JP2023509870A - Hbvの処置のためのhbvを標的とする治療用オリゴヌクレオチドとtlr7アゴニストとの医薬組合せ - Google Patents
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Abstract
本発明は、B型肝炎ウイルス感染症を処置するための組成物及び方法に関する。特に、本発明は、慢性B型肝炎患者の処置に使用するための、HBVを標的とする治療用オリゴヌクレオチドとTLR7アゴニストとを投与することを含む併用療法に関する。
Description
発明の分野
本発明は、B型肝炎ウイルス感染症を処置するための組成物及び方法に関する。特に、本発明は、慢性B型肝炎患者の処置に使用するための、HBVを標的とする治療用オリゴヌクレオチドとTLR7アゴニストとを投与することを含む併用療法に関する。
本発明は、B型肝炎ウイルス感染症を処置するための組成物及び方法に関する。特に、本発明は、慢性B型肝炎患者の処置に使用するための、HBVを標的とする治療用オリゴヌクレオチドとTLR7アゴニストとを投与することを含む併用療法に関する。
背景
HBV感染は、推定3億5000万人の慢性キャリアに関する世界的に大きな健康問題のままである。キャリアのおおよそ25%は、慢性肝炎、肝硬変、又は肝臓癌で死亡すると予測することができる。B型肝炎ウイルスは、タバコに次いで2番目に重要な発癌物質であり、全原発性肝臓癌の60%~80%を引き起こす。
HBV感染は、推定3億5000万人の慢性キャリアに関する世界的に大きな健康問題のままである。キャリアのおおよそ25%は、慢性肝炎、肝硬変、又は肝臓癌で死亡すると予測することができる。B型肝炎ウイルスは、タバコに次いで2番目に重要な発癌物質であり、全原発性肝臓癌の60%~80%を引き起こす。
HBVの外側エンベロープタンパク質は、B型肝炎表面抗原(HBsAg)として集合的に知られている。HBsAgは、重複するオープンリーディングフレーム(ORF)によってコードされるS、M、及びLと呼ばれる3つの関連するポリペプチドからなる。最小のエンベロープタンパク質は、S-ORFと呼ばれる226アミノ酸のSである。M及びLは上流の翻訳開始部位から産生され、それぞれ55及び108アミノ酸をSに付加する。HBVのS、M、及びLの糖タンパク質は、Dane粒子と呼ばれる無傷の感染性HBVビリオンのウイルスエンベロープに見られ、3つ全てが非常に過剰に産生及び分泌されて、慢性HBV患者の血液に見られる非感染性の亜ウイルス球状及び糸状粒子(両方ともデコイ粒子と呼ばれる)を形成する。デコイ粒子の表面上のHBsAgの存在量は、慢性HBV感染(CHB)患者の体液性免疫及び自発的クリアランスを阻害すると考えられている。
慢性HBV感染の現在の標準治療は、HBV DNA合成を阻害することによってHBV複製の抑制を提供するが、HBsAgなどのウイルス抗原には直接作用しない、エンテカビル又はテノホビルなどの経口ヌクレオシ(チ)ド類似体による処置である。ヌクレオシ(チ)ド類似体は、長期間の治療であっても、低レベルのHBsAgクリアランスしか示さない。この点において、慢性B型肝炎患者は、非常に弱いHBV T細胞応答を示し、抗HBs抗体を欠いており、これが、これらの患者がウイルスを除去することができない理由の1つであると考えられる。
臨床的に重要な目標は、HBsAgセロコンバージョン及び血清HBV-DNA除去として定義される慢性HBV感染の機能的治癒を達成することである。これにより、持続的な応答がもたらされ、それによって肝硬変及び肝臓癌の発症が予防され、生存期間が延長されると予想される。現在、慢性HBV感染は、感染肝細胞の核内の共有結合的に閉じた環状DNA(cccDNA)としてのウイルスゲノムの長期又は永続性のために完全に根絶することはできない。慢性HBV感染からの完全な治癒は、aa感染肝細胞からのこのcccDNAの除去を必要とするであろう。
総説論文Soriano et al 2017 Expert Opinion on Investigational Drugs Vol.26,pp 843は、HBVの機能的治癒又は完全治癒のいずれかを達成することを目的とした薬物開発の現状を記載している。この論文は、HBV療法において現在試験されている30を超える薬物のいくつかを強調しており、治癒をもたらす任意の有効な処置がおそらくウイルス標的化療法と免疫療法の組合せを必要とすることにも言及している。
toll様受容体TLR7は、ウイルス感染に対する自然免疫応答の成分であり、主に形質細胞様細胞及びB細胞上に発現される。そのような免疫細胞の変化した応答性は、慢性ウイルス感染中の自然免疫応答の減少に寄与し得る。したがって、TLR7のアゴニスト誘発活性化は、免疫療法を用いた慢性ウイルス感染症の処置のための可能なアプローチを表す。GS-9620を含むいくつかのTLRアゴニストが臨床試験で試験されている。代替的なTLR7アゴニストは、国際公開第2006/066080号、国際公開第2016/055553号及び国際公開第2016/91698号に記載されている。
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、標的核酸にハイブリダイズすることによって標的遺伝子の発現を調節することができる本質的に一本鎖オリゴヌクレオチドである。標的調節は、RNアーゼH媒介分解又は転写の遮断による下方制御であり得る。アンチセンスオリゴヌクレオチドはまた、例えばスプライススイッチング又はマイクロRNA抑制を介して標的を上方制御することができる。肝臓における標的について、GalNAcコンジュゲーションは、アンチセンスオリゴヌクレオチドを送達するために非常に有効であることが証明されている。国際公開第2014/179627号及び国際公開第2015/173208号は、GalNAcコンジュゲーションと組み合わせて一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチドを使用する肝細胞におけるHBV mRNAの分解によるHBV処置を記載している。TLR7アゴニストGS-9620を含む様々な併用療法が国際公開第2015/173208号に簡単に言及されている。
国際公開第2016/077321号は、センス鎖上のGalNAcコンジュゲーションと組み合わせて二本鎖siRNAを使用する肝細胞におけるHBV mRNAの分解によるHBV処置を記載している。TLR7アゴニストを含む様々な併用療法が簡単に言及される。
本発明者らの知る限りでは、治療用オリゴヌクレオチドとTLR7アゴニストとの特定の組合せは、インビトロ又はインビボで試験されていない。
発明の目的
本発明は、HBVを標的とする治療用オリゴヌクレオチド及びTLR7アゴニストの新規な組合せを特定し、これらは、長期の血清HBV-DNA減少及びHBsAgにおける遅延したリバウンドに関して一化合物処置を超える利点を提供する。さらに、単独処置で使用される薬物濃度と比較して、併用処置を使用する場合、3~5倍低い用量で有意に改善された効果を達成することができ、高用量での同じ組合せと比較した場合、3~5倍低い用量の併用処置で本質的に同じ効果を達成することができるので、併用処置で治療域の増加を達成することができる。
本発明は、HBVを標的とする治療用オリゴヌクレオチド及びTLR7アゴニストの新規な組合せを特定し、これらは、長期の血清HBV-DNA減少及びHBsAgにおける遅延したリバウンドに関して一化合物処置を超える利点を提供する。さらに、単独処置で使用される薬物濃度と比較して、併用処置を使用する場合、3~5倍低い用量で有意に改善された効果を達成することができ、高用量での同じ組合せと比較した場合、3~5倍低い用量の併用処置で本質的に同じ効果を達成することができるので、併用処置で治療域の増加を達成することができる。
発明の概要
本発明の一態様は、治療用オリゴヌクレオチドである第1の医療用化合物と、以下に定義される式(I)又は(II)のTLR7アゴニストである第2の医療用化合物とを含むか、又はこれらからなる医薬組合せである。本発明の好ましい実施形態は、RNAiオリゴヌクレオチドである第1の医療用化合物(好ましくはHBsAg mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドであり、該オリゴヌクレオチドは、19~30ヌクレオチド長のアンチセンス鎖を含み、該アンチセンス鎖は、ACAANAAUCCUCACAAUA(配列番号33)に示すHBsAg mRNAの配列に対して相補性の領域を含む)と、以下に定義される式(I)又は(II)のTLR7アゴニストである第2の医療用化合物とを含むか、又はそれからなる医薬組合せである。本発明の別の実施形態は、アンチセンスオリゴヌクレオチド、好ましくは、配列番号1の1530~1602位の連続配列に100%相補的な少なくとも12ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を有する13~22ヌクレオチド長のGalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドである第1の医療用化合物と、以下に定義される式(I)又は(II)のTLR7アゴニストである第2の医療用化合物とを含むか、又はそれらからなる医薬組合せである。
本発明の一態様は、治療用オリゴヌクレオチドである第1の医療用化合物と、以下に定義される式(I)又は(II)のTLR7アゴニストである第2の医療用化合物とを含むか、又はこれらからなる医薬組合せである。本発明の好ましい実施形態は、RNAiオリゴヌクレオチドである第1の医療用化合物(好ましくはHBsAg mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドであり、該オリゴヌクレオチドは、19~30ヌクレオチド長のアンチセンス鎖を含み、該アンチセンス鎖は、ACAANAAUCCUCACAAUA(配列番号33)に示すHBsAg mRNAの配列に対して相補性の領域を含む)と、以下に定義される式(I)又は(II)のTLR7アゴニストである第2の医療用化合物とを含むか、又はそれからなる医薬組合せである。本発明の別の実施形態は、アンチセンスオリゴヌクレオチド、好ましくは、配列番号1の1530~1602位の連続配列に100%相補的な少なくとも12ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を有する13~22ヌクレオチド長のGalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドである第1の医療用化合物と、以下に定義される式(I)又は(II)のTLR7アゴニストである第2の医療用化合物とを含むか、又はそれらからなる医薬組合せである。
式(I)及び(II):
式中、XはCH2又はSであり、
式(I)について、R1は-OH又は-Hであり、R2は1-ヒドロキシプロピル又はヒドロキシメチルであり、
式(II)について、R1は-OH又は-H又はアセトキシであり、R2は1-アセトキシプロピル又は1-ヒドロキシプロピル又は1-ヒドロキシメチル又はアセトキシ(シクロプロピル)メチル又はアセトキシ(プロピン-1-イル)メチルである、
又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマー。
式(I)について、R1は-OH又は-Hであり、R2は1-ヒドロキシプロピル又はヒドロキシメチルであり、
式(II)について、R1は-OH又は-H又はアセトキシであり、R2は1-アセトキシプロピル又は1-ヒドロキシプロピル又は1-ヒドロキシメチル又はアセトキシ(シクロプロピル)メチル又はアセトキシ(プロピン-1-イル)メチルである、
又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマー。
本発明の更なる態様は、HBV感染個体、特に慢性HBVを有する個体の処置に使用するための医薬組合せに関する。
本発明の更なる態様は、B型肝炎ウイルス感染症を処置するための第1の医薬の製造における治療用オリゴヌクレオチドの使用であり、第1の医薬は、本出願に記載の治療用オリゴヌクレオチドであり、第1の医薬は、第2の医薬と組み合わせて投与され、第2の医薬は、本出願に記載のTLR7アゴニストである。
一実施形態では、治療用オリゴヌクレオチド化合物(第1の医薬又は第1の医療用化合物)は皮下注射用に製剤化され、TLR7アゴニスト化合物(第2の医薬又は第2の医療用化合物)は経口投与用に製剤化される。医療用化合物は2つの異なる投与経路を介して投与されるので、それらは異なる投与計画に従うことができる。最適な組合せ効果のために、第1及び第2の医療用化合物は、1ヶ月未満の間隔、例えば1週間未満の間隔、例えば2日の間隔、例えば同日に投与される。
本発明の更なる態様は、第1の医療用化合物(第1の医薬)と、HBVの処置における第2の医療用化合物(第2の医薬)の投与のための説明がある添付文書とを含むキットオブパーツである。一実施形態では、キットオブパーツは、第1及び第2の医療用化合物の両方を含む。
本発明の更なる態様は、慢性感染個体などのB型肝炎ウイルスに感染した対象に、本出願に記載の治療有効量のTLR7アゴニスト(第2の医薬)と組み合わせて、本出願に記載の治療有効量の治療用オリゴヌクレオチド(第1の医薬)を投与することを含む、B型肝炎ウイルス感染症を処置するための方法である。
非常に好ましい実施形態では、本出願で言及される治療用オリゴヌクレオチドは、RNAiオリゴヌクレオチド、好ましくは低分子干渉RNA(siRNA)、好ましくはHBsAg mRNAの発現を減少させるためのRNAiオリゴヌクレオチド又はsiRNAである。異なる実施形態では、治療用オリゴヌクレオチドは、アンチセンスオリゴヌクレオチド、好ましくはGalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチド、好ましくはHBVを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はGalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドである。
定義
オリゴヌクレオチド
本明細書で用いられる「オリゴヌクレオチド」という用語は、2つ以上の共有結合したヌクレオシドを含む分子として当業者に一般に理解されるように定義される。このような共有結合したヌクレオシドはまた、核酸分子又はオリゴマーとも称されうる。オリゴヌクレオチドは、通常、固相化学合成と、その後の精製及び単離によって研究室内で作製される。オリゴヌクレオチドの配列に言及する場合には、共有結合したヌクレオチド又はヌクレオシドの核酸塩基部分の配列又は順序、若しくはその修飾が言及される。本発明のオリゴヌクレオチドは、人工のものであり、化学的に合成され、通常は精製又は単離される。本発明のオリゴヌクレオチドは、例えば2’糖修飾ヌクレオシド等の1種以上の修飾ヌクレオシド又はヌクレオチドを含んでもよい。
オリゴヌクレオチド
本明細書で用いられる「オリゴヌクレオチド」という用語は、2つ以上の共有結合したヌクレオシドを含む分子として当業者に一般に理解されるように定義される。このような共有結合したヌクレオシドはまた、核酸分子又はオリゴマーとも称されうる。オリゴヌクレオチドは、通常、固相化学合成と、その後の精製及び単離によって研究室内で作製される。オリゴヌクレオチドの配列に言及する場合には、共有結合したヌクレオチド又はヌクレオシドの核酸塩基部分の配列又は順序、若しくはその修飾が言及される。本発明のオリゴヌクレオチドは、人工のものであり、化学的に合成され、通常は精製又は単離される。本発明のオリゴヌクレオチドは、例えば2’糖修飾ヌクレオシド等の1種以上の修飾ヌクレオシド又はヌクレオチドを含んでもよい。
さらに、オリゴヌクレオチドは、例えば、100ヌクレオチド長未満の短い核酸である。オリゴヌクレオチドは、一本鎖又は二本鎖であってよい。オリゴヌクレオチドは、二重鎖領域を有していても有していなくてもよい。一連の非限定的な例として、オリゴヌクレオチドは、低分子干渉RNA(siRNA)、マイクロRNA(miRNA)、短鎖ヘアピンRNA(shRNA)、ダイサー基質干渉RNA(dsiRNA)、アンチセンスオリゴヌクレオチド、短鎖siRNA、又は一本鎖siRNAであり得るが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、二本鎖オリゴヌクレオチドは、RNAiオリゴヌクレオチドである。
合成
本明細書で使用される場合、「合成」という用語は、人工的に合成された(例えば、機械(例えば、固体核酸合成装置)を使用する)か、そうでなければ、分子を通常産生する天然源(例えば、細胞又は生物)に由来しない核酸又は他の分子を指す。
本明細書で使用される場合、「合成」という用語は、人工的に合成された(例えば、機械(例えば、固体核酸合成装置)を使用する)か、そうでなければ、分子を通常産生する天然源(例えば、細胞又は生物)に由来しない核酸又は他の分子を指す。
二本鎖オリゴヌクレオチド
本明細書で使用される場合、「二本鎖オリゴヌクレオチド」という用語は、実質的に二重鎖形態のオリゴヌクレオチドを指す。いくつかの実施形態において、二本鎖オリゴヌクレオチドの二重鎖領域の相補的な塩基対合は、共有結合的に分離した核酸鎖のヌクレオチドの逆平行配列の間に形成される。いくつかの実施形態において、二本鎖オリゴヌクレオチドの二重鎖領域の相補的な塩基対合は、共有結合している核酸鎖のヌクレオチドの逆平行配列の間に形成される。いくつかの実施形態において、二本鎖オリゴヌクレオチドの二重鎖領域の相補的な塩基対合は、一緒に塩基対合するヌクレオチドの相補的な逆平行配列を提供するために(例えば、ヘアピンを介して)折り畳まれる一本鎖核酸から形成される。いくつかの実施形態において、二本鎖オリゴヌクレオチドは、互いと完全に二重鎖化された2本の共有結合的に分離した核酸鎖を含む。しかしながら、いくつかの実施形態では、二本鎖オリゴヌクレオチドは、部分的に二重鎖化されている、例えば一端又は両端にオーバーハングを有する2本の共有結合的に分離した核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、二本鎖オリゴヌクレオチドは、部分的に相補的なヌクレオチドの逆平行配列を含み、したがって、内部ミスマッチ又は末端ミスマッチを含み得る1つ又は複数のミスマッチを有し得る。
本明細書で使用される場合、「二本鎖オリゴヌクレオチド」という用語は、実質的に二重鎖形態のオリゴヌクレオチドを指す。いくつかの実施形態において、二本鎖オリゴヌクレオチドの二重鎖領域の相補的な塩基対合は、共有結合的に分離した核酸鎖のヌクレオチドの逆平行配列の間に形成される。いくつかの実施形態において、二本鎖オリゴヌクレオチドの二重鎖領域の相補的な塩基対合は、共有結合している核酸鎖のヌクレオチドの逆平行配列の間に形成される。いくつかの実施形態において、二本鎖オリゴヌクレオチドの二重鎖領域の相補的な塩基対合は、一緒に塩基対合するヌクレオチドの相補的な逆平行配列を提供するために(例えば、ヘアピンを介して)折り畳まれる一本鎖核酸から形成される。いくつかの実施形態において、二本鎖オリゴヌクレオチドは、互いと完全に二重鎖化された2本の共有結合的に分離した核酸鎖を含む。しかしながら、いくつかの実施形態では、二本鎖オリゴヌクレオチドは、部分的に二重鎖化されている、例えば一端又は両端にオーバーハングを有する2本の共有結合的に分離した核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、二本鎖オリゴヌクレオチドは、部分的に相補的なヌクレオチドの逆平行配列を含み、したがって、内部ミスマッチ又は末端ミスマッチを含み得る1つ又は複数のミスマッチを有し得る。
鎖
本明細書で使用される「鎖」という用語は、ヌクレオチド間結合(例えば、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合)を介して互いに連結されたヌクレオチドの単一の連続した配列を指す。いくつかの実施形態において、鎖は、2つの自由端、例えば、5’末端及び3’末端を有する。
本明細書で使用される「鎖」という用語は、ヌクレオチド間結合(例えば、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合)を介して互いに連結されたヌクレオチドの単一の連続した配列を指す。いくつかの実施形態において、鎖は、2つの自由端、例えば、5’末端及び3’末端を有する。
二重鎖
本明細書で使用される場合、核酸(例えば、オリゴヌクレオチド)に関して「二重鎖」という用語は、2つの逆平行配列のヌクレオチドの相補的塩基対合によって形成される構造を指す。
本明細書で使用される場合、核酸(例えば、オリゴヌクレオチド)に関して「二重鎖」という用語は、2つの逆平行配列のヌクレオチドの相補的塩基対合によって形成される構造を指す。
オーバーハング
本明細書で使用される「オーバーハング」という用語は、一方の鎖又は領域が二重鎖を形成する相補鎖の末端を越えて延びる一方の鎖又は領域から生じる末端非塩基対合ヌクレオチド(複数可)を指す。いくつかの実施形態では、オーバーハングは、二本鎖オリゴヌクレオチドの5’末端又は3’末端の二重鎖領域から延びる1つ又は複数の不対ヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態では、オーバーハングは、二本鎖オリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖又はセンス鎖上の3’又は5’オーバーハングである。
本明細書で使用される「オーバーハング」という用語は、一方の鎖又は領域が二重鎖を形成する相補鎖の末端を越えて延びる一方の鎖又は領域から生じる末端非塩基対合ヌクレオチド(複数可)を指す。いくつかの実施形態では、オーバーハングは、二本鎖オリゴヌクレオチドの5’末端又は3’末端の二重鎖領域から延びる1つ又は複数の不対ヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態では、オーバーハングは、二本鎖オリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖又はセンス鎖上の3’又は5’オーバーハングである。
ループ
本明細書で使用される用語「ループ」は、適切なハイブリダイゼーション条件下(例えば、リン酸緩衝液中、細胞中)で、不対合領域に隣接する2つの逆平行領域がハイブリダイズして二重鎖(「ステム」と呼ばれる)を形成するように互いに十分相補的な核酸の2つの逆平行領域に隣接する核酸(例えば、オリゴヌクレオチド)の不対合領域を指す。
本明細書で使用される用語「ループ」は、適切なハイブリダイゼーション条件下(例えば、リン酸緩衝液中、細胞中)で、不対合領域に隣接する2つの逆平行領域がハイブリダイズして二重鎖(「ステム」と呼ばれる)を形成するように互いに十分相補的な核酸の2つの逆平行領域に隣接する核酸(例えば、オリゴヌクレオチド)の不対合領域を指す。
RNAiオリゴヌクレオチド
本明細書で使用される「RNAiオリゴヌクレオチド」という用語は、(a)センス鎖(パッセンジャー)及びアンチセンス鎖(ガイド)を有する二本鎖オリゴヌクレオチドであって、アンチセンス鎖又はその一部が、標的mRNAの切断においてアルゴノート2(Ago2)エンドヌクレアーゼによって使用される、二本鎖オリゴヌクレオチド、又は(b)一本鎖アンチセンス鎖を有する一本鎖オリゴヌクレオチドであって、そのアンチセンス鎖(又はその一部)が、標的mRNAの切断においてAgo2エンドヌクレアーゼによって使用される、一本鎖オリゴヌクレオチドのいずれかを指す。
本明細書で使用される「RNAiオリゴヌクレオチド」という用語は、(a)センス鎖(パッセンジャー)及びアンチセンス鎖(ガイド)を有する二本鎖オリゴヌクレオチドであって、アンチセンス鎖又はその一部が、標的mRNAの切断においてアルゴノート2(Ago2)エンドヌクレアーゼによって使用される、二本鎖オリゴヌクレオチド、又は(b)一本鎖アンチセンス鎖を有する一本鎖オリゴヌクレオチドであって、そのアンチセンス鎖(又はその一部)が、標的mRNAの切断においてAgo2エンドヌクレアーゼによって使用される、一本鎖オリゴヌクレオチドのいずれかを指す。
RNAi剤
本明細書で同じ意味で用いられる、用語「iRNA」、「RNAi剤」、「iRNA剤」、及び「RNA干渉剤」は、本明細書におけるRNAヌクレオシドを含有し、RNAが誘導するサイレンシング複合体(RISC)経路により、RNA転写産物の標的開裂を媒介する、作用物質、例えばRNAiオリゴヌクレオチドを意味する。iRNAは、RNA干渉(RNAi)として知られるプロセスを通して、mRNAの配列特異的分解を指令する。iRNAは、細胞、例えば、哺乳動物対象などの対象内の細胞における、標的核酸発現を調節する、例えば阻害する。RNAi剤は、一本鎖RNAi剤及び二本鎖siRNA、並びに短鎖ヘアピンRNA(shRNA)を含む。本発明のオリゴヌクレオチド、又はその連続ヌクレオチド配列は、RNAi剤の形態であることができる、又は、siRNA若しくはshRNAなどのRNAi剤の一部を形成することができる。本発明のいくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチド、又はその連続ヌクレオチド配列は、siRNAなどのRNAi剤である。
本明細書で同じ意味で用いられる、用語「iRNA」、「RNAi剤」、「iRNA剤」、及び「RNA干渉剤」は、本明細書におけるRNAヌクレオシドを含有し、RNAが誘導するサイレンシング複合体(RISC)経路により、RNA転写産物の標的開裂を媒介する、作用物質、例えばRNAiオリゴヌクレオチドを意味する。iRNAは、RNA干渉(RNAi)として知られるプロセスを通して、mRNAの配列特異的分解を指令する。iRNAは、細胞、例えば、哺乳動物対象などの対象内の細胞における、標的核酸発現を調節する、例えば阻害する。RNAi剤は、一本鎖RNAi剤及び二本鎖siRNA、並びに短鎖ヘアピンRNA(shRNA)を含む。本発明のオリゴヌクレオチド、又はその連続ヌクレオチド配列は、RNAi剤の形態であることができる、又は、siRNA若しくはshRNAなどのRNAi剤の一部を形成することができる。本発明のいくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチド、又はその連続ヌクレオチド配列は、siRNAなどのRNAi剤である。
siRNA
用語「siRNA」は、小型の干渉性リボ核酸RNAi剤を意味し、二本鎖RNA分子の一種であり、当該技術分野においては、短鎖干渉RNA又はサイレンシングRNAとしても知られている。siRNAは典型的には、(パッセンジャー鎖とも呼ばれる)センス鎖、及び(ガイド鎖とも呼ばれる)アンチセンス鎖を含み、各鎖は17~30ヌクレオチド長、典型的には19~25ヌクレオシド長であり、アンチセンス鎖は、標的核酸(好適には成熟mRNA配列)に、完全に相補性であるといった、相補性であり、センス鎖はアンチセンス鎖に相補性であるために、センス鎖とアンチセンス鎖は二重鎖又は二重鎖領域を形成する。siRNA鎖は、平滑末端二重鎖を形成することができ、又は有利には、センス鎖及びアンチセンス鎖の3’末端は、例えば1、2、又は3個のヌクレオシドの3’オーバーハングを形成することができる。いくつかの実施形態では、センス鎖及びアンチセンス鎖の両方は、2nt3’オーバーハングを有する。したがって、二重鎖領域は、例えば17~25ヌクレオチド長、例えば21~23ヌクレオチド長であり得る。
用語「siRNA」は、小型の干渉性リボ核酸RNAi剤を意味し、二本鎖RNA分子の一種であり、当該技術分野においては、短鎖干渉RNA又はサイレンシングRNAとしても知られている。siRNAは典型的には、(パッセンジャー鎖とも呼ばれる)センス鎖、及び(ガイド鎖とも呼ばれる)アンチセンス鎖を含み、各鎖は17~30ヌクレオチド長、典型的には19~25ヌクレオシド長であり、アンチセンス鎖は、標的核酸(好適には成熟mRNA配列)に、完全に相補性であるといった、相補性であり、センス鎖はアンチセンス鎖に相補性であるために、センス鎖とアンチセンス鎖は二重鎖又は二重鎖領域を形成する。siRNA鎖は、平滑末端二重鎖を形成することができ、又は有利には、センス鎖及びアンチセンス鎖の3’末端は、例えば1、2、又は3個のヌクレオシドの3’オーバーハングを形成することができる。いくつかの実施形態では、センス鎖及びアンチセンス鎖の両方は、2nt3’オーバーハングを有する。したがって、二重鎖領域は、例えば17~25ヌクレオチド長、例えば21~23ヌクレオチド長であり得る。
一旦細胞内に入ると、アンチセンス鎖は、標的核酸の標的分解又は標的阻害を媒介するRISC複合体に組み込まれる。siRNAは、典型的には、RNAヌクレオシドに加えて修飾ヌクレオシドを含むか、又はいくつかの実施形態では、siRNA鎖のヌクレオチドの全てが修飾され得る(LNA(例えば、国際公開第2004083430号、国際公開第2007085485号を参照)、2’-フルオロ、2’-O-メチル又は2’-O-メトキシエチルなどのセンス2’糖修飾ヌクレオシドがsiRNAに組み込まれてもよい)。いくつかの実施形態では、siRNAのパッセンジャー鎖は不連続であることができる(例えば、国際公開第2007107162号を参照のこと)。siRNAのアンチセンス鎖のシード領域にて生じる、熱不安定化ヌクレオチドの組み込みが、siRNAのオフターゲット活性の低減に有用であると、報告されている(例えば、国際公開第18098328号を参照)。
いくつかの実施形態では、本発明のsiRNAなどの、dsRNA剤は、少なくとも1つの修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、センス鎖のヌクレオチドの実質的に全てが修飾を含む;アンチセンス鎖のヌクレオチドの実質的に全てが修飾を含む、又は、センス鎖のヌクレオチドの実質的に全て、及び、アンチセンス鎖のヌクレオチドの実質的に全てが修飾を含む。さらに別の実施形態では、センス鎖のヌクレオチドの全てが修飾を含む;アンチセンス鎖のヌクレオチドの全てが修飾を含む;又は、センス鎖のヌクレオチドの全て、及び、アンチセンス鎖のヌクレオチドの全てが修飾を含む。
いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは、デオキシ-ヌクレオチド、3’末端デオキシ-チミン(dT)ヌクレオチド、2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、2’-デオキシ修飾ヌクレオチド、ロックド・ヌクレオチド、アンロックド・ヌクレオチド、配座制限ヌクレオチド、拘束(constrained)エチルヌクレオチド、無塩基ヌクレオチド、2’-アミノ修飾ヌクレオチド、2’-O-アリル修飾ヌクレオチド、2’-C-アルキル修飾ヌクレオチド、2’-ヒドロキシル修飾ヌクレオチド、2’-メトキシエチル修飾ヌクレオチド、2’-O-アルキル修飾ヌクレオチド、モルホリノヌクレオチド、
ホスホロアミデート、非天然塩基含有ヌクレオチド、非結合ヌクレオチド、テトラヒドロピラン修飾ヌクレオチド、1,5-無水ヘキシトール修飾ヌクレオチド、シクロヘキセニル修飾ヌクレオチド、ホスホロチオエート基含有ヌクレオチド、メチルホスホネート基含有ヌクレオチド、5’-ホスホネート含有ヌクレオチド、5’-ホスフェート模倣物含有ヌクレオチド、グリコール変性ヌクレオチド、及び2-O-(N-メチルアセトアミド)修飾ヌクレオチド、並びにこれらの組合せからなる群から独立して選択されることができる。好適には、siRNAは、アンチセンス鎖の5’末端に5’リン酸基又は5’リン酸模倣物を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖の5’末端は、RNAヌクレオシドである。
ホスホロアミデート、非天然塩基含有ヌクレオチド、非結合ヌクレオチド、テトラヒドロピラン修飾ヌクレオチド、1,5-無水ヘキシトール修飾ヌクレオチド、シクロヘキセニル修飾ヌクレオチド、ホスホロチオエート基含有ヌクレオチド、メチルホスホネート基含有ヌクレオチド、5’-ホスホネート含有ヌクレオチド、5’-ホスフェート模倣物含有ヌクレオチド、グリコール変性ヌクレオチド、及び2-O-(N-メチルアセトアミド)修飾ヌクレオチド、並びにこれらの組合せからなる群から独立して選択されることができる。好適には、siRNAは、アンチセンス鎖の5’末端に5’リン酸基又は5’リン酸模倣物を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖の5’末端は、RNAヌクレオシドである。
一実施形態では、dsRNA剤は、少なくとも1つのホスホロチオエート又はメチルホスホネートヌクレオチド間結合をさらに含む。ホスホロチオエート若しくはメチルホスホネートのヌクレオチド間結合は一方若しくは両方の鎖の3’末端にあり得る(例えば、アンチセンス鎖又はセンス鎖)か、又はホスホロチオエート若しくはメチルホスホネートのヌクレオシド間結合は一方若しくは両方の鎖の5’末端にあり得る(例えば、アンチセンス鎖又はセンス鎖)か、又はホスホロチオエート若しくはメチルホスホネートのヌクレオシド間結合は一方又は両方の鎖の5’末端及び3’末端の両方にあり得る(例えば、アンチセンス鎖又はセンス鎖)。いくつかの実施形態では、残りのヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合である。
dsRNA剤はリガンドをさらに含むことができる。いくつかの実施形態では、リガンドは、センス鎖の3’末端に結合する。生物学的分布については、siRNAを標的リガンドに結合させるか、及び/又は例えば、脂質ナノ粒子に製剤化することができる。
本発明の他の態様は、治療的使用に適したsiRNA分子といったこれらのdsRNAを含む医薬組成物と、例えば本明細書に開示されている種々の疾患状態の処置のために、本発明のsiRNAといったdsRNA分子を投与することによって標的遺伝子の発現を阻害する方法と、に関する。
テトラループ
本明細書で使用される場合、「テトラループ」という用語は、ヌクレオチドの隣接配列のハイブリダイゼーションによって形成される隣接二重鎖の安定性を増加させるループを指す。安定性の増加は、ランダムに選択されたヌクレオチドの配列からなる同等の長さのループのセットから平均して予想される隣接ステム二重鎖のTmよりも高い隣接ステム二重鎖の融解温度(Tm)の増加として検出可能である。例えば、テトラループは、10mMのNaHPO4中、少なくとも50℃、少なくとも55℃、少なくとも56℃、少なくとも58℃、少なくとも60℃、少なくとも65℃又は少なくとも75℃の融解温度を、長さが少なくとも2塩基対の二重鎖を含むヘアピンに与えることができる。いくつかの実施形態では、テトラループは、スタッキング相互作用によって隣接するステム二重鎖の塩基対を安定化し得る。さらに、テトラループ中のヌクレオチド間の相互作用には、非ワトソン・クリック塩基対合、スタッキング相互作用、水素結合及び接触相互作用(Cheong et al.,Nature 1990 Aug.16;346(6285):680-2;Heus and Pardi,Science 1991 Jul.12;253(5016):191-4)が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、テトラループは4~5個のヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態では、テトラループは、修飾されていてもされていなくてもよい(例えば、標的化部分にコンジュゲートされていてもされていなくてもよい)、3、4、5、又は6個のヌクレオチドを含むか、又はそれらからなる。一実施形態では、テトラループは4つのヌクレオチドからなる。任意のヌクレオチドをテトラループに使用してもよく、Cornish-Bowden(1985)Nucl.Acids Res.13:3021-3030に記載されるように、そのようなヌクレオチドの標準IUPAC-IUB記号を使用してもよい。例えば、文字「N」は、任意の塩基がその位置にあり得ることを示すために使用され得、文字「R」は、A(アデニン)又はG(グアニン)がその位置にあり得ることを示すために使用され得、「B」は、C(シトシン)、G(グアニン)又はT(チミン)がその位置にあり得ることを示すために使用され得る。テトラループの例には、テトラループのUNCGファミリー(例えば、UUCG)、テトラループのGNRAファミリー(例えば、GAAA)、及びCUUGテトラループ(Woese et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1990 November;87(21):8467-71;Antao et al.,Nucleic Acids Res.1991 Nov.11;19(21):5901-5)が含まれる。DNAテトラループの例には、テトラループのd(GNNA)ファミリー(例えば、d(GTTA))、テトラループのd(GNRA)ファミリー、テトラループのd(GNAB)ファミリー、テトラループのd(CNNG)ファミリー、及びテトラループのd(TNCG)ファミリー(例えば、d(TTCG))が含まれる。例えば、Nakano et al.Biochemistry,41(48),14281-14292,2002.SHINJI et al.Nippon Kagakkai Koen Yokoshu VOL.78th;NO.2;PAGE.731(2000)を参照のこと。これらの文献は関連する開示に関して本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、テトラループは、ニックが入ったテトラループ構造内に含まれる。
本明細書で使用される場合、「テトラループ」という用語は、ヌクレオチドの隣接配列のハイブリダイゼーションによって形成される隣接二重鎖の安定性を増加させるループを指す。安定性の増加は、ランダムに選択されたヌクレオチドの配列からなる同等の長さのループのセットから平均して予想される隣接ステム二重鎖のTmよりも高い隣接ステム二重鎖の融解温度(Tm)の増加として検出可能である。例えば、テトラループは、10mMのNaHPO4中、少なくとも50℃、少なくとも55℃、少なくとも56℃、少なくとも58℃、少なくとも60℃、少なくとも65℃又は少なくとも75℃の融解温度を、長さが少なくとも2塩基対の二重鎖を含むヘアピンに与えることができる。いくつかの実施形態では、テトラループは、スタッキング相互作用によって隣接するステム二重鎖の塩基対を安定化し得る。さらに、テトラループ中のヌクレオチド間の相互作用には、非ワトソン・クリック塩基対合、スタッキング相互作用、水素結合及び接触相互作用(Cheong et al.,Nature 1990 Aug.16;346(6285):680-2;Heus and Pardi,Science 1991 Jul.12;253(5016):191-4)が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、テトラループは4~5個のヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態では、テトラループは、修飾されていてもされていなくてもよい(例えば、標的化部分にコンジュゲートされていてもされていなくてもよい)、3、4、5、又は6個のヌクレオチドを含むか、又はそれらからなる。一実施形態では、テトラループは4つのヌクレオチドからなる。任意のヌクレオチドをテトラループに使用してもよく、Cornish-Bowden(1985)Nucl.Acids Res.13:3021-3030に記載されるように、そのようなヌクレオチドの標準IUPAC-IUB記号を使用してもよい。例えば、文字「N」は、任意の塩基がその位置にあり得ることを示すために使用され得、文字「R」は、A(アデニン)又はG(グアニン)がその位置にあり得ることを示すために使用され得、「B」は、C(シトシン)、G(グアニン)又はT(チミン)がその位置にあり得ることを示すために使用され得る。テトラループの例には、テトラループのUNCGファミリー(例えば、UUCG)、テトラループのGNRAファミリー(例えば、GAAA)、及びCUUGテトラループ(Woese et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1990 November;87(21):8467-71;Antao et al.,Nucleic Acids Res.1991 Nov.11;19(21):5901-5)が含まれる。DNAテトラループの例には、テトラループのd(GNNA)ファミリー(例えば、d(GTTA))、テトラループのd(GNRA)ファミリー、テトラループのd(GNAB)ファミリー、テトラループのd(CNNG)ファミリー、及びテトラループのd(TNCG)ファミリー(例えば、d(TTCG))が含まれる。例えば、Nakano et al.Biochemistry,41(48),14281-14292,2002.SHINJI et al.Nippon Kagakkai Koen Yokoshu VOL.78th;NO.2;PAGE.731(2000)を参照のこと。これらの文献は関連する開示に関して本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、テトラループは、ニックが入ったテトラループ構造内に含まれる。
ニックが入ったテトラループ構造
「ニックが入ったテトラループ構造」は、別個のセンス(パッセンジャー)鎖及びアンチセンス(ガイド)鎖の存在を特徴とするRNAiオリゴヌクレオチドの構造であり、センス鎖はアンチセンス鎖と相補性の領域を有し、鎖の少なくとも1つ、一般にセンス鎖は、少なくとも1つの鎖内に形成された隣接するステム領域を安定化するように構成されたテトラループを有する。
「ニックが入ったテトラループ構造」は、別個のセンス(パッセンジャー)鎖及びアンチセンス(ガイド)鎖の存在を特徴とするRNAiオリゴヌクレオチドの構造であり、センス鎖はアンチセンス鎖と相補性の領域を有し、鎖の少なくとも1つ、一般にセンス鎖は、少なくとも1つの鎖内に形成された隣接するステム領域を安定化するように構成されたテトラループを有する。
アンチセンスオリゴヌクレオチド
本明細書で用いられる「アンチセンスオリゴヌクレオチド」という用語は、標的核酸、特に標的核酸上の連続配列にハイブリダイズすることによって標的遺伝子の発現を調節することができるオリゴヌクレオチドとして定義される。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、本質的に二本鎖ではなく、したがってsiRNA又はshRNAではない。好ましくは、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは一本鎖である。本発明の単鎖オリゴヌクレオチドは、自己内又は自己間の相補性の程度がオリゴヌクレオチドの全長にわたって50%未満である限り、ヘアピン又は分子間二重構造(同じオリゴヌクレオチドの2つの分子間の二重鎖)を形成することができるものと理解される。
本明細書で用いられる「アンチセンスオリゴヌクレオチド」という用語は、標的核酸、特に標的核酸上の連続配列にハイブリダイズすることによって標的遺伝子の発現を調節することができるオリゴヌクレオチドとして定義される。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、本質的に二本鎖ではなく、したがってsiRNA又はshRNAではない。好ましくは、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは一本鎖である。本発明の単鎖オリゴヌクレオチドは、自己内又は自己間の相補性の程度がオリゴヌクレオチドの全長にわたって50%未満である限り、ヘアピン又は分子間二重構造(同じオリゴヌクレオチドの2つの分子間の二重鎖)を形成することができるものと理解される。
有利には、本発明の一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ヌクレアーゼ耐性を低下させるためRNAヌクレオシドを含まない。
有利には、本発明のオリゴヌクレオチドは、例えば2’糖修飾ヌクレオシドなどの1つ以上の修飾ヌクレオシド又はヌクレオチドを含む。さらに、修飾されていないヌクレオシドがDNAヌクレオシドであることは有利である。
連続ヌクレオチド配列
「連続ヌクレオチド配列」という用語は、標的核酸に相補的なオリゴヌクレオチドの領域を指す。この用語は、本明細書で「連続核酸塩基配列」という用語及び「オリゴヌクレオチドモチーフ配列」という用語と互換的に用いられる。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの全てのヌクレオチドが連続ヌクレオチド配列を構成する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、連続ヌクレオチド配列、例えばF-G-F’ギャップマー領域を含み、任意に、更なるヌクレオチド(複数可)、例えば、官能基を連続ヌクレオチド配列に結合するのに使用され得るヌクレオチドリンカー領域を含んでもよい。ヌクレオチドリンカー領域は、標的核酸に相補的であっても相補的でなくてもよい。オリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列は、それ自体としてオリゴヌクレオチドより長くなることはできないことと、オリゴヌクレオチドは連続ヌクレオチド配列より短くなることはできないことと、が理解される。
「連続ヌクレオチド配列」という用語は、標的核酸に相補的なオリゴヌクレオチドの領域を指す。この用語は、本明細書で「連続核酸塩基配列」という用語及び「オリゴヌクレオチドモチーフ配列」という用語と互換的に用いられる。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの全てのヌクレオチドが連続ヌクレオチド配列を構成する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、連続ヌクレオチド配列、例えばF-G-F’ギャップマー領域を含み、任意に、更なるヌクレオチド(複数可)、例えば、官能基を連続ヌクレオチド配列に結合するのに使用され得るヌクレオチドリンカー領域を含んでもよい。ヌクレオチドリンカー領域は、標的核酸に相補的であっても相補的でなくてもよい。オリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列は、それ自体としてオリゴヌクレオチドより長くなることはできないことと、オリゴヌクレオチドは連続ヌクレオチド配列より短くなることはできないことと、が理解される。
ヌクレオチド
ヌクレオチドは、オリゴヌクレオチド及びポリヌクレオチドの構成要素であり、本発明の目的では、天然に存在するヌクレオチド及び天然に存在しないヌクレオチドの両方を含む。本来、DNAヌクレオチド及びRNAヌクレオチドなどのヌクレオチドは、リボース糖部分、核酸塩基部分、及び1つ以上のリン酸基(ヌクレオシドには存在しない)を含む。ヌクレオシド及びヌクレオチドはまた、互換的に「単位」又は「モノマー」と呼ぶことができる。
ヌクレオチドは、オリゴヌクレオチド及びポリヌクレオチドの構成要素であり、本発明の目的では、天然に存在するヌクレオチド及び天然に存在しないヌクレオチドの両方を含む。本来、DNAヌクレオチド及びRNAヌクレオチドなどのヌクレオチドは、リボース糖部分、核酸塩基部分、及び1つ以上のリン酸基(ヌクレオシドには存在しない)を含む。ヌクレオシド及びヌクレオチドはまた、互換的に「単位」又は「モノマー」と呼ぶことができる。
デオキシリボヌクレオチド
本明細書で使用される「デオキシリボヌクレオチド」という用語は、リボヌクレオチドと比較して、そのペントース糖の2’位にヒドロキシルの代わりに水素を有するヌクレオチドを指す。修飾デオキシリボヌクレオチドは、糖、リン酸基又は塩基の修飾又は置換を含む、2’位以外の原子の1つ又は複数の修飾又は置換を有するデオキシリボヌクレオチドである。
本明細書で使用される「デオキシリボヌクレオチド」という用語は、リボヌクレオチドと比較して、そのペントース糖の2’位にヒドロキシルの代わりに水素を有するヌクレオチドを指す。修飾デオキシリボヌクレオチドは、糖、リン酸基又は塩基の修飾又は置換を含む、2’位以外の原子の1つ又は複数の修飾又は置換を有するデオキシリボヌクレオチドである。
リボヌクレオチド
本明細書中で使用される用語「リボヌクレオチド」は、そのペントース糖としてリボースを有し、その2’位にヒドロキシル基を含有するヌクレオチドのことを指す。修飾リボヌクレオチドは、リボース、リン酸基又は塩基の修飾又は置換を含む、2’位以外の原子の1つ又は複数の修飾又は置換を有するリボヌクレオチドである。
本明細書中で使用される用語「リボヌクレオチド」は、そのペントース糖としてリボースを有し、その2’位にヒドロキシル基を含有するヌクレオチドのことを指す。修飾リボヌクレオチドは、リボース、リン酸基又は塩基の修飾又は置換を含む、2’位以外の原子の1つ又は複数の修飾又は置換を有するリボヌクレオチドである。
修飾ヌクレオシド
本明細書で用いられる「修飾ヌクレオシド」又は「ヌクレオシド修飾」という用語は、糖部分又は(核酸)塩基部分の1つ以上の修飾の導入によって、同等のDNA又はRNAヌクレオシドと比較して修飾されたヌクレオシドを指す。好ましい実施形態では、修飾ヌクレオシドは、修飾された糖部分を含む。修飾ヌクレオシドという用語はまた、「ヌクレオシド類似体」又は修飾「ユニット」又は修飾「モノマー」という用語と互換的に使用されてもよい。非修飾DNA又はRNA糖部分を有するヌクレオシドは、本明細書ではDNA又はRNAヌクレオシドと称される。DNA又はRNAヌクレオシドの塩基領域に修飾を有するヌクレオシドは、それらがワトソン・クリック塩基対合可能な場合には、依然として一般的にDNA又はRNAと称される。
本明細書で用いられる「修飾ヌクレオシド」又は「ヌクレオシド修飾」という用語は、糖部分又は(核酸)塩基部分の1つ以上の修飾の導入によって、同等のDNA又はRNAヌクレオシドと比較して修飾されたヌクレオシドを指す。好ましい実施形態では、修飾ヌクレオシドは、修飾された糖部分を含む。修飾ヌクレオシドという用語はまた、「ヌクレオシド類似体」又は修飾「ユニット」又は修飾「モノマー」という用語と互換的に使用されてもよい。非修飾DNA又はRNA糖部分を有するヌクレオシドは、本明細書ではDNA又はRNAヌクレオシドと称される。DNA又はRNAヌクレオシドの塩基領域に修飾を有するヌクレオシドは、それらがワトソン・クリック塩基対合可能な場合には、依然として一般的にDNA又はRNAと称される。
修飾ヌクレオチド
本明細書で使用される「修飾ヌクレオチド」という用語は、アデニンリボヌクレオチド、グアニンリボヌクレオチド、シトシンリボヌクレオチド、ウラシルリボヌクレオチド、アデニンデオキシリボヌクレオチド、グアニンデオキシリボヌクレオチド、シトシンデオキシリボヌクレオチド及びチミジンデオキシリボヌクレオチドから選択される対応する参照ヌクレオチドと比較して1つ又は複数の化学修飾を有するヌクレオチドを指す。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは、天然に存在しないヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは、その糖、核酸塩基及び/又はリン酸基に1つ又は複数の化学修飾を有する。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは、対応する参照ヌクレオチドにコンジュゲートされた1つ又は複数の化学部分を有する。典型的には、修飾ヌクレオチドは、修飾ヌクレオチドが存在する核酸に1つ又は複数の望ましい特性を付与する。例えば、修飾ヌクレオチドは、熱安定性、分解に対する耐性、ヌクレアーゼ耐性、溶解性、バイオアベイラビリティ、生物活性、免疫原性の低下などを改善し得る。
本明細書で使用される「修飾ヌクレオチド」という用語は、アデニンリボヌクレオチド、グアニンリボヌクレオチド、シトシンリボヌクレオチド、ウラシルリボヌクレオチド、アデニンデオキシリボヌクレオチド、グアニンデオキシリボヌクレオチド、シトシンデオキシリボヌクレオチド及びチミジンデオキシリボヌクレオチドから選択される対応する参照ヌクレオチドと比較して1つ又は複数の化学修飾を有するヌクレオチドを指す。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは、天然に存在しないヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは、その糖、核酸塩基及び/又はリン酸基に1つ又は複数の化学修飾を有する。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは、対応する参照ヌクレオチドにコンジュゲートされた1つ又は複数の化学部分を有する。典型的には、修飾ヌクレオチドは、修飾ヌクレオチドが存在する核酸に1つ又は複数の望ましい特性を付与する。例えば、修飾ヌクレオチドは、熱安定性、分解に対する耐性、ヌクレアーゼ耐性、溶解性、バイオアベイラビリティ、生物活性、免疫原性の低下などを改善し得る。
修飾ヌクレオシド間結合
「修飾ヌクレオシド間結合」という用語は、2つのヌクレオシドを共に共有結合する、ホスホジエステル(PO)結合以外の結合として当業者に一般的に理解されるように定義される。したがって、本発明のオリゴヌクレオチドは、修飾ヌクレオシド間結合を含み得る。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合と比較して、オリゴヌクレオチドのヌクレアーゼ耐性を増大させる。天然に存在するオリゴヌクレオチドでは、ヌクレオシド間結合は、隣接するヌクレオシド間のホスホジエステル結合を生成するリン酸基を含む修飾ヌクレオシド間結合は、インビボ使用のためのオリゴヌクレオチドの安定化に特に有用であり、本発明のオリゴヌクレオチドのDNA又はRNAヌクレオシドの領域、例えばギャップマーオリゴヌクレオチドのギャップ領域G内、並びに領域F及びF’などの修飾ヌクレオシドの領域におけるヌクレアーゼ切断から保護する役割を果たし得る。
「修飾ヌクレオシド間結合」という用語は、2つのヌクレオシドを共に共有結合する、ホスホジエステル(PO)結合以外の結合として当業者に一般的に理解されるように定義される。したがって、本発明のオリゴヌクレオチドは、修飾ヌクレオシド間結合を含み得る。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合と比較して、オリゴヌクレオチドのヌクレアーゼ耐性を増大させる。天然に存在するオリゴヌクレオチドでは、ヌクレオシド間結合は、隣接するヌクレオシド間のホスホジエステル結合を生成するリン酸基を含む修飾ヌクレオシド間結合は、インビボ使用のためのオリゴヌクレオチドの安定化に特に有用であり、本発明のオリゴヌクレオチドのDNA又はRNAヌクレオシドの領域、例えばギャップマーオリゴヌクレオチドのギャップ領域G内、並びに領域F及びF’などの修飾ヌクレオシドの領域におけるヌクレアーゼ切断から保護する役割を果たし得る。
一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、1つ以上の修飾ヌクレオシド間結合が、例えばヌクレアーゼ攻撃に対してより耐性であるように、天然のホスホジエステルから修飾された1つ以上のヌクレオシド間結合を含む。ヌクレアーゼ耐性は、オリゴヌクレオチドを血清中でインキュベートすることによって、又はヌクレアーゼ耐性アッセイ(例えば、ヘビ毒ホスホジエステラーゼ(SVPD))を使用することによって決定することができ、これらの両方は当該技術分野でよく知られている。オリゴヌクレオチドのヌクレアーゼ耐性を増強することができるヌクレオシド間結合は、ヌクレアーゼ耐性ヌクレオシド間結合と呼ばれる。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド又はその連続ヌクレオチド配列の少なくとも50%のヌクレオシド間結合が修飾されており、例えばオリゴヌクレオチド又はその連続ヌクレオチド配列の、少なくとも60%、例えば少なくとも70%、例えば少なくとも75%、例えば少なくとも80%、又は例えば少なくとも90%のヌクレオシド間結合が、修飾されている。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド又はその連続ヌクレオチド配列のヌクレオシド間結合の全てが修飾されている。いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドを非ヌクレオチド官能基、例えばコンジュゲートに結合するヌクレオシドは、ホスホジエステルであり得ることが認識されるであろう。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド又はその連続ヌクレオチド配列のヌクレオシド間結合は全て、ヌクレアーゼ耐性ヌクレオシド間結合である。
本発明のオリゴヌクレオチドでは、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を用いることが有利である。
ホスホロチオエートヌクレオシド間結合は、ヌクレアーゼ耐性、有益な薬物動態、及び製造の容易さに起因して、特に有用である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド又はその連続ヌクレオチド配列の少なくとも50%のヌクレオシド間結合がホスホロチオエートであり、オリゴヌクレオチド又はその連続ヌクレオチド配列の少なくとも60%、例えば少なくとも70%、例えば少なくとも75%、例えば少なくとも80%又は例えば少なくとも90%のヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートである。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド又はその連続ヌクレオチド配列のヌクレオシド間結合の全てが、ホスホロチオアートである。
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、ホスホロジチオエート結合(複数可)に加えて、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合と、2、3、又は4ホスホジエステル結合などの少なくとも1つのホスホジエステル結合との両方を含む。ギャップマーオリゴヌクレオチドでは、ホスホジエステル結合は、存在する場合には、ギャップ領域G内の連続DNAヌクレオシド間に適切に位置していない。
ホスホロチオエート結合などのヌクレアーゼ耐性結合は、標的核酸と二重鎖を形成するときにヌクレアーゼを動員することができるオリゴヌクレオチド領域、例えばギャップマーの領域Gにおいて特に有用である。しかしながら、ホスホロチオエート結合は、非ヌクレアーゼ動員領域及び/又は親和性増強領域、例えばギャップマーの領域F及びF’においても有用でありうる。ギャップマーオリゴヌクレオチドは、いくつかの実施形態では、領域F若しくはF’、又は領域F及びF’の両方に1つ以上のホスホジエステル結合を含んでもよく、領域Gのヌクレオシド間結合の全てはホスホロチオエートであり得る。
有利には、オリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列の全てのヌクレオシド間結合がホスホロチオエートであるか、又はオリゴヌクレオチドの全てのヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合である。特に、アンチセンスオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列の全てのヌクレオシド間結合がホスホロチオエートであるか、又はアンチセンスオリゴヌクレオチドの全てのヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合である。
欧州特許第2742135号に開示されているように、治療用オリゴヌクレオチドは、他のヌクレオシド間結合(ホスホジエステル及びホスホロチオエート以外の)、例えばアルキルホスホネート/メチルホスホネートヌクレオシド間結合を含んでもよいことが認識され、これは欧州特許第2742135号によれば、例えば別のDNAホスホロチオエートのギャップ領域内で耐性であり得る。
核酸塩基
核酸塩基という用語は、ヌクレオシド及びヌクレオチドに存在するプリン(例えばアデニン及びグアニン)及びピリミジン(例えばウラシル、チミン及びシトシン)部分を含み、これらは核酸ハイブリダイゼーションにおいて水素結合を形成する。本発明の文脈において、核酸塩基という用語はまた、天然に存在する核酸塩基とは異なっていてもよいが、核酸ハイブリダイゼーション中に機能する修飾核酸塩基も包含する。この文脈において、「核酸塩基」とは、アデニン、グアニン、シトシン、チミジン、ウラシル、キサンチン、及びヒポキサンチンなどの天然に存在する核酸塩基と、天然に存在しないバリアントとの両方を指す。このようなバリアントは、例えば、Hirao et al(2012)Accounts of Chemical Research vol 45 page 2055及びBergstrom(2009)Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry Suppl.37 1.4.1に記載されている。
核酸塩基という用語は、ヌクレオシド及びヌクレオチドに存在するプリン(例えばアデニン及びグアニン)及びピリミジン(例えばウラシル、チミン及びシトシン)部分を含み、これらは核酸ハイブリダイゼーションにおいて水素結合を形成する。本発明の文脈において、核酸塩基という用語はまた、天然に存在する核酸塩基とは異なっていてもよいが、核酸ハイブリダイゼーション中に機能する修飾核酸塩基も包含する。この文脈において、「核酸塩基」とは、アデニン、グアニン、シトシン、チミジン、ウラシル、キサンチン、及びヒポキサンチンなどの天然に存在する核酸塩基と、天然に存在しないバリアントとの両方を指す。このようなバリアントは、例えば、Hirao et al(2012)Accounts of Chemical Research vol 45 page 2055及びBergstrom(2009)Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry Suppl.37 1.4.1に記載されている。
いくつかの実施形態では、核酸塩基部分は、プリン又はピリミジンを修飾プリン又はピリミジン、例えば置換プリン又は置換ピリミジン、例えばイソシトシン、シュードイソシトシン、5-メチルシトシン、5-チオゾロ-シトシン、5-プロピニル-シトシン、5-プロピニル-ウラシル、5-ブロモウラシル5-チアゾロ-ウラシル、2-チオ-ウラシル、2’-チオ-チミン、イノシン、ジアミノプリン、6-アミノプリン、2-アミノプリン、2,6-ジアミノプリン及び2-クロロ-6-アミノプリンから選択される核酸塩基に変えることにより修飾される。
核酸塩基部分は、対応する各核酸塩基についての文字コード、例えば、A、T、G、C又はUにより示されてもよく、ここで、各文字は、任意に等価機能の改変された核酸塩基を含んでもよい。例えば、例示したオリゴヌクレオチドにおいて、核酸塩基部分は、A、T、G、C、及び5-メチルシトシンから選択される。任意に、LNAギャップマーについて、5-メチルシトシンLNAヌクレオシドが使用され得る。
修飾オリゴヌクレオチド
修飾オリゴヌクレオチドという用語は、1つ以上の糖修飾ヌクレオシド及び/又は修飾ヌクレオシド間結合を含むオリゴヌクレオチドを表す。「キメラ」オリゴヌクレオチドという用語は、修飾ヌクレオシドを有するオリゴヌクレオチドを説明するために、文献で用いられている用語である。
修飾オリゴヌクレオチドという用語は、1つ以上の糖修飾ヌクレオシド及び/又は修飾ヌクレオシド間結合を含むオリゴヌクレオチドを表す。「キメラ」オリゴヌクレオチドという用語は、修飾ヌクレオシドを有するオリゴヌクレオチドを説明するために、文献で用いられている用語である。
相補性
本明細書で使用される「相補的」は、(例えば、2つの対向する核酸上又は1本の核酸鎖の対向する領域上にある)2つのヌクレオチド間、又はヌクレオチドの2つの配列間の構造的関係であって、2つのヌクレオチド又はヌクレオチドの2つの配列が互いに塩基対を形成することを可能にする構造的関係を指す。例えば、対向する核酸のピリミジンヌクレオチドに相補的な1つの核酸のプリンヌクレオチドは、互いに水素結合を形成することによって塩基対を形成し得る。いくつかの実施形態において、相補的なヌクレオチドは、ワトソン-クリック様式で、又は安定な二重鎖の形成を可能にする任意の他の様式で塩基対合することができる。ワトソン・クリック塩基対は、グアニン(G)-シトシン(C)及びアデニン(A)-チミン(T)/ウラシル(U)である。オリゴヌクレオチドは修飾核酸塩基を有するヌクレオシドを含んでいてもよく、例えば5-メチルシトシンは、しばしばシトシンの代わりに用いられ、したがって、相補性という用語は、非修飾核酸塩基と修飾核酸塩基との間のワトソン・クリック塩基対合を包含することが理解されよう(例えば、Hirao et al(2012)Accounts of Chemical Research vol 45 page 2055 and Bergstrom(2009)Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry Suppl.37 1.4.1を参照されたい)。
本明細書で使用される「相補的」は、(例えば、2つの対向する核酸上又は1本の核酸鎖の対向する領域上にある)2つのヌクレオチド間、又はヌクレオチドの2つの配列間の構造的関係であって、2つのヌクレオチド又はヌクレオチドの2つの配列が互いに塩基対を形成することを可能にする構造的関係を指す。例えば、対向する核酸のピリミジンヌクレオチドに相補的な1つの核酸のプリンヌクレオチドは、互いに水素結合を形成することによって塩基対を形成し得る。いくつかの実施形態において、相補的なヌクレオチドは、ワトソン-クリック様式で、又は安定な二重鎖の形成を可能にする任意の他の様式で塩基対合することができる。ワトソン・クリック塩基対は、グアニン(G)-シトシン(C)及びアデニン(A)-チミン(T)/ウラシル(U)である。オリゴヌクレオチドは修飾核酸塩基を有するヌクレオシドを含んでいてもよく、例えば5-メチルシトシンは、しばしばシトシンの代わりに用いられ、したがって、相補性という用語は、非修飾核酸塩基と修飾核酸塩基との間のワトソン・クリック塩基対合を包含することが理解されよう(例えば、Hirao et al(2012)Accounts of Chemical Research vol 45 page 2055 and Bergstrom(2009)Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry Suppl.37 1.4.1を参照されたい)。
用語「%相補的」とは、本明細書で使用される場合、連続ヌクレオチド配列にわたって参照配列(例えば、標的配列又は配列モチーフ)に相補的である、核酸分子(例えば、オリゴヌクレオチド)の連続ヌクレオチド配列のヌクレオチドの割合(パーセント)を指す。したがって、相補性のパーセンテージは、2つの配列間(標的配列5’-3’と3’-5’からのオリゴヌクレオチド配列とを整列させた場合)で(例えばワトソン・クリック塩基対から)相補的である整列した核酸塩基の数を数え、その数をオリゴヌクレオチド中のヌクレオチドの総数で割り、100を掛けることによって計算される。このような比較において、整列(例えば塩基対を形成)しない核酸塩基/ヌクレオチドは、ミスマッチと称される。挿入及び欠失は、連続ヌクレオチド配列の%相補性の計算において許容されない。相補性の決定において、核酸塩基の化学的修飾は、核酸塩基が、例えばワトソン・クリック塩基対合を形成する機能的能力が保持される限り、無視されることが理解されるであろう(例えば、5-メチルシトシンは、%同一性の計算の目的のために、シトシンと同一であると見なされる)。
「完全に相補的な」という用語は、100%の相補性を指す。
以下は、HBV転写物の領域に完全に相補的な連続ヌクレオチド配列の例である。
いくつかの実施形態では、2つの核酸は、本明細書に記載されるように、相補性の領域を形成するように互いに相補的な複数のヌクレオチドの領域を有し得る。
相補性の領域
本明細書で使用される「相補性の領域」という用語は、適切なハイブリダイゼーション条件下、例えば、リン酸緩衝液中、細胞中などでヌクレオチドの2つの配列間のハイブリダイゼーションを可能にする、ヌクレオチドの逆平行配列に十分に相補的な核酸(例えば、二本鎖オリゴヌクレオチド)のヌクレオチドの配列を指す。
本明細書で使用される「相補性の領域」という用語は、適切なハイブリダイゼーション条件下、例えば、リン酸緩衝液中、細胞中などでヌクレオチドの2つの配列間のハイブリダイゼーションを可能にする、ヌクレオチドの逆平行配列に十分に相補的な核酸(例えば、二本鎖オリゴヌクレオチド)のヌクレオチドの配列を指す。
同一性
本明細書で使用される「同一性」という用語は、連続ヌクレオチド配列にわたって参照配列(例えば、配列モチーフ)と同一である、核酸分子(例えば、オリゴヌクレオチド)内の連続ヌクレオチド配列のヌクレオチドの割合(パーセントで表される)を指す。したがって、同一性のパーセンテージは、2つの配列(本発明の化合物の連続ヌクレオチド配列及び参照配列における)の間で同一の(一致する)整列された核酸塩基の数を数え、その数をオリゴヌクレオチドのヌクレオチドの総数で割り、100を掛けることにより計算される。したがって、同一性の百分率=(一致数×100)/整列領域(例えば、連続ヌクレオチド配列)の長さ。挿入及び欠失は、連続ヌクレオチド配列の同一性の百分率の計算において許容されない。同一性の決定において、核酸塩基の化学的修飾は、核酸塩基がWatson Crick塩基対を形成する機能的能力が保持される限り、無視されることが理解されよう(例えば、5-メチルシトシンは、同一性%の計算の目的のために、シトシンと同一であると見なされる)。
本明細書で使用される「同一性」という用語は、連続ヌクレオチド配列にわたって参照配列(例えば、配列モチーフ)と同一である、核酸分子(例えば、オリゴヌクレオチド)内の連続ヌクレオチド配列のヌクレオチドの割合(パーセントで表される)を指す。したがって、同一性のパーセンテージは、2つの配列(本発明の化合物の連続ヌクレオチド配列及び参照配列における)の間で同一の(一致する)整列された核酸塩基の数を数え、その数をオリゴヌクレオチドのヌクレオチドの総数で割り、100を掛けることにより計算される。したがって、同一性の百分率=(一致数×100)/整列領域(例えば、連続ヌクレオチド配列)の長さ。挿入及び欠失は、連続ヌクレオチド配列の同一性の百分率の計算において許容されない。同一性の決定において、核酸塩基の化学的修飾は、核酸塩基がWatson Crick塩基対を形成する機能的能力が保持される限り、無視されることが理解されよう(例えば、5-メチルシトシンは、同一性%の計算の目的のために、シトシンと同一であると見なされる)。
ハイブリダイゼーション
本明細書で用いられる「ハイブリダイズ」又は「ハイブリダイズする」という用語は、2つの核酸鎖(例えば、オリゴヌクレオチド及び標的核酸)が対向する鎖上の塩基対間に水素結合を形成することにより二重鎖を形成することと理解されるべきである。2つの核酸鎖の間の結合の親和性は、ハイブリダイゼーションの強度である。これは、オリゴヌクレオチドの半分が標的核酸と二重鎖を形成する温度として定義される、融解温度(Tm)によって説明されることが多い。生理学的条件では、Tmは親和性に厳密に比例しない(Mergny及びLacroix(2003年)「Oligonucleotides」第13巻第515~537頁)。標準状態ギブス自由エネルギーΔG°は、結合親和性をより正確に表し、ΔG°=-RTln(Kd)によって反応の解離定数(Kd)に関連付けられ、式中、Rは気体定数であり、Tは絶対温度である。したがって、オリゴヌクレオチドと標的核酸との間の反応の非常に低いΔG°は、オリゴヌクレオチドと標的核酸との間の強いハイブリダイゼーションを反映している。ΔG°は、水性濃度が1M、pHが7、温度が37℃の反応に関連したエネルギーである。標的核酸へのオリゴヌクレオチドのハイブリダイゼーションは、自発反応であり、自発反応の場合、ΔG°はゼロ未満である。ΔG°は、例えば、Hansen et al.,1965,Chem.Comm.36-38 and Holdgate et al.,2005,Drug Discov Today.に記載されているように、例えば等温滴定熱量測定(ITC)法を使用することによって、実験的に測定することができる。当業者は、ΔG°測定のために市販の装置が入手可能であることを知るであろう。ΔG°は、SantaLucia,1998,Proc Natl Acad Sci USA.95:1460-1465 に記載の最近接モデル(nearest neighbor model)を用いて、Sugimoto et al.,1995,Biochemistry 34:11211-11216 and McTigue et al.,2004,Biochemistry 43:5388-5405に記載される適切に得られる熱力学的パラメータを使用し、数値的に推定し得る。その意図した核酸標的をハイブリダイゼーションによって調節する可能性を確保するために、本発明のオリゴヌクレオチドは、10~30ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチドに対して-10kcal未満の概算ΔG°値で標的核酸にハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、ハイブリダイゼーションの程度又は強度は、標準状態ギブス自由エネルギーΔG°により測定される。オリゴヌクレオチドは、8~30ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチドに対して-10kcalの範囲未満、例えば-15kcal未満、例えば-20kcal未満、及び例えば-25kcal未満の概算ΔG°値で標的核酸にハイブリダイズし得る。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、-10から-60kcal、例えば-12から-40、例えば-15から-30kcal、又は-16から-27kcal、例えば-18から-25kcalの推定ΔG°値で、標的核酸にハイブリダイズする。
本明細書で用いられる「ハイブリダイズ」又は「ハイブリダイズする」という用語は、2つの核酸鎖(例えば、オリゴヌクレオチド及び標的核酸)が対向する鎖上の塩基対間に水素結合を形成することにより二重鎖を形成することと理解されるべきである。2つの核酸鎖の間の結合の親和性は、ハイブリダイゼーションの強度である。これは、オリゴヌクレオチドの半分が標的核酸と二重鎖を形成する温度として定義される、融解温度(Tm)によって説明されることが多い。生理学的条件では、Tmは親和性に厳密に比例しない(Mergny及びLacroix(2003年)「Oligonucleotides」第13巻第515~537頁)。標準状態ギブス自由エネルギーΔG°は、結合親和性をより正確に表し、ΔG°=-RTln(Kd)によって反応の解離定数(Kd)に関連付けられ、式中、Rは気体定数であり、Tは絶対温度である。したがって、オリゴヌクレオチドと標的核酸との間の反応の非常に低いΔG°は、オリゴヌクレオチドと標的核酸との間の強いハイブリダイゼーションを反映している。ΔG°は、水性濃度が1M、pHが7、温度が37℃の反応に関連したエネルギーである。標的核酸へのオリゴヌクレオチドのハイブリダイゼーションは、自発反応であり、自発反応の場合、ΔG°はゼロ未満である。ΔG°は、例えば、Hansen et al.,1965,Chem.Comm.36-38 and Holdgate et al.,2005,Drug Discov Today.に記載されているように、例えば等温滴定熱量測定(ITC)法を使用することによって、実験的に測定することができる。当業者は、ΔG°測定のために市販の装置が入手可能であることを知るであろう。ΔG°は、SantaLucia,1998,Proc Natl Acad Sci USA.95:1460-1465 に記載の最近接モデル(nearest neighbor model)を用いて、Sugimoto et al.,1995,Biochemistry 34:11211-11216 and McTigue et al.,2004,Biochemistry 43:5388-5405に記載される適切に得られる熱力学的パラメータを使用し、数値的に推定し得る。その意図した核酸標的をハイブリダイゼーションによって調節する可能性を確保するために、本発明のオリゴヌクレオチドは、10~30ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチドに対して-10kcal未満の概算ΔG°値で標的核酸にハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、ハイブリダイゼーションの程度又は強度は、標準状態ギブス自由エネルギーΔG°により測定される。オリゴヌクレオチドは、8~30ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチドに対して-10kcalの範囲未満、例えば-15kcal未満、例えば-20kcal未満、及び例えば-25kcal未満の概算ΔG°値で標的核酸にハイブリダイズし得る。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、-10から-60kcal、例えば-12から-40、例えば-15から-30kcal、又は-16から-27kcal、例えば-18から-25kcalの推定ΔG°値で、標的核酸にハイブリダイズする。
標的核酸
本発明によれば、標的核酸は、B型肝炎ウイルスをコードする核酸であり、例えば遺伝子、RNA、mRNA、ウイルスmRNA、又はcDNA配列であり得る。標的核酸は、配列番号1及びその天然に存在するバリアントによって表される。
本発明によれば、標的核酸は、B型肝炎ウイルスをコードする核酸であり、例えば遺伝子、RNA、mRNA、ウイルスmRNA、又はcDNA配列であり得る。標的核酸は、配列番号1及びその天然に存在するバリアントによって表される。
インビボ又はインビトロ用途に関して、本発明のオリゴヌクレオチドは、典型的には、HBV標的核酸を発現する細胞内で、HBV標的核酸の発現を阻害することが可能である。本発明のオリゴヌクレオチドの核酸塩基の連続配列は、典型的には、オリゴヌクレオチドの長さにわたって測定され、任意に1つ又は2つのミスマッチを除いて、また任意に、オリゴヌクレオチドをコンジュゲートなどの任意の官能基に結合し得るヌクレオチドベースのリンカー領域、又は他の非相補的末端ヌクレオチド(例えば、D’又はD’’)を除いて、HBV標的核酸に相補的である。
標的配列
本明細書で使用される用語「標的配列」は、本発明のオリゴヌクレオチドに相補的な核酸塩基配列を含む、標的核酸中に存在するヌクレオチドの配列を指す。いくつかの実施形態では、標的配列は、本発明のオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列に相補的な核酸塩基配列を有する標的核酸上の領域からなる。標的核酸のこの領域は、互換的に標的ヌクレオチド配列、標的配列、又は標的領域と称され得る。いくつかの実施形態では、標的配列は、単一オリゴヌクレオチドの相補的配列よりも長く、例えば本発明のいくつかのオリゴヌクレオチドによって標的化され得る標的核酸の好ましい領域を表すことができる。
本明細書で使用される用語「標的配列」は、本発明のオリゴヌクレオチドに相補的な核酸塩基配列を含む、標的核酸中に存在するヌクレオチドの配列を指す。いくつかの実施形態では、標的配列は、本発明のオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列に相補的な核酸塩基配列を有する標的核酸上の領域からなる。標的核酸のこの領域は、互換的に標的ヌクレオチド配列、標的配列、又は標的領域と称され得る。いくつかの実施形態では、標的配列は、単一オリゴヌクレオチドの相補的配列よりも長く、例えば本発明のいくつかのオリゴヌクレオチドによって標的化され得る標的核酸の好ましい領域を表すことができる。
配列番号1又は配列番号28の1530~1602位の配列によって表される治療用オリゴヌクレオチドのHBV mRNA標的領域が本明細書に記載される。この標的領域は、より小さい標的配列に分割され得、配列番号1の1530~1602;1530~1598;1530~1543;1530~1544;1531~1543;1551~1565;1551~1566;1577~1589;1577~1591;1577~1592;1578~1590;1578~1592;1583~1598;1584~1598;1585~1598又は1583~1602位からなる群から選択され得る。
一実施形態では、本発明の治療用オリゴヌクレオチドは、配列番号1又は配列番号28の1530~1602位の標的配列に相補的であるか又はそれにハイブリダイズする連続ヌクレオチド配列を含む。特に、1530~1544;1531~1543;1585~1598及び1583~1602からなる群から選択される標的解列に対する。
アンチセンスオリゴヌクレオチドが相補的又はハイブリダイズする標的配列は、一般に、少なくとも10ヌクレオチドの連続核酸塩基配列を含む。標的領域の連続ヌクレオチド配列は、10~50ヌクレオチド、例えば12~30、例えば14~20、例えば15~18連続ヌクレオチドである。
標的細胞
本明細書で使用される用語「標的細胞」は、標的核酸を発現している細胞を指す。いくつかの実施形態では、標的細胞は、インビボ又はインビトロであり得る。いくつかの実施形態では、標的細胞は、マウス細胞又はヒト細胞などのげっ歯類細胞、特にHBV感染肝細胞などの、HBV感染哺乳動物細胞である。
本明細書で使用される用語「標的細胞」は、標的核酸を発現している細胞を指す。いくつかの実施形態では、標的細胞は、インビボ又はインビトロであり得る。いくつかの実施形態では、標的細胞は、マウス細胞又はヒト細胞などのげっ歯類細胞、特にHBV感染肝細胞などの、HBV感染哺乳動物細胞である。
好ましい実施形態では、標的細胞はHBV mRNAを発現し、HBsAg及びHBeAgを分泌する。
肝細胞
本明細書で使用される「肝細胞」(単数又は複数)という用語は、肝臓の実質組織の細胞を指す。これらの細胞は、肝臓の質量のおおよそ70~85%を構成し、血清アルブミン、フィブリノーゲン、及び凝固因子のプロトロンビン群(因子3及び4を除く)を産生する。肝細胞系統細胞のマーカーとしては、トランスサイレチン(Ttr)、グルタミンシンセターゼ(Glul)、肝細胞核因子1a(Hnf1a)及び肝細胞核因子4a(Hnf4a)が挙げられ得るが、これらに限定されない。成熟肝細胞のマーカーとしては、シトクロムP450(Cyp3a11)、フマリルアセト酢酸ヒドロラーゼ(Fah)、グルコース6-リン酸(G6p)、アルブミン(Alb)及びOC2-2F8が挙げられ得るが、これらに限定されない。例えば、Huch et al.,(2013)、Nature,494(7436):247-250を参照のこと(その内容は参照により本明細書に組み込まれる)。
本明細書で使用される「肝細胞」(単数又は複数)という用語は、肝臓の実質組織の細胞を指す。これらの細胞は、肝臓の質量のおおよそ70~85%を構成し、血清アルブミン、フィブリノーゲン、及び凝固因子のプロトロンビン群(因子3及び4を除く)を産生する。肝細胞系統細胞のマーカーとしては、トランスサイレチン(Ttr)、グルタミンシンセターゼ(Glul)、肝細胞核因子1a(Hnf1a)及び肝細胞核因子4a(Hnf4a)が挙げられ得るが、これらに限定されない。成熟肝細胞のマーカーとしては、シトクロムP450(Cyp3a11)、フマリルアセト酢酸ヒドロラーゼ(Fah)、グルコース6-リン酸(G6p)、アルブミン(Alb)及びOC2-2F8が挙げられ得るが、これらに限定されない。例えば、Huch et al.,(2013)、Nature,494(7436):247-250を参照のこと(その内容は参照により本明細書に組み込まれる)。
低下した発現
本明細書で使用される、遺伝子の「低下した発現」という用語は、適切な参照細胞又は対象と比較して、細胞又は対象における遺伝子によってコードされるRNA転写物又はタンパク質の量の減少及び/又は遺伝子の活性の量の減少を指す。例えば、医薬組合せ又は二本鎖オリゴヌクレオチド(例えば、HBsAg mRNA配列に相補的なアンチセンス鎖を有するもの)で細胞を処理する行為は、それぞれ医薬組合せ又は二本鎖オリゴヌクレオチドで処理されていない細胞と比較して、RNA転写物、タンパク質及び/又は酵素活性(例えば、HBVゲノムのS遺伝子によってコードされる)の量の減少をもたらし得る。同様に、本明細書で使用される「発現を減少させる」とは、遺伝子(例えば、HBVゲノムのS遺伝子)の発現の低下をもたらす行為を指す。
本明細書で使用される、遺伝子の「低下した発現」という用語は、適切な参照細胞又は対象と比較して、細胞又は対象における遺伝子によってコードされるRNA転写物又はタンパク質の量の減少及び/又は遺伝子の活性の量の減少を指す。例えば、医薬組合せ又は二本鎖オリゴヌクレオチド(例えば、HBsAg mRNA配列に相補的なアンチセンス鎖を有するもの)で細胞を処理する行為は、それぞれ医薬組合せ又は二本鎖オリゴヌクレオチドで処理されていない細胞と比較して、RNA転写物、タンパク質及び/又は酵素活性(例えば、HBVゲノムのS遺伝子によってコードされる)の量の減少をもたらし得る。同様に、本明細書で使用される「発現を減少させる」とは、遺伝子(例えば、HBVゲノムのS遺伝子)の発現の低下をもたらす行為を指す。
「その天然に存在するバリアント」という用語は、HBV遺伝子型A~Hなどの定義された分類群内に天然に存在する標的核酸のバリアントを指す。典型的には、ポリヌクレオチドの「天然に存在するバリアント」に言及する場合、この用語は、染色体転座又は重複によって見出されるゲノムDNA、及びそれに由来するRNA、例えばmRNAをコードする標的配列の任意の対立遺伝子バリアントも包含し得る。「天然に存在するバリアント」には、標的配列mRNAの選択的スプライシングに由来するバリアントも含まれ得る。例えば特定のポリペプチド配列に言及される場合、この用語は、例えばシグナルペプチド切断、タンパク質分解切断、グリコシル化などの同時又は翻訳後修飾によってプロセシングされ得る天然に存在する形態のタンパク質も含む。
高親和性修飾ヌクレオシド
高親和性修飾ヌクレオシドは、修飾ヌクレオチドであり、これは、オリゴヌクレオチドに組み込まれる場合、例えば融解温度(Tm)によって測定されるように、その相補的標的に対するオリゴヌクレオチドの親和性を高める。本発明の高親和性修飾ヌクレオシドは、好ましくは、修飾ヌクレオシドあたり+0.5~+12oC、より好ましくは+1.5~+10oC、最も好ましくは+3~+8oCの融解温度の上昇をもたらす。数多くの高親和性修飾ヌクレオシドが当該技術分野において知られており、例えば、多くの2’置換ヌクレオシド及びロックド核酸(LNA)が挙げられる(例えば、Freier&Altmann;Nucl.Acid Res.,1997,25,4429-4443及びUhlmann;Curr.Opinion in Drug Development,2000,3(2),293-213を参照されたい)。
高親和性修飾ヌクレオシドは、修飾ヌクレオチドであり、これは、オリゴヌクレオチドに組み込まれる場合、例えば融解温度(Tm)によって測定されるように、その相補的標的に対するオリゴヌクレオチドの親和性を高める。本発明の高親和性修飾ヌクレオシドは、好ましくは、修飾ヌクレオシドあたり+0.5~+12oC、より好ましくは+1.5~+10oC、最も好ましくは+3~+8oCの融解温度の上昇をもたらす。数多くの高親和性修飾ヌクレオシドが当該技術分野において知られており、例えば、多くの2’置換ヌクレオシド及びロックド核酸(LNA)が挙げられる(例えば、Freier&Altmann;Nucl.Acid Res.,1997,25,4429-4443及びUhlmann;Curr.Opinion in Drug Development,2000,3(2),293-213を参照されたい)。
糖修飾
本発明のオリゴマーは、修飾された糖部分、すなわち、DNA及びRNAに見られるリボース糖部分と比較して、糖部分が修飾された1つ以上のヌクレオシドを含み得る。
本発明のオリゴマーは、修飾された糖部分、すなわち、DNA及びRNAに見られるリボース糖部分と比較して、糖部分が修飾された1つ以上のヌクレオシドを含み得る。
リボース糖部分の修飾を有する数多くのヌクレオシドは、親和性及び/又はヌクレアーゼ耐性などのオリゴヌクレオチドのある特定の性質を改善することを主な目的として作製されてきた。
そのような修飾には、例えばヘキソース環(HNA)又は二環式環(典型的には、リボース環(LNA)のC2とC4炭素の間にバイラジカル架橋を有する)、又は典型的にはC2とC3炭素の間の結合を欠く非結合リボース環(例えば、UNA)で置き換えることにより、リボース環構造が修飾されているものが含まれる。他の糖修飾ヌクレオシドには、例えばビシクロヘキソース核酸(国際公開第2011/017521号)又は三環式核酸(国際公開第2013/154798号)が含まれる。修飾ヌクレオシドにはまた、糖部分が例えばペプチド核酸(PNA)又はモルホリノ核酸の場合には非糖部分で置き換えられているヌクレオシドが含まれる。
糖修飾にはまた、リボース環上の置換基を、水素以外の基、又はDNA及びRNAヌクレオシド中に天然に存在する2’-OH基に変更することによってなされる修飾も含まれる。置換基は、例えば2’、3’、4’、又は5’位で導入され得る。
2’糖修飾ヌクレオシド
2’糖修飾ヌクレオシドは、2’位にH若しくは-OH以外の置換基を有するヌクレオシド(2’置換ヌクレオシド)、又はリボース環の2’炭素と第2の炭素との間に架橋を形成できる2’結合バイラジカルを含むヌクレオシド、例えばLNA(2’-4’バイラジカル架橋)ヌクレオシドである。
2’糖修飾ヌクレオシドは、2’位にH若しくは-OH以外の置換基を有するヌクレオシド(2’置換ヌクレオシド)、又はリボース環の2’炭素と第2の炭素との間に架橋を形成できる2’結合バイラジカルを含むヌクレオシド、例えばLNA(2’-4’バイラジカル架橋)ヌクレオシドである。
実際、2’糖置換ヌクレオシドの開発には多くの注目が集まっており、数多くの2’置換ヌクレオシドが、オリゴヌクレオチドに組み込まれた際に有益な特性を有することが見出されている。例えば、2’修飾糖は、高められた結合親和性及び/又は増大されたヌクレアーゼ耐性をオリゴヌクレオチドにもたらすことができる。2’置換修飾ヌクレオシドの例は、2’-O-アルキル-RNA、2’-O-メチル-RNA、2’-アルコキシ-RNA、2’-O-メトキシエチル-RNA(MOE)、2’-アミノ-DNA、2’-フルオロ-RNA及び2’-F-ANAヌクレオシドである。更なる例については、例えばFreier&Altmann;Nucl.Acid Res.,1997,25,4429-4443及びUhlmann;Curr.Opinion in Drug Development,2000,3(2),293-213、及びDeleavey and Damha,Chemistry and Biology 2012,19,937を参照されたい。以下は、幾つかの2’置換修飾ヌクレオシドの例示である。
本発明に関して、2’置換糖修飾ヌクレオシドは、LNAのような2’架橋ヌクレオシドを含まない。
ロックド核酸ヌクレオシド(LNAヌクレオシド)
「LNAヌクレオシド」は、上記ヌクレオシドのリボース糖環のC2’とC4’とを結合するバイラジカル(「2’-4’架橋」とも称される)を含む2’修飾ヌクレオシドであり、これはリボース環のコンホメーションを制限又は固定する。これらのヌクレオシドはまた、文献において、架橋核酸又は二環式核酸(BNA)とも称されている。リボースの立体配座の固定は、LNAが相補的RNA又はDNA分子のオリゴヌクレオチドに組み込まれる場合、ハイブリダイゼーションの親和性の向上(二重鎖の安定化)に関連している。これは、オリゴヌクレオチド/相補二重鎖の融解温度を測定することによって、日常的に決定されうる。
「LNAヌクレオシド」は、上記ヌクレオシドのリボース糖環のC2’とC4’とを結合するバイラジカル(「2’-4’架橋」とも称される)を含む2’修飾ヌクレオシドであり、これはリボース環のコンホメーションを制限又は固定する。これらのヌクレオシドはまた、文献において、架橋核酸又は二環式核酸(BNA)とも称されている。リボースの立体配座の固定は、LNAが相補的RNA又はDNA分子のオリゴヌクレオチドに組み込まれる場合、ハイブリダイゼーションの親和性の向上(二重鎖の安定化)に関連している。これは、オリゴヌクレオチド/相補二重鎖の融解温度を測定することによって、日常的に決定されうる。
非限定的な、例示的なLNAヌクレオシドは、国際公開第99/014226号、国際公開第00/66604号、国際公開第98/039352号、国際公開第2004/046160号、国際公開第00/047599号、国際公開第2007/134181号、国際公開第2010/077578号、国際公開第2010/036698号、国際公開第2007/090071号、国際公開第2009/006478号、国際公開第2011/156202号、国際公開第2008/154401号、国際公開第2009/067647号、国際公開第2008/150729号、Morita et al.、Bioorganic&Med.Chem.Lett.12,73-76,Seth et al.J.Org.Chem.2010,Vol 75(5)pp.1569-81、及びMitsuoka et al.,Nucleic Acids Research 2009,37(4),1225-1238、及びWan and Seth,J.Medical Chemistry 2016,59,9645-9667に開示されている。
更なる非限定的な例示的LNAヌクレオシドを、スキーム1に開示する。
特定のLNAヌクレオシドは、ベータ-D-オキシ-LNA、6’-メチル-ベータ-D-オキシLNA、例えば(S)-6’-メチル-ベータ-D-オキシ-LNA(ScET)及びENAである。特定の有利なLNAは、ベータ-D-オキシ-LNAである。
リン酸類似体
本明細書で使用される「リン酸類似体」という用語は、リン酸基の静電特性及び/又は立体特性を模倣する化学部分を指す。いくつかの実施形態において、リン酸類似体は、酵素的除去を受けやすいことが多い5’-リン酸の代わりに、オリゴヌクレオチドの5’末端ヌクレオチドに配置される。いくつかの実施形態において、5’リン酸類似体は、ホスファターゼ耐性連結を含有する。リン酸類似体の例としては、5’メチレンホスホネート(5’-MP)及び5’-(E)-ビニルホスホネート(5’-VP)などの5’ホスホネートが挙げられる。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、5’末端ヌクレオチドに、糖の4’-炭素位置にリン酸類似体(「4’-リン酸類似体」と呼ばれる)を有する。4’-リン酸類似体の例は、オキシメチル基の酸素原子が糖部分(例えばその4’-炭素)に結合しているオキシメチルホスホネート又はその類似体である。例えば、2016年9月2日に出願された米国仮特許出願第62/383,207号及び2016年9月12日に出願された米国仮特許出願第62/393,401号を参照されたい。これらのリン酸類似体に関するそれぞれの内容は、参照により本明細書に組み込まれる。オリゴヌクレオチドの5’末端に対する他の修飾が開発されている(例えば、国際公開第2011/133871号;米国特許第8,927,513号明細書;及びPrakash et al.(2015),Nucleic Acids Res.,43(6):2993-3011を参照されたい。リン酸類似体に関するそれぞれの内容は参照により本明細書に組み込まれる)。
本明細書で使用される「リン酸類似体」という用語は、リン酸基の静電特性及び/又は立体特性を模倣する化学部分を指す。いくつかの実施形態において、リン酸類似体は、酵素的除去を受けやすいことが多い5’-リン酸の代わりに、オリゴヌクレオチドの5’末端ヌクレオチドに配置される。いくつかの実施形態において、5’リン酸類似体は、ホスファターゼ耐性連結を含有する。リン酸類似体の例としては、5’メチレンホスホネート(5’-MP)及び5’-(E)-ビニルホスホネート(5’-VP)などの5’ホスホネートが挙げられる。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、5’末端ヌクレオチドに、糖の4’-炭素位置にリン酸類似体(「4’-リン酸類似体」と呼ばれる)を有する。4’-リン酸類似体の例は、オキシメチル基の酸素原子が糖部分(例えばその4’-炭素)に結合しているオキシメチルホスホネート又はその類似体である。例えば、2016年9月2日に出願された米国仮特許出願第62/383,207号及び2016年9月12日に出願された米国仮特許出願第62/393,401号を参照されたい。これらのリン酸類似体に関するそれぞれの内容は、参照により本明細書に組み込まれる。オリゴヌクレオチドの5’末端に対する他の修飾が開発されている(例えば、国際公開第2011/133871号;米国特許第8,927,513号明細書;及びPrakash et al.(2015),Nucleic Acids Res.,43(6):2993-3011を参照されたい。リン酸類似体に関するそれぞれの内容は参照により本明細書に組み込まれる)。
ヌクレアーゼ媒介分解
ヌクレアーゼ媒介分解は、相補的なヌクレオチド配列と二重鎖を形成するときに、そのような配列の分解を媒介することができるオリゴヌクレオチドを指す。
ヌクレアーゼ媒介分解は、相補的なヌクレオチド配列と二重鎖を形成するときに、そのような配列の分解を媒介することができるオリゴヌクレオチドを指す。
いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、標的核酸のヌクレアーゼ媒介分解を介して機能し得、本発明のオリゴヌクレオチドは、ヌクレアーゼ、特にエンドヌクレアーゼ、好ましくはRNase Hなどのエンドリボヌクレアーゼ(RNase)を動員することができる。ヌクレアーゼ媒介機構を介して機能するオリゴヌクレオチド設計の例は、少なくとも5又は6の連続DNAヌクレオシドの領域を通常含み、親和性増強ヌクレオシド、例えばギャップマー、ヘッドマー及びテイルマーが片側又は両側に隣接するオリゴヌクレオチドである。
RNase Hの活性及び動員
一実施形態では、治療用オリゴヌクレオチドは、RNase Hを動員することができるアンチセンスオリゴヌクレオチドである。アンチセンスオリゴヌクレオチドのRNase H活性とは、相補的RNA分子との二重鎖にある場合にRNase Hを動員する能力を指す。国際公開第01/23613号は、RNase Hを動員する能力を決定するために使用され得る、RNase H活性を決定するためのインビトロ方法を提供する。典型的には、オリゴヌクレオチドが、相補的標的核酸配列が提供された場合に、試験されている修飾オリゴヌクレオチドと同じ塩基配列を有するが、オリゴヌクレオチド中の全てのモノマー間にホスホロチオアート結合を有するDNAモノマーのみを含有するオリゴヌクレオチドを使用し、国際公開第01/23613号(参照により本明細書に組み込まれる)の実施例91~95により提供される方法論を使用したときに決定された初期速度の少なくとも5%、例えば、少なくとも10%又は20%超のpmol/l/分で測定された初期速度を有する場合に、このオリゴヌクレオチドはRNase Hを動員し得ると見なされる。RNase H活性の決定に使用するために、組換えヒトRNase H1が、Lubio Science GmbH、Lucerne、Switzerlandから入手可能である。
一実施形態では、治療用オリゴヌクレオチドは、RNase Hを動員することができるアンチセンスオリゴヌクレオチドである。アンチセンスオリゴヌクレオチドのRNase H活性とは、相補的RNA分子との二重鎖にある場合にRNase Hを動員する能力を指す。国際公開第01/23613号は、RNase Hを動員する能力を決定するために使用され得る、RNase H活性を決定するためのインビトロ方法を提供する。典型的には、オリゴヌクレオチドが、相補的標的核酸配列が提供された場合に、試験されている修飾オリゴヌクレオチドと同じ塩基配列を有するが、オリゴヌクレオチド中の全てのモノマー間にホスホロチオアート結合を有するDNAモノマーのみを含有するオリゴヌクレオチドを使用し、国際公開第01/23613号(参照により本明細書に組み込まれる)の実施例91~95により提供される方法論を使用したときに決定された初期速度の少なくとも5%、例えば、少なくとも10%又は20%超のpmol/l/分で測定された初期速度を有する場合に、このオリゴヌクレオチドはRNase Hを動員し得ると見なされる。RNase H活性の決定に使用するために、組換えヒトRNase H1が、Lubio Science GmbH、Lucerne、Switzerlandから入手可能である。
ギャップマー
本発明の治療用オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドであるいくつかの実施形態において、本発明の核酸分子又はその連続ヌクレオチド配列は、ギャップマーアンチセンスオリゴヌクレオチドである。アンチセンスギャップマーは、通常、RNase H媒介分解を介した標的核酸の阻害に用いられる。本発明の一実施形態では、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNase Hを動員することが可能である。
本発明の治療用オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドであるいくつかの実施形態において、本発明の核酸分子又はその連続ヌクレオチド配列は、ギャップマーアンチセンスオリゴヌクレオチドである。アンチセンスギャップマーは、通常、RNase H媒介分解を介した標的核酸の阻害に用いられる。本発明の一実施形態では、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNase Hを動員することが可能である。
ギャップマーアンチセンスオリゴヌクレオチドは、少なくとも3つの区別される構造領域、5’-フランク、ギャップ、及び3’-フランク、F-G-F’を、5’->3’配向で含む。「ギャップ」領域(G)は、オリゴヌクレオチドがRNase Hを動員することを可能にする連続DNAヌクレオチドのストレッチを含む。ギャップ領域は、1つ以上の糖修飾ヌクレオシド、有利には高親和性糖修飾ヌクレオシドを含む5’隣接領域(F)と、1つ以上の糖修飾ヌクレオシド、有利には高親和性糖修飾ヌクレオシドを含む3’隣接領域(F’)が隣接する。領域F及びF’の1種以上の糖修飾ヌクレオシドは、標的核酸に対するオリゴヌクレオチドの親和性を向上させる(すなわち、これは親和性向上糖修飾ヌクレオシドである)。いくつかの実施形態では、領域F及びF’の1つ又は複数の糖修飾ヌクレオシドは、例えばLNA及び2’-MOEから独立して選択される、高親和性2’糖修飾などの2’糖修飾ヌクレオシドである。
ギャップマー設計において、ギャップ領域の最も5’及び3’のヌクレオシドはDNAヌクレオシドであり、それぞれ、5’(F)又は3’(F’)領域の糖修飾ヌクレオシドに隣接して配置されている。フランクはさらに、ギャップ領域から最も遠い端、即ち5’フランクの5’末端及び3’フランクの3’末端に少なくとも1つの糖修飾ヌクレオシドを有することによって定義されてもよい。
領域F-G-F’は、連続ヌクレオチド配列を形成する。本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその連続ヌクレオチド配列は、式F-G-F’のギャップマー領域を含み得る。
ギャップマー設計F-G-F’の全長は、例えば12から30ヌクレオシド、例えば13から24、例えば14から22ヌクレオシド、例えば13から17、例えば14から16ヌクレオシドでありうる。
例として、本発明のギャップマーオリゴヌクレオチドは、以下の式によって表すことができる:
F1-6-G6-16-F’1-6、例えば
F1-4-G7-10-F’2-4
F1-6-G6-16-F’1-6、例えば
F1-4-G7-10-F’2-4
ただし、ギャップマー領域F-G-F’の全長は、少なくとも12、例えば少なくとも13ヌクレオチド長であることを条件とする。
本発明の一態様では、アンチセンスオリゴヌクレオチド又はその連続ヌクレオチド配列は、式5’-F-G-F’-3’のギャップマーからなるか又はそれを含み、式中、領域F及びF’が独立して1~8個のヌクレオシドを含むか又はそれらからなり、そのうち1~4個が2’糖修飾され、F及びF’領域の5’及び3’末端を規定し、GがRNase Hを動員することができる6~16個のヌクレオシドの領域である。
本発明の一実施形態では、連続ヌクレオチド配列は、式5’-F-G-F’-3’のギャップマーであり、領域F及びF’は、独立して、2~4個の2’糖修飾ヌクレオチドからなり、F及びF’領域の5’及び3’末端を規定し、Gは、RNアーゼHを動員することができる6~10個のDNAヌクレオシド領域である。
いくつかの実施形態では、ギャップ領域Gは、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15又は16個の連続するホスホロチオエート結合DNAヌクレオシドからなっていてもよい。いくつかの実施形態では、ギャップ領域Gは、7個~10個のDNAヌクレオシドからなる。いくつかの実施形態では、ギャップ内の全てのヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合である。
いくつかの実施形態では、領域F及びF’は、独立して、糖修飾ヌクレオシドの連続する配列からなるか、又はそれを含む。いくつかの実施形態では、領域Fの糖修飾ヌクレオシドは、独立して、2’-O-アルキル-RNA単位、2’-O-メチル-RNA、2’-アミノ-DNA単位、2’-フルオロ-DNA単位、2’-アルコキシ-RNA、MOE単位、LNA単位、アラビノ核酸(ANA)単位及び2’-フルオロ-ANA単位から選択されてもよい。
いくつかの実施形態では、領域F若しくはF’、又はF及びF’の全ヌクレオシドは、例えばベータ-D-オキシLNA、ENA又はScETヌクレオシドから独立して選択されるような、LNAヌクレオシドである。いくつかの実施形態では、領域Fは、1~5つ、例えば2~4つ、例えば3~4つ、例えば1、2、3、4又は5つの連続するLNAヌクレオシドからなる。いくつかの実施形態では、領域F及びF’の全ヌクレオシドは、ベータ-D-オキシLNAヌクレオシドである。
いくつかの実施形態では、領域F若しくはF’、又はF及びF’の全ヌクレシドは、2’置換ヌクレオシド、例えばOMe又はMOEヌクレオシドである。いくつかの実施形態では、領域Fは、1、2、3、4、5、6、7又は8つの連続するOMe又はMOEヌクレオシドからなる。いくつかの実施形態では、フランキング領域の一方のみが、2’置換ヌクレオシド、例えばOMe又はMOEヌクレオシドからなり得る。いくつかの実施形態では、2’置換ヌクレオシド、例えばOMe又はMOEヌクレオシドからなるのは5’(F)フランキング領域であり、一方、3’(F’)フランキング領域は、少なくとも1つのLNAヌクレオシド、例えばベータ-D-オキシLNAヌクレオシド又はcETヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態では、2’置換ヌクレオシド、例えばOMe又はMOEヌクレオシドからなるのは3’(F’)フランキング領域であり、一方、5’(F)フランキング領域は、少なくとも1つのLNAヌクレオシド、例えばベータ-D-オキシLNAヌクレオシド又はcETヌクレオシドを含む。
更なるギャップマー設計は、参照することによって本明細書に組み込まれる、国際公開第2004/046160号、国際公開第2007/146511号、及び国際公開第2008/113832号に開示されている。
LNAギャップマー
LNAギャップマーは、領域F及びF’の一方又は両方に、LNAヌクレオシドを含むか、若しくはそれからなるギャップマーである。ベータ-D-オキシギャップマーは、領域F及びF’の一方又は両方に、ベータ-D-オキシLNAヌクレオシドを含むか、若しくはそれからなるギャップマーである。
LNAギャップマーは、領域F及びF’の一方又は両方に、LNAヌクレオシドを含むか、若しくはそれからなるギャップマーである。ベータ-D-オキシギャップマーは、領域F及びF’の一方又は両方に、ベータ-D-オキシLNAヌクレオシドを含むか、若しくはそれからなるギャップマーである。
いくつかの実施形態では、LNAギャップマーは、式:[LNA]1-5-[領域G]6-10-[LNA]1-5であり、領域Gはギャップマー領域Gの定義で定義したとおりである。
MOEギャップマー
MOEギャップマーは、領域F及びF’がMOEヌクレオシドからなるギャップマーである。いくつかの実施形態では、MOEギャップマーは、設計[MOE]1-8-[領域G]5-16-[MOE]1-8、例えば[MOE]2-7-[領域G]6-14-[MOE]2-7、例えば[MOE]3-6-[領域G]8-12-[MOE]3-6のものであり、ここで、領域Gはギャップマーの定義に規定したとおりである。5-10-5設計(MOE-DNA-MOE)を有するMOEギャップマーは、当技術分野で広く使用されている。
MOEギャップマーは、領域F及びF’がMOEヌクレオシドからなるギャップマーである。いくつかの実施形態では、MOEギャップマーは、設計[MOE]1-8-[領域G]5-16-[MOE]1-8、例えば[MOE]2-7-[領域G]6-14-[MOE]2-7、例えば[MOE]3-6-[領域G]8-12-[MOE]3-6のものであり、ここで、領域Gはギャップマーの定義に規定したとおりである。5-10-5設計(MOE-DNA-MOE)を有するMOEギャップマーは、当技術分野で広く使用されている。
混合ウイングギャップマー
混合ウイングギャップマーは、領域F及びF’の一方又は両方が、2’置換ヌクレオシド、例えば2’-O-アルキル-RNA単位、2’-O-メチル-RNA、2’-アミノ-DNA単位、2’-フルオロ-DNA単位、2’-アルコキシ-RNA、MOE単位、アラビノ核酸(ANA)単位、及び2’-フルオロ-ANA単位からなる群から独立して選択される2’置換ヌクレオシド、例えばMOEヌクレオシドを含むLNAギャップマーである。領域F及びF’の少なくとも一方、又は領域F及びF’の両方が少なくとも1つのLNAヌクレオシドを含むいくつかの実施形態では、領域F及びF’の残りのヌクレオシドは、MOE及びLNAからなる群から独立して選択される。領域F及びF’の少なくとも一方、又は領域F及びF’の両方が少なくとも2つのLNAヌクレオシドを含むいくつかの実施形態では、領域F及びF’の残りのヌクレオシドは、MOE及びLNAからなる群から独立して選択される。いくつかの混合ウイング実施形態では、領域F及びF’の一方又は両方が、1つ又は複数のDNAヌクレオシドをさらに含んでもよい。
混合ウイングギャップマーは、領域F及びF’の一方又は両方が、2’置換ヌクレオシド、例えば2’-O-アルキル-RNA単位、2’-O-メチル-RNA、2’-アミノ-DNA単位、2’-フルオロ-DNA単位、2’-アルコキシ-RNA、MOE単位、アラビノ核酸(ANA)単位、及び2’-フルオロ-ANA単位からなる群から独立して選択される2’置換ヌクレオシド、例えばMOEヌクレオシドを含むLNAギャップマーである。領域F及びF’の少なくとも一方、又は領域F及びF’の両方が少なくとも1つのLNAヌクレオシドを含むいくつかの実施形態では、領域F及びF’の残りのヌクレオシドは、MOE及びLNAからなる群から独立して選択される。領域F及びF’の少なくとも一方、又は領域F及びF’の両方が少なくとも2つのLNAヌクレオシドを含むいくつかの実施形態では、領域F及びF’の残りのヌクレオシドは、MOE及びLNAからなる群から独立して選択される。いくつかの混合ウイング実施形態では、領域F及びF’の一方又は両方が、1つ又は複数のDNAヌクレオシドをさらに含んでもよい。
混合ウイングギャップマー設計は、国際公開第2008/049085号及び国際公開第2012/109395号(これらのいずれもが参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
オリゴヌクレオチド内の領域D’又はD’’
本発明のオリゴヌクレオチドは、いくつかの実施形態では、標的核酸に相補的なオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列、例えばギャップマーF-G-F’、並びにさらに5’及び/又は3’ヌクレオシドを含むか、又はそれからなり得る。更なる5’及び/又は3’ヌクレオシドは、標的核酸に完全に相補的であっても、完全に相補的でなくてもよい。このような更なる5’及び/又は3’ヌクレオシドは、本明細書では領域D’及びD’’と称され得る。
本発明のオリゴヌクレオチドは、いくつかの実施形態では、標的核酸に相補的なオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列、例えばギャップマーF-G-F’、並びにさらに5’及び/又は3’ヌクレオシドを含むか、又はそれからなり得る。更なる5’及び/又は3’ヌクレオシドは、標的核酸に完全に相補的であっても、完全に相補的でなくてもよい。このような更なる5’及び/又は3’ヌクレオシドは、本明細書では領域D’及びD’’と称され得る。
領域D’又はD’’の付加は、連続ヌクレオチド配列、例えばギャップマーをコンジュゲート部分又は別の官能基に連結する目的のために使用され得る。連続ヌクレオチド配列をコンジュゲート部分と連結するために使用される場合、それは生体切断可能なリンカーとして働くことができる。あるいは、それはエキソヌクレアーゼ保護を提供するために、又は合成若しくは製造を容易にするために使用され得る。
領域D’及びD’’は、それぞれ、領域Fの5’末端又は領域F’の3’末端に結合して、以下の式D’-F-G-F’、F-G-F’-D’’又は
領域D’及びD’’は、それぞれ、領域Fの5’末端又は領域F’の3’末端に結合して、以下の式D’-F-G-F’、F-G-F’-D’’又は
D’-F-G-F’-D’’の設計を生成することができる。この場合、F-G-F’はオリゴヌクレオチドのギャップマー部分であり、領域D’又はD’’は、オリゴヌクレオチドの別個の部分を構成する。領域D’とF領域との間及び領域F’とD’’領域との間の移行は、D’又はD’’領域に向かうホスホジエステル結合及びF又はF’領域に向かうホスホロチオエート結合を有するヌクレオシドによって特徴付けられ、ヌクレオシドはギャップマー(標的核酸に相補的な連続ヌクレオチド配列)の一部であると考えられる。
領域D’又はD’’は、独立して、1、2、3、4又は5個の追加のヌクレオチドを含むか、又はそれからなり、標的核酸に相補的であっても、相補的でなくてもよい。F又はF’領域に隣接するヌクレオチドは、DNA又はRNAなどの糖修飾ヌクレオチドではなく、若しくはこれらの塩基修飾バージョンでもない。D’又はD’’領域は、ヌクレアーゼ感受性の生体切断可能なリンカーとしての役割を果たしうる(リンカーの定義を参照されたい)。いくつかの実施形態では、追加の5’及び/又は3’末端ヌクレオチドは、ホスホジエステル結合で結合されており、DNA又はRNAである。領域D’又はD’’としての使用に好適なヌクレオチドベースの生体切断性リンカーは、国際公開第2014/076195号に開示されており、これには例としてホスホジエステル結合DNAジヌクレオチドが含まれる。いくつかの実施形態では、領域D’又はD’’は、標的核酸に対して相補的ではないか、又は少なくとも50%のミスマッチを含む。
いくつかの実施形態では、領域D’又はD’’は、配列AA、AT、AC、AG、TA、TT、TC、TG、CA、CT、CC、CG、GA、GT、GC、又はGGのジヌクレオチドを含むか又はそれからなり、Cは5-メチルシトシンであってよく、及び/又はTはUで置き換えられてよい。ジヌクレオチド中のヌクレオシド間結合はホスホジエステル結合である。いくつかの実施形態では、領域D’又はD’’は、配列AAA、AAT、AAC、AAG、ATA、ATT、ATC、ATG、ACA、ACT、ACC、ACG、AGA、AGT、AGC、AGG、TAA、TAT、TAC、TAG、TTA、TTT、TTC、TAG、TCA、TCT、TCC、TCG、TGA、TGT、TGC、TGG、CAA、CAT、CAC、CAG、CTA、CTG、CTC、CTT、CCA、CCT、CCC、CCG、CGA、CGT、CGC、CGG、GAA、GAT、GAC、CAG、GTA、GTT、GTC、GTG、GCA、GCT、GCC、GCG、GGA、GGT、GGC、及びGGGのトリヌクレオチドからなるか、又はそれからなり、Cは5-メチルシトシンであってよく、及び/又は、Tは、Uで置き換えられてよい。ヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合である。(天然に存在する)核酸塩基A(アデニン、T(チミン)、U(ウラシル)、G(グアニン)、C(シトシン)に言及する場合、これらは、同等の天然核酸塩基(例えば、相補的ヌクレオシドとの塩基対)として機能する核酸塩基類似体で置換され得ることが理解されるであろう。
一実施形態では、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、ギャップマーを構成する連続ヌクレオチド配列に加えて、領域D’及び/又はD’’を含む。
いくつかの実施形態において、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下の式によって表すことができる:
D’-F-G-F’、特に、D’1-3-F1-4-G6-10-F’2-4
F-G-F’-D’’、特に、F1-4-G6-10-F’2-4-D’’1-3
D’-F-G-F’-D’’、特に、D’1-3-F1-4-G6-10-F’2-4-D’’1-3
D’-F-G-F’、特に、D’1-3-F1-4-G6-10-F’2-4
F-G-F’-D’’、特に、F1-4-G6-10-F’2-4-D’’1-3
D’-F-G-F’-D’’、特に、D’1-3-F1-4-G6-10-F’2-4-D’’1-3
いくつかの実施形態では、領域D’と領域Fとの間に位置するヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合である。いくつかの実施形態では、領域F’と領域D’’との間に位置するヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合である。
コンジュゲート
本明細書で使用されるコンジュゲートという用語は、治療用オリゴヌクレオチドに共有結合することができるGalNAcクラスターなどの非ヌクレオチド部分(コンジュゲート)を指す。コンジュゲート及びクラスター又はコンジュゲート部分という用語は、互換的に使用され得る。いくつかの例において、コンジュゲートされた治療用オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドコンジュゲートとも称され得る。一実施形態では、コンジュゲートは標的化リガンドである。
本明細書で使用されるコンジュゲートという用語は、治療用オリゴヌクレオチドに共有結合することができるGalNAcクラスターなどの非ヌクレオチド部分(コンジュゲート)を指す。コンジュゲート及びクラスター又はコンジュゲート部分という用語は、互換的に使用され得る。いくつかの例において、コンジュゲートされた治療用オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドコンジュゲートとも称され得る。一実施形態では、コンジュゲートは標的化リガンドである。
標的化リガンド
本明細書で使用される「標的化リガンド」という用語は、目的の組織又は細胞の同族分子(例えば、受容体)に選択的に結合する分子であって、目的の組織又は細胞に他の物質を標的化する目的で他の物質にコンジュゲート可能な分子(例えば、炭水化物、アミノ糖、コレステロール、ポリペプチド又は脂質)を指す。例えば、いくつかの実施形態では、標的化リガンドは、オリゴヌクレオチドを目的の特定の組織又は細胞に標的化する目的でオリゴヌクレオチドにコンジュゲートされ得る。いくつかの実施形態において、標的化リガンドは細胞表面受容体に選択的に結合する。したがって、いくつかの実施形態では、標的化リガンドは、オリゴヌクレオチドにコンジュゲートされた場合、細胞の表面に発現される受容体への選択的結合、並びに、オリゴヌクレオチド、標的化リガンド及び受容体を含む複合体の細胞によるエンドソーム内部移行によって、特定の細胞へのオリゴヌクレオチドの送達を容易にする。いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、オリゴヌクレオチドが細胞内の標的化リガンドから放出されるように、細胞の内在化の後又は細胞の内在化の間に切断されるリンカーを介してオリゴヌクレオチドにコンジュゲートされる。
本明細書で使用される「標的化リガンド」という用語は、目的の組織又は細胞の同族分子(例えば、受容体)に選択的に結合する分子であって、目的の組織又は細胞に他の物質を標的化する目的で他の物質にコンジュゲート可能な分子(例えば、炭水化物、アミノ糖、コレステロール、ポリペプチド又は脂質)を指す。例えば、いくつかの実施形態では、標的化リガンドは、オリゴヌクレオチドを目的の特定の組織又は細胞に標的化する目的でオリゴヌクレオチドにコンジュゲートされ得る。いくつかの実施形態において、標的化リガンドは細胞表面受容体に選択的に結合する。したがって、いくつかの実施形態では、標的化リガンドは、オリゴヌクレオチドにコンジュゲートされた場合、細胞の表面に発現される受容体への選択的結合、並びに、オリゴヌクレオチド、標的化リガンド及び受容体を含む複合体の細胞によるエンドソーム内部移行によって、特定の細胞へのオリゴヌクレオチドの送達を容易にする。いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、オリゴヌクレオチドが細胞内の標的化リガンドから放出されるように、細胞の内在化の後又は細胞の内在化の間に切断されるリンカーを介してオリゴヌクレオチドにコンジュゲートされる。
オリゴヌクレオチドリンカー
結合又はリンカーは、1つ以上の共有結合を介して目的の1つの化学基又はセグメントを目的の別の化学基又はセグメントに連結する、2つの原子間の接続である。コンジュゲート基は、直接又は連結部分(例えば、リンカー又はテザー)を介してオリゴヌクレオチドに結合させることができる。リンカーは、コンジュゲート基を、標的核酸に相補的なオリゴヌクレオチド又は連続ヌクレオチド配列に共有結合的にコンジュゲートするのに役立つ。
結合又はリンカーは、1つ以上の共有結合を介して目的の1つの化学基又はセグメントを目的の別の化学基又はセグメントに連結する、2つの原子間の接続である。コンジュゲート基は、直接又は連結部分(例えば、リンカー又はテザー)を介してオリゴヌクレオチドに結合させることができる。リンカーは、コンジュゲート基を、標的核酸に相補的なオリゴヌクレオチド又は連続ヌクレオチド配列に共有結合的にコンジュゲートするのに役立つ。
本発明のいくつかの実施形態では、治療用オリゴヌクレオチドは、任意に、標的核酸に相補的なオリゴヌクレオチド又は連続ヌクレオチド配列とコンジュゲートとの間に位置するリンカー領域を含む。
そのようなリンカーは、哺乳動物の体内で通常遭遇する又は遭遇するものに類似した条件下で切断可能である生理学的に不安定な結合を含むか、又はそれからなる生体切断可能なリンカーであり得る。一実施形態では、生体切断可能なリンカーは、S1ヌクレアーゼ切断の影響を受けやすい。
コンジュゲートと治療用オリゴヌクレオチドとの間に配置された生体切断可能なリンカーについては、標的組織(例えば、筋肉、肝臓、腎臓又は腫瘍)に見られる切断速度が血清に見られるものよりも大きいことが好ましい。血清に対する標的組織における切断又はS1ヌクレアーゼによる切断のレベル(%)を決定するための適切な方法は、「材料及び方法」のセクションに記載されている。いくつかの実施形態では、生体切断可能なリンカーは、標準と比較した場合、少なくとも約20%切断され、例えば少なくとも約30%切断され、例えば少なくとも約40%切断され、例えば少なくとも約50%切断され、例えば少なくとも約60%切断され、例えば少なくとも約70%切断され、例えば少なくとも約75%切断される。
好ましい実施形態では、ヌクレアーゼ感受性リンカーは、少なくとも2つの連続したホスホジエステル結合、例えば、少なくとも3つ又は4つ又は5つの連続したホスホジエステル結合を含む、1から10の間のヌクレオシド、例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10のヌクレオシド、より好ましくは2から6の間のヌクレオシド、最も好ましくは2から4の間の結合したヌクレオシドを含む。好ましくは、ヌクレオシドは、DNA又はRNAである。ホスホジエステルを含む生体切断可能なリンカー(POリンカー)は、国際公開第2014/076195号(参照することによって本明細書に組み込まれる)により詳細に記載されている。
必ずしも生体切断可能ではないが、主にコンジュゲートをオリゴヌクレオチドに共有結合的に連結するのに役立つ追加の又は代替のリンカーも、単独で又はPOリンカーと組み合わせて使用され得る。切断不可能なリンカーは、エチレングリコール、アミノ酸単位、又はアミノアルキル基などの繰り返し単位の鎖構造又はオリゴマーを含みうる。いくつかの実施形態では、切断不可能なリンカーは、例えばC6~C12アミノアルキル基を含むC2~C36アミノアルキル基などのアミノアルキルである。好ましい実施形態では、リンカーは、C6アミノアルキル基である。
B型肝炎ウイルス
本明細書で使用される「B型肝炎ウイルス」又は「HBV」は、おおよそ3,200塩基対の小さな二本鎖DNAゲノム及び肝細胞に対する親和性を有するヘパドナウイルス科のメンバーを指す。「HBV」には、様々な哺乳動物(例えば、ヒト、非ヒト霊長類など)及び鳥類(アヒル等)の宿主のいずれかに感染するB型肝炎ウイルスが含まれる。「HBV」は、任意の既知のHBV遺伝子型、例えば血清型A、B、C、D、E、F、及びG;任意のHBV血清型又はHBVサブタイプ;任意のHBV分離物;HBVバリアント、例えばHBeAg陰性バリアント、薬剤耐性HBVバリアント(例えば、ラミブジン耐性バリアント;アデホビル耐性突然変異体;テノホウイルス耐性突然変異体;エンテカビル耐性突然変異体等);などを含む。
本明細書で使用される「B型肝炎ウイルス」又は「HBV」は、おおよそ3,200塩基対の小さな二本鎖DNAゲノム及び肝細胞に対する親和性を有するヘパドナウイルス科のメンバーを指す。「HBV」には、様々な哺乳動物(例えば、ヒト、非ヒト霊長類など)及び鳥類(アヒル等)の宿主のいずれかに感染するB型肝炎ウイルスが含まれる。「HBV」は、任意の既知のHBV遺伝子型、例えば血清型A、B、C、D、E、F、及びG;任意のHBV血清型又はHBVサブタイプ;任意のHBV分離物;HBVバリアント、例えばHBeAg陰性バリアント、薬剤耐性HBVバリアント(例えば、ラミブジン耐性バリアント;アデホビル耐性突然変異体;テノホウイルス耐性突然変異体;エンテカビル耐性突然変異体等);などを含む。
「HBV」は、オルトヘパドナウイルス属のタイプ種に分類される、ヘパドナウイルス科に属する小DNAウイルスである。HBVウイルス粒子(ビリオン)は、外側脂質エンベロープと、タンパク質で構成された正二十面体ヌクレオカプシドコアとを含む。ヌクレオカプシドは、一般に、ウイルスDNA及びレトロウイルスと同様の逆転写酵素活性を有するDNAポリメラーゼを封入する。HBV外側エンベロープは、感受性細胞のウイルス結合及びその中への侵入に関与する埋め込みタンパク質を含む。肝臓を攻撃するHBVは、配列に基づいて少なくとも10の遺伝子型(A~J)に従って分類されている。一般に、ゲノムによってコードされる4つの遺伝子があり、これらの遺伝子はC、P、S及びXと呼ばれる。コアタンパク質は、遺伝子C(HBcAg)によってコードされ、その開始コドンの前には上流のインフレームAUG開始コドンがあり、そこからプレコアタンパク質が産生される。HBeAgは、プレコアタンパク質のタンパク質分解プロセシングによって産生される。DNAポリメラーゼは遺伝子Pによってコードされる。遺伝子Sは表面抗原(HBsAg)をコードする。HBsAg遺伝子は1つの長いオープンリーディングフレームであるが、遺伝子を3つの部分、すなわちプレS1、プレS2、及びSに分ける3つのインフレーム「開始」(ATG)コドンを含む。複数の開始コドンのために、大、中、及び小(プレS1+プレS2+S、プレS2+S、又はS)と呼ばれる3つの異なるサイズのポリペプチドが産生される。これらは、1:1:4の比を有し得る(Heermannら、1984年)。
B型肝炎ウイルス(HBV)タンパク質は、いくつかのカテゴリ及び機能に編成することができる。ポリメラーゼは、逆転写酵素(RT)として機能してプレゲノムRNA(pgRNA)からウイルスDNAを作製し、またDNA依存性ポリメラーゼとして機能してウイルスDNAから共有結合閉環状DNA(cccDNA)を作製する。それらは、マイナス鎖の5’末端に共有結合している。コアタンパク質は、ウイルスキャプシド及び分泌されたE抗原を作製する。表面抗原は、肝細胞内在化リガンドであり、またウイルス球状粒子及び糸状粒子の主成分でもある。Aviral粒子は、Dane粒子(感染性ビリオン)の1000倍よりも多く産生され、免疫デコイとして作用し得る。
B型肝炎ウイルス表面抗原
本明細書で使用される「B型肝炎ウイルス表面抗原」又は「HBsAg」という用語は、HBVゲノムの遺伝子S(例えば、ORF S)によってコードされるSドメインタンパク質を指す。B型肝炎ウイルス粒子は、大きな表面タンパク質、中間の表面タンパク質及び主要な表面タンパク質である、遺伝子Sによってコードされる3つのタンパク質によって包まれたコア粒子内にウイルス核酸を保有する。これらのタンパク質のうち、主要な表面タンパク質は、一般に約226アミノ酸であり、Sドメインのみを含む。
本明細書で使用される「B型肝炎ウイルス表面抗原」又は「HBsAg」という用語は、HBVゲノムの遺伝子S(例えば、ORF S)によってコードされるSドメインタンパク質を指す。B型肝炎ウイルス粒子は、大きな表面タンパク質、中間の表面タンパク質及び主要な表面タンパク質である、遺伝子Sによってコードされる3つのタンパク質によって包まれたコア粒子内にウイルス核酸を保有する。これらのタンパク質のうち、主要な表面タンパク質は、一般に約226アミノ酸であり、Sドメインのみを含む。
感染
本明細書で使用される「感染」という用語は、対象におけるウイルスなどの微生物の病原性の侵入及び/又は増殖を指す。感染は溶原性であり得、例えば、ウイルスDNAが細胞内に休眠している。あるいは、感染は溶解性であり得、例えば、ウイルスが活発に増殖し、感染細胞の破壊を引き起こす。感染は、臨床的に明らかな症状を引き起こしても、引き起こさなくてもよい。感染は、局所的なままであってもよく、又は、例えば、対象の血液又はリンパ系を介して伝播してもよい。例えば、HBV感染を有する個体は、ウイルス量、表面抗原(HBsAg)、e抗原(HBeAg)、及び当技術分野で公知のHBV感染を検出するための様々な他のアッセイの1つ又は複数を検出することによって識別することができる。HBV感染を検出するためのアッセイは、HBsAg及び/又はHBeAgの存在について血清又は血液試料を試験すること、並びに任意に、HBV抗原が検出不能なレベルであり得る任意の期間を補うために1つ又は複数のウイルス抗体(例えば、IgM及び/又はIgG)の存在についてさらにスクリーニングすることを含み得る。
本明細書で使用される「感染」という用語は、対象におけるウイルスなどの微生物の病原性の侵入及び/又は増殖を指す。感染は溶原性であり得、例えば、ウイルスDNAが細胞内に休眠している。あるいは、感染は溶解性であり得、例えば、ウイルスが活発に増殖し、感染細胞の破壊を引き起こす。感染は、臨床的に明らかな症状を引き起こしても、引き起こさなくてもよい。感染は、局所的なままであってもよく、又は、例えば、対象の血液又はリンパ系を介して伝播してもよい。例えば、HBV感染を有する個体は、ウイルス量、表面抗原(HBsAg)、e抗原(HBeAg)、及び当技術分野で公知のHBV感染を検出するための様々な他のアッセイの1つ又は複数を検出することによって識別することができる。HBV感染を検出するためのアッセイは、HBsAg及び/又はHBeAgの存在について血清又は血液試料を試験すること、並びに任意に、HBV抗原が検出不能なレベルであり得る任意の期間を補うために1つ又は複数のウイルス抗体(例えば、IgM及び/又はIgG)の存在についてさらにスクリーニングすることを含み得る。
HBV感染
用語「B型肝炎ウイルス感染症」又は「HBV感染」とは、当該技術分野では一般的に知られており、B型肝炎ウイルス(HBV)によって引き起こされ、かつ肝臓に影響を及ぼす感染性疾患を指す。HBV感染は急性感染又は慢性感染であり得る。感染者の中には、初期感染中に症状がなく、嘔吐、黄色がかった皮膚、疲労、暗色尿及び腹痛を伴う病気を急速に発症する者もいる(「B型肝炎ファクトシート204番」。who.int.2014年7月。2014年11月4日検索)。多くの場合、これらの症状は数週間続き、死に至る可能性がある。症状が始まるのに30~180日かかることがある。出生時の頃に感染した人の90%が慢性B型肝炎感染を発症し、5歳以降に感染した人の10%未満が発症する(2011年11月29日に検索された米国疾病管理予防センター(CDC)の「公衆伝染に関するB型肝炎のFAQs」)。慢性疾患を有する人の大部分は症状を有しないが、肝硬変及び肝臓癌が最終的に発症し得る(Chang,2007,Semin Fetal Neonatal Med,12:160-167)。これらの合併症は、慢性疾患を有する者の15~25%の死亡をもたらす(「B型肝炎ファクトシート204番」。who.int.2014年7月。2014年11月4日検索)。本明細書において、「HBV感染」という用語は、急性及び慢性B型肝炎感染を含む。「HBV感染」という用語はまた、HBV感染の初期感染の無症候性段階、症候性段階、並びに無症候性慢性段階を含む。
用語「B型肝炎ウイルス感染症」又は「HBV感染」とは、当該技術分野では一般的に知られており、B型肝炎ウイルス(HBV)によって引き起こされ、かつ肝臓に影響を及ぼす感染性疾患を指す。HBV感染は急性感染又は慢性感染であり得る。感染者の中には、初期感染中に症状がなく、嘔吐、黄色がかった皮膚、疲労、暗色尿及び腹痛を伴う病気を急速に発症する者もいる(「B型肝炎ファクトシート204番」。who.int.2014年7月。2014年11月4日検索)。多くの場合、これらの症状は数週間続き、死に至る可能性がある。症状が始まるのに30~180日かかることがある。出生時の頃に感染した人の90%が慢性B型肝炎感染を発症し、5歳以降に感染した人の10%未満が発症する(2011年11月29日に検索された米国疾病管理予防センター(CDC)の「公衆伝染に関するB型肝炎のFAQs」)。慢性疾患を有する人の大部分は症状を有しないが、肝硬変及び肝臓癌が最終的に発症し得る(Chang,2007,Semin Fetal Neonatal Med,12:160-167)。これらの合併症は、慢性疾患を有する者の15~25%の死亡をもたらす(「B型肝炎ファクトシート204番」。who.int.2014年7月。2014年11月4日検索)。本明細書において、「HBV感染」という用語は、急性及び慢性B型肝炎感染を含む。「HBV感染」という用語はまた、HBV感染の初期感染の無症候性段階、症候性段階、並びに無症候性慢性段階を含む。
肝臓炎症
本明細書で使用される「肝臓炎症」又は「肝炎」という用語は、特に肝毒性薬への曝露によって引き起こされ得る損傷又は感染の結果として、肝臓が腫脹、機能不全及び/又は有痛性になる身体状態を指す。症状としては、黄疸(皮膚又は眼の黄変)、疲労、脱力感、吐き気、嘔吐、食欲不振、及び体重減少が挙げられ得る。肝臓炎症は、処置せずに放置すると、線維症、肝硬変、肝不全、又は肝臓癌に進行する可能性がある。
本明細書で使用される「肝臓炎症」又は「肝炎」という用語は、特に肝毒性薬への曝露によって引き起こされ得る損傷又は感染の結果として、肝臓が腫脹、機能不全及び/又は有痛性になる身体状態を指す。症状としては、黄疸(皮膚又は眼の黄変)、疲労、脱力感、吐き気、嘔吐、食欲不振、及び体重減少が挙げられ得る。肝臓炎症は、処置せずに放置すると、線維症、肝硬変、肝不全、又は肝臓癌に進行する可能性がある。
肝線維症
本明細書で使用される「肝線維症」又は「肝臓の線維症」という用語は、炎症及び肝細胞死に起因するコラーゲン(I、III、及びIV)、フィブロネクチン、ウンドリン(undulin)、エラスチン、ラミニン、ヒアルロナン、及びプロテオグリカンを含み得る細胞外マトリックスタンパク質の肝臓への過剰な蓄積を指す。肝線維症は、処置せずに放置すると、肝硬変、肝不全、又は肝臓癌に進行し得る。
本明細書で使用される「肝線維症」又は「肝臓の線維症」という用語は、炎症及び肝細胞死に起因するコラーゲン(I、III、及びIV)、フィブロネクチン、ウンドリン(undulin)、エラスチン、ラミニン、ヒアルロナン、及びプロテオグリカンを含み得る細胞外マトリックスタンパク質の肝臓への過剰な蓄積を指す。肝線維症は、処置せずに放置すると、肝硬変、肝不全、又は肝臓癌に進行し得る。
TLR7
本明細書で使用される「TLR7」は、任意の起源種(例えば、ヒト、マウス、ウッドチャックなど)のToll様受容体7を指す。
本明細書で使用される「TLR7」は、任意の起源種(例えば、ヒト、マウス、ウッドチャックなど)のToll様受容体7を指す。
TLR7アゴニスト
本明細書中で使用される「TLR7アゴニスト」とは、TLR7のアゴニストとして作用する化合物のことを指す。別段示されない限り、TLR7アゴニストは、任意の異性体(例えば、ジアステレオマー又はエナンチオマー)、塩、溶媒和物、多形などを含む任意の薬学的に許容され得る形態の化合物を含むことができる。特定の化合物に対するTLRアゴニズムは、任意の適切な様式で決定され得る。例えば、試験化合物のTLRアゴニズムを検出するためのアッセイは、例えば、2002年12月11日に出願された米国仮特許出願第60/432,650号に記載されており、そのようなアッセイに使用するのに適した組換え細胞株は、例えば、2002年12月11日に出願された米国仮特許出願第60/432,651号に記載されている。TLR7アゴニストを評価するための更なるアッセイは、国際公開第2016/091698号の実施例43に記載されるHEK293-Blue-hTLR-7細胞アッセイである(このアッセイは参照により本明細書に組み込まれる)。
本明細書中で使用される「TLR7アゴニスト」とは、TLR7のアゴニストとして作用する化合物のことを指す。別段示されない限り、TLR7アゴニストは、任意の異性体(例えば、ジアステレオマー又はエナンチオマー)、塩、溶媒和物、多形などを含む任意の薬学的に許容され得る形態の化合物を含むことができる。特定の化合物に対するTLRアゴニズムは、任意の適切な様式で決定され得る。例えば、試験化合物のTLRアゴニズムを検出するためのアッセイは、例えば、2002年12月11日に出願された米国仮特許出願第60/432,650号に記載されており、そのようなアッセイに使用するのに適した組換え細胞株は、例えば、2002年12月11日に出願された米国仮特許出願第60/432,651号に記載されている。TLR7アゴニストを評価するための更なるアッセイは、国際公開第2016/091698号の実施例43に記載されるHEK293-Blue-hTLR-7細胞アッセイである(このアッセイは参照により本明細書に組み込まれる)。
ジアステレオマージアステレオマー
本明細書において用いられる用語「ジアステレオマー」とは、2つ以上のキラル中心を有し、その分子が互いに鏡像ではない立体異性体を意味する。ジアステレオマーは、例えば、融点、沸点、スペクトル特性、活性及び反応性等の異なる物理特性を有する。
本明細書において用いられる用語「ジアステレオマー」とは、2つ以上のキラル中心を有し、その分子が互いに鏡像ではない立体異性体を意味する。ジアステレオマーは、例えば、融点、沸点、スペクトル特性、活性及び反応性等の異なる物理特性を有する。
1個又は数個のキラル中心を含む一般式(I)~(V)の化合物は、ラセミ体、ジアステレオマー混合物、又は光学活性単一異性体のいずれかとして存在することができる。ラセミ体は、既知の方法に従ってエナンチオマーに分離することができる。特に、結晶化によって分離することができるジアステレオマー塩は、例えば、D-若しくはL-酒石酸、マンデル酸、リンゴ酸、乳酸又はカンファースルホン酸などの光学活性酸との反応によって、ラセミ混合物から形成される。
薬学的に許容され得る塩
本発明による化合物は、その薬学的に許容され得る塩の形態で存在し得る。
本発明による化合物は、その薬学的に許容され得る塩の形態で存在し得る。
用語「薬学的に許容され得る塩」は、生物学的に又はそれ以外の点で望ましくないものではない、遊離塩基又は遊離酸の生物学的な有効性及び特性を保持する塩を指す。塩は、塩酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、リン酸などの無機酸、特に塩酸、並びに、酢酸、プロピオン酸、グリコール酸、ピルビン酸、シュウ酸、マレイン酸、マロン酸、コハク酸、フマル酸、酒石酸、クエン酸、安息香酸、ケイ皮酸、マンデル酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、p-トルエンスルホン酸、サリチル酸、N-アセチルシステインなどの有機酸と共に形成される。
あるいは、これらの塩は、無機塩基又は有機塩基を遊離酸に加えることによって調製することができる。無機塩基から誘導される塩には、ナトリウム、カリウム、リチウム、アンモニウム、カルシウム、マグネシウムの塩が含まれるがこれらに限定されない。有機塩基から誘導される塩には、第一級、第二級、及び第三級アミン、天然に存在する置換アミンを含む置換アミン、環式アミン及び塩基性イオン交換樹脂、例えばイソプロピルアミン、トリメチルアミン、ジエチルアミン、トリエチルアミン、トリプロピルアミン、エタノールアミン、リジン、アルギニン、N-エチルピペリジン、ピペリジン、ポリアミン樹脂の塩が含まれるが、これらに限定されない。式(I)の化合物は、双性イオンの形態で存在することもできる。特に好ましくは、式(I)の化合物の薬学的に許容され得る塩は、塩酸、臭化水素酸、硫酸、リン酸、及びメタンスルホン酸の塩である。
医薬化合物の塩への化学修飾は、化合物の物理的及び化学的安定性、吸湿性、流動性並びに溶解性を改善するために、医薬系化学者に周知の技法である。これは例えば、Bastin,Organic Process Research&Development 2000,4,427-435 or in Ansel,In:Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems,6th ed.(1995),pp.196 and 1456-1457に記載されている。例えば、本明細書で提供される化合物の薬学的に許容され得る塩は、ナトリウム塩であり得る。
医薬組合せ
本明細書で使用される医薬組合せは、疾患を処置するための少なくとも2つの異なる活性化合物又はプロドラッグ(医療用化合物又は医薬)の組合せとして理解される。医薬組合せは、物理的、化学的、又は他の方法で組み合わせられる化合物(例えば、同じバイアル内);一緒にパッケージ化される化合物(例えば、同時投与又は別々の投与のいずれかのための同じパッケージ(キットオブパーツ)内の2つの別々の物体として);又は別々に提供されているが一緒に使用されることが意図されている化合物(例えば、組合せが化合物ラベル又は添付文書に明示的に記載されている)を含み得る。一実施形態では、医薬組合せは、経口投与用に製剤化された医療用化合物及び皮下注射用に製剤化された医療用化合物からなる。
本明細書で使用される医薬組合せは、疾患を処置するための少なくとも2つの異なる活性化合物又はプロドラッグ(医療用化合物又は医薬)の組合せとして理解される。医薬組合せは、物理的、化学的、又は他の方法で組み合わせられる化合物(例えば、同じバイアル内);一緒にパッケージ化される化合物(例えば、同時投与又は別々の投与のいずれかのための同じパッケージ(キットオブパーツ)内の2つの別々の物体として);又は別々に提供されているが一緒に使用されることが意図されている化合物(例えば、組合せが化合物ラベル又は添付文書に明示的に記載されている)を含み得る。一実施形態では、医薬組合せは、経口投与用に製剤化された医療用化合物及び皮下注射用に製剤化された医療用化合物からなる。
おおよそ
本明細書で使用する場合、「おおよそ」又は「約」という用語は、関心対象の1つ以上の値に適用される場合、記載された参照値と同様の値を指す。ある特定の実施形態では、「おおよそ」又は「約」という用語は、特に記載がない限り、又は文脈から特に明白でない限り、記載された参照値のいずれかの方向(より大きいか又はより小さい)において、25%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%又はそれより低い範囲内に収まる値の範囲を指す(このような数が、可能な値の100%を超過するであろう場合を除く)。
本明細書で使用する場合、「おおよそ」又は「約」という用語は、関心対象の1つ以上の値に適用される場合、記載された参照値と同様の値を指す。ある特定の実施形態では、「おおよそ」又は「約」という用語は、特に記載がない限り、又は文脈から特に明白でない限り、記載された参照値のいずれかの方向(より大きいか又はより小さい)において、25%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%又はそれより低い範囲内に収まる値の範囲を指す(このような数が、可能な値の100%を超過するであろう場合を除く)。
投与
本明細書で使用される「投与する」又は「投与」という用語は、薬理学的に有用な様式(例えば、対象における症状を処置するため)で対象に物質(例えば、医薬組合せ又はオリゴヌクレオチド)を提供することを意味する。
本明細書で使用される「投与する」又は「投与」という用語は、薬理学的に有用な様式(例えば、対象における症状を処置するため)で対象に物質(例えば、医薬組合せ又はオリゴヌクレオチド)を提供することを意味する。
アシアロ糖タンパク質受容体(ASGPR)
本明細書で使用される「アシアロ糖タンパク質受容体」又は「ASGPR」という用語は、主要な48kDaのサブユニット(ASGPR-1)と副次的な40kDaのサブユニット(ASGPR-2)によって形成される二成分C型レクチンを指す。ASGPRは、主に肝細胞細胞の類洞表面に発現され、末端ガラクトース残基又はN-アセチルガラクトサミン残基(アシアロ糖タンパク質)を含有する循環糖タンパク質の結合、内在化、及びその後のクリアランスにおいて主要な役割を果たす。
本明細書で使用される「アシアロ糖タンパク質受容体」又は「ASGPR」という用語は、主要な48kDaのサブユニット(ASGPR-1)と副次的な40kDaのサブユニット(ASGPR-2)によって形成される二成分C型レクチンを指す。ASGPRは、主に肝細胞細胞の類洞表面に発現され、末端ガラクトース残基又はN-アセチルガラクトサミン残基(アシアロ糖タンパク質)を含有する循環糖タンパク質の結合、内在化、及びその後のクリアランスにおいて主要な役割を果たす。
プロドラッグ
本明細書で使用される「プロドラッグ」という用語は、所望の薬理学的効果をもたらすために、生体内で、例えば生物学的流体又は酵素によって、投与後に対象によって化合物の薬理学的に活性な形態に代謝される化合物の形態又は誘導体を指す。プロドラッグは、例えば、Richard B.SilvermanによるOrganic Chemistry of Drug Design and Drug Action,Academic Press,San Diego,2004,Chapter 8 Prodrugs and Drug Delivery Systems,pp.497-558に記載されている。
本明細書で使用される「プロドラッグ」という用語は、所望の薬理学的効果をもたらすために、生体内で、例えば生物学的流体又は酵素によって、投与後に対象によって化合物の薬理学的に活性な形態に代謝される化合物の形態又は誘導体を指す。プロドラッグは、例えば、Richard B.SilvermanによるOrganic Chemistry of Drug Design and Drug Action,Academic Press,San Diego,2004,Chapter 8 Prodrugs and Drug Delivery Systems,pp.497-558に記載されている。
対象
本明細書で使用される「対象」という用語は、マウス、ウサギ、及びヒトを含む任意の哺乳動物を意味する。一実施形態では、対象は、ヒト又は非ヒト霊長類である。「個体」又は「患者」という用語は、「対象」と互換的に使用され得る。
本明細書で使用される「対象」という用語は、マウス、ウサギ、及びヒトを含む任意の哺乳動物を意味する。一実施形態では、対象は、ヒト又は非ヒト霊長類である。「個体」又は「患者」という用語は、「対象」と互換的に使用され得る。
処置
本明細書で使用される「処置」、「処置すること」、「処置する」などの用語は、一般に、所望の薬理学的及び/又は生理学的効果を得ることを意味する。この効果は、疾患及び/又は疾患に起因する有害作用を部分的又は完全に治癒するという点で治療的である。効果は、既存の状態(例えば、既存のHBV感染)に関して対象の健康及び/又は幸福を改善する目的で、又は、状態の発生の可能性を予防又は減少させる目的(例えば、肝線維症、肝炎、肝臓癌又はHBV感染に関連する他の状態を予防すること)で、治療剤(例えば、医薬組合せ又はオリゴヌクレオチド)を対象に投与することによって提供される。本明細書で使用される「処置」という用語は、対象におけるHBV感染の任意の処置を包含し、以下を含む:(a)疾患を阻害すること、すなわち、HBsAg及び/又はHBeAgの増加を阻害することのように、その発症を停止させること;又は、(b)疾患を改善すること(すなわち、緩和)、すなわち、HBsAg及び/又はHBeAg産生の抑制のように、疾患の退縮を引き起こすこと。したがって、HBV感染を改善及び/又は阻害する化合物又は化合物の組合せは、HBV感染を処置する化合物又は化合物の組合せである。好ましくは、本明細書で使用される「処置」という用語は、既に定義され顕在化したHBV感染、特に慢性HBV感染の処置のような、既に顕在化した障害の医学的介入に関する。
本明細書で使用される「処置」、「処置すること」、「処置する」などの用語は、一般に、所望の薬理学的及び/又は生理学的効果を得ることを意味する。この効果は、疾患及び/又は疾患に起因する有害作用を部分的又は完全に治癒するという点で治療的である。効果は、既存の状態(例えば、既存のHBV感染)に関して対象の健康及び/又は幸福を改善する目的で、又は、状態の発生の可能性を予防又は減少させる目的(例えば、肝線維症、肝炎、肝臓癌又はHBV感染に関連する他の状態を予防すること)で、治療剤(例えば、医薬組合せ又はオリゴヌクレオチド)を対象に投与することによって提供される。本明細書で使用される「処置」という用語は、対象におけるHBV感染の任意の処置を包含し、以下を含む:(a)疾患を阻害すること、すなわち、HBsAg及び/又はHBeAgの増加を阻害することのように、その発症を停止させること;又は、(b)疾患を改善すること(すなわち、緩和)、すなわち、HBsAg及び/又はHBeAg産生の抑制のように、疾患の退縮を引き起こすこと。したがって、HBV感染を改善及び/又は阻害する化合物又は化合物の組合せは、HBV感染を処置する化合物又は化合物の組合せである。好ましくは、本明細書で使用される「処置」という用語は、既に定義され顕在化したHBV感染、特に慢性HBV感染の処置のような、既に顕在化した障害の医学的介入に関する。
いくつかの実施形態では、処置は、対象が経験する状態(例えば、HBV感染又は関連する状態)の少なくとも1つの徴候、症状又は寄与因子の頻度又は重症度を低下させることを含む。HBV感染の間、対象は、皮膚及び眼の黄変(黄疸)、暗色尿、極度の疲労、悪心、嘔吐及び腹痛などの症状を示し得る。したがって、いくつかの実施形態では、本明細書で提供される処置、例えば医薬組合せは、そのような症状の1つ又は複数の頻度又は重症度の低下をもたらし得る。しかしながら、HBV感染は、肝硬変、肝線維症、肝臓炎症又は肝臓癌などの1つ又は複数の肝臓症状に発展し得る。したがって、いくつかの実施形態では、本明細書で提供される処置、例えば医薬組合せは、そのような状態の1つ又は複数の、頻度若しくは重症度の低下、又は予防若しくは軽減をもたらし得る。
治療有効量
「治療有効量」という用語は、対象へ投与されると、(i)特定の疾患、容態若しくは障害を処置する若しくは予防する、(ii)特定の疾患、容態若しくは障害のうちの1つ以上の症状を減弱させる、寛解させる、若しくは除去する、又は(iii)本明細書に説明する特定の疾患、容態若しくは障害のうちの1つ以上の症状の発症を予防する若しくは遅延させる、本発明の化合物又は医薬組合せの量を表す。治療有効量は、化合物、処置される疾患の状態、処置される疾患の重症度、対象の齢及び相対的な健康状態、投与の経路及び形式、担当の医師又は獣医の判断、並びに他の因子によって変わることになる。
「治療有効量」という用語は、対象へ投与されると、(i)特定の疾患、容態若しくは障害を処置する若しくは予防する、(ii)特定の疾患、容態若しくは障害のうちの1つ以上の症状を減弱させる、寛解させる、若しくは除去する、又は(iii)本明細書に説明する特定の疾患、容態若しくは障害のうちの1つ以上の症状の発症を予防する若しくは遅延させる、本発明の化合物又は医薬組合せの量を表す。治療有効量は、化合物、処置される疾患の状態、処置される疾患の重症度、対象の齢及び相対的な健康状態、投与の経路及び形式、担当の医師又は獣医の判断、並びに他の因子によって変わることになる。
賦形剤
本明細書で使用される「賦形剤」という用語は、例えば、所望の稠度又は安定化効果を提供又は寄与するために、医薬組合せの一部である医薬を含む組成物の1つ又は複数に含まれ得る非治療薬を指す。
本明細書で使用される「賦形剤」という用語は、例えば、所望の稠度又は安定化効果を提供又は寄与するために、医薬組合せの一部である医薬を含む組成物の1つ又は複数に含まれ得る非治療薬を指す。
発明の詳細な説明
本発明は、i)治療用オリゴヌクレオチド及びii)TLR7アゴニストの2つのカテゴリの化合物をそれぞれ薬学的に許容され得る担体中に含む医薬組合せに関する。医薬組合せは、B型肝炎ウイルス感染症の処置、特に慢性HBVを有する患者の処置に使用するためのものである。
本発明は、i)治療用オリゴヌクレオチド及びii)TLR7アゴニストの2つのカテゴリの化合物をそれぞれ薬学的に許容され得る担体中に含む医薬組合せに関する。医薬組合せは、B型肝炎ウイルス感染症の処置、特に慢性HBVを有する患者の処置に使用するためのものである。
組合せ中の化合物の各カテゴリの下には別々に記載されるが、各カテゴリからの少なくとも1つの化合物が医薬組合せ中に存在することが理解されるべきである。化合物は、同時に又は別々に投与することができる。HBVを標的とする治療用オリゴヌクレオチドのカテゴリの化合物は、非経口的に(例えば、静脈内、皮下、又は筋肉内)投与され得る。TLR7アゴニストは、経腸的に(例えば、経口的に又は消化管を通して)投与され得る。
第1の実施形態では、HBVを標的とする治療用オリゴヌクレオチドは、HBsAg mRNAの発現を減少させるためのRNAiオリゴヌクレオチド、好ましくはRNAiオリゴヌクレオチドである。第2の実施形態では、HBVを標的とする治療用オリゴヌクレオチドは、HBVを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド、好ましくはGalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドである。
1.本発明のRNAiオリゴヌクレオチド
いくつかの実施形態では、本発明の医薬組合せにおける第1の医薬は、治療上の利益を達成するために使用することができるHBV表面抗原発現のオリゴヌクレオチドに基づく阻害剤である。HBV表面抗原mRNAの検査及び異なるオリゴヌクレオチドの試験を通して、HBV感染を処置するためにHBV表面抗原(HBsAg)の発現を減少させるための強力なオリゴヌクレオチドが開発された。本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドは、いくつかの実施形態では、全ての既知の遺伝子型にわたって既知のHBVゲノムの>95%をカバーするHBsAg mRNA配列を標的とするように設計される。いくつかの実施形態では、そのようなオリゴヌクレオチドは、肝臓においてHBVプレゲノムRNA(pgRNA)及びHBsAg mRNAの90%を超える減少をもたらす。いくつかの実施形態では、HBsAg発現の減少は、単回用量又は処置レジメン後に長期間持続する。
いくつかの実施形態では、本発明の医薬組合せにおける第1の医薬は、治療上の利益を達成するために使用することができるHBV表面抗原発現のオリゴヌクレオチドに基づく阻害剤である。HBV表面抗原mRNAの検査及び異なるオリゴヌクレオチドの試験を通して、HBV感染を処置するためにHBV表面抗原(HBsAg)の発現を減少させるための強力なオリゴヌクレオチドが開発された。本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドは、いくつかの実施形態では、全ての既知の遺伝子型にわたって既知のHBVゲノムの>95%をカバーするHBsAg mRNA配列を標的とするように設計される。いくつかの実施形態では、そのようなオリゴヌクレオチドは、肝臓においてHBVプレゲノムRNA(pgRNA)及びHBsAg mRNAの90%を超える減少をもたらす。いくつかの実施形態では、HBsAg発現の減少は、単回用量又は処置レジメン後に長期間持続する。
したがって、いくつかの実施形態では、本明細書に提供されるオリゴヌクレオチドは、細胞内の転写物を標的化し、その発現を阻害する目的で、HBsAg mRNAに対して相補性の領域を有するように設計される。相補性の領域は、一般に、オリゴヌクレオチド(又はその鎖)をHBsAg mRNAに、その発現を阻害する目的でアニーリングすることを可能にするのに適した長さ及び塩基含有量である。いくつかの実施形態において、相補性の領域は、少なくとも12、少なくとも13、少なくとも14、少なくとも15、少なくとも16、少なくとも17、少なくとも18、少なくとも19又は少なくとも20ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、本明細書に提供されるオリゴヌクレオチドは、12~30(例えば、12~30、12~22、15~25、17~21、18~27、19~27、又は15~30)ヌクレオチド長の範囲にあるHBsAg mRNAと相補性の領域を有する。いくつかの実施形態では、本明細書に提供されるオリゴヌクレオチドは、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29又は30ヌクレオチド長である、HBsAg mRNAと相補性の領域を有する。
いくつかの実施形態では、本明細書に提供されるオリゴヌクレオチドは、HBsAgをコードするmRNA配列を標的とするように設計される。例えば、いくつかの実施形態では、以下に示される配列に対して相補性の領域を有するアンチセンス鎖を有するオリゴヌクレオチドが提供される:ACAANAAUCCUCACAAUA(配列番号33)、Nは任意のヌクレオチド(A、G、T、又はC)を指す。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖をさらに含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、以下に記載の配列に対して相補性の領域を有する:UUNUUGUGAGGAUUN(配列番号34)。いくつかの実施形態では、センス鎖は、以下に記載の配列(5’から3’に示される)に対して相補性の領域を含む:UUAUUGUGAGGAUUNUUGUC(配列番号35)。
いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、以下に記載の配列を含むか、又はそれからなる:UUAUUGUGAGGAUUNUUGUCGG(配列番号36)。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、以下に記載の配列を含むか、又はそれからなる:UUAUUGUGAGGAUUCUUGUCGG(配列番号37)。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、以下に記載の配列を含むか、又はそれからなる:UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)。いくつかの実施形態では、センス鎖は、以下に記載の配列を含むか、又はそれからなる:ACAANAAUCCUCACAAUAA(配列番号39)。いくつかの実施形態では、センス鎖は、以下に記載の配列を含むか、又はそれからなる:GACAANAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号40)。いくつかの実施形態では、センス鎖は、以下に記載の配列を含むか、又はそれからなる:GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)。いくつかの実施形態では、センス鎖は、以下に記載の配列を含むか、又はそれからなる:GACAAGAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号42)。
いくつかの実施形態では、HBsAg mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドは、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、該センス鎖は、配列番号39~42のいずれか1つに記載の配列を含み、該アンチセンス鎖は、配列番号36~38のいずれか1つに記載の配列を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、2’-フルオロ及び2’-O-メチル修飾ヌクレオチド並びに少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)部分にコンジュゲートされる。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、2’-フルオロ及び2’-O-メチル修飾ヌクレオチド並びに少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素は、リン酸類似体を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖及びセンス鎖の各々は、2’-フルオロ及び2’-O-メチル修飾ヌクレオチド並びに少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含み、アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素は、リン酸類似体を含み、センス鎖は、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)部分にコンジュゲートされている。
いくつかの実施形態では、配列番号40~42のいずれか1つに記載の配列を含むセンス鎖は、3位、8~10位、12位、13位及び17位の位置に2’-フルオロ修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、1位、2位、4~7位、11位、14~16位、18~26位及び31~36位に2’-O-メチル修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、1位と2位のヌクレオチド間にホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)部分にコンジュゲートされる。
いくつかの実施形態では、配列番号36~38のいずれか1つに記載の配列を含むアンチセンス鎖は、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位に2’-フルオロ修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位に2’-O-メチル修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、3つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、1と2位のヌクレオチド間、2と3位のヌクレオチド間、3と4位のヌクレオチド間、20と21位のヌクレオチド間、及び、21と22位のヌクレオチド間のホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素は、リン酸類似体を含む。
I.HBsAg mRNAを標的化するための二本鎖オリゴヌクレオチド
RNAi、アンチセンス、miRNAなどを含む、本開示の医薬組合せにおけるHBsAg mRNA発現を標的化するのに有用なオリゴヌクレオチドの様々な構造が存在する。本明細書又は他の場所に記載される構造のいずれも、本明細書に記載の配列を組み込む又は標的とするためのフレームワークとして使用され得る。HBV抗原発現を(例えば、RNAi経路を介して)標的とするための二本鎖オリゴヌクレオチドは、一般に、互いに二重鎖を形成するセンス鎖及びアンチセンス鎖を有する。いくつかの実施形態では、センス鎖及びアンチセンス鎖は共有結合していない。しかしながら、いくつかの実施形態では、センス鎖及びアンチセンス鎖は共有結合している。
RNAi、アンチセンス、miRNAなどを含む、本開示の医薬組合せにおけるHBsAg mRNA発現を標的化するのに有用なオリゴヌクレオチドの様々な構造が存在する。本明細書又は他の場所に記載される構造のいずれも、本明細書に記載の配列を組み込む又は標的とするためのフレームワークとして使用され得る。HBV抗原発現を(例えば、RNAi経路を介して)標的とするための二本鎖オリゴヌクレオチドは、一般に、互いに二重鎖を形成するセンス鎖及びアンチセンス鎖を有する。いくつかの実施形態では、センス鎖及びアンチセンス鎖は共有結合していない。しかしながら、いくつかの実施形態では、センス鎖及びアンチセンス鎖は共有結合している。
本発明のいくつかの実施形態では、HBsAg mRNA発現の発現を減少させるための二本鎖オリゴヌクレオチドは、RNA干渉(RNAi)に関与する。例えば、RNAiオリゴヌクレオチドは、1~5ヌクレオチドの少なくとも1つの3’オーバーハングを有する19~25ヌクレオチドのサイズを有する各鎖を用いて開発されている(例えば、米国特許第8,372,968号を参照されたい)。Dicerによって処理されて活性RNAi産物を生成する、より長いオリゴヌクレオチドも開発されている(例えば、米国特許第8,883,996号を参照されたい)。更なる研究により、鎖の1つが熱力学的に安定化するテトラループ構造を含む構造を含む、少なくとも1つの鎖の少なくとも1つの末端が二重鎖標的化領域を超えて伸長された伸長二本鎖オリゴヌクレオチドが生成された(例えば、米国特許第8,513,207号及び第8,927,705号、並びに国際公開第2010033225号を参照されたい。これらのオリゴヌクレオチドの開示について、参照により本明細書に組み込まれる)。そのような構造は、一本鎖伸長(分子の片側又は両側)並びに二本鎖伸長を含み得る。
いくつかの実施形態では、本明細書において提供されるオリゴヌクレオチドは、Dicer酵素によって切断可能である。そのようなオリゴヌクレオチドは、センス鎖の3’末端にオーバーハング(例えば、1、2又は3ヌクレオチド長)を有し得る。そのようなオリゴヌクレオチド(例えば、siRNA)は、標的RNA及び相補的なパッセンジャー鎖に対してアンチセンスである21ヌクレオチドガイド鎖を含み得、両鎖はアニールして19bpの二重鎖及び3’末端のいずれか又は両方に2つのヌクレオチドオーバーハングを形成する。23ヌクレオチドのガイド鎖及び21ヌクレオチドのパッセンジャー鎖を有するオリゴヌクレオチドを含むより長いオリゴヌクレオチド設計も利用可能であり、分子の右側(パッセンジャー鎖の3’末端/ガイド鎖の5’末端)に平滑末端があり、分子の左側(パッセンジャー鎖の5’末端/ガイド鎖の3’末端)に2ヌクレオチドの3’ガイド鎖オーバーハングがある。そのような分子には、21塩基対の二重鎖領域が存在する。例えば、米国特許第9012138号、米国特許第9012621号、及び米国特許第9193753号を参照されたい。これらの各々は、それらの関連する開示について本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示されるオリゴヌクレオチドは、両方とも17~26(例えば、17~26、20~25、19~21又は21~23)ヌクレオチド長の範囲にあるセンス鎖及びアンチセンス鎖を含み得る。いくつかの実施形態では、センス鎖及びアンチセンス鎖は、等しい長さである。いくつかの実施形態では、両方とも21~23ヌクレオチド長の範囲にあるセンス鎖及びアンチセンス鎖を有するオリゴヌクレオチドの場合、センス鎖、アンチセンス鎖、又はセンス鎖及びアンチセンス鎖の両方の3’オーバーハングは、1又は2ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、23ヌクレオチドのガイド鎖及び21ヌクレオチドのパッセンジャー鎖を有し、分子の右側(パッセンジャー鎖の3’末端/ガイド鎖の5’末端)に平滑末端があり、分子の左側(パッセンジャー鎖の5’末端/ガイド鎖の3’末端)に2ヌクレオチドの3’ガイド鎖オーバーハングがある。そのような分子には、21塩基対の二重鎖領域が存在する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、dicer酵素によって作用されると、成熟RISCに組み込まれるアンチセンス鎖をもたらす25ヌクレオチドのセンス鎖及び27ヌクレオチドのアンチセンス鎖を含む。
本明細書に開示される組成物及び方法で使用するための他のオリゴヌクレオチド設計には、16量体siRNA(例えば、Nucleic Acids in Chemistry and Biology.Blackburn(ed.),Royal Society of Chemistry,2006を参照)、shRNA(例えば、19bp又はそれより短いステムを有する;例えば、Moore et al.Methods Mol.Biol.2010;629:141-158)を参照)、ブラントsiRNA(例えば、長さ19bps;例えば、Kraynack and Baker,RNA Vol.12,p163-176(2006)を参照)、非対称siRNA(aiRNA;例えば、Sun et al.,Nat.Biotechnol.26,1379-1382(2008)を参照)、非対称短鎖二重鎖siRNA(例えば、Chang et al.,Mol Ther.2009 Apr;17(4):725-32を参照)、フォークsiRNA(例えば、Hohjoh,FEBS Letters,Vol 557,issues 1-3;Jan 2004,p 193-198を参照)、一本鎖siRNA(Elsner;Nature Biotechnology 30,1063(2012))、ダンベル形状環状siRNA(例えば、Abe et al.J Am Chem Soc 129:15108-15109(2007)を参照)、及び、低分子内部セグメント化干渉RNA(sisiRNA;例えば、Bramsen et al.,Nucleic Acids Res.2007 Sep;35(17):5886-5897を参照)が含まれる。前述の参考文献の各々は、その中の関連する開示についてその全体が参照により組み込まれる。HBsAgの発現を低減又は阻害するためにいくつかの実施形態において医薬組合せで使用され得るオリゴヌクレオチド構造のさらなる非限定的な例は、マイクロRNA(miRNA)、短ヘアピンRNA(shRNA)、及び短siRNAである(例えば、Hamilton et al.,Embo J.,2002,21(17):4671-4679を参照;米国特許出願第20090099115号も参照)。
a.アンチセンス鎖
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖は、「ガイド鎖」と呼ばれる場合がある。例えば、アンチセンス鎖がRNA誘導性サイレンシング複合体(RISC)と係合してアルゴノートタンパク質に結合することができるか、又は1つ若しくは複数の同様の因子と係合若しくは結合し、標的遺伝子の直接サイレンシングを行うことができる場合、それはガイド鎖と呼ばれ得る。いくつかの実施形態において、ガイドストランドと相補的なセンス鎖は、「パッセンジャー鎖」と呼ばれ得る。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖は、「ガイド鎖」と呼ばれる場合がある。例えば、アンチセンス鎖がRNA誘導性サイレンシング複合体(RISC)と係合してアルゴノートタンパク質に結合することができるか、又は1つ若しくは複数の同様の因子と係合若しくは結合し、標的遺伝子の直接サイレンシングを行うことができる場合、それはガイド鎖と呼ばれ得る。いくつかの実施形態において、ガイドストランドと相補的なセンス鎖は、「パッセンジャー鎖」と呼ばれ得る。
いくつかの実施形態において、本明細書中に提供されるオリゴヌクレオチドは、最大50ヌクレオチド長(例えば、最大30、最大27、最大25、最大21、又は最大19ヌクレオチド長)のアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に提供されるオリゴヌクレオチドは、少なくとも12ヌクレオチド長(例えば、少なくとも12、少なくとも15、少なくとも19、少なくとも21、少なくとも25、又は少なくとも27ヌクレオチド長)であるアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示されるオリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖は、12~50又は12~30(例えば、12~30、11~27、11~25、15~21、15~27、17~21、17~25、19~27、又は19~30)ヌクレオチド長の範囲内である。いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるオリゴヌクレオチドのいずれか1つのアンチセンス鎖は、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、又は50ヌクレオチド長である。
いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、AATCCTCACA(配列番号43)に記載の配列(5’から3’に示される)に対して相補性の領域を含む:いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、UGUGAGGAUU(配列番号44)に記載の配列(5’から3’に示される)を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、TGTGAGGATT(配列番号45)に記載の配列(5’から3’に示される)を含む。
いくつかの実施形態では、HBsAg mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドは、配列番号43に記載の配列と相補性の領域を有するアンチセンス鎖と、その3’末端に1つ又は2つの非相補的ヌクレオチドとを含むことができる。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、配列番号36~38のいずれか1つに記載のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、HBsAg mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドは、配列番号43に記載の配列と相補性の領域を有するアンチセンス鎖を含むことができ、アンチセンス鎖は、以下のいずれか1つに記載の配列を有さない(5’から3’に記載の):TATTGTGAGGATTCTTGTCA(配列番号46);CGGTATTGTGAGGATTCTTG(配列番号47);TGTGAGGATTCTTGTCAACA(配列番号48);UAUUGUGAGGAUUUUUGUCAA(配列番号49);UGCGGUAUUGUGAGGAUUCTT(配列番号50);ACAGCATTGTGAGGATTCTTGTC(配列番号51);UAUUGUGAGGAUUUUUGUCAACA(配列番号52);AUUGUGAGGAUUUUUGUCAACAA(配列番号53);及びUUGUGAGGAUUUUUGUCAACAAG(配列番号54)。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、配列番号36、37、又は38に示されるヌクレオチド配列と3ヌクレオチド以下だけ異なる。
b.センス鎖
いくつかの実施形態において、二本鎖オリゴヌクレオチドは、最大40ヌクレオチド長(例えば、最大40、最大35、最大30、最大27、最大25、最大21、最大19、最大17、又は最大12ヌクレオチド長)のセンス鎖を有し得る。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも12ヌクレオチド長(例えば、少なくとも12、少なくとも15、少なくとも19、少なくとも21、少なくとも25、少なくとも27、少なくとも30、少なくとも35、又は少なくとも38ヌクレオチド長)のセンス鎖を有し得る。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、12~50(例えば、12~40、12~36、12~32、12~28、15~40、15~36、15~32、15~28、17~21、17~25、19~27、19~30、20~40、22~40、25~40、又は32~40)ヌクレオチド長の範囲のセンス鎖を有し得る。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、、30、31、32、33、34、35、36、37、38、29、39、又は40ヌクレオチド長のセンス鎖を有し得る。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのセンス鎖は、27ヌクレオチドよりも長い(例えば、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39又は40ヌクレオチド)。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのセンス鎖は、25ヌクレオチドよりも長い(例えば、26、27、28、29又は30ヌクレオチド)。
いくつかの実施形態において、二本鎖オリゴヌクレオチドは、最大40ヌクレオチド長(例えば、最大40、最大35、最大30、最大27、最大25、最大21、最大19、最大17、又は最大12ヌクレオチド長)のセンス鎖を有し得る。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも12ヌクレオチド長(例えば、少なくとも12、少なくとも15、少なくとも19、少なくとも21、少なくとも25、少なくとも27、少なくとも30、少なくとも35、又は少なくとも38ヌクレオチド長)のセンス鎖を有し得る。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、12~50(例えば、12~40、12~36、12~32、12~28、15~40、15~36、15~32、15~28、17~21、17~25、19~27、19~30、20~40、22~40、25~40、又は32~40)ヌクレオチド長の範囲のセンス鎖を有し得る。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、、30、31、32、33、34、35、36、37、38、29、39、又は40ヌクレオチド長のセンス鎖を有し得る。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのセンス鎖は、27ヌクレオチドよりも長い(例えば、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39又は40ヌクレオチド)。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのセンス鎖は、25ヌクレオチドよりも長い(例えば、26、27、28、29又は30ヌクレオチド)。
いくつかの実施形態において、センス鎖は、その3’末端にステムループを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、その5’末端にステムループを含む。いくつかの実施形態において、ステムループを含む鎖は、2~66ヌクレオチド長(例えば、2~66、10~52、14~40、2~30、4~26、8~22、12~18、10~22、14~26、or 14~30ヌクレオチド長)の範囲である。いくつかの実施形態において、ステムループを含む鎖は、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29又は30ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、ステムは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13又は14ヌクレオチド長の二重鎖を含む。いくつかの実施形態において、ステムループは、分解(例えば、酵素分解)に対する分子のより良好な保護を提供し、標的細胞への送達のための標的化特性を容易にする。例えば、いくつかの実施形態では、ループは、オリゴヌクレオチドの遺伝子発現阻害活性に実質的に影響を与えることなく修飾を行うことができる付加ヌクレオチドを提供する。ある特定の実施形態において、ここで、センス鎖が以下に記載されるステムループを(例えばその3’末端に)含むオリゴヌクレオチドが本明細書中に提供される:S1-L-S2であって、式中、S1はS2と相補的であり、LはS1とS2との間に最大10ヌクレオチド長(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9又は10ヌクレオチド長)のループを形成する。
いくつかの実施形態において、ステムループのループ(L)は、テトラループ(例えば、ニックが入ったテトラループ構造内)である。テトラループは、リボヌクレオチド、デオキシリボヌクレオチド、修飾ヌクレオチド、及びそれらの組合せを含み得る。典型的には、テトラループは4~5ヌクレオチドを有する。
c.二重鎖の長さ
いくつかの実施形態において、センス鎖とアンチセンス鎖との間に形成される二重鎖は、少なくとも12(例えば、少なくとも15、少なくとも16、少なくとも17、少なくとも18、少なくとも19、少なくとも20、又は少なくとも21)ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、センス鎖とアンチセンス鎖との間に形成される二重鎖は、12~30ヌクレオチド長(例えば、12~30、12~27、12~22、15~25、18~30、18~22、18~25、18~27、18~30、19~30又は21~30ヌクレオチド長)の範囲である。いくつかの実施形態において、センス鎖とアンチセンス鎖との間に形成される二重鎖は、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29又は30ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、センス鎖とアンチセンス鎖との間に形成される二重鎖は、センス鎖及び/又はアンチセンス鎖の全長に及んでいない。いくつかの実施形態において、センス鎖とアンチセンス鎖との間の二重鎖は、センス鎖又はアンチセンス鎖のいずれかの全長に及ぶ。ある特定の実施形態において、センス鎖とアンチセンス鎖との間の二重鎖は、センス鎖とアンチセンス鎖の両方の全長に及ぶ。
いくつかの実施形態において、センス鎖とアンチセンス鎖との間に形成される二重鎖は、少なくとも12(例えば、少なくとも15、少なくとも16、少なくとも17、少なくとも18、少なくとも19、少なくとも20、又は少なくとも21)ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、センス鎖とアンチセンス鎖との間に形成される二重鎖は、12~30ヌクレオチド長(例えば、12~30、12~27、12~22、15~25、18~30、18~22、18~25、18~27、18~30、19~30又は21~30ヌクレオチド長)の範囲である。いくつかの実施形態において、センス鎖とアンチセンス鎖との間に形成される二重鎖は、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29又は30ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、センス鎖とアンチセンス鎖との間に形成される二重鎖は、センス鎖及び/又はアンチセンス鎖の全長に及んでいない。いくつかの実施形態において、センス鎖とアンチセンス鎖との間の二重鎖は、センス鎖又はアンチセンス鎖のいずれかの全長に及ぶ。ある特定の実施形態において、センス鎖とアンチセンス鎖との間の二重鎖は、センス鎖とアンチセンス鎖の両方の全長に及ぶ。
d.オリゴヌクレオチド末端
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、センス鎖及びアンチセンス鎖を含み、それにより、センス鎖若しくはアンチセンス鎖のいずれか、又はセンス鎖及びアンチセンス鎖の両方に3’-オーバーハングが存在する。いくつかの実施形態において、本明細書において提供されるオリゴヌクレオチドは、他の5’末端と比較して熱力学的に安定でない1つの5’末端を有する。いくつかの実施形態において、センス鎖の3’末端に平滑末端を含み、アンチセンス鎖の3’末端にオーバーハングを含む非対称オリゴヌクレオチドが提供される。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖上の3’オーバーハングは1~8ヌクレオチド長(例えば、1、2、3、4、5、6、7又は8ヌクレオチド長)である。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、センス鎖及びアンチセンス鎖を含み、それにより、センス鎖若しくはアンチセンス鎖のいずれか、又はセンス鎖及びアンチセンス鎖の両方に3’-オーバーハングが存在する。いくつかの実施形態において、本明細書において提供されるオリゴヌクレオチドは、他の5’末端と比較して熱力学的に安定でない1つの5’末端を有する。いくつかの実施形態において、センス鎖の3’末端に平滑末端を含み、アンチセンス鎖の3’末端にオーバーハングを含む非対称オリゴヌクレオチドが提供される。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖上の3’オーバーハングは1~8ヌクレオチド長(例えば、1、2、3、4、5、6、7又は8ヌクレオチド長)である。
典型的には、RNAiのオリゴヌクレオチドは、アンチセンス(ガイド)鎖の3’末端に2つのヌクレオチドオーバーハングを有する。しかしながら、他のオーバーハングも可能である。いくつかの実施形態において、オーバーハングは、1~6ヌクレオチド、任意に、1~5、1~4、1~3、1~2、2~6、2~5、2~4、2~3、3~6、3~5、3~4、4~6、4~5、5~6ヌクレオチド又は1、2、3、4、5又は6ヌクレオチドの長さを含む3’オーバーハングである。しかしながら、いくつかの実施形態では、オーバーハングは、1~6ヌクレオチド、任意に、1~5、1~4、1~3、1~2、2~6、2~5、2~4、2~3、3~6、3~5、3~4、4~6、4~5、5~6ヌクレオチド、又は1、2、3、4、5又は6ヌクレオチドの長さを含む5’オーバーハングである。
いくつかの実施形態において、センス鎖及び/又はアンチセンス鎖の3’末端又は5’末端の1つ又は複数(例えば、2、3、4個)の末端ヌクレオチドが修飾される。例えば、いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖の3’末端の1つ又は2つの末端ヌクレオチドが修飾される。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖の3’末端の最後のヌクレオチドは、修飾されており、例えば、2’-修飾、例えば、2’-O-メトキシエチルを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖の3’末端における最後の1つ又は2つの末端ヌクレオチドは標的と相補的である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖の3’末端における最後の1つ又は2つのヌクレオチドは標的と相補的ではない。
いくつかの実施形態において、ニックが入ったテトラループ構造を3’末端センス鎖に有し、そのアンチセンス鎖の3’末端に2つの末端オーバーハングヌクレオチドを有する二本鎖オリゴヌクレオチドが提供される。いくつかの実施形態において、2つの末端オーバーハングヌクレオチドはGGである。典型的には、アンチセンス鎖の2つの末端GGヌクレオチドの一方又は両方は、標的と相補的であるか、又は相補的ではない。
いくつかの実施形態において、センス鎖又はアンチセンス鎖の5’末端及び/又は3’末端は逆キャップヌクレオチドを有する。
いくつかの実施形態において、1つ又は複数(例えば、2、3、4、5、6個)の修飾ヌクレオチド間結合が、センス鎖及び/又はアンチセンス鎖の3’末端又は5’末端の末端ヌクレオチドの間に提供される。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオチド間結合が、センス鎖及び/又はアンチセンス鎖の3’末端又は5’末端におけるオーバーハングヌクレオチドの間に提供される。
e.ミスマッチ
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、センス鎖とアンチセンス鎖との間に1つ又は複数(例えば、1、2、3、4、5個)のミスマッチを有し得る。センス鎖とアンチセンス鎖との間に2つ以上のミスマッチがある場合、それらは連続的に(例えば、連続して2、3又はそれを超えて)配置され得るか、又は相補性の領域全体に散在し得る。いくつかの実施形態において、センス鎖の3’末端は、1つ又は複数のミスマッチを含有する。一実施形態において、2つのミスマッチがセンス鎖の3’末端に組み込まれる。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのセンス鎖の3’末端におけるセグメントの塩基ミスマッチ又は不安定化は、おそらくDicerによるプロセシングを促進することによって、RNAiにおける合成二重鎖の効力を改善した。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、センス鎖とアンチセンス鎖との間に1つ又は複数(例えば、1、2、3、4、5個)のミスマッチを有し得る。センス鎖とアンチセンス鎖との間に2つ以上のミスマッチがある場合、それらは連続的に(例えば、連続して2、3又はそれを超えて)配置され得るか、又は相補性の領域全体に散在し得る。いくつかの実施形態において、センス鎖の3’末端は、1つ又は複数のミスマッチを含有する。一実施形態において、2つのミスマッチがセンス鎖の3’末端に組み込まれる。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのセンス鎖の3’末端におけるセグメントの塩基ミスマッチ又は不安定化は、おそらくDicerによるプロセシングを促進することによって、RNAiにおける合成二重鎖の効力を改善した。
いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、対応する転写物配列と比較して1つ又は複数のミスマッチを含むHBsAg転写物に対して相補性の領域を有し得る。オリゴヌクレオチド上の相補性の領域は、適切なハイブリダイゼーション条件下で転写物と相補的塩基対を形成する能力を維持する限り、最大1、最大2、最大3、最大4、最大5などのミスマッチを有し得る。あるいは、オリゴヌクレオチドの相補性の領域は、適切なハイブリダイゼーション条件下でHBsAg mRNAと相補的塩基対を形成する能力を維持する限り、1個以下、2個以下、3個以下、4個以下又は5個以下のミスマッチを有し得る。いくつかの実施形態では、相補性の領域に2つ以上のミスマッチがある場合、オリゴヌクレオチドが適切なハイブリダイゼーション条件下でHBsAg mRNAと相補的塩基対を形成する能力を維持する限り、それらは連続的に(例えば、連続して2、3、4、又はそれ以上)配置されるか、又は相補性の領域全体に散在し得る。
II.一本鎖オリゴヌクレオチド
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のHBsAg発現を減少させるためのRNAiオリゴヌクレオチドは、HBsAg mRNAと相補性を有する一本鎖オリゴヌクレオチドである。そのような構造には、一本鎖RNAiオリゴヌクレオチドが含まれ得るが、これらに限定されない。最近の試みにより、一本鎖RNAiオリゴヌクレオチドの活性が実証されている(例えば、Matsui et al.(May 2016),Molecular Therapy,Vol.24(5),946-955を参照されたい)。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のHBsAg発現を減少させるためのRNAiオリゴヌクレオチドは、HBsAg mRNAと相補性を有する一本鎖オリゴヌクレオチドである。そのような構造には、一本鎖RNAiオリゴヌクレオチドが含まれ得るが、これらに限定されない。最近の試みにより、一本鎖RNAiオリゴヌクレオチドの活性が実証されている(例えば、Matsui et al.(May 2016),Molecular Therapy,Vol.24(5),946-955を参照されたい)。
そのような一本鎖RNAiオリゴヌクレオチドは、技術的にはアンチセンスオリゴヌクレオチドと見なされ得るが、依然としてRNA干渉の機構を介して機能することができ、RNAiオリゴヌクレオチドについて本明細書に記載されるような特徴を有する。
2.本発明の特定のRNAiオリゴヌクレオチド
参照を容易にし、不必要な繰り返しを避けるために、本明細書に記載の本発明のRNAiオリゴヌクレオチドのいくつかの定義は、以下の「RNAi番号」によっても参照される。
参照を容易にし、不必要な繰り返しを避けるために、本明細書に記載の本発明のRNAiオリゴヌクレオチドのいくつかの定義は、以下の「RNAi番号」によっても参照される。
一実施形態では、本発明の医薬組合せ中のRNAiオリゴヌクレオチドは、HBVを標的とするオリゴヌクレオチドである。このRNAiオリゴヌクレオチドは、本明細書ではRNAi番号1とも呼ばれる。
一実施形態では、本発明の医薬組合せ中のRNAiオリゴヌクレオチドは、HBsAg mRNAを標的とするオリゴヌクレオチドである。このRNAiオリゴヌクレオチドは、本明細書ではRNAi番号2とも呼ばれる。
一実施形態では、本発明の医薬組合せ中のRNAiオリゴヌクレオチドは、HBsAg mRNAの発現を減少させるオリゴヌクレオチドである。このRNAiオリゴヌクレオチドは、本明細書ではRNAi番号3とも呼ばれる。
一実施形態では、本発明の医薬組合せにおけるRNAiオリゴヌクレオチドは、19~30ヌクレオチド長のアンチセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドであり、アンチセンス鎖は、ACAANAAUCCUCACAAUA(配列番号33に記載のHBsAg mRNAの配列に対して相補性の領域を含む。このRNAiオリゴヌクレオチドは、本明細書ではRNAi番号4とも呼ばれる。
一実施形態では、本発明の医薬組合せにおけるRNAiオリゴヌクレオチドは、HBsAg mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドであり、該オリゴヌクレオチドは、19~30ヌクレオチド長のアンチセンス鎖を含み、アンチセンス鎖は、ACAANAAUCCUCACAAUA(配列番号33に記載のHBsAg mRNAの配列に対して相補性の領域を含む。このRNAiオリゴヌクレオチドは、本明細書ではRNAi番号5とも呼ばれる。
一実施形態において、本発明の医薬組合せにおけるRNAiオリゴヌクレオチドは、B型肝炎ウイルス表面抗原(HBsAg)mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドであり、該オリゴヌクレオチドは、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、
センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3、8~10、12、13及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1と2位のヌクレオチド間のホスホロチオエート結合を含む、配列からなり、センス鎖上の-GAAA-配列の各ヌクレオチドは、一価GalNac部分にコンジュゲートされており、
アンチセンス鎖は、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに、1と2位のヌクレオチド間、2と3位のヌクレオチド間、3と4位のヌクレオチド間、20と21位のヌクレオチド間、及び21と22位のヌクレオチド間のホスホロチオエート結合を含む配列からなり、
アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素は、メトキシホスホネート(MOP)を含む。このRNAiオリゴヌクレオチドは、本明細書ではRNAi番号6とも呼ばれる。
センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3、8~10、12、13及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1と2位のヌクレオチド間のホスホロチオエート結合を含む、配列からなり、センス鎖上の-GAAA-配列の各ヌクレオチドは、一価GalNac部分にコンジュゲートされており、
アンチセンス鎖は、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに、1と2位のヌクレオチド間、2と3位のヌクレオチド間、3と4位のヌクレオチド間、20と21位のヌクレオチド間、及び21と22位のヌクレオチド間のホスホロチオエート結合を含む配列からなり、
アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素は、メトキシホスホネート(MOP)を含む。このRNAiオリゴヌクレオチドは、本明細書ではRNAi番号6とも呼ばれる。
一実施形態において、本発明の医薬組合せにおけるRNAiオリゴヌクレオチドは、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドであり、
センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3、8~10、12、13及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1と2位のヌクレオチド間の1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、配列を含み、センス鎖上の-GAAA-配列の各ヌクレオチドは、一価GalNac部分にコンジュゲートされており、-GAAA-配列は、以下の構造:
を含み、
アンチセンス鎖は、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20-22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに、ヌクレオチド1と2、2と3、3と4、20と21、及び21と22の間に5つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む配列を含み、アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素は以下の構造:
を有する。
センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3、8~10、12、13及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1と2位のヌクレオチド間の1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、配列を含み、センス鎖上の-GAAA-配列の各ヌクレオチドは、一価GalNac部分にコンジュゲートされており、-GAAA-配列は、以下の構造:
アンチセンス鎖は、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20-22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに、ヌクレオチド1と2、2と3、3と4、20と21、及び21と22の間に5つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む配列を含み、アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素は以下の構造:
このRNAiオリゴヌクレオチドは、本明細書ではRNAi番号7とも呼ばれる。一実施形態では、RNAi番号7は、HBsAg mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドである。一実施形態において、RNAi番号7のセンス鎖若しくはアンチセンス鎖、又はアンチセンス鎖とセンス鎖の両方は、RNAi番号7におけるこれらの鎖について上述したそれぞれの配列からなる。RNAi番号7における一実施形態では、配列番号41は5’-GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC-3’であり、及び/又は配列番号38は5’-UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG-3’である。
一実施形態において、本発明の医薬組合せにおけるRNAiオリゴヌクレオチドは、図29Aに示される構造を有する。このRNAiオリゴヌクレオチドは、本明細書ではRNAi番号8とも呼ばれる。
一実施形態において、本発明の医薬組合せにおけるRNAiオリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドHBV(s)-219である。このRNAiオリゴヌクレオチドは、本明細書ではRNAi番号9とも呼ばれる。
3.本発明のRNAi剤のオリゴヌクレオチド修飾
このセクションで論じられる修飾は、本発明のRNAiオリゴヌクレオチドでの実施に特に好ましい。
このセクションで論じられる修飾は、本発明のRNAiオリゴヌクレオチドでの実施に特に好ましい。
オリゴヌクレオチドは、特異性、安定性、送達、バイオアベイラビリティ、ヌクレアーゼ分解からの耐性、免疫原性、塩基対形成特性、RNA分布及び細胞取り込み、並びに治療的又は研究的使用に関連する他の特徴を改善又は制御するために様々な方法で修飾され得る。例えば、Bramsen et al.,Nucleic Acids Res.,2009,37,2867-2881;Bramsen and Kjems(Frontiers in Genetics,3(2012):1-22)を参照のこと。したがって、いくつかの実施形態において、本開示の治療用オリゴヌクレオチドは、1つ又は複数の適切な修飾を含んでいてもよい。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオチドは、その塩基(又は核酸塩基)、糖(例えば、リボース、デオキシリボース)又はリン酸基において修飾を有する。
オリゴヌクレオチド上の修飾の数及びそれらのヌクレオチド修飾の位置は、オリゴヌクレオチドの特性に影響を及ぼし得る。例えば、オリゴヌクレオチドは、それらを脂質ナノ粒子(LNP)又は同様の担体にコンジュゲートさせるか又は包含することによって、インビボで送達され得る。しかしながら、オリゴヌクレオチドがLNP又は同様の担体によって保護されていない場合、そのヌクレオチドの少なくともいくつかが修飾されることが有利であり得る。したがって、本明細書中に提供される治療用オリゴヌクレオチドのいずれかの特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドのヌクレオチドの全て又は実質的に全てが修飾される。ある特定の実施形態では、ヌクレオチドの半分よりも多くが修飾される。特定の実施形態では、ヌクレオチドの半分未満が修飾される。典型的には、裸の送達では、全ての糖が2’位で修飾される。これらの修飾は可逆的又は不可逆的であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるオリゴヌクレオチドは、所望の特徴(例えば、酵素分解からの保護、インビボ投与後に所望の細胞を標的化する能力、及び/又は熱力学的安定性)を引き起こすのに十分な数及び種類の修飾ヌクレオチドを有する。
I.糖修飾
いくつかの実施形態では、修飾された糖(本明細書では糖類似体とも呼ばれる)は、修飾されたデオキシリボース又はリボース部分を含み、例えば、1つ又は複数の修飾が糖の2’、3’、4’及び/又は5’炭素位置で起こる。いくつかの実施形態では、修飾された糖はまた、非天然の代替炭素構造、例えば、ロックド核酸(「LNA」)(例えばKoshkin et al.(1998),Tetrahedron 54,3607-3630を参照)、アンロックド核酸(「UNA」)(例えば、Snead et al.(2013),Molecular Therapy-Nucleic Acids,2,e103を参照)、及び架橋核酸(「BNA」)(例えば、Imanishi and Obika(2002),The Royal Society of Chemistry,Chem.Commun.,1653-1659を参照)に存在するものを含み得る。Koshkin et al.、Snead et al.、及び、Imanishi and Obikaは、糖修飾に関するそれらの開示について参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、修飾された糖(本明細書では糖類似体とも呼ばれる)は、修飾されたデオキシリボース又はリボース部分を含み、例えば、1つ又は複数の修飾が糖の2’、3’、4’及び/又は5’炭素位置で起こる。いくつかの実施形態では、修飾された糖はまた、非天然の代替炭素構造、例えば、ロックド核酸(「LNA」)(例えばKoshkin et al.(1998),Tetrahedron 54,3607-3630を参照)、アンロックド核酸(「UNA」)(例えば、Snead et al.(2013),Molecular Therapy-Nucleic Acids,2,e103を参照)、及び架橋核酸(「BNA」)(例えば、Imanishi and Obika(2002),The Royal Society of Chemistry,Chem.Commun.,1653-1659を参照)に存在するものを含み得る。Koshkin et al.、Snead et al.、及び、Imanishi and Obikaは、糖修飾に関するそれらの開示について参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態において、糖におけるヌクレオチド修飾は、2’修飾を含む。2’修飾は、2’-アミノエチル、2’-フルオロ、2’-O-メチル、2’-O-メトキシエチル、及び2’-デオキシ-2’-フルオロ-β-d-アラビノ核酸であり得る。典型的には、修飾は、2’-フルオロ、2’-O-メチル又は2’-O-メトキシエチルである。いくつかの実施形態では、糖の修飾は、糖環の修飾を含み、これは糖環の1つ又は複数の炭素の修飾を含み得る。例えば、ヌクレオチドの糖の修飾は、糖の2’-酸素が糖の1’-炭素又は4’-炭素に結合しているか、又は2’-酸素がエチレン又はメチレン架橋を介して1’-炭素又は4’-炭素に結合していることを含み得る。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオチドは、2’-炭素-3’-炭素結合を欠く非環式糖を有する。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオチドは、例えば糖の4’位にチオール基を有する。
いくつかの実施形態において、末端3’-末端基(例えば、3’-ヒドロキシル)は、リン酸基又は他の基であり、例えば、リンカー、アダプター若しくは標識を付着させるために、又はオリゴヌクレオチドを別の核酸に直接ライゲーションするために使用することができる。
II.5’末端リン酸
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドの5’末端リン酸基は、アルゴノート2との相互作用を増強する。しかしながら、5’-リン酸基を含むオリゴヌクレオチドは、ホスファターゼ又は他の酵素を介して分解されやすく、インビボでのそれらのバイオアベイラビリティを制限する可能性がある。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、そのような分解に耐性の5’リン酸の類似体を含む。いくつかの実施形態では、リン酸類似体は、オキシメチルホスホネート、ビニルホスホネート、又はマロニルホスホネートであり得る。ある特定の実施形態では、オリゴヌクレオチド鎖の5’末端は、天然の5’リン酸基(「リン酸模倣物」)の静電特性及び立体特性を模倣する化学部分に結合している(例えば、Prakash et al.(2015),Nucleic Acids Res.,Nucleic Acids Res.2015 Mar 31;43(6):2993-3011を参照のこと。リン酸類似体に関するその内容は参照により本明細書に組み込まれる)。5’末端に結合することができる多くのリン酸模倣物が開発されている(例えば、米国特許第8,927,513号を参照されたい。リン酸類似体に関するその内容が参照により本明細書に組み込まれる)。オリゴヌクレオチドの5’末端に対する他の修飾が開発されている(例えば、国際公開第2011/133871号を参照されたい。リン酸類似体に関するその内容は参照により本明細書に組み込まれる)。ある特定の実施形態において、ヒドロキシル基は、オリゴヌクレオチドの5’末端に結合している。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドの5’末端リン酸基は、アルゴノート2との相互作用を増強する。しかしながら、5’-リン酸基を含むオリゴヌクレオチドは、ホスファターゼ又は他の酵素を介して分解されやすく、インビボでのそれらのバイオアベイラビリティを制限する可能性がある。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、そのような分解に耐性の5’リン酸の類似体を含む。いくつかの実施形態では、リン酸類似体は、オキシメチルホスホネート、ビニルホスホネート、又はマロニルホスホネートであり得る。ある特定の実施形態では、オリゴヌクレオチド鎖の5’末端は、天然の5’リン酸基(「リン酸模倣物」)の静電特性及び立体特性を模倣する化学部分に結合している(例えば、Prakash et al.(2015),Nucleic Acids Res.,Nucleic Acids Res.2015 Mar 31;43(6):2993-3011を参照のこと。リン酸類似体に関するその内容は参照により本明細書に組み込まれる)。5’末端に結合することができる多くのリン酸模倣物が開発されている(例えば、米国特許第8,927,513号を参照されたい。リン酸類似体に関するその内容が参照により本明細書に組み込まれる)。オリゴヌクレオチドの5’末端に対する他の修飾が開発されている(例えば、国際公開第2011/133871号を参照されたい。リン酸類似体に関するその内容は参照により本明細書に組み込まれる)。ある特定の実施形態において、ヒドロキシル基は、オリゴヌクレオチドの5’末端に結合している。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、糖の4’-炭素位置にリン酸類似体(「4’-リン酸類似体」と呼ばれる)を有する。例えば、2016年9月2日に出願され4’-Phosphate Analogs and Oligonucleotides Comprising the Sameと題された米国仮特許出願第62/383,207号、及び、2016年9月12日に出願され4’-Phosphate Analogs and Oligonucleotides Comprising the Sameと題された米国仮特許出願第62/393,401号を参照されたい。これらの各々のリン酸類似体に関する内容は、参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態において、本明細書において提供されるオリゴヌクレオチドは、5’末端ヌクレオチドに4’-リン酸類似体を含む。いくつかの実施形態では、リン酸類似体は、オキシメチル基の酸素原子が糖部分(例えばその4’-炭素)に結合しているオキシメチルホスホネート又はその類似体である。他の実施形態では、4’リン酸類似体は、チオメチルホスホネート又はアミノメチルホスホネート(チオメチル基の硫黄原子又はアミノメチル基の窒素原子が糖部分の4’-炭素に結合している)又はその類似体である。ある特定の実施形態において、4’リン酸類似体は、オキシメチルホスホネートである。いくつかの実施形態では、オキシメチルホスホネートは、式-O-CH2-PO(OH)2又は-O-CH2-PO(OR)2で表され、式中、Rは、H、CH3アルキル基、CH2CH2CN、CH2OCOC(CH3)3、CH2OCH2CH2Si(CH3)3、又は保護基から独立して選択される。ある特定の実施形態において、アルキル基は、CH2CH3である。より典型的には、Rは、H、CH3又はCH2CH3から独立して選択される。
ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドに結合したリン酸類似体は、メトキシホスホネート(MOP)である。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドに結合したリン酸類似体は、5’モノメチル保護MOPである。いくつかの実施形態では、リン酸類似体を含む以下のウリジンヌクレオチドが、例えば、ガイド(アンチセンス)鎖の1位で使用され得る。
この修飾ヌクレオチドは、[Meホスホン酸-4O-mU]又は5’-メトキシ、ホスホン酸-4’オキシ-2’-O-メチルウリジンと呼ばれる。
III.修飾ヌクレオシド間結合
いくつかの実施形態において、リン酸修飾又は置換は、少なくとも1つ(例えば、少なくとも1つ、少なくとも2つ、少なくとも3つ又は少なくとも5つ)の修飾ヌクレオチド間結合を含むオリゴヌクレオチドをもたらし得る。いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるオリゴヌクレオチドのいずれか1つは、1~10個(例えば、1~10、2~8、4~6、3~10、5~10、1~5、1~3、又は1~2個)の修飾ヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示されるオリゴヌクレオチドのいずれか1つは、1、2、3、4、5、6、7、8、9又は10個の修飾ヌクレオチド間結合を含む。
いくつかの実施形態において、リン酸修飾又は置換は、少なくとも1つ(例えば、少なくとも1つ、少なくとも2つ、少なくとも3つ又は少なくとも5つ)の修飾ヌクレオチド間結合を含むオリゴヌクレオチドをもたらし得る。いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるオリゴヌクレオチドのいずれか1つは、1~10個(例えば、1~10、2~8、4~6、3~10、5~10、1~5、1~3、又は1~2個)の修飾ヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示されるオリゴヌクレオチドのいずれか1つは、1、2、3、4、5、6、7、8、9又は10個の修飾ヌクレオチド間結合を含む。
修飾ヌクレオチド間結合は、ホスホロチオエート結合、ホスホロチオエート結合、ホスホトリエステル結合、チオノアルキルホスホネート結合、チオノアルキルホスホトリエステル結合、ホスホラミダイト結合、ホスホネート結合又はボラノホスフェート結合であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるオリゴヌクレオチドのいずれか1つの少なくとも1つの修飾ヌクレオチド間結合は、ホスホロチオエート結合である。
IV.塩基修飾
いくつかの実施形態において、本明細書において提供されるオリゴヌクレオチドは、1つ又は複数の修飾核酸塩基を有する。いくつかの実施形態において、修飾核酸塩基(本明細書では塩基類似体とも呼ばれる)は、ヌクレオチド糖部分の1’位に連結されている。ある特定の実施形態では、修飾核酸塩基は窒素塩基である。ある特定の実施形態では、修飾核酸塩基は窒素原子を含まない。例えば、米国特許出願公開第20080274462号を参照されたい。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオチドは、ユニバーサル塩基を含む。しかしながら、ある特定の実施形態では、修飾ヌクレオチドは核酸塩基を含有しない(脱塩基性)。
いくつかの実施形態において、本明細書において提供されるオリゴヌクレオチドは、1つ又は複数の修飾核酸塩基を有する。いくつかの実施形態において、修飾核酸塩基(本明細書では塩基類似体とも呼ばれる)は、ヌクレオチド糖部分の1’位に連結されている。ある特定の実施形態では、修飾核酸塩基は窒素塩基である。ある特定の実施形態では、修飾核酸塩基は窒素原子を含まない。例えば、米国特許出願公開第20080274462号を参照されたい。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオチドは、ユニバーサル塩基を含む。しかしながら、ある特定の実施形態では、修飾ヌクレオチドは核酸塩基を含有しない(脱塩基性)。
いくつかの実施形態では、ユニバーサル塩基は、修飾ヌクレオチド中のヌクレオチド糖部分の1’位に位置する複素環部分、又は二重鎖中に存在する場合に二重鎖の構造を実質的に変化させることなく2種類以上の塩基の反対側に位置することができるヌクレオチド糖部分置換の等価な位置である。いくつかの実施形態では、標的核酸に完全に相補的な参照一本鎖核酸(例えば、オリゴヌクレオチド)と比較して、ユニバーサル塩基を含有する一本鎖核酸は、相補的核酸で形成された二重鎖よりも低いTmを有する標的核酸との二重鎖を形成する。しかし、いくつかの実施形態では、ユニバーサル塩基が塩基で置換されて単一のミスマッチが生じる参照一本鎖核酸と比較して、ユニバーサル塩基を含む一本鎖核酸は、ミスマッチ塩基を含む核酸で形成された二重鎖よりも高いTmを有する標的核酸との二重鎖を形成する。
ユニバーサル結合ヌクレオチドの非限定的な例としては、イノシン、1-β-D-リボフラノシル-5-ニトロインドール、及び/又は1-β-D-リボフラノシル-3-ニトロピロールが挙げられる(Quayらによる米国特許出願公開米国特許第20070254362号明細書;Van Aerschot et al.,An acyclic 5-nitroindazole nucleoside analogue as ambiguous nucleoside,Nucleic Acids Res.1995 Nov 11;23(21):4363-70;Loakes et al.,3-Nitropyrrole and 5-nitroindole as universal bases in primers for DNA sequencing and PCR,Nucleic Acids Res.1995 Jul 11;23(13):2361-6;Loakes and Brown,5-Nitroindole as an universal base analogue,Nucleic Acids Res.1994 Oct 11;22(20):4039-43。上記の各々は、塩基修飾に関連するそれらの開示について参照により本明細書に組み込まれる)。
V.可逆的修飾
標的細胞に到達する前にオリゴヌクレオチドをインビボ環境から保護するための特定の修飾を行うことができるが、それにより、一旦標的細胞の細胞質ゾルに到達するとオリゴヌクレオチドの効力又は活性を低下し得る。可逆的修飾は、分子が細胞の外側で望ましい特性を保持するように行うことができ、その後、細胞の細胞質ゾル環境に入ると除去される。可逆的修飾は、例えば、細胞内酵素の作用又は細胞内の化学的条件によって(例えば、細胞内グルタチオンによる還元を介して)除去することができる。
標的細胞に到達する前にオリゴヌクレオチドをインビボ環境から保護するための特定の修飾を行うことができるが、それにより、一旦標的細胞の細胞質ゾルに到達するとオリゴヌクレオチドの効力又は活性を低下し得る。可逆的修飾は、分子が細胞の外側で望ましい特性を保持するように行うことができ、その後、細胞の細胞質ゾル環境に入ると除去される。可逆的修飾は、例えば、細胞内酵素の作用又は細胞内の化学的条件によって(例えば、細胞内グルタチオンによる還元を介して)除去することができる。
いくつかの実施形態では、可逆的に修飾ヌクレオチドは、グルタチオン感受性部分を含む。典型的には、核酸分子は、環状ジスルフィド部分で化学的に修飾されて、ヌクレオチド間二リン酸結合によって生成される負電荷をマスクし、細胞取り込み及びヌクレアーゼ耐性を改善する。Traversa Therapeutics,Inc.に最初に譲渡された米国特許出願公開第2011/0294869号(「Traversa」)、Solstice Biologics,Ltd.のPCT公開番号WO 2015/188197(「Solstice」)、Meade et al.,Nature Biotechnology,2014,32:1256-1263(「Meade」)、Merck Sharp&Dohme CorpのPCT公開番号WO 2014/088920を参照。これらの各々は、そのような修正の開示について参照により組み込まれる。ヌクレオチド間二リン酸結合のこの可逆的修飾は、細胞質ゾルの還元環境(例えば、グルタチオン)によって細胞内で切断されるように設計されている。以前の例には、細胞内で切断可能であると報告された中和ホスホトリエステル修飾が含まれる(Dellinger et al.J.Am.Chem.Soc.2003,125:940-950)。
いくつかの実施形態において、そのような可逆的修飾は、オリゴヌクレオチドがヌクレアーゼ及び他の過酷な環境条件(例えば、pH)に曝露されるインビボ投与(例えば、血液及び/又は細胞のリソソーム/エンドソーム区画を通過する)中の保護を可能にする。グルタチオンレベルが細胞外空間と比較して高い細胞の細胞質ゾルに放出されると、修飾が逆転し、切断されたオリゴヌクレオチドが得られる。可逆的グルタチオン感受性部分を使用すると、不可逆的な化学修飾を使用して利用可能な選択肢と比較して、目的のオリゴヌクレオチドに立体的により大きな化学基を導入することが可能である。これは、これらのより大きな化学基が細胞質ゾルで除去され、したがって、細胞の細胞質ゾル内のオリゴヌクレオチドの生物学的活性を妨げないからである。結果として、これらのより大きな化学基は、ヌクレアーゼ耐性、親油性、電荷、熱安定性、特異性、及び免疫原性の低下などの様々な利点をヌクレオチド又はオリゴヌクレオチドに与えるように操作することができる。いくつかの実施形態では、グルタチオン感受性部分の構造を、その放出の動態を改変するように操作することができる。
いくつかの実施形態では、グルタチオン感受性部分は、ヌクレオチドの糖に結合している。いくつかの実施形態では、グルタチオン感受性部分は、修飾ヌクレオチドの糖の2’-炭素に結合している。いくつかの実施形態では、グルタチオン感受性部分は、特に修飾ヌクレオチドがオリゴヌクレオチドの5’末端ヌクレオチドである場合、糖の5’炭素に位置する。いくつかの実施形態では、グルタチオン感受性部分は、特に修飾ヌクレオチドがオリゴヌクレオチドの3’末端ヌクレオチドである場合、糖の3’炭素に位置する。いくつかの実施形態では、グルタチオン感受性部分はスルホニル基を含む。例えば、2016年8月23日に出願されCompositions Comprising Reversibly Modified Oligonucleotides and Uses Thereofと題された米国特許仮出願第62/378,635号を参照されたい。その内容は、その関連する開示について参照により本明細書に組み込まれる。
IV.標的化リガンド
いくつかの実施形態において、本開示のオリゴヌクレオチドを1つ若しくは複数の細胞又は1つ若しくは複数の器官に標的化することが望ましい場合がある。そのような戦略は、他の器官における望ましくない影響を回避するのに役立ち得るか、又はオリゴヌクレオチドにとって利益にならない細胞、組織若しくは器官へのオリゴヌクレオチドの過度の喪失を回避し得る。したがって、いくつかの実施形態において、本明細書中に開示されるオリゴヌクレオチドは、特定の組織、細胞又は器官の標的化を容易にするために、例えば、肝臓へのオリゴヌクレオチドの送達を容易にするために修飾され得る。ある特定の実施形態において、本明細書中に開示されるオリゴヌクレオチドは、肝臓の肝細胞へのオリゴヌクレオチドの送達を容易にするために修飾され得る。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、1つ又は複数の標的化リガンドにコンジュゲートさせたヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態において、本開示のオリゴヌクレオチドを1つ若しくは複数の細胞又は1つ若しくは複数の器官に標的化することが望ましい場合がある。そのような戦略は、他の器官における望ましくない影響を回避するのに役立ち得るか、又はオリゴヌクレオチドにとって利益にならない細胞、組織若しくは器官へのオリゴヌクレオチドの過度の喪失を回避し得る。したがって、いくつかの実施形態において、本明細書中に開示されるオリゴヌクレオチドは、特定の組織、細胞又は器官の標的化を容易にするために、例えば、肝臓へのオリゴヌクレオチドの送達を容易にするために修飾され得る。ある特定の実施形態において、本明細書中に開示されるオリゴヌクレオチドは、肝臓の肝細胞へのオリゴヌクレオチドの送達を容易にするために修飾され得る。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、1つ又は複数の標的化リガンドにコンジュゲートさせたヌクレオチドを含む。
標的化リガンドは、炭水化物、アミノ糖、コレステロール、ペプチド、ポリペプチド、タンパク質、又は、タンパク質(例えば、抗体又は抗体フラグメント)若しくは脂質の一部を含み得る。いくつかの実施形態において、標的化リガンドはアプタマーである。例えば、標的化リガンドは、腫瘍脈管構造又は神経膠腫細胞を標的化するために使用されるRGDペプチド、腫瘍脈管構造又はストーマを標的化するためのCREKAペプチド、トランスフェリン、ラクトフェリン、又はCNS脈管構造上に発現されるトランスフェリン受容体を標的化するためのアプタマー、又は神経膠腫細胞上のEGFRを標的化するための抗EGFR抗体であり得る。ある特定の実施形態において、標的化リガンドは、1つ又は複数のGalNAc部分である。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドの1つ又は複数(例えば、1、2、3、4、5又は6個)のヌクレオチドは、それぞれ、別個の標的化リガンドにコンジュゲートされる。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドの2~4個のヌクレオチドは、それぞれ、別個の標的化リガンドにコンジュゲートされる。いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、標的化リガンドが歯ブラシの剛毛に類似し、オリゴヌクレオチドが歯ブラシに類似するように、センス鎖又はアンチセンス鎖のいずれかの末端において2~4個のヌクレオチドにコンジュゲートされる(例えば、リガンドは、センス鎖又はアンチセンス鎖の5’末端又は3’末端上の2~4個のヌクレオチドのオーバーハング又は伸長にコンジュゲート化される)。例えば、オリゴヌクレオチドは、センス鎖の5’末端又は3’末端のいずれかにステムループを含み得、ステムのループの1、2、3又は4個のヌクレオチドは、標的化リガンドに個々にコンジュゲートされ得る。
いくつかの実施形態では、HBV抗原の発現を減少させるオリゴヌクレオチドを対象の肝臓の肝細胞に標的化することが望ましい。この目的のために、任意の適切な肝細胞標的化部分を使用してもよい。
GalNAcは、アシアロ糖タンパク質受容体(ASGPR)に対する高親和性リガンドであり、主に肝細胞細胞の類洞表面に発現され、末端ガラクトース残基又はN-アセチルガラクトサミン残基(アシアロ糖タンパク質)を含有する循環糖タンパク質の結合、内在化、及びその後のクリアランスにおいて主要な役割を果たす。GalNAc部分の本開示のオリゴヌクレオチドへの(間接的又は直接的な)コンジュゲーションを使用して、これらのオリゴヌクレオチドをこれらの肝細胞細胞上に発現されるASGPRに標的化することができる。
いくつかの実施形態において、本開示のオリゴヌクレオチドは、一価GalNAcに直接的又は間接的にコンジュゲートされる。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、2つ以上の一価GalNAcに直接的又は間接的にコンジュゲートされる(すなわち、2、3又は4個の一価のGalNAc部分にコンジュゲートされ、典型的には、3又は4個の一価のGalNAc部分にコンジュゲートされる)。いくつかの実施形態において、本開示のオリゴヌクレオチドは、1つ又は複数の二価GalNAc、三価GalNAc又は四価GalNAc部分にコンジュゲートされている。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドの1つ又は複数(例えば、1、2、3、4、5又は6個)のヌクレオチドは、それぞれ、GalNAc部分にコンジュゲートされる。いくつかの実施形態において、ステムループのループ(L)の2~4個のヌクレオチドはそれぞれ、別個のGalNAcにコンジュゲートされる。いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、GalNAc部分が歯ブラシの剛毛に類似し、オリゴヌクレオチドが歯ブラシに類似するように、センス鎖又はアンチセンス鎖のいずれかの末端において2~4個のヌクレオチドにコンジュゲートされる(例えば、リガンドは、センス鎖又はアンチセンス鎖の5’末端又は3’末端上の2~4個のヌクレオチドのオーバーハング又は伸長にコンジュゲート化される)。例えば、オリゴヌクレオチドは、センス鎖の5’末端又は3’末端のいずれかにステムループを含み得、ステムのループの1、2、3又は4個のヌクレオチドは、GalNAc部分に個々にコンジュゲートされ得る。いくつかの実施形態において、GalNAc部分は、センス鎖のヌクレオチドにコンジュゲートされる。例えば、4つのGalNAc部分をセンス鎖のテトラループ中のヌクレオチドにコンジュゲートさせることができ、各GalNAc部分は1つのヌクレオチドにコンジュゲートされる。
いくつかの実施形態では、本明細書のオリゴヌクレオチドは、以下に示すように、[ademG-GalNAc]又は2’-アミノジエトキシメタノール-グアニジン-GalNAcと呼ばれるグアニジンヌクレオチドに結合した一価GalNAcを含む。
いくつかの実施形態では、本明細書のオリゴヌクレオチドは、以下に示すように、[ademA-GalNAc]又は2’-アミノジエトキシメタノール-アデニン-GalNAcと呼ばれるアデニンヌクレオチドに結合した一価GalNAcを含む。
そのようなコンジュゲーションの例を、5’から3’にヌクレオチド配列GAAAを含むループについて以下に示す(L=リンカー、X=ヘテロ原子)。ステム結合点が示される。そのようなループは、例えば、図20に示す分子の27~30位に存在し得る。化学式中、
はオリゴヌクレオチド鎖への結合点である。
適切な方法又は化学(例えば、クリックケミストリー)を使用して、標的化リガンドをヌクレオチドに連結することができる。いくつかの実施形態では、標的化リガンドは、クリックリンカーを使用してヌクレオチドにコンジュゲートされる。いくつかの実施形態では、アセタール系リンカーは、標的化リガンドを本明細書中に記載されるオリゴヌクレオチドのいずれか1つのヌクレオチドにコンジュゲート化するために使用される。アセタール系リンカーは、例えば、2016年6月23日に公開された国際特許出願公開番号WO2016100401 A1に開示されており、そのようなリンカーに関する内容は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、リンカーは不安定なリンカーである。しかしながら、他の実施形態では、リンカーはかなり安定である。
GalNAc部分がアセタールリンカーを使用してループのヌクレオチドに結合している、5’から3’にヌクレオチドGAAAを含むループの例を以下に示す。
そのようなループは、例えば、図20に示す分子の27~30位に存在し得る。化学式中、
はオリゴヌクレオチド鎖への結合点である。
そのようなループは、例えば、図20に示す分子の27~30位に存在し得る。化学式中、
4.HBVを標的とする更なるGalNAcコンジュゲート治療用オリゴヌクレオチド
一実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、HBV mRNAを標的とし、二価、三価又は四価のGalNAcクラスターなどのアシアロ糖タンパク質受容体(ASGPR)標的化コンジュゲートへのコンジュゲーションによって肝臓、特に肝細胞への送達が改善された治療用オリゴヌクレオチドである(図1の例示的な例)。国際公開第2015/173208号は、HBV mRNA)を標的とするそのようなGalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチド(配列番号1及びそれらの製造を記載している。
一実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、HBV mRNAを標的とし、二価、三価又は四価のGalNAcクラスターなどのアシアロ糖タンパク質受容体(ASGPR)標的化コンジュゲートへのコンジュゲーションによって肝臓、特に肝細胞への送達が改善された治療用オリゴヌクレオチドである(図1の例示的な例)。国際公開第2015/173208号は、HBV mRNA)を標的とするそのようなGalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチド(配列番号1及びそれらの製造を記載している。
本発明の医薬組合せにおけるGalNAcコンジュゲート治療用オリゴヌクレオチドは、HBV mRNA(標的核酸)からの発現、特に、B型肝炎ウイルスのHBsAg及びHBx(両方とも配列番号1によってコードされる)の発現を減少させることができる。さらに、本発明のGalNAcコンジュゲート治療用オリゴヌクレオチドは、好ましくは、染色体に組み込まれたHBV断片からのHBsAg発現を減少させることができる。
いくつかの実施形態において、本発明のGalNAcコンジュゲート治療用オリゴヌクレオチドは、標的核酸に結合し、正常発現レベルと比較して少なくとも10%又は20%、より好ましくは、正常発現レベル(例えば、GalNAcコンジュゲート治療用オリゴヌクレオチドの非存在下における発現レベル)と比較して少なくとも30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%又は95%発現を減少させる。
一実施形態において、本発明のGalNAcコンジュゲート治療用オリゴヌクレオチドは、HBx又はHBsAg遺伝子の発現を下方制御(例えば、阻害、低減、又は除去)することができる。そのような下方制御は、典型的には、標的細胞、例えば哺乳動物細胞、例えばヒト細胞、例えば肝臓細胞、例えば肝細胞、特にHBV感染肝細胞で起こり得る。いくつかの実施形態において、本発明のGalNAcコンジュゲート治療用オリゴヌクレオチドは、標的核酸に結合し、正常発現レベルと比較して少なくとも50%の発現阻害、より好ましくは、正常発現レベル(例えば、GalNAcコンジュゲート治療用オリゴヌクレオチドの非存在下における発現レベル)と比較して少なくとも60%、70%、80%、90%又は95%の阻害に影響を及ぼす。HBV mRNA及びHBsAg及びHBV DNAの発現レベルの調節は、材料及び方法のセクションに記載されている方法を使用して決定することができる。
本発明の一態様は、配列番号1の1530~1602位に対して少なくとも90%の相補性を有する12~30ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含む治療用オリゴヌクレオチドに関する。
本発明の一実施形態では、治療用オリゴヌクレオチドは、配列番号1の1530~1602;1530~1598;1530~1543;1530~1544;1531~1543;1551~1565;1551~1566;1577~1589;1577~1591;1577~1592;1578~1590;1578~1592;1583~1598;1584~1598;1585~1598、及び1583~1602位から選択される配列に相補的である。特に、1530~1544位、1531~1543位、1583~1602位、及び1583~1598位の標的配列に対して100%の相補性を有する治療用オリゴヌクレオチドが有利である。
いくつかの実施形態では、治療用オリゴヌクレオチドは、12~30ヌクレオチド長の連続配列を含み、これは、標的核酸又は標的配列の領域と、少なくとも91%相補的、例えば少なくとも92%、例えば少なくとも93%、例えば少なくとも94%、例えば少なくとも95%、例えば少なくとも96%、例えば少なくとも97%、例えば少なくとも98%、99%又は100%相補的である。
連続ヌクレオチド配列が、配列番号1の1530~1602;1530~1598;1530~1543;1530~1544;1531~1543;1551~1565;1551~1566;1577~1589;1577~1591;1577~1592;1578~1590;1578~1592;1583~1598;1584~1598;1585~1598、又は1583~1602位からなる群から選択される標的配列中の連続する配列と完全に相補的(100%相補的)であることが有利であり、又は、いくつかの実施形態では、治療用オリゴヌクレオチドと標的配列との間に1つ又は2つのミスマッチを含み得る。
本発明の一実施形態において、GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドは、配列番号1又は配列番号28の1530~1602位の連続配列に100%相補的な少なくとも12ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を有する13から20ヌクレオチド長である。この化合物は、TLR7アゴニストに関する項に記載されるように、TLR7アゴニストと組み合わせられることが理解される。
いくつかの実施形態では、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、13~24ヌクレオチド長、例えば13~22、例えば14~20連続ヌクレオチド長を含むか、又はそれらからなる。好ましい実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、13~18、例えば15~18ヌクレオチド長を含むか、又はそれらからなる。
いくつかの実施形態では、その連続ヌクレオチド配列は、12~20ヌクレオチド長、例えば12~18、例えば13~17、例えば13~15、例えば13、14、15、16又は17ヌクレオチド長を含むか、又はそれらからなる。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、例えば、連続ヌクレオチド配列とコンジュゲートとの間の生体切断可能なリンカーとして働く更なるヌクレオシドを含み得るので、連続ヌクレオチド配列は常にアンチセンスオリゴヌクレオチドの全長と等しいか又はそれより短いことを理解されたい。また、本明細書で提供されるいずれの範囲も、範囲の終点を含むことを理解するべきである。したがって、アンチセンスオリゴヌクレオチドが12~30ヌクレオチドを含むと記される場合、12ヌクレオチド及び30ヌクレオチドの両方が含まれる。
いくつかの実施形態では、連続ヌクレオチド配列は、以下からなる群から選択されるから選択される配列を含むか、又はそれからなる。
gcgtaaagagagg(配列番号2);
gcgtaaagagaggt(配列番号3);
cgcgtaaagagaggt(配列番号4);
agaaggcacagacgg(配列番号5);
gagaaggcacagacgg(配列番号6);
agcgaagtgcacacgg(配列番号7);
gaagtgcacacgg(配列番号8);
gcgaagtgcacacgg(配列番号9);
agcgaagtgcacacg(配列番号10);
cgaagtgcacacg(配列番号11);
aggtgaagcgaagtgc(配列番号12);
aggtgaagcgaagtg(配列番号13);
aggtgaagcgaagt(配列番号14);及び
gcagaggtgaagcgaagtgc(配列番号29)。
gcgtaaagagaggt(配列番号3);
cgcgtaaagagaggt(配列番号4);
agaaggcacagacgg(配列番号5);
gagaaggcacagacgg(配列番号6);
agcgaagtgcacacgg(配列番号7);
gaagtgcacacgg(配列番号8);
gcgaagtgcacacgg(配列番号9);
agcgaagtgcacacg(配列番号10);
cgaagtgcacacg(配列番号11);
aggtgaagcgaagtgc(配列番号12);
aggtgaagcgaagtg(配列番号13);
aggtgaagcgaagt(配列番号14);及び
gcagaggtgaagcgaagtgc(配列番号29)。
いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下からなる群から選択される配列に対して少なくとも90%の同一性、好ましくは100%の同一性を有する少なくとも12ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を有する12~22ヌクレオチド長を含むか、又はそれからなる。
gcgtaaagagagg(配列番号2);
gcgtaaagagaggt(配列番号3);及び
cgcgtaaagagaggt(配列番号4)。
gcgtaaagagaggt(配列番号3);及び
cgcgtaaagagaggt(配列番号4)。
いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下から選択される配列に対して少なくとも90%の同一性、好ましくは100%の同一性を有する少なくとも12ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を有する12~22ヌクレオチド長を含むか、又はそれからなる。
agaaggcacagacgg(配列番号5);又は
gagaaggcacagacgg(配列番号6)。
gagaaggcacagacgg(配列番号6)。
いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下からなる群から選択される配列に対して少なくとも90%の同一性、好ましくは100%の同一性を有する少なくとも12ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を有する12~22ヌクレオチド長を含むか、又はそれからなる。
agcgaagtgcacacgg(配列番号7);
gaagtgcacacgg(配列番号8);
gcgaagtgcacacgg(配列番号9);
agcgaagtgcacacg(配列番号10);
cgaagtgcacacg(配列番号11);
aggtgaagcgaagtgc(配列番号12)
aggtgaagcgaagtg(配列番号13);
aggtgaagcgaagt(配列番号14);及び
gcagaggtgaagcgaagtgc(配列番号29)。
gaagtgcacacgg(配列番号8);
gcgaagtgcacacgg(配列番号9);
agcgaagtgcacacg(配列番号10);
cgaagtgcacacg(配列番号11);
aggtgaagcgaagtgc(配列番号12)
aggtgaagcgaagtg(配列番号13);
aggtgaagcgaagt(配列番号14);及び
gcagaggtgaagcgaagtgc(配列番号29)。
いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下からなる群から選択される配列に対して少なくとも90%の同一性、好ましくは100%の同一性を有する少なくとも12ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を有する12~22ヌクレオチド長を含むか、又はそれからなる。
aggtgaagcgaagtgc(配列番号12)
aggtgaagcgaagtg(配列番号13);
aggtgaagcgaagt(配列番号14);及び
gcagaggtgaagcgaagtgc(配列番号29)。
aggtgaagcgaagtg(配列番号13);
aggtgaagcgaagt(配列番号14);及び
gcagaggtgaagcgaagtgc(配列番号29)。
5.本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドのオリゴヌクレオチド修飾
このセクションで論じられる修飾は、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドでの実施に特に好ましい。
このセクションで論じられる修飾は、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドでの実施に特に好ましい。
連続核酸塩基配列(モチーフ配列)は、例えばヌクレアーゼ耐性及び/又は標的核酸に対する結合親和性を増大させるために修飾され得ることが理解される。
一実施形態において、オリゴヌクレオチドの連続する核酸塩基配列は、少なくとも1つの修飾されたヌクレオシド間結合を含む。好適なヌクレオシド間修飾は、「修飾ヌクレオシド間結合」の「定義」セクションに記載されている。連続ヌクレオチド配列内のヌクレオシド間結合の、少なくとも75%、例えば全てがヌクレオシド間結合である場合、有利である。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドの連続する配列中の全てのヌクレオチド間結合は、ホスホロチオエート結合である。
本発明のオリゴヌクレオチドは、修飾ヌクレオシド及びDNAヌクレオシドを用いて設計される。高親和性修飾ヌクレオシドを用いることが有利である。
一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも3つの修飾ヌクレオシド、例えば少なくとも4、少なくとも5、少なくとも6、少なくとも7、少なくとも8、少なくとも9、少なくとも10、少なくとも11、少なくとも12、少なくとも13、少なくとも14、少なくとも15、又は少なくとも16個の修飾ヌクレオシドを含む。一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、3~8個の修飾ヌクレオシド、例えば4~6個の修飾ヌクレオシド、例えば4、5又は6個のヌクレオシド、例えば5又は6個の修飾ヌクレオシドを含む。好適な修飾は、「修飾ヌクレオシド」、「高親和性修飾ヌクレオシド」、「糖修飾」、「2’糖修飾」、及びロックド核酸(LNA)の「定義」セクションに記載されている。
一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、1つ以上の糖修飾ヌクレオシド、例えば2’糖修飾ヌクレオシドを含む。好ましくは、本発明のオリゴヌクレオチドは、2’-O-アルキル-RNA、2’-O-メチル-RNA、2’-アルコキシ-RNA、2’-O-メトキシエチル-RNA、2’-アミノ-DNA、2’-フルオロ-DNA、アラビノ核酸(ANA)、2’-フルオロ-ANA、及びLNAヌクレオシドからなる群から独立して選択される1つ以上の2’糖修飾ヌクレオシドを含む。修飾ヌクレオシド(複数可)の1つ又は複数又は全てがロックド核酸(LNA)である場合、有利である。
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチド、例えば連続ヌクレオチド配列は、少なくとも1つのLNAヌクレオシド、例えば1、2、3、4、5、6、7又は8個のLNAヌクレオシド、例えば2~6個のLNAヌクレオシド、例えば3~6個のLNAヌクレオシド、4~6個のLNAヌクレオシド、又は4、5若しくは6個のLNAヌクレオシドを含む。
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドの少なくとも75%、例えば修飾ヌクレオシドの少なくとも80%、例えば少なくとも85%、例えば少なくとも90%がLNAヌクレオシドである。なおさらなる実施形態では、オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドの全ては、LNAヌクレオシドである。更なる実施形態では、LNAヌクレオシドは、ベータ-D-オキシLNA、チオLNA、アミノLNA、オキシLNA、ScET及び/又はENAから、ベータ-D若しくはアルファ-L配置又はそれらの組合せで選択される。更なる実施形態では、全てのLNAヌクレオシドはベータ-D-オキシLNAである。更なる実施形態では、シトシン単位は、5-メチル-シトシンである。オリゴヌクレオチド又は連続ヌクレオチド配列のヌクレアーゼ安定性にとって、ヌクレオチド配列の5’末端に少なくとも1つのLNAヌクレオシドと3’末端に少なくとも2つのLNAヌクレオシドとを有することが有利である。
6.RNアーゼH動員のためのアンチセンスオリゴヌクレオチド設計
治療用オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである本発明の実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、標的核酸にハイブリダイズしたときにRNase Hを動員することができる。
治療用オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである本発明の実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、標的核酸にハイブリダイズしたときにRNase Hを動員することができる。
修飾ヌクレオシド(高親和性修飾ヌクレオシドなど)がオリゴヌクレオチド配列に組み込まれるパターンは、一般にオリゴヌクレオチド設計と称される。
治療用オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである本発明の一実施形態では、有利な構造設計は、例えば、「ギャップマー」、「LNAギャップマー」、「MOEギャップマー」、及び「混合ウイングギャップマー」の「定義」セクションに記載されているギャップマー設計である。ギャップマー設計には、均一なフランク及び混合ウイング・フランクを有するギャップマーが含まれる。本発明では、本発明の連続ヌクレオチド配列がF-G-F’設計のギャップマーである場合が有利である。いくつかの実施形態では、ギャップマーは、それに続く均一なフランク設計3-7-3、3-8-2、3-8-3、2-9-4、3-9-3、3-10-3又は5-10-5を有するLNA又はMOEギャップマーである。
いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下からなる群から選択される連続ヌクレオチド配列を有する12~22ヌクレオチド長を含むか、又はそれからなる:
GCGtaaagagaGG(配列番号2);
GCGtaaagagAGG(配列番号2);
GCGtaaagagaGGT(配列番号3);
CGCgtaaagagaGGT(配列番号4);
AGAaggcacagaCGG(配列番号5);
GAGaaggcacagaCGG(配列番号6);
AGCgaagtgcacaCGG(配列番号7);
GAAgtgcacacGG(配列番号8);
GAAgtgcacaCGG(配列番号8);
GCGaagtgcacaCGG(配列番号9);
AGCgaagtgcacACG(配列番号10);
CGAagtgcacaCG(配列番号11);
AGGtgaagcgaagTGC(配列番号12);
AGGtgaagcgaaGTG(配列番号13)
AGgtgaagcgaAGTG(配列番号13);及び
AGGtgaagcgaAGT(配列番号14);
大文字はベータ-D-オキシLNAなどのLNAヌクレオシドを示し、小文字はDNAヌクレオシドを示す。
GCGtaaagagaGG(配列番号2);
GCGtaaagagAGG(配列番号2);
GCGtaaagagaGGT(配列番号3);
CGCgtaaagagaGGT(配列番号4);
AGAaggcacagaCGG(配列番号5);
GAGaaggcacagaCGG(配列番号6);
AGCgaagtgcacaCGG(配列番号7);
GAAgtgcacacGG(配列番号8);
GAAgtgcacaCGG(配列番号8);
GCGaagtgcacaCGG(配列番号9);
AGCgaagtgcacACG(配列番号10);
CGAagtgcacaCG(配列番号11);
AGGtgaagcgaagTGC(配列番号12);
AGGtgaagcgaaGTG(配列番号13)
AGgtgaagcgaAGTG(配列番号13);及び
AGGtgaagcgaAGT(配列番号14);
大文字はベータ-D-オキシLNAなどのLNAヌクレオシドを示し、小文字はDNAヌクレオシドを示す。
いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下からなる群から選択される連続ヌクレオチド配列を有する12~22ヌクレオチド長を含むか、又はそれからなる:
GCGtaaagagaGG(配列番号2);
GCGtaaagagAGG(配列番号2);
GCGtaaagagaGGT(配列番号3);及び
CGCgtaaagagaGGT(配列番号4);
大文字はベータ-D-オキシLNAなどのLNAヌクレオシドを示し、小文字はDNAヌクレオシドを示す。
GCGtaaagagaGG(配列番号2);
GCGtaaagagAGG(配列番号2);
GCGtaaagagaGGT(配列番号3);及び
CGCgtaaagagaGGT(配列番号4);
大文字はベータ-D-オキシLNAなどのLNAヌクレオシドを示し、小文字はDNAヌクレオシドを示す。
いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下からなる連続ヌクレオチド配列を有する12~22ヌクレオチド長を含むか、又はそれからなる。
AGAaggcacagaCGG(配列番号5);又は
GAGaaggcacagaCGG(配列番号6);
大文字はベータ-D-オキシLNAなどのLNAヌクレオシドを示し、小文字はDNAヌクレオシドを示す。
GAGaaggcacagaCGG(配列番号6);
大文字はベータ-D-オキシLNAなどのLNAヌクレオシドを示し、小文字はDNAヌクレオシドを示す。
いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下からなる群から選択される連続ヌクレオチド配列を有する12~22ヌクレオチド長を含むか、又はそれからなる:
AGCgaagtgcacaCGG(配列番号7);
GAAgtgcacacGG(配列番号8);
GAAgtgcacaCGG(配列番号8);
GCGaagtgcacaCGG(配列番号9);
AGCgaagtgcacACG(配列番号10);
CGAagtgcacaCG(配列番号11);
AGGtgaagcgaagTGC(配列番号12);
AGGtgaagcgaaGTG(配列番号13)
AGgtgaagcgaAGTG(配列番号13);及び
AGGtgaagcgaAGT(配列番号14);
大文字はベータ-D-オキシLNAなどのLNAヌクレオシドを示し、小文字はDNAヌクレオシドを示す。
AGCgaagtgcacaCGG(配列番号7);
GAAgtgcacacGG(配列番号8);
GAAgtgcacaCGG(配列番号8);
GCGaagtgcacaCGG(配列番号9);
AGCgaagtgcacACG(配列番号10);
CGAagtgcacaCG(配列番号11);
AGGtgaagcgaagTGC(配列番号12);
AGGtgaagcgaaGTG(配列番号13)
AGgtgaagcgaAGTG(配列番号13);及び
AGGtgaagcgaAGT(配列番号14);
大文字はベータ-D-オキシLNAなどのLNAヌクレオシドを示し、小文字はDNAヌクレオシドを示す。
いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下からなる群から選択される連続ヌクレオチド配列を有する12~22ヌクレオチド長を含むか、又はそれからなる:
AGGtgaagcgaagTGC(配列番号12);
AGGtgaagcgaaGTG(配列番号13)
AGgtgaagcgaAGTG(配列番号13);及び
AGGtgaagcgaAGT(配列番号14);
大文字はベータ-D-オキシLNAなどのLNAヌクレオシドを示し、小文字はDNAヌクレオシドを示す。
AGGtgaagcgaagTGC(配列番号12);
AGGtgaagcgaaGTG(配列番号13)
AGgtgaagcgaAGTG(配列番号13);及び
AGGtgaagcgaAGT(配列番号14);
大文字はベータ-D-オキシLNAなどのLNAヌクレオシドを示し、小文字はDNAヌクレオシドを示す。
いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下の連続ヌクレオチド配列を有する20~24ヌクレオチド長を含むか、又はそれからなる。
GCAGAggtgaagcgaAGTGC(配列番号29)
大文字の下線付き文字はMOEヌクレオシドを示し、小文字はDNAヌクレオシドを示す。
大文字の下線付き文字はMOEヌクレオシドを示し、小文字はDNAヌクレオシドを示す。
表1の設計欄において、大文字は2’-糖修飾ヌクレオシド、特にベータ-D-オキシ-LNAなどのLNAヌクレオシド、又はMOEヌクレオシドを表し、小文字はDNAヌクレオシドを表す。ヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル又はホスホロチオエートであり得る。いくつかの実施形態において、全てのヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエートである。
全ての場合において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、「オリゴヌクレオチド内の領域D’又はD’’」の「定義」セクションに記載されているように、F-G-F’設計の5’又は3’末端に領域D’及び/又はD’’をさらに含み得る。いくつかの実施形態では、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、ギャップマー領域の5’末端又は3’末端に、1~5個、例えば、1、2、又は3個のホスホジエステル結合ヌクレオシド単位、例えばDNA単位を有する。DNAヌクレオシドは一般に、プリン(例えば、アデニン及びグアニン)及びピリミジン(例えば、ウラシル、チミン及びシトシン)から選択される核酸塩基を有する天然に存在するDNAヌクレオシドなど、核酸塩基の定義において定義される核酸塩基を有する。いくつかの実施形態では、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、2つの5’ホスホジエステル結合DNAヌクレオシドと、続いて「定義」セクションで定義したF-G-F’ギャップマー領域と、からなる。5’末端又は3’末端にホスホジエステル結合されたDNA単位を含むオリゴヌクレオチドは、コンジュゲーションに好適であり、本明細書に記載されるようなコンジュゲート部分をさらに含み得る。肝臓への送達では、ASGPR標的化部分は、コンジュゲート部分として特に有利である。
いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下からなる群から選択される配列を含むか、又はそれからなる:
cagcgtaaagagagg(配列番号15)
cagcgtaaagagaggt(配列番号16)
cacgcgtaaagagaggt(配列番号17)
caagaaggcacagacgg(配列番号18)
cagagaaggcacagacgg(配列番号19)
caagcgaagtgcacacgg(配列番号20)
cagaagtgcacacgg(配列番号21)
cagcgaagtgcacacgg(配列番号22)
caagcgaagtgcacacg(配列番号23)
cacgaagtgcacacg(配列番号24)
caaggtgaagcgaagtgc(配列番号25)
caaggtgaagcgaagtg(配列番号26)
caaggtgaagcgaagt(配列番号27)
(5’末端から出発して)1~3位のヌクレオシド間のヌクレオシド間結合はホスホジエステル結合であり、3位と4位のヌクレオシド間結合はホスホロチオエート結合である(3位のヌクレオシドは連続ヌクレオチド配列の5’末端である)。オリゴヌクレオチドの4位から3’末端の後の全てのヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合であると有利である。一実施形態では、連続ヌクレオチド配列は、表1の対応する配列の設計を有する。
cagcgtaaagagagg(配列番号15)
cagcgtaaagagaggt(配列番号16)
cacgcgtaaagagaggt(配列番号17)
caagaaggcacagacgg(配列番号18)
cagagaaggcacagacgg(配列番号19)
caagcgaagtgcacacgg(配列番号20)
cagaagtgcacacgg(配列番号21)
cagcgaagtgcacacgg(配列番号22)
caagcgaagtgcacacg(配列番号23)
cacgaagtgcacacg(配列番号24)
caaggtgaagcgaagtgc(配列番号25)
caaggtgaagcgaagtg(配列番号26)
caaggtgaagcgaagt(配列番号27)
(5’末端から出発して)1~3位のヌクレオシド間のヌクレオシド間結合はホスホジエステル結合であり、3位と4位のヌクレオシド間結合はホスホロチオエート結合である(3位のヌクレオシドは連続ヌクレオチド配列の5’末端である)。オリゴヌクレオチドの4位から3’末端の後の全てのヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合であると有利である。一実施形態では、連続ヌクレオチド配列は、表1の対応する配列の設計を有する。
7.アシアロ糖タンパク質に結合するコンジュゲート
アシアロ糖タンパク質受容体(ASGPR)に結合できるコンジュゲートは、肝臓の肝細胞を標的とするのに特に有用である。ガラクトース、ガラクトサミン、N-ホルミル-ガラクトサミン、N-アセチルガラクトサミン、N-プロピオニル-ガラクトサミン、N-n-ブタノイル-ガラクトサミン及びN-イソブタノイルガラクトサミンからなる群から選択される少なくとも2つの炭水化物部分を含むコンジュゲートは、一般に、ASGPRに結合することができる。N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)部分は、ASGPRを標的化するのに有利であることが示されているが、上記のリストからの代替物、例えばガラクトースも使用することができる。一実施形態では、コンジュゲートは、ブランチャー分子に各GalNAc部分を連結し、それによって治療用オリゴヌクレオチドに結合され得るクラスターを形成するスペーサーに結合された2~4個の末端GalNAc部分からなる。
アシアロ糖タンパク質受容体(ASGPR)に結合できるコンジュゲートは、肝臓の肝細胞を標的とするのに特に有用である。ガラクトース、ガラクトサミン、N-ホルミル-ガラクトサミン、N-アセチルガラクトサミン、N-プロピオニル-ガラクトサミン、N-n-ブタノイル-ガラクトサミン及びN-イソブタノイルガラクトサミンからなる群から選択される少なくとも2つの炭水化物部分を含むコンジュゲートは、一般に、ASGPRに結合することができる。N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)部分は、ASGPRを標的化するのに有利であることが示されているが、上記のリストからの代替物、例えばガラクトースも使用することができる。一実施形態では、コンジュゲートは、ブランチャー分子に各GalNAc部分を連結し、それによって治療用オリゴヌクレオチドに結合され得るクラスターを形成するスペーサーに結合された2~4個の末端GalNAc部分からなる。
GalNAcクラスターは、例えば、GalNAc部分をそのC-l炭素を介してスペーサーに連結することによって生成され得る。好ましいスペーサーは、柔軟な親水性スペーサーである(米国特許第5885968号;Biessenら J.Med.Chem.1995、39巻、1538~1546頁)。好ましい柔軟な親水性スペーサーは、PEGスペーサーである。好ましいPEGスペーサーは、PEG3スペーサーである。分岐点は、2~3つのGalNAc部分(又は他のアシアロ糖タンパク質受容体標的化部分)の付着を可能にし、さらにオリゴヌクレオチドへの分岐点の付着を可能にする任意の小分子であり得、そのような構築物は、GalNAcクラスター又はGalNAcコンジュゲートと呼ばれる。例示的な分岐点群は、ジリジンである。ジリジン分子は、3つのGalNAc部分又は他のアシアロ糖タンパク質受容体標的化部分が結合され得る3つのアミン基、及びジリジンがオリゴマーに結合され得るカルボキシル反応性基を含む。Khorev、et al 2008 Bioorg.Med.Chem.Vol 16、pp.5216は、適切な三価分岐剤の合成についても説明している。他の市販のブランチャーは、1,3-ビス-[5-(4,4’-ジメトキシトリチルオキシ)ペンチルアミド]プロピル-2-[(2-シアノエチル)-(N,N-ジイソプロピル)]ホスホラミダイト(Glen Researchカタログ番号10-1920-xx);トリス-2,2,2-[3-(4,4’-ジメトキシトリチルオキシ)プロピルオキシメチル]エチル-[(2-シアノエチル)-(N,N-ジイソプロピル)]-フォスフォルミダイト(Glen Researchカタログ番号10-1922-xx);及び
トリス-2,2,2-[3-(4,4’-ジメトキシトリチルオキシ)プロピルオキシメチル]メチレンオキシプロピル-[(2-シアノエチル)-(N、N-ジイソプロピル)]-ホスホルアミダイト、及び1-[5-(4,4’-ジメトキシ-トリチルオキシ)ペンチルアミド]-3-[5-フルオレノメトキシ-カルボニル-オキシ-ペンチルアミド]-プロピル-2-[(2-シアノエチル)-(N、N-ジイソプロピル)]-ホスホロアミダイト(Glen Research カタログ番号:10-1925-xx)である。他のGalNAcクラスターは、Tyr-Glu-Glu-(アミノヘキシルGalNAc)3(YEE(ahGalNAc)3などのGalNAc部分が結合した小さなペプチド;肝細胞上のアシアロ糖タンパク質受容体に結合するグリコトリペプチド、例えば、Duff,et al.,Methods Enzymol,2000,313,297;lysine-based galactose clusters(e.g.,L3G4;Biessen,et al.,Cardovasc.Med.,1999,214)を参照;リシン系ガラクトースクラスター(例えば、L3G4;Biessen,et al.,Cardovasc.Med.,1999,214);及びコラン系ガラクトースクラスター(例えば、アシアロ糖タンパク質受容体に対する炭水化物認識モチーフ)であり得る。
本発明の一実施形態において、本発明の治療用オリゴヌクレオチドは、例えば、細胞分布、特にオリゴヌクレオチドの肝細胞における細胞取り込みに影響を及ぼすことによって、オリゴヌクレオチドの薬理学を改善するためにGalNAcクラスターにコンジュゲートされる。
適切なGalNAcコンジュゲートは、アシアロ糖タンパク質受容体(ASGPR)に結合することができるもの、例えば二価、三価又は四価のGalNAcクラスターである。特に、三価N-アセチルガラクトサミンのコンジュゲートは、ASGPRへの結合に適しており、例えば、WO2014/076196,WO2014/207232,WO2014/179620,WO2016/055601及びWO2017/178656(参照することによって本明細書に組み込まれる)を参照されたい。図1は、少なくともインビトロ試験に供された好適なGalNAcコンジュゲートの図である。しかしながら、代替的なGalNAcコンジュゲートは、アシアロ糖タンパク質受容体に結合することができる場合にも好適であり得る。このようなコンジュゲートは、肝臓へのオリゴヌクレオチドの取り込みを促進する一方で、腎臓におけるその存在を減少させるのに役立ち、それによって、同じオリゴヌクレオチドの非コンジュゲートバージョンと比較して、GalNAcコンジュゲートオリゴヌクレオチドの肝臓/腎臓比を増加させる。
GalNAcクラスターは、当該分野で公知の方法を使用してオリゴヌクレオチドの3’末端又は5’末端に結合され得る。一実施形態では、GalNAcクラスターは、オリゴヌクレオチドの5’末端に結合する。
コンジュゲート(コンジュゲート部分のブランチャー部分など)とオリゴヌクレオチドとの間に1つ又は複数のリンカーを挿入することができる。任意にC6リンカーなどの切断不可能なリンカーと組み合わせて、コンジュゲート部分と治療用オリゴヌクレオチドとの間に生体切断可能なリンカーを有することが有利である。リンカー(複数可)は、「リンカー」の「定義」セクションに記載されているリンカーから選択することができ、特に、生体切断可能な領域D’又はD’’のリンカーが有利である。GalNAcクラスター及び生体切断可能なPOリンカーは、細胞内に入るとギャップマー又は連続ヌクレオチド配列から除去されるので、コンジュゲートとギャップマー又は連続ヌクレオチド配列との間に生体切断可能なリンカーを有するGalNAcコンジュゲートオリゴヌクレオチドは、効果的なプロドラッグである。
一実施形態では、コンジュゲート部分は、図1に示すような三価のN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)である。
一実施形態において、GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下からなる群から選択される:
大文字の太字はベータ-D-オキシLNA単位を表し、小文字はDNA単位を表し、下付き文字「o」はホスホジエステル結合を表し、下付き文字「s」はホスホロチオエート結合を表し、上付き文字mは5-メチルシトシン塩基を含有するDNA又はベータ-D-オキシLNA単位を表し、GN2-C6は、C6リンカーを有するGalNAc 2コンジュゲートを表す。
一実施形態において、GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下からなる群から選択される:
大文字の太字はベータ-D-オキシLNA単位を表し、小文字はDNA単位を表し、下付き文字「o」はホスホジエステル結合を表し、下付き文字「s」はホスホロチオエート結合を表し、上付き文字mは5-メチルシトシン塩基を含有するDNA又はベータ-D-オキシLNA単位を表し、GN2-C6は、C6リンカーを有するGalNAc 2コンジュゲートを表す。
一実施形態において、GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドは以下である:
大文字の太字はベータ-D-オキシLNA単位を表し、小文字はDNA単位を表し、下付き文字「o」はホスホジエステル結合を表し、下付き文字「s」はホスホロチオエート結合を表し、上付き文字mは5-メチルシトシン塩基を含有するDNA又はベータ-D-オキシLNA単位を表し、GN2-C6は、C6リンカーを有するGalNAc 2コンジュゲートを表す。
一実施形態において、GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下からなる群から選択される:
大文字の太字はベータ-D-オキシLNA単位を表し、小文字はDNA単位を表し、下付き文字「o」はホスホジエステル結合を表し、下付き文字「s」はホスホロチオエート結合を表し、上付き文字mは5-メチルシトシン塩基を含有するDNA又はベータ-D-オキシLNA単位を表し、GN2-C6は、C6リンカーを有するGalNAc 2コンジュゲートを表す。
一実施形態において、GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下からなる群から選択される:
大文字の太字はベータ-D-オキシLNA単位を表し、小文字はDNA単位を表し、下付き文字「o」はホスホジエステル結合を表し、下付き文字「s」はホスホロチオエート結合を表し、上付き文字mは5-メチルシトシン塩基を含有するDNA又はベータ-D-オキシLNA単位を表し、GN2-C6は、C6リンカーを有するGalNAc 2コンジュゲートを表す。
一実施形態において、GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下からなる群から選択される:
大文字の太字はベータ-D-オキシLNA単位を表し、小文字はDNA単位を表し、下付き文字「o」はホスホジエステル結合を表し、下付き文字「s」はホスホロチオエート結合を表し、上付き文字mは5-メチルシトシン塩基を含有するDNA又はベータ-D-オキシLNA単位を表し、GN2-C6は、C6リンカーを有するGalNAc 2コンジュゲートを表す。
以下の表2に、5末端に生体切断可能なCAリンカー(存在する場合)を有するアンチセンスオリゴヌクレオチド配列を示し、配列番号1の1530~1602位を標的とするGalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドを示す。
ュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチド。
大文字の太字はベータ-D-オキシLNA単位を表し、大文字の下線文字はMOEを表し、小文字はDNA単位を表し、下付き文字「o」はホスホジエステル結合を表し、下付き文字「s」はホスホロチオエート結合を表し、上付き文字mは5-メチルシトシン塩基を含有するDNA又はベータ-D-オキシLNA単位を表し、GN2-C6は、C6リンカーを有するGalNAc 2コンジュゲート(図1D)を表す。化合物15_~27_1は全て国際公開第2015/173208号に記載されており、化合物29_1は国際公開第2014/179627号に記載されており、化合物のいくつかは表2に示す図にも示されている。
大文字の太字はベータ-D-オキシLNA単位を表し、大文字の下線文字はMOEを表し、小文字はDNA単位を表し、下付き文字「o」はホスホジエステル結合を表し、下付き文字「s」はホスホロチオエート結合を表し、上付き文字mは5-メチルシトシン塩基を含有するDNA又はベータ-D-オキシLNA単位を表し、GN2-C6は、C6リンカーを有するGalNAc 2コンジュゲート(図1D)を表す。化合物15_~27_1は全て国際公開第2015/173208号に記載されており、化合物29_1は国際公開第2014/179627号に記載されており、化合物のいくつかは表2に示す図にも示されている。
8.TLR7アゴニスト
本発明のTLR7アゴニストは、Toll様受容体アゴニズム活性を有する3-置換5-アミノ-6H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2,7-ジオン化合物並びにそのプロドラッグである。国際公開第2006/066080号、国際公開第2016/055553号及び国際公開第2016/091698号には、そのようなTLR7アゴニスト及びそれらのプロドラッグ並びにそれらの製造が記載されている(参照により本明細書に組み込まれる)。
本発明のTLR7アゴニストは、Toll様受容体アゴニズム活性を有する3-置換5-アミノ-6H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2,7-ジオン化合物並びにそのプロドラッグである。国際公開第2006/066080号、国際公開第2016/055553号及び国際公開第2016/091698号には、そのようなTLR7アゴニスト及びそれらのプロドラッグ並びにそれらの製造が記載されている(参照により本明細書に組み込まれる)。
本発明の一態様では、本発明の医薬組合せにおけるTLR7アゴニストは、式(I):
式中、XはCH2又はSであり、
R1は-OH又は-Hであり、
R2は、1-ヒドロキシプロピル又はヒドロキシメチルである
によって表されるか、
又は式(II):
式中、XはCH2又はSであり、
R1は、-OH又は-H又はアセトキシであり、
R2は、1-アセトキシプロピル又は1-ヒドロキシプロピル又は1-ヒドロキシメチル又はアセトキシ(シクロプロピル)メチル又はアセトキシ(プロピン-1-イル)メチルである
によって表されるか、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである。
R1は-OH又は-Hであり、
R2は、1-ヒドロキシプロピル又はヒドロキシメチルである
によって表されるか、
又は式(II):
R1は、-OH又は-H又はアセトキシであり、
R2は、1-アセトキシプロピル又は1-ヒドロキシプロピル又は1-ヒドロキシメチル又はアセトキシ(シクロプロピル)メチル又はアセトキシ(プロピン-1-イル)メチルである
によって表されるか、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである。
式(I)の化合物は、活性TLR7アゴニストである。
本発明の一実施形態では、式(I)の活性TLR7アゴニストのサブセットは、式(V):
式中、R1は-OHであり、R2は1-ヒドロキシプロピル又はヒドロキシメチルである
によって表されるか、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである。
によって表されるか、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである。
式(II)のTLR7アゴニストプロドラッグのサブセットは、式(III):
式中、R1は-OH又はアセトキシであり、R2は1-アセトキシプロピル又は1-ヒドロキシプロピル又は1-ヒドロキシメチル又は
である
によって表されるか、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマー;又は
式(IV):
式中、R1は、アセトキシ(シクロプロピル)メチル又はアセトキシ(プロピン-1-イル)メチルであるか、若しくは
である
によって表されるか、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである。
によって表されるか、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマー;又は
式(IV):
によって表されるか、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである。
式(IV)の化合物は、R1がOHであり、R2が1-アセトキシプロピルである、式(III)の化合物と同様に二重プロドラッグである。R1がアセトキシであり、R2が三重プロドラッグである式(III)の化合物。
投与後、式(II)、(III)又は式(IV)の化合物は、有用なTLR7アゴニストであるそれらの活性形態に代謝される。
一実施形態では、本発明の医薬組合せに使用されるTLR7アゴニストは、
[(1S)-1-[(2S,4R,5R)-5-(5-アミノ-2-オキソ-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-3-イル)-4-ヒドロキシ-テトラヒドロフラン-2-イル]プロピル]アセテート(CMP番号VI);
5-アミノ-3-[(2R,3R,5S)-3-ヒドロキシ-5-[(1S)-1-ヒドロキシプロピル]テトラヒドロフラン-2-イル]-6H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2,7-ジオン(CMP番号VII);
5-アミノ-3-[(2R,3R,5S)-3-ヒドロキシ-5-[(1S)-1-ヒドロキシプロピル]テトラヒドロフラン-2-イル]チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2-オン(CMP番号VIII);
5-アミノ-3-(3’-デオキシ-β-D-リボフラノシル)-3H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2-オン(CMP番号IX);
5-アミノ-3-(2’-O-アセチル-3’-デオキシ-β-D-リボフラノシル)-3H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2-オン(CMP番号X);
5-アミノ-3-(3’-デオキシ-β-D-リボフラノシル)-3H,6H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2,7-ジオン(CMP番号XI);
[(S)-[(2S,5R)-5-(5-アミノ-2-オキソ-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-3-イル)-1,3-オキサチオラン-2-イル]-シクロプロピル-メチル]アセテート(CMP番号XII);及び
(1S)-1-[(2S,5R)-5-(5-アミノ-2-オキソ-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-3-イル)-1,3-オキサチオラン-2-イル]ブタ-2-イニル]アセテート(CMP番号XIII)及びそれらの薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー又はジアステレオマー
からなる群から選択される。
[(1S)-1-[(2S,4R,5R)-5-(5-アミノ-2-オキソ-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-3-イル)-4-ヒドロキシ-テトラヒドロフラン-2-イル]プロピル]アセテート(CMP番号VI);
5-アミノ-3-[(2R,3R,5S)-3-ヒドロキシ-5-[(1S)-1-ヒドロキシプロピル]テトラヒドロフラン-2-イル]-6H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2,7-ジオン(CMP番号VII);
5-アミノ-3-[(2R,3R,5S)-3-ヒドロキシ-5-[(1S)-1-ヒドロキシプロピル]テトラヒドロフラン-2-イル]チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2-オン(CMP番号VIII);
5-アミノ-3-(3’-デオキシ-β-D-リボフラノシル)-3H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2-オン(CMP番号IX);
5-アミノ-3-(2’-O-アセチル-3’-デオキシ-β-D-リボフラノシル)-3H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2-オン(CMP番号X);
5-アミノ-3-(3’-デオキシ-β-D-リボフラノシル)-3H,6H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2,7-ジオン(CMP番号XI);
[(S)-[(2S,5R)-5-(5-アミノ-2-オキソ-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-3-イル)-1,3-オキサチオラン-2-イル]-シクロプロピル-メチル]アセテート(CMP番号XII);及び
(1S)-1-[(2S,5R)-5-(5-アミノ-2-オキソ-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-3-イル)-1,3-オキサチオラン-2-イル]ブタ-2-イニル]アセテート(CMP番号XIII)及びそれらの薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー又はジアステレオマー
からなる群から選択される。
特に好ましい実施形態では、TLR7アゴニストがCMP番号VIである。
9.医薬組成物
更なる態様では、本発明は、前述の治療用オリゴヌクレオチド又はTLR7アゴニスト又はその塩のいずれかと、薬学的に許容され得る希釈剤、担体、塩及び/又はアジュバントとを含む医薬組成物を提供する。一実施形態では、本発明の医薬組合せにおける治療用オリゴヌクレオチド及びTLR7アゴニストは、別々の組成物で投与される。一実施形態では、治療用オリゴヌクレオチドは皮下投与用のリン酸緩衝生理食塩水に製剤化され、TLR7アゴニストは経口投与用の錠剤として製剤化される。
更なる態様では、本発明は、前述の治療用オリゴヌクレオチド又はTLR7アゴニスト又はその塩のいずれかと、薬学的に許容され得る希釈剤、担体、塩及び/又はアジュバントとを含む医薬組成物を提供する。一実施形態では、本発明の医薬組合せにおける治療用オリゴヌクレオチド及びTLR7アゴニストは、別々の組成物で投与される。一実施形態では、治療用オリゴヌクレオチドは皮下投与用のリン酸緩衝生理食塩水に製剤化され、TLR7アゴニストは経口投与用の錠剤として製剤化される。
本発明の医薬組合せにおける治療用オリゴヌクレオチドは、医薬組成物又は製剤の調製のために、薬学的に許容され得る活性又は不活性物質と混合することができる。医薬組成物の調製のための組成物及び方法は、限定されるものではないが、投与経路、疾患の程度、又は投与される用量を含む多くの基準に依存する。治療用オリゴヌクレオチドの薬学的に許容され得る希釈剤には、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)が含まれ、薬学的に許容され得る塩には、限定するものではないが、ナトリウム塩及びカリウム塩が含まれる。いくつかの実施形態において、治療用オリゴヌクレオチドの薬学的に許容され得る希釈剤は、無菌リン酸緩衝生理食塩水である。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、薬学的に許容され得る希釈剤中50~150mg/ml溶液の濃度で使用される。治療用オリゴヌクレオチド又は治療用オリゴヌクレオチドを含む医薬組成物は、静脈内、動脈内、皮下又は筋肉内の注射又は注入を含む非経口経路によって投与される。一実施形態では、オリゴヌクレオチドコンジュゲートは、静脈内投与される。治療用オリゴヌクレオチドの場合、皮下投与することが有利である。いくつかの実施形態において、本発明のオリゴヌクレオチドコンジュゲート又は医薬組成物は、0.5~6.0mg/kg、例えば0.75~5.0mg/kg、例えば1.0~4mg/kgの用量で投与される。投与は、1週間に1回、2週間に1回(隔週)、3週間に1回、1ヶ月に1回、又はより長い間隔で行うことができる。
本発明の医薬組合せにおけるTLR7アゴニストの場合、薬学的有効量の本発明の化合物は、経腸的に(例えば、経口的に又は胃腸管を通して)投与される。本発明におけるTLR7アゴニスト化合物は、任意の便利な投与形態、例えば錠剤、粉末、カプセル、溶液、分散液、懸濁液、シロップ剤、スプレー、座薬、ゲル、エマルションの単位用量で投与され得る。特に、錠剤及びカプセルなどの経口単位剤形を使用することができる。一例では、本発明のTLR7アゴニスト化合物の薬学的有効量は、約75~250mg、例えば100~200mg、例えば150~170mg pr.用量の範囲である。投与は、毎日、1日おき(QOD)又は毎週(QW)であり得る。
好適な担体及び賦形剤は当業者に周知であり、例えば、Ansel,Howard C.,et al.,Ansel’s Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems.Philadelphia:Lippincott,Williams&Wilkins,2004;Gennaro,Alfonso R.,et al.Remington:The Science and Practice of Pharmacy.Philadelphia:Lippincott,Williams&Wilkins,2000;及び、Rowe,Raymond C.Handbook of Pharmaceutical Excipients.Chicago,Pharmaceutical Press,2005に詳細に記載されている。
これらの組成物は、従来の滅菌技術によって滅菌されても、又は滅菌フィルタにかけられてもよい。得られた水溶液は、そのまま使用するために包装するか、又は凍結乾燥することができ、凍結乾燥された調製物は、投与前に滅菌水性担体と組み合わされる。調製物のpHは、典型的には3~11、より好ましくは5~9又は6~8、最も好ましくは7~8、例えば7~7.5であろう。得られた固体形態の組成物は、錠剤又はカプセルの密封パッケージなどのように、各々が上記の薬剤又は薬剤群の固定量を含む複数の単回用量単位で包装することができる。
10.治療用オリゴヌクレオチドの製剤
治療的オリゴヌクレオチドの使用を容易にするために様々な製剤が開発されており、これは本発明の医薬組合せに使用される治療用オリゴヌクレオチドに適用可能であり得る。例えば、オリゴヌクレオチドは、分解を最小限に抑え、送達及び/又は取り込みを容易にし、又は製剤中のオリゴヌクレオチドに別の有益な特性を提供する製剤を使用して、対象又は細胞環境に送達され得る。いくつかの実施形態では、HBV抗原(例えば、HBsAg)の発現を減少させるためのオリゴヌクレオチド(例えば、一本鎖又は二本鎖オリゴヌクレオチド)を含む組成物である第1の医薬を含む医薬組合せが本明細書で提供される。そのような組成物は、標的細胞の直接環境又は全身のいずれかで対象に投与された場合、オリゴヌクレオチドの十分な部分が細胞に入り、HBV抗原発現を減少させるように適切に製剤化することができる。本明細書に開示されるHBV抗原の減少のためのオリゴヌクレオチドを送達するために、様々な適切なオリゴヌクレオチド製剤のいずれかを使用することができる。いくつかの実施形態では、本発明の医薬組合せのオリゴヌクレオチドは、リン酸緩衝生理食塩水などの緩衝液、リポソーム、ミセル構造及びキャプシド中に製剤化される。
治療的オリゴヌクレオチドの使用を容易にするために様々な製剤が開発されており、これは本発明の医薬組合せに使用される治療用オリゴヌクレオチドに適用可能であり得る。例えば、オリゴヌクレオチドは、分解を最小限に抑え、送達及び/又は取り込みを容易にし、又は製剤中のオリゴヌクレオチドに別の有益な特性を提供する製剤を使用して、対象又は細胞環境に送達され得る。いくつかの実施形態では、HBV抗原(例えば、HBsAg)の発現を減少させるためのオリゴヌクレオチド(例えば、一本鎖又は二本鎖オリゴヌクレオチド)を含む組成物である第1の医薬を含む医薬組合せが本明細書で提供される。そのような組成物は、標的細胞の直接環境又は全身のいずれかで対象に投与された場合、オリゴヌクレオチドの十分な部分が細胞に入り、HBV抗原発現を減少させるように適切に製剤化することができる。本明細書に開示されるHBV抗原の減少のためのオリゴヌクレオチドを送達するために、様々な適切なオリゴヌクレオチド製剤のいずれかを使用することができる。いくつかの実施形態では、本発明の医薬組合せのオリゴヌクレオチドは、リン酸緩衝生理食塩水などの緩衝液、リポソーム、ミセル構造及びキャプシド中に製剤化される。
カチオン性脂質を有するオリゴヌクレオチドの製剤を使用して、細胞へのオリゴヌクレオチドのトランスフェクションを容易にすることができる。例えば、カチオン性脂質、例えば、リポフェクチン、カチオン性グリセロール誘導体及びポリカチオン性分子(例えば、ポリリジン)を使用することができる。適切な脂質には、オリゴフェクトアミン、リポフェクトアミン(Life Technologies)、NC388(Ribozyme Pharmaceuticals,Inc.,Boulder,Colo.)、又はFuGene 6(Roche)が含まれ、これらは全て製造業者の指示に従って使用することができる。
したがって、いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチド製剤は、脂質ナノ粒子を含む。いくつかの実施形態では、賦形剤は、リポソーム、脂質、脂質複合体、ミクロスフェア、微粒子、ナノスフェア若しくはナノ粒子を含むか、又はそれを必要とする対象の細胞、組織、器官若しくは身体への投与のために他の方法で製剤化され得る(例えば、Remington:The Science and Practice of Pharmacy,22nd edition,Pharmaceutical Press,2013を参照のこと)。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される製剤は賦形剤を含む。いくつかの実施形態では、賦形剤は、活性成分の改善された安定性、改善された吸収、改善された溶解度及び/又は治療強化を組成物に与える。いくつかの実施形態では、賦形剤は緩衝剤(例えば、クエン酸ナトリウム、リン酸ナトリウム、トリス塩基、又は水酸化ナトリウム)又はビヒクル(例えば、緩衝溶液、ワセリン、ジメチルスルホキシド、又は鉱油)である。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、その貯蔵寿命を延ばすために凍結乾燥され、次いで、使用(例えば、対象への投与)前に溶液にされる。したがって、本明細書に記載のオリゴヌクレオチドのいずれか1つを含む組成物中の賦形剤は、凍結保護剤(例えば、マンニトール、ラクトース、ポリエチレングリコール、又はポリビニルピロリドン)又は崩壊温度調整剤(例えば、デキストラン、フィコール又はゼラチン)であり得る。
本発明の医薬組合せのいくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドを含む組成物は、その意図される投与経路と適合するように製剤化される。投与経路の例としては、非経口、例えば、静脈内、皮内、皮下、経口(例えば、吸入)、経皮(局所)、経粘膜及び直腸投与が挙げられる。皮下用製剤は、本発明の医薬組合せ中のオリゴヌクレオチドがRNAiオリゴヌクレオチドである場合に特に有利である。
注射用途に適した医薬組成物には、滅菌水溶液(水溶性の場合)又は分散液、及び滅菌注射液又は分散液の即時調製のための滅菌粉末が含まれる。適切な担体としては、生理食塩水、静菌水、Cremophor EL.TM.(BASF,Parsippany,N.J.)又はリン酸緩衝生理食塩水(PBS)が挙げられる。担体は、水又は溶媒又は分散媒であり得る。溶媒又は分散媒は、例えば、水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、液体ポリエチレングリコール等)及びそれらの適切な混合物を含んでよい。多くの場合、等張剤、例えば、糖、多価アルコール、例えば、マンニトール、ソルビトール、及び塩化ナトリウムを組成物に含むことが好ましい。滅菌注射溶液は、必要に応じて、上に列挙した成分の1つ又は組合せを含む選択された溶媒中に必要量のオリゴヌクレオチドを組み込み、続いて濾過滅菌することによって調製することができる。
本発明の医薬組合せのいくつかの実施形態では、組合せ中の組成物は、少なくとも約0.1%以上の治療薬(例えば、HBV抗原発現を減少させるためのオリゴヌクレオチド)を含有し得るが、活性成分(複数可)のパーセンテージは、全組成物の重量又は体積の約1%~約80%以上であり得る。溶解度、バイオアベイラビリティ、生物学的半減期、投与経路、製品貯蔵寿命、並びに他の薬理学的考慮事項などの要因は、そのような医薬製剤を調製する当業者によって企図され、したがって、様々な投与量及び処置レジメンが望ましい場合がある。
いくつかの実施形態は、本明細書に開示されるオリゴヌクレオチドのいずれかの肝臓標的化送達を対象としているが、他の組織の標的化も企図される。
11.医薬組合せ及びキットオブパーツ
11.医薬組合せ及びキットオブパーツ
本発明の一態様は、それぞれが薬学的に許容され得る担体中に製剤化された、本明細書に記載のHBVを標的とする治療用オリゴヌクレオチドとTLR7アゴニストとの医薬組合せに関する。
本発明の医薬組合せは、含まれる治療用オリゴヌクレオチド又はTLR7アゴニスト単独よりも効果的にHBV感染を処置するために使用することができる。一実施形態では、本発明の医薬組合せを使用して、含まれる治療用オリゴヌクレオチド又はTLR7アゴニスト単独よりも迅速にHBVを阻害し、持続時間を延長してHBVを阻害し、及び/又はより大きな効果でHBVを阻害することができる。これらの効果は、HBsAg滴定の減少によって測定することができる。一実施形態では、本発明の医薬組合せは、含まれる治療用オリゴヌクレオチド又はTLR7アゴニスト単独よりも迅速にHBsAg力価の低下を生じさせる。一実施形態では、本発明の医薬組合せは、含まれる治療用オリゴヌクレオチド又はTLR7アゴニスト単独よりも長いHBsAg力価の低下を生じさせる。一実施形態では、本発明の医薬組合せは、含まれる治療用オリゴヌクレオチド又はTLR7アゴニスト単独よりも大きなHBsAg力価の低下を生じさせる。
本発明の好ましい実施形態では、医薬組合せは、本明細書に記載のRNAiオリゴヌクレオチド及びTLR7アゴニストを含むか、又はこれからなる。
本発明の一実施形態では、医薬組合せは、RNAiオリゴヌクレオチド及び式(I)又は(II)のTLR7アゴニストを含むか、又はこれからなる:
式中、XはCH2又はSであり、
式(I)について、R1は-OH又は-Hであり、R2は1-ヒドロキシプロピル又はヒドロキシメチルであり、
式(II)について、R1は-OH又は-H又はアセトキシであり、R2は1-アセトキシプロピル又は1-ヒドロキシプロピル又は1-ヒドロキシメチル又はアセトキシ(シクロプロピル)メチル又はアセトキシ(プロピン-1-イル)メチルである、
又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである。
本発明の一実施形態では、医薬組合せは、RNAiオリゴヌクレオチド及び式(I)又は(II)のTLR7アゴニストを含むか、又はこれからなる:
式(I)について、R1は-OH又は-Hであり、R2は1-ヒドロキシプロピル又はヒドロキシメチルであり、
式(II)について、R1は-OH又は-H又はアセトキシであり、R2は1-アセトキシプロピル又は1-ヒドロキシプロピル又は1-ヒドロキシメチル又はアセトキシ(シクロプロピル)メチル又はアセトキシ(プロピン-1-イル)メチルである、
又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである。
本発明のRNAiオリゴヌクレオチド及びTLR7アゴニストは、上記、例えば上記のセクション1~3及び8に個別に記載されている。
本発明の一実施形態では、医薬組合せは、以下からなる群から選択される:
RNAi番号1とCMP番号VI;RNAi番号2とCMP番号VI;RNAi番号3とCMP番号VI;RNAi番号4とCMP番号VI;RNAi番号5とCMP番号VI;RNAi番号6とCMP番号VI;RNAi番号7とCMP番号VI;RNAi番号8とCMP番号VI;RNAi番号9とCMP番号VI;
RNAi番号1とCMP番号VII;RNAi番号2とCMP番号VII;RNAi番号3とCMP番号VII;RNAi番号4とCMP番号VII;RNAi番号5とCMP番号VII;RNAi番号6とCMP番号VII;RNAi番号7とCMP番号VII;RNAi番号8とCMP番号VII;RNAi番号9とCMP番号VII;
RNAi番号1とCMP番号VIII;RNAi番号2とCMP番号VIII;RNAi番号3とCMP番号VIII;RNAi番号4とCMP番号VIII;RNAi番号5とCMP番号VIII;RNAi番号6とCMP番号VIII;RNAi番号7とCMP番号VIII;RNAi番号8とCMP番号VIII;RNAi番号9とCMP番号VIII;
RNAi番号1とCMP番号XIII;RNAi番号2とCMP番号XIII;RNAi番号3とCMP番号XIII;RNAi番号4とCMP番号XIII;RNAi番号5とCMP番号XIII;RNAi番号6とCMP番号XIII;RNAi番号7とCMP番号XIII;RNAi番号8とCMP番号XIII;RNAi番号9とCMP番号XIII;
又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマー。
RNAi番号1とCMP番号VI;RNAi番号2とCMP番号VI;RNAi番号3とCMP番号VI;RNAi番号4とCMP番号VI;RNAi番号5とCMP番号VI;RNAi番号6とCMP番号VI;RNAi番号7とCMP番号VI;RNAi番号8とCMP番号VI;RNAi番号9とCMP番号VI;
RNAi番号1とCMP番号VII;RNAi番号2とCMP番号VII;RNAi番号3とCMP番号VII;RNAi番号4とCMP番号VII;RNAi番号5とCMP番号VII;RNAi番号6とCMP番号VII;RNAi番号7とCMP番号VII;RNAi番号8とCMP番号VII;RNAi番号9とCMP番号VII;
RNAi番号1とCMP番号VIII;RNAi番号2とCMP番号VIII;RNAi番号3とCMP番号VIII;RNAi番号4とCMP番号VIII;RNAi番号5とCMP番号VIII;RNAi番号6とCMP番号VIII;RNAi番号7とCMP番号VIII;RNAi番号8とCMP番号VIII;RNAi番号9とCMP番号VIII;
RNAi番号1とCMP番号XIII;RNAi番号2とCMP番号XIII;RNAi番号3とCMP番号XIII;RNAi番号4とCMP番号XIII;RNAi番号5とCMP番号XIII;RNAi番号6とCMP番号XIII;RNAi番号7とCMP番号XIII;RNAi番号8とCMP番号XIII;RNAi番号9とCMP番号XIII;
又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマー。
一実施形態では、本発明の医薬組合せの治療用オリゴヌクレオチドは、RNAi番号7であるRNAiオリゴヌクレオチドからなる:
B型肝炎ウイルス表面抗原(HBsAg)mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドであり、該オリゴヌクレオチドが、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、
センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3、8~10、12、13及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1と2位のヌクレオチド間の1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、配列を含み、センス鎖上の-GAAA-配列の各ヌクレオチドは、一価GalNac部分にコンジュゲートされており、-GAAA-配列は、以下の構造:
を含み、
アンチセンス鎖は、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに、ヌクレオチド1と2、2と3、3と4、20と21、及び21と22の間に5つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む配列を含み、アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素は以下の構造:
を有し、
TLR7アゴニストはCMP番号VI:
である、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである。
B型肝炎ウイルス表面抗原(HBsAg)mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドであり、該オリゴヌクレオチドが、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、
センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3、8~10、12、13及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1と2位のヌクレオチド間の1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、配列を含み、センス鎖上の-GAAA-配列の各ヌクレオチドは、一価GalNac部分にコンジュゲートされており、-GAAA-配列は、以下の構造:
アンチセンス鎖は、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに、ヌクレオチド1と2、2と3、3と4、20と21、及び21と22の間に5つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む配列を含み、アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素は以下の構造:
TLR7アゴニストはCMP番号VI:
RNAiオリゴヌクレオチドとTLR7アゴニストとを含む医薬組合せの特に好ましい実施形態では、TLR7アゴニストがCMP番号VIである。
一実施形態では、本発明のRNAiオリゴヌクレオチドとTLR7アゴニストとを含む医薬組合せは、CpAM(コアタンパク質アロステリックモジュレータ)をさらに含む。
好ましい実施形態では、CpAMは化合物(CpAM1)によるものである。化合物(CpAM1)は、国際公開第2015132276号に開示された、HBVカプシドを標的とすることによるヒトにおけるHBVの処置及び/又は予防のためのCpAMである。化合物(CpAM1)の構造を以下に示す:
式中、
R1は、水素、ハロゲン又はC1-6アルキルであり、
R2は、水素又はハロゲンであり、
R3は、水素又はハロゲンであり、
R4はC1-6アルキルであり、
R5は、水素、ヒドロキシC1-6アルキル、アミノカルボニル、C1-6アルコキシカルボニル又はカルボキシであり、
R6は、水素、C1-6アルコキシカルボニル又はカルボキシ-CmH2m-であり、
Xは、カルボニル又はスルホニルであり、
Yは、-CH2-、-O-又は-N(R7)-であり、
式中、R7は、水素、C1-6アルキル、ハロC1-6アルキル、C3-7シクロアルキル-CmH2m-、C1-6アルコキシカルボニル-CmH2m-、-CtH2t-COOH、-ハロC1-6アルキル-COOH、-(C1-6アルコキシ)C1-6アルキル-COOH、-C1-6アルキル-O-C1-6アルキル-COOH、-C3-7シクロアルキル-CmH2m-COOH、-CmH2m-C3-7シクロアルキル-COOH、ヒドロキシ-CtH2t-、カルボキシスピロ[3.3]ヘプチル又はカルボキシフェニル-CmH2m-、カルボキシピリジニル-CmH2m-であり、
Wは、-CH2-、-C(C1-6アルキル)2-、-O-又はカルボニルであり、
nは、0又は1であり、
mは0~7であり、
tは1~7である、
又はその薬学的に許容され得る塩、若しくはエナンチオマー、若しくはジアステレオマー。
R1は、水素、ハロゲン又はC1-6アルキルであり、
R2は、水素又はハロゲンであり、
R3は、水素又はハロゲンであり、
R4はC1-6アルキルであり、
R5は、水素、ヒドロキシC1-6アルキル、アミノカルボニル、C1-6アルコキシカルボニル又はカルボキシであり、
R6は、水素、C1-6アルコキシカルボニル又はカルボキシ-CmH2m-であり、
Xは、カルボニル又はスルホニルであり、
Yは、-CH2-、-O-又は-N(R7)-であり、
式中、R7は、水素、C1-6アルキル、ハロC1-6アルキル、C3-7シクロアルキル-CmH2m-、C1-6アルコキシカルボニル-CmH2m-、-CtH2t-COOH、-ハロC1-6アルキル-COOH、-(C1-6アルコキシ)C1-6アルキル-COOH、-C1-6アルキル-O-C1-6アルキル-COOH、-C3-7シクロアルキル-CmH2m-COOH、-CmH2m-C3-7シクロアルキル-COOH、ヒドロキシ-CtH2t-、カルボキシスピロ[3.3]ヘプチル又はカルボキシフェニル-CmH2m-、カルボキシピリジニル-CmH2m-であり、
Wは、-CH2-、-C(C1-6アルキル)2-、-O-又はカルボニルであり、
nは、0又は1であり、
mは0~7であり、
tは1~7である、
又はその薬学的に許容され得る塩、若しくはエナンチオマー、若しくはジアステレオマー。
さらに好ましい実施形態では、CpAMは、化合物(CpAM 2)又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーによるものである。化合物(CpAM2)は、HBVカプシドを標的とすることによるヒトにおけるHBVの処置及び/又は予防のためのCpAMであり、これは国際公開第2015132276号の実施例76に開示されており、それに応じて調製することができる。化合物(CpAM2)の構造を以下に示す:
さらに好ましい実施形態では、CpAMは、3-[(8aS)-7-[[(4S)-5-エトキシカルボニル-4-(3-フルオロ-2-メチル-フェニル)-2-チアゾール-2-イル-1,4-ジヒドロピリミジン-6-イル]メチル]-3-オキソ-5,6,8,8a-テトラヒドロ-1H-イミダゾ[1,5-a]ピラジン-2-イル]-2,2-ジメチル-プロパン酸であり、これは国際公開第2015132276号の実施例76に開示されており、それに応じて調製することができる。
本発明の別の実施形態では、医薬組合せは、配列番号1の1530~1602位までの連続配列に100%相補的な少なくとも12ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を有する13~22ヌクレオチド長のGalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチド、及び式(I)又は(II)のTLR7アゴニストを含むか、又はこれからなる:
式中、XはCH2又はSであり、
式(I)について、R1は-OH又は-Hであり、R2は1-ヒドロキシプロピル又はヒドロキシメチルであり、
式(II)について、R1は-OH又は-H又はアセトキシであり、R2は1-アセトキシプロピル又は1-ヒドロキシプロピル又は1-ヒドロキシメチル又はアセトキシ(シクロプロピル)メチル又はアセトキシ(プロピン-1-イル)メチルである
又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである。
式(I)について、R1は-OH又は-Hであり、R2は1-ヒドロキシプロピル又はヒドロキシメチルであり、
式(II)について、R1は-OH又は-H又はアセトキシであり、R2は1-アセトキシプロピル又は1-ヒドロキシプロピル又は1-ヒドロキシメチル又はアセトキシ(シクロプロピル)メチル又はアセトキシ(プロピン-1-イル)メチルである
又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである。
本発明の、HBVを標的とするGalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチド及びTLR7アゴニストは、例えば上記のセクション4~6及び8に個別に記載されている。
本発明の一実施形態では、医薬組合せは、以下からなる群から選択される:
CMP番号15_1とVI、CMP番号15_2とVI;CMP番号16_1とVI;CMP番号20_1とVI;CMP番号23_1とVI;CMP番号26_1とVI;CMP番号29_1とVI;
CMP番号15_1とVII、CMP番号15_2とVII;CMP番号16_1とVII;CMP番号20_1とVII;CMP番号23_1,VII;CMP番号26_1とVII;CMP番号29_1とVII;
CMP番号15_1とVIII、CMP番号15_2とVIII;CMP番号16_1とVIII;CMP番号20_1とVIII;CMP番号23_1とVII;CMP番号26_1とVIII;CMP番号29_1とVIII;及び
CMP番号15_1とXIII、CMP番号15_2とXIII;CMP番号16_1とXIII;CMP番号20_1とXIII;CMP番号23_1とXIII;CMP番号26_1とXIIIとCMP番号29_1とXIII;
又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマー。
CMP番号15_1とVI、CMP番号15_2とVI;CMP番号16_1とVI;CMP番号20_1とVI;CMP番号23_1とVI;CMP番号26_1とVI;CMP番号29_1とVI;
CMP番号15_1とVII、CMP番号15_2とVII;CMP番号16_1とVII;CMP番号20_1とVII;CMP番号23_1,VII;CMP番号26_1とVII;CMP番号29_1とVII;
CMP番号15_1とVIII、CMP番号15_2とVIII;CMP番号16_1とVIII;CMP番号20_1とVIII;CMP番号23_1とVII;CMP番号26_1とVIII;CMP番号29_1とVIII;及び
CMP番号15_1とXIII、CMP番号15_2とXIII;CMP番号16_1とXIII;CMP番号20_1とXIII;CMP番号23_1とXIII;CMP番号26_1とXIIIとCMP番号29_1とXIII;
又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマー。
一実施形態において、医薬組合せは、図5に示されるCMP番号15_1のGalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドからなり、TLR7アゴニストはCMP番号VI:
であるか、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである。
アンチセンスオリゴヌクレオチドを含む医薬組合せの特に好ましい実施形態では、TLR7アゴニストがCMP番号VIである。
「キット」又は「キットオブパーツ」という用語は、HBV感染個体の処置を実施する際に使用される材料のアセンブリを指し、処置をどのように行うかの説明を含む。
本発明の一態様は、1つ、2つ又は複数の治療有効成分(例えば、医療成分又は医薬)を含有するキットオブパーツであり、そのうちの2つは、本明細書中に記載の治療用オリゴヌクレオチド及び本明細書中に記載のTLR7アゴニストから選択される。
本発明の一実施形態は、本明細書に記載の治療用オリゴヌクレオチド及び本明細書に記載のTLR7アゴニストを医療成分として含むキットオブパーツである。
一実施形態では、本発明のキットは、皮下注射用に製剤化された本明細書に記載の治療用オリゴヌクレオチドである第1の医薬と、経口投与用に製剤化された本明細書に記載のTLR7アゴニストである第2の医薬とを含む。治療用オリゴヌクレオチドは、1回又は複数回の用量を含むバイアル中、又は1つの薬学的に有効な用量を含むプレフィルドシリンジ中の、液体として製剤化することができる。あるいは、治療用オリゴヌクレオチドは凍結乾燥粉末の形態であり得、キットは注射用の治療用オリゴヌクレオチドを調製するための溶媒和剤を含む。注射用の全ての医薬は無菌であることが理解される。キット中のTLR7アゴニストは、単一の薬学的有効用量pr.錠剤を有する錠剤形態(又はカプセル及びゲルなどの経口投与のための代替の単位用量形態)であり得、キットは複数の錠剤を含むことができる。
更なる実施形態において、本発明のキットオブパーツは、B型肝炎ウイルス感染症を処置するための、TLR7アゴニストと組み合わせた治療用オリゴヌクレオチドの投与を指示する添付文書をさらに含む。特に、添付文書には、慢性B型肝炎ウイルス感染症の処置が記載されている。
キットは、医療成分の1つのみと、他の医療成分との併用を指示する添付文書とを含んでいてもよい。1つの実施形態において、本発明のキットオブパーツは、本明細書中に記載される治療用オリゴヌクレオチドである第1の医薬と、別個に購入されるが第2の医薬として本明細書中に記載されるTLR7アゴニストとの組合せでのその使用を指示する添付文書とを含むか又は含有する。別の実施形態において、本発明のキットオブパーツは、本明細書中に記載されるTLR7アゴニストである第1の医薬と、別個に購入されるが第2の医薬として本明細書中に記載される治療用オリゴヌクレオチドとの組合せでのその使用を指示する添付文書とを含むか又は含有する。
いくつかの実施形態において、本発明の医薬組合せは、第3の治療剤又は更なる治療剤(複数可)と組み合わせて使用され得、これらは、キットオブパーツに含まれ得るか、又は別々に供給され得る。更なる治療薬は、例えば、HBV感染症、特に慢性HBV感染症の処置のための標準的なケアであり得る。
12.用途
本発明の医薬組合せは、B型肝炎ウイルス感染症の処置、特に慢性HBVを有する患者の処置に使用するためのものである。
本発明の医薬組合せは、B型肝炎ウイルス感染症の処置、特に慢性HBVを有する患者の処置に使用するためのものである。
本発明の医薬組合せは、治療薬として及び予防に利用することができる。
本発明の医薬組合せは、B型肝炎ウイルス標的化療法と免疫療法の併用として使用することができる。特に、本発明の医薬組合せは、感染細胞におけるHBVの処置に使用される場合、i)細胞HBV mRNAを減少させる、ii)血清中のHBV DNAを減少させる、及び/又はiii)HBsAg及びHBeAgなどのHBVウイルス抗原を減少させる、HBV感染パラメータの1つ又は複数に影響を及ぼすことができる。本発明の一実施形態では、これらのパラメータの1つ又は複数に対する効果は、医薬組合せの個々の医療成分で処置を実施するときに達成される効果と比較して改善される。
HBV感染に対する効果は、HBV感染初代ヒト肝細胞又はHBV感染HepaRG細胞又はASGPR-HepaRG細胞を使用してインビトロで測定することができる(例えば、PCT/EP2018/078136を参照)。HBV感染に対する効果はまた、HBVゲノムを保有する組換えアデノ随伴ウイルス(AAV)に感染したマウスのAAV/HBVマウスモデル(AAV/HBV)(Dan Yang,et al.2014 Cellular&Molecular Immunology 11,71-78)又はHBVミニサークルマウス(Covance Shanghaiで入手可能、Guo et al 2016 Sci Rep 6:2552及びYan et al 2017 J Hepatology 66(6):1149-1157も参照)又はヒト化肝細胞PXBマウスモデル(PhoenixBioで入手可能であり、Kakuni et al 2014 Int.J.Mol.Sci.15:58-74も参照)を使用してインビボで測定することもできる。HBsAg及び/又はHBeAgの分泌阻害は、製造業者の指示に従って、例えばCLIA ELISAキット(Autobio Diagnostic)を用いてELISAにより測定することができる。HBV mRNA及びpgRNAの減少は、例えば、材料及び方法のセクションに記載されるように、qPCRによって測定することができる。試験化合物がHBV感染を阻害するかどうかを評価するための更なる方法は、例えば国際公開第2015/173208号に記載されているとおりqPCRにより、又はノーザンブロット、インサイチュハイブリダイゼーション、又は免疫蛍光を用いて、HBV DNAの分泌を測定することである。
本発明の一実施形態では、本明細書に記載のHBV mRNAを標的とする治療用オリゴヌクレオチドと本明細書に記載のTLR7アゴニストとの医薬組合せは、単一化合物処置(治療用オリゴヌクレオチド単独又はTLR7アゴニスト単独)を超える利点を提供する。利点は、例えば、i)単剤療法と比較して長期の血清HBV-DNA減少;ii)単剤療法と比較したHBsAgのリバウンドの遅延、及び/又はiii)治療域の増加であり得る。薬物に関する「治療域」又は「薬学域」という用語は、毒性作用を有することなく疾患を効果的に処置することができる薬物投与量の範囲である。本発明の一実施形態では、単剤療法と比較して、併用処置によって治療域の増加を達成することができる。
本出願の研究では、併用処置を使用する場合、単剤療法を使用する場合に必要とされる投与量と比較して、3~5倍低い投与量で有意に改善された効果を達成することができ、より高い投与量での同じ組合せと比較した場合に3~5倍低い投与量の併用処置で本質的に同じ効果を達成することができることが観察された。例えば、単剤療法ではHBsAgの効率的な減少を達成するために高用量(7.5mg/kgの抗HBVアンチセンスオリゴヌクレオチド又は2日に1回(QOD)の100mgのTLR7アゴニスト)が必要であり、低用量(毎週(QW)1.5mg/kg及び100mg)のHBsAgを併用する場合は、HBsAgが検出限界未満に減少し、リバウンドする時間が高用量の単剤療法と比較して有意に延長されることが示されている。さらに、1日おきではなく週に1回投与されるTLR7アゴニスト(用量の4倍の減少に対応する)と組み合わせて、5倍低い用量(1.5mg/kg対7.5mg/kg)の抗HBV治療用オリゴヌクレオチドの医薬組合せを使用する場合、ウイルスパラメータHBsAgのリバウンドを同じ程度まで遅らせることができる。HBV-DNA減少についても同様の結果が観察される。
本発明は、HBV感染を処置又は予防するための方法であって、治療的又は予防的有効量の本発明の医薬組合せを、HBV感染を患う、又はそれに罹り易い対象に投与することを含む、方法を提供する。
本発明の更なる態様は、慢性HBV感染の発症を阻害又は処置するための本発明の医薬組合せの使用に関する。
本発明の一態様は、HBVに感染した個体(慢性HBV感染を有する個体など)を処置する方法であって、薬学的有効量の本明細書で定義される治療用オリゴヌクレオチド、及び、薬学的有効量の式(I)又は(II)のTLR7アゴニスト
式中、XはCH2又はSであり、
式(I)について、R1は-OH又は-Hであり、R2は1-ヒドロキシプロピル又はヒドロキシメチルであり、
式(II)について、HBV感染個体に対して、R1は-OH又は-H又はアセトキシであり、R2は1-アセトキシプロピル又は1-ヒドロキシプロピル又は1-ヒドロキシメチル又はアセトキシ(シクロプロピル)メチル又はアセトキシ(プロピン-1-イル)メチルである
を投与することを含む方法である。
式(I)について、R1は-OH又は-Hであり、R2は1-ヒドロキシプロピル又はヒドロキシメチルであり、
式(II)について、HBV感染個体に対して、R1は-OH又は-H又はアセトキシであり、R2は1-アセトキシプロピル又は1-ヒドロキシプロピル又は1-ヒドロキシメチル又はアセトキシ(シクロプロピル)メチル又はアセトキシ(プロピン-1-イル)メチルである
を投与することを含む方法である。
本発明はまた、併用処置において医薬として使用するための、本出願に記載の治療用オリゴヌクレオチドに関する。本発明はまた、併用処置において医薬として使用するための、本出願に記載のTLR7アゴニストに関する。
特に、本明細書で定義される治療用オリゴヌクレオチド、及び式(I)又は(II)のTLR7アゴニスト:
式中、XはCH2又はSであり、
式(I)について、R1は-OH又は-Hであり、R2は1-ヒドロキシプロピル又はヒドロキシメチルであり、
式(II)について、R1は-OH又は-H又はアセトキシであり、R2は1-アセトキシプロピル又は1-ヒドロキシプロピル又は1-ヒドロキシメチル又はアセトキシ(シクロプロピル)メチル又はアセトキシ(プロピン-1-イル)メチルである
は、B型肝炎ウイルス感染症の処置に使用するためのものである。
式(I)について、R1は-OH又は-Hであり、R2は1-ヒドロキシプロピル又はヒドロキシメチルであり、
式(II)について、R1は-OH又は-H又はアセトキシであり、R2は1-アセトキシプロピル又は1-ヒドロキシプロピル又は1-ヒドロキシメチル又はアセトキシ(シクロプロピル)メチル又はアセトキシ(プロピン-1-イル)メチルである
は、B型肝炎ウイルス感染症の処置に使用するためのものである。
本発明の一実施形態は、慢性HBVウイルス感染などのB型肝炎ウイルス感染症を処置するための第1の医薬の製造における治療用オリゴヌクレオチドの使用であり、第1の医薬は、本出願に記載の治療用オリゴヌクレオチドであり、第1の医薬は、第2の医薬と組み合わせて投与され、第2の医薬は、本出願に記載のTLR7アゴニストである。
本発明の一実施形態では、治療用オリゴヌクレオチドを含有する医療用組成物は、皮下用量として投与される。本発明の更なる実施形態では、TLR7アゴニストは、経口用量として投与されるべきである。医療用組成物は2つの異なる投与経路を介して投与されるので、それらは異なる投与計画に従うことができる。
本発明による医薬組合せは、典型的には有効量で投与される。
一実施形態では、本出願に記載される治療用オリゴヌクレオチドを、1mg/kg~4mg/kgの用量範囲で、24間~72週間、例えば36~60週間、例えば48週間、毎週又は毎月投与して皮下投与し、本出願に記載されるTLR7アゴニストを、8~26週間、例えば10~24週間、例えば12又は13週間、1日おき(QOD)に150~170mgの範囲の単位用量として経口投与し、続いて24~48週間、例えば30~40週間、例えば35週間、毎週投与(QW)する。隔日投与の期間中、10週間~14週間、例えば12週間の処置休止期間があり得る。TLR7アゴニストの投与される用量数は、処置期間を通して60~100用量、例えば75~90用量、例えば81、82、83又は84用量である。治療用オリゴヌクレオチドの投与される用量数は、6~72用量、例えば9~15用量、例えば12又は48用量である。
最適な組合せ効果のために、治療用オリゴヌクレオチド及びTLR7アゴニストは、1ヶ月未満の間隔、例えば1週間未満の間隔、例えば2日の間隔、例えば同日に投与される。
13.使用方法
I.HBsAg発現の減少
いくつかの実施形態では、HBsAgの発現を減少させる目的で、本明細書に開示されるオリゴヌクレオチド、特に本明細書に開示されるRNAiオリゴヌクレオチドを含む有効量の本発明の医薬組合せのいずれか1つを細胞に送達する方法が提供される。本明細書で提供される方法は、任意の適切な細胞型において有用である。いくつかの実施形態では、細胞は、HBV抗原を発現する任意の細胞(例えば、肝細胞、マクロファージ、単球由来細胞、前立腺癌細胞、脳の細胞、内分泌組織、骨髄、リンパ節、肺、胆嚢、肝臓、十二指腸、小腸、膵臓、腎臓、消化管、膀胱、脂肪及び軟部組織並びに皮膚)である。いくつかの実施形態では、細胞は、対象から得られた初代細胞であり、限定された数の継代を受けていてもよく、その結果、細胞はその天然の表現型特性を実質的に維持する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドが送達される細胞は、エクスビボ又はインビトロである(すなわち、培養中の細胞又は細胞が存在する生物に送達することができる)。ある特定の実施形態では、肝細胞のみにおけるHBsAgの発現を減少させる目的で、有効量の本明細書に開示されるオリゴヌクレオチド、特に本明細書に開示されるRNAiオリゴヌクレオチドのいずれか1つを含む医薬組合せを細胞に送達する方法が提供される。
I.HBsAg発現の減少
いくつかの実施形態では、HBsAgの発現を減少させる目的で、本明細書に開示されるオリゴヌクレオチド、特に本明細書に開示されるRNAiオリゴヌクレオチドを含む有効量の本発明の医薬組合せのいずれか1つを細胞に送達する方法が提供される。本明細書で提供される方法は、任意の適切な細胞型において有用である。いくつかの実施形態では、細胞は、HBV抗原を発現する任意の細胞(例えば、肝細胞、マクロファージ、単球由来細胞、前立腺癌細胞、脳の細胞、内分泌組織、骨髄、リンパ節、肺、胆嚢、肝臓、十二指腸、小腸、膵臓、腎臓、消化管、膀胱、脂肪及び軟部組織並びに皮膚)である。いくつかの実施形態では、細胞は、対象から得られた初代細胞であり、限定された数の継代を受けていてもよく、その結果、細胞はその天然の表現型特性を実質的に維持する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドが送達される細胞は、エクスビボ又はインビトロである(すなわち、培養中の細胞又は細胞が存在する生物に送達することができる)。ある特定の実施形態では、肝細胞のみにおけるHBsAgの発現を減少させる目的で、有効量の本明細書に開示されるオリゴヌクレオチド、特に本明細書に開示されるRNAiオリゴヌクレオチドのいずれか1つを含む医薬組合せを細胞に送達する方法が提供される。
いくつかの実施形態では、本明細書中に開示される医薬組合せにおけるオリゴヌクレオチドは、適切な核酸送達方法を使用して導入することができ、この方法には、オリゴヌクレオチドを含有する溶液の注入、オリゴヌクレオチドによって覆われた粒子による衝撃、オリゴヌクレオチドを含有する溶液に細胞又は生物を曝露すること、又はオリゴヌクレオチドの存在下での細胞膜のエレクトロポレーションが含まれる。細胞にオリゴヌクレオチドを送達するための他の適切な方法、例えば脂質媒介キャリア輸送、化学媒介輸送、及びカチオン性リポソームトランスフェクション、例えばリン酸カルシウムなどを使用してもよい。
阻害の結果は、細胞又は対象の1つ又は複数の特性を評価するための適切なアッセイによって、又はHBV抗原発現を示す分子(例えば、RNA、タンパク質)を評価する生化学的技術によって確認することができる。いくつかの実施形態では、本明細書において提供される医薬組合せのオリゴヌクレオチドがHBV抗原の発現レベルを低下させる程度は、HBV抗原の発現レベル(例えば、mRNA又はタンパク質レベル)を適切な対照(例えば、医薬組合せが送達されていないか、又は陰性対照が送達されている細胞又は細胞集団におけるHBV抗原発現のレベル)と比較することによって評価される。いくつかの実施形態では、HBV抗原発現の適切な制御レベルは、制御レベルが毎回測定される必要がないように、所定のレベル又は値であり得る。所定のレベル又は値は、様々な形態をとることができる。いくつかの実施形態では、所定のレベル又は値は、中央値又は平均値などの単一のカットオフ値であり得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のオリゴヌクレオチド、特に本明細書に記載のRNAiオリゴヌクレオチドを含む医薬組合せの投与は、細胞におけるHBV抗原(例えば、HBsAg)発現レベルの低下をもたらす。いくつかの実施形態では、HBV抗原発現レベルの低下は、HBV抗原の適切な対照レベルと比較して、1%以下、5%以下、10%以下、15%以下、20%以下、25%以下、30%以下、35%以下、40%以下、45%以下、50%以下、55%以下、60%以下、70%以下、80%以下、又は90%以下への低下であり得る。適切な対照レベルは、本明細書に記載のオリゴヌクレオチド、特にRNAiオリゴヌクレオチドを含む医薬組合せと接触していない細胞又は細胞集団におけるHBV抗原発現のレベルであり得る。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法による細胞への本発明の医薬組合せのオリゴヌクレオチドの送達の効果は、有限期間後に評価される。例えば、HBV抗原のレベルは、オリゴヌクレオチドを細胞に導入してから、少なくとも8時間、12時間、18時間、24時間、又は、少なくとも1、2、3、4、5、6、7、14、21、28、35、42、49、56、63、70、77、84、91、98、105、112、119、126、133、140、若しくは147日後に、細胞内で分析することができる。
いくつかの実施形態では、HBV抗原(例えば、HBsAg)発現レベルの低下は、投与後長期間持続する。いくつかの実施形態において、HBsAg発現の検出可能な減少は、特にオリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである場合、本発明の医薬組合せのオリゴヌクレオチドの投与後7~70日の期間内で持続する。例えば、いくつかの実施形態において、検出可能な減少は、オリゴヌクレオチドの投与後10~70、10~60、10~50、10~40、10~30、又は10~20日の期間内で持続する。いくつかの実施形態において、検出可能な減少は、特にオリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである場合、本発明の医薬組合せのオリゴヌクレオチドの投与後20~70、20~60、20~50、20~40又は20~30日の期間内で持続する。いくつかの実施形態において、検出可能な減少は、特にオリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである場合、本発明の医薬組合せのオリゴヌクレオチドの投与後30~70、30~60、30~50又は30~40日の期間内で持続する。いくつかの実施形態において、検出可能な減少は、特にオリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである場合、本発明の医薬組合せのオリゴヌクレオチドの投与後40~70、40~60、40~50、50~70、50~60又は60~70日の期間内で持続する。
いくつかの実施形態において、HBsAg発現の検出可能な減少は、特にオリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである場合、本発明の医薬組合せのオリゴヌクレオチドの投与後2週間~21週間の期間内で持続する。例えば、いくつかの実施形態において、検出可能な減少は、特にオリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである場合、本発明の医薬組合せのオリゴヌクレオチドの投与後2~20、4~20、6~20、8~20、10~20、12~20、14~20、16~20又は18~20週間の期間内で持続する。いくつかの実施形態において、検出可能な減少は、特にオリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである場合、本発明の医薬組合せのオリゴヌクレオチドの投与後2~16、4~16、6~16、8~16、10~16、12~16又は14~16週間の期間内で持続する。いくつかの実施形態において、検出可能な減少は、特にオリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである場合、本発明の医薬組合せのオリゴヌクレオチドの投与後2~12、4~12、6~12、8~12又は10~12週間の期間内で持続する。いくつかの実施形態において、検出可能な減少は、特にオリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである場合、本発明の医薬組合せのオリゴヌクレオチドの投与後2~10、4~10、6~10又は8~10週間の期間内で持続する。
いくつかの実施形態において、本発明の医薬組合せのオリゴヌクレオチドは、特にオリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである場合、細胞内でオリゴヌクレオチド(例えば、そのセンス鎖及びアンチセンス鎖)を発現するように操作された導入遺伝子の形態で送達される。いくつかの実施形態において、本発明の医薬組合せのオリゴヌクレオチドは、特にオリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである場合、本明細書中に開示される任意のオリゴヌクレオチを発現するように操作された導入遺伝子を使用して送達される。導入遺伝子は、ウイルスベクター(例えば、アデノウイルス、レトロウイルス、ワクシニアウイルス、ポックスウイルス、アデノ随伴ウイルス又は単純ヘルペスウイルス)又は非ウイルスベクター(例えば、プラスミド又は合成mRNA)を使用して送達され得る。いくつかの実施形態では、本発明の医薬組合せの導入遺伝子を対象に直接注射することができる。
II.処置方法
本開示の態様は、対象におけるHBV感染の処置のためのHBsAg発現を減少させる(例えば、HBsAg発現を減少させる)方法に関する。いくつかの実施形態において、本方法は、有効量の本明細書に開示されるオリゴヌクレオチドのいずれか1つを含む医薬組合せを、それを必要とする対象に投与することを含み得る。本開示は、HBV感染のリスクがある(又は感受性がある)対象及び/又はHBV感染に関連する疾患若しくは障害を処置する予防的及び治療的方法の両方を提供する。
本開示の態様は、対象におけるHBV感染の処置のためのHBsAg発現を減少させる(例えば、HBsAg発現を減少させる)方法に関する。いくつかの実施形態において、本方法は、有効量の本明細書に開示されるオリゴヌクレオチドのいずれか1つを含む医薬組合せを、それを必要とする対象に投与することを含み得る。本開示は、HBV感染のリスクがある(又は感受性がある)対象及び/又はHBV感染に関連する疾患若しくは障害を処置する予防的及び治療的方法の両方を提供する。
ある特定の態様では、本開示は、対象に治療剤(例えば、治療的組合せ、オリゴヌクレオチド若しくはベクター、又はそれをコードする導入遺伝子)を投与することによって、対象において本明細書に記載の疾患又は障害を予防する方法を提供する。いくつかの実施形態では、特に治療的組合せのオリゴヌクレオチドがRNAiオリゴヌクレオチドである場合、処置される対象は、例えば肝臓におけるHBsAgタンパク質の量の減少から治療上利益を得る対象である。疾患又は障害のリスクがある対象は、例えば、当技術分野で公知の診断アッセイ又は予後アッセイ(例えば、肝硬変及び/又は肝臓炎症の同定)の1つ又は組合せによって同定することができる。予防剤の投与は、疾患又は障害が予防されるか、あるいはその進行が遅延されるように、疾患又は障害に特徴的な症状の検出又は発現の前に行うことができる。
本明細書に記載の方法は、典型的には、有効量の治療的組合せ、すなわち、望ましい治療結果をもたらすことができる量を対象に投与することを含む。治療上許容され得る量は、疾患又は障害を処置することができる量であり得る。任意の1人の対象の適切な投与量は、対象の大きさ、体表面積、年齢、投与される特定の組成物、組成物中の活性成分(複数可)、投与の時間及び経路、全身の健康状態、並びに同時に投与される他の薬物を含む特定の因子に依存する。例えば、投与量は、0.1mg/kg~12mg/kgの範囲であり得る。投与量はまた、0.5~10mg/kgの範囲であり得る。あるいは、投与量は、1.0~6.0mg/kgの範囲であり得る。投与量はまた、3.0~5.0mg/kgの範囲であり得る。
いくつかの実施形態では、対象は、本明細書に開示される治療的組合せの組成物のいずれか1つを、経腸(例えば、経口、胃栄養チューブ、十二指腸栄養チューブ、胃瘻造設術又は直腸によって)、非経口(例えば、皮下注射、静脈内注射又は注入、動脈内注射又は注入、骨内注入、筋肉内注射、脳内注射、脳室内注射、髄腔内)、局所(例えば、皮膚上、吸入、点眼剤を介して、又は粘膜を介して)、又は標的器官(例えば、対象の肝臓)への直接注射のいずれかによって投与される。典型的には、本明細書に開示される治療的組合せのオリゴヌクレオチドは、静脈内又は皮下に投与される。
非限定的な一組の例として、本開示の治療的組合せのオリゴヌクレオチドは、典型的には、年4回(3ヶ月に1回)、2ヶ月毎(2ヶ月に1回)、毎月、又は毎週投与される。例えば、オリゴヌクレオチドは、1、2又は3週間ごとに投与され得る。オリゴヌクレオチドは毎日投与され得る。
好ましい実施形態では、本発明のRNAi化合物は、HBVを標的とするsiRNAであり、0.1mg/kg~7mg/kg、好ましくは0.5mg/kg~6.5mg/kg、最も好ましくは1mg/kg~6mg/kgの用量で皮下投与される。一実施形態では、用量は、2週間に1回、4週間に1回、又は6週間に1回投与される。好ましい実施形態では、用量は月に1回投与される。特に好ましい実施形態では、1mg/kg~6mg/kgの用量を月1回投与する。1ヶ月に1回は、ほぼ1暦月の長さである間隔で連続用量が投与されることを意味すると理解される。
いくつかの実施形態では、処置される対象は、ヒト若しくは非ヒト霊長類又は他の哺乳動物対象である。他の例示的な対象としては、イヌ及びネコなどの家畜;ウマ、ウシ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、ニワトリ等の家畜;マウス、ラット、モルモット、ハムスターなどの動物が挙げられる。
実施形態
本発明の以下の実施形態は、本明細書に記載される任意の他の実施形態と組み合わせて使用することができる。
本発明の以下の実施形態は、本明細書に記載される任意の他の実施形態と組み合わせて使用することができる。
1.治療用オリゴヌクレオチド、及び式(I)又は(II):
のTLR7アゴニストを含む、又はそれらからなる医薬組合せであって
式中、XはCH2又はSであり、
式(I)について、R1は-OH又は-Hであり、R2は1-ヒドロキシプロピル又はヒドロキシメチルであり、
式(II)について、R1は-OH又は-H又はアセトキシであり、R2は1-アセトキシプロピル又は1-ヒドロキシプロピル又は1-ヒドロキシメチル又はアセトキシ(シクロプロピル)メチル又はアセトキシ(プロピン-1-イル)メチルである、
又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマー。
式中、XはCH2又はSであり、
式(I)について、R1は-OH又は-Hであり、R2は1-ヒドロキシプロピル又はヒドロキシメチルであり、
式(II)について、R1は-OH又は-H又はアセトキシであり、R2は1-アセトキシプロピル又は1-ヒドロキシプロピル又は1-ヒドロキシメチル又はアセトキシ(シクロプロピル)メチル又はアセトキシ(プロピン-1-イル)メチルである、
又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマー。
2.治療用オリゴヌクレオチドがRNAiオリゴヌクレオチドである、実施形態1に記載の医薬組合せ。
3.RNAiオリゴヌクレオチドが、HBV(RNAi番号1)を標的とするオリゴヌクレオチドである、実施形態2に記載の医薬組合せ。
4.RNAiオリゴヌクレオチドが、HBsAg mRNA(RNAi番号2)を標的とするオリゴヌクレオチドである、実施形態2又は3に記載の医薬組合せ。
5.RNAiオリゴヌクレオチドが、HBsAg mRNA(RNAi番号3)の発現を減少させるオリゴヌクレオチドである、実施形態2~4のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
6.RNAiオリゴヌクレオチドが、19~30ヌクレオチド長のアンチセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドであり、アンチセンス鎖が、ACAANAAUCCUCACAAUA(配列番号33)に記載のHBsAg mRNA(RNAi番号4)の配列に対して相補性の領域を含む、実施形態2~5のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
7.RNAiオリゴヌクレオチドが、B型肝炎ウイルス表面抗原(HBsAg)mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドであり、オリゴヌクレオチドが、19~30ヌクレオチド長のアンチセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドであり、アンチセンス鎖が、ACAANAAUCCUCACAAUA(配列番号33)に記載のHBsAg mRNA(RNAi番号5)の配列に対して相補性の領域を含む、実施形態2~5のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
8.RNAiオリゴヌクレオチドが、19~50ヌクレオチド長のセンス鎖をさらに含み、センス鎖が、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成する、実施形態6又は7に記載の医薬組合せ。
9.センス鎖が、UUNUUGUGAGGAUUN(配列番号34)に記載の配列と相補性の領域を含む、実施形態8に記載の医薬組合せ。
10.センス鎖が、5’-UUAUUGUGAGGAUUNUUGUC(配列番号35)に記載の配列と相補性の領域を含む、実施形態8又は9に記載の医薬組合せ。
11.アンチセンス鎖が、UUAUUGUGAGGAUUNUUGUCGG(配列番号36)に記載の配列を含む、実施形態9に記載の医薬組合せ。
12.アンチセンス鎖が、UUAUUGUGAGGAUUCUUGUCGG(配列番号37)に記載の配列からなる、実施形態9に記載の医薬組合せ。
13.アンチセンス鎖が、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列からなる、実施形態9に記載の医薬組合せ。
14.センス鎖が、ACAANAAUCCUCACAAUAA(配列番号39)に記載の配列を含む、実施形態8から12のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
15.センス鎖が、GACAANAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号40)に記載の配列を含む、実施形態8~14のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
16.センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列からなる、実施形態8~14のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
17.センス鎖が、GACAAGAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号42)に記載の配列からなる、実施形態8~14のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
18.RNAiオリゴヌクレオチドが、B型肝炎ウイルス表面抗原(HBsAg)mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドであり、オリゴヌクレオチドが、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、センス鎖がGACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列を含み、アンチセンス鎖が、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列を含み、
アンチセンス鎖及びセンス鎖の各々が、1つ又は複数の2’-フルオロ及び2’-O-メチル修飾ヌクレオチド並びに少なくとも1つのホスホロチオエート結合を含み、アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素がリン酸類似体を含み、センス鎖が1つ又は複数のN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)部分にコンジュゲートされている、実施形態2~5のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
アンチセンス鎖及びセンス鎖の各々が、1つ又は複数の2’-フルオロ及び2’-O-メチル修飾ヌクレオチド並びに少なくとも1つのホスホロチオエート結合を含み、アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素がリン酸類似体を含み、センス鎖が1つ又は複数のN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)部分にコンジュゲートされている、実施形態2~5のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
19.RNAiオリゴヌクレオチドが、B型肝炎ウイルス表面抗原(HBsAg)mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドであり、オリゴヌクレオチドが、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、
センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3、8~10、12、13及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む配列を含み、センス鎖は、1つ又は複数のN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)部分にコンジュゲートされており、
アンチセンス鎖は、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも3つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む配列を含み、アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素はリン酸類似体を含む、実施形態2~5のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3、8~10、12、13及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む配列を含み、センス鎖は、1つ又は複数のN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)部分にコンジュゲートされており、
アンチセンス鎖は、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも3つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む配列を含み、アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素はリン酸類似体を含む、実施形態2~5のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
20.センス鎖が、1位及び2位のヌクレオチド間にホスホロチオエート結合を含む、実施形態19に記載の医薬組合せ。
21.アンチセンス鎖が、ヌクレオチド1と2、2と3、3と4、20と21、及び21と22の間に5個のホスホロチオエート結合を含む、実施形態19又は20に記載の医薬組合せ。
23.センス鎖上の-GAAA-配列のヌクレオチドのうちの1つ又は複数が一価GalNAc部分にコンジュゲートされている、実施形態19~22のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
24.センス鎖上の-GAAA-配列のヌクレオチドの各々が一価GalNAc部分にコンジュゲートされている、実施形態23に記載の医薬組合せ。
25.-GAAA-モチーフが、以下の構造:
を含み、
式中、
Lは、置換及び非置換アルキレン、置換及び非置換アルケニレン、置換及び非置換アルキニレン、置換及び非置換ヘテロアルキレン、置換及び非置換ヘテロアルケニレン、置換及び非置換ヘテロアルキニレン、及びそれらの組合せからなる群から選択される、結合、クリックケミストリーハンドル、又は長さが1個以上20個以下の連続する共有結合原子のリンカーを表し、
Xは、O、S又はNである、実施形態24に記載の医薬組合せ。
式中、
Lは、置換及び非置換アルキレン、置換及び非置換アルケニレン、置換及び非置換アルキニレン、置換及び非置換ヘテロアルキレン、置換及び非置換ヘテロアルケニレン、置換及び非置換ヘテロアルキニレン、及びそれらの組合せからなる群から選択される、結合、クリックケミストリーハンドル、又は長さが1個以上20個以下の連続する共有結合原子のリンカーを表し、
Xは、O、S又はNである、実施形態24に記載の医薬組合せ。
26.Lがアセタールリンカーである、実施形態25に記載の医薬組合せ。
27.XがOである、実施形態25又は26に記載の医薬組合せ。
29.センス鎖が、その3’末端に、以下に記載のステムループ:S1-L-S2を含み、式中、S1はS2に相補的であり、LはS1とS2との間に最大6ヌクレオチド長のループを形成する、実施形態8に記載の医薬組合せ。
30.Lがテトラループである、実施形態29に記載の医薬組合せ。
31.Lが、S1とS2との間に4ヌクレオチド長のループを形成する、実施形態29又は30に記載の医薬組合せ。
32.LがGAAAとして示される配列を含む、実施形態29~31のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
33.ステムループの最大4ヌクレオチドのLがそれぞれ別個のGalNAcにコンジュゲートされる、実施形態29~32のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
34.RNAiオリゴヌクレオチドが少なくとも1つの修飾ヌクレオチドを含む、実施形態6~16のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
35.修飾ヌクレオチドが2’-修飾を含む、実施形態34に記載の医薬組合せ。
36.2’-修飾が、2’-アミノエチル、2’-フルオロ、2’-O-メチル、2’-O-メトキシエチル、及び2’-デオキシ-2’-フルオロ-β-d-アラビノ核酸から選択される、実施形態35に記載の医薬組合せで。
37.RNAiオリゴヌクレオチドのヌクレオチドの全てが修飾ヌクレオチドである、実施形態6~16のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
38.RNAiオリゴヌクレオチドが少なくとも1つの修飾ヌクレオチド間結合を含む、実施形態6~16のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
39.少なくとも1つの修飾ヌクレオチド間結合がホスホロチオエート結合である、実施形態38に記載の医薬組合せ。
40.アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素がリン酸類似体を含む、実施形態6~16のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
41.オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオチドが標的化リガンドにコンジュゲートされる、実施形態6~16のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
42.標的化リガンドがN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)部分である、実施形態41に記載の医薬組合せ。
43.RNAiオリゴヌクレオチドが、B型肝炎ウイルス表面抗原(HBsAg)mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドであり、オリゴヌクレオチドが、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、
センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3、8~10、12、13及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1と2位のヌクレオチド間のホスホロチオエート結合を含む、配列からなり、センス鎖上の-GAAA-配列の各ヌクレオチドは、一価GalNAc部分にコンジュゲートされており、
アンチセンス鎖は、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに、1と2位のヌクレオチド間、2と3位のヌクレオチド間、3と4位のヌクレオチド間、20と21位のヌクレオチド間、及び21と22位のヌクレオチド間のホスホロチオエート結合を含む配列からなり、
アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素がメトキシホスホネート(MOP)(RNAi番号6)を含む、実施形態2~5のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3、8~10、12、13及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1と2位のヌクレオチド間のホスホロチオエート結合を含む、配列からなり、センス鎖上の-GAAA-配列の各ヌクレオチドは、一価GalNAc部分にコンジュゲートされており、
アンチセンス鎖は、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに、1と2位のヌクレオチド間、2と3位のヌクレオチド間、3と4位のヌクレオチド間、20と21位のヌクレオチド間、及び21と22位のヌクレオチド間のホスホロチオエート結合を含む配列からなり、
アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素がメトキシホスホネート(MOP)(RNAi番号6)を含む、実施形態2~5のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
44.RNAiオリゴヌクレオチドが、B型肝炎ウイルス表面抗原(HBsAg)mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドであり、オリゴヌクレオチドが、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、
センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3、8~10、12、13及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1と2位のヌクレオチド間の1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、配列を含み、センス鎖上の-GAAA-配列の各ヌクレオチドは、一価GalNAc部分にコンジュゲートされており、-GAAA-配列は、以下の構造:
を含み
アンチセンス鎖は、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに、ヌクレオチド1と2、2と3、3と4、20と21、及び21と22の間に5つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む配列を含み、アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素は以下の構造:
を有する、実施形態2~5のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3、8~10、12、13及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1と2位のヌクレオチド間の1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、配列を含み、センス鎖上の-GAAA-配列の各ヌクレオチドは、一価GalNAc部分にコンジュゲートされており、-GAAA-配列は、以下の構造:
アンチセンス鎖は、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに、ヌクレオチド1と2、2と3、3と4、20と21、及び21と22の間に5つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む配列を含み、アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素は以下の構造:
45.RNAiオリゴヌクレオチドが図29Aに示される構造(RNAi番号8)を有する、実施形態2~5のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
46.RNAiオリゴヌクレオチドがオリゴヌクレオチドHBV(s)-219(RNAi番号9)である、実施形態2~5のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
47.治療用オリゴヌクレオチドが、配列番号1の1530位から1602位までの連続配列に100%相補的な少なくとも12ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を有する13~22ヌクレオチド長のGalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態1に記載の医薬組合せ。
48.連続ヌクレオチド配列が、配列番号1の1530~1598;1530~1543;1530~1544;1531~1543;1551~1565;1551~1566;1577~1589;1577~1591;1577~1592;1578~1590;1578~1592;1583~1598;1584~1598;1585~1598及び1583~1602位からなる群から選択される標的配列に100%相補的である、実施形態47に記載の医薬組合せ。
49.連続ヌクレオチド配列が12~16ヌクレオチド長である、実施形態47又は48に記載の医薬組合せ。
50.GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列が、以下:
gcgtaaagagagg(配列番号2);
gcgtaaagagaggt(配列番号3);
cgcgtaaagagaggt(配列番号4);
agaaggcacagacgg(配列番号5);
gagaaggcacagacgg(配列番号6);
agcgaagtgcacacgg(配列番号7);
gaagtgcacacgg(配列番号8);
gcgaagtgcacacgg(配列番号9);
agcgaagtgcacacg(配列番号10);
cgaagtgcacacg(配列番号11);
aggtgaagcgaagtgc(配列番号12)
aggtgaagcgaagtg(配列番号13);
aggtgaagcgaagt(配列番号14);及び
gcagaggtgaagcgaagtgc(配列番号29)
からなる群から選択される、又はその薬学的に許容され得る塩である、実施形態47~49のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
gcgtaaagagagg(配列番号2);
gcgtaaagagaggt(配列番号3);
cgcgtaaagagaggt(配列番号4);
agaaggcacagacgg(配列番号5);
gagaaggcacagacgg(配列番号6);
agcgaagtgcacacgg(配列番号7);
gaagtgcacacgg(配列番号8);
gcgaagtgcacacgg(配列番号9);
agcgaagtgcacacg(配列番号10);
cgaagtgcacacg(配列番号11);
aggtgaagcgaagtgc(配列番号12)
aggtgaagcgaagtg(配列番号13);
aggtgaagcgaagt(配列番号14);及び
gcagaggtgaagcgaagtgc(配列番号29)
からなる群から選択される、又はその薬学的に許容され得る塩である、実施形態47~49のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
51.GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列が、式5’-F-G-F’-3’のギャップマーであり、領域F及びF’は、独立して、2~5個の2’糖修飾ヌクレオチドからなり、F及びF’領域の5’及び3’末端を規定し、Gは、RNアーゼHを動員することができる6~10個のDNAヌクレオシド領域である、実施形態47~50のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
52.2’糖修飾ヌクレオシドが、2’-O-アルキル-RNA、2’-O-メチル-RNA、2’-アルコキシ-RNA、2’-O-メトキシエチル-RNA、2’-アミノ-DNA、2’-フルオロ-DNA、2’-フルオロ-ANA及びLNAヌクレオシドからなる群から独立して選択される、実施形態51に記載の医薬組合せ。
53.1つ又は複数の2’糖修飾ヌクレオシドがMOEヌクレオシドである、実施形態51又は52に記載の医薬組合せ。
54.1つ又は複数の2’糖修飾ヌクレオシドがLNAヌクレオシドである、実施形態51又は52に記載の医薬組合せ。
55.修飾LNAヌクレオシドが、オキシLNA、アミノLNA、チオLNA、cET及びENAから選択される、実施形態54に記載の医薬組合せ。
56.修飾LNAヌクレオシドが、それに続く2’-4’架橋-O-CH2-を有するオキシLNAである、実施形態54又は55に記載の医薬組合せ。
57.オキシLNAがベータ-D-オキシLNAである、実施形態56に記載の医薬組合せ。
58.修飾LNAヌクレオシドが、それに続く2’-4’架橋-O-CH(CH3)-を有するcETである、実施形態54又は55に記載の医薬組合せ。
59.cETが(S)cET、すなわち6’(S)メチル-ベータ-D-オキシLNAである、実施形態58に記載の医薬組合せ。
60.LNAがENAであり、それに続く2’-4’架橋-O-CH2-CH2-を有する、実施形態54又は55に記載の医薬組合せ。
61.GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列が、
GCGtaaagagaGG(配列番号2);
GCGtaaagagAGG(配列番号2);
GCGtaaagagaGGT(配列番号3);
CGCgtaaagagaGGT(配列番号4);
AGAaggcacagaCGG(配列番号5);
GAGaaggcacagaCGG(配列番号6);
AGCgaagtgcacaCGG(配列番号7);
GAAgtgcacacGG(配列番号8);
GAAgtgcacaCGG(配列番号8);
GCGaagtgcacaCGG(配列番号9);
AGCgaagtgcacACG(配列番号10);
CGAagtgcacaCG(配列番号11);
AGGtgaagcgaagTGC(配列番号12);
AGGtgaagcgaaGTG(配列番号13)
AGgtgaagcgaAGTG(配列番号13);
AGGtgaagcgaAGT(配列番号14);及び
GCAGAGgtgaagcgaAGTGC(配列番号29)
からなる群から選択され、大文字はLNA又はMOEヌクレオシドを示し、小文字はDNAヌクレオシドを示す、実施形態47~60のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
GCGtaaagagaGG(配列番号2);
GCGtaaagagAGG(配列番号2);
GCGtaaagagaGGT(配列番号3);
CGCgtaaagagaGGT(配列番号4);
AGAaggcacagaCGG(配列番号5);
GAGaaggcacagaCGG(配列番号6);
AGCgaagtgcacaCGG(配列番号7);
GAAgtgcacacGG(配列番号8);
GAAgtgcacaCGG(配列番号8);
GCGaagtgcacaCGG(配列番号9);
AGCgaagtgcacACG(配列番号10);
CGAagtgcacaCG(配列番号11);
AGGtgaagcgaagTGC(配列番号12);
AGGtgaagcgaaGTG(配列番号13)
AGgtgaagcgaAGTG(配列番号13);
AGGtgaagcgaAGT(配列番号14);及び
GCAGAGgtgaagcgaAGTGC(配列番号29)
からなる群から選択され、大文字はLNA又はMOEヌクレオシドを示し、小文字はDNAヌクレオシドを示す、実施形態47~60のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
62.連続ヌクレオチド配列内のヌクレオシド間結合の少なくとも50%がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態47~61のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
63.GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列内の全てのヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態47~62のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
64.GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドのGalNAcコンジュゲートが、二価、三価又は四価のGalNAcクラスターである、実施形態47~63のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
65.GalNAcコンジュゲートが、図1B、図1D又は図1Jから選択される、実施形態64に記載の医薬組合せ。
66.GalNAcコンジュゲート及びGalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列が、2、3、4又は5個のホスホジエステル結合DNAヌクレオシドを含むPOリンカーによって共有結合している、実施形態47~65のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
67.POリンカーが、アンチセンスオリゴヌクレオチドの一部であり、一方がCとAとの間にあり他方がGalNAcクラスターに対するものである少なくとも2つのホスホジエステル結合を有するシトシン及びアデニン(CA)のジヌクレオチド配列からなる、実施形態66に記載の医薬組合せ。
68.GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドが12~18ヌクレオチド長である、実施形態47~67のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
69.GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドが、
からなる群から選択され、大文字の太字はベータ-D-オキシLNA単位を表し、小文字はDNA単位を表し、下付き文字「o」はホスホジエステル結合を表し、下付き文字「s」はホスホロチオエート結合を表し、上付き文字mは5-メチルシトシン塩基を含有するDNA又はベータ-D-オキシLNA単位を表し、GN2-C6は、C6リンカーを有するGalNAc 2コンジュゲートを表す、又はその薬学的に許容され得る塩である、実施形態47~68のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
70.GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドが5’-図1J-o
GsCsAsGsAsgsgstsgsasasgscsgsasAsGsTsGsC-3’(図2)であり、式中、下線付き大文字下線付き文字はMOE単位を表し、小文字はDNA単位を表し、下付き文字「o」は、ホスホジエステル結合を表し、下付き文字「s」は、ホスホロチオエート結合を表す、実施形態47~69のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
71.TLR7アゴニストが式(III):
であり、
式中、R1は-OH又はアセトキシであり、R2は1-アセトキシプロピル又は1-ヒドロキシプロピル又は1-ヒドロキシメチルである、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである、実施形態1~70のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
式中、R1は-OH又はアセトキシであり、R2は1-アセトキシプロピル又は1-ヒドロキシプロピル又は1-ヒドロキシメチルである、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである、実施形態1~70のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
73.TLR7アゴニストが式(V):
であり、
式中、R1は-OHであり、R2は1-ヒドロキシプロピル又はヒドロキシメチルである、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである、実施形態1~70のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
式中、R1は-OHであり、R2は1-ヒドロキシプロピル又はヒドロキシメチルである、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである、実施形態1~70のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
74.TLR7アゴニストが、
[(1S)-1-[(2S,4R,5R)-5-(5-アミノ-2-オキソ-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-3-イル)-4-ヒドロキシ-テトラヒドロフラン-2-イル]プロピル]アセテート(CMP番号VI);
5-アミノ-3-[(2R,3R,5S)-3-ヒドロキシ-5-[(1S)-1-ヒドロキシプロピル]テトラヒドロフラン-2-イル]-6H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2,7-ジオン(CMP番号VII);
5-アミノ-3-[(2R,3R,5S)-3-ヒドロキシ-5-[(1S)-1-ヒドロキシプロピル]テトラヒドロフラン-2-イル]チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2-オン(CMP番号VIII);
5-アミノ-3-(3’-デオキシ-β-D-リボフラノシル)-3H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2-オン(CMP番号IX);
5-アミノ-3-(2’-O-アセチル-3’-デオキシ-β-D-リボフラノシル)-3H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2-オン(CMP番号X);
5-アミノ-3-(3’-デオキシ-β-D-リボフラノシル)-3H,6H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2,7-ジオン(CMP番号XI);
[(S)-[(2S,5R)-5-(5-アミノ-2-オキソ-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-3-イル)-1,3-オキサチオラン-2-イル]-シクロプロピル-メチル]アセテート(CMP番号XII);及び
(1S)-1-[(2S,5R)-5-(5-アミノ-2-オキソ-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-3-イル)-1,3-オキサチオラン-2-イル]ブタ-2-イニル]アセテート(CMP番号XIII);
からなる群から選択される、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである、実施形態1~73のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
[(1S)-1-[(2S,4R,5R)-5-(5-アミノ-2-オキソ-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-3-イル)-4-ヒドロキシ-テトラヒドロフラン-2-イル]プロピル]アセテート(CMP番号VI);
5-アミノ-3-[(2R,3R,5S)-3-ヒドロキシ-5-[(1S)-1-ヒドロキシプロピル]テトラヒドロフラン-2-イル]-6H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2,7-ジオン(CMP番号VII);
5-アミノ-3-[(2R,3R,5S)-3-ヒドロキシ-5-[(1S)-1-ヒドロキシプロピル]テトラヒドロフラン-2-イル]チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2-オン(CMP番号VIII);
5-アミノ-3-(3’-デオキシ-β-D-リボフラノシル)-3H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2-オン(CMP番号IX);
5-アミノ-3-(2’-O-アセチル-3’-デオキシ-β-D-リボフラノシル)-3H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2-オン(CMP番号X);
5-アミノ-3-(3’-デオキシ-β-D-リボフラノシル)-3H,6H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2,7-ジオン(CMP番号XI);
[(S)-[(2S,5R)-5-(5-アミノ-2-オキソ-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-3-イル)-1,3-オキサチオラン-2-イル]-シクロプロピル-メチル]アセテート(CMP番号XII);及び
(1S)-1-[(2S,5R)-5-(5-アミノ-2-オキソ-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-3-イル)-1,3-オキサチオラン-2-イル]ブタ-2-イニル]アセテート(CMP番号XIII);
からなる群から選択される、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである、実施形態1~73のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
75.RNAiオリゴヌクレオチドとTLR7アゴニストとを含む組合せが、以下の組合せ:
RNAi番号1とCMP番号VI;RNAi番号2とCMP番号VI;RNAi番号3とCMP番号VI;RNAi番号4とCMP番号VI;RNAi番号5とCMP番号VI;RNAi番号6とCMP番号VI;RNAi番号7とCMP番号VI;RNAi番号8とCMP番号VI;RNAi番号9とCMP番号VI;
RNAi番号1とCMP番号VII;RNAi番号2とCMP番号VII;RNAi番号3とCMP番号VII;RNAi番号4とCMP番号VII;RNAi番号5とCMP番号VII;RNAi番号6とCMP番号VII;RNAi番号7とCMP番号VII;RNAi番号8とCMP番号VII;RNAi番号9とCMP番号VII;
RNAi番号1とCMP番号VIII;RNAi番号2とCMP番号VIII;RNAi番号3とCMP番号VIII;RNAi番号4とCMP番号VIII;RNAi番号5とCMP番号VIII;RNAi番号6とCMP番号VIII;RNAi番号7とCMP番号VIII;RNAi番号8とCMP番号VIII;RNAi番号9とCMP番号VIII;
RNAi番号1とCMP番号XIII;RNAi番号2とCMP番号XIII;RNAi番号3とCMP番号XIII;RNAi番号4とCMP番号XIII;RNAi番号5とCMP番号XIII;RNAi番号6とCMP番号XIII;RNAi番号7とCMP番号XIII;RNAi番号8とCMP番号XIII、又はRNAi番号9とCMP番号XIII;
からなる群から選択される、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである、実施形態2~46及び71~74のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
RNAi番号1とCMP番号VI;RNAi番号2とCMP番号VI;RNAi番号3とCMP番号VI;RNAi番号4とCMP番号VI;RNAi番号5とCMP番号VI;RNAi番号6とCMP番号VI;RNAi番号7とCMP番号VI;RNAi番号8とCMP番号VI;RNAi番号9とCMP番号VI;
RNAi番号1とCMP番号VII;RNAi番号2とCMP番号VII;RNAi番号3とCMP番号VII;RNAi番号4とCMP番号VII;RNAi番号5とCMP番号VII;RNAi番号6とCMP番号VII;RNAi番号7とCMP番号VII;RNAi番号8とCMP番号VII;RNAi番号9とCMP番号VII;
RNAi番号1とCMP番号VIII;RNAi番号2とCMP番号VIII;RNAi番号3とCMP番号VIII;RNAi番号4とCMP番号VIII;RNAi番号5とCMP番号VIII;RNAi番号6とCMP番号VIII;RNAi番号7とCMP番号VIII;RNAi番号8とCMP番号VIII;RNAi番号9とCMP番号VIII;
RNAi番号1とCMP番号XIII;RNAi番号2とCMP番号XIII;RNAi番号3とCMP番号XIII;RNAi番号4とCMP番号XIII;RNAi番号5とCMP番号XIII;RNAi番号6とCMP番号XIII;RNAi番号7とCMP番号XIII;RNAi番号8とCMP番号XIII、又はRNAi番号9とCMP番号XIII;
からなる群から選択される、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである、実施形態2~46及び71~74のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
76.RNAiオリゴヌクレオチドがRNAi番号7であり、
アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドであり、
センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3、8~10、12、13及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1と2位のヌクレオチド間の1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、配列を含み、センス鎖上の-GAAA-配列の各ヌクレオチドは、一価GalNac部分にコンジュゲートされており、-GAAA-配列は、以下の構造:
を含み、
アンチセンス鎖は、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに、ヌクレオチド1と2、2と3、3と4、20と21、及び21と22の間に5つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む配列を含み、アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素は以下の構造:
を有しており、
TLR7アゴニストはCMP番号VI:
である、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである、実施形態2~46及び71~74のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドであり、
センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3、8~10、12、13及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1と2位のヌクレオチド間の1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、配列を含み、センス鎖上の-GAAA-配列の各ヌクレオチドは、一価GalNac部分にコンジュゲートされており、-GAAA-配列は、以下の構造:
アンチセンス鎖は、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに、ヌクレオチド1と2、2と3、3と4、20と21、及び21と22の間に5つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む配列を含み、アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素は以下の構造:
TLR7アゴニストはCMP番号VI:
77.GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドとTLR7アゴニストとを含む組合せが、以下の組合せ:CMP番号15_1とVI、CMP番号15_2とVI;CMP番号16_1とVI;CMP番号20_1とVI;CMP番号23_1とVI;CMP番号26_1とVI;CMP番号29_1とVI;CMP番号15_1とVII,CMP番号15_2とVII;CMP番号16_1とVII;CMP番号20_1とVII;CMP番号23_1とVII;CMP番号26_1とVII;CMP番号29_1とVII;CMP番号15_1とVIII、CMP番号15_2とVIII;CMP番号16_1とVIII;CMP番号20_1とVIII;CMP番号23_1とVII;CMP番号26_1とVIII;CMP番号29_1とVIII;CMP番号15_1とXIII、CMP番号15_2とXIII;CMP番号16_1とXIII;CMP番号20_1とXIII;CMP番号23_1とXIII;CMP番号26_1とXIII;及びCMP番号29_1とXIIIからなる群から選択される、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである、実施形態47~74のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
78.GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドが、図5に示されるCMP番号15_1であり、TLR7アゴニストが、CMP番号VI:
である、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである、実施形態47~74のいずれか一つに記載の医薬組合せ、医薬組合せ。
79.治療用オリゴヌクレオチドが薬学的に許容され得る塩と共に製剤化される、実施形態1~78のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
80.薬学的に許容され得る塩が金属カチオンイオンであり、好ましくは、薬学的に許容され得る塩がNa+又はK+である、実施形態79に記載の医薬組合せ。
81.実施形態1~80のいずれか一つに記載の治療用オリゴヌクレオチド及びTLR7アゴニストが、薬学的に許容され得る担体と共に製剤化される、実施形態1~80のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
82.薬学的に許容され得る担体が水である、実施形態81に記載の医薬組合せ。
83.治療用オリゴヌクレオチドがリン酸緩衝生理食塩水において製剤化される、実施形態1~82のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
84.治療用オリゴヌクレオチドが皮下注射用に製剤化され、TLR7アゴニストが経口投与用に製剤化される、実施形態1~83のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
85.治療用オリゴヌクレオチドが静脈内注射用に製剤化され、TLR7アゴニストが経口投与用に製剤化される、実施形態1~83のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
86.治療用オリゴヌクレオチドが皮下注射用に製剤化されたsiRNAであり、TLR7アゴニストが経口投与用に製剤化される、実施形態2~46、75、76及び79~83のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
87.RNAiオリゴヌクレオチドとTLR7アゴニストとを含み、CpAM(コアタンパク質アロステリックモジュレータ)をさらに含む、実施形態1~86のいずれか一つに記載の医薬組合せ。
88.CpAMが以下に示される化合物(CpAM1):
による式を有し、
式中、
R1は、水素、ハロゲン又はC1-6アルキルであり、
R2は、水素又はハロゲンであり、
R3は、水素又はハロゲンであり、
R4はC1-6アルキルであり、
R5は、水素、ヒドロキシC1-6アルキル、アミノカルボニル、C1-6アルコキシカルボニル又はカルボキシであり、
R6は、水素、C1-6アルコキシカルボニル又はカルボキシ-CmH2m-であり、
Xは、カルボニル又はスルホニルであり、
Yは、-CH2-、-O-又は-N(R7)-であり、
式中、R7は、水素、C1-6アルキル、ハロC1-6アルキル、C3-7シクロアルキル-CmH2m-、C1-6アルコキシカルボニル-CmH2m-、-CtH2t-COOH、-ハロC1-6アルキル-COOH、-(C1-6アルコキシ)C1-6アルキル-COOH、-C1-6アルキル-O-C1-6アルキル-COOH、-C3-7シクロアルキル-CmH2m-COOH、-CmH2m-C3-7シクロアルキル-COOH、ヒドロキシ-CtH2t-、カルボキシスピロ[3.3]ヘプチル又はカルボキシフェニル-CmH2m-、カルボキシピリジニル-CmH2m-であり、
Wは、-CH2-、-C(C1-6アルキル)2-、-O-又はカルボニルであり、
nは0又は1であり、
mは0~7であり、
tは1~7である、
又はその薬学的に許容され得る塩、若しくはエナンチオマー、若しくはジアステレオマーである、実施形態87に記載の医薬組合せ。
式中、
R1は、水素、ハロゲン又はC1-6アルキルであり、
R2は、水素又はハロゲンであり、
R3は、水素又はハロゲンであり、
R4はC1-6アルキルであり、
R5は、水素、ヒドロキシC1-6アルキル、アミノカルボニル、C1-6アルコキシカルボニル又はカルボキシであり、
R6は、水素、C1-6アルコキシカルボニル又はカルボキシ-CmH2m-であり、
Xは、カルボニル又はスルホニルであり、
Yは、-CH2-、-O-又は-N(R7)-であり、
式中、R7は、水素、C1-6アルキル、ハロC1-6アルキル、C3-7シクロアルキル-CmH2m-、C1-6アルコキシカルボニル-CmH2m-、-CtH2t-COOH、-ハロC1-6アルキル-COOH、-(C1-6アルコキシ)C1-6アルキル-COOH、-C1-6アルキル-O-C1-6アルキル-COOH、-C3-7シクロアルキル-CmH2m-COOH、-CmH2m-C3-7シクロアルキル-COOH、ヒドロキシ-CtH2t-、カルボキシスピロ[3.3]ヘプチル又はカルボキシフェニル-CmH2m-、カルボキシピリジニル-CmH2m-であり、
Wは、-CH2-、-C(C1-6アルキル)2-、-O-又はカルボニルであり、
nは0又は1であり、
mは0~7であり、
tは1~7である、
又はその薬学的に許容され得る塩、若しくはエナンチオマー、若しくはジアステレオマーである、実施形態87に記載の医薬組合せ。
90.RNAiオリゴヌクレオチド、TLR7アゴニスト及びCpAMを含む医薬組合せであって、RNAiオリゴヌクレオチドがRNAi番号7:
アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドであり、
センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3、8~10、12、13及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1と2位のヌクレオチド間の1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、配列を含み、センス鎖上の-GAAA-配列の各ヌクレオチドは、一価GalNAc部分にコンジュゲートされており、-GAAA-配列は、以下の構造:
を含み、
アンチセンス鎖は、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに、ヌクレオチド1と2、2と3、3と4、20と21、及び21と22の間に5つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む配列を含み、アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素は以下の構造:
を有しており、
TLR7アゴニストはCMP番号VI:
である、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーであり;
CpAMは、化合物(CpAM2):
又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである、医薬組合せ、。
アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドであり、
センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3、8~10、12、13及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1と2位のヌクレオチド間の1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、配列を含み、センス鎖上の-GAAA-配列の各ヌクレオチドは、一価GalNAc部分にコンジュゲートされており、-GAAA-配列は、以下の構造:
アンチセンス鎖は、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに、ヌクレオチド1と2、2と3、3と4、20と21、及び21と22の間に5つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む配列を含み、アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素は以下の構造:
TLR7アゴニストはCMP番号VI:
CpAMは、化合物(CpAM2):
91.実施形態1~90のいずれか一つに記載の医薬組合せを含む医薬組成物。
92.実施形態1~90のいずれか一つに記載の治療用オリゴヌクレオチドと、B型肝炎ウイルス感染症を処置するためのTLR7アゴニストとの投与のための説明がある添付文書とを含むキットオブパーツ。
93.添付文書に記載のTLR7アゴニストが、実施形態1~90のいずれか一つに記載のTLR7アゴニストである、実施形態92に記載のキットオブパーツ。
94.実施形態1~90のいずれか一つに記載の治療用オリゴヌクレオチドと、実施形態1~90のいずれか一つに記載のTLR7アゴニストとを含む、実施形態92又は93に記載のキットオブパーツ。
95.治療用オリゴヌクレオチドが皮下注射用に製剤化され、TLR7アゴニストが経口投与用に製剤化される、実施形態92~94のいずれか一つに記載のキットオブパーツ。
96.添付文書に慢性B型肝炎ウイルス感染症の処置が記載されている、実施形態92~95のいずれか一つに記載のキットオブパーツ。
97.治療用オリゴヌクレオチドが、細胞内でオリゴヌクレオチドを発現するように操作された導入遺伝子の形態である、実施形態1~96のいずれか一つに記載の医薬組合せ、組成物、又はキット。
98.B型肝炎ウイルス感染症を処置するための、実施形態1~97のいずれか一つに記載の医薬組合せ、組成物、又はキットの使用。
99.処置されるB型肝炎ウイルス感染症が慢性B型肝炎ウイルス感染症である、実施形態98に記載の使用。
100.治療用オリゴヌクレオチド及びTLR7アゴニストが薬学的有効量で投与される、実施形態98又は99に記載の使用。
101.治療用オリゴヌクレオチドを毎週投与し、TLR7アゴニストを1日おきに投与する、実施形態98~100のいずれか一つに記載の使用。
102.治療用オリゴヌクレオチドを投与前1~4mg/kgで投与し、TLR7アゴニストを投与前150~170mgで投与する、実施形態98~101のいずれか一つに記載の使用。
103.治療用オリゴヌクレオチドを48週間投与し、84用量のTLR7アゴニストを投与する、実施形態98~102のいずれか一つに記載の使用。
104.治療用オリゴヌクレオチド及びTLR7アゴニストの投与が同じ週に開始される、実施形態98~103のいずれか一つに記載の使用。
105.治療用オリゴヌクレオチドが皮下投与用の剤形であり、TLR7アゴニストが経口投与用の剤形である、実施形態98~104のいずれか一つに記載の使用。
106.治療用オリゴヌクレオチドの用量が100~150mg/mlであり、TLR7アゴニストの用量が150~170mgである、実施形態98~105のいずれか一つに記載の使用。
107.治療用オリゴヌクレオチドが、HBV mRNA転写物をコードする非表面抗原を標的とするRNAiオリゴヌクレオチドによる処置の非存在下で投与される、実施形態98~106のいずれか一つに記載の使用。
108.対象に、HBxAg mRNA転写物を選択的に標的化するRNAiオリゴヌクレオチドが投与されない、実施形態98~107のいずれか一つに記載の使用。
109.対象に有効量のエンテカビルを投与することをさらに含む、実施形態98~108のいずれか一つに記載の使用。
110.治療用オリゴヌクレオチドが、細胞内でオリゴヌクレオチドを発現するように操作された導入遺伝子の形態で送達される、実施形態98~109のいずれか一つに記載の使用。
111.医薬に使用するための、実施形態1~97のいずれか一つに記載の医薬組合せ、組成物、又はキット。
112.B型肝炎ウイルス感染症の処置での使用のための、実施形態1~97のいずれか一つに記載の医薬組合せ、組成物、又はキット。
113.処置されるB型肝炎ウイルス感染症が慢性B型肝炎ウイルス感染症である、実施形態111又は112に記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
114.治療用オリゴヌクレオチド及びTLR7アゴニストが薬学的有効量で投与される、実施形態111~113のいずれか一つに記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
115.治療用オリゴヌクレオチドを毎週投与し、TLR7アゴニストを1日おきに投与する、実施形態111~114のいずれか一つに記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
116.治療用オリゴヌクレオチドを投与前1~4mg/kgで投与し、TLR7アゴニストを投与前150~170mgで投与する、実施形態111~115のいずれか一つに記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
117.治療用オリゴヌクレオチドを48週間投与し、84用量のTLR7アゴニストを投与する、実施形態111~116のいずれか一つに記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
118.治療用オリゴヌクレオチド及びTLR7アゴニストの投与が同じ週に開始される、実施形態111~117のいずれか一つに記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
119.治療用オリゴヌクレオチドが皮下投与用の剤形であり、TLR7アゴニストが経口投与用の剤形である、実施形態111~118のいずれか一つに記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
120.治療用オリゴヌクレオチドの用量が100~150mg/mlであり、TLR7アゴニストの用量が150~170mgである、実施形態111~119のいずれか一つに記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
121.治療用オリゴヌクレオチドが、HBV mRNA転写物をコードする非表面抗原を標的とするRNAiオリゴヌクレオチドによる処置の非存在下で投与される、実施形態111~120のいずれか一つに記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
122.対象に、HBxAg mRNA転写物を選択的に標的化するRNAiオリゴヌクレオチドが投与されない、実施形態111~121のいずれか一つに記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
123.対象に有効量のエンテカビルを投与することをさらに含む、実施形態111~122のいずれか一つに記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
124.治療用オリゴヌクレオチドが、細胞内でオリゴヌクレオチドを発現するように操作された導入遺伝子の形態で送達される、実施形態111~123のいずれか一つに記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
125.B型肝炎ウイルス感染症を処置するための第1の医薬の製造における治療用オリゴヌクレオチドの使用であって、第1の医薬が、実施形態1~97のいずれか一つに記載の治療用オリゴヌクレオチドであり、第1の医薬が、第2の医薬と組み合わせて投与されるものであり、第2の医薬が、実施形態1~97のいずれか一つに記載のTLR7アゴニストである、使用。
126.医薬の製造における、実施形態1~97のいずれか一つに記載の医薬組合せ、組成物、又はキットの使用。
127.B型肝炎ウイルス感染症を処置するための医薬の製造における、実施形態1~97のいずれか一つに記載の医薬組合せ、組成物、又はキットの使用。
128.処置されるB型肝炎ウイルス感染症が慢性B型肝炎ウイルス感染症である、実施形態125~127のいずれか一つに記載の使用。
129.治療用オリゴヌクレオチド及びTLR7アゴニストが薬学的有効量で投与される、実施形態125~128のいずれか一つに記載の使用。
130.治療用オリゴヌクレオチドを毎週投与し、TLR7アゴニストを1日おきに投与する、実施形態125~129のいずれか一つに記載の使用。
131.治療用オリゴヌクレオチドを投与前1~4mg/kgで投与し、TLR7アゴニストを投与前150~170mgで投与する、実施形態125~130のいずれか一つに記載の使用。
132.治療用オリゴヌクレオチドを48週間投与し、84用量のTLR7アゴニストを投与する、実施形態125~131のいずれか一つに記載の使用。
133.治療用オリゴヌクレオチド及びTLR7アゴニストの投与が同じ週に開始される、実施形態125~132のいずれか一つに記載の使用。
134.治療用オリゴヌクレオチドが皮下投与用の剤形であり、TLR7アゴニストが経口投与用の剤形である、実施形態125~133のいずれか一つに記載の使用。
135.治療用オリゴヌクレオチドの用量が100~150mg/mlであり、TLR7アゴニストの用量が150~170mgである、実施形態125~134のいずれか一つに記載の使用。
136.治療用オリゴヌクレオチドが、HBV mRNA転写物をコードする非表面抗原を標的とするRNAiオリゴヌクレオチドによる処置の非存在下で投与される、実施形態125~135のいずれか一つに記載の使用。
137.対象に、HBxAg mRNA転写物を選択的に標的化するRNAiオリゴヌクレオチドが投与されない、実施形態125~136のいずれか一つに記載の使用。
138.対象に有効量のエンテカビルを投与することをさらに含む、実施形態125~137のいずれか一つに記載の使用。
139.治療用オリゴヌクレオチドが、細胞内でオリゴヌクレオチドを発現するように操作された導入遺伝子の形態で送達される、実施形態125~138のいずれか一つに記載の使用。
140.B型肝炎ウイルス感染症を処置するための方法であって、治療有効量の実施形態1~97のいずれか一つに記載の治療用オリゴヌクレオチドを、治療有効量の実施形態1~91又は94~97のいずれか一つに記載のTLR7アゴニストと組み合わせて、B型肝炎ウイルス感染症に感染した対象に投与するステップを含む方法。
141.B型肝炎ウイルス感染症を処置するための方法であって、治療有効量の実施形態1~97のいずれか一つに記載の医薬組合せ、組成物、又はキットを、B型肝炎ウイルス感染症に感染した対象に投与するステップを含む方法。
142.処置されるB型肝炎ウイルス感染症が慢性B型肝炎ウイルス感染症である、実施形態140又は141に記載の方法。
143.治療用オリゴヌクレオチド及びTLR7アゴニストが薬学的有効量で投与される、実施形態140~142のいずれか一つに記載の方法。
144.治療用オリゴヌクレオチドを毎週投与し、TLR7アゴニストを1日おきに投与する、実施形態140~143のいずれか一つに記載の方法。
145.治療用オリゴヌクレオチドを投与前1~4mg/kgで投与し、TLR7アゴニストを投与前150~170mgで投与する、実施形態140~144のいずれか一つに記載の方法。
146.治療用オリゴヌクレオチドを48週間投与し、84用量のTLR7アゴニストを投与する、実施形態140~145のいずれか一つに記載の方法。
147.治療用オリゴヌクレオチド及びTLR7アゴニストの投与が同じ週に開始される、実施形態140~146のいずれか一つに記載の方法。
148.治療用オリゴヌクレオチドが皮下投与用の剤形であり、TLR7アゴニストが経口投与用の剤形である、実施形態140~147のいずれか一つに記載の方法。
149.治療用オリゴヌクレオチドの用量が100~150mg/mlであり、TLR7アゴニストの用量が150~170mgである、実施形態140~148のいずれか一つに記載の方法。
150.治療用オリゴヌクレオチドが、HBV mRNA転写物をコードする非表面抗原を標的とするRNAiオリゴヌクレオチドによる処置の非存在下で投与される、実施形態140~149のいずれか一つに記載の方法。
151.対象に、HBxAg mRNA転写物を選択的に標的化するRNAiオリゴヌクレオチドが投与されない、実施形態140~150のいずれか一つに記載の方法。
152.対象に有効量のエンテカビルを投与することをさらに含む、実施形態140~151のいずれか一つに記載の方法。
153.治療用オリゴヌクレオチドが、細胞内でオリゴヌクレオチドを発現するように操作された導入遺伝子の形態で送達される、実施形態140~152のいずれか一つに記載の方法。
154.細胞におけるB型肝炎ウイルス表面抗原の発現を減少させる方法であって、実施形態1~91のいずれか一つに記載の医薬組合せ又は組成物を細胞に送達することを含む方法。
155.細胞が肝細胞である、実施形態154に記載の方法。
156.細胞がインビボである、実施形態154又は155に記載の方法。
157.細胞がインビトロである、実施形態154又は155に記載の方法。
158.治療用オリゴヌクレオチドが、細胞内でオリゴヌクレオチドを発現するように操作された導入遺伝子の形態で送達される、実施形態154~157のいずれか一つに記載の方法。
159.本明細書中において添付の図面を参照して実質的に記載される医薬組合せ、組成物、キット、使用、又は方法。
パートA:RNAiオリゴヌクレオチドの効果
実施例A1.HBsAg発現の強力なオリゴヌクレオチド阻害剤の開発
HBV表面抗原は、HBV感染を処置するためのRNAiベースの治療の標的として同定された。図20に示すHBVゲノム構成に示すように、HBsAgは、単一のORFから転写された3つのRNA分子によってコードされる。オリゴヌクレオチドは、HBsAgアセンブリに寄与する1つ又は複数のRNA転写物をサイレンシングする目的で設計された(RNAi標的部位の例を図20において「X」で示す)。HBsAg標的化オリゴヌクレオチド、HBV-254を設計し、インビトロ及びインビボで評価した。HBV-254は、4つのHBV RNA種についてmRNA転写物を直接標的化する能力に基づいて選択及び設計された。実験に使用したHBV-254二重鎖オリゴヌクレオチドは、以下に示す配列のセンス鎖(5’から3’に示す):GUGGUGGACUUCUCUCAAUAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号55);及び以下に示す配列のアンチセンス鎖(5’から3’に示す):UAUUGAGAGAAGUCCACCACGG(配列番号56)を含んでいた。
実施例A1.HBsAg発現の強力なオリゴヌクレオチド阻害剤の開発
HBV表面抗原は、HBV感染を処置するためのRNAiベースの治療の標的として同定された。図20に示すHBVゲノム構成に示すように、HBsAgは、単一のORFから転写された3つのRNA分子によってコードされる。オリゴヌクレオチドは、HBsAgアセンブリに寄与する1つ又は複数のRNA転写物をサイレンシングする目的で設計された(RNAi標的部位の例を図20において「X」で示す)。HBsAg標的化オリゴヌクレオチド、HBV-254を設計し、インビトロ及びインビボで評価した。HBV-254は、4つのHBV RNA種についてmRNA転写物を直接標的化する能力に基づいて選択及び設計された。実験に使用したHBV-254二重鎖オリゴヌクレオチドは、以下に示す配列のセンス鎖(5’から3’に示す):GUGGUGGACUUCUCUCAAUAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号55);及び以下に示す配列のアンチセンス鎖(5’から3’に示す):UAUUGAGAGAAGUCCACCACGG(配列番号56)を含んでいた。
HDIマウスにおけるオリゴヌクレオチドHBV-254の単回用量評価を行い、HBsAgウイルス転写物を皮下標的化する能力を実証した(図20)。示されるように、HBV-254は、投与量の増加と共にマウスにおいてHBsAgレベルを体系的に低下させた。前臨床効力を、HBV-254を3 mg/kgで皮下投与したQW×3投薬レジメン後のマウスにおいてさらに評価した(図23)。投与点は、図中に矢印で示されている。HBsAgレベルを、147日間にわたる期間、オリゴヌクレオチド処置マウス及び未処置対照マウスの両方でモニターした。減少したHBsAgレベルは、試験全体を通して処置マウスで持続し、発現レベル(対照と比較して)は、初回投与後おおよそ2ヶ月で低下したベースラインで安定するように見えた。
さらなる強力なHBsAg標的化オリゴヌクレオチドを、未修飾テトラループ形態のオリゴヌクレオチドを用いたpsiCHECKレポーターアッセイを用いたインビトロスクリーニングによって同定した。3つの異なるプレートからの結果を図14に示す。HBV-254を含む各オリゴヌクレオチドを、蛍光ベースのレポーターアッセイを使用してHeLa細胞において3つの濃度(1、10、及び100pM)で評価した。各プレートについて報告した結果を、陽性対照(8、40、及び200pM)、陰性対照(1nM)及び擬似トランスフェクションと比較してさらに示す。ボックスで強調して示したオリゴヌクレオチドをインビボ試験のためにスケールアップしたところ、HBV-219及びHBV-258は、HBV-254及びスクリーニングから同定されたオリゴヌクレオチドの中で最も強力なオリゴヌクレオチドであることが分かった。HBV-219は、HBV-254を超える効力の多重対数の改善を示し、さらなる評価のために選択された。
実施例A2.全体的な治療有用性を高めるための配列保存分析及び工学的ミスマッチ
実施例A1で評価した最も強力なオリゴヌクレオチドのいくつかを、HBV遺伝子型A-Iのゲノム配列と比較した。初期保存分析の結果を表10に列挙する。示されるように、HBV-219は、これらのゲノムにわたって比較的低い保存率を有する。しかしながら、ミスマッチ(MM)がガイド鎖の15位に導入される場合、保存パーセントは有意に増加する(66%から96%)。参照により本明細書に組み込まれるGenBank公共データベースからの遺伝子型決定B型肝炎ウイルス(HBV)配列データを、バイオインフォマティクスのキュレーション及びアラインメントに使用した。
実施例A1で評価した最も強力なオリゴヌクレオチドのいくつかを、HBV遺伝子型A-Iのゲノム配列と比較した。初期保存分析の結果を表10に列挙する。示されるように、HBV-219は、これらのゲノムにわたって比較的低い保存率を有する。しかしながら、ミスマッチ(MM)がガイド鎖の15位に導入される場合、保存パーセントは有意に増加する(66%から96%)。参照により本明細書に組み込まれるGenBank公共データベースからの遺伝子型決定B型肝炎ウイルス(HBV)配列データを、バイオインフォマティクスのキュレーション及びアラインメントに使用した。
表10からのオリゴヌクレオチドのいくつかに焦点を合わせ、より広い探索パラメータを伴うその後の保存解析を行った。例えば、最初の解析は完全長ゲノム配列のみを含んでいたのに対して、集中的な解析は完全長及び部分的(標的部位に対して80%を超える同一性)配列を含んでいた。さらに、試験されたゲノムの数は、最初の解析での5,628から、集中的な解析では17,000を超えるゲノムに増加した。集中的な解析の結果は、最初の解析で観察された傾向と概ね一致した(表11)。示され、さらに図15に示されるように、HBV-219は、ガイド鎖の15位でのミスマッチが許容されない限り、HBV遺伝子型B、E、F、H、及びIに対して不活性であると予測された。
psiCHECK-2二重ルシフェラーゼレポーターシステムを利用して、HBV-217、HBV-219、HBV-254、HBV-255、及びHBV-258のそれぞれの選択された位置におけるミスマッチの影響を評価した。psiCHECKベクターは、レポーター遺伝子に融合された標的遺伝子の発現の変化のモニタリングを可能にし、活性RNAiが融合構築物を分解して、レポーターシグナルの対応する減少をもたらす。図16の図は、これらのアッセイで利用されるベクターを一般的に示す。親部分レポーター配列は、S ORF中の目的の標的部位の周りに遺伝子型A(GenBank:AM 282986.1)由来の120塩基対断片を含有していた。親オリゴヌクレオチド二重鎖配列は、図16に示される対応する部位でレポータープラスミドと100%の相同性を有するが、ミスマッチオリゴヌクレオチド二重鎖配列はレポータープラスミドとの単一ミスマッチを有する。試験したオリゴヌクレオチドの親配列及びミスマッチ配列を、対応する親部分レポーター配列に対してアラインメントして図17に示す。
ミスマッチアッセイの例では、試験したオリゴヌクレオチドは同じ修飾パターンを含んでいた。図17の各オリゴヌクレオチドについて示される番号付けスキームによれば、修飾は以下のとおりであった:1位の5’-メトキシ、ホスホネート-4’-オキシ-2’-O-メチルウリジン;2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド;1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20-22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド;並びに、1と2、2と3、3と4、20と21、及び21と22位におけるヌクレオチド間のホスホロチオエートヌクレオチド間結合。ミスマッチ位置は、親及びミスマッチ組ごとに異なり、図17のボックスに示されている。
各オリゴヌクレオチドを用いたpsiCHECK2レポーターアッセイを、HeLa細胞にトランスフェクトした1nMで開始する6点、5倍の段階希釈を用いて3日間にわたって行った。1日目に、10,000個のHeLa細胞/ウェル(96ウェル)を黒色壁の透明底プレートに播種した(80~90%コンフルエント)。2日目に、ベクターDNA及びRNAi分子を、血清を含まない適切な量のOpti-MEM(登録商標)I培地で希釈し、穏やかに混合した。リポフェクタミ(登録商標)2000を穏やかに混合した後、各反応について、0.2μLを血清を含まない25μLのOpti-MEM(登録商標)I培地に希釈した。希釈物を穏やかに混合し、室温で5分間インキュベートした。5分間のインキュベーション後、等量の希釈したDNA及びRNAi分子を希釈したリポフェクタミン(登録商標)2000と合わせた。合わせた混合物を穏やかに混合し、室温で20分間インキュベートして複合体形成を生じさせた。この後、DNA-RNAi分子-リポフェクタミン(登録商標)2000複合体を、細胞及び培地を含有する各ウェルに添加し、プレートを前後に揺動させることによって穏やかに混合した。次いで、細胞を回収して標的遺伝子をアッセイする準備ができるまで、細胞をCO2インキュベーター中37℃でインキュベートした。3日目に、100μLのDual-Glo Reagentを各ウェルに添加し、混合し、10分間インキュベートした後、発光を読み取った。さらに100μLのDual-Glo Stop&Gloを各ウェルに添加し、混合し、10分間インキュベートした後、発光を読み取った。各親オリゴヌクレオチド及びミスマッチオリゴヌクレオチドについて用量応答曲線を作成して、活性に対するミスマッチの影響を評価した。各オリゴヌクレオチドについて決定されたEC50値を、追加の仕様と共に表12に示す。
相対的なEC50値によって実証されるように、HBV-219二重鎖についてのインビトロ用量応答曲線は、ガイド鎖の15位に単一ミスマッチによる活性の喪失を示さなかった。HBV-219親(本明細書ではHBV(s)-219P1と呼ばれる)とミスマッチオリゴヌクレオチド(本明細書ではHBV(s)-219P2と呼ばれる)とを比較するその後のインビボ分析により、ミスマッチの導入が活性の損失をもたらさないことが確認された(図18)。図19に示す単回用量滴定プロットに示すように、HBV-219ミスマッチオリゴヌクレオチド二重鎖(HBV(s)-219P2)は、投与後70日間にわたってインビボで許容された。
図20は、ミスマッチが組み込まれたHBV-219(本明細書ではHBV(s)-219と呼ばれる)のための修正二重鎖構造の例を示す。図17の各オリゴヌクレオチドについて示されるナンバリングスキームによれば、センス鎖はヌクレオチド1から36に及んでおり、アンチセンス鎖はオリゴヌクレオチド1から22に及んでおり、後者の鎖は右から左に向かってナンバリングされて示されている。二重鎖形態は、センス鎖の36位とアンチセンス鎖の1位のヌクレオチド間に切れ目がある状態で示されている。センス鎖における修飾は以下のとおりであった:3、8~10、12、13及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド;1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド;1と2位のヌクレオチド間のホスホロチオエートヌクレオチド間結合;27~30位の2’-OHヌクレオチド;27位の2’-アミノジエトキシメタノール-グアニジン-GalNAc;並びに、28、29、及び30位のそれぞれに2’-アミノジエトキシメタノール-アデニン-GalNAcを含む。アンチセンス鎖における修飾は以下のとおりであった:1位の5’-メトキシ、ホスホネート-4’-オキシ-2’-O-メチルウリジンホスホロチオエート;2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド;1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20-22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド;並びに、1と2、2と3、3と4、20と21、及び21と22位におけるヌクレオチド間のホスホロチオエートヌクレオチド間結合。アンチセンス鎖は、15位に組み込まれたミスマッチを含んでいた。また、示されるように、二重鎖のアンチセンス鎖は、21~22位にわたる「GG」オーバーハングを含んでいた。
実施例A3:HBV(s)-219前駆体の抗ウイルス活性
HBVコア抗原(HBcAg)の細胞内局在化に対するHBV(s)-219前駆体による処置の効果を評価した。NODscidマウスを、HBVゲノムの頭尾二量体の流体力学的注射(HDI)に供した。オリゴヌクレオチドによる処置をHDIの2週間後に開始した。処置後にマウスから単離した肝細胞の免疫組織化学染色は、HBVコア抗原(HBcAg)発現の急激な減少を示した。
HBVコア抗原(HBcAg)の細胞内局在化に対するHBV(s)-219前駆体による処置の効果を評価した。NODscidマウスを、HBVゲノムの頭尾二量体の流体力学的注射(HDI)に供した。オリゴヌクレオチドによる処置をHDIの2週間後に開始した。処置後にマウスから単離した肝細胞の免疫組織化学染色は、HBVコア抗原(HBcAg)発現の急激な減少を示した。
HBVウイルス転写物の全体的な発現に対するHBsAgノックダウンの効果を調べるために、RNA配列決定を行った。3回の週1回のそれぞれ3mg/kgの投与の4日後に、肝細胞をHDIマウスから単離した。肝細胞から全RNAを抽出し、HiSeq Platformを用いてIlluminaシーケンシングを行った。図21Bは、検出されたRNA転写物配列をHBV RNAに対してマッピングしたRNA配列決定結果を示す。HBV(s)-219及びその前駆体の標的部位も示されており、オリゴヌクレオチドがpgRNA(3.5kb)、S1(2.4kb)、及びS2(2.1kb)転写物を標的とすることを示している。結果は、ビヒクル対照と比較して、HBV(s)-219P1による処置が、全てのHBVウイルス転写物の90%を超えるサイレンシングをもたらしたことを示している。
HBV(s)-219P1オリゴヌクレオチドの持続時間効果を、HBVの2つの異なるマウスモデル、すなわちcccDNA依存性であるHDIモデル及びcccDNA非依存性であるAAVモデルで試験した。HBsAg mRNA発現の時間経過(12週間)分析を、HBVのHDIモデルにおいて、ビヒクル対照及びHBxAg mRNAを標的とするRNAiオリゴヌクレオチドと比較して、HBsAg mRNAを標的とするHBV(s)-219P1オリゴヌクレオチドを用いた3回の週1回の用量3mg/kgを含む処置に関連して行った(図22A)。HBV(s)-219P1オリゴヌクレオチドは、3.9log以上の減少をもたらし、比較的長い活性持続期間が7週間を超えて持続した。一方、比較すると、HBV(x)標的化オリゴヌクレオチドは、約3.0logの減少をもたらし、より短い持続時間で持続した。
HBsAg mRNA発現のさらなる時間経過(12週間)分析を、AAV-HBVモデルにおいて、ビヒクル対照及びHBxAg mRNAを標的とするRNAiオリゴヌクレオチドと比較して、HBsAg mRNAを標的とするHBV(s)-219P2オリゴヌクレオチドを用いた3回の週1回の用量3mg/kgを含む処置に関連して行った(図22B)。このモデルでは、HBV(s)-219P2オリゴヌクレオチドは、HBV(x)標的化オリゴヌクレオチドと同等の対数減少及び持続時間をもたらした。図22A及び図22Bで使用されるHBxAg mRNAを標的とするRNAiオリゴヌクレオチドは、UGCACUUCGCGUCACCUCUAGCAGCCGAAAGGCUGCのセンス鎖配列及びUAGAGGUGACGCGAAGUGCAGGのアンチセンス鎖配列を有する。HBxAgを標的とするこのRNAiオリゴヌクレオチドは、本明細書ではGalXC-HBVXと呼ばれる。
上述のように、ビヒクル対照及びHBxAg mRNAを標的とするRNAiオリゴヌクレオチドと比較して、HBsAg mRNAを標的とする上記のHBV(s)-219前駆体オリゴヌクレオチドでの処置後のAAV-HBVモデル及びHBVのHDIモデルから得られた肝細胞におけるHBcAgの細胞内分布を調べるために、免疫組織化学染色を行なった。(図23)処置後の残留コアタンパク質(HBcAg)は、HDIモデルでは2つのRNAiオリゴヌクレオチド間の細胞内局在に顕著な差を示したが、AAVモデルでは示さなかった。
実施例A4:PXB-HBVキメラヒト肝臓モデル遺伝子型CにおけるHBV(s)-219P1の評価
HBV(s)-219P1の抗ウイルス活性を、HBV文献においてキメラヒト肝臓モデルとしても知られているPXB-HBVモデルにおいて評価した。この技術は、重度の免疫無防備状態のマウスにヒト肝細胞を移植し、次いで、宿主マウス肝細胞を毒する遺伝的機構を使用することに基づく(Tateno et al.,2015)。このプロセスは、野生型マウスとは異なりHBVに感染し得る、70%よりも多くがヒト組織に由来する肝臓を含むマウスをもたらす(Li et al.,2014)。PXB-HBVモデルは、HBV(s)-219の薬理学に関連していくつかの目的を果たす。(1)オリゴヌクレオチドがインビボでヒトRNAi機構(RISC)と係合し得ることを確認すること、(2)GalNAc標的化リガンド構成がインビボでヒトASGRを介して肝細胞に内在化し得ることを確認すること、及び(3)HBV感染の真のモデル(HBV発現の操作されたモデルとは対照的に)における有効性を確認すること。移植ヒト肝細胞が不規則なキメラ肝臓生理学をもたらすという制限にもかかわらず(Tateno et al.,2015)、このモデルでは有意な抗ウイルス効果が観察され得る。
HBV(s)-219P1の抗ウイルス活性を、HBV文献においてキメラヒト肝臓モデルとしても知られているPXB-HBVモデルにおいて評価した。この技術は、重度の免疫無防備状態のマウスにヒト肝細胞を移植し、次いで、宿主マウス肝細胞を毒する遺伝的機構を使用することに基づく(Tateno et al.,2015)。このプロセスは、野生型マウスとは異なりHBVに感染し得る、70%よりも多くがヒト組織に由来する肝臓を含むマウスをもたらす(Li et al.,2014)。PXB-HBVモデルは、HBV(s)-219の薬理学に関連していくつかの目的を果たす。(1)オリゴヌクレオチドがインビボでヒトRNAi機構(RISC)と係合し得ることを確認すること、(2)GalNAc標的化リガンド構成がインビボでヒトASGRを介して肝細胞に内在化し得ることを確認すること、及び(3)HBV感染の真のモデル(HBV発現の操作されたモデルとは対照的に)における有効性を確認すること。移植ヒト肝細胞が不規則なキメラ肝臓生理学をもたらすという制限にもかかわらず(Tateno et al.,2015)、このモデルでは有意な抗ウイルス効果が観察され得る。
HBV遺伝子型Cによるマウスの最初の感染のおおよそ8週間後、ベースラインHBsAg測定値として機能するように各マウスの血漿を収集する。次いで、各9匹のマウスのコホート(PKについてはn=3、PDについてはn=6)に、0(PBS)又は3mg/kgのHBV(s)-219P1の3回の毎週のSC注射を行った。投与の最初の日を0日目と考える。非終末採血を毎週実施して、各マウスの血清HBsAg及び循環HBV DNAレベルを決定した(図24A~24D)。マウスを28日目に最終組織エンドポイントのために安楽死させた。28日目に、肝臓試料を肝臓内HBV DNA及びcccDNAレベルについて分析した。HBsAgの80%超の減少、並びに循環HBV DNA、肝内HBV DNA、及びcccDNAの有意な減少を含む、HBV(s)-219P1で処置したマウスについて分析した全てのエンドポイントで有意な抗ウイルス活性が観察された(図24A~24D)。これらのデータは、HBV(s)-219処置が全身投与後に感染ヒト肝細胞において抗ウイルス活性をもたらすことを実証している。
実施例A5:HBV(s)-219P2はエンテカビルの抗ウイルス活性を増強する
現在の標準治療であるヌクレオ(シ)チド類似体(例えば、エンテカビル)は、循環HBVゲノムDNAを減少させるのに有効であるが、循環HBsAgを減少させない。これは、そのような処置中にウイルス血症の制御をもたらすが、生涯にわたる処置が必要であり、機能的治癒はほとんど達成されない。S抗原を標的とするRNAiオリゴヌクレオチドは、ウイルスポリメラーゼとHBsAgタンパク質の両方に影響を及ぼす。この研究では、単剤療法及びエンテカビルとの併用処置としてのHBV(s)-219P2の併用効果を、抗ウイルス活性についてHBV発現マウス(HDIモデル)で調査した。
現在の標準治療であるヌクレオ(シ)チド類似体(例えば、エンテカビル)は、循環HBVゲノムDNAを減少させるのに有効であるが、循環HBsAgを減少させない。これは、そのような処置中にウイルス血症の制御をもたらすが、生涯にわたる処置が必要であり、機能的治癒はほとんど達成されない。S抗原を標的とするRNAiオリゴヌクレオチドは、ウイルスポリメラーゼとHBsAgタンパク質の両方に影響を及ぼす。この研究では、単剤療法及びエンテカビルとの併用処置としてのHBV(s)-219P2の併用効果を、抗ウイルス活性についてHBV発現マウス(HDIモデル)で調査した。
マウスには、500ng/kgのエンテカビル(ETV)を14日間にわたって毎日経口投与した。HBV(s)-219P2の単回皮下投与を行った。循環ウイルス量(HBV DNA)をqPCRによって測定し(図25A)、血漿HBsAgレベルをELISAによって測定し(図25B)、肝臓HBV mRNA及びpgRNAレベルをqPCRによって測定した。HBV(s)-219P2及びETVを用いた併用療法では、明らかな相加効果が観察された。結果は、ETV療法単独では循環HBsAg又は肝臓ウイルスRNAに対する有効性は示されないことを示している。さらに、HBsAg又はHBV RNAによって測定されるHBV(s)-219P2の抗ウイルス活性は、ETVの同時投与によって影響されない(図25B~25C)。
図25A~図25Cに示すように、500ng/kg POで14日間毎日投与したエンテカビルの単剤療法は、PBS処置マウスと比較して、血漿中で検出されたHBV DNAの平均約1.6log減少をもたらした(n=6)。循環HBsAg又は肝臓ウイルスRNAのいずれにおいても有意な減少は観察されなかった。0日目のHBV(s)-219P2の単回の1mg/kg又は3mg/kgのSC用量の単剤療法は、それぞれ、PBSと比較して、HBV DNAの平均約0.8log又は約1.8logの減少が血漿中で検出された(n=7)。0日目のHBV(s)-219P2の単回の6mg/kgのSC用量の単独療法は、血漿中のHBV DNAの平均約2.5log減少をもたらし、2匹のマウスのレベルは検出限界未満に低下した(n=7)。0日目のHBV(s)-219P2の単回のSC用量の単剤療法は、循環HBsAg並びに肝ウイルスRNAの両方の用量依存的減少をもたらした。500ng/kg POで14日間毎日投与するエンテカビルと、0日目の単回の1mg/kgのSC用量のHBV(s)-219P2との併用療法は、血漿中に検出されるHBV DNAの平均約2.3logの付加性の減少をもたらした。単回の1mg/kgのSC用量のHBV(s)-219P2の単剤療法で観察される血漿HBsAg及び肝臓ウイルス転写物のレベルの同様の減少は、血漿HBV DNAの減少における付加性を示すが、循環HBsAg又は肝臓ウイルス転写物では示さない。
実施例A6.HBV(s)-219P2及びGalXC-HBVXの抗ウイルス活性の比較
この試験では、HBV発現マウス(HDIモデル)にHBV(s)-219P2、GalXC-HBVX(図22A及び22Bで使用したGalXC-HBVXと同じ配列)、又は2つのRNAiオリゴヌクレオチドの組合せを投与し、投与の2週間後又は9週間後に血漿HBsAgレベルをモニタリングした。図26Bに示すように、HBV(s)-219P2、GalXC-HBVX、又は両方の組合せのいずれかの単一飽和9mg/kg SC用量による処置の2週間後に、同様のレベルのHBsAg抑制が観察された。HBsAgの長期抑制は、S標的化HBV(s)-219P2処置で処置したマウスで観察されたが、GalXC-HBVX、又は両方の組合せで処置したマウスは、処置9週間後にHBsAgの有意な回復を示した(n=3)。
この試験では、HBV発現マウス(HDIモデル)にHBV(s)-219P2、GalXC-HBVX(図22A及び22Bで使用したGalXC-HBVXと同じ配列)、又は2つのRNAiオリゴヌクレオチドの組合せを投与し、投与の2週間後又は9週間後に血漿HBsAgレベルをモニタリングした。図26Bに示すように、HBV(s)-219P2、GalXC-HBVX、又は両方の組合せのいずれかの単一飽和9mg/kg SC用量による処置の2週間後に、同様のレベルのHBsAg抑制が観察された。HBsAgの長期抑制は、S標的化HBV(s)-219P2処置で処置したマウスで観察されたが、GalXC-HBVX、又は両方の組合せで処置したマウスは、処置9週間後にHBsAgの有意な回復を示した(n=3)。
HBV発現マウスにおけるHBVコア抗原(HBcAg)の細胞内局在化も、HBV(s)-219P2、GalXC-HBVX、又は2つのRNAiオリゴヌクレオチドの組合せを投与したマウスで評価した。HBV発現マウス(HDIモデル)を、単回飽和用量(9mg/kg、皮下)のHBV(s)-219P2、GalXC-HBVX、又は1:1の組合せで処置した。図27Aに示す時点で、肝臓切片をHBcAgについて染色した。代表的な肝細胞を示す。単独療法として又はGalXC-HBVXと組み合わせてHBV(s)-219P2で処置されたコホートは、核HBcAgを特徴とする。GalXC-HBVSのみで処置したコホートは、HBcAgのサイトゾル局在化のみを示し、処置応答の好ましい予後指標として報告されている(Huang et al.J.Cell.Mol.Med.2018)。各動物における核染色を有するHBcAg陽性細胞のパーセンテージを図27Bに示す(n=3/群、動物あたり50個の細胞を計数、投与後2週間)。HBcAg細胞内局在化に対する効果がHBVトランスクリプトームの領域によるものであり、RNAi配列の未知の特性によるものではないことを確認するために、X及びSオープンリーディングフレーム内を標的とする代替配列を設計及び試験した(図27 Cを参照)。HBV-254を図27Cで使用した。HBV-254の配列は、実施例A1に記載されている。図27Cで使用されるHBxAgを標的とする代替オリゴヌクレオチドは、GCACCUCUCUUUACGCGGAAGCAGCCGAAAGGCUGCのセンス鎖配列及びUUCCGCGUAAAGAGAGGUGCGGのアンチセンス配列を有する。2つの代替RNAiオリゴヌクレオチドは、図26Bで使用されるRNAiオリゴヌクレオチドとは異なるRNAi標的配列をS抗原又はX抗原に有する。しかしながら、それらは血漿レベルHBcAgに対して同じ差次的効果を示し、この効果はS抗原自体を標的とすることに特異的であるが、使用されるオリゴヌクレオチドには特異的ではないことを示している。
実施例A7 健康なヒト対象における安全性、耐容性及びHBV患者におけるHBV(s)-219の有効性の評価
この研究は、健康な対象(グループA)における安全性及び忍容性並びにHBV患者(グループB)におけるHBV(s)-219の有効性を評価するように設計されている。コホート情報による用量を図28に示す。HBV(s)-219の分子構造を図20、図29Aに示し、以下にも示す。
この研究は、健康な対象(グループA)における安全性及び忍容性並びにHBV患者(グループB)におけるHBV(s)-219の有効性を評価するように設計されている。コホート情報による用量を図28に示す。HBV(s)-219の分子構造を図20、図29Aに示し、以下にも示す。
患者選択基準を以下に示す。
グループA-健常者
選択基準:
1.インフォームドコンセントへの署名時の年齢は18歳(又は法定同意年齢のうち年が上の方)以上65歳以下である。
2.病歴、身体検査、検査を含む医学的評価によって決定されるスクリーニング時の明らかに健康
a.進行中の病気の症状なし
b.体温、脈拍数、呼吸数、血圧に臨床的に有意な異常なし
c.臨床的に重要な心血管疾患又は肺疾患、及び薬理学的投薬を必要とする心血管疾患又は肺疾患はない。
3.12誘導心電図(ECG)が正常範囲内であるか、治験責任医師の意見でスクリーニング時及び-1日目に臨床的に有意な異常がない
4.スクリーニング来院1回目及び入院時(-1日目)のアルコール又は乱用薬物に対する陰性スクリーニング
5.スクリーニング来院1回目の前の少なくとも5年間の非喫煙者であり、スクリーニング来院1回目に尿コチニン濃度が陰性
6.ボディーマス指数(BMI)が18.0以上32.0kg/m2以下の範囲。
7.男性又は女性:
a.男性参加者:
男性参加者は、処置期間中及び試験介入投与後少なくとも2週間は避妊を使用することに同意し、この期間中は精子を提供しないことに同意しなければならない。
b.女性参加者:
女性参加者は、妊娠しておらず、母乳を与えておらず、かつ、以下の条件の少なくとも1つが適用される場合に参加する資格がある。妊娠可能な女性(WOCBP)ではないか、又は地域によってはWOCBPであり、試験登録時のスクリーニング後から、処置期間中及び試験介入投与後少なくとも12週間、避妊の指導に従うことに同意する者。
8.要件及び制限の遵守を含む署名付きインフォームドコンセント1を与えることができる。
選択基準:
1.インフォームドコンセントへの署名時の年齢は18歳(又は法定同意年齢のうち年が上の方)以上65歳以下である。
2.病歴、身体検査、検査を含む医学的評価によって決定されるスクリーニング時の明らかに健康
a.進行中の病気の症状なし
b.体温、脈拍数、呼吸数、血圧に臨床的に有意な異常なし
c.臨床的に重要な心血管疾患又は肺疾患、及び薬理学的投薬を必要とする心血管疾患又は肺疾患はない。
3.12誘導心電図(ECG)が正常範囲内であるか、治験責任医師の意見でスクリーニング時及び-1日目に臨床的に有意な異常がない
4.スクリーニング来院1回目及び入院時(-1日目)のアルコール又は乱用薬物に対する陰性スクリーニング
5.スクリーニング来院1回目の前の少なくとも5年間の非喫煙者であり、スクリーニング来院1回目に尿コチニン濃度が陰性
6.ボディーマス指数(BMI)が18.0以上32.0kg/m2以下の範囲。
7.男性又は女性:
a.男性参加者:
男性参加者は、処置期間中及び試験介入投与後少なくとも2週間は避妊を使用することに同意し、この期間中は精子を提供しないことに同意しなければならない。
b.女性参加者:
女性参加者は、妊娠しておらず、母乳を与えておらず、かつ、以下の条件の少なくとも1つが適用される場合に参加する資格がある。妊娠可能な女性(WOCBP)ではないか、又は地域によってはWOCBPであり、試験登録時のスクリーニング後から、処置期間中及び試験介入投与後少なくとも12週間、避妊の指導に従うことに同意する者。
8.要件及び制限の遵守を含む署名付きインフォームドコンセント1を与えることができる。
除外基準、グループA
1.試験薬の吸収、分布若しくは排出、又は本試験における臨床評価及び検査評価を妨害し得る医学的状態の病歴(これらに限定されない);慢性若しくは再発性腎疾患、機能性腸障害(例えば、頻繁な下痢又は便秘)、消化管疾患、膵炎、発作性障害、皮膚粘膜若しくは筋骨格障害、自殺企図若しくは自殺念慮の病歴、又は臨床的に有意なうつ病若しくは薬理学的介入を必要とする他の精神神経障害
2.制御不良又は不安定な高血圧;又はスクリーニング時に150mmHgを超える持続性収縮期BP又は95mmHgを超える拡張期BP
3.インスリン又は血糖降下薬で処置された真性糖尿病の病歴
4.過去12ヶ月以内に入院を必要とする喘息の病歴
5.中央研究室でのスクリーニング結果によって決定されるG-6-PD欠損の証拠
6.薬理学的に処置中の甲状腺疾患は除き、甲状腺疾患(甲状腺機能亢進症/甲状腺機能低下症など)を除く現在制御不良の内分泌疾患。
7.参加者の悪性腫瘍が化学療法から完全に寛解しており、過去3年間に追加の医学的又は外科的介入がない場合、悪性腫瘍の病歴が許容される。
8.多剤アレルギーの病歴又はオリゴヌクレオチド若しくはGalNAcに対するアレルギー反応の病歴
9.試験介入投与又は局所忍容性の評価を潜在的に妨げる可能性があるSC注射に対する不耐性の病歴又は著しい腹部瘢痕
10.臨床的に関連する手術歴
11.過去3年以内の持続的エタノール乱用(>40gmエタノール/日)又は違法薬物使用歴。
12.試験介入投与前7日以内の臨床的に有意な疾患
13.試験介入投与前2ヶ月以内の500mLを超える血液の提供又はスクリーニング前7日以内の血漿提供
14.スクリーニング時に進行中の重大な感染又は既知の炎症プロセス(治験責任医師の意見による)
15.慢性若しくは再発性尿路感染(UTI)又はスクリーニング前1ヶ月以内のUTIの病歴
16.本研究の実施中の選択的外科処置の予定
17.試験介入投与前4週間以内の処方薬の使用
18.治験責任医師及び治験依頼者によって臨床的に関連がないと合意された場合を除き、初回投与から7日以内の市販薬(OTC)の医薬品又はハーブサプリメント(日常的なビタミンを除く)の使用。
19.投与前3ヶ月以内に治験薬を投与されたことがあるか、又は試験登録前に別の臨床試験のフォローアップ中である。
20.スクリーニング時にHBV、HIV、HCV、又はHDVのいずれかについて抗体陽性(スクリーニング前3ヶ月以内に行われた場合は、過去の試験を使用してもよい)
21.スクリーニング来院時又は入院時(-1日目)に、アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)、アスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)、γ-グルタミルトランスフェラーゼ(GGT)、総ビリルビン、アルカリホスファターゼ(ALP)又はアルブミンが基準範囲外である
22.治験責任医師が臨床的に関連があり許容できないと考えられる完全な血球カウント試験の異常;ヘモグロビン<12.0g/dL(120g/L相当);正常範囲外の血小板。
23.ヘモグロビンA1C(HbA1C)>7%
24.治験責任医師が臨床的に有意で許容できないと考えられるその他の安全性検査結果
25.臨床研究センターに入る48時間前から試験終了までの運動レベルの有意な変化があったか、又はそのような予定がある。
26.治験責任医師の意見において、参加者を登録に適さないものにする、又は試験への参加若しくは試験の完了を妨げる可能性がある任意の条件。
1.試験薬の吸収、分布若しくは排出、又は本試験における臨床評価及び検査評価を妨害し得る医学的状態の病歴(これらに限定されない);慢性若しくは再発性腎疾患、機能性腸障害(例えば、頻繁な下痢又は便秘)、消化管疾患、膵炎、発作性障害、皮膚粘膜若しくは筋骨格障害、自殺企図若しくは自殺念慮の病歴、又は臨床的に有意なうつ病若しくは薬理学的介入を必要とする他の精神神経障害
2.制御不良又は不安定な高血圧;又はスクリーニング時に150mmHgを超える持続性収縮期BP又は95mmHgを超える拡張期BP
3.インスリン又は血糖降下薬で処置された真性糖尿病の病歴
4.過去12ヶ月以内に入院を必要とする喘息の病歴
5.中央研究室でのスクリーニング結果によって決定されるG-6-PD欠損の証拠
6.薬理学的に処置中の甲状腺疾患は除き、甲状腺疾患(甲状腺機能亢進症/甲状腺機能低下症など)を除く現在制御不良の内分泌疾患。
7.参加者の悪性腫瘍が化学療法から完全に寛解しており、過去3年間に追加の医学的又は外科的介入がない場合、悪性腫瘍の病歴が許容される。
8.多剤アレルギーの病歴又はオリゴヌクレオチド若しくはGalNAcに対するアレルギー反応の病歴
9.試験介入投与又は局所忍容性の評価を潜在的に妨げる可能性があるSC注射に対する不耐性の病歴又は著しい腹部瘢痕
10.臨床的に関連する手術歴
11.過去3年以内の持続的エタノール乱用(>40gmエタノール/日)又は違法薬物使用歴。
12.試験介入投与前7日以内の臨床的に有意な疾患
13.試験介入投与前2ヶ月以内の500mLを超える血液の提供又はスクリーニング前7日以内の血漿提供
14.スクリーニング時に進行中の重大な感染又は既知の炎症プロセス(治験責任医師の意見による)
15.慢性若しくは再発性尿路感染(UTI)又はスクリーニング前1ヶ月以内のUTIの病歴
16.本研究の実施中の選択的外科処置の予定
17.試験介入投与前4週間以内の処方薬の使用
18.治験責任医師及び治験依頼者によって臨床的に関連がないと合意された場合を除き、初回投与から7日以内の市販薬(OTC)の医薬品又はハーブサプリメント(日常的なビタミンを除く)の使用。
19.投与前3ヶ月以内に治験薬を投与されたことがあるか、又は試験登録前に別の臨床試験のフォローアップ中である。
20.スクリーニング時にHBV、HIV、HCV、又はHDVのいずれかについて抗体陽性(スクリーニング前3ヶ月以内に行われた場合は、過去の試験を使用してもよい)
21.スクリーニング来院時又は入院時(-1日目)に、アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)、アスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)、γ-グルタミルトランスフェラーゼ(GGT)、総ビリルビン、アルカリホスファターゼ(ALP)又はアルブミンが基準範囲外である
22.治験責任医師が臨床的に関連があり許容できないと考えられる完全な血球カウント試験の異常;ヘモグロビン<12.0g/dL(120g/L相当);正常範囲外の血小板。
23.ヘモグロビンA1C(HbA1C)>7%
24.治験責任医師が臨床的に有意で許容できないと考えられるその他の安全性検査結果
25.臨床研究センターに入る48時間前から試験終了までの運動レベルの有意な変化があったか、又はそのような予定がある。
26.治験責任医師の意見において、参加者を登録に適さないものにする、又は試験への参加若しくは試験の完了を妨げる可能性がある任意の条件。
グループB B型肝炎を有する成人
選択基準、グループB
1.インフォームドコンセントへの署名時の年齢は18歳(又は法定同意年齢のうち年が上の方)以上65歳以下である。
2.以下によって文書化される慢性B型肝炎感染:
a.適合する臨床情報、並びにHBsAg及び潜在的に他のHBV血清学的マーカー(HBeAg、HBV DNA)についての以前の血清陽性に基づく、CHBに適合する病歴
b.HBeAg陽性患者についてはスクリーニング時の血清HBsAg>1000IU/mL、又は、HBeAg陰性患者についてはスクリーニング時の血清HBsAg>500IU/mL
c.中央研究室でのTaqMan(商標)HBV DNA v2.0アッセイによって決定される、処置未経験患者のスクリーニング時の血清HBV DNA>20,000IU/mL
d.血清IgM抗HBc陰性
3.代償性肝疾患に適合する病歴、肝硬変の証拠なし:
a.食道又は胃腸静脈瘤からの出血の病歴なし
b.腹水の病歴なし
c.慢性肝疾患に起因する黄疸の病歴なし
d.肝性脳症の病歴なし
e.門脈圧亢進症の物理的徴候なし-クモ状血管腫など
f.肝硬変を示す以前の肝生検、肝臓の画像検査、又はエラストグラフィ結果なし
4.B型肝炎未処置:B型肝炎に対する以前の抗ウイルス療法なし(以前のHBVヌクレオシ[チ]ド又はインターフェロン含有処置なし)、又は、スクリーニング来院前の少なくとも12週間にわたってヌクレオシ(チ)ド療法(エンテカビル又はテノホビル)を継続的に行い、十分な耐性及びコンプライアンスを有する
5.血清ALT>60U/L(男性)又は>38U/L(女性)(American Association for the Study of Liver Diseases(AASLD)HBVガイダンス基準による2×ULN、Terrault et al.,2016)
6.12ECGがスクリーニング時及び-1日目に臨床的に有意な異常がない(治験責任医師の意見)
7.肝疾患の他の公知の原因がない
8.十分に管理された高血圧及び高コレステロール血症のスタチン管理以外に、持続的な医学的管理又は慢性的若しくは反復的な薬理学的介入を必要とする他の医学的状態がない
9.BMIが18.0以上32.0kg/m2以下の範囲
10.男性又は女性
a.男性参加者:
男性参加者は、処置期間中及び試験介入の最終投与後12週間は避妊を使用することに同意し、この期間中は精子を提供しないことに同意しなければならない。
b.女性参加者:
女性参加者は、妊娠しておらず、母乳を与えておらず、かつ、以下の条件の少なくとも1つが適用される場合に参加する資格がある。WOCBPではないか、又は地域によってはWOCBPであり、処置期間中及び試験介入投与後少なくとも12週間、避妊の指導に従うことに同意する者。
11.要件及び制限の遵守を含む署名付きインフォームドコンセントを与えることができる。
選択基準、グループB
1.インフォームドコンセントへの署名時の年齢は18歳(又は法定同意年齢のうち年が上の方)以上65歳以下である。
2.以下によって文書化される慢性B型肝炎感染:
a.適合する臨床情報、並びにHBsAg及び潜在的に他のHBV血清学的マーカー(HBeAg、HBV DNA)についての以前の血清陽性に基づく、CHBに適合する病歴
b.HBeAg陽性患者についてはスクリーニング時の血清HBsAg>1000IU/mL、又は、HBeAg陰性患者についてはスクリーニング時の血清HBsAg>500IU/mL
c.中央研究室でのTaqMan(商標)HBV DNA v2.0アッセイによって決定される、処置未経験患者のスクリーニング時の血清HBV DNA>20,000IU/mL
d.血清IgM抗HBc陰性
3.代償性肝疾患に適合する病歴、肝硬変の証拠なし:
a.食道又は胃腸静脈瘤からの出血の病歴なし
b.腹水の病歴なし
c.慢性肝疾患に起因する黄疸の病歴なし
d.肝性脳症の病歴なし
e.門脈圧亢進症の物理的徴候なし-クモ状血管腫など
f.肝硬変を示す以前の肝生検、肝臓の画像検査、又はエラストグラフィ結果なし
4.B型肝炎未処置:B型肝炎に対する以前の抗ウイルス療法なし(以前のHBVヌクレオシ[チ]ド又はインターフェロン含有処置なし)、又は、スクリーニング来院前の少なくとも12週間にわたってヌクレオシ(チ)ド療法(エンテカビル又はテノホビル)を継続的に行い、十分な耐性及びコンプライアンスを有する
5.血清ALT>60U/L(男性)又は>38U/L(女性)(American Association for the Study of Liver Diseases(AASLD)HBVガイダンス基準による2×ULN、Terrault et al.,2016)
6.12ECGがスクリーニング時及び-1日目に臨床的に有意な異常がない(治験責任医師の意見)
7.肝疾患の他の公知の原因がない
8.十分に管理された高血圧及び高コレステロール血症のスタチン管理以外に、持続的な医学的管理又は慢性的若しくは反復的な薬理学的介入を必要とする他の医学的状態がない
9.BMIが18.0以上32.0kg/m2以下の範囲
10.男性又は女性
a.男性参加者:
男性参加者は、処置期間中及び試験介入の最終投与後12週間は避妊を使用することに同意し、この期間中は精子を提供しないことに同意しなければならない。
b.女性参加者:
女性参加者は、妊娠しておらず、母乳を与えておらず、かつ、以下の条件の少なくとも1つが適用される場合に参加する資格がある。WOCBPではないか、又は地域によってはWOCBPであり、処置期間中及び試験介入投与後少なくとも12週間、避妊の指導に従うことに同意する者。
11.要件及び制限の遵守を含む署名付きインフォームドコンセントを与えることができる。
除外基準、グループB
1.試験薬の吸収、分布若しくは排出、又は本試験における臨床評価及び検査評価を妨害し得る医学的状態の病歴(これらに限定されない);慢性若しくは再発性腎疾患、機能性腸障害(例えば、頻繁な下痢又は便秘)、消化管疾患、膵炎、発作性障害、皮膚粘膜若しくは筋骨格障害、自殺企図若しくは自殺念慮の病歴、又は臨床的に有意なうつ病若しくは薬理学的介入を必要とする他の精神神経障害
2.制御不良又は不安定な高血圧
3.インスリン又は血糖降下薬で処置された真性糖尿病の病歴
4.過去12ヶ月以内に入院を必要とする喘息の病歴
5.中央研究室でのスクリーニング結果によって決定されるG-6-PD欠損の証拠
6.薬理学的に処置中の甲状腺疾患は除き、甲状腺疾患(例えば、甲状腺機能亢進症/甲状腺機能低下症など)を除く現在制御不良の内分泌疾患。
7.慢性若しくは再発性UTI又はスクリーニング前1ヶ月以内のUTIの病歴
8.HCCの病歴
9.患者の悪性腫瘍が化学療法から完全に寛解しており、過去3年間に追加の医学的又は外科的介入がない場合、HCC以外の悪性腫瘍の病歴が許容され得る。
10.過去3年以内の持続的エタノール乱用(>40 gmエタノール/日)又は違法薬物使用歴。
11.試験介入投与又は局所忍容性の評価を潜在的に妨げる可能性があるSC注射に対する不耐性の病歴又は著しい腹部瘢痕。
12.治療前の最後の6週間における輸血の受領、又は試験後フォローアップによる予想される輸血。
13.スクリーニング前2ヶ月以内に500mL超の血液の提供若しくは喪失、又はスクリーニング前7日間以内の血漿提供
14.スクリーニングから3ヶ月以内の抗ウイルス療法(エンテカビル又はテノホビル以外)又は過去3年間のインターフェロンによる処置
15.抗凝固剤、全身投与されたコルチコステロイド、全身投与された免疫調節剤、又は全身投与された免疫抑制剤の最近6ヶ月以内の使用(又は予想される必要性)
16.PI又は試験依頼人の意見では試験実施を妨げるであろう試験介入の投与前14日以内の処方薬の使用。全身吸収のない局所製品、スタチン(ロスバスタチンを除く)、高血圧薬、OTC及び処方薬の鎮痛薬又はホルモン避妊薬(女性)は許容され得る。
17.注入可能/埋め込み可能な受胎制御を除いて、試験介入投与前3ヶ月以内の任意の薬物のデポー注射又はインプラント。
18.ハーブサプリメント又は全身性の市販薬の持続使用;参加者は、試験期間中に停止する意思がなければならない
19.投与前3ヶ月以内に治験薬を投与されたことがあるか、又は試験登録前に別の臨床試験のフォローアップ中である。
20.スクリーニング時の肝臓エラストグラフィ(すなわち、FibroScan(登録商標))kPa>10.5
21.スクリーニング時の10分間の仰臥位後の収縮期血圧>150 mmHg及び拡張期血圧>95mmHg。
22.スクリーニング時に7×ULN超が確認された肝トランスアミナーゼ(ALT又はAST)
23.既知のギルバート病又はデュビン・ジョンソン症候群でない限り、持続性又は再発性の高ビリルビン血症の病歴
24.ヒト免疫不全ウイルス(HIV)又はC型肝炎ウイルス(HCV)又はデルタ肝炎ウイルス(HDV)に対する抗体に対して血清陽性である
25.Hgb<12g/dL(男性)又は<11g/dL(女性)
26.スクリーニング時の血清アルブミン<3.5g/dL。
27.スクリーニング時の総WBC数<4,000細胞/μL又は絶対好中球数(ANC)<1800細胞/μL。
28.スクリーニング時の血小板数≦100,000/μL。
29.スクリーニング時の正常基準範囲の上限(局所検査室基準範囲による)を超える国際標準化比(INR)又はプロトロンビン時間(PT)。
30.血清BUN又はクレアチニン>ULN
31.血清アミラーゼ又はリパーゼ>1.25×ULN
32.血清HbA1c>7.0%
33.血清アルファフェトプロテイン(AFP)値>100ng/mL。スクリーニング時のAFPが>ULNであるが<100ng/mLである場合、肝画像検査でHCCの可能性が疑われる病変が示されない場合、患者は適格である
34.治験責任医師が臨床的に有意で許容できないと考えられるその他の安全性検査結果
35.臨床研究センターに入る48時間前から試験終了までの運動レベルの有意な変化があったか、又はそのような予定がある。
1.試験薬の吸収、分布若しくは排出、又は本試験における臨床評価及び検査評価を妨害し得る医学的状態の病歴(これらに限定されない);慢性若しくは再発性腎疾患、機能性腸障害(例えば、頻繁な下痢又は便秘)、消化管疾患、膵炎、発作性障害、皮膚粘膜若しくは筋骨格障害、自殺企図若しくは自殺念慮の病歴、又は臨床的に有意なうつ病若しくは薬理学的介入を必要とする他の精神神経障害
2.制御不良又は不安定な高血圧
3.インスリン又は血糖降下薬で処置された真性糖尿病の病歴
4.過去12ヶ月以内に入院を必要とする喘息の病歴
5.中央研究室でのスクリーニング結果によって決定されるG-6-PD欠損の証拠
6.薬理学的に処置中の甲状腺疾患は除き、甲状腺疾患(例えば、甲状腺機能亢進症/甲状腺機能低下症など)を除く現在制御不良の内分泌疾患。
7.慢性若しくは再発性UTI又はスクリーニング前1ヶ月以内のUTIの病歴
8.HCCの病歴
9.患者の悪性腫瘍が化学療法から完全に寛解しており、過去3年間に追加の医学的又は外科的介入がない場合、HCC以外の悪性腫瘍の病歴が許容され得る。
10.過去3年以内の持続的エタノール乱用(>40 gmエタノール/日)又は違法薬物使用歴。
11.試験介入投与又は局所忍容性の評価を潜在的に妨げる可能性があるSC注射に対する不耐性の病歴又は著しい腹部瘢痕。
12.治療前の最後の6週間における輸血の受領、又は試験後フォローアップによる予想される輸血。
13.スクリーニング前2ヶ月以内に500mL超の血液の提供若しくは喪失、又はスクリーニング前7日間以内の血漿提供
14.スクリーニングから3ヶ月以内の抗ウイルス療法(エンテカビル又はテノホビル以外)又は過去3年間のインターフェロンによる処置
15.抗凝固剤、全身投与されたコルチコステロイド、全身投与された免疫調節剤、又は全身投与された免疫抑制剤の最近6ヶ月以内の使用(又は予想される必要性)
16.PI又は試験依頼人の意見では試験実施を妨げるであろう試験介入の投与前14日以内の処方薬の使用。全身吸収のない局所製品、スタチン(ロスバスタチンを除く)、高血圧薬、OTC及び処方薬の鎮痛薬又はホルモン避妊薬(女性)は許容され得る。
17.注入可能/埋め込み可能な受胎制御を除いて、試験介入投与前3ヶ月以内の任意の薬物のデポー注射又はインプラント。
18.ハーブサプリメント又は全身性の市販薬の持続使用;参加者は、試験期間中に停止する意思がなければならない
19.投与前3ヶ月以内に治験薬を投与されたことがあるか、又は試験登録前に別の臨床試験のフォローアップ中である。
20.スクリーニング時の肝臓エラストグラフィ(すなわち、FibroScan(登録商標))kPa>10.5
21.スクリーニング時の10分間の仰臥位後の収縮期血圧>150 mmHg及び拡張期血圧>95mmHg。
22.スクリーニング時に7×ULN超が確認された肝トランスアミナーゼ(ALT又はAST)
23.既知のギルバート病又はデュビン・ジョンソン症候群でない限り、持続性又は再発性の高ビリルビン血症の病歴
24.ヒト免疫不全ウイルス(HIV)又はC型肝炎ウイルス(HCV)又はデルタ肝炎ウイルス(HDV)に対する抗体に対して血清陽性である
25.Hgb<12g/dL(男性)又は<11g/dL(女性)
26.スクリーニング時の血清アルブミン<3.5g/dL。
27.スクリーニング時の総WBC数<4,000細胞/μL又は絶対好中球数(ANC)<1800細胞/μL。
28.スクリーニング時の血小板数≦100,000/μL。
29.スクリーニング時の正常基準範囲の上限(局所検査室基準範囲による)を超える国際標準化比(INR)又はプロトロンビン時間(PT)。
30.血清BUN又はクレアチニン>ULN
31.血清アミラーゼ又はリパーゼ>1.25×ULN
32.血清HbA1c>7.0%
33.血清アルファフェトプロテイン(AFP)値>100ng/mL。スクリーニング時のAFPが>ULNであるが<100ng/mLである場合、肝画像検査でHCCの可能性が疑われる病変が示されない場合、患者は適格である
34.治験責任医師が臨床的に有意で許容できないと考えられるその他の安全性検査結果
35.臨床研究センターに入る48時間前から試験終了までの運動レベルの有意な変化があったか、又はそのような予定がある。
36.治験責任医師の意見において、参加者を登録に適さないものにする、又は試験への参加若しくは試験の完了を妨げる可能性がある任意の条件。
パートB:GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドの効果
材料及び方法
AAV/HBVマウスモデル
AAV-HBVマウスモデルは、複製可能なHBVゲノムを有する組換えアデノ随伴ウイルス(AAV-HBV)をC57BL/6マウスに注射することによって生成される。rAAV8-1.3 HBV aywウイルスストックは、Beijing FivePlus Molecular Medicine Institute(中国、北京)から購入した。動物(雄、到着時4~5週齢)をSLAC Laboratory Animal Co.Ltd(中国、上海)から購入し、動物施設で5~7日間馴化させ、次いで、尾静脈を通して1×1011ベクターゲノムのAAV-HBV(200μLのPBSで希釈)を注射した。HBVゲノムの持続的発現は、3週間後に確立することができ、マウス血清中のHBV DNA、HBsAg、及びHBeAgを含む高レベルのHBVウイルスマーカーを有する。C57BL/6マウスの安定なHBVウイルス血症及びコンピテント免疫系を用いて、AAV-HBVマウスモデルを使用して、化合物のインビボ抗HBV有効性を評価した。AAV-HBV研究の生存中の部分は、Covance Pharmaceutical Research and Development(Shanghai)Co.Ltd.(Covance Shanghai)の契約サービスを通して実施し、血清を使用する寿命後の分析は、Roche Innovation Center Shanghai(RICS)の内部で実施した。
材料及び方法
AAV/HBVマウスモデル
AAV-HBVマウスモデルは、複製可能なHBVゲノムを有する組換えアデノ随伴ウイルス(AAV-HBV)をC57BL/6マウスに注射することによって生成される。rAAV8-1.3 HBV aywウイルスストックは、Beijing FivePlus Molecular Medicine Institute(中国、北京)から購入した。動物(雄、到着時4~5週齢)をSLAC Laboratory Animal Co.Ltd(中国、上海)から購入し、動物施設で5~7日間馴化させ、次いで、尾静脈を通して1×1011ベクターゲノムのAAV-HBV(200μLのPBSで希釈)を注射した。HBVゲノムの持続的発現は、3週間後に確立することができ、マウス血清中のHBV DNA、HBsAg、及びHBeAgを含む高レベルのHBVウイルスマーカーを有する。C57BL/6マウスの安定なHBVウイルス血症及びコンピテント免疫系を用いて、AAV-HBVマウスモデルを使用して、化合物のインビボ抗HBV有効性を評価した。AAV-HBV研究の生存中の部分は、Covance Pharmaceutical Research and Development(Shanghai)Co.Ltd.(Covance Shanghai)の契約サービスを通して実施し、血清を使用する寿命後の分析は、Roche Innovation Center Shanghai(RICS)の内部で実施した。
化合物処置の7日前に、血清調製のために血液試料を採取し(約15μL)、HBV DNA、血清中のHBsAgレベル及び体重に基づいて、AAV-HBV感染動物を異なる処置群に層別化した。
生理食塩水(群01)及び1.5又は7.5mg/kgのCMP番号15_1の抗HBV ASOを、0~49日目の間、0、7、14、21、28、35、42及び49日目に、週に1回皮下投与した。CMP番号VIのTLR7アゴニスト(100mg/kg)を、0~55日目の間、1日おきに1回(QOD)、又は0~49日目の間、0、7、14、21、28、35、42及び49日目に週1回(QW)、経口胃管栄養法によって投与した。動物は、研究全体を通してサンプル採取のために眼窩後洞を介して毎週採血した。
オリゴヌクレオチド合成
オリゴヌクレオチド合成は、当技術分野で一般に知られている。以下は、適用できるプロトコルである。本発明のオリゴヌクレオチドは、使用される装置、支持体、及び濃度に関してわずかに異なる方法によって、生成されている場合がある。
オリゴヌクレオチド合成は、当技術分野で一般に知られている。以下は、適用できるプロトコルである。本発明のオリゴヌクレオチドは、使用される装置、支持体、及び濃度に関してわずかに異なる方法によって、生成されている場合がある。
オリゴヌクレオチドは、Oligomaker 48のホスホロアミダイトアプローチを1μmolスケールで用いて、ウリジンユニバーサル支持体上で合成される。合成の最後に、水性アンモニアを使用して60℃で5~16時間、オリゴヌクレオチドを固相支持体から切断する。オリゴヌクレオチドは逆相HPLC(RP-HPLC)又は固相抽出によって精製され、UPLCによって特徴付けられ、分子量はさらにESI-MSによって確認される。
オリゴヌクレオチドの伸長:
β-シアノエチル-ホスホロアミダイトのカップリング(DNA-A(Bz)、DNA-G(ibu)、DNA-C(Bz)、DNA-T、LNA-5-メチル-C(Bz)、LNA-A(Bz)、LNA-G(dmf)、又はLNA-T)は、アセトニトリル中の0.1Mの5’-O-DMT保護アミダイト及びアセトニトリル(0.25M)中のDCI(4,5-ジシアノイミダゾール)の溶液を活性剤として用いて行われる。最終サイクルでは、所望の修飾を有するホスホロアミダイト、例えばコンジュゲート基を結合するためのC6リンカ、又はそのようなコンジュゲート基を使用できる。ホスホロチオエート結合を導入するためのチオール化は、水素化キサンタン(アセトニトリル/ピリジン9:1中0.01M)を使用することにより行われる。ホスホジエステル結合は、THF/ピリジン/水7:2:1中の0.02Mヨウ素を用いて導入できる。残りの試薬は、オリゴヌクレオチド合成に通常使用される試薬である。
β-シアノエチル-ホスホロアミダイトのカップリング(DNA-A(Bz)、DNA-G(ibu)、DNA-C(Bz)、DNA-T、LNA-5-メチル-C(Bz)、LNA-A(Bz)、LNA-G(dmf)、又はLNA-T)は、アセトニトリル中の0.1Mの5’-O-DMT保護アミダイト及びアセトニトリル(0.25M)中のDCI(4,5-ジシアノイミダゾール)の溶液を活性剤として用いて行われる。最終サイクルでは、所望の修飾を有するホスホロアミダイト、例えばコンジュゲート基を結合するためのC6リンカ、又はそのようなコンジュゲート基を使用できる。ホスホロチオエート結合を導入するためのチオール化は、水素化キサンタン(アセトニトリル/ピリジン9:1中0.01M)を使用することにより行われる。ホスホジエステル結合は、THF/ピリジン/水7:2:1中の0.02Mヨウ素を用いて導入できる。残りの試薬は、オリゴヌクレオチド合成に通常使用される試薬である。
固相合成後のコンジュゲーションでは、固相合成の最後のサイクルで市販のC6アミノリンカーホスホラミダイトを使用でき、脱保護及び固相支持体からの切断後、アミノ結合脱保護オリゴヌクレオチドが分離される。コンジュゲートは、標準的な合成方法を使用した官能基の活性化によって導入される。
RP-HPLCによる精製:
粗化合物は、Phenomenex Jupiter C18 10μ 150×10mmカラムでの分取RP-HPLCにより精製される。0.1M酢酸アンモニウムpH8及びアセトニトリルを5mL/分の流速で緩衝液として使用する。収集された画分を凍結乾燥して、精製された化合物を典型的には白色固体として得る。
粗化合物は、Phenomenex Jupiter C18 10μ 150×10mmカラムでの分取RP-HPLCにより精製される。0.1M酢酸アンモニウムpH8及びアセトニトリルを5mL/分の流速で緩衝液として使用する。収集された画分を凍結乾燥して、精製された化合物を典型的には白色固体として得る。
略語:
DCI:4,5-ジシアノイミダゾール
DCM:ジクロロメタン
DMF:ジメチルホルムアミド
DMT:4,4’-ジメトキシトリチル
THF:テトラヒドロフラン
Bz:ベンゾイル
Ibu:イソブチリル
RP-HPLC:逆相高速液体クロマトグラフィ
DCI:4,5-ジシアノイミダゾール
DCM:ジクロロメタン
DMF:ジメチルホルムアミド
DMT:4,4’-ジメトキシトリチル
THF:テトラヒドロフラン
Bz:ベンゾイル
Ibu:イソブチリル
RP-HPLC:逆相高速液体クロマトグラフィ
Tmアッセイ:
オリゴヌクレオチドとRNA標的(リン酸結合、PO)二重鎖は、500mlのRNaseフリー水で3mMに希釈され、500mlの2xTmバッファー(200mM NaCl、0.2mM EDTA、20mMリン酸、pH7.0)と混合される。この溶液を95℃で3分間加熱し、次いで、室温で30分間アニールする。二重鎖の融解温度(Tm)は、PE Templabソフトウェア(Perkin Elmer)を用いて、ペルチェ温度プログラマPTP6を備えたLambda 40 UV/VIS分光光度計で測定する。温度を20℃から95℃に上昇させ、次いで25℃に低下させ、260nmで吸収を記録する。一次導関数と、融解及びアニーリングの両方の極大値とを使用して、二重鎖Tmを評価する。
オリゴヌクレオチドとRNA標的(リン酸結合、PO)二重鎖は、500mlのRNaseフリー水で3mMに希釈され、500mlの2xTmバッファー(200mM NaCl、0.2mM EDTA、20mMリン酸、pH7.0)と混合される。この溶液を95℃で3分間加熱し、次いで、室温で30分間アニールする。二重鎖の融解温度(Tm)は、PE Templabソフトウェア(Perkin Elmer)を用いて、ペルチェ温度プログラマPTP6を備えたLambda 40 UV/VIS分光光度計で測定する。温度を20℃から95℃に上昇させ、次いで25℃に低下させ、260nmで吸収を記録する。一次導関数と、融解及びアニーリングの両方の極大値とを使用して、二重鎖Tmを評価する。
組織特異的インビトロリンカー切断アッセイ
試験する生体切断可能なリンカー(例えば、DNAホスホジエステルリンカー(POリンカー))を有するFAM標識オリゴヌクレオチドを、関連する組織(例えば、肝臓又は腎臓)及び血清のホモジネートを使用してインビトロ切断に供する。
試験する生体切断可能なリンカー(例えば、DNAホスホジエステルリンカー(POリンカー))を有するFAM標識オリゴヌクレオチドを、関連する組織(例えば、肝臓又は腎臓)及び血清のホモジネートを使用してインビトロ切断に供する。
組織及び血清試料を適切な動物(例えば、マウス、サル、ブタ又はラット)から収集し、ホモジナイゼーションバッファー(0.5% Igepal CA-630、25mM Tris pH8.0、100mM NaCl、pH8.0(1N NaOHで調整))中でホモジナイズする。組織ホモジネート及び血清にオリゴヌクレオチドを添加して、200μg/g組織の濃度にする。試料を37oCで24時間インキュベートし、その後、試料をフェノール-クロロホルムで抽出する。Dionex DNApac p-100カラム及びpH 7.5で10 mM~1M過塩素酸ナトリウムの範囲の勾配を使用して、Dionex Ultimate 3000で溶液をAIE HPLC分析に供する。切断されたオリゴヌクレオチド及び切断されていないオリゴヌクレオチドの含有量を、615nmの蛍光検出器及び260nmのUV検出器の両方を使用して標準に対して決定する。
S1ヌクレアーゼ切断アッセイ
S1ヌクレアーゼ感受性リンカー(例えば、DNAホスホジエステルリンカー(POリンカー))を有するFAM標識オリゴヌクレオチドを、S1ヌクレアーゼ抽出物又は血清においてインビトロ切断に供する。
S1ヌクレアーゼ感受性リンカー(例えば、DNAホスホジエステルリンカー(POリンカー))を有するFAM標識オリゴヌクレオチドを、S1ヌクレアーゼ抽出物又は血清においてインビトロ切断に供する。
100μMのオリゴヌクレオチドを、ヌクレアーゼ緩衝液(60Upr.100μL)中のS1ヌクレアーゼによるインビトロ切断に20分間及び120分間供する。緩衝液にEDTAを添加することによって酵素活性を停止する。Dionex DNApac p-100カラム及びpH 7.5で10 mM~1M過塩素酸ナトリウムの範囲の勾配を使用して、Dionex Ultimate 3000で溶液をAIE HPLC分析に供する。切断されたオリゴヌクレオチド及び切断されていないオリゴヌクレオチドの含有量を、615nmの蛍光検出器及び260nmのUV検出器の両方を使用して標準に対して決定する。
HBsAg抗原測定
製造業者のプロトコルに従って、HBsAg化学発光免疫アッセイ(CLIA)(Autobio diagnostics Co.Ltd.,Zhengzhou,China,カタログ番号CL0310-2)を使用して、感染AAV-HBVマウスの血清中の血清HBsAgレベルを決定した。簡単に説明すると、50μlの血清を抗体コーティングマイクロタイタープレートに移し、50μlの酵素コンジュゲート試薬を添加した。プレートを振盪機上で室温にて60分間インキュベートした後、自動洗浄機を用いて洗浄緩衝液により全ウェルを6回洗浄した。25μlの基質A、次いで25μlの基質Bを各ウェルに添加した。プレートを室温にて10分間インキュベートした後、Envision発光リーダ(Perkin Elmer)を用いて発光を測定した。HBsAgは単位IU/mlで与えられる;式中、1ngのHBsAg=1.14IUである。
製造業者のプロトコルに従って、HBsAg化学発光免疫アッセイ(CLIA)(Autobio diagnostics Co.Ltd.,Zhengzhou,China,カタログ番号CL0310-2)を使用して、感染AAV-HBVマウスの血清中の血清HBsAgレベルを決定した。簡単に説明すると、50μlの血清を抗体コーティングマイクロタイタープレートに移し、50μlの酵素コンジュゲート試薬を添加した。プレートを振盪機上で室温にて60分間インキュベートした後、自動洗浄機を用いて洗浄緩衝液により全ウェルを6回洗浄した。25μlの基質A、次いで25μlの基質Bを各ウェルに添加した。プレートを室温にて10分間インキュベートした後、Envision発光リーダ(Perkin Elmer)を用いて発光を測定した。HBsAgは単位IU/mlで与えられる;式中、1ngのHBsAg=1.14IUである。
HBeAgレベルは、製造業者のプロトコル及びHBsAgについて上記に記載された簡単な説明に従って、CLIA ELISAキット(Autobio Diagnostic#CL0310-2)を使用して同様に測定することができる。
HBV感染細胞からの細胞内HBVmRNAのリアルタイムPCR
HBV mRNAは、QuantStudio 12K Flex(Applied Biosystems)、TaqMan RNA-to-CT 1-Step Kit(Applied Biosystems、#4392938)、Human ACTB内因性対照(Applied Biosystems、#4310881E)を使用してqPCRによって技術的に二重で定量することができる。Taqman試薬を以下の市販のThermoFisher Scientificプライマー(HBV Pa03453406_s1,ACTB 4310881E)と共に使用する。mRNA発現は、参照遺伝子ACTB及びPBS処置細胞に対して正規化した比較サイクル閾値2-ΔΔCt法を用いて分析する。
HBV mRNAは、QuantStudio 12K Flex(Applied Biosystems)、TaqMan RNA-to-CT 1-Step Kit(Applied Biosystems、#4392938)、Human ACTB内因性対照(Applied Biosystems、#4310881E)を使用してqPCRによって技術的に二重で定量することができる。Taqman試薬を以下の市販のThermoFisher Scientificプライマー(HBV Pa03453406_s1,ACTB 4310881E)と共に使用する。mRNA発現は、参照遺伝子ACTB及びPBS処置細胞に対して正規化した比較サイクル閾値2-ΔΔCt法を用いて分析する。
HBV DNA抽出及びqPCR
最初に、マウス血清をリン酸緩衝生理食塩水(PBS)で10倍(1:10)に希釈した。MagNA Pure 96(Roche)ロボットを用いてDNAを抽出した。50μlの希釈血清を、200ulのMagNA Pure 96外部溶解緩衝液(Roche、カタログ番号番号06374913001)を含む処理カートリッジ中で混合し、10分間インキュベートした。次いで、「MagNA Pure 96 DNA and Viral Nucleic Acid Small Volume Kit」(Roche、カタログ番号06543588001)及び「Viral NA Plasma SV external lysis 2.0」プロトコルを使用してDNAを抽出した。DNA溶出体積は50μlであった。
最初に、マウス血清をリン酸緩衝生理食塩水(PBS)で10倍(1:10)に希釈した。MagNA Pure 96(Roche)ロボットを用いてDNAを抽出した。50μlの希釈血清を、200ulのMagNA Pure 96外部溶解緩衝液(Roche、カタログ番号番号06374913001)を含む処理カートリッジ中で混合し、10分間インキュベートした。次いで、「MagNA Pure 96 DNA and Viral Nucleic Acid Small Volume Kit」(Roche、カタログ番号06543588001)及び「Viral NA Plasma SV external lysis 2.0」プロトコルを使用してDNAを抽出した。DNA溶出体積は50μlであった。
抽出されたHBV DNAの定量を、Taqman qPCR装置(ViiA7,life technologiesを使用して行った。各DNA試料をPCRで2連で試験した。5μlのDNA試料を、384ウェルプレート中の10μlのTaqMan Gene Expression Master Mix(Applied Biosystems、カタログ番号4369016)、0.5μlのPrimeTime XL qPCR Primer/Probe(IDT)及び4.5μlの蒸留水を含有する15μlのPCRマスターミックスに加え、PCRを、以下の設定を使用して行った:UDGインキュベーション(2分、50℃)、酵素活性化(10分、95℃)及びPCR(変性のために15秒、95°、アニーリング及び伸長のために1分、60℃の40サイクル)。DNAコピー数は、ViiA7ソフトウェアによるHBVプラスミドDNA標準曲線に基づくCt値から計算した。
ZENは内部クエンチャである。
実施例B1
この研究は、HBVを標的とするGalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチド(抗HBV ASO)とTLR7アゴニストとの組合せが、HBVインビボ有効性マウスモデルを使用して有益な抗ウイルス効果を有するという証拠を提供することを目的とする。
この研究は、HBVを標的とするGalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチド(抗HBV ASO)とTLR7アゴニストとの組合せが、HBVインビボ有効性マウスモデルを使用して有益な抗ウイルス効果を有するという証拠を提供することを目的とする。
HBVを標的とするGalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチド(抗HBV ASO)などの直接作用型抗ウイルス薬と、toll様受容体7のアゴニスト(TLR7アゴニスト)などの免疫調節薬との組合せは、慢性HBV処置において、各個々の化合物単独の単剤療法の活性から予測できない方法で複合効果に影響を及ぼす可能性がある。
インビボ系における抗HBV ASOとTLR7アゴニストの組合せを評価するために、慢性HBV感染のマウスモデルを使用した。材料及び方法に記載されているAAV/HBVマウスモデルでは、持続的なHBV感染が確立され、血漿中で検出可能なウイルスマーカー(HBsAg、HBeAg、HBV DNA)の発現をもたらす。1.5mg/kg又は7.5mg/kgで投与されたCMP番号15_1(表2及び図4)の抗HBV ASO及び100mgを1日おき(QOD)又は週に1回(QW)で投与されたCMP番号VI(表3)のTLR7アゴニストによる処置時のこれらのウイルスマーカーに対する効果を、単独療法又は組合せて評価した。
表15~表18及び図9A~図9Dは、CMP番号15_1及びCMP番号VIの投与の示された組合せについて、研究の期間にわたるウイルスマーカーHBV-DNAの変化を示す。アッセイのより低い定量レベル(LLOQ)未満へのHBV-DNAの急速な減少は、1.5mg/kg及び7.5mg/kgの両方でのCMP番号15_1(抗HBV ASO)単独療法について(図9A及びC)、並びに任意の濃度の抗HBV ASOを含有する任意の組合せについて(図9A~図9D、実線)見られた。対照的に、TLR7アゴニスト(CM番号VI)単独で処置した場合、1日おきに投与した場合(QOD)にのみHBV-DNAの減少がLLOQに達した(図9A及びC)。QW投与では(図9B及び図9D)、TLR7アゴニスト単剤療法で約1.5-logの最大減少が達成された。
投与終了後、HBV-DNAレベルは全ての処置群で部分的にリバウンドし、1.5mg/kg用量の単剤療法で抗HBV ASOについて最大の絶対リバウンドが見られた(図9A及び図9B)。この群のHBV DNA血漿レベルは、対照群の1/2log以内に戻った。同様に、TLR7アゴニスト処置動物のリバウンドは、QOD又はQW投与の単独療法であるかにかかわらず、フォローアップ期間中に対照群の1log以内に戻った。このリバウンドは、抗HBV ASOの場合と同じ大きさではないが、抗HBV ASO処置群からも処置終了後に早く起こった。
抗HBV ASOとTLR7アゴニストとの組合せで処置した群でHBV DNAによって測定されるリバウンドは、各単一化合物での処置と比較して常に遅延した。注目すべきことに、高用量抗HBV-ASOの開始遅延及びリバウンド動態は、TLR7アゴニストの頻繁な投与とあまり頻繁でない投与との組合せの間で同様であり、リバウンドは、それぞれ91日目及び84日目に始まった。興味深いことに、最も低い併用用量(図8B)では、リバウンドは、高TLR7アゴニスト低抗HBV ASO用量(図8A)の場合より遅い84日目に始まるようであり、77日目にリバウンドが観察される。したがって、抗HBV ASO及びTLR7アゴニストを組み合わせると、TLR7の治療域は増加するようであり、これは、TLR7アゴニスト単剤処置で観察されるものと比較して、用量の3倍の減少はリバウンドが観察される時間に悪影響を及ぼさないためである。
HBeAgレベルも測定したが、単剤処置と併用処置との間に市場差(market difference)は観察されなかった。
表19~表22及び図10A~図10Dは、HBsAgに対する効果が一般にHBV-DNAに対する効果と同様であったことを示す。HBV DNAとは異なり、1.5mg/kgの抗HBV ASO(CMP番号15)による処置は、HBsAgを検出限界未満のレベルまで抑制することができず(図10A及び図10B)、TLR7アゴニスト(CMP番号VI)も、いずれの用量においても抑制できなかった(図10A~図10D)。一方、抗HBV ASOとTLR7アゴニストの組合せは、全ての用量でHBsAgを検出限界未満に低下させることができ、単剤処置と比較してリバウンドを遅延させた。HBV DNAの場合と同様に、少なくともTLR7アゴニストの治療域の増加もHBsAgの減少に関連して観察され、HBsAgの場合、最低用量での組合せ(図10B)は、HBsAg減少及びリバウンド遅延の両方の点で、最高用量での組合せ(図10C)と本質的に同程度に有効であるため、さらに顕著であり、抗HBV ASOの治療域の増大もあり得ることを示している。
研究の結論
本研究のデータは、慢性HBV感染症のインビボモデルにおける抗HBV ASOとTLR7アゴニストとの組合せの利点を示す。これらの利益は、HBV DNA及びHBsAgの両方によって測定されるように、処置終了後のリバウンド遅延として最も明確に見ることができる。組合せがこれらの化合物のリスク・プロファイルを変化させることは示唆されておらず、臨床現場における各活性成分のより低い用量は、より高い用量での組合せと同じ抗ウイルス効果を達成することができる。組合せの治療域のこの正の増加は、患者にとって明らかな利益である。
本研究のデータは、慢性HBV感染症のインビボモデルにおける抗HBV ASOとTLR7アゴニストとの組合せの利点を示す。これらの利益は、HBV DNA及びHBsAgの両方によって測定されるように、処置終了後のリバウンド遅延として最も明確に見ることができる。組合せがこれらの化合物のリスク・プロファイルを変化させることは示唆されておらず、臨床現場における各活性成分のより低い用量は、より高い用量での組合せと同じ抗ウイルス効果を達成することができる。組合せの治療域のこの正の増加は、患者にとって明らかな利益である。
パートC:RNAi及びアンチセンスオリゴヌクレオチドの効果の比較
実施例C1:
この研究の目的は、AAV-HBVマウスモデルにおける特定の化合物のインビボ薬理学及び有効性を評価することであった。
実施例C1:
この研究の目的は、AAV-HBVマウスモデルにおける特定の化合物のインビボ薬理学及び有効性を評価することであった。
試験した化合物:陰性対照siRNA(DCR-AUD1、HBVゲノムを標的としないsiRNA);HBV(s)-219(抗HBV siRNA);CMP番号15_1(抗HBV ASO)。
B型肝炎ウイルス(HBV)ゲノムrAAV8-1.3HBV ayw(ロット番号:2019032703)を保有する組換えアデノ随伴ウイルス(AAV)を、Beijing FivePlus Molecular Medicine Instituteから購入し、使用前に-70℃で保存した。
115匹の雄C57BL/6マウスを得た。投与前0日目に、全ての動物に、モデル誘導のために1×1011ベクターゲノムのAAV-HBVを尾静脈を通して注射した。ベースライン血清ウイルスマーカー及び投与前24日目の体重に基づいて、80匹の適格HBV感染マウスを選択した。
80匹の選択したマウスを、化合物処置のために4つの群に無作為に分けた。滅菌水、DCR-AUD1、DCR-S219(9mg/kg)及びCMP番号15_1(6.6mg/kg)を0日目に5mL/kgで1回皮下注射した。投与量は2mLであった。
体重を0~21日目に週に1回測定した。試験期間中、試験群間で体重増加の有意差は観察されなかった。
全血を回収して、0~21日目に週に2回、血清(マウスあたり15μL)を調製した。21日目に、マウスを安楽死させた。ウイルスマーカーアッセイのための血清試料に加えて、追加の血清試料(マウスあたり120μL)を調製し、-70℃で保存した。肝臓全体を回収し、半分に切断し、急速凍結し、-70℃で保存した。残りの投与製剤並びに最終血清及び組織試料を、それぞれ2019年11月16日及び20日に廃棄した。
HBsAgのベースライン血清レベルをARCHITECT i 2000(Abbott Laboratories,Lake Bluff,IL,USA)及び支持試薬によって決定した。ベースライン血清HBVDNAレベルを、ABI 7500(Applied Biosystems,Foster City,CA,USA)及び検出キット(Sansure Biotech Inc.,Changsha,Hunan,China)を使用することによって測定した。
結果を図30に示す。抗HBV ASO(HBV-LNA)は、HBsAgレベルの急速な減少をもたらし、これは約10日まで維持され、その後、HBsAgレベルはリバウンドした。HBVを標的とするsiRNA化合物(DCR-S219)は、HBsAgレベルの初期低下速度がやや遅いが、それでも非常に速い速度であった。さらに、siRNA化合物では、驚くべきレベルの減少が実験の21日間にわたって維持され、リバウンドの徴候はなかった。LNA化合物よりもはるかに低いモル投与量で優れた結果が達成されるという点で、siRNA化合物についてさらなる利点が図30に見られる。図30は、9mg/kgのsiRNA及び6.6mg/kgのLNAを投与されたマウスによる結果を示すが、これらの化合物間の分子量の差により、siRNAのモル用量はLNAのモル用量の約0.3倍にすぎない(DCR-S219のMwは22262Daであり、CMP番号15_1のMwは6638Daである)。したがって、アンチセンスオリゴヌクレオチドよりもはるかに低いモル投与量の本発明のsiRNAで優れた結果を達成することができる。
データは、抗HBV ASO及びTLR7アゴニストに関するデータと組み合わせると、例えば実施例B及び図9に示すように、HBVを標的とするsiRNAなどのRNAiオリゴヌクレオチドとTLR7アゴニストを組み合わせる利点を示す。
図10Aに示すように、TLR7アゴニスト単独でHBsAgの減少をもたらしたが、HBsAgの減少の初期速度は遅かった(最も低いHBsAgは42日目に見られた)。したがって、実施例C/図30のHBVを標的化するsiRNAが迅速で(すなわち10日までに)効果的なHBsAgノックダウンを達成したので、HBVを標的化するsiRNAなどのRNAiオリゴヌクレオチドをTLR7アゴニストとともに使用するための相乗効果がある。さらに、図30に示すように、HBVを標的とするsiRNAは、抗HBV ASOよりも優れた非常に効果的な長期ノックダウンを提供した。
本明細書に開示されるデータから、1)HBVを標的とするsiRNAなどのRNAiオリゴヌクレオチドと、2)TLR7アゴニストとを含む組合せの効果は、したがって、長期間続く効果的なHBsAgノックダウンが迅速に誘導され、長期間にわたって効果的な抗ウイルス制御を示すと判断され得る。したがって、RNAiオリゴヌクレオチドとTLR7アゴニストとを含む組合せが、本発明の最も好ましい組合せである。
そのような有益な効果は、本明細書に開示される実施例のパートA、B及びCの発見以前には予想され得なかった。
Claims (159)
- 前記治療用オリゴヌクレオチドがRNAiオリゴヌクレオチドである、請求項1に記載の医薬組合せ。
- 前記RNAiオリゴヌクレオチドが、HBV(RNAi番号1)を標的とするオリゴヌクレオチドである、請求項2に記載の医薬組合せ。
- 前記RNAiオリゴヌクレオチドが、HBsAg mRNA(RNAi番号2)を標的とするオリゴヌクレオチドである、請求項2又は3に記載の医薬組合せ。
- 前記RNAiオリゴヌクレオチドが、HBsAg mRNA(RNAi番号3)の発現を減少させるオリゴヌクレオチドである、請求項2~4のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記RNAiオリゴヌクレオチドが、19~30ヌクレオチド長のアンチセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドであり、前記アンチセンス鎖が、ACAANAAUCCUCACAAUA(配列番号33)に記載のHBsAg mRNA(RNAi番号4)の配列に対して相補性の領域を含む、請求項2~5のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記RNAiオリゴヌクレオチドが、B型肝炎ウイルス表面抗原(HBsAg)mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドであり、前記オリゴヌクレオチドが、19~30ヌクレオチド長のアンチセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドであり、前記アンチセンス鎖が、ACAANAAUCCUCACAAUA(配列番号33)に記載のHBsAg mRNA(RNAi番号5)の配列に対して相補性の領域を含む、請求項2~5のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記RNAiオリゴヌクレオチドが、19~50ヌクレオチド長のセンス鎖をさらに含み、前記センス鎖が、前記アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成する、請求項6又は7に記載の医薬組合せ。
- 前記センス鎖が、UUNUUGUGAGGAUUN(配列番号34)に記載の配列と相補性の領域を含む、請求項8に記載の医薬組合せ。
- 前記センス鎖が、5’-UUAUUGUGAGGAUUNUUGUC(配列番号35)に記載の配列と相補性の領域を含む、請求項8又は9に記載の医薬組合せ。
- 前記アンチセンス鎖が、UUAUUGUGAGGAUUNUUGUCGG(配列番号36)に記載の配列を含む、請求項9に記載の医薬組合せ。
- 前記アンチセンス鎖が、UUAUUGUGAGGAUUCUUGUCGG(配列番号37)に記載の配列からなる、請求項9に記載の医薬組合せ。
- 前記アンチセンス鎖が、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列からなる、請求項9に記載の医薬組合せ。
- 前記センス鎖が、ACAANAAUCCUCACAAUAA(配列番号39)に記載の配列を含む、請求項8から12のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記センス鎖が、GACAANAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号40)に記載の配列を含む、請求項8~14のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列からなる、請求項8~14のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記センス鎖が、GACAAGAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号42)に記載の配列からなる、請求項8~14のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記RNAiオリゴヌクレオチドが、B型肝炎ウイルス表面抗原(HBsAg)mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドであり、前記オリゴヌクレオチドが、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、前記センス鎖がGACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列を含み、前記アンチセンス鎖が、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列を含み、
前記アンチセンス鎖及び前記センス鎖の各々が、1つ又は複数の2’-フルオロ及び2’-O-メチル修飾ヌクレオチド並びに少なくとも1つのホスホロチオエート結合を含み、前記アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素がリン酸類似体を含み、前記センス鎖が1つ又は複数のN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)部分にコンジュゲートされている、請求項2~5のいずれか一項に記載の医薬組合せ。 - 前記RNAiオリゴヌクレオチドが、B型肝炎ウイルス表面抗原(HBsAg)mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドであり、前記オリゴヌクレオチドが、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、
前記センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3位、8~10位、12位、13位及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1位、2位、4~7位、11位、14~16位、18~26位及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、配列を含み、前記センス鎖は、1つ又は複数のN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)部分にコンジュゲートされており、
前記アンチセンス鎖が、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2位、3位、5位、7位、8位、10位、12位、14位、16位及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1位、4位、6位、9位、11位、13位、15位、17位、18位及び20~22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも3つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、配列を含み、前記アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素はリン酸類似体を含む、請求項2~5のいずれか一項に記載の医薬組合せ。 - 前記センス鎖が、1位及び2位のヌクレオチド間にホスホロチオエート結合を含む、請求項19に記載の医薬組合せ。
- 前記アンチセンス鎖が、ヌクレオチド1と2、2と3、3と4、20と21、及び21と22の間に5個のホスホロチオエート結合を含む、請求項19又は20に記載の医薬組合せ。
- 前記センス鎖上の-GAAA-配列のヌクレオチドのうちの1つ又は複数が一価GalNAc部分にコンジュゲートされている、請求項19~22のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記センス鎖上の前記-GAAA-配列のヌクレオチドの各々が一価GalNAc部分にコンジュゲートされている、請求項23に記載の医薬組合せ。
- Lがアセタールリンカーである、請求項25に記載の医薬組合せ。
- XがOである、請求項25又は26に記載の医薬組合せ。
- 前記センス鎖が、その3’末端に、ステムループ:S1-L-S2を含み、式中、S1はS2に相補的であり、LはS1とS2との間に最大6ヌクレオチド長のループを形成する、請求項8に記載の医薬組合せ。
- Lがテトラループである、請求項29に記載の医薬組合せ。
- Lが、S1とS2との間に4ヌクレオチド長のループを形成する、請求項29又は30に記載の医薬組合せ。
- LがGAAAとして記載の配列を含む、請求項29~31のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記ステムループの最大4ヌクレオチドのLがそれぞれ別個のGalNAcにコンジュゲートされる、請求項29~32のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記RNAiオリゴヌクレオチドが少なくとも1つの修飾ヌクレオチドを含む、請求項6~16のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記修飾ヌクレオチドが2’-修飾を含む、請求項34に記載の医薬組合せ。
- 前記2’-修飾が、2’-アミノエチル、2’-フルオロ、2’-O-メチル、2’-O-メトキシエチル、及び2’-デオキシ-2’-フルオロ-β-d-アラビノ核酸から選択される、請求項35に記載の医薬組合せ。
- 前記RNAiオリゴヌクレオチドのヌクレオチドの全てが修飾ヌクレオチドである、請求項6~16のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記RNAiオリゴヌクレオチドが少なくとも1つの修飾ヌクレオチド間結合を含む、請求項6~16のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記少なくとも1つの修飾ヌクレオチド間結合がホスホロチオエート結合である、請求項38に記載の医薬組合せ。
- 前記アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素がリン酸類似体を含む、請求項6~16のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオチドが標的化リガンドにコンジュゲートされている、請求項6~16のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記標的化リガンドがN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)部分である、請求項41に記載の医薬組合せ。
- 前記RNAiオリゴヌクレオチドが、B型肝炎ウイルス表面抗原(HBsAg)mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドであり、前記オリゴヌクレオチドが、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、
前記センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3位、8~10位、12位、13位及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1位、2位、4~7位、11位、14~16位、18~26位及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1位と2位のヌクレオチド間のホスホロチオエート結合を含む、配列からなり、前記センス鎖上の-GAAA-配列の各ヌクレオチドは、一価GalNac部分にコンジュゲートされており、
前記アンチセンス鎖が、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2位、3位、5位、7位、8位、10位、12位、14位、16位及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1位、4位、6位、9位、11位、13位、15位、17位、18位及び20~22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1位と2位のヌクレオチド間、2位と3位のヌクレオチド間、3位と4位のヌクレオチド間、20位と21位のヌクレオチド間、及び21位と22位のヌクレオチド間のホスホロチオエート結合を含む、配列からなり、
前記アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素がメトキシホスホネート(MOP)(RNAi番号6)を含む、請求項2~5のいずれか一項に記載の医薬組合せ。 - 前記RNAiオリゴヌクレオチドが、B型肝炎ウイルス表面抗原(HBsAg)mRNAの発現を減少させるためのオリゴヌクレオチドであり、前記オリゴヌクレオチドが、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、
前記センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3位、8~10位、12位、13位及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1位、2位、4~7位、11位、14~16位、18~26位及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1位と2位のヌクレオチド間の1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、配列を含み、前記センス鎖上の-GAAA-配列の各ヌクレオチドは、一価GalNAc部分にコンジュゲートされており、前記-GAAA-配列は、以下の構造:
前記アンチセンス鎖が、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2位、3位、5位、7位、8位、10位、12位、14位、16位及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1位、4位、6位、9位、11位、13位、15位、17位、18位及び20~22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びにヌクレオチド1と2、2と3、3と4、20と21、及び21と22の間に5つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、配列を含み、前記アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素は以下の構造:
- 前記RNAiオリゴヌクレオチドが図29Aに示される構造(RNAi番号8)を有する、請求項2~5のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記RNAiオリゴヌクレオチドがオリゴヌクレオチドHBV(s)-219(RNAi番号9)である、請求項2~5のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが、配列番号1の1530位から1602位までの連続配列に100%相補的な少なくとも12ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を有する13~22ヌクレオチド長のGalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項1に記載の医薬組合せ。
- 前記連続ヌクレオチド配列が、配列番号1の1530~1598位;1530~1543位;1530~1544位;1531~1543位;1551~1565位;1551~1566位;1577~1589位;1577~1591位;1577~1592位;1578~1590位;1578~1592位;1583~1598位;1584~1598位;1585~1598位及び1583~1602位からなる群から選択される標的配列に100%相補的である、請求項47に記載の医薬組合せ。
- 前記連続ヌクレオチド配列が12~16ヌクレオチド長である、請求項47又は48に記載の医薬組合せ。
- 前記GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列が、
gcgtaaagagagg(配列番号2);
gcgtaaagagaggt(配列番号3);
cgcgtaaagagaggt(配列番号4);
agaaggcacagacgg(配列番号5);
gagaaggcacagacgg(配列番号6);
agcgaagtgcacacgg(配列番号7);
gaagtgcacacgg(配列番号8);
gcgaagtgcacacgg(配列番号9);
agcgaagtgcacacg(配列番号10);
cgaagtgcacacg(配列番号11);
aggtgaagcgaagtgc(配列番号12)
aggtgaagcgaagtg(配列番号13);
aggtgaagcgaagt(配列番号14);及び
gcagaggtgaagcgaagtgc(配列番号29)
からなる群から選択される、請求項47~49のいずれか一項に記載の医薬組合せ、又はその薬学的に許容され得る塩。 - 前記GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列が、式5’-F-G-F’-3’のギャップマーであり、領域F及びF’は、独立して、2~5個の2’糖修飾ヌクレオチドからなり、F及びF’領域の5’及び3’末端を規定し、Gは、RNアーゼHを動員することができる6~10個のDNAヌクレオシド領域である、請求項47~50のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記2’糖修飾ヌクレオシドが、2’-O-アルキル-RNA、2’-O-メチル-RNA、2’-アルコキシ-RNA、2’-O-メトキシエチル-RNA、2’-アミノ-DNA、2’-フルオロ-DNA、2’-フルオロ-ANA及びLNAヌクレオシドからなる群から独立して選択される、請求項51に記載の医薬組合せ。
- 1つ又は複数の2’糖修飾ヌクレオシドがMOEヌクレオシドである、請求項51又は52に記載の医薬組合せ。
- 1つ又は複数の2’糖修飾ヌクレオシドがLNAヌクレオシドである、請求項51又は52に記載の医薬組合せ。
- 前記修飾LNAヌクレオシドが、オキシLNA、アミノLNA、チオLNA、cET及びENAから選択される、請求項54に記載の医薬組合せ。
- 前記修飾LNAヌクレオシドが、それに続く2’-4’架橋-O-CH2-を有するオキシLNAである、請求項54又は55に記載の医薬組合せ。
- 前記オキシLNAがベータ-D-オキシLNAである、請求項56に記載の医薬組合せ。
- 前記修飾LNAヌクレオシドが、それに続く2’-4’架橋-O-CH(CH3)-を有するcETである、請求項54又は55に記載の医薬組合せ。
- 前記cETが(S)cET、すなわち6’(S)メチル-ベータ-D-オキシLNAである、請求項58に記載の医薬組合せ。
- 前記LNAがENAであり、それに続く2’-4’架橋-O-CH2-CH2-を有する、請求項54又は55に記載の医薬組合せ。
- 前記GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列が、
GCGtaaagagaGG(配列番号2);
GCGtaaagagAGG(配列番号2);
GCGtaaagagaGGT(配列番号3);
CGCgtaaagagaGGT(配列番号4);
AGAaggcacagaCGG(配列番号5);
GAGaaggcacagaCGG(配列番号6);
AGCgaagtgcacaCGG(配列番号7);
GAAgtgcacacGG(配列番号8);
GAAgtgcacaCGG(配列番号8);
GCGaagtgcacaCGG(配列番号9);
AGCgaagtgcacACG(配列番号10);
CGAagtgcacaCG(配列番号11);
AGGtgaagcgaagTGC(配列番号12);
AGGtgaagcgaaGTG(配列番号13)
AGgtgaagcgaAGTG(配列番号13);
AGGtgaagcgaAGT(配列番号14);及び
GCAGAGgtgaagcgaAGTGC(配列番号29)
からなる群から選択され、大文字はLNA又はMOEヌクレオシドを示し、小文字はDNAヌクレオシドを示す、請求項47~60のいずれか一項に記載の医薬組合せ。 - 前記連続ヌクレオチド配列内のヌクレオシド間結合の少なくとも50%がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項47~61のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドの前記連続ヌクレオチド配列内の全てのヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項47~62のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドのGalNAcコンジュゲートが、二価、三価又は四価のGalNAcクラスターである、請求項47~63のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記GalNAcコンジュゲートが、図1B、図1D又は図1Jから選択される、請求項64に記載の医薬組合せ。
- 前記GalNAcコンジュゲート及び前記GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドの前記連続ヌクレオチド配列が、2個、3個、4個又は5個のホスホジエステル結合DNAヌクレオシドを含むPOリンカーによって共有結合している、請求項47~65のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記POリンカーが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの一部であり、一方がCとAとの間にあり他方が前記GalNAcクラスターに対するものである少なくとも2つのホスホジエステル結合を有するシトシン及びアデニン(CA)のジヌクレオチド配列からなる、請求項66に記載の医薬組合せ。
- 前記GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドが12~18ヌクレオチド長である、請求項47~67のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドが5’-図1J-o G s C s A s G s A sgsgstsgsasasgscsgsas A s G s T s G s C-3’(図2)であり、式中、下線付き大文字下線付き文字はMOE単位を表し、小文字はDNA単位を表し、下付き文字「o」は、ホスホジエステル結合を表し、下付き文字「s」は、ホスホロチオエート結合を表す、請求項47~69のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記TLR7アゴニストが、
[(1S)-1-[(2S,4R,5R)-5-(5-アミノ-2-オキソ-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-3-イル)-4-ヒドロキシ-テトラヒドロフラン-2-イル]プロピル]アセテート(CMP番号VI);
5-アミノ-3-[(2R,3R,5S)-3-ヒドロキシ-5-[(1S)-1-ヒドロキシプロピル]テトラヒドロフラン-2-イル]-6H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2,7-ジオン(CMP番号VII);
5-アミノ-3-[(2R,3R,5S)-3-ヒドロキシ-5-[(1S)-1-ヒドロキシプロピル]テトラヒドロフラン-2-イル]チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2-オン(CMP番号VIII);
5-アミノ-3-(3’-デオキシ-β-D-リボフラノシル)-3H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2-オン(CMP番号IX);
5-アミノ-3-(2’-O-アセチル-3’-デオキシ-β-D-リボフラノシル)-3H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2-オン(CMP番号X);
5-アミノ-3-(3’-デオキシ-β-D-リボフラノシル)-3H,6H-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-2,7-ジオン(CMP番号XI);
[(S)-[(2S,5R)-5-(5-アミノ-2-オキソ-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-3-イル)-1,3-オキサチオラン-2-イル]-シクロプロピル-メチル]アセテート(CMP番号XII);及び
(1S)-1-[(2S,5R)-5-(5-アミノ-2-オキソ-チアゾロ[4,5-d]ピリミジン-3-イル)-1,3-オキサチオラン-2-イル]ブタ-2-イニル]アセテート(CMP番号XIII);
からなる群から選択される、
又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである、
請求項1~73のいずれか一項に記載の医薬組合せ。 - RNAiオリゴヌクレオチドとTLR7アゴニストとを含む組合せが、以下の組合せ:
RNAi番号1とCMP番号VI;RNAi番号2とCMP番号VI;RNAi番号3とCMP番号VI;RNAi番号4とCMP番号VI;RNAi番号5とCMP番号VI;RNAi番号6とCMP番号VI;RNAi番号7とCMP番号VI;RNAi番号8とCMP番号VI;RNAi番号9とCMP番号VI;
RNAi番号1とCMP番号VII;RNAi番号2とCMP番号VII;RNAi番号3とCMP番号VII;RNAi番号4とCMP番号VII;RNAi番号5とCMP番号VII;RNAi番号6とCMP番号VII;RNAi番号7とCMP番号VII;RNAi番号8とCMP番号VII;RNAi番号9とCMP番号VII;
RNAi番号1とCMP番号VIII;RNAi番号2とCMP番号VIII;RNAi番号3とCMP番号VIII;RNAi番号4とCMP番号VIII;RNAi番号5とCMP番号VIII;RNAi番号6とCMP番号VIII;RNAi番号7とCMP番号VIII;RNAi番号8とCMP番号VIII;RNAi番号9とCMP番号VIII;
RNAi番号1とCMP番号XIII;RNAi番号2とCMP番号XIII;RNAi番号3とCMP番号XIII;RNAi番号4とCMP番号XIII;RNAi番号5とCMP番号XIII;RNAi番号6とCMP番号XIII;RNAi番号7とCMP番号XIII;RNAi番号8とCMP番号XIII;RNAi番号9とCMP番号XIII;
からなる群から選択される、又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである、
請求項2~46及び71~74のいずれか一項に記載の医薬組合せ。 - 前記RNAiオリゴヌクレオチドがRNAi番号7であり、
アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドであり、
前記センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3位、8~10位、12位、13位及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1位、2位、4~7位、11位、14~16位、18~26位及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1位と2位のヌクレオチド間の1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、配列を含み、前記センス鎖上の-GAAA-配列の各ヌクレオチドは、一価GalNac部分にコンジュゲートされており、前記-GAAA-配列は、以下の構造:
前記アンチセンス鎖が、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2位、3位、5位、7位、8位、10位、12位、14位、16位及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1位、4位、6位、9位、11位、13位、15位、17位、18位及び20-22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びにヌクレオチド1と2、2と3、3と4、20と21、及び21と22の間に5つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、配列を含み、前記アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素は以下の構造:
TLR7アゴニストはCMP番号VI:
請求項2~46及び71~74のいずれか一項に記載の医薬組合せ。 - GalNAcコンジュゲートアンチセンスオリゴヌクレオチドとTLR7アゴニストとを含む組合せが、以下の組合せ:CMP番号15_1とVI,CMP番号15_2とVI;CMP番号16_1とVI;CMP番号20_1とVI;CMP番号23_1とVI;CMP番号26_1とVI;CMP番号29_1とVI;CMP番号15_1とVII,CMP番号15_2とVII;CMP番号16_1とVII;CMP番号20_1とVII;CMP番号23_1とVII;CMP番号26_1とVII;CMP番号29_1とVII;CMP番号15_1とVIII,CMP番号15_2とVIII;CMP番号16_1とVIII;CMP番号20_1とVIII;CMP番号23_1とVII;CMP番号26_1とVIII;CMP番号29_1とVIII;CMP番号15_1とXIII,CMP番号15_2とXIII;CMP番号16_1とXIII;CMP番号20_1とXIII;CMP番号23_1とXIII;CMP番号26_1とXIII;及びCMP番号29_1とXIII
からなる群から選択される、
又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである、
請求項47~74のいずれか一項に記載の医薬組合せ。 - 前記治療用オリゴヌクレオチドが薬学的に許容され得る塩と共に製剤化される、請求項1~78のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記薬学的に許容され得る塩が金属カチオンであり、好ましくは、前記薬学的に許容され得る塩がNa+又はK+である、請求項79に記載の医薬組合せ。
- 請求項1~80のいずれか一項に記載の治療用オリゴヌクレオチド及びTLR7アゴニストが、薬学的に許容され得る担体と共に製剤化される、請求項1~80のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記薬学的に許容され得る担体が水である、請求項81に記載の医薬組合せ。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドがリン酸緩衝生理食塩水において製剤化される、請求項1~82のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが皮下注射用に製剤化され、前記TLR7アゴニストが経口投与用に製剤化される、請求項1~83のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが静脈内注射用に製剤化され、前記TLR7アゴニストが経口投与用に製剤化される、請求項1~83のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが皮下注射用に製剤化されたsiRNAであり、前記TLR7アゴニストが経口投与用に製剤化される、請求項2~46、75、76及び79~83のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- RNAiオリゴヌクレオチドとTLR7アゴニストとを含み、CpAM(コアタンパク質アロステリックモジュレータ)をさらに含む、請求項1~86のいずれか一項に記載の医薬組合せ。
- 前記CpAMが以下に示される化合物(CpAM1):
式中、
R1は、水素、ハロゲン又はC1-6アルキルであり、
R2は、水素又はハロゲンであり、
R3は、水素又はハロゲンであり、
R4はC1-6アルキルであり、
R5は、水素、ヒドロキシC1-6アルキル、アミノカルボニル、C1-6アルコキシカルボニル又はカルボキシであり、
R6は、水素、C1-6アルコキシカルボニル又はカルボキシ-CmH2m-であり、
Xは、カルボニル又はスルホニルであり、
Yは、-CH2-、-O-又は-N(R7)-であり、
式中、R7は、水素、C1-6アルキル、ハロC1-6アルキル、C3-7シクロアルキル-CmH2m-、C1-6アルコキシカルボニル-CmH2m-、-CtH2t-COOH、-ハロC1-6アルキル-COOH、-(C1-6アルコキシ)C1-6アルキル-COOH、-C1-6アルキル-O-C1-6アルキル-COOH、-C3-7シクロアルキル-CmH2m-COOH、-CmH2m-C3-7シクロアルキル-COOH、ヒドロキシ-CtH2t-、カルボキシスピロ[3.3]ヘプチル又はカルボキシフェニル-CmH2m-、カルボキシピリジニル-CmH2m-であり、
Wは、-CH2-、-C(C1-6アルキル)2-、-O-又はカルボニルであり、
nは0又は1であり、
mは0~7であり、
tは1~7である
又はその薬学的に許容され得る塩、若しくはエナンチオマー、若しくはジアステレオマーである、
請求項87に記載の医薬組合せ。 - RNAiオリゴヌクレオチド、TLR7アゴニスト及びCpAMを含む医薬組合せであって、前記RNAiオリゴヌクレオチドがRNAi番号7であり、
アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドであり、
前記センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号41)に記載の配列であって、3位、8~10位、12位、13位及び17位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1位、2位、4~7位、11位、14~16位、18~26位及び31~36位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びに1位と2位のヌクレオチド間の1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、配列を含み、前記センス鎖上の-GAAA-配列の各ヌクレオチドは、一価GalNac部分にコンジュゲートされており、前記-GAAA-配列は、以下の構造:
前記アンチセンス鎖が、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号38)に記載の配列であって、2位、3位、5位、7位、8位、10位、12位、14位、16位及び19位の2’-フルオロ修飾ヌクレオチド、1位、4位、6位、9位、11位、13位、15位、17位、18位及び20-22位の2’-O-メチル修飾ヌクレオチド、並びにヌクレオチド1と2、2と3、3と4、20と21、及び21と22の間に5つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、配列を含み、前記アンチセンス鎖の5’-ヌクレオチドの糖の4’-炭素は以下の構造:
前記TLR7アゴニストはCMP番号VI:
又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーであり;
前記CpAMは、化合物(CpAM2):
又はその薬学的に許容され得る塩、エナンチオマー若しくはジアステレオマーである、
医薬組合せ。 - 請求項1~90のいずれか一項に記載の医薬組合せを含む医薬組成物。
- 請求項1~90のいずれか一項に記載の治療用オリゴヌクレオチドと、B型肝炎ウイルス感染症を処置するためのTLR7アゴニストの投与のための説明がある添付文書とを含むキットオブパーツ。
- 前記添付文書に記載の前記TLR7アゴニストが、請求項1~90のいずれか一項に記載のTLR7アゴニストである、請求項92に記載のキットオブパーツ。
- 請求項1~90のいずれか一項に記載の治療用オリゴヌクレオチドと、請求項1~90のいずれか一項に記載のTLR7アゴニストとを含む、請求項92又は93に記載のキットオブパーツ。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが皮下注射用に製剤化され、前記TLR7アゴニストが経口投与用に製剤化される、請求項91~94のいずれか一項に記載のキットオブパーツ。
- 前記添付文書に慢性B型肝炎ウイルス感染症の処置が記載されている、請求項92~95のいずれか一項に記載のキットオブパーツ。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが、細胞内で前記オリゴヌクレオチドを発現するように操作された導入遺伝子の形態である、請求項1~96のいずれか一項に記載の医薬組合せ、組成物、又はキット。
- B型肝炎ウイルス感染症を処置するための、請求項1~97のいずれか一項に記載の医薬組合せ、組成物、又はキットの使用。
- 処置される前記B型肝炎ウイルス感染症が慢性B型肝炎ウイルス感染症である、請求項98に記載の使用。
- 前記治療用オリゴヌクレオチド及び前記TLR7アゴニストが薬学的有効量で投与される、請求項98又は99に記載の使用。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドを毎週投与し、前記TLR7アゴニストを1日おきに投与する、請求項98~100のいずれか一項に記載の使用。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドを1~4mg/kg pr.で投与し、前記TLR7アゴニストを150~170mg pr.で投与する、請求項98~101のいずれか一項に記載の使用。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドを48週間投与し、84用量のTLR7アゴニストを投与する、請求項98~102のいずれか一項に記載の使用。
- 前記治療用オリゴヌクレオチド及び前記TLR7アゴニストの投与が同じ週に開始される、請求項98~103のいずれか一項に記載の使用。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが皮下投与用の剤形であり、前記TLR7アゴニストが経口投与用の剤形である、請求項98~104のいずれか一項に記載の使用。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドの用量が100~150mg/mlであり、前記TLR7アゴニストの用量が150~170mgである、請求項98~105のいずれか一項に記載の使用。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが、HBV mRNA転写物をコードする非表面抗原を標的とするRNAiオリゴヌクレオチドによる処置の非存在下で投与される、請求項98~106のいずれか一項に記載の使用。
- 対象に、HBxAg mRNA転写物を選択的に標的化するRNAiオリゴヌクレオチドが投与されない、請求項98~107のいずれか一項に記載の使用。
- 前記対象に有効量のエンテカビルを投与することをさらに含む、請求項98~108のいずれか一項に記載の使用。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが、細胞内で前記オリゴヌクレオチドを発現するように操作された導入遺伝子の形態で送達される、請求項98~109のいずれか一項に記載の使用。
- 医薬に使用するための、請求項1~97のいずれか一項に記載の医薬組合せ、組成物、又はキット。
- B型肝炎ウイルス感染症の処置での使用のための、請求項1~97のいずれか一項に記載の医薬組合せ、組成物、又はキット。
- 処置される前記B型肝炎ウイルス感染症が慢性B型肝炎ウイルス感染症である、請求項111又は112に記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
- 前記治療用オリゴヌクレオチド及び前記TLR7アゴニストが薬学的有効量で投与される、請求項111~113のいずれか一項に記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドを毎週投与し、前記TLR7アゴニストを1日おきに投与する、請求項111~114のいずれか一項に記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドを1~4mg/kg pr.で投与し、前記TLR7アゴニストを150~170mg pr.で投与する、請求項111~115のいずれか一項に記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドを48週間投与し、84用量のTLR7アゴニストを投与する、請求項111~116のいずれか一項に記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
- 前記治療用オリゴヌクレオチド及び前記TLR7アゴニストの投与が同じ週に開始される、請求項111~117のいずれか一項に記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが皮下投与用の剤形であり、前記TLR7アゴニストが経口投与用の剤形である、請求項111~118のいずれか一項に記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドの用量が100~150mg/mlであり、前記TLR7アゴニストの用量が150~170mgである、請求項107~115のいずれか一項に記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが、HBV mRNA転写物をコードする非表面抗原を標的とするRNAiオリゴヌクレオチドによる処置の非存在下で投与される、請求項111~120のいずれか一項に記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
- 対象に、HBxAg mRNA転写物を選択的に標的化するRNAiオリゴヌクレオチドが投与されない、請求項111~121のいずれか一項に記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
- 前記対象に有効量のエンテカビルを投与することをさらに含む、請求項項111~122のいずれか一項に記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが、細胞内で前記オリゴヌクレオチドを発現するように操作された導入遺伝子の形態で送達される、請求項項111~123のいずれか一項に記載の使用のための医薬組合せ、組成物、又はキット。
- B型肝炎ウイルス感染症を処置するための第1の医薬の製造における治療用オリゴヌクレオチドの使用であって、前記第1の医薬が、請求項1~97のいずれか一項に記載の治療用オリゴヌクレオチドであり、前記第1の医薬が、第2の医薬と組み合わせて投与されるものであり、前記第2の医薬が、請求項1~97のいずれか一項に記載のTLR7アゴニストである、使用。
- 医薬の製造における、請求項1~97のいずれか一項に記載の医薬組合せ、組成物、又はキットの使用。
- B型肝炎ウイルス感染症を処置するための医薬の製造における、請求項1~97のいずれか一項に記載の医薬組合せ、組成物、又はキットの使用。
- 処置される前記B型肝炎ウイルス感染症が慢性B型肝炎ウイルス感染症である、請求項125~127のいずれか一項に記載の使用。
- 前記治療用オリゴヌクレオチド及び前記TLR7アゴニストが薬学的有効量で投与される、請求項125~128のいずれか一項に記載の使用。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドを毎週投与し、前記TLR7アゴニストを1日おきに投与する、請求項125~129のいずれか一項に記載の使用。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドを1~4mg/kg pr.で投与し、前記TLR7アゴニストを150~170mg pr.で投与する、請求項125~130のいずれか一項に記載の使用。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドを48週間投与し、84用量のTLR7アゴニストを投与する、請求項125~131のいずれか一項に記載の使用。
- 前記治療用オリゴヌクレオチド及び前記TLR7アゴニストの投与が同じ週に開始される、請求項125~132のいずれか一項に記載の使用。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが皮下投与用の剤形であり、前記TLR7アゴニストが経口投与用の剤形である、請求項125~133のいずれか一項に記載の使用。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドの用量が100~150mg/mlであり、前記TLR7アゴニストの用量が150~170mgである、請求項125~134のいずれか一項に記載の使用。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが、HBV mRNA転写物をコードする非表面抗原を標的とするRNAiオリゴヌクレオチドによる処置の非存在下で投与される、請求項125~135のいずれか一項に記載の使用。
- 対象に、HBxAg mRNA転写物を選択的に標的化するRNAiオリゴヌクレオチドが投与されない、請求項125~136のいずれか一項に記載の使用。
- 前記対象に有効量のエンテカビルを投与することをさらに含む、請求項125~137のいずれか一項に記載の使用。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが、細胞内で前記オリゴヌクレオチドを発現するように操作された導入遺伝子の形態で送達される、請求項125~138のいずれか一項に記載の使用。
- B型肝炎ウイルス感染症を処置するための方法であって、治療有効量の請求項1~97のいずれか一項に記載の治療用オリゴヌクレオチドを、治療有効量の請求項1~91又は94~97のいずれか一項に記載のTLR7アゴニストと組み合わせて、B型肝炎ウイルス感染症に感染した対象に投与することを含む、方法。
- B型肝炎ウイルス感染症を処置するための方法であって、治療有効量の請求項1~97のいずれか一項に記載の医薬組合せ、組成物、又はキットを、B型肝炎ウイルス感染症に感染した対象に投与することを含む、方法。
- 処置される前記B型肝炎ウイルス感染症が慢性B型肝炎ウイルス感染症である、請求項140又は141に記載の方法。
- 前記治療用オリゴヌクレオチド及び前記TLR7アゴニストが薬学的有効量で投与される、請求項140~142のいずれか一項に記載の方法。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドを毎週投与し、前記TLR7アゴニストを1日おきに投与する、請求項140~143のいずれか一項に記載の方法。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドを1~4mg/kg pr.で投与し、前記TLR7アゴニストを150~170mg pr.で投与する、請求項140~144のいずれか一項に記載の方法。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドを48週間投与し、84用量のTLR7アゴニストを投与する、請求項140~145のいずれか一項に記載の方法。
- 前記治療用オリゴヌクレオチド及び前記TLR7アゴニストの投与が同じ週に開始される、請求項140~146のいずれか一項に記載の方法。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが皮下投与用の剤形であり、前記TLR7アゴニストが経口投与用の剤形である、請求項140~147のいずれか一項に記載の方法。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドの用量が100~150mg/mlであり、前記TLR7アゴニストの用量が150~170mgである、請求項140~148のいずれか一項に記載の方法。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが、HBV mRNA転写物をコードする非表面抗原を標的とするRNAiオリゴヌクレオチドによる処置の非存在下で投与される、請求項140~149のいずれか一項に記載の方法。
- 対象に、HBxAg mRNA転写物を選択的に標的化するRNAiオリゴヌクレオチドが投与されない、請求項140~150のいずれか一項に記載の方法。
- 前記対象に有効量のエンテカビルを投与することをさらに含む、請求項140~151のいずれか一項に記載の方法。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが、細胞内で前記オリゴヌクレオチドを発現するように操作された導入遺伝子の形態で送達される、請求項140~152のいずれか一項に記載の方法。
- 細胞におけるB型肝炎ウイルス表面抗原の発現を減少させる方法であって、請求項1~91のいずれか一項に記載の医薬組合せ又は組成物を前記細胞に送達することを含む、方法。
- 前記細胞が肝細胞である、請求項154に記載の方法。
- 前記細胞がインビボである、請求項154又は155に記載の方法。
- 前記細胞がインビトロである、請求項154又は155に記載の方法。
- 前記治療用オリゴヌクレオチドが、前記細胞内で前記オリゴヌクレオチドを発現するように操作された導入遺伝子の形態で送達される、請求項154~157のいずれか一項に記載の方法。
- 本明細書中において添付の図面を参照して実質的に記載される医薬組合せ、組成物、キット、使用、又は方法。
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