JP2022529503A - 植物メッセンジャーパックに関する組成物及び方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本明細書で使用される「ペクチン」又は「ペクチン多糖」という語は、多糖、例えば植物細胞壁又はミドルラメラ中で生じる多糖、例えばガラクツロン酸リッチ多糖を指す。例示的なペクチンには、ホモガラクツロナン、ラムノガラクツロナンI及び置換ガラクツロナンラムノガラクツロナンII(RG-II)及びキシロガラクツロナン(XGA)が含まれる。ペクチンは、メチルエステル化度に基づいて低メトキシルペクチン又は高メトキシルペクチンに分類することができる。いくつかの態様では、メチルエステル化度は、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%又は100%のメチルエステル化である。
植物メッセンジャーパック(PMP)は、植物EV又はそのセグメント、一部若しくは抽出物(例えば、脂質抽出物)を含む脂質構造(例えば、脂質二重層、単層又は多層構造)である。植物EVは、植物に天然に存在する閉じた脂質二重層構造である。植物EVは、直径が約5~2000nmであり得る。植物EVは、様々な植物生合成経路に由来し得る。自然界では、植物EVは、原形質膜の外側に位置し、細胞壁及び細胞外空間の連続体によって形成される区画である植物アポプラストなどの植物の細胞内及び細胞外区画に見られ得る。代わりに、PMPは、植物細胞からの分泌時に細胞培養培地に見られる濃縮された植物EVであり得る。植物EVは、植物から(例えば、アポプラスト液から)分離することができ、それにより本明細書でさらに説明される様々な方法によってPMPが提供される。さらに、PMPは、インビボ又はインビトロで導入(例えば、PMP中又は上にロード)することができる異種機能性剤(例えば、異種農業剤(例えば、殺虫剤、施肥剤、除草剤、植物改変剤)又は異種治療剤(例えば、病原体制御剤、例えば抗真菌剤、抗菌剤、殺ウイルス剤、抗ウイルス剤、殺昆虫剤、殺線虫剤、抗寄生虫剤又は昆虫忌避剤)を任意選択により含み得る。
PMPは、植物又は植物組織若しくは植物細胞を含むその一部に天然に存在する植物EV又はそのセグメント、一部若しくは抽出物(例えば、脂質抽出物)から生成することができる。
本組成物及び方法のPMPは、PMPが植物EVから生成され、且つ/又はそのセグメント、一部若しくは抽出物を含んでいるとして識別する一連のマーカーを有し得る。本明細書で使用される「植物EVマーカー」という語は、植物に自然に会合し、植物タンパク質、植物核酸、植物小分子、植物脂質又はそれらの組み合わせなどの植物体の植物EV内又は植物EV上に組み込まれる成分を指す。植物EVマーカーの例は、例えば、それぞれ参照により本明細書に組み込まれるRutter and Innes,Plant Physiol.173(1):728-741,2017;Raimondo et al.,Oncotarget.6(23):19514,2015;Ju et al.,Mol.Therapy.21(7):1345-1357,2013;Wang et al.,Molecular Therapy.22(3):522-534,2014;及びRegente et al,J of Exp.Biol.68(20):5485-5496,2017で確認することができる。植物EVマーカーの追加の例は、付録に列挙されており、本明細書でさらに概説する。
本明細書の方法に従って製造されるPMPは、異種機能性剤(例えば、異種農業剤(例えば、殺虫剤、施肥剤、除草剤、植物改変剤)又は異種治療剤(例えば、病原体制御剤、例えば抗真菌剤、抗菌剤、殺ウイルス剤、抗ウイルス剤、殺昆虫剤、殺線虫剤、抗寄生虫剤又は昆虫忌避剤))、例えば本明細書に記載のものを含むように修飾することができる。PMPは、標的生物への作用物質の送達を可能にする様々な手段、例えば作用物質の封入、脂質二重層構造中への成分の組み込み又は成分とPMPの脂質二重層構造の表面との会合(例えば、コンジュゲーションによる)により、そのような作用物質を担持するか又はそれらと会合し得る。
例えば、ヒト又は非ヒト農業動物(例えば、雌牛、去勢牛、ブタ、ニワトリ又はシチメンチョウ)などの動物への投与のために医薬組成物に製剤化することができる組成物が本明細書に含まれる。医薬組成物は、薬学的に許容される希釈剤、担体及び/又は賦形剤と共に動物に投与することができる。投与方式及び投与量に応じて、本明細書に記載の方法の医薬組成物は、容易な送達を可能にするために適切な医薬組成物に製剤化される。単回投与は、必要に応じて単位剤形であり得る。
適用、取り扱い、輸送、保管及び活性を容易にするために、活性剤、ここではPMPを他の物質と配合することができる。PMPは、例えば、餌、濃縮エマルション、ダスト、乳剤濃縮物、燻蒸剤、ゲル、顆粒、マイクロ封入、種子処理、懸濁液濃縮物、サスポエマルション、錠剤、水溶性液体、水分散性顆粒又は乾燥流動性物質、水和剤及び超微量溶液に製剤化することができる。製剤タイプのさらなる情報については、“Catalogue of Pesticide Formulation Types and International Coding System”Technical Monograph n° 2,5th Edition by CropLife International(2002)を参照されたい。
本明細書で製造されるPMPは、異種機能性剤(例えば、異種農業剤(例えば、殺虫剤、施肥剤、除草剤、植物改変剤)又は異種治療剤(例えば、病原体制御剤、例えば抗真菌剤、抗菌剤、殺ウイルス剤、抗ウイルス剤、殺昆虫剤、殺線虫剤、抗寄生虫剤又は昆虫忌避剤)をさらに含み得る。例えば、PMPは、異種機能性剤を封入し得る。代わりに、異種機能性剤は、PMP上に包埋するか又はその表面にコンジュゲートさせることができる。場合により、PMPは、2つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10又は10超)の異なる異種機能性剤を含む。異種機能性剤は、作用物質を製造されるPMP中に導入するのに有効な製造プロセス中の任意の工程で添加することができる。
本明細書で製造されるPMPは、異種農業剤(例えば、植物又は植物に付随する生物に影響を与え、PMP中にロードすることができる作用物質)、例えば殺虫剤、除草剤、施肥剤又は植物改変剤を含み得る。
本明細書に記載のPMP組成物は、抗菌剤をさらに含み得る。場合により、PMP組成物は、2つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10又は10超)の異なる抗菌剤を含む。例えば、抗菌剤は、植物有害細菌(例えば、細菌性植物病原体)の適応度を減少させ得る(例えば、成長を減少させるか又は殺傷し得る)。本明細書に記載の抗生物質を含むPMP組成物は、(a)標的害虫内部又は上で標的レベル(例えば、所定又は閾値レベル)の抗生物質濃度を達成し;且つ(b)標的害虫の適応度を減少させるのに十分な量及び時間で、標的害虫又はそれが侵入した植物と接触させることができる。本明細書に記載の抗菌剤は、本明細書に記載の方法のいずれかのためにPMP組成物に製剤化することができ、ある場合にはそのPMPと会合させることができる。
本明細書に記載のPMP組成物は、抗真菌剤をさらに含み得る。場合により、PMP組成物は、2つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10又は10超)の異なる抗真菌剤を含む。例えば、抗真菌剤は、植物有害真菌の適応度を減少させ得る(例えば、成長を減少させるか又は殺傷し得る)。本明細書に記載の抗真菌剤を含むPMP組成物は、(a)標的真菌内部又は上で標的レベル(例えば、所定又は閾値レベル)の抗生物質濃度を達成し;且つ(b)標的真菌の適応度を減少させるのに十分な量及び時間で、標的有害真菌又はそれが侵入した植物と接触させることができる。本明細書に記載の抗真菌剤は、本明細書に記載の方法のいずれかのためにPMP組成物に製剤化することができ、ある場合にはそのPMPと会合させることができる。
本明細書に記載のPMP組成物は、昆虫駆除剤をさらに含み得る。場合により、PMP組成物は、2つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10又は10超)の異なる昆虫駆除剤を含む。例えば、昆虫駆除剤は、植物有害昆虫の適応度を減少させ得る(例えば、成長を減少させるか又は殺傷し得る)。本明細書に記載の昆虫駆除剤を含むPMP組成物は、(a)標的昆虫内部又は上で標的レベル(例えば、所定又は閾値レベル)の昆虫駆除剤濃度を達成し;且つ(b)標的昆虫の適応度を減少させるのに十分な量及び時間で、標的有害昆虫又はそれが侵入した植物と接触させることができる。本明細書に記載の昆虫駆除剤は、本明細書に記載の方法のいずれかのためにPMP組成物に製剤化することができ、ある場合にはそのPMPと会合させることができる。
本明細書に記載のPMP組成物は、線虫駆除剤をさらに含み得る。場合により、PMP組成物は、2つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10又は10超)の異なる線虫駆除剤を含む。例えば、線虫駆除剤は、植物有害線虫の適応度を減少させ得る(例えば、成長を減少させるか又は殺傷し得る)。本明細書に記載の線虫駆除剤を含むPMP組成物は、(a)標的線虫内部又は上で標的レベル(例えば、所定又は閾値レベル)の線虫駆除剤濃度を達成し;且つ(b)標的線虫の適応度を減少させるのに十分な量及び時間で、標的有害線虫又はそれが侵入した植物と接触させることができる。本明細書に記載の線虫駆除剤は、本明細書に記載の方法のいずれかのためにPMP組成物に製剤化することができ、ある場合にはそのPMPと会合させることができる。
本明細書に記載のPMP組成物は、軟体動物駆除剤をさらに含み得る。場合により、PMP組成物は、2つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10又は10超)の異なる軟体動物駆除剤を含む。例えば、軟体動物駆除剤は、植物有害軟体動物の適応度を減少させ得る(例えば、成長を減少させるか又は殺傷し得る)。本明細書に記載の軟体動物駆除剤を含むPMP組成物は、(a)標的軟体動物内部又は上で標的レベル(例えば、所定又は閾値レベル)の軟体動物駆除剤濃度を達成し;且つ(b)標的軟体動物の適応度を減少させるのに十分な量及び時間で、標的有害軟体動物又はそれが侵入した植物と接触させることができる。本明細書に記載の軟体動物駆除剤は、本明細書に記載の方法のいずれかのためにPMP組成物に製剤化することができ、ある場合にはそのPMPと会合させることができる。
本明細書に記載のPMP組成物は、ウイルス駆除剤をさらに含み得る。場合により、PMP組成物は、2つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10又は10超)の異なるウイルス駆除剤を含む。例えば、ウイルス駆除剤は、ウイルス性植物病原体の適応度を減少させ得る(例えば、減少させるか又は排除し得る)。本明細書に記載のウイルス駆除剤を含むPMP組成物は、(a)標的レベル(例えば、所定又は閾値レベル)のウイルス駆除剤濃度を達成し;且つ(b)標的ウイルスを減少させるか又は排除するのに十分な量及び時間で、標的ウイルス又はそれが侵入した植物と接触させることができる。本明細書に記載のウイルス駆除剤は、本明細書に記載の方法のいずれかのためにPMP組成物に製剤化することができ、ある場合にはそのPMPと会合させることができる。
本明細書に記載のPMP組成物は、1つ又は複数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10又は10超)の雑草駆除剤をさらに含み得る。例えば、雑草駆除剤は、雑草の適応度を減少させ得る(例えば、減少させるか又は排除し得る)。本明細書に記載の雑草駆除剤を含むPMP組成物は、(a)植物上で標的レベル(例えば、所定又は閾値レベル)の雑草駆除剤濃度を達成し、且つ(b)雑草の適応度を減少させるのに十分な量及び時間で、標的雑草と接触させることができる。本明細書に記載の雑草駆除剤は、本明細書に記載の方法のいずれかのためにPMP組成物に製剤化することができ、ある場合にはそのPMPと会合させることができる。
本明細書に記載のPMP組成物は、忌避剤をさらに含み得る。場合により、PMP組成物は、2つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10又は10超)の異なる忌避剤を含む。例えば、忌避剤は、本明細書に記載の害虫(例えば、昆虫、線虫又は軟体動物);微生物(例えば、植物病原体又は内生菌、例えば細菌、真菌又はウイルス);又は雑草のいずれかを忌避し得る。本明細書に記載の忌避剤を含むPMP組成物は、(a)標的レベル(例えば、所定又は閾値レベル)の忌避剤濃度を達成し;且つ(b)未処置の植物に対して植物上の害虫のレベルを減少させるのに十分な量及び時間で、標的植物又はそれが侵入した植物と接触させることができる。本明細書に記載の忌避剤は、本明細書に記載の方法のいずれかのためにPMP組成物に製剤化することができ、ある場合にはそのPMPと会合させることができる。
本明細書に記載のPMP組成物は、異種施肥剤をさらに含み得る。場合により、異種施肥剤は、PMPと会合している。例えば、PMPは、異種施肥剤を封入し得る。加えて又は代わりに、異種施肥剤は、PMP上に包埋するか又はその表面にコンジュゲートさせることができる。
本明細書に記載のPMP組成物は、1つ又は複数の異種植物改変剤を含む。例えば、PMPは、異種植物改変剤を封入し得る。代わりに又は加えて、異種植物改変剤は、PMPの表面上に包埋するか又はそれにコンジュゲートさせることができる。
本明細書に記載のPMP組成物(例えば、PMP)は、異種ポリペプチドを含み得る。場合により、本明細書に記載のPMP組成物は、動物(例えば、哺乳動物)又は植物を改変する(例えば、動物又は植物の適応度を増加させる)ポリペプチド又はその機能的断片若しくは誘導体を含む。例えば、ポリペプチドは、動物又は植物の適応度を増加させ得る。本明細書に記載のポリペプチドを含むPMP組成物は、(a)標的レベル(例えば、所定又は閾値レベル)のポリペプチド濃度を達成し;且つ(b)動物又は植物を改変する(例えば、動物又は植物の適応度を増加させる)のに十分な量及び時間で、動物又は植物と接触させることができる。
本明細書に記載のPMP組成物及び方法において多数の核酸が有用である。本明細書に開示されるPMP組成物は、任意の数又は種類(例えば、クラス)の異種核酸(例えば、DNA分子又はRNA分子、例えばmRNA、ガイドRNA(gRNA)若しくは阻害性RNA分子(例えば、siRNA、shRNA又はmiRNA)又はハイブリッドDNA-RNA分子)、例えば少なくとも約1つのクラス又は変異体の核酸、2、3、4、5、10、15、20個又はそれを超えるクラス又は変異体の核酸を含み得る。組成物中の各核酸の好適な濃度は、核酸の有効性、安定性、個別の核酸の数、製剤及び組成物の適用方法などの要因に依存する。本明細書で有用な核酸の例には、アンチセンスRNA、低分子干渉RNA(siRNA)、低分子ヘアピン(shRNA)、マイクロRNA(miRNA)、(非対称干渉RNA)aiRNA、ペプチド核酸(PNA)、モルホリノ、ロックド核酸(LNA)、piwi干渉RNA(piRNA)、リボザイム、デオキシリボザイム(DNAザイム)、アプタマー(DNA、RNA)、環状RNA(circRNA)、ガイドRNA(gRNA)又はDNA分子が含まれる。
場合により、PMP組成物は、ポリペプチドをコードする異種核酸を含む。ポリペプチドをコードする核酸は、約10~約50,000ヌクレオチド(nt)、約25~約100nt、約50~約150nt、約100~約200nt、約150~約250nt、約200~約300nt、約250~約350nt、約300~約500nt、約10~約1000nt、約50~約1000nt、約100~約1000nt、約1000~約2000nt、約2000~約3000nt、約3000~約4000nt、約4000~約5000nt、約5000~約6000nt、約6000~約7000nt、約7000~約8000nt、約8000~約9000nt、約9000~約10,000nt、約10,000~約15,000nt、約10,000~約20,000nt、約10,000~約25,000nt、約10,000~約30,000nt、約10,000~約40,000nt、約10,000~約45,000nt、約10,000~約50,000nt又はそれらの間の任意の範囲の長さを有し得る。
PMP組成物は、合成mRNA分子、例えばポリペプチドをコードする合成mRNA分子を含み得る。合成mRNA分子は、例えば、化学的に修飾することができる。mRNA分子は、化学的に合成するか又はインビトロで転写させることができる。mRNA分子は、プラスミド、例えばウイルスベクター、細菌ベクター又は真核生物発現ベクター上に配置することができる。場合により、mRNA分子は、形質移入、エレクトロポレーション又は形質導入(例えば、アデノウイルス又はレンチウイルス形質導入)により、細胞に送達することができる。
場合により、PMP組成物は、阻害性RNA分子、例えばRNA干渉(RNAi)経路を介して作用する阻害性RNA分子を含む。場合により、阻害性RNA分子は、植物における遺伝子発現のレベルを減少させ、且つ/又は植物におけるタンパク質のレベルを減少させる。場合により、阻害性RNA分子は、植物遺伝子の発現を阻害する。例えば、阻害性RNA分子には、植物中の遺伝子を標的化する低分子干渉RNA、低分子ヘアピンRNA及び/又はマイクロRNAが含まれ得る。あるRNA分子は、RNA干渉(RNAi)の生物学的プロセスを介して遺伝子発現を阻害し得る。RNAi分子は、典型的に、15~50塩基対(例えば、約18~25塩基対)を含むRNA又はRNA様構築物を含み、細胞内の発現される標的遺伝子中のコード配列と同一(相補的)又はほぼ同一(実質的に相補的)のヌクレオ塩基配列を有する。RNAi分子には、限定されるものではないが、低分子干渉RNA(siRNA)、二本鎖RNA(dsRNA)、低分子ヘアピンRNA(shRNA)、メロデュプレックス、ダイサー基質及び多価RNA干渉(米国特許第8,084,599号明細書、同第8,349,809号明細書、同第8,513,207号明細書及び同第9,200,276号明細書)が含まれる。shRNAは、RNAiを介して標的遺伝子の発現を減少させるヘアピンターンを含むRNA分子である。shRNAは、例えば、形質移入、エレクトロポレーション又は形質導入によって)、プラスミド、例えばウイルス又は細菌ベクターの形態で細胞に送達することができる。マイクロRNAは、典型的に、約22ヌクレオチド長を有するノンコーディングRNA分子である。miRNAは、mRNA分子上の標的部位に結合し、例えばmRNAの開裂、mRNAの脱安定化又はmRNAの翻訳の阻害を引き起こすことにより、mRNAを抑制する。場合により、阻害性RNA分子は、機能の負調節因子のレベル及び/又は活性を減少させる。他の例では、阻害性RNA分子は、機能の正調節因子のレベル及び/又は活性を減少させる。阻害性RNA分子は、例えば、化学的に合成するか又はインビトロで転写させることができる。
本明細書に記載のPMP組成物は、遺伝子編集系の成分を含み得る。例えば、作用物質は、植物における遺伝子中に変更(例えば、挿入、欠失(例えば、ノックアウト)、転座、逆位、単一点突然変異又は他の突然変異)を導入することができる。例示的な遺伝子編集系には、ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)、転写アクチベーター様エフェクターベースヌクレアーゼ(TALEN)及びクラスター化された規則的に間隔を置いた短鎖パリンドロームリピート(CRISPR)系が含まれる。ZFN、TALEN及びCRISPRベースの方法は、例えば、Gaj et al.,Trends Biotechnol.31(7):397-405,2013に記載されている。
本明細書で製造されるPMPは、異種治療剤(例えば、動物(例えば、ヒト)、動物病原体又はその病原体ベクターに影響し、PMP中にロードすることができる作用物質)、例えば病原体制御剤(例えば、抗真菌剤、抗菌剤、殺ウイルス剤、抗ウイルス剤、殺昆虫剤、殺線虫剤、抗寄生虫剤又は昆虫忌避剤)を含み得る。このような作用物質がロードされるPMPは、動物、動物病原体又はその病原体ベクターへの送達のために、薬学的に許容される担体と共に製剤化され得る。
本明細書に記載のPMP組成物は、抗菌剤をさらに含み得る。例えば、本明細書に記載の抗生物質を含むPMP組成物は、動物内部若しくは上で標的レベル(例えば、所定又は閾値レベル)の抗生物質濃度を達成し;且つ/又は動物における細菌感染を治療若しくは予防するのに十分な量及び時間で、動物に投与することができる。本明細書に記載の抗菌剤は、本明細書に記載の方法のいずれかのためにPMP組成物に製剤化することができ、ある場合には、そのPMPと会合させることができる。場合により、PMP組成物は、2つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10又は10超)の異なる抗菌剤を含む。
本明細書に記載のPMP組成物は、抗真菌剤をさらに含み得る。例えば、本明細書に記載の抗真菌剤を含むPMP組成物は、動物内部若しくは上で標的レベル(例えば、所定又は閾値レベル)の抗真菌剤濃度を達成し;且つ/又は動物における真菌感染を治療若しくは予防するのに十分な量及び時間で、動物に投与することができる。本明細書に記載の抗真菌剤は、本明細書に記載の方法のいずれかのためにPMP組成物に製剤化することができ、ある場合にはそのPMPと会合させることができる。場合により、PMP組成物は、2つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10又は10超)の異なる抗真菌剤を含む。
本明細書に記載のPMP組成物は、昆虫駆除剤をさらに含み得る。例えば、昆虫駆除剤は、動物病原体の昆虫ベクターの適応度を減少させ得る(例えば、成長を減少させるか又は殺傷し得る)。本明細書に記載の昆虫駆除剤を含むPMP組成物は、(a)昆虫内部又は上で標的レベル(例えば、所定又は閾値レベル)の昆虫駆除剤濃度を達成し;且つ(b)昆虫の適応度を減少させるのに十分な量及び時間で、昆虫と接触させることができる。場合により、昆虫駆除剤は、寄生昆虫の適応度を減少させ得る(例えば、成長を減少させるか又は殺傷し得る)。本明細書に記載の昆虫駆除剤を含むPMP組成物は、(a)寄生昆虫内部又は上で標的レベル(例えば、所定又は閾値レベル)の昆虫駆除剤濃度を達成し;且つ(b)寄生昆虫の適応度を減少させるのに量及び時間で、寄生昆虫又はその感染動物と接触させることができる。本明細書に記載の昆虫駆除剤は、本明細書に記載の方法のいずれかのためにPMP組成物に製剤化することができ、ある場合にはそのPMPと会合させることができる。場合により、PMP組成物は、2つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10又は10超)の異なる殺昆虫剤を含む。
本明細書に記載のPMP組成物は、殺線虫剤をさらに含み得る。場合により、PMP組成物は、2つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10又は10超)の異なる線虫駆除剤を含む。例えば、線虫駆除剤は、寄生線虫の適応度を減少させ得る(例えば、成長を減少させるか又は殺傷し得る)。本明細書に記載の線虫駆除剤を含むPMP組成物は、(a)標的線虫内部又は上で標的レベル(例えば、所定又は閾値レベル)の線虫駆除剤濃度を達成し;且つ(b)寄生線虫の適応度を減少させるのに十分な量及び時間で、寄生線虫又はその感染動物と接触させることができる。本明細書に記載の線虫駆除剤は、本明細書に記載の方法のいずれかのためにPMP組成物に製剤化することができ、ある場合にはそのPMPと会合させることができる。
本明細書に記載のPMP組成物は、抗寄生虫剤をさらに含み得る。例えば、抗寄生虫剤は、寄生原虫の適応度を減少させ得る(例えば、成長を減少させるか又は殺傷し得る)。本明細書に記載の抗寄生虫剤を含むPMP組成物は、(a)原虫又はその感染動物内部又は上で標的レベル(例えば、所定又は閾値レベル)の抗寄生虫剤濃度を達成し;且つ(b)原虫の適応度を減少させるのに十分な量及び時間で、原虫と接触させることができる。これは、動物における寄生虫の処置又は予防において有用であり得る。例えば、本明細書に記載の抗寄生虫剤を含むPMP組成物は、動物内部若しくは上で標的レベル(例えば、所定又は閾値レベル)の抗寄生虫剤濃度を達成し;且つ/又は動物における寄生虫(例えば、寄生線虫、寄生昆虫又は原虫)感染を処置若しくは予防するのに十分な量及び時間で、動物に投与することができる。本明細書に記載の抗寄生虫剤は、本明細書に記載の方法のいずれかのためにPMP組成物に製剤化することができ、ある場合にはそのPMPと会合させることができる。場合により、PMP組成物は、2つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10又は10超)の異なる抗寄生虫剤を含む。
本明細書に記載のPMP組成物は、抗ウイルス剤をさらに含み得る。本明細書に記載の抗ウイルス剤を含むPMP組成物は、動物内部若しくは上で標的レベル(例えば、所定又は閾値レベル)の抗ウイルス剤濃度を達成し;且つ/又は動物におけるウイルス感染を治療若しくは予防するのに十分な量及び時間で、動物に投与することができる。本明細書に記載の抗ウイルス剤は、本明細書に記載の方法のいずれかのためにPMP組成物に製剤化することができ、ある場合にはそのPMPと会合させることができる。場合により、PMP組成物は、2つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10又は10超)の異なる抗ウイルス剤を含む。
本明細書に記載のPMP組成物は、忌避剤をさらに含み得る。例えば、忌避剤は、動物病原体のベクター、例えば昆虫を忌避し得る。本明細書に記載の忌避剤は、本明細書に記載の方法のいずれかのためにPMP組成物に製剤化することができ、ある場合にはそのPMPと会合させることができる。場合により、PMP組成物は、2つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10又は10超)の異なる忌避剤を含む。
場合により、治療剤は、哺乳動物(例えば、ヒト)状態又は疾患の予防又は処置に使用される作用物質である。疾患は、例えば、癌、自己免疫状態又は代謝障害であり得る。
本明細書で製造されるPMPは、様々な農業又は治療方法において有用である。PMPを使用する方法の例は、以下にさらに記載される。
例えば、植物又はその一部をPMP組成物と接触させることにより、PMP組成物(例えば、本明細書の方法又はバイオリアクターに従って製造される)を植物に送達する方法が本明細書に提供される。場合により、植物を非ロードPMPで処置することができる。他の例では、PMPは、異種機能性剤、例えば殺虫剤(例えば、抗菌剤、抗真菌剤、線虫駆除剤、軟体動物駆除剤、ウイルス駆除剤、雑草駆除剤)、害虫制御剤(例えば、忌避剤)、施肥剤又は植物改変剤を含む。植物への送達が意図されるPMPは、例えば、植物への送達のために製剤化される農業的に許容される担体と共に製剤化することができる。
様々な植物に本明細書に記載のPMP組成物を送達するか又は様々な植物をそれで処置することができる。本方法に従ってPMP組成物を送達する(即ち「処置する」)ことができる植物には、植物全体及びそれらの一部、例として、限定されるものではないが、新芽の栄養器官/構造(例えば、葉、茎及び塊茎)、根、花及び花器/構造(例えば、包葉、がく片、花びら、雄しべ、心皮、葯及び胚珠)、種子(胚、胚乳、子葉及び種皮を含む)並びに果実(成熟した子房)、植物組織(例えば、維管束組織、基本組織など)並びに細胞(例えば、孔辺細胞、卵細胞など)並びにそれらの子孫が含まれる。植物の一部は、さらに、新芽、根、茎、種子、托葉、葉、花びら、花、胚珠、包葉、枝、葉柄、節間板、樹皮、軟毛、分げつ、根茎、葉状体、葉身、花粉、雄しべなどの植物の一部も指し得る。
雑草駆除剤をPMP又はその組成物中に含める場合、方法は、雑草の適応度を減少させるか又はそれを枯らすためにさらに使用することができる。このような例では、方法は、雑草の適応度を未処置の雑草(例えば、PMP組成物が投与されていない雑草)と比較して約2%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%以上減少させるのに有効であり得る。例えば、方法は、雑草を殺傷するのに有効であり得、それにより雑草の集団を未処置の雑草と比較して約2%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%以上減少させる。場合により、方法は、雑草を実質的に排除する。本方法に従って処置することができる雑草の例は、本明細書にさらに記載される。
例えば、植物害虫をPMP組成物と接触させることによってPMP組成物(例えば、本明細書の方法又はバイオリアクターに従って製造される)を植物害虫に送達する方法が本明細書に提供される。場合により、植物害虫を非ロードPMPで処置することができる。他の例では、PMPは、異種機能性剤、例えば殺虫剤(例えば、抗菌剤、抗真菌剤、線虫駆除剤、軟体動物駆除剤、ウイルス駆除剤又は雑草駆除剤)又は害虫制御剤(例えば、忌避剤)を含む。例えば、方法は、害虫の適応度を減少させるため、例えばPMP組成物の送達の結果として害虫侵入を予防又は処置するために有用であり得る。
PMP組成物及び関連する方法は、例えば、植物における真菌感染を予防又は処置するために、真菌の適応度を減少させるのに有用であり得る。真菌をPMP組成物と接触させることにより、PMP組成物を真菌に送達する方法が含まれる。加えて又は代わりに、方法は、植物をPMP組成物と接触させることにより、真菌感染のリスクがあるか又は真菌感染を有する植物にPMP組成物を送達することを含む。
Bipolaris)シノニム:ヘルミントスポリウム属(Helminthosporium))によって引き起こされるもの;コレトトリカム属(Colletotrichum)種、例えばコレトトリカム・コッコデス(Colletotrichum coccodes)によって引き起こされるもの;フザリウム属(Fusarium)種、例えばフザリウム・クルモラム(Fusarium culmorum)によって引き起こされるもの;ジベレラ属(Gibberella)種、例えばジベレラ・ゼアエ(Gibberella zeae)によって引き起こされるもの;マクロフォミナ属(Macrophomina)種、例えばマクロフォミナ・ファゼオリナ(Macrophomina phaseolina)によって引き起こされるもの;モノグラフェラ属(Monographella)種)、例えばモノグラフェラ・ニバリス(Monographella nivalis)によって引き起こされるもの;ペニシリウム属(Penicillium)種、例えばペニシリウム・エキスパンサム(Penicillium expansum)によって引き起こされるもの;フォーマ属(Phoma)種、例えばフォーマ・リンガム(Phoma lingam)によって引き起こされるもの;フォモプシス属(Phomopsis)種、例えばフォモプシス・ソジャエ(Phomopsis sojae)によって引き起こされるもの;フィトフトラ種(Phytophthora)種、例えばフィトフトラ・カクトラム(Phytophthora cactorum)によって引き起こされるもの;ピレノホラ属(Pyrenophora)種、例えばピレノホラ・グラミネア(Pyrenophora graminea)によって引き起こされるもの;ピリクラリア属(Pyricularia)種、例えばピリクラリア・オリゼ(Pyricularia oryzae)によって引き起こされるもの;ピチウム属(Pythium)種、例えばピチウム・ウルチマム(Pythium ultimum)によって引き起こされるもの;リゾクトニア属(Rhizoctonia)種、例えばリゾクトニア・ソラニ(Rhizoctonia solani)によって引き起こされるもの;リゾプス属(Rhizopus)種、例えばリゾプス・オリゼ(Rhizopus oryzae)によって引き起こされるもの;スクレロチウム属(Sclerotium)種、例えばスクレロチウム・ロルフシイ(Sclerotium rolfsii)によって引き起こされるもの;セプトリア属(Septoria)種、例えばセプトリア・ノドラム(Septoria nodorum)によって引き起こされるもの;チフラ属(Typhula)種、例えばチフラ・インカルナタ(Typhula incarnata)によって引き起こされるもの;ベルチシリウム属(Verticillium)種、例えばベルチシリウム・ダーリアエ(Verticillium dahliae)によって引き起こされるもの;例えば、:ネクトリア属(Nectria)種、例えばネクトリア・ガリゲナ(Nectria galligena)によって引き起こされる癌腫病、虫こぶ及び天狗巣病;例えば、モニリニア属(Monilinia)種、例えばモニリニア・ラキサ(Monilinia laxa)によって引き起こされる萎凋病;例えば、エクソバシジウム属(Exobasidium)種、例えばエクソバシジウム・ベキサンス(Exobasidium vexans);タフリナ属(Taphrina)種、例えばタフリナ・デフォルマンス(Taphrina deformans)によって引き起こされる葉ぶくれ病又は葉巻病;例えば、以下のものによって引き起こされる木本植物の変性病害:例えば、ファエモニエラ・クラミドスポラ(Phaemoniella clamydospora)、ファエオアクレモニウム・アレオフィラム(Phaeoacremonium aleophilum)及びフォミチポリア・メジテラネア(Fomitiporia mediterranea)によって引き起こされるエスカ病;例えば、ユータイパ・ラタ(Eutypa lata)によって引き起こされるユータイパ・ダイバック;例えば、シママンネンタケ(Ganoderma boninense)によって引き起こされるマンネンタケ属(Ganoderma)病;例えば、リギドポルス・リグノサス(Rigidoporus lignosus)によって引き起こされるリギドポルス属(Rigidoporus)病;例えば、ボトリチス属種(Botrytis)種、例えばボトリチス・シネレア(Botrytis cinerea)によって引き起こされる花及び種子の病害;例えば、リゾクトニア属(Rhizoctonia)種、例えばリゾクトニア・ソラニ(Rhizoctonia solani);ヘルミントスポリウム属(Helminthosporium)種、例えばヘルミントスポリウム・ソラニ(Helminthosporium solani)によって引き起こされる植物塊茎の病害;例えば、プラスモディオフォラ属(Plasmodiophora)種、例えばプラスモディオフォラ・ブラシカエ(Plamodiophora brassicae)によって引き起こされる根こぶ;細菌性病原体、例えばキサントモナス属(Xanthomonas)種、例えばキサントモナス・カムペストリス病原型オリゼ(Xanthomonas campestris pv.oryzae);シュードモナス属(Pseudomonas)種、例えばシュードモナス・シリンガエ病原型ラクリマンス(Pseudomonas syringae pv.lachrymans);エルウィニア属(Erwinia)種、例えばエルウィニア・アミロボラ(Erwinia amylovora)によって引き起こされる病害が含まれる。
PMP組成物及び関連する方法は、例えば、植物における細菌感染を予防又は処置するために、細菌の適応度を減少させるのに有用であり得る。細菌をPMP組成物と接触させることにより、PMP組成物を細菌に送達する方法が含まれる。加えて又は代わりに、本方法は、植物をPMP組成物と接触させることにより、細菌感染のリスクがあるか又は細菌感染を有する植物にバイオ駆除剤を送達することを含む。
キサントモナス・アキソノポジス病原型マニホチス(Xanthomonas axonopodis pv.manihotis)(=キサントモナス・カムペストリス病原型マニホチス(Xanthomonas campestris pv.manihotis))、キサントモナス・アキソノポジス病原型マルチニイコラ(Xanthomonas axonopodis pv.martyniicola)(=キサントモナス・カムペストリス病原型マルチニイコラ(Xanthomonas campestris pv.martyniicola))、キサントモナス・アキソノポジス病原型メルフシイ(Xanthomonas axonopodis pv.melhusii)(=キサントモナス・カムペストリス病原型メルフシイ(Xanthomonas campestris pv.melhusii))、キサントモナス・アキソノポジス病原型ナカタエコルコリ(Xanthomonas axonopodis pv.nakataecorchori)(=キサントモナス・カムペストリス病原型ナカタエコルコリ(Xanthomonas campestris pv.nakataecorchori))、キサントモナス・アキソノポジス病原型パシフロラエ(Xanthomonas axonopodis pv.passiflorae)(=キサントモナス・カムペストリス病原型パシフロラエ(Xanthomonas campestris pv.passiflorae))、キサントモナス・アキソノポジス病原型パテリイ(Xanthomonas axonopodis pv.patelii)(=キサントモナス・カムペストリス病原型パテリイ(Xanthomonas campestris pv.patelii))、キサントモナス・アキソノポジス病原型ペダリイ(Xanthomonas axonopodis pv.pedalii)(=キサントモナス・カムペストリス病原型ペダリイ(Xanthomonas campestris pv.pedalii))、キサントモナス・アキソノポジス病原型ファセオリ(Xanthomonas axonopodis pv.phaseoli)(=キサントモナス・カムペストリス病原型ファセオリ(Xanthomonas campestris pv.phaseoli)、キサントモナス・ファセオリ(Xanthomonas phaseoli))、キサントモナス・アキソノポジス病原型ファセオリ変種フスカンス(Xanthomonas axonopodis pv.phaseoli var.fuscans)(=キサントモナス・フスカンス(Xanthomonas fuscans))、キサントモナス・アキソノポジス病原型フィランチ(Xanthomonas axonopodis pv.phyllanthi)(=キサントモナス・カムペストリス病原型フィランチ(Xanthomonas campestris pv.phyllanthi))、キサントモナス・アキソノポジス病原型フィサリジコラ(Xanthomonas axonopodis pv.physalidicola)(=キサントモナス・カムペストリス病原型フィサリジコラ(Xanthomonas campestris pv.physalidicola))、キサントモナス・アキソノポジス病原型ポインセチイコラ(Xanthomonas axonopodis pv.poinsettiicola)(=キサントモナス・カムペストリス病原型ポインセチイコラ(Xanthomonas campestris pv.poinsettiicola))、キサントモナス・アキソノポジス病原型プニカエ(Xanthomonas axonopodis pv.punicae)(=キサントモナス・カムペストリス病原型プニカエ(Xanthomonas campestris pv.punicae))、キサントモナス・アキソノポジス病原型リンコシアエ(Xanthomonas axonopodis pv.rhynchosiae)(=キサントモナス・カムペストリス病原型リンコシアエ(Xanthomonas campestris pv.rhynchosiae))、キサントモナス・アキソノポジス病原型リシニ(Xanthomonas axonopodis pv.ricini)(=キサントモナス・カムペストリス病原型リシニ(Xanthomonas campestris pv.ricini))、キサントモナス・アキソノポジス病原型セスバニアエ(Xanthomonas axonopodis pv.sesbaniae)(=キサントモナス・カムペストリス病原型セスバニアエ(Xanthomonas campestris pv.sesbaniae))、キサントモナス・アキソノポジス病原型タマリンジ(Xanthomonas axonopodis pv.tamarindi)(=キサントモナス・カムペストリス病原型タマリンジ(Xanthomonas campestris pv.tamarindi))、キサントモナス・アキソノポジス病原型バスクロルム(Xanthomonas axonopodis pv.vasculorum)(=キサントモナス・カムペストリス病原型バスクロルム(Xanthomonas campestris pv.vasculorum))、キサントモナス・アキソノポジス病原型ベシカトリア(Xanthomonas axonopodis pv.vesicatoria)(=キサントモナス・カムペストリス病原型ベシカトリア(Xanthomonas campestris pv.vesicatoria)、キサントモナス・ベシカトリア(Xanthomonas vesicatoria))、キサントモナス・アキソノポジス病原型ビグナエラジアタエ(Xanthomonas axonopodis pv.vignaeradiatae)(=キサントモナス・カムペストリス病原型ビグナエラジアタエ(Xanthomonas campestris pv.vignaeradiatae))、キサントモナス・アキソノポジス病原型ビグニコラ(Xanthomonas axonopodis pv.vignicola)(=キサントモナス・カムペストリス病原型ビグニコラ(Xanthomonas campestris pv.vignicola))又はキサントモナス・アキソノポジス病原型ビチアンス(Xanthomonas axonopodis pv.vitians)(=キサントモナス・カムペストリス病原型ビチアンス(Xanthomonas campestris pv.vitians))である。
PMP組成物及び関連する方法は、例えば、植物における昆虫侵入を予防又は処置するために、昆虫の適応度を減少させるのに有用であり得る。「昆虫」という語は、任意の発生段階の、即ち幼虫及び成虫の、節足動物門(Arthropoda)及び昆虫綱(Insecta)又はクモ綱(Arachnida)に属する任意の生物を含む。昆虫をPMP組成物と接触させることにより、PMP組成物を昆虫に送達する方法が含まれる。加えて又は代わりに、本方法は、植物をPMP組成物と接触させることにより、昆虫侵入のリスクがあるか又は昆虫侵入を有する植物にバイオ駆除剤を送達することを含む。
PMP組成物及び関連する方法は、例えば、植物における軟体動物侵入を予防又は処置するために、軟体動物の適応度を減少させるのに有用であり得る。「軟体動物」という語は、軟体動物門(Mollusca)に属する任意の生物を含む。軟体動物をPMP組成物と接触させることにより、PMP組成物を軟体動物に送達する方法が含まれる。加えて又は代わりに、方法は、植物をPMP組成物と接触させることにより、軟体動物侵入のリスクがあるか又は軟体動物侵入を有する植物にバイオ駆除剤を送達することを含む。
PMP組成物及び関連する方法は、例えば、植物における線虫侵入を予防又は処置するために、線虫の適応度を減少させるに有用であり得る。「線虫」という語は、線虫門(Nematoda)に属する任意の生物を含む。線虫をPMP組成物と接触させることにより、PMP組成物を線虫に送達する方法が含まれる。加えて又は代わりに、本方法は、植物をPMP組成物と接触させることにより、線虫侵入のリスクがあるか又は線虫侵入を有する植物にバイオ駆除剤を送達することを含む。
パラトリコドルス・テレス(Paratrichodorus teres)及びパラトリコドルス属種(Paratrichodorus spp.)全般、パラチレンクス・ハマタス(Paratylenchus hamatus)、パラチレンクス・ミヌタス(Paratylenchus minutus)、パラチレンクス・プロジェクタス(Paratylenchus projectus)及びパラチレンクス属種(Paratylenchus spp.)全般、プラチレンクス・アギリス(Pratylenchus agilis)、プラチレンクス・アレニ(Pratylenchus alleni)、プラチレンクス・アンジヌス(Pratylenchus andinus)、プラチレンクス・ブラキュルス(Pratylenchus brachyurus)、プラチレンクス・セレアリス(Pratylenchus cerealis)、プラチレンクス・コフェアエ(Pratylenchus coffeae)、プラチレンクス・クレナタス(Pratylenchus crenatus)、プラチレンクス・デラトレイ(Pratylenchus delattrei)、プラチレンクス・ギイビカウダタス(Pratylenchus giibbicaudatus)、プラチレンクス・ゴーデイ(Pratylenchus goodeyi)、プラチレンクス・ハマタス(Pratylenchus hamatus)、プラチレンクス・ヘキシンシサス(Pratylenchus hexincisus)、プラチレンクス・ローシ(Pratylenchus loosi)、プラチレンクス・ネグレクタス(Pratylenchus neglectus)、プラチレンクス・ペネトランス(Pratylenchus penetrans)、プラチレンクス・プラテンシス(Pratylenchus pratensis)、プラチレンクス・スクリブネリ(Pratylenchus scribneri)、プラチレンクス・テレス(Pratylenchus teres)、プラチレンクス・トルネイ(Pratylenchus thornei)、プラチレンクス・バルヌス(Pratylenchus vulnus)、プラチレンクス・ゼアエ(Pratylenchus zeae)及び移動性内部寄生虫であるプラチレンクス属種(Pratylenchus spp.)全般、シュードハレンクス・ミヌタス(Pseudohalenchus minutus)、シレンクス・マグニデンス(Psilenchus magnidens)、シレンクス・ツミダス(Psilenchus tumidus)、プンクトデラ・チャコエンシス(Punctodera chalcoensis)、クイニスルシウス・アクタス(Quinisulcius acutus)、ラドフォルス・シトロフィルス(Radopholus citrophilus)、ラドフォルス・シミリス(Radopholus similis)、移動性内部寄生虫であるラドフォルス属種(Radopholus spp.)全般、ロチレンクルス・ボレアリス(Rotylenchulus borealis)、ロチレンクルス・パルブス(Rotylenchulus parvus)、ロチレンクルス・レニフォルミス(Rotylenchulus reniformis)及びロチレンクルス属種(Rotylenchulus spp.)全般、ロチレンクス・ラウレンチヌス(Rotylenchus laurentinus)、ロチレンクス・マクロドラタス(Rotylenchus macrodoratus)、ロチレンクス・ロブスタス(Rotylenchus robustus)、ロチレンクス・ユニフォルミス(Rotylenchus uniformis)及びロチレンクス属種(Rotylenchus spp.)全般、スクテロネマ・ブラキュルム(Scutellonema brachyurum)、スクテロネマ・ブラディス(Scutellonema bradys)、スクテロネマ・クラスリカウダタム(Scutellonema clathricaudatum)及び移動性内部寄生虫であるスクテロネマ属種(Scutellonema spp.)全般、スバンギナ・ラジシオラ(Subanguina radiciola)、テチレンクス・ニコチアナエ(Tetylenchus nicotianae)、トリコドルス・シリンドリクス(Trichodorus cylindricus)、トリコドルス・マイナー(Trichodorus minor)、トリコドルス・プリミチブス(Trichodorus primitivus)、トリコドルス・プロキシムス(Trichodorus proximus)、トリコドルス・シミリス(Trichodorus similis)、トリコドルス・スパルサス(Trichodorus sparsus)及び外部寄生虫であるトリコドルス属種(Trichodorus spp.)全般、チレンコリンクス・アグリ(Tylenchorhynchus agri)、チレンコリンクス・ブラシカエ(Tylenchorhynchus brassicae)、チレンコリンクス・クラルス(Tylenchorhynchus clarus)、チレンコリンクス・クレイトニ(Tylenchorhynchus claytoni)、チレンコリンクス・ジギタタス(Tylenchorhynchus digitatus)、チレンコリンクス・エブリエンシス(Tylenchorhynchus ebriensis)、チレンコリンクス・マキシムス(Tylenchorhynchus maximus)、チレンコリンクス・ヌダス(Tylenchorhynchus nudus)、チレンコリンクス・ブルガリス(Tylenchorhynchus vulgaris)及びチレンコリンクス属種(Tylenchorhynchus spp.)全般、チレンクルス・セミペネトランス(Tylenchulus semipenetrans)及び半寄生虫であるチレンクルス属種(Tylenchulus spp.)全般、キシフィネマ・アメリカナム(Xiphinema americanum)、キシフィネマ・ブレビコレ(Xiphinema brevicolle)、キシフィネマ・ジモルフィカウダツム(Xiphinema dimorphicaudatum)、キシフィネマ・インデックス(Xiphinema index)及び外部寄生虫であるキシフィネマ属種(Xiphinema spp.)全般。
PMP組成物及び関連する方法は、例えば、植物におけるウイルス感染を予防又は処置するために、ウイルスの適応度を減少させるに有用であり得る。ウイルスをPMP組成物と接触させることにより、PMP組成物をウイルスに送達する方法が含まれる。加えて又は代わりに、方法は、植物をPMP組成物と接触させることにより、ウイルス感染のリスクがあるか又はウイルス感染を有する植物にPMP組成物を送達することを含む。
本明細書に開示されるPMP組成物を植物共生生物に送達する方法が本明細書に提供される。共生生物をPMP組成物と接触させることによってPMP組成物を植物共生生物(例えば、細菌内部共生生物、真菌内部共生生物又は昆虫)に送達する方法が含まれる。方法は、植物共生生物、例えば植物の適応度に有益な共生生物の適応度を増加させるのに有用であり得る。場合により、植物共生生物を非ロードPMPで処置することができる。他の例では、PMPは、異種機能性剤、例えば施肥剤を含む。
PMP組成物及び関連する方法は、真菌、例えば植物の内部共生生物である真菌(例えば、菌根菌)の適応度の増加に有用であり得る。
PMP組成物及び関連する方法は、細菌、例えば植物の内部共生生物である細菌(例えば、窒素固定細菌)の適応度を増加させるのに有用であり得る。
PMP組成物及び関連する方法は、昆虫、例えば植物に有益な昆虫の適応度を増加させるのに有用であり得る。昆虫という用語は、任意の発生段階、即ち幼虫及び成虫の節足動物門及び昆虫綱又はクモ綱に属する任意の生物を含む。例えば、宿主には、農業用途において使用される昆虫、例として作物の送粉、種子の拡散又は害虫制御を補助する昆虫が含まれ得る。
病原体をPMP組成物と接触させることにより、PMP組成物(例えば、本明細書の方法又はバイオリアクターに従って製造される)を動物(例えば、ヒト)病原体、例えば本明細書に開示されるものに送達する方法が本明細書に提供される。本明細書で使用される「病原体」という語は、例えば、(i)動物に直接感染することにより、(ii)動物において疾患又は病状を引き起こす作用物質を産生することによって(例えば、病原性毒素を産生する細菌など)、及び/又は(iii)動物において免疫(例えば、炎症応答)を誘発する(例えば、刺咬昆虫、例えばトコジラミ)、動物において疾患又は病状を引き起こす生物、例えば微生物又は無脊椎動物を指す。本明細書で使用される病原体には、限定されるものではないが、細菌、原虫、寄生虫、真菌、線虫、昆虫、ウイロイド及びウイルス又はそれらの任意の組み合わせが含まれ、各病原体は、それ自体で又は別の病原体と協調して動物、例えばヒトにおいて疾患又は症状を誘発し得る。
PMP組成物及び関連する方法は、例えば、動物の真菌感染症を予防又は処置するために真菌の適応度を低下させるのに有用であり得る。真菌をPMP組成物に接触させることによって真菌にPMP組成物を送達する方法が含まれる。加えて又は代わりに、この方法は、動物にPMP組成物を投与することにより、真菌感染(例えば、本明細書に記載の真菌によって引き起こされる)のリスクがあるか又はそれを必要とする動物の真菌感染を予防又は処置する工程を含む。
PMP組成物及び関連する方法は、例えば、動物の細菌感染を予防又は処置するために細菌の適応度を低下させるのに有用であり得る。細菌をPMP組成物に接触させることによってPMP組成物を細菌に投与する方法が含まれる。加えて又は代わりに、この方法は、動物にPMP組成物を投与することにより、細菌感染(例えば、本明細書に記載の細菌によって引き起こされる)のリスクがあるか又はそれを必要とする動物の細菌感染を予防又は処置する工程を含む。
PMP組成物及び関連する方法は、例えば、動物における寄生昆虫感染を予防又は処置するために、寄生昆虫の適応度を減少させるのに有用であり得る。「昆虫」という語は、任意の発生段階の、即ち幼虫及び成虫の、節足動物門(Arthropoda)及び昆虫綱(Insecta)又はクモ綱(Arachnida)に属する任意の生物を含む。昆虫をPMP組成物と接触させることにより、PMP組成物を昆虫に送達する方法が含まれる。加えて又は代わりに、本方法は、PMP組成物を動物に投与することにより、寄生昆虫感染のリスクがあるか又はその予防若しくは処置が必要とされる動物における寄生昆虫感染(例えば、本明細書に記載の寄生昆虫によって引き起こされる)を予防又は処置することを含む。
PMP組成物及び関連する方法は、例えば、動物における寄生原虫感染を予防又は処置するために、寄生原虫の適応度を減少させるのに有用であり得る。「原虫」という語は、原虫門(Protozoa)に属する任意の生物を含む。寄生原虫をPMP組成物と接触させることにより、PMP組成物を寄生原虫に送達する方法が含まれる。加えて又は代わりに、方法は、PMP組成物を動物に投与することにより、原虫感染のリスクがあるか又はその予防若しくは処置が必要とされる動物における原虫感染(例えば、本明細書に記載の原虫によって引き起こされる)を予防又は処置することを含む。
PMP組成物及び関連する方法は、例えば、動物における寄生線虫感染を予防又は処置するために、寄生線虫の適応度を減少させるのに有用であり得る。寄生線虫をPMP組成物と接触させることにより、PMP組成物を寄生線虫に送達する方法が含まれる。加えて又は代わりに、方法は、PMP組成物を動物に投与することによって寄生線虫感染のリスクがあるか又はその予防若しくは処置が必要とされる動物における寄生線虫感染(例えば、本明細書に記載の寄生線虫によって引き起こされる)を予防又は処置することを含む。
PMP組成物及び関連する方法は、例えば、動物におけるウイルス感染を予防又は処置するために、ウイルスの適応度を減少させるのに有用であり得る。ウイルスをPMP組成物と接触させることにより、PMP組成物をウイルスに送達する方法が含まれる。加えて又は代わりに、方法は、PMP組成物を動物に投与することにより、ウイルス感染のリスクがあるか又はその予防若しくは処置が必要とされる動物におけるウイルス感染(例えば、本明細書に記載のウイルスによって引き起こされる)を予防又は処置することを含む。
病原体ベクターをPMP組成物と接触させることにより、PMP組成物(例えば、本明細書の方法又はバイオリアクターに従って製造される)を病原体ベクター、例えば本明細書に開示されるものに送達する方法が本明細書に提供される。本明細書で使用される「ベクター」という語は、動物病原体を担持するか、又は保有宿主から動物に伝達し得る昆虫を指す。例示的なベクターには、昆虫、例えばカメムシ目(Hemiptera)及び一部のハチ目(Hymenoptera)及びハエ目(Diptera)に見られる刺吸口器を有するもの、例えばカ、ハチ、カリバチ、ユスリカ、シラミ、ツェツェバエ、ノミ及びアリ並びにクモ綱(Arachnidae)のメンバー、例えばダニ(tick)及びダニ(mite)が含まれる。
本明細書に提供される方法及び組成物は、動物病原体のためのベクターの適応度を減少させるのに有用であり得る。場合により、ベクターは、昆虫であり得る。例えば、昆虫ベクターには、限定されるものではないが、カメムシ目(Hemiptera)及び一部のハチ目(Hymenoptera)及びハエ目(Diptera)に見られる刺吸口器を有するもの、例えばカ、ハチ、カリバチ、ユスリカ、シラミ、ツェツェバエ、ノミ及びアリ並びにクモ綱(Arachnidae)のメンバー、例えばダニ(tick)及びダニ(mite);ダニ目(Acarina)(ダニ(tick)及びダニ(mite))の目、綱又は科、例えばヒメダニ科(Argasidae)、ワクモ科(Dermanyssidae)、マダニ科(Ixodidae)、キュウセンダニ科(Psoroptidae)又はヒゼンダニ科(Sarcoptidae)の科の代表例及びキララマダニ属種(Amblyomma spp.)、アノセントン属種(Anocenton spp.)、ナガヒメダニ属種(Argas spp.)、ウシマダニ属種(Boophilus spp.)、ツメダニ属種(Cheyletiella spp.)、ショクヒヒゼンダニ属種(Chorioptes spp.)、ニキビダニ属種(Demodex spp.)、カクマダニ属種(Dermacentor spp.)、ワクモ属種(Denmanyssus spp.)、チマダニ属種(Haemophysalis spp.)、イボマダニ属種(Hyalomma spp.)、マダニ属種(Ixodes spp.)、リンクサカルス属種(Lynxacarus spp.)、トゲダニ亜目属種(Mesostigmata spp.)、ノトエドネス属種(Notoednes spp.)、ヒメダニ属種(Ornithodoros spp.)、イエダニ属種(Ornithonyssus spp.)、オトビウス属種(Otobius spp.)、ミミヒゼンダニ属種(otodectes spp.)、ハイダニ属種(Pneumonyssus spp.)、ソロプテス属種(Psoroptes spp.)、リピセファルス属種(Rhipicephalus spp.)、サンコプテス属種(Sancoptes spp.)又はツツガムシ属種(Trombicula spp.)の種の代表例;シラミ亜目(Anoplura)(刺咬シラミ)、例えばボビコーラ属種(Bovicola spp.)、ハエマトピヌス属種(Haematopinus spp.)、リノグナツス属種(Linognathus spp.)、タンカクハジラミ属種(Menopon spp.)、シラミ属種(Pediculus spp.)、ペムフィグス属種(Pemphigus spp.)、フィロキセラ属種(Phylloxera spp.)又はソレノポテス属種(Solenopotes spp.)の種の代表例;ハエ目(Diptera)(ハエ)、例えばヤブカ属種(Aedes spp.)、ハマダラカ属種(Anopheles spp.)、オオクロバエ属種(Calliphora spp.)、オビキンバエ属種(Chrysomyia spp.)、メクラアブ属種(Chrysops spp.)、コクリオミア属種(Cochliomyia spp.)、Cw/ex属種(Cw/ex spp.)、ヌカカ属種(Culicoides spp.)、ウナギヒフバエ属種(Cuterebra spp.)、ヒフバエ属種(Dermatobia spp.)、ウマバエ属種(Gastrophilus spp.)、ツェツェバエ属種(Glossina spp.)、ノサシバエ属種(Haematobia spp.)、ゴマフアブ属種(Haematopota spp.)、シラミバエ属種(Hippobosca spp.)、ウシバエ属種(Hypoderma spp.)、キンバエ属種(Lucilia spp.)、リペロシア属種(Lyperosia spp.)、メロファグス属種(Melophagus spp.)、エストラス属種(Oestrus spp.)、ファエニシア属種(Phaenicia spp.)、サシチョウバエ属種(Phlebotomus spp.)、ホルミア属種(Phormia spp.)、ダニ目(Acari)(疥癬ダニ)、例えばヒゼンダニ属種(Sarcoptidae spp.)、ニクバエ属種(Sarcophaga spp.)、ブユ属種(Simulium spp.)、サシバエ属種(Stomoxys spp.)、アブ属種(Tabanus spp.)、タンニア属種(Tannia spp.)又はZzpu/アルファ属種(Zzpu/alpha spp.)の種の代表例;ハジラミ目(Mallophaga)(刺咬シラミ)、例えばダマリニア属種(Damalina spp.)、フェリコラ属種(Felicola spp.)、ヘテロドクサス属種(Heterodoxus spp.)又はトリコデクテス属種(Trichodectes spp.)の種の代表例;又はノミ目(Siphonaptera)(無翅昆虫)、例えばセラトフィルス属種(Ceratophyllus spp.)、ネズミノミ属種(Xenopsylla spp)の種の代表例;トコジラミ科(Cimicidae)(半翅昆虫)、例えばシメクス属種(Cimex spp.)、オオサシガメ亜科属種(Tritominae spp.)、ロドニウス属種(Rhodinius spp.)又はサシガメ属種(Triatoma spp.)の種の代表例が含まれ得る。
組成物の植物への送達又は投与を可能にする任意の好適な手法で、本明細書に記載の植物を本明細書に記載のPMP組成物に曝露することができる。PMP組成物は、単独で又は他の活性物質(例えば、施肥剤)又は非活性物質との組み合わせのいずれでも送達することができ、例えば有効濃度のPMP組成物を送達するように製剤化された濃縮液、ゲル、溶液、懸濁液、散布液、粉末、ペレット、ブリケット、ブリックなどの形態で、例えば噴霧、インジェクション(例えば、マイクロインジェクション)、植物経由、注入、浸漬によって適用することができる。本明細書に記載の組成物の適用量及び適用場所は、一般に、植物の生息環境、植物をPMP組成物によって標的化することができる生活環段階、適用を行うべき部位並びにPMP組成物の物理的及び機能的特性によって決定される。
本明細書に記載のPMP組成物は、様々な治療方法において有用である。例えば、方法及び組成物は、ヒト疾患若しくは障害を処置若しくは予防するために;又は農業動物(例えば、雌牛、去勢牛、ブタ、ウマ又はニワトリ)若しくは他の獣医学的動物種、例えばウマ、イヌ若しくはネコにおける障害を処置若しくは予防するために動物(例えば、ヒト)における病原体感染の予防又は処置に使用することができる。本明細書で使用される「処置」という語は、医薬組成物を予防及び/又は治療目的で動物に投与することを指す。「予防する」ことは、未だ疾病状態ではないが、特定の疾患を受けやすいか又はそうでなければそのリスクがある動物の予防的処置を指す。「処置する」ことは、すでに疾患に罹患している動物に処置を施して動物の状態を改善又は安定化することを指す。本方法は、本明細書に記載のPMP組成物を動物、例えばヒトに送達することを含む。
本発明は、本明細書に記載のPMP組成物を有する容器を含むキットも提供する。キットは、本発明の方法に従ってPMP組成物を植物に適用又は送達するための教材をさらに含み得る。当業者は、本発明の方法でPMP組成物を適用する上での指示が、任意の形態の指示であり得ることを理解する。このような指示には、限定されるものではないが、文書教材(例えば、ラベル、冊子、パンフレット)、口述教材(例えば、オーディオカセットテープ又はCD)又はビデオ教材(例えば、ビデオテープ又はDVD)が含まれる。
この実施例では、葉のアポプラスト、種子のアポプラスト、根、果物、野菜、花粉、師部、木部樹液及び植物細胞培養培地を含む様々な植物源からの粗植物メッセンジャーパック(PMP)の単離について説明する。
a)シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)の葉のアポプラストからのPMPの単離
シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana Col-0)の種子を50%の漂白剤で表面滅菌し、0.8%の寒天を含む0.53ムラシゲスクーグ培地にプレーティングする。種子を4℃で2日間春化処理してから、短日条件(9時間日長、22℃、150μEm-2)に変更する。1週間後、苗をPro-Mix PGXに移す。植物は、4~6週間育ててから収穫する。
無傷のヒマワリ(H.annuus L.)の種子に水を2時間吸収させ、皮をむいて果皮を除去し、アポプラスト細胞外液を修正減圧浸透遠心分離手順によって抽出する(出典:Regente et al,FEBS Letters.583:3363-3366,2009)。簡単に説明すると、種子を小胞単離緩衝液(20mM MES、2mM CaCl2及び0.1M NaCl、pH6)に浸し、45kPaの圧力において30秒間隔で3回の10秒の真空パルスにさらす。浸透した種子を回収し、ろ紙上で乾燥させ、フリットガラスフィルターに入れ、4℃、400gで20分間遠心分離する。アポプラストの細胞外液を回収し、0.85μmフィルターでろ過して大きい粒子を除去し、実施例2に記載されるようにPMPを精製する。
新鮮なショウガ(Zingiber officinale)の地下茎を地元の供給業者から購入し、PBSで3回洗浄する。合計200グラムの洗浄した根をミキサー(Osterizer 12スピードブレンダー)で最高速度において10分間粉砕し(1分のブレンディングごとに1分間一時停止)、PMPを、Zhuang et al.,J Extracellular Vesicles.4(1):28713,2015に記載されているように単離した。簡単に説明すると、ショウガ汁を1,000gで10分間、3,000gで20分間、10,000gで40分間連続して遠心分離して、PMPを含む上清から大きい粒子を除去する。実施例2に記載されるようにPMPを精製する。
新鮮なグレープフルーツ(Citrus×paradisi)を地元の供給業者から購入し、その皮を取り除き、果実を手動でプレスするか又はミキサー(Osterizer 12スピードブレンダー)で最高速度において10分間粉砕し(1分のブレンディングごとに1分間一時停止)、Wang et al.,Molecular Therapy.22(3):522-534,2014に記載されているものをわずかに変更して、果汁を収集する。簡単に説明すると、果汁/果汁果肉を1,000gで10分間、3,000gで20分間、10,000gで40分間連続して遠心分離し、PMPを含む上清から大きい粒子を除去する。実施例2に記載されるようにPMPを精製する。
ブロッコリー(Brassica oleracea var.italica)のPMPを、既に説明されているように単離する(Deng et al.,Molecular Therapy,25(7):1641-1654,2017)。簡単に説明すると、新鮮なブロッコリーを地元の供給業者から購入し、PBSで3回洗浄し、ミキサー(Osterizer 12スピードブレンダー)で最高速度において10分間粉砕する(1分のブレンディングごとに1分間一時停止)。次いで、ブロッコリー果汁を1,000gで10分間、3,000gで20分間、10,000gで40分間連続して遠心分離し、PMPを含む上清から大きい粒子を除去する。実施例2に記載されているようにPMPを精製する。
オリーブ(Olea europaea)花粉のPMPを、Prado et al.,Molecular Plant.7(3):573-577,2014に既に記載されているように単離する。簡単に説明すると、オリーブ花粉(0.1g)を湿度の高いチャンバー内において室温で30分間水和してから、20mlの発芽培地:10%スクロース、0.03%Ca(NO3)2、0.01%KNO3、0.02%MgSO4及び0.03%H3BO3を含むペトリ皿(直径15cm)に移す。花粉を30℃の暗所に16時間置いて発芽させる。花粉粒は、その直径よりも管が長い場合にのみ発芽したと見なされる。PMPを含む培養培地を採取し、遠心分離による0.85μmフィルターでの2回の連続ろ過によって花粉の破片を取り除いた。実施例2に記載されるようにPMPを精製する。
シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana Col-0)の種子を50%の漂白剤で表面滅菌し、0.8%の寒天を含む0.53ムラシゲスクーグ培地にプレーティングする。種子を4℃で2日間春化処理してから、短日条件(9時間日長、22℃、150μEm-2)に変更する。1週間後、苗をPro-Mix PGXに移す。植物は、4~6週間育ててから収穫する。
トマト(Solanum lycopersicum)の種子を、Sunshine Mix(Sun Gro Horticulture,Agawam,MA)などの有機物が豊富な土壌の単一のポットに植え、22℃~28℃の温室で維持する。発芽の約2週間後、苗を双葉の段階において、90%の砂及び10%の有機混合物を含む無菌砂質土壌が満たされたポット(直径10cm、深さ17cm)に個別に移植する。植物を22~28℃の温室で4週間維持する。
タバコBY-2(Nicotiana tabacum L cv.Bright Yellow 2)細胞を26℃の暗所において、180rpmのシェーカー上において、30g/Lのスクロース、2.0mg/Lのリン酸二水素カリウム、0.1g/Lのmyoイノシトール、0.2mg/Lの2,4-ジクロロフェノキシ酢酸及び1mg/LのチアミンHClが添加されたMS塩(Duchefa,Haarlem,Netherlands,at#M0221)を含むMS(Murashige and Skoog,1962)BY-2培養培地(pH5.8)で培養する。BY-2細胞を、7日齢の細胞培養物の5%(v/v)を100mLの新鮮な液体培地に移すことにより、毎週継代培養する。72~96時間後、BY-2培養培地を収集し、300g、4℃で10分間遠心分離して、細胞を除去する。PMPを含む上清を収集し、0.85μmフィルターでろ過して破片を取り除く。実施例2に記載されるようにPMPを精製する。
この実施例では、サイズ排除クロマトグラフィー、密度勾配(イオジキサノール又はスクロース)と組み合わせた限外ろ過及び沈殿又はサイズ排除クロマトグラフィーによる凝集体の除去を使用する、実施例1に記載されているように粗PMP画分から精製されたPMPが生成される。
a)サイズ排除クロマトグラフィーと組み合わせた限外ろ過を使用した精製グレープフルーツPMPの生成
実施例1aの粗グレープフルーツPMP画分を、100kDA分子量カットオフ(MWCO)Amiconスピンフィルター(Merck Millipore)を使用して濃縮する。続いて、濃縮された粗PMP溶液をPURE-EVサイズ排除クロマトグラフィーカラム(HansaBioMed Life Sciences Ltd)にロードし、製造業者の指示に従って分離する。精製されたPMP含有画分を溶出後にプールする。任意選択により、PMPを100kDa MWCO Amiconスピンフィルターの使用又はTangential Flow Filtration(TFF)によってさらに濃縮することができる。実施例3に記載されるように精製されたPMPを分析する。
粗シロイヌナズナの葉のアポプラストPMPを、実施例1aに記載されているように単離し、精製されたPMPを、Rutter and Innes,Plant Physiol.173(1):728-741,2017に記載されているようにイオジキサノール勾配を使用して生成する。不連続イオジキサノール勾配(OptiPrep; Sigma-Aldrich)を用意するために、40%(v/v)、20%(v/v)、10%(v/v)及び5%(v/v)のイオジキサノールの溶液を、小胞分離緩衝液(VIB; 20mM MES、2mM CaCl2及び0.1M NaCl、pH6)で60%OptiPrepストック水溶液を希釈することによって作成する。この勾配は、3mlの40%溶液、3mLの20%溶液、3mLの10%溶液及び2mLの5%溶液を重ねることによって形成される。実施例1aの粗アポプラストPMP溶液を4℃で60分間、40,000gで遠心分離する。ペレットを0.5mlのVIBに再懸濁し、勾配の上に重ねる。遠心分離は、4℃で17時間、100,000gで行う。勾配の上部にある最初の4.5mlを廃棄し、続いてアポプラストPMPを含む0.7mlの3倍量を収集し、VIBで3.5mLにし、4℃で60分間、100,000gで遠心分離する。ペレットを3.5mlのVIBで洗浄し、同じ遠心分離条件を使用して再ペレット化する。精製されたPMPペレットを、実施例3に記載されるようにその後の分析のために組み合わせる。
粗グレープフルーツ果汁のPMPを、実施例1dに記載されているように単離し、150,000gで90分間遠心分離し、PMP含有ペレットを、記載されているように1mlのPBSに再懸濁する(Mu et al.,Molecular Nutrition&Food Research.58(7):1561-1573,2014)。再懸濁したペレットをスクロース段階勾配(8%/15%/30%/45%/60%)に移し、120分間、150,000gで遠心分離して、精製PMPを生成する。精製グレープフルーツPMPを30%/45%の界面から回収し、その後、実施例3に記載されるように分析する。
実施例1dに記載されるように生成されたグレープフルーツPMP又は実施例2a~2cの精製PMPからタンパク質凝集体を除去するために、追加の精製工程を含めることができる。生成されたPMP溶液を様々なpHにして、タンパク質凝集体を溶液中に沈殿させる。水酸化ナトリウム又は塩酸を加えて、pHを3、5、7、9又は11に調整する。pHは、校正済みのpHプローブを使用して測定する。溶液が指定のpHになったら、ろ過して粒子を除去する。代わりに、単離PMP溶液を、Polymin-P又はPraestol 2640などの帯電ポリマーの添加を使用して凝集させることができる。簡単に説明すると、1LのPolymin-P又はPraestol 2640当たり2~5gを溶液に添加してインペラーで混合する。次いで、溶液をろ過して粒子を除去する。代わりに、塩濃度を上げることによって凝集体を可溶化する。1mol/LになるまでNaClをPMP溶液に添加する。次いで、溶液をろ過してPMPを精製する。代わりに、温度を上げることによって凝集体を可溶化する。単離されたPMP混合物を、50℃の均一温度になるまで5分間混合しながら加熱する。次いで、PMP混合物をろ過してPMPを単離する。代わりに、PMP溶液の可溶性汚染物質を標準的な手順に従ってサイズ排除クロマトグラフィーカラムによって分離する。この際、PMPは、最初の画分で溶出する一方、タンパク質とリボヌクレオタンパク質及び一部のリポタンパク質とは、後に溶出する。タンパク質凝集体除去の効率は、BCA/Bradfordタンパク質定量化によるタンパク質凝集体の除去の前後のタンパク質濃度を測定及び比較することによって決定する。生成されたPMPを、実施例3に記載されるように分析する。
この実施例では、実施例1又は実施例2に記載されているように生成されたPMPの特性について説明する。
a)PMP濃度の決定
PMP粒子濃度を、Malvern NanoSightを使用したナノ粒子トラッキング解析(NTA)又はiZon qNanoを使用した調整可能抵抗パルスセンシング(TRPS)により、製造業者の指示に従って決定する。精製PMPのタンパク質濃度を、DCタンパク質アッセイ(Bio-Rad)を使用して決定する。精製PMPの脂質濃度を、Rutter and Innes,Plant Physiol.173(1):728-741,2017に記載されているように、DiOC6(ICN Biomedicals)などの蛍光親油性色素を使用して決定する。簡単に説明すると、実施例2の精製PMPペレットを、MES緩衝液(20mM MES、pH6)並びに1%植物プロテアーゼ阻害剤カクテル(Sigma-Aldrich)及び2mMの2,29-ジピリジルジスルフィドで希釈した100mlの10mMのDiOC6(ICN Biomedicals)に再懸濁する。再懸濁したPMPを37℃で10分間インキュベートし、3mLのMES緩衝液で洗浄し、再ペレット化し(40,000g、60分、4℃)、新しいMES緩衝液に再懸濁する。DiOC6の蛍光強度を485nmの励起及び535nmの発光で測定する。
PMPを、Wu et al.,Analyst.140(2):386-406,2015のプロトコルに従い、JEOL 1010透過型電子顕微鏡での電子及び低温電子顕微鏡法によって特性を明らかにする。PMPのサイズ及びゼータ電位も、Malvern Zetasizer又はiZon qNanoを使用して製造業者の指示に従って測定する。Xiao et al.,Plant Cell.22(10):3193-3205,2010で実証されているように、クロロホルム抽出を使用して脂質をPMPから単離し、LC-MS/MSで特性評価する。グリコシルイノシトールホスホリルセラミド(GIPC)脂質を、Cacas et al.Plant Physiology.170:367-384、2016に記載されているように抽出及び精製し、上記のLC-MS/MSで分析する。全RNA、全DNA及びタンパク質を、指示に従ってThermo FisherのQuant-Itキットを使用して特性を明らかにする。PMP上のタンパク質を、Rutter and Innes,Plant Physiol.173(1):728-741,2017のプロトコルに従ったLC-MS/MSによって特性を明らかにする。RNA及びDNAを、Trizolを使用して抽出し、IlluminaのTruSeq Total RNA with Ribo-ZeroPlantキット及びNextera Mate Pair Library Prep Kitを使用してライブラリーにし、製造業者の指示に従ってIllumina MiSeqで配列決定する。
この実施例では、様々な保管及び生理学的条件下でのPMPの安定性の測定について説明する。
実施例1及び2に記載されているように生成したPMPを様々な条件にさらす。PMPを水、5%スクロース又はPBSに懸濁し、-20℃、4℃、20℃及び37℃で1日間、7日間、30日間及び180日間放置する。PMPも水に懸濁し、ロータリーエバポレーターシステムを使用して乾燥させ、4℃、20℃、37℃で1日間、7日間、30日間、180日間放置する。また、PMPを水又は5%スクロース溶液に懸濁し、液体窒素で瞬間冷凍して凍結乾燥させる。1日後、7日後、30日後及び180日後、乾燥及び凍結乾燥させたPMPを水に再懸濁する。0℃を超える温度の条件での前の3つの実験も、模擬屋外UV条件での内容物の安定性を判断するために人工日光シミュレーターにさらす。また、PMPを、1単位のトリプシン又は他の模擬胃液を添加して又は添加せずに、pH1、3、5、7及び9の緩衝液で37℃、40℃、45℃、50℃及び55℃の温度に1時間、6時間及び24時間さらす。
本実施例は、PMP生成プロセス中のペクチンの除去が、それらのインプランタ取り込み及び全身輸送に影響を与えないことを実証する。この実施例において、レモンPMPをモデルPMPとして使用し、アルファルファスプラウトをモデル植物として使用した。
レモンを地元のマーケットから入手した。果汁プレスを使用してレモン果汁(1260ml)を収集し、2つの画分に分けた。630mlを未処理とし、630mlをNaOHでpH4に調整し、6U/mlペクチナーゼ(Sigma,17389)と室温で1.45時間インキュベートした。続いて、ペクチナーゼ処理及び未処理果汁を3000gで20分間、次いで10,000gで40分間遠心分離して大きい破片を除去した。次に、加工された果汁を500mM EDTA pH8.6と最終濃度50mM EDTA pH7.19~7.25に室温で30分間インキュベートしてカルシウムをキレート化し、ペクチン高分子の形成を予防した。続いて、EDTA処理果汁を11um、1um及び0.45umフィルターに通して大きい粒子を除去した。ろ過した果汁を洗浄し(TFF手順中、260mlのPBS)、タンジェンシャルフローろ過(TFF)によって400mlの総容量に約1.6倍濃縮し、300kDa透析膜を使用してPBS、pH7.4中で一晩透析した。続いて、透析した果汁をTFFによって30mlの最終濃度にさらに濃縮した(約21倍)。次に、本発明者らは、サイズ排除クロマトグラフィーを使用してPMP含有画分を溶出させ、280nmの吸光度(SpectraMax)を分析して汚染物質を含有する後期溶出画分からPMP含有画分を決定した。精製PMPを含有するSEC画分4~6(ペクチナーゼ処理なし)及びSEC画分4~7(ペクチナーゼ処理あり)を、個々の処理群中で一緒にプールした。プールしたSEC画分を、300kDa透析膜を使用してPBS、pH7.4中で一晩透析した。0.85um、0.4um及び0.22umシリンジフィルターを使用する連続ろ過によって試料を滅菌し、PMPを40,000×gで1.5時間ペレット化することによってさらに濃縮し、最終的にペレットをUltrapure水中で再懸濁させる。未処理レモンPMPについての最終PMP濃度は1.24×1012PMP/mlであり、PMPサイズの中央値は129nm+/-12nm SDであり;ペクチナーゼ処理レモンPMPについて、最終濃度は2.261012PMP/mlであり、PMPサイズの中央値は、ナノフローサイトメトリー(NanoFCM)により、製造業者によって提供される濃度及びサイズ標準を使用して決定されたとおり130nm+/-11nm(SD)であった。
ペクチナーゼ処理及び未処理レモンPMPをDyLight 800 NHS Ester(Life Technologies,#46421)共有結合膜色素(DyL800)で標識した。簡潔に述べると、DyL800をDMSO中で10mg/mlの最終濃度に溶解させ、200ulのPMPを5ulの色素と混合し、シェーカー上で室温で1時間インキュベートし、標識PMPを100,000×gでの4℃での1時間の超遠心分離によって2~3回洗浄し、ペレットを1.5mlのUltrapure水で再懸濁させた。潜在的な色素凝集物の存在を照査するため、同じ手順に従い、PMPの代わりに200ulのUltraPure水を添加して色素単独対照試料を調製した。最終DyL800標識PMPペレット及びDyL800色素単独対照を最小量のUltraPure水中で再懸濁させ、NanoFCMによって特性決定した。非ペクチナーゼ処理Dyl800標識レモンPMPの最終濃度は3.2×1012PMP/mlであり、ペクチナーゼ処理DyL800標識の最終濃度は5.57×1012PMP/mlであった。標識効率は、nanoFCMが赤外線を検出することができないため、nanoFCMを使用して決定することができなかった。
PMP生成中のペクチンの除去がPMP取り込みに影響を与えるか否かを評価するため、アルファルファスプラウトを地元のスーパーマーケットから入手し、ペクチナーゼ処理及び未処理DyLight800-レモンPMP、水(陰性対照)、DyLight800nm色素単独(色素凝集物対照)で、0.5% スクロース及び2.5mM MES、pH5.6が補給された半強度のムラシゲスクーグ(MS)中で23℃で21時間処理した(図9A)。次いで苗をMS培地中で3回洗浄し、Odyssey赤外線撮像装置を使用して撮像した。ペクチナーゼ処理あり又はなしで生成されたPMPの取り込み及び輸送の違いはなかった(図9B)。
この実施例では、フルーツをブレンドし、連続遠心分離を組み合わせて破片を除去し、超遠心分離で粗PMPをペレット化し、スクロース密度勾配を使用してPMPを精製することによってフルーツからPMPを生成した。グレープフルーツをモデルフルーツとして使用した。
ブレンダー、超遠心分離及びスクロース勾配精製を使用したグレープフルーツPMP生成の例示的なワークフローを図10Aに示す。地元の市場から1つの赤いグレープフルーツを購入し、アルベド、フラベド及びじょうのう膜を除去して果汁嚢を収集し、ブレンダーを使用して最大速度で10分間均質化した。100mLの果汁をPBSで5倍に希釈した後、1000×gで10分間、3000×gで20分間及び10,000×gで40分間遠心分離して、大きい破片を除去した。28mLの透明な果汁を、S50-ST(4×7mL)スイング型ローターを使用して、Sorvall(商標)MX 120 Plus Micro-Ultracentrifugeで150,000×g、4℃で90分間超遠心分離して粗PMPペレットを得、PBS pH7.4に再懸濁した。次に、スクロース勾配を、Tris-HCL pH7.2で調製し、粗PMPをスクロース勾配の上に重ね(上から下に、8%、15%、30%、45%及び60%スクロース)、S50-ST(4×7mL)スイング型ローターを使用して、4℃で120分間の150,000×gでの超遠心分離によって沈降させた。1mLの画分を収集し、PMPを30~45%の界面で単離した。画分を4℃で120分間の150,000×gでの超遠心分離によってPBSで洗浄し、ペレットを最少量のPBSに溶解した。
この実施例では、より穏やかな果汁生産プロセス(メッシュストレーナー)を使用することにより、PMP生成プロセス中に細胞壁及び細胞膜の汚染物質を低減させた。グレープフルーツをモデルフルーツとして使用した。
実施例2に記載されているように、赤いグレープフルーツから果汁嚢を分離した。PMP生成中のゲル化を低減するために、破壊的ブレンディング法を使用する代わりに、果汁嚢を茶漉し、メッシュに穏やかに押し付けて果汁を収集し、細胞壁及び細胞膜の膜汚染物質を低減した。分画遠心分離後、果汁は、ブレンダーを使用した後よりも透明になり、スクロース密度勾配遠心分離後、30~45%の交差部分に1つのきれいなPMP含有スクロースバンドが観察された(図11)。PMPの生成中及び生成後のゲル化は、全体的に少なかった。
この実施例では、超遠心分離(UC)及びサイズ排除クロマトグラフィー(SEC)の使用による果物からのPMPの生成について説明する。この実施例では、グレープフルーツをモデルフルーツとして使用する。
実施例6aに記載されているように、果汁嚢を赤グレープフルーツから分離し、茶漉し、メッシュに穏やかに押し付けて、28mlの果汁を収集した。UC及びSECを使用したグレープフルーツPMP生成のワークフローを図12Aに示す。簡単に説明すると、果汁を1000×gで10分間、3000×gで20分間、10,000×gで40分間の分画遠心分離にかけて大きい破片を除去した。透明な28mlの果汁を、S50-ST(4×7mL)スイング型ローターを使用して、Sorvall(商標)MX 120 Plus Micro-Ultracentrifugeで100,000×g、4℃で60分間超遠心分離して粗PMPペレットを得て、MES緩衝液(20mM MES、NaCl、pH6)に再懸濁した。ペレットをMES緩衝液で2回洗浄した後、最終ペレットを1mlのPBS、pH7.4に再懸濁した。次いで、サイズ排除クロマトグラフィーを使用してPMP含有画分を溶出させた。SEC溶出画分を、NanoFCMを使用したナノフローサイトメトリーによって分析し、製造業者が提供する濃度及びサイズ標準を使用してPMPのサイズ及び濃度を決定した。加えて、280nmでの吸光度(SpectraMax(登録商標))及びタンパク質濃度(Pierce(商標)BCAアッセイ、ThermoFisher)をSEC画分で測定し、いずれの画分でPMPが溶出されるかを特定した(図12B~図12D)。SEC画分2~4をPMP含有画分として識別した。初期及び後期の溶出画分の分析により、SEC画分3が主なPMP含有画分であり、その濃度が2.83×1011PMP/mL(すべての粒子の57.2%が50~120nmのサイズ範囲)であり、サイズの中央値が83.6nm+/-14.2nm(SD)であることが示された。NanoFCMによって示されるように、後期溶出画分8~13の粒子濃度は、非常に低かったが、タンパク質汚染物質は、BCA分析によってこれらの画分で検出された。
この実施例では、ペクチン高分子の形成を低減するためのEDTAインキュベーション及び汚染物質を低減するための夜間透析と組み合わせた、タンジェンシャルフローろ過(TFF)及びサイズ排除クロマトグラフィー(SEC)を使用した果物からのスケーリングされたPMPの生成について説明する。この実施例では、グレープフルーツをモデルフルーツとして使用する。
赤いグレープフルーツを地元の市場から入手し、果汁プレスを使用して1000mlの果汁を分離した。TFF及びSECを使用したグレープフルーツPMP生成のワークフローを図13Aに示す。果汁を1000×gで10分間、3000×gで20分間、10,000×gで40分間の分画遠心分離にかけて大きい破片を除去した。破片が除去されたグレープフルーツ果汁を濃縮し、TFF(TFF-easy、HansaBioMed Life Sciences)を使用して1回洗浄して2mL(100倍)にした。次に、サイズ排除クロマトグラフィーを使用してPMP含有画分を溶出させた。SEC溶出画分を、NanoFCMを使用したナノフローサイトメトリーによって分析し、製造業者が提供する濃度及びサイズ標準を使用してPMP濃度を決定した。加えて、タンパク質濃度(Pierce(商標)BCAアッセイ、ThermoFisher)をSEC画分について決定して、PMPが溶出される画分を特定した。1リットルの果汁(100倍濃縮)からのスケーリングされた生成も、BCAアッセイで検出できる大量の汚染物質を後期SEC画分中で濃縮した(図13B、上のパネル)。全体的な総PMP収量(図13B、下のパネル)は、単一のグレープフルーツ分離と比較した場合、スケーリングされた生成で低く、PMPの減少を示している可能性がある。
赤いグレープフルーツを地元の市場から入手し、果汁プレスを使用して800mlの果汁を分離した。果汁を1000×gで10分間、3000×gで20分間及び10,000×gで40分間の分画遠心分離にかけて大きい破片を除去し、且つ1μm及び0.45μmフィルターでろ過して大きい粒子を除去した。破片及び粒子が除去されたグレープフルーツ果汁を、それぞれ125mlの果汁を含む4つの異なる処置群に分けた。処置群1を、実施例9aに記載されているように処理し、濃縮し、洗浄(PBS)して63倍の最終濃度にし、SECに供した。TFF前に475mlの果汁を最終濃度50mMのEDTA、pH7.15と共にRTで1.5時間インキュベートして、鉄をキレート化し、ペクチン高分子の形成を低減した。その後、果汁を3つの処置群に分け、これらの処置群を、PBS(カルシウム/マグネシウムなし)pH7.4、MES pH6又はトリス pH8.6洗浄のいずれかでTFF濃縮を行って63倍の最終果汁濃度にした。次に、試料を、300kDa膜を使用して同じ洗浄緩衝液で4℃において一晩透析し、SECにかけた。TFFのみの対照の後期溶出画分の高い汚染物質ピークと比較して、280nmでの吸光度(図13C)及びBCAタンパク質分析(図13D)で示されるように、EDTAインキュベーションと、それに続く一晩の透析により汚染物質が大幅に減少し、これは、糖及びペクチンの存在に影響を受ける。使用した透析緩衝液に違いはなかった(カルシウム/マグネシウムを含まないPBS pH7.4、MES pH6、トリス pH8.6)。
この実施例では、PMPを植物細胞培養から生成した。Zea mays Black Mexican Sweet(BMS)細胞株をモデル植物細胞株として使用する。
Zea mays Black Mexican sweet(BMS)細胞株をABRCから購入し、攪拌(110rpm)しながら24℃において、4.3g/Lのムラシゲスクーグ基礎塩混合物(Sigma M5524)、2%のスクロース(S0389、Millipore Sigma)、1×MSビタミン溶液(M3900、Millipore Sigma)、2mg/Lの2,4-ジクロロフェノキシ酢酸(D7299、Millipore Sigma)及び250μg/LのチアミンHCL(V-014、Millipore Sigma)を含むムラシゲスクーグ基礎培地pH5.8で増殖させ、7日ごとに20%の体積/体積で継代した。
本実施例は、植物細胞によるPMPとの会合及びPMPの取り込みを記載する。本実施例において、レモンPMPをモデルPMPとして使用し、ダイズ、コムギ及びトウモロコシ細胞系をモデル植物細胞として使用する。
赤い有機グレープフルーツ(Florida)を地元のマーケットから入手した。果汁プレスを使用して1リットルのグレープフルーツ果汁を収集し、続いて3000×gで20分間、次いで10,000×gで40分間遠心分離して大きい破片を除去した。次に、500mM EDTA p8.6を最終濃度50mM EDTA、pH7に添加し、溶液を30分間インキュベートしてカルシウムをキレート化し、ペクチン高分子の形成を予防した。続いて、果汁を11μm、1μm及び0.45μmフィルターに通して大きい粒子を除去した。ろ過した果汁をタンジェンシャルフローろ過(TFF)(孔径5nm)によって400ml(2.5倍)に濃縮及び洗浄し(500mlのPBS)、300kDa透析膜を使用してPBS pH7.4中で一晩透析して汚染物質を除去した(1回の培地交換を伴う)。続いて、透析した果汁をTFFによって50mlの最終濃度(20倍)にさらに濃縮した。次に、本発明者らはサイズ排除クロマトグラフィーを使用してPMP含有画分を溶出させ、それを280nmでの吸光度(SpectraMax(登録商標))及びタンパク質濃度アッセイ(Pierce(商標)BCAアッセイ、ThermoFisher)によって分析してPMP含有画分及び汚染物質を含有する後期画分を確認した。SEC画分4~6は精製PMPを含有し(画分8~14は汚染物質を含有した)、それらを一緒にプールし、0.8μm、0.45μm及び0.22μmシリンジフィルターを使用する連続ろ過によってフィルター滅菌した。組み合わせ滅菌したPMP含有画分における最終PMP濃度(1.32×1011PMP/mL)及びPMPサイズの中央値(71.9nm+/-14.5nm)をNanoFCMにより、製造業者によって提供される濃度及びサイズ標準を使用して決定した。
レモンを地元のマーケットから入手した。果汁プレスを使用して1リットルのレモン果汁を収集し、続いて3000gで20分間、次いで10,000gで40分間遠心分離して大きい破片を除去した。次に、500mMのEDTA pH8.6を50mMのEDTA、pH7の最終濃度に添加し、溶液を30分間インキュベートしてカルシウムをキレート化し、ペクチン高分子の形成を予防した。続いて、果汁をコーヒーフィルター、1μm及び0.45μmフィルターに通して大きい粒子を除去した。ろ過した果汁をタンジェンシャルフローろ過(TFF)(5nm孔径)によって400ml(2.5倍濃縮)に濃縮し、300kDa透析膜を使用してPBS pH7.4中で一晩透析して汚染物質を除去した。続いて、透析した果汁をTFFによって50mlの最終濃度(20倍)にさらに濃縮した。次に、本発明者らは、サイズ排除クロマトグラフィーを使用してPMP含有画分を溶出させ、それを280nmでの吸光度(SpectraMax(登録商標))及びタンパク質濃度アッセイ(Pierce(商標)BCAアッセイ、ThermoFisher)によって分析してPMP含有画分及び汚染物質を含有する後期画分を確認した。SEC画分4~6は精製PMPを含有し(画分8~14は汚染物質を含有した)、それらを一緒にプールし、0.8μm、0.45μm及び0.22μmシリンジフィルターを使用する連続ろ過によってフィルター滅菌した。組み合わせ滅菌したPMP含有画分における最終PMP濃度(2.7×1011PMP/mL)及びPMPサイズの中央値(70.7nm+/-15.8nm)をNanoFCMにより、製造業者によって提供される濃度及びサイズ標準を使用して決定した。
レモンPMPを実施例11bに記載のとおり生成した。PMPをAlexa Fluor 488(登録商標)NHS Ester(Life Technologies,共有結合膜色素(AF488))で標識した。簡潔に述べると、AF488をDMSO中で10mg/mlの最終濃度に溶解させ、200ulのPMP(1.53E+13PMP/ml)を5ulの色素と混合し、シェーカー上で室温で1時間インキュベートし、標識PMPを100,000gでの4℃での1時間の超遠心分離によって2~3回洗浄した。ペレットを1.5mlのUltraPure水で再懸濁させた。潜在的な色素凝集物の存在を照査するため、同じ手順に従い、PMPの代わりに200ulのUltraPure水を添加して色素単独対照試料を調製した。最終AF488標識PMPペレット及びAF488色素単独対照を最小量のUltraPure水中で再懸濁させ、NanoFCMによって特性決定した。レモン488標識PMPの最終濃度は2.91×1012PMP/mlであり、AF488-PMPサイズの中央値は79.4nm+/-14.7nmであり、標識効率は89.4%であった(図15A)。
植物細胞系をDeutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen(DSMZ)(ダイズ(Glycine max)、# PC-1026;コムギ(Triticum aestivum)、# PC-998)から購入し、ABRC(トウモロコシ(Zea mays)、ブラックメキシカンスイート(Black Mexican sweet)(BMS)をバッフル通気250mLのフラスコ中で暗所で24℃で撹拌(110rpm)しながら成長させた。ダイズ(Glycine max)及びコムギ(Triticum aestivum)を、2%のスクロース及び2mg/Lの2,4-ジクロロフェノキシ酢酸(2,4D)(D7299,Millipore Sigma)が補給された、補給最少有機物を有する3.2g/LのガンボーグB-5基礎培地(G5893,Millipore Sigma)pH5.5中で供給業者の説明書に従って成長させた。BMS細胞を、4.3g/Lのムラシゲスクーグ基礎塩混合物(Sigma M5524)、2%のスクロース(S0389,Millipore Sigma)、1×MSビタミン溶液(M3900,Millipore Sigma)、2mg/Lの2,4-ジクロロフェノキシ酢酸(D7299,Millipore Sigma)及び250ug/LのチアミンHCL(V-014,Millipore Sigma)を含有するムラシゲスクーグ基礎培地pH5.8中で成長させた。
本実施例において、PMPはインプランタで取り込まれ、全身輸送された。グレープフルーツ、レモン及びシロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)苗PMPをモデルPMPとして使用し、シロイヌナズナ苗及びアルファルファスプラウトをモデル植物として使用する。
グレープフルーツ及びレモンPMPを、実施例11a及び11bに記載のとおり生成した。PMPをDyLight 800 NHS Ester(Life Technologies、#46421)共有結合膜色素(DyL800)で標識した。簡潔に述べると、Dyl800をDMSO中で10mg/mlの最終濃度まで溶解させ、200μlのPMPを5μlの色素と混合し、シェーカー上で室温で1時間インキュベートした後、標識PMPを100,000×gでの4℃での1時間の超遠心分離によって2~3回洗浄し、ペレットを1.5mlのUltraPure水で再懸濁させた。潜在的な色素凝集体の存在を照査するため、同じ手順に従い、PMPの代わりに200μlのUltraPure水を添加して、色素単独対照試料を調製した。最終DyL800標識PMPペレット及びDyL800色素単独対照を最小量のUltraPure水中で再懸濁させ、NanoFCMによって特性決定した。グレープフルーツDyL800標識PMPの最終濃度は4.44×1012PMP/mlであり、レモンDyL800標識PMPの最終濃度は5.18×1012PMP/mlであった。標識効率は、NanoFCMが赤外線を検出することができないため、NanoFCMを使用して決定することはできなかった。
野生型シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)Col-0種子をABRCから入手し、70%のエタノールで表面滅菌してから、50%漂白剤/0.1%トリトンX-100と10分間インキュベートし、4回滅菌ddH2O洗浄して漂白剤溶液を除去した。種子を暗所で4℃で1日間層別化した。20mLの0.5×MS培地(2.15g/Lムラシゲスクーグ塩、1%スクロース、pH5.8)を含有する100cm2プレート(水中0.5%ウシ胎仔血清で予めコーティングされている)当たりおよそ250個の種子を発芽させ、3M外科用テープで密封し、23℃の16時間の明期/21℃の8時間の暗期の光周期を用いてインキュベーター中で成長させた。
PMPがインプランタで取り込まれ、全身輸送され得るか否かを評価するため、メッシュフィルターの頂部上で、実施例12bに記載のとおりシロイヌナズナ苗を液体培地中で発芽させて、根がメッシュを通って成長するようにし、PMP溶液へのAt苗の部分的曝露を可能にした。アルファルファスプラウトは地元のスーパーマーケットから入手した。9日齢のシロイヌナズナ苗及びアルファルファスプラウトを、0.5×MS培地中の水(陰性対照)、DyL800色素単独(色素対照)、DyL800標識グレープフルーツPMP(1.6×1010PMP/ml)又はレモン(5.1×1010PMP/ml)PMPの0.5ml溶液で、部分的根曝露(PMP溶液中で浮遊するメッシュ中のAt苗に又はアルファルファスプラウトでは1.5mlのEppendorfチューブ中の部分的根曝露によって)により、23℃で、それぞれ22又は24時間処置した。次に、植物をMS培地中で3回洗浄し、Odyssey(登録商標)CLx赤外線撮像装置(Li-Cor)で撮像した。
a)ブレンダーを使用するPMPの生成
図1Aに示されるとおりブレンド、超遠心分離及びスクロース勾配精製を含む例示的ワークフローを使用してグレープフルーツからPMPを生成した。簡潔に述べると、果実をブレンダー中で最大速度で10分間ブレンドし、次いで1000×gで10分間、3000×gで20分間及び10,000×gで40分間遠心分離して大きい破片を除去することによってグレープフルーツPMPを生成した。スウィングバケットロータを使用する150,000×gでの4℃での90分間の超遠心分離によって粗PMPをペレット化した。150,000×gでの4℃での120分間の超遠心分離を使用するスクロース密度勾配によってPMPを精製した。PMPを30~35%の界面で単離し、画分を超遠心分離によってPBSで洗浄した。この生成プロセスは、生成プロセスのすべての工程で産物のゲル化をもたらした。
図1Bに示されるとおりメッシュストレーナーを使用する穏やかな果汁抽出法、超遠心分離及びスクロース勾配精製を含む例示的ワークフローを使用してグレープフルーツからPMPを生成した。簡潔に述べると、グレープフルーツ果汁嚢を単離し、それらを茶漉しに通して穏やかにプレスすることによってグレープフルーツPMPを生成した。果汁を収集し、続いて1000×gで10分間、3000×gで20分間及び10,000×gで40分間遠心分離して大きい破片を除去した。スウィングバケットロータを使用する150,000×gでの4℃での90分間の超遠心分離によって粗PMPをペレット化した。150,000×gでの4℃での120分間の超遠心分離を使用するスクロース密度勾配によってPMPを精製した。PMPを30~35%の界面で単離し、画分を超遠心分離によってPBSで洗浄した。図1Aのスクロース勾配精製プロセスと比較して、穏やかな果汁生産プロセスはより白色且つより清澄なPMP含有スクロースバンドをもたらした。しかしながら、この生成プロセスも、生成プロセスのすべての工程でゲル化をもたらした。
図1Cに示されるとおり果汁プレス、大きい破片を除去するための分画遠心分離、タンジェンシャルフローろ過(TFF)を使用する果汁の20倍濃縮及びPMP含有画分を単離するためのサイズ排除クロマトグラフィーを含む例示的ワークフローを使用してグレープフルーツからPMPを生成した。PMP画分を、ナノフローサイトメトリー(NanoFCM)を使用してPMP濃度及び粒径について且つビシンコニン酸アッセイ(BCA)を使用してタンパク質濃度について分析した。PMP濃度を粒子/mLで図1Dに示す。PMPは、SEC画分4~6中に溶出される。PMPの大多数は、図1E及び表11に示されるとおりSEC画分3(Fr3)中に存在する。果汁プレスを使用するPMP生成は、実施例13a及び13bに記載の方法と比較してゲル化の低減をもたらした。
a)大容量のグレープフルーツ果汁からのPMPの生成
図2Aに示されるとおり果汁プレス、大きい破片を除去するための分画遠心分離、タンジェンシャルフローろ過(TFF)を使用する果汁の100倍濃縮及びPMP含有画分を単離するためのサイズ排除クロマトグラフィーを含む例示的ワークフローを使用して大容量のグレープフルーツ果汁(1リットル、約7個のグレープフルーツの果汁)からPMPを生成した。PMP画分を、ナノフローサイトメトリー(NanoFCM)を使用してPMP濃度及び粒径について且つビシンコニン酸アッセイ(BCA)を使用してタンパク質濃度について分析した。150mLのグレープフルーツ果汁(1個のグレープフルーツ)からのPMP産物と比較して、BCAアッセイを使用して検出されたとおり1Lのグレープフルーツ果汁からのPMP産物は、後期SEC画分中に濃縮された多量の汚染物質を有した(図2B)。さらに、粒子/mLの全体PMP収量は、1000mL調製において予測されるよりも低く、それは、ペクチン凝集及びゲル化の結果としての生成プロセス中のPMPの損失(図2B)を示し得る。
a)キレート化及び透析を含むPMP生成プロセス
PMP生成プロセスを改変して汚染物質の除去を向上させた。例示的ワークフローを図3Aに提供する。手短に述べると、プレスした果汁から粗PMP調製物を生成し、次いで3000×gで20分間、続いて遠心分離し、次いで10,000×gで40分間遠心分離して大きい破片を除去した。PMPを精製するため、粗PMP調製物を500mM EDTA(pH8.6)と最終濃度50mM EDTA(pH7.2~8)に30分間インキュベートしてカルシウムをキレート化し、ペクチン高分子の形成を予防した。続いて、EDTA処理粗PMP画分を、1μm及び0.45μmフィルターに通した。ろ過した果汁をPBSで洗浄し、タンジェンシャルフローろ過(TFF)によって5倍濃縮した。濃縮した果汁をPBS中で4℃で300kDa透析膜を使用して一晩透析して汚染物質の除去した。続いて、透析した果汁をTFFによって20倍の最終濃度にさらに濃縮した。次に、サイズ排除クロマトグラフィーを使用してPMP含有画分を溶出させた。合わせたPMP含有画分を下記のとおりさらに特性決定した。
柑橘果汁又は植物細胞培養培地を、汚染物質の除去が向上したPMP生成プロセスに供する。例示的ワークフローを図4A及び4Bに提供する。簡潔に述べると、果汁又は培養培地を収集し、続いて1000×gで10分間、3000×gで20分間及び10,000×gで40分間遠心分離して大きい破片を除去して粗PMP画分を生成する。粗PMP画分を最終濃度50mMのEDTA(pH7)中で30分間インキュベートし、続いて1μm及び0.45μmフィルターに通す。ろ過した果汁又は培地をタンジェンシャルフローろ過(TFF)によってPBS洗浄して5倍濃縮し、300kDa透析膜を使用してPBS中で一晩透析して混合物を除去する。続いて、透析した果汁をTFFによって20倍の最終濃度にさらに濃縮する。次いで、サイズ排除クロマトグラフィーを使用してPMP含有画分を溶出させ、PMP含有画分を、例えばナノフローサイトメトリー(NanoFCM)を使用するPMP濃度及び粒径の分析並びにビシンコニン酸アッセイ(BCA)を使用するタンパク質濃度の分析によって特性決定する。
レモン果汁調製物及びグレープフルーツ果汁調製物を、ペクチナーゼでの処理を含むPMP生成プロセスに供した。
グレープフルーツ果汁調製物を、ペクチナーゼでの処理及びキレート化を含むPMP生成プロセスに供した。例示的ワークフローを図7Aに提供する。果汁プレスを使用して4リットルのグレープフルーツ果汁を単離した。果汁調製物を実施例15cに記載のとおり0.5U/mLのペクチナーゼで処理した。次いで、ペクチナーゼ処理果汁調製物を1000×gで10分間で、3000×gで20分間及び10,000×gで40分間遠心分離して大きい破片を除去した。次いで、果汁調製物を実施例15aに記載のとおりEDTAで処理した。次いで、Spectrum(登録商標)300kDa TFFフィルターモジュールを使用して調製物を5倍濃縮し、PBSでの6容量交換によって洗浄し、20倍の最終濃度に濃縮した。次に、サイズ排除クロマトグラフィー(maxiPURE-EVカラム,HansaBioMed Life Sciences)を使用してPMP含有画分を溶出させた。
光透過スペクトルを標準濃度のペクチン(0.1~1%)について収集し、超純水中で溶解させた。ペクチン濃度の増加は%透過率を低減させ、即ち溶液の濁度を増加させた(図8A)。透過スペクトルはSpectraMax(登録商標)i3xで測定した。
本実施例では、ペクチナーゼ処理PMPはインプランタで取り込まれ、全身輸送された。レモンPMPをモデルPMPとして使用し、アルファルファスプラウトをモデル植物として使用する。
ペクチナーゼ処理及び未処理レモンPMPを、実施例15cに記載のとおり0.5Uのペクチナーゼを使用して生成した。PMPをDyLight 800赤外線膜色素(Invitrogen;DyL800)で標識した。簡潔に述べると、Dyl800をDMSO中で10mg/mlの最終濃度まで溶解させ、200μlのPMPを5μlの色素と混合し、シェーカー上で室温で1時間インキュベートした後、標識PMPを100,000×gでの4℃での1時間の超遠心分離によって2~3回洗浄し、ペレットを1.5mlのUltraPure水で再懸濁させた。潜在的な色素凝集体の存在を照査するため、同じ手順に従い、PMPの代わりに200μlのUltraPure水を添加して、色素単独対照試料を調製した。最終DyL800標識PMPペレット及びDyL800色素単独対照を最小量のUltraPure水中で再懸濁させ、NanoFCMによって特性決定した。
ペクチナーゼ処理がPMPの取り込み及び/又は全身輸送に影響するか否かを評価するため、アルファルファスプラウトを地元のスーパーマーケットから入手した。アルファルファスプラウトを、0.5%スクロース及び2.5mM MES、pH5.6が補給された半強度のムラシゲスクーグ(MS)培地中の水(陰性対照)、DyL800色素単独(色素対照)、ペクチナーゼ処理レモンPMP又は未処理レモンPMPの0.5mL溶液で、1.5mlのEppendorfチューブ中の23℃での21時間の部分的根曝露によって処置した。次いで、植物をMS培地中で3回洗浄し、Odyssey(登録商標)CLx赤外線撮像装置(Li-Cor)を使用して撮像した(図9A)。処置アルファルファスプラウトの茎における類似の赤外線シグナル強度及びシグナルの高さによって観察することができるとおり、ペクチナーゼ処理あり又はなしで生成されたPMPの取り込み及び輸送の違いはなかった(図9B)。
本実施例は、18LスケールのPMPの生成を記載する。生成プロセス中、柑橘果汁をペクチナーゼ酵素で処理し、EDTAとインキュベートしてペクチン凝集を予防した。本実施例では、グレープフルーツをモデルフルーツとして使用する。
赤いグレープフルーツを地元の食料品店から入手した。果実を1%Liquinox(登録商標)洗浄剤(Alconox(登録商標))で洗浄し、温水ですすいだ。次に、市販の柑橘ジューサー(Zumex(登録商標)、モデル番号08826)を使用して18Lの果汁を単離し、順送的清澄化によって加工した。大きいパルプ断片をジューサー自体から除去し、600μmナイロンスクリーンフィルターに通す後続のろ過を実施した。果汁を10N水酸化ナトリウム溶液(VWR Chemicals BDH(登録商標))でpH4にしてから、最終濃度0.5U/mLのペクチナーゼ酵素を添加した(アスペルギルス・ニガー(Aspergillus niger)からのペクチナーゼ、TCI P0026-10)。ペクチンの酵素的消化を室温(23℃~25℃)で少なくとも2時間実施した。次いで、3000×gでの20分間及び10,000×gでの40分間の一連の分画遠心分離を実施して大きい破片を除去した。後続の果汁清澄化を、漏斗フラスコ系上で設置された11μmディスクフィルター(Whatman(登録商標))に通す真空ろ過によって実施した。蠕動ポンプ系(250リットル/m2/時間(LMH))上で設置された1.2μmガラス繊維デプスフィルター(ガラス繊維、Sartopure(登録商標)GF+1.2μm,Sartorius)、次いで0.8/0.45μm PESデプスフィルター(PES,Sartopore(登録商標)2,0.8/0.45um,250LMH)を使用してさらなる清澄化を実施した。EDTAを50mMの最終濃度で果汁に添加し、pHをpH7.5にした。清澄化した果汁を4℃で一晩貯蔵し、次いでTFF mPES中空繊維フィルター(mPES,300kDa孔径、Repligen)を有するTFF系(Repligen,KrosFlo(登録商標)KR2i TFF System)を使用して加工し、12.5倍に連続濃縮し(1.6L)、7ダイアボリュームのフィルター滅菌PBS pH7.4でのダイアフィルトレーションによって洗浄し、初期果汁容量に基づいて最終的に60倍(300mL)まで濃縮した。
本実施例は、ホモジナイズした植物源、例として大型果実、液果、全植物及び野菜からのPMP生成を記載する。本実施例では、ミジンコウキクサ(Wolffia globosa)をモデル植物として使用し、ザクロ及びブルーベリーをモデルフルーツとして、ブロッコリーをモデル野菜として使用する。
ザクロを地元の食料品店から入手した。果実を1%洗浄剤(Alconox(登録商標))で洗浄し、温水ですすいだ。次に、ジューサー/ミンサー(Slowstar)を使用して8Lの果汁を単離した。果汁を順送的清澄化プロセスに付した。果汁を10N水酸化ナトリウム溶液(VWR Chemicals BDH(登録商標))でpH4にしてから、最終濃度0.5U/mLのペクチナーゼ酵素を添加した(アスペルギルス・ニガー(Aspergillus niger)からのペクチナーゼ、Sigma-Aldrich 17389)。ペクチンの酵素的消化を室温で少なくとも2時間(25℃)実施した。次いで、3000×gでの20分間及び10,000×gでの40分間の一連の分画遠心分離を実施して大きい破片を除去した。Miraclothメッシュ(20~25μm,Sigma-Aldrich)を使用して後続の果汁清澄化を実施して追加の破片を除去した。EDTAを50mMの最終濃度で果汁に添加し、pHをpH7.5にした。果汁のさらなる清澄化を、漏斗フラスコ系上で設置された11μmディスクフィルター(Whatman(登録商標))、次いで蠕動ポンプ系(250LMH)上で設置された1μmガラス繊維デプスフィルター(ガラス繊維、Acrodisc(登録商標),Pall Laboratory)、次いで0.8/0.45μm PESデプスフィルター(PES,Sartopore(登録商標)2,0.8/0.45um,250LMH)に通す真空ろ過によって実施した。清澄化した果汁を4℃で一晩貯蔵した。次に、TFF mPES中空繊維フィルター(mPES,300kDa孔径)を有するTFF系(Repligen,KrosFlo(登録商標)KR2i TFF System)を使用して果汁を加工し、連続的に10倍濃縮し(1.6L)、10ダイアボリュームのフィルター滅菌PBS(pH7.4)でのダイアフィルトレーションによって洗浄し、最終的に初期果汁容量に基づいて70倍に濃縮した。
ブルーベリー(2.5kg)を地元の食料品店から入手した。果実を1%洗浄剤(Alconox(登録商標))で洗浄し、温水ですすいだ。次に、ジューサー/ミンサー(Slowstar)を使用してブルーベリー果汁を単離した。2.6LのPBS pH7.4緩衝液を果汁生産プロセス中に添加して抽出材料を収集した一方、果汁粘度を5.2Lの最終容量に低減させた。収集した果汁を順送的清澄化プロセスに付した。最初に、果汁を10N水酸化ナトリウム溶液(VWR Chemicals BDH(登録商標))でpH4にしてから、最終濃度1U/mLのペクチナーゼ酵素を添加した(アスペルギルス・ニガー(Aspergillus niger)からのペクチナーゼ、Sigma-Aldrich 17389)。ペクチンの酵素的消化を室温(23℃~25℃)で少なくとも2時間実施した。次いで、3000×gでの20分間及び10,000×gでの40分間の一連の分画遠心分離を実施して大きい破片を除去した。Miraclothメッシュ(20~25μm,Sigma-Aldrich)を使用して後続の果汁清澄化を実施して追加の破片を除去した。EDTAを50mMの最終濃度で4.5Lの果汁に添加し、pHをpH7.5にした。果汁のさらなる清澄化を、漏斗フラスコ系上で設置された11μmディスクフィルター(Whatman(登録商標))、次いで蠕動ポンプ系(250LMH、リットル/m2/時間)上で設置された1μmろ過(ガラス繊維、Acrodisc(登録商標),Pall Laboratory)及び真空系上で設置された0.45μmフィルター(PES,CELLTREAT(登録商標)Scientific Products)に通す真空ろ過によって実施した。清澄化した果汁を4℃で一晩貯蔵した。次に、TFF mPES中空繊維フィルター(mPES,300kDa孔径)を有するTFF系(Repligen,KrosFlo(登録商標)KR2i TFF System)を使用して果汁を加工し、連続的に10倍濃縮し(1.6L)、10ダイアボリュームのフィルター滅菌PBS、pH7.4でのダイアフィルトレーションによって洗浄し、最終的に初期果汁容量に基づいて70倍に濃縮した。
ミジンコウキクサ(Wolffia globosa)株9349-31をRutgers Duckweed Stock Cooperativeから入手し、インハウスでpH5.8の葉状体培地(3.2g/L Schenk及びHildebrandt基礎塩混合物、20g/Lスクロース、KOHでpH5.8に調整)中で25℃で連続光及び100rpmの撹拌条件(Percivalインキュベーター)下で培養した。ミジンコウキクサ(Wolffia globosa)植物全体を5%(重量/容量)の密度で400mLの培養物からMiraclothメッシュ(20~25um,Sigma-Aldrich)を使用するろ過を介して回収した。次に、およそ18gの植物をフードプロセッサー(Oster、最大速度で2分間)中で135mLのPBS pH7.4を添加してブレンドした。ブレンドした植物を、順送的清澄化プロセスを介して加工した。最初に、ブレンドした植物を10N水酸化ナトリウム溶液(VWR Chemicals BDH(登録商標))でpH4にしてから、最終濃度0.5U/mLのペクチナーゼ酵素を添加した(アスペルギルス・ニガー(Aspergillus niger)からのペクチナーゼ、Sigma-Aldrich 17389)。ペクチンの酵素的消化を室温で少なくとも2時間(25℃)実施した。次いで、3000×gでの20分間の一連の分画遠心分離を実施して大きい破片を除去した。Miraclothメッシュ(20~25μm,Sigma-Aldrich)を使用して後続の清澄化を実施して追加の破片を除去した。EDTAを50mMの最終濃度で、ブレンドした抽出物に添加し、pHをpH7.5にした。さらなる清澄化を、漏斗フラスコ系上で設置された11μmディスクフィルター(Whatman(登録商標))に通す真空ろ過と、それに続く1μmシリンジろ過(ガラス繊維、Acrodisc(登録商標),Pall Laboratory)及び真空系上で設置された0.45μmフィルター(PES,CELLTREAT(登録商標)Scientific Products)によって行った。清澄化したブレンド植物溶液を4℃で一晩貯蔵した。次いで、TFF系及びサイズ排除クロマトグラフィーを連続的に使用して試料を加工した。使用されるTFF系(Repligen,KrosFlo(登録商標)KR2i TFF System)は、TFF mPES中空繊維フィルター(mPES,300kDa孔径)を用いて設置した。試料を連続的に12.5倍濃縮し、フィルター滅菌PBS pH7.4の7ダイアボリュームでのダイアフィルトレーションによって洗浄し、最終的に初期果汁容量に基づいて50倍に濃縮した。
ブロッコリークラウンを地元の食料品店から入手した。ブロッコリークラウンを1%の洗浄剤(Alconox(登録商標))で手洗いし、温水ですすいだ。次に、ジューサー/ミンサー(Slowstar)を使用してPBS pH7.4を添加しておよそ1.3kgのブロッコリーを単離した。得られた果汁(800mL)を1mmメッシュ金属ストレーナー及びMiraclothメッシュ(20~25μm)に通して加工して大きい破片を除去した。次にブロッコリー果汁を順送的清澄化プロセスに通して加工した。最初に、果汁を10N水酸化ナトリウム溶液(VWR Chemicals BDH(登録商標))でpH4にしてから、最終濃度0.5U/mLのペクチナーゼ酵素を添加した(アスペルギルス・ニガー(Aspergillus niger)からのペクチナーゼ、Sigma-Aldrich 17389)。ペクチンの酵素的消化を室温で少なくとも2時間実施した(25℃)。次いで、大きい破片を除去するための3000×gでの20分間及び10,000×gでの40分間の一連の分画遠心分離を実施した。EDTAを50mMの最終濃度で果汁に添加し、pHをpH7.5にした。
上記方法(例えば、実施例18及び19におけるもの)を使用して、PMPをアボカド、ブドウ、トマト果実及びタマネギからも生成した。
前述の本発明は、理解を明確にするために例示及び実施例によってある程度詳細に説明されたが、説明及び実施例は、本発明の範囲を限定するものとして解釈されるべきではない。本明細書で引用されたすべての特許及び科学文献の開示は、参照によりその全体が明示的に組み込まれる。
Claims (90)
- 植物メッセンジャーパック(PMP)を生成する方法であって、
(a)細胞外小胞(EV)を含む植物からペクチンリッチ調製物を提供することであって、前記調製物は、650nmの吸光度で0.8AU以上の濁度を有する、提供すること;
(b)前記調製物を処理して、前記調製物又はその画分の前記濁度を低減させること;及び
(c)前記調製物又はその画分からPMPを分離し、それによりPMPを生成すること
を含む方法。 - 植物メッセンジャーパック(PMP)を生成する方法であって、
(a)EVを含む植物からペクチンリッチ調製物を提供すること;
(b)前記調製物を、ペクチンゲル化を低減させる作用物質で処理すること;
(c)前記調製物を濃縮することであって、前記濃縮調製物の粘度は、ペクチンゲル化を低減させる前記作用物質で処理されていない濃縮調製物に対して少なくとも10%だけ低減される、濃縮すること;及び
(d)前記調製物又はその画分からPMPを分離し、それによりPMPを生成すること
を含む方法。 - 植物メッセンジャーパック(PMP)を生成する方法であって、
(a)EVを含む植物からペクチンリッチ調製物を提供すること;
(b)前記調製物を処理して、前記調製物又はその画分中の高分子量ペクチンを低減させること;及び
(c)前記調製物又はその画分からPMPを分離し、それによりPMPを生成すること
を含む方法。 - 植物メッセンジャーパック(PMP)を生成する方法であって、
(a)EVを含む植物からペクチンリッチ調製物を提供すること;
(b)前記調製物又はその画分をキレート化剤と接触させること;及び
(c)前記キレート化調製物又はその画分からPMPを分離し、それによりPMPを生成すること
を含む方法。 - PMPを製造する方法であって、
(a)少なくとも500gの、EVを含むペクチンリッチ植物又は植物の一部を調製物に加工すること;
(b)前記調製物又はその画分をキレート化剤と接触させること;及び
(c)前記キレート化調製物又はその画分を加工して、PMPを分離すること
を含み、前記接触させることは、前記キレート化調製物又はその画分中の高分子量ペクチンを少なくとも10%だけ低減させるのに十分な量及び時間で実施される、方法。 - 工程(c)の前記加工することは、前記キレート化調製物又はその画分から前記PMPを分離することを含む、請求項5に記載の方法。
- 前記キレート化剤は、前記キレート化調製物又はその画分中のペクチンのゲル化を低減させる、請求項4~6のいずれか一項に記載の方法。
- 前記キレート化剤は、EDTA又はEGTAである、請求項4~7のいずれか一項に記載の方法。
- 前記EDTA又はEGTAは、MES、トリス又はPBSを有する溶液中におけるものである、請求項8に記載の方法。
- 前記調製物をペクチナーゼ酵素で処理することをさらに含む、請求項1~9のいずれか一項に記載の方法。
- PMPを生成する方法であって、
(a)EVを含む植物からペクチンリッチ調製物を提供すること;
(b)前記調製物又はその画分をペクチナーゼ酵素と接触させること;及び
(c)前記調製物又はその画分からPMPを分離し、それによりPMPを生成すること
を含む方法。 - 前記ペクチナーゼ酵素の除去又は不活化をさらに含む、請求項10又は11に記載の方法。
- 前記調製物におけるペクチン濃度は、少なくとも0.1%である、請求項1~12のいずれか一項に記載の方法。
- 工程(c)の前記PMPは、工程(a)の前記調製物に対して少なくとも10倍濃縮される、請求項1~13のいずれか一項に記載の方法。
- 前記分離又は加工することは、遠心分離を含む、請求項1~14のいずれか一項に記載の方法。
- 前記遠心分離は、分画遠心分離である、請求項15に記載の方法。
- 前記分離又は加工することは、1つ又は複数のろ過工程を含む、請求項1~16のいずれか一項に記載の方法。
- 前記1つ又は複数のろ過工程は、タンジェンシャルフローろ過を含む、請求項17に記載の方法。
- 前記タンジェンシャルフローろ過は、前記調製物の容量を少なくとも10回交換することを含む、請求項18に記載の方法。
- 前記1つ又は複数のろ過工程は、サイズ排除クロマトグラフィーを含む、請求項17に記載の方法。
- 前記1つ又は複数のろ過工程は、タンジェンシャルフローろ過及びサイズ排除クロマトグラフィーを含む、請求項17に記載の方法。
- 前記分離又は加工することは、遠心分離、タンジェンシャルフローろ過及びサイズ排除クロマトグラフィーの1つ、2つ又は3つすべてを含む、請求項1~17のいずれか一項に記載の方法。
- 前記分離又は加工することは、洗浄工程、希釈、pH改変、透析及び汚染物質の除去の1つ又は複数を含む、請求項1~22のいずれか一項に記載の方法。
- 工程(c)の前記PMPにおけるペクチン濃度は、処理されていない調製物から生成されるPMPに対して少なくとも10%だけ低減される、請求項1~23のいずれか一項に記載の方法。
- 前記調製物を提供することは、植物又は植物の一部を加工してPMPを放出させることを含む、請求項1~24のいずれか一項に記載の方法。
- 前記加工することは、植物又は植物の一部をブレンドすることを含む、請求項25に記載の方法。
- 前記植物の一部は、グレープフルーツ又はレモンの果汁嚢である、請求項26に記載の方法。
- 前記加工することは、ストレーナーを通して植物又は植物の一部をマッシングすることを含む、請求項25に記載の方法。
- 前記加工することは、植物又は植物の一部を低温プレスすることを含む、請求項25に記載の方法。
- 前記調製物は、ペクチンリッチ植物又はペクチンリッチ植物の一部から得られる、請求項1~29のいずれか一項に記載の方法。
- 前記植物は、柑橘植物である、請求項25、26又は28~30のいずれか一項に記載の方法。
- 前記柑橘植物は、グレープフルーツ又はレモンである、請求項31に記載の方法。
- 前記植物は、顕花植物である、請求項25、26又は28~30のいずれか一項に記載の方法。
- 前記植物は、野菜である、請求項25、26又は28~30のいずれか一項に記載の方法。
- 前記調製物の粘度は、モニタリングされる、請求項1~34のいずれか一項に記載の方法。
- 前記調製物の粘度は、処理されていない調製物に対して少なくとも5%だけ低減される、請求項1~35のいずれか一項に記載の方法。
- 工程(c)において生成された前記PMPを担体と共に製剤化することを含む、請求項1~36のいずれか一項に記載の方法。
- 前記担体は、農業的に許容される担体である、請求項37に記載の方法。
- 前記PMPは、植物への送達のために製剤化される、請求項38に記載の方法。
- 前記担体は、薬学的に許容される担体である、請求項39に記載の方法。
- 前記PMPは、ヒトへの投与のために製剤化される、請求項40に記載の方法。
- 前記PMPは、液体、固体、エアロゾル、ペースト、ゲル又は気体組成物と共に製剤化される、請求項37~41のいずれか一項に記載の方法。
- 前記PMPは、少なくとも24時間、48時間、7日間又は30日間にわたって安定である、請求項37~42のいずれか一項に記載の方法。
- 前記PMPは、少なくとも4℃の温度で安定である、請求項37~43のいずれか一項に記載の方法。
- 前記PMPは、少なくとも1μg、10μg、50μg、100μg又は250μgのPMPタンパク質/mlの濃度である、請求項37~44のいずれか一項に記載の方法。
- 前記PMPに異種機能性剤をロードすることを含む、請求項1~45のいずれか一項に記載の方法。
- 前記異種機能性剤は、異種農業剤である、請求項46に記載の方法。
- 前記異種農業剤は、殺虫剤である、請求項47に記載の方法。
- 前記異種農業剤は、施肥剤である、請求項47に記載の方法。
- 前記異種農業剤は、除草剤である、請求項47に記載の方法。
- 前記異種農業剤は、植物改変剤である、請求項47に記載の方法。
- 前記異種機能性剤は、異種治療剤である、請求項46に記載の方法。
- 前記異種機能性剤は、抗真菌剤、抗菌剤、殺ウイルス剤、抗ウイルス剤、殺昆虫剤、殺線虫剤、抗寄生虫剤又は昆虫忌避剤を含む、請求項46に記載の方法。
- 複数のPMPを含むPMP組成物であって、前記PMPは、
(a)細胞外小胞(EV)を含む植物からペクチンリッチ調製物を提供する工程であって、前記調製物は、650nmの吸光度で0.8AU以上の濁度を有する、工程;
(b)前記調製物を処理して、前記調製物又はその画分の前記濁度を低減させる工程;及び
(c)前記調製物又はその画分からPMPを分離し、それによりPMPを生成する工程
を含むプロセスによって生成される、PMP組成物。 - 複数のPMPを含むPMP組成物であって、前記PMPは、
(a)EVを含む植物からペクチンリッチ調製物を提供する工程;
(b)前記調製物を、ペクチンゲル化を低減させる作用物質で処理する工程;
(c)前記調製物を濃縮する工程であって、前記濃縮調製物の粘度は、ペクチンゲル化を低減させる前記作用物質で処理されていない濃縮調製物に対して少なくとも10%だけ低減される、工程;及び
(d)前記調製物又はその画分からPMPを分離し、それによりPMPを生成する工程
を含むプロセスによって生成される、PMP組成物。 - 複数のPMPを含むPMP組成物であって、前記PMPは、
(a)EVを含む植物からペクチンリッチ調製物を提供する工程;
(b)前記調製物を処理して、前記調製物又はその画分中の高分子量ペクチンを低減させる工程;及び
(c)前記調製物又はその画分からPMPを分離し、それによりPMPを生成する工程
を含むプロセスによって生成される、PMP組成物。 - 複数のPMPを含むPMP組成物であって、前記PMPは、
(a)EVを含む植物からペクチンリッチ調製物を提供する工程;
(b)前記調製物又はその画分をキレート化剤と接触させる工程;及び
(c)前記キレート化調製物又はその画分からPMPを分離し、それによりPMPを生成する工程
を含むプロセスによって生成される、PMP組成物。 - 複数のPMPを含むPMP組成物であって、前記PMPは、
(a)少なくとも500gの、EVを含むペクチンリッチ植物又は植物の一部を調製物に加工する工程;
(b)前記調製物又はその画分をキレート化剤と接触させる工程;及び
(c)前記キレート化調製物又はその画分を加工して、PMPを分離する工程
を含むプロセスによって生成され、前記接触させることは、前記キレート化調製物又はその画分中の高分子量ペクチンを少なくとも10%だけ低減させるのに十分な量及び時間で実施される、PMP組成物。 - 工程(c)の前記加工することは、前記キレート化調製物又はその画分から前記PMPを分離することを含む、請求項58に記載のPMP組成物。
- 前記キレート化剤は、前記キレート化調製物又はその画分中のペクチンの重合を低減させる、請求項57~59のいずれか一項に記載のPMP組成物。
- 前記キレート化剤は、EDTA又はEGTAである、請求項57~60のいずれか一項に記載のPMP組成物。
- 前記EDTA又はEGTAは、MES、トリス又はPBSを有する溶液中におけるものである、請求項61に記載のPMP組成物。
- 前記調製物をペクチナーゼ酵素で処理することをさらに含む、請求項54~62のいずれか一項に記載のPMP組成物。
- 複数のPMPを含むPMP組成物であって、前記PMPは、
(a)EVを含む植物からペクチンリッチ調製物を提供する工程;
(b)前記調製物又はその画分をペクチナーゼ酵素と接触させる工程;及び
(c)前記調製物又はその画分からPMPを分離し、それによりPMPを生成する工程
を含むプロセスによって生成される、PMP組成物。 - 前記ペクチナーゼ酵素の除去又は不活化をさらに含む、請求項63又は64に記載のPMP組成物。
- 担体をさらに含む、請求項54~65のいずれか一項に記載のPMP組成物。
- 前記担体は、農業的に許容される担体である、請求項66に記載のPMP組成物。
- 前記担体は、薬学的に許容される担体である、請求項66に記載のPMP組成物。
- 液体、固体、エアロゾル、ペースト、ゲル又は気体組成物として製剤化される、請求項54~68のいずれか一項に記載のPMP組成物。
- 少なくとも24時間、48時間、7日間又は30日間にわたって安定である、請求項54~69のいずれか一項に記載のPMP組成物。
- 少なくとも4℃の温度で安定である、請求項54~70のいずれか一項に記載のPMP組成物。
- 前記組成物中の前記PMPは、少なくとも1μg、10μg、50μg、100μg又は250μgのPMPタンパク質/mlの濃度である、請求項54~71のいずれか一項に記載のPMP組成物。
- 植物の適応度を増加させる方法であって、有効量の、請求項54~72のいずれか一項に記載のPMP組成物を前記植物に送達することを含み、前記植物の適応度を未処置の植物に対して増加させる方法。
- 植物害虫の適応度を減少させる方法であって、有効量の、請求項54~72のいずれか一項に記載のPMP組成物を前記植物害虫に送達することを含み、前記植物害虫の適応度を未処置の植物害虫に対して減少させる方法。
- 感染の処置を、それを必要とする動物において行う方法であって、有効量の、請求項54~72のいずれか一項に記載のPMP組成物を前記動物に投与することを含む方法。
- 病原体の適応度を減少させる方法であって、有効量の、請求項54~72のいずれか一項に記載のPMP組成物を前記病原体に送達することを含み、前記病原体の適応度を未処置の病原体に対して減少させるのに有効である方法。
- 動物病原体ベクターの適応度を減少させる方法であって、有効量の、請求項54~72のいずれか一項に記載のPMP組成物を前記ベクターに送達することを含み、前記ベクターの適応度を未処置のベクターに対して減少させる方法。
- 植物メッセンジャーパック(PMP)を生成する方法であって、
(a)EVを含む植物からペクチンリッチ調製物を提供すること;
(b)(i)前記調製物を処理して、前記調製物若しくはその画分の濁度を低減させること;(ii)前記調製物を処理して、前記調製物若しくはその画分の粘度を低減させること;(iii)前記調製物を処理して、前記調製物若しくはその画分中の高分子量ペクチンを低減させること;(iv)前記調製物若しくはその画分をキレート化剤と接触させること;又は(v)前記調製物若しくはその画分をペクチナーゼ酵素と接触させること;
(c)工程(b)中に前記調製物又はその画分の粘度を間欠的又は継続的に測定すること;
(d)前記調製物又はその画分の粘度が、工程(e)の前記調製物又はその画分が、処理されていない調製物又はその画分に対して低減されたゲル化を有することを通知する所定のレベル未満である場合、工程(b)を終了すること;及び
(e)前記調製物又はその画分からPMPを分離すること
を含む方法。 - 粘度は、工程(b)中にインプロセスで測定される、請求項78に記載の方法。
- 粘度は、工程(b)中に間欠的に測定される、請求項78に記載の方法。
- 粘度は、工程(b)の少なくとも一部中に継続的に測定される、請求項78に記載の方法。
- 粘度は、工程(b)中に継続的に測定される、請求項78に記載の方法。
- 粘度の前記所定のレベルは、粘度が20℃で測定される場合に1.4cPである、請求項78~82のいずれか一項に記載の方法。
- 工程(b)中の前記組成物の温度は、20℃である、請求項78~83のいずれか一項に記載の方法。
- 植物メッセンジャーパック(PMP)を生成する方法であって、
(a)EVを含む植物からペクチンリッチ調製物を提供すること;
(b)(i)前記調製物を処理して、前記調製物若しくはその画分の濁度を低減させること;(ii)前記調製物を処理して、前記調製物若しくはその画分の粘度を低減させること;(iii)前記調製物を処理して、前記調製物若しくはその画分中の高分子量ペクチンを低減させること;(iv)前記調製物若しくはその画分をキレート化剤と接触させること;又は(v)前記調製物若しくはその画分をペクチナーゼ酵素と接触させること;
(c)工程(b)中に前記調製物又はその画分の濁度を間欠的又は継続的に測定すること;
(d)前記調製物又はその画分の濁度が、工程(e)の前記調製物又はその画分が、処理されていない調製物又はその画分に対して低減されたゲル化を有することを通知する所定のレベル未満である場合、工程(b)を終了すること;及び
(e)前記調製物又はその画分からPMPを分離すること
を含む方法。 - 濁度は、工程(b)中にインプロセスで測定される、請求項85に記載の方法。
- 濁度は、工程(b)中に間欠的に測定される、請求項85に記載の方法。
- 濁度は、工程(b)の少なくとも一部中に継続的に測定される、請求項85に記載の方法。
- 濁度は、工程(b)中に継続的に測定される、請求項85に記載の方法。
- 濁度の前記所定のレベルは、650nmの吸光度で0.8AUである、請求項85~89のいずれか一項に記載の方法。
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