JP2023509708A - 抗tcr抗体分子およびその使用 - Google Patents

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Abstract

Figure 2023509708000001
本開示は、TCR Vβ領域に結合する抗体分子および前記抗体分子を含む多特異性分子を提供する。さらに、それをコードする核酸、前述の分子を産生する方法、前述の分子を含む医薬組成物、および前述の分子を使用してがんを処置する方法が開示される。
【選択図】図108C

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2020年1月3日に出願された米国仮出願第62/957,024号、および2020年8月26日に出願された米国仮出願第63/070,596号の利益を主張し、これらのそれぞれのすべての内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
がん免疫療法のために腫瘍細胞溶解を促進するためにT細胞を再指向させるように設計された現在の分子は、典型的に、T細胞受容体(TCR)のCD3イプシロン(CD3e)サブユニットを標的とする。しかしながら、このアプローチには制限がある。以前の研究では、例えば、低用量の抗CD3eモノクローナル抗体(mAb)が、T細胞機能不全を引き起こし、免疫抑制作用を生じ得ることが示されている。加えて、抗CD3e mAbは、すべてのT細胞に結合し、したがって、多数のT細胞を活性化する。これらの抗CD3e mAbによるT細胞のそのような非生理学的な大規模な活性化は、炎症促進性サイトカイン、例えば、IFN-ガンマ、IL-1-ベータ、IL-6、IL-10、およびTNF-アルファの産生をもたらし、サイトカイン放出症候群(CRS)としても知られ神経毒性(NT)とも関係している「サイトカインストーム」を引き起こし得る。したがって、CRSおよび/またはNTを回避するかまたは低減させる抗体を開発することが有利であり得る。
T細胞、例えば、T細胞のサブセットに結合し、例えば、それを活性化するかまたは拡大させる、TCRのベータサブユニットの可変鎖(TCRβV)に指向される抗体分子(「抗TCRβV抗体分子」)が、とりわけ、本明細書に開示される。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβV領域以外の受容体または分子に結合するT細胞エンゲージャー(「非TCRβV結合性T細胞エンゲージャー」)のものとは異なるサイトカインプロファイル、例えば、サイトカイン分泌プロファイルをもたらす。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、サイトカイン放出症候群(CRS)と関連するサイトカイン、例えば、IL-6、IL-1ベータ、IL-10、およびTNFアルファのより少ない産生をもたらすか、最小限の産生をもたらすか、もしくは産生をもたらさず、IL-2およびIFN-ガンマの増強および/もしくは遅延された産生をもたらす。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体は、免疫細胞、例えば、T細胞、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)、NK細胞、または他の免疫細胞(例えば、本明細書に記載される)の拡大をもたらす。また、前記抗TCRβV抗体分子を作製する方法、ならびに免疫細胞または免疫細胞集団を拡大させるために抗TCRβV抗体分子を使用する方法を含む前記抗TCRβV抗体分子を使用する方法、ならびにTILおよび免疫チェックポイント治療薬との組合せ治療としての使用を含むがんを処置するために抗TCRβV抗体分子を使用する方法も、本明細書に開示される。本開示は、前記抗TCRβV抗体分子を含む多特異性分子、例えば、二特異性分子をさらに提供する。一部の実施形態では、本開示の抗TCRβV抗体分子を含む組成物は、例えば、がん免疫療法のために腫瘍細胞溶解を促進させるために、T細胞を活性化し、かつ/またはそれを再指向させるために使用することができる。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子を含む組成物は、CRSおよび/またはNT、例えば、抗CD3e標的化と関連するCRSおよび/またはNTの望ましくない副作用を制限する。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、抗CD3抗体分子(例えば、低親和性抗CD3抗体分子)と比較して、サイトカイン放出症候群(CRS)と関連するサイトカイン、例えば、IL-6、IL-1ベータ、IL-10、およびTNFアルファのより少ない産生をもたらすか、最小限の産生をもたらすか、もしくは産生をもたらさず、IL-2およびIFN-ガンマの増強および/もしくは遅延された産生をもたらす。一部の実施形態では、対象における本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子の投与は、抗CD3抗体分子(例えば、低親和性抗CD3抗体分子)の同様の投与と比較して、サイトカイン放出症候群(CRS)の低減(例えば、CRSの持続期間がより短いこともしくはCRSがないこと)、CRSの重症度の低減(例えば、重度のCRS、例えば、CRSグレード4もしくは5の不在)、神経毒性(NT)の低減、またはNTの重症度の低減をもたらす。
したがって、抗TCRβV抗体分子、抗TCRβV抗体分子を含む多特異性または多機能性分子(例えば、多特異性もしくは多機能性抗体分子)(本明細書において「組成物」とも称される)、それをコードする核酸、前述の分子を産生する方法、前述の分子を含む医薬組成物、および前述の分子を使用して疾患または障害、例えば、がんを処置する方法が本明細書で提供される。本明細書に開示される抗体分子および医薬組成物は、例えば、本明細書に記載される障害および状態、例えば、がんを処置、予防、および/または診断するために(単独で、または他の薬剤もしくは治療モダリティと組み合わせて)使用することができる。
一態様では、本開示は、T細胞受容体ベータ可変(TCRβV)領域に結合する、例えば、特異的に結合する、例えば、非マウスの、例えば、ヒト様の抗体分子(例えば、ヒトまたはヒト化抗体分子)を提供する。
一部の実施形態では、抗TCRBV抗体分子は、表1~2もしくは10~13のうちのいずれかに開示される抗体の抗原結合性ドメイン、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗TCRBV抗体分子は、配列番号3288のアミノ酸配列を含むリーダー配列を含む。一部の実施形態では、抗TCRBV抗体分子は、配列番号3288のアミノ酸配列を含むリーダー配列を含まない。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合は、TCRβV領域以外の受容体または分子に結合するT細胞エンゲージャー(「非TCRβV結合性T細胞エンゲージャー」)のものとは異なるサイトカインプロファイル、例えば、サイトカイン分泌プロファイル(例えば、1つもしくは複数のサイトカインおよび/または1つもしくは複数のケモカインを含む)をもたらす。
一部の実施形態では、サイトカインプロファイル、例えば、サイトカイン分泌プロファイルは、以下:
(i)IL-2のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加、
(ii)IL-1βのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
(iii)IL-6のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
(iv)TNFαのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
(v)IL-10のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
(vi)IL-2のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加における遅延、例えば、少なくとも1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間、もしくはそれ以上の遅延、
(vii)IFN-ガンマのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加における遅延、例えば、少なくとも1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、
7時間、8時間、9時間、10時間の遅延、または
(viii)IL-15のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加、のうちの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、またはすべてを含み、
例えば、(i)~(viii)は、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーのサイトカインプロファイル、例えば、サイトカイン分泌プロファイルと比較したものである。
一部の実施形態では、抗TCRBV抗体のTCRβV領域への結合は、実施例3のアッセイによって測定したときに、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーによって誘導されるサイトカインストームと比較して、サイトカインストームの低減、例えば、サイトカイン放出症候群(CRS)および/または神経毒性(NT)の低減をもたらす。
一部の実施形態では、抗TCRBV抗体のTCRβV領域への結合は、
(ix)T細胞増殖動態の低減、
(x)例えば、実施例4のアッセイによって測定したときに、細胞殺滅、例えば、標的細胞殺滅、例えば、がん細胞殺滅、
(xi)ナチュラルキラー(NK)細胞増殖、例えば、拡大の増加、または
(xii)例えば本明細書に記載される、メモリー様表現型を有するT細胞集団の拡大、例えば、少なくとも約1.1~10倍の拡大(例えば、少なくとも約1.1倍、1.2倍、1.3倍、1.4倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、もしくは10倍の拡大)
のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてをもたらし、
例えば、(ix)~(xii)は、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーと比較したものである。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβVタンパク質上の構造的に保存されたドメイン(例えば、図24Aにおいて丸で囲んだ領域によって示される)を認識する(例えば、それに結合する)。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRVβ抗体は、例えば本明細書に記載される、Fc領域を含む。一部の実施形態では、Fc領域は、野生型Fc領域、例えば、野生型ヒトFc領域である。一部の実施形態では、Fc領域は、バリアント、例えば、例えば、少なくとも1つのFc受容体に対するおよび/またはそれへの結合の親和性の低減をもたらす、Fc領域中の少なくとも1つのアミノ酸残基の付加、置換、または欠失を含むFc領域を含む。一部の実施形態では、親和性の低減は、野生型Fc領域を有するそれ以外は類似の抗体と比較したものである。
一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む抗TCRVβ抗体は、以下の特性:(1)エフェクター機能の低減(例えば、ADCC、ADCPおよび/もしくはCDCの低減)、(2)1つもしくは複数のFc受容体への結合の低減、ならびに/または(3)C1q補体への結合の低減のうちの1つまたは複数を有する。一部の実施形態では、特性(1)~(3)のうちのいずれか1つ、またはすべてにおける低減は、野生型Fc領域を有するそれ以外は類似の抗体と比較したものである。
一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む抗TCRVβ抗体は、ヒトFc受容体、例えば、FcγR I、FcγR IIおよび/またはFcγR IIIに対する低減された親和性を有する。一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む抗TCRVβ抗体は、ヒトIgG1領域またはヒトIgG4領域を含む。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRVβ抗体は、表21に開示される、Fc領域バリアント、例えば、突然変異の任意の1つまたはすべて、または任意の組合
せを含む。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRVβ抗体は、Asn297Ala(N297A)突然変異を含む。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRVβ抗体は、Leu234Ala/Leu235Ala(LALA)突然変異を含む。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβV:TCRアルファ複合体の境界部を認識しない、例えば、それに結合しない。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβVタンパク質の定常領域を認識しない、例えば、それに結合しない。TCRBV領域の定常領域に結合する例示的な抗体は、Viney et al., (Hybridoma. 1992 Dec;11(6):701-13)に記載されるJOVI.1である。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβVタンパク質の相補性決定領域(例えば、CDR1、CDR2、および/またはCDR3)のうちの1つまたは複数(例えば、すべて)を認識しない、例えば、それに結合しない。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合は、以下:
(i)IL-1βのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
(ii)IL-6のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
(iii)TNFαのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
(iv)IL-2のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加、
(v)IL-2のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加における遅延、例えば、少なくとも1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間、もしくはそれ以上の遅延、
(vi)IFN-ガンマのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加における遅延、例えば、少なくとも1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間の遅延、
(vii)T細胞増殖動態の低減、
(viii)例えば、実施例3のアッセイによって測定したときに、サイトカインストーム、例えば、サイトカイン放出症候群(CRS)および/もしくは神経毒性(NT)の低減、
(ix)例えば、実施例4のアッセイによって測定したときに、細胞殺滅、例えば、標的細胞殺滅、例えば、がん細胞殺滅、
(x)IL-15のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加、または(xi)ナチュラルキラー(NK)細胞増殖、例えば、拡大の増加
のうちの1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、またはそれ以上(例えば、すべて)をもたらす。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子により生じる(i)~(xi)のうちのいずれか1つもしくはすべてまたはそれらの任意の組合せは、CD3分子、例えば、CD3イプシロン(CD3e)分子、またはTCRアルファ(TCRα)分子に結合する抗体と比較される。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合は、パーフォリンおよび/またはグランザイムBの分泌、例えば、産生をもたらす。
ある態様では、本開示は、T細胞受容体ベータ可変鎖(TCRβV)領域に結合する、例えば、特異的に結合する抗体分子であって、抗TCRβV抗体分子は、
(a)軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)配列番号10もしくは配列番号11の(例えば、3つの)軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、および軽鎖相補性決定領
域3(LC CDR3)のうちの1つ、2つ、もしくはすべて、ならびに
(ii)(例えば、4つの)非マウス生殖系列フレームワーク1(FR1)、非マウス生殖系列フレームワーク領域2(FR2)、非マウス生殖系列フレームワーク領域3(FR3)、および非マウス生殖系列フレームワーク領域4(FR4)のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべてと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む、軽鎖可変領域(VL)、ならびに/または
(b)重鎖可変領域(VH)であって、
(i)配列番号9の(例えば、3つの)重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、および重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)のうちの1つ、2つ、もしくはすべて、ならびに
(ii)(例えば、4つの)非マウス生殖系列フレームワーク1(FR1)、非マウス生殖系列フレームワーク領域2(FR2)、非マウス生殖系列フレームワーク領域3(FR3)、および非マウス生殖系列フレームワーク領域4(FR4)のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべてと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む、重鎖可変領域(VH)
を含む抗原結合性ドメインを含む、抗体分子を提供する。
一部の実施形態では、VLは、配列番号230または3289のコンセンサス配列を有する配列を含む。
一部の実施形態では、VHは、配列番号231または3290のコンセンサス配列を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V6、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、もしくはTCRβ
V6-1*01のうちの1つもしくは複数、またはそのバリアントに結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)配列番号1もしくは配列番号9、または表1に列挙されるアミノ酸配列のHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3、または
(ii)配列番号2、配列番号10、もしくは配列番号11、または表1に列挙されるアミノ酸配列のLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3
を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、配列番号2、配列番号10、もしくは配列番号11、または表1に列挙されるアミノ酸配列のLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3のうちの1つ、2つ、またはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、配列番号1もしくは配列番号9、または表1に列挙されるアミノ酸配列のHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3のうちの1つ、2つ、もしくはすべて(例えば、3つ)を含む重鎖可変領域(VH)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)配列番号6のLC CDR1アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、配列番号7のLC CDR2アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、および/または配列
番号8のLC CDR3アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)を含むVL、ならびに/または
(ii)配列番号3のHC CDR1アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、配列番号4のHC CDR2アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、および/または配列番号5のHC CDR3アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)を含むVH
を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
表1に列挙されるアミノ酸配列、例えば、配列番号9、または表1に列挙されるアミノ酸配列、例えば、配列番号9もしくは配列番号1312に対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列の可変重鎖(VH)、および/または
表1に列挙されるアミノ酸配列、例えば、配列番号10もしくは配列番号11、または表1に列挙されるアミノ酸配列、例えば、配列番号10もしくは配列番号11もしくは配列番号1314に対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列の可変軽鎖(VL)
を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)配列番号9もしくは配列番号1312のVHアミノ酸配列、
(ii)配列番号9もしくは配列番号1312のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列、
(iii)配列番号10もしくは配列番号1314のVLアミノ酸配列、および/または(iv)配列番号10もしくは配列番号1314のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列
を含む抗原結合性ドメインを含む。
ある態様では、T細胞受容体ベータ可変鎖(TCRβV)領域に結合する、例えば、特異的に結合する抗体分子であって、抗TCRβV抗体分子は、
(a)軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)表2のヒト化B-H軽鎖(LC)の(例えば、3つの)軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、および軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)のうちの1つ、2つ、もしくはすべて、ならびに
(ii)表2のヒト化B-H LCのフレームワーク領域1(FR1)、フレームワーク領域2(FR2)、フレームワーク領域3(FR3)、およびフレームワーク領域4(FR4)のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて(例えば、4つ)と少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む、軽鎖可変領域(VL)、ならびに/または
(b)重鎖可変領域(VH)であって、
(i)表2のヒト化B-H重鎖(HC)の(例えば、3つの)重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、および重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)のうちの1つ、2つ、もしくはすべて、ならびに
(ii)表2のヒト化B-H HCのフレームワーク領域1(FR1)、フレームワーク領域2(FR2)、フレームワーク領域3(FR3)、およびフレームワーク領域4(FR4)のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて(例えば、4つ)と少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む、重鎖可変領域(VH)
を含む抗原結合性ドメインを含む、抗体分子が本明細書で提供される。
一部の実施形態では、抗TCRBVは、TCRβ V12、例えば、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01、もしくはTCRβ V12-5*01、またはそのバリアントに結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)表2に列挙される抗体BのHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3、または
(ii)表2に列挙される抗体BのLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3
を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表2に列挙されるヒト化B-H抗体のLC CDR1、LC CDR2およびLC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表2に列挙されるヒト化B-H抗体のHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3のうちの1つ、2つ、もしくはすべて(例えば、3つ)を含む重鎖可変領域(VH)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表2に列挙されるヒト化B-H抗体のLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3のうちの1つ、2つ、またはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
表2に列挙されるヒト化B-H抗体のVH配列、または表2に列挙されるヒト化B-H抗体のVHに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列、および/または
表2に列挙されるヒト化B-H抗体のVL配列、もしくは表2に列挙されるヒト化B-H抗体のVLに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表2のヒト化B-H LCのFR1、FR2、FR3、およびFR4のうちの1つと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表2のヒト化B-H LCのFR1、FR2、FR3、およびFR4のうちのいずれか2つと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表2のヒト化B-H LCのFR1、FR2、FR3、およびFR4のうちのいずれか3つと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表2のヒト化B-H LCのFR1、FR2、FR3、およびFR4のうちのすべてと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表2のヒト化B-H HCのFR1、FR2、FR3、およびFR4のうちの1つと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表2のヒト化B-H HCのFR1、FR2、FR3、およびFR4のうちのいずれか2つと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表2のヒト化B-H HCのFR1、FR2、FR3、およびFR4のうちのいずれか3つと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表2のヒト化B-H HCのFR1、FR2、FR3、およびFR4のうちのすべてと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)表10に列挙される抗体CのHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3、または
(ii)表10に列挙される抗体CのLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3
を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表10に列挙される抗体Cまたはヒト化C-H抗体のHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む重鎖可変領域(VH)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表10に列挙される抗体Cまたはヒト化C-H抗体のLC CDR1、LC CDR2およびLC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
表10に列挙されるヒト化C-H抗体のVH配列、もしくは表10に列挙されるヒト化C-H抗体のVHに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列、および/または
表10に列挙されるヒト化C-H抗体のVL配列、もしくは表10に列挙されるヒト化C-H抗体のVLに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)表11に列挙される抗体EのHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3、または
(ii)表11に列挙される抗体EのLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3
を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表11に列挙される抗体Eまたはヒト
化E-H抗体のHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む重鎖可変領域(VH)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表11に列挙される抗体Eまたはヒト化E-H抗体のLC CDR1、LC CDR2およびLC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
表11に列挙されるヒト化E-H抗体のVH配列、もしくは表11に列挙されるヒト化E-H抗体のVHに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列、および/または
表11に列挙されるヒト化E-H抗体のVL配列、もしくは表11に列挙されるヒト化E-H抗体のVLに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)表12に列挙される抗体DのHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3、または
(ii)表12に列挙される抗体DのLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3
を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表12に列挙される抗体Dまたはヒト化D-H抗体のHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む重鎖可変領域(VH)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表12に列挙される抗体Dまたはヒト化D-H抗体のLC CDR1、LC CDR2およびLC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
表12に列挙されるヒト化D-H抗体のVH配列、もしくは表12に列挙されるヒト化D-H抗体のVHに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列、および/または
表12に列挙されるヒト化D-H抗体のVL配列、もしくは表12に列挙されるヒト化D-H抗体のVLに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)表13に列挙される抗体GのHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3、または
(ii)表13に列挙される抗体GのLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3
を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表13に列挙される抗体Gまたはヒト化G-H抗体のHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む重鎖可変領域(VH)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表13に列挙される抗体Gまたはヒト化G-H抗体のLC CDR1、LC CDR2およびLC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
表13に列挙されるヒト化G-H抗体のVH配列、もしくは表13に列挙されるヒト化G-H抗体のVHに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列、および/または
表13に列挙されるヒト化G-H抗体のVL配列、もしくは表13に列挙されるヒト化G-H抗体のVLに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)表13に列挙される抗体HのHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3、または
(ii)表13に列挙される抗体HのLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3
を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表13に列挙される抗体Hまたはヒト化H-H抗体のHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む重鎖可変領域(VH)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表13に列挙される抗体Hまたはヒト化H-H抗体のLC CDR1、LC CDR2およびLC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
表13に列挙されるヒト化H-H抗体のVH配列、もしくは表13に列挙されるヒト化H-H抗体のVHに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列、および/または
表13に列挙されるヒト化H-H抗体のVL配列、もしくは表13に列挙されるヒト化H-H抗体のVLに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)表13に列挙される抗体IのHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3、または
(ii)表13に列挙される抗体IのLC CDR1、LC CDR2、およびLC C
DR3
を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表13に列挙される抗体Iまたはヒト化I-H抗体のHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む重鎖可変領域(VH)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表13に列挙される抗体Iまたはヒト化I-H抗体のLC CDR1、LC CDR2およびLC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
表13に列挙されるヒト化I-H抗体のVH配列、もしくは表13に列挙されるヒト化I-H抗体のVHに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列、および/または
表13に列挙されるヒト化I-H抗体のVL配列、もしくは表13に列挙されるヒト化I-H抗体のVLに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)表13に列挙される抗体JのHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3、または
(ii)表13に列挙される抗体JのLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3
を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表13に列挙される抗体Jまたはヒト化J-H抗体のHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む重鎖可変領域(VH)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表13に列挙される抗体Jまたはヒト化J-H抗体のLC CDR1、LC CDR2およびLC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
表13に列挙されるヒト化J-H抗体のVH配列、もしくは表13に列挙されるヒト化J-H抗体のVHに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列、および/または
表13に列挙されるヒト化J-H抗体のVL配列、もしくは表13に列挙されるヒト化J-H抗体のVLに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)表13に列挙される抗体KのHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR
3、または
(ii)表13に列挙される抗体KのLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3
を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表13に列挙される抗体Kまたはヒト化K-H抗体のHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む重鎖可変領域(VH)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表13に列挙される抗体Kまたはヒト化K-H抗体のLC CDR1、LC CDR2およびLC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
表13に列挙されるヒト化G-H抗体のVH配列、もしくは表13に列挙されるヒト化K-H抗体のVHに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列、および/または
表13に列挙されるヒト化G-H抗体のVL配列、もしくは表13に列挙されるヒト化K-H抗体のVLに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)表13に列挙される抗体LのHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3、または
(ii)表13に列挙される抗体LのLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3
を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表13に列挙される抗体Lまたはヒト化L-H抗体のHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む重鎖可変領域(VH)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表13に列挙される抗体Lまたはヒト化L-H抗体のLC CDR1、LC CDR2およびLC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
表13に列挙されるヒト化L-H抗体のVH配列、もしくは表13に列挙されるヒト化L-H抗体のVHに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列、および/または
表13に列挙されるヒト化L-H抗体のVL配列、もしくは表13に列挙されるヒト化L-H抗体のVLに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)表13に列挙される抗体MのHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3、または
(ii)表13に列挙される抗体MのLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3
を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表13に列挙される抗体Mまたはヒト化M-H抗体のHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む重鎖可変領域(VH)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表13に列挙される抗体Mまたはヒト化M-H抗体のLC CDR1、LC CDR2およびLC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
表13に列挙されるヒト化M-H抗体のVH配列、もしくは表13に列挙されるヒト化M-H抗体のVHに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列、および/または
表13に列挙されるヒト化M-H抗体のVL配列、もしくは表13に列挙されるヒト化M-H抗体のVLに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)表13に列挙される抗体NのHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3、または
(ii)表13に列挙される抗体NのLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3
を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表13に列挙される抗体Nまたはヒト化N-H抗体のHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む重鎖可変領域(VH)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表13に列挙される抗体Nまたはヒト化N-H抗体のLC CDR1、LC CDR2およびLC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
表13に列挙されるヒト化N-H抗体のVH配列、もしくは表13に列挙されるヒト化N-H抗体のVHに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列、および/または
表13に列挙されるヒト化N-H抗体のVL配列、もしくは表13に列挙されるヒト化N-H抗体のVLに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)表13に列挙される抗体OのHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3、または
(ii)表13に列挙される抗体OのLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3
を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表13に列挙される抗体Oまたはヒト化O-H抗体のHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む重鎖可変領域(VH)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、表13に列挙される抗体Oまたはヒト化O-H抗体のLC CDR1、LC CDR2およびLC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗原結合性ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
表13に列挙されるヒト化O-H抗体のVH配列、もしくは表13に列挙されるヒト化O-H抗体のVHに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列、および/または
表13に列挙されるヒト化O-H抗体のVL配列、もしくは表13に列挙されるヒト化O-H抗体のVLに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列
を含む。
別の態様では、本開示は、T細胞受容体ベータ可変(TCRβV)領域に結合する、例えば、特異的に結合する、非マウスの、例えば、ヒト様の抗体分子(例えば、ヒトまたはヒト化抗体分子)を提供する。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子の結合は、T細胞集団、例えば、メモリー様表現型を有するT細胞、例えば、CD45RA+ CCR7- T細胞集団の拡大、例えば、少なくとも約1.1~50倍の拡大(例えば、少なくとも約1.5~40倍、2~35倍、3~30倍、5~25倍、8~20倍、または10~15倍の拡大)をもたらす。一部の実施形態では、メモリー様表現型を有するT細胞集団は、CD4+および/またはCD8+ T細胞を含む。一部の実施形態では、メモリー様表現型を有するT細胞集団は、メモリーT細胞、例えば、Tエフェクターメモリー(TEM)細胞、例えば、CD45RAを発現するTEM細胞(TEMRA)細胞、例えば、CD4+またはCD8+ TEMRA細胞集団を含む。一部の実施形態では、メモリー様表現型を有するT細胞集団は、老化マーカー、例えば、CD57を発現しない。一部の実施形態では、メモリー様表現型を有するT細胞集団は、阻害受容体、例えば、OX40、4-1BB、および/またはICOSを発現しない。
一部の実施形態では、メモリー様表現型を有するT細胞集団は、CD45RA+ CCR7- CD57-を有するT細胞集団である。一部の実施形態では、メモリー様表現型を有するT細胞集団は、阻害受容体、例えば、OX40、4-1BB、および/またはICOSを発現しない。
一部の実施形態では、例えば本明細書に記載される、メモリー様表現型を有するT細胞集団は、例えば、参照細胞集団、例えば、抗TCRβV抗体と接触させていないそれ以外
は類似の細胞集団と比較して、増加した増殖能力を有する。
一部の実施形態では、拡大は、少なくとも約1.1~10倍の拡大(例えば、少なくとも約1.1倍、1.2倍、1.3倍、1.4倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、または10倍の拡大)である。
一部の実施形態では、メモリー様表現型を有するT細胞、例えば、メモリーエフェクターT細胞、例えば、TEM細胞、例えば、TEMRA細胞、例えば、CD4+またはCD8+ TEMRA細胞集団の拡大は、CD3分子、例えば、CD3イプシロン(CD3e)分子、またはTCRアルファ(TCRα)分子に結合する抗体を用いた類似の細胞集団の拡大と比較される。
一部の実施形態では、メモリー様表現型を有する拡大させたT細胞、例えば、Tエフェクターメモリー細胞集団は、T細胞、例えば、CD3+、CD8+またはCD4+ T細胞を含む。一部の実施形態では、メモリー様表現型を有する拡大させたT細胞、Tエフェクターメモリー細胞集団は、CD3+およびCD8+ T細胞を含む。一部の実施形態では、メモリー様表現型を有する拡大させたT細胞、例えば、Tエフェクターメモリー細胞集団は、CD3+およびCD4+ T細胞を含む。
一部の実施形態では、メモリー様表現型を有する拡大させたT細胞、Tエフェクターメモリー(TEM)細胞集団は、CD45RAを発現または再発現する、例えば、CD45RA+の、T細胞、例えば、CD3+、CD8+またはCD4+ T細胞を含む。一部の実施形態では、集団は、CD45RAを発現するTEM細胞、例えば、TEMRA細胞を含む。一部の実施形態では、TEMRA細胞、例えば、CD4+またはCD8+ TEMRA細胞上のCD45RAの発現は、本明細書に開示される方法、例えば、フローサイトメトリーによって検出することができる。
一部の実施形態では、メモリー様表現型を有するT細胞、例えば、TEMRA細胞集団は、CCR7の発現が低いまたはそれを発現しない、例えば、CCR7-またはCCR7
lowである。一部の実施形態では、TEMRA細胞上のCCR7の発現は、本明細書に開示される方法、例えば、フローサイトメトリーによって検出することができない。
一部の実施形態では、メモリー様表現型を有するT細胞、例えば、TEMRA細胞集団は、CD95を発現する、例えば、CD95+である。一部の実施形態では、TEMRA細胞上のCD95の発現は、本明細書に開示される方法、例えば、フローサイトメトリーによって検出され得る。
一部の実施形態では、メモリー様表現型を有するT細胞、例えば、TEMRA細胞集団は、CD45RAを発現する、例えば、CD45RA+であり、CCR7の発現が低いまたはそれを発現しない、例えば、CCR7-またはCCR7 lowであり、かつCD95を発現する、例えば、CD95+である。一部の実施形態では、メモリー様表現型を有するT細胞、例えば、TEMRA細胞集団は、CD45RA+、CCR7-およびCD95+細胞として同定され得る。一部の実施形態では、メモリー様表現型を有するT細胞、例えば、TEMRA細胞集団は、CD3+、CD4+またはCD8+ T細胞(例えば、CD3+ T細胞、CD3+ CD8+ T細胞、またはCD3+ CD4+ T細胞)を含む。
一部の実施形態では、メモリー様表現型を有するT細胞集団は、老化マーカー、例えば、CD57を発現しない。
一部の実施形態では、メモリー様表現型を有するT細胞集団は、阻害受容体、例えば、
OX40、4-1BB、および/またはICOSを発現しない。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子の結合は、T細胞の部分集団の拡大、例えば、少なくとも約1.1~50倍の拡大(例えば、少なくとも約1.5~40倍、2~35倍、3~30倍、5~25倍、8~20倍、または10~15倍の拡大)をもたらす。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子により活性化された(例えば、拡大された)T細胞の部分集団は、CD45RAの高い発現および/またはCCR7の低い発現という点で、TEMRA細胞に近似している。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子により活性化された(例えば、拡大された)T細胞の部分集団は、老化マーカーCD57および/またはKLRG1の上方制御を示さない。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子により活性化された(例えば、拡大された)T細胞の部分集団は、共刺激分子CD27および/またはCD28の上方制御を示さない。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子により活性化された(例えば、拡大された)T細胞の部分集団は、高度に増殖性である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子により活性化された(例えば、拡大された)T細胞の部分集団は、IL-2を分泌する。一部の実施形態では、T細胞上の表面マーカーの発現は、本明細書に開示される方法、例えば、フローサイトメトリーによって検出することができる。一部の実施形態では、T細胞の増殖能力は、本明細書に開示される方法、例えば、実施例4に記載される方法によって検出することができる。一部の実施形態では、T細胞のサイトカイン発現は、本明細書に開示される方法、例えば、実施例10および21に記載される方法によって検出することができる。一部の実施形態では、拡大は、少なくとも約1.1~10倍の拡大(例えば、少なくとも約1.1倍、1.2倍、1.3倍、1.4倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、または10倍の拡大)である。一部の実施形態では、拡大は、CD3分子、例えば、CD3イプシロン(CD3e)分子、またはTCRアルファ(TCRα)分子に結合する抗体を用いた類似の細胞集団の拡大と比較される。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合は、CD3分子、例えば、CD3イプシロン(CD3e)分子、またはTCRアルファ(TCRα)分子に結合する抗体と比較して、以下:
(i)IL-1βのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
(ii)IL-6のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
(iii)TNFαのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
(iv)IL-2のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加、
(v)IL-2のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加における遅延、例えば、少なくとも1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間、もしくはそれ以上の遅延、
(vi)IFNgのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加における遅延、例えば、少なくとも1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間の遅延、
(vii)T細胞増殖動態の低減、
(viii)例えば、実施例3のアッセイによって測定したときに、サイトカインストーム、例えば、サイトカイン放出症候群(CRS)および/もしくは神経毒性(NT)の低減、
(ix)例えば、実施例4のアッセイによって測定したときに、細胞殺滅、例えば、標的細胞殺滅、例えば、がん細胞殺滅、
(x)IL-15のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加、または(xi)ナチュラルキラー(NK)細胞増殖、例えば、拡大の増加
のうちの1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、またはそれ以上(例えば、すべて)をもたらす。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合は、実施例3のアッセイによって測定したときに、IL-1βの発現レベルおよび/または活性の、2分の1以下、5分の1以下、10分の1以下、20分の1以下、50分の1以下、100分の1以下、もしくは200分の1以下、または少なくとも2~200分の1以下(例えば、5~150分の1以下、10~100分の1以下、20~50分の1以下)への低減をもたらす。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合は、実施例3のアッセイによって測定したときに、IL-6の発現レベルおよび/または活性の、2分の1以下、5分の1以下、10分の1以下、20分の1以下、50分の1以下、100分の1以下、200分の1以下、300分の1以下、400分の1以下、500分の1以下、600分の1以下、700分の1以下、800分の1以下、900分の1以下、もしくは1000分の1以下、または少なくとも2~1000分の1以下(例えば、5~900分の1以下、10~800分の1以下、20~700分の1以下、50~600分の1以下、100~500分の1以下、もしくは200~400分の1以下)への低減をもたらす。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合は、実施例3のアッセイによって測定したときに、TNFαの発現レベルおよび/または活性の、2分の1以下、5分の1以下、10分の1以下、20分の1以下、50分の1以下、100分の1以下、200分の1以下、300分の1以下、400分の1以下、500分の1以下、600分の1以下、700分の1以下、800分の1以下、900分の1以下、1000分の1以下、もしくは2000分の1以下、または少なくとも2~2000分の1以下(例えば、5~1000分の1以下、10~900分の1以下、20~800分の1以下、50~700分の1以下、100~600分の1以下、200~500分の1以下、もしくは300~400分の1以下)への低減をもたらす。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合は、実施例3のアッセイによって測定したときに、IL-2の発現レベルおよび/または活性の、少なくとも2倍、5倍、10倍、20倍、50倍、100倍、200倍、300倍、400倍、500倍、600倍、700倍、800倍、900倍、1000倍、もしくは2000倍、または少なくとも2~2000倍(例えば、5~1000倍、10~900倍、20~800倍、50~700倍、100~600倍、200~500倍、もしくは300~400倍)の増加をもたらす。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合は、実施例4のアッセイによって測定したときに、IL-15の発現レベルおよび/または活性の、少なくとも2倍、5倍、10倍、20倍、50倍、100倍、200倍、300倍、400倍、500倍、600倍、700倍、800倍、900倍、1000倍、もしくは2000倍、または少なくとも2~2000倍(例えば、5~1000倍、10~900倍、20~800倍、50~700倍、100~600倍、200~500倍、もしくは300~400倍)の増加をもたらす。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子の結合は、ナチュラルキラー(NK)細胞集団の増殖、例えば、拡大、例えば、少なくとも約1.1~50倍の拡大(例えば、少なくとも約1.5~40倍、2~35倍、3~30倍、5~25倍、8~20倍、または10~15倍の拡大)をもたらす。一部の実施形態では、NK細胞の拡大は、少なくとも約1.1~30倍の拡大(例えば、少なくとも約1.1倍、1.2倍、1.3倍、1.4倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、
6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、15倍、20倍、25倍、または少なくとも約1.1~5倍、5~10倍、10~15倍、15~20倍、20~25倍、もしくは25~30倍の拡大)である。一部の実施形態では、NK細胞の拡大は、実施例4のアッセイによって測定される。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子による、例えば、その結合による、NK細胞の拡大は、抗TCRβV抗体分子と接触していないそれ以外は類似の集団の拡大と比較される。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子の結合は、細胞殺滅、例えば、標的細胞殺滅、例えば、がん細胞殺滅をもたらす。一部の実施形態では、がん細胞は、血液がん細胞または固形腫瘍細胞である。一部の実施形態では、がん細胞は、多発性骨髄腫細胞である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子の結合は、in vitroまたはin vivoにおいて細胞殺滅をもたらす。一部の実施形態では、細胞殺滅は、実施例4のアッセイによって測定される。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合は、米国特許第5,861,155号に記載される、16G8もしくはTM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの活性と比較して、本明細書に記載される活性のうちのいずれかの、少なくとも2倍、5倍、10倍、20倍、50倍、100倍、200倍、300倍、400倍、500倍、600倍、700倍、800倍、900倍、1000倍、もしくは2000倍、または少なくとも2~2000倍(例えば、5~1000倍、10~900倍、20~800倍、50~700倍、100~600倍、200~500倍、もしくは300~400倍)の増加、あるいは2分の1以下、5分の1以下、10分の1以下、20分の1以下、50分の1以下、100分の1以下、200分の1以下、300分の1以下、400分の1以下、500分の1以下、600分の1以下、700分の1以下、800分の1以下、900分の1以下、1000分の1以下、もしくは2000分の1以下、または2~2000分の1以下(例えば、5~1000分の1以下、10~900分の1以下、20~800分の1以下、50~700分の1以下、100~600分の1以下、200~500分の1以下、もしくは300~400分の1以下)への減少をもたらす。
ある態様では、T細胞受容体ベータ可変鎖(TCRβV)領域に結合する、例えば、特異的に結合する、抗体分子(抗TCRβV抗体分子)であって、
(i)TCRβV上のエピトープ、例えば、本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、例えば、第2の抗TCRβV抗体分子によって認識されるエピトープと同じかもしくは類似のエピトープに特異的に結合するか、
(ii)本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、例えば、第2の抗TCRβV抗体分子と同じかもしくは類似の結合親和性もしくは特異性またはその両方を示すか、
(iii)本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、例えば、第2の抗TCRβV抗体分子の結合を阻害する、例えば、競合的に阻害するか、
(iv)本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、例えば、第2の抗TCRβV抗体分子と同じかもしくはオーバーラップするエピトープに結合するか、または
(v)本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、例えば、第2の抗TCRβV抗体分子と、結合について競合し、かつ/もしくは同じエピトープに結合する、
抗体分子が本明細書で提供される。
一部の実施形態では、第2の抗TCRβV抗体分子は、表1もしくは表2から選択される抗原結合性ドメイン、またはそれに対して実質的に同一の配列を含む。一部の実施形態では、第2の抗TCRβV抗体分子は、
配列番号1もしくは配列番号9の重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、および/もしくは重鎖相補性決定領域3(HC CDR
3)、ならびに/または配列番号2、配列番号10、もしくは配列番号11の軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、および/もしくは軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)
を含む抗原結合性ドメインを含む。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合は、米国特許第5,861,155号に記載される16G8もしくはTM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの活性と比較して、(i)~(v)のうちのいずれか(例えば、1つ、2つ、3つ、4つ、またはすべて)の、異なる変化、例えば、少なくとも2倍、5倍、10倍、20倍、50倍、100倍の増加、または2分の1以下、5分の1以下、10分の1以下、20分の1以下、100分の1以下への減少をもたらす。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRBVファミリー(例えば、遺伝子ファミリー)、例えば、例として本明細書に記載されるサブファミリーを含むTCRBV遺伝子ファミリーに結合する。一部の実施形態では、TCRBVファミリー、例えば、遺伝子ファミリーは、TCRβ V6サブファミリー、TCRβ V10サブファミリー、TCRβ V12サブファミリー、TCRβ V5サブファミリー、TCRβ V7サブファミリー、TCRβ V11サブファミリー、TCRβ V14サブファミリー、TCRβ V16サブファミリー、TCRβ V18サブファミリー、TCRβ V9サブファミリー、TCRβ V13サブファミリー、TCRβ V4サブファミリー、TCRβ V3サブファミリー、TCRβ V2サブファミリー、TCRβ V15 v、TCRβ V30サブファミリー、TCRβ
V19サブファミリー、TCRβ V27サブファミリー、TCRβ V28サブファミリー、TCRβ V24サブファミリー、TCRβ V20サブファミリー、TCRβ
V25サブファミリー、TCRβ V29サブファミリー、TCRβ V23サブファミリー、TCRβ V21サブファミリー、TCRβ V1サブファミリー、TCRβ V17サブファミリー、またはTCRβ V26サブファミリーを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、またはTCRβ V6-1*01から選択されるTCRβ V6サブファミリーに結合する。一部の実施形態では、TCRβ V6サブファミリーは、TCRβ V6-5*01を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、TCRβ V10-1*01、TCRβ V10-1*02、TCRβ V10-3*01、またはTCRβ V10-2*01から選択されるTCRβ V10サブファミリーに結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01、またはTCRβ V12-5*01から選択されるTCRβ V12サブファミリーに結合する。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V12に結合しないか、あるいは米国特許第5,861,155号に記載される16G8マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性よりも低い(例えば、約10%未満、20%未満、30%未満、40%未満、50%未満、60%未満、70%未満、80%未満、90%未満、または約2分の1未満、5分の1未満、もしくは10分の1未満)の親和性および/または結合特異性で、TCR
β V12に結合する。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載される16G8マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性を上回る(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、または約2倍、5倍、もしくは10倍上回る)親和性および/または結合特異性で、TCRβ V12に結合する。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載される16G8マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性を上回る(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、または約2倍、5倍、もしくは10倍上回る)親和性および/または結合特異性で、TCRβ V12以外のTCRβV領域(例えば、本明細書に記載されるTCRβV領域、例えば、TCRβ V6サブファミリー(例えば、TCRβ V6-5*01)に結合する。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、抗体Bの少なくとも1つのCDRを含まない。本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、抗体BのCDRを含まない。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、TCRβ V5-5*01、TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、TCRβ V5-8*01、TCRβ V5-1*01から選択されるTCRβ V5サブファミリーに結合する。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、TCRβ V5-5*01、TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、TCRβ V5-8*01、TCRβ V5-1*01から選択されるTCRβ V5サブファミリーに結合する。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V5-5*01にもTCRβ V5-1*01にも結合しないか、あるいは米国特許第5,861,155号に記載されるTM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性よりも低い(例えば、約10%未満、20%未満、30%未満、40%未満、50%未満、60%未満、70%未満、80%未満、90%未満、または約2分の1未満、5分の1未満、もしくは10分の1未満の)親和性および/または結合特異性で、TCRβ V5-5*01またはTCRβ V5-1*01に結合する。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載されるTM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性を上回る(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、または約2倍、5倍、もしくは10倍上回る)親和性および/または結合特異性で、TCRβ V5-5*01またはTCRβ V5-1*01に結合する。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載されるTM23マウス抗体またはその
ヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性を上回る(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、または約2倍、5倍、もしくは10倍上回る)親和性および/または結合特異性で、TCRβ V5-5*01またはTCRβ V5-1*01以外のTCRβV領域(例えば、本明細書に記載されるTCRβV領域、例えば、TCRβ V6サブファミリー(例えば、TCRβ V6-5*01)に結合する。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TM23マウス抗体の少なくとも1つのCDRを含まない。本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TM23マウス抗体のCDRを含まない。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、例えば、J Exp Med. 1989 Jan 1; 169(1): 73-86に開示される、マウス抗ラットTCR抗体R73の配列を含まず、これは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性抗体分子は、例えば、J Immunol. 1993 Mar 15;150(6):2305-15に開示される、マウス抗ラットTCR抗体R73の配列を含まず、これは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、例えば、Oncoimmunology. 2016;
5(1): e1052930に開示される、ウイルスペプチド-MHC複合体を含まず、これは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性抗体分子は、例えば、Oncoimmunology. 2016; 5(1): e1052930に開示される、ウイルスペプチド-MHC複合体を含まず、これは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、以下のTCRβVサブファミリー:
(i)例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、もしくはTCRβ V6-1*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ
V6サブファミリー、
(ii)例えば、TCRβ V10-1*01、TCRβ V10-1*02、TCRβ
V10-3*01、もしくはTCRβ V10-2*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V10サブファミリー、
(iii)例えば、TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、もしくはTCRβ V5-8*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V5サブファミリー、
(iv)例えば、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01、もしくはTCRβ V12-5*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V12サブファミリー、
(v)例えば、TCRβ V7-7*01、TCRβ V7-6*01、TCRβ V7
-8*02、TCRβ V7 -4*01、TCRβ V7-2*02、TCRβ V7-2*03、TCRβ V7-2*01、TCRβ V7-3*01、TCRβ V7-9*03、もしくはTCRβ V7-9*01のうちの1つもしくは複数を含む、TC
Rβ V7サブファミリー、
(vi)例えば、TCRβ V11-1*01、TCRβ V11-2*01、もしくはTCRβ V11-3*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V11サブファミリー、
(vii)TCRβ V14*01を含む、TCRβ V14サブファミリー、
(viii)TCRβ V16*01を含む、TCRβ V16サブファミリー、
(ix)TCRβ V18*01を含む、TCRβ V18サブファミリー、
(x)例えば、TCRβ V9*01もしくはTCRβ V9*02のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V9サブファミリー、
(xi)TCRβ V13*01を含む、TCRβ V13サブファミリー、
(xii)例えば、TCRβ V4-2*01、TCRβ V4-3*01、もしくはTCRβ V4-1*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V4サブファミリー、
(xiii)TCRβ V3-1*01を含む、TCRβ V3サブファミリー、
(xiv)TCRβ V2*01を含む、TCRβ V2サブファミリー、
(xv)TCRβ V15*01を含む、TCRβ V15サブファミリー、
(xvi)例えば、TCRβ V30*01もしくはTCRβ V30*02のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V30サブファミリー、
(xvii)例えば、TCRβ V19*01もしくはTCRβ V19*02のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V19サブファミリー、
(xviii)TCRβ V27*01を含む、TCRβ V27サブファミリー、
(xix)TCRβ V28*01を含む、TCRβ V28サブファミリー、
(xx)TCRβ V24-1*01を含む、TCRβ V24サブファミリー、
(xxi)例えば、TCRβ V20-1*01もしくはTCRβ V20-1*02のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V20サブファミリー、
(xxii)TCRβ V25-1*01を含む、TCRβ V25サブファミリー、または
(xxiii)TCRβ V29-1*01を含む、TCRβ V29サブファミリー、(xxiv)TCRβ V21サブファミリー、
(xxv)TCRβ V1サブファミリー、
(xxvi)TCRβ V17サブファミリー、
(xvii)TCRβ V23サブファミリー、または
(xviii)TCRβ V26サブファミリー
のうちの1つまたは複数(例えば、すべて)に結合する。
本明細書に開示される組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、以下のTCRβVサブファミリー:
(i)TCRβ V6、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、もしくはTCRβ V6-1*01のうちの1つもしくは複数、
(ii)TCRβ V10、例えば、TCRβ V10-1*01、TCRβ V10-1*02、TCRβ V10-3*01、もしくはTCRβ V10-2*01のうちの1つもしくは複数、
(iii)TCRβ V12、例えば、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01、もしくはTCRβ V12-5*01のうちの1つもしくは複数、または
(iv)TCRβ V5、例えば、TCRβ V5-5*01、TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、TCRβ V5-8*01、TCRβ V5-1*01のうちの1つもしくは複数
のうちの1つまたは複数(例えば、すべて)に結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V6、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、またはTCRβ V6-1*01のうちの1つもしくは複数に結合する。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V6-5*01に結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V12に結合しない。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V5-5*01にもTCRβ V5-1*01にも結合しない。
ある態様では、T細胞受容体ベータ可変領域(TCRβV)に結合する(例えば、特異的に結合する)抗体分子(「抗TCRβV抗体分子」)を含む第1の部分(例えば、第1の免疫細胞エンゲージャー)を含む、多特異性分子(例えば、二特異性分子)が本明細書で提供される。
一部の実施形態では、多特異性分子は、腫瘍標的化部分、サイトカイン分子、間質改変部分、または第1の部分以外の抗TCRβV抗体分子のうちの1つまたは複数を含む、第2の部分を含む。
一部の実施形態では、第1の部分のTCRβV領域への結合は、TCRβV領域以外の受容体または分子に結合するT細胞エンゲージャー(「非TCRβV結合性T細胞エンゲージャー」)のものとは異なるサイトカインプロファイル、例えば、サイトカイン分泌プロファイルをもたらす。
別の態様では、本開示は、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子を含む、多特異性分子、例えば、二特異性分子を提供する。
一部の実施形態では、多特異性分子は、腫瘍標的化部分、サイトカイン分子、免疫細胞エンゲージャー、例えば、第2の免疫細胞エンゲージャー、および/または間質改変部分をさらに含む。
なおも別の態様では、
(i)本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子を含む、第1の免疫細胞エンゲージャーを含む、第1の部分、ならびに
(ii)腫瘍標的化部分、第2の免疫細胞エンゲージャー、サイトカイン分子、または間質改変部分のうちの1つまたは複数を含む、第2の部分
を含む、多特異性分子、例えば、二特異性分子が、本明細書に開示される。
別の態様では、本開示は、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子をコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子を提供する。
別の態様では、本開示は、本明細書に開示される多特異性分子をコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子を提供する。
なおも別の態様では、本開示は、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子をコード
するヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む、ベクター、例えば、発現ベクターを提供する。
別の態様では、本開示は、本明細書に開示される多特異性分子をコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む、ベクター、例えば、発現ベクターを提供する。
一態様では、本開示は、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子をコードする核酸分子、またはそれに対して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む、細胞、例えば、宿主細胞、例えば、細胞集団を提供する。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子をコードする核酸分子を含む細胞または細胞集団は、(i)可変領域(VH)、例えば、表1~2もしくは10~13に列挙されるVH、またはそれに対して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列、および例えば、本明細書に記載される1つもしくは複数の重鎖定常領域を含む、重鎖、ならびに/または(ii)可変領域(VL)、例えば、表1~2もしくは10~13に列挙されるVL、またはそれに対して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列、および例えば、本明細書に記載される軽鎖定常領域、例えば、配列番号39の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む、カッパ鎖定常領域を含む、軽鎖を含む。一部の実施形態では、細胞または細胞集団は、IgJ重鎖定常領域、またはその断片をさらに含む。一部の実施形態では、IgJ重鎖定常領域は、配列番号76の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、IgJは、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV抗体分子の重鎖および/または軽鎖を含む、例えば、それを発現する、同じ細胞または細胞集団に含まれる、例えば、それにおいて発現される。一部の実施形態では、IgJは、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV抗体分子の重鎖および/または軽鎖を含む、例えば、それを発現する、細胞または細胞集団とは異なる細胞または細胞集団において発現される。
一態様では、本開示は、本明細書に開示される多特異性分子をコードする核酸分子、またはそれに対して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む、細胞、例えば、宿主細胞、例えば、細胞集団を提供する。
一態様では、対象における疾患、例えば、がんを処置するための医薬の製造における使用のための、抗TCRβV抗体分子が、本明細書に開示される。
一態様では、対象における疾患、例えば、がんを処置するための医薬の製造における使用のための、抗TCRβV抗体分子を含む多特異性分子が、本明細書に開示される。
別の態様では、本開示は、本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、多特異性分子を作製する、例えば産生する方法であって、本明細書に記載される宿主細胞を、好適な条件下において培養するステップを含む、方法を提供する。多特異性分子を作製する方法の一部の実施形態では、条件は、例えば、遺伝子発現および/またはホモもしくはヘテロ二量体化に好適な条件を含む。
別の態様では、本開示は、本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、または多特異性分子と、薬学的に許容される担体、賦形剤、または安定化剤とを含む、医薬組成物を提供する。
ある態様では、本開示は、対象において免疫応答をモジュレート、例えば、増強させる方法であって、対象に、有効量の、T細胞受容体ベータ可変領域(TCRβV)に結合する(例えば、特異的に結合する)抗体分子(「抗TCRβV抗体分子」)を投与するステップを含む、方法を提供する。
ある態様では、本開示は、対象において免疫応答をモジュレート、例えば、増強させる方法であって、対象に、有効量の本明細書に開示される多特異性分子を投与するステップを含む、方法を提供する。
一部の実施形態では、本方法は、対象において免疫細胞集団を拡大させる、例えば、その数を増加させるステップを含む。
ある態様では、本開示は、免疫細胞集団を拡大させる、例えば、その数を増加させる方法であって、免疫細胞集団を、有効量の、T細胞受容体ベータ可変領域(TCRβV)に結合する(例えば、特異的に結合する)抗体分子(「抗TCRβV抗体分子」)と接触させるステップを含む、方法を提供する。
ある態様では、本開示は、免疫細胞集団を拡大させる、例えば、その数を増加させる方法であって、免疫細胞集団を、有効量の本明細書に開示される多特異性分子と接触させるステップを含む、方法を提供する。
一部の実施形態では、拡大は、in vivoまたはex vivo(例えば、in vitro)で生じる。
一部の実施形態では、免疫細胞集団は、TCRβVを発現する細胞、例えば、TCRβV+細胞を含む。
一部の実施形態では、TCRβVを発現する細胞は、T細胞、例えば、CD8+ T細胞、CD3+ T細胞、またはCD4+ T細胞である。
一部の実施形態では、免疫細胞集団は、T細胞(例えば、CD4 T細胞、またはCD8 T細胞)を含む。一部の実施形態では、免疫細胞集団は、メモリー様表現型、例えば、CD45RA+ CCR7-を有するT細胞を含む。一部の実施形態では、免疫細胞集団は、エフェクターT細胞またはメモリーT細胞(例えば、メモリーエフェクターT細胞(例えば、TEM細胞、例えば、TEMRA細胞)、または腫瘍浸潤性リンパ球(TIL))を含む。
一部の実施形態では、免疫細胞集団は、T細胞、ナチュラルキラー細胞、B細胞、または骨髄性細胞を含む。
一部の実施形態では、免疫細胞集団は、健常対象から得られる。
ある態様では、対象における疾患、例えば、がんを処置する方法であって、対象に、有効量の、例えば、治療有効量の、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子または抗TCRβV抗体分子を含む多特異性分子を投与するステップを含み、それによって疾患を処置する、方法が本明細書で提供される。
関連する態様では、対象における疾患、例えば、がんの処置における使用のための、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子または抗TCRβV抗体分子を含む多特異性分子を含む、組成物が本明細書で提供される。
一部の実施形態では、疾患は、がん、例えば、固形腫瘍、または血液がん、または転移病変である。
一部の実施形態では、本方法は、例えば、本明細書に記載される第2の薬剤、例えば、治療剤を投与するステップをさらに含む。一部の実施形態では、第2の薬剤は、治療剤(例えば、化学療法剤、生物剤、ホルモン療法)、放射線、または外科手術を含む。一部の実施形態では、治療剤は、化学療法剤または生物剤から選択される。
別の態様では、例えば、例として、疾患、例えば、がんを有する対象において、療法、例えば、処置を、T細胞へと標的化する、例えば、指向または再指向させる方法であって、有効量の、(i)本明細書に開示される抗TCRβV抗体、および(ii)例えば、本明細書に記載される療法、例えば、腫瘍標的化療法(例えば、がん抗原に結合する抗体)を投与するステップを含み、それによって、T細胞を標的化する方法が本明細書で提供される。
一部の実施形態では、(i)および(ii)は、コンジュゲートされている、例えば、連結されている。
一部の実施形態では、(i)および(ii)は、同時にまたは並行して投与される。
一部の実施形態では、本方法は、(ii)単独の投与と比較して、サイトカイン放出症候群(CRS)の低減(例えば、CRSの持続期間がより短いこともしくはCRSがないこと)、またはCRSの重症度の低減(例えば、重度のCRS、例えば、CRSグレード4もしくは5の不在)をもたらす。一部の実施形態では、CRSは、実施例3のアッセイによって評価される。一部の実施形態では、本方法は、(ii)単独の投与と比較して、神経毒性(NT)の低減(例えば、NTの持続期間がより短いこともしくはNTがないこと)、またはNTの重症度の低減(例えば、重度のNTの不在)をもたらす。
なおも別の態様では、本開示は、本明細書に開示される抗TCRβV抗体または本明細書に開示される抗TCRβV抗体を含む多特異性分子を用いて、例えば、疾患、例えば、がんを有する対象において、T細胞を標的化する方法を提供する。
別の態様では、本開示は、対象におけるサイトカイン放出症候群(CRS)および/または神経毒性(NT)、例えば、処置、例えば以前に投与された処置と関連するCRSおよび/またはNTを処置する、例えば、予防または低減する方法であって、対象に、有効量の、本明細書に開示される抗TCRβV抗体または本明細書に開示される抗TCRβV抗体を含む多特異性分子を投与するステップであって、対象が、疾患、例えば、がんを有する、ステップを含み、それによって、対象におけるCRSおよび/またはNTを処置、例えば、予防または低減する、方法を提供する。
関連する態様では、本開示は、対象に、有効量の抗TCRβV抗体を投与するステップを含む、対象におけるサイトカイン放出症候群(CRS)および/または神経毒性(NT)、例えば、処置、例えば以前に投与された処置と関連するCRSおよび/またはNTの処置、例えば、予防または低減における使用のための、本明細書に開示される抗TCRβV抗体または本明細書に開示される抗TCRβV抗体を含む多特異性分子を含む、組成物であって、対象が、疾患、例えば、がんを有する、組成物を提供する。
本明細書に開示される方法または使用のための組成物の一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、CRSおよび/またはNTと関連する処置の投与と並行してまたはその後に、投与される。
別の態様では、免疫細胞集団を拡大させる、例えば、その数を増加させる方法であって、免疫細胞集団を、T細胞受容体ベータ可変鎖(TCRβV)領域に結合する、例えば、特異的に結合する、抗体分子、例えば、ヒト化抗体分子(例えば、本明細書に記載される
抗TCRβV抗体分子または本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子を含む多特異性分子)と接触させるステップを含み、それによって免疫細胞集団を拡大させる、方法が本明細書で提供される。
一部の実施形態では、拡大は、in vivoまたはex vivo(例えば、in vitro)で生じる。
ある態様では、がんを有する対象を評価する方法であって、対象について、TCRβV分子のステータスの値を取得するステップを含み、前記値が、対象から得られた試料におけるTCRβV分子の存在、例えば、レベルまたは活性の尺度を含み、TCRβV分子のステータスの値が、対象から得られた試料において、参照値、例えば、健常対象、例えば、がんを有さない対象から得られた値と比較して、高い、例えば、増加している、方法が本明細書で提供される。
別の態様では、本開示は、がんを有する対象を処置する方法であって、(i)対象について、TCRβV分子のステータスの値を取得するステップであって、前記値が、対象から得られた試料におけるTCRβV分子の存在、例えば、レベルまたは活性の尺度を含む、ステップと、(ii)前記値に応じて、対象に、有効量の本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子(例えば、TCRβVアゴニスト)を投与するステップとを含み、それによってがんを処置する、方法を提供する。
一部の実施形態では、値は、対象由来の試料において、参照値、例えば、健常対象、例えば、がんを有さない対象から得られた値と比較して、高い、例えば、増加している。
関連する態様では、本開示は、(i)対象について、TCRβV分子のステータスの値を取得するステップであって、前記値が、対象由来の試料におけるTCRβV分子の存在、例えば、レベルまたは活性の尺度を含む、ステップと、(ii)前記値に応じて、対象に、有効量の本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子(例えば、TCRβVアゴニスト)を投与するステップとを含む、がんを有する対象の処置における使用のための、抗TCRβV抗体分子を含む組成物を提供する。
ある態様では、がんの存在に関して、対象を評価する方法であって、
(i)対象について、例えば、対象由来の生体試料において、1つまたは複数のTCRβV分子のステータスの値を取得するステップであって、前記値が、対象から得られた試料におけるTCRβV分子の存在、例えば、レベルまたは活性の尺度を含む、ステップと、(ii)1つまたは複数のTCRβV分子の値が、対象由来の試料において、参照値、例えば、健常対象、例えば、がんを有さない対象から得られた値と比較して、高い、例えば、増加しているかどうかを判定するステップと
を含み、対象において、参照物、例えば、健常対象と比較して高い、例えば、増加している値は、対象におけるがんの存在を示す、方法が本明細書で提供される。
別の態様では、本開示は、がんを有する対象を処置する方法であって、
(i)対象について、例えば、対象由来の生体試料において、1つまたは複数のTCRβV分子のステータスの値を取得するステップであって、前記値が、対象から得られた試料におけるTCRβV分子の存在、例えば、レベルまたは活性の尺度を含む、ステップと、(ii)1つまたは複数のTCRβV分子の値が、対象由来の試料において、参照値、例えば、健常対象、例えば、がんを有さない対象から得られた値と比較して、高い、例えば、増加しているかどうかを判定するステップと、
(iii)対象において、参照値と比較して高い、例えば、増加している値が判定された場合、対象に、有効量の、例えば、本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子(例えば、TCRβVアゴニスト)を投与するステップと
を含み、それによって、がんを処置する、方法を提供する。
関連する態様では、
(i)対象について、例えば、対象由来の生体試料において、1つまたは複数のTCRβV分子のステータスの値を取得するステップであって、前記値が、対象から得られた試料におけるTCRβV分子の存在、例えば、レベルまたは活性の尺度を含む、ステップと、(ii)1つまたは複数のTCRβV分子の値が、対象由来の試料において、参照値、例えば、健常対象、例えば、がんを有さない対象から得られた値と比較して、高い、例えば、増加しているかどうかを判定するステップと、
(iii)対象において、参照値と比較して高い、例えば、増加している値が判定された場合、対象に、有効量の、例えば、本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子(例えば、TCRβVアゴニスト)を投与するステップと
を含む、がんを有する対象を処置する方法における使用のための、抗TCRβV抗体分子を含む組成物が本明細書で提供される。
本明細書に開示される処置の方法または使用のための組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、ステータスは、対象ががんまたはその症状を有することを示す。
本明細書に開示される処置の方法または使用のための組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、ステータスは、療法、例えば、例として本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子を含む療法に対する応答性を示す。
本明細書に開示される処置の方法または使用のための組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、ステータスの値は、本明細書に記載されるアッセイによって判定、例えば、測定される。
なおも別の態様では、がんを有する対象を処置する方法であって、対象に有効量の本明細書に記載される抗TCRBV抗体分子を投与するステップを含み、対象は、例えば、本明細書に記載される1つまたは複数のTCRBV分子のレベルまたは活性が、例えば、健常対象、例えば、がんを有さない対象における1つまたは複数のTCRBV分子の参照レベルまたは活性と比較して、高い、例えば、増加している、方法が本明細書で提供される。
ある態様では、本開示は、がんを有する対象を処置する方法であって、
(i)対象から生体試料、例えば、末梢血試料、生検試料、または骨髄試料を単離するステップと、
(ii)対象について、例えば、対象由来の生体試料において、1つまたは複数のTCRβV分子のステータスの値を取得するステップであって、前記値が、参照値、例えば、健常対象由来の試料と比較した、対象から得られた試料におけるTCRβV分子の存在、例えば、レベルまたは活性の尺度を含み、
対象において、参照物、例えば、健常対象と比較して高い、例えば、増加している値は、対象におけるがんの存在を示す、ステップと、
(iii)生体試料を、例えば、in vitroにおいて、抗TCRβV抗体分子と接触させるステップと、
(iv)ステップ(iii)から得られた生体試料またはその一部分を、対象に投与するステップと
を含む、方法を提供する。
別の態様では、がんを有する対象由来の免疫エフェクター細胞集団を拡大させる方法であって、
(i)対象から、免疫エフェクター細胞集団を含む生体試料、例えば、末梢血試料、生検試料、または骨髄試料を単離するステップと、
(ii)対象について、例えば、対象由来の生体試料において、1つまたは複数のTCRβV分子のステータスの値を取得するステップであって、前記値が、参照値、例えば、健常対象由来の試料と比較した、対象由来の試料におけるTCRβV分子の存在、例えば、レベルまたは活性の尺度を含み、
対象において、参照物、例えば、健常対象と比較して高い、例えば、増加している値は、対象におけるがんの存在を示す、ステップと、
(iii)免疫エフェクター細胞集団を含む生体試料を、抗TCRβV抗体分子と接触させるステップと
を含む、方法が本明細書で提供される。
一部の実施形態では、本方法は、対象に、抗TCRβV抗体分子と接触させた免疫エフェクター細胞集団を投与するステップをさらに含む。
一部の実施形態では、本明細書に開示される拡大の方法、または処置の方法、または使用のための組成物は、免疫エフェクター細胞集団におけるT細胞機能(例えば、細胞傷害活性、サイトカイン分泌、もしくは脱顆粒化)を、例えば、参照集団、例えば、抗TCRβV抗体分子と接触していないその他は類似の集団または健常対象(例えば、がんを有さない対象)から得られた免疫エフェクター細胞集団と比較して測定するステップを含む。
本明細書に開示される方法または使用のための組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、免疫エフェクター細胞集団を含む生体試料を、その生体試料において高い、例えば、増加しているとして特定された1つまたは複数のTCRβV分子(例えば、同じTCRβV分子)に結合する抗TCRβV抗体分子と接触させる。
本明細書に開示される方法または使用のための組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、免疫エフェクター細胞集団を含む生体試料を、その生体試料において高い、例えば、増加しているとして特定された1つまたは複数のTCRβV分子(例えば、異なるTCRβV分子)に結合しない抗TCRβV抗体分子と接触させる。
別の態様では、がんと関連する1つまたは複数のTCRβV分子を特定する方法であって、
(i)疾患を有する第1の対象由来の生体試料および疾患を有さない第2の対象由来の生体試料において、複数のTCRβV分子のステータスを取得するステップと、
(ii)TCRβV分子のうちの1つまたは複数のレベルまたは活性が、第1の対象において、第2の対象と比較して高い、例えば、増加しているかどうかを判定するステップとを含み、それによって、がんと関連する1つまたは複数のTCRβV分子を特定する、方法が本明細書で提供される。
本明細書に開示される方法または使用のための組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、TCRβV分子のうちの1つまたは複数は、以下のTCRβVサブファミリー:(i)例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、もしくはTCRβ V6-1*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ
V6サブファミリー、
(ii)例えば、TCRβ V10-1*01、TCRβ V10-1*02、TCRβ
V10-3*01、もしくはTCRβ V10-2*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V10サブファミリー、
(iii)例えば、TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、もしくはTCRβ V5-8*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V5サブファミリー、
(iv)例えば、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01、もしくはTCRβ V12-5*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V12サブファミリー、
(v)例えば、TCRβ V7-7*01、TCRβ V7-6*01、TCRβ V7
-8*02、TCRβ V7 -4*01、TCRβ V7-2*02、TCRβ V7-2*03、TCRβ V7-2*01、TCRβ V7-3*01、TCRβ V7-9*03、もしくはTCRβ V7-9*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V7サブファミリー、
(vi)例えば、TCRβ V11-1*01、TCRβ V11-2*01、もしくはTCRβ V11-3*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V11サブファミリー、
(vii)TCRβ V14*01を含む、TCRβ V14サブファミリー、
(viii)TCRβ V16*01を含む、TCRβ V16サブファミリー、
(ix)TCRβ V18*01を含む、TCRβ V18サブファミリー、
(x)例えば、TCRβ V9*01もしくはTCRβ V9*02のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V9サブファミリー、
(xi)TCRβ V13*01を含む、TCRβ V13サブファミリー、
(xii)例えば、TCRβ V4-2*01、TCRβ V4-3*01、もしくはTCRβ V4-1*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V4サブファミリー、
(xiii)TCRβ V3-1*01を含む、TCRβ V3サブファミリー、
(xiv)TCRβ V2*01を含む、TCRβ V2サブファミリー、
(xv)TCRβ V15*01を含む、TCRβ V15サブファミリー、
(xvi)例えば、TCRβ V30*01もしくはTCRβ V30*02のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V30サブファミリー、
(xvii)例えば、TCRβ V19*01もしくはTCRβ V19*02のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V19サブファミリー、
(xviii)TCRβ V27*01を含む、TCRβ V27サブファミリー、
(xix)TCRβ V28*01を含む、TCRβ V28サブファミリー、
(xx)TCRβ V24-1*01を含む、TCRβ V24サブファミリー、
(xxi)例えば、TCRβ V20-1*01もしくはTCRβ V20-1*02のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V20サブファミリー、
(xxii)TCRβ V25-1*01を含む、TCRβ V25サブファミリー、または
(xxiii)TCRβ V29-1*01を含む、TCRβ V29サブファミリー、(xxiv)TCRβ V21サブファミリー、
(xxv)TCRβ V1サブファミリー、
(xxvi)TCRβ V17サブファミリー、
(xvii)TCRβ V23サブファミリー、または
(xviii)TCRβ V26サブファミリー
のうちの1つまたは複数(例えば、すべて)を含む。
本明細書に開示される方法または使用のための組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、がんは、黒色腫、膵臓がん(例えば、膵臓腺癌)、乳がん、結腸直腸がん(CRC)、肺がん(例えば、小細胞もしくは非小細胞肺がん)、皮膚がん、卵巣がん、または肝臓がんを含むがこれらに限定されない、固形腫瘍である。
本明細書に開示される方法または使用のための組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、がんは、B細胞もしくはT細胞悪性腫瘍、例えば、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫(例えば、B細胞リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)
、濾胞性リンパ腫、慢性リンパ球性白血病(B-CLL)、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯B細胞リンパ腫、バーキットリンパ腫、リンパ形質細胞性リンパ腫、有毛細胞性白血病)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群、多発性骨髄腫、および急性リンパ球性白血病を含むがこれらに限定されない、血液がんである。
本明細書に開示される拡大の方法、または処置の方法、または使用のための組成物の一部の実施形態では、対象、例えば、対象由来の試料における高い、例えば、増加した、1つまたは複数のTCRβV分子のレベルまたは活性は、対象における前記1つまたは複数のTCRβV分子を発現するT細胞のバイアス、例えば、優先的な拡大、例えば、クローン拡大を示す。
一部の実施形態では、例えば、本明細書に開示されるがんを有する対象は、がんと関連する1つまたは複数のTCRβV分子のレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、TCRβV分子は、がん抗原、例えば、がん関連抗原またはネオ抗原と会合する、例えば、それを認識する。
本明細書に開示される方法または使用のための組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、対象は、B-CLLを有する。一部の実施形態では、B-CLLを有する対象は、1つまたは複数のTCRβV分子、例えば、(i)例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、もしくはTCRβ V6-1*01を含む、TCRβ V6サブファミリー、(ii)TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、もしくはTCRβ V5-8*01を含む、TCRβ V5サブファミリー、(iii)TCRβ V3-1*01を含む、TCRβ V3サブファミリー、(iv)TCRβ V2*01を含む、TCRβ V2サブファミリー、または(v)TCRβ V19*01もしくはTCRβ V19*02を含む、TCRβ V19サブファミリーを含む、1つまたは複数のTCRβV分子のレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。
一部の実施形態では、B-CLLを有する対象は、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、またはTCRβ V6-1*01を含むTCRβ V6サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V6サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V6サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、B-CLLを有する対象は、TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、またはTCRβ V5-8*01を含むTCRβ V5サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V5サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V5サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、B-CLLを有する対象は、TCRβ V3-1*01を含むTCRβ V3サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部
の実施形態では、対象に、TCRβ V3サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V3サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、B-CLLを有する対象は、TCRβ V2*01を含むTCRβ V2サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V2サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V2サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、B-CLLを有する対象は、TCRβ V19*01またはTCRβ V19*02を含むTCRβ V19サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V19サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRBV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V19サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
本明細書に開示される方法または使用のための組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、対象は、黒色腫を有する。一部の実施形態では、黒色腫を有する対象は、1つまたは複数のTCRβV分子、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、またはTCRβ V6-1*01を含む、TCRβ V6サブファミリーを含む、1つまたは複数のTCRβV分子のレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V6サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V6サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
本明細書に開示される方法または使用のための組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、対象は、DLBCLを有する。一部の実施形態では、黒色腫を有する対象は、1つまたは複数のTCRβV分子、例えば、(i)TCRβ V13*01を含む、TCRβ V13サブファミリー、(ii)TCRβ V3-1*01を含む、TCRβ V3サブファミリー、または(iii)TCRβ V23サブファミリーを含む、1つまたは複数のTCRβV分子のレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。
一部の実施形態では、DLBCLを有する対象は、高い、例えば、増加した、TCRβ
V13*01を含むTCRβ V13サブファミリーのレベルまたは活性を有する。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V13サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V13サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、DLBCLを有する対象は、TCRβ V3-1*01を含むTCRβ V3サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V3サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに
結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V3サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、DLBCLを有する対象は、TCRβ V23サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V23サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V23サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
本明細書に開示される方法または使用のための組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、対象は、CRCを有する。一部の実施形態では、黒色腫を有する対象は、1つまたは複数のTCRβV分子、例えば、(i)TCRβ V19*01もしくはTCRβ V19*02を含む、TCRβ V19サブファミリー、(ii)TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01、もしくはTCRβ V12-5*01を含む、TCRβ V12サブファミリー、(iii)TCRβ V16*01を含む、TCRβ V16サブファミリー、または(iv)TCRβ V21サブファミリーを含む、1つまたは複数のTCRβV分子のレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。
一部の実施形態では、CRCを有する対象は、TCRβ V19*01またはTCRβ
V19*02を含むTCRβ V19サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V19サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V19サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、CRCを有する対象は、TCRβ V12-4*01、TCRβ
V12-3*01、またはTCRβ V12-5*01を含むTCRβ V12サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V12サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V12サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、CRCを有する対象は、TCRβ V16*01を含むTCRβ
V16サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V16サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V16サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、CRCを有する対象は、TCRβ V21サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ
V21サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V21サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
代替的に、または本明細書に開示される実施形態のうちのいずれかとの組合せで、
(i)TCRβV上のエピトープ、例えば、本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、例えば、第2の抗TCRβV抗体分子によって認識されるエピトープと同じかもしくは類似のエピトープに特異的に結合するか、
(ii)本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、例えば、第2の抗TCRβV抗体分子と同じかもしくは類似の結合親和性もしくは特異性またはその両方を示すか、
(iii)本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、例えば、第2の抗TCRβV抗体分子の結合を阻害する、例えば、競合的に阻害するか、
(iv)本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、例えば、第2の抗TCRβV抗体分子と同じかもしくはオーバーラップするエピトープに結合するか、または
(v)本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、例えば、第2の抗TCRβV抗体分子と、結合について競合し、かつ/もしくは同じエピトープに結合する、
抗TCRβV抗体分子が本明細書で提供される。
一部の実施形態では、第2の抗TCRβV抗体分子は、表1もしくは表2から選択される抗原結合性ドメイン、またはそれに対して実質的に同一の配列を含む。一部の実施形態では、第2の抗TCRβV抗体分子は、
配列番号1もしくは配列番号9の重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、および/もしくは重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)、ならびに/または配列番号2、配列番号10、もしくは配列番号11の軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、および/もしくは軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)
を含む抗原結合性ドメインを含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)配列番号1もしくは配列番号9、または表1に開示される配列の重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、および/または重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)、または
(ii)配列番号2、配列番号10、もしくは配列番号11、または表1に開示される配列の軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、および/または軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)
を含む抗原結合性ドメインを含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、配列番号2、配列番号10、または配列番号11のLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3のうちの1つ、2つ、またはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む、抗原結合性ドメインを含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、配列番号1または配列番号9のHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3のうちの1つ、2つ、またはすべて(例えば、3つ)を含む重鎖可変領域(VH)を含む、抗原結合性ドメインを含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)配列番号6のLC CDR1アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、配列番号7のLC CDR2アミノ酸配列(またはその1つ、2、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、および/または配列番
号8のLC CDR3アミノ酸配列(またはその1つ、2、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)を含む、VL、ならびに/または
(ii)配列番号3のHC CDR1アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、配列番号4のHC CDR2アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、および/または配列番号5のHC CDR3アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)を含む、VH
を含む抗原結合性ドメインを含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
配列番号9もしくは配列番号1312の可変重鎖(VH)、またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列、および/または
配列番号10もしくは配列番号11もしくは配列番号1314の可変軽鎖(VL)、またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列
を含む抗原結合性ドメインを含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、配列番号9のVHアミノ酸配列および配列番号10のVLアミノ酸配列を含む、抗原結合性ドメインを含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、配列番号9のVHアミノ酸配列および配列番号11のVLアミノ酸配列を含む、抗原結合性ドメインを含む。
本明細書に開示される任意の組成物または方法の一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、配列番号1312のVHアミノ酸配列および配列番号1314のVLアミノ酸配列を含む抗原結合性ドメインを含む。
本明細書に開示される任意の組成物または方法の一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、配列番号1337のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有する配列を含む抗原結合性ドメインを含む。
本明細書に開示される任意の組成物または方法の一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、配列番号1500のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有する配列を含む抗原結合性ドメインを含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、(i)73位におけるスレオニン、例えば、Kabatの番号付けによる73位における置換、例えば、グルタミン酸からスレオニンへの置換、または(ii)位におけるグリシン、例えば、Kabatの番号付けによる94位における置換、例えば、アルギニンからグリシンへの置換のうちの一方または両方を含む、フレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む、重鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列重鎖フレームワーク領域配列に対するものである。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、10位におけるフェニルアラニン、例えば、Kabatの番号付けによる10位における置換、例えば、セリンからフェニルアラニン(Phenyalanine)への置換を含む、フレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む、軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列に対するものである。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、(i)36位におけるヒスチジン、例えば、Kabatの番号付けによる36位における置換、例えば、チロシンからヒスチジンへの置換、または(ii)46位におけるアラニン、例えば、Kabatの番号付けによる46位における置換、例えば、アルギニンからアラニンへの置換のうちの一方または両方を含む、フレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域2(FR2)を含む、軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列に対するものである。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、87位におけるフェニルアラニン、例えば、Kabatの番号付けによる87位における置換、例えば、チロシンからフェニルアラニンへの置換を含む、フレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む、軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列に対するものである。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V6、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、またはTCRβ V6-1*01に結合する。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V6-5*01に結合する。
一部の実施形態では、TCRβ V6、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ
V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、またはTCRβ V6-1*01は、配列番号1および/または配列番号2によって認識され、例えば結合される。一部の実施形態では、TCRβ V6、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、またはTCRβ V6-1*01は、配列番号9および/または配列番号10によって認識され、例えば結合される。一部の実施形態では、TCRβ V6、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、またはTCRβ V6-1*01は、配列番号9および/または配列番号11によって認識され、例えば結合される。一部の実施形態では、TCRβ V6-5*01は、配列番号9および/もしくは配列番号10、またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列によって認識され、例えば結合される。一部の実施形態では、TCRβ V6-5*01は、配列番号9および/もしくは配列番号11、またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列によって認識され、例
えば結合される。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)配列番号15、配列番号23、配列番号24、もしくは配列番号25、または表2に開示される配列の重鎖相補性決定領域(HC CDR1)、HC CDR2、および/またはHC CDR3、ならびに/または
(ii)配列番号16、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、もしくは配列番号30、または表2に開示される配列の軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、LC CDR2、および/またはLC CDR3
を含む抗原結合性ドメインを含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、配列番号16、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、または配列番号30のLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3のうちの1つ、2つ、またはすべてを含む軽鎖可変領域(VL)を含む、抗原結合性ドメインを含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、配列番号15、配列番号23、配列番号24、または配列番号25のHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3のうちの1つ、2つ、またはすべてを含む重鎖可変領域(VH)を含む、抗原結合性ドメインを含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)配列番号20のLC CDR1アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、配列番号21のLC CDR2アミノ酸配列(またはその1つ、2、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、および/または配列番号22のLC CDR3アミノ酸配列(またはその1つ、2、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)を含む、VL、ならびに/または
(ii)配列番号17のHC CDR1アミノ酸配列(またはその1つ、2、3、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、配列番号18のHC CDR2アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、および/または配列番号19のHC CDR3アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)を含む、VH
を含む抗原結合性ドメインを含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
配列番号23、配列番号24、もしくは配列番号25、またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列の可変重鎖(VH)、および/または
配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、もしくは配列番号30、またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列の可変軽鎖(VL)
を含む抗原結合性ドメインを含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、(i)1位におけるアスパラギン酸、例えば、Kabatの番号付けによる1位における置換、例えば、アラニンからアスパラギン酸への置換、または(ii)2位におけるアスパラギン、例えば、Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換、セリンからアスパラギンへの置換、もしくはチロシンからアスパラギンへの置換、または(iii)4位におけるロイシン、例えば、Kabatの番号付けによる4位における置換、例えば、メチオニンからロイシンへの置換のうちの1つ、2つ、またはすべて(例えば、3つ)を含む、フレームワーク領域、例えばフレームワーク領域1(FR1)を含む、軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列に対するものである。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、(i)66位におけるグリシン、例えば、Kabatの番号付けによる66位における置換、例えば、リシンからグリシンへの置換、もしくはセリンからグリシンへの置換、(ii)69位におけるアスパラギン、例えば、Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、スレオニンからアスパラギンへの置換、または(iii)71位におけるチロシン、例えば、Kabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換、もしくはアラニンからチロシンへの置換のうちの1つ、2つ、またはすべて(例えば、3つ)を含む、フレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む、軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列に対するものである。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V12、例えば、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01、またはTCRβ V12-5*01に結合する。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V12-4*01またはTCRβ V12-3*01に結合する。
一部の実施形態では、TCRβ V12、例えば、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01、またはTCRβ V12-5*01は、配列番号15および/または配列番号16によって認識され、例えば結合される。一部の実施形態では、TCRβ V12、例えば、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01、またはTCRβ V12-5*01は、配列番号23~25のうちのいずれか1つ、および/または配列番号26~30のうちのいずれか1つ、またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列によって認識され、例えば結合される。一部の実施形態では、TCRβ V12-4*01は、配列番号23~25のうちのいずれか1つ、および/または配列番号26~30のうちのいずれか1つ、またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列によって認識され、例えば結合される。一部の実施形態では、TCRβ V12-3*01は、配列番号23~25のうちのいずれか1つ、および/または配列番号26~30のうちのいずれか1つ、またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列によって認識され、例えば結合される。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、一本鎖Fv(scFv)またはFabを含む抗原結合性ドメインを含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、T細胞上の立体構造エピトープまたは線形エピトープに結合する。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、腫瘍は、抗原、例えば、腫瘍抗原、例えば、腫瘍関連抗原またはネオ抗原を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、腫瘍抗原を認識し、例えば、それに結合する。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、全長抗体(例えば、少なくとも1つ、好ましくは2つの完全重鎖と、少なくとも1つ、好ましくは2つの完全軽鎖とを含む抗体)、または抗原結合性断片(例えば、Fab、F(ab’)、Fv、一本鎖 Fv断片、単一ドメイン抗体、ダイアボディ(dAb)、二価抗体、または二特異性抗体もしくはその断片、その単一ドメインバリアント、ラクダ抗体、またはラット由来VHである。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、例えば、表3に開示される、IgG1、IgG2、IgG3、IgGA1、IgGA2、IgM、IgJ、もしくはIgG4から選択される1つもしくは複数の重鎖定常領域、またはその断片を含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、IgMの重鎖定常領域またはその断片を含み、必要に応じて、IgM重鎖定常領域は、配列番号73の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む。本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、IgM定常領域を含む抗TCRβV抗体分子は、IgJの重鎖定常領域またはその断片をさらに含み、必要に応じて、IgJ重鎖定常領域は、配列番号76の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、IgJの重鎖定常領域またはその断片を含み、必要に応じて、IgJ重鎖定常領域は、配列番号76の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、IgGA1の重鎖定常領域またはその断片を含み、必要に応じて、IgGA1重鎖定常領域は、配列番号74の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、IgGA2の重鎖定常領域またはその断片を含み、必要に応じて、IgGA2重鎖定常領域は、表3に列挙される配列、例えば、配列番号75の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合は、TCRβV領域以外の受容体または分子に結合するT細胞エンゲージャー(「非TCRβV結合性T細胞エンゲージャー」)のものとは異なるサイトカインプロファイル、例えば、サイトカイン分泌プロファイル(例えば、1つもしくは複数のサイトカインおよび/または1つもしくは複数のケモカインを含む)をもたらす。
一部の実施形態では、サイトカインプロファイル、例えば、サイトカイン分泌プロファイルは、1つもしくは複数のサイトカインおよび/または1つもしくは複数のケモカイン
(例えば、本明細書に記載される)のレベルおよび/または活性を含む。ある実施形態では、サイトカインプロファイル、例えば、サイトカイン分泌プロファイルは、IL-2(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、IL-1ベータ(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、IL-6(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、TNFα(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、IFNg(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、IL-10(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、IL-4(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、TNFアルファ(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、IL-12p70(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、IL-13(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、IL-8(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、エオタキシン(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、エオタキシン-3(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、IL-8(HA)(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、IP-10(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、MCP-1(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、MCP-4(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、MDC(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、MIP-1a(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、MIP-1b(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、TARC(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、GM-CSF(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、IL-12 23p40(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、IL-15(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、IL-16(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、IL-17a(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、IL-1a(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、IL-5(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、IL-7(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、TNF-ベータ(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)、またはVEGF(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)のうちの1つまたは複数のレベルおよび/または活性を含む。
一部の実施形態では、サイトカインプロファイル、例えば、サイトカイン分泌プロファイルは、以下:
(i)IL-2のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加、
(ii)IL-1βのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
(iii)IL-6のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
(iv)TNFαのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
(v)IL-10のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
(vi)IL-2のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加における遅延、例えば、少なくとも1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間、もしくはそれ以上の遅延、
(vii)IFNgのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加における遅延、例えば、少なくとも1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間の遅延、または
(viii)IL-15のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加、のうちの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、またはすべてを含み、
例えば、(i)~(viii)は、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーのサイトカインプロファイル、例えば、サイトカイン分泌プロファイルと比較したものである。
一部の実施形態では、抗TCRBV抗体のTCRβV領域への結合は、実施例3のアッセイによって測定したときに、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーによって誘導されるサイトカインストームと比較して、サイトカインストームの低減、例えば、サイトカイン放出症候群(CRS)および/または神経毒性(NT)の低減をもたらす。
一部の実施形態では、抗TCRBV抗体のTCRβV領域への結合は、
(ix)T細胞増殖動態の低減、
(x)例えば、実施例4のアッセイによって測定したときに、細胞殺滅、例えば、標的細胞殺滅、例えば、がん細胞殺滅、
(xi)ナチュラルキラー(NK)細胞増殖、例えば、拡大の増加、または
(xii)メモリー様表現型を有するT細胞集団の拡大、例えば、少なくとも約1.1~10倍の拡大(例えば、少なくとも約1.1倍、1.2倍、1.3倍、1.4倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、もしくは10倍の拡大)
のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてをもたらし、
例えば、(ix)~(xii)は、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーと比較したものである。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβVタンパク質上の構造的に保存されたドメイン(例えば、図24Aにおいて丸で囲んだ領域によって示される)を認識する(例えば、それに結合する)。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβV:TCRアルファ複合体の境界部を認識しない、例えば、それに結合しない。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβVタンパク質の定常領域を認識しない、例えば、それに結合しない。TCRBV領域の定常領域に結合する例示的な抗体は、Viney et al., (Hybridoma. 1992 Dec;11(6):701-13)に記載されるJOVI.1である。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβVタンパク質の相補性決定領域(例えば、CDR1、CDR2、および/またはCDR3)のうちの1つまたは複数(例えば、すべて)を認識しない、例えば、それに結合しない。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、例えば、表3に開示される、カッパもしくはラムダの軽鎖定常領域、またはその断片から選択される軽鎖定常領域を含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、カッパ鎖の軽鎖定常領域またはその断片を含み、必要に応じて、カッパ鎖定常領域は、配列番号39の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、
(i)例えば、表3に記載される、IgG1、IgG2、IgG3、IgGA1、IgGA2、IgG4、IgJ、IgM、IgD、もしくはIgEから選択される重鎖定常領域、またはその断片を含む、1つまたは複数の重鎖定常領域、および
(ii)例えば、表3に記載される、カッパまたはラムダの軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域、またはその断片を含む、軽鎖定常領域
を含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、または抗TCRβV抗体分子を含む細胞は、
(i)可変領域(VH)、例えば、本明細書に開示される抗体のVH、および/または例えば、本明細書に開示される1つもしくは複数の重鎖定常領域を含む、重鎖、ならびに/または
(ii)可変軽鎖(VL)、例えば、本明細書に開示される抗体のVL、および/または例えば、本明細書に開示される1つもしくは複数の軽鎖定常領域を含む、軽鎖
を含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、または抗TCRβV抗体分子を含む細胞は、
(i)(a)配列番号73の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む、IgM重鎖定常領域またはその断片、
(b)配列番号74の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む、IgGA1重鎖定常領域またはその断片、または
(c)配列番号75の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む、IgGA2重鎖定常領域またはその断片を含む、重鎖定常領域を含む、重鎖、および
(ii)配列番号39の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む、カッパ鎖定常領域を含む、軽鎖定常領域を含む、軽鎖
を含み、
必要に応じて、抗TCRβV抗体分子は、IgJ重鎖定常領域またはその断片をさらに含み、IgJ重鎖定常領域は、配列番号76の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、または抗TCRβV抗体分子を含む細胞は、
(i)表1~2もしくは10~13のVHから選択されるVH、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列、および重鎖定常領域であって、
(a)配列番号73の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む、IgM重鎖定常領域またはその断片、
(b)配列番号74の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む、IgGA1重鎖定常領域またはその断片、または
(c)配列番号75の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む、IgGA2重鎖定常領域またはその断片を含む、重鎖定常領域を含む、重鎖、ならびに
(ii)表1~2もしくは10~13のVLから選択されるVL、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列、および配列番号39の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含むカッパ鎖定常領域を含む、軽鎖定常領域を含む、軽鎖
を含み、
必要に応じて、抗TCRβV抗体分子は、IgJ重鎖定常領域またはその断片をさらに含み、IgJ重鎖定常領域は、配列番号76の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む。
本明細書に開示される方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、以下のTCRβVサブファミリー:
(i)例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-
6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、もしくはTCRβ V6-1*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ
V6サブファミリー、
(ii)例えば、TCRβ V10-1*01、TCRβ V10-1*02、TCRβ
V10-3*01、もしくはTCRβ V10-2*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V10サブファミリー、
(iii)例えば、TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、もしくはTCRβ V5-8*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V5サブファミリー、
(iv)例えば、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01、もしくはTCRβ V12-5*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V12サブファミリー、
(v)例えば、TCRβ V7-7*01、TCRβ V7-6*01、TCRβ V7
-8*02、TCRβ V7 -4*01、TCRβ V7-2*02、TCRβ V7-2*03、TCRβ V7-2*01、TCRβ V7-3*01、TCRβ V7-9*03、もしくはTCRβ V7-9*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V7サブファミリー、
(vi)例えば、TCRβ V11-1*01、TCRβ V11-2*01、もしくはTCRβ V11-3*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V11サブファミリー、
(vii)TCRβ V14*01を含む、TCRβ V14サブファミリー、
(viii)TCRβ V16*01を含む、TCRβ V16サブファミリー、
(ix)TCRβ V18*01を含む、TCRβ V18サブファミリー、
(x)例えば、TCRβ V9*01もしくはTCRβ V9*02のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V9サブファミリー、
(xi)TCRβ V13*01を含む、TCRβ V13サブファミリー、
(xii)例えば、TCRβ V4-2*01、TCRβ V4-3*01、もしくはTCRβ V4-1*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V4サブファミリー、
(xiii)TCRβ V3-1*01を含む、TCRβ V3サブファミリー、
(xiv)TCRβ V2*01を含む、TCRβ V2サブファミリー、
(xv)TCRβ V15*01を含む、TCRβ V15サブファミリー、
(xvi)例えば、TCRβ V30*01もしくはTCRβ V30*02のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V30サブファミリー、
(xvii)例えば、TCRβ V19*01もしくはTCRβ V19*02のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V19サブファミリー、
(xviii)TCRβ V27*01を含む、TCRβ V27サブファミリー、
(xix)TCRβ V28*01を含む、TCRβ V28サブファミリー、
(xx)TCRβ V24-1*01を含む、TCRβ V24サブファミリー、
(xxi)例えば、TCRβ V20-1*01もしくはTCRβ V20-1*02のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V20サブファミリー、
(xxii)TCRβ V25-1*01を含む、TCRβ V25サブファミリー、または
(xxiii)TCRβ V29-1*01を含む、TCRβ V29サブファミリー、(xxiv)TCRβ V21サブファミリー、
(xxv)TCRβ V1サブファミリー、
(xxvi)TCRβ V17サブファミリー、
(xvii)TCRβ V23サブファミリー、または
(xviii)TCRβ V26サブファミリー
のうちの1つまたは複数(例えば、すべて)に結合する。
本明細書に開示される方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、以下のTCRβVサブファミリー:
(i)TCRβ V6、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、もしくはTCRβ V6-1*01、
(ii)TCRβ V10、例えば、TCRβ V10-1*01、TCRβ V10-1*02、TCRβ V10-3*01、もしくはTCRβ V10-2*01、
(iii)TCRβ V12、例えば、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01、もしくはTCRβ V12-5*01、または
(iv)TCRβ V5、例えば、TCRβ V5-5*01、TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、TCRβ V5-8*01、TCRβ V5-1*01のうちの1つまたは複数(例えば、すべて)に結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V6、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、またはTCRβ V6-1*01に結合する。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V6-5*01に結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V12に結合しない。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V5-5*01にもTCRβ V5-1*01にも結合しない。
本明細書に開示される方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V12に結合しないか、あるいは米国特許第5,861,155号に記載される16G8マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性よりも低い(例えば、約10%未満、20%未満、30%未満、40%未満、50%未満、60%未満、70%未満、80%未満、90%未満、または約2分の1未満、5分の1未満、もしくは10分の1未満の)親和性および/または結合特異性で、TCRβ
V12に結合する。
本明細書に開示される方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載される16G8マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性を上回る(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、または約2倍、5倍、もしくは10倍上回る)親和性および/または結合特異性で、TCRβ V12に結合する。
本明細書に開示される方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載される16G8マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性を上回る(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、または約2倍、5倍、もしくは10倍上回る)親和性および/または結合特異性で、TCRβ V12以外のTCRβV領域(例えば、本明細書に記載されるTCRβV領域、例えば、TCRβ V6サブファミリー(例えば、TCRβ V6-5*01)に結合する。
本明細書に開示される方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体
分子は、抗体Bの少なくとも1つのCDRを含まない。本明細書に開示される方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、抗体BのCDRを含まない。
本明細書に開示される方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V5-5*01にもTCRβ V5-1*01にも結合しないか、あるいは米国特許第5,861,155号に記載されるTM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性よりも低い(例えば、約10%未満、20%未満、30%未満、40%未満、50%未満、60%未満、70%未満、80%未満、90%未満、または約2分の1未満、5分の1未満、もしくは10分の1未満の)親和性および/または結合特異性で、TCRβ V5-5*01またはTCRβ V5-1*01に結合する。
本明細書に開示される方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載されるTM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性を上回る(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、または約2倍、5倍、もしくは10倍上回る)親和性および/または結合特異性で、TCRβ V5-5*01またはTCRβ V5-1*01に結合する。
本明細書に開示される方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載されるTM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性を上回る(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、または約2倍、5倍、もしくは10倍上回る)親和性および/または結合特異性で、TCRβ V5-5*01またはTCRβ V5-1*01以外のTCRβV領域(例えば、本明細書に記載されるTCRβV領域、例えば、TCRβ V6サブファミリー(例えば、TCRβ V6-5*01)に結合する。
本明細書に開示される方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TM23マウス抗体の少なくとも1つのCDRを含まない。本明細書に開示される方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TM23マウス抗体のCDRを含まない。
本明細書に開示される方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、例えば、J Exp Med. 1989 Jan 1;
169(1): 73-86に開示される、マウス抗ラットTCR抗体R73の配列を含まず、これは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。本明細書に開示される方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性抗体分子は、例えば、J Immunol. 1993 Mar 15;150(6):2305-15に開示される、マウス抗ラットTCR抗体R73の配列を含まず、これは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本明細書に開示される方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、例えば、Oncoimmunology. 2016; 5(1): e1052930に開示される、ウイルスペプチド-MHC複合体を含まず、これは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。本明細書に開示される方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性抗体分子は、例えば、Oncoimmunology. 2016; 5(1): e1052930に開示される、ウイルスペプチド-MHC複合体を含まず、これは、参照によりその全体が本
明細書に組み込まれる。
本明細書に開示される方法の一部の実施形態では、免疫細胞集団は、T細胞、ナチュラルキラー細胞、B細胞、抗原提示細胞、または骨髄性細胞(例えば、単球、マクロファージ、好中球、もしくは顆粒球)を含む。
本明細書に開示される方法の一部の実施形態では、免疫細胞集団は、T細胞、例えば、CD4+ T細胞、CD8+ T細胞、TCRアルファ-ベータT細胞、またはTCRガンマ-デルタT細胞を含む。一部の実施形態では、T細胞は、メモリーT細胞(例えば、セントラルメモリーT細胞、またはエフェクターメモリーT細胞(例えば、TEMRA)、またはエフェクターT細胞を含む。一部の実施形態では、T細胞は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を含む。
本明細書に開示される方法の一部の実施形態では、免疫細胞集団は、健常対象から得られる。
本明細書に開示される方法の一部の実施形態では、免疫細胞集団は、例えば、本明細書に記載される疾患、例えば、がん有する対象から(例えば、対象由来のアフェレーシス試料から)得られる。一部の実施形態では、疾患、例えば、がんを有する対象から得られた免疫細胞集団は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を含む。
本明細書に開示される方法の一部の実施形態では、本方法は、少なくとも1.1~10倍の拡大(例えば、少なくとも1.1倍、1.2倍、1.3倍、1.4倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、もしくは10倍の拡大)をもたらす。
本明細書に開示される方法の一部の実施形態では、本方法は、細胞集団を、免疫細胞の拡大を促進する、例えば、増加させる薬剤と接触させるステップをさらに含む。一部の実施形態では、薬剤には、例えば、本明細書に記載される免疫チェックポイント阻害剤が含まれる。一部の実施形態では、薬剤には、4-1BB(CD127)アゴニスト、例えば、抗4-1BB抗体が含まれる。
本明細書に開示される方法の一部の実施形態では、本方法は、細胞集団を、非分裂細胞、例えば、フィーダー細胞、例えば、照射した同種ヒトPBMCの集団と接触させるステップをさらに含む。
本明細書に開示される方法の一部の実施形態では、本明細書に記載される拡大方法は、細胞を、少なくとも約4時間、6時間、10時間、12時間、15時間、18時間、20時間、もしくは22時間、または少なくとも1日間、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、14日間、15日間、16日間、17日間、18日間、19日間、20日間、もしくは21日間、または少なくとも約1週間、2週間、3週間、4週間、5週間、6週間、7週間、もしくは8週間の期間、拡大させるステップを含む。
本明細書に開示される方法の一部の実施形態では、免疫細胞集団の拡大は、CD3分子、例えば、CD3イプシロン(CD3e)分子、またはTCRアルファ(TCRα)分子に結合する抗体を用いた類似の細胞集団の拡大と比較される。
本明細書に開示される方法の一部の実施形態では、免疫細胞集団の拡大は、抗TCRβV抗体分子と接触していない類似の細胞集団の拡大と比較される。
本明細書に開示される方法の一部の実施形態では、メモリーエフェクターT細胞、例えば、TEM細胞、例えば、TEMRA細胞の集団の拡大は、CD3分子、例えば、CD3
イプシロン(CD3e)分子、またはTCRアルファ(TCRα)分子に結合する抗体を用いた類似の細胞集団の拡大と比較される。
本明細書に開示される方法の一部の実施形態では、本方法は、T細胞受容体(TCR)アルファおよび/またはTCRベータ分子を含むTCRを発現するT細胞、例えば、TCRアルファ-ベータT細胞(αβ T細胞)の拡大、例えば、選択的または優先的な拡大をもたらす。
本明細書に開示される方法の一部の実施形態では、本方法は、TCRガンマおよび/またはTCRデルタ分子を含むTCRを発現するT細胞、例えば、TCRガンマ-デルタT細胞(γδ T細胞)の拡大を上回るαβT細胞の拡大をもたらす。一部の実施形態では、γδ T細胞を上回るαβT細胞の拡大は、CRSと関連するサイトカインの産生の低減をもたらす。一部の実施形態では、γδ T細胞を上回るαβT細胞の拡大は、対象に投与したときに、CRSを誘導する能力が低減された、例えば、そうなる可能性が低い、免疫細胞をもたらす。
本明細書に開示される方法の一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体の存在下において培養された、例えば、それを用いて拡大させた、免疫細胞集団(例えば、T細胞(例えば、TEMRA細胞もしくはTIL)またはNK細胞)は、対象、例えば、本明細書に記載される疾患または状態を有する対象に投与された場合に、CRSおよび/またはNTを誘導しない。
一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子中の抗TCRβV抗体分子は、第1の免疫細胞エンゲージャー部分である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V12に結合しないか、あるいは米国特許第5,861,155号に記載される16G8マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性よりも低い(例えば、約10%未満、20%未満、30%未満、40%未満、50%未満、60%未満、70%未満、80%未満、90%未満、または約2分の1未満、5分の1未満、もしくは10分の1未満の)親和性および/または結合特異性で、TCRβ V12に結合する。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載される16G8マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性を上回る(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、または約2倍、5倍、もしくは10倍上回る)親和性および/または結合特異性で、TCRβ V12に結合する。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載される16G8マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性を上回る(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、または約2倍、5倍、もしくは10倍上回る)親和性および/または結合特異性で、TCRβ V12以外のTCRβV領域(例えば、本明細書に記載されるTCRβV領域、例えば、TCRβ V6サブファミリー(例えば、TCRβ V6-5*01)に結合する。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、抗体Bマウス抗体のCDRを含まない。
一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子中の抗TCRβV抗体分子は、第1の免疫細胞エンゲージャー部分である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V5-5*01にもTCRβ V5-1*01にも結合しないか、あるいは米国特許第5,861,155号に記載されるTM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性よりも低い(例えば、約10%未満、20%未満、30%未満、40%未満、50%未満、60%未満、70%未満、80%未満、90%未満、または約2分の1未満、5分の1未満、もしくは10分の1未満の)親和性および/または結合特異性で、TCRβ V5-5*01またはTCRβ V5-1*0
1に結合する。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載されるTM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性を上回る(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、または約2倍、5倍、もしくは10倍上回る)親和性および/または結合特異性で、TCRβ V5-5*01またはTCRβ V5-1*01に結合する。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載されるTM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性を上回る(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、または約2倍、5倍、もしくは10倍上回る)親和性および/または結合特異性で、TCRβ V5-5*01またはTCRβ V5-1*01以外のTCRβV領域(例えば、本明細書に記載されるTCRβV領域、例えば、TCRβ V6サブファミリー(例えば、TCRβ V6-5*01)に結合する。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TM23マウス抗体のCDRを含まない。
一部の実施形態では、多特異性分子は、第2の免疫細胞エンゲージャー部分をさらに含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の免疫細胞エンゲージャーは、免疫細胞、例えば、エフェクター細胞に結合し、それを活性化する。一部の実施形態では、第1および/または第2の免疫細胞エンゲージャーは、免疫細胞、例えば、エフェクター細胞に結合するが、それを活性化しない。一部の実施形態では、第2の免疫細胞エンゲージャーは、NK細胞エンゲージャー、T細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、もしくはマクロファージ細胞エンゲージャー、またはこれらの組合せから選択される。一部の実施形態では、第2の免疫細胞エンゲージャーは、CD3、TCRα、TCRγ、TCRζ、ICOS、CD28、CD27、HVEM、LIGHT、CD40、4-1BB、OX40、DR3、GITR、CD30、TIM1、SLAM、CD2、またはCD226に結合するT細胞エンゲージャーを含む。
一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、腫瘍標的化部分を含む。一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、がん抗原に結合する抗体分子(例えば、FabもしくはscFv)、受容体分子(例えば、受容体、受容体断片、もしくはその機能性バリアント)、もしくはリガンド分子(例えば、リガンド、リガンド断片、もしくはその機能性バリアント)、またはこれらの組合せを含む。一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、がん、例えば、血液がん、固形腫瘍、転移がん、軟部組織腫瘍、転移病変、またはこれらの組合せに存在するがん抗原に結合する。一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、がん抗原、例えば、BCMAまたはFcRH5に結合する。
一部の実施形態では、腫瘍標的化抗体分子は、腫瘍抗原上の立体構造エピトープまたは線形エピトープに結合する。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、抗原、例えば、がん抗原である。一部の実施形態では、がん抗原は、腫瘍抗原もしくは間質抗原、または血液抗原である。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、BCMA、FcRH5、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD38、CD47、CD99、CD123、FcRH5、CLEC12、CD179A、SLAMF7、もしくはNY-ESO1、PDL1、CD47、ガングロシド2(GD2)、前立腺幹細胞抗原(PSCA)、前立腺特異的膜抗原(PMSA)、前立腺特異的抗原(PSA)、癌胎児性抗原(CEA)、Ronキナーゼ、c-Met、未成熟ラミニン受容体、TAG-72、BING-4、カルシウム活性化塩素チャネル2、サイクリン-B1、9D7、Ep-CAM、EphA3、Her2/neu、テロメラーゼ、SAP-1、サバイビン、NY-ESO-1/LAGE-1、PRAME、SSX-2、
メラン-A/MART-1、Gp100/pmel17、チロシナーゼ、TRP-1/-2、MC1R、β-カテニン、BRCA1/2、CDK4、CML66、フィブロネクチン、p53、Ras、TGF-Β受容体、AFP、ETA、MAGE、MUC-1、CA-125、BAGE、GAGE、NY-ESO-1、β-カテニン、CDK4、CDC27、αアクチニン-4、TRP1/gp75、TRP2、gp100、メラン-A/MART1、ガングリオシド、WT1、EphA3、上皮成長因子受容体(EGFR)、MART-2、MART-1、MUC1、MUC2、MUM1、MUM2、MUM3、NA88-1、NPM、OA1、OGT、RCC、RUI1、RUI2、SAGE、TRG、TRP1、TSTA、葉酸受容体アルファ、L1-CAM、CAIX、gpA33、GD3、GM2、VEGFR、インテグリン(インテグリンアルファVベータ3、インテグリンアルファ5ベータ1)、炭水化物(Le)、IGF1R、EPHA3、TRAILR1、TRAILR2、RANKL、(FAP)、TGF-ベータ、ヒアルロン酸、コラーゲン、例えば、IV型コラーゲン、テネイシンC、またはテネイシンWから選択されるがん抗原に結合する。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、がんは、膵臓がん(例えば、膵臓腺癌)、乳がん、結腸直腸がん、肺がん(小細胞もしくは非小細胞肺がん)、皮膚がん、卵巣がん、または肝臓がんを含むがこれらに限定されない、固形腫瘍である。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、がん抗原または腫瘍抗原は、血液抗原である。一部の実施形態では、がんまたは腫瘍抗原は、BCMA、FcRH5、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD38、CD47、CD99、CD123、FcRH5、CLEC12、CD179A、SLAMF7、またはNY-ESO1のうちの1つまたは複数から選択される。一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、BCMAまたはFcRH5のうちの一方または両方に結合する。
一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、BCMAに結合する。実施形態では、腫瘍標的化部分は、BCMA標的化部分を含む。一部の実施形態では、BCMA標的化部分を含む腫瘍標的化部分は、細胞、例えば、がん細胞または造血細胞の表面上のBCMA抗原に結合する。BCMA抗原は、原発性腫瘍細胞またはその転移病変に存在し得る。一部の実施形態では、がんは、血液がん、例えば、多発性骨髄腫である。例えば、BCMA抗原は、腫瘍に、例えば、限定的な腫瘍灌流、血管の圧縮、または線維性腫瘍間質のうちの1つまたは複数を有することが典型的なクラスの腫瘍に、存在し得る。一部の実施形態では、BCMA標的化部分を含む腫瘍標的化部分は、米国特許第8920776号、同第9243058号、同第9340621号、同第8846042号、同第7083785号、同第9545086号、同第7276241号、同第9034324号、同第7799902号、同第9387237号、同第8821883号、同第861745号、米国特許出願公開第20130273055号、同第20160176973号、同第20150368351号、同第20150376287号、同第20170022284号、同第20160015749号、同第20140242077号、同第20170037128号、同第20170051068号、同第20160368988号、同第20160311915号、同第20160131654号、同第20120213768号、同第20110177093号、同第20160297885号、欧州特許第3137500号、同第2699259号、同第2982694号、同第3029068号、同第3023437号、国際公開第2016090327号、同第2017021450号、同第2016110584号、同第2016118641号、同第2016168149号に記載される抗BCMA抗体またはその抗原結合性断片を含み、これらのすべての内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
一部の実施形態では、BCMA標的化部分は、BCMAに結合する抗体分子(例えば、FabまたはscFv)を含む。一部の実施形態では、BCMAに対する抗体分子は、表9の重鎖可変ドメイン配列のうちのいずれかに由来する1つ、2つ、もしくは3つのCDR、または緊密に関連するCDR、例えば、表9のCDR配列のうちのいずれかから少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つ、もしくは4つ以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する、CDRを含む。一部の実施形態では、BCMAに対する抗体分子は、表9のアミノ酸配列のうちのいずれか、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個、もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列から選択される、重鎖可変ドメイン配列を含む。
一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、FcRH5に結合する。実施形態では、腫瘍標的化部分は、FcRH5標的化部分を含む。一部の実施形態では、FcRH5標的化部分を含む腫瘍標的化部分は、細胞、例えば、がん細胞または造血細胞の表面上のFcRH5抗原に結合する。FcRH5抗原は、原発性腫瘍細胞またはその転移病変に存在し得る。一部の実施形態では、がんは、血液がん、例えば、多発性骨髄腫である。例えば、FcRH5抗原は、腫瘍に、例えば、限定的な腫瘍灌流、血管の圧縮、または線維性腫瘍間質のうちの1つまたは複数を有することが典型的なクラスの腫瘍に、存在し得る。一部の実施形態では、FcRH5標的化部分を含む腫瘍標的化部分は、米国特許第7,999,077号に記載される抗FcRH5抗体またはその抗原結合性断片を含み、このすべての内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかの一部の実施形態では、がんは、B細胞もしくはT細胞悪性腫瘍、例えば、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫(例えば、B細胞リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、慢性リンパ球性白血病、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯B細胞リンパ腫、バーキットリンパ腫、リンパ形質細胞性リンパ腫、有毛細胞性白血病)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群、多発性骨髄腫、および急性リンパ球性白血病を含むがこれらに限定されない、血液がんである。一部の実施形態では、血液がんは、多発性骨髄腫である。
一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、サイトカイン分子、例えば、1つまたは2つのサイトカイン分子をさらに含む。一部の実施形態では、サイトカイン分子は、インターロイキン-2(IL-2)、インターロイキン-7(IL-7)、インターロイキン-12(IL-12)、インターロイキン-15(IL-15)、インターロイキン-18(IL-18)、インターロイキン-21(IL-21)、もしくはインターフェロンガンマ、またはこれらの断片、バリアント、もしくは組合せから選択される。一部の実施形態では、単量体または二量体である。一部の実施形態では、サイトカイン分子は、受容体二量体化ドメイン、例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、サイトカイン分子(例えば、IL-15)および受容体二量体化ドメイン(例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメイン)は、共有結合的に連結されず、例えば、非共有結合的に会合される。
一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、
(i)抗TCRβV抗体分子(例えば、本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子)、および
(ii)腫瘍標的化抗体分子(例えば、本明細書に記載される、例えば、BCMA、FcRH5、CD19、CD22、CD33、CD123、FcRH5、CD179a、もし
くはCLEC12のうちの1つまたは複数から選択される血液抗原に結合する抗体分子)を含む。
一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、(i)の抗TCRβV抗体分子、(ii)の腫瘍標的化抗体分子、および本明細書に記載されるサイトカイン分子、例えば、IL-12サイトカイン分子を含む。
一部の実施形態では、多特異性分子は、本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、およびBCMAまたはFcRH5のうちの一方または両方に結合する腫瘍標的化抗体分子を含む。一部の実施形態では、多特異性分子は、IL-12サイトカイン分子をさらに含む。多特異性分子は、BCMAまたはFcRH5を発現する血液がん、例えば、多発性骨髄腫を処置するために使用することができる。
一部の実施形態では、多特異性分子は、本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、およびCD19、CD22、またはCD123のうちの1つまたは複数に結合する腫瘍標的化抗体分子を含む。一部の実施形態では、多特異性分子は、IL-12サイトカイン分子をさらに含む。多特異性分子は、CD19、CD22、またはCD123を発現する血液がん、例えば、白血病またはリンパ腫を処置するために使用することができる。一部の実施形態では、CD19、CD22、またはCD123を発現する血液がんは、B細胞またはT細胞悪性腫瘍、例えば、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫(例えば、B細胞リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、慢性リンパ球性白血病、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯B細胞リンパ腫、バーキットリンパ腫、リンパ形質細胞性リンパ腫、有毛細胞性リンパ腫)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群、多発性骨髄腫、および急性リンパ球性白血病から選択される。一部の実施形態では、血液がんは、多発性骨髄腫である。
一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、IgG1、IgG2、およびIgG4の重鎖定常領域、より具体的には、ヒトIgG1、IgG2、またはIgG4の重鎖定常領域から選択される、免疫グロブリン定常領域(例えば、Fc領域)をさらに含む。一部の実施形態では、免疫グロブリン定常領域(例えば、Fc領域)は、腫瘍標的化部分、免疫細胞エンゲージャー、サイトカイン分子、または間質改変部分のうちの1つまたは複数に連結されている、例えば、共有結合的に連結されている。一部の実施形態では、第1および第2の免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)の境界部は、例えば、操作されていない境界部と比較して、二量体化を増加または減少させるように、変更、例えば、突然変異されている。一部の実施形態では、免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)の二量体化は、第1および第2のFc領域のFc境界部に、対になった孔と突起(「ノブ・イン・ホール」)、静電相互作用、または鎖交換のうちの1つまたは複数を提供し、それによって、例えば、操作されていない境界部と比較して、より高い比のヘテロ多量体:ホモ多量体が形成される。一部の実施形態では、
一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、リンカー、例えば、本明細書に記載されるリンカーをさらに含み、必要に応じて、リンカーは、切断性リンカー、非切断性リンカー、ペプチドリンカー、可撓性リンカー、剛性リンカー、ヘリックスリンカー、または非ヘリックスリンカーから選択される。
一部の実施形態では、多特異性分子は、少なくとも2つの非連続的ポリペプチド鎖を含む。
一部の実施形態では、多特異性分子は、以下の構成:
A,B-[二量体化モジュール]-C,-D
を含み、ここで、
(1)二量体化モジュールは、免疫グロブリン定常ドメイン、例えば、重鎖定常ドメイン
(例えば、ホモ二量体もしくはヘテロ二量体重鎖定常領域、例えば、Fc領域)、または免疫グロブリン可変領域(例えば、Fab領域)の定常ドメインを含み、
(2)A、B、C、およびDは、独立して、不在であるか、(i)本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子を含む第1の免疫細胞エンゲージャーに優先的に結合する抗原結合性ドメイン、(ii)腫瘍標的化部分(例えば、本明細書に記載される腫瘍標的化抗体分子)、(iii)T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、もしくはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される第2の免疫細胞エンゲージャー、(iv)サイトカイン分子、または(v)間質改変部分であるが、ただし、
A、B、C、およびDのうちの少なくとも1つ、2つ、または3つが、本明細書に開示されるTCRβV領域に優先的に結合する抗原結合性ドメインを含むこと、ならびに
残りのA、B、C、およびDのうちのいずれかは、不在であるか、または腫瘍標的化部分、第2の免疫細胞エンゲージャー、サイトカイン分子、もしくは間質改変部分のうちの1つを含むこと
を条件とする。
一部の実施形態では、二量体化モジュールは、対になった孔と突起(「ノブ・イン・ホール」)、静電相互作用、または鎖交換のうちの1つまたは複数を含む、1つまたは複数の免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)を含む。一部の実施形態では、1つまたは複数の免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)は、例えば、ヒトIgG1のFc領域の、347位、349位、350位、351位、366位、368位、370位、392位、394位、395位、397位、398位、399位、405位、407位、または409位のうちの1つまたは複数から選択される位置に、アミノ酸置換を含む。一部の実施形態では、1つまたは複数の免疫グロブリン定常領域(例えば、Fc領域)は、T366S、L368A、もしくはY407V(例えば、孔もしくはホールに対応する)、またはT366W(例えば、突起もしくはノブに対応する)、またはこれらの組合せから選択されるアミノ酸置換を含む。
一部の実施形態では、多特異性分子は、リンカー、例えば、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子の抗原結合性ドメインと腫瘍標的化部分との間、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子の抗原結合性ドメインと第2の免疫細胞エンゲージャーとの間、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子の抗原結合性ドメインとサイトカイン分子との間、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子の抗原結合性ドメインと間質改変部分との間、第2の免疫細胞エンゲージャーとサイトカイン分子との間、第2の免疫細胞エンゲージャーと間質改変部分との間、サイトカイン分子と間質改変部分との間、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子の抗原結合性ドメインと二量体化モジュールとの間、第2の免疫細胞エンゲージャーと二量体化モジュールとの間、サイトカイン分子と二量体化モジュールとの間、間質改変部分と二量体化モジュールとの間、腫瘍標的化部分と二量体化モジュールとの間、腫瘍標的化部分とサイトカイン分子との間、腫瘍標的化部分と第2の免疫細胞エンゲージャーとの間、または腫瘍標的化部分と本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子の抗原結合性ドメインとの間のうちの1つまたは複数におけるリンカーをさらに含む。一部の実施形態では、リンカーは、切断性リンカー、非切断性リンカー、ペプチドリンカー、可撓性リンカー、剛性リンカー、ヘリックスリンカー、または非ヘリックスリンカーから選択される。一部の実施形態では、リンカーは、ペプチドリンカーである。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、GlyおよびSerを含む。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、配列番号142~145または175~178から選択されるアミノ酸配列を含む。
本明細書に開示される方法または使用のための組成物の一部の実施形態では、疾患は、血液がん、固形腫瘍、転移がん、軟部組織腫瘍、転移病変、またはこれらの組合せから選
択されるがんである。
本明細書に開示される方法または使用のための組成物の一部の実施形態では、がんは、黒色腫、膵臓がん(例えば、膵臓腺癌)、乳がん、結腸直腸がん(CRC)、肺がん(例えば、小細胞もしくは非小細胞肺がん)、皮膚がん、卵巣がん、または肝臓がんから選択される固形腫瘍である。一部の実施形態では、がんは、黒色腫またはCRCである。
本明細書に開示される方法または使用のための組成物の一部の実施形態では、がんは、B細胞もしくはT細胞悪性腫瘍、例えば、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫(例えば、B細胞リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、慢性リンパ球性白血病、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯B細胞リンパ腫、バーキットリンパ腫、リンパ形質細胞性リンパ腫、有毛細胞性白血病)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群、多発性骨髄腫、または急性リンパ球性白血病から選択される血液がんである。一部の実施形態では、血液がんは、多発性骨髄腫である。一部の実施形態では、血液がんは、CLLまたはDLBCLである。
本明細書に開示される方法または使用のための組成物の一部の実施形態では、対象由来の試料は、血液試料、例えば、末梢血試料、生検、例えば、腫瘍生検、または骨髄試料を含む。一部の実施形態では、試料は、免疫エフェクター細胞、例えば、T細胞またはNK細胞を含む、生体試料を含む。一部の実施形態では、T細胞は、CD4 T細胞、CD8
T細胞(例えば、エフェクターT細胞もしくはメモリーT細胞(例えば、メモリーエフェクターT細胞(例えば、TEM細胞、例えば、TEMRA細胞)、または腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を含む。
別途定義されない限り、本明細書において使用されるすべての技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって広く理解されているものと同じ意味を有する。本明細書に記載されるものに類似またはそれと同等の方法および材料を、本発明の実施または試験において使用することができるが、好適な方法および材料が、以下に記載されている。本明細書に記載されるすべての刊行物、特許出願、特許、および他の参考文献は、参照によりその全体が組み込まれる。矛盾が生じた場合には、定義を含め、本明細書が優先される。加えて、材料、方法、および実施例は、例示に過ぎず、限定することを意図するものではない。
本発明の他の特性および利点は、以下の詳細な説明および特許請求の範囲から明らかであろう。
特許または出願ファイルは、カラーを付して作成された少なくとも1つの図面を含む。カラー図面(複数可)を含むこの特許または特許出願公開の写しは、請求および必要な手数料の納付があった場合に特許庁によって提供される。
図1A~1Bは、抗体A供給源のマウスVHおよびVLフレームワーク1、CDR1、フレームワーク2、CDR2、フレームワーク3、CDR3、およびフレームワーク4領域の、それらのそれぞれのヒト化配列とのアラインメントを示す図である。Kabat CDRを太字で、Chothia CDRを斜体で、組合せCDRをボックスで示す。復帰突然変異したフレームワークの位置には、二重下線が施される。図1Aは、マウス抗体A(配列番号1)およびヒト化抗体A-H(配列番号9)のVH配列を示す。図1Bは、マウス抗体A(配列番号2)およびヒト化抗体A-H(配列番号10および配列番号11)のVL配列を示す。 図1Bは、マウス抗体A(配列番号2)およびヒト化抗体A-H(配列番号10および配列番号11)のVL配列を示す。 図2A~2Bは、抗体B供給源のマウスVHおよびVLフレームワーク1、CDR1、フレームワーク2、CDR2、フレームワーク3、CDR3、およびフレームワーク4領域の、それらのそれぞれのヒト化配列とのアラインメントを示す図である。Kabat CDRを太字で、Chothia CDRを斜体で、組合せCDRをボックスで示す。復帰突然変異したフレームワークの位置には、二重下線が施される。図2Aは、マウス抗体B(配列番号15)およびヒト化VH配列B-H.1A~B-H.1C(配列番号23~25)のVH配列を示す。図2Bは、マウス抗体B(配列番号16)およびヒト化VL配列B-H.1D~B-H.1H(配列番号26~30)のVL配列を示す。 図2Bは、マウス抗体B(配列番号16)およびヒト化VL配列B-H.1D~B-H.1H(配列番号26~30)のVL配列を示す。 図2Bは、マウス抗体B(配列番号16)およびヒト化VL配列B-H.1D~B-H.1H(配列番号26~30)のVL配列を示す。 対応する抗体がマップされたTCRBV遺伝子ファミリーおよびサブファミリーの系統樹を示す図である。サブファミリーの同一性は以下の通りである:サブファミリーA:TCRβ V6;サブファミリーB:TCRβ V10;サブファミリーC:TCRβ V12;サブファミリーD:TCRβ V5;サブファミリーE:TCRβ V7;サブファミリーF:TCRβ V11;サブファミリーG:TCRβ V14;サブファミリーH:TCRβ V16;サブファミリーI:TCRβ V18;サブファミリーJ:TCRβ V9;サブファミリーK:TCRβ V13;サブファミリーL:TCRβ V4;サブファミリーM:TCRβ V3;サブファミリーN:TCRβ V2;サブファミリーO:TCRβ V15;サブファミリーP:TCRβ V30;サブファミリーQ:TCRβ V19;サブファミリーR:TCRβ V27;サブファミリーS:TCRβ V28;サブファミリーT:TCRβ V24;サブファミリーU:TCRβ V20;サブファミリーV:TCRβ V25;およびサブファミリーW:TCRβ V29サブファミリー。サブファミリーメンバーは、本明細書では「TCRベータV(TCRβV)」というセクションに詳細に記載されている。 図4A~4Cは、抗TCR Vβ13.1抗体(A-H.1)によって6日間、活性化されたヒトCD3+ T細胞を示す図である。ヒトCD3+ T細胞を磁気ビーズ分離(負の選択)を用いて単離し、100nMで、固定化(プレート被覆した)抗TCR Vβ13.1(A-H.1)または抗CD3ε(OKT3)抗体で6日間、活性化した。図4Aは、抗TCR Vβ13.1(A-H.1)、続く、フローサイトメトリー分析のための二次蛍光色素結合した抗体を用いて、TCR Vβ13.1表面発現について評価した、拡大されたT細胞の2つの散布図(左:OKT3で活性化;右:A-H.1で活性化)を示す。図4Bは、抗TCR Vβ13.1(A-H.1)または抗CD3e(OKT3)によって活性化されたTCR Vβ13.1陽性T細胞のパーセンテージ(%)を、総T細胞(CD3+)に対してプロットした図である。図4Cは、60μl/分の一定速度で20秒間、各T細胞サブセットゲート(CD3またはTCR Vβ13.1)における事象の数をカウントすることによって獲得された相対細胞計数を示す。データは、3人のドナーからの平均値として示される。 図4Aは、抗TCR Vβ13.1(A-H.1)、続く、フローサイトメトリー分析のための二次蛍光色素結合した抗体を用いて、TCR Vβ13.1表面発現について評価した、拡大されたT細胞の2つの散布図(左:OKT3で活性化;右:A-H.1で活性化)を示す。 図4Bは、抗TCR Vβ13.1(A-H.1)または抗CD3e(OKT3)によって活性化されたTCR Vβ13.1陽性T細胞のパーセンテージ(%)を、総T細胞(CD3+)に対してプロットした図である。 図4Cは、60μl/分の一定速度で20秒間、各T細胞サブセットゲート(CD3またはTCR Vβ13.1)における事象の数をカウントすることによって獲得された相対細胞計数を示す。データは、3人のドナーからの平均値として示される。 図5A~5Bは、形質転換された細胞系RPMI8226に対する抗TCR Vβ13.1抗体(A-H.1)によって活性化されたヒトCD3+ T細胞の細胞溶解活性を示す図である。図5Aは、A-H.1またはOKT3で活性化されたヒトCD3+ T細胞の標的細胞溶解を示す。ヒトCD3+ T細胞を磁気ビーズ分離(負の選択)を用いて単離し、RPMI8226細胞と、5:1の(E:T)比で2日間の共培養前に、示された濃度で固定化(プレート被覆した)A-H.1またはOKT3で4日間、活性化した。次に、フローサイトメトリー分析を用いて、CFSE/CD138標識したおよび膜不透過性DNA色素(DRAQ7)についてのFACS染色によって、試料をRPMI8226細胞の細胞溶解について分析した。図5Bは、RPMI-8226と、5:1の(E:T)比で6日間インキュベートしたA-H.1またはOKT3で活性化されたヒトCD3+ T細胞の標的細胞溶解、続く、上記されるように、RPMI8226細胞の細胞溶解分析を示す。標的細胞溶解のパーセンテージ(%)は、以下の式:[(x-基底)/(100%-基底)、式中、xは試料の細胞溶解である]を用いて、基底標的細胞溶解(すなわち、抗体処置なし)に対して標準化することによって決定された。示されたデータは、n=1のドナーの代表的なものである。 図5Bは、RPMI-8226と、5:1の(E:T)比で6日間インキュベートしたA-H.1またはOKT3で活性化されたヒトCD3+ T細胞の標的細胞溶解、続く、上記されるように、RPMI8226細胞の細胞溶解分析を示す。標的細胞溶解のパーセンテージ(%)は、以下の式:[(x-基底)/(100%-基底)、式中、xは試料の細胞溶解である]を用いて、基底標的細胞溶解(すなわち、抗体処置なし)に対して標準化することによって決定された。示されたデータは、n=1のドナーの代表的なものである。 図6A~6Bは、示された抗体で活性化されたヒトPBMCによるIFNg産生を示す図である。示された数のドナーからの全血からヒトPBMCを単離し、続いて、100Nmで、示された抗体で固相(プレート被覆)刺激を行った。1日目、2日目、3日目、5日目、または6日目に上清を回収した。図6Aは、活性化後の1日目、2日目、3日目、5日目、または6日目に、抗TCR Vβ13.1抗体(A-H.1またはA-H.2)または抗CD3e抗体(OKT3またはSP34-2)で活性化された、示された抗体で活性化されたヒトPBMCにおけるIFNgの産生を比較するグラフである。図6Bは、活性化後の1日目、2日目、3日目、5日目、または6日目に、示された抗TCR Vβ13.1抗体または抗CD3e抗体(OKT3)で活性化された、示された抗体で活性化されたヒトPBMCにおけるIFNgの産生を示す。 図6Bは、活性化後の1日目、2日目、3日目、5日目、または6日目に、示された抗TCR Vβ13.1抗体または抗CD3e抗体(OKT3)で活性化された、示された抗体で活性化されたヒトPBMCにおけるIFNgの産生を示す。 図7A~7Bは、示された抗体で活性化されたヒトPBMCによるIL-2産生を示す図である。図6A~6Bに記載されるのと類似の実験設定を使用した。 図7A~7Bは、示された抗体で活性化されたヒトPBMCによるIL-2産生を示す図である。図6A~6Bに記載されるのと類似の実験設定を使用した。 図8A~8Bは、示された抗体で活性化されたヒトPBMCによるIL-6産生を示す図である。図6A~6Bに記載されるのと類似の実験設定を使用した。 図8A~8Bは、示された抗体で活性化されたヒトPBMCによるIL-6産生を示す図である。図6A~6Bに記載されるのと類似の実験設定を使用した。 図9A~9Bは、示された抗体で活性化されたヒトPBMCによるTNF-α産生を示す図である。図6A~6Bに記載されるのと類似の実験設定を使用した。 図9A~9Bは、示された抗体で活性化されたヒトPBMCによるTNF-α産生を示す図である。図6A~6Bに記載されるのと類似の実験設定を使用した。 図10A~10Bは、示された抗体で活性化されたヒトPBMCによるIL-1β産生を示す図である。図6A~6Bに記載されるのと類似の実験設定を使用した。 図10A~10Bは、示された抗体で活性化されたヒトPBMCによるIL-1β産生を示す図である。図6A~6Bに記載されるのと類似の実験設定を使用した。 図11A~11Bは、抗CD3e抗体OKT3によって活性化されたPBMCと比較した場合、抗TCR Vβ13.1抗体A-H.1によって活性化されたヒトPMBCにおけるIFNg分泌の遅延動態を示すグラフである。図11Aは、4人のドナーからのIFNg分泌データを示す。図11Bは、追加の4人のドナーからのIFNg分泌データを示す。示されたデータは、n=8のドナーの代表的なものである。 図11Bは、追加の4人のドナーからのIFNg分泌データを示す。示されたデータは、n=8のドナーの代表的なものである。 抗CD3e抗体(OKT3またはSP34-2)によって活性化されたPBMCと比較して、抗TCR Vβ13.1抗体(A-H.1またはA-H.2)によって活性化されたヒトPBMCにおけるCD8+ TSCMおよびTemra T細胞サブセットの増加を示す図である。 図13A~13Fは、抗TCRVb抗体の特徴を示す図である。図13Aは、抗CD3(OKT3)抗体または抗TCRVb抗体で活性化されたT細胞の増殖を示すグラフである。図13Bは、抗TCRVb抗体を用いたCD45RA+エフェクターメモリーCD8+およびCD4+T細胞(TEMRA)細胞の選択的拡大を示す。Tn=ナイーブT細胞;Tscm=幹細胞メモリーT細胞;Tcm=中央メモリーT細胞;Tem=エフェクターメモリーT細胞;Temra=エフェクターメモリーCD45RA+T細胞。図13Cは、抗TCRVb抗体、または抗CD3抗体で刺激されたPBMCによるIFN-g分泌を示すグラフである。図13Dは、抗TCRVb抗体、または抗CD3抗体で刺激されたT細胞による標的細胞溶解を示す。細胞を4日間刺激し、続いて、多発性骨髄腫標的細胞と2日間インキュベートして、細胞殺滅の評価を行った。図13Eは、抗TCRVb抗体、または抗CD3抗体で刺激されたT細胞によるパーフォリン分泌を示すグラフである。パーフォリンは、100ng/mlプレート結合した抗体で5日間刺激した後、PBMCにおけるTCRVB陽性およびTCRVB陰性T細胞において、FACS染色により分析された。図13Fは、抗TCRVb抗体、または抗CD3抗体で刺激されたT細胞によるグランザイムBを示すグラフである。グランザイムBは、100ng/mlプレート結合した抗体で5日間刺激した後、PBMCにおけるTCRVB陽性およびTCRVB陰性T細胞において、FACS染色により分析された。 図13Bは、抗TCRVb抗体を用いたCD45RA+エフェクターメモリーCD8+およびCD4+T細胞(TEMRA)細胞の選択的拡大を示す。Tn=ナイーブT細胞;Tscm=幹細胞メモリーT細胞;Tcm=中央メモリーT細胞;Tem=エフェクターメモリーT細胞;Temra=エフェクターメモリーCD45RA+T細胞。 図13Cは、抗TCRVb抗体、または抗CD3抗体で刺激されたPBMCによるIFN-g分泌を示すグラフである。 図13Dは、抗TCRVb抗体、または抗CD3抗体で刺激されたT細胞による標的細胞溶解を示す。細胞を4日間刺激し、続いて、多発性骨髄腫標的細胞と2日間インキュベートして、細胞殺滅の評価を行った。 図13Eは、抗TCRVb抗体、または抗CD3抗体で刺激されたT細胞によるパーフォリン分泌を示すグラフである。パーフォリンは、100ng/mlプレート結合した抗体で5日間刺激した後、PBMCにおけるTCRVB陽性およびTCRVB陰性T細胞において、FACS染色により分析された。 図13Fは、抗TCRVb抗体、または抗CD3抗体で刺激されたT細胞によるグランザイムBを示すグラフである。グランザイムBは、100ng/mlプレート結合した抗体で5日間刺激した後、PBMCにおけるTCRVB陽性およびTCRVB陰性T細胞において、FACS染色により分析された。 図14A~14Bは、100nMの用量で6日間、抗TCRVb抗体を用いたPBMCの刺激による、IL-2およびIL-15の産生、ならびにヒトNK細胞の拡大を示す図である。図14Aは、抗TCRVb抗体、または抗CD3抗体で刺激されたT細胞におけるIL-2またはIL-15の分泌を示す。図14Bは、抗TCRVb抗体もしくは抗CD3抗体、または対照試料で刺激された細胞におけるNKp46染色対CD56抗体染色を示すフローサイトメトリードットプロットを示す。 図14Bは、抗TCRVb抗体もしくは抗CD3抗体、または対照試料で刺激された細胞におけるNKp46染色対CD56抗体染色を示すフローサイトメトリードットプロットを示す。 図14Bは、抗TCRVb抗体もしくは抗CD3抗体、または対照試料で刺激された細胞におけるNKp46染色対CD56抗体染色を示すフローサイトメトリードットプロットを示す。 図15A~15Cは、抗TCRVb抗体、または抗CD3抗体で刺激されたPBMCにおけるサイトカインの分泌を示す図である。 図15A~15Cは、抗TCRVb抗体、または抗CD3抗体で刺激されたPBMCにおけるサイトカインの分泌を示す図である。 図15A~15Cは、抗TCRVb抗体、または抗CD3抗体で刺激されたPBMCにおけるサイトカインの分泌を示す図である。 図16A~16Bは、二重標的化BCMA-TCRvb抗体分子によるMM細胞の殺滅を示す図である。図16Aは、以下の二重標的抗体分子:BCMA-TCRVb(分子I)、BCMA-CD3、または対照-TCRVb;またはアイソタイプ対照のうちの1つによるin vitro殺滅を示す。図16Bは、二重標的BCM-TCRVb抗体(分子I)によるMM細胞のin vivo殺滅を示す。 図16Bは、二重標的BCM-TCRVb抗体(分子I)によるMM細胞のin vivo殺滅を示す。 一方のアーム上でFcRH5を認識し、他方のアーム上でTCRVbを認識する二重標的抗体(分子E)を用いたMM標的細胞の溶解を示す図である。 図18A~18Bは、抗CD3ε抗体(OKT3またはSP34-2)によって活性化されたものと比較した場合、抗TCR Vβ8a抗体(B-H.1)によって活性化されたヒトPBMCからのサイトカイン産生を示す図である。図18Aは、抗TCR Vβ8a抗体(B-H.1)によって活性化されたヒトPBMCが、類似のまたは低減したレベルのIFNγを産生することを示す。図18Bは、抗TCR Vβ8a抗体(B-H.1)によって活性化されたヒトPBMCが、抗CD3ε抗体(OKT3またはSP34-2)によって活性化されたものと比較した場合、より高いレベルのIL-2を産生することを示す。示されたデータは、n=6のドナーの代表的なものである。 図18Bは、抗TCR Vβ8a抗体(B-H.1)によって活性化されたヒトPBMCが、抗CD3ε抗体(OKT3またはSP34-2)によって活性化されたものと比較した場合、より高いレベルのIL-2を産生することを示す。示されたデータは、n=6のドナーの代表的なものである。 図19A~19Cは、抗TCR Vβ8a抗体(B-H.1)によって活性化されたヒトPBMCからのサイトカイン産生を示す図である。抗TCR Vβ8a抗体(B-H.1)によって活性化されたヒトPBMCは、抗CD3ε抗体(OKT3またはSP34-2)によって活性化されたPBMCと比較した場合、IL-6(図19A)、IL1b(図19B)を有意に産生せず、TNFa(図19C)はより少ない。示されたデータは、n=6のドナーの代表的なものである。 図19A~19Cは、抗TCR Vβ8a抗体(B-H.1)によって活性化されたヒトPBMCからのサイトカイン産生を示す図である。抗TCR Vβ8a抗体(B-H.1)によって活性化されたヒトPBMCは、抗CD3ε抗体(OKT3またはSP34-2)によって活性化されたPBMCと比較した場合、IL-6(図19A)、IL1b(図19B)を有意に産生せず、TNFa(図19C)はより少ない。示されたデータは、n=6のドナーの代表的なものである。 図19A~19Cは、抗TCR Vβ8a抗体(B-H.1)によって活性化されたヒトPBMCからのサイトカイン産生を示す図である。抗TCR Vβ8a抗体(B-H.1)によって活性化されたヒトPBMCは、抗CD3ε抗体(OKT3またはSP34-2)によって活性化されたPBMCと比較した場合、IL-6(図19A)、IL1b(図19B)を有意に産生せず、TNFa(図19C)はより少ない。示されたデータは、n=6のドナーの代表的なものである。 図20A~20Eは、対照抗CD3e抗体(OKT3)と比較して、抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCからのサイトカイン産生を示す図である。図20Aは、抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCが、類似のまたは低減したレベルのIFNγを産生することを示す。図20Bは、抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCが、抗CD3ε抗体(OKT3)によって活性化されたものと比較した場合、より高いレベルのIL-2を産生することを示す。抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCは、IL-1β(図20C)、IL-6(図20D)、またはTNFアルファ(図20E)を有意に産生しない。示されたデータは、n=4のドナーの代表的なものである。 図20A~20Eは、対照抗CD3e抗体(OKT3)と比較して、抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCからのサイトカイン産生を示す図である。図20Aは、抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCが、類似のまたは低減したレベルのIFNγを産生することを示す。図20Bは、抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCが、抗CD3ε抗体(OKT3)によって活性化されたものと比較した場合、より高いレベルのIL-2を産生することを示す。抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCは、IL-1β(図20C)、IL-6(図20D)、またはTNFアルファ(図20E)を有意に産生しない。示されたデータは、n=4のドナーの代表的なものである。 図20A~20Eは、対照抗CD3e抗体(OKT3)と比較して、抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCからのサイトカイン産生を示す図である。図20Aは、抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCが、類似のまたは低減したレベルのIFNγを産生することを示す。図20Bは、抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCが、抗CD3ε抗体(OKT3)によって活性化されたものと比較した場合、より高いレベルのIL-2を産生することを示す。抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCは、IL-1β(図20C)、IL-6(図20D)、またはTNFアルファ(図20E)を有意に産生しない。示されたデータは、n=4のドナーの代表的なものである。 図20A~20Eは、対照抗CD3e抗体(OKT3)と比較して、抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCからのサイトカイン産生を示す図である。図20Aは、抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCが、類似のまたは低減したレベルのIFNγを産生することを示す。図20Bは、抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCが、抗CD3ε抗体(OKT3)によって活性化されたものと比較した場合、より高いレベルのIL-2を産生することを示す。抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCは、IL-1β(図20C)、IL-6(図20D)、またはTNFアルファ(図20E)を有意に産生しない。示されたデータは、n=4のドナーの代表的なものである。 図20A~20Eは、対照抗CD3e抗体(OKT3)と比較して、抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCからのサイトカイン産生を示す図である。図20Aは、抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCが、類似のまたは低減したレベルのIFNγを産生することを示す。図20Bは、抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCが、抗CD3ε抗体(OKT3)によって活性化されたものと比較した場合、より高いレベルのIL-2を産生することを示す。抗TCRβV抗体D抗体によって活性化されたヒトPBMCは、IL-1β(図20C)、IL-6(図20D)、またはTNFアルファ(図20E)を有意に産生しない。示されたデータは、n=4のドナーの代表的なものである。 図21A~21Bは、抗TCR Vβ5抗体(抗体E)によって活性化されたヒトPBMCからのサイトカイン産生を示す図である。図21Aは、抗TCR Vβ5抗体によって活性化されたヒトPBMCが、抗CD3ε抗体(OKT3またはSP34-2)によって活性化されたPBMCSと比較して類似のまたは低減したレベルのIFNγを産生することを示す。図21Bは、抗TCR Vβ5 1抗体によって活性化されたヒトPBMCが、抗CD3ε抗体(OKT3またはSP34-2)によって活性化されたものと比較した場合、より高いレベルのIL-2を産生することを示す。示されたデータは、n=4のドナーの代表的なものである。 図21Bは、抗TCR Vβ5 1抗体によって活性化されたヒトPBMCが、抗CD3ε抗体(OKT3またはSP34-2)によって活性化されたものと比較した場合、より高いレベルのIL-2を産生することを示す。示されたデータは、n=4のドナーの代表的なものである。 図22A~22Dは、抗TCR Vβ5抗体(抗体E)によって活性化されたヒトPBMCからのサイトカイン産生を示す図である。抗TCR Vβ5抗体によって活性化されたヒトPBMCは、抗CD3ε抗体(OKT3またはSP34-2)によって活性化されたPBMCと比較して、IL-1β(図22A)、IL-6(図22B)、TNFアルファ(図22C)、またはIL-10(図22D)を有意に産生しない。示されたデータは、n=4のドナーの代表的なものである。 図22A~22Dは、抗TCR Vβ5抗体(抗体E)によって活性化されたヒトPBMCからのサイトカイン産生を示す図である。抗TCR Vβ5抗体によって活性化されたヒトPBMCは、抗CD3ε抗体(OKT3またはSP34-2)によって活性化されたPBMCと比較して、IL-1β(図22A)、IL-6(図22B)、TNFアルファ(図22C)、またはIL-10(図22D)を有意に産生しない。示されたデータは、n=4のドナーの代表的なものである。 図22A~22Dは、抗TCR Vβ5抗体(抗体E)によって活性化されたヒトPBMCからのサイトカイン産生を示す図である。抗TCR Vβ5抗体によって活性化されたヒトPBMCは、抗CD3ε抗体(OKT3またはSP34-2)によって活性化されたPBMCと比較して、IL-1β(図22A)、IL-6(図22B)、TNFアルファ(図22C)、またはIL-10(図22D)を有意に産生しない。示されたデータは、n=4のドナーの代表的なものである。 図22A~22Dは、抗TCR Vβ5抗体(抗体E)によって活性化されたヒトPBMCからのサイトカイン産生を示す図である。抗TCR Vβ5抗体によって活性化されたヒトPBMCは、抗CD3ε抗体(OKT3またはSP34-2)によって活性化されたPBMCと比較して、IL-1β(図22A)、IL-6(図22B)、TNFアルファ(図22C)、またはIL-10(図22D)を有意に産生しない。示されたデータは、n=4のドナーの代表的なものである。 図23A~23Eは、抗TCRβV結合部分およびBCMA結合部分を含む二重標的化(二特異性分子)によって活性化されたヒトPBMCからのサイトカイン産生を示す図である。図23Aは、二特異性分子によって活性化されたヒトPBMCが、抗CD3ε抗体(OKT3)によって活性化されたPBMCSと類似のまたは低減したレベルのIFNγを産生することを示す。図23Bは、二特異性分子によって活性化されたヒトPBMCが、抗CD3ε抗体(OKT3)によって活性化されたPBMCと比較した場合、より高いレベルのIL-2を産生することを示す。二特異性分子によって活性化されたヒトPBMCは、IL-1ベータ(図23C)、IL-6(図23C)、TNFアルファ(図23E)、またはIL-10(図23F)を有意に産生しない。示されたデータは、n=3のドナーの代表的なものである。 図23Bは、二特異性分子によって活性化されたヒトPBMCが、抗CD3ε抗体(OKT3)によって活性化されたPBMCと比較した場合、より高いレベルのIL-2を産生することを示す。二特異性分子によって活性化されたヒトPBMCは、IL-1ベータ(図23C)、IL-6(図23C)、TNFアルファ(図23E)、またはIL-10(図23F)を有意に産生しない。示されたデータは、n=3のドナーの代表的なものである。 図23Bは、二特異性分子によって活性化されたヒトPBMCが、抗CD3ε抗体(OKT3)によって活性化されたPBMCと比較した場合、より高いレベルのIL-2を産生することを示す。二特異性分子によって活性化されたヒトPBMCは、IL-1ベータ(図23C)、IL-6(図23C)、TNFアルファ(図23E)、またはIL-10(図23F)を有意に産生しない。示されたデータは、n=3のドナーの代表的なものである。 図23Bは、二特異性分子によって活性化されたヒトPBMCが、抗CD3ε抗体(OKT3)によって活性化されたPBMCと比較した場合、より高いレベルのIL-2を産生することを示す。二特異性分子によって活性化されたヒトPBMCは、IL-1ベータ(図23C)、IL-6(図23C)、TNFアルファ(図23E)、またはIL-10(図23F)を有意に産生しない。示されたデータは、n=3のドナーの代表的なものである。 図23Bは、二特異性分子によって活性化されたヒトPBMCが、抗CD3ε抗体(OKT3)によって活性化されたPBMCと比較した場合、より高いレベルのIL-2を産生することを示す。二特異性分子によって活性化されたヒトPBMCは、IL-1ベータ(図23C)、IL-6(図23C)、TNFアルファ(図23E)、またはIL-10(図23F)を有意に産生しない。示されたデータは、n=3のドナーの代表的なものである。 図23Bは、二特異性分子によって活性化されたヒトPBMCが、抗CD3ε抗体(OKT3)によって活性化されたPBMCと比較した場合、より高いレベルのIL-2を産生することを示す。二特異性分子によって活性化されたヒトPBMCは、IL-1β(図23C)、IL-6(図23C)、TNFアルファ(図23E)、またはIL-10(図23F)を有意に産生しない。示されたデータは、n=3のドナーの代表的なものである。 図24A~24Bは、7つの異なるサブファミリー:TCRβV6サブファミリー(TCRβV6-5およびTCRβV6-4を示す)、TCRβV28サブファミリー、TCRβV19サブファミリー、TCRβV9サブファミリー、TCRβV5サブファミリー、TCRβV20サブファミリーおよびTCRβV12サブファミリーからの8つのTCRβVタンパク質の構造および配列を示す図である。図24Aは、異なるTCRβVタンパク質の構造アラインメントを示す。丸で囲んだ領域は、本明細書に開示される抗TCRβV抗体のための提案された結合部位を含む外向きの領域を表す。図24Bは、図24Aに示されるタンパク質のアミノ酸配列アラインメントを示す(登場順にそれぞれ配列番号3449~3456)。種々のTCRβVタンパク質(7つの異なるTCRβVサブファミリーに由来する)は、多様な配列を有するが、保存された(類似の)構造および機能を共有する。 図24Bは、図24Aに示されるタンパク質のアミノ酸配列アラインメントを示す(登場順にそれぞれ配列番号3449~3456)。種々のTCRβVタンパク質(7つの異なるTCRβVサブファミリーに由来する)は、多様な配列を有するが、保存された(類似の)構造および機能を共有する。 図25A~25Jは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図25A~25Jは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図25A~25Jは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図25A~25Jは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図25A~25Jは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図25A~25Jは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図25A~25Jは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図25A~25Jは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図25A~25Jは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図25A~25Jは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図26A~26Hは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図26A~26Hは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図26A~26Hは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図26A~26Hは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図26A~26Hは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図26A~26Hは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図26A~26Hは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図26A~26Hは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図27A~27Lは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図27A~27Lは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図27A~27Lは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図27A~27Lは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図27A~27Lは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図27A~27Lは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図27A~27Lは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図27A~27Lは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図27A~27Lは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図27A~27Lは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図27A~27Lは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 図27A~27Lは、抗TCRVb抗体(分子H)、対照アイソタイプ(122)または抗CD3e抗体(OKT3)を含む二特異性分子である抗TCRVb抗体(A-H.1、B-H.1)で活性化されたPBMCのサイトカインまたはケモカイン分泌を示す図である。示されたデータは、n=2のドナーの代表的なものであり、2つの独立した実験の代表的なものである。 10~28日目にRaji-luc細胞を移植したNOD/SCID/IL-2Rγヌル(NSG)マウスにおける平均腫瘍体積を示すグラフである。スターは、PBMC移植を示す。白三角形は、示された抗体による抗体処置を示す。 図29A~Bは、がん細胞を移植し、示された抗体で処置されたNOD/SCID/IL-2Rγヌル(NSG)マウスにおける平均腫瘍負荷(総フラックス)を示す図である。NSGマウスに1日目にPBMCを移植し、続いて、7日目にがん細胞を注入した(図29A中のRaji-luc;図29B中のK562-Luc対照)。16日目に、示された抗体による抗体処置が開始された。図29Aは、Raji-luc細胞を移植したNOD/SCID/IL-2Rγヌル(NSG)マウスにおける、16~37日目の平均腫瘍負荷を示す。図29Bは、K562-luc細胞を移植した動物における、16~30日目の平均腫瘍負荷(総フラックス)を示す。 図29A~Bは、がん細胞を移植し、示された抗体で処置されたNOD/SCID/IL-2Rγヌル(NSG)マウスにおける平均腫瘍負荷(総フラックス)を示す図である。NSGマウスに1日目にPBMCを移植し、続いて、7日目にがん細胞を注入した(図29A中のRaji-luc;図29B中のK562-Luc対照)。16日目に、示された抗体による抗体処置が開始された。図29Aは、Raji-luc細胞を移植したNOD/SCID/IL-2Rγヌル(NSG)マウスにおける、16~37日目の平均腫瘍負荷を示す。図29Bは、K562-luc細胞を移植した動物における、16~30日目の平均腫瘍負荷(総フラックス)を示す。 RPMI-8226細胞を移植したNOD/SCID/IL-2Rγヌル(NSG)マウスにおける平均腫瘍負荷(総フラックス)の平均腫瘍体積を示すグラフである。RPMI-8226細胞を1日目に移植した。11日目に、PBMCをマウスに移植し、17日目に抗体処置を開始した。 図31A~31Bは、異なる抗体濃度における標的細胞溶解%を示すグラフである。図31Aは、抗TCR Vβ13.1/抗CD19(分子F)、抗CD3/抗CD19、および抗TCR Vβ13.1(A-H.1)を用いて生成されたデータを示す。図31Bは、抗TCR Vβ13.1/抗BCMA(分子G)、抗CD3/抗BCMA、および抗TCR Vβ13.1(A-H.1)を用いて生成されたデータを示す。 図31Bは、抗TCR Vβ13.1/抗BCMA(分子G)、抗CD3/抗BCMA、および抗TCR Vβ13.1(A-H.1)を用いて生成されたデータを示す。 図32A~32Fは、1日目、2日目、3日目、および5日目に、抗TCR Vβ/抗BCMA(分子H)または抗CD3(OKT3)によって刺激されたサイトカイン分泌を示すグラフである。調べられたサイトカインには、IFNγ、IL-2、IL-1β、IL-6、IL-10、およびTNFα(それぞれ図32A~32F)が含まれる。 図32A~32Fは、1日目、2日目、3日目、および5日目に、抗TCR Vβ/抗BCMA(分子H)または抗CD3(OKT3)によって刺激されたサイトカイン分泌を示すグラフである。調べられたサイトカインには、IFNγ、IL-2、IL-1β、IL-6、IL-10、およびTNFα(それぞれ図32A~32F)が含まれる。 図32A~32Fは、1日目、2日目、3日目、および5日目に、抗TCR Vβ/抗BCMA(分子H)または抗CD3(OKT3)によって刺激されたサイトカイン分泌を示すグラフである。調べられたサイトカインには、IFNγ、IL-2、IL-1β、IL-6、IL-10、およびTNFα(それぞれ図32A~32F)が含まれる。 図32A~32Fは、1日目、2日目、3日目、および5日目に、抗TCR Vβ/抗BCMA(分子H)または抗CD3(OKT3)によって刺激されたサイトカイン分泌を示すグラフである。調べられたサイトカインには、IFNγ、IL-2、IL-1β、IL-6、IL-10、およびTNFα(それぞれ図32A~32F)が含まれる。 図32A~32Fは、1日目、2日目、3日目、および5日目に、抗TCR Vβ/抗BCMA(分子H)または抗CD3(OKT3)によって刺激されたサイトカイン分泌を示すグラフである。調べられたサイトカインには、IFNγ、IL-2、IL-1β、IL-6、IL-10、およびTNFα(それぞれ図32A~32F)が含まれる。 図32A~32Fは、1日目、2日目、3日目、および5日目に、抗TCR Vβ/抗BCMA(分子H)または抗CD3(OKT3)によって刺激されたサイトカイン分泌を示すグラフである。調べられたサイトカインには、IFNγ、IL-2、IL-1β、IL-6、IL-10、およびTNFα(それぞれ図32A~32F)が含まれる。 図33A~33Fは、2日目および5日目に、抗TRBC1(抗体F)または抗CD3(OKT3)によって刺激されたサイトカイン分泌を示すグラフである。調べられたサイトカインには、IFNγ、IL-2、IL-1β、IL-6、IL-10、およびTNFα(それぞれ図33A~33F)が含まれる。 図33A~33Fは、2日目および5日目に、抗TRBC1(抗体F)または抗CD3(OKT3)によって刺激されたサイトカイン分泌を示すグラフである。調べられたサイトカインには、IFNγ、IL-2、IL-1β、IL-6、IL-10、およびTNFα(それぞれ図33A~33F)が含まれる。 図33A~33Fは、2日目および5日目に、抗TRBC1(抗体F)または抗CD3(OKT3)によって刺激されたサイトカイン分泌を示すグラフである。調べられたサイトカインには、IFNγ、IL-2、IL-1β、IL-6、IL-10、およびTNFα(それぞれ図33A~33F)が含まれる。 図33A~33Fは、2日目および5日目に、抗TRBC1(抗体F)または抗CD3(OKT3)によって刺激されたサイトカイン分泌を示すグラフである。調べられたサイトカインには、IFNγ、IL-2、IL-1β、IL-6、IL-10、およびTNFα(それぞれ図33A~33F)が含まれる。 図33A~33Fは、2日目および5日目に、抗TRBC1(抗体F)または抗CD3(OKT3)によって刺激されたサイトカイン分泌を示すグラフである。調べられたサイトカインには、IFNγ、IL-2、IL-1β、IL-6、IL-10、およびTNFα(それぞれ図33A~33F)が含まれる。 図33A~33Fは、2日目および5日目に、抗TRBC1(抗体F)または抗CD3(OKT3)によって刺激されたサイトカイン分泌を示すグラフである。調べられたサイトカインには、IFNγ、IL-2、IL-1β、IL-6、IL-10、およびTNFα(それぞれ図33A~33F)が含まれる。 図34は、抗TCRvb 6-5 v1を使用した8日にかけてのTCRvb 6-5+ T細胞の拡大を示すFACSプロットである。 図35は、抗CD3ε抗体OKT3(100nM)を使用した8日にかけてのTCRvb 6-5+ CD4+ T細胞およびTCRvb 6-5+ CD8+ T細胞の拡大を示す棒グラフである。 図36は、抗TCRvb 6-5 v1抗体(100nM)を使用した8日にかけてのTCRvb 6-5+ CD4+ T細胞およびTCRvb 6-5+ CD8+ T細胞の拡大を示す棒グラフである。 図37は、抗TCRvb 6-5 v1または抗CD3ε抗体OKT3を使用した8日にかけてのTCRvb 6-5+ T細胞の拡大を示すFACSプロットである。 図38Aは、示される抗体との8日の培養後のPBMC培養物中のTCRβV 6-5+ T細胞のパーセンテージを示す棒グラフである。5つの複製物についてのデータを示す。 図38Bは、示される抗体との8日の培養後の精製されたT細胞培養物中のTCRβV 6-5+ T細胞のパーセンテージを示す棒グラフである。5つの複製物についてのデータを示す。 図39Aは、示される抗体との8日の培養後のPBMC培養物中のTCRβV 6-5+ T細胞の相対数を示す棒グラフである。 図39Bは、示される抗体との8日の培養後のPBMC培養物中のTCRβV 6-5+ T細胞の相対数を示す棒グラフである。 図40Aは、示される抗体との8日の培養後の精製されたT細胞培養物中のTCRβV 6-5+ T細胞の相対数を示す棒グラフである。 図40Bは、示される抗体との8日の培養後の精製されたT細胞培養物中のTCRβV 6-5+ T細胞の相対数を示す棒グラフである。 図41は、抗CD3ε抗体OKT3または抗TCRvb 6-5 v1抗体のいずれかとの8日のT細胞培養後の総CD3+ T細胞数(増加倍数)を示す線グラフである。 図42は、TCRβV 6-5 v1活性化T細胞または抗CD3ε(OKT3)活性化T細胞による標的細胞の動態を示す一連の線グラフである。異なる3人のドナーからのT細胞を利用した(ドナー6769、ドナー9880、ドナー5411)。 図43Aは、T細胞予備活性化なしでのTCRβV 6-5 v1活性化T細胞または抗CD3ε(OKT3)活性化T細胞によるT細胞による標的細胞溶解のパーセントを示す散布図である。標的細胞およびエフェクターT細胞の間の共培養の6日目におけるデータを提示している。 図43Bは、4日のT細胞予備活性化ありでのTCRβV 6-5 v1活性化T細胞または抗CD3ε(OKT3)活性化T細胞によるT細胞による標的細胞溶解のパーセントを示す散布図である。標的細胞およびエフェクターT細胞の間の共培養の2日目(T細胞予備活性化の4日後)におけるデータを提示している。 図44は、4日のT細胞予備活性化ありでのTCRβV 6-5 v1活性化T細胞または抗CD3ε(OKT3)活性化T細胞によるT細胞による標的細胞溶解のパーセントを示す散布図である。標的細胞およびエフェクターT細胞の間の共培養の2日目(T細胞予備活性化の4日後)におけるデータを提示している。 図45は、TCRβV 6-5 v1活性化T細胞または抗CD3ε(OKT3)活性化T細胞(100nMの各抗体)によるT細胞による標的細胞溶解を示す棒グラフである。データは各実験条件の7つの複製物を含む。 図46は、抗体活性化後0、1、2、4、6、または8日目における、SP34-2(抗CD3ε抗体)または抗TCRβV 6-5 v1(抗TCRβV 6-5抗体)のいずれかを用いて活性化されたCD4+ TCRβV 6-5またはCD4+ TCRβV 6-5 T細胞上のCD3εの細胞表面発現を示す一連のFACSプロットである。 図47は、抗体活性化後0、1、2、4、6、または8日目における、SP34-2(抗CD3ε抗体)または抗TCRβV 6-5 v1(抗TCRβV 6-5抗体)のいずれかを用いて活性化されたCD8+ TCRβV 6-5またはCD8+ TCRβV 6-5 T細胞上のCD3εの細胞表面発現を示す一連のFACSプロットである。 図48は、抗体活性化後0、1、2、4、6、または8日目における、SP34-2(抗CD3ε抗体)または抗TCRβV 6-5 v1(抗TCRβV 6-5抗体)のいずれかを用いて活性化されたCD4+ TCRβV 6-5またはCD4+ TCRβV 6-5 T細胞上のTCRβVの細胞表面発現を示す一連のFACSプロットである。 図49は、抗体活性化後0、1、2、4、6、または8日目における、SP34-2(抗CD3ε抗体)または抗TCRβV 6-5 v1(抗TCRβV 6-5抗体)のいずれかを用いて活性化されたCD8+ TCRβV 6-5またはCD8+ TCRβV 6-5 T細胞上のTCRβVの細胞表面発現を示す一連のFACSプロットである。 図50Aは、カニクイザルPBMCの活性化の7日後の未刺激(左)または抗TCRβV 6-5 v1を用いて刺激された(右)TCRβV 6-5カニクイザルT細胞拡大のFACSプロットを示す。ドナーDW8NからのPBMC(新鮮なPBMC試料、雄、8歳、体重7.9kg)を使用した。 図50Bは、カニクイザルPBMCの活性化の7日後の未刺激(左)または抗TCRβV 6-5 v1を用いて刺激された(右)TCRβV 6-5カニクイザルT細胞拡大のFACSプロットを示す。ドナーG709からのPBMC(凍結保存された試料、雄、6歳、体重4.7kg)を使用した。 図51は、凍結保存されたドナーDW8NカニクイザルPBMCの活性化後の未刺激(左)、SP34-2(抗CD3ε抗体)を用いて刺激された(中央);または抗TCRβV 6-5 v1を用いて刺激された(右)TCRβV 6-5カニクイザルT細胞拡大のFACSプロットおよび対応する顕微鏡画像を示す。顕微鏡画像は細胞クラスター形成(丸によって示される)を示す。 図52は、γδ T細胞精製前のPBMCのFACSゲーティング/染色を示すFACSプロットの図解を示す。 図53は、精製されたγδ T細胞集団のFACSゲーティング/染色を示すFACSプロットの図解を示す。 図54は、抗CD3ε抗体(SP34-2)(左)または抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1)(右)を用いた精製されたγδ T細胞集団の活性化を示す。 図55Aは、抗CD3ε抗体(SP34-2)、抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1)を用いて活性化された、または未刺激の精製されたγδ T細胞集団からのIFNγの放出を示す。 図55Bは、抗CD3ε抗体(SP34-2)、抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1)を用いて活性化された、または未刺激の精製されたγδ T細胞集団からのTNFαの放出を示す。 図55Cは、抗CD3ε抗体(SP34-2)、抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1)を用いて活性化された、または未刺激の精製されたγδ T細胞集団からのIL-2の放出を示す。 図55Dは、抗CD3ε抗体(SP34-2)、抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1)を用いて活性化された、または未刺激の精製されたγδ T細胞集団からのIL-17Aの放出を示す。 図55Eは、抗CD3ε抗体(SP34-2)、抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1)を用いて活性化された、または未刺激の精製されたγδ T細胞集団からのIL-1αの放出を示す。 図55Fは、抗CD3ε抗体(SP34-2)、抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1)を用いて活性化された、または未刺激の精製されたγδ T細胞集団からのIL-1βの放出を示す。 図55Gは、抗CD3ε抗体(SP34-2)、抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1)を用いて活性化された、または未刺激の精製されたγδ T細胞集団からのIL-6の放出を示す。 図55Hは、抗CD3ε抗体(SP34-2)、抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1)を用いて活性化された、または未刺激の精製されたγδ T細胞集団からのIL-10の放出を示す。 図56は、すべてのTCRアルファVセグメント(TRAV遺伝子群)およびそれらのバリアント(上)、すべてのTCRベータVセグメント6-5バリアント(TRBV6-5遺伝子)(左下)、ならびに6-5を除外したすべてのTCRベータVセグメントおよびバリアント(右下)の相対表現を示す。 図57Aは、抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1)を用いて拡大させたCD4+ T細胞の表現型マーカーを示すFACSプロットである。定義された表現型は、TEMRA(左上)、ナイーブ/TSCM(右上)、TEM(左下)、およびTCM(右下)を含む。 図57Bは、抗CD3ε抗体(OKT3)を用いて拡大させたCD4+ T細胞の表現型マーカーを示すFACSプロットである。定義された表現型は、TEMRA(左上)、ナイーブ/TSCM(右上)、TEM(左下)、およびTCM(右下)を含む。 図58Aは、抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1)を用いて拡大させたCD8+ T細胞の表現型マーカーを示すFACSプロットである。定義された表現型は、TEMRA(左上)、ナイーブ/TSCM(右上)、TEM(左下)、およびTCM(右下)を含む。 図58Bは、抗CD3ε抗体(OKT3)を用いて拡大させたCD8+ T細胞の表現型マーカーを示すFACSプロットである。定義された表現型は、TEMRA(左上)、ナイーブ/TSCM(右上)、TEM(左下)、およびTCM(右下)を含む。 図59Aは、抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1)、抗CD3ε抗体(OKT3)を用いて活性化された、または未刺激のT細胞培養物からのPD1発現CD4+ T細胞のパーセンテージを示す棒グラフである。 図59Bは、抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1)、抗CD3ε抗体(OKT3)を用いて活性化された、または未刺激のT細胞培養物からのPD1発現CD8+ T細胞のパーセンテージを示す棒グラフである。 図60Aは、抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1)、抗CD3ε抗体(OKT3)を用いて活性化された、または未刺激のT細胞培養物からのCD4+ T細胞によるKi-67の発現を示す棒グラフである。 図60Bは、抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1)、抗CD3ε抗体(OKT3)を用いて活性化された、または未刺激のT細胞培養物からのCD8+ T細胞によるKi-67の発現を示す棒グラフである。 図61Aは、CD57(18.7%)を発現する抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1)を使用して活性化されたTEMRA様CD8+ T細胞のパーセンテージを示すFACSプロットである。 図61Bは、CD57(46.8%)を発現する抗CD3ε抗体(OKT3)を使用して活性化されたTEM様CD8+ T細胞のパーセンテージおよびCD57(18.9%)を発現する抗CD3ε抗体(OKT3)を使用して活性化されたTCM様CD8+ T細胞のパーセンテージを示すFACSプロットである。 図62は、抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1)、抗CD3ε抗体(OKT3)を用いて活性化された、または未刺激のT細胞培養物からのCD4+(上)またはCD8+(下)T細胞によるCD27の発現を示す一連のFACSプロットを示す。 図63は、抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1)、抗CD3ε抗体(OKT3)を用いて活性化された、または未刺激のT細胞培養物からのCD4+(上)またはCD8+(下)T細胞によるOX40、41BB、およびICOSの発現を示す一連のFACSプロットを示す。 図64は、BCMAおよび抗TCR Vβ抗体、抗TCR Vβ 6-5 v1を用いた活性化の1、2、3、4、5、6、および8日後のCD3+(CD4ゲート)TCRβV 6-5+ T細胞のパーセンテージを示す一連のFACSプロットを示す。 図64は、BCMAおよび抗TCR Vβ抗体、抗TCR Vβ 6-5 v1を用いた活性化の1、2、3、4、5、6、および8日後のCD3+(CD4ゲート)TCRβV 6-5+ T細胞のパーセンテージを示す一連のFACSプロットを示す。 図65Aは、活性化後0日目におけるアイソタイプ対照(IgG1 N297A)、抗TCRβV(抗TCR Vβ 6-5 v1)、または抗CD3ε(OKT3)抗体を使用して拡大させたCD4+ T細胞のパーセンテージを示す一連のFACSプロットを示す。 図65Bは、活性化後1日目におけるアイソタイプ対照(IgG1 N297A)、抗TCRβV(抗TCR Vβ 6-5 v1)、または抗CD3ε(OKT3)抗体を使用して拡大させたCD4+ T細胞のパーセンテージを示す一連のFACSプロットを示す。 図65Cは、活性化後2日目におけるアイソタイプ対照(IgG1 N297A)、抗TCRβV(抗TCR Vβ 6-5 v1)、または抗CD3ε(OKT3)抗体を使用して拡大させたCD4+ T細胞のパーセンテージを示す一連のFACSプロットを示す。 図65Dは、活性化後3日目におけるアイソタイプ対照(IgG1 N297A)、抗TCRβV(抗TCR Vβ 6-5 v1)、または抗CD3ε(OKT3)抗体を使用して拡大させたCD4+ T細胞のパーセンテージを示す一連のFACSプロットを示す。 図65Eは、活性化後4日目におけるアイソタイプ対照(IgG1 N297A)、抗TCRβV(抗TCR Vβ 6-5 v1)、または抗CD3ε(OKT3)抗体を使用して拡大させたCD4+ T細胞のパーセンテージを示す一連のFACSプロットを示す。 図65Fは、活性化後5日目におけるアイソタイプ対照(IgG1 N297A)、抗TCRβV(抗TCR Vβ 6-5 v1)、または抗CD3ε(OKT3)抗体を使用して拡大させたCD4+ T細胞のパーセンテージを示す一連のFACSプロットを示す。 図65Gは、活性化後6日目におけるアイソタイプ対照(IgG1 N297A)、抗TCRβV(抗TCR Vβ 6-5 v1)、または抗CD3ε(OKT3)抗体を使用して拡大させたCD4+ T細胞のパーセンテージを示す一連のFACSプロットを示す。 図65Hは、活性化後8日目におけるアイソタイプ対照(IgG1 N297A)、抗TCRβV(抗TCR Vβ 6-5 v1)、または抗CD3ε(OKT3)抗体を使用して拡大させたCD4+ T細胞のパーセンテージを示す一連のFACSプロットを示す。 図66Aは、示される抗体を用いて活性化されたT細胞培養物の解糖からのATP産生を示す棒グラフである。 図66Bは、示される抗体を用いて活性化されたT細胞培養物の酸化的リン酸化からのATP産生を示す棒グラフである。 図67は、示される抗体を用いて活性化された約0~75分のT細胞の酸素消費速度(OCR)を示す線グラフである。 図68Aは、基礎呼吸の間の示される抗体を用いて活性化されたT細胞の酸素消費速度(OCR)を示す。 図68Bは、最大呼吸の間の示される抗体を用いて活性化されたT細胞の酸素消費速度(OCR)を示す。 図68Cは、予備呼吸能の間の示される抗体を用いて活性化されたT細胞の酸素消費速度(OCR)を示す。 図68Dは、それぞれ図68Aおよび図68Bに示される基礎呼吸および最大呼吸の領域を示す線グラフである。 図69Aは、抗TCRβV 6-5 v1を用いて活性化され、かつ示される抗体を用いて再刺激されたT細胞培養物の解糖からのATP産生を示す棒グラフである。 図69Bは、抗TCRβV 6-5 v1を用いて活性化され、かつ示される抗体を用いて再刺激されたT細胞培養物の酸化的リン酸化からのATP産生を示す棒グラフである。 図70A~70Gは、BHM1710(抗TCRVB)、親和性低減抗CD3抗体(TB)およびSP34抗CD3e抗体を用いたIFNg、TNFa、IL-1a、IL-1b、IL-6(CRSおよび神経毒性関連サイトカイン)の発現を示すグラフである。 図70A~70Gは、BHM1710(抗TCRVB)、親和性低減抗CD3抗体(TB)およびSP34抗CD3e抗体を用いたIFNg、TNFa、IL-1a、IL-1b、IL-6(CRSおよび神経毒性関連サイトカイン)の発現を示すグラフである。 図70A~70Gは、BHM1710(抗TCRVB)、親和性低減抗CD3抗体(TB)およびSP34抗CD3e抗体を用いたIFNg、TNFa、IL-1a、IL-1b、IL-6(CRSおよび神経毒性関連サイトカイン)の発現を示すグラフである。 図70A~70Gは、BHM1710(抗TCRVB)、親和性低減抗CD3抗体(TB)およびSP34抗CD3e抗体を用いたIFNg、TNFa、IL-1a、IL-1b、IL-6(CRSおよび神経毒性関連サイトカイン)の発現を示すグラフである。 図70A~70Gは、BHM1710(抗TCRVB)、親和性低減抗CD3抗体(TB)およびSP34抗CD3e抗体を用いたIFNg、TNFa、IL-1a、IL-1b、IL-6(CRSおよび神経毒性関連サイトカイン)の発現を示すグラフである。 図70A~70Gは、BHM1710(抗TCRVB)、親和性低減抗CD3抗体(TB)およびSP34抗CD3e抗体を用いたIFNg、TNFa、IL-1a、IL-1b、IL-6(CRSおよび神経毒性関連サイトカイン)の発現を示すグラフである。 図70A~70Gは、BHM1710(抗TCRVB)、親和性低減抗CD3抗体(TB)およびSP34抗CD3e抗体を用いたIFNg、TNFa、IL-1a、IL-1b、IL-6(CRSおよび神経毒性関連サイトカイン)の発現を示すグラフである。 図71は、示される抗体を用いて活性化されたT細胞培養物から拡大させたNK細胞のパーセンテージを示すFACSプロットである。 図72は、示される抗体を用いて活性化されたT細胞培養物から拡大させたNK細胞の数を示す棒グラフである。 図73は、示される抗体を用いて活性化されたT細胞培養物によって誘導されたNK細胞増殖を示す一連のFACSプロットを示す。 図74は、標的K562細胞のNK細胞媒介性溶解を決定するための実施例に記載されるアッセイを示す図解である。 図75は、示される抗体を用いて活性化されたPBMCによって活性化されたNK細胞によって媒介される標的細胞溶解パーセントを示す棒グラフである。 図76は、示される抗体(アイソタイプ対照またはOKT3)を用いて活性化/拡大させたPBMC培養物からのNK細胞の増殖を示す一連のFACSプロットを示す。3人のドナー(D1、D2、およびD3)からのPBMCを分析した。 図77は、示される抗体(抗TCRvβ 12-3/4 v1または抗TCRvβ 12-3/4 v2)を用いて活性化/拡大させたPBMC培養物からのNK細胞の増殖を示す一連のFACSプロットを示す。3人のドナー(D1、D2、およびD3)からのPBMCを分析した。 図78は、示される抗体(抗TCRvβ 12-3/4 v3またはSP34-2)を用いて活性化/拡大させたPBMC培養物からのNK細胞の増殖を示す一連のFACSプロットを示す。3人のドナー(D1、D2、およびD3)からのPBMCを分析した。 図79は、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、またはSP34)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、または5)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIFNγの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図80は、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、またはSP34)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、または5)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-2の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図81は、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、またはSP34)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、または5)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-15の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図82は、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、またはSP34)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、または5)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-1βの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図83は、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、またはSP34)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、または5)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-6の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図84は、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、またはSP34)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、または5)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-10の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図85は、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1またはSP34)を用いて活性化/拡大させたT細胞によって分泌された示されるサイトカインのレベルを示す棒グラフである。データは、17の個々のPBMCドナーの使用を含む。 図86Aは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1またはOKT3)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、5、または6)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIFNγの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図86Bは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1またはOKT3)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、5、または6)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-1βの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図86Cは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1またはOKT3)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、5、または6)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-4の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図86Dは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1またはOKT3)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、5、または6)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-6の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図86Eは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1またはOKT3)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、5、または6)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-10の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図86Fは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1またはOKT3)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、5、または6)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるTNFαの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図86Gは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1またはOKT3)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、5、または6)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-2の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図87Aは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、SP34-2、またはアイソタイプ対照)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、5、または6)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIFNγの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図87Bは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、SP34-2、またはアイソタイプ対照)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、5、または6)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-1βの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図87Cは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、SP34-2、またはアイソタイプ対照)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、5、または6)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-4の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図87Dは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、SP34-2、またはアイソタイプ対照)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、5、または6)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-6の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図87Eは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、SP34-2、またはアイソタイプ対照)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、5、または6)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-10の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図87Fは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、SP34-2、またはアイソタイプ対照)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、5、または6)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるTNFαの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図87Gは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、SP34-2、またはアイソタイプ対照)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、5、または6)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-2の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図88Aは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIFNγの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図88Bは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-1βの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図88Cは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-4の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図88Dは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-6の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図88Eは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-10の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図88Fは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるTNFαの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図88Gは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-2の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図89Aは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(2、5、または7)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-17Aの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図89Bは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(2、5、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-17Aの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図89Cは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1、OKT3、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(2、5、または7)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-17Aの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図89Dは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、5、または7)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-17Aの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Aは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIFNγの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Bは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-1βの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Cは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-4の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Dは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-6の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Eは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-10の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Fは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるTNFαの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Gは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-2の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Hは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-12p70の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Iは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-13の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Jは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-8の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Kは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるエキソタキシン(exotaxin)の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Lは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるエキソトキシン-3(exotoxin-3)の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Mは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-8の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Nは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIP-10の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Oは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるMCP-1の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Pは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるMCP-4の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Qは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるMDCの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Rは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるMIP-1aの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Sは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるMIP-1bの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Tは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるTARCの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Uは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるGMCSFの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Vは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-12-23p40の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Wは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-15の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Xは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-16の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Yは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-17aの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90Zは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-1aの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90AAは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-5の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90BBは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-7の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90CCは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるTNF-Bの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図90DDは、示される抗体(アイソタイプ対照;抗BCMA抗体を伴う抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 6-5 v1;抗TCRβV 123/4 v1、またはSP34-2)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、2、3、4、5、6、または8)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるVEGFの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図91は、異なるTCRVBクロノタイプサブファミリーの間の配列の関係のグラフ表現を示す。 図92Aは、示される抗体(抗TCRβV 12-3/4 v1またはSP34-2)を使用して8日間活性化/拡大させたPBMCからのサイトカイン放出のパーセンテージを示す棒グラフである。 図92Bは、示される抗体(抗TCRβV 5またはSP34-2)を使用して8日間活性化/拡大させたPBMCからのサイトカイン放出のパーセンテージを示す棒グラフである。 図92Cは、示される抗体(抗TCRβV 10またはSP34-2)を使用して8日間活性化/拡大させたPBMCからのサイトカイン放出のパーセンテージを示す棒グラフである。 図93Aは、示される日数(3または6)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIFNγの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図93Bは、示される日数(3または6)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-10の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図93Cは、示される日数(3または6)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-17Aの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図93Dは、示される日数(3または6)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-1αの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図93Eは、示される日数(3または6)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-1βの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図93Fは、示される日数(3または6)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-6の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図93Gは、示される日数(3または6)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるTNFαの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図93Hは、示される日数(3または6)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-2の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図94は、示される抗TCRVβ抗体を使用して6日間活性化/拡大させたPBMCのFACS分析からのデータを要約する棒グラフである。 図95Aは、示される日数(1、3、5、または7)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIFNγの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図95Bは、示される日数(1、3、5、または7)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-10の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図95Cは、示される日数(1、3、5、または7)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-17Aの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図95Dは、示される日数(1、3、5、または7)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-1αの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図95Eは、示される日数(1、3、5、または7)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-1βの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図95Fは、示される日数(1、3、5、または7)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-6の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図95Gは、示される日数(1、3、5、または7)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-4の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図95Hは、示される日数(1、3、5、または7)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-2の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図96は、示される抗TCRVβ抗体を使用して7日間活性化/拡大させたPBMCのFACS分析からのデータを要約する棒グラフである。 図97Aは、示される日数(3または6)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIFNγの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図97Bは、示される日数(3または6)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-10の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図97Cは、示される日数(3または6)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-17Aの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図97Dは、示される日数(3または6)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-1αの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図97Eは、示される日数(3または6)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-1βの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図97Fは、示される日数(3または6)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-6の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図97Gは、示される日数(3または6)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-4の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図97Hは、示される日数(3または6)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるTNFαの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図97Iは、示される日数(3または6)にわたり示される抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞によるIL-2の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図98Aは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1(プレート被覆)、抗CD3ε(プレート被覆)、抗TCRβV 6-5 v1(溶液中)、または抗CD3ε(溶液中)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、5、または7)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIFN-γの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図98Bは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1(プレート被覆)、抗CD3ε(プレート被覆)、抗TCRβV 6-5 v1(溶液中)、または抗CD3ε(溶液中)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、5、または7)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIFN-γの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図98Cは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1(プレート被覆)、抗CD3ε(プレート被覆)、抗TCRβV 6-5 v1(溶液中)、または抗CD3ε(溶液中)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、5、または7)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-1bの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図98Dは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1(プレート被覆)、抗CD3ε(プレート被覆)、抗TCRβV 6-5 v1(溶液中)、または抗CD3ε(溶液中)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、5、または7)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-6の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図98Eは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1(プレート被覆)、抗CD3ε(プレート被覆)、抗TCRβV 6-5 v1(溶液中)、または抗CD3ε(溶液中)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、5、または7)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-10の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図98Fは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1(プレート被覆)、抗CD3ε(プレート被覆)、抗TCRβV 6-5 v1(溶液中)、または抗CD3ε(溶液中)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、5、または7)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-15の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図98Gは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1(プレート被覆)、抗CD3ε(プレート被覆)、抗TCRβV 6-5 v1(溶液中)、または抗CD3ε(溶液中)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、5、または7)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-17Aの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図98Hは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1(プレート被覆)、抗CD3ε(プレート被覆)、抗TCRβV 6-5 v1(溶液中)、または抗CD3ε(溶液中)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、5、または7)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-1aの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図98Iは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1(プレート被覆)、抗CD3ε(プレート被覆)、抗TCRβV 6-5 v1(溶液中)、または抗CD3ε(溶液中)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、5、または7)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-1bの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図98Jは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1(プレート被覆)、抗CD3ε(プレート被覆)、抗TCRβV 6-5 v1(溶液中)、または抗CD3ε(溶液中)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、5、または7)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-2の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図98Kは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1(プレート被覆)、抗CD3ε(プレート被覆)、抗TCRβV 6-5 v1(溶液中)、または抗CD3ε(溶液中)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、5、または7)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるIL-4の分泌のレベルを示す棒グラフである。 図98Lは、示される抗体(抗TCRβV 6-5 v1(プレート被覆)、抗CD3ε(プレート被覆)、抗TCRβV 6-5 v1(溶液中)、または抗CD3ε(溶液中)を用いて活性化/拡大され、かつ示される日数(1、3、5、または7)にわたり前記抗体と培養されたT細胞によるTNF-aの分泌のレベルを示す棒グラフである。 図99は、PBMCがTM23とプレインキュベートされるかまたはそうされない(MH3-2単独)場合の2人のドナーのうちの1人からのPBMCに結合するMH3-2の能力を示すFACSプロットである。 図100は、PBMCがTM23とプレインキュベートされるかまたはそうされない(MH3-2単独)場合の2人のドナーのうちの1人からのPBMCに結合するMH3-2の能力を示すFACSプロットである。 図101Aは、PBMC CD4+ T細胞、抗CD3抗体を用いて拡大させたCD4+ T細胞(CD3拡大T細胞)、および抗TCRVβ 6-5抗体を用いて拡大させたCD4+ T細胞(薬物拡大T細胞)の多機能性強度指数(PSI)を示す棒グラフである。エフェクターメディエーターは、グランザイムB、IFNγ、MIP-1α、パーフォリン、TNFα、およびTNFβである。刺激性メディエーターはIL-5である。化学誘引性メディエーターはMIP-1bである。 図101Bは、PBMC CD8+ T細胞、抗CD3抗体を用いて拡大させたCD8+ T細胞(CD3拡大T細胞)、および抗TCRVβ 6-5抗体を用いて拡大させたCD8+ T細胞(薬物拡大T細胞)の多機能性強度指数(PSI)を示す棒グラフである。エフェクターメディエーターは、グランザイムB、IFNγ、MIP-1α、パーフォリン、およびTNFβである。化学誘引性メディエーターはMIP-1bおよびRANTESである。 図102A~102Cは、TCR分子に対するCD19xTCRvβ二特異性分子の結合を示す。図102Aは、この研究において使用された二特異性分子の図解である。 図102Bは、可溶性TCRに対するCD19xTCRvβ二特異性分子の結合を示すグラフである。 図102Cは、Jurkat細胞上に発現されたTCRに対するCD19xTCRvβ二特異性分子の結合を示すグラフである。 図103A~103Dは、マウスCD19xTCRvβ 13-2/3(2x2)二特異性分子の特徴付けを示す。図103Aは、この研究において使用された二特異性分子の図解である。 図103Bは、マウスCD19xTCRvβ 13-2/3の結合動態を示すグラフである。 図103Cは、マウスCD19xTCRvβ 13-2/3との6日のインキュベーション後のTCRVB+ T細胞の拡大を示すドットプロットである。 図103Dは、マウスCD19xTCRvβ 13-2/3二特異性抗体との6日のin vitroインキュベーション後の脾臓B細胞の相対数を示すグラフである。 図104は、0.1mg/kgまたは1mg/kgのマウスCD19xTCRvβ 13-2/3二特異性抗体を用いて処置された動物の血液または脾臓中のB細胞のレベルを示すグラフである。 図105A~105Bは、0.1mg/kgまたは1mg/kgのマウスCD19xTCRvβ 13-2/3二特異性抗体を用いて処置された動物の血液または脾臓中のNK細胞(図105A)またはT細胞(図105B)のレベルを示すグラフである。 図105A~105Bは、0.1mg/kgまたは1mg/kgのマウスCD19xTCRvβ 13-2/3二特異性抗体を用いて処置された動物の血液または脾臓中のNK細胞(図105A)またはT細胞(図105B)のレベルを示すグラフである。 図106A~106Fは、CD19xTCRvβ二特異性分子を用いたTCRVB+ T細胞の拡大および標的細胞の溶解を示す。図106Aは、この研究において使用された二特異性分子の図解である。 図106Bは、予備拡大させたTCRVB+ T細胞またはCD3+拡大汎T細胞による標的細胞溶解を示すグラフである。 図106Cは、CD19xTCRvβ二特異性分子を用いて処置された精製されたT細胞による精製されたB細胞の枯渇を示す。 図106Dは、CD19xCD3二特異性分子を用いて処置された精製されたT細胞による精製されたB細胞の枯渇を示す。 図106Eは、CD19xTCRvβ二特異性分子を用いて処置されたPBMC調製物中のB細胞の枯渇を示す。 図106Fは、CD19xCD3二特異性分子を用いて処置されたPBMC調製物中のB細胞の枯渇を示す。 図107A~107Bは、CD19 x CD3二特異性分子(図107A)またはCD19xTCRVB 6-5二特異性分子(図107B)を用いて処置されたPBMCからの様々なサイトカインの発現を示すグラフである。 図107A~107Bは、CD19 x CD3二特異性分子(図107A)またはCD19xTCRVB 6-5二特異性分子(図107B)を用いて処置されたPBMCからの様々なサイトカインの発現を示すグラフである。 図108A~108Cは、CD19 x TCRvβ 6-5(2x2)薬物動態(PK)プロファイルおよび投薬戦略を示す。図108Aは、実験の設計の図解である。 図108Bは、処置後の示される時点におけるCD19 x TCRvβ 6-5の濃度を示すグラフである。 図108Cは、CD19 x TCRvβ 6-5を検出するために使用された検出試薬を示す。
がん免疫療法のために腫瘍細胞溶解を促進するためにT細胞を再指向させるように設計された現在の二特異性構築物は、典型的には、T細胞受容体(TCR)のCD3eサブユニットに対して指向されるモノクローナル抗体(mAb)に由来する抗体断片(Fab、scFv、VHなど)を利用する。しかしながら、このアプローチには限界があり、このような二特異性構築物の治療可能性の完全な実現を妨げる可能性がある。これまでの研究では、低い「活性化」用量の抗CD3e mAbでさえも長期のT細胞機能不全を引き起こし、免疫抑制作用を発揮することが示されている。さらに、抗CD3e mAbは、大量のT細胞活性化に起因する副作用と関連している。多数の活性化T細胞は相当量のサイトカインを分泌し、そのうち最も重要なものはインターフェロンガンマ(IFNg)である。この過剰量のIFNgは、次にマクロファージを活性化し、その後、それがIL-1ベータ、IL-6、IL-10およびTNF-αなどの炎症性サイトカインを過剰に産生し、サイトカイン放出症候群(CRS)として公知である「サイトカインストーム」を引き起こす(参照により全体が本明細書に組み込まれるShimabukuro-Vornhagenら、J Immunother Cancer.2018年6月15日;6巻(1号):56ページ)。したがって、例えば、CRSおよび/または神経毒性(NT)を低減させるために、エフェクターT細胞のサブセットのみに結合および活性化することができる抗体を開発する必要性が存在する。
本発明は、TCRのTCRβV鎖を標的とする分子およびその方法を特徴とする。理論に拘泥するものではないが、このような分子は、T細胞のサブセットのみを結合、活性化、および/または拡大することができ、CRSおよび/またはNTを回避または低下させ、抗CD3 mAbの潜在的な免疫抑制効果を最小限に抑えることができる。
TCRは、不変のCD3鎖分子との複合体の一部として発現される、通常、高度に可変なアルファ(α)およびベータ(β)鎖からなるジスルフィド連結した膜アンカー型ヘテロ二量体タンパク質である。αβT細胞上のTCRは、1つのアルファ鎖と1つのベータ鎖とのヘテロ二量体によって形成される。各アルファ鎖またはベータ鎖は、定常ドメインと、免疫グロブリンスーパーファミリー(IgSF)フォールドとして分類される高度に可変なドメインとからなる。TCRβV鎖は、さらに30のサブファミリー(TRBV1-30)に分類され得る。それらの高い構造的および機能的な相同性にもかかわらず、TRBV遺伝子におけるアミノ酸配列相同性は非常に低い。約95個のアミノ酸のうち4個だけが同一であり、一方、10個のさらなるアミノ酸が、すべてのサブファミリーで保存されている(表9のTCRBVアミノ酸配列のアラインメントを参照)。それにもかかわらず、非常に多様な配列のアルファ鎖とベータ鎖の間に形成されたTCRは、顕著な構造的相同性を示し(図24Aおよび24B)、ならびに類似の機能、例えば、T細胞の活性化を誘発する。
本明細書には、新規なクラスの抗体、すなわち、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子の発見が開示され、これは、低い配列類似性(例えば、異なるTCRβVサブファミリーを認識する異なる抗体分子間の低い配列同一性)を有するにもかかわらず、TCRβVタンパク質上の構造的に保存されているが、配列的に可変な領域、例えば、ドメインを認識し(図24Aの円で囲まれた領域で示される)、類似の機能(例えば、T細胞の活性化および本明細書に記載される類似のサイトカインプロファイル)を有する。したがって、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、構造-機能関係を共有する。
理論に拘泥するものではないが、一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRαタンパク質と複合体を形成している場合、例えば、図24Aの円で囲まれた領域で示されるように、TCRβVタンパク質の外向きのエピトープに結合すると考えられる。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、(1)異なるTCRβVサブファミリー間で構造的に保存され;(2)異なるTCRβVサブファミリー間で最小の配列同一性を有する、TCRβVタンパク質上のドメイン(例えば、エピトープ)を認識する(例えば、結合する)。表9に示されるように、異なるTCRBVサブファミリー由来のTCRβVタンパク質は、最小配列類似性を共有する。しかしながら、図24A~Bに示されるように、最小配列類似性を有するTCRβVタンパク質は、類似の3D立体構造および構造を共有する。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβV:TCRα複合体の界面を認識しない、例えば、それに結合しない。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβVタンパク質の定常領域を認識しない、例えば、それに結合しない。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβVタンパク質の相補性決定領域(例えば、CDR1、CDR2および/またはCDR3)のうちの1つまたは複数(例えば、すべて)を認識しない、例えば、それに結合しない。
本開示は、特に、T細胞のサブセットに結合し、例えば、それを活性化するTCR(TCRβV)のベータサブユニットの可変鎖に指向された抗体分子を提供する。本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、CRSに関連するサイトカイン、例えば、IL-6、IL-1β、IL-10およびTNFαの産生をより減少させるかまたは全く産生させず;ならびにIL-2およびIFNgの産生の増強および/または遅延をもたらす。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体は、例えば、本明細書に記載されるサイトカインプロファイルを有し、これは、TCRβV領域以外の受容体または分子に結合するT細胞エンゲージャー(「非TCRβV結合T細胞エンゲージャー」)のサイトカインプロファイルとは異なる。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体は、TCRβV+T細胞、例えば、TEMRAとして公知であるメモリーエフェクターT細胞のサブセットの拡大をもたらす。理論に拘泥するものではないが、一部の実施形態では、TEMRA細胞は、腫瘍細胞溶解を促進することができるが、CRSを促進することはできないと考えられる。したがって、本明細書には、前記抗TCRβV抗体分子を作製する方法、およびその使用が提供される。また、本明細書には、前記抗TCRβV抗体分子を含む多特異性分子、例えば、二特異性分子が開示される。一部の実施形態では、本開示の抗TCRβV抗体分子を含む組成物は、例えば、(1)がん免疫療法のための腫瘍細胞溶解を促進するためにT細胞を活性化および再指向させ;および/または(2)TCRβV+T細胞を拡大するために使用することができる。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子を含む組成物は、CRSおよび/またはNT、例えば、抗CD3e標的化に関連するCRSおよび/またはNTの有害な副作用を制限する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβV12に結合せず、または米国特許第5,861,155号に記載されているように、16G8マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/もしくは結合特異性よりも低い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍未満)親和性および/または結合特異性でTCRβV12に結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載されているように、16G8マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/もしくは結合特異性よりも大きい(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍を超える)親和性および/または結合特異性でTCRβV12に結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、本明細書中に記載されるTCRβ V12以外のTCRβV領域(例えば、TCRβ V6サブファミリー(例えば、TCRβ
V6-501)に、米国特許第5,861,155号に記載されるように、16G8マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性より大きい(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍を超える)親和性および/または結合特異性で結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、抗体Bマウス抗体のCDRを含まない。
一部の実施形態では、抗TCRβ抗体分子は、TCRβ V5-501もしくはTCRβ V5-101に結合しないか、またはTCRβ V5-501もしくはTCRβ V5-101に、米国特許第5,861,155号に記載されるように、TM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/もしくは結合特異性よりも低い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍未満)親和性および/または結合特異性で結合しない。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V5-501またはTCRβ V5-101に、米国特許第5,861,155号に記載されるように、TM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/もしくは結合特異性より大きい(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍を超える)親和性および/または結合特異性で結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V5-501またはTCRβ V5-101以外のTCRβV領域(例えば、本明細書に記載されるTCRβV領域、例えば、TCRβV6サブファミリー(例えば、TCRβ V6-501))に、米国特許第5,861,155号に記載されるように、TM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/もしくは結合特異性より大きい(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍を超える)親和性および/または結合特異性で結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TM23マウス抗体のCDRを含まない。
したがって、本明細書には、特に、抗TCRβV抗体分子、抗TCRβV抗体分子を含む多特異性または多機能性分子(例えば、多特異性分子または多機能性抗体分子)、それをコードする核酸、前述の分子を産生する方法、前述の分子を含む医薬組成物、および前
述の分子を用いて、疾患または障害、例えば、がんを処置する方法が提供される。本明細書に開示される抗体分子および医薬組成物は、本明細書に記載される疾患および状態、例えば、がんを処置、予防および/または診断するために(単独でまたは他の薬剤もしくは治療モダリティと組み合わせて)使用することができる。
定義
別段の定義がない限り、本明細書で使用されるすべての技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般的に理解されるものと同じ意味を有する。
用語「ある(a)」および「ある(an)」は、物品の文法的対象物の1つまたは1を超えること(すなわち、少なくとも1つ)を指す。例として、「あるエレメント」は、1つのエレメントまたは1を超えるエレメントを意味する。
量、持続時間などの測定可能な値を参照する場合、用語「約」は、特定の値から±20%の変動、またはいくつかの例では±10%、またはいくつかの例では±5%、またはいくつかの例では±1%、またはいくつかの例では±0.1%の変動を包含することを意味し、このような変動は開示された方法を実施するために適切である。
用語「獲得する」または「獲得すること」とは、本明細書で使用される場合、物理的実体(例えば、試料、ポリペプチド、核酸、または配列)、または値、例えば、数値の所有を、物理的実体もしくは値を「直接的に獲得すること」または「間接的に獲得すること」によって得ることを指す。「直接的に取得すること」とは、物理的実体または値を得るためのプロセス(例えば、合成方法または分析方法を実施すること)を実施することを意味する。「間接的に取得すること」とは、別の者もしくは情報源(例えば、物理的実体または値を直接的に取得した第三者機関)から物理的実体または値を受け取ることを指す。物理的実体を直接的に取得することは、物理的物質、例えば出発材料の物理的変化を含むプロセスを実行することを含む。値を直接的に取得することは、試料または別の物質の物理的変化を含むプロセスを実施すること、例えば、物質、例えば、試料の物理的変化を含む分析プロセスを実施することを含む。
本明細書で使用される場合、用語「T細胞受容体ベータ可変鎖」または「TCRβV」は、T細胞受容体の抗原認識ドメインを含むT細胞受容体ベータ鎖の細胞外領域を指す。用語TCRβVは、TCRβVと少なくとも1つの共通エピトープを含む、アイソフォーム、哺乳動物の、例えば、ヒトTCRβV、ヒトの種相同体およびアナログを含む。ヒトTCRβVには、限定されないが、TCRβ V6サブファミリー、TCRβ V10サブファミリー、TCRβ V12サブファミリー、TCRβ V5サブファミリー、TCRβ V7サブファミリー、TCRβ V11サブファミリー、TCRβ V14サブファミリー、TCRβ V16サブファミリー、TCRβ V18サブファミリー、TCRβ V9サブファミリー、TCRβ V13サブファミリー、TCRβ V4サブファミリー、TCRβ V3サブファミリー、TCRβ V2サブファミリー、TCRβ V15サブファミリー、TCRβ V30サブファミリー、TCRβ V19サブファミリー、TCRβ V27サブファミリー、TCRβ V28サブファミリー、TCRβ V24サブファミリー、TCRβ V20サブファミリー、TCRβ V25サブファミリー、TCRβ V29サブファミリー、TCRβ V1サブファミリー、TCRβ V17サブファミリー、TCRβ V21サブファミリー、TCRβ V23サブファミリー、またはTCRβ V26サブファミリー、ならびに前記サブファミリーのメンバー、およびそれらのバリアント(例えば、その構造的または機能的バリアント)を含むサブファミリーを含む遺伝子ファミリーが含まれる。一部の実施形態では、TCRβV6サブファミリーは、TCRβ V6-401、TCRβ V6-402、TCRβ V6-901、TCRβ V6-801、TCRβ V6-501、TCRβ V6-6
2、TCRβ V6-601、TCRβ V6-201、TCRβ V6-301またはTCRβ V6-101を含む。一部の実施形態では、TCRβVは、TCRβV6-501、またはそのバリアント、例えば、天然に存在する配列と85%、90%、95%、99%またはそれ以上の同一性を有するバリアントを含む。TCRβ V6-501は、TRBV65;TCRBV6S5;TCRBV13S1、またはTCRβ V13.1としても公知である。TCRβV6-501、例えば、ヒトTCRβV6-501のアミノ酸配列は、当該技術分野において公知であり、例えば、IMGT ID
L36092によって提供される。一部の実施形態では、TCRβV6-501は、配列番号43の核酸配列、またはその85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列によってコードされる。一部の実施形態では、TCRβV6-501は、配列番号44のアミノ酸配列、またはその85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列を含む。
用語「ヒト様抗体分子」は、本明細書で使用される場合、ヒト化抗体分子、ヒト抗体分子、または非マウス生殖系列フレームワーク領域、例えば、FR1、FR2、FR3および/またはFR4と少なくとも95%の同一性を有する抗体分子を指す。一部の実施形態では、ヒト様抗体分子は、ヒト生殖系列フレームワーク領域、例えば、ヒト生殖系列フレームワーク領域のFR1、FR2、FR3および/またはFR4と少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域を含む。一部の実施形態では、ヒト様抗体分子は、組換え抗体である。一部の実施形態では、ヒト様抗体分子は、ヒト化抗体分子である。一部の実施形態では、ヒト様抗体分子は、ヒト抗体分子である。一部の実施形態、ヒト様抗体分子は、ファージディスプレイまたは酵母ディスプレイ抗体分子である。一部の実施形態では、ヒト様抗体分子は、キメラ抗体分子である。一部の実施形態では、ヒト様抗体分子は、CDRグラフト化抗体分子である。
用語「サイトカインプロファイル」は、本明細書で使用される場合、1つまたは複数のサイトカインまたはケモカイン上のレベルおよび/または活性化、例えば、本明細書中に記載されるものを指す。一部の実施形態では、サイトカインプロファイルは、天然に存在するサイトカイン、その断片またはバリアントのレベルおよび/または活性化を含む。ある実施形態では、サイトカインプロファイルは、1つまたは複数のサイトカインおよび/または1つまたは複数のケモカイン(例えば、本明細書に記載される)のレベルおよび/または活性化を含む。一部の実施形態では、サイトカインプロファイルは、天然に存在するサイトカイン、その断片またはバリアントのレベルおよび/または活性化を含む。一部の実施形態では、サイトカインプロファイルは、天然に存在するケモカイン、その断片またはバリアントのレベルおよび/または活性化を含む。ある実施形態では、サイトカインプロファイルは、IL-2(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);IL-1β(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);IL-6(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);TNFα(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);IFNg(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);IL-10(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);IL-4(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);TNFα(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);IL-12p70(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);IL-13(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);IL-8(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);エオタキシン(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);エオタキシン-3(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);IL-8(HA)(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);IP-10(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);MCP-1(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);MCP-4(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);MDC(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);MIP-1a(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);MIP-1b(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);TARC(例えば、
全長、そのバリアント、もしくは断片);GM-CSF(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);IL-12 23p40(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);IL-15(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);IL-16(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);IL-17a(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);IL-1a(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);IL-5(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);IL-7(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);TNF-β(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片);またはVEGF(例えば、全長、そのバリアント、もしくは断片)のうちの1つまたは複数のレベルおよび/または活性化を含む。一部の実施形態では、サイトカインプロファイルは、1つまたは複数のサイトカインまたはケモカインの分泌を含む。
ある実施形態では、サイトカインプロファイル中のサイトカインは、本明細書に記載される抗TCRBV抗体分子によって、モジュレート、例えば、増加または減少させることができる。一実施形態では、サイトカインプロファイルは、サイトカインストームまたはサイトカイン放出症候群(CRS)に関連するサイトカイン、例えば、IL-6、IL-1β、TNFαおよびIL-10を含む。
用語「バリアント」は、天然に存在する配列と実質的に同一のアミノ酸配列を有するか、または実質的に同一のヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチドを指す。一部の実施形態では、バリアントは、機能的バリアントである。一部の実施形態では、TCRβVバリアントは、TCRαに結合し、TCRα:β複合体を形成し得る。
用語「機能的バリアント」は、天然に存在する配列と実質的に同一のアミノ酸配列を有するか、または実質的に同一のヌクレオチド配列によりコードされ、天然に存在する配列の1つまたは複数の活性化を有し得るポリペプチドを指す。
本明細書で使用される場合、「多機能性」分子または「多特異性」分子は、2つ以上の機能性、例えば、2つ以上の結合特異性を有する分子、例えば、ポリペプチドを指す。一部の実施形態では、機能性は、1つまたは複数の免疫細胞エンゲージャー、1つまたは複数の腫瘍結合分子、1つまたは複数のサイトカイン分子、1つまたは複数の間質改変剤、および本明細書に記載される他の部分を含むことができる。一部の実施形態では、多特異性分子は、多特異性抗体分子、例えば、二特異性抗体分子である。一部の実施形態では、多特異性分子は、本明細書に記載される抗TCRVb抗体分子を含む。
一部の実施形態では、多機能性分子は、免疫細胞エンゲージャーを含む。「免疫細胞係合体」とは、免疫細胞、例えば、免疫応答に関与する細胞に結合および/または活性化する1つまたは複数の結合特異性を指す。実施形態では、免疫細胞は、T細胞、NK細胞、B細胞、樹状細胞、および/またはマクロファージ細胞から選択される。免疫細胞エンゲージャーは、抗体分子、受容体分子(例えば、全長受容体、受容体断片、またはそれらの融合体(例えば、受容体-Fc融合体))、または免疫細胞抗原(例えば、T細胞、NK細胞抗原、B細胞抗原、樹状細胞抗原、および/またはマクロファージ細胞抗原)に結合するリガンド分子(例えば、全長リガンド、リガンド断片、またはそれらの融合体(例えば、リガンド-Fc融合体))であり得る。実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、標的免疫細胞に特異的に結合し、例えば、標的免疫細胞に優先的に結合する。例えば、免疫細胞エンゲージャーが抗体分子である場合、それは、約10nM未満の解離定数で、免疫細胞抗原(例えば、T細胞抗原、NK細胞抗原、B細胞抗原、樹状細胞抗原、および/またはマクロファージ細胞抗原)に結合する。
一部の実施形態では、多機能性分子は、サイトカイン分子を含む。本明細書で使用される場合、「サイトカイン分子」とは、サイトカインの全長、断片またはバリアント;さら
に、受容体ドメイン、例えば、サイトカイン受容体二量化ドメインを含むサイトカイン;または、天然に存在するサイトカインの少なくとも1つの活性化を誘発する、サイトカイン受容体のアゴニスト、例えば、サイトカイン受容体に対する抗体分子(例えば、アゴニスト抗体)を指す。一部の実施形態では、サイトカイン分子は、インターロイキン-2(IL-2)、インターロイキン-7(IL-7)、インターロイキン-12(IL-12)、インターロイキン-10(IL-10)、インターロイキン-15(IL-15)、インターロイキン-18(IL-18)、インターロイキン-21(IL-21)、もしくはインターフェロンγ、またはこれらの断片もしくはバリアント、または前述のサイトカインのいずれかの組合せから選択される。サイトカイン分子は、モノマーまたは二量体であり得る。実施形態では、サイトカイン分子は、サイトカイン受容体二量体化ドメインをさらに含むことができる。他の実施形態では、サイトカイン分子は、サイトカイン受容体のアゴニスト、例えば、IL-15RaまたはIL-21Rから選択されるサイトカイン受容体に対する抗体分子(例えば、アゴニスト抗体)である。
本明細書で使用される場合、例えば、抗体分子、サイトカイン分子、受容体分子において使用される用語「分子」は、改変されていない(例えば、天然に存在する)分子の少なくとも1つの機能および/または活性化が残る限り、全長の天然に存在する分子、ならびにバリアント、例えば、機能性バリアント(例えば、切断、断片、突然変異(例えば、実質的に類似の配列)またはその誘導体化された形態)を含む。
一部の実施形態では、多機能性分子は、間質改変部分を含む。本明細書で使用される「間質改変部分」とは、間質の成分を改変、例えば、分解することができる薬剤、例えば、タンパク質(例えば、酵素)を指す。実施形態では、間質の成分は、例えば、ECM成分、例えば、グリコサミノグリカン、例えば、ヒアルロン酸(ヒアルロン酸またはHAとしても公知である)、コンドロイチン硫酸、コンドロイチン、デルマタン硫酸、ヘパリン硫酸、ヘパリン、エンタクチン、テネイシン、アグリカンおよびケラチン硫酸;または細胞外タンパク質、例えば、コラーゲン、ラミニン、エラスチン、フィブリノーゲン、フィブロネクチン、およびビトロネクチンから選択される。
特定の用語を以下に定義する。
本明細書で使用される場合、冠詞「ある(a)」および「ある(an)」は、冠詞の文法的対象物の1つまたは複数、例えば、少なくとも1つを指す。用語「ある(a)」または「ある(an)」の使用は、本明細書における用語「含んでいる」とともに使用される場合、「1つ」を意味し得るが、「1つまたは複数」、「少なくとも1つ」および「1または1を超える」の意味とも一致する。
本明細書で使用される場合、「約」および「ほぼ」は、一般に、測定の性質または精度を与えられて測定された量についての許容可能な誤差の程度を意味する。誤差の例示的な程度は、所定の範囲の値の20パーセント(%)以内であり、典型的には10%以内であり、より典型的には5%以内である。
本明細書で使用される「抗体分子」とは、少なくとも1つの免疫グロブリン可変ドメイン構造および/または配列を含む、タンパク質、例えば、免疫グロブリン鎖またはその断片を指す。抗体分子は、抗体(例えば、全長抗体)および抗体断片を包含する。ある実施形態では、抗体分子は、全長抗体の抗原結合もしくは機能的断片、または全長免疫グロブリン鎖を含む。例えば、全長抗体は、天然に存在するか、または正常な免疫グロブリン遺伝子断片の組換えプロセスによって形成される免疫グロブリン(Ig)分子(例えば、IgG抗体)である。実施形態では、抗体分子は、免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な抗原結合部分、例えば、抗体断片を指す。抗体断片、例えば、機能性断片は、抗体の一部、例えば、Fab、Fab’、F(ab’)、F(ab)、可変断片(Fv)、ドメ
イン抗体(dAb)、または一本鎖可変断片(scFv)である。機能性抗体断片は、インタクトな(例えば、全長)抗体によって認識されるものと同じ抗原に結合する。用語「抗体断片」または「機能性断片」はまた、重鎖および軽鎖の可変領域からなる「Fv」断片、または軽鎖および重鎖の可変領域がペプチドリンカーによって連結されている組換え一本鎖ポリペプチド分子(「scFvタンパク質」)などの可変領域からなる単離された断片を含む。一部の実施形態では、抗体断片は、抗原結合活性を有さない抗体の部分、例えば、Fc断片または単一アミノ酸残基を含まない。例示的な抗体分子は、全長抗体および抗体断片、例えば、dAb(ドメイン抗体)、一本鎖、Fab、Fab’、およびF(ab’)断片、ならびに一本鎖可変断片(scFv)を含む。一部の実施形態では、抗体分子は、抗体模倣体である。一部の実施形態では、抗体分子は、フィブロネクチン、アンキリンリピート(例えば、設計されたアンキリンリピートタンパク質(DARPins))、アビマー、アフィボディ親和性リガンド、アンチカリン、またはアフィリン分子などの抗体様フレームワークまたは足場であるか、またはそれを含む。
本明細書で使用される場合、「免疫グロブリン可変ドメイン配列」とは、免疫グロブリン可変ドメインの構造を形成することができるアミノ酸配列を指す。例えば、配列は、天然に存在する可変ドメインのアミノ酸配列の全部または一部を含み得る。例えば、配列は、1個、2個、もしくはそれ以上のN末端またはC末端アミノ酸を含むかまたは含まない場合があり、あるいはタンパク質構造の形成に適合する他の改変を含む場合がある。
実施形態では、抗体分子は、単一特異性であり、例えば、単一のエピトープに対する結合特異性を含む。一部の実施形態では、抗体分子は、多特異性であり、例えば、それは、複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列を含み、第1の免疫グロブリン可変ドメイン配列は、第1のエピトープに対して結合特異性を有し、第2の免疫グロブリン可変ドメイン配列は、第2のエピトープに対して結合特異性を有する。一部の実施形態では、抗体分子は、二特異性抗体分子である。「二特異性抗体分子」とは、本明細書で使用される場合、1を超える(例えば、2、3、4、またはそれを超える)エピトープおよび/または抗原に対する特異性を有する抗体分子を指す。
本明細書で使用される「抗原」(Ag)とは、例えば、ある種の免疫細胞の活性化および/または抗体生成を伴う、免疫応答を引き起こすことができる分子を指す。ほとんどすべてのタンパク質またはペプチドを含む任意の高分子は、抗原であり得る。抗原はまた、ゲノム組換え体またはDNAから誘導され得る。例えば、免疫応答を誘導することができるタンパク質をコードするヌクレオチド配列または部分的ヌクレオチド配列を含む任意のDNAは、「抗原」をコードする。実施形態では、抗原は、遺伝子の全長ヌクレオチド配列によってのみコードされる必要はなく、また、抗原は、遺伝子によって全くコードされる必要もない。実施形態では、抗原は、生体試料、例えば、組織試料、腫瘍試料、細胞、または他の生体成分を有する流体から合成することができ、または誘導することができる。本明細書で使用される場合、「腫瘍抗原」または同義的に、「がん抗原」は、がん、例えば、がん細胞、または免疫応答を引き起こすことができる腫瘍微小環境上に存在するか、またはそれと関連する任意の分子を含む。本明細書で使用される場合、「免疫細胞抗原」とは、免疫応答を引き起こすことができる免疫細胞上に存在するか、またはそれと関連する任意の分子を含む。
抗体分子の「抗原結合部位」または「結合部位」とは、抗原結合に関与する抗体分子、例えば、免疫グロブリン(Ig)分子の一部を指す。実施形態では、抗原結合部位は、重鎖(H)および軽鎖(L)の可変領域(V)のアミノ酸残基によって形成される。超可変領域と呼ばれる、重鎖および軽鎖の可変領域内の3つの高度に分岐ストレッチは、「フレームワーク領域」(FR)と呼ばれる、より保存された隣接領域間に配置される。FRは、免疫グロブリン中の超可変領域の間で、およびそれに隣接して天然に見出されるアミノ
酸配列である。実施形態では、抗体分子において、軽鎖の3つの超可変領域および重鎖の3つの超可変領域は、三次元空間において互いに対して配置されて、結合抗原の三次元表面に相補的な抗原結合表面を形成する。重鎖および軽鎖のそれぞれの3つの超可変領域は、「相補性決定領域」または「CDR」と呼ばれる。フレームワーク領域およびCDRは、例えば、Kabat,E.A.ら(1991年)Sequences of Proteins of Immunological Interest、第5版、U.S.Department of Health and Human Services、NIH公開番号91-3242、およびChothia,C.ら(1987年)J.Mol.Biol.196巻:901~917ページにおいて定義され、記載されている。各可変鎖(例えば、可変重鎖および可変軽鎖)は、典型的には、3つのCDRおよび4つのFRから構成され、アミノ酸の順序:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、およびFR4でアミノ末端からカルボキシ末端に配列される。
本明細書で使用される「がん」は、すべてのタイプの発がんプロセスおよび/またはがん性増殖を包含することができる。実施形態では、がんは、原発性腫瘍、ならびに転移性組織、または悪性に形質転換された細胞、組織、もしくは臓器を含む。実施形態では、がんは、がんのすべての組織病理学および病期、例えば、浸潤性/重症度の病期を包含する。実施形態では、がんは、再発がんおよび/または抵抗性がんを含む。用語「がん」および「腫瘍」は、互換的に使用することができる。例えば、両方の用語は、固形腫瘍および液体腫瘍を包含する。本明細書で使用される場合、用語「がん」または「腫瘍」は、前がん、ならびに悪性がんおよび腫瘍を含む。
本明細書で使用される場合、「免疫細胞」とは、免疫系において機能する、例えば、感染および異物の作用物質に対して防御する、種々の細胞のいずれかを指す。実施形態では、この用語は、白血球、例えば、好中球、好酸球、好塩基球、リンパ球、および単球を含む。先天性白血球には、食細胞(例えば、マクロファージ、好中球、および樹状細胞)、肥満細胞、好酸球、好塩基球、およびナチュラルキラー細胞が含まれる。先天性白血球は、接触を通じてより大きな病原体を攻撃するか、微生物を飲み込んで殺滅させることによって病原体を特定し、排除し、適応免疫応答の活性化のメディエーターである。適応免疫系の細胞は、リンパ球と呼ばれる特殊なタイプの白血球である。B細胞およびT細胞は、重要なタイプのリンパ球であり、骨髄の造血幹細胞に由来する。B細胞は、体液性免疫応答に関与し、T細胞は、細胞性免疫応答に関与する。用語「免疫細胞」は、免疫エフェクター細胞を含む。
「免疫エフェクター細胞」という用語は、本明細書で使用される場合、免疫応答、例えば、免疫エフェクター応答の促進に関与する細胞を指す。免疫エフェクター細胞の例は、限定されないが、T細胞、例えば、アルファ/ベータT細胞およびガンマ/デルタT細胞、B細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、ナチュラルキラーT細胞、および肥満細胞を含む。
用語「エフェクター機能」または「エフェクター応答」は、細胞の特殊化された機能を指す。T細胞のエフェクター機能は、例えば、細胞溶解活性、またはサイトカインの分泌を含むヘルパー活性であり得る。
本発明の組成物および方法は、特定の配列、またはそれに対して実質的に同一もしくは類似の配列、例えば、特定の配列に対して少なくとも80%、85%、90%、95%同一である、またはそれ以上同一である配列を有するポリペプチドおよび核酸を包含する。アミノ酸配列との関連で、用語「実質的に同一」が本明細書において使用され、第1および第2のアミノ酸配列が共通の構造ドメインおよび/または共通の機能活性を有し得るように、i)第2のアミノ酸配列と同一であるか、あるいはii)第2アミノ酸配列におけ
る整列されたアミノ酸残基の保存的置換である、十分な数または最小限の数のアミノ酸残基を含有する第1アミノ酸を指す。例えば、共通の構造ドメインを含有するアミノ酸配列は、参照配列、例えば、本明細書で提供される配列に対して少なくとも約80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有する。
ヌクレオチド配列との関連で、用語「実質的に同一」が本明細書において使用され、第1および第2ヌクレオチド配列が、共通の機能活性を有するポリペプチドをコードする、または共通のポリペプチド構造ドメインまたは共通のポリペプチド機能活性をコードするように、第2核酸配列におけるアラインされたヌクレオチドと同一である、十分な数または最小限の数のヌクレオチドを含有する第1核酸配列を指す。例えば、参照配列、例えば本明細書で提供される配列に対して少なくとも約80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するヌクレオチド配列。
用語「バリアント」とは、参照アミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を有するか、または実質的に同一のヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチドを指す。一部の実施形態では、バリアントは、機能的バリアントである。
用語「機能的バリアント」とは、参照アミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を有するポリペプチド、または実質的に同一のヌクレオチド配列によりコードされ、参照アミノ酸配列の1つまたは複数の活性化を有し得るポリペプチドを指す。
配列間の相同性または配列同一性(これらの用語は本明細書において互換的に使用される)の計算は以下のように行われる。
2つのアミノ酸配列または2つの核酸配列の同一性パーセントを決定するため、最適な比較目的のために配列がアラインメントされる(例えば、最適アラインメントのために、第1および第2アミノ酸または核酸配列の1つまたは両方にギャップが導入され得、非相同配列は比較目的のために無視され得る)。好ましい実施形態では、比較目的のためにアラインされた参照配列の長さは、参照配列の長さの少なくとも30%、好ましくは少なくとも40%、さらに好ましくは少なくとも50%、60%、なおさらに好ましくは少なくとも70%、80%、90%、100%である。次に、対応するアミノ酸位置またはヌクレオチド位置のアミノ酸残基またはヌクレオチドが比較される。第1配列の位置が、第2配列での対応する位置と同じアミノ酸残基またはヌクレオチドによって占められる場合、分子は、その位置にて同一である(本明細書で使用される場合、アミノ酸または核酸「同一性」は、アミノ酸または核酸「相同性」と等しい)。
2つの配列間の同一性パーセントは、配列によって共有される同一位置の数の関数であり、2つの配列の最適アラインメントのために導入する必要がある、ギャップ数および各ギャップの長さが考慮に入れられる。
配列の比較および2つの配列間の同一性パーセントの決定は、数学的アルゴリズムを用いて達成することができる。好ましい実施形態では、2つのアミノ酸配列間の同一性パーセントは、Blossum62マトリックスまたはPAM250マトリックス、および16、14、12、10、8、6、または4のギャップの重みおよび1、2、3、4、5、または6の長さの重みのいずれかを用いて、GCGソフトウェアパッケージ(http://www.gcg.comにて入手可能である)のGAPプログラムに組み込まれているNeedlemanおよびWunsch((1970年)J.Mol.Biol.48巻:444~453ページ)アルゴリズムを用いて決定される。さらに別の好ましい実施形態では、2つのヌクレオチド配列間の同一性パーセントは、GCGソフトウェアパッケ
ージ(http://www.gcg.comにて入手可能である)のGAPプログラムを使用して、NWSgapdna.CMPマトリックスおよび40、50、60、70、または80のギャップの重みおよび1、2、3、4、5、または6の長さの重みを用いて決定される。特に好ましいセットのパラメーター(および別段の指定がない限り使用されるべきであるもの)は、ギャップペナルティ12、ギャップ伸張ペナルティ4、およびフレームシフトギャップペナルティ5を有するBlossum62スコアマトリックスである。
2つのアミノ酸配列間またはヌクレオチド配列間の同一性パーセントは、PAM120残基重み付け表、ギャップ長ペナルティ12およびギャップペナルティ4を用いて、ALIGNプログラム(バージョン2.0)に組み込まれたE.MeyersおよびW.Miller((1989年)CABIOS、4巻:11~17ページ)のアルゴリズムを使用して決定することができる。
本明細書に記載される核酸およびタンパク質配列は、例えば、他のファミリーメンバーまたは関連配列を同定するために、公開データベースに対する検索を行うための「クエリー配列」として用いることができる。このような検索は、Altschulら(1990年)J.Mol.Biol.215巻:403~10ページのNBLASTおよびXBLASTプログラム(バージョン2.0)を用いて行うことができる。BLASTヌクレオチド検索は、本発明の核酸分子と相同なヌクレオチド配列を得るために、NBLASTプログラム、スコア=100、ワードレングス=12を用いて行うことができる。BLASTタンパク質検索は、本発明のタンパク質分子と相同なアミノ酸配列を得るために、XBLASTプログラム、スコア=50、ワードレングス=3を用いて行うことができる。比較目的のためのギャップドアラインメントを得るために、ギャップドBLASTは、Altschulら(1997年)Nucleic Acids Res.25巻:3389~3402ページに記載されているように利用することができる。BLASTおよびギャップドBLASTプログラムを利用する場合、それぞれのプログラム(例えば、XBLASTおよびNBLAST)のデフォルトパラメーターを使用することができる。
本発明の分子は、それらの機能に実質的な影響を及ぼさない、さらなる保存的または非必須アミノ酸置換を有し得ることが理解される。
用語「アミノ酸」は、天然または合成のいずれであっても、アミノ官能性と酸官能性の両方を含み、天然に存在するアミノ酸のポリマーに含まれ得るすべての分子を包含することを意図する。例示的なアミノ酸には、天然に存在するアミノ酸;そのアナログ、誘導体および同族体;バリアント側鎖を有するアミノ酸アナログ;ならびに先述のいずれかのすべての立体異性体が含まれる。本明細書で使用される場合、用語「アミノ酸」は、DまたはL光学異性体とペプチド模倣体の両方を含む。
「保存的アミノ酸置換」とは、アミノ酸残基が、類似の側鎖を有するアミノ酸残基で置換されるものである。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当該技術分野において定義されている。これらのファミリーには、塩基性側鎖(例えば、リシン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖(例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸)、非荷電極性側鎖(例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、チロシン、システイン)、非極性側鎖(例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン)、ベータ分枝側鎖(例えば、スレオニン、バリン、イソロイシン)および芳香族側鎖(例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)を有するアミノ酸が含まれる。
用語「ポリペプチド」、「ペプチド」および「タンパク質」(一本鎖の場合)は、本明細書において互換的に使用され、任意の長さのアミノ酸のポリマーを指す。ポリマーは、
直鎖状または分枝鎖状であり得て、修飾アミノ酸を含み得、非アミノ酸により割り込まれ得る。これらの用語はまた、修飾されているアミノ酸ポリマー;例えば、ジスルフィド結合形成、グリコシル化、脂質化、アセチル化、リン酸化、または標識成分とのコンジュゲーションなどの任意の他の操作を包含する。ポリペプチドは、天然源から単離することができ、真核生物もしくは原核生物宿主からの組換え技術により産生することができ、または合成手法の産生物であり得る。
用語「核酸」、「核酸配列」、「ヌクレオチド配列」、または「ポリヌクレオチド配列」、および「ポリヌクレオチド」は、互換的に使用される。それらは、デオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチド、またはそれらのアナログのいずれかの長さのヌクレオチドのポリマー形態を指す。ポリヌクレオチドは、一本鎖または二本鎖のいずれかであり得、一本鎖である場合、コード鎖または非コード(アンチセンス)鎖であり得る。ポリヌクレオチドは、メチル化ヌクレオチドおよびヌクレオチドアナログなどの修飾ヌクレオチドを含み得る。ヌクレオチドの配列は、非ヌクレオチド成分によって割り込まれ得る。ポリヌクレオチドは、重合後、例えば、標識成分とのコンジュゲーションによってさらに修飾され得る。核酸は、組換えポリヌクレオチド、またはゲノム、cDNA、天然に存在しないかもしくは非天然配列で別のポリヌクレオチドに連結されている半合成、または合成起源のポリヌクレオチドであり得る。
用語「単離された」とは、本明細書で使用される場合、その元の環境または天然の環境(例えば、天然に存在する場合には自然環境)から取り出される材料を指す。例えば、生きている動物に存在する天然に存在するポリヌクレオチドまたはポリペプチドは単離されないが、天然系の共存物質の一部または全部からヒトの介入によって分離された同一のポリヌクレオチドまたはポリペプチドが単離される。このようなポリヌクレオチドは、ベクターの一部であり得、および/またはこのようなポリヌクレオチドもしくはポリペプチドは、組成物の一部であり得、このようなベクターまたは組成物は、天然に見出される環境の一部ではないという点で依然として単離され得る。
本発明の種々の態様を以下にさらに詳細に説明する。追加の定義は、明細書全体にわたって記載される。
ヒトT細胞受容体(TCR)複合体
T細胞受容体(TCR)は、T細胞の表面に見出すことができる。TCRは、細胞、例えば、抗原提示細胞の表面上に提示される、例えば、主要組織適合性複合体(MHC)分子に結合される、抗原、例えば、ペプチドを認識する。TCRはヘテロ二量体分子であり、アルファ鎖、ベータ鎖、ガンマ鎖またはデルタ鎖を含むことができる。アルファ鎖およびベータ鎖を含むTCRはまた、TCRαβと呼ばれる。TCRβ鎖は、以下の領域(セグメントとしても公知である):可変(V)、多様(D)、結合(J)および定常(C)からなる(Mayer G.およびNyland J.(2010年)10章:Major Histocompatibility Complex and T-cell Receptors-Role in Immune Responses.In:Microbiology and Immunology on-line、University of South Carolina School of Medicineを参照)。TCRα鎖は、V、JおよびC領域からなる。V(可変)、D(多様)、J(結合)、およびC(定常)領域の体細胞組換えによるT細胞受容体(TCR)の再編成は、T細胞の発生および成熟における決定的な事象である。TCR遺伝子再編成は、胸腺で起こる。
TCRは、アルファ鎖およびベータ鎖を含むTCRヘテロ二量体、ならびに二量体シグナル伝達分子、例えば、CD3共受容体、例えば、CD3δ/εおよび/またはCD3γ/εを含むTCR複合体として公知である受容体複合体を含み得る。
TCRベータV(TCRβV)
免疫系の多様性は、膨大な数の病原体に対する防御を可能にする。生殖系列ゲノムの大きさは限られているため、多様性は、V(D)J組換えの過程だけでなく、ヌクレオチドの接合部(V-DセグメントとD-Jセグメントの間の接合部)の欠失および偽ランダムで鋳型化されていないヌクレオチドの付加によっても達成される。TCRベータ遺伝子は、多様性を生み出すために遺伝子配列を受ける。
TCR Vベータレパートリーは、例えば、機能的遺伝子セグメントにおいて7つの頻繁に起こる不活性化多型、および2つのVベータ遺伝子セグメントを包含する大きな挿入/欠失関連多型のために、個体と集団との間で変化する。本開示は、例えば、本明細書に記載されるように、例えば、ヒトTCRベータV鎖(TCRβV)、例えば、TCRβV遺伝子ファミリー(グループとも呼ばれる)、例えば、TCRβVサブファミリー(サブグループとも呼ばれる)に結合する、例えば、特異的に結合する、とりわけ、抗体分子およびその断片を提供する。TCRベータVファミリーおよびサブファミリーは、当該技術分野において公知であり、例えばYassaiら(2009年)Immunogenetics 61巻(7号)493~502ページ;Wei S.およびConcannon
P.(1994年)Human Immunology 41巻(3号)201~206ページに記載されている。本明細書に記載される抗体は、組換え抗体、例えば、組換え非マウス抗体、例えば、組換えヒトまたはヒト化抗体であり得る。
用語TCRBV、TCRVB、TRBV、TCRβV、TCRVβまたはTRβVは、本明細書において交換可能に使用され、例えば本明細書に記載される、TCRベータV鎖を指す。
ある態様では、本開示は、ヒトTCRβV、例えば、TCRβVファミリー、例えば、遺伝子ファミリーまたはそのバリアントに結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、TCRBV遺伝子ファミリーは、例えば、本明細書に記載されるように、例えば、図3、表8Aまたは8Bに記載されるように、1つまたは複数のサブファミリーを含む。一部の実施態様では、TCRβV遺伝子ファミリーは、TCRβ V6サブファミリー、TCRβ V10サブファミリー、TCRβ V12サブファミリー、TCRβ V5サブファミリー、TCRβ V7サブファミリー、TCRβ V11サブファミリー、TCRβ V14サブファミリー、TCRβ V16サブファミリー、TCRβ
V18サブファミリー、TCRβ V9サブファミリー、TCRβ V13サブファミリー、TCRβ V4サブファミリー、TCRβ V3サブファミリー、TCRβ V2サブファミリー、TCRβ V15サブファミリー、TCRβ V30サブファミリー、TCRβ V19サブファミリー、TCRβ V27サブファミリー、TCRβ V28サブファミリー、TCRβ V24サブファミリー、TCRβ V20サブファミリー、TCRβ V25サブファミリー、TCRβ V29サブファミリー、TCRβ V1サブファミリー、TCRβ V17サブファミリー、TCRβ V21サブファミリー、TCRβ V23サブファミリー、またはTCRβ V26サブファミリーを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V6サブファミリーはまた、TCRβ V13.1としても公知である。一部の実施形態では、TCRβ V6サブファミリーは、TCRβ V6-401、TCRβ V6-402、TCRβ V6-901、TCRβ V6-801、TCRβ V6-501、TCRβ V6-602、TCRβ V6-601、TCRβ V6-201、TCRβ V6-301またはTCRβ V6-101、またはそれらのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-401、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-402、またはそのバリアントを含む。一部の実施
形態では、TCRβV6は、TCRβ V6-901、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-801、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-501、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-602、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-601、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCR βV6-201、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-301、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-101、またはそのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-501、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6、例えば、TCRβ V6-501は、配列番号1および/または配列番号2によって認識され、例えば結合される。一部の実施形態では、TCRβ V6、例えば、TCRβ V6-501は、配列番号9および/または配列番号10によって認識され、例えば結合される。一部の実施形態では、TCRβ V6は、配列番号9および/または配列番号11によって認識され、例えば結合される。
一部の実施形態では、TCRβ V10サブファミリーはまた、TCRβ V12としても公知である。一部の実施形態では、TCRβ V10サブファミリーは、TCRβ V10-101、TCRβ V10-102、TCRβ V10-301もしくはTCRβ V10-201、またはそれらのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V12サブファミリーはまた、TCRβ V8.1としても公知である。一部の実施形態では、TCRβ V12サブファミリーは、TCRβ
V12-401、TCRβ V12-301、もしくはTCRβ V12-501、またはそれらのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V12は、配列番号15および/または配列番号16によって認識され、例えば結合される。一部の実施形態では、TCRβ V12は、配列番号23~25のいずれか1つ、および/または配列番号26~30のいずれか1つによって認識され、例えば結合される。
一部の実施形態では、TCRβ V5サブファミリーは、TCRβ V5-501、TCRβ V5-601、TCRβ V5-401、TCRβ V5-801、TCRβ V5-101、またはそれらのバリアントから選択される。
一部の実施形態では、TCRβ V7サブファミリーは、TCRβ V7-701、TCRβ V7-601、TCRβ V7-802、TCRβ V7-401、TCRβ V7-202、TCRβ V7-203、TCRβ V7-201、TCRβ V7-301、TCRβ V7-903、もしくはTCRβ V7-901、またはそれらのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V11サブファミリーは、TCRβ V11-101、TCRβ V11-201もしくはTCRβ V11-301、またはそれらのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V14サブファミリーは、TCRβ V1401、またはそのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V16サブファミリーは、TCRβ V1601、またはそのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V18サブファミリーは、TCRβ V1801、またはそのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V9サブファミリーは、TCRβ V901もしくはTCRβ V902、またはそのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V13サブファミリーは、TCRβV1301、またはそのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V4サブファミリーは、TCRβ V4-201、TCRβ V4-301、もしくはTCRβ V4-101、またはそれらのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V3サブファミリーは、TCRβ V3-101、またはそのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V2サブファミリーは、TCRβ V201、またはそのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V15サブファミリーは、TCRβ V1501、またはそのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V30サブファミリーは、TCRβ V3001、もしくはTCRβ V3002、またはそのバリアントを含む
一部の実施形態では、TCRβ V19サブファミリーは、TCRβ V1901、もしくはTCRβ V1902、またはそのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V27サブファミリーは、TCRβ V2701、またはそのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V28サブファミリーは、TCRβ V2801、またはそのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V24サブファミリーは、TCRβ V24-101、またはそのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V20サブファミリーは、TCRβ V20-101、もしくはTCRβ V20-102、またはそのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V25サブファミリーは、TCRβ V25-101、またはそのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V29サブファミリーは、TCRβ V29-101、またはそのバリアントを含む。
Figure 2023509708000002
Figure 2023509708000003
様々なTCRβVサブファミリーおよび/またはサブファミリーメンバーは、Kitaura K.ら、(2016年)、BMC Immunology vol 17: 38(その全内容は参照により本明細書に組み込まれる)において開示されるように、個体、例えば、健常個体において異なるレベルで発現され得る。例えば、TCRβ V6-5は、約3~6%の健常ドナーにおいて表現される。
様々なTCRBVサブファミリーおよび/またはサブファミリーメンバーの表現はまた、がん細胞において異なり得る。例えば、TCRβVは、腫瘍タイプにかかわらず腫瘍浸潤性T細胞の約3~6%において存在する(Li B.ら、Nature Genetics、2016年、vol:48(7):725~32ページを参照;その全内容は参照により本明細書に組み込まれる)。Liらはまた、TCRβ V6-5は腫瘍細胞において高い頻度で存在することを開示する。
TCRβVサブファミリーメンバーの例示的なアミノ酸配列は、ImMunoGeneTics Information Systemのウェブサイト:http://www.imgt.org/、または類似の資料に見出すことができる。
Figure 2023509708000004
Figure 2023509708000005
表9のTCRBVアミノ酸配列のアラインメントは、TCR配列の多様性を強調している。特に、異なるサブファミリーからのTRBV配列は、互いにかなり異なる。
抗TCRβV抗体
低い配列類似性(例えば、異なるTCRβVサブファミリーを認識する異なる抗体分子の中での低い配列同一性)を有するにもかかわらず、(例えば、図24Aにおいて丸で囲った区画によって表されるように)TCRβVタンパク質上の構造的に保存された領域、例えば、ドメインを認識し、かつ類似の機能(例えば、類似のサイトカインプロファイル)を有する、抗体の新規のクラス、すなわち、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子の発見が本明細書に開示される。そのため、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は構造-機能関係性を共有する。
理論に拘泥するものではないが、一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、例えば、図24Aにおいて丸で囲った区画によって記載されるように、TCRアルファタンパク質との複合体である場合にTCRβVタンパク質の外向きのエピトープに結合すると考えられる。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、(例えば、図24Aにおいて丸で囲った区画によって表されるように)TCRβVタンパク質上の構造的に保存されたドメインを認識する(例えば、それに結合する)。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβV:TCRアルファ複合体の境界部を認識しない、例えば、それに結合しない。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβVタンパク質の定常領域を認識しない、例えば、それに結合しない。TCRBV領域の定常領域に結合する例示的な抗体は、Vineyら(Hybridoma. 1992 Dec;11(6):701~13ページ)に記載されるJOVI.1である。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβVタンパク質の相補性決定領域(例えば、CDR1、CDR2および/またはCDR3)のうちの1つまたは複数(例えば、すべて)を認識しない、例えば、それに結合しない。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβV領域に結合する(例えば、特異的に結合する)。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子の結合は、TCRβV領域以外の受容体または分子に結合するT細胞エンゲージャー(「非TCRβV結合性T細胞エンゲージャー」)のサイトカインプロファイルとは異なるサイトカインプロファイルをもたらす。一部の実施形態では、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーは、CD3分子(例えば、CD3イプシロン(CD3e)分子)、またはTCRアルファ(TCRα)分子に結合する抗体を含む。一部の実施形態では、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーは、OKT3抗体またはSP34-2抗体である。
一態様では、本開示は、例えば、本明細書に、例えば、図3、表8A、または表8Bに記載される、ヒトTCRβV、例えば、TCRβV遺伝子ファミリー、例えば、TCRβVサブファミリーのうちの1つまたは複数に結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V6サブファミリー、TCRβ V10サブファミリー、TCRβ V12サブファミリー、TCRβ V5サブファミリー、TCRβ V7サブファミリー、TCRβ V11サブファミリー、TCRβ V14サブファミリー、TCRβ V16サブファミリー、TCRβ V18サブファミリー、TCRβ V9サブファミリー、TCRβ V13サブファミリー、TCRβ V4サブファミリー、TCRβ V3サブファミリー、TCRβ V2サブファミリー、TCRβ V15サブファミリー、TCRβ V30サブファミリー、TCRβ V19サブファミリー、TCRβ V27サブファミリー、TCRβ V28サブファミリー、TCRβ V24サブファミリー、TCRβ V20サブファミリー、TCRβ V25サブファミリー、TCRβ V29サブファミリー、TCRβ V1サブファミリー、TCRβ V17サブファミリー、TCRβ V21サブファミリー、TCRβ V23サブファミリー、もしくはTCRβ V26サブファミリーから選択される1つもしくは複数のTCRβVサブファミリー、またはそのバリアントに結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V6-4*01、TCRβ
V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01もしくはTCRβ V6-1*01、またはそのバリアントを含むTCRβ V6サブファミリーに結合する。一部の実施形態では、TCRβ V6サブファミリーは、TCRβ V6-5*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-4*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-4*02、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-9*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-8*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ
V6は、TCRβ V6-5*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-6*02、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-6*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-2*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-3*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-1*01、またはそのバリアントを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V10-1*01、TCRβ V10-1*02、TCRβ V10-3*01もしくはTCRβ V10-2*01、またはそのバリアントを含むTCRβ V10サブファミリーに結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01もしくはTCRβ V12-5*01、またはそのバリアントを含むTCRβ V12サブファミリーに結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V5-5*01、TCRβ
V5-6*01、TCRβ V5-4*01、TCRβ V5-8*01、TCRβ V5-1*01、またはそのバリアントを含むTCRβ V5サブファミリーに結合する。
前記抗TCRβV抗体分子によって認識される例示的な抗TCRβV抗体分子および対応するTCRβVサブファミリーは、表10Aに開示される。
Figure 2023509708000006
Figure 2023509708000007
Figure 2023509708000008
Figure 2023509708000009
Figure 2023509708000010
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V12に結合しないか、または米国特許第5,861,155号に記載される16G8マウス抗体もしくはそのヒト化バージョンの親和性および/もしくは結合特異性より低い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍低い)親和性および/もしくは結合特異性でTCRβ V12に結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載される16G8マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性より高い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍高い)親和性および/または結合特異性でTCRβ V12に結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載される16G8マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性より高い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍高い)親和性および/または結合特異性でTCRβ V12以外のTCRβV領域(例えば、本明細書に記載されるTCRβV領域、例えば、TCRβ V6サブファミリー(例えば、TCRβ V6-5*01)に結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V5-5*01にもTCRβ V5-1*01にも結合せず、または米国特許第5,861,155号に記載されるTM23マウス抗体もしくはそのヒト化バージョンの親和性および/もしくは結合特異性より低い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%もしくは約2、5、もしくは10倍低い)親和性および/もしくは結合特異性でTCRβ V5-5*01もしくはTCRβ V5-1*01に結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載されるTM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性より高い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍高い)親和性および/または結合特異性でTCRβ V5-5*01またはTCRβ V5-1*01に結合する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載されるTM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性より高い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍高い)親和性および/または結合特異性でTCRβ V5-5*01またはTCRβ V5-1*01以外のTCRβV領域(例えば、本明細書に記載されるTCRβV領域、例えば、TCRβ V6サブファミリー(例えば、TCRβ V6-5*01)に結合する。
抗TCRβ V6抗体
よって、一態様では、本開示は、ヒトTCRβ V6、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01またはTCRβ V6-1*01を含むTCRβ V6サブファミリーに結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、TCRβ V6サブファミリーは、TCRβ V6-5*01またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-4*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ
V6-4*02、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-9*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-8*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-5*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-6*02、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-6*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-2*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-3*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-1*01、またはそのバリアントを含む。
一部の実施形態では、TCRβ V6-5*01は、配列番号43の核酸配列、またはその85%、90%、95%、99%もしくはより高い同一性を有する配列によってコードされる。
配列番号43
ATGAGCATCGGCCTCCTGTGCTGTGCAGCCTTGTCTCTCCTGTGGGCAGGTCCAGTGAATGCTGGTGTCACTCAGACCCCAAAATTCCAGGTCCTGAAGACAGGACAGAGCATGACACTGCAGTGTGCCCAGGATATGAACCATGAATACATGTCCTGGTATCGACAAGACCCAGGCATGGGGCTGAGGCTGATTCATTACTCAGTTGGTGCTGGTATCACTGACCAAGGAGAAGTCCCCAATGGCTACAATGTCTCCAGATCAACCACAGAGGATTTCCCGCTCAGGCTGCTGTCGGCTGCTCCCTCCCAGACATCTGTGTACTTCTGTGCCAGCAGTTACTC
一部の実施形態では、TCRβ V6-5*01は、配列番号44のアミノ酸配列、またはその85%、90%、95%、99%もしくはより高い同一性を有するアミノ酸配列を含む。
配列番号44
MSIGLLCCAALSLLWAGPVNAGVTQTPKFQVLKTGQSMTLQCAQDMNHEYMSWYRQDPGMGLRLIHYSVGAGITDQGEVPNGYNVSRSTTEDFPLRLLSAAPSQTSVYFCASSY
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、非マウス抗体分子、例えば、ヒトまたはヒト化抗体分子である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、ヒト抗体分子である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、ヒト化抗体分子である。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、単離されているか、または組換えである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、または表1に記載されるか、もしくは表1中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる抗体からの少なくとも1つの抗原結合性領域、例えば、可変領域またはその抗原結合性断片を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H85のいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、または表1に記載されるか、もしくは表1中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる抗体からの少なくとも1つ、2つ、3つまたは4つの可変領域を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗
TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、または表1に記載されるか、もしくは表1中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる抗体分子からの少なくとも1つまたは2つの重鎖可変領域を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、配列番号231または3290のコンセンサス配列を有する重鎖可変領域(VH)を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、または表1に記載されるか、もしくは表1中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる抗体からの少なくとも1つまたは2つの軽鎖可変領域を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、配列番号230または3289のコンセンサス配列を有する軽鎖可変領域(VL)を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、IgG4、例えば、ヒトIgG4の重鎖定常領域を含む。さらに別の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、IgG1、例えば、ヒトIgG1の重鎖定常領域を含む。一実施形態では、重鎖定常領域は、表3に示されるアミノ酸配列、またはそれに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、カッパ軽鎖定常領域、例えば、ヒトカッパ軽鎖定常領域を含む。一実施形態では、軽鎖定常領域は、表3に示されるアミノ酸配列、またはそれに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、または表1に記載されるか、もしくは表1中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる抗体の重鎖可変領域(VH)からの少なくとも1つ、2つ、または3つの相補性決定領域(CDR)を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表1に示されるか、または表1に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(またはCDRのまとめてすべて)を含む。一実施形態では、CDRのうちの1つまたは複数(またはCDRのまとめてすべて)は、表1に示されるか、または表1に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、または表1に記載されるか、もしくは表1中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる抗体の軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つの相補性決定領域(CDR)を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表1に示されるか、または表1に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(またはCDRのまとめてすべて)を含む。一実施形態では、CDRのうちの1つまたは複数(またはCDRのまとめてすべて)は、表1に示されるか、または表1に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表1に示されるか、または表1に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つまたは6つのCDR(またはCDRのまとめてすべて)を含む。一実施形態では、CDRのうちの1つまたは複数(またはCDRのまとめてすべて)は、表1に示されるか、または表1に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、または表1に記載されるか、もしくは表1中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体からの6つすべてのCDR、または密接に関連したCDR、例えば、同一であるか、もしくは少なくとも1つのアミノ酸変更であるが2つ、3つもしくは4つ以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、もしくは表1に記載の抗体の重鎖可変領域からのKabatらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表1に示されるKabatの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表1に示されるKabatらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、もしくは表1に記載の抗体の軽鎖可変領域からのKabatらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表1に示されるKabatの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表1に示されるKabatらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、もしくは表1に記載されるか、もしくは表1中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのKabatらによる少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR(例えば、表1に示されるKabatの定義による少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表1に示されるKabatらによる1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、もしくは表1に記載されるか、もしくは表1中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのKabatらによる6つすべてのCDR(例えば、表1に示されるKabatの定義による6つすべてのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表1に示されるKabatらによる6つすべてのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2またはA-H.68、の対応する超可変ループと同じカノニカルな構造、例えば、本明細書に記載の抗体の重鎖および/または軽鎖可変ドメインの少なくともループ1および/またはループ2と同じカノニカルな構造を有する少なくとも1つ、2つ、または3つの超可変ループを含む。例えば、超可変ループのカノニカルな構造の記載についてChothiaら、(1992) J. Mol. Biol. 227:799~817ページ;Tomlinsonら、(1992) J. Mol. Biol. 227:776~798
ページを参照。これらの構造は、これらの参考文献に記載の表の検査によって決定することができる。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、もしくは表1に記載される抗体の重鎖可変領域からのChothiaらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表1に示されるChothiaの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表1に示されるChothiaらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85から選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、もしくは表1に記載の抗体の軽鎖可変領域からのChothiaらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表1に示されるChothiaの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表1に示されるChothiaらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、もしくは表1に記載されるか、もしくは表1中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのChothiaらによる少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR(例えば、表1に示されるChothiaの定義による少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表1に示されるChothiaらによる1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、もしくは表1に記載されるか、もしくは表1中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのChothiaらによる6つすべてのCDR(例えば、表1に示されるChothiaの定義による6つすべてのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表1に示されるChothiaらによる6つすべてのCDRと比較して、少
なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、Kabatら、Chothiaらに従って定義されるか、または表1に記載されるCDRまたは超可変ループの組合せを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、KabatおよびChothiaの定義によるCDRまたは超可変ループの任意の組合せを含有し得る。
一部の実施形態では、表1に示される組合せCDRは、Kabat CDRおよびChothia CDRを含むCDRである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表1において組合せCDRとして同定されるCDRまたは超可変ループの組合せを含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表1に記載される「組合せ」CDRによるCDRまたは超可変ループの任意の組合せを含有し得る。
一実施形態、例えば、可変領域、CDR(例えば、組合せCDR、Chothia CDRもしくはKabat CDR)、または本明細書、例えば、表1において言及される他の配列を含む一実施形態では、抗体分子は、単一特異性抗体分子、二特異性抗体分子、二価抗体分子、二重パラトープ性抗体分子、または抗体の抗原結合性断片を含む抗体分子、例えば、半抗体もしくは半抗体の抗原結合性断片である。ある特定の実施形態では、抗体分子は、例えば本明細書に記載される、多特異性分子、例えば、二特異性分子を含む。
一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
(i)配列番号2、配列番号10もしくは配列番号11の軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、および軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべて、ならびに/または
(ii)配列番号1もしくは配列番号9の重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、および重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべて
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、配列番号2のLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3、ならびに配列番号1のHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、配列番号10のLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3、ならびに配列番号9のHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗
TCRβ V6-5*01)抗体分子は、配列番号11のLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3、ならびに配列番号9のHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3を含む。
一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
(i)配列番号6のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号7のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号8のLC CDR3アミノ酸配列、および/または
(ii)配列番号3のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号4のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号5のHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
(i)配列番号6のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号7のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号8のLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
(ii)配列番号3のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号4のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号5のHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)を含む。
一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
(i)配列番号51のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号52のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号53のLC CDR3アミノ酸配列、および/または
(ii)配列番号45のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号46のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号47のHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
(i)配列番号51のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号52のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号53のLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
(ii)配列番号45のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号46のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号47のHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
(i)配列番号54のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号55のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号56のLC CDR3アミノ酸配列、および/または
(ii)配列番号48のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号49のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号50のHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
(i)配列番号54のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号55のLC CDR2アミ
ノ酸配列、もしくは配列番号56のLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
(ii)配列番号48のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号49のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号50のHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子の軽鎖または重鎖可変フレームワーク(例えば、少なくともFR1、FR2、FR3、および必要に応じてFR4を包含する領域)は、(a)ヒト軽鎖もしくは重鎖可変フレームワークからのアミノ酸残基、例えば、ヒト成熟抗体、ヒト生殖系列配列、もしくはヒトコンセンサス配列からの軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク残基のうちの少なくとも80%、85%、87% 90%、92%、93%、95%、97%、98%、もしくは100%を含む軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク、(b)ヒト軽鎖もしくは重鎖可変フレームワークからのアミノ酸残基、例えば、ヒト成熟抗体、ヒト生殖系列配列、もしくはヒトコンセンサス配列からの軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク残基の20%~80%、40%~60%、60%~90%、もしくは70%~95%を含む軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク、(c)非ヒトフレームワーク(例えば、齧歯動物フレームワーク)、または(d)例えば抗原性もしくは細胞傷害性決定因子を除去するように、修飾されている、例えば、脱免疫化(deimmunized)、もしくは部分的にヒト化されている非ヒトフレームワークから選択することができる。一実施形態では、軽鎖または重鎖可変フレームワーク領域(特に、FR1、FR2および/またはFR3)は、ヒト生殖系列遺伝子のVLまたはVHセグメントのフレームワークに対して少なくとも70、75、80、85、87、88、90、92、94、95、96、97、98、99%同一のまたは同一の軽鎖または重鎖可変フレームワーク配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、A-H.1~A-H.85のいずれか1つのアミノ酸配列、例えば、A-H.1、A-H.2またはA-H.68からの、例えば、例えば図1A、または配列番号9に示される、可変領域全体中のFR領域のアミノ酸配列からの少なくとも1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、10個、15個、20個またはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する重鎖可変ドメインを含む。
代替的に、または本明細書に記載の重鎖置換と組み合わせて、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、A-H.1~A-H.85のいずれか1つのアミノ酸配列、例えば、A-H.1、A-H.2またはA-H.68からの、例えば、例えば図1B、または配列番号10もしくは配列番号11に示される、可変領域全体中のFR領域のアミノ酸配列からの少なくとも1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、10個、15個、20個またはより多くのアミノ酸変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する軽鎖可変ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、図1Aに示される1つ、2つ、3つ、もしくは4つの重鎖フレームワーク領域、またはそれに対して実質的に同一の配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、図1Bに示される1つ、2つ、3つ、もしくは4つの軽鎖フレームワーク領域、またはそれに対して実質的に同一の配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗
TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば図1Bに示される、A-H.1またはA-H.2の軽鎖フレームワーク領域1を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば図1Bに示される、A-H.1またはA-H.2の軽鎖フレームワーク領域2を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば図1Bに示される、A-H.1またはA-H.2の軽鎖フレームワーク領域3を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば図1Bに示される、A-H.1またはA-H.2の軽鎖フレームワーク領域4を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、Kabatの番号付けによる10位における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、FR1は、10位におけるフェニルアラニン、例えば、セリンからフェニルアラニンへの置換を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、Kabatの番号付けによる本明細書に開示される位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域2(FR2)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、FR2は、Kabatの番号付けによる36位におけるヒスチジン、例えば、36位における置換、例えば、チロシンからヒスチジンへの置換を含む。一部の実施形態では、FR2は、Kabatの番号付けによる46位におけるアラニン、例えば、46位における置換、例えば、アルギニンからアラニンへの置換を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、Kabatの番号付けによる本明細書に開示される位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、FR3は、Kabatの番号付けによる87位におけるフェニルアラニン、例えば、87位における置換、例えば、チロシンからフェニルアラニンへの置換を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、配列番号10のアミノ酸配列に示されるように、(a)Kabatの番号付けによる10位におけるフェニルアラニン、例えば、10位における置換、例えば、セリンからフェニルアラニンへの置換を含むフレームワーク領域1(FR1)、(b)Kabatの番号付けによる36位におけるヒスチジン、例えば、36位における置換、例えば、チロシンからヒスチジンへの置換、およびKabatの番号付けによる46位におけるアラニン、例えば、46位における置換、例えば、アルギニンからアラニンへの置換を含むフレームワーク領域2(FR2)、ならびに(c
)Kabatの番号付けによる87位におけるフェニルアラニン、例えば、87位における置換、例えば、チロシンからフェニルアラニンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、配列番号11のアミノ酸配列に示されるように、(a)Kabatの番号付けによる36位におけるヒスチジン、例えば、36位における置換、例えば、チロシンからヒスチジンへの置換、およびKabatの番号付けによる46位におけるアラニン、例えば、46位における置換、例えば、アルギニンからアラニンへの置換を含むフレームワーク領域2(FR2)、ならびに(b)Kabatの番号付けによる87位におけるフェニルアラニン、例えば、87位における置換、例えば、チロシンからフェニルアラニンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、(a)Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数(例えば、すべて)の位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域1(FR1)、(b)Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数(例えば、すべて)の位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域2(FR2)、および(c)Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数(例えば、すべて)の位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば図1Aに示されるように、A-H.1またはA-H.2の重鎖フレームワーク領域1を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば図1Aに示されるように、A-H.1またはA-H.2の重鎖フレームワーク領域2を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば図1Aに示されるように、A-H.1またはA-H.2の重鎖フレームワーク領域3を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば図1Aに示されるように、A-H.1またはA-H.2の重鎖フレームワーク領域4を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、Kabatの番号付けによる本明細書に開示される位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む重鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、FR3は、Kabatの番号付けによる73位におけるスレオニン、例えば、73位における置換、例えば、グルタミン酸からスレオニンへの置換を含む。一部の実施形態では、FR3は、Kabatの番号付けによる94位におけるグリシン、例えば、9
4位における置換、例えば、アルギニンからグリシンへの置換を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列重鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、配列番号10のアミノ酸配列に示されるように、Kabatの番号付けによる73位におけるスレオニン、例えば、73位における置換、例えば、グルタミン酸からスレオニンへの置換、およびKabatの番号付けによる94位におけるグリシン、例えば、94位における置換、例えば、アルギニンからグリシンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む重鎖可変ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、A-H.1またはA-H.2の重鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号9、または図1Aおよび図1Bに示されるものを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、A-H.1の軽鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号10のもの、または図1Aおよび図1Bに示されるものを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、A-H.2の軽鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号11、または図1Aおよび図1Bに示されるものを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、A-H.1の重鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号9、およびA-H.1の軽鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号10、または図1Aおよび図1Bに示されるものを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、A-H.2の重鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号9、およびA-H.2の軽鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号11、または図1Aおよび図1Bに示されるものを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子の重鎖もしくは軽鎖可変ドメイン、または両方は、本明細書に開示されるアミノ酸に対して実質的に同一である、例えば、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、もしくは表1に記載されるか、もしくは表1中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の可変領域に対して少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一である、または本明細書に記載の抗体の可変領域から少なくとも1個もしくは5個の残基、かつ40個、30個、20個、もしくは10個未満の残基が異なる、アミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表1に示されるアミノ酸配列、またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一である、もしくは表1に示される配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なる配列を有する少なくとも1つ、2
つ、3つ、または4つの抗原結合性領域、例えば、可変領域を含む。別の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表1に示されるヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるか、もしくは表1に示される配列から3個、6個、15個、30個、もしくは45個以下のヌクレオチドが異なる配列を有する核酸によってコードされるVHおよび/またはVLドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
配列番号9のアミノ酸配列、配列番号9のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号9のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および/または
配列番号10のアミノ酸配列、配列番号10のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号10のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
配列番号9のアミノ酸配列、配列番号9のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号9のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および/または
配列番号11のアミノ酸配列、配列番号11のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号11のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、全長抗体またはその断片(例えば、Fab、F(ab’)、Fv、もしくは一本鎖Fv断片(scFv))である。実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、モノクローナル抗体または単一の特異性を有する抗体である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子はまた、ヒト化、キメラ、ラクダ、サメ、またはin vitroで生成された抗体分子であり得る。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、ヒト化抗体分子である。抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子の重鎖および軽鎖は、全長であり得(例えば、抗体は、少なくとも1つ、好ましくは2つの、完全重鎖、および少なくとも1つ、好ましくは2つの、完全軽鎖を含むことができる)、または抗原結合性断片(例えば、Fab、F(ab’)2、Fv、一本鎖Fv断片、単一ドメイン抗体、ダイアボディ(dAb)、二価抗体、もしくは二特異性抗体もしくはその断片、その単一ドメインバリアント、もしくはラクダ抗体)を含むことができる。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗
TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば本明細書に記載される、多特異性分子、例えば、二特異性分子の形態である。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD、およびIgEの重鎖定常領域から選択される重鎖定常領域(Fc)を有する。一部の実施形態では、Fc領域は、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4の重鎖定常領域から選択される。一部の実施形態では、Fc領域は、IgG1またはIgG2(例えば、ヒトIgG1、またはIgG2)の重鎖定常領域から選択される。一部の実施形態では、重鎖定常領域はヒトIgG1である。一部の実施形態では、Fc領域は、例えば本明細書に記載される、Fc領域バリアントを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、カッパまたはラムダ、好ましくはカッパ(例えば、ヒトカッパ)の軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を有する。一実施形態では、定常領域は、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子の特性を修飾するため(例えば、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞機能、または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるため)に変更、例えば、突然変異されている。例えば、定常領域は、例えば、ヒトIgG1と比較して、Fc受容体結合を変更するために296位(MからYへ)、298位(SからTへ)、300位(TからEへ)、477位(HからKへ)および478位(NからFへ)において突然変異されている(例えば、突然変異した位置は、配列番号212もしくは214の132位(MからYへ)、134位(SからTへ)、136位(TからEへ)、313位(HからKへ)および314位(NからFへ)、または配列番号215、216、217もしくは218の135位(MからYへ)、137位(SからTへ)、139位(TからEへ)、316位(HからKへ)および317位(NからFへ)に対応する)。
抗体A-H.1は、配列番号3278のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。抗体A-H.2は、配列番号3278のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号3279のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。抗体A-H.68は、配列番号1337のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。抗体A-H.69は、配列番号1500のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
追加の例示的なヒト化抗TCRB V6抗体は表1に提供される。一部の実施形態では、抗TCRβ V6は、表1に提供される抗体A、例えば、ヒト化抗体A(抗体A-H)である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、表1に提供されるLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて);ならびに/もしくは表1に提供されるHC CDR1、HC CDR2、およびHC
CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて)、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗体Aは、表1に提供される可変重鎖(VH)および/もしくは可変軽鎖(VL)、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗
TCRβ V6-5*01)抗体分子は、A-H.1、A-H.2、A-H.3、A-H.4、A-H.5、A-H.6、A-H.7、A-H.8、A-H.9、A-H.10、A-H.11、A-H.12、A-H.13、A-H.14、A-H.15、A-H.16、A-H.17、A-H.18、A-H.19、A-H.20、A-H.21、A-H.22、A-H.23、A-H.24、A-H.25、A-H.26、A-H.27、A-H.28、A-H.29、A-H.30、A-H.31、A-H.32、A-H.33、A-H.34、A-H.35、A-H.36、A-H.37、A-H.38、A-H.39、A-H.40、A-H.1、A-H.42、A-H.43、A-H.44、A-H.45、A-H.46、A-H.47、A-H.48、A-H.49、A-H.50、A-H.51、A-H.52、A-H.53、A-H.54、A-H.55、A-H.56、A-H.57、A-H.58、A-H.59、A-H.60、A-H.61、A-H.62、A-H.63、A-H.64、A-H.65、A-H.66、A-H.67、A-H.68、A-H.69、A-H.70、A-H.71、A-H.72、A-H.73、A-H.74、A-H.75、A-H.76、A-H.77、A-H.78、A-H.79、A-H.80、A-H.81、A-H.82、A-H.83、A-H.84、もしくはA-H.85のVH、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、A-H.1、A-H.2、A-H.3、A-H.4、A-H.5、A-H.6、A-H.7、A-H.8、A-H.9、A-H.10、A-H.11、A-H.12、A-H.13、A-H.14、A-H.15、A-H.16、A-H.17、A-H.18、A-H.19、A-H.20、A-H.21、A-H.22、A-H.23、A-H.24、A-H.25、A-H.26、A-H.27、A-H.28、A-H.29、A-H.30、A-H.31、A-H.32、A-H.33、A-H.34、A-H.35、A-H.36、A-H.37、A-H.38、A-H.39、A-H.40、A-H.1、A-H.42、A-H.43、A-H.44、A-H.45、A-H.46、A-H.47、A-H.48、A-H.49、A-H.50、A-H.51、A-H.52、A-H.53、A-H.54、A-H.55、A-H.56、A-H.57、A-H.58、A-H.59、A-H.60、A-H.61、A-H.62、A-H.63、A-H.64、A-H.65、A-H.66、A-H.67、A-H.68、A-H.69、A-H.70、A-H.71、A-H.72、A-H.73、A-H.74、A-H.75、A-H.76、A-H.77、A-H.78、A-H.79、A-H.80、A-H.81、A-H.82、A-H.83、A-H.84、もしくはA-H.85のVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、A-H.1、A-H.2、A-H.3、A-H.4、A-H.5、A-H.6、A-H.7、A-H.8、A-H.9、A-H.10、A-H.11、A-H.12、A-H.13、A-H.14、A-H.15、A-H.16、A-H.17、A-H.18、A-H.19、A-H.20、A-H.21、A-H.22、A-H.23、A-H.24、A-H.25、A-H.26、A-H.27、A-H.28、A-H.29、A-H.30、A-H.31、A-H.32、A-H.33、A-H.34、A-H.35、A-H.36、A-H.37、A-H.38、A-H.39、A-H.40、A-H.1、A-H.42、A-H.43、A-H.44、A-H.45、A-H.46、A-H.47、A-H.48、A-H.49、A-H.50、A-H.51、A-H.52、A-H.53、A-H.54、A-H.55、A-H.56、A-H.57、A-H.58、A-H.59、A-H.60、A-H.61、A-H.62、A-H.63、A-H.64、A-H.65、A-H.66、A-H.67、A-
H.68、A-H.69、A-H.70、A-H.71、A-H.72、A-H.73、A-H.74、A-H.75、A-H.76、A-H.77、A-H.78、A-H.79、A-H.80、A-H.81、A-H.82、A-H.83、A-H.84、もしくはA-H.85のVH、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列;およびA-H.1、A-H.2、A-H.3、A-H.4、A-H.5、A-H.6、A-H.7、A-H.8、A-H.9、A-H.10、A-H.11、A-H.12、A-H.13、A-H.14、A-H.15、A-H.16、A-H.17、A-H.18、A-H.19、A-H.20、A-H.21、A-H.22、A-H.23、A-H.24、A-H.25、A-H.26、A-H.27、A-H.28、A-H.29、A-H.30、A-H.31、A-H.32、A-H.33、A-H.34、A-H.35、A-H.36、A-H.37、A-H.38、A-H.39、A-H.40、A-H.1、A-H.42、A-H.43、A-H.44、A-H.45、A-H.46、A-H.47、A-H.48、A-H.49、A-H.50、A-H.51、A-H.52、A-H.53、A-H.54、A-H.55、A-H.56、A-H.57、A-H.58、A-H.59、A-H.60、A-H.61、A-H.62、A-H.63、A-H.64、A-H.65、A-H.66、A-H.67、A-H.68、A-H.69、A-H.70、A-H.71、A-H.72、A-H.73、A-H.74、A-H.75、A-H.76、A-H.77、A-H.78、A-H.79、A-H.80、A-H.81、A-H.82、A-H.83、A-H.84、もしくはA-H.85のVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列を含む。
Figure 2023509708000011
Figure 2023509708000012
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Figure 2023509708000021
Figure 2023509708000022
Figure 2023509708000023
Figure 2023509708000024
Figure 2023509708000025
Figure 2023509708000026
Figure 2023509708000027
Figure 2023509708000028
Figure 2023509708000029
Figure 2023509708000030
Figure 2023509708000031
Figure 2023509708000032
Figure 2023509708000033
Figure 2023509708000034
Figure 2023509708000035
Figure 2023509708000036
Figure 2023509708000037
Figure 2023509708000038
Figure 2023509708000039
Figure 2023509708000040
Figure 2023509708000041
Figure 2023509708000042
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表1に記載の抗体のVHおよび/もしくはVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはより高い同一性を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表1に記載の抗体のVHおよびVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはより高い同一性を有する配列を含む。
親和性成熟したヒト化抗体A-H VL配列のアラインメント(登場順にそれぞれ配列番号3377~3389)
Figure 2023509708000043
コンセンサスVL:配列番号230
DIQMTQSPSFLSASVGDRVTITCKASQNV G/E/A/D N/D R/K VAW Y/H QQKPGKAPKALIYSSSHRY K/S GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYFCQQFKSYPLTFGQGTKLEIK
コンセンサスVL:配列番号3289
DIQMTQSPSFLSASVGDRVTITCKASQNVXVAWXQQKPGKAPKALIYSSSHRYX GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYFCQQFKSYPLTFGQGTKLEIK(X1は、G、E、AまたはDであり、X2はNまたはDであり、X3はRまたはKであり、X4はYまたはHであり、X5はKまたはSである)
親和性成熟したヒト化抗体A-H VH配列のアラインメント(登場順にそれぞれ配列番号3390~3436)
Figure 2023509708000044
Figure 2023509708000045
コンセンサスVH:配列番号231
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASG H/T/G/Y D/T/S
F H/R/D/K/T L/D/K/T/N W/F/T/I/Y/G YIHWVRQAPGQGLEWMG R/W V/I/F F/S/Y A/P GSG N/S T/V/Y/I K/R YNEKFKGRVTITADTSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCA G/V S Y/I YS Y/A D/G VLDYWGQGTTVTVSS
コンセンサスVH:配列番号3290
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGXFXYIHWVRQAPGQGLEWMGXGSGX101112YNEKFKGRVTITADTSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAX13SX14YSX1516VLDYWGQGTTVTVSS(X1はHまたはTまたはGまたはYであり、X2はDまたはTまたはSであり、X3はHまたはRまたはDまたはKまたはTであり、X4はLまたはDまたはKまたはTまたはNであり、X5はWまたはFまたはTまたはIまたはYまたはGであり、X6はRまたはWであり、X7はVまたはIまたはFであり、X8はFまたはSまたはYであり、X9はAまたはPであり、X10はNまたはSであり、X11はTまたはVまたはYまたはIであり、X12はKまたはRであり、X13はGまたはVであり、X14はYまたはIであり、X15はYまたはAであり、X16はDまたはGである)
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRVb抗体は、配列番号230(30位はG、E、AもしくはDであり、31位はNもしくはDであり、32位はRもしくは
Kであり、36位はYもしくはHであり、かつ/または56位はKもしくはSである)のコンセンサス配列を有するVLを有する抗原結合性ドメインを有する。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRVb抗体は、配列番号231(27位はHもしくはTもしくはGもしくはYであり、28位はDもしくはTもしくはSであり、30位はHもしくはRもしくはDもしくはKもしくはTであり、31位はLもしくはDもしくはKもしくはTもしくはNであり、32位はWもしくはFもしくはTもしくはIもしくはYもしくはGであり、49位はRもしくはWであり、50位はVもしくはIもしくはFであり、51位はFもしくはSもしくはYであり、52位はAもしくはPであり、56位はNもしくはSであり、57位はTもしくはVもしくはYもしくはIであり、58位はKもしくはRであり、97位はGもしくはVであり、99位はYもしくはIであり、102位はYもしくはAであり、かつ/または103位はDもしくはGである)のコンセンサス配列を有するVHを有する抗原結合性ドメインを有する。
抗TCRβ V12抗体
よって、一態様では、本開示は、ヒトTCRβ V12、例えば、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01またはTCRβ V12-5*01を含むTCRβ V12サブファミリーに結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、TCRβ V12サブファミリーはTCRβ V12-4*01を含む。一部の実施形態では、TCRβ V12サブファミリーはTCRβ V12-3*01を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は非マウス抗体分子、例えば、ヒトまたはヒト化抗体分子である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子はヒト抗体分子である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子はヒト化抗体分子である。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、単離されているか、または組換えである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載されるか、もしくは表2中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体からの少なくとも1つの抗原結合性領域、例えば、可変領域もしくはその抗原結合性断片、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載されるか、もしくは表2中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体からの少なくとも1つ、2つ、3つもしくは4つの可変領域、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載されるか、もしくは表2中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体からの少なくとも1つもしくは2つの重鎖可変領域、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載されるか、もしくは表2中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体からの少なくとも1つもしくは2つの軽鎖可変領域、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、IgG4、例えば、ヒトIgG4の重鎖定常領域を含む。さらに別の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、IgG1、例えば、ヒトIgG1の重鎖定常領域を含む。一実施形態では、重鎖定常領域は、表3に示されるアミノ酸配列、またはそれに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、カッパ軽鎖定常領域、例えば、ヒトカッパ軽鎖定常領域を含む。一実施形態では、軽鎖定常領域は、表3に示されるアミノ酸配列、またはそれに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載されるか、もしくは表2中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、もしくは3つの相補性決定領域(CDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表2に示されるか、または表2に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(またはCDRのまとめてすべて)を含む。一実施形態では、CDRのうちの1つまたは複数(またはCDRのまとめてすべて)は、表2に示されるか、または表2に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載されるか、もしくは表2中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、もしくは3つの相補性決定領域(CDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表2に示されるか、または表2に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(またはCDRのまとめてすべて)を含む。一実施形態では、CDRのうちの1つまたは複数(またはCDRのまとめてすべて)は、表2に示されるか、または表2に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表2に示されるか、または表2に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つまたは6つのCDR(またはCDRのまとめてすべて)を含む。一実施形態では、CDRのうちの1つまたは複数(またはCDRのまとめてすべて)は、表2に示されるか、または表2に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載されるか、もしくは表2中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体からの6つすべてのCDR、または密接に関連したCDR、例えば、同一であるか、もしくは少なくとも1つのアミノ酸変更であるが2つ、3つもしくは4つ以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載される選択された抗体の重鎖可変領域からのKabatらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表2に示されるKabatの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表2に示されるKabatらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載される抗体の軽鎖可変領域からのKabatらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表2に示されるKabatの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表2に示されるKabatらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載されるか、もしくは表2中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのKabatらによる少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR(例えば、表2に示されるKabatの定義による少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表2に示されるKabatらによる1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載されるか、もしくは表2中のヌクレオチド配列によってコードされるような抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのKabatらによる6つすべてのCDR(例えば、表2に示されるKabatの定義による6つすべてのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表2に示されるKabatらによる6つすべてのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載の抗体の対応する超可変ループと同じカノニカルな構造、例えば、本明細書に記載の抗体の重鎖および/または軽鎖可変ドメインの少なくともループ1および/またはループ2と同じカノニカルな構造を有する少なくとも1つ、2つ、または3つの超可変ループを含む。例えば、超可変ループのカノニカルな構造の記載についてChothiaら、(1992) J. Mol. Biol. 227:799~817ページ;Tomlinsonら、(1992) J. Mol. Biol. 227:776-798ページを参照。これらの構造は、これらの参考文献に記載の表の検査によって決定することができる。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載される選択された抗体の重鎖可変領域からのChothiaらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表2に示されるChothiaの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表2に示されるChothiaらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載される抗体の軽鎖可変領域からのChothiaらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表2に示されるChothiaの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表2に示されるChothiaらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載されるか、もしくは表2中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのChothiaらによる少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR(例えば、表2に示されるChothiaの定義による少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表2に示されるChothiaらによる1つ、2つ、3つ、4つ
、5つ、もしくは6つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載されるか、もしくは表2中のヌクレオチド配列によってコードされるような抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのChothiaらによる6つすべてのCDR(例えば、表2に示されるChothiaの定義による6つすべてのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表2に示されるChothiaらによる6つすべてのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載される選択された抗体の重鎖可変領域からの組合せCDRによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表2に示される組合せCDRの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表2に示される組合せCDRによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載される抗体の軽鎖可変領域からの組合せCDRによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表2に示される組合せCDRの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表2に示される組合せCDRによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載されるか、もしくは表2中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖および軽鎖可変領域からの組合せCDRによる少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR(例えば、表2に示される組合せCDRの定義による少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表2に示される組合せCDRによる1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載されるか、もしくは表2中のヌクレオチド
配列によってコードされるような抗体の重鎖および軽鎖可変領域からの組合せCDRによる6つすべてのCDR(例えば、表2に示される組合せCDRの定義による6つすべてのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表2に示される組合せCDRによる6つすべてのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
一部の実施形態では、表1に示される組合せCDRは、Kabat CDRおよびChothia CDRを含むCDRである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表1において組合せCDRとして同定されるCDRまたは超可変ループの組合せを含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表1に記載される「組合せ」CDRによるCDRまたは超可変ループの任意の組合せを含有し得る。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、KabatらおよびChothiaらに従って定義されるか、または表1に記載されるCDRまたは超可変ループの組合せを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、KabatおよびChothiaの定義によるCDRまたは超可変ループの任意の組合せを含有し得る。
一実施形態では、例えば、本明細書、例えば、表2において言及される可変領域、CDR(例えば、組合せCDR、Chothia CDRもしくはKabat CDR)、または他の配列を含む一実施形態では、抗体分子は、単一特異性抗体分子、二特異性抗体分子、二価抗体分子、二重パラトープ性抗体分子、または抗体の抗原結合性断片を含む抗体分子、例えば、半抗体もしくは半抗体の抗原結合性断片である。ある特定の実施形態では、抗体分子は、例えば本明細書に記載される、多特異性分子、例えば、二特異性分子を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
(i)配列番号16、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29もしくは配列番号30の軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、および軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべて、ならびに/または
(ii)配列番号15、配列番号23、配列番号24もしくは配列番号25の重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、および重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべてを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
(i)配列番号20のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号21のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号22のLC CDR3アミノ酸配列、および/または
(ii)配列番号17のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号18のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号19のHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
(i)配列番号20のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号21のLC CDR2アミノ酸配列、および配列番号2のLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、ならびに/または
(ii)配列番号17のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号18のHC CDR2アミノ酸配列、および配列番号19のHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
(i)配列番号63のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号64のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号65のLC CDR3アミノ酸配列、および/または
(ii)配列番号57のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号58のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号59のHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
(i)配列番号63のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号64のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号65のLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
(ii)配列番号57のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号58のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号59のHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
(i)配列番号66のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号67のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号68のLC CDR3アミノ酸配列、および/または
(ii)配列番号60のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号61のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号62のHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
(i)配列番号63のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号64のLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号65のLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
(ii)配列番号57のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号58のHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号59のHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子の軽鎖または重鎖可変フレームワーク(例えば、少なくともFR1、FR2、FR3、および必
要に応じてFR4を包含する領域)は、(a)ヒト軽鎖もしくは重鎖可変フレームワークからのアミノ酸残基、例えば、ヒト成熟抗体、ヒト生殖系列配列、もしくはヒトコンセンサス配列からの軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク残基のうちの少なくとも80%、85%、87%、90%、92%、93%、95%、97%、98%、もしくは100%を含む軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク、(b)ヒト軽鎖もしくは重鎖可変フレームワークからのアミノ酸残基、例えば、ヒト成熟抗体、ヒト生殖系列配列、もしくはヒトコンセンサス配列からの軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク残基の20%~80%、40%~60%、60%~90%、もしくは70%~95%を含む軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク、(c)非ヒトフレームワーク(例えば、齧歯動物フレームワーク)、または(d)例えば抗原性もしくは細胞傷害性決定因子を除去するように、修飾されている、例えば、脱免疫化、もしくは部分的にヒト化されている非ヒトフレームワークから選択することができる。一実施形態では、軽鎖または重鎖可変フレームワーク領域(特に、FR1、FR2および/またはFR3)は、ヒト生殖系列遺伝子のVLまたはVHセグメントのフレームワークに対して少なくとも70、75、80、85、87、88、90、92、94、95、96、97、98、99%同一のまたは同一の軽鎖または重鎖可変フレームワーク配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表2に記載のアミノ酸配列からの、例えば、例えば図2Aおよび図2Bに示されるか、または配列番号23~25における、可変領域全体中のFR領域のアミノ酸配列からの少なくとも1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、10個、15個、20個またはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する重鎖可変ドメインを含む。
代替的に、または本明細書に記載の重鎖置換と組み合わせて、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体のアミノ酸配列からの、例えば、例えば図2Aおよび図2Bに示されるか、または配列番号26~30における、可変領域全体中のFR領域のアミノ酸配列からの少なくとも1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、10個、15個、20個またはより多くのアミノ酸変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する軽鎖可変ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、図2Aに示される1つ、2つ、3つ、もしくは4つの重鎖フレームワーク領域、またはそれに対して実質的に同一の配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、図2Bに示される1つ、2つ、3つ、もしくは4つの軽鎖フレームワーク領域、またはそれに対して実質的に同一の配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図2Bに示される、軽鎖フレームワーク領域1を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図2Bに示される、軽鎖フレームワーク領域2を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図2Bに示される、軽鎖フレームワーク領域3を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図2Bに示される、軽鎖フレームワーク領域4を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数の、例えば、すべて
の、位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、FR1は、Kabatの番号付けによる1位におけるアスパラギン酸、例えば、1位における置換、例えば、アラニンからアスパラギン酸への置換を含む。一部の実施形態では、FR1は、Kabatの番号付けによる2位におけるアスパラギン、例えば、2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換、セリンからアスパラギンへの置換またはチロシンからアスパラギンへの置換を含む。一部の実施形態では、FR1は、Kabatの番号付けによる4位におけるロイシン、例えば、4位における置換、例えば、メチオニンからロイシンへの置換を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる1位における置換、例えば、アラニンからアスパラギン酸への置換、Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換、セリンからアスパラギンへの置換またはチロシンからアスパラギンへの置換、およびKabatの番号付けによる4位における置換、例えば、メチオニンからロイシンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ
V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる1位における置換、例えば、アラニンからアスパラギン酸への置換、およびKabatの番号付けによる2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換、セリンからアスパラギンへの置換またはチロシンからアスパラギンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる1位における置換、例えば、アラニンからアスパラギン酸への置換、およびKabatの番号付けによる4位における置換、例えば、メチオニンからロイシンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換、セリンからアスパラギンへの置換またはチロシンからアスパラギンへの置換、およびKabatの番号付けによる4位における置換、例えば、メチオニンからロイシンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数の、例えば、すべての、位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、FR3は、Kabatの番号付けによる66位におけるグリシン、例えば、66位における置換、例えば、リシンからグリシンへの置換、またはセリンからグリシンへの置換を含む。一部の実施形態では、FR3は、Kabatの番号付けによる69位におけるアスパラギン、例えば、69位における置換、例えば、チロシンからアスパラギンへの置換を含む。一部の実施形態では、FR3は、Kabatの番号付けによる71位におけるチロシン、例えば、71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換、またはアラニンからチロシンへの置換を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる66位における置換、例えば、リシンからグリシンへの置換、またはセリンからグリシンへの置換、およびKabatの番号付けによる69位における置換、例えば、チロシンからアスパラギンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、抗TCR
βV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる66位における置換、例えば、リシンからグリシンへの置換、またはセリンからグリシンへの置換、およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換、またはアラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、チロシンからアスパラギンへの置換およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換、またはアラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる66位における置換、例えば、リシンからグリシンへの置換、またはセリンからグリシンへの置換、Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、チロシンからアスパラギンへの置換およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換、またはアラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、配列番号26のアミノ酸配列に示されるように、Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換を含むフレームワーク領域1(FR1)、ならびにKabatの番号付けによる69位における置換、例えば、スレオニンからアスパラギンへの置換およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、配列番号27のアミノ酸配列に示されるように、(a)Kabatの番号付けによる1位における置換、例えば、アラニンからアスパラギン酸への置換、およびKabatの番号付けによる2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換を含むフレームワーク領域1(FR1)、ならびに(b)Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、スレオニンからアスパラギンへの置換およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、配列番号28のアミノ酸配列に示されるように、(a)Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、セリンからアスパラギンへの置換、およびKabatの番号付けによる4位における置換、例えば、メチオニンからロイシンへの置換を含むフレームワーク領域1(FR1)、ならびに(b)Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、スレオニンからアスパラギンへの置換およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、配列番号29のアミノ酸配列に示されるように、(a)Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、セリンからアスパラギンへの置換を含むフレームワー
ク領域1(FR1)、ならびに(b)Kabatの番号付けによる66位における置換、例えば、リシンからグリシンへの置換、Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、スレオニンからアスパラギンへの置換、およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、アラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、配列番号29のアミノ酸配列に示されるように、(a)Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、チロシンからアスパラギンへの置換を含むフレームワーク領域1(FR1)、ならびに(b)Kabatの番号付けによる66位における置換、例えば、セリンからグリシンへの置換、Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、スレオニンからアスパラギンへの置換、およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、アラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、(a)Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数(例えば、すべて)の位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域1(FR1)、および(b)Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数(例えば、すべて)の位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図2Aに示される、重鎖フレームワーク領域1を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図2Aに示される、重鎖フレームワーク領域2を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図2Aに示される、重鎖フレームワーク領域3を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図2Aに示される、重鎖フレームワーク領域4を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、重鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号20~23、または図2Aに示されるものを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、軽鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号26~30、または図2Bに示されるものを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、重鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号23~25、ならびに軽鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号26~30、または図2Aおよび図2Bに示されるものを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子の重鎖もしくは軽鎖可変ドメイン、または両方は、本明細書に開示されるアミノ酸に対して
実質的に同一である、例えば、本明細書に記載の抗体、例えば、表2に記載されるか、もしくは表2中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の可変領域に対して少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一である、または本明細書に記載の抗体の可変領域から少なくとも1個もしくは5個の残基、かつ40個、30個、20個、もしくは10個未満の残基が異なるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表2に示されるアミノ酸配列、またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるか、もしくは表2に示される配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なる配列を有する少なくとも1つ、2つ、3つ、または4つの抗原結合性領域、例えば、可変領域を含む。別の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表2に示されるヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるか、もしくは表2に示される配列から3個、6個、15個、30個、もしくは45個以下のヌクレオチドが異なる配列を有する核酸によってコードされるVHおよび/またはVLドメインを含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号23、配列番号24もしくは配列番号25のアミノ酸配列、配列番号23、配列番号24もしくは配列番号25のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23、配列番号24もしくは配列番号25のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および/または
配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29もしくは配列番号30のアミノ酸配列、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29もしくは配列番号30のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29もしくは配列番号30のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号23のアミノ酸配列、配列番号23のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号26のアミノ酸配列、配列番号26のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号23のアミノ酸配列、配列番号23のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号27のアミノ酸配列、配列番号27のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号27のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号23のアミノ酸配列、配列番号23のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号28のアミノ酸配列、配列番号28のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号28のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号23のアミノ酸配列、配列番号23のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号29のアミノ酸配列、配列番号29のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号29のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号23のアミノ酸配列、配列番号23のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号30のアミノ酸配列、配列番号30のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号30のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号24のアミノ酸配列、配列番号24のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号
24のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号26のアミノ酸配列、配列番号26のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号24のアミノ酸配列、配列番号24のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号27のアミノ酸配列、配列番号27のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号27のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号24のアミノ酸配列、配列番号24のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号28のアミノ酸配列、配列番号28のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号28のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号24のアミノ酸配列、配列番号24のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号29のアミノ酸配列、配列番号29のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号29のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号24のアミノ酸配列、配列番号24のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号30のアミノ酸配列、配列番号30のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号30のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号25のアミノ酸配列、配列番号25のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号26のアミノ酸配列、配列番号26のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号25のアミノ酸配列、配列番号25のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号27のアミノ酸配列、配列番号27のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号27のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号25のアミノ酸配列、配列番号25のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号28のアミノ酸配列、配列番号28のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号28のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号25のアミノ酸配列、配列番号25のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号29のアミノ酸配列、配列番号29のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号
29のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号25のアミノ酸配列、配列番号25のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号30のアミノ酸配列、配列番号30のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号30のアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、全長抗体またはその断片(例えば、Fab、F(ab’)、Fv、もしくは一本鎖Fv断片(scFv))である。実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、モノクローナル抗体または単一の特異性を有する抗体である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子はまた、ヒト化、キメラ、ラクダ、サメ、またはin vitroで生成された抗体分子であり得る。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子はヒト化抗体分子である。抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子の重鎖および軽鎖は、全長であり得(例えば、抗体は、少なくとも1つ、好ましくは2つの、完全重鎖、および少なくとも1つ、好ましくは2つの、完全軽鎖を含むことができる)、または抗原結合性断片(例えば、Fab、F(ab’)2、Fv、一本鎖Fv断片、単一ドメイン抗体、ダイアボディ(dAb)、二価抗体、もしくは二特異性抗体もしくはその断片、その単一ドメインバリアント、もしくはラクダ抗体)を含むことができる。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば本明細書に記載される、多特異性分子、例えば、二特異性分子の形態である。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD、およびIgEの重鎖定常領域から選択される重鎖定常領域(Fc)を有する。一部の実施形態では、Fc領域は、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4の重鎖定常領域から選択される。一部の実施形態では、Fc領域は、IgG1またはIgG2(例えば、ヒトIgG1、またはIgG2)の重鎖定常領域から選択される。一部の実施形態では、重鎖定常領域はヒトIgG1である。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、カッパまたはラムダ、好ましくはカッパ(例えば、ヒトカッパ)の軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を有する。一実施形態では、定常領域は、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子の特性を修飾するため(例えば、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞機能、または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるため)に変更、例えば、突然変異されている。例えば、定常領域は、Fc受容体結合を変更するために296位(MからYへ)、298位(SからTへ)、300位(TからEへ)、477位(HからKへ)および478位(NからFへ)において突然変異されている(例えば、突然変異した位置は、配列
番号212もしくは214の132位(MからYへ)、134位(SからTへ)、136位(TからEへ)、313位(HからKへ)および314位(NからFへ)、または配列番号215、216、217もしくは218の135位(MからYへ)、137位(SからTへ)、139位(TからEへ)、316位(HからKへ)および317位(NからFへ)に対応する)。
抗体B-H.1は、配列番号3280のアミノ酸配列を含む第1の鎖および配列番号3281のアミノ酸配列を含む第2の鎖を含む。
本開示の追加の例示的な抗TCRβ V12抗体は表2に提供される。一部の実施形態では、抗TCRβ V12は、表2に提供される抗体B、例えば、ヒト化抗体B(抗体B-H)である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、表2に提供されるLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて);ならびに/もしくは表2に提供されるHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて)、またはそれに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗体Bは、表2に提供される可変重鎖(VH)および/もしくは可変軽鎖(VL)、またはそれに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRVB 12抗体分子(例えば、抗TCRVB 12-3または抗TCRVB 12-4抗体分子)は、B-H.1A、B-H.1B、B-H.1C、B-H.1D、B-H.1E、B-H.1F、B-H.1G、B-H.1H、B-H.1、B-H.2、B-H.3、B-H.4、B-H.5、もしくはB-H.6のVH、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRVB 12抗体分子(例えば、抗TCRVB 12-3または抗TCRVB 12-4抗体分子)は、B-H.1A、B-H.1B、B-H.1C、B-H.1D、B-H.1E、B-H.1F、B-H.1G、B-H.1H、B-H.1、B-H.2、B-H.3、B-H.4、B-H.5、もしくはB-H.6のVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRVB 12抗体分子(例えば、抗TCRVB 12-3または抗TCRVB 12-4抗体分子)は、B-H.1A、B-H.1B、B-H.1C、B-H.1D、B-H.1E、B-H.1F、B-H.1G、B-H.1H、B-H.1、B-H.2、B-H.3、B-H.4、B-H.5、もしくはB-H.6のVH、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列;およびB-H.1A、B-H.1B、B-H.1C、B-H.1D、B-H.1E、B-H.1F、B-H.1G、B-H.1H、B-H.1、B-H.2、B-H.3、B-H.4、B-H.5、もしくはB-H.6のVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列を含む。
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抗TCRβ V5抗体
よって、一態様では、本開示は、ヒトTCRβ V5に結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、TCRβ V5サブファミリーは、TCRβ V5-5*01、TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、TCRβ V5-8*01、TCRβ V5-1*01、またはそのバリアントを含む。
本開示の例示的な抗TCRβ V5抗体は表10に提供される。一部の実施形態では、抗TCRβ V5は、表10に提供される抗体C、例えば、ヒト化抗体C(抗体C-H)である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、表10に提供されるLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて);ならびに/もしくは表10に提供されるHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて)、またはそれに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗体Cは、表10に提供される可変重鎖(VH)および/もしくは可変軽鎖(VL)、またはそれに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。
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本開示の例示的な抗TCRβ V5抗体は表11に提供される。一部の実施形態では、抗TCRβ V5は、表11に提供される抗体E、例えば、ヒト化抗体E(抗体E-H)である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、表11に提供されるLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべ
て);ならびに/もしくは表11に提供されるHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて)、またはそれに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗体Eは、表11に提供される可変重鎖(VH)および/もしくは可変軽鎖(VL)、またはそれに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗体Eは、配列番号3284のアミノ酸配列を含む重鎖および/もしくは配列番号3285のアミノ酸配列を含む軽鎖、またはそれに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。
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一部の実施形態では、抗TCRβ V5抗体分子は、表10に記載の抗体のVHおよび/もしくはVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはより高い同一性を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβ V5抗体分子は、表10に記載の抗体のVHおよびVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはより高い同一性を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβ V5抗体分子は、表11に記載の抗体のVHおよび/もしくはVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはより高い同一性を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβ V5抗体分子は、表11に記載の抗体のVHおよびVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはより高い同一性を有する配列を含む。
抗TCRβ V10抗体
よって、一態様では、本開示は、ヒトTCRβ V10サブファミリーメンバーに結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、TCRβ V10サブファミリーは、TCRβ V12としても公知である。一部の実施形態では、TCRβ V10サブファミリーは、TCRβ V10-1*01、TCRβ V10-1*02、TCRβ V10-3*01もしくはTCRβ V10-2*01、またはそのバリアントを含む。
本開示の例示的な抗TCRβ V10抗体は表12に提供される。一部の実施形態では、抗TCRβ V10は、表12に提供される抗体D、例えば、ヒト化抗体D(抗体D-H)である。一部の実施形態では、抗体Dは、表12に提供される1つもしくは複数(例えば、3つ)の軽鎖CDRおよび/もしくは1つもしくは複数(例えば、3つ)の重鎖CDR、またはそれに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗体Dは、表12に提供される可変重鎖(VH)および/もしくは可変軽鎖(VL)、またはそれに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。
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一部の実施形態では、抗TCRβ V10抗体分子は、表12に記載の抗体のVHもしくはVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはより高い同一性を有する配列を含む。
一部の実施形態では、抗TCRβ V10抗体分子は、表12に記載の抗体のVHおよびVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはより高い同一性を有する配列を含む。
追加の抗TCRVβ抗体
本開示の追加の例示的な抗TCRβV抗体は表13に提供される。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、例えば表13に提供される、ヒト化抗体である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、表13に提供されるLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて);ならびに/もしくは表13に提供されるHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて)、またはそれに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、表13に提供される可変重鎖(VH)および/もしくは可変軽鎖(VL)、またはそれに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。
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抗TCRVβ抗体エフェクター機能およびFcバリアント
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRVβ抗体は、例えば本明細書に記載される、Fc領域を含む。一部の実施形態では、Fc領域は、野生型Fc領域、例えば、野生型ヒトFc領域である。一部の実施形態では、Fc領域は、バリアント、例えば、例えば、少なくとも1つのFc受容体に対する親和性の低減または除去をもたらす、Fc領域中の少なくとも1つのアミノ酸残基の付加、置換、または欠失を含むFc領域を含む。
抗体のFc領域は、Fc受容体(例えば、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIIA)を含む多数の受容体またはリガンド、補体タンパク質CIq、ならびにプロテイン
AおよびGなどの他の分子と相互作用する。これらの相互作用は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性(ADCC)、抗体依存性細胞ファゴサイトーシス(ADCP)および補体依存性細胞傷害性(CDC)を含む様々なエフェクター機能および下流のシグナル伝達事象のために必須である。
一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む抗TCRVβ抗体は、低減された、例えば、除去された、Fc受容体、例えば、本明細書に記載のFc受容体に対する親和性を有する。一部の実施形態では、親和性の低減は、野生型Fc領域を有するそれ以外は類似の抗体と比較したものである。
一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む抗TCRVβ抗体は、以下の特性:(1)エフェクター機能の低減(例えば、ADCC、ADCPおよび/もしくはCDCの低減);(2)1つもしくは複数のFc受容体への結合の低減;ならびに/または(3)C1q補体への結合の低減のうちの1つまたは複数を有する。一部の実施形態では、特性(1)~(3)のうちのいずれか1つ、またはすべてにおける低減は、野生型Fc領域を有するそれ以外は類似の抗体と比較したものである。
一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む抗TCRVβ抗体は、ヒトFc受容体、例えば、FcγR I、FcγR IIおよび/またはFcγR IIIに対する低減された親和性を有する。一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む抗TCRVβ抗体は、ヒトIgG1領域またはヒトIgG4領域を含む。
一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む抗TCRVβ抗体は、例えば、本明細書に記載されるように、T細胞を活性化および/または拡大させる。一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む抗TCRVβ抗体は、本明細書に記載のサイトカインプロファイル、例えば、TCRβV領域以外の受容体または分子に結合するT細胞エンゲージャー(「非TCRβV結合性T細胞エンゲージャー」)のサイトカインプロファイルとは異なるサイトカインプロファイルを有する。一部の実施形態では、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーは、CD3分子(例えば、CD3イプシロン(CD3e)分子);またはTCRアルファ(TCRα)分子に結合する抗体を含む。
例示的なFc領域バリアントは表21に提供され、そしてまたSaunders O、(2019年) Frontiers in Immunology; vol 10、article1296(その全内容は参照により本明細書に組み込まれる)に開示される。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRVβ抗体は、表21に開示されるFc領域バリアントの任意の1つまたはすべて、または任意の組合せを含む。
一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRVβ抗体は、表21に開示される、Fc領域バリアント、例えば、突然変異の任意の1つまたはすべて、または任意の組合せを含む。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRVβ抗体は、Asn297Ala(N297A)突然変異を含む。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRVβ抗体は、Leu234Ala/Leu235Ala(LALA)突然変異を含む。
Figure 2023509708000105
抗体分子
一実施形態では、抗体分子は、がん抗原、例えば、腫瘍抗原または間質抗原に結合する。一部の実施形態では、がん抗原は、例えば、哺乳動物、例えば、ヒトのがん抗原である。他の実施形態では、抗体分子は、免疫細胞抗原、例えば、哺乳動物、例えば、ヒトの免疫細胞抗原に結合する。例えば、抗体分子は、がん抗原または免疫細胞抗原上のエピトープ、例えば、線形エピトープまたは立体構造エピトープに特異的に結合する。
一実施形態では、抗体分子は単一特異性抗体分子であり、単一のエピトープに結合する
。例えば、単一特異性抗体分子は、それぞれが同じエピトープに結合する複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列を有する。
一実施形態では、抗体分子は、多特異性または多機能性抗体分子であり、例えば、それは複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列を含み、複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列のうちの第1のものは第1のエピトープに対する結合特異性を有し、複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列のうちの第2のものは第2のエピトープに対する結合特異性を有する。一実施形態では、第1および第2のエピトープは、同じ抗原、例えば、同じタンパク質(または多量体タンパク質のサブユニット)上にある。一実施形態では、第1および第2のエピトープはオーバーラップする。一実施形態では、第1および第2のエピトープはオーバーラップしない。一実施形態では、第1および第2のエピトープは、異なる抗原、例えば、異なるタンパク質(または多量体タンパク質の異なるサブユニット)上にある。一実施形態では、多特異性抗体分子は、第3、第4または第5の免疫グロブリン可変ドメインを含む。一実施形態では、多特異性抗体分子は、二特異性抗体分子、三特異性抗体分子、または四特異性抗体分子である。
一実施形態では、多特異性抗体分子は二特異性抗体分子である。二特異性抗体は、2つ以下の抗原に対して特異性を有する。二特異性抗体分子は、第1のエピトープに対して結合特異性を有する第1の免疫グロブリン可変ドメイン配列および第2のエピトープに対して結合特異性を有する第2の免疫グロブリン可変ドメイン配列によって特徴付けられる。一実施形態では、第1および第2のエピトープは、同じ抗原、例えば、同じタンパク質(または多量体タンパク質のサブユニット)上にある。一実施形態では、第1および第2のエピトープはオーバーラップする。一実施形態では、第1および第2のエピトープはオーバーラップしない。一実施形態では、第1および第2のエピトープは、異なる抗原、例えば、異なるタンパク質(または多量体タンパク質の異なるサブユニット)上にある。一実施形態では、二特異性抗体分子は、第1のエピトープに対して結合特異性を有する重鎖可変ドメイン配列および軽鎖可変ドメイン配列ならびに第2のエピトープに対して結合特異性を有する重鎖可変ドメイン配列および軽鎖可変ドメイン配列を含む。一実施形態では、二特異性抗体分子は、第1のエピトープに対して結合特異性を有する半抗体および第2のエピトープに対して結合特異性を有する半抗体を含む。一実施形態では、二特異性抗体分子は、第1のエピトープに対して結合特異性を有する半抗体、またはその断片、および第2のエピトープに対して結合特異性を有する半抗体、またはその断片を含む。一実施形態では、二特異性抗体分子は、第1のエピトープに対して結合特異性を有するscFvもしくはFab、またはその断片、および第2のエピトープに対して結合特異性を有するscFvもしくはFab、またはその断片を含む。
一実施形態では、抗体分子は、ダイアボディ、および一本鎖分子の他に、抗体の抗原結合性断片(例えば、Fab、F(ab’)、およびFv)を含む。例えば、抗体分子は、重(H)鎖可変ドメイン配列(本明細書でVHと略記される)、および軽(L)鎖可変ドメイン配列(本明細書でVLと略記される)を含むことができる。一実施形態では、抗体分子は、重鎖および軽鎖を含むかまたはからなる(本明細書で半抗体と称される。別の例では、抗体分子は、2つの重(H)鎖可変ドメイン配列および2つの軽(L)鎖可変ドメイン配列を含み、それによって、2つの抗原結合性部位、例えば、Fab、Fab’、F(ab’)、Fc、Fd、Fd’、Fv、一本鎖抗体(例えばscFv)、単一可変ドメイン抗体、ダイアボディ(Dab)(二価および二特異性)、ならびにキメラ(例えば、ヒト化)抗体を形成し、これらは全長抗体の修飾によって産生されるか、または組換えDNA技術を使用してde novoで合成されるものであってもよい。これらの機能的抗体断片は、それらの各々の抗原または受容体と選択的に結合する能力を保持する。抗体および抗体断片は、IgG、IgA、IgM、IgD、およびIgEが挙げられるがそれに限定されない抗体の任意のクラスから、ならびに抗体の任意のサブクラス(例えば、
IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4)からのものであり得る。抗体分子の調製物は、モノクローナルまたはポリクローナルであり得る。抗体分子はまた、ヒト、ヒト化、CDRグラフト化、またはin vitroで生成された抗体であり得る。抗体は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4から選択される重鎖定常領域を有し得る。抗体はまた、例えば、カッパまたはラムダから選択される軽鎖を有し得る。「免疫グロブリン」(Ig)という用語は、本明細書で「抗体」という用語と交換可能に使用される。
抗体分子の抗原結合性断片の例としては、(i)VL、VH、CLおよびCH1ドメインからなる一価断片である、Fab断片、(ii)ヒンジ領域においてジスルフィド架橋によって連結された2つのFab断片を含む二価断片である、F(ab’)2断片、(iii)VHおよびCH1ドメインからなる、Fd断片、(iv)抗体の単一のアームのVLおよびVHドメインからなる、Fv断片、(v)VHドメインからなる、ダイアボディ(dAb)断片、(vi)ラクダまたはラクダ化可変ドメイン、(vii)一本鎖Fv(scFv)、例えば、Birdら、(1988) Science 242:423~426ページ;およびHustonら、(1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879~5883ページを参照)、(viii)単一ドメイン抗体が挙げられる。これらの抗体断片は、当業者に公知の従来技術を使用して得られ、断片は、インタクトな抗体と同じ方式で有用性についてスクリーニングされる。
抗体分子としては、インタクトな分子の他に、その機能的断片が挙げられる。抗体分子の定常領域は、抗体の特性を修飾するため(例えば、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞機能、または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるため)に変更、例えば、突然変異され得る。
抗体分子はまた、単一ドメイン抗体であり得る。単一ドメイン抗体は、その相補性(complementary)決定領域が単一ドメインポリペプチドの部分である抗体を含むことができる。例としては、重鎖抗体、軽鎖を天然に欠いている抗体、従来の4鎖抗体に由来する単一ドメイン抗体、操作された抗体および抗体に由来するもの以外の単一ドメインスキャフォールドが挙げられるがそれに限定されない。単一ドメイン抗体は、当該技術分野における任意のもの、または任意の将来的な単一ドメイン抗体であってもよい。単一ドメイン抗体は、マウス、ヒト、ラクダ、ラマ、魚、サメ、ヤギ、ウサギ、およびウシが挙げられるがそれに限定されない任意の種に由来してもよい。本発明の別の態様によれば、単一ドメイン抗体は、軽鎖を欠いている重鎖抗体として公知の天然に存在する単一ドメイン抗体である。そのような単一ドメイン抗体は、例えば、WO9404678に開示されている。明確性の理由から、軽鎖を天然に欠いている重鎖抗体に由来するこの可変ドメインは、4鎖免疫グロブリンの従来のVHからそれを区別するためにVHHまたはナノボディとして本明細書で知られる。そのようなVHH分子は、ラクダ科の種、例えば、ラクダ、ラマ、ヒトコブラクダ、アルパカおよびグアナコにおいて産生された抗体に由来することができる。ラクダ科以外の他の種が、軽鎖を天然に欠いている重鎖抗体を産生することがあり、そのようなVHHは本発明の範囲内である。
VHおよびVL領域は、「フレームワーク領域」(FRまたはFW)と称されるより保存された領域が差し挟まれた、「相補性決定領域」(CDR)と称される超可変性の領域にさらに分割することができる。
フレームワーク領域およびCDRの範囲は、多数の方法によって精密に定義されている(Kabat, E. A.ら、(1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest、第5版、U.S. Department of Health and Human Services、N
IH Publication No. 91-3242;Chothia, C.ら、(1987) J. Mol. Biol. 196:901~917ページ;およびOxford MolecularのAbM抗体モデリングソフトウェアによって使用されるAbMの定義を参照。一般に、例えば、「Protein Sequence and
Structure Analysis of Antibody Variable
Domains」、Antibody Engineering Lab Manual(Duebel, S.およびKontermann, R.編、Springer-Verlag、Heidelberg)を参照)。
「相補性決定領域」、および「CDR」という用語は、本明細書で使用される場合、抗原特異性および結合親和性を付与する抗体可変領域内のアミノ酸の配列を指す。一般に、各重鎖可変領域中に3つのCDR(HCDR1、HCDR2、HCDR3)および各軽鎖可変領域中に3つのCDR(LCDR1、LCDR2、LCDR3)がある。
所与のCDRの精密なアミノ酸配列の境界は、Kabatら、(1991)、「Sequences of Proteins of Immunological Interest」、第5版、Public Health Service、National
Institutes of Health、Bethesda、MD(「Kabat」番号付けスキーム)、Al-Lazikaniら、(1997) JMB 273、927~948ページ(「Chothia」番号付けスキーム)に記載のものを含む、多数の公知のスキームのいずれかを使用して決定することができる。本明細書で使用される場合、「Chothia」番号スキームに従って定義されるCDRは、「超可変ループ」と称されることもある。
例えば、Kabatの下で、重鎖可変ドメイン(VH)中のCDRアミノ酸残基は、31~35(HCDR1)、50~65(HCDR2)、および95~102(HCDR3)と番号付けされ、軽鎖可変ドメイン(VL)中のCDRアミノ酸残基は、24~34(LCDR1)、50~56(LCDR2)、および89~97(LCDR3)と番号付けされる。Chothiaの下で、VH中のCDRアミノ酸は、26~32(HCDR1)、52~56(HCDR2)、および95~102(HCDR3)と番号付けされ、VL中のアミノ酸残基は、26~32(LCDR1)、50~52(LCDR2)、および91~96(LCDR3)と番号付けされる。
各VHおよびVLは、典型的には、以下の順序:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4でアミノ末端からカルボキシ末端へと並んだ3つのCDRおよび4つのFRを含む。
抗体分子は、ポリクローナルまたはモノクローナル抗体であり得る。
「モノクローナル抗体」または「モノクローナル抗体組成物」という用語は、本明細書で使用される場合、単一の分子組成の抗体分子の調製物を指す。モノクローナル抗体組成物は、特定のエピトープに対して単一の結合特異性および親和性を表し示す。モノクローナル抗体は、ハイブリドーマ技術によって、またはハイブリドーマ技術を使用しない方法(例えば、組換え法)によって作製することができる。
抗体は、組換えによって産生することができ、例えば、ファージディスプレイまたはコンビナトリアル法、または酵母ディスプレイによって産生することができる。
抗体を生成するためのファージディスプレイおよびコンビナトリアル法は、当該技術分野において公知である(例えば、Ladnerら、米国特許第5,223,409号;Kangら、国際公開WO92/18619;Dowerら、国際公開WO91/17271;Winterら、国際公開WO92/20791;Marklandら、国際公開W
O92/15679;Breitlingら、国際公開WO93/01288;McCaffertyら、国際公開WO92/01047;Garrardら、国際公開WO92/09690;Ladnerら、国際公開WO90/02809;Fuchsら、(1991) Bio/Technology 9:1370~1372ページ;Hayら、(1992) Hum Antibod Hybridomas 3:81~85ページ;Huseら、(1989) Science 246:1275~1281ページ;Griffthsら、(1993) EMBO J 12:725~734ページ;Hawkinsら、(1992) J Mol Biol 226:889~896ページ;Clacksonら、(1991) Nature 352:624~628ページ;Gramら、(1992) PNAS 89:3576~3580ページ;Garradら、(1991) Bio/Technology 9:1373~1377ページ;Hoogenboomら、(1991) Nuc Acid Res 19:4133~4137ページ;およびBarbasら、(1991) PNAS 88:7978~7982ページ(これらのすべての内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に記載される通りである)。
抗体を生成または同定するための酵母ディスプレイ法は当該技術分野において公知であり、例えば、Chaoら、(2006) Nature Protocols 1(2):755~68ページ(その内容全体はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に記載される通りである。
一実施形態では、抗体は、完全ヒト抗体(例えば、ヒト免疫グロブリン配列からの抗体を産生するように遺伝子操作されたマウスにおいて作製される抗体)、または非ヒト抗体、例えば、齧歯動物(マウスもしくはラット)、ヤギ、霊長動物(例えば、サル)、ラクダ抗体である。好ましくは、非ヒト抗体は齧歯動物(マウスまたはラット抗体)である。齧歯動物抗体を産生する方法は当該技術分野において公知である。
ヒトモノクローナル抗体は、マウス系ではなくヒト免疫グロブリン遺伝子を持つトランスジェニックマウスを使用して生成することができる。目的の抗原を用いて免疫化されたこれらのトランスジェニックマウスからの脾臓細胞を使用して、ヒトタンパク質からのエピトープに対して特異的親和性を有するヒトmAbを分泌するハイブリドーマが産生される(例えば、Woodら、国際出願WO91/00906、Kucherlapatiら、PCT国際公開WO91/10741;Lonbergら、国際出願WO92/03918;Kayら、国際出願92/03917;Lonberg, N.ら、1994 Nature 368:856~859ページ;Green, L.L.ら、1994 Nature Genet. 7:13~21ページ;Morrison, S.L.ら、1994 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851~6855ページ;Bruggemanら、1993 Year Immunol 7:33~40ページ;Tuaillonら、1993 PNAS 90:3720~3724ページ;Bruggemanら、1991 Eur J Immunol 21:1323~1326ページを参照)。
抗体分子は、可変領域、またはその部分、例えば、CDRが、非ヒト生物、例えば、ラットまたはマウスにおいて生成されたものであり得る。キメラ、CDRグラフト化、およびヒト化抗体は、本発明の範囲内である。非ヒト生物、例えば、ラットまたはマウスにおいて生成され、次に、ヒトにおける抗原性を減少させるために、例えば、可変フレームワークまたは定常領域において修飾された抗体分子は、本発明の範囲内である。
「有効ヒト」タンパク質は、中和抗体応答、例えば、ヒト抗マウス抗体(HAMA)応答を実質的に誘起しないタンパク質である。HAMAは、多数の状況において、例えば、
例えば慢性または再発性の疾患状態の処置において、抗体分子が繰り返し投与される場合に、問題となり得る。HAMA応答は、血清からの抗体クリアランスの増加(例えば、Salehら、Cancer Immunol. Immunother.、32:180~190ページ(1990)を参照)のため、そしてまた潜在的なアレルギー性反応(例えば、LoBuglioら、Hybridoma、5:5117~5123ページ(1986)を参照)のため、繰返しの抗体投与を潜在的に有効でないものとさせることがある。
キメラ抗体は、当該技術分野において公知の組換えDNA技術によって産生することができる(Robinsonら、国際公開PCT/US86/02269;Akiraら、欧州特許出願第184,187号;Taniguchi, M.、欧州特許出願第171,496号;Morrisonら、欧州特許出願第173,494号;Neubergerら、国際出願WO86/01533;Cabillyら、米国特許第4,816,567号;Cabillyら、欧州特許出願第125,023号;Betterら、(1988 Science 240:1041~1043ページ);Liuら、(1987) PNAS 84:3439~3443ページ;Liuら、1987、J. Immunol. 139:3521~3526ページ;Sunら、(1987) PNAS 84:214~218ページ;Nishimuraら、1987、Canc. Res. 47:999~1005ページ;Woodら、(1985) Nature 314:446~449ページ;およびShawら、1988、J. Natl Cancer Inst. 80:1553~1559ページを参照)。
ヒト化またはCDRグラフト化抗体は、ドナーCDRで置き換えられた(重およびまたは軽免疫グロブリン(immuoglobulin)鎖のうちの)少なくとも1つまたは2つであるが一般に3つすべてのレシピエントCDRを有する。抗体は、非ヒトCDRの少なくとも部分で置き換えられていてもよく、またはCDRの一部のみが非ヒトCDRで置き換えられていてもよい。抗原への結合のために要求されるCDRの数を置き換えることのみが必要である。好ましくは、ドナーは、齧歯動物抗体、例えば、ラットまたはマウス抗体であり、レシピエントは、ヒトフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークである。典型的には、CDRを提供する免疫グロブリンは「ドナー」と呼ばれ、フレームワークを提供する免疫グロブリンは「アクセプター」と呼ばれる。一実施形態では、ドナー免疫グロブリンは非ヒト(例えば、齧歯動物)である。アクセプターフレームワークは、天然に存在する(例えば、ヒト)フレームワークもしくはコンセンサスフレームワーク、またはそれに対して約85%もしくはより高い、好ましくは、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一である配列である。
本明細書で使用される場合、「コンセンサス配列」という用語は、関連配列のファミリーにおいて最も頻繁に生じるアミノ酸(またはヌクレオチド)から形成される配列を指す(例えば、Winnaker、From Genes to Clones(Verlagsgesellschaft、Weinheim、Germany 1987)を参照。タンパク質のファミリーにおいて、コンセンサス配列中の各位置は、ファミリーにおいてその位置において最も頻繁に生じるアミノ酸によって占有される。2つのアミノ酸が等しく頻繁に生じる場合、いずれかをコンセンサス配列に含めることができる。「コンセンサスフレームワーク」は、コンセンサス免疫グロブリン配列中のフレームワーク領域を指す。
抗体分子は、当該技術分野において公知の方法によってヒト化させることができる(例えば、Morrison, S. L.、1985、Science 229:1202~1207ページ、Oiら、1986、BioTechniques 4:214、ならびにQueenら、米国特許第5,585,089号、米国特許第5,693,761号
および米国特許第5,693,762号(これらのすべての内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
ヒト化またはCDRグラフト化抗体分子は、CDRグラフト化またはCDR置換によって産生することができ、それにおいて免疫グロブリン鎖の1つ、2つ、またはすべてのCDRを置き換えることができる。例えば、米国特許第5,225,539号;Jonesら、1986 Nature 321:552~525ページ;Verhoeyanら、1988 Science 239:1534;Beidlerら、1988 J. Immunol. 141:4053~4060ページ;Winter、米国特許第5,225,539号(これらのすべての内容はこれにより明示的に参照により本明細書に組み込まれる)を参照。Winterは、本発明のヒト化抗体を調製するために使用され得るCDRグラフト化方法を記載する(1987年3月26日に出願された英国特許出願第2188638A号;Winter、米国特許第5,225,539号)(その内容は明示的に参照により本明細書に組み込まれる)。
具体的なアミノ酸が置換、欠失または付加されたヒト化抗体分子もまた本発明の範囲である。ドナーからのアミノ酸を選択する基準は、米国特許第5,585,089号、例えば、米国特許第5,585,089号の第12~16欄、例えば、米国特許第5,585,089号の第12~16欄に記載されている(その内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)。抗体をヒト化する他の技術は、1992年12月23日に公開されたPadlanら、EP519596A1に記載されている。
抗体分子は一本鎖抗体であり得る。一本鎖抗体(scFV)は操作されていてもよい(例えば、Colcher, D.ら、(1999) Ann N Y Acad Sci
880:263~80ページ;およびReiter, Y.、(1996) Clin
Cancer Res 2:245~52ページを参照)。一本鎖抗体は、二量体化または多量体化して、同じ標的タンパク質の異なるエピトープに対して特異性を有する多価抗体を生成することができる。
さらに他の実施形態では、抗体分子は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD、およびIgEの重鎖定常領域から選択される、特に、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4の(例えば、ヒト)重鎖定常領域から選択される重鎖定常領域を有する。別の実施形態では、抗体分子は、例えば、カッパまたはラムダの(例えば、ヒト)軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を有する。定常領域は、抗体の特性を修飾するため(例えば、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞機能、および/または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるため)に変更、例えば、突然変異され得る。一実施形態では、抗体は、エフェクター機能を有し、かつ補体を固定することができる。他の実施形態では、抗体は、エフェクター細胞をリクルートせず、かつ補体を固定しない。別の実施形態では、抗体は、Fc受容体に結合する低減した能力を有し、または該能力を有しない。例えば、それは、Fc受容体への結合をサポートしないアイソタイプまたはサブタイプ、断片または他の突然変異体であり、例えば、それは、突然変異誘発されたFc受容体結合性領域を有し、またはそれを欠失している。
抗体定常領域を変更する方法は当該技術分野において公知である。変更された機能、例えば、エフェクターリガンド、例えば、細胞上のFcR、または補体のC1成分に対する変更された親和性を有する抗体は、抗体の定常部分中の少なくとも1つのアミノ酸残基を異なる残基で置き換えることによって産生することができる(例えば、EP388,151A1、米国特許第5,624,821号および米国特許第5,648,260号(これらのすべての内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。マウス、
または他の種の免疫グロブリンに応用された場合にこれらの機能を低減または排除する類似の種類の変更が記載され得る。
抗体分子は、誘導体化または別の機能分子(例えば、別のペプチドもしくはタンパク質)に連結させることができる。本明細書で使用される場合、「誘導体化」された抗体分子は、修飾された抗体分子である。誘導体化の方法としては、蛍光部分、放射性ヌクレオチド、毒素、酵素または親和性リガンド、例えば、ビオチンの付加が挙げられるがそれに限定されない。よって、本発明の抗体分子は、免疫接着分子を含む、本明細書に記載の抗体の誘導体化および他に修飾された形態を含むことが意図される。例えば、抗体分子は、1つまたは複数の他の分子実体、例えば、別の抗体(例えば、二特異性抗体もしくはダイアボディ)、検出可能な剤、細胞傷害剤、医薬剤、および/または抗体もしくは抗体部分の別の分子(例えば、ストレプトアビジンコア領域もしくはポリヒスチジンタグ)との会合を媒介することができるタンパク質もしくはペプチドに(化学的カップリング、遺伝子融合、非共有結合的会合またはその他によって)機能的に連結させることができる。
1つの種類の誘導体化された抗体分子は、(例えば、二特異性抗体を作出するために、同じ種類または異なる種類の)2つまたはより多くの抗体を架橋することによって産生される。好適なクロスリンカーとしては、適切なスペーサー(例えば、m-マレイミドベンゾイル-N-ヒドロキシスクシンイミドエステル)またはホモ二官能性(例えば、スベリン酸ジサクシンイミジル)によって分離された2つの別個に反応性の基を有するヘテロ二官能性のものが挙げられる。そのようなリンカーは、Pierce Chemical Company、Rockford、Illから入手可能である。
多特異性または多機能性抗体分子
本明細書で定義される多特異性および多機能性分子の例示的な構造は、全体を通じて記載されている。例示的な構造は、Weidle Uら、(2013) The Intriguing Options of Multispecific Antibody
Formats for Treatment of Cancer. Cancer
Genomics & Proteomics 10: 1~18ページ(2013);およびSpiess Cら、(2015) Alternative molecular formats and therapeutic applications for bispecific antibodies. Molecular Immunology 67: 95~106ページ(これらのそれぞれの全内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)にさらに記載されている。
実施形態では、多特異性抗体分子は、異なる部位が異なる抗原に特異的である1つより多くの抗原結合性部位を含むことができる。実施形態では、多特異性抗体分子は、同じ抗原上の1つより多く(例えば、2つまたはより多く)のエピトープに結合することができる。実施形態では、多特異性抗体分子は、標的細胞(例えば、がん細胞)に特異的な抗原結合性部位および免疫エフェクター細胞に特異的な異なる抗原結合性部位を含む。一実施形態では、多特異性抗体分子は二特異性抗体分子である。二特異性抗体分子は、5つの異なる構造群:(i)二特異性免疫グロブリンG(BsIgG)、(ii)追加の抗原結合性部分を付加されたIgG、(iii)二特異性抗体断片、(iv)二特異性融合タンパク質、および(v)二特異性抗体コンジュゲートに分類することができる。
BsIgGは、各抗原について一価のフォーマットである。例示的なBsIgGフォーマットとしては、crossMab、DAF(two-in-one)、DAF(four-in-one)、DutaMab、DT-IgG、ノブ・イン・ホール(knobs-in-holes)共通LC、ノブ・イン・ホールアセンブリー、電荷対、Fabアーム交換、SEEDボディ、triomab、LUZ-Y、Fcab、κλボディ、直交F
abが挙げられるがそれに限定されない。Spiessら、Mol. Immunol.
67(2015):95~106ページを参照。例示的なBsIgGとしては、抗CD3アームおよび抗EpCAMアームを含有するカツマキソマブ(Fresenius Biotech、Trion Pharma、Neopharm)、ならびにCD3およびHER2を標的化するエルツマキソマブ(Neovii Biotech、Fresenius Biotech)が挙げられる。一部の実施形態では、BsIgGは、ヘテロ二量体化のために操作された重鎖を含む。例えば、重鎖は、「ノブ・イントゥー・ホール」(knobs-into-holes)戦略、SEEDプラットフォーム、(例えば、κλボディ中の)共通重鎖、およびヘテロ二量体Fc領域の使用を使用してヘテロ二量体化のために操作することができる。Spiessら、Mol. Immunol. 67(2015):95~106ページを参照。BsIgGにおけるホモ二量体の重鎖対合を回避するために使用されてきた戦略としては、ノブ・イン・ホール、デュオボディ(duobody)、アジメトリック(azymetric)、電荷対、HA-TF、SEEDボディ、および差次的なプロテインA親和性が挙げられる。同文献を参照。BsIgGは、異なる宿主細胞中での成分抗体の別々の発現およびその後の精製/BsIgGへのアセンブリーによって産生することができる。BsIgGはまた、単一の宿主細胞中での成分抗体の発現によって産生することができる。BsIgGは、例えば、プロテインAおよび逐次的pH溶出を使用する、親和性クロマトグラフィーを使用して精製することができる。
追加の抗原結合性部分を付加されたIgGは、二特異性抗体分子の別のフォーマットである。例えば、単一特異性IgGは、例えば、重鎖または軽鎖のいずれかのNまたはC末端において、追加の抗原結合性単位を単一特異性IgGに付加することによって二特異性を有するように操作することができる。例示的な追加の抗原結合性単位としては、単一ドメイン抗体(例えば、可変重鎖または可変軽鎖)、操作されたタンパク質スキャフォールド、および対合した抗体可変ドメイン(例えば、単鎖可変断片または可変断片)が挙げられる。同文献を参照。付加されたIgGフォーマットの例としては、二重可変ドメインIgG(DVD-Ig)、IgG(H)-scFv、scFv-(H)IgG、IgG(L)-scFv、scFv-(L)IgG、IgG(L,H)-Fv、IgG(H)-V、V(H)-IgG、IgG(L)-V、V(L)-IgG、KIH IgG-scFab、2scFv-IgG、IgG-2scFv、scFv4-Ig、ザイボディ(zybody)、およびDVI-IgG(4-in-1)が挙げられる。Spiessら、Mol. Immunol. 67(2015):95~106ページを参照。IgG-scFvの例は、IGF-1RおよびHER3に結合するMM-141(Merrimack Pharmaceuticals)である。DVD-Igの例としては、IL-1αおよびIL-1βに結合するABT-981(AbbVie)、ならびにTNFおよびIL-17Aに結合するABT-122(AbbVie)が挙げられる。
二特異性抗体断片(BsAb)は、抗体定常ドメインの一部またはすべてを欠いた二特異性抗体分子のフォーマットである。例えば、一部のBsAbはFc領域を欠いている。実施形態では、二特異性抗体断片は、単一の宿主細胞中でのBsAbの効率的な発現を許容するペプチドリンカーによって接続された重鎖および軽鎖領域を含む。例示的な二特異性抗体断片としては、ナノボディ、ナノボディ-HAS、BiTE、ダイアボディ、DART、TandAb、scDiabody、scDiabody-CH3、ダイアボディ-CH3、トリプルボディ、ミニ抗体、ミニボディ、TriBiミニボディ、scFv-CH3 KIH、Fab-scFv、scFv-CH-CL-scFv、F(ab’)2、F(ab’)2-scFv2、scFv-KIH、Fab-scFv-Fc、四価HCAb、scDiabody-Fc、ダイアボディ-Fc、タンデムscFv-Fc、およびイントラボディが挙げられるがそれに限定されない。同文献を参照。例えば、BiTEフォーマットはタンデムscFvを含み、成分scFvは、T細胞上のCD3およびがん細胞上の表面抗原に結合する。
二特異性融合タンパク質としては、例えば、追加の特異性および/または機能性を加えるために、他のタンパク質に連結された抗体断片が挙げられる。二特異性融合タンパク質の例は、HLA提示ペプチドを認識する親和性成熟したT細胞受容体に連結された抗CD3 scFvを含むimmTACである。実施形態では、より高い価数を有する二特異性抗体分子を生成するためにドック-アンド-ロック(dock-and-lock)(DNL)法を使用することができる。また、アルブミン結合性タンパク質またはヒト血清アルブミンへの融合は、抗体断片の血清半減期を延長させることができる。同文献を参照。
実施形態では、BsAb分子を作出するために化学的コンジュゲーション、例えば、抗体および/または抗体断片の化学的コンジュゲーションを使用することができる。同文献を参照。例示的な二特異性抗体コンジュゲートとしては、CovXボディフォーマットが挙げられ、該フォーマットでは、低分子量薬物が、各Fabアームまたは抗体もしくはその断片中の単一の反応性リシンに部位特異的にコンジュゲートしている。実施形態では、コンジュゲーションは、低分子量薬物の血清半減期を向上させる。例示的なCovXボディは、VEGFまたはAng2のいずれかを阻害する2つの短いペプチドにコンジュゲートした抗体を含むCVX-241(NCT01004822)である。同文献を参照。
抗体分子は、例えば、宿主系中での少なくとも1つまたは複数の成分の、組換え発現によって産生することができる。例示的な宿主系としては、真核細胞(例えば、哺乳動物細胞、例えば、CHO細胞、または昆虫細胞、例えば、SF9もしくはS2細胞)および原核細胞(例えば、E. coli)が挙げられる。二特異性抗体分子は、異なる宿主細胞中での成分の別々の発現およびその後の精製/アセンブリーによって産生することができる。代替的に、抗体分子は、単一の宿主細胞中での成分の発現によって産生することができる。二特異性抗体分子の精製は、例えば、プロテインAおよび逐次的pH溶出を使用する、親和性クロマトグラフィーなどの、様々な方法によって行うことができる。他の実施形態では、親和性タグ、例えば、ヒスチジン含有タグ、mycタグ、またはストレプトアビジンタグを精製のために使用することができる。
例示的な二特異性分子
一態様では、本明細書に開示される多特異性分子は、本明細書に開示される配列、例えば、配列番号1004~1007、3275~3277、3286、もしくは3287から選択される配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、955、96%、97%、98%、99%もしくはより高い同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、配列番号3288のアミノ酸配列を含むリーダー配列を含む。一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、配列番号3288のアミノ酸配列を含むリーダー配列を含まない。
分子F:aCD19×aVb6.5
分子Fは、配列番号1004のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号1005のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
分子F.1
配列番号1004(重鎖)(Tcrvベータ6_5 scFv/抗CD19重鎖)
METDTLLLWVLLLWVPGSTGQVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYSFTTYYIHWVRQAPGQGLEWMGWFFPGSGNIKYNEKFKGRVTITADTSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAGSYYSYDVLDYWGQGTTVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPSFLSASVGDRVTITCKASQNVGINVVWHQQKPGKAPKALIYSSSHRYSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYFCQQFKSYPLTFGQGTKLEIKGGGGSQVTLRESGP
ALVKPTQTLTLTCTFSGFSLSTSGMGVGWIRQPPGKALEWLAHIWWDDDKRYNPALKSRLTISKDTSKNQVFLTMTNMDPVDTATYYCARMELWSYYFDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
分子F.2
配列番号1005(軽鎖)(抗CD19軽鎖)
METPAQLLFLLLLWLPDTTGENVLTQSPATLSLSPGERATLSCSASSSVSYMHWYQQKPGQAPRLLIYDTSKLASGIPARFSGSGSGTDHTLTISSLEPEDFAVYYCFQGSVYPFTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
一態様では、本明細書に開示される多特異性分子は、配列番号1004および/もしくは配列番号1005またはそれに対して少なくとも85%、90%、955、96%、97%、98%、99%もしくはより高い同一性を有する配列を含む。
分子G:aBCMA×aVb6.5
分子Gは、配列番号1006のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号1007のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
分子G.1
配列番号1006(重鎖)
METDTLLLWVLLLWVPGSTGQVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYSFTTYYIHWVRQAPGQGLEWMGWFFPGSGNIKYNEKFKGRVTITADTSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAGSYYSYDVLDYWGQGTTVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPSFLSASVGDRVTITCKASQNVGINVVWHQQKPGKAPKALIYSSSHRYSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYFCQQFKSYPLTFGQGTKLEIKGGGGSQVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGIDFSRYWMSWVRQAPGKGLEWVGEINPDSSTINYAPSLKDRFTISRDNSKNTLYLQMSSLRAEDTAVYYCASLYYDYGDAMDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNRFTQKSLSLSPGK
分子G.2
配列番号1007(軽鎖)
METDTLLLWVLLLWVPGSTGDIQMTQSPSSLSASVGDRVT
ITCKASQSVDSNVAWYQQKPEKAPKALIFSASLRFSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYFCQQYNNYPLTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
一態様では、本明細書に開示される多特異性分子は、配列番号1006および/もしくは配列番号1007またはそれに対して少なくとも85%、90%、955、96%、97%、98%、99%もしくはより高い同一性を有する配列を含む。
分子H:aBCMA x aTCRvベータ6_5
分子Hは、配列番号3275のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、配列番号3277のアミノ酸配列を含む軽鎖、および配列番号3276のアミノ酸配列を含む第2の重鎖を含む。分子H.1
配列番号3275(抗BCMA重鎖)
METDTLLLWVLLLWVPGSTGQVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGIDFSRYWMSWVRQAPGKGLEWVGEINPDSSTINYAPSLKDRFTISRDNSKNTLYLQMSSLRAEDTAVYYCASLYYDYGDAMDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNATYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCREEMTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
分子H.2
配列番号3276(ヒト化TCRvベータ_6_5 scFv)
METDTLLLWVLLLWVPGSTGQVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYSFTTYYIHWVRQAPGQGLEWMGWFFPGSGNIKYNEKFKGRVTITADTSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAGSYYSYDVLDYWGQGTTVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPSFLSASVGDRVTITCKASQNVGINVVWHQQKPGKAPKALIYSSSHRYSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYFCQQFKSYPLTFGQGTKLEIKGGGGSGGGGSDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSREEMTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
分子H.3
配列番号3277(抗BCMA軽鎖)
METDTLLLWVLLLWVPGSTGDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQSVDSNVAWYQQKPEKAPKALIFSASLRFSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYFCQQYNNYPLTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
一態様では、本明細書に開示される多特異性分子は、配列番号3275、配列番号3276、および/もしくは配列番号3277またはそれに対して少なくとも85%、90%
、955、96%、97%、98%、99%もしくはより高い同一性を有する配列を含む。
分子I:c末端scFv TCRvベータを有する半アームBCMA Fab
分子Iは、配列番号3286のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、配列番号3277のアミノ酸配列を含む軽鎖、および配列番号3287のアミノ酸配列を含む第2の重鎖を含む。
分子I.1
配列番号3286(重鎖1)
METDTLLLWVLLLWVPGSTGQVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGIDFSRYWMSWVRQAPGKGLEWVGEINPDSSTINYAPSLKDRFTISRDNSKNTLYLQMSSLRAEDTAVYYCASLYYDYGDAMDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCREEMTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGKGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSTYAMNWVRQAPGKGLEWVSRIRSKYNNYATYYADSVKDRFTISRDDSKNTLYLQMNSLKTEDTAVYYCVRHGNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSQAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCRSSTGAVTTSNYANWVQQKPGQAPRGLIGGTNKRAPWTPARFSGSLLGGKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSNLWVFGGGTKLTVL
分子I.2
配列番号3277(軽鎖)
METDTLLLWVLLLWVPGSTGDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQSVDSNVAWYQQKPEKAPKALIFSASLRFSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYFCQQYNNYPLTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
分子I.3
配列番号3287(重鎖2)
METDTLLLWVLLLWVPGSTGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSREEMTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
一態様では、本明細書に開示される多特異性分子は、配列番号3286、配列番号3277、および/もしくは配列番号3287またはそれに対して少なくとも85%、90%、955、96%、97%、98%、99%もしくはより高い同一性を有する配列を含む。
抗体様フレームワークまたはスキャフォールド
結果としてもたらされるポリペプチドが、標的抗原、例えば、特に、TCRvb、腫瘍抗原に特異的に結合する少なくとも1つの結合性領域を含む限り、本明細書に開示される抗TCRvb抗体分子またはその多機能性フォーマットにおいて多様な抗体/免疫グロブリンフレームワークまたはスキャフォールドを用いることができる。そのようなフレームワークまたはスキャフォールドは、5つの主なイディオタイプのヒト免疫グロブリン、またはその断片を含み、好ましくはヒト化された態様を有する、他の動物種の免疫グロブリンを含む。新規のフレームワーク、スキャフォールドおよび断片が当業者によって発見および開発され続けている。
一実施形態では、本明細書に開示される抗TCRvb抗体分子またはその多機能性フォーマットは、CDRをグラフト化することができる非免疫グロブリンスキャフォールドを使用した非免疫グロブリンベースの抗体を含む。標的抗原(例えば、TCRvbまたは腫瘍抗原)に特異的な結合性領域を含む限り、任意の非免疫グロブリンフレームワークおよびスキャフォールドを用いることができる。例示的な非免疫グロブリンフレームワークまたはスキャフォールドとしては、フィブロネクチン(Compound Therapeutics, Inc.、Waltham、MA)、アンキリン(Molecular Partners AG、Zurich、Switzerland)、ドメイン抗体(Domantis, Ltd.、Cambridge、MA、およびAblynx nv、Zwijnaarde、Belgium)、リポカリン(Pieris Proteolab AG、Freising、Germany)、小モジュール式免疫医薬品(Trubion Pharmaceuticals Inc.、Seattle、WA)、マキシボディ(maxybodies)(Avidia, Inc.、Mountain View、CA)、プロテインA(Affibody AG、Sweden)、ならびにアフィリン(ガンマ-クリスタリンまたはユビキチン)(Scil Proteins GmbH、Halle、Germany)が挙げられるがそれに限定されない。
フィブロネクチンスキャフォールドは、典型的には、フィブロネクチンIII型ドメイン(例えば、フィブロネクチンIII型の第10モジュール(10 Fn3ドメイン))に基づく。フィブロネクチンIII型ドメインは、互いに対してパッキングされてタンパク質のコアを形成する2つのベータシートの間に分布した7つまたは8つのベータ鎖を有し、かつベータ鎖を互いに接続し、溶媒曝露される(CDRに類似した)ループをさらに含有する。ベータシートサンドイッチの各エッジにおいて少なくとも3つのそのようなループがあり、エッジは、ベータ鎖の方向に対して垂直なタンパク質の境界である(米国特許第6,818,418号を参照)。この構造のため、非免疫グロブリン抗体は、性質および親和性が抗体に類似している抗原結合特性を模倣する。これらのスキャフォールドは、ループ無作為化、およびin vivoでの抗体の親和性成熟のプロセスに類似したin vitroでのシャッフリング戦略において使用することができる。これらのフィブロネクチンベースの分子は、標準的なクローニング技術を使用して分子のループ領域を本発明のCDRで置き換えることができるスキャフォールドとして使用することができる。アンキリン技術は、異なる標的への結合のために使用することができる可変領域を担うためのスキャフォールドとしてアンキリン由来の反復モジュールを有するタンパク質を使用することに基づく。アンキリン反復モジュールは、典型的には、2つの逆平行のα-ヘリックスおよびβターンからなる約33アミノ酸のポリペプチドである。可変領域の結合は、リボソームディスプレイを使用することによって最適化することができる。
アビマーは、タンパク質-タンパク質相互作用の性質によって使用され、ヒトにおいて250を超えるタンパク質が構造的にAドメインに基づく。アビマーは、アミノ酸リンカーを介して連結された多数の異なる「Aドメイン」単量体(2~10)からなる。例えば、米国特許出願公開第20040175756号、同第20050053973号、同第20050048512号、および同第20060008844号に記載の方法論を使用
して標的抗原に結合できるアビマーを作出することができる。
アフィボディ親和性リガンドは、プロテインAのIgG結合性ドメインのうちの1つのスキャフォールドに基づく3ヘリックスバンドルから構成される小さい単純なタンパク質である。プロテインAは、細菌Staphylococcus aureusからの表面タンパク質である。このスキャフォールドドメインは58アミノ酸からなり、そのうちの13個は無作為化されて、多数のリガンドバリアントを有するアフィボディライブラリーを生成する(例えば、米国特許第5,831,012号を参照)。アフィボディ分子は、抗体を模倣し、150kDaである抗体の分子量と比較して、6kDaの分子量を有する。その小さいサイズにもかかわらず、アフィボディ分子の結合性部位は抗体のそれに類似している。
アンチカリンは、例えば、Pieris ProteoLab AGといった、商業的に公知なものである。それらは、通常、化学的に感受性のまたは不溶性の化合物の生理学的輸送または貯蔵に関与する小さい堅牢なタンパク質の広範な群である、リポカリンに由来する。いくつかの天然のリポカリンがヒト組織または体液中に存在する。タンパク質の構成は、免疫グロブリンをしのばせるものであり、剛性のフレームワークの上部に超可変ループを有する。しかしながら、抗体またはそれらの組換え断片とは対照的に、リポカリンは、160~180個のアミノ酸残基を有する単一のポリペプチド鎖から構成され、単一の免疫グロブリンドメインよりわずかにのみ大きい。結合性ポケットを作り上げる4つのループのセットは、著しい構造的可塑性を示し、様々な側鎖を許容する。結合性部位は、そのため、高い親和性および特異性で異なる形状の処方された標的分子を認識するために独自のプロセスにおいて再成形され得る。リポカリンファミリーの1つのタンパク質、Pieris Brassicaeのビリン結合性タンパク質(BBP)は、4つのループのセットを突然変異誘発することによってアンチカリンを開発するために使用されている。アンチカリンを記載する特許出願の1つの例は、PCT国際公開WO199916873中にある。
アフィリン分子は、タンパク質および小分子に対する特異的な親和性のために設計される小さい非免疫グロブリンタンパク質である。新たなアフィリン分子は、異なるヒト由来のスキャフォールドタンパク質にそれぞれ基づく2つのライブラリーから非常に迅速に選択することができる。アフィリン分子は、免疫グロブリンタンパク質に対するいかなる構造的相同性も示さない。現在、2つのアフィリンスキャフォールドが用いられており、その1つは、ヒト構造的眼水晶体タンパク質であるガンマクリスタリン(gamma crystalline)であり、他方は「ユビキチン」スーパーファミリータンパク質である。両方のヒトスキャフォールドは、非常に小さく、高い温度安定性を示し、かつpH変化および変性剤に対してほぼ耐性である。この高い安定性は、主に、タンパク質の拡大したベータシート構造に起因する。ガンマクリスタリン由来のタンパク質の例はWO200104144に記載されており、「ユビキチン様」タンパク質の例はWO2004106368に記載されている。
タンパク質エピトープ模倣物(PEM)は、タンパク質-タンパク質相互作用に関与する主要な二次構造であるタンパク質のベータ-ヘアピン二次構造を模倣する、中間サイズの、環式の、ペプチド様分子(MW 1~2kDa)である。
ドメイン抗体(dAb)は、本明細書に開示される抗TCRvb抗体分子またはその多機能性フォーマットにおいて使用することができ、抗体の重鎖または軽鎖のいずれかの可変領域に対応する、抗体の小さい機能的な結合性断片である。ドメイン抗体は、細菌、酵母、および哺乳動物細胞系においてよく発現される。ドメイン抗体およびその産生方法のさらなる詳細は当該技術分野において公知である(例えば、米国特許第6,291,15
8号、同第6,582,915号、同第6,593,081号、同第6,172,197号、同第6,696,245号、欧州特許第0368684号&0616640号、WO05/035572、WO04/101790、WO04/081026、WO04/058821、WO04/003019およびWO03/002609を参照。ナノボディは、抗体の重鎖に由来する。
ナノボディは、典型的には、単一の可変ドメインならびに2つの定常ドメイン(CH2およびCH3)を含み、元々の抗体の抗原結合能力を保持する。ナノボディは、当該技術分野において公知の方法によって調製することができる(例えば、米国特許第6,765,087号、米国特許第6,838,254号、WO06/079372を参照)。ユニボディ(Unibodies)は、IgG4抗体の1つの軽鎖および1つの重鎖からなる。ユニボディは、IgG4抗体のヒンジ領域の除去によって作製することができる。ユニボディおよびそれを調製する方法のさらなる詳細は、WO2007/059782に見出すことができる。
腫瘍抗原部分
一態様では、
(i)本明細書に記載の抗TCRβV抗体分子を含む第1の部分(例えば、第1の免疫細胞エンゲージャー)、および
(ii)腫瘍標的化部分、第2の免疫細胞エンゲージャー、サイトカイン分子または間質改変部分のうちの1つまたは複数を含む第2の部分
を含む多特異性分子、例えば、二特異性分子が本明細書で提供される。
本明細書に開示される任意の組成物または方法の一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は抗原、例えば、がん抗原である。一部の実施形態では、がん抗原は、腫瘍抗原もしくは間質抗原、または血液抗原である。
本明細書に開示される任意の組成物または方法の一部の実施形態では、腫瘍標的化部分、例えば、がん抗原は、BCMA、FcRH5、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD38、CD47、CD99、CD123、FcRH5、CLEC12、CD179A、SLAMF7、またはNY-ESO1、PDL1、CD47、ガングロシド(gangloside)2(GD2)、前立腺幹細胞抗原(PSCA)、前立腺特異的膜抗原(PMSA)、前立腺特異的抗原(PSA)、癌胎児性抗原(CEA)、Ronキナーゼ、c-Met、未成熟ラミニン受容体、TAG-72、BING-4、カルシウム活性化塩素チャネル2、サイクリン-B1、9D7、Ep-CAM、EphA3、Her2/neu、テロメラーゼ、SAP-1、サバイビン、NY-ESO-1/LAGE-1、PRAME、SSX-2、メラン-A/MART-1、Gp100/pmel17、チロシナーゼ、TRP-1/-2、MC1R、β-カテニン、BRCA1/2、CDK4、CML66、フィブロネクチン、p53、Ras、TGF-B受容体、AFP、ETA、MAGE、MUC-1、CA-125、BAGE、GAGE、NY-ESO-1、β-カテニン、CDK4、CDC27、αアクチニン-4、TRP1/gp75、TRP2、gp100、メラン-A/MART1、ガングリオシド、WT1、EphA3、上皮成長因子受容体(EGFR)、MART-2、MART-1、MUC1、MUC2、MUM1、MUM2、MUM3、NA88-1、NPM、OA1、OGT、RCC、RUI1、RUI2、SAGE、TRG、TRP1、TSTA、葉酸受容体アルファ、L1-CAM、CAIX、gpA33、GD3、GM2、VEGFR、インテグリン(Intergrins)(インテグリンアルファVベータ3、インテグリンアルファ5ベータ1)、炭水化物(Le)、IGF1R、EPHA3、TRAILR1、TRAILR2、RANKL、(FAP)、TGF-ベータ、ヒアルロン酸、コラーゲン、例えば、IV型コラーゲン、テネイシンC、またはテネイシンWから選択される。一部の実施形態では、腫瘍標的化
部分、例えば、がん抗原は、BCMAである。一部の実施形態では、腫瘍標的化部分、例えば、がん抗原は、FcRH5である。
本明細書に開示される任意の組成物または方法の一部の実施形態では、腫瘍標的化部分、例えば、がん抗原は、CD19、CD123、CD22、CD30、CD171、CS-1、C型レクチン様分子-1、CD33、上皮増殖因子受容体バリアントIII(EGFRvIII)、ガングリオシドG2(GD2)、ガングリオシドGD3、TNF受容体ファミリーメンバーB細胞成熟(BCMA)、Tn抗原((Tn Ag)もしくは(GalNAcα-Ser/Thr))、前立腺特異的膜抗原(PSMA)、受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体1(ROR1)、Fms様チロシンキナーゼ3(FLT3)、腫瘍関連糖タンパク質72(TAG72)、CD38、CD44v6、癌胎児性抗原(CEA)、上皮細胞接着分子(EPCAM)、B7H3(CD276)、KIT(CD117)、インターロイキン-13受容体サブユニットアルファ-2、メソテリン、インターロイキン11受容体アルファ(IL-11Ra)、前立腺幹細胞抗原(PSCA)、プロテアーゼセリン21、血管内皮増殖因子受容体2(VEGFR2)、Lewis(Y)抗原、CD24、血小板由来増殖因子受容体ベータ(PDGFR-ベータ)、ステージ特異的胚性抗原-4(SSEA-4)、CD20、葉酸受容体アルファ、受容体チロシン-プロテインキナーゼERBB2(Her2/neu)、細胞表面関連ムチン1(MUC1)、上皮増殖因子受容体(EGFR)、神経細胞接着分子(NCAM)、プロスターゼ(Prostase)、前立腺酸ホスファターゼ(PAP)、突然変異型伸長因子2(ELF2M)、エフリンB2、線維芽細胞活性化タンパク質アルファ(FAP)、インスリン様増殖因子1受容体(IGF-I受容体)、炭酸脱水酵素IX(CAIX)、プロテアソーム(プロソーム、マクロペイン)サブユニット、ベータ型、9(LMP2)、糖タンパク質100(gp100)、ブレークポイントクラスター領域(BCR)およびエーベルソンマウス白血病ウイルスがん遺伝子ホモログ1(Abl)からなるがん遺伝子融合タンパク質(bcr-abl)、チロシナーゼ、エフリンA型受容体2(EphA2)、フコシルGM1、シアリルルイス接着分子(sLe)、ガングリオシドGM3、トランスグルタミナーゼ5(TGS5)、高分子量黒色腫関連抗原(HMWMAA)、o-アセチル-GD2ガングリオシド(OAcGD2)、葉酸受容体ベータ、腫瘍内皮マーカー1(TEM1/CD248)、腫瘍内皮マーカー7関連(TEM7R)、クローディン6(CLDN6)、甲状腺刺激ホルモン受容体(TSHR)、Gタンパク質共役型受容体クラスCグループ5、メンバーD(GPRC5D)、染色体Xオープンリーディングフレーム 61(CXORF61)、CD97、CD179a、未分化リンパ腫キナーゼ(ALK)、ポリシアル酸、胎盤特異的1(PLAC1)、globoHグリコセラミドの六糖部分(GloboH)、乳腺分化抗原(NY-BR-1)、ウロプラキン2(UPK2)、A型肝炎ウイルス細胞受容体1(HAVCR1)、アドレノセプターベータ3(ADRB3)、パネキシン3(PANX3)、Gタンパク質共役型受容体20(GPR20)、リンパ球抗原6複合体、座位K9(LY6K)、嗅覚受容体51E2(OR51E2)、TCRガンマオルタネートリーディングフレームタンパク質(TARP)、ウィルムス腫瘍タンパク質(WT1)、がん/精巣抗原1(NY-ESO-1)、がん/精巣抗原2(LAGE-1a)、黒色腫関連抗原1(MAGE-A1)、第12p染色体に位置するETS転座バリアント遺伝子6(ETV6-AML)、精子タンパク質17(SPA17)、X抗原ファミリー、メンバー1A(XAGE1)、アンジオポエチン結合性細胞表面受容体2(Tie 2)、黒色腫がん精巣抗原-1(MAD-CT-1)、黒色腫がん精巣抗原-2(MAD-CT-2)、Fos関連抗原1、腫瘍タンパク質p53(p53)、p53突然変異体、プロステイン(prostein)、サバイビン(surviving)、テロメラーゼ、前立腺癌腫瘍抗原-1、T細胞に認識される黒色腫抗原1(melanoma
antigen recognized by T cells 1)、ラット肉腫(Ras)突然変異体、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素(hTERT)、肉腫転座ブレークポイント、黒色腫アポトーシス阻害因子(ML-IAP)、ERG(膜貫通プロテアーゼ、
セリン2(TMPRSS2)ETS融合遺伝子)、N-アセチルグルコサミニル-トランスフェラーゼV(NA17)、ペアードボックスタンパク質Pax-3(PAX3)、アンドロゲン受容体、サイクリンB1、v-myc鳥類骨髄球腫症ウイルス性がん遺伝子神経芽腫由来ホモログ(MYCN)、RasホモログファミリーメンバーC(RhoC)、チロシナーゼ関連タンパク質2(TRP-2)、シトクロムP450 1B1(CYP1B1)、CCCTC結合因子(ジンクフィンガータンパク質)様、T細胞に認識される扁平細胞癌抗原3(Squamous Cell Carcinoma Antigen Recognized By T Cells 3)(SART3)、ペアードボックスタンパク質Pax-5(PAX5)、プロアクロシン結合性タンパク質sp32(OY-TES1)、リンパ球特異的タンパク質チロシンキナーゼ(LCK)、Aキナーゼアンカータンパク質4(AKAP-4)、滑膜肉腫Xブレークポイント2(SSX2)、終端糖化産物受容体(RAGE-1)、renal ubiquitous 1(RU1)、renal ubiquitous 2(RU2)、レグマイン、ヒトパピローマウイルスE6(HPV E6)、ヒトパピローマウイルスE7(HPV E7)、腸カルボキシルエステラーゼ、突然変異型熱ショックタンパク質70-2(mut hsp70-2)、CD79a、CD79b、CD72、白血球関連免疫グロブリン様受容体1(LAIR1)、IgA受容体のFc断片(FCARもしくはCD89)、白血球免疫グロブリン様受容体サブファミリーAメンバー2(LILRA2)、CD300分子様ファミリーメンバーf(CD300LF)、C型レクチンドメインファミリー12メンバーA(CLEC12A)、骨髄間質細胞抗原2(BST2)、EGF様モジュール含有ムチン様ホルモン受容体様2(EMR2)、リンパ球抗原75(LY75)、グリピカン-3(GPC3)、Fc受容体様5(FCRL5)、または免疫グロブリンラムダ様ポリペプチド1(IGLL1)から選択される。
FcRH5標的化部分
一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、FcRH5に結合する標的化部分(例えば、FcRH5標的化部分)を含む。FcRH5標的化部分は、抗体分子(例えば、本明細書に記載される抗原結合性ドメイン)、受容体もしくは受容体断片、もしくはリガンドもしくはリガンド断片、またはこれらの組合せから選択することができる。一部の実施形態では、FcRH5標的化部分は、がんまたは造血細胞(例えば、がんまたは造血細胞の表面上に存在する分子、例えば、抗原)と会合する、例えば、それに結合する。ある特定の実施形態では、FcRH5標的化部分は、本明細書に開示される多特異性分子をがんまたは造血細胞に標的化する、例えば、方向付ける。一部の実施形態では、がんは、血液がん、例えば、多発性骨髄腫である。
一部の実施形態では、多特異性分子、例えば、FcRH5標的化部分は、細胞、例えば、がんまたは造血細胞の表面上のFcRH5抗原に結合する。FcRH5抗原は、原発性腫瘍細胞、またはその転移性病変上に存在し得る。一部の実施形態では、がんは、血液がん、例えば、多発性骨髄腫である。例えば、FcRH5抗原は、腫瘍上、例えば、限定された腫瘍灌流、血管の圧迫、または線維性腫瘍間質のうちの1つまたは複数を有することによって型判定されるクラスの腫瘍上に存在し得る。
本明細書に記載の多特異性分子は、米国特許第7,999,077号、米国特許出願公開第20150098900号、米国特許第8299220号、米国特許第7105149号、米国特許第8362213号、米国特許第8466260号、米国特許第8617559号、米国特許出願公開第20160368985号、米国特許出願公開第20150166661号、および米国特許出願公開第20080247944号(上記の刊行物のいずれかの全内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に記載の抗FcRH5抗体またはその抗原結合性断片を含むFcRH5標的化部分を含む。
一部の実施形態では、本明細書に記載の多特異性分子は、米国特許第7,999,077号(その全内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に記載の抗FcRH5抗体またはその抗原結合性断片を含むFcRH5標的化部分を含む。
BCMA標的化部分
ある特定の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、BCMAに結合する標的化部分(例えば、BCMA標的化部分)を含む。BCMA標的化部分は、抗体分子(例えば、本明細書に記載される抗原結合性ドメイン)、受容体もしくは受容体断片、もしくはリガンドもしくはリガンド断片、またはこれらの組合せから選択することができる。一部の実施形態では、BCMA標的化部分は、がんまたは造血細胞(例えば、がんまたは造血細胞の表面上に存在する分子、例えば、抗原)と会合する、例えば、それに結合する。ある特定の実施形態では、BCMA標的化部分は、本明細書に開示される多特異性分子をがんまたは造血細胞に標的化する、例えば、方向付ける。一部の実施形態では、がんは、血液がん、例えば、多発性骨髄腫である。
一部の実施形態では、多特異性分子、例えば、BCMA標的化部分は、細胞、例えば、がんまたは造血細胞の表面上のBCMA抗原に結合する。BCMA抗原は、原発性腫瘍細胞、またはその転移性病変上に存在し得る。一部の実施形態では、がんは、血液がん、例えば、多発性骨髄腫である。例えば、BCMA抗原は、腫瘍上、例えば、限定された腫瘍灌流、血管の圧迫、または線維性腫瘍間質のうちの1つまたは複数を有することによって型判定されるクラスの腫瘍上に存在し得る。
例示的なBCMA標的化部分
本明細書に記載の多特異性分子は、米国特許第8920776号、米国特許第9243058号、米国特許第9340621号、米国特許第8846042号、米国特許第7083785号、米国特許第9545086号、米国特許第7276241号、米国特許第9034324号、米国特許第7799902号、米国特許第9387237号、米国特許第8821883号、米国特許第861745号、米国特許出願公開第20130273055号、米国特許出願公開第20160176973号、米国特許出願公開第20150368351号、米国特許出願公開第20150376287号、米国特許出願公開第20170022284号、米国特許出願公開第20160015749号、米国特許出願公開第20140242077号、米国特許出願公開第20170037128号、米国特許出願公開第20170051068号、米国特許出願公開第20160368988号、米国特許出願公開第20160311915号、米国特許出願公開第20160131654号、米国特許出願公開第20120213768号、米国特許出願公開第20110177093号、米国特許出願公開第20160297885号、EP3137500、EP2699259、EP2982694、EP3029068、EP3023437、WO2016090327、WO2017021450、WO2016110584、WO2016118641、WO2016168149(これらの全内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に記載の抗BCMA抗体またはその抗原結合性断片を含むBCMA標的化部分を含むことができる。
一実施形態では、BCMA標的化部分は、BCMAに結合する抗体分子(例えば、FabまたはscFv)を含む。一部の実施形態では、BCMAに対する抗体分子は、表1の重鎖可変ドメイン配列のいずれかからの1つ、2つ、もしくは3つのCDR、または密接に関連したCDR、例えば、表9のCDR配列のいずれかからの少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。一部の実施形態では、BCMAに対する抗体分子は、表9のアミノ酸配列のいずれかから選択される重鎖可変ドメイン配列、またはそれに対して実質的に同一(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしく
は少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する))のアミノ酸配列を含む。
代替的に、または本明細書に開示されるBCMAに対する重鎖と組み合わせて、BCMAに対する抗体分子は、表9の軽鎖可変ドメイン配列のいずれかからの1つ、2つ、もしくは3つのCDR、または密接に関連したCDR、例えば、表9のCDR配列のいずれかから少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。一部の実施形態では、BCMAに対する抗体分子は、表9のアミノ酸配列のいずれかから選択される軽鎖可変ドメイン配列、またはそれに対して実質的に同一(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する))のアミノ酸配列を含む。
Figure 2023509708000106
CDRグラフト化スキャフォールド
実施形態では、抗体分子は、CDRグラフト化スキャフォールドドメインである。実施
形態では、スキャフォールドドメインは、フィブロネクチンドメイン、例えば、フィブロネクチンIII型ドメインに基づく。フィブロネクチンIII型(Fn3)ドメインの全体的なフォールドは、最小の機能的抗体断片、抗体重鎖の可変ドメインのそれに密接に関係する。Fn3の末端には3つのループがあり、BC、DEおよびFGループの位置は、抗体のVHドメインのCDR1、2および3のそれにおおよそ対応する。Fn3はジスルフィド結合を有さず、したがって、Fn3は、抗体およびそれらの断片とは異なり、還元条件下で安定である(例えば、WO98/56915、WO01/64942、WO00/34784を参照)。Fn3ドメインは、例えば、本明細書に記載の抗原/マーカー/細胞に結合するドメインを選択するために、(例えば、本明細書に記載のCDRまたは超可変ループを使用して)修飾または変更することができる。
実施形態では、スキャフォールドドメイン、例えば、フォールディングしたドメインは、抗体、例えば、モノクローナル抗体の重鎖可変ドメインから3つのベータ鎖を欠失させることにより作出される「ミニボディ」スキャフォールドに基づく(例えば、Tramontanoら、1994、J Mol. Recognit. 7:9、およびMartinら、1994、EMBO J. 13:5303~5309ページを参照)。「ミニボディ」は、2つの超可変ループを提示するために使用することができる。実施形態では、スキャフォールドドメインは、V様ドメイン(例えば、Coiaら、WO99/45110を参照)、または2つのジスルフィド結合によって一緒に保持された74残基の6鎖ベータシートサンドイッチであるテンダミスタチン(tendamistatin)に由来するドメインである(例えば、McConnellおよびHoess、1995、J Mol. Biol. 250:460を参照)。例えば、テンダミスタチンのループは、例えば、本明細書に記載のマーカー/抗原/細胞に結合するドメインを選択するために、(例えば、CDRまたは超可変ループを使用して)修飾または変更することができる。別の例示的なスキャフォールドドメインは、CTLA-4の細胞外ドメインに由来するベータ-サンドイッチ構造である(例えば、WO00/60070を参照)。
他の例示的なスキャフォールドドメインとしては、T細胞受容体、MHCタンパク質、細胞外ドメイン(例えば、フィブロネクチンIII型リピート、EGFリピート)、プロテアーゼ阻害剤(例えば、Kunitzドメイン、エコチン、およびBPTIなど)、TPRリピート、トリフォイル(trifoil)構造、ジンクフィンガードメイン、DNA結合性タンパク質、特に、単量体DNA結合性タンパク質、RNA結合性タンパク質、酵素、例えば、プロテアーゼ(特に、不活性化プロテアーゼ)、RNase、シャペロン、例えば、チオレドキシン、および熱ショックタンパク質、ならびに細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、SH2およびSH3ドメイン)が挙げられるがそれに限定されない。例えば、米国特許出願公開第20040009530号および米国特許第7,501,121号(参照により本明細書に組み込まれる)を参照。
実施形態では、スキャフォールドドメインは、例えば、以下の基準:(1)アミノ酸配列、(2)いくつかの相同ドメインの配列、(3)三次元構造、および/または(4)pH、温度、塩分、有機溶媒、酸化剤濃度の範囲にわたる安定性データのうちの1つまたは複数によって評価および選択される。実施形態では、スキャフォールドドメインは、小さい、安定なタンパク質ドメイン、例えば、100個、70個、50個、40個または30個未満のアミノ酸のタンパク質である。ドメインは、1つもしくは複数のジスルフィド結合を含んでもよく、または金属、例えば、亜鉛をキレートしてもよい。
抗体ベースの融合物
抗体のNまたはC末端に取り付けられた追加の結合性実体を含有する様々なフォーマットを生成することができる。単鎖またはジスルフィド安定化FvもしくはFabを有するこれらの融合物は、各抗原に対して二価の結合特異性を有する四価分子の生成をもたらす
。IgGとのscFvおよびscFabの組合せは、3つまたはより多くの異なる抗原を認識することができる分子の産生を可能にする。
抗体-Fab融合物
抗体-Fab融合物は、第1の標的に対する伝統的な抗体および抗体重鎖のC末端に融合した第2の標的に対するFabを含む二特異性抗体である。一般的に、抗体およびFabは共通の軽鎖を有する。抗体融合物は、(1)標的融合物のDNA配列を操作すること、および(2)標的DNAを好適な宿主細胞にトランスフェクトして融合タンパク質を発現させることにより産生させることができる。Coloma, Jら、(1997) Nature Biotech 15:159によって記載されるように、抗体-scFv融合物は、CH3ドメインのC末端とscFvのN末端との間の(Gly)-Serリンカーによって連結されてもよいようである。
抗体-scFv融合物
抗体-scFv融合物は、伝統的な抗体および抗体重鎖のC末端に融合した特有の特異性のscFvを含む二特異性抗体である。scFvは、直接的にまたはリンカーペプチドを通じてscFvの重鎖を通じてC末端に融合させることができる。抗体融合物は、(1)標的融合物のDNA配列を操作すること、および(2)標的DNAを好適な宿主細胞にトランスフェクトして融合タンパク質を発現させることにより産生させることができる。Coloma, Jら、(1997) Nature Biotech 15:159によって記載されるように、抗体-scFv融合物は、CH3ドメインのC末端とscFvのN末端との間の(Gly)-Serリンカーによって連結されてもよいようである。
可変ドメイン免疫グロブリンDVD
関連するフォーマットは、より短いリンカー配列によってVドメインのN末端に配置された第2の特異性のVHおよびVLドメインから構成される二重可変ドメイン免疫グロブリン(DVD)である。
他の例示的な多特異性抗体フォーマットとしては、例えば、以下:米国特許出願公開第20160114057A1号、米国特許出願公開第20130243775A1号、米国特許出願公開第20140051833号、米国特許出願公開第20130022601号、米国特許出願公開第20150017187A1号、米国特許出願公開第20120201746A1号、米国特許出願公開第20150133638A1号、米国特許出願公開第20130266568A1号、米国特許出願公開第20160145340A1号、WO2015127158A1、米国特許出願公開第20150203591A1号、米国特許出願公開第20140322221A1号、米国特許出願公開第20130303396A1号、米国特許出願公開第20110293613号、米国特許出願公開第20130017200A1号、米国特許出願公開第20160102135A1号、WO2015197598A2、WO2015197582A1、米国特許第9359437号、米国特許出願公開第20150018529号、WO2016115274A1、WO2016087416A1、米国特許出願公開第20080069820A1号、米国特許第9145588B号、米国特許第7919257号、および米国特許出願公開第20150232560A1号に記載のものが挙げられる。全長抗体-Fab/scFabフォーマットを利用する例示的な多特異性分子としては、以下:米国特許第9382323B2号、米国特許出願公開第20140072581A1号、米国特許出願公開第20140308285A1号、米国特許出願公開第20130165638A1号、米国特許出願公開第20130267686A1号、米国特許出願公開第20140377269A1号、米国特許第7741446B2号、およびWO1995009917A1に記載のものが挙げられる。ドメイン交換フォーマットを利用する例示的な多特異性分子としては、以下:米国特許出願公開第20150315296A1号、WO201608
7650A1、米国特許出願公開第20160075785A1号、WO2016016299A1、米国特許出願公開第20160130347A1号、米国特許出願公開第20150166670号、米国特許第8703132B2号、米国特許出願公開第20100316645号、米国特許第8227577B2号、米国特許出願公開第20130078249号に記載のものが挙げられる。
Fc含有実体(ミニ抗体)
ミニ抗体としても公知のFc含有実体は、scFvを定常重鎖領域ドメイン3のC末端(CH3-scFv)および/または異なる特異性を有する抗体のヒンジ領域(scFv-ヒンジ-Fc)に融合させることにより生成することができる。IgGのCH3ドメインのC末端に融合した(ペプチドリンカーを有さない)ジスルフィド安定化可変ドメインを有する三価の実体もまた作製することができる。
Fc含有多特異性分子
一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、免疫グロブリン定常領域(例えば、Fc領域)を含む。例示的なFc領域は、IgG1、IgG2、IgG3またはIgG4の重鎖定常領域、より特には、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4の重鎖定常領域から選択することができる。
一部の実施形態では、免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)は、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞機能、または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるために、変更、例えば、突然変異される。
他の実施形態では、第1および第2の免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、第1および第2のFc領域)の境界部は、例えば、操作されていない境界部、例えば、天然に存在する境界部と比較して、二量体化を増加または減少させるために、変更、例えば、突然変異される。例えば、免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)の二量体化は、第1および第2のFc領域のFc境界部に、対になった孔と突起(「ノブ・イン・ホール」)、静電相互作用、または鎖交換のうちの1つまたは複数を提供し、それによって、例えば、操作されていない境界部と比較して、より高い比のヘテロ多量体:ホモ多量体が形成されることにより、増強させることができる。
一部の実施形態では、多特異性分子は、例えば、ヒトIgG1のFc領域の、347、349、350、351、366、368、370、392、394、395、397、398、399、405、407、または409のうちの1つまたは複数から選択される位置において、対になったアミノ酸置換を含む。例えば、免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)は、T366S、L368A、またはY407V(例えば、孔またはホールに対応する)、およびT366W(例えば、突起またはノブに対応する)から選択される対になったアミノ酸置換を含むことができる。
他の実施形態では、多機能性分子は、半減期延長剤、例えば、ヒト血清アルブミンまたはヒト血清アルブミンに対する抗体分子を含む。
ヘテロ二量体化抗体分子および作製方法
正しくない重鎖対合の問題に対処するために多特異性抗体を産生する様々な方法が開示されてきた。例示的な方法は以下に記載される。例示的な多特異性抗体フォーマットおよび前記多特異性抗体を作製する方法もまた、例えば、Speissら、Molecular Immunology 67(2015)95~106ページ、およびKleinら、mAb 4:6、653~663ページ、2012年11月/12月(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
ヘテロ二量体化二特異性抗体は天然のIgG構造に基づき、2つの結合性アームが異なる抗原を認識する。定義された一価(および同時の)抗原結合を可能にするIgG由来のフォーマットは、軽鎖誤対合を最小化する技術(例えば、共通軽鎖)と組み合わせた強制的な重鎖ヘテロ二量体化により生成される。強制的な重鎖ヘテロ二量体化は、例えば、ノブ・イン・ホールまたは鎖交換操作ドメイン(SEED)を使用して、得ることができる。
ノブ・イン・ホール
米国特許第5,731,116号、米国特許第7,476,724号およびRidgway, Jら、(1996)Prot. Engineering 9(7):617~621ページに記載されるノブ・イン・ホールは、概して、(1)1つまたは両方の抗体のCH3ドメインを突然変異させてヘテロ二量体化を促進すること、および(2)ヘテロ二量体化を促進する条件下で突然変異した抗体を組み合わせることを伴う。「ノブ」または「突起」は、典型的には、親抗体中の小さいアミノ酸をより大きいアミノ酸で置き換えること(例えば、T366YまたはT366W)により作出され、「ホール」または「孔」は、親抗体中のより大きい残基をより小さいアミノ酸で置き換えること(例えば、Y407T、T366S、L368Aおよび/またはY407V)により作出される。
Fcドメインを含む二特異性抗体のために、Fc部分の正しいヘテロ二量体化を促進するための重鎖の定常領域への特定の突然変異の導入を利用することができる。いくつかのそのような技術は、Kleinら(mAb(2012)4:6、1~11ページ)(その内容はこれにより参照により全体が本明細書に組み込まれる)において総説されている。これらの技術としては、抗体重鎖のうちの1つのCH3ドメインのうちの1つへのバルク残基の導入を伴う「ノブ・イントゥー・ホール」(KiH)アプローチが挙げられる。このバルク残基は、対になった重鎖の他のCH3ドメイン中の相補的な「ホール」にフィットし、それによって、重鎖の正しい対合が促進される(例えば、米国特許第7642228号を参照)。
例示的なKiH突然変異としては、「ノブ」重鎖中のS354C、T366Wおよび「ホール」重鎖中のY349C、T366S、L368A、Y407Vが挙げられる。他の例示的なKiH突然変異は、追加の必要に応じた安定化性Fcシステイン突然変異と共に、表4において提供される。
Figure 2023509708000107
他のFc突然変異はIgawaおよびTsunodaにより提供されており、彼らは、他の鎖のCH3ドメイン中の3つの正に荷電した残基と対合する1つの鎖のCH3ドメイン中の3つの負に荷電した残基を同定した。これらの特定の荷電した残基対は、E356-K439、E357-K370、D399-K409およびその逆である。単独でまたは新たに同定されたジスルフィド架橋と組み合わせて、以下の3つの鎖A中の突然変異:E356K、E357KおよびD399Kの他に、鎖B中のK370E、K409D、K439Eのうちの少なくとも2つを導入することにより、それらは、同時にホモ二量体化を抑制しながら非常に効率的なヘテロ二量体化に有利に働くことができた(Martens Tら、「A novel one-armed antic- Met antibody inhibits glioblastoma growth in vivo.」、Clin Cancer Res 2006;12:6144~52ページ;PMID:17062691)。Xencorは、構造算出および配列情報の組合せに基づいて41個のバリアント対を定義し、それをその後に最大のヘテロ二量体化についてスクリーニングして、鎖A上のS364H、F405A(HA)および鎖B上のY349T、T394F(TF)の組合せを定義した(Moore GLら、「A novel bispecific antibody format enables simultaneous bivalent and monovalent co-engagement of distinct target antigens.」、MAbs 2011;3:546~57ページ;PMID:22123055)。
多特異性抗体のヘテロ二量体化を促進するための他の例示的なFc突然変異としては、以下の参考文献(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる):WO2016071377A1、米国特許出願公開第20140079689A1号、米国特許出願公開第20160194389A1号、米国特許出願公開第20160257763号、WO2016071376A2、WO2015107026A1、WO2015107025A1、WO2015107015A1、米国特許出願公開第20150353636A1号、米国特許出願公開第20140199294A1号、米国特許第7750128B2号、米国特許出願公開第20160229915A1号、米国特許出願公開第20150344570A1号、米国特許第8003774A1号、米国特許出願公開第20150337049A1号、米国特許出願公開第20150175707A1号、米国特許出願公開第20140242075A1号、米国特許出願公開第20130195849A1号、米国特許出願公開第20120149876A1号、米国特許
出願公開第20140200331A1号、米国特許第9309311B2号、米国特許第8586713号、米国特許出願公開第20140037621A1号、米国特許出願公開第20130178605A1号、米国特許出願公開第20140363426A1号、米国特許出願公開第20140051835A1号および米国特許出願公開第20110054151A1号に記載のものが挙げられる。
安定化性システイン突然変異もまた、KiHおよび他のFcヘテロ二量体化促進性バリアントと組み合わせて使用されている(例えば、米国特許第7183076号を参照)。他の例示的なシステイン修飾としては、例えば、米国特許出願公開第20140348839A1号、米国特許第7855275B2号、および米国特許第9000130B2号に開示されるものが挙げられる。
鎖交換操作ドメイン(SEED)
鎖交換操作ドメイン(SEED)C(H)3ヘテロ二量体を工作することによって二特異性かつ非対称性の融合タンパク質の設計をサポートするヘテロ二量体Fcプラットフォームが公知である。ヒトIgGおよびIgA C(H)3ドメインのこれらの誘導体は、ヒトIgAおよびIgG C(H)3配列の交互のセグメントから構成される相補的なヒトSEED C(H)3ヘテロ二量体を作出する。もたらされるSEED C(H)3ドメインの対は、哺乳動物細胞中で発現された場合に優先的に会合してヘテロ二量体を形成する。SEEDボディ(Sb)融合タンパク質は、1つまたは複数の融合パートナーに遺伝子連結されていてもよい[IgG1ヒンジ]-C(H)2-[SEED C(H)3]からなる(例えば、Davis JHら、「SEEDbodies: fusion proteins based on strand exchange engineered domain (SEED) CH3 heterodimers in an
Fc analogue platform for asymmetric binders or immunofusions and bispecific antibodies.」、Protein Eng Des Sel 2010;23:195~202ページ;PMID:20299542および米国特許第8871912号(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
デュオボディ
正しい重鎖対合を有する二特異性抗体を産生するための「デュオボディ」技術は公知である。デュオボディ技術は、産生後交換反応において安定な二特異性ヒトIgG1抗体を生成するための3つの基本的なステップを伴う。第1のステップにおいて、第3の定常(CH3)ドメイン中に単一のマッチした突然変異をそれぞれ含有する2つのIgG1が、標準的な哺乳動物組換え細胞系を使用して別々に産生される。その後に、これらのIgG1抗体は、回収および精製のための標準的な方法に従って精製される。産生および精製後(産生後)、2つの抗体は調整された実験室条件下で組み換えられて、非常に高い収率(典型的には>95%)で二特異性抗体産物をもたらす(例えば、Labrijnら、PNAS 2013;110(13):5145~5150ページおよびLabrijnら、Nature Protocols 2014;9(10):2450~63ページ(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
静電相互作用
ホモ二量体形成が静電気的に不都合であるように荷電性アミノ酸を有するCH3アミノ酸変化を使用して多特異性抗体を作製する方法が開示されている。EP1870459およびWO2009089004は、宿主細胞中での異なる抗体ドメインの共発現の際のヘテロ二量体形成に有利に働くための他の戦略を記載する。これらの方法において、重鎖定常ドメイン3(CH3)、両方のCH3ドメイン中のCH3-CH3境界部を作り上げる1つまたは複数の残基は、ホモ二量体形成が静電気的に不都合であり、かつヘテロ二量体
化が静電気的に好都合であるように荷電性アミノ酸で置き換えられる。静電相互作用を使用して多特異性分子を作製する追加の方法は、米国特許出願公開第20100015133号、米国特許第8592562B2号、米国特許第9200060B2号、米国特許出願公開第20140154254A1号、および米国特許第9358286A1号を含む参考文献(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。
共通軽鎖
軽鎖誤対合は、二特異性IgGの均質な調製物を生成するために回避される必要がある。これを達成する1つのやり方は、共通軽鎖の原理、すなわち、1つの軽鎖を共有するが依然として別々の特異性を有する2つのバインダーを組み合わせることの使用を通じたものである。単量体の混合物からの所望の二特異性抗体の形成を増強する例示的な方法は、二特異性抗体のヘテロマー可変重鎖領域のそれぞれと相互作用するための共通の可変軽鎖を提供することによる。共通軽鎖を有する二特異性抗体の組成物およびその産生方法は、例えば、米国特許第7183076B2号、米国特許出願公開第20110177073A1号、EP2847231A1、WO2016079081A1、およびEP3055329A1(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
CrossMab
軽鎖誤対合を低減するための別のオプションはCrossMab技術であり、これは、二特異性抗体の1つの半分のFab中のCH1およびCLドメインを交換することによって非特異的L鎖誤対合を回避する。そのようなクロスオーバーバリアントは結合特異性および親和性を保持するが、L鎖誤対合が予防されるように2つのアームを異なるものとさせる。(Kleinら、上掲に総説されるように)CrossMab技術は、正しい対合の形成を促進するように重鎖と軽鎖との間のドメインスワッピングを伴う。簡潔に述べれば、2つの別個の軽鎖-重鎖対を使用することによって2つの抗原に結合し得る二特異性IgG様CrossMab抗体を構築するために、2ステップ修飾プロセスが応用される。最初に、二量体化境界部は、ヘテロ二量体化アプローチ、例えば、ノブ・イントゥー・ホール(KiH)技術を使用して各重鎖のC末端中に操作されて、1つの抗体(例えば、抗体A)および第2の抗体(例えば、抗体B)からの2つの別個の重鎖のヘテロ二量体のみが効率的に形成されることが確実にされる。次に、可変重鎖(VH)および可変軽鎖(VL)ドメインを一貫したままに保って、1つの抗体の定常重鎖1(CH1)および定常軽鎖(CL)ドメインが交換される(抗体A)。CH1およびCLドメインの交換は、修飾抗体(抗体A)軽鎖は修飾抗体(抗体A)重鎖とのみ効率的に二量体化し、非修飾抗体(抗体B)軽鎖は非修飾抗体(抗体B)重鎖とのみ効率的に二量体化するため、所望の二特異性CrossMabのみが効率的に形成されることを確実にした(例えば、Cain, C.、SciBX 4(28);doi:10.1038/scibx.2011.783(その内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
共通重鎖
単量体の混合物からの所望の二特異性抗体の形成を増強する例示的な方法は、二特異性抗体のヘテロマー可変軽鎖領域のそれぞれと相互作用するための共通の可変重鎖を提供することによる。共通重鎖を有する二特異性抗体の組成物およびその産生方法は、例えば、米国特許出願公開第20120184716号、米国特許出願公開第20130317200号、および米国特許出願公開第20160264685A1号(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
アミノ酸修飾
正しい軽鎖対合を有する多特異性抗体の代替的な組成物およびその産生方法としては、
様々なアミノ酸修飾が挙げられる。例えば、Zymeworksは、軽鎖と重鎖との間の境界部の部分であり、各重鎖と所望の軽鎖との優先的な対合を作製する、CH1および/もしくはCLドメイン中の1つもしくは複数のアミノ酸修飾、VHおよび/もしくはVLドメイン中の1つもしくは複数のアミノ酸修飾、またはこれらの組合せを有し、それによって、ヘテロ二量体対の2つの重鎖および2つの軽鎖が細胞中で共発現された場合に、第1のヘテロ二量体の重鎖が、他のものよりも軽鎖の1つと優先的に対合する、ヘテロ二量体を記載する(例えば、WO2015181805を参照)。他の例示的な方法は、WO2016026943(Argen-X)、米国特許出願公開第20150211001号、米国特許出願公開第20140072581A1号、米国特許出願公開第20160039947A1号、および米国特許出願公開第20150368352号に記載されている。
ラムダ/カッパフォーマット
ラムダ軽鎖ポリペプチドおよびカッパ軽鎖ポリペプチドを含む多特異性分子(例えば、多特異性抗体分子)は、ヘテロ二量体化を可能とするために使用することができる。ラムダ軽鎖ポリペプチドおよびカッパ軽鎖ポリペプチドを含む二特異性抗体分子を生成する方法は、2017年9月22日に出願され、公開番号WO2018/057955を与えられたPCT/US17/53053(これにより参照により全体が本明細書に組み込まれる)に開示されている。
実施形態では、多特異性分子は、多特異性抗体分子、例えば、2つの結合特異性を含む抗体分子、例えば、二特異性抗体分子を含む。多特異性抗体分子は、
第1のエピトープに特異的なラムダ軽鎖ポリペプチド1(LLCP1)、
第1のエピトープに特異的な重鎖ポリペプチド1(HCP1)、
第2のエピトープに特異的なカッパ軽鎖ポリペプチド2(KLCP2)、および
第2のエピトープに特異的な重鎖ポリペプチド2(HCP2)
を含む。
「ラムダ軽鎖ポリペプチド1(LLCP1)」は、その用語が本明細書で使用される場合、コグネイト重鎖可変領域と組み合わせられた場合に、そのエピトープへの特異的結合を媒介し、HCP1と複合体化することができる十分な軽鎖(LC)配列を含むポリペプチドを指す。一実施形態では、それは、CH1領域のすべてまたは断片を含む。一実施形態では、LLCP1は、LC-CDR1、LC-CDR2、LC-CDR3、FR1、FR2、FR3、FR4、およびCH1、またはそのエピトープの特異的結合を媒介し、HCP1と複合体化するために十分なこれらからの配列を含む。LLCP1は、そのHCP1と共に、第1のエピトープに対する特異性を提供する(KLCP2は、そのHCP2と共に、第2のエピトープに対する特異性を提供する)。本明細書の他の箇所に記載されるように、LLCP1は、HCP2に対してよりもHCP1に対してより高い親和性を有する。
「カッパ軽鎖ポリペプチド2(KLCP2)」は、その用語が本明細書で使用される場合、コグネイト重鎖可変領域と組み合わせられた場合に、そのエピトープへの特異的結合を媒介し、HCP2と複合体化することができる十分な軽鎖(LC)配列を含むポリペプチドを指す。一部の実施形態では、それは、CH1領域のすべてまたは断片を含む。一実施形態では、KLCP2は、LC-CDR1、LC-CDR2、LC-CDR3、FR1、FR2、FR3、FR4、およびCH1、またはそのエピトープの特異的結合を媒介し、HCP2と複合体化するために十分なこれらからの配列を含む。KLCP2は、そのHCP2と共に、第2のエピトープに対する特異性を提供する(LLCP1は、そのHCP1と共に、第1のエピトープに対する特異性を提供する)。
「重鎖ポリペプチド1(HCP1)」は、その用語が本明細書で使用される場合、コグネイトLLCP1と組み合わせられた場合に、そのエピトープへの特異的結合を媒介し、HCP1と複合体化することができる十分な重鎖(HC)配列、例えば、HC可変領域配列を含むポリペプチドを指す。一部の実施形態では、それは、CH1領域のすべてまたは断片を含む。一実施形態では、それは、CH2および/またはCH3領域のすべてまたは断片を含む。一実施形態では、HCP1は、HC-CDR1、HC-CDR2、HC-CDR3、FR1、FR2、FR3、FR4、CH1、CH2、およびCH3、または(i)そのエピトープの特異的結合を媒介し、LLCP1と複合体化し、(ii)本明細書に記載されるように、KLCP2とは対照的にLLCP1に対して優先的に複合体化し、かつ(iii)本明細書に記載されるように、HCP1の別の分子とは対照的にHCP2に対して優先的に複合体化するために十分なこれらからの配列を含む。HCP1は、そのLLCP1と共に、第1のエピトープに対する特異性を提供する(KLCP2は、そのHCP2と共に、第2のエピトープに対する特異性を提供する)。
「重鎖ポリペプチド2(HCP2)」は、その用語が本明細書で使用される場合、コグネイトLLCP1と組み合わせられた場合に、そのエピトープへの特異的結合を媒介し、HCP1と複合体化することができる十分な重鎖(HC)配列、例えば、HC可変領域配列を含むポリペプチドを指す。一部の実施形態では、それは、CH1領域のすべてまたは断片を含む。一部の実施形態では、それは、CH2および/またはCH3領域のすべてまたは断片を含む。一実施形態では、HCP1は、HC-CDR1、HC-CDR2、HC-CDR3、FR1、FR2、FR3、FR4、CH1、CH2、およびCH3、または(i)そのエピトープの特異的結合を媒介し、KLCP2と複合体化し、(ii)本明細書に記載されるように、LLCP1とは対照的にKLCP2に対して優先的に複合体化し、かつ(iii)本明細書に記載されるように、HCP2の別の分子とは対照的にHCP1に対して優先的に複合体化するために十分なこれらからの配列を含む。HCP2は、そのKLCP2と共に、第2のエピトープに対する特異性を提供する(LLCP1は、そのHCP1と共に、第1のエピトープに対する特異性を提供する)。
本明細書に開示される多特異性抗体分子の一部の実施形態では、
LLCP1は、HCP2に対してよりもHCP1に対してより高い親和性を有し、かつ/または
KLCP2は、HCP1に対してよりもHCP2に対してより高い親和性を有する。
実施形態では、HCP1に対するLLCP1の親和性は、HCP2に対するその親和性より十分に高く、それによって、予め選択された条件下、例えば、例えばpH7の水性緩衝液中、例えばpH7の生理食塩水中、または生理的条件下で、多特異性抗体分子の少なくとも75、80、90、95、98、99、99.5、または99.9%は、HCP1と複合体化した、または結び付けられたLLCP1を有する。
本明細書に開示される多特異性抗体分子の一部の実施形態では、
HCP1は、HCP1の第2の分子に対してよりもHCP2に対してより高い親和性を有し、かつ/または
HCP2は、HCP2の第2の分子に対してよりもHCP1に対してより高い親和性を有する。
実施形態では、HCP2に対するHCP1の親和性は、HCP1の第2の分子に対するその親和性より十分に高く、それによって、予め選択された条件下、例えば、例えばpH7の水性緩衝液中、例えばpH7の生理食塩水中、または生理的条件下で、多特異性抗体分子の少なくとも75%、80、90、95、98、99 99.5または99.9%は、HCP2と複合体化した、または結び付けられたHCP1を有する。
別の態様では、多特異性抗体分子を作製、または産生する方法が本明細書に開示される。方法は、(i)~(iv)が会合する条件下で、
(i)第1の重鎖ポリペプチド(例えば、第1の重鎖可変領域(第1のVH)、第1のCH1、第1の重鎖定常領域(例えば、第1のCH2、第1のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)を提供するステップ、
(ii)第2の重鎖ポリペプチド(例えば、第2の重鎖可変領域(第2のVH)、第2のCH1、第2の重鎖定常領域(例えば、第2のCH2、第2のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)を提供するステップ、
(iii)第1の重鎖ポリペプチド(例えば、第1のVH)と優先的に会合するラムダ鎖ポリペプチド(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VL□)、ラムダ軽鎖定常鎖(VL□)、または両方)を提供するステップ、および
(iv)第2の重鎖ポリペプチド(例えば、第2のVH)と優先的に会合するカッパ鎖ポリペプチド(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VL□)、ラムダ軽鎖定常鎖(VL□)、または両方)を提供するステップ
を含む。
実施形態では、第1および第2の重鎖ポリペプチドは、ヘテロ二量体化を増強するFc境界部を形成する。
実施形態では、(i)~(iv)(例えば、(i)~(iv)をコードする核酸)は、単一の細胞、例えば、単一の哺乳動物細胞、例えば、CHO細胞に導入される。実施形態では、(i)~(iv)は、細胞中で発現される。
実施形態では、(i)~(iv)(例えば、(i)~(iv)をコードする核酸)は、異なる細胞、例えば、異なる哺乳動物細胞、例えば、2つまたはより多くのCHO細胞に導入される。実施形態では、(i)~(iv)は、細胞中で発現される。
実施形態では、方法は、例えば、ラムダおよび/またはカッパ特異的精製、例えば、親和性クロマトグラフィーを使用して、細胞発現抗体分子を精製するステップをさらに含む。
実施形態では、方法は、細胞発現多特異性抗体分子を評価することをさらに含む。例えば、精製された細胞発現多特異性抗体分子は、質量分析を含む、当該技術分野において公知の技術によって分析することができる。一実施形態では、精製された細胞発現抗体分子は、切断、例えば、パパインを用いて消化されて、Fab部分をもたらし、質量分析を使用して評価される。
実施形態では、方法は、高い収率、例えば、少なくとも75%、80、90、95、98、99 99.5または99.9%で、正しく対になったカッパ/ラムダ多特異性の、例えば、二特異性の抗体分子を産生する。
他の実施形態では、多特異性の、例えば、二特異性の、抗体分子は、
(i)第1の重鎖ポリペプチド(HCP1)(例えば、第1の重鎖可変領域(第1のVH)、第1のCH1、第1の重鎖定常領域(例えば、第1のCH2、第1のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)であって、例えば、第1のエピトープに結合する、HCP1、
(ii)第2の重鎖ポリペプチド(HCP2)(例えば、第2の重鎖可変領域(第2のVH)、第2のCH1、第2の重鎖定常領域(例えば、第2のCH2、第2のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)であって、例えば、第2のエピトープに結合する、HCP2、
(iii)第1の重鎖ポリペプチド(例えば、第1のVH)と優先的に会合するラムダ軽鎖ポリペプチド(LLCP1)(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VLl)、ラムダ軽鎖定常鎖(VLl)、または両方)であって、例えば、第1のエピトープに結合する、LLCP1、および
(iv)第2の重鎖ポリペプチド(例えば、第2のVH)と優先的に会合するカッパ軽鎖ポリペプチド(KLCP2)(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VLk)、ラムダ軽鎖定常鎖(VLk)、または両方)であって、例えば、第2のエピトープに結合する、KLCP2
を含む。
実施形態では、第1および第2の重鎖ポリペプチドは、ヘテロ二量体化を増強するFc境界部を形成する。実施形態では、多特異性抗体分子は、Fc定常、CH2-CH3ドメイン(ノブ修飾を有する)に接続された第1の重鎖可変領域にヘテロ二量体化したハイブリッドVLl-CLlを含む第1の結合特異性、およびFc定常、CH2-CH3ドメイン(ホール修飾を有する)に接続された第2の重鎖可変領域にヘテロ二量体化したハイブリッドVLk-CLkを含む第2の結合特異性を有する。
サイトカイン分子
サイトカインは、一般に、例えば、シグナル伝達経路を通じて、細胞活性に影響を及ぼすポリペプチドである。よって、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインは有用であり、細胞膜の外側からシグナルを伝達して細胞内の応答をモジュレートする受容体媒介性のシグナル伝達と関連付けられ得る。サイトカインは、免疫応答のメディエーターであるタンパク質性のシグナル伝達化合物である。それらは、増殖、分化および細胞生存/アポトーシスを含む多くの異なる細胞機能を制御し、サイトカインはまた、ウイルス感染症および自己免疫疾患を含むいくつかの病態生理学的プロセスに関与する。サイトカインは、自然免疫系(単球、マクロファージ、樹状細胞)ならびに適応免疫系(TおよびB細胞)の両方の様々な細胞によって様々な刺激下で合成される。サイトカインは、炎症促進性および抗炎症性の2つの群に分類することができる。IFNγ、IL-1、IL-6およびTNF-アルファを含む炎症促進性サイトカインは、主に、自然免疫細胞およびTh1細胞に由来する。IL-10、IL-4、IL-13およびIL-5を含む抗炎症性サイトカインは、Th2免疫細胞から合成される。
本開示は、とりわけ、1つまたは複数のサイトカイン分子、例えば、免疫調節性(例えば、炎症促進性)サイトカインおよびそのバリアント、例えば、機能的バリアントを含む、例えば、それを含有するように操作された多特異性(例えば、二、三、四特異性)または多機能性分子を提供する。よって、一部の実施形態では、サイトカイン分子は、インターロイキンまたはそのバリアント、例えば、機能的バリアントである。一部の実施形態では、インターロイキンは炎症促進性インターロイキンである。一部の実施形態では、インターロイキンは、インターロイキン-2(IL-2)、インターロイキン-12(IL-12)、インターロイキン-15(IL-15)、インターロイキン-18(IL-18)、インターロイキン-21(IL-21)、インターロイキン-7(IL-7)、またはインターフェロンガンマから選択される。一部の実施形態では、サイトカイン分子は炎症促進性サイトカインである。
ある特定の実施形態では、サイトカインは一本鎖サイトカインである。ある特定の実施形態では、サイトカインは、多鎖サイトカインである(例えば、サイトカインは、2つまたはより多くの(例えば、2つの)ポリペプチド鎖を含む。例示的な多鎖サイトカインはIL-12である。
有用なサイトカインの例としては、GM-CSF、IL-1α、IL-1β、IL-2
、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-10、IL-12、IL-21、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、MIP-1α、MIP-1β、TGF-β、TNF-α、およびTNFβが挙げられるがそれに限定されない。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインは、GM-CSF、IL-2、IL-7、IL-8、IL-10、IL-12、IL-15、IL-21、IFN-α、IFN-γ、MIP-1α、MIP-1βおよびTGF-βの群から選択されるサイトカインである。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインは、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IFN-α、およびIFN-γの群から選択されるサイトカインである。ある特定の実施形態では、サイトカインは、N-および/またはO-グリコシル化部位を除去するために突然変異される。グリコシル化の排除は、組換え産生において得られ得る製造物の均質性を増加させる。
一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインはIL-2である。詳細な実施形態では、IL-2サイトカインは、活性化Tリンパ球細胞の増殖、活性化Tリンパ球細胞の分化、細胞傷害性T細胞(CTL)活性、活性化B細胞の増殖、活性化B細胞の分化、ナチュラルキラー(NK)細胞の増殖、NK細胞の分化、活性化T細胞またはNK細胞によるサイトカイン分泌、およびNK/リンパ球活性化キラー(LAK)抗腫瘍細胞傷害性からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。別の特定の実施形態では、IL-2サイトカインは、IL-2受容体のアルファ-サブユニットに対して低減した結合親和性を有する突然変異体IL-2サイトカインである。ベータ-およびガンマ-サブユニット(それぞれCD122およびCD132としても公知)と共に、アルファ-サブユニット(CD25としても公知)は、ヘテロ三量体高親和性IL-2受容体を形成するが、β-およびγ-サブユニットのみからなる二量体受容体は、中親和性IL-2受容体と称される。PCT特許出願番号PCT/EP2012/051991(これにより参照により全体が本明細書に組み込まれる)に記載されるように、IL-2受容体のアルファ-サブユニットに対して低減した結合を有する突然変異体IL-2ポリペプチドは、野生型IL-2ポリペプチドと比較して、制御性T細胞中でIL-2シグナル伝達を誘導する低減した能力を有し、T細胞中でより少ない活性化誘導性細胞死(AICD)を誘導し、かつin vivoでの低減した毒性プロファイルを有する。低減した毒性を有するそのようなサイトカインの使用は、Fcドメインの存在に起因して長い血清半減期を有する本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドにおいて特に有利である。一実施形態では、本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドの突然変異体IL-2サイトカインは、突然変異されていないIL-2サイトカインと比較して、IL-2受容体のアルファ-サブユニット(CD25)に対する突然変異体IL-2サイトカインの親和性を低減しまたは消失させるが、中親和性IL-2受容体(IL-2受容体のβおよびγサブユニットからなる)に対する突然変異体IL-2サイトカインの親和性を保存する少なくとも1つのアミノ酸突然変異を含む。一実施形態では、1つまたは複数のアミノ酸突然変異はアミノ酸置換である。詳細な実施形態では、突然変異体IL-2サイトカインは、ヒトIL-2の残基42、45、および72に対応する位置から選択される1つ、2つまたは3つの位置における1つ、2つまたは3つのアミノ酸置換を含む。より詳細な実施形態では、突然変異体IL-2サイトカインは、ヒトIL-2の残基42、45および72に対応する位置における3つのアミノ酸置換を含む。よりいっそう詳細な実施形態では、突然変異体IL-2サイトカインは、アミノ酸置換F42A、Y45AおよびL72Gを含むヒトIL-2である。一実施形態では、突然変異体IL-2サイトカインは、ヒトIL-2の3位に対応する位置におけるアミノ酸突然変異を追加的に含み、これはIL-2のO-グリコシル化部位を排除する。特に、前記追加のアミノ酸突然変異は、スレオニン残基をアラニン残基によって置き換えるアミノ酸置換である。本発明において有用な特定の突然変異体IL-2サイトカインは、ヒトIL-2の残基3、42、45および72に対応する位置における4つのアミノ酸置換を含む。特定のアミノ酸置換は、T3A、F42A、Y45AおよびL72Gである。PCT特許出
願番号PCT/EP2012/051991および付加された実施例において実証されるように、前記四重突然変異体IL-2ポリペプチド(IL-2 qm)は、CD25への検出可能な結合を呈さず、T細胞においてアポトーシスを誘導する低減した能力を呈し、制御性T細胞(T.sub.reg cells)においてIL-2シグナル伝達を誘導する低減した能力を呈し、かつin vivoでの低減した毒性プロファイルを呈する。しかしながら、それは、エフェクター細胞においてIL-2シグナル伝達を活性化させ、エフェクター細胞の増殖を誘導し、かつNK細胞により二次的なサイトカインとしてIFN-γを生成させる能力を保持する。
上記の実施形態のいずれかによるIL-2または突然変異体IL-2サイトカインは、発現または安定性の増加などのさらなる利点を提供する追加の突然変異を含んでもよい。例えば、125位におけるシステインは、ジスルフィド架橋によるIL-2二量体の形成を回避するために、アラニンなどの中性アミノ酸で置き換えられてもよい。そのため、ある特定の実施形態では、本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドのIL-2または突然変異体IL-2サイトカインは、ヒトIL-2の残基125に対応する位置における追加のアミノ酸突然変異を含む。一実施形態では、前記追加のアミノ酸突然変異はアミノ酸置換C125Aである。
詳細な実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのIL-2サイトカインは、配列番号2270
[APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINN YKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHL RPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT]
のポリペプチド配列を含む。
別の詳細な実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのIL-2サイトカインは、配列番号2280[APASSSTKKTQLQLEHLLLD LQMILNGINN YKNPKLTRMLTAKFAMPKKATELKHLQCLE EELKPLEEVLNGAQSKNFHL RPRDLISNIN VIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT]のポリペプチド配列を含む。
別の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインはIL-12である。詳細な実施形態では、前記IL-12サイトカインは一本鎖IL-12サイトカインである。よりいっそう詳細な実施形態では、一本鎖IL-12サイトカインは、配列番号2290
[IWELKKDVYVVELDWYPDAPGEMVVLTCDTPEEDGITWTLDQSSEVLGSGKTLTIQVKEFGDAGQYTCHKGGEVLSHSLLLLHKKEDGIWSTDILKDQKEPKNKTFLRCEAKNYSGRFTCWWLTTISTDLTFSVKSSRGSSDPQGVTCGAATLSAERVRGDNKEYEYSVECQEDSACPAAEESLPIEVMVDAVHKLKYENYTSSFFIRDIIKPDPPKNLQLKPLKNSRQVEVSWEYPDTWSTPHSYFSLTFCVQVQGKSKREKKDRVFTDKTSATVICRKNASISVRAQDRYYSSSWSEWASVPCSGGGGSGGGGSGGGGSRNLPVATPDPGMFPCLHHSQNLLRAVSNMLQKARQTLEFYPCTSEEIDHEDITKDKTSTVEACLPLELTKNESCLNSRETSFITNGSCLASRKTSFMMALCLSSIYEDLKMYQVEFKTMNAKLLMDPKRQIFLDQNMLAVIDELMQALNFNSETVPQKSSLEEPDFYKTKIKLCILLHAFRIRAVTIDRVMSYLNAS]
のポリペプチド配列を含む。一実施形態では、IL-12サイトカインは、NK細胞の増殖、NK細胞の分化、T細胞の増殖、およびT細胞の分化からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。
別の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインはIL-10である。詳細な実施形態では、前記IL-10サイトカインは一本鎖IL-10サイトカインである。よりいっそう詳細な実施形態では、一本鎖IL-10サイトカインは、配列番号2300
[SPGQGTQSENSCTHFPGNLPNMLRDLRDAFSRVKTFFQMKDQLDNLLLKESLLEDFKGYLGCQALSEMIQFYLEEVMPQAENQDPDIKAHVNSLGENLKTLRLRLRRCHRFLPCENKSKAVEQVKNAFNKLQEKGIYKAMSEFDIFINYIEAYMTMKIRNGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSSPGQGTQSENSCTHFPGNLPNMLRDLRDAFSRVKTFFQMKDQLDNLLLKESLLEDFKGYLGCQALSEMIQFYLEEVMPQAENQDPDIKAHVNSLGENLKTLRLRLRRCHRFLPCENKSKAVEQVKNAFNKLQEKGIYKAMSEFDIFINYIEAYMTMKIRN]のポリペプチド配列を含む。
別の詳細な実施形態では、IL-10サイトカインは単量体IL-10サイトカインである。より詳細な実施形態では、単量体IL-10サイトカインは、配列番号2310
[SPGQGTQSENSCTHFPGNLPNMLRDLRDAFSRVKTFFQMKDQLDNLLLKESLLEDFKGYLGCQALSEMIQFYLEEVMPQAENQDPDIKAHVNSLGENLKTLRLRLRRCHRFLPCENGGGSGGKSKAVEQVKNAFNKLQEKGIYKAMSEFDIFINYIEAYMTMKIRN]のポリペプチド配列を含む。一実施形態では、IL-10サイトカインは、サイトカイン分泌の阻害、抗原提示細胞による抗原提示の阻害、酸素ラジカル放出の低減、およびT細胞増殖の阻害からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。サイトカインがIL-10である本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドは、例えば、炎症性障害の処置における、炎症の下方調節のために特に有用である。
別の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインはIL-15である。詳細な実施形態では、前記IL-15サイトカインは、IL-15受容体のα-サブユニットに対して低減した結合親和性を有する突然変異体IL-15サイトカインである。理論に拘泥するものではないが、IL-15受容体のアルファ-サブユニットへの低減した結合を有する突然変異体IL-15ポリペプチドは、野生型IL-15ポリペプチドと比較して、身体の全体を通じて線維芽細胞に結合する低減した能力を有し、向上した薬物動態および毒性プロファイルをもたらす。記載される突然変異体IL-2および突然変異体IL-15エフェクター部分などの低減した毒性を有するサイトカインの使用は、Fcドメインの存在に起因して長い血清半減期を有する本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドにおいて特に有利である。一実施形態では、本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドの突然変異体IL-15サイトカインは、突然変異していないIL-15サイトカインと比較して、IL-15受容体のアルファ-サブユニットに対する突然変異体IL-15サイトカインの親和性を低減しまたは消失させるが、中親和性IL-15/IL-2受容体(IL-15/IL-2受容体のベータ-およびガンマ-サブユニットからなる)に対する突然変異体IL-15サイトカインの親和性を保存する少なくとも1つのアミノ酸突然変異を含む。一実施形態では、アミノ酸突然変異はアミノ酸置換である。詳細な実施形態では、突然変異体IL-15サイトカインは、ヒトIL-15の残基53に対応する位置においてアミノ酸置換を含む。より詳細な実施形態では、突然変異体IL-15サイトカインは、アミノ酸置換E53Aを含むヒトIL-15である。
一実施形態では、突然変異体IL-15サイトカインは、ヒトIL-15の79位に対応する位置においてアミノ酸突然変異を追加的に含み、これはIL-15のN-グリコシル化部位を排除する。特に、前記追加のアミノ酸突然変異は、アスパラギン残基をアラニン残基によって置き換えるアミノ酸置換である。よりいっそう詳細な実施形態では、IL-15サイトカインは、配列番号2320[NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLASGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGAVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS]のポリペプチド配列を含む。一実施形態では、IL-15サイトカインは、活性化Tリンパ球細胞の増殖、活性化Tリンパ球細胞の分化、細胞傷害性T細胞(CTL)活性、活性化B細胞の増殖、活性化B細胞の分化、ナチュラルキラー(NK)細胞の増殖、NK細胞の分化、活性化T細胞またはNK細胞によるサイトカイン分泌、およびNK/リンパ球活性化キラー(LAK)抗腫瘍細胞傷害性からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。
多特異性または多機能性ポリペプチド中のエフェクター部分として有用な突然変異体サイトカイン分子は、当該技術分野において周知の遺伝学的または化学的方法を使用して欠失、置換、挿入または修飾によって調製することができる。遺伝学的方法は、コーディングDNA配列の部位特異的突然変異誘発、PCR、および遺伝子合成などを含んでもよい。正しいヌクレオチド変化は、例えばシークエンシングによって検証することができる。置換または挿入は、天然アミノ酸残基の他に非天然アミノ酸残基を伴ってもよい。アミノ酸修飾としては、グリコシル化部位の付加もしくは除去または炭水化物の取付けなどの化学修飾の周知の方法が挙げられる。
一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはGM-CSFである。詳細な実施形態では、GM-CSFサイトカインは、顆粒球、単球または樹状細胞において増殖および/または分化を誘発することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはIFN-αである。詳細な実施形態では、IFN-αサイトカインは、ウイルス感染細胞におけるウイルス複製の阻害、および主要組織適合複合体I(MHC I)の発現の上方調節からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。別の詳細な実施形態では、IFN-αサイトカインは、腫瘍細胞において増殖を阻害することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはIFNγである。詳細な実施形態では、IFN-γサイトカインは、マクロファージ活性の増加、MHC分子の発現の増加、およびNK細胞活性の増加の群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはIL-7である。詳細な実施形態では、IL-7サイトカインは、Tおよび/またはBリンパ球の増殖を誘発することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはIL-8である。詳細な実施形態では、IL-8サイトカインは、好中球において走化性を誘発することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはMIP-1αである。詳細な実施形態では、MIP-1αサイトカインは、単球およびTリンパ球細胞において走化性を誘発することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはMIP-1βである。詳細な実施形態では、MIP-1βサイトカインは、単球およびTリンパ球細胞において走化性を誘発することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはTGF-βである。詳細な実施形態では、TGF-βサイトカインは、単球における走化性、マクロファージにおける走化性、活性化マクロファージにおけるIL-1発現の上方調節、および活性化B細胞におけるIgA発現の上方調節からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数
を誘発することができる。
一実施形態では、本発明の多特異性または多機能性ポリペプチドは、対照サイトカインについてよりも少なくとも約1、1.5、2、2.5、3、3.5、4、4.5、5、5.5、6、6.5、7、7.5、8、8.5、9、9.5または10倍高い解離定数(K)でサイトカイン受容体に結合する。別の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドは、2つまたはより多くのエフェクター部分を含む対応する多特異性または多機能性ポリペプチドについてよりも少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、または10倍高いKでサイトカイン受容体に結合する。別の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドは、2つまたはより多くのサイトカインを含む対応する多特異性または多機能性ポリペプチドについてよりも約10倍高い解離定数Kでサイトカイン受容体に結合する。
一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、サイトカイン分子を含む。実施形態では、サイトカイン分子は、サイトカインの全長、断片もしくはバリアント;サイトカイン受容体ドメイン、例えば、サイトカイン受容体二量体化ドメイン;またはサイトカイン受容体のアゴニスト、例えば、サイトカイン受容体に対する抗体分子(例えば、アゴニスト抗体)を含む。
一部の実施形態では、サイトカイン分子は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-7、IL-21、もしくはインターフェロンガンマ、もしくはその断片もしくはバリアント、または上記のサイトカインの任意の組合せから選択される。サイトカイン分子は、単量体または二量体であり得る。実施形態では、サイトカイン分子は、サイトカイン受容体二量体化ドメインをさらに含むことができる。
他の実施形態では、サイトカイン分子は、サイトカイン受容体のアゴニスト、例えば、IL-15RaまたはIL-21Rから選択されるサイトカイン受容体に対する抗体分子(例えば、アゴニスト抗体)である。
一実施形態では、サイトカイン分子は、IL-15、例えば、ヒトIL-15(例えば、アミノ酸配列:
NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS(配列番号2170)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号2170のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、サイトカイン分子は、受容体二量体化ドメイン、例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメインを含む。一実施形態では、IL15Rアルファ二量体化ドメインは、アミノ酸配列:
MAPRRARGCRTLGLPALLLLLLLRPPATRGITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVL(配列番号2180)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号2180のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、多特異性分子のサイトカイン分子(例えば、IL-15)および受容体二量体化ドメイン(例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメイン)は、例えば
、リンカー(例えば、Gly-Serリンカー、例えば、アミノ酸配列SGGSGGGGSGGGSGGGGSLQ(配列番号2190)を含むリンカーを介して、共有結合的に連結されている。他の実施形態では、多特異性分子のサイトカイン分子(例えば、IL-15)および受容体二量体化ドメイン(例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメイン)は、共有結合的に連結されておらず、例えば、非共有結合的に会合している。
他の実施形態では、サイトカイン分子は、IL-2、例えば、ヒトIL-2(例えば、アミノ酸配列:
APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号2191)その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号2191のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、サイトカイン分子は、IL-18、例えば、ヒトIL-18(例えば、アミノ酸配列:
YFGKLESKLSVIRNLNDQVLFIDQGNRPLFEDMTDSDCRDNAPRTIFIISMYKDSQPRGMAVTISVKCEKISTLSCENKIISFKEMNPPDNIKDTKSDIIFFQRSVPGHDNKMQFESSSYEGYFLACEKERDLFKLILKKEDELGDRSIMFTVQNED(配列番号2192)その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号2192のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、サイトカイン分子は、IL-21、例えば、ヒトIL-21(例えば、アミノ酸配列:
QGQDRHMIRMRQLIDIVDQLKNYVNDLVPEFLPAPEDVETNCEWSAFSCFQKAQLKSANTGNNERIINVSIKKLKRKPPSTNAGRRQKHRLTCPSCDSYEKKPPKEFLERFKSLLQKMIHQHLSSRTHGSEDS(配列番号2193)その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号2193のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む。
さらに他の実施形態では、サイトカイン分子は、インターフェロンガンマ、例えば、ヒトインターフェロンガンマ(例えば、アミノ酸配列:
QDPYVKEAENLKKYFNAGHSDVADNGTLFLGILKNWKEESDRKIMQSQIVSFYFKLFKNFKDDQSIQKSVETIKEDMNVKFFNSNKKKRDDFEKLTNYSVTDLNVQRKAIHELIQVMAELSPAAKTGKRKRSQMLFRG(配列番号2194)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号2194のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む。
免疫細胞エンゲージャー
本明細書に開示される多特異性または多機能性分子の免疫細胞エンゲージャー、例えば、第1および/または第2の免疫細胞エンゲージャーは、免疫細胞、例えば、免疫エフェクター細胞への結合、および/またはその活性化を媒介することができる。一部の実施形態では、免疫細胞は、T細胞、NK細胞、B細胞、樹状細胞、もしくはマクロファージ細胞エンゲージャー、またはこれらの組合せから選択される。一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、もしくはマクロファージ細胞エンゲージャーのうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて、またはこれらの組合せから選択される。免疫細胞エンゲージャーは、免疫系のアゴニストであり得る。一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、抗体分子、リガンド分子(例えば、免疫グロブリン定常領域、例えば、Fc領域をさらに含むリガンド)、小分子、ヌクレオチド分子であり得る。
ナチュラルキラー細胞エンゲージャー
ナチュラルキラー(NK)細胞は、抗体非依存性の方式で腫瘍およびウイルス感染細胞を認識および破壊する。NK細胞の調節は、NK細胞表面上の受容体を活性化および阻害することによって媒介される。活性化受容体の1つのファミリーは、NKp30、NKp44およびNKp46を含む天然細胞傷害性受容体(NCR)である。NCRは、がん細胞上のヘパラン硫酸の認識によって腫瘍標的化を開始させる。NKG2Dは、活性化キラー(NK)細胞において刺激性および共刺激性の両方の自然免疫応答を提供する受容体であり、細胞傷害活性に繋がる。DNAM1は、細胞間接着、リンパ球シグナル伝達、細胞傷害性ならびに細胞傷害性Tリンパ球(CTL)およびNK細胞によって媒介されるリンホカイン分泌に関与する受容体である。DAP10(HCSTとしても公知)は、リンパ球様および骨髄性細胞においてKLRK1と会合して活性化受容体KLRK1-HCSTを形成する膜貫通アダプタータンパク質であり、この受容体は、MHCクラスI鎖関連MICAおよびMICB、ならびにU(必要に応じてL1)6結合性タンパク質(ULBP)などの細胞表面リガンドを発現する標的細胞に対する細胞傷害性の誘発において大きな役割を果たし、KLRK1-HCST受容体は、腫瘍に対する免疫サーベイランスにおいて役割を果たし、腫瘍細胞の細胞溶解のために要求され、実際に、KLRK1リガンドを発現しない黒色腫細胞は、NK細胞によって媒介される免疫サーベイランスを免れる。CD16は、IgGのFc領域に対する受容体であり、複合体化または凝集IgG、そして単量体IgGにも結合し、それによって、抗体依存性細胞傷害性(ADCC)およびファゴサイトーシスなどの他の抗体依存性応答を媒介する。
一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーはウイルスヘマグルチニン(HA)であり、HAは、インフルエンザウイルスの表面上に見出される糖タンパク質である。それは、上気道中の細胞または赤血球などの膜上にシアル酸を有する細胞へのウイルスの結合の原因となる。HAは、少なくとも18の異なる抗原を有する。これらのサブタイプは、H1~H18と命名されている。NCRはウイルスタンパク質を認識することができる。NKp46は、インフルエンザのHAならびにセンダイウイルスおよびニューカッスル病ウイルスを含むパラミクソウイルスのHA-NAと相互作用できることが示されている。NKp46の他に、NKp44もまた、異なるインフルエンザサブタイプのHAと機能的に相互作用することができる。
本開示は、とりわけ、NK細胞への結合および/またはその活性化を媒介する1つまたは複数のNK細胞エンゲージャーを含有するように操作されている多特異性(例えば、二、三、四特異性)または多機能性分子を提供する。よって、一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKp30、NKp40、NKp44、NKp46、NKG2D、DNAM1、DAP10、CD16(例えば、CD16a、CD16b、もしくは両方)
、CRTAM、CD27、PSGL1、CD96、CD100(SEMA4D)、NKp80、CD244(SLAMF4もしくは2B4としても公知)、SLAMF6、SLAMF7、KIR2DS2、KIR2DS4、KIR3DS1、KIR2DS3、KIR2DS5、KIR2DS1、CD94、NKG2C、NKG2E、またはCD160に結合する(例えば、それを活性化させる)抗原結合性ドメインまたはリガンドから選択される。
一実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKp30のリガンド、B7-6であり、例えば、
DLKVEMMAGGTQITPLNDNVTIFCNIFYSQPLNITSMGITWFWKSLTFDKEVKVFEFFGDHQEAFRPGAIVSPWRLKSGDASLRLPGIQLEEAGEYRCEVVVTPLKAQGTVQLEVVASPASRLLLDQVGMKENEDKYMCESSGFYPEAINITWEKQTQKFPHPIEISEDVITGPTIKNMDGTFNVTSCLKLNSSQEDPGTVYQCVVRHASLHTPLRSNFTLTAARHSLSETEKTDNFS(配列番号3291)のアミノ酸配列、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号3291のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、ウイルスHAである、NKp44またはNKp46のリガンドである。ウイルスヘマグルチニン(HA)は、ウイルスの表面上にある糖タンパク質である。HAタンパク質は、シアル酸糖部分を介してウイルスが細胞の膜に結合することを可能とし、これは細胞膜とのウイルス膜の融合に寄与する(例えば、Eur J Immunol. 2001 Sep;31(9):2680~9ページ、「Recognition of viral hemagglutinins by
NKp44 but not by NKp30」;およびNature 2001 Feb 22;409(6823):1055~60ページ、「Recognition
of haemagglutinins on virus-infected cells by NKp46 activates lysis by human NK
cells」(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、MICA、MICB、またはULBP1から選択されるNKG2Dのリガンドであり、例えば、
(i)MICAは、アミノ酸配列:
EPHSLRYNLTVLSWDGSVQSGFLTEVHLDGQPFLRCDRQKCRAKPQGQWAEDVLGNKTWDRETRDLTGNGKDLRMTLAHIKDQKEGLHSLQEIRVCEIHEDNSTRSSQHFYYDGELFLSQNLETKEWTMPQSSRAQTLAMNVRNFLKEDAMKTKTHYHAMHADCLQELRRYLKSGVVLRRTVPPMVNVTRSEASEGNITVTCRASGFYPWNITLSWRQDGVSLSHDTQQWGDVLPDGNGTYQTWVATRICQGEEQRFTCYMEHSGNHSTHPVPSGKVLVLQSHW(配列番号3292)その断片、もしくはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号3292のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含み、
(ii)MICBは、アミノ酸配列:
AEPHSLRYNLMVLSQDESVQSGFLAEGHLDGQPFLRYDRQKRRAKPQGQWAEDVLGAKTWDTETEDLTENGQDLRRTLTHIKDQKGGLHSLQEIRVCEIHEDSSTRGSRHFYYDGELFLSQNLETQESTVPQSSRAQTLAMNVTNFWKEDAMKTKTHYRAMQADCLQKLQRYLKSGVAIRRTVPPMVNVTCSEVSEGNITVTCRASSFYPRNITLTWRQDGVSLSHNTQQWGDVLPDGNGTYQTWVATRIRQGEEQRFTCYMEHSGNHGTHPVPSGKVLVLQSQRTD(配列番号3293)その断片、もしくはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号3293のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含み、または
(iii)ULBP1は、アミノ酸配列:
GWVDTHCLCYDFIITPKSRPEPQWCEVQGLVDERPFLHYDCVNHKAKAFASLGKKVNVTKTWEEQTETLRDVVDFLKGQLLDIQVENLIPIEPLTLQARMSCEHEAHGHGRGSWQFLFNGQKFLLFDSNNRKWTALHPGAKKMTEKWEKNRDVTMFFQKISLGDCKMWLEEFLMYWEQMLDPTKPPSLAPG(配列番号3294)その断片、もしくはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号3294のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NECTIN2またはNECL5から選択されるDNAM1のリガンドであり、例えば、
(i)NECTIN2は、アミノ酸配列:
QDVRVQVLPEVRGQLGGTVELPCHLLPPVPGLYISLVTWQRPDAPANHQNVAAFHPKMGPSFPSPKPGSERLSFVSAKQSTGQDTEAELQDATLALHGLTVEDEGNYTCEFATFPKGSVRGMTWLRVIAKPKNQAEAQKVTFSQDPTTVALCISKEGRPPARISWLSSLDWEAKETQVSGTLAGTVTVTSRFTLVPSGRADGVTVTCKVEHESFEEPALIPVTLSVRYPPEVSISGYDDNWYLGRTDATLSCDVRSNPEPTGYDWSTTSGTFPTSAVAQGSQLVIHAVDSLFNTTFVCTVTNAVGMGRAEQVIFVRETPNTAGAGATGG(配列番号3295)その断片、もしくはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号3295のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含み、または
(ii)NECL5は、アミノ酸配列:
WPPPGTGDVVVQAPTQVPGFLGDSVTLPCYLQVPNMEVTHVSQLTWARHGESGSMAVFHQTQGPSYSESKRLEFVAARLGAELRNASLRMFGLRVEDEGNYTCLFVTFPQGSRSVDIWLRVLAKPQNTAEVQKVQLTGEPVPMARCVSTGGRPPAQITWHSDLGGMPNTSQVPGFLSGTVTVTSLWILVPSSQVDGKNVTCKVEHESFEKPQLLTVNLTVYYPPEVSISGYDNNWYLGQNEATLTCDARSNPEPTGYNWSTTMGPLPPFAVAQGAQLLIRPVDKPINTTLICNVTNALGARQAELTVQVKEGPPSEHSGISRN(配列番号3296)その断片、もしくはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号3296aのアミ
ノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
さらに他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKG2Dのアダプターである、DAP10のリガンドである(例えば、Proc Natl Acad Sci U S A. 2005 May 24;102(21):7641~7646ページ;およびBlood、15 September 2011 Volume 118、Number 11(これらのそれぞれの全内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CD16a/bリガンドである、CD16のリガンド、例えば、抗体Fc領域をさらに含むCD16a/bリガンドである(例えば、Front Immunol. 2013;4:76を参照;これは、CD16を通じてNK細胞を誘発するために抗体がFcをどのように使用するのかを議論しており、その内容の全体は本明細書に組み込まれる)。
他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NECL2である、CRTAMのリガンドであり、例えば、NECL2は、アミノ酸配列:
QNLFTKDVTVIEGEVATISCQVNKSDDSVIQLLNPNRQTIYFRDFRPLKDSRFQLLNFSSSELKVSLTNVSISDEGRYFCQLYTDPPQESYTTITVLVPPRNLMIDIQKDTAVEGEEIEVNCTAMASKPATTIRWFKGNTELKGKSEVEEWSDMYTVTSQLMLKVHKEDDGVPVICQVEHPAVTGNLQTQRYLEVQYKPQVHIQMTYPLQGLTREGDALELTCEAIGKPQPVMVTWVRVDDEMPQHAVLSGPNLFINNLNKTDNGTYRCEASNIVGKAHSDYMLYVYDPPTTIPPPTTTTTTTTTTTTTILTIITDSRAGEEGSIRAVDH(配列番号3297)その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号3297のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CD70である、CD27のリガンドであり、例えば、CD70は、アミノ酸配列:
QRFAQAQQQLPLESLGWDVAELQLNHTGPQQDPRLYWQGGPALGRSFLHGPELDKGQLRIHRDGIYMVHIQVTLAICSSTTASRHHPTTLAVGICSPASRSISLLRLSFHQGCTIASQRLTPLARGDTLCTNLTGTLLPSRNTDETFFGVQWVRP(配列番号3298)その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号3298のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、L-セレクチン(CD62L)である、PSGL1のリガンドであり、例えば、L-セレクチンは、アミノ酸配列:
WTYHYSEKPMNWQRARRFCRDNYTDLVAIQNKAEIEYLEKTLPFSRSYYWIGIRKIGGIWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKNKEDCVEIYIKRNKDAGKWNDDACHKLKAALCYTASCQPWSCSGHGECVEIINNYTCNCDVGYYGPQCQFVIQCE
PLEAPELGTMDCTHPLGNFSFSSQCAFSCSEGTNLTGIEETTCGPFGNWSSPEPTCQVIQCEPLSAPDLGIMNCSHPLASFSFTSACTFICSEGTELIGKKKTICESSGIWSNPSPICQKLDKSFSMIKEGDYN(配列番号3299)その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号3299のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NECL5である、CD96のリガンドであり、例えば、NECL5は、アミノ酸配列:
WPPPGTGDVVVQAPTQVPGFLGDSVTLPCYLQVPNMEVTHVSQLTWARHGESGSMAVFHQTQGPSYSESKRLEFVAARLGAELRNASLRMFGLRVEDEGNYTCLFVTFPQGSRSVDIWLRVLAKPQNTAEVQKVQLTGEPVPMARCVSTGGRPPAQITWHSDLGGMPNTSQVPGFLSGTVTVTSLWILVPSSQVDGKNVTCKVEHESFEKPQLLTVNLTVYYPPEVSISGYDNNWYLGQNEATLTCDARSNPEPTGYNWSTTMGPLPPFAVAQGAQLLIRPVDKPINTTLICNVTNALGARQAELTVQVKEGPPSEHSGISRN(配列番号3296)その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号3296のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CD72である、CD100(SEMA4D)のリガンドであり、例えば、CD72は、
アミノ酸配列:
RYLQVSQQLQQTNRVLEVTNSSLRQQLRLKITQLGQSAEDLQGSRRELAQSQEALQVEQRAHQAAEGQLQACQADRQKTKETLQSEEQQRRALEQKLSNMENRLKPFFTCGSADTCCPSGWIMHQKSCFYISLTSKNWQESQKQCETLSSKLATFSEIYPQSHSYYFLNSLLPNGGSGNSYWTGLSSNKDWKLTDDTQRTRTYAQSSKCNKVHKTWSWWTLESESCRSSLPYICEMTAFRFPD(配列番号3300)その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号3300のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CLEC2B(AICL)である、NKp80のリガンドであり、例えば、CLEC2B(AICL)は、アミノ酸配列:
KLTRDSQSLCPYDWIGFQNKCYYFSKEEGDWNSSKYNCSTQHADLTIIDNIEEMNFLRRYKCSSDHWIGLKMAKNRTGQWVDGATFTKSFGMRGSEGCAYLSDDGAATARCYTERKWICRKRIH(配列番号3301)その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号3301のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CD48である、CD244のリガンドであり、例えば、CD48は、アミノ酸配列:
QGHLVHMTVVSGSNVTLNISESLPENYKQLTWFYTFDQKIVEWDSRKSKYFESKFKGRVRLDPQSGALYISKVQKEDNSTYIMRVLKKTGNEQEWKIKLQVLDPVPKPVIKIEKIEDMDDNCYLKLSCVIPGESVNYTWYGDKRPFPKELQNSVLETTLMPHNYSRCYTCQVSNSVSSKNGTVCLSPPCTLARS(配列番号3302)その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号3302のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
T細胞エンゲージャー
本開示は、とりわけ、T細胞への結合および/またはその活性化を媒介する1つまたは複数のT細胞エンゲージャーを含有するように操作されている多特異性(例えば、二、三、四特異性)または多機能性分子を提供する。一部の実施形態では、T細胞エンゲージャーは、本明細書に記載される、TCRβ、例えば、TCRβV領域に結合する、例えば、それを活性化させる抗原結合性ドメインである。一部の実施形態では、T細胞エンゲージャーは、CD3、TCRα、TCRγ、TCRζ、ICOS、CD28、CD27、HVEM、LIGHT、CD40、4-1BB、OX40、DR3、GITR、CD30、TIM1、SLAM、CD2、またはCD226のうちの1つまたは複数に結合する(例えば、一部の実施形態では、それを活性化させる)抗原結合性ドメインまたはリガンドから選択される。他の実施形態では、T細胞エンゲージャーは、CD3、TCRα、TCRγ、TCRζ、ICOS、CD28、CD27、HVEM、LIGHT、CD40、4-1BB、OX40、DR3、GITR、CD30、TIM1、SLAM、CD2、またはCD226のうちの1つまたは複数に結合し、かつそれを活性化させない抗原結合性ドメインまたはリガンドから選択される。
B細胞、マクロファージおよび樹状細胞エンゲージャー
概括的に言えば、Bリンパ球としても公知のB細胞は、リンパ球サブタイプの白血球の一種である。それらは、抗体を分泌することによって適応免疫系の液性免疫成分において機能する。追加的に、B細胞は、抗原を提示し(それらはまた、プロフェッショナル抗原提示細胞(APC)として分類される)、サイトカインを分泌する。マクロファージは、ファゴサイトーシスを介して細胞残屑、外来物質、微小生物、がん細胞を貪食および消化する白血球の一種である。ファゴサイトーシスの他に、それらは非特異的な防御(自然免疫)において重要な役割を果たし、そしてまた、リンパ球などの他の免疫細胞を動員することによって特異的な防御機構(適応免疫)の開始を助ける。例えば、それらは、T細胞への抗原提示主体として重要である。炎症の増加および免疫系の刺激の他に、マクロファージはまた、重要な抗炎症性の役割を果たし、サイトカインの放出を通じて免疫反応を減少させることができる。樹状細胞(DC)は、抗原材料のプロセシングにおいて機能し、それを細胞表面上で免疫系のT細胞に対して提示する抗原提示細胞である。
本開示は、とりわけ、B細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞への結合および/またはその活性化を媒介する1つまたは複数のB細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞エンゲージャーを含む、例えば、含有するように操作されている、多特異性(例えば、二、三、四特異性)または多機能性分子を提供する。
よって、一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、CD40リガンド(CD40L)もしくはCD70リガンド;CD40もしくはCD70に結合する抗体分子;OX
40に対する抗体分子;OX40リガンド(OX40L);Toll様受容体のアゴニスト(例えば、本明細書に記載されるもの、例えば、TLR4、例えば、構成的活性型TLR4(caTLR4)、もしくはTLR9アゴニスト);41BB;CD2;CD47;もしくはSTINGアゴニスト、またはこれらの組合せのうちの1つまたは複数から選択されるB細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞エンゲージャーを含む。
一部の実施形態では、B細胞エンゲージャーは、CD40L、OX40L、もしくはCD70リガンド、またはOX40、CD40もしくはCD70に結合する抗体分子である。
一部の実施形態では、マクロファージエンゲージャーはCD2アゴニストである。一部の実施形態では、マクロファージエンゲージャーは、CD40LもしくはCD40に結合する抗原結合性ドメインもしくはリガンド、Toll様受容体(TLR)アゴニスト(例えば、本明細書に記載されるもの)、例えば、TLR9もしくはTLR4(例えば、caTLR4(構成的活性型TLR4)、CD47、またはSTINGアゴニストに結合する抗原結合性ドメインである。一部の実施形態では、STINGアゴニストは、環状ジヌクレオチド、例えば、サイクリックジGMP(cdGMP)またはサイクリックジAMP(cdAMP)である。一部の実施形態では、STINGアゴニストはビオチン化されている。
一部の実施形態では、樹状細胞エンゲージャーはCD2アゴニストである。一部の実施形態では、樹状細胞エンゲージャーは、OX40L、41BB、TLRアゴニスト(例えば、本明細書に記載されるもの)(例えば、TLR9アゴニスト、TLR4(例えば、caTLR4(構成的活性型TLR4))、CD47、またはおよびSTINGアゴニストのうちの1つまたは複数に結合するリガンド、受容体アゴニスト、または抗体分子である。一部の実施形態では、STINGアゴニストは、環状ジヌクレオチド、例えば、サイクリックジGMP(cdGMP)またはサイクリックジAMP(cdAMP)である。一部の実施形態では、STINGアゴニストはビオチン化されている。
他の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、B細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞のうちの1つまたは複数への結合、またはその活性化を媒介する。例示的なB細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞エンゲージャーは、CD40リガンド(CD40L)もしくはCD70リガンド;CD40もしくはCD70に結合する抗体分子;OX40に対する抗体分子;OX40リガンド(OX40L);Toll様受容体アゴニスト(例えば、TLR4、例えば、構成的活性型TLR4(caTLR4)もしくはTLR9アゴニスト);41BBアゴニスト;CD2;CD47;もしくはSTINGアゴニスト、またはこれらの組合せのうちの1つまたは複数から選択することができる。
一部の実施形態では、B細胞エンゲージャーは、CD40L、OX40L、もしくはCD70リガンド、またはOX40、CD40もしくはCD70に結合する抗体分子のうちの1つまたは複数から選択される。
他の実施形態では、マクロファージ細胞エンゲージャーは、CD2アゴニスト;CD40L;OX40L;OX40、CD40もしくはCD70に結合する抗体分子;Toll様受容体アゴニストもしくはその断片(例えば、TLR4、例えば、構成的活性型TLR4(caTLR4));CD47アゴニスト;またはSTINGアゴニストのうちの1つまたは複数から選択される。
他の実施形態では、樹状細胞エンゲージャーは、CD2アゴニスト、OX40抗体、OX40L、41BBアゴニスト、Toll様受容体アゴニストもしくはその断片(例えば
、TLR4、例えば、構成的活性型TLR4(caTLR4))、CD47アゴニスト、またはSTINGアゴニストのうちの1つまたは複数から選択される。
一実施形態では、OX40Lは、アミノ酸配列:
QVSHRYPRIQSIKVQFTEYKKEKGFILTSQKEDEIMKVQNNSVIINCDGFYLISLKGYFSQEVNISLHYQKDEEPLFQLKKVRSVNSLMVASLTYKDKVYLNVTTDNTSLDDFHVNGGELILIHQNPGEFCVL(配列番号3303)その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号3303のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
別の実施形態では、CD40Lは、アミノ酸配列:
MQKGDQNPQIAAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQAPFIASLCLKSPGRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGVFELQPGASVFVNVTDPSQVSHGTGFTSFGLLKL(配列番号3304)その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号3304のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
さらに他の実施形態では、STINGアゴニストは、環状ジヌクレオチド、例えば、サイクリックジGMP(cdGMP)、サイクリックジAMP(cdAMP)、またはこれらの組合せを含み、必要に応じて2’,5’または3’,5’リン酸連結を有する。
一実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、41BBリガンド、例えば、アミノ酸配列:
ACPWAVSGARASPGSAASPRLREGPELSPDDPAGLLDLRQGMFAQLVAQNVLLIDGPLSWYSDPGLAGVSLTGGLSYKEDTKELVVAKAGVYYVFFQLELRRVVAGEGSGSVSLALHLQPLRSAAGAAALALTVDLPPASSEARNSAFGFQGRLLHLSAGQRLGVHLHTEARARHAWQLTQGATVLGLFRVTPEIPAGLPSPRSE(配列番号3305)その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号3305のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む41BBリガンドを含む。
Toll様受容体
Toll様受容体(TLR)は、ショウジョウバエTollタンパク質のホモログである進化的に保存された受容体であり、微生物病原体によって排他的に発現される病原体関連微生物パターン(PAMP)、または壊死したもしくは死にゆく細胞から放出される内因性分子である危険関連分子パターン(DAMP)として公知の高度に保存された構造モチーフを認識する。PAMPは、リポ多糖(LPS)、ペプチドグリカン(PGN)およびリポペプチドなどの様々な細菌細胞壁成分の他に、フラジェリン、細菌DNAおよびウイルス二本鎖RNAを含む。DAMPは、熱ショックタンパク質などの細胞内タンパク質の他に、細胞外基質からのタンパク質断片を含む。対応するPAMPまたはDAMPによるTLRの刺激は、シグナル伝達カスケードを開始させて、AP-1、NF-κBおよび
インターフェロン調節因子(IRF)などの転写因子の活性化に繋がる。TLRによるシグナル伝達は、インターフェロン(IFN)、炎症促進性サイトカインおよび適応免疫応答を指令するエフェクターサイトカインの産生を含む、様々な細胞応答をもたらす。TLRは、多数の炎症性および免疫障害に結び付けられており、がんにおいて役割を果たす(Rakoff-Nahoum S.およびMedzhitov R.、2009. Toll-like receptors and cancer. Nat Revs Cancer 9:57-63ページ)。
TLRは、ロイシンリッチリピート(LRR)およびToll/IL-1受容体(TIR)ドメインと呼ばれる保存された領域を含有する細胞質テイルを含有する細胞外ドメインによって特徴付けられるI型膜貫通タンパク質である。10個のヒトおよび12個のマウスTLRが特徴付けられており、それらは、ヒトにおけるTLR1~TLR10、ならびにマウスにおけるTLR1~TLR9、TLR11、TLR12およびTLR13であり、TLR10のホモログは偽遺伝子である。TLR2は、細菌リポタンパク質、リポマンナンおよびリポタイコ酸を含む、グラム陽性細菌からの様々なPAMPの認識のために必須である。TLR3は、ウイルス由来の二本鎖RNAに結び付けられている。TLR4は、主に、リポ多糖によって活性化される。TLR5は細菌フラジェリンを検出し、TLR9は、非メチル化CpG DNAに対する応答のために要求される。最後に、TLR7およびTLR8は、小さい合成の抗ウイルス分子を認識し、一本鎖RNAはそれらの天然リガンドであることが報告された。TLR11は、尿路病原性E. coliおよびToxoplasma gondiiからのプロフィリン様タンパク質を認識することが報告されている。TLRの特異性のレパートリーは、互いとヘテロ二量体化するTLRの能力によって拡張されるようである。例えば、TLR2およびTLR6の二量体は、ジアシル化リポタンパク質に対する応答のために要求され、TLR2およびTLR1は、相互作用してトリアシル化リポタンパク質を認識する。TLRの特異性はまた、LPSに応答してTLR4と複合体を形成するMD-2およびCD14などの、様々なアダプターおよびアクセサリー分子によって影響される。
TLRシグナル伝達は、炎症性サイトカインの産生に繋がるMyD88依存性経路、ならびにIFN-βの刺激および樹状細胞の成熟と関連付けられるMyD88非依存性経路という少なくとも2つの別個の経路からなる。MyD88依存性経路は、TLR3を除いてすべてのTLRに共通である(Adachi Oら、1998、「Targeted disruption of the MyD88 gene results in loss of IL-1- and IL-18-mediated function.」、Immunity、9(1):143~50ページ)。PAMPまたはDAMPによって活性化されると、TLRは、ヘテロまたはホモ二量体化して、細胞質TIRドメインを介してアダプタータンパク質の動員を誘導する。個々のTLRは、異なるアダプター分子の使用によって異なるシグナル伝達応答を誘導する。TLR4およびTLR2シグナル伝達は、MyD88依存性経路に関与するアダプターTIRAP/Malを要求する。TLR3は、アダプターTRIF/TICAM-1を通じて、MyD88非依存性の方式で、二本鎖RNAに応答してIFN-βの産生を誘発する。TRAM/TICAM-2は、その機能がTLR4経路に制限されたMyD88非依存性経路に関与する別のアダプター分子である。
TLR3、TLR7、TLR8およびTLR9は、ウイルス核酸を認識し、I型IFNを誘導する。I型IFNの誘導に繋がるシグナル伝達の機序は、活性化されるTLRに依存して異なる。それらは、抗ウイルス防御、細胞成長および免疫調節において不可欠な役割を果たすことが公知の転写因子のファミリー、インターフェロン調節因子、IRFを伴う。3つのIRF(IRF3、IRF5およびIRF7)は、ウイルス媒介性のTLRシグナル伝達の直接的なトランスデューサーとして機能する。TLR3およびTLR4はI
RF3およびIRF7を活性化させ、TLR7およびTLR8はIRF5およびIRF7を活性化させる(Doyle Sら、2002、「IRF3 mediates a TLR3/TLR4-specific antiviral gene program.」、Immunity、17(3):251~63ページ)。さらには、TLR9リガンドCpG-Aによって刺激されるI型IFN産生は、PI(3)KおよびmTORによって媒介されることが示されている(Costa-Mattioli M.およびSonenberg N. 2008、「RAPping production of type I interferon in pDCs through mTOR.」、Nature Immunol. 9:1097~1099ページ)。
TLR-9
TLR9は、DNA分子中の非メチル化CpG配列を認識する。CpG部位は、細菌ゲノムまたはウイルスDNAと比較して脊椎動物ゲノム上で比較的希少(約1%)である。TLR9は、Bリンパ球、単球、ナチュラルキラー(NK)細胞、および形質細胞性樹状細胞などの免疫系の多数の細胞によって発現される。TLR9は、細胞内、エンドソーム区画内において発現され、CpGモチーフリッチなDNAへの結合によって免疫系にウイルスおよび細菌感染を警告するように機能する。TLR9シグナルは、炎症促進性反応を開始させる細胞の活性化に繋がり、I型インターフェロンおよびIL-12などのサイトカインの産生をもたらす。
TLRアゴニスト
TLRアゴニストは、1つまたは複数のTLR、例えば、ヒトTLR-1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10のうちの1つまたは複数をアゴナイズすることができる。一部の実施形態では、本明細書に記載の付属的剤はTLRアゴニストである。一部の実施形態では、TLRアゴニストは、ヒトTLR-9を特異的にアゴナイズする。一部の実施形態では、TLR-9アゴニストはCpG部分である。本明細書で使用される場合、CpG部分は、配列:5’-C-ホスフェート-G-3’、すなわち、1つのみのホスフェートによって分離されたシトシンおよびグアニンを有する直鎖状ジヌクレオチドである。
一部の実施形態では、CpG部分は、少なくとも1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個、25個、26個、27個、28個、29個、30個、またはより多くのCpGジヌクレオチドを含む。一部の実施形態では、CpG部分は、1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個、25個、26個、27個、28個、29個、または30個のCpGジヌクレオチドからなる。一部の実施形態では、CpG部分は、1~5個、1~10個、1~20個、1~30個、1~40個、1~50個、5~10個、5~20個、5~30個、10~20個、10~30個、10~40個、または10~50個のCpGジヌクレオチドを有する。
一部の実施形態では、TLR-9アゴニストは合成ODN(オリゴデオキシヌクレオチド)である。CpG ODNは、特定の配列状況(CpGモチーフ)において非メチル化CpGジヌクレオチドを含有する短い合成の一本鎖DNA分子である。CpG ODNは、ゲノム細菌DNA中に見出される天然のホスホジエステル(PO)骨格とは対照的に、部分的または完全にホスホロチオエート化(PS)した骨格を持つ。クラスA、BおよびCというCpG ODNの3つの主要なクラスがあり、これらは免疫賦活活性において異なる。CpG-A ODNは、PO中央CpG含有パリンドロームモチーフおよびPS修飾3’ポリ-Gストリングによって特徴付けられる。それらは、pDCからの高いIFN
-α産生を誘導するが、TLR9依存性NF-κBシグナル伝達および炎症促進性サイトカイン(例えば、IL-6)産生の弱い刺激因子である。CpG-B ODNは、1つまたは複数のCpGジヌクレオチドを有する全長PS骨格を含有する。それらは、B細胞およびTLR9依存性NF-κBシグナル伝達を強く活性化させるが、IFN-α分泌を弱く刺激する。CpG-C ODNは、クラスAおよびBの両方の特徴を兼ね備える。それらは、完全なPS骨格およびCpG含有パリンドロームモチーフを含有する。CクラスCpG ODNは、pDCからの強いIFN-α産生の他に、B細胞刺激を誘導する。
腫瘍標的化部分
本開示は、とりわけ、分子を腫瘍細胞へと指向させる1つまたは複数の腫瘍特異的標的化部分を含む、例えば、それを含むように操作された、多特異性(例えば、二特異性、三特異性、四特異性)分子を提供する。
ある特定の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、腫瘍標的化部分を含む。腫瘍標的化部分は、抗体分子(例えば、本明細書に記載される抗原結合性ドメイン)、受容体もしくは受容体断片、またはリガンドもしくはリガンド断片、またはこれらの組合せから選択され得る。一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、腫瘍細胞(例えば、腫瘍細胞の表面上に存在する分子、例えば、抗原)と会合する、例えば、それに結合する。ある特定の実施形態では、腫瘍標的化部分は、本明細書に開示される多特異性分子を、がん(例えば、がんまたは腫瘍細胞)へと標的化する、例えば、指向させる。一部の実施形態では、がんは、血液がん、固形がん、転移がん、またはこれらの組合せから選択される。
一部の実施形態では、多特異性分子、例えば、腫瘍標的化部分は、固形腫瘍抗原または間質抗原に結合する。固形腫瘍抗原または間質抗原は、固形腫瘍またはその転移病変に存在し得る。一部の実施形態では、固形腫瘍は、膵臓がん(例えば、膵臓腺癌)、乳がん、結腸直腸がん、肺がん(例えば、小細胞もしくは非小細胞肺がん)、皮膚がん、卵巣がん、または肝臓がんのうちの1つまたは複数から選択される。一実施形態では、固形腫瘍は、線維性または線維形成性の固形腫瘍である。例えば、固形腫瘍抗原または間質抗原は、腫瘍に、例えば、限定的な腫瘍灌流、血管の圧縮、または線維性腫瘍間質のうちの1つまたは複数を有することが典型的なクラスの腫瘍に、存在し得る。ある特定の実施形態では、固形腫瘍抗原は、PDL1、CD47、ガングロシド2(GD2)、前立腺幹細胞抗原(PSCA)、前立腺特異的膜抗原(PMSA)、前立腺特異的抗原(PSA)、癌胎児性抗原(CEA)、Ronキナーゼ、c-Met、未成熟ラミニン受容体、TAG-72、BING-4、カルシウム活性化塩素チャネル2、サイクリン-B1、9D7、Ep-CAM、EphA3、Her2/neu、テロメラーゼ、SAP-1、サバイビン、NY-ESO-1/LAGE-1、PRAME、SSX-2、メラン-A/MART-1、Gp100/pmel17、チロシナーゼ、TRP-1/-2、MC1R、β-カテニン、BRCA1/2、CDK4、CML66、フィブロネクチン、p53、Ras、TGF-Β受容体、AFP、ETA、MAGE、MUC-1、CA-125、BAGE、GAGE、NY-ESO-1、β-カテニン、CDK4、CDC27、CD47、αアクチニン-4、TRP1/gp75、TRP2、gp100、メラン-A/MART1、ガングリオシド、WT1、EphA3、上皮成長因子受容体(EGFR)、MART-2、MART-1、MUC1、MUC2、MUM1、MUM2、MUM3、NA88-1、NPM、OA1、OGT、RCC、RUI1、RUI2、SAGE、TRG、TRP1、TSTA、葉酸受容体アルファ、L1-CAM、CAIX、EGFRvIII、gpA33、GD3、GM2、VEGFR、インテグリン(インテグリンアルファVベータ3、インテグリンアルファ5ベータ1)、炭水化物(Le)、IGF1R、EPHA3、TRAILR1、TRAILR2、またはRANKLのうちの1つまたは複数から選択される。
他の実施形態では、多特異性分子、例えば、腫瘍標的化部分は、血液がん、例えば、白血病またはリンパ腫の表面上に存在する分子、例えば、抗原に結合する。一部の実施形態では、血液がんは、B細胞またはT細胞悪性腫瘍である。一部の実施形態では、血液がんは、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫(例えば、B細胞リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、慢性リンパ球性白血病、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯B細胞リンパ腫、バーキットリンパ腫、リンパ形質細胞性リンパ腫、有毛細胞性リンパ腫)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群(MDS)、多発性骨髄腫、または急性リンパ球性白血病のうちの1つまたは複数から選択される。実施形態では、がんは、急性骨髄性白血病(AML)または骨髄異形成症候群(MDS)以外である。実施形態では、血液抗原は、CD47、CD99、CD30、CD38、SLAMF7、またはNY-ESO1から選択される。一部の実施形態では、血液抗原は、BCMA、CD19、CD20、CD22、CD33、CD123、FcRH5、CLEC12、またはCD179Aのうちの1つまたは複数から選択される。
間質改変部分
固形腫瘍は、実質(新生細胞)、および新生細胞により誘導され、新生細胞が分散される、間質という、正常組織のものを模倣した、異なっているが相互依存性の2つのコンパートメントを含む構造を有する。すべての腫瘍は、間質を有し、栄養サポートおよび老廃物の除去のために、間質を必要とする。細胞懸濁液として成長する腫瘍(例えば、白血病、腹水腫瘍)の場合、血漿が、間質としての機能を果たす(Connolly JL et al. Tumor Structure and Tumor Stroma Generation. In: Kufe DW et al., editors. Holland-Frei Cancer Medicine. 6th edition. Hamilton: BC Decker; 2003)。間質には、細胞外マトリックス(ECM)および細胞外分子とともに、線維芽細胞/筋線維芽細胞、膠細胞、上皮細胞、脂肪細胞、血管細胞、平滑筋細胞、および免疫細胞を含む様々な細胞型が含まれる(Li Hanchen et al. Tumor Microenvironment: The Role of the Tumor Stroma in Cancer. J of Cellular Biochemistry 101: 805-815 (2007))。
本明細書に記載される間質改変部分としては、間質の成分、例えば、ECM成分、例えば、グリコサミノグリカン、例えば、ヒアルロナン(ヒアルロン酸もしくはHAとしても知られる)、コンドロイチン硫酸塩、コンドロイチン、デルマタン硫酸塩、ヘパリン硫酸塩、ヘパリン、エンタクチン、テネイシン、アグリカン、およびケラチン硫酸塩、または細胞外タンパク質、例えば、コラーゲン、ラミニン、エラスチン、フィブリノーゲン、フィブロネクチン、およびビトロネクチンを分解することができる部分(例えば、タンパク質、例えば、酵素)が挙げられる。
間質改変酵素
一部の実施形態では、間質改変部分は、酵素である。例えば、間質改変部分としては、ヒアルロニダーゼ、コラゲナーゼ、コンドロイチナーゼ、マトリックスメタロプロテイナーゼ(例えば、マクロファージメタロエラスターゼ)を挙げることができるが、これらに限定されない。
ヒアルロニダーゼ
ヒアルロニダーゼは、動物界全体に見られる中性および酸性活性酵素の群である。ヒアルロニダーゼは、基質特異性、および作用の機序に関して、多様である。ヒアルロニダーゼには3つの一般的なクラスがある:(1)主要な最終生成物として四糖および六糖を有するエンド-ベータ-N-アセチルへキソサミニダーゼである、哺乳動物型ヒアルロニダ
ーゼ(EC 3.2.1.35)。これらは、加水分解活性およびトランスグリコシダーゼ活性の両方を有し、ヒアルロナンおよびコンドロイチン硫酸塩を分解することができ、(2)細菌ヒアルロニダーゼ(EC 4.2.99.1)は、ヒアルロナンを分解し、様々な程度で、コンドロイチン硫酸塩およびデルマタン硫酸塩を分解する。これらは、主として二糖の最終生成物をもたらすベータ脱離反応によって作動するエンド-ベータ-N-アセチルへキソサミニダーゼであり、(3)ヒル、他の寄生虫、および甲殻類に由来するヒアルロニダーゼ(EC 3.2.1.36)は、ベータ1-3連結の加水分解を通じて四糖および六糖の最終生成物をもたらす、エンド-ベータ-グルクロニダーゼである。
哺乳動物ヒアルロニダーゼは、さらに2つの群に分けることができる:(1)中性活性酵素および(2)酸性活性酵素。ヒトゲノムには、HYAL1、HYAL2、HYAL3、HYAL4、HYALP1、およびPH20/SPAM1の6つのヒアルロニダーゼ様遺伝子がある。HYALP1は、偽遺伝子であり、HYAL3は、いずれの公知の基質に対しても酵素活性を有することが示されていない。HYAL4は、コンドロイチナーゼであり、ヒアルロナンに対する活性が欠如している。HYAL1は、原型の酸性活性酵素であり、PH20は、原型の中性活性酵素である。酸性活性ヒアルロニダーゼ、例えば、HYAL1およびHYAL2は、中性pHでは触媒活性が欠如している。例えば、HYAL1は、in vitroにおいて、pH4.5を超えると触媒活性を有さない(Frost and Stern, “A Microtiter-Based Assay for Hyaluronidase Activity Not Requiring Specialized Reagents”, Analytical Biochemistry, vol. 251, pp. 263-269 (1997)。HYAL2は、酸性活性酵素であり、in vitroでの特異性活性は非常に低い。
一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは、哺乳動物ヒアルロニダーゼである。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは、組換えヒトヒアルロニダーゼである。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは、中性活性ヒアルロニダーゼである。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは、中性活性可溶性ヒアルロニダーゼである。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは、組換えPH20中性活性酵素である。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは、組換えPH20中性活性可溶性酵素である。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは、グリコシル化されている。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは、少なくとも1つのN結合型グリカンを有する。組換えヒアルロニダーゼは、当業者に公知の従来的な方法、例えば、米国特許第7767429号におけるものを使用して、産生することができ、このすべての内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは、rHuPH20である(Hylenex(登録商標)とも称され、現在Halozymeによって製造されており、2005年にFDAにより承認されている(例えば、Scodeller P (2014) Hyaluronidase and other Extracellular Matrix
Degrading Enzymes for Cancer Therapy: New Uses and Nano- Formulations. J Carcinog Mutage 5:178、米国特許第7767429号、同第8202517号、同第7431380号、同第8450470号、同第8772246号、同第8580252号を参照されたく、これらのそれぞれのすべての内容は、参照により本明細書に組み込まれる)。rHuPH20は、ヒトヒアルロニダーゼPH20の可溶性断片をコードするDNAプラスミドを含む、遺伝子操作されたCHO細胞によって産生される。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは、グリコシル化されている。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは、少なくとも1つのN結合型グリカンを有する。組換えヒアルロニダーゼは、当業者に公知の従来的な方法、例えば、米国特許第7767429号におけるものを使用して、産生することができ、このすべての内容は、参照により本明細書に組み込ま
れる。一部の実施形態では、rHuPH20は、LNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFCLGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISLQDHLDKAKKDITFYMPVDNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLSLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKKPGYNGSCFNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLPVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYMETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEKGGKFTVRGKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEEPQIFYNASPSTLS(配列番号3306)のアミノ酸配列に対して少なくとも95%(例えば、少なくとも96%、97%、98%、99%、100%)同一の配列を有する。
本明細書において提供される方法のうちのいずれかにおいて、抗ヒアルロナン剤は、ヒアルロナンを分解する薬剤であり得るか、またはヒアルロナンの合成を阻害する薬剤であり得る。例えば、抗ヒアルロナン剤は、ヒアルロナン分解酵素であり得る。別の例では、抗ヒアルロナン剤は、ヒアルロナンの合成を阻害する薬剤である。例えば、抗ヒアルロナン剤は、ヒアルロナンの合成を阻害する薬剤、例えば、HAシンターゼに対するセンスもしくはアンチセンス核酸分子であるか、または小分子薬である。例えば、抗ヒアルロナン剤は、4-メチルウンンベリフェロン(MU)もしくはその誘導体、またはレフルノミドもしくはその誘導体である。そのような誘導体としては、例えば、6,7-ジヒドロキシ-4-メチルクマリンまたは5,7-ジヒドロキシ-4-メチルクマリンである、4-メチルウンベリフェロン(MU)の誘導体が挙げられる。
本明細書において提供される方法のさらなる例では、ヒアルロナン分解酵素は、ヒアルロニダーゼである。一部の例では、ヒアルロナン分解酵素は、PH20ヒアルロニダーゼ、またはC末端グリコシルホスファチジルイノシトール(GPI)結合部位もしくはGPI結合部位の一部分が欠如したその短縮形態である。特定の例では、ヒアルロニダーゼは、ヒト、サル、ウシ、ヒツジ、ラット、マウス、またはモルモットPH20から選択される、PH20である。例えば、ヒアルロナン分解酵素は、中性活性であり、N-グリコシル化されている、ヒトPH20ヒアルロニダーゼであり、これは、(a)全長PH20、またはPH20のC末端短縮形態である、ヒアルロニダーゼポリペプチドであって、短縮形態が、配列番号139の少なくともアミノ酸残基36~464、例えば、36~481、36~482、36~483を含み、全長PH20が、配列番号139に記載されるアミノ酸配列を有する、ヒアルロニダーゼポリペプチド、または(b)配列番号139に記載されるアミノ酸配列のポリペプチドもしくは短縮形態と少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、もしくはそれ以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、ヒアルロニダーゼポリペプチド、または(c)アミノ酸置換を含み、それによって、ヒアルロニダーゼポリペプチドが配列番号139に記載されるポリペプチドもしくはその対応する短縮形態と少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、もしくはそれ以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を有する、(a)もしくは(b)のヒアルロニダーゼポリペプチドから選択される。例示的な例では、ヒアルロナン分解酵素は、rHuPH20と表記される組成物を含む、PH20である。
他の例では、抗ヒアルロナン剤は、ポリマーへのコンジュゲーションによって改変されたヒアルロナン分解酵素である。ポリマーは、PEGであってもよく、抗ヒアルロナン剤
は、PEG化ヒアルロナン分解酵素である。したがって、本明細書において提供される方法の一部の例では、ヒアルロナン分解酵素は、ポリマーへのコンジュゲーションによって改変されている。例えば、ヒアルロナン分解酵素は、PEGにコンジュゲートされており、したがって、ヒアルロナン分解酵素は、PEG化されている。例示的な例では、ヒアルロナン分解酵素は、PEG化PH20酵素(PEGPH20)である。本明細書において提供される方法では、コルチコステロイドは、コルチゾン、デキサメタゾン、ヒドロコルチゾン、メチルプレドニゾロン、プレドニゾロン、およびプレドニゾンの中から選択されるグルココルチコイドであり得る。
コンドロイチナーゼ
コンドロイチナーゼは、エンドグリコシダーゼ反応を通じてグリコサミノグリカン、特に、コンドロイチンおよびコンドロイチン硫酸塩を分解する、動物界全体に見られる酵素である。一部の実施形態では、コンドロイチナーゼは、哺乳動物コンドロイチナーゼである。一部の実施形態では、コンドロイチナーゼは、組換えヒトコンドロイチナーゼである。一部の実施形態では、コンドロイチナーゼは、HYAL4である。他の例示的なコンドロイチナーゼとしては、コンドロイチナーゼABC(プロテウス・ブルガリス由来、日本特許出願公開第6-153947号、T. Yamagata et al. J. Biol. Chem., 243, 1523 (1968)、S. Suzuki et al, J. Biol. Chem., 243, 1543 (1968))、コンドロイチナーゼAC(フラボバクテリウム・ヘパリヌム由来、T. Yamagata et al., J. Biol. Chem., 243, 1523 (1968))、コンドロイチナーゼAC II(アルスロバクター・アウレッセンス由来、K.
Hiyama, and S. Okada, J. Biol. Chem., 250, 1824 (1975)、K. Hiyama and S. Okada, J. Biochem. (Tokyo), 80, 1201 (1976))、ヒアルロニダーゼACIII(フラボバクテリウム種Hp102由来、Hirofumi Miyazono et al., Seikagaku, 61, 1023 (1989))、コンドロイチナーゼB(フラボバクテリウム・ヘパリヌム由来、Y. M. Michelacci and C. P. Dietrich, Biochem. Biophys. Res. Commun., 56, 973 (1974)、Y. M. Michelacci and C. P. Dietrich, Biochem. J., 151, 121 (1975)、Kenichi Maeyama et al, Seikagaku, 57, 1189 (1985))、コンドロイチナーゼC(フラボバクテリウム種Hp102由来、Hirofumi Miyazono
et al, Seikagaku, 61, 1023 (1939))などが挙げられる。
マトリックスメタロプロテイナーゼ
マトリックスメタロプロテアーゼ(MMP)は、細胞外マトリックス(ECM)分解に関与する主要なプロテアーゼである亜鉛依存性エンドペプチダーゼである。MMPは、広範な細胞外分子およびいくつかの生体活性分子を分解することができる。ヒトにおいて、24個のMMP遺伝子が特定されており、これらは、ドメイン構成および基質優先性に基づいて、6つの群に分類される:コラゲナーゼ(MMP-1、-8、および-13)、ゼラチナーゼ(MMP-2およびMMP-9)、ストロメライシン(MMP-3、-10、および-11)、マトリライシン(MMP-7およびMMP-26)、膜型(MT)-MMP(MMP-14、-15、-16、-17、-24、および-25)、ならびにその他(MMP-12、-19、-20、-21、-23、-27、および-28)。一部の実施形態では、間質改変部分は、ヒト組換えMMP(例えば、MMP-1、-2、-3、-4、-5、-6、-7、-8、-9、10、-11、-12、-13、-14、15、-15、-17、-18、-19、20、-21、-22、-23、または-24)であ
る。
コラゲナーゼ
3つの哺乳動物コラゲナーゼ(MMP-1、-8、および-13)は、コラーゲン性細胞外マトリックスを切断することができる主要な分泌型エンドペプチダーゼである。線維性コラーゲンに加えて、コラゲナーゼは、成長因子を含む複数の他のマトリックスおよび非マトリックスタンパク質を切断することができる。コラゲナーゼは、不活性な代替形態として合成され、一旦活性化されると、それらの活性は、特異的組織メタロプロテイナーゼ阻害剤、TIMPによって、ならびに非特異的プロテイナーゼ阻害剤によって阻害される(Ala-aho R et al. Biochimie. Collagenases in cancer. 2005 Mar-Apr;87(3-4):273-86)。一部の実施形態では、間質改変部分は、コラゲナーゼである。一部の実施形態では、コラゲナーゼは、ヒト組換えコラゲナーゼである。一部の実施形態では、コラゲナーゼは、MMP-1である。一部の実施形態では、コラゲナーゼは、MMP-8である。一部の実施形態では、コラゲナーゼは、MMP-13である。
マクロファージメタロエラスターゼ
MMP-12としても知られるマクロファージメタロエラスターゼ(MME)は、MMPのストロメライシンサブグループのメンバーであり、可溶性および不溶性エラスチン、ならびにIV型コラーゲン、フィブロネクチン、ラミニン、ビトロネクチン、エンタクチン、ヘパラン、およびコンドロイチン硫酸塩を含む広範なマトリックスおよび非マトリックス基質の加水分解を触媒する(Erja Kerkela et al. Journal of Investigative Dermatology (2000) 114, 1113-1119; doi:10.1046/j.1523-1747.2000.00993)。一部の実施形態では、間質改変部分は、MMEである。一部の実施形態では、MMEは、ヒト組換えMMEである。一部の実施形態では、MMEは、MMP-12である。
さらなる間質改変部分
一部の実施形態では、間質改変部分は、間質もしくは細胞外マトリックス(ECM)成分のレベルもしくは産生の減少、腫瘍線維形成の減少、間質腫瘍輸送の増加、腫瘍灌流の改善、腫瘍微小血管の拡大、腫瘍における間質液圧(IFP)の減少、または薬剤、例えば、がん治療薬もしくは細胞療法の、腫瘍もしくは腫瘍血管への浸透もしくは拡散の減少もしくは増強のうちの1つまたは複数を引き起こす。
一部の実施形態では、減少される間質またはECM成分は、グリコサミノグリカンもしくは細胞外タンパク質、またはそれらの組合せから選択される。一部の実施形態では、グリコサミノグリカンは、ヒアルロナン(ヒアルロン酸もしくはHAとしても知られる)、コンドロイチン硫酸塩、コンドロイチン、デルマタン硫酸塩、ヘパリン、ヘパリン硫酸塩、エンタクチン、テネイシン、アグリカン、およびケラチン硫酸塩から選択される。一部の実施形態では、細胞外タンパク質は、コラーゲン、ラミニン、エラスチン、フィブリノーゲン、フィブロネクチン、またはビトロネクチンから選択される。一部の実施形態では、間質改変部分は、腫瘍間質または細胞外マトリックス(ECM)を分解する酵素分子を含む。一部の実施形態では、酵素分子は、ヒアルロニダーゼ分子、コラゲナーゼ分子、コンドロイチナーゼ分子、マトリックスメタロプロテイナーゼ分子(例えば、マクロファージメタロエラスターゼ)、または前述のもののいずれかのバリアント(例えば、断片)から選択される。「酵素分子」という用語には、酵素の全長、その断片、またはバリアント、例えば、天然に存在する酵素の少なくとも1つの機能的特性を保持する酵素バリアントが含まれる。
一部の実施形態では、間質改変部分は、ヒアルロン酸のレベルまたは産生を減少させる。他の実施形態では、間質改変部分は、ヒアルロナン分解酵素、ヒアルロナン合成を阻害する薬剤、またはヒアルロン酸に対する抗体分子を含む。
一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素は、ヒアルロニダーゼ分子、例えば、全長またはそのバリアント(例えば、その断片)である。一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素は、中性または酸性のpH、例えば、約4~5のpHにおいて活性である。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、哺乳動物ヒアルロニダーゼ分子、例えば、組換えヒトヒアルロニダーゼ分子、例えば、全長またはそのバリアント(例えば、その断片、例えば、短縮形態)である。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、HYAL1、HYAL2、もしくはPH-20/SPAM1、またはそのバリアント(例えば、その短縮形態)から選択される。一部の実施形態では、短縮形態は、C末端グリコシルホスファチジルイノシトール(GPI)結合部位またはGPI結合部位の一部分が欠如している。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、グリコシル化されている、例えば、少なくとも1つのN結合型グリカンを含む。
一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、LNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFCLGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISLQDHLDKAKKDITFYMPVDNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLSLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKKPGYNGSCFNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLPVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYMETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEKGGKFTVRGKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEEPQIFYNASPSTLS(配列番号3311)のアミノ酸配列、もしくはその断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号3311のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個、もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、
(i)配列番号3311の36~464のアミノ酸配列、
(ii)PH20の36~481、36~482、もしくは36~483のアミノ酸配列、ここで、PH20は、配列番号3311に記載されるアミノ酸配列を有する、
(iii)配列番号3311に記載されるアミノ酸配列のポリペプチドもしくはその短縮形態に対して少なくとも95%~100%の配列同一性を有するアミノ酸配列、または
(iv)配列番号3311に記載されるアミノ酸配列に対して30個、20個、10個、5つ、もしくはそれよりも少ないアミノ酸置換を有するアミノ酸配列
を含む。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、配列番号3311のアミノ酸配列に対して少なくとも95%(例えば、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、100%)同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、配列番号3311のヌクレオチド配列に対して少なくとも95%(例えば、少なくとも96%、97%、98%、99%、100%)同一のヌクレオチド配列によってコードされる。
一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、PH20、例えば、rHuPH20で
ある。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、HYAL1であり、アミノ酸配列:
FRGPLLPNRPFTTVWNANTQWCLERHGVDVDVSVFDVVANPGQTFRGPDMTIFYSSQGTYPYYTPTGEPVFGGLPQNASLIAHLARTFQDILAAIPAPDFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRALVQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQGAARAWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLSPNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVAVAAGDPNLPVLPYVQIFYDTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESCQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPLSLRGALSLEDQAQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW(配列番号3312)もしくはその断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号3312のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個、もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素、例えば、ヒアルロニダーゼ分子は、ポリマーをさらに含み、例えば、ポリマー、例えば、PEGにコンジュゲートされている。一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素は、PEG化PH20酵素(PEGPH20)である。一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素、例えば、ヒアルロニダーゼ分子は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4の重鎖定常領域、より具体的には、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4の重鎖定常領域から選択される、免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)をさらに含む。一部の実施形態では、免疫グロブリン定常領域(例えば、Fc領域)は、ヒアルロナン分解酵素、例えば、ヒアルロニダーゼ分子に連結、例えば、共有結合的に連結されている。一部の実施形態では、免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)は、Fc受容体の結合、抗体のグリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞の機能、または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるように、変更、例えば、突然変異されている。一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素、例えば、ヒアルロニダーゼ分子は、二量体を形成する。
一部の実施形態では、間質改変部分は、ヒアルロナンの合成、例えば、HAシンターゼの阻害剤を含む。一部の実施形態では、阻害剤は、HAシンターゼに対するセンスもしくはアンチセンス核酸分子を含むか、または小分子薬である。一部の実施形態では、阻害剤は、4-メチルウンベリフェロン(MU)もしくはその誘導体(例えば、6,7-ジヒドロキシ-4-メチルクマリンもしくは5,7-ジヒドロキシ-4-メチルクマリン)、またはレフルノミドもしくはその誘導体である。
一部の実施形態では、間質改変部分は、ヒアルロン酸に対する抗体分子を含む。
一部の実施形態では、間質改変部分は、コラゲナーゼ分子、例えば、哺乳動物コラゲナーゼ分子、またはそのバリアント(例えば、断片)を含む。一部の実施形態では、コラゲナーゼ分子は、例えば、
YNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGEADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTVGGNSEGAPC
VFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDIDLGTGPTPTLGPVTPEICKQDIVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPRDKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFFAGNEYWIYSASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEVKKKMDPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLKSVKFGSIKSDWLGC(配列番号3313)のアミノ酸配列、もしくはその断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号3313のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個、もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む、コラゲナーゼ分子IVである。
リンカー
本明細書に開示される多特異性または多機能性分子は、リンカー、例えば、抗原結合性ドメインとサイトカイン分子との間、抗原結合性ドメインと免疫細胞エンゲージャーとの間、抗原結合性ドメインと間質改変部分との間、サイトカイン分子と免疫細胞エンゲージャーとの間、サイトカイン分子と間質改変部分との間、免疫細胞エンゲージャーと間質改変部分との間、抗原結合性ドメインと免疫グロブリン鎖定常領域との間、サイトカイン分子と免疫グロブリン鎖定常領域との間、免疫細胞エンゲージャーと免疫グロブリン鎖定常領域との間、または間質改変部分と免疫グロブリン鎖定常領域との間のうちの1つまたは複数におけるリンカーをさらに含み得る。実施形態では、リンカーは、切断性リンカー、非切断性リンカー、ペプチドリンカー、可撓性リンカー、剛性リンカー、ヘリックスリンカー、もしくは非ヘリックスリンカー、またはこれらの組合せから選択される。
一実施形態では、多特異性分子は、1つ、2つ、3つ、または4つのリンカー、例えば、ペプチドリンカーを含み得る。一実施形態では、ペプチドリンカーは、GlyおよびSerを含む。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、GGGGS(配列番号3307);GGGGSGGGGS(配列番号3308);GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号3309);およびDVPSGPGGGGGSGGGGS(配列番号3310)から選択される。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、A(EAAAK)nA(配列番号3437)ファミリーのリンカー(例えば、Protein Eng. (2001) 14 (8): 529-532に記載される)である。これらは、nが2~5の範囲である剛直なヘリックスリンカーである。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、AEAAAKEAAAKAAA(配列番号3314);AEAAAKEAAAKEAAAKAAA(配列番号3315);AEAAAKEAAAKEAAAKEAAAKAAA(配列番号3316);およびAEAAAKEAAAKEAAAKEAAAKEAAAKAAA(配列番号3317)から選択される。
核酸
前述の抗体分子、例えば、抗TCRβV抗体分子、多特異性または多機能性分子をコードする核酸もまた、開示される。
ある特定の実施形態では、本発明は、本明細書に記載される抗体分子の重鎖および軽鎖可変領域およびCDRまたは超可変ループをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を特徴とする。例えば、本発明は、本明細書に開示される抗体分子のうちの1つまたは複数から選択される抗体分子の、重鎖および軽鎖可変領域をそれぞれコードする、第1および第2の核酸を特徴とする。核酸は、本明細書の表に記載されるヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、9
5%、99%、もしくはそれ以上同一であるか、または3個、6個、15個、30個、もしくは45個以下のヌクレオチドが、本明細書の表に示される配列と異なる配列を含む。
ある特定の実施形態では、核酸は、本明細書の表に記載されるアミノ酸配列を有する重鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDRもしくは超可変ループをコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に相同である配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一である、かつ/または1つもしくは複数の置換、例えば、保存的置換を有する配列)を含み得る。他の実施形態では、核酸は、本明細書の表に記載されるアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDRもしくは超可変ループをコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に相同である配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一である、かつ/または1つもしくは複数の置換、例えば、保存的置換を有する配列)を含み得る。なおも別の実施形態では、核酸は、本明細書の表に記載されるアミノ酸配列を有する重鎖および軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRもしくは超可変ループをコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に相同である配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一である、かつ/または1つもしくは複数の置換、例えば、保存的置換を有する配列)を含み得る。
ある特定の実施形態では、核酸は、本明細書の表に記載されるヌクレオチド配列を有する重鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDRもしくは超可変ループをコードするヌクレオチド配列、それに対して実質的に相同である配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一である、かつ/または本明細書に記載されるストリンジェンシー条件下においてハイブリダイズすることができる配列)を含み得る。別の実施形態では、核酸は、本明細書の表に記載されるヌクレオチド配列を有する軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDRもしくは超可変ループをコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に相同である配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一である、かつ/または本明細書に記載されるストリンジェンシー条件下においてハイブリダイズすることができる配列)を含み得る。なおも別の実施形態では、核酸は、本明細書の表に記載されるヌクレオチド配列を有する重鎖および軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRもしくは超可変ループをコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に相同である配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一である、かつ/または本明細書に記載されるストリンジェンシー条件下においてハイブリダイズすることができる配列)を含み得る。
ある特定の実施形態では、核酸は、本明細書に開示されるサイトカイン分子、免疫細胞エンゲージャー、または間質改変部分をコードするヌクレオチド配列を含み得る。
別の態様では、本出願は、本明細書に記載される核酸を含む宿主細胞およびベクターを特徴とする。核酸は、本明細書において以下により詳細に記載されるように、同じ宿主細胞または別個の宿主細胞に存在する単一のベクターまたは別個のベクターに存在し得る。
ベクター
さらに、本明細書に記載される抗体分子、例えば、抗TCRβV抗体分子、または多特異性もしくは多機能性分子をコードするヌクレオチド配列を含むベクターが本明細書で提供される。一実施形態では、ベクターは、本明細書に記載される抗体分子、例えば、抗TCRβV抗体分子、または多特異性もしくは多機能性分子をコードする核酸配列を含む。一実施形態では、ベクターは、本明細書に記載されるヌクレオチド配列を含む。ベクター
としては、ウイルス、プラスミド、コスミド、ラムダファージ、または酵母人工染色体(YAC)が挙げられるが、これらに限定されない。
多数のベクター系を用いることができる。例えば、1つのクラスのベクターは、動物ウイルス、例えば、ウシパピローマウイルス、ポリオーマウイルス、アデノウイルス、ワクシニアウイルス、バキュロウイルス、レトロウイルス(ラウス肉腫ウイルス、MMTV、もしくはMOMLV)、またはSV40ウイルスなどに由来するDNAエレメントを利用する。別のクラスのベクターは、RNAウイルス、例えば、セムリキ森林ウイルス、東部ウマ脳炎ウイルス、およびフラビウイルスに由来するRNAエレメントを利用する。
加えて、DNAが染色体に安定に組み込まれた細胞を、トランスフェクトされた宿主細胞の選択を可能にする1つまたは複数のマーカーを導入することによって、選択することができる。マーカーは、例えば、栄養要求性宿主に対するプロトトロピー、殺生物剤耐性(例えば、抗生物質)、または重金属、例えば、銅に対する耐性などを提供し得る。選択可能なマーカー遺伝子は、発現させようとするDNA配列に直接的に連結させるか、または共形質転換によって同じ細胞に導入するかのいずれかを行うことができる。最適なmRNAの合成には、追加のエレメントも必要とされ得る。これらのエレメントとしては、スプライスシグナル、ならびに転写プロモーター、エンハンサー、および終結シグナルを挙げることができる。
構築物を含む発現ベクターまたはDNA配列を、発現のために調製した後、発現ベクターを、適切な宿主細胞にトランスフェクトまたは導入することができる。例えば、プロトプラスト融合、リン酸カルシウム沈降、エレクトロポレーション、レトロウイルス形質導入、ウイルストランスフェクション、遺伝子銃、脂質に基づくトランスフェクション、または他の従来的な技法など、様々な技法を用いてこれを達成することができる。プロトプラスト融合の場合、細胞を、培地において成長させ、適切な活性に関してスクリーニングする。
結果として得られたトランスフェクトした細胞の培養、および産生される抗体分子の回収のための方法および条件は、当業者に公知であり、本明細書に基づいて、用いられる具体的な発現ベクターおよび哺乳動物宿主細胞に応じて変更または最適化することができる。
細胞
別の態様では、本出願は、本明細書に記載される核酸を含む宿主細胞およびベクターを特徴とする。核酸は、同じ宿主細胞または別個の宿主細胞に存在する単一のベクターまたは別個のベクターに存在し得る。宿主細胞は、真核生物細胞、例えば、哺乳動物細胞、昆虫細胞、酵母細胞、または原核生物細胞、例えば、大腸菌であってもよい。例えば、哺乳動物細胞は、培養した細胞または細胞系であり得る。例示的な哺乳動物細胞としては、リンパ球細胞系(例えば、NSO)、チャイニーズハムスター卵巣細胞(CHO)、COS細胞、卵母細胞、およびトランスジェニック動物に由来する細胞、例えば、乳腺上皮細胞が挙げられる。
本発明はまた、本明細書に記載される抗体分子をコードする核酸を含む宿主細胞も提供する。
一実施形態では、宿主細胞は、抗体分子をコードする核酸を含むように遺伝子操作されている。
一実施形態では、宿主細胞は、発現カセットを使用することによって遺伝子操作されている。「発現カセット」という語句は、ヌクレオチド配列を指し、そのような配列と適合
性のある宿主における遺伝子の発現を達成することができる。そのようなカセットとしては、プロモーター、イントロンありまたはなしのオープンリーディングフレーム、終結シグナルを挙げることができる。例えば、誘導性プロモーターなど、発現を達成するのに必要であるかまたは役に立つ追加の因子もまた、使用することができる。
本発明はまた、本明細書に記載されるベクターを含む宿主細胞も提供する。
細胞は、真核生物細胞、細菌細胞、昆虫細胞、またはヒト細胞であり得るが、これらに限定されない。好適な真核生物細胞としては、Vero細胞、HeLa細胞、COS細胞、CHO細胞、HEK293細胞、BHK細胞、およびMDCKII細胞が挙げられるが、これらに限定されない。好適な昆虫細胞としては、Sf9細胞が挙げられるが、これに限定されない。
抗TCRVB抗体を用いて細胞を拡大させる方法
本明細書に記載される組成物および方法のうちのいずれかを使用して、免疫細胞集団を拡大させることができる。本明細書において提供される免疫細胞としては、造血幹細胞に由来する免疫細胞、または非造血幹細胞に由来する、例えば、分化もしくは脱分化による免疫細胞が挙げられる。
免疫細胞には、造血幹細胞、その子孫、および/または前記HSCから分化した細胞、例えば、リンパ系細胞もしくは骨髄性細胞が含まれる。免疫細胞は、適応免疫細胞であってもよく、先天免疫細胞であってもよい。免疫細胞の例としては、T細胞、B細胞、ナチュラルキラー細胞、ナチュラルキラーT細胞、好中球、樹状細胞、単球、マクロファージ、および顆粒球が挙げられる。
本明細書に開示される方法または組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、免疫細胞は、T細胞である。一部の実施形態では、T細胞は、CD4+ T細胞、CD8+ T細胞、TCRアルファ-ベータT細胞、TCRガンマ-デルタT細胞を含む。一部の実施形態では、T細胞は、メモリーT細胞(例えば、セントラルメモリーT細胞、もしくはエフェクターメモリーT細胞(例えば、TEMRA)、またはエフェクターT細胞を含む。一部の実施形態では、T細胞は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を含む。
本明細書に開示される方法または組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、免疫細胞は、NK細胞である。
本明細書に開示される方法または組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、免疫細胞は、TILである。TILは、腫瘍内または腫瘍の周辺(例えば、腫瘍の間質または腫瘍微小環境)、例えば、固形腫瘍、例えば、本明細書に記載されるものにおいて見出すことができる、免疫細胞(例えば、T細胞、B細胞、またはNK細胞)である。TILは、がんを有する対象由来の試料、例えば、生検または外科手術試料から得ることができる。一部の実施形態では、TILは、本明細書に開示される方法を使用して拡大させることができる。一部の実施形態では、拡大させた、例えば、本明細書に開示される方法を使用して拡大させたTILの集団は、疾患、例えば、がんを処置するために、対象に投与することができる。
本開示のある特定の態様において、免疫細胞、例えば、T細胞(例えば、TIL)は、Ficoll(商標)分離など、当業者に公知の任意の多数の技法を使用して、対象から採取された血液単位から得ることができる。一態様では、個体の循環血液由来の細胞は、アフェレーシスによって得られる。アフェレーシス産物は、典型的に、リンパ球、例えば、T細胞、単球、顆粒球、B細胞、他の有核白血球、赤血球、および血小板を含有する。一態様では、アフェレーシスによって採取された細胞を洗浄して、血漿画分を除去してもよく、必要に応じて、細胞を、後続の処理ステップに適した緩衝液または培地に入れても
よい。一実施形態では、細胞は、リン酸緩衝食塩水(PBS)で洗浄される。代替的な実施形態では、洗浄溶液は、カルシウムを含まず、かつマグネシウム不含であり得るか、またはすべてではないものの多くの二価カチオン不含であり得る。本明細書に記載される方法は、1つを上回る選択ステップ、例えば、1つを上回る枯渇ステップを含み得る。
一実施形態では、本出願の方法は、DMEM、DMEM F12、RPMI 1640、および/またはAIM V培地を含む培養培地条件を利用し得る。培地は、グルタミン、HEPES緩衝液(例えば、10mM)、血清(例えば、熱不活性化血清、例えば、10%)、および/またはベータメルカプトエタノール(例えば、55uM)が補充されていてもよい。一部の実施形態では、本明細書に開示される培養条件は、1つまたは複数の補充物質、サイトカイン、成長因子、またはホルモンを含む。一部の実施形態では、培養条件は、IL-2、IL-15、もしくはIL-7、またはこれらの組合せのうちの1つまたは複数を含む。
免疫エフェクター細胞、例えば、T細胞は、概して、例えば、米国特許第6,352,694号、同第6,534,055号、または同第6,905,680号に記載される方法を使用して、活性化および拡大させることができる。一般に、免疫細胞集団は、CD3/TCR複合体関連シグナルを刺激する薬剤およびT細胞の表面上の共刺激分子を刺激するリガンドとの接触によって、ならびに/またはサイトカイン、例えば、IL-2、IL-15、もしくはIL-7との接触によって、拡大させることができる。T細胞拡大プロトコールには、例えば、表面上に固定化された抗CD3抗体もしくはその抗原結合性断片、または抗CD2抗体との接触による、またはカルシウムイオノフォアと併せてタンパク質キナーゼC活性化因子(例えば、ブリオスタチン)との接触による、刺激も含まれ得る。例えば、T細胞の集団を、T細胞の増殖を刺激するのに適した条件下において、抗CD3抗体および抗CD28抗体と接触させてもよい。CD4+ T細胞またはCD8+ T細胞のいずれかの増殖を刺激するために、抗CD3抗体および抗CD28抗体が使用され得る。抗CD28抗体の例としては、9.3、B-T3、XR-CD28(Diaclone、Besancon、France)が挙げられ、当該技術分野において一般に公知の他の方法と同様に使用することができる(Berg et al., Transplant Proc. 30(8):3975-3977, 1998、Haanen et al., J. Exp. Med. 190(9):13191328, 1999、Garland et al., J. Immunol Meth. 227(1-2):53-63, 1999)。
TIL集団はまた、当該技術分野において公知の方法によって拡大させることができる。例えば、TIL集団は、Hall et al., Journal for ImmunoTherapy of Cancer (2016) 4:61に記載されるように拡大させることができ、このすべての内容は、参照により本明細書に組み込まれる。簡単に述べると、TILを、機械的および/または物理的消化によって試料から単離することができる。結果として得られたTIL集団を、非分裂フィーダー細胞の存在下において、抗CD3抗体で刺激することができる。一部の実施形態では、TIL集団は、IL-2、例えば、ヒトIL-2の存在下において、培養することができる、例えば、拡大させることができる。一部の実施形態では、TIL細胞は、少なくとも1~21日間、例えば、少なくとも1日間、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、14日間、15日間、16日間、17日間、18日間、19日間、20日間、または21日間の期間、培養することができる、例えば、拡大させることができる。
本明細書に開示されるように、一部の実施形態では、免疫細胞集団(例えば、T細胞(例えば、TEMRA細胞またはTIL集団)は、免疫細胞集団を、例えば、本明細書に記
載される抗TCRVB抗体と接触させることによって、拡大させることができる。
一部の実施形態では、拡大は、in vivoで、例えば、対象において生じる。一部の実施形態では、対象に、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子が投与され、その結果、in vivoで免疫細胞の拡大が生じる。
一部の実施形態では、拡大は、ex vivo、例えば、in vitroで生じる。一部の実施形態では、対象由来の細胞、例えば、T細胞、例えば、TIL細胞を、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子を用いて、in vitroで拡大させる。一部の実施形態では、拡大させたTILは、疾患または疾患の症状を処置するために、対象に投与される。
一部の実施形態では、本明細書に開示される拡大の方法は、少なくとも1.1~10倍の拡大、10~20倍、または20~50倍の拡大をもたらす。一部の実施形態では、拡大は、少なくとも1.1倍、1.2倍、1.3倍、1.4倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、15倍、20倍、25倍、30倍、35倍、40倍、45倍、または50倍の拡大である。
一部の実施形態では、本明細書に開示される拡大の方法は、細胞を、少なくとも4時間、6時間、10時間、12時間、15時間、18時間、20時間、または22時間、培養する、例えば、拡大させるステップを含む。一部の実施形態では、本明細書に開示される拡大の方法は、細胞を、少なくとも1日間、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、14日間、15日間、1,6日間 17日間、18日間、19日間、20日間、または21日間、培養する、例えば、拡大させるステップを含む。一部の実施形態では、本明細書に開示される拡大の方法は、細胞を、少なくとも約1週間、2週間、3週間、4週間、5週間、6週間、7週間、または8週間、培養する、例えば、拡大させるステップを含む。
一部の実施形態では、本明細書に開示される拡大の方法は、健常対象から得られた免疫細胞に行われる。
一部の実施形態では、本明細書に開示される拡大の方法は、疾患、例えば、がん、例えば、本明細書に開示される固形腫瘍を有する対象から得られた免疫細胞(例えば、TIL)に行われる。
一部の実施形態では、本明細書に開示される拡大の方法は、細胞集団を、免疫細胞の拡大を促進する、例えば、増加させる薬剤と接触させるステップをさらに含む。一部の実施形態では、この薬剤は、免疫チェックポイント阻害剤、例えば、PD-1阻害剤、LAG-3阻害剤、CTLA4阻害剤、またはTIM-3阻害剤を含む。一部の実施形態では、この薬剤は、4-1BBアゴニスト、例えば、抗4-1BB抗体を含む。
理論に拘泥するものではないが、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、T細胞受容体(TCR) アルファおよび/またはTCRベータ分子を含むTCRを発現するT細胞、例えば、TCRアルファ-ベータT細胞(αβ T細胞)を拡大させる、例えば、選択的または優先的に拡大させることができると考えられる。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRガンマおよび/またはTCRデルタ分子を含むTCRを発現するT細胞、例えば、TCRガンマ-デルタT細胞(γδ T細胞)を拡大させることも、その増殖を誘導することもない。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、γδ T細胞よりも、αβ T細胞を選択的または優先的に拡大させる。
理論に拘泥するものではないが、一部の実施形態では、γδ T細胞は、サイトカイン放出症候群(CRS)および/または神経毒性(NT)と関係していると考えられる。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、非γδ T細胞の選択的な拡大、例えば、αβ T細胞の拡大をもたらし、したがって、CRSおよび/またはNTを低減させる。
一部の実施形態では、本明細書に開示される組成物または方法のうちのいずれかは、γδ T細胞の低減、例えば、枯渇を有する免疫細胞集団をもたらす。一部の実施形態では、免疫細胞集団を、γδ T細胞を低減させる、例えば、阻害もしくは枯渇させる薬剤、例えば、抗IL-17抗体、またはTCRガンマおよび/もしくはTCRデルタ分子に結合する薬剤と接触させる。
使用および組合せ治療
本明細書に記載される方法は、本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、多特異性または多機能性分子を使用して、例えば、本明細書に記載される医薬組成物を使用して、対象におけるがんを処置するステップを含む。また、対象におけるがんの症状を低減または改善する方法、ならびにがんの成長を阻害するおよび/または1つもしくは複数のがん細胞を殺滅させる方法が、提供される。実施形態では、本明細書に記載される方法は、本明細書に記載されるものまたは本明細書に記載される医薬組成物が投与された対象において、腫瘍のサイズを減少させ、かつ/またはがん細胞の数を減少させる。
実施形態では、がんは、血液がんである。実施形態では、血液がんは、白血病またはリンパ腫である。本明細書で使用される場合、「血液がん」は、造血系またはリンパ系組織の腫瘍、例えば、血液、骨髄、またはリンパ節に罹患する腫瘍を指す。例示的な血液悪性腫瘍としては、白血病(例えば、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性リンパ球性白血病(CLL)、慢性骨髄性白血病(CML)、有毛細胞性白血病、急性単球性白血病(AMoL)、慢性骨髄単球性白血病(CMML)、若年性骨髄単球性白血病(JMML)、もしくは大顆粒リンパ球性白血病)、リンパ腫(例えば、AIDS関連リンパ腫、皮膚T細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫(例えば、古典的なホジキンリンパ腫もしくは結節性リンパ球優位型ホジキンリンパ腫)、菌状息肉腫、非ホジキンリンパ腫(例えば、B細胞非ホジキンリンパ腫(例えば、バーキットリンパ腫、小リンパ球性リンパ腫(CLL/SLL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、免疫芽球性大細胞型リンパ腫、前駆Bリンパ芽球性リンパ腫、もしくはマントル細胞リンパ腫)、またはT細胞非ホジキンリンパ腫(菌状息肉腫、未分化大細胞リンパ腫、もしくは前駆Tリンパ芽球性リンパ腫))、原発性中枢神経系リンパ腫、セザリー症候群、ワルデンシュトレーム型マクログロブリン血症)、慢性骨髄増殖性新生物、ランゲルハンス細胞組織球症、多発性骨髄腫/形質細胞新生物、骨髄異形成症候群、または骨髄異形成性/骨髄増殖性新生物が挙げられるが、これらに限定されない。
実施形態では、がんは、骨髄増殖性新生物、例えば、原発性もしくは特発性骨髄線維症(MF)、本態性血小板増加症(ET)、真性赤血球増加症(PV)、または慢性骨髄性白血病(CML)である。実施形態では、がんは、骨髄線維症である。実施形態では、対象は、骨髄線維症を有する。実施形態では、対象は、カルレティキュリン突然変異、例えば、本明細書に開示されるカルレティキュリン突然変異を有する。実施形態では、対象は、JAK2-V617F突然変異を有さない。実施形態では、対象は、JAK2-V617F突然変異を有する。実施形態では、対象は、MPL突然変異を有する。実施形態では、対象は、MPL突然変異を有さない。
実施形態では、がんは、固形がんである。例示的な固形がんとしては、卵巣がん、直腸がん、胃がん、精巣がん、肛門領域のがん、子宮がん、結腸がん、直腸がん、腎細胞癌、
肝臓がん、肺の非小細胞癌、小腸のがん、食道のがん、黒色腫、カポジ肉腫、内分泌系のがん、甲状腺のがん、副甲状腺のがん、副腎のがん、骨がん、膵臓がん、皮膚がん、頭頸部のがん、皮膚もしくは眼球の悪性黒色腫、子宮がん、脳幹神経膠腫、下垂体腺腫、類表皮がん、子宮頸の癌 扁平上皮細胞がん、卵管の癌、子宮内膜の癌、膣の癌、軟部組織の肉腫、尿道のがん、外陰部の癌、陰茎のがん、膀胱のがん、腎臓もしくは尿管のがん、腎盂の癌、脊髄軸腫瘍、中枢神経系(CNS)の新生物、原発性CNSリンパ腫、腫瘍血管新生、前記がんの転移病変、またはこれらの組合せが挙げられるが、これらに限定されない。
一部の実施形態では、がんは、急性リンパ芽球性白血病、急性リンパ球性白血病、急性骨髄性白血病、再生不良性貧血、慢性骨髄性白血病、線維形成性小円形細胞性腫瘍、ユーイング肉腫、ホジキン病、多発性骨髄腫、脊髄形成異常症、非ホジキンリンパ腫、発作性夜間ヘモグロビン尿症、放射線中毒、慢性リンパ球性白血病、ALアミロイドーシス、本態性血小板増加症、真性多血症、重症再生不良性貧血、神経芽腫、乳房腫瘍、卵巣腫瘍、腎細胞癌、自己免疫障害、例えば全身性硬化症、大理石骨病、遺伝性代謝障害、若年性慢性関節炎、副腎白質ジストロフィー、無巨核球性血小板減少症、鎌状赤血球疾患、重症先天性免疫不全、グリッセリ症候群II型、ハーラー症候群、コストマン症候群、クラッベ病、異染性白質ジストロフィー、サラセミア、血球貪食性リンパ組織球増多症、およびウィスコット-オルドリッチ症候群、白血病、リンパ腫、黒色腫、神経内分泌腫瘍、癌腫および肉腫である。本明細書において提供される化合物、医薬組成物、または方法を用いて処置され得る例示的ながんとしては、リンパ腫、肉腫、膀胱がん、骨がん、脳腫瘍、子宮頸がん、結腸がん、食道がん、胃がん、頭頸部がん、腎臓がん、骨髄腫、甲状腺がん、白血病、前立腺がん、乳がん(例えばトリプルネガティブ、ER陽性、ER陰性、化学療法抵抗性、ハーセプチン抵抗性、HER2陽性、ドキソルビシン抵抗性、タモキシフェン抵抗性、腺管癌、小葉癌、原発性、転移性)、卵巣がん、膵臓がん、肝臓がん(例えば、肝細胞癌)、肺がん(例えば非小細胞肺癌、扁平細胞肺癌、腺癌、大細胞肺癌、小細胞肺癌、カルチノイド、肉腫)、多形膠芽腫、神経膠腫、黒色腫、前立腺がん、去勢抵抗性前立腺がん、乳がん、トリプルネガティブ乳がん、膠芽腫、卵巣がん、肺がん、扁平細胞癌(例えば、頭、頸部、もしくは食道)、結腸直腸がん、白血病、急性骨髄性白血病、リンパ腫、B細胞リンパ腫、または多発性骨髄腫が挙げられる。追加の例としては、甲状腺がん、内分泌系がん、脳がん、乳がん、子宮頸がん、結腸がん、頭頸部がん、食道がん、肝臓がん、腎臓がん、肺がん、非小細胞肺がん、黒色腫、中皮腫、卵巣がん、肉腫、胃がん、子宮がんまたは髄芽腫、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫、多発性骨髄腫、神経芽腫、神経膠腫、多形膠芽腫、卵巣がん、横紋筋肉腫、原発性血小板増加症、原発性マクログロブリン血症、原発性脳腫瘍、がん、悪性膵臓インスリノーマ、悪性カルチノイド、膀胱がん、前悪性皮膚病変、精巣がん、リンパ腫、甲状腺がん、神経芽腫、食道がん、泌尿生殖路がん、悪性高カルシウム血症、子宮内膜がん、副腎皮質がん、内分泌もしくは外分泌膵臓の新生物、甲状腺髄様がん、甲状腺髄様癌、黒色腫、結腸直腸がん、甲状腺乳頭がん、肝細胞癌、乳頭のパジェット病、葉状腫瘍、小葉癌、腺管癌、膵臓星状細胞のがん、肝臓星状細胞のがん、または前立腺がんが挙げられる。一部の実施形態では、がんは固形腫瘍である。一部の実施形態では、がんは血液がんである。
実施形態では、抗TCRβV抗体分子、多特異性または多機能性分子(または医薬組成物)は、処置または予防しようとする疾患に適した様式で投与される。投与の回数および頻度は、患者の状態、ならびに患者の疾患の種類および重症度などの因子によって決定される。適切な投薬量は、臨床試験によって決定され得る。例えば、「有効量」または「治療量」が示される場合、投与しようとする医薬組成物(または多特異性もしくは多機能性分子)の厳密な量は、腫瘍サイズ、感染または転移の程度、対象の年齢、体重、および状態における個々の違いを考慮して、医師によって決定され得る。実施形態では、本明細書に記載される医薬組成物は、10~10個の細胞/体重kg、例えば、10~10
個の細胞/体重kgの投薬量で投与され得、これらの範囲内のすべての整数値が含まれる。実施形態では、本明細書に記載される医薬組成物は、これらの投薬量で複数回投与されてもよい。実施形態では、本明細書に記載される医薬組成物は、免疫療法において説明されている注入技法を使用して投与してもよい(例えば、Rosenberg et al., New Eng. J. of Med. 319:1676, 1988を参照されたい)。
実施形態では、抗TCRβV抗体分子、多特異性もしくは多機能性分子、または医薬組成物は、対象に非経口(parentally)投与される。実施形態では、細胞は、静脈内、皮下、腫瘍内、節内(intranodally)、筋肉内、皮内、または腹腔内で、対象に投与される。実施形態では、細胞は、腫瘍またはリンパ節に直接的に、投与される、例えば、注射される。実施形態では、細胞は、注入(例えば、Rosenberg
et al., New Eng. J. of Med. 319:1676, 1988に記載される)または静脈内プッシュ(intravenous push)として投与される。実施形態では、細胞は、注射可能なデポー製剤として投与される。
実施形態では、対象は、哺乳動物である。実施形態では、対象は、ヒト、サル、ブタ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ウサギ、ラット、またはマウスである。実施形態では、対象は、ヒトである。実施形態では、対象は、例えば、18歳未満、例えば、17歳未満、16歳未満、15歳未満、14歳未満、13歳未満、12歳未満、11歳未満、10歳未満、9歳未満、8歳未満、7歳未満、6歳未満、5歳未満、4歳未満、3歳未満、2歳未満、1歳未満、またはそれ未満の小児対象である。実施形態では、対象は、成人、例えば、少なくとも18歳、例えば、少なくとも19歳、20歳、21歳、22歳、23歳、24歳、25歳、25~30歳、30~35歳、35~40歳、40~50歳、50~60歳、60~70歳、70~80歳、または80~90歳である。
がん処置の方法
本明細書に記載される方法は、抗TCRβV抗体分子を使用して、例えば、本明細書に記載される医薬組成物を使用して、対象におけるがんを処置するステップを含む。また、対象におけるがんの症状を低減または改善する方法、ならびにがんの成長を阻害するおよび/または1つもしくは複数のがん細胞を殺滅させる方法が、提供される。実施形態では、本明細書に記載される方法は、本明細書に記載されるものまたは本明細書に記載される医薬組成物が投与された対象において、腫瘍のサイズを減少させ、かつ/またはがん細胞の数を減少させる。
がんを有する対象を処置する方法であって、対象における1つまたは複数のTCRBV分子のステータスを取得するステップを含む、方法が、本明細書に開示される。一部の実施形態では、対象、例えば、対象由来の試料における高い、例えば、増加した、1つまたは複数のTCRβV分子のレベルまたは活性は、対象における前記1つまたは複数のTCRβV分子を発現するT細胞のバイアス、例えば、優先的な拡大、例えば、クローン拡大を示す。
理論に拘泥するものではないが、バイアスされたT細胞集団、例えば、TCRβV分子を発現するT細胞集団は、疾患抗原、例えば、がん抗原に抗原特異性である(Wang CY, et al., Int J Oncol. (2016) 48(6):2247-56)。一部の実施形態では、がん抗原は、がん関連抗原またはネオ抗原を含む。一部の実施形態では、例えば、本明細書に開示されるがんを有する対象は、がんと関連する1つまたは複数のTCRβV分子のレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、TCRβV分子は、がん抗原、例えば、がん関連抗原またはネオ抗原と会合する、例えば、それを認識する。
したがって、対象から得られた免疫エフェクター細胞集団を拡大させる方法であって、対象由来の試料において1つまたは複数のTCRβV分子のステータスを取得するステップを含み、前記免疫エフェクター細胞集団を、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子、例えば、対象由来の試料中の免疫エフェクター細胞集団において高い、例えば、増加しているものと同じTCRβV分子に結合する抗TCRβV抗体分子と接触させるステップを含む、方法が、本明細書に開示される。一部の実施形態では、免疫エフェクター細胞(例えば、1つまたは複数のTCRβV分子を発現するT細胞を含む)集団を、抗TCRβV分子と接触させるステップは、1つまたは複数のTCRβV分子を発現する免疫エフェクター細胞集団の拡大をもたらす。一部の実施形態では、拡大させた集団、またはその一部分は、がんを処置するために、対象(例えば、免疫エフェクター細胞集団が得られたのと同じ対象)に投与される。一部の実施形態では、拡大させた集団、またはその一部分は、がんを処置するために、異なる対象(例えば、免疫エフェクター細胞集団が得られたのと同じではない対象)に投与される。
また、がんを有する対象を処置する方法であって、対象由来の試料において、1つまたは複数のTCRβV分子のステータスを取得するステップと、1つまたは複数のTCRβV分子が、対象由来の試料において、参照値と比較して高い、例えば、増加しているかどうかを判定するステップと、前記判定に応じて、対象に、有効量の抗TCRβV抗体分子、例えば、例として本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV抗体分子を投与するステップとを含む、方法が、本明細書に開示される。
本明細書に開示される方法または使用のための組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、対象は、B-CLLを有する。一部の実施形態では、B-CLLを有する対象は、1つまたは複数のTCRβV分子、例えば、(i)例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、もしくはTCRβ V6-1*01を含む、TCRβ V6サブファミリー、(ii)TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、もしくはTCRβ V5-8*01を含む、TCRβ V5サブファミリー、(iii)TCRβ V3-1*01を含む、TCRβ V3サブファミリー、(iv)TCRβ V2*01を含む、TCRβ V2サブファミリー、または(v)TCRβ V19*01もしくはTCRβ V19*02を含む、TCRβ V19サブファミリーを含む、1つまたは複数のTCRβV分子のレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。
一部の実施形態では、B-CLLを有する対象は、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、またはTCRβ V6-1*01を含むTCRβ V6サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V6サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V6サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、B-CLLを有する対象は、TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、またはTCRβ V5-8*01を含むTCRβ V5サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V5サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分
子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V5サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、B-CLLを有する対象は、TCRβ V3-1*01を含むTCRβ V3サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V3サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V3サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、B-CLLを有する対象は、TCRβ V2*01を含むTCRβ V2サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V2サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V2サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、B-CLLを有する対象は、TCRβ V19*01またはTCRβ V19*02を含むTCRβ V19サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V19サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRBV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V19サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
本明細書に開示される方法または使用のための組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、対象は、黒色腫を有する。一部の実施形態では、黒色腫を有する対象は、1つまたは複数のTCRβV分子、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、またはTCRβ V6-1*01を含む、TCRβ V6サブファミリーを含む、1つまたは複数のTCRβV分子のレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V6サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V6サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
本明細書に開示される方法または使用のための組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、対象は、DLBCLを有する。一部の実施形態では、黒色腫を有する対象は、1つまたは複数のTCRβV分子、例えば、(i)TCRβ V13*01を含む、TCRβ V13サブファミリー、(ii)TCRβ V3-1*01を含む、TCRβ V3サブファミリー、または(iii)TCRβ V23サブファミリーを含む、1つまたは複数のTCRβV分子のレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。
一部の実施形態では、DLBCLを有する対象は、高い、例えば、増加した、TCRβ
V13*01を含むTCRβ V13サブファミリーのレベルまたは活性を有する。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V13サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV
分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V13サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、DLBCLを有する対象は、TCRβ V3-1*01を含むTCRβ V3サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V3サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V3サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、DLBCLを有する対象は、TCRβ V23サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V23サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V23サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
本明細書に開示される方法または使用のための組成物のうちのいずれかの一部の実施形態では、対象は、CRCを有する。一部の実施形態では、黒色腫を有する対象は、1つまたは複数のTCRβV分子、例えば、(i)TCRβ V19*01もしくはTCRβ V19*02を含む、TCRβ V19サブファミリー、(ii)TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01、もしくはTCRβ V12-5*01を含む、TCRβ V12サブファミリー、(iii)TCRβ V16*01を含む、TCRβ V16サブファミリー、または(iv)TCRβ V21サブファミリーを含む、1つまたは複数のTCRβV分子のレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。
一部の実施形態では、CRCを有する対象は、TCRβ V19*01またはTCRβ
V19*02を含むTCRβ V19サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V19サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V19サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、CRCを有する対象は、TCRβ V12-4*01、TCRβ
V12-3*01、またはTCRβ V12-5*01を含むTCRβ V12サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V12サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V12サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、CRCを有する対象は、TCRβ V16*01を含むTCRβ
V16サブファミリーのレベルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ V16サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V16サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、CRCを有する対象は、TCRβ V21サブファミリーのレベ
ルまたは活性が、高い、例えば、増加している。一部の実施形態では、対象に、TCRβ
V21サブファミリーの1つまたは複数のメンバーに結合する抗TCRβV分子(例えば、本明細書に記載されるアゴニスト抗TCRβV分子)が投与される。一部の実施形態では、抗TCRβV分子の投与は、TCRβ V21サブファミリーの1つまたは複数のメンバーを発現する免疫細胞の拡大をもたらす。
一部の実施形態では、1つまたは複数のTCRβV分子のステータス、例えば、存在、レベル、および/または活性の値を取得するステップは、試料のT細胞受容体(TCR)レパートリーの尺度を取得することを含む。一部の実施形態では、値は、試料におけるT細胞集団のクローン型の尺度を含む。
一部の実施形態では、1つまたは複数のTCRβV分子のステータスの値は、Wang
CY, et al., Int J Oncol. (2016) 48(6):2247-56に記載されるアッセイを使用して得られ、例えば、測定され、そのすべての内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
一部の実施形態では、1つまたは複数のTCRβV分子のステータスの値は、フローサイトメトリーを使用して得られる、例えば、測定される。
併用療法
本明細書に開示されている抗TCRβV抗体分子、多特異性または多機能性分子は、第2の治療剤または手法と併用して使用することができる。
実施形態では、抗TCRβV抗体分子、多特異性または多機能性分子、および第2の治療剤または手法は、対象ががんと診断された後、例えば、がんが対象から除去される前に、投与される/行われる。実施形態では、抗TCRβV抗体分子、多特異性または多機能性分子、および第2の治療剤または手法は、同時にまたは並行して投与される/行われる。例えば、1つの処置の送達は、第2の送達を開始する場合、例えば、処置の投与に重複がある場合、なおも生じている。他の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、多特異性または多機能性分子、および第2の治療剤または手法は、連続的に投与される/行われる。例えば、一方の処置の送達は、他方の処置の送達が開始する前に停止する。
実施形態では、併用療法は、いずれかの薬剤単独による単独療法よりも、より効果的な処置をもたらすことができる。実施形態では、第1および第2の処置の併用は、第1または第2の処置単独よりも有効である(例えば、症状および/またはがん細胞のより大きな減少をもたらす)。実施形態では、併用療法は、単独療法として投与された場合に類似の効果を達成するために通常必要とされる第1または第2の処置の用量と比較して、第1または第2の処置のより低い用量の使用を可能にする。実施形態では、併用療法は、部分的な相加効果、完全な相加効果、または相加効果より大きい効果を有する。
一実施形態では、抗TCRBV抗体、多特異性または多機能性分子は、療法、例えば、がん療法(例えば、抗がん剤、免疫療法、光線力学的療法(PDT)、外科手術および/または放射線の1つまたは複数)と併用して投与される。用語「化学療法薬」、「化学療法剤」、および「抗がん剤」は、本明細書において互換的に使用される。多特異性または多機能性分子の投与および療法、例えば、がん療法は、連続的(重複を伴うまたは伴わない)であるかまたは同時であり得る。抗TCRBV抗体、多特異性または多機能性分子の投与は、療法(例えば、がん療法)の経過中、連続的または断続的であり得る。本明細書に記載される特定の療法は、がんおよび非がん性疾患を処置するために使用することができる。例えば、PDTの有効性は、本明細書に記載された方法および組成物を用いて、がん性および非がん性状態(例えば、結核)において増強され得る(例えば、Agostinis,P.ら(2011年)CA Cancer J.Clin.61巻:250~2
81ページに概説される)。
抗がん療法
他の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、多特異性または多機能性分子は、低分子量または小分子量の化学療法剤と併用して投与される。例示的な低分子量または小分子量の化学療法剤には、限定されないが、13-シス-レチノイン酸(イソトレチノイン、ACCUTANE(登録商標))、2-CdA(2-クロロデオキシアデノシン、クラドリビン、LEUSTATIN(商標))、5-アザシチジン(アザシチジン、VIDAZA(登録商標))、5-フルオロウラシル(5-FU、フルオロウラシル、ADRUCIL(登録商標))、6-メルカプトプリン(6-MP、メルカプトプリン、PURINETHOL(登録商標))、6-TG(6-チオグアニン、チオグアニン、THIOGUANINE TABLOID(登録商標))、アブラキサン(パクリタキセルタンパク質-結合)、アクチノマイシン-D(ダクチノマイシン、COSMEGEN(登録商標))、アリトレチノイン(PANRETIN(登録商標))、オールトランスレチノイン酸(ATRA、トレチノイン、VESANOID(登録商標))、アルトレタミン(ヘキサメチルメラミン、HMM、HEXALEN(登録商標))、アメトプテリン(メトトレキサート、メトトレキサートナトリウム、MTX、TREXALL(商標)、RHEUMATREX(登録商標))、アミフォスチン(ETHYOL(登録商標))、アラビノシルシトシン(Ara-C、シタラビン、CYTOSAR-U(登録商標))、三酸化ヒ素(TRISENOX(登録商標))、アスパラギナーゼ(エルウィニアL-アスパラギナーゼ、L-アスパラギナーゼ、ELSPAR(登録商標)、KIDROLASE(登録商標))、BCNU(カルムスチン、BiCNU(登録商標))、ベンダムスチン(TREANDA(登録商標))、ベキサロテン(TARGRETIN(登録商標))、ブレオマイシン(BLENOXANE(登録商標))、ブスルファン(BUSULFEX)(登録商標)、MYLERAN(登録商標))、カルシウムロイコボリン(シトロボラムファクター、フォリン酸、ロイコボリン)、カンプトテシン-11(CPT-11、イリノテカン、CAMPTOSAR(登録商標))、カペシタビン(XELODA(登録商標))、カルボプラチン(PARAPLATIN(登録商標))、カルムスチンウエハー(カルムスチンインプラントを有するプロリフェプロスパン20、GLIADEL(登録商標)ウエハー)、CCI-779(テムシロリムス、TORISEL(登録商標))、CCNU(ロムスチン、CeeNU)、CDDP(シスプラチン、PLATINOL(登録商標)、PLATINOL-AQ(登録商標))、クロラムブシル(ロイケラン)、シクロホスファミド(CYTOXAN(登録商標)、NEOSAR(登録商標))、ダカルバジン(DIC、DTIC、イミダゾールカルボキサミド、DTIC-DOME(登録商標))、ダウノマイシン(ダウノルビシン、ダウノルビシン塩酸塩、ルビドマイシンハイドロクロライド、CERUBIDINE(登録商標))、デシタビン(DACOGEN(登録商標))、デキサゾキサン(ZINECARD(登録商標))、DHAD(ミトキサントロン、NOVANTRONE(登録商標))、ドセタキセル(TAXOTERE(登録商標))、ドキソルビシン(ADRIAMYCIN(登録商標)、RUBEX(登録商標))、エピルビシン(ELLENCE(商標))、エストラムスチン(EMCYT(登録商標))、エトポシド(VP-16、リン酸エトポシド、TOPOSAR(登録商標)、VEPESID(登録商標)、ETOPOPHOS(登録商標))、フロクスウリジン(FUDR(登録商標))、フルダラビン(FLUDARA(登録商標))、フルオロウラシル(クリーム)(CARAC(商標)、EFUDEX(登録商標)、FLUOROPLEX(登録商標))、ゲムシタビン(GEMZAR(登録商標))、ヒドロキシ尿素(HYDREA(登録商標)、DROXIA(商標)、MYLOCEL(商標))、イダルビシン(IDAMYCIN(登録商標))、イフォスファミド(IFEX(登録商標))、イキサベピロン(IXEMPRA(商標))、LCR(ロイロクリスチン、ビンクリスチン、VCR、ONCOVIN(登録商標)、VINCASAR PFS(登録商標))、L-PAM(L-サルコリシン、メルファラン、フェニルアラニンマスタード、ALKERAN(登録商標
))、メクロレタミン(塩酸メクロレタミン、ムスチン、ナイトロジェンマスタード、MUSTARGEN(登録商標))、メスナ(MESNEX(商標))、マイトマイシン(マイトマイシン-C、MTC、MUTAMYCIN(登録商標))、ネララビン(ARRANON(登録商標))、オキサリプラチン(ELOXATIN(商標))、パクリタキセル(TAXOL(登録商標)、ONXAL(商標))、ペガスパルガーゼ(PEG-L-アスパラギナーゼ、ONCOSPAR(登録商標))、PEMETREXED(ALIMTA(登録商標))、ペントスタチン(NIPENT(登録商標))、プロカルバジン(MATULANE(登録商標))、ストレプトゾシン(ZANOSAR(登録商標))、テモゾロミド(TEMODAR(登録商標))、テニポシド(VM-26、VUMON(登録商標))、TESPA(チオホスホアミド、チオテパ、TSPA、THIOPLEX(登録商標))、トポテカン(HYCAMTIN(登録商標))、ビンブラスチン(硫酸ビンブラスチン、ビンカロイコブラスチン、VLB、ALKABAN-AQ(登録商標)、VELBAN(登録商標))、ビノレルビン(酒石酸ビノレルビン、NAVELBINE(登録商標))、およびボリノスタット(ZOLINZA(登録商標))が含まれる。
別の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、多特異性または多機能性分子は、生物製剤と併用して投与される。がんの処置に有用な生物製剤は、当該技術分野において公知であり、本発明の結合分子は、例えば、このような公知の生物製剤と組み合わせて投与することができる。例えば、FDAは、乳がんの処置のために次の生物製剤を承認している:HERCEPTIN(登録商標)(トラスツズマブ、Genentech Inc.、South San Francisco、Calif.;HER2陽性乳がんで抗腫瘍活性化を有するヒト化モノクローナル抗体);FASLODEX(登録商標)(フルベストラント、AstraZeneca Pharmaceuticals、LP、Wilmington、Del.;乳がんの処置に使用されるエストロゲン受容体拮抗薬);ARIMIDEX(登録商標)(アナストロゾール、AstraZeneca Pharmaceuticals、LP;エストロゲンの作製に必要な酵素であるアロマターゼを遮断する非ステロイド性アロマターゼ阻害剤);アロマシン(登録商標)(エキセメスタン、Pfizer Inc.、New York、N.Y.;乳がんの処置に使用される不可逆的なステロイド性アロマターゼ不活性化剤);FEMARA(登録商標)(レトロゾール、Novartis Pharmaceuticals、East Hanover、N.J.;FDAにより乳がんを処置するために承認された非ステロイドアロマターゼ阻害剤);およびNOLVADEX(登録商標)(タモキシフェン、AstraZeneca Pharmaceuticals、LP;FDAにより乳がんを処置するために承認された非ステロイド性抗エストロゲン剤)。本発明の結合分子と組み合わせることができる他の生物製剤には、以下が含まれる:アバスチン(登録商標)(ベバシズマブ、Genentech Inc.;血管新生を阻害するように設計された最初のFDA承認療法);およびZEVALIN(登録商標)(イブリツモマブチウキセタン、Biogen Idec、Cambridge、Mass;B細胞リンパ腫の処置のために現在承認されている放射性標識モノクローナル抗体)。
さらに、FDAは、結腸直腸がんの処置のために以下の生物製剤を承認した:アバスチン(登録商標);ERBITUX(登録商標)(セツキシマブ、ImClone Systems Inc.、New York、N.Y.、およびBristol-Myers
Squibb、New York、N.Y.;上皮成長因子受容体(EGFR)に対して指向されるモノクローナル抗体);GLEEVEC(登録商標)(メシル酸イマチニブ;プロテインキナーゼ阻害剤);ERGAMISOL(登録商標)(レバミゾール塩酸塩、Janssen Pharmaceutica Products、LP、Titusville、N.J.;デュークスのステージC結腸がんを有する患者の外科的切除後に5-フルオロウラシルと併用するアジュバント療法として1990年にFDAにより承認
された免疫調節薬)。
肺がんの処置のために、例示的な生物製剤には、TARCEBA(登録商標)(エルロチニブHCL、OSI Pharmaceuticals Inc.、Melville、N.Y.;ヒト上皮成長因子受容体1(HER1)経路を標的とするように設計された小分子)が含まれる。
多発性骨髄腫の処置のために、例示的な生物製剤には、VELCADE(登録商標)ベルケイド(ボルテゾミブ、Millennium Pharmaceuticals、Cambridge Mass.、プロテアソーム阻害剤)が含まれる。追加の生物製剤には、THALIDOMID(登録商標)(サリドマイド、Clegene Corporation、Warren、N.J.;免疫調節剤であり、骨髄腫細胞の成長と生存を阻害する能力、および抗血管新生を含む複数の作用があるようである)が含まれる。
追加の例示的ながん療法用抗体には、限定されないが、3F8、アバゴボマブ、アデカツマブ、アフツズマブ、アラシズマブペゴル、アレムツズマブ(CAMPATH(登録商標)、MABCAMPATH(登録商標))、アルツモマブペンテテート(HYBRI-CEAKER(登録商標))、アナツモマブマフェナトックス、アンルキンズマブ(IMA-638)、アポリズマブ、アルシツモマブ(CEA-SCAN(登録商標))、バビツキシマブ、ベクツモマブ(LYMPHOSCAN(登録商標))、ベリムマブ(BENLYSTA(登録商標)、LYMPHOSTAT-B(登録商標))、ベシレソマブ(SCINTIMUN(登録商標))、ベバシズマブ(AVASTIN(登録商標))、ビバツズマブマータンシン、ブリナツモマブ、ブレンツキシマブベドチン、カンツズマブメルタンシン、カプロマブペンデチド(PROSTASCINT(登録商標))、カツマキソマブ(REMOVAB(登録商標))、CC49、セツキシマブ(C225、ERBITUX(登録商標))、シタツズマブボガトックス、シクスツムマブ、クリバツズマブテトラキセタン、コナツムマブ、デセツズマブ、デノスマブ(PROLIA(登録商標))、デツモマブ、エクロメキシマブ、エドレコロマブ(PANOREX(登録商標))、エロツズマブ、エピツモマブシツキセタン、エプラツズマブ、エルツマキソマブ(REXOMUN(登録商標))、エタラシズマブ、ファルレツズマブ、フィギツムマブ、フレソリムマブ、ガリキシマブ、ゲムツズマブオゾガミシン(MYLOTARG(登録商標))、ギレンツキシマブ、グレンバツムマブベドチン、イブリツモマブ(イブリツモマブチウキセタン、ZEVALIN(登録商標))、イゴボマブ(INDIMACIS-125(登録商標))、インテツムマブ、イノツズマブオゾガマイシン、イピリムマブ、イラツムマブ、ラベツズマブ(CEA-CIDE(登録商標))、レキサツムマブ、リンツズマブ、ルカツムマブ、ルミリキシマブ、マパツムマブ、マツズマブ、ミラツズマブ、ミンレツモマブ、ミツモマブ、ナコロマブタフェナトックス、ナプツモマブエスタフェナトックス、ネシツムマブ、ニモツズマブ(THERACIM(登録商標)、THERALOC(登録商標))、ノフェツモマブメルペンタン(VERLUMA(登録商標))、オファツムマブ(ARZERRA(登録商標))、オララツマブ、オポルツズマブモナトックス、オレゴボマブ(OVAREX(登録商標))、パニツムマブ(VECTIBIX(登録商標))、ペムツモマブ(THERAGYN(登録商標))、パーツズマブ(OMNITARG(登録商標))、ピンツモマブ、プリツムマブ、ラムシルマブ、ラニビズマブ(LUCENTIS(登録商標))、リロツムマブ、リツキシマブ(MABTHERA(登録商標)、RITUXAN(登録商標))、ロバツムマブ、サツモマブペンデチド、シブロツズマブ、シルツキシマブ、ソンツズマブ、タカツズマブテトラキセタン(AFP-CIDE(登録商標))、タプリツモマブパプトックス、テナツモマブ、TGN1412、チシリムマブ(トレメリムマブ)、チガツズマブ、TNX-650、トシツモマブ(BEXXAR(登録商標))、トラスツズマブ(HERCEPTIN(登録商標))、トレメリムマブ、ツコツズマブセルモロイキン、ベルツズマブ、ボロシキシマブ、ボツムマブ(HUMAS
PECT(登録商標))、ザルツムマブ(HUMAX-EGFR(登録商標))、およびザノリムマブ(HUMAX-CD4(登録商標))が含まれる。
他の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、多特異性または多機能性分子は、ウイルスがん治療剤と併用して投与される。例示的なウイルスがん治療剤には、限定されないが、ワクシニアウイルス(vvDD-CDSR)、がん胎児性抗原発現麻疹ウイルス、組換えワクシニアウイルス(TK-欠失+GM-CSF)、セネカバレーウイルス-001、ニューカッスルウイルス、コクサッキーウイルスA21、GL-ONC1、EBNA1 C末端/LMP2キメラタンパク質発現組換え修飾ワクシニアアンカラワクチン、がん胎児性抗原発現麻疹ウイルス、G207腫瘍溶解性ウイルス、p53を発現する修飾ワクシニアウイルスアンカラワクチン、OncoVEX GM-CSF修飾ヘルペスシンプレックス1ウイルス、鶏痘ウイルスワクチンベクター、組換えワクシニア前立腺特異抗原ワクチン、ヒトパピローマウイルス16/18 L1ウイルス様粒子/AS04ワクチン、MVA-EBNA1/LMP2 Inj.ワクチン、4価HPVワクチン、4価ヒトパピローマウイルス(タイプ6、11、16、18)組換えワクチン(GARDASIL(登録商標))、組換え鶏痘-CEA(6D)/TRICOMワクチン;組換えワクシニア-CEA(6D)-TRICOMワクチン、組換え修飾ワクシニアAnkara-5T4ワクチン、組換え鶏痘-TRICOMワクチン、腫瘍崩壊性ヘルペスウイルスNV1020、HPV L1 VLPワクチンV504、ヒトパピローマウイルス二価(タイプ16および18)ワクチン(CERVARIX(登録商標))、単純ヘルペスウイルスHF10、Ad5CMV-p53遺伝子、組換えワクシニアDF3/MUC1ワクチン、組換えワクシニア-MUC-1ワクチン、組換えワクシニア-TRICOMワクチン、ALVAC MART-1ワクチン、ヒトプレプロエンケファリン(NP2)を発現する複製欠損単純ヘルペスウイルスI型(HSV-1)ベクター、野生型レオウイルス、レオウイルスタイプ3ディアリング(REOLYSIN(登録商標))、腫瘍溶解性ウイルスHSV1716、エプスタイン・バーウイルス標的抗原をコードする組換え改変ワクシニアアンカラ(MVA)ベースのワクチン、組換え鶏痘前立腺特異抗原ワクチン、組換えワクシニア前立腺特異抗原ワクチン、組換えワクシニア-B7.1ワクチン、rAd-p53遺伝子、Ad5-delta24RGD、HPVワクチン580299、JX-594(チミジンキナーゼ欠失ワクシニアウイルス+GM-CSF)、HPV-16/18 L1/AS04、鶏痘ウイルスワクチンベクター、ワクシニアチロシナーゼワクチン、MEDI-517 HPV-16/18 VLP AS04ワクチン、単純ヘルペスウイルスTK99UNのチミジンキナーゼを含むアデノウイルスベクター、HspE7、FP253/フルダラビン、ALVAC(2)黒色腫多抗原治療ワクチン、ALVAC-hB7.1、カナリア痘-hIL-12黒色腫ワクチン、Ad-REIC/Dkk-3、rAd-IFN SCH
721015、TIL-Ad-INFg、Ad-ISF35、およびコクサッキーウイルスA21(CVA21、CAVATAK(登録商標))が含まれる。
他の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、多特異性または多機能性分子は、ナノ医薬品と併用して投与される。例示的ながんナノ医薬品には、限定されないが、ABRAXANE(登録商標)(パクリタキセル結合アルブミンナノ粒子)、CRLX101(直鎖シクロデキストリンベースのポリマーにコンジュゲートしたCPT)、CRLX288(ドセタキセルを生分解性ポリマーポリ(乳酸-co-グリコール酸)にコンジュゲートしている)、シタラビンリポソーム(リポソームAra-C、DEPOCYT(商標))、ダウノルビシンリポソーム(DAUNOXOME(登録商標))、ドキソルビシンリポソーム(DOXIL(登録商標)、CAELYX(登録商標))、カプセル化ダウノルビシンクエン酸リポソーム(DAUNOXOME(登録商標))、およびPEG抗VEGFアプタマー(MACUGEN(登録商標))が含まれる。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、多特異性または多機能性分子は、パクリ
タキセルまたはパクリタキセル製剤、例えば、TAXOL(登録商標)、タンパク質結合パクリタキセル(例えば、ABRAXANE(登録商標))と併用して投与される。例示的なパクリタキセル製剤には、限定されないが、ナノ粒子アルブミン結合パクリタキセル(ABRAXANE(登録商標)、Abraxis Bioscienceにより販売される)、ドコサヘキサエン酸結合パクリタキセル(DHA-パクリタキセル、タキソプレキシン、Protargaにより販売される)、ポリグルタミン酸結合パクリタキセル(PG-パクリタキセル、パクリタキセル・ポリグルメックス、CT-2103、XYOTAX、Cell Therapeuticにより販売される)、腫瘍活性化プロドラッグ(TAP)、ANG105(Angiopep-2はパクリタキセルの3つの分子に結合し、ImmunoGenにより販売される)、パクリタキセル-EC-1(パクリタキセルはerbB2認識ペプチドEC-1に結合する;Liら、Biopolymers(2007年)87巻:225~230ページを参照)、およびグルコースをコンジュゲートしたパクリタキセル(例えば、2’-パクリタキセルメチル2-グルコピラノシルスクシナート、Liuら、Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters(2007年)17巻:617~620ページを参照)が含まれる。
がんを処置するための例示的なRNAiおよびアンチセンスRNA剤には、限定されないが、CALAA-01、siG12D LODER(Local Drug EluteR)、およびALN-VSP02が含まれる。
他のがん治療剤には、限定されないが、サイトカイン(例えば、アルデスロイキン(IL-2、インターロイキン-2、PROLEUKIN(登録商標))、アルファインターフェロン(IFN-アルファ、インターフェロンアルファ、INTRON(登録商標)A(インターフェロンアルファ-2b)、ROFERON-A(登録商標)(インターフェロンアルファ-2a))、エポエチンアルファ(PROCRIT(登録商標))、フィルグラスチム(G-CSF、顆粒球-コロニー刺激因子、NEUPOGEN(登録商標))、GM-CSF(顆粒球マクロファージコロニー刺激因子、サルグラモスチム、LEUKINE(商標))、IL-11(インターロイキン-11、オプレルベキン、NEUMEGA(登録商標))、インターフェロンアルファ-2b(PEGコンジュゲート)(PEGインターフェロン、PEG-INTRON(商標))、およびペグフィルグラスチム(NEULASTA(商標)))、ホルモン療法剤(例えば、アミノグルテチミド(CYTADREN(登録商標))、アナストロゾール(ARIMIDEX(登録商標))、ビカルタミド(CASODEX(登録商標))、エキセメスタン(AROMASIN(登録商標))、フルオキシメステロン(HALOTESTIN(登録商標))、フルタミド(EULEXIN(登録商標))、フルベストラント(FASLODEX(登録商標))、ゴセレリン(ZOLADEX(登録商標))、レトロゾール(FEMARA(登録商標))、リュープロリド(ELIGARD(商標)、LUPRON(登録商標)、LUPRON
DEPOT(登録商標)、VIADUR(商標))、メゲストロール(酢酸メゲストロール、MEGACE(登録商標))、ニルタミド(ANANDRON(登録商標)、NILANDRON(登録商標))、オクトレオチド(酢酸オクトレオチド、SANDOSTATIN(登録商標)、SANDOSTATIN LAR(登録商標))、ラロキシフェン(EVISTA(登録商標))、ロミプロスチム(NPLATE(登録商標))、タモキシフェン(NOVALDEX(登録商標))、およびトレミフェン(FARESTON(登録商標)))、ホスホリパーゼA2阻害剤(例えば、アナグレリド(AGRYLIN(登録商標)))、生物応答改変剤(例えば、BCG(THERACYS(登録商標)、TICE(登録商標))、およびダルベポエチンアルファ(ARANESP(登録商標)))、標的治療薬(例えば、ボルテゾミブ(VELCADE(登録商標))、ダサチニブ(SPRYCEL(商標))、デニロイキンジフチトックス(ONTAK(登録商標))、エルロチニブ(TARCEVA(登録商標))、エベロリムス(AFINITOR(登録商標))、ゲフィチニブ(IRESSA(登録商標))、メシル酸イマチニブ(STI
-571、GLEEVEC(商標))、ラパチニブ(TYKERB(登録商標))、ソラフェニブ(NEXAVAR(登録商標))、およびSU11248(スニチニブ、SUTENT(登録商標)))、免疫調節薬および抗血管新生薬(例えば、CC-5013(レナリドマイド、REVLIMID(登録商標))、およびサリドマイド(THALOMID(登録商標)))、グルココルチコステロイド(例えば、コルチゾン(ヒドロコルチゾン、ヒドロコルチゾンリン酸ナトリウム、ヒドロコルチゾンコハク酸ナトリウム、ALA-CORT(登録商標)、HYDROCORT ACETATE(登録商標)、リン酸ヒドロコルトン LANACORT(登録商標)、SOLU-CORTEF(登録商標))、デカドロン(デキサメタゾン、デキサメタゾン酢酸塩、デキサメタゾンリン酸ナトリウム、DEXASONE(登録商標)、DIODEX(登録商標)、HEXADROL(登録商標)、MAXIDEX(登録商標))、メチルプレドニゾロン(6-メチルプレドニゾロン、酢酸メチルプレドニゾロン、メチルプレドニゾロンコハク酸ナトリウム、DURALONE(登録商標)、MEDRALONE(登録商標)、MEDROL(登録商標)、M-PREDNISOL(登録商標)、SOLU-MEDROL(登録商標))、プレドニゾロン(DELTA-CORTEF(登録商標)、ORAPRED(登録商標)、PEDIAPRED(登録商標)、PRELONE(登録商標))、およびプレドニゾン(DELTASONE(登録商標)、LIQUID PRED(登録商標)、METICORTEN(登録商標)、ORASONE(登録商標)))、およびビスホスホネート(例えば、パミドロネート(AREDIA(登録商標))、およびゾレドロン酸(ZOMETA(登録商標))が含まれる。
一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、多特異性または多機能性分子は、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、受容体チロシンキナーゼ(RTK)阻害剤)と併用して使用される。例示的なチロシンキナーゼ阻害剤には、限定されないが、上皮成長因子(EGF)経路阻害剤(例えば、上皮成長因子受容体(EGFR)阻害剤)、血管内皮成長因子(VEGF)経路阻害剤(例えば、VEGFに対する抗体、VEGFトラップ、血管内皮成長因子受容体(VEGFR)阻害剤(例えば、VEGFR-1阻害剤、VEGFR-2阻害剤、VEGFR-3阻害剤))、血小板由来成長因子(PDGF)経路阻害剤(例えば、血小板由来成長因子受容体(PDGFR)阻害剤(例えば、PDGFR-β阻害剤))、RAF-1阻害剤、KIT阻害剤およびRET阻害剤が含まれる。一部の実施形態では、AHCM剤と併用して使用される抗がん剤は、アキシチニブ(AG013736)、ボスチニブ(SKI-606)、セジラニブ(RECENTIN(商標)、AZD2171)、ダサチニブ(SPRYCEL(登録商標)、BMS-354825)、エルロチニブ(TARCEVA(登録商標))、ゲフィチニブ(IRESSA(登録商標))、イマチニブ(Gleevec(登録商標)、CGP57148B、STI-571)、ラパチニブ(TYKERB(登録商標)、TYVERB(登録商標))、レスタウルチニブ(CEP-701)、ネラチニブ(HKI-272)、ニロチニブ(TASIGNA(登録商標))、セマキサニブ(セマキシニブ、SU5416)、スニチニブ(SUTENT(登録商標)、SU11248)、トセラニブ(PALLADIA(登録商標))、バンデタニブ(ZACTIMA(登録商標)、ZD6474)、バタラニブ(PTK787、PTK/ZK)、トラスツズマブ(HERCEPTIN(登録商標))、ベバシズマブ(AVASTIN(登録商標))、リツキシマブ(RITUXAN(登録商標))、セツキシマブ(ERBITUX(登録商標))、パニツムマブ(VECTIBIX(登録商標))、ラニビズマブ(Lucentis(登録商標))、ニロチニブ(TASIGNA(登録商標))、ソラフェニブ(NEXAVAR(登録商標))、アレムツズマブ(CAMPATH(登録商標))、ゲムツズマブオゾガマイシン(MYLOTARG(登録商標))、ENMD-2076、PCI-32765、AC220、乳酸ドビチニブ(TKI258、CHIR-258)、BIBW 2992(TOVOK(商標))、SGX523、PF-04217903、PF-02341066、PF-299804、BMS-777607、ABT-869、MP470、BIBF 1120(VARGATEF(登録商標)
)、AP24534、JNJ-26483327、MGCD265、DCC-2036、BMS-690154、CEP-11981、チボザニブ(AV-951)、OSI-930、MM-121、XL-184、XL-647、XL228、AEE788、AG-490、AST-6、BMS-599626、CUDC-101、PD153035、ペリチニブ(EKB-569)、バンデタニブ(ザクティマ)、WZ3146、WZ4002、WZ8040、ABT-869(リニファニブ)、AEE788、AP24534(ポナチニブ)、AV-951(チボザニブ)、アキシチニブ、BAY 73-4506(レゴラフェニブ)、ブリバニブアラニネート(BMS-582664)、ブリバニブ(BMS-540215)、セジラニブ(AZD2171)、CHIR-258(ドビチニブ)、CP 673451、CYC116、E7080、Ki8751、マシチニブ(AB1010)、MGCD-265、モテサニブ二リン酸(AMG-706)、MP-470、OSI-930、パゾパニブ塩酸塩、PD173074、ソラフェニブトシレート(Bay 43-9006)、SU 5402、TSU-68(SU6668)、バタラニブ、XL880(GSK1363089、EXEL-2880)からなる群から選択される。選択されたチロシンキナーゼ阻害剤は、スニチニブ、エルロチニブ、ゲフィチニブ、またはソラフェニブから選択される。一実施形態では、チロシンキナーゼ阻害剤は、スニチニブである。
一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、多特異性または多機能性分子は、抗血管新生剤、または血管標的剤または血管破壊剤のうちの1つまたは複数と併用して投与される。例示的な抗血管新生剤には、限定されないが、とりわけ、VEGF阻害剤(例えば、抗VEGF抗体(例えば、ベバシズマブ);VEGF受容体阻害剤(例えば、イトラコナゾール);細胞増殖および/または内皮細胞移動の阻害剤(例えば、カルボキシアミドトリアゾール、TNP-470);血管新生刺激剤の阻害剤(例えば、スラミン)が含まれる。血管標的剤(VTA)または血管破壊剤(VDA)は、中枢壊死を引き起こすがん腫瘍の血管系(血管)を損傷するように設計されている(例えば、Thorpe,P.E.(2004年)Clin.Cancer Res.Vol.10巻:415~427ページに概説される)。VTAは、小分子であり得る。例示的な小分子VTAには、限定されないが、微小管不安定化剤(例えば、コンブレタスタチンA-4リン酸二ナトリウム(CA4P)、ZD6126、AVE8062、Oxi 4503);およびバジメザン(ASA404)が含まれる。
免疫チェックポイント阻害剤
他の実施形態では、本明細書に記載される方法は、抗TCRβV抗体分子、多特異性または多機能性分子と併用した免疫チェックポイント阻害剤の使用を含む。この方法は、in vivoの治療プロトコールにおいて使用することができる。
実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、チェックポイント分子を阻害する。例示的なチェックポイント分子には、限定されないが、CTLA4、PD1、PD-L1、PD-L2、TIM3、LAG3、CD160、2B4、CD80、CD86、B7-H3(CD276)、B7-H4(VTCN1)、HVEM(TNFRSF14またはCD270)、BTLA、KIR、MHCクラスI、MHCクラスII、GAL9、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、およびA2aRが含まれる。例えば、参照により本明細書に組み込まれるPardoll.Nat.Rev.Cancer 12.4(2012年):252~64ページを参照されたい。
実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、PD-1阻害剤、例えば、ニボルマブ、ペンブロリズマブまたはピジリズマブなどの抗PD-1抗体である。ニボルマブ(MDX-1106、MDX-1106-04、ONO-4538、またはBMS-936558とも呼ばれる)は、PD1を特異的に阻害する完全ヒトIgG4モノクローナル抗体で
ある。例えば、米国特許第8,008,449号および国際公開第2006/121168号を参照されたい。ペンブロリズマブ(Lambrolizumab、MK-3475、MK03475、SCH-900475、またはKEYTRUDA(登録商標)とも呼ばれる;Merck)は、PD-1に結合するヒト化IgG4モノクローナル抗体である。例えば、Hamid,O.ら(2013年)New England Journal
of Medicine 369巻(2号):134~44ページ、米国特許第8,354,509号および国際公開第2009/114335号を参照されたい。ピジリズマブ(CT-011またはCure Techとも呼ばれる)は、PD1に結合するヒト化IgG1kモノクローナル抗体である。例えば、国際公開第2009/101611号を参照されたい。一実施形態では、PD-1の阻害剤は、実質的に同一または類似の配列、例えば、ニボルマブ、ペンブロリズマブまたはピジリズマブの配列に対して少なくとも85%、90%、95%同一であるまたはそれを超える配列を有する抗体分子である。追加の抗PD1抗体、例えば、AMP 514(Amplimmune)は、例えば、米国特許第8,609,089号、米国特許出願公開第2010/028330号、および/または米国特許出願公開第2012/0114649号に記載されている。
一部の実施形態では、PD-1阻害剤は、イムノアドヘシン、例えば、定常領域(例えば、免疫グロブリンのFc領域)に融合されたPD-1リガンド(例えば、PD-L1またはPD-L2)の細胞外/PD-1結合部分を含むイムノアドヘシンである。実施形態では、PD-1阻害剤は、B7-H1とPD-1の間の相互作用を遮断するPD-L2 Fc融合可溶性受容体であるAMP-224(B7-DCIg、例えば、国際公開第2011/066342号および国際公開第2010/027827号に記載される)である。
実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、PD-L1阻害剤、例えば、抗体分子である。一部の実施形態では、PD-L1阻害剤は、YW243.55.S70、MPDL3280A、MEDI-4736、MSB-0010718C、またはMDX-1105である。一部の実施形態では、抗PD-L1抗体は、MSB0010718C(A09-246-2とも呼ばれる;Merck Serono)であり、PD-L1に結合するモノクローナル抗体である。例示的なヒト化抗PD-L1抗体は、例えば、国際公開第2013/079174号に記載されている。一実施形態では、PD-L1阻害剤は、抗PD-L1抗体、例えば、YW243.55.S70である。YW243.55.S70抗体は、例えば、国際公開第2010/077634号に記載されている。一実施形態では、PD-L1阻害剤は、MDX-1105(BMS-936559とも呼ばれる)であり、例えば、国際公開第2007/005874号に記載されている。一実施形態では、PD-L1阻害剤は、MDPL3280A(Genentech/Roche)であり、PD-L1に対するヒトFc最適化IgG1モノクローナル抗体である。例えば、米国特許第7,943,743号および米国特許出願公開第2012/0039906号を参照されたい。一実施形態では、PD-L1の阻害剤は、実質的に同一または類似の配列、例えば、YW243.55.S70、MPDL3280A、MEDI-4736、MSB-0010718C、またはMDX-1105の配列に対して少なくとも85%、90%、95%同一であるまたはそれを超える配列を有する抗体分子である。
実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、PD-L2阻害剤、例えば、AMP-224(PD1とB7-H1の間の相互作用を遮断するPD-L2 Fc融合可溶性受容体である)である。例えば、国際公開第2010/027827号および国際公開第2011/066342号を参照されたい。
一実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、LAG-3阻害剤、例えば、抗LAG-3抗体分子である。実施形態では、抗LAG-3抗体は、BMS-986016(B
MS986016とも呼ばれる、Bristol-Myers Squibb)である。BMS-986016および他のヒト化抗LAG-3抗体は、例えば、米国特許出願公開第2011/0150892号、国際公開第2010/019570号、および国際公開第2014/008218号に記載されている。
実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、例えば、米国特許第8,552,156号、国際公開第2011/155607号、欧州特許第2581113号および米国特許出願公開第2014/044728号に記載される、抗TIM3抗体分子などのTIM-3阻害剤である。
実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、CTLA-4阻害剤、例えば、抗CTLA-4抗体分子である。例示的な抗CTLA4抗体には、トレメリムマブ(以前はチシリムマブ、CP-675,206として公知であるPfizerのIgG2モノクローナル抗体)、およびイピリムマブ(MDX-010とも呼ばれる、CAS No.477202-00-9)が含まれる。他の例示的な抗CTLA-4抗体は、例えば、米国特許第5,811,097号に記載されている。
CRSグレード付け
一部の実施形態では、CRSは、以下のように1~5の重症度でグレード付けすることができる。グレード1~3は、重度CRSよりも軽度である。グレード4~5は、重度CRSである。グレード1のCRSでは、対症療法のみが必要であり(例えば、悪心、発熱、疲労、筋肉痛、倦怠感、頭痛)、症状は生命を脅かすものではない。グレード2のCRSでは、症状には、中等度の介入が必要であり、一般に中等度の介入に応答する。グレード2のCRSを有する対象は、輸液もしくは1回の低用量昇圧剤のいずれかに応答する低血圧を発症するか、またはグレード2の臓器毒性もしくは低流量酸素(40%未満の酸素)に応答する軽度の呼吸器症状を発症する。グレード3のCRS対象では、低血圧は、一般に、輸液療法または1回の低用量昇圧剤によって回復することができない。これらの対象は、一般に、低流量酸素を超える必要があり、グレード3の臓器毒性(例えば、腎もしくは心機能障害または凝固障害)および/またはグレード4の高トランスアミナーゼ血症を有する。グレード3のCRS対象は、より積極的な介入(例えば、酸素40%以上、高用量昇圧剤、および/または複数の昇圧剤)が必要である。グレード4のCRS対象は、グレード4の臓器毒性または人工呼吸器の必要性など、直ちに生命を脅かす症状に苦しんでいる。グレード4のCRS対象は、通常、高トランスアミナーゼ血症を有しない。グレード5のCRS対象では、毒性は、死亡を引き起こす。CRSをグレード付けるための基準セットは、表5、表6、および表7として本明細書に提供される。別段の規定がない限り、本明細書で使用される場合CRSは、表6の基準に従ったCRSを指す。
実施形態では、CRSは、表5に従ってグレード付けされる:
Figure 2023509708000108
Figure 2023509708000109
Figure 2023509708000110
実施例1.α-TRBV6-5抗体クローン抗体Aのヒト化
マウスα-TCRβ抗体クローン抗体A VHおよびVLの生殖系列は、IMGT命名法を用いて割り当てられ、CDR領域はKabatおよびChothia分類を組み合わせて定義された。配列番号1および配列番号2は、それぞれ、抗体A VHおよびVL配列であり、VH生殖系列はマウスIGHV1S1201であり、VL生殖系列はマウスIGKV6-1501である。配列番号3~5は、それぞれ、抗体A VH CDR領域1~3であり、配列番号6~8は、VL CDR領域1~3に対応する(表1に記載される)。
抗体A VHおよびVL配列のヒト化は、類似の方法を用いて別々に行われた。CDRグラフト化の成功に重要であるフレームワーク領域においてアミノ酸位置を同定した。ヒト生殖系列配列は、必要な残基を保存し、全体的に高量の同一性を含むことが同定された。ヒト生殖系列フレームワーク配列が、一致する重要なアミノ酸を含まない場合、マウス配列と一致するように復帰突然変異させた。CDR領域を、未変化のヒト生殖系列にグラフト化した。抗体A VHをヒトIGHV1-6901にヒト化し、抗体A VLをIGKV1-1701およびIGKV1-2701にヒト化した。3つすべてのヒト化
配列は、ヒト化プロセスの結果として、NG、DG、NS、NN、DS、NT、NXS、またはNXTなどの、導入された負のポテンシャルの翻訳後修飾部位を含まないことが確認された。配列番号9は、ヒト化抗体A-H.1 VHであり、配列番号10および11は、それぞれ、ヒト化VL IGKV1-1701およびIGKV1-2701生殖系列である(表1に記載される)。図1Aおよび1Bは、CDRおよびフレームワーク領域(FR)を示す注釈付きのマウスおよびヒト化配列を示す。
実施例2:α-TRBV12-3およびTRBV12-4抗体クローン抗体Bのヒト化
マウスα-TCRβ抗体クローン抗体B VHおよびVLの生殖系列は、IMGT命名法を用いて割り当てられ、CDR領域はKabatおよびChothia分類を組み合わせて定義された。配列番号15および配列番号16は、それぞれ、抗体B VHおよびVL配列であり、VH生殖系列はマウスIGHV5-1702であり、VL生殖系列はマウスIGKV4-5001である。配列番号17~19は、それぞれ、B-H VH CDR領域1~3であり、配列番号20~22は、B-H VL CDR領域1~3である(表2に記載される)。
実施例1に記載されるヒト化抗体Aに適用された方法を用いて、抗体Bをヒト化した。抗体B VHをヒトIGHV3-3001、IGHV3-4801およびIGHV3-6601にヒト化し、抗体B VLをヒトIGKV1-901、IGKV1-3901、IGKV3-1501、IGLV1-4701およびIGLV3-1001にヒト化した。配列番号23~25は、B-H.1A、B-H.1B、およびB-H.1Cヒト化重鎖であり、配列番号26~30は、B-H.1D、B-H.1E、B-H.1F、B-H.1G、およびB-H.1Hヒト化軽鎖である(表2に記載される)。図2Aおよび2Bは、CDRおよびフレームワーク領域(FR)を示す注釈付きのマウスおよびヒト化配列を示す。
実施例3:抗TCRβV抗体の特徴
導入
がん免疫療法のための腫瘍細胞溶解を促進するためにT細胞を再指向させるように設計された現在の二特異性構築物は、典型的には、T細胞受容体(TCR)のCD3eサブユニットに対して指向されるモノクローナル抗体(mAb)に由来する一本鎖可変断片(scFV)を利用する。しかしながら、このアプローチには限界があり、このような二特異性構築物の治療可能性の完全な実現を妨げる可能性がある。これまでの研究では、例えば、低い「活性化」用量の抗CD3e mAbが長期のT細胞機能不全を引き起こし、免疫抑制作用を発揮することが示されている。さらに、抗CD3e mAbはすべてのT細胞に結合し、したがってすべてのT細胞を等しく活性化する。これは、T細胞の大量活性化に起因する抗CD3e mAbの初回投与時の副作用と関連している。これらの多数の活性化T細胞は相当量のサイトカインを分泌し、そのうち最も重要なものはインターフェロンガンマ(IFNg)である。この過剰量のIFNgは、次に、例えば、マクロファージを活性化し、その後、IL-1、IL-6およびTNF-αなどの炎症性サイトカインを過剰に産生することができ、サイトカイン放出症候群(CRS)として公知である「サイトカインストーム」を引き起こす。したがって、CRSを低減させるために必要なエフェクターT細胞のサブセットのみに結合し、活性化することができる抗体を開発することは有利であり得る。
結果
その目的で、TCR(TCR Vb)のベータサブユニットの可変鎖に指向される抗体を同定した。これらの抗TCR Vb抗体は、T細胞のサブセットに結合し、活性化するが、例えば、CRSが全く低減しないかまたは顕著には低減しない。プレート結合した抗TCR Vb13.1mAb(A-H.1およびA-H.2)を用いて、A-H.1での
陽性染色によって定義されるT細胞の集団が、(0日目のT細胞の約5%から6日目の細胞培養での総T細胞のほぼ60%まで)拡大され得ることが示された(図4A~4C)。この実験のために、ヒトCD3+T細胞を磁気ビーズ分離を用いて単離し(負の選択)、100nMで、固定化(プレート被覆された)A-H.1またはOKT3(抗CD3e)抗体で6日間、活性化した。拡大されたVb13.1+T細胞は、精製CD3+T細胞と共培養した場合、形質転換された細胞系RPMI-8226に対して細胞溶解活性化を示す(図5A-5B)。
次に、抗TCR VB抗体によって活性化されたPBMCがサイトカインを産生する能力を評価した。抗TCR VB抗体で活性化されたPBMCのサイトカイン産生を、(i)抗CD3e抗体(OKT3またはSP34-2);(ii)抗TCR VA 12.1抗体6D6.6、抗TCR VA24JA18抗体6B11などの抗TCR Vα(TCR VA)抗体;(iii)抗TCRαβ抗体T10B9;および/または(iv)アイソタイプ対照(BGM0109)で活性化されたPBMCのサイトカイン産生と比較した。試験した抗TCR VB抗体には、ヒト化抗TCRVB 13.1抗体(A-H.1またはA-H.2)、マウス抗TCR VB5抗体E、マウス抗TCR VB8.1抗体B、およびマウス抗TCR VB12抗体Dが含まれる。BGM0109は、以下:
METDTLLLWVLLLWVPGSTGGLNDIFEAQKIEWHEGGGGSEPRTDTDTCPNPPDPCPTCPTPDLLGGPSVFIFPPKPKDVLMISLTPKITCVVVDVSEEEPDVQFNWYVNNVEDKTAQTETRQRQYNSTYRVVSVLPIKHQDWMSGKVFKCKVNNNALPSPIEKTISKPRGQVRVPQIYTFPPPIEQTVKKDVSVTCLVTGFLPQDIHVEWESNGQPQPEQNYKNTQPVLDSDGSYFLYSKLNVPKSRWDQGDSFTCSVIHEALHNHHMTKTISRSLGNGGGGS(配列番号3282)のアミノ酸配列を含む。
図6Aに示されるように、プレート結合したA-H.1またはA-H.2、または抗CD3e抗体(OKT3またはSP34-2)を用いて、ヒトPBMCを活性化した場合、T細胞サイトカインIFNgが誘導された(図6A)。試験したすべての抗TCR VB抗体は、IFNgの産生に対して類似の効果を有した(図6B)。抗TCR VA抗体は、類似のIFNg産生を誘導しなかった。
IL-2産生に関して、A-H.1およびA-H.2で活性化されたPBMCは、抗CD3e抗体(OKT3またはSP34-2)で活性化されたPBMCと比較して、IL-2産生の増加(図7A)および遅延動態(図7B)をもたらした。図7Bは、抗TCR VB抗体で活性化されたPBMCが、活性化(プレート被覆された抗体とのインキュベーション)後の5日目または6日目にIL-2のピーク産生を実証する。対照的に、OKT3で活性化されたPBMCにおけるIL-2産生は、活性化後の2日目でピークに達した。IFNGと同様に、IL-2効果(例えば、IL-2の産生の増強および遅延動態)は、試験したすべての抗TCR VB抗体にわたって類似していた(図7B)。
また、サイトカインIL-6、IL-1βおよびTNF-αの産生は、「サイトカインストーム」(適切にはCRS)と関連し、類似の条件下で評価された。図8A、9Aおよび10Aは、抗CD3e抗体で活性化されたPBMCがIL-6(図8A)、TNF-α(図9A)およびIL-1β(図10A)の産生を実証するが、A-H.1またはA-H.2で活性化したPBMCでは、これらのサイトカインの誘導は、全く観察されないかまたはほとんど観察されなかったことを示す。図9Bおよび10Bに示されるように、TNF-αおよびIL-1βの産生は、抗TCR VB抗体のいずれかを用いたPBMCの活性化によって誘導されなかった。
さらに、A-H.1活性化されたCD3+T細胞によるIFNg産生の動態は、抗CD3e mAb(OKT3およびSP34-2)によって活性化されたCD3+T細胞により産生されるものに比べて遅延することが注目された(図11Aおよび11B)。
最後に、TEMRAとして公知であるメモリーエフェクターT細胞のサブセットは、A-H.1またはA-H.2によって活性化されたCD8+T細胞において優先的に拡大することが観察された(図12)。単離したヒトPBMCは、100nMで、固定化(プレート被覆)された抗CD3eまたは抗TCR Vβ13.1で6日間、活性化された。6日間のインキュベーション後、T細胞サブセットは、Naive T細胞(CD8+、CD95-、CD45RA+、CCR7+)、T幹細胞メモリー(TSCM;CD8+、CD95+、CD45RA+、CCR7+)、Tセントラルメモリー(Tcm;CD8+、CD95+、CD45RA-、CCR7+)、Tエフェクターメモリー(Tem;CD8+、CD95+、CD45RA-、CCR7-)、およびTエフェクターメモリー再発現CD45RA(Temra;CD8+、CD95+、CD45RA+、CCR7-)の表面マーカーに対してFACS染色により同定された。抗TCR Vβ13.1抗体(A-H.1またはA-H.2)によって活性化されたヒトPBMCは、抗CD3e抗体(OKT3またはSP34-2)によって活性化されたPBMCと比較した場合、CD8+TSCMおよびTemra T細胞サブセットを増加させた。類似した拡大は、CD4+T細胞を用いて観察された。
結論
この実施例において提供されるデータは、TCR Vbに対して指向される抗体が、例えば、T細胞のサブセットを優先的に活性化し、例えば、腫瘍細胞溶解を促進し得るが、CRSを促進し得ないTEMRAの拡大を導くことができることを示す。したがって、FabもしくはscFV、またはTCR Vbに指向されるペプチドのいずれかを利用する二特異性構築物は、例えば、抗CD3e標的化に関連するCRSの有害な副作用なしに、がん免疫療法のための腫瘍細胞溶解を促進するためにT細胞を活性化および再指向させるために使用することができる。
実施例4:BCMAおよびT細胞エンゲージャーに対する二重標的抗体分子による多発性骨髄腫(MM)細胞のオンターゲットT細胞媒介性の細胞毒性
この実施例は、T細胞上のT細胞エンゲージャー、例えば、TCRVbおよびMM細胞上のBCMAを認識する二重標的抗体分子による多発性骨髄腫(MM)細胞のオンターゲットT細胞媒介性の細胞毒性を示す。
図13Aに示されるように、プレート結合した抗TCRVb抗体で5日間、活性化された精製ヒトT細胞は、プレート結合した抗CD3(OKT3)抗体で活性化された精製ヒトT細胞よりも高速で増殖する。T細胞の抗TCRVb抗体刺激は、CD45RA+エフェクターメモリーCD8+およびCD4+T細胞(TEMRA)細胞の選択的拡大をもたらした(図13B)。CD8+およびCD4+Temra細胞集団の両方は、抗TCRVb抗体で刺激された場合、非刺激細胞または抗CD3(SP34)抗体で刺激された細胞と比較してより増大した。抗TCRVb抗体は、抗CD3抗体で刺激されたPBMCと比較して、抗TCRVb抗体で刺激されたPBMCによるIFN-gの分泌の遅延をもたらした(図13C)。さらに、抗TCRVb抗体または抗CD3抗体で刺激されたT細胞は、図13Dに示されるように、多発性骨髄腫標的細胞の同等の溶解をもたらした。図13E~13Fに示されるように、100ng/mlのプレート結合した抗TCRVb抗体、または抗CD3抗体で5日間、刺激されたT細胞は、パーフォリンおよびグランザイムBを分泌した。
抗TCRVb抗体によるPBMCの活性化は、抗OKT3抗体で活性化されたPBMC
と比較して、IL-2および/またはIL-15のより高い産生および/または分泌をもたらした(図14A)。抗TCRVb抗体で活性化されたPBMCは、例えば、ナチュラルキラー(NK)細胞の拡大および/または生存、例えば、増殖ももたらした(図14B)。対照的に、抗OKT3抗体で活性化されたPBMCSは、NK細胞拡大をもたらさなかった。さらに、実施例3に記載されるように、抗TCRVb抗体で活性化されたPBMCは、CRSと関連するサイトカインIL-6、IL-1βおよびTNF-αの産生をもたらさなかった(図15)。これらのin vitro特徴付け研究は、一部の実施形態では、抗TCRVb抗体は、例えば、T細胞を活性化および/または刺激して、標的細胞溶解、パーフォリン分泌およびグランザイムB分泌、ならびに、例えば、遅延動態を伴うIFN-gの分泌によって証明されるように、T細胞殺滅を促進することを示す。
次に、多発性骨髄腫(MM)細胞を標的とし、殺滅させる、一方のアームではBCMAを、他方のアームではTCRVbを標的とする二重標的抗体分子(分子I)の能力を試験した。健康なドナーPBMCは、RMPI8226 MM細胞系、および以下の二重標的抗体分子:BCMA-TCRVb(分子I)、BCMA-CD3、もしくは対照-TCRVbのうちの1つとともに同時インキュベートし、または、次に、フローサイトメトリーを用いてアイソタイプ対照標的細胞溶解を評価した。図16Aに示されるように、二重標的BCMA-TCRVb抗体分子(分子I)は、in vitroでMM細胞の殺滅をもたらした。
二重標的BCMA-TCRVb抗体分子(分子I)は、MMマウスモデルにおいてMM腫瘍成長を阻害するその能力についてin vivoでさらに試験された。NCI-H929細胞系を0日目にNOD-scid IL2rγヌル(NSG)レシピエントマウスに注射し、続いて、9日目にPBMCを送達した。12日目、15日目、18日目および21日目に、二重標的BCMA-TCRVb抗体分子(分子I)を0.5mg/kgの用量で腹腔内注射により投与した。図16Bは、二重標的化BCMA-TCRVb抗体分子(分子I)によるin vivoでのMM腫瘍成長の予防、例えば、阻害を示す。これらの結果は、一部の実施形態では、二重標的BCMA-TCRVb抗体分子は、例えば、腫瘍細胞、例えば、MM腫瘍細胞をin vitroおよびin vivoで殺滅させることができることを実証する。したがって、一部の実施形態では、二重標的BCMA-TCRVb抗体分子を、例えば、がん、例えば、血液がん、例えば、MMに対する療法として使用することができる。
実施例5:FcRH5およびT細胞エンゲージャーに対する二重標的抗体分子のインビトロ細胞毒性
この実施例は、T細胞上のT細胞エンゲージャー、例えば、TCRVb、およびMM細胞上のFcRH5を認識する二重標的抗体分子による、多発性骨髄腫(MM)細胞におけるin vitro細胞毒性を示す。健康なドナーのPBMCまたは精製T細胞を、MOL8M MM細胞系と一方のアームではFcRH5および他方のアームではTCRVb(分子E)を標的とする二重標的抗体分子とともに、またはアイソタイプ対照抗体とともに同時インキュベートした。次に、フローサイトメトリーを用いて、標的細胞溶解を評価した。図17に示されるように、二重標的化FcRH5-TCRVb分子(分子E)は、精製T細胞またはPBMCの両方によるMM細胞の殺滅をもたらした。これは、二重標的化FcRH5-TCRVb分子が、T細胞などの免疫細胞、例えば、PBMCによって、MM細胞の殺滅を標的化し、促進することができることを示す。
実施例6:抗TCR Vβ8a抗体の特徴
この実施例は、抗TCR Vβ8a抗体(B-H.1)のin vitro特徴付けを示す。TCR Vβ8は、TCR Vβ12とも呼ばれる(表8に記載される)。単離したヒトPBMCは、100nMで、固定化(プレート被覆)されたCD3εまたは抗TC
R Vβ8aで活性化され、細胞培養上清を刺激後の1日目、2日目、3日目、5日目、6日目および8日目に回収した。サイトカイン(IFNγ、IL-2、TNFα、IL-1βまたはIL-6)は、製造業者のプロトコールに記載されているように、MSDテクノロジープラットフォーム(MesoScale Discovery)を用いて測定された。
図18A~18Bに示されるように、抗TCR Vβ8a抗体(B-H.1)によって活性化されたヒトPBMCは、抗CD3ε抗体(OKT3またはSP34-2)によって活性化されたものと比較した場合、類似のまたは低減したレベルのIFNγ(図18B)、およびより高レベルのIL-2(図18B)を産生する。
図19A~19Bは、抗TCR Vβ8a抗体(B-H.1)によって活性化されたヒトPBMCが、有意なレベルのIL-6またはIL1bを産生しないことを示す。抗TCR Vβ8a抗体(B-H.1)によるヒトPBMCの活性化はまた、抗CD3ε抗体(OKT3またはSP34-2)によって活性化されたPBMCと比較した場合、より少ないTNFaをもたらす(図19Cを参照)。
要約すると、実施例3に示されるように、この実施例は、抗TCR Vβ8a抗体が、例えば、T細胞サイトカイン、例えば、IL-2およびIFNgの発現を優先的に誘導することができるが、「サイトカインストーム」(適切にはCRS)と関連するサイトカインIL-6、IL-1βおよびTNF-αの産生を誘導することができないことを示す。
実施例7:抗TCRβV抗体D抗体の特徴
この実施例は、T細胞のサブセットに結合し、活性化することができるが、例えば、CRSが全く低減しないかまたは顕著には低減しない、抗TCRβV抗体の特徴付けを記載する。
ヒトPBMCを全血から単離し、続いて、100nMで、抗TCR Vβ12抗体(抗体D)または抗CD3e抗体(OKT3)で固相(プレート被覆)刺激を行った。1日目、2日目、3日目、5日目、または6日目に上清を回収し、その後、IFNg、IL-2、IL-6、IL-1β、またはTNFαについてマルチプレックスサイトカイン分析を行った。データは、製造業者のプロトコールに従って、MSD(Meso Scale Discovery)プラットフォームを用いて定量化された。
図20Aに示されるように、プレート結合した抗TCR Vβ12抗体(抗体D)または抗CD3e抗体(OKT3)を用いて、ヒトPBMCを活性化した場合、T細胞サイトカインIFNgが誘導された。IL-2産生に関して、抗TCR Vβ12抗体(抗体D)で活性化されたPBMCは、抗CD3e抗体(OKT3)で活性化されたPBMCと比較して、遅延動態を伴うIL-2産生の増加をもたらした(図20B)。
また、サイトカインIL-6、IL-1βおよびTNF-αの産生は、「サイトカインストーム」(適切にはCRS)と関連し、類似の条件下で評価された。図20C~20Eは、抗CD3e抗体で活性化されたPBMCがIL-6(図20D)、TNF-α(図20C)およびIL-1β(図20E)の産生を実証するが、これらのサイトカインの誘導は、抗TCR Vβ12抗体(抗体D)で活性化されたPBMCでは全く観察されないかまたはほとんど観察されなかった。
この実施例で提供されるデータは、TCR Vβに対して指向される抗体が、例えば、T細胞のサブセットを優先的に活性化することができ、サイトカインストームまたはCRSに関連するサイトカインの誘導をもたらさないことを示す。
実施例8:抗TCRβV抗体Eの特徴
この実施例は、T細胞のサブセットに結合し、活性化することができるが、例えば、CRSが全く低減しないかまたは顕著には低減しない、抗TCRβV抗体の特徴付けを記載する。
全血からヒトPBMCを単離し、続いて、それぞれ100nMで、抗TCR Vβ5抗体(抗体E)または抗CD3e抗体(OKT3およびSP34-2)で固相(プレート被覆)刺激を行った。1日目、3日目、5日目、または7日目に上清を回収し、続いて、IFNg、IL-2、IL-6、IL-1β、IL-10またはTNFαについてマルチプレックスサイトカイン分析を行った。データは、製造業者のプロトコールに従って、MSD(Meso Scale Discovery)プラットフォームを用いて定量化した。
図21Aに示されるように、プレート結合した抗TCR Vβ5抗体(抗体E)または抗CD3e抗体(OKT3およびSP34-2)を用いて、ヒトPBMCを活性化した場合、T細胞サイトカインIFNgが誘導された。IL-2産生に関して、抗TCR Vβ5抗体(抗体E)で活性化されたPBMCは、抗CD3e抗体(OKT3またはSP34-2)で活性化されたPBMCと比較して、遅延動態を伴うIL-2産生の増加をもたらした(図21B)。
また、サイトカインIL-6、IL-1β、IL-10およびTNF-αの産生は、「サイトカインストーム」(適切にはCRS)と関連し、類似の条件下で評価された。図22A~22Dは、抗CD3e抗体で活性化されたPBMCがIL-1β(図22A)、IL-6(図22B)、TNF-α(図22C)およびIL-10(図22D)の産生を実証することを示すが、これらのサイトカインの誘導は、抗TCR Vβ5抗体(抗体E)で活性化したPBMCでは全く観察されないかまたはほとんど観察されなかった。
この実施例で提供されるデータは、TCR Vβに対して指向される抗体が、例えば、T細胞のサブセットを優先的に活性化することができ、サイトカインストームまたはCRSに関連するサイトカインの誘導をもたらさないことを示す。
実施例9:BCMAおよびTCRβVに対する二重標的抗体分子の特徴
この実施例は、T細胞のサブセットに結合し、活性化することができるが、例えば、CRSが全く低減しないかまたは顕著には低減しない、抗TCRβV結合部分およびBCMA結合部分(分子H)を含む二重標的抗体(例えば、二特異性分子)の特徴付けを記載する。
ヒトPBMCを全血から単離し、続いて、それぞれ100nMで、抗TCRβV×BCMA二特異性分子(分子H)または抗CD3e抗体(OKT3)で固相(プレート被覆)刺激を行った。1日目、2日目、3日目、または5日目に上清を回収し、その後、IFNg、IL-2、IL-6、IL-1β、IL-10またはTNFαについてマルチプレックスサイトカイン分析を行った。データは、製造業者のプロトコールに従って、MSD(Meso Scale Discovery)プラットフォームを用いて定量化された。
図23Aに示されるように、プレート結合した抗TCRβV×BCMA二特異性分子(分子H)または抗CD3e抗体(OKT3)を用いてヒトPBMCを活性化した場合、T細胞サイトカインIFNgが誘導された。IL-2産生に関して、抗TCRβV×BCMA二特異性分子(分子H)で活性化されたPBMCは、抗CD3e抗体(OKT3)で活性化されたPBMCと比較して、IL-2産生の増加をもたらした(図23B)。
また、サイトカインIL-6、IL-1β、IL-10およびTNF-αの産生は、「サイトカインストーム」(適切にはCRS)と関連し、類似の条件下で評価された。図23C~Eは、抗CD3e抗体で活性化されたPBMCがIL-1β(図23C)、IL-6(図23D)、TNF-α(図23D)およびIL-10(図23E)の産生を実証するが、これらのサイトカインの誘導は、抗TCRβV×BCMA二特異性分子(分子H)で活性化されたPBMCでは全く観察されないかまたはほとんど観察されなかった。
この実施例で提供されるデータは、TCR Vβに対して指向される抗体が、例えば、T細胞のサブセットを優先的に活性化することができ、サイトカインストームまたはCRSに関連するサイトカインの誘導をもたらさないことを示す。
実施例10:抗TCRVb抗体のサイトカインおよびケモカインプロファイル
この実施例は、抗TCR Vβ抗体による活性化後に、PBMCによって分泌されるサイトカインおよびケモカインを記載する。
全血からヒトPBMCを単離し、続いて、それぞれ100nMで、抗TCRβV抗体(A-H.1、B-H.1)、または抗TCRVb抗体(分子H)、アイソタイプ対照(BGM0122)または抗CD3e抗体(SP34)を含む二特異性分子で固相(プレート被覆)刺激を行った。1日目、2日目、3日目、4日目、5日目、6日目、7日目および8日目に上清を回収し、続いて、示されたサイトカインまたはケモカインについて多重分析を行った。データは、製造業者のプロトコールに従って、MSD(Meso Scale Discovery)プラットフォームを用いて定量化された。BGM0122は、以下:
METDTLLLWVLLLWVPGSTGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGKGGGGSGGGGSGLNDIFEAQKIEWHE(配列番号3283)のアミノ酸配列を含む。
図25A~25J、図26A~26H、および図27A~27Lは、示された抗体で活性化されたPBMCからのサイトカインおよびケモカインのレベルを示す。
図25Aに示されるように、プレート結合した抗TCR Vβ抗体または抗CD3e抗体(OKT3)を用いて、ヒトPBMCを活性化した場合、T細胞サイトカインIFNgが誘導された。IL-2産生に関して、抗TCR Vβ抗体で活性化されたPBMCは、抗CD3e抗体(OKT3)で活性化されたPBMCと比較して、遅延動態を伴うIL-2産生の増加をもたらした(図25B)。
IL-1β(図25C)、IL-6(図25D)、IL-10(図25E)、IL-4(図25F)、TNFα(図25G)、IP-10(図26C)、IL-12-23p40(図27D)、IL-17A(図27G)およびIL-1a(図27H)は、抗CD3e抗体(OKT3)によって誘導され、抗TCRVb抗体で活性化されたPBMCで、これらのサイトカインまたはケモカインの誘導は全く観察されないかまたはほとんど観察されなかった。
抗TCR Vβ抗体で活性化されたPBMCは、IL-13(図25I)、IL-8(図25J)、エオタキシン(図26A)、エオタキシン3(図26B)、IL-18(H
A)(図26C)、MCP-1(図26E)、MCP-4(図26F)、MDC(図26G)、MIP1a(図26H)、MIP1B(図27A)、TARC(図27B)、GM-CSF(図27C)、IL-15(図27E)、IL-16(図27F)、およびIL-15(図27I)、IL-7(図27J)の誘導を実証した。
実施例11:TCR Vb活性化T細胞のナノストリングに基づく遺伝子発現プロファイリング
この実施例は、TCR Vβ活性化T細胞の遺伝子発現プロファイリングを記載し、例えば、T細胞のTCR Vβ活性化の根底にある潜在的なメカニズムまたは経路を明らかにする。
第1の研究では、抗TCR Vβ13.1抗体A-H.1を抗CD3抗体OKT3と比較した。簡単に述べると、全血からヒトPBMCを単離した。単離されたPBMCから、ヒトCD3+T細胞を磁気ビーズ分離(負の選択)(Miltenyi biotec)を用いて単離し、100nMで、固定化(プレート被覆)された抗TCR Vβ13.1抗体(A-H.1)または抗CD3抗体(OKT3)によって6日間、活性化した。次に、製造業者のプロトコールに従って、遺伝子発現プロファイリング(PanCancer
IO 360(商標)パネル、nanoString)のために、活性化T細胞(プレート被覆由来)を調製した。差次的遺伝子発現分析は、nSolver分析ソフトウェア(Nanostring)を用いて、抗TCR Vβ13.1(A-H.1)対抗CD3(OKT3)活性化T細胞によりグループ化された。表15Aに示されるデータは、3人のドナーの平均値である。表15Aに示される差次的に制御された遺伝子のp値は、0.05以下である。遺伝子発現の倍の変化を示す表15Aの第4列において、正の値は、OKT3活性化T細胞と比較して、TCR Vβ活性化T細胞において転写レベルで上方制御される遺伝子を指し、負の値は、OKT3活性化T細胞と比較して、TCR Vβ活性化T細胞において転写レベルで下方制御される遺伝子を指す。
Figure 2023509708000111
Figure 2023509708000112
Figure 2023509708000113
Figure 2023509708000114
第2の研究では、多特異性抗TCR Vβ13.1/抗BCMA抗体分子Hを抗CD3抗体OKT3と比較した。精製されたT細胞は、100nMで、抗TCR Vβ抗体分子Hまたは抗CD3e抗体(OKT3)で6日間、固相抗TCR Vβ抗体で刺激された。拡大されたT細胞を遠心分離により回収し、続いて、RNAを抽出した。nCounter Technology(Nanostring)を用いて、778個の免疫関連遺伝子をカウントし、続いて、nSolver分析ツールを用いて遺伝子発現分析を行った。この実施例に記載されるデータは、3人のドナーの代表的なものである。
この分析に基づいて、一連の遺伝子が、OKT3活性化T細胞と比較して、TCR Vβ活性化T細胞において差次的に制御されていることが同定された(表15B)。表15Bに示される差次的に制御された遺伝子のp値は、0.05以下である。例えば、LIF、CD40LG、PDCD1、CXCR5、LTA、およびCD80はすべて、OKT3活性化T細胞と比較して、TCR Vβ活性化T細胞において転写レベルで上方制御される。GZMK、ENTPD1(CD39)、TCF7、CD96、HLA-DRB4、SIGIRRおよびSELLは、OKT3活性化T細胞と比較して、TCR Vβ活性化T細胞において転写レベルで下方制御される。TCR Vβ活性化T細胞はまた、高レベルの細胞溶解性エフェクター(例えば、IFNg、グランザイムBおよびパーフォリン)を発現した。
Figure 2023509708000115
実施例12:親和性成熟ヒト化抗体A-H抗体の結合親和性
この実施例は、組換えタンパク質TCRVB 6-5に対する親和性成熟ヒト化抗体A-H抗体の結合親和性の評価を記載する。
抗体A-Hヒト化抗体を親和性成熟させた。得られた親和性成熟抗体を、以下に記載されるように、TCRVB 6-5に対するそれらの結合親和性について試験した。
5μg/mLのTCRVB 6-5をビオチンCAPシリーズSセンサーチップ上に60RUに固定した。BJM0277を200nMに希釈し、次に、2倍に連続希釈した。会合は120秒、解離は300秒であった。このアッセイは、1×HBS-EP+緩衝液pH7.4および25℃で行った。データは、1:1結合モデルを用いて適合された。
5μg/mLのTCRVB 6-5をビオチンCAPシリーズSセンサーチップ上に60RUに固定した。A-H.45を50nMに希釈し、次に、2倍連続希釈した。会合は120秒、解離は300秒であった。このアッセイは、1×HBS-EP+緩衝液pH7.4および25℃で行った。データは、1:1結合モデルを用いて適合された。A-H.45は、改善された酵母クローン(TCRvB/CD19二特異性)であり、HCDR3の直前のフレームワーク3における最後の残基に突然変異(GからV)を含む。親和性は、BJM0277の35倍である(表16)。
5μg/mLのTCRVB 6-5をビオチンCAPシリーズSセンサーチップ上に60RUに固定した。A-H.52を50nMに希釈し、次に、2倍に連続希釈した。会合
は120秒、解離は300秒であった。このアッセイは、1×HBS-EP+緩衝液pH7.4および25℃で行った。データは、1:1結合モデルを用いて適合された。A-H.52はファージクローンであり、一価scFvである。A-H.52は、CDRH1に2つの突然変異を有する。A-H.52の親和性は、BJM0277の20倍である(表16)。
5μg/mLのTCRVB 6-5をビオチンCAPシリーズSセンサーチップ上に60RUに固定した。A-H.53を50nMに希釈し、次に、2倍連続希釈した。会合は120秒、解離は300秒であった。このアッセイは、1×HBS-EP+緩衝液pH7.4および25℃で行った。データは、1:1結合モデルを用いて適合された。A-H.53(ファージクローン)の親和性はpM範囲内にある(表16)。A-H.53の親和性は、BJM0277の200倍である(表16)。
5μg/mLのTCRVB 6-5をビオチンCAPシリーズSセンサーチップ上に60RUに固定した。A-H.54を50nMに希釈し、次に、2倍連続希釈した。会合は120秒、解離は300秒であった。このアッセイは、1×HBS-EP+緩衝液pH7.4および25℃で行った。データは、1:1結合モデルを用いて適合された。A-H.54(ファージクローン)の親和性は、BJM0277の17倍である(表16)。
Figure 2023509708000116
実施例13:皮下ヒト腫瘍異種移植モデルにおけるCD19/TCRvB二特異性分子の療法有効性
この実施例は、皮下ヒト腫瘍動物モデルにおけるCD19/TCRvB二特異性分子のin vivo有効性を実証する。
研究の1日目に、ホタルルシフェラーゼを安定に発現する、1×10細胞のヒトがん細胞系Raji(Raji-luc)は、雌NOD/SCID/IL-2Rγヌル(NSG)マウスの右背側腹に皮下注射された。3日目に、10×10個のヒトPBMCを腹腔内に注射によりマウスに移植した。
抗体処置は、腫瘍が平均腫瘍容積(TV)が80mmに達した10日目に開始した。各群の平均TVは、処置の開始時にいずれの他の群と統計学的に差はなかった。マウスは、0.2mg/kg、1mg/kgおよび5mg/kgのCD19/TCRvB二特異性分子を3日ごとに計7回ボーラス静脈内注射で処置された。腫瘍体積(TV)を3日ごとにキャリパーで測定し、TVの群間比較により進行を評価した。腫瘍増殖阻害T/C[%]は、T/C[%]=100×(分析群の平均TV)/(ビヒクル群の平均TV)として算出された。
結果を表17および図28に示す。CD19/TCRvB二特異性分子による処置は、ビヒクル対照処置と比較して、腫瘍増殖を阻害した(図28)。結果は、CD19/TCRvB二特異性分子が腫瘍成長を阻害し、抗腫瘍活性を有することを実証する。
Figure 2023509708000117
実施例14:ヒト腫瘍異種移植モデルにおけるCD19/TCRvB二特異性分子の療法有効性
この実施例は、異種移植動物モデルにおけるCD19/TCRvB二特異性分子のin
vivo有効性を実証する。
研究の1日目に、10×10個のヒトPBMCは、腹腔内への注射によりNOD/SCID/IL-2Rγヌル(NSG)マウスに移植された。
7日目に、ホタルルシフェラーゼを安定に発現する、1×10細胞のヒトがん細胞系Raji(Raji-luc)は、NOD/SCID/IL-2Rγヌル(NSG)マウスに静脈内注射された。対照動物は、ホタルルシフェラーゼを安定に発現する、10×10細胞のCD19陰性ヒトがん細胞系K562(K562-luc)を注射された。これらの動物を用いて、CD19/TCRvB分子の特異的殺滅能を評価した。抗体処置は、腫瘍生着が4×10光子/秒の平均生物発光フラックスレベルに達した16日目に開始した。各群の平均フラックスレベルは、処置の開始時にいずれの他の群と統計学的に差はなかった。マウスは、1mg/kgおよび5mg/kgのCD19/TCRvB二特異性分子を3日ごとに計6回ボーラス静脈内注射で処置された。
腫瘍負荷は、生物発光イメージングにより毎週測定され、総生物発光フラックス(総フラックス)の群間比較により評価された。腫瘍成長阻害T/C[%]は、T/C[%]=100×(分析群の平均総フラックス)/(ビヒクル群の平均総フラックス)として算出された。
Raji-luc移植動物の結果を表18および図29Aに示し、K562-luc移植動物の結果を表19および図29Bに示す。結果は、CD19/TCRvB二特異性分子が腫瘍成長を阻害し、抗腫瘍活性を有することを実証する(図29Aおよび表18)。
Figure 2023509708000118
Figure 2023509708000119
実施例15:ヒト腫瘍異種移植モデルにおけるBCMA/TCRvB二特異性分子の療法有効性
この実施例は、異種移植動物モデルにおけるBCMA/TCRvB二特異性分子のin
vivo有効性を実証する。
1日目に、ホタルルシフェラーゼを安定に発現する、20×10細胞のヒトがん細胞系RPMI-8226(RPMI-8226-luc)をNOD/SCID/IL-2Rγヌル(NSG)マウスに静脈内注射した。11日目に、10×10個のヒトPBMCを腹腔内に注射によりマウスに移植した。抗体処置は、腫瘍生着が4×10光子/秒の平均生物発光フラックスレベルに達した17日目に開始した。マウスは、BCMAとTCRvBの両方について2価である0.5mg/kgの分子(2×2分子)、およびBCMAについて2価であり、TCRvBについて1価である0.5mg/kgの分子(2×1分子)を週1回、計2用量で静脈内ボーラス注射により処置された。
腫瘍負荷は、生物発光イメージングにより毎週測定され、総生物発光フラックス(総フラックス)の群間比較により評価された。腫瘍成長阻害T/C[%]は、T/C[%]=100×(分析群の平均総フラックス)/(ビヒクル群の平均総フラックス)として算出された。
これらの研究の結果を表20および図30に示す。BCMA/TCRvB二特異性分子による処置は、ビヒクル対照処置と比較して、腫瘍成長を阻害した(図29)。結果は、BCMA/TCRvB二特異性分子が腫瘍成長を阻害し、抗腫瘍活性を有することを実証
する。
Figure 2023509708000120
実施例16:抗体構築物の発現および精製
プラスミドの構築
タンパク質配列をコードするDNAをCricetulus griseusにおける発現のために最適化し、合成し、ゲートウェイクローニングを用いてpcDNA3.4-TOPO(Life Technologies A14697)にクローニングした。すべての構築物は、Igカッパリーダー配列METDTLLLWVLLLWVPGSTG(配列番号3288)を含有した。
発現および精製
プラスミドをExpi293細胞(Life Technologies A14527)またはExpiCHO細胞(Life Technologies A29127)のいずれかに同時トランスフェクトした。1:1の重鎖比および3:2の軽鎖/重鎖比を有する多特異性構築物について、該当する場合、1mgの総DNAを用いてトランスフェクションを行った。Expi293細胞におけるトランスフェクションは、線状の25,000 Daポリエチレンイミン(PEI、Polysciences Inc 23966)を用いて、総DNAと3:1の比で行われた。DNAおよびPEIは、各々、50mLのOptiMem(Life Technologies 31985088)培地に添加され、滅菌濾過された。DNAおよびPEIを10分間合わせ、1.8~2.8×10細胞/mLの細胞密度および少なくとも95%の生存率でExpi293細胞に添加した。ExpiCHOトランスフェクションは、製造業者の指示に従って行われた。Expi293細胞を、トランスフェクション後の5~7日間、8%COの37℃で加湿インキュベーター中に増殖させ、ExpiCHO細胞を、5%COに32℃にて14日間、増殖させた。4500×gでの遠心分離により細胞をペレット化し、上清を0.2μm膜を通して濾過した。プロテインAレジン(GE 17-1279-03)を濾過された上清に添加し、1~3時間、室温でインキュベートした。レジンをカラムに充填し、3×10カラム体積のダルベッコのリン酸緩衝生理食塩水(DPBS、Life Technologies 14190-144)で洗浄した。結合したタンパク質を、20mMクエン酸塩、100mM NaCl、pH2.9でカラムから溶出させた。必要に応じて、タンパク質は、DPBSの泳動緩衝液を用いて、Superdex 200カラム上でリガンド親和性および/またはサイズ排除クロマトグラフィーを用いてさらに精製された。
実施例17:抗TRBV5-5抗体クローン抗体Cのヒト化
マウス抗TCRvβ抗体クローン抗体C VHおよびVLの生殖系列は、IMGT命名法を用いて割り当てられ、CDR領域はKabatおよびChothia分類を組み合わせて定義された。配列番号232および配列番号233は、それぞれ、抗体C VHおよびVL配列であり、VH生殖系列はマウスIGHV2-6-701であり、VL生殖系列はマウスIGKV10-9402である。実施例1に記載される抗体Aをヒト化するために適用された方法は、抗体Cをヒト化するために用いられた。抗体C VHをヒトIGHV2-2601、IGHV2-70*04、IGHV4-4*02、IGHV2-5*09、IGHV2-5*08、IGHV4-34*09、IGHV4-59*01、IGHV4-59*07、IGHV4-61*02、IGHV4-38-2*01、IGHV4-31*01、IGHV3-49*04、IGHV3-49*02、IGHV4-4*07、IGHV3-49*05、IGHV4-34*10、IGHV4-28*04、IGHV3-72*01、IGHV3-15*07、IGHV6-1*01、IGHV3-7*01、IGHV4-34*01、IGHV3-33*02、IGHV3-48*02、IGHV3-23*03、IGHV3-21*01、IGHV3-73*01、IGHV3-30*02、IGHV3-7*01、IGHV3-43*01、およびIGHV3-5303にヒト化し、抗体C VLをIGKV1D-4301、IGKV1-2701、IGKV1-1702、IGKV1-1701、IGKV1-501、IGKV4-101、IGKV3-702、IGKV3-701、IGKV2-2902、IGKV6D-4101、IGKV2-2801、IGKV2-4001、IGKV3-1501、IGKV2-2401、IGKV6-2101、IGKV2D-2601、およびIGKV2D-2603にヒト化した。
配列番号3040~3089は抗体Cヒト化重鎖であり、配列番号3000~3039は抗体Cヒト化軽鎖である(表10に記載される)。
実施例18:TRBV10-1、TRBV10-2、およびTRBV10-3抗体クローン抗体Dのヒト化
マウス抗TCRvβ抗体クローン抗体D VHおよびVLの生殖系列は、IMGT命名法を用いて割り当てられ、CDR領域はKabatおよびChothia分類を組み合わせて定義された。配列番号3183および配列番号3184は、それぞれ、抗体D VHおよびVL配列であり、VH生殖系列はマウスIGHV5-601であり、VL生殖系列はマウスIGKV4-5901である。
実施例1に記載される抗体Aをヒト化するために適用された方法は、抗体Dをヒト化するために用いられた。抗体D VHをヒトIGHV3-3003、IGHV3-30*02、IGHV3-7*01、IGHV3-21*01、IGHV3-23*04、IGHV3-30*15、IGHV3-48*02、IGHV3-53*04、IGHV3-23*03、IGHV3-53*03、IGHV3-53*01、IGHV3-9*01、IGHV3-30*13、IGHV3-20*01、IGHV3-43D*03、IGHV3-43*02、IGHV3-43*01、IGHV3-53*02、IGHV3-13*01、IGHV3-38-3*01、IGHV3-9*03、IGHV3-64D*06、IGHV3-33*02、IGHV3-11*03、IGHV3-64*02、IGHV3-64*01、IGHV3-64*03、IGHV3-7*01、IGHV3-35*01、IGHV3-13*02、IGHV3-38*02、およびIGHV3-3801にヒト化し、抗体D VLは、ヒトIGKV3-1101、IGKV1-1302、IGKV1-901、IGKV6-2101、IGKV1D-4301、IGKV3-1101、IGKV3D-1102、IGKV1-1703、IGKV3D-2001、IGKV3-2001、IGKV1D-1601、IGKV4-101、IGKV2-2801、IGKV2-4001、IGKV2-2902、IGKV2-2901、IGKV1D-4201、IGKV2-2401、およびIGKV5-201にヒト化された。配列番号3225~3274は、抗体Dヒ
ト化重鎖であり、配列番号3185~3224は、抗体Dヒト化軽鎖である(表12に記載される)。
実施例19:TRBV5-5およびTRBV5-6抗体クローン抗体Eのヒト化
マウス抗TCRβ抗体クローン抗体E VHおよびVLの生殖系列は、IMGT命名法を用いて割り当てられ、CDR領域はKabatおよびChothia分類を組み合わせて定義された。配列番号3091および配列番号3092は、それぞれ、抗体E VHおよびVL配列であり、VH生殖系列はマウスIGHV1-8201であり、VL生殖系列はマウスIGKV3-501である。
実施例1に記載される抗体Aをヒト化するために適用された方法は、抗体Eをヒト化するために用いられた。抗体E VHをヒトIGHV1-6908、IGHV1-3*02、IGHV1-18*03、IGHV1-3*01、IGHV1-18*01、IGHV1-2*06、IGHV1-2*01、IGHV1-2*06、IGHV1-8*01、IGHV7-4-1*02、IGHV1-58*02、IGHV5-51*01、IGHV7-4-1*04、IGHV7-81*01、IGHV5-51*04、IGHV5-51*01、IGHV1-45*03、IGHV3-49*04、IGHV3-49*02、IGHV3-49*05、IGHV4-4*02、IGHV3-49*05、IGHV3-73*01、IGHV4-4*02、IGHV3-15*07、IGHV3-15*02、IGHV3-72*01、IGHV4-59*07、IGHV4-31*01、IGHV4-31*02、IGHV3-30*15、IGHV3-21*01、IGHV3-7*01、IGHV4-28*01、IGHV4-28*02、IGHV3-30*08、IGHV3-30*05、およびIGHV3-3001にヒト化し、抗体E VLをヒトIGKV4-101、IGKV3-11*01、IGKV3-20*02、IGKV3-11*01、IGKV1-13*02、IGKV3D-11*01、IGKV3D-20*02、IGKV1-13*02、IGKV3D-20*01、IGKV1-9*01、IGKV3D-15*03、IGKV3-15*01、IGKV1-5*01、IGKV2D-29*01、IGKV3-7*02、IGKV1-9*01、IGKV2-28*01、IGKV2-40*01、IGKV2D-29*02、IGKV3-7*01、IGKV2-30*01、IGKV2-24*01、IGKV6D-41*01、IGKV1D-42*01、IGKV2D-26*01、IGKV2D-26*03、およびIGKV5-201にヒト化した。配列番号3133~3182は抗体Eヒト化重鎖であり、配列番号3093~3132は抗体Eヒト化軽鎖である(表11に記載される)。
実施例20:抗TCRVb/CD19抗体分子および抗TCRVb/BCMA抗体分子のin vitro細胞毒性
抗TCR/抗CD19二重標的抗体分子
ヒトPBMCを全血から単離した。単離されたPBMCから、ヒトCD3+T細胞を磁気ビーズ分離(負の選択)(Miltenyi biotec)を用いて単離し、100nMで、固定化(プレート被覆)された抗TCR Vβ13.1(A-H.1)によって6日間、活性化した。次に、活性化T細胞(プレート被覆由来)を移し、50U/mlの濃度でヒトIL-2の存在下、組織培養フラスコ中でさらに2日間拡大させた。拡大させたTCR Vβ13.1+細胞を洗浄し、E:T比が5:1の、CD19を発現するRaji細胞(標的細胞)、および連続希釈濃度のT細胞エンゲージャー二特異性抗体、例えば、抗TCR Vβ13.1/CD19(分子F)、抗CD3/CD19、および抗TCR Vβ13.1(A-H.1、対照として供給)の存在下で24時間、共培養した。24時間後、細胞の共培養上清を回収し、特異的な標的細胞死について定量化した。標的細胞(Raji細胞)は、KILR-レトロ粒子レポーター細胞アッセイ(DiscoverX)である。KILR-Raji標的細胞は、KILRレトロ粒子を用いて、増強され
たProLabel(ePL)、β-galレポーター断片でタグ化されたタンパク質を安定に発現するように操作され、標的細胞の膜が細胞死により損傷された場合、標的細胞は、タグ化されたタンパク質を培地中に放出する。このKILRレポータータンパク質は、β-galレポーターの酵素アクセプター(EA)断片を含有する検出試薬の添加によって、培地/上清中で検出することができる。これにより、基質を加水分解して化学発光出力(RLU)を与える活性β-gal酵素が形成される。標的細胞死のパーセンテージ(%)は、以下の式:
(RLU処置-RLU処置なし)/(RLU最大溶解-RLU処置なし)×100
を用いて算出される。図31Aに示されるデータは、4人のドナーからの平均値である。
抗TCR/抗BCMA二重標的抗体分子
全血からヒトPBMCを単離した。単離されたPBMCから、ヒトCD3+T細胞を磁気ビーズ分離(負の選択)(Miltenyi biotec)を用いて単離し、100nMで、固定化(プレート被覆)された抗TCR Vβ13.1(A-H.1)によって6日間、活性化した。次に、活性化T細胞(プレート被覆由来)を移し、50U/mlの濃度でヒトIL-2の存在下、組織培養フラスコ中でさらに2日間、拡大させた。拡大させたTCR Vβ13.1+細胞を洗浄し、E:T比が5:1の、BCMAを発現するRPMI8226細胞(標的細胞)、および連続希釈濃度のT細胞エンゲージャー二特異性抗体、例えば、抗TCR Vβ13.1/BCMA(分子G)、抗CD3/BCMA、および抗TCR Vβ13.1(A-H.1、対照として供給)の存在下で24時間、共培養した。24時間後、細胞の共培養上清を回収し、特異的な標的細胞死について定量化した。標的細胞(RPMI8226細胞)は、KILR-レトロ粒子レポーター細胞アッセイ(DiscoverX)である。KILR-RPMI8226標的細胞は、KILRレトロ粒子を用いて、増強されたProLabel(ePL)、β-galレポーター断片でタグ化されたタンパク質を安定に発現するように操作され、標的細胞の膜が細胞死により損傷された場合、標的細胞は、タグ化されたタンパク質を培地中に放出する。このKILRレポータータンパク質を検出し、標的細胞死のパーセンテージ(%)を上記されるように算出した。図31Bに示されるデータは、4人のドナーからの平均値である。
実施例21:抗TCRVb/BCMA抗体分子のサイトカインプロファイル
本実施例は、抗TCR Vβ/抗BCMA抗体分子Hによる活性化後にPBMCによって分泌されるサイトカインを記載する。比較のために、抗TCRβ定常1(TRBC1)抗体の抗体Fによる活性化も分析された。
簡単に説明すると、全血からヒトPBMCを単離し、続いて、100nMで、分子Hまたは抗体Fによる固相(プレート被覆)刺激を行った。上清を、1日目、2日目、3日目、および5日目(分子Hについて)、または2日目および5日目(抗体Fについて)に回収し、続いて、IFNγ、IL-2、IL-1β、IL-6、IL-10、およびTNFαについてマルチプレックスサイトカイン分析を行い、製造業者のプロトコールに従って、MSD(Meso Scale Discovery)プラットフォームを用いて定量化した。
図32A-32Fおよび33A-33Fに示されるように、抗TCR Vβ/抗BCMA抗体分子Hのサイトカインプロファイルは、抗CD3抗体OKT3または抗TRBC1抗体Fのものとは異なる。
実施例22:TCRβV 6-5刺激後のT細胞拡大の動態
抗TCRβv 6-5拡大T細胞の動態および絶対数を評価するために、PBMCまたは精製されたT細胞のいずれかを、100nMのT細胞活性化抗体を用いて8日にかけてプレート固定化抗TCRvb 6-5抗体を用いて刺激した。試験されたT細胞活性化抗
体は、i)抗TCRvb 6-5 v1抗体;ii)抗TCRvb 6-5 v2;iii)OKT3(抗CD3ε抗体);iv)SP34-2(抗CD3ε抗体);およびv)IgG1 N297A(アイソタイプ対照)を含んだ。細胞ペレットを各日に収集し、フロー分析のためにCD3、CD4、CD8およびTCRvb 6-5について染色した。
フローサイトメトリーによって評価された、抗TCRvb 6-5 v1を使用した8日にかけてのTCRvb 6-5+ T細胞拡大を図34に示す。データは単一の代表的なドナーについてのものであり、類似した結果が2人の他の独立したドナーからのPBMCで見られた。図36は、TCRvb 6-5 v1によるTCRvb 6-5+ CD4+ T細胞およびTCRvb 6-5+ CD8+ T細胞の特異的な拡大をさらに示す。対照的に、OKT3による特異的なTCRvb 6-5+ T細胞拡大はなかった(図35;図37)。
図38Aおよび図38Bは、ヒトPBMC(図38A)および精製されたT細胞(図38B)におけるTCRβV 6-5+ T細胞の選択的な拡大を示す。
図39A~41は、TCRVB 6-5+ T細胞の相対数(図39A~40B)および総CD3+ T細胞の相対数(図39A~41)の両方によって測定したときに、抗TCRβVおよび抗CD3ε抗体はPBMC培養物(図39Aおよび図39B)または精製されたT細胞培養物(図40Aおよび図40B)中のT細胞を8日後に同等のレベルまで拡大させることを示す。
実施例23:活性化されたTCRvb 6-5+ T細胞は細胞溶解機能を発揮する
腫瘍細胞溶解を媒介する、抗TCRVβを用いて活性化/拡大させたT細胞の能力を評価するために、精製されたT細胞を、100nMの固定化されたT細胞活性化抗体を用いて6日にかけて刺激した。試験されたT細胞活性化抗体は、i)TCRvb 6-5 v1抗体;ii)OKT3(抗CD3ε抗体);またはiii)IgG1 N297A(アイソタイプ対照)を含んだ。標的細胞(RPMI-8226細胞)を各日に加え、活性化されたT細胞と5:1の初期エフェクターT細胞:標的(E:T)細胞比で48時間インキュベートした。CFSE/CD138およびDRAQ7 FACS染色を使用して標的細胞溶解の定量化を測定した。3人の異なるT細胞ドナーを使用した(ドナー6769、ドナー9880、ドナー54111)。TCRVb 6-5 v1活性化T細胞による標的細胞溶解の動態はTCRvb 6-5+ T細胞の拡大と相関することをデータは示す(図42)。
標的細胞溶解をさらに評価するために、精製されたT細胞(汎CD3で単離された)の活性化のために100nMの最高用量濃度から1/2 log段階希釈でOKT3またはTCRvb 6-5 v1抗体を固定化(プレート被覆)した。精製されたT細胞を、0(すなわち抗体予備活性化なし)~4(すなわち抗体予備活性化あり)日間活性化プレートを用いて刺激した後に標的細胞を加えた。標的細胞(RPMI8226)を活性化プレート(初期E:T細胞比、5:1)に最長6日間(すなわちプレート0について6日間のE:Tの共培養、プレート4について2日間のE:Tの共培養)加え、続いてCFSE/CD138およびDRAQ7 FACS染色を介して標的細胞溶解定量化を行った。T細胞予備活性化なしで、VB細胞の約3%が(より高い濃度において)6日目に標的細胞を殺滅することができ(図43A)、T細胞予備活性化ありで、VB細胞の約25%が6日目に標的細胞を殺滅することができた(殺滅曲線は左にシフトしている)(図43B)ことをデータは示す。TCRvb 6-5 v1活性化T細胞は、T細胞を4日間予備活性化する場合の抗CD3εと比較した場合に同等の最大標的細胞溶解を呈する(図44)。100nMにおいて、TCRvb 6-5 v1活性化は、抗CD3ε活性化と同等の標的細胞の殺滅を示す(図45)(ドナーおよび標的細胞の存在下で48h培養される培養物に依存する4~6日の予備活性化)。
実施例24:抗TCRvb 6-5抗体によるTCRvb下方調節/内部移行の評価
抗TCRvb 6-5媒介性T細胞活性化がTCRvbの細胞表面発現に対して有する効果を評価するために、精製されたT細胞を、100nMの示されるT細胞活性化抗体(プレート結合)を用いて8日にかけて刺激した。T細胞活性化抗体は、i)抗TCRvb
6-5 v1抗体;またはii)SP34-2(抗CD3ε抗体)を含んだ。細胞ペレットを各日に収集し、フローサイトメトリー分析のためにCD3、CD4、CD8およびTCRβV 6-5について染色した。計3人のドナーを試験したところ、各々は類似した結果を示した。
抗CD3εおよび抗TCRvb抗体活性化CD4+ T細胞(図46)および活性化CD8+ T細胞(図47)の両方は、低減されたCD3ε細胞表面発現を示す一方、CD4+ T細胞(図48)およびCD8+ T細胞(図49)上のTCRvb 6-5細胞表面発現はT細胞活性化後に依然として検出可能であることを結果は示す。CD3εサブユニットは、抗CD3εまたは抗TCRvb抗体のいずれかによって活性化されたT細胞において下方調節/内部移行を受けるが、TCRvb 6-5はT細胞活性化後に依然として検出可能であることを結果は示す。追加的に、CD4およびCD8染色は、いずれかの抗体によるこれらの受容体の下方調節のいかなる徴候も示さなかった。
実施例25:抗TCRβV抗体のカニクイザル交差反応性
カニクイザルTCRβVクロノタイプについての抗TCRβV抗体の交差反応性を評価するために、新鮮なおよび凍結保存されたカニクイザルPBMCを、100nMの濃度の抗TCRβV 6-5 v1または抗CD3ζ抗体を前被覆された組織培養処置平底96ウェルプレート中の完全培地(10%のFBSを含むRPMI)中で培養した。陰性対照または未刺激ウェルにはPBSを単独で与えた。CytoFlexフローサイトメーター(Beckmann Coulter)を使用して6日の培養後にTCRβV 6-5発現を評価し、イメージングした。2つのドナー試料を使用した:ドナーDW8N - 新鮮なPBMC試料、雄、8歳、体重7.9kg(データを図50Aに提示する);ドナーG709 - 凍結保存された試料、雄、6歳、体重4.7kg(データを図50Bに提示する)。カニクイザルT細胞は抗TCRβV 6-5 v1によって活性化および拡大させたことをデータは示す(図50Aおよび図50B)。TCRvb 6-5拡大を示したドナーDW8Nからの新鮮なカニクイザルPBMCを凍結保存し、1週の凍結保存後に、細胞を解凍し、抗CD3ξおよび抗TCRvb 6-5 v1を使用して7日間刺激した。クラスター形成および拡大の両方は図51に示されるように再現性があった。
実施例26:抗TCRβV抗体によるγδ T細胞の無活性化
抗TCRvb抗体はγδ T細胞を活性化させることができるのかどうかを決定するために、ヒトPBMCから磁気ビーズ分離を介してγδ T細胞を精製した。γδ T細胞をプレート被覆抗CD3ε(SP34-2)または抗TCRvb 6-5(抗TCRvb
6-5 v1)抗体上に24時間固定化し、フローサイトメトリーによってCD69およびCD25発現について分析した。上清を活性化2、5、および7日後に収集し、Meso Scale Discovery(MSD)アッセイを使用してサイトカインについて分析した。PBMCに対してFACSゲーティング/染色を実行した後にγδ T細胞精製を行ったところ、γδ T細胞はvβ 6-5陰性であることを示した(ドナー12657 - FMOに基づいてγδ TおよびTCRvβ 6-5についてゲーティング)(図52)。精製されたγδ T細胞に対してFACSゲーティング/染色を実行したところ、精製されたγδ T細胞はvβ 6-5陰性であることを示した(ドナー12657 - FMOに基づいてγδ TおよびTCRvβ 6-5についてゲーティング)(図53)。図54に示されるように、抗TCR Vβ 6-5抗体(抗TCRvb 6-5 v1)はγδ T細胞を活性化させなかったが、抗CD3ε抗体(SP34-2
)は活性化させた。抗TCRβV 6-5 v1はγδ T細胞によるサイトカイン放出を誘導しないことをサイトカイン分析は示し、分析されたサイトカインは、IFNγ、TNFα、IL-2、IL-17A、IL-1α、IL-1β、IL-6、およびIL-10を含む(図55A~55H)。
実施例27:抗TCRVβ抗体によるポリクローナルT細胞拡大
ポリクローナルT細胞拡大を誘導する抗TCRVβ抗体の能力を評価するために、磁気ビーズ分離(陰性選択)を使用してヒトCD3+ T細胞を単離し、100nMの固定化(プレート被覆)された抗TCRβV 6-5 v1を用いて6日間活性化させた。拡大させたT細胞集団を洗浄し、Takara single cell lysis buffer for SMART(er) TCR cDNA synthesis and sequencingを使用して溶解させた。TCRシークエンシングを実行し、異なるTCRアルファVおよびJセグメントならびにTCRベータV、D、およびJセグメントの他に、V(D)J組換えの間にArtemis/TdT活性から生じ、かつT細胞の独特のクローンに対応するそれらの各々の異なるバリアントの絶対数および相対表現を決定した。図56は、すべてのTCRアルファVセグメント(TRAV遺伝子群)およびそれらのバリアント(上)、すべてのTCRベータVセグメント6-5バリアント(TRBV6-5遺伝子)(左下)、ならびに6-5を除外したすべてのTCRベータVセグメントおよびバリアント(右下)の相対表現を示す。抗TCRVβ抗体刺激はTRBV6-5陽性集団内の特異的なT細胞クローンの増殖を誘導せず、その集団におけるクローン表現における相対的な差異はTRBV6-5陰性集団の他に総TRAV使用と同等であることをデータは示す。
実施例28:抗TCRβVによって拡大させたT細胞は最近活性化されたエフェクターT細胞の新規のサブセットを表す
抗TCRβV拡大T細胞の表現型を評価するために、精製されたT細胞を、100nMの示されるT細胞活性化抗体:i)抗TCRvb 6-5 v1抗体;ii)抗TCRvb 6-5 v2;iii)OKT3(抗CD3ε抗体);またはiv)IgG1 N297A(アイソタイプ対照)を用いて8日にかけて固相抗TCRβV抗体を用いて刺激した。T細胞サブセットは、以下:ナイーブT細胞(CD4/CD8+、CD45RA+、CCR7+);T幹細胞メモリー(TSCM;CD4/CD8+、CD95+、CD45RA+、CCR7+);Tセントラルメモリー(TCM;CD4/CD8+、CD95+、CD45RA-、CCR7+);Tエフェクターメモリー(TEM;CD4/CD8+、CD95+、CD45RA-、CCR7-);CD45RAを再発現するTエフェクターメモリー(TEMRA;CD4/CD8+、CD95+、CD45RA+、CCR7-);ならびにCD27、CD28、4-1BB、OX40、およびICOSについての特異的な表面マーカーのFACS染色によって同定した。データは、5つより多くの独立した実験の代表である。
抗TCR Vβ抗体(図57A)によって拡大させたCD4+ T細胞はTEMRAサブセットと表現型マーカーを共有するがOKT3(図57B)によるものはそうではないことをデータは示す。同様に、抗TCR Vβ抗体(図58A)によって拡大させたCD4+ T細胞はTEMRAサブセットと表現型マーカーを共有するがOKT3(図58B)によるものはそうではないことをデータは示す。抗TCR Vβ活性化CD4+ T細胞(図59A)およびCD8+ T細胞(図59B)は抗CD3ε活性化CD4+ T細胞(図59A)およびCD8+ T細胞(図59B)と比較してPD1発現の増加を示すことをPD1発現のさらなる分析は示した。これらの抗TCR Vβ活性化CD4+ T細胞(図60A)(PD-1+ TEMRA表現型)および抗TCR Vβ活性化CD8+ T細胞(図60B)(PD-1+ TEMRA表現型)は、抗CD3ε活性化CD4+ T細胞(図60A)およびCD8+ T細胞(図60B)と比較してKi-67が富
化された表現型を示す。
抗TCR Vβ活性化CD8+ T細胞(図61A)は抗CD3ε活性化CD8+ T細胞(図61B)と比較してCD57発現の増加を示さないことをCD57発現のさらなる分析は示した。同様に、抗TCR Vβ活性化CD4+ T細胞(図62上)および抗TCR Vβ活性化CD8+ T細胞(図62下)は抗CD3ε活性化CD8+ T細胞と比較してCD27およびCD28発現の増加を示さないことをCD27およびCD28発現の分析は示した(図62)。
抗TCR Vβ活性化CD4+ T細胞(図63上)および抗TCR Vβ活性化CD8+ T細胞(図63下)は抗CD3ε活性化CD8+ T細胞と比較してOX40、41BB、およびICOS発現の増加を示すことをOX40、41BB、およびICOS発現のさらなる分析は示した(図63)。
活性化後の異なる時点におけるCD45RAおよびCCR7の発現を評価するためにタイムラプスフローサイトメトリーを使用して抗TCR Vβ抗体拡大T細胞のTEMRA様表現型をさらに分析した。単離されたヒトT細胞を、100nMの固定化(プレート被覆)された抗CD3εまたは抗TCR Vβを用いて1~8日間活性化させた。各(1、2、3、4、5、6、8)日数の活性化後に、ナイーブ/TSCM T細胞(CD4+/CD8+、CD45RA+、CCR7+)、Tセントラルメモリー(TCM;CD4+/CD8+、CD95+、CD45RA-、CCR7+)、Tエフェクターメモリー(TEM;CD4+/CD8+、CD95+、CD45RA-、CCR7-)、ならびにCD45RAを再発現するTエフェクターメモリー(TEMRA;CD4+/CD8+、CD95+、CD45RA+、CCR7-)についての表面マーカーのFACS染色によってT細胞サブセットを同定した。TCRβV+ T細胞はTCR Vβ+染色によって同定される。FACS染色試料をフローサイトメトリー分析によって分析した。データは、3人のドナーのうちの1人からのCD4+ T細胞について代表的なものを示した。
図64は、BCMAおよび抗TCR Vβ抗体、抗TCR Vβ 6-5 v1を用いた活性化の1、2、3、4、5、6、および8日後のCD3+(CD4ゲート)TCRβV 6-5+ T細胞のパーセンテージを示す一連のFACSプロットを示す。活性化後0日目(図65A)、活性化後1日目(図65B)、活性化後2日目(図65C)、活性化後3日目(図65D)、活性化後4日目(図65E)、活性化後5日目(図65F)、活性化後6日目(図65G)、および活性化後8日目(図65H)におけるアイソタイプ対照(IgG1 N297A)、抗TCRβV(抗TCR Vβ 6-5 v1)、または抗CD3ε(OKT3)抗体を使用して拡大させたCD4+ T細胞のパーセンテージの分析。CD45RAおよびCCR7の両方を発現するTEMRA様T細胞のパーセンテージは、抗TCR Vβ 6-5 v1抗体を用いて拡大させたCD4+ TCR Vβ
6-5+ T細胞培養物におけるTEMRA様細胞集団における、OKT3抗体を用いて拡大させた場合と比較した増加を示す。類似した結果がCD8+ T細胞で見られた。抗CD3ε(OKT3)によって活性化された精製されたT細胞と比較した場合に、抗TCRβV 6-5によって活性化された精製されたヒトT細胞は直接的にTEMRAサブセットに分化し、増殖することを結果はさらに示す。
要約すると、抗TCRβV抗体によって活性化および拡大させたT細胞は、TEMRAと表現型マーカーを共有する最近活性化されたエフェクターT細胞の新規のサブセットを表すことをデータは示す。これは、TCMおよびTEMに分化した抗CD3e拡大T細胞とは対照的である。TCRβV拡大T細胞は高度に増殖性であり、老化マーカーCD57を上方調節せず、OX40、4-1BB、およびICOSは抗TCRβV活性化T細胞上で上方調節される。
実施例29:αTCRβV活性化T細胞の代謝状態
αTCRβV抗体を用いて活性化されたT細胞の代謝表現型を評価するために、PBMCからのナイーブT細胞を、プレート結合抗CD3抗体(OKT3)または抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1抗体)を用いて5日間刺激し、拡大させた。活性化されたT細胞を次にIL-2含有培地中で2日間静置した後に、凍結保存した。アッセイの準備の前に、細胞を解凍し、それぞれプレート結合抗CD3 Ab(クローンOKT3)または抗TCRβV抗体(抗TCRβV 6-5 v1抗体)を用いて3日間再刺激した。等数の生細胞をSeahorseカートリッジ上にプレーティングし、Real-Time ATP Rate Assayを製造者の使用説明書にしたがって行った。抗TCRβV 6-5 v1抗体を用いて活性化された3人のドナーからのT細胞における解糖(図66A)、酸化的リン酸化(図66B)からのATP産生(単一のドナーからの代表的な結果が図66A~66Bに提示される)は、OKT3抗体を用いて活性化されたT細胞と比較して増加し(ATP産生における3倍の増加が平均で観察された)、1人のドナーは抗TCRβV 6-5 v1およびOKT3 Ab刺激細胞における等しいレベルのATP産生を示した(データ示さず)ことをデータは示した。
OKT3抗体を用いて活性化されたT細胞と比較した抗TCRβV 6-5 v1抗体を用いて活性化されたT細胞におけるミトコンドリア呼吸の増加は図67にさらに示され、図67は、示される抗体を用いて活性化された約0~75分のT細胞の酸素消費速度(OCR)を示す。図66におけるデータは単一のドナーからであり、試験された第2のドナーは抗TCRβV 6-5 v1およびOKT3 Ab刺激細胞において等しいレベルのATP産生を示した(データ示さず)。図68A~68Cは、基礎呼吸(図68A)、最大呼吸(図68B)、および予備呼吸能(図68C)の間の示される抗体を用いて活性化されたT細胞の酸素消費速度(OCR)を示す。グルコースおよびグルタミンを含有する培地中に細胞をプレーティングして基底OCRを測定した。FCCP(ETC促進剤)を細胞培養培地に加えて最大呼吸能/最大OCRを決定した。アンチマイシンAおよびロテノン(ETC阻害剤)を細胞培養培地に加えて予備呼吸能および非ミトコンドリア酸素消費を決定した。図68A~68Cに提示されるデータでは、α-TCRβV 6-5 v1活性化T細胞は、α-CD3(OKT3)活性化T細胞と比較して基礎呼吸、最大呼吸、および予備呼吸能を有意に増加させた(単一のドナーからのデータ)。第2のドナーを試験したところ、抗TCRβV 6-5 v1およびOKT3 Ab刺激細胞において等しいレベルのATP産生を示した(データ示さず)。図68Dは、それぞれ図67Aおよび図67Bに示される基礎呼吸および最大呼吸の領域を示す。
代謝における観察された増加がT細胞刺激における差異に起因するのか、それとも抗TCRβV抗体を用いて活性化されたT細胞の分化ステージに内因的なものなのかどうかを決定するために、プレート結合抗TCRβV 6-5 v1 Abを用いてTCRβV 6-5+ T細胞を5日間拡大させた。細胞を次にIL-2含有培地中で2日間静置し、凍結保存した。解凍し、細胞を抗TCRβV 6-5 v1で3日間再刺激した。細胞を次にカウントし、等数の生細胞を再播種し、それぞれプレート結合抗CD3 Ab(クローンOKT3)または抗TCRβV 6-5 v1を用いて24時間刺激した。等数の生細胞をSeahorseカートリッジ上にプレーティングし、Real-Time ATP Rate Assayを行った。
抗TCRβV 6-5 v1を用いて活性化されたT細胞による解糖(図69A)および酸化的リン酸化(図69B)によるATP産生は、α-TCRβV 6-5 v1抗体に対してα-CD3抗体OKT3を用いた再刺激で有意に増加されることを結果は示す。抗TCRβV 6-5 v1を用いて活性化されたT細胞の代謝における観察された増加は、これらの細胞への分化における内因性の差異に起因するようである。抗TCRβV
6-5 v1を用いて活性化されたT細胞は、CD3活性化T細胞と比較して増加した代謝を有し、これはOKT3を介する強いT細胞刺激を用いてさらに増強され得る。
要約すると、抗TCRβV抗体を用いて活性化されたT細胞は代謝メモリー表現型を有することを結果は示す。疲弊T細胞は減少した代謝を有するため、細胞は代謝的に疲弊していない。α-TCRβV 6-5 v1刺激は、エフェクターメモリー表現型の指標となる、高度に代謝的に活性のT細胞分化ステージを誘導する。これらの細胞が他のT細胞エンゲージャー(OKT3)で再刺激され場合にこの代謝表現型は維持される。
実施例30:抗TCRβV抗体と比較した抗CD3e抗体を用いたCRSの評価
低親和性(Teneobio)抗CD3e抗体のCRS効果を決定するために、PBMCを用いるサイトカイン放出アッセイ(CRA)を使用した。簡潔に述べれば、2人のドナーからのPBMCを、プレート被覆された抗体:抗TCRvb6-5 v2、抗CD3e(SP34)またはTeneobioの抗CD3e抗体を用いて刺激した。このアッセイにおいてCRSサイトカインを誘導しないことが以前に示された最も高い濃度である100nMにおいてT細胞活性化抗体を試験した。上清を1、3、5および7日目に収集した。MSD分析を使用してサイトカイン分泌測定値(IFN-g、IL-10、IL-15、IL-17A、IL-1a、IL-1b、IL-2、IL-4、IL-6およびTNF-a)を検出した。データは2人のドナーからの結果を示す。
親和性低減抗CD3e抗体(TeneoBio)は、SP34-2抗CD3e抗体と類似したIFNg、TNFa、IL-1a、IL-1b、IL-6(CRSおよび神経毒性関連サイトカイン)の発現を誘導することを図70A~70Fは示す。対照的に、本発明の抗TCRvb6-5 v2はCRSも神経毒性関連サイトカインも誘導しない。
要約すると、Tenebioの抗CD3e抗体は、この高度に感受性のPBMC CRAにおいてCRSおよび神経毒性と関連付けられるサイトカインを誘導することをデータは示す。そのため、Tenebioの抗CD3e抗体は、SP34ベースのT細胞再方向付け二特異性分子で見られるようにCRSおよびNTを誘導する潜在能力を有する。本明細書に開示される抗TCRvb6-5は、このアッセイにおいてCRSおよびNT関連サイトカインを誘導せず、一部の実施形態では、TCRvb6-5ベースの抗体は、より高い用量での投与に適して、現行のCD3eベースの二特異性分子のために必要とされるMABEL(推定最小薬理作用量)投薬レジメンを回避し得ることを示唆する。
実施例31:抗TCRβV刺激PBMCはNK細胞拡大の刺激を媒介した
抗TCRβV刺激PBMCがin vitroでNK細胞の拡大を媒介するかどうかを評価するために、100nMのプレート被覆された抗TCRβV 6-5 v1、抗CD3ε(OKT3およびSP34-2)を用いてヒトPBMCを最長7日間刺激した。CD3-/CD56+/CD16+/NKp46+集団のFACS染色を介してNK細胞を同定した。NK細胞数を一定のμl試料によって決定した(各ドナーについての相対数として表される)。NK細胞媒介性の標的細胞溶解を刺激の6日後に決定し、この場合、PBMCを収穫し、K562標的細胞と4時間共培養して、DRAQ7 viability
FACS染色を介して細胞殺滅を決定した。
抗TCRβV刺激はOKT3刺激と比較してNK細胞数を増加させることを結果は示す(図71;図72)。FACS CFSE染色はNK細胞増殖をさらに示す(図73)。図74および図75は、標的K562細胞のNK細胞媒介性溶解を示す。要約すると、抗TCRβV 6-5抗体はPBMCにおいてNK細胞の拡大を誘導し、抗CD3ε抗体はNK細胞を拡大しなかったため、この効果はNK細胞上のFcRを通じて媒介されるものではないと思われる。抗TCRβV 6-5 v1による拡大させたNK細胞はin v
itroで強力な標的細胞(K562)溶解を媒介する。
抗TCRβV 6-5 v1抗体を使用して上記で実行された実験に加えて、異なるクロノタイプを認識する抗TCRβV抗体を使用して類似した実験を実行した。1つの実験において、抗TCRβV 12抗体:抗TCRvβ 12-3/4 v1、抗TCRvβ
12-3/4 v2、および抗TCRvβ 12-3/4 v3を使用し、上記のように6日間100nMの示されるT細胞活性化抗体を用いて刺激(プレート被覆)された固相を使用してPBMCを活性化/拡大させた。NKp46およびCD56(CD3陰性)を使用してNK細胞についてフロー分析を行った。3人のドナーおよび1つの独立した実験の代表からデータを生成した。
アイソタイプ対照または抗CD3ε抗体OKT3もしくはSP34-2を用いたPBMCの活性化/拡大はNK細胞の拡大を誘導しなかった(図76;図78)。しかしながら、抗TCRvβ 12-3/4 v1(図77)、抗TCRvβ 12-3/4 v2(図77)、および抗TCRvβ 12-3/4 v3(図78)を用いたPBMCの活性化/拡大はすべてNK細胞拡大を誘導した。要約すると、抗TCRvb 12抗体はin
vitroでPBMC培養物からのNK細胞の間接的な拡大を誘導できることをデータは示す。
実施例32:in vitroでの抗TCRβV刺激に対する濃度応答
示される異なる濃度の示されるT細胞活性化抗体:i)抗TCRvb 6-5 v1抗体;ii)OKT3(抗CD3ε抗体);またはiii)SP34-2(抗CD3ε抗体)を用いてヒトPBMCを固相刺激(プレート被覆)した。上清を1日目、3日目および5日目に収集し、Meso Scale Discovery(MSD)アッセイを使用することによってサイトカインを定量化した。サイトカインIFNγ(図79)、IL-2(図80)、IL-15(図81)、IL-1β(図82)、IL-6(図83)、およびIL-10(図84)の産生を分析した。抗TCRvbを用いて活性化されたT細胞によるCRS関連サイトカイン誘導の欠如は高い抗体濃度に起因する阻害または毒性の結果ではないことを結果は示す。
実施例33:抗TCRβV抗体によって活性化されたT細胞は、抗CD3ε抗体を用いて活性化されたT細胞と比較して別個のサイトカイン放出プロファイルを有する
抗CD3ε抗体と比較して抗TCRβV抗体を使用して活性化/拡大させたT細胞のサイトカイン放出プロファイルを評価するために、固定化された抗TCRβV抗体、抗TCRβV 6-5 v1または抗CD3ε抗体、OKT3もしくはSP37-2のいずれかを被覆された細胞培養プレート中でPBMCを培養した。細胞を1~8日間培養し、上清を収集し、Meso Scale Discovery(MSD)アッセイを使用してサイトカインを分析した。多数の異なるヒトドナーからのT細胞試料を試験した。
図85は、17人のドナーからのデータの要約を示す。時点(3日目およびその後)からの最も高い全体的なサイトカイン分泌をさらなる分析のために使用した。各データ点を各ドナーについて最も高い分泌に対して正規化し、(0.95パーセンタイルの信頼区画における)最大の相対%として示した。抗CD3ε抗体と比較して抗TCRβV抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞はより少ないIFNγ、TNFα、IL-1β、IL-4、IL-6、IL10、およびIL-17を放出すると同時に増加した量のIL-2を放出することをデータは示す(図85)。
培養期間を変更したが以前に記載された方法を使用した一連の実験を、異なるドナーからのPBMCを用いて実行した。1つの実験において、4人の異なるドナーからのPBMCを、固定化された抗TCRβV抗体、抗TCRβV 6-5 v1または抗CD3ε抗
体、OKT3もしくはSP37-2のいずれかを被覆したプレート中で1~6日間培養した。抗CD3ε抗体と比較して抗TCRβV抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞は、より低いレベルのIFNγ(図86A)、IL-1β(図86B)、IL-4(図86C)、IL-6(図86D)、IL10(図86E)、およびTNFα(図86F);ならびにより高いレベルのIL-2(図86G)を放出することをデータは裏付けている。
第2の実験において、6人の異なるドナーからのPBMCを、固定化された抗TCRβV抗体、抗TCRβV 6-5 v1もしくは抗TCRβV 6-5 v1のいずれか;または抗CD3ε抗体、OKT3もしくはSP37-2のいずれか、またはアイソタイプ対照を被覆したプレート中で1~6日間培養した。抗CD3ε抗体と比較して抗TCRβV抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞は、より低いレベルのIFNγ(図87A)、IL-1β(図87B)、IL-4(図87C)、IL-6(図87D)、IL10(図87E)、およびTNFα(図87F);ならびにより高いレベルのIL-2(図87G)を放出することをデータは裏付けている。
第3の実験において、3人の異なるドナーからのPBMCを、固定化された抗TCRβV抗体、抗TCRβV 6-5 v1もしくは抗TCRβV 6-5 v1のいずれか;または抗CD3ε抗体、OKT3もしくはSP37-2のいずれか、またはアイソタイプ対照を被覆したプレート中で1~8日間培養した。抗CD3ε抗体と比較して抗TCRβV抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞は、より低いレベルのIFNγ(図88A)、IL-1β(図88B)、IL-4(図88C)、IL-6(図88D)、IL10(図88E)、およびTNFα(図88F);ならびにより高いレベルのIL-2(図88G)を放出することをデータは裏付けている。
第4の実験において、2人の異なるドナーからのPBMCを、固定化された抗TCRβV抗体、抗TCRβV 6-5 v1もしくは抗TCRβV 6-5 v1のいずれか;または抗CD3ε抗体、OKT3もしくはSP37-2のいずれか、またはアイソタイプ対照を被覆したプレート中で2~7日間培養した。抗CD3ε抗体と比較して抗TCRβV抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞は、より低いレベルのIL-17A(図89A)を放出することをデータは裏付けている。第5の実験において、4人の異なるドナーからのPBMCを、固定化された抗TCRβV抗体、抗TCRβV 6-5 v1もしくは抗TCRβV 6-5 v1のいずれか;または抗CD3ε抗体、OKT3もしくはSP37-2のいずれか、またはアイソタイプ対照を被覆したプレート中で2~8日間培養した。抗CD3ε抗体と比較して抗TCRβV抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞は、より低いレベルのIL-17A(図89B)を放出することをデータは裏付けている。第6の実験において、2人の異なるドナーからのPBMCを、固定化された抗TCRβV抗体、抗TCRβV 6-5 v1もしくは抗TCRβV 6-5 v1のいずれか;または抗CD3ε抗体、OKT3もしくはSP37-2のいずれか、またはアイソタイプ対照を被覆したプレート中で2~7日間培養した。抗CD3ε抗体と比較して抗TCRβV抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞は、より低いレベルのIL-17A(図859C)を放出することをデータは裏付けている。第7の実験において、2人の異なるドナーからのPBMCを、固定化された抗TCRβV抗体、抗TCRβV 6-5 v1もしくは抗TCRβV 6-5 v1のいずれか;または抗CD3ε抗体、OKT3もしくはSP37-2のいずれか、またはアイソタイプ対照を被覆したプレート中で2~7日間培養した。抗CD3ε抗体と比較して抗TCRβV抗体を用いて活性化/拡大させたT細胞は、より低いレベルのIL-17A(図859D)を放出することをデータは裏付けている。
TCRβV抗体、抗TCRβV 6-5 v1または抗TCRvb 12-3/4 v1を使用して一連の類似した実験を実行して、抗CD3ε抗体と比較して抗TCRβV抗体を使用して活性化/拡大させたT細胞のサイトカイン放出プロファイルをさらに評価し
た。上記のように、固定化された抗TCRβV抗体、抗TCRβV 6-5 v1もしくは抗TCRvb 12-3/4 v1;または抗CD3ε抗体、OKT3もしくはSP37-2のいずれか;アイソタイプ対照;または組合せでの抗TCRβV 6-5 v1を被覆した細胞培養プレート中でPBMCを培養した。細胞を1~8日間培養し、上清を収集し、Meso Scale Discovery(MSD)アッセイを使用してサイトカインを分析した。2人のドナーおよび2つの独立した実験の代表からデータを生成した。
いずれかの抗CD3ε抗体(OKT3またはSP37-2)と比較して、いずれかの抗TCRβV抗体、抗TCRβV 6-5 v1または抗TCRvb 12-3/4 v1によって活性化/拡大させたT細胞は、より低いレベルのIFNγ(図90A)、IL-1β(図90B)、IL-4(図90C)、IL-6(図90D)、IL10(図90E)、TNFα(図90F);およびより高いレベルのIL-2(図90G)を分泌することをデータは裏付けた。IL-12p70(図90H)、IL-13(図90I)、IL-8(図90J)、エキソタキシン(図90K)、エキソタキシン-3(図90L)、IL-8(図90M)、IP-10(図90N)、MCP-1(図90O)、MCP-4(図90P)、MDC(図90Q)、MIP-1a(図90R)、MIP-1b(図90S)、TARC(図90T)、GMCSF(図90U)、IL-12-23p40(図90V)、IL-15(図90W)、IL-16(図90X)、IL-17a(図90Y)、IL-1a(図90Z)、IL-5(図90AA)、IL-7(図90BB)、TNF-B(図90CC)、およびVEGF(図90DD)の分泌もまた試験した。
αTCRβV抗体、αTCRβV 6-5 v1およびαTCRβV 6-5 v2を用いて活性化されたT細胞のサイトカインプロファイルの決定(上記)に加えて、異なるクロノタイプを認識する追加のαTCRβV抗体を用いてアッセイを実行した。
1つのシリーズの実験において、試験された抗体は、抗TCRvb 12-3/4 v1、抗TCRvb 10、および抗TCRvb 5を含んだ。上記のプロトコールにしたがって、100nMの示されるT細胞活性化抗体(抗TCRvb 12-3/4 v1、抗TCRvb 10、抗TCRvb 5、または抗CD3ε抗体SP34)を用いてヒトPBMCを固相刺激(プレート被覆)した。上清を1日目~8日目に収集し、Meso Scale Discovery(MSD)アッセイを使用してサイトカインを定量化した。91は、異なるクロノタイプ間の配列のグラフ表現を提供し、このシリーズの実験において試験された4つのサブファミリーを強調している。抗TCRvb 12-3/4 v1抗体(図92A)、抗TCRvb 10抗体(図92B)、または抗TCRvb抗体(図92C)を用いて活性化/拡大させたPBMCは、抗CD3ε抗体SP34-2を用いて活性化/拡大させたPBMCと比較して、IFNγ、TNFα、IL-1β、IL-2、IL-6、およびIL-10を含む、サイトカイン放出症候群と関連付けられるサイトカインのより低いレベルの分泌を呈した。
第2のシリーズの実験において、試験された抗体は、抗TCRVβ抗体:BJ1460、BJ1461、BJ1465、BJ1187、BJM1709;抗CD3ε抗体OKT3、および細胞のみの対照を含んだ。0日目にドナー10749からのPBMCを解凍し、2人の新鮮なドナー(13836および14828)からのPBMCと共にカウントした。180uLのX-vivo培地/ウェル中の200,000個のPBMC(1×10e6細胞/mL)を丸底96ウェルプレートに加えた(プレートの1/3のために1ドナー)。100nMまたは15μg/mLの20uLの10X TCRVβ抗体をプレートのウェルに加え、ウェルの1つの三連には細胞のみを加えた。プレートを5%のCOと共に37℃のインキュベーター中に保った。選択された抗体を用いて細胞を3日間刺激し、50μLの上清をプレートから収穫し、-20℃で貯蔵した。50μLの培地を各ウェ
ルに再び加え、プレートを5%のCOと共に37℃のインキュベーター中に保った。6日目に50uLの上清をプレートの各ウェルから収穫し、-20℃で貯蔵した。三連からの2つのウェルからの細胞を合わせ、huIL-2を補充した培地に各ドナーについての細胞懸濁液を加え、12ウェルプレートに移した。細胞を終夜インキュベートして、IL-2中で静置および拡大させた。FACS分析による特異的なVβクローン拡大の検出のために特異的なVβクローンについて細胞をその後に染色した。培地中のサイトカイン(IFNγ、IL-10、IL-17A、IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-6、およびTNFαを含む)の濃度を、Meso Scale Discovery(MSD)アッセイを使用して3日目および6日目の上清試料において分析した。抗TCRβV抗体、BJ1460、BJ1461、BJ1465、BJ1187、BJM1709のいずれかを使用して活性化/拡大させたPBMC細胞は、より低いレベルのIFNγ(図93A)、IL-10(図93B)、IL-17A(図93C)、IL-1α(図93D)、IL-1β(図93E)、IL-6(図93F)、TNFα(図93G);およびより高いレベルのIL-2(図93H)を分泌することをデータは裏付けた。FACS分析は、示されるTCRVβクローンを発現するT細胞の拡大をさらに示した(図94)。
第3のシリーズの実験において、試験された抗体は、抗TCRVβ抗体:BHM1675、BJM0816、BJ1188、BJ1189、BJ1190;および抗CD3ε抗体SP34-2を含んだ。示される抗体をPBS中200μl/ウェルで100nMまたは15μg/mLの濃度で96ウェル丸底プレートに4℃で終夜または37℃で最小2時間被覆した。200μLのPBSならびにドナー:CTL_123、CTL_323およびCTL_392からの0.2×10^6個のPBMC/ウェルを用いてプレートを翌日に洗浄した。上清試料を1、3、5、および7日目に収集した。10-plex Meso Scale Discovery(MSD)アッセイを上清に対して実行して、サイトカイン(IFNγ、IL-10、IL-17A、IL-1α、IL-1β、IL-6、IL-4、およびIL-2を含む)の濃度を決定した。7日目の後に、細胞をペレット化し、さらに1日間IL-2を補充した培養培地に加えて拡大させた。同じ活性化抗体、続いて二次抗ヒト/マウスFITC抗体を使用してFACS染色によってTCRVβクローンを発現するT細胞の拡大を分析した。BHM1675、BJM0816、BJ1189およびBJ1190抗体を使用してLive/Dead、CD4+およびCD8+ T細胞もまた染色した。抗TCRβV抗体、BHM1675、BJM0816、BJ1188、BJ1189、BJ1190のいずれかを使用して活性化/拡大させたPBMC細胞は、より低いレベルのIFNγ(図95A)、IL-10(図95B)、IL-17A(図95C)、IL-1α(図95D)、IL-1β(図95E)、IL-6(図95F)、IL-4(図95G);およびより高いレベルのIL-2(図95H)を分泌することをデータは裏付けた。TCRVβサブクローンT細胞はそれらの各々の活性化抗体によって拡大されることをFACS分析はさらに示した(図96)。
第4のシリーズの実験において、試験された抗体は、抗TCRVβ抗体:BJ1538、BJ1539、BJ1558、BJ1559、BHM1709;および抗CD3ε抗体OKT3を含んだ。示される抗体をPBS中200μl/ウェルで100nMまたは15μg/mLの濃度で96ウェル丸底プレートに4℃で終夜または37℃で最小2時間被覆した。200μLのPBSならびにドナー:10749、5078および15562(凍結および解凍された試料)からの0.2×10^6個のPBMC/ウェルを用いてプレートを翌日に洗浄した。上清試料を3および6日目に収集した。10-plex Meso
Scale Discovery(MSD)アッセイを上清に対して実行して、サイトカイン(IFNγ、IL-10、IL-17A、IL-1α、IL-1β、IL-6、IL-4、TNFα、およびIL-2を含む)の濃度を決定した。抗TCRβV抗体、BJ1538、BJ1539、BJ1558、BJ1559、BHM1709のいずれかを使用して活性化/拡大させたPBMC細胞は、より低いレベルのIFNγ(図97A)、I
L-10(図97B)、IL-17A(図97C)、IL-1α(図97D)、IL-1β(図97E)、IL-6(図97F)、IL-4(図97G)TNFα(図97H);およびより高いレベルのIL-2(図97I)を分泌することをデータは裏付けた。
要約すると、異なるTCRvbサブファミリー(またはサブタイプ)を認識する抗TCRvb抗体は、類似したサイトカインプロファイルを有し、CRSと関連付けられるサイトカインを誘導しないことをデータは示す。
実施例34:抗TCRvbは架橋なしのT細胞を活性化させない
二価抗TCRvb抗体は架橋なしでT細胞を活性化させるかどうかを評価するために、2人のドナーからの精製されたT細胞を、プレート被覆されているかまたは溶液中のいずれかの、抗TCRvb(TCRvb 6-5 v1)または抗CD3e(SP34)を用いて刺激した。上清を活性化後1、3、5および7日目に収集した。MSD 10 plex kitを使用してサイトカイン分泌を検出した(IFN-g、IL-10、IL-15、IL-17A、IL-1a、IL-1b、IL-2、IL-4、IL-6およびTNF-a)。
溶液中の抗TCRvb 6-5 v1抗体を用いて活性化/拡大させたPBMCは、固定化された(架橋を可能とする)抗TCRvb 6-5 v1抗体を用いて活性化/拡大させたPBMCと比較して、IFNγ分泌をごくわずかしか誘導しないことを結果は示す(図98Aおよび図98B)。溶液中の抗TCRvb 6-5 v1抗体を用いて活性化/拡大させたPBMCは、IL-1b(図98C)、IL-10(図98E)、IL-15(図98F)、IL-17A(図98G)、IL-1a(図98H)、IL-1b(図98I)、IL-2(図98J)、IL-4(図98K)、IL-6(図98D)、およびTNF-a(図98L)分泌をごくわずかしか誘導しないかまたは全く誘導しないことを結果は示す。要約すると、抗CD3εは溶液中(架橋なし)でT細胞を活性化させるが、抗TCRvb抗体は溶液中でT細胞を活性化させないことをデータは示す。
実施例35:別個の配列を有する2つの抗TCRVβ 5-5、5-6抗体によるTCRVBへの結合の競合
この実施例は、それらの共有されるTCRVB抗原への結合についての2つの抗TCRVβ 5-5、5-6抗体のエピトープ競合を記載する。TM23およびMH3-2抗体の両方はTCRVβ 5-5、5-6に結合する。しかしながら、TM23およびMH3-2抗体は実質的な配列相同性を共有しない。図24A~Bに示されるように、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRBVタンパク質上の構造的に保存されたドメイン(図24Aにおいて丸で囲んだ領域によって示される)を認識するが、それらの間で低い配列類似性を有する。実質的な配列相同性を共有しない2つの抗TCRVβ 5-5、5-6抗体がTCRBV抗原への結合について競合できるかどうかを試験するために、競合アッセイを実行した。
精製されたMH3-2抗体をAF647にコンジュゲートした。2人のドナーからのT細胞を500nMのTM23抗体とプレインキュベートしたか、または未処置とした。T細胞を次に、AF647にコンジュゲートされたMH3-2抗体を用いて染色した。
TM23抗体とのT細胞のプレインキュベーションはMH3-2の結合を遮断することを結果は示す(図99および図100)。両方の抗体は異なった配列を有するにもかかわらず、TM23抗体はMH3-2抗体と同じエピトープを用いて結合について競合することをデータは示す。それらの間で低い配列類似性を有する抗TCRβV抗体分子は、TCRBVタンパク質上の構造的に保存されたエピトープに結合および認識するという観察をこのデータは裏付ける。
実施例36.抗TCRVβ 6-5抗体拡大T細胞の多機能性強度指数
抗CD3ε抗体拡大CD4+ T細胞(図101A)およびCD8+ T細胞(図101B)ならびに抗TCRVβ 6-5抗体拡大(薬物拡大T細胞)CD4+ T細胞(図101A)およびCD8+ T細胞(図101B)に対してPBMCの多機能性強度指数(PSI)を比較した。PSIは、試料中の多機能性細胞のパーセンテージに、分泌されたサイトカインの強度を掛けたものとして定義される。抗TCRVβ 6-5抗体を用いて拡大させた群の間でCD4+ T細胞(図101A)およびCD8+ T細胞(図101B)におけるPSIのより大きい上方調節があることをデータは示す。
実施例37:可溶性TCRおよびTCRを発現するJurkat細胞に対するTCRVB/CD19二特異性物質の結合
この実施例では、TCRに対するTCRVB/CD19二特異性物質(図102A)の結合親和性を試験した。
TRBV6-5を発現するJurkat細胞を、増加性濃度の二特異性分子CD19 x TCRvb6-5(2x2)または対照抗体TCRvb6-5 v1を用いて4℃で30分間染色した。その後に、細胞をPBS緩衝液で洗浄し、抗体を細胞の表面に結合させ、それをPE標識抗ヒトFc抗体によって検出した。陽性染色細胞のパーセンテージを濃度に対してブロットした。図102Bは、可溶性TCRに対するTCRVB/CD19二特異性物質の結合を示す。二特異性分子は12nMのKdで可溶性TCRに結合する。
二特異性CD19 x TCRvb6-5(2x2)抗体を抗ヒトFc抗体を介して50RUまでCM5 Series S Sensor Chip上に固定化した。可溶性TRBV6-5抗原を500nMに希釈し、次に2倍に段階希釈した。会合は180秒、解離は300秒であった。このアッセイをpH7.4の1xHBS-EP+緩衝液中25Cで実行した。1:1結合モデルを使用してデータをフィッティングした。図102Cは、Jurkat細胞上に発現されるTCRに対するTCRVB/CD19二特異性物質または抗TCRVB 6-5 v1抗体の結合を示す。抗TCRVB 6-5 v1抗体のEC50は0.6486であり、二特異性分子のEC50は1.720であった。
実施例38:マウス抗TCRVB抗体のin vitroおよびin vivo特徴付け
この実施例はマウス抗TCRVB抗体の特徴付けを記載する。ヒトクロノタイプ(サブファミリー)に類似して、マウスにおけるTCRb可変鎖座位は31の異なるファミリーからなり、これは合計35のサブファミリーを有し、そのうちの23は機能的に発現される。マウス系統C57BL/6のサロゲートTCRvbクロノタイプ抗体が同定されており、これはヒトTCRvb抗体と類似した特徴を共有する。この抗マウスTCRvb抗体は、すべてのT細胞のうちの約15%において発現されるC57BL/6マウスにおけるTCRvb 13-2および13-3に特異的に結合する。ヒトTCRvb特異的抗体に類似して、このマウスTCRvb特異的抗体(TCRvb 13-2/3)はin vitroでマウスT細胞増殖および類似したサイトカインプロファイルを誘導する。TCRvb 13-2/3の発見は、完全免疫コンピテントマウスモデルにおいてTCRvb媒介性T細胞活性化および再方向付けされた細胞殺滅の評価の他に、in vivoでメモリー抗腫瘍応答を評価することを可能にする。
図103Aは、以下の実験において使用された二特異性分子の図解を示す。二特異性分子は、マウスCD19およびマウスTCRVB 13-2、13-3(別称:mCD19
X mTCRvb 13-2/3)を認識する。二特異性分子はマウスFcガンマ受容体に結合しなかった。
最初に、マウス二特異性分子のin vitro機能的活性を試験した。脾臓単核細胞をC57BL6マウスから新たに単離し、mCD19 X mTCRvb 13-2/3(2X2)を用いて処置した。単離された細胞をB細胞枯渇、TCRvβ+ T細胞結合、拡大および活性化について評価した。10%のFBSを含むRPMI-1640中の0.0008~200nMの用量(4倍希釈)のmCD19 X mTCRvb 13-2/3(2X2)、または培地単独を用いて細胞を6日間処置した。3および6日目に、下記に示される抗体を使用してフローサイトメトリーによって細胞を分析した:
Figure 2023509708000121
mCD19 X mTCRvb 13-2/3(2X2)二特異性抗体はC57BL6マウスからの脾臓T細胞に特異的に結合したことを図103Bは示す。mTCRvβ+ T細胞の活性化および拡大がそれぞれ3および6日目に観察された(図103C)。6日の処置後に、mCD19 X mTCRvb 13-2/3(2X2)はin vitroでC57BL6脾臓細胞において効率的なマウスB細胞枯渇を誘導した(図103D)。以上を合わせて、mCD19 X mTCRvb 13-2/3(2X2)は同系腫瘍モデル研究のためのサロゲートツールとして役立ち得ることをin vitro特徴付けは示す。
次に、マウス二特異性分子を用いてin vivo実験を行った。0日目に、8週齢雌C57BL/6マウスを体重に基づいて3つのアーム(n=5/アーム)に無作為化した。マウスの静脈内にPBS、0.1mg/kgおよび1mg/kgのmCD19 X mTCRvb 13-2/3(2X2)のいずれかを1回注射した。3日目にマウスを屠殺し、全血および脾臓を収穫した。組織をフローサイトメトリーに供し、B細胞、NK細胞、TCRvb+細胞およびCD3+細胞についてチェックした。
マウスmCD19 X mTCRvb 13-2/3二特異性分子は動物の血液および脾臓中のB細胞を枯渇させることを結果は示す(図104)。マウス二特異性分子はまた、in vivoで血液および脾臓中のマウスNK細胞を拡大させる(図105)。mCD19 X mTCRvb 13-2/3(2X2)は示される用量および研究の持続期間において忍容性良好であることも研究は実証した。
実施例39:CD19xTCRvβ二特異性分子の標的細胞溶解およびサイトカインプロファイル
この実施例は、CD19xTCRvβ二特異性分子を用いた標的細胞の強力な溶解および低減されたCRS関連サイトカイン分泌を記載する。
標的細胞殺滅を試験するために、αTCRvβ 6-5 v1予備拡大T細胞をCD19xTCRvβ二特異性分子、CD19xCD3二特異性分子またはαTCRvβ 6-5 v1抗体(非標的化)の存在下でRaji標的細胞と24時間インキュベートした。以下のようにKILR Cytotoxicity and Cytokine Qua
ntificationによって標的細胞溶解を評価した。ヒトPBMCを全血から単離した。単離されたPBMCから、磁気ビーズ分離(陰性選択)(Miltenyi biotec)を使用してヒトCD3+ T細胞を単離し、100nMの固定化(プレート被覆)された抗TCR Vβ13.1(BHM1709)によって6日間活性化させた。(プレート被覆から)活性化T細胞を次に50U/mlの濃度のヒトIL-2の存在下の組織培養フラスコに移してさらに2日間拡大させた。拡大させたTCR Vβ13.1を洗浄し、5:1のE:T比のCD19発現Raji細胞(標的細胞)ならびに抗TCR Vβ13.1/CD19(BJM0093)、抗CD3/CD19(BJM0030)および抗TCR Vβ13.1(BHM1709、対照として働く)を含む連続希釈濃度のT細胞エンゲージャー二特異性抗体の存在下で24時間共培養した。24時間後に、細胞共培養上清を収集し、特異的な標的細胞死について定量化した。標的細胞(Raji細胞)はKILR-retroparticles reporter cell assay(DiscoverX)である。
KILR-Raji標的細胞は、KILR Retroparticlesを使用して、強化型ProLabel(ePL)、β-galレポーター断片をタグ付加されたタンパク質を安定的に発現するように操作されており、その膜が細胞死に起因して劣化したときに、タグ付加されたタンパク質を培地中に放出する。KILRレポータータンパク質は、β-galレポーターの酵素アクセプター(EA)断片を含有する検出試薬の添加によって培地/上清中に検出される。これは、基質を加水分解して化学発光出力(RLU)を与える活性β-gal酵素の形成に繋がる。標的細胞死のパーセンテージ(%)は、以下の式:(RLU処置-RLU非処置)を使用して算出される。図106Bはこのアッセイの結果を示す。αTCRvβ 6-5 v1予備拡大T細胞(TrEK)は、0.25:1の低いエフェクター対標的比でのRaji標的細胞の効率的な殺滅を実証する。
次に、CD19xTCRvβ二特異性分子を用いたB細胞枯渇を試験した。同じドナーからの精製されたT細胞および精製されたB細胞を、抗TCRvβ/CD19二特異性物質またはAmgenのBlincytoを用いて2~6日間処置した。FACS分析を介して抗CD20染色によってB細胞枯渇を測定した。図106C~Dに示されるように、CD19xTCRvβ 6-5(2x2)二特異性概念分子は、標的細胞との共インキュベーションの6日後にB細胞枯渇を誘導する。PBMCを抗TCRvβ/CD19二特異性物質または抗CD3/CD19二特異性物質で1~6日間処置し、続いてFACS分析を介して抗CD20染色によってB細胞枯渇の測定を行った場合に類似した結果が観察された(図106D~E)。抗TCRvβ/CD19二特異性物質はTCRvβ+ T細胞の分化および拡大のための時間を必要とすることをこのデータは示す。
固定化された抗TCR Vb抗体によるCRS関連サイトカイン誘導の欠如はCD19を標的化する二特異性分子によって再現され得るかどうかを決定するために、ヒトPBMCを3nMのT細胞活性化抗体二特異性分子の存在下でインキュベートした。試験/比較された化合物はCD19 x TCRvbおよびCD19 x CD3eであった。1日目~6日目に上清を収集し、MSDを使用することによってサイトカインを定量化した。
CD19 x TCRvβ(2x2)二特異性分子は、CD19 x CD3e二特異性分子と比較してCRS関連サイトカインの遅延および低減されたレベルの背景に対してIL-2産生の増加を示すことを図107A~Bは示す。
実施例40:マウスにおけるCD19 x TCRvβ 6-5(2x2)の薬物動態(PK)プロファイル
この実施例は、有効性研究のための投薬および/またはスケジュール処置の決定をガイドするためのマウスにおけるCD19 x TCRvβ 6-5(2x2)の薬物動態(
PK)プロファイルを記載する。研究設計を図108Aに示す。簡潔に述べれば、0日目に、6~8週齢の雌NSGマウスの皮下に1×10(6)個のRaji白血病細胞を移植した。2日目に、腹膜腔を介して10×10(6)個のヒトPBMCを注射することによってマウスをヒト化した。9日目に、静脈内に単回用量のCD19 x TCRvβ 6-5(2x2)を用いてマウスを処置した。0、0.5、1、6、24、48、72、96、148時間(n=3/時点)に顎下出血によって動物から血清を収穫した。血清薬物濃度をサンドイッチELISAによって測定した。
図108Bおよび下記の表22に示されるように、腫瘍保有ヒト化NSG動物におけるCD19 x TCRvβ 6-5(2x2)の血清半減期は、iv経路を介する1mg/kgの単回用量後に約24時間である。このデータは、有効性研究のための用量およびスケジュールの決定を可能とした。この用量における曝露は、100時間を超えて細胞EC90を上回るカバレージを可能とする。
Figure 2023509708000122
実施例41.α-TRBV6-5抗体の最適化
ヒトおよびカニクイザル抗原に対する親和性を向上させ、熱安定性を向上させ、かつ化学的安定性の不利益を課す可能性がある配列モチーフを除去するように抗TRBV6-5抗体を最適化した。ランダム突然変異誘発(Caldwellら、(1992年)、「Randomization of genes by PCR mutagenesis.」、PCR Meth. Appl. 2:28)または改変型のKunkel突然変異誘発(Kunkel TA.、(1985年)、「Rapid and efficient site-specific mutagenesis without phenotypic selection.」、PNAS 82(2):488~92ページ)を使用してScFvライブラリーを構築した。親和性の向上のために、標準的なファージディスプレイ(Lee, CMら、(2007年)、「Selection of human antibody fragments by phage display.」、Nature protocols 2、3001)および酵母ディスプレイ技術(Chao Gら、(2006年)、「Isolating and engineering human antibodies using yeast surface display.」、Nature Protocols. 1(2):755~69ページ)を使用してヒトおよびカニクイザル抗原に対するライブラリー選択を行った。ファージまたは酵母集団の熱曝露を使用して、向上された熱安定性を有するクローンを選択した。選択は、向上された特性を有する個々のクローンを同定するためのELISAおよびフローサイトメトリーなどの標準的なスクリーニング方法にしたがった。ヒットシークエンシングおよび突然変異-活性相関の分析後に、上記と同じ方法を使用して第2世代ライブラリーを構築した。最大化された活性を有するクローンを選択するためによりスト
リンジェントな条件を適用するという改変と共に上記と同様にライブラリー選択および個々のクローンのスクリーニングを繰り返した。ヒットシークエンシング後に、scFv遺伝子を、発現、精製、および格付けのための生物学的に妥当な抗体フォーマットに再フォーマット化した。
参考文献による組み込み
本明細書に記載されるすべての刊行物および特許は、個々の刊行物または特許の各々が、参照により組み込まれるように具体的におよび個別に指示されているかのように、それらの全体がこれにより参照により本明細書に組み込まれる。
均等物
当業者は、本明細書に記載される本発明の具体的な実施形態に対する多くの均等物を、単に日常的な実験を用いて認識するか、または確認することができる。このような均等物は、以下の特許請求の範囲に包含されることが意図される。

Claims (183)

  1. T細胞受容体ベータ可変領域(TCRβV)に結合する(例えば、特異的に結合する)抗体分子(「抗TCRβV抗体分子」)を含む第1の部分(例えば、第1の免疫細胞エンゲージャー)を含む、多特異性分子(例えば、二特異性分子)であって、第1の部分のTCRβV領域への結合が、TCRβV領域以外の受容体または分子に結合するT細胞エンゲージャー(「非TCRβV結合性T細胞エンゲージャー」)のサイトカインプロファイルとは異なるサイトカインプロファイルをもたらす、多特異性分子。
  2. 腫瘍標的化部分、サイトカイン分子、間質改変部分、または第1の部分以外の抗TCRβV抗体分子のうちの1つまたは複数を含む第2の部分を含む、請求項1に記載の多特異性分子。
  3. 抗TCRβV抗体分子を含む第1の部分が、バリアント、例えば、表21に記載されるFcバリアント、例えば、Asn297Ala(N297A)突然変異またはLeu234Ala/Leu235Ala(LALA)突然変異を含むFc領域を含む、請求項1または2に記載の多特異性分子。
  4. 非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーが、CD3分子(例えば、CD3イプシロン(CD3e)分子)、またはTCRアルファ(TCRα)分子に結合する抗体を含む、請求項3に記載の多特異性分子。
  5. 第1の部分のサイトカインプロファイルが、以下:
    (i)IL-2のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加、
    (ii)IL-1βのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
    (iii)IL-6のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
    (iv)TNFαのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
    (v)IL-10のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
    (vi)IL-2のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加における遅延、例えば、少なくとも1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間、もしくはそれ以上の遅延、
    (vii)IFNgのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加における遅延、例えば、少なくとも1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間の遅延、または
    (viii)IL-15のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加
    のうちの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、またはすべてを含み、
    例えば、(i)~(viii)が、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーのサイトカインプロファイルと比較したものである、請求項3または4に記載の多特異性分子。
  6. 第1の部分のTCRβV領域への結合が、実施例3のアッセイによって測定したときに、例えば、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーによって誘導されるサイトカインストームと比較して、サイトカインストームの低減、例えば、サイトカイン放出症候群(CRS)の低減をもたらす、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子。
  7. 第1の部分のTCRβV領域への結合が、
    (ix)T細胞増殖動態の低減、
    (x)例えば、実施例4のアッセイによって測定したときに、細胞殺滅、例えば、標的細胞殺滅、例えば、がん細胞殺滅、
    (xi)ナチュラルキラー(NK)細胞増殖、例えば、拡大の増加、または
    (xii)メモリー様表現型を有するT細胞集団の拡大、例えば、少なくとも約1.1~
    10倍の拡大(例えば、少なくとも約1.1倍、1.2倍、1.3倍、1.4倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、もしくは10倍の拡大)
    のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてをもたらし、
    例えば、(ix)~(xii)が、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーと比較したものである、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子。
  8. メモリー様表現型を有するT細胞集団が、CD45RA+ CCR7- T細胞、例えば、CD4+および/またはCD8+ T細胞を含む、請求項7に記載の多特異性分子。
  9. 第1の部分が、
    (i)例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01もしくはTCRβ V6-1*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V6サブファミリー、
    (ii)例えば、TCRβ V10-1*01、TCRβ V10-1*02、TCRβ
    V10-3*01もしくはTCRβ V10-2*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V10サブファミリー、
    (iii)例えば、TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、TCRβ V5-1*01もしくはTCRβ V5-8*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V5サブファミリー、
    (iv)例えば、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01、もしくはTCRβ V12-5*01のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V12サブファミリー、
    (v)TCRβ V27サブファミリー、
    (vi)TCRβ V28サブファミリー、
    (vii)例えば、TCRβ V4-1、TCRβ V4-2もしくはTCRβ V4-3のうちの1つもしくは複数を含む、TCRβ V4サブファミリー、
    (viii)TCRβ V19サブファミリー、
    (ix)TCRβ V9サブファミリー、または
    (x)例えば、TCRβ V11-2を含む、TCRβ V11サブファミリー
    から選択されるTCRβVサブファミリーのうちの1つまたは複数に結合する、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子。
  10. 抗TCRβV抗体分子が、
    (i)TCRβV上のエピトープ、例えば、本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、例えば、第2の抗TCRβV抗体分子によって認識されるエピトープと同じかもしくは類似のエピトープに特異的に結合するか、
    (ii)本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、例えば、第2の抗TCRβV抗体分子と同じかもしくは類似の結合親和性もしくは特異性またはその両方を示すか、
    (iii)本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、例えば、第2の抗TCRβV抗体分子の結合を阻害する、例えば、競合的に阻害するか、
    (iv)本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、例えば、第2の抗TCRβV抗体分子と同じかもしくはオーバーラップするエピトープに結合するか、または
    (v)本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子、例えば、第2の抗TCRβV抗体分子と、結合について競合する、かつ/もしくは同じエピトープに結合し、
    第2の抗TCRβV抗体分子が、配列番号1もしくは配列番号9の重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、および/もしくは重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)、ならびに/または配列番号2、配列番号10、もしくは配列番号11の軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2
    (LC CDR2)、および/もしくは軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)を含む抗原結合性ドメインを含む、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子。
  11. 抗TCRβV抗体分子が、
    (i)(a)配列番号15、配列番号23、配列番号24、もしくは配列番号25のHC
    CDR1、HC CDR2、および/もしくはHC CDR3、ならびに/または(b)配列番号16、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、もしくは配列番号30のLC CDR1、LC CDR2、および/もしくはLC CDR3、または
    (ii)(a)配列番号2、配列番号10、もしくは配列番号11のLC CDR1、LC CDR2、および/もしくはLC CDR3、ならびに/または(b)配列番号1または配列番号9のHC CDR1、HC CDR2、および/もしくはHC CDR2
    を含む抗原結合性ドメインを含む、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子。
  12. 抗TCRβV抗体分子が、同じかまたは異なるTCRβVサブファミリーメンバーに結合する、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子。
  13. 二特異性抗体分子、二価抗体分子、または二重パラトープ性抗体分子から選択される抗体分子を含む、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子。
  14. 2つの異なるTCRβVサブファミリーメンバーに結合する二特異性抗体分子を含む、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子。
  15. 抗TCRβV抗体分子が、
    (i)TCRβ V6サブファミリーメンバーのうちの1つもしくは複数およびTCRβ
    V10サブファミリーメンバーのうちの1つもしくは複数、
    (ii)TCRβ V6サブファミリーメンバーのうちの1つもしくは複数およびTCRβ V5サブファミリーメンバーのうちの1つもしくは複数、
    (iii)TCRβ V6サブファミリーメンバーのうちの1つもしくは複数およびTCRβ V12サブファミリーメンバーのうちの1つもしくは複数、
    (iv)TCRβ V10サブファミリーメンバーのうちの1つもしくは複数およびTCRβ V5サブファミリーメンバーのうちの1つもしくは複数、
    (v)TCRβ V10サブファミリーメンバーのうちの1つもしくは複数およびTCRβ V12サブファミリーメンバーのうちの1つもしくは複数、または
    (vi)TCRβ V5サブファミリーメンバーのうちの1つもしくは複数およびTCRβ V12サブファミリーメンバーのうちの1つもしくは複数
    に結合する、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子。
  16. 請求項1から15のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子を含む、多特異性分子、例えば、二特異性分子。
  17. T細胞受容体ベータ可変鎖(TCRβV)領域に結合する、例えば、特異的に結合する抗体分子であって、抗TCRβV抗体分子が、
    (a)軽鎖可変領域(VL)であって、
    (i)配列番号10もしくは配列番号11の(例えば、3つの)軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、および軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)のうちの1つ、2つ、もしくはすべて、ならびに
    (ii)(例えば、4つの)非マウス生殖系列フレームワーク1(FR1)、非マウス生殖系列フレームワーク領域2(FR2)、非マウス生殖系列フレームワーク領域3(FR3)、および非マウス生殖系列フレームワーク領域4(FR4)のうちの1つ、2つ、3
    つ、もしくはすべてと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む、軽鎖可変領域(VL)、ならびに/または
    (b)重鎖可変領域(VH)であって、
    (i)配列番号9の(例えば、3つの)重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、および重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)のうちの1つ、2つ、もしくはすべて、ならびに
    (ii)(例えば、4つの)非マウス生殖系列フレームワーク1(FR1)、非マウス生殖系列フレームワーク領域2(FR2)、非マウス生殖系列フレームワーク領域3(FR3)、および非マウス生殖系列フレームワーク領域4(FR4)のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべてと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む、重鎖可変領域(VH)
    を含む抗原結合性ドメインを含む、抗体分子。
  18. VLが、配列番号230のコンセンサス配列を有するアミノ酸配列を含む、請求項17に記載の抗TCRβV抗体分子。
  19. VHが、配列番号231のコンセンサス配列を有するアミノ酸配列を含む、請求項17または18に記載の抗TCRβV抗体分子。
  20. TCRβ V6、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、もしくはTCRβ V6-1*01のうちの1つもしくは複数、またはそのバリアントに結合する、請求項17から19のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  21. (i)配列番号1もしくは配列番号9、または表1に列挙されるアミノ酸配列のHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3、または
    (ii)配列番号2、配列番号10、もしくは配列番号11、または表1に列挙されるアミノ酸配列のLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3
    を含む抗原結合性ドメインを含む、請求項17から20のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  22. 配列番号2、配列番号10、もしくは配列番号11、または表1に列挙されるアミノ酸配列のLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3のうちの1つ、2つ、またはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗原結合性ドメインを含む、請求項17から21のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  23. 配列番号1もしくは配列番号9、または表1に列挙されるアミノ酸配列のHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3のうちの1つ、2つ、もしくはすべて(例えば、3つ)を含む重鎖可変領域(VH)を含む抗原結合性ドメインを含む、請求項17から22のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  24. (i)配列番号6のLC CDR1アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、配列番号7のLC CDR2アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、および/または配列番号8のLC CDR3アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)を含むVL、ならびに/または
    (ii)配列番号3のHC CDR1アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、配列番号4のHC CDR2アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、および/または配列番号5のHC CDR3アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)を含むVH
    を含む抗原結合性ドメインを含む、請求項17から23のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  25. 表1に列挙されるアミノ酸配列、例えば、配列番号9もしくは配列番号1312、もしくは表1に列挙されるアミノ酸配列、例えば、配列番号9もしくは配列番号1312に対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列の可変重鎖(VH)、および/または
    表1に列挙されるアミノ酸配列、例えば、配列番号10もしくは配列番号11もしくは配列番号1314、もしくは表1に列挙されるアミノ酸配列、例えば、配列番号10もしくは配列番号11もしくは配列番号1314に対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列の可変軽鎖(VL)
    を含む抗原結合性ドメインを含む、請求項17から24のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  26. (i)配列番号9もしくは配列番号1312のVHアミノ酸配列、
    (ii)配列番号9もしくは配列番号1312のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列、
    (iii)配列番号10もしくは配列番号1314のVLアミノ酸配列、および/または(iv)配列番号10もしくは配列番号1314のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列
    を含む抗原結合性ドメインを含む、請求項17から25のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  27. (i)配列番号9もしくは配列番号1312のVHアミノ酸配列、
    (ii)配列番号9もしくは配列番号1312のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列、
    (iii)配列番号11もしくは配列番号1314のVLアミノ酸配列、および/または(iv)配列番号11もしくは配列番号1314のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列
    を含む抗原結合性ドメインを含む、請求項17から26のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  28. (i)73位におけるスレオニン、例えば、Kabatの番号付けによる73位における置換、例えば、グルタミン酸からスレオニンへの置換、または
    (ii)94位におけるグリシン、例えば、Kabatの番号付けによる94位における置換、例えば、アルギニンからグリシンへの置換
    のうちの一方または両方を含む、フレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む重鎖を含み、
    置換が、ヒト生殖系列重鎖フレームワーク領域配列に対するものである、請求項17から27のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  29. 10位におけるフェニルアラニン(Phenyalanine)、例えば、Kabatの番号付けによる10位における置換、例えば、セリンからフェニルアラニンへの置換を含む、フレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖を含み
    、置換が、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列に対するものである、請求項17から28のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  30. (i)36位におけるヒスチジン、例えば、Kabatの番号付けによる36位における置換、例えば、チロシンからヒスチジンへの置換、または
    (ii)46位におけるアラニン、例えば、Kabatの番号付けによる46位における置換、例えば、アルギニンからアラニンへの置換
    のうちの一方または両方を含む、フレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域2(FR2)を含む軽鎖を含み、
    置換が、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列に対するものである、
    請求項17から29のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  31. 87位におけるフェニルアラニン、例えば、Kabatの番号付けによる87位における置換、例えば、チロシンからフェニルアラニンへの置換を含む、フレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含み、置換が、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列に対するものである、請求項17から30のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  32. T細胞受容体ベータ可変鎖(TCRβV)領域に結合する、例えば、特異的に結合する抗体分子であって、抗TCRβV抗体分子が、
    (a)軽鎖可変領域(VL)であって、
    (i)表2のヒト化B-H軽鎖(LC)の(例えば、3つの)軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、および軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)のうちの1つ、2つ、もしくはすべて、ならびに
    (ii)表2のヒト化B-H LCのフレームワーク領域1(FR1)、フレームワーク領域2(FR2)、フレームワーク領域3(FR3)、およびフレームワーク領域4(FR4)のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて(例えば、4つ)と少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む、軽鎖可変領域(VL)、ならびに/または
    (b)重鎖可変領域(VH)であって、
    (i)表2のヒト化B-H重鎖(HC)の(例えば、3つの)重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、および重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)のうちの1つ、2つ、もしくはすべて、ならびに
    (ii)表2のヒト化B-H HCのフレームワーク領域1(FR1)、フレームワーク領域2(FR2)、フレームワーク領域3(FR3)、およびフレームワーク領域4(FR4)のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて(例えば、4つ)と少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む、重鎖可変領域(VH)
    を含む抗原結合性ドメインを含む、抗体分子。
  33. TCRβ V12、例えば、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01、もしくはTCRβ V12-5*01、またはそのバリアントに結合する、請求項32に記載の抗TCRβV抗体分子。
  34. (i)表2に列挙される抗体B-HのHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3、または
    (ii)表2に列挙される抗体B-HのLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3
    を含む抗原結合性ドメインを含む、請求項32または33に記載の抗TCRβV抗体分子。
  35. 前配列番号2、配列番号10、もしくは配列番号11、または表1に列挙されるアミノ酸配列のLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3のうちの1つ、2つ、またはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗原結合性ドメインを含む、請求項32から34のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  36. 表2に列挙されるヒト化抗体B-HのHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3のうちの1つ、2つ、もしくはすべて(例えば、3つ)を含む重鎖可変領域(VH)を含む抗原結合性ドメインを含む、請求項32から35のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  37. 表2に列挙されるヒト化抗体B-HのLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3のうちの1つ、2つ、またはすべて(例えば、3つ)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗原結合性ドメインを含む、請求項32から36のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  38. 表2に列挙されるヒト化抗体B-HのVH配列、または表2に列挙されるヒト化抗体B-HのVHに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列、および/または
    表2に列挙されるヒト化抗体B-HのVL配列、もしくは表2に列挙されるヒト化抗体B-HのVLに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列
    を含む、請求項32から37のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  39. 表2のヒト化B-H LCのFR1、FR2、FR3、およびFR4のうちの1つと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む、請求項32から38のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  40. 表2のヒト化B-H LCのFR1、FR2、FR3、およびFR4のうちのいずれか2つと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む、請求項32から39のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  41. 表2のヒト化B-H LCのFR1、FR2、FR3、およびFR4のうちのいずれか3つと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む、請求項32から40のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  42. 表2のヒト化B-H LCのFR1、FR2、FR3、およびFR4のうちのすべてと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む、請求項32から41のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  43. 表2のヒト化B-H HCのFR1、FR2、FR3、およびFR4のうちの1つと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む、請求項32から42のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  44. 表2のヒト化B-H HCのFR1、FR2、FR3、およびFR4のうちのいずれか2つと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む、請求項32から42のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  45. 表2のヒト化B-H HCのFR1、FR2、FR3、およびFR4のうちのいずれか3つと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む、請求項32から42のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  46. 表2のヒト化B-H HCのFR1、FR2、FR3、およびFR4のうちのすべてと少なくとも95%の同一性を有するフレームワーク領域(FR)を含む、請求項32から42のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  47. 抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合が、TCRβV領域以外の受容体または分子に結合するT細胞エンゲージャー(「非TCRβV結合性T細胞エンゲージャー」)のサイトカインプロファイルとは異なるサイトカインプロファイルをもたらす、請求項17から46のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  48. 非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーが、CD3分子(例えば、CD3イプシロン(CD3e)分子)、またはTCRアルファ(TCRα)分子に結合する抗体を含む、請求項47に記載の抗TCRβV抗体分子。
  49. 第1の部分のサイトカインプロファイルが、以下:
    (i)IL-2のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加、
    (ii)IL-1βのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
    (iii)IL-6のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
    (iv)TNFαのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
    (v)IL-10のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
    (vi)IL-2のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加における遅延、例えば、少なくとも1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間、もしくはそれ以上の遅延、
    (vii)IFNgのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加における遅延、例えば、少なくとも1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間の遅延、または
    (viii)IL-15のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加
    のうちの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、またはすべてを含み、
    例えば、(i)~(vii)が、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーのサイトカインプロファイルと比較したものである、請求項47または48に記載の抗TCRβV抗体分子。
  50. 抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合が、実施例3のアッセイによって測定したときに、例えば、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーによって誘導されるサイトカインストームと比較して、サイトカインストームの低減、例えば、サイトカイン放出症候群(CRS)の低減をもたらす、請求項17から49のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  51. 抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合が、
    例えば、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーと比較して、
    (ix)T細胞増殖動態の低減、
    (x)例えば、実施例4のアッセイによって測定したときに、細胞殺滅、例えば、標的細胞殺滅、例えば、がん細胞殺滅、
    (xi)ナチュラルキラー(NK)細胞増殖、例えば、拡大の増加、または
    (xii)メモリー様表現型を有するT細胞集団の拡大、例えば、少なくとも約1.1~10倍の拡大(例えば、少なくとも約1.1倍、1.2倍、1.3倍、1.4倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、もしくは10倍の拡大)
    のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてをもたらす、請求項17から50のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子。
  52. メモリー様表現型を有するT細胞集団が、CD45RA+ CCR7- T細胞、例えば、CD4+および/またはCD8+ T細胞を含む、請求項51に記載の抗TCRβV抗体分子。
  53. 抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合が、実施例3のアッセイによって測定したときに、IL-1βの発現レベルおよび/または活性の、2分の1以下、5分の1以下、10分の1以下、20分の1以下、50分の1以下、100分の1以下、もしくは200分の1以下、または2~200分の1以下(例えば、5~150分の1以下、10~100分の1以下、20~50分の1以下)への低減をもたらす、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子または抗TCRβV抗体分子。
  54. 抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合が、実施例3のアッセイによって測定したときに、IL-6の発現レベルおよび/または活性の、2分の1以下、5分の1以下、10分の1以下、20分の1以下、50分の1以下、100分の1以下、200分の1以下、300分の1以下、400分の1以下、500分の1以下、600分の1以下、700分の1以下、800分の1以下、900分の1以下、もしくは1000分の1以下、または2~1000分の1以下(例えば、5~900分の1以下、10~800分の1以下、20~700分の1以下、50~600分の1以下、100~500分の1以下、もしくは200~400分の1以下)への低減をもたらす、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子または抗TCRβV抗体分子。
  55. 抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合が、実施例3のアッセイによって測定したときに、TNFαの発現レベルおよび/または活性の、2分の1以下、5分の1以下、10分の1以下、20分の1以下、50分の1以下、100分の1以下、200分の1以下、300分の1以下、400分の1以下、500分の1以下、600分の1以下、700分の1以下、800分の1以下、900分の1以下、1000分の1以下、もしくは2000分の1以下、または2~2000分の1以下(例えば、5~1000分の1以下、10~900分の1以下、20~800分の1以下、50~700分の1以下、100~600分の1以下、200~500分の1以下、もしくは300~400分の1以下)への低減をもたらす、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子または抗TCRβV抗体分子。
  56. 抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合が、実施例3のアッセイによって測定したときに、IL-2の発現レベルおよび/または活性の、少なくとも2倍、5倍、10倍、20倍、50倍、100倍、200倍、300倍、400倍、500倍、600倍、700倍、800倍、900倍、1000倍、もしくは2000倍、または少なくとも2~2000倍(例えば、5~1000倍、10~900倍、20~800倍、50~700倍、100~600倍、200~500倍、もしくは300~400倍)の増加をもたらす、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子または抗TCRβV抗体分子。
  57. 抗TCRβV抗体分子が、一本鎖Fv(scFv)またはFabを含む抗原結合性ドメインを含む、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子または抗TCRβV抗体分子。
  58. 抗TCRβV抗体分子が、T細胞上の立体構造エピトープまたは線形エピトープに結合する、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子または抗TCRβV抗体分子。
  59. 抗TCRβV抗体分子が、全長抗体(例えば、少なくとも1つ、好ましくは2つの完全重鎖と、少なくとも1つ、好ましくは2つの完全軽鎖とを含む抗体)、または抗原結合性断片(例えば、Fab、F(ab’)2、Fv、一本鎖Fv断片、単一ドメイン抗体、ダ
    イアボディ(dAb)、二価抗体、または二特異性抗体もしくはその断片、その単一ドメインバリアント、またはラクダ抗体)である、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子または抗TCRβV抗体分子。
  60. 抗TCRβV抗体分子が、例えば、表3に記載される、IgG1、IgG2、IgG3、IgGA1、IgGA2、IgG4、IgJ、IgM、IgD、もしくはIgEから選択される1つもしくは複数の重鎖定常領域、またはその断片を含む、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子または抗TCRβV抗体分子。
  61. 抗TCRβV抗体分子が、IgMの重鎖定常領域またはその断片を含み、必要に応じて、IgM重鎖定常領域が、配列番号73の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子または抗TCRβV抗体分子。
  62. 抗TCRβV抗体分子が、IgJの重鎖定常領域またはその断片を含み、必要に応じて、IgJ重鎖定常領域が、配列番号76の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子または抗TCRβV抗体分子。
  63. 抗TCRβV抗体分子が、IgGA1の重鎖定常領域またはその断片を含み、必要に応じて、IgGA1重鎖定常領域が、配列番号74の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子または抗TCRβV抗体分子。
  64. 抗TCRβV抗体分子が、IgGA2の重鎖定常領域またはその断片を含み、必要に応じて、IgGA2重鎖定常領域が、表3に列挙される配列、例えば、配列番号75の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子または抗TCRβV抗体分子。
  65. 抗TCRβV抗体分子が、例えば、表3に記載される、カッパもしくはラムダの軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域、またはその断片を含む、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子または抗TCRβV抗体分子。
  66. 抗TCRβV抗体分子が、カッパ鎖の軽鎖定常領域またはその断片を含み、必要に応じて、カッパ鎖定常領域が、配列番号39の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子または抗TCRβV抗体分子。
  67. 抗TCRβV抗体分子が、
    (i)例えば、表3に記載される、IgG1、IgG2、IgG3、IgGA1、IgGA2、IgG4、IgJ、IgM、IgD、もしくはIgEから選択される重鎖定常領域、またはその断片を含む、1つまたは複数の重鎖定常領域、および
    (ii)例えば、表3に記載される、カッパまたはラムダの軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域、またはその断片を含む、軽鎖定常領域
    を含む、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子または抗TCRβV抗体分子。
  68. 抗TCRβV抗体分子が、
    (i)重鎖定常領域であって、
    (a)配列番号73の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、も
    しくは99%の配列同一性を有する配列を含む、IgM重鎖定常領域またはその断片、
    (b)配列番号74の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む、IgGA1重鎖定常領域またはその断片、または
    (c)配列番号75の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む、IgGA2重鎖定常領域またはその断片を含む、重鎖定常領域、および
    (ii)配列番号39の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む、カッパ鎖定常領域を含む、軽鎖定常領域
    を含み、
    必要に応じて、抗TCRβV抗体分子が、IgJ重鎖定常領域またはその断片をさらに含み、IgJ重鎖定常領域が、配列番号76の配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列を含む、先行する請求項のいずれかに記載の多特異性分子または抗TCRβV抗体分子。
  69. 第2の部分が、腫瘍標的化部分である、請求項1から16または53から68のいずれか1項に記載の多特異性分子。
  70. 第2の部分が、サイトカイン分子である、請求項1から16または53から68のいずれか1項に記載の多特異性分子。
  71. 第2の部分が、間質改変部分である、請求項1から16または53から68のいずれか1項に記載の多特異性分子。
  72. 第2の部分が、第1の部分以外の抗TCRβV抗体分子である、請求項1から16または53から68のいずれか1項に記載の多特異性分子。
  73. 第1および/または第2の部分が、免疫細胞、例えば、エフェクター細胞に結合し、それを活性化する、請求項1から16または53から72のいずれか1項に記載の多特異性分子。
  74. 第1および/または第2の部分が、免疫細胞、例えば、エフェクター細胞に結合するが、それを活性化しない、請求項1から16または53から72のいずれか1項に記載の多特異性分子。
  75. 第2の部分が、NK細胞エンゲージャー、抗TCRβV抗体分子以外のT細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、もしくはマクロファージ細胞エンゲージャー、またはこれらの組合せから選択される、請求項1から16または53から74のいずれか1項に記載の多特異性分子。
  76. 腫瘍標的化部分が、がん抗原に結合する抗体分子(例えば、FabもしくはscFv)、受容体分子(例えば、受容体、受容体断片、もしくはその機能性バリアント)、もしくはリガンド分子(例えば、リガンド、リガンド断片、もしくはその機能性バリアント)、またはこれらの組合せを含む、請求項1から16または53から69のいずれか1項に記載の多特異性分子。
  77. 腫瘍標的化部分が、がん、例えば、血液がん、固形腫瘍、転移がん、軟部組織腫瘍、転移病変、またはこれらの組合せに存在するがん抗原に結合する、請求項1から16、53から69、または76のいずれか1項に記載の多特異性分子。
  78. がん抗原が、腫瘍抗原もしくは間質抗原、または血液抗原である、請求項77に記載の多特異性分子。
  79. がん抗原が、BCMA、CD19、CD20、CD22、FcRH5、PDL1、CD47、ガングロシド(gangloside)2(GD2)、前立腺幹細胞抗原(PSCA)、前立腺特異的膜抗原(PMSA)、前立腺特異的抗原(PSA)、癌胎児性抗原(CEA)、Ronキナーゼ、c-Met、未成熟ラミニン受容体、TAG-72、BING-4、カルシウム活性化塩素チャネル2、サイクリン-B1、9D7、Ep-CAM、EphA3、Her2/neu、テロメラーゼ、SAP-1、サバイビン、NY-ESO-1/LAGE-1、PRAME、SSX-2、メラン-A/MART-1、Gp100/pmel17、チロシナーゼ、TRP-1/-2、MC1R、β-カテニン、BRCA1/2、CDK4、CML66、フィブロネクチン、p53、Ras、TGF-Β受容体、AFP、ETA、MAGE、MUC-1、CA-125、BAGE、GAGE、NY-ESO-1、β-カテニン、CDK4、CDC27、αアクチニン-4、TRP1/gp75、TRP2、gp100、メラン-A/MART1、ガングリオシド、WT1、EphA3、上皮増殖因子受容体(EGFR)、MART-2、MART-1、MUC1、MUC2、MUM1、MUM2、MUM3、NA88-1、NPM、OA1、OGT、RCC、RUI1、RUI2、SAGE、TRG、TRP1、TSTA、葉酸受容体アルファ、L1-CAM、CAIX、gpA33、GD3、GM2、VEGFR、インテグリン(インテグリンアルファVベータ3、インテグリンアルファ5ベータ1)、炭水化物(Le)、IGF1R、EPHA3、TRAILR1、TRAILR2、RANKL、(FAP)、TGF-ベータ、ヒアルロン酸、コラーゲン、例えば、IV型コラーゲン、テネイシンC、またはテネイシンWから選択される、請求項77または78に記載の多特異性分子。
  80. 腫瘍標的化部分が、BCMA標的化部分またはFcRH5標的化部分である、請求項1から16、53から69、または76から79のいずれか1項に記載の多特異性分子。
  81. がんが、膵臓がん(例えば、膵臓腺癌)、乳がん、結腸直腸がん、肺がん(例えば、小細胞もしくは非小細胞肺がん)、皮膚がん、卵巣がん、または肝臓がんを含むがこれらに限定されない固形腫瘍である、請求項77から80のいずれか1項に記載の多特異性分子。
  82. がんが、B細胞もしくはT細胞悪性腫瘍、例えば、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫(例えば、B細胞リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、慢性リンパ球性白血病、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯B細胞リンパ腫、バーキットリンパ腫、リンパ形質細胞性リンパ腫、有毛細胞性白血病)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群、多発性骨髄腫、および急性リンパ球性白血病を含むがこれらに限定されない血液がんである、請求項77から80のいずれか1項に記載の多特異性分子。
  83. サイトカイン分子が、インターロイキン-2(IL-2)、インターロイキン-7(IL-7)、インターロイキン-12(IL-12)、インターロイキン-15(IL-15)、インターロイキン-18(IL-18)、インターロイキン-21(IL-21)、もしくはインターフェロンガンマ、またはこれらの断片、バリアント、もしくは組合せから選択される、請求項1から16、53から68、または70のいずれか1項に記載の多特異性分子。
  84. サイトカイン分子が、単量体または二量体である、請求項1から16、53から68、
    70、または83のいずれか1項に記載の多特異性分子。
  85. サイトカイン分子が、受容体二量体化ドメイン、例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメインをさらに含む、請求項1から16、53から68、70、または83から84のいずれか1項に記載の多特異性分子。
  86. サイトカイン分子(例えば、IL-15)および受容体二量体化ドメイン(例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメイン)が、共有結合的に連結されていない、例えば、非共有結合的に会合している、請求項1から16、53から68、70、または83から85のいずれか1項に記載の多特異性分子。
  87. IgG1、IgG2、IgG3、IgGA1、IgGA2、IgG4、IgJ、IgM、IgD、もしくはIgEの重鎖定常領域、またはその断片から選択される免疫グロブリン定常領域(例えば、Fc領域)をさらに含み、必要に応じて、重鎖定常領域が、ヒトIgG1、IgG2、またはIgG4の重鎖定常領域を含む、請求項1から16または53から86のいずれか1項に記載の多特異性分子。
  88. 免疫グロブリン定常領域(例えば、Fc領域)が、腫瘍標的化部分、サイトカイン分子、または間質改変部分のうちの1つまたは複数に連結されている、例えば、共有結合的に連結されている、請求項87に記載の多特異性分子。
  89. 第1および第2の免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)の境界部が、例えば、操作されていない境界部と比較して、二量体化を増加または減少させるように変更、例えば、突然変異されている、請求項87または88に記載の多特異性分子。
  90. 免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)の二量体化が、第1および第2のFc領域のFc境界部に、対になった孔と突起(「ノブ・イン・ホール」)、静電相互作用、または鎖交換のうちの1つまたは複数を提供し、それによって、例えば、操作されていない境界部と比較して、より高い比のヘテロ多量体:ホモ多量体が形成される、請求項89に記載の多特異性分子。
  91. リンカー、例えば、本明細書に記載されるリンカーをさらに含み、必要に応じて、リンカーが、切断性リンカー、非切断性リンカー、ペプチドリンカー、可撓性リンカー、剛性リンカー、ヘリックスリンカー、または非ヘリックスリンカーから選択される、請求項1から16または53から90のいずれかに記載の多特異性分子。
  92. 請求項17から53のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子をコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子。
  93. 請求項1から16もしくは53から91のいずれかに記載の多特異性分子をコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子。
  94. 請求項92または93のいずれかに記載の核酸分子のうちの1つまたは複数を含むベクター、例えば、発現ベクター。
  95. 請求項92もしくは93のいずれかに記載の核酸分子、または請求項94に記載のベクターを含む細胞、例えば、宿主細胞。
  96. 請求項17から53のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子、または請求項1から16もしくは53から91のいずれかに記載の多特異性分子を作製する、例えば、産生もしくは製造する方法であって、請求項95に記載の宿主細胞を、好適な条件、例えば、抗TCRβV抗体分子または多特異性分子の発現に好適な条件下において培養するステップを含む、方法。
  97. 請求項17から53のいずれかに記載の抗TCRβV抗体分子または請求項1から16もしくは53から91のいずれかに記載の多特異性分子と、薬学的に許容される担体、賦形剤、または安定化剤とを含む、医薬組成物。
  98. 対象において免疫応答をモジュレートする、例えば、増強させる方法であって、対象に、有効量の、T細胞受容体ベータ可変領域(TCRβV)に結合する(例えば、特異的に結合する)抗体分子(「抗TCRβV抗体分子」)を投与するステップを含む、方法。
  99. 対象において免疫応答をモジュレートする、例えば、増強させる方法であって、対象に、有効量の請求項1から16または53から91のいずれかに記載の多特異性分子を投与するステップを含む、方法。
  100. 対象において免疫細胞集団を拡大させる、例えば、その数を増加させるステップを含む、請求項98または99に記載の方法。
  101. 免疫細胞集団を拡大させる、例えば、その数を増加させる方法であって、免疫細胞集団を、有効量の、T細胞受容体ベータ可変領域(TCRβV)に結合する(例えば、特異的に結合する)抗体分子(「抗TCRβV抗体分子」)と接触させるステップを含む、方法。
  102. 免疫細胞集団を拡大させる、例えば、その数を増加させる方法であって、免疫細胞集団を、有効量の請求項1から16または53から91のいずれかに記載の多特異性分子と接触させるステップを含む、方法。
  103. 拡大が、in vivoまたはex vivo(例えば、in vitro)で生じる、請求項100から102のいずれかに記載の方法。
  104. 免疫細胞集団が、TCRβVを発現する細胞、例えば、TCRβV+細胞を含む、請求項100から103のいずれかに記載の方法。
  105. TCRβVを発現する細胞が、T細胞、例えば、CD8+ T細胞、CD3+ T細胞、またはCD4+ T細胞である、請求項104に記載の方法。
  106. 免疫細胞集団が、T細胞(例えば、CD4 T細胞、CD8 T細胞(例えば、エフェクターT細胞、メモリー様表現型を有するT細胞もしくはメモリーT細胞(例えば、メモリーエフェクターT細胞(例えば、TEM細胞、例えば、TEMRA細胞)、または腫瘍浸潤性リンパ球(TIL)を含む、請求項100から105のいずれかに記載の方法。
  107. 免疫細胞集団が、T細胞、ナチュラルキラー細胞、B細胞、または骨髄性細胞を含む、請求項100から106のいずれかに記載の方法。
  108. 免疫細胞集団が、健常な対象から得られる、請求項100から107のいずれかに記載の方法。
  109. 免疫細胞集団が、例えば、本明細書に記載される疾患、例えば、がんを有する対象から(例えば、対象由来のアフェレーシス試料から)得られ、必要に応じて、免疫細胞集団が、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を含む、請求項100から108のいずれかに記載の方法。
  110. 少なくとも1.1~10倍の拡大(例えば、少なくとも1.1倍、1.2倍、1.3倍、1.4倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、または10倍の拡大)をもたらす、請求項100から109のいずれかに記載の方法。
  111. 細胞集団を、免疫細胞の拡大を促進する、例えば、増加させる薬剤と接触させるステップをさらに含む、請求項100から110のいずれかに記載の方法。
  112. 細胞集団を、免疫チェックポイント阻害剤、例えば、PD-1阻害剤と接触させるステップをさらに含む、請求項100から111のいずれかに記載の方法。
  113. 細胞集団を、4-1BB(CD127)アゴニスト、例えば、抗4-1BB抗体と接触させるステップをさらに含む、請求項100から112のいずれかに記載の方法。
  114. 細胞集団を、非分裂細胞、例えば、フィーダー細胞、例えば、照射した同種ヒトPBMCの集団と接触させるステップをさらに含む、請求項100から113のいずれかに記載の方法。
  115. 細胞集団を、1つまたは複数のサイトカイン、例えば、IL-2、IL-7、IL-15、またはこれらの組合せを含む適切な培地(例えば、本明細書に記載される培地)において拡大させる、請求項100から114のいずれかに記載の方法。
  116. 細胞集団を、少なくとも約4時間、6時間、10時間、12時間、15時間、18時間、20時間、もしくは22時間、または少なくとも1日間、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、14日間、15日間、1,6日間、17日間、18日間、19日間、20日間、もしくは21日間、または少なくとも約1週間、2週間、3週間、4週間、5週間、6週間、7週間、もしくは8週間の期間、拡大させる、請求項100から115のいずれかに記載の方法。
  117. 免疫細胞集団の拡大が、CD3分子、例えば、CD3イプシロン(CD3e)分子、またはTCRアルファ(TCRα)分子に結合する抗体を用いた類似の細胞集団の拡大と比較される、請求項100から116のいずれか1項に記載の方法。
  118. 免疫細胞集団の拡大が、抗TCRβV抗体分子または抗TCRβV抗体分子を含む多特異性分子と接触していない類似の細胞集団の拡大と比較される、請求項100から117のいずれかに記載の方法。
  119. メモリー様表現型を有するT細胞、例えば、CD45RA+ CCR7-細胞(例えば、メモリーエフェクターT細胞、例えば、TEM細胞、例えば、TEMRA細胞)集団の拡大が、CD3分子、例えば、CD3イプシロン(CD3e)分子、またはTCRアルファ(TCRα)分子に結合する抗体を用いた類似の細胞集団の拡大と比較される、請求項100から118のいずれかに記載の方法。
  120. メモリー様表現型を有する拡大させたT細胞、例えば、エフェクターメモリー細胞集団が、
    (i)検出可能なレベルのCD45RAを有する、例えば、CD45RAを発現もしくは再発現する細胞、
    (ii)CCR7の低い発現を有するかもしくはその発現を有さない細胞、および/または
    (iii)検出可能なレベルのCD95を有する、例えば、CD95を発現する細胞、
    例えば、CD45RA+、CCR7-、CD95+ T細胞集団を含み、必要に応じて、T細胞が、CD3+、CD4+またはCD8+ T細胞を含む、請求項119に記載の方法。
  121. T細胞受容体(TCR)アルファおよび/またはTCRベータ分子を含むTCRを発現するT細胞、例えば、TCRアルファ-ベータT細胞(αβ T細胞)の拡大、例えば、選択的または優先的な拡大をもたらす、請求項100から120のいずれかに記載の方法。
  122. TCRガンマおよび/またはTCRデルタ分子を含むTCRを発現するT細胞、例えば、TCRガンマ-デルタT細胞(γδ T細胞)の拡大を上回るαβT細胞の拡大をもたらす、請求項121に記載の方法。
  123. 対象における疾患、例えば、がんを処置する方法であって、対象に、有効量の、T細胞受容体ベータ可変領域(TCRβV)に結合する(例えば、特異的に結合する)抗体分子(「抗TCRβV抗体分子」)を投与するステップを含み、それによって、がんを処置する、方法。
  124. 対象における疾患、例えば、がんを処置する際における使用のための、T細胞受容体ベータ可変領域(TCRβV)に結合する(例えば、特異的に結合する)抗体分子(「抗TCRβV抗体分子」)を含む組成物。
  125. 対象における疾患、例えば、がんを処置するための医薬の製造における使用のための、T細胞受容体ベータ可変領域(TCRβV)に結合する(例えば、特異的に結合する)抗体分子(「抗TCRβV抗体分子」)を含む組成物。
  126. 対象における疾患、例えば、がんを処置する方法であって、対象に、有効量の請求項1から16または53から91のいずれかに記載の多特異性分子を投与するステップを含み、それによってがんを処置する、方法。
  127. 対象における疾患、例えば、がんを処置する際における使用のための、請求項1から16または53から91のいずれかに記載の多特異性分子を含む組成物。
  128. 対象における疾患、例えば、がんを処置するための医薬の製造における使用のための、請求項1から16または53から91のいずれかに記載の多特異性分子を含む組成物。
  129. 対象におけるサイトカイン放出症候群(CRS)および/または神経毒性(NT)、例えば、処置、例えば以前に投与された処置と関連するCRSおよび/またはNTを処置する、例えば、予防または低減する方法であって、対象に、有効量の、T細胞受容体ベータ可変領域(TCRβV)に結合する(例えば、特異的に結合する)抗体分子(「抗TCRβV抗体分子」)を投与するステップを含み、それによって、対象におけるCRSおよび/またはNTを予防する、方法。
  130. 対象におけるサイトカイン放出症候群(CRS)および/または神経毒性(NT)、例えば、処置、例えば以前に投与された処置と関連するCRSおよび/またはNTを処置す
    る、例えば、予防または低減する方法であって、対象に、有効量の、請求項1から16または53から91のいずれかに記載の多特異性分子を投与するステップを含み、それによって、対象におけるCRSおよび/またはNTを予防する、方法。
  131. 疾患、例えば、がんを有する対象において、療法、例えば、処置を、T細胞へと標的化する方法であって、有効量の、
    (i)T細胞受容体ベータ可変領域(TCRβV)に結合する(例えば、特異的に結合する)抗体分子(「抗TCRβV抗体分子」)、および
    (ii)例えば、本明細書に記載される、療法、例えば、腫瘍標的化療法(例えば、がん抗原に結合する抗体)
    を投与するステップを含み、それによって、対象において療法をT細胞へと標的化する、方法。
  132. 疾患、例えば、がんを有する対象において、療法、例えば、処置を、T細胞へと標的化する方法であって、有効量の、
    (i)請求項1から16または53から91のいずれかに記載の多特異性分子、および
    (ii)例えば、本明細書に記載される、療法、例えば、腫瘍標的化療法(例えば、がん抗原に結合する抗体)
    を投与するステップを含み、それによって、対象において療法をT細胞へと標的化する、方法。
  133. (ii)単独の投与と比較して、サイトカイン放出症候群(CRS)の低減(例えば、CRSの持続期間がより短いこともしくはCRSがないこと)、またはCRSの重症度の低減(例えば、重度のCRS、例えば、CRSグレード4もしくは5の不在)をもたらす、請求項131または132に記載の方法。
  134. 抗TCRβV抗体または多特異性分子が、CRSと関連する処置の投与と並行してまたはその後に投与される、請求項131から133のいずれか1項に記載の方法。
  135. がんを有する対象を処置する方法であって、
    対象について、TCRβVサブファミリーのステータスの値を取得するステップであって、前記値が、対象由来の試料におけるTCRβV分子の存在、例えば、レベルまたは活性の尺度を含む、ステップと、
    対象に、有効量の、T細胞受容体ベータ可変領域(TCRβV)に結合する(例えば、特異的に結合する)抗体分子(「抗TCRβV抗体分子」)を投与するステップと
    を含み、それによって、対象を処置する、方法。
  136. がんを有する対象を処置する方法であって、
    対象について、TCRβVサブファミリーのステータスの値を取得するステップであって、前記値が、対象由来の試料におけるTCRβV分子の存在、例えば、レベルまたは活性の尺度を含む、ステップと、
    対象に、有効量の、請求項1から16または53から91のいずれかに記載の多特異性分子を投与するステップと
    を含み、それによって、対象を処置する、方法。
  137. がんを有する対象を処置する方法であって、対象に、有効量の、T細胞受容体ベータ可変領域(TCRβV)に結合する(例えば、特異的に結合する)抗体分子(「抗TCRβV抗体分子」)を投与するステップを含み、対象は、例えば、本明細書に記載される1つまたは複数のTCRβVサブファミリーのレベルまたは活性が、例えば、健常対象、例えば、がんを有さない対象における1つまたは複数のTCRβVサブファミリーの参照レベ
    ルまたは活性と比較して、高い、例えば、増加している、方法。
  138. がんを有する対象を処置する方法であって、対象に、有効量の、請求項1から16または53から91のいずれかに記載の多特異性分子を投与するステップを含み、対象は、例えば、本明細書に記載される1つまたは複数のTCRβVサブファミリーのレベルまたは活性が、例えば、健常対象、例えば、がんを有さない対象における1つまたは複数のTCRβVサブファミリーの参照レベルまたは活性と比較して、高い、例えば、増加している、方法。
  139. がんを有する対象由来の免疫エフェクター細胞集団を拡大させる方法であって、
    (i)対象から、免疫エフェクター細胞集団を含む生体試料、例えば、末梢血試料、生検試料、または骨髄試料を単離するステップと、
    (ii)対象について、例えば、対象由来の生体試料において、1つまたは複数のTCRβVサブファミリーのステータスの値を取得するステップであって、前記値が、参照値、例えば、健常対象由来の試料と比較した、対象由来の試料におけるTCRβVサブファミリーの存在、例えば、レベルまたは活性の尺度を含み、対象における参照物、例えば、健常対象と比較して高い、例えば、増加した値が、対象におけるがんの存在を示す、ステップと、
    (iii)免疫エフェクター細胞集団を含む生体試料を、例えば、本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子と接触させるステップと
    を含む、方法。
  140. 対象に、抗TCRβV抗体分子と接触させた免疫エフェクター細胞集団を投与するステップをさらに含む、請求項139に記載の方法。
  141. がんを有する対象由来の免疫エフェクター細胞集団を拡大させる方法であって、
    (i)対象から、免疫エフェクター細胞集団を含む生体試料、例えば、末梢血試料、生検試料、または骨髄試料を単離するステップと、
    (ii)対象について、例えば、対象由来の生体試料において、1つまたは複数のTCRβVサブファミリーのステータスの値を取得するステップであって、前記値が、参照値、例えば、健常対象由来の試料と比較した、対象由来の試料におけるTCRβVサブファミリーの存在、例えば、レベルまたは活性の尺度を含み、対象における参照物、例えば、健常対象と比較して高い、例えば、増加した値が、対象におけるがんの存在を示す、ステップと、
    (iii)免疫エフェクター細胞集団を含む生体試料を、請求項1から16または53から91のいずれかに記載の多特異性分子と接触させるステップと
    を含む、方法。
  142. 対象に、多特異性分子と接触させた免疫エフェクター細胞集団を投与するステップをさらに含む、請求項141に記載の方法。
  143. 免疫エフェクター細胞集団におけるT細胞機能(例えば、細胞傷害活性、サイトカイン分泌、または脱顆粒化)を、例えば、参照集団、例えば、抗TCRβV抗体分子と接触していないその他は類似の集団または健常対象(例えば、がんを有さない対象)から得られた免疫エフェクター細胞集団と比較して測定するステップを含む、請求項139から142のいずれか1項に記載の方法。
  144. 免疫エフェクター細胞集団を含む生体試料を、生体試料において高い、例えば、増加しているとして特定された1つまたは複数のTCRβVサブファミリー(例えば、同じTCRβVサブファミリー)に結合する抗TCRβV抗体分子または多特異性分子と接触させ
    る、請求項139から143のいずれか1項に記載の方法。
  145. 免疫エフェクター細胞集団を含む生体試料を、生体試料において高い、例えば、増加しているとして特定された1つまたは複数のTCRβVサブファミリー(例えば、異なるTCRβVサブファミリー)に結合しない抗TCRβV抗体分子または多特異性分子と接触させる、請求項139から144のいずれか1項に記載の方法。
  146. がんが、黒色腫、膵臓がん(例えば、膵臓腺癌)、乳がん、結腸直腸がん(CRC)、肺がん(例えば、小細胞もしくは非小細胞肺がん)、皮膚がん、卵巣がん、または肝臓がんを含むがこれらに限定されない固形腫瘍である、請求項139から145のいずれか1項に記載の方法。
  147. がんが、B細胞もしくはT細胞悪性腫瘍、例えば、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫(例えば、B細胞リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、濾胞性リンパ腫、慢性リンパ球性白血病(B-CLL)、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯B細胞リンパ腫、バーキットリンパ腫、リンパ形質細胞性リンパ腫、有毛細胞性白血病)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群、多発性骨髄腫、および急性リンパ球性白血病を含むがこれらに限定されない血液がんである、請求項139から145のいずれか1項に記載の方法。
  148. がんが、B-CLLであり、TCRβV分子が、
    (i)例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01、もしくはTCRβ V6-1*01を含む、TCRβ V6サブファミリー、
    (ii)TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、もしくはTCRβ V5-8*01を含む、TCRβ V5サブファミリー、
    (iii)TCRβ V3-1*01を含む、TCRβ V3サブファミリー、
    (iv)TCRβ V2*01を含む、TCRβ V2サブファミリー、または
    (v)TCRβ V19*01もしくはTCRβ V19*02を含む、TCRβ V19サブファミリー
    を含む、請求項139から147のいずれか1項に記載の方法。
  149. がんが、黒色腫であり、TCRβV分子が、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ
    V6-2*01、TCRβ V6-3*01、またはTCRβ V6-1*01を含む、TCRβ V6サブファミリーを含む、請求項139から147のいずれか1項に記載の方法。
  150. がんが、DLBCLであり、TCRβV分子が、
    (i)TCRβ V13*01を含む、TCRβ V13サブファミリー、
    (ii)TCRβ V3-1*01を含む、TCRβ V3サブファミリー、または
    (iii)TCRβ V23サブファミリー
    を含む、請求項139から147のいずれか1項に記載の方法。
  151. がんが、CRCであり、TCRβV分子が、
    (i)TCRβ V19*01もしくはTCRβ V19*02を含む、TCRβ V19サブファミリー、
    (ii)TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01、もしくはTCRβ
    V12-5*01を含む、TCRβ V12サブファミリー、
    (iii)TCRβ V16*01を含む、TCRβ V16サブファミリー、または
    (iv)TCRβ V21サブファミリー
    を含む、請求項139から147のいずれか1項に記載の方法。
  152. 腫瘍が、抗原、例えば、腫瘍抗原、例えば、腫瘍関連抗原もしくはネオ抗原を含み、かつ/または
    1つもしくは複数のTCRβVサブファミリーが、腫瘍抗原を認識する、例えば、それに結合する、
    請求項139から151のいずれか1項に記載の方法。
  153. 試料が、血液試料、例えば、末梢血試料、生検、例えば、腫瘍生検、または骨髄試料を含む、請求項139から152のいずれか1項に記載の方法。
  154. 試料が、免疫細胞、例えば、TCRBVを発現する細胞(例えば、TCRBV+細胞)、T細胞、またはNK細胞を含む生体試料を含む、請求項139から152のいずれか1項に記載の方法。
  155. T細胞が、CD4 T細胞、CD8 T細胞(例えば、エフェクターT細胞もしくはメモリーT細胞(例えば、メモリーエフェクターT細胞(例えば、TEM細胞、例えば、TEMRA細胞)、または腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を含む、請求項154に記載の方法。
  156. TCRVB発現免疫エフェクター細胞、例えば、T細胞を含む免疫エフェクター細胞集団の拡大、例えば、in vivoまたはex vivoでの拡大、少なくとも1.1~1000倍、例えば、1.1~10倍、10~100倍、100~200倍、200~300倍、300~400倍、400~500倍、500~600倍、600~700倍、700~800倍、800~900倍、または900~1000倍の拡大をもたらす、請求項139から155のいずれかに記載の方法。
  157. 細胞集団を、1つまたは複数のサイトカイン、例えば、IL-2、IL-7、IL-15、またはこれらの組合せを含む適切な培地(例えば、本明細書に記載される培地)において拡大させる、請求項139から156のいずれかに記載の方法。
  158. 細胞集団を、少なくとも約4時間、6時間、10時間、12時間、15時間、18時間、20時間、もしくは22時間、または少なくとも1日間、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、14日間、15日間、1,6日間、17日間、18日間、19日間、20日間、もしくは21日間、または少なくとも約1週間、2週間、3週間、4週間、5週間、6週間、7週間、もしくは8週間の期間、拡大させる、請求項139から157のいずれかに記載の方法。
  159. 免疫細胞集団の拡大が、CD3分子、例えば、CD3イプシロン(CD3e)分子、またはTCRアルファ(TCRα)分子に結合する抗体を用いた類似の細胞集団の拡大と比較される、請求項139から158のいずれかに記載の方法。
  160. 免疫細胞集団の拡大が、抗TCRβV抗体分子と接触していない類似の細胞集団の拡大と比較される、請求項139から159のいずれかに記載の方法。
  161. メモリー様表現型を有するT細胞、例えば、メモリーエフェクターT細胞、例えば、T
    EM細胞、例えば、TEMRA細胞集団の拡大が、CD3分子、例えば、CD3イプシロン(CD3e)分子、またはTCRアルファ(TCRα)分子に結合する抗体を用いた類似の細胞集団の拡大と比較される、請求項139から160のいずれかに記載の方法。
  162. メモリー様表現型を有する拡大させたT細胞、例えば、エフェクターメモリー細胞集団が、
    (i)検出可能なレベルのCD45RAを有する、例えば、CD45RAを発現もしくは再発現する細胞、
    (ii)CCR7の低い発現を有するかもしくはその発現を有さない細胞、および/または
    (iii)検出可能なレベルのCD95を有する、例えば、CD95を発現する細胞、
    例えば、CD45RA+、CCR7-、CD95+ T細胞集団を含み、必要に応じて、T細胞が、CD3+、CD4+またはCD8+ T細胞を含む、請求項133から161のいずれかに記載の方法。
  163. T細胞受容体(TCR)アルファおよび/またはTCRベータ分子を含むTCRを発現するT細胞、例えば、TCRアルファ-ベータT細胞(αβ T細胞)の拡大、例えば、選択的または優先的な拡大をもたらす、請求項139から162のいずれかに記載の方法。
  164. TCRガンマおよび/またはTCRデルタ分子を含むTCRを発現するT細胞、例えば、TCRガンマ-デルタT細胞(γδ T細胞)の拡大を上回るαβT細胞の拡大をもたらす、請求項163に記載の方法。
  165. 抗TCRβV抗体分子が、表1、表2、表10、表11、表12または表13に開示される軽鎖可変領域(VL)のLC CDR1、LC CDR2およびLC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべてを含むVL、例えば、配列番号1314、配列番号2、配列番号10、配列番号11、配列番号16、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29または配列番号30を含む抗原結合性ドメインを含む、請求項98から164のいずれか1項に記載の方法または使用のための組成物。
  166. 抗TCRβV抗体分子が、表1、表2、表10、表11、表12または表13に開示される重鎖可変領域(VH)のHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3のうちの1つ、2つまたはすべてを含むVH、例えば、配列番号1312、配列番号1、配列番号9、配列番号15、配列番号23、配列番号24または配列番号25を含む抗原結合性ドメインを含む、請求項98から165のいずれか1項に記載の方法または使用のための組成物。
  167. 抗TCRβV抗体分子が、
    (i)配列番号20のLC CDR1アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、配列番号21のLC CDR2アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、および/または配列番号22のLC CDR3アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)を含むVL、ならびに/または
    (ii)配列番号17のHC CDR1アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、配列番号18のHC CDR2アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、および/また
    は配列番号19のHC CDR3アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む抗原結合性ドメインを含む、請求項98から166のいずれか1項に記載の方法または使用のための組成物。
  168. 抗TCRβV抗体分子が、
    配列番号23、配列番号24、もしくは配列番号25、またはそれに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列の可変重鎖(VH)、および/または
    配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、もしくは配列番号30、またはそれに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列の可変軽鎖(VL)
    を含む抗原結合性ドメインを含む、請求項98から167のいずれか1項に記載の方法または使用のための組成物。
  169. 抗TCRβV抗体分子が、
    (i)配列番号6のLC CDR1アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、配列番号7のLC CDR2アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、および/または配列番号8のLC CDR3アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)を含むVL、ならびに/または
    (ii)配列番号3のHC CDR1アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、配列番号4のHC CDR2アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)、および/または配列番号5のHC CDR3アミノ酸配列(またはその1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の改変、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有するアミノ酸配列)を含むVH
    を含む抗原結合性ドメインを含む、請求項98から168のいずれか1項に記載の方法または使用のための組成物。
  170. 抗TCRβV抗体分子が、
    配列番号1もしくは配列番号9もしくは配列番号1312、もしくはそれに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列の可変重鎖(VH)、および/または
    配列番号2、配列番号10もしくは配列番号11もしくは配列番号1314、もしくはそれに対して少なくとも約85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列の可変軽鎖(VL)
    を含む抗原結合性ドメインを含む、請求項98から169のいずれか1項に記載の方法または使用のための組成物。
  171. 抗TCRβV抗体分子が、
    (i)1位におけるアスパラギン酸、例えば、Kabatの番号付けによる1位における置換、例えば、アラニンからアスパラギン酸への置換、または
    (ii)2位におけるアスパラギン、例えば、Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギン、セリンからアスパラギン、もしくはチロシンからアスパラギン(Asparagein)への置換、または
    (iii)4位におけるロイシン、例えば、Kabatの番号付けによる4位における置換、例えば、メチオニンからロイシンへの置換
    のうちの1つ、2つ、またはすべて(例えば、3つ)を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖を含み、
    置換が、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列に対するものである、
    請求項98から170のいずれか1項に記載の方法または使用のための組成物。
  172. 抗TCRβV抗体分子が、
    (i)66位におけるグリシン、例えば、Kabatの番号付けによる66位における置換、例えば、リシンからグリシン、もしくはセリンからグリシンへの置換、または
    (ii)69位におけるアスパラギン、例えば、Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、スレオニンからアスパラギンへの置換、または
    (iii)71位におけるチロシン、例えば、Kabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシン、もしくはアラニンからチロシンへの置換
    のうちの1つ、2つ、またはすべて(例えば、3つ)を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含み、
    置換が、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列に対するものである、
    請求項98から171のいずれか1項に記載の方法または使用のための組成物。
  173. 抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合が、TCRβV領域以外の受容体または分子に結合するT細胞エンゲージャー(「非TCRβV結合性T細胞エンゲージャー」)のサイトカインプロファイルとは異なるサイトカインプロファイルをもたらす、請求項98から171のいずれか1項に記載の方法または使用のための組成物。
  174. 非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーが、CD3分子(例えば、CD3イプシロン(CD3e)分子)、またはTCRアルファ(TCRα)分子に結合する抗体を含む、請求項173に記載の方法または使用のための組成物。
  175. 第1の部分のサイトカインプロファイルが、以下:
    (i)IL-2のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加、
    (ii)IL-1βのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
    (iii)IL-6のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
    (iv)TNFαのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
    (v)IL-10のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の低減、
    (vi)IL-2のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加における遅延、例えば、少なくとも1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間、もしくはそれ以上の遅延、
    (vii)IFNgのレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加における遅延、例えば、少なくとも1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間の遅延、または
    (viii)IL-15のレベル、例えば、発現レベル、および/もしくは活性の増加
    のうちの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、またはすべてを含み、
    例えば、(i)~(vii)が、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーのサイトカインプロファイルと比較したものである、請求項173または174に記載の方法または使用のための組成物。
  176. 抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合が、実施例3のアッセイによって測定したときに、例えば、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーによって誘導されるサイトカインストームと比較して、サイトカインストームの低減、例えば、サイトカイン放出症候群(CRS)の低減をもたらす、請求項173から175のいずれか1項に記載の方法または使用のための組成物。
  177. 抗TCRβV抗体分子のTCRβV領域への結合が、
    例えば、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーと比較して、
    (ix)T細胞増殖動態の低減、
    (x)例えば、実施例4のアッセイによって測定したときに、細胞殺滅、例えば、標的細胞殺滅、例えば、がん細胞殺滅、
    (xi)ナチュラルキラー(NK)細胞増殖、例えば、拡大の増加、または
    (xii)メモリー様表現型を有するT細胞集団の拡大、例えば、少なくとも約1.1~10倍の拡大(例えば、少なくとも約1.1倍、1.2倍、1.3倍、1.4倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、もしくは10倍の拡大)、
    のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてをもたらす、請求項173から176のいずれか1項に記載の方法または使用のための組成物。
  178. 抗TCRβV抗体分子が、例えば、図24Aにおいて丸で囲んだ領域によって示される、TCRβVタンパク質上の外向きの領域(例えば、エピトープ)に結合する、請求項98から177のいずれか1項に記載の方法または使用のための組成物。
  179. TCRβVタンパク質上の外部に面した領域が、TCRβVの構造的に保存される領域、例えば、1つまたは複数のTCRβVサブファミリーにわたって類似の構造を有するTCRβVの領域を含む、請求項178に記載の方法または使用のための組成物。
  180. 方法が、例えば、本明細書に記載される、第2の薬剤、例えば、治療剤を(例えば、逐次的に、同時に、または並行して)投与するステップをさらに含む、請求項98から179のいずれか1項に記載の方法または使用のための組成物。
  181. 第2の薬剤、例えば、治療剤が、化学療法剤、生物剤、ホルモン療法)、放射線、または外科手術を含む、請求項180に記載の方法または使用のための組成物。
  182. 疾患が、がん、例えば、固形腫瘍もしくは血液がん、または転移病変である、請求項98から134のいずれか1項に記載の方法または使用のための組成物。
  183. がん抗原が、BCMAまたはFcRH5である、請求項175に記載の方法。
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