JP2023507989A - 気道及び／または肺への遺伝子送達のための組成物及び方法 - Google Patents

気道及び／または肺への遺伝子送達のための組成物及び方法 Download PDF

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Abstract

Figure 2023507989000001
本開示は、ポリペプチド（例えば、ヒトアルファ－１－アンチトリプシンポリペプチドなどの吸入治療用ポリペプチド）をコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む組換え核酸；組換え核酸を含むウイルス；組換え核酸及び／またはウイルスを含む組成物及び製剤；それらの使用方法（例えば、ポリペプチドを呼吸器の１つ以上の細胞に送達するため、及び／またはアルファ－１－アンチトリプシン欠乏症など、肺に影響を与える疾患の治療のため）；ならびにその製品またはキットを提供する。
【選択図】図３

Description

関連出願の相互参照
本出願は、２０１９年１２月２０日に出願された米国仮出願第６２／９５１，５２３号に対する優先権の利益を主張するものであり、その全ての内容は参照により本明細書に組み込まれる。
ＡＳＣＩＩテキストファイルでの配列表の提出
ＡＳＣＩＩテキストファイルでの以下の提出物に関する内容は、その全体が参照によって本明細書に組み込まれる：配列表のコンピュータ可読形式（ＣＲＦ）（ファイル名：７６１３４２００１３４０ＳｅｑＬｉｓｔ．ｔｘｔ、記録日：２０２０年１２月１８日、サイズ：３６６ＫＢ）。
技術分野
本開示は、ポリペプチド（例えば、ヒトアルファ－１－アンチトリプシンポリペプチドなどの吸入治療用ポリペプチド）をコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む組換え核酸；本組換え核酸を含むウイルス；これらの医薬組成物及び製剤；これらの使用方法（例えば、ポリペプチドを呼吸器の１つ以上の細胞に送達するため、及び／またはアルファ－１－アンチトリプシン欠乏症など、肺に影響を与える疾患の治療のため）に一部関する。
背景
遺伝性肺疾患は、生涯において重大な罹患率及び死亡率となる。すべての小児病院への入院の約２２％は、呼吸器障害に向けたものであり、呼吸器疾患の先天的原因は、多くの場合致命的である。臨床ケアにおいて有意に進歩がみられ、病原性メカニズムがより良く理解されているにもかかわらず、これらの患者のための決定的な治療オプションは欠けており、治療アプローチは、多くの場合、補助的かつ思いやりのあるケアまたは肺移植に制限されている。そのため、患者の根本的な遺伝的／分子的欠陥に対処するために、新しい治療戦略が必要とされる。
特許出願、特許公報、非特許文献、及びＮＣＢＩ／ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ／Ｓｗｉｓｓ－Ｐｒｏｔ受託番号を含む、本明細書に引用されるすべての参考文献は、各個々の参考文献が参照により組み込まれるように具体的かつ個別に示されているかのように、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
概要
これら及び他のニーズを満たすために、１つ以上のポリペプチドを呼吸器の１つ以上の細胞（例えば、気道上皮細胞）に送達するため、及び／またはそれを必要としている対象の気道及び／または肺に影響を与える１つ以上の疾患を治療するために有用なウイルス（例えば、ヘルペスウイルス）、医薬組成物及び製剤、医用薬剤、及び／または方法で使用するため、１つ以上のポリペプチド（例えば、１つ以上の吸入治療用ポリペプチド）をコードする組換え核酸（例えば、組換えヘルペスウイルスゲノム）が本明細書に提供される。
したがって、本開示の特定の態様は、吸入治療用ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む組換えヘルペスウイルスゲノムに関する。いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、吸入治療用ポリペプチドをコードする２つ以上のポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、複製能力を有する。いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、複製欠損である。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、１つ以上のウイルス遺伝子座内に吸入治療用ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、組換え単純ヘルペスウイルスゲノム、組換え水痘帯状疱疹ウイルスゲノム、組換えヒトサイトメガロウイルスゲノム、組換えヘルペスウイルス６Ａゲノム、組換えヘルペスウイルス６Ｂゲノム、組換えヘルペスウイルス７ゲノム、Ｅｐｓｔｅｉｎ－Ｂａｒｒウイルスゲノム、組換えカポジ肉腫関連ヘルペスウイルスゲノム及びそれらの任意の組み合わせまたは派生体から選択される。
先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムである。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、組換え単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ－１）ゲノム、組換え単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ－２）ゲノムまたはそれらの任意の派生体である。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、組換えＨＳＶ－１ゲノムである。
先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、１つ以上の毒性単純ヘルペスウイルス遺伝子の発現が減少するまたは排除されるように操作されている。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、不活性化突然変異は、単純ヘルペスウイルス遺伝子に存在する。いくつかの実施形態では、不活性化突然変異は、単純ヘルペスウイルス遺伝子のコード配列の欠失である。いくつかの実施形態では、単純ヘルペスウイルス遺伝子は、感染細胞タンパク質（ＩＣＰ）０（一方または両方のコピー）、ＩＣＰ４（一方または両方のコピー）、ＩＣＰ２２、ＩＣＰ２７、ＩＣＰ４７、チミジンキナーゼ（ｔｋ）、ロングユニーク領域（ＵＬ）４１及びＵＬ５５から選択される。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４遺伝子の一方または両方のコピー中に不活性化突然変異を含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ２２遺伝子に不活性化突然変異を含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＵＬ４１遺伝子に不活性化突然変異を含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子の一方または両方のコピーに不活性化突然変異を含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ２７遺伝子に不活性化突然変異を含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４７遺伝子に不活性化突然変異を含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ｔｋ遺伝子に不活性化突然変異を含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＵＬ５５遺伝子に不活性化突然変異を含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ジョイント（Ｊｏｉｎｔ）領域に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ジョイント領域の欠失を含む。
先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、１つ以上のウイルス遺伝子座内に吸入治療用ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、一方または両方のＩＣＰ４ウイルス遺伝子座内に吸入治療用ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ２２ウイルス遺伝子座内に吸入治療用ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＵＬ４１ウイルス遺伝子座内に吸入治療用ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、一方または両方のＩＣＰ０ウイルス遺伝子座内に吸入治療用ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ２７ウイルス遺伝子座内に吸入治療用ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４７ウイルス遺伝子座内に吸入治療用ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ｔｋウイルス遺伝子座内に吸入治療用ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＵＬ５５ウイルス遺伝子座内に吸入治療用ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。
先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、吸入治療用ポリペプチドは、アルファ－１－アンチトリプシンポリペプチド、ナトリウム依存性リン酸輸送タンパク質２Ｂポリペプチド、ダイニン重鎖５軸糸ポリペプチド、ダイニン重鎖１１軸糸ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質３９ポリペプチド、ダイニン中間鎖１軸糸ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質４０ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１０３ポリペプチド、精子関連抗原１ポリペプチド、ジンクフィンガーＭＹＮＤドメイン含有タンパク質１０ポリペプチド、アルマジロリピート含有タンパク質４ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１５１ポリペプチド、ダイニン中間鎖２軸糸ポリペプチド、ラジアルスポークヘッド１ホモログポリペプチド、コイルドコイルメイン含有タンパク質１１４ポリペプチド、ラジアルスポークヘッドタンパク質４ホモログＡポリペプチド、ダイニンアセンブリ因子１軸糸ポリペプチド、ダイニンアセンブリ因子２軸糸ポリペプチド、ロイシンリッチリピート含有タンパク質６ポリペプチド、肺サーファクタント関連タンパク質Ｂポリペプチド、肺サーファクタント関連タンパク質Ｃポリペプチド、ホメオボックスタンパク質Ｎｋｘ－２．１ポリペプチド、ＡＴＰ結合カセットサブファミリーＡメンバー３ポリペプチド、サイトカイン受容体共通サブユニットベータポリペプチド、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体サブユニットアルファポリペプチド、骨形成タンパク質受容体２型ポリペプチド、筋小胞体／小胞体カルシウムＡＴＰアーゼ２ポリペプチド、セリン／スレオニンプロテインキナーゼ受容体Ｒ３ポリペプチド、エンドグリンポリペプチド、マザーズアゲインストデカペンタプレジックホモログ９ポリペプチド、カベオリン－１ポリペプチド、カリウムチャネルサブファミリーＫメンバー３ポリペプチド、ｅＩＦ－２－アルファキナーゼＧＣＮ２ポリペプチド、肺サーファクタント関連タンパク質Ａ２ポリペプチド、テロメラーゼ逆転写酵素ポリペプチド、ジスケリンポリペプチド、テロメア伸長ヘリカーゼ１ポリペプチドの調節因子、ポリ（Ａ）特異的リボヌクレアーゼＰＡＲＮポリペプチド、ＴＥＲＦ１相互作用核因子２ポリペプチド、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質複合体非コアサブユニットＮＡＦ１ポリペプチド、ムチン－５Ｂポリペプチド、デスモプラキンポリペプチド、ＣＳＴ複合体サブユニットＳＴＮ１ポリペプチド、及びジペプチジルペプチダーゼ９ポリペプチドから選択される。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、吸入治療用ポリペプチドは、ヒトポリペプチドである。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、吸入治療用ポリペプチドは、配列番号３～４６から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％の配列同一性を有する配列を含む。いくつかの実施形態では、吸入治療用ポリペプチドは、配列番号３のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％の配列同一性を有する配列を含む。いくつかの実施形態では、吸入治療用ポリペプチドは、配列番号４のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％の配列同一性を有する配列を含む。いくつかの実施形態では、吸入治療用ポリペプチドは、配列番号５～２１から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％の配列同一性を有する配列を含む。いくつかの実施形態では、吸入治療用ポリペプチドは、配列番号５のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％の配列同一性を有する配列を含む。いくつかの実施形態では、吸入治療用ポリペプチドは、配列番号２２～２７から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％の配列同一性を有する配列を含む。いくつかの実施形態では、吸入治療用ポリペプチドは、配列番号２８～３５から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％の配列同一性を有する配列を含む。いくつかの実施形態では、吸入治療用ポリペプチドは、配列番号２３、２５及び３６～４６から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％の配列同一性を有する配列を含む。
先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、対応する野生型ヘルペスウイルスゲノムと比較して、標的細胞に導入されたときに細胞毒性が低減している。いくつかの実施形態では、標的細胞は、ヒト細胞である。いくつかの実施形態では、標的細胞は、呼吸器の細胞である。いくつかの実施形態では、標的細胞は、気道上皮細胞である。
本開示の他の態様は、本明細書に記載の組換えヘルペスウイルスゲノムのいずれかを含むヘルペスウイルスに関する。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスは複製能力を有する。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスは複製欠損である。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスは、対応する野生型ヘルペスウイルスと比較して細胞毒性が低減している。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスは、単純ヘルペスウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、ヒトサイトメガロウイルス、ヘルペスウイルス６Ａ、ヘルペスウイルス６Ｂ、ヘルペスウイルス７、Ｅｐｓｔｅｉｎ－Ｂａｒｒウイルス、及びカポジ肉腫関連ヘルペスウイルス、及びそれらの任意の組み合わせまたは派生体から選択される。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスは、単純ヘルペスウイルスである。いくつかの実施形態では、単純ヘルペスウイルスは、ＨＳＶ－１、ＨＳＶ－２またはそれらの任意の派生体である。いくつかの実施形態では、単純ヘルペスウイルスは、ＨＳＶ－１である。
本開示の他の態様は、本明細書に記載の組換えヘルペスウイルスゲノムのいずれか及び／またはヘルペスウイルスのいずれかと、薬学的に許容され得る担体とを含む医薬組成物に関する。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、医薬組成物は、局所（ｔｏｐｉｃａｌ）投与、経皮投与、皮下投与、皮内投与、経口投与、鼻腔内投与、気管内投与、舌下投与、頬側投与、直腸投与、膣内投与、吸入投与、静脈内投与、動脈内投与、筋肉内投与、心臓内投与、骨内投与、腹腔内投与、経粘膜投与、硝子体内投与、網膜下投与、関節内投与、関節周囲投与、局所（ｌｏｃａｌ）投与、または皮膚上投与に適している。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、医薬組成物は、経口、鼻腔内、気管内、または吸入投与に適している。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、鼻腔内投与または吸入投与に適している。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、吸入投与に適している。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、医薬組成物は、乾燥粉末吸入器、加圧定量吸入器、ソフトミスト吸入器、ネブライザー、電気流体力学的エアロゾル装置、またはそれらの任意の組み合わせでの使用に適している。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、医薬組成物は、ネブライザーで使用するのに好適である。いくつかの実施形態では、ネブライザーは、振動型メッシュ式ネブライザーである。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、医薬組成物は、リン酸緩衝液を含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、医薬組成物は、グリセロールを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、医薬組成物は、脂質担体を含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、医薬組成物は、ナノ粒子担体を含む。
本開示の他の態様は、本明細書に記載の組換え核酸（例えば、組換えヘルペスウイルスゲノム）、組換えウイルス（例えば、組換えヘルペスウイルス）、及び／または医薬組成物のいずれかの、医用薬剤としての使用に関する。
本開示の他の態様は、本明細書に記載の組換え核酸（例えば、組換えヘルペスウイルスゲノム）、組換えウイルス（例えば、組換えヘルペスウイルス）、及び／または医薬組成物のいずれかの、治療法においての使用に関する。
本開示の他の態様は、１つ以上の肺疾患（例えば、遺伝性肺疾患）を治療するための、医用薬剤の調製において、本明細書に記載の組換え核酸（例えば、組換えヘルペスウイルスゲノム）、組換えウイルス（例えば、組換えヘルペスウイルス）、及び／または医薬組成物のいずれかの使用に関する。
本開示の他の態様は、対象の１つ以上の、呼吸器の細胞、気道上皮細胞、及び／または肺細胞における吸入治療用ポリペプチドのレベルを発現、増強、増加、増大、及び／または補足する方法に関し、本方法は、本明細書に記載の有効量の組換えヘルペスウイルス及び／または医薬組成物のいずれかを対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象は、慢性肺疾患に罹患している。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、対象はヒトである。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、対象に、経口投与される、鼻腔内投与される、気管内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、対象に、鼻腔内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、吸入を介して対象に投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、乾燥粉末吸入器、加圧定量吸入器、ソフトミスト吸入器、ネブライザー、または電気流体力学的エアロゾル装置を使用して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、ネブライザーを使用して投与される。いくつかの実施形態では、ネブライザーは、振動型メッシュ式ネブライザーである。
本開示の他の態様は、進行性肺破壊の低減または阻害を必要とする対象においてそれを行う方法に関し、方法は、対象に有効量の本明細書に記載の組換えヘルペスウイルス、及び／または医薬組成物のいずれかを投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象は、慢性肺疾患に罹患している。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、対象はヒトである。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、対象に、経口投与される、鼻腔内投与される、気管内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、対象に、鼻腔内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、吸入を介して対象に投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、乾燥粉末吸入器、加圧定量吸入器、ソフトミスト吸入器、ネブライザー、または電気流体力学的エアロゾル装置を使用して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、ネブライザーを使用して投与される。いくつかの実施形態では、ネブライザーは、振動型メッシュ式ネブライザーである。
本開示の他の態様は、気道及び／または肺に影響を与える疾患の１つ以上の徴候または症状の予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法に関し、方法は、有効量の本明細書に記載の組換えヘルペスウイルスまたは医薬組成物のいずれかを対象に投与することを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、対象はヒトである。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、対象に、経口投与される、鼻腔内投与される、気管内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、対象に、鼻腔内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、吸入を介して対象に投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、乾燥粉末吸入器、加圧定量吸入器、ソフトミスト吸入器、ネブライザー、または電気流体力学的エアロゾル装置を使用して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、ネブライザーを使用して投与される。いくつかの実施形態では、ネブライザーは、振動型メッシュ式ネブライザーである。
本開示の他の態様は、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症の１つ以上の徴候または症状の予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法に関し、方法は、有効量の本明細書に記載の組換えヘルペスウイルスまたは医薬組成物のいずれかを対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象のゲノムは、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子における病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、アルファ－１－アンチトリプシンポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、対象はヒトである。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、対象に、経口投与される、鼻腔内投与される、気管内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、対象に、鼻腔内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、吸入を介して対象に投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、乾燥粉末吸入器、加圧定量吸入器、ソフトミスト吸入器、ネブライザー、または電気流体力学的エアロゾル装置を使用して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、ネブライザーを使用して投与される。いくつかの実施形態では、ネブライザーは、振動型メッシュ式ネブライザーである。
本開示の他の態様は、肺胞微石症の１つ以上の徴候または症状の予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法に関し、方法は、有効量の本明細書に記載の組換えヘルペスウイルス及び／または医薬組成物のいずれかを対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象のゲノムは、ＳＬＣ３４Ａ２遺伝子における病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、ナトリウム依存性リン酸輸送タンパク質２Ｂポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、対象はヒトである。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、対象に、経口投与される、鼻腔内投与される、気管内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、対象に、鼻腔内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、吸入を介して対象に投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、乾燥粉末吸入器、加圧定量吸入器、ソフトミスト吸入器、ネブライザー、または電気流体力学的エアロゾル装置を使用して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、ネブライザーを使用して投与される。いくつかの実施形態では、ネブライザーは、振動型メッシュ式ネブライザーである。
本開示の他の態様は、原発性線毛機能不全の１つ以上の徴候または症状の予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法に関し、方法は、有効量の本明細書に記載の組換えヘルペスウイルスまたは医薬組成物のいずれかを対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象のゲノムは、ＤＮＡＨ５、ＤＮＡＨ１１、ＣＣＤＣ３９、ＤＮＡＩ１、ＣＣＤＣ４０、ＣＣＤＣ１０３、ＳＰＡＧ１、ＺＭＹＮＤ１０、ＡＲＭＣ４、ＣＣＤＣ１５１、ＤＮＡＩ２、ＲＳＰＨ１、ＣＣＤＣ１１４、ＲＳＰＨ４Ａ、ＤＮＡＡＦ１、ＤＮＡＡＦ２、及びＬＲＲＣ６から選択される１つ以上の遺伝子における病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、ダイニン重鎖５軸糸ポリペプチド、ダイニン重鎖１１軸糸ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質３９ポリペプチド、ダイニン中間鎖１軸糸ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質４０ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１０３ポリペプチド、精子関連抗原１ポリペプチド、ジンクフィンガーＭＹＮＤドメイン含有タンパク質１０ポリペプチド、アルマジロリピート含有タンパク質４ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１５１ポリペプチド、ダイニン中間鎖２軸糸ポリペプチド、ラジアルスポークヘッド１ホモログポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１１４ポリペプチド、ラジアルスポークヘッドタンパク質４ホモログＡポリペプチド、ダイニンアセンブリ因子１軸糸ポリペプチド、ダイニンアセンブリ因子２軸糸ポリペプチド、及びロイシンリッチリピート含有タンパク質６ポリペプチドから選択されるポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、ダイニン重鎖５軸糸ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、対象はヒトである。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、対象に、経口投与される、鼻腔内投与される、気管内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、対象に、鼻腔内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、吸入を介して対象に投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、乾燥粉末吸入器、加圧定量吸入器、ソフトミスト吸入器、ネブライザー、または電気流体力学的エアロゾル装置を使用して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、ネブライザーを使用して投与される。いくつかの実施形態では、ネブライザーは、振動型メッシュ式ネブライザーである。
本開示の他の態様は、先天性肺胞タンパク症の１つ以上の徴候または症状の予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法に関し、方法は、有効量の本明細書に記載の組換えヘルペスウイルスまたは医薬組成物のいずれかを対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象のゲノムは、ＳＦＴＰＢ、ＳＦＴＰＣ、ＮＫＸ２－１、ＡＢＣＡ３、ＣＳＦ２ＲＢ、及びＣＳＦ２ＲＡから選択される１つ以上の遺伝子における病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、肺サーファクタント関連タンパク質Ｂポリペプチド、肺サーファクタント関連タンパク質Ｃポリペプチド、ホメオボックスタンパク質Ｎｋｘ－２．１ポリペプチド、ＡＴＰ結合カセットサブファミリーＡメンバー３ポリペプチド、サイトカイン受容体共通サブユニットベータポリペプチド、及び顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体サブユニットアルファポリペプチドから選択されるポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、対象はヒトである。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、対象に、経口投与される、鼻腔内投与される、気管内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、対象に、鼻腔内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、吸入を介して対象に投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、乾燥粉末吸入器、加圧定量吸入器、ソフトミスト吸入器、ネブライザー、または電気流体力学的エアロゾル装置を使用して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、ネブライザーを使用して投与される。いくつかの実施形態では、ネブライザーは、振動型メッシュ式ネブライザーである。
本開示の他の態様は、肺動脈性肺高血圧症の１つ以上の徴候または症状の予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法に関し、方法は、有効量の本明細書に記載の組換えヘルペスウイルスまたは医薬組成物のいずれかを対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象のゲノムは、ＢＭＰＲ２、ＡＴＰ２Ａ２、ＡＣＶＲＬ１、ＥＮＧ、ＳＭＡＤ９、ＣＡＶ１、ＫＣＮＫ３、及びＥＩＦ２ＡＫ４から選択される１つ以上の遺伝子における病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、骨形成タンパク質受容体２型ポリペプチド、筋小胞体／小胞体カルシウムＡＴＰアーゼ２ポリペプチド、セリン／スレオニンプロテインキナーゼ受容体Ｒ３ポリペプチド、エンドグリンポリペプチド、マザーズアゲインストデカペンタプレジックホモログ９ポリペプチド、カベオリン－１ポリペプチド、カリウムチャネルサブファミリーＫメンバー３ポリペプチド、及びｅＩＦ－２－アルファキナーゼＧＣＮ２ポリペプチドから選択されるポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、対象はヒトである。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、対象に、経口投与される、鼻腔内投与される、気管内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、対象に、鼻腔内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、吸入を介して対象に投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、乾燥粉末吸入器、加圧定量吸入器、ソフトミスト吸入器、ネブライザー、または電気流体力学的エアロゾル装置を使用して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、ネブライザーを使用して投与される。いくつかの実施形態では、ネブライザーは、振動型メッシュ式ネブライザーである。
本開示の他の態様は、肺線維症の１つ以上の徴候または症状の予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法に関し、方法は、有効量の本明細書に記載の組換えヘルペスウイルスまたは医薬組成物のいずれかを対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象のゲノムは、ＳＦＴＰＣ、ＡＢＣＡ３、ＳＦＴＰＡ２、ＴＥＲＴ、ＴＥＲＣ、ＤＫＣ１、ＲＴＥＬ、ＰＡＲＮ、ＴＩＮＦ２、ＮＡＦ１、ＭＵＣ５Ｂ、ＤＳＰ、ＳＴＮ１、及びＤＰＰ９から選択される１つ以上の遺伝子における病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、肺サーファクタント関連タンパク質Ｃポリペプチド、ＡＴＰ結合カセットサブファミリーＡメンバー３ポリペプチド、肺サーファクタント関連タンパク質Ａ２ポリペプチド、テロメラーゼ逆転写酵素ポリペプチド、ジスケリンポリペプチド、テロメア伸長ヘリカーゼ１ポリペプチドの調節因子、ポリ（Ａ）特異的リボヌクレアーゼＰＡＲＮポリペプチド、ＴＥＲＦ１相互作用核因子２ポリペプチド、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質複合体非コアサブユニットＮＡＦ１ポリペプチド、ムチン－５Ｂポリペプチド、デスモプラキンポリペプチド、ＣＳＴ複合体サブユニットＳＴＮ１ポリペプチド、及びジペプチジルペプチダーゼ９ポリペプチドから選択されるポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、対象はヒトである。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、対象に、経口投与される、鼻腔内投与される、気管内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、対象に、鼻腔内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、吸入を介して対象に投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、乾燥粉末吸入器、加圧定量吸入器、ソフトミスト吸入器、ネブライザー、または電気流体力学的エアロゾル装置を使用して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、ネブライザーを使用して投与される。いくつかの実施形態では、ネブライザーは、振動型メッシュ式ネブライザーである。
本開示の他の態様は、対象の呼吸器の１つ以上の細胞にポリペプチドを送達する方法に関し、本方法は、（ａ）組換えヘルペスウイルスゲノムを含むヘルペスウイルス、及び（ｂ）薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を対象に投与することを含み、ここで、組換えヘルペスウイルスゲノムは、ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、対象は、遺伝性肺疾患に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、気道及び／または肺に影響を与える疾患に罹患している。いくつかの実施形態では、疾患は、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症、肺胞微石症、原発性線毛機能不全、先天性肺胞タンパク症、肺動脈性肺高血圧症、及び肺線維症から選択される。
いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスは複製能力を有する。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスは複製欠損である。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスは、対応する野生型ヘルペスウイルスと比較して細胞毒性が低減している。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスは、単純ヘルペスウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、ヒトサイトメガロウイルス、ヘルペスウイルス６Ａ、ヘルペスウイルス６Ｂ、ヘルペスウイルス７、Ｅｐｓｔｅｉｎ－Ｂａｒｒウイルス、及びカポジ肉腫関連ヘルペスウイルス、及びそれらの任意の組み合わせまたは派生体から選択される。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスは、単純ヘルペスウイルスである。いくつかの実施形態では、単純ヘルペスウイルスは、ＨＳＶ－１、ＨＳＶ－２またはそれらの任意の派生体である。いくつかの実施形態では、単純ヘルペスウイルスは、ＨＳＶ－１である。
先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、組換え単純ヘルペスウイルスゲノム、組換え水痘帯状疱疹ウイルスゲノム、組換えヒトサイトメガロウイルスゲノム、組換えヘルペスウイルス６Ａゲノム、組換えヘルペスウイルス６Ｂゲノム、組換えヘルペスウイルス７ゲノム、Ｅｐｓｔｅｉｎ－Ｂａｒｒウイルスゲノム、組換えカポジ肉腫関連ヘルペスウイルスゲノム及びそれらの任意の組み合わせまたは派生体から選択される。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムである。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、組換え単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ－１）ゲノム、組換え単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ－２）ゲノムまたはそれらの任意の派生体である。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、組換えＨＳＶ－１ゲノムである。
先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、１つ以上の毒性単純ヘルペスウイルス遺伝子の発現が減少するまたは排除されるように操作されている。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、不活性化突然変異は、単純ヘルペスウイルス遺伝子に存在する。いくつかの実施形態では、不活性化突然変異は、単純ヘルペスウイルス遺伝子のコード配列の欠失である。いくつかの実施形態では、単純ヘルペスウイルス遺伝子は、感染細胞タンパク質（ＩＣＰ）０（一方または両方のコピー）、ＩＣＰ４（一方または両方のコピー）、ＩＣＰ２２、ＩＣＰ２７、ＩＣＰ４７、チミジンキナーゼ（ｔｋ）、ロングユニーク領域（ＵＬ）４１及びＵＬ５５から選択される。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４遺伝子の一方または両方のコピー中に不活性化突然変異を含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ２２遺伝子に不活性化突然変異を含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＵＬ４１遺伝子に不活性化突然変異を含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子の一方または両方のコピーに不活性化突然変異を含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ２７遺伝子に不活性化突然変異を含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４７遺伝子に不活性化突然変異を含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ｔｋ遺伝子に不活性化突然変異を含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＵＬ５５遺伝子に不活性化突然変異を含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ジョイント（Ｊｏｉｎｔ）領域に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ジョイント領域の欠失を含む。
先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、１つ以上のウイルス遺伝子座内にポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、一方または両方のＩＣＰ４ウイルス遺伝子座内にポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ２２ウイルス遺伝子座内にポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＵＬ４１ウイルス遺伝子座内にポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、一方または両方のＩＣＰ０ウイルス遺伝子座内にポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ２７ウイルス遺伝子座内にポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４７ウイルス遺伝子座内にポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ｔｋウイルス遺伝子座内にポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＵＬ５５ウイルス遺伝子座内にポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。
先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、対象はヒトである。先行実施形態のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施形態では、医薬組成物は、対象に、経口投与される、鼻腔内投与される、気管内投与される、または吸入によって投与される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、対象に、鼻腔内投与される、または吸入によって投与される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、対象に、吸入によって投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、乾燥粉末吸入器、加圧定量吸入器、ソフトミスト吸入器、ネブライザー、または電気流体力学的エアロゾル装置を使用して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、ネブライザーを使用して投与される。いくつかの実施形態では、ネブライザーは、振動型メッシュ式ネブライザーである。
本開示の他の態様は、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを含む製品またはキット、及びこれらの投与のための指示書に関する。
図１Ａ～図１Ｉは、野生型及び改変単純ヘルペスウイルスゲノムの概略図を示す。図１Ａは野生型単純ヘルペスウイルスゲノムを示している。図１Ｂは、野生型及び改変単純ヘルペスウイルスゲノムの概略図を示す。ＩＣＰ４のコード配列（両方のコピー）の欠失を含み、ＩＣＰ４遺伝子座のそれぞれに組み込まれた吸入治療用ポリペプチドをコードする核酸を含む発現カセットを有する、改変単純ヘルペスウイルスゲノムを示す。図１Ｃは、野生型及び改変単純ヘルペスウイルスゲノムの概略図を示す。ＩＣＰ４（両方のコピー）及びＵＬ４１のコード配列の欠失を含み、ＩＣＰ４遺伝子座のそれぞれに組み込まれた吸入治療用ポリペプチドをコードする核酸を含む発現カセットを有する、改変単純ヘルペスウイルスゲノムを示す。図１Ｄ野生型及び改変単純ヘルペスウイルスゲノムの概略図を示す。ＩＣＰ４（両方のコピー）及びＵＬ４１のコード配列の欠失を含み、ＵＬ４１遺伝子座に組み込まれた吸入治療用ポリペプチドをコードする核酸を含む発現カセットを有する、改変単純ヘルペスウイルスゲノムを示す。図１Ｅは、野生型及び改変単純ヘルペスウイルスゲノムの概略図を示す。ＩＣＰ４（両方のコピー）及びＩＣＰ２２のコード配列の欠失を含み、ＩＣＰ４遺伝子座のそれぞれに組み込まれた吸入治療用ポリペプチドをコードする核酸を含む発現カセットを有する、改変単純ヘルペスウイルスゲノムを示す。図１Ｆは、野生型及び改変単純ヘルペスウイルスゲノムの概略図を示す。ＩＣＰ４（両方のコピー）及びＩＣＰ２２のコード配列の欠失を含み、ＩＣＰ２２遺伝子座に組み込まれた吸入治療用ポリペプチドをコードする核酸を含む発現カセットを有する、改変単純ヘルペスウイルスゲノムを示す。図１Ｇは、野生型及び改変単純ヘルペスウイルスゲノムの概略図を示す。ＩＣＰ４（両方のコピー）、ＵＬ４１、及びＩＣＰ２２のコード配列の欠失を含み、ＩＣＰ４遺伝子座のそれぞれに組み込まれた吸入治療用ポリペプチドをコードする核酸を含む発現カセットを有する、改変単純ヘルペスウイルスゲノムを示す。図１Ｈは、野生型及び改変単純ヘルペスウイルスゲノムの概略図を示す。ＩＣＰ４（両方のコピー）、ＵＬ４１、及びＩＣＰ２２のコード配列の欠失を含み、ＵＬ４１遺伝子座に組み込まれた吸入治療用ポリペプチドをコードする核酸を含む発現カセットを有する、改変単純ヘルペスウイルスゲノムを示す。図１Ｉは、野生型及び改変単純ヘルペスウイルスゲノムの概略図を示す。ＩＣＰ４（両方のコピー）、ＵＬ４１、及びＩＣＰ２２のコード配列の欠失を含み、ＩＣＰ２２遺伝子座に組み込まれた吸入治療用ポリペプチドをコードする核酸を含む発現カセットを有する、改変単純ヘルペスウイルスゲノムを示す。 図１－１の説明を参照。 図１－１の説明を参照。 図１－１の説明を参照。 図１－１の説明を参照。 図２は、ヒトＣＦＴＲ導入遺伝子をコードする改変単純ヘルペスウイルス（「ＨＳＶ－ＣＦＴＲ」）または陰性対照（ビヒクル）の噴霧後の野生型及びＣＦＴＲ欠損マウスの気道におけるベクター形質導入及び導入遺伝子発現を示す図であり、図２Ａは、ｑＰＣＲ分析によって評価された、ＨＳＶ－ＣＦＴＲまたはビヒクル対照の噴霧の４８時間後にマウスでの示された気道組織から採取された生検材料中に存在するヒトＣＦＴＲ ＤＮＡのレベルを示す。図２Ｂは、ｑＲＴ－ＰＣＲ分析によって評価された、ＨＳＶ－ＣＦＴＲまたはビヒクル対照の噴霧の４８時間後にマウスでの示された気道組織から採取された生検材料中に存在するヒトＣＦＴＲ転写物のレベルを示す。データは、２つの組織サンプルの平均（２つの複製／組織）±平均標準誤差（ＳＥＭ）として表される。 ヒトＣＦＴＲ導入遺伝子をコードする改変単純ヘルペスウイルス（「ＨＳＶ－ＣＦＴＲ」）または陰性対照（ビヒクル）の噴霧後に野生型及びＣＦＴＲ欠損マウスから採取された代表的なヘマトキシリン及びエオシン（Ｈ＆Ｅ）染色気道組織サンプルを示す図である。 ヒトＣＦＴＲ導入遺伝子をコードする改変単純ヘルペスウイルス（「ＨＳＶ－ＣＦＴＲ」）または陰性対照（ビヒクル）の噴霧後に野生型及びＣＦＴＲ欠損マウスの肺から採取された気管支肺胞洗浄液（ＢＡＬＦ）中での細胞浸潤を示す図である。データは、２つのサンプリングされた±ＳＥＭの平均として表わす。統計は、両側スチューデントのＴ検定を使用して計算した。 非ヒト霊長類におけるヒトＣＦＴＲ導入遺伝子をコードする改変単純ヘルペスウイルス（「ＨＳＶ－ＣＦＴＲ」）の反復投与噴霧の研究デザインの概略図を示す図である。 図６は、ヒトＣＦＴＲ導入遺伝子をコードする改変単純ヘルペスウイルス（「ＨＳＶ－ＣＦＴＲ」）の噴霧後の非ヒト霊長類の選択された組織におけるベクター形質導入及び導入遺伝子発現を示す図であり、図６Ａは、ｑＰＣＲ分析によって評価された、高用量のＨＳＶ－ＣＦＴＲの噴霧の４８時間後に示された、組織から採取された生検材料中に存在するヒトＣＦＴＲ ＤＮＡのレベルを示す。図６Ｂは、ｑＲＴ－ＰＣＲ分析によって評価された、高用量のＨＳＶ－ＣＦＴＲの噴霧の４８時間後に示された、組織から採取された生検材料中に存在するヒトＣＦＴＲ転写物のレベルを示す。データは、２回の複製／組織の平均±ＳＥＭとして表わす。ｎｄ：検出なし。 非感染対照細胞（モック）または感染多重度（ＭＯＩ）が１または２で、ヒトＳＥＲＰＩＮＡ１導入遺伝子をコードする改変単純ヘルペスウイルスに感染した細胞における細胞内ヒトアルファ－１－アンチトリプシン（Ａ１ＡＴ）のウエスタンブロット検出を示す図である。組換えヒトＡ１ＡＴ（ｒＡ１ＡＴ）を陽性対照として使用した。 非感染対照細胞（モック）または感染多重度（ＭＯＩ）が１または２で、ヒトＳＥＲＰＩＮＡ１導入遺伝子をコードする改変単純ヘルペスウイルスに感染した細胞の細胞培養上清に分泌されたヒトアルファ－１－アンチトリプシン（Ａ１ＡＴ）のウエスタンブロット検出を示す図である。組換えヒトＡ１ＡＴ（ｒＡ１ＡＴ）を陽性対照として使用した。ゲルをロードするときに、各感染細胞上清サンプルの間にブランクウェルを残した（レーン５、７、及び９）。
詳細な説明
以下の説明では、例示的な方法、パラメータなどを述べる。しかしながら、そのような説明は、本開示の範囲を制限することを意図するものではなく、代わりに、例示的な実施形態の説明として提供されることを認識されたい。
Ｉ．一般的技術
本明細書に記載または参照される技術及び手順は、概して、当業者によってよく理解され、従来の方法論、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ ３ｄ ｅｄｉｔｉｏｎ（２００１）Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ｆ．Ｍ．Ａｕｓｕｂｅｌ，ｅｔ ａｌ．ｅｄｓ．，（２００３））、ｔｈｅ ｓｅｒｉｅｓ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ（Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｉｎｃ．）：ＰＣＲ ２：Ａ Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ａｐｐｒｏａｃｈ（Ｍ．Ｊ．ＭａｃＰｈｅｒｓｏｎ，Ｂ．Ｄ．Ｈａｍｅｓ ａｎｄ Ｇ．Ｒ．Ｔａｙｌｏｒ ｅｄｓ．（１９９５）），Ｈａｒｌｏｗ ａｎｄ Ｌａｎｅ，ｅｄｓ．（１９８８）、Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ（Ｍ．Ｊ．Ｇａｉｔ，ｅｄ．，１９８４）、Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ、Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌｏｇｙ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｎｏｔｅｂｏｏｋ（Ｊ．Ｅ．Ｃｅｌｌｉｓ，ｅｄ．，１９９８）Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ、Ａｎｉｍａｌ Ｃｅｌｌ Ｃｕｌｔｕｒｅ（Ｒ．Ｉ．Ｆｒｅｓｈｎｅｙ），ｅｄ．，１９８７）、Ｉｎｔｒｏｄｕｃｔｉｏｎ ｔｏ Ｃｅｌｌ ａｎｄ Ｔｉｓｓｕｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ（Ｊ．Ｐ．Ｍａｔｈｅｒ ａｎｄ Ｐ．Ｅ．Ｒｏｂｅｒｔｓ，１９９８）Ｐｌｅｎｕｍ Ｐｒｅｓｓ、Ｃｅｌｌ ａｎｄ Ｔｉｓｓｕｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ：Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｏｃｅｄｕｒｅｓ（Ａ．Ｄｏｙｌｅ，Ｊ．Ｂ．Ｇｒｉｆｆｉｔｈｓ，ａｎｄ Ｄ．Ｇ．Ｎｅｗｅｌｌ，ｅｄｓ．，１９９３－８）Ｊ．Ｗｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎｓ、Ｇｅｎｅ Ｔｒａｎｓｆｅｒ Ｖｅｃｔｏｒｓ ｆｏｒ Ｍａｍｍａｌｉａｎ Ｃｅｌｌｓ（Ｊ．Ｍ．Ｍｉｌｌｅｒ ａｎｄ Ｍ．Ｐ．Ｃａｌｏｓ，ｅｄｓ．，１９８７）、ＰＣＲ：Ｔｈｅ Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ Ｃｈａｉｎ Ｒｅａｃｔｉｏｎ，（Ｍｕｌｌｉｓ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ．，１９９４）、Ｓｈｏｒｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ｗｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎｓ，１９９９）に記載されている広く利用されている方法論などを使用して一般的に援用されている。
ＩＩ．定義
本開示を詳細に説明する前に、本開示は、特定の組成物または生体系に限定されず、言うまでもなく変化し得ることを理解されたい。また、本明細書で使用する用語は、単に特定の実施形態を説明する目的のためのものであり、限定を意図するものではないことも理解されたい。
本明細書で使用する場合、文脈上明らかに別段に示されていない限り、「１つの（ａ）」、「１つの（ａｎ）」及び「その（ｔｈｅ）」という単数形には、複数の指示対象が含まれる。したがって、例えば、「分子」への言及は、２つ以上のそのような分子の組み合わせなどを任意に含む。
本明細書で使用する場合、「及び／または」という用語は、関連する列挙した項目の１つ以上のあらゆるすべての組み合わせを含み得る。例えば、「ａ及び／またはｂ」という用語は、「ａのみ」、「ｂのみ」、「ａまたはｂ」、または「ａ及びｂ」を指すことができ、「ａ、ｂ及び／またはｃ」という用語は、「ａのみ」、「ｂのみ」、「ｃのみ」、「ａまたはｂ」、「ａまたはｃ」、「ｂまたはｃ」、「ａ、ｂまたはｃ」、「ａ及びｂ」、「ａ及びｃ」、「ｂ及びｃ」、または「ａ、ｂ及びｃ」などを指すことができる。
本明細書で使用する場合、「約」という用語は、当業者であれば容易に理解するそれぞれの値の通常の誤差範囲を指す。本明細書における「約」の値またはパラメータへの言及は、その値またはパラメータ自体を対象とする実施形態を含む（かつ説明する）。
本開示の態様及び実施形態は、態様及び実施形態「を含む」、「からなる」、及び「から本質的になる」を含むことが理解される。
本明細書で使用する場合、「ポリヌクレオチド」、「核酸配列」、「核酸」という用語、及びそれらの変形は、ポリデオキシリボヌクレオチド（２－デオキシ－Ｄ－リボースを含有する）、ポリリボヌクレオチド（Ｄ－リボースを含有する）、プリン塩基またはピリミジン塩基のＮ－グリコシドである任意の他のタイプのポリヌクレオチド、ならびに非ヌクレオチド骨格を含有する他のポリマー（ただし、ＤＮＡ及びＲＮＡで見られるような塩基対形成及び塩基スタッキングが可能な構成中で核酸塩基を含有するポリマーに限る）の総称であるものとする。したがって、これらの用語には、既知のタイプの核酸配列修飾、例えば、類似体による１つ以上の天然ヌクレオチドの置換、及びヌクレオチド間修飾が含まれる。
本明細書で使用する場合、核酸は、それが別の核酸配列と機能的な関係に置かれるとき、「作動可能に連結（ｏｐｅｒａｔｉｖｅｌｙ ｌｉｎｋｅｄ）」または「作動可能に連結（ｏｐｅｒａｂｌｙ ｌｉｎｋｅｄ）」されている。例えば、プロモーターもしくはエンハンサーは、それが配列の転写に影響を及ぼす場合、コード配列に作動可能に連結されており、またはリボソーム結合部位は、それが翻訳を促進するように配置されている場合、コード配列に作動可能に連結されている。一般に、「作動可能に連結された（ｏｐｅｒａｔｉｖｅｌｙ ｌｉｎｋｅｄ）」または「作動可能に連結された（ｏｐｅｒａｂｌｙ ｌｉｎｋｅｄ）」は、連結されているＤＮＡ配列またはＲＮＡ配列が隣接していることを意味する。
本明細書で使用する場合、「ベクター」という用語は、異種核酸を、それらの発現または複製のいずれかのために細胞に導入するために使用される個々の要素を指す。発現ベクターは、プロモーター領域などの調節配列と作動可能に連結された核酸を発現することができるベクターを含み、調節配列は、そのような核酸の発現をもたらすことができる。したがって、発現ベクターは、プラスミド、ファージ、組換えウイルス、または適切な宿主細胞に導入されると核酸の発現をもたらす他のベクターなどのＤＮＡコンストラクトまたはＲＮＡコンストラクトを指し得る。適切な発現ベクターは当業者に周知であり、真核細胞中で複製可能なもの、及びエピソームのままであるもの、または宿主細胞ゲノムに組み込まれるものが含まれる。
本明細書で使用する場合、「オープンリーディングフレーム」または「ＯＲＦ」は、タンパク質またはポリペプチドをコードする、ＤＮＡまたはＲＮＡのいずれかの核酸の連続ストレッチを指す。典型的には、核酸は、ＡＴＧまたはＡＵＧなどの翻訳開始シグナルまたは開始コドン、及び終止コドンを含む。
本明細書で使用する場合、「非翻訳領域」または「ＵＴＲ」は、オープンリーディングフレームの５’末端及び／または３’末端にある非翻訳核酸を指す。ポリヌクレオチドに１つ以上のＵＴＲを含有させると、ポリヌクレオチドの転写後調節、ｍＲＮＡ安定性及び／または翻訳に影響を及ぼす場合がある。
本明細書で使用する場合、「導入遺伝子」という用語は、細胞に導入された後、適切な条件下でＲＮＡに転写され、翻訳及び／または発現することができるポリヌクレオチドを指す。いくつかの態様では、導入遺伝子は、それが導入された細胞に所望の特性を付与するか、またはさもなければ所望の治療結果または診断結果をもたらす。
本明細書で使用する場合、「ポリペプチド」、「タンパク質」及び「ペプチド」という用語は互換的に使用され、２つ以上のアミノ酸のポリマーを指し得る。
本明細書で使用する場合、「対象」、「宿主」または「個体」は、ヒト、飼育動物及び家畜を含む哺乳動物、ならびにイヌ、ウマ、ネコ、雌ウシなどの動物園の動物、競技用動物または愛玩動物、加えて、マウス、ラット、ハムスター、ウサギ及び非ヒト霊長類などの研究で使用される動物などに分類される任意の動物を指す。いくつかの実施形態では、哺乳動物は、ヒトである。
本明細書で使用する場合、「医薬製剤」または「医薬組成物」という用語は、活性成分（複数可）の生物学的活性が有効になるような形態であり、かつ組成物または製剤を投与される対象が許容できない毒性を有する追加の成分を含まない調製物を指す。「薬学的に許容され得る」賦形剤（例えば、ビヒクル、添加物）は、対象の哺乳動物に適度に投与され、用いられる有効用量の活性成分（複数可）を提供することができるものである。
本明細書で使用する場合、「有効量」とは、特定の障害の１つ以上の症状の測定可能な改善または予防をもたらすために必要な少なくとも最小の量である。「有効量」は、患者の病態、年齢、性別及び体重などの要因によって異なり得る。有効量は、治療上の有益な効果が処置の任意の毒性作用または有害作用を上回るものでもある。予防的使用の場合、有益なまたは所望の結果には、疾患のリスクの排除もしくは低減、疾患の重症度の軽減、または疾患、その合併症及び疾患の発症中に現れる中間病理学的表現型の発生の遅延などの結果が含まれる。治療的使用の場合、有益なまたは所望の結果には、疾患に起因する１つ以上の症状の軽減、疾患に罹患している者の生活の質の向上、疾患の症状の処置に使用される他の薬物療法の用量の減少、疾患の進行の遅延、及び／または生存期間の延長などの臨床結果が含まれる。有効量は、１回または複数回の投与で投与することができる。本開示の目的に関して、組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物の有効量は、予防的または治療的処置を直接または間接的のいずれかで達成するのに十分な量である。臨床的文脈において理解されるように、有効量の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物は、別の薬物、化合物または医薬組成物と併せて達成される場合もあれば、達成されない場合もある。したがって、「有効量」は、１つ以上の治療剤の投与の状況において考慮される場合があり、単一の薬剤は、１つ以上の他の薬剤と併せると望ましい結果が達成され得るか、または達成される場合、有効量で与えられるとみなすことができる。
本明細書で使用する場合、「処置」は、臨床病態の経過中に処置されている個体または細胞の自然経過を変化させるように設計された臨床的介入を指す。処置の望ましい効果には、疾患／障害／異常の進行速度の減速、疾患／障害／異常状態の改善または緩和、及び寛解または予後の改善が含まれる。例えば、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症に関連する１つ以上の徴候または症状が軽減または除去される場合に、個体は成功裡に「処置される」。
本明細書で使用する場合、疾患／障害／異常「の進行を遅延させる」という用語は、疾患／障害／異常の発症の延期、妨害、減速、抑制、安定化及び／または遅発を指す。この遅延は、疾患／障害／異常の病歴及び／または処置されている個体に応じて異なる長さまたは期間であり得る。当業者に明らかであるように、十分な、または大幅な遅延は、事実上、個体が疾患を発症しないという点で予防を包含し得る。
ＩＩＩ．組換え核酸
本開示の特定の態様は、ポリペプチド（例えば、吸入治療用ポリペプチド）をコードする１つ以上（例えば、１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、１０以上など）のポリヌクレオチドを含む組換え核酸（例えば、単離された組換え核酸）に関する。いくつかの実施形態では、組換え核酸は、吸入治療用ポリペプチドをコードする１つのポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、組換え核酸は、吸入治療用ポリペプチドをコードする２つのポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、組換え核酸は、吸入治療用ポリペプチドをコードする３つのポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、組換え核酸は、２つ以上の吸入治療用ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、２つ以上の吸入治療用ポリペプチドは同一である。いくつかの実施形態では、２つ以上の吸入治療用ポリペプチドは異なる。
いくつかの実施形態では、組換え核酸は、ベクターである。いくつかの実施形態では、組換え核酸は、ウイルスベクターである。いくつかの実施形態では、組換え核酸は、ヘルペスウイルスベクターである。いくつかの実施形態では、組換え核酸は、単純ヘルペスウイルスアンプリコンである。いくつかの実施形態では、組換え核酸は、組換えヘルペスウイルスゲノムである。いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムである。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、組換え単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ－１）ゲノムである。
吸入治療用ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド
いくつかの実施形態では、本開示は、ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む組換え核酸に関する（例えば、吸入治療用ポリペプチド）。いくつかの実施形態では、吸入治療用ポリペプチドは、気道及び／または肺に影響を与える１つ以上の疾患と相関する、原因となる、または寄与するポリペプチドの野生型及び／または機能的バリアント（例えば、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症、肺胞微石症、原発性線毛機能不全、先天性肺胞タンパク症、肺動脈性肺高血圧症、及び／または肺線維症のうちの１つ以上と相関する、原因となる、または寄与する突然変異体及び／または短縮型ポリペプチド）である。
いくつかの実施形態では、本開示の組換え核酸は、気道及び／または肺に影響を与える１つ以上の疾患と相関する、原因となる、または寄与する病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異（例えば、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症、肺胞微石症、原発性線毛機能不全、先天性肺胞タンパク症、肺動脈性肺高血圧症、肺線維症などのうちの１つ以上に罹患している患者において特定された遺伝子中の病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異）を含むものとして特定されている遺伝子の野生型及び／または機能的型のコード配列を含む１つ以上のポリヌクレオチドを含む。気道及び／または肺に影響を与える１つ以上の疾患または状態（例えば、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症、肺胞微石症、原発性線毛機能不全、先天性肺胞タンパク症、肺動脈性肺高血圧症、肺線維症）と相関する、原因となる、または寄与する病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を保有する遺伝子としては、例えば、ＳＥＲＰＩＮＡ１、ＳＬＣ３４Ａ２、ＤＮＡＨ５、ＤＮＡＨ１１、ＣＣＤＣ３９、ＤＮＡＩ１、ＣＣＤＣ４０、ＣＣＤＣ１０３、ＳＰＡＧ１、ＺＭＹＮＤ１０、ＡＲＭＣ４、ＣＣＤＣ１５１、ＤＮＡＩ２、ＲＳＰＨ１、ＣＣＤＣ１１４、ＲＳＰＨ４Ａ、ＤＮＡＡＦ１、ＤＮＡＡＦ２、ＬＲＲＣ６、ＳＦＴＰＢ、ＳＦＴＰＣ、ＮＫＸ２－１、ＡＢＣＡ３、ＣＳＦ２ＲＢ、ＣＳＦ２ＲＡ、ＢＭＰＲ２、ＡＴＰ２Ａ２、ＡＣＶＲＬ１、ＥＮＧ、ＳＭＡＤ９、ＣＡＶ１、ＫＣＮＫ３、ＥＩＦ２ＡＫ４、ＳＦＴＰＡ２、ＴＥＲＴ、ＴＥＲＣ、ＤＫＣ１、ＲＴＥＬ、ＰＡＲＮ、ＴＩＮＦ２、ＮＡＦ１、ＭＵＣ５Ｂ、ＤＳＰ、ＳＴＮ１、及びＤＰＰ９が挙げられる。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、本明細書に記載される遺伝子のいずれかの野生型コード配列（その任意のアイソフォームなど）を含む。ヒトＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の野生型コード配列を含む例示的ポリヌクレオチドは、配列番号１として提供される。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、本明細書に記載の遺伝子のいずれかの野生型コード配列のコドン最適化バリアントを含む。ヒトＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の野生型コード配列のコドン最適化バリアントを含む例示的ポリヌクレオチドは、配列番号２として提供される。いくつかの実施形態では、遺伝子のコード配列のコドン最適化バリアントの使用により、対応する、非コドン最適化野生型配列の異種発現の安定性及び／または収量と比較して、標的細胞中でのコードされたポリペプチドの異種発現（ＲＮＡ及び／またはタンパク質）の安定性及び／または収量が増加する。１つ以上の標的細胞（例えば、１つ以上のヒト細胞）における発現のための配列のコドン最適化を実施するための当技術分野で知られている任意の好適な方法を使用することができ、例えば、Ｆａｔｈらによって記載された方法による（ＰＬｏＳ Ｏｎｅ．２０１１ Ｍａｒ３；６（３）：ｅ１７５９６）。
当技術分野において公知である任意の適切なポリペプチドは、本開示のポリヌクレオチドによってコードされ得る。例えば、アルファ－１－アンチトリプシンポリペプチド、ナトリウム依存性リン酸輸送タンパク質２Ｂポリペプチド、ダイニン重鎖５軸糸ポリペプチド、ダイニン重鎖１１軸糸ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質３９ポリペプチド、ダイニン中間鎖１軸糸ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質４０ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１０３ポリペプチド、精子関連抗原１ポリペプチド、ジンクフィンガーＭＹＮＤドメイン含有タンパク質１０ポリペプチド、アルマジロリピート含有タンパク質４ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１５１ポリペプチド、ダイニン中間鎖２軸糸ポリペプチド、ラジアルスポークヘッド１ホモログポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１１４ポリペプチド、ラジアルスポークヘッドタンパク質４ホモログＡポリペプチド、ダイニンアセンブリ因子１軸糸ポリペプチド、ダイニンアセンブリ因子２軸糸ポリペプチド、ロイシンリッチリピート含有タンパク質６ポリペプチド、肺サーファクタント関連タンパク質Ｂポリペプチド、肺サーファクタント関連タンパク質Ｃポリペプチド、ホメオボックスタンパク質Ｎｋｘ－２．１ポリペプチド、ＡＴＰ結合カセットサブファミリーＡメンバー３ポリペプチド、サイトカイン受容体共通サブユニットベータポリペプチド、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体サブユニットアルファポリペプチド、骨形成タンパク質受容体２型ポリペプチド、筋小胞体／小胞体カルシウムＡＴＰアーゼ２ポリペプチド、セリン／スレオニンプロテインキナーゼ受容体Ｒ３ポリペプチド、エンドグリンポリペプチド、マザーズアゲインストデカペンタプレジックホモログ９ポリペプチド、カベオリン－１ポリペプチド、カリウムチャネルサブファミリーＫメンバー３ポリペプチド、ｅＩＦ－２－アルファキナーゼＧＣＮ２ポリペプチド、肺サーファクタント関連タンパク質Ａ２ポリペプチド、テロメラーゼ逆転写酵素ポリペプチド、ジスケリンポリペプチド、テロメア伸長ヘリカーゼ１ポリペプチドの調節因子、ポリ（Ａ）特異的リボヌクレアーゼＰＡＲＮポリペプチド、ＴＥＲＦ１相互作用核因子２ポリペプチド、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質複合体非コアサブユニットＮＡＦ１ポリペプチド、ムチン－５Ｂポリペプチド、デスモプラキンポリペプチド、ＣＳＴ複合体サブユニットＳＴＮ１ポリペプチド、ジペプチジルペプチダーゼ９ポリペプチドなどが挙げられる。いくつかの実施形態では、本開示の吸入治療用ポリペプチドは、本明細書に記載のポリペプチドのいずれかのアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の配列同一性を有する配列を含む。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、アルファ－１－アンチトリプシンポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、アルファ－１－アンチトリプシンポリペプチドは、ヒトアルファ－１－アンチトリプシンポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｐ０１００９を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：５２６５を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、アルファ－１－アンチトリプシンポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、アルファ－１－アンチトリプシンポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、アルファ－１－アンチトリプシンポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号３の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、しかし４１８未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ナトリウム依存性リン酸輸送タンパク質２Ｂポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ナトリウム依存性リン酸輸送タンパク質２Ｂポリペプチドは、ヒトナトリウム依存性リン酸輸送タンパク質２Ｂポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｏ９５４３６を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＳＬＣ３４Ａ２遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：１０５６８を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ナトリウム依存性リン酸輸送タンパク質２Ｂポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ナトリウム依存性リン酸輸送タンパク質２Ｂポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ナトリウム依存性リン酸輸送タンパク質２Ｂポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号４の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも６００、しかし６９０未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ダイニン重鎖５軸糸ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ダイニン重鎖５軸糸ポリペプチドは、ヒトダイニン重鎖５軸糸ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ８ＴＥ７３を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＤＮＡＨ５遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：１７６７を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ダイニン重鎖５軸糸ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号５の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ダイニン重鎖５軸糸ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号５のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ダイニン重鎖５軸糸ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号５のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号５の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも７５０、少なくとも１０００、少なくとも１２５０、少なくとも１５００、少なくとも１７５０、少なくとも２０００、少なくとも２２５０、少なくとも２５００、少なくとも２７５０、少なくとも３０００、少なくとも３２５０、少なくとも３５００、少なくとも３７５０、少なくとも４０００、少なくとも４２５０、少なくとも４５００、しかし４６２４未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ダイニン重鎖１１軸糸ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ダイニン重鎖１１軸糸ポリペプチドは、ヒトダイニン重鎖１１軸糸ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ９６ＤＴ５を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＤＮＡＨ１１遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：８７０１を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ダイニン重鎖１１軸糸ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号６の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ダイニン重鎖１１軸糸ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号６のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ダイニン重鎖１１軸糸ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号６のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号６の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも７５０、少なくとも１０００、少なくとも１２５０、少なくとも１５００、少なくとも１７５０、少なくとも２０００、少なくとも２２５０、少なくとも２５００、少なくとも２７５０、少なくとも３０００、少なくとも３２５０、少なくとも３５００、少なくとも３７５０、少なくとも４０００、少なくとも４２５０、少なくとも４５００、しかし４５１６未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、コイルドコイルドメイン含有タンパク質３９ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質３９ポリペプチドは、ヒトコイルドコイルドメイン含有タンパク質３９ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ９ＵＦＥ４を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＣＣＤＣ３９遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：３３９８２９を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質３９ポリペプチドは、配列番号７の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質３９ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号７のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質３９ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号７のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号７の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも６００、少なくとも７００、少なくとも８００、少なくとも９００、しかし９４１未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ダイニン中間鎖１軸糸ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ダイニン中間鎖１軸糸ポリペプチドは、ヒトダイニン中間鎖１軸糸ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ９ＵＩ４６を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＤＮＡＩ１遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：２７０１９を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ダイニン中間鎖１軸糸ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号８の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ダイニン中間鎖１軸糸ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号８のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ダイニン中間鎖１軸糸ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号８のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号８の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも６００、しかし６９９未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、コイルドコイルドメイン含有タンパク質４０ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質４０ポリペプチドは、ヒトコイルドコイルドメイン含有タンパク質４０ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ４Ｇ０Ｘ９を参照されたい）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＣＣＤＣ４０遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：５５０３６を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質４０ポリペプチドは、配列番号９の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質４０ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号９のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質４０ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号９のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号９の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも７５０、少なくとも１０００、しかし１１４２未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１０３ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１０３ポリペプチドは、ヒトコイルドコイルドメイン含有タンパク質１０３ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ８ＩＷ４０を参照されたい）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＣＣＤＣ１０３遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：３８８３８９を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１０３ポリペプチドは、配列番号１０の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１０３ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１０のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１０３ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１０のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号１０の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、しかし２４２未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、精子関連抗原１ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、精子関連抗原１ポリペプチドは、ヒト精子関連抗原１ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ０７６１７を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＳＰＡＧ１遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：６６７４を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、精子関連抗原１ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１１の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、精子関連抗原１ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１１のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、精子関連抗原１ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１１のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号１１の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも６００、少なくとも７００、少なくとも８００、少なくとも９００、しかし９２６未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ジンクフィンガーＭＹＮＤドメイン含有タンパク質１０ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ジンクフィンガーＭＹＮＤドメイン含有タンパク質１０ポリペプチドは、ヒトジンクフィンガーＭＹＮＤドメイン含有タンパク質１０ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｏ７５８００を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＺＭＹＮＤ１０遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：５１３６４を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ジンクフィンガーＭＹＮＤドメイン含有タンパク質１０ポリペプチドは、配列番号１２の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ジンクフィンガーＭＹＮＤドメイン含有タンパク質１０ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１２のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ジンクフィンガーＭＹＮＤドメイン含有タンパク質１０ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１２のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号１２の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、しかし４４０未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、アルマジロリピート含有タンパク質４ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、アルマジロリピート含有タンパク質４ポリペプチドは、ヒトアルマジロリピート含有タンパク質４ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ５Ｔ２Ｓ８を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＡＲＭＣ４遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：５５１３０を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、アルマジロリピート含有タンパク質４ポリペプチドは、配列番号１３の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、アルマジロリピート含有タンパク質４ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１３のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、アルマジロリピート含有タンパク質４ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１３のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号１３の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも７５０、少なくとも１０００、しかし１０４４未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１５１ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１５１ポリペプチドは、ヒトコイルドコイルドメイン含有タンパク質１５１ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号Ａ５Ｄ８Ｖ７を参照されたい）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＣＣＤＣ１５１遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：１１５９４８を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１５１ポリペプチドは、配列番号１４の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１５１ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１４のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１５１ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１４のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号１４の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、しかし５９５未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ダイニン中間鎖２軸糸ポリペプチドをコードするいくつかの実施形態では、ダイニン中間鎖２軸糸ポリペプチドは、ヒトダイニン中間鎖２軸糸ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ９ＧＺＳ０を参照のこと）いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＤＮＡＩ２遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：６４４４６を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ダイニン中間鎖２軸糸ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１５の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ダイニン中間鎖２軸糸ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１５のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ダイニン中間鎖２軸糸ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１５のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号１５の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも６００、しかし６０５未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ラジアルスポークヘッド１ホモログポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ラジアルスポークヘッド１ホモログポリペプチドは、ヒトラジアルスポークヘッド１ホモログポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ８ＷＹＲ４を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＲＳＰＨ１遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：８９７６５を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ラジアルスポークヘッド１ホモログポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１６の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ラジアルスポークヘッド１ホモログポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１６のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ラジアルスポークヘッド１ホモログポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１６のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号１６の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、しかし３０９未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１１４ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１１４ポリペプチドは、ヒトコイルドコイルドメイン含有タンパク質１１４ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ９６Ｍ６３を参照されたい）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＣＣＤＣ１１４遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：９３２３３を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１１４ポリペプチドは、配列番号１７の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１１４ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１７のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１１４ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１７のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号１７の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも６００、しかし６７０未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ラジアルスポークヘッドタンパク質４ホモログＡポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ラジアルスポークヘッドタンパク質４ホモログＡポリペプチドは、ヒトラジアルスポークヘッドタンパク質４ホモログＡポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ５ＴＤ９４を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＲＳＰＨ４Ａ遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：３４５８９５を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ラジアルスポークヘッドタンパク質４ホモログＡポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１８の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ラジアルスポークヘッドタンパク質４ホモログＡポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１８のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ラジアルスポークヘッドタンパク質４ホモログＡポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１８のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号１８の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも６００、少なくとも７００、しかし７１６未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ダイニンアセンブリ因子１軸糸ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ダイニンアセンブリ因子１軸糸ポリペプチドは、ヒトダイニンアセンブリ因子１軸糸ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ８ＮＥＰ３を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＤＮＡＡＦ１遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：１２３８７２を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ダイニンアセンブリ因子１軸糸ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１９の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ダイニンアセンブリ因子１軸糸ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１９のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ダイニンアセンブリ因子１軸糸ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号１９のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号１９の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも６００、少なくとも７００、しかし７２５未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ダイニンアセンブリ因子２軸糸ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ダイニンアセンブリ因子２軸糸ポリペプチドは、ヒトダイニンアセンブリ因子２軸糸ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ９ＮＶＲ５を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＤＮＡＡＦ２遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：５５１７２を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ダイニンアセンブリ因子２軸糸ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２０の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ダイニンアセンブリ因子２軸糸ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２０のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ダイニンアセンブリ因子２軸糸ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２０のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号２０の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも６００、少なくとも７００、少なくとも８００、しかし８３７未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ロイシンリッチリピート含有タンパク質６ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ロイシンリッチリピート含有タンパク質６ポリペプチドは、ヒトロイシンリッチリピート含有タンパク質６ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ８６Ｘ４５を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＬＲＲＣ６遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：２３６３９を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ロイシンリッチリピート含有タンパク質６ポリペプチドは、配列番号２１の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ロイシンリッチリピート含有タンパク質６ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２１のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ロイシンリッチリピート含有タンパク質６ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２１のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号２１の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、しかし４６６未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、肺サーファクタント関連タンパク質Ｂポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、肺サーファクタント関連タンパク質Ｂポリペプチドは、ヒト肺サーファクタント関連タンパク質Ｂポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｐ０７９８８を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＳＦＴＰＢ遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：６４３９を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、肺サーファクタント関連タンパク質Ｂポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２２の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、肺サーファクタント関連タンパク質Ｂポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２２のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、肺サーファクタント関連タンパク質Ｂポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２２のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号２２の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、しかし３８１未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、肺サーファクタント関連タンパク質Ｃポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、肺サーファクタント関連タンパク質Ｃポリペプチドは、ヒト肺サーファクタント関連タンパク質Ｃポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｐ１１６８６を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＳＦＴＰＣ遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：６４４０を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、肺サーファクタント関連タンパク質Ｃポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２３の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、肺サーファクタント関連タンパク質Ｃポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２３のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、肺サーファクタント関連タンパク質Ｃポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２３のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号２３の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、しかし１９７未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ホメオボックスタンパク質Ｎｋｘ－２．１ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ホメオボックスタンパク質Ｎｋｘ－２．１ポリペプチドは、ヒトホメオボックスタンパク質Ｎｋｘ－２．１ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｐ４３６９９を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＮＫＸ２－１遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：７０８０を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ホメオボックスタンパク質Ｎｋｘ－２．１ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２４の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ホメオボックスタンパク質Ｎｋｘ－２．１ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２４のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ホメオボックスタンパク質Ｎｋｘ－２．１ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２４のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号２４の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、しかし３７１未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ＡＴＰ結合カセットサブファミリーＡメンバー３ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＴＰ結合カセットサブファミリーＡメンバー３ポリペプチドは、ヒトＡＴＰ結合カセットサブファミリーＡメンバー３ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ９９７５８を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＡＢＣＡ３遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：２１を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ＡＴＰ結合カセットサブファミリーＡメンバー３ポリペプチドは、配列番号２５の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ＡＴＰ結合カセットサブファミリーＡメンバー３ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２５のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ＡＴＰ結合カセットサブファミリーＡメンバー３ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２５のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号２５の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも７５０、少なくとも１０００、少なくとも１２５０、少なくとも１５００、しかし１７０４未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、サイトカイン受容体共通サブユニットベータポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、サイトカイン受容体共通サブユニットベータポリペプチドは、ヒトサイトカイン受容体共通サブユニットベータポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｐ３２９２７を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＣＳＦ２ＲＢ遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：１４３９を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、サイトカイン受容体共通サブユニットベータポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２６の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、サイトカイン受容体共通サブユニットベータポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２６のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、サイトカイン受容体共通サブユニットベータポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２６のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号２６の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも６００、少なくとも７００、少なくとも８００、しかし８９７未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体サブユニットアルファポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体サブユニットアルファポリペプチドは、ヒト顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体サブユニットアルファポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｐ１５５０９を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＣＳＦ２ＲＡ遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：１４３８を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体サブユニットアルファポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２７の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体サブユニットアルファポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２７のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体サブユニットアルファポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２７のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号２７の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、しかし４００未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、骨形成タンパク質受容体２型ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、骨形成タンパク質受容体２型ポリペプチドは、ヒト骨形成タンパク質受容体２型ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ１３８７３を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＢＭＰＲ２遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：６５９を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、骨形成タンパク質受容体２型ポリペプチドは、配列番号２８の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、骨形成タンパク質受容体２型ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２８のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、骨形成タンパク質受容体２型ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２８のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号２８の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも７５０、少なくとも１０００、しかし１０３８未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、筋小胞体／小胞体カルシウムＡＴＰアーゼ２ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、筋小胞体／小胞体カルシウムＡＴＰアーゼ２ポリペプチドは、ヒト筋小胞体／小胞体カルシウムＡＴＰアーゼ２ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｐ１６６１５を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＡＴＰ２Ａ２遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：４８８を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、筋小胞体／小胞体カルシウムＡＴＰアーゼ２ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２９の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、筋小胞体／小胞体カルシウムＡＴＰアーゼ２ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２９のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、筋小胞体／小胞体カルシウムＡＴＰアーゼ２ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号２９のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号２９の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも７５０、少なくとも１０００、しかし１０４２未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、セリン／スレオニンプロテインキナーゼ受容体Ｒ３ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、セリン／スレオニンプロテインキナーゼ受容体Ｒ３ポリペプチドは、ヒトセリン／スレオニンプロテインキナーゼ受容体Ｒ３ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｐ３７０２３を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＡＣＶＲＬ１遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：９４を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、セリン／スレオニンプロテインキナーゼ受容体Ｒ３ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３０の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、セリン／スレオニンプロテインキナーゼ受容体Ｒ３ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３０のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、セリン／スレオニンプロテインキナーゼ受容体Ｒ３ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３０のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号３０の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、しかし５０３未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、エンドグリンポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、エンドグリンポリペプチドは、ヒトエンドグリンポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｐ１７８１３を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＥＮＧ遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：２０２２を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、エンドグリンポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３１の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、エンドグリンポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３１のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、エンドグリンポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３１のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号３１の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも６００、しかし６５８未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、マザーズアゲインストデカペンタプレジックホモログ９ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、マザーズアゲインストデカペンタプレジックホモログ９ポリペプチドは、ヒトマザーズアゲインストデカペンタプレジックホモログ９ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｏ１５１９８を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＳＭＡＤ９遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：４０９３を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、マザーズアゲインストデカペンタプレジックホモログ９ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３２の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、マザーズアゲインストデカペンタプレジックホモログ９ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３２のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、マザーズアゲインストデカペンタプレジックホモログ９ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３２のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号３２の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、しかし４６７未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、カベオリン－１ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、カベオリン－１ポリペプチドは、ヒトカベオリン－１ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ０３１３５を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＣＡＶ１遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：８５７を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、カベオリン－１ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３３の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、カベオリン－１ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３３のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、カベオリン－１ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３３のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号３３の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、しかし１７８未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、カリウムチャネルサブファミリーＫメンバー３ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、カリウムチャネルサブファミリーＫメンバー３ポリペプチドは、ヒトカリウムチャネルサブファミリーＫメンバー３ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｏ１４６４９を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＫＣＮＫ３遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：３７７７を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、カリウムチャネルサブファミリーＫメンバー３ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３４の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、カリウムチャネルサブファミリーＫメンバー３ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３４のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、カリウムチャネルサブファミリーＫメンバー３ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３４のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号３４の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、しかし３９４未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ｅＩＦ－２－アルファキナーゼＧＣＮ２ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ｅＩＦ－２－アルファキナーゼＧＣＮ２ポリペプチドは、ヒトｅＩＦ－２－アルファキナーゼＧＣＮ２ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ９Ｐ２Ｋ８を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＥＩＦ２ＡＫ４遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：４４０２７５を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ｅＩＦ－２－アルファキナーゼＧＣＮ２ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３５の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ｅＩＦ－２－アルファキナーゼＧＣＮ２ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３５のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ｅＩＦ－２－アルファキナーゼＧＣＮ２ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３５のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号３５の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも７５０、少なくとも１０００、少なくとも１２５０、少なくとも１５００、しかし１６４９未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、肺サーファクタント関連タンパク質Ａ２ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、肺サーファクタント関連タンパク質Ａ２ポリペプチドは、ヒト肺サーファクタント関連タンパク質Ａ２ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ８ＩＷＬ１を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＳＦＴＰＡ２遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：７２９２３８を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、肺サーファクタント関連タンパク質Ａ２ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３６の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、肺サーファクタント関連タンパク質Ａ２ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３６のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、肺サーファクタント関連タンパク質Ａ２ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３６のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号３６の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、しかし２４８未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、テロメラーゼ逆転写酵素ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、テロメラーゼ逆転写酵素ポリペプチドは、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｏ１４７４６を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＴＥＲＴ遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：７０１５を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、テロメラーゼ逆転写酵素ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３７の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、テロメラーゼ逆転写酵素ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３７のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、テロメラーゼ逆転写酵素ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３７のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号３７の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも７５０、少なくとも１０００、しかし１１３２未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ジスケリンポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ジスケリンポリペプチドは、ヒトジスケリンポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｏ６０８３２を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＤＫＣ１遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：１７３６を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ジスケリンポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３８の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ジスケリンポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３８のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ジスケリンポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号３８のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号３８の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、しかし５１４未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、テロメア伸長ヘリカーゼ１ポリペプチドの調節因子をコードする。いくつかの実施形態では、テロメア伸長ヘリカーゼ１ポリペプチドの調節因子は、テロメア伸長ヘリカーゼ１ポリペプチドのヒト調節因子である（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ９ＮＺ７１を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＲＴＥＬ遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：５１７５０を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、テロメア伸長ヘリカーゼ１ポリペプチドの調節因子をコードするポリヌクレオチドは、配列番号３９の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、テロメア伸長ヘリカーゼ１ポリペプチドの調節因子をコードするポリヌクレオチドは、配列番号３９のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、テロメア伸長ヘリカーゼ１ポリペプチドの調節因子をコードするポリヌクレオチドは、配列番号３９のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号３９の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも７５０、少なくとも１０００、しかし１２１９未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ポリ（Ａ）特異的リボヌクレアーゼＰＡＲＮポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ポリ（Ａ）特異的リボヌクレアーゼＰＡＲＮポリペプチドは、ヒトポリ（Ａ）特異的リボヌクレアーゼＰＡＲＮポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｏ９５４５３を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＰＡＲＮ遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：５０７３を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ポリ（Ａ）特異的リボヌクレアーゼＰＡＲＮポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４０の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ポリ（Ａ）特異的リボヌクレアーゼＰＡＲＮポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４０のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ポリ（Ａ）特異的リボヌクレアーゼＰＡＲＮポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４０のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号４０の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも６００、しかし６３９未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ＴＥＲＦ１相互作用核因子２ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ＴＥＲＦ１相互作用核因子２ポリペプチドは、ヒトＴＥＲＦ１相互作用核因子２ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ９ＢＳＩ４を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＴＩＮＦ２遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：２６２７７を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ＴＥＲＦ１相互作用核因子２ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４１の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ＴＥＲＦ１相互作用核因子２ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４１のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ＴＥＲＦ１相互作用核因子２ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４１のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号４１の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、しかし４５１未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質複合体非コアサブユニットＮＡＦ１ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質複合体非コアサブユニットＮＡＦ１ポリペプチドは、ヒトＨ／ＡＣＡリボ核タンパク質複合体非コアサブユニットＮＡＦ１ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ９６ＨＲ８を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＮＡＦ１遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：９２３４５を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質複合体非コアサブユニットＮＡＦ１ポリペプチドは、配列番号４２の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質複合体非コアサブユニットＮＡＦ１ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４２のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質複合体非コアサブユニットＮＡＦ１ポリペプチドは、配列番号４２のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号４２の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、しかし４９４未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ムチン－５Ｂポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ムチン－５Ｂポリペプチドは、ヒトムチン－５Ｂポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ９ＨＣ８４を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＭＵＣ５Ｂ遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：７２７８９７を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ムチン－５Ｂポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４３の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ムチン－５Ｂポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４３のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ムチン－５Ｂポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４３のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号４３の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも７５０、少なくとも１０００、少なくとも１２５０、少なくとも１５００、少なくとも１７５０、少なくとも２０００、少なくとも２２５０、少なくとも２５００、少なくとも２７５０、少なくとも３０００、少なくとも３２５０、少なくとも３５００、少なくとも３７５０、少なくとも４０００、少なくとも４２５０、少なくとも４５００、少なくとも４７５０、少なくとも５０００、少なくとも５２５０、少なくとも５５００、少なくとも５７５０、しかし５７６２未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、デスモプラキンポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、デスモプラキンポリペプチドは、ヒトデスモプラキンポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｐ１５９２４を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＤＳＰ遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：１８３２を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、デスモプラキンポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４４の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、デスモプラキンポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４４のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、デスモプラキンポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４４のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号４４の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも７５０、少なくとも１０００、少なくとも１２５０、少なくとも１５００、少なくとも１７５０、少なくとも２０００、少なくとも２２５０、少なくとも２５００、少なくとも２７５０、しかし２８７１未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ＣＳＴ複合体サブユニットＳＴＮ１ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ＣＳＴ複合体サブユニットＳＴＮ１ポリペプチドは、ヒトＣＳＴ複合体サブユニットＳＴＮ１ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ９Ｈ６６８を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＳＴＮ１遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：７９９９１を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＳＴ複合体サブユニットＳＴＮ１ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４５の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ＣＳＴ複合体サブユニットＳＴＮ１ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４５のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ＣＳＴ複合体サブユニットＳＴＮ１ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４５のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号４５の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、しかし３６８未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ジペプチジルペプチダーゼ９ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、ジペプチジルペプチダーゼ９ポリペプチドは、ヒトジペプチジルペプチダーゼ９ポリペプチドである（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号：Ｑ８６ＴＩ２を参照のこと）。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、野生型ＤＰＰ９遺伝子（例えば、ＮＣＢＩ遺伝子ＩＤ：９１０３９を参照のこと）、またはそのコドン最適化バリアントのコード配列を含む。いくつかの実施形態では、ジペプチジルペプチダーゼ９ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４６の配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、ジペプチジルペプチダーゼ９ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４６のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ジペプチジルペプチダーゼ９ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号４６のアミノ酸配列のＮ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片をコードするポリヌクレオチドである。Ｎ末端短縮型、Ｃ末端短縮型、または断片は、配列番号４６の少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも６００、少なくとも７００、少なくとも８００、しかし８９２未満の連続アミノ酸を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、配列番号３～４６から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、配列番号３～４６から選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、配列番号５～２１から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、配列番号５～２１から選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、配列番号２２～２７から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、配列番号２２～２７から選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、配列番号２８～３５から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、配列番号２８～３５から選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、配列番号２３、２５、及び３６～４６から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、配列番号２３、２５、及び３６～４６から選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする。
ポリペプチドをコードする本開示のポリヌクレオチド（例えば、吸入治療用ポリペプチド）は、追加のコード配列及び非コード配列をさらにコードし得る。追加のコード配列及び非コード配列の例には、追加のポリペプチドタグ（例えば、融合タンパク質を産生するためにポリペプチドにインフレームでコードされたポリペプチドタグ）、イントロン（例えば、天然イントロン、改変イントロンまたは異種イントロン）、５’ＵＴＲ及び／または３’ＵＴＲ（例えば、天然５’ＵＴＲ及び／または３’ＵＴＲ、改変５’ＵＴＲ及び／または３’ＵＴＲ、または異種５’ＵＴＲ及び／または３’ＵＴＲ）などをコードする配列が含まれ得るが、これらに限定されない。好適なポリペプチドタグの例には、精製タグ（例えば、ｈｉｓタグ、ｆｌａｇタグ、マルトース結合タンパク質及びグルタチオン－Ｓ－トランスフェラーゼタグ）、測光的に検出され得るタグなどの検出タグ（例えば、緑色蛍光タンパク質または赤色蛍光タンパク質など）、ならびに検出可能な酵素活性を有するタグ（例えば、アルカリホスファターゼなど）、分泌配列、シグナル配列、リーダー配列及び／または安定化配列を含有するタグ、プロテアーゼ切断部位（例えば、フーリン切断部位、ＴＥＶ切断部位、トロンビン切断部位など）などの任意の組み合わせなどが含まれ得るが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、５’ＵＴＲ及び／または３’ＵＴＲは、ポリヌクレオチドの安定性、局在化及び／または翻訳効率を向上させる。いくつかの実施形態では、５’ＵＴＲ及び／または３’ＵＴＲは、タンパク質発現のレベル及び／または持続時間を改善させる。いくつかの実施形態では、５’ＵＴＲ及び／または３’ＵＴＲは、オフターゲット発現を阻止または低減させ得る（例えば、細胞周期の特定の時期、特定の発生段階などで、特定の細胞タイプ（例えば、神経細胞）における発現を阻害する）エレメント（例えば、１つ以上のｍｉＲＮＡ結合部位など）を含む。いくつかの実施形態では、５’ＵＴＲ及び／または３’ＵＴＲは、特定の細胞タイプにおけるコードされたポリペプチドの発現を増強させ得るエレメント（例えば、１つ以上のｍｉＲＮＡ結合部位など）を含む。
いくつかの実施形態では、ポリペプチド（例えば、吸入治療用ポリペプチド）をコードする本開示のポリヌクレオチドは、１つ以上（例えば、１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、１０個以上など）の調節配列に作動可能に連結されている。「調節配列」という用語は、エンハンサー、インシュレーター、プロモーター及び他の発現制御エレメント（例えば、ポリアデニル化シグナル）を含み得る。当該技術分野において既知の任意の好適なエンハンサー（複数可）を使用することができ、それらとしては、例えば、哺乳動物遺伝子由来のエンハンサー配列（例えば、グロビン、エラスターゼ、アルブミン、α－フェトプロテイン、インスリンなど）、真核細胞ウイルス由来のエンハンサー配列（例えば、複製起点の後側にあるＳＶ４０エンハンサー（ｂｐ１００～２７０）、サイトメガロウイルス初期プロモーターエンハンサー、複製起点の後側にあるポリオーマエンハンサー、アデノウイルスエンハンサーなど）及びそれらの任意の組み合わせが含まれる。当該技術分野において既知の任意の好適なインシュレーター（複数可）を使用することができ、それらとしては、例えば、ＨＳＶクロマチン境界（ＣＴＲＬ／ＣＴＣＦ結合／インシュレーター）エレメントＣＴＲＬ１及び／またはＣＴＲＬ２、ニワトリ高感受性部位４インシュレーター（ｃＨＳ４）、ヒトＨＮＲＰＡ２Ｂ１－ＣＢＸ３ユビキタスクロマチンオープニングエレメント（ＵＣＯＥ）、ヒトインターフェロンベータ遺伝子（ＩＦＮＢ１）由来のスキャフォールド／マトリックス結合領域（Ｓ／ＭＡＲ）ならびにそれらの任意の組み合わせが含まれる。当該技術分野において既知の任意の好適なプロモーター（例えば、哺乳動物宿主細胞における転写に好適なプロモーター）を使用することができ、それらとしては、例えば、ウイルス（例えば、ポリオーマウイルス、鶏痘ウイルス、アデノウイルス（アデノウイルス２など）、ウシパピローマウイルス、トリ肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、レトロウイルス、Ｂ型肝炎ウイルス、シミアンウイルス４０（ＳＶ４０）など）のゲノムから得られたプロモーター、異種の哺乳動物遺伝子由来のプロモーター（例えば、アクチンプロモーター（例えば、β－アクチンプロモーター）、ユビキチンプロモーター（例えば、ユビキチンＣ（ＵｂＣ）プロモーター）、ホスホグリセリン酸キナーゼ（ＰＧＫ）プロモーター、免疫グロブリンプロモーター、熱ショックプロモーター由来など）、同種の哺乳動物遺伝子由来のプロモーター、合成プロモーター（ＣＡＧプロモーターなど）、及びそれらの任意の組み合わせ（ただし、そのようなプロモーターが宿主細胞と適合する場合に限る）が含まれる。調節配列は、核酸の構成的発現を指示するもの、ならびに組織特異的な調節配列及び／または誘導性配列もしくは抑制性配列を含み得る。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、１つ以上の異種プロモーターに作動可能に連結されている。いくつかの実施形態では、１つ以上の異種プロモーターは、構成的プロモーター、組織特異的プロモーター、時間的プロモーター、空間的プロモーター、誘導性プロモーター及び抑制性プロモーターのうちの１つ以上である。いくつかの実施形態では、１つ以上の異種プロモーターは、ヒトサイトメガロウイルス（ＨＣＭＶ）前初期プロモーター、ヒト伸長因子－１（ＥＦ１）プロモーター、ヒトβ－アクチンプロモーター、ヒトＵｂＣプロモーター、ヒトＰＧＫプロモーター、合成ＣＡＧＧプロモーター及びそれらの任意の組み合わせのうちの１つ以上である。いくつかの実施形態では、ポリペプチド（例えば、吸入治療用ポリペプチド）をコードする本開示のポリヌクレオチドは、ＨＣＭＶプロモーターに作動可能に連結されている。
いくつかの実施形態では、ポリペプチド（例えば、アルファ－１－アンチトリプシンなどの吸入治療用ポリペプチド）をコードする本開示のポリヌクレオチドは、ポリヌクレオチドが、対象の１つ以上の標的細胞（例えば、対象の呼吸器（ｒｅｓｐｉｒａｔｏｒｙ ｔｒａｃｔ）、気道（ａｉｒｗａｙ）、肺などの１つ以上の細胞）に送達されるときに、ポリペプチドを発現する。いくつかの実施形態では、ポリペプチド（例えば、アルファ－１－アンチトリプシンなどの吸入治療用ポリペプチド）の発現は、（例えば、ポリペプチドの発現前と比較して、細胞内で発現した内因性ポリペプチドのレベルと比較して、など）対象の１つ以上の標的細胞中ポリペプチドのレベル、機能、及び／または活性を増強、増加、増大、及び／または補足する。いくつかの実施形態では、ポリペプチド（例えば、アルファ－１－アンチトリプシンなどの吸入治療用ポリペプチド）の発現は、対象において（例えば、ポリペプチドの発現前と比較して）、気道及び／または肺に影響を与える疾患（例えば、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症、肺胞微石症、原発性線毛機能不全、先天性肺胞タンパク症、肺動脈性肺高血圧症、肺線維症など）の１つ以上の徴候または症状の予防的、姑息的、または治療的な緩和を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、コラーゲンアルファ－１（ＶＩＩ）鎖ポリペプチド（ＣＯＬ７）のコード配列（例えば、それをコードする導入遺伝子のコード配列）を含まない。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、リシルヒドロキシラーゼ３ポリペプチド（ＬＨ３）のコード配列（例えば、それをコードする導入遺伝子のコード配列）を含まない。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、ケラチンＩ型細胞骨格１７ポリペプチド（ＫＲＴ１７）のコード配列（例えば、それをコードする導入遺伝子のコード配列）を含まない。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、トランスグルタミナーゼ（ＴＧＭ）ポリペプチド（例えば、ヒトＴＧＭ１ポリペプチド及び／またはヒトＴＧＭ５ポリペプチドなどのヒトトランスグルタミナーゼポリペプチド）のコード配列（例えば、それをコードする導入遺伝子のコード配列）を含まない。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、化粧用タンパク質（例えば、コラーゲンタンパク質、フィブロネクチン、エラスチン、ルミカン、ビトロネクチン／ビトロネクチン受容体、ラミニン、神経調節物質、フィブリリン、付加的な皮膚細胞外マトリックスタンパク質など）のコード配列（例えば、それらをコードする導入遺伝子のコード配列）を含まない。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、抗体（例えば、完全長抗体、抗体断片など）のコード配列（例えば、それをコードする導入遺伝子のコード配列）を含まない。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、セリンプロテアーゼ阻害剤カザル型（ＳＰＩＮＫ）ポリペプチド（例えば、ＳＰＩＮＫ５ポリペプチドなどのヒトＳＰＩＮＫポリペプチド）のコード配列（例えば、それをコードする導入遺伝子のコード配列）を含まない。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、フィラグリンまたはフィラグリン２ポリペプチド（例えば、ヒトフィラグリンまたはフィラグリン２ポリペプチド）のコード配列（例えば、それをコードする導入遺伝子のコード配列）を含まない。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子（ＣＦＴＲ）ポリペプチド（例えば、ヒトＣＦＴＲポリペプチド）のコード配列（例えば、それをコードする導入遺伝子のコード配列）を含まない。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、魚鱗癬関連ポリペプチド（例えば、ＡＴＰ結合カセットサブファミリーＡメンバー１２ポリペプチド、１－アシルグリセロール－３－リン酸Ｏ－アシルトランスフェラーゼＡＢＨＤ５ポリペプチド、アルデヒドデヒドロゲナーゼファミリー３メンバーＡ２ポリペプチド、アラキドネート１２－リポキシゲナーゼ１２Ｒ型ポリペプチド、ヒドロペルオキシドイソメラーゼＡＬＯＸＥ３ポリペプチド、ＡＰ－１複合体サブユニットシグマ－１Ａポリペプチド、アリールスルファターゼＥポリペプチド、カスパーゼ－１４ポリペプチド、コルネオデスモシンポリペプチド、セラミドシンターゼ３ポリペプチド、炭水化物スルホトランスフェラーゼ８ポリペプチド、クローディン－１ポリペプチド、シスタチン－Ａポリペプチド、チトクロームＰ４５０ ４Ｆ２２ポリペプチド、３－ベータ－ヒドロキシステロイド－デルタ（８）、デルタ（７）－イソメラーゼポリペプチド、非常に長鎖の脂肪酸タンパク質４ポリペプチドの伸長、フィラグリンポリペプチド、フィラグリン２ポリペプチド、ギャップジャンクションベータ－２ポリペプチド、ギャップジャンクションベータ－３ポリペプチド、ギャップジャンクションベータ－４ポリペプチド、ギャップジャンクションベータ－６ポリペプチド、３－ケトジヒドロスフィンゴシンレダクターゼポリペプチド、ケラチン、ＩＩ型細胞骨格１ポリペプチド、ケラチン、ＩＩ型細胞骨格２表皮ポリペプチド、ケラチン、Ｉ型細胞骨格９ポリペプチド、ケラチン、Ｉ型細胞骨格１０ポリペプチド、リパーゼメンバーＮポリペプチド、ロリクリンポリペプチド、膜結合転写因子部位２プロテアーゼポリペプチド、マグネシウムトランスポーターＮＩＰＡ４ポリペプチド、ステロール－４－アルファ－カルボキシレート３－デヒドロゲナーゼ、脱カルボキシル化ポリペプチド、ペルオキシソームターゲティングシグナル２受容体ポリペプチド、Ｄ－３－ホスホグリセリン酸デヒドロゲナーゼポリペプチド、フィタノイル－ＣｏＡジオキシゲナーゼ、ペルオキシソームポリペプチド、パタチン様ホスホリパーゼドメイン含有タンパク質１ポリペプチド、プロテアソーム成熟タンパク質ポリペプチド、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼポリペプチド、短鎖デヒドロゲナーゼ／レダクターゼファミリー９Ｃメンバー７ポリペプチド、セルピンＢ８ポリペプチド、長鎖脂肪酸輸送タンパク質４ポリペプチド、シナプトソーム関連タンパク質２９ポリペプチド、腫瘍形成抑制剤１４タンパク質ポリペプチド、ステリルスルファターゼポリペプチド、真空タンパク質選別関連タンパク質３３Ｂポリペプチド、及びＣＡＡＸプレニルプロテアーゼ１ホモログポリペプチド）のコード配列（例えば、コードする導入遺伝子のコード配列）を含まない。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、コラーゲンアルファ－１（ＶＩＩ）鎖ポリペプチド、リシルヒドロキシラーゼ３ポリペプチド、ケラチンＩ型細胞骨格１７ポリペプチド及び／またはそれらの任意のキメラポリペプチドのコード配列（例えば、それらをコードする導入遺伝子のコード配列）を含まない。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドは、コラーゲンアルファ－１（ＶＩＩ）鎖ポリペプチド、リシルヒドロキシラーゼ３ポリペプチド、ケラチンＩ型細胞骨格１７ポリペプチド、トランスグルタミナーゼ（ＴＧＭ）ポリペプチド、フィラグリンポリペプチド、化粧用タンパク質、抗体、ＳＰＩＮＫポリペプチド、ＣＦＴＲポリペプチド、魚鱗癬関連ポリペプチド、及び／またはそれらの任意のキメラポリペプチド（例えば、これらをコードする導入遺伝子）のコード配列を含まない。
組換え核酸
いくつかの実施形態では、本開示は、本明細書に記載のポリヌクレオチドのいずれか１つ以上を含む組換え核酸に関する。いくつかの実施形態では、組換え核酸は、ベクター（例えば、発現ベクター、ディスプレイベクターなど）である。いくつかの実施形態では、ベクターはＤＮＡベクターまたはＲＮＡベクターである。一般に、対象において１つ以上のポリペプチドを産生させるために、ポリヌクレオチドを維持、増殖及び／または発現させるのに適したベクターを使用することができる。適切なベクターの例には、例えば、プラスミド、コスミド、エピソーム、トランスポゾン及びウイルスベクター（例えば、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、シンドビスウイルスベクター、麻疹ベクター、ヘルペスウイルスベクター、レンチウイルスベクター、レトロウイルスベクターなど）が含まれ得る。いくつかの実施形態では、ベクターは、ヘルペスウイルスベクターである。いくつかの実施形態では、ベクターは、宿主細胞内で自律複製することができる。いくつかの実施形態では、ベクターは、宿主細胞内で自律複製することができない。いくつかの実施形態では、ベクターを宿主ＤＮＡに組み込むことができる。いくつかの実施形態では、ベクターを宿主ＤＮＡに組み込むことができない（例えば、エピソームである）。１つ以上の目的のポリヌクレオチドを含有するベクターを作製する方法は当業者に周知であり、例えば、化学合成による、または核酸の単離されたセグメントの人為的操作による（例えば、遺伝子工学技術による）方法が含まれる。
いくつかの実施形態では、本開示の組換え核酸は、単純ヘルペスウイルス（ＨＳＶ）アンプリコンである。ヘルペスウイルスアンプリコンは、構造的特徴及びその作製方法を含めて、当業者に一般的に知られている（例えば、ｄｅ Ｓｉｌｖａ Ｓ．ａｎｄ Ｂｏｗｅｒｓ Ｗ．「Ｈｅｒｐｅｓ Ｖｉｒｕｓ Ａｍｐｌｉｃｏｎ Ｖｅｃｔｏｒｓ」Ｖｉｒｕｓｅｓ ２００９，１，５９４－６２９を参照されたい）。いくつかの実施形態では、単純ヘルペスウイルスアンプリコンは、ＨＳＶ－１アンプリコンである。いくつかの実施形態では、単純ヘルペスウイルスアンプリコンは、ＨＳＶ－１ハイブリッドアンプリコンである。ＨＳＶ－１ハイブリッドアンプリコンの例としては、ＨＳＶ／ＡＡＶハイブリッドアンプリコン、ＨＳＶ／ＥＢＶハイブリッドアンプリコン、ＨＳＶ／ＥＢＶ／ＲＶハイブリッドアンプリコン及び／またはＨＳＶ／Ｓｌｅｅｐｉｎｇ Ｂｅａｕｔｙハイブリッドアンプリコンを挙げることができるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、アンプリコンは、ＨＳＶ／ＡＡＶハイブリッドアンプリコンである。いくつかの実施形態では、アンプリコンは、ＨＳＶ／Ｓｌｅｅｐｉｎｇ Ｂｅａｕｔｙハイブリッドアンプリコンである。
いくつかの実施形態では、本開示の組換え核酸は、組換えヘルペスウイルスゲノムである。組換えヘルペスウイルスゲノムは、当該技術分野において既知のヘルペスウイルス科ファミリーのＤＮＡウイルスの任意のメンバーに由来する組換えゲノムであり得、それらとしては、例えば、組換え単純ヘルペスウイルスゲノム、組換え水痘帯状疱疹ウイルスゲノム、組換えヒトサイトメガロウイルスゲノム、組換えヘルペスウイルス６Ａゲノム、組換えヘルペスウイルス６Ｂゲノム、組換えヘルペスウイルス７ゲノム、組換えＥｐｓｔｅｉｎ－Ｂａｒｒウイルスゲノム、組換えカポジ肉腫関連ヘルペスウイルスゲノム及びそれらの任意の組み合わせまたは派生体が含まれる。いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、１つ以上の（例えば、１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、６つ以上、７つ以上、８つ以上、９つ以上、１０個以上など）の不活性化突然変異を含む。本明細書で使用する場合、「不活性化突然変異」は、（例えば、不活性化突然変異を欠く対応する配列と比較して）量及び／または機能が減少、検出不能、または排除された遺伝子またはレギュロン産物（ＲＮＡまたはタンパク質）をもたらす任意の突然変異を指し得る。不活性化突然変異の例には、転写制御配列（プロモーター、エンハンサー、インシュレーターなど）及び／または所与の遺伝子またはレギュロンのコード配列における欠失、挿入、点突然変異及び再配列が含まれ得るが、これらに限定されない。当該技術分野で既知の遺伝子産物またはレギュロン産物の量を測定する任意の好適な方法を使用することができ、それらとしては、例えば、ｑＰＣＲ、ノーザンブロット、ＲＮＡｓｅｑ、ウエスタンブロット、ＥＬＩＳＡなどが含まれる。いくつかの実施形態では、１つ以上の不活性化突然変異は、１つ以上の（例えば、１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、６つ以上、７つ以上、８つ以上、９つ以上、１０個以上など）のヘルペスウイルス遺伝子に存在する。いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、（例えば、対応する野生型ヘルペスウイルスゲノムと比較して）弱毒化されている。いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、複製能力を有する。いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、複製欠損である。
いくつかの実施形態では、組換え核酸は、組換え単純ヘルペスウイルス（ＨＳＶ）ゲノムである。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、１つ以上の（例えば、１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、６つ以上、７つ以上、８つ以上、９つ以上、１０個以上など）の不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、１つ以上の不活性化突然変異は、１つ以上の（例えば、１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、６つ以上、７つ以上、８つ以上、９つ以上、１０個以上など）の単純ヘルペスウイルス遺伝子に存在する。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、（例えば、対応する野生型単純ヘルペスウイルスゲノムと比較して）弱毒化されている。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、複製能力を有する。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、複製欠損である。
いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、組換え単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ－１）ゲノム、組換え単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ－２）ゲノムまたはそれらの任意の派生体である。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、組換えＨＳＶ－１ゲノムである。いくつかの実施形態では、組換えＨＳＶ－１ゲノムは、例えば、株１７、Ｔｙ２５、Ｒ６２、Ｓ２５、Ｋｕ８６、Ｓ２３、Ｒ１１、Ｔｙ１４８、Ｋｕ４７、Ｈ１６６ｓｙｎ、１３１９－２００５、Ｆ－１３、Ｍ－１２、９０２３７、Ｆ－１７、ＫＯＳ、３０８３－２００８、Ｆ１２ｇ、Ｌ２、ＣＤ３８、Ｈ１９３、Ｍ－１５、Ｉｎｄｉａ ２０１１、０１１６２０９、Ｆ－１１Ｉ、６６－２０７、２７６２、３６９－２００７、３３５５、ＭａｃＩｎｔｙｒｅ、ＭｃＫｒａｅ、７８６２、７－ｈｓｅ、ＨＦ１０、１３９４，２００５、２７０－２００７、ＯＤ４、ＳＣ１６、Ｍ－１９、４Ｊ１０３７、５Ｊ１０６０、Ｊ１０６０、ＫＯＳ７９、１３２－１９８８、１６０－１９８２、Ｈ１６６、２１５８－２００７、ＲＥ、７８３２６、Ｆ１８ｇ、Ｆ１１、１７２－２０１０、Ｈ１２９、Ｆ、Ｅ４、ＣＪ９９４、Ｆ１４ｇ、Ｅ０３、Ｅ２２、Ｅ１０、Ｅ０６、Ｅ１１、Ｅ２５、Ｅ２３、Ｅ３５、Ｅ１５、Ｅ０７、Ｅ１２、Ｅ１４、Ｅ０８、Ｅ１９、Ｅ１３、ＡＴＣＣ ２０１１など、当技術分野で公知である任意のＨＳＶ－１株に由来し得る（例えば、Ｂｏｗｅｎ ｅｔ ａｌ．Ｊ Ｖｉｒｏｌ．２０１９ Ａｐｒ ３；９３（８））を参照）。いくつかの実施形態では、組換えＨＳＶ－１ゲノムは、ＫＯＳ株に由来する。いくつかの実施形態では、組換えＨＳＶ－１ゲノムは、ＭｃＫｒａｅ株に由来しない。いくつかの実施形態では、組換えＨＳＶ－１ゲノムは、（例えば、対応する野生型ＨＳＶ－１ゲノムと比較して）弱毒化されているいくつかの実施形態では、組換えＨＳＶ－１ゲノムは、複製能力を有する。いくつかの実施形態では、組換えＨＳＶ－１ゲノムは、複製欠損である。
いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、感染細胞タンパク質（または感染細胞ポリペプチド）（ＩＣＰ）０、ＩＣＰ４、ＩＣＰ２２、ＩＣＰ２７、ＩＣＰ４７、チミジンキナーゼ（ｔｋ）、ロングユニーク領域（ＵＬ）４１及び／またはＵＬ５５単純ヘルペスウイルス遺伝子の少なくとも１つ、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、少なくとも６つ、少なくとも７つまたは８つすべてに不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、（例えば、免疫刺激ウイルスの産生を回避するための）ＩＣＰ３４．５単純ヘルペスウイルス遺伝子（一方もしくは両方のコピー）及び／またはＩＣＰ４７単純ヘルペスウイルス遺伝子に不活性化突然変異を含まない。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ３４．５単純ヘルペスウイルス遺伝子（一方または両方のコピー）に不活性化突然変異を含まない。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４７単純ヘルペスウイルス遺伝子に不活性化突然変異を含まない。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ３４．５単純ヘルペスウイルス遺伝子（一方または両方のコピー）及びＩＣＰ４７単純ヘルペスウイルス遺伝子に不活性化突然変異を含まない。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは腫瘍溶解性ではない。
いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子（一方または両方のコピー）に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子（一方もしくは両方のコピー）に不活性化突然変異を含み、ＩＣＰ４遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ２２遺伝子、ＩＣＰ２７遺伝子、ＩＣＰ４７遺伝子、ＵＬ４１遺伝子及び／またはＵＬ５５遺伝子に不活性化突然変異をさらに含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子（一方または両方のコピー）における不活性化突然変異、及びＩＣＰ４遺伝子（一方または両方のコピー）に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子（一方または両方のコピー）における不活性化突然変異、及びＩＣＰ２２遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子（一方または両方のコピー）における不活性化突然変異、及びＵＬ４１遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子（一方または両方のコピー）に不活性化突然変異、ＩＣＰ４遺伝子（一方または両方のコピー）における不活性化突然変異、及びＩＣＰ２２遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子（一方または両方のコピー）に不活性化突然変異、ＩＣＰ４遺伝子（一方または両方のコピー）に不活性化突然変異、及びＵＬ４１遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子（一方または両方のコピー）に不活性化突然変異、ＩＣＰ２２遺伝子における不活性化突然変異、及びＵＬ４１遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子（一方または両方のコピー）に不活性化突然変異、ＩＣＰ４遺伝子（一方または両方のコピー）に不活性化突然変異、ＩＣＰ２２遺伝子に不活性化突然変異、及びＵＬ４１遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、不活性化突然変異は、ＩＣＰ０遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ４遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ２２遺伝子及び／またはＵＬ４１遺伝子のコード配列の欠失である。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ２７遺伝子、ＩＣＰ４７遺伝子及び／またはＵＬ５５遺伝子に不活性化突然変異をさらに含む。
いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４遺伝子（一方または両方のコピー）に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４遺伝子（一方もしくは両方のコピー）に不活性化突然変異を含み、ＩＣＰ０遺伝子（一方もしくは両方のコピー）ＩＣＰ２２遺伝子、ＩＣＰ２７遺伝子、ＩＣＰ４７遺伝子、ＵＬ４１遺伝子及び／またはＵＬ５５遺伝子に不活性化突然変異をさらに含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４遺伝子（一方または両方のコピー）に不活性化突然変異、及びＩＣＰ２２遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４遺伝子（一方または両方のコピー）に不活性化突然変異、及びＵＬ４１遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４遺伝子（一方または両方のコピー）に不活性化突然変異、ＩＣＰ２２遺伝子に不活性化突然変異、及びＵＬ４１遺伝子における不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、不活性化突然変異は、ＩＣＰ４遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ２２遺伝子及び／またはＵＬ４１遺伝子のコード配列の欠失である。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ２７遺伝子、ＩＣＰ４７遺伝子及び／またはＵＬ５５遺伝子に不活性化突然変異をさらに含む。
いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ２２遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ２２遺伝子に不活性化突然変異を含み、ＩＣＰ０遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ４遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ２７遺伝子、ＩＣＰ４７遺伝子、ＵＬ４１遺伝子及び／またはＵＬ５５遺伝子に不活性化突然変異をさらに含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ２２遺伝子における不活性化突然変異、及びＵＬ４１遺伝子における不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、不活性化突然変異は、ＩＣＰ２２遺伝子及び／またはＵＬ４１遺伝子のコード配列の欠失である。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ４遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ２７遺伝子、ＩＣＰ４７遺伝子及び／またはＵＬ５５遺伝子に不活性化突然変異をさらに含む。
いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ２７遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ２７遺伝子に不活性化突然変異を含み、ＩＣＰ０遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ４遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ２２遺伝子、ＩＣＰ４７遺伝子、ＵＬ４１遺伝子及び／またはＵＬ５５遺伝子に不活性化突然変異をさらに含む。いくつかの実施形態では、不活性化突然変異は、ＩＣＰ２７遺伝子のコード配列の欠失である。
いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４７遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４７遺伝子に不活性化突然変異を含み、ＩＣＰ０遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ４遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ２２遺伝子、ＩＣＰ２７遺伝子、ＵＬ４１遺伝子及び／またはＵＬ５５遺伝子に不活性化突然変異をさらに含む。いくつかの実施形態では、不活性化突然変異は、ＩＣＰ４７遺伝子のコード配列の欠失である。
いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＵＬ４１遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＵＬ４１遺伝子に不活性化突然変異を含み、ＩＣＰ０遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ４遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ２２遺伝子、ＩＣＰ２７遺伝子、ＩＣＰ４７遺伝子及び／またはＵＬ５５遺伝子に不活性化突然変異をさらに含む。いくつかの実施形態では、不活性化突然変異は、ＵＬ４１遺伝子のコード配列の欠失である。
いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＵＬ５５遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＵＬ５５遺伝子に不活性化突然変異を含み、ＩＣＰ０遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ４遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ２２遺伝子、ＩＣＰ２７遺伝子、ＩＣＰ４７遺伝子及び／またはＵＬ４１遺伝子に不活性化突然変異をさらに含む。いくつかの実施形態では、不活性化突然変異は、ＵＬ５５遺伝子のコード配列の欠失である。
いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、内部リピートロング（ＩＲＬ）領域及び内部リピートショート（ＩＲＳ）領域を含む内部リピート（ジョイント）領域に、不活性化突然変異（例えば、それらの欠失）を含む。いくつかの実施形態では、ジョイント領域の不活性化（例えば、欠失）は、ＩＣＰ４遺伝子及びＩＣＰ０遺伝子の各々１つのコピーを除去する。いくつかの実施形態では、ジョイント領域の不活性化（例えば、欠失）は、ＩＣＰ２２遺伝子及びＩＣＰ４７遺伝子のプロモーターをさらに不活性化する（例えば、欠失させる）。必要に応じて、これらの遺伝子の一方または両方の発現は、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムに前初期プロモーターを挿入することによって回復させることができる（例えば、Ｈｉｌｌ ｅｔ ａｌ．（１９９５）．Ｎａｔｕｒｅ ３７５（６５３０）：４１１－４１５；Ｇｏｌｄｓｍｉｔｈ ｅｔ ａｌ．（１９９８）．Ｊ Ｅｘｐ Ｍｅｄ １８７（３）：３４１－３４８を参照されたい）。理論に束縛されることを望まないが、ジョイント領域を不活性化する（例えば、欠失させる）ことは、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムの安定性に寄与し、及び／または組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、より多く及び／またはより大きな導入遺伝子を収容することを可能にし得ると考えられる。
いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４遺伝子（一方または両方のコピー）、ＩＣＰ２２遺伝子及びＩＣＰ２７遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４遺伝子（一方または両方のコピー）、ＩＣＰ２７遺伝子及びＵＬ５５遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４遺伝子（一方または両方のコピー）、ＩＣＰ２２遺伝子、ＩＣＰ２７遺伝子、ＩＣＰ４７遺伝子及びＵＬ５５遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、ＩＣＰ４遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ２７遺伝子及び／またはＵＬ５５遺伝子における不活性化突然変異は、ＩＣＰ４遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ２７遺伝子及び／またはＵＬ５５遺伝子のコード配列の欠失である。いくつかの実施形態では、ＩＣＰ２２遺伝子及びＩＣＰ４７遺伝子における不活性化突然変異は、ＩＣＰ２２遺伝子及びＩＣＰ４７遺伝子のプロモーター領域の欠失である（例えば、ＩＣＰ２２及びＩＣＰ４７のコード配列はインタクトであるが、転写的に活性ではない）。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４遺伝子（一方または両方のコピー）、ＩＣＰ２７遺伝子及びＵＬ５５遺伝子のコード配列における欠失、ならびにＩＣＰ２２遺伝子及びＩＣＰ４７遺伝子のプロモーター領域における欠失を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子（一方もしくは両方のコピー）及び／またはＵＬ４１遺伝子に不活性化突然変異をさらに含む。
いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子（一方または両方のコピー）に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子（一方または両方のコピー）及びＩＣＰ４遺伝子（一方または両方のコピー）に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子（一方または両方のコピー）、ＩＣＰ４遺伝子（一方または両方のコピー）及びＩＣＰ２２遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子（一方または両方のコピー）、ＩＣＰ４遺伝子（一方または両方のコピー）、ＩＣＰ２２遺伝子及びＩＣＰ２７遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ０遺伝子（一方または両方のコピー）、ＩＣＰ４遺伝子（一方または両方のコピー）、ＩＣＰ２２遺伝子、ＩＣＰ２７遺伝子及びＵＬ５５遺伝子に不活性化突然変異を含む。いくつかの実施形態では、ＩＣＰ０遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ４遺伝子（一方もしくは両方のコピー）ＩＣＰ２２遺伝子、ＩＣＰ２７遺伝子及び／またはＵＬ５５遺伝子における不活性化突然変異は、ＩＣＰ０遺伝子（一方もしくは両方のコピー）、ＩＣＰ４遺伝子（一方もしくは両方のコピー）ＩＣＰ２２遺伝子、ＩＣＰ２７遺伝子及び／またはＵＬ５５遺伝子のコード配列の欠失を含む。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４７遺伝子及び／またはＵＬ４１遺伝子に不活性化突然変異をさらに含む。
いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、６つまたは７つ以上のウイルス遺伝子座内に本開示の１つ以上のポリヌクレオチドを含む。好適なウイルス遺伝子座の例には、ＩＣＰ０（一方または両方のコピー）、ＩＣＰ４（一方または両方のコピー）、ＩＣＰ２２、ＩＣＰ２７、ＩＣＰ４７、ｔｋ、ＵＬ４１及びＵＬ５５単純ヘルペスウイルス遺伝子座が含まれ得るが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４ウイルス遺伝子座の一方または両方の中に本開示の１つ以上のポリヌクレオチドを含む（例えば、ＩＣＰ４遺伝子座の一方または両方にポリペプチド（吸入治療用ポリペプチドなど）をコードするポリヌクレオチドを含む組換えウイルス）。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ２２ウイルス遺伝子座内に本開示の１つ以上のポリヌクレオチドを含む（例えば、組換えウイルスは、ＩＣＰ２２遺伝子座内にポリペプチド（吸入治療用ポリペプチドなど）をコードするポリヌクレオチドを含む）。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＵＬ４１ウイルス遺伝子座内に本開示の１つ以上のポリヌクレオチドを含む（例えば、組換えウイルスは、ＵＬ４１遺伝子座内にポリペプチド（吸入治療用ポリペプチドなど）をコードするポリヌクレオチドを含む）。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ２７ウイルス遺伝子座内に本開示の１つ以上のポリヌクレオチドを含む（例えば、組換えウイルスは、ＩＣＰ２７遺伝子座内にポリペプチド（吸入治療用ポリペプチドなど）をコードするポリヌクレオチドを含む）。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４７ウイルス遺伝子座内に本開示の１つ以上のポリヌクレオチドを含む（例えば、組換えウイルスは、ＩＣＰ４７遺伝子座内にポリペプチド（吸入治療用ポリペプチドなど）をコードするポリヌクレオチドを含む）。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＵＬ５５ウイルス遺伝子座内に本開示の１つ以上のポリヌクレオチドを含む（例えば、組換えウイルスは、ＵＬ５５遺伝子座内にポリペプチド（吸入治療用ポリペプチドなど）をコードするポリヌクレオチドを含む）。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ｔｋウイルス遺伝子座内に本開示の１つ以上のポリヌクレオチドを含む（例えば、組換えウイルスは、ｔｋ遺伝子座内にポリペプチド（吸入治療用ポリペプチドなど）をコードするポリヌクレオチドを含む）。
いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４ウイルス遺伝子座の一方または両方内に本開示の１つ以上のポリヌクレオチド、及びＩＣＰ２２ウイルス遺伝子座内に本開示の１つ以上のポリヌクレオチドを含む（例えば、組換えウイルスは、ＩＣＰ４遺伝子座の一方または両方内にポリペプチド（吸入治療用ポリペプチドなど）をコードするポリヌクレオチド、及びＩＣＰ２２遺伝子座内にポリペプチド（吸入治療用ポリペプチドなど）をコードするポリヌクレオチドを含む）。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４ウイルス遺伝子座の一方または両方内に本開示の１つ以上のポリヌクレオチド、及びＵＬ４１ウイルス遺伝子座内に本開示の１つ以上のポリヌクレオチドを含む（例えば、組換えウイルスは、ＩＣＰ４遺伝子座の一方または両方内にポリペプチド（吸入治療用ポリペプチドなど）をコードするポリヌクレオチド、及びＵＬ４１遺伝子座内にポリペプチド（吸入治療用ポリペプチドなど）をコードするポリヌクレオチドを含む）。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ２２ウイルス遺伝子座内に本開示の１つ以上のポリヌクレオチド、及びＵＬ４１ウイルス遺伝子座内に本開示の１つ以上のポリヌクレオチドを含む（例えば、組換えウイルスは、ＩＣＰ２２遺伝子座内にポリペプチド（吸入治療用ポリペプチドなど）をコードするポリヌクレオチド、及びＵＬ４１遺伝子座内にポリペプチド（吸入治療用ポリペプチドなど）をコードするポリヌクレオチドを含む）。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４ウイルス遺伝子座の一方または両方内に本開示の１つ以上のポリヌクレオチド、ウイルスＩＣＰ２２遺伝子座内に本開示の１つ以上のポリヌクレオチド、及びＵＬ４１ウイルス遺伝子座内に本開示の１つ以上のポリヌクレオチドを含む（例えば、組換えウイルスは、ＩＣＰ４遺伝子座の一方または両方内にポリペプチド（吸入治療用ポリペプチドなど）をコードするポリヌクレオチド、ＩＣＰ２２遺伝子座内にポリペプチド（吸入治療用ポリペプチドなど）をコードするポリヌクレオチド、及びＵＬ４１遺伝子座内にポリペプチド（吸入治療用ポリペプチドなど）をコードするポリヌクレオチドを含む）。いくつかの実施形態では、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムは、ＩＣＰ４ウイルス遺伝子座の一方または両方に本開示の１つ以上のポリヌクレオチド、ＩＣＰ２２ウイルス遺伝子座に本開示の１つ以上のポリヌクレオチド、ＵＬ４１ウイルス遺伝子座に本開示、ＩＣＰ２７ウイルス遺伝子座内の本開示の１つ以上のポリヌクレオチド、ＩＣＰ４７ウイルス遺伝子座に本開示の１つ以上のポリヌクレオチド、ｔｋウイルス遺伝子座、及び／またはＵＬ５５ウイルス遺伝子座に本開示の１つ以上のポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノム（例えば、組換え単純ヘルペスウイルスゲノム）は、１つ以上のヘルペスウイルス遺伝子（例えば、１つ以上の毒性ヘルペスウイルス遺伝子）、例えば、ＨＳＶ ＩＣＰ０遺伝子の両方のコピー、ＨＳＶ ＩＣＰ４遺伝子の一方または両方のコピー、ＨＳＶ ＩＣＰ２２遺伝子、ＨＳＶ ＵＬ４１遺伝子、ＨＳＶ ＩＣＰ２７遺伝子、ＨＳＶ ＩＣＰ４７遺伝子、ＨＳＶ ｔｋ遺伝子、ＨＳＶ ＵＬ５５遺伝子などの発現を減少または除去するように操作されている。いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノム（例えば、組換え単純ヘルペスウイルスゲノム）は、対応する野生型ヘルペスウイルスゲノム（例えば、野生型単純ヘルペスウイルスゲノム）と比較して、（例えば、標的細胞に導入されたときに）組換えゲノムの細胞毒性を低減させるように操作されている。いくつかの実施形態では、標的細胞は、ヒト細胞（一次細胞またはそれに由来する細胞株）である。いくつかの実施形態では、標的細胞は、呼吸器の細胞（一次細胞またはそれに由来する細胞株）である。いくつかの実施形態では、標的細胞は、気道上皮細胞（一次細胞またはそれに由来する細胞株）である。いくつかの実施形態では、標的細胞は、肺の細胞（一次細胞またはそれに由来する細胞株）である。いくつかの実施形態では、組換えゲノム（例えば、組換え単純ヘルペスウイルスゲノム）の（例えば、標的細胞における）細胞毒性は、対応する野生型ヘルペスウイルスゲノムと比較して、少なくとも約５％、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約３５％、少なくとも約４０％、少なくとも約４５％、少なくとも約５０％、少なくとも約５５％、少なくとも約６０％、少なくとも約６５％、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％または少なくとも約９９％低減される（例えば、標的細胞における野生型単純ヘルペスウイルスゲノムに対する、組換えΔＩＣＰ４（一方または両方のコピー）単純ヘルペスウイルスゲノムの相対的細胞毒性の測定；標的細胞における野生型単純ヘルペスウイルスゲノムに対する、組換えΔＩＣＰ４（一方または両方のコピー）／ΔＩＣＰ２２単純ヘルペスウイルスゲノムの相対的細胞毒性の測定など）。いくつかの実施形態では、組換えヘルペスゲノム（例えば、組換え単純ヘルペスウイルスゲノム）の（例えば、標的細胞における）細胞毒性は、対応する野生型ヘルペスウイルスゲノムと比較して、少なくとも約１．５倍、少なくとも約２倍、少なくとも約３倍、少なくとも約４倍、少なくとも約５倍、少なくとも約６倍、少なくとも約７倍、少なくとも約８倍、少なくとも約９倍、少なくとも約１０倍、少なくとも約１５倍、少なくとも約２０倍、少なくとも約２５倍、少なくとも約５０倍、少なくとも約７５倍、少なくとも約１００倍、少なくとも約２５０倍、少なくとも約５００倍、少なくとも約７５０倍または少なくとも約１０００倍以上低減される（例えば、標的細胞における野生型単純ヘルペスウイルスゲノムに対する、組換えΔＩＣＰ４（一方または両方のコピー）単純ヘルペスウイルスゲノムの相対的細胞毒性の測定；標的細胞における野生型単純ヘルペスウイルスゲノムに対する、組換えΔＩＣＰ４（一方または両方のコピー）／ΔＩＣＰ２２単純ヘルペスウイルスゲノムの相対的細胞毒性の測定など）。細胞毒性の測定方法は当業者に既知であり、例えば、生体染色色素の使用（ホルマザン色素）、プロテアーゼバイオマーカー、ＭＴＴアッセイ（または、ＸＴＴ、ＭＴＳ、水溶性テトラゾリウム塩などの関連するテトラゾリウム塩を使用するアッセイ）、ＡＴＰ含有量の測定などによるものが含まれる。
いくつかの実施形態では、組換えゲノム（例えば、組換え単純ヘルペスウイルスゲノム）は、対応する野生型ゲノム（例えば、野生型単純ヘルペスウイルスゲノム）と比較して、標的細胞の組換えゲノムへの曝露後の標的細胞増殖に対する影響を低減させるように操作されている。いくつかの実施形態では、標的細胞は、ヒト細胞（一次細胞またはそれに由来する細胞株）である。いくつかの実施形態では、標的細胞は、呼吸器の細胞（一次細胞またはそれに由来する細胞株）である。いくつかの実施形態では、標的細胞は、気道上皮細胞（一次細胞またはそれに由来する細胞株）である。いくつかの実施形態では、標的細胞は、肺の細胞（一次細胞またはそれに由来する細胞株）である。いくつかの実施形態では、組換えゲノムへの曝露後の標的細胞増殖は、対応する野生型ゲノムへの曝露後の標的細胞増殖と比較して、少なくとも約５％、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約３５％、少なくとも約４０％、少なくとも約４５％、少なくとも約５０％、少なくとも約５５％、少なくとも約６０％、少なくとも約６５％、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％または少なくとも約９９％速い（例えば、標的細胞における野生型単純ヘルペスウイルスゲノムへの曝露後の細胞増殖に対する、組換えΔＩＣＰ４（一方または両方のコピー）単純ヘルペスウイルスゲノムへの曝露後の相対的細胞増殖の測定；標的細胞における野生型単純ヘルペスウイルスゲノムへの曝露後の細胞増殖に対する、組換えΔＩＣＰ４（一方または両方のコピー）／ΔＩＣＰ２２単純ヘルペスウイルスゲノムへの曝露後の相対的細胞増殖の測定など）。いくつかの実施形態では、組換えゲノムへの曝露後の標的細胞増殖は、対応する野生型ゲノムへの曝露後の標的細胞増殖と比較して、少なくとも約１．５倍、少なくとも約２倍、少なくとも約３倍、少なくとも約４倍、少なくとも約５倍、少なくとも約６倍、少なくとも約７倍、少なくとも約８倍、少なくとも約９倍、少なくとも約１０倍、少なくとも約１５倍、少なくとも約２０倍、少なくとも約２５倍、少なくとも約５０倍、少なくとも約７５倍、少なくとも約１００倍、少なくとも約２５０倍、少なくとも約５００倍、少なくとも約７５０倍または少なくとも約１０００倍速い（例えば、標的細胞における野生型単純ヘルペスウイルスゲノムへの曝露後の細胞増殖に対する、組換えΔＩＣＰ４（一方または両方のコピー）単純ヘルペスウイルスゲノムへの曝露後の相対的細胞増殖の測定；標的細胞における野生型単純ヘルペスウイルスゲノムへの曝露後の細胞増殖に対する、組換えΔＩＣＰ４（一方または両方のコピー）／ΔＩＣＰ２２単純ヘルペスウイルスゲノムへの曝露後の相対的細胞増殖の測定など）。細胞増殖の測定方法は当業者に既知であり、例えば、Ｋｉ６７細胞増殖アッセイ、ＢｒｄＵ細胞増殖アッセイなどの使用によるものが含まれる。
ベクター（例えば、ヘルペスウイルスベクター）は、宿主細胞でのポリヌクレオチドの発現に適した形態で、本開示の１つ以上のポリヌクレオチドを含み得る。ベクターは、発現されるポリヌクレオチドに（例えば、前述の通りに）作動可能に連結された１つ以上の調節配列を含み得る。
いくつかの実施形態では、本開示は、本明細書に記載の組換え核酸のいずれかを含む１つ以上の異種ポリヌクレオチド（例えば、細菌人工染色体（ＢＡＣ））に関する。
いくつかの実施形態では、本開示の組換え核酸（例えば、組換え単純ヘルペスウイルスゲノム）は、組換え核酸に任意の方向で挿入された本明細書に記載のポリヌクレオチドの１つ以上を含む。組換え核酸が本明細書に記載の２つ以上のポリヌクレオチド（例えば、２つ以上、３つ以上など）を含む場合、ポリヌクレオチドは、互いに同じ方向または向かい合う方向で挿入され得る。理論に束縛されることを望まないが、２つのポリヌクレオチド（例えば、２つの導入遺伝子）を組換え核酸（例えば、ベクター）にアンチセンス方向で組み込むことは、リードスルーを回避し、確実に各ポリヌクレオチドを適切に発現させるのに役立ち得る。
いくつかの実施形態では、本開示の組換え核酸は、コラーゲンアルファ－１（ＶＩＩ）鎖ポリペプチド（ＣＯＬ７）をコードするポリヌクレオチドを含まない。いくつかの実施形態では、本開示の組換え核酸は、リシルヒドロキシラーゼ３ポリペプチド（ＬＨ３）をコードするポリヌクレオチドを含まない。いくつかの実施形態では、本開示の組換え核酸は、ケラチンＩ型細胞骨格１７ポリペプチド（ＫＲＴ１７）をコードするポリヌクレオチドを含まない。いくつかの実施形態では、本開示の組換え核酸は、トランスグルタミナーゼ（ＴＧＭ）ポリペプチド（例えば、ヒトＴＧＭ１ポリペプチド及び／またはヒトＴＧＭ５ポリペプチドなどのヒトトランスグルタミナーゼポリペプチド）をコードするポリヌクレオチドを含まない。いくつかの実施形態では、本開示の組換え核酸は、化粧用タンパク質（例えば、コラーゲンタンパク質、フィブロネクチン、エラスチン、ルミカン、ビトロネクチン／ビトロネクチン受容体、ラミニン、神経調節物質、フィブリリン、付加的な皮膚細胞外マトリックスタンパク質など）をコードするポリヌクレオチドを含まない。いくつかの実施形態では、本開示の組換え核酸は、抗体（例えば、完全長抗体、抗体断片など）をコードするポリヌクレオチドを含まない。いくつかの実施形態では、本開示の組換え核酸は、セリンプロテアーゼ阻害剤カザル型（ＳＰＩＮＫ）ポリペプチド（例えば、ＳＰＩＮＫ５ポリペプチドなどのヒトＳＰＩＮＫポリペプチド）をコードするポリヌクレオチドを含まない。いくつかの実施形態では、本開示の組換え核酸は、フィラグリンまたはフィラグリン２ポリペプチド（例えば、ヒトフィラグリンまたはフィラグリン２ポリペプチド）をコードするポリヌクレオチドを含まない。いくつかの実施形態では、本開示の組換え核酸は、嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子（ＣＦＴＲ）ポリペプチド（例えば、ヒトＣＦＴＲポリペプチド）をコードするポリヌクレオチドを含まない。いくつかの実施形態では、本開示の組換え核酸は、魚鱗癬関連ポリペプチド（例えば、ＡＴＰ結合カセットサブファミリーＡメンバー１２ポリペプチド、１－アシルグリセロール－３－リン酸Ｏ－アシルトランスフェラーゼＡＢＨＤ５ポリペプチド、アルデヒドデヒドロゲナーゼファミリー３メンバーＡ２ポリペプチド、アラキドネート１２－リポキシゲナーゼ１２Ｒ型ポリペプチド、ヒドロペルオキシドイソメラーゼＡＬＯＸＥ３ポリペプチド、ＡＰ－１複合体サブユニットシグマ－１Ａポリペプチド、アリールスルファターゼＥポリペプチド、カスパーゼ－１４ポリペプチド、コルネオデスモシンポリペプチド、セラミドシンターゼ３ポリペプチド、炭水化物スルホトランスフェラーゼ８ポリペプチド、クローディン－１ポリペプチド、シスタチン－Ａポリペプチド、チトクロームＰ４５０ ４Ｆ２２ポリペプチド、３－ベータ－ヒドロキシステロイド－デルタ（８）、デルタ（７）－イソメラーゼポリペプチド、非常に長鎖の脂肪酸タンパク質４ポリペプチドの伸長、フィラグリンポリペプチド、フィラグリン２ポリペプチド、ギャップジャンクションベータ２ポリペプチド、ギャップジャンクションベータ－３ポリペプチド、ギャップジャンクションベータ－４ポリペプチド、ギャップジャンクションベータ－６ポリペプチド、３－ケトジヒドロスフィンゴシンレダクターゼポリペプチド、ケラチン、ＩＩ型細胞骨格１ポリペプチド、ケラチン、ＩＩ型細胞骨格２表皮ポリペプチド、ケラチン、Ｉ型細胞骨格９ポリペプチド、ケラチン、Ｉ型細胞骨格１０ポリペプチド、リパーゼメンバーＮポリペプチド、ロリクリンポリペプチド、膜結合転写因子部位２プロテアーゼポリペプチド、マグネシウムトランスポーターＮＩＰＡ４ポリペプチド、ステロール－４－アルファ－カルボキシレート３－デヒドロゲナーゼ、脱カルボキシル化ポリペプチド、ペルオキシソームターゲティングシグナル２受容体ポリペプチド、Ｄ－３－ホスホグリセリン酸デヒドロゲナーゼポリペプチド、フィタノイル－ＣｏＡジオキシゲナーゼ、ペルオキシソームポリペプチド、パタチン様ホスホリパーゼドメイン含有タンパク質１ポリペプチド、プロテアソーム成熟タンパク質ポリペプチド、ホスホセリンアミノトランスフェラーゼポリペプチド、短鎖デヒドロゲナーゼ／レダクターゼファミリー９Ｃメンバー７ポリペプチド、セルピンＢ８ポリペプチド、長鎖脂肪酸輸送タンパク質４ポリペプチド、シナプトソーム関連タンパク質２９ポリペプチド、腫瘍形成抑制剤１４タンパク質ポリペプチド、ステリルスルファターゼポリペプチド、真空タンパク質選別関連タンパク質３３Ｂポリペプチド、及びＣＡＡＸプレニルプロテアーゼ１ホモログポリペプチド）をコードするポリヌクレオチドを含まない。いくつかの実施形態では、本開示の組換え核酸は、コラーゲンアルファ－１（ＶＩＩ）鎖ポリペプチド、リシルヒドロキシラーゼ３ポリペプチド、ケラチンＩ型細胞骨格１７ポリペプチド及び／またはそれらの任意のキメラポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含まない。いくつかの実施形態では、本開示の組換え核酸は、コラーゲンアルファ－１（ＶＩＩ）鎖ポリペプチド、リシルヒドロキシラーゼ３ポリペプチド、ケラチンＩ型細胞骨格１７ポリペプチド、トランスグルタミナーゼ（ＴＧＭ）ポリペプチド、フィラグリンポリペプチド、化粧用タンパク質、抗体、ＳＰＩＮＫポリペプチド、ＣＦＴＲポリペプチド、魚鱗癬関連ポリペプチド、及び／またはそれらの任意のキメラポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含まない。
ＩＶ．ウイルス
本開示の特定の態様は、本明細書に記載のポリヌクレオチド及び／または組換え核酸のいずれかを含むウイルスに関する。いくつかの実施形態では、ウイルスは、対象（例えば、ヒト）の１つ以上の標的細胞に感染することができる。いくつかの実施形態では、ウイルスは、ポリヌクレオチド及び／または組換え核酸を対象（例えば、ヒト対象）の１つ以上の標的細胞に送達するのに適している。いくつかの実施形態では、１つ以上の標的細胞は、ヒト細胞である。いくつかの実施形態では、１つ以上の標的細胞は、ポリヌクレオチド及び／または組換えゲノムによってコードされるポリペプチドの突然変異バリアントをコードする内因性遺伝子中に遺伝的欠損（例えば、病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異）を含む１つ以上の細胞である（例えば、ポリヌクレオチド及び／または組換えゲノムからのポリペプチドの発現は、根底にあるタンパク質欠損を分子的に修正する）。いくつかの実施形態では、１つ以上の標的細胞は、１つ以上の気道上皮細胞である。いくつかの実施形態では、１つ以上の標的細胞は、呼吸器の１つ以上の細胞（例えば、気道上皮細胞（杯細胞、繊毛細胞、クララ細胞、神経内分泌細胞、基底細胞、中間または傍基底細胞、漿液細胞、刷子細胞、腫瘍細胞、非繊毛円柱細胞、及び／または化生細胞など）；肺胞細胞（１型肺細胞、２型肺細胞、及び／または立方状の非繊毛細胞など）；気管支中の唾液腺細胞（漿液細胞、粘液細胞、及び／または管細胞）；など）である。いくつかの実施形態では、１つ以上の標的細胞は、肺の１つ以上の細胞である。
当該技術分野において既知の任意の好適なウイルスを使用することができ、それらとしては、例えば、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、レトロウイルス、レンチウイルス、センダイウイルス、パピローマウイルス、ヘルペスウイルス（例えば、単純ヘルペスウイルス）、ワクシニアウイルス及び／またはそれらの任意のハイブリッドウイルスもしくは派生ウイルスが含まれる。いくつかの実施形態では、ウイルスは弱毒化されている。いくつかの実施形態では、ウイルスは複製能力を有する。いくつかの実施形態では、ウイルスは複製欠損である。いくつかの実施形態では、ウイルスは、対応する未改変の野生型ウイルスの組織向性と比較して、その組織向性を変化させるように改変されている。いくつかの実施形態では、ウイルスは、（例えば、標的細胞中において）、対応する野生型ウイルスと比較して細胞毒性が低減している。組換え核酸を含むウイルスを産生する方法は、当業者に周知である。
いくつかの実施形態では、ウイルスは、例えば、単純ヘルペスウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、ヒトサイトメガロウイルス、ヘルペスウイルス６Ａ、ヘルペスウイルス６Ｂ、ヘルペスウイルス７、Ｅｐｓｔｅｉｎ－Ｂａｒｒウイルス及びカポジ肉腫関連ヘルペスウイルスなどを含む、ヘルペスウイルス科ファミリーのＤＮＡウイルスのメンバーである。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスは弱毒化されている。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスは複製欠損である。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスは複製能力を有する。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスは、１つ以上のヘルペスウイルス遺伝子（例えば、１つ以上の毒性ヘルペスウイルス遺伝子）の発現を低減または排除するように操作されている。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスは、対応する野生型ヘルペスウイルスと比較して細胞毒性が低減している。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスは腫瘍溶解性ではない。
いくつかの実施形態では、ウイルスは単純ヘルペスウイルスである。組換え核酸を含む単純ヘルペスウイルスは、例えば、ＷＯ２０１５／００９９５２、ＷＯ２０１７／１７６３３６、ＷＯ２０１９／２００１６３、及び／またはＷＯ２０１９／２１０２１９に開示されているプロセスによって産生され得る。いくつかの実施形態では、単純ヘルペスウイルスは弱毒化されている。いくつかの実施形態では、単純ヘルペスウイルスは複製欠損である。いくつかの実施形態では、単純ヘルペスウイルスは複製能力を有する。いくつかの実施形態では、単純ヘルペスウイルスは、１つ以上の単純ヘルペスウイルス遺伝子（例えば、１つ以上の毒性単純ヘルペスウイルス遺伝子）の発現を低減または排除するように操作されている。いくつかの実施形態では、単純ヘルペスウイルスは、対応する野生型単純ヘルペスウイルスと比較して細胞毒性が低減している。いくつかの実施形態では、単純ヘルペスウイルスは、腫瘍溶解性ではない。いくつかの実施形態では、単純ヘルペスウイルスは、ＨＳＶ－１、ＨＳＶ－２またはそれらの任意の派生体である。いくつかの実施形態では、単純ヘルペスウイルスは、ＨＳＶ－１ウイルスである。いくつかの実施形態では、ＨＳＶ－１は弱毒化されている。いくつかの実施形態では、ＨＳＶ－１は複製欠損である。いくつかの実施形態では、ＨＳＶ－１は複製能力を有する。いくつかの実施形態では、ＨＳＶ－１は、１つ以上のＨＳＶ－１遺伝子（例えば、１つ以上の毒性ＨＳＶ－１遺伝子）の発現を低減または排除するように操作されている。いくつかの実施形態では、ＨＳＶ－１は、対応する野生型ＨＳＶ－１と比較して細胞毒性が低減している。いくつかの実施形態では、ＨＳＶ－１は腫瘍溶解性ではない。
いくつかの実施形態では、単純ヘルペスウイルスは、未改変の野生型単純ヘルペスウイルスの組織向性と比較して、その組織向性を変化させるように改変されている。いくつかの実施形態では、単純ヘルペスウイルスは改変されたエンベロープを含む。いくつかの実施形態では、改変されたエンベロープは、１つ以上の（例えば、１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上など）の突然変異した単純ヘルペスウイルス糖タンパク質を含む。単純ヘルペスウイルス糖タンパク質の例には、糖タンパク質ｇＢ、ｇＣ、ｇＤ、ｇＨ及びｇＬが含まれ得るが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、改変されたエンベロープは、野生型単純ヘルペスウイルスと比較して、単純ヘルペスウイルスの組織向性を変化させる。
いくつかの実施形態では、１つ以上の標的細胞（例えば、呼吸器の１つ以上の細胞）に対する本開示のウイルス（例えば、単純ヘルペスウイルスなどのヘルペスウイルス）の形質導入効率（ｉｎ ｖｉｔｒｏ及び／またはｉｎ ｖｉｖｏ）は、少なくとも約２５％である。例えば、１つ以上の標的細胞に対するウイルスの形質導入効率は、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約３５％、少なくとも約４０％、少なくとも約４５％、少なくとも約５０％、少なくとも約５５％、少なくとも約６０％、少なくとも約６５％、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９９％または少なくとも約９９．５％以上であり得る。いくつかの実施形態では、ウイルスは単純ヘルペスウイルスであり、１つ以上の標的細胞（例えば、呼吸器の１つ以上の細胞）に対するウイルスの形質導入効率は、約８５％～約１００％である。いくつかの実施形態では、ウイルスは単純ヘルペスウイルスであり、１つ以上の標的細胞（例えば、呼吸器の１つ以上の細胞）に対するウイルスの形質導入効率は、少なくとも約８５％、少なくとも約８６％、少なくとも約８７％、少なくとも約８８％、少なくとも約８９％、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％または１００％である。Ｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｉｎ ｖｉｖｏでウイルス形質導入効率を測定する方法は当業者に周知であり、例えば、ｑＰＣＲ分析、ディープシーケンシング、ウェスタンブロッティング、蛍光分析（例えば、蛍光ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）、蛍光レポーター遺伝子発現、免疫蛍光法、ＦＡＣＳ）などが含まれる。
Ｖ．医薬組成物及び製剤
本開示の特定の態様は、本明細書に記載の組換え核酸（例えば、組換えヘルペスウイルスゲノム）及び／またはウイルス（例えば、組換えゲノムを含むヘルペスウイルス）のいずれか（組換え単純ヘルペスウイルスゲノムを含む単純ヘルペスウイルスなど）と、薬学的に許容される賦形剤もしくは担体とを含む医薬組成物または製剤に関する。
いくつかの実施形態では、医薬組成物または製剤は、本明細書に記載のウイルス（例えば、ヘルペスウイルス）のいずれか１つ以上を含む。いくつかの実施形態では、医薬組成物または製剤は、約１０４～約１０１２プラーク形成単位（ＰＦＵ）／ｍＬのウイルスを含む。例えば、医薬組成物または製剤は、約１０４～約１０１２、約１０５～約１０１２、約１０６～約１０１２、約１０７～約１０１２、約１０８～約１０１２、約１０９～約１０１２、約１０１０～約１０１２、約１０１１～約１０１２、約１０４～約１０１１、約１０５～約１０１１、約１０６～約１０１１、約１０７～約１０１１、約１０８～約１０１１、約１０９～約１０１１、約１０１０～約１０１１、約１０４～約１０１０、約１０５～約１０１０、約１０６～約１０１０、約１０７～約１０１０、約１０８～約１０１０、約１０９～約１０１０、約１０４～約１０９、約１０５～約１０９、約１０６～約１０９、約１０７～約１０９、約１０８～約１０９、約１０４～約１０８、約１０５～約１０８、約１０６～約１０８、約１０７～約１０８、約１０４～約１０７、約１０５～約１０７、約１０６～約１０７、約１０４～約１０６、約１０５～約１０６または約１０４～約１０５ＰＦＵ／ｍＬのウイルスを含み得る。いくつかの実施形態では、医薬組成物または製剤は、約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１１または約１０１２ＰＦＵ／ｍＬのウイルスを含む。
医薬組成物及び製剤は、所望の純度を有する有効成分（複数可）（組換え核酸及び／またはウイルスなど）を１つ以上の薬学的に許容され得る担体または賦形剤と混合することによって調製することができる。薬学的に許容され得る担体または賦形剤は、一般に、用いられる用量及び濃度でレシピエントに対して非毒性であり、限定されないが、緩衝液（例えば、リン酸塩、クエン酸塩、酢酸塩及び他の有機酸）；酸化防止剤（例えば、アスコルビン酸及びメチオニン）；防腐剤（例えば、オクタデシルジメチルベンジル塩化アンモニウム、塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム、フェノール、ブチルアルコールもしくはベンジルアルコール、アルキルパラベン、カテコール、レゾルシノール、シクロヘキサノール、３－ペンタノール及びｍ－クレゾール）；アミノ酸（例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、もしくはリジン）；低分子量（約１０残基未満）ポリペプチド；タンパク質（例えば、血清アルブミン、ゼラチンもしくは免疫グロブリン）；ポリオール（グリセロールなど、例えば、１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％などのグリセロールを含む製剤）；親水性ポリマー（例えば、ポリビニルピロリドン）；単糖類、二糖類及び他の炭水化物（グルコース、マンノースもしくはデキストリンを含む）；キレート剤（例えば、ＥＤＴＡ）；糖類（例えば、スクロース、マンニトール、トレハロースもしくはソルビトール）；塩形成対イオン（例えば、ナトリウム）；金属複合体（例えば、Ｚｎ－タンパク質複合体）；及び／または非イオン性界面活性剤（例えば、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ））を含み得る。薬学的に許容され得る担体の完全な考察は、ＲＥＭＩＮＧＴＯＮ’Ｓ ＰＨＡＲＭＡＣＥＵＴＩＣＡＬ ＳＣＩＥＮＣＥＳ（Ｍａｃｋ Ｐｕｂ．Ｃｏ．，Ｎ．Ｊ．１９９１）にて入手可能である。
いくつかの実施形態では、医薬組成物または製剤は、１つ以上の脂質（例えば、カチオン性脂質）担体を含む。いくつかの実施形態では、医薬組成物または製剤は、１つ以上のナノ粒子担体を含む。ナノ粒子は、カプセル化された薬物（合成小分子、タンパク質、ペプチド、細胞、ウイルス及び核酸ベースの生物学的製剤など）を迅速放出または制御放出のために運搬することができる、サブミクロン（約１０００ｎｍ未満）サイズのドラッグデリバリービヒクルである。様々な分子（例えば、タンパク質、ペプチド、組換え核酸など）を、当該技術分野で周知のプロセスを使用して、ナノ粒子中に効率的にカプセル化することができる。いくつかの実施形態では、ナノ粒子中に「カプセル化された」分子は、ナノ粒子内に含有されるか、またはナノ粒子の表面に付着及び／または会合するか、あるいはそれらの任意の組み合わせである分子（ウイルスなど）を指し得る。本明細書に記載の組成物または製剤で使用するためのナノ粒子は、例えば、ポリ（乳酸）、ポリ（グリコール酸）、ＰＬＧＡ、ＰＬＡ、ＰＧＡを含むナノ粒子及びそれらの任意の組み合わせを含む、当該技術分野において既知の任意のタイプの生体適合性ナノ粒子であり得る（例えば、Ｖａｕｔｈｉｅｒ ｅｔ ａｌ．Ａｄｖ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌ Ｒｅｖ．（２００３）５５：５１９－４８、ＵＳ２００７／０１４８０７４、ＵＳ２００７／００９２５７５、ＵＳ２００６／０２４６１３９、ＵＳ５７５３２３４、ＵＳ７０８１４８３及びＷＯ２００６／０５２２８５を参照されたい）。
いくつかの実施形態では、薬学的に許容され得る担体または賦形剤は、例えば、静脈内投与、筋肉内投与、皮下投与、皮膚投与、経口投与、鼻腔内投与、気管内投与、舌下投与、頬側投与、局所投与、経皮投与、皮内投与、腹腔内投与、眼窩内投与、硝子体内投与、網膜下投与、経粘膜投与、関節内投与、移植による投与、吸入による投与、髄腔内投与、脳室内投与及び／または鼻腔内投与を含む、当該技術分野において既知の任意の投与経路に適合するか、または適し得る。いくつかの実施形態では、薬学的に許容され得る担体または賦形剤は、経口投与、鼻腔内投与、気管内投与、及び／または吸入投与に適合するか、または適している。いくつかの実施形態では、薬学的に許容され得る担体または賦形剤は、鼻腔内投与及び／または吸入投与に適合するか、または適している。いくつかの実施形態では、薬学的に許容され得る担体または賦形剤は、吸入投与に適合するか、または適している。
いくつかの実施形態では、医薬組成物または製剤は、例えば、静脈内投与、筋肉内投与、皮下投与、皮膚投与、経口投与、鼻腔内投与、気管内投与、舌下投与、頬側投与、局所投与、経皮投与、皮内投与、腹腔内投与、眼窩内投与、硝子体内投与、網膜下投与、経粘膜投与、関節内投与、移植による投与、吸入による投与、髄腔内投与、脳室内投与または鼻腔内投与を含む、当該技術分野において既知の任意の投与経路に適合するか、または適し得る。いくつかの実施形態では、医薬組成物または製剤は、経口、鼻腔内、気管内、及び／または吸入投与に適合するか、または適している。いくつかの実施形態では、医薬組成物または製剤は、鼻腔内、及び／または吸入投与に適合するか、または適している。いくつかの実施形態では、医薬組成物または製剤は、吸入投与に適合するか、または適している。
いくつかの実施形態では、医薬組成物または製剤は、１つ以上の追加の成分をさらに含む。追加の成分の例には、結合剤（例えば、アルファ化トウモロコシデンプン、ポリビニルピロリドンまたはヒドロキシプロピルメチルセルロースなど）、充填剤（例えば、ラクトース及び他の糖類、微結晶性セルロース、ペクチン、ゼラチン、硫酸カルシウム、エチルセルロース、ポリアクリレートまたはリン酸水素カルシウムなど）、潤滑剤（例えば、ステアリン酸マグネシウム、タルク、シリカ、コロイド状二酸化ケイ素、ステアリン酸、ステアリン酸金属塩、硬化植物油、トウモロコシデンプン、ポリエチレングリコール、安息香酸ナトリウム、酢酸ナトリウムなど）、崩壊剤（例えば、デンプン、デンプングリコール酸ナトリウムなど）、湿潤剤（例えば、ラウリル硫酸ナトリウムなど）、塩類溶液、アルコール類、ポリエチレングリコール、ゼラチン、ラクトース、アミラーゼ、ステアリン酸マグネシウム、タルク、ケイ酸、粘性パラフィン、ヒドロキシメチルセルロース、ポリビニルピロリドン、甘味剤、香味剤、芳香剤、着色剤、保湿剤、日焼け止め剤、抗菌剤、ポリヌクレオチドを安定化させるか、またはその分解を防止することのできる薬剤などが含まれ得るが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、医薬組成物または製剤は、メチルセルロースゲル（例えば、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、カルボキシメチルセルロースなど）を含む。いくつかの実施形態では、医薬組成物または製剤は、リン酸緩衝液を含む。いくつかの実施形態では、医薬組成物または製剤は、グリセロールを（例えば、約１％、約２％、約３％、約４％、約５％、約６％、約７％、約８％、約９％、約１０％、約１１％、約１２％、約１３％、約１４％、約１５％などで）含む。いくつかの実施形態では、医薬組成物または製剤は、リン酸緩衝液及びグリセロールを含む。
Ｉｎ ｖｉｖｏ投与に使用される医薬組成物及び製剤は、一般に滅菌である。滅菌状態は、例えば、滅菌濾過膜を通した濾過により容易に実現することができる。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを使用して、ポリペプチド（例えば、アルファ－１－アンチトリプシンポリペプチドなどの吸入治療用ポリペプチド）をコードする１つ以上のポリヌクレオチドを、対象の１つ以上の細胞（例えば、対象の呼吸器の１つ以上の細胞）に送達することができる。いくつかの実施形態では、対象は、気道及び／または肺に影響を与える疾患に罹患している。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを、疾患または状態（例えば、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症、肺胞微石症、原発性線毛機能不全、先天性肺胞タンパク症、肺動脈性肺高血圧症、及び／または肺線維症など、気道及び／または肺に影響を与えるもの）の治療に使用することができる。これらは、コードされたポリペプチドの発現から利益を得るであろう。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを、進行性肺破壊の予防または治療に使用することができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを、急性または慢性肺疾患の治療に使用することができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症の治療に使用することができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを、肺胞微石症の治療に使用することができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを、原発性線毛機能不全の治療に使用することができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを、肺胞タンパク症の治療に使用することができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを、肺動脈性肺高血圧症の治療に使用することができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを、肺線維症の治療に使用することができる。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかは、ポリペプチド（例えば、アルファ－１－アンチトリプシンポリペプチドなどの吸入治療用ポリペプチド）をコードする１つ以上のポリヌクレオチドを、対象の１つ以上の細胞（例えば、対象の呼吸器の１つ以上の細胞）へ送達するのに有用な医用薬剤を調製する際に使用することができる。いくつかの実施形態では、対象は、気道及び／または肺に影響を与える疾患に罹患している。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを、疾患または状態（例えば、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症、肺胞微石症、原発性線毛機能不全、先天性肺胞タンパク症、肺動脈性肺高血圧症、及び／または肺線維症など、気道及び／または肺に影響を与えるもの）の治療に有用な医用薬剤を調製する際に使用することができる。これらは、コードされたポリペプチドの発現から利益を得るであろう。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを、進行性肺破壊の予防または治療に有用な医用薬剤を調製する際に使用することができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを、急性または慢性肺疾患の治療に有用な医用薬剤を調製する際に使用することができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症の治療に有用な医用薬剤を調製する際に使用することができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを、肺胞微石症の治療に有用な医用薬剤の調製に使用することができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを、原発性線毛機能不全の治療に有用な医用薬剤の調製に使用することができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを、肺胞タンパク症の治療に有用な医用薬剤の調製に使用することができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを、肺動脈性肺高血圧症の治療に有用な医用薬剤の調製に使用することができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを、肺線維症の治療に有用な医用薬剤の調製に使用することができる。
ＶＩ．方法
本開示の特定の態様は、ポリペプチドを対象の呼吸器の１つ以上の細胞（例えば、気道上皮細胞（杯細胞、繊毛細胞、クララ細胞、神経内分泌細胞、基底細胞、中間または傍基底細胞）、漿液細胞、刷子細胞、腫瘍細胞、非繊毛円柱細胞、及び／または化生細胞）；肺胞細胞（１型肺細胞、２型肺細胞、及び／または立方体の非繊毛細胞）；気管支の唾液腺細胞（漿液腺細胞など、粘液細胞、及び／または管細胞）；など））を送達させる方法に関し、方法は、（ａ）ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む、本明細書に記載の組換え核酸（例えば、組換え単純ヘルペスウイルスゲノム、例えば、組換えＨＳＶ－１ゲノム）のいずれかを含む、本明細書に記載のウイルス（例えば、単純ヘルペスウイルス、例えば、ＨＳＶ－１）のいずれかを含む医薬組成物と、薬学的に許容される担体と、を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、対象に、経口的投与される、鼻腔内投与される、気管内投与される、または吸入によって投与される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、対象に、鼻腔内投与される、または吸入によって投与される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、対象に、吸入によって投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、乾燥粉末吸入器、加圧定量吸入器、ソフトミスト吸入器、ネブライザー、または電気流体力学的エアロゾル装置を使用して投与される。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスまたは医薬組成物は、ネブライザーを使用して投与される。いくつかの実施形態では、ネブライザーは、振動型メッシュ式ネブライザーである。
いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルス（例えば、単純ヘルペスウイルス）は、複製能力を有する。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルス（例えば、単純ヘルペスウイルス）は、複製欠損である。いくつかの実施形態では、対象はヒトである。いくつかの実施形態では、対象は、気道及び／または肺に影響を与える疾患に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症、肺胞微石症、原発性線毛機能不全、先天性肺胞タンパク症、肺動脈性肺高血圧症、及び肺線維症のうちの１つ以上に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、嚢胞性線維症及び／または慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）に罹患していない。いくつかの実施形態では、対象は、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、肺胞微石症に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、原発性線毛機能不全に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、肺胞タンパク症に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、肺動脈性肺高血圧症に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、肺線維症に罹患している。いくつかの実施形態では、このポリペプチドは、本明細書に記載のポリペプチドのうちのいずれかである。いくつかの実施形態では、ヘルペスウイルスは、本明細書に記載のヘルペスウイルスのうちのいずれかである。いくつかの実施形態では、組換えヘルペスウイルスゲノムは、本明細書に記載の組換え核酸のうちのいずれかである。
本開示の他の態様は、対象の１つ以上の細胞におけるポリペプチド（例えば、吸入治療用ポリペプチド）のレベルを発現、増強、増加、増大、及び／または補足することに関し、方法は、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤のうちのいずれかを対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象はヒトである。いくつかの実施形態では、対象は、気道及び／または肺に影響を与える疾患に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、急性及び／または慢性肺疾患に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症、肺胞微石症、原発性線毛機能不全、先天性肺胞タンパク症、肺動脈性肺高血圧症、及び肺線維症のうちの１つ以上に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、嚢胞性線維症及び／または慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）に罹患していない。
いくつかの実施形態では、対象への組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤の投与は、対象における１つ以上の対応する未処理細胞におけるポリペプチドの内因性レベルと比較して、対象の１つ以上の接触または処理された細胞において、ポリペプチド（例えば、吸入治療用ポリペプチド）レベル（転写物またはタンパク質レベル）を少なくとも約２倍増加させる。例えば、組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤の投与は、対象における１つ以上の対応する未処理細胞におけるポリペプチドの内因性レベルと比較して、対象の１つ以上の接触または処理された細胞において、ポリペプチド（例えば、吸入治療用ポリペプチド）レベル（転写物またはタンパク質レベル）を少なくとも約２倍、少なくとも約３倍、少なくとも約４倍、少なくとも約５倍、少なくとも約６倍、少なくとも約７倍、少なくとも約８倍、少なくとも約９倍、少なくとも約１０倍、少なくとも約１５倍、少なくとも約２０倍、少なくとも約２５倍、少なくとも約５０倍、少なくとも約７５倍、少なくとも約１００倍、少なくとも約２５０倍、少なくとも約５００倍、少なくとも約７５０倍、少なくとも約１０００倍、またはそれ以上増加させることができる。いくつかの実施形態では、１つ以上の接触または処理された細胞は、呼吸器の１つ以上の細胞（例えば、気道上皮の１つ以上の細胞）である。サンプルから転写物またはタンパク質レベルを測定する方法は、例えば、ｑＰＣＲ、ウエスタンブロット、質量分析など、当業者に周知である。
本開示の他の態様は、少なくとも１つの呼吸量の測定の改善を必要とする対象において、それを行う方法に関し、方法は、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象はヒトである。いくつかの実施形態では、対象は、気道及び／または肺に影響を与える疾患に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、急性及び／または慢性肺疾患に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症、肺胞微石症、原発性線毛機能不全、先天性肺胞タンパク症、肺動脈性肺高血圧症、及び肺線維症のうちの１つ以上に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、嚢胞性線維症及び／または慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）に罹患していない。
いくつかの実施形態では、組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤を対象へ投与することは、治療前に対象において測定された少なくとも１つの参照呼吸量と比較して、少なくとも１つの呼吸量の測定値を少なくとも約５％、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約３５％、少なくとも約４０％、少なくとも約４５％、少なくとも約５０％、少なくとも約５５％、少なくとも約６０％、少なくとも約６５％、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９９％、またはそれ以上改善する。測定できる適切な呼吸量の例としては、例えば、総肺気量（ＴＬＣ）、最大膨張時の肺内での量；１回換気量（ＴＶ）、安静呼吸中に肺に出入りする空気の量；残気量（ＲＶ）、最大呼気後に肺中に残存している空気の量；予備呼気量（ＥＲＶ）、努力性呼出中に呼出可能な（１回換気量を超える）最大空気量；予備吸気量（ＥＲＶ）、吸気終了位置から吸入できる最大空気量；最大吸気量（ＩＣ）、ＩＲＶ及びＴＶの合計；吸気肺活量（ＩＶＣ）、最大呼気点から吸入される空気最大量；肺活量（ＶＣ）、最も深い吸入後に呼出された空気の量；機能的残気量（ＦＲＣ）、呼気終末位置での肺の容量；努力性肺活量（ＦＶＣ）、最大努力呼出からの肺活量の測定；努力性呼気肺活量（時間）（ＦＥＶｔ）、最初のｔ秒間に努力条件下で呼出される空気の量；努力性吸気流量（ＦＩＦ）、努力性吸気曲線の特定の測定値；努力性呼気流量（ＰＥＦ）、ピークフローメーターで測定された最大努力性呼気流量；最大努力換気量（ＭＶＶ）、反復最大努力中の特定の期間に呼出された空気の量などが挙げられる。方法は、一般に、当業者に公知である。
本開示の他の態様は、肺の慢性炎症の低減、予防、または治療を必要とする対象において、それを行う方法に関し、方法は、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象はヒトである。いくつかの実施形態では、対象は、気道及び／または肺に影響を与える疾患に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、急性及び／または慢性肺疾患に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症、肺胞微石症、原発性線毛機能不全、先天性肺胞タンパク症、肺動脈性肺高血圧症、及び肺線維症のうちの１つ以上に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、嚢胞性線維症及び／または慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）に罹患していない。肺炎症の測定に対する改善を含む肺炎症を測定する方法、例えば、呼気酸化窒素を測定すること、喀痰及び／または血液中の好酸球の割合（パーセンテージ）を決定することによるなどは、当業者に周知である。
本開示の他の態様は、進行性肺破壊の低減、阻害、または治療を必要とする対象において、それを行う方法に関し、方法は、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象はヒトである。いくつかの実施形態では、対象は、気道及び／または肺に影響を与える疾患に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、急性及び／または慢性肺疾患に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症、肺胞微石症、原発性線毛機能不全、先天性肺胞タンパク症、肺動脈性肺高血圧症、及び肺線維症のうちの１つ以上に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、嚢胞性線維症及び／または慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）に罹患していない。肺破壊を測定する方法は、当業者に周知であり、例えば、Ｓａｅｔｔａ ｅｔ ａｌ．（Ａｍ Ｒｅｖ Ｒｅｓｐｉｒ Ｄｉｓ．１９８５Ｍａｙ；１３１（５）：７６４－９）に記載の方法によるものである。
本開示の他の態様は、気道及び／または肺に影響を与える疾患の１つ以上の徴候または症状の予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法に関し、方法は、有効量の本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象はヒトである。いくつかの実施形態では、対象は、急性及び／または慢性肺疾患に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症、肺胞微石症、原発性線毛機能不全、先天性肺胞タンパク症、肺動脈性肺高血圧症、及び肺線維症のうちの１つ以上に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、嚢胞性線維症及び／または慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）に罹患していない。
本開示の他の態様は、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症の１つ以上の徴候または症状に対して予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法に関し、方法は、有効量の本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象はヒトである。いくつかの実施形態では、対象のゲノムは、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子（一方または両方のコピー）における病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え核酸（例えば、組換えヘルペスウイルスゲノム）は、アルファ－１－アンチトリプシンポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤の投与は、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症の１つ以上の徴候または症状の測定可能な改善または予防に影響を与える。
アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症の徴候及び症状としては、これらに限定されないが、息切れ（特に運動中）；呼吸中の喘鳴（ｗｈｅｅｚｉｎｇ）及び／または喘鳴（ｗｈｉｓｔｌｉｎｇ）の音；肺感染症に対する感受性の増大；疲労；起立時の速い心拍；体重減少；慢性咳嗽（多くの場合、血液を伴う）；肺気腫（一般的には、汎細葉性）；及び痰の生成の増加が挙げられ得る。
本開示の他の態様は、肺胞微石症の１つ以上の徴候または症状に対して予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法に関し、方法は、有効量の本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象はヒトである。いくつかの実施形態では、対象のゲノムは、ＳＬＣ３４Ａ２遺伝子（一方または両方のコピー）における病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え核酸（例えば、組換えヘルペスウイルスゲノム）は、ナトリウム依存性リン酸輸送タンパク質２Ｂポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤の投与は、肺胞微石症の１つ以上の徴候または症状の測定可能な改善または予防に影響を与える。
肺胞微石症の徴候及び症状としては、これらに限定されないが、息切れ、乾いた咳（散発的に血液を含む）；胸痛；無力症；及び気胸が挙げられ得る。
本開示の他の態様は、原発性線毛機能不全の１つ以上の徴候または症状に対して予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法に関し、方法は、有効量の本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象はヒトである。いくつかの実施形態では、対象のゲノムは、ＤＮＡＨ５、ＤＮＡＨ１１、ＣＣＤＣ３９、ＤＮＡＩ１、ＣＣＤＣ４０、ＣＣＤＣ１０３、ＳＰＡＧ１、ＺＭＹＮＤ１０、ＡＲＭＣ４、ＣＣＤＣ１５１、ＤＮＡＩ２、ＲＳＰＨ１、ＣＣＤＣ１１４、ＲＳＰＨ４Ａ、ＤＮＡＡＦ１、ＤＮＡＡＦ２、及びＬＲＲＣ６から選択される１つ以上の遺伝子（一方または両方のコピー）における病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え核酸（例えば、組換えヘルペスウイルスゲノム）は、ダイニン重鎖５軸糸ポリペプチド、ダイニン重鎖１１軸糸ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質３９ポリペプチド、ダイニン中間鎖１軸糸ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質４０ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１０３ポリペプチド、精子関連抗原１ポリペプチド、ジンクフィンガーＭＹＮＤドメイン含有タンパク質１０ポリペプチド、アルマジロリピート含有タンパク質４ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１５１ポリペプチド、ダイニン中間鎖２軸糸ポリペプチド、ラジアルスポークヘッド１ホモログポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１１４ポリペプチド、ラジアルスポークヘッドタンパク質４ホモログポリペプチド、ダイニンアセンブリ因子１軸糸ポリペプチド、ダイニンアセンブリ因子２軸糸ポリペプチド、及び／またはロイシンリッチリピート含有タンパク質６ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、対象のゲノムは、原発性線毛機能不全に関連する１つ以上の遺伝子中に病原性変異及び／または機能喪失型突然変異を含み、対象は、対応するポリペプチドの野生型及び／または機能的バリアントをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む組換え核酸で治療され（例えば、対象のゲノムは、ＤＮＡＨ５遺伝子（一方または両方のコピー）に、病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む）、対象は、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤（ダイニン重鎖５軸糸ポリペプチドなどをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む組換え核酸を含むもの）を投与される。いくつかの実施形態では、組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤の投与は、原発性線毛機能不全の１つ以上の徴候または症状の測定可能な改善または予防に影響を与える。
原発性線毛機能不全の徴候及び症状としては、これらに限定されないが、副鼻腔、耳、及び／または肺の慢性感染症；慢性鼻づまり；粘液及び膿の排出を伴う鼻水；難聴；呼吸困難（特に新生児）；慢性咳嗽；再発性肺炎；慢性副鼻腔炎；気管支拡張症；及び肺の一部または全部の崩壊が挙げられ得る。
本開示の他の態様は、肺胞タンパク症の１つ以上の徴候または症状に対して予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法に関し、方法は、有効量の本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象はヒトである。いくつかの実施形態では、対象のゲノムは、ＳＦＴＰＢ、ＳＦＴＰＣ、ＮＫＸ２－１、ＡＢＣＡ３、ＣＳＦ２ＲＢ、及び／またはＣＳＦ２ＲＡから選択される１つ以上の遺伝子（一方または両方のコピー）における病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え核酸（例えば、組換えヘルペスウイルスゲノム）は、肺サーファクタント関連タンパク質Ｂポリペプチド、肺サーファクタント関連タンパク質Ｃポリペプチド、ホメオボックスタンパク質Ｎｋｘ－２．１ポリペプチド、ＡＴＰ結合カセットサブファミリーＡメンバー３ポリペプチド、サイトカイン受容体共通サブユニットベータポリペプチド、及び顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体サブユニットアルファポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、対象のゲノムは、肺胞タンパク症に関連する１つ以上の遺伝子中に病原性変異及び／または機能喪失型突然変異を含み、対象は、対応するポリペプチドの野生型及び／または機能的バリアントをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む組換え核酸で治療され（例えば、対象のゲノムは、ＳＦＴＰＢ遺伝子（一方または両方のコピー）に、病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む）、対象は、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤（肺サーファクタント関連タンパク質Ｂポリペプチドなどをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む組換え核酸を含むもの）を投与される。いくつかの実施形態では、組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤の投与は、肺胞タンパク症の１つ以上の徴候または症状の測定可能な改善または予防に影響を与える。
肺胞タンパク症の徴候及び症状としては、これらに限定されないが、呼吸困難；咳時折粘液または血液を伴う咳；青みがかった顔色；全身倦怠感；微熱；体重減少；胸痛または緊張；低レベルの血中酸素；ばち指形成が挙げられ得る。
本開示の他の態様は、肺動脈性肺高血圧症の１つ以上の徴候または症状に対して予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法に関し、方法は、有効量の本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象はヒトである。いくつかの実施形態では、対象のゲノムは、ＢＭＰＲ２、ＡＴＰ２Ａ２、ＡＣＶＲＬ１、ＥＮＧ、ＳＭＡＤ９、ＣＡＶ１、ＫＣＮＫ３、及び／またはＥＩＦ２ＡＫ４から選択される１つ以上の遺伝子（一方または両方のコピー）における病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え核酸（例えば、組換えヘルペスウイルスゲノム）は、骨形成タンパク質受容体２型ポリペプチド、筋小胞体／小胞体カルシウムＡＴＰアーゼ２ポリペプチド、セリン／スレオニンプロテインキナーゼ受容体Ｒ３ポリペプチド、エンドグリンポリペプチド、マザーズアゲインストデカペンタプレジックホモログ９ポリペプチド、カベオリン－１ポリペプチド、カリウムチャネルサブファミリーＫメンバー３ポリペプチド、及び／またはｅＩＦ－２－アルファキナーゼＧＣＮ２ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、対象のゲノムは、肺動脈性肺高血圧症に関連する１つ以上の遺伝子中に病原性変異及び／または機能喪失型突然変異を含み、対象は、対応するポリペプチドの野生型及び／または機能的バリアントをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む組換え核酸で治療され（例えば、対象のゲノムは、ＢＭＰＲ２遺伝子（一方または両方のコピー）に、病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む）、対象は、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤（骨形成タンパク質受容体２型ポリペプチドなどをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む組換え核酸を含むもの）を投与される。いくつかの実施形態では、組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤の投与は、肺動脈性肺高血圧症の１つ以上の徴候または症状の測定可能な改善または予防に影響を与える。
肺動脈性肺高血圧症の徴候及び症状としては、これらに限定されないが、最初は運動中、最終的には安静時の息切れ；倦怠感；めまいまたは失神発作；胸部圧迫感または胸痛；足首、脚、及び／または腹部の腫脹；青みを帯びた色の唇及び肌；脈拍または動悸が挙げられ得る。
本開示の他の態様は、肺線維症の１つ以上の徴候または症状に対して予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法に関し、方法は、有効量の本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、対象はヒトである。いくつかの実施形態では、対象のゲノムは、ＳＦＴＰＣ、ＡＢＣＡ３、ＳＦＴＰＡ２、ＴＥＲＴ、ＴＥＲＣ、ＤＫＣ１、ＲＴＥＬ、ＰＡＲＮ、ＴＩＮＦ２、ＮＡＦ１、ＭＵＣ５Ｂ、ＤＳＰ、ＳＴＮ１、及び／またはＤＰＰ９から選択される１つ以上の遺伝子（一方または両方のコピー）における病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む。いくつかの実施形態では、組換え核酸（例えば、組換えヘルペスウイルスゲノム）は、肺サーファクタント関連タンパク質Ｃポリペプチド、ＡＴＰ結合カセットサブファミリーＡメンバー３ポリペプチド、肺サーファクタント関連タンパク質Ａ２ポリペプチド、テロメラーゼ逆転写酵素ポリペプチド、ジスケリンポリペプチド、テロメア伸長ヘリカーゼ１ポリペプチドの調節因子、ポリ（Ａ）特異的リボヌクレアーゼＰＡＲＮポリペプチド、ＴＥＲＦ１相互作用核因子２ポリペプチド、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質複合体非コアサブユニットＮＡＦ１ポリペプチド、ムチン－５Ｂポリペプチド、デスモプラキンポリペプチド、ＣＳＴ複合体サブユニットＳＴＮ１ポリペプチド、及び／またはジペプチジルペプチダーゼ９ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、対象のゲノムは、肺線維症に関連する１つ以上の遺伝子の病原性変異及び／または機能喪失型突然変異を含み、対象は、対応するポリペプチドの野生型及び／または機能的バリアントをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む組換え核酸で治療され（例えば、対象のゲノムは、ＳＦＴＰＣ遺伝子（一方または両方のコピー）に、病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む）、対象は、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤（肺サーファクタント関連タンパク質Ｃポリペプチドなどをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む組換え核酸を含むもの）を投与される。いくつかの実施形態では、組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤の投与は、肺線維症の１つ以上の徴候または症状の測定可能な改善または予防に影響を与える。
肺線維症の徴候及び症状としては、これらに限定されないが、特に運動中の息切れ；乾いた、頻発空咳；速くて浅い呼吸；徐々に意図しない体重減少；疲労；関節及び筋肉の痛み；脚の腫脹；指先またはつま先のばち指が挙げられ得る。
本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤は、これらに限定されないが、経口的、鼻腔内、気管内、舌下、頬側、局所的に、直腸的に、吸入による、経皮的に、皮下、皮内、静脈内、動脈内、筋肉内、心臓内、骨内、腹腔内、経粘膜的に、膣内に、硝子体内に、眼窩内、網膜下、関節内、関節周囲、局所的に、皮膚上、またはそれらの任意の組み合わせなど、当技術分野で公知である任意の適切な方法または経路によって投与され得る。したがって、本開示は、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを個体（例えば、気道及び／または肺に影響を与える疾患を有する、または発症するリスクがある個体）に送達する方法を包含する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤は、経口投与される、鼻腔内投与される、気管内投与される、及び／または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤は、鼻腔内投与される、または吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤は、吸入を介して投与される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤は、乾燥粉末吸入器、加圧定量吸入器、ソフトミスト吸入器、ネブライザー、または電気流体力学的エアロゾル装置を使用して投与される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤は、ネブライザーを使用して、投与される。いくつかの実施形態では、ネブライザーは、振動型メッシュ式ネブライザーである。
経口、鼻腔内、気管内、及び／または吸入投与経路を介して気道及び／または肺に薬物を送達する方法は、一般に、当業者に知られている（例えば、Ｇａｒｄｅｎｈｉｒｅ ｅｔ ａｌ．Ａ Ｇｕｉｄｅ ｔｏ Ａｅｒｏｓｏｌ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｄｅｖｉｃｅｓ ｆｏｒ Ｒｅｓｐｉｒａｔｏｒｙ Ｔｈｅｒａｐｉｓｔｓ，４ｔｈ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ａｍｅｒｉｃａｎ Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ｆｏｒ Ｒｅｓｐｉｒａｔｏｒｙ ｃａｒｅ，２０１７；Ｐａｔｉｌ ｅｔ ａｌ．Ｐｕｌｍｏｎａｒｙ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ：Ａ Ｃｏｎｃｉｓｅ，Ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃ Ｒｅｖｉｅｗ，Ｌｕｎｇ Ｉｎｄｉａ．２０１２．２９（１）：４４－９；Ｍａｒｘ ｅｔ ａｌ．Ｉｎｔｒａｎａｓａｌ Ｄｒｕｇ Ａｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎ－Ａｎ Ａｔｔｒａｃｔｉｖｅ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｒｏｕｔｅ ｆｏｒ Ｓｏｍｅ Ｄｒｕｇｓ，２０１５）。
いくつかの実施形態では、組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または組成物もしくは製剤は、エアロゾル化された製剤の吸入によって肺に送達される。吸入は、対象の鼻及び／または口を介して生じ得る。組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤を肺に送達するための例示的な装置にとしては、これらに限定されないが、乾燥粉末吸入器、加圧定量吸入器、ソフトミスト吸入器、ネブライザー（例えば、ジェットネブライザー、超音波式ネブライザー、振動型メッシュ式ネブライザー）、衝突ジェット、押し出しジェット、表面波マイクロ流体噴霧、キャピラリーエアロゾル生成、電気流体力学的エアロゾル装置など（例えば、Ｃａｒｖａｌｈｏ及びＭｃＣｏｎｖｉｌｌｅ．Ｔｈｅ ｆｕｎｃｔｉｏｎ ａｎｄ ｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅ ｏｆ ａｑｕｅｏｕｓ ｄｅｖｉｃｅｓ ｆｏｒ ｉｎｈａｌａｔｉｏｎ ｔｈｅｒａｐｙ．（２０１６） Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙ ａｎｄ Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙを参照されたい）が挙げられ得る。
液体製剤は、例えば、加圧定量吸入器（ｐＭＤＩ）を使用して、対象の肺に投与することができる。ｐＭＤＩは、一般に、少なくとも２つの構成要素：液体製剤が１つ以上の噴射剤と組み合わせて圧力下で保持されるキャニスター、及びキャニスターを保持し、作動させるために使用される容器を含む。キャニスターは、製剤の単回投与または複数回投与を含み得る。キャニスターは、キャニスターの内容物が排出され得るバルブ、典型的には、計量バルブを含み得る。エアロゾル化された薬物は、キャニスターに力を加えて、レセプタクル内に押し込むことによって、ｐＭＤＩから投与され、それによってバルブが開き、薬物粒子がバルブからレセプタクル出口を通って運ばれる。キャニスターから排出されると、液体製剤は噴霧され、エアロゾルを形成する。ｐＭＤＩは、典型的には、１つ以上の噴射剤を使用して、キャニスターの内容物を加圧し、液体製剤をレセプタクル出口から推進させて、エアロゾルが形成される。任意の適切な噴射剤を利用することができ、例えば、圧縮ガスまたは液化ガスなど、様々な形態をとることができる。
液体製剤は、例えば、ネブライザーを使用して、対象の肺に投与することができる。ネブライザーは、液体製剤を小滴の霧またはクラウドに変換する液体エアロゾル発生器であり、多くの場合、直径が約５ミクロン未満の空気力学的直径の中央値を有し、下気道に吸入させ得る。エアロゾルクラウドが吸入されたときに、液滴により、活性剤（複数可）が、鼻、上気道、及び／または深部肺に運ばれる。これらに限定されないが、空気圧（ジェット）式ネブライザー、電気機械式ネブライザー（例えば、超音波式ネブライザー、振動型メッシュ式ネブライザー）など、当技術分野において公知である任意のタイプのネブライザーを使用して、製剤を患者に投与することができる。空気圧（ジェット）式ネブライザーは、液体製剤の噴霧化の駆動力として、加圧ガス供給を使用する。圧縮ガスは、ノズルまたはジェットを介して送達され、周囲の液体製剤を飛沫同伴する低圧フィールドを作成し、それを剪断して、薄膜またはフィラメントにする。薄膜またはフィラメントは不安定であり、小滴に分解され、これらは、圧縮ガスの流れによって吸気に運ばれる。液滴プルームに挿入されたバッフルは、大きい液滴をふるいにかけ、バルク液体リザーバーに戻す。電気機械式ネブライザーは、電気的に生成された機械力を使用して、液体製剤を噴霧する。電気機械的駆動力は、例えば、液体製剤を超音波周波数で振動させることによって、またはバルク液体を薄膜の小さな穴に強制的に通すことによって加えることができる。この力により、薄い液膜またはフィラメントストリームが生成され、それらは小滴に分解され、吸気流に飛沫同伴され得るゆっくりと動くエアロゾルストリームが形成される。いくつかの実施形態では、ネブライザーは、振動型メッシュ式ネブライザーである。振動型メッシュ式ネブライザーの例としては、例えば、Ｐｈｉｌｌｉｐｓ ＩｎｎｏＳｐｉｒｅ、Ａｅｒｏｇｅｎ Ｓｏｌｏ、ＰＡＲＩ ｅＦｌｏｗなどが挙げられる。
液体製剤は、例えば、電気流体力学的（ＥＨＤ）エアロゾル装置を使用して、対象の肺に投与することができる。ＥＨＤエアロゾル装置は、電気エネルギーを使用して、液体の薬液または懸濁液をエアロゾル化する。
乾燥粉末製剤は、例えば、乾燥粉末吸入器（ＤＰＩ）を使用して、対象の肺に投与することができる。ＤＰＩは、典型的には、ガスのバーストなどの機序を使用して、容器内に乾燥粉末のクラウドを作成し、それが対象によって吸入され得る。ＤＰＩ中では、投与される用量は、非加圧乾燥粉末の形態で保存され、吸入器の作動時に、粉末の粒子が対象によって吸入される。場合によっては、ｐＭＤＩと同様に、圧縮ガスを使用して粉末を投与することができる。場合によっては、ＤＰＩは、呼吸により作動させ得る（吸気に正確に反応して、エアロゾルが生成される）。典型的には、乾燥粉末吸入器は、咳の誘発を回避するために、吸入ごとに数十ミリグラム未満の用量を投与する。ＤＰＩの例としては、例えば、Ｔｕｒｂｏｈａｌｅｒ（登録商標）吸入器（ＡｓｔｒａＺｅｎｅｃａ）、Ｃｌｉｃｋｈａｌｅｒ（登録商標）吸入器（Ｉｎｎｏｖａｔａ）、Ｄｉｓｋｕｓ（登録商標）吸入器（Ｇｌａｘｏ）、ＥａｓｙＨａｌｅｒ（登録商標）（Ｏｒｉｏｎ）、Ｅｘｕｂｅｒａ（登録商標）吸入器（Ｐｆｉｚｅｒ）などが挙げられる。
いくつかの実施形態では、組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤は、対象に１回投与される。いくつかの実施形態では、組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤は、対象に少なくとも２回（例えば、少なくとも２回、少なくとも３回、少なくとも４回、少なくとも５回、少なくとも１０回など）投与される。いくつかの実施形態では、少なくとも約１時間（例えば、少なくとも約１時間、少なくとも約６時間、少なくとも約１２時間、少なくとも約１８時間、少なくとも約１日、少なくとも約２日、少なくとも約３日、少なくとも約４日、少なくとも約５日、少なくとも約６日、少なくとも約７日、少なくとも約１５日、少なくとも約２０日、少なくとも約３０日、少なくとも約４０日、少なくとも約５０日、少なくとも約６０日、少なくとも約７０日、少なくとも約８０日、少なくとも約９０日、少なくとも約１００日、少なくとも約１２０日など）が、投与の間（例えば、第１の投与と第２の投与の間、第２の投与と第３の投与の間など）に経過する。いくつかの実施形態では、組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤は、対象に１日１回、２回、３回、４回または５回以上投与される。いくつかの実施形態では、組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤は、対象に１ヶ月に１回、２回、３回、４回または５回以上投与される
ＶＩＩ．宿主細胞
本開示の特定の態様は、本明細書に記載の組換え核酸のいずれかを含む１つ以上の宿主細胞に関する。当該技術分野において既知の任意の好適な宿主細胞（原核細胞または真核細胞）を使用することができ、それらとしては、例えば、グラム陰性微生物またはグラム陽性微生物などの真正細菌、例えば、エシェリキア（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）（例えば、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ））、エンテロバクター（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ）、エルミニア（Ｅｒｍｉｎｉａ）、クレブシエラ（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ）、プロテウス（Ｐｒｏｔｅｕｓ）、サルモネラ（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ）（例えば、Ｓ．チフィリウム（Ｓ．ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ））、セラチア（Ｓｅｒｒａｔｉａ）（例えば、Ｓ．マルセセンス（Ｓ．ｍａｒｃｅｓｃａｎｓ））及びシゲラ（Ｓｈｉｇｅｌｌａ）などの腸内細菌科、ならびにＢ．サブティリス（Ｂ．ｓｕｂｔｉｌｉｓ）及びＢ．リケニフォルミス（Ｂ．ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ）などの桿菌を含む原核細胞；真菌細胞（例えば、Ｓ．セレビシエ（Ｓ．ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ））；昆虫細胞（例えば、Ｓ２細胞など）；ならびに、ＳＶ４０によって形質転換されたサル腎臓ＣＶ１株（ＣＯＳ－７、ＡＴＣＣ ＣＲＬ １６５１）、ヒト胚性腎臓株（２９３細胞または懸濁培養における増殖のためにサブクローニングされた２９３細胞）、ベビーハムスター腎臓細胞（ＢＨＫ、ＡＴＣＣ ＣＣＬ １０）、マウスセルトリ細胞（ＴＭ４）、サル腎臓細胞（ＣＶ１ ＡＴＣＣ ＣＣＬ ７０）、アフリカミドリザル腎臓細胞（ＶＥＲＯ－７６、ＡＴＣＣ ＣＲＬ－１５８７）、ヒト子宮頸癌細胞（ＨＥＬＡ、ＡＴＣＣ ＣＣＬ ２）、イヌ腎臓細胞（ＭＤＣＫ、ＡＴＣＣ ＣＣＬ ３４）、バッファローラット肝細胞（ＢＲＬ ３Ａ、ＡＴＣＣ ＣＲＬ １４４２）、ヒト肺細胞（Ｗ１３８、ＡＴＣＣ ＣＣＬ ７５）、ヒト肝細胞（Ｈｅｐ Ｇ２、ＨＢ ８０６５）、マウス乳癌（ＭＭＴ ０６０５６２、ＡＴＣＣ ＣＣＬ５１）、ＴＲＩ細胞、ＭＲＣ ５細胞、ＦＳ４細胞、ヒト肝癌株（Ｈｅｐ Ｇ２）、ＤＨＦＲ” ＣＨＯ細胞を含むチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞、ならびにＮＳ０及びＳｐ２／０などの骨髄腫細胞株を含む哺乳動物細胞が含まれる。いくつかの実施形態では、宿主細胞は、ヒト細胞または非ヒト霊長類細胞である。いくつかの実施形態では、宿主細胞は、細胞株由来の細胞である。好適な宿主細胞または細胞株の例には、２９３細胞、ＨｅＬａ細胞、ＳＨ－Ｓｙ５ｙ細胞、Ｈｅｐ Ｇ２細胞、ＣＡＣＯ－２細胞、Ａ５４９細胞、Ｌ９２９細胞、３Ｔ３細胞、Ｋ５６２細胞、ＣＨＯ－Ｋ１細胞、ＭＤＣＫ細胞、ＨＵＶＥＣ細胞、Ｖｅｒｏ細胞、Ｎ２０細胞、ＣＯＳ－７細胞、ＰＳＮ１細胞、ＶＣａＰ細胞、ＣＨＯ細胞などが含まれ得るが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、組換え核酸は、単純ヘルペスウイルスベクターである。いくつかの実施形態では、組換え核酸は、単純ヘルペスウイルスアンプリコンである。いくつかの実施形態では、組換え核酸は、ＨＳＶ－１アンプリコンまたはＨＳＶ－１ハイブリッドアンプリコンである。いくつかの実施形態では、ヘルパーウイルスを含む宿主細胞を本明細書に記載のＨＳＶ－１アンプリコンまたはＨＳＶ－１ハイブリッドアンプリコンと接触させることにより、本明細書に記載の１つ以上の組換え核酸を含むウイルスが産生される。いくつかの実施形態では、ウイルスを、接触させた宿主細胞の上清から回収する。ヘルパーウイルスを含む宿主細胞をＨＳＶ－１アンプリコンまたはＨＳＶ－１ハイブリッドアンプリコンと接触させることによってウイルスを産生する方法は、当該技術分野において既知である。
いくつかの実施形態では、宿主細胞は、補完宿主細胞である。いくつかの実施形態では、補完宿主細胞は、本明細書に記載のウイルスベクターのいずれかにおいて不活性化される１つ以上の遺伝子を発現する。いくつかの実施形態では、補完宿主細胞を、本明細書に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム（例えば、組換え単純ヘルペスウイルスゲノム）と接触させる。いくつかの実施形態では、補完宿主細胞を組換えヘルペスウイルスゲノムと接触させることにより、本明細書に記載の１つ以上の組換え核酸を含むヘルペスウイルスが産生される。いくつかの実施形態では、ウイルスを、接触させた宿主細胞の上清から回収する。補完宿主細胞を組換え単純ヘルペスウイルスと接触させることによってウイルスを産生する方法は、概して、ＷＯ２０１５／００９９５２、ＷＯ２０１７／１７６３３６、ＷＯ２０１９／２００１６３、及び／またはＷＯ２０１９／２１０２１９に記載されている。
ＶＩＩＩ．製品またはキット
本開示の特定の態様は、本明細書に記載の組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤のいずれかを含む製品またはキットに関する。いくつかの実施形態では、製品またはキットは、組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物、または製剤を投与するための指示書を含む添付文書を含む。
組換え核酸、ウイルス、医用薬剤、及び／または医薬組成物もしくは製剤のための好適な容器には、例えば、ボトル、バイアル、バッグ、チューブ及びシリンジが含まれ得る。容器は、様々な材料、例えば、ガラス、プラスチック（ポリ塩化ビニルもしくはポリオレフィンなど）、または合金（ステンレス鋼もしくはハステロイなど）から形成され得る。いくつかの実施形態では、容器は、容器上のまたは容器に付属のラベルを含み、ラベルは使用のための指示を示している。製品またはキットは、その他の緩衝液、希釈剤、フィルター、吸入器、ネブライザー、鼻腔内投与装置、添付文書などを含む、商業的及び使用者の観点から望ましいその他の材料をさらに含み得る。
本明細書は、当業者が本開示を実施することを可能にするのに十分なものであるとみなされる。本明細書に示され、説明される改変に加えて、本開示の様々な改変が前述の説明から当業者に明らかとなり、添付の特許請求の範囲内に入るであろう。
本開示は、以下の実施例を参照することにより、より完全に理解されるであろう。しかしながら、それらは、本開示の範囲を限定するものとして解釈されるべきではない。本明細書に記載される実施例及び実施形態は例示のみを目的とするものであり、それを考慮した様々な修正または変更が当業者に示唆され、それらは本出願の趣旨及び範囲内に、ならびに添付の特許請求の範囲内に含まれることが理解される。
実施例１：吸入治療用ポリペプチドをコードする改変単純ヘルペスウイルスベクター
標的哺乳動物細胞（呼吸器の細胞など）中で吸入治療用ポリペプチドを発現することができる改変単純ヘルペスウイルスゲノムベクターを作製するために、まず、単純ヘルペスウイルスゲノム（図１Ａ）を、１つ以上の単純ヘルペスウイルス遺伝子を不活性化するように改変させる。このような改変は、哺乳動物細胞におけるゲノムの毒性を低減させ得る。次に、これらの改変／弱毒化組換えウイルスコンストラクトのバリアントを、それらが所望の吸入治療用ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを保有するように生成する。これらのバリアントには以下が含まれる：１）各ＩＣＰ４遺伝子座に組み込まれた異種プロモーターの制御下にある吸入治療用ポリペプチド（例えば、配列番号３）のコード配列を含む発現カセットを含む組換えΔＩＣＰ４改変ＨＳＶ－１ゲノム（図１Ｂ）；２）各ＩＣＰ４遺伝子座に組み込まれた異種プロモーターの制御下にある吸入治療用ポリペプチド（例えば、配列番号３）のコード配列を含む発現カセットを含む組換えΔＩＣＰ４／ΔＵＬ４１改変ＨＳＶ－１ゲノム（図１Ｃ）；３）各ＵＬ４１遺伝子座に組み込まれた異種プロモーターの制御下にある吸入治療用ポリペプチド（例えば、配列番号３）のコード配列を含む発現カセットを含む組換えΔＩＣＰ４／ΔＵＬ４１改変ＨＳＶ－１ゲノム（図１Ｄ）；４）各ＩＣＰ４遺伝子座に組み込まれた異種プロモーターの制御下にある吸入治療用ポリペプチド（例えば、配列番号３）のコード配列を含む発現カセットを含む組換えΔＩＣＰ４／ΔＩＣＰ２２改変ＨＳＶ－１ゲノム（図１Ｅ）；５）各ＩＣＰ２２遺伝子座に組み込まれた異種プロモーターの制御下にある吸入治療用ポリペプチド（例えば、配列番号３）のコード配列を含む発現カセットを含む組換えΔＩＣＰ４／ΔＩＣＰ２２改変ＨＳＶ－１ゲノム（図１Ｆ）；６）各ＩＣＰ４遺伝子座に組み込まれた異種プロモーターの制御下にある吸入治療用ポリペプチド（例えば、配列番号３）のコード配列を含む発現カセットを含む組換えΔＩＣＰ４／ΔＵＬ４１／ΔＩＣＰ２２改変ＨＳＶ－１ゲノム（図１Ｇ）；７）各ＵＬ４１遺伝子座に組み込まれた異種プロモーターの制御下にある吸入治療用ポリペプチド（例えば、配列番号３）のコード配列を含む発現カセットを含む組換えΔＩＣＰ４／ΔＵＬ４１／ΔＩＣＰ２２改変ＨＳＶ－１ゲノム（図１Ｈ）；及び８）各ＩＣＰ２２遺伝子座に組み込まれた異種プロモーターの制御下にある吸入治療用ポリペプチド（例えば、配列番号３）のコード配列を含む発現カセットを含む組換えΔＩＣＰ４／ΔＵＬ４１／ΔＩＣＰ２２改変ＨＳＶ－１ゲノム（図１Ｉ）。
これらの改変単純ヘルペスウイルスゲノムベクターを、１つ以上の単純ヘルペスウイルス遺伝子を発現するように改変された、操作された細胞にトランスフェクトする。これらの操作された細胞は、細胞培養物の上清に、改変されたゲノムがその中にパッケージングされた複製欠損単純ヘルペスウイルスを分泌する。次に、上清を回収して濃縮し、５μｍのフィルターに通して滅菌濾過する。
実施例２：野生型及び変異型動物の気道への改変単純ヘルペスウイルスベクターのｉｎ ｖｉｖｏ投与
８匹のＣ５７ＢＬ／６マウス（「野生型」）及び４匹の腸を矯正したＣＦＴＲ欠損Ｃｆｔｒｔｍ１ＵｎｃＴｇ（ＦＡＢＰＣＦＴＲ）１ Ｊａｗ／Ｊマウス（「ＣＦＴＲ－／－」）でｉｎ ｖｉｖｏ実験を行い、改変単純ヘルペスウイルスベクター（「ＨＳＶ－ＣＦＴＲ」、ヒトＣＦＴＲをコードする操作されたＨＳＶ－１）が、非侵襲的な吸入投与に修正可能であり、かつ投与された動物の気道全体に組織を形質導入することができるか否かを判断した。４匹の野生型マウス及び４匹のＣＦＴＲ－／－マウスに、臨床的に承認されたネブライザーを使用して、ＨＳＶ－ＣＦＴＲを並行して投与した。この同じ吸入装置を使用して、４匹の野生型マウスにビヒクル対照を別々に投与した。実験を通して実施されたケージ側及び臨床観察では、ＨＳＶ－ＣＦＴＲとビヒクル処置動物との間に差がないことが確認された。群間で体重差は見られなかった。噴霧の４８時間後、動物を安楽死させ、次の組織サンプルを各動物の気道全体で別々に採取した：気管（上及び下）、気管支（左及び右）、右肺（前葉、中葉、後葉、及び副葉）、ならびに左肺。ｑＰＣＲ／ｑＲＴ－ＰＣＲ分析用の組織（２匹／群）を液体窒素で急速冷凍した。組織学用の組織（２匹／群）を１０％中性緩衝ホルマリンで固定し、パラフィン包埋した。剖検中、任意の処置された動物の肉眼的観察は認められなかった。
ＨＳＶ－ＣＦＴＲに曝露された動物の気道から採取された生検材料から、ｑＰＣＲ分析によって検出可能なレベルのヒトＣＦＴＲ ＤＮＡを明らかにし、ベクターの大部分は、右肺及び左肺に比較的均等に播種させた（図２Ａ）。驚いたことに、ＣＦＴＲ欠損動物は、テストしたすべての肺組織で形質導入効率の改善を示し、それぞれ右副葉、右後葉、右前葉、右中葉、及び左肺葉で検出されたベクターゲノムが、野生型対応物と比較して、３１．９倍、７．１倍、３．２倍、６．４倍、及び３．４倍増加した。外れ値として右副葉肺を無視した場合であっても、ＨＳＶ－ＣＦＴＲ形質導入の５．１倍の増加が、ＣＦＴＲ－／－マウス及び野生型マウスで検出された。ヒトＣＦＴＲ ＲＮＡが、投与された動物の肺中で検出され、テストされたほとんどの組織中で、ＣＦＴＲ欠損動物対野生型動物において、より高い導入遺伝子発現が検出されたため、この転写レベルでも、同様の傾向が観察された（図２Ｂ）。ビヒクル処置動物では、ヒトＣＦＴＲ ＤＮＡまたはＲＮＡがほとんどまたはまったく観察されなかったことから、ヒト導入遺伝子がコードされたＨＳＶ－ＣＦＴＲのアッセイの特異性が示唆された。
各処置群から気道全体で採取された組織の組織学的検査を実施して、操作されたベクターによる感染が、急性炎症、壊死、またはｉｎ ｖｉｖｏでのＨＳＶ－ＣＦＴＲ吸入療法の潜在的な安全性の懸念を示し得る他の肉眼的生理学的変化を引き起こしたか否かを判断した。ビヒクル処置マウスと比較して、野生型またはＣＦＴＲ欠損免疫担当動物からのＨＳＶ－ＣＦＴＲ投与組織のいずれにおいても、免疫細胞浸潤、線維症、または壊死の明らかな徴候は検出されなかった（図３）感染の４８時間後にこれらの動物から採取した気管支肺胞洗浄（ＢＡＬ）液は、群間で肺への細胞浸潤に有意差が認められなかったことを示し、さらに、噴霧後の野生型動物及びＣＦＴＲ欠損動物の両方において、このベクターが安全であることを示している（図４）。
まとめると、このデータは、この改変単純ヘルペスウイルスベクターが、臨床的に承認されたネブライザーを使用した非侵襲的吸入投与に適していること、及びベクターが、ＣＦＴＲ欠損肺上皮の状況で効果的に送達され得ることを示し、これにより、強力な形質導入及び標的気道組織において、コードされたヒトＣＦＴＲ導入遺伝子がその後に発現することが明らかになる。
実施例３：非ヒト霊長類における反復投与改変単純ヘルペスウイルスベクターのｉｎ ｖｉｖｏ忍容性及び生体内分布
本試験の目的の一部は、噴霧後の非ヒト霊長類（ＮＨＰ）における改変単純ヘルペスウイルスベクターの送達を評価することであった。本試験は、一部は、改変単純ヘルペスウイルスベクターの反復送達が、将来の吸入試験のために実行可能であることを確実にするために実施した。単一の雄のカニクイザルは、合計３回の曝露（ビヒクル（１日目）、低用量ＨＳＶ－ＣＦＴＲ（５日目）、及び高用量ＨＳＶ－ＣＦＴＲ（１７日目））を受け、その後安楽死させ、組織収集を行った（図５）。収集された組織には、脳、脾臓、腎臓、肝臓、肺（３つの固有の場所）、心臓、ならびにリンパ節（腋窩及び鼠径部）を含めた。血液は、また、吸入適用後の薬物生成物への全身曝露を判断するために、投与前及び投与後に採取した。実施された手順はすべて、該当する動物福祉法に準拠しており、各国のＩｎｓｔｉｔｕｔｉｏｎａｌ Ａｎｉｍａｌ Ｃａｒｅ ａｎｄ Ｕｓｅ Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ（ＩＡＣＵＣ）によって承認された。
本試験を通して、動物について異常なケージ側または臨床的観察は認められなかった。さらに、投薬期間中に食物消費または体重の変化は見られず、これは、改変単純ヘルペスウイルスベクターの反復投薬が十分に許容されたことを示している。
噴霧された高用量ＨＳＶ－ＣＦＴＲの投与から４８時間後の１９日目に、それぞれ、ｑＰＣＲ及びｑＲＴ－ＰＣＲを介して生体内分布及びエフェクター発現を分析するために、血液及び組織サンプルを収集した。試験した３つの肺組織すべてで有意なベクターの蓄積が観察されたが、残りの組織中ではベクターがほとんどまたはまったく検出されなかった（図６Ａ）。すべての血液サンプルは、ｑＰＣＲアッセイの検出限界を下回っていた。これは、ベクターが循環器系への有意な拡散はなく、気道に限定されていることを示唆している。ヒトＣＦＴＲ ＲＮＡは、主に動物の肺で検出され、他の試験組織では、エフェクターの発現は、あるにしても、ほとんどなかった（図６Ｂ）。興味深いことに、肺中での導入遺伝子の発現レベルは、試験組織中でのベクターゲノムよりも１～２桁高く（組織のコピー／グラムベースで）、噴霧後の気道上皮の感染時に、改変単純ヘルペスウイルスベクターが、コードされたヒト導入遺伝子を確固として発現することを示唆している。
まとめると、理論によって拘束されることを望むものではないが、本明細書で提供される前臨床データは、改変単純ヘルペスウイルスベクターが、関連する気道上皮を感染させることが可能であり、コードされたヒト導入遺伝子を効率的に産生し、有意な毒性または全身性のベクター分布のない、臨床的に関連のあるネブライザーを使用する非侵襲的吸入投与を介して、ｉｎ ｖｉｖｏで動物に（再）投与させ得ることを示している。したがって、理論によって拘束されることを望むものではないが、これらのｉｎ ｖｉｖｏ試験及び安全性評価の結果により、遺伝性肺疾患の治療のための新規の標的化された広く適用可能な遺伝子治療ベクターとしての吸入用の操作単純ヘルペスウイルスの適用が裏付けられる。
実施例４：ヒトアルファ－１－アンチトリプシンをコードする改変単純ヘルペスウイルスベクターの構築
次の実施例では、ヒトＳＥＲＰＩＮＡ１を正常にコードし（例えば、配列番号１及び２を参照）、完全長のヒトアルファ－１－アンチトリプシン（Ａ１ＡＴ）タンパク質を発現した（例えば、配列番号３を参照）組換えＨＳＶ－１の操作について記載している。
組換えＨＳＶ－１は、異種プロモーター及びポリＡ配列を含むヒトＳＥＲＰＩＮＡ１発現カセットを組み込むように操作された（例えば、実施例１を参照）。ヒトＳＥＲＰＩＮＡ１カセットを含むことが推定される１８のウイルスプラークを採取し、補完細胞株における感染によってスクリーニングし、ウエスタンブロット分析によって、ヒトＡ１ＡＴタンパク質の発現の試験を行った（データは示さず）。その後、さらなるｉｎ ｖｉｔｒｏ分析のために、ＨＳＶ－Ａ１ＡＴと呼ばれる高発現クローンのうちの１つを選択した。
非補完Ｕ２－ＯＳ及びＶｅｒｏ細胞は、ビヒクル対照にモック感染させたか、無血清細胞培養培地において、感染多重度（ＭＯＩ）１または２でＨＳＶ－Ａ１ＡＴに感染させた。感染の４８時間後、細胞ペレットを採取し、プロテアーゼ阻害剤を含むＲＩＰＡバッファー中で溶解し、タンパク質含有量をＢＣＡアッセイで定量した。３０μｇの各サンプルをロードして４～１５％アクリルアミドゲルで泳動させ、ヒトタンパク質がコードされたＨＳＶの発現をウエスタンブロット分析で評価した（図７）。陽性対照として、組換えヒトＡ１ＡＴ（ｒＡ１ＡＴ）をゲルにロードした。非感染対照のＶｅｒｏ細胞及びＵ２－ＯＳ細胞ではヒトＡ１ＡＴは検出されなかったが、両方の細胞株中でＨＳＶ－Ａ１ＡＴに感染後、ヒトＡ１ＡＴの確固とした発現が用量依存的に観察された。Ａ１ＡＴは、自然に分泌されるタンパク質であるため、細胞培養上清も採取し、ヒトタンパク質の存在について試験した（図８）。細胞ペレットのデータと一致して、モック感染した対照は、Ａ１ＡＴの分泌を十分に示さなかった。しかし、試験した両方のＭＯＩでＨＳＶ－Ａ１ＡＴに感染したＶｅｒｏ細胞及びＵ２－ＯＳ細胞の上清中でヒトＡ１ＡＴが検出され、これは、組換えベクターからの発現後に完全長のヒトタンパク質が適切に処理／分泌されたことを示唆している。
まとめると、この実施例で提示されたデータは、組換えＨＳＶ－１ベクターＨＳＶ－Ａ１ＡＴが、複数の細胞型を効率的に形質導入し、そこにコードされているヒト導入遺伝子を発現できたことを示している。さらに、データは、外因性のヒトタンパク質がその後（適切に）感染細胞から分泌されたことを示している。理論に拘束されることを望むものではないが、このデータは、遺伝性肺疾患の治療のための新規の、標的化された、広く適用可能な遺伝子治療ベクターとしての操作された単純ヘルペスウイルスの使用をさらに裏付けるものと考えられる。

Claims (113)

  1. 吸入治療用ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む、組換えヘルペスウイルスゲノム。
  2. 複製能力を有する、請求項１に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  3. 複製欠損である、請求項１に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  4. 組換え単純ヘルペスウイルスゲノム、組換え水痘帯状疱疹ウイルスゲノム、組換えヒトサイトメガロウイルスゲノム、組換えヘルペスウイルス６Ａゲノム、組換えヘルペスウイルス６Ｂゲノム、組換えヘルペスウイルス７ゲノム、組換えＥｐｓｔｅｉｎ－Ｂａｒｒウイルスゲノム、組換えカポジ肉腫関連ヘルペスウイルスゲノム及びそれらの任意の派生体からなる群から選択される、請求項１～３のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  5. 組換え単純ヘルペスウイルスゲノムである、請求項１～４のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  6. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、組換え単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ－１）ゲノム、組換え単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ－２）ゲノムまたはそれらの任意の派生体である、請求項５に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  7. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、組換え単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ－１）ゲノムである、請求項５または請求項６に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  8. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、１つ以上の毒性単純ヘルペスウイルス遺伝子の発現が減少するまたは排除されるように操作されている、請求項４～７のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  9. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、不活性化突然変異を含む、請求項４～８のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  10. 前記不活性化突然変異が、単純ヘルペスウイルス遺伝子に存在する、請求項９に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  11. 前記不活性化突然変異が、前記単純ヘルペスウイルス遺伝子のコード配列の欠失である、請求項１０に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  12. 前記単純ヘルペスウイルス遺伝子が、感染細胞タンパク質（ＩＣＰ）０、ＩＣＰ４、ＩＣＰ２２、ＩＣＰ２７、ＩＣＰ４７、チミジンキナーゼ（ｔｋ）、ロングユニーク領域（ＵＬ）４１及びＵＬ５５からなる群から選択される、請求項１０または請求項１１に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  13. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＩＣＰ４遺伝子の一方または両方のコピーに不活性化突然変異を含む、請求項１２に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  14. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＩＣＰ２２遺伝子に不活性化突然変異を含む、請求項１２または請求項１３に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  15. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＵＬ４１遺伝子に不活性化突然変異を含む、請求項１２～１４のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  16. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＩＣＰ０遺伝子の一方または両方のコピーに不活性化突然変異を含む、請求項１２～１５のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  17. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＩＣＰ２７遺伝子に不活性化突然変異を含む、請求項１２～１６のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  18. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＩＣＰ４７遺伝子に不活性化突然変異を含む、請求項１２～１７のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  19. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＵＬ５５遺伝子に不活性化突然変異を含む、請求項１２～１８のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  20. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、一方または両方の前記ＩＣＰ４ウイルス遺伝子座内に前記吸入治療用ポリペプチドをコードする前記１つ以上のポリヌクレオチドを含む、請求項４～１９のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  21. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＩＣＰ２２ウイルス遺伝子座内に前記吸入治療用ポリペプチドをコードする前記１つ以上のポリヌクレオチドを含む、請求項４～２０のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  22. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＵＬ４１ウイルス遺伝子座内に前記吸入治療用ポリペプチドをコードする前記１つ以上のポリヌクレオチドを含む、請求項４～２１のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  23. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、一方または両方の前記ＩＣＰ０ウイルス遺伝子座内に前記吸入治療用ポリペプチドをコードする前記１つ以上のポリヌクレオチドを含む、請求項４～２２のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  24. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＩＣＰ２７ウイルス遺伝子座内に前記吸入治療用ポリペプチドをコードする前記１つ以上のポリヌクレオチドを含む、請求項４～２３のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  25. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＩＣＰ４７ウイルス遺伝子座内に前記吸入治療用ポリペプチドをコードする前記１つ以上のポリヌクレオチドを含む、請求項４～２４のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  26. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＵＬ５５ウイルス遺伝子座内に前記吸入治療用ポリペプチドをコードする前記１つ以上のポリヌクレオチドを含む、請求項４～２５のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  27. 前記吸入治療用ポリペプチドが、アルファ－１－アンチトリプシンポリペプチド、ナトリウム依存性リン酸輸送タンパク質２Ｂポリペプチド、ダイニン重鎖５軸糸ポリペプチド、ダイニン重鎖１１軸糸ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質３９ポリペプチド、ダイニン中間鎖１軸糸ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質４０ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１０３ポリペプチド、精子関連抗原１ポリペプチド、ジンクフィンガーＭＹＮＤドメイン含有タンパク質１０ポリペプチド、アルマジロリピート含有タンパク質４ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１５１ポリペプチド、ダイニン中間鎖２軸糸ポリペプチド、ラジアルスポークヘッド１ホモログポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１１４ポリペプチド、ラジアルスポークヘッドタンパク質４ホモログＡポリペプチド、ダイニンアセンブリ因子１軸糸ポリペプチド、ダイニンアセンブリ因子２軸糸ポリペプチド、ロイシンリッチリピート含有タンパク質６ポリペプチド、肺サーファクタント関連タンパク質Ｂポリペプチド、肺サーファクタント関連タンパク質Ｃポリペプチド、ホメオボックスタンパク質Ｎｋｘ－２．１ポリペプチド、ＡＴＰ結合カセットサブファミリーＡメンバー３ポリペプチド、サイトカイン受容体共通サブユニットベータポリペプチド、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体サブユニットアルファポリペプチド、骨形成タンパク質受容体２型ポリペプチド、筋小胞体／小胞体カルシウムＡＴＰアーゼ２ポリペプチド、セリン／スレオニンプロテインキナーゼ受容体Ｒ３ポリペプチド、エンドグリンポリペプチド、マザーズアゲインストデカペンタプレジックホモログ９ポリペプチド、カベオリン－１ポリペプチド、カリウムチャネルサブファミリーＫメンバー３ポリペプチド、ｅＩＦ－２－アルファキナーゼＧＣＮ２ポリペプチド、肺サーファクタント関連タンパク質Ａ２ポリペプチド、テロメラーゼ逆転写酵素ポリペプチド、ジスケリンポリペプチド、テロメア伸長ヘリカーゼ１ポリペプチドの調節因子、ポリ（Ａ）特異的リボヌクレアーゼＰＡＲＮポリペプチド、ＴＥＲＦ１相互作用核因子２ポリペプチド、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質複合体非コアサブユニットＮＡＦ１ポリペプチド、ムチン－５Ｂポリペプチド、デスモプラキンポリペプチド、ＣＳＴ複合体サブユニットＳＴＮ１ポリペプチド、及びジペプチジルペプチダーゼ９ポリペプチドからなる群から選択される、請求項１～２６のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  28. 前記吸入治療用ポリペプチドが、ヒトポリペプチドである、請求項１～２７のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  29. 前記吸入治療用ポリペプチドが、配列番号３～４６からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％の配列同一性を有する配列を含む、請求項１～２８のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  30. 前記吸入治療用ポリペプチドが、アルファ－１－アンチトリプシンポリペプチドである、請求項１～２９のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  31. 前記吸入治療用ポリペプチドが、ヒトアルファ－１－アンチトリプシンポリペプチドである、請求項１～３０のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  32. 前記吸入治療用ポリペプチドが、配列番号３のアミノ酸配列に対して、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％の配列同一性を有する配列を含む、請求項１～３１のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  33. 対応する野生型ヘルペスウイルスゲノムと比較して、標的細胞に導入されたときに細胞毒性が低減している、請求項１～３２のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  34. 前記標的細胞が、ヒト細胞である、請求項３３に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  35. 前記標的細胞が、呼吸器の細胞である、請求項３３または請求項３４に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  36. 前記標的細胞が、気道上皮細胞である、請求項３３～３５のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノム。
  37. 請求項１～３６のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノムを含む、ヘルペスウイルス。
  38. 複製能力を有する、請求項３７に記載のヘルペスウイルス。
  39. 複製欠損である、請求項３７に記載のヘルペスウイルス。
  40. 対応する野生型ヘルペスウイルスと比較して細胞毒性が低減している、請求項３７～３９のいずれか１項に記載のヘルペスウイルス。
  41. 単純ヘルペスウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、ヒトサイトメガロウイルス、ヘルペスウイルス６Ａ、ヘルペスウイルス６Ｂ、ヘルペスウイルス７、Ｅｐｓｔｅｉｎ－Ｂａｒｒウイルス、及びカポジ肉腫関連ヘルペスウイルスからなる群から選択される、請求項３７～４０のいずれか１項に記載のヘルペスウイルス。
  42. 単純ヘルペスウイルスである、請求項３７～４１のいずれか１項に記載のヘルペスウイルス。
  43. 前記単純ヘルペスウイルスが、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ－１）、単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ－２）またはそれらの任意の派生体である、請求項４１または請求項４２に記載のヘルペスウイルス。
  44. 前記単純ヘルペスウイルスが、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ－１）である、請求項４１～４３のいずれか１項に記載のヘルペスウイルス。
  45. 請求項１～３６のいずれか１項に記載の組換えヘルペスウイルスゲノムまたは請求項３７～４４のいずれか１項に記載のヘルペスウイルスと、薬学的に許容され得る賦形剤と
    を含む、医薬組成物。
  46. 局所（ｔｏｐｉｃａｌ）投与、経皮投与、皮下投与、皮内投与、経口投与、鼻腔内投与、気管内投与、舌下投与、頬側投与、直腸投与、膣内投与、吸入投与、静脈内投与、動脈内投与、筋肉内投与、心臓内投与、骨内投与、腹腔内投与、経粘膜投与、硝子体内投与、網膜下投与、関節内投与、関節周囲投与、局所（ｌｏｃａｌ）投与、または皮膚上投与に適している、請求項４５に記載の医薬組成物。
  47. 経口投与、鼻腔内投与、気管内投与、または吸入投与に適している、請求項４５または請求項４６に記載の医薬組成物。
  48. 鼻腔内投与または吸入投与に適している、請求項４５～４７のいずれか１項に記載の医薬組成物。
  49. 吸入投与に適している、請求項４５～４８のいずれか１項に記載の医薬組成物。
  50. 乾燥粉末吸入器、加圧定量吸入器、ソフトミスト吸入器、ネブライザー、電気流体力学的エアロゾル装置、またはそれらの任意の組み合わせでの使用に適している、請求項４５～４９のいずれか１項に記載の医薬組成物。
  51. ネブライザーで使用するのに好適である、請求項４５～５０のいずれか１項に記載の医薬組成物。
  52. 前記ネブライザーが、振動型メッシュ式ネブライザーである、請求項５１に記載の医薬組成物。
  53. リン酸緩衝液を含む、請求項４５～５２のいずれか１項に記載の医薬組成物。
  54. グリセロールを含む、請求項４５～５３のいずれか１項に記載の医薬組成物。
  55. 脂質担体を含む、請求項４５～５４のいずれか１項に記載の医薬組成物。
  56. ナノ粒子担体を含む、請求項４５～５５のいずれか１項に記載の医薬組成物。
  57. 医用薬剤として使用するための、請求項３７～４４のいずれか１項に記載のヘルペスウイルスまたは請求項４５～５６のいずれか１項に記載の医薬組成物。
  58. 治療法において使用するための、請求項３７～４４のいずれか１項に記載のヘルペスウイルスまたは請求項４５～５６のいずれか１項に記載の医薬組成物。
  59. １つ以上の遺伝性肺疾患を治療するための医用薬剤の製造における、請求項３７～４４のいずれか１項に記載のヘルペスウイルスまたは請求項４５～５６のいずれか１項に記載の医薬組成物の使用。
  60. 対象の１つ以上の、呼吸器の細胞、気道上皮細胞、及び／または肺細胞における吸入治療用ポリペプチドのレベルを発現、増強、増加、増大、及び／または補足する方法であって、
    有効量の請求項３７～４４のいずれか１項に記載のヘルペスウイルスまたは請求項４５～５６のいずれか１項に記載の医薬組成物を、前記対象に投与することを含む、前記方法。
  61. 進行性肺破壊の低減または阻害を必要とする対象において、それを行う方法であって、
    有効量の請求項３７～４４のいずれか１項に記載のヘルペスウイルスまたは請求項４５～５６のいずれか１項に記載の医薬組成物を、前記対象に投与することを含む、前記方法。
  62. 前記対象が、慢性肺疾患に罹患している、請求項６０または請求項６１に記載の方法。
  63. 気道及び／または肺に影響を与える疾患の１つ以上の徴候または症状の予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法であって、
    有効量の請求項３７～４４のいずれか１項に記載のヘルペスウイルスまたは請求項４５～５６のいずれか１項に記載の医薬組成物を、前記対象に投与することを含む、前記方法。
  64. アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症の１つ以上の徴候または症状の予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法であって、
    有効量の請求項３７～４４のいずれか１項に記載のヘルペスウイルスまたは請求項４５～５６のいずれか１項に記載の医薬組成物を、前記対象に投与することを含む、前記方法。
  65. 前記対象のゲノムが、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子における病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む、請求項６４に記載の方法。
  66. 前記組換えヘルペスウイルスゲノムが、アルファ－１－アンチトリプシンポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む、請求項６４または請求項６５に記載の方法。
  67. 肺胞微石症の１つ以上の徴候または症状の予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法であって、
    有効量の請求項３７～４４のいずれか１項に記載のヘルペスウイルスまたは請求項４５～５６のいずれか１項に記載の医薬組成物を、前記対象に投与することを含む、前記方法。
  68. 前記対象のゲノムが、ＳＬＣ３４Ａ２遺伝子における病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む、請求項６７に記載の方法。
  69. 前記組換えヘルペスウイルスゲノムが、ナトリウム依存性リン酸輸送タンパク質２Ｂポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む、請求項６７または請求項６８に記載の方法。
  70. 原発性線毛機能不全の１つ以上の徴候または症状の予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法であって、
    有効量の請求項３７～４４のいずれか１項に記載のヘルペスウイルスまたは請求項４５～５６のいずれか１項に記載の医薬組成物を、前記対象に投与することを含む、前記方法。
  71. 前記対象のゲノムが、ＤＮＡＨ５、ＤＮＡＨ１１、ＣＣＤＣ３９，ＤＮＡＩ１、ＣＣＤＣ４０、ＣＣＤＣ１０３、ＳＰＡＧ１、ＺＭＹＮＤ１０、ＡＲＭＣ４、ＣＣＤＣ１５１、ＤＮＡＩ２、ＲＳＰＨ１、ＣＣＤＣ１１４、ＲＳＰＨ４Ａ、ＤＮＡＡＦ１、ＤＮＡＡＦ２、及びＬＲＲＣ６からなる群から選択される１つ以上の遺伝子における病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む、請求項７０に記載の方法。
  72. 前記組換えヘルペスウイルスゲノムが、ダイニン重鎖５軸糸ポリペプチド、ダイニン重鎖１１軸糸ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質３９ポリペプチド、ダイニン中間鎖１軸糸ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質４０ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１０３ポリペプチド、精子関連抗原１ポリペプチド、ジンクフィンガーＭＹＮＤドメイン含有タンパク質１０ポリペプチド、アルマジロリピート含有タンパク質４ポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１５１ポリペプチド、ダイニン中間鎖２軸糸ポリペプチド、ラジアルスポークヘッド１ホモログポリペプチド、コイルドコイルドメイン含有タンパク質１１４ポリペプチド、ラジアルスポークヘッドタンパク質４ホモログＡポリペプチド、ダイニンアセンブリ因子１軸糸ポリペプチド、ダイニンアセンブリ因子２軸糸ポリペプチド、及びロイシンリッチリピート含有タンパク質６ポリペプチドからなる群から選択されるポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む、請求項７０または請求項７１に記載の方法。
  73. 先天性肺胞タンパク症の１つ以上の徴候または症状の予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法であって、
    有効量の請求項３７～４４のいずれか１項に記載のヘルペスウイルスまたは請求項４５～５６のいずれか１項に記載の医薬組成物を、前記対象に投与することを含む、前記方法。
  74. 前記対象のゲノムが、ＳＦＴＰＢ、ＳＦＴＰＣ、ＮＫＸ２－１、ＡＢＣＡ３、ＣＳＦ２ＲＢ、及びＣＳＦ２ＲＡからなる群から選択される、１つ以上の遺伝子における病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む、請求項７３に記載の方法。
  75. 前記組換えヘルペスウイルスゲノムが、肺サーファクタント関連タンパク質Ｂポリペプチド、肺サーファクタント関連タンパク質Ｃポリペプチド、ホメオボックスタンパク質Ｎｋｘ－２．１ポリペプチド、ＡＴＰ結合カセットサブファミリーＡメンバー３ポリペプチド、サイトカイン受容体共通サブユニットベータポリペプチド、及び顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体サブユニットアルファポリペプチドからなる群から選択されるポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む、請求項７３または請求項７４に記載の方法。
  76. 肺動脈性肺高血圧症の１つ以上の徴候または症状の予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法であって、
    有効量の請求項３７～４４のいずれか１項に記載のヘルペスウイルスまたは請求項４５～５６のいずれか１項に記載の医薬組成物を、前記対象に投与することを含む、前記方法。
  77. 前記対象のゲノムが、ＢＭＰＲ２、ＡＴＰ２Ａ２、ＡＣＶＲＬ１、ＥＮＧ、ＳＭＡＤ９、ＣＡＶ１、ＫＣＮＫ３、及びＥＩＦ２ＡＫ４からなる群から選択される１つ以上の遺伝子における病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む、請求項７６に記載の方法。
  78. 前記組換えヘルペスウイルスゲノムが、骨形成タンパク質受容体２型ポリペプチド、筋小胞体／小胞体カルシウムＡＴＰアーゼ２ポリペプチド、セリン／スレオニンプロテインキナーゼ受容体Ｒ３ポリペプチド、エンドグリンポリペプチド、マザーズアゲインストデカペンタプレジックホモログ９ポリペプチド、カベオリン－１ポリペプチド、カリウムチャネルサブファミリーＫメンバー３ポリペプチド、及びｅＩＦ－２－アルファキナーゼＧＣＮ２ポリペプチドからなる群から選択されるポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む、請求項７６または請求項７７に記載の方法。
  79. 肺線維症の１つ以上の徴候または症状の予防的、姑息的、または治療的な緩和を、それを必要とする対象において提供する方法であって、
    有効量の請求項３７～４４のいずれか１項に記載のヘルペスウイルスまたは請求項４５～５６のいずれか１項に記載の医薬組成物を、前記対象に投与することを含む、前記方法。
  80. 前記対象のゲノムが、ＳＦＴＰＣ、ＡＢＣＡ３、ＳＦＴＰＡ２、ＴＥＲＴ、ＴＥＲＣ、ＤＫＣ１、ＲＴＥＬ、ＰＡＲＮ、ＴＩＮＦ２、ＮＡＦ１、ＭＵＣ５Ｂ、ＤＳＰ、ＳＴＮ１、及びＤＰＰ９からなる群から選択される１つ以上の遺伝子における病原性バリアント及び／または機能喪失型突然変異を含む、請求項７９に記載の方法。
  81. 前記組換えヘルペスウイルスゲノムが、肺サーファクタント関連タンパク質Ｃポリペプチド、ＡＴＰ結合カセットサブファミリーＡメンバー３ポリペプチド、肺サーファクタント関連タンパク質Ａ２ポリペプチド、テロメラーゼ逆転写酵素ポリペプチド、ジスケリンポリペプチド、テロメア伸長ヘリカーゼ１ポリペプチドの調節因子、ポリ（Ａ）特異的リボヌクレアーゼＰＡＲＮポリペプチド、ＴＥＲＦ１相互作用核因子２ポリペプチド、Ｈ／ＡＣＡリボ核タンパク質複合体非コアサブユニットＮＡＦ１ポリペプチド、ムチン－５Ｂポリペプチド、デスモプラキンポリペプチド、ＣＳＴ複合体サブユニットＳＴＮ１ポリペプチド、及びジペプチジルペプチダーゼ９ポリペプチドからなる群から選択されるポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む、請求項７９または請求項８０に記載の方法。
  82. 前記対象がヒトである、請求項６０～８１のいずれか１項に記載の方法。
  83. 前記ヘルペスウイルスまたは医薬組成物が、前記対象に、経口投与される、鼻腔内投与される、気管内投与される、または吸入を介して投与される、請求項６０～８２のいずれか１項に記載の方法。
  84. 前記ヘルペスウイルスまたは医薬組成物が、前記対象に、鼻腔内投与される、または吸入を介して投与される、請求項６０～８３のいずれか１項に記載の方法。
  85. 前記ヘルペスウイルスまたは医薬組成物が、吸入を介して前記対象に投与される、請求項６０～８４のいずれか１項に記載の方法。
  86. 前記ヘルペスウイルスまたは医薬組成物が、乾燥粉末吸入器、加圧定量吸入器、ソフトミスト吸入器、ネブライザー、または電気流体力学的エアロゾル装置を使用して投与される、請求項６０～８５のいずれか１項に記載の方法。
  87. 前記ヘルペスウイルスまたは医薬組成物が、ネブライザーを使用して投与される、請求項６０～８６のいずれか１項に記載の方法。
  88. 前記ネブライザーが、振動型メッシュ式ネブライザーである、請求項８７に記載の方法。
  89. 対象の呼吸器の１つ以上の細胞にポリペプチドを送達する方法であって、
    前記対象に、以下：
    （ａ）組換えヘルペスウイルスゲノムを含むヘルペスウイルスであって、前記組換えヘルペスウイルスゲノムが、前記ポリペプチドをコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含む、前記ヘルペスウイルスと；
    （ｂ）薬学的に許容される担体と
    を含む医薬組成物を投与することを含む、前記方法。
  90. 前記対象が、気道及び／または肺に影響を与える疾患に罹患している、請求項８９に記載の方法。
  91. 前記疾患が、アルファ－１－アンチトリプシン欠乏症、肺胞微石症、原発性線毛機能不全、先天性肺胞タンパク症、肺動脈性肺高血圧症、及び肺線維症からなる群から選択される、請求項９０に記載の方法。
  92. 前記ヘルペスウイルスが、複製能力を有する、請求項８９～９１のいずれか１項に記載の方法。
  93. 前記ヘルペスウイルスが、複製欠損である、請求項８９～９１のいずれか１項に記載の方法。
  94. 前記ヘルペスウイルスが、単純ヘルペスウイルスである、請求項８９～９３のいずれか１項に記載の方法。
  95. 前記組換えヘルペスウイルスゲノムが、組換え単純ヘルペスウイルスゲノムである、請求項８９～９４のいずれか１項に記載の方法。
  96. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、不活性化突然変異を含む、請求項９５に記載の方法。
  97. 前記不活性化突然変異が、単純ヘルペスウイルス遺伝子に存在する、請求項９６に記載の方法。
  98. 前記不活性化突然変異が、前記単純ヘルペスウイルス遺伝子のコード配列の欠失である、請求項９７に記載の方法。
  99. 前記単純ヘルペスウイルス遺伝子が、感染細胞タンパク質（ＩＣＰ）０、ＩＣＰ４、ＩＣＰ２２、ＩＣＰ２７、ＩＣＰ４７、チミジンキナーゼ（ｔｋ）、ロングユニーク領域（ＵＬ）４１及びＵＬ５５からなる群から選択される、請求項９７または請求項９８に記載の方法。
  100. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＩＣＰ４遺伝子の一方または両方のコピーに不活性化突然変異を含む、請求項９９に記載の方法。
  101. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＩＣＰ２２遺伝子に不活性化突然変異を含む、請求項９９または請求項１００に記載の方法。
  102. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＵＬ４１遺伝子に不活性化突然変異を含む、請求項９９～１０１のいずれか１項に記載の方法。
  103. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＩＣＰ０遺伝子の一方または両方のコピーに不活性化突然変異を含む、請求項９９～１０２のいずれか１項に記載の方法。
  104. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＩＣＰ２７遺伝子に不活性化突然変異を含む、請求項９９～１０３のいずれか１項に記載の方法。
  105. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＩＣＰ４７遺伝子に不活性化突然変異を含む、請求項９９～１０４のいずれか１項に記載の方法。
  106. 前記組換え単純ヘルペスウイルスゲノムが、前記ＵＬ５５遺伝子に不活性化突然変異を含む、請求項９９～１０５のいずれか１項に記載の方法。
  107. 前記医薬組成物が、前記対象に、経口投与される、鼻腔内投与される、気管内投与される、または吸入を介して投与される、請求項８９～１０６のいずれか１項に記載の方法。
  108. 前記医薬組成物が、前記対象に、鼻腔内投与される、または吸入を介して投与される、請求項８９～１０７のいずれか１項に記載の方法。
  109. 前記医薬組成物が、吸入を介して前記対象に投与される、請求項８９～１０８のいずれか１項に記載の方法。
  110. 前記医薬組成物が、吸入を介して前記対象に投与される、請求項８９～１０９のいずれか１項に記載の方法。
  111. 前記医薬組成物が、乾燥粉末吸入器、加圧定量吸入器、ソフトミスト吸入器、ネブライザー、または電気流体力学的エアロゾル装置を使用して投与される、請求項８９～１１０のいずれか１項に記載の方法。
  112. 前記医薬組成物が、ネブライザーを使用して投与される、請求項８９～１１１のいずれか１項に記載の方法。
  113. 前記ネブライザーが、振動型メッシュ式ネブライザーである、請求項１１２に記載の方法。
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