JP2023514162A - ピーナッツアレルギーを検出するためのアッセイ - Google Patents

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Abstract

本開示は、ピーナッツペプチド組成物及びキット、ならびに、ピーナッツアレルギーの診断方法、ピーナッツに対する臨床耐性の発達を検出するための方法、ならびに、ピーナッツアレルゲンに対して乳児を脱感作するための方法を提供する。

Description

本開示は、部分的には、ピーナッツペプチド組成物及びキット、ならびに、ピーナッツアレルギーの診断方法、ピーナッツに対する臨床耐性の発達を検出するための方法、ならびに、ピーナッツアレルゲンに対して乳児を脱感作するための方法に関する。
食物アレルギーは、成人及び子どもに共通の問題であり、症状は、穏やかな口腔掻痒から、場合により命を脅かすアナフィラキシーショックまで、広範囲にまたがり得る。食物アレルギーは現在、プリックテストまたは経口誘発、ならびに、特定のIgE、及び、場合によっては、IgG4などの他の血清抗体の血清レベルの測定により診断される。これらの検査は、臨床反応性の可能性を示しはするものの、異なるフェノタイプの食物アレルギーを区別しない、または、予後情報を提供しない。現在のアレルギー検査はまた、患者にある程度のリスクを伴う。現在のIgE検査と、患者の実際の臨床感度との関係は、通常、反応感度と、反応を刺激するアレルゲンの量との組み合わせとして定義される、弱いものである。現在の検査の別の制限は、小児患者のアレルギーが小児期の間に強くなるか否かを測定することができないことである。この場合、特定のIgEレベルと、臨床アレルギーの期間とには、正ではあるが弱い相関がある。
より最近では、食物アレルゲンに対する臨床反応性が、エピトープ認識レベルで、アレルゲン特異的IgEとより良く相関し得ることが示唆されている。持続性、または、より深刻なアレルギー反応を有する患者は、より多くの数のIgEエピトープを認識することが報告されており、このことは、アレルギー診断及び予測のための追加のツールとしてのエピトープマッピングを示唆している。スポットメンブレンベースのイムノアッセイが、エピトープマッピングのために使用されている。本システムでは、ペプチドはメンブレン上で合成され、患者の血清と共にインキュベートされる。本プロセスは多数のペプチドを必要とするため、エラーが起こりやすく、時間を浪費し、労働集約型であり、かつ高価である。本フォーマットでのイムノアッセイはまた、多量の患者血清を必要とする。
食物アレルギーに対する臨床症状の著しい不均質性は、管理及び治療の成功に対して難題を突きつけ、故に、予防を改善し、現在の症例を管理して、食物アレルギーにおける新しい治療法を開始するための精密医療戦略が、非常に妥当である。食物アレルギーのエンドタイプ、進行するアレルギーのリスク、反応の深刻さ、及び治療による予後を測定するための、感受性及び特異的バイオマーカーは、精密医療を目指すにおいて必須要素である(非特許文献1)。過去10年間で、持続性の食物アレルギーを治療するための、経口免疫療法(OIT)の有効性を評価する多数の研究が存在する(非特許文献2)。ピーナッツアレルギーでは、OITは、許容される安全性プロファイルを有することが示されており、臨床効果を示している(非特許文献3)。臨床反応性は改善されているにもかかわらず、OITは重大な悪影響と関連しており、中には、アナフィラキシーを経験する者もおり、15%~20%が、拒絶反応が原因で治療法を中断させられた(Bird et al.,J.Allergy Clin.Immunol.Pract.,2017、非特許文献4、非特許文献5、非特許文献6、非特許文献7、非特許文献8)。拒絶反応に加えて、OITに対する応答は、治療法が中断すると通常は維持されない、即ち、患者は一時的に、アレルゲンに対して脱感作されるが、耐性を手に入れはしない(非特許文献2、非特許文献9、非特許文献10、非特許文献11、非特許文献12、及び非特許文献13)。しかし、進歩がなされており、新しい食物アレルギー治療法がFDA認可を受けようとしていることは明らかである。これらの治療的アプローチは、診断及び予後検査の恩恵を受け、これは、患者及びその医者が、治療に入る際の疾患の深刻度を理解し、拒絶反応が生じる前に、拒絶反応の進行または開始を評価する治療法において患者を監視し、治療が中断したときに患者の状態を追跡するのに役立つであろう。
ピーナッツタンパク質に対するIgE抗体の産生は、ピーナッツアレルギーの病因に対して要となる。臨床反応性の95%を予測する予測曲線を生成して、ピーナッツ特異的IgE濃度を同定したものの、ピーナッツIgEは低いIgEレベルでは予測が不十分であり、高いレベルでは読出しがただ二元的であるために、これを使用して、治療法の安全性または有効性を評価するのに役立てるのは難しい。これは、臨床的に関係しないピーナッツの構成成分に対するIgE抗体の測定が原因であり得る。Ara h 2に対するIgEは、ピーナッツに対する臨床反応性を予測する(非特許文献14)が、同様のレベルのAra h 2を有する個体においては、かなり多くの臨床不均質性が存在する。主要なアレルゲンの、連続したエピトープレパートリー全体を覆う、重なり合ったペプチドで構成されるペプチドマイクロアレイを開発して、エピトープ特異的免疫グロブリン応答が測定されてきた(非特許文献15、及び非特許文献16)。IgEに結合するAra h 1、2、及び3における、ピーナッツエピトープの数は、反応の深刻度を予測する(非特許文献17)。成分分解診断方法論(ImmunoCAP)として、ピーナッツ、Ara h1、Ara h2、及びAra h3に対して、sIgEが存在することは、「本当の」ピーナッツアレルギーを示し、高リスクの深刻な反応が存在することを示す(例えば、sIgE≧0.35kU/Lのレベルは、アレルギーの診断において、75~95% PPV、90% NPVを示す;非特許文献18)。
Sicherer et al.,J.Allergy Clin.Immunol.,2015,135,357-67 Wood et al.,J.Allergy Clin.Immunol.,2016,137,1103-1110 Bird et al.,J.Allergy Clin.Immunol.Pract.,2017,5,335-344 Keet Et al.,J.Allergy Clin.Immunol.,2012,129,448-455 Longo et al.,J.Allergy Clin.Immunol.,2008,121,343-7 Meglio et al.,Pediatr.Allergy Immunol.,2008,19,412-419 Skripak et al.,J.Allergy Clin.Immunol.,2008,122,1154-60 Staden et al.,Allergy,2007,62,1261-1269 Burks et al.,N.Engl.J.Med.,2012,367,233-243 Burks et al.,J.Allergy Clin.Immunol.,2008,121,1344-1350 Burks,Arb.Paul Ehrlich Inst.Bundesinstitut Impfstoffe Biomed Arzneim Langen Hess,2013,97,122-123 Gorelik et al.,J.Allergy Clin.Immunol.,2015,135,1283-1292 Keet et al.,J.Allergy Clin.Immunol.,2013,132,737-739 Lieberman et al.,J.Allergy Clin.Immunol.Pract.,2013,1,75-82 Lin et al.,J.Allergy Clin.Immunol.,2009,124,315-22 Lin et al.,J.Allergy Clin.Immunol.,2012,129,1321-1328 Flinterman et al.,J.Allergy Clin.Immunol.,2008,121,737-743 Klemans et al.,J.Allergy Clin.Immunol.,2013,131,157-163
本開示は、対象において、ピーナッツアレルギーを診断するための方法であって、固体支持体に結合した2つのピーナッツペプチドを、上記対象から入手した生体試料と、上記生体試料中の1つ以上のアレルギー関連免疫グロブリン(AAI)を上記2つのピーナッツペプチドと結合させて、AAI-ペプチド-固体支持体複合体を形成するのに十分な条件下にて接触させることであって、上記2つのピーナッツペプチドのうちの一方が、アミノ酸配列WELQGDRRCQSQLER(配列番号1)、または、配列番号1を含むが、当該配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列、を含み、上記2つのピーナッツペプチドのうちの他方が、アミノ酸配列DSYERDPYSPSQDPY(配列番号2)、または、配列番号2を含むが、当該配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列、を含む、上記接触させることと、上記AAI-ペプチド-固体支持体複合体を、AAI特異的標識試薬と接触させて、標識試薬-AAI-ペプチド-固体支持体複合体を形成することと、上記AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することと、を含み、上記AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、上記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合が、閾値を上回る場合に、上記対象がピーナッツアレルギーであり、上記AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、上記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合が、上記閾値以下である場合に、上記対象がピーナッツアレルギーではない、上記方法を提供する。
本開示は、ピーナッツアレルギーの対象において、ピーナッツに対する臨床耐性の発達を検出するための方法であって、固体支持体に結合した2つのピーナッツペプチドを、上記対象から入手した生体試料と、上記生体試料中の1つ以上のアレルギー関連免疫グロブリン(AAI)を上記2つのピーナッツペプチドと結合させて、2つのAAI-ペプチド-固体支持体複合体を形成するのに十分な条件下にて接触させることであって、上記2つのピーナッツペプチドのうちの一方が、アミノ酸配列WELQGDRRCQSQLER(配列番号1)、または、配列番号1を含むが、当該配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列、を含み、上記2つのピーナッツペプチドのうちの他方が、アミノ酸配列DSYERDPYSPSQDPY(配列番号2)、または、配列番号2を含むが、当該配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列、を含む、上記接触させることと、上記AAI-ペプチド-固体支持体複合体を、AAI特異的標識試薬と接触させて、標識試薬-AAI-ペプチド-固体支持体複合体を形成することと、上記AAI-特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することと、上記AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を、上記AAI特異的標識試薬の、上記対象から以前に入手した生体試料に由来する各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合と比較することと、を含み、上記AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、上記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合が、上記AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、上記以前に入手した生体試料用の上記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合以上である場合に、上記対象がピーナッツに対して臨床耐性を確立しておらず、上記AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、上記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合が、上記AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、上記以前に入手した生体試料用の上記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合未満である場合に、上記対象がピーナッツに対して臨床耐性を確立している、上記方法もまた提供する。
本開示は、乳児を、2つのピーナッツアレルゲンに対して脱感作し、ピーナッツに対して耐性またはノンアレルギーを誘発するための方法であって、2つのピーナッツペプチドを上記乳児に投与することを含み、上記2つのピーナッツペプチドのうちの一方が、アミノ酸配列WELQGDRRCQSQLER(配列番号1)、または、配列番号1を含むが、当該配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列、を含み、上記2つのピーナッツペプチドのうちの他方が、アミノ酸配列DSYERDPYSPSQDPY(配列番号2)、または、配列番号2を含むが、当該配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列、を含む、上記方法もまた提供する。
本開示は、アミノ酸配列WELQGDRRCQSQLER(配列番号1)、または、配列番号1を含むが、当該配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、第1のピーナッツペプチド、及び、アミノ酸配列DSYERDPYSPSQDPY(配列番号2)、または、配列番号2を含むが、当該配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、第2のピーナッツペプチドからなる組成物もまた提供する。
本開示は、アミノ酸配列WELQGDRRCQSQLER(配列番号1)、または、配列番号1を含むが、当該配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、第1のピーナッツペプチド、及び、アミノ酸配列DSYERDPYSPSQDPY(配列番号2)、または、配列番号2を含むが、当該配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、第2のピーナッツペプチドに結合した固体支持体;ならびに、アレルギー関連免疫グロブリン(AAI)特異的標識試薬を含むキットもまた提供する。
認証コホートでの検査結果、加えて、比較のために示す他の診断検査のパフォーマンスを示す。
本明細書に使用される用語は、特定の実施形態を説明する目的のみであり、制限するように意図するものではない。
いくつかの例示的実施形態を説明する前に、実施形態は、以下の説明で記載される構成またはプロセスステップの詳細に限定されないことと理解されるべきである。本明細書に記載する実施形態は変更可能であり、様々な方法で実践または実施可能である。
本開示を通して、「いくつかの実施形態」、またはその派生表現への言及は、実施形態に関連して記載される特定の特徴、構造、材料、または特色が、少なくとも1つの実施形態に含まれることを意味する。したがって、本開示を通した様々な場所における、「いくつかの実施形態では」などの語句の出現は、必ずしも、同一実施形態を参照するものではなく、一般的に、任意の他の実施形態に帰属することができる。さらに、特定の特徴、構造、材料、または特色は、1つ以上の実施形態における任意の好適な方法で組み合わせることができる。
本明細書で使用する場合、用語「アレルギー関連免疫グロブリン」及び「AAI」とは、ピーナッツアレルゲンに対する過敏症を媒介する、血清中の免疫グロブリンを意味する。これらとしては、IgE、IgD、IgA、IgM、及びIgG(IgG4を含む)のうちの1つ以上が挙げられる。
本明細書で使用する場合、用語「反応性の」、「反応性」、「認識する」などは、アレルギー関連免疫グロブリンが、アレルゲンエピトープ含有ペプチドに結合する能力を意味する。反応性のレベルは、より高いAAI濃度と関連する高い反応性及びより低いAAI濃度と関連するより低い反応性を有する、血清または血漿中のAAIの濃度を示す。相対的なAAI濃度(即ち、相対的な血清または血漿反応性)は、アッセイで検出されるシグナルの量により測定される。アレルゲンエピトープ含有ペプチドに対するAAIの反応性のレベルは、アレルギー反応の強度もまた示す(即ち、高い反応性は、より強いアレルギー反応と関連する)。
本明細書で使用する場合、用語「臨床耐性」とは、アレルゲンへの曝露の結果として、アレルギー対象により発達される、ピーナッツアレルゲンに対する免疫耐性(即ち、免疫療法の結果として発達した耐性)を意味する。
本明細書で使用する場合、用語「自然耐性」とは、生きている間での、または、曝露無しでの、アレルゲンに対する自然曝露の結果のいずれかとして、経時的に生化学的プロセスとして、アレルギー対象により発達される、ピーナッツアレルゲンに対する免疫耐性を意味する。
本開示は、ピーナッツペプチド組成物を提供する。いくつかの実施形態では、組成物は、2つのピーナッツペプチドからなる。いくつかの実施形態では、両方のピーナッツペプチドが、ara h 2ピーナッツアレルゲンに由来する。
いくつかの実施形態では、組成物中の第1のピーナッツペプチドは、アミノ酸配列WELQGDRRCQSQLER(ara h2 2.008;配列番号1)を含む。いくつかの実施形態では、組成物中の第1のピーナッツペプチドは、配列番号1に従うが、当該配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、組成物中の第1のピーナッツペプチドは、配列番号1に従うが、当該配列番号1の中に1個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、組成物中の第1のピーナッツペプチドは、配列番号1に従うが、当該配列番号1の中に2個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、組成物中の第1のピーナッツペプチドは、配列番号1に従うが、当該配列番号1の中に3個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、組成物中の第1のピーナッツペプチドは、配列番号1に従うが、当該配列番号1の中に4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、組成物中の第2のピーナッツペプチドは、アミノ酸配列DSYERDPYSPSQDPY(ara h2 2.019;配列番号2)を含む。いくつかの実施形態では、組成物中の第1のピーナッツペプチドは、配列番号2に従うが、当該配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、組成物中の第1のピーナッツペプチドは、配列番号2に従うが、当該配列番号2の中に1個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、組成物中の第1のピーナッツペプチドは、配列番号2に従うが、当該配列番号2の中に2個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、組成物中の第1のピーナッツペプチドは、配列番号2に従うが、当該配列番号2の中に3個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、組成物中の第1のピーナッツペプチドは、配列番号2に従うが、当該配列番号2の中に4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む。
保存的アミノ酸置換は、アミノ酸構造、及び、その側鎖(R基)の全般的な化学的特色に基づき、大部分が分類される。例えば、脂肪族アミノ酸としては、グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、及びイソロイシンが挙げられ、これらのアミノ酸はそれぞれ、互いに置換可能である。ヒドロキシルまたは硫黄/セレン含有アミノ酸としては、セリン、システイン、セレノシステイン、トレオニン、及びメチオニンが挙げられ、これらのアミノ酸はそれぞれ、互いに置換可能である。芳香族アミノ酸としては、フェニルアラニン、チロシン、及びトリプトファンが挙げられ、これらのアミノ酸はそれぞれ、互いに置換可能である。塩基性アミノ酸としてはヒスチジン、リジン、及びアルギニンが挙げられ、これらのアミノ酸はそれぞれ、互いに置換可能である。酸性またはアミド含有アミノ酸としては、アスパルテート、グルタメート、アスパラギン、及びグルタミンが挙げられ、これらのアミノ酸はそれぞれ、互いに置換可能である。
いくつかの実施形態では、各ピーナッツペプチドは固体支持体に結合している。いくつかの実施形態では、固体支持体はミクロスフェアビーズ、ガラスアレイ、シリコーンアレイ、メンブレン、またはマイクロタイタープレートである。いくつかの実施形態では、固体支持体はガラスアレイである。いくつかの実施形態では、固体支持体はシリコーンアレイである。いくつかの実施形態では、固体支持体はメンブレンである。いくつかの実施形態では、固体支持体はマイクロタイタープレートである。いくつかの実施形態では、固体支持体はミクロスフェアビーズである。いくつかの実施形態では、ミクロスフェアビーズはアビジン結合ミクロスフェアビーズである。いくつかの実施形態では、ビーズは、Mag(商標)Avidinビーズ、またはLumAvidin(商標)ビーズなどのLuminexビーズである。いくつかの実施形態では、固体支持体のそれぞれは、単一のピーナッツペプチドに結合する。
いくつかの実施形態では、ピーナッツペプチドのそれぞれは、リンカー-スペーサーにより固体支持体に結合する。いくつかの実施形態では、リンカー-スペーサーは、ビオチン、チオール、ヒドラジン、及びアミンから選択されるリンカーを含む。いくつかの実施形態では、リンカーはビオチンである。いくつかの実施形態では、リンカーはチオールである。いくつかの実施形態では、リンカーはヒドラジンである。いくつかの実施形態では、リンカーはアミンである。いくつかの実施形態では、リンカー-スペーサーは、ポリペプチド、オリゴヌクレオチド、アルキル基、及びポリエチレングリコール(PEG)基から選択されるスペーサーを含む。いくつかの実施形態では、スペーサーはポリペプチドである。いくつかの実施形態では、スペーサーはオリゴヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、スペーサーはアルキル基である。いくつかの実施形態では、アルキル基は、C-C18アルキル基、または、C-C12アルキル基である。いくつかの実施形態では、スペーサーはPEG基である。いくつかの実施形態では、PEG基はPEG1~PEG18である。いくつかの実施形態では、PEG基はPEG12である。いくつかの実施形態では、スペーサーはアルキル基、またはPEG基である。いくつかの実施形態では、ピーナッツペプチドのそれぞれのC末端は、リンカー-スペーサーにより固体支持体に結合している。いくつかの実施形態では、ピーナッツペプチドのそれぞれのN末端は、リンカー-スペーサーにより固体支持体に結合している。いくつかの実施形態では、ピーナッツペプチドのそれぞれのC末端は、ビオチン-PEG12リンカー-スペーサーにより固体支持体に結合している。
いくつかの実施形態では、ピーナッツペプチドは固体支持体に結合可能であり、各構成要素が、一対のクリックケミストリーリンカーの半分を有する。例えば、ピーナッツペプチド及び固体支持体の一方は1つのクリックケミストリーリンカーを有することができる一方で、ピーナッツペプチド及び固体支持体の他方は、対応するクリックケミストリーリンカーを有することができる。クリックケミストリーリンカーペアの例としては、アジド-DBCO、アミン-NHSエステル、及びチオール-マラミドが挙げられるが、これらに限定されない。
本開示は、対象においてピーナッツアレルギーを診断するための方法もまた提供する。方法は、固体支持体に結合した2つのピーナッツペプチドを、対象から入手した生体試料と接触させることを含む。接触させることは、生体試料中の1つ以上のアレルギー関連免疫グロブリン(AAI)を2つのピーナッツペプチドと結合させて、AAI-ペプチド-固体支持体複合体を形成するのに十分な条件下にて生じる。方法は、AAI-ペプチド-固体支持体複合体を、AAI特異的標識試薬と接触させて、標識試薬-AAI-ペプチド-固体支持体複合体を形成することもまた含む。方法は、AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することもまた含む。AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合が、閾値を上回る場合に、対象はピーナッツアレルギーである。AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合が、閾値以下である場合に、対象はピーナッツアレルギーではない。本明細書に記載するステップは、生体試料中で、2つのピーナッツペプチドに特異的なAAIの存在を検出するためのアッセイを含む。
本明細書に記載する固体支持体のいずれかに結合した2つのピーナッツペプチドのいずれかを使用することができる。例えば、いくつかの実施形態では、2つのピーナッツペプチドのうちの一方は、配列番号1に従ったアミノ酸配列、または、配列番号1を含むが、当該配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含み、2つのピーナッツペプチドのうちの他方は、配列番号2に従ったアミノ酸配列、または、配列番号2を含むが、当該配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、2つのピーナッツペプチドのうちの一方は、配列番号1に従ったアミノ酸配列を含み、2つのピーナッツペプチドのうちの他方は、配列番号2に従ったアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、これらのピーナッツペプチドはミクロスフェアビーズに結合している。ピーナッツペプチドのそれぞれは、本明細書に記載するリンカー-スペーサーのいずれかにより、固体支持体に結合することができる。ピーナッツペプチドのそれぞれは、本明細書に記載するそのC末端またはN末端により、固体支持体に結合することができる。
生体試料は、対象から入手される任意の生体試料であることができる。いくつかの実施形態では、生体試料は血清、血漿、唾液、または口腔スワブから選択される。いくつかの実施形態では、生体試料は血清または血漿である。いくつかの実施形態では、生体試料は血清である。いくつかの実施形態では、生体試料は血漿である。いくつかの実施形態では、生体試料は唾液である。いくつかの実施形態では、生体試料は口腔スワブである。
対象由来の生体試料に存在し得るAAIとしては、IgM、IgA、IgD、IgG、及び/またはIgEのいずれか1つ以上を挙げることができる。いくつかの実施形態では、生体試料中のAAIは、IgM、IgA、及び/またはIgDである。いくつかの実施形態では、生体試料中のAAIは、IgG及び/またはIgEである。いくつかの実施形態では、生体試料中のAAIは、IgEである。
いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬は、検出可能に標識された抗ヒト抗体である。いくつかの実施形態では、検出可能に標識された抗ヒト抗体は、検出可能に標識された抗ヒトIgA抗体である。いくつかの実施形態では、検出可能に標識された抗ヒト抗体は、検出可能に標識された抗ヒトIgD抗体である。いくつかの実施形態では、検出可能に標識された抗ヒト抗体は、検出可能に標識された抗ヒトIgM抗体である。いくつかの実施形態では、検出可能に標識された抗ヒト抗体は、検出可能に標識された抗ヒトIgG抗体である。いくつかの実施形態では、検出可能に標識された抗ヒト抗体は、検出可能に標識された抗ヒトIgE抗体である。
いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、フィコエリトリン(PE)、シアニン染料、蛍光染料、赤外線染料、色原体染料、酵素標識、及び放射能標識から選択される。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、PEである。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、シアニン染料である。いくつかの実施形態では、シアニン染料は、Cy3またはCy5である。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、蛍光染料である。いくつかの実施形態では、蛍光染料はテキサスレッドまたはアレクサフルオロである。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、赤外線(IR)染料である。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、色原体染料である。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、酵素標識である。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、放射能標識である。いくつかの実施形態では、酵素標識は、西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)またはアルカリホスファターゼである。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、HRPである。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、アルカリホスファターゼである。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬は、PE標識された抗ヒトIgE抗体である。いくつかの実施形態では、単一の検出可能な標識は一般に、あらゆる複合体の普遍的な検出に使用することができる。
いくつかの実施形態では、抗ヒトAAI抗体を、直接検出可能ではないレポーター部分にコンジュゲートすることができる。それ故に、第2の直接検出可能なレポーター部分の、標識試薬への特異的結合が、結合を分析するために必要である。例えば、ビオチンコンジュゲート化抗AAIを検出するために、ビオチンコンジュゲート化抗AAI抗体を、ストレプトアビジンコンジュゲート化蛍光染料と組み合わせて使用することができる。間接的に検出可能なレポーター部分の例としては、ビオチン、ジゴキシゲニン、及び、直接検出のために標識された、二次抗体(例えば、抗ジゴキシゲニン)または他の結合パートナー(例えば、ストレプトアビジン)の、その後の結合の際に検出可能な、他のハプテンが挙げられる。
いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することは、ポイントオブケアデバイスにより実施される。いくつかの実施形態では、ポイントオブケアデバイスは、多重ペプチド-ビーズフローサイトメトリー分析デバイス、または、ラテラルフローアッセイデバイスである。いくつかの実施形態では、検出可能な標識は、銀染色、量子ドット、または屈折法により観察することができる。
前述の実施形態のいずれかは、マイクロアレイイムノアッセイの形態であることができ、2つのピーナッツペプチドのそれぞれは、マイクロタイタープレートの個別のウェルに結合し、生体試料と反応してAAIに結合する。ピーナッツペプチドは、ラテラルフローイムノアッセイフォーマットでも使用可能であり、各ペプチドは、多孔質またはクロマトグラフ支持体上の個々の領域で固定され、血清または血漿は、支持体を通して吸い上げられて、AAIをペプチドに結合させるためのペプチドと接触する。本アッセイでは、AAI特異的標識試薬は、抗AAI抗体にコンジュゲート化した発色団または染料を含むことができる。標識試薬もまた、支持体を通して吸い上げられて、標識試薬を複合体に結合するためのペプチド-AAI複合体と接触し、このことは、支持体の各個別の位置において固定されたピーナッツペプチドに対する抗体が、血清または血漿に存在するか、または存在しないかを示す。
前述の実施形態のいずれかは、各ピーナッツペプチドが、ビーズなどのフローサイトメトリーにより、分析に適した、個別に特定可能な固体支持体に結合する、フローサイトメトリーアッセイの形態で存在することもまた可能である。いくつかの実施形態では、結合ペプチドを含むビーズは、対象の生体試料と接触し、ペプチドを介してビーズに結合した、任意のペプチド特異的AAIと結合することによって、ビーズ上にペプチド-AAI複合体を形成する。次に、例えば蛍光性レポーター部分を含むAAI特異的標識試薬を、ペプチド-AAI複合体に結合させ、ビーズをフローサイトメトリーにより、定量的または定性的に分析する。これは、ピーナッツペプチドが結合する各ビーズと関連する、結合した標識試薬からの蛍光を検出する。
いくつかの実施形態では、フローサイトメトリーアッセイは、Luminexにより提供されるものなどの多重アッセイであることができ、これは、ペプチド及びタンパク質の定量化及び検出のために、ミクロスフェアアレイプラットフォームを使用する。ピーナッツペプチドのそれぞれは、同一または異なる分光特性を有する一連のビーズに結合し、これを使用して、フローサイトメトリーにより、AAIに結合した関連するピーナッツペプチドを定量することができる。次に、一連のビーズを、対象の生体試料と接触させて、ペプチド認識AAIを各ビーズと結合させて、ビーズ上にペプチド-AAI複合体、及び、例えば、複合体のAAIに結合した蛍光性レポーター部分を含むAAI特異的標識試薬を形成する。各ビーズの分光特性、及び、結合した標識試薬からの、関連する蛍光の量を監視することにより、ビーズを分析する。本プロセスにより、ビーズ上でのペプチドの定量、及び、当該ペプチドに対して反応性であるAAIの有無の定量が可能となる。アッセイの結果を、本明細書で論じるように解釈する。
本明細書に記載の方法のいずれかで使用するのに特に有用な定量アッセイは、ELISAのハイスループット代替物である、LUMINEX exMAP多重ビーズアッセイなどの、フローサイトメトリー分析のための多重ペプチド-ビーズアッセイである。本アッセイでは、異なる比率の赤色、及び近赤外線フルオロフォアで染色したポリスチレンビーズ(ミクロスフェア)を、固体支持体として使用する。ペプチドは、ビーズ上でコーティングされたペプチド特異的捕捉抗体を通して、化学的に、ビーズに連結、またはビーズに結合することができる。フルオロフォアの比率は、デジタル信号処理を使用するフローサイトメーターにより識別可能な、各ビーズ集団に対する「スペクトルアドレス」を画定する。ビーズに結合した標識試薬のレポーター部分の蛍光強度を測定するために、第3の蛍光色の検出を使用する。各ペプチドを、特定の「スペクトルアドレス」を有するビーズに結合させることにより、複数の検体を同時に検出することができる。ビーズに結合したペプチドに対して特異的なAAIを含有する生体試料を、ビーズと接触させた後で、レポーター部分にコンジュゲート化した抗ヒトAAI抗体を添加する。いくつかの実施形態では、抗ヒトAAIのレポーター部分はビオチンであり、フィコエリスリン(PE)コンジュゲート化ストレプトアビジンへの結合により、検出のための蛍光シグナルがもたらされる。標識試薬の結合の後、ビーズを、LUMINEX 200またはBio-Rad BIO-PLEX分析器などの、デュアルレーザーフローベース検出機器で分析する。第1のレーザーは、ビーズを分類して、ビーズに結合したペプチドを識別する。第2のレーザーは、レポーターに由来するシグナルの規模を測定し、これは、結合した血清または血漿AAIの量に正比例する。
いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することは、各AAI特異的標識試薬の平均蛍光強度(MFI)を測定することを含む。AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、AAI特異的標識試薬への組み合わせたMFI結合が、閾値を上回る場合に、対象はピーナッツアレルギーである。AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、AAI特異的標識試薬への組み合わせたMFIが、閾値以下である場合に、対象はピーナッツアレルギーではない。いくつかの実施形態では、h2.008+(h2.019)/20が≦0.20である場合、対象はピーナッツアレルギーではない。いくつかの実施形態では、h2.008+(h2.019)/20が>0.20である場合、対象はピーナッツアレルギーである。これらの等式において、h2.008は、標識試薬AAI-ペプチド-固体支持体複合体の較正純MFIであり、ピーナッツペプチドは配列番号1を含み、h2.019は、標識試薬AAI-ペプチド-固体支持体複合体の較正純MFIであり、ピーナッツペプチドは配列番号2を含む。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬は、本明細書に記載する、検出可能に標識された抗ヒト抗体のいずれかである。いくつかの実施形態では、各AAI特異的標識試薬のMFIは、バックグラウンド減算される。
いくつかの実施形態では、方法は、プリックテスト(SPT)及び/または全ピーナッツ特異的IgE(sIgE)検査を行うこと、または、行っていることをさらに含む。いくつかの実施形態では、方法は、SPTを行うこと、または、行っていることをさらに含む。いくつかの実施形態では、方法は、sIgE検査を行うこと、または、行っていることをさらに含む。いくつかの実施形態では、SPT≦3mmであり、及び/または、sIgE≦0.10kU/Lであるとき、対象はピーナッツアレルギーではなく、SPT≧18mmであり、及び/または、sIgE≧18kU/Lであるとき、対象はピーナッツアレルギーである。
本開示は、ピーナッツアレルギーの対象において、ピーナッツに対する臨床耐性の発達を検出するための方法もまた提供する。方法は、固体支持体に結合した2つのピーナッツペプチドを、対象から入手した生体試料と、生体試料中の1つ以上のアレルギー関連免疫グロブリン(AAI)を2つのピーナッツペプチドと結合させて、2つのAAI-ペプチド-固体支持体複合体を形成するのに十分な条件下にて接触させることを含む。次に、AAI-ペプチド-固体支持体複合体をAAI特異的標識試薬と接触させて、標識試薬-AAI-ペプチド-固体支持体複合体を形成する。方法は、AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することを含む。方法は、AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を、AAI特異的標識試薬の、対象から以前に入手した生体試料に由来する各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合と比較することもまた含む。AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合が、AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、以前に入手した生体試料用の上記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合以上である場合、対象はピーナッツに対して臨床耐性を確立していない。AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合が、AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、以前に入手した生体試料用のAAI特異的標識試薬への組み合わせた結合未満である場合、対象はピーナッツに対して臨床耐性を確立している。
本明細書に記載する固体支持体のいずれかに結合した2つのピーナッツペプチドのいずれかを使用することができる。例えば、いくつかの実施形態では、2つのピーナッツペプチドのうちの一方は、配列番号1に従ったアミノ酸配列、または、配列番号1を含むが、当該配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含み、2つのピーナッツペプチドのうちの他方は、配列番号2に従ったアミノ酸配列、または、配列番号2を含むが、当該配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、2つのピーナッツペプチドのうちの一方は、配列番号1に従ったアミノ酸配列を含み、2つのピーナッツペプチドのうちの他方は、配列番号2に従ったアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、これらのピーナッツペプチドはミクロスフェアビーズに結合している。ピーナッツペプチドのそれぞれは、本明細書に記載するリンカー-スペーサーのいずれかにより、固体支持体に結合することができる。ピーナッツペプチドのそれぞれは、本明細書に記載するそのC末端またはN末端により、固体支持体に結合することができる。
生体試料は、対象から入手される任意の生体試料であることができる。いくつかの実施形態では、生体試料は血清、血漿、唾液、または口腔スワブから選択される。いくつかの実施形態では、生体試料は血清または血漿である。いくつかの実施形態では、生体試料は血清である。いくつかの実施形態では、生体試料は血漿である。いくつかの実施形態では、生体試料は唾液である。いくつかの実施形態では、生体試料は口腔スワブである。
対象由来の生体試料に存在し得るAAIとしては、IgM、IgA、IgD、IgG、及び/またはIgEのいずれか1つ以上を挙げることができる。いくつかの実施形態では、生体試料中のAAIは、IgM、IgA、及び/またはIgDである。いくつかの実施形態では、生体試料中のAAIは、IgG及び/またはIgEである。いくつかの実施形態では、生体試料中のAAIは、IgEである。
いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬は、検出可能に標識された抗ヒト抗体である。いくつかの実施形態では、検出可能に標識された抗ヒト抗体は、検出可能に標識された抗ヒトIgA抗体である。いくつかの実施形態では、検出可能に標識された抗ヒト抗体は、検出可能に標識された抗ヒトIgD抗体である。いくつかの実施形態では、検出可能に標識された抗ヒト抗体は、検出可能に標識された抗ヒトIgM抗体である。いくつかの実施形態では、検出可能に標識された抗ヒト抗体は、検出可能に標識された抗ヒトIgG抗体である。いくつかの実施形態では、検出可能に標識された抗ヒト抗体は、検出可能に標識された抗ヒトIgE抗体である。
いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、フィコエリトリン(PE)、シアニン染料、蛍光染料、赤外線染料、色原体染料、酵素標識、及び放射能標識から選択される。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、PEである。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、シアニン染料である。いくつかの実施形態では、シアニン染料は、Cy3またはCy5である。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、蛍光染料である。いくつかの実施形態では、蛍光色素は、テキサスレッドまたはアレクサフルオロである。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、IR染料である。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、色原体染料である。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、酵素標識である。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、放射能標識である。いくつかの実施形態では、酵素標識は、西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)またはアルカリホスファターゼである。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、HRPである。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の検出可能な標識は、アルカリホスファターゼである。いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬は、PE標識された抗ヒトIgE抗体である。いくつかの実施形態では、単一の検出可能な標識は一般に、あらゆる複合体の普遍的な検出に使用することができる。
いくつかの実施形態では、抗ヒトAAI抗体を、直接検出可能ではないレポーター部分にコンジュゲートすることができる。それ故に、第2の直接検出可能なレポーター部分の、標識試薬への特異的結合が、結合を分析するために必要である。例えば、ビオチンコンジュゲート化抗AAIを検出するために、ビオチンコンジュゲート化抗AAI抗体を、ストレプトアビジンコンジュゲート化蛍光染料と組み合わせて使用することができる。間接的に検出可能なレポーター部分の例としては、ビオチン、ジゴキシゲニン、及び、直接検出のために標識された、二次抗体(例えば、抗ジゴキシゲニン)または他の結合パートナー(例えば、ストレプトアビジン)の、その後の結合の際に検出可能な、他のハプテンが挙げられる。
いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することは、ポイントオブケアデバイスにより実施される。いくつかの実施形態では、ポイントオブケアデバイスは、多重ペプチド-ビーズフローサイトメトリー分析デバイス、または、ラテラルフローアッセイデバイスである。いくつかの実施形態では、検出可能な標識は、銀染色、量子ドット、または屈折法により観察することができる。
前述の実施形態のいずれかは、マイクロアレイイムノアッセイの形態であることができ、2つのピーナッツペプチドのそれぞれは、マイクロタイタープレートの個別のウェルに結合し、生体試料と反応してAAIに結合する。ピーナッツペプチドは、ラテラルフローイムノアッセイフォーマットでも使用可能であり、各ペプチドは、多孔質またはクロマトグラフ支持体上の個々の領域で固定され、血清または血漿は、支持体を通して吸い上げられて、AAIをペプチドに結合させるためのペプチドと接触する。本アッセイでは、AAI特異的標識試薬は、抗AAI抗体にコンジュゲート化した発色団または染料を含むことができる。標識試薬もまた、支持体を通して吸い上げられて、標識試薬を複合体に結合するためのペプチド-AAI複合体と接触し、このことは、支持体の各個別の位置において固定されたピーナッツペプチドに対する抗体が、血清または血漿に存在するか、または存在しないかを示す。
前述の実施形態のいずれかは、各ピーナッツペプチドが、ビーズなどのフローサイトメトリーにより、分析に適した、個別に特定可能な固体支持体に結合する、フローサイトメトリーアッセイの形態で存在することもまた可能である。いくつかの実施形態では、結合ペプチドを含むビーズは、対象の生体試料と接触し、ペプチドを介してビーズに結合した、任意のペプチド特異的AAIと結合することによって、ビーズ上にペプチド-AAI複合体を形成する。次に、例えば蛍光性レポーター部分を含むAAI特異的標識試薬を、ペプチド-AAI複合体に結合させ、ビーズをフローサイトメトリーにより、定量的または定性的に分析する。これは、ピーナッツペプチドが結合する各ビーズと関連する、結合した標識試薬からの蛍光を検出する。
いくつかの実施形態では、フローサイトメトリーアッセイは、Luminexにより提供されるものなどの多重アッセイであることができ、これは、ペプチド及びタンパク質の定量化及び検出のために、ミクロスフェアアレイプラットフォームを使用する。ピーナッツペプチドのそれぞれは、同一または異なる分光特性を有する一連のビーズに結合し、これを使用して、フローサイトメトリーにより、AAIに結合した関連するピーナッツペプチドを定量することができる。次に、一連のビーズを、対象の生体試料と接触させて、ペプチド認識AAIを各ビーズと結合させて、ビーズ上にペプチド-AAI複合体、及び、例えば、複合体のAAIに結合した蛍光性レポーター部分を含むAAI特異的標識試薬を形成する。各ビーズの分光特性、及び、結合した標識試薬からの、関連する蛍光の量を監視することにより、ビーズを分析する。本プロセスにより、ビーズ上でのペプチドの定量、及び、当該ペプチドに対して反応性であるAAIの有無の定量が可能となる。アッセイの結果を、本明細書で論じるように解釈する。
本明細書に記載の方法のいずれかで使用するのに特に有用な定量アッセイは、ELISAのハイスループット代替物である、LUMINEX exMAP多重ビーズアッセイなどの、フローサイトメトリー分析のための多重ペプチド-ビーズアッセイである。本アッセイでは、異なる比率の赤色、及び近赤外線フルオロフォアで染色したポリスチレンビーズ(ミクロスフェア)を、固体支持体として使用する。ペプチドは、ビーズ上でコーティングされたペプチド特異的捕捉抗体を通して、化学的に、ビーズに連結、またはビーズに結合することができる。フルオロフォアの比率は、デジタル信号処理を使用するフローサイトメーターにより識別可能な、各ビーズ集団に対する「スペクトルアドレス」を画定する。ビーズに結合した標識試薬のレポーター部分の蛍光強度を測定するために、第3の蛍光色の検出を使用する。各ペプチドを、特定の「スペクトルアドレス」を有するビーズに結合させることにより、複数の検体を同時に検出することができる。ビーズに結合したペプチドに対して特異的なAAIを含有する生体試料を、ビーズと接触させた後で、レポーター部分にコンジュゲート化した抗ヒトAAI抗体を添加する。いくつかの実施形態では、抗ヒトAAIのレポーター部分はビオチンであり、フィコエリスリン(PE)コンジュゲート化ストレプトアビジンへの結合により、検出のための蛍光シグナルがもたらされる。標識試薬の結合の後、ビーズを、LUMINEX 200またはBio-Rad BIO-PLEX分析器などの、デュアルレーザーフローベース検出機器で分析する。第1のレーザーは、ビーズを分類して、ビーズに結合したペプチドを識別する。第2のレーザーは、レポーターに由来するシグナルの規模を測定し、これは、結合した血清または血漿AAIの量に正比例する。
いくつかの実施形態では、AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することは、本明細書に記載する各AAI特異的標識試薬のMFIを測定することを含む。方法は、AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を、AAI特異的標識試薬の、対象から以前に入手した生体試料に由来する各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合と比較することもまた含む。AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合が、AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、以前に入手した生体試料用の上記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合以上である場合、対象はピーナッツに対して臨床耐性を確立していない。AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合が、AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、以前に入手した生体試料用のAAI特異的標識試薬への組み合わせた結合未満である場合、対象はピーナッツに対して臨床耐性を確立している。いくつかの実施形態では、各AAI特異的標識試薬のMFIは、バックグラウンド減算される。
臨床耐性を発達させるために検査を受ける対象の年齢は、約2歳~17歳であることができる。いくつかの実施形態では、対象は約1歳未満、約2歳未満、約3歳未満、約4歳未満、約5歳未満、または、約6歳未満である。
いくつかの実施形態では、臨床耐性の発達の初期検出を使用して、対象が、アレルギーに対して自然耐性を発達させるか、または、治療法に対して応答性であるかのいずれであるかを予測することができる。いくつかの実施形態では、アレルギーの対象を、初期プロファイルを分析する前に免疫原(免疫療法)に曝露する。後の時点において、初期プロファイルにおける、本明細書に記載する2つのピーナッツペプチドに対する、AAI全ての血清濃度が、少なくとも2倍減少している場合、対象が、ピーナッツに対して臨床または自然耐性のいずれかを発達させている可能性が高い。
本開示は、乳児を、2つのピーナッツアレルゲンに対して脱感作し、ピーナッツに対して耐性またはノンアレルギーを誘発するための方法もまた提供する。いくつかの実施形態では、方法は、乳児に2つのピーナッツペプチドを投与することを含む。2つのピーナッツペプチドのうちの一方は、アミノ酸配列WELQGDRRCQSQLER(配列番号1)、または、配列番号1を含むが、当該配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む。2つのピーナッツペプチドのうちの他方は、アミノ酸配列DSYERDPYSPSQDPY(配列番号2)、または、配列番号2を含むが、当該配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む。本明細書に記載するピーナッツペプチドのいずれかを使用することができる。いくつかの実施形態では、2つのピーナッツペプチドのうちの一方は、配列番号1に従ったアミノ酸配列を含み、2つのピーナッツペプチドのうちの他方は、配列番号2に従ったアミノ酸配列を含む。これらのペプチドは、個別に、組み合わせて、または、他の治療アプローチと組み合わせて、のいずれかで、ピーナッツアレルギーを脱感作するための特定の実用性を有することができる。
ピーナッツペプチドを経口、舌下、皮内、皮下、吸引、または皮膚上経路を介して投与し、脱感作を誘発することができる。脱感作を受ける対象の年齢は、約1歳未満、約2歳未満、約3歳未満、約4歳未満、約5歳未満、または、約6歳未満であることができる。全ペプチドまたは個々のペプチドの量は、用量当たり約1グラム以下であることができる。
本開示は、本明細書に記載の方法のいずれかを実施するためのキットもまた提供する。いくつかの実施形態では、キットは、アミノ酸配列WELQGDRRCQSQLER(配列番号1)、または、配列番号1を含むが、当該配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、第1のピーナッツペプチド、及び、アミノ酸配列DSYERDPYSPSQDPY(配列番号2)、または、配列番号2を含むが、当該配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、第2のピーナッツペプチドに結合した固体支持体を含む。キットは、アレルギー関連免疫グロブリン(AAI)特異的標識試薬もまた含む。
本明細書に記載するキットは、追加の成分もまた含んでよい。いくつかの実施形態では、キットは、使用に関する指示をさらに含む。いくつかの実施形態では、キットは、結合緩衝液、洗浄緩衝液、検出緩衝液、非アレルギー対照試料、陰性緩衝液対照試料、及び、アレルギー陽性対照試料のうちの1つ以上をさらに含む。いくつかの実施形態では、ピーナッツタンパク質の非反応性エピトープを含有するペプチドを、陰性対照として使用することができる。
固体支持体に結合したペプチドは、本明細書に記載するピーナッツペプチドのいずれかであることができ、本明細書に記載する手段のいずれかにより、固体支持体に結合することができる。固体支持体は、本明細書に記載する固体支持体のいずれかであることができる。AAI特異的標識試薬は、本明細書に記載するAAI特異的標識試薬のいずれかであることができる。AAI特異的標識試薬のいずれかを検出可能な標識は、本明細書に記載する検出可能な標識のいずれかであることができる。
本明細書に記載する主題は、多くの利点を有する。まず、方法は、アレルギー対象及び非アレルギー対象を確実に識別する(例えば、PPV=95%、及びNPV=92%)。2番目に、方法により、医師が、場合により、不確定な試験結果及び/または不明瞭な病歴を有する、最大67%の既存の患者を取り除くことができるようになり、偽陽性を最小限に抑えることで、過剰診断を著しく減らし、生活の質の問題(例えば、不安、いじめ、ピーナッツのない環境の必要性)を改善することができるようになり得る。3番目に、方法は、経時的に対象の疾患状態を監視し、経時的にアレルギーの進展を監視し、経時的に疾患状態の定量的測定をもたらすための、より良い方法を提供する。4番目に、方法を使用して、より良い治療ガイダンスを提供することができる。例えば、方法を使用して、食物経口負荷試験(OFC)または治療法を行うか行わないかに関する決定を向上させ、OFCの使用を最適化し、確実に治療法の適切な候補を識別することができる。5番目に、本明細書に記載の方法は、コストを軽減する。例えば、方法は、追加の検査(例えば、OFC、sIgE、及び、成分分解診断(CRD))の必要性を減らし、誤った診断をした人の標識を外すことで、食物アレルギーに関連するコストを取り除き、標識を外すことで、不必要な免疫療法と関連するコストを取り除くことができ、標識を外した対象は、エピペンの購入及び再補充をする必要がなく、非ピーナッツ食物をさらに購入する必要がなく、例えば、職場で体調が悪い日などに、他のコストを軽減する。
以下に、代表的な実施形態を示す。
実施形態1。対象において、ピーナッツアレルギーを診断するための方法であって、固体支持体に結合した2つのピーナッツペプチドを、上記対象から入手した生体試料と、上記生体試料中の1つ以上のアレルギー関連免疫グロブリン(AAI)を上記2つのピーナッツペプチドと結合させて、AAI-ペプチド-固体支持体複合体を形成するのに十分な条件下にて接触させることであって、上記2つのピーナッツペプチドのうちの一方が、アミノ酸配列WELQGDRRCQSQLER(配列番号1)、または、配列番号1を含むが、当該配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列、を含み、上記2つのピーナッツペプチドのうちの他方が、アミノ酸配列DSYERDPYSPSQDPY(配列番号2)、または、配列番号2を含むが、当該配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列、を含む、上記接触させることと、上記AAI-ペプチド-固体支持体複合体を、AAI特異的標識試薬と接触させて、標識試薬-AAI-ペプチド-固体支持体複合体を形成することと、上記AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することと、を含み、上記AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、上記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合が、閾値を上回る場合に、上記対象がピーナッツアレルギーであり、上記AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、上記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合が、上記閾値以下である場合に、上記対象がピーナッツアレルギーではない、上記方法。
実施形態2。上記生体試料が血清、血漿、唾液、または口腔スワブから選択される、実施形態1に記載の方法。
実施形態3。上記生体試料が血清または血漿である、実施形態1に記載の方法。
実施形態4。上記2つのピーナッツペプチドのうちの一方が、配列番号1に従ったアミノ酸配列を含み、上記2つのピーナッツペプチドのうちの他方が、配列番号2に従ったアミノ酸配列を含む、実施形態1~3のいずれか1つに記載の方法。
実施形態5。上記ピーナッツペプチドのそれぞれが、リンカー-スペーサーにより上記固体支持体に結合する、実施形態1~4のいずれか1つに記載の方法。
実施形態6。上記リンカー-スペーサーが、ビオチン、チオール、ヒドラジン、及びアミンから選択されるリンカー、ならびに、ポリペプチド、オリゴヌクレオチド、アルキル基、及びポリエチレングリコール(PEG)基から選択されるスペーサーを含む、実施形態5に記載の方法。
実施形態7。上記スペーサーがアルキル基またはPEG基である、実施形態6に記載の方法。
実施形態8。上記アルキル基がC-C18アルキル基である、実施形態7に記載の方法。
実施形態9。上記PEG基がPEG1~PEG18である、実施形態7に記載の方法。
実施形態10。上記PEG基がPEG12である、実施形態9に記載の方法。
実施形態11。上記ピーナッツペプチドのそれぞれのC末端が、上記リンカー-スペーサーにより上記固体支持体に結合している、実施形態5~10のいずれか1つに記載の方法。
実施形態12。上記ピーナッツペプチドのそれぞれのN末端が、上記リンカー-スペーサーにより上記固体支持体に結合している、実施形態5~10のいずれか1つに記載の方法。
実施形態13。上記ピーナッツペプチドのそれぞれのC末端が、ビオチン-PEG12リンカー-スペーサーにより上記固体支持体に結合している、実施形態5に記載の方法。
実施形態14。上記固体支持体がミクロスフェアビーズ、ガラスアレイ、シリコーンアレイ、メンブレン、またはマイクロタイタープレートである、実施形態1~13のいずれか1つに記載の方法。
実施形態15。上記固体支持体がミクロスフェアビーズである、実施形態14に記載の方法。
実施形態16。上記ミクロスフェアビーズがアビジン結合ミクロスフェアビーズである、実施形態15に記載の方法。
実施形態17。上記AAIがIgM、IgA、及び/またはIgDである、実施形態1~16のいずれか1つに記載の方法。
実施形態18。上記AAIがIgG及び/またはIgEである、実施形態1~16のいずれか1つに記載の方法。
実施形態19。上記AAIがIgEである、実施形態1~16のいずれか1つに記載の方法。
実施形態20。上記AAI特異的標識試薬が、検出可能に標識された抗ヒト抗体である、実施形態1~19のいずれか1つに記載の方法。
実施形態21。上記検出可能に標識された抗ヒト抗体が、検出可能に標識された抗ヒトIgE抗体である、実施形態20に記載の方法。
実施形態22。上記AAI特異的標識試薬の上記検出可能な標識が、フィコエリトリン(PE)、シアニン染料、蛍光染料、赤外線染料、色原体染料、酵素標識、及び放射能標識から選択される、実施形態20または実施形態21に記載の方法。
実施形態23。上記検出可能な標識がPEである、実施形態22に記載の方法。
実施形態24。上記AAI特異的標識試薬が、PE標識された抗ヒトIgE抗体である、実施形態20に記載の方法。
実施形態25。上記AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することが、ポイントオブケアデバイスにより実施される、実施形態1~24のいずれか1つに記載の方法。
実施形態26。上記ポイントオブケアデバイスが、多重ペプチド-ビーズフローサイトメトリー分析デバイス、または、ラテラルフローアッセイデバイスである、実施形態25に記載の方法。
実施形態27。上記AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することが、各AAI特異的標識試薬の平均蛍光強度(MFI)を測定することを含み、h2.008+(h2.019)/20が≦0.20である場合、上記対象はピーナッツアレルギーではなく、h2.008+(h2.019)/20が>0.20である場合、上記対象はピーナッツアレルギーであり、h2.008は、上記標識試薬AAI-ペプチド-固体支持体複合体の較正純MFIであり、上記ピーナッツペプチドが配列番号1を含み、h2.019は、上記標識試薬AAI-ペプチド-固体支持体複合体の較正純MFIであり、上記ピーナッツペプチドが配列番号2を含み、上記AAI特異的標識試薬が、検出可能に標識された抗ヒト抗体である、実施形態1~26のいずれか1つに記載の方法。
実施形態28。各AAI特異的標識試薬のMFIが、バックグラウンド減算される、実施形態27に記載の方法。
実施形態29。プリックテスト(SPT)及び/または全ピーナッツ特異的IgE(sIgE)検査を行うこと、または、行っていることをさらに含む、実施形態1~28のいずれか1つに記載の方法。
実施形態30。SPT≦3mmであり、及び/または、sIgE≦0.10kU/Lであるとき、上記対象はピーナッツアレルギーではなく、SPT≧18mmであり、及び/または、sIgE≧18kU/Lであるとき、上記対象はピーナッツアレルギーである、実施形態29に記載の方法。
実施形態31。ピーナッツアレルギーの対象において、ピーナッツに対する臨床耐性の発達を検出するための方法であって、固体支持体に結合した2つのピーナッツペプチドを、上記対象から入手した生体試料と、上記生体試料中の1つ以上のアレルギー関連免疫グロブリン(AAI)を上記2つのピーナッツペプチドと結合させて、2つのAAI-ペプチド-固体支持体複合体を形成するのに十分な条件下にて接触させることであって、上記2つのピーナッツペプチドのうちの一方が、アミノ酸配列WELQGDRRCQSQLER(配列番号1)、または、配列番号1を含むが、当該配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列、を含み、上記2つのピーナッツペプチドのうちの他方が、アミノ酸配列DSYERDPYSPSQDPY(配列番号2)、または、配列番号2を含むが、当該配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列、を含む、上記接触させることと、上記AAI-ペプチド-固体支持体複合体を、AAI特異的標識試薬と接触させて、標識試薬-AAI-ペプチド-固体支持体複合体を形成することと、上記AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することと、上記AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を、上記AAI特異的標識試薬の、上記対象から以前に入手した生体試料に由来する各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合と比較することと、を含み、上記AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、上記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合が、上記AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、上記以前に入手した生体試料用の上記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合以上である場合に、上記対象がピーナッツに対して臨床耐性を確立しておらず、上記AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、上記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合が、上記AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、上記以前に入手した生体試料用の上記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合未満である場合に、上記対象がピーナッツに対して臨床耐性を確立している、上記方法。
実施形態32。上記生体試料が血清、血漿、唾液、または口腔スワブから選択される、実施形態31に記載の方法。
実施形態33。上記生体試料が血清または血漿である、実施形態31に記載の方法。
実施形態34。上記2つのピーナッツペプチドのうちの一方が、配列番号1に従ったアミノ酸配列を含み、上記2つのピーナッツペプチドのうちの他方が、配列番号2に従ったアミノ酸配列を含む、実施形態31~33のいずれか1つに記載の方法。
実施形態35。上記ピーナッツペプチドのそれぞれが、リンカー-スペーサーにより上記固体支持体に結合する、実施形態31~34のいずれか1つに記載の方法。
実施形態36。上記リンカー-スペーサーが、ビオチン、チオール、ヒドラジン、及びアミンから選択されるリンカー、ならびに、ポリペプチド、オリゴヌクレオチド、アルキル基、及びポリエチレングリコール(PEG)基から選択されるスペーサーを含む、実施形態35に記載の方法。
実施形態37。上記スペーサーがアルキル基またはPEG基である、実施形態36に記載の方法。
実施形態38。上記アルキル基がC-C18アルキル基である、実施形態37に記載の方法。
実施形態39。上記PEG基がPEG1~PEG18である、実施形態37に記載の方法。
実施形態40。上記PEG基がPEG12である、実施形態39に記載の方法。
実施形態41。上記ピーナッツペプチドのそれぞれのC末端が、上記リンカー-スペーサーにより上記固体支持体に結合している、実施形態35~40のいずれか1つに記載の方法。
実施形態42。上記ピーナッツペプチドのそれぞれのN末端が、上記リンカー-スペーサーにより上記固体支持体に結合している、実施形態35~40のいずれか1つに記載の方法。
実施形態43。上記ピーナッツペプチドのそれぞれのC末端が、ビオチン-PEG12リンカー-スペーサーにより上記固体支持体に結合している、実施形態35に記載の方法。
実施形態44。上記固体支持体がミクロスフェアビーズ、ガラスアレイ、シリコーンアレイ、メンブレン、またはマイクロタイタープレートである、実施形態31~43のいずれか1つに記載の方法。
実施形態45。上記固体支持体がミクロスフェアビーズである、実施形態44に記載の方法。
実施形態46。上記ミクロスフェアビーズがアビジン結合ミクロスフェアビーズである、実施形態45に記載の方法。
実施形態47。上記AAIがIgM、IgA、及び/またはIgDである、実施形態31~46のいずれか1つに記載の方法。
実施形態48。上記AAIがIgG及び/またはIgEである、実施形態31~46のいずれか1つに記載の方法。
実施形態49。上記AAIがIgEである、実施形態31~46のいずれか1つに記載の方法。
実施形態50。上記AAI特異的標識試薬が、検出可能に標識された抗ヒト抗体である、実施形態31~49のいずれか1つに記載の方法。
実施形態51。上記検出可能に標識された抗ヒト抗体が、検出可能に標識された抗ヒトIgE抗体である、実施形態50に記載の方法。
実施形態52。上記AAI特異的標識試薬の上記検出可能な標識が、フィコエリトリン(PE)、シアニン染料、蛍光染料、赤外線染料、色原体染料、酵素標識、及び放射能標識から選択される、実施形態50または実施形態51に記載の方法。
実施形態53。上記検出可能な標識がPEである、実施形態52に記載の方法。
実施形態54。上記AAI特異的標識試薬が、PE標識された抗ヒトIgE抗体である、実施形態50に記載の方法。
実施形態55。上記AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することが、ポイントオブケアデバイスにより実施される、実施形態31~54のいずれか1つに記載の方法。
実施形態56。上記ポイントオブケアデバイスが、多重ペプチド-ビーズフローサイトメトリー分析デバイス、または、ラテラルフローアッセイデバイスである、実施形態55に記載の方法。
実施形態57。上記AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することが、各AAI特異的標識試薬の平均蛍光強度(MFI)を測定することを含み、h2.008+(h2.019)/20が≦0.20である場合、上記対象はピーナッツアレルギーではなく、h2.008+(h2.019)/20が>0.20である場合、上記対象はピーナッツアレルギーであり、h2.008は、上記標識試薬AAI-ペプチド-固体支持体複合体の較正純MFIであり、上記ピーナッツペプチドが配列番号1を含み、h2.019は、上記標識試薬AAI-ペプチド-固体支持体複合体の較正純MFIであり、上記ピーナッツペプチドが配列番号2を含み、上記AAI特異的標識試薬が、検出可能に標識された抗ヒト抗体である、実施形態31~56のいずれか1つに記載の方法。
実施形態58。各AAI特異的標識試薬のMFIが、バックグラウンド減算される、実施形態57に記載の方法。
実施形態59。乳児を、2つのピーナッツアレルゲンに対して脱感作し、ピーナッツに対して耐性またはノンアレルギーを誘発するための方法であって、2つのピーナッツペプチドを上記乳児に投与することを含み、上記2つのピーナッツペプチドのうちの一方が、アミノ酸配列WELQGDRRCQSQLER(配列番号1)、または、配列番号1を含むが、当該配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列、を含み、上記2つのピーナッツペプチドのうちの他方が、アミノ酸配列DSYERDPYSPSQDPY(配列番号2)、または、配列番号2を含むが、当該配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列、を含む、上記方法。
実施形態60。上記2つのピーナッツペプチドのうちの一方が、配列番号1に従ったアミノ酸配列を含み、上記2つのピーナッツペプチドのうちの他方が、配列番号2に従ったアミノ酸配列を含む、実施形態59に記載の方法。
実施形態61。アミノ酸配列WELQGDRRCQSQLER(配列番号1)、または、配列番号1を含むが、当該配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、第1のピーナッツペプチド、及び、アミノ酸配列DSYERDPYSPSQDPY(配列番号2)、または、配列番号2を含むが、当該配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、第2のピーナッツペプチドからなる組成物。
実施形態62。上記第1のピーナッツペプチドが、配列番号1に従ったアミノ酸配列を含み、上記第2のピーナッツペプチドが、配列番号2に従ったアミノ酸配列を含む、実施形態61に記載の組成物。
実施形態63。各ピーナッツペプチドが固体支持体に結合している、実施形態61または実施形態62に記載の組成物。
実施形態64。上記ピーナッツペプチドのそれぞれが、リンカー-スペーサーにより上記固体支持体に結合する、実施形態61~63のいずれか1つに記載の組成物。
実施形態65。上記リンカー-スペーサーが、ビオチン、チオール、ヒドラジン、及びアミンから選択されるリンカー、ならびに、ポリペプチド、オリゴヌクレオチド、アルキル基、及びポリエチレングリコール(PEG)基から選択されるスペーサーを含む、実施形態64に記載の組成物。
実施形態66。上記スペーサーがアルキル基またはPEG基である、実施形態65に記載の組成物。
実施形態67。上記アルキル基がC-C18アルキル基である、実施形態66に記載の組成物。
実施形態68。上記PEG基がPEG1~PEG18である、実施形態66に記載の組成物。
実施形態69。上記PEG基がPEG12である、実施形態68に記載の組成物。
実施形態70。上記ピーナッツペプチドのそれぞれのC末端が、上記リンカー-スペーサーにより上記固体支持体に結合している、実施形態64~69のいずれか1つに記載の組成物。
実施形態71。上記ピーナッツペプチドのそれぞれのN末端が、上記リンカー-スペーサーにより上記固体支持体に結合している、実施形態64~69のいずれか1つに記載の組成物。
実施形態72。上記ピーナッツペプチドのそれぞれのC末端が、ビオチン-PEG12リンカー-スペーサーにより上記固体支持体に結合している、実施形態64に記載の組成物。
実施形態73。上記固体支持体がミクロスフェアビーズ、ガラスアレイ、シリコーンアレイ、メンブレン、またはマイクロタイタープレートである、実施形態60~72のいずれか1つに記載の組成物。
実施形態74。上記固体支持体がミクロスフェアビーズである、実施形態73に記載の組成物。
実施形態75。上記ミクロスフェアビーズがアビジン結合ミクロスフェアビーズである、実施形態74に記載の組成物。
実施形態76。アミノ酸配列WELQGDRRCQSQLER(配列番号1)、または、配列番号1を含むが、当該配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、第1のピーナッツペプチド、及び、アミノ酸配列DSYERDPYSPSQDPY(配列番号2)、または、配列番号2を含むが、当該配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、第2のピーナッツペプチドに結合した固体支持体;ならびに、アレルギー関連免疫グロブリン(AAI)特異的標識試薬を含むキット。
実施形態77。使用のための指示をさらに含む、実施形態76に記載のキット。
実施形態78。結合緩衝液、洗浄緩衝液、検出緩衝液、非アレルギー対照試料、陰性緩衝液対照試料、及び、アレルギー陽性対照試料のうちの1つ以上をさらに含む、実施形態76または実施形態77に記載のキット。
実施形態79。上記ピーナッツペプチドのそれぞれが、リンカー-スペーサーにより上記固体支持体に結合する、実施形態76~78のいずれか1つに記載のキット。
実施形態80。上記リンカー-スペーサーが、ビオチン、チオール、ヒドラジン、及びアミンから選択されるリンカー、ならびに、ポリペプチド、オリゴヌクレオチド、アルキル基、及びポリエチレングリコール(PEG)基から選択されるスペーサーを含む、実施形態79に記載のキット。
実施形態81。上記スペーサーがアルキル基またはPEG基である、実施形態80に記載のキット。
実施形態82。上記アルキル基がC-C18アルキル基である、実施形態81に記載のキット。
実施形態83。上記PEG基がPEG1~PEG18である、実施形態81に記載のキット。
実施形態84。上記PEG基がPEG12である、実施形態83に記載のキット。
実施形態85。上記ピーナッツペプチドのそれぞれのC末端が、上記リンカー-スペーサーにより上記固体支持体に結合している、実施形態79~84のいずれか1つに記載のキット。
実施形態86。上記ピーナッツペプチドのそれぞれのN末端が、上記リンカー-スペーサーにより上記固体支持体に結合している、実施形態79~84のいずれか1つに記載のキット。
実施形態87。上記ピーナッツペプチドのそれぞれのC末端が、ビオチン-PEG12リンカー-スペーサーにより上記固体支持体に結合している、実施形態79に記載のキット。
実施形態88。上記固体支持体がミクロスフェアビーズ、ガラスアレイ、シリコーンアレイ、メンブレン、またはマイクロタイタープレートである、実施形態75~87のいずれか1つに記載のキット。
実施形態89。上記固体支持体がミクロスフェアビーズである、実施形態88に記載のキット。
実施形態90。上記ミクロスフェアビーズがアビジン結合ミクロスフェアビーズである、実施形態89に記載のキット。
実施形態91。上記AAI特異的標識試薬が、検出可能に標識された抗ヒト抗体である、実施形態75~90のいずれか1つに記載のキット。
実施形態92。上記検出可能に標識された抗ヒト抗体が、検出可能に標識された抗ヒトIgE抗体である、実施形態91に記載のキット。
実施形態93。上記AAI特異的標識試薬の上記検出可能な標識が、フィコエリトリン(PE)、シアニン染料、蛍光染料、赤外線染料、色原体染料、酵素標識、及び放射能標識から選択される、実施形態91または実施形態92に記載のキット。
実施形態94。上記検出可能な標識がPEである、実施形態93に記載のキット。
実施形態95。上記AAI特異的標識試薬が、PE標識された抗ヒトIgE抗体である、実施形態91に記載のキット。
実施形態96。上記AAI特異的標識試薬に特異的に結合するレポーター部分をさらに含む、実施形態75~95のいずれか1つに記載のキット。
本明細書にて開示する主題をより効率的に理解可能とするために、以下に実施例を記載する。これらの実施例は、単に例示目的であり、いかなる方法でも、特許請求される主題を制限するものとして解釈されるものではないと理解されたい。
実施例1:ピーナッツアレルギー診断の認証
アルゴリズム
以下は、2つのエピトープを分類因子:
h2.008+(h2.019)/20≦.20であれば「アレルギーではない」、そうでなければ「アレルギーである」。
に統合するアルゴリズムの例である。
このアルゴリズムに関して、h2.008及びh2.019は、較正された純MFIとして表され、以下に記載する式を使用して測定される。
Figure 2023514162000002
rnは、所与のバッチでn個の緩衝液対照を複製するための、Luminexシステムから報告される緩衝液対照に対するNetMFIである。
Figure 2023514162000003
rnは、所与のバッチでn個の陽性対照を複製するための、Luminexシステムから報告される陽性対照に対するNetMFIである。
Figure 2023514162000004
rnは、所与のバッチでn個の試料を複製するための、Luminexシステムから報告される試料に対するNetMFIである。
Figure 2023514162000005
定数は、エピトープ特異的補正定数である。
Figure 2023514162000006
追加のSPT及び/またはsIgE検査もまた、アルゴリズムに組み込むことができ、これにより、3つの検査のうちのいずれかが、対象の、ピーナッツに対するアレルゲン状態を確認することができる。
SPT≦3mm、またはsIgE≦0.10kU/Lである場合、「アレルギーでない」。停止。
SPT≧18mm、またはsIgE≧18kU/Lである場合、「アレルギーである」。停止。
SPTに関して、単位はmmである。sIgEに関して、単位はkU/Lである。
方法
LEAP検査の回避群からの133名の対象(31名がアレルギー、102名がアレルギーでない)で、検査を行った。全ての診断を、5歳の年齢にてOFCで測定した。血漿試料を、各対象の2.5歳及び5歳の時点で入手した。BBEA方法論を使用してこれらの試料を分析し、各対象に関して2.5歳及び5歳の時点での、IgE及びIgG4エピトープレベルを入手した。各対象に対するIgE(IgG4)エピトープレベルを、IgE(IgG4)エピトープ測定の全ての中央値により正規化した。
5歳の時点でデータを分析し、アレルギー及び非アレルギー対象を分離するための、最も性能を発揮するIgEまたはIgG4エピトープを測定した。具体的には、最も性能を発揮するIgEまたはIgG4エピトープは、0.1kU/Lを下回るピーナッツ特異的IgE(sIgE)レベルにより、対象の初期トリアージの後で、これらの対象をアレルギーまたは非アレルギーと分析するための、最良のAUCを備えたものである。次に、この同じIgEまたはIgG4エピトープは、2.5歳の時点で最も性能を発揮するエピトープでもあったことが確認された。最も性能を発揮するエピトープ、及び決定閾値の識別の後、診断検査を完了し、その後、認証を行った。
簡潔に述べると、ピーナッツペプチド(CS Bio,Menlo Park,CA,USA)をLumAvidinビーズ(Luminex Corporation,Austin,TX)に結合し、PBS-TBN緩衝液(1×PBS+0.02% Tween20+0.1% BSA)に保管した。ペプチド結合ビーズのマスターミックスをPBS-TBN緩衝液で調製し、100μLのビーズマスターミックスをフィルタープレート添加した。ビーズの洗浄後、100μLの対象の結晶(1:10で希釈)を、3通りにウェルに添加した。プレートを2時間、300rpmにて室温で、振盪器でインキュベートした。過剰な血漿を取り除き、プレートを洗浄した。50μL/ウェルのマウス抗ヒトIgE-PE(Thermo-Pierce Antibodies,Clone BE5,PBS-TBN中で1:50に希釈)、または、マウス抗ヒトIgG4 Fc-PE(SouthernBiotech,Clone HP6025,PBS-TBN中に1:40で希釈)二次抗体を添加し、プレートを30分間インキュベートした。最初の洗浄の後、100μLのPBS-TBN緩衝液を各ウェルに添加して、ビーズを再懸濁し、次にこれを、固定底96ウェル読み取りプレートに移し、Luminex200機器(Luminex(登録商標)100/200(商標)System,Luminex Corporation,Austin,TX)で定量した。
試料は全て、3通りで処理した。バックグラウンド強度を取り除くために、緩衝液試料(PBS-TBN緩衝液)もまた、各プレートで3通りで処理した。各エピトープ及び試料に対するMFIを、Luminexリーダーの出力から直接入手した。
検証
検査の検証を、XoFAR2検査の81名の対象(23名がアレルギー、58名が非アレルギー)で実施した。全ての診断を、5歳の年齢にてOFCで測定した。血漿試料を、各対象の2歳及び5歳の時点で入手した。BBEA方法論を使用してこれらの試料を分析し、各対象に関して2歳及び5歳の時点での、IgE及びIgG4エピトープレベルを入手した。Luminexデータを、対象試料全て、加えて、陰性(緩衝液)及び陽性対照に対して3通りで収集した。データを以下の方法で処理した:
1)複製を、メジアン関数を使用して単一の値にマージした;
2)対象、緩衝液、及び陽性対照の値を全て、log変換した;
3)緩衝値を、対象全て、及び陽性対照値から取り除くことにより、バックグラウンド除去を行った;ならびに
4)中央陽性対照値を各プレートに対して測定し、これを使用して、自身の陽性対照値に従い、各プレートで対象の値全てを較正した。
所定の仮説及び閾値を使用して、診断検査の検証を行った。まず、sIgEに対する閾値0.1Ku/Lを、及び、最適IgE(IgG4)エピトープに対する閾値0.30を使用する、診断検査の性能は、5歳の時点での対象の関連に対して、Χ2乗検定を使用すると、統計的に有意であった。同様に、2歳の時点での対象に対する診断検査の性能を評価した。データ分析は全て、Matlab R2015bを使用して行った。
結果
検証コホートでの検査結果を図1に示す。他の診断検査の性能を、比較のために表示する。検証コホートからの、10名のアレルギー、及び10名の非アレルギー対象の結果を、下表1に表す。
Figure 2023514162000007
エピトープアッセイから入手した生データを、MFIとして報告した。データを全て、上述のとおりに処理した。
本明細書に記載するものに加えて、記載する主題の様々な修正が、前述の説明から当業者には明白となろう。そのような修正はまた、添付の特許請求の範囲内に入ることが意図される。本出願に引用される各参考文献(ジャーナル記事、米国及び非米国特許、特許出願公報、国際特許出願公報、遺伝子バンクの寄託番号など)は、その全体が本明細書に参照により組み込まれる。

Claims (20)

  1. 対象においてピーナッツアレルギーを診断するための方法であって、
    固体支持体に結合した2つのピーナッツペプチドを、前記対象から入手した生体試料と、前記生体試料中の1つ以上のアレルギー関連免疫グロブリン(AAI)を前記2つのピーナッツペプチドと結合させてAAI-ペプチド-固体支持体複合体を形成するのに十分な条件下にて接触させることであって、前記2つのピーナッツペプチドのうちの一方が、アミノ酸配列WELQGDRRCQSQLER(配列番号1)、または、配列番号1を含むが前記配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列、を含み、前記2つのピーナッツペプチドのうちの他方が、アミノ酸配列DSYERDPYSPSQDPY(配列番号2)、または、配列番号2を含むが前記配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列、を含む、前記接触させることと、
    前記AAI-ペプチド-固体支持体複合体を、AAI特異的標識試薬と接触させて、標識試薬-AAI-ペプチド-固体支持体複合体を形成することと、
    前記AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することと、を含み、
    前記AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、前記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合が、閾値を上回る場合に、前記対象がピーナッツアレルギーであり、前記AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、前記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合が、前記閾値以下である場合に、前記対象がピーナッツアレルギーではない、前記方法。
  2. 前記2つのピーナッツペプチドのうちの一方が、配列番号1に従ったアミノ酸配列を含み、前記2つのピーナッツペプチドのうちの他方が、配列番号2に従ったアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の方法。
  3. 前記固体支持体がミクロスフェアビーズ、ガラスアレイ、シリコーンアレイ、メンブレン、またはマイクロタイタープレートである、請求項1または請求項2に記載の方法。
  4. 前記AAIがIgG及び/またはIgEである、請求項1~3のいずれか1項に記載の方法。
  5. 前記AAI特異的標識試薬が、検出可能に標識された抗ヒト抗体である、請求項1~4のいずれか1項に記載の方法。
  6. 前記AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することが、ポイントオブケアデバイスにより実施される、請求項1~5のいずれか1項に記載の方法。
  7. 前記AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することが、各AAI特異的標識試薬の平均蛍光強度(MFI)を測定することを含み、
    h2.008+(h2.019)/20が≦0.20である場合、前記対象はピーナッツアレルギーではなく、
    h2.008+(h2.019)/20が>0.20である場合、前記対象はピーナッツアレルギーであり、
    h2.008は、前記標識試薬-AAI-ペプチド-固体支持体複合体の較正純MFIであり、前記ピーナッツペプチドは配列番号1を含み、h2.019は、前記標識試薬AAI-ペプチド-固体支持体複合体の較正純MFIであり、前記ピーナッツペプチドは配列番号2を含み、
    前記AAI特異的標識試薬は、検出可能に標識された抗ヒト抗体である、請求項1~6のいずれか1項に記載の方法。
  8. プリックテスト(SPT)及び/または全ピーナッツ特異的IgE(sIgE)検査を行うこと、または、行っていることをさらに含む、請求項1~7のいずれか1項に記載の方法。
  9. SPT≦3mmであり、及び/または、sIgE≦0.10kU/Lであるとき、前記対象はピーナッツアレルギーではなく、SPT≧18mmであり、及び/または、sIgE≧18kU/Lであるとき、前記対象はピーナッツアレルギーである、請求項8に記載の方法。
  10. ピーナッツアレルギーの対象において、ピーナッツに対する臨床耐性の発達を検出するための方法であって、
    固体支持体に結合した2つのピーナッツペプチドを、前記対象から入手した生体試料と、前記生体試料中の1つ以上のアレルギー関連免疫グロブリン(AAI)を前記2つのピーナッツペプチドと結合させて2つのAAI-ペプチド-固体支持体複合体を形成するのに十分な条件下にて接触させることであって、前記2つのピーナッツペプチドのうちの一方が、アミノ酸配列WELQGDRRCQSQLER(配列番号1)、または、配列番号1を含むが前記配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列、を含み、前記2つのピーナッツペプチドのうちの他方が、アミノ酸配列DSYERDPYSPSQDPY(配列番号2)、または、配列番号2を含むが前記配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列、を含む、前記接触させることと、
    前記AAI-ペプチド-固体支持体複合体を、AAI特異的標識試薬と接触させて、標識試薬-AAI-ペプチド-固体支持体複合体を形成することと、
    前記AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することと、
    前記AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を、前記AAI特異的標識試薬の、前記対象から以前に入手した生体試料に由来する各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合と比較することと、を含み、
    前記AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、前記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合が、前記AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、前記以前に入手した生体試料用の前記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合以上である場合に、前記対象がピーナッツに対して臨床耐性を確立しておらず、前記AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、前記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合が、前記AAI-ペプチド-固体支持体複合体中の各ピーナッツペプチドに対する、前記以前に入手した生体試料用の前記AAI特異的標識試薬への組み合わせた結合未満である場合に、前記対象がピーナッツに対して臨床耐性を確立している、前記方法。
  11. 前記2つのピーナッツペプチドのうちの一方が、配列番号1に従ったアミノ酸配列を含み、前記2つのピーナッツペプチドのうちの他方が、配列番号2に従ったアミノ酸配列を含む、請求項10に記載の方法。
  12. 前記AAIがIgG及び/またはIgEである、請求項10または請求項11に記載の方法。
  13. 前記AAI特異的標識試薬が、検出可能に標識された抗ヒト抗体である、請求項10~12のいずれか1項に記載の方法。
  14. 前記AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することが、ポイントオブケアデバイスにより実施される、請求項10~13のいずれか1項に記載の方法。
  15. 前記AAI特異的標識試薬の、各AAI-ペプチド-固体支持体複合体への結合を測定することが、各AAI特異的標識試薬の平均蛍光強度(MFI)を測定することを含み、
    h2.008+(h2.019)/20が≦0.20である場合、前記対象はピーナッツアレルギーではなく、
    h2.008+(h2.019)/20が>0.20である場合、前記対象はピーナッツアレルギーであり、
    h2.008は、前記標識試薬-AAI-ペプチド-固体支持体複合体の較正純MFIであり、前記ピーナッツペプチドは配列番号1を含み、h2.019は、前記標識試薬-AAI-ペプチド-固体支持体複合体の較正純MFIであり、前記ピーナッツペプチドは配列番号2を含み、
    前記AAI特異的標識試薬は、検出可能に標識された抗ヒト抗体である、請求項10~14のいずれか1項に記載の方法。
  16. 乳児を、2つのピーナッツアレルゲンに対して脱感作し、ピーナッツに対して耐性またはノンアレルギーを誘発するための方法であって、2つのピーナッツペプチドを前記乳児に投与することを含み、前記2つのピーナッツペプチドのうちの一方が、アミノ酸配列WELQGDRRCQSQLER(配列番号1)、または、配列番号1を含むが前記配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列、を含み、前記2つのピーナッツペプチドのうちの他方が、アミノ酸配列DSYERDPYSPSQDPY(配列番号2)、または、配列番号2を含むが前記配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列、を含む、前記方法。
  17. 前記2つのピーナッツペプチドのうちの一方が、配列番号1に従ったアミノ酸配列を含み、前記2つのピーナッツペプチドのうちの他方が、配列番号2に従ったアミノ酸配列を含む、請求項16に記載の方法。
  18. アミノ酸配列WELQGDRRCQSQLER(配列番号1)、または、配列番号1を含むが前記配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、第1のピーナッツペプチド、及び、アミノ酸配列DSYERDPYSPSQDPY(配列番号2)、または、配列番号2を含むが前記配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、第2のピーナッツペプチドからなる組成物。
  19. 前記第1のピーナッツペプチドが、配列番号1に従ったアミノ酸配列を含み、前記第2のピーナッツペプチドが、配列番号2に従ったアミノ酸配列を含む、請求項18に記載の組成物。
  20. アミノ酸配列WELQGDRRCQSQLER(配列番号1)、または、配列番号1を含むが前記配列番号1の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、第1のピーナッツペプチド、及び、アミノ酸配列DSYERDPYSPSQDPY(配列番号2)、または、配列番号2を含むが前記配列番号2の中に1~4個の保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、第2のピーナッツペプチドに結合した固体支持体、ならびに
    アレルギー関連免疫グロブリン(AAI)特異的標識試薬
    を含むキット。
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