JP2022526446A - 皮膚の健康を改善するための、ならびに病原微生物に関連する疾患、障害、及び病態の治療及び予防のための、組成物及び方法 - Google Patents

Abstract

本願では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ（ヤンシノバクテリウム・リビダム）を使用する組成物及び方法を開示する。組成物は、皮膚の健康を改善する。方法は、宿主または宿主領域、例えば、皮膚または粘膜などに対してヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを適用して、１つ以上の微生物の存在を最小限にすること、治療効果を最大にすること、及び／または健康を改善することを含み得る。病原微生物を最小限にする方法は、ヒト由来のＪａｎｔｈｍｏｂａｅｔｅｒｎｍｉ ｌｉｖｉｄｕｍと、許容可能な担体とを含む組成物を表面に適用することを含み得る。組成物及び方法は、増殖及び／または代謝産物を最大にするためのプレバイオティクスを含み得る。組成物及び方法は、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ代謝産物、例えば、ビオラセイン、プロジギオシン、インドール－３－カルボキサルデヒド、及びランチビオティクス、ならびに／またはその他のポストバイオティクスなどを含み得る。【選択図】図４

Description

１．関連出願への相互参照
本出願は、２０１９年４月９日に出願した米国仮特許出願第６２／９２０，０１０号の優先権と利益を主張するものであって、その全内容を、参照により、本明細書で援用する。

２．分野
本発明は、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ（ヤンシノバクテリウム・リビダム）、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの代謝産物、細胞溶解物、またはポストバイオティクスを使用して、皮膚の健康を改善するための、及び病原微生物または微生物に関連する疾患、障害及び病態を、阻害、治療及び予防するための有用な組成物及び方法、及びＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを含有しており、化粧品や民生品に供する組成物、製剤及び産物を提供する。

３．背景
病原微生物がもたらす皮膚、爪、粘膜腔（ｍｕｃｏｓａ ｍｅｍｂｒａｎｅ ｃａｖｉｔｙ）及び粘膜腔（ｍｕｃｏｕｓ ｍｅｍｂｒａｎｅ ｃａｖｉｔｙ）の局所感染は、数多くのヒト及び対象での健康問題である。これらの微生物は、様々な細菌、ウイルス、酵母、真菌感染症を引き起こす。これらの病態は、皮膚、爪、粘膜腔（ｍｕｃｏｓａ ｍｅｍｂｒａｎｅ ｃａｖｉｔｙ）及び粘膜腔（ｍｕｃｏｕｓ ｍｅｍｂｒａｎｅ ｃａｖｉｔｙ）の腸内毒素症に起因して、病原微生物及び／または病原微生物の群集の確立を許容し得る。

細菌、ウイルス、酵母、及び／または真菌感染症など、比較的に数多くのヒト集団に影響を与える様々な感染症がある。潜在的に病原性である真菌として、酵母（例えば、Ｃａｎｄｉｄａ ａｌｂｉｃａｎｓ（カンジダ・アルビカンス））及び皮膚糸状菌がある。皮膚糸状菌は、ケラチンを栄養源とするカビであり、また、生存するためには、角膜層、毛髪、または爪甲の上に棲息しなければならない。ヒトの感染症は、Ｔｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ（白癬菌属）、Ｍｉｃｒｏｓｐｏｒｕｍ（ミクロスポルム属）、及びＥｐｉｄｅｒｍｏｐｈｙｔｏｎ（表皮菌属）種が引き起こす。Ｔｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ ｒｕｂｒｕｍ（紅色白癬菌）は、世界中で認められている皮膚及び爪での真菌症の約４６％～７２％に関与している。調査研究によれば、最も一般的な皮膚糸状菌であるＴｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ ｒｕｂｒｕｍ、及びＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ（黄色ブドウ球菌）が、それぞれ、足白癬とアトピー性皮膚炎の原因微生物であることが確認されている。一般的で、かつ、持続的な真菌感染症である爪真菌症は、世界人口の２～８パーセントで診断されている。この疾患は、爪の変形及び／または疼痛をもたらす。皮膚糸状菌症の治療として、抗真菌外用剤（例えば、テルビナフィン、イトラコナゾール、ミコナゾールなど）及び／または全身療法がある。一部の長期治療は効果が無く、そして毒性が認められており、それに、抗真菌薬の薬剤耐性、及び感染の再発があるので、代替治療が待望されている。

本明細書では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを使用して、病原微生物を治療、阻害、または予防するための組成物と方法を記載している。組成物及び方法は、微生物叢を調節して、微生物感染を効果的に阻害、治療または予防する上で有用である。これらの組成物及び方法は、本発明の目的である、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの産物を含む。

本明細書では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを使用して、皮膚の健康を改善する、日光曝露の影響と老化を抑制する外用剤及び化粧品組成物ならびに方法も記載している。

４．概要
本明細書では、局所病原微生物の阻害、治療、または予防での使用のための有効量の少なくとも１つの単離されたヒトＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを含む医薬組成物を開示する。本明細書では、局所病原微生物の阻害、治療、または予防での使用のための有効量のヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの１つ以上の代謝産物を含む医薬組成物も開示する。本明細書では、局所病原微生物の阻害、治療、または予防での使用のための有効量のヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの細胞溶解物を含む医薬組成物も開示する。本明細書では、局所病原微生物の阻害、治療、または予防での使用のための有効量の賦形剤と、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ、及び／またはヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍに由来する材料を含む医薬組成物、ならびに、これらの医薬組成物を、病原微生物を阻害、治療または予防するために使用する方法を開示する。これらの医薬組成物は、皮膚、粘膜、毛髪、及び／または爪に適用するために製剤することができる。

本明細書では、プロバイオティクスヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ、プロバイオティクスヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの代謝産物、プロバイオティクスヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの細胞溶解物、及び／または局所適用のために製剤したヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍのポストバイオティクスを含む合成組成物を開示する。これらの合成組成物は、対象（例えば、皮膚、粘膜、毛髪、爪甲）または当該対象と接触する物（例えば、布、床など）に適用するために製剤することができる。一部の実施形態では、これらの合成組成物は、化粧品組成物である。

一部の実施形態では、本発明の組成物は、プレバイオティクスをさらに含む。好ましい実施形態では、プレバイオティクスは、アミノ酸、ビオチン、グリセロール、フルクトオリゴ糖、ガラクトオリゴ糖、イヌリン、ラクツロース、マンナンオリゴ糖、オリゴフルクトースが豊富なイヌリン、オリゴフルクトース、オリゴデキストロース、タガトース、トランスガラクトオリゴ糖、及びキシロオリゴ糖の内の１つ以上から選択される。一部の実施形態では、医薬組成物は、単離された非病原性のさらなる微生物をさらに含む。好ましい実施形態では、単離されたさらなる微生物は、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ（ラクトバチルス）種、Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ（ラクトコッカス）種、ヒトの皮膚に一般的に認められる良性真菌種、またはＰｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ（プロピオニバクテリウム）種から選択される。一部の実施形態では、組成物は、さらなる抗真菌性化合物または抗菌化合物と共に投与するために製剤される。一部の実施形態では、医薬組成物は、皮膚または粘膜に対して局所投与するために製剤される。一部の実施形態では、組成物は、粘膜腔に向かう送達デバイスの一部である。

一部の実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ核酸配列を、配列番号５、配列番号６、または配列番号７で識別される。一部の実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍは、配列番号５、配列番号６、または配列番号７と少なくとも９０％同一である；または、１６ｓ ｒＲＮＡ遺伝子配列において配列番号５、配列番号６、または配列番号７と少なくとも９３％、または少なくとも９５％、または少なくとも９７％、または少なくとも９８％、または少なくとも９９％、または１００％同一である核酸配列を含む。一部の実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍは、配列番号５、配列番号６、または配列番号７と少なくとも９０％同一である、配列番号５、配列番号６、または配列番号７と少なくとも９２％同一である；または、配列番号５、配列番号６、または配列番号７と少なくとも９３％、または少なくとも９５％、または少なくとも９７％、または少なくとも９８％、または少なくとも９９％、または１００％同一である核酸配列を含む。一部の実施形態では、配列番号５、配列番号６、または配列番号７は、１６ｓ ｒＲＮＡ遺伝子配列においてヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ核酸配列と少なくとも９０％同一である；１６ｓ ｒＲＮＡ遺伝子配列においてヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ核酸配列と少なくとも９０％同一である；または、少なくとも９３％同一である、または少なくとも９５％、または少なくとも９７％、または少なくとも９８％、または少なくとも９９％、または１００％同一である。

一部の実施形態では、医薬組成物は、Ｃａｎｄｉｄａ ａｌｂｉｃａｎｓ、Ｃ．ｇｌａｂｒａｔａ（グラプラタ）、Ｃ．ｐａｒａｐｓｉｌｏｓｉｓ（パラプシローシス）、Ｃ．ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ（トロピカリス）、Ｃ．ｋｒｕｓｅｉ（クルセイ）またはＣ．ｋｅｆｙｒ（ケフィール）などの酵母病原微生物を治療するために使用される。一部の実施形態では、医薬組成物は、ＴｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎまたはＭａｌａｓｓｅｚｉａ（マラセチア）種などの真菌病原微生物を治療するために使用される。一部の実施形態では、医薬組成物は、Ｔ．ｒｕｂｒｕｍ、Ｔ．ｖｅｒｒｕｃｏｓｕｍ（ベルコースム）、Ｔ．ｔｏｎｓｕｒａｎｓ（トンスランス）、Ｔ．ｔｅｒｒｅｓｔｒｅ（テルエストレ）、Ｔ．ｉｎｔｅｒｄｉｇｉｔａｌｅ（インタージギターレ）などの真菌病原微生物を治療するために使用される。一部の実施形態では、医薬組成物は、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ（スタフィロコッカス属）、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ（シュードモナス属）、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ（エンテロコッカス属）及びＳ．ａｕｒｅｕｓなどの細菌病原微生物を治療するために使用される。一部の実施形態では、医薬組成物は、ポリオウイルス、単純ヘルペスウイルス、Ａ型肝炎ウイルス、ロタウイルス、アデノウイルス、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２及びＡ型インフルエンザウイルスなどのウイルス病原微生物を治療するために使用される。一部の実施形態では、医薬組成物は、Ｇａｒｄｎｅｒｅｌｌａ ｖａｇｉｎａｌｉｓ（ガードネレラ・バジナリス）、Ｃａｎｄｉｄａ ａｌｂｉｃａｎｓ、Ａｔｏｐｏｂｉｕｍ ｖａｇｉｎａｅ（アトポビウム・バジナリス）、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ（大腸菌）、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ（サルモネラ属）からなる群から選択する病原微生物を治療するために使用される。

一部の実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの代謝産物は、局所投与製剤に対して可溶性である。一部の実施形態では、医薬組成物は、ビオラセイン、インドール－３－カルボキサルデヒド、プロジギオシン、サリチル酸塩、２，４－ジアマブチレート及び１つ以上のランチビオティックから選択する代謝産物を含む。一部の実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍは、ビオラセイン、インドール－３－カルボキサルデヒド、プロジギオシン、サリチル酸塩、２，４－ジアマブチレート及び１つ以上のランチビオティックから選択する抗菌代謝産物を、その他の非ヒトＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ参照株よりも高レベルで産生する。

一部の実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを含む医薬組成物は、別個に保存した滅菌液体で再構成する前は、無水であり、－２０℃で凍結する、または－８０℃で凍結される。一部の実施形態では、再構成のための液体は、眼用潤滑剤、グリセロール、スクロース、マンニトール、２－ヒドロキシエチルスターチ（ＨＥＳ）、Ｎｏｖｅｏｎ ＡＡ－１ポリカルボフィル、Ｍｅｔｈｏｃｅｌ Ｆ４Ｍ（ＨＰＭＣ）、カルボキシメチルセルロース、及び／またはλ－カラギーナンから選択される。

一部の実施形態では、本明細書に記載するヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ組成物は、病原微生物を阻害、治療または予防する方法において使用しており、当該方法は、その必要がある対象に対して、有効量のヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの代謝産物及び／または細胞溶解物を投与することを含み、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの代謝産物及び／または細胞溶解物が、少なくとも１つの病原微生物を阻害、治療または予防するのに有効な量で存在する。一部の実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを、さらなる抗真菌剤または抗菌剤を併用して適用する。一部の実施形態では、組成物は、さらなるプロバイオティクスまたは非病原微生物を有する。

一部の実施形態では、本発明の医薬組成物、合成組成物、化粧品組成物及びプロバイオティクス組成物は、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍのミリリットルまたはミリグラムのあたりで、少なくとも１０、１０^２、１０^３、１０^４、１０^５、１０^１０、１０^２０コロニー形成単位（ＣＦＵ）を含む。

本明細書では、有効量のプロバイオティクスヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ、任意の代謝産物、細胞溶解物、及び／またはプレバイオティクス、及び医薬として許容可能な賦形剤を含む医薬組成物を製造する方法を開示しており、当該方法は、保存性を改善する賦形剤を含有する原薬製剤の存在下で噴霧乾燥または凍結乾燥して、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを保存し、第２の賦形剤製剤で再構成して投与の直前に製剤を生成するための保存したヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍをパッケージングすることを含む。一部の実施形態では、賦形剤は、アミノ酸、複合炭水化物、単純炭水化物、ＤＭＳＯ、マンニトール、天然涙液、眼用潤滑剤、トレハロース、及びグリセロールからなる群から選択される。

本明細書では、キットを記載しており、当該キットは、安定化したヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍのバイアル、及び安定化したヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを再構成する液体のための少なくとも１つの任意のバイアル、混合と使用に関する説明書、ならびに混合と使用のための１つ以上の任意の器具を含む。一部の実施形態では、混合と使用のための器具を含んでおり、注射器、空の滅菌容器、及び噴霧器またはミスト生成器から選択する１つ以上の要素を含む。一部の実施形態では、キットは、その必要がある１名以上の対象に対する複数回の適用のために、安定化したヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの複数のバイアル、及び安定化したヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを再構成する液体のための少なくとも１つのバイアルを含む。一部の実施形態では、キットは、医療従事者用に準備される。一部の実施形態では、キットは、患者用に準備される。

５．図面の簡単な説明
ヒトの踵、ヒトの前額部、及び大根から単離したＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの代表例を示しており、すべてを、ペトリ皿で培養を行った。 次世代配列決定読み取りを使用して、１６ｓ ｒＲＮＡ遺伝子の一部として推定した、健康な皮膚でのＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの有病率と存在量を示している。 ゲノム規模ＡＮＩ比較を使用して行われたＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの複数の分離株の間での遺伝的比較を視覚化した系統樹を示しており、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの複数の異なるグループを単離したことを実証している。 Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ ＤＢ０２４７３が、寒天プレートで、Ｔ．ｒｕｂｒｕｍの増殖を有意に阻害したことを示している。 ＢＤ ＢＢＬ Ｓｅｎｓｉ－Ｄｉｓｃｓを使用して、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株が、１０種類の抗生物質に対して感受性があることを示している。 純度アッセイの画像を示しており、製造の間に汚染がないことを示している。Ａ－Ｆ１０７ 震盪フラスコ、Ｂ－Ｆ１０７ 集菌、Ｃ－Ｆ１０８ 震盪フラスコ、Ｄ－Ｆ１０８ 集菌。 集菌して直接に播種した（ＷＰＩ）、及び、遠心分離して、抗凍結剤ビヒクルに再懸濁した後に直接に播種した（Ｔｕｆｔｓ）Ｆ１０７（Ａ）及びＦ１０８（Ｂ）発酵槽試料でのＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの生存数をＣＦＵ／ｍｌで示す。 Ｒａｍｓｅｙアッセイの代表的な画像を示す（実施例４）。画像は、４つのＴ．ｒｕｂｒｕｍ １８７５４コロニーだけのもの（Ａ、Ｃ）、または１０^７ ＣＦＵ／ｍｌのＦ１０７から得たヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ ＤＢ０２４７３の中央十字を設けたもの（Ｂ、Ｄ）を示す。Ａ及びＢは、１２日目に撮像した。Ｃ及びＤは、３４日目に撮像した。Ｃ及びＤでの棒状部は、それぞれのＴ．ｒｕｂｒｕｍコロニーについて測定した半径方向距離の位置を示す。 製造したＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株の有効性を示しており、この有効性は、モックコントロールのＴ．ｒｕｂｒｕｍの増殖半径と、３４日間増殖させた後のＦ１０７及びＦ１０８収集試料の希釈物との差異から明らかである。 Ｓ．ａｕｒｅｕｓ抗生物質アッセイの代表的な結果を示す。詳細な方法は、実施例４に記載している。

６．詳細な説明
本発明の様々な実施形態を本明細書に示しており、また、説明をしているが、それら実施形態が例示目的だけで提供されていることは、当業者に自明であろう。当業者であれば、本発明から逸脱せずに、無数の変形、変更、及び置換を想到し得る。本明細書に記載する本発明の実施形態の様々な代替形態を使用し得ることを理解されたい。

本明細書では、プロバイオティクス細菌ヒト由来Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを記載している。本明細書では、抗菌性及びその他の有用な特性を有するプロバイオティクス細菌ヒト由来Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを含む組成物を記載している。ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍは、ヒト宿主に適応しており、ヒトへの適用に関する安全性と、少なくとも治療的に有効であるのに十分に長い期間にわたってヒト宿主で生存する能力を備えていることを確実にする。好ましい組成物は、局所病原微生物を治療、阻害、または予防するのに有効な量の少なくとも１つのヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを含む医薬組成物である。別の好ましい組成物は、適用対象物の微生物叢を調節する局所適用のために製剤されたプロバイオティクスヒト由来Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを含む合成組成物である。

本発明の好ましい実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ、代謝産物、ポストバイオティクス及び／または細胞溶解物の組成物は、皮膚に対する投与のために製剤される。本発明の別の好ましい実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ、代謝産物、ポストバイオティクス及び／または細胞溶解物の組成物は、粘膜に対する投与のために製剤される。

本発明で使用する製剤は、少なくとも１つのプロバイオティクス細菌、プロバイオティクス細菌の少なくとも１つの代謝産物、プロバイオティクス細菌またはポストバイオティクスまたはプロバイオティクス細菌の少なくとも１つの細胞溶解物の１つ以上を含み得る、ことがさらに理解されよう。

製剤が、複数の細菌、可溶性代謝産物、細胞溶解物、またはポストバイオティクスを含み得ることがさらに理解されよう。例えば、製剤は、少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１２、１５または２０の細菌、培養物、それらの代謝産物、細胞溶解物、またはポストバイオティクスを含み得る。

当業者であれば、本明細書で使用する「プロバイオティクス」という用語が、生菌、微生物、生物培養物（例えば、細菌または酵母）のことを指しており、十分な数で提供すると、宿主生物に有用な影響を及ぼす、すなわち、宿主生物に１つ以上の実証可能な健康上の利益を付与する、ことが理解される。「プロバイオティクス細菌」または「プロバイオティクス微生物（ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍ）」または「プロバイオティクス微生物（ｍｉｃｒｏｂｅ）」または「プロバイオティクス培養物」または「プロバイオティクス細菌」は、十分な数で提供すると、宿主生物に有用な影響を及ぼす、すなわち、宿主生物に１つ以上の実証可能な健康上の利益を付与する細菌（ｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、微生物（ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍ）、微生物（ｍｉｃｒｏｂｅ）、培養物または細菌（ｂａｃｔｅｒｉａ）である。

本明細書で使用する「細胞溶解物」または「溶解物」という用語は、任意の適切な手段で溶解したプロバイオティクス細胞のことを指す。好ましい実施形態では、細胞の破片が使用前に除去される。より好ましい実施形態では、細胞溶解物が使用前に濾過される。例示的な実施形態では、細胞は、例えば、超音波処理、均質化、剪断または化学的溶解によって溶解される。

本明細書で使用する「ポストバイオティクス」という用語は、プロバイオティクスによって生成される機能性生物活性化合物のことを指しており、健康を促すために使用され得る。ポストバイオティクスという用語は、これらの微生物成分のすべての同義語及び関連用語の総称と見なすことができる。したがって、ポストバイオティクスは、代謝産物、短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ、例えば、酢酸、プロピオン酸、及び酪酸など）、微生物細胞画分、機能性タンパク質、細胞外多糖類（ＥＰＳ）、細胞溶解物、テイコ酸、フェニル乳酸、揮発性有機化合物（ＶＯＣ）、Ｂ－ビタミン合成（ビオチン、コバラミン、葉酸、ニコチン酸、パントテン酸、ピリドキシン、リボフラビン、及びチアミン）、ペプチドグリカン由来のムロペプチド、抗菌ペプチド（ＡＭＰ）及びピブタイプ構造などの数多くの様々な成分を含むことができる。

本発明での使用に適したプロバイオティクス細菌として、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ（ヤンシノバクテリウム属）、及びＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ（ビフィドバクテリウム属）、Ｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ（ブレビバクテリウム属）、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ（プロピオニバクテリウム属）、Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ（ラクトコッカス属）、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ（ストレプトコッカス属）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ（ラクトバチルス属）（例えば、Ｌ．ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ（アシドフィルス））、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ（ペジオコッカス属）、Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ（リューコノストック属）、及び／またはＯｅｎｏｃｏｃｃｕｓ（オエノコッカス属）などのあらゆるさらなる非病原微生物があるが、これらに限定されない。

本発明で使用する可溶性代謝産物として、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ、及びＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ（例えば、Ｌ．ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ、Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ、及び／またはＯｅｎｏｃｏｃｃｕｓなどのあらゆるさらなる非病原微生物に由来する可溶性代謝産物があるが、これらに限定されない。

本発明で使用する細胞溶解物として、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、及びＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ（例えば、Ｌ．ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ、Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ、及び／またはＯｅｎｏｃｏｃｃｕｓなどのあらゆるさらなる非病原微生物に由来する細胞溶解物があるが、これらに限定されない。

本明細書で使用する「可溶性代謝産物」という用語は、細胞を除去して得た細胞培養物の上清に存在する１つ以上の代謝産物のことを指す。好ましい実施形態では、培養物は、少なくとも約０．５のＯＤ_６００細胞密度にまで増殖させる。さらに好ましい実施形態では、細胞を、遠心分離で除去する。より好ましい実施形態では、上清を濾過する。上清を本発明の製剤に直接使用すること、または使用前に任意の適切な手段で、１つ以上の代謝産物を上清から単離できることは自明である。

本明細書で使用する局所という用語は、身体表面（例えば、皮膚、粘膜（ｍｕｃｏｓａ）または粘膜（ｍｕｃｏｕｓ ｍｅｍｂｒａｎｅ））に対する適用に適合した製剤のことも含む。皮膚として、足指の爪甲や手指などの外表面を含む。この点において言及し得る粘膜（ｍｕｃｏｕｓ ｍｅｍｂｒａｎｅ）、または粘膜（ｍｕｃｏｓａ）として、膣、陰茎、尿道、膀胱、肛門、結腸、口（頬の粘膜、柔軟な口蓋、舌の裏側表面、及び口の底床）、鼻、咽喉（咽頭、喉頭、気管、及び食道の粘膜など）、気管支、肺、目、及び耳の粘膜がある。

「改善する（ａｍｅｌｉｏｒａｔｉｎｇ）」という用語は、病状、例えば、その予防、重症度または進行の軽減、寛解、または治癒など、代謝性病状の治療における治療上有用な結果のことを指す。

「インサイチュ」という用語は、例えば、組織培養で増殖させるなど、生物とは別に増殖する生細胞で発生するプロセスのことを指す。

「インビボ」という用語は、生体内で発生するプロセスのことを指す。

本明細書で使用する「哺乳動物」という用語は、ヒト及び非ヒトの両方を含み、ヒト、非ヒト霊長類、イヌ、ネコ、ネズミ、ウシ、ウマ、及びブタなどがあるが、これらに限定されない。

本明細書で使用する「由来する（ｄｅｒｉｖｅｄ ｆｒｏｍ）」という用語は、環境試料から直ちに得た微生物（ｍｉｃｒｏｂｅ）、微生物（ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍ）またはその他の生物培養物を含み、ならびに環境源から単離し、次いで、純粋な培養物または単離物で増殖させた微生物（ｍｉｃｒｏｂｅ）、微生物（ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍ）またはその他の生物培養物も含む。

本明細書で使用する「菌株」という用語は、定義した１６ｓ ｒＲＮＡ核酸配列と９７％以上同一であるあらゆる核酸配列として定義される。より好ましくは、菌株の実施形態は、定義した１６ｓ ｒＲＮＡ核酸配列と９８％超、９９％超同一である核酸配列である。

２つ以上の核酸またはポリペプチド配列に関連する「同一パーセント」という用語は、２つ以上の配列またはサブ配列を比較して、最大限の対応関係となるように整列させて、以下に記載した配列比較アルゴリズム（例えば、ＢＬＡＳＴＰ及びＢＬＡＳＴＮまたは当業者が利用可能なその他のアルゴリズム）の１つを使用して測定して、または目視検査で認められた同一のヌクレオチドまたはアミノ酸残基に関して特定のパーセンテージを有する当該２つ以上の配列またはサブ配列のことを指す。目的に応じて、パーセント「同一」は、比較する配列の領域、例えば、機能ドメインにおいて存在することができる、あるいは、比較する２つの配列の全長にわたって存在することができる。一部の態様では、同一パーセントは、２つ以上の微生物など、２つ以上の生物の系統発生的類似性を特徴決定する上で有用な領域に関して定義される。これらの状況での同一パーセントは、例えば、プライマー、アダプターなどのクローニングまたは配列決定操作によって導入した配列を含むことができる大きな配列の枠内にある配列を同定し、系統学的類似性を通知しない導入配列を含めない分析でもってして、関心領域での同一パーセントを分析することによって、決定をすることができる。

配列比較のために、一般的には、１つの配列が、試験配列との比較に供する参照配列として機能する。配列比較アルゴリズムを使用する場合、試験配列と参照配列とをコンピューターに入力し、必要に応じて後続の座標を指定し、配列アルゴリズムプログラムパラメーターを指定する。次いで、配列比較アルゴリズムを、指定したプログラムパラメータに基づいて、参照配列と比較して試験配列（複数可）と同一の配列のパーセントを計算する。

配列の比較のための最適なアラインメントは、例えば、Ｓｍｉｔｈ ＆ Ｗａｔｅｒｍａｎ，Ａｄｖ．Ａｐｐｌ．Ｍａｔｈ．２：４８２ （１９８１）の局所的相同性アルゴリズム、Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ ＆ Ｗｕｎｓｃｈ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４３ （１９７０）の相同性アライメントアルゴリズム、Ｐｅａｒｓｏｎ ＆ Ｌｉｐｍａｎ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８５：２４４４ （１９８８）同様の方法のための検索、これらアルゴリズム（Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｓｏｆｔｗａｒｅ Ｐａｃｋａｇｅ，Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｃｏｍｐｕｔｅｒ Ｇｒｏｕｐ，５７５ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｄｒ．，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓ．でのＧＡＰ，ＢＥＳＴＦＩＴ，ＦＡＳＴＡ，及び ＴＦＡＳＴＡ）のコンピューターへの導入、または、目視検査（一般的には、以下のＡｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，を参照されたい）によって実施することができる。

パーセント配列同一性及び配列類似性を決定する上で好適なアルゴリズムの一例は、ＢＬＡＳＴアルゴリズムであり、これは、Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３－４１０ （１９９０）で説明がされている。ＢＬＡＳＴ分析を実行するためのソフトウェアは、Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎを通じて公的に入手可能である。

「十分な量」という用語は、所望の効果をもたらすのに十分な量、例えば、対象の微生物叢の微生物含有量を変えるのに十分な量のことを意味する。

「治療量」という用語は、処方された抗菌性化合物、例えば、抗真菌性または抗菌性の化合物の量である。一般的に、処方した濃度以下の濃度を、「治療量以下」の量と称する。

「治療有効量」という用語は、疾患の症状を改善するのに有効な量のことである。予防を治療法と見なすことができるので、治療上有効量を、「予防的有効量」とすることができる。

本明細書で使用する「方法」という用語は、所与の課題を解消するための方法、手段、技術、及び手順のことを指し、これらの方法、手段、技術、及び手順は、化学、薬理学、生物学、生化学及び医学分野の関係者が行う公知の方法、手段、手段、技術、及び手順から公知であるもの、または、それらから容易に開発できるもの、のいずれか一方であるが、これらに限定されない。

本明細書で使用する「阻害する」、「阻害すること」または「阻害」という用語は、病態または増殖の進行を停止すること、病態または増殖を実質的に予防すること、または病態または望ましくない増殖を実質的に治療することを含む。本明細書で使用する用語「治療する」、「治療すること」または「治療」とは、病態の進行を解消する、実質的に阻害する、遅延させる、または快方に向かわせること、病態の臨床的または審美的症状を実質的に改善することを含む。

本明細書で使用する「予防する」、「予防すること」または「予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎ）」という用語は、病態の初期の臨床的または審美的症状の可能性または発症または重症度を完全にまたは実質的に抑制することを含む。

本明細書で使用する「病原体」という用語は、疾患、障害または病態、ならびに疾患または感染に関連する微生物のことを指す。例えば、白癬性毛瘡は、顎髭領域の皮膚糸状菌感染症であり、大抵は、Ｔｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ ｍｅｎｔａｇｒｏｐｈｙｔｅｓ（トリコフィトン・メンタグロフィテス）またはＴ．ｖｅｒｒｕｃｏｓｕｍが原因である。頭部白癬は、Ｔｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ ｔｏｎｓｕｒａｎｓ（トリコフィトン・トンスランス）、Ｍｉｃｒｏｓｐｏｒｕｍ ｃａｎｉｓ（ミクロスポルム・カニス）、及びＭ．ａｕｄｏｕｉｎｉｉ（オーズアニー）、その他のＴｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ種（例えば、Ｔ．ｓｃｈｏｅｎｌｅｉｎｉｉ（シェーンライニ）、Ｔ．ｖｉｏｌａｃｅｕｍ（ビオラセウム））に起因する皮膚糸状菌症である。体部白癬は、顔、体幹、及び四肢の皮膚糸状菌感染症であり、一般的には、Ｔｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ ｍｅｎｔａｇｒｏｐｈｙｔｅｓ、Ｔ．ｒｕｂｒｕｍ、及びＭｉｃｒｏｓｐｏｒｕｍ ｃａｎｉｓが原因である。頑癬は、一般的に、Ｔｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ ｒｕｂｒｕｍまたはＴ．ｍｅｎｔａｇｒｏｐｈｙｔｅｓに起因する皮膚糸状菌症である。足白癬は、一般的に、Ｔ．ｒｕｂｒｕｍが引き起こす足の皮膚糸状菌感染症である。皮膚糸状菌疹（識別子またはｉｄ）反応は多様であり、それらは、真菌の局所的な増殖とは関係がなく、身体の他の箇所での皮膚糸状菌症に対する炎症反応である。アトピー性皮膚炎、膿痂疹、皮膚及び軟部組織感染症に関連するその他の疾患、障害、または病態は、グラム陽性菌及びＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓに起因することがよくあるが、これらに限定されない。

本明細書で使用する「約」という用語は、最大でおよそ＋／－１０％で、産物での機能的同等性を許容する変動を含む。

本明細書で使用する「コロニー形成単位」または「ＣＦＵ」という用語は、同一の細胞のコロニー全体に、それ自体をクローニングすることができる個々の細胞のことである。

本明細書で使用する場合、特に断りの無い限り、すべてのパーセンテージは、重量パーセントである。

本明細書で使用する「生存可能な生物」とは、成長及び増殖することができる生物のことである。一部の実施形態では、生存能力は、培養することができるコロニー形成単位の数によって評価することができる。一部の実施形態では、生存能力は、定量的ポリメラーゼ連鎖反応などのその他の手段で評価することができる。

「由来する」という用語は、記載した供給源から単離した材料、及び単離した材料を使用して得た材料（例えば、記載した供給源から単離した微生物から作製した微生物の培養物）を含む。

「微生物叢（ｍｉｃｒｏｂｉｏｔａ）」とは、動物対象、一般的には、真核生物、古細菌、細菌、及びウイルス（細菌ウイルス、すなわち、ファージなど）など、ヒトなどの哺乳動物内で、及び当該哺乳動物上で（持続的または一時的に）発生する微生物または微生物の群集のことを指す。

「微生物叢」とは、真核生物、古細菌、細菌、及びウイルス（細菌ウイルス（すなわち、ファージ）など）など、ヒトの体内及び体外に持続的及び一時的に生息する微生物（ｍｉｃｒｏｂｅ）、微生物（ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍ）、または生物培養物の群集の遺伝的内容のことを指し、「遺伝的内容」は、ゲノムＤＮＡ、リボソームＲＮＡなどのＲＮＡ、エピゲノム、プラスミド、及びその他のすべてのタイプの遺伝情報を含む。

「対象」という用語は、ヒト、実験動物（例えば、霊長類、ラット、マウス）、家畜（例えば、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、シチメンチョウ、及びトリ）、及び家庭用ペット（例えば、イヌ、ネコ、及び齧歯類）などのあらゆる動物対象のことを指す。対象は、病原微生物による感染症を含むが、それに限定されない感染症に起因する腸内毒素症に罹患し得る、または病原微生物に起因する感染症を発症または他者に感染させるリスクを持ち合わせ得る。

宿主生物の「コロニー形成」は、細菌またはその他の微視的生物の一時的でない滞留を含む。病原性細菌に起因する宿主対象の皮膚（または、その他の微生物的ニッチ）での「コロニー形成の減少」は、本明細書では、皮膚上での病原体の滞留時間の短縮、ならびに皮膚上の病原体または皮膚に付着した病原体の数（または、濃度）の減少を含む。付着病原体の減少の測定は、例えば、生検試料によって、皮膚から拭き取ることにより実証し得る、または減少は、間接的に測定し得る。

２つ以上の細菌の「組み合わせ」として、同じ材料または製品、または、物理的に接続した製品のいずれかでの２つの細菌の物理的共存、ならびに２つの細菌の一時的な同時投与または共局在化がある。

本明細書で使用する「乾燥」は、一般的には、凍結乾燥（ｌｙｏｐｈｉｌｉｚｅｄ）、凍結乾燥（ｆｒｅｅｚｅ ｄｒｉｅｄ）、または噴霧乾燥を行うことで、脱水、または脱水をすることを指す。

本出願を通して、本発明の様々な実施形態を、範囲形式で提示することができる。範囲形式での説明は、単に便宜上のため、及び簡潔にするために行うものであり、本発明の範囲に対する厳格な制限として解釈すべきではない、ことを理解されたい。したがって、範囲の説明とは、考え得るすべての部分的範囲と、その範囲内における個々の数値を具体的に開示したものと考慮すべきである。

明確にするために、別個の実施形態に関して説明をしている本発明のある特定の特徴を、単一の実施形態を組み合わせて提供することもできる。逆に、簡潔にするために単一の実施形態に関して説明をしている本発明の様々な特徴を、別個に提供することもできる、または任意の適切なサブコンビネーションとして、またはその他に説明をした本発明の実施形態において適切であれば提供することができる。様々な実施形態に関して説明されるある特定の特徴は、実施形態が、それらの要素が無いと動作しない限りは、それらの実施形態の本質的な特徴と考慮すべきではない。

本明細書及び添付した特許請求の範囲で使用している単数形「ａ」、「ａｎ」及び「ｔｈｅ」は、文脈において明確に別段の指示をしていない限りは、複数の指示対象を含むことに留意されたい。

Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ
Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍは、グラム陰性菌の属であり、人体を含む数多くの環境的ニッチで一般的に認められるベータプロテオ細菌である。Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍは、両生類を真菌感染から保護する能力があることが確認されている。一部の実施形態では、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの株は、環境源から単離される。好ましい実施形態では、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの株は、元来、ヒト供給源に由来する。ある実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株は、参照株と比較して、ヒトの皮膚において優れた持続性を示す。ある実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株は、参照株と比較して、代謝産物またはポストバイオティクスの良好な生産または過剰産生を示す。そのような実施形態では、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの参照株は、サンショウウオの皮膚、農産物などの異なる環境的ニッチから単離した株であり得る。

Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍは、抗菌効果を示す幾つかの代謝産物、すなわちビオラセイン、インドール－３－カルボキサルデヒド、プロジギオシン、サリチル酸塩、２，４－ジアマブチレート、及び１つ以上のランチビオティックが生成される。ビオラセインは、その紫色と、抗菌性で知られているビスインドール化合物である。インドール－３－カルボキサルデヒドは、植物代謝産物、ヒト生体異物代謝産物、細菌代謝産物、及び海洋代謝産物としての役割を果たす。それは、インドールアルカロイドであり、かつ、インドールのメンバーであるヘテロアレーンカルバルデヒドである。プロジギオシンは、アルカロイドであり、赤色に着色した二次代謝産物でもあり、往々にしてＳｅｒｒａｔｉａ（セラチア属）種に関連している。プロジギオシン分子は、それらの一般的なピロリルピロメテン骨格によって識別されており、また、抗菌活性などの様々な生物学的活性を有することが報告されている。

バクテリオシンのサブセットであるランチビオティクスは、分子内環構造を含む遺伝的にコードしたペプチドであり、その多くは、抗菌特性を有することが報告されている。ランチビオティクスペプチドは、翻訳後に修飾されて、特徴的な環構造を生成する。最もよく知られているランチビオティクスの１つは、ナイシンである。

一部の実施形態では、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ株を、参照株と比較する。一部の実施形態では、参照株は、別の環境的ニッチから単離した別のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ株である。一部の実施形態では、本出願のヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍは、両生類種から単離したＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株と比較したところ、両生類由来種及び植物由来種よりも有用なものであることが認められた。一部の実施形態では、利点は、ヒトの皮膚での寿命がより長いことである。一部の実施形態では、利点は、ビオラセイン、インドール－３－カルボキサルデヒド、プロジギオシン、サリチル酸塩、２，４－ジアマブチレート及び１つ以上のランチビオティクスがより多く産生されることである。一部の実施形態では、利点は、２－（α－Ｄ－マンノシル）－Ｄ－グリセリン酸、２－ケトグルコネート、２－Ｏ－エチルアスコルビン酸、アントラマイシン、アプロバルビタール、ベンジオカルブ、フタル酸ビス（２－エチルヘキシル）、シス－５－テトラデセノイルカルニチン、フタル酸ジブチル、プロピオン酸イミダゾール、インドール－３－カルボキシレート、インドリン－２－オン、Ｎ－アセチル－Ｌ－アスパラギン酸、リン酸、フタル酸、ピミルプロスト、トリメタジオン、及びベルノレートがより多く産生されることである。

一部の実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍまたは単離したヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍは、その他の株（例えば、参照株）と比較して、その化合物（例えば、代謝産物、例えば、ビオラセイン、インドール－３－カルボキサルデヒド、プロジギオシン、サリチル酸塩、２，４－ジアマブチレート及び１つ以上のランチビオティクス）を、過剰産生または過剰発現する。使用される「過剰生産」及び「過剰発現」という用語は、他の株（例えば、参照株）と比較して、（それぞれ）少なくとも１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、１００％、１１０％、１２０％、１３０％、１４０％、１．５倍、２倍、２．５倍、３倍多く、産生またはより多く発現することを指す。そのような実施形態では、参照Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株は、サンショウウオの皮、農産物などの異なる環境的ニッチから単離した株であり得る。使用される「過剰産生」という用語は、生物による化合物（例えば、代謝産物）の産生を指し、「過剰発現」という用語は、化合物（例えば、代謝産物）を産生する遺伝子の発現を指す。

プレバイオティクス
本発明の教示に従うプレバイオティクスは、有用な細菌の増殖を促す組成物を含む。プレバイオティクス物質は、関連するプロバイオティクスが消費する、または関連するプロバイオティクスが生存すること、または、その増殖を刺激することを補助する。プレバイオティクスは、効果的な量を適用する、または、効果的な量を消費すると、対象で自然に発生する微生物叢にも有用な影響を与え、それにより、健康上の利点をもたらすことができる。プレバイオティクス食品は結腸に到達し、内因性細菌の基質として機能し、それにより、間接的に、宿主に対して、エネルギー、代謝基質、及び必須微量栄養素を提供する。また、プレバイオティクスを、あらゆるプロバイオティクス組成物に添加して、プロバイオティクス株の有効性を高める、または寿命を延ばすことができる。

プレバイオティクスは、プロバイオティクスがそれらの環境内で繁栄することを補助し、したがって、それらの健康上の利点の大半は間接的なものである。例えば、短鎖脂肪酸など、腸内細菌叢による結腸発酵によって生成される代謝産物は、宿主の健康において重要な機能的役割を果たすことができる。プレバイオティクスは、ヒトの微生物叢が、それらの宿主に利益を与える能力を高める有用な薬剤であることができる。

本発明の実施形態でのプレバイオティクスとして、アミノ酸、グリセロール、ムコ多糖、オリゴ糖、多糖、アミノ酸、ビタミン、栄養前駆体、タンパク質、及びそれらの組み合わせがあるが、これらに限定されない。

特定の実施形態によると、組成物は、アミノ酸、グリセロール、多糖及びオリゴ糖を含むプレバイオティクスを含むが、これらに限定されない。これらの化合物は、プロバイオティクスの数を増やし、それらに関連する利点を強化することができる。例えば、有用なＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍが多くなると、腸内ｐＨが変化して、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍの増殖を促し、それにより、病原菌を減少させ得る。

特定の実施形態に従ってプレバイオティクスとして分類されるオリゴ糖の非限定例として、ガラクトオリゴ糖、フラクトオリゴ糖、イヌリン、イソマルトオリゴ糖、ラクチロール、ラクトスクロース、ラクツロース、ピロデキストリン、大豆オリゴ糖、トランスガラクトオリゴ糖、及びキシロオリゴ糖があるが、これらに限定されない。

他の特定の実施形態では、組成物は、アミノ酸を含むプレバイオティクスを含む。

ある実施形態では、１つ以上の有用な代謝産物の産生を増やすために、プレバイオティクスを含める。ある実施形態では、ビオラセインの産生を増やすために、トリプトファン及び／またはグリセロールを含める。

ある実施形態では、抗凍結剤としても機能するプレバイオティクスを加える。

本明細書に記載する組成物の投与量は「有効用量」と見なされ、このことは、プロバイオティクスまたはプレバイオティクス組成物を、所望の方法で、対象の生理機能を改変させるのに十分な量で投与することを示す。

好ましい実施形態は、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの増殖を改善するプレバイオティクス、例えば、Ｄ－マンニトール、Ｔｗｅｅｎ ２０、Ｔｗｅｅｎ ４０及びシチジンから選択するプレバイオティクスなどである。

好ましい実施形態は、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの機能を高めるプレバイオティクス、例えば、表１から選択したプレバイオティクスである。

より好ましい実施形態は、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの機能を高めるプレバイオティクス、例えば、以下の表で「＋」を付与したものから選択されるプレバイオティクスである。
（表１）ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの機能を高める成分

^＊１８時間の時点で、ネガティブコントロールよりも０．１ ＯＤ単位以上高める

製剤
本明細書では、一部の態様では、本明細書で開示するヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの少なくとも１つの株を含む組成物を提供し、当該組成物は、その必要がある対象に対する投与のために製剤される。一般的に、対象は、皮膚及び／または粘膜の局所病原微生物感染症に罹患しているヒトである。一部の実施形態では、組成物は、その必要がある対象に対する局所投与のために製剤される。一部の実施形態では、組成物は、対象の皮膚に対する局所投与のために製剤される。一部の実施形態では、組成物は、対象の頭皮に対する局所投与のために製剤される。一部の実施形態では、組成物は、粘膜表面に対して適用するために製剤される。一部の実施形態では、組成物は、経口投与のために製剤される。一部の実施形態では、組成物は、経皮投与のために製剤される。一部の実施形態では、組成物は、注射投与のために製剤される。ある特定の実施形態では、組成物は、ゲル、軟膏、ローション、エマルジョン、ペースト、クリーム、泡剤、ムース、液体、灌水、ガレージ、スプレー剤、懸濁液、分散液、鼻スプレー剤及びエアロゾルから選択する製剤である。ある特定の実施形態では、製剤は、皮膚に対する効果的な適用、被覆及び接着のための所望の形態及び所望の粘度、流動性またはその他の物理的または化学的特性を提供するための１つ以上の賦形剤を含む。

ある特定の実施形態では、本発明のヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍは、乾燥または脱水される。乾燥は、標準的な実施方法で達成することができ、凍結乾燥（ｌｙｏｐｈｉｌｉｚａｔｉｏｎ）、噴霧乾燥、または凍結乾燥（ｆｒｅｅｚｅ ｄｒｙｉｎｇ）などの方法から選択することができる。乾燥したヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを再水和すると、少なくとも２０％の生菌、少なくとも３０％、少なくとも５０％の生菌が生成される。

本明細書で開示する組成物は、室温で、少なくとも３０日間、少なくとも３０％生存可能な組成物である。少なくとも３０、６０、９０、１２０、１５０、１８０、または少なくとも３６０日間にわたって、少なくとも１％、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも５０％生存可能である組成物も開示する。

一部の実施形態では、組成物は、医薬組成物である。一部の実施形態では、組成物は、合成組成物である。一部の実施形態では、組成物は、化粧品組成物である。一部の実施形態では、組成物は、プロバイオティクス組成物である。

本明細書で開示する組成物は、保存期間、適用、皮膚浸透性、及び治療効果のいずれか１つ以上を改善するための１つ以上の賦形剤を含む製剤で提示し得る。一部の実施形態では、賦形剤は、保存期間、適用、皮膚浸透、及び治療効果のいずれか１つ以上を改善するために必要である。

本明細書で開示する組成物は、局所剤形であり得、当該局所剤形は、皮膚、爪甲、毛髪、及び／または粘膜などの表面に対する適用を容易にし得る。表面は、対象と接触する表面であり得る。

特定の実施形態では、本明細書に記載するＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍプロバイオティクス組成物は、経口摂取のために製剤される。経口摂取形態は、丸剤、錠剤、カプセル、ペースト、液体懸濁剤、コロイド、あるいはキャンディー、チューズ、ヨーグルト、ミルク、コテージチーズまたは非乳製品をベースとした代替物またはラクトース還元代替物などの様々な食品と混合したものであり得る。製剤は、食用組成物の風味、匂い、または食感を改善する、さらなる非活性成分を含み得る。製剤は、結合剤、カプセル化フィルム、または保存期間及び生物学的利用可能性を維持する賦形剤も含み得る。

エマルジョンは、第２の液体全体に小さな小球に分布した１つの液体の調製物として説明され得る。一部の実施形態では、分散液は不連続相であり、分散媒体は連続相である。油が分散液であり、水溶液が連続相であれば、それは水中油型エマルションとして知られており、水または水溶液が分散相であり、油または油性物質が連続相であるものは、油中水型エマルジョンとして知られている。油相は、少なくとも一部はＨＦＡ推進剤などの推進剤からなり得る。油相及び水相の一方または両方は、１つ以上の界面活性剤、乳化剤、乳化安定剤、緩衝剤、及びその他の賦形剤を含み得る。好ましい賦形剤として、界面活性剤、特に、非イオン性界面活性剤；乳化剤、特に、乳化ワックス；及び、液体の不揮発性非水性材料、特に、プロピレングリコールなどのグリコール類がある。油相は、医薬承認を受けた他の油性の賦形剤を含み得る。例えば、ヒドロキシル化ヒマシ油またはゴマ油などの材料を、界面活性剤または乳化剤として油相で使用し得る。

ローションは、低粘度から中粘度の液体製剤として説明され得る。ローションに、懸濁剤及び分散剤を使用することで、分散媒に溶解することができる微粉末物質を含むことができる。あるいは、ローションは、ビヒクルと非混和性であり、通常は、乳化剤または他の適切な安定剤によって分散される液体物質を分散相として利用することができる。ある実施形態では、ローションは、１００～１０００センチストークスの粘度を有するエマルジョンの形態である。ローションの流動性により、広範な表面積に向けて迅速かつ均一に適用することが可能となる。ローションは、一般的には、皮膚上で乾燥され、それにより、皮膚の表面に薬用成分の薄い皮膜が残存することが意図される。

クリームは、「水中油型」または「油中水型」のいずれかの粘性液体または半固体エマルジョンとして説明され得る。クリームは、乳化剤及び／またはその他の安定剤を含み得る。ある実施形態では、製剤は、１０００センチストークス超の粘度、一般的には、２０，０００～５０，０００センチストークスの範囲の粘度を有するクリームの形態である。クリームは、一般的に広げやすく、除去しやすいので、軟膏よりも好まれることが多い。

クリームとローションの基本的な違いは粘度であり、粘度は、製剤の調製のために使用する様々な油の量／使用と、水の割合に依存する。クリームは、一般的に、ローションよりも濃厚で、様々な用途があり得、皮膚に対する所望の効果に応じて、より多様な油／バターを使用することがよくある。クリーム製剤では、水性のものの割合は全体の約６０～７５％であり、油性のものの割合は全体の約２０～３０％であり、その他の割合は、乳化剤、防腐剤、添加剤であり、合計で１００％となる。

軟膏は、軟膏基剤と、本開示の任意の１つ以上の活性剤を含む半固体調製物として説明され得る。適切な軟膏基剤の例として、炭化水素基剤（例えば、ワセリン、白色ワセリン、黄色軟膏、及び鉱油）、吸収性基剤（親水性ｃ、無水ラノリン、ラノリン、及びコールドクリーム）、水で除去可能な基剤（例えば、親水性軟膏）、及び水溶性基剤（例えば、ポリエチレングリコール軟膏）がある。ペーストは、一般的には、固形物の割合が高いという点で軟膏とは異なる。ペーストは、一般的には、同じ成分で調製した軟膏よりも吸収性が強く、べたつかない。

ゲルは、液体ビヒクルにおいて小分子または大分子の分散液を含む半固体系として説明され得、液体ビヒクルに溶解または懸濁した増粘剤またはポリマー材料の作用を受けて半固体になる。液体は、親油性成分、水性成分、またはその両方を含み得る。一部のエマルジョンは、ゲルであるか、さもなければ、ゲル成分を含み得る。しかしながら、一部のゲルは、非混和性成分を均質化した混合物を含んでいないので、エマルジョンではない。適切なゲル化剤として、ヒドロキシプロピルセルロース及びヒドロキシエチルセルロースなどの修飾セルロース；カルボポールホモポリマー及びコポリマー；及びそれらの組み合わせがあるが、これらに限定されない。液体ビヒクルでの適切な溶媒として、ジグリコールモノエチルエーテル；プロピレングリコールなどのアルケングリコール類；ジメチルイソソルビド；イソプロピルアルコールやエタノールなどのアルコール類などがあるが、これらに限定されない。溶媒は、一般的に、薬物を溶解する能力に関して選択される。製剤の皮膚感触及び／または皮膚軟化性を改善するその他の添加剤も組み込まれ得る。そのような添加剤の例として、ミリスチン酸イソプロピル、酢酸エチル、Ｃ１２－Ｃ１５アルキル安息香酸塩、鉱油、スクアラン、シクロメチコン、カプリ／カプリルトリグリセリド、及びそれらの組み合わせがあるが、これらに限定されない。

泡剤は、ガス状推進剤と組み合わせたエマルジョンとして説明され得る。ガス状推進剤は、主に、ハイドロフルオロアルカン（ＨＦＡ）からなる。適切な推進剤として、１，１，１，２－テトラフルオロエタン（ＨＦＡ１３４ａ）、及び１，１，１，２，３，３，３－ヘプタフルオロプロパン（ＨＦＡ２２７）などのＨＦＡがあるが、これらと、医療用途で承認されているか承認され得る他のＨＦＡの混合物及び混和物は適切なものである。推進剤は、好ましくは、噴霧している間に可燃性または爆発性の蒸気を生成し得る炭化水素推進剤ガスではない。さらに、組成物は、好ましくは、使用している間に可燃性または爆発性の蒸気を生成する揮発性アルコールを含まない。

皮膚軟化剤は、皮膚を軟化または状態を和らげる外用剤として説明され得、また一般に当該技術分野で公知であり、“Ｈａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｅｘｃｉｐｉｅｎｔｓ”，４ｔｈ Ｅｄ．，Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｐｒｅｓｓ，２００３などの概要に記載がされている。ある特定の実施形態では、皮膚軟化剤は、アーモンド油、ヒマシ油、セラトニア抽出物、セトステアロイルアルコール、セチルアルコール、セチルエステルワックス、コレステロール、綿実油、シクロメチコン、ステアリン酸エチレングリコールパルミト、グリセリン、モノステアリン酸グリセリン、モノオレイン酸グリセリル、ミリスチン酸イソプロピル、パルミチン酸イソプロピル、ラノリン、レシチン、軽質鉱油、中鎖トリグリセリド、鉱油及びラノリンアルコール、ワセリン、ワセリン及びラノリンアルコール、大豆油、デンプン、ステアリルアルコール、ヒマワリ油、キシリトール及びそれらの組み合わせである。ある実施形態では、皮膚軟化剤は、ステアリン酸エチルヘキシル及びパルミチン酸エチルヘキシルである。

界面活性物質とは、表面張力を低下させ、それにより、生成物の乳化性、発泡性、分散性、拡散性、及び湿潤性を高める界面活性剤である。ある特定の実施形態では、適切な非イオン性界面活性剤として、乳化ワックス、モノオレイン酸グリセリル、ポリオキシエチレンアルキルエーテル、ポリオキシエチレンヒマシ油誘導体、ポリソルベート、ソルビタンエステル、ベンジルアルコール、安息香酸ベンジル、シクロデキストリン、モノステアリン酸グリセリン、ポロキサマー、ポビドン及びそれらの組み合わせがある。ある実施形態では、非イオン性界面活性剤は、ステアリルアルコールである。

乳化剤は、ある液体が、別の液体において懸濁することを促して、油と水の安定した混合物またはエマルジョンを形成させる表面活性物質である。ある特定の実施形態では、乳化剤は、金属石鹸、ある特定の動物油及び植物油、ならびに様々な極性化合物である。適切な乳化剤として、アカシア、陰イオン乳化ワックス、ステアリン酸カルシウム、カルボマー、セトステアリルアルコール、セチルアルコール、コレステロール、ジエタノールアミン、パルミトステアリン酸エチレングリコール、モノステアリン酸グリセリン、モノオレイン酸グリセリル、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒプロメロース、含水ラノリン、ラノリンアルコール、レシチン、中鎖トリグリセリド、メチルセルロース、鉱油およびラノリンアルコール、一塩基性リン酸ナトリウム、モノエタノーアミン、非イオン性乳化ワックス、オレイン酸、ポロキサマー、ポロキサマー類、ポリオキシエチレンアルキルエーテル、ポリオキシエチレンヒマシ油誘導体、ポリオキシエチレンソルビタン脂肪酸エステル、ステアリン酸ポリオキシエチレン、アルギン酸プロピレングリコール、自己乳化性モノステアリン酸グリセリル、クエン酸ナトリウム二水和物、ラウリル硫酸ナトリウム、ソルビタンエステル、ステアリン酸、ヒマワリ油、トラガカント、トリエタノールアミン、キサンタンガム及びそれらの組み合わせがある。ある実施形態では、乳化剤は、ステアリン酸グリセロールである。ある実施形態では、乳化剤は、グリセロールである。ある実施形態では、乳化剤は、グリセリンである。

一部の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、対象の頭皮に対する適用に向けて製剤される。一部の実施形態では、組成物は、シャンプー、コンディショナー、ムース、ゲル、及びスプレーから選択する製品での使用に向けて製剤される。そのような組成物は、脂漏性皮膚炎の治療に有用である。そのような組成物を用いた脂漏性皮膚炎の治療は、フケ及び乳痂から選択する症状を軽減し得る。しかしながら、本明細書で開示する組成物は、頭皮以外の身体の他の領域での脂漏性皮膚炎を治療するために使用し得る。他の領域の例として、胸、胃、皮膚の皺、腕、脚、鼠径部、及び胸の下があるが、これらに限定されない。

一部の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、緩衝剤を含んでおり、当該緩衝剤は、組成物のｐＨを制御する。好ましくは、緩衝剤は、組成物を、約４のｐＨ～約７．５のｐＨ、約４のｐＨ～約７のｐＨ、及び約５のｐＨ～約７のｐＨに維持する。

一部の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、所望の皮膚ｐＨを提供する、または維持するように製剤される。一部の実施形態では、所望の皮膚ｐＨは、約４．５～約６．５である。一部の実施形態では、所望の皮膚ｐＨは、約５～約６である。一部の実施形態では、所望の皮膚ｐＨは、約５．５である。一部の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、皮膚ｐＨ調節剤と一緒に製剤される。ｐＨ調節剤の例として、サリチル酸、グリコール酸、トリクロロ酢酸、アゼイル酸、乳酸、アスパラギン酸、塩酸塩、ステアリン酸、ステアリン酸グリセリル、パルミチン酸セチル、リン酸尿素、及び酢酸トコフェリルがあるが、これらに限定されない。

一部の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、より多くの酸素を皮膚に提供するように製剤される。一部の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、より多くの酸素を皮膚に曝露するように製剤される。一部の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、より多くの酸素を皮膚に拡散するように製剤される。一部の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、より多くの酸素が皮膚を通して拡散するように製剤される。一部の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、より多くの酸素を皮膚に提供する医薬と一緒に製剤される。一部の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、より多くの酸素を皮膚に提供する医薬と一緒に使用される。一部の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、より多くの酸素を皮膚に提供する医薬を使用する前に使用される。一部の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、より多くの酸素を皮膚に提供する医薬を使用した後に使用される。皮膚に酸素を供給する医薬の例として、クロロフィルがあるが、これに限定されない。

防腐剤を真菌や微生物の増殖を防ぐために使用することができる。適切な抗真菌剤及び抗菌剤として、安息香酸、ブチルパラベン、エチルパラベン、メチルパラベン、プロピルパラベン、安息香酸ナトリウム、プロピオン酸ナトリウム、塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム、ベンジルアルコール、塩化セチルピリジニウム、クロロブタノール、フェノール、フェニルエチルアルコール、及びチメロサールがあるが、これらに限定されない。ある実施形態では、真菌の増殖を予防する上で有効な防腐剤の濃度は、局所適用時に意図した組成物の目的に対する、当該組成物の有効性に影響を与えないように選択される。

製剤での賦形剤は、意図する製剤のタイプに基づいて選択される。ある特定の実施形態では、賦形剤として、ゼラチン、カゼイン、レシチン、アカシアガム、コレステロール、トラガカント、ステアリン酸、塩化ベンザルコニウム、ステアリン酸カルシウム、モノステアリン酸グリセリル、セトステアリルアルコール、セトマクロゴール乳化ワックス、ソルビタンエステル、ポリオキシエチレンアルキルエーテル、ポリオキシエチレンヒマシ油誘導体、ポリオキシエチレンソルビタン脂肪酸エステル、ポリエチレングリコール、ステアリン酸ポリオキシエチレン、コロイド状二酸化ケイ素、リン酸塩、ドデシル硫酸ナトリウム、カルボキシメチルセルロースカルシウム、カルボキシメチルセルロースナトリウム、メチルセルロース、ヒドロキシエチルセルロース、ヒドロキシプロピルセルロース、フタル酸ヒドロキシプロピルメチルセルロース、非結晶性セルロース、ケイ酸アルミニウムマグネシウム、トリエタノールアミン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、糖類、及びデンプンがある。

一部の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、グリセロールと一緒に製剤される。一部の事例では、組成物での細菌株がグリセロールを発酵させ、それにより、短鎖脂肪酸を生成する。短鎖脂肪酸の例として、酢酸、乳酸、及びプロピオン酸があるが、これらに限定されない。一部の事例では、グリセロールの存在下で増殖したヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍは、ビオラセインまたは１つ以上の抗菌代謝産物の生成を促す。

浸透促進剤は、皮膚全体、特に角膜層全体への医薬の経皮送達を促すために頻繁に使用されている。一部の浸透促進剤は、皮膚刺激、皮膚毒性、皮膚アレルギーを引き起こす。しかしながら、一般的に広く使用されている浸透促進剤として、尿素、（カルボニルジアミド）、イミド尿素、Ｎ、Ｎ－ジエチルホルムアミド、Ｎ－メチル－２－ピロリジン、１－ドデカル－アザシクロフェプタン－２－オン、チオグリン酸カルシウム、２－ピロリジン、Ｎ、Ｎ－ジエチル－ｍ－トルアミド、オレイン酸と、オレイン酸メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、ビニル及びグリセリルなどのそのエステル誘導体、ソルビタンエステル、例えば、モノラウリン酸ソルビタン、及びモノオレイン酸ソルビタンなど、その他の脂肪酸エステル、例えば、ラウリン酸イソプロピル、ミリスチン酸イソプロピル、パルミチン酸イソプロピル、アジピン酸ジイソプロピル、モノラウリン酸プロピレングリコール、モノオレイン酸プロピレングリコールなど、及び非イオン性洗浄剤、例えば、ＢＲＩＪ（登録商標）７６（ステアリルポリ（１０）オキシエチレンエーテル）、ＢＲＩＪ（登録商標）７８（ステアリルポリ（２０）オキシエチレンエーテル）、ＢＲＩＪ（登録商標）９６（オレイルポリ（１０）オキシエチレンエーテル）、及びＢＲＩＪ（登録商標）７２１（ステアリルポリ（２１）オキシエチレンエーテル）（ＩＣＩ Ａｍｅｒｉｃａｓ Ｉｎｃ．Ｃｏｒｐ．）などがある。

組成物は、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍプロバイオティクス組成物を特定の濃度で含むように製剤することができる。例えば、組成物は、微生物を有効量で送達し得る量のプロバイオティクスを含むことができる。ある特定の実施形態では、送達するプロバイオティクスの量は、少なくとも１×１０^∧３、１×１０^∧４、１×１０^∧５、１×１０^∧６、１×１０^∧７、１×１０^∧８、１×１０^∧９、１×１０^∧１０ ＣＦＵ／単位用量である。組成物は、組成物の総重量に対して、少なくとも約０．０００１重量％（乾燥重量で表している）、約０．０００１重量％～約９９重量％、約０．００１重量％～約９０重量％、約０．０１重量％～約８０重量％、及び約０．１重量％～約７０重量％の割合でＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍプロバイオティクスを使用して製剤され得る。一般的に、局所投与を意図した組成物は、少なくとも１×１０^∧３、１×１０^∧４、１×１０^∧５、１×１０^∧６、１×１０^∧７、１×１０^∧８、１×１０^∧９、１×１０^∧１０個の微生物／担体のグラム数、または不活性微生物または死滅微生物、または細菌画分、または生成した代謝産物について計算した同等の用量で微生物を含む。

本明細書で開示する微生物は、単位用量あたり、少なくとも約１×１０^∧２ ＣＦＵ～約１×１０^∧２０ ＣＦＵの有効量で送達し得る。局所投与する必要がある特定の事例の組成物では、それぞれの細菌株の濃度及び／または対応する画分及び／または代謝産物を、約１×１０^∧５～約１×１０^∧１２ ＣＦＵ／用量の範囲の用量（細菌等価物として表している）に対応するように調整することができる。

本明細書で開示する局所適用のための組成物は、一般的には、約１×１０^∧２～約１×１０^∧１５ ＣＦＵ／ｇ、約１×１０^∧５～約１×１０^∧１２ ＣＦＵ／ｇ、または約１×１０^∧６～約１０ｃ１０^∧１２ ＣＦＵ／ｇの細菌を含む。

ある特定の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、皮膚の平方ｃｍあたり少なくとも１０^∧６個の微生物を送達するように製剤される。ある特定の実施形態では、組成物は、皮膚の平方ｃｍあたり少なくとも１０^∧７個の微生物を送達するように製剤される。ある特定の実施形態では、組成物は、皮膚の平方ｃｍあたり少なくとも１０^∧８個の微生物を送達するように製剤される。ある特定の実施形態では、組成物は、皮膚の平方ｃｍあたり少なくとも１０^∧９個の微生物を送達するように製剤される。ある特定の実施形態では、組成物は、皮膚の平方ｃｍあたり１０^∧９個未満の微生物を送達するように製剤される。ある特定の実施形態では、組成物は、皮膚の平方ｃｍあたり１０^∧８個未満の微生物を送達するように製剤される。ある特定の実施形態では、組成物は、皮膚の平方ｃｍあたり１０^∧７個未満の微生物を送達するように製剤される。ある特定の実施形態では、組成物は、皮膚の平方ｃｍあたり約１０^∧７～１０^∧８個の微生物を送達するように製剤される。ある特定の実施形態では、組成物は、皮膚の平方ｃｍあたり約１０^∧６個と、皮膚の平方ｃｍあたり約１０^∧１０個との間の個数の微生物を送達するように製剤される。ある特定の実施形態では、組成物は、皮膚の平方ｃｍあたり約１０^∧６個と、皮膚の平方ｃｍあたり約１０^∧９個との間の個数の微生物を送達するように製剤される。ある特定の実施形態では、組成物は、皮膚の平方ｃｍあたり約１０^∧７個と、皮膚の平方ｃｍあたり約１０^∧１０個との間の個数の微生物を送達するように製剤される。ある特定の実施形態では、組成物は、皮膚の平方ｃｍあたり約１０^∧７個と、皮膚の平方ｃｍあたり約１０^∧９個との間の個数の微生物を送達するように製剤される。

ある特定の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、約１０^∧５個の微生物／ミリリットル～約１０^∧１２個の微生物／ミリリットルの濃度で製剤される。ある特定の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、１０^∧６個の微生物／ミリリットルの濃度で製剤される。ある特定の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、１０^∧７個の微生物／ミリリットルの濃度で製剤される。ある特定の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、１０^∧８個の微生物／ミリリットルの濃度で製剤される。ある特定の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、１０^∧９個の微生物／ミリリットルの濃度で製剤される。ある特定の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、１０^∧１０個の微生物／ミリリットルの濃度で製剤される。

特定の実施形態では、本明細書で開示する局所または経口使用のための組成物は、生物学的安定性化合物を含み、同化合物として、トレハロース、マンノース、フルクトース、グルコース、スクロース、ラクトース、ラフィノース、スタキオース、メレジトース、デキストラン、及び糖アルコールなどの炭水化物；及び／またはグリセロール、ウシ血清不含培地（例えば、トリプシン大豆培養液）、ホエータンパク質、ＮａＣｌ、リン酸緩衝剤、ＭｇＣｌ_２、凍結乾燥細菌、またはその他の不活性／死滅細菌などの凍結保存剤があるが、これらに限定されない。

製剤した後に、本明細書で開示する組成物は、利用者が送達及び使用する上で好適な方法でパッケージングされ得る。ある実施形態では、組成物を、適切なディスペンサーに入れ、利用者に向けて出荷する。最終容器の例として、ポンプボトル、スクイズボトル、ジャー、チューブ、カプセル、またはバイアルがある。

一部の実施形態では、本明細書で開示する組成物を、パッケージングの前にアプリケーターに加えることができる。アプリケーターの例として、綿パッド、ポリエステルパッド、Ｑ－チップ、スポンジ、及びブラシがあるが、これらに限定されない。一部の実施形態では、アプリケーターを、パッケージに入れ込む。パッケージの例として、袋及び金属箔またはワックスで裏打ちした紙製パケットがあるが、これらに限定されない。パッケージの内部を無菌とし得る。一部の実施形態では、パッケージ内の空気を、密封する前に真空で除去する。一部の実施形態では、パッケージを熱融着する。一部の実施形態では、パッケージを接着剤で密封する。

別の実施形態では、本明細書で開示する組成物は、皮膚に適用する前に再構成するために、凍結乾燥（ｌｙｏｐｈｉｌｉｚｅｄ）、凍結乾燥（ｆｒｅｅｚｅ ｄｒｉｅｄ）、または噴霧乾燥して脱水または乾燥される。ある実施形態では、１つ以上の賦形剤、例えば、グリセロールまたはその他の糖アルコールなどを使用して、凍結乾燥（ｌｙｏｐｈｉｌｉｚａｔｉｏｎ）、凍結乾燥（ｆｒｅｅｚｅ ｄｒｙｉｎｇ）、または噴霧乾燥を行って、選択した、形質転換した、または遺伝子操作した細菌の寿命を改善する。ある実施形態では、製剤組成物は、トレハロース（α－Ｄ－グルコピラノシル－１，１－α－Ｄ－グルコピラノシド）を含まない。一部の実施形態では、組成物を凍結させる必要はない。

本明細書で開示する組成物は、１つ以上の容器にパッケージングされ得る。例えば、単一のボトル、チューブ、容器、またはカプセルを、２つの等しい部分、または、２つの等しくない部分に分割して、一方の部分が、それらのパックされる形態（乾燥、凍結乾燥（ｆｒｅｅｚｅ ｄｒｉｅｄ）など）で細菌を含み、他方の部分が、液体またはゲルとすることが可能な活性化材料を含み得る。単一のボトルまたは容器を、利用者が容器に対して単一の力を加えることで、２つの容器部分の内容物の全部または一部を分注でき、選択した、形質転換した、または遺伝子操作した細菌、及び活性化材料を、皮膚またはその他の表面に分注するようにデザインすることができる。キットは、２つ以上の容器を含み、一方の容器には、選択した、形質転換した、または遺伝子操作した細菌の集団（複数可）が入れられており、かつ他方には、選択した、形質転換した、または遺伝子操作した細菌の集団と混合するための製剤を入れておく形態にもし得る。別の事例では、２つ以上の容器は、選択した、形質転換した、または遺伝子操作した細菌の集団が入れられている一方の容器、選択していない、形質転換していない、または遺伝子操作していない天然の非病原性皮膚細菌が入れられている他方の容器、及び、選択した、形質転換した、または遺伝子操作した細菌の集団と混合するための製剤が入れられている第３の容器を含む。別の事例では、単一のボトルを構成する２つ以上の容器は、２つの別個のチューブに接続した１つのポンプを有しており、それぞれのチューブが、異なるチャンバーの排液を行う。キットは、石鹸、ボディウォッシュ、またはローション、ある特定のｐＨの保湿ローション、またはクリームなど、１つ以上の補足品も含み得る。別の実施形態では、補足品は、プロバイオティクスである。補足品は、元の産物の活性のために有用であり、かつ持続的効果のためにその活性を高める化合物を含み得る。別に企図されるパッケージングは、選択した、形質転換した、または遺伝子操作した細菌の集団を、細菌の活性化を許容する包帯／フィルムの第２の層と組み合わせる包帯またはフィルム上の層として維持し、任意に、繁殖／増殖要因も制限し得るパッケージングである。別の実施形態では、細菌の活性状態を保ったままで、最終産物を冷蔵保存する。別の実施形態では、細菌を、水溶性セルロースの小さなビーズに保存する。ビーズは、日焼け止め、保湿剤、ボディウォッシュ、石鹸など、任意の溶液において混合することができる。

本明細書では、水性製剤中にヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを含む、局所適用のためのＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍプロバイオティクス組成物を開示する。一部の実施形態では、プロバイオティクス組成物を、皮膚に適用するために製剤する。一部の実施形態では、プロバイオティクス組成物を、粘膜に適用するために製剤する。

一部の実施形態では、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍプロバイオティクス組成物は、１つ以上のさらなる活性剤と一緒に製剤される。プロバイオティクス組成物は、組み合わせについての記載欄で詳述している通り、１つ以上のさらなる抗菌剤と一緒に製剤することができる。簡潔に説明すると、さらなる抗菌剤は、抗真菌剤、抗菌剤、抗寄生虫剤、またはこれらの薬剤のいずれかの組み合わせであることができる。

一部の実施形態では、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍプロバイオティクス組成物は、掻痒感、疼痛、変色またはその他の望ましくない効果を抑制する薬剤など、さらなる効能をもたらす１つ以上のさらなる活性薬剤と一緒に製剤される。

一部の実施形態では、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍプロバイオティクス組成物は、さらなる微生物をさらに含む。一部の実施形態では、組成物は、少なくとも２つ、３つ、または４つの別個のヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを含み、少なくとも１つは、ヒト宿主に由来する。一部の実施形態では、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍプロバイオティクスは、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ種またはＬａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ種をさらに含む。一部の実施形態では、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍプロバイオティクスは、ヒトの皮膚でよく認められる良性または有益である真菌株、またはＰｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍの良性株または有用株をさらに含む。

一部の実施形態では、本発明によるエマルジョン組成物の形態のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ化粧品組成物が、特に効果的である。この事例では、エマルジョンは、水中油型エマルジョン、油中水型エマルジョン、水中油中水型エマルジョン、または油中水中油型エマルジョンの形態とし得る。あるいは、本発明の化粧品組成物は、非水性組成物の形態でも使用し得る。非水性組成物の形態の例は、固体、半固体、圧縮体、ムース、粉末及び棒状の形態である。本発明では、「非水性組成物」は、水を配合していない組成物のことを指す。

本発明のヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ組成物は、併用療法モードにおいて、抗菌剤、プロバイオティクス、ポストバイオティクス、及びプレバイオティクスなどのその他の医薬と一緒に投与することができる。投与は、数時間または数日の期間にわたって順次に、または同時に行うことができる。

ある実施形態では、細菌組成物は、抗菌剤、抗真菌剤、抗ウイルス剤及び抗寄生虫剤を含む１つ以上の抗微生物剤ともに併用療法に含められる。

抗菌剤として、セファロスポリン系抗生物質（セファレキシン、セフロキシム、セファドロキシル、セファゾリン、セファロチン、セファクロル、セファマンドール、セフォキシチン、セフプロジル、及びセフトビプロール）；フルオロキノロン系抗生物質（シプロ、Ｌｅｖａｑｕｉｎ、フロキシン、テキン、アベロックス、及びノルフロキサシン）；テトラサイクリン系抗生物質（テトラサイクリン、ミノサイクリン、オキシテトラサイクリン、及びドキシサイクリン）；ペニシリン系抗生物質（アモキシシリン、アンピシリン、ペニシリンＶ、ジクロキサシリン、カルベニシリン、バンコマイシン、及びメチシリン）；及びカルバペネム系抗生物質（エルタペネム、ドリペネム、イミペネム／シラスタチン、及びメロペネム）を含むことができる。

抗ウイルス剤として、Ａｂａｃａｖｉｒ、Ａｃｙｃｌｏｖｉｒ、Ａｄｅｆｏｖｉｒ、Ａｍｐｒｅｎａｖｉｒ、Ａｔａｚａｎａｖｉｒ、Ｃｉｄｏｆｏｖｉｒ、Ｄａｒｕｎａｖｉｒ、Ｄｅｌａｖｉｒｄｉｎｅ、Ｄｉｄａｎｏｓｉｎｅ、Ｄｏｃｏｓａｎｏｌ、Ｅｆａｖｉｒｅｎｚ、Ｅｌｖｉｔｅｇｒａｖｉｒ、Ｅｍｔｒｉｃｉｔａｂｉｎｅ、Ｅｎｆｕｖｉｒｔｉｄｅ、Ｅｔｒａｖｉｒｉｎｅ、Ｆａｍｃｉｃｌｏｖｉｒ、Ｆｏｓｃａｒｎｅｔ、Ｆｏｍｉｖｉｒｓｅｎ、Ｇａｎｃｉｃｌｏｖｉｒ、Ｉｎｄｉｎａｖｉｒ、Ｉｄｏｘｕｒｉｄｉｎｅ、Ｌａｍｉｖｕｄｉｎｅ、Ｌｏｐｉｎａｖｉｒ Ｍａｒａｖｉｒｏｃ、ＭＫ－２０４８、Ｎｅｌｆｉｎａｖｉｒ、Ｎｅｖｉｒａｐｉｎｅ、Ｐｅｎｃｉｃｌｏｖｉｒ、Ｒａｌｔｅｇｒａｖｉｒ、Ｒｉｌｐｉｖｉｒｉｎｅ、Ｒｉｔｏｎａｖｉｒ、Ｓａｑｕｉｎａｖｉｒ、Ｓｔａｖｕｄｉｎｅ、Ｔｅｎｏｆｏｖｉｒ Ｔｒｉｆｌｕｒｉｄｉｎｅ、Ｖａｌａｃｉｃｌｏｖｉｒ、Ｖａｌｇａｎｃｉｃｌｏｖｉｒ、Ｖｉｄａｒａｂｉｎｅ、Ｉｂａｃｉｔａｂｉｎｅ、Ａｍａｎｔａｄｉｎｅ、Ｏｓｅｌｔａｍｉｖｉｒ、Ｒｉｍａｎｔｉｄｉｎｅ、Ｔｉｐｒａｎａｖｉｒ、Ｚａｌｃｉｔａｂｉｎｅ、Ｚａｎａｍｉｖｉｒ及びＺｉｄｏｖｕｄｉｎｅを含むことができる。

抗真菌化合物の例として、ナタマイシン、リモシジン、フィリピン、ナイスタチン、アムホテリシンＢ、カンジシン、及びハマイシンなどのポリエン系抗真菌剤；ミコナゾール、ケトコナゾール、クロトリマゾール、エコナゾール、オモコナゾール、ビホナゾール、ブトコナゾール、フェンチコナゾール、イソコナゾール、オキシコナゾール、セルタコナゾール、スルコナゾール、及びチオコナゾールなどのイミダゾール系抗真菌剤；フルコナゾール、イトラコナゾール、イサブコナゾール、ラブコナゾール、ポサコナゾール、ボリコナゾール、テルコナゾール、及びアルバコナゾールなどのトリアゾール系抗真菌剤；アバファンギンなどのチアゾール系抗真菌剤；テルビナフメ、ナフチフメ、ブテナフメなどのアリルアミン系抗真菌剤；及びアニデュラファンギン、カスポファンギン、ミカファンギンなどのエキノカンジン系抗真菌剤があるが、これらに限定されない。抗真菌特性を有するその他の化合物として、ポリゴジアル、安息香酸、シクロピロックス、トルナフタート、ウンデシレン酸、フルシトシンまたは５－フルオロシトシン、グリセオフルビン、及びハロプロギンがあるが、これらに限定されない。

ある実施形態では、細菌組成物は、１つ以上のコルチコステロイド、メサラジン、メサラミン、スルファサラジン、スルファサラジン誘導体、免疫抑制薬、シクロスポリンＡ、メルカプトプリン、アザチオプリン、プレドニゾン、メトトレキサート、抗ヒスタミン薬、グルココルチコイド、エピネフリン、セオフィリン、クロモリンナトリウム、抗ロイコトリエン薬、鼻炎用抗コリン作動剤、抗コリン作動性充血除去剤、肥満細胞安定剤、モノクローナル抗ＩｇＥ抗体、ワクチン、及びそれらの組み合わせとともに併用療法に含められる。

本明細書に記載する方法及び組成物は、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ ｌｉｖｉｄｕｍが産生する代謝産物に感受性を示す寄生微生物の増殖に起因する感染症を治療及び／または予防するために使用することができる。これらの微生物は、細菌、ウイルス、酵母、または真菌であることがことができる。

ある実施形態では、感染症は、爪真菌症である。ある実施形態では、感染症は、足白癬である。ある実施形態では、感染症は、アトピー性皮膚炎である。ある実施形態では、感染症は、膿痂疹である。ある実施形態では、感染症は、皮膚または軟組織のものである。

ある実施形態では、感染症は、皮膚糸状菌に起因するものである。ある実施形態では、感染症は、Ｍａｌａｓｓｅｚｉａ種に起因するものである。ある実施形態では、感染症は、Ｔｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ種に起因するものである。ある実施形態では、感染症は、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ種に起因するものである。ある実施形態では、感染症は、Ｔｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ ｒｕｂｒｕｍに起因するものである。ある実施形態では、感染症は、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓに起因するものである。ある実施形態では、感染症は、グラム陽性菌に起因するものである。

本発明の組成物を投与する前に、対象または患者が、任意に、細菌組成物の投与を受けるために皮膚を処置するための前処理プロトコルを設け得る。ある特定の実施形態では、非常に強力な病原体による急性感染症に患者が罹患している場合などでは、前処理プロトコルが推奨される。他の実施形態では、感染を引き起こす病原体がさほど強力でない場合、または治療には成功したが、感染が再発し得ると医師が懸念を示す急性感染に患者が罹患している場合などでは、前処理プロトコルは完全に任意である。これらの事例では、前処理プロトコルは、患者の微生物叢に細菌組成物が影響を及ぼす能力を高め得る。

微生物生態系の投与に向けて患者の準備を整える方法の１つとして、少なくとも１つの抗生物質または抗真菌剤を投与することができ、これにより、患者の微生物を改変し得る。これは、経口または局所的に適用し得る。

感染症の治療のために患者に抗生物質が投与されてる場合、または特定の前処理プロトコルの一部として患者に抗生物質を投与されている場合、ある実施形態では、細菌組成物を投与する前に、皮膚での抗生物質の濃度を実質的に下げるのに十分な時間の間は、抗生物質を停止する。ある実施形態では、抗生物質は、細菌組成物を投与する１、２、または３日前に中止し得る。ある実施形態では、抗生物質は、細菌組成物を投与する３、４、５、６、または７抗生物質半減期前に中止し得る。別の実施形態では、抗生物質として、細菌組成物の成分が、皮膚における抗生物質の濃度よりも高いＭＩＣ５０を示すものを選択し得る。

細菌組成物または組成物の要素のＭＩＣ５０は、当該技術分野で周知の方法によって決定することができる（Ｒｅｌｌｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ Ｓｕｓｃｅｐｔｉｂｉｌｉｔｙ Ｔｅｓｔｉｎｇ： Ａ Ｒｅｖｉｅｗ ｏｆ Ｇｅｎｅｒａｌ Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ａｎｄ Ｃｏｎｔｅｍｐｏｒａｒｙ Ｐｒａｃｔｉｃｅｓ，Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｉｎｆｅｃｔｉｏｕｓ Ｄｉｓｅａｓｅｓ ４９（１１）：１７４９－１７５５ （２００９））。そのような実施形態では、抗生物質の投与と細菌組成物の投与との間に追加の時間を設ける必要はない。前処理プロトコルが急性感染症の治療の一部である場合、感染症が抗生物質に感受性を示すが、細菌組成物での成分が抗生物質に感受性を示さない抗生物質を選択し得る。

一部の実施形態では、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍプロバイオティクス組成物を適用する前に、対象の皮膚を洗剤物質で前処理して、皮膚病原体の量を減らす。

一部の実施形態では、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍプロバイオティクスは、有用な代謝産物の産生を増加させる物質で前処理する。一部の実施形態では、プロバイオティクスを、プレバイオティクスの存在下でインキュベーションして、グリセロールまたはトリプトファンなどのビオラセインの産生を増加させる。

製造方法
医薬組成物、製造物、及び組成物を含む食品または家庭用製品など、本明細書に記載する組成物のいずれもが、任意の形態、例えば、溶液または懸濁液などの水性形態、粉末形態または凍結乾燥形態で半固体形態に埋設させた細菌株を含み得る。一部の実施形態では、組成物または細菌株の組成物が凍結乾燥される。一部の実施形態では、細菌株の組成物の一部が凍結乾燥される。組成物、特に細菌を含む組成物を凍結乾燥する方法は、当該技術分野で周知である。例えば、参照により、それらの全内容を本明細書で援用する、米国特許第３，２６１，７６１、４，２０５，１３２、ＰＣＴ公開公報ＷＯ２０１４／０２９５７８及びＷＯ２０１２／０９８３５８を参照されたい。細菌は、組み合わせて凍結乾燥し得る、及び／または細菌は、別々に凍結乾燥し、投与前に組み合わせられ得る。細菌株は、その他の細菌株と組み合わせる前に医薬賦形剤と組み合わせ得る、または複数の凍結乾燥細菌を、凍結乾燥形態の間に組み合わせておき、一旦組み合わせて得た細菌の混合物は、続けて、医薬賦形剤と組み合わせられ得る。一部の実施形態では、細菌株を、凍結乾燥固形物とする。一部の実施形態では、１つ以上の細菌株を含む組成物は、凍結乾燥固形物である。

細菌株の組成物は、当該技術分野で周知の発酵技術を使用して製造することができる。一部の実施形態では、有効成分は、嫌気性細菌種の急速な増殖を促すことができる嫌気性発酵槽を使用して製造される。嫌気性発酵槽は、例えば、撹拌槽型反応器またはディスポーザブルウェーブバイオリアクターであり得る。ＢＬ培地やＥＧ培地などの培地、または動物成分を含んでいないこれらの培地の同様のバージョンを使用して、細菌種の増殖を促すことができる。細菌産物は、遠心分離及び濾過などの従来の技術によって、発酵培地から精製及び濃縮することができ、また、任意に、当該技術分野で周知の技術によって乾燥及び凍結乾燥することができる。

一部の実施形態では、細菌株の組成物は、医薬組成物として投与するために製剤され得る。本明細書で使用する「医薬組成物」という用語は、少なくとも１つの有効成分、例えば、本明細書に記載する２つ以上のあらゆる精製細菌株などと、１つ以上の医薬として許容可能な賦形剤を含み得る１つ以上の不活性成分とを、混合して、または組み合わせて得る生産物のことを意味する。

「許容可能な」賦形剤とは、有効成分に対して適合性を示さなければならず、かつ投与を受ける対象に有害でない賦形剤のことを指す。一部の実施形態では、医薬として許容可能な賦形剤は、組成物の意図した投与経路に基づいて選択され、例えば、経口または経鼻投与のための組成物は、直腸投与のための組成物とは異なる医薬として許容可能な賦形剤を含み得る。賦形剤の例として、滅菌水、生理食塩水、溶媒、基材、乳化剤、懸濁化剤、界面活性剤、安定剤、香味剤、芳香剤、賦形剤、ビヒクル、防腐剤、結合剤、希釈剤、等張性調整剤、鎮静剤、増量剤、崩壊剤、緩衝剤、コーティング剤、滑沢剤、着色剤、甘味剤、増粘剤、及び可溶化剤がある。

本発明の医薬組成物は、当該技術分野で周知であり、かつ日常的に利用される方法に従って調製することができる（例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ： Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙ，Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏ．２０ｔｈ ｅｄ．２０００を参照されたい）。本明細書に記載する医薬組成物は、凍結乾燥製剤または水溶液の形態の任意の担体または安定剤をさらに含み得る。許容可能な賦形剤、担体、または安定剤として、例えば、緩衝剤、抗酸化剤、防腐剤、ポリマー、キレート試薬、及び／または界面活性剤を含み得る。医薬組成物は、好ましくは、ＧＭＰ条件下で製造される。医薬組成物は、例えば、カプセル、錠剤、丸剤、サシェ、液体、粉末、顆粒、細粒、フィルムコーティング製剤、ペレット、トローチ、舌下製剤、チュアブル、バッカル剤、ペースト、シロップ、懸濁液、エリキシル剤、エマルジョン、塗布剤、軟膏、プラスター、ハップ、経皮吸収システム、ローション、吸入剤、エアロゾル、注射剤、坐剤などの形態で、経口、経鼻または非経口的に使用することができる。

製造物
一部の実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍは、製造物、例えば、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍまたはポストバイオティクス、または溶解物、またはヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの代謝産物を含浸させた物質に製剤される。

一部の実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍは、生地（ｃｌｏｔｈ）に付随する。一般的に、生地とは、衣服用に適した柔軟な材料であって、例えば、十分な材料強度を有しており、着用者の日常の動作に耐える材料のことを指している。生地は、繊維状、織物、または編み物にすることができる；生地は、天然に存在する材料または合成材料で作ることができる。生地材料の例として、綿、亜麻、羊毛、ラミー、絹、デニム、皮革、ナイロン、ポリエステル、及びスパンデックス、及びそれらを混ぜ合わせたものがある。

一部の実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍは、紡糸（ｙａｒｎ）に付随する。一般的に、紡糸は、編み物や織り物に適した、長く、細く紡いだ柔軟な素材のことを指す。例えば、紡糸は、羊毛、綿、ポリエステル、及びそれらを混ぜ合わせたものから作ることができる。

一部の実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍは、撚糸（ｔｈｒｅａｄ）に付随する。一般的に、撚糸は、縫製に適した、長く、細く紡いだ柔軟な素材のことを指す。撚糸の直径は、一般的に、紡糸の直径よりも小さい。例えば、撚糸は、綿、ポリエステル、ナイロン、絹、及びそれらを混ぜ合わせたものから作ることができる。

例えば、靴、靴の中敷き、パジャマ、スニーカー、ベルト、帽子、シャツ、下着、運動着、ヘルメット、タオル、手袋、靴下、包帯などの衣類も、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍで処理され得る。シーツ、枕、枕カバー、毛布などの寝具も、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍで処理され得る。一部の実施形態では、一定期間は洗浄ができない皮膚の領域も、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍと接触させ得る。例えば、治癒プロセスの間に負傷した手足を固定する整形外科用ギプスで囲まれた皮膚、及び傷口などを適切に治癒するために乾燥状態を保つ必要がある負傷箇所近傍の領域を、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍと接触させることは効果的であり得る。

一部の態様では、本開示は、本明細書に記載するヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを含むウェアラブル物品を提供する。ウェアラブル物品は、歩行を妨げない方法で、利用者の身体と密接に付随することができる軽量の物品であり得る。ウェアラブル製品の例として、腕時計、リストバンド、ヘッドバンド、ヘアゴム、ヘアネット、シャワーキャップ、帽子、ヘアピース、ジュエリーなどがある。本明細書に記載するヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを含むウェアラブル物品は、例えば、皮膚障害の治療または予防、低濃度の亜硝酸塩に関連する疾患または病態の治療または予防、体臭の治療または予防、一酸化窒素を対象に供給する治療、または微生物の増殖を阻害する治療の１つ以上を提供する濃度で提供され得る。

一部の実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍは、毛髪への接触を意図した製品、例えば、ブラシ、櫛、シャンプー、コンディショナー、ヘッドバンド、ヘアゴム、ヘアネット、シャワーキャップ、帽子、及びヘアピースと関係する。おむつなどのヒト対象の表面に接触する物品は、本発明のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍが付随し得る。

一部の実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍは、それがなければヒト皮膚病原体の棲家として機能し得る家庭用品に付随する。一部の実施形態では、シャワーカーテン、バスマット、シャワーマット、または排水タイルに、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、またはヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍのポストバイオティクス、または溶解物、または代謝産物を含浸させる。

一部の実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍは、家庭用洗剤、または、業務用洗剤、例えば、体育施設のシャワーを洗浄するための洗剤などに付随する。

一部の実施形態では、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを含む品物がパッケージングされる。パッケージングは、品物を圧縮する役割を果たし得る、または、損傷、汚損、劣化から品物を保護し得る。パッケージングは、例えば、プラスチック、紙、段ボール、または木材を含み得る。一部の実施形態では、パッケージングは、細菌を通さない。一部の実施形態では、パッケージングは、酸素及び／または二酸化炭素を通す。
配列表

７．実施例
７．１．実施例１：ヒトＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの単離
材料及び方法
生物資源探査のための試料
試料を様々な供給源から調達及び収集した。皮膚微生物叢試料をｅＳｗａｂチューブ（Ｆｉｓｈｅｒ，Ｃａｔ．Ｎｏ．２３－６００－９００）を使用して、標準的な洗浄／綿球採取手順に従って、１８～２５歳の若い健康な成人対象から収集した。試料を、それぞれの対象の頭皮、前額部、鼻、肘前窩、手のひら、踵、及び足趾の間隙から収集した。

農産物試料を農産物の直売所と農場で入手した。

菌株の単離
ヒトの皮膚試料を、直接に処理をする、または、抗凍結剤としてＤＭＳＯを使用して－８０℃で保存し、処理にあたって室温で解凍する、とのいずれかの処理を行った。皮膚試料は、１００～３００コロニー／プレートの範囲に希釈した後に、標準的な微生物処理業務に従って、１％グリセロールを補充したＢＨＩ及びＲ２Ａ寒天プレートに播種した。プレートを、周囲温度で、３～５日間インキュベーションし、紫色の色素を含む細菌コロニーを視覚的に確認した。

農産物試料を、最初にエタノールワイプスで手短に洗浄した一対のはさみを使用して小さな断片に切り刻んだ。細かく刻んだ約５０グラムの断片を、２０～３０個の滅菌５ｍｍガラスビーズを事前に充填した５０ｍｌ Ｆａｌｃｏｎチューブ内で、１０ｍｌの滅菌１×ＰＢＳ緩衝剤と混合し、最高速度で、５分間、ボルテックスした。ボルテックスした後に、植物の残骸が底に沈下するまで、チューブを、５～１０分間静置した。この混合物を、４０μｍの細胞濾過器に通した。濾過した液体の１００μｌを、１００～３００コロニー／プレートの範囲に希釈した後に、１％グリセロールを補充したＢＨＩ及びＲ２Ａプレートに播種した。プレートを、周囲温度で、３～５日間インキュベーションし、紫色の色素を含む細菌コロニーを視覚的に確認した。

Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株の分子同定
すべての紫色のコロニーを、継代培養によって精製し、１６Ｓ ｒＲＮＡ配列決定を行って、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株であると確認した。精製した紫色のコロニーからＤＮＡを抽出し、標準の２７Ｆ／１４９２Ｒプライマーペアを使用したサーマルサイクラーを使用して増幅した。Ｓａｎｇｅｒ配列決定に供する前に、ＰＣＲ産物を、Ｅ－ゲルで確認した。取得した配列をＮＣＢＩデータベースで検索して分類学的情報を決定した。

結果、解釈、及び結論
３５名の対象から約７００の皮膚試料を収集した。２名の個別の対象に由来する２つの試料は、それぞれ、１つと５０個超の紫色のコロニーを形成した（図１）。１つの紫色のコロニーを踵の試料が入ったＲ２Ａプレートで単離し、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍとして確認した（図１、パネルＡ）。別の前額部の試料では、ＢＨＩ寒天プレート上に５０個超の紫色のコロニーを得た（図１、パネルＢ）。分子同定は、無作為に選択した５つの紫色のコロニーが、すべてＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍであることを示した。

大根、ニンニク、ほうれん草、バジル、ビート、アスパラガス、チャイブ、トマト、スイスチャード、レタス、コショウなど、幾つかの農産物試料の稚苗を処理した。例えば、大根の試料では、３つの紫色のコロニーを分離した（図１、パネルＣ）。

７．２．実施例２：遺伝学的試験
概要
ヒト皮膚上におけるＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの存在率を調査するために、４２名の健康な若年成人から収集した約７００個の皮膚微生物叢試料を、定量ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）アッセイでスクリーニングした。加えて、９名の健康な若年成人から収集した約１５６個の皮膚微生物叢試料に関して、ショットガン配列決定を行った。結果は、ｑＰＣＲでは、対象の１９％が、当該対象の皮膚にＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが存在していること、ショットガン配列決定によって、９名の対象全員が、当該対象の皮膚にＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが存在していることを示した。ショットガン配列決定分析は、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを、複数の解剖学的部位、及び複数の試料収集箇所で検出したことを示しており、このことは、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを、土壌、両生類、及び植物において同定されていることに加えて、ヒトの皮膚に遍在していることも示している。

本明細書に開示するＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株、ならびに、公開されたゲノム配列を有する株の遺伝子分析及び分子進化試験は、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株が、少なくとも４つの異なるサブグループに分類されており、それぞれのサブグループが、土壌、植物、両生類、及びヒトの皮膚を含む様々な供給源から単離したＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株からなることを示した。

材料及び方法
ヒト皮膚微生物叢試料由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍのｑＰＣＲスクリーニング
Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの分子スクリーニングを、ＳｅｎｓｉＦＡＳＴ ＳＹＢＲ Ｎｏ－ＲＯＸキット（Ｂｉｏｌｉｎｅ）を使用して、１０μｌの反応で、ＣＦＸリアルタイムＰＣＲ検出システム（ＢｉｏＲａｄ）によって、指示に従って、２回行った。スクリーニングは、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ特異的（Ｊａｎｔｈｉｎｏ２Ｆ２、ＧＣＡＣＧＧＡＡＧＴＧＡＣＣＡＡＡＡＡ及びＪａｎｔｈｉｎｏ２Ｒ２、ＡＣＡＴＧＧＡＧＡＣＴＴＧＧＧＣＴＴＴＧ）及びビオラセイン特異的（ＪｌｉｖＦ、ＴＡＣＣＡＣＧＡＡＴＴＧＣＴＧＴＧＣＣＡＧＴＴＧ及びＪｌｉｖＲ、ＡＣＡＣＧＣＴＣＣＡＧＧＴＡＴＡＣＧＴＣＴＴＣＡ）である２つのセットのプライマーペアを使用して、連続して行った。

全ゲノムショットガン配列決定とゲノム配列アセンブリ
それぞれのＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株のショットガン配列ライブラリを、Ｉｌｌｕｍｉｎａ社製のＮｅｘｔｅｒａ Ｆｌｅｘキットを使用して、指示に従って生成した。ショットガンライブラリを、ＨｉＳｅｑ Ｘプラットフォームでプール及び配列決定した。配列決定の読み取りを、自動的に個々のＦＡＳＴＡファイルに逆多重化し、ＤｅｒｍＢｉｏｎｆのバイオインフォマティクス分析パイプラインを実行して、除去した配列決定の読み取りから構築したゲノムを生成した。

Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株のヌクレオチドレベルでのゲノム類似性
５つのＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株（ＪＬ００１、ＪＬ００２、ＪＬ００４、ＪＬ００５、及びＪＬ００７）のゲノム配列を、幾つかの公開されたＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍゲノムとともに、Ａｖｅｒａｇｅ Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ Ｉｄｅｎｔｉｆｙ（ＡＮＩ、ｈｔｔｐｓ：／／ｉｍｇ．ｊｇｉ．ｄｏｅ．ｇｏｖ／ｄｏｃｓ／ｄｏｃｓ／ＡＮＩ．ｐｄｆ）分析に供して、類似性と遺伝的多様性を決定した。

Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍゲノム配列の系統発生学的分析
本明細書に記載するＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株、及び公開されたゲノム配列を有する株を含むＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株の系統発生学的関係を、ＲＡｘＭＬパッケージを使用して、指示に従って、評価した。

結果、解釈、及び結論
４２名の若い健康な成人の頭皮、前額部、翼状の皺、肘前窩、手のひら、踵、及び足趾の間隙などの様々な解剖学的部位から収集した７０４個の皮膚微生物叢試料をスクリーニングした。Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ特異的なプライマーペアとビオラセイン特異的なプライマーペアをそれぞれ使用してｑＰＣＲスクリーニングを行ったところ、それぞれ、１１６個と３０個の陽性試料を認めた（表２）。予想した通り、８名の個々の対象由来の８つの試料が、両方のプローブセットに対して陽性を示しており（表２）、このことは、試験した対象の約１９％が、皮膚にＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを有していることを示唆している。
（表２）皮膚微生物叢試料由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍのｑＰＣＲスクリーニング

皮膚微生物叢試料でのＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの存在率と存在量をさらに評価するために、９名の若い健康な対象について３度の試料収集訪問を行って、７つの解剖学的部位から合計で１２７個の皮膚微生物叢試料を得て、これら試料に対して、メタゲノムショットガン配列決定を行った。ショットガン配列決定手法の感度が高いため、ｑＰＣＲスクリーニングよりも高い割合でＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ陽性試料が得られるものと予想した。実際のところ、そして、当然のことながら、９名の全対象については、複数の解剖学的部位または複数回の試料収集訪問で得た皮膚試料に、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを認めた（図２）。平均して、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ ＤＮＡは、皮膚微生物ＤＮＡ全体の０．４％を占めており、肘前窩と手のひらに豊富に存在しており、また、足の領域ではごくわずかしか存在していない（図２）。

ＡＮＩは、２つのゲノムの間のベストヒットと相互ベストヒットの両方を使用して、平均ヌクレオチド同一性を推定する（ｅｎｖｅ－ｏｍｉｃｓ．ｃｅ．ｇａｔｅｃｈ．ｅｄｕ／ａｎｉ／）。８つの公開されているＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍゲノムをダウンロードし、ＡＮＩ分析のために自前で単離したＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍゲノム配列と比較した。Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ菌株の進化的関係をさらに評価するために、すべてのＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ菌株の系統樹を、全ゲノム配列を使用して構築した。Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍには、少なくとも４つの異なるサブグループがある（図３）。さらに、それぞれのサブグループは、土壌、植物、両生類、ヒトの皮膚など、様々な入手源から収集したＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍから構成されている（図３）。

７．３．実施例３：プレバイオティクスの同定
Ｂｉｏｌｏｇ（Ｈａｙｗａｒｄ，ＣＡ，ＵＳＡ）のＰＭ１－ＰＭ５ １０ ｐｈｅｎｏｔｙｐｅ ＭｉｃｒｏＡｒｒａｙｓ ｆｏｒ Ｍｉｃｒｏｂｉａｌ Ｃｅｌｌｓを使用して、我々は、細菌Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ、及びその構成産物のための製剤、凍結乾燥、発酵、及び／または送達のビヒクルに使用すると、増殖速度（表３）を高める、及び／またはＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓなど、これらに限定されない細菌感染症の微生物病原体；Ｔｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ、Ｍａｌａｓｓｅｚｉａ（マラセチア属）、Ｃａｎｄｉｄａ（カンジダ属）など、これらに限定されない真菌病原体；ポリオウイルス、単純ヘルペスウイルス、Ａ型肝炎、ロタウイルス、アデノウイルス、Ｈ１Ｎ１、コロナウイルス、及びＡ型インフルエンザなど、これらに限定されないＤＮＡ及びＲＮＡウイルスの阻害に対して、作用の有効性（表４）を高める化合物を同定した。
（表３）ＤＢＩ００１の増殖を促す培地成分においてＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍの増殖を促す成分^*

^＊２７℃で、１０時間及び１１時間の時点で、標準培地コントロールと比較して、０．１ＯＤ単位以上も高い
（表４）真菌または細菌病原体に対する機能を高める成分

^＊２４時間及び７日間、２７℃で、概説した標準状態と比較して、抑制域の直径が５％以上増加している。

ビオラセイン及びプロジギオシンの抽出及び定量は、当該技術分野で周知であり、標準的な技術を使用して実施することができる。

ビオラセインの生成は、分光光度計を使用して、５８０ｎｍ及び７６４ｎｍでの細菌培養物の吸光度を測定して定量できる。５８０ｎｍでの数値から７６４ｎｍでの数値を減じると、吸光度への細菌細胞の寄与部分が除去されるので、残余の数値を、ビオラセインレベルとして定量する。

酸性化エタノールで色素を抽出すると、プロジギオシンのレベルを同様に測定することができる。酸性化エタノールでのプロジギオシンは、５３５ｎｍで、特徴的な波長を示す。インキュベーションの終了時に６００ｎｍでの吸光度を測定した後に、プロジギオシンの推定値を、単位／セルで表すことができる。

７．４．実施例４：製造
概要
Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ ＤＢ０２４７３を、発酵槽で、５Ｌ規模で増殖させた。１４～１５時間経過した震盪フラスコ培養接種物から発酵槽に接種を行い、６００ｎｍでの吸光度を測定して増殖を監視した。発酵槽培養物を無菌的に回収し、細胞ペレットを、抗凍結剤と安定剤を含む製剤緩衝剤に再懸濁して、凍結製剤または凍結乾燥製剤を調製した。最終製剤物を、１０^８、１０^７、及び１０^６ ＣＦＵ／ｍｌに希釈する前後に、病原体Ｔ．ｒｕｂｒｕｍ及びＳ．ａｕｒｅｕｓに対する生存能力、純度、及び作用的活性について試験した。純度は９９．９９％超であり、生存能力の低下はゼロから最小限であり、また、非希釈試料と希釈試料との間で活性に変化は認められなかった。

材料及び方法
微生物株
Ｔｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ ｒｕｂｒｕｍ １８７５４株を、ＡＴＣＣから購入し、指示に従って維持した。Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ ＪＬ００７冷凍ストック２株を、ＤＭＳＯまたはグリセロールを抗凍結剤として使用して、－８０℃で保存した。Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ ２５９２３株を、ＡＴＣＣから購入し、指示に従って維持した。

純度アッセイ
発酵槽に接種するために使用する震盪フラスコ培養物、及び抗凍結剤ビヒクルに再懸濁した収穫培養物を、１００μｌのプレーティングが、推定で１００～３００個のコロニー／プレートになるように希釈した。この推定値は、６００ｎｍでの吸光度の読み取り値と、１ ＯＤ単位が５×１０^８ＣＦＵ／ｍｌであるとの過去の経験とに基づいたものである。０．５％グリセロール寒天を補充したＬＢ５０寒天またはＢＨＩの６～１０枚のプレートに、１００ｍＬの培養物で拡げて播種した。プレートを、室温で、最大１週間インキュベーションし、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ以外の増殖を監視した。

生存能力アッセイ
収集時に、６００ｎｍでの吸光度を測定し、１ ＯＤ単位が５×１０^∧８ ＣＦＵ／ｍｌに等しいと仮定してＣＦＵ／ｍｌを算出した。１つの試料を、後述するようにして、直ちにプレートに載置し、別の試料を、実験室に氷上で持ち込み、次いで、Ｒａｍｓｅｙアッセイ（下記参照）と、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ抗生物質アッセイとを使用して、Ｔ．ｔｕｂｒｕｍに関する分析を行い、その後、改めて計数するためにプレートに載置した。加えて、３つの試料を収集物から調製して、１０^８、１０^７、及び１０^６ ＣＦＵ／ｍｌに等しくなるようにした。それぞれの希釈液から得た１００μｌを、９６ウェルプレートの第１のウェルに３度加えた。このウェルから３０μｌを除去し、９６ウェルプレートの第２のウェルの２７０μｌの滅菌ＰＢＳに加えた。このものを、１００μｌの容量のピペットを使用して混合してからチップを交換し、第２のウェルから３０μｌを取り出し、次いで、２７０μｌの滅菌ＰＢＳを含む第３のウェルに移した。１００μｌの量を使用して、培養物を混合した。このようにして、当初の１０倍希釈に対して７回の連続１０倍希釈を行った。それぞれの希釈液の１０μｌスポットを、３つの複製希釈液のそれぞれが入ったＬＢ５０寒天プレートにスポットし、乾燥させた。プレートを、室温で、２日間インキュベーションし、ＣＦＵを計数した。ＣＦＵ／ｍｌは、スポット計数値の希釈係数を使用して算出した。

Ｒａｍｓｅｙインビトロ抗生物質アッセイ
Ｒａｍｓｅｙ ｅｔ ａｌ．，（２０１５）が報告し、ＤｅｒｍＢｉｏｎｔが最適化した手順に従って、インビトロアッセイを準備した。簡潔に説明すると、５０％ＬＢ－ベジトン（ＬＢ５０）で、約２×ｌ０^９ ＣＦＵ／ｍｌまで増殖させたＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの２４時間培養物を、綿棒を使用して、３３％トリプトン寒天プレートに、２本の直線を、一方を他方に対して直交させてプレート上に十字を描くようにして引いた。Ｔ．ｒｕｂｒｕｍの分生子胞子を、Ｓａｂｏｕｒａｕｄ Ｄｅｘｔｒｏｓｅ Ａｇａｒで培養した約２週齢の培養物から収集し、標準的な顕微鏡下で血球計を使用して計数を行い、１０^６個の胞子／ｍｌの濃度で、４つの複製スポットに、５μｌ／スポットを流した。Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍのクロススポットと胞子スポットの位置は、鋳型を使用して、それぞれのプレートに複製した。アッセイプレートを、周囲温度または２７℃で、２～３週間インキュベーションした。画像を、１４日目と２１日目に撮影した。これらの結果を図４に示す。

Ｔ．ｒｕｂｒｕｍの阻害とは、コントロールと比較して、コロニーサイズがｍｍ単位で抑制したことを指す。Ｔ．ｒｕｂｒｕｍコロニーの半径を、まず、ＩｍａｇｅＪを使用してピクセル（直線）で測定を行い、ペトリ皿のピクセル測定に基づいてｍｍに変換した。

Ｓ．ａｕｒｅｕｓ抗生物質アッセイ
インビトロアッセイを、標準的な実験手順に従って準備した。簡潔に説明すると、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ ２５９２３は、冷凍ストックからＢＨＩ寒天培地を取り除いて、３７℃で、一晩インキュベーションしたものであった。寒天プレートを、１週間以内にアッセイで使用した。３ｍｌのＢＨＩ培地に、寒天プレートから得たコロニーを接種し、３７℃で、２～３時間増殖させた。１ ＯＤ単位が１×１０^∧９ ＣＦＵ／ｍｌに等しいと仮定して、６００ｎｍでの吸光度を測定し、１×１０^∧７ ＣＦＵ／ｍｌに希釈した。２００μ１の１×ｌ０^∧７ ＣＦＵ／ｍｌを、ＬＢ５０寒天プレートに添加し、５～１０個の５ｍｍの滅菌ガラスビーズを使用して、寒天上で細菌の菌叢を分散させた。ビーズを取り除き、プレートを乾燥させた。凍結試料、または、２０～２４時間培養物から得たＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ ＪＬ００７の１～２個の５μｌスポットを、それぞれのプレートに加え、乾燥させた。モックコントロールプレートは、そのままにした。コントロールＪＬ００７培養物を、Ｒａｍｓｅｙアッセイについて上記したようにして増殖させた。すべてのプレートを、室温で、４～６日間インキュベーションした。

結果は、定性的である。成功した結果は、モックコントロールの菌叢と比較して、実験区またはＪＬ００７コントロールを播種したＳ．ａｕｒｅｕｓコロニーでは、まばらな集まり具合を示している。モックコントロールと比較して、１～３の定性的スコアが与えられており、１は、５０～７５％の増殖を示し、２は、１５～５０％の増殖を示し、３は、１５％未満の増殖を示す。

結果、解釈、及び結論
純度アッセイ
コロニー数／プレートの推定値を、以下の表５に示す。代表的な画像を、図６に示す。Ｆ１０７またはＦ１０８震盪フラスコまたは収集培養物のいずれについても、非Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍのコロニーは認められず、このことは、振とうフラスコ及び収集培養物では、培養が、９９．９９％超の単一栽培であることを確認するものである。
（表５）

生存能力
Ｆ１０７及びＦ１０８収集培養物でのＣＦＵ／ｍｌを、１０^∧８、１０^∧７、及び１０^∧６ ＣＦＵ／ｍｌに希釈する前後で決定した。図７は、これらのプレート試料でのＣＦＵ／ｍｌを、収集時の計数値と比較したものである。計数値は、収集試料を氷上に移した後でも、生存能力の有意な欠損は認められず、試料が正確な方法で１０^∧８、１０^∧７、及び１０^∧６ ＣＦＵ／ｍｌに希釈されたことを示している。

Ｒａｍｓｅｙアッセイ
Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ－Ｔ．ｒｕｂｒｕｍ抗生物質アッセイは、主に、非希釈の収穫培養物と、１０^∧８、１０^∧７、及び１０^∧６に希釈した収集培養物とを使用して実施した。モックコントロール、１０^∧８ ＣＦＵ／ｍｌ培養物、及びモックコントロールの代表的な画像を図８に示す。図１０は、モックコントロールでの近接模様（図８ｃに示している）の大きさと、実験試料での近接模様の大きさとの差異を、ｍｍで示している。いずれもが、それぞれのプレートから得た４つのＴ．ｒｕｂｒｕｍコロニーの平均である。試料を希釈しても、Ｔ．ｒｕｂｒｕｍの増殖の阻害に有意な効果を及ぼさないと結論することができる。ＪＬ００７十字に最も近接した位置で、Ｔ．ｒｕｂｒｕｍコロニーの増殖は、約５ｍｍの減少として認められる。

Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ抗生物質アッセイ。
Ｓ．ａｕｒｅｕｓ抗生物質アッセイの結果は、アッセイに使用した方法によって、収集発酵槽から得たＪＬ００７が、散発的な増殖を除いて、すべて停止してしまうので、定性的である。比較のために、従前の発酵発生での代表的なモックと実験室で増殖させたＪＬ００７の画像を示す。表６は、Ｆ１０７及びＦ１０８の非希釈と、それぞれの希釈度での定性的スコアを示す。Ｆ１０７とＦ１０８での希釈と非希釈との間に相違は認められない、と結論することができる。
（表６）定性的なＳ．ａｕｒｅｕｓの抗生物質アッセイスコア

まとめると、Ｆ１０７及びＦ１０８の非希釈培養物を、発酵槽で直接に分析したところ、１０^∧９ ＣＦＵ／ｍｌをわずかに超えていた。Ｆ１０７とＦ１０８の両方については、希釈と接種の際に、計数値で約１０倍の希釈を続けた。震盪試料及び収集試料の純度は９９．９９％超であり、このことは、真の単一培養物を示唆しており、この点は、ＱＰＣＲによって、両方の発酵槽で確認をした。Ｔ．ｒｕｂｒｕｍ及びＳ．ａｕｒｅｕｓに対する活性アッセイでは、非希釈培養物と希釈培養物との間に差異は認められず、または震盪フラスコで培養したコントロールと比較しても差異は認められず、これらのことは、発酵槽で培養した培養物は、これらの病原体の増殖を阻害する活性がある、ことを確認するものである。

７．５．実施例５：病原性因子
概要
Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株のバイオセーフティを評価するために、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株の病原性因子を試験し、インシリコ分析と、ウェットラボ実験での確認の両方を行って、抗生物質耐性プロファイルを調べた。インシリコゲノム検索では、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの５つの株のゲノムにおいて、公知の病原性因子や抗生物質耐性遺伝子は認められなかった（表１）。抗生物質試験は、試験したＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株が、２４個超の抗生物質に様々な程度で感受性があることを示した。Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株は、セファロスポリン、キノロン、及びテトラサイクリンクラスの抗生物質に対して感受性があり、アミノグリコシド、マクロライド、アズトレオナム、カルバペネム、メロペネム、クロラムフェニコール、クリンダマイシン、及びアモキシシリン／クラブラン酸塩（４：１）に対する感受性は小さく、バシトラシンには耐性を示す。

材料及び方法
全ゲノムショットガン配列決定及びバイオインフォマティクス分析
それぞれのＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株のショットガン配列ライブラーを、Ｎｅｘｔｅｒａ Ｆｌｅｘキット（Ｉｌｌｕｍｉｎａ）を使用して生成した。このショットガンライブラリを、ＨｉＳｅｑ Ｘプラットフォームにプールし、配列決定をした。配列決定の読み取りを、自動的に個々のＦＡＳＴＡファイルに逆多重化し、バイオインフォマティック分析パイプラインを実行して、除去した配列決定の読み取りから構築したゲノムを生成した。

それぞれのＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株のゲノム配列について、ＣｏｓｍｏＩＤオンラインサービス（ｃｏｓｍｏｓｉｄ．ｃｏｍ）を実行して、病原性因子遺伝子と公知の抗生物質耐性遺伝子を検索した。

内部抗生物質耐性試験
５０％ＢＨＩ寒天培地で増殖させた３日齢の１つのＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍコロニーを、１０×及び１００×にそれぞれ希釈した１ｍｌの１×ＰＢＳ緩衝剤で十分に混合した。２００μｌの希釈したＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ細胞を、１５０ｍｍペトリ皿のＲ２Ａ／ＢＨＩ寒天プレートに、３重で、均等に播種した。ディスクディスペンサー（ＢＤ ＢＢＬ Ｓｅｎｓｉ－Ｄｉｓｃ Ｄｅｓｉｇｎｅｒ Ｄｉｓｐｅｎｓｅｒ Ｓｙｓｔｅｍ、１２箇所用）を使用して、抗生物質ディスク（ＢＤ ＢＢＬ Ｓｅｎｓｉ－Ｄｉｓｃ抗菌感受性試験ディスク）に配置した。プレートを、室温で、２～３日間インキュベーションし、インキュベーションの最後に画像を作成した。

Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの抗生物質に対する感受性は、抗生物質ディスクを取り囲むＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ細胞の明確な阻害ゾーンに反映される。ＩｍａｇｅＪを使用して阻害ゾーンを測定し、分析のためにｃｍへと変換した。

抗生物質ＭＩＣ試験
精製した培養物で増殖させ、ベジトンＬＢ培養液で増殖させたＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを使用して、抗生物質耐性プロファイルと、ＭＩＣ試験を行った。

結果、解釈、及び結論
Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの５つ全部の株について、ゲノムサイズの少なくとも１００倍の範囲で配列決定を行った。ゲノム配列を、コンティグに集め、ＣｏｓｍｏＩＤ（ｃｏｓｍｏｓｉｄ．ｃｏｍ）を実行して、病原性因子遺伝子と抗生物質耐性遺伝子を検索した。ＣｏｓｍｏｓＩＤには、細菌の病原性因子遺伝子と、抗生物質耐性遺伝子に関して厳選した参照データベースがある。インシリコ検索では、病原性因子と抗生物質耐性とをコードする公知の遺伝子は認められなかった。

抗生物質感受性は、ベジトン及びＬＢ培養液で増殖させたＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ培養物で増殖したＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを使用した実験室アッセイでも確認した。実施した抗生物質アッセイは、５つのＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株の全てが、以下の抗生物質／用量に感受性が示すことを明らかにした：ペニシリン １０ ＩＵ、アンピシリン １０μｇ、ストレプトマイシン １０μｇ、バンコマイシン ３０μｇ、エリスロマイシン １５μｇ、ドキシサイクリン ３０μｇ、テラサイクリン ３０μｇ、セファロチン ３０μｇ、シプロフロキサシン ５μｇ、及びクロラムフェニコール ５μｇ（図５）。

Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株は、セファロスポリン、キノロン、及びテトラサイクリンクラスの抗生物質に対して感受性があり、アミノグリコシド、マクロライド、アズトレオナム、カルバペネム、メロペネム、クロラムフェニコール、クリンダマイシン、及びアモキシシリン／クラブラン酸塩（４：１）に対する感受性は小さく、バシトラシンには耐性を示す（表７及び８）。
（表７）Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株のＭＩＣ特性

（表８）Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株のＭＩＣ特性

７．６．実施例６：インビトロ有効性
概要
Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの５つの固有の菌株が、実験室でのインビトロアッセイにおいて、周囲温度及び２７℃で、皮膚糸状菌Ｔｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ ｒｕｂｒｕｍの増殖を有意に阻害する、ことを実証された。３０℃では、ＪＬ００７によって、Ｔ．ｒｕｂｒｕｍを穏やかに増殖阻害されることが認められた。

材料及び方法
微生物株
Ｔｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ ｒｕｂｒｕｍ １８７５４株をＡＴＣＣから購入し、指示に従って維持した。Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株は、抗凍結剤としてＤＭＳＯまたはグリセロールを使用して、－８０℃で保存した。

Ｒａｍｓｅｙインビトロ抗生物質アッセイ
Ｒａｍｓｅｙ ｅｔ ａｌ．，（２０１５）が報告した手順に従って、インビトロアッセイを準備した。簡潔に説明すると、５０％ｖｅｇＬＢ（ＬＢ５０）で、約２×ｌ０^∧９ ＣＦＵ／ｍｌまで増殖させたＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの２４時間培養物を、滅菌Ｑ－Ｔｉｐを使用して、５０％トリプトン寒天プレートに、２本の直線を、一方を他方に対して直交させてプレート上に十字を描くようにして引いた。Ｔ．ｒｕｂｒｕｍの分生子胞子を、Ｓａｂｏｕｒａｕｄ Ｄｅｘｔｒｏｓｅ Ａｇａｒで培養した約１週齢の培養物から収集し、標準的な顕微鏡下で血球計を使用して計数を行い、１０^∧６個の胞子／ｍｌの濃度で、４つの複製スポットに、５μｌ／スポットを流した。アッセイプレートを、周囲温度または２７℃で、２～３週間インキュベーションした。画像は、７日目、１４日目、及び２１日目に撮影した。

抑制域の定量
Ｔ．ｒｕｂｒｕｍの阻害とは、コロニーのｃｍ単位での抑制を指した。Ｔ．ｒｕｂｒｕｍコロニーの直径を、まず、ＩｍａｇｅＪを使用してピクセル（直線）で測定を行い、ペトリ皿のピクセル測定に基づいてｃｍに変換した。

結果、解釈、及び結論
Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ－Ｔ．ｒｕｂｒｕｍ抗生物質アッセイを、ＤＢ０２４７３ヒト単離株Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを使用して実施した。周囲温度で培養したプレートでは、Ｔ．ｒｕｂｒｕｍは、４日目から当初の接種スポットを超えて増殖した。７日目に、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍと一緒に培養して増殖させたＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍで処理をしたＴ．ｒｕｂｒｕｍコロニーは、モックコントロール（Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ不含）コロニーよりも著しく小さかった。１４日目に、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍで処理をしたコロニーは、コントロールコロニーよりも有意に小さく（図１０）、このことは、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍによる、強力な増殖阻害を示している。その他の固有のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株でも、同様の結果が認められた。

７．７．実施例７．代謝産物
概要
Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの２つの公知の代謝産物であるビオラセインとインドール－３－カルボキアルデヒドは、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが発揮する増殖阻害に関与する活性化合物である。Ｔ．ｒｕｂｒｕｍまたはＳ．ａｕｒｅｕｓ培養物の存在下及び非存在下でのＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの代謝プロファイルを、液体クロマトグラフィー－質量分析（ＬＣ－ＭＳ）で分析した。Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ分離株が生成した代謝産物の全範囲と、Ｔ．ｒｕｂｒｕｍまたはＳ．ａｕｒｅｕｓ培養物の存在下でＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍがアップレギュレーションした代謝産物の全範囲を解明した（表９）。インドール－３－カルボキアルデヒド及びその他の１７の代謝産物は、その他のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ分離株と比較して、ＤＢ０２４７３で固有に過剰発現を示している（表１０）。病原菌（Ｓｔａｐｈ．またはＴ．ｒｕｂｒｕｍ）の接種に応答して、それぞれのＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ分離株について有意に（コントロールと比較して２倍の差で）発現した代謝産物を比較した（表１１）。

材料及び方法
１．２ｍｌの試料を、強度４０％に設定したプローブ超音波破砕機を使用して、３×４０秒間かけて超音波処理を行い、超音波処理粉砕の間は、２０秒間、氷上に置いた。この手順は、パイロット実験での知見に基づいたものであり、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ ＤＢ０２４７３の６０～８０％を溶解する。超音波処理した材料を、１４，０００×ｇで、２分間遠心分離した。７００μｌの上清を、Ｍｅｔａｂｏｌｏｎ社製のバーコード付きのＭｉｃｒｏｎｉｃチューブに移した。これらのチューブに蓋をし、液体窒素で瞬間冷凍し、－８０℃で保存した。溶解物上清の残余を瞬間冷凍した後に、－８０℃のフリーザーボックスで保存した。

急速凍結培養物を、４℃で解凍し、１４，０００×ｇで、１０分間遠心分離した。このペレットを、１ｍｌのメタノールに再懸濁し、ビーズ破砕用チューブに定量的に移した。当初のチューブを１ｍｌのメタノールでさらに洗浄し、ビーズ破砕用チューブにおいて、先に入れた１ｍｌのメタノールと混合した。０．１ｍｍのガラスビーズを、このチューブの円錐形の底に敷きつめられるように、それぞれのビーズ破砕用チューブに加えた。これらのチューブを、Ｑｉａｇｅｎｅ ＴｉｓｓｕｅＬｙｓｅｒ ＩＩに入れて、３０Ｈｚで、１０分間、ビーズ破砕に供した。試料を、１４，０００×ｇで、１０分間遠心分離し、上清を、清潔なチューブに移した。スピードバキュームを使用して、３０℃で、メタノールを蒸発させた。このペレットを、２００μｌのＨＰＬＣグレードのメタノールに再懸濁し、オートサンプラバイアルのインサートに移した。

結果、解釈、及び結論
ＤＢ０２４７３と比較して、２倍にまで大幅に増えた、または減った代謝産物を同定する方法。
１．ＤＢ０２４７３に照らして、培地コントロールまたは病原体と比較した代謝産物の存在量を、多いものから少ないものへとランク付けした。
２．ＤＢ０２４７３対その他のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｉｕｍの比率を計算した。少なくとも４つのその他の株で、２倍に増えた、または減った場合、その代謝産物は、ＤＢ０２４７３株とは異なる挙動を示すものと見なした。
３．培地コントロールまたは病原体と比較して存在量が有意でなかった代謝産物は、除外した。
（表９）すべてのＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ株の代謝プロファイル

（表１０）他の株と比較してＤＢ０２４７３が２倍の発現を示す特有の代謝化合物

（表１１）病原体（Ｓｔａｐｈ．またはＴ．ｒｕｂｒｕｍ）の接種に応答して、それぞれの株が、有意に発現した（コントロールと比較して２倍の差）代謝産物

７．８．実施例８．治験
皮膚病の治療と予防に有用であるヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ、ＤＢ０２４７３。ＤＢ０２４７３ｔは、第Ｉｌａ相、単回投与、用量漸増臨床試験で、足白癬の治療において有効性を示した（参照［ｈｔｔｐｓ：／／ｗｗｗ．ｄｅｒｍｂｉｏｎｔ．ｃｏｍ／ｉｎ－ｔｈｅ－ｎｅｗｓ／ｄｅｒｍｂｉｏｎｔ－ａｎｎｏｕｎｃｅｓ－ｐｏｓｉｔｉｖｅ－ｄａｔａ－ｆｒｏｍ－ｐｈａｓｅ－２ａ－ｃｌｉｎｉｃａｌ－ｔｒｉａｌ－ａｎｄ－ｓｔａｒｔ－ｏｆ－ｐｈａｓｅ－２ｂ－ｃｌｉｎｉｃａｌ－ｔｒｉａｌ－ｆｏｒ－ａｔｈｌｅｔｅｓ－ｆｏｏｔ－ｗｉｔｈ－ａ－ｔｏｐｉｃａｌ－ｌｉｖｅ－ｂｉｏｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ）。これらの臨床試験は、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを近接して増殖させると、Ｔ．ｒｕｂｒｕｍ及びＳ．ａｕｒｅｕｓの増殖を阻害するとの知見を実証した。

８．参照による援用
本出願で引用するすべての刊行物、特許、特許出願及びその他の文献は、個々の刊行物、特許、特許出願またはその他の文献は、すべての目的のために、参照により援用することを個別に明示されるのと同然に、すべての目的のために、参照により、その全内容を本明細書で援用する。

９．均等物
様々な特定の実施形態を、例示及び説明してきたが、上記明細書は限定を意図するものではない。本開示（複数可）の精神及び範囲から逸脱せずに、様々な変更を加えることができることが理解されるであろう。この明細書を検討すれば、当業者には、数多くの変更が自明となるであろう。

１．関連出願への相互参照
本出願は、２０２０年４月９日に出願した国際出願第ＰＣＴ／ＵＳ２０２０／０２７５５６号の米国国内移行出願であり、これは２０１９年４月９日に出願した米国仮特許出願第６２／９２０，０１０号の優先権と利益を主張するものであって、その全内容を、参照により、本明細書で援用する。

本明細書では、キットを記載しており、当該キットは、安定化したヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍのバイアル、及び安定化したヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを再構成する液体のための少なくとも１つの任意のバイアル、混合と使用に関する説明書、ならびに混合と使用のための１つ以上の任意の器具を含む。一部の実施形態では、混合と使用のための器具を含んでおり、注射器、空の滅菌容器、及び噴霧器またはミスト生成器から選択する１つ以上の要素を含む。一部の実施形態では、キットは、その必要がある１名以上の対象に対する複数回の適用のために、安定化したヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの複数のバイアル、及び安定化したヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを再構成する液体のための少なくとも１つのバイアルを含む。一部の実施形態では、キットは、医療従事者用に準備される。一部の実施形態では、キットは、患者用に準備される。
[本発明1001]
ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ（ヤンシノバクテリウム・リビダム）を、病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害、または予防するのに有効な量で含む、医薬組成物。
[本発明1002]
病原微生物の感染に起因する哺乳動物対象の疾患の症状を予防、治療、または抑制するための局所適用のために製剤された、本発明1001の組成物。
[本発明1003]
前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、配列番号5、配列番号6、または配列番号7と少なくとも95％同一である核酸配列を含む、本発明1001の組成物。
[本発明1004]
前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、配列番号5、配列番号6、または配列番号7と少なくとも99％同一である核酸配列を含む、本発明1001の組成物。
[本発明1005]
単離されたさらなる微生物をさらに含む、本発明1001の組成物。
[本発明1006]
第1の単離されたさらなる微生物と、第2の単離されたさらなる微生物とをさらに含み、前記第1及び第2の単離されたさらなる微生物が、独立して、細菌、ウイルス、酵母、または真菌から選択される、本発明1001の組成物。
[本発明1007]
前記疾患、障害、または病態が、皮膚糸状菌に関連するがこれに限定されず、白癬性毛瘡、頭部白癬、体部白癬、頑癬、足白癬、または爪甲真菌症から選択され; あるいは、前記疾患、障害、または病態が、グラム陽性細菌及びＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ（スタフィロコッカス属）に関連するがこれらに限定されず、アトピー性皮膚炎、膿痂疹、皮膚感染症、及び軟部組織感染症から選択される、本発明1001の組成物。
[本発明1008]
前記単離されたさらなる微生物が、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ（ラクトバチルス属）、Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ（ラクトコッカス属）、またはＰｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ（プロピオニバクテリウム属）を含む、本発明1005の組成物。
[本発明1009]
抗真菌化合物をさらに含む、本発明1001の組成物。
[本発明1010]
前記抗真菌化合物が治療量で前記組成物中に存在する、本発明1009の組成物。
[本発明1011]
前記抗真菌化合物が治療量未満の量で前記組成物中に存在する、本発明1009の組成物。
[本発明1012]
抗菌化合物をさらに含む、本発明1001の組成物。
[本発明1013]
前記抗菌化合物が治療量で前記組成物中に存在する、本発明1012の組成物。
[本発明1014]
前記抗菌化合物が治療量未満の量で前記組成物中に存在する、本発明1012の組成物。
[本発明1015]
プレバイオティクスをさらに含む、本発明1001の組成物。
[本発明1016]
前記プレバイオティクスが、アミノ酸、ビオチン、グリセロール、フルクトオリゴ糖、ガラクトオリゴ糖、イヌリン、ラクツロース、マンナンオリゴ糖、オリゴフルクトース富化イヌリン、オリゴフルクトース、オリゴデキストロース、タガトース、トランス－ガラクトオリゴ糖、及びキシロオリゴ糖の内の1つ以上から選択される、本発明1015の組成物。
[本発明1017]
少なくとも1つのポストバイオティクスをさらに含む、本発明1001の組成物。
[本発明1018]
前記疾患、障害、または病態が、哺乳動物対象の皮膚の疾患、障害、または病態を含む、本発明1001の医薬組成物。
[本発明1019]
前記哺乳動物対象が、ヒト対象である、本発明1018の医薬組成物。
[本発明1020]
ヒトの皮膚の疾患、障害、または病態の症状を治療、阻害、抑制するのに有効な量で、あるいは、ヒトの皮膚の疾患、障害、または病態を予防するのに有効な量で投与される、本発明1019の医薬組成物。
[本発明1021]
ヒト対象の組織上または組織内に存在する局所病原微生物の増殖を阻害するのに有効な量で投与される、本発明1019の医薬組成物。
[本発明1022]
前記局所病原微生物が、皮膚糸状菌である、本発明1021の医薬組成物。
[本発明1023]
前記局所病原微生物が、Ｔｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ ｍｅｎｔａｇｒｏｐｈｙｔｅｓ（トリコフィトン・メンタグロフィテス）である、本発明1022の医薬組成物。
[本発明1024]
前記局所病原微生物が、Ｔｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ ｒｕｂｒｕｍ（紅色白癬菌）である、本発明1022の医薬組成物。
[本発明1025]
前記局所病原微生物が、細菌である、本発明1021の医薬組成物。
[本発明1026]
前記細菌が、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ（黄色ブドウ球菌）である、本発明1025の医薬組成物。
[本発明1027]
前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが乾燥されている、本発明1001の医薬組成物。
[本発明1028]
前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、乾燥状態からの再水和により少なくとも20％生存可能である、本発明1027の医薬組成物。
[本発明1029]
前記組成物が、室温で、少なくとも30日間にわたって、少なくとも30％生存可能である、本発明1001の医薬組成物。
[本発明1030]
前記組成物が、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの乾燥製剤を含む、本発明1001の医薬組成物。
[本発明1031]
ヒトまたは非ヒト対象に対する局所投与のために製剤される、本発明1001の医薬組成物。
[本発明1032]
クリーム、ゲル、泡剤、軟膏、粉末またはローションとして製剤される、本発明1031の医薬組成物。
[本発明1033]
液剤、チンキ剤、スプレー剤、ミスト生成器または吸入器として製剤される、本発明1031の医薬組成物。
[本発明1034]
前記組成物が、ヒトの皮膚に対する局所投与のために製剤される、本発明1031の医薬組成物。
[本発明1035]
前記組成物が、ヒトの粘膜に対する局所投与のために製剤される、本発明1031の医薬組成物。
[本発明1036]
配列番号5、配列番号6、または配列番号7と95％同一である核酸配列を含むヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを含む合成組成物であって、前記組成物が、局所適用のために製剤される、前記合成組成物。
[本発明1037]
前記ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、配列番号5、配列番号6、または配列番号7と99％同一である核酸配列を含む、本発明1036の合成組成物。
[本発明1038]
前記組成物が、ヒトの皮膚、爪、毛髪または粘膜と接触する材料に対する適用のために製剤される、本発明1036の合成組成物。
[本発明1039]
前記組成物が、ヒトの皮膚及び／または粘膜に対する適用のために製剤される、本発明1036の合成組成物。
[本発明1040]
前記組成物が、水性製剤中に製剤される、本発明1036の合成組成物。
[本発明1041]
前記組成物が、ヒトと接触する表面に対する局所適用のために製剤される、本発明1036の合成組成物。
[本発明1042]
前記組成物が、化粧品組成物を含む、本発明1039の合成組成物。
[本発明1043]
練歯磨、含嗽薬、シャンプー、石鹸、またはデンタルフロスを含む、本発明1042の化粧品組成物。
[本発明1044]
日焼け止め、保湿剤、老化防止剤、プロバイオティクスまたは健康促進組成物を含む、本発明1042の化粧品組成物。
[本発明1045]
Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを含む医薬組成物であって、前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、16ｓ ｒＲＮＡ遺伝子配列において配列番号5、配列番号6、または配列番号7と少なくとも98％同一である核酸配列を、病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害、または予防するのに有効な量で含む、前記医薬組成物。
[本発明1046]
配列番号5、配列番号6、または配列番号7を含む核酸配列を含むＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ（ヤンシノバクテリウム属）を、病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害、または予防するのに有効な量で含む、医薬組成物。
[本発明1047]
賦形剤、及び少なくとも1つのヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを、病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害、または予防するのに有効な量で含む、医薬組成物。
[本発明1048]
病原微生物を阻害または予防する方法であって、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの有効量を、その必要がある対象に対して投与することを含む、前記方法。
[本発明1049]
病原微生物の存在下で少なくとも1つの代謝産物を2倍に増やす非病原性ヒト皮膚微生物叢から得た非病原性細菌の集団を含む組成物であって、前記代謝産物が、ビオラセイン、インドール－3－カルボキサルデヒド、プロジギオシン、またはランチビオティックを含み、前記組成物が、対象に対する局所適用のために製剤される、前記組成物。
[本発明1050]
その必要がある対象において皮膚病態を治療する方法であって、対象に対して、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ属の細菌を含む医薬組成物の治療有効量を局所投与することを含み、前記細菌が、配列番号5、配列番号6、または配列番号7の16ｓ ｒＲＮＡ遺伝子配列と少なくとも95％同一である核酸配列を含む、前記方法。
[本発明1051]
配列番号5、配列番号6、または配列番号7と少なくとも98％同一である16ｓ ｒＲＮＡ核酸配列を含む、単離されたＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ。
[本発明1052]
本発明1051のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍを含む医薬組成物。
[本発明1053]
配列番号5、配列番号6、または配列番号7と少なくとも99％同一である16ｓ ｒＲＮＡ核酸配列を含む単離されたＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ。
[本発明1054]
本発明1053のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを含む医薬組成物。
[本発明1055]
その必要がある対象において病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害または予防するのに有効な量で存在する、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの少なくとも1つの種を含み、局所剤形である、医薬組成物。
[本発明1056]
ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの少なくとも1つの種に由来する代謝産物を含み、前記代謝産物が、その必要がある対象において病原微生物に関連する疾患、障害または病態を治療、阻害または予防するのに十分な量で存在し、前記医薬組成物が、局所剤形である、医薬組成物。
[本発明1057]
その必要がある対象において病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害、または予防するのに有効な量で存在する、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの少なくとも1つの種の細胞溶解物を含み、局所剤形である、医薬組成物。
[本発明1058]
その必要がある対象において病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害または予防するのに有効な量で存在する、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの少なくとも1つの種のポストバイオティクスを含み、局所剤形である、医薬組成物。
[本発明1059]
病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害または予防するのに有効な量の、ビオラセイン、インドール－3－カルボキサルデヒド、プロジギオシン、サリチル酸塩、2，4－ジアマブチレート及び1つ以上のランチビオティクスを過剰産生する、単離されたヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ。
[本発明1060]
16Ｓ ｒＲＮＡ配列において配列番号5、配列番号6、または配列番号7と少なくとも95％同一である核酸配列を含む、本発明1059のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ。
[本発明1061]
本発明1059のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍと、生理学的に許容可能な担体とを含む、組成物。
[本発明1062]
その必要がある対象において皮膚障害を治療する方法であって、前記方法が、有効量のプロバイオティクス細菌、プロバイオティクス細菌の代謝産物、プロバイオティクス細菌のポストバイオティクス、及び／またはプロバイオティクス細菌の細胞溶解物を含む製剤を局所投与することを含み、前記プロバイオティクス細菌が、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍであり、前記障害が、局所病原微生物の存在に関連する、前記方法。
[本発明1063]
前記製剤が、皮膚または毛髪に対する投与のために製剤される、本発明1062の方法。
[本発明1064]
前記製剤が、粘膜に対する投与のために製剤される、本発明1062の方法。
[本発明1065]
前記粘膜が、膣、陰茎、尿道、膀胱、肛門、口、鼻、咽喉、気管支、肺、眼、及び耳の粘膜からなる群から選択される、本発明1064の方法。
[本発明1066]
少なくとも1つのヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍから産生された代謝産物を、病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害、または予防するのに有効な量で含む、医薬組成物。
[本発明1067]
少なくとも1つのヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍに由来する細胞溶解物を、病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害、または予防するのに有効な量で含む、医薬組成物。
[本発明1068]
少なくとも1つのヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍに由来するポストバイオティクスを、病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害、または予防するのに有効な量で含む、医薬組成物。
[本発明1069]
前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、配列番号5、配列番号6、または配列番号7と少なくとも95％同一である遺伝子配列を含む、本発明1066、1067、及び1068のいずれかの医薬組成物。
[本発明1070]
前記組成物が、ビオラセイン、インドール－3－カルボキサルデヒド、プロジギオシン、サリチル酸塩、2，4－ジアマブチレート及び1つ以上のランチビオティクスから選択される1つ以上の化合物を含む、本発明1066の医薬組成物。
[本発明1071]
有効量の少なくとも1つのヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ代謝産物を含み、局所適用のために製剤される、合成組成物。
[本発明1072]
前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、配列番号5、配列番号6、または配列番号7と少なくとも95％同一である16Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子配列を含む、本発明1071の合成組成物。
[本発明1073]
化粧品組成物である、本発明1071の合成組成物。
[本発明1074]
前記組成物が、ビオラセイン、インドール－3－カルボキサルデヒド、プロジギオシン、サリチル酸塩、2，4－ジアマブチレート及び1つ以上のランチビオティクスから選択される1つ以上の化合物を含む、本発明1071の合成組成物。
[本発明1075]
有効量のヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ細胞溶解物を含み、局所適用のために製剤される、合成組成物。
[本発明1076]
前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、配列番号5、配列番号6、または配列番号7と少なくとも95％同一である16Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子配列を含む、本発明1075の合成組成物。
[本発明1077]
化粧品組成物である、本発明1075の合成組成物。
[本発明1078]
有効量のヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍポストバイオティクスを含み、局所適用のために製剤される、合成組成物。
[本発明1079]
前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、配列番号5、配列番号6、または配列番号7と少なくとも95％同一である16Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子配列を含む、本発明1078の合成組成物。
[本発明1080]
化粧品組成物である、本発明1078の合成組成物。
[本発明1081]
練歯磨、含嗽薬、シャンプー、石鹸、保湿剤、またはデンタルフロスを含む、本発明1073、1077、及び1080の化粧品組成物。
[本発明1082]
日焼け止め、保湿剤、老化防止剤、プロバイオティクスまたは健康促進組成物を含む、本発明1073、1077、及び1080の化粧品組成物。
[本発明1083]
2－（α－Ｄ－マンノシル）－Ｄ－グリセリン酸、2－ケトグルコン酸塩、2－Ｏ－エチルアスコルビン酸、アントラマイシン、アプロバルビタール、ベンジオカルブ、ビス（2－エチルヘキシル）フタル酸塩、シス－5－テトラデセノイルカルニチン、フタル酸ジブチル、プロピオン酸イミダゾール、インドール－3－カルボキサルデヒド、インドリン－2－オン、Ｎ－アセチル－Ｌ－アスパラギン酸、リン酸、フタル酸、ピミルプロスト、トリメタジオン、またはベルノレートを過剰産生する、単離されたヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍであって、前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害、または予防するのに有効な量で組成物中に存在する、前記単離されたヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ。

材料及び方法
ヒト皮膚微生物叢試料由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍのｑＰＣＲスクリーニング
Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの分子スクリーニングを、ＳｅｎｓｉＦＡＳＴ ＳＹＢＲ Ｎｏ－ＲＯＸキット（Ｂｉｏｌｉｎｅ）を使用して、１０μｌの反応で、ＣＦＸリアルタイムＰＣＲ検出システム（ＢｉｏＲａｄ）によって、指示に従って、２回行った。スクリーニングは、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ特異的（Ｊａｎｔｈｉｎｏ２Ｆ２、ＧＣＡＣＧＧＡＡＧＴＧＡＣＣＡＡＡＡＡ（配列番号８）及びＪａｎｔｈｉｎｏ２Ｒ２、ＡＣＡＴＧＧＡＧＡＣＴＴＧＧＧＣＴＴＴＧ（配列番号９））及びビオラセイン特異的（ＪｌｉｖＦ、ＴＡＣＣＡＣＧＡＡＴＴＧＣＴＧＴＧＣＣＡＧＴＴＧ（配列番号１０）及びＪｌｉｖＲ、ＡＣＡＣＧＣＴＣＣＡＧＧＴＡＴＡＣＧＴＣＴＴＣＡ（配列番号１１））である２つのセットのプライマーペアを使用して、連続して行った。

Claims (83)

1. ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ（ヤンシノバクテリウム・リビダム）を、病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害、または予防するのに有効な量で含む、医薬組成物。
2. 病原微生物の感染に起因する哺乳動物対象の疾患の症状を予防、治療、または抑制するための局所適用のために製剤された、請求項１に記載の組成物。
3. 前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、配列番号５、配列番号６、または配列番号７と少なくとも９５％同一である核酸配列を含む、請求項１に記載の組成物。
4. 前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、配列番号５、配列番号６、または配列番号７と少なくとも９９％同一である核酸配列を含む、請求項１に記載の組成物。
5. 単離されたさらなる微生物をさらに含む、請求項１に記載の組成物。
6. 第１の単離されたさらなる微生物と、第２の単離されたさらなる微生物とをさらに含み、前記第１及び第２の単離されたさらなる微生物が、独立して、細菌、ウイルス、酵母、または真菌から選択される、請求項１に記載の組成物。
7. 前記疾患、障害、または病態が、皮膚糸状菌に関連するがこれに限定されず、白癬性毛瘡、頭部白癬、体部白癬、頑癬、足白癬、または爪甲真菌症から選択され; あるいは、前記疾患、障害、または病態が、グラム陽性細菌及びＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ（スタフィロコッカス属）に関連するがこれらに限定されず、アトピー性皮膚炎、膿痂疹、皮膚感染症、及び軟部組織感染症から選択される、請求項１に記載の組成物。
8. 前記単離されたさらなる微生物が、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ（ラクトバチルス属）、Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ（ラクトコッカス属）、またはＰｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ（プロピオニバクテリウム属）を含む、請求項５に記載の組成物。
9. 抗真菌化合物をさらに含む、請求項１に記載の組成物。
10. 前記抗真菌化合物が治療量で前記組成物中に存在する、請求項９に記載の組成物。
11. 前記抗真菌化合物が治療量未満の量で前記組成物中に存在する、請求項９に記載の組成物。
12. 抗菌化合物をさらに含む、請求項１に記載の組成物。
13. 前記抗菌化合物が治療量で前記組成物中に存在する、請求項１２に記載の組成物。
14. 前記抗菌化合物が治療量未満の量で前記組成物中に存在する、請求項１２に記載の組成物。
15. プレバイオティクスをさらに含む、請求項１に記載の組成物。
16. 前記プレバイオティクスが、アミノ酸、ビオチン、グリセロール、フルクトオリゴ糖、ガラクトオリゴ糖、イヌリン、ラクツロース、マンナンオリゴ糖、オリゴフルクトース富化イヌリン、オリゴフルクトース、オリゴデキストロース、タガトース、トランス－ガラクトオリゴ糖、及びキシロオリゴ糖の内の１つ以上から選択される、請求項１５に記載の組成物。
17. 少なくとも１つのポストバイオティクスをさらに含む、請求項１に記載の組成物。
18. 前記疾患、障害、または病態が、哺乳動物対象の皮膚の疾患、障害、または病態を含む、請求項１に記載の医薬組成物。
19. 前記哺乳動物対象が、ヒト対象である、請求項１８に記載の医薬組成物。
20. ヒトの皮膚の疾患、障害、または病態の症状を治療、阻害、抑制するのに有効な量で、あるいは、ヒトの皮膚の疾患、障害、または病態を予防するのに有効な量で投与される、請求項１９に記載の医薬組成物。
21. ヒト対象の組織上または組織内に存在する局所病原微生物の増殖を阻害するのに有効な量で投与される、請求項１９に記載の医薬組成物。
22. 前記局所病原微生物が、皮膚糸状菌である、請求項２１に記載の医薬組成物。
23. 前記局所病原微生物が、Ｔｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ ｍｅｎｔａｇｒｏｐｈｙｔｅｓ（トリコフィトン・メンタグロフィテス）である、請求項２２に記載の医薬組成物。
24. 前記局所病原微生物が、Ｔｒｉｃｈｏｐｈｙｔｏｎ ｒｕｂｒｕｍ（紅色白癬菌）である、請求項２２に記載の医薬組成物。
25. 前記局所病原微生物が、細菌である、請求項２１に記載の医薬組成物。
26. 前記細菌が、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ（黄色ブドウ球菌）である、請求項２５に記載の医薬組成物。
27. 前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが乾燥されている、請求項１に記載の医薬組成物。
28. 前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、乾燥状態からの再水和により少なくとも２０％生存可能である、請求項２７に記載の医薬組成物。
29. 前記組成物が、室温で、少なくとも３０日間にわたって、少なくとも３０％生存可能である、請求項１に記載の医薬組成物。
30. 前記組成物が、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの乾燥製剤を含む、請求項１記載の医薬組成物。
31. ヒトまたは非ヒト対象に対する局所投与のために製剤される、請求項１に記載の医薬組成物。
32. クリーム、ゲル、泡剤、軟膏、粉末またはローションとして製剤される、請求項３１に記載の医薬組成物。
33. 液剤、チンキ剤、スプレー剤、ミスト生成器または吸入器として製剤される、請求項３１に記載の医薬組成物。
34. 前記組成物が、ヒトの皮膚に対する局所投与のために製剤される、請求項３１に記載の医薬組成物。
35. 前記組成物が、ヒトの粘膜に対する局所投与のために製剤される、請求項３１に記載の医薬組成物。
36. 配列番号５、配列番号６、または配列番号７と９５％同一である核酸配列を含むヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを含む合成組成物であって、前記組成物が、局所適用のために製剤される、前記合成組成物。
37. 前記ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、配列番号５、配列番号６、または配列番号７と９９％同一である核酸配列を含む、請求項３６に記載の合成組成物。
38. 前記組成物が、ヒトの皮膚、爪、毛髪または粘膜と接触する材料に対する適用のために製剤される、請求項３６に記載の合成組成物。
39. 前記組成物が、ヒトの皮膚及び／または粘膜に対する適用のために製剤される、請求項３６に記載の合成組成物。
40. 前記組成物が、水性製剤中に製剤される、請求項３６に記載の合成組成物。
41. 前記組成物が、ヒトと接触する表面に対する局所適用のために製剤される、請求項３６に記載の合成組成物。
42. 前記組成物が、化粧品組成物を含む、請求項３９に記載の合成組成物。
43. 練歯磨、含嗽薬、シャンプー、石鹸、またはデンタルフロスを含む、請求項４２に記載の化粧品組成物。
44. 日焼け止め、保湿剤、老化防止剤、プロバイオティクスまたは健康促進組成物を含む、請求項４２に記載の化粧品組成物。
45. Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを含む医薬組成物であって、前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、１６ｓ ｒＲＮＡ遺伝子配列において配列番号５、配列番号６、または配列番号７と少なくとも９８％同一である核酸配列を、病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害、または予防するのに有効な量で含む、前記医薬組成物。
46. 配列番号５、配列番号６、または配列番号７を含む核酸配列を含むＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ（ヤンシノバクテリウム属）を、病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害、または予防するのに有効な量で含む、医薬組成物。
47. 賦形剤、及び少なくとも１つのヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを、病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害、または予防するのに有効な量で含む、医薬組成物。
48. 病原微生物を阻害または予防する方法であって、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの有効量を、その必要がある対象に対して投与することを含む、前記方法。
49. 病原微生物の存在下で少なくとも１つの代謝産物を２倍に増やす非病原性ヒト皮膚微生物叢から得た非病原性細菌の集団を含む組成物であって、前記代謝産物が、ビオラセイン、インドール－３－カルボキサルデヒド、プロジギオシン、またはランチビオティックを含み、前記組成物が、対象に対する局所適用のために製剤される、前記組成物。
50. その必要がある対象において皮膚病態を治療する方法であって、対象に対して、Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ属の細菌を含む医薬組成物の治療有効量を局所投与することを含み、前記細菌が、配列番号５、配列番号６、または配列番号７の１６ｓ ｒＲＮＡ遺伝子配列と少なくとも９５％同一である核酸配列を含む、前記方法。
51. 配列番号５、配列番号６、または配列番号７と少なくとも９８％同一である１６ｓ ｒＲＮＡ核酸配列を含む、単離されたＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ。
52. 請求項５１に記載のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍを含む医薬組成物。
53. 配列番号５、配列番号６、または配列番号７と少なくとも９９％同一である１６ｓ ｒＲＮＡ核酸配列を含む単離されたＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ。
54. 請求項５３に記載のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍを含む医薬組成物。
55. その必要がある対象において病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害または予防するのに有効な量で存在する、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの少なくとも１つの種を含み、局所剤形である、医薬組成物。
56. ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの少なくとも１つの種に由来する代謝産物を含み、前記代謝産物が、その必要がある対象において病原微生物に関連する疾患、障害または病態を治療、阻害または予防するのに十分な量で存在し、前記医薬組成物が、局所剤形である、医薬組成物。
57. その必要がある対象において病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害、または予防するのに有効な量で存在する、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの少なくとも１つの種の細胞溶解物を含み、局所剤形である、医薬組成物。
58. その必要がある対象において病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害または予防するのに有効な量で存在する、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍの少なくとも１つの種のポストバイオティクスを含み、局所剤形である、医薬組成物。
59. 病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害または予防するのに有効な量の、ビオラセイン、インドール－３－カルボキサルデヒド、プロジギオシン、サリチル酸塩、２，４－ジアマブチレート及び１つ以上のランチビオティクスを過剰産生する、単離されたヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ。
60. １６Ｓ ｒＲＮＡ配列において配列番号５、配列番号６、または配列番号７と少なくとも９５％同一である核酸配列を含む、請求項５９に記載のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ。
61. 請求項５９に記載のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍと、生理学的に許容可能な担体とを含む、組成物。
62. その必要がある対象において皮膚障害を治療する方法であって、前記方法が、有効量のプロバイオティクス細菌、プロバイオティクス細菌の代謝産物、プロバイオティクス細菌のポストバイオティクス、及び／またはプロバイオティクス細菌の細胞溶解物を含む製剤を局所投与することを含み、前記プロバイオティクス細菌が、ヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍであり、前記障害が、局所病原微生物の存在に関連する、前記方法。
63. 前記製剤が、皮膚または毛髪に対する投与のために製剤される、請求項６２に記載の方法。
64. 前記製剤が、粘膜に対する投与のために製剤される、請求項６２に記載の方法。
65. 前記粘膜が、膣、陰茎、尿道、膀胱、肛門、口、鼻、咽喉、気管支、肺、眼、及び耳の粘膜からなる群から選択される、請求項６４に記載の方法。
66. 少なくとも１つのヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍから産生された代謝産物を、病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害、または予防するのに有効な量で含む、医薬組成物。
67. 少なくとも１つのヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍに由来する細胞溶解物を、病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害、または予防するのに有効な量で含む、医薬組成物。
68. 少なくとも１つのヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍに由来するポストバイオティクスを、病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害、または予防するのに有効な量で含む、医薬組成物。
69. 前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、配列番号５、配列番号６、または配列番号７と少なくとも９５％同一である遺伝子配列を含む、請求項６６、６７、及び６８のいずれか１項に記載の医薬組成物。
70. 前記組成物が、ビオラセイン、インドール－３－カルボキサルデヒド、プロジギオシン、サリチル酸塩、２，４－ジアマブチレート及び１つ以上のランチビオティクスから選択される１つ以上の化合物を含む、請求項６６に記載の医薬組成物。
71. 有効量の少なくとも１つのヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ代謝産物を含み、局所適用のために製剤される、合成組成物。
72. 前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、配列番号５、配列番号６、または配列番号７と少なくとも９５％同一である１６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子配列を含む、請求項７１に記載の合成組成物。
73. 化粧品組成物である、請求項７１に記載の合成組成物。
74. 前記組成物が、ビオラセイン、インドール－３－カルボキサルデヒド、プロジギオシン、サリチル酸塩、２，４－ジアマブチレート及び１つ以上のランチビオティクスから選択される１つ以上の化合物を含む、請求項７１に記載の合成組成物。
75. 有効量のヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ細胞溶解物を含み、局所適用のために製剤される、合成組成物。
76. 前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、配列番号５、配列番号６、または配列番号７と少なくとも９５％同一である１６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子配列を含む、請求項７５に記載の合成組成物。
77. 化粧品組成物である、請求項７５に記載の合成組成物。
78. 有効量のヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍポストバイオティクスを含み、局所適用のために製剤される、合成組成物。
79. 前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、配列番号５、配列番号６、または配列番号７と少なくとも９５％同一である１６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子配列を含む、請求項７８に記載の合成組成物。
80. 化粧品組成物である、請求項７８に記載の合成組成物。
81. 練歯磨、含嗽薬、シャンプー、石鹸、保湿剤、またはデンタルフロスを含む、請求項７３、７７、及び８０に記載の化粧品組成物。
82. 日焼け止め、保湿剤、老化防止剤、プロバイオティクスまたは健康促進組成物を含む、請求項７３、７７、及び８０に記載の化粧品組成物。
83. ２－（α－Ｄ－マンノシル）－Ｄ－グリセリン酸、２－ケトグルコン酸塩、２－Ｏ－エチルアスコルビン酸、アントラマイシン、アプロバルビタール、ベンジオカルブ、ビス（２－エチルヘキシル）フタル酸塩、シス－５－テトラデセノイルカルニチン、フタル酸ジブチル、プロピオン酸イミダゾール、インドール－３－カルボキサルデヒド、インドリン－２－オン、Ｎ－アセチル－Ｌ－アスパラギン酸、リン酸、フタル酸、ピミルプロスト、トリメタジオン、またはベルノレートを過剰産生する、単離されたヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍであって、前記Ｊａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍが、病原微生物に関連する疾患、障害、または病態を治療、阻害、または予防するのに有効な量で組成物中に存在する、前記単離されたヒト由来のＪａｎｔｈｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｖｉｄｕｍ。

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