JP2022526300A - RuBP再生および電子伝達の促進を介して植物中のバイオマスを増強する方法 - Google Patents
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Abstract
本開示の態様は、RubP再生および電子伝達を促進する遺伝子改変を含んでいる増強されたバイオマスを有する遺伝子改変植物に関する。特に、本開示は、CBタンパク質(例えば、FBPase/SBPaseまたはSBPase)の過剰発現、および光合成電子伝達タンパク質(例えば、シトクロムc6およびリスケ鉄硫黄の場合)の過剰発現を介して増強されたバイオマスを有する遺伝子改変植物に関する。
Description
〔関連出願の交差リファレンス〕
本出願は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる、2019年3月21日に出願された米国仮出願第62/821,786号の利益を主張する。
本出願は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる、2019年3月21日に出願された米国仮出願第62/821,786号の利益を主張する。
〔ASCIIテキストファイルとしての配列表の提出〕
ASCIIテキストファイルに関する以下の提出の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる:配列表のコンピュータ読み取り可能な形式(CRF)(ファイル名:794542000640SEQLIST.TXT、記録日:2020年3月16日、サイズ:316KB)。
ASCIIテキストファイルに関する以下の提出の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる:配列表のコンピュータ読み取り可能な形式(CRF)(ファイル名:794542000640SEQLIST.TXT、記録日:2020年3月16日、サイズ:316KB)。
〔技術分野〕
本開示は、遺伝子改変植物に関する。特に、本開示は、FBPase/SBPaseまたはSBPaseなどのカルビンベンソンサイクル(CB)タンパク質の過剰発現を介することを含んでいる、RuBP再生を促進する遺伝子改変を含む、およびシトクロムc6およびリスケ鉄硫黄(Rieske FeS)などの光合成電子伝達タンパク質の過剰発現を介することを含んでいる電子伝達を刺激する遺伝子改変を含む、増強されたバイオマスを有する遺伝子改変植物に関する。
本開示は、遺伝子改変植物に関する。特に、本開示は、FBPase/SBPaseまたはSBPaseなどのカルビンベンソンサイクル(CB)タンパク質の過剰発現を介することを含んでいる、RuBP再生を促進する遺伝子改変を含む、およびシトクロムc6およびリスケ鉄硫黄(Rieske FeS)などの光合成電子伝達タンパク質の過剰発現を介することを含んでいる電子伝達を刺激する遺伝子改変を含む、増強されたバイオマスを有する遺伝子改変植物に関する。
〔背景〕
作物種の生産力は、農業管理および環境条件を含む複数の外部要因によって制限される。しかしながら、最適な管理および条件下でさえ、作物種のエネルギー変換効率は、依然として収量を制限し得る。エネルギー変換効率は、生産されたバイオマスエネルギーを、一定期間にわたり作物冠(crop canopy)によって遮断された光エネルギーで割った比率であり、光合成および呼吸などの植物内部プロセスによって決定される。モデリングは、主要な作物種のエネルギー変換効率が、他の生産力改善構成要素に遅れをとり、作物種の生産力改善における主要な障害物に相当することを示した(Zhu, et al., Annu. Rev. Plant. Biol. (2010)61:235-261)。
作物種の生産力は、農業管理および環境条件を含む複数の外部要因によって制限される。しかしながら、最適な管理および条件下でさえ、作物種のエネルギー変換効率は、依然として収量を制限し得る。エネルギー変換効率は、生産されたバイオマスエネルギーを、一定期間にわたり作物冠(crop canopy)によって遮断された光エネルギーで割った比率であり、光合成および呼吸などの植物内部プロセスによって決定される。モデリングは、主要な作物種のエネルギー変換効率が、他の生産力改善構成要素に遅れをとり、作物種の生産力改善における主要な障害物に相当することを示した(Zhu, et al., Annu. Rev. Plant. Biol. (2010)61:235-261)。
カルビンベンソンサイクル(CB)は、炭素の同化、すなわちバイオマスエネルギーの生成に関与するので、光合成を改善するための有望な標的である。初期の研究は、個々のCB酵素のわずかな減少でさえ、炭素同化および植物成長を減少させるのに十分であることを示した。いくつかの酵素は他の酵素よりも大きな効果を有するが、異なる個々のCB酵素を過剰発現することが、結果として、光合成炭素同化を増加させ、かつ植物成長を改善させることを、調査は示した。したがって、光合成炭素同化において単独の制限段階はない。これは、CB酵素活性を操作して生産性を増加することができるが、主要な作物種のための有効な工学的ストラテジーを開発することは、1つの構成要素を変えるほど簡単ではないことが今日まで証明されていることを意味する。
光合成電子伝達は、作物冠によって遮断された光エネルギーの利用に関与するので、光合成を改善するための別の考えられる標的である。光合成電子伝達鎖の個々の構成要素は、電子伝達速度を増加させ得ることが示されている。例えば、植物リスケ鉄硫黄タンパク質の過剰発現は、結果として、電子伝達速度を増加させ、および植物バイオマスを増加させた(Simkin, et al.,Plant Physiol. (2017) 175:134-145)。個々の構成要素が有望な結果を提供したが、研究は全体として、高等植物における光合成電子伝達の効率は、高等植物(例えば、プラストシアニン)の光合成電子伝達タンパク質によって制限されることを示した(Chida, et la., Plant Cell Physiol. (2007) 48:948-957;Finazzi, et la., Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. (2005) 102:7031-7036)。
作物種の最適の生産力を達成するために、改善されたエネルギー変換効率に対して明らかな必要性が存在する。改善されたエネルギー変換効率を有する植物を開発するために、光合成の異なった性状を組み込む多構成要素工学が必要とされる。
〔概要〕
これらの要求を満たすために、本開示は、RuBP再生および電子伝達を促進することによって植物バイオマスを増強する方法を提供する。特に、本開示は、CBタンパク質(例えば、FBPase/SBPaseまたはSBPase)の過剰発現、および光合成電子伝達タンパク質(例えば、シトクロムc6およびリスケ鉄硫黄)の過剰発現を介して増強されたバイオマスを有する遺伝子改変植物に関する。
これらの要求を満たすために、本開示は、RuBP再生および電子伝達を促進することによって植物バイオマスを増強する方法を提供する。特に、本開示は、CBタンパク質(例えば、FBPase/SBPaseまたはSBPase)の過剰発現、および光合成電子伝達タンパク質(例えば、シトクロムc6およびリスケ鉄硫黄)の過剰発現を介して増強されたバイオマスを有する遺伝子改変植物に関する。
本開示の態様は、遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞を含み、植物、植物の一部、または細胞は、CBタンパク質の活性を増加するRuBP再生を向上する1つ以上の遺伝子改変および光合成電子伝達を向上する1つ以上の遺伝子改変を含む。この態様のさらなる実施形態は、光合成電子伝達を向上する1つ以上の遺伝子改変が1つ以上の光合成電子伝達タンパク質の過剰発現であることを含む。この態様のさらに別の実施形態は、シトクロムc6タンパク質、リスケ鉄硫黄タンパク質、または、シトクロムc6タンパク質およびリスケ鉄硫黄タンパク質、の群から選択される1つ以上の光合成電子伝達タンパク質を含む。この態様のさらなる実施形態は、1つ以上の光合成電子伝達タンパク質が、シトクロムc6タンパク質であることを含む。この態様のさらに別の実施形態は、シトクロムc6タンパク質が、藻類のシトクロムc6タンパク質であることを含む。この態様のさらなる実施形態において、藻類のシトクロムc6タンパク質は、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号95または配列番号102に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態において、藻類のシトクロムc6タンパク質は、配列番号95に対して少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態は、1つ以上の光合成電子伝達タンパク質がリスケ鉄硫黄タンパク質であることを含む。この態様のさらなる実施形態において、リスケ鉄硫黄タンパク質は、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、または配列番号101に対して少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態は、1つ以上の光合成電子伝達タンパク質がシトクロムc6タンパク質およびリスケ鉄硫黄タンパク質であることを含む。この態様のさらなる実施形態において、シトクロムc6タンパク質は、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号95、または配列番号102に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み;および、リスケ鉄硫黄タンパク質は、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、または配列番号101に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
シトクロムc6を有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができる本態様のさらに別の実施形態では、シトクロムc6タンパク質が、遺伝子改変植物の細胞内の少なくとも1つの葉緑体のチラコイドルーメンに局在する。この態様のさらなる実施形態は、シトクロムc6タンパク質をチラコイドルーメンに局在させる輸送ペプチドを含むシトクロムc6タンパク質を含む。この態様のさらなる実施形態は、クロロフィルa/b結合タンパク質6輸送ペプチド、集光性複合体Iクロロフィルa/b結合タンパク質1輸送ペプチド、または、プラストシアニンシグナルペプチド、の群から選択されるシトクロムc6輸送ペプチドを含む。リスケ鉄硫黄を有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができる本態様のさらに別の実施形態では、リスケ鉄硫黄タンパク質が、リスケ鉄硫黄タンパク質をチラコイド膜に局在させる輸送ペプチドを含む。この態様のさらなる実施形態は、シトクロムf輸送ペプチド、シトクロムb6輸送ペプチド、PetD輸送ペプチド、PetG輸送ペプチド、PetL輸送ペプチド、PetN輸送ペプチド、PetM輸送ペプチド、および、プラストキノン輸送ペプチド、の群から選択されるリスケ鉄硫黄輸送ペプチドを含む。シトクロムc6を有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、植物プロモーターに作動可能に連結された核酸配列をコードするシトクロムc6タンパク質をさらに含む。この態様のさらなる実施形態は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、から選択されるプロモーターを含む。リスケ鉄硫黄を有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、植物プロモーターに作動可能に連結された核酸配列をコードするリスケ鉄硫黄タンパク質をさらに含む。この態様のさらなる実施形態は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、から選択されるプロモーターを含む。
前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態では、RuBP再生を向上する1つ以上の遺伝子改変は、CBタンパク質の過剰発現を含む。この態様のさらなる実施形態は、セドヘプツロース-1,7-ビスホスファターゼ(SBPase)、フルクトース-1,6-ビスホスフェートアルドラーゼ(FBPA)、葉緑体フルクトース-1,6-ビスホスファターゼ(FBPase)、二機能性フルクトース-1,6-ビスホスファターゼ/セドヘプツロース-1,7-ビスホスファターゼ(FBP/SBPase)、または、トランスケトラーゼ(TK)、の群から選択されるCBタンパク質を含む。この態様のさらなる実施形態は、SBPaseであるCBタンパク質を含む。この態様のさらに別の実施形態において、SBPaseは、配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、または配列番号96に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態は、遺伝子改変植物の細胞内の少なくとも1つの葉緑体の葉緑体ストロマに局在しているSBPaseを含む。この態様のさらに別の実施形態において、SBPaseは、葉緑体ストロマにSBPaseを局在させる輸送ペプチドを含む。SBPaseを有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、植物プロモーターに作動可能に連結された核酸配列をコードするSBPaseをさらに含む。この態様のさらなる実施形態は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、から選択されるプロモーターを含む。この態様のさらなる実施形態は、FBPAであるCBタンパク質を含む。この態様のさらに別の実施形態では、FBPAが、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、または配列番号97に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態は、遺伝子改変植物の細胞内の少なくとも1つの葉緑体の葉緑体ストロマに局在されるFBPAを含む。この態様のさらに別の実施形態において、FBPAは、葉緑体ストロマにFBPAを局在化する輸送ペプチドを含む。FBPAを有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、植物プロモーターに作動可能に連結された核酸配列をコードするFBPAをさらに含む。この態様のさらなる実施形態は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、から選択されるプロモーターを含む。この態様のさらなる実施形態は、FBPaseであるCBタンパク質を含む。この態様のさらに別の実施形態において、FBPaseは、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、または配列番号98に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態は、遺伝子改変植物の細胞内の少なくとも1つの葉緑体の葉緑体ストロマに局在しているFBPaseを含む。この態様のさらに別の実施形態において、FBPaseは、葉緑体ストロマにFBPaseを局在される輸送ペプチドを含む。FBPaseを有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、植物プロモーターに作動可能に連結された核酸配列をコードするFBPaseをさらに含む。この態様のさらなる実施形態は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、から選択されるプロモーターを含む。この態様のさらなる実施形態は、FBP/SBPaseであるCBタンパク質を含む。この態様のさらなる実施形態は、シアノバクテリアFBP/SBPaseであるFBP/SBPaseを含む。この態様のさらに別の実施形態において、シアノバクテリアFBP/SBPaseは、配列番号38、配列番号39、配列番号40、または配列番号99に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。FBP/SBPaseを有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、遺伝子改変植物の細胞内の少なくとも1つの葉緑体の葉緑体ストロマに局在しているFBP/SBPaseを含む。この態様のさらなる実施形態において、FBP/SBPaseは、葉緑体ストロマにFBP/SBPaseを局在させる輸送ペプチドを含む。この態様のさらなる実施形態は、ゲラニオールシンターゼ輸送ペプチド、SBPase輸送ペプチド、FBPA輸送ペプチド、FBPase輸送ペプチド、トランスケトラーゼ輸送ペプチド、PGK輸送ペプチド、GAPDH輸送ペプチド、AGPase輸送ペプチド、RPI輸送ペプチド、RPE輸送ペプチド、PRK輸送ペプチド、または、ルビスコ(Rubisco)輸送ペプチド、の群から選択される輸送ペプチドを含む。FBP/SBPaseを有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、植物プロモーターに作動可能に連結された核酸配列をコードするFBP/SBPaseをさらに含む。この態様のさらなる実施形態は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、から選択されるプロモーターを含む。この態様のさらなる実施形態は、トランスケトラーゼであるCBタンパク質を含む。この態様のさらに別の実施形態において、トランスケトラーゼは、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、または配列番号100に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態は、遺伝子改変植物の細胞内の少なくとも1つの葉緑体の葉緑体ストロマに局在しているトランスケトラーゼを含む。トランスケトラーゼを有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、植物プロモーターに作動可能に連結された核酸配列をコードするトランスケトラーゼをさらに含む。この態様のさらなる実施形態は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、から選択されるプロモーターを含む。
植物に内因性であり得るCBタンパク質を有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらなる実施形態は、内因性であるCBタンパク質をコードする核酸を含む。この態様のさらなる実施形態は、CBタンパク質を、過剰発現し、誘導的に発現し、特定の組織または細胞型において発現し、誘導的に過剰発現し、または特定の組織または細胞型において誘導的に発現するように遺伝子操作される、CBタンパク質をコードする核酸に作動可能に連結されるプロモーターを含む。CBタンパク質を有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、異種由来であるCBタンパク質をコードする核酸を含む。
核酸配列をコードするリスケ鉄硫黄タンパク質を有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、内因性であるリスケ鉄硫黄タンパク質をコードする核酸を含む。この態様のさらなる実施形態は、リスケ鉄硫黄タンパク質を、過剰発現し、誘導的に発現し、特定の組織または細胞型において発現し、誘導的に過剰発現し、または特定の組織または細胞型において誘導的に発現するように遺伝子操作される、リスケ鉄硫黄タンパク質をコードする核酸に作動可能に連結されたプロモーターを含む。核酸配列をコードするリスケ鉄硫黄タンパク質を有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、異種由来であるCBタンパク質をコードする核酸を含む。
前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態において、植物は、未改変の野生型(WT)植物と比較して、増加したバイオマスを有する。この態様のさらなる実施形態は、1000μmol m-2 s-1を超える光量を有する条件下で生育させた場合、未改変のWT植物と比較して、改善した水利用効率を有する植物を含む。この態様のさらなる実施形態は、カウピー、ダイズ、キャッサバ、イネ、コムギ、オオムギ、トマト、ジャガイモ、タバコ、カノーラ、または、他のC3作物植物、の群から選択される植物を含む。この態様のさらに別の実施形態は、カウピー、ダイズ、キャッサバ、イネ、コムギ、オオムギ、および、タバコ、の群から選択される植物を含む。
植物の一部に関して前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、葉、茎、根、塊茎、花、種子、穀粒(kernel)、穀粒(grain)、果実、細胞、またはそれらの一部である植物の一部、および1つ以上の遺伝子改変を含む遺伝子改変植物の一部を含む。この態様のさらなる実施形態は、果実、塊茎、穀粒(kernel)、または穀粒(grain)である植物の一部を含む。花粉粒または胚珠に関して前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、前述の実施形態のいずれか1つの植物の遺伝子改変花粉粒または遺伝子改変胚珠を含み、遺伝子改変花粉粒または遺伝子改変胚珠は、1つ以上の遺伝子改変を含む。前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらなる実施形態は、前述の実施形態のいずれかの遺伝子改変植物から生産された遺伝子改変プロトプラストを含み、遺伝子改変プロトプラストは、1つ以上の遺伝子改変を含む。前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらなる実施形態は、前述の実施形態のいずれか1つの遺伝子改変植物由来のプロトプラストまたは細胞から生産された遺伝子改変組織培養物を含み、細胞またはプロトプラストは、葉、葉肉細胞、葯、めしべ、茎、葉柄、根、根端、塊茎、果実、種子、穀粒(kernel)、穀粒(grain)、花、子葉、胚軸、胚、または分裂組織の細胞の群から選択された植物の一部から生産され、遺伝子改変組織培養物は、1つ以上の遺伝的改変を含む。この態様のさらなる実施形態は、1つ以上の遺伝子改変を含む遺伝子改変組織培養物から再生された遺伝子改変植物を含む。前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、前述の実施形態のいずれか1つの遺伝子改変植物から生産された遺伝子改変植物種子を含む。
本開示のさらなる態様は、以下を含む前述の実施形態のいずれかの遺伝子改変植物を生産する方法を含む:(a)CBタンパク質の活性を増加するRuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変、光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変、またはCBタンパク質の活性を増加するRuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変および光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変の両方を植物細胞、組織、または他の外植片に導入すること;(b)遺伝子改変プラントレット(plantlet)に植物細胞、組織、または他の外植片を再生すること;および、(c)CBタンパク質の活性を増加するRuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変、光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変、またはCBタンパク質の活性を増加するRuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変および光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変の両方を有する遺伝子改変植物に遺伝子改変プラントレットを育てること。この態様のさらなる実施形態は、工程(b)の前に植物細胞、組織、または他の外植片をスクリーニングまたは選択すること;工程(b)と(c)との間にプラントレットをスクリーニングまたは選択すること;または工程(c)の後に植物をスクリーニングまたは選択すること、によって、1つ以上の遺伝子改変の成功した導入を確認することをさらに包含する。前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態では、形質転換が粒子衝撃(すなわち、バイオリスティック、遺伝子銃)、アグロバクテリウム媒介形質転換、リゾビウム媒介形質転換、または、プロトプラストトランスフェクションもしくは形質転換、の群から選択される形質転換方法を使用して行われる。
前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、ベクターを用いて導入される遺伝子改変を含む。この態様のさらなる実施形態において、ベクターは、1つ以上の光合成電子伝達タンパク質をコードするヌクレオチドに作動可能に連結されたプロモーター、1つ以上のCBタンパク質をコードするヌクレオチド、または1つ以上の光合成電子伝達タンパク質および1つ以上のCBタンパク質をコードするヌクレオチドを含む。この態様のさらに別の実施形態は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、の群から選択されるプロモーターを含む。前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらなる実施形態において、光合成電子伝達タンパク質が、シトクロムc6タンパク質、リスケ鉄硫黄タンパク質、または、シトクロムc6タンパク質およびリスケ鉄硫黄タンパク質、の群から選択される。この態様のさらに別の実施形態において、シトクロムc6タンパク質は、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号95または配列番号102に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらに別の実施形態において、リスケ鉄硫黄タンパク質は、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、または配列番号101に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態において、ベクターは、CBタンパク質をコードする核酸に作動可能に連結された核ゲノム配列を標的とする1つ以上の遺伝子編集構成要素を含む。本態様のさらに別の実施形態において、1つ以上の遺伝子編集構成要素は、核ゲノム配列を標的とするリボヌクレオタンパク質複合体;TALENタンパク質をコードしている配列を含んでいるベクター(TALENタンパク質は核ゲノム配列を標的とする);ZFNタンパク質をコードする配列を含むベクター(ZFNタンパク質は核ゲノム配列を標的とする);オリゴヌクレオチドドナー(ODN)(ODNは核ゲノム配列を標的とする);または、CRISPR/Cas酵素をコードする配列および標的配列を含むベクター(標的配列は核ゲノム配列を標的とする)、の群から選択される。
1つ以上のCBタンパク質をコードするヌクレオチドを含んでいるベクターを有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらなる実施形態において、CBタンパク質が、セドヘプツロース-1,7-ビスホスファターゼ(SBPase)、フルクトース-1,6-ビスホスフェートアルドラーゼ(FBPA)、葉緑体フルクトース-1,6-ビスホスファターゼ(FBPase)、二機能性フルクトース-1,6-ビスホスファターゼ/セドヘプツロース-1,7-ビスホスファターゼ(FBP/SBPase)、または、トランスケトラーゼ(TK)、の群から選択される。この態様のさらなる実施形態において、CBタンパク質はSBPaseであり、SBPアーゼは、配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、または配列番号96に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様の別の実施形態において、CBタンパク質はFBPAであり、FBPAは、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、または配列番号97に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらに別の実施形態において、CBタンパク質はFBPaseであり、FBPaseは、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、または配列番号98に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態において、CBタンパク質はFBP/SBPaseであり、FBP/SBPaseは、配列番号38、配列番号39、配列番号40、または配列番号99に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらに別の実施形態において、CBタンパク質はトランスケトラーゼであり、トランスケトラーゼは、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、または配列番号100に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
本開示のさらなる態様は、遺伝子改変植物を有する前述の実施形態のいずれかの遺伝子改変植物を栽培する方法を含み、当該方法は、遺伝子改変実生苗(seedling)、遺伝子改変プラントレット、遺伝子改変挿し木、遺伝子改変塊茎、遺伝子改変根、または遺伝子改変種子を土壌中に植え付けて、遺伝子改変植物を生産する、または遺伝子改変実生苗、遺伝子改変プラントレット、または遺伝子改変挿し木を土壌中で育てた根茎または第2の植物に接合して、遺伝子改変植物を生産する工程;植物を栽培して、収穫可能な種子、収穫可能な葉、収穫可能な根、収穫可能な挿し木、収穫可能な木、収穫可能な果実、収穫可能な穀粒(kernel)、収穫可能な塊茎、および/または収穫可能な穀粒(grain)を生産する工程;ならびに収穫可能な種子、収穫可能な葉、収穫可能な根、収穫可能な挿し木、収穫可能な木、収穫可能な果実、収穫可能な穀粒(kernel)、収穫可能な塊茎、および/または収穫可能な穀粒(grain)を収穫する工程、を含む。
〔図面の簡単な説明〕
本特許または本出願書類は、カラーを付して作成された少なくとも1つの図面を含んでいる。カラー図面を伴っている本特許または本特許出願公報の写しは、請求および必要な手数料の納付によって、特許庁が提供する。
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図1A~1Bは、トランスジェニックN.tabacum系統を生成するために使用されるコンストラクトの模式図を示す。図1Aは、N.tabacum品種 Petit HavanaにおけるFBP/SBPase(SynFBP/SBPase)の発現に使用されるコンストラクト(上部、EC23083)およびPorphyra umbilicalisシトクロムc6(PuCytc6)の発現に使用されるコンストラクト(下部、EC23028)を示す。図1Bは、N.tabacum品種 Samsunにおけるシトクロムc6(PuCytc6)の発現に使用されるコンストラクト(B2-C6)を示す。RB=T-DNA右縁;pFMV=ゴマノハグサモザイクウイルスプロモーター;tNOS=ノパリンシンターゼターミネーター;35S=カリフラワーモザイクウイルス35Sプロモーター;HPT=A.thalianaヒートショックタンパク質18.2(HSP)ターミネーター;LB=T-DNA左縁;p2x35S=2xカリフラワーモザイクウイルス35Sプロモーター;tHSP=A.thalianaヒートショックタンパク質18.2(HSP)ターミネーター;pNos=ノパリンシンターゼプロモーター;NPT II=ネオマイシンホスホトランスフェラーゼ遺伝子。
図2A~2Eは、FBP/SBPase、SBPase、およびシトクロムc6を過剰発現するトランスジェニック植物のスクリーニングを示す。図2Aは、SB系統(FBP/SBPaseを発現するN.tabacum品種 Petit Havana系統;SB系統03、06、21、および44)、C6系統(シトクロムc6を発現するN.tabacum品種 Petit Havana系統;C6系統15、41、47および50)、SBC6系統(FBP/SBPaseおよびシトクロムc6を発現するN.tabacum品種 Petit Havana系統;SBC6系統1、2、および3)、ならびにコントロール系統(CN;WTおよびazygous植物の両方)における転写レベルを示す。図2Bは、S系統(SBPaseを発現するN.tabacum品種 Samsun系統;S系統30および60)、SC6系統(SBPaseおよびシトクロムc6を発現するN.tabacum品種 Samsun系統;SC6系統1、2および3)、ならびにコントロール系統(CN;WTおよびazygous植物の両方)における転写レベルを示す。図2Cは、コントロール(CN;WTおよびazygous植物の両方)に対するSB系統およびSBC6系統におけるFBPase活性を示す。図2D~2Eは、600~650μmol m-2 s-1(PPFD)でのFq’/Fm’(最大PSII作動効率)を測定するために用いられた、管理された環境条件下で生育させた植物のクロロフィル蛍光イメージングを示す。図2Dは、600PPFDでのコントロール(CN;WTおよびazygous植物の両方)、SB系統、C6系統およびSBC6系統(1系統当たり6個の植物;1操作当たり3~4系統)の最大PSII作動効率を示す。図2Eは、650PPFDでのコントロール(CN;WT植物)、S系統およびSC6系統(CN=1操作当たり11個の植物;SおよびSC6系統=1操作当たり6~7個の植物)の最大PSII作動効率を示す。図2C~2Eにおいて、アスタリスクは、コントロール群と統計的に異なる系統を示す(*P<0.05)。
図3A~3Bは、トランスジェニックN.tabacum 品種Petit HavanaおよびN.tabacum 品種Samsun植物の生化学分析を示す。図3Aは、野生型(WT)コントロール植物(CN)由来の抽出物と比較した、FBP/SBPase(SB系統03、06、21、および44)およびFBP/SBPase+シトクロムc6(SBC6系統1、2、および3)を発現するN.tabacum 品種Petit Havana系統の成熟葉由来の複数の実験を代表するタンパク質抽出物のイムノブロット解析を示し、FBP/SBPase抗体に対してブロットした。グリシン切断システム由来のHタンパク質の発現は、ローディングコントロール(loding control)として使用した。図3Bは、WTコントロール植物(CN)由来の抽出物と比較した、SBPase(S系統S30およびS60)およびSBPase+シトクロムc6(SC6系統1、2、および3)を発現するN.tabacum 品種Samsun系統の成熟葉由来の複数の実験を代表するタンパク質抽出物のイムノブロット解析を示し、SBPase抗体に対してブロットした。図3A~3Bでは、グリシン切断システム(Hタンパク質)、トランスケトラーゼ(TK)、およびRubiscoからのHタンパク質の発現をローディングコントロールとして使用した。イムノブロット解析を、植物の複数のセットについて繰り返し、示した結果は、典型的なブロットの代表である。
図4は、図2Cに示した、分析したN.tabacum 品種Petit Havana植物におけるFBPase酵素アッセイの完全なデータセットを示す。棒は、コントロール(WTおよびazygous植物の両方)におけるFBPase活性に対する試験したトランスジェニック系統におけるFBPase活性を表す。それぞれの棒は、FBP/SBPaseを発現するSB系統(SB03、SB06、SB21、SB44;中央に表示され、「SB」とラベル表示されている)、FBP/SBPase+シトクロムc6を発現するSBC6系統(SBC1、SBC2、SBC3;右側に表示され、「SBC6」とラベル表示されている)、およびコントロール系統(CN;WTおよびazygous植物の両方;左側に黒色で表示されている)由来の個々の植物である。平均的なコントロール活性は、相対的なFBPase活性の1.0に黒い横棒で表示され、および「CN」とラベル表示されている。
図5A~5Bは、シトクロムc6を発現するトランスジェニックN.tabacum 品種Petit Havana植物の生化学分析を示す。図5Aは、C6系統(C15、C41、およびC47)、WTコントロール系統、およびヌルセグリガント(A)コントロール系統、ならびにPorphyra umbilicalis粗タンパク質抽出物(P)の発育中の葉のプール由来のタンパク質抽出物のイムノブロット解析を示す。図5Bは、図5Aにおけるイムノブロット膜のポンソー染色を示し、図5Aにおける植物葉抽出物と同様のローディングレベルであることを明らかにした。
図6A~6Bは、2017年の圃場実験(すなわち、圃場栽培植物を評価する実験)中の平均環境条件を示す。図6Aは、2017年の圃場実験からの平均の1日の光量(μmol m-2 s-1)を示す。図6Bは、2017年の圃場実験からの気温(℃)を示す。図6A~6Bにおいて、黒色=2017年 実験1、および灰色=2017年実験2である。
図7A~7Bは、管理された条件下(すなわち、温室(GH))で生育したトランスジェニック植物の光合成応答を示す。図7A~7Bは、光合成の炭素固定率(A(μmol m -2 s-1))、光におけるPSIIの実際の作動効率(Fq’/Fm’)、PSIIから引き出された電子シンク(electron sinks)(Fq’/Fv’)、およびPSIIの最大効率(Fv’/Fm’)を示している。パラメータは、飽和光レベル(400μmol m-2 s-1から1000μmol m-2 s-1の間で発振された温室内の自然光レベル;400μmol m-2 s-1の最小の放射照度レベルを維持するために必要に応じて、補助光が提供された)でのCO2濃度の増加(Ci(μmol m-2))の関数として決定された。図7Aは、FBP/SBPase(SB)、シトクロムc6(C6)、FBP/SBPase+シトクロムc6(SBC6)、およびコントロール(CN;WTおよびazygous植物の両方)を発現するN.tabacum 品種Petit Havana系統の成熟葉の光合成応答を示す。図7Bは、SBPase(S)、SBPase+シトクロムc6(SC6)、およびコントロール(CN;WTおよびazygous植物の両方)を表現するN.tabacum 品種Samsun系統の成熟葉(左列)および発育中の葉(すなわち、長さ11~13cm;右列)の光合成応答を示す。図7A~7Bにおいて、3~4個の独立したトランスジェニック系統由来の3~4個の個々の植物を評価した。アスタリスクは、線形混合効果モデルおよびIII型ANOVAを用いて決定したトランスジェニックとコントロール群との間の有意性を示す、*P<0.05、**P<0.01、***P<0.001。
図8は、SBPaseの発現の増加またはFBP/SBPase+シトクロムc6の発現の増加が、管理された条件下(すなわち、温室(GH))で生育された植物におけるバイオマスを増加させることを示す。グラフの左列は、FBP/SBPase(SB)、シトクロムc6(C6)、およびFBP/SBPase+シトクロムc6(SBC6)を発現する40日齢のN.tabacum 品種Petit Havana系統についてのコントロール値の割合として表示された植物の高さ、葉面積、および地上バイオマス乾燥重量の平均±SEを示す。グラフの右列は、SBPase(S)およびSBPase+シトクロムc6(SC6)を発現する56日齢のN.tabacum 品種Samsun系統についてのコントロール値の割合として表示された植物の高さ、葉面積、および地上バイオマス乾燥重量の平均±SEを示す。2~4個の独立したトランスジェニック系統由来の5~6個の個々の植物を評価した。WTおよびazygous植物の両方を含有するコントロール群について得られた値は、100%に設定された灰色の陰影として示され、グラフ上に重ねられている。アスタリスクは、チューキーの事後検定を用いたANOVAを使用して決定されたトランスジェニックとコントロール群との間、または遺伝子型間の有意性を示す、*P<0.05、**P<0.01、***P<0.001。
図9は、SBPaseの発現の増加、またはFBP/SBPase+シトクロムc6の発現の増加が、GH生育植物のバイオマスの増加を引き起こすことを示す。グラフの左列は、FBP/SBPase(SB)、シトクロムc6(C6)、およびFBP/SBPase+シトクロムc6(SBC6)を発現する40日齢のN.tabacum 品種Petit Havana系統についてのコントロール値の割合として表示された葉数、葉乾燥重量、および茎乾燥重量の平均±SEを示す。グラフの右列は、SBPase(S)およびSBPase+シトクロムc6(SC6)を発現する56日齢のN.tabacum 品種Samsun系統についてのコントロール値の割合として表示された葉数、葉乾燥重量、および茎乾燥重量の平均±SEを示す。2~4個の独立したトランスジェニック系統由来の5~6個の個々の植物を評価した。WTおよびazygous植物の両方を含有するコントロール群について得られた値は、100%に設定された灰色の陰影として示され、グラフ上に重ねられている。アスタリスクは、チューキーの事後検定を用いたANOVAを使用して決定されたトランスジェニックとコントロール群との間、または遺伝子型間の有意性を示す、*P<0.05、**P<0.01、***P<0.001。
図10A~10Cは、FBP/SBPase+シトクロムc6の同時発現が、圃場栽培植物におけるバイオマスを増大させることを示す。図10Aは、シトクロムc6(C6)またはFBP/SBPase(SB)を発現する40日齢(すなわち、若い)の2016年圃場栽培N.tabacum 品種Petit Havana植物についてのコントロール値の割合として表示された、植物の高さ、葉面積、および地上バイオマス乾燥重量の平均±SEを示す。図10Bは、FBP/SBPase(SB系統;薄い灰色の棒)またはシトクロムc6(C6系統;濃い灰色の棒)を発現する57日齢の圃場栽培N.tabacum 品種Petit Havana植物についてのコントロール値の割合として表示された、植物の高さ、葉面積、および地上バイオマス乾燥重量の平均±SEを示す。図10Cは、シトクロムc6(C6系統;濃い灰色の棒)またはFBP/SBPase+シトクロムc6(SBC6系統;白色の棒)を発現する61日齢(すなわち、開花期)の圃場栽培N.tabacum 品種Petit Havana植物についてのコントロール値の割合として表示された、植物の高さ、葉面積、および地上バイオマス乾燥重量の平均±SEを示す。2~3個の独立したトランスジェニック系統(図10A)由来の6個の個々の植物または2~3個の独立したトランスジェニック系統(図10B~10C)由来の24個の個々の植物を評価した。WTおよびazygous植物の両方を含有するコントロール群について得られた値は、100%に設定された灰色の陰影として示され、グラフ上に重ねられている。アスタリスクは、チューキーの事後検定を用いたANOVAを使用してトランスジェニックとコントロール群との間、または遺伝子型間の有意性を示す、*P<0.05、**P<0.01、***P<0.001。
図11A~11Bは、圃場栽培トランスジェニック植物の光合成能力を示す。図11Aは、FBP/SBPase(SB)、シトクロムc6(C6)、コントロール植物(CN;WTとazygous植物の両方)を発現する圃場栽培N.tabacum 品種Petit Havana系統由来の成熟葉における飽和光レベルでのCO2濃度の増加(Ci(μmol m -2))の関数として、光合成の炭素固定率(A(μmol m-2 s-1))およびPSIIの作動効率(Fq’/Fm’)を示す。差し込み棒グラフは、圃場栽培SBおよびC6 N.tabacum 品種Petit Havana系統、ならびにCN系統由来の成熟葉の最大炭素固定率(Amax)を示す。図11Bは、シトクロムc6(C6)、FBP/SBPase+シトクロムc6(SBC6)、およびコントロール植物(CN;WTおよびazygous植物の両方)を発現する圃場栽培N.tabacum 品種Petit Havana系統由来の成熟葉における飽和光レベルでのCO2濃度の増加(Ci(μmol m-2)の関数として、光合成の炭素固定率(A(μmol m-2 s-1))およびPSIIの作動効率(Fq’/Fm’)を示す。差し込み棒グラフは、圃場栽培C6およびSBC6 N.tabacum 品種Petit Havana系統、ならびにCN系統由来の成熟葉の最大炭素固定率(Amax)を示す。図11A~11Bにおいて、2~3個の独立したトランスジェニック系統由来の4~5個の個々の植物の平均±SEを示す。アスタリスクは、線形混合効果モデルおよびIII型ANOVAによって決定されたときの、トランスジェニックとコントロール群との間の有意性を示す、*P<0.05。
図12A~12Dは、FBP/SBPase+シトクロムc6の同時発現が、圃場条件下での水利用効率を増加させることを示す。図12Aは、平均±SEの正味のCO2同化速度(A(μmol m-2 s-1))を示し、図12Bは、平均±SEの気孔伝導度(gs(mol m-2 s-1))を示し、図12Cは、平均±SEの細胞間CO2濃度(Ci(μmol m-2))を示し、図12Dは、平均±SEの潜在的水利用効率(iWUE(A/gs))を示す。図12A~12Dに示されるパラメータは、シトクロムc6(C6)、FBP/SBPase+シトクロムc6(SBC6)、およびコントロール植物(CN;WTおよびazygous植物の両方)を発現する圃場栽培N.tabacum 品種Petit Havana系統における光(PPFD(μmol m-2 s-1))の関数として提供される。2~3個の独立したトランスジェニック系統由来の4~5個の個々の植物を評価した。アスタリスクは、線形混合効果モデルおよびIII型ANOVAを使用して決定したトランスジェニック系統とコントロール群との間の有意性を示す、*P<0.05、**P<0.01、***P<0.001。
図13A~13Dは、2017年圃場実験1にてFBP/SBPaseまたはシトクロムc6を発現したN.tabacum 品種Petit Havana植物における吸収光量に対するガス交換パラメータの応答を示す。図13Aは、正味のCO2同化速度(A(μmol m-2 s-1))を示し、図13Bは、気孔伝導度(gs(mol m-2 s-1))を示し、図13Cは、細胞間CO2濃度(Ci(μmol m-2))を示し、図13Dは、潜在的水利用効率(iWUE(A/gs))を示す。図13A~13Dに示されるパラメータは、FBP/SBPase(SB)、シトクロムc6(C6)、およびコントロール植物(CN;WTおよびazygous植物の両方)を発現する圃場栽培N.tabacum 品種Petit Havana系統における光(PPFD(μmol m-2 s-1))の関数として提供される。2~3個の独立したトランスジェニック系統由来の4~5個の個々の植物を評価し、平均±SEを示した。アスタリスクは、線形混合効果モデルおよびIII型ANOVAを使用して決定した群間の有意性を示す、*P<0.05、**P<0.01、***P<0.001。
図14A~14Dは、Chlamydomonas reinhardtii(C_reinhardtii_SBPase_XP_001691997.1(配列番号13);C reinhardtii_SBPase_P46284.1(配列番号14))、Zea mays(Z_mays_SBPase_NP_001148402.1(配列番号10);Z_mays_SBPase_ONM36378.1 配列番号11))、Brachypodium distachyon(配列番号9)、Triticum aestivum(T_aestivum_SBPase_P46285.1(配列番号7);T_aestivum_SBPase_CBH32512.1(配列番号8))、Arabidopsis thaliana(配列番号1)、Brassica napus(配列番号2)、Ananas comosus(配列番号6)、Glycine max(配列番号12)、Solanum lycopersicum(配列番号3)、およびNicotiana tabacum(N_tabacum_SBPase_016455125.1(配列番号4);N_tabacum_SBPase_016497321.1(配列番号5))由来のSBPaseポリペプチド配列のアラインメントを示す。図14Aは、SBPaseポリペプチドのN末端部のアラインメントを示す。図14Bは、SBPaseポリペプチドの中央部の第1部分のアラインメントを示す(囲みは、非TRx(酸化還元)活性化SBPaseを有する植物を産生するために変異されるべきシステイン残基を示す)。図14Cは、SBPaseポリペプチドの中央部の第2部分のアラインメントを示す。図14Dは、SBPaseポリペプチドのC末端部を示す。
図15A~15Dは、Chlamydomonas reinhardtii(配列番号26)、Arabidopsis thaliana(配列番号17)、Brassica napus(配列番号18)、Solanum lycopersicum(配列番号15)、Nicotiana tabacum(配列番号16)、Glycine max(G_max_FBPA_NP_001347079.1(配列番号22)、G_max_FBPA1_XP_003522841.1(配列番号23))、Ananas comosus(配列番号24)、Zea mays(Z_mays_FBPA_ACG36798.1(配列番号19)、Z_mays_FBPA_PWZ45921.1(配列番号20))、Triticum aestivum(配列番号21)、およびBrachypodium distachyon(配列番号25)由来のFBPAポリペプチド配列のアラインメントを示す。図15Aは、FBPAポリペプチドのN末端部のアラインメントを示す。図15Bは、FBPAポリペプチドの中央部の第1部分のアラインメントを示す。図15Cは、FBPAポリペプチドの中央部の第2部分のアラインメントを示す。図15Dは、FBPAポリペプチドのC末端部のアラインメントを示す。
図16A~16Dは、Chlamydomonas reinhardtii(配列番号37)、Zea mays(配列番号35)、Brachypodium distachyon(配列番号33)、Triticum aestivum(配列番号36)、Arabidopsis thaliana(配列番号27)、Brassica napus(配列番号34)、Glycine max(G_max_FBPase_NP_001238269.2(配列番号28);G_max_FBPase_XP_003552216.1(配列番号29))、Nicotiana tabacum(配列番号30)、およびSolanum lycopersicum(配列番号32)由来のFBPaseポリペプチド配列のアラインメントを示す。図16Aは、FBPaseポリペプチドのN末端部のアラインメントを示す。図16Bは、FBPaseポリペプチドの中央部の第1部分のアラインメントを示す。図16Cは、FBPaseポリペプチドの中央部の第2部分のアラインメントを示す。図16Dは、FBPaseポリペプチドのC末端部のアラインメントを示す。図16B~16Cにおいて、囲みは、非TRx(酸化還元)活性化FBPaseを有する植物を産生するために変異されるべきシステイン残基を示す。
図17A~17Bは、Synechocystis種 PCC6803(配列番号38)、Synechocystis種 PCC6714(配列番号39)およびMicrocystis aeruginosa(配列番号40)由来のFBP/SBPaseポリペプチド配列のアラインメントを示す。図17Aは、FBP/SBPaseポリペプチドのN末端部のアラインメントを示す。図17Bは、FBP/SBPaseポリペプチドのC末端部のアラインメントを示す。
図18A~18Eは、Brachypodium distachyon(B_distachyon_TK_XP_003557240.1(配列番号46);B_distachyon_TK_XP_003581128.1(配列番号47))、Zea mays(配列番号45)、Nicotiana tabacum(配列番号43)、Solanum lycopersicum(配列番号44)、Arabidopsis thaliana(A_thaliana_TK1(配列番号41);A_thaliana_TK2(配列番号48))、およびBrassica napus(配列番号42)由来のトランスケトラーゼポリペプチド配列のアラインメントを示す。図18Aは、トランスケトラーゼポリペプチドのN末端部のアラインメントを示す。図18Bは、トランスケトラーゼポリペプチドの中央部の第1部分のアラインメントを示す。図18Cは、トランスケトラーゼポリペプチドの中央部の第2部分のアラインメントを示す。図18Dは、トランスケトラーゼポリペプチドの中央部の第3部分のアラインメントを示す。図18Eは、トランスケトラーゼポリペプチドのC末端部のアラインメントを示す。
図19A~19Bは、Chlamydomonas reinhardtii(配列番号80)、Ananas comosus(配列番号74)、Zea mays(配列番号78)、Oryza sativa(配列番号76)、Triticum aestivum(配列番号75)、Brachypodium distachyon(配列番号77)、Arabidopsis thaliana(配列番号70)、Brassica napus(配列番号71)、Glycine max(配列番号79)、Solanum lycopersicum(配列番号72)、およびNicotiana tabacum(配列番号73)由来のリスケ鉄硫黄ポリペプチド配列のアラインメントを示す。図19Aは、リスケ鉄硫黄ポリペプチドのN末端部のアラインメントを示す。図19Bは、トランスケトラーゼポリペプチドのC末端部のアラインメントを示す。
図20A~20Cは、Chlamydomonas reinhardtii(配列番号49)、Oscillatoria acuminata(配列番号68)、Chamaesiphon polymorphus(配列番号69)、Pyropia tenera(配列番号53)、Porphyra umbilicalis(配列番号95)、Porphyra purpurea(配列番号51)、Bangia fuscopurpurea(配列番号50)、Pyropia pulchra(配列番号52)、Ulva fasciata(配列番号64)、Thorea hispida(配列番号55)、Gracilaria ferox(配列番号58)、Gracilariopsis mclachlanii(配列番号62)、Ahnfeltia plicata(配列番号56)、Porolithon onkodes(配列番号57)、Saccharina japonica(配列番号67)、Sargassum confusum(配列番号59)、Fucus vesiculosus変種 spiralis(配列番号65)、Porphyridium purpureum(配列番号54)、Trachydiscus minutus(配列番号60)、Nannochloropsis oculata(配列番号66)、Vischeria種 CAUP Q(配列番号61)、およびMonodopsis種 MarTras21(配列番号63)由来のシトクロムc6ポリペプチド配列のアラインメントを示す。図20Aは、シトクロムc6ポリペプチドのN末端部のアラインメントを示す。図20Bは、シトクロムc6ポリペプチドの中央部のアラインメントを示す。図20Cは、シトクロムc6ポリペプチドのC末端部のアラインメントを示す。
〔詳細な説明〕
以下の説明は、例示的な方法、パラメータなどを記載する。しかしながら、そのような説明は本開示の適用範囲に対する限定として意図されておらず、代わりに、例示的な実施形態の説明として提供されることが認識されるべきである。
以下の説明は、例示的な方法、パラメータなどを記載する。しかしながら、そのような説明は本開示の適用範囲に対する限定として意図されておらず、代わりに、例示的な実施形態の説明として提供されることが認識されるべきである。
(遺伝子改変植物および種子)
本開示の態様は、遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞を含み、植物、植物の一部、または細胞は、CBタンパク質の活性を増加するRuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変および光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変を含む。この態様のさらなる実施形態は、1つ以上の光合成電子伝達タンパク質の過剰発現である光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変を含む。この態様のさらに別の実施形態は、シトクロムc6タンパク質、リスケ鉄硫黄タンパク質、または、シトクロムc6タンパク質およびリスケ鉄硫黄タンパク質、の群から選択される1つ以上の光合成電子伝達タンパク質を含む。この態様のさらなる実施形態は、シトクロムc6タンパク質である1つ以上の光合成電子伝達タンパク質を含む。この態様のさらに別の実施形態は、藻類のシトクロムc6タンパク質であるシトクロムc6タンパク質を含む。この態様のさらなる実施形態において、藻類のシトクロムc6タンパク質は、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号95、または配列番号102に対して、少なくとも70%配列同一性、少なくとも71%配列同一性、少なくとも72%配列同一性、少なくとも73%配列同一性、少なくとも74%配列同一性、少なくとも75%配列同一性、少なくとも76%配列同一性、少なくとも77%配列同一性、少なくとも78%配列同一性、少なくとも79%配列同一性、少なくとも80%配列同一性、少なくとも81%配列同一性、少なくとも82%配列同一性、少なくとも83%配列同一性、少なくとも84%配列同一性、少なくとも85%配列同一性、少なくとも86%配列同一性、少なくとも87%配列同一性、少なくとも88%配列同一性、少なくとも89%配列同一性、少なくとも90%配列同一性、少なくとも91%配列同一性、少なくとも92%配列同一性、少なくとも93%配列同一性、少なくとも94%配列同一性、少なくとも95%配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態において、藻類のシトクロムc6タンパク質は、配列番号95に対して、少なくとも70%配列同一性、少なくとも71%配列同一性、少なくとも72%配列同一性、少なくとも73%配列同一性、少なくとも74%配列同一性、少なくとも75%配列同一性、少なくとも76%配列同一性、少なくとも77%配列同一性、少なくとも78%配列同一性、少なくとも79%配列同一性、少なくとも80%配列同一性、少なくとも81%配列同一性、少なくとも82%配列同一性、少なくとも83%配列同一性、少なくとも84%配列同一性、少なくとも85%配列同一性、少なくとも86%配列同一性、少なくとも87%配列同一性、少なくとも88%配列同一性、少なくとも89%配列同一性、少なくとも90%配列同一性、少なくとも91%配列同一性、少なくとも92%配列同一性、少なくとも93%配列同一性、少なくとも94%配列同一性、少なくとも95%配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらに別の実施形態において、藻類のシトクロムc6タンパク質は、配列番号102に対して、少なくとも70%配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態は、リスケ鉄硫黄タンパク質である1つ以上の光合成電子伝達タンパク質を含む。この態様のさらなる実施形態において、リスケ鉄硫黄タンパク質は、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、または配列番号101に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%配の列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらに別の実施形態において、リスケ鉄硫黄タンパク質は、配列番号101に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態は、シトクロムc6タンパク質およびリスケ鉄硫黄タンパク質である1つ以上の光合成電子伝達タンパク質を含む。この態様のさらなる実施形態において、シトクロムc6タンパク質は、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号95、または配列番号102に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み;リスケ鉄硫黄タンパク質は、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、または配列番号101に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
本開示の態様は、遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞を含み、植物、植物の一部、または細胞は、CBタンパク質の活性を増加するRuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変および光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変を含む。この態様のさらなる実施形態は、1つ以上の光合成電子伝達タンパク質の過剰発現である光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変を含む。この態様のさらに別の実施形態は、シトクロムc6タンパク質、リスケ鉄硫黄タンパク質、または、シトクロムc6タンパク質およびリスケ鉄硫黄タンパク質、の群から選択される1つ以上の光合成電子伝達タンパク質を含む。この態様のさらなる実施形態は、シトクロムc6タンパク質である1つ以上の光合成電子伝達タンパク質を含む。この態様のさらに別の実施形態は、藻類のシトクロムc6タンパク質であるシトクロムc6タンパク質を含む。この態様のさらなる実施形態において、藻類のシトクロムc6タンパク質は、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号95、または配列番号102に対して、少なくとも70%配列同一性、少なくとも71%配列同一性、少なくとも72%配列同一性、少なくとも73%配列同一性、少なくとも74%配列同一性、少なくとも75%配列同一性、少なくとも76%配列同一性、少なくとも77%配列同一性、少なくとも78%配列同一性、少なくとも79%配列同一性、少なくとも80%配列同一性、少なくとも81%配列同一性、少なくとも82%配列同一性、少なくとも83%配列同一性、少なくとも84%配列同一性、少なくとも85%配列同一性、少なくとも86%配列同一性、少なくとも87%配列同一性、少なくとも88%配列同一性、少なくとも89%配列同一性、少なくとも90%配列同一性、少なくとも91%配列同一性、少なくとも92%配列同一性、少なくとも93%配列同一性、少なくとも94%配列同一性、少なくとも95%配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態において、藻類のシトクロムc6タンパク質は、配列番号95に対して、少なくとも70%配列同一性、少なくとも71%配列同一性、少なくとも72%配列同一性、少なくとも73%配列同一性、少なくとも74%配列同一性、少なくとも75%配列同一性、少なくとも76%配列同一性、少なくとも77%配列同一性、少なくとも78%配列同一性、少なくとも79%配列同一性、少なくとも80%配列同一性、少なくとも81%配列同一性、少なくとも82%配列同一性、少なくとも83%配列同一性、少なくとも84%配列同一性、少なくとも85%配列同一性、少なくとも86%配列同一性、少なくとも87%配列同一性、少なくとも88%配列同一性、少なくとも89%配列同一性、少なくとも90%配列同一性、少なくとも91%配列同一性、少なくとも92%配列同一性、少なくとも93%配列同一性、少なくとも94%配列同一性、少なくとも95%配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらに別の実施形態において、藻類のシトクロムc6タンパク質は、配列番号102に対して、少なくとも70%配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態は、リスケ鉄硫黄タンパク質である1つ以上の光合成電子伝達タンパク質を含む。この態様のさらなる実施形態において、リスケ鉄硫黄タンパク質は、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、または配列番号101に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%配の列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらに別の実施形態において、リスケ鉄硫黄タンパク質は、配列番号101に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態は、シトクロムc6タンパク質およびリスケ鉄硫黄タンパク質である1つ以上の光合成電子伝達タンパク質を含む。この態様のさらなる実施形態において、シトクロムc6タンパク質は、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号95、または配列番号102に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み;リスケ鉄硫黄タンパク質は、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、または配列番号101に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
シトクロムc6を有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態では、シトクロムc6タンパク質が、遺伝子改変植物の細胞内の少なくとも1つの葉緑体のチラコイドルーメンに局在する。この態様のさらなる実施形態は、シトクロムc6タンパク質をチラコイドルーメンに局在させる輸送ペプチドを含んでいるシトクロムc6タンパク質を含む。この態様のさらなる実施形態は、クロロフィルa/b結合タンパク質6輸送ペプチド、集光性複合体Iクロロフィルa/b結合タンパク質1輸送ペプチド、または、プラストシアニンシグナルペプチド、の群から選択されるシトクロムc6輸送ペプチドを含む。リスケ鉄硫黄を有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態では、リスケ鉄硫黄タンパク質が、リスケ鉄硫黄タンパク質をチラコイド膜に局在させる輸送ペプチドを含む。この態様の別の実施形態は、シトクロムb6f複合体タンパク質輸送ペプチドであるリスケ鉄硫黄輸送ペプチドを含む。この態様のさらなる実施形態は、シトクロムf輸送ペプチド、シトクロムb6輸送ペプチド、PetD輸送ペプチド、PetG輸送ペプチド、PetL輸送ペプチド、PetN輸送ペプチド、PetM輸送ペプチド、および、プラストキノン輸送ペプチド、の群から選択されるリスケ鉄硫黄輸送ペプチドを含む。シトクロムc6を有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、植物プロモーターに作動可能に連結された核酸配列をコードするシトクロムc6タンパク質をさらに含む。この態様のさらなる実施形態は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、から選択されるプロモーターを含む。リスケ鉄硫黄を有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、植物プロモーターに作動可能に連結されたリスケ鉄硫黄タンパク質をコードする核酸配列をさらに含む。この態様のさらなる実施形態は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、から選択されるプロモーターを含む。
前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態では、RuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変が、CBタンパク質の過剰発現を含む。この態様のさらなる実施形態は、セドヘプツロース-1,7-ビスホスファターゼ(SBPase)、フルクトース-1,6-ビスホスフェートアルドラーゼ(FBPA)、葉緑体フルクトース-1,6-ビスホスファターゼ(FBPase)、二機能性フルクトース-1,6-ビスホスファターゼ/セドヘプツロース-1,7-ビスホスファターゼ(FBP/SBPase)、または、トランスケトラーゼ(TK)、の群から選択されるCBタンパク質を含む。この態様のさらなる実施形態は、SBPaseであるCBタンパク質を含む。この態様のさらに別の実施形態において、SBPaseは、配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、または配列番号96に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらに別の実施形態において、SBPaseは、配列番号96に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態は、SBPaseが、遺伝子改変植物の細胞内の少なくとも1つの葉緑体の葉緑体ストロマに局在することを含む。この態様のさらに別の実施形態において、SBPaseが、葉緑体ストロマにSBPaseを局在させる輸送ペプチドを含む。SBPaseを有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、植物プロモーターに作動可能に連結された、SBPaseをコードする核酸配列をさらに含む。この態様のさらなる実施形態は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、から選択されるプロモーターを含む。この態様のさらなる実施形態は、FBPAであるCBタンパク質を含む。この態様のさらに別の実施形態において、FBPAは、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、または配列番号97に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらに別の実施形態において、FBPAは、配列番号97に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態は、遺伝子改変植物の細胞内の少なくとも1つの葉緑体の葉緑体ストロマに局在するFBPAを含む。この態様のさらに別の実施形態において、FBPAは、葉緑体ストロマにFBPAを局在させる輸送ペプチドを含む。FBPAを有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、植物プロモーターに作動可能に連結された、FBPAをコードする核酸配列をさらに含む。この態様のさらなる実施形態は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、から選択されるプロモーターを含む。この態様のさらなる実施形態は、FBPaseであるCBタンパク質を含む。この態様のさらに別の実施形態では、FBPaseが、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、または配列番号98に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらに別の実施形態において、FBPaseは、配列番号98に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態は、遺伝子改変植物の細胞内の少なくとも1つの葉緑体の葉緑体ストロマに局在するFBPaseを含む。この態様のさらに別の実施形態において、FBPaseは、葉緑体ストロマにFBPaseを局在させる輸送ペプチドを含む。FBPaseを有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、植物プロモーターに作動可能に連結された、FBPaseをコードする核酸配列をさらに含む。この態様のさらなる実施形態は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、から選択されるプロモーターを含む。この態様のさらなる実施形態は、FBP/SBPaseであるCBタンパク質を含む。この態様のさらなる実施形態は、シアノバクテリアFBP/SBPaseであるFBP/SBPaseを含む。この態様のさらに別の実施形態において、シアノバクテリアFBP/SBPaseは、配列番号38、配列番号39、配列番号40、または配列番号99に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、
少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらに別の実施形態において、シアノバクテリアFBP/SBPaseは、配列番号99に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。FBP/SBPaseを有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、遺伝子改変植物の細胞内の少なくとも1つの葉緑体の葉緑体ストロマに局在するFBP/SBPaseを含む。この態様のさらなる実施形態において、FBP/SBPaseは、葉緑体ストロマにFBP/SBPaseを局在させる輸送ペプチドを含む。この態様のさらに別の実施形態は、植物の葉緑体ストロマのタンパク質輸送ペプチドである輸送ペプチドを含む。この態様のさらなる実施形態は、ゲラニオールシンターゼ輸送ペプチド、SBPase輸送ペプチド、FBPA輸送ペプチド、FBPase輸送ペプチド、トランスケトラーゼ輸送ペプチド、PGK輸送ペプチド、GAPDH輸送ペプチド、AGPase輸送ペプチド、RPI輸送ペプチド、RPE輸送ペプチド、PRK輸送ペプチド、または、ルビスコ輸送ペプチド、の群から選択される輸送ペプチドを含む。FBP/SBPaseを有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、植物プロモーターに作動可能に連結された、FBP/SBPaseをコードする核酸配列をさらに含む。この態様のさらなる実施形態は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、から選択されるプロモーターを含む。この態様のさらなる実施形態は、トランスケトラーゼであるCBタンパク質を含む。この態様のさらに別の実施形態において、トランスケトラーゼは、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、または配列番号100に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらに別の実施形態において、トランスケトラーゼは、配列番号100に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態は、遺伝子改変植物の細胞内の少なくとも1つの葉緑体の葉緑体ストロマに局在するトランスケトラーゼを含む。トランスケトラーゼを有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、植物プロモーターに作動可能に連結された、トランスケトラーゼをコードする核酸配列をさらに含む。この態様のさらなる実施形態は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、から選択されるプロモーターを含む。
少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらに別の実施形態において、シアノバクテリアFBP/SBPaseは、配列番号99に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。FBP/SBPaseを有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、遺伝子改変植物の細胞内の少なくとも1つの葉緑体の葉緑体ストロマに局在するFBP/SBPaseを含む。この態様のさらなる実施形態において、FBP/SBPaseは、葉緑体ストロマにFBP/SBPaseを局在させる輸送ペプチドを含む。この態様のさらに別の実施形態は、植物の葉緑体ストロマのタンパク質輸送ペプチドである輸送ペプチドを含む。この態様のさらなる実施形態は、ゲラニオールシンターゼ輸送ペプチド、SBPase輸送ペプチド、FBPA輸送ペプチド、FBPase輸送ペプチド、トランスケトラーゼ輸送ペプチド、PGK輸送ペプチド、GAPDH輸送ペプチド、AGPase輸送ペプチド、RPI輸送ペプチド、RPE輸送ペプチド、PRK輸送ペプチド、または、ルビスコ輸送ペプチド、の群から選択される輸送ペプチドを含む。FBP/SBPaseを有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、植物プロモーターに作動可能に連結された、FBP/SBPaseをコードする核酸配列をさらに含む。この態様のさらなる実施形態は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、から選択されるプロモーターを含む。この態様のさらなる実施形態は、トランスケトラーゼであるCBタンパク質を含む。この態様のさらに別の実施形態において、トランスケトラーゼは、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、または配列番号100に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらに別の実施形態において、トランスケトラーゼは、配列番号100に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。この態様のさらなる実施形態は、遺伝子改変植物の細胞内の少なくとも1つの葉緑体の葉緑体ストロマに局在するトランスケトラーゼを含む。トランスケトラーゼを有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、植物プロモーターに作動可能に連結された、トランスケトラーゼをコードする核酸配列をさらに含む。この態様のさらなる実施形態は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、から選択されるプロモーターを含む。
FBP/SBPaseではないCBタンパク質を有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらなる実施形態は、内因性であるCBタンパク質をコードする核酸を含む。この態様のさらなる実施形態は、CBタンパク質を過剰発現し、誘導的に発現し、特定の組織または細胞型において発現し、誘導的に過剰発現し、または特定の組織または細胞型において誘導的に発現するように遺伝子操作されているCBタンパク質をコードする核酸に作動可能に連結されるプロモーターを含む。CBタンパク質を有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、異種由来であるCBタンパク質をコードする核酸を含む。
前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態では、植物は、未改変の野生型(WT)植物と比較してバイオマスが増加している。この態様のさらなる実施形態は、1000μmol m-2 s-1を超える光量を用いた条件下で生育させた場合、未改変のWT植物と比較して、水利用効率が改善した植物を含む。この態様のさらなる実施形態は、カウピー(例えば、ササゲマメ(black-eyed pea)、ハタササゲ(catjang)、ジュウロクササゲ(yardlong bean)、Vigna unguiculata)、ダイズ(例えば、Glycine max、Glycine soja)、キャッサバ(例えば、マニオック、ユッカ、Manihot esculenta)、イネ(例えば、インディカイネ、ジャポニカイネ、香り米、餅米、Oryza sativa、Oryza glaberrima)、コムギ(例えば、一般的なコムギ、スペルトコムギ(spelt)、デュラム、ヒトツブコムギ(einkorn)、エンマーコムギ(emmer)、カムット(kamut)、Triticum aestivum、Triticum spelta、Triticum durum、Triticum urartu、Triticum monococcum、Triticum turanicum、Triticum種)、オオムギ(例えば、Hordeum vulgare)、トマト(例えば、Solanum lycopersicum)、ジャガイモ(例えば、ラセットポテト、イエローポテト、レッドポテト、Solanum tuberosum)、タバコ(例えば、Nicotiana tabacum)、カノーラ(例えば、Brassica rapa、Brassica napus、Brassica juncea)、または、他のC3作物植物、の群から選択される植物を含む。この態様のさらに別の実施形態は、カウピー(例えば、ササゲ、ハタササゲ、ジュウロクササゲ、Vigna unguiculata)、ダイズ(例えば、Glycine max、Glycine soja)、キャッサバ(例えば、マニオック、ユッカ、Manihot esculenta)、イネ(例えば、インディカイネ、ジャポニカイネ、香り米、餅米、Oryza sativa、Oryza glaberrima)、コムギ(例えば、一般的なコムギ、スペルトコムギ、デュラム、ヒトツブコムギ、エンマーコムギ、カムット、Triticum aestivum、Triticum spelta、Triticum durum、Triticum urartu、Triticum monococcum、Triticum turanicum、Triticum種)、オオムギ(例えば、Hordeum vulgare)、および、タバコ(例えば、Nicotiana tabacum)、の群から選択される植物を含む。
植物の一部に関して前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、葉、茎、根、塊茎、花、種子、穀粒(kernel)、穀粒(grain)、果実、細胞、またはそれらの一部である植物の一部、および1つ以上の遺伝子改変を含んでいる遺伝子改変植物の一部を含む。この態様のさらなる実施形態は、果実、塊茎、穀粒(kernel)、または穀粒(grain)である植物の一部を含む。花粉粒または胚珠に関して前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、前述の実施形態のいずれか1つの植物の遺伝子改変花粉粒または遺伝子改変胚珠を含み、遺伝子改変花粉粒または遺伝子改変胚珠は、1つ以上の遺伝子改変を含む。前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらなる実施形態は、前述の実施形態のいずれかの遺伝子改変植物から生産された遺伝子改変プロトプラストを含み、遺伝子改変プロトプラストは、1つ以上の遺伝的改変を含む。前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらなる実施形態は、前述の実施形態のいずれか1つの遺伝子改変植物由来のプロトプラストまたは細胞から生産された遺伝子改変組織培養物を含み、細胞またはプロトプラストは、葉、葉肉細胞、葯、めしべ、茎、葉柄、根、根端、塊茎、果実、種子、穀粒(kernel)、穀粒(grain)、花、子葉、胚軸、胚、または、分裂組織の細胞、の群から選択される植物の一部から生産され、遺伝子改変組織培養物は、1つ以上の遺伝的改変を含む。この態様のさらなる実施形態は、1つ以上の遺伝子改変を含む、遺伝子改変組織培養物から再生された遺伝子改変植物を含む。前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、前述の実施形態のいずれか1つの遺伝子改変植物から生産された遺伝子改変植物種子を含む。
(遺伝子改変植物を生産し、栽培する方法)
本開示のさらなる態様は、(a)植物細胞、組織、または他の外植片に、CBタンパク質の活性を増加するRuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変、光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変、またはCBタンパク質の活性を増加するRuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変および光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変の両方を導入すること;(b)植物細胞、組織、または他の外植片を遺伝子改変プラントレットに再生すること;(c)遺伝子改変プラントレットを、CBタンパク質の活性を増加するRuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変、光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変、またはCBタンパク質の活性を増加するRuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変および光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変の両方を有する遺伝子改変植物に育てること、を含む、前述の実施形態のいずれかの遺伝子改変植物体を生産する方法を含む。この態様のさらなる実施形態は、工程(b)の前に植物細胞、組織、または他の外植片をスクリーニングまたは選択すること;工程(b)と(c)との間に、プラントレットをスクリーニングまたは選択すること;または工程(c)の後に植物をスクリーニングまたは選択することによって、1つ以上の遺伝子改変の成功した導入を確認することをさらに包含する。前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態では、形質転換が粒子衝撃(すなわち、バイオリスティック、遺伝子銃)、アグロバクテリウム媒介形質転換、リゾビウム媒介形質転換、または、プロトプラストトランスフェクションもしくは形質転換、の群から選択される形質転換方法を使用して行われる。
本開示のさらなる態様は、(a)植物細胞、組織、または他の外植片に、CBタンパク質の活性を増加するRuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変、光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変、またはCBタンパク質の活性を増加するRuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変および光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変の両方を導入すること;(b)植物細胞、組織、または他の外植片を遺伝子改変プラントレットに再生すること;(c)遺伝子改変プラントレットを、CBタンパク質の活性を増加するRuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変、光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変、またはCBタンパク質の活性を増加するRuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変および光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変の両方を有する遺伝子改変植物に育てること、を含む、前述の実施形態のいずれかの遺伝子改変植物体を生産する方法を含む。この態様のさらなる実施形態は、工程(b)の前に植物細胞、組織、または他の外植片をスクリーニングまたは選択すること;工程(b)と(c)との間に、プラントレットをスクリーニングまたは選択すること;または工程(c)の後に植物をスクリーニングまたは選択することによって、1つ以上の遺伝子改変の成功した導入を確認することをさらに包含する。前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態では、形質転換が粒子衝撃(すなわち、バイオリスティック、遺伝子銃)、アグロバクテリウム媒介形質転換、リゾビウム媒介形質転換、または、プロトプラストトランスフェクションもしくは形質転換、の群から選択される形質転換方法を使用して行われる。
前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらに別の実施形態は、ベクターを用いて導入される遺伝子改変を含む。この態様のさらなる実施形態において、ベクターは、1つ以上の光合成電子伝達タンパク質をコードするヌクレオチドに作動可能に連結されたプロモーター、1つ以上のCBタンパク質をコードするヌクレオチド、または1つ以上の光合成電子伝達タンパク質および1つ以上のCBタンパク質をコードするヌクレオチドを含む。この態様のさらに別の実施形態は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、の群から選択されるプロモーターを含む。前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらなる実施形態では、光合成電子伝達タンパク質が、シトクロムc6タンパク質、リスケ鉄硫黄タンパク質、または、シトクロムc6タンパク質およびリスケ鉄硫黄タンパク質、の群から選択される。この態様のさらに別の実施形態において、シトクロムc6タンパク質は、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号95、または配列番号102に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。図20A~20Cは、例示的なシトクロムc6タンパク質ポリペプチド配列のアラインメントを示す。この態様のさらに別の実施形態において、リスケ鉄硫黄タンパク質は、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、または配列番号101に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。図19A~19Bは、例示的なリスケ鉄硫黄ポリペプチド配列のアラインメントを示す。この態様のさらなる実施形態において、ベクターは、CBタンパク質をコードする核酸に作動可能に連結された核ゲノム配列を標的とする1つ以上の遺伝子編集構成要素を含む。本態様のさらに別の実施形態において、1つ以上の遺伝子編集構成要素は、核ゲノム配列を標的とするリボ核タンパク質複合体;TALENタンパク質をコードする配列を含むベクター(TALENタンパク質は核ゲノム配列を標的とする);ZFNタンパク質をコードする配列を含むベクター(ZFNタンパク質は核ゲノム配列を標的とする);オリゴヌクレオチドドナー(ODN)(ODNは核ゲノム配列を標的とする);または、CRISPR/Cas酵素をコードする配列および標的配列を含むベクター(標的配列は核ゲノム配列を標的とする)、の群から選択される。
1つ以上のCBタンパク質をコードするヌクレオチドを含むベクターを有する前述の実施形態のいずれかと組み合わせることができるこの態様のさらなる実施形態では、CBタンパク質は、セドヘプツロース-1,7-ビスホスファターゼ(SBPase)、フルクトース-1,6-ビスホスフェートアルドラーゼ(FBPA)、葉緑体フルクトース-1,6-ビスホスファターゼ(FBPase)、二機能性フルクトース-1,6-ビスホスファターゼ/セドヘプツロース-1,7-ビスホスファターゼ(FBP/SBPase)、または、トランスケトラーゼ(TK)、の群から選択される。この態様のさらなる実施形態において、CBタンパク質は、SBPaseであり、SBPaseは、配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、または配列番号96に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。図14A~14Dは、例示的なSBPaseポリペプチド配列のアラインメントを示す。この態様の別の実施形態では、CBタンパク質はFBPAであり、FBPAは、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、または配列番号97に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。図15A~15Dは、例示的なFBPAポリペプチド配列のアラインメントを示す。この態様のさらに別の実施形態において、CBタンパク質はFBPaseであり、FBPaseは、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号98に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。図16A~16Dは、例示的なFBPaseポリペプチド配列のアラインメントを示す。この態様のさらなる実施形態において、CBタンパク質はFBP/SBPaseであり、FBP/SBPaseは、配列番号38、配列番号39、配列番号40、または配列番号99に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。図17A~17Bは、例示的なFBP/SBPaseポリペプチド配列のアラインメントを示す。この態様のさらに別の実施形態において、CBタンパク質はトランスケトラーゼであり、トランスケトラーゼは、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、または配列番号100に対して、少なくとも70%の配列同一性、少なくとも71%の配列同一性、少なくとも72%の配列同一性、少なくとも73%の配列同一性、少なくとも74%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも76%の配列同一性、少なくとも77%の配列同一性、少なくとも78%の配列同一性、少なくとも79%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも81%の配列同一性、少なくとも82%の配列同一性、少なくとも83%の配列同一性、少なくとも84%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも86%の配列同一性、少なくとも87%の配列同一性、少なくとも88%の配列同一性、少なくとも89%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも91%の配列同一性、少なくとも92%の配列同一性、少なくとも93%の配列同一性、少なくとも94%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、少なくとも96%の配列同一性、少なくとも97%の配列同一性、少なくとも98%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。図18A~18Eは、例示的なトランスケトラーゼ配列のアラインメントを示す。
本開示のさらなる態様は、遺伝子改変植物を有する前述の実施形態のいずれかの遺伝子改変植物を栽培する方法を含み、遺伝子改変実生苗、遺伝子改変プラントレット、遺伝子改変挿し木、遺伝子改変塊茎、遺伝子改変根、または遺伝子改変種子を土壌中に植え付けて、遺伝子改変植物を生産する、または遺伝子改変実生苗、遺伝子改変プラントレット、または遺伝子改変挿し木を、土壌中で育てられた根茎または第2の植物に接合して、遺伝子改変植物を生産する工程;植物を栽培して、収穫可能な種子、収穫可能な葉、収穫可能な根、収穫可能な挿し木、収穫可能な木、収穫可能な果実、収穫可能な穀粒(kernel)、収穫可能な塊茎、および/または収穫可能な穀粒(grain)を生産する工程;ならびに収穫可能な種子、収穫可能な葉、収穫可能な根、収穫可能な挿し木、収穫可能な木、収穫可能な果実、収穫可能な穀粒(kernel)、収穫可能な塊茎、および/または収穫可能な穀粒(grain)を収穫する工程、を含む。
(遺伝子改変植物、植物の一部、および植物細胞を生産する分子生物学的方法)
本発明の1つの態様は、未改変の植物、植物の一部、または植物細胞と比較して、発現を修飾された1つ以上のCBタンパク質、および発現を修飾された1つ以上の光合成電子伝達タンパク質を有する、遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞を提供する。例えば、本開示は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーターに作動可能に連結された1つ以上のCBタンパク質の付加、および1つ以上の光合成電子伝達タンパク質の付加を有する遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞を提供し、1つ以上のCBタンパク質および/または1つ以上の光合成電子伝達タンパク質をコードする核酸が、植物の遺伝子改変によって導入されており、プロモーターが、植物の遺伝子改変によって導入されており、または1つ以上のCBタンパク質および/または1つ以上の光合成電子伝達タンパク質をコードする核酸およびプロモーターの両方が、植物の遺伝子改変によって導入されている。
本発明の1つの態様は、未改変の植物、植物の一部、または植物細胞と比較して、発現を修飾された1つ以上のCBタンパク質、および発現を修飾された1つ以上の光合成電子伝達タンパク質を有する、遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞を提供する。例えば、本開示は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーターに作動可能に連結された1つ以上のCBタンパク質の付加、および1つ以上の光合成電子伝達タンパク質の付加を有する遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞を提供し、1つ以上のCBタンパク質および/または1つ以上の光合成電子伝達タンパク質をコードする核酸が、植物の遺伝子改変によって導入されており、プロモーターが、植物の遺伝子改変によって導入されており、または1つ以上のCBタンパク質および/または1つ以上の光合成電子伝達タンパク質をコードする核酸およびプロモーターの両方が、植物の遺伝子改変によって導入されている。
遺伝子改変単子葉植物細胞および遺伝子改変双子葉植物細胞の形質転換および生産は、当該分野において周知である。例えば、Weising et al., Ann. Rev. Genet. 22:421-477 (1988);米国特許第5,679,558号;Agrobacterium Protocols編:Gartland, Humana Press Inc. (1995);Wang, et al. Acta Hort. 461:401-408(1998)、およびBroothaerts, et al. Nature 433:629-633(2005)を参照されたい。方法の選択は、形質転換される植物の型、特定用途および/または所望の結果によって変化する。適切な形質転換技術は、当業者によって容易に選択される。
細胞DNA(例えば、ゲノムDNAおよびオルガネラDNA)を欠失、挿入または他の方法で修飾するための当技術分野において既知の任意の方法論を、本明細書中に開示される本発明の実施において使用することができる。一例として、CRISPR/Cas-9システムおよび関連システム(例えば、TALEN、ZFN、ODNなど)を使用して、ゲノムDNA中の標的部位に異種由来の遺伝子を挿入するか、または内因性遺伝子を実質的に編集して、異種由来の遺伝子を発現するか、もしくはプロモーターを修飾して、例えば、リプレッサー結合部位の除去もしくはエンハンサー結合部位の導入を介して内因性遺伝子の発現を増大するか、さもなければ変化することができる。例えば、Agrobacterium tumefaciensにおける標的遺伝子の欠失または挿入のための遺伝子コンストラクトを含んでいる安全化されたTiプラスミドは、植物細胞を形質転換するために使用され得、その後、形質転換された植物は、当技術分野で記載された手段、例えば、欧州特許第0116718号、欧州特許第0270822号、PCT出願国際公開第84/02913号、および公開された欧州特許出願(「EP」)第0242246号に記載された手段を使用して、形質転換された植物細胞から再生され得る。Tiプラスミドベクターはそれぞれ、TiプラスミドのT-DNAの境界配列の間、または少なくとも右境界配列の左側に位置する遺伝子を含む。もちろん、ベクターの他の型は、直接遺伝子導入(例えば、欧州特許第0233247号に記載されるように)、花粉媒介形質転換(例えば、欧州特許第0270356号、PCT出願国際公開第85/01856号、および米国特許第4,684,611号に記載されるように)、植物RNAウイルス媒介形質転換(例えば、欧州特許第0067553号および米国特許第4,407,956号に記載されるように)、リポソーム媒介形質転換(例えば、米国特許第4,536,475号に記載されるように)、および、トウモロコシの特定の系統を形質転換するための方法(例えば、米国特許第6,140,553号;Fromm et al., Bio/Technology (1990) 8, 833-839);Gordon-Kamm et al., The Plant Cell, (1990) 2、603-618)、イネの特定の系統を形質転換するための方法(Shimamoto et al., Nature, (1989) 338, 274-276;Datta et al., Bio/Technology, (1990) 8, 736-740)、ならびに単子葉植物を一般的に形質転換するための方法(PCT出願国際公開第92/09696号)のような他の方法、などの手段を使用して、植物細胞の形質転換に使用され得る。綿の形質転換については、PCT出願国際特許公報第00/71733号に記載された方法を使用することができる。ダイズの形質転換については、当該分野で既知の方法、例えば、Hinchee et al., (Bio/Technology, (1988) 6, 915)およびChristou et al., (Trends Biotech, (1990) 8, 145)または国際公開第00/42207号の方法が言及される。
本発明の遺伝子改変植物は、同じ特性を有するもっと多くの遺伝子改変植物を生産するために、または同じもしくは関連する植物種の他の品種に遺伝子改変を導入するために、従来の植物育種スキームにおいて使用され得る。改変された植物から得られる種子は、好ましくは染色体DNA中の安定な挿入物として、または内因性遺伝子もしくはプロモーターに対する修飾として、遺伝子改変を含む。本発明に基づき遺伝子改変を含んでいる植物は、本発明の遺伝子改変を含んでいる植物の根茎、例えば、果樹、または観賞植物を含む、もしくはそれに由来する植物を含む。したがって、形質転換された植物または植物の一部に挿入された植物の一部が接合された任意の非トランスジェニックが、本発明に含まれる。
導入された遺伝子の発現または内因性遺伝子の改変された発現をもたらす発現ベクターまたは発現カセットを含んでいる本開示の遺伝子改変は、典型的には植物発現可能なプロモーターを利用するものである。本明細書中で使用される「植物発現可能なプロモーター」は、植物細胞における本発明の遺伝子改変の発現を確実にするプロモーターをいう。植物細胞においてしばしば使用される構成的プロモーターの例は、カリフラワーモザイク(CaMV)35Sプロモーター(KAY et al., Scence, 236, 4805, 1987)、最小のCaMV 35Sプロモーター(Benfey & Chua, Science, (1990)250, 959-966)、CaMV 35Sプロモーターの各種の他の誘導体、ゴマノハグサモザイクウイルス(FMV)プロモーター(Richins, et al., Nucleic Acids Res. (1987) 15:8451-8466)、トウモロコシ(maize)ユビキチンプロモーター(CHRISTENSEN & QUAIL, Transgenic Res, 5, 213-8, 1996)、シロツメクサプロモーター(Ljubql, MAEKAWA et al. Mol Plant Microbe Interact. 21、375-82, 2008)、葉脈モザイクキャッサバウイルスプロモーター(国際出願国際公開第97/48819号)、およびアラビドプシスUBQ10プロモーター、Norris et al. Plant Mol. Biol. 21,895-906,1993)である。
植物における構成的発現を指示するプロモーターのさらなる例は、当該分野において既知であり、カリフラワーモザイクウイルス(CaMV)の強力な構成的35Sプロモーター(「35Sプロモーター」)、例えば、単離物CM 1841(Gardner et al., Nucleic Acids Res, (1981) 9, 2871-2887)、CabbB S(Franck et al., Cell (1980) 21, 285-294)、およびCabbB JI(Hull and Howell, Virology, (1987) 86, 482-493);ユビキチンファミリー由来のプロモーター(例えば、トウモロコシユビキチンプロモーター、Christensen et al., Plant Mol Biol, (1992) 18,675-689)、gos2プロモーター(de Pater et al., The Plant J (1992) 2, 834-844)、emuプロモーター(Last et al., Theor Appl Genet, (1990) 81, 581-588)、Anらによって記載されたプロモーターなどのアクチンプロモーター(The Plant J, (1996) 10 107)、Zhangらによって記載されたイネアクチンプロモーター(The Plant Cell, (1991) 3, 1155-1165);ゴマノハグサモザイクウイルス(FMV)のプロモーター(Richins et al., Nucleic Acids Res. (1987) 15:8451-8466)、キャッサバ葉脈モザイクウイルスプロモーター(WO97/48819;Verdaguer et al., Plant Mol Biol, (1998) 37, 1055-1067)、サブタレニアン・クローバ発育阻害ウイルス由来のプロモーターのpPLEXシリーズ(WO96/06932、特にS4またはS7プロモーター)、アルコールデヒドロゲナーゼプロモーター、例えば、pAdh1S(GenBank受託番号X04049、X00581)、およびそれぞれT DNAの1’および2’遺伝子の発現を促進するTR1’プロモーターならびにTR2’プロモーター(それぞれ、「TR1’プロモーター」および「TR2’プロモーター」)(Velten et al., EMBO J, (1984) 3, 2723-2730)を含む。
あるいは、植物発現可能なプロモーターは、組織特異的プロモーター、すなわち、植物のいくつかの細胞または組織、例えば(クロロフィルa/b結合タンパク質(Cab)のプロモーターなどの)緑色組織において、より高レベルの発現を指令するプロモーターであり得る。植物Cabプロモーター(Mitra et al., Planta, (2009) 5:1015-1022)は、緑色組織(例えば、葉および茎)における発現のための強力な双方向性プロモーターであることが記載されており、本発明の一実施形態において有益である。これらの植物発現可能なプロモーターは、エンハンサーエレメントと組み合わせることができ、それらは最小プロモーターエレメントと組み合わせることができ、または所望の発現プロファイルを確保するために反復エレメントを含むことができる。
組織特異的プロモーターのさらなる非限定的な例は、トウモロコシ(maize)アロチオネインプロモーター(DE FRAMOND et al, FEBS 290, 103-106, 1991;欧州特許出願公開第452269号)、キチナーゼプロモーター(SAMAC et al. Plant Physiol 93, 907-914, 1990)、トウモロコシ(maize)ZRP2プロモーター(米国特許第5,633,363号)、トマトLeExtlプロモーター(Bucher et al. Plant Physiol. 128, 911-923, 2002)、グルタミンシンテターゼダイズ根プロモーター(HIREL et al. Plant Mol. Biol. 20, 207-218, 1992)、RCC3プロモーター(PCT出願国際公開第2009/016104号)、イネアンチキチンプロモーター(the rice antiquitine promoter)(PCT出願国際公開第2007/076115号)、LRR受容体キナーゼプロモーター(PCT出願国際公開第02/46439号)、およびアラビドプシスpCO2プロモーター(HEIDSTRA et al, Genes Dev. 18, 1964-1969, 2004)を含む。組織特異的プロモーターのさらなる非限定的な例は、RbcS2Bプロモーター、RbcS1Bプロモーター、RbcS3Bプロモーター、LHB1B1プロモーター、LHB1B2プロモーター、cab1プロモーター、およびEngler et al., ACS Synthetic Biology, DOI:10.1021/sb4001504, 2014に記載される他のプロモーターを含む。これらの植物プロモーターは、エンハンサーエレメントと組み合わせることができ、これらは最小プロモーターエレメントと組み合わせることができ、または所望の発現プロフィールを確保するために反復エレメントを含むことができる。
いくつかの実施形態では、植物細胞における発現を増加するためのさらなる遺伝子改変が、利用され得る。例えば、導入された遺伝子の5’末端もしくは3’末端のイントロン、または導入された遺伝子のコード配列中のイントロン、例えば、hsp70イントロンである。他のこのような遺伝的エレメントは、プロモーターエンハンサーエレメント、重複または三重プロモーター領域、別の導入遺伝子とは異なるまたは内因性(植物宿主)遺伝子リーダー配列とは異なる5’リーダー配列、同じ植物で使用される別の導入遺伝子とは異なるまたは内因性(植物宿主)トレーラー配列とは異なる3’トレーラー配列を含むが、これらに限定されない。
本開示の導入された遺伝子は、宿主細胞DNA中に挿入され得るため、挿入された遺伝子部分が適切な3’末端転写調節シグナル(すなわち、転写物形成およびポリアデニル化シグナル)の上流(すなわち、5’)である。これは、好ましくは植物細胞ゲノム(核または葉緑体)に遺伝子を挿入することによって達成される。好ましいポリアデニル化および転写物形成シグナルは、ノパリンシンターゼ遺伝子(Depicker et al., J. Molec Appl Gen, (1982)) 1、561-573)、オクトピンシンターゼ遺伝子(Gielen et al., EMBO J, (1984) 3:835-845)、SCSVまたはMalic酵素ターミネーター(Schunmann et al., Plant Funct Biol, (2003) 30:453-460)、および形質転換植物細胞において3’非翻訳DNA配列として作用するT DNA遺伝子7(Velten and Schell, Nucleic Acids Res, (1985) 13, 6981-6998)を含む。いくつかの実施形態において、1つ以上の導入された遺伝子は、核ゲノムに安定に組み込まれる。安定な組込みは、核酸配列が核ゲノムに組込まれたままであり、その後の植物生成の間中、発現し続ける(すなわち、検出可能なmRNA転写物またはタンパク質が生産される)場合に存在する。核ゲノムへの安定な組み込みは、当該分野において任意の既知の方法(例えば、微粒子衝撃、アグロバクテリウム媒介形質転換、CRISPR/Cas9、プロトプラストのエレクトロポレーション、マイクロインジェクションなど)によって達成され得る。
組み換え核酸または修飾された核酸という用語は、遺伝子工学技術または化学合成によるポリヌクレオチドの単離されたセグメントの人為的操作によって達成される、配列の2つの別の分離されたセグメントの組み合わせによって作製されるポリヌクレオチドを指す。その際、所望の機能のポリヌクレオチドセグメントを一緒に連結して、所望の機能の組み合わせを生成し得る。
本明細書中で使用される場合、用語「過剰発現」は、野生型生物(例えば、植物)における発現と比較して、(例えば、mRNA、ポリペプチドなどの)遺伝子改変の結果としての発現の増加をいい、そして収率の増加などの所望の結果を達成するのに十分なレベルでの異種由来の遺伝子の発現をいい得る。いくつかの実施形態では、発現の増加は、野生型における発現より約10%多いわずかな増加である。いくつかの実施形態において、発現の増加は、野生型における発現と比較して、50%以上(例えば、60%、70%、80%、100%など)の増加である。いくつかの実施形態において、内因性遺伝子は、アップレギュレートされる。いくつかの実施形態において、外因性遺伝子は、発現される効力によってアップレギュレートされる。植物における遺伝子のアップレギュレーションは、これらに限定されるものではないが、誘導性応答エレメントを付加した構成的プロモーター、誘導性プロモーター、誘導性応答エレメントを付加した高発現プロモーター(例えば、PsaDプロモーター)、エンハンサー、転写ならびに/もしくは翻訳調節配列、コドン最適化、修飾転写因子、および/またはサイトカイニンシグナル伝達などの刺激に応じてアップレギュレートされる遺伝子の発現を制御する遺伝子の変異体または修飾された遺伝子を含む、当該技術分野における任意の既知の方法を通して達成することができる。
組み換え核酸が、特定の配列の発現、クローニング、または複製を意図する場合、宿主細胞への導入のために調製されるDNAコンストラクトは、典型的には所望のポリペプチドをコードする意図されたDNAフラグメントを含んでいる、宿主によって認識される複製システム(例えば、ベクター)を含み、そしてまた、ポリペプチドをコードするセグメントに作動可能に連結される転写および翻訳開始調節配列を含み得る。さらに、このようなコンストラクトは、細胞局在化シグナル(例えば、原形質膜局在化シグナル)を含み得る。好ましい実施形態において、このようなDNAコンストラクトは、宿主細胞のゲノムDNA、葉緑体DNAまたはミトコンドリアDNAに導入される。
いくつかの実施形態では、非組み込み発現システムを使用して、1つ以上の導入された遺伝子の発現を誘導することができる。発現システム(発現ベクター)は、例えば、複製起点、または自発的に複製する配列(ARS)および発現制御配列、プロモーター、エンハンサー、ならびに必要なプロセシング情報部位(例えば、リボソーム結合部位、RNAスプライス部位、ポリアデニル化部位、転写ターミネーター配列、およびmRNA安定化配列)を含むことができる。シグナルペプチドはまた、適切な場合には、タンパク質が細胞膜、細胞壁、または細胞から分泌されて横切るおよび/またはとどまることを可能にする、同じ種または関連する種の分泌されたポリペプチドから含まれ得る。
本明細書中に開示される発明の方法論を実施する際に有効な選択マーカーは、ポジティブ選択マーカーであり得る。典型的には、ポジティブ選択が、目的の組み換えポリヌクレオチドが細胞内に存在する場合にのみ、遺伝子改変細胞が毒性物質の存在下で生存し得るケースをいう。ネガティブ選択マーカーおよびスクリーニング可能なマーカーもまた、当該分野において周知であり、本発明によって検討される。当業者は、利用可能な任意の関連マーカーが、本明細書中に開示される本発明の実施において利用され得ることを認識する。
本発明の組み換え系統のスクリーニングおよび分子分析は、核酸ハイブリダイゼーション技術を利用して行うことができる。ハイブリダイゼーション手段は、本明細書中に教示されたように利用するような対象の調節配列に対して十分な相同性を伴う、ポリヌクレオチド(例えば、本明細書中に記載された技術を用いて修飾されたポリヌクレオチド)を同定するのに有益である。特定のハイブリダイゼーション技術は、対象の発明に必須ではない。ハイブリダイゼーション技術の改善がなされるにつれて、それらは当業者によって容易に適用され得る。ハイブリダイゼーションプローブは、当業者に既知の任意の適切な標識を用いて標識され得る。ハイブリダイゼーション条件および洗浄条件(例えば、温度および濃度)は、検知閾値のストリンジェンシーを変化するために変更され得る。ハイブリダイゼーション条件に関するさらなる手引きについては、例えば、Sambrook et al. (1989) vide infra、またはAusubel et al. (1995) Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, NY, N. Y.を参照されたい。
さらに、遺伝子改変系統のスクリーニングおよび分子分析、ならびに所望の単離された核酸の作製は、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を使用して実施され得る。PCRは、核酸配列の反復的な、酵素的な、準備された合成である。この手段は、当業者に周知であり、一般的に使用される(Mullis、米国特許第4,683,195号、第4,683,202号、および第4,800,159号;Saiki et al. (1985) Science 230:1350-1354を参照のこと)。PCRは、標的配列の反対鎖にハイブリダイズする2つのオリゴヌクレオチドプライマーが隣接している、目的のDNAフラグメントの酵素増幅に基づく。プライマーは、3’末端が互いに向くように配向される。鋳型の熱変性、プライマーのそれらの相補的配列へのアニーリング、およびDNAポリメラーゼを用いたアニーリングされたプライマーの延伸の反復サイクルは、PCRプライマーの5’末端によって規定されるセグメントの増幅を生じる。各プライマーの伸長産物は、他のプライマーの鋳型として供給することができるので、各サイクルは、前のサイクルで産生されたDNA鋳型の量を本質的に2倍にする。これは、数時間で最大で数百万倍まで、特異的標的フラグメントの指数関数的な蓄積を生じる。好熱性細菌Thermus aquaticusから単離されるTaqポリメラーゼなどの熱安定性DNAポリメラーゼを使用することによって、増幅プロセスを完全に自動化することができる。使用することができる他の酵素は、当業者において知られている。
本発明の核酸およびタンパク質はまた、具体的に開示された配列の相同体を包含することができる。相同性(例えば、配列同一性)は、50%~100%であり得る。いくつかの例では、そのような相同性が80%を超え、85%を超え、90%を超え、または95%を超える。配列の任意の意図された使用に必要とされる相同性または同一性の程度は、当業者によって容易に同定される。本明細書中で使用されるように、2つの核酸の配列同一性の割合は、例えば、Karlin and Altschul (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87:2264-2268等によって開示され、Karlin and Altschul (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873-5877のように修正された、当該分野において既知のアルゴリズムを使用して決定される。このようなアルゴリズムは、Altschul et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:402-410のプログラムである、BLASTN、BLASTP、およびBLASTXに組み込まれる。BLASTヌクレオチド検索は、BLASTNプログラム(スコア=100、ワード長=12)を用いて行い、所望の割合の配列同一性を有するヌクレオチド配列を取得する。比較を目的としてギャップアラインメントを取得するために、Altschul et al. (1997) Nucl. Acids. Res. 25:3389-3402に記載されるように、Gapped BLASTを利用する。BLASTおよびGapped BLASTプログラムを利用する場合、それぞれのプログラム(BLASTNおよびBLASTX)のデフォルトパラメーターを使用する。www.ncbi.nih.govを参照されたい。当業者は、デフォルト設定で適切なBLASTプログラムを使用して参照配列を有する目的の配列をアライニングすることによって、参照配列中のアミノ酸または核酸に対応する位置が生じる場合、目的の配列を容易に決定することができる(例えば、BLASTPに関して:ギャップオープンペナルティ:11、ギャップ延伸ペナルティ:1、期待値:10、ワードサイズ:3、最大スコア:25、最大アラインメント:15、およびマトリックス:blosum62;ならびにBLASTNに関して:ギャップオープンペナルティ:5、ギャップ延伸ペナルティ:2、核の一致:1、核の不一致 -3、期待値:10、ワードサイズ:11、最大スコア:25、および最大アラインメント:15)。
好ましい宿主細胞は、植物細胞である。組み換え宿主細胞は、本文脈において、遺伝的に修飾されたものであり、単離された核酸分子を含有するか、宿主細胞中に通常存在し、機能的である、1つ以上の欠失または別の非機能的遺伝子を含有するか、または少なくとも1つの組み換えタンパク質を生産するための1つ以上の遺伝子を含有する。本発明のタンパク質をコードする核酸は、これらに限定されないが、形質転換、リポフェクション、エレクトロポレーション、または当業者に知られている任意の他の方法を含んでいる、特定の型の細胞に適した当業者に知られている任意の手段によって導入され得る。
本発明を一般的に説明したが、本発明をさらに説明するために本明細書に含まれ、特許請求の範囲によって定義される本発明の範囲を限定することを意図しない、特定の具体的な実施例を引用することによって、本発明はより良く理解されるだろう。
〔実施例〕
本開示は、以下の実施例においてさらに詳細に記載される。これらの実施例は、特許請求される本開示の範囲を限定することを決して意図しない。添付の図面は、本開示の明細書および説明の不可欠な部分とみなされることが意図される。以下の実施例は、例示のために提供されるが、特許請求される開示を限定するものではない。
本開示は、以下の実施例においてさらに詳細に記載される。これらの実施例は、特許請求される本開示の範囲を限定することを決して意図しない。添付の図面は、本開示の明細書および説明の不可欠な部分とみなされることが意図される。以下の実施例は、例示のために提供されるが、特許請求される開示を限定するものではない。
<実施例1:コンストラクトおよびトランスジェニックN.tabacum植物の生成>
RuBP再生に関与する遺伝子の操作と、電子伝達に関与する遺伝子の操作との組合せを試験するために、以下の実施例では、コンストラクトおよびトランスジェニックN.tabacum(タバコ)植物の生成について述べる。非常に異なる生育習性を有する2つの異なるタバコ品種として、Nicotiana tabacum 品種Petit HavanaおよびNicotiana tabacum 品種Samsunを使用した。
RuBP再生に関与する遺伝子の操作と、電子伝達に関与する遺伝子の操作との組合せを試験するために、以下の実施例では、コンストラクトおよびトランスジェニックN.tabacum(タバコ)植物の生成について述べる。非常に異なる生育習性を有する2つの異なるタバコ品種として、Nicotiana tabacum 品種Petit HavanaおよびNicotiana tabacum 品種Samsunを使用した。
(材料および方法)
コンストラクトの生成:コンストラクトを、Golden Gateクローニング(Engler et al., Plos One (2009)4;Engler et al., Plos One (2008)3:e3647)またはGatewayクローニング技術(Nakagawa et al., J. Biosci. Bioeng. (2007)104:34-41)を使用して生成した。導入遺伝子を、CaMV35SおよびFMV構成的プロモーターの制御下で発現した。
コンストラクトの生成:コンストラクトを、Golden Gateクローニング(Engler et al., Plos One (2009)4;Engler et al., Plos One (2008)3:e3647)またはGatewayクローニング技術(Nakagawa et al., J. Biosci. Bioeng. (2007)104:34-41)を使用して生成した。導入遺伝子を、CaMV35SおよびFMV構成的プロモーターの制御下で発現した。
Nicotiana tabacum 品種Petit Havanaトランスジェニック系統について、ゲラニオールシンターゼ輸送ペプチド(Simkin et al., Phytochemistry (2013)85:36-43)に連結されたシアノバクテリア二機能性フルクトース-1,6-ビスホスファターゼ/セドヘプツロース-1,7-ビスホスファターゼ(FBP/SBPase;slr2094 Synechocystis種 PCC 7942(Miyagawa et al., Nat. Biotechnol. (2001)19:965-969))を最適化されたコドン、およびArabidopsis thaliana(AT3G54890)由来のクロロフィルa/b結合タンパク質6輸送ペプチドを有するP.umbilicalis シトクロムc6(AFC39870)を最適化されたコドンは、FMV(Richins et al., Nucleic Acids Res. (1987)15;8451-8466)およびCaMV 35Sプロモーターによってそれぞれ駆動される、Golden Gate(Engler et al., Plos One (2008)3:e3647)過剰発現コンストラクト(EC23083およびEC23028)を生成するために使用された(図1A)。
N.tabacum 品種Samsunトランスジェニック系統について、CaMV 35Sプロモーターによって駆動される、集光性複合体Iクロロフィルa/b結合タンパク質6(AT3G54890)由来の輸送ペプチドに連結された全長P.umbilicalisシトクロムc6遺伝子を使用して、ベクターpGWB2(Nakagawa et al., J. Biosci. Bioeng. (2007)104:34-41)に、過剰発現コンストラクトB2~C6を生成した(図1B)。
タバコ形質転換体の生産:60系統のN.tabacum 品種Petit Havanaおよび12~14系統のN.tabacum 品種Samsunを、コンストラクトごとに生成した。組換えプラスミドEC23083およびEC23028を、リーフディスク形質転換(Horsch et al., Abstr. Pap. Am. Chem. S. (1985)190:67)によって、Agrobacterium tumefaciens株 LBA4404を用いて、WT N.tabacum 品種Petit Havanaに導入した。シュートを、ハイグロマイシン(20mg L-1)およびセフォタキシム(400mg L-1)を含むMS培地上で再生した。確立された根系を有するハイグロマイシン耐性一次形質転換体(T0世代)を土壌に移し、自家受粉させた。組込まれた導入遺伝子を発現しているT0およびT1系統を、半定量的RT-PCRを用いてスクリーニングした。FBP/SBPase(SB系統:03、06、21、44)またはシトクロムc6(C6系統:C15、C41、C47、C50)を発現しているN.tabacum 品種Petit Havana T2/T3子孫を、上述のように生産された一次形質転換体から選択した。SBおよびC6の両方を発現しているN.tabacum 品種Petit Havana植物は、SB系統(SB06、SB44、SB21)をC6系統(C15、C47、C50)と交配させることによって生成され、SBC1(SB06×C47)、SBC2(SB06×C50)、SBC3(SB44×C47)、およびSBC6(SB21×C15)の4つの独立したSBC6系統を生成した。次に、これらの4つの独立した系統を自家受粉させた。
組換えプラスミドB2-C6を、リーフディスク形質転換(Horsch et al., Abstr. Pap. Am. Chem. S. (1985)190:67)によって、Agrobacterium tumefaciens株 AGL1を用いて、Lefebvre et al., Plant Physiol. (2005)138:451-460に記載された、SBPase過剰発現N.tabacum 品種Samsun T4系統に導入した。一次形質転換体(T0世代、39個の植物)を、カナマイシン(100mg L-1)、ヒグロマイシン(20mg L-1)およびオーグメンチン(500mg L-1)を含むMS培地上で再生した。組み込まれた導入遺伝子を発現する植物を、半定量的RT-PCRを用いてスクリーニングした。SBPase+シトクロムc6(SC6系統:1、2および3)を発現するN.tabacum 品種Samsun系統を自家受粉し、その後の実験に使用した子孫は、半定量的RT-PCRによって導入遺伝子の存在および発現について確認した。
本研究で使用したコントロール植物は、トランスジェニック系統由来のWTおよびヌル分離個体(すなわち、azygous系統)の複合群であり、導入遺伝子が非組込みであることをPCRおよび半定量的RT-PCRによって確認された。以下の実施例に記載した実験で使用したトランスジェニック株およびコントロール株の全リストを、表1に提供する。
タバコ形質転換体の選択:半定量的RT-PCR(実施例2に記載)を用いて、SB系統およびSBC6系統におけるFBP/SBPaseトランスクリプトの存在、C6系統、SBC6系統およびSC6系統におけるシトクロムc6トランスクリプトの存在、並びにS系統およびSC6系統におけるSBPaseトランスクリプトの存在を検出した(図2A~2B)。イムノブロット解析を用いて、選択したSB系統およびSBC6系統がFBP/SBPaseタンパク質を累積したこと、およびS系統およびSC6系統がSBPaseタンパク質を過剰発現したことを示した(図3A~3B、実施例4に記載されたイムノブロット解析)。イムノブロット解析に加えて、N.tabacum 品種Petit HavanaのSB系統およびC6系統(T2/T4生成)ならびにSBC6系統(F3ホモ接合生成;F1は交配由来の最初の種子)の葉における総抽出FBPase活性を、測定した。この解析は、SB系統およびSBC6系統が、コントロールよりも34%から47%多くの活性の範囲でFBPase活性レベルが増加していたことを示した(図2B)。複数のSB植物およびSBC6植物由来のFBPase活性の変動を示すフルセットのアッセイは、図4で見ることができる。さらに、P.umbilicalisシトクロムc6タンパク質に対して産生された抗体を用いたイムノブロット法により、C6系統におけるシトクロムc6タンパク質の発現を測定した。図5Aに示すように、P.umbilicalis粗タンパク質抽出物(P)、およびC6系統15、41および47(C6)の複合のタンパク質混合物において、独特のバンドが現れた。野生型(WT)またはazygous(A)コントロールにおいて、バンドは観察されなかった(図5A~5B)。
600μmol m-2 s-1の放射照度におけるN.tabacum 品種Petit Havana SB系統、C6系統およびSBC6系統、または650μmol m-2 s-1の放射照度におけるN.tabacum 品種Samsunのクロロフィル蛍光分析は、若齢植物では、光化学系2(PSII)光化学(Fq’/Fm’)の作動効率が、WTまたはヌル分離個体コントロールのいずれかと比較して、すべてのトランスジェニック系統で有意に高かった(図2C~2D)。しかしながら、SBC6系統およびSC6系統のFq’/Fm’値は、FBP/SBPase(SB)、シトクロムc6(C6)、またはSBPase(S)を個別に発現している植物から得られたFq’/Fm’値と有意には異ならなかった。
<実施例2:cDNA生成および半定量RT-PCR>
cDNA生成:cDNA生成に使用した葉は、光合成測定に使用したものと同じ葉であった(実施例7参照)。NucleoSpin(登録商標)RNA Plant Kit(Macherey-Nagel、Fisher Scientific、UK)を用いて、タバコリーフディスク(温室栽培植物からサンプリングし、液体窒素中で迅速に凍結した)から全RNAを抽出した。RevertAid Reverse Transcriptase Kit(Fermentas、Life Sciences、UK)のプロトコールに従って、オリゴ-dTプライマーを用いて、20μl中1μgの全RNAを使用して、cDNAを合成した。cDNAを、12.5ng μL-1の最終濃度まで4倍に希釈した。
cDNA生成:cDNA生成に使用した葉は、光合成測定に使用したものと同じ葉であった(実施例7参照)。NucleoSpin(登録商標)RNA Plant Kit(Macherey-Nagel、Fisher Scientific、UK)を用いて、タバコリーフディスク(温室栽培植物からサンプリングし、液体窒素中で迅速に凍結した)から全RNAを抽出した。RevertAid Reverse Transcriptase Kit(Fermentas、Life Sciences、UK)のプロトコールに従って、オリゴ-dTプライマーを用いて、20μl中1μgの全RNAを使用して、cDNAを合成した。cDNAを、12.5ng μL-1の最終濃度まで4倍に希釈した。
RT-PCR:半定量的RT-PCRについて、全容量25μL中の2μLのRT反応混合物(100ngのRNA)を、製造業者の推奨に従って、DreamTaq DNAポリメラーゼ(Thermo Fisher Scientific、UK)と共に使用した。PCR産物を、1.0%アガロースゲル上で分画した。半定量的RT-PCRに使用したプライマーを以下の表2に提供する。
<実施例3:植物の栽培>
(トランスジェニック植物系統の生成)
野生型タバコ植物、およびトランスジェニック植物の自家受粉に起因するT1子孫を、土壌(Levington F2、Fisons、Ipswich、UK)中に播種して育てた。実施例1に記載されるように、N.tabacum 品種Samsunにおける実験については、ヌル分離個体を形質転換系統から選択した。N.tabacum 品種Petit Havanaにおける実験については、ヌル分離個体をSBC6系統から選択した。実験的研究に使用した種子を下記のように発芽させ、得られた植物を管理条件下で育てた。
(トランスジェニック植物系統の生成)
野生型タバコ植物、およびトランスジェニック植物の自家受粉に起因するT1子孫を、土壌(Levington F2、Fisons、Ipswich、UK)中に播種して育てた。実施例1に記載されるように、N.tabacum 品種Samsunにおける実験については、ヌル分離個体を形質転換系統から選択した。N.tabacum 品種Petit Havanaにおける実験については、ヌル分離個体をSBC6系統から選択した。実験的研究に使用した種子を下記のように発芽させ、得られた植物を管理条件下で育てた。
(管理条件)
実験的研究のために、T2~T4およびF1~F3子孫種子を、130μmol光子m-2 s-1の放射照度、22℃の温度、60%の相対湿度、および16時間の光周期(16時間明期:8時間暗期)で管理された環境チャンバー中において、土壌上で発芽させた。植物を個々の8cmのポットに移し、同じ条件下(130μmol光子m-2 s-1の放射照度、22℃の温度、60%の相対湿度、および16時間の光周期)で2週間育てた。次いで、植物を4Lのポットに移し、環境管理された温室(16時間の光周期;日中25℃~30℃と夜間20℃との間の温度)で栽培した。雲の覆いによって誘発される低い自然光の期間中、自然光は、高圧ナトリウムライトバルブで補われ、それぞれ、鉢の高さから植物の上端部まで、380~1000μmol光子m-2 s-1(ハイライト)の最小限の放射照度を提供した。植物の位置を毎週3回変え、栄養剤とともに植物に定期的に給水した(Hoagland et al., The College of Agriculture (1950)1)。植物は、成熟時に、ほとんど閉じた冠が達成され、温度範囲が、周囲の外部環境に類似するよう維持されるように配置された。
実験的研究のために、T2~T4およびF1~F3子孫種子を、130μmol光子m-2 s-1の放射照度、22℃の温度、60%の相対湿度、および16時間の光周期(16時間明期:8時間暗期)で管理された環境チャンバー中において、土壌上で発芽させた。植物を個々の8cmのポットに移し、同じ条件下(130μmol光子m-2 s-1の放射照度、22℃の温度、60%の相対湿度、および16時間の光周期)で2週間育てた。次いで、植物を4Lのポットに移し、環境管理された温室(16時間の光周期;日中25℃~30℃と夜間20℃との間の温度)で栽培した。雲の覆いによって誘発される低い自然光の期間中、自然光は、高圧ナトリウムライトバルブで補われ、それぞれ、鉢の高さから植物の上端部まで、380~1000μmol光子m-2 s-1(ハイライト)の最小限の放射照度を提供した。植物の位置を毎週3回変え、栄養剤とともに植物に定期的に給水した(Hoagland et al., The College of Agriculture (1950)1)。植物は、成熟時に、ほとんど閉じた冠が達成され、温度範囲が、周囲の外部環境に類似するよう維持されるように配置された。
(圃場)
Lopez-Calcagno et al., Plant Biotechnol. J. (2018)に記載されるように、植物を育てた。圃場場所は、イリノイ大学エネルギー農園(米国イリノイ州アーバナ、40.11°N、88.21°W)に位置していた。2つの異なる実験設計が、2つの異なる年に使用された。
Lopez-Calcagno et al., Plant Biotechnol. J. (2018)に記載されるように、植物を育てた。圃場場所は、イリノイ大学エネルギー農園(米国イリノイ州アーバナ、40.11°N、88.21°W)に位置していた。2つの異なる実験設計が、2つの異なる年に使用された。
図6Aは、2016年に使用された複製管理設計を示す。植物を、野生型植物の境界である外側の境界に対して、30cmの間隔をあけた列で育てた。全体の実験は、野生型植物の2列の境界に囲まれていた。必要に応じて雨塔を用いて、植物を潅漑した。T2種子を発芽させ、11日後に個々のポット(350mL)に実生苗を移動した。実生苗は、圃場に移す前に、温室内でさらに15日間生育させた。植物は、収穫前に14日間、圃場で生育させた。
図6Bは、2つの実験が2週間あけて実施されたときの、2017年に使用された列設計内のブロックを示す。この設計において、1つのブロックは、5つのコンフリクトの各々の1つの独立したトランスジェニック系統を含み、各列は、全ての系統を有する。各ブロックの中央の20個体の植物は、遺伝子型当たり4個体ずつ5列に分けられる。2017年の実験1は、コントロール(WTおよびヌル分離個体)、FBP/SBPase発現系統(SB)およびシトクロムc6発現系統(C6)を含んでいた。2017年の実験2は、コントロール(WTおよびヌル分離個体)、シトクロムc6発現系統(C6)およびFBP/SBPase+シトクロムc6発現系統(SBC6)を含んでいた。また、2017年の実験では、グリシン切断システムのHタンパク質を過剰発現する系統(G系統)およびこれらの系統由来のヌル分離個体(aG系統)(データは、Lopez-Calcagno et al., Plant Biotechnol. J. (2019)17(1):141-151に公表されている)、並びにBおよびCタンパク質を発現し、Hタンパク質を過剰発現する系統(SBCG系統)およびこれらの系統由来のヌル分離個体(aSBCG系統)(データは公表されていない)を単独で評価した系統も含まれていた。種子を発芽させ、12日後に水耕トレー(Trans-plant Tray GP009 6912 cells;Speedling Inc.,Ruskin,FL)に移した。実生苗は、圃場に移す前に31~33日間温室内で生育させた。植物は、収穫前に開花するまで(さらに24~30日)、圃場で生育させた。
圃場は、Kromdijk et al., Science (2016)354:857-861に記載されているように、両方の年に整備した。光量(LI-quantum sensor;LI-COR)および気温(Model 109 tempreture probe;Campbell Scientific Inc.,Logan,UT)を同じ圃場場所の近くで測定し、データロガー(CR1000;Campbell Scientific)を用いて15分間の平均値(図6A~6B)を記録した。
<実施例4:タンパク質抽出およびイムノブロット解析>
リーフディスク(直径0.8cm)を、光合成測定(実施例7を参照)に使用した葉の同じ領域から採取し、液体N2中に速やかに浸漬し、-80℃で保存した。リーフディスクを、ドライアイス中で粉砕した。タンパク質抽出は、Lopez-Calcagno, et al., J. Exp. Bot. (2017)68:2285-2298に記載されているように、またはRNA調製中にヌクレオスピンRNA/タンパク質キット(Macherey-Nagel;www.mn-net.com)を使用して行った。Macherey-Nagel製のタンパク質定量キットを用いて、タンパク質定量を行った。サンプルをタンパク質の基準と同等に充填し、12%(w/v)SDS-PAGEを使用して分離し、ニトロセルロース膜(GE Healthcare Life science、Germany)に移し、SBPaseおよびFBP/SBPaseに対して産生された抗体を使用してプローブした。二次抗体に結合した西洋ワサビペルオキシダーゼおよびECL化学発光検出試薬(Amersham、Buckinghamshire、UK)を用いて、タンパク質を検出した。SBPase抗体は、以前に特徴付けられた(Lefebvre et al., Plant Physiol. (2005)138:451-460;Dunford et al., Protein Expr. Purif. (1998)14:139-145)。FBP/SBPase抗体は、タンパク質[C]-DRPRHKELIQEIRNAG-アミド(配列番号93)の保存領域由来のペプチドに対して産生され、シトクロムc6抗体は、ペプチド[C]-[Nle]-PDKTLKKDVLEANS-アミド(配列番号94)(Cambridge Research Biochemicals,Cleveland,UK)に対して産生された。前述の抗体に加えて、トランスケトラーゼ(Henkes, et al., Plant Cell (2001)13:535-551;Khozaei, et al., Plant Cell (2015)27:432-447)に対して産生された抗体、およびローディングコントロールとして使用するためにグリシンデカルボキシラーゼHタンパク質を使用してサンプルをプローブした。グリシンデカルボキシラーゼHタンパク質抗体は、Timm et al., Febs Lett. (2012)586:3692-3697において以前に特徴付けられた。
リーフディスク(直径0.8cm)を、光合成測定(実施例7を参照)に使用した葉の同じ領域から採取し、液体N2中に速やかに浸漬し、-80℃で保存した。リーフディスクを、ドライアイス中で粉砕した。タンパク質抽出は、Lopez-Calcagno, et al., J. Exp. Bot. (2017)68:2285-2298に記載されているように、またはRNA調製中にヌクレオスピンRNA/タンパク質キット(Macherey-Nagel;www.mn-net.com)を使用して行った。Macherey-Nagel製のタンパク質定量キットを用いて、タンパク質定量を行った。サンプルをタンパク質の基準と同等に充填し、12%(w/v)SDS-PAGEを使用して分離し、ニトロセルロース膜(GE Healthcare Life science、Germany)に移し、SBPaseおよびFBP/SBPaseに対して産生された抗体を使用してプローブした。二次抗体に結合した西洋ワサビペルオキシダーゼおよびECL化学発光検出試薬(Amersham、Buckinghamshire、UK)を用いて、タンパク質を検出した。SBPase抗体は、以前に特徴付けられた(Lefebvre et al., Plant Physiol. (2005)138:451-460;Dunford et al., Protein Expr. Purif. (1998)14:139-145)。FBP/SBPase抗体は、タンパク質[C]-DRPRHKELIQEIRNAG-アミド(配列番号93)の保存領域由来のペプチドに対して産生され、シトクロムc6抗体は、ペプチド[C]-[Nle]-PDKTLKKDVLEANS-アミド(配列番号94)(Cambridge Research Biochemicals,Cleveland,UK)に対して産生された。前述の抗体に加えて、トランスケトラーゼ(Henkes, et al., Plant Cell (2001)13:535-551;Khozaei, et al., Plant Cell (2015)27:432-447)に対して産生された抗体、およびローディングコントロールとして使用するためにグリシンデカルボキシラーゼHタンパク質を使用してサンプルをプローブした。グリシンデカルボキシラーゼHタンパク質抗体は、Timm et al., Febs Lett. (2012)586:3692-3697において以前に特徴付けられた。
(シトクロムc6のタンパク質抽出)
全葉を8週齢の植物から収穫し、冷水で洗浄し、次いで80%エタノールに浸した布で拭いて、葉残渣の大部分を除去した。次いで、葉を冷水中でさらに2回洗浄し、中央脈を除去し、残りの組織50gを密封したビニール袋に入れ、暗所で4℃下にて一晩保存した。タンパク質を、いくつかの変化を伴って、Hiyama, Methods Mol. Biol. (2004)274:11-17のように抽出した。葉組織を、250mlの冷却した葉緑体調製緩衝液(50mMリン酸ナトリウム緩衝液、pH7、10mM NaCl)中で30秒間ホモジナイズした。次に、溶液を4層のモスリン布に通して濾過し、10,000×gで5分間遠心分離した。次いで、得られた沈殿物を、50mLの冷却した葉緑体調製緩衝液に穏やかに再懸濁し、クロロフィル濃度を測定し、約2mg ml-1に調製した。次いで、得られた混合物を、2容量の予熱した(45℃)可溶化溶剤(50mM Tris-HCl、pH8.8、および3% triton X-100)に添加し、45℃で30分間インキュベートした。次いで、氷浴中でさらに30分間冷却した後、12000gで30分間遠心分離した。上清を、次の段階で使用するために-80℃で保存した。シトクロムc6タンパク質を精製するために、Biorad Econo-Pac High-Q 5ml型洗浄カラムを、1ml min-1の流速で使用した。最初に、100mlの出発緩衝液(starting buffer)(10mM Tris-HCl pH8.8、0.2% triton X-100、および20% スクロース)で洗浄することによって、カラムを調製した。次いで、前工程からのタンパク質混合物を等量の冷却した出発緩衝液で希釈し、1mL min-1の流速でカラムを通過させた。全てのタンパク質をカラムに充填したら、次いで、それを10mM NaClを補充した1000mlの出発緩衝液を用いて洗浄した。次いで、カラムを、50mlのNaClを補充した300mlの出発緩衝液を用いて洗浄し、最後に、カラムを、50mM~200mMのNaCl濃度を補充した出発緩衝液の直線勾配で、1ml min-1の流速にて4時間かけて溶出し、アリコートを複数回収集した。サンプルを、300μlの充填緩衝液(50% グリセロール、25% β-メルカプトエタノール、25% EDTA)と混合し、同等のタンパク質基準で充填し、18%(w/v)SDS-PAGEを用いて分離し、ニトロセルロース膜に移して、シトクロムc6に対して産生された抗体を用いてプローブした。
全葉を8週齢の植物から収穫し、冷水で洗浄し、次いで80%エタノールに浸した布で拭いて、葉残渣の大部分を除去した。次いで、葉を冷水中でさらに2回洗浄し、中央脈を除去し、残りの組織50gを密封したビニール袋に入れ、暗所で4℃下にて一晩保存した。タンパク質を、いくつかの変化を伴って、Hiyama, Methods Mol. Biol. (2004)274:11-17のように抽出した。葉組織を、250mlの冷却した葉緑体調製緩衝液(50mMリン酸ナトリウム緩衝液、pH7、10mM NaCl)中で30秒間ホモジナイズした。次に、溶液を4層のモスリン布に通して濾過し、10,000×gで5分間遠心分離した。次いで、得られた沈殿物を、50mLの冷却した葉緑体調製緩衝液に穏やかに再懸濁し、クロロフィル濃度を測定し、約2mg ml-1に調製した。次いで、得られた混合物を、2容量の予熱した(45℃)可溶化溶剤(50mM Tris-HCl、pH8.8、および3% triton X-100)に添加し、45℃で30分間インキュベートした。次いで、氷浴中でさらに30分間冷却した後、12000gで30分間遠心分離した。上清を、次の段階で使用するために-80℃で保存した。シトクロムc6タンパク質を精製するために、Biorad Econo-Pac High-Q 5ml型洗浄カラムを、1ml min-1の流速で使用した。最初に、100mlの出発緩衝液(starting buffer)(10mM Tris-HCl pH8.8、0.2% triton X-100、および20% スクロース)で洗浄することによって、カラムを調製した。次いで、前工程からのタンパク質混合物を等量の冷却した出発緩衝液で希釈し、1mL min-1の流速でカラムを通過させた。全てのタンパク質をカラムに充填したら、次いで、それを10mM NaClを補充した1000mlの出発緩衝液を用いて洗浄した。次いで、カラムを、50mlのNaClを補充した300mlの出発緩衝液を用いて洗浄し、最後に、カラムを、50mM~200mMのNaCl濃度を補充した出発緩衝液の直線勾配で、1ml min-1の流速にて4時間かけて溶出し、アリコートを複数回収集した。サンプルを、300μlの充填緩衝液(50% グリセロール、25% β-メルカプトエタノール、25% EDTA)と混合し、同等のタンパク質基準で充填し、18%(w/v)SDS-PAGEを用いて分離し、ニトロセルロース膜に移して、シトクロムc6に対して産生された抗体を用いてプローブした。
<実施例5:リン酸放出によるFBPase活性の測定>
SBPaseに関する以前の記載にわずかな変更を加えて、FBPase活性を、リン酸放出によって決定した(Simkin et al., J. Exp. Bot. (2015)66:4075-4090)。光合成測定に使用したのと同じ葉からリーフディスクを得て(実施例7参照)、光合成測定が完了した後、ディスクを単離し、液体窒素中で凍結した。リーフディスクを液体窒素中で微粉末に粉砕し、抽出緩衝液(50mM HEPES、pH8.2;5mM MgCl;1mM EDTA;1mM EGTA;10% グリセロール;0.1% triton X-100;2mM ベンズアミジン;2mM アミノカプロン酸;0.5mM フェニルメチルスルホニルフッ化物;10mM ジチオスレイトール)に浸漬し、14,000×g、4℃で1分間遠心分離した。得られた上清(1ml)を、NAP-10カラム(Amersham)を通して脱塩し、液体窒素中で保存した。アッセイは、Simkin, et al., J. Exp. Bot. (2015)66:4075-4090に記載されているように行った。簡潔には、20μlの抽出物を、80μlのアッセイ緩衝液(50mM Tris、pH8.2;15mM MgCl2;1.5mM EDTA;10mM DTT;7.5mM フルクトース-1,6-ビスリン酸)に添加し、25℃で30分間インキュベートした。反応は、50μlの1M 過塩素酸の添加によって停止させた。300μlのBiomol Green(Affiniti Research Products,Exeter,UK)を加えた後、30μlのサンプルまたは標準物質(0.125nmol~4nmolの濃度のPO3- 4)を、室温で30分間インキュベートし、マイクロプレートリーダー(VERSAmax,Molecular Devices,Sunnyvale,CA)を用いて、620nmでの吸光度(A620)を測定した。FBPase活性を、トランスケトラーゼ活性に正規化した(Zhao, et al., Biomed. Res. Int. (2014)2014:572915)。
SBPaseに関する以前の記載にわずかな変更を加えて、FBPase活性を、リン酸放出によって決定した(Simkin et al., J. Exp. Bot. (2015)66:4075-4090)。光合成測定に使用したのと同じ葉からリーフディスクを得て(実施例7参照)、光合成測定が完了した後、ディスクを単離し、液体窒素中で凍結した。リーフディスクを液体窒素中で微粉末に粉砕し、抽出緩衝液(50mM HEPES、pH8.2;5mM MgCl;1mM EDTA;1mM EGTA;10% グリセロール;0.1% triton X-100;2mM ベンズアミジン;2mM アミノカプロン酸;0.5mM フェニルメチルスルホニルフッ化物;10mM ジチオスレイトール)に浸漬し、14,000×g、4℃で1分間遠心分離した。得られた上清(1ml)を、NAP-10カラム(Amersham)を通して脱塩し、液体窒素中で保存した。アッセイは、Simkin, et al., J. Exp. Bot. (2015)66:4075-4090に記載されているように行った。簡潔には、20μlの抽出物を、80μlのアッセイ緩衝液(50mM Tris、pH8.2;15mM MgCl2;1.5mM EDTA;10mM DTT;7.5mM フルクトース-1,6-ビスリン酸)に添加し、25℃で30分間インキュベートした。反応は、50μlの1M 過塩素酸の添加によって停止させた。300μlのBiomol Green(Affiniti Research Products,Exeter,UK)を加えた後、30μlのサンプルまたは標準物質(0.125nmol~4nmolの濃度のPO3- 4)を、室温で30分間インキュベートし、マイクロプレートリーダー(VERSAmax,Molecular Devices,Sunnyvale,CA)を用いて、620nmでの吸光度(A620)を測定した。FBPase活性を、トランスケトラーゼ活性に正規化した(Zhao, et al., Biomed. Res. Int. (2014)2014:572915)。
<実施例6:実生苗におけるクロロフィル蛍光イメージングスクリーニング>
130μmol mol-2 s-2および周囲CO2濃度(400μmol mol-1)にて管理された環境チャンバー内で育てた2~3週齢のタバコ実生苗について、クロロフィル蛍光イメージングを行った。クロロフィル蛍光パラメータは、クロロフィル蛍光(CF)イメージングシステム(Technologica,Colchester,UK(Barbagallo, et al., Plant Physiol. (2003)132:485-493;von Caemmerer, et al., J. Exp. Bot. (2004)55:1157-1166))を用いて得た。光化学系2(PSII)光化学、Fq’/Fm’の作動効率は、6300μmol m-2 s-1 PPFDの飽和800msパルスの後、次の方程式Fq’/Fm’=(Fm’-F’)/Fm’を用いて、光(F’)における定常状態蛍光および最大蛍光(Fm’)の測定から計算した。Fq’/Fm’のイメージは、N.tabacum 品種Petit Havanaに対する600μmol m-2 s-2の安定PPFDの下、およびN.tabacum 品種Samsunに対する650μmol m-2 s-2の安定PPFDの下で取った(Baker, et al., Journal of Experimental Botany (2001)52:615-621;Oxborough, et al., Philos. Trans. R. Soc. Lond. B. Biol. Sci. (2000)355:1489-1498;Lawson, et al., J. Exp. Bot. (2008)59:3609-3619)。
130μmol mol-2 s-2および周囲CO2濃度(400μmol mol-1)にて管理された環境チャンバー内で育てた2~3週齢のタバコ実生苗について、クロロフィル蛍光イメージングを行った。クロロフィル蛍光パラメータは、クロロフィル蛍光(CF)イメージングシステム(Technologica,Colchester,UK(Barbagallo, et al., Plant Physiol. (2003)132:485-493;von Caemmerer, et al., J. Exp. Bot. (2004)55:1157-1166))を用いて得た。光化学系2(PSII)光化学、Fq’/Fm’の作動効率は、6300μmol m-2 s-1 PPFDの飽和800msパルスの後、次の方程式Fq’/Fm’=(Fm’-F’)/Fm’を用いて、光(F’)における定常状態蛍光および最大蛍光(Fm’)の測定から計算した。Fq’/Fm’のイメージは、N.tabacum 品種Petit Havanaに対する600μmol m-2 s-2の安定PPFDの下、およびN.tabacum 品種Samsunに対する650μmol m-2 s-2の安定PPFDの下で取った(Baker, et al., Journal of Experimental Botany (2001)52:615-621;Oxborough, et al., Philos. Trans. R. Soc. Lond. B. Biol. Sci. (2000)355:1489-1498;Lawson, et al., J. Exp. Bot. (2008)59:3609-3619)。
<実施例7:リーフガス交換>
光合成ガス交換およびクロロフィル蛍光パラメータを、6400~40蛍光光度計ヘッドユニットを有する携帯型赤外線ガス分析器(LI-COR 6400;LI-COR,Lincoln,NE,USA)を使用して記録した。特に明記しない限り、全ての測定は、LI-COR 6400キュベットを用いて行った。温室で育てた植物の場合、条件は、400μmol mol-1のCO2濃度、25℃の葉温、および1±0.2kPaの蒸気圧欠損(VPD)で維持された。圃場条件下で育てた植物のチャンバー条件は、400μmol mol-1のCO2濃度を有し、遮断温度は周囲温度より2℃高く設定され(それぞれのガス交換応答曲線を生成する前に、周囲気温を測定した)、VPDは、できるだけ1kPaに近くなるように維持された。
光合成ガス交換およびクロロフィル蛍光パラメータを、6400~40蛍光光度計ヘッドユニットを有する携帯型赤外線ガス分析器(LI-COR 6400;LI-COR,Lincoln,NE,USA)を使用して記録した。特に明記しない限り、全ての測定は、LI-COR 6400キュベットを用いて行った。温室で育てた植物の場合、条件は、400μmol mol-1のCO2濃度、25℃の葉温、および1±0.2kPaの蒸気圧欠損(VPD)で維持された。圃場条件下で育てた植物のチャンバー条件は、400μmol mol-1のCO2濃度を有し、遮断温度は周囲温度より2℃高く設定され(それぞれのガス交換応答曲線を生成する前に、周囲気温を測定した)、VPDは、できるだけ1kPaに近くなるように維持された。
(A/Ci応答曲線(光合成能力))
細胞内CO2濃度(Ci)に対する正味の光合成(A)の応答は、2000μmol mol -2 s-1の飽和光量で測定した。照明は、リーフキュベットに取り付けられた赤色-青色光源によって提供された。Aの測定は、400μmol mol-1の周囲CO2濃度(Ca)で開始された。その後、Caは、最低濃度の50μmol mol-1まで段階的に減少され、次いで、上限濃度の2000μmol mol-1まで段階的に増加された。最大飽和CO2同化率(Amax)、最大カルボキシル化率(Vcmax)および最大電子伝達流量(Jmax)のパラメータを計算するために、C3光合成モデル(Farquhar, et al., Planta (1980)149:78-90)を、Sharkey, et al., Plant Cell Environ. (2007)30:1035-1040によって提供されたスプレッドシートを用いて、A/Ciデータに挿入した。さらに、数学的にはPSII効率因子Fq’/Fv’と同じである、PSIIの作動効率(Fq’/Fm’)および光化学的クエンチング係数(qP)を含むクロロフィル蛍光パラメータは、それぞれの時点で記録された。
細胞内CO2濃度(Ci)に対する正味の光合成(A)の応答は、2000μmol mol -2 s-1の飽和光量で測定した。照明は、リーフキュベットに取り付けられた赤色-青色光源によって提供された。Aの測定は、400μmol mol-1の周囲CO2濃度(Ca)で開始された。その後、Caは、最低濃度の50μmol mol-1まで段階的に減少され、次いで、上限濃度の2000μmol mol-1まで段階的に増加された。最大飽和CO2同化率(Amax)、最大カルボキシル化率(Vcmax)および最大電子伝達流量(Jmax)のパラメータを計算するために、C3光合成モデル(Farquhar, et al., Planta (1980)149:78-90)を、Sharkey, et al., Plant Cell Environ. (2007)30:1035-1040によって提供されたスプレッドシートを用いて、A/Ciデータに挿入した。さらに、数学的にはPSII効率因子Fq’/Fv’と同じである、PSIIの作動効率(Fq’/Fm’)および光化学的クエンチング係数(qP)を含むクロロフィル蛍光パラメータは、それぞれの時点で記録された。
(A/Q応答曲線)
光の機能としての光合成(A/Q応答曲線)を、上記のA/Ci曲線と同じキュベット条件で測定した。Aおよびgsを以下の光レベルにて測定した後に、葉を、2200μmol m-2 s-1の飽和放射照度に、初めに安定させた:2000μmol m-2 s-1、1650μmol m-2 s-1、1300μmol m-2 s-1、1000μmol m-2 s-1、750μmol m-2 s-1、500μmol m-2 s-1、400μmol m-2 s-1、300μmol m-2 s-1、200μmol m-2 s-1、150μmol m-2 s-1、100μmol m-2 s-1、50μmol m-2 s-1、および0μmol m-2 s-1。Aが新たな定常状態(1分~3分)に達した後、gsが新たな光レベルに変化する前に、測定を記録した。Aおよびgsの値を用いて、本質的な水利用効率(iWUE=A/gs)を推定した。
光の機能としての光合成(A/Q応答曲線)を、上記のA/Ci曲線と同じキュベット条件で測定した。Aおよびgsを以下の光レベルにて測定した後に、葉を、2200μmol m-2 s-1の飽和放射照度に、初めに安定させた:2000μmol m-2 s-1、1650μmol m-2 s-1、1300μmol m-2 s-1、1000μmol m-2 s-1、750μmol m-2 s-1、500μmol m-2 s-1、400μmol m-2 s-1、300μmol m-2 s-1、200μmol m-2 s-1、150μmol m-2 s-1、100μmol m-2 s-1、50μmol m-2 s-1、および0μmol m-2 s-1。Aが新たな定常状態(1分~3分)に達した後、gsが新たな光レベルに変化する前に、測定を記録した。Aおよびgsの値を用いて、本質的な水利用効率(iWUE=A/gs)を推定した。
<実施例8:統計解析>
すべての統計解析は、Sys-stat、University of Essex,UK、およびRを用いて行った(ウェブサイト www.r-project.orgを参照)。収穫データ、実生苗クロロフィルイメージング、および酵素活性について、分散分析(ANOVA)およびPost hoc Tukey試験を行った。ガス交換曲線について、データを、lmer関数およびIII型ANOVA(Vialet-Chabrand, et al., Plant Physiol. (2017)173:2163-2179)を使用する線形混合モデル分析によって比較した。操作間の有意差は、コントラスト分析(lsmeans package)を用いて同定した。
すべての統計解析は、Sys-stat、University of Essex,UK、およびRを用いて行った(ウェブサイト www.r-project.orgを参照)。収穫データ、実生苗クロロフィルイメージング、および酵素活性について、分散分析(ANOVA)およびPost hoc Tukey試験を行った。ガス交換曲線について、データを、lmer関数およびIII型ANOVA(Vialet-Chabrand, et al., Plant Physiol. (2017)173:2163-2179)を使用する線形混合モデル分析によって比較した。操作間の有意差は、コントラスト分析(lsmeans package)を用いて同定した。
<実施例9:電子伝達およびRuBP再生の促進は、温室条件下の2つの異なるタバコ品種における光合成能力を高める>
上記の最初の選別に基づいて選択されたトランスジェニック系統は、400μmol m-2 s -1~1000μmol m-2 s-1の照明を提供するために補完された自然光を伴う、温室内で育てられた。正味のCO2同化率(A)およびFq’/Fm’を、N.tabacum 品種Samsun(SおよびSC6)の成熟葉および発育中の葉ならびにN.tabacum 品種Petit Havana(SB、C6およびSBC6)の成熟葉における細胞内CO2濃度(Ci)の関数として決定した(図7A~7B)。トランスジェニック系統は、コントロール植物(CN)よりも高いCO2同化率を示した。Aは、約300μmol mol-1のCiで、SC6の成熟葉においてコントロールよりも15%高かった(一方、現行の周囲CO2濃度は約400μmol-1であり、測定されたCi濃度は、気孔制限を含む多数の要因のために周囲よりも低い)(図7B)。また、SC6植物の発育中の葉は、PSII作動効率(Fq’/Fm’)およびPSII効率因子(efficiency factor)(Fq’/Fv’)においても有意な増加を示した(図7B)。これらは、酸化された状態にQAを維持する光合成装置の能力によって決定され、従って、コントロール植物と比較した場合の光化学的クエンチング(quenching)の指標である。興味深いことに、N.tabacum 品種Samsunトランスジェニック植物の成熟葉において、トランスジェニック植物とコントロール植物との間の同化率およびPSII光化学の作動効率の差が、発育中の葉よりも小さかった。Sトランスジェニック植物の成熟葉だけが、すべての測定したCO2濃度で、Fq’/Fm’およびFq’/Fv’の平均値がコントロール植物に比べて高いことを示した(図7B)。対照的に、SC6植物の成熟葉は、300μmol m-1と900μmol m-1との間のCiレベルでのみ、コントロールより高いFq’/Fv’値を表した(図7B)。
上記の最初の選別に基づいて選択されたトランスジェニック系統は、400μmol m-2 s -1~1000μmol m-2 s-1の照明を提供するために補完された自然光を伴う、温室内で育てられた。正味のCO2同化率(A)およびFq’/Fm’を、N.tabacum 品種Samsun(SおよびSC6)の成熟葉および発育中の葉ならびにN.tabacum 品種Petit Havana(SB、C6およびSBC6)の成熟葉における細胞内CO2濃度(Ci)の関数として決定した(図7A~7B)。トランスジェニック系統は、コントロール植物(CN)よりも高いCO2同化率を示した。Aは、約300μmol mol-1のCiで、SC6の成熟葉においてコントロールよりも15%高かった(一方、現行の周囲CO2濃度は約400μmol-1であり、測定されたCi濃度は、気孔制限を含む多数の要因のために周囲よりも低い)(図7B)。また、SC6植物の発育中の葉は、PSII作動効率(Fq’/Fm’)およびPSII効率因子(efficiency factor)(Fq’/Fv’)においても有意な増加を示した(図7B)。これらは、酸化された状態にQAを維持する光合成装置の能力によって決定され、従って、コントロール植物と比較した場合の光化学的クエンチング(quenching)の指標である。興味深いことに、N.tabacum 品種Samsunトランスジェニック植物の成熟葉において、トランスジェニック植物とコントロール植物との間の同化率およびPSII光化学の作動効率の差が、発育中の葉よりも小さかった。Sトランスジェニック植物の成熟葉だけが、すべての測定したCO2濃度で、Fq’/Fm’およびFq’/Fv’の平均値がコントロール植物に比べて高いことを示した(図7B)。対照的に、SC6植物の成熟葉は、300μmol m-1と900μmol m-1との間のCiレベルでのみ、コントロールより高いFq’/Fv’値を表した(図7B)。
N.tabacum 品種Petit Havanaトランスジェニック植物についても同様の傾向が示され、コントロールと比較して、A、Fq’/Fm’、およびFq’/Fv’のより高い平均値を表した(図7A)。SBC6植物(N.tabacum 品種Petit Havana)の成熟葉では、これらの有意な増加はSC6系統(N.tabacum 品種Samsun)の発育中の葉について示された傾向に類似していた(図7A-7B)。
SおよびSC6植物の両方(N.tabacum 品種Samsun)の発育中の葉は、コントロール植物と比較した場合、JmaxおよびAmaxにおいて有意な増加を示した(表3)。また、SC6トランスジェニック植物の成熟葉は、コントロール植物と比較して、Vcmax、Jmax、およびAmaxの値が有意に高いことを表した。対照的に、SBC6植物(N.tabacum 品種Petit Havana)の葉は、VcmaxおよびJmaxのより高い平均値は明らかであったが、Amaxが有意に増加しただけだった。これらの結果は、FBP/SBPaseまたはSBPaseと組み合わせたシトクロムc6の発現による電子伝達およびRuBP再生の同時促進が、全ての分析された植物において、単一操作よりも光合成に対してより大きな影響を有することを示した。
<実施例10:電子伝達およびRuBP再生の促進は、温室条件下で2つの異なるタバコ品種の生育を促進する>
並行実験において、FBP/SBPase(SB)、シトクロムc6(C6)、またはFBP/SBPase+シトクロムc6(SBC6)を発現するN.tabacum 品種Petit Havana植物は、収穫前の4週間、管理条件において生育させ、SBPase(S)またはSBPase+シトクロムc6(SC6)を発現するN.tabacum 品種Samsun植物は、収穫前の6週間、管理条件において生育させた。高さ、葉数、総葉面積および地上バイオマスを測定した(図8および9)。全ての分析したトランスジェニック植物は、コントロール植物と比較してより高い高さを示した。シトクロムc6(C6およびSBC6=N.tabacum 品種Petit Havana;およびSC6=N.tabacum 品種Samsun)を発現する植物は、それぞれのコントロールと比較して、葉面積、ならびに茎および葉のバイオマスにおいて有意な増加があった。SBトランスジェニック植物(N.tabacum 品種Petit Havana)では、茎のバイオマスのみがコントロール植物よりも大きかった。特に、SBC6およびSC6トランスジェニックは、それぞれ単独のSBおよびSトランスジェニック植物よりも有意に大きな葉面積を示した。コントロール群と比較した場合、地上バイオマスの総増加は、SBで35%、C6で44%、およびSで9%であった。二重操作トランスジェニック株(SBC6およびSC6)は、コントロール群と比較して、一貫して高い地上質量平均を示した;SBC6で52%高く、SC6で32%高い(図8および9)。
並行実験において、FBP/SBPase(SB)、シトクロムc6(C6)、またはFBP/SBPase+シトクロムc6(SBC6)を発現するN.tabacum 品種Petit Havana植物は、収穫前の4週間、管理条件において生育させ、SBPase(S)またはSBPase+シトクロムc6(SC6)を発現するN.tabacum 品種Samsun植物は、収穫前の6週間、管理条件において生育させた。高さ、葉数、総葉面積および地上バイオマスを測定した(図8および9)。全ての分析したトランスジェニック植物は、コントロール植物と比較してより高い高さを示した。シトクロムc6(C6およびSBC6=N.tabacum 品種Petit Havana;およびSC6=N.tabacum 品種Samsun)を発現する植物は、それぞれのコントロールと比較して、葉面積、ならびに茎および葉のバイオマスにおいて有意な増加があった。SBトランスジェニック植物(N.tabacum 品種Petit Havana)では、茎のバイオマスのみがコントロール植物よりも大きかった。特に、SBC6およびSC6トランスジェニックは、それぞれ単独のSBおよびSトランスジェニック植物よりも有意に大きな葉面積を示した。コントロール群と比較した場合、地上バイオマスの総増加は、SBで35%、C6で44%、およびSで9%であった。二重操作トランスジェニック株(SBC6およびSC6)は、コントロール群と比較して、一貫して高い地上質量平均を示した;SBC6で52%高く、SC6で32%高い(図8および9)。
<実施例11:FBP/SBPaseおよびシトクロムc6の同時発現は、圃場条件下で生育および水利用効率を増加する>
管理された温室条件下で、トランスジェニック植物において観察されたバイオマスの増加が、圃場環境において再現され得るかどうかを試験するために、系統のサブセット(subset)を、圃場における試験のために選択した。トランスジェニックN.tabacum 品種Petit Havana系統に関して、バイオマスにおけるより大きな割合の増加が示されたため、これらの植物を選択し、2つの異なる年の3つの圃場実験で検証した(1つは2016年、2つは2017年)。
管理された温室条件下で、トランスジェニック植物において観察されたバイオマスの増加が、圃場環境において再現され得るかどうかを試験するために、系統のサブセット(subset)を、圃場における試験のために選択した。トランスジェニックN.tabacum 品種Petit Havana系統に関して、バイオマスにおけるより大きな割合の増加が示されたため、これらの植物を選択し、2つの異なる年の3つの圃場実験で検証した(1つは2016年、2つは2017年)。
2016年に、FBP/SBPase(SB)およびシトクロムc6(C6)の単独の遺伝子コンストラクトを発現する株の小規模複製コントロール実験を実施し、圃場での栄養生長(vegetative growth)を評価した。植物を発芽させ、圃場に移す前に26日間、管理した環境条件下で生育させた。圃場中で14日後、植物を初期の栄養生長期(vegetative stage)で収穫し、植物の高さ、全葉面積、および地上バイオマスを測定した(図10A)。これらのデータは、コントロールと比較して、SB植物が、それぞれ27%、35%および25%の高さ、葉面積および地上バイオマスの増加を示すことを明らかにした(図10A)。C6植物はまた、コントロールと比べて、それぞれ50%、41%および36%の高さ、葉面積および地上バイオマスにおける増加を示した(図10A)。2017年には、2つの大規模、ランダムブロック設計圃場実験を行い、コントロール植物に対するSB、C6、およびSBC6植物の性能を評価した。植物は、31~13日間、温室内にて種子から生育させ、次いで、圃場に移動させ、収穫前に、開花の開始まで(さらに24~30日)生育させた。図10B~10Cでは、開花の開始後に収穫されたSBおよびC6植物は、高さ、葉面積またはバイオマスの有意な増加を示さなかったことが分かる。興味深いことに、FBP/SBPase+シトクロムc6(SBC6)を発現する植物は、コントロールと比較した場合、いくつかの生育パラメータにおいて、それぞれ、高さ、葉面積、および地上バイオマスにおける13%、17%、27%の増加を伴って、有意な増加を示した(図10C)。
さらに、2017年の圃場実験では、飽和光(A/Ci)でのCiの関数としてAを決定した。2017年の実験1では、PSII作動効率(Fq’/Fm’)に差がないSBおよびC6植物において、Aの有意な増加が観察された(図11A)。しかしながら、2017年の実験2では、コントロール植物と比較した場合、C6およびSBC6植物におけるAの値において、明らかな差はみられず、かつFq’/Fm’の値においても明らかな差はみられなかった(図11B)。光の関数(PPFD)としてのAの分析は、遺伝子型間のAにおける小さな差異または有意でない差異のいずれかを示した(図12Aおよび図13A)。興味深いことに、SBC6植物における気孔伝導度(gS)は、1000μmol m-2 s-1を超える光量にて、C6またはコントロール植物よりも有意に低かった(図12B)。結果としてこれは、SBC6植物の潜在的水利用効率(iWUE)において有意な増加となった(図12D)。SBまたはC6のトランスジェニック植物について、iWUEに有意な差は見られなかった(図12Dおよび図13D)。
上述の実施例は、2つの異なったタバコ品種において、電子伝達の増加およびRuBP再生の改善された能力を同時に有するトランスジェニック植物の生成および分析を記載する。これらの実施例は、(シトクロムc6の発現による)電子伝達の独立した促進および(FBP/SBPaseの発現またはSBPaseの過剰発現による)RuBP再生の促進が、管理された条件下で育てられた植物における光合成およびバイオマスを増加したことを示す。さらに、これらの実施例は、これら2つの過程(SBC6およびSC6植物)を同時に標的にすることは、光合成および生育を促進する上でさらに大きな影響を与えることを明らかにした。さらに、圃場研究において、電子伝達およびRuBP再生の同時促進を伴う植物は、iWUEおよびバイオマスの増加を示した。
温室条件下では、光合成パラメータの増加が、全ての分析されたトランスジェニック植物において観察され、これらはバイオマスの増加と一貫して相関していることが見出された。本明細書で提示した実施例は、電子伝達およびRuBP再生の同時促進による光合成およびバイオマス増加の最初の報告を提供する。ここで試験した両方のタバコ品種(N.tabacum 品種Petit HavanaおよびN.tabacum 品種Samsun)における分析した全てのトランスジェニックタバコ植物の葉において、温室条件下で、Aの増加が観察された。A/Ci応答曲線の分析により、光合成パラメータVcmax、Jmax、およびAmaxの平均値は、それぞれ17%、14%、および12%まで増加した。これらの結果は、電子伝達の最大速度および増加したRuBP再生だけでなく、ルビスコによるカルボキシル化率も増加した。ルビスコ活性は、直接的に標的化されなかったが、この結果は、JmaxとVcmaxとの間に線形相関を示す、100種の植物種を超えるWullschleger, et al., J. Exp. Bot. (1993) 44:907-920による研究と一致する。さらに、SBPaseの過剰表現が、Jmaxの有意な増加をもたらすだけでなく、Vcmaxおよびルビスコ活性化状態の増加をもたらすことも以前に示されている。
特に、温室調査では、電子伝達およびRuBP再生の両方(SBC6およびSC6)が増加した植物の葉から最も高い光合成率が観察され、これらの遺伝子の共発現が、光合成の改善に追加の効果をもたらすことを示した。Aの増加に加えて、電子伝達およびRuBP再生の同時促進を伴う植物は、Fq’/Fm’の有意な増加を示し、コントロール植物と比較してPSIIを通して線形電子フラックスの量子収量が高いことを示した。これらの結果は、PSIに対してより効率的な電子供与体を代わりに使用することによって、PSIの還元が促進されることを示す(Chida, et al., Plant Cell Physiol. (2007) 48:948-957;Finazzi, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. (2005) 102:7031-7036)。これは、アラビドプシスにおけるシトクロムc6の導入およびリスケ鉄硫黄タンパク質の過剰発現が、PSIIの量子収量の増加およびより酸化されたプラストキノンプールを引き起こすことを示す公表されたデータと一致する(Simkin, et al., Plant Physiol. (2017) 175:134-145;Chida, et al., Plant Cell Physiol. (2007) 48:948-957)。さらに、SBC6およびSC6植物では、Fq’/Fm’の増加は、PSII効率因子(Fq’/Fv’)の増加によって大きく左右されることが分かった。このことは、これらの植物における効率の増加が、CO2同化などのPSIIの下流の工程の促進によって起こり得ることを示唆している。
作物収量を改善するために電子伝達およびRuBP再生の両方を標的とすることの適用性のさらなる証拠を提供するために、植物を圃場で試験した。圃場結果は、FBP/SBPase単独の発現が、初期の栄養生長(開花の開始前)の間に収穫された場合、2016年の圃場生育植物における生育およびバイオマスの22%~40%の増加をもたらしたことを示した。興味深いことに、同じトランスジェニック操作を有する植物を、2017年の圃場試験における開花の開始後、発育の後期に収穫した場合、この利点は、もはや明らかではなく、単独のFBP/SBPase発現系統は、コントロール植物と区別できなかった。
シトクロムc6単独を発現するトランスジェニック植物もまた、発育の初期に収穫された場合、生育およびバイオマスの増強を示したが、FBP/SBPase植物と同様に、植物が開花後に収穫された場合、この改良は、もはや明らかではなかった。初期収穫と後期収穫との間のバイオマス獲得におけるこの表現型の違いは、圃場条件下で、初期発育中に収穫された植物および開花の開始後に収穫された植物において、Hタンパク質の過剰発現が、バイオマスを増加させることが示された並列実験では、観察されなかった(Lopez-Calcagno, et al., Plant Biotechnol. J. (2019) 17(1):141-151))。これらの結果は、FBP/SBPaseまたはシトクロムc6単独の発現が、特定の規定の条件下または植物発育の特定の段階で利点を提供し得る。これは、初期収穫が望ましいいくつかの作物(例えば、いくつかの型のレタス、ホウレンソウ、および柔らかい野菜)に利用可能であり得る(Ichikawa, et al., GM Crops (2010) 1:322-326)。上記の単独操作の結果とは対照的に、シトクロムc6およびFBP/SBPaseの両方を同時に発現する植物は、圃場条件下で開花の後に、バイオマスの一貫した増加を示した。
圃場で生育させたトランスジェニック株では、光合成の増加とバイオマスの増加との間の相関が、温室条件下で観察されたものよりも一貫性が低かった。個々の操作を伴うトランスジェニック系統、すなわち、FBP/SBPase(SB系統)およびシトクロムc6(C6系統)は、バイオマスの増加なしに、2017年の実験1において光合成能力を有意に増加させた。対照的に、2017年の実験2におけるC6系統は、バイオマスを増加させたが、光合成能力に有意な差はなかった。二重配列操作を伴うトランスジェニック系統、すなわち、FBP/SBPase+シトクロムc6(SBC6)も、2017年の実験2において、光合成能力に有意な差を伴わずに、バイオマスを増加させた。すべての実験にわたって、トランスジェニック植物の平均A値は、コントロールのそれよりも一貫して高かった。たとえ差がすべての実験にわたって一貫して統計的に異なっていなくても、植物の生涯にわたる同化のわずかな増加でさえ、有意なバイオマス蓄積に変換され得る累積効果を有することが知られている(Simkin, et al., J. Exp. Bot. (2015) 66:4075-4090)。
1000μmol m-2 s-1を超える光量では、FBP/SBPase+シトクロムc6(SBC6)の同時発現を有する植物が、コントロール植物と比較した場合、気孔伝導度(gs)が低く、Ci濃度が低いことが観察された(図12C)。通常、Ciを低くすると、光合成が減少すると思われるが、興味深いことに、これらの植物はコントロール植物と同等またはそれ以上のCO2同化率を維持でき、結果としてiWUEの改善となった。iWUEにおける同様の改善は、NPQ関連タンパク質、PsbSを過剰発現する植物において見られた(Glowacka, et al., Nat. Commun. (2018)9)。これらの植物では、光誘発気孔開口が減少し、気孔運動のシグナルとして作用すると提唱されているより酸化されたQAプールを有することが示された(Busch, et al., Photosynth. Res. (2014)119:131-140)。
これらの実施例の結果は、SBC6植物において増加した光合成能力が、Ciの減少を補うという案の立証を提供する。より高いiWUE、およびコントロールと比較してより高い生産性が、RuBP再生が増加したトランスジェニック系統についてCO2エンリッチメント(enrichment)を有する圃場調査において報告されているという事実(Rosenthal et al., BMC Plant Biol. (2011)11:123;Ichikawa, et al., GM Crops (2010)1:322-326)は、気候変動シナリオのもとで光合成および収率を持続させることができる新しい植物品種の発育のために、電子伝達およびRuBP再生を操作する可能性を強調する。
これらの実施例の結果は、調査した条件下で電子伝達およびRuBP再生の同時促進をもたらす操作の組み合わせは、単独操作よりもバイオマスの有意な増加をもたらし、高収率作物の発育のためのこのストラテジーの可能性を強調する明確な実証を提供する。
Claims (20)
- 遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞であって、
前記植物、植物の一部、または植物細胞が、同じ条件下で生育した未改変の植物、植物の一部、または植物細胞と比較して、カルビンベンソンサイクル(CB)タンパク質の活性を増加するRuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変および光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変を含む、遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞。 - 前記光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変が、1つ以上の光合成電子伝達タンパク質の過剰発現を含み、
前記1つ以上の光合成電子伝達タンパク質が、シトクロムc6タンパク質、リスケ鉄硫黄タンパク質(Rieske FeS protein)、または、シトクロムc6タンパク質およびリスケ鉄硫黄タンパク質を含む、請求項1に記載の遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞。 - 前記シトクロムc6タンパク質が、配列番号102に対して少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項2に記載の遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞。
- 前記リスケ鉄硫黄タンパク質が、配列番号101に対して少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項2に記載の遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞。
- 前記シトクロムc6タンパク質が、前記遺伝子改変植物の細胞内の少なくとも1つの葉緑体のチラコイドルーメンに局在している、請求項2または3に記載の遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞。
- 前記シトクロムc6タンパク質が、前記チラコイドルーメンに前記シトクロムc6タンパク質を局在させる輸送ペプチドを含み、
前記輸送ペプチドが、クロロフィルa/b結合タンパク質6輸送ペプチド、集光性複合体Iクロロフィルa/b結合タンパク質1輸送ペプチド、または、プラストシアニンシグナルペプチドを含む、請求項5に記載の遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞。 - 前記リスケ鉄硫黄タンパク質が、前記遺伝子改変植物の細胞内の少なくとも1つの葉緑体のチラコイド膜に局在している、請求項2または請求項4に記載の遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞。
- 前記リスケ鉄硫黄タンパク質が、前記チラコイド膜に前記リスケ鉄硫黄タンパク質を局在させる輸送ペプチドを含み、
前記輸送ペプチドが、シトクロムf輸送ペプチド、シトクロムb6輸送ペプチド、PetD輸送ペプチド、PetG輸送ペプチド、PetL輸送ペプチド、PetN輸送ペプチド、PetM輸送ペプチド、または、プラストキノン輸送ペプチドを含む、請求項7に記載の遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞。 - 前記シトクロムc6タンパク質または前記リスケ鉄硫黄タンパク質をコードする核酸配列に作動可能に連結された植物プロモーターをさらに含み、
前記植物プロモーターが、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーターを含む、請求項2~8のいずれか1項に記載の遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞。 - 前記RuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変が、CBタンパク質の過剰発現を含み、
前記CBタンパク質が、セドヘプツロース-1,7-ビスホスファターゼ(SBPase)、フルクトース-1,6-ビスホスフェートアルドラーゼ(FBPA)、葉緑体フルクトース-1,6-ビスホスファターゼ(FBPase)、二機能性フルクトース-1,6-ビスホスファターゼ/セドヘプツロース-1,7-ビスホスファターゼ(FBP/SBPase)、または、トランスケトラーゼ(TK)を含む、請求項1~9のいずれか1項に記載の遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞。 - 前記SBPaseが、配列番号96に対して少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項10に記載の遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞。
- 前記FBPAが、配列番号97に対して少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項10に記載の遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞。
- 前記FBPaseが、配列番号98に対して少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項10に記載の遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞。
- 前記FBP/SBPaseが、配列番号99に対して少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項10に記載の遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞。
- 前記トランスケトラーゼが、配列番号100に対して少なくとも70%の配列同一性、少なくとも75%の配列同一性、少なくとも80%の配列同一性、少なくとも85%の配列同一性、少なくとも90%の配列同一性、少なくとも95%の配列同一性、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項10に記載の遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞。
- 前記SBPase、前記FBPA、前記FBPase、前記FBP/SBPase、または、前記トランスケトラーゼが、前記遺伝子改変植物の細胞内の少なくとも1つの葉緑体の葉緑体ストロマに局在し、
前記SBPase、前記FBPA、前記FBPase、前記FBP/SBPase、または、前記トランスケトラーゼが、前記植物の前記葉緑体ストロマに、前記SBPase、前記FBPA、前記FBPase、前記FBP/SBPase、または、前記トランスケトラーゼを局在させる輸送ペプチドを含む、請求項10~15のいずれか1項に記載の遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞。 - 前記SBPase、前記FBPA、前記FBPAase、前記FBPase/SBPase、または、前記トランスケトラーゼをコードする核酸配列に作動可能に連結された植物プロモーターをさらに含み、
前記植物プロモーターが、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、組織もしくは細胞型特異的プロモーター、または、誘導性の、組織もしくは細胞型特異的プロモーターを含む、請求項10~16のいずれか1項に記載の遺伝子改変植物、植物の一部、または植物細胞。 - 前記植物が、未改変野生型(WT)植物と比較して増加したバイオマスを有する、請求項1~17のいずれか1項に記載の遺伝子改変植物。
- 1000μmol m-2 s-1を超える光量を有する条件下で成長させた場合に、前記植物が、未改変WT植物と比較して、改善された水利用効率を有する、請求項1~18のいずれか1項に記載の遺伝子改変植物。
- 請求項1~19のいずれか1項に記載の遺伝子改変植物の生産方法であって、以下を含む、方法:
(a)植物細胞、組織、または他の外植片に、CBタンパク質の活性を増加する前記RuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変、前記光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変、またはCBタンパク質の活性を増加する前記RuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変および前記光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変の両方を導入すること;
(b)前記植物細胞、組織、または他の外植片を遺伝子改変プラントレット(plantlet)に再生すること;および
(c)前記遺伝子改変プラントレットを、CBタンパク質の活性を増加する前記RuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変、前記光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変、またはCBタンパク質の活性を増加する前記RuBP再生を向上させる1つ以上の遺伝子改変および前記光合成電子伝達を向上させる1つ以上の遺伝子改変の両方を有する遺伝子改変植物に育てること。
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