約５０～９９体積％とイソプロパノール約１～５０体積％との混合物を含む可能性がある。より好ましくは、アルコールは、エタノール約６０～９８体積％とイソプロパノール約２～４０体積％との混合物を含む可能性がある。なおさらに好ましくは、アルコールは、エタノール約７５～９７体積％とイソプロパノール約３～２５体積％との混合物を含む可能性がある。なおさらに好ましくは、アルコールは、エタノール約８０～９６体積％とイソプロパノール約４～２０体積％との混合物を含む可能性がある。なおさらに好ましくは、アルコールは、エタノール約８５～９５体積％とイソプロパノール約５～１５体積％との混合物を含む可能性がある。なおさらに好ましくは、アルコールは、エタノール約９０～９５体積％とイソプロパノール約５～１０体積％との混合物を含む可能性がある。なおさらに好ましくは、アルコールは、エタノール約９２～９５体積％とイソプロパノール約５～８体積％との混合物を含む可能性がある。なおさらに好ましくは、アルコールは、エタノール約９５体積％とイソプロパノール約５体積％との混合物を含む可能性がある。最も好ましくは、アルコールは、ＳＤＡ ３Ｃであるか又はそれを含む可能性がある。
アルコール（例えば、ＳＤＡ ３Ｃ）は、組成物中に約１７．７３重量％で、又は約１０重量％～約２５重量％、好ましくは約１２重量％～約２２重量％、より好ましくは約１５重量％～約２０重量％、なおさらに好ましくは約１６重量％～約１９重量％、なおさらに好ましくは約１７重量％～約１８重量％の範囲で包含される可能性がある。いくつかの実施態様において、組成物中に包含されるアルコールの量は、典型的で従来の、つまり既存の核酸保存液（例えば、組成物を輸送若しくは運搬のためにより改良可能にするもの）よりも少ない（例えば、約２０％未満、約２５％未満、約３０％未満、約３５％未満、約４０％未満、約４５％未満、約５０％未満、約５５％未満、又は約６０％未満）可能性がある。いくつかの実施態様において、組成物は、５～２５重量％、好ましくは１０～２２重量％、より好ましくは１２～２０重量％、なおさらに好ましくは１５～１９重量％、なおさらに好ましくは１６～１８．５重量％、なおさらに好ましくは１７～１８．２５重量％、なおさらに好ましくは１７．５～１８重量％、又はこれら値の範囲内の任意の値若しくは範囲のアルコールを包含する可能性がある。
好ましくは、アルコールは、エタノールと、イソプロパノールなどの１以上の追加の化学物質又は構成成分との混合物、より好ましくはエタノール約９５体積％とイソプロパノール約５体積％との混合物を含む。なおさらに好ましくは、アルコールは、特別変性アルコール（ＳＤＡ）であり、なおさらに好ましくはＳＤＡ ３Ｃ（すなわち、エタノール約９５体積％とイソプロパノール約５体積％との混合物）である。最も好ましくは、組成物は、（約）１７．７３重量％のＳＤＡ ３Ｃを包含する可能性がある。いくつかの実施態様において、アルコール（例えば、ＳＤＡ ３Ｃ）は、組成物中にエタノールを約１６．８４重量％で又はエタノールを約１０重量％～約２５重量％、好ましくは約１２重量％～約２２重量％、より好ましくは約１５重量％～約２０重量％、なおさらに好ましくは約１６重量％～約１８重量％、なおさらに好ましくは約１６．５重量％～約１７重量％の範囲で、及びイソプロパノールを約０．８９重量％で又はイソプロパノールを約０．０５重量％～約２．５重量％、好ましくは約０．１重量％～約２重量％、より好ましくは約０．５重量％～約１．５重量％、なおさらに好ましくは約０．７５重量％～約１．２５重量％、なおさらに好ましくは約０．８重量％～約１重量％の範囲で包含される可能性がある。
いくつかの実施態様において、組成物中に包含されるアルコールの量は、典型的な従来の、つまり既存の核酸保存液（例えば、組成物を輸送若しくは運搬のためにより改良可能にするもの）よりも少ない（例えば、約５０％未満）可能性がある。
［酸－ｐＨ調整剤］
少なくとも１実施態様において、組成物は酸を含む可能性がある。好ましくは、酸は塩酸（ＨＣｌ）であるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、酸は、臭化水素酸（ＨＢｒ）、過塩素酸（ＨＣｌＯ４）、硝酸（ＨＮＯ３）、又は硫酸（Ｈ２ＳＯ４）であるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、酸は、炭酸（Ｈ２ＣＯ３）又は酢酸（ＣＨ３ＣＯＯＨ）であるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、酸は、リン酸（Ｈ３ＰＯ４）、ホウ酸（Ｈ３ＢＯ３）、又はＥｍｅｒａｌｄ Ｓａｆｅ酸（ＥＳＡ）であるか又はそれを含む可能性がある。
少なくとも１実施態様において、組成物は酸を含む可能性がある。好ましくは、酸は塩酸（ＨＣｌ）であるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、酸は、臭化水素酸（ＨＢｒ）、過塩素酸（ＨＣｌＯ４）、硝酸（ＨＮＯ３）、又は硫酸（Ｈ２ＳＯ４）であるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、酸は、炭酸（Ｈ２ＣＯ３）又は酢酸（ＣＨ３ＣＯＯＨ）であるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、酸は、リン酸（Ｈ３ＰＯ４）、ホウ酸（Ｈ３ＢＯ３）、又はＥｍｅｒａｌｄ Ｓａｆｅ酸（ＥＳＡ）であるか又はそれを含む可能性がある。
いくつかの実施態様において、酸は、乾燥型、固形、粉末形状、無水型、及び／又は顆粒形状であるか、それを有するか、それを含むか、又はその形態で提供される可能性がある。いくつかの実施態様において、酸は、少なくとも及び／又は最大及び／又はおよそ９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．１％、９９．２％、９９．３％、９９．４％、９９．５％、９９．６％、９９．７％、９９．８％、又は９９．９％の純度（ＣｏＡなどの好適な物質アッセイによって測定される場合）を有する可能性がある。いくつかの実施態様において、酸は、任意の好適な濃度（例えば、約１０重量％、１５重量％、２０重量％、２５重量％、３０重量％、３２重量％、３５重量％、３７重量％、３８重量％、４０重量％、又は４５重量％の水溶液（例えば、水中の溶液））を有する貯蔵液（例えば、水中の貯蔵溶液）の形態で含むか又はそれである（それで提供される）可能性がある。いくつかの実施態様において、酸は、溶液中の酸の濃度に実質上対応する（例えば、約３７重量％）純度（ＣｏＡなどの好適な物質アッセイによって測定される場合）を有する可能性がある。
いくつかの実施態様において、組成物は、ｐＨ約８．０若しくは約８．１、又はｐＨ７．５～９．５、ｐＨ６．５～９．５、ｐＨ７～９、ｐＨ７．１～９．５、ｐＨ７．２～９．５、ｐＨ７．２～９、ｐＨ７．２～８．８、ｐＨ７．４～８．６、ｐＨ７．５～８．５、ｐＨ７．６～８．４又はｐＨ７．８～８．２（又はこれらの値の範囲内の任意の値若しくは範囲）にするに足る量の酸（例えば、塩酸）を包含することが可能である。いくつかの実施態様において、組成物のｐＨは、約５超でかつ約１２未満、好ましくは約７超でかつ約１０未満、より好ましくは約７．０超若しくは７．１超でかつ１０．０未満、９．８未満、９．６未満、９．５未満、９．２未満、９．０未満、８．８未満若しくは８．５未満、又は約６～約１１までのｐＨ範囲、より好ましくは約７～約１０までのｐＨ範囲、なおさらに好ましくは約７．２～約９．５までのｐＨ範囲、なおさらに好ましくは約７．２～約９．０までのｐＨ範囲、なおさらに好ましくは約７．２～約８．８までのｐＨ範囲、なおさらに好ましくは約７．５～約８．５までのｐＨ範囲、なおさらに好ましくは約７．６～約８．４までのｐＨ範囲、なおさらに好ましくは約７．７～約８．３までのｐＨ範囲、なおさらに好ましくは約７．８～約８．３までのｐＨ範囲、なおさらに好ましくは約７．９～約８．２までのｐＨ範囲、そして最も好ましくはｐＨ約８．０又は８．１である可能性がある。
いくつかの実施態様において、酸（例えば、ＨＣｌ）は、約０．４重量％で、又は約０．０１重量％～約５重量％、好ましくは約０．０２５重量％～約２．５重量％、より好ましくは約０．０５重量％～約２重量％、より好ましくは約０．１重量％～約１．５重量％、より好ましくは約０．２５重量％～約１重量％、より好ましくは約０．５重量％～約０．７５重量％、より好ましくは約０．３重量％～約０．５重量％の範囲で組成物中に包含される可能性がある。いくつかの実施態様において、組成物は、０．００５～５重量％、好ましくは０．０１～２．５重量％、より好ましくは０．０２５～１．５重量％、なおさらに好ましくは０．０５～１重量％、なおさらに好ましくは０．１～０．７５重量％、なおさらに好ましくは０．２５～０．５重量％の酸（例えば、塩酸）を包含する可能性がある。少なくとも１実施態様において、酸（例えば、ＨＣｌ）は、組成物中に約３７重量％の又は約１２Ｍの貯蔵（水）溶液を約１．０８重量％、又はそれと等価で包含されることが可能である。最も好ましくは、組成物は、３７重量％の塩酸を（約）１．０８重量％、又はそれと等価、あるいはｐＨ（約）８．０にするに足る量の塩酸を包含することが可能である。
理論に束縛されるものではないが、酸が変われば「強度」又は酸がプロトン（Ｈ＋）を失うこと能力若しくは傾向も異なるは知られており、またそのことを当業者は理解している。強酸は、溶液（十分な溶媒があるとして）中で完全に電離（溶解）するものである。水中では、例えば、１モルの強酸ＨＡが溶解すると、１モルのＨ＋（ヒドロニウムイオンＨ３Ｏ＋及びより高等な凝集体として）と１モルの共役塩基Ａ－が生成する。原則的に、イオン化しない酸ＨＡはない。強酸のいくつかの例は、塩酸（ＨＣｌ）、ヨウ化水素酸（ＨＩ）、臭化水素酸（ＨＢｒ）、過塩素酸（ＨＣｌＯ４）、硝酸（ＨＮＯ３）及び硫酸（Ｈ２ＳＯ４）である。水溶液中では、これらはそれぞれ原則的に１００％イオン化する。一方、弱酸は、一部のみ溶解する。水中での例としては、炭酸（Ｈ２ＣＯ３）及び酢酸（ＣＨ３ＣＯＯＨ）があげられる。平衡状態では、酸と共役塩基の両方が溶液中に存在する。強い酸であるほど大きな酸解離定数（Ｋａ）を有し、また定数の対数値（ｐＫａ＝－ｌｏｇ Ｋａ）が小さいほど弱い酸となる。酸は強くなるほど、プロトンＨ＋を失いやすくなる。脱プロトン化し易さに寄与する２つの重要な要因は、Ｈ－Ａ結合の極性と原子Ａの大きさであり、これがＨ－Ａ結合の強さを決定する。酸の強度はまた、共役塩基の安定性によっても決まる。
上述の観点から、組成物のｐＨを所望のレベルにするのに必要な各酸の重量比量は様々である。例として、３７％塩酸（水溶液）（約）１．０８重量％は、本開示のある実施態様のｐＨを（約）８．０にするのに十分である場合もあるが、３７％塩酸（水溶液）１．０８重量％が同様の実施態様のｐＨを（約）８．０にするには弱すぎる場合もあり、３７％硫酸（水中）１．０８重量％がその実施態様のｐＨを（約）８．０にするには強すぎる場合もあり、３７％硝酸（水中）１．０８重量％がアルコールを酸化する場合もある、など。理論に束縛されるものではないが、当業者でさえ、さらに研究を進めると、酸が本開示の１以上の実施態様に好適であると断定できない場合もある。
塩基（例えば、－ＯＨの供給源）もまた、ｐＨを調節するのに使用される可能性がある。
［粘液溶解薬］
少なくとも１実施態様において、組成物は粘液溶解薬を包含する可能性がある。１以上の実施態様において、粘液溶解薬は、還元剤であるか又はそれを含む可能性がある。好ましくは、粘液溶解薬は、アセチルシステイン（すなわち、Ｎ－アセチルシステイン（ＮＡＣ）であって、Ｎ－アセチル－Ｌ－システイン、Ｎ－アセチル－Ｄ－システイン、及びラセミ体Ｎ－アセチルシステイン、又はＮ－アセチル－Ｌ－システインとＮ－アセチル－Ｄ－システインとの（ラセミ体）混合物を包含するもの）であるか又はそれを含む可能性がある。より好ましくは、粘液溶解薬は、Ｎ－アセチル－Ｌ－システインであるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、粘液溶解薬は、Ｎ－アセチルシステイン（Ｎ－アセチル－Ｌ－システイン）、アスコルビン酸、亜ジチオン酸塩、エリチオルビン酸塩（ｅｒｙｔｈｉｏｒｂａｔｅ）、システイン、グルタチオン、ジチオスレイトール、２－メルカプトエタノール、トリス（２－カルボキシエチル）ホスフィン（ＴＣＥＰ）であって、場合により塩酸塩（ＴＣＥＰ－ＨＣｌ）として、ジエリスリトール、樹脂担持チオール、樹脂担持ホスフィン、ビタミンＥ及び／又はトロロクス、あるいはそれらの塩であって、クエン酸ナトリウム、クエン酸カリウム、ヨウ化カリウム、塩化アンモニウム、グアイフェネシン、トルー（Ｔｏｌｕ）バルサム、ヴァサカ（Ｖａｓａｋａ）、アンブロキソール、カルボシステイン、エルドステイン、メシステイン、ドルナーゼアルファなどであるか又はそれを含む可能性がある。組成物は、１以上の粘液溶解薬を包含する可能性がある。好ましくは、粘液溶解薬は、アスコルビン酸、エリチオルビン酸塩（ｅｒｙｔｈｉｏｒｂａｔｅ）、Ｎ－アセチルシステイン、ジチオスレイトール、又は２－メルカプトエタノールであり、そして最も好ましくは、粘液溶解薬は、Ｎ－アセチルシステインである。
少なくとも１実施態様において、組成物は粘液溶解薬を包含する可能性がある。１以上の実施態様において、粘液溶解薬は、還元剤であるか又はそれを含む可能性がある。好ましくは、粘液溶解薬は、アセチルシステイン（すなわち、Ｎ－アセチルシステイン（ＮＡＣ）であって、Ｎ－アセチル－Ｌ－システイン、Ｎ－アセチル－Ｄ－システイン、及びラセミ体Ｎ－アセチルシステイン、又はＮ－アセチル－Ｌ－システインとＮ－アセチル－Ｄ－システインとの（ラセミ体）混合物を包含するもの）であるか又はそれを含む可能性がある。より好ましくは、粘液溶解薬は、Ｎ－アセチル－Ｌ－システインであるか又はそれを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、粘液溶解薬は、Ｎ－アセチルシステイン（Ｎ－アセチル－Ｌ－システイン）、アスコルビン酸、亜ジチオン酸塩、エリチオルビン酸塩（ｅｒｙｔｈｉｏｒｂａｔｅ）、システイン、グルタチオン、ジチオスレイトール、２－メルカプトエタノール、トリス（２－カルボキシエチル）ホスフィン（ＴＣＥＰ）であって、場合により塩酸塩（ＴＣＥＰ－ＨＣｌ）として、ジエリスリトール、樹脂担持チオール、樹脂担持ホスフィン、ビタミンＥ及び／又はトロロクス、あるいはそれらの塩であって、クエン酸ナトリウム、クエン酸カリウム、ヨウ化カリウム、塩化アンモニウム、グアイフェネシン、トルー（Ｔｏｌｕ）バルサム、ヴァサカ（Ｖａｓａｋａ）、アンブロキソール、カルボシステイン、エルドステイン、メシステイン、ドルナーゼアルファなどであるか又はそれを含む可能性がある。組成物は、１以上の粘液溶解薬を包含する可能性がある。好ましくは、粘液溶解薬は、アスコルビン酸、エリチオルビン酸塩（ｅｒｙｔｈｉｏｒｂａｔｅ）、Ｎ－アセチルシステイン、ジチオスレイトール、又は２－メルカプトエタノールであり、そして最も好ましくは、粘液溶解薬は、Ｎ－アセチルシステインである。
１以上の実施態様において、組成物は、アスコルビン酸、亜ジチオン酸塩、エリチオルビン酸塩（ｅｒｙｔｈｉｏｒｂａｔｅ）、ジチオスレイトール、２－メルカプトエタノール、ＴＣＥＰ、ジエリスリトール、樹脂担持チオール、樹脂担持ホスフィン、ビタミンＥ、トロロクス、及び／又はそれらの塩を含有しない。少なくとも１実施態様は、アスコルビン酸、亜ジチオン酸塩、エリチオルビン酸塩（ｅｒｙｔｈｉｏｒｂａｔｅ）、ジチオスレイトール、２－メルカプトエタノール、ジエリスリトール、樹脂担持チオール、樹脂担持ホスフィン、ビタミンＥ、トロロクス、及び／又はそれらの塩を（実質上）有さない。少なくとも１実施態様は、Ｎ－アセチル－Ｌ－システイン以外の粘液溶解薬を（実質上）有さない。
いくつかの実施態様において、粘液溶解薬は、乾燥型、固形、粉末形状、無水型、及び／又は顆粒形状であるか、それを有するか、それを含むか、又はその形態で提供される可能性がある。いくつかの実施態様において、粘液溶解薬は、少なくとも及び／又は最大及び／又はおよそ９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．１％、９９．２％、９９．３％、９９．４％、９９．５％、９９．６％、９９．７％、９９．８％、又は９９．９％の純度（ＣｏＡなどの好適な物質アッセイによって測定される場合）を有する可能性がある。いくつかの実施態様において、粘液溶解薬は、任意の好適な濃度を有する貯蔵液（例えば、水中の貯蔵溶液）の形態で含むか又はそれである（それで提供される）可能性がある。いくつかの実施態様において、粘液溶解薬は、溶液中の粘液溶解薬の濃度に実質上対応する純度（ＣｏＡなどの好適な物質アッセイによって測定される場合）を有する可能性がある。
粘液溶解薬（例えば、Ｎ－アセチルシステイン、又はＴＣＥＰ）は、組成物中に約０．０９３重量％で、又は約０．０１重量％～約０．５重量％、好ましくは約０．０２５重量％～約０．２５重量％、より好ましくは約０．０５重量％～約０．２重量％、なおさらに好ましくは約０．０７５重量％～約０．１５重量％、なおさらに好ましくは約０．０８重量％～約０．１重量％の範囲で包含される可能性がある。
いくつかの実施態様において、組成物は、０．００５～０．２５重量％、好ましくは０．００５～０．２重量％、より好ましくは０．０１～０．２重量％、なおさらに好ましくは０．０２５～０．１７５重量％、なおさらに好ましくは０．０５～０．１６５重量％、なおさらに好ましくは０．０７５～０．１５重量％、なおさらに好ましくは０．０８～０．１２５重量％、なおさらに好ましくは０．０９～０．１重量％、又はこれら値の範囲内の任意の値若しくは範囲の粘液溶解薬（例えば、Ｎ－アセチル－Ｌ－システイン、又はＴＣＥＰ）を包含する可能性がある。最も好ましくは、組成物は、（約）０．０９３重量％のＮ－アセチル－Ｌ－システインを包含する可能性がある。
［視覚的指標］
少なくとも１実施態様は、視覚的指標を包含する可能性がある。好ましくは、視覚的指標は、着色剤であるか又はそれを含む可能性がある。より好ましくは、視覚的指標は、色素又は有色色素であるか又はそれを含む可能性がある。なおさらに好ましくは、視覚的指標は、青色色素であるか又はそれを含む可能性がある。最も好ましくは、視覚的指標は、食用青色１号（ＦＤ＆Ｃ Ｂｌｕｅ Ｎｏ．１）であるか又はそれを含む可能性がある。組成物は、視覚的指標、好ましくは着色剤、より好ましくは有色色素、なおさらに好ましくは青色色素、なおさらに好ましくは食用青色１号を包含する可能性がある。
少なくとも１実施態様は、視覚的指標を包含する可能性がある。好ましくは、視覚的指標は、着色剤であるか又はそれを含む可能性がある。より好ましくは、視覚的指標は、色素又は有色色素であるか又はそれを含む可能性がある。なおさらに好ましくは、視覚的指標は、青色色素であるか又はそれを含む可能性がある。最も好ましくは、視覚的指標は、食用青色１号（ＦＤ＆Ｃ Ｂｌｕｅ Ｎｏ．１）であるか又はそれを含む可能性がある。組成物は、視覚的指標、好ましくは着色剤、より好ましくは有色色素、なおさらに好ましくは青色色素、なおさらに好ましくは食用青色１号を包含する可能性がある。
いくつかの実施態様において、視覚的指標は、乾燥型、固形、粉末形状、無水型、及び／又は顆粒形状であるか、それを有するか、それを含むか、又はその形態で提供される可能性がある。いくつかの実施態様において、視覚的指標は、少なくとも及び／又は最大及び／又はおよそ８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．１％、９９．２％、９９．３％、９９．４％、９９．５％、９９．６％、９９．７％、９９．８％、又は９９．９％の純度（ＣｏＡなどの好適な物質アッセイによって測定される場合）を有する可能性がある。いくつかの実施態様において、視覚的指標は、任意の好適な濃度（例えば、約０．０１重量％、０．０５重量％、０．０７５重量％、０．１重量％、０．１２５重量％、０．１５重量％、０．１７５重量％、０．２重量％、０．２５重量％、０．３重量％、又は０．５重量％の水溶液（例えば、水中の溶液））を有する貯蔵液（例えば、水中の貯蔵溶液）の形態で含むか又はそれである（それで提供される）可能性がある。いくつかの実施態様において、貯蔵液は、乾燥型、固形、粉末形状、無水型、及び／又は顆粒の物質を用いて製造される可能性がある。いくつかの実施態様において、視覚的指標は、溶液中の酸の濃度（例えば、約０．２重量％）に実質上対応する純度（ＣｏＡなどの好適な物質アッセイによって測定される場合）を有する可能性がある。
視覚的指標（例えば、食用青色１号）は、組成物中に約０．０００３７重量％、又は約０．００００５重量％～約０．００１重量％の範囲、好ましくは約０．０００１量％～約０．０００７５重量％の範囲、より好ましくは約０．０００２重量％～約０．０００５重量％の範囲、なおさらに好ましくは約０．０００３重量％～約０．０００４重量％の範囲などの任意の視覚的に適切な量で包含される可能性がある。いくつかの実施態様において、組成物は、見て明らかな（又は視覚的に適切な）量の視覚的指標、好ましくは着色剤、より好ましくは有色色素、なおさらに好ましくは青色色素、なおさらに好ましくは食用青色１号を包含することが可能である。最も好ましくは、組成物は、（約）０．０００３７重量％の食用青色１号を包含する可能性がある。
少なくとも１実施態様において、視覚的指標（例えば、食用青色１号）は、組成物に濃縮物として添加される可能性がある。濃縮物は、いくつかの実施態様において水溶性又は水性濃縮物である可能性がある。いくつかの実施態様において、組成物は、０．０１～５重量％の（水中）視覚的指標濃縮物を０．０１～２．５重量％包含することが可能である。好ましくは、組成物は、０．０５～１重量％の（水中）視覚的指標濃縮物を０．０５～１重量％包含することが可能である。より好ましくは、組成物は、０．０７５～０．５重量％の（水中）視覚的指標濃縮物を０．０７５～０．５重量％包含することが可能である。なおさらに好ましくは、組成物は、０．１～０．２５重量％の（水中）視覚的指標濃縮物を０．１～０．２５重量％包含することが可能である。なおさらに好ましくは、組成物は、（約）０．２重量％の（水中）視覚的指標濃縮物を（約）０．１８５重量％包含することが可能である。少なくとも１実施態様において、視覚的指標（例えば、食用青色１号）は、組成物中に約０．２％の貯蔵（水）溶液を約０．１８５重量％で、又はそれと等価で包含される可能性がある。最も好ましくは、組成物は、（約）０．２重量％の（水中）食用青色１号濃縮物（約）０．１８５重量％を包含する可能性がある。
［抗菌剤］
いくつかの実施態様において、組成物は抗菌剤を包含する可能性がある。いくつかの実施態様において、１以上の前記構成成分は、抗菌作用を示す可能性がある。例えば、アルコール、カオトロピック剤、界面活性剤、及び／又は粘液溶解薬は、いくつかの実施態様において抗菌性であるか又は抗菌活性を示す可能性がある。したがって、ある実施態様では、別個の抗菌（例えば、殺菌及び／又は静菌）剤を包含しなくてよい。１以上の実施態様において、アルコール（例えば、ＳＤＡ ３Ｃ）の抗菌性は、本開示の実施態様においてアルコールが供給される低い濃度（例えば、約１７．７３重量％、又は５～２５重量％、１０～２２重量％、１０～２０重量％、１５～１９重量％、１６～１８．５重量％、１７～１８．２５重量％、若しくは１７．５～１８重量％、又はこれら範囲内の任意の値若しくは値の範囲）でさえ持続する。
いくつかの実施態様において、組成物は抗菌剤を包含する可能性がある。いくつかの実施態様において、１以上の前記構成成分は、抗菌作用を示す可能性がある。例えば、アルコール、カオトロピック剤、界面活性剤、及び／又は粘液溶解薬は、いくつかの実施態様において抗菌性であるか又は抗菌活性を示す可能性がある。したがって、ある実施態様では、別個の抗菌（例えば、殺菌及び／又は静菌）剤を包含しなくてよい。１以上の実施態様において、アルコール（例えば、ＳＤＡ ３Ｃ）の抗菌性は、本開示の実施態様においてアルコールが供給される低い濃度（例えば、約１７．７３重量％、又は５～２５重量％、１０～２２重量％、１０～２０重量％、１５～１９重量％、１６～１８．５重量％、１７～１８．２５重量％、若しくは１７．５～１８重量％、又はこれら範囲内の任意の値若しくは値の範囲）でさえ持続する。
［リボヌクレアーゼ阻害剤］
いくつかの実施態様は、リボヌクレアーゼ阻害剤、つまり、ヘパリン、ヘパラン硫酸、オリゴ（ビニルスルホン酸）、ポリ（ビニルスルホン酸）、オリゴ（ビニルホスホン酸）、及びポリ（ビニルスルホン酸）（ｐｏｌｙ（ｖｉｎｙｌｓｕｌｆｏｎｉｃ ａｃｉｄ））、又はこれらの塩などのリボヌクレアーゼの阻害物質を包含する。ある（例えば、好ましい）実施態様では、組成物は、リボヌクレアーゼ阻害剤又はリボヌクレアーゼの阻害物質を包含しないか、又は１以上の（例えば、任意の）リボヌクレアーゼ阻害剤又はリボヌクレーゼの阻害物質（例えば、グアニジンチオシアン酸塩などのカオトロピック剤以外であって、固有のリボヌクレアーゼ阻害活性を有する可能性のあるもの）を（実質上）有さない。したがって、少なくとも１実施態様は、１以上の（任意の）リボヌクレアーゼ阻害剤又はリボヌクレーゼの阻害物質を（実質上）有さない。１以上の実施態様は、任意のリボヌクレアーゼ阻害剤又はリボヌクレーゼの阻害物質（例えば、グアニジンチオシアン酸塩などのカオトロピック剤以外）を（実質上）有さない。
いくつかの実施態様は、リボヌクレアーゼ阻害剤、つまり、ヘパリン、ヘパラン硫酸、オリゴ（ビニルスルホン酸）、ポリ（ビニルスルホン酸）、オリゴ（ビニルホスホン酸）、及びポリ（ビニルスルホン酸）（ｐｏｌｙ（ｖｉｎｙｌｓｕｌｆｏｎｉｃ ａｃｉｄ））、又はこれらの塩などのリボヌクレアーゼの阻害物質を包含する。ある（例えば、好ましい）実施態様では、組成物は、リボヌクレアーゼ阻害剤又はリボヌクレアーゼの阻害物質を包含しないか、又は１以上の（例えば、任意の）リボヌクレアーゼ阻害剤又はリボヌクレーゼの阻害物質（例えば、グアニジンチオシアン酸塩などのカオトロピック剤以外であって、固有のリボヌクレアーゼ阻害活性を有する可能性のあるもの）を（実質上）有さない。したがって、少なくとも１実施態様は、１以上の（任意の）リボヌクレアーゼ阻害剤又はリボヌクレーゼの阻害物質を（実質上）有さない。１以上の実施態様は、任意のリボヌクレアーゼ阻害剤又はリボヌクレーゼの阻害物質（例えば、グアニジンチオシアン酸塩などのカオトロピック剤以外）を（実質上）有さない。
［プロテアーゼ］
いくつかの実施態様は、プロテアーゼを包含する。ある（例えば、好ましい）実施態様では、組成物は、プロテアーゼを包含しないか、又は１以上（例えば、任意の）プロテアーゼを（実質上）有さない。したがって、少なくとも１実施態様は、１以上の（任意の）プロテアーゼを（実質上）有さない。どの理論にも束縛されるものではないが、プロテアーゼ（又はタンパク質分解酵素、ペプチダーゼ又はプロテイナーゼ）はある種の酵素であって、１以上のペプチド結合を加水分解によって破壊し、その結果、タンパク質をより小さなタンパク質小片（若しくはペプチド）又は個々のタンパク質サブユニット（若しくはアミノ酸）へ転換する、ある種の酵素である。
いくつかの実施態様は、プロテアーゼを包含する。ある（例えば、好ましい）実施態様では、組成物は、プロテアーゼを包含しないか、又は１以上（例えば、任意の）プロテアーゼを（実質上）有さない。したがって、少なくとも１実施態様は、１以上の（任意の）プロテアーゼを（実質上）有さない。どの理論にも束縛されるものではないが、プロテアーゼ（又はタンパク質分解酵素、ペプチダーゼ又はプロテイナーゼ）はある種の酵素であって、１以上のペプチド結合を加水分解によって破壊し、その結果、タンパク質をより小さなタンパク質小片（若しくはペプチド）又は個々のタンパク質サブユニット（若しくはアミノ酸）へ転換する、ある種の酵素である。
［タンパク質変性剤］
いくつかの実施態様は、１以上のタンパク質変性剤を包含する。例えば、少なくとも１実施態様において、（ｉ）カオトロピック剤が、タンパク質変性剤として存在するか、含むか、又は機能する（あるいはタンパク質を変性させるか又はタンパク質変性作用を示す）可能性がある。少なくとも１実施態様において、（ｉｉ）界面活性剤が、タンパク質変性剤として存在するか、含むか、又は機能する（あるいはタンパク質を変性させるか又はタンパク質変性作用を示す）可能性がある。少なくとも１実施態様において、（ｉｉｉ）アルコールが、タンパク質変性剤として存在するか、含むか、あるいは機能する（又はタンパク質を変性させるか若しくはタンパク質変性作用を示す）可能性がある。少なくとも１実施態様において、（ｉｖ）粘液溶解薬は、例えばタンパク質が接触しやすいジスルフィド結合又はジスルフィド架橋を含有する場合に、タンパク質変性剤として存在するか、含むか、又は機能する（あるいはタンパク質を変性させるか若しくはタンパク質変性作用を示す）可能性がある。いくつかの実施態様において、（ｉ）カオトロピック剤、（ｉｉ）界面活性剤、（ｉｉｉ）アルコール及び（ｉｖ）粘液溶解薬のうちの２以上は、タンパク質変性剤として存在するか、含むか、又は機能する（あるいはタンパク質を変性させるか若しくはタンパク質変性作用を示す）可能性がある。いくつかの実施態様において、（ｉ）カオトロピック剤、（ｉｉ）界面活性剤、（ｉｉｉ）アルコール及び（ｉｖ）粘液溶解薬はそれぞれが又はそれら全てが、タンパク質変性剤として存在するか、含むか、又は機能する（あるいはタンパク質を変性させるか若しくはタンパク質変性作用を示す）可能性がある。
いくつかの実施態様は、１以上のタンパク質変性剤を包含する。例えば、少なくとも１実施態様において、（ｉ）カオトロピック剤が、タンパク質変性剤として存在するか、含むか、又は機能する（あるいはタンパク質を変性させるか又はタンパク質変性作用を示す）可能性がある。少なくとも１実施態様において、（ｉｉ）界面活性剤が、タンパク質変性剤として存在するか、含むか、又は機能する（あるいはタンパク質を変性させるか又はタンパク質変性作用を示す）可能性がある。少なくとも１実施態様において、（ｉｉｉ）アルコールが、タンパク質変性剤として存在するか、含むか、あるいは機能する（又はタンパク質を変性させるか若しくはタンパク質変性作用を示す）可能性がある。少なくとも１実施態様において、（ｉｖ）粘液溶解薬は、例えばタンパク質が接触しやすいジスルフィド結合又はジスルフィド架橋を含有する場合に、タンパク質変性剤として存在するか、含むか、又は機能する（あるいはタンパク質を変性させるか若しくはタンパク質変性作用を示す）可能性がある。いくつかの実施態様において、（ｉ）カオトロピック剤、（ｉｉ）界面活性剤、（ｉｉｉ）アルコール及び（ｉｖ）粘液溶解薬のうちの２以上は、タンパク質変性剤として存在するか、含むか、又は機能する（あるいはタンパク質を変性させるか若しくはタンパク質変性作用を示す）可能性がある。いくつかの実施態様において、（ｉ）カオトロピック剤、（ｉｉ）界面活性剤、（ｉｉｉ）アルコール及び（ｉｖ）粘液溶解薬はそれぞれが又はそれら全てが、タンパク質変性剤として存在するか、含むか、又は機能する（あるいはタンパク質を変性させるか若しくはタンパク質変性作用を示す）可能性がある。
理論に束縛されるものではないが、前述の構成成分又は成分のうち１以上のタンパク質変性作用は、濃度依存性及び／又は時間依存性である可能性がある。
［製剤］
本開示の実施態様は、キャリア、カオトロピック剤、緩衝剤、キレート剤、界面活性剤、アルコール、酸、及び粘液溶解薬を含む、核酸保存組成物（又は製剤）を包含する。実施態様はさらに、任意の視覚的指標も包含する。実施態様は、カオトロピック剤２０～５０重量％、緩衝剤１～５重量％、キレート剤０．０５～２．５重量％、界面活性剤０．０５～２．５重量％、アルコール５～２５重量％、粘液溶解薬０．００５～０．２５重量％、ｐＨ約６．５～９．５にするのに足る量の酸、及び１００％にするのに足る量のキャリアを含むことも可能である。実施態様はさらに、視覚的指標０．００５～２．５重量％も包含する。
本開示の実施態様は、キャリア、カオトロピック剤、緩衝剤、キレート剤、界面活性剤、アルコール、酸、及び粘液溶解薬を含む、核酸保存組成物（又は製剤）を包含する。実施態様はさらに、任意の視覚的指標も包含する。実施態様は、カオトロピック剤２０～５０重量％、緩衝剤１～５重量％、キレート剤０．０５～２．５重量％、界面活性剤０．０５～２．５重量％、アルコール５～２５重量％、粘液溶解薬０．００５～０．２５重量％、ｐＨ約６．５～９．５にするのに足る量の酸、及び１００％にするのに足る量のキャリアを含むことも可能である。実施態様はさらに、視覚的指標０．００５～２．５重量％も包含する。
少なくとも１実施態様において、組成物は、カオトロピック剤４３．９２重量％、緩衝剤２．６５重量％、キレート剤約０．８１重量％又は約１．０２９重量％、界面活性剤０．２７９重量％、アルコール１７．７３重量％、粘液溶解薬０．０９３重量％、ｐＨ約８．０にするのに足る量の酸（例えば、３７％酸溶液を約１．０８％、又はそれと等価のもの）、及び１００％にするのに足る量のキャリアを包含する。組成物は、視覚的指標約０．０００３７重量％を包含することが可能である。
いくつかの実施態様において、キャリアは、水、好ましくは濾過水、純水、蒸留水及び／又は脱イオン水であるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、カオトロピック剤は、グアニジン及び／又はチオシアン酸塩、好ましくはグアニジンチオシアン酸塩であるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、緩衝剤は、トリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン（Ｔｒｉｓ）、好ましくはＴｒｉｓ－ＨＣｌ、より好ましくはＴｒｉｚｍａ（登録商標）塩基であるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、キレート剤は、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）、好ましくはより好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム（塩）二水和物であるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、界面活性剤は、ラウロイルサルコシンナトリウム塩（ＳＬＳ）であるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、アルコールは、特別変性アルコール（ＳＤＡ）又はエタノールとイソプロパノールとの混合物、より好ましくはエタノール約９５体積％とイソプロパノール約５体積％の混合物、つまり、ＳＤＡ ３Ｃであるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、酸は、塩酸であるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、粘液溶解薬は、Ｎ－アセチル－Ｌ－システインであるか又はそれを含む可能性がある。
本開示の実施態様は、カオトロピック剤（例えば、グアニジンチオシアン酸塩）約４３．９２重量％、緩衝剤（例えば、Ｔｒｉｓ）約２．６５重量％、キレート剤（例えば、ＥＤＴＡ又はＥＤＴＡ二ナトリウム（塩）二水和物）約０．８１重量％又は約１．０２９重量％、界面活性剤（例えば、ＳＬＳ）約０．２７９重量％、アルコール（例えば、ＳＤＡ ３Ｃ）約１７．７３重量％、粘液溶解薬（例えば、Ｎ－アセチル－Ｌ－システイン）約０．０９３重量％、ｐＨ８．０又は８．１にするのに足る量の酸（例えば、塩酸）、及び／又は１００％にするのに足る量のキャリア（例えば、濾過水、純水、蒸留水及び／又は脱イオン水を含む含水キャリア）を含む、核酸安定化及び／又は保存組成物を包含する。実施態様はさらに、視覚的指標約０．０００３７重量％も包含する可能性がある。
本開示の実施態様は、カオトロピック剤（例えば、グアニジンチオシアン酸塩）４３．９２±１０重量％、緩衝剤（例えば、Ｔｒｉｓ）２．６５±１０重量％、キレート剤（例えば、ＥＤＴＡ又はＥＤＴＡ二ナトリウム（塩）二水和物）０．８１±１０重量％又は１．０２９±１０重量％、界面活性剤（例えば、ＳＬＳ）０．２７９±１０重量％、アルコール（例えば、ＳＤＡ ３Ｃ又はエタノール９５±１０体積％とイソプロパノール５±１０体積％の混合物）１７．７３±１０重量％、粘液溶解薬（例えば、Ｎ－アセチル－Ｌ－システイン）０．０９３±１０重量％、及び／又は（必要に応じて）ｐＨ７．２～９．５、好ましくはｐＨ約８にするのに足る量の酸（例えば、塩酸）を、１００％にするのに足る量のキャリア（例えば、含水キャリア、好ましくは、濾過水、純水、蒸留水及び／又は脱イオン水）と共に包含する。実施態様はさらに、視覚的指標（例えば、食用青色１号）を約０．０００３７±１０重量％又はそれと等価（例えば、０．２±１０重量％の視覚的指標（例えば、水中）濃縮物を０．１８５±１０重量％）含むことも可能である。実施態様において、各構成成分の量の±１０％は、さらには±９％であり（列挙した量に限定される）、好ましくは±８％であり、より好ましくは±７％であり、さらにより好ましくは±６％であり、さらにより好ましくは±５％であり、さらにより好ましくは±４％であり、さらにより好ましくは±３％であり、さらにより好ましくは±２％であり、さらにより好ましくは±１％である。
少なくとも１実施態様において、組成物は、グアニジンチオシアン酸塩約４３．９２重量％、Ｔｒｉｓ約２．６５重量％、ＥＤＴＡ又はＥＤＴＡ二ナトリウム（塩）二水和物約０．８１重量％又は約１．０２９重量％、ＳＬＳ約０．２７９重量％、ＳＤＡ ３Ｃ約１７．７３重量％、Ｎ－アセチル－Ｌ－システイン約０．０９３重量％、必要に応じて、３７％塩酸約１．０８重量％若しくはそれと等価の物、又は必要に応じて、ｐＨ約８．０若しくは８．１にするのに足る量の塩酸、及び１００％にするのに足る量の水を包含する。組成物は、食用青色１号を約０．０００３７重量％（又はその０．２重量％（水中）濃縮物を０．１８５重量％）、そして水を約３２．６０２重量％包含する。
いくつかの実施態様において、組成物は、微生物（例えば、細菌性、真菌性、及び／又はウイルス性）の汚染を実質上含まないか又は有さない可能性がある。いくつかの実施態様において、組成物は、細菌又は細菌汚染が（約）１００ｃｆｕ／ｇ以下である可能性がある。いくつかの実施態様において、組成物は、細菌又は細菌汚染が（約）９９ｃｆｕ／ｇ以下、（約）９８ｃｆｕ／ｇ以下、（約）９７ｃｆｕ／ｇ以下、（約）９６ｃｆｕ／ｇ以下、（約）９５ｃｆｕ／ｇ以下、（約）９０ｃｆｕ／ｇ以下、（約）８５ｃｆｕ／ｇ以下、（約）８０ｃｆｕ／ｇ以下、（約）７５ｃｆｕ／以下、（約）７０ｃｆｕ／ｇ以下、（約）６５ｃｆｕ／以下、（約）６０ｃｆｕ／ｇ以下、（約）５５ｃｆｕ／ｇ以下、（約）５０ｃｆｕ／ｇ以下、（約）４５ｃｆｕ／ｇ以下、（約）４０ｃｆｕ／ｇ以下、（約）３５ｃｆｕ／ｇ以下、（約）３０ｃｆｕ／ｇ以下、（約）２５ｃｆｕ／ｇ以下、（約）２０ｃｆｕ／ｇ以下、（約）１５ｃｆｕ／ｇ以下、（約）１０ｃｆｕ／ｇ以下、又は（約）５ｃｆｕ／ｇ以下である可能性がある。いくつかの実施態様において、組成物は、真菌（つまり、酵母及び／又はカビなどの菌類）又は真菌汚染が（約）１００ｃｆｕ／ｇ以下である可能性がある。いくつかの実施態様において、組成物は、真菌（つまり、酵母及び／又はカビなどの菌類）又は真菌汚染が（約）９９ｃｆｕ／ｇ以下、（約）９８ｃｆｕ／ｇ以下、（約）９７ｃｆｕ／ｇ以下、（約）９６ｃｆｕ／ｇ以下、（約）９５ｃｆｕ／ｇ以下、（約）９０ｃｆｕ／ｇ以下、（約）８５ｃｆｕ／ｇ以下、（約）８０ｃｆｕ／ｇ以下、（約）７５ｃｆｕ／以下、（約）７０ｃｆｕ／ｇ以下、（約）６５ｃｆｕ／以下、（約）６０ｃｆｕ／ｇ以下、（約）５５ｃｆｕ／ｇ以下、（約）５０ｃｆｕ／ｇ以下、（約）４５ｃｆｕ／ｇ以下、（約）４０ｃｆｕ／ｇ以下、（約）３５ｃｆｕ／ｇ以下、（約）３０ｃｆｕ／ｇ以下、（約）２５ｃｆｕ／ｇ以下、（約）２０ｃｆｕ／ｇ以下、（約）１５ｃｆｕ／ｇ以下、（約）１０ｃｆｕ／ｇ以下、又は（約）５ｃｆｕ／ｇ以下である可能性がある。本明細書で使用するとき、「ｃｆｕ／ｇ」は、（最終及び／又は液体）組成物１ｇ当たりの（１以上の微生物の）コロニー形成単位を指す。
本開示の代表的な実施態様を以下の表２に提示する。表２は、代表的な組成物の成分、並びに当該成分の使用、機能、及び／又は活性について記述している。
表２．１は、本開示の組成物における別の代表的な組成を表す。
本開示の更なる特徴は、米国特許第７，４８２，１１６号から知ることができ、その全体を本明細書中に参照として組み込む。
［キット］
いくつかの実施態様は、生体試料保存キットなどのキットを包含する。とりわけ、１以上の実施態様において、本発明の組成物は、キットに組み込むことが可能である。キットは、例えば、本明細書に開示及び／又は記載されているような組成物と、試料採取装置とを包含する可能性がある。少なくとも１実施態様において、組成物は、試料採取装置の一部に配置される可能性がある。代表的な試料採取装置は、試料採取部を有する容器又はバイアル（例えば、チューブ）を包含する可能性がある。例えば、容器は、内部区画と少なくとも部分的に隣接している外壁を含む可能性がある。内部区画には組成物を入れることができ、そこへ生体試料を追加することができる。あるいは、試料を（内部）区画へ追加して、採取後の試料へ組成物を追加することも可能である。例えば、装置は、試料の採取前又は採取後に組成物を（内部）区画へ追加するための組成物ディスペンサーを包含する可能性がある。少なくとも１実施態様において、ディスペンサーは、装置の開口部を閉鎖又は密封するためのキャップを含む可能性がある。開口部は、区画に通じているか又は区画と流体連通している可能性がある。キャップは、組成物が容器の区画へ追加されるまで組成物を保持するための区画を有している可能性がある。
いくつかの実施態様は、生体試料保存キットなどのキットを包含する。とりわけ、１以上の実施態様において、本発明の組成物は、キットに組み込むことが可能である。キットは、例えば、本明細書に開示及び／又は記載されているような組成物と、試料採取装置とを包含する可能性がある。少なくとも１実施態様において、組成物は、試料採取装置の一部に配置される可能性がある。代表的な試料採取装置は、試料採取部を有する容器又はバイアル（例えば、チューブ）を包含する可能性がある。例えば、容器は、内部区画と少なくとも部分的に隣接している外壁を含む可能性がある。内部区画には組成物を入れることができ、そこへ生体試料を追加することができる。あるいは、試料を（内部）区画へ追加して、採取後の試料へ組成物を追加することも可能である。例えば、装置は、試料の採取前又は採取後に組成物を（内部）区画へ追加するための組成物ディスペンサーを包含する可能性がある。少なくとも１実施態様において、ディスペンサーは、装置の開口部を閉鎖又は密封するためのキャップを含む可能性がある。開口部は、区画に通じているか又は区画と流体連通している可能性がある。キャップは、組成物が容器の区画へ追加されるまで組成物を保持するための区画を有している可能性がある。
いくつかの実施態様は、生体試料採取装置（又は容器）と、本開示の組成物とを包含するキットを包含する可能性がある。少なくとも１実施態様において、組成物は、装置の一部に配置される可能性がある。例えば、いくつかの実施態様において、組成物は、装置のキャップ又は蓋の一部に配置される可能性がある。採取装置（又は容器）は、生体試料を（例えば、その内部区画内に）受容して、そこに組成物を添加させるように構成される可能性がある。
いくつかの実施態様において、キット内の組成物は、（前述のように）微生物の汚染を実質上含まないか又は有さない可能性がある。
様々な試料採取装置が次に挙げる出願に記載されており、それらそれぞれの全体を具体的な参照として本明細書に組み込む。２０１５年１１月２５日出願の米国特許出願第１４／９５２，７１２号、２０１６年８月３日出願の米国仮特許出願第６２／３７０，６３０号、２０１７年２月１日出願の米国仮特許出願第６２／４５３，４５９号、２０１７年５月２３日出願の米国仮特許出願第６２／５１０，１７４号、２０１７年５月３０日出願の米国仮特許出願第６２／５１２，５９４号、２０１７年５月３１日出願の米国仮特許出願第６２／５１３，２３５号、２０１７年６月６日出願の米国仮特許出願第６２／５２９，３５５号、２０１７年８月２日出願の米国特許出願第１５／６６７，２２８号、２０１７年８月３日出願の国際出願番号ＰＣＴ／ＵＳ２０１７／０４５３５２、２０１７年８月３１日出願の米国出願番号第１５／６９２，２５９号、及び２０１７年１１月２２日出願の米国仮特許出願第６２／５９０，１６５号、並びにこれらを基に優先権主張された出願。
本開示の組成物は、前述の出願のいずれかに記載の装置に組み込まれる可能性がある。本開示の実施態様は、本明細書に開示及び／又は説明されるような組成物を含むキットと、前述の出願のいずれかに記載の試料採取装置とを包含する可能性がある。
［製造方法］
いくつかの実施態様は、本開示の組成物の製造方法を包含する。実施態様は、本明細書に記載されているようなキャリアを提供又は入手することを包含する可能性がある。実施態様は、キャリアに、好適な量の１以上の本明細書に最初に記載の構成成分又は成分を（例えば、本明細書に記載の最終濃度まで）添加することを包含する可能性がある。実施態様は、キャリアに、前記の量の本明細書に記載の１以上の構成成分又は成分の貯蔵溶液を添加することを包含する可能性がある。
いくつかの実施態様は、本開示の組成物の製造方法を包含する。実施態様は、本明細書に記載されているようなキャリアを提供又は入手することを包含する可能性がある。実施態様は、キャリアに、好適な量の１以上の本明細書に最初に記載の構成成分又は成分を（例えば、本明細書に記載の最終濃度まで）添加することを包含する可能性がある。実施態様は、キャリアに、前記の量の本明細書に記載の１以上の構成成分又は成分の貯蔵溶液を添加することを包含する可能性がある。
少なくとも１実施態様は、キャリアに、カオトロピック剤、緩衝剤、キレート剤、界面活性剤、アルコール、酸、及び／又は粘液溶解薬を添加することを包含する。１以上の実施態様は、キャリアに視覚的指標を添加することを包含する可能性がある。少なくとも１実施態様は、（液体）キャリアに、２０～５０重量％の最終濃度までのカオトロピック剤、０．１～５重量％の最終濃度までの緩衝剤、０．０１～５重量％の最終濃度までのキレート剤、０．０１～５重量％の最終濃度までの界面活性剤、５～２５重量％の最終濃度までのアルコール、ｐＨ７．２～９．５、好ましくはｐＨ約８又は８．１までの酸、及び／又は０．００５～０．２５重量％の最終濃度までの粘液溶解薬を添加することを包含する。少なくとも１実施態様は、（液体）キャリアに、０．００００５～０．５重量％の最終濃度までの視覚的指標を添加することを包含する可能性がある。キャリアは、１００％にするに足る量で包含される可能性がある。
少なくとも１実施態様は、（液体）キャリアに、（約）４３．９２重量％の最終濃度までのカオトロピック剤、（約）２．６５重量％の最終濃度までの緩衝剤、（約）０．８１重量％又は（約）１．０２９重量％の最終濃度までのキレート剤、（約）０．２７９重量％の最終濃度までの界面活性剤、（約）１７．７３重量％の最終濃度までのアルコール、必要に応じて、ｐＨ（約）７．２～９．５、好ましくはｐＨ（約）８若しくは８．１まで又は（約）０．４重量％の最終濃度までの酸、及び／又は（約）０．０９３重量％の最終濃度までの粘液溶解薬を添加することを包含する。少なくとも１実施態様は、（液体）キャリアに（約）０．０００３７重量％の最終濃度までの視覚的指標を添加することを包含する。キャリアは、（約）３４．１２重量％又は１００％にするに足る量で包含される可能性がある。
いくつかの実施態様において、カオトロピック剤は、グアニジン及び／又はチオシアン酸塩であるか又はそれを含む可能性があり、緩衝剤は、Ｔｒｉｓ若しくはＴｒｉｚｍａ塩基であるか又はそれを含む可能性があり、キレート剤は、ＥＤＴＡ若しくはＥＤＴＡ二ナトリウム（塩）二水和物であるか又はそれを含む可能性があり、界面活性剤は、ＳＬＳであるか又はそれを含む可能性があり、アルコールは、エタノール及び／又はイソプロパノール（例えば、ＳＤＡ ３Ｃ）であるか又はそれを含む可能性があり、粘液溶解薬は、Ｎ－アセチル－Ｌ－システインであるか又はそれを含む可能性があり、酸は、ＨＣＬであるか又はそれを含む可能性があり、キャリアは、水であるか又はそれを含む可能性があり、並びに／あるいは任意の視覚的指標は、食用青色１号であるか又はそれを含む可能性がある。
核酸安定化及び／又は保存組成物の製造方法は、キャリアを容器に加えること（例えば、混合タンクに（濾過水、脱イオン水などの）水を入れること）を包含する可能性がある。いくつかの実施態様において、キャリアは、組成物の約３４．１２重量％の最終濃度で又は１００％に足る量まで包含される可能性がある。
いくつかの実施態様において、ミキサーは、１以上の追加の構成成分又は成分をキャリアに添加する前に作動される可能性がある。いくつかの実施態様において、ミキサーは、１以上の追加の構成成分又は成分をキャリアに添加した後に作動される可能性がある。いくつかの実施態様において、ミキサーは、２～８、好ましくは３～７、より好ましくは４～６、なおさらに好ましくは５の速度設定、及び／又は２～８、好ましくは３～７、より好ましくは４～６、なおさらに好ましくは５の掃引設定に設定される可能性がある。いくつかの実施態様において、ミキサーは、１以上の追加の構成成分又は成分をキャリアに添加する前に好適な混合温度まで加熱される可能性がある。いくつかの実施態様において、ミキサーは、１以上の追加の構成成分又は成分をキャリアに添加した後に好適な混合温度まで加熱される可能性がある。いくつかの実施態様において、好適な混合温度は、（約）５５～９５±５°Ｆ、好ましくは（約）６０～９０±５°Ｆ、より好ましくは（約）６５～８５±５°Ｆ、なおさらに好ましくは（約）７０～８０±５°Ｆ、最も好ましくは７５±５°Ｆである可能性がある。
いくつかの実施態様において、好適な量のカオトロピック剤（例えば、グアニジンチオシアン酸塩）がキャリアに（組成物の約４３．９２重量％の最終濃度まで）添加される可能性がある。いくつかの実施態様において、カオトロピック剤は、ある期間（例えば、３０～３００分、好ましくは６０～２４０分、より好ましくは１２０～１８０分、なおさらに好ましくは１４０～１６０分、最も好ましくは１５０分、又はカオトロピック剤がキャリア中で（溶液に）溶解するまで）混合される可能性がある。
いくつかの実施態様において、好適な量の緩衝剤（例えば、Ｔｒｉｓ又はＴｒｉｚｍａ塩基）がキャリアに（組成物の約２．６５重量％の最終濃度まで）添加される可能性がある。いくつかの実施態様において、緩衝剤は、ある期間（例えば、１～９０分、好ましくは５～６０分、より好ましくは１０～４５分、なおさらに好ましくは１２～３０分、なおさらに好ましくは１５～２５分、最も好ましくは（約）２０分、又は緩衝剤がキャリア中で（溶液に）溶解するまで）混合される可能性がある。
いくつかの実施態様において、好適な量のキレート剤（例えば、ＥＤＴＡ、ＥＤＴＡ二ナトリウム塩、ＥＤＴＡ二ナトリウム（塩）二水和物）がキャリアに（組成物の約０．８１％又は約１．０２９重量％（無水物又は二水和物）の最終濃度まで）添加される可能性がある。いくつかの実施態様において、キレート剤は、ある期間（例えば、１～９０分、好ましくは５～６０分、より好ましくは１０～４５分、なおさらに好ましくは１２～３０分、なおさらに好ましくは１５～２５分、最も好ましくは（約）２０分、又はキレート剤がキャリア中で（溶液に）溶解するまで）混合される可能性がある。少なくとも１実施態様において、緩衝剤とキレート剤は、一緒に予備混合して又はしないで、一緒に、（ほぼ）同じタイミングで、又は同時期に、又は付随的に、及び／又は（実質上）一斉に（若しくは同時に）キャリアへ添加される可能性がある。いくつかの実施態様において、緩衝剤とキレート剤は別々にキャリアに添加される可能性がある。
いくつかの実施態様において、好適な量の界面活性剤（例えば、ＳＬＳ）がキャリアに（組成物の約０．２７９重量％の最終濃度まで、又はそれと等価の量、例えば、３０％ＳＬＳ溶液を０．９３重量％まで）添加される可能性がある。いくつかの実施態様において、界面活性剤は、ある期間（例えば、１～９０分、好ましくは５～６０分、より好ましくは１０～４５分、なおさらに好ましくは１５～３５分、なおさらに好ましくは２０～３０分、最も好ましくは（約）２５分、又は界面活性剤がキャリア中で（溶液に）溶解するまで）混合される可能性がある。
いくつかの実施態様において、好適な量のアルコール（例えば、エタノール、エタノールとイソプロパノールなどの別の化学物質との混合物、つまりＳＤＡ、好ましくはＳＤＡＣ）がキャリアに（例えば、組成物の約１７．７３重量％の最終濃度まで、又はその等価の量まで）添加される可能性がある。いくつかの実施態様において、アルコールは、ある期間（例えば、５～９０分、好ましくは１０～７５分、より好ましくは１５～６０分、なおさらに好ましくは２５～４５分、なおさらに好ましくは３０～４０分、最も好ましくは（約）３５分、又はアルコールがキャリア中で（溶液に）溶解するまで）キャリア中で混合される可能性がある。
いくつかの実施態様において、好適な量の任意の視覚的指標（例えば、着色剤、色素、好ましくは青色色素、例としては食用青色１号など）がキャリアに（組成物の約０．０００３７重量％の最終濃度まで）添加される可能性がある。いくつかの実施態様において、視覚的指標は、ある期間（例えば、５～９０分、好ましくは１０～６０分、より好ましくは１５～４５分、なおさらに好ましくは１０～３０分、なおさらに好ましくは１５～２５分、最も好ましくは（約）２０分、又はアルコール（ａｌｃｏｈｏｌ）がキャリア中で（溶液に）溶解するまで）混合される可能性がある。
いくつかの実施態様において、好適な量の酸（例えば、塩酸）がキャリアに（組成物の約０．４重量％の最終濃度まで、又は組成物のｐＨ８．０まで（ｔｏ ａ ｐＨ ８．０））添加される可能性がある。いくつかの実施態様において、酸は、ある期間（例えば、５～９０分、好ましくは１０～６０分、より好ましくは１５～４５分、なおさらに好ましくは１０～３０分、なおさらに好ましくは１５～２５分、最も好ましくは（約）２０分、又は酸がキャリア中で（溶液に）溶解する及び／又は混合物が所望のｐＨで平衡状態に達するまで）混合される可能性がある。
いくつかの実施態様において、好適な量の粘液溶解薬（又は還元剤）（例えば、Ｎ－アセチルシステイン、Ｎ－アセチ－Ｌ－システイン）がキャリアに（組成物の約０．０９３重量％の最終濃度まで）添加される可能性がある。いくつかの実施態様において、酸（ａｃｉｄ）は、ある期間（例えば、５～９０分、好ましくは１０～６０分、より好ましくは１５～４５分、なおさらに好ましくは１０～３０分、なおさらに好ましくは１５～２５分、最も好ましくは（約）２０分、又は酸（ａｃｉｄ）がキャリア中で（溶液に）溶解する及び／又は混合物が所望のｐＨで平衡状態に達するまで）混合される可能性がある。
一連の代表的な製造パッチ手順を表３に表す。
品質管理試験は、製造中の任意の好適な時点で実施されてよい。例えば、各バッチのバルク製造プロセスの完了時に、２つの試料（それぞれ約４オンス）をバルク混合タンクから、次の位置、すなわち、タンクの中心近くのバッチ上面、タンクの側壁近くのバッチ上面、タンクの中心近くのバッチ内部、タンクの側壁近くのバッチ内部、タンクの中心近くのバッチの最下層、及びタンクの側壁近くのバッチの最下層からそれぞれ試料を入手するために清掃及び消毒済みの承認された適切な用具を用いて無菌状態で入手した。各試料は、滅菌カップに入れて標識を付けた。
各試料の固有の外観、比重及びｐＨを検査した。加えて、アッセイを行って、キレート剤、アルコール及び粘液溶解薬の濃度及び／又は有効性も検査した。加えて、汚染（微生物限界）も、総好気性生菌数、酵母及びカビ、黄色ブドウ球菌、及び緑膿菌を測定することによって検査した。表４は、様々な品質管理測定の試験仕様書を表す。
いくつかの実施態様において、方法は、組成物を好適な貯蔵容器又は試料採取装置の一部（例えば、容器又はバイアル（例えば、チューブ）の組成物貯蔵部位）に密封することを包含する可能性がある。試料はさらに、貯蔵容器及び試料採取装置内で制御された室温（ＣＲＴ）に置かれて加速（ＡＣＣ）安定性試験も行った。
いくつかの実施態様において、方法は、（前述のように）微生物の汚染を実質上含まないか又は有さない可能性がある組成物を製造するか又はもたらす可能性がある。
［使用方法］
いくつかの実施態様は、核酸、好ましくはウイルス核酸（例えば、ＲＮＡ又はＤＮＡ）の保存及び／又は安定化方法を包含する。方法は、核酸を含有する生体試料を提供することと、本開示の組成物を生体試料と組み合わせることを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、生体試料は、痰又は唾液などのムチン含有体液又は組織である可能性がある。方法は、（例えば、ムチンに固有のジスルフィド結合を粘液溶解薬又は還元剤で還元することによって）ムチン含有体液又は組織の粘度を低下させることを包含する可能性がある。
いくつかの実施態様は、核酸、好ましくはウイルス核酸（例えば、ＲＮＡ又はＤＮＡ）の保存及び／又は安定化方法を包含する。方法は、核酸を含有する生体試料を提供することと、本開示の組成物を生体試料と組み合わせることを含む可能性がある。少なくとも１実施態様において、生体試料は、痰又は唾液などのムチン含有体液又は組織である可能性がある。方法は、（例えば、ムチンに固有のジスルフィド結合を粘液溶解薬又は還元剤で還元することによって）ムチン含有体液又は組織の粘度を低下させることを包含する可能性がある。
少なくとも１実施態様において、核酸は、ＤＮＡ又はＲＮＡである。いくつかの実施態様において、組成物は、核酸、ＤＮＡ又はＲＮＡを（例えば、分解に対して）安定化する可能性がある。いくつかの実施態様において、組成物は、核酸、ＤＮＡ又はＲＮＡを第１の期間安定化する可能性がある。いくつかの実施態様において、第１の期間は、約１４日以上、約３０日以上、約６０日以上、約９０日以上、約１２０日以上、約２４０日以上、約３００日以上又は約３６５日以上である可能性がある。いくつかの実施態様において、組成物は、核酸、ＤＮＡ又はＲＮＡを第１の期間、室温で、－２０℃～５０℃の間で、又は他の好適な温度又は温度範囲で安定化する可能性がある。いくつかの実施態様において、組成物は、第２の期間安定である可能性がある。いくつかの実施態様において、第２の期間は、約１２か月以上、約１８か月以上、約２４か月以上、約３０か月以上又は約３６か月以上である可能性がある。いくつかの実施態様において、組成物は、第２の期間、室温で、－２０℃～５０℃の間で、又は他の好適な温度又は温度範囲で安定である可能性がある。
少なくとも１実施態様は、痰から核酸を回収する方法であって、方法が、ｉ）対象から痰又は唾液を入手すること、ｉｉ）痰又は唾液を本開示の組成物と接触させて試料混合物を形成すること、ｉｉｉ）場合により、混合物をプロテアーゼと接触させること、及びｉｖ）核酸を混合物から回収することを含む、前記方法を包含する。
いくつかの実施態様において、組成物は、好適な量で生体試料に添加された場合に、ＲＮＡ逆転写、ＤＮＡ増幅（ＰＣＲによるもの）、（次世代）シーケンシングなどのその後の核酸分析を、ほとんど阻害しないか、又は、妨げない。
［試料採取］
本開示のいくつかの実施態様は、生体試料を（例えば、対象、例としてはヒト被験者から）入手、提供及び／又は採取することを包含する。いくつかの実施態様において、生体試料は、（ヒトの）唾液であるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、生体試料は、喀痰された（ヒトの）唾液であるか又はそれを含む可能性がある。（ヒト）試料は、（（微生物）汚染を防止するために）無菌状態で採取される可能性がある。１以上の実施態様において、試料は、試料採取装置内又はその試料容器内に採取される可能性がある。いくつかの実施態様において、試料採取装置又は容器は、キットの一部である可能性があり、及び／又は本開示の組成物を包含する可能性がある。実施態様は、試料を本開示の組成物と接触させることを包含する可能性がある。
本開示のいくつかの実施態様は、生体試料を（例えば、対象、例としてはヒト被験者から）入手、提供及び／又は採取することを包含する。いくつかの実施態様において、生体試料は、（ヒトの）唾液であるか又はそれを含む可能性がある。いくつかの実施態様において、生体試料は、喀痰された（ヒトの）唾液であるか又はそれを含む可能性がある。（ヒト）試料は、（（微生物）汚染を防止するために）無菌状態で採取される可能性がある。１以上の実施態様において、試料は、試料採取装置内又はその試料容器内に採取される可能性がある。いくつかの実施態様において、試料採取装置又は容器は、キットの一部である可能性があり、及び／又は本開示の組成物を包含する可能性がある。実施態様は、試料を本開示の組成物と接触させることを包含する可能性がある。
［核酸の抽出及び分析：］
本開示のいくつかの実施態様は、核酸を生体試料から抽出することを包含する。以降には、本開示の組成物と共に使用するのに適切であり得る様々な様式の抽出又は抽出手順を非包括的に列挙又は説明している。
本開示のいくつかの実施態様は、核酸を生体試料から抽出することを包含する。以降には、本開示の組成物と共に使用するのに適切であり得る様々な様式の抽出又は抽出手順を非包括的に列挙又は説明している。
［抽出法］
有機的－フェノール・クロロホルム抽出は、今もなお研究所と臨床検査室の両方で用いられる機構であって、組織の起源に触れる場合は試料の種類に左右される。手動のフェノール／クロロホルム抽出は、その後、有機溶媒汚染の除去促進を目的としたクロロホルムの逆抽出を行うことで、高分子量のゲノムＤＮＡ又はＲＮＡが抽出されることがある。
有機的－フェノール・クロロホルム抽出は、今もなお研究所と臨床検査室の両方で用いられる機構であって、組織の起源に触れる場合は試料の種類に左右される。手動のフェノール／クロロホルム抽出は、その後、有機溶媒汚染の除去促進を目的としたクロロホルムの逆抽出を行うことで、高分子量のゲノムＤＮＡ又はＲＮＡが抽出されることがある。
塩析－自作の塩析法と市販の塩析法はどちらも高分子量の核酸抽出に広く使用されている。これら手法は、エタノールの添加を受けて核酸を外へ逃がすために高濃度の塩を唾液試料に添加する必要がある。一連の洗浄を行うことで、分析前に試料から過剰の塩が取り除かれる。
固相－様々な技術提供者らは、核酸を核酸精製用の固体担体に付着させることに関してスピンカラム法と真空マニホールド法の両方を用意している。核酸を担体に結合した後、一連の洗浄を実行する。最終的に核酸は、固体担体から分析用に少容量で溶出される。スピンカラム法が、研究所と臨床検査室の両方でよく使用される。
ビーズによる－ビーズ又は（パラ）磁性ビーズは、高分子量核酸を結合するために、様々な結合部分を含んで又は帯電によって調製される。ビーズは磁界で捕捉されるので、ビーズに結合していないものは、精製プロセスの一部として洗い流される可能性がある。洗浄完了後、核酸は核酸を溶解する溶液と共にビーズから溶出されるが、ビーズは、そのまま残っており、その後、磁界を再適用することによって除去される。研究室及び臨床環境下でのこの手法には、少容量と大容量の両方の自動化ソリューションがある。
［代表的な抽出］
試験には、本開示の組成物を含む唾液採取キットから予め抽出された１０の核酸試料と、既存の唾液採取キットから得た最大６の試料を使用した。さらに２３の試料を本発明の唾液採取キットを用いて新たに採取した。２３の試料をそれぞれ７００μｌアリコートで２回ずつ抽出した。標準的な品質管理（ＱＣ）を実行して、核酸の質を評価した。
試験には、本開示の組成物を含む唾液採取キットから予め抽出された１０の核酸試料と、既存の唾液採取キットから得た最大６の試料を使用した。さらに２３の試料を本発明の唾液採取キットを用いて新たに採取した。２３の試料をそれぞれ７００μｌアリコートで２回ずつ抽出した。標準的な品質管理（ＱＣ）を実行して、核酸の質を評価した。
前記２３中２３の試料は１試料につき２回抽出した。全試料の紫外線分光光度法（Ｎａｎｏｄｒｏｐ）による平均総収量は２０．４μｇ（２．８～１１１．４）であった。２３中２０の抽出物は所望の値である１．７を上回る２６０／２８０の割合であったが、１．７未満の３試料はダウンストリーム分析で上手く機能する可能性がある。図１Ａに示す通り、全試料が高分子量核酸を有していた。
唾液試料溶液７００μｌは、ＭＳＭＩ（Ｃｈｅｍａｇｅｎ）抽出システムにおいてＰｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ製試薬を用いて抽出した。全試料の濃度を紫外線分光光度法（Ｎａｎｏｄｒｏｐ）で測定した。純度の推定は、紫外線分光光度法を用いてＡ２６０／Ａ２８０の吸光度比を測定することによって求めた。加えて、試料をアガロースゲル電気泳動で分析することで試料の完全性を可視化した。分子量サイジングラダー（Ｌ）及び５０ｋｂ超の対照試料（Ｃ）が、各ゲルに含まれている。Ｂｉｏｎｅｘｕｓ製汎用ＨＩ－ＬＯ核酸マーカーを定性分析用ゲル（クロマトグラフィー）で使用した（図３Ｂ参照）。
［分析手法］
いくつかの実施態様は、抽出された核酸の分析を包含する。それぞれの方法は、抽出された核酸の分析に利用可能である。以降には、本開示の組成物と共に使用するのに適切であり得る様々な様式の抽出された核酸の分析方法を非包括的に列挙又は説明している。
いくつかの実施態様は、抽出された核酸の分析を包含する。それぞれの方法は、抽出された核酸の分析に利用可能である。以降には、本開示の組成物と共に使用するのに適切であり得る様々な様式の抽出された核酸の分析方法を非包括的に列挙又は説明している。
［逆転写］
当該技術分野で知られているような逆転写を実行することで、例えば、抽出されたウイルスＲＮＡに基づいてＤＮＡを産生する可能性もある。逆転写された「ウイルス」ＤＮＡは、任意の好適なＤＮＡ分析法で（ｔｉｎ）使用される可能性がある。
当該技術分野で知られているような逆転写を実行することで、例えば、抽出されたウイルスＲＮＡに基づいてＤＮＡを産生する可能性もある。逆転写された「ウイルス」ＤＮＡは、任意の好適なＤＮＡ分析法で（ｔｉｎ）使用される可能性がある。
［ＰＣＲ］
ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ分析析は、ＤＮＡテンプレートのフィデリティ及び清浄度の評価を目的とした迅速でコスト効率の良い手段である。一連のＰＣＲ反応（様々なサイズのアンプリコンに関する）がＤＮＡテンプレートから生じて、的確なサイズの増幅産物が電気泳動法によって分離。される。ＰＣＲアンプリコンのサイズ範囲は、ＤＮＡ抽出産物のフィデリティ情報を提供する。
ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ分析析は、ＤＮＡテンプレートのフィデリティ及び清浄度の評価を目的とした迅速でコスト効率の良い手段である。一連のＰＣＲ反応（様々なサイズのアンプリコンに関する）がＤＮＡテンプレートから生じて、的確なサイズの増幅産物が電気泳動法によって分離。される。ＰＣＲアンプリコンのサイズ範囲は、ＤＮＡ抽出産物のフィデリティ情報を提供する。
［ｑＰＣＲ］
定量ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）は、ＰＣＲアンプリコンの定量を目的としてダブル蛍光標識プローブを使用する。Ｔａｑｍａｎ法を用いた対立遺伝子の識別は、あらゆる抽出手段において採取及び抽出されたすべてのＤＮＡに関して特異的な遺伝子型を測定するのに使用。される。対象それぞれの遺伝子型は、分析される全ての変数で一致することが測定される。すべての定量測定は３回ずつ行われる。
定量ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）は、ＰＣＲアンプリコンの定量を目的としてダブル蛍光標識プローブを使用する。Ｔａｑｍａｎ法を用いた対立遺伝子の識別は、あらゆる抽出手段において採取及び抽出されたすべてのＤＮＡに関して特異的な遺伝子型を測定するのに使用。される。対象それぞれの遺伝子型は、分析される全ての変数で一致することが測定される。すべての定量測定は３回ずつ行われる。
［ＲＴ－ＰＣＲ］
逆転写ポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ－ＰＣＲ）は、ＲＮＡ抽出（例えば、（ビーズによる）核酸抽出を使用）によるウイルス検出、そして好ましくはＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス転写産物などの核酸の検出のために、その後、定量ＰＣＲ（ダブル標識プローブ法を使用）が行われる可能性がある。
逆転写ポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ－ＰＣＲ）は、ＲＮＡ抽出（例えば、（ビーズによる）核酸抽出を使用）によるウイルス検出、そして好ましくはＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス転写産物などの核酸の検出のために、その後、定量ＰＣＲ（ダブル標識プローブ法を使用）が行われる可能性がある。
［ｄＰＣＲ］
デジタルＰＣＲ（ｄＰＣＲ）は、新たな技術であって、限定的な量及び／又は限られた品質を有する試料の遺伝子型の高感度検出を目的として用いられる。同様のＴａｑｍａｎ法は、抽出されたあらゆるＤＮＡ試料の絶対感度を求めるために使用される。ｄＰＣＲの感度をもってすれば、分析される変異体それぞれの限界感度を求めることもできる。
デジタルＰＣＲ（ｄＰＣＲ）は、新たな技術であって、限定的な量及び／又は限られた品質を有する試料の遺伝子型の高感度検出を目的として用いられる。同様のＴａｑｍａｎ法は、抽出されたあらゆるＤＮＡ試料の絶対感度を求めるために使用される。ｄＰＣＲの感度をもってすれば、分析される変異体それぞれの限界感度を求めることもできる。
［マイクロアレイ］
何十万回又は何百万回のＳＮＰの判定は、それがたった一つのＤＮＡ試料に関する発見と臨床的分類の両方に至ると同時に、多大な影響も与える。感度及び特異性の要件は、ＱＰＣＲに基づく分析とは全く異なり、またＳＮＰ検出手法も異なる。というのもこの分析手法は、ＤＮＡの変異を確認するためのハイブリッド化による機構を用いるためである。様々なＤＮＡ抽出法で処理された供与体にわたるコールレート及びＳＮＰの一致は、非常に重要な分析のエンドポイント。である。
何十万回又は何百万回のＳＮＰの判定は、それがたった一つのＤＮＡ試料に関する発見と臨床的分類の両方に至ると同時に、多大な影響も与える。感度及び特異性の要件は、ＱＰＣＲに基づく分析とは全く異なり、またＳＮＰ検出手法も異なる。というのもこの分析手法は、ＤＮＡの変異を確認するためのハイブリッド化による機構を用いるためである。様々なＤＮＡ抽出法で処理された供与体にわたるコールレート及びＳＮＰの一致は、非常に重要な分析のエンドポイント。である。
［サンガーシーケンシング］
変異体分析の代表的なものを、本研究では全ての試料に用いるつもりである。分析の目標領域は、ＱＰＣＲ、ｄＰＣＲ及びマイクロアレイの同一アプリコンに広がり、その結果、他のすべての分析法で遺伝子型を相互検証する。高品質のサンガーのベースコールを作る能力（そしてそれ故の変異）は、核酸の品質に大きく依存している。この手法は、臨床分析で定期的に使用される。
変異体分析の代表的なものを、本研究では全ての試料に用いるつもりである。分析の目標領域は、ＱＰＣＲ、ｄＰＣＲ及びマイクロアレイの同一アプリコンに広がり、その結果、他のすべての分析法で遺伝子型を相互検証する。高品質のサンガーのベースコールを作る能力（そしてそれ故の変異）は、核酸の品質に大きく依存している。この手法は、臨床分析で定期的に使用される。
［次世代シーケンシング］
本明細書で使用するとき、高スループットシーケンシングとしても知られる「次世代シーケンシング」（ＮＧＳ）は、サンガーによるものではない高スループットＤＮＡシーケンシング技術を指す。ＮＧＳによれば、何百万さらには何十億のＤＮＡ鎖を同時に配列決定することで、実質上さらに高いスループットが得られ、そしてゲノムのサンガーシーケンスにおいてよく用いられるフラグメント・クローニング法の必要を最小限に抑える可能性がある。ＮＧＳは、例えば、当該技術分野で知られているようなパイロシーケンシング、合成によるシーケンシング、核酸連結によるシーケンシング、イオン半導体シーケンシング、などを包含する多数の様々な最新のシーケンシング技術又はプラットフォームを説明するのに使用される包括的な語である。
本明細書で使用するとき、高スループットシーケンシングとしても知られる「次世代シーケンシング」（ＮＧＳ）は、サンガーによるものではない高スループットＤＮＡシーケンシング技術を指す。ＮＧＳによれば、何百万さらには何十億のＤＮＡ鎖を同時に配列決定することで、実質上さらに高いスループットが得られ、そしてゲノムのサンガーシーケンスにおいてよく用いられるフラグメント・クローニング法の必要を最小限に抑える可能性がある。ＮＧＳは、例えば、当該技術分野で知られているようなパイロシーケンシング、合成によるシーケンシング、核酸連結によるシーケンシング、イオン半導体シーケンシング、などを包含する多数の様々な最新のシーケンシング技術又はプラットフォームを説明するのに使用される包括的な語である。
当業者によって理解されているように、ＮＧＳは一般に、大量のＤＮＡ及びＲＮＡのシーケンシングをサンガーシーケンシングよりもはるかに迅速にかつ入手しやすい価格にする。ＮＧＳにおいて、おびただしい数の短いリードが一回の動作で配列決定される。これを行うために、初めに入力試料を短い部分に切断してもよい。この部分の長さは、使用される特定のシーケンシング装置次第である。具体的なＮＧＳ技術の代表例には、例えば、Ｉｌｌｕｍｉｎａ（登録商標）（Ｓｏｌｅｘａ）シーケンシング、Ｒｏｃｈｅ ４５４（商標）シーケンシング、Ｉｏｎ ｔｏｒｒｅｎｔ（商標）、プロトン／ＰＧＭシーケンシング、ＳＯＬｉＤシーケンシングなどが包含される。
Ｉｌｌｕｍｉｎａシーケンシングでは、１００～１５０ｂｐのリードを用いる。やや長いフラグメントは、包括的アダプターに連結し、そしてアダプターを用いてスライドとアニーリングする。ＰＣＲを実行してリードを増幅することで、同一リードの多数の複製を有するスポットを作成する。それらを、次いで、配列決定すべき単一鎖に分離する。スライドは、ヌクレオチドとＤＮＡポリメラーゼで溢れている。これらヌクレオチドが、塩基に対応する色で蛍光標識化される。それらはまたターミネーターも有しているので、一度に１塩基のみが付加される。スライドの画像を撮影する。各リード位置には、付加された塩基を示す蛍光信号が存在する。次いで、次のサイクルのためのスライドを準備する。ターミネーターを除去することで次の塩基を付加させることができ、また蛍光信号を取り除くことで、信号が次の画像を汚染しないようにする。この作業を繰り返すことで、一度に１ヌクレオチドを付加して、その間に撮像する。次いで、コンピュータを用いて各画像において位置ごとに塩基を検出し、そしてこれらを用いて配列を組み合立てる。全てのシークエンスリードは、リードの長さが実行されるサイクル数に左右されるため、同じ長さ。である。
Ｒｏｃｈｅ ４５４（商標）は一般に、Ｉｌｌｕｍｉｎａ（登録商標）よりも非常に長いリードを配列決定する可能性がある。それは、塩基を追加したときに光学信号を読み取って一度に複数のリードを配列決定するという点でＩｌｌｕｍｉｎａ（登録商標）と同じように実行される。Ｉｌｌｕｍｉｎａ（登録商標）と同様に、ＤＮＡ又はＲＮＡを短いリード、この場合は最大１ｋｂに断片化する。包括的アダプターを末端に付加して、１ビーズにつき１ＤＮＡフラグメントでビーズにアニーリングする。フラグメントを次いで、アダプター－特異的プライマーを用いたＰＣＲによって増幅する。次いで、各ビーズをスライドの１つのウェルに入れる。ウェルはそれぞれ１つのビーズを収容するため、同一配列の多数のＰＣＲコピーで覆われる。ウェルはまた、ＤＮＡポリメラーゼとシーケンシング緩衝液も含む。スライドは、４つのＮＴＰ種のうち１つで溢れている。このヌクレオチドが配列の順序で次になる場合、それをシークエンスリードに加える。その単一塩基が反復する場合は、さらに多く加えることがある。つまり、グアニン塩基で溢れて配列での次の順番がＧの場合は、１つのＧを加えるが、配列の次の部分がＧＧＧＧの場合は、４つのＧを加えることがある。ヌクレオチドの付加ごとに、光信号が放出される。これらの信号の位置を検出しそして使用することで、どのビーズにヌクレオチドを付加するかを決定する。このＮＴＰ混合物を洗い落とす。次のＮＴＰ混合物をさらに加えて作業を繰り返し、この４つのＮＴＰを繰り返す。この種のシーケンシングはシーケンスリードごとにグラフを生成することで、ヌクレオチドの洗浄ごとに信号密度を示す。配列は次いで、洗浄ごとの信号密度から計算に基づいて決定される可能性がある。（Ｒｏｃｈｅ）４５４（商標）で得られたシーケンスリードはすべて長さが様々である。というのも、サイクルごとに異なる数の塩基を付加するため。である。
Ｉｌｌｕｍｉｎａ（登録商標）及びＲｏｃｈｅ ４５４（商標）とは異なり、Ｉｏｎ ｔｏｒｒｅｎｔ（商標）及びイオンプロトンシーケンシングは、光学信号を使用しない。その代わりに、それらは、ＤＮＡポリマーへのｄＮＴＰの付加がＨ＋イオンを放出するという事実を利用している。他の種類のＮＧＳと同様に、入力ＤＮＡ又はＲＮＡを断片化するが、今回は約２００ｂｐにする。アダプターを加えて、ビーズ上に１分子を配置する。分子は、エマルジョンＰＣＲによってビーズ上で増幅される。ビーズそれぞれをスライドの１つのウェルに入れる。Ｒｏｃｈｅ ４５４（商標）と同様に、スライドは、緩衝液及びポリメラーゼと共にｄＮＴＰの単一種で、一度に１つのＮＴＰで溢れさせる。ウェルごとのｐＨを検出する。というのも、放出されるＨ＋イオンがそれぞれｐＨを低下させるためである。ｐＨの変化によって、塩基が、そしていくつの塩基が、シーケンスリードに付加されたかを測定することができる。ｄＮＴＰを洗い落して一連の作業を繰り返すことで、様々なｄＮＴＰ種でサイクルを繰り返す。もしあればｐＨ変化を利用することで、いくつの塩基が（もしあれば）サイクルごとに付加されるかを測定する。
加えて、又はあるいは、シーケンシングは、蛍光によるシーケンシング技術及び／又は任意の電流によるシーケンシング技術によってさらに広く実行される場合がある。蛍光によるシーケンシング技術の代表例としては、蛍光色素分子と共役したヌクレオチドを組み込む任意の技術、例えば、Ｉｌｌｕｍｉｎａ（登録商標）をベースとするシーケンシング法及びシステムを用いたシーケンシングなどがあげられる。電流によるシーケンシング技術の代表例としては、帯電膜に差し込まれたポアを通過するとき又は他の方法でセンサー又は帯電膜の電流を明確に妨げるときにポリヌクレオチドの電流を測定する（ストランドシーケンシング法を包含する）任意のシーケンシング技術があげられる。電流によるシーケンシング技術の非限定例としては、Ｏｘｆｏｒｄ ＮａｎｏＰｏｒｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ（登録商標）製のナノポア（Ｎａｎｏｐｏｒｅ）ＤＮＡシーケンシングシステム及び方法があげられる。
ストランドシーケンシングシステム、例としては、Ｏｘｆｏｒｄ ＮａｎｏＰｏｒｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ（登録商標）から提供されるものなどは、核酸のコピー数変異、特に、新生細胞及び／又はがん性細胞由来のＤＮＡ（又は他の核酸）を潜在的に含有する試料のコピー数変異を測定するときに役立つことがある。例えば、ストランドシーケンシング技術では、ゲノムの１部位が連続的に配列決定されるが、これは、試料の核酸がシーケンシングで小さなフラグメントに切り分けられる他のシーケンシング法で与えられるシーケンシングデータを分析する場合、生じ得るコピー数変異を潜在的分析する代わりに、コピー数変異を直接分析できるようにする。このことは、配列度が低い実施態様において特に有利な場合がある。すなわち、いくつかの実施態様において、低い配列包括度は、不完全なゲノムデータの組を回復する場合がある。配列決定された領域ごとに潜在的コピー数に加えて、ゲノム領域の有無をシーケンスデータから推察できる場合がある。また一方、ストランドシーケンシング法では、得られた長いシークエンスリードがコピー数変異を、特に重複又は削除された領域において、さらに明確に評価できる場合がある。低カバレッジのシーケンシングを実行したせいで完全な配列が入手できない場合、統計的確率（無作為抽出）に基づいてどのようなゲノム部位が表現されなかったかに対比してどのようなゲノム部位が削除されたか（コピー数変異の形態）を決定することが難しい場合もある。
具体例としては、カバレッジ０．５Ｘのデータを生成するシーケンシングの実行は、理論上、試料の半分を表さないまま放置する。核酸をシーケンシングのために小さなフラグメントに「切り分ける」シーケンシング法を用いると、最終成果は、基準ゲノム全体の約半分を表す配列ライブラーである場合があり、ここでは、アライメントされた基準ゲノムには、少数のさらに細かな核酸マッチが散乱している。他方で、ストランドシーケンシング法を低カバレッジ（例えば、０．５Ｘ）で使用すると、結果は、基準ゲノム全体の約半分を再び表すシークエンス・ライブラリである場合がある。しかしながら、基準ゲノムにアライメントすると、マッチング部位はさらに長くなり、どのような配列が削除され、重複し、挿入されているかなどといったさらに明確な情報が得られる場合もある。これがまた問題となる場合もある。ゲノムの隣接部位は長いほど、ストランドシーケンシング法によって表される可能性があるが、ゲノムの長い隣接部位もまた解明されないままである。したがって、ストランドシーケンシング法はゲノムの部位の高解像度表示を可能にする場合もあるが、シーケンシングリードが細かいほどゲノム全体のより広範囲の像が得られる可能性がある。このような方法（Ｉｎ ｉｎ ｔｈｉｓ）や他の方法によっても、ストランドシーケンシングは、コピー数変異を分析するための着実なモデルを提供する場合がある。
前述は、既知のシーケンシング技術の例証と本明細書に開示される本発明の方法及びシステムへの応用の例証であるが、これは、未だ未発見のケーシング法かそうでなければ未公表のシーケンシング法を本発明の範囲内で適用することから除外するものではないと理解されるべきである。すなわち、多くの実施態様において、シーケンシング法自体は本発明の工程に必要不可欠なものではなく（例えば、特定のシーケンシング技術を利用して方法及び／又はシステムが改善される場合を除く）、むしろ、シーケンシング法で得たシーケンシングデータを処理するもの及び／又はこのデータの活用方法が概して本発明の工程を構成している。したがって、今後のシーケンシング技術（及び本明細書に明白に列挙されなかったシーケンシング技術）は、開示される方法又はシステムにおいてツールとして使用されるのであれば、本出願の範疇に包含されると解されるべきである。
さらに、前述のシーケンシング技術はどれもかなりの数又は容量で、シーケンシング反応／実行ごとに得られるシーケンシングリードの総数に影響を及ぼす任意の数のフローセル又は他の同様の入力データと共に使用される場合がある。
次世代シーケンシングは、最終的に、ターゲットＤＮＡ及びＲＮＡの両方の分析において標準となるかもしれない。ｑＰＣＲ、ｄＰＣＲ及びアレイによるターゲットで網羅されるゲノム領域を包含する標的パネルは、標準ライブラリ調整過程中にすべてのＤＮＡ試料に向けて作成される。試料は、変異分析用の次世代（ＮｅｘｔＧｅｎ）プラットフォームにおいてバーコードを付けられて多重化される。データは、他のすべてのプラットフォーム全域で遺伝子型判定の直接比較のために逆多重化されて分析される。
上記及び他のＤＮＡによるダウンストリーム法のうちいくつかを行って、本開示の核酸保存組成物を含む２ｍＬ唾液採取キットを用いて採取した試料から抽出されたＤＮＡの品質及び有用性を評価した。さらに、２つの既存の製品から抽出された少数のＤＮＡ試料を、いくつかのダウンストリーム法において比較のために使用した。以下は、実施したいくつかのダウンストリーム法についての非包括的な列挙又は説明であって、例として、ＯｐｅｎＡｒｒａｙ（登録商標）フォーマットを使用する一塩基遺伝子多型（ＳＮＰ）検出用のＴａｑＭａｎ（登録商標）法（ｎ＝試料当たり１２０ＳＮＰ）、ＴａｑＭａｎ法を用いたコピー数変異（ＣＮＶ）（ＣＹＰ２Ｄ６遺伝子）、全エクソーム次世代シーケンシング（ＷＥＳ）（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）、及び染色体マイクロアレイ解析（ＣＭＡ）（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ ＣｙｔｏＳｃａｎ ＨＤ）があげられる。これらの方法は、分子遺伝学研究所で使用される多種多様な共通の方法を包含するように選択した。ダウンストリーム解析に加えて、バクテリアＢＮＡ含有量を全ＤＮＡの百分率として、定量ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）アッセイを用いて測定した。理論に何ら束縛されるものではないが、唾液試料は、いくつかの方法では妨害物質であり得る高濃度のバクテリアＤＮＡを有することが知られている。
［ＴａｑＭａｎ（登録商標）Ｏｐｅｎ Ａｒｒａｙ（登録商標）ＳＮＰ遺伝子型判定：］
一塩基遺伝子多型に関する遺伝子型判定は、ＴａｑＭａｎ（登録商標）ＯｐｅｎＡｒｒａｙ（登録商標）遺伝子型判定アッセイを用いて遂行した。ＴａｑＭａｎ（登録商標）アッセイは、ＰＣＲ増幅とＳＮＰを標的とする蛍光染料検出器対とを用いた対立遺伝子識別アッセイである。ある蛍光染料を第１の対立遺伝子（例えば、「Ａ」ヌクレオチド）と完全適合する検出器に付着させ、そして別の蛍光染料を第２の対立遺伝子（例えば、「Ｃ」ヌクレオチド）と完全適合する検出器に付着させる。ＰＣＲ中に、ポリメラーゼが溶液中で蛍光プローブを放出することがあり、それを、Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、 Ｉｎｃ．においてエンドポイント解析を用いて検出する。具体的には、ＯｐｅｎＡｒｒａｙ（登録商標）技術は、低容量液相反応を目的としたナノリットル量の流体工学プラットフォームである。ＯｐｅｎＡｒｒａｙ（登録商標）技術は、３，０７２のスルーホールを有する顕微鏡スライドサイズのプレートを用いる。スルーホールはそれぞれ直径３００μｍ及び深さ３００μｍであり、親水性及び疎水性コーティングで処理されている。シングルアッセイ用のＴａｑＭａｎ（登録商標）化学物質をあらかじめ組み込んで各スルーホール内で乾燥させる。ＯｐｅｎＡｒｒａｙｓ（登録商標）は、Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓの設計・製造によって入手した。遺伝子型は、Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ製Ｔａｑｍａｎ遺伝子型ソフトウェアバージョン１．０．１を用いて測定した。
一塩基遺伝子多型に関する遺伝子型判定は、ＴａｑＭａｎ（登録商標）ＯｐｅｎＡｒｒａｙ（登録商標）遺伝子型判定アッセイを用いて遂行した。ＴａｑＭａｎ（登録商標）アッセイは、ＰＣＲ増幅とＳＮＰを標的とする蛍光染料検出器対とを用いた対立遺伝子識別アッセイである。ある蛍光染料を第１の対立遺伝子（例えば、「Ａ」ヌクレオチド）と完全適合する検出器に付着させ、そして別の蛍光染料を第２の対立遺伝子（例えば、「Ｃ」ヌクレオチド）と完全適合する検出器に付着させる。ＰＣＲ中に、ポリメラーゼが溶液中で蛍光プローブを放出することがあり、それを、Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、 Ｉｎｃ．においてエンドポイント解析を用いて検出する。具体的には、ＯｐｅｎＡｒｒａｙ（登録商標）技術は、低容量液相反応を目的としたナノリットル量の流体工学プラットフォームである。ＯｐｅｎＡｒｒａｙ（登録商標）技術は、３，０７２のスルーホールを有する顕微鏡スライドサイズのプレートを用いる。スルーホールはそれぞれ直径３００μｍ及び深さ３００μｍであり、親水性及び疎水性コーティングで処理されている。シングルアッセイ用のＴａｑＭａｎ（登録商標）化学物質をあらかじめ組み込んで各スルーホール内で乾燥させる。ＯｐｅｎＡｒｒａｙｓ（登録商標）は、Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓの設計・製造によって入手した。遺伝子型は、Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ製Ｔａｑｍａｎ遺伝子型ソフトウェアバージョン１．０．１を用いて測定した。
合計５２３４の遺伝子型を、４４の試料について試料当たり１１８～１２０ＳＮＰで測定した。４４の試料には、それぞれ本発明のキットと既存のキットの両方からの抽出物から得た各３試料についての反復配列が包含されていた。本発明のキットから得た試料の遺伝子型判定は非常に好結果であり、またこのタイプのアッセイの既知の（ｋｎｏｗ）業績期待値を上回っていた。理論に何ら束縛されるものではないが、Ｔａｑｍａｎ遺伝子型判定は、試料の９９％超でうまく遺伝子型判定が得られることが見込める。この実験では、９９．７５％の試料から遺伝子型が得られた（５２２１／５２３４）。本発明の溶液ＤＮＡ抽出物と既存の抽出物の遺伝子型判定評価はそれぞれ９９．７４％と９９．８７％と、ほとんど差がなかった。本発明の溶液ＤＮＡ抽出物と既存の抽出物の両者で複製された６の試料では、遺伝子型が全て一致した。
［Ｔａｑｍａｎ（登録商標）コピー数変異検出：］
ＴａｑＭａｎ（登録商標）コピー数アッセイ（ＣＹＰ２Ｄ６－Ｈｓ０００１０００１＿ｃｎ）を用いて、薬理遺伝学で評価されたよく特徴付けられたＣＮＶであるＣＹＰ２Ｄ６遺伝子のコピー数を検出した。ＴａｑＭａｎ（登録商標）コピー数アッセイは、ＴａｑＭａｎ（登録商標）ＭＧＢプローブ化学物質を用いてゲノムのターゲットＤＮＡのコピー数を評価する。このアッセイは、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ（登録商標）７９００ ＨＴリアルタイムＰＣＲ機器とｃｏｐｙ ｃａｌｌｅｒソフトウェアを使用してコピー数を測定した。各試料を３回増幅しそして標準曲線と対照してプロットすることで、コピー数を測定した。
ＴａｑＭａｎ（登録商標）コピー数アッセイ（ＣＹＰ２Ｄ６－Ｈｓ０００１０００１＿ｃｎ）を用いて、薬理遺伝学で評価されたよく特徴付けられたＣＮＶであるＣＹＰ２Ｄ６遺伝子のコピー数を検出した。ＴａｑＭａｎ（登録商標）コピー数アッセイは、ＴａｑＭａｎ（登録商標）ＭＧＢプローブ化学物質を用いてゲノムのターゲットＤＮＡのコピー数を評価する。このアッセイは、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ（登録商標）７９００ ＨＴリアルタイムＰＣＲ機器とｃｏｐｙ ｃａｌｌｅｒソフトウェアを使用してコピー数を測定した。各試料を３回増幅しそして標準曲線と対照してプロットすることで、コピー数を測定した。
３３の抽出された核酸試料と５の既存の抽出試料は、ＣＹＰ２Ｄ６遺伝子中のよく特徴付けられたコピー数変異について分析した。３３の本発明の溶液抽出された核酸試料のうち３３試料からはＣＮＶ結果が得られた。５の競合他社の抽出試料すべてからもＣＮＶ結果が得られた。ＣＮＶ結果が得られなかった３試料はいずれも同一人物（「Ｂ」）から同日に採取した３つの別個の試料からのものであった。この同一人物から別の日に採取されて既存の唾液キットから抽出されたある試料は、正常なＣＮＶ結果をもたらし、潜在的な妨害変異は認められなかった。
［全エクソームシーケンシング（ＷＥＳ）：］
エクソームライブラリは、ＡｍｐｌｉＳｅｑ（商標）エクソームキットを用いて準備した。ライブラリキットを、１２のプライマープール全域に約２９４，０００のプライマー対を収容するＡｍｐｌｉｓｅｑ Ｅｘｏｍｅ Ｐａｎｅｌ Ｐｒｉｍｅｒプールと結合させる。その結果生じる標的にされたアプリコンを次いで試薬で処理してプライマーを一部消化し、そしてアプリコンをリン酸化する（ｐｈｏｓｐｈｏｒｌｙａｔｅ）。アプリコンを次いで、バーコードの付いたイオンアダプター（Ｉｏｎ Ａｄａｐｔｅｒｓ）と連結して精製する。エクソームライブラリの準備が完了した後、精製済のエクソームが充実したライブラリをリアルタイムＰＣＲで定量化する。定量化ライブラリを次いで１００ｐＭまで希釈し、そしてシーケンシング用の鋳型になるＩｏｎ ＰＩ（商標）製Ｉｏｎ Ｓｐｈｅｒｅ（商標）粒子（ＩＳＰ）を調製するのに使用する。試料を次いで、イオンプロトンシステム（Ｉｏｎ Ｐｒｏｔｏｎ Ｓｙｓｔｅｍ）においてＩｏｎ ＰＩ（商標）チップｖ３を用いて配列決定した。Ｉｏｎ Ｈｉ－Ｑシーケンシング２００ Ｖ２法を用いて最大２００の平均塩基対挿入ライブラリを配列決定した。
エクソームライブラリは、ＡｍｐｌｉＳｅｑ（商標）エクソームキットを用いて準備した。ライブラリキットを、１２のプライマープール全域に約２９４，０００のプライマー対を収容するＡｍｐｌｉｓｅｑ Ｅｘｏｍｅ Ｐａｎｅｌ Ｐｒｉｍｅｒプールと結合させる。その結果生じる標的にされたアプリコンを次いで試薬で処理してプライマーを一部消化し、そしてアプリコンをリン酸化する（ｐｈｏｓｐｈｏｒｌｙａｔｅ）。アプリコンを次いで、バーコードの付いたイオンアダプター（Ｉｏｎ Ａｄａｐｔｅｒｓ）と連結して精製する。エクソームライブラリの準備が完了した後、精製済のエクソームが充実したライブラリをリアルタイムＰＣＲで定量化する。定量化ライブラリを次いで１００ｐＭまで希釈し、そしてシーケンシング用の鋳型になるＩｏｎ ＰＩ（商標）製Ｉｏｎ Ｓｐｈｅｒｅ（商標）粒子（ＩＳＰ）を調製するのに使用する。試料を次いで、イオンプロトンシステム（Ｉｏｎ Ｐｒｏｔｏｎ Ｓｙｓｔｅｍ）においてＩｏｎ ＰＩ（商標）チップｖ３を用いて配列決定した。Ｉｏｎ Ｈｉ－Ｑシーケンシング２００ Ｖ２法を用いて最大２００の平均塩基対挿入ライブラリを配列決定した。
４試料、つまり、本発明の唾液キットから抽出された３試料と既存の唾液キットから抽出した１試料を、全エクソームライブラリプレップ（ＡｍｐｌｉＳｅｑ Ｅｘｏｍｅ、Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）で評価した後、イオンプロトン機器（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）で次世代シーケンシングを行った。典型的に期待される結果は、３０００万リード超、カバレッジの平均深度８０Ｘ超、及び深度２０Ｘ以上でカバーされる塩基８０％超である。４試料のうち３試料はこれらの基準を満たした。本発明の唾液キットからの１抽出試料は、３０００万リード未満でかつカバレッジの平均深度が８０Ｘ未満を有する、３つのＱＣ測定基準のうち２つを満たさなかった。注目すべきことは、標準以下の試料は同じ試料のうちの一つであり、さらにはＣＮＶ解析もうまくいかなかったことである。ＤＮＡのＱＣプロファイル検査からは、この試料について他と異なる点がいくつか指摘された。ＱＣ測定基準は全て満たしていた。標準以下だが、この試料のエクソームシーケンシング評価結果は適正であった。
［染色体マイクロアレイ（ＣＭＡ）：］
ＣＭＡ解析は、ＡｆｆｙｍｅｔｒｉｘのＣｙｔｏＳｃａｎ ＨＤアッセイを用いてメーカーのプロトコルに従って行った。試料はＧｅｎｏｍｅ Ａｎａｌｙｚｅｒ ３０００でスキャンした。染色体マイクロアレイを用いることで、染色体異常を核型分析よりも高解像度で検出した。アッセイは、ＤＮＡの調製とその後のＣｙｔｏＳｃａｎ ＨＤチップとのハイブリッド化から成り、チップにはゲノム全域におよそ２７０万のＣＮＶが含まれている。試料は、ＡｆｆｙｍｅｔｒｉｘのＣｈＡＳソフトウェアを用いて評価した。
ＣＭＡ解析は、ＡｆｆｙｍｅｔｒｉｘのＣｙｔｏＳｃａｎ ＨＤアッセイを用いてメーカーのプロトコルに従って行った。試料はＧｅｎｏｍｅ Ａｎａｌｙｚｅｒ ３０００でスキャンした。染色体マイクロアレイを用いることで、染色体異常を核型分析よりも高解像度で検出した。アッセイは、ＤＮＡの調製とその後のＣｙｔｏＳｃａｎ ＨＤチップとのハイブリッド化から成り、チップにはゲノム全域におよそ２７０万のＣＮＶが含まれている。試料は、ＡｆｆｙｍｅｔｒｉｘのＣｈＡＳソフトウェアを用いて評価した。
１試料を、Ｓｐｅｃｔｒｕｍ製唾液キットで抽出されたＤＮＡから選出した。それは染色体マイクロアレイ（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ、ＣｙｔｏＳｃａｎ ＨＤ）において好結果と評価された。試料は、ＭＡＰＤ値が０．２５以下（０．１８）、ＳＮＰＱＣ値が１５以上（１６．４７）、波形値が０．１２以下（０．０９）、そしてＱＣコールレートが９５％以上（９６．８％）であった。
［ｑＰＣＲアッセイを用いたバクテリアＤＮＡ含有量］
試料内のバクテリアＤＮＡ含有量は、文献に記載の改良プロトコルを用いて測定した。手短に言えば、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）の段階希釈を利用して標準曲線を作成することで、得られたリアルタイムＰＣＲデータと比較した。ＰＣＲプライマーは、幅広い種類の微生物にわたって保存されていることで知られておりかつ真核生物のＤＮＡでは発見されていない１６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子領域から選択した。ＤＮＡは、１６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子の存在について、コピーコーラーソフトウェアを利用したＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ ７９００ＨＴ機器においてリアルタイムｑＰＣＲを用いて検査した。
試料内のバクテリアＤＮＡ含有量は、文献に記載の改良プロトコルを用いて測定した。手短に言えば、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）の段階希釈を利用して標準曲線を作成することで、得られたリアルタイムＰＣＲデータと比較した。ＰＣＲプライマーは、幅広い種類の微生物にわたって保存されていることで知られておりかつ真核生物のＤＮＡでは発見されていない１６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子領域から選択した。ＤＮＡは、１６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子の存在について、コピーコーラーソフトウェアを利用したＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ ７９００ＨＴ機器においてリアルタイムｑＰＣＲを用いて検査した。
バクテリアＤＮＡ含有量は、唾液採取試料からのＤＮＡ全量の割合（％）として、ダウンストリーム解析の成功率を場合により抑制又は軽減すると考えられていた。本発明の唾液キットから抽出された３３のＤＮＡ試料と既存の唾液キットから抽出された５のＤＮＡ試料のバクテリアＤＮＡの存在割合（％）を検査した。競合他社から得たこれまでのデータは、バクテリアＤＮＡの割合がおよそ１３％であると推定された。本発明の唾液キット抽出法に関する平均バクテリア含有量は、５．５％（１．１～１４．３％）であった。競合他社の唾液キット抽出法に関する平均バクテリア含有量は、２６％（２．１～９６．２％）～１４．３１％）であった。
一連の上記及び／又は他の実験的検査を行うことで、有機的抽出法、固相抽出法、ビーズによる抽出法及び塩析抽出法を包含する様々な入手可能な化学的手法のいずれか一つだけでなく、ＰＣＲ、ｑＰＣＲ、ｄＰＣＲ、マイクロアレイ、サンガーシーケンシング及びいわゆる次世代（すなわち、ＮｅｘｔＧｅｎ）シーケンシング（ＮＧＳ）を包含する現在使用されている様々な分子解析のいずれか一つも用いた核酸抽出用の採取装置において、以下の表５に概略を説明する通り、本開示の製剤の使用認可を得るために５１０Ｋ検討事項に関するＦＤＡ提出物を立証した。
［結果概要］
核酸は、すべての複製において試料すべてから上手く抽出された。概して、抽出された核酸のサイズ（及び収量）は高かった。分解の証拠は最小限であった。試料からの複製は、収量という点では極めて同等であった。さらに、同一個体であると思われるもの全体での収量は、同様の挙動を示した。ＳＮＰに関する遺伝子型判定は、高品質の成果をもたらし、また期待された収量を満たした。ある個体からの試料であって、別個に採取された４試料は、ＣＮＶ（Ｎ＝３）又はＮＧＳ（Ｎ＝１）に関してＱＣ測定基準を満たさなかった。全ＤＮＡの割合（％）としてのバクテリアＤＮＡ含有量は、本発明の唾液キットによる核酸抽出法では比較的低かった。
核酸は、すべての複製において試料すべてから上手く抽出された。概して、抽出された核酸のサイズ（及び収量）は高かった。分解の証拠は最小限であった。試料からの複製は、収量という点では極めて同等であった。さらに、同一個体であると思われるもの全体での収量は、同様の挙動を示した。ＳＮＰに関する遺伝子型判定は、高品質の成果をもたらし、また期待された収量を満たした。ある個体からの試料であって、別個に採取された４試料は、ＣＮＶ（Ｎ＝３）又はＮＧＳ（Ｎ＝１）に関してＱＣ測定基準を満たさなかった。全ＤＮＡの割合（％）としてのバクテリアＤＮＡ含有量は、本発明の唾液キットによる核酸抽出法では比較的低かった。
表６及び７に提示する更なる例では、１００の試料を用いて、本開示の核酸保存組成物（「本発明」）と２つの既存の製品（「既存１」及び「既存２」）の性能を検査した。表６に示すように、本開示の「本発明」の核酸保存組成物は、どちらの「既存」製品よりも高い核酸平均濃度及びより高い全核酸量（収量）をもたらした。
さらに表７に示すように、本開示の「本発明」の核酸保存組成物で処理した試料は、非ヒト核酸の平均量がどちらの「既存」製品よりもかなり低かった。
したがって、本開示の組成物は、驚くべきことに、既存の核酸保存製品よりもかなり優れている。とりわけ、驚くべきこと及び予想外のことに、本開示の組成物は非常にうまく作用した（例えば、大量の核酸を得る及び／又は低濃度の微生物汚染を有する若しくは示す）。驚くべきこと及び予想外のことに、本開示の組成物は、いくつかの実施態様において少量のアルコールが提供されたにもかかわらず上手く作用した。例えば、いくつかの実施態様において、組成物中に包含されるアルコールの量は、典型的な、又は従来の、又は既存の核酸保存液よりも少ない（例えば、約２０％未満、約２５％未満、約３０％未満、約３５％未満、約４０％未満、約４５％未満、約５０％未満、約５５％未満、又は約６０％未満）可能性がある。加えて、アルコールの量が少ないほど、効率的であり及び／又は組成物を輸送若しくは運搬に対して修正し易くする（例えば、輸送要件及び基準により適合し易くすること、揮発性を低下させること、などにより）。
［採取後の安定性］
使用（すなわち、試料採取）後、装置を、様々な温度（室温、４℃、－２０℃又は－８０℃）で様々な期間（７２時間、６か月、１２か月又は２４か月）保管した。いくつかの装置は、加速劣化条件で保管した。１３人の被検者からそれぞれ唾液（４試料）を採取した。３つの異なるロットの採取装置を使用し（タイムポイントごとに１つのロット番号）、そして結果を以下の表に従って検査した。被験者１３の試料は、抽出の前に加速劣化条件にさらした（４０℃で５６日）。
使用（すなわち、試料採取）後、装置を、様々な温度（室温、４℃、－２０℃又は－８０℃）で様々な期間（７２時間、６か月、１２か月又は２４か月）保管した。いくつかの装置は、加速劣化条件で保管した。１３人の被検者からそれぞれ唾液（４試料）を採取した。３つの異なるロットの採取装置を使用し（タイムポイントごとに１つのロット番号）、そして結果を以下の表に従って検査した。被験者１３の試料は、抽出の前に加速劣化条件にさらした（４０℃で５６日）。
試料の収量－全ＤＮＡ収量は少なくとも１０ｎｇ（０．０１０μｇ）、ＤＮＡ濃度は２ｎｇ／μＬ以上。
試料の純度－ＤＮＡの純度（Ａ２６０／Ａ２８０）は１．２～２．３。
最低限度の一致－任意の再検査後に１００％。
遺伝子型の一致（複数人の被験者）－ １００％。
遺伝子型の一致（サンガーシーケンシング 対 ＱＰＣＲ）－ １００％。
使用した器具：唾液採取装置、唾液ＱｉａＳｙｍｐｏｎｙのＤＮＡ抽出キット、定量ＰＣＲ用の二重標識プローブ及びプライマー、サンガーシーケンシング用のＢｉｇ Ｄｙｅターミネーター反応混合物、ＱＰＣＲ解析用のＴａｑポリメラーゼ、キュベットレス分光測定用のＬｕａｎｔｉｃプレート、分子生物学適用を目的とした一般的なラボウェア。
使用した測定機器：核酸抽出－ＱｉａＳｙｍｐｈｏｎｙ （Ｑｉａｇｅｎ）、核酸定量／純度－Ｕｎｃｈａｉｎｅｄ Ｌｕｎａｔｉｃ （Ｕｎｃｈａｉｎｅｄ Ｌａｂｓ）＊キュベットレス分光法、対立遺伝子の識別－ＶｉｉＡ ７リアルタイムＰＣＲ器具（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）、サンガーシーケンシング－ＡＢＩ ３７３０ ＤＮＡシーケンサー（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）
ＡＲＭ ２ｂ ＡＱＣ検査の概要（表８）
ＡＲＭ ２ｂ遺伝子型の一致検査の概要（表９）
サンガーシーケンシングによる全血中の遺伝子型とＱＰＣＲによる血中の遺伝子型との間の一致は、すべての被験者において１００％であった。
検査は、唾液ＤＮＡ採取装置の性能を実証するものであり、またロット、被験者、温度及び時間についての装置の採取後安定性を測定した。装置は、要求される合否基準及び仕様を満たしていた。
［採取キット内の組成物によるＳａｒｓ－ＣｏＶ－２ウイルス不活性化／死滅の確認］
プロトコル：
プロトコル：
１日目：ＢＡ－ＰＢＳで１：１０に希釈したＳＡＲＳ－２ ＷＡ－１菌株を調製する。
溶解（Ｌｙｓｉｓ）緩衝液＋ＢＡ－ＰＢＳ（１：３）
３つの条件：
１） Ｓｐｅｃｔｒｕｍ Ｌｙｓｉｓ ３ｍＬ ＋ ＢＡ－ＰＢＳ ＋ ＳＡＲＳ－２ １００μｇ（１：１０） （溶解したウイルスが非伝染性であることを表す）
２） ＢＡ－ＰＢＳ ３ｍＬ（ｌｙｓｉｓ緩衝液なし）＋ＳＡＲＳ－２ １００μｌ（１：１０）
（濾過後にウイルスが未だ生存していることを表す）
（濾過後にウイルスが未だ生存していることを表す）
３） ＢＡ－ＰＢＳ ３ｍＬ＋ｌｙｓｉｓ緩衝液（対照細胞）
室温（ＲＴ）で１０分静置する。
予備洗浄したａｍｉｃｏｎ遠心式フィルターユニット５０Ｋカットオフに５００μｌずつ投入する。
１４０００ｒｐｍで５分回転させて、フロースルーを捨てる。
ＰＢＳ ５００μｌで３回洗浄する（１４０００（ｒｐｍ）で５分）。
遠心分離ユニットを反転させて、残留画分を収集する。
ＢＡ－ＰＢＳを用いて元の５００μｌ体積にする。
濾過後にＲＴ－ＰＣＲ試料５０μｌを採取して、再度元の５００μｌ体積にする。
１）ＳＡＲＳ－２／Ｓｐｅｃｔｒｕｍ ｌｙｓｉｓ／ａｍｉｃｏｎ（１０の０乗希釈、０日目）
２）ＳＡＲＳ－２／ｌｙｓｉｓなし／ａｍｉｃｏｎ（１０の０乗希釈、０日目）
段階希釈：１０の０乗、１０の－１乗、１０の－２乗、１０の－３乗、１０の－４乗、１０の－５乗
１）ＳＡＲＳ－２／Ｓｐｅｃｔｒｕｍ ｌｙｓｉｓ／ａｍｉｃｏｎ
２）ＳＡＲＳ－２／ｌｙｓｉｓなし／ａｍｉｃｏｎ
３）ＢＡ－ＰＢＳ／Ｓｐｅｃｔｒｕｍ ｌｙｓｉｓ／ａｍｉｃｏｎ
４）ＳＡＲＳ－２（ａｍｉｃｏｎなし）
５）ＳＡＲＳ－２／Ｓｐｅｃｔｒｕｍ ｌｙｓｉｓ（ａｍｉｃｏｎなし）
３日目Ｖｅｒｏ細胞、予め播種された９６ウェル平底プレートに対し：
培養液を除去する。
ＢＡ－ＰＢＳ １００μｌを追加する対照細胞のウェルを除く全ウェルに、ＢＡ－ＰＢＳ ５０μｌを追加する。
上記で得た希釈液５０μｌを２回追加する。
ＢＳＣ（室温）で２０分静置する。
ＭＥＭ Ｈａｎｋｓ培養液１５０μｌを追加する。
プレートをプレートシーラーで密封して、その上部に蓋を載せる。
３７℃の加湿型インキュベータに入れる。
４～６日目：ＣＰＥを読み取る：
１）ＳＡＲＳ－２／Ｓｐｅｃｔｒｕｍ ｌｙｓｉｓ／ａｍｉｃｏｎ －－ どの希釈液もＣＰＥなし（細胞シート上にはｌｙｓｉｓ緩衝液又はウイルスの影響なし）
２）ＳＡＲＳ－２／ｌｙｓｉｓなし／ａｍｉｃｏｎ－ＣＰＥ＋＋＋、１０の－３乗まで（ウイルス感染性）
３）ＳＡＲＳ－２（ａｍｉｃｏｎなし）－ ＣＰＥ＋＋＋、１０の－３乗まで（予想通りの対照ウイルス）
４）ＢＡ－ＰＢＳ／Ｓｐｅｃｔｒｕｍ ｌｙｓｉｓ／ａｍｉｃｏｎ－ＣＰＥなし（ｌｙｓｉｓ緩衝液はａｍｉｃｏｎで除去）
５）ＳＡＲＳ－２／ｓｐｅｃｔｒｕｍ ｌｙｓｉｓ（ａｍｉｃｏｎなし）－ 細胞シートは１０の－２～－３乗（０．０１～０．００１倍）で死滅した（ｌｙｓｉｓ緩衝液が細胞を死滅させた）
ＲＴ－ＰＣＲ試料の採取：
ＳＡＲＳ－２／Ｓｐｅｃｔｒｕｍ ｌｙｓｉｓ／ａｍｉｃｏｎ（１０の０乗希釈、３日目）
５日目：予め播種した９６ウェルプレートへ継代。
培養液を除去する。
新たに調製したＭＥＭ－Ｈａｎｋｓ ２００μｌとプレートからの上澄み部５０μｌとを追加する。
密封して３７℃で培養する。
７日目に再度ＣＰＥを読み取る。
１）ＳＡＲＳ－２／Ｓｐｅｃｔｒｕｍ ｌｙｓｉｓ／ａｍｉｃｏｎ －－どの希釈液もＣＰＥなし（感染性の継代なし）
２）ＳＡＲＳ－２／ｌｙｓｉｓなし／ａｍｉｃｏｎ－ＣＰＥ＋＋＋、１０の－３．５５乗まで（感染性ウイルスの継代）
３）ＳＡＲＳ－２（ａｍｉｃｏｎなし）－ ＣＰＥ＋＋＋、１０の－３．５５乗まで（予想通りの対照ウイルスＣＰＥ）
４）ＢＡ－ＰＢＳ／Ｓｐｅｃｔｒｕｍ ｌｙｓｉｓ／ａｍｉｃｏｎ－ＣＰＥなし
５）ＳＡＲＳ－２／ｓｐｅｃｔｒｕｍ ｌｙｓｉｓ（ａｍｉｃｏｎなし）－ 細胞シートは１０の－１乗で死滅し
ＲＴ－ＰＣＲ（試料）５０μｌを採取する：
１）ＳＡＲＳ－２／Ｓｐｅｃｔｒｕｍ ｌｙｓｉｓ／ａｍｉｃｏｎ（１０の０乗希釈、初代培養（ｐ１）、３日目（ｄ３））
ＲＴ－ＰＣＲ結果： ＣＤＣのＥＵＡ（緊急使用許可）を利用、 Ｎ１及びＮ２のＲＴ－ＰＣＲ平均
ＳＡＲＳ－２／Ｓｐｅｃｔｒｕｍ ｌｙｓｉｓ／ａｍｉｃｏｎ（１０の０乗希釈、０日目）Ｃｔ＝２９
ＳＡＲＳ－２／ｌｙｓｉｓなし／ａｍｉｃｏｎ（１０の０乗希釈、０日目）Ｃｔ＝１７
ＳＡＲＳ－２／Ｓｐｅｃｔｒｕｍ ｌｙｓｉｓ／ａｍｉｃｏｎ（１０の０乗希釈、３日目）ＣＴ＝３２
ＳＡＲＳ－２／Ｓｐｅｃｔｒｕｍ ｌｙｓｉｓ／ａｍｉｃｏｎ（１０の１乗希釈、初代培養（ｐａｓｓａｇｅ １）、３日目（ｄ３））、Ｃｔ＝３３
結果：ＣＰＥ情報又はＲＴ－ＰＣＲのどちらによってもｌｙｓｉｓ緩衝液の存在下でのウイルス増殖の証拠なし。
培養液：
１Ｘクローズドシステム培養液（１０％ＦＢＳ、９０％ ＭＥＭ Ｈａｎｋｓ）１００ｍＬごとに
Ｍｉｌｌｉ－Ｑ滅菌水７５．６ｍｌ
Ｈａｎｋｓ塩を含むＥａｇｌｅ製１０ｘ最小必須培地（Ｓｉｇｍａ Ｍ９２８８）１０．０ｍｌ
ウシ胎児血清（５６℃で３０分培養）（Ａｔｌａｎｔａ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｓ）１０．０ｍｌ
７．５％重炭酸ナトリウム（ＧＩＢＣＯ ２５０８０－０９４）１．２ｍｌ
２００ｍＭ Ｌ－グルタミン（ＧＩＢＣＯ ２５０３０－０８１）２．０ｍｌ
ペニシリン／ストレプトマイシン（それぞれ１０，０００Ｕ／ｍｌ）（ＧＩＢＣＯ）１．０ｍｌ
アムホテリシンＢ ２５０μｇ／ｍｌ（ＧＩＢＣＯ １５２９０－０１８）０．２ｍｌ
ＰＲＮＴ用希釈剤ＢＡ－ＰＢＳ（ＰＢＳ中ウシアルブミン、ｐＨ７．４）
溶液ＡとＢから１０Ｘ溶液を作成する：
ＰＲＮＴ用のウイルス希釈剤及び血清希釈剤に使用する。
１０Ｘ溶液Ａ：
溶液Ａ：１Ｌビーカー中：
ＮａＣｌ ８０ｇ
ＫＣｌ ２ｇ
ＭｇＣｌ２・６Ｈ２Ｏ １ｇ
１０％ ＣａＣｌ２・２Ｈ２Ｏ １０ｍＬ
０．５％フェノールレッド ８ｍＬ
Ｍｉｌｌｉ－Ｑ水 ９９０ｍＬ
溶解するまで攪拌子を用いて攪拌する。
１００ｍＬガラス瓶に分注して、オートクレーブ処理して滅菌する。
１０Ｘ溶液Ｂ：１Ｌ三角フラスコで計量する：
Ｎａ２ＨＰＯ４ １１．５ｇ
ＫＨ２ＰＯ４ ２ｇ
Ｍｉｌｌｉ－Ｑ水９９２ｍＬを追加する。溶解するまで回旋又は攪拌する。
０．５％フェノールレッド溶液８ｍＬを追加する。
溶解するまで攪拌子を用いて攪拌する。
１００ｍＬガラス瓶に分注して、オートクレーブ処理して滅菌する。
室温で貯蔵する。
１Ｘ ＢＡ－ＰＢＳ希釈液（別表Ａ）１Ｌを作成するために
１０Ｘ溶液Ａ １００ｍＬ
１０Ｘ溶液Ｂ １００ｍＬ
７．５％ＢＳＡ（Ｇｉｂｃｏ）１００ｍＬ
ペニシリン／ストレプトマイシン（Ｐｅｎ／Ｓｔｒｅｐ）（１０，０００ Ｕ／ｍＬ、Ｇｉｂｃｏ）２０ｍＬ
ｍｉｌｌｉ Ｑ滅菌水６８０ｍＬ
［結論］
ある実施態様（例えば、組成物、キット、方法など）は、本明細書中に開示及び／又は記載される特徴（例えば、特性、構成成分、成分、要素、部分、部位、工程など）を包含する、組み込む、あるいは別法で含む場合があることが分かる。したがって、１実施態様の様々な特徴は、本開示の他の実施態様に対応する、組み合わされる、包含される、及び／又は組み込まれる可能性がある。本開示の１実施態様に関連するある特徴の開示は、特定の実施態様への前記特徴の限定的な適用又は包含と解釈されるべきではない。むしろ、別の実施態様もまた、必ずしも本開示の範疇を逸脱せずとも前記特徴を包含する可能性があることが分かる。さらに、特徴が別の特徴と組み合わせる必要があると記載されている場合を除いて、本明細書中の任意の特徴は、本明細書に開示される同じ又は異なる実施態様のその他の特徴と組み合わされてもよい。
ある実施態様（例えば、組成物、キット、方法など）は、本明細書中に開示及び／又は記載される特徴（例えば、特性、構成成分、成分、要素、部分、部位、工程など）を包含する、組み込む、あるいは別法で含む場合があることが分かる。したがって、１実施態様の様々な特徴は、本開示の他の実施態様に対応する、組み合わされる、包含される、及び／又は組み込まれる可能性がある。本開示の１実施態様に関連するある特徴の開示は、特定の実施態様への前記特徴の限定的な適用又は包含と解釈されるべきではない。むしろ、別の実施態様もまた、必ずしも本開示の範疇を逸脱せずとも前記特徴を包含する可能性があることが分かる。さらに、特徴が別の特徴と組み合わせる必要があると記載されている場合を除いて、本明細書中の任意の特徴は、本明細書に開示される同じ又は異なる実施態様のその他の特徴と組み合わされてもよい。
記載の実施態様は、どの点でも具体的であるが制限されないものとしてのみ考えられるべきである。そのため、本発明の範囲は、前述の記載よりもむしろ添付の請求項によって示唆される。請求項の意味になる変更点及びそれと同等の範囲内の変更点はすべて、本発明の範疇に含まれるべきである。関連する技術分野において技術を有しかつ本開示の所有権を有する者が想起される本明細書で解説された特徴の様々な変更及び／又は修正並びに更なる応用は、請求項で定義されるような本発明の主旨及び範囲から逸脱することなく、解説された実施態様になる可能性があり、また本開示の範疇にあるものとみなされるべきである。様々な特徴及び実施態様が本明細書に開示されているが、その他の特徴及び実施態様についても考慮する。例えば、周知の特徴及び実施態様は、記載された実施態様の解釈を不明瞭にするのを避けるために、本明細書では特に詳細には記載されていない。けれども、その様な特徴及び実施態様もまた本明細書において検討される。
〔実施の態様〕
（１） ウイルス核酸を生体外の唾液試料中で保存する方法であって、前記方法が、前記ウイルス核酸を含有する前記生体外の唾液試料を入手すること、及び
前記生体外の唾液試料を核酸保存組成物と接触させることを含み、前記組成物が、
カオトロピック剤２０～５０重量％、
緩衝剤１～５重量％、
キレート剤０．０５～２．５重量％、
界面活性剤０．０５～２．５重量％、
アルコール５～２５重量％、
粘液溶解薬０．００５～０．２５重量％、
任意の視覚的指標、
１００％にするに足る量のキャリア、及び
ｐＨ７．１～９．５を含む、前記方法。
（２） 前記組成物がｐＨ７．２～９．０、好ましくはｐＨ７．２～８．８、好ましくはｐＨ７．５～８．５、より好ましくはｐＨ７．８～８．４、なおさらに好ましくはｐＨ７．９～８．３、なおさらに好ましくはｐＨ８．０～８．２である、請求項１に記載の方法。
（３） 前記カオトロピック剤がグアニジンチオシアン酸塩を含み、
前記緩衝剤がトリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン（Ｔｒｉｓ）を含み、
前記キレート剤が、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）、好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩、より好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩二水和物を含み、
前記界面活性剤がラウロイルサルコシンナトリウム塩（ＳＬＳ）を含み、
前記アルコールがエタノールと別の化学物質との混合物を含み、前記別の化学物質が好ましくはイソプロパノールであり、
前記粘液溶解薬がＮ－アセチル－Ｌ－システインを含み、
前記視覚的指標が、着色剤、より好ましくは有色色素、なおさらに好ましくは青色色素、なおさらに好ましくは食用青色１号を含み、及び／又は
前記キャリアが含水キャリアであって、好ましくは濾過水、純水、蒸留水及び／又は脱イオン水を含み、
前記組成物が、好ましくは、
前記カオトロピック剤４３．９２±１０重量％、
前記緩衝剤２．６５±１０重量％、
前記キレート剤１．０２９±１０重量％、
前記界面活性剤０．２７９±１０重量％、
前記アルコール１７．７３±１０重量％、及び／又は
前記粘液溶解薬０．０９３±１０重量％を含む、実施態様１又は２に記載の方法。
（４） 前記組成物の各構成成分の±１０％での量が、さらには±９％、好ましくは±８％であり、より好ましくは±７％であり、なおさらにより好ましくは±６％であり、なおさらにより好ましくは±５％であり、なおさらにより好ましくは±４％であり、なおさらにより好ましくは±３％であり、なおさらにより好ましくは±２％であり、なおさらにより好ましくは±１％である、実施態様３に記載の方法。
（５） 前記生体外の唾液試料が、喀出されたヒトの唾液を含む、実施態様１に記載の方法。
（１） ウイルス核酸を生体外の唾液試料中で保存する方法であって、前記方法が、前記ウイルス核酸を含有する前記生体外の唾液試料を入手すること、及び
前記生体外の唾液試料を核酸保存組成物と接触させることを含み、前記組成物が、
カオトロピック剤２０～５０重量％、
緩衝剤１～５重量％、
キレート剤０．０５～２．５重量％、
界面活性剤０．０５～２．５重量％、
アルコール５～２５重量％、
粘液溶解薬０．００５～０．２５重量％、
任意の視覚的指標、
１００％にするに足る量のキャリア、及び
ｐＨ７．１～９．５を含む、前記方法。
（２） 前記組成物がｐＨ７．２～９．０、好ましくはｐＨ７．２～８．８、好ましくはｐＨ７．５～８．５、より好ましくはｐＨ７．８～８．４、なおさらに好ましくはｐＨ７．９～８．３、なおさらに好ましくはｐＨ８．０～８．２である、請求項１に記載の方法。
（３） 前記カオトロピック剤がグアニジンチオシアン酸塩を含み、
前記緩衝剤がトリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン（Ｔｒｉｓ）を含み、
前記キレート剤が、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）、好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩、より好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩二水和物を含み、
前記界面活性剤がラウロイルサルコシンナトリウム塩（ＳＬＳ）を含み、
前記アルコールがエタノールと別の化学物質との混合物を含み、前記別の化学物質が好ましくはイソプロパノールであり、
前記粘液溶解薬がＮ－アセチル－Ｌ－システインを含み、
前記視覚的指標が、着色剤、より好ましくは有色色素、なおさらに好ましくは青色色素、なおさらに好ましくは食用青色１号を含み、及び／又は
前記キャリアが含水キャリアであって、好ましくは濾過水、純水、蒸留水及び／又は脱イオン水を含み、
前記組成物が、好ましくは、
前記カオトロピック剤４３．９２±１０重量％、
前記緩衝剤２．６５±１０重量％、
前記キレート剤１．０２９±１０重量％、
前記界面活性剤０．２７９±１０重量％、
前記アルコール１７．７３±１０重量％、及び／又は
前記粘液溶解薬０．０９３±１０重量％を含む、実施態様１又は２に記載の方法。
（４） 前記組成物の各構成成分の±１０％での量が、さらには±９％、好ましくは±８％であり、より好ましくは±７％であり、なおさらにより好ましくは±６％であり、なおさらにより好ましくは±５％であり、なおさらにより好ましくは±４％であり、なおさらにより好ましくは±３％であり、なおさらにより好ましくは±２％であり、なおさらにより好ましくは±１％である、実施態様３に記載の方法。
（５） 前記生体外の唾液試料が、喀出されたヒトの唾液を含む、実施態様１に記載の方法。
（６） 前記生体外の唾液試料と前記核酸保存組成物との混合物を分析してウイルス核酸の存在を検出することをさらに含む、実施態様１に記載の方法。
（７） 前記分析することが、ＤＮＡを産生するためのウイルスＲＮＡの逆転写及び／又はＤＮＡのポリメラーゼ連鎖反応を含む、実施態様６に記載の方法。
（８） 前記組成物が、
（ｉ）Ｎ－アセチル－Ｌ－システインを除いて、又はそれ以外の、１種の、追加の、又は任意の、粘液溶解薬を、実質上含まないか又は有さず、
（ｉｉ）前記アルコール、カオトロピック剤、界面活性剤／洗浄剤、及び／又は粘液溶解薬を除いて、又は、それら以外の、追加の又は任意の、抗菌剤、殺菌剤及び／又は静菌剤を、実質上含まないか又は有さず、
（ｉｉｉ）前記カオトロピック剤を除いて又はそれ以外の、追加の又は任意のリボヌクレアーゼ阻害剤（ｒｉｂｏｎｕｃｌｅａｓｅ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ（ｓ））又はリボヌクレアーゼの阻害剤（ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ（ｓ） ｏｆ ｒｉｂｏｎｕｃｌｅａｓｅ）を実質上含まないか又は有さず、前記組成物が好ましくはヘパリン、ヘパラン硫酸、オリゴ（ビニルスルホン酸）、ポリ（ビニルスルホン酸）、オリゴ（ビニルホスホン酸）、及び／又はポリ（ビニルスルホン酸）（ｐｏｌｙ（ｖｉｎｙｌｓｕｌｆｏｎｉｃ ａｃｉｄ））、又はこれらの塩を実質上有さず、
（ｉｖ）１種又は任意のプロテアーゼを実質上含まないか又は有さず、
（ｖ）アスコルビン酸、亜ジチオン酸塩、エリチオルビン酸塩（ｅｒｙｔｈｉｏｒｂａｔｅ）、ジチオスレイトール、２－メルカプトエタノール、ジエリスリトール、樹脂担持チオール、樹脂担持ホスフィン、ビタミンＥ、及び／又はトロロクス、又はそれらの塩を実質上含まないか又は有さず、
（ｖｉ）微生物及び／又は微生物汚染を実質上含まないか又は有さず、及び／又は
（ｖｉｉ）前記組成物１グラム当たりに約１００、９９、９８、９７、９６、９５、９０、８５、８０、７５、７０、６５、６０、５５、５０、４５、４０、３５、３０、２５、２０、１５、１０、又は５コロニー形成ユニット（ｃｆｕ）以下の１以上の微生物（ｃｆｕ／ｇ）を有する、実施態様１に記載の方法。
（９） 米国食品医薬品局（ＦＤＡ）に公認された手法でウイルス核酸を生体外の唾液試料中に保存するためのキットであって、前記キットが、
試料採取装置、及び
前記試料採取装置の一部に配置された核酸保存組成物を含み、前記核酸保存組成物が、
カオトロピック剤２０～５０重量％、
緩衝剤１～５重量％、
キレート剤０．０５～２．５重量％、
界面活性剤０．０５～２．５重量％、
アルコール５～２５重量％、
粘液溶解薬０．００５～０．２５重量％、
任意の視覚的指標、
１００％にするに足る量のキャリア、及び
ｐＨ７．２～９．５を含む、前記キット。
（１０） 前記組成物が、ｐＨ７．２～９．０、好ましくはｐＨ７．２～８．８、好ましくはｐＨ７．５～８．５、より好ましくはｐＨ７．８～８．４、なおさらに好ましくはｐＨ７．９～８．３、なおさらに好ましくはｐＨ８．０～８．２である、実施態様９に記載のキット。
（７） 前記分析することが、ＤＮＡを産生するためのウイルスＲＮＡの逆転写及び／又はＤＮＡのポリメラーゼ連鎖反応を含む、実施態様６に記載の方法。
（８） 前記組成物が、
（ｉ）Ｎ－アセチル－Ｌ－システインを除いて、又はそれ以外の、１種の、追加の、又は任意の、粘液溶解薬を、実質上含まないか又は有さず、
（ｉｉ）前記アルコール、カオトロピック剤、界面活性剤／洗浄剤、及び／又は粘液溶解薬を除いて、又は、それら以外の、追加の又は任意の、抗菌剤、殺菌剤及び／又は静菌剤を、実質上含まないか又は有さず、
（ｉｉｉ）前記カオトロピック剤を除いて又はそれ以外の、追加の又は任意のリボヌクレアーゼ阻害剤（ｒｉｂｏｎｕｃｌｅａｓｅ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ（ｓ））又はリボヌクレアーゼの阻害剤（ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ（ｓ） ｏｆ ｒｉｂｏｎｕｃｌｅａｓｅ）を実質上含まないか又は有さず、前記組成物が好ましくはヘパリン、ヘパラン硫酸、オリゴ（ビニルスルホン酸）、ポリ（ビニルスルホン酸）、オリゴ（ビニルホスホン酸）、及び／又はポリ（ビニルスルホン酸）（ｐｏｌｙ（ｖｉｎｙｌｓｕｌｆｏｎｉｃ ａｃｉｄ））、又はこれらの塩を実質上有さず、
（ｉｖ）１種又は任意のプロテアーゼを実質上含まないか又は有さず、
（ｖ）アスコルビン酸、亜ジチオン酸塩、エリチオルビン酸塩（ｅｒｙｔｈｉｏｒｂａｔｅ）、ジチオスレイトール、２－メルカプトエタノール、ジエリスリトール、樹脂担持チオール、樹脂担持ホスフィン、ビタミンＥ、及び／又はトロロクス、又はそれらの塩を実質上含まないか又は有さず、
（ｖｉ）微生物及び／又は微生物汚染を実質上含まないか又は有さず、及び／又は
（ｖｉｉ）前記組成物１グラム当たりに約１００、９９、９８、９７、９６、９５、９０、８５、８０、７５、７０、６５、６０、５５、５０、４５、４０、３５、３０、２５、２０、１５、１０、又は５コロニー形成ユニット（ｃｆｕ）以下の１以上の微生物（ｃｆｕ／ｇ）を有する、実施態様１に記載の方法。
（９） 米国食品医薬品局（ＦＤＡ）に公認された手法でウイルス核酸を生体外の唾液試料中に保存するためのキットであって、前記キットが、
試料採取装置、及び
前記試料採取装置の一部に配置された核酸保存組成物を含み、前記核酸保存組成物が、
カオトロピック剤２０～５０重量％、
緩衝剤１～５重量％、
キレート剤０．０５～２．５重量％、
界面活性剤０．０５～２．５重量％、
アルコール５～２５重量％、
粘液溶解薬０．００５～０．２５重量％、
任意の視覚的指標、
１００％にするに足る量のキャリア、及び
ｐＨ７．２～９．５を含む、前記キット。
（１０） 前記組成物が、ｐＨ７．２～９．０、好ましくはｐＨ７．２～８．８、好ましくはｐＨ７．５～８．５、より好ましくはｐＨ７．８～８．４、なおさらに好ましくはｐＨ７．９～８．３、なおさらに好ましくはｐＨ８．０～８．２である、実施態様９に記載のキット。
（１１） 前記カオトロピック剤がグアニジンチオシアン酸塩を含み、
前記緩衝剤がトリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン（Ｔｒｉｓ）を含み、
前記キレート剤が、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）、好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩、より好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩二水和物を含み、
前記界面活性剤がラウロイルサルコシンナトリウム塩（ＳＬＳ）を含み、
前記アルコールが、エタノールと別の化学物質との混合物を含み、前記別の化学物質が好ましくはイソプロパノールであり、
前記粘液溶解薬がＮ－アセチル－Ｌ－システインを含み、
前記視覚的指標が、着色剤、より好ましくは有色色素、なおさらに好ましくは青色色素、なおさらに好ましくは食用青色１号を含み、及び／又は
前記キャリアが含水キャリアであって、好ましくは濾過水、純水、蒸留水及び／又は脱イオン水を含み、
前記組成物が、好ましくは、
前記カオトロピック剤４３．９２±１０重量％、
前記緩衝剤２．６５±１０重量％、
前記キレート剤１．０２９±１０重量％、
前記界面活性剤０．２７９±１０重量％、
前記アルコール１７．７３±１０重量％、及び／又は
前記粘液溶解薬０．０９３±１０重量％を含む、実施態様９又は１０に記載のキット。
（１２） 前記組成物の各構成成分の±１０％での量が、さらには±９％、好ましくは±８％であり、より好ましくは±７％であり、なおさらにより好ましくは±６％であり、なおさらにより好ましくは±５％であり、なおさらにより好ましくは±４％であり、なおさらにより好ましくは±３％であり、なおさらにより好ましくは±２％であり、なおさらにより好ましくは±１％である、実施態様１１に記載のキット。
（１３） 前記組成物が、
（ｉ）Ｎ－アセチル－Ｌ－システインを除いて又はそれ以外の１種の、追加の又は任意の粘液溶解薬を、実質上含まないか又は有さず、
（ｉｉ）前記アルコール、カオトロピック剤、界面活性剤及び／又は粘液溶解薬を除いて又はそれ以外の追加の又は任意の抗菌剤、殺菌剤及び／又は静菌剤を、実質上含まないか又は有さず、
（ｉｉｉ）前記カオトロピック剤を除いて又はそれ以外の追加の又は任意のリボヌクレアーゼ阻害剤又はリボヌクレアーゼの阻害剤を実質上含まないか又は有さず、前記組成物が好ましくはヘパリン、ヘパラン硫酸、オリゴ（ビニルスルホン酸）、ポリ（ビニルスルホン酸）、オリゴ（ビニルホスホン酸）、及び／又はポリ（ビニルスルホン酸）（ｐｏｌｙ（ｖｉｎｙｌｓｕｌｆｏｎｉｃ ａｃｉｄ））、又はこれらの塩を、実質上有さず、
（ｉｖ）１種又は任意のプロテアーゼを、実質上含まないか又は有さず、
（ｖ）アスコルビン酸、亜ジチオン酸塩、エリチオルビン酸塩（ｅｒｙｔｈｉｏｒｂａｔｅ）、ジチオスレイトール、２－メルカプトエタノール、ジエリスリトール、樹脂担持チオール、樹脂担持ホスフィン、ビタミンＥ、及び／又はトロロクス、又はそれらの塩を、実質上含まないか又は有さず、
（ｖｉ）微生物及び／又は微生物汚染物を、実質上含まないか又は有さず、及び／又は
（ｖｉｉ）前記組成物１グラム当たり、約１００、９９、９８、９７、９６、９５、９０、８５、８０、７５、７０、６５、６０、５５、５０、４５、４０、３５、３０、２５、２０、１５、１０、又は５コロニー形成ユニット（ｃｆｕ）以下で、１種以上の微生物（ｃｆｕ／ｇ）を有する、実施態様９に記載のキット。
（１４） 生体外の唾液試料中のウイルスの存在を検出する方法であって、前記ウイルスが、好ましくはコロナウイルス、より好ましくは重症急性呼吸器症候群（ＳＡＲＳ）関連のコロナウイルス（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ）、なおさらに好ましくはＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２であり、前記方法が、
ウイルス核酸を含有する生体外の唾液試料を入手すること、
前記生体外の唾液試料を核酸保存組成物と接触させることであって、前記組成物が、
カオトロピック剤２０～５０重量％、
緩衝剤１～５重量％、
キレート剤０．０５～２．５重量％、
界面活性剤０．０５～２．５重量％、
アルコール５～２５重量％、
粘液溶解薬０．００５～０．２５重量％、
任意の視覚的指標、
１００％にするに足る量のキャリア、及び
ｐＨ７．１～９．５を含むものである、接触させること、及び
前記生体外の唾液試料と前記核酸保存組成物との混合物を分析してウイルス核酸の存在を検出することを含み、
前記分析することが場合により、ＤＮＡを産生するためのウイルスＲＮＡの逆転写及び／又はＤＮＡのポリメラーゼ連鎖反応を含む、前記方法。
（１５） 前記組成物が、ｐＨ７．２～９．０、好ましくはｐＨ７．２～８．８、好ましくはｐＨ７．５～８．５、より好ましくはｐＨ７．８～８．４、なおさらに好ましくはｐＨ７．９～８．３、なおさらに好ましくはｐＨ８．０～８．２である、実施態様１４に記載の方法。
前記緩衝剤がトリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン（Ｔｒｉｓ）を含み、
前記キレート剤が、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）、好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩、より好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩二水和物を含み、
前記界面活性剤がラウロイルサルコシンナトリウム塩（ＳＬＳ）を含み、
前記アルコールが、エタノールと別の化学物質との混合物を含み、前記別の化学物質が好ましくはイソプロパノールであり、
前記粘液溶解薬がＮ－アセチル－Ｌ－システインを含み、
前記視覚的指標が、着色剤、より好ましくは有色色素、なおさらに好ましくは青色色素、なおさらに好ましくは食用青色１号を含み、及び／又は
前記キャリアが含水キャリアであって、好ましくは濾過水、純水、蒸留水及び／又は脱イオン水を含み、
前記組成物が、好ましくは、
前記カオトロピック剤４３．９２±１０重量％、
前記緩衝剤２．６５±１０重量％、
前記キレート剤１．０２９±１０重量％、
前記界面活性剤０．２７９±１０重量％、
前記アルコール１７．７３±１０重量％、及び／又は
前記粘液溶解薬０．０９３±１０重量％を含む、実施態様９又は１０に記載のキット。
（１２） 前記組成物の各構成成分の±１０％での量が、さらには±９％、好ましくは±８％であり、より好ましくは±７％であり、なおさらにより好ましくは±６％であり、なおさらにより好ましくは±５％であり、なおさらにより好ましくは±４％であり、なおさらにより好ましくは±３％であり、なおさらにより好ましくは±２％であり、なおさらにより好ましくは±１％である、実施態様１１に記載のキット。
（１３） 前記組成物が、
（ｉ）Ｎ－アセチル－Ｌ－システインを除いて又はそれ以外の１種の、追加の又は任意の粘液溶解薬を、実質上含まないか又は有さず、
（ｉｉ）前記アルコール、カオトロピック剤、界面活性剤及び／又は粘液溶解薬を除いて又はそれ以外の追加の又は任意の抗菌剤、殺菌剤及び／又は静菌剤を、実質上含まないか又は有さず、
（ｉｉｉ）前記カオトロピック剤を除いて又はそれ以外の追加の又は任意のリボヌクレアーゼ阻害剤又はリボヌクレアーゼの阻害剤を実質上含まないか又は有さず、前記組成物が好ましくはヘパリン、ヘパラン硫酸、オリゴ（ビニルスルホン酸）、ポリ（ビニルスルホン酸）、オリゴ（ビニルホスホン酸）、及び／又はポリ（ビニルスルホン酸）（ｐｏｌｙ（ｖｉｎｙｌｓｕｌｆｏｎｉｃ ａｃｉｄ））、又はこれらの塩を、実質上有さず、
（ｉｖ）１種又は任意のプロテアーゼを、実質上含まないか又は有さず、
（ｖ）アスコルビン酸、亜ジチオン酸塩、エリチオルビン酸塩（ｅｒｙｔｈｉｏｒｂａｔｅ）、ジチオスレイトール、２－メルカプトエタノール、ジエリスリトール、樹脂担持チオール、樹脂担持ホスフィン、ビタミンＥ、及び／又はトロロクス、又はそれらの塩を、実質上含まないか又は有さず、
（ｖｉ）微生物及び／又は微生物汚染物を、実質上含まないか又は有さず、及び／又は
（ｖｉｉ）前記組成物１グラム当たり、約１００、９９、９８、９７、９６、９５、９０、８５、８０、７５、７０、６５、６０、５５、５０、４５、４０、３５、３０、２５、２０、１５、１０、又は５コロニー形成ユニット（ｃｆｕ）以下で、１種以上の微生物（ｃｆｕ／ｇ）を有する、実施態様９に記載のキット。
（１４） 生体外の唾液試料中のウイルスの存在を検出する方法であって、前記ウイルスが、好ましくはコロナウイルス、より好ましくは重症急性呼吸器症候群（ＳＡＲＳ）関連のコロナウイルス（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ）、なおさらに好ましくはＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２であり、前記方法が、
ウイルス核酸を含有する生体外の唾液試料を入手すること、
前記生体外の唾液試料を核酸保存組成物と接触させることであって、前記組成物が、
カオトロピック剤２０～５０重量％、
緩衝剤１～５重量％、
キレート剤０．０５～２．５重量％、
界面活性剤０．０５～２．５重量％、
アルコール５～２５重量％、
粘液溶解薬０．００５～０．２５重量％、
任意の視覚的指標、
１００％にするに足る量のキャリア、及び
ｐＨ７．１～９．５を含むものである、接触させること、及び
前記生体外の唾液試料と前記核酸保存組成物との混合物を分析してウイルス核酸の存在を検出することを含み、
前記分析することが場合により、ＤＮＡを産生するためのウイルスＲＮＡの逆転写及び／又はＤＮＡのポリメラーゼ連鎖反応を含む、前記方法。
（１５） 前記組成物が、ｐＨ７．２～９．０、好ましくはｐＨ７．２～８．８、好ましくはｐＨ７．５～８．５、より好ましくはｐＨ７．８～８．４、なおさらに好ましくはｐＨ７．９～８．３、なおさらに好ましくはｐＨ８．０～８．２である、実施態様１４に記載の方法。
（１６） 前記カオトロピック剤がグアニジンチオシアン酸塩を含み、
前記緩衝剤がトリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン（Ｔｒｉｓ）を含み、
前記キレート剤が、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）、好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩、より好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩二水和物を含み、
前記界面活性剤がラウロイルサルコシンナトリウム塩（ＳＬＳ）を含み、
前記アルコールが、エタノールと別の化学物質との混合物を含み、前記別の化学物質が好ましくはイソプロパノールであり、
前記粘液溶解薬がＮ－アセチル－Ｌ－システインを含み、
前記視覚的指標が、着色剤、より好ましくは有色色素、なおさらに好ましくは青色色素、なおさらに好ましくは食用青色１号を含み、及び／又は
前記キャリアが含水キャリアであって、好ましくは濾過水、純水、蒸留水及び／又は脱イオン水を含み、
前記組成物が、好ましくは、
前記カオトロピック剤４３．９２±１０重量％、
前記緩衝剤２．６５±１０重量％、
前記キレート剤１．０２９±１０重量％、
前記界面活性剤０．２７９±１０重量％、
前記アルコール１７．７３±１０重量％、及び／又は
前記粘液溶解薬０．０９３±１０重量％を含む、実施態様１４又は１５に記載の方法。
（１７） 前記組成物の各構成成分の±１０％での量が、さらには±９％、好ましくは±８％であり、より好ましくは±７％であり、なおさらにより好ましくは±６％であり、なおさらにより好ましくは±５％であり、なおさらにより好ましくは±４％であり、なおさらにより好ましくは±３％であり、なおさらにより好ましくは±２％であり、なおさらにより好ましくは±１％である、実施態様１６に記載の方法。
（１８） 前記生体外の唾液試料が、喀出されたヒトの唾液を含む、実施態様１４に記載の方法。
（１９） 前記組成物が、
（ｉ）Ｎ－アセチル－Ｌ－システインを除いて又はそれ以外の、１種の、追加の、又は任意の、粘液溶解薬を、実質上含まないか又は有さず、
（ｉｉ）前記アルコール、カオトロピック剤、界面活性剤／洗浄剤及び／又は粘液溶解薬を除いて又はそれら以外の、追加の又は任意の、抗菌剤、殺菌剤及び／又は静菌剤を、実質上含まないか又は有さず、
（ｉｉｉ）前記カオトロピック剤を除いて又はそれ以外の、追加の又は任意の、リボヌクレアーゼ阻害剤又はリボヌクレアーゼの阻害剤を、実質上含まないか又は有さず、前記組成物が好ましくは、ヘパリン、ヘパラン硫酸、オリゴ（ビニルスルホン酸）、ポリ（ビニルスルホン酸）、オリゴ（ビニルホスホン酸）、及び／又はポリ（ビニルスルホン酸）（ｐｏｌｙ（ｖｉｎｙｌｓｕｌｆｏｎｉｃ ａｃｉｄ））、又はこれらの塩を、実質上有さず、
（ｉｖ）１種又は任意の、プロテアーゼを、実質上含まないか又は有さず、
（ｖ）アスコルビン酸、亜ジチオン酸塩、エリチオルビン酸塩（ｅｒｙｔｈｉｏｒｂａｔｅ）、ジチオスレイトール、２－メルカプトエタノール、ジエリスリトール、樹脂担持チオール、樹脂担持ホスフィン、ビタミンＥ、及び／又はトロロクス、又はそれらの塩を、実質上含まないか又は有さず、
（ｖｉ）微生物及び／又は微生物汚染を、実質上含まないか又は有さず、及び／又は
（ｖｉｉ）前記組成物１グラム当たり、約１００、９９、９８、９７、９６、９５、９０、８５、８０、７５、７０、６５、６０、５５、５０、４５、４０、３５、３０、２５、２０、１５、１０又は５コロニー形成ユニット（ｃｆｕ）以下で、１種以上の微生物（ｃｆｕ／ｇ）を有する、実施態様１４に記載の方法。
前記緩衝剤がトリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン（Ｔｒｉｓ）を含み、
前記キレート剤が、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）、好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩、より好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩二水和物を含み、
前記界面活性剤がラウロイルサルコシンナトリウム塩（ＳＬＳ）を含み、
前記アルコールが、エタノールと別の化学物質との混合物を含み、前記別の化学物質が好ましくはイソプロパノールであり、
前記粘液溶解薬がＮ－アセチル－Ｌ－システインを含み、
前記視覚的指標が、着色剤、より好ましくは有色色素、なおさらに好ましくは青色色素、なおさらに好ましくは食用青色１号を含み、及び／又は
前記キャリアが含水キャリアであって、好ましくは濾過水、純水、蒸留水及び／又は脱イオン水を含み、
前記組成物が、好ましくは、
前記カオトロピック剤４３．９２±１０重量％、
前記緩衝剤２．６５±１０重量％、
前記キレート剤１．０２９±１０重量％、
前記界面活性剤０．２７９±１０重量％、
前記アルコール１７．７３±１０重量％、及び／又は
前記粘液溶解薬０．０９３±１０重量％を含む、実施態様１４又は１５に記載の方法。
（１７） 前記組成物の各構成成分の±１０％での量が、さらには±９％、好ましくは±８％であり、より好ましくは±７％であり、なおさらにより好ましくは±６％であり、なおさらにより好ましくは±５％であり、なおさらにより好ましくは±４％であり、なおさらにより好ましくは±３％であり、なおさらにより好ましくは±２％であり、なおさらにより好ましくは±１％である、実施態様１６に記載の方法。
（１８） 前記生体外の唾液試料が、喀出されたヒトの唾液を含む、実施態様１４に記載の方法。
（１９） 前記組成物が、
（ｉ）Ｎ－アセチル－Ｌ－システインを除いて又はそれ以外の、１種の、追加の、又は任意の、粘液溶解薬を、実質上含まないか又は有さず、
（ｉｉ）前記アルコール、カオトロピック剤、界面活性剤／洗浄剤及び／又は粘液溶解薬を除いて又はそれら以外の、追加の又は任意の、抗菌剤、殺菌剤及び／又は静菌剤を、実質上含まないか又は有さず、
（ｉｉｉ）前記カオトロピック剤を除いて又はそれ以外の、追加の又は任意の、リボヌクレアーゼ阻害剤又はリボヌクレアーゼの阻害剤を、実質上含まないか又は有さず、前記組成物が好ましくは、ヘパリン、ヘパラン硫酸、オリゴ（ビニルスルホン酸）、ポリ（ビニルスルホン酸）、オリゴ（ビニルホスホン酸）、及び／又はポリ（ビニルスルホン酸）（ｐｏｌｙ（ｖｉｎｙｌｓｕｌｆｏｎｉｃ ａｃｉｄ））、又はこれらの塩を、実質上有さず、
（ｉｖ）１種又は任意の、プロテアーゼを、実質上含まないか又は有さず、
（ｖ）アスコルビン酸、亜ジチオン酸塩、エリチオルビン酸塩（ｅｒｙｔｈｉｏｒｂａｔｅ）、ジチオスレイトール、２－メルカプトエタノール、ジエリスリトール、樹脂担持チオール、樹脂担持ホスフィン、ビタミンＥ、及び／又はトロロクス、又はそれらの塩を、実質上含まないか又は有さず、
（ｖｉ）微生物及び／又は微生物汚染を、実質上含まないか又は有さず、及び／又は
（ｖｉｉ）前記組成物１グラム当たり、約１００、９９、９８、９７、９６、９５、９０、８５、８０、７５、７０、６５、６０、５５、５０、４５、４０、３５、３０、２５、２０、１５、１０又は５コロニー形成ユニット（ｃｆｕ）以下で、１種以上の微生物（ｃｆｕ／ｇ）を有する、実施態様１４に記載の方法。
Claims (19)
- ウイルス核酸を生体外の唾液試料中で保存する方法であって、前記方法が、前記ウイルス核酸を含有する前記生体外の唾液試料を入手すること、及び
前記生体外の唾液試料を核酸保存組成物と接触させることを含み、前記組成物が、
カオトロピック剤２０～５０重量％、
緩衝剤１～５重量％、
キレート剤０．０５～２．５重量％、
界面活性剤０．０５～２．５重量％、
アルコール５～２５重量％、
粘液溶解薬０．００５～０．２５重量％、
任意の視覚的指標、
１００％にするに足る量のキャリア、及び
ｐＨ７．１～９．５を含む、前記方法。 - 前記組成物がｐＨ７．２～９．０、好ましくはｐＨ７．２～８．８、好ましくはｐＨ７．５～８．５、より好ましくはｐＨ７．８～８．４、なおさらに好ましくはｐＨ７．９～８．３、なおさらに好ましくはｐＨ８．０～８．２である、請求項１に記載の方法。
- 前記カオトロピック剤がグアニジンチオシアン酸塩を含み、
前記緩衝剤がトリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン（Ｔｒｉｓ）を含み、
前記キレート剤が、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）、好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩、より好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩二水和物を含み、
前記界面活性剤がラウロイルサルコシンナトリウム塩（ＳＬＳ）を含み、
前記アルコールがエタノールと別の化学物質との混合物を含み、前記別の化学物質が好ましくはイソプロパノールであり、
前記粘液溶解薬がＮ－アセチル－Ｌ－システインを含み、
前記視覚的指標が、着色剤、より好ましくは有色色素、なおさらに好ましくは青色色素、なおさらに好ましくは食用青色１号を含み、及び／又は
前記キャリアが含水キャリアであって、好ましくは濾過水、純水、蒸留水及び／又は脱イオン水を含み、
前記組成物が、好ましくは、
前記カオトロピック剤４３．９２±１０重量％、
前記緩衝剤２．６５±１０重量％、
前記キレート剤１．０２９±１０重量％、
前記界面活性剤０．２７９±１０重量％、
前記アルコール１７．７３±１０重量％、及び／又は
前記粘液溶解薬０．０９３±１０重量％を含む、請求項１又は２に記載の方法。 - 前記組成物の各構成成分の±１０％での量が、さらには±９％、好ましくは±８％であり、より好ましくは±７％であり、なおさらにより好ましくは±６％であり、なおさらにより好ましくは±５％であり、なおさらにより好ましくは±４％であり、なおさらにより好ましくは±３％であり、なおさらにより好ましくは±２％であり、なおさらにより好ましくは±１％である、請求項３に記載の方法。
- 前記生体外の唾液試料が、喀出されたヒトの唾液を含む、請求項１に記載の方法。
- 前記生体外の唾液試料と前記核酸保存組成物との混合物を分析してウイルス核酸の存在を検出することをさらに含む、請求項１に記載の方法。
- 前記分析することが、ＤＮＡを産生するためのウイルスＲＮＡの逆転写及び／又はＤＮＡのポリメラーゼ連鎖反応を含む、請求項６に記載の方法。
- 前記組成物が、
（ｉ）Ｎ－アセチル－Ｌ－システインを除いて、又はそれ以外の、１種の、追加の、又は任意の、粘液溶解薬を、実質上含まないか又は有さず、
（ｉｉ）前記アルコール、カオトロピック剤、界面活性剤／洗浄剤、及び／又は粘液溶解薬を除いて、又は、それら以外の、追加の又は任意の、抗菌剤、殺菌剤及び／又は静菌剤を、実質上含まないか又は有さず、
（ｉｉｉ）前記カオトロピック剤を除いて又はそれ以外の、追加の又は任意のリボヌクレアーゼ阻害剤（ｒｉｂｏｎｕｃｌｅａｓｅ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ（ｓ））又はリボヌクレアーゼの阻害剤（ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ（ｓ） ｏｆ ｒｉｂｏｎｕｃｌｅａｓｅ）を実質上含まないか又は有さず、前記組成物が好ましくはヘパリン、ヘパラン硫酸、オリゴ（ビニルスルホン酸）、ポリ（ビニルスルホン酸）、オリゴ（ビニルホスホン酸）、及び／又はポリ（ビニルスルホン酸）（ｐｏｌｙ（ｖｉｎｙｌｓｕｌｆｏｎｉｃ ａｃｉｄ））、又はこれらの塩を実質上有さず、
（ｉｖ）１種又は任意のプロテアーゼを実質上含まないか又は有さず、
（ｖ）アスコルビン酸、亜ジチオン酸塩、エリチオルビン酸塩（ｅｒｙｔｈｉｏｒｂａｔｅ）、ジチオスレイトール、２－メルカプトエタノール、ジエリスリトール、樹脂担持チオール、樹脂担持ホスフィン、ビタミンＥ、及び／又はトロロクス、又はそれらの塩を実質上含まないか又は有さず、
（ｖｉ）微生物及び／又は微生物汚染を実質上含まないか又は有さず、及び／又は
（ｖｉｉ）前記組成物１グラム当たりに約１００、９９、９８、９７、９６、９５、９０、８５、８０、７５、７０、６５、６０、５５、５０、４５、４０、３５、３０、２５、２０、１５、１０、又は５コロニー形成ユニット（ｃｆｕ）以下の１以上の微生物（ｃｆｕ／ｇ）を有する、請求項１に記載の方法。 - 米国食品医薬品局（ＦＤＡ）に公認された手法でウイルス核酸を生体外の唾液試料中に保存するためのキットであって、前記キットが、
試料採取装置、及び
前記試料採取装置の一部に配置された核酸保存組成物を含み、前記核酸保存組成物が、
カオトロピック剤２０～５０重量％、
緩衝剤１～５重量％、
キレート剤０．０５～２．５重量％、
界面活性剤０．０５～２．５重量％、
アルコール５～２５重量％、
粘液溶解薬０．００５～０．２５重量％、
任意の視覚的指標、
１００％にするに足る量のキャリア、及び
ｐＨ７．２～９．５を含む、前記キット。 - 前記組成物が、ｐＨ７．２～９．０、好ましくはｐＨ７．２～８．８、好ましくはｐＨ７．５～８．５、より好ましくはｐＨ７．８～８．４、なおさらに好ましくはｐＨ７．９～８．３、なおさらに好ましくはｐＨ８．０～８．２である、請求項９に記載のキット。
- 前記カオトロピック剤がグアニジンチオシアン酸塩を含み、
前記緩衝剤がトリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン（Ｔｒｉｓ）を含み、
前記キレート剤が、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）、好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩、より好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩二水和物を含み、
前記界面活性剤がラウロイルサルコシンナトリウム塩（ＳＬＳ）を含み、
前記アルコールが、エタノールと別の化学物質との混合物を含み、前記別の化学物質が好ましくはイソプロパノールであり、
前記粘液溶解薬がＮ－アセチル－Ｌ－システインを含み、
前記視覚的指標が、着色剤、より好ましくは有色色素、なおさらに好ましくは青色色素、なおさらに好ましくは食用青色１号を含み、及び／又は
前記キャリアが含水キャリアであって、好ましくは濾過水、純水、蒸留水及び／又は脱イオン水を含み、
前記組成物が、好ましくは、
前記カオトロピック剤４３．９２±１０重量％、
前記緩衝剤２．６５±１０重量％、
前記キレート剤１．０２９±１０重量％、
前記界面活性剤０．２７９±１０重量％、
前記アルコール１７．７３±１０重量％、及び／又は
前記粘液溶解薬０．０９３±１０重量％を含む、請求項９又は１０に記載のキット。 - 前記組成物の各構成成分の±１０％での量が、さらには±９％、好ましくは±８％であり、より好ましくは±７％であり、なおさらにより好ましくは±６％であり、なおさらにより好ましくは±５％であり、なおさらにより好ましくは±４％であり、なおさらにより好ましくは±３％であり、なおさらにより好ましくは±２％であり、なおさらにより好ましくは±１％である、請求項１１に記載のキット。
- 前記組成物が、
（ｉ）Ｎ－アセチル－Ｌ－システインを除いて又はそれ以外の１種の、追加の又は任意の粘液溶解薬を、実質上含まないか又は有さず、
（ｉｉ）前記アルコール、カオトロピック剤、界面活性剤及び／又は粘液溶解薬を除いて又はそれ以外の追加の又は任意の抗菌剤、殺菌剤及び／又は静菌剤を、実質上含まないか又は有さず、
（ｉｉｉ）前記カオトロピック剤を除いて又はそれ以外の追加の又は任意のリボヌクレアーゼ阻害剤又はリボヌクレアーゼの阻害剤を実質上含まないか又は有さず、前記組成物が好ましくはヘパリン、ヘパラン硫酸、オリゴ（ビニルスルホン酸）、ポリ（ビニルスルホン酸）、オリゴ（ビニルホスホン酸）、及び／又はポリ（ビニルスルホン酸）（ｐｏｌｙ（ｖｉｎｙｌｓｕｌｆｏｎｉｃ ａｃｉｄ））、又はこれらの塩を、実質上有さず、
（ｉｖ）１種又は任意のプロテアーゼを、実質上含まないか又は有さず、
（ｖ）アスコルビン酸、亜ジチオン酸塩、エリチオルビン酸塩（ｅｒｙｔｈｉｏｒｂａｔｅ）、ジチオスレイトール、２－メルカプトエタノール、ジエリスリトール、樹脂担持チオール、樹脂担持ホスフィン、ビタミンＥ、及び／又はトロロクス、又はそれらの塩を、実質上含まないか又は有さず、
（ｖｉ）微生物及び／又は微生物汚染物を、実質上含まないか又は有さず、及び／又は
（ｖｉｉ）前記組成物１グラム当たり、約１００、９９、９８、９７、９６、９５、９０、８５、８０、７５、７０、６５、６０、５５、５０、４５、４０、３５、３０、２５、２０、１５、１０、又は５コロニー形成ユニット（ｃｆｕ）以下で、１種以上の微生物（ｃｆｕ／ｇ）を有する、請求項９に記載のキット。 - 生体外の唾液試料中のウイルスの存在を検出する方法であって、前記ウイルスが、好ましくはコロナウイルス、より好ましくは重症急性呼吸器症候群（ＳＡＲＳ）関連のコロナウイルス（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ）、なおさらに好ましくはＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２であり、前記方法が、
ウイルス核酸を含有する生体外の唾液試料を入手すること、
前記生体外の唾液試料を核酸保存組成物と接触させることであって、前記組成物が、
カオトロピック剤２０～５０重量％、
緩衝剤１～５重量％、
キレート剤０．０５～２．５重量％、
界面活性剤０．０５～２．５重量％、
アルコール５～２５重量％、
粘液溶解薬０．００５～０．２５重量％、
任意の視覚的指標、
１００％にするに足る量のキャリア、及び
ｐＨ７．１～９．５を含むものである、接触させること、及び
前記生体外の唾液試料と前記核酸保存組成物との混合物を分析してウイルス核酸の存在を検出することを含み、
前記分析することが場合により、ＤＮＡを産生するためのウイルスＲＮＡの逆転写及び／又はＤＮＡのポリメラーゼ連鎖反応を含む、前記方法。 - 前記組成物が、ｐＨ７．２～９．０、好ましくはｐＨ７．２～８．８、好ましくはｐＨ７．５～８．５、より好ましくはｐＨ７．８～８．４、なおさらに好ましくはｐＨ７．９～８．３、なおさらに好ましくはｐＨ８．０～８．２である、請求項１４に記載の方法。
- 前記カオトロピック剤がグアニジンチオシアン酸塩を含み、
前記緩衝剤がトリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン（Ｔｒｉｓ）を含み、
前記キレート剤が、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）、好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩、より好ましくはＥＤＴＡ二ナトリウム塩二水和物を含み、
前記界面活性剤がラウロイルサルコシンナトリウム塩（ＳＬＳ）を含み、
前記アルコールが、エタノールと別の化学物質との混合物を含み、前記別の化学物質が好ましくはイソプロパノールであり、
前記粘液溶解薬がＮ－アセチル－Ｌ－システインを含み、
前記視覚的指標が、着色剤、より好ましくは有色色素、なおさらに好ましくは青色色素、なおさらに好ましくは食用青色１号を含み、及び／又は
前記キャリアが含水キャリアであって、好ましくは濾過水、純水、蒸留水及び／又は脱イオン水を含み、
前記組成物が、好ましくは、
前記カオトロピック剤４３．９２±１０重量％、
前記緩衝剤２．６５±１０重量％、
前記キレート剤１．０２９±１０重量％、
前記界面活性剤０．２７９±１０重量％、
前記アルコール１７．７３±１０重量％、及び／又は
前記粘液溶解薬０．０９３±１０重量％を含む、請求項１４又は１５に記載の方法。 - 前記組成物の各構成成分の±１０％での量が、さらには±９％、好ましくは±８％であり、より好ましくは±７％であり、なおさらにより好ましくは±６％であり、なおさらにより好ましくは±５％であり、なおさらにより好ましくは±４％であり、なおさらにより好ましくは±３％であり、なおさらにより好ましくは±２％であり、なおさらにより好ましくは±１％である、請求項１６に記載の方法。
- 前記生体外の唾液試料が、喀出されたヒトの唾液を含む、請求項１４に記載の方法。
- 前記組成物が、
（ｉ）Ｎ－アセチル－Ｌ－システインを除いて又はそれ以外の、１種の、追加の、又は任意の、粘液溶解薬を、実質上含まないか又は有さず、
（ｉｉ）前記アルコール、カオトロピック剤、界面活性剤／洗浄剤及び／又は粘液溶解薬を除いて又はそれら以外の、追加の又は任意の、抗菌剤、殺菌剤及び／又は静菌剤を、実質上含まないか又は有さず、
（ｉｉｉ）前記カオトロピック剤を除いて又はそれ以外の、追加の又は任意の、リボヌクレアーゼ阻害剤又はリボヌクレアーゼの阻害剤を、実質上含まないか又は有さず、前記組成物が好ましくは、ヘパリン、ヘパラン硫酸、オリゴ（ビニルスルホン酸）、ポリ（ビニルスルホン酸）、オリゴ（ビニルホスホン酸）、及び／又はポリ（ビニルスルホン酸）（ｐｏｌｙ（ｖｉｎｙｌｓｕｌｆｏｎｉｃ ａｃｉｄ））、又はこれらの塩を、実質上有さず、
（ｉｖ）１種又は任意の、プロテアーゼを、実質上含まないか又は有さず、
（ｖ）アスコルビン酸、亜ジチオン酸塩、エリチオルビン酸塩（ｅｒｙｔｈｉｏｒｂａｔｅ）、ジチオスレイトール、２－メルカプトエタノール、ジエリスリトール、樹脂担持チオール、樹脂担持ホスフィン、ビタミンＥ、及び／又はトロロクス、又はそれらの塩を、実質上含まないか又は有さず、
（ｖｉ）微生物及び／又は微生物汚染を、実質上含まないか又は有さず、及び／又は
（ｖｉｉ）前記組成物１グラム当たり、約１００、９９、９８、９７、９６、９５、９０、８５、８０、７５、７０、６５、６０、５５、５０、４５、４０、３５、３０、２５、２０、１５、１０又は５コロニー形成ユニット（ｃｆｕ）以下で、１種以上の微生物（ｃｆｕ／ｇ）を有する、請求項１４に記載の方法。
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US202063010037P | 2020-04-14 | 2020-04-14 | |
| US63/010,037 | 2020-04-14 | ||
| PCT/US2021/027327 WO2021211740A1 (en) | 2020-04-14 | 2021-04-14 | Products and methods for detection of viral nucleic acid |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2023521803A true JP2023521803A (ja) | 2023-05-25 |
Family
ID=78084984
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2022562080A Pending JP2023521803A (ja) | 2020-04-14 | 2021-04-14 | ウイルス核酸の検出用製品及びその検出方法 |
Country Status (7)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20230272368A1 (ja) |
| EP (1) | EP3996732A4 (ja) |
| JP (1) | JP2023521803A (ja) |
| CN (1) | CN115397453A (ja) |
| CA (1) | CA3171097A1 (ja) |
| MX (1) | MX2022012104A (ja) |
| WO (1) | WO2021211740A1 (ja) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| GB2614481A (en) * | 2020-09-01 | 2023-07-05 | Longhorn Vaccines & Diagnostics Llc | Compositions and methods for screening biological samples |
Family Cites Families (8)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| AU2001256976A1 (en) * | 2000-04-03 | 2001-10-15 | Cytyc Corporation | Detection and typing of human papillomavirus using pna probes |
| JP2007519613A (ja) * | 2003-10-23 | 2007-07-19 | アルザ・コーポレーシヨン | 微小突出部をコーティングするための安定化されたｄｎａの組成物 |
| US8084443B2 (en) * | 2007-10-01 | 2011-12-27 | Longhorn Vaccines & Diagnostics Llc | Biological specimen collection and transport system and methods of use |
| US8652782B2 (en) * | 2006-09-12 | 2014-02-18 | Longhorn Vaccines & Diagnostics, Llc | Compositions and methods for detecting, identifying and quantitating mycobacterial-specific nucleic acids |
| WO2008040126A1 (en) * | 2006-10-06 | 2008-04-10 | Dna Genotek Inc. | Stabilizing compositions and methods for extraction of ribonucleic acid |
| GB0705245D0 (en) * | 2007-03-19 | 2007-04-25 | Stabilitech Ltd | Stable biological products |
| EP2598661B1 (en) * | 2010-07-26 | 2017-09-27 | Biomatrica, INC. | Compositions for stabilizing dna, rna and proteins in saliva and other biological samples during shipping and storage at ambient temperatures |
| ES2942577T3 (es) * | 2017-01-16 | 2023-06-02 | Spectrum Solutions L L C | Solución de conservación de ácidos nucleicos y procedimientos de uso |
-
2021
- 2021-04-14 WO PCT/US2021/027327 patent/WO2021211740A1/en unknown
- 2021-04-14 EP EP21788311.5A patent/EP3996732A4/en active Pending
- 2021-04-14 US US17/919,100 patent/US20230272368A1/en active Pending
- 2021-04-14 JP JP2022562080A patent/JP2023521803A/ja active Pending
- 2021-04-14 MX MX2022012104A patent/MX2022012104A/es unknown
- 2021-04-14 CN CN202180028582.2A patent/CN115397453A/zh active Pending
- 2021-04-14 CA CA3171097A patent/CA3171097A1/en active Pending
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN115397453A (zh) | 2022-11-25 |
| WO2021211740A1 (en) | 2021-10-21 |
| EP3996732A1 (en) | 2022-05-18 |
| MX2022012104A (es) | 2022-10-18 |
| EP3996732A4 (en) | 2022-08-24 |
| CA3171097A1 (en) | 2021-10-21 |
| US20230272368A1 (en) | 2023-08-31 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US11655495B2 (en) | Nucleic acid preservation solution and methods of manufacture and use | |
| JP5442105B2 (ja) | 生物試料回収／輸送組成物および方法 | |
| US8652782B2 (en) | Compositions and methods for detecting, identifying and quantitating mycobacterial-specific nucleic acids | |
| US11046949B2 (en) | Method and system for microbial lysis using periodates | |
| US20210071232A1 (en) | Rna preservation solution and methods of manufacture and use | |
| US20120171728A1 (en) | Process for amplifying dna using tetratethylene glycol, kit of parts therefor and use thereof | |
| JP2023521803A (ja) | ウイルス核酸の検出用製品及びその検出方法 | |
| US20240002905A1 (en) | Pathogen inactivating and nucleic acid stabilization media for microorganism collection and transport | |
| WO2022031992A1 (en) | Lysis buffer compositions and methods for preparing a viral biological sample useful for covid-19 testing | |
| US20210189458A1 (en) | Methods and compositions for the purification of unbiased rna | |
| Zaorska et al. | Multiplexed SNP Typing of DNA after Demineralization and Organic Extraction from a Bone | |
| WO2023057422A1 (en) | Universal buffer in methods for safe and rapid detection of pathogen infection |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20240405 |