JP2023501229A - Ｔｍｅｍ２１９抗体及びその治療的使用 - Google Patents

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Abstract

本発明は、IGFBP3受容体、すなわちTMEM219に特異的に結合する抗体又はその抗原結合性断片、それらの生産方法、前記抗体を含む医薬組成物、及びその使用に関する。

Description

本発明は、IGFBP3受容体、すなわちTMEM219に特異的に結合する抗体又はその抗原結合性断片、それらの生産方法、前記抗体を含む医薬組成物、及びその使用に関する。
IGFBP3/TMEM219軸
インスリン様成長因子結合タンパク質は、インスリン様成長因子(IGF)のバイオアベイラビリティを調節する7つの結合タンパク質のファミリーである。それらの中でも、IGFBP3は最も豊富であり、ほとんど全ての組織に存在し、IGFに対してより高い親和性を有し;実際に、IGFのおよそ80～90%は、酸不安定性サブユニット(ALS)との三元複合体におけるIGFBP3に結合する(1)。
IGFのアベイラビリティを調節するその能力に加えて、IGFBP3は、IGF非依存性機能も有することが分かっている(2)。実際に、それは、細胞表面タンパク質、必須のシグナル伝達能力を有する細胞表面受容体、細胞内タンパク質及び核タンパク質(転写調節因子)と会合することができ、結果として、細胞増殖に影響を及ぼし、アポトーシスを直接誘導する(2)。死受容体の中でも、シングルスパン膜タンパク質であるTMEM219は、IGFBP-3への高い結合性が示された(3)。TMEM219へのIGFBP3の結合はがん細胞(すなわち、前立腺がん細胞及び乳がん細胞)を含む様々な細胞においてカスパーゼ8媒介性アポトーシスを誘導するが(3)、幹細胞(すなわち、結腸幹細胞)においても誘導する(4)。様々な戦略によってIGFBP3/TMEM219軸を遮断又は増強することは、それぞれ細胞死を防止又は増加させることが分かっている。発明者らの知る限りにおいて、IGFBP3/TMEM219の結合を防ぐことができ、TMEM219へのIGFBP3の結合の標的組織/細胞に対するIGF-I非依存性のカスパーゼ8媒介性有害効果を止めることができるような、市販のTMEM219又はIGFBP3に対するモノクローナル抗体は存在しない。
糖尿病におけるIGFBP3/TMEM219軸
1型(T1D)及び2型糖尿病(T2D)は両方とも、結果としてインスリンの分泌の低減、血糖値の制御不全、及び多糖症を引き起こすβ細胞の喪失によって特徴付けられる(5、6)。異なる発症メカニズムにもかかわらず、T1Dにおける自己免疫反応又はT2Dにおけるインスリン耐性/炎症は、両方とも、β細胞集団の漸減を生じる。実際に、発生する自己免疫活性化は、T1Dにおけるβ細胞喪失を完全に説明するのに十分なようには思われないということが明らかになりつつある(5)。その上、免疫療法ではT1Dを治療することができない(7)ことは、(i)自己免疫は、T1D病因に関与する唯一の要因ではないかもしれないこと、及び、(ii)T1Dに対する効果的な処置を確立するためには、β細胞喪失等の疾患の異なるメカニズムを標的にする代替戦略が必要であることを浮き彫りにした。点在するβ細胞が長期のT1Dを有する個体において検出されるという観察(8)は、β細胞の代謝回転を維持するために新たなβ細胞が生じなければならないか(5、9)、又は破壊されたβ細胞は、「異なり」得るか、又は死ぬ傾向にあり得るか(10)のどちらかであることを裏付けている。このことは、表面β細胞受容体の上方/下方制御された発現が、それらを免疫システムに認識させるために、重要な役割を有し得ること、より重要なことに、他の非免疫学的決定因子が、β細胞の運命及び機能を調節し得ることを示唆し得る。したがって、T1Dにおける非免疫学的β細胞破壊及びT2Dにおけるβ細胞の進行性喪失を防ぐことは、β細胞の発生と破壊の間のバランスを、適切なβ細胞集団の回復へと傾け得、結果として、疾患の最初の段階を停止又は遅延させることができる新規の治療アプローチのための道を整え得る。IGFBP3受容体であるTMEM219は、β細胞系及びヒト/マウス膵島において発現されること、及びそのライゲーションは、β細胞に対して毒性であることが分かっている。興味深いことに、ヒトIGFBP3に対するマウス遺伝子移植は、多糖症を発症し、膵島質量の減少を示し、インスリン-グルコース刺激に対する反応の低減を示すが(11)、その一方で、IGFBP3のためにノックダウンされたものは、糖代謝制御に関するいかなる変更も示さなかった(12)ことも観察されている。
ヒトにおいて、最近、Drogan及び同僚は、IGFBP3の高い血中濃度が、T2Dの発症に関連することを公開した(13)。その上、Diabimmune研究グループによる最近の研究は、IGFBP3レベルが、T1Dに対するリスクにある子供での血清変換に対する自己抗体の陽性及び機会と相関し、したがって、β細胞自己免疫の早期発達におけるIGFBP3の循環の役割を示唆していることを実証した(14)。
IGFBP3受容体であるTMEM219は、死受容体として既に記載されているが、その活性化は、標的細胞内においてカスパーゼ8媒介性アポトーシスを引き起こし、結果として、それらの喪失を生じる(4)。
炎症性腸疾患におけるIGFBP3/TMEM219軸
腸幹細胞(ISC)は、小腸及び大腸の陰窩の底部に存在し、陰窩再生及び代謝回転を制御する。特に、ISCは、陰窩に沿って分化することにより、杯細胞、腸細胞、腸内分泌細胞を生じることができる(4)。
炎症性腸疾患(IBD)は、2つの臨床エンティティであるクローン病(CD)及び潰瘍性大腸炎(UC)を包含する免疫媒介性の慢性状態であり、ヨーロッパの約250万人及び米国の100万人に影響を及ぼす(15)。IBDの病因は、まだ調査中であるが、最近の証拠は、回腸CDにおけるパーネト細胞への、並びにUCにおける杯細胞へのISCの分化の減少が、当該疾患の発症において重要な役割を果たし得ることを示唆している。特に、粘膜での局所シグナル伝達及び炎症性経路は両方とも、外部刺激に反応して、ISCの数及び機能を保ち、結果として、腸の恒常性を維持する(16)。実際に、近年、Yancuらは、CDにおけるIGFBP-3の役割を支持する結果を公開した。実際に、彼らは、デキストラン-ナトリウム-サルフェート(DSS)大腸炎マウスモデルにおいて、IGFBP3のノックアウトが、炎症を調節する役割を有することを実証した(17)。
本発明者らは、最近、インスリン様成長因子結合タンパク質3(IGFBP3)受容体、すなわち、TMEM219受容体が、ISCにおいて発現されること、並びに循環ホルモンIGFBP3との相互作用が、糖尿病及び糖尿病性腸疾患での腸障害のモデルにおいて、ISCの運命及び機能を制御することを見出した(4)。糖尿病性腸疾患及びIBDは、腸幹細胞(ISC)恒常性における変更及び粘膜モルホロジーの変更として、共通の特徴を共有するため、これらの結果は、依然として未知であるIBD病因における重要な洞察を加え得、おそらく、IBD処置のための新規の治療アプローチの導入につながるであろう。
IBDに対して現在利用可能な療法は、抗炎症剤の使用及び免疫療法的戦略に基づいており、それらは、いくつかの有害作用及び長期での有効性に対する疑わしさによって悪化される。特にUCでは、疾患の進行した状態において、外科手術も首尾よく用いられている(15)。主にCDにおける疾患の再発も頻繁であり、結果として、異なる治療アプローチの必要性を浮き彫りにする。結果として、IBDの処置における新規の治療標的及び治療戦略の特定は、臨床的に非常に重要であり、健康な共同体にとって必要である。
WO2016193497及びWO2016193496(参照によりその全体が本明細書に組み入れられる)には、有効な治療剤として機能する、TMEM219細胞外ドメインであるecto-TMEMについて記載されている。しかしながら、受容体コンストラクトは、抗体より治療剤としてあまり望ましくない。したがって、抗体又はその誘導体のような、ecto-TMEMの効果を模倣するさらなる治療剤が依然として必要とされている。
WO2016193497 WO2016193496 WO2002/020565 US20040132028 米国特許出願公開第2003/0157108号 US2004/0093621 WO2003/011878 米国特許第6,602,684号 US2005/0123546 WO1997/30087 WO1998/58964 WO1999/22764 米国特許第7,521,541号 米国特許第7,083,784号 米国特許第8,323,962号 米国特許第5,215,534号 米国特許第9,248,242号 米国特許第9,427,531号 米国特許第9,566,395号
Chothiaら、(1992) J. Mol. Biol. 227:799～817 Tomlinsonら、(1992) J. Mol. Biol. 227:776～798 J. Mol. Biol. 332, 489～503 (2003) PNAS 100(4), 1700～1705 (2003) J. Mol. Biol. 369, 1015～1028 (2007) Kam, N.W.ら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102 (2005) 11600～11605 Angalら(1993) Molecular Immunology 30:105 Dall'Aquaら、J. Biol. Chem. 281(33):23514～23524 (2006) Hintonら、J. Immunology 176:346～356 (2006) Yeungら、J. Immunology 182:7663～7671 (2009) Petkovaら、Intn'l Immunology,18: 1759～1769 (2006) Taylorら(1992) Nucl. Acids Res.20:6287～6295 Eichele及びKharbanda、"Dextran sodium sulfate colitis murine model: an indispensable tool for advancing our understanding of inflammatory bowel disease pathogenesis," World J. Gastroenterol. 23(33):6016～6028 (2017)63 Taghipour Nら Gastroenterol Hepatol Bed Bench 2016;9(1):45～52
高い親和性でヒトecto-TMEM(TMEMの細胞外ドメイン)に特異的に結合し、結合の際にTMEM219経路を活性化することなく、その同族の受容体であるTMEM219へのIGFBP3の結合を低減又は排除することができる抗体が、本明細書において開示される。そのような中和抗体は、TMEM219に結合するIGFBP3が、糖尿病性腸疾患、炎症性腸疾患(IBD)、例えば、潰瘍性大腸炎及びクローン病等、並びに1型又は2型糖尿病等の疾患の病態生理に貢献するような障害の治療において有用である。そのような中和抗体は、受容体ベースのリガンドトラップecto-TMEM219と類似の治療活性を有する、有利な治療剤を提供する。
第1の態様において、ヒトTEMP219に結合し、前記TMEM219受容体へのIGFBP3の結合を阻害又は低減する、単離された抗体又はその抗原結合性断片が提供される。
好ましくは、単離された抗体又はその抗原結合性断片は、IGFBP3の結合によって誘導されるTMEM219受容体の活性化を阻害、低減、又は中和する。
IGFBP3によって誘導されるTMEM219受容体の活性化は、当技術分野において公知の、又は下記に記載される任意の方法によって測定され得る。特に、TMEM219受容体のIGFBP3誘導活性化は、そこで記載されるようなアポトーシスの増加、又は当技術分野において公知であり、いくつかの刊行物に記載される、ミニ腸(minigut)成長の減少を測定することによって測定され得る(4、18、27、28)。
好ましくは、単離された抗体又はその抗原結合性断片は、ヒトTMEM219に結合する際にTMEM219経路を活性化しない。
好ましい実施形態において、単離された抗体又はその抗原結合性断片は、糖尿病患者においてβ細胞を保存すること、及び/又は膵島破壊を防ぐこと、及び/又はインビボモデルにおいて血糖値を制御することにおいて有効である。
好ましい実施形態において、単離された抗体又はその抗原結合性断片は、インビボモデルにおいて急性結腸炎を低減させることにおいて有効である。
好ましい実施形態において、単離された抗体又はその抗原結合性断片は、DAIスコア及び組織学的スコアにおけるDSS誘導増加を減少させるか、又は、インビボモデルにおいて急性結腸炎を低減させることにおいて有効である。
本発明は、
a-IGFBP3で処置された健康な対象のミニ腸成長の増加;
b-IBD患者のミニ腸成長の増加;
c-糖尿病性腸疾患血清で処置された健康な対象のミニ腸成長の増加;
d-IGFBP3で処置された健康な対象のミニ腸におけるEphB2及び/又はLGR5の発現の増加;
e-IGFBP3で処置された健康な対象のミニ腸におけるカスパーゼ8発現の減少;
f-IGFBP3で処置されたβ細胞におけるβ細胞喪失の減少;
g-IGFBP3で処置されたβ細胞におけるインスリンの発現の増加;
h-DSSで誘導された腸内細胞アポトーシスを阻害又は減少させる;
i-DSSで処置された結腸におけるPCNAの発現を回復させる;
j-IGFBP3で処置されたβ細胞におけるβ細胞のアポトーシスの減少;
k-糖尿病の動物モデルにおける膵島炎スコア(insulitis score)の減少;
l-糖尿病の動物モデルにおける糖尿病の発症の減少;
m-糖尿病の動物モデルにおけるβ細胞傷害を保護する;
n-糖尿病の動物モデルにおけるβ細胞喪失を防ぐ
から選択される少なくとも1つの活性を有する、単離された抗体又はその抗原結合性断片も提供する。
好ましくは、a)、b)、及びc)における増加は、少なくとも20%であり;d)及びe)における増加は、少なくとも30%、好ましくは少なくとも50%であり;f)における減少及びg)における増加は、少なくとも10%であり、k)及びl)における減少は、少なくとも50%であり;好ましくは、l)における減少は、少なくとも70%である。好ましくは、j)における減少は、少なくとも30%である。
本発明は、
a.以下を含む重鎖可変ドメイン(VH):
i.配列番号1、4、8、10、56、59、62、65、及び68からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR1配列;
ii.配列番号2、5、11、57、60、63、66及び69からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR2配列;及び
iii.配列番号3、6、7、9、12、13、58、61、64、67、及び70からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR3配列;並びに/又は
b.以下を含む軽鎖可変ドメイン(VL):
i.配列番号14、17、20、23、26、29、71、77、80、82、及び85からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR1配列;
ii.配列番号15、18、21、24、27、30、72、78、83、及び86からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR2配列;及び
iii.配列番号16、19、22、25、28、31、73、74、75、76、79、81、84、87、166、及び167からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR3配列
を含む、単離された抗体又はその抗原結合性断片を提供する。
好ましくは、単離された抗体又はその抗原結合性断片は、
- 配列番号4及び配列番号5及び配列番号6及び配列番号17及び配列番号18及び配列番号19又はTC01若しくはTC05のKabat、IMGT、Chothia、AbM若しくはContact CDRs、或いは
- 配列番号4及び配列番号5及び配列番号6及び配列番号17及び配列番号18及び配列番号166又はTC03のKabat、IMGT、Chothia、AbM、若しくはContact CDR、或いは
- 配列番号4及び配列番号5及び配列番号6及び配列番号17及び配列番号18及び配列番号167又はTC04のKabat、IMGT、Chothia、AbM、若しくはContact CDR、或いは
- 配列番号68及び配列番号69及び配列番号70及び配列番号85及び配列番号86及び配列番号87又はTM1のKabat、IMGT、Chothia、AbM、若しくはContact CDR
を含む。
好ましくは、単離された抗体又はその抗原結合性断片は、
a.以下を含む重鎖可変ドメイン(VH):
i.abysisツール解析(www.abysis.org)を使用して定義される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR1配列;
ii.abysisツール解析(www.abysis.org)を使用して定義される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR2配列;及び
iii.abysisツール解析(www.abysis.org)を使用して定義される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR3配列;並びに/又は
b.以下を含む軽鎖可変ドメイン(VL):
i.abysisツール解析(www.abysis.org)を使用して定義される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR1配列;
ii.abysisツール解析(www.abysis.org)を使用して定義される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR2配列;及び
iii.abysisツール解析(www.abysis.org)を使用して定義される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR3配列
を含む。
好ましくは、単離された抗体又はその抗原結合性断片は、Table 2～5(表1～8)、Table 8～11(表11～14)、及びTables 3.1～3.4(表3～6)に示されるCDRを含む。
好ましくは、前記抗体又はその抗原結合性断片は、TMEM219に特異的に結合する。
好ましくは、それは、:
a-IGFBP3で処置された健康な対象のミニ腸成長の増加;
b-IBD患者のミニ腸成長の増加;
c-糖尿病性腸疾患血清で処置された健康な対象のミニ腸成長の増加;
d-IGFBPで3処置された健康な対象のミニ腸におけるEphB2及び/又はLGR5の発現の増加;
e-IGFBP3で処置された健康な対象のミニ腸におけるカスパーゼ8発現の減少;
f-IGFBP3で処置されたβ細胞におけるβ細胞喪失の減少;
g-IGFBP3で処置されたβ細胞におけるインスリンの発現の増加;
h-DSSで誘導された腸内細胞アポトーシスを阻害又は減少させる;
i-DSSで処置された結腸におけるPCNAの発現を回復させる;
j-IGFBP3で処置されたβ細胞におけるβ細胞のアポトーシスの減少
から選択される少なくとも1つの活性を有する。
好ましくは、a)、b)、及びc)における増加は、少なくとも20%であり;d)及びe)における増加が、少なくとも50%であり;f)における減少及びg)における増加は、少なくとも10%である。
好ましくは、単離された抗体又はその抗原結合性断片は、
a.以下を含む重鎖可変ドメイン(VH):
i.配列番号4、1、8、10、56、59、62、65、及び68からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR1配列;
ii.配列番号5、2、11、57、60、63、66、及び69からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR2配列;及び
iii.配列番号6、3、7、9、12、13、58、61、64、67及び70からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR3配列;並びに/又は
b.以下を含む軽鎖可変ドメイン(VL):
i.配列番号17、14、20、23、26、29、71、77、80、82、及び85からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR1配列;
ii.配列番号18、15、21、24、27、30、72、78、83、及び86からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR2配列;及び
iii.配列番号19、16、22、25、28、31、73、74、75、76、79、81、84、87、166、及び167からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR3配列
を含む。
好ましくは、単離された抗体又はその抗原結合性断片は、
- 配列番号4及び配列番号5及び配列番号6及び配列番号17及び配列番号18及び配列番号19又はTC01若しくはTC05のKabat、IMGT、Chothia、AbM、若しくはContact CDR、或いは
- 配列番号4及び配列番号5及び配列番号6及び配列番号17及び配列番号18及び配列番号166又はTC03のKabat、IMGT、Chothia、AbM、若しくはContact CDR、或いは
- 配列番号4及び配列番号5及び配列番号6及び配列番号17及び配列番号18及び配列番号167又はTC04のKabat、IMGT、Chothia、AbM、若しくはContact CDR、或いは
- 配列番号68及び配列番号69及び配列番号70及び配列番号85及び配列番号86及び配列番号87又はTM1のKabat、IMGT、Chothia、AbM、若しくはContact CDR
を含む。
好ましくは、単離された抗体又はその抗原結合性断片は、
a.以下を含む重鎖可変ドメイン(VH):
i.abysisツール解析(www.abysis.org)を使用して定義される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR1配列;
ii.abysisツール解析(www.abysis.org)を使用して定義される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR2配列;及び
iii.abysisツール解析(www.abysis.org)を使用して定義される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR3配列;並びに/又は
b.以下を含む軽鎖可変ドメイン(VL):
i.abysisツール解析(www.abysis.org)を使用して定義される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR1配列;
ii.abysisツール解析(www.abysis.org)を使用して定義される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR2配列;及び
iii.abysisツール解析(www.abysis.org)を使用して定義される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR3配列
を含む。
好ましくは、単離された抗体又はその抗原結合性断片は、
a.配列番号32から配列番号37、若しくは配列番号88から配列番号95、若しくは配列番号168、配列番号169、及び配列番号170からなる群から選択されるアミノ酸配列の重鎖可変ドメイン配列;又は
b.配列番号38から配列番号43、若しくは配列番号96から配列番号103、若しくは配列番号171、配列番号172、若しくは配列番号173からなる群から選択されるアミノ酸配列の軽鎖可変ドメイン配列;
c.(a)の軽鎖可変ドメイン及び(b)の重鎖可変ドメイン
を含む。
更に好ましくは、単離された抗体は、TC01、TC03、TC04、TC05、TA02、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10、又はそれらの抗原結合性断片であり、好ましくは、単離された抗体は、Table 4(表7)、7(表10)、及び10～13(表13～16)、並びにTable 3.1～3.4(表3～6)に報告されるような、TC01、TC05、TC03、TC04、又はTM1、或いはそれらの抗原結合性断片である。好ましくは、単離された抗体は、TC01である。
更に好ましくは、単離された抗体は、配列番号33及び配列番号39を含むTC01、配列番号168及び配列番号171を含むTC03、配列番号169及び配列番号172を含むTC04、配列番号170及び配列番号173を含むTC05、配列番号32及び配列番号38を含むTA02、配列番号33及び配列番号39を含むTC01、配列番号34及び配列番号40を含むTC02、配列番号35及び配列番号41を含むTD01、配列番号36及び配列番号42を含むTE01、配列番号37及び配列番号43を含むTG02、配列番号88及び配列番号96を含むTE02.1、配列番号89及び配列番号97を含むTE02.2、配列番号90及び配列番号98を含むTE02.3、配列番号91及び配列番号99を含むTE03、配列番号92及び配列番号100を含むTE04、配列番号93及び配列番号101を含むTE07、配列番号94及び配列番号102を含むTE10、配列番号95及び配列番号103を含むTM1である。
好ましくは、本発明の単離された抗体又は抗原結合性断片は、10-7M以下の親和性定数、好ましくは2×10ー8M以下の親和性定数でヒトTMEM219に結合する。
本発明は、
(a)IGFBP3上のエピトープ、例えば、Table 2～19(表1～22)並びにTable 3.1～3.4(表3～6)において定義されるモノクローナル抗体TC01、TC03、TC04、TC05、TA02、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10によって認識されるエピトープと同じ若しくは類似のエピトープに特異的に結合する;又は
(b)Table 2～19(表1～22)及びTable 3.1～3.4(表3～6)において定義されるモノクローナル抗体TC01、TC03、TC04、TC05、TA02、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10との結合に対して交差競合する;又は
(c)Table 2～19(表1～22)及びTable 3.1～3.4(表3～6)において定義される、TC01、TC03、TC04、TC05、TA02、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかと同じ若しくは類似の結合親和性若しくは特異性若しくはその両方を示す;又は
(d)本明細書に記載される抗体分子、例えば、Table 2～19(表1～22)及びTable 3.1～3.4(表3～6)において定義される、例えば、TC01、TC03、TC04、TC05、TA02、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体分子の1つ若しくは複数の生物学的特性を有する;又は
(e)本明細書に記載される抗体分子、例えば、Table 2～19(表1～22)及びTable 3.1～3.4(表3～6)において定義される、例えば、TC01、TC03、TC04、TC05、TA02、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体分子の1つ若しくは複数の薬物動態特性を有する、
単離された抗体又はその抗原結合性断片も提供する。
好ましくは、本発明の単離された抗体又はその抗原結合性断片は、ヒト抗体又はヒト化抗体である。
より好ましくは、本発明の単離された抗体又はその抗原結合性断片は、IgG2又はIgG4抗体、好ましくは、IgG2κ抗体、IgG2λ抗体、IgG4κ抗体、又はIgG4λ抗体であり、好ましくは、前記IgG2又はIgG4は、ヒトIgG2又はヒトIgG4である。
本発明は、上記において定義される抗体又はその抗原結合性断片をコードする少なくとも1つの配列を含む単離されたポリヌクレオチドを提供し、好ましくは、前記ポリヌクレオチドは、cDNAである。
本発明は、上記において定義されるポリヌクレオチドを含むベクターを提供し、好ましくは、前記ベクターは、プラスミド、ウイルスベクター、非エピソーム性哺乳動物ベクター、発現ベクター、及び組換え発現ベクターからなる群から選択される。
本発明は、更に、上記において定義されるポリヌクレオチド又は上記において定義されるベクターを含む、単離された細胞を提供し、好ましくは、当該単離された細胞は、ハイブリドーマ又はチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞又はヒト胚性腎臓細胞(HEK293)である。
本発明は、更に、医薬としての使用のため、好ましくは、糖尿病、腸管及び/又は腸障害、吸収不良症候群、悪液質、又は糖尿病性腸疾患の処置における使用のための、上記において定義された抗体若しくはその抗原結合性断片又は単離されたポリヌクレオチド又はベクター又は単離された細胞を提供し、好ましくは、糖尿病は、I型又はII型糖尿病であり、好ましくは、腸管及び/又は腸障害は、炎症性腸疾患、セリアック病、潰瘍性大腸炎、クローン病、又は腸閉塞である。
本発明は、好ましくは、糖尿病、腸管及び/又は腸障害、吸収不良症候群、悪液質、又は糖尿病性腸疾患の処置における使用のための、上記において定義される単離された抗体若しくはその抗原結合性断片又は単離されたポリヌクレオチド又はベクター又は単離された細胞と、薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物も提供し、好ましくは、腸管及び/又は腸障害は、炎症性腸疾患、セリアック病、潰瘍性大腸炎、クローン病、又は腸閉塞である。
本発明は、TMEM219受容体へのIGFBP3の結合を阻害する方法であって、TMEM219を上記において定義される抗体又は組成物と接触させる工程を含む方法を提供する。
本発明は、糖尿病、好ましくは、1型又は2型糖尿病、腸管及び/又は腸障害、吸収不良症候群、悪液質、又は糖尿病性腸疾患の処置方法であって、好ましくは、腸管及び/又は腸障害は、炎症性腸疾患、IBD、セリアック病、クローン病、又は腸閉塞であり、上記において定義される単離された抗体又はその抗原結合性断片又は単離されたポリヌクレオチド又はベクター又は単離された細胞と薬学的に許容される担体と含む医薬組成物をそれを必要とする対象に投与する工程、或いは上記において定義される単離された抗体又はその抗原結合性断片又は単離されたポリヌクレオチド又はベクター又は単離された細胞を、それを必要とする対象に投与する工程を含む方法を提供する。
本発明は、抗体又はその抗原結合性断片を生産するための方法であって、上記において定義される細胞を得る工程及び抗体又はその抗原結合性断片を生産する工程を含む方法も提供する。
いくつかの実施形態において、当該組み合わせは、IGFBP3の阻害剤(例えば、本明細書に記載される抗TMEM抗体分子)を含む。したがって、IGFBP3を検出するための組成物及び方法、並びに、糖尿病及び腸管及び/又は腸障害を含む様々な障害を、抗TTMEM抗体分子及びその組み合わせを使用して処置する方法が、本明細書において開示される。
したがって、一態様において、本発明は、以下の特性:
- 高い親和性で、例えば、少なくとも約4x106M-1、好ましくは107M-1、典型的には約108M-1、より典型的には約109M-1から1010M-1、又はそれ以上の親和性定数で、TMEM219、例えば、ヒトTMEM219に結合する;
- その受容体TMEMへのIGFBP3の結合を阻害又は低減する;
- TMEM219上のエピトープ、例えば、Table 2～19(表1～22)及びTable 3.1～3.4(表3～6)において定義されるモノクローナル抗体TC01、TC03、TC04、TC04、TA02、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10によって認識されるエピトープと同じ又は類似のエピトープに特異的に結合する;
- Table 2～19(表1～22)及びTable 3.1～3.4(表3～6)において定義されるモノクローナル抗体TC01、TC03、TC04、TC04、TA02、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10との結合に対して交差競合する;
- Table 2～19(表1～22)及びTable 3.1～3.4(表3～6)において定義されるTC01、TC03、TC04、TC04、TA02、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかと同じ又は類似の結合親和性又は特異性又はその両方を示す;
- Table 2～19(表1～22)に記載される抗体分子(例えば、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域)と同じ又は類似の結合親和性又は特異性又はその両方を示す;
- Table 、4、5、10、11、16、17(表7、8、13、14、19、20)に示されるアミノ酸配列を有する抗体分子(例えば、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域)と同じ又は類似の結合親和性又は特異性又はその両方を示す;
- Table 6～7及び12、13、16、17(表9～10及び15、16、19、20)に示されるヌクレオチド配列によってコードされる抗体分子(例えば、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域)と同じ又は類似の結合親和性又は特異性又はその両方を示す;
- 同じエピトープ又は第2の抗体分子とオーバーラップするエピトープをTMEM219に結合させる(この場合、第2の抗体分子は、本明細書に記載される抗体分子、例えば、Table 2～19(表1～22)及びTable 3.1～3.4(表3～6)において定義されるTC01、TC03、TC04、TC04、TA02、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10から選択される抗体分子である);
- 本明細書に記載される抗体分子、例えば、Table 2～19(表1～22)及びTable 3.1～3.4(表3～6)において定義される、例えば、TC01、TC03、TC04、TC04、TA02、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体分子の1つ又は複数の生物学的特性を有する;
- 本明細書に記載される抗体分子、例えば、Table 2～19(表1～22)及びTable 3.1～3.4(表3～6)において定義される、例えば、TC01、TC03、TC04、TC04、TA02、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体分子の1つ又は複数の薬物動態特性を有する;
- IGFBP3の1つ又は複数の活性を阻害し、例えば、結果として、未処理試料と比較した場合の、IBD患者由来の組織試料からのミニ腸の発達の少なくとも20%の増加、及び/又は、未処理試料と比較した場合の、IGFBP3の存在下でのミニ腸成長の発達の少なくとも20%の増加、又は未処理試料と比較した場合の、糖尿病性腸疾患血清の存在下でのミニ腸成長の発達の少なくとも20%の増加、うちの1つ又は複数を生じる;
- IGFBP3処理試料と比較して少なくとも50%のEphB2及びLGR5の増加;又はIGFBP3処理試料と比較して少なくとも50%のカスパーゼ8発現レベルの減少を誘導する;又は
- IGFBP3の1つ又は複数の活性を阻害し、例えば、結果として、β細胞喪失の低減又はインスリンの増加のうちの1つ又は複数を生じる;β細胞喪失の低減又はインスリンの増加は、IGFBP3処理試料と比較して少なくとも10%である;
(xvi)IGFBP3の1つ又は複数の活性を阻害、低減、又は中和し、結果として、IGFBP3誘導アポトーシスの遮断又は低減を生じる;
- ヒトTMEM219に結合し、カニクイザルTMEM219と交差反応する
のうちの1つ又は複数を有する抗体分子(例えば、単離された抗体分子又は組換え抗体分子)を特徴とする。
抗体分子をコードする核酸分子、発現ベクター、宿主細胞、及び抗体分子を作製する方法も提供される。イムノコンジュゲート、多重又は二重特異性抗体分子、及び抗体分子を含む医薬組成物も提供される。
理論に束縛されるわけではないが、IGFBP3/TMEM219軸は、炎症性腸疾患(IBD)において機能不全であり、したがって、ISC喪失及び粘膜関門の機能の変更を引き起こし、それは、更に微生物によって侵入され、免疫反応活性化及び炎症を引き起こし、それを持続させる。IBDにおけるIGFBP3-TMEM219相互作用を遮断する薬剤の使用は、ISCを保護し得、腸のバリアの完全性を維持し得、結果として、局所炎症の発症を防ぎ得ると考えられる。
更に、TMEM219シグナル伝達の活性化は、カスパーゼ8発現の上方調節及びインスリン発現の低減により、β細胞のアポトーシスを増加させる。プレT1D及びプレT2Dを有する患者の血清において、並びに新たに診断された糖尿病患者及び長年の糖尿病患者において、IGFBP3は増加し、TMEM219が、β細胞において発現される。TMEM219の発現又は過剰発現は、β細胞の破壊に有利に働き、β細胞集団に影響を及ぼし、結果として生じる多糖症/炎症は、糖尿病の発症及び進行の間のプロセスを実行する。プレ糖尿病状態における血糖制御の変更及び炎症は、IGFBP3の肝臓での産生の増加に有利に働き、それは、膵臓のβ細胞において発現されたTMEM219を標的にし得、TMEM219過剰発現が、IGFBP3放出の増加と平行するループを引き起こし得る。次いで、TMEM219は、β細胞の死を引き起こし得、結果として、IGFBP3/TMEM219軸の標的化は、そのような細胞死を防ぎ得る。
本明細書において開示される抗TMEM抗体分子は、障害、例えば、糖尿病、並びに腸管及び/又は腸障害、吸収不良症候群、炎症性腸疾患、悪液質、IBD、セリアック病、糖尿病性腸疾患等を処置、予防、及び/又は診断するために、(単独で、又は他の薬剤又は治療法と組み合わせて)使用することができる。更に、下記のカテゴリ(i)～(iii):(i)糖尿病を処置する薬剤;(ii)抗炎症剤;又は(iii)免疫療法剤のうちの1つ、2つ、又は全てから選択される2つ、3つ、又はそれ以上の治療剤の組み合わせを含む方法及び組成物が、本明細書において開示される。
追加の治療剤は、インスリン、Vandana, 2014(19、参照により組み入れられる)において詳述されるインスリングラルギン、ビグアニド、グルコシダーゼ阻害剤、チアゾリジンジオン、DPP-4阻害剤、Georgeら 2013(20、参照により組み入れられる)において詳述されるGLP-1受容体アゴニスト、糖尿病を予防するために使用される薬剤、アスピリン、抗凝固及び血小板抗凝集剤(例えば、エノキサパリン、ヘパリン、スロデキシド等);コレステロール低下薬(例えば、スタチン、胆汁酸隔離剤、エゼチミブ、Marshaら 2011(21、参照により組み入れられる)に記載されるフィブレート等);他の血圧降下剤(例えば、チアジド、ACE阻害剤、β及びαブロッカー等);抗アポトーシス剤、抗炎症剤、コルチコステロイド、及び免疫抑制剤(22、参照により組み入れられる)、臓器移植におけるアジュバント療法、細胞治療アプローチにおける保護剤、痛み止め、抗生物質、プロバイオティクス、TNF-αブロッカー(23、参照により組み入れられる)、SGLT2阻害剤(例えば、グリフロジン誘導体等)、インテグリン阻害剤(24、参照により組み入れられる)、等の糖尿病を処置する薬剤から選択され得る。
IGFBP3の存在下、及び/又は糖尿病性腸疾患血清の存在下でのミニ腸成長と比較した場合の、ミニ腸成長の増加を測定する方法は、当該分野において既知であり、いくつかの刊行物(4、18、27、28)に記載される。
IGFBP3の存在下での発現と比較した場合の、EphB2、LGR5、又はカスパーゼ8の発現の増加及び/又は減少を測定する方法は、当該分野において公知であり、その例としては、定量的RT-PCR、リアルタイムRT-PCR、マイクロアレイ、ノーザンブロット法、RNA-Seq(29、30)、又は下記の方法のセクションに記載されるものが挙げられる。
IGFBP3の存在下でのβ細胞喪失と比較した場合の、β細胞喪失の減少を測定する方法は、当該分野において公知であり、その例としては、細胞増殖アッセイ(CFSE染色法、Calcein/PI染色法、トリパンブルー色素排除法、BrdU染色法、MTT)、アポトーシスアッセイ(TUNEL、カスパーゼ活性化及び検出、Annexin V結合)又は下記の方法のセクションに記載されるものが挙げられる。
IGFBP3の存在下でのインスリンレベルと比較した場合の、インスリンレベルの増加を測定する方法は、当該分野において公知であり、その例としては、ウエスタンブロット法、ELISA、質量分光分析(31～33)が挙げられる。
IGFBP3の存在下でのアポトーシスと比較した場合の、アポトーシスの減少を測定する方法は、当該分野において公知であり、その例としては、DNA断片化、カスパーゼ活性化分析、ミトコンドリア膜透過性、Annexin V結合(34)、又は下記の方法のセクションに記載されるものが挙げられる。
いくつかの実施形態において、当該抗体分子は、高い親和性で、例えば、マウス抗TMEM抗体分子又はキメラ抗TMEM抗体分子又は商業的抗TMEM抗体分子のKDとほぼ同じか、又は少なくとも約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、又は90%高い又は低いKDで、IGFBP3に結合する。いくつかの実施形態において、マウス又はキメラ抗TMEM抗体分子のKDは、例えば、Biacore法又はKinExA=結合平衡除外法によって測定された場合、約0.4、0.3、0.2、0.1、又は0.05nM未満である。いくつかの実施形態において、マウス又はキメラ抗TMEM219抗体分子のKDは、約0.2nM未満である。他の実施形態において、マウス又はキメラ抗IGFBP3抗体分子のKDは、例えば、IGFBP3を発現する細胞(例えば、300.19細胞)上での結合によって測定した場合、約10、5、3、2、又は1nM未満である。いくつかの実施形態において、マウス又はキメラ抗IGFBP3抗体分子のKDは、約1nM未満である。
TMEM219への結合を測定する方法は、タンパク質-タンパク質相互作用アッセイとして当該分野において公知であり、その例としては、ELISA、共免疫沈降法、表面プラズモン共鳴、FRET-フェルスター共鳴エネルギー移動(35)、又は下記の方法のセクションに記載されるものが挙げられる。
いくつかの実施形態において、当該抗体分子の発現レベルは、マウス又はキメラ抗体分子、例えば、マウス抗TMEM抗体分子、商業的抗TMEM抗体分子、又はキメラ抗TMEM抗体分子、発現レベルより高い、例えば、少なくとも約0.5、1、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10倍高い。いくつかの実施形態において、当該抗体分子は、HEK293細胞、CHO細胞、又は当技術分野において公知の任意の好適な哺乳動物細胞系において発現される。
いくつかの実施形態において、当該抗TMEM219抗体分子は、マウス抗TMEM抗体分子、商業的抗TMEM抗体分子、又はキメラ抗TMEM抗体分子、例えば、本明細書に記載される、マウス抗TMEM抗体分子、商業的抗TMEM抗体分子、又はキメラ抗TMEM抗体分子のIC50とほぼ同じか又はより低い、例えば、少なくとも約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、又は90%低いIC50(50%阻害での濃度)での1つ又は複数のTMEM関連活性を低減する。
いくつかの実施形態において、本明細書に記載される抗TMEM抗体分子は、下記の材料のセクションにおいて定義される、例えば、HPA051870等の、マウス抗TMEM抗体分子、商業的抗TMEM抗体分子、又はキメラ抗TMEM抗体分子、より、例えば、インビボ又はインビトロにおいて少なくとも約0.5、1、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10倍より安定な、向上した安定性を有する。
一実施形態において、抗TMEM抗体分子は、ヒト化抗体分子である。
別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)において定義されるTA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体、又はTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる抗体に由来する少なくとも1つの抗原結合性領域、例えば、可変領域又はその抗原結合性断片;或いは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、又はそれ以上において同一の)配列を含む。
さらなる別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)において定義されるTA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体、又はTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる抗体に由来する少なくとも1つ、2つ、3つ、又は4つの可変領域;或いは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、又はそれ以上において同一の)配列を含む。
さらなる別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)において定義されるTA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体、又はTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる抗体に由来する少なくとも1つ又は2つの重鎖可変領域;或いは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、又はそれ以上)において同一の)配列を含む。
さらなる別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、Table2～5(表1～8)、8～11(表11～14)において定義される、又はTable 6、7、12、13(表9、10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる、TA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体に由来する少なくとも1つ又は2つの軽鎖可変領域;或いは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、又はそれ以上において同一の)配列を含む。
さらなる別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、IgG4、例えば、ヒトIgG4に対する重鎖定常領域を含む。一実施形態において、ヒトIgG4は、位置228での置換(例えば、SerからProへの置換)を含む。一実施形態において、ヒトIgG4は、位置235での置換(例えば、LeuからGluへの置換)を含む。一実施形態において、ヒトIgG4は、位置228での置換(例えば、SerからProへの置換)及び位置235での置換(例えば、LeuからGluへの置換)を含む。さらなる別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、IgG1、例えば、ヒトIgG1に対する重鎖定常領域を含む。一実施形態において、ヒトIgG1は、位置297での置換(例えば、AsnからAlaへの置換)を含む。一実施形態において、ヒトIgG1は、位置250での置換、位置428での置換、又はその両方(例えば、位置250でのThrからGlnへの置換及び/又は位置428でのMetからLeuへの置換)を含む。一実施形態において、ヒトIgG1は、位置234での置換、位置235での置換、又はその両方(例えば、位置234でのLeuからAlaへの置換及び/又は位置235でのLeuからAlaへの置換)を含む。
さらなる別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、κ軽鎖定常領域、例えば、ヒトκ軽鎖定常領域を含む。一実施形態において、当該軽鎖定常領域は、Table 8(表11)に記載されるアミノ配列、又は当該配列に対して実質的に同一の(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、又はそれ以上において同一の)配列を含む。
別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、IgG4、例えば、ヒトIgG4に対する重鎖定常領域及びκ軽鎖定常領域、例えば、ヒトκ軽鎖定常領域を含む。一実施形態において、ヒトIgG1又はIgG4は、凝集を減少させるため、電荷の不均一性を低減するため、親和性を増加させるため、及び抗原結合性を調節するための、可変領域における置換;(26)(参照により組み入れられる)に記載されるような、可変領域における推定されるN-グリコシル化部位のCDRにおける不安定性ホットスポットの変異による除去を含む。
別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)において定義されるTA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかのアミノ酸配列を含むか、又はTable 6～7、12、13 (表9～10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる、重鎖可変ドメイン及び定常領域、軽鎖可変ドメイン及び定常領域、又はその両方;或いは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、又はそれ以上において同一の)配列を含む。抗TMEM抗体分子は、適宜、重鎖又は軽鎖に由来するリーダー配列、又はその両方を含む。
さらなる別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、Table2～5(表1～8)、8～11(表11～14)において定義される、又はTable 6、7、12、13(表9、10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる、TA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体の重鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、又は3つの相補性決定領域(CDR);或いは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、又はそれ以上において同一の)配列を含む。
さらなる別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)に示されるアミノ酸配列を含むか又はTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)に示されるヌクレオチド配列によってコードされる重鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、又は3つのCDR(又は、まとめて全てのCDR)を含む。一実施形態において、1つ又は複数のCDR(又は、まとめて全てのCDR)は、Table 2～5、8～11 (表1～8、11～14)に示されているアミノ酸配列又はTable 6～7、12、13 (表9～10、15、16)に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列に対する、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、又はそれ以上の変更、例えば、アミノ酸の置換又は欠失を有する。
さらなる別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)において定義されるTA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体、又はTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる抗体の軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、又は3つのCDR;或いは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、又はそれ以上において同一の)配列を含む。
さらなる別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)に示されているアミノ酸配列又はTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、又は3つのCDR(又は、まとめて全てのCDR)を含む。一実施形態において、1つ又は複数のCDR(又は、まとめて全てのCDR)は、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)に示されているアミノ酸配列又はTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列に対する、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、又はそれ以上の変更、例えば、アミノ酸の置換又は欠失を有する。ある特定の実施形態において、抗TMEM3抗体分子は、軽鎖CDRにおける置換、例えば、軽鎖のCDR1、CDR2、及び/又はCDR3における1つ又は複数の置換を含む。
別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)に示されているアミノ酸配列又はTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、又は6つのCDR(又は、まとめて全てのCDR)を含む。一実施形態において、1つ又は複数のCDR(又は、まとめて全てのCDR)は、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)に示されているアミノ酸配列又はTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列に対する、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、又はそれ以上の変更、例えば、アミノ酸の置換又は欠失を有する。
一実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)において定義されるTA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体、或いはTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる抗体に由来する6つ全てのCDR、或いは密接に関連するCDR、例えば、同一であるか、又は少なくとも1つのアミノ酸変更だが、2つ以下、3つ以下、又は4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、又は挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。一実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される任意のCDRを含み得る。ある特定の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、軽鎖CDRにおける置換、例えば、軽鎖のCDR1,CDR2、及び/又はCDR3における1つ又は複数の置換を含む。別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)において定義されるTA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体、又はTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖可変領域に由来するKabatらに従った少なくとも1つ、2つ、又は3つのCDR(例えば、Table 2～5(表1～8))において設定されるKabat定義に従った少なくとも1つ、2つ、又は3つのCDR);或いは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、又はそれ以上において同一の)配列;或いはKabatらに従ったTable 2～5、8～11(表1～8、11～14)に示される1つ、2つ、又は3つのCDRに対して、少なくとも1つのアミノ酸変更だが、2つ以下、3つ以下、又は4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、又は挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)において定義されるTA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体、又はTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる抗体の軽鎖可変領域に由来するKabatらに従った少なくとも1つ、2つ、又は3つのCDR(例えば、Table 2～5、8～11 (表1～8、11～14)において設定されるKabat定義に従った少なくとも1つ、2つ、又は3つのCDR);或いは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、又はそれ以上において同一の)配列、或いはTable 2～5、8～11(表1～8、11～14)に示されるKabatらに従った1つ、2つ、又は3つのCDRに対して、少なくとも1つのアミノ酸変更だが、2つ以下、3つ以下、又は4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、又は挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
さらなる別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)において定義されるTA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体、又はTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖可変領域及び軽鎖可変領域に由来するKabatらに従った少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、又は6つのCDR(例えば、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)において設定されるKabat定義に従った少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、又は6つのCDR);或いは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、又はそれ以上において同一の)配列;或いは、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)に示されるKabatらに従った1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、又は6つCDRに対して、少なくとも1つのアミノ酸変更だが、2つ以下、3つ以下、又は4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、又は挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
さらなる別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)において定義されるTA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体、又はTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖可変領域及び軽鎖可変領域に由来するKabatらに従った6つ全てのCDR(例えば、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)において設定されるKabat定義に従った6つ全てのCDR);或いは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、又はそれ以上において同一の)配列;或いはTable 2～5、8～11(表1～8、11～14)に示されるKabatらに従った6つ全てのCDRに対して、少なくとも1つのアミノ酸変更だが、2つ以下、3つ以下、又は4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、又は挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。一実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される任意のCDRを含み得る。
別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)において定義されるTA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体、又はTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、又は3つのChothia又はKabat超可変ループ(例えば、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)において設定されるChothia又はKabat定義に従った少なくとも1つ、2つ、又は3つの超可変ループ);或いはTMEMに接触するそれら超可変ループに由来する少なくともアミノ酸;或いはTable 2～5、8～11(表1～8、11～14)に示されるChothiaらに従った1つ、2つ、又は3つの超可変ループに対して、少なくとも1つのアミノ酸変更だが、2つ以下、3つ以下、又は4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、又は挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸を含む。
別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)において定義されるTA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体、又はTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる抗体の軽鎖可変領域の少なくとも1つ、2つ、又は3つのChothia超可変ループ(例えば、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)において設定されるChothia定義に従った少なくとも1つ、2つ、又は3つの超可変ループ);或いはTMEMに接触するそれら超可変ループに由来する少なくともアミノ酸;或いはTable 2～5、8～11(表1～8、11～14)に示されるChothiaらに従った1つ、2つ、又は3つの超可変ループに対して、少なくとも1つのアミノ酸変更だが、2つ以下、3つ以下、又は4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、又は挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸を含む。
さらなる別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)において定義されるTA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体; 又はTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖可変領域及び軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、又は6つの超可変ループ(例えば、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)において設定されるChothia定義に従った少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、又は6つの超可変ループ);或いはTMEMに接触するそれら超可変ループに由来する少なくともアミノ酸;或いはTable 2～5、8～11(表1～8、11～14)に示されるChothiaらに従った1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、又は6つの超可変ループに対して、少なくとも1つのアミノ酸変更だが、2つ以下、3つ以下、又は4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、又は挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸を含む。
一実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、Table2～5(表1～8)、8～11(表11～14)において定義される、又はTable 6、7、12、13(表9、10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる、TA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体の6つ全ての超可変ループ(例えば、Table2～5(表1～8)、8～11(表11～14)において設定されるChothia定義に従った6つ全ての超可変ループ)、又は密接に関連する超可変ループ、例えば、同一の、又は少なくとも1つのアミノ酸変更だが、2つ以下、3つ以下、又は4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、又は挿入、例えば、保存的置換)を有する、超可変ループ;或いは、Table2～5(表1～8)、8～11(表11～14)に示されるChothiaらに従った6つ全ての超可変ループに対して、少なくとも1つのアミノ酸変更だが、2つ以下、3つ以下、又は4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、又は挿入、例えば、保存的置換)を有する超可変ループを含む。一実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される任意の超可変ループを含み得る。
さらなる別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、Table2～5(表1～8)、8～11(表11～14)において定義される、又はTable 6、7、12、13(表9、10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる、TA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体における対応する超可変ループと同じ標準構造、例えば、本明細書に記載される抗体の重鎖及び/又は軽鎖可変ドメインの少なくともループ1及び/又はループ2と同じ標準構造を有する少なくとも1つ、2つ、又は3つの超可変ループを含む。超可変ループの標準構造の説明については、例えば、Chothiaら, (1992) J. Mol. Biol. 227:799～817;Tomlinsonら、(1992) J. Mol. Biol. 227:776～798を参照されたい。これらの構造は、これらの参考文献に記載される表の点検によって特定することができる。
ある特定の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、Kabatら及びChothiaらに従って定義されるCDR又は超可変ループの組み合わせを含む。
一実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、Kabat及びChothiaの定義に従って、Table2～5(表1～8)、8～11(表11～14)において定義される、又はTable 6、7、12、13(表9、10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる、TA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体の重鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、又は3つのCDR又は超可変ループ(例えば、Table2～5(表1～8)、8～11(表11～14)において設定される少なくとも1つ、2つ、又は3つのCDR又は超可変ループ);或いはTable 6、7、12、13(表9、10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされるCDR又は超可変ループ;或いは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、又はそれ以上において同一の)配列;或いはTable2～5(表1～8)、8～11(表11～14)に示されるKabat及び/又はChothiaに従った1つ、2つ、又は3つのCDR又は超可変ループに対して、少なくとも1つのアミノ酸変更だが、2つ以下、3つ以下、又は4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、又は挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
例えば、抗TMEM抗体分子は、Kabatらに従ったVH CDR1又はChothiaらに従ったVH超可変ループ1又は、例えば、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)に示されるような、それらの組み合わせを含み得る。抗TMEM抗体分子は、更に、例えば、Kabatらに従ったVH CDR2～3及びKabatらに従った、Table 2～5、8～11(表1～8、11～14)に示されるようなVL CDR1～3を含むことができる。したがって、いくつかの実施形態において、フレームワーク領域は、Kabatらに従って定義されるCDR及びChothiaらに従って定義される超可変ループの組み合わせに基づいて定義される。例えば、抗TMEM抗体分子は、Chothiaらに従ったVH超可変ループ1に基づいて定義されたVH FR1及びKabatらに従った、例えば、Table 2～5、8～11、6、7、12、13 (表1～8、11～14、9、10、15、16) に示されるようなVH CDR1～2に基づいて定義されたVH FR2を含むことができる。抗TMEM抗体分子は、更に、例えば、Kabatらに従ったVH CDR2～3に基づいて定義されるVH FR3～4及びKabatらに従ったVL CDR1～3に基づいて定義されるVL FR1～4を含むことができる。
抗TMEM抗体分子は、Kabat及びChothia定義に従ったCDR又は超可変ループの任意の組み合わせ物を含有することができる。一実施形態において、抗TMEM抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、Table2～5(表1～8)、8～11(表11～14)において定義される、又はTable 6、7、12、13(表9、10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる、TA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体の軽鎖可変領域に由来するKabat及びChothia定義に従った少なくとも1つ、2つ、又は3つのCDR(例えば、Table3.3又は3.4(表5又は6)において設定されるKabat及びChothiaの定義に従った少なくとも1つ、2つ、又は3つのCDR)を含む。好ましい抗TMEM抗体は、Table2～5(表1～8)、8～11(表11～14)において定義されるような、又はTable 6、7、12、13(表9、10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる、TC01及びTM1である。ある実施形態において、例えば、可変領域、CDR(例えば、Chothia CDR又はKabat CDR)、又は本明細書において、例えば、Table2～5(表1～8)、8～11(表11～14)において言及される他の配列を含む実施形態において、当該抗体分子は、単一特異性抗体分子、二重特異性抗体分子であるか、又は抗体の抗原結合性断片、例えば、半抗体(half antibody)又は半抗体の抗原結合性断片を含む抗体分子である。ある実施形態において、当該抗体分子は、IGFBP3対する第1の結合特異性、及びTNF-α、インテグリン、IL1、IL12及びIL23、CD3、CD20、CD80、CD86に対する第2の結合特異性を有する二重特異性抗体分子である。
一実施形態において、抗TMEM抗体分子は、
(i)配列番号1、4、8、10、56、59、62、65、及び68のいずれか1つから選択されるVHCDR1アミノ酸配列と;配列番号2、5、11、57、60、63、66、及び69のいずれか1つから選択されるVHCDR2アミノ酸配列と;配列番号3、6、7、9、12、13、58、61、64、67、及び70のいずれか1つから選択されるVHCDR3アミノ酸配列とを含む重鎖可変領域(VH);並びに
(ii)配列番号14、17、20、23、26、29、71、77、80、82、及び85のいずれか1つから選択されるVLCDR1アミノ酸配列と、配列番号15、18、21、24、27、30、72、78、83、及び86のいずれか1つから選択されるVLCDR2アミノ酸配列と、配列番号16、19、22、25、28、31、73、74、75、76、79、81、84、及び87のいずれか1つから選択されるVLCDR3アミノ酸配列とを含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
一実施形態において、抗TMEM抗体分子の軽鎖又は重鎖可変フレームワーク(例えば、少なくともFR1、FR2、FR3、及び適宜FR4を含む領域)は、(a)ヒト軽鎖又は重鎖可変フレームワークのアミノ酸残基、例えば、ヒト成熟抗体、ヒト生殖系列配列、又はヒトコンセンサス配列に由来する軽鎖又は重鎖可変フレームワーク残基の少なくとも80%、85%、87%、90%、92%、93%、95%、97%、98%、好ましくは100%を含む軽鎖又は重鎖可変フレームワーク;(b)ヒト軽鎖又は重鎖可変フレームワークのアミノ酸残基、例えば、ヒト成熟抗体、ヒト生殖系列配列、又はヒトコンセンサス配列に由来する軽鎖又は重鎖可変フレームワーク残基の20%から80%、40%から60%、60%から90%、又は70%から95%を含む軽鎖又は重鎖可変フレームワーク;(c)非ヒトフレームワーク(例えば、齧歯類のフレームワーク);又は(d)例えば、抗原性又は細胞傷害性決定因子を除去する等のために修飾されている、例えば、脱免疫化又は部分的ヒト化されている、非ヒトフレームワークから選択することができる。一実施形態において、当該軽鎖又は重鎖可変フレームワーク領域(特に、FR1、FR2、及び/又はFR3)は、ヒト生殖系列遺伝子のVL又はVHセグメントのフレームワークに対して少なくとも70、75、80、85、87、88、90、92、94、95、96、97、98、99%同一であるか又は同一である軽鎖又は重鎖可変フレームワーク配列を含む。
ある特定の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、10、15、20、又はそれ以上の変更、例えば、アミノ酸置換又は欠失を有する重鎖可変ドメインを含む。
一実施形態において、抗TMEM抗体分子の重鎖又は軽鎖可変領域又はその両方は、本明細書に記載される核酸配列、或いは例えば、低過酷、中過酷、又は高過酷な条件下、又は本明細書に記載される他のハイブリダイゼーション条件下において、本明細書に記載される核酸配列(例えば、Table 6、7、12、13(表9、10、15、16)に示される核酸配列)にハイブリダイズする核酸又はその補体によってコードされるアミノ酸配列を含む。
別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、Table 2～5、8～11(表3～8、11～14)に記載されるアミノ酸配列、又はそれらと実質的に同一である配列(例えば、それらと少なくとも約85%、90%、95%、99%、又はそれ以上同一である配列、又は、Table 2～5、8～11(表3～8、11～14)に示される配列とは1以下、2以下、5以下、10以下、又は15以下のアミノ酸残基において異なる配列)を有する少なくとも1つ、2つ、3つ、又は4つの抗原結合性領域、例えば、可変領域を含む。別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、Table 2～5、8～11(表3～8、11～14)に記載されるヌクレオチド配列、又はそれらと実質的に同一である配列(例えば、それらと少なくとも約85%、90%、95%、99%、又はそれ以上同一である配列、又は、2～5、8～11(表3～8、11～14)に示される配列とは3以下、6以下、15以下、30以下、又は45以下のヌクレオチドにおいて異なる配列)を有する核酸によってコードされるVH及び/又はVLドメインを含む。
さらなる別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、Table 2～5、8～11(表3～8、11～14)に記載されるアミノ酸配列、又はそれらと実質的に相同である配列(例えば、それらと少なくとも約85%、90%、95%、99%、又はそれ以上同一である配列、及び/又は1つ、2つ、3つ、又はそれ以上の置換、挿入、又は欠失、例えば、保存された置換を有する配列)を有する重鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、又は3つのCDRを含む。さらなる別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、Table 2～5、8～11(表3～8、11～14)に記載されるアミノ酸配列、又はそれらと実質的に相同である配列(例えば、それらと少なくとも約85%、90%、95%、99%、又はそれ以上同一である配列、及び/又は1つ、2つ、3つ、又はそれ以上の置換、挿入、又は欠失、例えば、保存された置換を有する配列)を有する軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、又は3つのCDRを含む。さらなる別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、Table 2～5、8～11(表3～8、11～14)に記載されるアミノ酸配列、又は、それらと実質的に相同である配列(例えば、それらと少なくとも約85%、90%、95%、99%、又はそれ以上同一である配列、及び/又は1つ、2つ、3つ、又はそれ以上の置換、挿入、又は欠失、例えば、保存された置換を有する配列)を有する重鎖及び軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、又は6つのCDRを含む。
さらなる他の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD、及びIgEの重鎖定常領域(Fc)から選択される、特に、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4の重鎖定常領域から選択される重鎖定常領域、より詳しくは、IgG1、又はIgG4(例えば、ヒトIgG1、IgG2、又はIgG4)の重鎖定常領域を有する。一実施形態において、重鎖定常領域は、ヒトIgG1である。別の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、例えば、κ又はλの軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を有する。一実施形態において、定常領域は、抗TMEM抗体分子の特性を変えるように(例えば、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞の機能、補体の機能、半減期、凝集、及び安定性のうちの1つ又は複数を増加又は減少させるように)、変更、例えば、変異される。ある特定の実施形態において、抗TMEM抗体分子は、変異されたヒトIgG4を含む。
一実施形態において、抗TMEM抗体分子は、単離されるか、又は組換え型である。
一実施形態において、抗TMEM抗体分子は、ヒト化抗体分子又はヒト抗体分子である。
本発明は、本明細書に記載されるような、重鎖及び軽鎖可変領域をコードする一方又は両方のヌクレオチド配列、CDR、超可変ループ、抗TMEM抗体分子のフレームワーク領域を含む核酸分子も特徴とする。ある特定の実施形態において、抗TMEM抗体分子をコードするヌクレオチド配列は、コドン最適化される。例えば、本発明は、例えば、Table2～5(表1～8)、8～11(表11～14)において定義される、又はTable 6、7、12、13(表9、10、15、16)におけるヌクレオチド配列又はそれらと実質的に同一である配列によってコードされる、TA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかのうちの1つ又は複数から選択される抗TMEM抗体分子のそれぞれ重鎖可変領域及び軽鎖可変領域をコードする第1及び第2の核酸を特徴とする。例えば、当該核酸は、Table 6、7、12、13(表9、10、15、16)に記載されるヌクレオチド配列、又はそれらと実質的に同一である配列(例えば、それらと少なくとも約85%、90%、95%、99%、又はそれ以上同一である配列、又は、Table 6、7、12、13(表9、10、15、16)に示される配列とは3以下、6以下、15以下、30以下、又は45以下のヌクレオチドにおいて異なる配列)を含むことができる。
他の実施形態において、核酸分子は、Table 2～5、8～11(表3～8、11～14)において定義される、或いはTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)におけるヌクレオチド配列によってコードされる、TA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかのアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメイン及び/又は重鎖定常領域をコードするヌクレオチド配列;;或いは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約85%、90%、95%、99%、又はそれ以上において同一の)配列を含む。
他の実施形態において、核酸分子は、Table 2～5、8～11(表3～8、11～14)において定義されるTA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかのアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン及び/又は軽鎖定常領域をコードするヌクレオチド配列;或いはTable 6～7、12、13(表9～10、15、16)におけるヌクレオチド配列;或いは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約85%、90%、95%、99%、又はそれ以上において同一の)配列を含む。
抗TMEM重鎖及び軽鎖可変ドメイン及び定常領域をコードする前述のヌクレオチド配列は、別々の核酸分子に、又は同じ核酸分子に存在することができる。ある特定の実施形態において、当該核酸分子は、リーダー配列をコードするヌクレオチド配列を含む。
ある特定の実施形態において、核酸分子は、Table 2～5、8～11(表3～8、11～14)に記載されるアミノ酸配列、又は、それらと実質的に相同である配列(例えば、それらと少なくとも約85%、90%、95%、99%、又はそれ以上同一である配列、及び/又は1つ、2つ、3つ、又はそれ以上の置換、挿入、又は欠失、例えば、保存された置換を有する配列)を有する重鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、又は3つのCDR、又は超可変ループをコードするヌクレオチド配列を含む。
別の実施形態において、核酸分子は、Table 2～5、8～11(表3～8、11～14)に記載されるアミノ酸配列、又はそれらと実質的に相同である配列(例えば、それらと少なくとも約85%、90%、95%、99%、又はそれ以上同一である配列、及び/又は1つ、2つ、3つ、又はそれ以上の置換、挿入、又は欠失、例えば、保存された置換を有する配列)を有する軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、又は3つのCDR、又は超可変ループをコードするヌクレオチド配列を含む。
さらなる別の実施形態において、核酸分子は、Table 2～5、8～11(表3～8、11～14)に記載されるアミノ酸配列、又はそれらと実質的に相同である配列(例えば、それらと少なくとも約85%、90%、95%、99%、又はそれ以上同一である配列、及び/又は1つ、2つ、3つ、又はそれ以上の置換、挿入、又は欠失、例えば、保存された置換を有する配列)を有する重鎖及び軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、又は6つのCDR、又は超可変ループをコードするヌクレオチド配列を含む。
別の実施形態において、核酸分子は、Table 2～5、8～11(表3～8、11～14)において定義されるTA02、TC01、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれか、又はそれらと実質的に同一である配列に対する1つ又は複数の重鎖フレームワーク領域(例えば、VHFW1(タイプa)、VHFW1(タイプb)、VHFW1(タイプc)、VHFW1(タイプd)、VHFW2(タイプa)、VHFW2(タイプa')、VHFW2(タイプb)、VHFW2(タイプc)、VHFW2(タイプd)、VHFW2(タイプe)、VHFW3(タイプa)、VHFW3(タイプb)、VHFW3(タイプc)、VHFW3(タイプd)、VHFW3(タイプe)、又はVHFW4のいずれか、又は、それらの任意の組み合わせ、例えば、本明細書に記載されるフレームワークの組み合わせ)を含む。例えば、核酸分子は、Table 6、7、12、13(表9、10、15、16)に記載されるヌクレオチド配列、又はそれらと実質的に同一である配列(例えば、それらと少なくとも約85%、90%、95%、99%、又はそれ以上同一である配列、又は、Table 6、7、12、13(表9、10、15、16)に示される配列とは3以下、6以下、15以下、30以下、又は45以下のヌクレオチドにおいて異なる配列)を含むことができる。
別の実施形態において、核酸分子は、Table 2～5、8～11(表3～8、11～14)において定義されるE01、E02、E08、E14、E19、E20、E23、E24、又はM1のいずれか、又はそれらと実質的に同一である配列に対する、1つ又は複数の軽鎖フレームワーク領域(例えば、VLFW1(タイプa)、VLFW1(タイプb)、VLFW1(タイプc)、VLFW1(タイプd)、VLFW1(タイプe)、VLFW1(タイプf)、VLFW2(タイプa)、VLFW2(タイプc)、VLFW3(タイプa)、VLFW3(タイプb)、VLFW3(タイプc)、VLFW3(タイプd)、VLFW3(タイプe)、VLFW3(タイプf)、VLFW3(タイプg)、又はVLFW4のいずれか、或いはそれらの任意の組み合わせ、例えば、本明細書に記載されるフレームワークの組み合わせ)を含む。例えば、当該核酸分子は、Table 6、7、12、13(表9、10、15、16)に記載されるヌクレオチド配列、又はそれらと実質的に同一である配列(例えば、それらと少なくとも約85%、90%、95%、99%、又はそれ以上同一である配列、又は、Table 6、7、12、13(表9、10、15、16)に示される配列とは3以下、6以下、15以下、30以下、又は45以下のヌクレオチドにおいて異なる配列)を含むことができる。
別の実施形態において、当該核酸分子は、本明細書に記載される1つ又は複数の重鎖フレームワーク領域及び1つ又は複数の軽鎖フレームワーク領域を含む。当該重鎖及び軽鎖フレームワーク領域は、同じベクター又は別々のベクターに存在し得る。
別の態様において、本願は、本明細書に記載される核酸又は公知の方法に従ってコドン最適化のために変更された核酸を含有する宿主細胞及びベクターを特徴とする。当該核酸は、同じ宿主細胞又は別々の宿主細胞に存在する単一のベクター又は別々のベクターに存在し得る。当該宿主細胞は、真核細胞、例えば、哺乳動物細胞、昆虫細胞、酵母細胞、又は原核細胞、例えば、大腸菌(E. coli)であり得る。例えば、当該哺乳動物細胞は、培養細胞又は細胞系であり得る。例示的哺乳動物細胞としては、リンパ球細胞系(例えば、NSO)、チャイニーズハムスター卵巣細胞(CHO)、COS細胞、卵母細胞、及び遺伝子導入動物に由来する細胞、例えば、乳房上皮細胞が挙げられる。
一態様において、本発明は、本明細書に記載される抗体分子を提供する方法を特徴とする。当該方法は、TMEM抗原(例えば、TMEMエピトープの少なくとも一部を含む抗原)を提供する工程;当該TMEMポリペプチドに特異的に結合する抗体分子を得る工程;及び当該抗体分子がTMEMポリペプチドに特異的に結合するか否かを評価する工程、又は、TMEMの活性の調節、例えば、阻害における抗体分子の有効性を評価する工程を含む。当該方法は、更に、対象、例えば、ヒト又は非ヒト動物に当該抗体分子を投与する工程を含むことができる。
別の態様において、本発明は、薬学的に許容される担体、賦形剤、又は安定化剤と、本明細書に記載される抗TMEM抗体分子の少なくとも1つとを含む組成物、例えば、医薬組成物を提供する。一実施形態において、当該組成物、例えば、医薬組成物は、抗体分子と1つ又は複数の薬剤、例えば、本明細書に記載される治療剤又は他の抗体分子との組み合わせを含む。一実施形態において、当該抗体分子は、ラベル又は治療剤にコンジュゲートされる。
本明細書において開示される抗TMEM抗体分子は、上記において示されたIGFBP3の1つ又は複数の活性を阻害、低減、又は中和することができる。したがって、そのような抗体分子は、対象におけるIGFBP3誘導活性の阻害、低減、又は中和が望まれる障害を処置又は予防するために使用することができる。
抗TMEM抗体分子の使用
本発明の抗体は、様々な障害又は状態、例えば、糖尿病、並びに腸疾患、吸収不良症候群、炎症性腸疾患、悪液質、クローン病、潰瘍性大腸炎、セリアック病、糖尿病性腸疾患等の処置方法において使用される。
したがって、別の態様において、対象におけるIGFBP3/TMEM219軸を調節する方法が提供される。当該方法は、対象におけるIGFBP3/TMEM219軸が調節されるように、対象に、本明細書において開示される抗TMEM抗体分子(例えば、抗TMEM抗体分子の治療有効量)を、単独において又は1つ又は複数の薬剤又は手順との組み合わせにおいて投与する工程を含む。一実施形態において、当該抗体分子は、対象におけるIGFBP3/TMEM219軸活性を阻害、低減、又は中和、又は遮断する。当該対象は、哺乳動物、例えば、霊長類、好ましくは、高等霊長類、例えば、ヒト(例えば、本明細書に記載される障害を有する患者又は有するリスクにある患者)であり得る。一実施形態において、対象は、IGFBP3/TMEM219軸を阻害、低減、中和、又は遮断することを必要としている。一実施形態において、対象は、本明細書に記載される障害、例えば、糖尿病、又は炎症性腸疾患(IBD)、吸収不良症候群、過敏性腸疾患、悪液質、セリアック病、本明細書に記載される糖尿病性腸疾患を有するか又は有するリスクにある。
マウスにおけるDSS誘導大腸炎に対する新たに生成した抗TMEM mAbの効果。DSS誘導大腸炎のマウス研究における実験タイムライン:C57BL/6マウスに、5日間、飲料水中において2.5%のDSSを投与し、0.5mg/マウスの抗TMEMm Absの毎日の腹腔内投与を大腸炎誘導の3日前に開始し、最後のDSS投与の7日後に安楽死させるまで行った。 (A)疾患活動性指数(DAI)、マウスにおける大腸炎の重症度を特定するために使用される採点法、及び(B)組織学的スコア(Histological score)、炎症の重症度及び範囲を評価するために使用される診査法、粘膜における細胞浸潤物の強度、粘膜下組織におけるその拡張、上皮性病変の存在、及び粘膜再生を、創傷治癒の間のDSSの最後の投与の7日後/慢性フェーズの始まりにおいて評価した。値は、平均±SEMである。DSS群に対して、*はp≦0.05を表し、**はp≦0.01を表す。 安楽死において、すなわち、DSSの最後の投与の7日後に得られた結腸のパラフィン切片を、組織学的検査のために、(A)May-Grunwald-Giemsaで染色した。(B)TUNELアッセイによってアポトーシス細胞を検出し、DAPIによって対比染色した。(C)PCNAアッセイによって細胞増殖を検出し、DAPIによって対比染色した。 T1Dマウスモデルにおける糖尿病発症に対する、新たに生成した抗TMEM219 mAbの効果。NODマウス研究の実験タイムライン。 (A)22週齢のNODマウスの糖尿病発症の予防における抗TMEM219 mAbの効果、及び(B)血糖値(Blood glucose level)の維持における抗IGFBP3mAbsの効果。抗TMEM219 mAbの使用によって得られる糖尿病予防を、100%のマウスにおいて観察した。*は、マンテル-コックス分析対未処理によるp<0.05を表す。糖尿病なし(Diabetes free)は、血糖正常のマウスである。3回の連続測定における血糖>250mg/dlを糖尿病発症に定義した。糖尿病なしのマウスは、3回の連続測定において血糖>250mg/dlを有さない。 安楽死で得られた膵臓組織の連続パラフィン切片を調製し、H&Eで染色し、膵島の領域及びモルホロジーを光学顕微鏡により分析した。(A)代表的画像を示す;元の倍率は20倍。(B)膵島炎スコア(insulitis score)を示す。(B)において、細胞浸潤の程度を0から4において得点化した。膵島炎は、動物1匹あたり最小で30の膵島を調べることによって得点化した。*は、マン・ホイットニー検定全て対未処理によるp < 0.05を表す。 安楽死で得られた膵臓組織の連続パラフィン切片を調製し、それは、インスリンに対する免疫組織化学的染色を示している(茶色)。代表的画像を示す;元の倍率は20倍。 IGFBP3に曝露されたβ細胞系でのCASP8発現の下方制御における抗TMEM219 mAbの効果。**はIGFBP3に対するp<0.01を表し、***はIGFBP3に対するp<0.001を表す(n=3実験)。 IGFBP3が富化されたT1D血清(T1D serum)に曝露されたβ細胞系でのCASP8発現の下方制御における抗TMEM219 mAbの効果。*はT1Dに対するp<0.05を表し、**はT1Dに対するp<0.01を表す(n=3実験)。 IGFBP3に曝露されたヒト膵島でのCASP8発現の下方制御における抗TMEM219 mAbの効果。N=3実験。***はIGFBP3に対するP<0.001を表す。 IGFBP3に曝露されたヒト膵島でのアポトーシス(apoptosis)の低減における抗TMEM219 mAbの効果。N=3実験。***はIGFBP3に対するP<0.001を表し、*はp<0.05を表す。 T1D血清に曝露されたヒト膵島でのアポトーシスの低減における抗TMEM219 mAbの効果。N=3実験。**はT1D血清に対するP<0.01を表し、*はT1D血清に対するp<0.05を表す。 T1D血清に曝露されたβ細胞系でのCASP8発現の下方制御における抗TMEM219 mAbの効果。N=3実験。**はT1D血清に対するP<0.001を表す。 β細胞系のアポトーシスに対する抗TMEM219 mAbの効果。**は、IGFBP3対未処理におけるp<0.01を表す。実験は72時間培養したβ-lox5において3連で実施した。 β細胞系でのCASP8 mRNA発現に対する抗TMEM219 mAbの効果。****はIGFBP3対未処理のTM1、TC01におけるp<0.0001を表し、**はIGFBP3対抗TMEM219市販におけるp<0.01を表す。実験は、72時間培養したβ-lox5において3連で実施した。 糖尿病マウスモデルにおける糖尿病発症に対する、新たに生成した抗TMEM219 mAbの効果。糖尿病の低用量ストレプトゾトシンモデルの実験タイムライン。 複数の低用量のストレプトゾトシン(ldSTZ、50 mg/Kg)を注入し、抗TMEM219 mAbで処置した、又は未処置のままの、B6マウスにおいて測定した血糖値を示す線グラフ(n=5)。 10日目に抗TMEM219 mAbを伴った/を伴わないld-STZを注入されたB6マウスにおいてIPGTT(1g/Kg)の際の60分間において測定した血糖(n=5)。*はp<0.05を、**はp<0.01を表す。 ldSTZを注入し抗TMEM219 mAbを用いて/用いないで処理したB6マウスから得られた連続膵島組織片の代表的H&E染色(n=3)。元の倍率の20倍、スケールバーは100μm。
本発明の抗体は、ヒトTMEM219に特異的に結合する。本明細書に記載されるように、本発明の抗体は、まとめて、「抗TMEM又は抗TMEM219抗体」と呼ばれる。そのような全ての抗体は、本明細書における説明によって包含される。それぞれの抗体は、単独において、又は本発明の方法における組み合わせにおいて使用することができる。
TMEM219「に特異的に結合する抗体」によって、当該抗体が、別の非相同ヒトペプチドとは実質的に交差反応しないことが意図される。「実質的に交差反応しない」により、当該抗体又は断片が、非相同タンパク質に対して結合親和性を有し、それが、TMEM219に対する結合親和性の10%未満、より好ましくは5%未満、更により好ましくは1%未満であることが意図される。
様々な実施形態において、本明細書に使用される、TMEM219「に特異的に結合する」抗体は、オクテットバイオレイヤー干渉法デバイスによって、又は、例えば、BIAcore(商標)システム(Biacore Life Sciences division of GE Healthcare、ピスキャタウェイ、ニュージャージー州)を使用して、表面プラズモン共鳴アッセイにおいて、又は結合平衡除外法において、又は当技術分野において公知の任意の方法において、測定した場合に、約1000nM未満、約500nM未満、約300nM未満、約200nM未満、約100nM未満、約90nM未満、約80nM未満、約70nM未満、約60nM未満、約50nM未満、約40nM未満、約30nM未満、約20nM未満、約10nM未満、約5nM未満、約4nM未満、約3nM未満、約2nM未満、約1nM未満、又は約0.5nM未満のKDで、TMEM219又はその細胞外部分、例えば、ecto-TMEM等に結合する抗体を含む。
本明細書における用語「抗体」は、参照により本明細書に組み入れられる(25)において抗体として記載される全てのポリペプチドを含む、当技術分野において理解される最も広い意味において使用される。
例えば、用語「抗体」は、本明細書に使用される場合、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、単一特異性及び多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)、及び断片が所望の抗原結合活性を示す限り、抗体断片(抗原結合性断片)を包含する。当該用語は、当技術分野において認識されるその最も広い意味を有し、全ての公知の形式、例えば、これらに限定されるわけではないが、二価の単一特異性モノクローナル抗体、二価の二重特異性抗体、三価の三重特異性抗体、F(ab)断片、F(ab)'2断片、scFv断片、ダイアボディ、単一ドメイン抗体、例えば、ラクダ化VHHシグナルドメイン抗体等、TandAb、及びフレキシボディを包含する。
抗体の「抗原結合性断片」又は同等の抗体の「抗原結合性部分」等の用語は、本明細書に使用される場合、抗体の一部を含み、抗原に特異的に結合して複合体を形成するような、天然に存在する、酵素的に入手可能な、合成の、又は遺伝子操作による、任意のポリペプチド又は糖タンパク質を包含する。抗体の抗原結合性断片は、例えば、任意の好適な標準的技術、例えば、抗体可変ドメイン及び適宜定常ドメインをコードするDNAの操作及び発現を伴う、タンパク質分解的消化又は組換え遺伝子操作技術等を使用して、完全な抗体分子から得られ得る。そのようなDNAは、公知であり、及び/又は、例えば、市販の供給元、DNAライブラリー(例えば、ファージ抗体ライブラリーを含む)から容易に入手可能であり、又は合成することができる。当該DNAは、配列決定され得、例えば、1つ又は複数の可変ドメイン及び/又は定常ドメインを好適な立体配置へと整列させるため、又は、コドンを導入するため、システイン残基を作り出すため、アミノ酸を修飾、追加、又は欠失するために、化学的に、又は、分子生物学技術を使用することによって、操作される。
完全抗体分子を用いる場合、抗原結合性断片は、単一特異的であり得るか、又は多重特異的(例えば、二重特異的)であり得る。抗体の多重特異的抗原結合性断片は、典型的には、少なくとも2つの異なる可変ドメインを含み、その場合、各可変ドメインは、別々の抗原に、又は同じ抗原上の異なるエピトープに、特異的に結合することができる。
特定の実施形態において、抗体の抗原結合性断片は、少なくとも1つの定常ドメインに共有結合によって連結された少なくとも1つの可変ドメインを含む。抗体の抗原結合性断片内に見出され得る可変ドメイン及び定常ドメインの非限定的な例示的立体配置としては、(i)VH-CH1;(ii)VH-CH2;(iii)VH-CH3;(iv)VH-CH1-CH2;(v)VH-CH1-CH2-CH3;(vi)VH-CH2-CH3;(vii)VH-CL;(viii)VL-CH1;(ix)VL-CH2;(x)VL-CH3;(xi)VL-CH1-CH2;(xii)VL-CH1-CH2-CH3;(xiii)VL-CH2-CH3;及び(xiv)VL-CLが挙げられる。上記に一覧した例示的立体配置のいずれかを含む、可変ドメイン及び定常ドメインの任意の立体配置において、当該可変ドメイン及び定常ドメインは、お互いに直接連結され得るか、又は完全又は部分的ヒンジ領域又はリンカー領域によって連結され得る。ヒンジ領域は、様々な実施形態において、少なくとも2(例えば、5、10、15、20、40、60、又はそれ以上)のアミノ酸からなり得、結果として、単一のポリペプチド分子において、隣接する可変ドメイン及び/又は定常ドメインの間に、フレキシブルな又はセミフレキシブルな連結を生じる。その上、抗体の抗原結合性断片は、様々な実施形態において、(例えば、ジスルフィド結合による)お互いとの及び/又は1つ若しくは複数の単量体VH又はVLドメインとの非共有結合性会合における、上記において一覧した可変ドメイン及び定常ドメインの立体配置のいずれかにおけるホモ二量体又はヘテロ二量体(又は他の多量体)を含むことができる。
抗体の「抗原結合性断片」なる用語は、更に、単一ドメイン抗体を含む。
単一ドメイン抗体は、単一の単量体可変抗体ドメインからなる抗体断片である。いくつかの実施形態において、単一ドメイン抗体は、ラクダ科の動物に由来する抗体重鎖の可変ドメインから得られる(ナノボディ又はVHH断片とも称される)。いくつかの実施形態において、単一ドメイン抗体は、サメから得られる、自発的ヒト重鎖可変ドメイン(aVH)又はVNAR断片である。
抗原結合性断片の非限定的な例としては、(i)Fab断片;(ii)F(ab')2断片;(iii)Fd断片;(iv)Fv断片;(v)単鎖Fv(scFv)分子;(vi)dAb断片;及び(vii)抗体の超可変領域(例えば、単離された相補性決定領域(CDR)、例えば、CDR3ペプチド等)又は拘束されたFR3-CDR3-FR4ペプチドを模倣するアミノ酸残基からなる最小認識ユニットが挙げられる。他の操作された分子、例えば、ドメイン特異的抗体、単一ドメイン抗体、ドメイン欠失抗体、キメラ抗体、CDR移植抗体、ダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ、ミニボディ、ナノボディ、(例えば、一価のナノボディ及び二価のナノボディ)、小モジュラー免疫薬(SMIPs)、及びサメ可変IgNARドメイン等、も、本明細書において使用される表現「抗原結合性断片」に包含される。
抗体の抗原結合性断片は、典型的には、少なくとも1つの可変ドメインを含むであろう。当該可変ドメインは、任意のサイズ又はアミノ酸組成であり得、概して、1つ又は複数のフレームワーク配列に隣接するか又はインフレームにおける、少なくとも1つのCDRを含むであろう。VLドメインに関連するVHドメインを有する抗原結合性断片において、当該VH及びVLドメインは、お互いに対して任意の好適な配置に位置され得る。例えば、当該可変領域は、二量性であり、VH-VH、VH-VL、又はVL-VL二量体を含有し得る。或いは、抗体の抗原結合性断片は、単量体VH又はVLドメインを含有し得る。
本発明の抗体又は結合性分子は、更に、活性物質、好ましくはナノ粒子又はラジオヌクレオチドに連結することができる。
本明細書において使用される場合、用語「抗原結合性分子」は、最も広い意味において、抗原決定基に特異的に結合する分子を意味する。抗原結合性分子の例は、抗原結合性抗体断片を含めた抗体、及び足場抗原結合タンパク質である。
用語「抗原結合性部分」は、抗原決定基に特異的に結合する抗原結合性分子の一部分を意味する。抗原結合性部分は、標的細胞上の抗原に特異的に結合することができる抗体及びその抗原結合性断片、例えば、scFv等を含む。特定の態様において、抗原結合性部分は、それが取り付けられたエンティティ、例えば、細胞等を、標的部位へと向かわせることができる。加えて、標的細胞抗原に特異的に結合することができる抗原結合性部分は、本明細書の下記において定義される足場抗原結合タンパク質、例えば、設計された反復タンパク質又は設計された反復ドメイン、例えば、設計されたアンキリン反復タンパク質(DARPin)(例えば、WO2002/020565を参照されたい)又はリポカリン(アンチカリン)等に基づく結合性ドメインを含む。
細胞骨格への膜内在性タンパク質の取り付けを媒介するタンパク質のファミリーであるアンキリンから得られる設計されたアンキリン反復タンパク質(DARPin)。単一のアンキリン反復は、2つのα螺旋とβターンからなる33残基モチーフである。それらは、各反復の第1のα螺旋及びβターンにおいて残基をランダマイズすることによって、異なる標的抗原に結合するように操作され得る。それらの結合界面は、モジュールの数を増加させることによって(親和性成熟の方法)、増加させることができる。さらなる詳細については、J. Mol. Biol. 332, 489～503 (2003)、PNAS 100(4), 1700～1705 (2003)、及びJ. Mol. Biol. 369, 1015～1028 (2007)、並びにUS20040132028を参照されたい。
ある特定の実施形態において、本明細書において提供される抗体及び抗原結合性分子は、抗原結合性部分がグリコシル化される程度を、増加又は減少させるように変更される。当該分子のグリコシル化バリアントは、1つ又は複数のグリコシル化部位が作り出されるように、又は除去されるようにアミノ酸配列を変更することによって簡便に得られ得る。抗原結合性分子が、Fc領域を含む場合、それらに取り付けられる炭水化物は変更され得る。一態様において、Fc領域に(直接的又は間接的に)取り付けられたフコースを欠く炭水化物構造を有する抗原結合性分子のバリアントが提供される。そのようなフコシル化バリアントは、改善されたADCC機能を有し得、例えば、米国特許出願公開第2003/0157108号(Presta, L.)又はUS2004/0093621(協和発酵工業社)を参照されたい。本発明の抗原結合性分子のさらなるバリアントとしては、二分されたオリゴ糖、例えば、Fc領域に取り付けられた二分岐オリゴ糖がGlcNAcによって二分されるオリゴ糖を有するものが挙げられる。そのようなバリアントは、低減したフコシル化及び/又は改善されたADCC機能を有し得、例えば、WO2003/011878(Jean-Mairetら);米国特許第6,602,684号(Umanaら);及びUS2005/0123546 (Umanaら)を参照されたい。Fc領域に取り付けられたオリゴ糖における少なくとも1つのガラクトース残基を有するバリアントも提供される。そのような抗体バリアントは、改善されたCDC機能を有し得、例えば、WO1997/30087(Patelら);WO1998/58964(Raju, S.)及びWO1999/22764(Raju, S.)に記載される。
ある特定の実施形態において、分子の1つ又は複数の残基がシステイン残基で置換されている、本発明の抗体又は抗原結合性分子のシステイン操作されたバリアント、例えば、「thioMAb」を作り出すことは望ましくあり得る。特定の実施形態において、当該置換された残基は、当該分子におけるアクセス可能な部位において生じる。これらの残基をシステインで置換することにより、結果として、反応性チオール基が、当該抗体のアクセス可能な部位に位置され、イムノコンジュゲートを作り出すために、当該抗体を他の部分、例えば、薬物部分又はリンカー-薬物部分等にコンジュゲートするために使用され得る。ある特定の実施形態において、以下の残基の任意の1つ又は複数は、システインで置換され得る:軽鎖のV205(Kabat付番);重鎖のA118(EU付番);及び重鎖Fc領域のS400(EU付番)。システイン操作された抗原結合性分子は、例えば、米国特許第7,521,541号に記載されているように生成され得る。
ある特定の態様において、本明細書において提供される抗体又は抗原結合性分子は、当技術分野において公知で容易に利用可能な追加の非タンパク質性部分を含むように、更に修飾され得る。当該抗体又は抗原結合性分子の誘導体化にとって好適な部分としては、これらに限定されるわけではないが、水溶性ポリマーが挙げられる。水溶性ポリマーの非限定的な例としては、これらに限定されるわけではないが、ポリエチレングリコール(PEG)、エチレングリコール/プロピレングリコールのコポリマー、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、ポリ-1、3-ジオキソラン、ポリ-1,3,6-トリオキサン、エチレン/無水マレイン酸コポリマー、ポリアミノ酸(ホモポリマー又はランダムコポリマーのどちらか)、及びデキストラン又はポリ(n-ビニルピロリドン)ポリエチレングリコール、プロプロピレン(propropylene)グリコールホモポリマー、プロリプロピレン(prolypropylene)オキシド/エチレンオキシドコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオール(例えば、グリセロール)、ポリビニルアルコール、並びにそれらの混合物が挙げられる。ポリエチレングリコールプロピオンアルデヒドは、水中における安定性に起因する製造上の利点を有し得る。当該ポリマーは、任意の分子量のものであってもよく、分岐していても分岐していなくてもよい。抗体に結合したポリマーの数は様々であり得、2つ以上のポリマーが結合される場合、それらは、同じ分子又は異なる分子であり得る。一般的に、誘導体化に使用されるポリマーの数及び/又はタイプは、これらに限定されるわけではないが、向上させるべき抗体の特定の特性又は機能、当該抗体誘導体が、規定された条件下の療法において使用されるか否か等の考慮に基づいて決定することができる。
別の態様において、放射線への曝露によって選択的に加熱され得る抗体及び非タンパク質性部分のコンジュゲートが提供される。一実施形態において、当該非タンパク質性部分は、炭素ナノチューブである(Kam, N.W.ら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102 (2005) 11600～11605)。当該放射線は、任意の波長のものであり得、例えば、これらに限定されるわけではないが、通常の細胞を害さないが、非タンパク質性部分を、抗体-非タンパク質性部分の近位の細胞が死ぬ温度まで加熱する波長が挙げられる。別の態様において、本明細書において提供される抗原結合性分子のイムノコンジュゲートが、得られ得る。「イムノコンジュゲート」は、1つ又は複数の非相同分子、例えば、これらに限定されるわけではないが、細胞毒性薬等にコンジュゲートした抗体である。
抗体の当該定常領域は、補体を固定する抗体の能力において重要であり、細胞依存性細胞傷害性を媒介する。したがって、抗体のアイソタイプは、当該抗体が細胞傷害性を媒介することが望ましいか否かに基づいて選択され得る。ある特定の実施形態において、当該定常領域は、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4定常領域である。
本発明は、様々な実施形態において、例えば、所望の抗体形態の収量を改善するために生産において望ましくあり得るヒンジ領域、CH2領域、又はCH3領域に1つ又は複数の変異を有する抗体を包含する。いくつかの実施形態において、例えば、本明細書に記載される抗体は、ヒトIgG4定常領域を含む。特定の実施形態において、当該IgG4定常領域は、Fabアーム交換(Angalら(1993) Molecular Immunology 30:105)を、ヒトIgG1ヒンジを使用して典型的に観察されるレベルまで低減させたヒトIgG4ヒンジのヒンジ領域に単一のアミノ酸置換を有する。
ある特定の実施形態において、当該抗体は、血清半減期を増加させる、定常領域における1つ又は複数の変異、例えば、米国特許第7,083,784号、同第8,323,962号、及びDall'Aquaら、J. Biol. Chem. 281(33):23514～23524 (2006); Hintonら、J. Immunology 176:346～356 (2006); Yeungら、J. Immunology 182:7663～7671 (2009);及びPetkovaら、Intn'l Immunology,18: 1759～1769 (2006)に記載されるものを含み、なお、当該文献は、参照によりその全体が本明細書に組み入れられる。
用語「ヒト抗体」は、本明細書に使用される場合、ヒト生殖細胞系列免疫グロブリン配列に由来する可変領域及び定常領域を有する抗体を含むことが意図される。それにもかかわらず、本発明において取り上げられるヒト抗体は、様々な実施形態において、例えば、CDRにおいて、及びいくつかの実施形態ではCDR3において、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列によってコードされないアミノ酸残基(例えば、インビトロでのランダム変異誘発又は部位特異的変異誘発によって、又はインビボでの体細胞変異によって導入された変異)を含むことができる。しかしながら、用語「ヒト抗体」は、本明細書に使用される場合、CDR配列が、ヒトフレームワーク配列にグラフト化されている、別の哺乳動物種、例えば、マウス等の生殖系列に由来する抗体を含むことを意図しない。
用語「組換えヒト抗体」は、本明細書に使用される場合、組換え手段によって調製、発現、作出、又は単離される全てのヒト抗体、例えば、宿主細胞へトランスフェクトされた組換え発現ベクターを使用して発現される抗体(下記に更に記載される)、組換え型から単離された抗体、コンビナトリアルヒト抗体ライブラリー(下記に更に記載される)、ヒト免疫グロブリン遺伝子に対してトランスジェニックである動物(例えば、マウス)から単離された抗体(例えば、参照によりその全体が本明細書に組み入れられる、Taylorら(1992) Nucl. Acids Res.20:6287～6295を参照されたい)、又は他のDNA配列へのヒト免疫グロブリン遺伝子配列のスプライシングを伴う任意の他の手段によって調製、発現、作出、又は単離される抗体等を含むことが意図される。そのような組換えヒト抗体は、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列に由来する可変領域及び定常領域を有する。しかしながら、ある特定の実施形態において、そのような組換えヒト抗体は、インビトロ変異誘発を受け(又は、ヒトIg配列に対する動物トランスジェニックが使用される場合は、インビボ体細胞変異)、結果として、当該組換え抗体のVH及びVL領域のアミノ酸配列は、ヒト生殖系列VH及びVL配列に由来しそれらに関連するが、インビボにおいてヒト抗体生殖系列レパートリー内には天然には存在し得ない、配列である。
「単離された抗体」は、本明細書に使用される場合、同定され、その天然環境の少なくとも1つの構成要素から分離及び/又は回収されている抗体を意味する。例えば、有機体の少なくとも1つの構成要素から、又は当該抗体が天然において存在するか又は天然において生み出される組織又は細胞から分離又は除去されている抗体は、「単離された抗体」である。様々な実施形態において、単離された抗体は、組換え細胞内においてインサイチューの抗体も含む。他の実施形態において、単離された抗体は、少なくとも1つの精製工程又は単離工程を受けている抗体である。様々な実施形態において、単離された抗体は、他の細胞材料及び/又は化学物質を実質的に不含であり得る。
用語「エピトープ」は、パラトープとして知られる抗体分子の可変領域における特定の抗原結合性部位と相互作用する抗原決定基を意味する。単一の抗原は、2つ以上のエピトープを有し得る。したがって、異なる抗体は、抗原上の異なるエリアに結合し得、異なる生物学的効果を有し得る。エピトープは、立体構造的又は直線状のどちらかであり得る。立体構造エピトープは、直鎖状ポリペプチド鎖の様々なセグメントからの空間的に並置されたアミノ酸で作り出される。直線状エピトープは、ポリペプチド鎖における隣接するアミノ酸残基によって作り出されるものである。ある特定の状況において、エピトープは、当該抗原における糖類、ホスホリル基類、又はスルホニル基類の部分を含み得る。
本明細書に記載され、本明細書において取り上げられる方法にとって有用である抗TMEM219抗体は、様々な実施形態において、当該抗体が由来する対応する生殖系列配列と比較した場合、重鎖及び軽鎖可変ドメインのフレームワーク及び/又はCDR領域において1つ又は複数のアミノ酸置換、挿入、及び/又は欠失を含み得る。そのような変異は、本明細書において開示されるアミノ酸配列を、例えば公共の抗体配列データベースに由来する生殖系列配列と比較することによって、容易に確認することができる。
本発明は、様々な実施形態において、抗体及び抗体の使用を伴う方法、並びに本明細書において開示されるアミノ酸配列のいずれかに由来するその抗原結合性断片を含み、この場合、1つ又は複数のフレームワーク領域及び/又はCDR領域内の1つ又は複数のアミノ酸は、当該抗体が由来する生殖系列配列における対応する残基へ、又は別のヒト生殖系列配列における対応する残基へ、又は当該対応する生殖系列残基の保存的アミノ酸置換(そのような配列変更は、本明細書においてまとめて「生殖細胞系列変異」と呼ばれる)へと変異される。
1つ又は複数の個々の生殖細胞系列変異又はその組み合わせを含む多数の抗体及び抗原結合性断片が構築され得る。ある特定の実施形態において、VHドメイン及び/又はVLドメイン内のフレームワーク及び/又はCDR残基の全ては、当該抗体が由来する元の生殖系列配列に見出される残基へと変異し戻る。他の実施形態において、ある特定の残基のみ、例えば、FR1の最初の8つのアミノ酸内又はFR4の最後の8つのアミノ酸内に見出される変異した残基のみ、又は、CDR1、CDR2、又はCDR3内に見出される変異した残基のみが、元の生殖系列配列へと変異し戻る。他の実施形態において、フレームワーク及び/又はCDR残基の1つ又は複数は、異なる生殖系列配列(すなわち、当該抗体が元々由来する生殖系列配列とは異なる生殖系列配列)における対応する残基へと変異する。その上、当該抗体は、フレームワーク領域及び/又はCDR領域内の2つ以上の生殖細胞系列変異の任意の組み合わせを有し得、例えば、その場合、ある特定の個々の残基は、ある特定の生殖系列配列における対応する残基へと変異し、その一方で、元の生殖系列配列とは異なるある特定の他の残基は、維持されるか、又は異なる生殖系列配列における対応する残基へと変異する。得られた後、1つ又は複数の生殖細胞系列変異を有する抗体及び抗原結合性断片は、1つ又は複数の所望の特性、例えば、向上した結合特異性、増加した結合親和性、改善又は増強したアンタゴニスト又はアゴニスト生物学的特性(場合によって)、低減した免疫原性等について容易に試験することができる。この一般的な方式において得られる抗体及び抗原結合性断片の使用は、本発明内に包含される。
本発明は、抗TMEM219抗体並びに1つ又は複数の保存的置換を有する本明細書において開示されるHCVR、LCVR、及び/又はCDRアミノ酸配列のいずれかのバリアントを含む抗TMEM219抗体の使用を伴う方法も含む。例えば、本発明は、本明細書において開示されるHCVR、LCVR、及び/又はCDRアミノ酸配列のいずれかに対して、例えば、10つ以下、8つ以下、6つ以下、又は4つ以下等の保存的アミノ酸置換を伴うHCVR、LCVR、及び/又はCDRアミノ酸配列を有する抗IL-6R抗体の使用を含む。
用語「生物学的に同等」は、本明細書に使用される場合、類似の条件下(例えば、同じ投与経路)において同じモル用量の投与後に類似のバイオアベイラビリティ(アベイラビリティの率及び程度)を有し、それにより、有効性及び安全性の両方において、当該効果が、比較対象の分子と実質的に同じであると予想できる分子を意味する。抗IGFBP3抗体を含む2つの医薬組成物は、それらが、薬学的に同等である場合、生物学的に同等であり、それは、それらが、同じ投与経路に対して、同じ剤形において、同じ量の有効成分(例えば、IGFBP3抗体)を含有し、同じ又は匹敵する標準を満たすことを意味する。生物学的等価は、例えば、2つの組成物に対する、薬物動力学パラメータを比較するインビボ研究によって特定することができる。生物学的等価試験において一般的に使用されるパラメータとしては、ピーク血漿濃度(Cmax)及び血漿薬物濃度時間曲線下面積(AUC)が挙げられる。
ある特定の実施形態において、本発明は、抗体、並びに、配列番号32から配列番号37又は配列番号88から配列番号95の群から選択される配列を含む重鎖可変領域と配列番号38から配列番号43又は配列番号96から配列番号103の群から選択される配列を含む軽鎖可変領域とを含む抗体を対象に投与する工程を含む方法に関する。本開示は、そのような抗体を含む医薬組成物、及びこれらの組成物を使用する方法を提供する。
様々な実施形態において、当該抗体は、向上した移動、送達、容認性等を提供するために好適な担体、賦形剤、及び他の薬剤を含み、静脈内又は皮下注射に好適な、製剤において対象に投与される。
注入可能な調製物は、公的に知られる方法によって調製され得る。例えば、注入可能な調製物は、例えば、上記に記載される抗体又はその塩を注射液のために慣習的に使用される無菌水性媒体又は油性媒体に溶解、懸濁、又は乳化することによって調製され得る。注射液のための水性媒体としては、例えば、生理食塩水、グルコース及び他の助剤を含有する等張液等が存在し、それらは、適切な可溶化剤、例えば、アルコール(例えば、エタノール)、ポリアルコール(例えば、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール)、非イオン性界面活性剤[例えば、ポリソルベート20又は80、HCO-50(水素化ひまし油のポリオキシエチレン(50mol)付加体)]等、と組み合わせて使用され得る。油性媒体として、例えば、胡麻油、大豆油等が採用され、それらは、可溶化剤、例えば、安息香酸ベンジル、ベンジルアルコール等と組み合わせて使用され得る。このように調製された注入可能な調製物は、適切なアンプルに充填することができる。
本発明による抗体は、任意の許容可能なデバイス又はメカニズムを使用して対象に投与することができる。例えば、投与は、注射器及び針を使用して、又は再使用可能なペン及び/又は自動注入送達装置によって、達成することができる。本発明の方法は、抗体(又は、当該抗体を含む医薬製剤)を投与するために、多数の再使用可能なペン及び/又は自動注入送達装置の使用を含む。そのようなデバイスの例としては、これらに限定されるわけではないが、ほんのいくつかの名前を挙げると、AUTOPEN(商標)(Owen Mumford社、ウッドストック、イギリス)、DISETRONIC(商標)ペン(Disetronic Medical Systems社、バーグドルフ、スイス)、HUMALOG MIX75/25(商標)ペン、HUMALOG(商標)ペン、HUMALIN70/30(商標)ペン(Eli Lilly社、インディアナポリス、インディアナ州)、NOVOPEN(商標) I、II、及びIII(Novo Nordisk社、コペンハーゲン、デンマーク)、NOVOPEN JUNIOR(商標)(Novo Nordisk社、コペンハーゲン、デンマーク)、BD(商標)ペン(Becton Dickinson社、フランクリン・レイクス、ニュージャージー州)、OPTIPEN(商標)、OPTIPEN PRO(商標)、OPTIPEN STARLET(商標)、及びOPTICLIK(商標)(Sanofi-Aventis社、フランクフルト、ドイツ)が挙げられる。本発明の医薬組成物の皮下送達において用途を有する使い捨てペン及び/又は自動注入送達装置の例としては、これらに限定されるわけではないが、SOLOSTAR(商標)ペン(Sanofi-Aventis社)、FLEXPEN(商標)(Novo Nordisk社)、及びKWIKPEN(商標)(Eli Lilly社)、SURECLICK(商標)自動注入装置(Amgen社、サウサンドオークス、カリフォルニア州)、PENLET(商標)(Haselmeier社、シュツットガルト、ドイツ)、EPIPEN(Dey, L.P社)、HUMIRA(商標)ペン(Abbott Labs社、アボットパーク、イリノイ州)、DAI(登録商標)自動注入装置(SHL Group社)、及びPUSHCLICK(商標)技術(SHL Group社)を特徴とする任意の自動注入装置が挙げられる。
一実施形態において、抗体は、プレフィルドシリンジによって投与される。別の実施形態において、抗体は、安全システムを含むプレフィルドシリンジによって投与される。例えば、当該安全システムは、偶発的な針刺し損傷を防ぐ。様々な実施形態において、抗体は、ERIS(商標)安全システム(West Pharmaceutical Services社)を含むプレフィルドシリンジによって投与される。参照によりその全体が本明細書に組み入れられる、米国特許第5,215,534号及び同第9,248,242号も参照されたい。
別の実施形態において、抗体は、自動注入装置によって投与される。様々な実施形態において、抗体は、PUSHCLICK(商標)技術(SHL Group社)を特徴とする自動注入装置によって投与される。様々な実施形態において、当該自動注入装置は、対象への、ある用量の組成物及び/又は抗体の投与を可能にする注射器を備える装置である。参照によりその全体が本明細書に組み入れられる、米国特許第9,427,531号及び同第9,566,395号も参照されたい。
本発明によれば、「対象」は、ヒト対象又はヒト患者を意味する。
方法
組換えタンパク質
組換えヒトIGFBP3をLife Technologies社から入手した(IGFBP3、Life Technologies社、10430H07H5)。TMEM219受容体の細胞外ドメインであるEcto-TMEM219を、Genescript社のカスタマイズされたタンパク質サービスを通じて入手した。大腸菌において産生される当該タンパク質は、以下のアミノ酸配列を有する。
ヒトEcto-TMEMアミノ酸配列
THRTGLRSPDIPQDWVSFLRSFGQLTLCPRNGTVTGKWRGSHVVGLLTTLNFGDGPDRNKTRTFQATVLGSQMGLKGSSAGQLVLITARVTTERTAGTCLYFSAVPGILPSSQPPISCSEEGAGNATLSPRMGEECVSVWSHEGLVLTKLLTSEELALCGSR (配列番号125)
マウスEcto-TMEMアミノ酸配列
THTTGLRSPDIPQDWVSFLRSFGQLSLCPMNETVTGTWQGPHVVGLLTTLNFGDGPDRNKTQTFQAKIHGSQIGLTGSSAGESVLVTARVASGRTPGTCLYFSGVPKVLPSSQPPISCSEEGVGNATLSPVMGEECVRVWSHERLVLTELLTSEELALCGS (配列番号126)
ナイーブヒトファージディスプレイライブラリーからのモノクローナル抗体の開発
スクリーニングのための抗原としてヒトEctoTMEM219(Genescript社のカスタマイズされたタンパク質サービスから入手)を使用して、ナイーブヒトファージディスプレイライブラリーからモノクローナル抗TMEM抗体を選択した。直接吸着又は抗ectoTMEMポリクローナル抗体による捕捉のどちらかによって、EctoTMEM抗原を96ウェルELISAプレート上に固定した。BSAによるウェルの洗浄及びブロッキングの後に、当該抗体-ファージライブラリーを加えた。先に、粘着性又は交差反応性の抗体-ファージからライブラリーを排除した。
抗原特異的抗体を示したファージを、プレート表面上において捕捉した。PBS-Tによる洗浄によって未結合/弱い結合のファージを除去した後、抗原特異的ファージを溶離させて、増幅させた。この増幅したライブラリーサブセットを、よりストリンジェントな条件下での標的結合のために再び選択し、すなわち、未結合又は弱い結合のファージを排除するために、洗浄ステップの数を増やした。抗原特異的抗体-ファージを富化するために、合計で3回の選択ラウンドを実施した。
選択プロセスの終了時に、選択アウトプットを、ELISAによって抗原特異的抗体に対してスクリーニングした。この目的のため、選択アウトプットのクローンからモノクローナルscFv抗体を生産した。次いで、これらをELISAによって特異的抗原結合性について試験した。15の標的特異的ヒットが同定された。それらのうちの11が、独特なCDR配列を含んでいた。これらを哺乳動物scFv-Fc発現ベクターへとクローン化し、結果として、scFvとヒトIgG4 Fcとの遺伝子融合を生じた。
これらの抗体のうちの6つは、HEK293細胞の一過性トランスフェクションによって、scFv-Fc形式において生産することができた。当該抗体を、親和性クロマトグラフィ(プロテインA)及びPBSにおける再バッファリングによって精製した。タンパク質濃度をUV/VIS分光分析によって特定し、純度をクマシー染色によって確認した。
ハイブリドーマベースのモノクローナル抗体開発
モノクローナル抗TMEM抗体を、関連するヒト免疫グロブリン配列が遺伝子工学によって動物のゲノム中に導入されている遺伝子導入マウスTrianni Mouse(商標)(Trianni社)、の利用によって同定した。そのような技術の使用によって、ヒト重鎖及び軽鎖可変ドメインの完全なレパートリーを含み、マウスの定常ドメインを保持するキメラモノクローナル抗体を生産した。
本質的には、Trianni Mouse(商標)の2つの群(群1:ALD/MDPアジュバント及び群2:SAS/Ribiアジュバント)を、ヒトEctoTMEM219(Genescript社のカスタマイズされたタンパク質サービス)によって、1週間に2回の注射において4週間、更に1週間に1回の注射による2週間の延長によって免疫した。次いで、リンパ細胞(B細胞等)を、抗体を発現するマウスから回収し、そのような細胞を、不死のハイブリドーマ細胞系を調製するために骨髄タイプの細胞系と融合させ、そのようなハイブリドーマ細胞系を、ヒトEcto-TMEM219に対して特異的な抗体を産生するハイブリドーマ細胞系を同定するために、ELISAによってスクリーニングし選択した。関心対象の抗原に対して反応性であったハイブリドーマ細胞系を増殖させた。RNA単離によって配列決定を実施し、その後に、Sanger配列決定法を用いて、ヒトVH及びヒトVKのcDNA配列決定を実施した。
抗体は、ハイブリドーマ細胞系以外の細胞系において発現することができる。好適な哺乳動物宿主細胞の形質転換のために、抗体をコードする配列を使用することができる。
CHO細胞において組換えタンパク質を発現する方法
完全ヒトIgG4 mAbを生産するために、対応するTC01及びTM1 cDNAを、従来の(非PCRベースの)クローニング技術を使用して、evitria社のベクターシステムへとクローニングした。当該evitria社のベクタープラスミドは、合成された遺伝子であった。アニオン交換クロマトグラフィに基づく低エンドトキシン条件下において、プラスミドDNAを調製した。配列の正しさを、Sanger配列決定法によって検証した(cDNAのサイズに応じてプラスミドあたり最大2回の配列決定反応による)。
懸濁液適合CHO K1細胞(evitria社)を生産のために使用した。シードを、既知組成の、動物成分不含の、血清不含の培地であるeviGrow培地において増殖させた。細胞を、evitria社のカスタムメイドの、独占所有権のあるトランスフェクション試薬であるeviFectを用いてトランスフェクトし、トランスフェクション後に、細胞を、動物成分不含で血清不含の培地であるeviMakeにおいて、37℃及び5%のCO2において7日間増殖させた。遠心分離及びその後のろ過(0.2μmフィルター)によって、上清を収穫した。
抗体を、洗浄緩衝液としてダルベッコPBS(Lonza BE17-512Q)及び溶出緩衝液としてpH3.5の0.1Mグリシンを用いたMabSelect(TM) SuRe(TM)を使用して精製した。その後に、ランニングバッファーとして最終緩衝液を使用したHiLoad Superdex 200pgカラムにおいてサイズ排除クロマトグラフィを実施した。
Agilent AdvanceBio SECカラム(300A 2.7μm 7.8×300mm)と、ランニングバッファーとして0.8ml/分のDPBSとを用いた分析的サイズ排除クロマトグラフィによって単量体性を特定した。
ヒトファージディスプレイライブラリーからの6つの新規の抗TMEM抗体の配列を、下記のTable2～7(表1～11)において報告する。
Figure 2023501229000001
Figure 2023501229000002
Table4、5、10、及び11(表7、8、13、14)において定義される完全VH及びVLアミノ酸配列に基づいて、http://www.abysis.org/から注釈ツールを使用することにより、CDRの定義も提供される。例えば、本明細書において開示される任意の抗体のVHアミノ酸配列は、当該注釈ツールにつながれており、Kabat定義されたCDR配列が提供される。
以下には、配列番号33(TC01のVH)を参照する例が示されている。
Figure 2023501229000003
本明細書において開示される任意の抗体のVHアミノ酸配列も、当該注釈ツールにつながれ得、IMGT定義されたCDR配列が提供される。
以下には、配列番号33(TC01のVH)を参照する例が示されている。
Figure 2023501229000004
加えて、本明細書において開示される任意の抗体のVHアミノ酸配列も、当該注釈ツールにつながれ得、「All, side by side」定義されたCDR配列が提供される。
以下には、配列番号33(TC01のVH)を参照する例が示されている。
Figure 2023501229000005
Figure 2023501229000006
TC01の完全VLアミノ酸(配列番号39)に基づいて、http://www.abysis.org/から注釈ツールを使用して提供されるCDR定義も報告する。
Figure 2023501229000007
Figure 2023501229000008
Figure 2023501229000009
Figure 2023501229000010
Figure 2023501229000011
Figure 2023501229000012
Figure 2023501229000013
ハイブリドーマベースの8つの新規の抗TMEM抗体配列を、下記のTable8～13(表11～16)に報告する。
Figure 2023501229000014
Figure 2023501229000015
Figure 2023501229000016
Figure 2023501229000017
Figure 2023501229000018
Figure 2023501229000019
Figure 2023501229000020
Figure 2023501229000021
Figure 2023501229000022
さらなる抗体
IgG生産
アミノ酸配列をDNAへ逆翻訳させ、HEK発現のためにコドン最適化した。当該最適化されたDNA配列を化学的に合成し、ヒトIgG4(S228P L235E変異体)発現ベクターへとクローン化した。トランスフェクショングレードのDNAを調製し、HEK細胞の一過性トランスフェクションのために使用した。生産した抗体を、アフィニティクロマトグラフィ(プロテインA)によってHEK培養上清から精製した。タンパク質濃度をUV/VIS分光分析によって特定し、SDS-PAGE分析を低減させることによって純度を確認した。
Figure 2023501229000023
Figure 2023501229000024
Figure 2023501229000025
Figure 2023501229000026
Figure 2023501229000027
Figure 2023501229000028
Figure 2023501229000029
Figure 2023501229000030
Figure 2023501229000031
Figure 2023501229000032
全ての研究は、完全ヒトIgG4抗体を使用して実施した。
(実施例1)
親和性測定
Octet BLIベースの分析
抗体は、標的TMEMに対して高い親和性を有する。生体分子間相互作用解析に基づくバイオレイヤー干渉法(BLI)プラットフォームであるOctet機器(Octet BMIA)を使用して、結合親和性測定を実施した。当該アッセイを確立するために、標的モノクローナル抗体(PBS中における30μg/ml)を、抗マウスIgG Fc捕捉(AMC)バイオセンサー又は抗ヒトIgG Fc捕捉(AMC)バイオセンサーにおいてFcにより固定化し、150nMにおいて、抗原であるヒト及びマウスEcto-TMEM219(Genescript社のカスタマイズされたタンパク質サービス)との相互作用を測定した。標的のヒト及びマウスEcto-TMEM219に対する抗TMEM mAbsの親和性測定をTable21(表24)に報告する。
Figure 2023501229000033
新たに生成した抗TMEM mAbは、2×10-8M未満のKDにおいて良好なヒト抗原結合親和性を示す。当該抗体は、マウス交差反応性も示す。このデータにより、マウスは、前臨床開発の際におけるモノクローナル抗体の試験のための関連動物種と見なすことができることが確認された。
ELISAによる抗体結合活性の測定
組換えectoTMEMタンパク質に対する精製したIgG4(TC03、TC04、TC05)の結合活性を、ELISAによって測定した。簡潔に言えば、ectoTMEMをPBSにおいて5μg/mlまで希釈し、室温で1時間かけて96ウェルELISAプレート上にコーティングした(100μl/ウェル)。プレートをブロッキング及び洗浄した後、抗体連続希釈を当該プレートに加え、室温で1時間インキュベートした。当該プレートを洗浄した後、結合した抗体を、二次抗ヒト-Fc HRP-標識抗体によって検出した。別の洗浄工程の後、TMB反応を実施し、硫酸によって反応を止め、吸光度を測定した。吸光度の読み取りに基づいて、飽和抗体のEC50を算出した。標的ヒトEcto-TMEM219に対する抗TMEM mAbのEC50をTable22(表25)に報告する。
Figure 2023501229000034
(実施例2)
腹腔内(IP)投与後のIBDマウスモデルにおける抗TMEM mAbの有効性
C57BL/6Jマウスにおいてデキストラン硫酸ナトリウム(DSS)によって誘導された大腸炎のモデルは、IBDにおける薬物の抗炎症特性及び創傷治癒特性を評価するため、並びに確認もするための、有効な動物モデルである。DSS(飲料水における経口投与)は、激しい下痢症状とその後の炎症を誘導する。このモデルは、十分に特徴付けられ、信頼でき、再現可能であり、監督機関によって承認されている[例えば、Eichele及びKharbanda、"Dextran sodium sulfate colitis murine model: an indispensable tool for advancing our understanding of inflammatory bowel disease pathogenesis," World J. Gastroenterol. 23(33):6016～6028(2017)を参照されたい]。この研究は、C57BL/6Jマウスにおいて実施した。この特定の遺伝的背景において、マウスは、最後のDSS投与の3日後に分析した場合、急性結腸炎を、又は最後のDSS投与の7日後に分析した場合、慢性様炎症を発症する。
抗炎症及び創傷治癒効果を、有効な臨床スコアである疾患活動性指数(DAI) (Table23(表26))及び組織学的分析のための有効なスコア(Table24(表27))を使用して、臨床レベル及び組織学的レベルにおいて評価した。
動物
雄C57BL/6Jマウスを、Charles River研究所、ラルブレル、フランスから入手した。当該マウスを20±5℃において飼育し、水及び餌を不断給餌した。全ての実験的プロトコルを、政府指針に従ってリールのパスツール研究所の公認の施設において実施した。
DSS誘導マウス大腸炎モデルの確立及び治療
飲料水に溶解させた2.5%(w/v)DSS(45kD;TDB Consultancy AB社、ウプサラ、スウェーデン、バッチ番号DB001-41)を5日間にわたってマウスに給餌することによって、急性大腸炎を誘導した。当該マウスを無作為に5つの群:対照群;DSS+ビヒクル;DSS+ヒュミラ(アダリムマブ)0.3mg/マウス(Abbvie社、1108722)、DSS+TM1 0.5mg/マウス、及びDSS+TC01 0.5mg/マウスに分けた。C57BL/6JマウスにおけるDSS誘導急性大腸炎に対する抗TMEM mAbの効果を評価するために、当該マウスを、大腸炎誘導の3日前に開始した示された用量の抗TMEM mAbによる毎日の腹腔内投与によって処置し、最後のDSS投与の7日後に安楽死させるまで実施した。動物モデルの実験のタイムラインを図1に示す。
TMEM mAbの治療特性を、クローン病及び潰瘍性大腸炎の両方の処置に対して承認されている陽性対照であるヒュミラ(アダリムマブ)と比較した(Taghipour Nら Gastroenterol Hepatol Bed Bench 2016;9(1):45～52)。
DSSマウスモデルは、抗体-TMEM mAb及び陽性対照ヒュミラ-のそれぞれが、その同族ヒト抗原(それぞれ、TMEM219及びTNFα)のマウスオーソログと交差反応することを必要とするので、ヒトにおける相対的有効性を測ることができない。
臨床スコアリング
全ての群において、マウスの体重、大便稠度、及び血便を毎日記録した。疾患活動性指数(DAI)スコアは、標準スコアリングシステムに従った、体重変化、大便の稠度、及びヘモカルト出血に基づいている。これらのパラメータを、Table23(表26)に記載されるスケールにおいて評価した。DAIデータは、毎日取得されたこれらのパラメータの平均スコアとして提示される。動物は、麻酔下での頸椎脱臼によって犠牲にした。安楽死させて、結腸を慎重に解剖し、結腸の重さ及びサイズを測定した。潜血(OB)の存在を、ヘモカルト法を使用して記録する。
Figure 2023501229000035
図2Aに示されるように、最後のDSS投与の7日後、DAIスコアは、健康な対照群(ビヒクルのみを受けた群)と比較して、ビヒクルを受けたDSSマウスの群において著しく増加し(p値=0.0012)、それは、大腸炎の重症度を示している。ビヒクルのみを受けたDSSマウスと比較して、DAIスコアの著しい減少が、TCO1(p値=0.002)、TM1(p値=0.05)、及びヒュミラ(p値=0.02)を受けた大腸炎マウスにおいて記録された。この結果は、新たに生成した抗TMEM mAbの強い抗炎症効果を示している。
組織学的結腸病変の評価
炎症のレベル及び組織再生を評価するために、結腸試料をパラフィンに包埋させて分析した。組織学的評価のために、結腸組織片(4μm)をMay-Grunwald-Giemsaで染色し、評価した。Dielemanら 1998に記載されるようなマルチパラメータスコアリング(0から18)(Table24(表27))を、2人の治験担当医師によって盲検的に実施した。組織学的検査は、炎症の重症度及び範囲、粘膜における細胞浸潤物の強度、粘膜下組織におけるその拡張、上皮性病変の存在、及び組織再生を点数付けした。アポプトーシスを検出するために、製造元のプロトコルに従って、TUNEL Assay Kit(Sigma社、ref 11684795910)を使用したデオキシヌクレオチジルトランスフェラーゼ媒介性デオキシウリジントリホスファターゼ(TUNEL)の免疫蛍光染色によって、パラフィン包埋結腸試料を更に調べた。TUNEL法は、細胞内エンドヌクレアーゼのアポトーシス活性化から得られたDNA断片を測定するための有効な方法である。その一方で、細胞増殖のレベルを特定するために、製造元のプロトコルに従って、PCNAアッセイキット(Novus社、NB600-1331)を使用して、増殖性細胞核抗原(PCNA)の免疫蛍光染色法を実施した。PCNAは、増殖細胞の晩期G1フェーズ及びSフェーズにおいて最大限に上げられる細胞周期関連タンパク質である。当該切片を、DAPIを使用する核染色法によって対比染色した。局所的蛍光を蛍光顕微鏡によって検出した。
Figure 2023501229000036
図2Bに示されるように、最後のDSS投与の7日後に、各群における組織学的スコアを、May-Grunwald-Giemsa染色した切片から定量化した(図3A)。大腸炎を有さない健康な対照群と比較して、持続するかなりの結腸炎症が、ビヒクルを受けたDSSマウスの群にて組織学的レベルにおいて依然として記録された(p値=0.002)。0.5mg/マウスでのTC01のIP投与の後、ビヒクルを受けた大腸炎マウスと比較して、炎症のレベルの著しい改善(p値=0.01)及び組織学的レベルでの粘膜再生が観察された。更に、0.5mg/マウスでのTM1のIP投与は、ビヒクルを受けた大腸炎マウスと比較して、炎症レベルの改善及び組織学的レベルでの粘膜再生を示した。
TC01及びTM1は、アポトーシスの際に生成されるDNA断片化を検出するための方法である、TUNEL染色キットによって染色された結腸組織からの切片に示されるように、マウスにおいてDSS誘導腸内細胞アポトーシスを阻害する(図3B)。核染色を提供するために、当該切片をDAPIによって対比染色した。TC01及びTM1群におけるTUNEL陽性細胞は、DSS群と比較して低かった。
DSSで処置されたマウスの群では、PCNAの発現は阻害され、それは、大腸炎の重症度を示している。その一方で、TC01及びTM1処置群において、結腸でのPCNAの発現は維持され、それは、PCNA染色キットによって染色された結腸組織からの切片において示されるように、DSSを受けていない対照群における発現に匹敵する(図3C)。
核染色を提供するために、当該切片をDAPIによって対比染色した。
統計解析
全ての比較を、2つの独立する試料に対する並べ替え検定(Permutation Test)を使用して分析した。統計は、GraphPad Prismバージョン7.0(GraphPad Software社、サンディエゴ、カルフォルニア州)を使用して算出した。p値が≦0.05である場合に、差は統計的に有意であると見なした。
(実施例3)
腹腔内(IP)投与後のT1Dマウスモデルにおける抗TMEM mAbの有効性
動物
雌の非肥満体糖尿病(NOD)マウス(10週齢)を、Charles River研究所(カルコ、バレーゼ、イタリア)から入手した(ストック#613)。全てのマウスは、動物飼育に関するイタリアの法律N°116/1992及び欧州共同体Council Directive EEC/609/86に従って飼育し使用した。
糖尿病のモニタリング及び処置
顕性糖尿病(最も進行した段階であり、高い絶食血糖濃度及び古典的な症状によって特徴付けられる)を、3回の連続した測定に対して250mg/dLを超える血糖値として定義した。糖血症を1週間に2回モニターした。発明者らは以下の処置群を設定した:
1)未処置
2)10日間のEcto-TMEM219 0.1mg/日(i.p)
3)10日間の抗TMEM219 TM1 0.5mg/日(i.p)
4)10日間の抗TMEM219 TC01 0.5mg/日(i.p)
Ecto-TMEM及び抗体は、PBSに溶解させた。
N=10匹のマウスを処置の各群に含ませた。処置は、マウスが10週齢になった時に1日目において開始した。マウスを、22週齢まで経過観察した。糖尿病が評価されるか又は22週齢になった時にマウスを捕獲した。エクスビボ分析のために血漿試料及び膵臓を採取した。実験のタイムラインを図1に示す。
膵島炎スコアリング及び膵島組織病理学
前に説明したように、膵島炎スコアリングを、5μm厚のホルマリン固定されパラフィン包埋されたヘマトキシリン及びエオシン(H&E)及びインスリン染色した膵臓切片に対して実施した(Vergani Aら Diabetes 2010;Ben Nasr Mら Sci Transl Med 2017)。膵島炎スコアリングを、ヘマトキシリン及びエオシン(H&E)染色された膵臓切片において実施した。0から4のスコアを、経験豊富な病理学者によって膵島浸潤に基づいて割り当てた。膵島炎スコアは、以下のように等級付けした:グレード0、正常な膵島;グレード1、周囲での穏やかな単核浸潤(25%);グレード2、膵島の25～50%が浸透;グレード3、(膵島の50%が浸透);グレード4、膵島が完全に浸透し、残存実質は残っていない。群あたり少なくとも30の膵島を分析し、異なるマウスから得られた切片からプールした。
統計解析
データは、特に報告されない限り、平均及び標準誤差(SEM)として提示される。違いの統計的有意性を、両側t検定(マン-ホイットニー検定)を用いて検定した。異なる群の間での糖尿病発症は、ログランク(マンテル・コックス)検定によって解析した。GraphPad Prismバージョン7.0(GraphPad Software社、ラ・ホーヤ、カリフォルニア州)を使用して、統計解析を行った。全ての統計検定は、5%有意水準において実施した。
図4及び図5に示されるように、本発明者らは、新たに生成した抗TMEM219 mAbの10日間の投与が、NODマウス、すなわち、自己免疫性1型糖尿病(T1D)を研究するために選別されたマウスモデルにおいて臨床糖尿病発症を防ぐか否かを評価した。驚くことに、抗TMEM219 mAbは、経時において血糖値を制御下に維持し、T1D NODマウスモデルにおいて糖尿病の発症を防ぐことにおいて有効である。興味深いことに、未処置の対照の50%を比較して、抗体TM1及びTC01で処置したマウスの100%が、22週において糖尿病を有さなかった(p<0.05、全て対未処置)。
次に、未処置のマウス、TM1処置マウス、TC01処置マウス、及びEcto-TMEM219処置マウスから得たNODマウスの膵臓組織片を、膵島浸潤(膵島炎)膵島領域及びモルホロジー(図6A)、及びインスリン染色(図7)について分析した。TM1処置群及びTC01処置群の両方は、良好な膵島モルホロジーを示し、加えて、領域は、TM1処置マウスにおいてわずかに増加しているように見え、このことは、抗TMEM mAbによる処置が、膵島破壊を防ぐことを示唆しており、それにより、β細胞の正常な機能を可能にする。その上、未処置対照と比較して、TM1処置マウス及びTC01処置マウスは、良好に保存されたインスリン陽性を示し、それは更に、膵島の機能が保存されることを支持した。実際に、膵島浸潤は、未処置のマウスと比較して、処置マウスにおいて際立って減少し、したがって、抗体の保護的役割を支持した(図7)。
したがって、本データは、糖尿病の予防及び/又は処置に対する抗TMEMモノクローナル抗体の有効性を示している。
(実施例4)
新たに生成したモノクローナル抗TMEM219抗体は、膵臓内においてTMEM219発現細胞に対するIGFBP3のアポトーシス促進効果を防ぎ得ることを確認するために、発明者らは更に、β細胞系Betalox-5においてインビトロにてそれらを試験した。IGFBP3曝露によって誘導されたCASP8の上方制御は、新たに生成した抗TMEM219 mAbによって、CASP8の30%近い低減において妨げられた。その上、IGFBP3を富化したプールされたT1D血清に対するβ細胞の曝露は、CASP8発現を増加させ、抗TMEM219 mAbは、少なくとも30%のCASP8を低減させることによってこの効果を相殺することができ、結果として、脾臓のβ細胞アポトーシスを防ぐ際の、これらの新たに生成したモノクローナル抗TMEM219抗体の有益効果を支援することができた(図8及び図9)。
(実施例5)
新たに生成したモノクローナル抗TMEM219抗体はヒト膵島においてアポトーシスを阻害する
新たに生成したモノクローナル抗TMEM219抗体が、膵臓内においてTMEM219発現細胞に対するIGFBP3のアポトーシス促進効果を防ぎ得ることを確認するために、発明者らは更に、ヒト膵島(Celprogen社)においてインビトロにてそれらを試験した。IGFBP3曝露によって誘導されたCASP8の上方制御並びにアポトーシスは、新たに生成した抗TMEM219 mAbによって、CASP8の40%及びアポトーシスの30%の低減において妨げられた(図10及び図11)。興味深いことに、IGFBP3が自然に富化されたプールされたT1D血清に対するヒト膵島の曝露は、CASP8発現及びアポトーシスを増加させ、抗TMEM219 mAbは、CASP8及びアポトーシスの両方をおよそ50%減少させることによってこの効果を相殺することができ、結果として、膵島アポトーシスを防ぐことにおいて、新たに生成したモノクローナル抗TMEM219抗体の有益効果を支援することができる(図12及び図13)。
(実施例6)
新たに生成したモノクローナル抗TMEM219抗体はβ細胞に対して毒性ではない
新たに生成したモノクローナル抗TMEM219抗体は、TMEM219下流シグナル伝達を活性化せず、したがって、IGFBP3ライゲーションの不在下において細胞アポトーシスを誘導することを実証するために、発明者らは、2つの主なアッセイを実施した。最初に、発明者らは、およそ30%の細胞死の増加を誘導するIGFBP3によってチャレンジしたものと比較して、抗TMEM219処置β細胞がアポトーシスを受けないことを実証した(図14)。次に、発明者らは、CASP8 mRNA発現を評価し、予想通りのIGFBP3を用いて培養したβ細胞における上方制御(およそ70%)を実証し、その一方で、CASP8は、抗TMEM219培養β細胞において変わらないままであった(図15)。これらのデータは、全体として、抗TMEM219 mAbのいかなる毒性/アポトーシス効果もないことを支持している。
(実施例7)
ストレプトゾトシン誘導β細胞死糖尿病モデルにおける抗TMEM219 mAbの効果
発明者らは、更に、複数回の低用量のストレプトゾトシン((ldSTZ、50mg/Kgで5日間)によるβ細胞破壊及び糖尿病の第2のモデルにおいて、抗TMEM219 mAbによるIGFBP3/TMEM219薬理学的遮断の効果を試験した。
主にβ細胞集団に対する標的化戦略の効果を評価するために、ストレプトゾトシン注入による化学的に誘導された糖尿病を用いた。それは、軽度炎症の発症に関連するが、例えば、NODマウスにおいて観察されるような自己免疫反応を生じない。したがって、血糖値を維持する化合物の成功は、主に、損傷からβ細胞集団を保護すること、及びインスリン分泌を維持することに存する。
ストレプトゾトシンは、例えば、5日間連続での50mg/Kgの低用量の投薬計画を使用することによって投与した場合に糖尿病において観察されるようなβ細胞死を誘導し、糖尿病/高血糖症は、通常、投与から最初の2週間以内に発症する(図16)。したがって、発明者らは、B6マウスに5日間にわたって低用量STZを投与し、同時に、10日間にわたって0.5mg/日の用量において抗TMEM219 mAbを受けさせた。抗TMEM219 mAb処置は、未処置動物と比較して、処置マウスにおいて血糖値を首尾よく維持し(図17)、腹膜内グルコース耐性試験(IPGTT)の際の60分間において検出された血糖値も改善した(図18)。モルホロジー分析も、膵島の数及び範囲が、未処置のマウスと比較して、抗TMEM219 mAbで処置された動物においてよく保存されたことを明らかにした(図19)。全体的に、このことは、抗TMEM219が、β細胞破壊のモデルにおいても、β細胞集団を保存し、血糖値を維持し得、結果として、糖尿病によって誘導されるβ細胞喪失及び機能不全から膵島を保護するためのこの戦略の有益性を強調し得ることを裏付ける。
TC01等の抗TMEM219抗体は、傷害からβ細胞を保護すること、並びにそれらの喪失を防ぐこと、更にグルコース刺激に対して反応するそれらの能力を維持することにおいて有効である。更に、抗TMEM219 TC01で処置されたマウスの膵島において炎症は検出できず、したがって、膵島モルホロジーに対する保護効果を裏付ける。
実施例4～7の方法
組換えタンパク質及び介入研究
組換えヒトIGFBP3(Life Technologies社、10430H07H5)、50ng/ml(IGFBP3)、及び130ng/mlのecto-TMEM219を、ミニ腸培養から+1日目に培養物に加えた。10μg/ml濃度のIGFBP3と比較して、新たに生成した抗TMEM219モノクローナル抗体を1:1の分子比において加えた。
β細胞系(β-lox5)
細胞を、DMEM、10%のFBS、0.02%のBSA、15mMのHEPES、1倍のNEA、1g/Lのグルコース、PEN/STREPと共に培養した。通常は、細胞を、10,000細胞/ウェルの密度において35mmウェルに播種する。細胞を80%の培養密度において継代させる。組換えタンパク質及び介入研究のセクションにおいて記載したように、細胞を、組換えタンパク質/抗体の有無において3日間培養した。
ヒト膵島
健康被験者から単離したランゲルハンス(#35002-04)のヒト膵島も、商業的供給元(Celprogen社、トーランス、カリフォルニア州)から購入し、製造元の取扱説明書に従って、標準培地及び10FBSによって培養した。糖尿病状態を模倣するために、確立されたT1Dから得たヒト糖尿病血清(n=5/群)を、10%の濃度において、ヒト膵島/β細胞系に、通常のFBSの代わりに加えた。
膵島/β細胞の細胞死
精製されたヒト膵島及びβ細胞系におけるアポトーシス/細胞死を評価するために、発明者らは、細胞質溶解物及び細胞上清に対して細胞ストレスを誘導した後にヒストン関連DNA断片をインビトロにおいて定量化する、光度測定エンザイムイムノアッセイ(Roche Diagnostics GmbH社、11544675001、マンハイム、ドイツ)を用いた。
STZ誘導糖尿病研究
低用量のストレプトゾトシン(50mg/Kg、腹腔内投与;Sigma Aldrich社 S0130)を5日連続で注入することによって、糖尿病を化学的に誘導し、糖血症を、続く15日間モニターした。野生型B6マウスからなる対照群にも、低用量ストレプトゾトシンを注入し、それに応じてモニターした。また、抗TMEM219 mAb及びecto-TMEM219を、それぞれ0.5mg/日及び0.1mg/日の用量において0日目から10日目まで腹腔内投与し、糖血症を、続く15日間モニターした。終了時に、夜通しの飢餓性衰弱の後にグルコース1Kg/gをマウスに注入することによって、腹膜内グルコース耐性試験(IPGTT)を実施し、糖血症を、0分、30分、60分、及び120分においてモニターした。
統計解析
データは、平均値及び標準誤差(SEM)として提示された。違いの統計的有意性を、両側t検定を用いて検定した。二つの群の間の有意性を、両側独立スチューデントt検定によって特定した。多重比較のために、Bonferroni補正による分散分析を用いた。グラフは、GraphPad Prismバージョン5.0(GraphPad Software社、ラ・ホーヤ、カリフォルニア州)を使用して生成した。全ての統計検定は、5%有意水準において実施した。
(参考文献)
Figure 2023501229000037
Figure 2023501229000038

Claims (23)

  1. ヒトTMEM219受容体に結合し、前記TMEM219受容体へのIGFBP3の結合を阻害又は低減する、単離された抗体又はその抗原結合性断片。
  2. IGFBP3の結合によって誘導されるTMEM219受容体の活性化を阻害、低減、又は中和する、請求項1に記載の単離された抗体又はその抗原結合性断片。
  3. ヒトTMEM219に結合する際にTMEM219経路を活性化しない、請求項1又は2に記載の単離された抗体又はその抗原結合性断片。
  4. 糖尿病患者においてβ細胞を保存すること、及び/又は膵島破壊を防ぐこと、及び/又はインビボモデルにおいて血糖値を制御することにおいて有効である、請求項1から3のいずれか一項に記載の単離された抗体又はその抗原結合性断片。
  5. インビボモデルにおいて急性結腸炎を低減させることにおいて有効である、請求項1から4のいずれか一項に記載の単離された抗体又はその抗原結合性断片。
  6. a-IGFBP3で処置された健康な対象のミニ腸成長の増加;
    b-IBD患者のミニ腸成長の増加;
    c-糖尿病性腸疾患血清で処置された健康な対象のミニ腸成長の増加;
    d-IGFBP3で処置された健康な対象のミニ腸におけるEphB2及び/又はLGR5の発現の増加;
    e-IGFBP3で処置された健康な対象のミニ腸におけるカスパーゼ8発現の減少;
    f-IGFBP3で処置されたβ細胞におけるβ細胞喪失の減少;
    g-IGFBP3で処置されたβ細胞におけるインスリンの発現の増加;
    h-DSSで誘導された腸内細胞アポトーシスを阻害又は減少させる;
    i-DSSで処置された結腸におけるPCNAの発現を回復させる;
    j-IGFBP3で処置されたβ細胞におけるβ細胞のアポトーシスの減少;
    k-糖尿病の動物モデルにおける膵島炎スコアの減少;
    l-糖尿病の動物モデルにおける糖尿病の発症の減少;
    m-糖尿病の動物モデルにおけるβ細胞傷害を保護する;
    n-糖尿病の動物モデルにおけるβ細胞喪失を防ぐ
    から選択される少なくとも1つの活性を有する、請求項1から5のいずれか一項に記載の単離された抗体又はその抗原結合性断片。
  7. a)、b)、及びc)における増加が、少なくとも20%であり;d)及びe)における増加が、少なくとも30%、好ましくは少なくとも50%であり;f)における減少及びg)における増加が、少なくとも10%である、請求項6に記載の単離された抗体又はその抗原結合性断片。
  8. a.以下を含む重鎖可変ドメイン(VH):
    i.配列番号4、1、8、10、56、59、62、65、及び68からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR1配列;
    ii.配列番号5、2、11、57、60、63、66、及び69からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR2配列;及び
    iii.配列番号6、3、7、9、12、13、58、61、64、67、及び70からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR3配列;並びに/又は
    b.以下を含む軽鎖可変ドメイン(VL):
    i.配列番号17、14、20、23、26、29、71、77、80、82、及び85からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR1配列;
    ii.配列番号18、15、21、24、27、30、72、78、83、及び86からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR2配列;及び
    iii.配列番号19、16、22、25、28、31、73、74、75、76、79、81、84、87、166、及び167からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR3配列
    を含む、請求項1から7のいずれか一項に記載の単離された抗体又はその抗原結合性断片。
  9. - 配列番号4及び配列番号5及び配列番号6及び配列番号17及び配列番号18及び配列番号19又はTC01若しくはTC05の、Kabat、IMGT、Chothia、AbM、若しくはContact CDR、或いは
    - 配列番号4及び配列番号5及び配列番号6及び配列番号17及び配列番号18及び配列番号166又はTC03のKabat、IMGT、Chothia、AbM、若しくはContact CDR、或いは
    - 配列番号4及び配列番号5及び配列番号6及び配列番号17及び配列番号18及び配列番号167又はTC04のKabat、IMGT、Chothia、AbM、若しくはContact CDR、或いは
    - 配列番号68及び配列番号69及び配列番号70及び配列番号85及び配列番号86及び配列番号87又はTM1のKabat、IMGT、Chothia、AbM、若しくはContact CDR
    を含む、請求項1から8のいずれか一項に記載の単離された抗体又はその抗原結合性断片。
  10. a.以下を含む重鎖可変ドメイン(VH):
    i.abysisツール解析(www.abysis.org)を使用して定義される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR1配列;
    ii.abysisツール解析(www.abysis.org)を使用して定義される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR2配列;及び
    iii.abysisツール解析(www.abysis.org)を使用して定義される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR3配列;並びに/又は
    b.以下を含む軽鎖可変ドメイン(VL):
    i.abysisツール解析(www.abysis.org)を使用して定義される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR1配列;
    ii.abysisツール解析(www.abysis.org)を使用して定義される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR2配列;及び
    iii.abysisツール解析(www.abysis.org)を使用して定義される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列のCDR3配列
    を含む、請求項1から9のいずれか一項に記載の単離された抗体又はその抗原結合性断片。
  11. a.配列番号32から配列番号37、若しくは配列番号88から配列番号95、若しくは配列番号168、配列番号169、及び配列番号170からなる群から選択されるアミノ酸配列の重鎖可変ドメイン配列;又は
    b.配列番号38から配列番号43、若しくは配列番号96から配列番号103、若しくは配列番号171、配列番号172、若しくは配列番号173からなる群から選択されるアミノ酸配列の軽鎖可変ドメイン配列;又は
    c.(a)の重鎖可変ドメイン及び(b)の軽鎖可変ドメイン
    を含む、請求項1から10のいずれか一項に記載の単離された抗体又はその抗原結合性断片。
  12. TC01、TC03、TC04、TC05、TA02、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10からなる群から一緒に選択されるVH及びVL領域を含み、好ましくは、抗体TC01、TC03、TC04、TC05、又はTM1のVH及びVL領域を含む、請求項1から11のいずれか一項に記載の単離された抗体又はその抗原結合性断片。
  13. 前記抗体が、Table 3.3(表5)から選択されるVH CDR1、CDR2、及びCDR3、並びにTable 3.4(表6)から選択されるVL CDR1、CDR2、及びCDR3を含む、請求項10に記載の単離された抗体又はその抗原結合性断片。
  14. ヒトTMEMに対して10--7M以下の親和性定数を有する、請求項1から13のいずれか一項に記載の単離された抗体又はその抗原結合性断片。
  15. (a)Table2～19(表1～22)及びTable3.1～3.4(表3～6)において定義されるモノクローナル抗体TC01、TC03、TC04、TC05、TA02、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10によって認識されるエピトープと同じ若しくは類似のエピトープである、TMEM上のエピトープに特異的に結合する;又は
    (b)Table2～19(表1～22)及びTable3.1～3.4(表3～6)において定義されるモノクローナル抗体TC01、TC03、TC04、TC05、TA02、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10との結合に対して交差競合する;又は
    (c)Table2～19(表1～22)及びTable3.1～3.4(表3～6)において定義されるTC01、TC03、TC04、TC05、TA02、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかと同じ若しくは類似の結合親和性若しくは特異性若しくはその両方を示す;又は
    (d)本明細書に記載される抗体分子、例えば、Table2～19(表1～22)及びTable3.1～3.4(表3～6)において定義される、例えば、TC01、TC03、TC04、TC05、TA02、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体分子の1つ若しくは複数の生物学的特性を有する;又は
    (e)本明細書に記載される抗体分子、例えば、Table2～19(表1～22)及びTable3.1～3.4(表3～6)において定義される、例えば、TC01、TC03、TC04、TC05、TA02、TC02、TD01、TE01、TG02、TM1、TE02.1、TE02.2、TE02.3、TE03、TE04、TE07、TE10のいずれかから選択される抗体分子の1つ若しくは複数の薬物動態特性を有する、
    単離された抗体又はその抗原結合性断片。
  16. ヒト抗体又はヒト化抗体である、請求項1から15のいずれか一項に記載の単離された抗体又はその抗原結合性断片。
  17. IgG2又はIgG4抗体、好ましくは、IgG2κ抗体、IgG2λ抗体、IgG4κ抗体、又はIgG4λ抗体であり、好ましくは、前記IgG2又はIgG4は、ヒトIgG2又はヒトIgG4である、請求項1から16のいずれか一項に記載の単離された抗体又はその抗原結合性断片。
  18. 好ましくはcDNAである、請求項1から17のいずれか一項に記載の抗体又はその抗原結合性断片をコードする少なくとも1つの配列を含む単離されたポリヌクレオチド。
  19. 好ましくは、プラスミド、ウイルスベクター、非エピソーム性哺乳動物ベクター、発現ベクター、及び組換え発現ベクターからなる群から選択される、請求項18に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
  20. 好ましくは、ハイブリドーマ又はチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞又はヒト胚性腎臓細胞(HEK293)である、請求項18に記載のポリヌクレオチド又は請求項19に記載のベクターを含む単離された細胞。
  21. 医薬としての使用のため、好ましくは、糖尿病、腸管及び/又は腸障害、吸収不良症候群、悪液質、又は糖尿病性腸疾患の処置における使用のためであって、好ましくは、糖尿病が、I型又はII型糖尿病であり、好ましくは、腸管及び/又は腸障害が、炎症性腸疾患、セリアック病、潰瘍性大腸炎、クローン病、又は腸閉塞である、使用のための、請求項1から17のいずれか一項に記載の抗体若しくはその抗原結合性断片又は請求項18に記載のポリヌクレオチド又は請求項19に記載のベクター又は請求項20に記載の細胞。
  22. 好ましくは、糖尿病、腸管及び/又は腸障害、吸収不良症候群、悪液質、又は糖尿病性腸疾患の処置における使用のためであって、好ましくは、腸管及び/又は腸障害が、炎症性腸疾患、セリアック病、潰瘍性大腸炎、クローン病、又は腸閉塞である、使用のための、請求項1から17のいずれか一項に記載の単離された抗体若しくはその抗原結合性断片、又は請求項18に記載のポリヌクレオチド、又は請求項19に記載のベクター、又は請求項20に記載の細胞と、薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
  23. TMEM219受容体へのIGFBP3の結合を阻害する方法であって、TMEM219を請求項1から17のいずれか一項に記載の抗体又は請求項22に記載の組成物と接触させる工程を含む方法。
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