JP2023512441A - 筋肉標的複合体および筋肉の健康に関連する遺伝子のモジュレーションのためのその使用 - Google Patents

筋肉標的複合体および筋肉の健康に関連する遺伝子のモジュレーションのためのその使用 Download PDF

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Abstract

本開示の側面は、筋肉の成長および維持に関与する遺伝子(例として、MSTN、INHBA、および/またはACVR1B)の発現または活性をモジュレートする分子ペイロード、およびかかる分子ペイロードに共有結合的に連結された筋標的化剤を含む複合体に関する。いくつかの態様において、筋標的化剤は、筋細胞(例として、心筋細胞)上の内在化する細胞表面受容体に特異的に結合する。いくつかの態様において、分子ペイロードは、アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはRNAiオリゴヌクレオチドなどのオリゴヌクレオチドである。

Description

関連出願
本出願は、2020年1月10日に出願された「筋肉標的複合体およびミオスタチンのモジュレーションのためのその使用」と題された米国仮出願第62/959,398号、2020年1月10日に出願された「筋肉標的複合体およびINHBAのモジュレーションのためのその使用」と題された米国仮出願第62/959,590号、および2020年1月10日に出願された「筋肉標的複合体およびACVR1Bのモジュレーションのためのその使用」と題された米国仮出願第62/959,469号の出願日の35U.S.C§119(e)に基づく利益を主張し、これらの各々の内容全体は、参照により本明細書に組み込まれる。
EFS-WEBを介しテキストファイルとして提出された配列表への言及
本出願は配列表を含有する。これはEFS-WebからASCIIフォーマットで提出されており、その全体が参照によってここに組み込まれる。2021年1月8日に作成された該ASCIIコピーはD082470012WO00-SEQ-ZJGという名称であり、サイズは333キロバイトである。
本発明の分野
本出願は、筋肉の健康(例として、筋肉の成長および維持)に関連する遺伝子(例として、MSTN、INHBA、またはACVR1B)の発現または活性をモジュレートする分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)およびかかる分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)を細胞(例として、心筋細胞)に送達するための標的複合体およびその使用、特に疾患の処置に関する使用に関する。
背景
ミオスタチン(MSTN)、インヒビンベータA(INHBA)およびアクチビン受容体タイプ1B(ACVR1B)を含む数個の遺伝子の発現および/または活性は、筋肉の健康の様々な側面に関係している。これらの遺伝子の1以上の異常な発現、またはその変異型の発現は、数ある中でも、心臓線維症、心筋萎縮、および骨格筋萎縮などの心臓および骨格筋障害を含む、様々な筋肉障害に関与し得る。
概要
いくつかの側面に従って、本開示は、筋肉の健康(例として、筋肉の成長および維持)に関連する遺伝子(例として、MSTN、INHBA、またはACDR1B)の発現または活性をモジュレートする分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)および分子ペイロードをそれらの細胞に送達する目的のための筋細胞(例として、心臓および/または骨格筋細胞)を標的とする複合体を提供する。いくつかの態様において、本明細書で提供される複合体は、心筋細胞を標的とするように設計されている。いくつかの態様において、本明細書で提供される複合体は、骨格筋細胞を標的とするように設計されている。いくつかの態様において、本明細書で提供される複合体は、筋肉の成長および維持などの筋肉の健康に関与する遺伝子の発現または活性をモジュレートする分子ペイロードを送達するために特に有用である。かかる遺伝子は、MSTN、INHBAおよびACVR1Bを含むが、これらに限定されない。いくつかの態様において、本開示は、MSTN、INHBAおよびACVR1Bの1つ以上の発現をモジュレートする分子ペイロードを送達する目的のための筋細胞を標的とする複合体を提供する。
いくつかの態様において、本明細書で提供される複合体は、例として、心不全を有するまたは有すると疑われる対象において、MSTNの発現または活性を阻害する分子ペイロードを送達するために特に有用である。例えば、本開示は、心筋消耗、心筋症、または心臓悪液質(心不全における筋肉消耗)を有するまたは有すると疑われる対象において、MSTNの発現または活性を阻害することを企図する。いくつかの側面において、本開示はまた、骨格筋におけるMSTNの発現または活性を阻害することを企図し、これは、ミオスタチンの循環量を減少させることによって心臓萎縮に正の効果を有し得るであろう。いくつかの側面において、本開示は、骨格筋萎縮を有する対象におけるMSTNの発現または活性を阻害することをさらに企図する。いくつかの態様において、本明細書で提供される複合体は、例として、疾患(例として、心筋萎縮などの筋萎縮)を有するまたは有すると疑われる対象において、INHBAおよび/またはアクチビンAの発現または活性を阻害する分子ペイロードを送達するために特に有用である。いくつかの態様において、本明細書で提供される複合体は、例として、心臓線維症または心肥大を有するまたは有すると疑われる対象において、ACVR1Bの発現または活性を阻害する分子ペイロードを送達するために特に有用である。
結果的に、いくつかの態様において、本明細書で提供される複合体は、分子ペイロードを筋細胞に送達する目的のために筋細胞の表面上の受容体に特異的に結合する筋標的化剤(例として、筋肉標的抗体)を含む。いくつかの態様において、複合体は、受容体媒介性内在化を介して細胞に取り込まれ、その後、分子ペイロードが放出されて、細胞内で機能を実行し得る。例えば、オリゴヌクレオチドを送達するように改変された複合体は、オリゴヌクレオチドが筋細胞における(例として、MSTN、INHBA、および/またはACVR1Bの)遺伝子発現を阻害できるように、オリゴヌクレオチドを放出し得る。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドを送達するように改変された複合体は、MSTN、INHBAおよびACVR1Bの2以上の遺伝子発現を阻害することができるオリゴヌクレオチドを送達し得る。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドと複合体の筋標的化剤とを接続する共有結合リンカーのエンドソーム切断によって放出される。
本開示のいくつかの側面は、ミオスタチン(MSTN)、インヒビンベータA(INHBA)および/またはアクチビン受容体タイプ1B(ACVR1B)の発現または活性をモジュレートする分子ペイロードに共有結合的に連結された筋標的化剤を含む複合体を提供し、ここで、筋標的化剤は、筋細胞上の内在化する細胞表面受容体に特異的に結合する。
いくつかの態様において、筋細胞は心筋細胞である。
いくつかの態様において、筋標的化剤は、抗トランスフェリン受容体(TfR)抗体であり、任意にここで、抗TfR抗体は、表1、3、および6中に挙げられた抗TfR抗体のいずれかの重鎖相補性決定領域1(CDR-H1)、重鎖相補性決定領域2(CDR-H2)、重鎖相補性決定領域3(CDR-H3)、軽鎖相補性決定領域1(CDR-L1)、軽鎖相補性決定領域2(CDR-L2)、および軽鎖相補性決定領域3(CDR-L3)を含む。
いくつかの態様において、抗体は、配列番号15のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)のCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3、および配列番号16のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)のCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。いくつかの態様において、抗体は、配列番号204のアミノ酸配列を含むVHのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3、ならびに配列番号205のアミノ酸配列を含むVLのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。いくつかの態様において、抗体は、配列番号7のアミノ酸配列を含むVHのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3、ならびに配列番号8のアミノ酸配列を含むVLのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。いくつかの態様において、抗体は、配列番号23のアミノ酸配列を含むVHのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3、ならびに配列番号24のアミノ酸配列を含むVLのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、抗体は、配列番号155のCDR-H1、配列番号156のCDR-H2、配列番号157のCDR-H3、配列番号158のCDR-L1、配列番号159のCDR-L2、および配列番号14のCDR-L3を含む。いくつかの態様において、抗体は、配列番号194のCDR-H1、配列番号195のCDR-H2、配列番号196のCDR-H3、配列番号197のCDR-L1、配列番号198のCDR-L2、および配列番号193のCDR-L3を含む。いくつかの態様において、抗体は、配列番号145のCDR-H1、配列番号146、配列番号249、または配列番号252のCDR-H2、配列番号147のCDR-H3、配列番号148のCDR-L1、配列番号149のCDR-L2、および配列番号6のCDR-L3を含む。いくつかの態様において、抗体は、配列番号165、配列番号255、または配列番号257のCDR-H1、配列番号166のCDR-H2、配列番号167のCDR-H3、配列番号168のCDR-L1、配列番号169のCDR-L2、および配列番号22のCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、抗体はヒトのまたはヒト化フレームワーク領域を含み、配列番号15で表されるとおりのVHのCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、および配列番号16で表されるとおりのVLのCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3を有する。いくつかの態様において、抗体はヒトのまたはヒト化フレームワーク領域を含み、配列番号204で表されるとおりのVHのCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、および配列番号205で表されるとおりのVLのCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3を有する。いくつかの態様において、抗体はヒトのまたはヒト化フレームワーク領域を含み、配列番号7で表されるとおりのVHのCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、および配列番号8で表されるとおりのVLのCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3を有する。いくつかの態様において、抗体はヒトのまたはヒト化フレームワーク領域を含み、配列番号23で表されるとおりのVHのCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、および配列番号24で表されるとおりのVLのCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3を有する。
いくつかの態様において、抗体は、配列番号15と少なくとも80%同一のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号16と少なくとも80%同一のアミノ酸配列を含むVLを含む。いくつかの態様において、抗体は、配列番号204と少なくとも80%同一のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号205と少なくとも80%同一のアミノ酸配列を含むVLを含み、任意にここで、抗体は、配列番号204のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号205のアミノ酸配列を含むVLを含む。いくつかの態様において、抗体は、配列番号7と少なくとも80%同一のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号8と少なくとも80%同一のアミノ酸配列を含むVLを含む。いくつかの態様において、抗体は、配列番号23と少なくとも80%同一のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号24と少なくとも80%同一のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、抗体のトランスフェリン受容体への結合の平衡解離定数(KD)は、10-11Mから10-6Mまでの範囲にある。
いくつかの態様において、抗体は、完全長IgG、Fabフラグメント、F(ab’)フラグメント、F(ab’)2フラグメント、scFv、およびFvからなる群から選択される。いくつかの態様において、抗体は、Fab’フラグメントである。
いくつかの態様において、分子ペイロードは、MSTN標的配列と相補性のある領域を含むアンチセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドである。いくつかの態様において、MSTN標的配列は、配列番号300または配列番号301で表されるMSTN mRNA配列、または配列番号302~349のいずれか1つで表されるMSTN標的配列である。いくつかの態様において、アンチセンス鎖は長さが18~25ヌクレオチドであり、および/または相補性のある領域は長さが少なくとも16ヌクレオシドである。
いくつかの態様において、アンチセンス鎖は、配列番号350~373のいずれか1つで表されるヌクレオチド配列の少なくとも16の連続的なヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、アンチセンス鎖は、配列番号350~373のいずれか1つのヌクレオチド配列を含む。
いくつかの態様において、分子ペイロードは、INHBA標的配列と相補性のある領域を含むアンチセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドである。いくつかの態様において、INHBA標的配列は、配列番号422または配列番号423で表されるINHBA mRNA配列、または配列番号424~471のいずれか1つで表されるINHBA標的配列である。いくつかの態様において、アンチセンス鎖は長さが18~25ヌクレオチドであり、および/または相補性のある領域は長さが少なくとも16ヌクレオシドである。
いくつかの態様において、アンチセンス鎖は、配列番号472~495のいずれか1つで表されるヌクレオチド配列の少なくとも16の連続的なヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、アンチセンス鎖は、配列番号472~495のいずれか1つのヌクレオチド配列を含む。
いくつかの態様において、分子ペイロードは、ACVR1B標的配列と相補性のある領域を含むアンチセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドである。いくつかの態様において、ACVR1B標的配列は、配列番号520~523のいずれか1つで表されるACVR1B mRNA配列、または配列番号374~421のいずれか1つで表されるACVR1B標的配列である。いくつかの態様において、アンチセンス鎖は長さが18~25ヌクレオチドであり、および/または相補性のある領域は長さが少なくとも16ヌクレオシドである。
いくつかの態様において、アンチセンス鎖は、配列番号496~519のいずれか1つで表されるヌクレオチド配列の少なくとも16の連続的なヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、アンチセンス鎖は、配列番号496~519のいずれか1つのヌクレオチド配列を含む。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、アンチセンス鎖にハイブリダイズして二本鎖siRNAを形成するセンス鎖をさらに含む。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、1以上の修飾ヌクレオシドを含み、任意にここで、オリゴヌクレオチドにおける各ヌクレオシドは、修飾ヌクレオシドである。
いくつかの態様において、1以上の修飾ヌクレオシドは、2’修飾ヌクレオチドであり、任意にここで、1以上の2’修飾ヌクレオシドは、2’-フルオロ(2’-F)、2’-O-メチル(2’-O-Me)、2’-O-メトキシエチル(2’-MOE)、2’-O-アミノプロピル(2’-O-AP)、2’-O-ジメチルアミノエチル(2’-O-DMAOE)、2’-O-ジメチルアミノプロピル(2’-O-DMAP)、2’-O-ジメチルアミノエチルオキシエチル(2’-O-DMAEOE)、2’-O-N-メチルアセトアミド(2’-O-NMA)、ロックド核酸(LNA)、エチレン-架橋核酸(ENA)、および(S)拘束エチル架橋核酸(cEt)から選択され、任意にここで、2’修飾ヌクレオチドは、2’-O-メチルまたは2’-フルオロ(2’-F)である。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、1以上のホスホロチオアートヌクレオシド間連結を含み、任意にここで、1以上のホスホロチオアートヌクレオシド間連結は、RNAiオリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖上に存在し、さらに任意にここで、センス鎖の3’末端における2つのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結である。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、表11中に挙げられたsiRNAである。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、表14中に挙げられたsiRNAである。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、表17中に挙げられたsiRNAである。
いくつかの態様において、筋標的化剤は、(i)切断可能なリンカー、任意にここで、切断可能なリンカーはバリン-シトルリンジペプチド配列を含む;または(ii)切断不能なリンカー、任意にここで、切断不能なリンカーはアルカンリンカーである、を介して分子ペイロードに共有結合的に連結されている。
本開示の他の側面は、筋細胞においてMSTN、INHBA、および/またはACVR1Bの発現を低減する方法を提供する。いくつかの態様において、方法は、筋細胞への分子ペイロードの内在化を促進するために、筋細胞を本明細書に記載の有効量の複合体と接触させることを含む。
本開示の他の側面は、有効量の本明細書に記載の複合体をそれを必要とする対象へ投与することを含む、筋萎縮を処置する方法を提供する。いくつかの態様において、対象は、MSTN、INHBA、および/またはACVR1Bの上昇した発現または活性を有する。
本明細書にさらに提供されるのは、表11、表14、および表17中に挙げられたsiRNAである。
図面の簡単な記載
図1は、細胞をsiRNAでトランスフェクトする効果を示す非限定的な概略図を示す。
図2は、siRNAを含む筋肉標的複合体の活性を示す非限定的な概略図を示す。
図3A-3Bは、対照実験と比べた、in vivoのマウス筋組織(心臓(cardiac)/心臓(heart)、図3B;および腓腹筋、図3A)におけるsiRNAを含む筋肉標的複合体の活性を示す非限定的な概略図を示す。(N=4匹のC57BL/6 WTマウス)。
図4A-4Eは、siRNAを含む筋肉標的複合体の組織選択性を示す非限定的な概略図を示す。データは、脳(図4A)、肝臓(図4B)、肺(図4C)、腎臓(図4D)、および脾臓(図4E)における遺伝子発現を示し、筋肉標的複合体が非筋組織において遺伝子阻害を促進しないことを実証する。 図4A-4Eは、siRNAを含む筋肉標的複合体の組織選択性を示す非限定的な概略図を示す。データは、脳(図4A)、肝臓(図4B)、肺(図4C)、腎臓(図4D)、および脾臓(図4E)における遺伝子発現を示し、筋肉標的複合体が非筋組織において遺伝子阻害を促進しないことを実証する。 図4A-4Eは、siRNAを含む筋肉標的複合体の組織選択性を示す非限定的な概略図を示す。データは、脳(図4A)、肝臓(図4B)、肺(図4C)、腎臓(図4D)、および脾臓(図4E)における遺伝子発現を示し、筋肉標的複合体が非筋組織において遺伝子阻害を促進しないことを実証する。
図5は、0.5nMおよび10nMの用量で試験された24のsiRNAによるMSTN遺伝子発現の阻害を示す。
図6は、100nM~10fMの濃度の範囲にわたるオリゴヌクレオチド候補配列によるヒトMSTNの阻害についての用量応答曲線を示す。
図7は、0.5nMおよび10nMの用量で試験された24のsiRNAによるINHBA遺伝子発現の阻害を示す。
図8は、100nM~10fMの濃度の範囲にわたるオリゴヌクレオチド候補配列によるヒトINHBAの阻害についての用量応答曲線を示す。
図9は、0.1および10nMの用量で試験された24のsiRNAによるACVR1B遺伝子発現の阻害を示す。
図10は、100nM~10fMの濃度の範囲にわたるオリゴヌクレオチド候補配列によるヒトACVR1Bの阻害についての用量応答曲線を示す。
図11は、100nM~10fMの濃度の範囲にわたるオリゴヌクレオチド候補配列によるマウスACVR1Bの阻害についての用量応答曲線を示す。
詳細な記載
本開示のいくつかの側面は、筋肉の健康(例として、筋肉の成長および維持)に関連する遺伝子(例として、MSTN、INHBA、またはACDR1B)の発現または活性をモジュレートする分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)を提供する。本開示の他の側面は、ある分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド、ペプチド、小分子)が筋細胞(例として、心筋細胞)において有益な効果を有し得るが、かかる細胞を有効に標的にすることは困難であることが証明されているという認識に関する。結果的に、本明細書にさらに提供されるのは、かかる課題を克服するために、分子ペイロードに共有結合的に連結された筋標的化剤を含む複合体である。いくつかの態様において、複合体は、例として、希少な筋疾患を有するまたは有すると疑われる対象において、筋細胞における標的遺伝子の発現または活性を阻害する分子ペイロードを送達するために特に有用である。いくつかの態様において、本明細書に提供される複合体は、心筋細胞または心筋組織を標的にするように設計されている。いくつかの態様において、本明細書に提供される複合体は、筋萎縮(例として、筋肉減少症または悪液質)を有する対象を処置するために提供される。例えば、いくつかの態様において、複合体は、心筋消耗、心筋症、または心臓悪液質、および/または骨格筋萎縮を有する対象を処置するためにMSTN発現を標的にするために提供される。いくつかの態様において、複合体は、筋萎縮(例として、心筋萎縮)を有する対象を処置するためにINHBAを標的にするために提供される。いくつかの態様において、複合体は、心臓線維症または心肥大を有する対象を処置するためにACVR1Bを標的にするために提供される。
成長分化因子8(GDF8)とも称されるミオスタチンは、筋肉量を負に調節する分泌された成長因子である。ヒトにおいて、ミオスタチンはMSTN遺伝子によってコードされている。ミオスタチン遺伝子(MSTN)における機能喪失型変異は、筋肉過多の表現型につながり、畜牛、ヒツジ、魚類、イヌ、およびヒトにおいて記述されている。ミオスタチンは骨格筋において発現され、脂肪および心臓組織においてより低いレベルの発現が報告されている。ミオスタチンシグナリングの阻害は、筋肉のサイズの増加につながる。
ミオスタチンは、細胞周期の進行を操作することによって心筋細胞の増殖および分化を阻害し得、サイクリン依存性キナーゼ複合体2(CDK2)のレベルを減少させ、p21レベルを増加させることにより、細胞周期G1からS相への推移を防ぐことが示されている。生理学的には、最小限の量の心臓ミオスタチンが心筋から血清に分泌され、筋肉の成長に限定された効果を有する。しかしながら、心臓ミオスタチンの増加はその血清濃度を増加させ得、骨格筋の萎縮を引き起こし得る。
心臓ストレスを増加させ、心不全を促進する病的状態は、心臓内の心臓ミオスタチンmRNAおよびタンパク質レベルの両方の上昇を誘発し得る。虚血性または拡張型心筋症では、ミオスタチンmRNAの増加したレベルが左心室内で検出されている。さらにまた、慢性心不全中のミオスタチンレベルの増加は、心臓悪液質を引き起こすことが示されている。心臓ミオスタチンの全身性の阻害は、既存の心不全を有する実験モデルにおいて全体的な筋肉重量を維持することが示されている。
インヒビンベータA(INHBA)は、アクチビンAおよびインヒビンAのオリゴマーサブユニットとして存在し得るタンパク質である。いくつかの場合において、INHBAは、ジスルフィド連結型ホモ二量体(すなわち、2つのINHBA分子間の二量体)を形成して、アクチビンAを形成し得、これは、卵胞刺激ホルモン(FSH)の生合成および分泌を増強し、細胞の増殖および分化、免疫応答および創傷修復、および内分泌機能を含む、数個の生物学的プロセスに関与している。他の場合において、INHBAはインヒビンアルファと二量体化してインヒビンAを形成し得、FSHの生合成および分泌を減少させる。
アクチビンAは、アクチビンタイプ1受容体(例として、ACVR1、ACVR1B、およびACVR1C)およびアクチビンタイプ2受容体(ACVR2AおよびACVR2B)と相互作用する。これらのタンパク質-タンパク質相互作用は、SMAD2およびSMAD3のリン酸化につながり、結局は多種多様な遺伝子の遺伝子発現に変化をもたらし得る。
アクチビンAは、(例として、ミオスタチンに関連して)筋肉量を負に調節することが示されており、よって、例として、Lee SJ, et al., "Regulation of muscle mass by follistatin and activins", Mol. Endocrinol. 2010 Oct;24(10):1998-2008;およびLach-Trifilieff et al., Mol Cell Biol. 2014 Feb; 34(4): 606-618に記載されているように、筋萎縮(例として、心筋萎縮)を含む数個の筋肉障害に関係している。いくつかの場合において、筋萎縮は生命を脅かす合併症をもたらす。上昇したアクチビンAレベルは、(例として、Lin et al., Acta Cardiol Sin. 2016 Jul; 32(4): 420-427;およびKuo et al., Sci Rep 8, 9957 (2018) に記載されているように)2型糖尿病患者の心筋合併症にも関連している。これらの適応症は、アクチビンAおよびそのサブユニットINHBAを標的にするための組成物および方法が治療的な利益を提供し得ることを実証する。しかしながら、INHBAの機能および発現を標的にする有効な処置(例として、アクチビンAを形成するための二量体化を含む)は限定されている。
ALK-4としても知られるアクチビン受容体タイプ1B(ACVR1B)は、アクチビン受容体タイプ2と相互作用してアクチビン受容体複合体を形成する膜貫通型セリン/トレオニンキナーゼアクチビンタイプ1受容体である。アクチビン受容体複合体は、アクチビンに結合し、ニューロンの分化および生存、創傷治癒、細胞外マトリックス産生、免疫抑制および発癌を含むシグナル伝達を通じて、多様なアレイの細胞プロセスを調節するように機能する。受容体複合体内では、ACVR1Bは、アクチビン結合に続いてアクチビン受容体タイプ2タンパク質によってリン酸化される。リン酸化されたACVR1Bは、続いて、数個のSMADタンパク質(例として、SMAD2およびSMAD3)をリン酸化して、アクチビンシグナリングを伝播することができる。ACVR1BとSMAD7との間の相互作用は、アクチビンシグナリングを阻害するように代替的に機能することができる。
ACVR1Bを通じたそのシグナル伝達経路を通じて機能するアクチビンは、心臓線維症(例として、心房線維症)の主要調節因子であることが確立されている。この調節は、アンジオテンシン-IIの存在によって増強されると考えられている。心筋における細胞外マトリックスの過剰産生を伴う状態である心臓線維症は、一般的に、正常でない心臓機能、心房細動、および/または心臓発作に関連する構造上のリモデリングに関連している。例として、Wang, Q. et al. "The crucial role of activin A/ALK4 pathway in the pathogenesis of Ang-II-induced atrial fibrosis and vulnerability to atrial fibrillation." Basic Res Cardiol. 2017 Jul;112(4):47を参照(その内容は、参照により本明細書に組み込まれる)。さらに、ACVR1Bを標的にすることは、心臓線維症を有する対象において心臓線維症および機能障害を相殺するように機能することが示されている。加えて、ACVR1Bの阻害は、心肥大を有する対象において効果を有する。例として、Chen Y.H. et al., "Haplodeficiency of activin receptor-like kinase 4 alleviates myocardial infarction-induced cardiac fibrosis and preserves cardiac function." J Mol Cell Cardiol. 2017 Apr;105:1-11.;およびWang, Q. et al., "Activin Receptor-Like Kinase 4 Haplodeficiency Mitigates Arrhythmogenic Atrial Remodeling and Vulnerability to Atrial Fibrillation in Cardiac Pathological Hypertrophy." J Am Heart Assoc. 2018 Aug 21;7(16):e008842を参照(それらの各々の内容は、参照により本明細書に組み込まれる)。
定義された用語の記載を含む本開示のさらなる側面は、以下に提供される。
I.定義
ACVR1B:本明細書に使用されるとき、「ACVR1B」または「ALK-4」という用語は、アクチビンA受容体タイプ1Bをコードする遺伝子を指す。ACVR1Bは、アクチビン受容体タイプ2と相互作用してアクチビン受容体複合体を形成し、アクチビンシグナリングを可能にする膜貫通型セリン/トレオニンキナーゼアクチビンタイプ1受容体である。いくつかの態様において、ACVR1Bは、ヒト(遺伝子ID:91)、霊長目の非ヒト動物(例として、遺伝子ID:696587、遺伝子ID:101865702)、または齧歯類の動物の遺伝子(例として、遺伝子ID:11479、遺伝子ID:29381)であり得る。加えて、複数の例示のヒト転写産物(例として、GenBank RefSeqアクセッション番号:NM_004302.5、NM_020327.3、NM_020328.4、XM_017020201.2、XM_011538966.3、およびXM_011538967.3の下で注釈が付けられている)が特徴付けられている。ヒトACVR1B遺伝子によってコードされる例示のACVR1Bタンパク質は、NCBI参照配列:NP_004293.1、NP_064732.3、およびNP_064733.3の下で注釈が付けられており、以下のアミノ酸配列を有する:
NP_004293.1(配列番号251)
MAESAGASSFFPLVVLLLAGSGGSGPRGVQALLCACTSCLQANYTCETDGACMVSIFNLDGMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSSEDLRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLKEPEHPSMWGPVELVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLVINYHQRVYHNRQRLDMEDPSCEMCLSKDKTLQDLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTIEGMIKLALSAASGLAHLHMEIVGTQGKPGIAHRDLKSKNILVKKNGMCAIADLGLAVRHDAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMAPEVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLVYWEIARRCNSGGVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEEMRKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGKMMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSVQEDVKI
NP_064732.3(配列番号274)
MVSIFNLDGMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSSEDLRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLKEPEHPSMWGPVELVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLVINYHQRVYHNRQRLDMEDPSCEMCLSKDKTLQDLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTIEGMIKLALSAASGLAHLHMEIVGTQGKPGIAHRDLKSKNILVKKNGMCAIADLGLAVRHDAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMAPEVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLVYWEIARRCNSGGVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEEMRKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGKMMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSVQEDVKI
NP_064733.3(配列番号278)
MAESAGASSFFPLVVLLLAGSGGSGPRGVQALLCACTSCLQANYTCETDGACMVSIFNLDGMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSSEDLRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLKEPEHPSMWGPVELVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLVINYHQRVYHNRQRLDMEDPSCEMCLSKDKTLQDLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKADCSFLTLPWEVVMVSAAPKLRSLRLQYKGGRGRARFLFPLNNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTIEGMIKLALSAASGLAHLHMEIVGTQGKPGIAHRDLKSKNILVKKNGMCAIADLGLAVRHDAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMAPEVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLVYWEIARRCNSGGVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEEMRKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGKMMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSVQEDVKI
投与する(施す)こと:本明細書に使用されるとき、用語「投与する(施す)こと」または「投与(施し)」は、生理学的におよび/または薬理学的に有用なやり方で対象へ複合体を提供すること(例として、対象における疾病を処置すること)を意味する。
およそ:本明細書に使用されるとき、用語「およそ」または「約」は、関心のある1つ以上の値へ適用されるとき、規定された参照値と同様の値を指す。ある態様において、用語「およそ」または「約」は、別様に述べられない限りまたは文脈から明らかでない限り(かかる数字が実行可能な値の100%を超える場合を除く)、規定された参照値のプラスマイナス(超または未満)の15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、またはこれ未満に収まる広範な値を指す。
抗体:本明細書に使用されるとき、用語「抗体」は、少なくとも1個の免疫グロブリン可変ドメインまたは少なくとも1個の抗原決定基、例として、抗原へ特異的に結合するパラトープを包含するポリペプチドを指す。いくつかの態様において、抗体は、完全長の抗体である。いくつかの態様において、抗体は、キメラ抗体である。いくつかの態様において、抗体は、ヒト化抗体である。しかしながら、いくつかの態様において、抗体は、Fabフラグメント、F(ab’)2フラグメント、Fvフラグメント、またはscFvフラグメントである。いくつかの態様において、抗体は、ラクダ科の動物の抗体に由来するナノボディー、またはサメ抗体に由来するナノボディーである。いくつかの態様において、抗体は、二重特異性抗体である。いくつかの態様において、抗体は、ヒト生殖細胞系配列を有するフレームワークを含む。別の態様において、抗体は、IgG、IgG1、IgG2、IgG2A、IgG2B、IgG2C、IgG3、IgG4、IgA1、IgA2、IgD、IgM、およびIgEの定常領域からなる群から選択される重鎖定常領域を含む。いくつかの態様において、抗体は、重(H)鎖可変領域(本明細書中VHと略される)、および/または、軽(L)鎖可変領域(本明細書中VLと略される)を含む。いくつかの態様において、抗体は、定常領域、例としてFc領域を含む。免疫グロブリン定常領域は、重鎖または軽鎖定常領域を指す。ヒトIgG重鎖および軽鎖定常領域アミノ酸配列およびそれらの機能的バリエーションは知られている。重鎖に関し、いくつかの態様において本明細書に記載の抗体の重鎖は、アルファ(α)、デルタ(Δ)、イプシロン(ε)、ガンマ(γ)、またはミュー(μ)重鎖であり得る。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗体の重鎖は、ヒトのアルファ(α)、デルタ(Δ)、イプシロン(ε)、ガンマ(γ)、またはミュー(μ)重鎖を含み得る。具体的な態様において、本明細書に記載の抗体は、ヒトのガンマ1 CH1ドメイン、CH2ドメイン、および/または、CH3ドメインを含む。いくつかの態様において、VHドメインのアミノ酸配列は、ヒトガンマ(γ)重鎖定常領域のアミノ酸配列、たとえば当該技術分野において知られているいずれの配列も含む。ヒト定常領域配列の非限定例は当該技術分野において記載されており、例として、米国特許第5,693,780号および上記のKabat E Aら(1991)を見よ。いくつかの態様において、VHドメインは、本明細書に提供される可変鎖定常領域のいずれかと少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの態様において、抗体は修飾されており、例として、グリコシル化、リン酸化、SUMO化、および/または、メチル化を介して修飾されている。いくつかの態様において、抗体は、1個以上の糖または炭水化物分子へ抱合されたグリコシル化抗体である。いくつかの態様において、1個以上の糖または炭水化物分子は、N-グリコシル化、O-グリコシル化、C-グリコシル化、グリピエーション(glypiation)(GPIアンカー付着)、および/または、ホスホグリコシル化を介して抗体へ抱合されている。いくつかの態様において、1個以上の糖または炭水化物分子は、単糖類、二糖類、オリゴ糖類、またはグリカンである。いくつかの態様において、1個以上の糖または炭水化物分子は、分枝オリゴ糖類または分枝グリカンである。いくつかの態様において、1個以上の糖または炭水化物分子は、マンノース単位、グルコース単位、N-アセチルグルコサミン単位、N-アセチルガラクトサミン単位、ガラクトース単位、フコース単位、またはホスホ脂質単位を包含する。いくつかの態様において、抗体は、リンカーポリペプチドまたは免疫グロブリン定常領域へ連結された本開示の1個以上の抗原結合性フラグメントを含むポリペプチドを含む構築物である。リンカーポリペプチドは、ペプチド結合によって結び合わされた2個以上のアミノ酸残基を含み、1個以上の抗原結合部と連結させるために使用される。リンカーポリペプチドの例は報告されている(例として、Holliger,P.,et al.(1993)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:6444-6448;Poljak,R.J.,et al.(1994)Structure 2:1121-1123を見よ)。またさらに、抗体は、1以上の他のタンパク質またはペプチドと、抗体もしくは抗体部分との共有結合または非共有結合の結び付きによって形成される、より大きな免疫接着分子の一部であってもよい。かかる免疫接着分子の例は、四量体scFv分子を作製するためのストレプトアビジンコア領域の使用(Kipriyanov,S.M.,et al.(1995)Human Antibodies and Hybridomas 6:93-101)、ならびに二価のおよびビオチン化されたscFv分子を作製するためのシステイン残基、マーカーペプチド、およびC末ポリヒスチジンタグの使用(Kipriyanov,S.M.,et al.(1994)Mol.Immunol.31:1047-1058)を包含する。
CDR:本明細書に使用されるとき、用語「CDR」は、抗体可変配列内の相補性決定領域を指す。重鎖および軽鎖の可変領域の各々において3つのCDRがあり、これらは可変領域の各々につきCDR1、CDR2、およびCDR3と指定される。用語「CDRセット」は、本明細書に使用されるとき、抗原に結合することが可能な単一の可変領域に生じる3つのCDRの一群を指す。これらのCDRの厳密な境界は、種々の系に従い異なって定義されている。Kabat(Kabat et al.,Sequence of Proteins of Immunological Interest(国立衛生研究所,Bethesda,Md.(1987)および(1991))によって記載される系は、抗体のいずれの可変領域へも適用可能な一義的な残基ナンバリング系を提供するのみならず、3つのCDRを定義する正確な残基境界をも提供する。これらのCDRは、Kabat CDRと称されることもある。CDRの下位部(Sub-portions)は、L1、L2、およびL3、またはH1、H2、およびH3と指定されることがあり、ここで「L」および「H」は夫々、軽鎖および重鎖領域を指定する。これらの領域は、Kabat CDRと重複する境界を有するChothia CDRと称されることもある。Kabat CDRと重複するCDRを定義する他の境界は、Padlan(FASEB J.9:133-139(1995))およびMacCallum(J Mol Biol 262(5):732-45(1996))によって記載されている。さらに他のCDR境界定義は、上の系の1つに厳重に従わなくてもよいが、それでもなおKabat CDRと重複することがあり、具体的な残基もしくは残基の群またはCDR全体でさえも抗原結合に有意に影響を及ぼすものではないという予測あるいは実験的知見を踏まえ、それらは短縮または伸長されてもよい。本明細書に使用される方法は、これらの系のいずれかに従って定義されるCDRを利用してもよいが、好ましい態様はKabatまたはChothiaに定義されるCDRを使用する。
CDR接合(-grafted)抗体:用語「CDR接合抗体」は、マウス重鎖および軽鎖可変領域を有するがマウスCDRの1以上(例として、CDR3)がヒトCDR配列に置き換えられている抗体などの、ある種からの重鎖および軽鎖可変領域配列を含むが、そのVHおよび/またはVLのCDR領域の1以上の配列が別の種のCDR配列に置き換えられている抗体を指す。
キメラ抗体:用語「キメラ抗体」は、ヒト定常領域へ連結されたマウス重鎖および軽鎖可変領域を有する抗体などの、ある種からの重鎖および軽鎖可変領域配列と別の種からの定常領域配列を含む抗体を指す。
相補的:本明細書に使用されるとき、用語「相補的」は、2ヌクレオチド間または2組のヌクレオチド間の正確な対形成のための能力(capacity)を指す。とりわけ、相補的は、2ヌクレオチド間または2組のヌクレオチド間に結合をもたらす水素結合対形成の程度を特徴付ける用語である。例えば、ある位置のオリゴヌクレオチドの塩基が、対応する位置の標的核酸(例として、mRNA)の塩基と水素結合することが可能である場合、そのとき塩基は、その位置にて互いに相補的であると見なされる。塩基対合は、標準的なWatson-Crick塩基対合と非Watson-Crick塩基対合(例として、Wobble塩基対合およびHoogsteen塩基対合)との両方を包含してもよい。例えば、いくつかの態様において、相補的な塩基対合として、アデノシン型塩基(A)は、チミジン型塩基(T)またはウラシル型塩基(U)に相補的であり、シトシン型塩基(C)は、グアノシン型塩基(G)に相補的であり、3-ニトロピロールまたは5-ニトロインドールなどのユニバーサル塩基は、いずれのA、C、U、またはTとハイブリダイズし得、これらと相補的であると見なされる。イノシン(I)はまた、当該技術分野においてユニバーサル塩基であるとも見なされており、いずれのA、C、U、またはTに相補的であると見なされる。
保存アミノ酸置換:本明細書に使用されるとき、「保存アミノ酸置換」は、アミノ酸置換がなされたタンパク質の相対的な電荷またはサイズの特徴を変更しないアミノ酸置換を指す。バリアントは、当業者に知られているポリペプチド配列を変更するための方法に従って調製され得、たとえば、かかる方法をまとめた参考文献、例として、Molecular Cloning:A Laboratory Manual,J.Sambrook,et al.,eds.,Fourth Edition,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,New York,2012、またはCurrent Protocols in Molecular Biology,F.M.Ausubel,et al.,eds.,John Wiley & Sons,Inc.,New Yorkから見出される。アミノ酸の保存的置換は、以下の群:(a)M、I、L、V;(b)F、Y、W;(c)K、R、H;(d)A、G;(e)S、T;(f)Q、N;および(g)E、D内のアミノ酸に対してなされる置換を包含する。
共有結合的に連結された(ている):本明細書に使用されるとき、用語「共有結合的に連結された(ている)」は、少なくとも1個の共有結合を介して一緒に連結されている2個以上の分子の特徴を指す。いくつかの態様において、2個の分子は一緒に、分子間リンカーとして働く単結合(例として、ジスルフィド結合またはジスルフィド架橋)によって共有結合的に連結され得る。しかしながら、いくつかの態様において、複数の共有結合を通して2個以上の分子を一緒に結び合わせるリンカーとして働く分子を介して、2個以上の分子は一緒に、共有結合的に連結され得る。いくつかの態様において、リンカーは、切断可能なリンカーであってもよい。しかしながら、いくつかの態様において、リンカーは、切断不能なリンカーであってもよい。
交差反応すること:本明細書に使用されるとき、および標的化剤(例として、抗体)の文脈において、用語「交差反応すること」は、同様のタイプまたはクラスの1種より多くの抗原(例として、複数のホモログ、パラログ、もしくはオルソログの抗原)へ、同様の親和性または結合活性で特異的に結合することが可能な剤の特性を指す。例えば、いくつかの態様において、同様のタイプまたはクラスのヒトおよび霊長目の非ヒト動物の抗原(例として、ヒトトランスフェリン受容体および霊長目の非ヒト動物のトランスフェリン受容体)に対して交差反応する抗体は、ヒト抗原および霊長目の非ヒト動物の抗原へ、同様の親和性または結合活性で結合することが可能である。いくつかの態様において、抗体は、同様のタイプまたはクラスのヒト抗原および齧歯類動物抗原に対して交差反応する。いくつかの態様において、抗体は、同様のタイプまたはクラスの齧歯類動物の抗原および霊長目の非ヒト動物の抗原に対して交差反応する。いくつかの態様において、抗体は、同様のタイプまたはクラスのヒト抗原、霊長目の非ヒト動物の抗原、および齧歯類動物の抗原に対して交差反応する。
フレームワーク:本明細書に使用されるとき、用語「フレームワーク」または「フレームワーク配列」は、CDRを差し引いた可変領域の残りの配列を指す。CDR配列の厳密な定義が種々の系によって決定され得ることから、フレームワーク配列の意味は、相応に異なる解釈に依存する。6つのCDR(軽鎖のCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3、ならびに重鎖のCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3)もまた、軽鎖および重鎖上のフレームワーク領域を各鎖上の4つの下位領域(FR1、FR2、FR3、およびFR4)に分け、ここでCDR1はFR1とFR2との間に、CDR2はFR2とFR3との間に、CDR3はFR3とFR4との間に位置付けられる。具体的な下位領域をFR1、FR2、FR3、またはFR4と特定しないフレームワーク領域は、他によって言及されるとき、天然に存在する単一の免疫グロブリン鎖の可変領域内の組み合わされたFR(複数)を表す。本明細書に使用されるとき、FRは4つの下位領域のうち1つを表し、FR(複数)はフレームワーク領域を含有する4つの下位領域のうち2つ以上を表す。ヒト重鎖および軽鎖アクセプター配列は、当該技術分野において知られている。一態様において、当該技術分野において知られているアクセプター配列は、本明細書に開示の抗体に使用されていてもよい。
ヒト抗体:用語「ヒト抗体」は、本明細書に使用されるとき、ヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列に由来する可変領域および定常領域を有する抗体を包含することが意図される。本開示のヒト抗体は、例えばCDR、とりわけCDR3において、ヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列によってコードされないアミノ酸残基(例として、in vitroでのランダム変異誘発もしくは部位特異的変異誘発によってか、またはin vivoでの体細胞変異によって導入された突然変異)を包含していてもよい。しかしながら、用語「ヒト抗体」は、本明細書に使用されるとき、マウスなどの別の哺乳動物種の生殖細胞系列に由来するCDR配列がヒトフレームワーク配列上へ接合された抗体を包含することは意図されない。
ヒト化抗体:用語「ヒト化抗体」は、非ヒト種(例として、マウス)からの重鎖および軽鎖の可変領域配列を含むが、VH配列および/またはVL配列の少なくとも一部がより「ヒト様」に、すなわち、ヒト生殖細胞系可変配列とより同様なものに変更された抗体を指す。ヒト化抗体のあるタイプは、ヒトCDR配列が非ヒトVHおよびVL配列上へ導入されて対応する非ヒトCDR配列と置き換えられたCDR接合抗体である。一態様において、ヒト化抗トランスフェリン受容体抗体および抗原結合部分が提供される。かかる抗体は、既存のハイブリドーマ技術、これに続くin vitroの遺伝子工学を使用するヒト化(KasaianらのPCT刊行物第WO 2005/123126 A2号に開示されたものなど)を使用してマウス抗トランスフェリン受容体モノクローナル抗体を得ることによって生成されてもよい。
INHBA:本明細書に使用されるとき、「INHBA」または「インヒビン、ベータA」という用語は、インヒビン、ベータA(INHBA)をコードする遺伝子を指す。いくつかの態様において、INHBA遺伝子は、ヒトINHBA遺伝子(遺伝子ID:3624)、霊長目の非ヒト動物のINHBA遺伝子(例として、遺伝子ID:102146142、遺伝子ID:702734)、または齧歯類の動物のINHBA遺伝子(例として、遺伝子ID:16323、遺伝子ID:29200)であり得る。加えて、例示のヒト転写産物(例として、GenBank RefSeqアクセッション番号:NM_002192.4の下で注釈が付けられている)が特徴付けられている。ヒトINHBA遺伝子によってコードされる例示のINHBAタンパク質は、NCBI参照配列:NP_002183.1の下で注釈が付けられており、以下のアミノ酸配列を有する:
MPLLWLRGFLLASCWIIVRSSPTPGSEGHSAAPDCPSCALAALPKDVPNSQPEMVEAVKKHILNMLHLKKRPDVTQPVPKAALLNAIRKLHVGKVGENGYVEIEDDIGRRAEMNELMEQTSEIITFAESGTARKTLHFEISKEGSDLSVVERAEVWLFLKVPKANRTRTKVTIRLFQQQKHPQGSLDTGEEAEEVGLKGERSELLLSEKVVDARKSTWHVFPVSSSIQRLLDQGKSSLDVRIACEQCQESGASLVLLGKKKKKEEEGEGKKKGGGEGGAGADEEKEQSHRPFLMLQARQSEDHPHRRRRRGLECDGKVNICCKKQFFVSFKDIGWNDWIIAPSGYHANYCEGECPSHIAGTSGSSLSFHSTVINHYRMRGHSPFANLKSCCVPTKLRPMSMLYYDDGQNIIKKDIQNMIVEECGCS(配列番号286)
内在化する細胞表面受容体:本明細書に使用されるとき、用語「内在化する細胞表面受容体」は、例として、外部刺激(例として、受容体へ結合するリガンド)の際、細胞によって内在化される細胞表面受容体を指す。いくつかの態様において、内在化する細胞表面受容体は、エンドサイトーシスによって内在化される。いくつかの態様において、内在化する細胞表面受容体は、クラスリン媒介エンドサイトーシスによって内在化される。しかしながら、いくつかの態様において、内在化する細胞表面受容体は、クラスリンに依存しない経路、例えば、食作用、マクロピノサイトーシス、カベオラ-およびラフト-媒介取り込み、またはクラスリンに依存しない構成的エンドサイトーシスなどによって内在化される。いくつかの態様において、内在化する細胞表面受容体は、細胞内ドメイン、膜貫通ドメイン、および/または、細胞外ドメインを含み、これらは任意にさらにリガンド結合ドメインを含む。いくつかの態様において、細胞表面受容体は、リガンド結合後に細胞によって内在化されるようになる。いくつかの態様において、リガンドは、筋標的化剤または筋標的化抗体であってもよい。いくつかの態様において、内在化する細胞表面受容体は、トランスフェリン受容体である。
単離された抗体:「単離された抗体」は、本明細書に使用されるとき、異なる抗原特異性を有する他の抗体が実質的にない抗体を指すことが意図される(例として、トランスフェリン受容体に特異的に結合する単離された抗体は、トランスフェリン受容体以外の抗原に特異的に結合する抗体が実質的にない)。しかしながら、トランスフェリン受容体複合体に特異的に結合する単離された抗体は、他の種からのトランスフェリン受容体分子などの他の抗原への交差反応性を有していてもよい。その上、単離された抗体は、他の細胞の材料および/または化学物質が実質的になくてもよい。
Kabatナンバリング:用語「Kabatナンバリング」、「Kabat定義」、および「Kabat標識化」は本明細書中、互換的に使用される。これらの用語は、当該技術分野において認識されているが、抗体またはその抗原結合部分の重鎖および軽鎖可変領域中の他のアミノ酸残基より可変(すなわち、高可変)であるアミノ酸残基をナンバリングする系を指す(Kabat et al.(1971)Ann.NY Acad,Sci.190:382-391および、Kabat,E.A.,et al.(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest,Fifth Edition,U.S.Department of Health and Human Services,NIH Publication No.91-3242)。重鎖可変領域において、超可変領域は、CDR1につきアミノ酸位置31~35、CDR2につきアミノ酸位置50~65、およびCDR3につきアミノ酸位置95~102に及ぶ。軽鎖可変領域において、超可変領域は、CDR1につきアミノ酸位置24~34、CDR2につきアミノ酸位置50~56、およびCDR3につきアミノ酸位置89~97に及ぶ。
分子ペイロード:本明細書に使用されるとき、用語「分子ペイロード」は、生物学的結果(biological outcome)をモジュレートするよう機能する分子または種を指す。いくつかの態様において、分子ペイロードは、筋標的化剤へ連結されているか、または筋標的化剤へ別様に結び付けられている。いくつかの態様において、分子ペイロードは、小分子、タンパク質、ペプチド、核酸、またはオリゴヌクレオチドである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、DNA配列の転写をモジュレートするよう、タンパク質の発現をモジュレートするよう、またはタンパク質の活性をモジュレートするよう機能する。いくつかの態様において、分子ペイロードは、標的遺伝子と相補性のある領域を有する鎖を含むオリゴヌクレオチドである。
MSTN:本明細書に使用されるとき、「MSTN」という用語は、筋肉量を負に調節する分泌された成長因子であるミオスタチンをコードする遺伝子を指す。いくつかの態様において、MSTNは、ヒト(遺伝子ID:2660)、霊長目の非ヒト動物(例として、遺伝子ID:710114、遺伝子ID:470605)、または齧歯類の動物の遺伝子(例として、遺伝子ID:29152、遺伝子ID:17700)であり得る。加えて、例示のヒト転写産物(例として、GenBank RefSeqアクセッション番号:NM_005259.3の下で注釈が付けられている)が特徴付けられている。ヒトMSTN遺伝子によってコードされる例示のミオスタチンタンパク質は、NCBI参照配列:NP_005250.1の下で注釈が付けられており、以下のアミノ酸配列を有する:
MQKLQLCVYIYLFMLIVAGPVDLNENSEQKENVEKEGLCNACTWRQNTKSSRIEAIKIQILSKLRLETAPNISKDVIRQLLPKAPPLRELIDQYDVQRDDSSDGSLEDDDYHATTETIITMPTESDFLMQVDGKPKCCFFKFSSKIQYNKVVKAQLWIYLRPVETPTTVFVQILRLIKPMKDGTRYTGIRSLKLDMNPGTGIWQSIDVKTVLQNWLKQPESNLGIEIKALDENGHDLAVTFPGPGEDGLNPFLEVKVTDTPKRSRRDFGLDCDEHSTESRCCRYPLTVDFEAFGWDWIIAPKRYKANYCSGECEFVFLQKYPHTHLVHQANPRGSAGPCCTPTKMSPINMLYFNGKEQIIYGKIPAMVVDRCGCS(配列番号290)
筋萎縮:本明細書に使用されるとき、「筋萎縮」という用語は、筋肉の消耗によって特徴付けられる状態を指す。いくつかの態様において、筋萎縮は、廃用(disuse)期間中および/または全身性炎症(例として、悪液質)に応えて生じる、高度に調節された異化プロセスである。いくつかの態様において、筋萎縮は、対象における減少する筋肉量、筋肉サイズの低減、および/または筋細胞の数の低減に関連している。慢性の病気(例として、うっ血性心不全、糖尿病、がん、エイズ、および腎疾患)、重度の熱傷、クリティカルケアミオパチー、肢の除神経、脳卒中、肢の骨折、食欲不振、脊髄傷害、または筋肉の廃用につながる他の状態を含む状態は、筋萎縮をもたらし得る。いくつかの態様において、筋萎縮は、がん悪液質、心臓悪液質、絶食、糖尿病、腎不全、除神経、またはグルココルチコイド誘発性筋萎縮によって引き起こされる。
筋標的化剤:本明細書に使用されるとき、用語「筋標的化剤」は、筋細胞(例として、心筋細胞)上に発現されている抗原へ特異的に結合する分子を指す。筋細胞中または筋細胞上の抗原は、膜タンパク質、例えば、内在性膜タンパク質または表在性膜タンパク質であってもよい。典型的には、筋標的化剤は、筋細胞中への筋標的化剤(および結び付けられたいずれの分子ペイロード)の内在化を容易にさせる筋細胞上の抗原へ特異的に結合する。いくつかの態様において、筋標的化剤は、筋肉上の内在化する細胞表面受容体へ特異的に結合し、受容体媒介内在化を通して筋細胞中へ内在化されることが可能である。いくつかの態様において、筋標的化剤は、小分子、タンパク質、ペプチド、核酸(例として、アプタマー)、または抗体である。いくつかの態様において、筋標的化剤は、分子ペイロードへ連結されている。
筋標的化抗体:本明細書に使用されるとき、用語「筋標的化抗体」は、筋細胞(例として、心筋細胞)中または筋細胞(例として、心筋細胞)上に見出される抗原へ特異的に結合する抗体である筋標的化剤を指す。いくつかの態様において、筋標的化抗体は、筋細胞中への筋標的化抗体(および結び付けられたいずれの分子ペイロード)の内在化を容易にする筋細胞上の抗原へ特異的に結合する。いくつかの態様において、筋標的化抗体は、筋細胞上に存在する、内在化する細胞表面受容体へ特異的に結合する。いくつかの態様において、筋標的化抗体は、トランスフェリン受容体へ特異的に結合する抗体である。
オリゴヌクレオチド:本明細書に使用されるとき、用語「オリゴヌクレオチド」は、長さが最大200ヌクレオチドまでのオリゴマーの核酸化合物を指す。オリゴヌクレオチドの例は、これらに限定されないが、RNAiオリゴヌクレオチド(例として、siRNA、shRNA)、マイクロRNA、gapmer、mixmer、ホスホロジアミダイトモルホリノ、ペプチド核酸、アプタマー、ガイド核酸(例として、Cas9ガイドRNA)等々を包含する。オリゴヌクレオチドは一本鎖または二本鎖であってもよい。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、1個以上の修飾ヌクレオチド(例として、2’-O-メチル糖修飾、プリンまたはピリミジン修飾)を含んでいてもよい。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、1個以上の修飾ヌクレオチド間連結を含んでいてもよい。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、RpまたはSpの立体化学配置にあってもよい1個以上のホスホロチオアート連結を含んでいてもよい。
組換え抗体:用語「組換えヒト抗体」は、本明細書に使用されるとき、組換え手段によって調製、発現、創出、もしくは単離されたすべてのヒト抗体、たとえば、宿主細胞中へトランスフェクトされた組換え発現ベクターを使用して発現された抗体(本開示により詳細に記載される)、組換えコンビナトリアルヒト抗体ライブラリから単離された抗体(Hoogenboom H.R.,(1997)TIB Tech.15:62-70;Azzazy H.,and Highsmith W.E.,(2002)Clin.Biochem.35:425-445;Gavilondo J.V.,and Larrick J.W.(2002)BioTechniques 29:128-145;Hoogenboom H.,and Chames P.(2000)Immunology Today 21:371-378)、ヒト免疫グロブリン遺伝子トランスジェニック動物(例として、マウス)から単離された抗体(例として、Taylor,L.D.,et al.(1992)Nucl.Acids Res.20:6287-6295;Kellermann S-A.,and Green L.L.(2002)Current Opinion in Biotechnology 13:593-597;Little M.et al(2000)Immunology Today 21:364-370を見よ)、またはヒト免疫グロブリン遺伝子配列の他のDNA配列とのスプライシングを伴ういずれの他の手段によって調製、発現、創出、もしくは単離された抗体を包含することが意図される。かかる組換えヒト抗体は、ヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列に由来する可変領域および定常領域を有する。しかしながら、ある態様において、かかる組換えヒト抗体は、in vitroでの変異誘発(または、ヒトIg配列トランスジェニック動物が使用されるとき、in vivoでの体細胞変異誘発)へ供され、よって、組換え抗体のVHおよびVL領域のアミノ酸配列は、ヒト生殖細胞系のVH配列およびVL配列に由来しかつこれに関するとはいえ、in vivoでのヒト抗体の生殖細胞系列レパートリー内には天然に存在しないこともある配列である。本開示の一態様は、当該技術分野において周知である技法を使用して、たとえば、これらに限定されないが、ヒトIgファージライブラリ(たとえば、JermutusらのPCT刊行物第WO 2005/007699 A2号に開示されたもの)を使用する技法を使用して生成され得るヒトトランスフェリン受容体に結合することが可能な完全ヒト抗体を提供する。
相補性のある領域:本明細書に使用されるとき、用語「相補性のある領域」は、2つのヌクレオチド配列が生理学的な条件下(例として、細胞中)相互にアニーリングすることが可能であるような、同族の(cognate)ヌクレオチド配列(例として、標的核酸のヌクレオチド配列)に充分に相補的であるヌクレオチド配列(例として、オリゴヌクレオチドのヌクレオチド配列)を指す。いくつかの態様において、相補性のある領域は、標的核酸の同族のヌクレオチド配列に完全に相補的である。しかしながら、いくつかの態様において、相補性のある領域は、標的核酸の同族のヌクレオチド配列に部分的に相補的(例として、少なくとも80%、90%、95%、または99%相補性)である。いくつかの態様において、相補性のある領域は、標的核酸の同族のヌクレオチド配列と比較して1個、2個、3個、または4個のミスマッチを含有する。
特異的に結合する:本明細書に使用されるとき、用語「特異的に結合する」は、結合アッセイまたは他の結合に関する文脈(binding context)において、分子が、適切な対照から結合パートナーを区別するために使用され得る親和性または結合活性の程度での、分子の、結合パートナーへの結合能を指す。抗体に関し、用語「特異的に結合する」は、親和性または結合活性の程度で(例として、本明細書に記載のとおり、抗原への結合を通してある細胞(例として、筋細胞)への優先的な標的化を許容する程度で)、適切な参照抗原、または抗体が他の抗原から特定の抗原を区別するために使用され得る抗原と比較して、抗体が特定の抗原へ結合する能力を指す。いくつかの態様において、抗体が標的へ結合する際少なくとも約10-4M、10-5M、10-6M、10-7M、10-8M、10-9M、10-10M、10-11M、10-12M、10-13M、またはこれ未満のKを有する場合、抗体は標的へ特異的に結合する。いくつかの態様において、抗体が、トランスフェリン受容体、例として、トランスフェリン受容体の先端ドメインのエピトープへ特異的に結合する。
対象:本明細書に使用されるとき、「対象」という用語は、哺乳動物を指す。いくつかの態様において、対象は、霊長目の非ヒト動物、または齧歯類の動物である。いくつかの態様において、対象はヒトである。いくつかの態様において、対象は、患者、例として、疾患を有するまたは有すると疑われるヒト患者である。いくつかの態様において、対象は、2型糖尿病を有する患者である。いくつかの態様において、対象は、がんを有する患者である。いくつかの態様において、対象は、心不全、筋萎縮(例として、骨格および/または心筋萎縮)、筋ジストロフィー、悪液質(例として、心臓悪液質)、筋肥大、心筋消耗、および/または心筋症を有するまたは有すると疑われるヒト患者である。いくつかの態様において、筋肥大を有する対象は、(参照により本明細書に組み込まれる)Schuelke, M. et al., "Myostatin Mutation Associated with Gross Muscle Hypertrophy in a Child" N Engl J Med 2004; 350:2682-2688におけるように、MSTNにおいて少なくとも1の突然変異を有する。いくつかの態様において、対象は、心筋合併症(例として、心不全、心筋萎縮、悪液質、および/または心筋肥大)を患っている2型糖尿病を有する患者である。いくつかの態様において、対象は、悪液質を患っているがん患者である。いくつかの態様において、対象は、心臓線維症または心肥大を有するまたは有すると疑われるヒト患者である。いくつかの態様において、対象は、アンギオテンシンII誘発性心肥大を有するまたは有すると疑われるヒト患者である。いくつかの態様において、対象は、心筋梗塞(すなわち、心臓発作)を経験している。
トランスフェリン受容体:本明細書に使用されるとき、用語「トランスフェリン受容体」(またCD71、p90、TFR、またはTFR1としても知られている)は、エンドサイトーシスによる鉄取り込みを容易にするためのトランスフェリンへ結合する、内在化する細胞表面受容体を指す。いくつかの態様において、トランスフェリン受容体は、ヒト(NCBI Gene ID 7037)、霊長目の非ヒト動物(例として、NCBI Gene ID 711568もしくはNCBI Gene ID 102136007)、または齧歯類の動物(例として、NCBI Gene ID 22042)を起源としていてもよい。加えて、受容体の種々のアイソフォームをコードした複数のヒト転写産物バリアントが(例として、GenBank RefSeq受託番号:NP_001121620.1、NP_003225.2、NP_001300894.1、およびNP_001300895.1の注釈付きのものであるように)特徴付けられている。
2’修飾ヌクレオシド:本明細書に使用されるとき、用語「2’修飾ヌクレオシド」および「2’修飾リボヌクレオシド」は互換的に使用され、2’位にて修飾された糖部分を有するヌクレオシドを指す。いくつかの態様において、2’修飾ヌクレオシドは、2’-4’二環式ヌクレオシドであり、ここで糖の2’および4’位は架橋されている(例として、メチレン、エチレン、または(S)-拘束エチル架橋による)。いくつかの態様において、2’修飾ヌクレオシドは非二環式2’修飾ヌクレオシドであり、例えばここで糖部分の2’位は置換されている。2’修飾ヌクレオシドの非限定例は、以下:2’デオキシ、2’-フルオロ(2’-F)、2’-O-メチル(2’-O-Me)、2’-O-メトキシエチル(2’-MOE)、2’-O-アミノプロピル(2’-O-AP)、2’-O-ジメチルアミノエチル(2’-O-DMAOE)、2’-O-ジメチルアミノプロピル(2’-O-DMAP)、2’-O-ジメチルアミノエチルオキシエチル(2’-O-DMAEOE)、2’-O-N-メチルアセトアミド(2’-O-NMA)、ロックド核酸(LNA、メチレン架橋核酸)、エチレン架橋核酸(ENA)、および(S)-拘束エチル架橋核酸(cEt)を包含する。いくつかの態様において、本明細書に記載の2’修飾ヌクレオシドは高親和性修飾ヌクレオチドであり、2’修飾ヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチドは、未修飾のオリゴヌクレオチドと比べて標的配列に対する増大した親和性を有する。2’修飾ヌクレオシドの構造の例は、下に提供される:
Figure 2023512441000002
II.複合体
本明細書に提供されるのは、標的化剤、例として、分子ペイロードへ共有結合的に連結された抗体を含む複合体である。いくつかの態様において、複合体は、オリゴヌクレオチドへ共有結合的に連結された筋標的化抗体を含む。複合体は、単一の抗原部位に特異的に結合する抗体、または同じ抗原上もしくは異なる抗原上に存在していてもよい少なくとも2つの抗原部位へ結合する抗体を含んでいてもよい。
複合体は、少なくとも1つの遺伝子、タンパク質、および/または、核酸の活性あるいは機能をモジュレートするために使用されてもよい。いくつかの態様において、複合体とともに存在する分子ペイロードは、遺伝子、タンパク質、および/または、核酸のモジュレーションを担う。分子ペイロードは、細胞中の遺伝子、タンパク質、および/または、核酸の活性あるいは機能をモジュレートすることが可能な、小分子、タンパク質、核酸、オリゴヌクレオチド、あるいはいずれの分子実体であってもよい。いくつかの態様において、分子ペイロードは、筋細胞(例として、心筋細胞)におけるMSTN遺伝子を標的にするオリゴヌクレオチドである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、筋細胞(例として、心筋細胞)におけるINHBAまたはアクチビンAを標的にするオリゴヌクレオチドである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、筋細胞(例として、心筋細胞)におけるACVR1Bを標的にするオリゴヌクレオチドである。
いくつかの態様において、複合体は、筋標的化剤、例として、分子ペイロード(例として、MSTN遺伝子を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチド、INHBAを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチド、またはACVR1Bを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチド)に共有結合的に連結された抗トランスフェリン受容体抗体を含む。
A.筋標的化剤
本開示のいくつかの側面は、筋標的化剤、例として、分子ペイロードを筋細胞(例として、心筋細胞)へ送達するための筋標的化剤を提供する。いくつかの態様において、かかる筋標的化剤は、例として、筋細胞上の抗原への特異的な結合を介して、筋細胞へ結合すること、および結び付けられた分子ペイロードを筋細胞へ送達することが可能である。いくつかの態様において、筋標的化剤は、心筋細胞または心筋組織を標的にするように設計されている。いくつかの態様において、分子ペイロードは、筋標的化剤へ結合されて(例として、共有結合的に結合されて)おり、筋標的化剤が筋細胞上の抗原へ結合した際、例としてエンドサイトーシスを介して、筋細胞中へ内在化される。様々なタイプの筋標的化剤が本開示に従い使用されてもよいことは解されるはずである。例えば、筋標的化剤は、核酸(例として、DNAまたはRNA)、ペプチド(例として、抗体)、脂質(例として、マイクロベシクル)、または糖部(例として、多糖類)を含んでいてもよく、またはこれらからなっていてもよい。例示の筋標的化剤は本明細書中さらに詳細に記載されているが、しかしながら、本明細書に提供される例示の筋標的化剤が限定されることを意図していないことは解されるはずである。
本開示のいくつかの側面は、骨格筋、平滑筋、または心筋(cardiac muscle)などの筋肉上の抗原へ特異的に結合する筋標的化剤を提供する。いくつかの態様において、本明細書に提供される筋標的化剤のいずれも、心筋細胞、骨格筋細胞,および/または平滑筋細胞上の抗原へ結合する(例として、特異的に結合する)。いくつかの態様において、本明細書に提供される筋標的化剤のいずれも、心筋細胞上の抗原へ結合する(例として、特異的に結合する)。
筋肉特異的細胞表面認識要素(例として、細胞膜タンパク質)との相互作用によって、組織局在化と筋細胞への選択的取り込みとの両方が達成され得る。いくつかの態様において、筋肉の取り込みトランスポーターの基質である分子は、分子ペイロードを筋組織中へ送達するのに有用である。筋肉表面認識要素への結合、これに続くエンドサイトーシスは、抗体などの巨大分子さえも筋細胞へ侵入できるようにし得る。別の例として、トランスフェリンまたは抗トランスフェリン受容体抗体へ抱合された分子ペイロードは、トランスフェリン受容体への結合を介し筋細胞によって取り入れられ得、次いで、例としてクラスリン媒介エンドサイトーシスを介し、形質膜陥入され(endocytosed)てもよい。
筋標的化剤の使用は、他の組織において効果に関連する毒性を低減しつつ、筋肉中の分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)を濃縮するのに有用なこともある。いくつかの態様において、筋標的化剤は、対象内の別の細胞型と比較して、筋細胞中の結合された分子ペイロードを濃縮させる。いくつかの態様において、筋標的化剤は、筋細胞(例として、心筋細胞)中の結合された分子ペイロードを、非筋細胞(例として、肝臓細胞、神経細胞、血液細胞、または脂肪細胞)中の量より少なくとも1倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、15倍、20倍、30倍、40倍、50倍、60倍、70倍、80倍、90倍、または100倍多い量で濃縮する。いくつかの態様において、筋標的化剤へ結合された場合の分子ペイロードの対象における毒性は、これが対象へ送達されたとき、少なくとも1%、2%、3%、4%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、90%、または95%低減される。
いくつかの態様において、筋肉選択性を獲得するために、筋肉認識要素(例として、筋細胞抗原)が要されることもある。一例として、筋標的化剤は、筋肉特異的取り込みトランスポーターの基質である小分子であってもよい。別の例として、筋標的化剤は、トランスポーター媒介エンドサイトーシスを介して筋細胞へ侵入する抗体であってもよい。別の例として、筋標的化剤は、筋細胞上の細胞表面受容体へ結合するリガンドであってもよい。トランスポーターをベースとしたアプローチが細胞侵入への直通路を提供するのに対し、受容体をベースとした標的化が所望の作用部位に達するために刺激されたエンドサイトーシスを伴うこともあることは解されるはずである。
i.筋標的抗体
いくつかの態様において、筋標的化剤は、抗体である。一般に、それらの標的抗原に対する抗体の高い特異性は、筋細胞(例として、骨格筋細胞、平滑筋細胞、および/または(例として、および)、心筋細胞)を選択的に標的にする潜在力を提供する。この特異性はまた、オフターゲット毒性(off-target toxicity)を限定することもある。筋細胞の表面抗原を標的にすることが可能である抗体の例は報告されており、かつ本開示の範囲内にある。例えば、筋細胞の表面を標的にする抗体は、Arahata K.,et al."Immunostaining of skeletal and cardiac muscle surface membrane with antibody against Duchenne muscular dystrophy peptide"Nature 1988;333:861-3;Song K.S.,et al."Expression of caveolin-3 in skeletal,cardiac,and smooth muscle cells.Caveolin-3 is a component of the sarcolemma and co-fractionates with dystrophin and dystrophin-associated glycoproteins"J Biol Chem 1996;271:15160-5;およびWeisbart R.H.et al.,"Cell type specific targeted intracellular delivery into muscle of a monoclonal antibody that binds myosin IIb"Mol Immunol.2003 Mar,39(13):78309に記載されている;これら各々の内容全体は参照により本明細書に組み込まれる。
a.抗トランスフェリン受容体抗体
本開示のいくつかの側面は、トランスフェリン受容体、例として抗トランスフェリン受容体抗体へ結合する剤は筋細胞を標的にすることが可能であるという認識に基づく。トランスフェリン受容体は、細胞膜を越えてトランスフェリンを輸送し細胞内鉄レベルの調節およびホメオスタシスに加わる内在化する細胞表面受容体である。本開示のいくつかの側面は、トランスフェリン受容体へ結合することが可能なトランスフェリン受容体結合タンパク質を提供する。結果的に、本開示の側面は、トランスフェリン受容体へ結合する結合タンパク質(例として、抗体)を提供する。いくつかの態様において、トランスフェリン受容体へ結合する結合タンパク質は、結合されたいずれの分子ペイロードと共に、筋細胞中へ内在化される。本明細書に使用されるとき、トランスフェリン受容体へ結合する抗体は、トランスフェリン受容体抗体、抗トランスフェリン受容体抗体、または抗TfR抗体と互換的に称されることもある。トランスフェリン受容体へ結合する、例として特異的に結合する抗体は、トランスフェリン受容体へ結合した際、例として受容体媒介エンドサイトーシスを通して、細胞中へ内在化されてもよい。
抗トランスフェリン受容体抗体が、知られている数種の方法論、例としてファージディスプレーを使用するライブラリ設計を使用して、産生、合成、および/または(例として、および)、誘導体化されてもよいことは解されるはずである。例示の方法論は当該技術分野において特徴付けられており、参照により組み込まれる(Diez,P.et al."High-throughput phage-display screening in array format",Enzyme and microbial technology,2015,79,34-41.;Christoph M.H.and Stanley,J.R."Antibody Phage Display:Technique and Applications"J Invest Dermatol.2014,134:2.;Engleman,Edgar(Ed.)"Human Hybridomas and Monoclonal Antibodies."1985,Springer)。他の態様において、抗トランスフェリン抗体はこれまでに特徴付けられているかまたは開示されている。トランスフェリン受容体へ特異的に結合する抗体は当該技術分野において知られている(例として、米国特許第4,364,934号、12/4/1979出願、"Monoclonal antibody to a human early thymocyte antigen and methods for preparing same";米国特許第8,409,573号、6/14/2006出願、"Anti-CD71 monoclonal antibodies and uses thereof for treating malignant tumor cells";米国特許第9,708,406号、5/20/2014出願、"Anti-transferrin receptor antibodies and methods of use";米国特許第9,611,323号、12/19/2014出願、"Low affinity blood brain barrier receptor antibodies and uses therefor";WO 2015/098989、12/24/2014出願、"Novel anti-Transferrin receptor antibody that passes through blood-brain barrier";Schneider C.et al."Structural features of the cell surface receptor for transferrin that is recognized by the monoclonal antibody OKT9."J Biol Chem.1982,257:14,8516-8522.;Lee et al."Targeting Rat Anti-Mouse Transferrin Receptor Monoclonal Antibodies through Blood-Brain Barrier in Mouse"2000,J Pharmacol.Exp.Ther.,292:1048-1052を見よ)。
本明細書に提供されるは、いくつかの側面において、筋標的化剤としての(例として、筋標的化複合体への)使用のための新しい抗TfR抗体である。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、高い特異性および親和性でトランスフェリン受容体に結合する。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、トランスフェリン受容体のいずれかの細胞外エピトープまたは抗体に対して暴露されるようになるエピトープに特異的に結合する。いくつかの態様において、本明細書に提供される抗TfR抗体はヒト、霊長目の非ヒト動物、マウス、ラットなどからのトランスフェリン受容体に特異的に結合する。いくつかの態様において、本明細書に提供される抗TfR抗体はヒトトランスフェリン受容体に結合する。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号242~244で提供されるヒトまたは霊長目の非ヒト動物トランスフェリン受容体のアミノ酸セグメントに結合する。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、トランスフェリン受容体の頂点ドメインにはない、配列番号242で表されるとおりのヒトトランスフェリン受容体のアミノ酸90~96に対応するアミノ酸セグメントに結合する。
いくつかの態様において、抗TFR抗体は、少なくとも約10-4M、10-5M、10-6M、10-7M、10-8M、10-9M、10-10M、10-11M、10-12M、10-13M、またはより小さい結合親和性(例として、Kdによって指し示される)によってTfR1(例として、ヒトまたは霊長目の非ヒト動物TfR1)に特異的に結合する。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体はサブナノモル範囲のKDによってTfR1に結合する。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体はトランスフェリン受容体1(TfR1)に選択的に結合するが、トランスフェリン受容体2(TfR2)には結合しない。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体はヒトTfR1およびカニクイTfR1に結合するが(例として、10-7M、10-8M、10-9M、10-10M、10-11M、10-12M、10-13M、またはより小さいKdによる)、マウスTfR1には結合しない。抗TfR抗体の親和性および結合動態は、バイオセンサ技術(例として、OCTETまたはBIACORE)を包含するがこれらに限定されないいずれか好適な方法を使用して試験され得る。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体のいずれか1つの結合は、TfR1へのトランスフェリン結合と競合も阻害もしない。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体のいずれか1つの結合は、TfR1に対するHFE-ベータ2-ミクログロブリン結合と競合も阻害もしない。
NCBI配列NP_003225.2(トランスフェリン受容体タンパク質1アイソフォーム1、homo sapiens)に対応する、ヒトトランスフェリン受容体アミノ酸配列の例は、以下のとおりである:
MMDQARSAFSNLFGGEPLSYTRFSLARQVDGDNSHVEMKLAVDEEENADNNTKANVTKPKRCSGSICYGTIAVIVFFLIGFMIGYLGYCKGVEPKTECERLAGTESPVREEPGEDFPAARRLYWDDLKRKLSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREAGSQKDENLALYVENQFREFKLSKVWRDQHFVKIQVKDSAQNSVIIVDKNGRLVYLVENPGGYVAYSKAATVTGKLVHANFGTKKDFEDLYTPVNGSIVIVRAGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKFPIVNAELSFFGHAHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEGDCPSDWKTDSTCRMVTSESKNVKLTVSNVLKEIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDAWGPGAAKSGVGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLSSLHLKAFTYINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQNVKHPVTGQFLYQDSNWASKVEKLTLDNAAFPFLAYSGIPAVSFCFCEDTDYPYLGTTMDTYKELIERIPELNKVARAAAEVAGQFVIKLTHDVELNLDYERYNSQLLSFVRDLNQYRADIKEMGLSLQWLYSARGDFFRATSRLTTDFGNAEKTDRFVMKKLNDRVMRVEYHFLSPYVSPKESPFRHVFWGSGSHTLPALLENLKLRKQNNGAFNETLFRNQLALATWTIQGAANALSGDVWDIDNEF(配列番号242)。
NCBI配列NP_001244232.1(トランスフェリン受容体タンパク質1、Macaca mulatta)に対応する、霊長目の非ヒト動物トランスフェリン受容体アミノ酸配列の例は、以下のとおりである:
MMDQARSAFSNLFGGEPLSYTRFSLARQVDGDNSHVEMKLGVDEEENTDNNTKPNGTKPKRCGGNICYGTIAVIIFFLIGFMIGYLGYCKGVEPKTECERLAGTESPAREEPEEDFPAAPRLYWDDLKRKLSEKLDTTDFTSTIKLLNENLYVPREAGSQKDENLALYIENQFREFKLSKVWRDQHFVKIQVKDSAQNSVIIVDKNGGLVYLVENPGGYVAYSKAATVTGKLVHANFGTKKDFEDLDSPVNGSIVIVRAGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKFPIVKADLSFFGHAHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPSQSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEGDCPSDWKTDSTCKMVTSENKSVKLTVSNVLKETKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDAWGPGAAKSSVGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLSSLHLKAFTYINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQDVKHPVTGRSLYQDSNWASKVEKLTLDNAAFPFLAYSGIPAVSFCFCEDTDYPYLGTTMDTYKELVERIPELNKVARAAAEVAGQFVIKLTHDTELNLDYERYNSQLLLFLRDLNQYRADVKEMGLSLQWLYSARGDFFRATSRLTTDFRNAEKRDKFVMKKLNDRVMRVEYYFLSPYVSPKESPFRHVFWGSGSHTLSALLESLKLRRQNNSAFNETLFRNQLALATWTIQGAANALSGDVWDIDNEF(配列番号243)
NCBI配列XP_005545315.1(トランスフェリン受容体タンパク質1、Macaca fascicularis)に対応する、霊長目の非ヒト動物トランスフェリン受容体アミノ酸配列の例は、以下のとおりである:
MMDQARSAFSNLFGGEPLSYTRFSLARQVDGDNSHVEMKLGVDEEENTDNNTKANGTKPKRCGGNICYGTIAVIIFFLIGFMIGYLGYCKGVEPKTECERLAGTESPAREEPEEDFPAAPRLYWDDLKRKLSEKLDTTDFTSTIKLLNENLYVPREAGSQKDENLALYIENQFREFKLSKVWRDQHFVKIQVKDSAQNSVIIVDKNGGLVYLVENPGGYVAYSKAATVTGKLVHANFGTKKDFEDLDSPVNGSIVIVRAGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKFPIVKADLSFFGHAHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPSQSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEGDCPSDWKTDSTCKMVTSENKSVKLTVSNVLKETKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDAWGPGAAKSSVGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLSSLHLKAFTYINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQDVKHPVTGRSLYQDSNWASKVEKLTLDNAAFPFLAYSGIPAVSFCFCEDTDYPYLGTTMDTYKELVERIPELNKVARAAAEVAGQFVIKLTHDTELNLDYERYNSQLLLFLRDLNQYRADVKEMGLSLQWLYSARGDFFRATSRLTTDFRNAEKRDKFVMKKLNDRVMRVEYYFLSPYVSPKESPFRHVFWGSGSHTLSALLESLKLRRQNNSAFNETLFRNQLALATWTIQGAANALSGDVWDIDNEF(配列番号244)。
NCBI配列NP_001344227.1(トランスフェリン受容体タンパク質1、mus musculus)に対応する、マウストランスフェリン受容体アミノ酸配列の例は、以下のとおりである:
MMDQARSAFSNLFGGEPLSYTRFSLARQVDGDNSHVEMKLAADEEENADNNMKASVRKPKRFNGRLCFAAIALVIFFLIGFMSGYLGYCKRVEQKEECVKLAETEETDKSETMETEDVPTSSRLYWADLKTLLSEKLNSIEFADTIKQLSQNTYTPREAGSQKDESLAYYIENQFHEFKFSKVWRDEHYVKIQVKSSIGQNMVTIVQSNGNLDPVESPEGYVAFSKPTEVSGKLVHANFGTKKDFEELSYSVNGSLVIVRAGEITFAEKVANAQSFNAIGVLIYMDKNKFPVVEADLALFGHAHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPSQSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGKMEGSCPARWNIDSSCKLELSQNQNVKLIVKNVLKERRILNIFGVIKGYEEPDRYVVVGAQRDALGAGVAAKSSVGTGLLLKLAQVFSDMISKDGFRPSRSIIFASWTAGDFGAVGATEWLEGYLSSLHLKAFTYINLDKVVLGTSNFKVSASPLLYTLMGKIMQDVKHPVDGKSLYRDSNWISKVEKLSFDNAAYPFLAYSGIPAVSFCFCEDADYPYLGTRLDTYEALTQKVPQLNQMVRTAAEVAGQLIIKLTHDVELNLDYEMYNSKLLSFMKDLNQFKTDIRDMGLSLQWLYSARGDYFRATSRLTTDFHNAEKTNRFVMREINDRIMKVEYHFLSPYVSPRESPFRHIFWGSGSHTLSALVENLKLRQKNITAFNETLFRNQLALATWTIQGVANALSGDIWNIDNEF(配列番号245)
いくつかの態様において、抗トランスフェリン受容体抗体は、以下のとおりの受容体のアミノ酸セグメント:
FVKIQVKDSAQNSVIIVDKNGRLVYLVENPGGYVAYSKAATVTGKLVHANFGTKKDFEDLYTPVNGSIVIVRAGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKFPIVNAELSFFGHAHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEGDCPSDWKTDSTCRMVTSESKNVKLTVSNVLKE(配列番号247)へ結合し、トランスフェリン受容体とトランスフェリンおよび/または(例として、および)ヒトヘモクロマトーシスタンパク質(またHFEとしても知られている)との間の結合相互作用を阻害しない。いくつかの態様において、抗本明細書に記載のトランスフェリン受容体抗体は、配列番号247のエピトープには結合しない。
適切な方法論は、例として、組換えDNAプロトコルの使用を通じて、抗体、抗体フラグメント、もしくは抗原結合剤を得るか、および/または(例として、および)、産生するために使用されてもよい。いくつかの態様において、抗体はまた、ハイブリドーマの生成を通しても産生されてよい(例として、Kohler, G and Milstein,C."Continuous cultures of fused cells secreting antibody of predefined specificity"Nature,1975,256:495-497を見よ)。関心のある抗原は、いずれの型または実体の、例として、組換え型もしくは天然に存在する型または実体の免疫原として使用されてもよい。ハイブリドーマは、標準的な方法、例としてELISAスクリーニングを使用してスクリーニングされることで、具体的な抗原を標的にする抗体を産生する少なくとも1個のハイブリドーマが見出される。抗体はまた、抗体を発現するタンパク質発現ライブラリ(例として、ファージディスプレーライブラリ)のスクリーニングを通しても産生されてよい。ファージディスプレーライブラリ設計はまた、いくつかの態様において使用されてもよい(例として、米国特許第5,223,409号、3/1/1991出願、"Directed evolution of novel binding proteins";WO 1992/18619、4/10/1992出願、"Heterodimeric receptor libraries using phagemids";WO 1991/17271、5/1/1991出願、"Recombinant library screening methods";WO 1992/20791、5/15/1992出願、"Methods for producing members of specific binding pairs";およびWO 1992/15679、2/28/1992出願、"Improved epitope displaying phage"を見よ)。いくつかの態様において、関心のある抗原は、非ヒト動物、例として、齧歯類の動物またはヤギを免疫するために使用されてもよい。いくつかの態様において、次いで抗体が非ヒト動物から得られたら、任意に数多の方法論を使用し、例として組換えDNA技法を使用し、修飾してもよい。抗体産生および方法論の追加の例も当該技術分野において知られている(例として、Harlow et al."Antibodies:A Laboratory Manual",Cold Spring Harbor Laboratory,1988を見よ)。
いくつかの態様において、抗体は修飾されている(例として、グリコシル化、リン酸化、SUMO化、および/または(例として、および)、メチル化を介して修飾されている)。いくつかの態様において、抗体は、1個以上の糖または炭水化物分子へ抱合されたグリコシル化抗体である。いくつかの態様において、1個以上の糖または炭水化物分子は、N-グリコシル化、O-グリコシル化、C-グリコシル化、グリピエーション(GPIアンカー付着)、および/または(例として、および)、ホスホグリコシル化を介して、抗体へ抱合されている。いくつかの態様において、1個以上の糖または炭水化物分子は、単糖類、二糖類、オリゴ糖類、またはグリカンである。いくつかの態様において、1個以上の糖または炭水化物分子は、分枝オリゴ糖類または分枝グリカンである。いくつかの態様において、1個以上の糖または炭水化物分子は、マンノース単位、グルコース単位、N-アセチルグルコサミン単位、N-アセチルガラクトサミン単位、ガラクトース単位、フコース単位、またはホスホ脂質単位を包含する。いくつかの態様において、糖分子は、約1~10個、約1~5個、約5~10個、約1~4個、約1~3個、または約2個存在する。いくつかの態様において、グリコシル化抗体は、全体的にまたは部分的にグリコシル化されている。いくつかの態様において、抗体は、化学反応によって、または酵素的な手段によってグリコシル化されている。いくつかの態様において、抗体は、in vitroでまたは細胞(任意にN-またはO-グリコシル化経路中の酵素(例として、グリコシルトランスフェラーゼ)を欠乏していてもよい)内部でグリコシル化される。いくつかの態様において、抗体は、"Modified antibody, antibody-conjugate and process for the preparation thereof"と題する2014年5月1日に公開された国際特許出願刊行物WO2014065661に記載のとおりの糖または炭水化物分子で官能化されている。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、表1から選択される抗TfR抗体のいずれか1つのVLドメインおよび/または(例として、および)VHドメインを含み、IgG、IgE、IgM、IgD、IgA、またはIgY免疫グロブリン分子、いずれかのクラス(例として、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、およびIgA2)、またはいずれかのサブクラス(例として、IgG2aおよびIgG2b)の免疫グロブリン分子の定常領域のアミノ酸配列を含む定常領域を含む。ヒト定常領域の非限定例は当該技術分野において記載されている。例として、Kabat E A et al.,(1991)上記を見よ。
抗TfR抗体の例の重鎖および軽鎖可変ドメインおよびCDR配列は、表1において提供される。
表1.抗TfR1抗体の例(CDRはIMGT(登録商標)定義に従う)
Figure 2023512441000003
Figure 2023512441000004
Figure 2023512441000005
Figure 2023512441000006
Figure 2023512441000007
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、表1から選択される抗TfR抗体のいずれか1つからのCDR-H(例として、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3)アミノ酸配列の1つ以上を含む。いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、表1から選択される抗体のいずれか1つについて提供されるCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、表1から選択される抗TfR抗体のいずれか1つからのCDR-L(例として、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3)アミノ酸配列の1つ以上を含む。いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、表1から選択される抗TfR抗体のいずれか1つについて提供されるCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、表1から選択される抗TfR抗体のいずれか1つに提供されるCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。いくつかの態様において、抗体の重鎖および軽鎖CDR3ドメインは、抗原に対する抗体の結合特異性/親和性において特に重要な役割を果たし得る。結果的に、本開示の抗TfR抗体は、表1から選択される抗TfR抗体のいずれか1つの少なくとも重鎖および/または(例として、および)軽鎖CDR3を包含し得る。
いくつかの例において、本開示の抗TfR抗体のいずれも、表1から選択される抗TfR抗体のうち1つからのCDR-H1配列、CDR-H2配列、CDR-H3配列、CDR-L1配列、CDR-L2配列、および/または(例として、および)、CDR-L3配列のいずれかと実質的に同様の1以上のCDR(例として、CDR-HまたはCDR-L)配列を有する。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗体のVH(例として、CDR-H1、CDR-H2、もしくはCDR-H3)領域、および/またはVL(例として、CDR-L1、CDR-L2、もしくはCDR-L3)領域に沿う1以上のCDRの位置は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)への免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される、例えば、それが由来する元の抗体の結合に対して少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%維持される)限り、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのアミノ酸位置によって変動し得る。例えば、いくつかの態様において、本明細書に記載のいずれの抗体のCDRを定義する位置は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)への免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される、例えば、それが由来する元の抗体の結合に対して少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%維持される)限り、CDRのN末および/または(例として、および)C末の境界をシフトすることによって、本明細書に記載の抗体のいずれか1つのCDR位置と比べ1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのアミノ酸位置によって変動し得る。別の態様において、本明細書に記載の抗体のVH(例として、CDR-H1、CDR-H2、もしくはCDR-H3)領域、および/または(例として、および)、VL(例として、CDR-L1、CDR-L2、もしくはCDR-L3)領域に沿う1以上のCDRの長さは、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)への免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される、例えば、それが由来する元の抗体の結合に対して少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%維持される)限り、1、2、3、4、5アミノ酸、またはそれより多くのアミノ酸によって変動し(例として、より短くまたはより長くなり)得る。
結果的に、いくつかの態様において、本明細書に記載のCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、および/または(例として、および)CDR-H3は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)への免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される、例えば、それが由来する元の抗体の結合に対して少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%維持される)限り、本明細書に記載のCDR(例として、表1から選択される抗TfR抗体のいずれかからのCDR)の1以上より、1、2、3、4、または5以上のアミノ酸の差で短くてもよい。いくつかの態様において、本明細書に記載のCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、および/または(例として、および)CDR-H3は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)への免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される、例えば、それが由来する元の抗体の結合に対して少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%維持される)限り、本明細書に記載のCDR(例として、表1から選択される抗TfR抗体のいずれかからのCDR)の1以上より、1、2、3、4、または5以上のアミノ酸の差で長くてもよい。いくつかの態様において、本明細書に記載のCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、および/または(例として、および)、CDR-H3のアミノ部分は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)への免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される、例えば、それが由来する元の抗体の結合に対して少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%維持される)限り、本明細書に記載のCDR(例として、表1から選択される抗TfR抗体のいずれかからのCDR)の1以上と比較して1、2、3、4、5アミノ酸、またはそれより多くのアミノ酸の差で伸長され得る。CDR-H2および/またはCDR-H3のカルボキシ部分は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)への免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される、例えば、それが由来する元の抗体の結合に対して少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%維持される)限り、本明細書に記載のCDR(例として、表1から選択される抗TfR抗体のいずれかからのCDR)の1以上と比較して1、2、3、4、5アミノ酸、またはそれより多くのアミノ酸の差で伸長され得る。いくつかの態様において、本明細書に記載のCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、および/または(例として、および)、CDR-H3のアミノ部分は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)への免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される、例えば、それが由来する元の抗体の結合に対して少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%維持される)限り、本明細書に記載のCDR(例として、表1から選択される抗TfR抗体のいずれかからのCDR)の1以上と比較して1、2、3、4、5アミノ酸、またはそれより多くのアミノ酸の差で短縮され得る。いくつかの態様において、本明細書に記載のCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、および/または(例として、および)、CDR-H3のカルボキシ部分は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)への免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される、例えば、それが由来する元の抗体の結合に対して少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%維持される)限り、本明細書に記載のCDR(例として、表1から選択される抗TfR抗体のいずれかからのCDR)の1以上と比較して1、2、3、4、5アミノ酸、またはそれより多くのアミノ酸の差で短縮され得る。いずれの方法も使用されて、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)への免疫特異的結合が、例えば、結合アッセイおよび当該技術分野において記載されている条件を使用して、維持されるかどうかが解明され得る。
いくつかの例において、本開示の抗TfR抗体のいずれも、表1から選択される抗TfR抗体のいずれか1つと実質的に同様の1以上のCDR(例として、CDR-HまたはCDR-L)配列を有する。例えば、抗体は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)への免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される、例えば、それが由来する元の抗体の結合に対して少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%維持される)限り、本明細書に提供されるCDR(例として、表1から選択される抗TfR抗体のいずれかからのCDR)のいずれか1つにおいて対応するCDR領域と比較して、最大5、4、3、2、または1アミノ酸残基バリエーションまでを含有する表1から選択される抗TfR抗体のいずれかからの1以上のCDR配列(単数または複数)を包含していてもよい。いくつかの態様において、本明細書に提供されるCDRのいずれかにおけるアミノ酸バリエーションのいずれも、保存的なバリエーションであってもよい。保存的なバリエーションは、その残基が、例えば結晶構造に基づき決定されるとおりの、トランスフェリン受容体タンパク質(例として、ヒトトランスフェリン受容体タンパク質)との相互作用に関与しなさそうな位置にて、CDR中へ導入され得る。本開示のいくつかの側面は、本明細書に提供される重鎖可変(VH)ドメイン、および/または(例として、および)、軽鎖可変(VL)ドメインの1以上を含む抗TfR抗体を提供する。いくつかの態様において、本明細書に提供されるVHドメインのいずれも、本明細書に提供されるCDR-H配列(例として、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3)の(例えば、表1から選択される抗TfR抗体のいずれか1つにおいて提供されるCDR-H配列のいずれか)1以上を包含する。いくつかの態様において、本明細書に提供されるVLドメインのいずれも、本明細書に提供されるCDR-L配列(例として、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3)の(例えば、表1から選択される抗TfR抗体のいずれか1つにおいて提供されるCDR-L配列のいずれか)1以上を包含する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、表1から選択される抗TfR抗体のいずれか1つの重鎖可変ドメインおよび/または(例として、および)軽鎖可変ドメイン、ならびにそれらのバリアントも包含するいずれの抗体も包含する。いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、表1から選択される抗TfR抗体のいずれか1つの重鎖可変および軽鎖可変の対も包含するいずれの抗体も包含する。
本開示の側面は、本明細書に記載の抗TfR抗体のいずれかと相同の重鎖可変(VH)ドメインアミノ酸配列、および/または(例として、および)、軽鎖可変(VL)ドメインアミノ酸配列を有する抗TfR抗体を提供する。いくつかの態様において、抗TfR抗体は、表1から選択される抗TfR抗体のいずれか1つなどのいずれの抗TfR抗体の重鎖可変配列および/または(例として、および)いずれの軽鎖可変配列と少なくとも75%(例として、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一の重鎖可変配列または軽鎖可変配列を含む。いくつかの態様において、相同の重鎖可変および/または軽鎖可変アミノ酸配列は、本明細書に提供されるCDR配列のいずれかの範囲内での変動はない。例えば、いくつかの態様において、配列バリエーションの程度(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)は、本明細書に提供されるCDR配列のいずれも除外する重鎖可変配列および/または(例として、および)軽鎖可変配列の範囲内で生じてもよい。いくつかの態様において、本明細書に提供される抗TfR抗体のいずれも、表1から選択される抗TfR抗体のいずれの抗TfR抗体のフレームワーク配列と少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%同一のフレームワーク配列を含む重鎖可変配列および軽鎖可変配列を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号7のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号8のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号1のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号2のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号4のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号1のアミノ酸配列を有するCDR-H1;位置5にてアミノ酸置換をもつ配列番号2のアミノ酸配列を有するCDR-H2(例として、位置5でのアスパラギンが、例として、Arg(R)、Lys(K)、Asp(D)、Glu(E)、Gln(Q)、His(H)、Ser(S)、Thr(T)、Tyr(Y)、Cys(C)、Trp(W)、Met(M)、Ala(A)、Ile(I)、Leu(L)、Phe(F)、Val(V)、Pro(P)、Gly(G)のいずれか1つによって置換されている);および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号4のアミノ酸配列を有するCDR-L1;配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR-L2;および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR-L3を含む。いくつかの態様において、配列番号2で表されるとおりのCDR-H2の位置5でのアミノ酸置換は、N5TまたはN5Sである。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号1のアミノ酸配列を有するCDR-H1;配列番号248または配列番号80のアミノ酸配列を有するCDR-H2;および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号4のアミノ酸配列を有するCDR-L1;配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR-L2;および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号1のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号2、配列番号248、または配列番号80のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較したとき、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。「合わせて」は、本開示のどこにでも使用されたとき、3つの重鎖CDRすべてにおけるアミノ酸バリエーションの総数が、定義された範囲内にあることを意味する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR受容体抗体は、配列番号4のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較したとき、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2または1アミノ酸バリエーション)を含有するCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号1のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号2、配列番号248、または配列番号80のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号4のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号1のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号2、配列番号248、または配列番号80のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/あるいは(例として、および)配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号4のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号7のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号8のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号7で表されるとおりのVHと比較したとき、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号8で表されるとおりのVLと比較したとき、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号7で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号8で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号7で表されるとおりのVHを含み、位置55にてアミノ酸置換をもつ(例として、位置55でのアスパラギンが、例として、Arg(R)、Lys(K)、Asp(D)、Glu(E)、Gln(Q)、His(H)、Ser(S)、Thr(T)、Tyr(Y)、Cys(C)、Trp(W)、Met(M)、Ala(A)、Ile(I)、Leu(L)、Phe(F)、Val(V)、Pro(P)、Gly(G)のいずれか1つによって置換される)。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号8で表されるとおりのVLを含む。いくつかの態様において、配列番号7で表されるとおりのVHの位置55でのアミノ酸置換は、N55TまたはN55Sである。配列番号7で表されるとおりのVHがKabat付番系を使用してアノテートされるとき、配列番号7のアミノ酸位置55は、番号54を割り当てられる。N54TまたはN54Sが本明細書に言及されるとき、それはKabat付番系を使用する突然変異を指している。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号7と比べて位置64にてアミノ酸置換を含むVHを含む。いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号7の位置64に対応する位置にてMetを含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号8で表されるとおりのVLと少なくとも80%(例として、80%、85%、90%、95%、98%、99%、または100%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号15のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号16のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号9のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号10のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号11のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号12のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号13のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号14のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号9のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号10のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号11のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号12のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号13のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号14のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号9のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号10のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号11のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号12のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号13のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号14のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号9のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号10のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号11のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号12のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号13のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号14のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号15のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号16のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号15で表されるとおりのVHと比較してわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号16で表されるとおりのVLと比較してわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号15で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号16で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号23のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号24のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号17のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号18のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号19のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号20のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号21のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号22のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:位置8にアミノ酸置換を有する配列番号17のアミノ酸配列を有するCDR-H1(例として、位置8のシステインが例えばArg(R)、Lys(K)、Asp(D)、Glu(E)、Gln(Q)、His(H)、Ser(S)、Thr(T)、Tyr(Y)、Asn(N)、Trp(W)、Met(M)、Ala(A)、Ile(I)、Leu(L)、Phe(F)、Val(V)、Pro(P)、Gly(G)のいずれか1つによって置換される);配列番号18のアミノ酸配列を有するCDR-H2;および配列番号19のアミノ酸配列を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号20のアミノ酸配列を有するCDR-L1;配列番号21のアミノ酸配列を有するCDR-L2;および配列番号22のアミノ酸配列を有するCDR-L3を含む。いくつかの態様において、配列番号17で表されるとおりのCDR-H1の位置8のアミノ酸置換はC8DまたはC8Yである。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号254または配列番号256のアミノ酸配列を有するCDR-H1;配列番号18のアミノ酸配列を有するCDR-H2;および配列番号19のアミノ酸配列を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号20のアミノ酸配列を有するCDR-L1;配列番号21のアミノ酸配列を有するCDR-L2;および配列番号22のアミノ酸配列を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号17、配列番号254、または配列番号256のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号18のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号19のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号20のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号21のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号22のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号17、配列番号254、または配列番号256のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号18のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号19のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号20のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号21のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号22のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号17、配列番号254、または配列番号256のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号18のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有する;および/あるいは(例として、および)配列番号19のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号20のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号21のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号22のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号23のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号24のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号23で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号24で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号23で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号24で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、位置33にアミノ酸置換を有する配列番号23で表されるとおりのVHを含む(例として、位置33のシステインが、例えばArg(R)、Lys(K)、Asp(D)、Glu(E)、Gln(Q)、His(H)、Ser(S)、Thr(T)、Tyr(Y)、Asn(N)、Trp(W)、Met(M)、Ala(A)、Ile(I)、Leu(L)、Phe(F)、Val(V)、Pro(P)、Gly(G)のいずれか1つによって置換される)。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号24で表されるとおりのVLを含む。いくつかの態様において、配列番号23で表されるとおりのVHの位置33のアミノ酸置換は、C33DまたはC33Yである。配列番号23で表されるとおりのVHがKabat付番系によってアノテートされるとき、配列番号23のアミノ酸33は番号33を割り当てられる。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号31のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号32のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号25のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号26のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号27のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号28のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号29のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号30のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号25のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号26のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号27のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号28のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号30のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号25のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号26のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号27のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号28のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号30のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号25のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号26のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号27のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号28のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号29のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号30のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号31のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号32のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号31で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号32で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号31で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号32で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号39のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号40のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号33のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号34のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号35のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号36のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号37のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号38のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号33のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号34のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号35のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号36のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号37のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号38のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号33のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号34のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号35のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号36のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号37のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号38のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号33のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号34のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号35のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号36のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号37のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号38のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号39のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号40のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号39で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号40で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号39で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号40で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号47のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号48のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号41のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号42のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号43のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号44のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号46のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号41のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号42のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号43のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号44のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号46のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号41のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号42のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号43のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号44のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号46のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号41のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号42のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号43のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号44のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号46のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号47のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号48のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号47で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号48で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号47で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号48で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号54のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号55のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号49のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号50のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号51のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号52のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号29のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号53のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号49のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号50のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号51のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号52のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号53のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号49のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号50のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号51のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号52のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号53のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号49のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号50のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号51のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号52のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号29のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号53のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号54のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号55のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号54で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号55で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号54で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号55で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号62のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号63のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号56のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号57のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号58のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号59のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号60のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号61のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号56のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号57のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号58のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号59のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号60のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号61のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号56のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号57のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号58のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号59のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号60のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号61のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号56のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号57のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号58のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号59のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号60のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号61のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号62のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号63のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号62で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号63で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号62で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号63で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号70のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号71のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号64のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号65のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号66のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号67のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号68のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号69のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号64のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号65のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号66のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号67のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号68のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号69のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号64のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号65のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号66のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号67のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号68のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号69のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号64のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号65のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号66のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号67のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号68のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号69のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号70のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号71のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号70で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号71で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号70で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号71で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号77のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号78のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号72のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号73のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号74のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号75のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号76のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号72のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号73のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号74のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号75のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号76のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号72のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号73のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号74のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号75のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号76のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号72のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号73のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号74のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号75のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号76のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号77のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号78のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号77で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号78で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号77で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号78で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号85のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号86のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号79のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号80のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号81のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号82のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号83のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号84のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号79のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号80のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号81のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号82のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号83のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号84のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号79のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号80のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号81のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号82のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号83のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号84のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号79のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号80のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号81のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号82のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号83のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号84のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号85のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号86のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号85で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号86で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号85で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号86で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号89のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号90のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号72のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号87のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号74のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号75のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号88のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号72のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号87のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号74のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号75のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号88のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号72のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号87のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号74のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号75のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号88のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号72のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号87のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号74のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号75のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号88のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号89のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号90のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号89で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号90で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号89で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号90で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号97のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号98のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号91のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号92のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号93のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号94のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号95のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号96のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号91のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号92のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号93のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号94のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号95のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号96のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号91のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号92のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号93のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号94のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号95のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号96のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号91のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号92のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号93のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号94のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号95のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号96のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号97のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号98のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号97で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号98で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号97で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号98で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号104のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号105のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号99のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号100のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号101のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号102のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号60のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号103のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号99のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号100のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号101のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号102のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号60のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号103のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号99のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号100のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号101のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号102のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号60のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号103のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号104のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号105のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号104で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号105で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号104で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号105で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号112のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号113のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号106のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号107のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号108のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号109のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号110のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号111のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号106のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号107のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号108のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号109のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号110のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号111のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号106のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号107のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号108のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号109のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号110のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号111のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号106のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号107のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号108のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号109のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号110のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号111のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号112のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号113のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号112で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号113で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号112で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号113で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号117のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号118のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号79のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号114のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号115のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号82のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号83のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号116のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号79のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号114のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号115のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号82のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号83のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号116のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号79のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号114のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号115のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号82のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号83のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号116のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号79のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号114のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号115のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号82のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号83のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号116のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号117のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号118のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号117で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号118で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号117で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号118で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号124のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号125のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号119のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号120のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号121のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号122のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号123のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号119のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号120のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号121のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号122のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号123のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号119のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号120のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号121のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号122のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号123のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号119のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号120のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号121のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号122のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号123のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号124のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号125のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号124で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号125で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号124で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号125で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号132のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号133のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号126のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号127のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号128のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号129のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号130のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号131のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号126のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号127のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号128のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号129のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号130のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号131のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号126のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号127のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号128のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号129のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号130のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号131のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号126のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号127のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号128のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号129のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号130のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号131のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号132のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号133のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号132で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号133で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号132で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号133で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号136のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号137のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号79のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号2のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号134のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号75のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号135のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号79のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号2のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号134のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号75のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号135のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号79のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号2のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号134のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号75のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号135のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号79のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号2のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号134のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号75のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号45のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号135のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号136のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号137のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号136で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号137で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号136で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号137で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号143のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号144のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号138のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号139のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号140のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号141のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号29のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号142のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号138のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号139のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号140のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号141のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号142のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号138のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号139のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号140のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号141のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号142のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号138のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号139のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号140のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号141のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号29のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号142のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号143のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号144のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号143で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号144で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号143で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号144で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
抗体のCDRは、異なる定義系が使用されたとき、異なるアミノ酸配列を有し得る(例として、IMGT定義、Kabat定義、またはChothia定義)。定義系は、所与の抗体配列(例として、VHまたはVL配列)における各アミノ酸を番号でアノテートするものであって、重鎖および軽鎖CDRに対応する番号は表2に提供される。表1に挙げられるCDRは、IMGT定義に従って定義されている。種々の定義系に従う抗TfR抗体例のCDR配列が表3に提供される。当業者は、表1に提供される抗TfR抗体について、種々の付番系を使用してCDR配列を導出することができる。
表2.CDR定義
Figure 2023512441000008

表3.種々の定義系に従う抗TfR1抗体例のCDR配列
Figure 2023512441000009
Figure 2023512441000010
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号145のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Kabat定義系に従う)、配列番号146、配列番号249、または配列番号252のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Kabat定義系に従う)、配列番号147のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Kabat定義系に従う)、配列番号148のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Kabat定義系に従う)、配列番号149のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Kabat定義系に従う)、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Kabat定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号145のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号146、配列番号249、または配列番号252のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号147のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号148のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号149のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号145のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号146、配列番号249、または配列番号252のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号147のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号148のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号149のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号145のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号146、配列番号249、または配列番号252のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号147のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号148のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号149のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号150のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Chothia定義系に従う)、配列番号151、配列番号250、または配列番号253のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Chothia定義系に従う)、配列番号152のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Chothia定義系に従う)、配列番号153のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Chothia定義系に従う)、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Chothia定義系に従う)、および配列番号154のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Chothia定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号150のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号151、配列番号250、または配列番号253のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号152のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号153のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号154のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号150のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号151、配列番号250、または配列番号253のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号152のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号153のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号154のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号150のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号151、配列番号250、または配列番号253のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/あるいは(例として、および)配列番号152のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号153のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号154のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号155のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Kabat定義系に従う)、配列番号156のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Kabat定義系に従う)、配列番号157のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Kabat定義系に従う)、配列番号158のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Kabat定義系に従う)、配列番号159のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Kabat定義系に従う)、および配列番号14のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Kabat定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号155のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号156のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号157のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号158のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号159のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号14のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号155のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号156のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号157のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号158のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号159のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号14のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号155のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号156のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号157のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号158のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号159のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号14のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号160のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Chothia定義系に従う)、配列番号161のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Chothia定義系に従う)、配列番号162のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Chothia定義系に従う)、配列番号163のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Chothia定義系に従う)、配列番号13のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Chothia定義系に従う)、および配列番号164のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Chothia定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号160のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号161のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号162のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号163のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号13のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号164のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号160のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号161のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号162のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号163のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号13のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号164のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号160のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号161のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号162のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号163のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号13のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号164のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号165、配列番号255、または配列番号257のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Kabat定義系に従う)、配列番号166のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Kabat定義系に従う)、配列番号167のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Kabat定義系に従う)、配列番号168のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Kabat定義系に従う)、配列番号169のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Kabat定義系に従う)、および配列番号22のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Kabat定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号165、配列番号255、または配列番号257のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号166のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号167のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号168のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号169のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号22のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号165、配列番号255、または配列番号257のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号166のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号167のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号168のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号169のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号22のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号165、配列番号255、または配列番号257のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号166のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/あるいは(例として、および)配列番号167のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号168のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号169のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号22のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号170のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Chothia定義系に従う)、配列番号171のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Chothia定義系に従う)、配列番号172のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Chothia定義系に従う)、配列番号173のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Chothia定義系に従う)、配列番号21のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Chothia定義系に従う)、および配列番号174のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Chothia定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号170のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号171のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号172のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号173のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号21のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号174のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号170のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号171のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号172のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号173のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号21のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号174のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号170のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号171のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号172のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号173のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号21のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号174のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化抗体である(例として、表1または表3の1以上のCDRを含有するヒト化バリアント)。いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、表1または表3に示されるCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3と同じCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、ヒト化重鎖可変領域および/または(例として、および)ヒト化軽鎖可変領域を含む。
ヒト化抗体は、レシピエントの相補性決定領域(CDR)からの残基が、所望の特異性、親和性、および容量を有するマウス、ラット、またはウサギなどの非ヒト生物種(ドナー抗体)のCDRからの残基によって置き換えられているヒト免疫グロブリン(レシピエント抗体)である。いくつかの態様において、ヒト免疫グロブリンのFvフレームワーク領域(ER)残基は、対応する非ヒト残基によって置き換えられる。さらにまた、ヒト化抗体は、レシピエント抗体上にも移入されるCDRまたはフレームワーク配列上にも見出されないが、抗体性能をさらに改良および最適化するために包含される残基を含み得る。一般に、ヒト化抗体は、CDR領域のすべてまたは実質的にすべてが非ヒト免疫グロブリンのものに対応し、FR領域のすべてまたは実質的にすべてがヒト免疫グロブリンコンセンサス配列のものである少なくとも1つの、典型的には2つの可変ドメインの実質的にすべてを含むであろう。最適なことには、ヒト化抗体は、免疫グロブリン定常領域またはドメインの少なくともある部分(Fc)、典型的にはヒト免疫グロブリンのものをもまた含むであろう。抗体は、WO99/58572に記載されているとおり改変されたFc領域を有し得る。ヒト化抗体の他の形態は元の抗体に対して変更されている1以上のCDR(1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ)を有する。これらは元の抗体からの1以上のCDRに由来する1以上のCDRともまた呼称される。ヒト化抗体には親和性成熟もまた関わり得る。
ヒト化抗体およびこれらを作製する方法は知られており、例として、Almagro et al.,Front.Biosci.13:1619-1633(2008);Riechmann et al.,Nature 332:323-329(1988);Queen et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 86:10029-10033(1989);米国特許第5,821,337号、第7,527,791号、第6,982,321号、および第7,087,409号;Kashmiri et al.,Methods 36:25-34(2005);Padlan et al.,Mol.Immunol.28:489-498(1991);Dall’Acqua et al.,Methods 36:43-60(2005);Osbourn et al.,Methods 36:61-68(2005);ならびにKlimka et al.,Br.J.Cancer,83:252-260(2000)に記載されるとおりである。これらすべての内容は参照によって本明細書に組み込まれる。ヒト化に使用され得るヒトフレームワーク領域は、例として、Sims et al.J.Immunol.151:2296(1993);Carter et al.Proc.Natl.Acad.Sci.USA.89:4285(1992);Presta et al.J.Immunol.151:2623(1993);Almagro et al.,Front.Biosci.13:1619-1633(2008));Baca et al.,J.Biol.Chem.272:10678-10684(1997);およびRosok et al.,J Biol.Chem.271:22611-22618(1996)に記載されている。これらすべての内容は参照によって本明細書に組み込まれる。いくつかの態様において、ヒト化は、CDR(例として、表1または表3に示されるとおり)をIGKV1-NL1*01およびIGHV1-3*01ヒト可変ドメイン上にグラフトすることによって達成される。
いくつかの態様において、ヒト化VHフレームワークまたはVLフレームワークは、コンセンサスヒトフレームワークである。いくつかの態様において、コンセンサスヒト化フレームワークは、ヒト免疫グロブリンVLまたはVHフレームワーク配列の選択肢において最も一般的に生起するアミノ酸残基を表し得る。
いくつかの態様において、本明細書に記載のヒト化抗TfR抗体の重鎖CDRへの使用に好適なコンセンサスヒトVHフレームワーク領域は(サブグループIIIコンセンサス)、以下:
a)VH FR1:EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS(配列番号267);
b)VH FR2:WVRQAPGKGLEWV(配列番号268);
c)VH FR3:RFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYC(配列番号269);および
d)VH FR4:WGQGTLVTVSS(配列番号270)
を包含する。
いくつかの態様において、本明細書に記載のヒト化抗TfR抗体の重鎖CDRへの使用に好適なコンセンサスヒトVHフレームワーク領域は(サブグループIコンセンサス)、以下:
a)VH FR1:QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS(配列番号271);
b)VH FR2:WVRQAPGQGLEWM(配列番号272);
c)VH FR3:RVTITADTSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYC(配列番号273);および
d)VH FR4:WGQGTLVTVSS(配列番号270)
を包含する。
いくつかの態様において、本明細書に記載のヒト化抗TfR抗体の重鎖CDRへの使用に好適なコンセンサスヒトVHフレームワーク領域は(サブグループIIコンセンサス)、以下:
a)VH FR1:QVQLQESGPGLVKPSQTLSLTCTVS(配列番号275);
b)VH FR2:WIRQPPGKGLEWI(配列番号276);
c)VH FR3:RVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYC(配列番号277);および
d)VH FR4:WGQGTLVTVSS(配列番号270)
を包含する。
いくつかの態様において、本明細書に記載のヒト化抗TfR抗体の軽鎖CDRへの使用に好適なコンセンサスヒトVLフレームワーク領域は(サブグループIコンセンサス)、以下:
a)VL FR1:DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(配列番号279);
b)VL FR2:WYQQKPGKAPKLLIY(配列番号280);
c)VL FR3:GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(配列番号281);および
d)VL FR4:FGQGTKVEIK(配列番号282)
を包含する。
いくつかの態様において、本明細書に記載のヒト化抗TfR抗体の軽鎖CDRへの使用に好適なコンセンサスヒトVLフレームワーク領域は(サブグループIIコンセンサス)、以下:
a)VL FR1:DIVMTQSPLSLPVTPGEPASISC(配列番号283);
b)VL FR2:WYLQKPGQSPQLLIY(配列番号284);
c)VL FR3:GVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC(配列番号285);および
d)VL FR4:FGQGTKVEIK(配列番号282)
を包含する。
いくつかの態様において、本明細書に記載のヒト化抗TfR抗体の軽鎖CDRへの使用に好適なコンセンサスヒトVLフレームワーク領域は(サブグループIIIコンセンサス)、以下:
a)VL FR1:DIVMTQSPDSLAVSLGERATINC(配列番号287);
b)VL FR2:WYQQKPGQPPKLLIY(配列番号288);
c)VL FR3:GVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDFAVYYC(配列番号289);および
d)VL FR4:FGQGTKVEIK(配列番号282)
を包含する。
いくつかの態様において、本明細書に記載のヒト化抗TfR抗体の軽鎖CDRへの使用に好適なコンセンサスヒトVLフレームワーク領域は(サブグループIVコンセンサス)、以下:
a)VL FR1:DIVMTQSPDSLAVSLGERATINC(配列番号287);
b)VL FR2:WYQQKPGQPPKLLIY(配列番号288);
c)VL FR3:GVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDFAVYYC(配列番号289);および
d)VL FR4:FGQGTKVEIK(配列番号282)
を包含する。
いくつかの態様において、本開示のヒト化抗TfR抗体は、ヒト化VHフレームワーク領域を含み、これらは、本明細書に記載のコンセンサスヒトVHフレームワーク領域サブグループのいずれか1つと比較して、合わせてわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示のヒト化抗TfR抗体は、ヒト化VLフレームワーク領域を含み、これらは、本明細書に記載のコンセンサスヒトVLフレームワーク領域サブグループのいずれか1つと比較して、合わせてわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示のヒト化抗TfR抗体は、ヒト化VHフレームワーク領域を含み、これらは、本明細書に記載のコンセンサスヒトVHフレームワーク領域サブグループのいずれか1つと、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示のヒト化抗TfR抗体は、ヒト化VLフレームワーク領域を含み、これらは、本明細書に記載のコンセンサスヒトVLフレームワーク領域サブグループのいずれか1つと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化バリアントであり、表1、表3または表4に挙げられる、または表1、表3または表4によって提供されるVHのいずれか1つと比較して1以上のアミノ酸バリエーション(例として、VHフレームワーク領域の)および/または(例として、および)表1、表3または表4に挙げられる、または表1、表3または表4によって提供されるVLのいずれか1つと比較して1以上のアミノ酸バリエーション(例として、VLフレームワーク領域の)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化抗体であり、表1に挙げられる抗TfR抗体のいずれかのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化抗体であり、表1に挙げられる抗TfR抗体のいずれか1つのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化抗体であり、配列番号7、15、および23のいずれか1つで表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化抗体であり、配列番号8、16、および24のいずれか1つで表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化抗体であり、配列番号7、15、および23のいずれか1つで表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化抗体であり、配列番号8、16、および24のいずれか1つで表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化抗体であり、配列番号7、15、および23のいずれか1つで表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化抗体であり、配列番号8、16、および24のいずれか1つで表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化抗体であり、配列番号7、15、および23のいずれか1つで表されるとおりのVHと比べて、位置1、2、5、9、11、12、13、17、20、23、33、38、40、41、42、43、44、45、48、49、55、67、68、70、71、72、76、77、80、81、82、84、87、88、91、95、112、または115に1以上の(例として、10~25)アミノ酸バリエーションを有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化抗体であり、配列番号8、16、および24のいずれか1つで表されるとおりのVLと比べて、位置4、7、8、9、11、15、17、18、19、22、39、41、42、43、50、62、64、72、75、77、79、80、81、82、83、85、87、89、100、104、または109に1以上の(例として、10~20)アミノ酸バリエーションを有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化VHを含み、配列番号1のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号2、配列番号248、または配列番号80のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)を含み、配列番号7で表されるとおりのVHと比較して、フレームワーク領域にわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化VLを含み、配列番号4のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含み、配列番号8で表されるとおりのVLと比較して、フレームワーク領域にわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号1のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号2、配列番号248、または配列番号80のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)を含むヒト化VHを含み、フレームワーク領域において、配列番号7で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号4のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含むヒト化VLを含み、フレームワーク領域において、配列番号8で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化VHを含み、配列番号145のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Kabat定義系に従う)、配列番号146、配列番号249、または配列番号252のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Kabat定義系に従う)、配列番号147のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Kabat定義系に従う)を含み、配列番号7で表されるとおりのVHと比較して、フレームワーク領域にわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化VLを含み、配列番号148のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Kabat定義系に従う)、配列番号149のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Kabat定義系に従う)、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Kabat定義系に従う)を含み、配列番号8で表されるとおりのVLと比較して、フレームワーク領域にわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号145のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Kabat定義系に従う)、配列番号146、配列番号249、または配列番号252のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Kabat定義系に従う)、配列番号147のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Kabat定義系に従う)を含むヒト化VHを含み、フレームワーク領域において、配列番号7で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号148のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Kabat定義系に従う)、配列番号149のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Kabat定義系に従う)、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Kabat定義系に従う)を含むヒト化VLを含み、フレームワーク領域において、配列番号8で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化VHを含み、配列番号150のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Chothia定義系に従う)、配列番号151、配列番号250、または配列番号253のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Chothia定義系に従う)、配列番号152のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Chothia定義系に従う)を含み、配列番号7で表されるとおりのVHと比較して、フレームワーク領域にわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化VLを含み、配列番号153のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Chothia定義系に従う)、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Chothia定義系に従う)、および配列番号154のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Chothia定義系に従う)を含み、配列番号8で表されるとおりのVLと比較して、フレームワーク領域にわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号150のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Chothia定義系に従う)、配列番号151、配列番号250、または配列番号253のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Chothia定義系に従う)、配列番号152のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Chothia定義系に従う)を含むヒト化VHを含み、フレームワーク領域において、配列番号7で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号153のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Chothia定義系に従う)、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Chothia定義系に従う)、および配列番号154のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Chothia定義系に従う)を含むヒト化VLを含み、フレームワーク領域において、配列番号8で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化VHを含み、配列番号9のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号10のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号11のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)を含み、配列番号15で表されるとおりのVHと比較して、フレームワーク領域にわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化VLを含み、配列番号12のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号13のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号14のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含み、配列番号16で表されるとおりのVLと比較して、フレームワーク領域にわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号9のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号10のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号11のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)を含むヒト化VHを含み、フレームワーク領域において、配列番号15で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号12のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号13のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号14のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含むヒト化VLを含み、フレームワーク領域において、配列番号16で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化VHを含み、配列番号155のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Kabat定義系に従う)、配列番号156のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Kabat定義系に従う)、配列番号157のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Kabat定義系に従う)を含み、配列番号15で表されるとおりのVHと比較して、フレームワーク領域にわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化VLを含み、配列番号158のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Kabat定義系に従う)、配列番号159のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Kabat定義系に従う)、および配列番号14のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Kabat定義系に従う)を含み、配列番号16で表されるとおりのVLと比較して、フレームワーク領域にわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号155のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Kabat定義系に従う)、配列番号156のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Kabat定義系に従う)、配列番号157のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Kabat定義系に従う)を含むヒト化VHを含み、フレームワーク領域において、配列番号15で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号158のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Kabat定義系に従う)、配列番号159のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Kabat定義系に従う)、および配列番号14のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Kabat定義系に従う)を含むヒト化VLを含み、フレームワーク領域において、配列番号16で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化VHを含み、配列番号160のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Chothia定義系に従う)、配列番号161のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Chothia定義系に従う)、配列番号162のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Chothia定義系に従う)を含み、配列番号15で表されるとおりのVHと比較して、フレームワーク領域にわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化VLを含み、配列番号163のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Chothia定義系に従う)、配列番号13のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Chothia定義系に従う)、および配列番号164のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Chothia定義系に従う)を含み、配列番号16で表されるとおりのVLと比較して、フレームワーク領域にわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号160のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Chothia定義系に従う)、配列番号161のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Chothia定義系に従う)、配列番号162のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Chothia定義系に従う)を含むヒト化VHを含み、フレームワーク領域において、配列番号15で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号163のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Chothia定義系に従う)、配列番号13のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Chothia定義系に従う)、および配列番号164のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Chothia定義系に従う)を含むヒト化VLを含み、フレームワーク領域において、配列番号16で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化VHを含み、配列番号17、配列番号254、または配列番号256のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号18のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号19のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)を含み、配列番号23で表されるとおりのVHと比較して、フレームワーク領域にわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化VLを含み、配列番号20のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号21のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号22のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含み、配列番号24で表されるとおりのVLと比較して、フレームワーク領域にわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号17、配列番号254、または配列番号256のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号18のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号19のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)を含むヒト化VHを含み、フレームワーク領域において、配列番号23で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号20のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号21のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号22のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含むヒト化VLを含み、フレームワーク領域において、配列番号24で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化VHを含み、配列番号165、配列番号255、または配列番号257のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Kabat定義系に従う)、配列番号166のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Kabat定義系に従う)、配列番号167のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Kabat定義系に従う)を含み、配列番号23で表されるとおりのVHと比較して、フレームワーク領域にわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化VLを含み、配列番号168のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Kabat定義系に従う)、配列番号169のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Kabat定義系に従う)、および配列番号22のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Kabat定義系に従う)を含み、配列番号24で表されるとおりのVLと比較して、フレームワーク領域にわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号165、配列番号255、または配列番号257のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Kabat定義系に従う)、配列番号166のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Kabat定義系に従う)、配列番号167のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Kabat定義系に従う)を含むヒト化VHを含み、フレームワーク領域において、配列番号23で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号168のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Kabat定義系に従う)、配列番号169のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Kabat定義系に従う)、および配列番号22のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Kabat定義系に従う)を含むヒト化VLを含み、フレームワーク領域において、配列番号24で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化VHを含み、配列番号170のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Chothia定義系に従う)、配列番号171のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Chothia定義系に従う)、配列番号172のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Chothia定義系に従う)を含み、配列番号23で表されるとおりのVHと比較して、フレームワーク領域にわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化VLを含み、配列番号173のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Chothia定義系に従う)、配列番号21のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Chothia定義系に従う)、および配列番号174のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Chothia定義系に従う)を含み、配列番号24で表されるとおりのVLと比較して、フレームワーク領域にわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号170のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Chothia定義系に従う)、配列番号171のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Chothia定義系に従う)、配列番号172のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Chothia定義系に従う)を含むヒト化VHを含み、フレームワーク領域において、配列番号23で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号173のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Chothia定義系に従う)、配列番号21のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Chothia定義系に従う)、および配列番号174のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Chothia定義系に従う)を含むヒト化VLを含み、フレームワーク領域において、配列番号24で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、キメラ抗体であり、これはヒト抗体からの重鎖定常領域および軽鎖定常領域を包含し得る。キメラ抗体は、第1の生物種からの可変領域または可変領域の一部と第2の生物種からの定常領域とを有する抗体を指す。典型的には、これらのキメラ抗体では、軽および重鎖両方の可変領域は哺乳動物の1つの生物種(例として、非ヒト哺乳動物、例えばマウス、ウサギ、およびラット)に由来する抗体の可変領域を模倣し、定常部分は、別の哺乳動物、例えばヒトに由来する抗体の配列に相同である。いくつかの態様においては、アミノ酸改変が可変領域および/または(例として、および)定常領域になされ得る。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、キメラ抗体であり、これはヒト抗体からの重鎖定常領域および軽鎖定常領域を包含し得る。キメラ抗体は、第1の生物種からの可変領域または可変領域の一部と第2の生物種からの定常領域とを有する抗体を指す。典型的には、これらのキメラ抗体では、軽および重鎖両方の可変領域は、哺乳動物の1つの生物種(例として、非ヒト哺乳動物、例えばマウス、ウサギ、およびラット)に由来する抗体の可変領域を模倣し、定常部分は、別の哺乳動物、例えばヒトに由来する抗体の配列に相同である。いくつかの態様においては、アミノ酸改変が可変領域および/または(例として、および)定常領域になされ得る。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体のいずれかの重鎖は、重鎖定常領域(CH)またはそのある部分(例として、CH1、CH2、CH3、またはそれらの組み合わせ)を含み得る。重鎖定常領域は、いずれかの好適な起源、例えばヒト、マウス、ラット、またはウサギであり得る。1つの具体的な例では、重鎖定常領域はヒトIgG(ガンマ重鎖)、例えばIgG1、IgG2、またはIgG4からである。ヒトIgG1定常領域の例は、下に与えられる:
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号175)
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体のいずれかの重鎖は、突然変異体ヒトIgG1定常領域を含む。例えば、ヒトIgG1のCH2ドメイン上のLALA突然変異の導入(ヒンジ下部残基Leu234 Leu235をAla234およびAla235によって置き換えるように突然変異させられたmAb b12に由来する突然変異体)は、Fcg受容体結合を低減することが知られている(Bruhns,P.,et al.(2009)およびXu,D.et al.(2000))。突然変異体ヒトIgG1定常領域は、下に提供される(突然変異は太字かつ下線付き):
Figure 2023512441000011

(配列番号176)
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体のいずれかの軽鎖はさらに、軽鎖定常領域(CL)を含み得、これは当該技術分野において知られているいずれかのCLであり得る。いくつかの例において、CLはカッパ軽鎖である。他の例では、CLはラムダ軽鎖である。いくつかの態様において、CLはカッパ軽鎖であり、この配列は下に提供される:
RTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号177)
他の抗体の重鎖および軽鎖定常領域は当該技術分野において周知であり、例として、IMGTデータベース(www.imgt.org)において、またはwww.vbase2.org/vbstat.php.にて提供されるものであるが、これらの両方とも参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、表1に挙げられるVHまたはそれらのいずれかのバリアントのいずれか1つ、および配列番号175または配列番号176と少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%同一である重鎖定常領域を含む重鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、表1に挙げられるVHまたはそれらのいずれかのバリアントのいずれか1つ、および配列番号175または配列番号176と比較してわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する重鎖定常領域を含む重鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、表1に挙げられるVHまたはそれらのいずれかのバリアントのいずれか1つ、および配列番号175で表されるとおりの重鎖定常領域を含む重鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、表1に挙げられるVHまたはそれらのいずれかのバリアントのいずれか1つ、および配列番号176で表されるとおりの重鎖定常領域を含む重鎖を含む。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、表1に挙げられるVLまたはそれらのいずれかのバリアントのいずれか1つ、および配列番号177と少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%同一である軽鎖定常領域を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、表1に挙げられるVLまたはそれらのいずれかのバリアントのいずれか1つ、および配列番号177と比較してわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する軽鎖定常領域を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、表1に挙げられるVLまたはそれらのいずれかのバリアントのいずれか1つ、および配列番号177で表されるとおりの軽鎖定常領域を含む軽鎖を含む。
記載される抗TfR抗体のIgG重鎖および軽鎖アミノ酸配列の例は、下の表4に提供される。
表4.抗TfR IgGの例の重鎖および軽鎖配列
Figure 2023512441000012
Figure 2023512441000013
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号178、配列番号180、配列番号182、配列番号258、配列番号259、配列番号260、または配列番号261で表されるとおりの重鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号179、配列番号181、または配列番号183で表されるとおりの軽鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号178、配列番号180、配列番号182、配列番号258、配列番号259、配列番号260、または配列番号261と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号179、配列番号181、または配列番号183と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号178、配列番号180、配列番号182、配列番号258、配列番号259、配列番号260、または配列番号261のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号179、配列番号181、または配列番号183のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号178、配列番号258、または配列番号259で表されるとおりの重鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号179で表されるとおりの軽鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、10、11、9、8、7、6、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号178、配列番号258、または配列番号259と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号179と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号178、配列番号258、または配列番号259のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号179のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号180で表されるとおりの重鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号181で表されるとおりの軽鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号180と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号181と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号180のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号181のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号182、配列番号260、または配列番号261で表されるとおりの重鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号183で表されるとおりの軽鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号182、配列番号260、または配列番号261と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号183と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号182、配列番号260、または配列番号261のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号183のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
いくつかの態様において、抗TfR抗体は、無傷の抗体(全長抗体)のFABフラグメント、F(ab’)フラグメント、またはF(ab’)フラグメントである。無傷の抗体(全長抗体)の抗原結合フラグメントは、定型的な方法を介して(例として、組み換え的に、または全長IgGの重鎖定常領域をパパインなどの酵素を使用して消化することによって)調製され得る。例えば、F(ab’)フラグメントは、抗体分子のペプシンまたはパパイン消化によって生じ得、Fabフラグメントは、F(ab’)フラグメントのジスルフィド架橋を還元することによって産生され得る。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR1抗体のF(ab’)フラグメント上の重鎖定常領域は、以下:
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHT(配列番号184)のアミノ酸配列を含む。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、表1に挙げられるVHまたはそれらのいずれかのバリアントのいずれか1つ、および配列番号184と少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%同一である重鎖定常領域を含む重鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、表1に挙げられるVHまたはそれらのいずれかのバリアントのいずれか1つ、および配列番号184と比較してわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する重鎖定常領域を含む重鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、表1に挙げられるVHまたはそれらのいずれかのバリアントのいずれか1つ、および配列番号184で表されるとおりの重鎖定常領域を含む重鎖を含む。
本明細書に記載の抗TfR抗体のF(ab’)アミノ酸配列の例は、表5に提供される。
表5.抗TfR F(ab’)の例の重鎖および軽鎖配列
Figure 2023512441000014
Figure 2023512441000015
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号185、配列番号186、配列番号187、配列番号262、配列番号263、配列番号264、または配列番号265で表されるとおりの重鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号179、配列番号181、または配列番号183で表されるとおりの軽鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号185、配列番号186、配列番号187、配列番号262、配列番号263、配列番号264、または配列番号265と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号179、配列番号181、または配列番号183と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号185、配列番号186、配列番号187、配列番号262、配列番号263、配列番号264、または配列番号265のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号179、配列番号181、または配列番号183のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号185、配列番号262、または配列番号263で表されるとおりの重鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号179で表されるとおりの軽鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号185、配列番号262、または配列番号263と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号179と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号185、配列番号262、または配列番号263のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号179のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号186で表されるとおりの重鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号181で表されるとおりの軽鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、10、11、9、8、7、6、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号186と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号181と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号186のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号181のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号187、配列番号264、または配列番号265で表されるとおりの重鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号183で表されるとおりの軽鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号187、配列番号264、または配列番号265と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号183と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号187、配列番号264、または配列番号265のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号183のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
本明細書に記載の抗TfR受容体抗体は、いずれかの抗体形態であり得、無傷の(すなわち全長)抗体、それらの抗原結合フラグメント(例として、Fab、F(ab’)、F(ab’)2、Fv)、一本鎖抗体、二重特異性抗体、またはナノボディを包含するが、これらに限定されない。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、scFvである。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、scFv-Fabである(例として、定常領域のある部分に融合されたscFv)。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR受容体抗体は、N末端または(of)C末端どちらかにおいて定常領域(例として、配列番号175もしくは配列番号176で表されるとおりのヒトIgG1定常領域、またはその部分、例えばFc部分)に融合されたscFvである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR1抗体のいずれか1つは、重鎖および/または(例として、および)軽鎖配列上にシグナルペプチド(例として、N末端シグナルペプチド)を含み得る。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR1抗体は、VHおよびVL配列のいずれか1つ、IgG重鎖および軽鎖配列のいずれか1つ、または本明細書に記載のF(ab’)重鎖および軽鎖配列のいずれか1つを含み、さらにシグナルペプチド(例として、N末端シグナルペプチド)を含む。いくつかの態様において、シグナルペプチドはMGWSCIILFLVATATGVHS(配列番号214)のアミノ酸配列を含む。
本開示は、いくつかの側面において、筋標的化剤として(例として、筋標的化複合体に)使用され得る別の新たな抗TfR抗体を提供する。抗体のCDR配列および可変ドメイン配列は表6に提供される。
表6.種々の定義系に従う抗TfR抗体のCDR配列および可変ドメイン配列
Figure 2023512441000016
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、表6に提供される抗TfR抗体からのCDR-H(例として、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3)アミノ酸配列の1つ以上を含む。いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、表6に提供される各付番系について提供されるCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、表6に提供される抗TfR抗体からのCDR-L(例として、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3)アミノ酸配列の1つ以上を含む。いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、表6に提供される各付番系について提供されるCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、表6において提供される各ナンバリングシステムについて提供されるCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。いくつかの態様において、抗体の重鎖および軽鎖のCDR3ドメインは、抗原に対する抗体の結合特異性/親和性において特に重要な役割を果たし得る。結果的に、本開示の抗TfR抗体は、表6において提供される抗TfR抗体の少なくとも重鎖および/または(例として、および)軽鎖のCDR3を包含し得る。
いくつかの例において、本開示の抗TfR抗体のいずれかは、表6に提供されるCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、CDR-L1、CDR-L2、および/または(例として、および)CDR-L3配列のいずれかに実質的に類似の1以上のCDR(例として、CDR-HまたはCDR-L)配列を有する。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗体のVH(例として、CDR-H1、CDR-H2、またはCDR-H3)および/または(例として、および)VL(例として、CDR-L1、CDR-L2、またはCDR-L3)領域上の1以上のCDRの位置は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合の少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、1、2、3、4、5、または6つのアミノ酸位置だけ変動し得る。例えば、いくつかの態様においては、本明細書に記載のいずれかの抗体のCDRを定義する位置は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合の少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、CDRのN末端および/または(例として、および)C末端境界を、本明細書に記載の抗体のいずれか1つのCDR位置と比べて1、2、3、4、5、または6アミノ酸だけずらすことによって変動し得る。別の態様においては、本明細書に記載の抗体のVH(例として、CDR-H1、CDR-H2、またはCDR-H3)および/または(例として、および)VL(例として、CDR-L1、CDR-L2、またはCDR-L3)領域上の1以上のCDRの長さは、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合の少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、1、2、3、4、5アミノ酸、またはより多くだけ変動し得る(例として、より短いかまたはより長い)。
結果的に、いくつかの態様において、本明細書に記載のCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、および/または(例として、および)CDR-H3は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合と比べて少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、本明細書に記載のCDR(例として、表6に提供される)の1つ以上よりも1、2、3、4、5アミノ酸、またはより多く短くあり得る。いくつかの態様において、本明細書に記載のCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、および/または(例として、および)CDR-H3は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合と比べて少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、本明細書に記載のCDR(例として、表6に提供される抗TfR抗体からのCDR)の1つ以上よりも1、2、3、4、5アミノ酸、またはより多く長くあり得る。いくつかの態様において、本明細書に記載のCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、および/または(例として、および)CDR-H3のアミノ部分は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合と比べて少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、本明細書に記載のCDR(例として、表6に提供される抗TfR抗体からのCDR)の1つ以上と比較して1、2、3、4、5アミノ酸、またはより多くだけ延伸され得る。いくつかの態様において、本明細書に記載のCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、および/または(例として、および)CDR-H3のカルボキシ部分は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合と比べて少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、本明細書に記載のCDR(例として、表6に提供される抗TfR抗体からのCDR)の1つ以上と比較して1、2、3、4、5アミノ酸、またはより多くだけ延伸され得る。いくつかの態様において、本明細書に記載のCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、および/または(例として、および)CDR-H3のアミノ部分は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合と比べて少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、本明細書に記載のCDR(例として、表6に提供される抗TfR抗体からのCDR)の1つ以上と比較して1、2、3、4、5アミノ酸、またはより多くだけ短縮され得る。いくつかの態様において、本明細書に記載のCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、および/または(例として、および)CDR-H3のカルボキシ部分は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合と比べて少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、本明細書に記載のCDR(例として、表6に提供される抗TfR抗体からのCDR)の1つ以上と比較して1、2、3、4、5アミノ酸、またはより多くだけ短縮され得る。例えば当該技術分野において記載された結合アッセイおよび条件を使用して、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持されるかどうかを確かめるためのいずれかの方法が使用され得る。
いくつかの例において、本開示の抗TfR抗体のいずれかは、表6に提供される抗TfR抗体に実質的に類似の1以上のCDR(例として、CDR-HまたはCDR-L)配列を有する。例えば、抗体は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合と比べて少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、表6に提供され、本明細書に提供されるCDR(例として、表6に提供される抗TfR抗体からのCDR)のいずれか1つの対応するCDR領域と比較して最大5、4、3、2、または1アミノ酸残基バリエーションまでを含有する抗TfR抗体からの1以上のCDR配列(単数または複数)を包含し得る。いくつかの態様において、本明細書に提供されるCDRのいずれかにおけるアミノ酸バリエーションのいずれかは保存的なバリエーションであり得る。保存的なバリエーションは、例えば結晶構造に基づいて決定されるとおり、残基がトランスフェリン受容体タンパク質(例として、ヒトトランスフェリン受容体タンパク質)との相互作用に関わることが蓋然的ではない位置においてCDRに導入され得る。
本開示のいくつかの側面は、本明細書に提供される重鎖可変(VH)および/または(例として、および)軽鎖可変(VL)ドメインの1つ以上を含む抗TfR抗体を提供する。いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、表6に提供される抗TfR1抗体の重鎖可変ドメインおよび/または(例として、および)軽鎖可変ドメインを包含するいずれかの抗体を包含する。
本開示の側面は、本明細書に記載のもののいずれかに相同な重鎖可変(VH)および/または(例として、および)軽鎖可変(VL)ドメインアミノ酸配列を有する抗TfR抗体を提供する。いくつかの態様において、抗TfR抗体は、表6に提供される重鎖可変配列および/または軽鎖可変配列と少なくとも75%(例として、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である重鎖可変配列または軽鎖可変配列を含む。いくつかの態様において、相同な重鎖可変および/または(例として、および)軽鎖可変アミノ酸配列は、本明細書に提供されるCDR配列のいずれかにおいては変動しない。例えば、いくつかの態様において、配列バリエーションの程度(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)は、本明細書に提供されるCDR配列のいずれかを排除する重鎖可変および/または(例として、および)軽鎖可変配列内において生起し得る。いくつかの態様において、本明細書に提供される抗TfR抗体のいずれかは、表6に提供される抗TfR抗体のフレームワーク配列と少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%同一であるフレームワーク配列を含む重鎖可変配列および軽鎖可変配列を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号204のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号205のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号188のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号189のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号190のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)、配列番号191のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号192のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号193のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号188のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号189のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号190のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号191のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号192のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号193のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号188のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号189のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号190のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号191のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号192のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号193のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号188のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号189のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号190のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号191のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号192のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号193のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号194のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Kabat定義系に従う)、配列番号195のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Kabat定義系に従う)、配列番号196のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Kabat定義系に従う)、配列番号197のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Kabat定義系に従う)、配列番号198のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Kabat定義系に従う)、および配列番号193のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Kabat定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号194のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号195のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号196のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。「合わせて」は、3つの重鎖CDRのすべてにおけるアミノ酸バリエーションの全数が、定義された範囲内であることを意味する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号197のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号198のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号193のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号194のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号195のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号196のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号197のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号198のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号193のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号194のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号195のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号196のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号197のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号198のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号193のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号199のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Chothia定義系に従う)、配列番号200のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Chothia定義系に従う)、配列番号201のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Chothia定義系に従う)、配列番号202のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Chothia定義系に従う)、配列番号192のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Chothia定義系に従う)、および配列番号203のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Chothia定義系に従う)を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、配列番号199のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号200のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号201のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。「合わせて」は、3つの重鎖CDRのすべてにおけるアミノ酸バリエーションの全数が、定義された範囲内であることを意味する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これは、配列番号202のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号192のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号203のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらは、配列番号199のアミノ酸配列を有するCDR-H1、配列番号200のアミノ酸配列を有するCDR-H2、および配列番号201のアミノ酸配列を有するCDR-H3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、これらは、配列番号202のアミノ酸配列を有するCDR-L1、配列番号192のアミノ酸配列を有するCDR-L2、および配列番号203のアミノ酸配列を有するCDR-L3と、合わせて少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号199のアミノ酸配列を有するCDR-H1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H1;配列番号200のアミノ酸配列を有するCDR-H2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H2;および/または(例として、および)配列番号201のアミノ酸配列を有するCDR-H3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、以下:配列番号202のアミノ酸配列を有するCDR-L1と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L1;配列番号192のアミノ酸配列を有するCDR-L2と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L2;および/または(例として、および)配列番号203のアミノ酸配列を有するCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を有するCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR-H2、配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR-H3、配列番号10のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号11のアミノ酸配列を含むCDR-L2、および配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号204のアミノ酸配列を含むVHを含むヒト抗体である。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号205のアミノ酸配列を含むVLを含むヒト抗体である。いくつかの態様において、本開示は、配列番号204を含むVHのCDR-H1、CDR-H1、CDR-H3ならびに配列番号205を含むVLのCDR-L1、CDR-L1、およびCDR-L3をヒトフレームワーク領域と含む他のヒト化/ヒト抗体を企図する。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号204で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号205で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号204で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号205で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化抗体である。いくつかの態様において、ヒト化抗TfR抗体は、配列番号188のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号189のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号190のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)を含むヒト化VHと;配列番号191のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号192のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号193のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含むヒト化VLとを含み、ヒト化VHは、配列番号204で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含み、ヒト化VLは、配列番号205で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの態様において、ヒト化抗TfR抗体は、配列番号188のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号189のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号190のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)を含むヒト化VHと;配列番号191のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号192のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号193のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含むヒト化VLとを含み、ヒト化VHは、配列番号204で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有し、ヒト化VLは、配列番号205で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、ヒト化抗TfR抗体はヒト化VHを含み、配列番号194のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Kabat定義系に従う)、配列番号195のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Kabat定義系に従う)、配列番号196のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Kabat定義系に従う)、配列番号197のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Kabat定義系に従う)、配列番号198のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Kabat定義系に従う)、および配列番号193のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Kabat定義系に従う)を含み、ヒト化VHは、配列番号204で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含み、ヒト化VLは、配列番号205で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの態様において、ヒト化抗TfR抗体は、配列番号194のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Kabat定義系に従う)、配列番号195のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Kabat定義系に従う)、配列番号196のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Kabat定義系に従う)、配列番号197のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Kabat定義系に従う)、配列番号198のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Kabat定義系に従う)、および配列番号193のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Kabat定義系に従う)を含み、ヒト化VHは、配列番号204で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有し、ヒト化VLは、配列番号205で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、ヒト化抗TfR抗体はヒト化VHを含み、配列番号199のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Chothia定義系に従う)、配列番号200のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Chothia定義系に従う)、配列番号201のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Chothia定義系に従う)、配列番号202のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Chothia定義系に従う)、配列番号192のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Chothia定義系に従う)、および配列番号203のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Chothia定義系に従う)を含み、ヒト化VHは、配列番号204で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含み、ヒト化VLは、配列番号205で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの態様において、ヒト化抗TfR抗体は、配列番号199のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Chothia定義系に従う)、配列番号200のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Chothia定義系に従う)、配列番号201のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Chothia定義系に従う)、配列番号202のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Chothia定義系に従う)、配列番号192のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Chothia定義系に従う)、および配列番号203のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Chothia定義系に従う)を含み、ヒト化VHは、配列番号204で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有し、ヒト化VLは、配列番号205で表されるとおりのVLと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、抗TfR抗体は、IgG、Fabフラグメント、F(ab’)フラグメント、scFv、または定常領域に融合されたscFvである(例として、NまたはC末端融合)。異なるフォーマットの抗TfR抗体の非限定例が本明細書に提供される。
いくつかの態様において、抗TfR1抗体は、VHおよびVLを単一のポリペプチド鎖上に含む一本鎖フラグメント可変(scFv)である。いくつかの態様において、scFvは、本明細書に記載の重鎖CDR、軽鎖CDR、VH、および/または(例として、および)VLのいずれか1つを単一のポリペプチド鎖上に含む。いくつかの態様において、scFvはVLのN末端に連結されたVHを含む。いくつかの態様において、scFvはVHのN末端に連結されたVLを含む。いくつかの態様において、VHおよびVLはリンカー(例として、ポリペプチドリンカー)によって連結される。いずれかのポリペプチドリンカーは、scFv上においてVHおよびVLを連結するために使用され得る。リンカー配列の選択は当業者の能力の範囲内である。
いくつかの態様において、scFvは、配列番号188のアミノ酸配列を有するCDR-H1(IMGT定義系に従う)、配列番号189のアミノ酸配列を有するCDR-H2(IMGT定義系に従う)、配列番号190のアミノ酸配列を有するCDR-H3(IMGT定義系に従う)を含むVH(例として、ヒト化VH)と;配列番号191のアミノ酸配列を有するCDR-L1(IMGT定義系に従う)、配列番号192のアミノ酸配列を有するCDR-L2(IMGT定義系に従う)、および配列番号193のアミノ酸配列を有するCDR-L3(IMGT定義系に従う)を含むVL(例として、ヒト化VL)とを含み、VHおよびVLは単一のポリペプチド鎖上にあり(例として、アミド結合によって連結されるか、またはペプチドリンカーなどのリンカーによって連結される)、VHはVLのN末端またはC末端に連結される。いくつかの態様において、VHおよびVLは、EGKSSGSGSESKAS(配列番号215)のアミノ酸配列を含むリンカーによって連結される。
いくつかの態様において、scFvは、配列番号194のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Kabat定義系に従う)、配列番号195のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Kabat定義系に従う)、配列番号196のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Kabat定義系に従う)を含むVH(例として、ヒト化VH)と;配列番号197のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Kabat定義系に従う)、配列番号198のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Kabat定義系に従う)、および配列番号193のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Kabat定義系に従う)を含むVL(例として、ヒト化VL)とを含み、VHおよびVLは単一のポリペプチド鎖上にあり(例として、アミド結合によって連結されるか、またはペプチドリンカーなどのリンカーによって連結される)、VHはVLのN末端またはC末端に連結される。いくつかの態様において、VHおよびVLは、EGKSSGSGSESKAS(配列番号215)のアミノ酸配列を含むリンカーによって連結される。
いくつかの態様において、scFvは、配列番号199のアミノ酸配列を有するCDR-H1(Chothia定義系に従う)、配列番号200のアミノ酸配列を有するCDR-H2(Chothia定義系に従う)、配列番号201のアミノ酸配列を有するCDR-H3(Chothia定義系に従う)を含むVH(例として、ヒト化VH)と;配列番号202のアミノ酸配列を有するCDR-L1(Chothia定義系に従う)、配列番号192のアミノ酸配列を有するCDR-L2(Chothia定義系に従う)、および配列番号203のアミノ酸配列を有するCDR-L3(Chothia定義系に従う)を含むVL(例として、ヒト化VL)とを含み、VHおよびVLは単一のポリペプチド鎖上にあり(例として、アミド結合によって連結されるか、またはペプチドリンカーなどのリンカーによって連結される)、VHはVLのN末端またはC末端に連結される。いくつかの態様において、VHおよびVLは、EGKSSGSGSESKAS(配列番号215)のアミノ酸配列を含むリンカーによって連結される。
いくつかの態様において、scFVは、配列番号204で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVH(例として、ヒト化VH)、および配列番号205で表されるとおりのVLと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含むVL(例として、ヒト化VL)を含み、VHおよびVLは単一のポリペプチド鎖上にあり(例として、アミド結合によって連結されるか、またはペプチドリンカーなどのリンカーによって連結される)、VHはVLのN末端またはC末端に連結される。いくつかの態様において、VHおよびVLは、EGKSSGSGSESKAS(配列番号215)のアミノ酸配列を含むリンカーによって連結される。
いくつかの態様において、scFVは、配列番号204で表されるとおりのVHと比較してわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVH(例として、ヒト化VH)と、配列番号205で表されるとおりのVLと比較してわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するヒト化VL(例として、ヒト化VL)とを含み、VHおよびVLは単一のポリペプチド鎖上にあり(例として、アミド結合によって連結されるか、またはペプチドリンカーなどのリンカーによって連結される)、VHはVLのN末端またはC末端に連結される。いくつかの態様において、VHおよびVLは、EGKSSGSGSESKAS(配列番号215)のアミノ酸配列を含むリンカーによって連結される。
いくつかの態様において、scFvは、配列番号204のアミノ酸配列を含むVHと配列番号205のアミノ酸配列を含むVLとを含み、VHおよびVLは単一のポリペプチド鎖上にあり(例として、アミド結合によって連結されるか、またはペプチドリンカーなどのリンカーによって連結される)、VHはVLのN末端またはC末端に連結される。いくつかの態様において、VHおよびVLは、EGKSSGSGSESKAS(配列番号215)のアミノ酸配列を含むリンカーによって連結される。
いくつかの態様において、scFvは、配列番号205のアミノ酸配列を含むVLのN末端に連結された配列番号204のアミノ酸配列を含むVHを含む。いくつかの態様において、VHおよびVLは、EGKSSGSGSESKAS(配列番号215)のアミノ酸配列を含むリンカーによって連結される。
いくつかの態様において、scFvは、配列番号205のアミノ酸配列を含むVLのC末端に連結された配列番号204のアミノ酸配列を含むVHを含む。いくつかの態様において、VHおよびVLは、EGKSSGSGSESKAS(配列番号215)のアミノ酸配列を含むリンカーによって連結される。
scFVのアミノ酸配列は、下に提供される
Figure 2023512441000017

(配列番号206)
いくつかの態様において、本明細書に記載のscFvは、配列番号206で表されるとおりのVHと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載のscFvは、配列番号206と比較してわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するアミノ酸配列を含む。いくつかの態様において、scFvは配列番号206のアミノ酸配列を含む。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、定常領域に連結されたscFv(例として、本明細書に記載のscFvのいずれか1つ)を含む。いくつかの態様において、Fc領域は結晶化可能フラグメント領域(Fc領域)である。Fc領域は、Fc受容体と呼ばれる細胞表面受容体と相互作用する重鎖定常領域のフラグメントである。いずれかの知られているFc領域が本開示に従って使用され得、本明細書に記載のscFvのいずれか1つに融合され得る。Fc領域の例のアミノ酸配列は、下に提供される:
PKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号207)
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号207で表されるとおりのFc領域と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるFc領域のC末端に、(例として、アミド結合またはペプチドリンカーなどのリンカーによって)連結されたscFv(例として、本明細書に記載のscFvまたはそれらのバリアントのいずれか1つ)を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号207と比較してわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するFc領域のC末端に、(例として、アミド結合またはペプチドリンカーなどのリンカーによって)連結されたscFv(例として、本明細書に記載のscFvまたはそれらのバリアントのいずれか1つ)を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号207で表されるとおりのFc領域のC末端に(例として、アミド結合またはペプチドリンカーなどのリンカーによって)連結されたscFv(例として、本明細書に記載のscFvまたはそれらのバリアントのいずれか1つ)を含む。いくつかの態様において、scFVおよびFcは、DIEGRMD(配列番号246)のアミノ酸配列を含むリンカーによって連結される。
Fc領域のC末端に連結されたscFv(例として、本明細書に記載のscFvのいずれか1つ)を含む抗TfR抗体の例のアミノ酸配列は下で提供される
Figure 2023512441000018

(配列番号208)
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号208と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号208と比較してわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するアミノ酸配列を含む。いくつかの態様において、抗TfR抗体は、配列番号208のアミノ酸配列を含む。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号207で表されるとおりのFc領域と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるFc領域のN末端に、(例として、アミド結合またはペプチドリンカーなどのリンカーによって)連結されたscFv(例として、本明細書に記載のscFvのいずれか1つ)を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号207と比較してわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するFc領域のN末端に、(例として、アミド結合またはペプチドリンカーなどのリンカーによって)連結されたscFv(例として、本明細書に記載のscFvのいずれか1つ)を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号207で表されるとおりのFc領域のN末端に、(例として、アミド結合またはペプチドリンカーなどのリンカーによって)連結されたscFv(例として、本明細書に記載のscFvのいずれか1つ)を含む。いくつかの態様において、scFVおよびFcは、DIEGRMD(配列番号246)のアミノ酸配列を含むリンカーによって連結される。
Fc領域のN末端に連結されたscFv(例として、本明細書に記載のscFvのいずれか1つ)を含む抗TfR抗体の例のアミノ酸配列は下で提供される
Figure 2023512441000019

(配列番号209)
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号209と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号209と比較してわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するアミノ酸配列を含む。いくつかの態様において、抗TfR抗体は、配列番号209のアミノ酸配列を含む。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体はIgGである。いくつかの態様において、IgGは重鎖および軽鎖を含み、重鎖は本明細書に記載の抗TfR抗体のいずれか1つのCDR-H1、CDRH2、およびCDR-H3を含み、さらに重鎖定常領域またはその部分(例として、CH1、CH2、CH3、またはそれらの組み合わせ)を含み;軽鎖は本明細書に記載の抗TfR抗体のいずれか1つのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、さらに軽鎖定常領域を含む。いくつかの態様において、IgGは重鎖および軽鎖を含み、重鎖は本明細書に記載の抗TfR抗体のいずれか1つのVHを含み、さらに重鎖定常領域またはその部分(例として、CH1、CH2、CH3、またはそれらの組み合わせ)を含み;軽鎖は本明細書に記載の抗TfR抗体のいずれか1つのVLを含み、さらに軽鎖定常領域を含む。
重鎖定常領域は、いずれかの好適な起源、例えばヒト、マウス、ラット、またはウサギであり得る。1つの具体的な例では、重鎖定常領域はヒトIgG(ガンマ重鎖)、例えばIgG1、IgG2、またはIgG4からである。ヒトIgG1定常領域の例は、下に与えられる:
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号175)
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体のいずれかの重鎖は、突然変異体ヒトIgG1定常領域を含む。例えば、ヒトIgG1のCH2ドメイン上のLALA突然変異の導入(ヒンジ下部残基Leu234 Leu235をAla234およびAla235によって置き換えるように突然変異させられたmAb b12に由来する突然変異体)は、Fcg受容体結合を低減することが公知である(Bruhns,P.,et al.(2009)およびXu,D.et al.(2000))。突然変異体ヒトIgG1定常領域は下で提供される(突然変異は太字かつ下線付き):
Figure 2023512441000020

(配列番号176)
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体のいずれかの軽鎖定常領域は、当該技術分野において知られているいずれかの軽鎖定常領域であり得る。いくつかの例では、カッパ軽鎖またはラムダ軽鎖である。いくつかの態様において、軽鎖定常領域はカッパ軽鎖であり、この配列は下に提供される:
RTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号177)
他の抗体の重鎖および軽鎖定常領域は当該技術分野において周知であり、例として、IMGTデータベース(www.imgt.org)において、またはwww.vbase2.org/vbstat.php.にて提供されるものであるが、これらの両方とも参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号204のアミノ酸配列を含むVHまたはそのいずれかのバリアント、および配列番号175または配列番号176と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一の重鎖定常領域を含む重鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号204のアミノ酸配列を含むVHまたはそのいずれかのバリアント、および配列番号175または配列番号176で表されるとおりの重鎖と比較してわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する重鎖定常領域を含む重鎖を含む。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号204で表されるとおりのVHと配列番号175で表されるとおりの重鎖定常領域とを含む重鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号204で表されるとおりのVHと配列番号176で表されるとおりの重鎖定常領域とを含む重鎖を含む。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号205のアミノ酸配列を含むVLまたはそのいずれかのバリアント、および配列番号177と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である軽鎖定常領域を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号205のアミノ酸配列を含むVLまたはそのいずれかのバリアント、および配列番号177で表されるとおりの重鎖と比較してわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する軽鎖定常領域を含む軽鎖を含む。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号205で表されるとおりのVLと配列番号177で表されるとおりの軽鎖定常領域とを含む軽鎖を含む。
記載される抗TfR抗体のIgG重鎖および軽鎖アミノ酸配列の例は、下に提供される。
抗TfR IgG重鎖(野生型ヒトIgG1定常領域あり、VHは下線付き)
QVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKGSGYSFTSYWIGWVRQMPGKGLEWMGIIYPGDSDTRYSPSFQGQVTISADKSISTAYLQWSSLKASDTAMYYCARFPYDSSGYYSFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号210)
抗TfR IgG重鎖(ヒトIgG1定常領域突然変異体L234A/L235Aあり、VHは下線付き)
QVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKGSGYSFTSYWIGWVRQMPGKGLEWMGIIYPGDSDTRYSPSFQGQVTISADKSISTAYLQWSSLKASDTAMYYCARFPYDSSGYYSFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号211)
抗TfR IgG軽鎖(カッパ、VLは下線付き)
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSTPLTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号212)
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号210または配列番号211と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号212のいずれか1つと少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号210または配列番号211で表されるとおりの重鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号212で表されるとおりの軽鎖と比較してわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する軽鎖を含む。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号210または配列番号211のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号212のいずれか1つのアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
いくつかの態様において、抗TfR抗体は、無傷の抗体(全長抗体)のFABフラグメントまたはF(ab’)フラグメントである。無傷の抗体(全長抗体)の抗原結合フラグメントは定型的な方法によって(例として、組み換え的に、または全長IgGの重鎖定常領域をパパインなどの酵素を使用して消化することによって)調製され得る。例えば、F(ab’)フラグメントは抗体分子のペプシンまたはパパイン消化によって生じ得、FabフラグメントはF(ab’)フラグメントのジスルフィド架橋を還元することによって作出され得る。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR1抗体のF(ab’)フラグメント上の重鎖定常領域は、以下:
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHT(配列番号184)のアミノ酸配列を含む。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号204のアミノ酸配列を含むVHまたはそのいずれかのバリアント、および配列番号184と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一の重鎖定常領域を含む重鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号204のアミノ酸配列を含むVHまたはそのいずれかのバリアント、および配列番号184で表されるとおりの重鎖と比較してわずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する重鎖定常領域を含む重鎖を含む。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号204で表されるとおりのVHと配列番号184で表されるとおりの重鎖定常領域とを含む重鎖を含む。
本明細書に記載の抗TfR抗体の例示のF(ab’)アミノ酸配列は、下に提供される。
抗TfR Fab’重鎖(ヒトIgG1定常領域フラグメントあり、VHは下線付き)
QVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKGSGYSFTSYWIGWVRQMPGKGLEWMGIIYPGDSDTRYSPSFQGQVTISADKSISTAYLQWSSLKASDTAMYYCARFPYDSSGYYSFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCP(配列番号213)
または
QVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKGSGYSFTSYWIGWVRQMPGKGLEWMGIIYPGDSDTRYSPSFQGQVTISADKSISTAYLQWSSLKASDTAMYYCARFPYDSSGYYSFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHT(配列番号266)
抗TfR Fab’軽鎖(カッパ、VLは下線付き)
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSTPLTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号212)
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号213または配列番号266と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号212と少なくとも75%(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、配列番号213または配列番号266で表されるとおりの重鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗TfR抗体は、配列番号212で表されるとおりの軽鎖と比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号213または配列番号266のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗TfR抗体は、配列番号212のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR1抗体のいずれか1つは、重鎖および/または(例として、および)軽鎖配列上にシグナルペプチド(例として、N末端シグナルペプチド)を含み得る。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR1抗体は、VHおよびVL配列のいずれか1つ、挙げられるIgG重鎖および軽鎖配列のいずれか1つ、または本明細書に記載のF(ab’)重鎖および軽鎖配列のいずれか1つを含み、さらにシグナルペプチド(例として、N末端シグナルペプチド)を含む。いくつかの態様において、シグナルペプチドはMGWSCIILFLVATATGVHS(配列番号214)のアミノ酸配列を含む。
他の知られている抗トランスフェリン受容体抗体
当該技術分野において知られているいずれか他の適切な抗トランスフェリン受容体抗体は、本明細書に開示の複合体において筋標的化剤として使用され得る。知られている抗トランスフェリン受容体抗体(関連する参考文献および結合エピトープを包含する)の例は、表7に挙げられる。いくつかの態様において、抗トランスフェリン受容体抗体は、本明細書に提供される抗トランスフェリン受容体抗体、例として、表7に挙げられる抗トランスフェリン受容体抗体のいずれかの相補性決定領域(CDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3)を含む。
表7.関連する参考文献および結合エピトープ情報を包含する、抗トランスフェリン受容体抗体クローンのリスト。
Figure 2023512441000021
Figure 2023512441000022
Figure 2023512441000023
いくつかの態様において、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つからのCDR-H(例として、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3)アミノ酸配列の1つ以上を包含する。いくつかの態様において、トランスフェリン受容体抗体は、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つについて提供されるCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を包含する。いくつかの態様において、抗トランスフェリン受容体抗体は、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つについて提供されるCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を包含する。いくつかの態様において、抗トランスフェリン抗体は、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つについて提供されるCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を包含する。本開示は、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つについて提供されるCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、CDR-L1、CDR-L2、またはCDR-L3を含む分子をコードするいずれかの核酸配列をもまた包含する。いくつかの態様において、抗体の重鎖および軽鎖CDR3ドメインは、ある抗原についての抗体の結合特異性/親和性に特に重要な役割を演じ得る。したがって、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つの少なくとも重鎖および/または(例として、および)軽鎖CDR3を包含し得る。
いくつかの例において、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体のいずれかは、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体の1つからのCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、CDR-L1、CDR-L2、および/または(例として、および)CDR-L3配列のいずれかに実質的に類似の1以上のCDR(例として、CDR-HまたはCDR-L)配列を有する。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗体のVH(例として、CDR-H1、CDR-H2、またはCDR-H3)および/または(例として、および)VL(例として、CDR-L1、CDR-L2、またはCDR-L3)領域上の1以上のCDRの位置は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合の少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、1、2、3、4、5、または6アミノ酸位置だけ変動し得る。例えば、いくつかの態様において、本明細書に記載のいずれかの抗体のCDRを定義する位置は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合の少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、CDRのN末端および/または(例として、および)C末端境界を、本明細書に記載の抗体のいずれか1つのCDR位置と比べて1、2、3、4、5、または6アミノ酸だけずらすことによって変動し得る。別の態様においては、本明細書に記載の抗体のVH(例として、CDR-H1、CDR-H2、またはCDR-H3)および/または(例として、および)VL(例として、CDR-L1、CDR-L2、またはCDR-L3)領域上の1以上のCDRの長さは、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合の少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、1、2、3、4、5アミノ酸、またはより多くだけ変動し得る(例として、より短いかまたはより長い)。
従って、いくつかの態様において、本明細書に記載のCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、および/または(例として、および)CDR-H3は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合と比べて少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、本明細書に記載のCDR(例として、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれかからのCDR)の1つ以上よりも1、2、3、4、5アミノ酸、またはより多く短くあり得る。いくつかの態様において、本明細書に記載のCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、および/または(例として、および)CDR-H3は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合と比べて少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、本明細書に記載のCDR(例として、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれかからのCDR)の1つ以上よりも1、2、3、4、5アミノ酸、またはより多く長くあり得る。いくつかの態様において、本明細書に記載のCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、および/または(例として、および)CDR-H3のアミノ部分は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合と比べて少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、本明細書に記載のCDR(例として、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれかからのCDR)の1つ以上と比較して1、2、3、4、5アミノ酸、またはより多くだけ延伸され得る。いくつかの態様において、本明細書に記載のCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、および/または(例として、および)CDR-H3のカルボキシ部分は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合と比べて少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、本明細書に記載のCDR(例として、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれかからのCDR)の1つ以上と比較して1、2、3、4、5アミノ酸、またはより多くだけ延伸され得る。いくつかの態様において、本明細書に記載のCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、および/または(例として、および)CDR-H3のアミノ部分は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合と比べて少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、本明細書に記載のCDR(例として、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれかからのCDR)の1つ以上と比較して1、2、3、4、5アミノ酸、またはより多くだけ短縮され得る。いくつかの態様において、本明細書に記載のCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、および/または(例として、および)CDR-H3のカルボキシ部分は、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合と比べて少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、本明細書に記載のCDR(例として、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれかからのCDR)の1つ以上と比較して1、2、3、4、5アミノ酸、またはより多くだけ短縮され得る。例えば当該技術分野において記載された結合アッセイおよび条件を使用して、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持されるかどうかを確かめるためのいずれかの方法が使用され得る。
いくつかの例において、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体のいずれかは、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つに実質的に類似の1以上のCDR(例として、CDR-HまたはCDR-L)配列を有する。例えば、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に対する免疫特異的結合が維持される(例として、実質的に維持される。例えば、それが由来する元の抗体の結合と比べて少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%)限り、抗体は、本明細書に提供されるCDR(例として、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれかからのCDR)のいずれか1つの対応するCDR領域と比較して最大5、4、3、2、または1アミノ酸残基バリエーションまでを含有する表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれかからの1以上のCDR配列(単数または複数)を包含し得る。いくつかの態様において、本明細書に提供されるCDRのいずれかにおけるアミノ酸バリエーションのいずれかは、保存的なバリエーションであり得る。保存的なバリエーションは、例えば結晶構造に基づいて決定されるとおり、残基がトランスフェリン受容体タンパク質(例として、ヒトトランスフェリン受容体タンパク質)との相互作用に関わることが蓋然的ではない位置においてCDRに導入され得る。本開示のいくつかの側面は、本明細書に提供される重鎖可変(VH)および/または(例として、および)軽鎖可変(VL)ドメインの1つ以上を含むトランスフェリン受容体抗体を提供する。いくつかの態様において、本明細書に提供されるVHドメインのいずれかは、本明細書に提供されるCDR-H配列(例として、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3)の1つ以上、例えば、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つで提供されるCDR-H配列のいずれかを包含する。いくつかの態様において、本明細書に提供されるVLドメインのいずれかは、本明細書に提供されるCDR-L配列(例として、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3)の1つ以上、例えば、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つで提供されるCDR-L配列のいずれかを包含する。
いくつかの態様において、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つなどの、いずれかの抗トランスフェリン受容体抗体の重鎖可変ドメインおよび/または(例として、および)軽鎖可変ドメインを包含するいずれかの抗体を包含する。いくつかの態様において、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つなどのいずれかの抗トランスフェリン受容体抗体の重鎖可変および軽鎖可変ペアを包含するいずれかの抗体を包含する。
本開示の側面は、本明細書に記載のもののいずれかと相同な重鎖可変(VH)および/または(例として、および)軽鎖可変(VL)ドメインアミノ酸配列を有する抗トランスフェリン受容体抗体を提供する。いくつかの態様において、抗トランスフェリン受容体抗体は、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つなどのいずれかの抗トランスフェリン受容体抗体の重鎖可変配列および/またはいずれかの軽鎖可変配列と少なくとも75%(例として、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)同一である重鎖可変配列または軽鎖可変配列を含む。いくつかの態様において、相同な重鎖可変および/または(例として、および)軽鎖可変アミノ酸配列は、本明細書に提供されるCDR配列のいずれかにおいては変動しない。例えば、いくつかの態様において、配列バリエーションの程度(例として、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%)は、本明細書に提供されるCDR配列のいずれかを排除する重鎖可変および/または(例として、および)軽鎖可変配列内において生起し得る。いくつかの態様において、本明細書に提供される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれかは、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つなどのいずれかの抗トランスフェリン受容体抗体のフレームワーク配列と少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%同一であるフレームワーク配列を含む重鎖可変配列および軽鎖可変配列を含む。
いくつかの態様において、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に特異的に結合する抗トランスフェリン受容体抗体は、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれかの、本明細書に提供されるCDR-Lドメイン(CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3)またはCDR-Lドメインバリアントのいずれかを含む軽鎖可変VLドメインを含む。いくつかの態様において、トランスフェリン受容体(例として、ヒトトランスフェリン受容体)に特異的に結合する抗トランスフェリン受容体抗体は、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つなどの、いずれかの抗トランスフェリン受容体抗体のCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む軽鎖可変VLドメインを含む。いくつかの態様において、抗トランスフェリン受容体抗体は、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つなどの、いずれかの抗トランスフェリン受容体抗体の軽鎖可変領域配列のフレームワーク領域の1、2、3、または4つを含む軽鎖可変(VL)領域配列を含む。いくつかの態様において、抗トランスフェリン受容体抗体は、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つなどの、いずれかの抗トランスフェリン受容体抗体の軽鎖可変領域配列のフレームワーク領域の1、2、3、または4つと少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、または100%同一である軽鎖可変領域配列のフレームワーク領域の1、2、3、または4つを含む。いくつかの態様において、前記のアミノ酸配列に由来する軽鎖可変フレームワーク領域は、最大10アミノ酸までの置換、欠失、および/または(例として、および)挿入、好ましくは最大10アミノ酸までの置換の存在を除けば、前記のアミノ酸配列からなる。いくつかの態様において、該アミノ酸配列に由来する軽鎖可変フレームワーク領域は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10アミノ酸残基が、対応する霊長目の非ヒト動物またはヒトの軽鎖可変フレームワーク領域中の類似した位置に見出されるアミノ酸と置換された該アミノ酸配列からなる。
いくつかの態様において、トランスフェリン受容体へ特異的に結合する抗トランスフェリン受容体抗体は、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つなどのいずれの抗トランスフェリン受容体抗体のCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。いくつかの態様において、抗体はさらに、ヒトもしくは霊長目の動物の抗体のVLに由来する1つ、2つ、3つ、または4つすべてのVLフレームワーク領域を含む。本明細書に記載の軽鎖CDR配列との併用のための選択される抗体の霊長目の動物またはヒトの軽鎖フレームワーク領域は、例えば、非ヒト親抗体の軽鎖フレームワーク領域と、少なくとも70%(例として、少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、98%、または少なくとも99%)の同一性を有し得る。選択される霊長目の動物またはヒトの抗体は、その軽鎖相補性決定領域において、本明細書に提供される抗体のいずれか(例として、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか)の軽鎖相補性決定領域のアミノ酸に対し、同じ数または実質的に同じ数のアミノ酸を有し得る。いくつかの態様において、霊長目の動物またはヒトの軽鎖フレームワーク領域のアミノ酸残基は、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つなどのいずれの抗トランスフェリン受容体抗体の軽鎖フレームワーク領域と少なくとも75%同一性、少なくとも80%同一性、少なくとも85%同一性、少なくとも90%同一性、少なくとも95%同一性、少なくとも98%同一性、少なくとも99%(またはこれを超える)同一性を有する、天然の霊長目の動物またはヒトの抗体軽鎖フレームワーク領域からのものである。いくつかの態様において、抗トランスフェリン受容体抗体はさらに、ヒト軽鎖可変カッパサブファミリーに由来する1つ、2つ、3つ、または4つすべてのVLフレームワーク領域を含む。いくつかの態様において、抗トランスフェリン受容体抗体はさらに、ヒト軽鎖可変ラムダサブファミリーに由来する1つ、2つ、3つ、または4つすべてのVLフレームワーク領域を含む。
いくつかの態様において、本明細書に提供される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれも、軽鎖定常領域をさらに含む軽鎖可変ドメインを含む。いくつかの態様において、軽鎖定常領域は、カッパまたはラムダ軽鎖定常領域である。いくつかの態様において、カッパまたはラムダ軽鎖定常領域は、哺乳動物から、例として、ヒト、サル、ラット、またはマウスからのものである。いくつかの態様において、軽鎖定常領域は、ヒトカッパ軽鎖定常領域である。いくつかの態様において、軽鎖定常領域は、ヒトラムダ軽鎖定常領域である。本明細書に提供される軽鎖定常領域のいずれも、本明細書に提供される軽鎖定常領域のいずれかのバリアントであってもよいことは解されるはずである。いくつかの態様において、軽鎖定常領域は、表から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つなどのいずれの抗トランスフェリン受容体抗体の軽鎖定常領域のいずれかと少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの態様において、抗トランスフェリン受容体抗体は、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つなどの、いずれの抗トランスフェリン受容体抗体でもある。
いくつかの態様において、抗トランスフェリン受容体抗体は、表7から選択される抗トランスフェリン受容体抗体のいずれか1つなどのいずれの抗トランスフェリン受容体抗体のアミノ酸配列を含むVLドメインを含み、ここで定常領域は、IgG、IgE、IgM、IgD、IgA、もしくはIgY免疫グロブリン分子、またはヒトIgG、IgE、IgM、IgD、IgA、もしくはIgY免疫グロブリン分子の定常領域のアミノ酸配列を含む。いくつかの態様において、抗トランスフェリン受容体抗体は、VLドメイン、またはVLドメインのバリアントのいずれか、およびVHドメイン、またはVHドメインバリアントのいずれかを含み、ここでVLおよびVHドメイン、またはそれらのバリアントは、同じ抗体クローンからものであり、ここで定常領域は、IgG、IgE、IgM、IgD、IgA、もしくはIgY免疫グロブリン分子、いずれのクラス(例として、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、およびIgA2)またはいずれのサブクラス(例として、IgG2aおよびIgG2b)の免疫グロブリン分子の定常領域のアミノ酸配列を含む。ヒト定常領域の非限定例は当該技術分野において記載されており、例として、上述のKabat E A et al.(1991)を見よ。
いくつかの態様において、筋標的化剤は、抗トランスフェリン受容体抗体(例として、国際出願刊行物WO 2016/081643(参照により本明細書に組み込まれる)に記載のとおりの抗体およびそのバリアント)である。
種々の定義系に従う抗体の重鎖および軽鎖CDRは、表8中に提供される。種々の定義系、例として、Kabat定義、Chothia定義、および/またはContact定義は記載されている。例として、(例として、Kabat,E.A.,et al.(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition,U.S.Department of Health and Human Services,NIH Publication No.91-3242,Chothia et al.,(1989)Nature 342:877;Chothia,C.et al.(1987)J.Mol.Biol.196:901-917,Al-lazikani et al(1997)J.Molec.Biol.273:927-948;およびAlmagro,J.Mol.Recognit.17:132-143(2004)。またhgmp.mrc.ac.ukおよびbioinf.org.uk/absも見よ)を見よ。
表8.マウストランスフェリン受容体抗体の重鎖および軽鎖CDR
Figure 2023512441000024
重鎖可変ドメイン(VH)および軽鎖可変ドメイン配列もまた提供される:
VH
QVQLQQPGAELVKPGASVKLSCKASGYTFTSYWMHWVKQRPGQGLEWIGEINPTNGRTNYIEKFKSKATLTVDKSSSTAYMQLSSLTSEDSAVYYCARGTRAYHYWGQGTSVTVSS(配列番号230)
VL
DIQMTQSPASLSVSVGETVTITCRASDNLYSNLAWYQQKQGKSPQLLVYDATNLADGVPSRFSGSGSGTQYSLKINSLQSEDFGTYYCQHFWGTPLTFGAGTKLELK(配列番号231)
いくつかの態様において、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、表8に示されるCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3と同じであるCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、表8に示されるCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3と同じであるCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これは、表8に示されるCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。「合わせて」は、3つの重鎖CDRのすべてにおけるアミノ酸バリエーションの全数が、定義された範囲内であることを意味する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み得、これは、表8に示されるCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3と比較して、合わせてわずか5アミノ酸バリエーション(例として、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、CDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を含み、これらの少なくとも1つは、表8に示されるカウンターパート重鎖CDRと比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み得、これらの少なくとも1つは、表8に示されるカウンターパート軽鎖CDRと比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。
いくつかの態様において、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、CDR-L3を含み、これは表8に示されるCDR-L3と比較してわずか3アミノ酸バリエーション(例として、わずか3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する。いくつかの態様において、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、表8に示されるCDR-L3と比較して1つのアミノ酸バリエーションを含有するCDR-L3を含む。いくつかの態様において、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、QHFAGTPLT(配列番号232)KabatおよびChothia定義系に従う)またはQHFAGTPL(配列番号233)Contact定義系に従う)のCDR-L3を含む。いくつかの態様において、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、表8に示されるCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3と同じであるCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、CDR-L1、およびCDR-L2を含み、QHFAGTPLT(配列番号232)KabatおよびChothia定義系に従う)またはQHFAGTPL(配列番号233)Contact定義系に従う)のCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、表8に示される重鎖CDRと、合わせて少なくとも80%(例として、80%、85%、90%、95%、または98%)同一である重鎖CDRを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、表8に示される軽鎖CDRと、合わせて少なくとも80%(例として、80%、85%、90%、95%、または98%)同一である軽鎖CDRを含む。
いくつかの態様において、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、配列番号230のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、配列番号231のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、配列番号230で表されるとおりのVHと比較して、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、配列番号231で表されるとおりのVLと比較して、1わずか5アミノ酸バリエーション(例として、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、9、8、7、6、わずか5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、配列番号230で表されるとおりのVHと少なくとも80%(例として、80%、85%、90%、95%、または98%)同一であるアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、配列番号231で表されるとおりのVLと少なくとも80%(例として、80%、85%、90%、95%、または98%)同一であるアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、ヒト化抗体(例として、抗体のヒト化バリアント)である。いくつかの態様において、本開示のトランスフェリン受容体抗体は、表8に示されるCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3と同じであるCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み、ヒト化重鎖可変領域および/または(例として、および)ヒト化軽鎖可変領域を含む。
ヒト化抗体は、レシピエントの相補性決定領域(CDR)からのその残基が、所望の特異性、親和性、および能力を有するマウス、ラット、またはウサギなどの非ヒト種(ドナー抗体)のCDRからの残基によって置き換えられているヒト免疫グロブリン(レシピエント抗体)である。いくつかの態様において、ヒト免疫グロブリンのFvフレームワーク領域(FR)残基は、対応する非ヒト残基によって置き換えられている。さらにまた、ヒト化抗体は、レシピエント抗体から見出されない残基も、移入された(imported)CDRまたはフレームワーク配列から見出されない残基も含んでいてもよいが、抗体の性能をさらに洗練および最適化するために包含される残基を含むこともある。一般に、ヒト化抗体は、少なくとも1つの、典型的には2つの可変ドメインのすべてを実質的に含むであろうが、前記可変ドメインにおいて、CDR領域のすべてまたは実質的にすべてが、非ヒト免疫グロブリンのCDR領域に対応し、かつFR領域のすべてまたは実質的にすべてが、ヒト免疫グロブリンコンセンサス配列のFR領域である。ヒト化抗体はまた、最適には、免疫グロブリン(典型的には、ヒト免疫グロブリンの)定常領域またはドメイン(Fc)の少なくとも一部も含むであろう。抗体は、WO 99/58572に記載のとおりに修飾されたFc領域を有していてもよい。ヒト化抗体の他の形態は、元の抗体に関して変更された1以上のCDR(1、2、3、4、5、6)を有しており、これらはまた、元の抗体からの1以上のCDRに由来する1以上のCDRとも呼ばれる。ヒト化抗体はまた、親和性成熟も伴うことがある。
いくつかの態様において、ヒト化は、CDR(例として、表8に示されるとおりの)をIGKV1-NL1*01およびIGHV1-3*01ヒト可変ドメイン中へ接合させることによって達成される。いくつかの態様において、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、位置9、13、17、18、40、45、および70での1以上のアミノ酸置換(配列番号231で表されるとおりのVLと比較したとき)、および/または(例として、および)、位置1、5、7、11、12、20、38、40、44、66、75、81、83、87、および108での1以上のアミノ酸置換(配列番号230で表されるとおりのVHと比較したとき)を含むヒト化バリアントである。いくつかの態様において、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、位置9、13、17、18、40、45、および70のすべてでのアミノ酸置換(配列番号231で表されるとおりのVLと比較したとき)、および/または(例として、および)、位置1、5、7、11、12、20、38、40、44、66、75、81、83、87、および108のすべてでのアミノ酸置換(配列番号230で表されるとおりのVHと比較したとき)を含むヒト化バリアントである。
いくつかの態様において、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、ヒト化抗体であって、配列番号231で表されるとおりのVLの位置43および48での残基を含有する。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、ヒト化抗体であって、配列番号230で表されるとおりのVHの位置48、67、69、71、および73での残基を含有する。
本開示に従い使用されてもよいヒト化抗体の例の、VHおよびVLアミノ酸配列は、以下に提供される:
ヒト化VH
EVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYWMHWVRQAPGQRLEWIGEINPTNGRTNYIEKFKSRATLTVDKSASTAYMELSSLRSEDTAVYYCARGTRAYHYWGQGTMVTVSS(配列番号234)
ヒト化VL
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASDNLYSNLAWYQQKPGKSPKLLVYDATNLADGVPSRFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFATYYCQHFWGTPLTFGQGTKVEIK(配列番号235)
いくつかの態様において、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、配列番号234のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、配列番号235のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、配列番号234で表されるとおりのVHと比較したとき、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、配列番号235で表されるとおりのVLと比較したとき、わずか15アミノ酸バリエーション(例として、わずか20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有するVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、配列番号234で表されるとおりのVHと少なくとも80%(例として、80%、85%、90%、95%、または98%)同一のアミノ酸配列を含むVHを含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、配列番号235で表されるとおりのVLと少なくとも80%(例として、80%、85%、90%、95%、または98%)同一のアミノ酸配列を含むVLを含む。
いくつかの態様において、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、位置43および48の1以上でのアミノ酸置換(配列番号231で表されるとおりのVLと比較したとき)、および/または(例として、および)、位置48、67、69、71、および73の1以上でのアミノ酸置換(配列番号230で表されるとおりのVHと比較したとき)を含むヒト化バリアントである。いくつかの態様において、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、S43Aおよび/または(例として、および)V48L突然変異(配列番号231で表されるとおりのVLと比較したとき)、および/または(例として、および)、A67V、L69I、V71R、およびK73T突然変異の1以上(配列番号230で表されるとおりのVHと比較したとき)を含むヒト化バリアントである。
いくつかの態様において、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、位置9、13、17、18、40、43、48、45、および70の1以上でのアミノ酸置換(配列番号231で表されるとおりのVLと比較したとき)、および/または(例として、および)、位置1、5、7、11、12、20、38、40、44、48、66、67、69、71、73、75、81、83、87、および108の1以上でのアミノ酸置換(配列番号230で表されるとおりのVHと比較したとき)を含むヒト化バリアントである。
いくつかの態様において、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、ヒト抗体からの重鎖定常領域および軽鎖定常領域を包含し得るキメラ抗体である。キメラ抗体は、第1の種からの可変領域または一部の可変領域、および第2の種からの定常領域を有する抗体を指す。典型的には、これらのキメラ抗体において、軽鎖と重鎖との両方の可変領域は、ある種の哺乳動物(例として、マウス、ウサギ、およびラットなどの非ヒト哺乳動物)に由来する抗体の可変領域を模倣する一方で、定常部は、ヒトなどの別の哺乳動物に由来する抗体中の配列と相同である。いくつかの態様において、アミノ酸修飾は、可変領域および/または(例として、および)定常領域においてなされ得る。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗トランスフェリン受容体抗体は、ヒト抗体からの重鎖定常領域および軽鎖定常領域を包含し得るキメラ抗体である。キメラ抗体は、第1の種からの可変領域または一部の可変領域、および第2の種からの定常領域を有する抗体を指す。典型的には、これらのキメラ抗体において、軽鎖と重鎖との両方の可変領域は、ある種の哺乳動物(例として、マウス、ウサギ、およびラットなどの非ヒト哺乳動物)に由来する抗体の可変領域を模倣する一方で、定常部は、ヒトなどの別の哺乳動物に由来する抗体中の配列と相同である。いくつかの態様において、アミノ酸修飾は、可変領域および/または(例として、および)定常領域においてなされ得る。
いくつかの態様において、本明細書に記載のとおりの抗トランスフェリン受容体抗体のいずれの重鎖も、重鎖定常領域(CH)またはこの一部(例として、CH1、CH2、CH3、またはそれらの組み合わせ)を含んでいてもよい。重鎖定常領域は、いずれの好適な起源、例として、ヒト、マウス、ラット、またはウサギに属し得る。特定の一例において、重鎖定常領域は、ヒトIgG(ガンマ重鎖)、例として、IgG1、IgG2、またはIgG4からのものである。ヒトIgG1定常領域の例は、下に与えられる:
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号175)
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗トランスフェリン受容体抗体のいずれの軽鎖も、軽鎖定常領域(CL)をさらに含んでいてもよいが、これは当該技術分野において知られているいずれのCLでもあり得る。いくつかの例において、CLは、カッパ軽鎖である。他の例において、CLは、ラムダ軽鎖である。いくつかの態様において、CLはカッパ軽鎖であって、その配列は下に与えられる:
RTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号177)
他の抗体の重鎖および軽鎖定常領域は当該技術分野において周知であり、例として、IMGTデータベース(www.imgt.org)において、またはwww.vbase2.org/vbstat.php.にて提供されるものであるが、これらの両方とも参照により本明細書に組み込まれる。
記載される抗トランスフェリン受容体抗体の重鎖および軽鎖アミノ酸配列の例は、下に提供される:
重鎖(VH+ヒトIgG1定常領域)
QVQLQQPGAELVKPGASVKLSCKASGYTFTSYWMHWVKQRPGQGLEWIGEINPTNGRTNYIEKFKSKATLTVDKSSSTAYMQLSSLTSEDSAVYYCARGTRAYHYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号236)
軽鎖(VL+カッパ軽鎖)
DIQMTQSPASLSVSVGETVTITCRASDNLYSNLAWYQQKQGKSPQLLVYDATNLADGVPSRFSGSGSGTQYSLKINSLQSEDFGTYYCQHFWGTPLTFGAGTKLELKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号237)
重鎖(ヒト化VH+ヒトIgG1定常領域)
EVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYWMHWVRQAPGQRLEWIGEINPTNGRTNYIEKFKSRATLTVDKSASTAYMELSSLRSEDTAVYYCARGTRAYHYWGQGTMVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号238)
軽鎖(ヒト化VL+カッパ軽鎖)
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASDNLYSNLAWYQQKPGKSPKLLVYDATNLADGVPSRFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFATYYCQHFWGTPLTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号239)
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗トランスフェリン受容体抗体は、配列番号236と少なくとも80%(例として、80%、85%、90%、95%、または98%)同一のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗トランスフェリン受容体抗体は、配列番号237と少なくとも80%(例として、80%、85%、90%、95%、または98%)同一のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗トランスフェリン受容体抗体は、配列番号236のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗トランスフェリン受容体抗体は、配列番号237のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、配列番号236で表されるとおりの重鎖と比較したとき、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、配列番号237で表されるとおりの軽鎖と比較したとき、わずか15アミノ酸バリエーション(例として、わずか20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する軽鎖を含む。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗トランスフェリン受容体抗体は、配列番号238と少なくとも80%(例として、80%、85%、90%、95%、または98%)同一のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗トランスフェリン受容体抗体は、配列番号239と少なくとも80%(例として、80%、85%、90%、95%、または98%)同一のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗トランスフェリン受容体抗体は、配列番号238のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載の抗トランスフェリン受容体抗体は、配列番号239のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、配列番号238で表されるとおりのヒト化抗体の重鎖と比較したとき、わずか25アミノ酸バリエーション(例として、わずか25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本開示の抗トランスフェリン受容体抗体は、配列番号239で表されるとおりのヒト化抗体の軽鎖と比較したとき、わずか15アミノ酸バリエーション(例として、わずか20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸バリエーション)を含有する軽鎖を含む。
いくつかの態様において、抗トランスフェリン受容体抗体は、無傷の抗体(完全長抗体)の抗原結合性フラグメント(FAB)である。無傷の抗体(完全長抗体)の抗原結合性フラグメントは、定型的な方法を介して調製され得る。例えば、F(ab’)2フラグメントは、抗体分子のペプシン消化によって産生され得、Fabフラグメントは、F(ab’)2フラグメントのジスルフィド架橋を還元することによって生成され得る。本明細書に記載の抗トランスフェリン受容体抗体のFABアミノ酸配列の例は、下に提供される:
重鎖FAB(VH+一部のヒトIgG1定常領域)
QVQLQQPGAELVKPGASVKLSCKASGYTFTSYWMHWVKQRPGQGLEWIGEINPTNGRTNYIEKFKSKATLTVDKSSSTAYMQLSSLTSEDSAVYYCARGTRAYHYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCP(配列番号240)
重鎖FAB(ヒト化VH+一部のヒトIgG1定常領域)
EVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYWMHWVRQAPGQRLEWIGEINPTNGRTNYIEKFKSRATLTVDKSASTAYMELSSLRSEDTAVYYCARGTRAYHYWGQGTMVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCP(配列番号241)
いくつかの態様において、本明細書に記載のトランスフェリン受容体抗体は、配列番号240のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載のトランスフェリン受容体抗体は、配列番号237のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
いくつかの態様において、本明細書に記載のトランスフェリン受容体抗体は、配列番号241のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。代替的にまたは加えて(例として、加えて)、本明細書に記載のトランスフェリン受容体抗体は、配列番号239のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
本明細書に記載の抗トランスフェリン受容体抗体は、これらに限定されないが、無傷の(すなわち、完全長)抗体、それらの抗原結合性フラグメント(Fab、Fab’、F(ab’)2、Fvなどの)、単一鎖抗体、二重特異性抗体、またはナノボディーを包含する、いずれの抗体の形態でもあり得る。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗トランスフェリン受容体抗体は、scFvである。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗トランスフェリン受容体抗体は、scFv-Fab(例として、一部の定常領域と縮合されたscFv)である。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗トランスフェリン受容体抗体は、定常領域(例として、配列番号175で表されるとおりのヒトIgG1定常領域)と縮合されたscFvである。
b.他の筋標的抗体
いくつかの態様において、筋標的化抗体は、ヘモジュベリン(hemojuvelin)、カベオリン-3、デュシェンヌ型筋ジストロフィーペプチド、またはミオシンIib、またはCD63に特異的に結合する抗体である。いくつかの態様において、筋標的化抗体は、筋原性前駆体タンパク質に特異的に結合する抗体である。例示の筋原性前駆体タンパク質は、限定せずに、ABCG2、M-カドヘリン/カドヘリン-15、カベオリン-1、CD34、FoxK1、インテグリンアルファ7、インテグリンアルファ7ベータ1、MYF-5、MyoD、ミオゲニン、NCAM-1/CD56、Pax3、Pax7、およびPax9を包含する。いくつかの態様において、筋標的化抗体は、骨格筋タンパク質に特異的に結合する抗体である。例示の骨格筋タンパク質は、限定せずに、アルファ-サルコグリカン、ベータ-サルコグリカン、カルパインインヒビター、クレアチンキナーゼMM/CKMM、eIF5A、エノラーゼ2/ニューロン特異的エノラーゼ、イプシロン-サルコグリカン、FABP3/H-FABP、GDF-8/ミオスタチン、GDF-11/GDF-8、インテグリンアルファ7、インテグリンアルファ7ベータ1、インテグリンベータ1/CD29、MCAM/CD146、MyoD、ミオゲニン、ミオシン軽鎖キナーゼインヒビター、NCAM-1/CD56、およびトロポニンIを包含する。いくつかの態様において、筋標的化抗体は、平滑筋タンパク質に特異的に結合する抗体である。例示の平滑筋タンパク質は、限定せずに、アルファ-平滑筋アクチン、VE-カドヘリン、カルデスモン/CALD1、カルポニン1、デスミン、ヒスタミンH2 R、モチリンR/GPR38、トランスジェリン(Transgelin)/TAGLN、およびビメンチンを包含する。しかしながら、追加の標的への抗体が本開示の範囲内であること、および本明細書に提供される標的の例示のリストが限定することを意図していないことは解されるはずである。
c.抗体特色/変更
いくつかの態様において、保存的突然変異は、例えば結晶構造に基づき決定されるとき、その残基が標的抗原(例として、トランスフェリン受容体)との相互作用に関与しそうにない位置にて、抗体配列(例として、CDRまたはフレームワーク配列)中へ導入され得る。いくつかの態様において、1、2個以上の突然変異(例として、アミノ酸置換)は、血清半減期、補体結合、Fc受容体結合、および/または細胞への抗原依存的細胞傷害性などの、抗体の1以上の機能特性を変更させるために、本明細書に記載の筋標的化抗体のFc領域中(例として、Kabatナンバリング系(例として、KabatのEUインデックス)に従うナンバリングで、CH2ドメイン(ヒトIgG1の残基231~340)中、および/またはCH3ドメイン(ヒトIgG1の残基341~447)中、および/またはヒンジ領域中)へ導入される。
いくつかの態様において、1、2個以上の突然変異(例として、アミノ酸置換)は、ヒンジ領域中のシステイン残基の数が、例として米国特許第5,677,425号に記載のとおり変動(例として、増大または減少)され得るように、Fc領域(CH1ドメイン)のヒンジ領域中へ導入される。CH1ドメインのヒンジ領域中のシステイン残基の数は、例として、軽鎖および重鎖の会合(assembly)を容易にさせるため、または抗体の安定性を変更(例として、増大もしくは減少)するため、またはリンカー抱合を容易にさせるため、変更され得る。
いくつかの態様において、1、2個以上の突然変異(例として、アミノ酸置換)は、抗体の、エフェクター細胞表面上のFc受容体(例として、活性化されたFc受容体)への親和性を増加または減少させるため、本明細書に記載の筋標的化抗体のFc領域中(例として、Kabatナンバリング系(例として、KabatのEUインデックス)に従うナンバリングで、CH2ドメイン(ヒトIgG1の残基231~340)中、および/またはCH3ドメイン(ヒトIgG1の残基341~447)中、および/またはヒンジ領域中)へ導入される。抗体のFc受容体への親和性を増大または減少させる抗体のFc領域中の突然変異、およびかかる突然変異をFc受容体中またはそのフラグメント中へ導入するための技法は、当業者に知られている。抗体のFc受容体への親和性を変更するためになされ得る、抗体のFc受容体中の突然変異の例は、例として、Smith P et al.,(2012)PNAS 109:6181-6186、米国特許第6,737,056号、ならびに国際刊行物第WO 02/060919号;第WO 98/23289号;および第WO 97/34631号(これらは参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。
いくつかの態様において、1、2個以上のアミノ酸突然変異(すなわち、置換、挿入、または欠失)は、in vivoでの抗体の半減期を変更(例として、増加または減少)させるため、IgG定常領域またはそのFcRn-結合フラグメント(好ましくは、Fcまたはヒンジ-Fcドメインフラグメント)中へ導入される。例えば、in vivoでの抗体の半減期を変更(例として、増加または減少)させるであろう突然変異について、例として、国際刊行物第WO 02/060919号;第WO 98/23289号;および第WO 97/34631号;ならびに米国特許第5,869,046号、第6,121,022号、第6,277,375号、および第6,165,745号を見よ。
いくつかの態様において、1、2個以上のアミノ酸突然変異(すなわち、置換、挿入、または欠失)は、in vivoでの抗トランスフェリン受容体抗体の半減期を減少させるため、IgG定常領域またはそのFcRn-結合フラグメント(好ましくは、Fcまたはヒンジ-Fcドメインフラグメント)中へ導入される。いくつかの態様において、1、2個以上のアミノ酸突然変異(すなわち、置換、挿入、または欠失)は、in vivoでの抗体の半減期を増加させるため、IgG定常領域またはそのFcRn-結合フラグメント(好ましくは、Fcまたはヒンジ-Fcドメインフラグメント)中へ導入される。いくつかの態様において、抗体は、KabatのEUインデックス(上記のKabat E Aら(1991))に従うナンバリングで第2定常(CH2)ドメイン(ヒトIgG1の残基231~340)中および/または第3定常(CH3)ドメイン(ヒトIgG1の残基341~447)中に、1個以上のアミノ酸突然変異(例として、置換)を有し得る。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗体のIgG1定常領域は、KabatにあるようなEUインデックスに従ってナンバリングされた位置252におけるメチオニン(M)からチロシン(Y)への置換、位置254におけるセリン(S)からトレオニン(T)への置換、および位置256におけるトレオニン(T)からグルタミン酸(E)への置換を含む。米国特許第7,658,921(これは、参照により本明細書に組み込まれる)を見よ。「YTE突然変異体」と称されるこのタイプの突然変異体IgGは、同じ抗体の野生型バージョンと比較して4倍増大した半減期を発揮したことが示されている(Dall’Acqua W F et al.,(2006)J Biol Chem 281:23514-24を見よ)。いくつかの態様において、抗体は、KabatにあるようなEUインデックスに従ってナンバリングされた位置251~257、285~290、308~314、385~389、および428~436でのアミノ酸残基の、1、2、3以上のアミノ酸置換を含むIgG定常領域を含む。
いくつかの態様において、1、2以上のアミノ酸置換は、抗トランスフェリン受容体抗体のエフェクター機能(単数または複数)を変更するため、IgG定常領域Fc領域中へ導入される。自身への親和性が変更されたエフェクターリガンドは、例えば、Fc受容体または補体のC1構成要素であり得る。このアプローチは、米国特許第5,624,821号および第5,648,260号においてさらに詳細に記載される。いくつかの態様において、定常領域ドメインの欠失または不活化(点突然変異または他の手段を通して)は、循環抗体のFc受容体への結合を低減し、それによって腫瘍局在化を増大し得る。定常領域を欠失または不活化し、それによって腫瘍局在化を増大させる突然変異の記載については、例として、米国特許第5,585,097号および第8,591,886号を見よ。いくつかの態様において、1以上のアミノ酸置換は、Fc領域上の潜在的なグリコシル化部位を除去するため(これによってFc受容体への結合が低減されることもある)、本明細書に記載の抗体のFc領域中へ導入されてもよい(例として、Shields R L et al.,(2001)J Biol Chem 276:6591-604を見よ)。
いくつかの態様において、本明細書に記載の筋標的化抗体の定常領域中の1以上のアミノ酸残基は、抗体が変更されたClq結合および/または低減もしくは消失された補体依存性細胞傷害性(CDC)を有し得るように、異なるアミノ酸残基に置き換えられ得る。このアプローチは、米国特許第6,194,551号(Idusogieら)においてさらに詳細に記載されている。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗体のCH2ドメインのN末領域中の1以上のアミノ酸残基は変更されて、それによって抗体の補体結合能を変更する。このアプローチは、国際刊行物第WO 94/29351号においてさらに記載されている。いくつかの態様において、本明細書に記載の抗体のFc領域は、抗体の、細胞への抗体依存性細胞傷害性(ADCC)の媒介能を増大させるため、および/または、抗体のFcγ受容体への親和性を増大させるため、修飾されている。このアプローチは、国際刊行物第WO 00/42072号においてさらに記載されている。
いくつかの態様において、本明細書に提供される抗体の重鎖および/または軽鎖可変ドメイン(単数または複数)配列(単数または複数)は、本明細書の他の箇所に記載されるとおり、例えば、CDR接合抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、もしくは複合ヒト抗体、または抗原結合性フラグメントを生成するために使用され得る。当業者によって理解されるとおり、本明細書に提供される抗体のいずれかに由来するいずれのバリアント、CDR接合抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、または複合抗体は、本明細書に記載の組成物および方法に有用であってもよく、バリアント、CDR接合抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、または複合抗体が、これが由来する元の抗体と比べて、トランスフェリン受容体への少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%以上の結合を有し得るように、トランスフェリン受容体への特異的結合能を維持するであろう。
いくつかの態様において、本明細書に提供される抗体は、所望の特性を抗体へ付与する突然変異を含む。例えば、ネイティブなIgG4 mAbに生じることが知られているFabアーム交換(Fab-arm exchange)に起因する潜在的合併症を回避するため、本明細書に提供される抗体は、安定化「Adair」突然変異を含んでいてもよく(Angal S.,et al.,"A single amino acid substitution abolishes the heterogeneity of chimeric mouse/human (IgG4) antibody",Mol Immunol 30,105-108;1993)、ここでセリン228(EUナンバリング;残基241 Kabatナンバリング)は、IgG1様ヒンジ配列をもたらすプロリンへ変換されている。結果的に、抗体のいずれも、安定化「Adair」突然変異を包含していてもよい。
本明細書に提供されるとおり、本開示の抗体は、任意に、定常領域またはその一部を含んでいてもよい。例えば、VLドメインは、そのC末端にて、軽鎖定常領域様CκまたはCλへ付着されていてもよい。同様に、VHドメインまたはその一部は、すべてのまたは一部の重鎖様IgA、IgD、IgE、IgG、およびIgM、およびいずれのアイソタイプのサブクラスへ付着されていてもよい。抗体は、好適な定常領域を包含していてもよい(例えば、Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,No.91-3242,National Institutes of Health Publications,Bethesda,Md.(1991)を見よ)。したがって、本開示の範囲内の抗体は、いずれの好適な定常領域と組み合わされて、VHおよびVLドメイン、またはその抗原結合部を包含していてもよい。
いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、ヒト化抗体であり、表1または表3に挙げられるマウス抗体(例として、3A4、3M12、または5H12)のCDRを有するヒトフレームワーク領域を含む。いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、IgG1カッパであり、これが、表1または表3に挙げられるマウス抗体(例として、3A4、3M12、または5H12)のCDRを有するヒトフレームワーク領域を含む。いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、IgG1カッパのFab’フラグメントであり、これが、表1または表3に挙げられるマウス抗体(例として、3A4、3M12、または5H12)のCDRを有するヒトフレームワーク領域を含む。いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、表6に提供される抗体のCDRを含む。いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、表6に提供される抗体の可変領域を含むIgG1カッパである。いくつかの態様において、本開示の抗TfR抗体は、IgG1カッパのFab’フラグメントであり、これが、表6に提供される抗体の可変領域を含む。
いくつかの態様において、本明細書に記載の抗TfR抗体のいずれか1つは、組み換えDNAテクノロジーによって、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞浮遊培養から、任意にCHO-K1細胞(例として、European Collection of Animal Cell Cultureに由来するCHO-K1細胞Cat.No.85051005)浮遊培養から生ずる。
いくつかの態様において、本明細書に提供される抗体は、1以上の翻訳後修飾を有し得る。いくつかの態様においては、ピログルタミン酸形成(ピロGlu)ともまた呼ばれるN末端環化が、産生の間にN末端グルタミン酸(Glu)および/またはグルタミン(Gln)残基において抗体に生起し得る。いくつかの態様において、ピログルタミン酸形成は、重鎖配列に生起する。いくつかの態様において、ピログルタミン酸形成は軽鎖配列に生起する。
ii.筋標的化ペプチド
本開示のいくつかの側面は、筋標的化ペプチドを筋標的化剤として提供する。特定の細胞型へ結合する短いペプチド配列(例として、長さが5~20アミノ酸のペプチド配列)は記載されている。例えば、細胞標的化ペプチドは、Vines e.,et al.,A."Cell-penetrating and cell-targeting peptides in drug delivery"Biochim Biophys Acta 2008,1786:126-38;Jarver P.,et al.,"In vivo biodistribution and efficacy of peptide mediated delivery"Trends Pharmacol Sci 2010;31:528-35;Samoylova T.I.,et al.,"Elucidation of muscle-binding peptides by phage display screening"Muscle Nerve 1999;22:460-6;米国特許第6,329,501号、2001年12月11日発行、表題"METHODS AND COMPOSITIONS FOR TARGETING COMPOUNDS TO MUSCLE";およびSamoylov A.M.,et al.,"Recognition of cell-specific binding of phage display derived peptides using an acoustic wave sensor."Biomol Eng 2002;18:269-72に記載されている;これら各々の内容全体は参照により本明細書に組み込まれる。特定の細胞表面抗原(例として、受容体)と相互作用するようにペプチドを設計することによって、所望される組織、例として、筋肉への選択性が獲得され得る。骨格筋標的化が調査されており、広範な分子ペイロードが送達されることができる。巨大な抗体またはウイルス粒子についての実際上の不利な点の多くが存在しないこれらのアプローチは、筋組織への高選択性を有していてもよい。結果的に、いくつかの態様において、筋標的化剤は、長さが4アミノ酸から50アミノ酸までの筋標的化ペプチドである。いくつかの態様において、筋標的化ペプチドは、長さが4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、または50アミノ酸である。筋標的化ペプチドは、ファージディスプレーなどの数種の方法のいずれかを使用して生成され得る。
いくつかの態様において、筋標的化ペプチドは、他のある細胞と比較して、筋細胞において過剰発現されているかまたは相対的に高度に発現されている、内在化する細胞表面受容体(例として、トランスフェリン受容体)へ結合してもよい。いくつかの態様において、筋標的化ペプチドは、トランスフェリン受容体を標的にしてもよい(例として、トランスフェリン受容体へ結合してもよい)。いくつかの態様において、トランスフェリン受容体を標的にするペプチドは、天然に存在するリガンド、例として、トランスフェリンのセグメントを含んでいてもよい。いくつかの態様において、トランスフェリン受容体を標的にするペプチドは、米国特許第6,743,893号、11/30/2000出願、「RECEPTOR-MEDIATED UPTAKE OF PEPTIDES THAT BIND THE HUMAN TRANSFERRIN RECEPTOR」に記載のとおりである。いくつかの態様において、トランスフェリン受容体を標的にするペプチドは、Kawamoto, M. et al,"A novel transferrin receptor-targeted hybrid peptide disintegrates cancer cell membrane to induce rapid killing of cancer cells."BMC Cancer.2011 Aug 18;11:359に記載のとおりである。いくつかの態様において、トランスフェリン受容体を標的にするペプチドは、米国特許第8,399,653号、5/20/2011出願、「TRANSFERRIN/TRANSFERRIN RECEPTOR-MEDIATED SIRNA DELIVERY」に記載のとおりである。
上述のとおり、筋標的化ペプチドの例は報告されている。例えば、筋肉特異的ペプチドは、表面へプタペプチドを提示するファージディスプレーライブラリを使用して同定された。一例として、アミノ酸配列ASSLNIA(配列番号291)を有するペプチドは、in vitroでC2C12マウス筋管へ結合し、かつin vivoでマウス筋組織へ結合した。結果的に、いくつかの態様において、筋標的化剤は、アミノ酸配列ASSLNIA(配列番号291)を含む。このペプチドは、肝臓、腎臓、および脳への結合が低減された、マウスへの静脈内注射後の心筋組織および骨格筋組織への結合について改善された特異性を発揮した。追加の筋肉特異的ペプチドがファージディスプレーを使用して同定されている。例えば、DMDへの処置という文脈において、12アミノ酸ペプチドが、筋標的化のためのファージディスプレーライブラリによって同定された。Yoshida D.,et al.,"Targeting of salicylate to skin and muscle following topical injections in rats."Int J Pharm 2002;231:177-84を見よ;この内容全体はこれによって参照により組み込まれる。ここで、配列SKTFNTHPQSTP(配列番号292)を有する12アミノ酸ペプチドが同定され、この筋標的化ペプチドは、ASSLNIA(配列番号291)ペプチドと比べてC2C12細胞への改善された結合を示した。
他の細胞型より筋肉(例として、骨格筋)に対して選択的なペプチドを同定するためのいずれの追加の方法はin vitroでの選択を包含し、これはGhosh D.,et al.,"Selection of muscle-binding peptides from context-specific peptide-presenting phage libraries for adenoviral vector targeting"J Virol 2005;79:13667-72に記載されている;この内容全体は参照により本明細書に組み込まれる。ランダム12-merペプチドファージディスプレーライブラリを非筋細胞型の混合物とプレインキュベートすることによって、非特異的細胞バインダーが選出された。選択ラウンド(rounds of selection)を受けて、12アミノ酸ペプチドTARGEHKEEELI(配列番号293)が最も頻繁に現れた。結果的に、いくつかの態様において、筋標的化剤は、アミノ酸配列TARGEHKEEELI(配列番号293)を含む。
筋標的化剤は、アミノ酸含有分子またはペプチドであってもよい。筋標的化ペプチドは、筋細胞から見出されたタンパク質受容体へ優先的に結合するタンパク質の配列に対応していてもよい。いくつかの態様において、筋標的化ペプチドは、ペプチドが筋細胞(例として、心筋細胞)を優先的に標的にし得るように、疎水性アミノ酸(例として、バリン)の性質(propensity)を高く含有する。いくつかの態様において、筋標的化ペプチドは、これまでに特徴付けも開示もされていない。これらのペプチドは、数種の方法論のいずれか、例として、ファージディスプレードペプチドライブラリ、1ビーズ・1化合物(one-bead one-compound)ペプチドライブラリ、または位置走査性(positional scanning)合成ペプチドコンビナトリアルライブラリを使用して、想起、産生、合成、および/または、誘導体化されてもよい。例示の方法論は当該技術分野において特徴付けされており、参照により組み込まれる(Gray,B.P.and Brown,K.C."Combinatorial Peptide Libraries:Mining for Cell-Binding Peptides"Chem Rev.2014,114:2,1020-1081.;Samoylova,T.I.and Smith,B.F."Elucidation of muscle-binding peptides by phage display screening."Muscle Nerve,1999,22:4.460-6)。いくつかの態様において、筋標的化ペプチドはこれまでに開示されている(例として、Writer M.J.et al."Targeted gene delivery to human airway epithelial cells with synthetic vectors incorporating novel targeting peptides selected by phage display."J.Drug Targeting.2004;12:185;Cai,D."BDNF-mediated enhancement of inflammation and injury in the aging heart."Physiol Genomics.2006,24:3,191-7.;Zhang,L."Molecular profiling of heart endothelial cells."Circulation,2005,112:11,1601-11.;McGuire,M.J.et al."In vitro selection of a peptide with high selectivity for cardiomyocytes in vivo."J Mol Biol.2004,342:1,171-82を見よ)。例示の筋標的化ペプチドは、以下の群のアミノ酸配列を含む:CQAQGQLVC(配列番号294)、CSERSMNFC(配列番号295)、CPKTRRVPC(配列番号296)、WLSEAGPVVTVRALRGTGSW(配列番号297)、ASSLNIA(配列番号291)、CMQHSMRVC(配列番号298)、およびDDTRHWG(配列番号299)。いくつかの態様において、筋標的化ペプチドは、約2~25アミノ酸、約2~20アミノ酸、約2~15アミノ酸、約2~10アミノ酸、または約2~5アミノ酸を含んでいてもよい。筋標的化ペプチドは、天然に存在するアミノ酸、例として、システイン、アラニン、または天然に存在しないアミノ酸、もしくは修飾アミノ酸を含んでいてもよい。天然に存在しないアミノ酸は、β-アミノ酸、ホモ-アミノ酸、プロリン誘導体、3-置換アラニン誘導体、線形コアアミノ酸(linear core amino acids)、N-メチルアミノ酸、および当該技術分野において知られているその他のアミノ酸を包含する。いくつかの態様において、筋標的化ペプチドは線状であってもよい;他の態様において、筋標的化ペプチドは環状(例として、二環式)であってもよい(例として、Silvana,M.G.et al.Mol.Therapy,2018,26:1,132-147を見よ)。
iii.筋標的化受容体リガンド
筋標的化剤は、リガンド、例として、受容体タンパク質へ結合するリガンドであってもよい。筋標的化リガンドは、筋細胞(例として、心筋細胞)によって発現される内在化する細胞表面受容体へ結合するタンパク質、例として、トランスフェリンであってもよい。結果的に、いくつかの態様において、筋標的化剤は、トランスフェリン、またはトランスフェリン受容体へ結合するその誘導体である。筋標的化リガンドは、代替的に、小分子、例として、他の細胞型と比べて優先的に筋細胞を標的にする親油性小分子であってもよい。筋細胞を標的にしてもよい例示の親油性小分子は、コレステロール、コレステリル、ステアリン酸、パルミチン酸、オレイン酸、オレイル、リノレン酸、リノール酸、ミリスチン酸、ステロール、ジヒドロテストステロン、テストステロン誘導体、グリセリン、アルキル鎖、トリチル基、およびアルコキシ酸を含む化合物を包含する。
iv.筋標的化アプタマー
筋標的化剤は、他の細胞型と比べて優先的に筋細胞を標的にするアプタマー、例としてRNAアプタマーであってもよい。いくつかの態様において、筋標的化アプタマーはこれまでに特徴付けも開示もされていない。これらのアプタマーは、数種の方法論のいずれか、例として、指数関数的濃縮によるリガンドの体系的進化(Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment)を使用して、想起、産生、合成、および/または、誘導体化されてもよい。例示の方法論は当該技術分野において特徴付けされており、参照により組み込まれる(Yan,A.C. and Levy,M."Aptamers and aptamer targeted delivery" RNA biology,2009,6:3,316-20.;Germer,K.et al."RNA aptamers and their therapeutic and diagnostic applications."Int.J.Biochem.Mol.Biol.2013;4:27-40)。いくつかの態様において、筋標的化アプタマーはこれまでに開示されている(例として、Phillippou,S.et al."Selection and Identification of Skeletal-Muscle-Targeted RNA Aptamers."Mol Ther Nucleic Acids.2018,10:199-214.;Thiel,W.H.et al."Smooth Muscle Cell-targeted RNA Aptamer Inhibits Neointimal Formation."Mol Ther.2016,24:4,779-87を見よ)。例示の筋標的化アプタマーは、A01B RNAアプタマーおよびRNA Apt 14を包含する。いくつかの態様において、アプタマーは、核酸をベースとしたアプタマー、オリゴヌクレオチドアプタマー、またはペプチドアプタマーである。いくつかの態様において、アプタマーは、約5~15kDa、約5~10kDa、約10~15kDa、約1~5Da、約1~3kDa、またはこれより小さいものであってもよい。
v.他の筋標的化剤
筋細胞(例として、心筋細胞)を標的にするための1つのストラテジーは、筋線維鞘上に発現されたトランスポータータンパク質などの筋肉トランスポータータンパク質の基質を使用することである。いくつかの態様において、筋標的化剤は、筋組織に特異的な流入トランスポーターの基質である。いくつかの態様において、流入トランスポーターは、骨格筋組織に特異的である。骨格筋の筋線維鞘上に発現されるトランスポーターの二大クラスは、(1)骨格筋組織からの流出に容易にさせる、アデノシン三リン酸(ATP)結合カセット(ABC)スーパーファミリー、および(2)基質の骨格筋中への流入を容易にし得る、溶質輸送体(solute carrier)(SLC)スーパーファミリーである。いくつかの態様において、筋標的化剤は、トランスポーターのABCスーパーファミリーまたはSLCスーパーファミリーへ結合する基質である。いくつかの態様において、トランスポーターのABCまたはSLCスーパーファミリーへ結合する基質は、天然に存在する基質である。いくつかの態様において、トランスポーターのABCまたはSLCスーパーファミリーへ結合する基質は、天然に存在しない基質、例えば、トランスポーターのABCまたはSLCスーパーファミリーへ結合するその合成誘導体である。
いくつかの態様において、筋標的化剤は、トランスポーターのSLCスーパーファミリーの基質である。SLCトランスポーターは、平衡型であるか、または基質の輸送を推進させる膜にわたって創出されたプロトンもしくはナトリウムのイオン勾配を使用するかのいずれかである。骨格筋への高発現を有する例示のSLCトランスポーターは、限定せずに、SATTトランスポーター(ASCT1;SLC1A4)、GLUT4トランスポーター(SLC2A4)、GLUT7トランスポーター(GLUT7;SLC2A7)、ATRC2トランスポーター(CAT-2;SLC7A2)、LAT3トランスポーター(KIAA0245;SLC7A6)、PHT1トランスポーター(PTR4;SLC15A4)、OATP-Jトランスポーター(OATP5A1;SLC21A15)、OCT3トランスポーター(EMT;SLC22A3)、OCTN2トランスポーター(FLJ46769;SLC22A5)、ENTトランスポーター(ENT1;SLC29A1およびENT2;SLC29A2)、PAT2トランスポーター(SLC36A2)、およびSAT2トランスポーター(KIAA1382;SLC38A2)を包含する。これらのトランスポーターは、基質の骨格筋中への流入を容易にさせることで、筋標的化のための好機を提供し得る。
いくつかの態様において、筋標的化剤は、平衡型ヌクレオシドトランスポーター2(ENT2)トランスポーターの基質である。他のトランスポーターと比べて、ENT2は、骨格筋において最高発現するmRNAの1つを有する。ヒトENT2(hENT2)は、脳、心臓、胎盤、胸腺、膵臓、前立腺、および腎臓などのほとんどの体器官に発現されるものの、とくに骨格筋に豊富である。ヒトENT2は、その基質の取り込みを、それらの濃度勾配に応じて容易にさせる。ENT2は、広範なプリンおよびピリミジン核酸塩基を輸送することによってヌクレオシドホメオスタシスを維持する役割を果たす。hENT2トランスポーターは、イノシンを除くすべてのヌクレオシド(アデノシン、グアノシン、ウリジン、チミジン、およびシチジン)に対して低親和性を有する。結果的に、いくつかの態様において、筋標的化剤は、ENT2基質である。例示のENT2基質は、限定せずに、イノシン、2’,3’-ジデオキシイノシン、およびクロファラビンを包含する。いくつかの態様において、本明細書に提供される筋標的化剤のいずれも、分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチドペイロード)に関連する。いくつかの態様において、筋標的化剤は、分子ペイロードへ共有結合的に連結されている。いくつかの態様において、筋標的化剤は、分子ペイロードへ非共有結合的に連結されている。
いくつかの態様において、筋標的化剤は、ナトリウムイオン依存性の高親和性カルニチントランスポーターである有機カチオン/カルニチントランスポーター(OCTN2)の基質である。いくつかの態様において、筋標的化剤は、カルニチン、ミルドロネート、アセチルカルニチン、またはOCTN2へ結合するそのいずれかの誘導体である。いくつかの態様において、カルニチン、ミルドロネート、アセチルカルニチン、またはそれらの誘導体は、分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチドペイロード)へ共有結合的に連結されている。
筋標的化剤は、筋細胞を標的にする少なくとも1つの可溶性形態で存在するタンパク質であるタンパク質であってもよい。いくつかの態様において、筋標的化タンパク質は、鉄過剰およびホメオスタシスに関与するタンパク質ヘモジュベリン(またrepulsive guidance molecule Cまたはヘモクロマトーシスタイプ2タンパク質としても知られている)であってもよい。いくつかの態様において、ヘモジュベリンは、完全長もしくはフラグメントであっても、または機能的ヘモジュベリンタンパク質と少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%配列同一性をもつ突然変異体であってもよい。いくつかの態様において、ヘモジュベリン突然変異体は、可溶性フラグメントであってもよく、N末シグナリングを欠いていてもよく、および/または、C末アンカードメイン(anchoring domain)を欠いていてもよい。いくつかの態様において、ヘモジュベリンは、GenBank RefSeq受託番号NM_001316767.1、NM_145277.4、NM_202004.3、NM_213652.3、またはNM_213653.3の注釈付きのものであってもよい。ヘモジュベリンがヒト、霊長目の非ヒト動物、または齧歯類の動物を起源とするものであってもよいことは解されるはずである。
B.分子ペイロード
本開示のいくつかの側面は、分子ペイロード、例として、生物学的結果(例として、DNA配列の転写、タンパク質の発現、またはタンパク質の活性)をモジュレートするための分子ペイロードを提供する。いくつかの態様において、分子ペイロードは、筋標的化剤へ連結されているか、または別様に結び付けられている。いくつかの態様において、かかる分子ペイロードは、例として、結び付けられた筋標的化剤による筋細胞への送達を受けた筋細胞中の核酸またはタンパク質への特異的結合を介して、筋細胞を標的にすることが可能である。様々なタイプの筋標的化剤が本開示に従って使用されてもよいことは解されるはずである。例えば、分子ペイロードは、オリゴヌクレオチド(例として、アンチセンスオリゴヌクレオチド)、ペプチド(例として、疾患に関連する筋細胞中の核酸もしくはタンパク質に結合するペプチド)、タンパク質(例として、疾患に関連する筋細胞中の核酸もしくはタンパク質に結合するタンパク質)、または小分子(例として、疾患に関連する筋細胞中の核酸もしくはタンパク質の機能をモジュレートする小分子)を含んでいてもよく、またはこれらからなっていてもよい。いくつかの態様において、分子ペイロードは、MSTNと相補性のある領域を有する鎖を含むオリゴヌクレオチドである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、INHBA遺伝子(例として、INHBA DNAまたはINHBA RNA)と相補性のある領域を有する鎖を含むオリゴヌクレオチドである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、ACVR1Bと相補性のある領域を有する鎖を含むオリゴヌクレオチドである。いくつかの態様において、2以上の分子ペイロード(例として、2以上の遺伝子を標的にする)は、筋標的化剤へ連結され得る。非限定例として、複合体は、ACVR1BおよびMSTNを標的にする;ACVR1BおよびINHBAを標的にする;MSTNおよびINHBAを標的にする;またはACVR1B、MSTNおよびINHBAを標的にする分子ペイロードを含み得る。例示の分子ペイロードは本明細書にさらに詳細に記載されているが、しかしながら、本明細書に提供される例示の分子ペイロードが限定されることを意図していないことは解されるはずである。
i.オリゴヌクレオチド
いずれの好適なオリゴヌクレオチドも、分子ペイロードとして、本明細書に記載のとおり使用されてよい。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、mRNAの分解を引き起こすよう設計されていてもよい(例として、オリゴヌクレオチドは、分解を引き起こすgapmer、siRNA、リボザイム、またはアプタマーであってもよい)。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、mRNAの翻訳を遮断するよう設計されていてもよい(例として、オリゴヌクレオチドは、翻訳を遮断するmixmer、siRNA、またはアプタマーであってもよい)。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、mRNAの分解を引き起こしてその翻訳を遮断するよう設計されていてもよい。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、酵素(例として、遺伝子編集酵素)の活性に向かわせるためのガイド核酸(例として、ガイドRNA)であってもよい。オリゴヌクレオチドの他の例は本明細書に提供されている。いくつかの態様において、一方のフォーマット(format)からの機能的配列(例として、アンチセンス鎖配列)を他方のフォーマットへ組み込むことによって、あるフォーマットのオリゴヌクレオチド(例として、アンチセンスオリゴヌクレオチド)が、別のフォーマット(例として、siRNAオリゴヌクレオチド)へ好適に適応されてもよいことは解されるはずである。本明細書に提供されるオリゴヌクレオチドは、筋肉の成長および維持などの筋肉の健康に関与する標的遺伝子(MSTN、INHBAおよびACVR1Bを含む)の発現または活性をモジュレートするように設計され得る。
1.MSTNオリゴヌクレオチド
MSTNを標的にするために有用なオリゴヌクレオチドの例は、Lu-Nguyen, N. et. al. "Functional muscle recovery following dystrophin and myostatin exon splice modulation in aged mdx mice" Human Molecular Genetics, Vol. 28, 18, 3091-3100 (2019);Liu, C.M. et. al. "Myostatin antisense RNA-mediated muscle growth in normal and cancer cachexia mice" Gene Therapy, Vol. 15, 155-160 (2008);Kang, J.K., "Antisense-induced myostatin exon skipping leads to muscle hypertrophy in mice following octa-guanidine morpholino oligomer treatment" Mol Ther. 2011 Jan;19(1):159-64.;Kemaladewi, D.U. et. al. "Dual exon skipping in myostatin and dystrophin for Duchenne muscular dystrophy" BMC Med Genomics. 2011 Apr 20;4:36.;Tripathi, A.K. et. al. "Short hairpin RNA-induced myostatin gene silencing in caprine myoblast cells in vitro" Appl Biochem Biotechnol. 2013 Jan;169(2):688-94.;Lu-Nguyen, N. et. al., "Systemic Antisense Therapeutics for Dystrophin and Myostatin Exon Splice Modulation Improve Muscle Pathology of Adult mdx Mice" Mol. Ther. Nucleic Acids. 2017 Mar 17;6:15-28.;「RNA interference mediated inhibition of myostatin gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)と表題を付けられた2005年6月5日に公開された米国特許出願公開20050124566A1;「Systemic delivery of myostatin short interfering nucleic acids (siNA) conjugated to a lipophilic moiety」と表題を付けられた2018年6月26日に発行された米国特許第10,004,814号;「Antisense composition and method for treating muscle atrophy」と表題を付けられた2011年7月7日に公開された米国特許出願公開20110166082A1;「Treatment of Duchenne muscular dystrophy with myoblasts expressing dystrophin and treated to block myostatin signaling」と表題を付けられた2011年2月15日に発行された米国特許第7,887,793号;および2018年12月13日に公開された「Antisense-induced exon exclusion in myostatin」と表題を付けられた米国特許出願公開20180355358A1において提供され、それらの各々の内容は、それらの全体が本明細書に組み込まれる。
いくつかの態様において、MSTNを標的にするために有用であるオリゴヌクレオチドは、MSTN RNA配列のエキソンスキッピングを促進するオリゴヌクレオチドである。いくつかの態様において、MSTNを標的にするためのオリゴヌクレオチドは、エキソン2のエキソンスキッピングを促進する。エキソン2のスキッピングは、エキソン1および3の不適切な位相外れ(out-of-phase)のスプライシングへつながり得る。いくつかの態様において、MSTNを標的にするためのオリゴヌクレオチドは、例として、イントロン1/エキソン2またはエキソン2/イントロン2においてRNAスプライスジャンクションを標的にする。
MSTN遺伝子編集を促進するためのオリゴヌクレオチドの例は、Crispo, M. et. al. "Efficient Generation of Myostatin Knock-Out Sheep Using CRISPR/Cas9 Technology and Microinjection into Zygotes" PLoS One. 2015 Aug 25;10(8):e0136690;およびZhang, J. et. al. "Comparison of gene editing efficiencies of CRISPR/Cas9 and TALEN for generation of MSTN knock-out cashmere goats" Theriogenology. 2019 Jul 1;132:1-11を包含する。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、例えば、以下に提供されるように、ヒトMSTN遺伝子配列と相補性のある領域を有し得る(遺伝子ID:2660;NCBI参照番号:NM_005259.3):
AGATTCACTGGTGTGGCAAGTTGTCTCTCAGACTGTACATGCATTAAAATTTTGCTTGGCATTACTCAAAAGCAAAAGAAAAGTAAAAGGAAGAAACAAGAACAAGAAAAAAGATTATATTGATTTTAAAATCATGCAAAAACTGCAACTCTGTGTTTATATTTACCTGTTTATGCTGATTGTTGCTGGTCCAGTGGATCTAAATGAGAACAGTGAGCAAAAAGAAAATGTGGAAAAAGAGGGGCTGTGTAATGCATGTACTTGGAGACAAAACACTAAATCTTCAAGAATAGAAGCCATTAAGATACAAATCCTCAGTAAACTTCGTCTGGAAACAGCTCCTAACATCAGCAAAGATGTTATAAGACAACTTTTACCCAAAGCTCCTCCACTCCGGGAACTGATTGATCAGTATGATGTCCAGAGGGATGACAGCAGCGATGGCTCTTTGGAAGATGACGATTATCACGCTACAACGGAAACAATCATTACCATGCCTACAGAGTCTGATTTTCTAATGCAAGTGGATGGAAAACCCAAATGTTGCTTCTTTAAATTTAGCTCTAAAATACAATACAATAAAGTAGTAAAGGCCCAACTATGGATATATTTGAGACCCGTCGAGACTCCTACAACAGTGTTTGTGCAAATCCTGAGACTCATCAAACCTATGAAAGACGGTACAAGGTATACTGGAATCCGATCTCTGAAACTTGACATGAACCCAGGCACTGGTATTTGGCAGAGCATTGATGTGAAGACAGTGTTGCAAAATTGGCTCAAACAACCTGAATCCAACTTAGGCATTGAAATAAAAGCTTTAGATGAGAATGGTCATGATCTTGCTGTAACCTTCCCAGGACCAGGAGAAGATGGGCTGAATCCGTTTTTAGAGGTCAAGGTAACAGACACACCAAAAAGATCCAGAAGGGATTTTGGTCTTGACTGTGATGAGCACTCAACAGAATCACGATGCTGTCGTTACCCTCTAACTGTGGATTTTGAAGCTTTTGGATGGGATTGGATTATCGCTCCTAAAAGATATAAGGCCAATTACTGCTCTGGAGAGTGTGAATTTGTATTTTTACAAAAATATCCTCATACTCATCTGGTACACCAAGCAAACCCCAGAGGTTCAGCAGGCCCTTGCTGTACTCCCACAAAGATGTCTCCAATTAATATGCTATATTTTAATGGCAAAGAACAAATAATATATGGGAAAATTCCAGCGATGGTAGTAGACCGCTGTGGGTGCTCATGAGATTTATATTAAGCGTTCATAACTTCCTAAAACATGGAAGGTTTTCCCCTCAACAATTTTGAAGCTGTGAAATTAAGTACCACAGGCTATAGGCCTAGAGTATGCTACAGTCACTTAAGCATAAGCTACAGTATGTAAACTAAAAGGGGGAATATATGCAATGGTTGGCATTTAACCATCCAAACAAATCATACAAGAAAGTTTTATGATTTCCAGAGTTTTTGAGCTAGAAGGAGATCAAATTACATTTATGTTCCTATATATTACAACATCGGCGAGGAAATGAAAGCGATTCTCCTTGAGTTCTGATGAATTAAAGGAGTATGCTTTAAAGTCTATTTCTTTAAAGTTTTGTTTAATATTTACAGAAAAATCCACATACAGTATTGGTAAAATGCAGGATTGTTATATACCATCATTCGAATCATCCTTAAACACTTGAATTTATATTGTATGGTAGTATACTTGGTAAGATAAAATTCCACAAAAATAGGGATGGTGCAGCATATGCAATTTCCATTCCTATTATAATTGACACAGTACATTAACAATCCATGCCAACGGTGCTAATACGATAGGCTGAATGTCTGAGGCTACCAGGTTTATCACATAAAAAACATTCAGTAAAATAGTAAGTTTCTCTTTTCTTCAGGTGCATTTTCCTACACCTCCAAATGAGGAATGGATTTTCTTTAATGTAAGAAGAATCATTTTTCTAGAGGTTGGCTTTCAATTCTGTAGCATACTTGGAGAAACTGCATTATCTTAAAAGGCAGTCAAATGGTGTTTGTTTTTATCAAAATGTCAAAATAACATACTTGGAGAAGTATGTAATTTTGTCTTTGGAAAATTACAACACTGCCTTTGCAACACTGCAGTTTTTATGGTAAAATAATAGAAATGATCGACTCTATCAATATTGTATAAAAAGACTGAAACAATGCATTTATATAATATGTATACAATATTGTTTTGTAAATAAGTGTCTCCTTTTTTATTTACTTTGGTATATTTTTACACTAAGGACATTTCAAATTAAGTACTAAGGCACAAAGACATGTCATGCATCACAGAAAAGCAACTACTTATATTTCAGAGCAAATTAGCAGATTAAATAGTGGTCTTAAAACTCCATATGTTAATGATTAGATGGTTATATTACAATCATTTTATATTTTTTTACATGATTAACATTCACTTATGGATTCATGATGGCTGTATAAAGTGAATTTGAAATTTCAATGGTTTACTGTCATTGTGTTTAAATCTCAACGTTCCATTATTTTAATACTTGCAAAAACATTACTAAGTATACCAAAATAATTGACTCTATTATCTGAAATGAAGAATAAACTGATGCTATCTCAACAATAACTGTTACTTTTATTTTATAATTTGATAATGAATATATTTCTGCATTTATTTACTTCTGTTTTGTAAATTGGGATTTTGTTAATCAAATTTATTGTACTATGACTAAATGAAATTATTTCTTACATCTAATTTGTAGAAACAGTATAAGTTATATTAAAGTGTTTTCACATTTTTTTGAAAGACA
(配列番号300)
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、例えば、以下に提供されるように、マウスMSTN遺伝子配列と相補性のある領域を有し得る(遺伝子ID:17700;NCBI参照番号:NM_010834.3):
AGGACTCCCTGGCGTGGCAGGTTGTCTCTCGGACGGTACATGCACTAATATTTCACTTGGCATTACTCAAAAGCAAAAAGAAGAAATAAGAACAAGGGAAAAAAAAAGATTGTGCTGATTTTTAAAATGATGCAAAAACTGCAAATGTATGTTTATATTTACCTGTTCATGCTGATTGCTGCTGGCCCAGTGGATCTAAATGAGGGCAGTGAGAGAGAAGAAAATGTGGAAAAAGAGGGGCTGTGTAATGCATGTGCGTGGAGACAAAACACGAGGTACTCCAGAATAGAAGCCATAAAAATTCAAATCCTCAGTAAGCTGCGCCTGGAAACAGCTCCTAACATCAGCAAAGATGCTATAAGACAACTTCTGCCAAGAGCGCCTCCACTCCGGGAACTGATCGATCAGTACGACGTCCAGAGGGATGACAGCAGTGATGGCTCTTTGGAAGATGACGATTATCACGCTACCACGGAAACAATCATTACCATGCCTACAGAGTCTGACTTTCTAATGCAAGCGGATGGCAAGCCCAAATGTTGCTTTTTTAAATTTAGCTCTAAAATACAGTACAACAAAGTAGTAAAAGCCCAACTGTGGATATATCTCAGACCCGTCAAGACTCCTACAACAGTGTTTGTGCAAATCCTGAGACTCATCAAACCCATGAAAGACGGTACAAGGTATACTGGAATCCGATCTCTGAAACTTGACATGAGCCCAGGCACTGGTATTTGGCAGAGTATTGATGTGAAGACAGTGTTGCAAAATTGGCTCAAACAGCCTGAATCCAACTTAGGCATTGAAATCAAAGCTTTGGATGAGAATGGCCATGATCTTGCTGTAACCTTCCCAGGACCAGGAGAAGATGGGCTGAATCCCTTTTTAGAAGTCAAGGTGACAGACACACCCAAGAGGTCCCGGAGAGACTTTGGGCTTGACTGCGATGAGCACTCCACGGAATCCCGGTGCTGCCGCTACCCCCTCACGGTCGATTTTGAAGCCTTTGGATGGGACTGGATTATCGCACCCAAAAGATATAAGGCCAATTACTGCTCAGGAGAGTGTGAATTTGTGTTTTTACAAAAATATCCGCATACTCATCTTGTGCACCAAGCAAACCCCAGAGGCTCAGCAGGCCCTTGCTGCACTCCGACAAAAATGTCTCCCATTAATATGCTATATTTTAATGGCAAAGAACAAATAATATATGGGAAAATTCCAGCCATGGTAGTAGACCGCTGTGGGTGCTCATGAGCTTTGCATTAGGTTAGAAATTTCCCAAGTCATGGAAGGTCTTCCCCTCAATTTCGAAACTGTGAATTCAAGCACCACAGGCTGTAGGCCTTGAGTATGCTCTAGTAACGTAAGCACAAGCTACAGTGTATGAACTAAAAGAGAGAATAGATGCAATGGTTGGCATTCAACCACCAAAATAAACCATACTATAGGATGTTGTATGATTTCCAGAGTTTTTGAAATAGATGGAGATCAAATTACATTTATGTCCATATATGTATATTACAACTACAATCTAGGCAAGGAAGTGAGAGCACATCTTGTGGTCTGCTGAGTTAGGAGGGTATGATTAAAAGGTAAAGTCTTATTTCCTAACAGTTTCACTTAATATTTACGGAAGAATCTATATGTAGCCTTTGTAAAGTGTAGGATTGTTATCATTTAAAAACATCATGTACACTTATATTTGTATTGTATACTTGGTAAGATAAAATTCCACAAAGTAGGAATGGGGCCTTACATACACATTGCCATTCCTATTATAATTGGACAATCCACCACGGTGCTAATGCAGTGCTGAATGGCTCCTACTGGACCTCTCGATAGAACACTCTACAAAGTACGAGTCTCTCTCTCCCTTCCAGGTGCATCTCCACACACACAGCACTAAGTGTTCAATGCATTTTCTTTAAGGAAAGAAGAATCTTTTTTTCTAGAGGTCAACTTTCAGTCAACTCTAGCACAGCGGGAGTGACTGCTGCATCTTAAAAGGCAGCCAAACAGTATTCATTTTTTAATCTAAATTTCAAAATCACTGTCTGCCTTTATCACATGGCAATTTTGTGGTAAAATAATGGAAATGACTGGTTCTATCAATATTGTATAAAAGACTCTGAAACAATTACATTTATATAATATGTATACAATATTGTTTTGTAAATAAGTGTCTCCTTTTATATTTACTTTGGTATATTTTTACACTAATGAAATTTCAAATCATTAAAGTACAAAGACATGTCATGTATCACAAAAAAGGTGACTGCTTCTATTTCAGAGTGAATTAGCAGATTCAATAGTGGTCTTAAAACTCTGTATGTTAAGATTAGAAGGTTATATTACAATCAATTTATGTATTTTTTACATTATCAACATTCACTTATGGTTTCATGGTGGCTGTATCTATGAATGTGGCTCCCAGTCAAATTTCAATGCCCCACCATTTTAAAAATTACAAGCATTACTAAACATACCAACATGTATCTAAAGAAATACAAATATGGTATCTCAATAACAGCTACTTTTTTATTTTATAATTTGACAATGAATACATTTCTTTTATTTACTTCAGTTTTATAAATTGGAACTTTGTTTATCAAATGTATTGTACTCATAGCTAAATGAAATTATTTCTTACATAAAAATGTGTAGAAACTATAAATTAAAGTGTTTTCACATTTTTGAAAGGC
(配列番号301)
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、例えば、Schuelke, M. et al., "Myostatin Mutation Associated with Gross Muscle Hypertrophy in a Child" N Engl J Med 2004; 350:2682-2688(その内容は、その全体が参照されることによって本明細書に組み込まれる)において報告されているように、MSTNの突然変異体型と相補性のある領域を有し得る。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号300または配列番号301で表されるMSTN配列と相補性のある領域を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号300または配列番号301で表されるMSTN配列に少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%相補的である相補性のある領域を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号300または配列番号301で表されるMSTN配列に完全に相補的である少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、または19の連続的なヌクレオチドを有する配列を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号300または配列番号301で表されるMSTN配列のRNAバージョン(すなわち、ここで、TはUに置き換えられている)を標的にする(例として、これに相補的である)配列を含み得る。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号300または配列番号301で表されるMSTN配列のRNAバージョンに相補的(例として、少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%相補的)である配列を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号300または配列番号301で表されるMSTN配列のRNAバージョンに完全に相補的である少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、または19の連続的なヌクレオチドを有する配列を含む。
いくつかの態様において、MSTN標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号350~373のいずれか1つを含む配列の少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、または19の連続的なヌクレオチドを含むアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、MSTN標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号350~373のいずれか1つを含むアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号350~373のいずれか1つの少なくとも12または少なくとも15の連続的なヌクレオチドと少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、または97%の配列同一性を含む、共有するアンチセンス鎖を含む。
いくつかの態様において、MSTN標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号302~349のいずれか1つを含むMSTN配列を標的にするアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号302~349のいずれか1つを含むMSTN配列に相補的である少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、または19のヌクレオチド(例として、連続的なヌクレオチド)を含むアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、MSTN標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号302~349のいずれか1つの少なくとも12または少なくとも15の連続的なヌクレオチドと少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、または97%相補的である配列を含むアンチセンス鎖を含む。
いくつかの態様において、MSTN標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号302~349のいずれか1つで表される標的配列と相補性のある領域を含むアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、相補性のある領域は、長さが少なくとも8、少なくとも9、少なくとも10、少なくとも11、少なくとも12、少なくとも13、少なくとも14、少なくとも15、少なくとも16、少なくとも17、または少なくとも19ヌクレオチドである。いくつかの態様において、相補性のある領域は、長さが8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、または19ヌクレオチドである。いくつかの態様において、相補性のある領域は、長さが8~20、10~20、または15~20ヌクレオチドの範囲にある。いくつかの態様において、相補性のある領域は、その標的配列のすべてまたは一部と完全に相補的である。いくつかの態様において、相補性のある領域は、1、2、または3以上のミスマッチを含む。
いくつかの態様において、MSTN標的化オリゴヌクレオチドは、アンチセンス鎖にハイブリダイズして二本鎖siRNAを形成するセンス鎖をさらに含む。いくつかの態様において、MSTN標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号350~373のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、MSTN標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号326~349のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むセンス鎖をさらに含む。
いくつかの態様において、MSTN標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号350~373のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むアンチセンス鎖、およびアンチセンス鎖にハイブリダイズし、配列番号326~349のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むセンス鎖を含む二本鎖オリゴヌクレオチド(例として、siRNA)であり、ここで、アンチセンス鎖および/または(例として、および)は、1以上の修飾ヌクレオシド(例として、2’-修飾ヌクレオシド)を含む。いくつかの態様において、1以上の修飾ヌクレオシドは、2’-O-Meおよび2’-F修飾ヌクレオシドから選択される。
いくつかの態様において、MSTN標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号350~373のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むアンチセンス鎖、およびアンチセンス鎖にハイブリダイズし、配列番号326~349のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むセンス鎖を含む二本鎖オリゴヌクレオチド(例として、siRNA)であり、ここで、アンチセンス鎖における各ヌクレオシドおよび/または(例として、および)センス鎖における各ヌクレオシドは、2’-O-Meおよび2’-F修飾ヌクレオシドから選択される2’-修飾ヌクレオシドである。
いくつかの態様において、MSTN標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号350~373のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むアンチセンス鎖、およびアンチセンス鎖にハイブリダイズし、配列番号326~349のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むセンス鎖を含む二本鎖オリゴヌクレオチド(例として、siRNA)であり、ここで、アンチセンス鎖における各ヌクレオシドおよびセンス鎖における各ヌクレオシドは、2’-O-Meおよび2’-F修飾ヌクレオシドから選択される2’-修飾ヌクレオシドであり、およびここで、アンチセンス鎖および/または(例として、および)センス鎖は各々、1以上のホスホロチオアートヌクレオシド間連結を含む。いくつかの態様において、センス鎖は、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結を含まず(センス鎖におけるすべてのヌクレオシド間連結は、ホスホジエステルヌクレオシド間連結であり)、アンチセンス鎖は、1、2、または3ホスホロチオアートヌクレオシド間連結を含む。いくつかの態様において、アンチセンス鎖は、2つのホスホロチオアートヌクレオシド間連結を含み、任意にここで、アンチセンス鎖の3’末端における2つのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結であり、アンチセンス鎖における残りのヌクレオシド間連結は、ホスホジエステルヌクレオシド間連結である。
いくつかの態様において、MSTN標的化オリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖は、以下(5’~3’)の構造を含む:
fNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmN*fN*mN、ここで、「mN」は、2’-O-メチル(2’-O-Me)修飾ヌクレオシドを示し;「fN」は、2’-フルオロ(2’-F)修飾ヌクレオシドを示し;「*」は、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結を示し;2つのヌクレオシド間の「*」の不在は、ホスホジエステルヌクレオシド間連結を示す。
いくつかの態様において、MSTN標的化オリゴヌクレオチドのセンス鎖は、以下(5’~3’)の構造を含む:
mNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfN、ここで、「mN」は、2’-O-メチル(2’-O-Me)修飾ヌクレオシドを示し;「fN」は、2’-フルオロ(2’-F)修飾ヌクレオシドを示し;2つのヌクレオシド間の「*」の不在は、ホスホジエステルヌクレオシド間連結を示す。
いくつかの態様において、MSTN標的化オリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖は、表11中に挙げられた配列番号350~373の修飾されたバージョンから選択される。いくつかの態様において、MSTN標的化オリゴヌクレオチドのセンス鎖は、表11中に挙げられた配列番号326~349の修飾されたバージョンから選択される。いくつかの態様において、MSTN標的化オリゴヌクレオチドは、表11中に挙げられたsiRNAから選択されるsiRNAである。
表9.MSTN標的配列
Figure 2023512441000025
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、表10において提供されるような任意の配列を含み得るか、またはそれからなり得る。
表10.MSTNを標的にするためのオリゴヌクレオチド配列
Figure 2023512441000026
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、表11において提供されるような修飾されたオリゴヌクレオチドであり、ここで、「mN」は、2’-O-メチル修飾ヌクレオシドを表し(例として、mUは、2’-O-メチル修飾ウリジンである)、「fN」は、2’-フルオロ修飾ヌクレオシドを表し(例として、fUは、2’-フルオロ修飾ウリジンである)、「*」は、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結を表し、ヌクレオシド間の「*」の欠如は、ホスホジエステルヌクレオシド間連結を示す。
表11.MSTNを標的にするための修飾されたオリゴヌクレオチド
Figure 2023512441000027
Figure 2023512441000028
2.INHBAオリゴヌクレオチド
INHBAを標的にするために有用なオリゴヌクレオチドの例は、Tada et. al., "Differential expression and cellular localization of activin and inhibin mRNA in the rainbow trout ovary and testis" Gen Comp Endocrinol. 2002 Jan;125(1):142-9.;2019年4月16日に発行され、「Prophylactic agent and therapeutic agent for fibrodysplasia ossificans progressiva」と表題を付けられた米国特許10,260,068;Carlton, AL et. al. "Small molecule inhibition of the CBFβ/RUNX interaction decreases ovarian cancer growth and migration through alterations in genes related to epithelial-to-mesenchymal transition" Gynecol Oncol. 2018 May;149(2):350-360.;およびTakabe, K. et al. "Interruption of activin A autocrine regulation by antisense oligodeoxynucleotides accelerates liver tumor cell proliferation" Endocrinology. 1999 Jul;140(7):3125-32において提供され、それらの各々の内容は、それらの全体が本明細書に組み込まれる。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、例えば、以下に提供されるように、ヒトINHBA配列と相補性のある領域を有し得る(遺伝子ID:3624;NCBI参照番号:NM_002192.4):
ACAGTGCCAATACCATGAAGAGGAGCTCAGACAGCTCTTACCACATGATACAAGAGCCGGCTGGTGGAAGAGTGGGGACCAGAAAGAGAATTTGCTGAAGAGGAGAAGGAAAAAAAAAACACCAAAAAAAAAAATAAAAAAATCCACACACACAAAAAAACCTGCGCGTGAGGGGGGAGGAAAAGCAGGGCCTTTTAAAAAGGCAATCACAACAACTTTTGCTGCCAGGATGCCCTTGCTTTGGCTGAGAGGATTTCTGTTGGCAAGTTGCTGGATTATAGTGAGGAGTTCCCCCACCCCAGGATCCGAGGGGCACAGCGCGGCCCCCGACTGTCCGTCCTGTGCGCTGGCCGCCCTCCCAAAGGATGTACCCAACTCTCAGCCAGAGATGGTGGAGGCCGTCAAGAAGCACATTTTAAACATGCTGCACTTGAAGAAGAGACCCGATGTCACCCAGCCGGTACCCAAGGCGGCGCTTCTGAACGCGATCAGAAAGCTTCATGTGGGCAAAGTCGGGGAGAACGGGTATGTGGAGATAGAGGATGACATTGGAAGGAGGGCAGAAATGAATGAACTTATGGAGCAGACCTCGGAGATCATCACGTTTGCCGAGTCAGGAACAGCCAGGAAGACGCTGCACTTCGAGATTTCCAAGGAAGGCAGTGACCTGTCAGTGGTGGAGCGTGCAGAAGTCTGGCTCTTCCTAAAAGTCCCCAAGGCCAACAGGACCAGGACCAAAGTCACCATCCGCCTCTTCCAGCAGCAGAAGCACCCGCAGGGCAGCTTGGACACAGGGGAAGAGGCCGAGGAAGTGGGCTTAAAGGGGGAGAGGAGTGAACTGTTGCTCTCTGAAAAAGTAGTAGACGCTCGGAAGAGCACCTGGCATGTCTTCCCTGTCTCCAGCAGCATCCAGCGGTTGCTGGACCAGGGCAAGAGCTCCCTGGACGTTCGGATTGCCTGTGAGCAGTGCCAGGAGAGTGGCGCCAGCTTGGTTCTCCTGGGCAAGAAGAAGAAGAAAGAAGAGGAGGGGGAAGGGAAAAAGAAGGGCGGAGGTGAAGGTGGGGCAGGAGCAGATGAGGAAAAGGAGCAGTCGCACAGACCTTTCCTCATGCTGCAGGCCCGGCAGTCTGAAGACCACCCTCATCGCCGGCGTCGGCGGGGCTTGGAGTGTGATGGCAAGGTCAACATCTGCTGTAAGAAACAGTTCTTTGTCAGTTTCAAGGACATCGGCTGGAATGACTGGATCATTGCTCCCTCTGGCTATCATGCCAACTACTGCGAGGGTGAGTGCCCGAGCCATATAGCAGGCACGTCCGGGTCCTCACTGTCCTTCCACTCAACAGTCATCAACCACTACCGCATGCGGGGCCATAGCCCCTTTGCCAACCTCAAATCGTGCTGTGTGCCCACCAAGCTGAGACCCATGTCCATGTTGTACTATGATGATGGTCAAAACATCATCAAAAAGGACATTCAGAACATGATCGTGGAGGAGTGTGGGTGCTCATAGAGTTGCCCAGCCCAGGGGGAAAGGGAGCAAGAGTTGTCCAGAGAAGACAGTGGCAAAATGAAGAAATTTTTAAGGTTTCTGAGTTAACCAGAAAAATAGAAATTAAAAACAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAAACAAAAGTAAATTAAAAACAAAACCTGATGAACAGATGAAGGAAGATGTGGAAAAAATCCTTAGCCAGGGCTCAGAGATGAAGCAGTGAAAGAGACAGGAATTGGGAGGGAAAGGGAGAATGGTGTACCCTTTATTTCTTCTGAAATCACACTGATGACATCAGTTGTTTAAACGGGGTATTGTCCTTTCCCCCCTTGAGGTTCCCTTGTGAGCCTTGAATCAACCAATCTAGTCTGCAGTAGTGTGGACTAGAACAACCCAAATAGCATCTAGAAAGCCATGAGTTTGAAAGGGCCCATCACAGGCACTTTCCTACCCAATTACCCAGGTCATAAGGTATGTCTGTGTGACACTTATCTCTGTGTATATCAGCATACACACACACACACACACACACACACACACACACAGGCATTTCCACACATTACATATATACACATACTGGTAAAAGAACAATCGTGTGCAGGTGGTCACACTTCCTTTTTCTGTACCACTTTTGCAACAAAACAAAACAAACAACATTAAAAAATTGAGAACAAGTATGGAAAGAATGAAAGATCAAGGAAAAAAGAATACCAAGTTACATTTCGTTAAGGTGCTTATGATCTTAGAACTATGCAACCTAATAGGTTTGAAACTGTTTACCTGAGAGAGAACAAAAAGAGAGACTTTTTTGTATTGGAAGTAATCTGATTAATTTTTATTTTCTTCAAGGAGAGATACTTGAAAGGAATATGTTTGTCCATCTGTTGGATCCAAACATTTCTATATTTTGTAAATGTTGTTGTTGTTTTTTTTTTAATCGTTTACTATTTGCACTACAATGGTGTTTGACCTGTCTAATCCTTATTTAACAAGTATTTTCTTTGGTTGGGGGTGGGGGTGGGGTTTAAGAGCTGCACTTAATGTGAGCTATAAAAGAACTGCTACAGCACACAAAATAGCTATTTTTATTATTATAATTATAATTATTATTATTATTTTGTACCTTAAAAAATAGACACATACACCAAAGACATTTGTGTGAGCCTTTAAACAGTCTGTCTGTGGTTGGTATCATTCACCATCAATGAGTCAGGGGTTGGGATTCAAGGTTGAGTAGTGTGGATTGTGTTCAGGCTTAAAAGACCTGAGAAGTTTGGTTTTTGACTCCTTTTACATCCATGAAACAGGACATTTCATACTGGATGTACAGTAGTTGTACACTGTTGGATATCAAGTTCAATCAAATTCATGGAACTACATGCTTGTATGTGTATATATACATTGCTTGTGCATATGCATATCTGTATGTATATATACATGTATTGTACCATGTCCATACACATTTTAAGCACTTCAGGCTGTCATTTTTTAATGTTCTTAAAGCAATGAATGTTTGTGTGCAAAACACAGTATTTTTAAGAAGGATAGGCTATAGTTTTTGCTTTTACTCTGAACTAGGTGGGCGCATTTCAAAAATTCGGATGGGAAAAAGCCTGGAAATTCCAGTGAATATTCAGCAAGGCCCTCTTTCATTGTACAGGGATCAAATTTCCTCCTCTTTTTTGTGCCCCCTCCCACTTCTACAAGTTATCCCCTGTGGGGAAAACAGGATGATAATCAAAACTCTGGGCTGATGTTTTTCCAACTTAGTGTCTATTGGAATCAATCTTAAATCAGAAGCTTTTTCAGAAAAATAATATTTAGGCCAGAATTAGAGTTGAGTGTATTTTTTAAAAATGATTAAGGCTTGGTTGTGAGAAATATTACCTGTACCAGCTGGGAAAAATAATGTCATCACTAACTAAAAGATAATTAATTTGAGAGAAAGTGTTAAGAGAGGGAGAGTAAGGAAGAGAACAGTTAAGAGGAGGCAGAGGTGAGGGCAGTAGTAAAAATCTCTAAAATTTTAATTTACAGCCAAAATTCTTCATGTGTAAATTTGTATTGATTCAGATGCAGAAATGAAAAAAAAACACCTTTGTTTTATAAATATCAAAGTACATGCTTAAAGCCAAGTTTTTATCTAGTTTATTCTAGTACTTAGCTTGCCTGGAATAGCTAATAAATTATTCATGTATGTGCTTTTGAAAATCCAGAGCCCTATTTTTACACACTTGTGTGAAGTTGGCAAACATTTTGAAAAATGGAAAAAAGTTTCTAATAATTGGGAACAATTACATTAATTAATATTTTGTAAAATATTGAAGCTTTTAGCCCTATGTCAATTTGTAGATTAAAATAAATTAATTATAGGAAAGGAAGATAACAGTGAGAAACCAAACATTACAAAAGGTGGTTTAGCTCTCCTTGAAAAATATACTAAGTTGGTATACTATAACACTTGGCTATATGTAGGCAATGTCACTACTGGGCAAATACACTTACTGTGTTCTAGAGGCAGCCCTTTCTTATGCAGAAAATACAATACGCACTGCATGAGAAGCTTGAGAGTGGATTCTAATCCAGGTCTGTCGACCTTGGATATCATGCATGTGGGAAGGTGGGTGTGGTGAGAAAAGTTTTAAGGCAAGAGTAGATGGCCATGTTCAACTTTACAAAATTTCTTGGAAAACTGGCAGTATTTTGAACTGCATCTTCTTTGGTACCGGAACCTGCAGAAACAGTGTGAGAAATTAAGTCCTGGTTCACTGCGCAGTAGCAAAGATGGTCAAGGCCATGGAAAAAGCAGAAATTTACCAAGAAAGCTGATACCCATGTATAGTTCCCACTCATCTCAAATACATCTGCTATCTTTTTAAGCTAAGTCCTAGACATATCGGGGATAACATGGGGGTTGATTAGTGACCACAGTTATCAGAAGCAGAGAAATGTAATTCCATATTTTATTTGAAACTTATTCCATATTTTAATTGGATATTGAGTGATTGGGTTATCAAACACCCACAAACTTTAATTTTGTTAAATTTATATGGCTTTGAAATAGAAGTATAAGTTGCTACCATTTTTTGATAACATTGAAAGATAGTATTTTACCATCTTTAATCATCTTGGAAAATACAAGTCCTGTGAACAACCACTCTTTCACCTAGCAGCATGAGGCCAAAAGTAAAGGCTTTAAATTATAACATATGGGATTCTTAGTAGTATGTTTTTTTCTTGAAACTCAGTGGCTCTATCTAACCTTACTATCTCCTCACTCTTTCTCTAAGACTAAACTCTAGGCTCTTAAAAATCTGCCCACACCAATCTTAGAAGCTCTGAAAAGAATTTGTCTTTAAATATCTTTTAATAGTAACATGTATTTTATGGACCAAATTGACATTTTCGACTATTTTTTCCAAAAAAGTCAGGTGAATTTCAGCACACTGAGTTGGGAATTTCTTATCCCAGAAGACCAACCAATTTCATATTTATTTAAGATTGATTCCATACTCCGTTTTCAAGGAGAATCCCTGCAGTCTCCTTAAAGGTAGAACAAATACTTTCTATTTTTTTTTCACCATTGTGGGATTGGACTTTAAGAGGTGAC
TCTAAAAAAACAGAGAACAAATATGTCTCAGTTGTATTAAGCACGGACCCATATTATCATATTCACTTAAAAAAATGATTTCCTGTGCACCTTTTGGCAACTTCTCTTTTCAATGTAGGGAAAAACTTAGTCACCCTGAAAACCCACAAAATAAATAAAACTTGTAGATGTGGGCAGAAGGTTTGGGGGTGGACATTGTATGTGTTTAAATTAAACCCTGTATCACTGAGAAGCTGTTGTATGGGTCAGAGAAAATGAATGCTTAGAAGCTGTTCACATCTTCAAGAGCAGAAGCAAACCACATGTCTCAGCTATATTATTATTTATTTTTTATGCATAAAGTGAATCATTTCTTCTGTATTAATTTCCAAAGGGTTTTACCCTCTATTTAAATGCTTTGAAAAACAGTGCATTGACAATGGGTTGATATTTTTCTTTAAAAGAAAAATATAATTATGAAAGCCAAGATAATCTGAAGCCTGTTTTATTTTAAAACTTTTTATGTTCTGTGGTTGATGTTGTTTGTTTGTTTGTTTCTATTTTGTTGGTTTTTTACTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGCATACTACATGCAGTTCTTTAACCAATGTCTGTTTGGCTAATGTAATTAAAGTTGTTAATTTATATGAGTGCATTTCAACTATGTCAATGGTTTCTTAATATTTATTGTGTAGAAGTACTGGTAATTTTTTTATTTACAATATGTTTAAAGAGATAACAGTTTGATATGTTTTCATGTGTTTATAGCAGAAGTTATTTATTTCTATGGCATTCCAGCGGATATTTTGGTGTTTGCGAGGCATGCAGTCAATATTTTGTACAGTTAGTGGACAGTATTCAGCAACGCCTGATAGCTTCTTTGGCCTTATGTTAAATAAAAAGACCTGTTTGGGATGTA
(配列番号422)。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、例えば、以下の遺伝子ID:16323;NCBI参照番号:NM_008380.2によって提供されるように、マウスINHBA配列と相補性のある領域を有し得る:
GGGGTTCGCTAGTGGCTGCTCCTCCAGGCAGCACCGGGCCAGCGTGGAGTTGGAGCTTTGTGAAGTAGCCAGTAAATCAGAACGCCTCCGCTAGGTGCAGAGCGCGGTGGCAGCGGGCCACTCTGCCAGTGCGGTAGTCGGTGGGACCGAACTCTACACTCGGGAAGGGGCAGTCTGCGGGTGCGGGGCCTGAGCTGCCGCTCGCCTCCGTTGGCCAGGAGACCGGCAGCCCCACTGCAGCTGCCAAAAGGGGGGGAAAAATCAAGAGCTGCGCTTTTAAACGAAGTTGCCCTTGCTGGTGTTCAGGGTAAAAATAGAGGCGGCCGCTTGGACCAGCTTGGCCCCTGAGTCCAGGCGTCCCGCGAGCCGGGCTGGAGCTGCGCATTCGGGAGTGATCCCTGGAAACTGCCAGCAGGTGCTGCTCAAGTGCCAATACCATGAAGAGGAATTCAGACAGCTCTGACCTCATGAGACAAGAGCCGGCTGACAAAACAGAAGGGACCCGAAAGAGAATTTGCTGAAGAGGAGAAGGAAAAAAAAAGTCCAAAAAAACCTGTGCGTGAGGGGTGGGGAGGAAAAGCAGGGCCTTTAAAGAAGGCAACCACACGACTTTTGCTGCCAGGATGCCCTTGCTTTGGCTGAGAGGATTTCTGTTGGCAAGTTGCTGGATTATAGTGAGGAGTTCCCCCACCCCAGGATCCGAGGGGCACGGCTCAGCCCCGGACTGCCCGTCCTGTGCGCTGGCCACCCTTCCGAAGGATGGACCTAACTCTCAGCCAGAGATGGTAGAGGCTGTCAAGAAGCACATCTTAAACATGCTGCACTTGAAGAAGAGACCCGATGTCACCCAGCCGGTGCCCAAGGCGGCGCTTCTCAACGCGATCAGAAAGCTTCATGTGGGTAAAGTGGGGGAGAACGGGTATGTGGAGATAGAGGACGACATTGGCAGGAGGGCCGAAATGAATGAACTCATGGAGCAGACCTCGGAGATCATCACCTTTGCCGAGTCAGGCACAGCCAGGAAGACACTGCACTTTGAGATTTCCAAGGAAGGCAGTGACCTGTCAGTAGTGGAGCGTGCAGAAGTGTGGCTCTTCCTGAAAGTCCCCAAGGCTAACAGAACCAGGACCAAAGTCACCATCCGTCTATTTCAGCAGCAGAAGCACCCACAGGGCAGCTTGGACACGGGGGATGAGGCCGAGGAAATGGGCTTAAAGGGGGAGAGGAGTGAACTGTTGCTATCAGAGAAAGTAGTTGATGCTCGGAAGAGTACCTGGCACATCTTTCCAGTGTCCAGCAGCATCCAGCGCCTGCTGGACCAGGGAAAGAGTTCCCTGGACGTGCGGATTGCTTGTGAGCAGTGCCAGGAGAGTGGTGCCAGTCTAGTGCTTCTGGGCAAGAAGAAGAAGAAAGAGGTGGATGGAGATGGGAAGAAGAAAGATGGGAGTGACGGAGGGCTGGAAGAGGAAAAGGAACAGTCACATAGACCTTTCCTCATGCTGCAGGCTAGGCAGTCCGAAGACCACCCTCATCGCAGGCGTAGGCGGGGCTTGGAGTGCGACGGCAAGGTCAACATTTGCTGTAAGAAACAGTTCTTTGTCAGCTTCAAGGACATTGGCTGGAATGACTGGATCATTGCTCCCTCTGGCTATCACGCCAATTATTGTGAGGGGGAGTGCCCAAGCCACATAGCAGGCACCTCTGGGTCCTCGCTCTCCTTCCACTCAACAGTCATTAACCACTACCGCATGAGGGGTCACAGCCCCTTTGCCAACCTTAAGTCATGCTGTGTGCCCACCAAGCTGAGACCCATGTCCATGCTGTATTACGATGATGGTCAAAACATCATCAAAAAGGACATTCAAAACATGATTGTGGAGGAGTGTGGCTGCTCCTAGAGTCGCCAGGTCCCAGAGAAAATGGATCTAGAGAGTCCAGAGAAGACAGTGGCAAAATGAAGAAAAAAATATAAGATTTATGAACTAAACAAAACAACCAGAAAAATAGAAATAATAATAATAAAAAACCCACAAAAAAAAAACAAAAACAAAAATCAAAAACTAAACTGAAAACAAGACCTAATGAAACAGATGAAGGAAGATGTGGAAAAATATCCTAAGGCAGGGCTCAGAGATGAAGCAGTAAAGGAGACAGGGATTGGGGGGGGGGAGGGGGGAGAAGAGAGAATGGTGTACCTTCATTTCTTCCAAAACCAAACTGATTGCATCAGTTTTATCCAAACTGGGTATTGTCCTCTCTCCTGCCTCTTGCGGTTCCCTTGCGAGCCTGGAAGTCTACTTGTCTATTCTGCAGTAATGTGGGTTAGCACAACCCAAATAATAATGTCTAGAAAGCCATGAGTTTTAAAGGGCCAGTCCCACCCACTTACCCAGGTTATAAGTATGTCTATGTGACACTATCTCTGTGTATTTCAACACACACACACACACACACACACTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCCCCCCCACACACACACACACTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTCACACACACACACACACACACACACGCCCACACACACAAACACAGAGGTGTTTCCACACACCACATGCATACACATACTGGTAAAAGAACAATTCTGTGCAGGTGGTCACATTTTCTTTTCTGTACCACTTTTGCCACCAGACAAAACCAACATAAAACATTGAGAACAAGAGTGGAAAGAATGAAAGACCAAGGGAAGAAGAATACCAAGTTACATTTCGTTAAGGTGCTTTTGATCCTAGAACTATGCAACCTAATAGGTTTGAAACTGTTTACCTGAAAGAGGACAAAAAGAGAGACTTTTTTGTATTGGAAGTAACCTGATTAATTTTTATTTTCTTCAAGGAGAGATACTTGAAAGGAATATGTTTGTCCATCTGTTGGATTCAAACATTTCTATATTTTGTAAATGTTGTTTTTTTTATCGTTTACTATTTGCACTACGATGGTGTTTGACCTGTCTAATCCTTATTTAACAAGTATTTTCTTTGGGTGGGGGTGGGGGTGGGGTTTAAGAGCTGCACTTCATGTGAGCTATAAAAGAACTGCTACAGCACACAAAATAGCTATTTTTATTATTATAATTATAATTATTATTATTATTTTGTACCTTAAAAATAGACACATACACCAAAGACATTTGTGTGAGCCTTTAAACAGTCTGTCTGTGGTTGGTATTGTTCACCATCAATGAGTCAGGGGTACAGATTTAAGGTTGAGTTAGGTAGATTGTGTTCAGGCTTAAAAGACCTGAGAGGTTTGGGTTTTGACTCTTTTACATCCATGAAACAGGACATTTCATACTGGATGTACAGTAGTGTACACTGTTGGATTATCAAGTTCAAATTCATGAGACTACATGCTTGTATGTGTATATATACATTGCTTGTGCATATGCATATCTGTATGTATATATACATGTATTGTACCATGTCCATACACATTTTAAGCACTTCAGGCTGTCATTTTAAAAATGTTCTTAAAACAATGAATGTTTGTGTGCAAAACACAGTATTTTTAAGAAGGATAAGTGATAGATTTTTTTTTTTCTTGCTTTTACTCTGTAGTACGTGGGTACATTTCAAATGTTAGGATGGGGAAAGACTGAAAATCCCAGTGAGTATCCAGCCAGGCCCTCTTTAAATGTACAGGATGAAATCCCCTCTTTCATATCCCCCCTGCTCCCTACAAGTTATCCCCTGTGGGGAAAAATGGGATGTTACTTTAAAAACAAAATGGGCTGATTTTTTCAACTTATATTTATTATTTATTGGAATCAATCTTAAATCAGAAACATTTTTGGAAAAAATCTTTAGGCTAGAATAATTTTTTGAATAGTGTTATTACTACTTAAATAATAAAATAAGCAGGAAAGTATTTAAGACAGTGAGAGTTAAGGGAGAGAGCACTCAGGAGCCAGGGAGTTGTACAAATCTCTAATATTCTATTTTGCAGCCAAAAAACTTGCTGTGTATGTTTGTACTTTTTCAGAGGCAAAACTGAAAAGATTGTCTTACGAATATCAAAATACACACTTAACCCAAGTTCCTAATTTAACCCAGTGTTGGCTTGTCTAAAACAGCTAATCAGTTATTCATTTACATATTTAAAATATAGAGCCTTATTTTTACGGACTTGTTTGAAGTTTGAAAAACTTTATAAAAGTGAAAAACTCTAATTGAAAAAAAATCTATATTCCTCAGTATTTTGTAAAATATTGAAGCTTTTAGCATTAAGTCAGTCCATAGATTAAAGTCATTGTAGGAAAATGAAATACAAAGGAGAAATTAAATCTTAAAAAAGCTGGTTTAACTCTTAAAAAAATAAACTAACTCAATATGTATTAAATATACCGTCAATATACCTTATCACATTAGGCTGTGTGTAGGCAAACTACTTTAGTCTTGTTACTGGGCAAACATATTTACTGTGTTCCAGGGGCCCTCCCTGTCTTATGCAGGAAATGCATGTACTGCATAAGAAATGAATTATAATTAAGGTCTAATGACCTTGAAGATCTCGCATGCGAGGACAGATGGCATGTTGAGGACACAGAGGTGAGGTGGATGTCCAGGTTCAGCTTTGCCAATTTTTGTGAAAAACCTTTAGCGCCCTCTGAACTGTTTCTTTAGTATTGGAGCTAATGCCGAGGCCTAGAGAAATAGTGGGCAAGAGATCTAACTGTGCCATATCAGAGATGATCTAGACCATGGGAAGAGCAGGATTTATGTAACTACTAATTATAGTTCTCATTCATCTGAGATGAATCTGCAATCTTCTTAAGCCCTTTAAATTCTAGATGTTTTGAGGGTAAGCTTGGGTTTAATTAGTAGCCATAGTAATTAAATCTAGAAAGAAATGAAATTCCACAGGACAGTGTATTTACTGGAGACCAAGTGACTTGGTTGTCACATAAACCTCATCAGAACTCATCAAATTTGTATGGCCTTGCAATAGAATTTAAATTGCTAATATTTTAACAATATTAGATATTGTTAACAATTTAGAAAACATGAAGTCTTGTGAACTGGTCTTTCTACATAAGTGCTTAATCCAAAAT
TTGAAAAGCCTTTAATGCTTAAGATCTTAGTTTCTTCATGGTGTGCTTTCCCTAGTGTTAAAGTGGCTCTGTCTGGTCTCCCCACTTTCTCTAGGATAATTCTTAAATACCTGCCCACACAAGTTCTAGATGCTCTGAAGAGCATTTGTAGTTAGTATCTCTTTAATACTTGTAAGCTTCATTGACACTTTTCCTTCCCAAAATAAGTCAAATTTCAGCACAGCAATGGGGATTTTCTTATCTTAGAAGACCAGCCAATTCTATGTTCATTTAAGATTGATTCCACACTCCATTTTCAAGGAGAGGCCTTGTGTTTTCTTAAAAGGCAGAATAAGTAAAATTGGGAGCTATGCCAGACTGAACGCAAGACGTGACTTTGTGATTCCAGAACAAACATGCCTCAGTTATAGTAACATGCATTCAAATGATTGTGTCACTTGAAAAATATGATTTCCTGTGGGCCTTTTGGCAACTTCTCTTTTTAGTATCGAGAAAAATGTAATCACCCCAAAACCCGCATAAGTGTGACTTGTAGATGTGGGCAGGAGGTTGGGGGATGGACATTGTATGTGTTTAAATTAAACCCTGTATCACTGAGAAGCTATTGGAGGGGTCAGAGATAATGAATGCATAGATGCTGTTCACATCTTCAAGAGCAAAAGCAAATCACGTGTCTCAGCTATATTATTATTTATTTTTATGCATAAAGTGAATCATTTCTTCTGTATTAATTTTCAGTGGGGTTTGCCCTCTATTTAAATGCTTTGAAAAACAGTGCATTGACAATGGTTGATATTTTTCTTTAAAAGAAAAATATAATTATGAAAGCCAAGATAATCTGAAATCTGTTTTGATCTAAAACTTTTTATGTTATGTGGTTGATGTTGTTTGTTTGTTTTTTATTTTTATTTTGTGAGTTCCTTTGCATACTACATGCAATTCTTTAACCAATGTCTGGCTAATGTAATTAAAGTTGTTAATTTATATGAGTGCATTTCAACTATGTCAATGGTTTCTTAATATTTATTTTGTAGAAGTGCTGGTAATTTTTTATTTACGATATGTTTAAAGAGATAACGGTTGGATATGTTTTCATGTGTTTATAGCAGAAGTTATTTATTTCTATTCCATTCCAGCGGATATTCTGATGTTTGCGAGGCATGCAGTCAATACTTTGTACAGTTAGTAGGCAGTATTCAGCAATGCCCGATAGCTTCTTTGGCCTTATGTTAAATAAAAAGACCTGTTTGGGATGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA(配列番号423)。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号422または配列番号423で表されるINHBA配列と相補性のある領域を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号422または配列番号423で表されるINHBA配列に少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%相補的である相補性のある領域を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号422または配列番号423で表されるINHBA配列に完全に相補的である少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、または19の連続的なヌクレオチドを有する配列を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号422または配列番号423で表されるINHBA配列のRNAバージョン(すなわち、ここで、TはUに置き換えられている)を標的にする(例として、これに相補的である)配列を含み得る。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号422または配列番号423で表されるINHBA配列のRNAバージョンに相補的(例として、少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%相補的)である配列を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号422または配列番号423で表されるINHBA配列のRNAバージョンに完全に相補的である少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、または19の連続的なヌクレオチドを有する配列を含む。
いくつかの態様において、INHBA標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号472~495のいずれか1つを含む配列の少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、または19の連続的なヌクレオチドを含むアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、INHBA標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号472~495のいずれか1つを含むアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号472~495のいずれか1つの少なくとも12または少なくとも15の連続的なヌクレオチドと少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、または97%の配列同一性を含む、共有するアンチセンス鎖を含む。
いくつかの態様において、INHBA標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号424~471のいずれか1つを含むINHBA配列を標的にするアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号424~471のいずれか1つを含むINHBA配列に相補的である少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、または19のヌクレオチド(例として、連続的なヌクレオチド)を含むアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、INHBA標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号424~471のいずれか1つの少なくとも12または少なくとも15の連続的なヌクレオチドと少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、または97%相補的である配列を含むアンチセンス鎖を含む。
いくつかの態様において、INHBA標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号424~471のいずれか1つで表される標的配列と相補性のある領域を含むアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、相補性のある領域は、長さが少なくとも8、少なくとも9、少なくとも10、少なくとも11、少なくとも12、少なくとも13、少なくとも14、少なくとも15、少なくとも16、少なくとも17、または少なくとも19ヌクレオチドである。いくつかの態様において、相補性のある領域は、長さが8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、または19ヌクレオチドである。いくつかの態様において、相補性のある領域は、長さが8~20、10~20、または15~20ヌクレオチドの範囲にある。いくつかの態様において、相補性のある領域は、その標的配列のすべてまたは一部と完全に相補的である。いくつかの態様において、相補性のある領域は、1、2、または3以上のミスマッチを含む。
いくつかの態様において、INHBA標的化オリゴヌクレオチドは、アンチセンス鎖にハイブリダイズして二本鎖siRNAを形成するセンス鎖をさらに含む。いくつかの態様において、INHBA標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号472~495のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、INHBA標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号448~471のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むセンス鎖をさらに含む。
いくつかの態様において、INHBA標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号472~495のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むアンチセンス鎖、およびアンチセンス鎖にハイブリダイズし、配列番号448~471のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むセンス鎖を含む二本鎖オリゴヌクレオチド(例として、siRNA)であり、ここで、アンチセンス鎖および/または(例として、および)は、1以上の修飾ヌクレオシド(例として、2’-修飾ヌクレオシド)を含む。いくつかの態様において、1以上の修飾ヌクレオシドは、2’-O-Meおよび2’-F修飾ヌクレオシドから選択される。
いくつかの態様において、INHBA標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号472~495のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むアンチセンス鎖、およびアンチセンス鎖にハイブリダイズし、配列番号448~471のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むセンス鎖を含む二本鎖オリゴヌクレオチド(例として、siRNA)であり、ここで、アンチセンス鎖における各ヌクレオシドおよび/または(例として、および)センス鎖における各ヌクレオシドは、2’-O-Meおよび2’-F修飾ヌクレオシドから選択される2’-修飾ヌクレオシドである。
いくつかの態様において、INHBA標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号472~495のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むアンチセンス鎖、およびアンチセンス鎖にハイブリダイズし、配列番号448~471のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むセンス鎖を含む二本鎖オリゴヌクレオチド(例として、siRNA)であり、ここで、アンチセンス鎖における各ヌクレオシドおよびセンス鎖における各ヌクレオシドは、2’-O-Meおよび2’-F修飾ヌクレオシドから選択される2’-修飾ヌクレオシドであり、およびここで、アンチセンス鎖および/または(例として、および)センス鎖は各々、1以上のホスホロチオアートヌクレオシド間連結を含む。いくつかの態様において、センス鎖はホスホロチオアートヌクレオシド間連結を含まず(センス鎖におけるすべてのヌクレオシド間連結は、ホスホジエステルヌクレオシド間連結であり)、アンチセンス鎖は、1、2、または3ホスホロチオアートヌクレオシド間連結を含む。いくつかの態様において、アンチセンス鎖は、2つのホスホロチオアートヌクレオシド間連結を含み、任意にここで、アンチセンス鎖の3’末端における2つのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結であり、アンチセンス鎖における残りのヌクレオシド間連結は、ホスホジエステルヌクレオシド間連結である。
いくつかの態様において、INHBA標的化オリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖は、以下(5’~3’)の構造を含む:
fNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmN*fN*mN、ここで、「mN」は、2’-O-メチル(2’-O-Me)修飾ヌクレオシドを示し;「fN」は、2’-フルオロ(2’-F)修飾ヌクレオシドを示し;「*」は、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結を示し;2つのヌクレオシド間の「*」の不在は、ホスホジエステルヌクレオシド間連結を示す。
いくつかの態様において、INHBA標的化オリゴヌクレオチドのセンス鎖は、以下(5’~3’)の構造を含む:
mNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfN、ここで、「mN」は、2’-O-メチル(2’-O-Me)修飾ヌクレオシドを示し;「fN」は、2’-フルオロ(2’-F)修飾ヌクレオシドを示し;2つのヌクレオシド間の「*」の不在は、ホスホジエステルヌクレオシド間連結を示す。
いくつかの態様において、INHBA標的化オリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖は、表14中に挙げられた配列番号472~495の修飾されたバージョンから選択される。いくつかの態様において、INHBA標的化オリゴヌクレオチドのセンス鎖は、表14中に挙げられた配列番号448~471の修飾されたバージョンから選択される。いくつかの態様において、INHBA標的化オリゴヌクレオチドは、表14中に挙げられたsiRNAから選択されるsiRNAである。
表12.INHBA標的配列
Figure 2023512441000029
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、表13において提供されるような任意の配列を含み得るか、またはそれからなり得る。
表13.INHBAを標的にするためのオリゴヌクレオチド配列
Figure 2023512441000030
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、表14において提供されるような修飾されたオリゴヌクレオチドであり、ここで、「mN」は、2’-O-メチル修飾ヌクレオシドを表し(例として、mUは、2’-O-メチル修飾ウリジンである)、「fNは2’-フルオロ修飾ヌクレオシドを表し(例として、fUは、2’-フルオロ修飾ウリジンである)、「*」は、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結を表し、ヌクレオシド間の「*」の欠如は、ホスホジエステルヌクレオシド間連結を示す。
表14.INHBAを標的にするための修飾されたオリゴヌクレオチド
Figure 2023512441000031
Figure 2023512441000032

3.ACVR1Bオリゴヌクレオチド
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)である。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、siRNAである。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、低分子ヘアピン型RNAである。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、miRNAベースのshRNA(例として、miR-24、miR-210、miR-199a-5pに基づくshRNA)である。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、ACVR1Bを標的にするCRISPRガイドRNAである。ACVR1Bを標的にするために有用なオリゴヌクレオチドの例は、Katoh M., "Cardio-miRNAs and onco-miRNAs: circulating miRNA-based diagnostics for non-cancerous and cancerous diseases." Front Cell Dev Biol. 2014 Oct 16;2:61.;Mizuno, Y. et al. "miR-210 promotes osteoblastic differentiation through inhibition of AcvR1b." FEBS Lett. 2009 Jul 7;583(13):2263-8.;Lin, H.S. et al., "miR-199a-5p inhibits monocyte/macrophage differentiation by targeting the activin A type 1B receptor gene and finally reducing C/EBPα expression." J Leukoc Biol. 2014 Dec;96(6):1023-35.;2016年3月23日に出願され、「A method of treating neoplasias」と表題を付けられた国際特許出願公開WO2016/161477;および2014年3月27日に公開され、「Compounds and methods for altering activin receptor-like kinase signaling」と表題を付けられた米国特許出願公開US2014/0088174において提供され、それらの各々の内容は、それらの全体が本明細書に組み込まれる。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、例えば、以下に提供されるように、ヒトACVR1B配列と相補性のある領域を有し得る(遺伝子ID:91;NCBI参照番号:NM_004302.5):
GGGCGCTGCTGGGCTGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGTTACTATGGCGGAGTCGGCCGGAGCCTCCTCCTTCTTCCCCCTTGTTGTCCTCCTGCTCGCCGGCAGCGGCGGGTCCGGGCCCCGGGGGGTCCAGGCTCTGCTGTGTGCGTGCACCAGCTGCCTCCAGGCCAACTACACGTGTGAGACAGATGGGGCCTGCATGGTTTCCATTTTCAATCTGGATGGGATGGAGCACCATGTGCGCACCTGCATCCCCAAAGTGGAGCTGGTCCCTGCCGGGAAGCCCTTCTACTGCCTGAGCTCGGAGGACCTGCGCAACACCCACTGCTGCTACACTGACTACTGCAACAGGATCGACTTGAGGGTGCCCAGTGGTCACCTCAAGGAGCCTGAGCACCCGTCCATGTGGGGCCCGGTGGAGCTGGTAGGCATCATCGCCGGCCCGGTGTTCCTCCTGTTCCTCATCATCATCATTGTTTTCCTTGTCATTAACTATCATCAGCGTGTCTATCACAACCGCCAGAGACTGGACATGGAAGATCCCTCATGTGAGATGTGTCTCTCCAAAGACAAGACGCTCCAGGATCTTGTCTACGATCTCTCCACCTCAGGGTCTGGCTCAGGGTTACCCCTCTTTGTCCAGCGCACAGTGGCCCGAACCATCGTTTTACAAGAGATTATTGGCAAGGGTCGGTTTGGGGAAGTATGGCGGGGCCGCTGGAGGGGTGGTGATGTGGCTGTGAAAATATTCTCTTCTCGTGAAGAACGGTCTTGGTTCAGGGAAGCAGAGATATACCAGACGGTCATGCTGCGCCATGAAAACATCCTTGGATTTATTGCTGCTGACAATAAAGATAATGGCACCTGGACACAGCTGTGGCTTGTTTCTGACTATCATGAGCACGGGTCCCTGTTTGATTATCTGAACCGGTACACAGTGACAATTGAGGGGATGATTAAGCTGGCCTTGTCTGCTGCTAGTGGGCTGGCACACCTGCACATGGAGATCGTGGGCACCCAAGGGAAGCCTGGAATTGCTCATCGAGACTTAAAGTCAAAGAACATTCTGGTGAAGAAAAATGGCATGTGTGCCATAGCAGACCTGGGCCTGGCTGTCCGTCATGATGCAGTCACTGACACCATTGACATTGCCCCGAATCAGAGGGTGGGGACCAAACGATACATGGCCCCTGAAGTACTTGATGAAACCATTAATATGAAACACTTTGACTCCTTTAAATGTGCTGATATTTATGCCCTCGGGCTTGTATATTGGGAGATTGCTCGAAGATGCAATTCTGGAGGAGTCCATGAAGAATATCAGCTGCCATATTACGACTTAGTGCCCTCTGACCCTTCCATTGAGGAAATGCGAAAGGTTGTATGTGATCAGAAGCTGCGTCCCAACATCCCCAACTGGTGGCAGAGTTATGAGGCACTGCGGGTGATGGGGAAGATGATGCGAGAGTGTTGGTATGCCAACGGCGCAGCCCGCCTGACGGCCCTGCGCATCAAGAAGACCCTCTCCCAGCTCAGCGTGCAGGAAGACGTGAAGATCTAACTGCTCCCTCTCTCCACACGGAGCTCCTGGCAGCGAGAACTACGCACAGCTGCCGCGTTGAGCGTACGATGGAGGCCTACCTCTCGTTTCTGCCCAGCCCTCTGTGGCCAGGAGCCCTGGCCCGCAAGAGGGACAGAGCCCGGGAGAGACTCGCTCACTCCCATGTTGGGTTTGAGACAGACACCTTTTCTATTTACCTCCTAATGGCATGGAGACTCTGAGAGCGAATTGTGTGGAGAACTCAGTGCCACACCTCGAACTGGTTGTAGTGGGAAGTCCCGCGAAACCCGGTGCATCTGGCACGTGGCCAGGAGCCATGACAGGGGCGCTTGGGAGGGGCCGGAGGAACCGAGGTGTTGCCAGTGCTAAGCTGCCCTGAGGGTTTCCTTCGGGGACCAGCCCACAGCACACCAAGGTGGCCCGGAAGAACCAGAAGTGCAGCCCCTCTCACAGGCAGCTCTGAGCCGCGCTTTCCCCTCCTCCCTGGGATGGACGCTGCCGGGAGACTGCCAGTGGAGACGGAATCTGCCGCTTTGTCTGTCCAGCCGTGTGTGCATGTGCCGAGGTGCGTCCCCCGTTGTGCCTGGTTCGTGCCATGCCCTTACACGTGCGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTCTGTAGGTGCGCACTTACCTGCTTGAGCTTTCTGTGCATGTGCAGGTCGGGGGTGTGGTCGTCATGCTGTCCGTGCTTGCTGGTGCCTCTTTTCAGTAGTGAGCAGCATCTAGTTTCCCTGGTGCCCTTCCCTGGAGGTCTCTCCCTCCCCCAGAGCCCCTCATGCCACAGTGGTACTCTGTGTCTGGCAGGCTACTCTGCCCACCCCAGCATCAGCACAGCTCTCCTCCTCCATCTCAGACTGTGGAACCAAAGCTGGCCCAGTTGTCCATGACAAAAGAGGCTTTTGGGCCAAAATGTGAGGGTGGTGGGTGGGATGGGCAGGGAAGGAATCCTGGTGGAAGTCTTGGGTGTTAGTGTCAGCCATGGGAAATGAGCCAGCCCAAGGGCATCATCCTCAGCAGCATCGAGGAAGGGCCGAGGAATGTGAAGCCAGATCTCGGGACTCAGATTGGAATGTTACATCTGTCTTTCATCTCCCAGATCCTGGAAACAGCAGTGTATATTTTTGGTGGTGGTGGGTTTGGGGTGGGGAAGGGAAGGGCGGGCAAGGAGTGGGGAGGGAGTCTGGGGTGGGAGGGAGGCATCTGCATGGGTCTTCTTTTACTGGACTGTCTGATCAGGGTGGAGGGAAGGTGAGAGGTTTGCATCCACTTCAGGAGCCCTACTGAAGGGAACAGCCTGAGCCGAACATGTTATTTAACCTGAGTATAGTATTTAACGAAGCCTAGAAGCACGGCTGTGGGTGGTGATTTGGTCAGCATATCTTAGGTATATAATAACTTTGAAGCCATAACTTTTAACTGGAGTGGTTTGATTTCTTTTTTTAATTTTATTGGGAGGGTTTGGATTTTAACTTTTTTTAATGTTGTTAAATATTAAGTTTTTGTAAAAGGAAAACCATCTCTGTGATTACCTCTCAATCTATTTGTTTTTAAAGAAATCCCTAAAAAAAAAAATTATCCAATTGAACGCACATAGCTCAATCACACTGGAAATGTTTGTCCTTGCACCTGAGCCTGTTCCCACTCAGCAGTGAGAGTTCCTCTTTGCCCTGAGGCTCAGTCTCTCTCGTATTTTGTCCCCACCCCCAATTCCTTGAGTGGTTTTTGCTCTAGGGCCCTTTCTTGCACTGTCCAGCTGGTTGTACCCTCTCCAGGCATTTATTCAACAAATGTGGGTGAAGTGCCTGCTGGGTGCCAGGTGCTGGGAATACATCTGTGGACAAGACATGCTTGGGTCCTACTCCTGGAGCACTGTAAAAAGAGCTGATTCAAGTAAGTAGATGCCTGTTTTGAGACCAGAAGGTTTCATAATTGGTTCTACGACCCTTTTGAGCCTAGAATTATTGTTCTTATATAAGATCACTGAAGAAAGAGGAACCCCCACAACCCCCTCCACAAAGAGACCAGGGGCGGGTGATGAGACCTGGGGTTTAGAACCCCAGGTGAGACCTCAAATCACTGCATTCATTCTGAGCCCCCTTCCTGTCCCCAGGGGAGGTGTATTGTGTATGTAGCCTTAGAGCATCTCTGCCTCCAACCCAGCAGTTCTCTGCCAAAGCTTGTGGAGGAGGGAGAGCCCTGTCCCTGCCCTCAGGCTCCCCAGTGCTCCTGGCCCTTCTATTTATTTGACTGATTATTGCTTCTTTCCTTGCATTAAAGGAGATCTTCCCCTAACCTTTGGGCCAATTTACTGGCCACTAATTTCGTTTAAATACCATTGTGTCATTGGGGGGACCGTCTTTACCCCTGCTGACCTCCCACCTATCCGCCCTGCAGCAGAACCTTGGCGGTTTATAGGTAATGATGGAACTTAGACTCCTCTTCCCAGAGTCACAAGTAGCCTCTGGGATCTGCCAACACACGTCCACTCCCAAGCCACTAGCCCACTCCCCAGTTGGCCCTTCTGCCCTTACCCCACACACAGTCCAACTCTTCCACCTCTGGGGAAGATGGAGCAGGTCTTTGGGAAGCTCCCACACCCACCTCTGCCACTCTTAACACTAAGTGAGAGTTGGGGAGAAACTGAAGCCGTGTTTTTGGCCCCCCGAGGCTAACCCTGATCCATAGTGCTACCTGCACCTCTGGATTCTGGATTCACAGACCAAGTCCAAGCCCGTTCTTACGTCGCCATAAAGGCCCCCGAACGGCATTCTCGGTACTTCTGTTTGTTTTTGTACATTTTATTAGAAAGGACTGTAAAATAGCCACTTAGACACTTTACCTCTTCAGTATGCAAATGTAAATAAATTGTAATATAGGAAATCTTTTGTTTTAATATAAGAATGAGCCTGTCCAATTTCTGCTGTACATTATTAAAAGTTTTATTCACAGA(配列番号520)。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、例えば、以下に提供されるように、ヒトACVR1B配列と相補性のある領域を有し得る(遺伝子ID:91;NCBI参照番号:NM_020328.4):
GGGCGCTGCTGGGCTGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGTTACTATGGCGGAGTCGGCCGGAGCCTCCTCCTTCTTCCCCCTTGTTGTCCTCCTGCTCGCCGGCAGCGGCGGGTCCGGGCCCCGGGGGGTCCAGGCTCTGCTGTGTGCGTGCACCAGCTGCCTCCAGGCCAACTACACGTGTGAGACAGATGGGGCCTGCATGGTTTCCATTTTCAATCTGGATGGGATGGAGCACCATGTGCGCACCTGCATCCCCAAAGTGGAGCTGGTCCCTGCCGGGAAGCCCTTCTACTGCCTGAGCTCGGAGGACCTGCGCAACACCCACTGCTGCTACACTGACTACTGCAACAGGATCGACTTGAGGGTGCCCAGTGGTCACCTCAAGGAGCCTGAGCACCCGTCCATGTGGGGCCCGGTGGAGCTGGTAGGCATCATCGCCGGCCCGGTGTTCCTCCTGTTCCTCATCATCATCATTGTTTTCCTTGTCATTAACTATCATCAGCGTGTCTATCACAACCGCCAGAGACTGGACATGGAAGATCCCTCATGTGAGATGTGTCTCTCCAAAGACAAGACGCTCCAGGATCTTGTCTACGATCTCTCCACCTCAGGGTCTGGCTCAGGGTTACCCCTCTTTGTCCAGCGCACAGTGGCCCGAACCATCGTTTTACAAGAGATTATTGGCAAGGGTCGGTTTGGGGAAGTATGGCGGGGCCGCTGGAGGGGTGGTGATGTGGCTGTGAAAATATTCTCTTCTCGTGAAGAACGGTCTTGGTTCAGGGAAGCAGAGATATACCAGACGGTCATGCTGCGCCATGAAAACATCCTTGGATTTATTGCTGCTGACAATAAAGCAGACTGCTCATTCCTCACATTGCCATGGGAAGTTGTAATGGTCTCTGCTGCCCCCAAGCTGAGGAGCCTTAGACTCCAATACAAGGGAGGAAGGGGAAGAGCAAGATTTTTATTCCCACTGAATAATGGCACCTGGACACAGCTGTGGCTTGTTTCTGACTATCATGAGCACGGGTCCCTGTTTGATTATCTGAACCGGTACACAGTGACAATTGAGGGGATGATTAAGCTGGCCTTGTCTGCTGCTAGTGGGCTGGCACACCTGCACATGGAGATCGTGGGCACCCAAGGGAAGCCTGGAATTGCTCATCGAGACTTAAAGTCAAAGAACATTCTGGTGAAGAAAAATGGCATGTGTGCCATAGCAGACCTGGGCCTGGCTGTCCGTCATGATGCAGTCACTGACACCATTGACATTGCCCCGAATCAGAGGGTGGGGACCAAACGATACATGGCCCCTGAAGTACTTGATGAAACCATTAATATGAAACACTTTGACTCCTTTAAATGTGCTGATATTTATGCCCTCGGGCTTGTATATTGGGAGATTGCTCGAAGATGCAATTCTGGAGGAGTCCATGAAGAATATCAGCTGCCATATTACGACTTAGTGCCCTCTGACCCTTCCATTGAGGAAATGCGAAAGGTTGTATGTGATCAGAAGCTGCGTCCCAACATCCCCAACTGGTGGCAGAGTTATGAGGCACTGCGGGTGATGGGGAAGATGATGCGAGAGTGTTGGTATGCCAACGGCGCAGCCCGCCTGACGGCCCTGCGCATCAAGAAGACCCTCTCCCAGCTCAGCGTGCAGGAAGACGTGAAGATCTAACTGCTCCCTCTCTCCACACGGAGCTCCTGGCAGCGAGAACTACGCACAGCTGCCGCGTTGAGCGTACGATGGAGGCCTACCTCTCGTTTCTGCCCAGCCCTCTGTGGCCAGGAGCCCTGGCCCGCAAGAGGGACAGAGCCCGGGAGAGACTCGCTCACTCCCATGTTGGGTTTGAGACAGACACCTTTTCTATTTACCTCCTAATGGCATGGAGACTCTGAGAGCGAATTGTGTGGAGAACTCAGTGCCACACCTCGAACTGGTTGTAGTGGGAAGTCCCGCGAAACCCGGTGCATCTGGCACGTGGCCAGGAGCCATGACAGGGGCGCTTGGGAGGGGCCGGAGGAACCGAGGTGTTGCCAGTGCTAAGCTGCCCTGAGGGTTTCCTTCGGGGACCAGCCCACAGCACACCAAGGTGGCCCGGAAGAACCAGAAGTGCAGCCCCTCTCACAGGCAGCTCTGAGCCGCGCTTTCCCCTCCTCCCTGGGATGGACGCTGCCGGGAGACTGCCAGTGGAGACGGAATCTGCCGCTTTGTCTGTCCAGCCGTGTGTGCATGTGCCGAGGTGCGTCCCCCGTTGTGCCTGGTTCGTGCCATGCCCTTACACGTGCGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTCTGTAGGTGCGCACTTACCTGCTTGAGCTTTCTGTGCATGTGCAGGTCGGGGGTGTGGTCGTCATGCTGTCCGTGCTTGCTGGTGCCTCTTTTCAGTAGTGAGCAGCATCTAGTTTCCCTGGTGCCCTTCCCTGGAGGTCTCTCCCTCCCCCAGAGCCCCTCATGCCACAGTGGTACTCTGTGTCTGGCAGGCTACTCTGCCCACCCCAGCATCAGCACAGCTCTCCTCCTCCATCTCAGACTGTGGAACCAAAGCTGGCCCAGTTGTCCATGACAAAAGAGGCTTTTGGGCCAAAATGTGAGGGTGGTGGGTGGGATGGGCAGGGAAGGAATCCTGGTGGAAGTCTTGGGTGTTAGTGTCAGCCATGGGAAATGAGCCAGCCCAAGGGCATCATCCTCAGCAGCATCGAGGAAGGGCCGAGGAATGTGAAGCCAGATCTCGGGACTCAGATTGGAATGTTACATCTGTCTTTCATCTCCCAGATCCTGGAAACAGCAGTGTATATTTTTGGTGGTGGTGGGTTTGGGGTGGGGAAGGGAAGGGCGGGCAAGGAGTGGGGAGGGAGTCTGGGGTGGGAGGGAGGCATCTGCATGGGTCTTCTTTTACTGGACTGTCTGATCAGGGTGGAGGGAAGGTGAGAGGTTTGCATCCACTTCAGGAGCCCTACTGAAGGGAACAGCCTGAGCCGAACATGTTATTTAACCTGAGTATAGTATTTAACGAAGCCTAGAAGCACGGCTGTGGGTGGTGATTTGGTCAGCATATCTTAGGTATATAATAACTTTGAAGCCATAACTTTTAACTGGAGTGGTTTGATTTCTTTTTTTAATTTTATTGGGAGGGTTTGGATTTTAACTTTTTTTAATGTTGTTAAATATTAAGTTTTTGTAAAAGGAAAACCATCTCTGTGATTACCTCTCAATCTATTTGTTTTTAAAGAAATCCCTAAAAAAAAAAATTATCCAATTGAACGCACATAGCTCAATCACACTGGAAATGTTTGTCCTTGCACCTGAGCCTGTTCCCACTCAGCAGTGAGAGTTCCTCTTTGCCCTGAGGCTCAGTCTCTCTCGTATTTTGTCCCCACCCCCAATTCCTTGAGTGGTTTTTGCTCTAGGGCCCTTTCTTGCACTGTCCAGCTGGTTGTACCCTCTCCAGGCATTTATTCAACAAATGTGGGTGAAGTGCCTGCTGGGTGCCAGGTGCTGGGAATACATCTGTGGACAAGACATGCTTGGGTCCTACTCCTGGAGCACTGTAAAAAGAGCTGATTCAAGTAAGTAGATGCCTGTTTTGAGACCAGAAGGTTTCATAATTGGTTCTACGACCCTTTTGAGCCTAGAATTATTGTTCTTATATAAGATCACTGAAGAAAGAGGAACCCCCACAACCCCCTCCACAAAGAGACCAGGGGCGGGTGATGAGACCTGGGGTTTAGAACCCCAGGTGAGACCTCAAATCACTGCATTCATTCTGAGCCCCCTTCCTGTCCCCAGGGGAGGTGTATTGTGTATGTAGCCTTAGAGCATCTCTGCCTCCAACCCAGCAGTTCTCTGCCAAAGCTTGTGGAGGAGGGAGAGCCCTGTCCCTGCCCTCAGGCTCCCCAGTGCTCCTGGCCCTTCTATTTATTTGACTGATTATTGCTTCTTTCCTTGCATTAAAGGAGATCTTCCCCTAACCTTTGGGCCAATTTACTGGCCACTAATTTCGTTTAAATACCATTGTGTCATTGGGGGGACCGTCTTTACCCCTGCTGACCTCCCACCTATCCGCCCTGCAGCAGAACCTTGGCGGTTTATAGGTAATGATGGAACTTAGACTCCTCTTCCCAGAGTCACAAGTAGCCTCTGGGATCTGCCAACACACGTCCACTCCCAAGCCACTAGCCCACTCCCCAGTTGGCCCTTCTGCCCTTACCCCACACACAGTCCAACTCTTCCACCTCTGGGGAAGATGGAGCAGGTCTTTGGGAAGCTCCCACACCCACCTCTGCCACTCTTAACACTAAGTGAGAGTTGGGGAGAAACTGAAGCCGTGTTTTTGGCCCCCCGAGGCTAACCCTGATCCATAGTGCTACCTGCACCTCTGGATTCTGGATTCACAGACCAAGTCCAAGCCCGTTCTTACGTCGCCATAAAGGCCCCCGAACGGCATTCTCGGTACTTCTGTTTGTTTTTGTACATTTTATTAGAAAGGACTGTAAAATAGCCACTTAGACACTTTACCTCTTCAGTATGCAAATGTAAATAAATTGTAATATAGGAAATCTTTTGTTTTAATATAAGAATGAGCCTGTCCAATTTCTGCTGTACATTATTAAAAGTTTTATTCACAGA(配列番号521)。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、例えば、以下に提供されるように、マウスACVR1配列と相補性のある領域を有し得る(遺伝子ID:11479;NCBI参照番号:NM_007395.4)
GAGGGAGGGAGGGAGAGAGGCGCCGGGGGCGCGCGCGCGCGCTGGGCGCTGCTGGGCTGCGGCGGCGGTTACTATGGCGGAGTCGGCCGGAGCCTCCTCCTTCTTCCCCCTTGTTGTCCTCCTGCTCGCCGGCAGCGGCGGGTCCGGGCCCCGGGGGATCCAGGCTCTGCTGTGTGCGTGCACCAGCTGCCTACAGACCAACTACACCTGTGAGACAGATGGGGCTTGCATGGTCTCCATCTTTAACCTGGATGGCGTGGAGCACCATGTACGTACCTGCATCCCCAAGGTGGAGCTGGTTCCTGCTGGAAAGCCCTTCTACTGCCTGAGTTCAGAGGATCTGCGCAACACACACTGCTGCTATATTGACTTCTGCAACAAGATTGACCTCAGGGTCCCCAGCGGACACCTCAAGGAGCCTGCGCACCCCTCCATGTGGGGCCCTGTGGAGCTGGTCGGCATCATCGCCGGCCCCGTCTTCCTCCTCTTCCTTATCATTATCATCGTCTTCCTGGTCATCAACTATCACCAGCGTGTCTACCATAACCGCCAGAGGTTGGACATGGAGGACCCCTCTTGCGAGATGTGTCTCTCCAAAGACAAGACGCTCCAGGATCTCGTCTACGACCTCTCCACGTCAGGGTCTGGCTCAGGGTTACCCCTTTTTGTCCAGCGCACAGTGGCCCGAACCATTGTTTTACAAGAGATTATCGGCAAGGGCCGGTTCGGGGAAGTATGGCGTGGTCGCTGGAGGGGTGGTGACGTGGCTGTGAAAATCTTCTCTTCTCGTGAAGAACGGTCTTGGTTCCGTGAAGCAGAGATCTACCAGACCGTCATGCTGCGCCATGAAAACATCCTTGGCTTTATTGCTGCTGACAATAAAGATAATGGCACCTGGACCCAGCTGTGGCTTGTCTCTGACTATCACGAGCATGGCTCACTGTTTGATTATCTGAACCGCTACACAGTGACCATTGAGGGAATGATTAAGCTAGCCTTGTCTGCAGCCAGTGGTTTGGCACACCTGCATATGGAGATTGTGGGCACTCAAGGGAAGCCGGGAATTGCTCATCGAGACTTGAAGTCAAAGAACATCCTGGTGAAAAAAAATGGCATGTGTGCCATTGCAGACCTGGGCCTGGCTGTCCGTCATGATGCGGTCACTGACACCATAGACATTGCTCCAAATCAGAGGGTGGGGACCAAACGATACATGGCTCCTGAAGTCCTTGACGAGACAATCAACATGAAGCACTTTGACTCCTTCAAATGTGCCGACATCTATGCCCTCGGGCTTGTCTACTGGGAGATTGCACGAAGATGCAATTCTGGAGGAGTCCATGAAGACTATCAACTGCCGTATTACGACTTAGTGCCCTCCGACCCTTCCATTGAGGAGATGCGAAAGGTTGTATGTGACCAGAAGCTACGGCCCAATGTCCCCAACTGGTGGCAGAGTTATGAGGCCTTGCGAGTGATGGGAAAGATGATGCGGGAGTGCTGGTACGCCAATGGTGCTGCCCGTCTGACAGCTCTGCGCATCAAGAAGACTCTGTCCCAGCTAAGCGTGCAGGAAGATGTGAAGATTTAAGCTGTTCCTCTGCCTACACAAAGAACCTGGGCAGTGAGGATGACTGCAGCCACCGTGCAAGCGTCGTGGAGGCCTACCTCTTGTTTCTGCCCGGCCCTCTGGCCAGAGCCCTGGCCTGCAAGAGGGACAGAGCCTGGGAGACGCGCACTCCCGTTGGGTTTGAGACAGACACTTTTTATATTTACCTCCTGATGGCATGGAGACTCTGAGCAAATCATGTAGACAACTCAATGCCACAACTCAAACTGCTTGCAGTGGGAAGTACAGAGAGCCCAGTGCATCTGGCGTGTTGCCAGGAGCGGTGAAGGGTGCTGGGCTCGCCCAGGAGCGGCCCCCATACCTTGTGGTCCACTGGGCTGCAGGTTTTCCTCCAGGGACCAGTCAACTGGCATCAAGATATTGAGAGGAACCGGAAGTTTCCTCCCTCCTTCCCGTAGGCAGTCCTGAGCCACACCATCCCTTCTCATGGACATCCGGAGGGACTGCCCCTAGAGACACAACCTGCTGCCTGTCTGTCCAGCCAAGTGCGCATGTGCCGAGGTGTGTCCCACATTGTGCCTGGTCTGTGCCACGCCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGAGTGTGTGTGTGTACACTTAACCTGCTTGAGCTTTCTGTGCATGTGTAGGCCAGGGTGTGGTGGCCATACTGTCTCTGAGTGCTGCTGCTTCTCAGTGAGCAGCATGTAGTTAACCTGGTGCCCTCCTAGGTGTCTCCTGTCCCCAGACCCCATCAGTCAGGGAGGTTCTGTCTTCTCAGCAGGCTGCTTGCCCACCCTGTGTCACAGGCCCTCCTCTTCCATTTCAGACCAGAACCAAAGCTGGCCCACTTGTCCATGGTAGGAGAAGCTTTTGGGTCAAAATGAGGGGGACTTGATGAGCAGAGAGAGAATGTAGGTGGAAGTCTTGGGTGCTGTGTTTCAGCATCAGCCATGGGAAATGAGCCAGCCCAAGGGCATCTTCCTTGACAGCTGTGAGGAAGGGCCGAGGAATCCGAAGCCAGAGCTTGGGACTCAGATTGGAATGTAACATCTGTTTATGTCCCACCCCAGATTCTGCAAACTGCAGTGTATATTTTTGGTGGTGGGTTTGGGGTGGGAAGGGATGGGTTGCAGGGCGTGGGGAGGGAGGCTGGGGTGGGAGGGAGGCATCTGCATGGGCTTCTTGTACTGGATTCTCTGATCAGGGTAGAGAAGAGGCAAGGCTTGCATCCACTTCAGGGTCCCTACTGAGGAGAGTGAGCGGTCCGAGCTGAATATGGTGTTTAACCTAAGTTTAGTATTTAATGAATTCTAGAAGCCTGGCTGTGGGTGGTGATTTGGTCAGCATATCTTAGGTATATAATAACTTTGAAGCCATAACTTTTTAACTGGAGTGGTTTATTTTAATTCAGTTTATTTTATTTTATTTTGGGGGGAGGGTCAGGATTTTAACTTTAATATTGTTAAGTTTTGTAAAAGGAGAACCATCTCTGTGACAATTACCTCTTAGTCTGTTTGTTTTTAAAGAAATCCCTAAAACAAACAAAACACAAAAATTCTCCAGACTCAAACGCACATAGTTCAGTCACTGGAAACGCTTGTCTTTGCACCTGAGCCTGATCCCGCTGAGCAGTGAGGGCTGCTTTTCCCCATGGGGGCTTGCTGTCTCGTACTCCCTGCACCCTCGGCCCCATCCCGTGAGCACCTCGGCCCTCTGCACATTGCCCGGCTGGTTGGACCCTTTCCAGATACTTGCTCAGCAAATGTGGGCTGCGAGCCTGCTGAGCGCTGGCCCGGGAGGATCTCCTCAGGGTGGGGCAGGCTTGGGCGCTGCTCTGCTCCTCTACCACTGGAGGGAATGGAATCATGCGATGGGCGAGCACCTGCTGTGGAGACCAGAAGTGCTCATGGCTGGTCCTGAGAGCCTTGATGAGCTAGGATCACTGTTCTTAAAGACCACTGAAACTGGAAGGGGGACCTGTATCCCCTTGGGAAGAGAAGCCCCTGGCAAGCAGTGGGTCCTGGAGACTGGGTTCATTGTGAGCCTTTCCTGCCAGGGGAGGCATGAGTCTTTGCAGGGAAACTGTCTCCTCCAGCTTCTCCTGCCTTGGTCTCCCCATATTCTTAGCCTTTCTATTTATTTCCTGGTGTATAACTTTCCTTGCTTTAAAGGGATCTTCCTTTAATTCCTTGGGCCAATTTACTGGCCATTGAACAGTGTCCCTTGAGTCCCAACTGTGTCTCTGGGGAACCTCCTTACCCACCCCTGCTGACCTCCCACTTCCCACCCTGCAGCTGAGTATCCGTGATTACAGGCGATTGAACTGTAGAGTCCTCTCTGCCTCTGTACCTGCCAGCAGCAGCCTCACAGTGACCCCCACGCCACTGGACAACTCCCAGGAGACCTGTGCGCTCCGTGCAGCTCAGCTCAGCCGCCTCTCAGGAAGCCTGGAGCAGGTCTGGGGGACCCCCCCCCCATCACTCTTTACATTAAGCTGAGAGTTGGGAGAAGCTGTGCTTTGGCTCCCTGAGGCCACCCTGATCCACGGGGCACCCGCACCTCTGCGTTCTGGATTCACAGACCAAGTCTAAAGCCCGTTCGTTCCTGAGTTGCCGTCAAGGCCCCTGAACGGTACTCTCGGTACTTCTGTTTGTTTTTTGTACAATTTATTAGAAAGGACTGTAAAATAGCCACTTAGACACTTTACCTCTCCAGTATGCAAATGTAAATATATTGTAATATAGGAAATTTTTGTTTTAATATAAGAATGAGCCTGTCCAGTTTCTGCTGTACATTATTAAAGTTTTATTCACAGAACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA(配列番号522)。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、例えば、以下に提供されるように、ラットACVR1配列と相補性のある領域を有し得る(遺伝子ID:29381;NCBI参照番号:NM_199230.1)
GGCGGCGGTTACTATGGCGGAGTCGGCCGGAGCCTCCTCCTTCTTCCCCCTTGTTGTCCTCCTGCTCGCCGGCAGTGGCGGGTCCGGGCCCCGGGGGATCCAGGCTCTGCTGTGTGCATGCACCAGCTGCCTACAGACCAACTACACCTGCGAAACAGATGGGGCCTGCATGGTCTCCATCTTTAACCTGGATGGCATGGAGCACCACGTACGCACCTGCATCCCCAAGGTGGAGCTTGTGCCTGCTGGGAAGCCCTTCTACTGCCTGAGTTCAGAGGACCTGCGCAACACGCACTGCTGCTATATTGACTTCTGCAACAAGATTGACCTGAGGGTGCCCAGTGGACACCTCAAGGAGCCTGAGCACCCCTCCATGTGGGGCCCTGTGGAGCTGGTCGGCATCATTGCCGGTCCTGTCTTCCTCCTCTTCCTCATCATCATCATCGTCTTCCTGGTCATCAACTATCATCAGCGTGTCTACCACAACCGCCAAAGACTGGACATGGAGGACCCCTCATGTGAGATGTGTCTCTCCAAAGACAAGACGCTCCAGGATCTCGTCTACGATCTCTCCACTTCAGGATCGGGCTCAGGGTTACCCCTTTTTGTCCAGCGCACAGTGGCCCGAACCATTGTTTTACAAGAGATTATCGGCAAGGGCCGGTTTGGGGAAGTATGGCGTGGCCGCTGGAGGGGTGGTGATGTGGCTGTGAAAATCTTCTCTTCCCGTGAAGAGCGGTCGTGGTTCCGGGAGGCAGAGATCTACCAGACTGTCATGCTGCGCCATGAAAACATCCTTGGGTTTATTGCTGCTGACAATAAAGACAATGGCACCTGGACCCAGCTGTGGCTTGTCTCTGACTATCACGAGCACGGCTCACTGTTCGATTATCTGAACCGCTACACAGTGACCATTGAGGGGATGATTAAACTGGCCCTGTCTGCAGCCAGTGGTTTGGCACACCTGCATATGGAGATTGTGGGCACTCAGGGGAAGCCTGGAATTGCTCATCGAGACTTGAAGTCAAAGAACATTCTGGTGAAGAAGAATGGCATGTGTGCCATTGCAGACCTGGGCCTAGCTGTCCGTCACGATGCTGTCACTGACACCATAGACATTGCTCCAAATCAGAGGGTGGGAACCAAACGATACATGGCTCCTGAAGTACTTGACGAGACCATCAACATGAAGCACTTTGACTCCTTCAAGTGTGCCGATATCTACGCCCTCGGGCTTGTCTATTGGGAGATTGCTCGGAGGTGCAATTCTGGAGGAGTCCATGAAGAGTATCAACTGCCATATTATGATTTAGTGCCCTCTGACCCTTCCATTGAGGAAATGCGAAAGGTCGTCTGTGACCAGAAGCTACGGCCCAATGTCCCCAACTGGTGGCAGAGTTATGAGGCCTTGCGAGTGATGGGGAAGATGATGCGGGAGTGCTGGTACGCCAATGGTGCTGCCCGCCTGACAGCGCTGCGCATCAAGAAGACTTTGTCCCAGCTAAGCGTGCAGGAAGACGTGAAGATTTAAGCTGTTCCTCTGCCTACGCAAAGAACCTGGGCAGTGAGGATGCCTGCAGCCACCGTGCAAGCGTGGAGGCCTACCTCTTGTTTCTGCCCAGCCCTCTGGCCAGAGCCCTGGTCTGCAAGAGGGACAGAGCCTGGGAGACGCACACTCCCTACTGGGTTTGAGACAGACACTTTTTATATTTACCTCCTGATGGCATGGAGACTCTGAGAGCAAATCATGTAGATGACTCGATGCCACAACTCGCACTGCGTGCAGTGGGAAGGACAGAAAGCCCAGTGCATCTGGCATGTTGCCAGGAGTGGTGATGGGTGCTGGGCTCGCCTGGGAGCAGCCCCCATACCGTGTTGTCCACTGGACTGCAGGTTTCCTCCAGGGACCAGTCAACTGGCAGATACTGAGAGGAACCGGAAGTGTCCTCCCTTTTACCTGTGGGCAGTCCTGAGCCACGCCATCCCCTTCTCATCTGGAGGACCGCCCCTAGAGACACAACCTGCTGCCTGTCTGTCCAGCCAAGTGCGCATGTGCCGAGGTGTGTCTCACATTGTGCCTGGTCCGTGCCTCGCCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTTAGTGTAGGTGTGTGAGAGTGTGTGTGTAGGTGTGTGAGTGTGGGTGTGTGAGAGTGTGTGTAGGTGTATGTGAGTGTGTAAGTGTGTGTAGGTGTGTGAGTGTGTAGGTGTGTGAGTGTG(配列番号523)
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、例えば、Su, G.H. et al. Proc Natl Acad Sci U S A. 2001 Mar 13; 98(6): 3254-3257において報告されているように、ACVR1Bの突然変異体型と相補性のある領域を有し得、それらの内容は、それら全体が参照されることによって本明細書に組み込まれる。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号520、配列番号521、配列番号522、または配列番号523で表されるACVR1B配列と相補性のある領域を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号520、配列番号521、配列番号522、または配列番号523で表されるACVR1B配列に少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%相補的である相補性のある領域を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号520、配列番号521、配列番号522、または配列番号523で表されるACVR1B配列に完全に相補的である少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、または19の連続的なヌクレオチドを有する配列を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号520、配列番号521、配列番号522、または配列番号523で表されるACVR1B配列のRNAバージョン(すなわち、ここで、TはUに置き換えられている)を標的にする(例として、これに相補的である)配列を含み得る。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号520、配列番号521、配列番号522、または配列番号523で表されるACVR1B配列のRNAバージョンに相補的(例として、少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%相補的)である配列を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号520、配列番号521、配列番号522、または配列番号523で表されるACVR1B配列のRNAバージョンに完全に相補的である少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、または19の連続的なヌクレオチドを有する配列を含む。
いくつかの態様において、ACVR1B標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号496~519のいずれか1つを含む配列の少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、または19の連続的なヌクレオチドを含むアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、ACVR1B標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号496~519のいずれか1つを含むアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号496~519のいずれか1つの少なくとも12または少なくとも15の連続的なヌクレオチドと少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、または97%の配列同一性を含む、共有するアンチセンス鎖を含む。
いくつかの態様において、ACVR1B標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号374~421のいずれか1つを含むACVR1B配列を標的にするアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、配列番号374~421のいずれか1つを含むACVR1B配列に相補的である少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、または19のヌクレオチド(例として、連続的なヌクレオチド)を含むアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、ACVR1B標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号374~421のいずれか1つの少なくとも12または少なくとも15の連続的なヌクレオチドと少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、または97%相補的である配列を含むアンチセンス鎖を含む。
いくつかの態様において、ACVR1B標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号374~421のいずれか1つで表される標的配列と相補性のある領域を含むアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、相補性のある領域は、長さが少なくとも8、少なくとも9、少なくとも10、少なくとも11、少なくとも12、少なくとも13、少なくとも14、少なくとも15、少なくとも16、少なくとも17、または少なくとも19ヌクレオチドである。いくつかの態様において、相補性のある領域は、長さが8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、または19ヌクレオチドである。いくつかの態様において、相補性のある領域は、長さが8~20、10~20、または15~20ヌクレオチドの範囲にある。いくつかの態様において、相補性のある領域は、その標的配列のすべてまたは一部と完全に相補的である。いくつかの態様において、相補性のある領域は、1、2、または3以上のミスマッチを含む。
いくつかの態様において、ACVR1B標的化オリゴヌクレオチドは、アンチセンス鎖にハイブリダイズして二本鎖siRNAを形成するセンス鎖をさらに含む。いくつかの態様において、ACVR1B標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号496~519のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、ACVR1B標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号398~421のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むセンス鎖をさらに含む。
いくつかの態様において、ACVR1B標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号496~519のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むアンチセンス鎖、およびアンチセンス鎖にハイブリダイズし、配列番号398~421のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むセンス鎖を含む二本鎖オリゴヌクレオチド(例として、siRNA)であり、ここで、アンチセンス鎖および/または(例として、および)は、1以上の修飾ヌクレオシド(例として、2’-修飾ヌクレオシド)を含む。いくつかの態様において、1以上の修飾ヌクレオシドは、2’-O-Meおよび2’-F修飾ヌクレオシドから選択される。
いくつかの態様において、ACVR1B標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号496~519のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むアンチセンス鎖、およびアンチセンス鎖にハイブリダイズし、配列番号398~421のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むセンス鎖を含む二本鎖オリゴヌクレオチド(例として、siRNA)であり、ここで、アンチセンス鎖における各ヌクレオシドおよび/または(例として、および)センス鎖における各ヌクレオシドは、2’-O-Meおよび2’-F修飾ヌクレオシドから選択される2’-修飾ヌクレオシドである。
いくつかの態様において、ACVR1B標的化オリゴヌクレオチドは、配列番号496~519のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むアンチセンス鎖、およびアンチセンス鎖にハイブリダイズし、配列番号398~421のいずれか1つのヌクレオチド配列を含むセンス鎖を含む二本鎖オリゴヌクレオチド(例として、siRNA)であり、ここで、アンチセンス鎖における各ヌクレオシドおよびセンス鎖における各ヌクレオシドは、2’-O-Meおよび2’-F修飾ヌクレオシドから選択される2’-修飾ヌクレオシドであり、およびここで、アンチセンス鎖および/または(例として、および)センス鎖は各々、1以上のホスホロチオアートヌクレオシド間連結を含む。いくつかの態様において、センス鎖は、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結を含まず(センス鎖におけるすべてのヌクレオシド間連結は、ホスホジエステルヌクレオシド間連結であり)、アンチセンス鎖は、1、2、または3ホスホロチオアートヌクレオシド間連結を含む。いくつかの態様において、アンチセンス鎖は、2つのホスホロチオアートヌクレオシド間連結を含み、任意にここで、アンチセンス鎖の3’末端における2つのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結であり、アンチセンス鎖における残りのヌクレオシド間連結は、ホスホジエステルヌクレオシド間連結である。
いくつかの態様において、ACVR1B標的化オリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖は、以下(5’~3’)の構造を含む:
fNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmN*fN*mN、ここで、「mN」は、2’-O-メチル(2’-O-Me)修飾ヌクレオシドを示し;「fN」は、2’-フルオロ(2’-F)修飾ヌクレオシドを示し;「*」は、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結を示し;2つのヌクレオシド間の「*」の不在は、ホスホジエステルヌクレオシド間連結を示す。
いくつかの態様において、ACVR1B標的化オリゴヌクレオチドのセンス鎖は、以下(5’~3’)の構造を含む:
mNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfNmNfN、ここで、「mN」は、2’-O-メチル(2’-O-Me)修飾ヌクレオシドを示し;「fN」は、2’-フルオロ(2’-F)修飾ヌクレオシドを示し;2つのヌクレオシド間の「*」の不在は、ホスホジエステルヌクレオシド間連結を示す。
いくつかの態様において、ACVR1B標的化オリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖は、表17中に挙げられた配列番号496~519の修飾されたバージョンから選択される。いくつかの態様において、ACVR1B標的化オリゴヌクレオチドのセンス鎖は、表17中に挙げられた配列番号398~421の修飾されたバージョンから選択される。いくつかの態様において、ACVR1B標的化オリゴヌクレオチドは、表17中に挙げられたsiRNAから選択されるsiRNAである。
表15.ACVR1B標的配列
Figure 2023512441000033
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、表16において提供されるような任意の配列を含み得るか、またはそれからなり得る。
表16.ACVR1Bを標的にするためのオリゴヌクレオチド配列
Figure 2023512441000034
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、表17において提供されるような修飾されたオリゴヌクレオチドであり、ここで、「mN」は、2’-O-メチル修飾ヌクレオシドを表し(例として、mUは、2’-O-メチル修飾されたウリジンである)、「fN」は、2’-フルオロ修飾ヌクレオシドを表し(例として、fUは、2’-フルオロ修飾ウリジンである)、「*」は、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結を表し、ヌクレオシド間の「*」の欠如は、ホスホジエステルヌクレオシド間連結を示す。
表17.ACVR1Bを標的にするための修飾されたオリゴヌクレオチド
Figure 2023512441000035

Figure 2023512441000036
いくつかの態様において、MSTN標的化オリゴヌクレオチド、INHBA標的化オリゴヌクレオチド、またはACVR1B標的化オリゴヌクレオチドのいずれか1つは、例として、ナトリウム、カリウム、またはマグネシウム塩として塩形態であり得る。
いくつかの態様において、本明細書に記載のオリゴヌクレオチド(例として、表10、11、13、14、16、および17中に挙げられたオリゴヌクレオチド)のいずれか1つの5’または3’ヌクレオシド(例として、末端ヌクレオシド)は、任意にスペーサーを介してアミン基に抱合される。いくつかの態様において、スペーサーは脂肪族部分を含む。いくつかの態様において、スペーサーはポリエチレングリコール部分を含む。いくつかの態様においては、ホスホジエステル連結がスペーサーとオリゴヌクレオチドの5’または3’ヌクレオシドとの間に存在する。いくつかの態様において、本明細書に記載のオリゴヌクレオチド(例として、表10、11、13、14、16、および17中に挙げられたオリゴヌクレオチド)のいずれかの5’または3’ヌクレオシド(例として、末端ヌクレオシド)はスペーサーに抱合され、これが置換もしくは非置換の脂肪族、置換もしくは非置換のヘテロ脂肪族、置換もしくは非置換のカルボシクリレン、置換もしくは非置換のヘテロシクリレン、置換もしくは非置換のアリーレン、置換もしくは非置換のヘテロアリーレン、-O-、-N(R)-、-S-、-C(=O)-、-C(=O)O-、-C(=O)NR-、-NRC(=O)-、-NRC(=O)R-、-C(=O)R-、-NRC(=O)O-、-NRC(=O)N(R)-、-OC(=O)-、-OC(=O)O-、-OC(=O)N(R)-、-S(O)NR-、-NRS(O)-、またはそれらの組み合わせであり;各Rは独立して水素または置換もしくは非置換のアルキルである。ある種の態様において、スペーサーは置換もしくは非置換のアルキレン、置換もしくは非置換のヘテロシクリレン、置換もしくは非置換のヘテロアリーレン、-O-、-N(R)-、または-C(=O)N(R、あるいはそれらの組み合わせである。
いくつかの態様において、本明細書に記載のオリゴヌクレオチド(例として、表10、11、13、14、16、および17中に挙げられたオリゴヌクレオチド)のいずれか1つの5’または3’ヌクレオシドは、式-NH-(CH-の化合物に抱合され、nは1~12の整数である。いくつかの態様において、nは6、7、8、9、10、11、または12である。いくつかの態様においては、ホスホジエステル連結が式NH-(CH-の化合物とオリゴヌクレオチドの5’または3’ヌクレオシドとの間に存在する。いくつかの態様において、式NH-(CH-の化合物は6-アミノ-1-ヘキサノール(NH-(CH-OH)とオリゴヌクレオチドの5’リン酸との間の反応によってオリゴヌクレオチドに抱合される。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、標的化薬剤、例えば抗TfR抗体などの筋標的化剤に例えばアミン基を介して抱合される。
a.オリゴヌクレオチドサイズ/配列
オリゴヌクレオチドは、例としてフォーマットに応じて、様々な異なる長さのものであってもよい。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、長さが7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、35、40、45、50、75ヌクレオチドであるか、またはこれより長い。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、長さが8~50ヌクレオチド、長さが8~40ヌクレオチド、長さが8~30ヌクレオチド、長さが10~15ヌクレオチド、長さが10~20ヌクレオチド、長さが15~25ヌクレオチド、長さが21~23ヌクレオチド等々である。
いくつかの態様において、本開示の目的上オリゴヌクレオチドの相補的な核酸配列は、前記配列の標的分子(例として、mRNA)への結合が標的(例として、mRNA)の正常な機能に干渉して活性の喪失(例として、翻訳の阻害)または発現の喪失(例として、標的mRNAの分解)を引き起こしたとき、かつ非特異的結合の回避が所望される条件下、例として、in vivoアッセイまたは治療処置のケースおよびin vitroアッセイのケースにおける生理学的な条件下、アッセイがストリンジェンシー(stringency)の好適な条件下で実施される条件下で、前記配列の非標的配列への非特異的結合を回避するのに充分な程度の相補性があるとき、標的核酸に特異的にハイブリダイズ可能であるか、または標的核酸に特異的である。よって、いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、標的核酸の連続したヌクレオチドに少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%相補的であってもよい。いくつかの態様において、相補的なヌクレオチド配列は、標的核酸に特異的にハイブリダイズ可能であるか、または標的核酸に特異的であるその標的の配列に100%相補的である必要はない。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、長さが8~15、8~30、8~40、または10~50、または5~50、または5~40ヌクレオチドの範囲にある標的核酸と相補性のある領域を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドの、標的核酸と相補性のある領域は、長さが5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、または50ヌクレオチドである。いくつかの態様において、相補性のある領域は、標的核酸の少なくとも連続した8ヌクレオチドと相補的である。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、標的核酸の一部の連続したヌクレオチドと比較して1、2または3塩基ミスマッチを含有していてもよい。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、15塩基にわたり最大3ミスマッチまで、または10塩基にわたり最大2ミスマッチまで有していてもよい。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、本明細書に提供されるアンチセンス鎖(例として、表10、11、13、14、16、および17中に挙げられたアンチセンス鎖)のいずれか1つの標的配列に(例として、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または100%)相補的であるアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、かかる標的配列は、表10、11、13、14、16、および17中に挙げられたオリゴヌクレオチドに100%相補的である。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、本明細書に提供される(例として、表9、12、および15における)オリゴヌクレオチドの標的RNA配列に(例として、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または100%)相補的であるヌクレオチド配列を含むアンチセンス鎖を含むsiRNA分子である。
いくつかの態様において、本明細書に提供されるオリゴヌクレオチド(例として、表10、11、13、14、16、および17中に挙げられたオリゴヌクレオチド)のいずれか1つにおけるチミン塩基(T)の任意の1以上は、任意にウラシル塩基(U)であり得、および/またはUの任意の1以上は、任意にTであり得る。
b.オリゴヌクレオチド修飾:
本明細書に記載のオリゴヌクレオチドは、修飾されていてもよく、例として、修飾された糖部、修飾されたヌクレオシド間連結、修飾ヌクレオチド、および/またはそれらの組み合わせを含む。加えて、いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、以下の特性の1以上を呈してもよい:選択的スプライシングを媒介しない;免疫刺激性ではない;ヌクレアーゼ抵抗性である;非修飾オリゴヌクレオチドと比較して改善された細胞取り込みを有する;細胞または哺乳動物への毒性がない;改善されたエンドソームの内部への出口(exit)を細胞中に有する;TLR刺激を最小限に抑える;または、パターン認識受容体を回避する。本明細書に記載のオリゴヌクレオチドの修飾された化学的性質またはフォーマットのいずれも、互いに組み合わせられ得る。例えば、1、2、3、4、5、またはこれより多くの異なるタイプの修飾が、同じオリゴヌクレオチド内に包含され得る。
いくつかの態様において、修飾が組み込まれるオリゴヌクレオチドを、ネイティブなオリゴデオキシヌクレオチド分子またはオリゴリボヌクレオチド分子よりヌクレアーゼ消化に耐性があるようにさせる、特定のヌクレオチド修飾が使用されてもよい;これらの修飾されたオリゴヌクレオチドは、非修飾オリゴヌクレオチドより長時間無傷で存続する。修飾されたオリゴヌクレオチドの特定例は、修飾された主鎖、例えば、ホスホロチオアート、ホスホトリエステル、メチルホスホナート、短鎖アルキルもしくはシクロアルキル糖間連結、または短鎖ヘテロ原子のもしくは複素環式の糖間連結などの修飾されたヌクレオシド間連結を含むものを包含する。結果的に、本開示のオリゴヌクレオチドは、修飾、例として、ヌクレオチド修飾の組み込みなどによる核酸分解に対して安定化され得る。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの2~10、2~15、2~16、2~17、2~18、2~19、2~20、2~25、2~30、2~40、2~45ヌクレオチド、またはこれより多いヌクレオチドが修飾ヌクレオチドである、長さが最大50ヌクレオチドまでまたは最大100ヌクレオチドまでのオリゴヌクレオチドであってもよい。オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの2~10、2~15、2~16、2~17、2~18、2~19、2~20、2~25、2~30ヌクレオチドが修飾ヌクレオチドである、長さが8~30ヌクレオチドのオリゴヌクレオチドであってもよい。オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの2~4、2~5、2~6、2~7、2~8、2~9、2~10、2~11、2~12、2~13、2~14ヌクレオチドが修飾ヌクレオチドである、長さが8~15ヌクレオチドのオリゴヌクレオチドであってもよい。任意に、オリゴヌクレオチドは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10ヌクレオチドを除き、どのヌクレオチドも修飾されていてもよい。オリゴヌクレオチド修飾は本明細書にさらに記載されている。
c.修飾ヌクレオシド
いくつかの態様において、本明細書に記載のオリゴヌクレオチドは、糖の2’位において修飾された少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは少なくとも1つの2’修飾ヌクレオシドを含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチド上のヌクレオシドのすべては2’修飾ヌクレオシドである。
いくつかの態様において、本明細書に記載のオリゴヌクレオチドは、1以上の非二環式2’-修飾ヌクレオチド、例として、2’-デオキシ、2’-フルオロ(2’-F)、2’-O-メチル(2’-O-Me)、2’-O-メトキシエチル(2’-O-MOE)、2’-O-アミノプロピル(2’-O-AP)、2’-O-ジメチルアミノエチル(2’-O-DMAOE)、2’-O-ジメチルアミノプロピル(2’-O-DMAP)、2’-O-ジメチルアミノエチルオキシエチル(2’-O-DMAEOE)、または2’-O--N-メチルアセトアミド(2’-O--NMA)の修飾ヌクレオシドを包含する。
いくつかの態様において、本明細書に記載のオリゴヌクレオチドは、1以上の2’-4’二環式ヌクレオシドを含むが、前記ヌクレオシド中リボース環は、その環中2個の原子を接続する(例として、メチレン(LNA)架橋、エチレン(ENA)架橋、または(S)-拘束エチル(cEt)架橋を介して、2’-O原子を4’-C原子へ接続する)架橋部分を含む。LNAの例は、2008年4月17日に公開され「RNA Antagonist Compounds For The Modulation Of PCSK9」と題する国際特許出願刊行物WO/2008/043753(この内容は、その全体が参照されることによって本明細書に組み込まれる)に記載されている。本明細書に開示のオリゴヌクレオチドに使用されてもよい他の修飾は、エチレン架橋核酸(ENA)を包含する。ENAは、これらに限定されないが、2’-O,4’-C-エチレン架橋核酸を包含する。ENAの例は、2005年5月12日に公開され「APP/ENA Antisense」と題する国際特許刊行物第WO 2005/042777号;Morita et al.,Nucleic Acid Res.,Suppl 1:241-242,2001;Surono et al.,Hum.Gene Ther.,15:749-757,2004;Koizumi,Curr.Opin.Mol.Ther.,8:144-149,2006;およびHorie et al.,Nucleic Acids Symp.Ser(Oxf),49:171-172,2005に提供されており、これらの開示はそれらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。cEtの例は、米国特許7,101,993;7,399,845および7,569,686に提供されており、これら各々はそれら全体が参照により本明細書に組み込まれる。。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、以下の米国特許または特許出願刊行物のうち1つに開示された修飾ヌクレオシドを含む:米国特許7,399,845、2008年7月15日発行、表題「6-Modified Bicyclic Nucleic Acid Analogs」;米国特許7,741,457、2010年6月22日発行、表題「6-Modified Bicyclic Nucleic Acid Analogs」;米国特許8,022,193、2011年9月20日発行、表題「6-Modified Bicyclic Nucleic Acid Analogs」;米国特許7,569,686、2009年8月4日発行、表題「Compounds And Methods For Synthesis Of Bicyclic Nucleic Acid Analogs」;米国特許7,335,765、2008年2月26日発行、表題「Novel Nucleoside And Oligonucleotide Analogues」;米国特許7,314,923、2008年1月1日発行、表題「Novel Nucleoside And Oligonucleotide Analogues」;米国特許7,816,333、2010年10月19日発行、表題「Oligonucleotide Analogues And Methods Utilizing The Same」および米国刊行物第2011/0009471号、現在米国特許8,957,201、2015年2月17日発行、表題「Oligonucleotide Analogues And Methods Utilizing The Same」、すべての用途において(for all purposes)、これら各々の内容全体は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも1個の修飾ヌクレオシドも有さないオリゴヌクレオチドと比較して、1℃、2℃、3℃、4℃、または5℃の範囲にあるオリゴヌクレオチドのTmの増大をもたらす少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む。オリゴヌクレオチドは、修飾ヌクレオシドを有さないオリゴヌクレオチドと比較して、合計で2℃、3℃、4℃、5℃、6℃、7℃、8℃、9℃、10℃、15℃、20℃、25℃、30℃、35℃、40℃、45℃、またはこれを超える温度の範囲にあるオリゴヌクレオチドのTmの増大をもたらす複数の修飾ヌクレオシドを有していてもよい。
オリゴヌクレオチドは、異なる種類のヌクレオシドのミックスを含み得る。例えば、オリゴヌクレオチドは、2’-デオキシリボヌクレオシドまたはリボヌクレオシドおよび2’-フルオロ修飾ヌクレオシドのミックスを含み得る。オリゴヌクレオチドは、デオキシリボヌクレオシドまたはリボヌクレオシドおよび2’-O-Me修飾ヌクレオシドのミックスを含み得る。オリゴヌクレオチドは、2’-フルオロ修飾ヌクレオシドおよび2’-O-Me修飾ヌクレオシドのミックスを含み得る。オリゴヌクレオチドは、2’-4’二環式ヌクレオシドおよび2’MOE、2’-フルオロ、または2’-O-Me修飾ヌクレオシドのミックスを含み得る。オリゴヌクレオチドは、非二環式2’修飾ヌクレオシド(例として、2’-MOE、2’-フルオロ、または2’-O-Me)および2’-4’二環式ヌクレオシド(例として、LNA、ENA、cEt)のミックスを含み得る。
オリゴヌクレオチドは、異なる種類の交互のヌクレオシドを含み得る。例えば、オリゴヌクレオチドは、交互の2’-デオキシリボヌクレオシドまたはリボヌクレオシドおよび2’-フルオロ修飾ヌクレオシドを含み得る。オリゴヌクレオチドは、交互のデオキシリボヌクレオシドまたはリボヌクレオシドおよび2’-O-Me修飾ヌクレオシドを含み得る。オリゴヌクレオチドは、交互の2’-フルオロ修飾ヌクレオシドおよび2’-O-Me修飾ヌクレオシドを含み得る。オリゴヌクレオチドは、交互の2’-4’二環式ヌクレオシドおよび2’-MOE、2’-フルオロ、または2’-O-Me修飾ヌクレオシドを含み得る。オリゴヌクレオチドは、交互の非二環式2’修飾ヌクレオシド(例として、2’-MOE、2’-フルオロ、または2’-O-Me)および2’-4’二環式ヌクレオシド(例として、LNA、ENA、cEt)を含み得る。
いくつかの態様においては、本明細書に記載のオリゴヌクレオチドは、5’-ビニルホスホン酸修飾、1以上の無塩基残基、および/または1以上の逆向きの無塩基残基を含む。
d.ヌクレオチド間連結/主鎖
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、ホスホロチオアートまたは他の修飾ヌクレオシド間連結を含有していてもよい。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結を含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結を、少なくとも2個のヌクレオチド間に含む。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結を、すべてのヌクレオチド間に含む。例えば、いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、修飾ヌクレオシド間連結を、ヌクレオチド配列の5’または3’末端の、第1の、第2の、および/または(例として、および)、第3のヌクレオシド間連結にて含む。
使用されてもよい、リンを含有する連結は、これらに限定されないが、正常な3’-5’連結、これらの2’-5’連結類似体を有する、ホスホロチオアート、キラルのホスホロチオアート、ホスホロジチオアート、ホスホトリエステル、アミノアルキルホスホトリエステル、メチルおよび他のアルキルホスホナート(3’アルキレンホスホナートおよびキラルのホスホナートを含む)、ホスフィナート、ホスホロアミダート(3’-アミノホスホロアミダートおよびアミノアルキルホスホロアミダートを含む)、チオノホスホロアミダート、チオノアルキルホスホナート、チオノアルキルホスホトリエステル、ならびにボラノホスファートと、逆方向の極性を有するこれら(ここでヌクレオシド単位の隣接する対は3’-5’から5’-3’へまたは2’-5’から5’-2’へ連結されている)とを包含する;米国特許第3,687,808号;第4,469,863号;第4,476,301号;第5,023,243号;第5,177,196号;第5,188,897号;第5,264,423号;第5,276,019号;第5,278,302号;第5,286,717号;第5,321,131号;第5,399,676号;第5,405,939号;第5,453,496号;第5,455,233号;第5,466,677号;第5,476,925号;第5,519,126号;第5,536,821号;第5,541,306号;第5,550,111号;第5,563,253号;第5,571,799号;第5,587,361号;および第5,625,050号を見よ。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、メチレン(メチルイミノ)またはMMI主鎖;アミド主鎖(De Mesmaeker et al.Ace.Chem.Res.1995,28:366-374を見よ);モルホリノ主鎖(SummertonおよびWeller、米国特許第5,034,506号を見よ);またはペプチド核酸(PNA)主鎖(ここでオリゴヌクレオチドのホスホジエステル主鎖がポリアミド主鎖に置き換えられており、ヌクレオチドがポリアミド主鎖のアザ窒素原子へ直接的または間接的に結合されている、Nielsen et al.,Science 1991,254,1497を見よ)などのヘテロ原子主鎖を有していてもよい。
e.立体特異的オリゴヌクレオチド
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドのヌクレオチド間のリン原子はキラルであり、およびオリゴヌクレオチドの特性はキラルのリン原子の立体配置に基づき調整される。いくつかの態様において、適切な方法は、立体制御されたやり方(例として、Oka N, Wada T, Stereocontrolled synthesis of oligonucleotide analogs containing chiral internucleotidic phosphorus atoms.Chem Soc Rev.2011 Dec;40(12):5829-43に記載のとおりの)でP-キラルオリゴヌクレオチド類似体を合成するために使用されてもよい。いくつかの態様において、実質的にすべてのSpホスホロチオアート糖間連結または実質的にすべてのRpホスホロチオアート糖間連結のいずれかによって一緒に結び合わされたヌクレオシド単位を含む、ホスホロチオアート含有オリゴヌクレオチドが提供される。いくつかの態様において、実質的にキラル純粋な糖間連結を有するかかるホスホロチオアートオリゴヌクレオチドは、例えば、1996年12月12日に発行された米国特許5,587,261(この内容は全体が参照されることによって本明細書に組み込まれる)に記載されるとおり、酵素合成または化学合成によって調製される。いくつかの態様において、キラル制御されたオリゴヌクレオチドは、標的核酸の選択的切断パターンを提供する。例えば、いくつかの態様において、キラル制御されたオリゴヌクレオチドは、例えば、2017年2月2日に公開された表題「CHIRAL DESIGN」の米国特許出願刊行物20170037399 A1(この内容は全体が参照されることによって本明細書に組み込まれる)に記載のとおり、核酸の相補的な配列内に単一の切断部位を提供する。
f.モルホリノ
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、モルホリノをベースとした化合物であってもよい。モルホリノをベースとしたオリゴマー化合物は、Dwaine A.Braasch and David R.Corey,Biochemistry,2002,41(14),4503-4510);Genesis,volume 30,issue 3,2001;Heasman,J.,Dev.Biol.,2002,243,209-214;Nasevicius et al.,Nat.Genet.,2000,26,216-220;Lacerra et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.,2000,97,9591-9596;および1991年7月23日発行の米国特許第5,034,506号に記載されている。いくつかの態様において、モルホリノをベースとしたオリゴマー化合物は、ホスホロジアミダートモルホリノオリゴマー(PMO)(例として、Iverson,Curr.Opin.Mol.Ther.,3:235-238,2001;およびWang et al.,J.Gene Med.,12:354-364,2010に記載のとおり;これらの開示はこれら全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
g.ペプチド核酸(PNA)
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドのヌクレオチド単位の糖とヌクレオシド間連結(主鎖)との両方とも、新規な基に置き換えられている。いくつかの態様において、塩基単位は、適切な核酸標的化合物とのハイブリダイゼーションのために維持されている。かかるオリゴマー化合物の1つである、優れたハイブリダイゼーション特性を有することが示されているオリゴヌクレオチド模倣物は、ペプチド核酸(PNA)と称される。PNA化合物中のオリゴヌクレオチドの糖-主鎖は、アミド含有主鎖、例えば、アミノエチルグリシン主鎖に置き換えられている。核酸塩基は保持されており、主鎖のアミド部分のアザ窒素原子へ直接的または間接的に結合されている。PNA化合物の調製を報告する代表的な刊行物は、これらに限定されないが、米国特許第5,539,082号;第5,714,331号;および第5,719,262号(これら各々は参照により本明細書に組み込まれる)を包含する。PNA化合物のさらなる教示は、Nielsen et al.,Science,1991,254,1497-1500から見出され得る。
h.Gapmer
いくつかの態様において、本明細書に記載のオリゴヌクレオチドは、gapmerである。gapmerオリゴヌクレオチドは一般に、ギャップ領域Yを囲むフランキング(flanking)領域としてXおよびZをもつ式5’-X-Y-Z-3’を有する。いくつかの態様において、式5’-X-Y-Z-3’のフランキング領域Xは、X領域、フランキング配列X、5’ウイング領域X、または5’ウイングセグメントともまた言われる。いくつかの態様において、式5’-X-Y-Z-3’のフランキング領域ZはZ領域、フランキング配列Z、3’ウイング領域Z、または3’ウイングセグメントともまた言われる。いくつかの態様において、式5’-X-Y-Z-3’のギャップ領域YはY領域、Yセグメント、またはギャップセグメントYともまた言われる。いくつかの態様において、ギャップ領域Yの各ヌクレオシドは2’-デオキシリボヌクレオシドであり、5’ウイング領域Xも3’ウイング領域Zもいずれかの2’-デオキシリボヌクレオシドを含有しない。
いくつかの態様において、Y領域は、RNAse HなどのRNAseをリクルートすることができる一続きのヌクレオチド、例えば6つ以上のDNAヌクレオチドの領域である。いくつかの態様において、gapmerは標的核酸に結合し、この点において、RNAseがリクルートされ、それから標的核酸を切断し得る。いくつかの態様において、Y領域は、高親和性修飾ヌクレオシド、例えば1から6つの高親和性修飾ヌクレオシドを含む領域XおよびZによって5’および3’両方をフランキングされる。高親和性修飾ヌクレオシドの例は、2’修飾ヌクレオシド(例として、2’-MOE、2’O-Me、2’-F)または2’-4’二環式ヌクレオシド(例として、LNA、cEt、ENA)を包含するが、これらに限定されない。いくつかの態様において、フランキング配列XおよびZは長さが1~20ヌクレオチド、1~8ヌクレオチド、または1~5ヌクレオチドであり得る。フランキング配列XおよびZは類似の長さまたは非類似の長さであり得る。いくつかの態様において、ギャップセグメントYは、長さが5~20ヌクレオチド、5~15、12ヌクレオチド、または6~10ヌクレオチドのヌクレオチド配列であり得る。
いくつかの態様において、gapmerオリゴヌクレオチドのギャップ領域は、DNAヌクレオチドに加えて、効率的なRNase H作用にとって許容されることが知られている修飾ヌクレオチド、例えばC4’置換ヌクレオチド、非環状ヌクレオチド、およびアラビノ型ヌクレオチドを含有し得る。いくつかの態様において、ギャップ領域は1以上の未修飾のヌクレオシド間を含む。いくつかの態様において、一方または両方のフランキング領域は、各々独立して、1以上のホスホロチオアートヌクレオシド間連結(例として、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結または他の連結)を少なくとも2、少なくとも3、少なくとも4、少なくとも5、またはより多くのヌクレオチド間に含む。いくつかの態様において、ギャップ領域および2つのフランキング領域は、各々が独立して、修飾されたヌクレオシド間連結(例として、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結または他の連結)を少なくとも2、少なくとも3、少なくとも4、少なくとも5、またはより多くのヌクレオチド間に含む。
gapmerは適切な方法を使用して生じ得る。gapmerの調製を教示する代表的な米国特許、米国特許公開、およびPCT公開は、米国特許第5,013,830号;第5,149,797号;第5,220,007号;第5,256,775号;第5,366.878号;第5,403,711号;第5,491,133号;第5,565,350号;第5,623,065号;第5,652,355号;第5,652,356号;第5,700,922号;第5,898,031号;第7,015,315号;第7,101,993号;第7,399,845号;第7.432,250号;第7,569,686号;第7,683,036号;第7,750,131号;第8,580,756号;第9,045,754号;第9,428.534号;第9,695,418号;第10,017,764号;第10,260,069号;第9.428,534号;第8,580,756号;米国特許公開第US20050074801号、第US20090221685号;第US20090286969号、第US20100197762号、および第US20110112170号;PCT公開第W02004069991号;第W02005023825号;第W02008049085号および第W02009090182号;ならびに欧州特許第EP2,149,605号を包含するが、これらに限定されない。これら各々はその全体が参照によって本明細書に組み込まれる。
いくつかの態様において、gapmerは長さが10~40ヌクレオシドである。例えば、gapmerは長さが10~40、10~35、10~30、10~25、10~20、10~15、15~40、15~35、15~30、15~25、15~20、20~40、20~35、20~30、20~25、25~40、25~35、25~30、30~40、30~35、または35~40ヌクレオシドであり得る。いくつかの態様において、gapmerは長さが10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、または40ヌクレオシドである。
いくつかの態様において、gapmer上のギャップ領域Yは長さが5~20ヌクレオシドである。例えば、ギャップ領域Yは長さが5~20、5~15、5~10、10~20、10~15、または15~20ヌクレオシドであり得る。いくつかの態様において、ギャップ領域Yは長さが5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20ヌクレオシドである。いくつかの態様において、ギャップ領域Yの各ヌクレオシドは2’-デオキシリボヌクレオシドである。いくつかの態様において、ギャップ領域Yのすべてのヌクレオシドが2’デオキシリボヌクレオシドである。いくつかの態様において、ギャップ領域Yのヌクレオシドの1つ以上は修飾ヌクレオシドである(例として、2’修飾ヌクレオシド、例えば本明細書に記載のもの)。いくつかの態様において、ギャップ領域Yの1以上のシトシンは任意に5-メチルシトシンである。いくつかの態様において、ギャップ領域Yの各シトシンは5-メチルシトシンである。
いくつかの態様において、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)およびgapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)は、独立して1~20ヌクレオシドの長さである。例えば、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)およびgapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)は、独立して1~20、1~15、1~10、1~7、1~5、1~3、1~2、2~5、2~7、3~5、3~7、5~20、5~15、5~10、10~20、10~15、または15~20ヌクレオシドの長さであり得る。いくつかの態様において、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)およびgapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)は、独立して1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20ヌクレオシドの長さである。いくつかの態様において、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)およびgapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)は同じ長さである。いくつかの態様において、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)およびgapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)は異なる長さである。いくつかの態様において、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)はgapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)よりも長い。いくつかの態様において、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)はgapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)よりも短い。
いくつかの態様において、gapmerは、5-10-5、4-12-4、3-14-3、2-16-2、1-18-1、3-10-3、2-10-2、1-10-1、2-8-2、4-6-4、3-6-3、2-6-2、4-7-4、3-7-3、2-7-2、4-8-4、3-8-3、2-8-2、1-8-1、2-9-2、1-9-1、2-10-2、1-10-1、1-12-1、1-16-1、2-15-1、1-15-2、1-14-3、3-14-1、2-14-2、1-13-4、4-13-1、2-13-3、3-13-2、1-12-5、5-12-1、2-12-4、4-12-2、3-12-3、1-11-6、6-11-1、2-11-5、5-11-2、3-11-4、4-11-3、1-17-1、2-16-1、1-16-2、1-15-3、3-15-1、2-15-2、1-14-4、4-14-1、2-14-3、3-14-2、1-13-5、5-13-1、2-13-4、4-13-2、3-13-3、1-12-6、6-12-1、2-12-5、5-12-2、3-12-4、4-12-3、1-11-7、7-11-1、2-11-6、6-11-2、3-11-5、5-11-3、4-11-4、1-18-1、1-17-2、2-17-1、1-16-3、1-16-3、2-16-2、1-15-4、4-15-1、2-15-3、3-15-2、1-14-5、5-14-1、2-14-4、4-14-2、3-14-3、1-13-6、6-13-1、2-13-5、5-13-2、3-13-4、4-13-3、1-12-7、7-12-1、2-12-6、6-12-2、3-12-5、5-12-3、1-11-8、8-11-1、2-11-7、7-11-2、3-11-6、6-11-3、4-11-5、5-11-4、1-18-1、1-17-2、2-17-1、1-16-3、3-16-1、2-16-2、1-15-4、4-15-1、2-15-3、3-15-2、1-14-5、2-14-4、4-14-2、3-14-3、1-13-6、6-13-1、2-13-5、5-13-2、3-13-4、4-13-3、1-12-7、7-12-1、2-12-6、6-12-2、3-12-5、5-12-3、1-11-8、8-11-1、2-11-7、7-11-2、3-11-6、6-11-3、4-11-5、5-11-4、1-19-1、1-18-2、2-18-1、1-17-3、3-17-1、2-17-2、1-16-4、4-16-1、2-16-3、3-16-2、1-15-5、2-15-4、4-15-2、3-15-3、1-14-6、6-14-1、2-14-5、5-14-2、3-14-4、4-14-3、1-13-7、7-13-1、2-13-6、6-13-2、3-13-5、5-13-3、4-13-4、1-12-8、8-12-1、2-12-7、7-12-2、3-12-6、6-12-3、4-12-5、5-12-4、2-11-8、8-11-2、3-11-7、7-11-3、4-11-6、6-11-4、5-11-5、1-20-1、1-19-2、2-19-1、1-18-3、3-18-1、2-18-2、1-17-4、4-17-1、2-17-3、3-17-2、1-16-5、2-16-4、4-16-2、3-16-3、1-15-6、6-15-1、2-15-5、5-15-2、3-15-4、4-15-3、1-14-7、7-14-1、2-14-6、6-14-2、3-14-5、5-14-3、4-14-4、1-13-8、8-13-1、2-13-7、7-13-2、3-13-6、6-13-3、4-13-5、5-13-4、2-12-8、8-12-2、3-12-7、7-12-3、4-12-6、6-12-4、5-12-5、3-11-8、8-11-3、4-11-7、7-11-4、5-11-6、6-11-5、1-21-1、1-20-2、2-20-1、1-20-3、3-19-1、2-19-2、1-18-4、4-18-1、2-18-3、3-18-2、1-17-5、2-17-4、4-17-2、3-17-3、1-16-6、6-16-1、2-16-5、5-16-2、3-16-4、4-16-3、1-15-7、7-15-1、2-15-6、6-15-2、3-15-5、5-15-3、4-15-4、1-14-8、8-14-1、2-14-7、7-14-2、3-14-6、6-14-3、4-14-5、5-14-4、2-13-8、8-13-2、3-13-7、7-13-3、4-13-6、6-13-4、5-13-5、1-12-10、10-12-1、2-12-9、9-12-2、3-12-8、8-12-3、4-12-7、7-12-4、5-12-6、6-12-5、4-11-8、8-11-4、5-11-7、7-11-5、6-11-6、1-22-1、1-21-2、2-21-1、1-21-3、3-20-1、2-20-2、1-19-4、4-19-1、2-19-3、3-19-2、1-18-5、2-18-4、4-18-2、3-18-3、1-17-6、6-17-1、2-17-5、5-17-2、3-17-4、4-17-3、1-16-7、7-16-1、2-16-6、6-16-2、3-16-5、5-16-3、4-16-4、1-15-8、8-15-1、2-15-7、7-15-2、3-15-6、6-15-3、4-15-5、5-15-4、2-14-8、8-14-2、3-14-7、7-14-3、4-14-6、6-14-4、5-14-5、3-13-8、8-13-3、4-13-7、7-13-4、5-13-6、6-13-5、4-12-8、8-12-4、5-12-7、7-12-5、6-12-6、5-11-8、8-11-5、6-11-7、または7-11-6の5’-X-Y-Z-3’を含む。数は5’-X-Y-Z-3’gapmerのX、Y、およびZ領域のヌクレオシド数を指し示す。
いくつかの態様において、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)またはgapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)の1以上のヌクレオシドは、修飾ヌクレオチドである(例として、高親和性修飾ヌクレオシド)。いくつかの態様において、修飾ヌクレオシド(例として、高親和性修飾ヌクレオシド)は2’修飾ヌクレオシドである。いくつかの態様において、2’修飾ヌクレオシドは2’-4’二環式ヌクレオシドまたは非二環式2’修飾ヌクレオシドである。いくつかの態様において、高親和性修飾ヌクレオシドは、2’-4’二環式ヌクレオシド(例として、LNA、cEt、またはENA)または非二環式2’-修飾ヌクレオシド(例として、2’-フルオロ(2’-F)、2’-O-メチル(2’-O-Me)、2’-O-メトキシエチル(2’-MOE)、2’-O-アミノプロピル(2’-O-AP)、2’-O-ジメチルアミノエチル(2’-O-DMAOE)、2’-O-ジメチルアミノプロピル(2’-ODMAP)、2’-O-ジメチルアミノエチルオキシエチル(2’-O-DMAEOE)、または2’-O-N-メチルアセトアミド(2’-O-NMA))である。
いくつかの態様において、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)の1以上のヌクレオシドは高親和性修飾ヌクレオシドである。いくつかの態様において、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)の各ヌクレオシドは高親和性修飾ヌクレオシドである。いくつかの態様において、gapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)の1以上のヌクレオシドは高親和性修飾ヌクレオシドである。いくつかの態様において、gapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)の各ヌクレオシドは高親和性修飾ヌクレオシドである。いくつかの態様において、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)の1以上のヌクレオシドは高親和性修飾ヌクレオシドであり、gapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)の1以上のヌクレオシドは高親和性修飾ヌクレオシドである。いくつかの態様において、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)の各ヌクレオシドは高親和性修飾ヌクレオシドであり、gapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)の各ヌクレオシドは高親和性修飾ヌクレオシドである。
いくつかの態様において、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)は、gapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)と同じ高親和性ヌクレオシドを含む。例えば、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)およびgapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)は、1以上の非二環式2’修飾ヌクレオシド(例として、2’-MOEまたは2’-O-Me)を含み得る。別の例では、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)およびgapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)は、1以上の2’-4’二環式ヌクレオシド(例として、LNAまたはcEt)を含み得る。いくつかの態様において、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)およびgapmerの3’ウイング領域(5’-XY-Z-3’式のZ)の各ヌクレオシドは、非二環式2’修飾ヌクレオシド(例として、2’-MOEまたは2’-O-Me)である。いくつかの態様において、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)およびgapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)の各ヌクレオシドは、2’-4’二環式ヌクレオシド(例として、LNAまたはcEt)である。
いくつかの態様において、gapmerは5’-X-Y-Z-3’構成を含み、XおよびZは独立して長さが1~7(例として、1、2、3、4、5、6、または7)ヌクレオシドであり、Yは長さが6~10(例として、6、7、8、9、または10)ヌクレオシドであり、XおよびZの各ヌクレオシドは非二環式2’修飾ヌクレオシド(例として、2’-MOEまたは2’-O-Me)であり、Yの各ヌクレオシドは2’デオキシリボヌクレオシドである。いくつかの態様において、gapmerは5’-X-Y-Z-3’構成を含み、XおよびZは独立して長さが1~7(例として、1、2、3、4、5、6、または7)ヌクレオシドであり、Yは長さが6~10(例として、6、7、8、9、または10)ヌクレオシドであり、XおよびZの各ヌクレオシドは2’-4’二環式ヌクレオシド(例として、LNAまたはcEt)であり、Yの各ヌクレオシドは2’デオキシリボヌクレオシドである。いくつかの態様において、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)はgapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)とは(as)異なる高親和性ヌクレオシドを含む。例えば、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)は1以上の非二環式2’修飾ヌクレオシド(例として、2’-MOEまたは2’-O-Me)を含み得、gapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)は1以上の2’-4’二環式ヌクレオシド(例として、LNAまたはcEt)を含み得る。別の例では、gapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)は1以上の非二環式2’-修飾ヌクレオシド(例として、2’-MOEまたは2’-O-Me)を含み得、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)は1以上の2’-4’二環式ヌクレオシド(例として、LNAまたはcEt)を含み得る。
いくつかの態様において、gapmerは5’-X-Y-Z-3’構成を含み、XおよびZは独立して長さが1~7(例として、1、2、3、4、5、6、または7)ヌクレオシドであり、Yは長さが6~10(例として、6、7、8、9、または10)ヌクレオシドであり、Xの各ヌクレオシドは非二環式2’修飾ヌクレオシド(例として、2’-MOEまたは2’-O-Me)であり、Zの各ヌクレオシドは2’-4’二環式ヌクレオシド(例として、LNAまたはcEt)であり、Yの各ヌクレオシドは2’-デオキシリボヌクレオシドである。いくつかの態様において、gapmerは5’-X-Y-Z-3’構成を含み、XおよびZは独立して長さが1~7(例として、1、2、3、4、5、6、または7)ヌクレオシドであり、Yは長さが6~10(例として、6、7、8、9、または10)ヌクレオシドであり、Xの各ヌクレオシドは2’-4’二環式ヌクレオシド(例として、LNAまたはcEt)であり、Zの各ヌクレオシドは非二環式2’修飾ヌクレオシド(例として、2’MOEまたは2’-O-Me)であり、Yの各ヌクレオシドは2’-デオキシリボヌクレオシドである。
いくつかの態様において、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)は1以上の非二環式2’修飾ヌクレオシド(例として、2’-MOEまたは2’-OMe)および1以上の2’-4’二環式ヌクレオシド(例として、LNAまたはcEt)を含む。いくつかの態様において、gapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)は1以上の非二環式2’修飾ヌクレオシド(例として、2’-MOEまたは2’-O-Me)および1以上の2’-4’二環式ヌクレオシド(例として、LNAまたはcEt)を含む。いくつかの態様において、gapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)およびgapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)両方は、1以上の非二環式2’修飾ヌクレオシド(例として、2’-MOEまたは2’-OMe)および1以上の2’-4’二環式ヌクレオシド(例として、LNAまたはcEt)を含む。
いくつかの態様において、gapmerは5’-X-Y-Z-3’構成を含み、XおよびZは独立して長さが2~7(例として、2、3、4、5、6、または7)ヌクレオシドであり、Yは長さが6~10(例として、6、7、8、9、または10)ヌクレオシドであり、X(最も5’の位置は位置1である)の位置1、2、3、4、5、6、または7のすべてではないが少なくとも1つ(例として、1、2、3、4、5、または6)は非二環式2’修飾ヌクレオシド(例として、2’-MOEまたは2’-O-Me)であり、XおよびZ両方のヌクレオシドの残りは2’-4’二環式ヌクレオシド(例として、LNAまたはcEt)であり、Yの各ヌクレオシドは2’デオキシリボヌクレオシドである。いくつかの態様において、gapmerは5’-X-Y-Z-3’構成を含み、XおよびZは独立して長さが2~7(例として、2、3、4、5、6、または7)ヌクレオシドであり、Yは長さが6~10(例として、6、7、8、9、または10)ヌクレオシドであり、Z(最も5’の位置は位置1である)の位置1、2、3、4、5、6、または7のすべてではないが少なくとも1つ(例として、1、2、3、4、5、または6)は、非二環式2’修飾ヌクレオシド(例として、2’-MOEまたは2’-O-Me)であり、XおよびZ両方のヌクレオシドの残りは2’-4’二環式ヌクレオシド(例として、LNAまたはcEt)であり、Yの各ヌクレオシドは2’デオキシリボヌクレオシドである。いくつかの態様において、gapmerは5’-X-Y-Z-3’構成を含み、XおよびZは独立して長さが2~7(例として、2、3、4、5、6、または7)ヌクレオシドであり、Yは長さが6~10(例として、6、7、8、9、または10)ヌクレオシドであり、Xの位置1、2、3、4、5、6、または7のすべてではないが少なくとも1つ(例として、1、2、3、4、5、または6)およびZ(最も5’の位置は位置1である)のすべてではないが位置(例として、1、2、3、4、5、または6)1、2、3、4、5、6、または7の少なくとも1つが、非二環式2’修飾ヌクレオシド(例として、2’-MOEまたは2’-O-Me)であり、XおよびZ両方のヌクレオシドの残りは2’-4’二環式ヌクレオシド(例として、LNAまたはcEt)であり、Yの各ヌクレオシドは2’デオキシリボヌクレオシドである。
非二環式2’修飾ヌクレオシド(例として、2’-MOEまたは2’-O-Me)および2’-4’二環式ヌクレオシド(例として、LNAまたはcEt)のミックスをgapmerの5’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のX)および/またはgapmerの3’ウイング領域(5’-X-Y-Z-3’式のZ)に有するgapmer構成の非限定例は、以下:BBB-(D)n-BBBAA;KKK-(D)n-KKKAA;LLL-(D)n-LLLAA;BBB-(D)n-BBBEE;KKK-(D)n-KKKEE;LLL-(D)n-LLLEE;BBB-(D)n-BBBAA;KKK-(D)n-KKKAA;LLL-(D)n-LLLAA;BBB-(D)n-BBBEE;KKK-(D)n-KKKEE;LLL-(D)n-LLLEE;BBB-(D)n-BBBAAA;KKK-(D)n-KKKAAA;LLL-(D)n-LLLAAA;BBB-(D)n-BBBEEE;KKK-(D)n-KKKEEE;LLL-(D)n-LLLEEE;BBB-(D)n-BBBAAA;KKK-(D)n-KKKAAA;LLL-(D)n-LLLAAA;BBB-(D)n-BBBEEE;KKK-(D)n-KKKEEE;LLL-(D)n-LLLEEE;BABA-(D)n-ABAB;KAKA-(D)n-AKAK;LALA-(D)n-ALAL;BEBE-(D)n-EBEB;KEKE-(D)n-EKEK;LELE-(D)n-ELEL;BABA-(D)n-ABAB;KAKA-(D)n-AKAK;LALA-(D)n-ALAL;BEBE-(D)n-EBEB;KEKE-(D)n-EKEK;LELE-(D)n-ELEL;ABAB-(D)n-ABAB;AKAK-(D)n-AKAK;ALAL-(D)n-ALAL;EBEB-(D)n-EBEB;EKEK-(D)n-EKEK;ELEL-(D)n-ELEL;ABAB-(D)n-ABAB;AKAK-(D)n-AKAK;ALAL-(D)n-ALAL;EBEB-(D)n-EBEB;EKEK-(D)n-EKEK;ELEL-(D)n-ELEL;AABB-(D)n-BBAA;BBAA-(D)n-AABB;AAKK-(D)n-KKAA;AALL-(D)n-LLAA;EEBB-(D)n-BBEE;EEKK-(D)n-KKEE;EELL-(D)n-LLEE;AABB-(D)n-BBAA;AAKK-(D)n-KKAA;AALL-(D)n-LLAA;EEBB-(D)n-BBEE;EEKK-(D)n-KKEE;EELL-(D)n-LLEE;BBB-(D)n-BBA;KKK-(D)n-KKA;LLL-(D)n-LLA;BBB-(D)n-BBE;KKK-(D)n-KKE;LLL-(D)n-LLE;BBB-(D)n-BBA;KKK-(D)n-KKA;LLL-(D)n-LLA;BBB-(D)n-BBE;KKK-(D)n-KKE;LLL-(D)n-LLE;BBB-(D)n-BBA;KKK-(D)n-KKA;LLL-(D)n-LLA;BBB-(D)n-BBE;KKK-(D)n-KKE;LLL-(D)n-LLE;ABBB-(D)n-BBBA;AKKK-(D)n-KKKA;ALLL-(D)n-LLLA;EBBB-(D)n-BBBE;EKKK-(D)n-KKKE;ELLL-(D)n-LLLE;ABBB-(D)n-BBBA;AKKK-(D)n-KKKA;ALLL-(D)n-LLLA;EBBB-(D)n-BBBE;EKKK-(D)n-KKKE;ELLL-(D)n-LLLE;ABBB-(D)n-BBBAA;AKKK-(D)n-KKKAA;ALLL-(D)n-LLLAA;EBBB-(D)n-BBBEE;EKKK-(D)n-KKKEE;ELLL-(D)n-LLLEE;ABBB-(D)n-BBBAA;AKKK-(D)n-KKKAA;ALLL-(D)n-LLLAA;EBBB-(D)n-BBBEE;EKKK-(D)n-KKKEE;ELLL-(D)n-LLLEE;AABBB-(D)n-BBB;AAKKK-(D)n-KKK;AALLL-(D)n-LLL;EEBBB-(D)n-BBB;EEKKK-(D)n-KKK;EELLL-(D)n-LLL;AABBB-(D)n-BBB;AAKKK-(D)n-KKK;AALLL-(D)n-LLL;EEBBB-(D)n-BBB;EEKKK-(D)n-KKK;EELLL-(D)n-LLL;AABBB-(D)n-BBBA;AAKKK-(D)n-KKKA;AALLL-(D)n-LLLA;EEBBB-(D)n-BBBE;EEKKK-(D)n-KKKE;EELLL-(D)n-LLLE;AABBB-(D)n-BBBA;AAKKK-(D)n-KKKA;AALLL-(D)n-LLLA;EEBBB-(D)n-BBBE;EEKKK-(D)n-KKKE;EELLL-(D)n-LLLE;ABBAABB-(D)n-BB;AKKAAKK-(D)n-KK;ALLAALLL-(D)n-LL;EBBEEBB-(D)n-BB;EKKEEKK-(D)n-KK;ELLEELL-(D)n-LL;ABBAABB-(D)n-BB;AKKAAKK-(D)n-KK;ALLAALL-(D)n-LL;EBBEEBB-(D)n-BB;EKKEEKK-(D)n-KK;ELLEELL-(D)n-LL;ABBABB-(D)n-BBB;AKKAKK-(D)n-KKK;ALLALLL-(D)n-LLL;EBBEBB-(D)n-BBB;EKKEKK-(D)n-KKK;ELLELL-(D)n-LLL;ABBABB-(D)n-BBB;AKKAKK-(D)n-KKK;ALLALL-(D)n-LLL;EBBEBB-(D)n-BBB;EKKEKK-(D)n-KKK;ELLELL-(D)n-LLL;EEEK-(D)n-EEEEEEEE;EEK-(D)n-EEEEEEEEE;EK-(D)n-EEEEEEEEEE;EK-(D)n-EEEKK;K-(D)n-EEEKEKE;K-(D)n-EEEKEKEE;K-(D)n-EEKEK;EK-(D)n-EEEEKEKE;EK-(D)n-EEEKEK;EEK-(D)n-KEEKE;EK-(D)n-EEKEK;EK-(D)n-KEEK;EEK-(D)n-EEEKEK;EK-(D)n-KEEEKEE;EK-(D)n-EEKEKE;EK-(D)n-EEEKEKE;およびEK-(D)n-EEEEKEKを包含し;「A」ヌクレオシドは2’修飾ヌクレオシドを含み;「B」は2’-4’二環式ヌクレオシドを表し;「K」は-拘束エチルヌクレオシド(cEt)を表し;「L」はLNAヌクレオシドを表し;「E」は2’-MOE修飾リボヌクレオシドを表し;「D」は2’デオキシリボヌクレオシドを表し;「n」はギャップセグメント(5’-X-Y-Z-3’構成のY)の長さを表し、1~20の間の整数である。
いくつかの態様において、本明細書に記載のgapmerのいずれか1つは、1以上の修飾されたヌクレオシド連結(例として、ホスホロチオアート連結)をX、Y、およびZ領域の各々に含む。いくつかの態様において、本明細書に記載のgapmerのいずれか1つにおける各ヌクレオシド間連結はホスホロチオアート連結である。いくつかの態様において、X、Y、およびZ領域の各々は、独立して、ホスホロチオアート連結およびホスホジエステル連結のミックスを含む。いくつかの態様において、ギャップ領域Yの各ヌクレオシド間連結はホスホロチオアート連結であり、5’ウイング領域Xはホスホロチオアート連結およびホスホジエステル連結のミックスを含み、3’ウイング領域Zはホスホロチオアート連結およびホスホジエステル連結のミックスを含む。
i.Mixmer
いくつかの態様において、本明細書に記載のオリゴヌクレオチドは、mixmerであってもよく、またはmixmer配列パターンを含んでいてもよい。一般に、mixmerは、天然に存在するヌクレオシドと天然に存在しないヌクレオシドとの両方を含むオリゴヌクレオチドであるか、または2つの異なるタイプの天然に存在しないヌクレオシドを、典型的には互い違いなパターンで含むオリゴヌクレオチドである。Mixmerは一般に、非修飾オリゴヌクレオチドより高い結合親和性を有し、標的分子に特異的に結合する、例として、標的分子上の結合部位を遮断するために使用されてもよい。一般に、mixmerは、RNaseを標的分子へ動員させず、よって標的分子の切断を促進しない。RNase Hを動員することが可能ではない、かかるオリゴヌクレオチドは記載されており、例えば、WO2007/112754またはWO2007/112753を見よ。
いくつかの態様において、mixmerは、ヌクレオシド類似体と天然に存在するヌクレオシドとの反復パターン、もしくは1タイプのヌクレオシド類似体ともう1タイプのヌクレオシド類似体との反復パターンを含むか、またはこれらからなる。しかしながら、mixmerは、反復パターンを含む必要がなく、その代わりに、修飾ヌクレオシドと天然に存在するヌクレオシドとのいずれの配置も、または1タイプの修飾ヌクレオシドともう1タイプの修飾ヌクレオシドとのいずれの配置も含むことができる。反復パターンは、実例として、2ヌクレオシド毎または3ヌクレオシド毎に、LNAなどの修飾ヌクレオシドであってもよく、残りのヌクレオシドは、DNAなどの天然に存在するヌクレオシドであるか、あるいは2’MOEもしくは2’フルオロ類似体などの2’置換ヌクレオシド類似体、または本明細書に記載のいずれの他の修飾ヌクレオシドである。LNA単位などの修飾ヌクレオシドの反復パターンが、固定された位置にて-例として5’末または3’末にて、修飾ヌクレオシドと組み合わされてもよいことは認識されている。
いくつかの態様において、mixmerは、5個より多く、4個より多く、3個より多く、または2個より多く連続した、DNAヌクレオシドなどの天然に存在するヌクレオシドの領域を含まない。いくつかの態様において、mixmerは、少なくとも2個連続したLNAなどの、少なくとも2個連続した修飾ヌクレオシドからなる領域を少なくとも含む。いくつかの態様において、mixmerは、少なくとも3個連続したLNAなどの、少なくとも3個連続した修飾ヌクレオシドからなる領域を少なくとも含む。
いくつかの態様において、mixmerは、7個より多く、6個より多く、5個より多く、4個より多く、3個より多く、または2個より多く連続した、LNAなどのヌクレオシド類似体の領域を含まない。いくつかの態様において、LNA単位は、本明細書に言及されたヌクレオシド類似体などの他のヌクレオシド類似体に置き換えられていてもよい。
Mixmerは、非限定例におけるLNAヌクレオシドおよび2’-O-Me ヌクレオシドなどの親和性増強修飾ヌクレオシドの混合物を含むよう設計されていてもよい。いくつかの態様において、mixmerは、修飾ヌクレオシド間連結(例として、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結または他の連結)を、少なくとも2個の、少なくとも3個の、少なくとも4個の、少なくとも5個の、またはこれより多くのヌクレオシド間に含む。
mixmerは、いずれの好適な方法を使用しても産生されてよい。mixmerの調製を教示する代表的な米国特許、米国特許刊行物、およびPCT刊行物は、米国特許刊行物第US20060128646号、第US20090209748号、第US20090298916号、第US20110077288号、および第US20120322851号、および米国特許第7687617号を包含する。
いくつかの態様において、mixmerは、1以上のモルホリノヌクレオシドを含む。例えば、いくつかの態様において、mixmerは、1以上の他のヌクレオシド(例として、DNA、RNAヌクレオシド)または修飾ヌクレオシド(例として、LNA、2’-O-Me ヌクレオシド)と(例として、互い違いなやり方で)混合されたモルホリノヌクレオシドを含んでいてもよい。
いくつかの態様において、mixmerは、例えば、Touznik A.,et al.,LNA/DNA mixmer-based antisense oligonucleotides correct alternative splicing of the SMN2 gene and restore SMN protein expression in type 1 SMA fibroblasts Scientific Reports,volume 7,Article number:3672(2017),Chen S.et al.,Synthesis of a Morpholino Nucleic Acid (MNA)-Uridine Phosphoramidite, and Exon Skipping Using MNA/2’-O-Methyl Mixmer Antisense Oligonucleotide,Molecules 2016,21,1582(これら各々の内容は参照により本明細書に組み込まれる)に報告されるとおり、スプライス修正(splice correcting)またはエキソンスキッピングに有用である。
j.RNA干渉(RNAi)
いくつかの態様において、本明細書に提供されるオリゴヌクレオチドは、低分子干渉RNAまたはサイレンシングRNAとしても知られている、低分子干渉RNA(siRNA)の形態であってもよい。siRNAは、二本鎖RNA分子の類であって、細胞中のRNA干渉(RNAi)経路を介した分解のために核酸(例として、mRNA)を標的にする、典型的には長さが約20~25塩基対である。siRNA分子の特異性は、アンチセンス鎖分子のその標的RNAへの結合によって決定されてもよい。有効なsiRNA分子は一般に、より長いsiRNAもまた有効であり得るが、細胞中の非特異的なRNA干渉経路の引き金を、インターフェロン応答を介して引くことを防止するため、長さが30~35個未満の塩基対である。いくつかの態様において、siRNA分子は長さが7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、35、40、45、50塩基対、またはより多くである。いくつかの態様において、siRNA分子は長さが8~30塩基対、長さが10~15塩基対、長さが10~20塩基対、長さが15~25塩基対、長さが19~21塩基対、長さが21~23塩基対である。
適切な標的RNA配列の選択を受けて、すべてのまたは一部の標的配列に相補的なヌクレオチド配列、すなわちアンチセンス配列を含むsiRNA分子は、適切な方法(例として、PCT刊行物第WO2004/016735号;および米国特許刊行物第2004/0077574号および第2008/0081791号を見よ)を使用して設計および調製され得る。siRNA分子は、二本鎖(すなわち、アンチセンス鎖と、ハイブリダイズしてdsRNAを形成する相補的センス鎖とを含むdsRNA分子)または一本鎖(すなわち、アンチセンス鎖だけを含むssRNA分子)であり得る。siRNA分子は、自己相補的センスおよびアンチセンス鎖を有する、二重鎖、非対称二重鎖、ヘアピン、または非対称ヘアピン2次構造を含み得る。
いくつかの態様において、siRNA分子のアンチセンス鎖は長さが7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、35、40、45、50ヌクレオチド、またはより多くである。いくつかの態様において、アンチセンス鎖は長さが8~50ヌクレオチド、長さが8~40ヌクレオチド、長さが8~30ヌクレオチド、長さが10~15ヌクレオチド、長さが10~20ヌクレオチド、長さが15~25ヌクレオチド、長さが19~21ヌクレオチド、長さが21~23ヌクレオチドである。
いくつかの態様において、siRNA分子のセンス鎖は長さが7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、35、40、45、50ヌクレオチド、またはより多くである。いくつかの態様において、センス鎖は長さが8~50ヌクレオチド、長さが8~40ヌクレオチド、長さが8~30ヌクレオチド、長さが10~15ヌクレオチド、長さが10~20ヌクレオチド、長さが15~25ヌクレオチド、長さが19~21ヌクレオチド、長さが21~23ヌクレオチドである。
いくつかの態様において、siRNA分子は、標的mRNA上の標的領域に対する相補性の領域を含むアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、相補性の領域は、標的mRNA上の標的領域に対して少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%相補的である。いくつかの態様において、標的領域は、標的mRNA上の一続きのヌクレオチドの領域である。いくつかの態様において、標的RNA配列について特異的にハイブリダイゼーション可能または特異的であるためには、相補的なヌクレオチド配列は、その標的のものに対して100%相補的である必要はない。
いくつかの態様において、siRNA分子は標的RNA配列に対する相補性の領域を含むアンチセンス鎖を含み、相補性の領域は長さが8~15、8~30、8~40、または10~50、または5~50、または5~40ヌクレオチドの範囲である。いくつかの態様において、相補性の領域は長さが5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、または50ヌクレオチドである。いくつかの態様において、相補性の領域は、標的RNA配列の少なくとも6、少なくとも7、少なくとも8、少なくとも9、少なくとも10、少なくとも11、少なくとも12、少なくとも13、少なくとも14、少なくとも15、少なくとも16、少なくとも17、少なくとも18、少なくとも19、少なくとも20、少なくとも21、少なくとも22、少なくとも23、少なくとも24、少なくとも25、またはより多くの一続きのヌクレオチドと相補的である。いくつかの態様において、siRNA分子は、標的RNA配列の一続きのヌクレオチドの部分と比較して1、2、3、4、またはわずか5塩基ミスマッチを含有するヌクレオチド配列を含む。いくつかの態様において、siRNA分子は、15塩基につき最大3つまでのミスマッチ、または10塩基につき最大2つまでのミスマッチを有するヌクレオチド配列を含む。
いくつかの態様において、siRNA分子は、本明細書(例として、表9、12、および15)に提供されるオリゴヌクレオチドの標的RNA配列に対して相補的である(例として、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または100%)ヌクレオチド配列を含むアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、siRNA分子は、本明細書(例として、表10、11、13、14、16、および17)に提供されるオリゴヌクレオチドと少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または100%同一であるヌクレオチド配列を含むアンチセンス鎖を含む。いくつかの態様において、siRNA分子は、本明細書(例として、表10、11、13、14、16、および17)に提供されるオリゴヌクレオチドの少なくとも6、少なくとも7、少なくとも8、少なくとも9、少なくとも10、少なくとも11、少なくとも12、少なくとも13、少なくとも14、少なくとも15、少なくとも16、少なくとも17、少なくとも18、少なくとも19、少なくとも20、少なくとも21、少なくとも22、少なくとも23、少なくとも24、少なくとも25、またはより多くの一続きのヌクレオチドを含むアンチセンス鎖を含む。
二本鎖siRNAは、同じ長さまたは異なる長さのセンスRNA鎖およびアンチセンスRNA鎖を含んでいてもよい。二本鎖siRNA分子はまた、ステムループ構造の単一オリゴヌクレオチド(ここでsiRNA分子の自己相補的センスおよびアンチセンス領域は、核酸ベースのまたは非核酸ベースのリンカー(単数または複数)を用いて連結されている)、ならびに2以上のループ構造と自己相補的センスおよびアンチセンス鎖を含むステムとを有する環状一本鎖RNA(ここで環状RNAは、in vivoまたはin vitroのいずれかで処理されてRNAiを媒介することが可能な活性siRNA分子を生成し得る)からも会合され得る。よって小さいヘアピンRNA(shRNA)分子もまた、本明細書に企図される。これらの分子は、逆相補的(センス)配列に加えて、特定のアンチセンス配列を含み、典型的にはスペーサーまたはループ配列によって分離されている。スペーサーまたはループの切断は、(任意に、片鎖または両鎖の3’末端および/または(例として、および)5’末端から1、2、3個以上のヌクレオチドの付加または除去をもたらすこともある追加のプロセシングステップにより)一本鎖RNA分子およびその逆相補体を、それらがアニールしてdsRNA分子を形成し得るように提供する。スペーサーは、スペーサーの切断(および任意に、これに続く、片鎖または両鎖の3’末端および/または(例として、および)5’末端から1、2、3、4、もしくはこれより多いヌクレオチドの付加または除去をもたらすこともあるプロセシングステップ)に先立ちアンチセンス配列とセンス配列とをアニールさせて二本鎖構造体(またはステム)を形成させるのに充分な長さであり得る。スペーサー配列は、2つの相補的ヌクレオチド配列領域間に置かれた無関係なヌクレオチド配列であってもよく、前記領域はアニールして二本鎖核酸になったらshRNAを含むことになる。
siRNA分子の全体的な長さは、設計されたsiRNA分子のタイプに応じて、約14ヌクレオチドから約100ヌクレオチドまで変動し得る。一般に、これらのヌクレオチドの約14個と約50個との間は、RNA標的配列に相補的である、すなわちsiRNA分子の特定のアンチセンス配列を構成する。例えば、siRNAが二本鎖siRNAまたは一本鎖siRNAであるとき、長さは約14ヌクレオチドから約50ヌクレオチドまで変動し得るが一方、siRNAがshRNAまたは環状分子であるとき、長さは約40ヌクレオチドから約100ヌクレオチドまで変動し得る。
siRNA分子は、分子の一方の末端にて3’突出を含んでいてもよく、他方の末端は平滑末端であっても、または突出(5’または3’)も有していてよい。siRNA分子が分子の両末端にて突出を含むとき、突出の長さは、同じであっても、または異なっていてもよい。一態様において、本開示のsiRNA分子は、分子の両末端上に約1~約3ヌクレオチドの3’突出を含む。いくつかの態様において、siRNA分子は約1~約3ヌクレオチドの3’突出をセンス鎖に含む。いくつかの態様において、siRNA分子は約1~約3ヌクレオチドの3’突出をアンチセンス鎖に含む。いくつかの態様において、siRNA分子は約1~約3ヌクレオチドの3’突出をセンス鎖およびアンチセンス鎖両方に含む。
いくつかの態様において、siRNA分子は1以上の修飾ヌクレオチド(例として、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、またはより多く)を含む。いくつかの態様において、siRNA分子は1以上の修飾ヌクレオチドおよび/または(例として、および)1以上の修飾されたヌクレオチド間連結を含む。いくつかの態様において、修飾ヌクレオチドは修飾された糖部分(例として、2’修飾ヌクレオチド)である。いくつかの態様において、siRNA分子は、1以上の2’修飾ヌクレオチド、例えば2’-デオキシ、2’-フルオロ(2’-F)、2’-O-メチル(2’-O-Me)、2’-O-メトキシエチル(2’-MOE)、2’-O-アミノプロピル(2’-O-AP)、2’-O-ジメチルアミノエチル(2’-O-DMAOE)、2’-O-ジメチルアミノプロピル(2’-O-DMAP)、2’-O-ジメチルアミノエチルオキシエチル(2’-O-DMAEOE)、または2’-O-N-メチルアセトアミド(2’-O-NMA)を含む。いくつかの態様において、siRNA分子の各ヌクレオチドは修飾ヌクレオチド(例として、2’修飾ヌクレオチド)である。いくつかの態様において、siRNA分子は1以上のホスホロジアミダートモルホリノを含む。いくつかの態様において、siRNA分子の各ヌクレオチドはホスホロジアミダートモルホリノである。
いくつかの態様において、siRNA分子はホスホロチオアートまたは他の修飾されたヌクレオチド間連結を含有する。いくつかの態様において、siRNA分子はホスホロチオアートヌクレオシド間連結を含む。いくつかの態様において、siRNA分子はホスホロチオアートヌクレオシド間連結を少なくとも2つのヌクレオチド間に含む。いくつかの態様において、siRNA分子はホスホロチオアートヌクレオシド間連結をすべてのヌクレオチド間に含む。例えば、いくつかの態様において、siRNA分子は、修飾されたヌクレオチド間連結をsiRNA分子の5’または3’端の第1の、第2の、および/または(例として、および)第3のヌクレオシド間連結に含む。
いくつかの態様において、修飾されたヌクレオチド間連結はリン含有連結である。いくつかの態様において、使用され得るリン含有連結は、正常な3’-5’連結を有するホスホロチオアート、キラルホスホロチオアート、ホスホロジチオアート、ホスホトリエステル、アミノアルキルホスホトリエステル、3’アルキレンホスホナートおよびキラルホスホナートを含むメチルおよび他のアルキルホスホナート、ホスフィナート、3’-アミノホスホロアミダートおよびアミノアルキルホスホロアミダートを含むホスホロアミダート、チオノホスホロアミダート、チオノアルキルホスホナート、チオノアルキルホスホトリエステル、およびボラノホスファート、これらの2’-5’連結アナログ、ならびにヌクレオシド単位の隣接するペアが3’-5’対5’-3’または2’-5’対5’-2’で連結される逆向きの極性を有するものを包含するが、これらに限定されない;US特許no.3,687,808;4,469,863;4,476,301;5,023,243;5,177,196;5,188,897;5,264,423;5,276,019;5,278,302;5,286,717;5,321,131;5,399,676;5,405,939;5,453,496;5,455,233;5,466,677;5,476,925;5,519,126;5,536,821;5,541,306;5,550,111;5,563,253;5,571,799;5,587,361;および5,625,050を見よ。
本明細書に記載のsiRNA分子の修飾されたケミストリーまたはフォーマットのいずれかは、互いと組み合わせられ得る。例えば、1、2、3、4、5、またはより多くの異なる型の修飾が同じsiRNA分子上に包含され得る。
いくつかの態様において、アンチセンス鎖は1以上の修飾ヌクレオチド(例として、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、またはより多く)を含む。いくつかの態様において、アンチセンス鎖は1以上の修飾ヌクレオチドおよび/または(例として、および)1以上の修飾されたヌクレオチド間連結を含む。いくつかの態様において、修飾ヌクレオチドは修飾された糖部分(例として、2’修飾ヌクレオチド)を含む。いくつかの態様において、アンチセンス鎖は、1以上の2’修飾ヌクレオチド、例えば2’-デオキシ、2’-フルオロ(2’-F)、2’-O-メチル(2’-O-Me)、2’-O-メトキシエチル(2’-MOE)、2’-O-アミノプロピル(2’-O-AP)、2’-O-ジメチルアミノエチル(2’-O-DMAOE)、2’-O-ジメチルアミノプロピル(2’-O-DMAP)、2’-O-ジメチルアミノエチルオキシエチル(2’-O-DMAE0E)、または2’-O-N-メチルアセトアミド(2’-O-NMA)を含む。いくつかの態様において、アンチセンス鎖の各ヌクレオチドは修飾ヌクレオチド(例として、2’修飾ヌクレオチド)である。いくつかの態様において、アンチセンス鎖は1以上のホスホロジアミダートモルホリノを含む。いくつかの態様において、アンチセンス鎖はホスホロジアミダートモルホリノオリゴマー(PMO)である。
いくつかの態様において、アンチセンス鎖はホスホロチオアートまたは他の修飾されたヌクレオチド間連結を含有する。いくつかの態様において、アンチセンス鎖はホスホロチオアートヌクレオシド間連結を含む。いくつかの態様において、アンチセンス鎖はホスホロチオアートヌクレオシド間連結を少なくとも2つのヌクレオチド間に含む。いくつかの態様において、アンチセンス鎖はホスホロチオアートヌクレオシド間連結をすべてのヌクレオチド間に含む。例えば、いくつかの態様において、アンチセンス鎖は、修飾されたヌクレオチド間連結をsiRNA分子の5’または3’端の第1の、第2の、および/または(例として、および)第3のヌクレオシド間連結に含む。いくつかの態様において、修飾されたヌクレオチド間連結はリン含有連結である。いくつかの態様において、使用され得るリン含有連結は、正常な3’-5’連結を有するホスホロチオアート、キラルホスホロチオアート、ホスホロジチオアート、ホスホトリエステル、アミノアルキルホスホトリエステル、3’アルキレンホスホナートおよびキラルホスホナートを含むメチルおよび他のアルキルホスホナート、ホスフィナート、3’-アミノホスホロアミダートおよびアミノアルキルホスホロアミダートを含むホスホロアミダート、チオノホスホロアミダート、チオノアルキルホスホナート、チオノアルキルホスホトリエステル、およびボラノホスファート、これらの2’-5’連結アナログ、ならびにヌクレオシド単位の隣接するペアが3’-5’対5’-3’または2’-5’対5’-2’で連結される逆向きの極性を有するものを包含するが、これらに限定されない;米国特許第3,687,808号;第4,469,863号;第4,476,301号;第5,023,243号;第5,177,196号;第5,188,897号;第5,264,423号;第5,276,019号;第5,278,302号;第5,286,717号;第5,321,131号;第5,399,676号;第5,405,939号;第5,453,496号;第5,455,233号;第5,466,677号;第5,476,925号;第5,519,126号;第5,536,821号;第5,541,306号;第5,550,111号;第5,563,253号;第5,571,799号;第5,587,361号;および第5,625,050号を見よ。
本明細書に記載のアンチセンス鎖の修飾されたケミストリーまたはフォーマットのいずれかは、互いと組み合わせられ得る。例えば、1、2、3、4、5、またはより多くの異なる型の修飾が同じアンチセンス鎖上に包含され得る。
いくつかの態様において、センス鎖は1以上の修飾ヌクレオチド(例として、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、またはより多く)を含む。いくつかの態様において、センス鎖は1以上の修飾ヌクレオチドおよび/または(例として、および)1以上の修飾されたヌクレオチド間連結を含む。いくつかの態様において、修飾ヌクレオチドは修飾された糖部分(例として、2’修飾ヌクレオチド)である。いくつかの態様において、センス鎖は、1以上の2’修飾ヌクレオチド、例えば2’-デオキシ、2’-フルオロ(2’-F)、2’-O-メチル(2’-O-Me)、2’O-メトキシエチル(2’-MOE)、2’-O-アミノプロピル(2’-O-AP)、2’-O-ジメチルアミノエチル(2’-O-DMAOE)、2’-O-ジメチルアミノプロピル(2’-O-DMAP)、2’-O-ジメチルアミノエチルオキシエチル(2’-O-DMAEOE)、または2’-O-N-メチルアセトアミド(2’-O-NMA)を含む。いくつかの態様において、センス鎖の各ヌクレオチドは修飾ヌクレオチド(例として、2’修飾ヌクレオチド)である。いくつかの態様において、センス鎖は1以上のホスホロジアミダートモルホリノを含む。いくつかの態様において、アンチセンス鎖はホスホロジアミダートモルホリノオリゴマー(PMO)である。いくつかの態様において、センス鎖はホスホロチオアートまたは他の修飾されたヌクレオチド間連結を含有する。いくつかの態様において、センス鎖はホスホロチオアートヌクレオシド間連結を含む。いくつかの態様において、センス鎖はホスホロチオアートヌクレオシド間連結を少なくとも2つのヌクレオチド間に含む。いくつかの態様において、センス鎖はホスホロチオアートヌクレオシド間連結をすべてのヌクレオチド間に含む。例えば、いくつかの態様において、センス鎖は、修飾されたヌクレオチド間連結をセンス鎖の5’または3’端の第1の、第2の、および/または(例として、および)第3のヌクレオシド間連結に含む。
いくつかの態様において、修飾されたヌクレオチド間連結はリン含有連結である。いくつかの態様において、使用され得るリン含有連結は、正常な3’-5’連結を有するホスホロチオアート、キラルホスホロチオアート、ホスホロジチオアート、ホスホトリエステル、アミノアルキルホスホトリエステル、3’アルキレンホスホナートおよびキラルホスホナートを含むメチルおよび他のアルキルホスホナート、ホスフィナート、3’-アミノホスホロアミダートおよびアミノアルキルホスホロアミダートを含むホスホロアミダート、チオノホスホロアミダート、チオノアルキルホスホナート、チオノアルキルホスホトリエステル、およびボラノホスファート、これらの2’-5’連結アナログ、ならびにヌクレオシド単位の隣接するペアが3’-5’対5’-3’または2’-5’対5’-2’で連結される逆向きの極性を有するものを包含するが、これらに限定されない;米国特許第3.687.808号;第4.469.863号;第4,476,301号;第5,023.243号;第5,177,196号;第5,188,897号;第5,264,423号;第5,276,019号;第5,278,302号;第5,286,717号;第5,321,131号;第5,399,676号;第5,405,939号;第5,453,496号;第5,455,233号;第5,466,677号;第5,476,925号;第5,519,126号;第5,536,821号;第5,541,306号;第5,550,111号;第5,563,253号;第5,571,799号;第5,587,361号;および第5,625,050号を見よ。
本明細書に記載のセンス鎖の修飾されたケミストリーまたはフォーマットのいずれかは、互いと組み合わせられ得る。例えば、1、2、3、4、5、またはより多くの異なる型の修飾が同じセンス鎖上に包含され得る。
いくつかの態様において、siRNA分子のアンチセンスまたはセンス鎖は、RNA誘導サイレンシング複合体(RISC)ローディングを増強または低減する修飾を含む。いくつかの態様において、siRNA分子のアンチセンス鎖はRISCローディングを増強する修飾を含む。いくつかの態様において、siRNA分子のセンス鎖は、RISCローディングを低減およびオフターゲット効果を低減する修飾を含む。いくつかの態様において、siRNA分子のアンチセンス鎖は2’-O-メトキシエチル(2’-MOE)修飾を含む。その全体が参照によって本明細書に組み込まれるSong et al.,(2017)Mol Ther Nucleic Acids 9:242-250に記載されているとおり、切断部位における2’-O-メトキシエチル(2’-MOE)基の追加は、修飾鎖の指向的なRNA誘導サイレンシング複合体(RISC)ローディングを容易化することによって、siRNAの特異性およびサイレンシング活性両方を改善する。いくつかの態様において、siRNA分子のアンチセンス鎖は2’-OMe-ホスホロジチオアート修飾を含み、これは、その全体が参照によって本明細書に組み込まれるWu et al.(2014)Nat Commun 5:3459に記載されているとおり、RISCローディングを増大させる。
いくつかの態様において、siRNA分子のセンス鎖は5’モルホリノを含み、これは、その全体が参照によって本明細書に組み込まれるKumar et al.,(2019)Chem Commun(Camb)55(35):5139-5142に記載されているとおり、センス鎖のRISCローディングを低減ならびにアンチセンス鎖選択およびRNAi活性を改善する。いくつかの態様において、siRNA分子のセンス鎖は、合成RNA様高親和性ヌクレオチドアナログのロックド核酸(LNA)によって修飾される。これは、その全体が参照によって本明細書に組み込まれるElman et al.,(2005)Nucleic Acids Res.33(1):439-447に記載されているとおり、センス鎖のRISCローディングを低減し、RISCへのアンチセンス鎖組み込みをさらに増強する。いくつかの態様において、siRNA分子のセンス鎖は5’アンロックド核酸(UNA)修飾を含み、これは、その全体が参照によって本明細書に組み込まれるSnead et al.,(2013)Mol Ther Nucleic Acids 2(7):e103に記載されているとおり、センス鎖のRISCローディングを低減し、アンチセンス鎖のサイレンシング力価(potentcy)を改善する。いくつかの態様において、siRNA分子のセンス鎖は5-ニトロインドール修飾を含み、これは、その全体が参照によって本明細書に組み込まれるZhang et al.,(2012)Chembiochem 13(13):1940-1945に記載されているとおり、センス鎖のRNAi力価を減少させ(descresed)、オフターゲット効果を低減する。いくつかの態様において、センス鎖は2’-O’メチル(2’-O-Me)修飾を含み、これは、その全体が参照によって本明細書に組み込まれるZheng et al.,FASEB (2013)27(10):4017-4026に記載されているとおり、センス鎖のRISCローディングおよびオフターゲット効果を低減する。いくつかの態様において、siRNA分子のセンス鎖はモルホリノ、2’-MOE、または2’-O-Me残基によって完全に置換され、その全体が参照によって本明細書に組み込まれるKole et al.,(2012)Nature reviews.Drug Discovery 11(2):125-140に記載されているとおり、RISCによって認識されない。いくつかの態様において、siRNA分子のアンチセンス鎖は2’-MOE修飾を含み、センス鎖は2’-O-Me修飾を含む(例として、Song et al.,(2017)Mol Ther Nucleic Acids 9:242-250を見よ)。いくつかの態様においては、少なくとも1つの(例として、少なくとも2、少なくとも3、少なくとも4、少なくとも5、少なくとも10)siRNA分子が(例として、共有結合的に)筋標的化剤に連結される。いくつかの態様において、筋標的化剤は、核酸(例として、DNAまたはRNA)、ペプチド(例として、抗体)、脂質(例として、マイクロベシクル)、または糖部分(例として、多糖)を含み得るか、またはそれからなり得る。いくつかの態様において、筋標的化剤は抗体である。いくつかの態様において、筋標的化剤は抗トランスフェリン受容体抗体である(例として、本明細書に提供される抗TfR抗体のいずれか1つ)。いくつかの態様において、筋標的化剤はsiRNA分子のセンス鎖の5’端に連結され得る。いくつかの態様において、筋標的化剤はsiRNA分子のセンス鎖の3’端に連結され得る。いくつかの態様において、筋標的化剤はsiRNA分子のセンス鎖に内部で連結され得る。いくつかの態様において、筋標的化剤はsiRNA分子のアンチセンス鎖の5’端に連結され得る。いくつかの態様において、筋標的化剤はsiRNA分子のアンチセンス鎖の3’端に連結され得る。いくつかの態様において、筋標的化剤はsiRNA分子のアンチセンス鎖に内部で連結され得る。
k.マイクロRNA(miRNA)
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、マイクロRNA(miRNA)であってもよい。マイクロRNA(「miRNA」と称される)は、標的RNA転写産物上の相補的な部位へ結合することによって遺伝子発現を制御する調節性分子の類に属する、小さいノンコーディングRNAである。典型的には、miRNAは、巨大なRNA前駆体(pri-miRNAと呼ばれる)から生成されるが、前記前駆体は核中で処理されておよそ70ヌクレオチドpre-miRNAになり、これが折り畳まれて不完全なステムループ構造体になる。これらのpre-miRNAは、典型的には、細胞質内で追加のプロセシングステップを経るが、前記細胞質内の長さが18~25ヌクレオチドの成熟miRNAは、RNase III酵素であるDicerによってpre-miRNAヘアピンの片側から切除される。
本明細書に使用されるとき、miRNAは、pri-miRNA、pre-miRNA、成熟miRNA、そのバリアントのフラグメントを包含するmiRNAは、または成熟miRNAの生物活性を保持するそのバリアントのフラグメントを包含する。一態様において、miRNAのサイズ範囲は、21ヌクレオチドから170ヌクレオチドまでであり得る。一態様において、miRNAのサイズ範囲は、長さが70ヌクレオチドから170ヌクレオチドまでである。別の態様において、長さが21ヌクレオチドから25ヌクレオチドまでの成熟miRNAが使用され得る。
l.アプタマー
いくつかの態様において、本明細書に提供されるオリゴヌクレオチドは、アプタマーの形態であってもよい。一般に、分子ペイロードの文脈において、アプタマーは、細胞中の小分子、タンパク質、核酸などの標的へ特異的に結合するいずれの核酸でもある。いくつかの態様において、アプタマーは、DNAアプタマーまたはRNAアプタマーである。いくつかの態様において、核酸アプタマーは、一本鎖のDNAまたはRNA(ssDNAまたはssRNA)である。一本鎖核酸アプタマーが、ヘリックスおよび/またはループ構造を形成してもよいことは理解されるべきである。核酸アプタマーを形成する核酸は、天然に存在するヌクレオチド、修飾ヌクレオチド、炭化水素リンカー(例として、アルキレン)もしくはポリエーテルリンカー(例として、PEGリンカー)が1以上のヌクレオチド間に挿入された天然に存在するヌクレオチド、炭化水素もしくはPEGリンカーが1以上のヌクレオチド間に挿入された修飾ヌクレオチド、またはそれらの組み合わせを含んでいてもよい。アプタマーおよびアプタマーを産生する方法を記載する例示の刊行物および特許は、例として、Lorsch and Szostak,1996;Jayasena,1999;米国特許第5,270,163号;第5,567,588号;第5,650,275号;第5,670,637号;第5,683,867号;第5,696,249号;第5,789,157号;第5,843,653号;第5,864,026号;第5,989,823号;第6,569,630号;第8,318,438号およびPCT出願WO 99/31275を包含するが、これら各々は参照により本明細書に組み込まれる。
m.リボザイム
いくつかの態様において、本明細書に提供されるオリゴヌクレオチドは、リボザイムの形態であってもよい。リボザイム(リボ核酸酵素)は、タンパク質酵素の作用と同様の特定の生化学的反応を実施することが可能な分子、典型的にはRNA分子である。リボザイムは、これらがハイブリダイズしているRNA分子(mRNA、RNA含有基質、lncRNA、およびリボザイム自体など)中の特定のホスホジエステル連結での切断能を包含する酵素活性をもつ分子である。
リボザイムは、数種の物理的構造の1つを取り得、これらの1つが「ハンマーヘッド」と呼ばれる。ハンマーヘッド型リボザイムは、保存された9塩基を含有する触媒コア、二本鎖ステムおよびループ構造(ステムループII)、ならびに触媒コアを囲む標的RNAフランキング領域に相補的な2つの領域から構成される。フランキング領域によって、リボザイムは、二本鎖ステムIおよびIIIを形成することによって標的RNAへ特異的に結合することができる。切断は、3’,5’-リン酸ジエステルから2’,3’-環状リン酸ジエステルへのエステル交換反応による特定のリボヌクレオチド三塩基(triplet)の次に、cis(すなわち、ハンマーヘッドモチーフを含有する同じRNA分子の切断)で、またはtrans(リボザイムを含有するもの以外のRNA基質の切断)で生じる。理論によって拘束されることは望まないが、この触媒活性は、リボザイムの触媒領域中に高度に保存された特定の配列が存在することを要すると考えられている。
リボザイム構造中の修飾はまた、様々な分子の非コア部分の、非ヌクレオチド分子との置換または置き換えも包含する。例えば、Benselerら(J.Am.Chem.Soc.(1993)115:8483-8484)は、ハンマーヘッド様分子を開示しており、ここでステムIIの2塩基対およびループIIの4ヌクレオチドすべてが、ヘキサエチレングリコール、プロパンジオール、ビス(トリエチレングリコール)ホスファート、トリス(プロパンジオール)ビスホスファート、またはビス(プロパンジオール)ホスファートを基にする非ヌクレオシドリンカーに置き換えられていた。Maら(Biochem.(1993)32:1751-1758;Nucleic Acids Res.(1993)21:2585-2589)は、TARリボザイムヘアピンの6ヌクレオチドループを、エチレングリコールに関する非ヌクレオチドリンカーに置き換えた。Thomsonら(Nucleic Acids Res.(1993)21:5600-5603)は、ループIIを、長さが13、17、および19原子の線状の非ヌクレオチドリンカーに置き換えた。
リボザイムオリゴヌクレオチドは、周知の方法(例として、PCT刊行物WO9118624;WO9413688;WO9201806;およびWO92/07065;ならびに米国特許5436143および5650502を見よ)を使用して調製され得るか、または商業的供給源(例として、US Biochemicals)から購入され得、所望の場合、細胞中ヌクレアーゼによる分解に対するオリゴヌクレオチドの耐性を増大させるためにヌクレオチド類似体を組み込み得る。リボザイムは、例として、市販の合成機(例として、Applied Biosystems,Inc.またはMilligenによって製造された)の使用による、いずれの知られているやり方で合成されてもよい。リボザイムはまた、従来の手段によって、組換えベクターにおいても産生されてよい。Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory(Current edition)を見よ。リボザイムRNA配列は、例えば、T7またはSP6などのRNAポリメラーゼを使用することによる従来法で、合成されてもよい。
n.ガイド核酸
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、ガイド核酸、例として、ガイドRNA(gRNA)分子である。一般に、ガイドRNAは、(1)Cas9などの、核酸をプログラムできるDNA結合タンパク質(napDNAbp)へ結合する骨格(scaffold)配列、および(2)gRNAが、核酸をプログラムできるDNA結合タンパク質をDNA標的配列に近づけるために結合するDNA標的配列(例として、ゲノムDNA標的)を定義するヌクレオチドスペーサー部分から構成される低分子合成RNAである。いくつかの態様において、napDNAbpは、核酸をプログラムできるタンパク質に、標的DNA配列(例として、標的ゲノムDNA配列)を標的にさせる1以上のRNA(単数または複数)と(例として、これと結合して、またはこれと結び付いて)複合体を形成する、核酸をプログラムできるタンパク質である。いくつかの態様において、核酸プログラム可能なヌクレアーゼは、RNAとの複合体にあるとき、ヌクレアーゼ:RNA複合体と称されることもある。ガイドRNAは、2以上のRNAの複合体として、または単一のRNA分子として存在し得る。
単一のRNA分子として存在するガイドRNA(gRNA)は、単一のガイドRNA(sgRNA)と称されることもあるが、gRNAはまた、単一分子または2以上の分子の複合体のいずれかとして存在するガイドRNAを指すためにも使用される。典型的には、単一のRNA種として存在するgRNAは、2つのドメインを含む:(1)標的核酸(すなわち、Cas9複合体の標的への結合に向かわせる)との相同性を共有するドメイン;および(2)Cas9タンパク質に結合するドメイン。いくつかの態様において、ドメイン(2)は、tracrRNAとして知られている配列に対応し、ステムループ構造を含む。いくつかの態様において、ドメイン(2)は、Jinek et al.,Science 337:816-821(2012)(この内容全体は、参照により本明細書に組み込まれる)に提供されるとおり、tracrRNAと同一または相同である。
いくつかの態様において、gRNAは、ドメイン(1)および(2)の2以上を含み、伸長(extended)gRNAと称されることもある。例えば、伸長gRNAは、本明細書に記載のとおり、2以上のCas9タンパク質に結合し、および2以上の別個の領域での標的核酸に結合するであろう。gRNAは、ヌクレアーゼ/RNA複合体の該標的部位への結合を媒介する標的部位に相補的なヌクレオチド配列を含み、ヌクレアーゼ:RNA複合体の配列特異性を提供する。いくつかの態様において、RNAをプログラムできるヌクレアーゼは、(CRISPR関連系)Cas9エンドヌクレアーゼ、例えば、Streptococcus pyogenesからのCas9(Csn1)である(例として、"Complete genome sequence of an M1 strain of Streptococcus pyogenes."Ferretti J.J.,McShan W.M.,Ajdic D.J.,Savic D.J.,Savic G.,Lyon K.,Primeaux C.,Sezate S.,Suvorov A.N.,Kenton S.,Lai H.S.,Lin S.P.,Qian Y.,Jia H.G.,Najar F.Z.,Ren Q.,Zhu H.,Song L.,White J.,Yuan X.,Clifton S.W.,Roe B.A.,McLaughlin R.E.,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.98:4658-4663(2001);"CRISPR RNA maturation by trans-encoded small RNA and host factor RNase III."Deltcheva E.,Chylinski K.,Sharma C.M.,Gonzales K.,Chao Y.,Pirzada Z.A.,Eckert M.R.,Vogel J.,Charpentier E.,Nature 471:602-607(2011);および"A programmable dual-RNA-guided DNA endonuclease in adaptive bacterial immunity."Jinek M.,Chylinski K.,Fonfara I.,Hauer M.,Doudna J.A.,Charpentier E.Science 337:816-821(2012)(これら各々の内容全体は参照により本明細書に組み込まれる)を見よ。
p.マルチマー
いくつかの態様において、分子ペイロードは、リンカーによって接続された2以上のオリゴヌクレオチドのマルチマー(例として、コンカテマー)を含んでいてもよい。このように、いくつかの態様において、複合体/抱合体のオリゴヌクレオチドの負荷(loading)は、標的化剤上の利用可能な連結部位(例として、抗体上の利用可能なチオール部位)を超えて増大され得るか、または具体的なペイロード負荷量に達するよう別様に整え得る。マルチマー中のオリゴヌクレオチドは、同じかまたは異なり得る(例として、異なる遺伝子、もしくは同じ遺伝子上の異なる部位、またはそれらの産物を標的にする)。
いくつかの態様において、マルチマーは、切断可能なリンカーによって一緒に連結された2以上のオリゴヌクレオチドを含む。しかしながら、いくつかの態様において、マルチマーは、切断不能なリンカーによって一緒に連結された2以上のオリゴヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、マルチマーは、一緒に連結された2、3、4、5、6、7、8、9、10、またはこれより多くのオリゴヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、マルチマーは、一緒に連結された2~5、2~10、または4~20オリゴヌクレオチドを含む。
いくつかの態様において、マルチマーは、(線状配置において)末端間(end-to-end)で連結された2以上のオリゴヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、マルチマーは、オリゴヌクレオチドベースのリンカー(例として、ポリ-dTリンカー、塩基性リンカー)を介して、末端間で連結された2以上のオリゴヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、マルチマーは、あるオリゴヌクレオチドの3’末端へ連結された、別のオリゴヌクレオチドの5’末端を含む。いくつかの態様において、マルチマーは、あるオリゴヌクレオチドの3’末端へ連結された、別のオリゴヌクレオチドの3’末端を含む。いくつかの態様において、マルチマーは、あるオリゴヌクレオチドの5’末端へ連結された、別のオリゴヌクレオチドの5’末端を含む。またさらに、いくつかの態様において、マルチマーは、分枝リンカーによって一緒に連結された複数のオリゴヌクレオチドを含む分枝構造を含み得る。
本明細書に提供される複合体に使用されてもよいマルチマーのさらなる例は、例えば、2015年11月5日に公開され、Methods of delivering multiple targeting oligonucleotides to a cell using cleavable linkersと題する米国特許出願第2015/0315588 A1号;2015年9月3日に公開され、Multimeric Oligonucleotide Compoundsと題する米国特許出願第2015/0247141 A1号;2011年6月30日に公開され、Immunostimulatory Oligonucleotide Multimersと題する米国特許出願第US 2011/0158937 A1号;および1997年12月2日に発行され、Triplex-Forming Antisense Oligonucleotides Having Abasic Linkers Targeting Nucleic Acids Comprising Mixed Sequences Of Purines And Pyrimidinesと題する米国特許第5,693,773号に開示されており、これら各々の内容はそれら全体が参照されることにより本明細書に組み込まれる。
ii.小分子:
本明細書に記載のとおり、任意の好適な小分子は、分子ペイロードとして使用され得る。いくつかの態様において、小分子は、MSTN(例として、MSTNのエキソン2)配列のエキソンスキッピングを促進する。いくつかの態様において、小分子は、「Myostatin inhibitors」と表題を付けられ、2013年9月19日に公開された国際特許出願公開WO2013137832A1に記載されているとおりであり、その内容は、その全体が本明細書に組み込まれる。いくつかの態様において、小分子は、INHBAオリゴマーまたは二量体の形成を阻害する。いくつかの態様において、小分子は、アクチビンAおよび/またはインヒビンAの形成を阻害する。いくつかの態様において、小分子は、インヒビン、ベータA(INHBA)の機能を阻害する。
いくつかの態様において、小分子は、ACVR1Bインヒビターである。いくつかの態様において、小分子は、SB-431542またはSB-431542の誘導体である。いくつかの態様において、小分子は、AZ12601011またはAZ12601011の誘導体である。いくつかの態様において、小分子は、SB-505124またはSB-505124の誘導体である。いくつかの態様において、小分子は、Sun, Z. et al., "The TGF-β Pathway Mediates Doxorubicin Effects on Cardiac Endothelial Cells." J Mol Cell Cardiol. 2016 Jan; 90: 129-138.;Spender L.C., et al. "Preclinical Evaluation of AZ12601011 and AZ12799734, Inhibitors of Transforming Growth Factor β Superfamily Type 1 Receptors." Mol Pharmacol. 2019 Feb;95(2):222-234.;DaCosta Byfield S. et al., "SB-505124 is a selective inhibitor of transforming growth factor-beta type I receptors ALK4, ALK5, and ALK7." Mol Pharmacol. 2004 Mar;65(3):744-52.;Inman, G.J. et al., "SB-431542 is a potent and specific inhibitor of transforming growth factor-beta superfamily type I activin receptor-like kinase (ALK) receptors ALK4, ALK5, and ALK7." Mol Pharmacol. 2002 Jul;62(1):65-74.に記載されているとおりであり、それらの各々の内容は、それらの全体が本明細書に組み込まれる。
iii.ペプチド/タンパク質
本明細書に記載のとおり、任意の好適なペプチドまたはタンパク質は、分子ペイロードとして使用され得る。いくつかの態様において、タンパク質は酵素である。これらのペプチドまたはタンパク質は、数個の方法論(例として、ファージディスプレーペプチドライブラリ、1ビーズ1化合物ペプチドライブラリ、または位置走査性合成ペプチドコンビナトリアルライブラリ)を使用して、生成され、合成され、および/または誘導体化され得る。ペプチドまたはタンパク質は、天然に存在するアミノ酸、例として、システイン、アラニン、または天然に存在しないまたは修飾されたアミノ酸を含み得る。天然に存在しないアミノ酸は、β-アミノ酸、ホモアミノ酸、プロリン誘導体、3-置換アラニン誘導体、線状コアアミノ酸、N-メチルアミノ酸、および当該技術分野において知られている他のものを包含する。いくつかの態様において、ペプチドは線状であり得る。他の態様において、ペプチドは環状、例として二環式であり得る。
1.MSTNペプチドおよびタンパク質
いくつかの態様において、タンパク質またはペプチドは、「Myostatin-inhibiting peptide」と表題を付けられ、2014年8月7日に公開された国際特許出願公開WO2014119753A1;「Binding agents which inhibit myostatin」と表題を付けられ、2004年7月15日に公開された国際特許出願公開WO2004058988A2;「Antibodies that bind myostatin, compositions and methods」と表題を付けられ、2012年2月23日に公開された国際特許出願公開WO2012024242A1;Takayama, K. et. al. "Chain-Shortened Myostatin Inhibitory Peptides Improve Grip Strength in Mice" ACS Med Chem Lett. 2019 May 28;10(6):985-990.;Jin, Q. et. al. "A GDF11/myostatin inhibitor, GDF11 propeptide-Fc, increases skeletal muscle mass and improves muscle strength in dystrophic mdx mice" Skelet Muscle. 2019 May 27;9(1):16.;Long, K.K. et. al., "Specific inhibition of myostatin activation is beneficial in mouse models of SMA therapy" Hum Mol Genet. 2019 Apr 1;28(7):1076-1089.;Campbell, C. et. al. "Myostatin inhibitor ACE-031 treatment of ambulatory boys with Duchenne muscular dystrophy: Results of a randomized, placebo-controlled clinical trial" Muscle Nerve. 2017 Apr;55(4):458-464.;およびTakayama, K. et. al., "Effect of N-Terminal Acylation on the Activity of Myostatin Inhibitory Peptides" ChemMedChem. 2016 Apr 19;11(8):845-9.に記載されているとおりであり、上に挙げられたこれらの刊行物の各々の内容は、それらの全体が本明細書に組み込まれる。
いくつかの態様において、MSTNを標的にするペプチドまたはタンパク質は、ミオスタチンタンパク質の活性を選択的に阻害する。いくつかの態様において、MSTNを標的にするペプチドまたはタンパク質は、ミオスタチンタンパク質の活性を選択的に阻害し、10~50、20~50、20~40、20~30、10~100、25~100、50~100、または100超のアミノ酸を含む。いくつかの態様において、MSTNを標的にするペプチドまたはタンパク質は、成長分化因子11(GDF11)ポリペプチド(例として、GDF11プロペプチド-Fc融合)である。いくつかの態様において、MSTNを標的にするペプチドまたはタンパク質は、アクチビン受容体IIB型およびIgG1-Fcの融合タンパク質である。いくつかの態様において、MSTNを標的にするペプチドまたはタンパク質は、ミオスタチンタンパク質の活性を阻害するフォリスタチンポリペプチド(例として、組換え突然変異体フォリスタチン)である。フォリスタチンポリペプチドは、フォリスタチンN末ドメイン、フォリスタチン1ドメイン、フォリスタチン2ドメイン、フォリスタチン3ドメインおよび/またはフォリスタチンC末ドメインを含み得る。いくつかの態様において、MSTNを標的にするペプチドまたはタンパク質は、抗MSTN抗体である。
2.INHBAペプチドおよびタンパク質
いくつかの態様において、ペプチドまたはタンパク質は、Chen, J.L. et al. "Development of Novel Activin-Targeted Therapeutics" Mol Ther. 2015 Mar; 23(3): 434-444.;Hu, J. et al. "Activin A inhibition attenuates sympathetic neural remodeling following myocardial infarction in rats" Mol Med Rep. 2018 Apr; 17(4): 5074-5080.;Yaden, BC et al. "Inhibition of activin A ameliorates skeletal muscle injury and rescues contractile properties by inducing efficient remodeling in female mice" Am J Pathol. 2014 Apr;184(4):1152-66.;「Inhibin Analogs」と表題を付けれ、2018年9月27日に公開された米国特許出願公開US20180273599に記載されているとおりであり、その内容全体は、その全体が本明細書に組み込まれる。
いくつかの態様において、INHBAを標的にするペプチドまたはタンパク質は、INHBAを含むオリゴマーまたは二量体の形成を選択的に阻害する。いくつかの態様において、ペプチドまたはタンパク質は、アクチビンAおよび/またはインヒビンAの形成を阻害する。いくつかの態様において、INHBAを標的にするペプチドまたはタンパク質は、インヒビン、ベータA(INHBA)の機能を選択的に阻害する。いくつかの態様において、INHBAを標的にするペプチドまたはタンパク質は、修飾されたアクチビンAおよび/またはアクチビンBプロドメインである。いくつかの態様において、INHBAを標的にするペプチドまたはタンパク質は、フォリスタチンまたはその誘導体である。INHBAを標的にするペプチドまたはタンパク質は、10~50、20~50、20~40、20~30、10~100、25~100、50~100、または100超のアミノ酸を含む。いくつかの態様において、INHBAを標的にするペプチドまたはタンパク質は、インヒビン類似体である。いくつかの態様において、INHBAを標的にするペプチドまたはタンパク質は、抗INHBA抗体である。
3.ACVR1Bペプチドおよびタンパク質
いくつかの態様において、タンパク質は、トランケートされたACVR1Bタンパク質である。いくつかの態様において、トランケートされたACVR1Bタンパク質は、アクチビン受容体タイプ2タンパク質への結合について、内在性の完全長ACVR1Bと競合する。いくつかの態様において、トランケートされたACVR1Bタンパク質は、リン酸化され得ない。リン酸化され得ないトランケートされたACVR1Bタンパク質は、アクチビンシグナリングを伝達し得ない。いくつかの態様において、トランケートされたACVR1Bタンパク質は、そのC末端においてトランケートされている。トランケートされたACVR1Bタンパク質は、完全長ACVR1のサブドメインXIのほとんどを欠いているか、完全長ACVR1のサブドメインXおよびXIを欠いているか、または完全長ACVR1のキナーゼサブドメインIX-XIおよびサブドメインVIIIの一部を欠いていることがあり得る。
いくつかの態様において、タンパク質またはペプチドは、Zhou, Y. et al. "Truncated Activin Type I Receptor Alk4 Isoforms Are Dominant Negative Receptors Inhibiting Activin Signaling." Molecular Endocrinology, 2000, 14:12, 2066-2075.;2016年3月23日に出願され、「A method of treating neoplasias」と表題を付けられた国際特許出願公開WO2016/161477に記載されているとおりであり、上に挙げられたこれらの刊行物の各々の内容は、それらの全体が本明細書に組み込まれる。
iv.核酸構築物
本明細書に記載のとおり、任意の好適な遺伝子発現コンストラクトは、分子ペイロードとして使用され得る。いくつかの態様において、遺伝子発現コンストラクトは、ベクターまたはcDNAフラグメントであり得る。いくつかの態様において、遺伝子発現コンストラクトは、メッセンジャーRNA(mRNA)であり得る。いくつかの態様において、本明細書に使用されるmRNAは、修飾されたmRNA、例として、「Engineered nucleic acids encoding a modified erythropoietin and their expression」と表題を付けられ、2014年4月24日に発行された米国特許8,710,200に記載されているとおりのものであり得る。いくつかの態様において、mRNAは、5’メチルキャップを含み得る。いくつかの態様において、mRNAは、任意に長さが最大160ヌクレオチドのポリAテールを含み得る。遺伝子発現コンストラクトは、ミオスタチンの発現または活性を低減するタンパク質の配列をコードし得る。遺伝子発現コンストラクトは、INHBA二量体またはオリゴマーの形成を阻害または妨害するINHBAのペプチドまたはタンパク質類似体であるタンパク質の配列をコードし得る。いくつかの態様において、遺伝子発現コンストラクトは、アクチビンAおよび/またはインヒビンAの形成を阻害または妨害する。遺伝子発現コンストラクトは、トランケートされたACVR1Bタンパク質であるタンパク質の配列をコードし得る。いくつかの態様において、トランケートされたACVR1Bタンパク質は、アクチビン受容体タイプ2タンパク質への結合について、内在性の完全長ACVR1Bと競合する。いくつかの態様において、トランケートされたACVR1Bタンパク質は、リン酸化され得ない。リン酸化され得ないトランケートされたACVR1Bタンパク質は、アクチビンシグナリングを伝達し得ない。いくつかの態様において、トランケートされたACVR1Bタンパク質は、そのC末端においてトランケートされている。トランケートされたACVR1Bタンパク質は、完全長ACVR1のサブドメインXIのほとんどを欠いているか、完全長ACVR1のサブドメインXおよびXIを欠いているか、または完全長ACVR1のキナーゼサブドメインIX-XIおよびサブドメインVIIIの一部を欠いていることがあり得る。いくつかの態様において、遺伝子発現コンストラクトは、筋細胞の核内で発現(例として、過剰発現)され得る。いくつかの態様において、遺伝子発現コンストラクトは、成長分化因子11(GDF11)ポリペプチド(例として、GDF11プロペプチド-Fc融合)、アクチビン受容体IIB型およびIgG1-Fcの融合タンパク質、フォリスタチンポリペプチド(例として、組換え突然変異体フォリスタチン、例として、フォリスタチンN末ドメイン、フォリスタチン1ドメイン、フォリスタチン2ドメイン、フォリスタチン3ドメインおよび/またはフォリスタチンC-末端ドメインを含む)、または抗MSTN抗体をコードする。いくつかの態様において、遺伝子発現コンストラクトは、少なくとも1のジンクフィンガーを含むタンパク質をコードする。いくつかの態様において、遺伝子発現コンストラクトは、MSTN遺伝子の発現の低減につながるタンパク質をコードする。いくつかの態様において、遺伝子発現コンストラクトは、INHBA遺伝子の発現の低減につながるタンパク質をコードする。いくつかの態様において、遺伝子発現コンストラクトは、ACVR1B遺伝子へ結合するタンパク質をコードする。いくつかの態様において、遺伝子発現コンストラクトは、ACVR1B遺伝子の発現の低減につながるタンパク質をコードする。いくつかの態様において、遺伝子発現コンストラクトは、遺伝子編集酵素をコードする。分子ペイロードとして使用され得る核酸構築物の追加の例は、「CLOSED-ENDED LINEAR DUPLEX DNA FOR NON-VIRAL GENE TRANSFER」と表題を付けられ、2017年9月19日に公開された国際特許出願公開WO2017152149A1;「MRNA FOR USE IN TREATMENT OF HUMAN GENETIC DISEASES」と表題を付けられ、2014年10月7日に発行された米国特許8,853,377B2;および2014年9月2日に発行された米国特許US8822663B2、「ENGINEERED NUCLEIC ACIDS AND METHODS OF USE THEREOF」において提供され、これらの各々の内容は、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。
C.リンカー
本明細書に記載の複合体は一般に、筋標的化剤を分子ペイロードへ接続するリンカーを含む。リンカーは、少なくとも1つの共有結合を含む。いくつかの態様において、リンカーは、筋標的化剤を分子ペイロードへ接続する単結合、例として、ジスルフィド結合またはジスルフィド架橋であってもよい。しかしながら、いくつかの態様において、リンカーは、複数の共有結合を通して、筋標的化剤を分子ペイロードへ接続していてもよい。いくつかの態様において、リンカーは、切断可能なリンカーであってもよい。しかしながら、いくつかの態様において、リンカーは、切断不能なリンカーであってもよい。リンカーは一般に、in vitroおよびin vivoで安定しており、ある細胞環境において安定していてもよい。加えて、一般にリンカーは、筋標的化剤または分子ペイロードのいずれかの機能特性に負の影響を及ぼさない。リンカー合成の例および方法は、当該技術分野において知られている(例として、Kline,T.et al."Methods to Make Homogenous Antibody Drug Conjugates."Pharmaceutical Research,2015,32:11,3480-3493.;Jain,N.et al."Current ADC Linker Chemistry"Pharm Res.2015,32:11,3526-3540.;McCombs,J.R. and Owen,S.C."Antibody Drug Conjugates:Design and Selection of Linker,Payload and Conjugation Chemistry"AAPS J.2015,17:2,339-351.を見よ)。
リンカーの前駆体は、典型的には、筋標的化剤と分子ペイロードとの両方へ付着できる2つの異なる反応性の高い種を含有しているであろう。いくつかの態様において、2つの異なる反応性の高い種は、求核試薬および/または(例として、および)求電子試薬であってもよい。いくつかの態様において、リンカーは、筋標的化剤のリシン残基またはシステイン残基への抱合を介して、筋標的化剤へ接続されている。いくつかの態様において、リンカーは、マレイミド含有リンカーを介して筋標的化剤のシステイン残基へ接続されており、ここで任意に、マレイミド含有リンカーは、マレイミドカプロイルまたはマレイミドメチルシクロヘキサン-1-カルボキシラート基を含む。いくつかの態様において、リンカーは、3-アリールプロピオニトリル官能基を介して、筋標的化剤のシステイン残基またはチオール官能化分子ペイロードへ接続されている。いくつかの態様において、リンカーは、抗TfR抗体のリシン残基へ接続されている。いくつかの態様において、リンカーは、アミド結合、カルバマート結合、ヒドラジド、トリアゾール、チオエーテル、またはジスルフィド結合を介して、筋標的化剤および/または(例として、および)分子ペイロードへ接続されている。
i.切断可能なリンカー
切断可能なリンカーは、プロテアーゼ感受性リンカー、pH感受性リンカー、またはグルタチオン感受性リンカーであってもよい。これらのリンカーは一般に、細胞内のみで切断可能であって、好ましくは、細胞外環境において、例として、筋細胞の細胞外において安定している。
プロテアーゼ感受性リンカーは、プロテアーゼ酵素活性によって切断可能である。これらのリンカーは、典型的にはペプチド配列を含んでおり、長さが2~10アミノ酸、約2~5アミノ酸、約5~10アミノ酸、約10アミノ酸、約5アミノ酸、約3アミノ酸、または約2アミノ酸であってもよい。いくつかの態様において、ペプチド配列は、天然に存在するアミノ酸、例として、システイン、アラニン、または天然に存在しないかもしくは修飾されたアミノ酸を含んでいてもよい。天然に存在しないアミノ酸は、β-アミノ酸、ホモ-アミノ酸、プロリン誘導体、3-置換アラニン誘導体、線形コアアミノ酸、N-メチルアミノ酸、および当該技術分野において知られているその他のアミノ酸を包含する。いくつかの態様において、プロテアーゼ感受性リンカーは、バリン-シトルリンまたはアラニン-シトルリンのジペプチド配列を含む。いくつかの態様において、プロテアーゼ感受性リンカーは、リソソームのプロテアーゼ、例として、カテプシンB、および/またはエンドソームのプロテアーゼによって切断され得る。
pH感受性リンカーは、高または低pH環境において容易に分解される共有結合の連結である。いくつかの態様において、pH感受性リンカーは、4~6の範囲にあるpHにて切断されてもよい。いくつかの態様において、pH感受性リンカーは、ヒドラゾンまたは環状アセタールを含む。いくつかの態様において、pH感受性リンカーは、エンドソームまたはリソソーム内で切断される。
いくつかの態様において、グルタチオン感受性リンカーは、ジスルフィド部を含む。いくつかの態様において、グルタチオン感受性リンカーは、細胞内部でのグルタチオン種とのジスルフィド交換反応によって切断される。いくつかの態様において、ジスルフィド部はさらに、少なくとも1アミノ酸、例としてシステイン残基を含む。
いくつかの態様において、リンカーは、Val-citリンカー(例として、US米国特許6,214,345(参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるとおり)である。いくつかの態様において、抱合前のval-citリンカーは、以下の構造:
Figure 2023512441000037

を有する。
いくつかの態様において、抱合後のval-citリンカーは、以下の構造:
Figure 2023512441000038

を有する。
いくつかの態様において、Val-citリンカーは、反応性の化学的部分(例として、クリックケミストリー抱合のためのSPAAC)へ付着される。いくつかの態様においては、クリックケミストリー抱合前に、反応性の高い化学的部分(例として、クリックケミストリー抱合のためのSPAAC)へ付着されるval-citリンカーは、以下の構造:
Figure 2023512441000039

を有し、ここでnは0~10のいずれかの数である。いくつかの態様において、nは3である。
いくつかの態様において、反応性の高い化学的部分(例として、クリックケミストリー抱合のためのSPAAC)へ付着されるval-citリンカーは、(例として、異なる化学的部分を介して)分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)へ抱合される。いくつかの態様において、反応性の高い化学的部分(例として、クリックケミストリー抱合のためのSPAAC)へ付着され、分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)へ抱合されるval-citリンカーは(クリックケミストリー抱合前に)、以下の構造:
Figure 2023512441000040

を有し、ここでnは0~10のいずれかの数である。いくつかの態様において、nは3である。
いくつかの態様においては、分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)への抱合後、val-citリンカーは、以下の構造:
Figure 2023512441000041

を有し、ここでnは0~10のいずれかの数であり、およびここでmは0~10のいずれかの数である。いくつかの態様において、nは3であり、およびmは4である。
ii.切断不能リンカー
いくつかの態様において、切断不能なリンカーが使用されてもよい。一般に、切断不能なリンカーは、細胞環境または生理環境において容易に分解され得ない。いくつかの態様において、切断不能なリンカーは、任意に置換されていてもよいアルキル基を含むが、ここで置換は、ハロゲン、ヒドロキシル基、酸素種、および他の一般的な置換を包含していてもよい。いくつかの態様において、リンカーは、任意に置換されていてもよいアルキル、任意に置換されていてもよいアルキレン、任意に置換されていてもよいアリーレン、ヘテロアリーレン、少なくとも1個の非天然アミノ酸を含むペプチド配列、トランケートされたグリカン、酵素的に分解され得ない糖(単数もしくは複数)、アジド、アルキン-アジド、LPXTG配列(配列番号528)を含むペプチド配列、チオエーテル、ビオチン、ビフェニル、反復単位のポリエチレングリコールもしくは等価な化合物、酸エステル、酸アミド、スルファミド、および/または(例として、および)、アルコキシ-アミンリンカーを含んでいてもよい。いくつかの態様において、ソルターゼ媒介ライゲーションは、LPXTG配列(配列番号528)を含む筋標的化剤を(G)配列を含む分子ペイロードへ連結するために利用されるであろう(例として、Proft T.Sortase-mediated protein ligation:an emerging biotechnology tool for protein modification and immobilization.Biotechnol Lett.2010,32(1):1-10を見よ)。いくつかの態様において、リンカーは、LPXTG配列(配列番号528)を含み、ここでXは、いずれのアミノ酸である。
いくつかの態様において、リンカーは、置換されたアルキレン、任意に置換されていてもよいアルケニレン、任意に置換されていてもよいアルキニレン、任意に置換されていてもよいシクロアルキレン、任意に置換されていてもよいシクロアルケニレン、任意に置換されていてもよいアリーレン、N、O、およびSから選択される少なくとも1個のヘテロ原子をさらに含む任意に置換されていてもよいヘテロアリーレン;N、O、およびSから選択される少なくとも1個のヘテロ原子をさらに含む任意に置換されていてもよいヘテロシクリレン;イミノ、任意に置換されていてもよい窒素種、任意に置換されていてもよい酸素種O、任意に置換されていてもよい硫黄種、またはポリ(アルキレンオキシド)、例として、ポリエチレンオキシドまたはポリプロピレンオキシドを含んでいてもよい。
iii.リンカー抱合
いくつかの態様において、リンカーは、ホスファート、チオエーテル、エーテル、炭素-炭素、カルバマート、もしくはアミド結合を介して筋標的化剤および/または(例として、および)分子ペイロードへ接続されている。いくつかの態様において、リンカーは、リン酸塩またはホスホロチオアート基、例として、オリゴヌクレオチド主鎖の末端のホスファートを通してオリゴヌクレオチドへ接続されている。いくつかの態様において、リンカーは、筋標的化剤上に存在するリシン残基またはシステイン残基を通して、筋標的化剤、例として抗体へ接続されている。
いくつかの態様において、リンカーは、トリアゾールを形成するアジドとアルキンとの間のシクロ付加反応によって、筋標的化剤および/または(例として、および)分子ペイロードへ接続されており、ここでアジドおよびアルキンは、筋標的化剤、分子ペイロード、またはリンカー上に位置付けられていてもよい。いくつかの態様において、アルキンは、環状アルキン、例としてシクロオクチンであってもよい。いくつかの態様において、アルキンは、ビシクロノニン(またビシクロ[6.1.0]ノニンまたはBCNとしても知られている)または置換ビシクロノニンであってもよい。いくつかの態様において、シクロオクタンは、2011年11月3日に公開の国際特許出願刊行物WO2011136645、表題「Fused Cyclooctyne Compounds And Their Use In Metal-free Click Reactions」に記載のとおりである。いくつかの態様において、アジドは、アジドを含む糖または炭水化物分子であってもよい。いくつかの態様において、アジドは、6-アジド-6-デオキシガラクトースまたは6-アジド-N-アセチルガラクトサミンであってもよい。いくつかの態様において、アジドを含む糖または炭水化物分子は、2016年10月27日に公開の国際特許出願刊行物WO2016170186、表題「Process For The Modification Of A Glycoprotein Using A Glycosyltransferase That Is Or Is Derived From A β(1,4)-N-Acetylgalactosaminyltransferase」に記載のとおりである。いくつかの態様において、トリアゾールを形成するアジドとアルキンとの間のシクロ付加反応(ここでアジドおよびアルキンは、筋標的化剤、分子ペイロード、またはリンカー上に位置付けられていてもよい)は、2014年5月1日に公開の国際特許出願刊行物WO2014065661、表題「Modified antibody, antibody-conjugate and process for the preparation thereof」;または2016年10月27日に公開の国際特許出願刊行物WO2016170186、表題「Process For The Modification Of A Glycoprotein Using A Glycosyltransferase That Is Or Is Derived From A β(1,4)-N-Acetylgalactosaminyltransferase」に記載のとおりである。
いくつかの態様において、リンカーはさらに、スペーサー、例として、ポリエチレングリコールスペーサーまたはアシル/カルバモイルスルファミドスペーサー、例として、HydraSpace(商標)スペーサーを含む。いくつかの態様において、スペーサーは、Verkade,J.M.M.et al.,"A Polar Sulfamide Spacer Significantly Enhances the Manufacturability, Stability, and Therapeutic Index of Antibody-Drug Conjugates",Antibodies,2018,7,12に記載のとおりである。
いくつかの態様において、リンカーは、求ジエン体とジエン/ヘテロ-ジエンとの間のディールス・アルダー反応によって、筋標的化剤および/または(例として、および)分子ペイロードへ接続されるが、ここで求ジエン体およびジエン/ヘテロ-ジエンは、筋標的化剤、分子ペイロード、またはリンカー上に位置付けられていてもよい。いくつかの態様において、リンカーは、他のペリ環状反応、例として、エン反応によって、筋標的化剤および/または(例として、および)分子ペイロードへ接続される。いくつかの態様において、リンカーは、アミド、チオアミド、またはスルホンアミド結合反応によって、筋標的化剤および/または(例として、および)分子ペイロードへ接続される。いくつかの態様において、リンカーは、リンカーと筋標的化剤および/または(例として、および)分子ペイロードとの間に存在するオキシム基、ヒドラゾン基、またはセミカルバジド基を形成する縮合反応によって、筋標的化剤および/または(例として、および)分子ペイロードへ接続される。
いくつかの態様において、リンカーは、求核試薬(例として、アミン基またはヒドロキシル基)と求電子試薬(例として、カルボン酸、カーボナート、またはアルデヒド)との間の抱合体付加反応によって、筋標的化剤および/または(例として、および)分子ペイロードへ接続される。いくつかの態様において、リンカーと筋標的化剤または分子ペイロードとの間の反応に先立ち、求核試薬はリンカー上に存在していてもよく、求電子試薬は筋標的化剤または分子ペイロード上に存在していてもよい。いくつかの態様において、リンカーと筋標的化剤または分子ペイロードとの間の反応に先立ち、求電子試薬はリンカー上に存在していてもよく、求核試薬は筋標的化剤または分子ペイロード上に存在していてもよい。いくつかの態様において、求電子試薬は、アジド、ペンタフルオロフェニル、ケイ素中心、カルボニル、カルボン酸、無水物、イソシアナート、チオイソシアナート、スクシニミジルエステル、スルホスクシニミジルエステル、マレイミド、アルキルハロゲン化物、アルキル擬ハロゲン化物、エポキシド、エピスルフィド、アジリジン、アリール、活性化リン中心、および/または(例として、および)、活性化硫黄中心であってもよい。いくつかの態様において、求核試薬は、任意に置換されていてもよいアルケン、任意に置換されていてもよいアルキン、任意に置換されていてもよいアリール、任意に置換されていてもよいヘテロシクリル、ヒドロキシル基、アミノ基、アルキルアミノ基、アニリド基、またはチオール基であってもよい。
いくつかの態様において、反応性の高い化学的部分(例として、クリックケミストリー抱合のためのSPAAC)へ付着されるval-citリンカーは、以下の構造:
Figure 2023512441000042

によって抗TfR抗体へ抱合されており、ここでmは0~10のいずれかの数である。いくつかの態様において、mは4である。
いくつかの態様において、反応性の高い化学的部分(例として、クリックケミストリー抱合のためのSPAAC)へ付着されるval-citリンカーは、以下の構造:
Figure 2023512441000043

を有する抗TfR抗体に抱合されており、ここでmは0~10のいずれかの数である。いくつかの態様において、mは4である。
いくつかの態様において、反応性の高い化学的部分(例として、クリックケミストリー抱合のためのSPAAC)へ付着され、抗TfR抗体へ抱合されるval-citリンカーは、以下の構造:
Figure 2023512441000044

を有し、ここでnは0~10のいずれかの数であり、ここでmは0~10のいずれかの数である。いくつかの態様において、nは3であり、および/または(例として、および)mは4である。
いくつかの態様において、抗TfR抗体および分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)は、以下の構造:
Figure 2023512441000045

を介して連結され、ここでnは0~10のいずれかの数であり、ここでmは0~10のいずれかの数である。いくつかの態様において、nは3であり、および/または(例として、および)mは4である。いくつかの態様において、XはNH(例として、リジンのアミン基からのNH)である。いくつかの態様において、XはSであり、抗体は抱合を介して抗体のシステインへ連結される。いくつかの態様において、XはOであり、抗体は抱合を介して抗体のセリン、トレオニン、またはチロシンのヒドロキシル基へ連結される。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、以下の構造:
Figure 2023512441000046

を有し、ここでnは0~10のいずれかの数であり、ここでmは0~10のいずれかの数である。いくつかの態様において、nは3であり、および/または(例として、および)mは4である。
構造式(A)、(B)、(C)、および(D)中、L1は、いくつかの態様において、置換もしくは非置換の脂肪族、置換もしくは非置換のヘテロ脂肪族、置換もしくは非置換のカルボシクリレン、置換もしくは非置換のヘテロシクリレン、置換もしくは非置換のアリーレン、置換もしくは非置換のヘテロアリーレン、-O-、-N(R)-、-S-、-C(=O)-、-C(=O)O-、-C(=O)NR-、-NRC(=O)-、-NRC(=O)R-、-C(=O)R-、-NRC(=O)O-、-NRC(=O)N(R)-、-OC(=O)-、-OC(=O)O-、-OC(=O)N(R)-、-S(O)NR-、-NRS(O)-、またはそれらの組み合わせであるスペーサーである。いくつかの態様において、L1は、以下:
Figure 2023512441000047

であり、ここでピペラジン部分は、オリゴヌクレオチドへ連結し、ここでL2は、
Figure 2023512441000048

である。
いくつかの態様において、L1は、以下:
Figure 2023512441000049

であり、ここでピペラジンは、オリゴヌクレオチドへ連結されている。
いくつかの態様において、L1は、以下:
Figure 2023512441000050

である。
いくつかの態様において、L1は、オリゴヌクレオチドの5’ホスファートへ連結される。いくつかの態様において、L1は、オリゴヌクレオチドの5’ホスホロチオアートに連結される。いくつかの態様において、L1は、オリゴヌクレオチドの5’ホスホロアミダートへ連結される。
いくつかの態様において、L1は、任意である(例として、存在する必要はない)。
D.抗体-分子ペイロード複合体の例
他の本開示の側面は、本明細書に記載の分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)のいずれかへ共有結合的に連結された、本明細書に記載のいずれか1つの筋標的化剤(例として、抗TfR抗体)を含む複合体を提供する。いくつかの態様において、筋標的化剤(例として、抗TfR抗体)は、リンカーを介して分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)へ共有結合的に連結されている。本明細書に記載のリンカーのいずれも、使用されてもよい。いくつかの態様において、リンカーは、オリゴヌクレオチドの5’末端、3’末端、または内部へ連結されている。いくつかの態様において、リンカーは、チオール反応性の連結を介して(例として、抗体中のシステインを介して)抗体へ連結されている。いくつかの態様において、リンカー(例として、Val-citリンカー)は、抗体(例として、本明細書に記載の抗TfR抗体)へアミン基を介して(例として、抗体中のリシンを介して)連結されている。
Val-citリンカーを介してオリゴヌクレオチドへ共有結合的に連結された抗TfR抗体を含む複合体の構造の例は、下に提供される:
Figure 2023512441000051

ここでリンカーは、オリゴヌクレオチドの5’末端、3’末端、または内部へ連結されており、およびここでリンカーは、チオール反応性の連結を介して(例として、抗体中のシステインを介して)抗体へ連結されている。
Val-citリンカーを介して分子ペイロードへ共有結合的に連結された抗TfR抗体を含む複合体の構造の別の例は、下に提供される:
Figure 2023512441000052

ここでnは0~10の間の数であり、ここでmは0~10の間の数であり、ここでリンカーはアミン基(例として、リジン残基上の)を介して抗体へ連結され、および/または(例として、および)リンカーはオリゴヌクレオチドへ(例として、5’端、3’端にて、または内部に)連結される。いくつかの態様において、リンカーはリジンを介して抗体へ連結されている。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含み、リンカーはセンス鎖またはアンチセンス鎖へ5’端または3’端にて連結される。いくつかの態様において、nは3であり、mは4である。いくつかの態様において、L1は、本明細書に記載のスペーサーのいずれか1つである。
抗体は、種々の化学量論でオリゴヌクレオチドへ連結され得ることが解されるはずであって、前記特性は薬物抗体比(DAR)と称されることもあり、ここで「薬物」はオリゴヌクレオチドである。いくつかの態様において、1つのオリゴヌクレオチドが抗体へ連結されている(DAR=1)。いくつかの態様において、2つのオリゴヌクレオチドが抗体へ連結されている(DAR=2)。いくつかの態様において、3つのオリゴヌクレオチドが抗体へ連結されている(DAR=3)。いくつかの態様において、4つのオリゴヌクレオチドが抗体へ連結されている(DAR=4)。いくつかの態様において、各々が異なるDARを有する異なる複合体の混合物が提供される。いくつかの態様において、かかる混合物中の複合体の平均DARは、1~3、1~4、1~5以上の範囲にあってもよい。DARは、オリゴヌクレオチドを抗体上の種々の部位へ抱合させることによって、および/または(例として、および)、マルチマーを抗体上の1以上の部位へ抱合させることによって、増大されてもよい。例えば、2のDARは、単一オリゴヌクレオチドを抗体上の2つの異なる部位へ抱合させることによって、または二量体オリゴヌクレオチドを抗体の単一部位へ抱合させることによって、達成されてもよい。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、オリゴヌクレオチドに共有結合的に連結された抗TfR抗体(例として、本明細書に記載のとおりの抗体または任意のそのバリアント)を含む。いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、リンカー(例として、Val-citリンカー)を介してオリゴヌクレオチドに共有結合的に連結された抗TfR抗体(例として、本明細書に記載のとおりの抗体または任意のそのバリアント)を含む。いくつかの態様において、リンカー(例として、Val-citリンカー)は、オリゴヌクレオチドの5’末端、3’末端、または内側へ連結されている。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドは、siRNAであり、リンカー(例として、Val-citリンカー)は、siRNAのセンス鎖の5’末端、3’末端、または内側へ連結されている。いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドはsiRNAであり、リンカー(例として、Val-citリンカー)は、siRNAのアンチセンス鎖の5’末端、3’末端、または内側へ連結されている。いくつかの態様において、リンカー(例として、Val-citリンカー)は、チオール-反応性連結を介して(例として、抗体におけるシステインを介して)、抗体(例として、本明細書に記載のとおりの抗体または任意のそのバリアント)へ連結されている。いくつかの態様において、リンカー(例として、Val-citリンカー)は、アミン基を介して(例として、抗体におけるリシンを介して)、抗体(例として、本明細書に記載の抗TfR抗体)へ連結されている。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体の例のいずれか1つにおいて、分子ペイロードは、本明細書に記載の遺伝子標的配列のいずれか1つに対して、少なくとも15のヌクレオチド(例として、少なくとも15、少なくとも16、少なくとも17、少なくとも18、または少なくとも19以上)のヌクレオチドの相補性のある領域を含むオリゴヌクレオチドであり、任意にここで、標的配列は、表9、12、および15中に挙げられた配列である。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)に共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗TfR抗体は、表1、表3、表6~8において示されたCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3と同じであるCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3;および表1、表3、表6~8において示されたCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3と同じであるCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)に共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗TfR抗体は、以下を含む:
(i)配列番号1のCDR-H1、配列番号2、配列番号248、または配列番号80のCDR-H2、配列番号3のCDR-H3、配列番号4のCDR-L1、配列番号5のCDR-L2、および配列番号6のCDR-L3;
(ii)配列番号145のCDR-H1、配列番号146、配列番号249、または配列番号252のCDR-H2、配列番号147のCDR-H3、配列番号148のCDR-L1、配列番号149のCDR-L2、および配列番号6のCDR-L3;または
(iii)配列番号150のCDR-H1、配列番号151、配列番号250、または配列番号253のCDR-H2、配列番号152のCDR-H3、配列番号153のCDR-L1、配列番号5のCDR-L2、および配列番号154のCDR-L3。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)に共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗TfR抗体は、以下を含む:
(i)配列番号9のCDR-H1、配列番号10のCDR-H2、配列番号11のCDR-H3、配列番号12のCDR-L1、配列番号13のCDR-L2、および配列番号14のCDR-L3;
(ii)配列番号155のCDR-H1、配列番号156のCDR-H2、配列番号157のCDR-H3、配列番号158のCDR-L1、配列番号159のCDR-L2、および配列番号14のCDR-L3;または
(iii)配列番号160のCDR-H1、配列番号161のCDR-H2、配列番号162のCDR-H3、配列番号163のCDR-L1、配列番号13のCDR-L2、および配列番号164のCDR-L3。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)に共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗TfR抗体は、以下を含む:
(i)配列番号17、配列番号254、または配列番号256のCDR-H1、配列番号18のCDR-H2、配列番号19のCDR-H3、配列番号20のCDR-L1、配列番号21のCDR-L2、および配列番号22のCDR-L3;
(ii)配列番号165、配列番号255、または配列番号257のCDR-H1、配列番号166のCDR-H2、配列番号167のCDR-H3、配列番号168のCDR-L1、配列番号169のCDR-L2、および配列番号22のCDR-L3;または
(iii)配列番号170のCDR-H1、配列番号171のCDR-H2、配列番号172のCDR-H3、配列番号173のCDR-L1、配列番号21のCDR-L2、および配列番号174のCDR-L3。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)に共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗TfR抗体は、以下を含む:
(i)配列番号188のCDR-H1、配列番号189のCDR-H2、配列番号190のCDR-H3、配列番号191のCDR-L1、配列番号192のCDR-L2、および配列番号193のCDR-L3;
(ii)配列番号194のCDR-H1、配列番号195のCDR-H2、配列番号196のCDR-H3、配列番号197のCDR-L1、配列番号198のCDR-L2、および配列番号193のCDR-L3;または
(iii)配列番号199のCDR-H1、配列番号200のCDR-H2、配列番号201のCDR-H3、配列番号202のCDR-L1、配列番号192のCDR-L2、および配列番号203のCDR-L3。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)に共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗TfR抗体は、表1または表6に示されるとおりのVH;および表1または表6に示されるとおりのVLを含む。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)に共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗TfR抗体は、配列番号7のアミノ酸配列を有するVHおよび配列番号8のアミノ酸配列を有するVLを含む。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)に共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗TfR抗体は、配列番号15のアミノ酸配列を有するVHおよび配列番号16のアミノ酸配列を有するVLを含む。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)に共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗TfR抗体は、配列番号23のアミノ酸配列を有するVHおよび配列番号24のアミノ酸配列を有するVLを含む。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)に共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗TfR抗体は、配列番号204のアミノ酸配列を有するVHおよび配列番号205のアミノ酸配列を有するVLを含む。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)に共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗TfR抗体は、表4および5中に挙げられた抗体のいずれか1つの重鎖および軽鎖を含む。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロード(例として、オリゴヌクレオチド)に共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗TfR抗体は、配列番号210、配列番号211、配列番号213、または配列番号266のアミノ酸配列を有する重鎖、および配列番号212のアミノ酸配列を有する軽鎖を含む。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロードに共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗体は、表1または表3中に挙げられたマウス抗体(例として、3A4、3M12、または5H12)のCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を有するヒトフレームワーク領域を含有するVH、および表1または表3中に挙げられたマウス抗体(例として、3A4、3M12、または5H12)のCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を有するヒトフレームワーク領域を含有するVLを含むヒト化抗体である。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロードに共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗体は、配列番号7で表されるVHのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を有するヒトフレームワーク領域を含有するVH、および配列番号8で表されるVLのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を有するヒトフレームワーク領域を含有するVLを含む。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロードに共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗体は、配列番号15で表されるVHのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を有するヒトフレームワーク領域を含有するVH、および配列番号16で表されるVLのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を有するヒトフレームワーク領域を含有するVLを含む。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロードに共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗体は、配列番号23で表されるVHのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3を有するヒトフレームワーク領域を含有するVH、および配列番号24で表されるVLのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を有するヒトフレームワーク領域を含有するVLを含む。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロードに共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗体は、表1または表3中に挙げられたマウス抗体(例として、3A4、3M12、または5H12)のCDRを有するヒトフレームワーク領域を含むIgG1カッパである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロードに共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗体は、表1または表3中に挙げられたマウス抗体(例として、3A4、3M12、または5H12)のCDRを有するヒトフレームワーク領域を含むIgG1カッパのFab’フラグメントである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、分子ペイロードに共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、ここで、抗体は、表1または表3中に挙げられたマウス抗体(例として、3A4、3M12、または5H12)のCDRを有するヒトフレームワーク領域を含むIgG1カッパのFab’フラグメントである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、リジンを介してオリゴヌクレオチドの5’端へ共有結合的に連結された抗TfR抗体を含み、抗体はIgG1カッパのFab’フラグメントであり、これが、表1または表3に挙げられるマウス抗体(例として、3A4、3M12、または5H12)のCDRを有するヒトフレームワーク領域を含み、ここで複合体は、以下の構造:
Figure 2023512441000053

を有し、ここで、nは3であり、mは4である。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、リシンを介してオリゴヌクレオチド(例として、オリゴヌクレオチド標的MSTN、INHBAまたはACVR1B)に共有結合的に連結されている抗TfR Fab’を含み、ここで、抗TfR Fabは、表1、表3、表6~8中に挙げられた抗体のいずれか1つのCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含み;ここで、複合体は以下の構造:
Figure 2023512441000054

を有し、ここで、nは3であり、mは4である。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。いくつかの態様において、複合体におけるオリゴヌクレオチドは、表11、表14、または表17中に挙げられたsiRNAであり、該siRNAは、センス鎖またはアンチセンス鎖の5’末端または3’末端で連結されている。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、リシンを介してオリゴヌクレオチド(例として、オリゴヌクレオチド標的MSTN、INHBA、またはACVR1B)に共有結合的に連結されている抗TfR Fab’を含み、ここで、抗TfR Fabは、表1または表6中に挙げられた抗体のいずれか1つのVHおよびVLを含み;ここで、複合体は以下の構造:
Figure 2023512441000055

を有し、ここで、nは3であり、mは4である。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。いくつかの態様において、複合体におけるオリゴヌクレオチドは、表11、表14、または表17中に挙げられたsiRNAであり、該siRNAは、センス鎖またはアンチセンス鎖の5’末端または3’末端で連結されている。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、リシンを介してオリゴヌクレオチド(例として、オリゴヌクレオチド標的MSTN、INHBA、またはACVR1B)に共有結合的に連結されている抗TfR Fab’を含み、ここで、抗TfR Fabは、表4または表5中に挙げられた抗体のいずれか1つの重鎖および軽鎖を含み;ここで、複合体は以下の構造:
Figure 2023512441000056

を有し、ここで、nは3であり、mは4である。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。いくつかの態様において、複合体におけるオリゴヌクレオチドは、表11、表14、または表17中に挙げられたsiRNAであり、該siRNAは、センス鎖またはアンチセンス鎖の5’末端または3’末端で連結されている。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体は、リシンを介してオリゴヌクレオチド(例として、オリゴヌクレオチド標的MSTN、INHBA、またはACVR1B)に共有結合的に連結されている抗TfR Fab’を含み、ここで、抗TfR抗体は、配列番号210、配列番号211、配列番号213、または配列番号266のアミノ酸配列を有する重鎖、および配列番号212のアミノ酸配列を有する軽鎖を含み;ここで、複合体は以下の構造:
Figure 2023512441000057

を有し、ここで、nは3であり、mは4である。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表10中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むMSTN標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表11中に挙げられたMSTN標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表13中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むINHBA標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表14中に挙げられたINHBA標的化siRNAである。いくつかの態様において、分子ペイロードは、表16中に挙げられた配列の少なくとも16のヌクレオチドを含むACVR1B標的化オリゴヌクレオチドであり、任意にここで、分子ペイロードは、表17中に挙げられたACVR1B標的化siRNAである。いくつかの態様において、複合体におけるオリゴヌクレオチドは、表11、表14、または表17中に挙げられたsiRNAであり、該siRNAは、センス鎖またはアンチセンス鎖の5’末端または3’末端で連結されている。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体の例のいずれか1つにおいて、L1は、
Figure 2023512441000058

であり、ここで、ピペラジン部分はオリゴヌクレオチドに連結しており、ここで、L2は、
Figure 2023512441000059

である。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体の例のいずれか1つにおいて、L1は、以下:
Figure 2023512441000060

であり、ここでピペラジン部分は、オリゴヌクレオチドへ連結する。
いくつかの態様において、本明細書に記載の複合体の例のいずれか1つにおいて、L1は、
Figure 2023512441000061

である。
いくつかの態様において、L1は、オリゴヌクレオチドの5’ホスファートへ連結される。いくつかの態様において、L1は、オリゴヌクレオチドの5’ホスホロチオアートへ連結される。いくつかの態様において、L1は、オリゴヌクレオチドの5’ホスホロアミダートへ連結される。
いくつかの態様において、L1は、任意である(例として、存在する必要はない)。
III.製剤
本明細書に提供される複合体は、いずれの好適なやり方でも製剤化されていてよい。一般に、本明細書に提供される複合体は、医薬への使用に好適なやり方で製剤化されている。例えば、複合体は、分解を最小限に抑え、送達および/または取り込みを容易にする製剤を使用して、対象へ送達され得るか、あるいは、製剤中の複合体へ別の有益な特性を提供する。いくつかの態様において、本明細書に提供されるのは、複合体および薬学的に許容し得る担体を含む組成物である。かかる組成物は、対象の標的細胞周囲の環境中または対象の全身のいずれかへ投与されたとき充分量の複合体が標的筋細胞に侵入できるように、好適に製剤化され得る。いくつかの態様において、複合体は、リン酸緩衝生理食塩溶液などの緩衝溶液中、リポソーム中、ミセル構造体中、およびカプシド中に製剤化される。
いくつかの態様において、組成物が、本明細書に提供される複合体の1以上の構成要素(例として、筋標的化剤、リンカー、分子ペイロード、またはこれらのいずれか1つの前駆体分子)を個別に包含していてもよいことは解されるはずである。
いくつかの態様において、複合体は、水中または水性溶液(例として、pH調整された水)中に製剤化される。いくつかの態様において、複合体は、塩基性緩衝水性溶液(例として、PBS)中に製剤化される。いくつかの態様において、本明細書に開示のとおりの製剤は、賦形剤を含む。いくつかの態様において、賦形剤は、組成物へ、改善された安定性、改善された吸収、改善された可溶性、および/または、活性成分の治療増強を付与する。いくつかの態様において、賦形剤は、緩衝剤(例として、クエン酸ナトリウム、リン酸ナトリウム、トリス塩基、もしくは水酸化ナトリウム)、またはビヒクル(例として、緩衝溶液、ワセリン、ジメチルスルホキシド、または鉱油)である。
いくつかの態様において、複合体またはその構成要素(例として、オリゴヌクレオチドまたは抗体)は、その貯蔵寿命を延長するため凍結乾燥され、次いで使用(例として、対象への投与)前に溶液にさせられる。結果的に、本明細書に記載の複合体またはその構成要素を含む組成物中の賦形剤は、凍結保護剤(lyoprotectant)(例として、マンニトール、ラクトース、ポリエチレングリコール、もしくはポリビニルピロリドン)、または崩壊温度修飾因子(例として、デキストラン、フィコール、もしくはゼラチン)であってもよい。
いくつかの態様において、医薬組成物は、その意図された投与ルートに適合するよう製剤化されている。投与ルートの例は、非経口投与、例として、静脈内投与、皮内投与、皮下投与を包含する。典型的には、投与ルートは、静脈内投与または皮下投与である。
注射剤への使用に好適な医薬組成物は、滅菌水性溶液(ここで水に可溶性である)または分散溶液、および滅菌注射剤溶液または分散溶液の即時調製のための滅菌粉末を包含する。担体は、例えば、水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコール等)、および好適なそれらの混合物を含有する溶媒または分散媒体であり得る。いくつかの態様において、製剤は、組成物中に等張剤、例えば、糖、マンニトール、ソルビトールなどのポリアルコール、および塩化ナトリウムを包含する。滅菌注射剤溶液は、要求量の複合体を、上に列挙された成分の1つまたはそれらの組み合わせとともに、選択された溶媒に組み込むこと、要求に応じ、これに続き濾過滅菌することによって調製され得る。
いくつかの態様において、組成物は、活性成分(単数または複数)のパーセンテージが組成物全体の重量または体積の約1%と約80%以上との間であってもよいが、少なくとも約0.1%の複合体もしくはその構成要素を含有していてもよい。可溶性、バイオアベイラビリティ、生物学的半減期、投与ルート、産物の貯蔵寿命などの因子、ならびに他の薬理学的留意事項は、かかる医薬製剤を調製する当業者によって企図されるであろう。そのため様々な投薬量および処置計画が所望されることもある。
IV.使用/処置の方法
本明細書に記載のとおりの分子ペイロードに共有結合的に連結された筋標的化剤を含む複合体は、心不全、筋萎縮(例として、骨格のおよび/または心筋萎縮)、筋ジストロフィー、悪液質(例として、心臓悪液質)、筋肥大(例として、心肥大)、心筋消耗、心臓線維症、および/または心筋症を処置することにおいて有効である。いくつかの態様において、本明細書に記載のとおりの複合体は、2型糖尿病を有する対象における心筋合併症(例として、心不全)を処置することにおいて有効である。いくつかの態様において、複合体は、心臓の肥厚および/または心臓における細胞外マトリックスの増加に関与する任意の疾患または疾病を処置することにおいて有効である。いくつかの態様において、心臓線維症または心肥大は、増加したレベルまたはアンギオテンシン-IIに関連する。
いくつかの態様において、複合体は、心細胞におけるMSTNおよび/またはINHBAの発現を特異的に標的にすることにおいて有効である。いくつかの態様において、複合体は、心不全(例として、心筋消耗、心筋症、または悪液質を伴う)を処置および/または予防することにおいて有効である。心不全は、典型的には、多様な代謝障害によって特徴付けられ、その多くは筋肉および脂肪の代謝に悪影響を及ぼし、それによって悪液質につながる。とりわけ、慢性心不全患者では骨格筋萎縮が蔓延している。いくつかの態様において、心不全は、心筋および/または骨格筋の消耗に関連する。いくつかの態様において、心不全は心筋症に関連し、心筋症は、心臓が体の残りの部分に血液を送り出すことをより困難にする一群の心臓筋肉(heart muscle)の疾患を指す。いくつかの態様において、心筋症は拡張型心筋症であり、左心室のポンプ能力が拡大(拡張)し、血液を送り出す有効性を減少させる。いくつかの態様において、心筋症は、心臓筋肉の正常でない肥厚を伴う肥大型心筋症である。いくつかの態様において、心筋症は拘束性心筋症であり、心臓筋肉が硬くなり、弾力性が低下する。いくつかの態様において、心筋症は、右心室の筋肉が瘢痕組織によって置き換えられている不整脈源性右室異形成である。
いくつかの態様において、心不全は心臓の萎縮に関連する。心臓の萎縮は、心臓のサイズおよび量の後天性の低減を指す。いくつかの態様において、萎縮は、空洞のサイズが減少しているが、壁は同じままである同心性萎縮である。いくつかの態様において、萎縮は、壁が薄くなり心腔が拡張する動脈瘤性萎縮である。いくつかの態様において、萎縮は、心臓の体積にほとんど変化がなく、筋肉壁が薄くなる単純型萎縮である。いくつかの態様において、心不全は、心筋量の減少に関連する。いくつかの態様において、心不全は、心筋量の5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、75%、または80%以上の減少に関連する。
いくつかの態様において、心不全は心臓機能(例として、駆出率)の減少に関連する。駆出率は、収縮ごとに左心室がどれだけの血液を送り出すかをパーセンテージで表した測定値である。いくつかの態様において、典型的な駆出率は50%~70%である。いくつかの態様において、心不全は、心臓機能(例として、ポンプ当たりの血液の駆出率または体積)の5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、または95%以上の減少に関連する。いくつかの態様において、心不全は、50%、45%、40%、35%、30%、25%、20%、15%、10%、または5%以下の駆出率に関連する。駆出率が心臓機能の唯一の測定値ではなく、本開示はその点で限定することを意図していないことが理解されるべきである。例えば、いくつかの態様において、心臓機能の測定値は、心臓が送り出す血液の体積(例として、ポンプ当たり)の測定値に基づいてもよい。
いくつかの態様において、心不全は心臓悪液質に関連する。本明細書に提供される組成物および方法は、心臓悪液質を有するか、または発症するリスクがある対象を処置または予防するために使用され得る。心臓悪液質は、なかでも、心臓疾患に関する重度の重量減少によって特徴付けられる。心臓悪液質は、発病前の個体の正常な重量の意図的ではない非浮腫性の重量減少(例として、5%、6%、7%、8%、9%、10%、または15%以上よりも大きい)の存在に基づいて特徴付けられ得る。
心不全を処置または予防する1つの方法は、心筋細胞および/または骨格筋細胞において負の筋肉調節因子であるミオスタチンを阻害することである。
いくつかの態様において、対象は、ヒト対象、霊長目の非ヒト動物の対象、齧歯類の動物の対象、または任意の好適な哺乳動物の対象であり得る。いくつかの態様において、対象は、筋強直症ジストロフィーを有し得る。
いくつかの態様において、Schuelke, M. et al., "Myostatin Mutation Associated with Gross Muscle Hypertrophy in a Child" N Engl J Med 2004; 350:2682-2688にあるように、筋肥大を有する対象は、MSTNにおいて少なくとも1の突然変異を有する。
いくつかの態様において、複合体は、任意の筋組織(例として、心筋、骨格筋)においてMSTNおよび/またはINHBAの活性を標的にすることにおいて有効である。いくつかの態様において、骨格筋組織においてMSTNまたはINHBAの活性を標的にする複合体は、骨格筋萎縮(例として、過剰発現および過剰活性のMSTNまたはINHBAに起因する)を有する対象を処置するのに有効である。
いくつかの態様において、対象は、MSTNを標的にする複合体およびACVR1Bを標的にする複合体を投与される。いくつかの態様において、かかる投与は、増加した筋肉のサイズおよび機能へつながる。
いくつかの態様において、対象は、心臓の肥厚および/または心臓における細胞外マトリックスの増加を有する。いくつかの態様において、対象は、心臓線維症または心肥大を有するおよび/または患っている。いくつかの態様において、対象は、アンギオテンシン-II誘発性心肥大を有するおよび/または患っている。いくつかの態様において、対象は近年、心臓梗塞(すなわち、心臓発作)を経験している。
心筋症は、心臓があなたの体の残りの部分に血液を送り出すのを、あなたの心臓に対してより困難にする心臓筋肉の疾患である。心筋症は心不全へつながり得る。心筋症の主なタイプは、拡張型、肥大型、および拘束型の心筋症を包含する。
心肥大は、一般に、心筋細胞のサイズの非典型の増加および細胞外マトリックスの増加した肥厚などの心臓における他の非典型の発達に起因する、心臓のサイズまたは肥厚の非典型の増加によって特徴付けられる。いくつかの態様において、複合体は、心肥大を有する対象の心臓のサイズ(例として、筋肉量)または肥厚を(例として、対照の対象またはベースライン測定値と比べて、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、または50%)低減することにおいて有効である。いくつかの態様において、複合体は、心肥大を有する対象の心臓のサイズまたは肥厚の増加を遅らせる(例として、対照の対象またはベースライン率と比べて、増加の速度を少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、または50%遅らせる)ことにおいて有効である。
いくつかの態様において、心肥大は、アンギオテンシンII誘発性心肥大である。低血圧を処置するために使用される一般的な薬であるアンギオテンシンIIは、選択された患者対象において心肥大を誘発することが示されている。アンギオテンシンIIは、間接的に(例として、その血管収縮効果に起因する)および/または直接的に(例として、その心臓栄養効果(cardiac trophic effect)に起因する)心肥大を誘発し得る。いくつかの態様において、アンギオテンシンII誘発性心肥大を有する対象は、これまでに心肥大を経験していない。
いくつかの態様において、筋肉および心臓の発達障害を有するまたは有すると疑われる対象は、健常対象におけるACVR1Bの発現および/または活性レベルと比較して、ACVR1Bの発現および/または活性の増加したレベル(例として、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、またはそれ以上の増加)を有する。いくつかの態様において、本明細書に記載のとおりの分子ペイロードに共有結合的に連結された筋標的化剤を含む複合体は、ACVR1Bの発現および/または活性を少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、またはそれ以上減少させることにおいて有効である。いくつかの態様において、本明細書に記載のとおりの分子ペイロードに共有結合的に連結された筋標的化剤を含む複合体は、ACVR1Bの発現および/または活性を健常対象のレベルまで減少させることにおいて有効である。
いくつかの態様において、心臓疾患(例として、心肥大、心筋症)を有するまたは有すると疑われる対象は、健常対象におけるACVR1Bの発現および/または活性レベルと比較して、ACVR1Bの発現および/または活性の増加したレベル(例として、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、またはそれ以上の増加)を有する。いくつかの態様において、本明細書に記載のとおりの分子ペイロードに共有結合的に連結された筋標的化剤を含む複合体は、ACVR1Bの発現および/または活性を少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、またはそれ以上低減することにおいて有効である。いくつかの態様において、本明細書に記載のとおりの分子ペイロードに共有結合的に連結された筋標的化剤を含む複合体は、ACVR1Bの発現および/または活性を健常対象のレベルまで低減することにおいて有効である。いくつかの態様において、複合体は、心細胞におけるACVR1Bの発現を特異的に標的にすることにおいて有効である。
本開示の側面は、本明細書に記載のとおりの有効量の複合体を対象へ投与することを伴う方法を包含する。いくつかの態様において、分子ペイロードへ共有結合的に連結された筋標的化剤を含む複合体を含む有効量の医薬組成物は、処置を必要とする対象へ投与され得る。いくつかの態様において、本明細書に記載のとおりの複合体を含む医薬組成物は、静脈内投与を包含してもよい好適なルートによって、例として、ボーラスとして、またはある期間にわたる連続注入によって、投与されてもよい。いくつかの態様において、静脈内投与は、筋肉内の、腹腔内の、脳脊髄内の(intracerebrospinal)、皮下の、関節内の、滑液嚢内の、または髄腔内のルートによって実施されてもよい。いくつかの態様において、医薬組成物は、固体形態、水性形態、または液体形態であってもよい。いくつかの態様において、水性または液体形態は、噴霧されてもよく、または凍結乾燥されてもよい。いくつかの態様において、噴霧形態または凍結乾燥形態は、水性または液体溶液で再構成されてもよい。
静脈内投与のための組成物は、植物油、ジメチルアセトアミド、ジメチルホルムアミド、乳酸エチル、炭酸エチル、ミリスチン酸イソプロピル、エタノール、およびポリオール(グリセロール、プロピレングリコール、液体ポリエチレングリコール等)などの様々な担体を含有していてもよい。静脈内注射のための水可溶性抗体は点滴法によって投与され得、これによって抗体および薬学的に許容し得る賦形剤を含有する医薬製剤が注入される。薬学的に許容し得る賦形剤は、例えば、5%デキストロース、0.9%生理食塩水、リンガー溶液、または他の好適な賦形剤を包含していてもよい。筋肉内用調製物、例として、抗体の好適な可溶性の塩形態の滅菌製剤は、注射用水、0.9%生理食塩水、または5%グルコース溶液などの医薬賦形剤に溶解されて投与され得る。
いくつかの態様において、分子ペイロードへ共有結合的に連結されたた筋標的化剤を含む複合体を含む医薬組成物は、部位特異的または局部的な送達技法を介して投与される。これらの技法の例は、複合体の埋め込み型デポー供給源、局部送達カテーテル、部位特異的担体、直接注射、または直塗り(direct application)を包含する。
いくつかの態様において、分子ペイロードへ共有結合的に連結された筋標的化剤を含む複合体を含む医薬組成物は、治療効果を対象に付与する有効濃度にて投与される。有効量は、当業者によって認識されるとおり、疾患の重症度、処置される対象の特有な特徴、例として、年齢、体調、健康状態、または重量、処置時間、いずれの併用治療の性質、投与ルート、および関連因子に応じて変動する。これらの関連因子は当業者に知られており、わずかな定型的実験法で対処され得る。いくつかの態様において、有効濃度は、患者に安全であるとみなされる最大用量である。いくつかの態様において、有効濃度は、最大限の効き目を提供する、実行可能な最低濃度であろう。
経験的考察、例として、対象における複合体の半減期は一般に、処置のために使用される医薬組成物の濃度の決定に寄与するであろう。投与頻度は、処置の効き目を最大化するために経験的に決定かつ調整されてもよい。
一般に、本明細書に記載の複合体のいずれかの投与について、当初の候補投薬量は、上に記載の因子、例として、安全性または効き目に応じて、約1~100mg/kgであってもよく、またはこれより多くてもよい。いくつかの態様において、処置は、一度施されるであろう。いくつかの態様において、処置は、毎日、隔週、毎週、隔月、毎月、または対象へ最大の効き目を提供しつつ安全性へのリスクを最小に抑えるいずれの時間間隔にて、施されるであろう。一般に、効き目ならびに処置および安全性へのリスクは、処置過程を通してずっと監視されることもある。
処置の有効性は、任意の好適な方法を使用して評価され得る。いくつかの態様において、処置の有効性は、心不全、筋萎縮、筋ジストロフィー、悪液質、心臓線維症、および/または筋肥大(心肥大を含むが、これに限定されない)に関連する症状の観察の評価によって評価され得る。
いくつかの態様において、本明細書に記載の分子ペイロードへ共有結合的に連結された筋標的化剤を含む複合体を含む医薬組成物は、対照(例として、処置に先立つ遺伝子発現のベースラインレベル)と比べて、標的遺伝子の活性または発現を少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、または少なくとも95%阻害するのに充分な有効濃度にて、対象へ投与される。
いくつかの態様において、本明細書に記載の分子ペイロードへ共有結合的に連結された筋標的化剤を含む複合体を含む医薬組成物の対象への単回用量または投与は、少なくとも1~5日間、1~10日間、5~15日間、10~20日間、15~30日間、20~40日間、25~50日間、またはこれより長い期間、標的遺伝子の活性または発現を阻害するのに充分である。いくつかの態様において、本明細書に記載の分子ペイロードへ共有結合的に連結された筋標的化剤を含む複合体を含む医薬組成物の対象への単回用量または投与は、少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12週間、標的遺伝子の活性または発現を阻害するのに充分である。いくつかの態様において、本明細書に記載の分子ペイロードへ共有結合的に連結された筋標的化剤を含む複合体を含む医薬組成物の対象への単回用量または投与は、少なくとも1、2、3、4、5、または6カ月間、標的遺伝子の活性または発現を阻害するのに充分である。
いくつかの態様において、医薬組成物は、分子ペイロードに共有結合的に連結された筋標的化剤を含む複合体を2以上含み得る。非限定例として、医薬組成物は、MSTN、INHBAおよびACVR1Bのうちの1つへ連結された筋標的化剤を各々が含む2以上の複合体を含み得る。いくつかの態様において、医薬組成物は、MSTNを標的にする分子ペイロードへ連結された筋標的化剤を含む1つの複合体と、ACVR1Bを標的にする分子ペイロードへ連結された筋標的化剤を含む第2の複合体とを含み得る。いくつかの態様において、医薬組成物は、MSTNを標的にする分子ペイロードへ連結された筋標的化剤を含む1つの複合体と、INHBAを標的にする分子ペイロードへ連結された筋標的化剤を含む第2の複合体とを含み得る。いくつかの態様において、医薬組成物は、INHBAを標的にする分子ペイロードへ連結された筋標的化剤を含む1つの複合体と、ACVR1Bを標的にする分子ペイロードへ連結された筋標的化剤を含む第2の複合体とを含み得る。いくつかの態様において、MSTN、INHBAおよびACVR1Bのうちの2以上を標的にする複合体による対象の処置は、MSTN、INHBAおよびACVR1Bのうちの1つだけを標的にする単一の複合体による処置と比べて、増加した筋肉のサイズおよび機能などの改善された成果に同時につながる。いくつかの態様において、医薬組成物は、対象、例として、心不全、筋萎縮(心筋萎縮を含むが、これに限定されない)、筋ジストロフィー、悪液質、心臓線維症、および/または筋肥大(心肥大を含むが、これに限定されない)を有するヒト対象の処置のための任意の他の好適な治療剤をさらに含み得る。いくつかの態様において、他の治療剤は、本明細書に記載の複合体の有効性を増強または補足し得る。いくつかの態様において、他の治療剤は、本明細書に記載の複合体とは異なる症状または疾患を処置するために機能し得る。

例1:トランスフェクトされたアンチセンスオリゴヌクレオチドによるHPRTの標的化
ヒポキサンチンホスホリボシルトランスフェラーゼ(HPRT)を標的にするsiRNAを、不死化細胞株においてHPRTの発現レベルを低減させるその能力についてin vitroで試験した。手短に言えば、Hepa1-6細胞に、対照siRNA(siCTRL;100nM)またはHPRTを標的にするsiRNA(siHPRT;100nM)のいずれかをトランスフェクトし、lipofectamine 2000を処方した。トランスフェクションの48時間後にHPRT発現レベルを評価した。ビヒクル(リン酸緩衝生理食塩水)を培養中のHepa1-6細胞へ送達し、細胞を48時間維持する対照実験も行った。図1に示されるように、HPRT siRNAは、対照と比較してHPRT発現レベルを約90%低減させることがわかった。
表18.siHPRTおよびsiCTRLの配列
Figure 2023512441000062
例2:筋肉標的複合体によるHPRTの標的化
切断不能なN-ガンマ-マレイミドブチリル-オキシスクシンイミドエステル(GMBS)リンカーを介してDTX-A-002(抗トランスフェリン受容体抗体)へ共有結合的に連結されている例1において使用したHPRT siRNA(siHPRT)を含む筋肉標的複合体を生成した。
手短に言えば、GMBSリンカーを乾燥DMSOに溶解し、水性条件下でアミド結合形成を通じてsiHPRTのセンス鎖の3’末端に結合させた。反応の完了は、カイザーテストによって検証した。余分なリンカーおよび有機溶媒をゲル浸透クロマトグラフィーによって除去した。次いで、siHPRTの精製マレイミド官能化センス鎖を、マイケル付加反応を使用してDTX-A-002抗体に結合させた。
次いで、抗体カップリング反応の生成物を疎水性相互作用クロマトグラフィー(HIC-HPLC)に供した。DTX-A-002抗体に共有結合的に連結された1つまたは2つのsiHPRT分子を含む抗TfR-siHPRT複合体を精製した。濃度測定によって、複合体の精製試料が1.46の平均siHPRT対抗体比率を有することを確認した。SDS-PAGE分析によって、複合体の精製試料の>90%が1つまたは2つのいずれかのsiHPRT分子へ連結されているDTX-A-002を含むことを実証した。
上に記載のとおりの同じ方法を使用して、GMBSリンカーを介してIgG2a(Fab)抗体(DTX-A-003)へ共有結合的に連結されている例1において使用したHPRT siRNA(siHPRT)を含む対照IgG2a-siHPRT複合体を生成した。濃度測定によって、DTX-C-001が1.46の平均siHPRT対抗体比率を有することを確認し、SDS-PAGEによって、対照複合体の精製試料の>90%が1つまたは2つのいずれかのsiHPRT分子へ連結されているDTX-A-003を含むことを実証した。
次いで、抗TfR-siHPRT複合体を、細胞内在化およびHPRTの阻害についてin celluloで試験した。トランスフェリン受容体の相対的に高い発現レベルを有するHepa1-6細胞を、ビヒクル(リン酸緩衝生理食塩水)、IgG2a-siHPRT(100nM)、抗TfR-siCTRL(100nM)、または抗TfR-siHPRT(100nM)の存在下で72時間インキュベートした。72時間のインキュベーション後、細胞を単離し、HPRTの発現レベルについてアッセイした(図2)。抗TfR-siHPRTで処理した細胞によって、ビヒクル対照で処理した細胞と比べて、HPRT発現が約50%低減したことを実証した。その一方で、IgG2a-siHPRTまたは抗TfR-siCTRLのいずれかで処理した細胞は、ビヒクル対照に匹敵するHPRT発現レベルを有した(HPRT発現の低減はなし)。これらのデータは、抗TfR-siHPRTの抗トランスフェリン受容体抗体が複合体の細胞内在化を可能にし、それによってsiHPRTがHPRTの発現を阻害できることを示す。
例3:筋肉標的複合体によるマウス筋組織におけるHPRTの標的化
例2に記載の筋肉標的複合体(抗TfR-siHPRT)を、マウス組織におけるHPRTの阻害について試験した。C57BL/6野生型マウスにビヒクル対照(リン酸緩衝生理食塩水);siHPRT(2mg/kgのRNA);IgG2a-siHPRT(2mg/kgのRNA、9mg/kgの抗体複合体に対応);または抗TfR-siHPRT(2mg/kgのRNA、9mg/kgの抗体複合体に対応)の単回用量を静脈内注射した。各実験条件は、4匹の個々のC57BL/6野生型マウスでレプリケートした。注射後3日間の後、マウスを安楽死させ、単離した組織型に分割した。続いて、個々の組織試料をHPRTの発現レベルについてアッセイした(図3A~3Bおよび4A~4E)。
抗TfR-siHPRT複合体で処理したマウスによって、siHPRT対照で処理したマウスと比べて、心臓(30%低減;p<0.05)および腓腹筋(31%低減;p<0.05)におけるHPRT発現の低減を実証した(図3A~3B)。その一方で、IgG2a-siHPRT複合体で処理したマウスは、アッセイしたすべての筋組織タイプで、siHPRT対照に匹敵するHPRT発現レベルを有した(HPRT発現の低減はほとんどまたはまったくなし)。
抗TfR-siHPRT複合体で処理したマウスは、脳、肝臓、肺、腎臓、および脾臓組織などの非筋組織においてHPRT発現が変化しないことを実証した(図4A~4E)。
これらのデータは、抗TfR-siHPRT複合体の抗トランスフェリン受容体抗体が、in vivoマウスモデルにおいて筋肉特異的組織への複合体の細胞内在化を可能にし、それによってsiHPRTがHPRTの発現を阻害できるようにしたことを示す。これらのデータはさらに、本開示の抗TfR-オリゴヌクレオチド複合体が筋組織を特異的に標的にすることができることを実証する。
例4:筋肉標的複合体によるMSTNの標的化
カテプシンによって切断可能なリンカーを介してDTX-A-002(RI7 217(Fab))(抗トランスフェリン受容体抗体)へ共有結合的に連結されているMSTN(MSTN ASO)のアレルを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む筋肉標的複合体を生成した。
手短に言えば、マレイミドカプロイル-L-バリン-L-シトルリン-p-アミノベンジルアルコールp-ニトロフェニルカーボネート(MC-Val-Cit-PABC-PNP)リンカー分子を、アミドカップリング反応を使用してNH-C-DNM2 ASOに結合させる。余分なリンカーおよび有機溶媒をゲル浸透クロマトグラフィーによって除去する。精製したVal-Cit-リンカー-DNM2 ASOを、次いでチオール反応性抗トランスフェリン受容体抗体(DTX-A-002)に結合させる。
次いで、抗体カップリング反応の生成物を、疎水性相互作用クロマトグラフィー(HIC-HPLC)に供して筋肉標的複合体を精製する。精製した複合体の濃度測定およびSDS-PAGE分析によって、ASO対抗体の平均比率および総純度をそれぞれ決定することができる。
上に記載のとおりの同じ方法を使用して、Val-Citリンカーを介してIgG2a(Fab)抗体へ共有結合的に連結されているMSTN ASOを含む対照複合体を生成する。MSTN ASOに共有結合的に連結されたDTX-A-002を含む精製した筋肉標的複合体を、次いで細胞内在化およびMSTNの阻害について試験する。トランスフェリン受容体の相対的に高い発現レベルを有する疾患に関係のある筋細胞を、ビヒクル対照(生理食塩水)、筋肉標的複合体(100nM)、または対照複合体(100nM)の存在下で72時間インキュベートする。72時間のインキュベーションの後、細胞を単離し、MSTNの発現レベルについてアッセイする。
例5:MSTNを阻害するための候補オリゴヌクレオチドの同定
MSTNを阻害するための候補オリゴヌクレオチドを同定するために、siRNAをMSTN発現の抑制についてスクリーニングした。細胞を0.1nMまたは10nMの各siRNAで処理し、遺伝子発現を測定した。各siRNAを、異種間活性を有するように設計した。図5は、両方の用量で試験した24のsiRNAの各々についてのMSTN遺伝子発現データを示す。このスクリーニングからの4つのsiRNA(hsMSTN-1、hsMSTN-2、hsMSTN-3、およびhsMSTN-4)を、例6に記載の用量応答分析においてさらに試験した。
例6:候補オリゴヌクレオチドによるMSTNの阻害
ヒトMSTNを阻害するための候補オリゴヌクレオチドを評価するために、siRNAを二重ルシフェラーゼレポーターアッセイでスクリーニングした。用量応答分析を、100nMから10fMまでの各siRNAの10の濃度にわたって、各用量間で6倍の変化で行った。遺伝子阻害の結果を使用して、各オリゴヌクレオチドのIC50およびIC80値を計算した。図6はMSTNの阻害についての用量応答曲線を示し、表19は対応するIC50およびIC80値を示す。
表19.ヒトMSTNのオリゴヌクレオチド阻害
Figure 2023512441000063
例7:INHBA候補siRNAのスクリーニング
INHBAを阻害するための候補オリゴヌクレオチドを同定するために、siRNAをINHBA発現の抑制についてスクリーニングした。細胞を0.1nMまたは10nMの各siRNAで処理し、遺伝子発現を測定した。各siRNAを、異種間活性を有するように設計した。図7は、両方の用量で試験した24のsiRNAの各々についてのINHBA遺伝子発現データを示す。このスクリーニングからの3つのsiRNA(hsINHBA-1、hsINHBA-2、およびhsINHBA-3)を、例8に記載の用量応答分析においてさらに試験した。
例8:候補オリゴヌクレオチドによるINHBAの阻害
ヒトINHBAを阻害するための候補オリゴヌクレオチドを評価するために、siRNAを二重ルシフェラーゼレポーターアッセイでスクリーニングした。用量応答分析を、100nMから10fMまでの各siRNAの10の濃度にわたって、各用量間で6倍の変化で行った。遺伝子阻害の結果を使用して、各オリゴヌクレオチドのIC50およびIC80値を計算した。図8はINHBAの阻害についての用量応答曲線を示し、表20は対応するIC50およびIC80値を示す。
表20.ヒトINHBAのオリゴヌクレオチド阻害
Figure 2023512441000064
例9:ACVR1B候補siRNAのスクリーニング
ACVR1Bを阻害するための候補オリゴヌクレオチドを同定するために、siRNAをACVR1B発現の抑制についてスクリーニングした。細胞を0.1nMまたは10nMの各siRNAで処理し、遺伝子発現を測定した。各siRNAを、異種間活性、ヒトおよびカニクイザル配列に対する活性、またはラットおよびマウス配列に対する活性を有するように設計した。図9は、両方の用量で試験した24のsiRNAの各々についてのACVR1B遺伝子発現データを示す。このスクリーニングからの5つのsiRNA(hsACVR1B-1およびhsACVR1B-2;およびmmACVR1B-1、mmACVR1B-2およびmmACVR1B-3)を、例10に記載の用量応答分析においてさらに試験した。
例10:候補オリゴヌクレオチドによるACVR1Bの阻害
ヒトおよびマウスACVR1Bを阻害するための候補オリゴヌクレオチドを評価するために、siRNAを二重ルシフェラーゼレポーターアッセイでスクリーニングした。用量応答分析を、100nMから10fMまでの各siRNAの10の濃度にわたって、各用量間で6倍の変化で行った。遺伝子阻害の結果を使用して、各オリゴヌクレオチドのIC50およびIC80値を計算した。図10(ヒト)および11(マウス)はACVR1Bの阻害についての用量応答曲線を示し、表21(ヒト)および22(マウス)は対応するIC50およびIC80値を示す。
表21.ヒトACVR1Bのオリゴヌクレオチド阻害
Figure 2023512441000065

表22.マウスACVR1Bのオリゴヌクレオチド阻害
Figure 2023512441000066

追加の態様
1.筋肉成長および/または維持に関連する遺伝子の発現または活性を阻害するように構成された分子ペイロードに共有結合的に連結された筋標的化剤を含む複合体であって、筋標的化剤は、筋細胞上の内在化する細胞表面受容体に特異的に結合する、前記複合体。
2.筋肉成長および/または維持に関連する遺伝子がMSTNである、態様1の複合体。
3.筋肉成長および/または維持に関連する遺伝子がINHBAである、態様1の複合体。
4.筋肉成長および/または維持に関連する遺伝子がACVR1Bである、態様1の複合体。
5.筋細胞が心筋細胞である、態様1~4のいずれか1つの複合体。
6.筋標的化剤が筋標的抗体である、態様1~5のいずれか1つの複合体。
7.筋標的抗体が、トランスフェリン受容体の細胞外エピトープに特異的に結合する、態様6の複合体。
8.トランスフェリン受容体の細胞外エピトープが、トランスフェリン受容体の頂端部のエピトープを含む、態様7の複合体。
9.筋標的抗体が、配列番号242~244のC89~F760の範囲にある配列のエピトープに特異的に結合する、態様7または8の複合体。
10.トランスフェリン受容体への筋標的抗体の結合の平衡解離定数(Kd)が、10-11M~10-6Mの範囲にある、態様7~9のいずれか1つの複合体。
11.筋標的抗体が、トランスフェリン受容体のエピトープへの特異的な結合について表7中に挙げられた抗体と競合する、態様7~10のいずれか1つの複合体。
12.筋標的抗体が、10-6M以下のKdを有するトランスフェリン受容体のエピトープへの特異的な結合について競合する、態様11の複合体。
13.Kdが、10-11M~10-6Mの範囲にある、態様12の複合体。
14.筋標的抗体が、トランスフェリン受容体のトランスフェリン結合部位に特異的に結合せず、および/または筋標的抗体が、トランスフェリン受容体へのトランスフェリンの結合を阻害しない、態様7~13のいずれか1つの複合体。
15.筋標的抗体が、ヒト、霊長目の非ヒト動物および齧歯類の動物のトランスフェリン受容体の2以上の細胞外エピトープと交差反応性である、態様7~14のいずれか1つの複合体。
16.トランスフェリン受容体によって媒介される筋細胞への分子ペイロードの内在化を促進するように構成されている、態様7~15のいずれか1つの複合体。
17.筋標的抗体がキメラ抗体であり、ここで任意に、キメラ抗体はヒト化モノクローナル抗体である、態様6~16のいずれか1つの複合体。
18.筋標的抗体が、ScFv、Fabフラグメント、Fab’フラグメント、F(ab’)フラグメント、またはFvフラグメントの形態である、態様6~17のいずれか1つの複合体。
19.分子ペイロードがオリゴヌクレオチドである、態様1~18のいずれか1つの複合体。
20.オリゴヌクレオチドが、MSTN遺伝子と相補性のある領域を含む、態様19の複合体。
21.オリゴヌクレオチドが、表9中に挙げられた標的配列に相補的である配列を含む、態様19または20の複合体。
22.オリゴヌクレオチドが、表10中に挙げられた配列を含む、態様19~21のいずれか1つの複合体。
23.オリゴヌクレオチドが、表11中に挙げられた修飾されたオリゴヌクレオチドを含む、態様19~21のいずれか1つの複合体。
24.オリゴヌクレオチドが、INHBA遺伝子と相補性のある領域を含む、態様19の複合体。
25.オリゴヌクレオチドが、表12中に挙げられた標的配列に相補的である配列を含む、態様19または24の複合体。
26.オリゴヌクレオチドが、表13中に挙げられた配列を含む、態様19、24および25のいずれか1つの複合体。
27.オリゴヌクレオチドが、表14中に挙げられた修飾されたオリゴヌクレオチドを含む、態様19、24および25のいずれか1つの複合体。
28.オリゴヌクレオチドが、ACVR1B遺伝子と相補性のある領域を含む、態様19の複合体。
29.オリゴヌクレオチドが、表15中に挙げられた標的配列に相補的である配列を含む、態様19または28の複合体。
30.オリゴヌクレオチドが、表16中に挙げられた配列を含む、態様19、28および29のいずれか1つの複合体。
31.オリゴヌクレオチドが、表17中に挙げられた修飾されたオリゴヌクレオチドを含む、態様19、28および29のいずれか1つの複合体。
32.分子ペイロードがポリペプチドである、態様1~18のいずれか1つの複合体。
33.ポリペプチドが、ミオスタチンの活性を選択的に阻害する、態様32の複合体。
34.ポリペプチドが、成長分化因子11(GDF11)ポリペプチド、アクチビン受容体IIB型およびIgG1-Fcの融合ポリペプチド、フォリスタチンポリペプチド、または抗MSTN抗体である、態様32または33の複合体。
35.ポリペプチドが、INHBAの活性を阻害する、態様32の複合体。
36.ポリペプチドが、アクチビンAの機能または形成を阻害する、態様32または35の複合体。
37.ポリペプチドが、トランケートされたACVR1Bポリペプチドである、態様32の複合体。
38.ポリペプチドが、アクチビン受容体II型タンパク質への結合について内在性ACVR1Bタンパク質と競合する、態様32または37の複合体。
39.ポリペプチドが、リン酸化部位を欠くトランケートされたACVR1Bポリペプチドである、態様37または38の複合体。
40.オリゴヌクレオチドが、アレルによってコードされる野生型MSTN mRNA転写産物と細胞においてハイブリダイズするアンチセンス鎖を含む、態様19~23のいずれかの複合体。
41.オリゴヌクレオチドが、アレルによってコードされる突然変異体MSTN mRNA転写産物と細胞においてハイブリダイズするアンチセンス鎖を含む、態様19~23のいずれかの複合体。
42.オリゴヌクレオチドが、野生型INHBA mRNA転写産物と細胞においてハイブリダイズするアンチセンス鎖を含む、態様19および24~27のいずれかの複合体。
43.オリゴヌクレオチドが、突然変異体INHBA mRNA転写産物と細胞においてハイブリダイズするアンチセンス鎖を含む、態様19および24~27のいずれかの複合体。
44.オリゴヌクレオチドが、野生型ACVR1B mRNA転写産物と細胞においてハイブリダイズするアンチセンス鎖を含む、態様19または28のいずれかの複合体。
45.オリゴヌクレオチドが、突然変異体ACVR1B mRNA転写産物と細胞においてハイブリダイズするアンチセンス鎖を含む、態様19または28のいずれかの複合体。
46.オリゴヌクレオチドが、遺伝子発現コンストラクトである、態様1~18のいずれか1つの複合体。
47.遺伝子発現コンストラクトが、メッセンジャーRNA(mRNA)である、態様46の複合体。
48.遺伝子発現コンストラクトが、ミオスタチンの活性を選択的に阻害するポリペプチドをコードするmRNAである、態様46または47の複合体。
49.ポリペプチドが、成長分化因子11(GDF11)ポリペプチド、アクチビン受容体IIB型およびIgG1-Fcの融合ポリペプチド、フォリスタチンポリペプチド、または抗MSTN抗体である、態様48の複合体。
50.遺伝子発現コンストラクトが、INHBAの活性またはアクチビンAの形成を選択的に阻害するポリペプチドをコードするmRNAである、態様46または47の複合体。
51.遺伝子発現コンストラクトが、INHBAまたはアクチビンAへ結合する抗体をコードするmRNAである、態様46または47の複合体。
52.遺伝子発現コンストラクトが、トランケートされたACVR1Bタンパク質をコードするmRNAである、態様46または47の複合体。
53.トランケートされたACVR1Bタンパク質が、アクチビン受容体II型タンパク質への結合について内在性ACVR1Bタンパク質と競合する、態様52の複合体。
54.トランケートされたACVR1Bタンパク質が、リン酸化部位を欠く、態様52または53の複合体。
55.オリゴヌクレオチドが、MSTN mRNAのアンチセンスによって媒介されるエキソンスキッピングを促進する、態様19~23、40および41のいずれか1つの複合体。
56.オリゴヌクレオチドが、MSTNのエキソン2のスキッピングを促進する、態様55の複合体。
57.オリゴヌクレオチドが、少なくとも1の修飾ヌクレオチド間連結を含む、態様19~31および40~56のいずれか1つの複合体。
58.少なくとも1の修飾ヌクレオチド間連結が、ホスホロチオアート連結である、態様57の複合体。
59.オリゴヌクレオチドが、Rp立体化学コンフォメーションおよび/またはSp立体化学コンフォメーションのホスホロチオアート連結を含む、態様58の複合体。
60.オリゴヌクレオチドが、すべてRp立体化学コンフォメーションにあるか、またはすべてSp立体化学コンフォメーションにある、ホスホロチオアート連結を含む、態様59の複合体。
61.オリゴヌクレオチドが、1以上の修飾ヌクレオチドを含む、態様19~31および40~60のいずれか1つの複合体。
62.1以上の修飾ヌクレオチドが、2’-修飾ヌクレオチドである、態様61の複合体。
63.オリゴヌクレオチドが、細胞においてMSTN mRNA転写産物のRNAse Hによって媒介される切断を指示するgapmerオリゴヌクレオチドである、態様19~23および40~62のいずれか1つの複合体。
64.オリゴヌクレオチドが、細胞においてINHBA mRNA転写産物のRNAse Hによって媒介される切断を指示するgapmerオリゴヌクレオチドである、態様19、24~27、および40~62のいずれか1つの複合体。
65.オリゴヌクレオチドが、細胞においてACVR1B mRNA転写産物のRNAse Hによって媒介される切断を指示するgapmerオリゴヌクレオチドである、態様19、28~31、および40~62のいずれか1つの複合体。
66.gapmerオリゴヌクレオチドが、2~8個の修飾ヌクレオチドのウイングに隣接する5~15個のデオキシリボヌクレオチドの中心部を含む、態様65の複合体。
67.ウイングの修飾ヌクレオチドが、2’-修飾ヌクレオチドである、態様66の複合体。
68.オリゴヌクレオチドが、mixmerオリゴヌクレオチドである、態様19~31および40~62のいずれか1つの複合体。
69.mixmerオリゴヌクレオチドが、2以上の異なる2’修飾ヌクレオチドを含む、態様68の複合体。
70.オリゴヌクレオチドが、MSTN mRNA転写産物のRNAiによって媒介される切断を促進するRNAiオリゴヌクレオチドである、態様19~23および40~62のいずれか1つの複合体
71.オリゴヌクレオチドが、INHBA mRNA転写産物のRNAiによって媒介される切断を促進するRNAiオリゴヌクレオチドである、態様19、24~27、および40~62のいずれか1つの複合体。
72.オリゴヌクレオチドが、ACVR1B mRNA転写産物のRNAiによって媒介される切断を促進するRNAiオリゴヌクレオチドである、態様19、28~31、および40~62のいずれか1つの複合体。
73.RNAiオリゴヌクレオチドが、長さが19~25ヌクレオチドの二本鎖オリゴヌクレオチドである、態様70~72のいずれか1つの複合体
74.RNAiオリゴヌクレオチドが、少なくとも1の2’修飾ヌクレオチドを含む、態様70~73のいずれか1つの複合体。
75.各2’修飾ヌクレオチドが、2’-O-メチル(2’-O-Me)、2’-フルオロ(2’-F)、2’-O-メトキシエチル(2’-MOE)、および2’、4’-架橋ヌクレオチドからなる群から選択される、態様62、67、69、および74のいずれか1つの複合体。
76.1以上の修飾ヌクレオチドが、架橋ヌクレオチドである、態様61の複合体。
77.少なくとも1の2’修飾ヌクレオチドが、2’,4’-拘束2’-O-エチル(cEt)およびロックド核酸(LNA)ヌクレオチドから選択される2’,4’-架橋ヌクレオチドである、態様62、67、69、および74のいずれか1つの複合体。
78.オリゴヌクレオチドが、ゲノム編集ヌクレアーゼのガイド配列を含む、態様19~31および40~62のいずれか1つの複合体。
79.オリゴヌクレオチドが、ホスホロジアミダイトモルホリノオリゴマーである、態様19~31および40~62のいずれか1つの複合体。
80.筋標的化剤が、切断可能なリンカーを介して分子ペイロードに共有結合的に連結されている、態様1~79のいずれか1つの複合体。
81.切断可能なリンカーが、プロテアーゼ感受性リンカー、pH感受性リンカー、およびグルタチオン感受性リンカーから選択される、態様80の複合体。
82.切断可能なリンカーが、プロテアーゼ感受性リンカーである、態様81の複合体。
83.プロテアーゼ感受性リンカーが、リソソームプロテアーゼおよび/またはエンドソームプロテアーゼによって切断可能な配列を含む、態様82の複合体。
84.プロテアーゼ感受性リンカーが、バリン-シトルリンジペプチド配列を含む、態様82の複合体。
85.リンカーが、4~6の範囲にあるpHで切断されるpH感受性リンカーである、態様81の複合体。
86.筋標的化剤が、切断不能なリンカーを介して分子ペイロードに共有結合的に連結されている、態様1~79のいずれか1つの複合体。
87.切断不能なリンカーが、アルカンリンカーである、態様86の複合体。
88.筋標的抗体が、オリゴヌクレオチドが共有結合的に連結されている非天然アミノ酸を含む、態様6~87のいずれかの複合体。
89.筋標的抗体が、抗体のリシン残基またはシステイン残基への抱合を介してオリゴヌクレオチドに共有結合的に連結されている、態様6~87のいずれかの複合体。
90.オリゴヌクレオチドが、マレイミドを含有するリンカーを介して抗体のシステイン残基に抱合され、任意にここで、マレイミドを含有するリンカーは、マレイミドカプロイルまたはマレイミドメチルシクロヘキサン-1-カルボキシラート基を含む、態様89の複合体。
91.筋標的抗体が、オリゴヌクレオチドが共有結合的に連結されている少なくとも1の糖部を含むグリコシル化抗体である、態様6~90の複合体。
92.糖部が、分枝状のマンノースである、態様91の複合体。
93.筋標的抗体が、各々が別々のオリゴヌクレオチドに共有結合的に連結されている1~4個の糖部を含むグリコシル化抗体である、態様91または92の複合体。
94.筋標的抗体が、完全グリコシル化抗体である、態様93の複合体。
95.筋標的抗体が、部分的グリコシル化抗体である、態様93の複合体。
96.部分的グリコシル化抗体が、化学的または酵素的手段を介して生成される、態様95の複合体。
97.部分的グリコシル化抗体が、N-またはO-グリコシル化経路の酵素が欠乏している細胞において生成される、態様95の複合体。
98.トランスフェリン受容体を発現する細胞に分子ペイロードを送達する方法であって、細胞を態様1~97のいずれか1つの複合体と接触させることを含む、前記方法。
99.細胞においてMSTN、INHBAおよび/またはAVCR1Bの発現または活性を阻害する方法であって、細胞への分子ペイロードの内在化を促進するのに有効な量で、細胞を態様1~97のいずれか1つの複合体と接触させることを含む、前記方法。
100.細胞が、in vitroのものである、態様99の方法。
101.細胞が、対象におけるものである、態様99の方法。
102.対象が、ヒトである、態様101の方法。
103.ミオスタチン、INHBAおよび/またはアクチビンA、またはAVCR1Bの上昇した発現、活性および/または機能に関連する疾患または障害を有する対象を処置する方法であって、有効量の態様1~97のいずれか1つの複合体を対象へ投与することを含む、前記方法。
104.対象が、ヒト対象である、態様103の方法。
105.対象が、2型糖尿病を有する、態様103または104の方法。
106.対象が、がんを有する、態様103または104の方法。
107.ミオスタチン、INHBAおよび/またはアクチビンA、またはACVR1Bの上昇した発現または活性に関連する疾患または障害が、心不全、心筋症、筋萎縮、筋ジストロフィー、または心臓悪液質である、態様103または104の方法。
108.心筋症が、拡張型心筋症または肥大型心筋症である、態様107の方法
109.萎縮が、同心性萎縮、動脈瘤性萎縮、または単純型萎縮である、態様107の方法。
110.心不全が、心臓機能の減少に関連する、態様107の方法。
111.心不全が、駆出率の減少に関連する、態様107または110の方法。
等価物および専門用語
例証的に本明細書に記載された開示は、好適には、本明細書に具体的には開示されないいずれかの要素(単数または複数)、限定(単数または複数)の非存在下において実施され得る。それゆえに、例えば、本出願の各事例において、用語「含む」、「から本質的になる」、および「からなる」のいずれかは、他の2つの用語のどちらかによって置き換えられ得る。採用された用語および表現は、限定ではなく記載の用語として使用され、かかる用語および表現の使用には(that in)、示されるおよび記載される特徴のいずれかの等価物またはそれらの部分を排除する意図はなく、種々の改変が本開示の範囲内で可能であることが認識される。それゆえに、本開示は好ましい態様によって具体的に開示されたが、本明細書に開示される概念の任意の特徴、改変、および変形が当業者によって頼られ得ることと、かかる改変および変形は本開示の範囲内であると考慮されることとは理解されるべきである。
加えて、本開示の特徴または側面がマーカッシュ群または代替物の他の群分けとして記載されるところでは、当業者は、本開示がそれによってマーカッシュ群または他の群のいずれかの個々の構成員または構成員のサブグループとしてもまた記載されることを認識するであろう。
いくつかの態様において、オリゴヌクレオチドまたは他の核酸の構造を記載する際には、配列表で提示される配列が参照され得ることは了解されるべきである。かかる態様において、実際のオリゴヌクレオチドまたは他の核酸は、指定された配列と本質的に同じかまたは類似の相補的な特性を保持しながら、指定された配列と比較して、1以上の代替的なヌクレオチド(例として、DNAヌクレオチドのRNAカウンターパート、またはRNAヌクレオチドのDNAカウンターパート)および/または1以上の修飾ヌクレオチドおよび/または1以上の修飾されたヌクレオチド間連結および/または1以上の他の改変を有し得る。
本発明を記載する文脈における(特に次の請求項の文脈における)用語「a」および「an」および「the」ならびに類似のレファレントの使用は、本明細書に別様に指し示されないかまたは文脈によって明瞭に否定されない限り、単数および複数両方をカバーすると解釈されるべきである。用語「含む」、「有する」、「包含する」、および「含有する」は、別様に指摘されない限り、開放型の用語として解釈されるべきである(すなわち、「包含するが、これらに限定されない」を意味する)。本明細書における値の範囲の記載は、本明細書に別様に指し示されない限り、単に、範囲内に収まる各別個の値を個々に参照する簡略な方法として働くことを意図され、各別個の値は、それが本明細書に個々に記載される場合のように本明細書に組み込まれる。本明細書に別様に指し示されないかまたは別様には文脈によって明瞭に否定されない限り、本明細書に記載のすべての方法はいずれかの好適な順序で行われ得る。別様に請求されない限り、本明細書に提供されるいずれかのおよびすべての例または例示的な文言(例として、「などの」)の使用は、単に本発明をより良く解き明かすことを意図され、本発明の範囲に限定を課さない。本明細書のいかなる文言も、いずれかの請求されない要素を本発明の実施にとって必須であると指し示すものと解釈されるべきではない。
本発明の態様が本明細書に記載されている。それらの態様の変形は、先述の記載を読むことによって当業者には明らかになり得る。
本発明者は当業者がかかる変形を適当に採用することを予期し、本発明者は本発明が本明細書に具体的に記載されるとおりとは別様に実施されることを意図する。したがって、本発明は、然るべき法律によって許可される本明細書に添付される請求項に記載される主題のすべての改変および等価物を包含する。その上、それらのすべての可能な変形における上に記載された要素のいずれかの組み合わせは、本明細書に別様に指し示されないかまたは別様に文脈によって明瞭に否定されない限り、本発明によって包摂される。当業者は、本明細書に記載の本発明の具体的な態様の多くの等価物を認識するか、またはせいぜい定型的な実験作業によって確かめる能力があるであろう。かかる等価物は次の請求項によって包摂されることを意図される。

Claims (26)

  1. ミオスタチン(MSTN)、インヒビンベータA(INHBA)および/またはアクチビン受容体タイプ1B(ACVR1B)の発現または活性をモジュレートする分子ペイロードに共有結合的に連結された筋標的化剤を含む複合体であって、ここで、筋標的化剤は、筋細胞上の内在化する細胞表面受容体に特異的に結合する、前記複合体。
  2. 筋細胞が心筋細胞である、請求項1に記載の複合体。
  3. 筋標的化剤が、抗トランスフェリン受容体(TfR)抗体であり、任意にここで、抗TfR抗体は、表1中に挙げられた抗TfR抗体のいずれかの重鎖相補性決定領域1(CDR-H1)、重鎖相補性決定領域2(CDR-H2)、重鎖相補性決定領域3(CDR-H3)、軽鎖相補性決定領域1(CDR-L1)、軽鎖相補性決定領域2(CDR-L2)、および軽鎖相補性決定領域3(CDR-L3)を含む、請求項1または2に記載の複合体。
  4. (i)抗体が、配列番号15のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)のCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3、および配列番号16のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)のCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む;
    (ii)抗体が、配列番号204のアミノ酸配列を含むVHのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3、および配列番号205のアミノ酸配列を含むVLのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む;
    (iii)抗体が、配列番号7のアミノ酸配列を含むVHのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3、および配列番号8のアミノ酸配列を含むVLのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む;または
    (iv)抗体が、配列番号23のアミノ酸配列を含むVHのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3、および配列番号24のアミノ酸配列を含むVLのCDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3を含む、
    請求項3に記載の複合体。
  5. 抗体が、
    (i)配列番号155のCDR-H1、配列番号156のCDR-H2、配列番号157のCDR-H3、配列番号158のCDR-L1、配列番号159のCDR-L2、および配列番号14のCDR-L3;
    (ii)配列番号194のCDR-H1、配列番号195のCDR-H2、配列番号196のCDR-H3、配列番号197のCDR-L1、配列番号198のCDR-L2、および配列番号193のCDR-L3;
    (iii)配列番号145のCDR-H1、配列番号146、配列番号249、または配列番号252のCDR-H2、配列番号147のCDR-H3、配列番号148のCDR-L1、配列番号149のCDR-L2、および配列番号6のCDR-L3;または
    (iv)配列番号165、配列番号255、または配列番号257のCDR-H1、配列番号166のCDR-H2、配列番号167のCDR-H3、配列番号168のCDR-L1、配列番号169のCDR-L2、および配列番号22のCDR-L3
    を含む、請求項3または請求項4に記載の複合体。
  6. 抗体が、
    (i)配列番号15で表されるVHのCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、および配列番号16で表されるVLのCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3;
    (ii)配列番号204で表されるVHのCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、および配列番号205で表されるVLのCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3;
    (iii)配列番号7で表されるVHのCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、および配列番号8で表されるVLのCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3;または
    (iv)配列番号23で表されるVHのCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、および配列番号24で表されるVLのCDR-L1、CDR-L2、CDR-L3
    を有するヒトのまたはヒト化フレームワーク領域を含む、請求項3~5のいずれか一項に記載の複合体。
  7. 抗体が、
    (i)配列番号15と少なくとも80%同一のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号16と少なくとも80%同一のアミノ酸配列を含むVLを含む抗体;
    (ii)配列番号204と少なくとも80%同一のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号205と少なくとも80%同一のアミノ酸配列を含むVLを含む抗体、任意にここで、抗体は、配列番号204のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号205のアミノ酸配列を含むVLを含む;
    (iii)配列番号7と少なくとも80%同一のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号8と少なくとも80%同一のアミノ酸配列を含むVLを含む抗体;および
    (iv)配列番号23と少なくとも80%同一のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号24と少なくとも805%同一のアミノ酸配列を含むVLを含む抗体
    から選択される、請求項3~6のいずれか一項に記載の複合体。
  8. トランスフェリン受容体への抗体の結合の平衡解離定数(K)が、10-11M~10-6Mの範囲にある、請求項3~7のいずれか一項に記載の複合体。
  9. 抗体が、完全長IgG、Fabフラグメント、F(ab’)フラグメント、F(ab’)2フラグメント、scFv、およびFvからなる群から選択され、任意にここで、抗体はFab’フラグメントである、請求項3~8のいずれか一項に記載の複合体。
  10. 分子ペイロードが、MSTN標的配列と相補性のある領域を含むアンチセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドであり、任意にここで、MSTN標的配列は、配列番号300または配列番号301で表されるMSTN mRNA配列、または配列番号302~349のいずれか1つで表されるMSTN標的配列であり、さらに任意にここで、アンチセンス鎖は、長さが18~25ヌクレオチドであり、および/または相補性のある領域は、長さが少なくとも16ヌクレオシドである、請求項1~9のいずれか一項に記載の複合体。
  11. アンチセンス鎖が、配列番号350~373のいずれか1つで表されるヌクレオチド配列の少なくとも16の連続的なヌクレオチドを含み、任意にここで、アンチセンス鎖は、配列番号350~373のいずれか1つのヌクレオチド配列を含む、請求項10に記載の複合体。
  12. 分子ペイロードが、INHBA標的配列と相補性のある領域を含むアンチセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドであり、任意にここで、INHBA標的配列は、配列番号422または配列番号423で表されるINHBA mRNA配列、または配列番号424~471のいずれか1つで表されるINHBA標的配列であり、さらに任意にここで、アンチセンス鎖は、長さが18~25ヌクレオチドであり、および/または相補性のある領域は、長さが少なくとも16のヌクレオシドである、請求項1~9のいずれか一項に記載の複合体。
  13. アンチセンス鎖が、配列番号472~495のいずれか1つで表されるヌクレオチド配列の少なくとも16の連続的なヌクレオチドを含み、任意にここで、アンチセンス鎖は、配列番号472~495のいずれか1つのヌクレオチド配列を含む、請求項12に記載の複合体。
  14. 分子ペイロードが、ACVR1B標的配列と相補性のある領域を含むアンチセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドであり、任意にここで、ACVR1B標的配列は、配列番号520~523のいずれか1つで表されるACVR1B mRNA配列、または配列番号374~421のいずれか1つで表されるACVR1B標的配列であり、さらに任意にここで、アンチセンス鎖は、長さが18~25ヌクレオチドであり、および/または相補性のある領域は、長さが少なくとも16のヌクレオシドである、請求項1~9のいずれか一項に記載の複合体。
  15. アンチセンス鎖が、配列番号496~519のいずれか1つで表されるヌクレオチド配列の少なくとも16の連続的なヌクレオチドを含み、任意にここで、アンチセンス鎖は、配列番号496~519のいずれか1つのヌクレオチド配列を含む、請求項14に記載の複合体。
  16. オリゴヌクレオチドが、アンチセンス鎖にハイブリダイズして二本鎖siRNAを形成するセンス鎖をさらに含む、請求項10~15のいずれか一項に記載の複合体。
  17. オリゴヌクレオチドが、1以上の修飾ヌクレオシドを含み、任意にここで、オリゴヌクレオチドにおける各ヌクレオシドは、修飾ヌクレオシドである、請求項10~16のいずれか一項に記載の複合体。
  18. 1以上の修飾ヌクレオシドが、2’修飾ヌクレオチドであり、任意にここで、1以上の2’修飾ヌクレオシドは、2’-フルオロ(2’-F)、2’-O-メチル(2’-O-Me)、2’-O-メトキシエチル(2’-MOE)、2’-O-アミノプロピル(2’-O-AP)、2’-O-ジメチルアミノエチル(2’-O-DMAOE)、2’-O-ジメチルアミノプロピル(2’-O-DMAP)、2’-O-ジメチルアミノエチルオキシエチル(2’-O-DMAEOE)、2’-O-N-メチルアセトアミド(2’-O-NMA)、ロックド核酸(LNA)、エチレン架橋核酸(ENA)、および(S)拘束エチル架橋核酸(cEt)から選択され、任意にここで、2’修飾ヌクレオチドは、2’-O-メチルまたは2’-フルオロ(2’-F)である、請求項17に記載の複合体。
  19. オリゴヌクレオチドが、1以上のホスホロチオアートヌクレオシド間連結を含み、任意にここで、1以上のホスホロチオアートヌクレオシド間連結は、RNAiオリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖上に存在し、さらに任意にここで、センス鎖の3’末端における2つのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオアートヌクレオシド間連結である、請求項10~18のいずれか一項に記載の複合体。
  20. オリゴヌクレオチドが、表11中に挙げられたsiRNAである、請求項10、11、および16~19のいずれか一項に記載の複合体。
  21. オリゴヌクレオチドが、表14中に挙げられたsiRNAである、請求項12、13、および16~19のいずれか一項に記載の複合体。
  22. オリゴヌクレオチドが、表17中に挙げられたsiRNAである、請求項14~19のいずれか一項に記載の複合体。
  23. 筋標的化剤が、
    (i)切断可能なリンカー、任意にここで、切断可能なリンカーは、バリン-シトルリンジペプチド配列を含む;または
    (ii)切断不能なリンカー、任意にここで、切断不能なリンカーは、アルカンリンカーである、
    を介して分子ペイロードに共有結合的に連結されている、請求項1~22のいずれか一項に記載の複合体。
  24. 筋細胞におけるMSTN、INHBA、および/またはACVR1Bの発現を低減する方法であって、筋細胞への分子ペイロードの内在化を促進するために、筋細胞を有効量の請求項1~23のいずれか一項に記載の複合体と接触させることを含む、前記方法。
  25. 筋萎縮を処置する方法であって、有効量の請求項1~23のいずれか一項に記載の複合体をそれを必要とする対象に投与することを含み、ここで、対象は、MSTN、INHBA、および/またはACVR1Bの上昇した発現または活性を有する、前記方法。
  26. 表11、表14、または表17中に挙げられた、siRNA。
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US11168141B2 (en) 2018-08-02 2021-11-09 Dyne Therapeutics, Inc. Muscle targeting complexes and uses thereof for treating dystrophinopathies
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MX2021001284A (es) 2018-08-02 2021-07-15 Dyne Therapeutics Inc Complejos dirigidos al musculo y sus usos para el tratamiento de distrofia muscular facioescapulohumeral.
US11633498B2 (en) 2021-07-09 2023-04-25 Dyne Therapeutics, Inc. Muscle targeting complexes and uses thereof for treating myotonic dystrophy
US11648318B2 (en) 2021-07-09 2023-05-16 Dyne Therapeutics, Inc. Anti-transferrin receptor (TFR) antibody and uses thereof
US11771776B2 (en) 2021-07-09 2023-10-03 Dyne Therapeutics, Inc. Muscle targeting complexes and uses thereof for treating dystrophinopathies
US11969475B2 (en) 2021-07-09 2024-04-30 Dyne Therapeutics, Inc. Muscle targeting complexes and uses thereof for treating facioscapulohumeral muscular dystrophy
US11638761B2 (en) 2021-07-09 2023-05-02 Dyne Therapeutics, Inc. Muscle targeting complexes and uses thereof for treating Facioscapulohumeral muscular dystrophy
WO2023121445A1 (en) 2021-12-22 2023-06-29 Sapreme Technologies B.V. Compositions comprising therapeutic nucleic acid and saponin for the treatment of muscle-wasting disorders
WO2023121444A1 (en) 2021-12-22 2023-06-29 Sapreme Technologies B.V. Compositions comprising therapeutic nucleic acid and targeted saponin for the treatment of muscle-wasting disorders
WO2023121446A1 (en) 2021-12-22 2023-06-29 Sapreme Technologies B.V. Targeted saponin-nucleic acid conjugates for treatment of muscle wasting disorders
US11931421B2 (en) 2022-04-15 2024-03-19 Dyne Therapeutics, Inc. Muscle targeting complexes and formulations for treating myotonic dystrophy
WO2023201318A1 (en) * 2022-04-15 2023-10-19 Dyne Therapeutics, Inc. Muscle targeting complexes and formulations for treating myotonic dystrophy
WO2023230562A2 (en) * 2022-05-26 2023-11-30 Board Of Regents Of The University Ofnebraska Rna compositions and therapeutic methods thereof

Family Cites Families (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2007104971A (ja) * 2005-10-14 2007-04-26 New Industry Research Organization ミオスタチンのスプライシング制御アンチセンスオリゴヌクレオチド
ES2710463T3 (es) * 2008-04-11 2019-04-25 Cedars Sinai Medical Center Acido poli(beta málico) con tripéptido colgante Leu-Leu-Leu para la administración eficaz del fármaco citoplasmático
GB0904214D0 (en) * 2009-03-11 2009-04-22 Ucb Pharma Sa Biological products
EP3208282A1 (en) * 2010-11-30 2017-08-23 F. Hoffmann-La Roche AG Low affinity anti transferrin receptor and their use to transfer therapeutic scfv across the blood brain barrier
CA2929574A1 (en) * 2013-11-11 2015-05-14 Sirna Therapeutics, Inc. Systemic delivery of myostatin short interfering nucleic acids (sina) conjugated to a lipophilic moiety
CN107001473B (zh) * 2014-11-19 2021-07-09 豪夫迈·罗氏有限公司 抗-运铁蛋白受体抗体及使用方法
EP3473270B1 (en) * 2016-06-20 2022-11-30 Genahead Bio, Inc. Antibody-drug conjugate
EP3516062A1 (en) * 2016-09-21 2019-07-31 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Myostatin irna compositions and methods of use thereof
AR110586A1 (es) * 2016-12-26 2019-04-10 Japan Chem Res Anticuerpo de receptor antitransferrina humana que penetra la barrera hematoencefálica
MA51103A (fr) * 2017-12-06 2020-10-14 Avidity Biosciences Inc Compositions et procédés de traitement de l'atrophie musculaire et de la dystrophie myotonique
KR20200116952A (ko) * 2018-02-05 2020-10-13 제이씨알 파마 가부시키가이샤 약제를 근육에 송달하기 위한 방법
EP3829635A4 (en) * 2018-08-02 2022-05-11 Dyne Therapeutics, Inc. MUSCLE TARGETING COMPLEXES AND THEIR USES FOR THE TREATMENT OF MUSCLE ATROPHY

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