JP2022514113A - 細胞に形質移入するための組成物及び方法 - Google Patents

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Abstract

本開示は、安全かつ無毒性の核酸形質移入剤として遺伝子治療用途で使用される分枝状ポリマー及びポリプレックスに関する。

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2018年10月12日出願の米国仮出願第62/744,994号及び2019年03月29日出願の米国仮出願第62/826,461号の優先権の利益を主張するものであり、当該出願の内容は、参照によりその全体が本明細書に援用される。
本開示の分野
本開示の様々な実施形態は、安全かつ無毒性の核酸形質移入剤として、例えば、遺伝子治療用途で使用される、分枝状ポリマーに関する。
導入遺伝子発現を操作するために細胞(例えば、皮膚線維芽細胞)に機能的な遺伝子材料を送達することは、ナノ医療において非常に重要である。多数のポリマー遺伝子送達システムが開発されているにもかかわらず、高度に安全かつ効率的な遺伝子形質移入(例えば、線維芽細胞遺伝子形質移入)はまだ達成されていない。
ほぼ30年にわたる開発の後、遺伝子治療は、健康状態を改善し遺伝子障害を補正するための急増するナノ医療設備の主要部分となっている。[1]ウイルス遺伝子送達ベクターを用いた複数の臨床試験が行われているが、免疫原性応答及び導入遺伝子挿入による変異誘発のトリガーとなるリスク、遺伝子材料の大規模生産及び低い「カーゴ容量」に関連する制約、ならびにベクター移動性が予測不能である問題は、依然として対処されていない。[2、3]この観点から、非ウイルス遺伝子送達ベクターは、最小限の免疫原性、非腫瘍形成性、費用効果の高い製造、高ペイロードの核酸及び局在化遺伝子発現の可能性があるため、より有望と考えられる。2010年以降、非ウイルス遺伝子ベクターを用いた遺伝子治療の臨床試験の件数は著しく増加しており、プラスミドDNA及び低分子干渉RNA(siRNA)は、遺伝子補正、治療用タンパク質発現、及び抗原ワクチン接種のために少なくとも40種のナノ粒子ベース遺伝子治療で製剤化され、27件の臨床試験で12種の主要なリポソームシステムが研究され、13件の臨床試験で7種のポリマーベースシステムが研究されている。[3]ポリマーベース遺伝子治療の臨床試験の中では、市販のカチオン性ポリマーポリエチレンイミン(PEI)がいくつかの有望性を示している。しかし、PEIは非分解性であり、その安全性に関する懸念が深刻な妨げとなっている。[4]よって、ポリマーベース遺伝子治療を臨床応用に近づけるために、ポリマー遺伝子ベクターの遺伝子形質移入効率及び安全性を改善するための多大な努力が払われている。
ポリマー遺伝子送達ベクターの中で、ポリ(β-アミノエステル)(PAE)は最も有望な候補の1つのタイプである。PAEは、最初にLanger及び共同研究者によって設計及び合成され、1ステップのマイケル付加プロセスを通じたアミンとジアクリレートとの共重合によって行われた。[5]骨格上の3級アミン及び末端の1級アミンはカチオン単位として機能して、静電相互作用によってDNAを凝縮してナノ粒子にし、また「プロトンスポンジ効果」を介してエンド/リソソームからのポリプレックス脱出を容易にする。骨格上のエステル結合は、水性条件下で加水分解的に分解して、ポリプレックスを解離し、DNAを放出し、さらに遺伝子形質移入後の細胞毒性を低減することができる。[6、7]徹底的な構造/特性の最適化後、[8-10]in vitro及びin vivoの両方で好ましい安全性プロファイル及び高い形質移入効率を伴ったDNA形質移入向けにいくつかのPAEが同定されている。[6、11、12]しかし、2015年までは、PAEを用いたほぼ全ての研究において直鎖状構造のポリマーに焦点が当てられていた。分枝状ポリマーは、その3次元(3D)構造及び複数の末端官能基が、さらなる利点をポリマー遺伝子ベクターにもたらすため、遺伝子形質移入の可能性がより大きいと考えられる。本発明者らは、容易なワンポット「A2+B3+C2」マイケル付加戦略を介し、高度に分岐したポリ(β-アミノエステル)(HPAE)を開発することに成功した。[13-16]広範囲の細胞タイプにわたり、HPAEは、対応する直鎖状カウンターパートよりもはるかに高い遺伝子形質移入能力を示し、遺伝子送達におけるより大きな可能性を実証した。HPAEの高い遺伝子形質移入能力は、さらに、劣性栄養障害型表皮水疱症(RDEB)皮膚疾患モデルを用いてin vivoで実証された。RDEBは、VII型コラーゲン(C7)(表皮-皮膚の接着を固定するように機能する係留線維(AF)の重要な構成要素である)をコードするCOL7A1遺伝子の変異によって引き起こされる、希少で破壊的な遺伝性機械的水疱症である。[17] C7の欠乏は、皮膚の脆弱性、広範な水疱、及びびらんにつながり、これらは過剰な瘢痕及び稗粒腫形成を伴って治癒する特徴がある[18]。RDEBノックアウトマウスモデル及び移植マウスモデルのいずれにおいても、HPAEは、高レベルのC7発現及び最大10週間のC7発現回復を媒介しており[13、15、19]、臨床的皮膚遺伝子送達の大きな可能性が強調されている。HPAEは、米国特許公開第2017/0216455号でさらに説明されている(あらゆる目的において参照によりその全体が本明細書に援用される)。
線維芽細胞は、皮膚組織の完全性及び皮膚の生物学的機能の維持、細胞微小環境の制御において中心的な役割を果たしており、肥厚性瘢痕、老化/光老化、糖尿病性創傷治癒、がん、及び肥厚性皮膚骨膜症などの複数の皮膚疾患に関連する。線維芽細胞内で遺伝子発現を操作する能力は、機能的ゲノミクス、経路解析、及び生物医学的応用にとって基本的なものである。例えば、初代ヒト皮膚線維芽細胞(HPDF)は、表現型的にも核型的にも正常なヒト皮膚細胞のアクセス可能な供給源であり、不死化細胞株に比べて、生物学的にin vivo適用により適切である。[20]過去には、HPDFは、RDEBでのC7修復のために皮膚に直接注入された。それでも、HPDFの直接皮内注射により、RDEB患者においてAFの異常な形態[21]及び一過性のタンパク質置換[22]が示されている。これに対し、形質移入による遺伝子操作の後は、線維芽細胞は多様に適応し、より臨床遺伝子治療に適したものになることが想定され得る。HPDFのC7強化により、再構成されたAFの強度及び安定性の改善、投与スケジュールの最適化、ならびにRDEBの投与頻度の低減に顕著な効果があると考えられる。しかし、線維芽細胞の非ウイルス遺伝子形質移入は常に困難なものであった。最も一般的な方法としては、高費用のエレクトロポレーション、マグネトフェクション、及び比較的効率が低く毒性の化学製剤が挙げられる。[20、23、24]例えば、高感度緑色蛍光タンパク質(EGFP)送達効率は、異なるエレクトロポレーションシステムにより、ヒト皮膚線維芽細胞[25]では27%、ヒト初代線維芽細胞[26]では44%が検出されるにとどまった。有力な陽イオン性脂質試薬TransFectin、リポフェクタミンLTX、及びエレクトロポレーションにおいて、マウス胎児線維芽細胞における最大形質移入効率は、それぞれ15.7%、11.8%、及び48.1%であった[24]
そのため、高い効率及び安全性で線維芽細胞に形質移入するための信頼できる非ウイルス遺伝子送達システムの開発は必須であり、非常に重要である。
いくつかの実施形態において、本開示は、遺伝子形質移入療法に有用なポリプレックスを形成するのに適した分枝状ポリマーであって、以下のプロセス:
(a)式(A)の化合物
Figure 2022514113000002
を、式R-NHまたはR-N(H)-Z’-N(H)-Rを有する第1のアミンと反応させることと、
(b)ステップ(a)の生成物を、式R-NHまたはR-N(H)-Z’’-N(H)-Rを有する第2のアミンと反応させることと、
(c)ステップ(b)の生成物を式(B)の化合物と反応させることとによって作製され、
Figure 2022514113000003
式中、
各Jが、独立的に、-O-または-NH-であり、
Z、Z’、及びZ’’が結合部分であり、
Aが、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、2~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、または3~30個の原子を含む複素環であり、
Aが、任意選択で、1つ以上のハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、またはC-C10アリールで置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
Gが、-C-、-S-、-S(O)-、-P(OR)-、または-P(OH)-であり、
各Qが、C-C10直鎖状もしくは分枝状アルキル基であり、
各Eが、独立的に、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択され;
及びRが、各々独立的に、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、またはヘテロアリールであり、このとき、当該ヘテロシクリル及びヘテロアリールが、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、当該C-C40アルキル、C-C40アルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールが、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、または-N(C-Cアルキル)で置換され、Rは、非置換であるか、またはハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10)アリールのうちの1つ以上で置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
各nが少なくとも1である、分枝状ポリマーを提供する。
いくつかの実施形態において、本開示は、ポリマーを作製する方法であって、
(a)式(A)の化合物
Figure 2022514113000004
を、式R-NHまたはR-N(H)-Z’-N(H)-Rを有する第1のアミンと反応させることと、
(b)(a)の生成物を、式R-NHまたはR-N(H)-Z’’-N(H)-Rを有する第2のアミンと反応させることと、
(c)(b)の生成物を式(B)の化合物と反応させることとを含み、
Figure 2022514113000005
式中、
各Jが、独立的に、-O-または-NH-であり、
Z、Z’、及びZ’’が結合部分であり、
Aが、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、2~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、または3~30個の原子を含む複素環であり、
Aが、任意選択で、1つ以上のハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、またはC-C10アリールで置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
Gが、-C-、-S-、-S(O)-、-P(OR)-、または-P(OH)-であり、
各Qが、HまたはC-C10直鎖状もしくは分枝状アルキル基であり、
各Eが、独立的に、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択され;
及びR2が、各々独立的に、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、またはヘテロアリールであり、このとき、当該ヘテロシクリル及びヘテロアリールが、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、当該C-C40アルキル、C-C40アルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールが、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、または-N(C-Cアルキル)で置換され、Rは、非置換であるか、またはハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10)アリールのうちの1つ以上で置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
各nが少なくとも1である、方法を提供する。
いくつかの実施形態において、本開示は、核酸成分と、本明細書で説明される方法によって調製されたポリマー、または式(I)
Figure 2022514113000006
を含むポリマーとを含む、ポリプレックスであって、式中、
各Aが、独立的に、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、または3~30個の原子を含む複素環であり、
Aが、任意選択で、1つ以上のハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、またはC-C10アリールで置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
各Bが、独立的に、第1の結合部分であり、
各Xが、独立的に、
Figure 2022514113000007
であり、
各Yが、独立的に、
Figure 2022514113000008
であり、
各Lが、独立的に、第2の結合部分であり、
各R、R、及びRが、各出現において独立的に、H、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、もしくはヘテロアリールであり、当該ヘテロシクリル及びヘテロアリールが、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、当該C-Cアルキル、C-Cアルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-Cアルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールが、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、もしくは-N(C-Cアルキル)で置換され、または
及びRが、それらが結合する原子と一緒になって、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~3個のヘテロ原子を含むヘテロシクリルまたはヘテロアリールを形成してもよく、
aが1~1000であり、
bが1~4であり、
cが1~3であり、
zが1~100であり、
ただし、R及びRの少なくとも一方がHではないことを前提とする、ポリプレックスを提供する。
いくつかの実施形態において、本開示は、本開示のある特定の実施形態に従うポリプレックスの有効量と、医薬的に許容される担体との組合せを含む、医薬組成物を提供する。
いくつかの実施形態において、本開示は、細胞形質移入の方法であって、標的細胞に1つ以上のポリプレックスを形質移入するのに適した条件下で、1つ以上の標的細胞を、本開示のある特定の実施形態に従う少なくとも1つのポリプレックスを含む医薬組成物に接触させることを含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態において、本開示は、疾患の治療を必要とする患者における当該疾患を治療する方法であって、患者の細胞のうちの1つ以上にポリプレックス核酸成分が形質移入されるように、本開示のある特定の実施形態に従う少なくとも1つのポリプレックスを含む医薬組成物の治療有効量を投与することを含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態において、本開示は、疾患の治療を必要とする患者における当該疾患を治療する方法であって、本開示のある特定の実施形態に従う少なくとも1つのポリプレックスを含む医薬組成物の治療有効量を投与することを含み、当該組成物の投与が、対象における標的遺伝子の不完全な翻訳を補正する、方法を提供する。
形質移入効率及び細胞生存率の評価を示している。aは、一連のw/w比におけるLBPAE/DNA、PEI/DNA、及びSuperFect/DNAポリプレックスによる形質移入から48時間後のHPDFのGluc活性及び細胞生存率を示している。bは、3T3のGluc活性及び細胞生存率を示している。Gluc活性における*PEI及び#SuperFect群からの有意差(p<0.05、スチューデントの両側t検定)。 HPDF及び3T3におけるLBPAE/DNAポリプレックス及びSuperFect/DNAポリプレックスのLC50評価を示している。aは、未処置細胞または555μg/mL-1の濃度のLBPAE/DNAポリプレックスまたは35μg/mL-1の濃度のSuperFect/DNAポリプレックスにより形質移入した細胞の代表的な生/死画像を示している。スケールバーは50μmである。bは、アラマーブルーアッセイによって測定されたLBPAE/DNAポリプレックス濃度依存的な細胞生存率を示している。cは、アラマーブルーアッセイによって測定されたSuperFect/DNAポリプレックス濃度依存的な細胞生存率を示している。 異なる遺伝子送達系によって媒介されるGFP発現及びMFIの比較を示している。aは、LBPAE/DNA、PEI/DNA、及びSuperFect/DNAポリプレックスで処理した後のHPDF細胞のGFP画像を示している。未処置(UT)細胞を陰性対照として使用した。スケールバーは200μm。bは、異なるポリプレックスを形質移入した後のHPDF集団のヒストグラム分布を示している。cは、形質移入後の細胞のGFP陽性HPDFのパーセンテージ及びMFIを示している。dは、3T3のGFP画像を示している。スケールバーは200μm。eは、異なるポリプレックスを形質移入した後の3T3集団のヒストグラム分布を示している。fは、形質移入後のGFP陽性3T3のパーセンテージ及び細胞のMFIを示している。GFP陽性細胞の*パーセンテージ及び#MFIにおける市販試薬群との有意差(p<0.05、スチューデントの両側t検定)。 LBPAE/ポリプレックスの物理化学的特性を示している。aは、アガロースゲル電気泳動によるDNA凝縮能力定量を示している。bは、PicoGreenアッセイによるDNA結合親和性測定値を示している。cは、ポリプレックスサイズ及びゼータ電位測定値を示している。dは、TEMによるポリプレックス形態観測を示している。スケールバーは200nM。 多様なポリプレックスの細胞取込みを示している。aは、異なるポリプレックスによる形質移入から4時間後の細胞の蛍光画像を示している。核はDAPI(青)で染色し、DNAはCy3(赤)で標識した。スケールバーは20μm。bは、フローサイトメトリーで定量化されたHPDFにおけるポリプレックス取込み効率を示している。cは、フローサイトメトリーで定量化された3T3におけるポリプレックス取込み効率を示している。dは、Cy3陽性HPDFのパーセンテージ及び細胞の正規化MFIを示している。eは、Cy3陽性3T3のパーセンテージ及び細胞の正規化MFIを示している。*MFI定量におけるSuperFectとの有意差(p<0.05、スチューデントの両側t検定)。 LBPAEのプロトン緩衝能、分解、及びDNA放出評価を示している。aは、酸-塩基滴定によって定量されるプロトン緩衝能を示している。bは、GPCを用いて定量された分解プロファイルを示している。cは、PicoGreenアッセイで評価したポリプレックスからのDNA放出の評価を示している。 HPDFにおけるC7発現の免疫蛍光染色を示している。aは、LBPAE/MCC7ポリプレックスによる形質移入から4日後のHPDFの蛍光画像を示している。核をDAPI(青)で染色し、C7をモノクローナル抗コラーゲンVII一次抗体と共にインキュベートし、Alexa-568ヤギ抗マウス二次抗体(赤)で染色した。スケールバーは20μm。bは、HPDFのC7発現のフローサイトメトリー定量化を示している。cは、LBPAE/MCC7及びSuperFect/DNAポリプレックスによる形質移入後におけるC7発現の上方制御の程度及びHPDFのMFIを示している。C7上方制御の*パーセンテージ及び#MFIにおけるSuperFectとの有意差(p<0.05、スチューデントの両側t検定)。 直鎖状オリゴマーの組合せ戦略を通じたLBPAEの合成の概略図である。ステップ1では、A2型アミンは、C2型ジアクリレートと反応して、直鎖状A2-C2塩基オリゴマーを形成し、これはさらに、第2のアミンによってエンドキャップされて、直鎖状A2-C2オリゴマーを生成する。ステップ2では、直鎖状A2-C2オリゴマーを分岐によってB3型トリアクリレートと合わせてLBPAEを得る。四角の枠は、本作業でLBPAEの合成に使用したモノマー及びエンドキャップ剤を示している。 直鎖状オリゴマー及びLBPAEのGPC結果を示している。 MHアルファ曲線及びLBPAEの値を示している。 H NMRによるLBPAEの化学組成解析を示している。 MCC7及びpcDNA3.1COL7A1のアガロースゲル結果を示している。 aは、「A2+B3+C2」マイケル付加戦略を介したHPAE合成を示している。bは、本開示のHPAEのGPC曲線及びMw計算値を示している。cは、本開示のHPAEのMHアルファ曲線及び計算値を示している。(図13及び16~19は、「HC32-122」を使用して本開示のHPAEポリマーを定義している。HC32-122は、実施例で使用するHC32-DATOUに相当する。) 10:1、30:1、及び50:1(重量%/重量%)のHPAE/DNA比を用いて、11kDa、21kDa、34kDa、及び41kDaのMWを有するHPAEを含むポリプレックスを用いたRDEBケラチノサイトの形質移入を示している。 10:1、30:1、及び50:1(重量%/重量%)のポリマー/DNA比を用いて、11kDa、21kDa、34kDa、及び41kDaのMWを有するHPAEを含むポリプレックスを用いたRDEBケラチノサイトの遺伝子形質移入後の細胞DNAを示している。 HPAE/DNAポリプレックスを用いたRDEBK細胞におけるレポーター遺伝子形質移入試験を示している。aは、HPAE/DNA及びPEI/DNAポリプレックスによる形質移入から48時間後のRDEBK細胞の相対的Gluc活性を示している。データは、HPAE/DNAポリプレックス(30:1wt%/wt%)を形質移入したRDEBK細胞のGluc活性を基準に正規化したパーセンテージとして提示する。*HPAE群(w/w=30:1)との有意差(p<0.05、スチューデントt検定)。bは、HPAE/DNA及びPEI/DNAポリプレックスによる形質移入後のRDEBK細胞の生存率を示しており、cは、未処置(UT)細胞、HPAE/DNA(w/w=30:1)またはPEI/DNA(w/w=1:1)ポリプレックスで処置した細胞のGFP画像を示している。スケールバーは200μm。dは、UT及び形質移入した細胞集団の代表的なヒストグラム分布を示しており、eは、フローサイトメトリーで定量したGFP陽性RDEBK細胞及びMFIのパーセンテージを示している。GFP陽性細胞の*パーセンテージ及び細胞MFIにおけるPEIとの有意差(p<0.05、スチューデントのt検定)。 HPAE/MCC7ポリプレックスのMCC7生合成及び細胞取込みを示している。aは、phiC31及び1-scel消化システムを用いたMCC7生合成を示している。bは、EcoR1消化後の3つのCOL7A1コードプラスミドDNAのアガロースゲル電気泳動を示している。pcDNA3.1COL7A1の通常のプラスミド(RP)、MN511A-1-COL7A1の親プラスミド(PP)、及びMCC7の骨格長は、それぞれ5kb、8kb、及び3kbである。cは、異なるポリプレックスによる形質移入後のRDEBK細胞の蛍光画像を示している。核はDAPI(青)で染色し、DNAはCy3(赤)で標識した。スケールバーは20μm。dは、フローサイトメトリーで定量化したポリプレックス細胞取込み効率を示しており、eは、Cy3陽性細胞及びMFIのパーセンテージを示している。*細胞MFIにおけるPEI/MCC7群との有意差(p<0.05、スチューデントのt検定)。 HPAE/MCC7ポリプレックスによる形質移入後のCOL7A1m RNA及び組換え型C7発現を示している。aは、RT-qPCRによって得られた内在性対照GAPDHの増幅プロットを示している。bは、RT-qPCRによって得られた形質移入後のRDEBK細胞のCOL7A1 mRNAの増幅プロットを示している。cは、COL7A1 mRNAの定量化を示している。*PEI群との有意差(p<0.05、スチューデントのt検定)。dは、C7染色(赤色蛍光)の細胞免疫蛍光画像を示している(スケールバーは20μm)。eは、C7発現のウェスタンブロッティング結果を示している。42kDa β-アクチンを負荷対照として使用した。 HPAE/DNAのwt%/wt%比が30:1であるHPAE/MCC7ポリプレックスの物理化学的特性を示している。aは、HPAE/MCC7ポリプレックス形成を示している。bは、ポリプレックス調製から2時間後のDNA凝縮及びヘパリン競合アッセイのアガロースゲル結果を示している。cは、ポリプレックス調製から2時間後のPicoGreenアッセイによるヘパリンの存在下または非存在下でのDNA結合能力試験を示している。dは、NTAによって測定されたHPAE/MCC7ポリプレックスのサイズを示している。eは、HPAE/MCC7ポリプレックスのゼータ電位分布を示している。fは、HPAE/MCC7ポリプレックスのTEM画像を示している。スケールバーは500nM。 本開示のHPAEポリプレックスを含む製剤の遺伝子形質移入性能を示している。aは、RDEBK細胞におけるポリプレックス凍結乾燥及びさらなる形質移入試験を示している。bは、異なる保存方法及び凍結乾燥条件からのポリプレックスを用いた形質移入後の細胞のGFP画像を示している。FZ:凍結乾燥;Suc:スクロース。スケールバーは200μm。cは、UT及び形質移入細胞集団の代表的なヒストグラム分布を示している。dは、フローサイトメトリーによって定量化された形質移入後の細胞のGFP発現効率を示している。*新鮮に調製したポリプレックス群との有意差(p<0.05、スチューデントのt検定)。(e)フローサイトメトリーによって定量化した標準化MFI。*新鮮に調製したポリプレックス群との有意差(p<0.05、Studentのt検定)。 長期保存後のRDEBK細胞への本開示のHPAEポリプレックスの形質移入を示している。
上記で使用されているように、また本開示全体において、以下の用語は、別段の指示がない限り、以下の意味を有するように理解されるものとする。用語がない場合は、当業者に知られている従来の用語が優先される。
本明細書で使用する場合、「含む(including)」、「含む(containing)」、及び「含む(comprising)」という用語は、オープンな非限定的な意味で使用される。
冠詞「a」及び「an」は、本開示では、その冠詞の文法的目的語の1つまたは2つ以上(すなわち、少なくとも1つ)を意味するために使用される。例として、「要素(an element)」は、1つの要素または2つ以上の要素を意味する。
「及び/または」という用語は、別段の指示がない限り、本開示では「及び」あるいは「または」のいずれかを意味するために使用される。
より簡潔に説明するために、本明細書で示される定量的表現のいくつかは、「約」という用語で修飾されない。「約」という用語が明示的に使用されているかどうかにかかわらず、本明細書で示される全ての量は実際の所与の値を意味するように意図されており、また、このような所与の値に対する実験及び/または測定条件による同等の値及び近似値を含めて、当技術分野の通常の技量に基づいて合理的に推論されるこのような所与の値への近似も意味するように意図されていることを理解されたい。収率がパーセンテージとして示される場合は常に、このような収率は、特定の化学量論的条件下で得られ得る同じ実体の最大量に関して収率が示される実体の質量を意味する。別段の指示がない限り、パーセンテージで示される濃度は質量比を意味する。
「患者」とは、哺乳類、例えば、ヒト、マウス、ラット、モルモット、イヌ、ネコ、ウマ、ウシ、ブタ、または非ヒト霊長類、例えば、サル、チンパンジー、ヒヒ、もしくはアカゲザルである。「患者」には、ヒト及び動物の両方が含まれる。
化合物に関連して使用される場合、「有効量」または「治療有効量」という用語は、所望の生物学的結果を提供するのに十分な量の化合物を意味する。その結果とは、疾患の徴候、症状、もしくは原因の低減及び/または軽減、あるいは生物学的システムの他の任意の望ましい変化であり得る。例えば、治療使用のための「有効量」とは、臨床的に有意な疾患の減少をもたらすのに必要とされる、本明細書に開示されるような化合物を含む組成物の量である。個々の場合における適切な「有効量」は、通常の実験を用いて当業者が決定することができる。したがって、「有効量」という表現は、概して、活性物質が治療効果を有する量を意味する。
本明細書で使用する場合、「治療する」または「治療」という用語は、「予防する」という用語と同義であり、疾患の発症の延期、疾患の発症の予防、及び/または発症するまたは発症が予想されるこのような症状の重症度の低減を示すように意図されている。したがって、これらの用語は、既存の疾患症状を改善すること、追加の症状を予防すること、症状の根本的な原因を改善もしくは予防すること、障害もしくは疾患を阻害すること、例えば、障害もしくは疾患の発症を阻止すること、障害もしくは疾患を緩和すること、障害もしくは疾患の退行を引き起こすこと、疾患もしくは疾患によって引き起こされた状態を緩和すること、または疾患もしくは疾患の症状を停止もしくは軽減することを含む。ある特定の実施形態において、「治療する」または「治療」とは、健康な皮膚表現型を促進することを意味する。
「障害」という用語は、別段の指示がない限り、本開示では疾患、状態、または病気という用語を意味するために使用され、これらの用語と互換的に使用される。
「医薬的に許容される」または「薬理学的に許容される」という用語を使用することにより、生物学的に、または別の形で、望ましくない物質であることを意味するように意図されており、このような物質は、実質的に望ましくない生物学的作用を引き起こすことなく、またはそれが含まれる組成物の任意の成分と有害な方式で相互作用することなく、個体に投与することができる。
本開示で使用する場合、「担体」という用語は、担体、賦形剤、及び希釈剤を包含し、対象の臓器または身体の一部から別の臓器または身体の一部への医薬剤の運搬または輸送に関与する材料、組成物、またはビヒクル、例えば、液体もしくは固体充填剤、希釈剤、賦形剤、溶媒、または封入材料を意味する。賦形剤は、所望の剤形の適合性及び放出プロファイルに基づいて選択すべきである。例示的な担体材料としては、例えば、結合剤、懸濁化剤、崩壊剤、充填剤、界面活性剤、可溶化剤、安定剤、滑沢剤、湿潤剤、希釈剤、噴霧乾燥分散液などが挙げられる。
「医薬的に適合する担体材料」という用語は、例えば、アラビアゴム、ゼラチン、コロイド状二酸化ケイ素、グリセロリン酸カルシウム、乳酸カルシウム、マルトデキストリン、グリセリン、ケイ酸マグネシウム、カゼインナトリウム、ダイズレシチン、塩化ナトリウム、リン酸三カルシウム、リン酸二カリウム、ステアロイル乳酸ナトリウム、カラギーナン、モノグリセリド、ジグリセリド、アルファ化デンプンなどを含み得る。例えば、Hoover,John E.,Remington’s Pharmaceutical Sciences,Mack Publishing Co.,Easton,Pa.1975を参照
本明細書で使用する場合、「対象」という用語は哺乳類及び非哺乳類を包含する。哺乳類の例としては、限定されるものではないが、哺乳類クラスの任意のメンバー:ヒト、非ヒト霊長類、例えば、チンパンジー、ならびに他の類人猿及びサル種;家畜、例えば、ウシ、ウマ、ヒツジ、ヤギ、ブタ;飼育動物、例えば、ウサギ、イヌ、ネコ;げっ歯類を含む実験動物、例えば、ラット、マウス及びモルモットなどが挙げられる。非哺乳類の例としては、限定されるものではないが、鳥類、魚類などが挙げられる。本開示の1つの実施形態において、哺乳類はヒトである。
本開示において使用する場合、「投与される」、「投与」、または「投与する」という用語は、開示される化合物もしくは開示される化合物の医薬的に許容される塩または組成物を対象に直接投与すること、あるいは、治療を必要とする対象(動物を含む)の体内で、このような個体をこのような化合物に接触させるまたは別の方法で曝露することにより、活性化合物の同等量を形成することができる、開示される化合物もしくは開示される化合物の医薬的に許容される塩または組成物のプロドラッグ誘導体またはアナログを対象に投与することを意味する。
本明細書で使用する場合、「アルキル」とは、1~40個の炭素原子を有する直鎖状または分枝状飽和鎖を意味する。代表的な飽和アルキル基としては、限定されるものではないが、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、2-メチル-1-プロピル、2-メチル-2-プロピル、2-メチル-1-ブチル、3-メチル-1-ブチル、2-メチル-3-ブチル、2,2-ジメチル-1-プロピル、2-メチル-1-ペンチル、3-メチル-1-ペンチル、4-メチル-1-ペンチル、2-メチル-2-ペンチル、3-メチル-2-ペンチル、4-メチル-2-ペンチル、2,2-ジメチル-1-ブチル、3,3-ジメチル-1-ブチル、2-エチル-1-ブチル、ブチル、イソブチル、t-ブチル、n-ペンチル、イソペンチル、ネオペンチル、n-ヘキシルなど、ならびにより長いアルキル基(例えば、ヘプチル、及びオクチルなど)が挙げられる。アルキル基は、非置換の場合も置換されている場合もある。3個以上の炭素原子を含むアルキル基は、直鎖状の場合も分枝状の場合もある。本明細書で使用する場合、「低級アルキル」とは、1~10個の炭素原子を有するアルキルを意味する。
本明細書で使用する場合、「アルケニル」には、2~40個の炭素原子を含む非分枝状または分枝状炭化水素鎖が含まれる。「アルケニル」基は、少なくとも1つの二重結合を含む。アルケニル基の二重結合は、別の不飽和基に結合しない場合も結合する場合もある。アルケニル基の例としては、限定されるものではないが、エチレニル、ビニル、アリル、ブテニル、ペンテニル、ヘキセニル、ブタジエニル、ペンタジエニル、ヘキサジエニル、2-エチルヘキセニル、2-プロピル-2-ブテニル、4-(2-メチル-3-ブテン)-ペンテニルなどが挙げられる。アルケニル基は、非置換の場合も置換されている場合もある。また、本明細書で定義する場合、アルケニルは、分枝状の場合も直鎖状の場合もある。
本明細書で使用する場合、「アルキニル」には、2~40個の炭素原子を含む非分枝状または分枝状不飽和炭化水素鎖が含まれる。「アルキニル」基は、少なくとも1つの三重結合を含む。アルキニル基の三重結合は、別の不飽和基に結合しない場合も結合する場合もある。アルキニル基の例としては、限定されるものではないが、エチニル、プロピニル、ブチニル、ペンチニル、ヘキシニル、メチルプロピニル、4-メチル-1-ブチニル、4-プロピル-2-ペンチニル、4-ブチル-2-ヘキシニルなどが挙げられる。アルキニル基は、非置換の場合も置換されている場合もある。
また、本明細書中の本文、スキーム、実施例、及び表にある満たされていない原子価を有する任意の炭素及びヘテロ原子は、原子価を満たすのに十分な数の水素原子(複数可)を有すると仮定されることにも留意されたい。
本明細書で使用する場合、水素への言及は、所望される場合重水素置換も意味し得る。本明細書で使用する場合、「重水素」という用語は、奇数の陽子及び中性子を有する水素の安定同位体を意味する。
「ハロ」または「ハロゲン」という用語は、フッ素、塩素、臭素、またはヨウ素を意味する。
本明細書で使用する場合、「ハロアルキル」という用語は、1つ以上のハロゲンで置換された本明細書で定義されるアルキル基を意味する。ハロアルキル基の例としては、限定されるものではないが、トリフルオロメチル、ジフルオロメチル、ペンタフルオロエチル、トリクロロメチル等が挙げられる。
別段の指定がない限り、「アリール」という用語は、フェニル、ビフェニル、またはナフチルなどの単環式または2環式基を含めた1~3つの芳香環を有する環式芳香族炭化水素基を意味する。2つの芳香環(2環式など)を含む場合、アリール基の芳香環は、単一の点で連結され得る(例えば、ビフェニル)、または縮合され得る(例えば、ナフチル)。アリール基は、任意選択で、1つ以上の置換基(例えば、1~5つの置換基)により、任意の結合点で置換されてもよい。置換基は、それ自体が任意選択で置換されてもよい。さらに、2つの縮合環を含む場合、本明細書で定義されるアリール基は、完全飽和環と縮合した不飽和または部分飽和環を有し得る。このようなアリール基の例示的な環系としては、限定されるものではないが、フェニル、ビフェニル、ナフチル、アントラセニル、フェナレニル、フェナントレニル、インダニル、インデニル、テトラヒドロナフタレニル、テトラヒドロベンゾアヌレニルなどが挙げられる。
別段の指定がない限り、「ヘテロアリール」とは、N、O、またはSから選択される1個以上の環ヘテロ原子を含み、残りの環原子がCである5~18個の環原子の1価の単環式芳香族ラジカルまたは多環式芳香族ラジカルを意味する。本明細書で定義されるヘテロアリールは、ヘテロ原子がN、O、またはSから選択される2環式ヘテロ芳香族基も意味する。芳香族ラジカルは、本明細書で説明される1つ以上の置換基で任意選択で独立的に置換される。置換基は、それ自体が任意選択で置換されてもよい。例としては、限定されるものではないが、ベンゾチオフェン、フリル、チエニル、ピロリル、ピリジル、ピラジニル、ピラゾリル、ピリダジニル、ピリミジニル、イミダゾリル、イソキサゾリル、オキサゾリル、オキサジアゾリル、ピラジニル、インドリル、チオフェン-2-イル、キノリル、ベンゾピラニル、イソチアゾリル、チアゾリル、チアジアゾリル、チエノ[3,2-b]チオフェン、トリアゾリル、トリアジニル、イミダゾ[1,2-b]ピラゾリル、フロ[2,3-c]ピリジニル、イミダゾ[1,2-a]ピリジニル、インダゾリル、ピロロ[2,3-c]ピリジニル、ピロロ[3,2-c]ピリジニル、ピラゾロ[3,4-c]ピリジニル、ベンゾイミダゾリル、チエノ[3,2-c]ピリジニル、チエノ[2,3-c]ピリジニル、チエノ[2,3-b]ピリジニル、ベンゾチアゾリル、インドリル、インドリニル、インドリノニル、ジヒドロベンゾチオフェニル、ジヒドロベンゾフラニル、ベンゾフラン、クロマニル、チオクロマニル、テトラヒドロキノリニル、ジヒドロベンゾチアジン、ジヒドロベンゾオキサニル、キノリニル、イソキノリニル、1,6-ナフチリジニル、ベンゾ[de]イソキノリニル、ピリド[4,3-b][1,6]ナフチリジニル、チエノ[2,3-b]ピラジニル、キナゾリニル、テトラゾロ[1,5-a]ピリジニル、[1,2,4]トリアゾロ[4,3-a]ピリジニル、イソインドリル、ピロロ[2,3-b]ピリジニル、ピロロ[3,4-b]ピリジニル、ピロロ[3,2-b]ピリジニル、イミダゾ[5,4-b]ピリジニル、ピロロ[1,2-a]ピリミジニル、テトラヒドロピロロ[1,2-a]ピリミジニル、3,4-ジヒドロ-2H-1λ-ピロロ[2,1-b]ピリミジン、ジベンゾ[b,d]チオフェン、ピリジン-2-オン、フロ[3,2-c]ピリジニル、フロ[2,3-c]ピリジニル、1H-ピリド[3,4-b][1,4]チアジニル、ベンゾオキサゾリル、ベンゾイソキサゾリル、フロ[2,3-b]ピリジニル、ベンゾチオフェニル、1,5-ナフチリジニル、フロ[3,2-b]ピリジン、[1,2,4]トリアゾロ[1,5-a]ピリジニル、ベンゾ[1,2,3]トリアゾリル、イミダゾ[1,2-a]ピリミジニル、[1,2,4]トリアゾロ[4,3-b]ピリダジニル、ベンゾ[c][1,2,5]チアジアゾリル、ベンゾ[c][1,2,5]オキサジアゾール、1,3-ジヒドロ-2H-ベンゾ[d]イミダゾール-2-オン、3,4-ジヒドロ-2H-ピラゾロ[1,5-b][1,2]オキサジニル、4,5,6,7-テトラヒドロピラゾロ[1,5-a]ピリジニル、チアゾロ[5,4-d]チアゾリル、イミダゾ[2,1-b][1,3,4]チアジアゾリル、チエノ[2,3-b]ピロリル、3H-インドリル、及びその誘導体が挙げられる。さらに、2つの縮合環を含む場合、本明細書で定義されるヘテロアリール基は、完全飽和環と縮合した不飽和または部分飽和環を有し得る。
本明細書で使用する場合、「シクロアルキル」という用語は、環当たり3~18個の炭素原子を有する、飽和または部分飽和であり単環式の縮合またはスピロ多環式炭素環を意味する。シクロアルキル環または炭素環は、任意選択で、1つ以上の置換基(例えば、1~5つの置換基)により、任意の結合点で置換されてもよい。置換基は、それ自体が任意選択で置換されてもよい。シクロアルキル基の例としては、限定されるものではないが、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプタニル、シクロオクタニル、ノルボラニル、ノルボレニル、ビシクロ[2.2.2]オクタニル、ビシクロ[2.2.2]オクテニル、デカヒドロナフタレニル、オクタヒドロ-1H-インデニル、シクロペンテニル、シクロヘキセニル、シクロヘキサ-1,4-ジエニル、シクロヘキサ-1,3-ジエニル、1,2,3,4-テトラヒドロナフタレニル、オクタヒドロペンタレニル、3a,4,5,6,7,7a-ヘキサヒドロ-1H-インデニル、1,2,3,3a-テトラヒドロペンタレニル、ビシクロ[3.1.0]ヘキサニル、ビシクロ[2.1.0]ペンタニル、スピロ[3.3]ヘプタニル、ビシクロ[2.2.1]ヘプタニル、ビシクロ[2.2.1]ヘプタ-2-エニル、ビシクロ[2.2.2]オクタニル、6-メチルビシクロ[3.1.1]ヘプタニル、2,6,6-トリメチルビシクロ[3.1.1]ヘプタニル、及びその誘導体が挙げられる。
本明細書で使用する場合、「シクロアルケニル」という用語は、環当たり3~18個の炭素原子を有し、少なくとも1つの二重結合を有する、部分飽和、単環式の縮合またはスピロ多環式炭素環を意味する。シクロアルケニル環は、任意選択で、1つ以上の置換基(例えば、1~5つの置換基)により、任意の結合点で置換されてもよい。置換基は、それ自体が任意選択で置換されてもよい。
本明細書で使用する場合、「ヘテロシクロアルキル」または「ヘテロシクリル」いう用語は、炭素原子、及び酸素、窒素、または硫黄から得られるヘテロ原子を含む4~18個の原子の飽和もしくは部分不飽和及び非芳香族の単環式、または縮合もしくはスピロ多環式環構造を意味し、環炭素またはヘテロ原子の間で共有される非局在化π電子(芳香族性)は存在しない。ヘテロシクロアルキルまたはヘテロシクリル環構造は、1つ以上の置換基によって置換されてもよい。置換基は、それ自体が任意選択で置換されてもよい。ヘテロシクロアルキルまたはヘテロシクリル環の例としては、限定されるものではないが、オキセタニル、アゼチジニル、テトラヒドロフラニル、ピロリジニル、オキサゾリニル、オキサゾリジニル、チアゾリニル、チアゾリジニル、ピラニル、チオピラニル、テトラヒドロピラニル、ジオキサリニル、ピペリジニル、モルホリニル、チオモルホリニル、チオモルホリニルS-オキシド、チオモルホリニルS-ジオキシド、ピペラジニル、アゼピニル、オキセピニル、ジアゼピニル、トロパニル、ホモトロパニル、ジヒドロチオフェン-2(3H)-オニル、テトラヒドロチオフェン1,1-ジオキシド、2,5-ジヒドロ-1H-ピロリル、イミダゾリジン-2-オン、ピロリジン-2-オン、ジヒドロフラン-2(3H)-オン、1,3-ジオキソラン-2-オン、イソチアゾリジン1,1-ジオキシド、4,5-ジヒドロ-1H-イミダゾリル、4,5-ジヒドロオキサゾリル、オキシラニル、ピラゾリジニル、4H-1,4-チアジニル、チオモルホリニル、1,2,3,4-テトラヒドロピリジニル、1,2,3,4-テトラヒドロピラジニル、1,3-オキサジナン-2-オン、テトラヒドロ-2H-チオピラン1,1-ジオキシド、7-オキサビシクロ[2.2.1]ヘプタニル、1,2-チアゼパン1,1-ジオキシド、オクタヒドロ-2H-キノリジニル、1,3-ジアザビシクロ[2.2.2]オクタニル、2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ジオキシン、3-アザビシクロ[3.2.1]オクタニル、8-アザスピロ[4.5]デカン、8-オキサ-3-アザビシクロ[3.2.1]オクタニル、2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン、2,8-ジアザスピロ[5.5]ウンデカニル、2-アザスピロ[5.5]ウンデカニル、3-アザスピロ[5.5]ウンデカニル、デカヒドロイソキノリニル、1-オキサ-8-アザスピロ[4.5]デカニル、8-アザビシクロ[3.2.1]オクタニル、1,4’-ビピペリジニル、アゼパニル、8-オキサ-3-アザビシクロ[3.2.1]オクタニル、3,4-ジヒドロ-2H-ベンゾ[b][1,4]オキサジニル、5,6,7,8-テトラヒドロイミダゾ[1,2-a]ピリジニル、1,4-ジアゼパニル、フェノキサチイニル、ベンゾ[d][1,3]ジオキソリル、2,3-ジヒドロベンゾフラニル、2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ジオキシニル、4-(ピペリジン-4-イル)モルホリニル、3-アザスピロ[5.5]ウンデカニル、デカヒドロキノリニル、ピペラジン-2-オン、1-(ピロリジン-2-イルメチル)ピロリジニル、1,3’-ビピロリジニル、及び6,7,8,9-テトラヒドロ-1H,5H-ピラゾロ[1,2-a][1,2]ジアゼピニルが挙げられる。
本明細書で使用する場合、数値範囲は、別段の記載がない限り、連続的な整数を含むように意図されている。例えば、「0から5まで」と表現される範囲は、0、1、2、3、4及び5を含むと考えられる。
本明細書で使用する場合、「置換された」という用語は、指定された基または部分が、1つ以上の位置でその指定された基または部分に接続し得る1つ以上の好適な置換基を有することを意味する。例えば、シクロアルキルで置換されたアリールは、シクロアルキルが、結合により、またはアリールと融合し2個以上の共通の原子を共有することにより、アリールの1個の原子に接続することを示し得る。
本明細書で使用する場合、「非置換」という用語は、指定された基が置換基を有しないことを意味する。
「任意選択で置換された」という用語は、所与の化学部分(例えば、アルキル基)が、(必須ではないが)他の置換基(例えば、ヘテロ原子)に結合し得ることを意味するものと理解されたい。例えば、任意選択で置換されたアルキル基は、完全飽和アルキル鎖(すなわち、純粋な炭化水素)であり得る。代替的に、同じ任意選択で置換されたアルキル基が、水素とは異なる置換基を有してもよい。例えば、アルキル基は、鎖に沿った任意の点で、ハロゲン原子、ヒドロキシル基、または本明細書で説明される他の任意の置換基に結合することができる。したがって、「任意選択で置換された」という用語は、所与の化学部分が他の官能基を含む可能性があるが、必ずしも任意のさらなる官能基を有するわけではないことを意味する。別段の指定がない場合、説明された基の任意選択の置換で使用される好適な置換基としては、限定されるものではないが、オキソ、-ハロゲン、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cハロアルキル、C-Cハロアルコキシ、-OC-Cアルケニル、-OC-Cアルキニル、-C-Cアルケニル、-C-Cアルキニル、-OH、CN(シアノ)、-CHCN、-OP(O)(OH)、-C(O)OH、-OC(O)C-Cアルキル、-C(O)C-Cアルキル、-C(O)-C-Cアルキレニル-シクロアルキル、-C(O)-C-Cアルキレニル-ヘテロシクロアルキル、-C(O)-C-Cアルキレニル-アリール、-C(O)-C-Cアルキレニル-ヘテロアリール、-OC(O)OC-Cアルキル、NH、NH(C-Cアルキル)、N(C-Cアルキル)、-C(O)NH、-C(O)NH(C-Cアルキル)、-C(O)N(C-Cアルキル)、-C(O)NHシクロアルキル、-C(O)N(C-Cアルキル)シクロアルキル、-C(O)NHヘテロシクロアルキル、-C(O)N(C-Cアルキル)ヘテロシクロアルキル、-C(O)NHアリール、-C(O)N(C-Cアルキル)アリール、-C(O)NHヘテロアリール、-C(O)N(C-Cアルキル)ヘテロアリール、-S(O)-C-Cアルキル、-S(O)-C-Cハロアルキル、-S(O)-シクロアルキル、-S(O)-ヘテロシクロアルキル、-S(O)-アリール、-S(O)-ヘテロアリール-C-Cアルキレニル-S(O)NH、-S(O)NHC-Cアルキル、-S(O)N(C-Cアルキル)、-S(O)NHシクロアルキル、-S(O)NHヘテロシクロアルキル、-S(O)NHアリール、-S(O)NHヘテロアリール、-NHS(O)-Cアルキル、-N(C-Cアルキル)S(O)(C-Cアルキル)、-NHS(O)アリール、-N(C-Cアルキル)S(O)アリール、-NHS(O)ヘテロアリール、-N(C-Cアルキル)S(O)ヘテロアリール、-NHS(O)シクロアルキル、-N(C-Cアルキル)S(O)シクロアルキル、-NHS(O)ヘテロシクロアルキル、-N(C-Cアルキル)S(O)ヘテロシクロアルキル、-N(C-Cアルキル)S(O)アリール,-C-Cアルキレニル-アリール、-C-Cアルキレニル-ヘテロアリール、-C-Cアルキレニル-シクロアルキル、-C-Cアルキレニル-ヘテロシクロアルキル、-O-アリール、-NH-アリール、及びN(C-Cアルキル)アリールが挙げられる。置換基は、それ自体が任意選択で置換されてもよい。多官能部分が示されている場合、コアへの結合点が線で示される。例えば、(シクロアルキルオキシ)アルキル-は、アルキルがコアへの結合点であり、一方シクロアルキルがオキシ基を介してアルキルに結合していることを意味する。また、「任意選択で置換された」は、「置換された」または「非置換」も意味し、これらの意味は上記で説明されている。
本明細書で使用する場合、「リンカー」または「結合部分」という用語は、2つの基を接続し、0から100個の間の原子の骨格を有する基を意味する。リンカーまたは結合は、2つの基または長さが1から100個の間の原子、例えば、長さが約1、2、3、4、5、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、または100個の炭素原子の鎖を接続する共有結合(すなわち、0個の原子の骨格)とすることができ、このときリンカーは、直鎖状、分枝状、環状、または単一の原子とすることができる。ある特定の場合において、リンカー骨格の1つ以上の炭素原子は、任意選択で、硫黄、窒素、または酸素ヘテロ原子で置換される場合がある。骨格原子間の結合は、飽和の場合も不飽和の場合もある。リンカーは、1つ以上の置換基、例えばアルキル、アリール、またはアルケニル基を含むことができる。リンカーとしては、限定されるものではないが、オリゴ(エチレングリコール)、エーテル、チオエーテル、3級アミン、直鎖状または分枝状であり得るアルキル、例えば、メチル、エチル、n-プロピル、1-メチルエチル(イソ-プロピル)、n-ブチル、n-ペンチル、1,1-ジメチルエチル(t-ブチル)などを挙げることができる。リンカー骨格としては、環状基、例えば、アリール、複素環、またはシクロアルキル基を挙げることができ、このとき、骨格には環状基の2個以上の原子、例えば、2個、3個または4個の原子が含まれる。リンカーは、切断可能な場合も切断不可能な場合もある。
別段の明記がない限り、分子量という用語は、量平均分子量(M)を意味する。
「ヘテロアルキレン」という用語は、硫黄、酸素、またはNR(式中、Rは水素またはアルキルである)で置き換えられた1個以上の炭素原子を有する2価アルキレンを意味する。ヘテロアルキレンは、直鎖状、分枝状、環状、またはこれらの組合せとすることができる。
「ヘテロアルケニレン」という用語は、その骨格内に少なくとも1つの炭素間二重結合と、1個以上のヘテロ原子(例えば、N、S、またはO)とを有する、2価の直鎖状または分枝状鎖ヒドロカルビル基を意味する。
「ヘテロアルキニレン」という用語は、その骨格内に少なくとも1つの炭素間三重結合と、1個以上のヘテロ原子(例えば、N、S、またはO)とを有する、2価の直鎖状または分枝状鎖ヒドロカルビル基を意味する。
本明細書で使用する場合、「ポリプレックス」という用語は、核酸とポリマーとの間の複合体を意味する。核酸は、非共有結合、詳細には静電結合を介し、ポリマーと結合する。
「プラスミド」という用語は、細胞の中心代謝の一部ではない遺伝子をしばしば有する染色体外エレメントを意味し、通常は環状2本鎖DNA分子の形態をとる。このようなエレメントは、任意の供給源に由来する1本鎖または2本鎖DNAまたはRNAの、線状、環状、またはスーパーコイル状の、自己複製配列、ゲノム組込配列、ファージまたはヌクレオチド配列とすることができ、このような配列においては、複数のヌクレオチド配列が連結または再合成されて、選択された遺伝子産物のプロモーターフラグメント及びDNA配列を適切な3’非翻訳配列と共に細胞に導入可能なユニークな構造となっている。本明細書で使用する場合、「プラスミド」という用語は、遺伝子材料(すなわち、核酸)から構成されたコンストラクトを意味する。典型的には、プラスミドは、細菌宿主細胞(例えば、Escherichia coli)内で機能的である複製起点と、プラスミドを含む細菌宿主細胞を検出するための選択マーカーとを含む。
「ナノプラスミド」という用語は、より小さなプラスミドに所望の遺伝子挿入物を提供する、細菌配列が低減された環状DNA配列を意味する。例えば、抗生物質を含まないRNA-OUT選択システムによって生成されたナノプラスミド及びその作製方法は、米国特許第9,109,012号(Nature Technologyによって特許されている)で説明されており、当該文献はその全体が参照により本明細書に援用される。
「核酸」という用語は、ヌクレオチド塩基の生物学的ポリマーを意味し、限定されるものではないが、デオキシリボ核酸(DNA)、リボ核酸(RNA)、マイクロRNA(miRNA)、及びペプチド核酸(PNA)を挙げることができる。
「ミニサークル」という用語は、細菌の複製配列を除去するために分子内組換えによって親プラスミドから誘導された小型の最小サイズの環状DNAを意味する。
「遺伝子編集システム」という用語は、多くのDNA修復経路の1つによって標的核酸を改変可能なシステムを意味する。
本開示は、直鎖状オリゴマーの組合せ戦略によって合成されたポリマーを含めた分枝状ポリマーの新規のクラスを対象とする。いくつかの実施形態において、直鎖状ポリ(β-アミノエステル)オリゴマーは、分岐単位によって接続されて、多官能性直鎖状-分枝状ハイブリッドポリ(β-アミノエステル)(LBPAE)を形成する。本開示のポリマーは、限定されるものではないが、高性能線維芽細胞遺伝子形質移入を含めた様々な用途のために設計及び調製される。ヒト初代皮膚線維芽細胞(HPDF)及びマウス胚線維芽細胞(3T3)において、超高度な導入遺伝子発現がLBPAEにより達成され、Gルシフェラーゼ(Gluc)発現の3292倍の強化及びほぼ100%の緑色蛍光タンパク質(GFP)発現が検出された。詳細な機構的試験により、LBPAEは、線維芽細胞遺伝子形質移入に関与する複数の細胞外及び細胞内バリアを通り抜けできることが明らかになった。さらに重要なことに、LBPAEは、様々な遺伝子(例えば、COL7A1)を有効に送達して、所望の発現(例えば、HPDFにおけるVII型コラーゲンタンパク質(C7))を実質的に上方制御し、疾患(例えば、劣性栄養障害型表皮水疱症(RDEB)などのC7欠損遺伝性皮膚症)の治療において大きな可能性を示し得る。
ポリマー
いくつかの実施形態において、本開示は、以下のプロセス:
(a)式(A)の化合物
Figure 2022514113000009
を、式R-NHまたはR-N(H)-Z’-N(H)-Rを有する第1のアミンと反応させることと、
(b)ステップ(a)の生成物を、式R-NHまたはR-N(H)-Z’’-N(H)-Rを有する第2のアミンと反応させることと、
(c)ステップ(b)の生成物を式(B)の化合物と反応させることとによって作製され、
Figure 2022514113000010
によって作製されるポリマーであって、式中、
各Jが、独立的に、-O-または-NH-であり、
Z、Z’、及びZ’’が結合部分であり、
Aが、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、2~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、または3~30個の原子を含む複素環であり、
Aが、任意選択で、1つ以上のハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、またはC-C10アリールで置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
Gが、-C-、-S-、-S(O)-、-P(OR)-、または-P(OH)-であり、
各Qが、HまたはC-C10直鎖状もしくは分枝状アルキル基であり、
各Eが、独立的に、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択され;
及びR2が、各々独立的に、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、またはヘテロアリールであり、このとき、当該ヘテロシクリル及びヘテロアリールが、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、当該C-C40アルキル、C-C40アルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールが、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、または-N(C-Cアルキル)で置換され、Rは、非置換であるか、またはハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10)アリールのうちの1つ以上で置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
各nが少なくとも1である、ポリマーを提供する。
いくつかの実施形態において、本開示は、以下のプロセス:
(a)式(A)の化合物
Figure 2022514113000011
及び式(B)の化合物:
Figure 2022514113000012
を、式R-NHまたはR-N(H)-Z’-N(H)-Rを有する第1のアミンと反応させることと、
(b)ステップ(a)の生成物を、式R-NHまたはR-N(H)-Z’’-N(H)-Rを有する第2のアミンと反応させることと
によって作製されるポリマーであって、式中、
各Jが、独立的に、-O-または-NH-であり、
Z、Z’、及びZ’’が結合部分であり、
Aが、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、2~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、または3~30個の原子を含む複素環であり、
Aが、任意選択で、1つ以上のハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、またはC-C10アリールで置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
Gが、-C-、-S-、-S(O)-、-P(OR)-、または-P(OH)-であり、
各Qが、HまたはC-C10直鎖状もしくは分枝状アルキル基であり、
各Eが、独立的に、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択され;
及びR2が、各々独立的に、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、またはヘテロアリールであり、このとき、当該ヘテロシクリル及びヘテロアリールが、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、当該C-C40アルキル、C-C40アルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールが、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、または-N(C-Cアルキル)で置換され、Rは、非置換であるか、またはハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10)アリールのうちの1つ以上で置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
各nが少なくとも1である、ポリマーを提供する。
いくつかの実施形態において、Zは、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、3~30個の炭素原子を含むアルキレン-炭素環、3~30個の原子を含む複素環、または3~30個の原子を含むアルキレン-複素環である。Zは、非置換の場合もあれば、ハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10アリールのうちの少なくとも1つで置換される場合もある(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)。いくつかの実施形態において、Zは、1~30個の炭素原子の直鎖状炭素鎖である。例えば、Zは、限定されるものではないが、C-C24アルキレン、C-C20アルキレン、C-C16アルキレン、C-C12アルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、Cアルキレンを含めたアルキレン基とすることができる。代表的なアルキレン基としては、限定されるものではないが、メチレン、エチレン、プロピレン、n-ブチレン、エテニレン、プロペニレン、n-ブテニレン、プロピニレン、n-ブチニレンなどが挙げられるが。いくつかの実施形態において、Zは、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、または1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖である。いくつかの実施形態において、Zは、1~10個の炭素原子の直鎖状または分枝状炭素鎖である。例えば、いくつかの実施形態において、Zは
Figure 2022514113000013
である。いくつかの実施形態において、Zは、1~30個の炭素原子の分枝状炭素鎖である。いくつかの実施形態において、Zは、1~30個の原子の直鎖状または分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖である。例えば、Zは、ヘテロ原子(限定されるものではないが、O、N、S、またはPを含む)で置換された1個以上の炭素原子を有する直鎖状または分枝状炭素鎖とすることができる。いくつかの実施形態において、Zは、3~30個の炭素原子を含む炭素環である。いくつかの実施形態において、Zは、3~30個の炭素原子を含むアルキレン-炭素環である。例えば、いくつかの実施形態において、Zは
Figure 2022514113000014
であり、式中、xは1~1000である。いくつかの実施形態において、Zは、3~30個の原子を含む複素環である。いくつかの実施形態において、Zは、3~30個の原子を含むアルキレン-複素環である。いくつかの実施形態において、Zは置換されていない。いくつかの実施形態において、Zは置換されている。いくつかの実施形態において、Zは、以下:
Figure 2022514113000015
のうちの1つである。
いくつかの実施形態において、Z’は、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、3~30個の炭素原子を含むアルキレン-炭素環、3~30個の原子を含む複素環、または3~30個の原子を含むアルキレン-複素環である。Z’は、非置換の場合もあれば、ハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10アリールのうちの少なくとも1つで置換される場合もある(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)。いくつかの実施形態において、Z’は、1~30個の炭素原子の直鎖状炭素鎖である。例えば、Z’は、限定されるものではないが、C-C24アルキレン、C-C20アルキレン、C-C16アルキレン、C-C12アルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、Cアルキレンを含めたアルキレン基とすることができる。代表的なアルキレン基としては、限定されるものではないが、メチレン、エチレン、プロピレン、n-ブチレン、エテニレン、プロペニレン、n-ブテニレン、プロピニレン、n-ブチニレンなどが挙げられるが。いくつかの実施形態において、Z’は、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、または1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖である。
いくつかの実施形態において、Z’’は、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、3~30個の炭素原子を含むアルキレン-炭素環、3~30個の原子を含む複素環、または3~30個の原子を含むアルキレン-複素環である。Z’’は、非置換の場合もあれば、ハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10アリールのうちの少なくとも1つで置換される場合もある(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)。いくつかの実施形態において、Z’’は、1~30個の炭素原子の直鎖状炭素鎖である。例えば、Z’’は、限定されるものではないが、C-C24アルキレン、C-C20アルキレン、C-C16アルキレン、C-C12アルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、Cアルキレンを含めたアルキレン基とすることができる。代表的なアルキレン基としては、限定されるものではないが、メチレン、エチレン、プロピレン、n-ブチレン、エテニレン、プロペニレン、n-ブテニレン、プロピニレン、n-ブチニレンなどが挙げられるが。いくつかの実施形態において、Z’’は、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、または1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖である。
本開示のある特定の実施形態によれば、Gは、-C-、-S-、-S(O)-、-P(OR)-、または-P(OH)-であり、よってそれぞれ、カルボニル、スルホキシド、スルホン、及びホスホノ基を形成する。したがって、いくつかの実施形態において、Gは-C-である。いくつかの実施形態において、Gは-S-である。いくつかの実施形態において、Gは-S(O)-である。
いくつかの実施形態において、式(B)の化合物は、
Figure 2022514113000016
であって、式中、
Rが、1~10個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~10個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~10個の炭素原子を含む炭素環、または3~10個の原子を含む複素環であり、Rが、非置換であるか、またはハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10アリールのうちの少なくとも1つで置換されており(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、R’’が、非置換または置換された、1~10個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~10個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~10個の炭素原子を含む炭素環、または3~10個の原子を含む複素環である。いくつかの実施形態において、Rは1個の炭素原子である。いくつかの実施形態において、R’’は、直鎖状または分枝状炭素鎖、例えば、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、2-メチル-1-プロピル、2-メチル-2-プロピル、2-メチル-1-ブチル、3-メチル-1-ブチル、2-メチル-3-ブチル、2,2-ジメチル-1-プロピル、2-メチル-1-ペンチル、3-メチル-1-ペンチル、4-メチル-1-ペンチル、2-メチル-2-ペンチル、3-メチル-2-ペンチル、4-メチル-2-ペンチル、2,2-ジメチル-1-ブチル、3,3-ジメチル-1-ブチル、2-エチル-1-ブチル、ブチル、イソブチル、t-ブチル、n-ペンチル、イソペンチル、ネオペンチル、n-ヘキシルである。例えば、いくつかの実施形態において、式(B)の化合物は
Figure 2022514113000017
である。いくつかの実施形態において、Rは、3~10個の炭素原子を含む炭素環である。例えば、Rは、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル、シクロノニル、シクロデシル、フェニル、またはナフチルとすることができる。いくつかの実施形態において、Rは、3~10個の原子を含む複素環である。
ある特定の実施形態において、第1のアミンは、式R-NHまたはR-N(H)-Z’-N(H)-Rを有する。いくつかの実施形態において、第1のアミンは、式R-NHを有する。いくつかの実施形態において、第1のアミンは、式R-N(H)-Z’-N(H)-Rを有する。いくつかの実施形態において、式R-N(H)-Z’-N(H)-Rを有する第1のアミンは、
Figure 2022514113000018
である。いくつかの実施形態において、第1のアミンは、R-N(H)-Z’-N-(Rを有する。いくつかの実施形態において、式R-N(H)-Z’-N-(Rを有する第1のアミンは、
Figure 2022514113000019
である。
ある特定の実施形態において、第2のアミンは、式R-NHまたはR-N(H)-Z’’-N(H)-Rを有する。いくつかの実施形態において、第2のアミンは、式R-NHを有する。いくつかの実施形態において、第2のアミンは、式R-N(H)-Z’’-N(H)-Rを有する。いくつかの実施形態において、式R-N(H)-Z’’-N(H)-Rを有する第2のアミンは、
Figure 2022514113000020
である。いくつかの実施形態において、第1のアミンは、R-N(H)-Z’’-N-(Rを有する。いくつかの実施形態において、式R-N(H)-Z’’-N-(Rを有する第1のアミンは、
Figure 2022514113000021
である。
ある特定の実施形態において、Rは、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、もしくはヘテロアリールであり、当該ヘテロシクリル及びヘテロアリールは、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、当該C-C40アルキル、C-C40アルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールは、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、もしくは-N(C-Cアルキル)で置換されている。Rは、非置換の場合もあれば、ハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10アリールのうちの少なくとも1つで置換される場合もある(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)。いくつかの実施形態において、Rは、C-C20アルキルである。例えば、Rは、C、C、C、C、C、C、C、C、C、C10、C11、C12、C13、C14、C15、C16、C17、C18、C19、またはC20アルキル基、例えば、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、2-メチル-1-プロピル、2-メチル-2-プロピル、2-メチル-1-ブチル、3-メチル-1-ブチル、2-メチル-3-ブチル、2,2-ジメチル-1-プロピル、2-メチル-1-ペンチル、3-メチル-1-ペンチル、4-メチル-1-ペンチル、2-メチル-2-ペンチル、3-メチル-2-ペンチル、4-メチル-2-ペンチル、2,2-ジメチル-1-ブチル、3,3-ジメチル-1-ブチル、2-エチル-1-ブチル、ブチル、イソブチル、t-ブチル、n-ペンチル、イソペンチル、ネオペンチル、n-ヘキシル、n-ヘプチル、n-オクチル、n-ノニル、n-デシル、n-ウンデシル、n-ドデシル、n-トリデシル、n-テトラデシル、n-ペンタデシル、n-ヘキサデシル、n-ヘプタデシル、n-オクタデシル、n-ノナデシル、またはn-イコシルとすることができる。いくつかの実施形態において、Rは置換されていない。いくつかの実施形態において、Rは置換されている。いくつかの実施形態において、Rは、
Figure 2022514113000022
からなる群より選択される。いくつかの実施形態において、Rは、
Figure 2022514113000023
である。いくつかの実施形態において、Rは、
Figure 2022514113000024
である。
ある特定の実施形態において、Rは、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、もしくはヘテロアリールであり、当該ヘテロシクリル及びヘテロアリールは、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、当該C-C40アルキル、C-C40アルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールは、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、もしくは-N(C-Cアルキル)で置換されている。Rは、非置換の場合もあれば、ハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10アリールのうちの少なくとも1つで置換される場合もある(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)。いくつかの実施形態において、Rは、C-C20アルキルである。例えば、Rは、C、C、C、C、C、C、C、C、C、C10、C11、C12、C13、C14、C15、C16、C17、C18、C19、またはC20アルキル基、例えば、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、2-メチル-1-プロピル、2-メチル-2-プロピル、2-メチル-1-ブチル、3-メチル-1-ブチル、2-メチル-3-ブチル、2,2-ジメチル-1-プロピル、2-メチル-1-ペンチル、3-メチル-1-ペンチル、4-メチル-1-ペンチル、2-メチル-2-ペンチル、3-メチル-2-ペンチル、4-メチル-2-ペンチル、2,2-ジメチル-1-ブチル、3,3-ジメチル-1-ブチル、2-エチル-1-ブチル、ブチル、イソブチル、t-ブチル、n-ペンチル、イソペンチル、ネオペンチル、n-ヘキシル、n-ヘプチル、n-オクチル、n-ノニル、n-デシル、n-ウンデシル、n-ドデシル、n-トリデシル、n-テトラデシル、n-ペンタデシル、n-ヘキサデシル、n-ヘプタデシル、n-オクタデシル、n-ノナデシル、またはn-イコシルとすることができる。いくつかの実施形態において、Rは置換されていない。いくつかの実施形態において、Rは置換されている。いくつかの実施形態において、Rは、
Figure 2022514113000025
からなる群より選択される。いくつかの実施形態において、Rは、
Figure 2022514113000026
である。いくつかの実施形態において、Rは、
Figure 2022514113000027
である。
いくつかの実施形態において、各Qは、HまたはC-C10直鎖状もしくは分枝状アルキル基である。したがって、いくつかの実施形態において、各QはHである。他の実施形態において、各QはC-C10直鎖状または分枝状アルキル基である。例えば、各Qは、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、2-メチル-1-プロピル、2-メチル-2-プロピル、2-メチル-1-ブチル、3-メチル-1-ブチル、2-メチル-3-ブチル、2,2-ジメチル-1-プロピル、2-メチル-1-ペンチル、3-メチル-1-ペンチル、4-メチル-1-ペンチル、2-メチル-2-ペンチル、3-メチル-2-ペンチル、4-メチル-2-ペンチル、2,2-ジメチル-1-ブチル、3,3-ジメチル-1-ブチル、2-エチル-1-ブチル、ブチル、イソブチル、t-ブチル、n-ペンチル、イソペンチル、ネオペンチル、n-ヘキシル、n-ヘプチル、n-オクチル、n-ノニル、またはn-デシルとすることができる。いくつかの実施形態において、各Qはメチルである。
いくつかの実施形態において、各Jは-O-である。いくつかの実施形態において、各Jは-NH-である。
いくつかの実施形態において、各Eは、独立的に、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択される。いくつかの実施形態において、各Eはヘテロアルキレンである。いくつかの実施形態において、各Eは-CH-O-である。様々な実施形態において、各nは、少なくとも1である。例えば、nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10であり得る。いくつかの実施形態において、nは1である。
いくつかの実施形態において、Aは、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、2~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、または3~30個の原子を含む複素環である。例えば、いくつかの実施形態において、Aは
Figure 2022514113000028
である。
いくつかの実施形態において、本開示のポリマーは、一般構造
Figure 2022514113000029
を有し、式中、波状の結合
Figure 2022514113000030
は、ポリマーの残りに対する結合を表し、R、R、及びRは、本明細書で示されるいずれかの定義を有する。連続的な直鎖状オリゴマーの成長及び分岐が高度に制御されているため、得られるポリマーは、上記の構造に示されるように、より均一に直鎖状セグメント及び分岐単位が分布している。以降のセクション及び実施例で説明されるように、ポリマーは、強力なDNA結合親和性を有しており、DNAを凝縮してナノサイズのポリプレックスをほぼ100%の細胞取込み効率で製剤化することができる。いくつかの実施形態において、本開示のポリマーは、
Figure 2022514113000031
である(式中、R基は本明細書で示されるいずれかの定義を有する)。
いくつかの実施形態において、本開示は、
Figure 2022514113000032
を含むポリマーであって、式中、R、R、A、E、G、J、Q、Z、Z’’、及びnが、本明細書で示されるいずれかの定義を有する、ポリマーを提供する。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約3kDa~約200kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約50kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaから50kDaの間である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約15kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約20kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約30kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約40kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクから定義されるアルファパラメーターは、約0.5未満である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.3~約0.5を範囲とする。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約1.0~約8.0である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約2.5である。
いくつかの実施形態において、本開示は、
Figure 2022514113000033
を含むポリマーであって、式中、R、R、A、E、G、J、Q、Z、及びnが、本明細書で示されるいずれかの定義を有する、ポリマーを提供する。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約3kDa~約200kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約50kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaから50kDaの間である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約15kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約20kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約30kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約40kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクから定義されるアルファパラメーターは、約0.5未満である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.3~約0.5を範囲とする。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約1.0~約8.0である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約2.5である。
いくつかの実施形態において、本開示は、
Figure 2022514113000034
を含むポリマーであって、式中、R、R、A、E、G、J、Q、Z、Z’’、及びnが、本明細書で示されるいずれかの定義を有する、ポリマーを提供する。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約3kDa~約200kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約50kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaから50kDaの間である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約15kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約20kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約30kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約40kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクから定義されるアルファパラメーターは、約0.5未満である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.3~約0.5を範囲とする。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約1.0~約8.0である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約2.5である。
いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーは、
Figure 2022514113000035
を含む。
いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーは、
Figure 2022514113000036
を含み、式中、
JはOであり、Zは
Figure 2022514113000037
であり、式中、xは1~1000である。
いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーは、
Figure 2022514113000038
を含む。
いくつかのさらなる実施形態において、R
Figure 2022514113000039
から選択される。
いくつかのさらなる実施形態において、Rは、
Figure 2022514113000040
である。
いくつかのさらなる実施形態において、Rは、
Figure 2022514113000041
である。
いくつかのさらなる実施形態において、R
Figure 2022514113000042
から選択される。
いくつかのさらなる実施形態において、Rは、
Figure 2022514113000043
である。
いくつかのさらなる実施形態において、Rは、
Figure 2022514113000044
である。
いくつかのさらなる実施形態において、R
Figure 2022514113000045
であり、R
Figure 2022514113000046
である。
いくつかのさらなる実施形態において、R
Figure 2022514113000047
であり、R
Figure 2022514113000048
である。
いくつかの実施形態において、ポリマーは、
Figure 2022514113000049
を含み、式中、

Figure 2022514113000050
であり、

Figure 2022514113000051
から選択される。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約3kDa~約200kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約50kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaから50kDaの間である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約15kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約20kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約30kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約40kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクから定義されるアルファパラメーターは、約0.5未満である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.3~約0.5を範囲とする。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約1.0~約8.0である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約2.5である。
いくつかの実施形態において、ポリマーは、
Figure 2022514113000052
を含み、式中、
JはOであり、Zは
Figure 2022514113000053
であり、式中、xは1~1000であり、

Figure 2022514113000054
であり、

Figure 2022514113000055
である。
いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約3kDa~約200kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約50kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaから50kDaの間である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約15kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約20kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約30kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約40kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクから定義されるアルファパラメーターは、約0.5未満である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.3~約0.5を範囲とする。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約1.0~約8.0である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約2.5である。
いくつかの実施形態において、本開示のある特定のポリマーは、式(A)の化合物と式R-NHまたはR-N(H)-Z’-N(H)-R(本明細書で説明の通り)を有する第1のアミンとの直鎖状ポリマー(オリゴマー)が式(B)の化合物(本明細書で説明の通り)と架橋したものとして説明することができる。式(A)の化合物が式R-NHまたはR-N(H)-Z’-N(H)-Rを有する第1のアミンよりもモル過剰で存在する条件下で直鎖状オリゴマーが調製される場合、得られるオリゴマー種は、マイケルアクセプター基(例えば、アクリレート、メタクリレート、アクリルアミド、または他のこのような基)で終結し、また、続いて適切な条件下で、式R-NHまたはR-N(H)-Z’’-N(H)-R(本明細書で説明の通り)を有する第2のアミンでエンドキャップしてもよい。次いで、得られたエンドキャップオリゴマーを、式(B)の三官能性マイケルアクセプター化合物(本明細書で説明の通り)と反応させて分枝状構造を得ることができる。代替的に、このような架橋ポリマーは、オリゴマーセグメントの分子量分布(例えば、本明細書で開示されるような約3~約200の範囲のM値)及び式(B)のマイケルアクセプター化合物の取込みから誘導される架橋のモルまたは重量パーセンテージによって定義することができる。
いくつかの実施形態において、モル過剰の式(A)の化合物を第1のアミンと反応させる。例えば、式(A)の化合物:第1のアミンの化学量論比は、約1.1:1~約10:1を範囲とすることができ、これには約1.1:1、約1.2:1、約1.3:1、約1.4:1、約1.5:1、約1.6:1、約1.7:1、約1.8:1、約1.9:1、約2:1、約3:1、約4:1、約5:1、約6:1、約7:1、約8:1、約9:1、または約10:1(これらの間の全ての範囲を含む)が含まれる。
いくつかの実施形態において、式(A)の化合物:第1のアミンの化学量論比は、約1.1:1、約1.2:1、約1.3:1、約1.4:1、約1.5:1、約1.6:1、約1.7:1、約1.8:1、約1.9:1、約2:1、約3:1、約4:1、約5:1、約6:1、約7:1、約8:1、約9:1、または約10:1である。いくつかの実施形態において、式(A)の化合物:第1のアミンの化学量論比は、約1.1:1~約2:1を範囲とすることができる。いくつかの実施形態において、式(A)の化合物:第1のアミンの化学量論比は、約1.2:1である。いくつかの実施形態において、式(A)の化合物は、モル等価(すなわち、約1:1)で第1のアミンと反応させる。
いくつかの実施形態において、ステップ(a)は、有機溶媒中で実施される。多種多様な有機溶媒を本開示の文脈で使用することができ、このような有機溶媒には、限定されるものではないが、ジメチルスルホキシド(DMSO)、N,N-ジメチルホルムアミド(DMF)、N-メチルピロリドン(NMP)など;ケトン、例えば、アセトン、メチルエチルケトン、メチルイソブチルケトンなど;エーテル、例えば、テトラヒドロフラン(THF)、ジエチルエーテル、メチル3級ブチルエーテルなど;炭化水素、例えば、トルエン、キシレン、シクロヘキサンなどが含まれる。いくつかの実施形態において、ステップ(a)はDMSO中で実施される。
いくつかの実施形態において、ステップ(a)は、約40℃から約120℃の範囲の温度で実施され、これには約40、約41、約42、約43、約44、約45、約46、約47、約48、約49、約50、約51、約52、約53、約54、約55、約56、約57、約58、約59、約60、約61、約62、約63、約64、約65、約66、約67、約68、約69、約70、約71、約72、約73、約74、約75、約76、約77、約78、約79、約80、約81、約82、約83、約84、約85、約86、約87、約88、約89、約90、約91、約92、約93、約94、約95、約96、約97、約98、約99、約100、約101、約102、約103、約104、約105、約106、約107、約108、約109、約110、約111、約112、約113、約114、約115、約116、約117、約118、約119、または120℃(これらの間の全ての範囲を含む)が含まれる。
いくつかの実施形態において、ステップ(a)は、40、約41、約42、約43、約44、約45、約46、約47、約48、約49、約50、約51、約52、約53、約54、約55、約56、約57、約58、約59、約60、約61、約62、約63、約64、約65、約66、約67、約68、約69、約70、約71、約72、約73、約74、約75、約76、約77、約78、約79、約80、約81、約82、約83、約84、約85、約86、約87、約88、約89、約90、約91、約92、約93、約94、約95、約96、約97、約98、約99、約100、約101、約102、約103、約104、約105、約106、約107、約108、約109、約110、約111、約112、約113、約114、約115、約116、約117、約118、約119、または120℃で実施される。いくつかの実施形態において、ステップ(a)は約90℃で実施される。
いくつかの実施形態において、ステップ(a)の生成物は、ステップ(b)の前に精製されない。他の実施形態において、ステップ(a)の生成物は、ステップ(b)の前に精製される。ステップ(a)の生成物は、当業者にとって明らかな様々な方法及び技法によって精製することができる。
いくつかの実施形態において、モル過剰の第2のアミンをステップ(a)の生成物に添加する。例えば、第2のアミン:ステップ(a)の生成物の化学量論比は、約1.1:1~約10:1を範囲とすることができ、これには約1.1:1、約1.2:1、約1.3:1、約1.4:1、約1.5:1、約1.6:1、約1.7:1、約1.8:1、約1.9:1、約2:1、約3:1、約4:1、約5:1、約6:1、約7:1、約8:1、約9:1、または約10:1(これらの間の全ての範囲を含む)が含まれる。
いくつかの実施形態において、第2のアミン:ステップ(a)の生成物の化学量論比は、約1.1:1、約1.2:1、約1.3:1、約1.4:1、約1.5:1、約1.6:1、約1.7:1、約1.8:1、約1.9:1、約2:1、約3:1、約4:1、約5:1、約6:1、約7:1、約8:1、約9:1、または約10:1である。いくつかの実施形態において、第2のアミン:ステップ(a)の化学量論比は約5:1である。いくつかの実施形態において、第2のアミンは、モル等価(すなわち、約1:1)でステップ(a)の生成物と反応させる。
いくつかの実施形態において、ステップ(b)は、約16℃~約40℃の範囲の温度で実施される。例えば、ステップ(b)は、約16、約17、約18、約19、約20、約21、約22、約23、約24、約25、約26、約27、約28、約29、約30、約31、約32、約33、約34、約35、約36、約37、約38、約39~約40℃の範囲の温度(これらの間の全ての範囲を含む)で実施される。
いくつかの実施形態において、ステップ(b)は、約16、約17、約18、約19、約20、約21、約22、約23、約24、約25、約26、約27、約28、約29、約30、約31、約32、約33、約34、約35、約36、約37、約38、約39、または約40℃の温度で実施される。
いくつかの実施形態において、ステップ(b)の生成物は、ステップ(c)の前に精製されない。他の実施形態において、ステップ(b)の生成物は、ステップ(c)の前に精製される。ステップ(b)の生成物は、当業者にとって明らかな様々な方法及び技法によって精製することができる。例えば、ステップ(b)の生成物は、透析によって精製することができる。
いくつかの実施形態において、ステップ(c)は、ステップ(b)より高い温度で実施される。例えば、ステップ(c)は、約21℃~約200℃の範囲の温度で実施される。例えば、ステップ(c)は、約21、約22、約23、約24、約25、約26、約27、約28、約29、約30、約31、約32、約33、約34、約35、約36、約37、約38、約39、約40、約41、約42、約43、約44、約45、約46、約47、約48、約49、約50、約51、約52、約53、約54、約55、約56、約57、約58、約59、約60、約61、約62、約63、約64、約65、約66、約67、約68、約69、約70、約71、約72、約73、約74、約75、約76、約77、約78、約79、約80、約81、約82、約83、約84、約85、約86、約87、約88、約89、約90、約91、約92、約93、約94、約95、約96、約97、約98、約99、約100、約101、約102、約103、約104、約105、約106、約107、約108、約109、約110、約111、約112、約113、約114、約115、約116、約117、約118、約119、約120、約121、約122、約123、約124、約125、約126、約127、約128、約129、約130、約131、約132、約133、約134、約135、約136、約137、約138、約139、約140、約141、約142、約143、約144、約145、約146、約147、約148、約149、約150、約151、約152、約153、約154、約155、約156、約157、約158、約159、約160、約161、約162、約163、約164、約165、約166、約167、約168、約169、約170、約171、約172、約173、約174、約175、約176、約177、約178、約179、約180、約181、約182、約183、約184、約185、約186、約187、約188、約189、約190、約191、約192、約193、約194、約195、約196、約197、約198、約199~約200℃の範囲の温度(これらの間の全ての範囲を含む)で実施される。
いくつかの実施形態において、ステップ(c)は、約21、約22、約23、約24、約25、約26、約27、約28、約29、約30、約31、約32、約33、約34、約35、約36、約37、約38、約39、約40、約41、約42、約43、約44、約45、約46、約47、約48、約49、約50、約51、約52、約53、約54、約55、約56、約57、約58、約59、約60、約61、約62、約63、約64、約65、約66、約67、約68、約69、約70、約71、約72、約73、約74、約75、約76、約77、約78、約79、約80、約81、約82、約83、約84、約85、約86、約87、約88、約89、約90、約91、約92、約93、約94、約95、約96、約97、約98、約99、約100、約101、約102、約103、約104、約105、約106、約107、約108、約109、約110、約111、約112、約113、約114、約115、約116、約117、約118、約119、約120、約121、約122、約123、約124、約125、約126、約127、約128、約129、約130、約131、約132、約133、約134、約135、約136、約137、約138、約139、約140、約141、約142、約143、約144、約145、約146、約147、約148、約149、約150、約151、約152、約153、約154、約155、約156、約157、約158、約159、約160、約161、約162、約163、約164、約165、約166、約167、約168、約169、約170、約171、約172、約173、約174、約175、約176、約177、約178、約179、約180、約181、約182、約183、約184、約185、約186、約187、約188、約189、約190、約191、約192、約193、約194、約195、約196、約197、約198、約199~約200℃で実施される。いくつかの実施形態において、ステップ(c)は約90℃で実施される。
いくつかの実施形態において、本開示は、式(I)のポリマー:
Figure 2022514113000056
(I)
であって、式中、
各Aが、独立的に、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、または3~30個の原子を含む複素環であり、
Aが、任意選択で、1つ以上のハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、またはC-C10アリールで置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
各Bが、独立的に、
Figure 2022514113000057
であり、
Gが、-C-、-S-、-S(O)-、-P(OR)-、または-P(OH)-であり、nが少なくとも1であり、
各Eが、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択され;
各Eが、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択され、
各Xが、独立的に、
Figure 2022514113000058
であり、
各Yが、独立的に、
Figure 2022514113000059
であり、
各Lが、独立的に、第2の結合部分であり、
各R、R、及びRが、各出現において独立的に、H、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、もしくはヘテロアリールであり、当該ヘテロシクリル及びヘテロアリールが、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、当該C-Cアルキル、C-Cアルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-Cアルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールが、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、もしくは-N(C-Cアルキル)で置換され、または
及びRが、それらが結合する原子と一緒になって、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~3個のヘテロ原子を含むヘテロシクリルまたはヘテロアリールを形成してもよく、
aが1~1000であり、
bが3または4であり、
cが1~3であり、
zが1~100であり、
ただし、R及びRの少なくとも一方がHではなく、GがCの場合、Eが-CH-O-ではないことを前提とする、ポリマーを提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、式(II)のポリマー:
Figure 2022514113000060
であって、式中、
各Eが、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択され;
各Eが、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択され;
Gが、-C-、-S-、-S(O)-、-P(OR)-、または-P(OH)-であり、
nが少なくとも1であり、
ただし、GがCである場合、Eが-CH-O-ではないことを前提とする、ポリマーを提供する。
いくつかの実施形態において、各E及びEは、独立的に、共有結合、-N-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択される。いくつかの実施形態において、各Eはヘテロアルキレンである。いくつかの実施形態において、各Eは-CH-N-である。いくつかの実施形態において、各Eはアルキレンである。いくつかの実施形態において、各Eは、
Figure 2022514113000061
である。いくつかの実施形態において、各Eは、
Figure 2022514113000062
である。いくつかの実施形態において、各nは少なくとも1である。例えば、nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10とすることができる。いくつかの実施形態において、nは1である。いくつかの実施形態において、Gは-C-である。いくつかの実施形態において、各Bは、
Figure 2022514113000063
ある。
いくつかの実施形態において、各Lは
Figure 2022514113000064
であり、式中、xは1~1000である。いくつかの実施形態において、aは少なくとも2であり、bは3であり、各Xは、
Figure 2022514113000065
である。いくつかの実施形態において、各Aは、
Figure 2022514113000066
である。いくつかの実施形態において、各Lは、
Figure 2022514113000067
である。
いくつかの実施形態において、各R及び/またはR
Figure 2022514113000068
である。
いくつかの実施形態において、各R
Figure 2022514113000069
である。
いくつかの実施形態において、本開示は、式(III)~(VIIe)のポリマー:
Figure 2022514113000070
Figure 2022514113000071
Figure 2022514113000072
であって、式中、各R、R、及びRが、各出現において独立的に、H、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、もしくはヘテロアリールであり、当該ヘテロシクリル及びヘテロアリールが、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、当該C-Cアルキル、C-Cアルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-Cアルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールが、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、もしくは-N(C-Cアルキル)で置換され、残りの変数が上記で定義されている通りである、ポリマーを提供する。
いくつかの実施形態において、zは、1、2、または3である。いくつかの実施形態において、zは1である。
マーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、マーク-フウィンクプロットを意味する。マーク-フウィンクプロットは、高感度で構造-分子量の関係を明らかにするため、溶液中のポリマー構造を調べるための強力なツールである。このプロットは、固有粘度(IV)に対する分子量(MW)を対数-対数グラフ上にプロットすることによって生成される。分子量は、当然ながらポリマー鎖の長さ(または重合度)を示すが、それ自体は何ら構造を示すことはできない。固有粘度(dL/gで表される)は、溶液中のポリマー鎖の分子密度の測定値である。溶液中で鎖のフォールディングまたはコイルが緊密になるほど、密度は高くなり、固有粘度は低くなる。この測定値は分子量に依存しないため、同じ分子量を有する2つの異なる構造は異なる固有粘度を有する場合があり、例えば、同じ分子量の直鎖状(非分枝状)ポリマー及び分枝状ポリマーは、異なる固有粘度を有する。さらに、ポリマーがその分子量分布にわたって構造を変化させる(例えば、より多く置換される)場合、固有粘度の変化は容易に検出される。このため、マーク-フウィンクプロットが非常に有用かつ強力なものとなる。マーク-フウィンクプロットの生データは、光散乱検出器からの分子量と粘度検出器からの固有粘度とを組み合わせることによって、高品質の多重検出GPC/SECデータから好都合かつ簡便に得られる。両方のデータセットは、試料の溶出プロファイルにまたがった各点で測定される。得られたプロットは、単に2つの構造がどの程度近いかの評価からポリマー分岐の複雑な定量的測定の実施に至るまで、多くの方法で使用することができる。概して、α<0.5:コンパクト/球状鎖、0.5<α<0.8:ランダムコイル/フレキシブル鎖、0.5<α<0.8:剛性のロッド/硬い鎖である。
いくつかの実施形態において、本開示のポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.5未満である。例えば、本開示のポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.01~約0.49を範囲とする。例えば、本開示のポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.01、約0.02、約0.03、約0.04、約0.05、約0.06、約0.07、約0.08、約0.09、約0.10、約0.11、約0.12、約0.13、約0.14、約0.15、約0.16、約0.17、約0.18、約0.19、約0.20、約0.21、約0.22、約0.23、約0.24、約0.25、約0.26、約0.27、約0.28、約0.29、約0.30、約0.31、約0.32、約0.33、約0.34、約0.35、約0.36、約0.37、約0.38、約0.39、約0.40、約0.41、約0.42、約0.43、約0.44、約0.45、約0.46、約0.47、約0.48~約0.49を範囲とする。いくつかの実施形態において、本開示のポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.2~約0.5である。
いくつかの実施形態において、本開示のポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.01、約0.02、約0.03、約0.04、約0.05、約0.06、約0.07、約0.08、約0.09、約0.10、約0.11、約0.12、約0.13、約0.14、約0.15、約0.16、約0.17、約0.18、約0.19、約0.20、約0.21、約0.22、約0.23、約0.24、約0.25、約0.26、約0.27、約0.28、約0.29、約0.30、約0.31、約0.32、約0.33、約0.34、約0.35、約0.36、約0.37、約0.38、約0.39、約0.40、約0.41、約0.42、約0.43、約0.44、約0.45、約0.46、約0.47、約0.48、または約0.49である。
「多分散性指数」(PDI)という用語は、所与のポリマー試料中の分子量分布の尺度を意味する。多分散性指数は、重量平均分子量(Mw)を数平均分子量(Mn)で割ることによって計算される。本明細書で使用する場合、「重量平均分子量」という用語は、概して、そのサイズに応じたポリマー分子の寄与に依存する分子量測定値を意味する。本明細書で使用する場合、「数平均分子量」という用語は、概して、試料中の全てのポリマー分子の総重量を試料中のポリマー分子の総数で割ることによって計算される分子量測定値を意味する。これらの用語は当業者に周知されている。
いくつかの実施形態において、本開示のポリマーのPDIは約1.01~約8.0である。例えば、PDIは、約1.01、約1.02、約1.03、約1.04、約1.05、約1.06、約1.07、約1.08、約1.09、約1.1、約1.2、約1.3、約1.4、約1.5、約1.6、約1.7、約1.8、約1.9、約2.0、約2.1、約2.2、約2.3、約2.4、約2.5、約2.6、約2.7、約2.8、約2.9、約3.0、約3.1、約3.2、約3.3、約3.4、約3.5、約3.6、約3.7、約3.8、約3.9、約4.0、約4.1、約4.2、約4.3、約4.4、約4.5、約4.6、約4.7、約4.8、約4.9、約5.0、約5.1、約5.2、約5.3、約5.4、約5.5、約5.6、約5.7、約5.8、約5.9、約6.0、約6.1、約6.2、約6.3、約6.4、約6.5、約6.6、約6.7、約6.8、約6.9、約7.0、約7.1、約7.2、約7.3、約7.4、約7.5、約7.6、約7.7、約7.8、約7.9~約8.0(これらの間の全ての範囲を含む)を範囲とすることができる。
いくつかの実施形態において、本開示のポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるPDIは、約1.01、約1.02、約1.03、約1.04、約1.05、約1.06、約1.07、約1.08、約1.09、約1.1、約1.2、約1.3、約1.4、約1.5、約1.6、約1.7、約1.8、約1.9、約2.0、約2.1、約2.2、約2.3、約2.4、約2.5、約2.6、約2.7、約2.8、約2.9、約3.0、約3.1、約3.2、約3.3、約3.4、約3.5、約3.6、約3.7、約3.8、約3.9、約4.0、約4.1、約4.2、約4.3、約4.4、約4.5、約4.6、約4.7、約4.8、約4.9、約5.0、約5.1、約5.2、約5.3、約5.4、約5.5、約5.6、約5.7、約5.8、約5.9、約6.0、約6.1、約6.2、約6.3、約6.4、約6.5、約6.6、約6.7、約6.8、約6.9、約7.0、約7.1、約7.2、約7.3、約7.4、約7.5、約7.6、約7.7、約7.8、約7.9、または約8.0である。いくつかの実施形態において、本開示のポリマーのPDIは約2.5である。
いくつかの実施形態において、本開示のポリマーのMは少なくとも3kDaである。いくつかの実施形態において、本開示のポリマーのMは約3kDa~約200kDaである。したがって、本開示のポリマーのMは、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9、約10、約11、約12、約13、約14、約15、約16、約17、約18、約19、約20、約21、約22、約23、約24、約25、約26、約27、約28、約29、約30、約31、約32、約33、約34、約35、約36、約37、約38、約39、約40、約41、約42、約43、約44、約45、約46、約47、約48、約49、約50、約51、約52、約53、約54、約55、約56、約57、約58、約59、約60、約61、約62、約63、約64、約65、約66、約67、約68、約69、約70、約71、約72、約73、約74、約75、約76、約77、約78、約79、約80、約81、約82、約83、約84、約85、約86、約87、約88、約89、約90、約91、約92、約93、約94、約95、約96、約97、約98、約99、約100、約101、約102、約103、約104、約105、約106、約107、約108、約109、約110、約111、約112、約113、約114、約115、約116、約117、約118、約119、約120、約121、約122、約123、約124、約125、約126、約127、約128、約129、約130、約131、約132、約133、約134、約135、約136、約137、約138、約139、約140、約141、約142、約143、約144、約145、約146、約147、約148、約149、約150、約151、約152、約153、約154、約155、約156、約157、約158、約159、約160、約161、約162、約163、約164、約165、約166、約167、約168、約169、約170、約171、約172、約173、約174、約175、約176、約177、約178、約179、約180、約181、約182、約183、約184、約185、約186、約187、約188、約189、約190、約191、約192、約193、約194、約195、約196、約197、約198、約199~約200kDa(これらの間の全ての範囲を含む)を範囲とする。いくつかの実施形態において、ポリマーのMは約5kDaから50kDaの間である。いくつかの実施形態において、ポリマーのMは約10kDaから50kDaの間である。
いくつかの実施形態において、本開示のポリマーのMは、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9、約10、約11、約12、約13、約14、約15、約16、約17、約18、約19、約20、約21、約22、約23、約24、約25、約26、約27、約28、約29、約30、約31、約32、約33、約34、約35、約36、約37、約38、約39、約40、約41、約42、約43、約44、約45、約46、約47、約48、約49、約50、約51、約52、約53、約54、約55、約56、約57、約58、約59、約60、約61、約62、約63、約64、約65、約66、約67、約68、約69、約70、約71、約72、約73、約74、約75、約76、約77、約78、約79、約80、約81、約82、約83、約84、約85、約86、約87、約88、約89、約90、約91、約92、約93、約94、約95、約96、約97、約98、約99、約100、約101、約102、約103、約104、約105、約106、約107、約108、約109、約110、約111、約112、約113、約114、約115、約116、約117、約118、約119、約120、約121、約122、約123、約124、約125、約126、約127、約128、約129、約130、約131、約132、約133、約134、約135、約136、約137、約138、約139、約140、約141、約142、約143、約144、約145、約146、約147、約148、約149、約150、約151、約152、約153、約154、約155、約156、約157、約158、約159、約160、約161、約162、約163、約164、約165、約166、約167、約168、約169、約170、約171、約172、約173、約174、約175、約176、約177、約178、約179、約180、約181、約182、約183、約184、約185、約186、約187、約188、約189、約190、約191、約192、約193、約194、約195、約196、約197、約198、約199~約200kDaである。いくつかの実施形態において、ポリマーのMは約5kDaから50kDaの間である。いくつかの実施形態において、ポリマーのMは約10kDaから50kDaの間である。いくつかの実施形態において、ポリマーのMは約10kDaである。いくつかの実施形態において、ポリマーのMは約20kDaである。いくつかの実施形態において、ポリマーのMは約30kDaである。いくつかの実施形態において、ポリマーのMは約40kDaである。
いくつかの実施形態において、ステップ(b)の後の生成物のMは約3kDaである。いくつかの実施形態において、ステップ(b)の後の生成物のMは約10kDaである。いくつかの実施形態において、ステップ(b)の後の生成物のMは約20kDaである。いくつかの実施形態において、ステップ(b)の後の生成物のMは約30kDaである。いくつかの実施形態において、ステップ(b)の後の生成物のMは約40kDaである。
作製方法
いくつかの実施形態において、本開示は、ポリマーを作製する方法であって、
(a)式(A)の化合物
Figure 2022514113000073
(A)
を、式R-NHまたはR-N(H)-Z’-N(H)-Rを有する第1のアミンと反応させることと、
(b)ステップ(a)の生成物を、式R-NHまたはR-N(H)-Z’’-N(H)-Rを有する第2のアミンと反応させることと、
(c)ステップ(b)の生成物を式(B)の化合物と反応させることと
Figure 2022514113000074
を含み、式中、
各Jが、独立的に、-O-または-NH-であり、
Z、Z’、及びZ’’が結合部分であり、
Aが、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、2~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、または3~30個の原子を含む複素環であり、
Aが、任意選択で、1つ以上のハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、またはC-C10アリールで置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
Gが、-C-、-S-、-S(O)-、-P(OR)-、または-P(OH)-であり、
各Qが、HまたはC-C10直鎖状もしくは分枝状アルキル基であり、
各Eが、独立的に、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択され;
及びR2が、各々独立的に、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、またはヘテロアリールであり、このとき、当該ヘテロシクリル及びヘテロアリールが、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、当該C-C40アルキル、C-C40アルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールが、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、または-N(C-Cアルキル)で置換され、Rは、非置換であるか、またはハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10)アリールのうちの1つ以上で置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
各nが少なくとも1である、方法を提供する。
いくつかの実施形態において、本開示は、ポリマーを作製する方法であって、
(a)式(A)の化合物
Figure 2022514113000075
及び式(B)の化合物:
Figure 2022514113000076
を、式R-NHまたはR-N(H)-Z’-N(H)-Rを有する第1のアミンと反応させることと、
(b)ステップ(a)の生成物を、式R-NHまたはR-N(H)-Z’’-N(H)-Rを有する第2のアミンと反応させることと
を含み、式中、
各Jが、独立的に、-O-または-NH-であり、
Z、Z’、及びZ’’が結合部分であり、
Aが、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、2~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、または3~30個の原子を含む複素環であり、
Aが、任意選択で、1つ以上のハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、またはC-C10アリールで置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
Gが、-C-、-S-、-S(O)-、-P(OR)-、または-P(OH)-であり、
各Qが、HまたはC-C10直鎖状もしくは分枝状アルキル基であり、
各Eが、独立的に、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択され;
及びR2が、各々独立的に、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、またはヘテロアリールであり、このとき、当該ヘテロシクリル及びヘテロアリールが、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、当該C-C40アルキル、C-C40アルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールが、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、または-N(C-Cアルキル)で置換され、Rは、非置換であるか、またはハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10)アリールのうちの1つ以上で置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
各nが少なくとも1である、方法を提供する。
いくつかの実施形態において、Zは、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、3~30個の炭素原子を含むアルキレン-炭素環、3~30個の原子を含む複素環、または3~30個の原子を含むアルキレン-複素環である。Zは、非置換の場合もあれば、ハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10アリールのうちの少なくとも1つで置換される場合もある(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)。いくつかの実施形態において、Zは、1~30個の炭素原子の直鎖状炭素鎖である。例えば、Zは、限定されるものではないが、C-C24アルキレン、C-C20アルキレン、C-C16アルキレン、C-C12アルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、Cアルキレンを含めたアルキレン基とすることができる。代表的なアルキレン基としては、限定されるものではないが、メチレン、エチレン、プロピレン、n-ブチレン、エテニレン、プロペニレン、n-ブテニレン、プロピニレン、n-ブチニレンなどが挙げられるが。いくつかの実施形態において、Zは、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、または1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖である。いくつかの実施形態において、Zは、1~10個の炭素原子の直鎖状または分枝状炭素鎖である。例えば、いくつかの実施形態において、Zは
Figure 2022514113000077
である。いくつかの実施形態において、Zは、1~30個の炭素原子の分枝状炭素鎖である。いくつかの実施形態において、Zは、1~30個の原子の直鎖状または分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖である。例えば、Zは、ヘテロ原子(限定されるものではないが、O、N、S、またはPを含む)で置換された1個以上の炭素原子を有する直鎖状または分枝状炭素鎖とすることができる。いくつかの実施形態において、Zは、3~30個の炭素原子を含む炭素環である。いくつかの実施形態において、Zは、3~30個の炭素原子を含むアルキレン-炭素環である。例えば、いくつかの実施形態において、Zは
Figure 2022514113000078
であり、式中、xは1~1000である。いくつかの実施形態において、Zは、3~30個の原子を含む複素環である。いくつかの実施形態において、Zは、3~30個の原子を含むアルキレン-複素環である。いくつかの実施形態において、Zは置換されていない。いくつかの実施形態において、Zは置換されている。いくつかの実施形態において、Zは、以下:
Figure 2022514113000079
のうちの1つである。
いくつかの実施形態において、Z’は、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、3~30個の炭素原子を含むアルキレン-炭素環、3~30個の原子を含む複素環、または3~30個の原子を含むアルキレン-複素環である。Z’は、非置換の場合もあれば、ハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10アリールのうちの少なくとも1つで置換される場合もある(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)。いくつかの実施形態において、Z’は、1~30個の炭素原子の直鎖状炭素鎖である。例えば、Z’は、限定されるものではないが、C-C24アルキレン、C-C20アルキレン、C-C16アルキレン、C-C12アルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、Cアルキレンを含めたアルキレン基とすることができる。代表的なアルキレン基としては、限定されるものではないが、メチレン、エチレン、プロピレン、n-ブチレン、エテニレン、プロペニレン、n-ブテニレン、プロピニレン、n-ブチニレンなどが挙げられるが。いくつかの実施形態において、Z’は、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、または1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖である。
いくつかの実施形態において、Z’’は、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、3~30個の炭素原子を含むアルキレン-炭素環、3~30個の原子を含む複素環、または3~30個の原子を含むアルキレン-複素環である。Z’’は、非置換の場合もあれば、ハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10アリールのうちの少なくとも1つで置換される場合もある(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)。いくつかの実施形態において、Z’’は、1~30個の炭素原子の直鎖状炭素鎖である。例えば、Z’’は、限定されるものではないが、C-C24アルキレン、C-C20アルキレン、C-C16アルキレン、C-C12アルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、C-Cアルキレン、Cアルキレンを含めたアルキレン基とすることができる。代表的なアルキレン基としては、限定されるものではないが、メチレン、エチレン、プロピレン、n-ブチレン、エテニレン、プロペニレン、n-ブテニレン、プロピニレン、n-ブチニレンなどが挙げられるが。いくつかの実施形態において、Z’’は、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、または1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖である。
本開示のある特定の実施形態によれば、Gは、-C-、-S-、-S(O)-、-P(OR)-、または-P(OH)-とすることができ、よってそれぞれ、カルボニル、スルホキシド、スルホン、及びホスホノ基を形成する。したがって、いくつかの実施形態において、Gは-C-である。いくつかの実施形態において、Gは-S-である。いくつかの実施形態において、Gは-S(O)-である。
いくつかの実施形態において、式(B)の化合物は、
Figure 2022514113000080
であり、式中、
Rが、1~10個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~10個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~10個の炭素原子を含む炭素環、または3~10個の原子を含む複素環であり、Rが、非置換であるか、またはハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10アリールのうちの少なくとも1つで置換されており(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、R’’が、非置換または置換された、1~10個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~10個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~10個の炭素原子を含む炭素環、または3~10個の原子を含む複素環である。いくつかの実施形態において、Rは1個の炭素原子である。いくつかの実施形態において、R’’は、直鎖状または分枝状炭素鎖、例えば、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、2-メチル-1-プロピル、2-メチル-2-プロピル、2-メチル-1-ブチル、3-メチル-1-ブチル、2-メチル-3-ブチル、2,2-ジメチル-1-プロピル、2-メチル-1-ペンチル、3-メチル-1-ペンチル、4-メチル-1-ペンチル、2-メチル-2-ペンチル、3-メチル-2-ペンチル、4-メチル-2-ペンチル、2,2-ジメチル-1-ブチル、3,3-ジメチル-1-ブチル、2-エチル-1-ブチル、ブチル、イソブチル、t-ブチル、n-ペンチル、イソペンチル、ネオペンチル、n-ヘキシルである。例えば、いくつかの実施形態において、式(B)の化合物は
Figure 2022514113000081
である。いくつかの実施形態において、Rは、3~10個の炭素原子を含む炭素環である。例えば、Rは、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル、シクロノニル、シクロデシル、フェニル、またはナフチルとすることができる。いくつかの実施形態において、Rは、3~10個の原子を含む複素環である。
ある特定の実施形態において、第1のアミンは、式R-NHまたはR-N(H)-Z’-N(H)-Rを有する。いくつかの実施形態において、第1のアミンは、式R-NHを有する。いくつかの実施形態において、第1のアミンは、式R-N(H)-Z’-N(H)-Rを有する。いくつかの実施形態において、式R-N(H)-Z’-N(H)-Rを有する第1のアミンは、
Figure 2022514113000082
である。いくつかの実施形態において、第1のアミンは、R-N(H)-Z’-N-(Rを有する。いくつかの実施形態において、式R-N(H)-Z’-N-(Rを有する第1のアミンは、
Figure 2022514113000083
である。
ある特定の実施形態において、第2のアミンは、式R-NHまたはR-N(H)-Z’’-N(H)-Rを有する。いくつかの実施形態において、第2のアミンは、式R-NHを有する。いくつかの実施形態において、第2のアミンは、式R-N(H)-Z’’-N(H)-Rを有する。いくつかの実施形態において、式R-N(H)-Z’’-N(H)-Rを有する第2のアミンは、
Figure 2022514113000084
である。いくつかの実施形態において、第1のアミンは、R-N(H)-Z’’-N-(Rを有する。いくつかの実施形態において、式R-N(H)-Z’’-N-(Rを有する第1のアミンは、
Figure 2022514113000085
である。
ある特定の実施形態において、Rは、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、もしくはヘテロアリールであり、当該ヘテロシクリル及びヘテロアリールは、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、当該C-C40アルキル、C-C40アルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールは、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、もしくは-N(C-Cアルキル)で置換されている。Rは、非置換の場合もあれば、ハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10アリールのうちの少なくとも1つで置換される場合もある(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)。いくつかの実施形態において、Rは、C-C20アルキルである。例えば、Rは、C、C、C、C、C、C、C、C、C、C10、C11、C12、C13、C14、C15、C16、C17、C18、C19、またはC20アルキル基、例えば、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、2-メチル-1-プロピル、2-メチル-2-プロピル、2-メチル-1-ブチル、3-メチル-1-ブチル、2-メチル-3-ブチル、2,2-ジメチル-1-プロピル、2-メチル-1-ペンチル、3-メチル-1-ペンチル、4-メチル-1-ペンチル、2-メチル-2-ペンチル、3-メチル-2-ペンチル、4-メチル-2-ペンチル、2,2-ジメチル-1-ブチル、3,3-ジメチル-1-ブチル、2-エチル-1-ブチル、ブチル、イソブチル、t-ブチル、n-ペンチル、イソペンチル、ネオペンチル、n-ヘキシル、n-ヘプチル、n-オクチル、n-ノニル、n-デシル、n-ウンデシル、n-ドデシル、n-トリデシル、n-テトラデシル、n-ペンタデシル、n-ヘキサデシル、n-ヘプタデシル、n-オクタデシル、n-ノナデシル、またはn-イコシルとすることができる。いくつかの実施形態において、Rは置換されていない。いくつかの実施形態において、Rは置換されている。いくつかの実施形態において、Rは、
Figure 2022514113000086
からなる群より選択される。いくつかの実施形態において、Rは、
Figure 2022514113000087
である。いくつかの実施形態において、Rは、
Figure 2022514113000088
である。
ある特定の実施形態において、Rは、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、もしくはヘテロアリールであり、当該ヘテロシクリル及びヘテロアリールは、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、当該C-C40アルキル、C-C40アルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールは、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、もしくは-N(C-Cアルキル)で置換されている。Rは、非置換の場合もあれば、ハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10アリールのうちの少なくとも1つで置換される場合もある(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)。いくつかの実施形態において、Rは、C-C20アルキルである。例えば、Rは、C、C、C、C、C、C、C、C、C、C10、C11、C12、C13、C14、C15、C16、C17、C18、C19、またはC20アルキル基、例えば、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、2-メチル-1-プロピル、2-メチル-2-プロピル、2-メチル-1-ブチル、3-メチル-1-ブチル、2-メチル-3-ブチル、2,2-ジメチル-1-プロピル、2-メチル-1-ペンチル、3-メチル-1-ペンチル、4-メチル-1-ペンチル、2-メチル-2-ペンチル、3-メチル-2-ペンチル、4-メチル-2-ペンチル、2,2-ジメチル-1-ブチル、3,3-ジメチル-1-ブチル、2-エチル-1-ブチル、ブチル、イソブチル、t-ブチル、n-ペンチル、イソペンチル、ネオペンチル、n-ヘキシル、n-ヘプチル、n-オクチル、n-ノニル、n-デシル、n-ウンデシル、n-ドデシル、n-トリデシル、n-テトラデシル、n-ペンタデシル、n-ヘキサデシル、n-ヘプタデシル、n-オクタデシル、n-ノナデシル、またはn-イコシルとすることができる。いくつかの実施形態において、Rは置換されていない。いくつかの実施形態において、Rは置換されている。いくつかの実施形態において、Rは、
Figure 2022514113000089
からなる群より選択される。いくつかの実施形態において、Rは、
Figure 2022514113000090
である。いくつかの実施形態において、Rは、
Figure 2022514113000091
である。
いくつかの実施形態において、各Qは、HまたはC-C10直鎖状もしくは分枝状アルキル基である。したがって、いくつかの実施形態において、各QはHである。他の実施形態において、各QはC-C10直鎖状または分枝状アルキル基である。例えば、各Qは、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、2-メチル-1-プロピル、2-メチル-2-プロピル、2-メチル-1-ブチル、3-メチル-1-ブチル、2-メチル-3-ブチル、2,2-ジメチル-1-プロピル、2-メチル-1-ペンチル、3-メチル-1-ペンチル、4-メチル-1-ペンチル、2-メチル-2-ペンチル、3-メチル-2-ペンチル、4-メチル-2-ペンチル、2,2-ジメチル-1-ブチル、3,3-ジメチル-1-ブチル、2-エチル-1-ブチル、ブチル、イソブチル、t-ブチル、n-ペンチル、イソペンチル、ネオペンチル、n-ヘキシル、n-ヘプチル、n-オクチル、n-ノニル、またはn-デシルとすることができる。いくつかの実施形態において、各Qはメチルである。
いくつかの実施形態において、各Jは-O-である。いくつかの実施形態において、各Jは-NH-である。
いくつかの実施形態において、各Eは、独立的に、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択される。いくつかの実施形態において、各Eはヘテロアルキレンである。いくつかの実施形態において、各Eは-CH-O-である。いくつかの実施形態において、各nは少なくとも1である。例えば、nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10とすることができる。いくつかの実施形態において、nは1である。
いくつかの実施形態において、Aは、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、2~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、または3~30個の原子を含む複素環である。例えば、いくつかの実施形態において、Aは
Figure 2022514113000092
である。
いくつかの実施形態において、本開示のポリマーは、一般構造
Figure 2022514113000093
を有し、式中、波状の結合は、ポリマーの残りに対する結合を表す。連続的な直鎖状オリゴマーの成長及び分岐が高度に制御されているため、得られるポリマーは、上記の構造に示されるように、より均一に直鎖状セグメント及び分岐単位が分布している。以降のセクション及び実施例で説明されるように、ポリマーは、強力なDNA結合親和性を有しており、DNAを凝縮してナノサイズのポリプレックスをほぼ100%の細胞取込み効率で製剤化することができる。いくつかの実施形態において、本開示のポリマーは、
Figure 2022514113000094
である。
いくつかの実施形態において、モル過剰の式(A)の化合物を第1のアミンと反応させる。例えば、式(A)の化合物:第1のアミンの化学量論比は、約1.1:1~約10:1を範囲とすることができ、これには約1.1:1、約1.2:1、約1.3:1、約1.4:1、約1.5:1、約1.6:1、約1.7:1、約1.8:1、約1.9:1、約2:1、約3:1、約4:1、約5:1、約6:1、約7:1、約8:1、約9:1、または約10:1(これらの間の全ての範囲を含む)が含まれる。
いくつかの実施形態において、式(A)の化合物:第1のアミンの化学量論比は、約1.1:1、約1.2:1、約1.3:1、約1.4:1、約1.5:1、約1.6:1、約1.7:1、約1.8:1、約1.9:1、約2:1、約3:1、約4:1、約5:1、約6:1、約7:1、約8:1、約9:1、または約10:1である。いくつかの実施形態において、式(A)の化合物:第1のアミンの化学量論比は約1.1:1~約2:1を範囲とすることができる。いくつかの実施形態において、式(A)の化合物:第1のアミンの化学量論比は約1.2:1である。いくつかの実施形態において、式(A)の化合物は、モル等価(すなわち、約1:1)で第1のアミンと反応させる。
いくつかの実施形態において、ステップ(a)は、有機溶媒中で実施される。多種多様な有機溶媒を本開示の文脈で使用することができ、このような有機溶媒には、限定されるものではないが、ジメチルスルホキシド(DMSO)、N,N-ジメチルホルムアミド(DMF)、N-メチルピロリドン(NMP)など;ケトン、例えば、アセトン、メチルエチルケトン、メチルイソブチルケトンなど;エーテル、例えば、テトラヒドロフラン(THF)、ジエチルエーテル、メチル3級ブチルエーテルなど;炭化水素、例えば、トルエン、キシレン、シクロヘキサンなどが含まれる。いくつかの実施形態において、ステップ(a)はDMSO中で実施される。
いくつかの実施形態において、ステップ(a)は、約40℃から約120℃の範囲の温度で実施され、これには約40、約41、約42、約43、約44、約45、約46、約47、約48、約49、約50、約51、約52、約53、約54、約55、約56、約57、約58、約59、約60、約61、約62、約63、約64、約65、約66、約67、約68、約69、約70、約71、約72、約73、約74、約75、約76、約77、約78、約79、約80、約81、約82、約83、約84、約85、約86、約87、約88、約89、約90、約91、約92、約93、約94、約95、約96、約97、約98、約99、約100、約101、約102、約103、約104、約105、約106、約107、約108、約109、約110、約111、約112、約113、約114、約115、約116、約117、約118、約119、または120℃(これらの間の全ての範囲を含む)が含まれる。
いくつかの実施形態において、ステップ(a)は、40、約41、約42、約43、約44、約45、約46、約47、約48、約49、約50、約51、約52、約53、約54、約55、約56、約57、約58、約59、約60、約61、約62、約63、約64、約65、約66、約67、約68、約69、約70、約71、約72、約73、約74、約75、約76、約77、約78、約79、約80、約81、約82、約83、約84、約85、約86、約87、約88、約89、約90、約91、約92、約93、約94、約95、約96、約97、約98、約99、約100、約101、約102、約103、約104、約105、約106、約107、約108、約109、約110、約111、約112、約113、約114、約115、約116、約117、約118、約119、または120℃で実施される。いくつかの実施形態において、ステップ(a)は約90℃で実施される。
いくつかの実施形態において、ステップ(a)の生成物は、ステップ(b)の前に精製されない。他の実施形態において、ステップ(a)の生成物は、ステップ(b)の前に精製される。ステップ(a)の生成物は、当業者にとって明らかな様々な方法及び技法によって精製することができる。
いくつかの実施形態において、モル過剰の第2のアミンをステップ(a)の生成物に添加する。例えば、第2のアミン:ステップ(a)の生成物の化学量論比は、約1.1:1~約10:1を範囲とすることができ、これには約1.1:1、約1.2:1、約1.3:1、約1.4:1、約1.5:1、約1.6:1、約1.7:1、約1.8:1、約1.9:1、約2:1、約3:1、約4:1、約5:1、約6:1、約7:1、約8:1、約9:1、または約10:1(これらの間の全ての範囲を含む)が含まれる。
いくつかの実施形態において、第2のアミン:ステップ(a)の生成物の化学量論比は、約1.1:1、約1.2:1、約1.3:1、約1.4:1、約1.5:1、約1.6:1、約1.7:1、約1.8:1、約1.9:1、約2:1、約3:1、約4:1、約5:1、約6:1、約7:1、約8:1、約9:1、または約10:1である。いくつかの実施形態において、第2のアミン:ステップ(a)の生成物の化学量論比は約5:1である。いくつかの実施形態において、第2のアミンは、モル等価(すなわち、約1:1)でステップ(a)の生成物と反応させる。
いくつかの実施形態において、ステップ(b)は、約16℃~約40℃の範囲の温度で実施される。例えば、ステップ(b)は、約16、約17、約18、約19、約20、約21、約22、約23、約24、約25、約26、約27、約28、約29、約30、約31、約32、約33、約34、約35、約36、約37、約38、約39~約40℃の範囲の温度(これらの間の全ての範囲を含む)で実施される。
いくつかの実施形態において、ステップ(b)は、約16、約17、約18、約19、約20、約21、約22、約23、約24、約25、約26、約27、約28、約29、約30、約31、約32、約33、約34、約35、約36、約37、約38、約39、または約40℃の温度で実施される。
いくつかの実施形態において、ステップ(b)の生成物は、ステップ(c)の前に精製されない。他の実施形態において、ステップ(b)の生成物は、ステップ(c)の前に精製される。ステップ(b)の生成物は、当業者にとって明らかな様々な方法及び技法によって精製することができる。例えば、ステップ(b)の生成物は、透析によって精製することができる。
いくつかの実施形態において、ステップ(c)は、ステップ(b)より高い温度で実施される。例えば、ステップ(c)は、約21℃~約200℃の範囲の温度で実施される。例えば、ステップ(c)は、約21、約22、約23、約24、約25、約26、約27、約28、約29、約30、約31、約32、約33、約34、約35、約36、約37、約38、約39、約40、約41、約42、約43、約44、約45、約46、約47、約48、約49、約50、約51、約52、約53、約54、約55、約56、約57、約58、約59、約60、約61、約62、約63、約64、約65、約66、約67、約68、約69、約70、約71、約72、約73、約74、約75、約76、約77、約78、約79、約80、約81、約82、約83、約84、約85、約86、約87、約88、約89、約90、約91、約92、約93、約94、約95、約96、約97、約98、約99、約100、約101、約102、約103、約104、約105、約106、約107、約108、約109、約110、約111、約112、約113、約114、約115、約116、約117、約118、約119、約120、約121、約122、約123、約124、約125、約126、約127、約128、約129、約130、約131、約132、約133、約134、約135、約136、約137、約138、約139、約140、約141、約142、約143、約144、約145、約146、約147、約148、約149、約150、約151、約152、約153、約154、約155、約156、約157、約158、約159、約160、約161、約162、約163、約164、約165、約166、約167、約168、約169、約170、約171、約172、約173、約174、約175、約176、約177、約178、約179、約180、約181、約182、約183、約184、約185、約186、約187、約188、約189、約190、約191、約192、約193、約194、約195、約196、約197、約198、約199~約200℃の範囲の温度(これらの間の全ての範囲を含む)で実施される。
いくつかの実施形態において、ステップ(c)は、約21、約22、約23、約24、約25、約26、約27、約28、約29、約30、約31、約32、約33、約34、約35、約36、約37、約38、約39、約40、約41、約42、約43、約44、約45、約46、約47、約48、約49、約50、約51、約52、約53、約54、約55、約56、約57、約58、約59、約60、約61、約62、約63、約64、約65、約66、約67、約68、約69、約70、約71、約72、約73、約74、約75、約76、約77、約78、約79、約80、約81、約82、約83、約84、約85、約86、約87、約88、約89、約90、約91、約92、約93、約94、約95、約96、約97、約98、約99、約100、約101、約102、約103、約104、約105、約106、約107、約108、約109、約110、約111、約112、約113、約114、約115、約116、約117、約118、約119、約120、約121、約122、約123、約124、約125、約126、約127、約128、約129、約130、約131、約132、約133、約134、約135、約136、約137、約138、約139、約140、約141、約142、約143、約144、約145、約146、約147、約148、約149、約150、約151、約152、約153、約154、約155、約156、約157、約158、約159、約160、約161、約162、約163、約164、約165、約166、約167、約168、約169、約170、約171、約172、約173、約174、約175、約176、約177、約178、約179、約180、約181、約182、約183、約184、約185、約186、約187、約188、約189、約190、約191、約192、約193、約194、約195、約196、約197、約198、約199~約200℃で実施される。いくつかの実施形態において、ステップ(c)は約90℃で実施される。
いくつかの実施形態において、本開示の方法によって作製されるポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.5未満である。例えば、本開示のポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.01、約0.02、約0.03、約0.04、約0.05、約0.06、約0.07、約0.08、約0.09、約0.10、約0.11、約0.12、約0.13、約0.14、約0.15、約0.16、約0.17、約0.18、約0.19、約0.20、約0.21、約0.22、約0.23、約0.24、約0.25、約0.26、約0.27、約0.28、約0.29、約0.30、約0.31、約0.32、約0.33、約0.34、約0.35、約0.36、約0.37、約0.38、約0.39、約0.40、約0.41、約0.42、約0.43、約0.44、約0.45、約0.46、約0.47、約0.48~約0.49を範囲とする。いくつかの実施形態において、本開示の方法によって作製されるポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.2~約0.5である。
いくつかの実施形態において、本開示の方法によって作製されるポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.01、約0.02、約0.03、約0.04、約0.05、約0.06、約0.07、約0.08、約0.09、約0.10、約0.11、約0.12、約0.13、約0.14、約0.15、約0.16、約0.17、約0.18、約0.19、約0.20、約0.21、約0.22、約0.23、約0.24、約0.25、約0.26、約0.27、約0.28、約0.29、約0.30、約0.31、約0.32、約0.33、約0.34、約0.35、約0.36、約0.37、約0.38、約0.39、約0.40、約0.41、約0.42、約0.43、約0.44、約0.45、約0.46、約0.47、約0.48、または約0.49である。
いくつかの実施形態において、本開示の方法によって作製されるポリマーのPDIは、約1.01~約8.0である。例えば、PDIは、約1.01、約1.02、約1.03、約1.04、約1.05、約1.06、約1.07、約1.08、約1.09、約1.1、約1.2、約1.3、約1.4、約1.5、約1.6、約1.7、約1.8、約1.9、約2.0、約2.1、約2.2、約2.3、約2.4、約2.5、約2.6、約2.7、約2.8、約2.9、約3.0、約3.1、約3.2、約3.3、約3.4、約3.5、約3.6、約3.7、約3.8、約3.9、約4.0、約4.1、約4.2、約4.3、約4.4、約4.5、約4.6、約4.7、約4.8、約4.9、約5.0、約5.1、約5.2、約5.3、約5.4、約5.5、約5.6、約5.7、約5.8、約5.9、約6.0、約6.1、約6.2、約6.3、約6.4、約6.5、約6.6、約6.7、約6.8、約6.9、約7.0、約7.1、約7.2、約7.3、約7.4、約7.5、約7.6、約7.7、約7.8、約7.9~約8.0(これらの間の全ての範囲を含む)を範囲とすることができる。
いくつかの実施形態において、本開示の方法によって作製されるポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるPDIは、約1.01、約1.02、約1.03、約1.04、約1.05、約1.06、約1.07、約1.08、約1.09、約1.1、約1.2、約1.3、約1.4、約1.5、約1.6、約1.7、約1.8、約1.9、約2.0、約2.1、約2.2、約2.3、約2.4、約2.5、約2.6、約2.7、約2.8、約2.9、約3.0、約3.1、約3.2、約3.3、約3.4、約3.5、約3.6、約3.7、約3.8、約3.9、約4.0、約4.1、約4.2、約4.3、約4.4、約4.5、約4.6、約4.7、約4.8、約4.9、約5.0、約5.1、約5.2、約5.3、約5.4、約5.5、約5.6、約5.7、約5.8、約5.9、約6.0、約6.1、約6.2、約6.3、約6.4、約6.5、約6.6、約6.7、約6.8、約6.9、約7.0、約7.1、約7.2、約7.3、約7.4、約7.5、約7.6、約7.7、約7.8、約7.9、または約8.0である。いくつかの実施形態において、本開示のポリマーのPDIは約2.5である。いくつかの実施形態において、本開示のポリマーのPDIは約3.5である。いくつかの実施形態において、本開示のポリマーのPDIは約6.5である。いくつかの実施形態において、本開示のポリマーのPDIは約8.5である。
いくつかの実施形態において、本開示の方法によって作製されるポリマーのMは、少なくとも3kDaである。いくつかの実施形態において、本開示の方法によって作製されるポリマーのMは、約3kDa~約200kDaである。したがって、本開示のポリマーのMは、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9、約10、約11、約12、約13、約14、約15、約16、約17、約18、約19、約20、約21、約22、約23、約24、約25、約26、約27、約28、約29、約30、約31、約32、約33、約34、約35、約36、約37、約38、約39、約40、約41、約42、約43、約44、約45、約46、約47、約48、約49、約50、約51、約52、約53、約54、約55、約56、約57、約58、約59、約60、約61、約62、約63、約64、約65、約66、約67、約68、約69、約70、約71、約72、約73、約74、約75、約76、約77、約78、約79、約80、約81、約82、約83、約84、約85、約86、約87、約88、約89、約90、約91、約92、約93、約94、約95、約96、約97、約98、約99、約100、約101、約102、約103、約104、約105、約106、約107、約108、約109、約110、約111、約112、約113、約114、約115、約116、約117、約118、約119、約120、約121、約122、約123、約124、約125、約126、約127、約128、約129、約130、約131、約132、約133、約134、約135、約136、約137、約138、約139、約140、約141、約142、約143、約144、約145、約146、約147、約148、約149、約150、約151、約152、約153、約154、約155、約156、約157、約158、約159、約160、約161、約162、約163、約164、約165、約166、約167、約168、約169、約170、約171、約172、約173、約174、約175、約176、約177、約178、約179、約180、約181、約182、約183、約184、約185、約186、約187、約188、約189、約190、約191、約192、約193、約194、約195、約196、約197、約198、約199~約200kDaを範囲とする。いくつかの実施形態において、ポリマーのMは約5kDaから50kDaの間である。いくつかの実施形態において、ポリマーのMは約10kDaから50kDaの間である。
いくつかの実施形態において、本開示の方法によって作製されるポリマーのMは、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9、約10、約11、約12、約13、約14、約15、約16、約17、約18、約19、約20、約21、約22、約23、約24、約25、約26、約27、約28、約29、約30、約31、約32、約33、約34、約35、約36、約37、約38、約39、約40、約41、約42、約43、約44、約45、約46、約47、約48、約49、約50、約51、約52、約53、約54、約55、約56、約57、約58、約59、約60、約61、約62、約63、約64、約65、約66、約67、約68、約69、約70、約71、約72、約73、約74、約75、約76、約77、約78、約79、約80、約81、約82、約83、約84、約85、約86、約87、約88、約89、約90、約91、約92、約93、約94、約95、約96、約97、約98、約99、約100、約101、約102、約103、約104、約105、約106、約107、約108、約109、約110、約111、約112、約113、約114、約115、約116、約117、約118、約119、約120、約121、約122、約123、約124、約125、約126、約127、約128、約129、約130、約131、約132、約133、約134、約135、約136、約137、約138、約139、約140、約141、約142、約143、約144、約145、約146、約147、約148、約149、約150、約151、約152、約153、約154、約155、約156、約157、約158、約159、約160、約161、約162、約163、約164、約165、約166、約167、約168、約169、約170、約171、約172、約173、約174、約175、約176、約177、約178、約179、約180、約181、約182、約183、約184、約185、約186、約187、約188、約189、約190、約191、約192、約193、約194、約195、約196、約197、約198、約199~約200kDaである。いくつかの実施形態において、本開示の方法によって作製されるポリマーのMは、約5kDaから50kDaの間である。いくつかの実施形態において、本開示の方法によって作製されるポリマーのMは、約10kDaである。いくつかの実施形態において、本開示の方法によって作製されるポリマーのMは、約20kDaである。いくつかの実施形態において、本開示の方法によって作製されるポリマーのMは、約30kDaである。いくつかの実施形態において、本開示の方法によって作製されるポリマーのMは、約40kDaである。
いくつかの実施形態において、ステップ(b)の後の生成物のMは約3kDaである。
ポリプレックス
いくつかの実施形態において、本開示は、本明細書で説明される核酸成分と、本明細書で開示される分枝状ポリマーのいずれか、例えば、本明細書で説明されるプロセスによって作製されたポリマー、または式(I)のポリマー:
Figure 2022514113000095
とを含むポリプレックスであって、式中、
各Aが、独立的に、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、または3~30個の原子を含む複素環であり、
Aが、任意選択で、1つ以上のハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、またはC-C10アリールで置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
各Bが、独立的に、第1の結合部分であり、
各Xが、独立的に、
Figure 2022514113000096
であり、
各Yが、独立的に、
Figure 2022514113000097
であり、
各Lが、独立的に、第2の結合部分であり、
各R、R、及びRが、各出現において独立的に、H、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、もしくはヘテロアリールであり、当該ヘテロシクリル及びヘテロアリールが、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、当該C-Cアルキル、C-Cアルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-Cアルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールが、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、もしくは-N(C-Cアルキル)で置換され、または
及びRが、それらが結合する原子と一緒になって、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~3個のヘテロ原子を含むヘテロシクリルまたはヘテロアリールを形成してもよく、
aが1~1000であり、
bが1~4であり、
cが1~3であり、
zが1~100であり、
ただし、R及びRの少なくとも一方がHではないことを前提とする、ポリプレックスを提供する。
ある特定の実施形態において、ポリプレックスは、核酸成分と、式(II)のポリマー:
Figure 2022514113000098
とを含み、式中、
各Eが、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択され;
各Eが、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択され;
Gが、-C-、-S-、-S(O)-、-P(OR)-、または-P(OH)-であり、
nが少なくとも1である。
いくつかの実施形態において、各Bは、独立的に、
Figure 2022514113000099
ある。いくつかの実施形態において、各E及びEは、独立的に、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択される。いくつかの実施形態において、各Eはヘテロアルキレンである。いくつかの実施形態において、各Eは-CH-O-である。いくつかの実施形態において、各Eはアルキレンである。いくつかの実施形態において、各Eは、
Figure 2022514113000100
である。いくつかの実施形態において、各Eは、
Figure 2022514113000101
である。いくつかの実施形態において、各nは少なくとも1である。例えば、nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10とすることができる。いくつかの実施形態において、nは1である。いくつかの実施形態において、Gは-C-である。いくつかの実施形態において、各Bは、
Figure 2022514113000102
である。
いくつかの実施形態において、B及びAは化合して、
Figure 2022514113000103
を形成する。
いくつかの実施形態において、各Lは
Figure 2022514113000104
であり、式中、xは1~1000である。いくつかの実施形態において、aは少なくとも2であり、bは3であり、各Xは、
Figure 2022514113000105
である。いくつかの実施形態において、各Aは、
Figure 2022514113000106
である。いくつかの実施形態において、各Lは、
Figure 2022514113000107
である。
いくつかの実施形態において、Yは、
Figure 2022514113000108
である。
いくつかの実施形態において、各R及び/またはR
Figure 2022514113000109
である。
いくつかの実施形態において、各R
Figure 2022514113000110
である。
いくつかの実施形態において、ポリプレックスは、核酸成分と、式(III)~(VIIe)のポリマー:
Figure 2022514113000111
Figure 2022514113000112
Figure 2022514113000113
とを含み、式中、各R、R、及びRは、各出現において独立的に、H、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、もしくはヘテロアリールであり、当該ヘテロシクリル及びヘテロアリールは、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、当該C-Cアルキル、C-Cアルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-Cアルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールは、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、もしくは-N(C-Cアルキル)で置換され、残りの変数は上記で定義されている通りである。
いくつかの実施形態において、zは、1、2、または3である。いくつかの実施形態において、zは1である。
いくつかの実施形態において、ポリプレックスは、核酸成分と、
Figure 2022514113000114
を含むポリマーとを含み、式中、R、R、A、E、G、J、Q、Z、Z’’、及びnは、本明細書で示されるいずれかの定義を有する。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約3kDa~約200kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約50kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaから50kDaの間である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約15kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約20kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約30kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約40kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクから定義されるアルファパラメーターは、約0.5未満である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.3~約0.5を範囲とする。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約1.0~約8.0である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約2.5である。
いくつかの実施形態において、ポリプレックスは、核酸成分と、
Figure 2022514113000115
を含むポリマーとを含み、式中、R、R、A、E、G、J、Q、Z、及びnは、本明細書で示されるいずれかの定義を有する。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約3kDa~約200kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約50kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaから50kDaの間である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約15kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約20kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約30kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約40kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクから定義されるアルファパラメーターは、約0.5未満である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.3~約0.5を範囲とする。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約1.0~約8.0である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約2.5である。
いくつかの実施形態において、ポリプレックスは、核酸成分と、
Figure 2022514113000116
を含むポリマーとを含み、式中、R、R、A、E、G、J、Q、Z、Z’’、及びnは、本明細書で示されるいずれかの定義を有する。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約3kDa~約200kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約50kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaから50kDaの間である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約15kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約20kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約30kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約40kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクから定義されるアルファパラメーターは、約0.5未満である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.3~約0.5を範囲とする。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約1.0~約8.0である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約2.5である。
いくつかのさらなる実施形態において、ポリプレックスは、核酸成分と、
Figure 2022514113000117
を含むポリマーとを含む。
いくつかのさらなる実施形態において、ポリプレックスは、核酸成分と、
Figure 2022514113000118
を含むポリマーと含み、式中、
JはOであり、Zは
Figure 2022514113000119
であり、式中、xは1~1000である。
いくつかのさらなる実施形態において、ポリプレックスは、核酸成分と、
Figure 2022514113000120
を含むポリマーとを含む。
いくつかのさらなる実施形態において、ポリプレックスは、核酸成分と、R
Figure 2022514113000121
及び
Figure 2022514113000122
から選択されるポリマーとを含む。
いくつかのさらなる実施形態において、ポリプレックスは、核酸成分と、R
Figure 2022514113000123
であるポリマーとを含む。
いくつかのさらなる実施形態において、ポリプレックスは、核酸成分と、R
Figure 2022514113000124
であるポリマーとを含む。
いくつかのさらなる実施形態において、ポリプレックスは、核酸成分と、R
Figure 2022514113000125
及び
Figure 2022514113000126
から選択されるポリマーとを含む。
いくつかのさらなる実施形態において、ポリプレックスは、核酸成分と、R
Figure 2022514113000127
であるポリマーとを含む。
いくつかのさらなる実施形態において、ポリプレックスは、核酸成分と、R
Figure 2022514113000128
であるポリマーとを含む。
いくつかのさらなる実施形態において、ポリプレックスは、核酸成分と、R
Figure 2022514113000129
であり、R
Figure 2022514113000130
であるポリマーとを含む。
いくつかのさらなる実施形態において、ポリプレックスは、核酸成分と、R
Figure 2022514113000131
であり、R
Figure 2022514113000132
であるポリマーとを含む。
いくつかの実施形態において、ポリプレックスは、核酸成分と、
Figure 2022514113000133
を含むポリマーと含み、式中、

Figure 2022514113000134
であり、

Figure 2022514113000135
から選択される。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約3kDa~約200kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約50kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaから50kDaの間である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約15kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約20kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約30kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約40kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクから定義されるアルファパラメーターは、約0.5未満である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.3~約0.5を範囲とする。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約1.0~約8.0である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約2.5である。
いくつかの実施形態において、ポリプレックスは、核酸成分と、
Figure 2022514113000136
を含むポリマーとを含み、式中、
JはOであり、Zは
Figure 2022514113000137
であり、式中、xは1~1000であり、

Figure 2022514113000138
であり、

Figure 2022514113000139
である。
いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約3kDa~約200kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約50kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaから50kDaの間である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約5kDa~約15kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約10kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約20kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約30kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのMは約40kDaである。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクから定義されるアルファパラメーターは、約0.5未満である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターは、約0.3~約0.5を範囲とする。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約1.0~約8.0である。いくつかのさらなる実施形態において、ポリマーのPDIは約2.5である。
いくつかの実施形態において、ポリマー及び核酸成分は、約0.1:1~約200:1(w/w)の比で存在する。例えば、ポリマー及び核酸成分は、約0.1:1、約0.2:1、約0.3:1、約0.4:1、約0.5:1、約0.6:1、約0.7:1、約0.8:1、約0.9:1、約1:1、約2:1、約3:1、約4:1、約5:1、約6:1、約7:1、約8:1、約9:1、約10:1、約11:1、約12:1、約13:1、約14:1、約15:1、約16:1、約17:1、約18:1、約19:1、約20:1、約21:1、約22:1、約23:1、約24:1、約25:1、約26:1、約27:1、約28:1、約29:1、約30:1、約31:1、約32:1、約33:1、約34:1、約35:1、約36:1、約37:1、約38:1、約39:1、約40:1、約41:1、約42:1、約43:1、約44:1、約45:1、約46:1、約47:1、約48:1、約49:1、約50:1、約51:1、約52:1、約53:1、約54:1、約55:1、約56:1、約57:1、約58:1、約59:1、約60:1、約61:1、約62:1、約63:1、約64:1、約65:1、約66:1、約67:1、約68:1、約69:1、約70:1、約71:1、約72:1、約73:1、約74:1、約75:1、約76:1、約77:1、約78:1、約79:1、約80:1、約81:1、約82:1、約83:1、約84:1、約85:1、約86:1、約87:1、約88:1、約89:1、約90:1、約91:1、約92:1、約93:1、約94:1、約95:1、約96:1、約97:1、約98:1、約99:1、約100:1、約101:1、約102:1、約103:1、約104:1、約105:1、約106:1、約107:1、約108:1、約109:1、約110:1、約111:1、約112:1、約113:1、約114:1、約115:1、約116:1、約117:1、約118:1、約119:1、約120:1、約121:1、約122:1、約123:1、約124:1、約125:1、約126:1、約127:1、約128:1、約129:1、約130:1、約131:1、約132:1、約133:1、約134:1、約135:1、約136:1、約137:1、約138:1、約139:1、約140:1、約141:1、約142:1、約143:1、約144:1、約145:1、約146:1、約147:1、約148:1、約149:1、約150:1、約151:1、約152:1、約153:1、約154:1、約155:1、約156:1、約157:1、約158:1、約159:1、約160:1、約161:1、約162:1、約163:1、約164:1、約165:1、約166:1、約167:1、約168:1、約169:1、約170:1、約171:1、約172:1、約173:1、約174:1、約175:1、約176:1、約177:1、約178:1、約179:1、約180:1、約181:1、約182:1、約183:1、約184:1、約185:1、約186:1、約187:1、約188:1、約189:1、約190:1、約191:1、約192:1、約193:1、約194:1、約195:1、約196:1、約197:1、約198:1、約199:1~約200:1(これらの間の全ての範囲を含む)を範囲とする比で存在する。いくつかの実施形態において、ポリマー及び核酸成分は、約20:1~約80:1(w/w)の比で存在する。
いくつかの実施形態において、ポリマー及び核酸成分は、約0.1:1、約0.2:1、約0.3:1、約0.4:1、約0.5:1、約0.6:1、約0.7:1、約0.8:1、約0.9:1、約1:1、約2:1、約3:1、約4:1、約5:1、約6:1、約7:1、約8:1、約9:1、約10:1、約11:1、約12:1、約13:1、約14:1、約15:1、約16:1、約17:1、約18:1、約19:1、約20:1、約21:1、約22:1、約23:1、約24:1、約25:1、約26:1、約27:1、約28:1、約29:1、約30:1、約31:1、約32:1、約33:1、約34:1、約35:1、約36:1、約37:1、約38:1、約39:1、約40:1、約41:1、約42:1、約43:1、約44:1、約45:1、約46:1、約47:1、約48:1、約49:1、約50:1、約51:1、約52:1、約53:1、約54:1、約55:1、約56:1、約57:1、約58:1、約59:1、約60:1、約61:1、約62:1、約63:1、約64:1、約65:1、約66:1、約67:1、約68:1、約69:1、約70:1、約71:1、約72:1、約73:1、約74:1、約75:1、約76:1、約77:1、約78:1、約79:1、約80:1、約81:1、約82:1、約83:1、約84:1、約85:1、約86:1、約87:1、約88:1、約89:1、約90:1、約91:1、約92:1、約93:1、約94:1、約95:1、約96:1、約97:1、約98:1、約99:1、約100:1、約101:1、約102:1、約103:1、約104:1、約105:1、約106:1、約107:1、約108:1、約109:1、約110:1、約111:1、約112:1、約113:1、約114:1、約115:1、約116:1、約117:1、約118:1、約119:1、約120:1、約121:1、約122:1、約123:1、約124:1、約125:1、約126:1、約127:1、約128:1、約129:1、約130:1、約131:1、約132:1、約133:1、約134:1、約135:1、約136:1、約137:1、約138:1、約139:1、約140:1、約141:1、約142:1、約143:1、約144:1、約145:1、約146:1、約147:1、約148:1、約149:1、約150:1、約151:1、約152:1、約153:1、約154:1、約155:1、約156:1、約157:1、約158:1、約159:1、約160:1、約161:1、約162:1、約163:1、約164:1、約165:1、約166:1、約167:1、約168:1、約169:1、約170:1、約171:1、約172:1、約173:1、約174:1、約175:1、約176:1、約177:1、約178:1、約179:1、約180:1、約181:1、約182:1、約183:1、約184:1、約185:1、約186:1、約187:1、約188:1、約189:1、約190:1、約191:1、約192:1、約193:1、約194:1、約195:1、約196:1、約197:1、約198:1、約199:1、または約200:1の比で存在する。いくつかの実施形態において、ポリマー及び核酸成分は、約30:1(w/w)の比で存在する。
いくつかの実施形態において、粒子サイズは2μm未満である。いくつかの実施形態において、ポリプレックスの粒子サイズは、約300nm未満である。例えば、ポリプレックスの粒子サイズは、約50、51、約52、約53、約54、約55、約56、約57、約58、約59、約60、約61、約62、約63、約64、約65、約66、約67、約68、約69、約70、約71、約72、約73、約74、約75、約76、約77、約78、約79、約80、約81、約82、約83、約84、約85、約86、約87、約88、約89、約90、約91、約92、約93、約94、約95、約96、約97、約98、約99、約100、約101、約102、約103、約104、約105、約106、約107、約108、約109、約110、約111、約112、約113、約114、約115、約116、約117、約118、約119、約120、約121、約122、約123、約124、約125、約126、約127、約128、約129、約130、約131、約132、約133、約134、約135、約136、約137、約138、約139、約140、約141、約142、約143、約144、約145、約146、約147、約148、約149、約150、約151、約152、約153、約154、約155、約156、約157、約158、約159、約160、約161、約162、約163、約164、約165、約166、約167、約168、約169、約170、約171、約172、約173、約174、約175、約176、約177、約178、約179、約180、約181、約182、約183、約184、約185、約186、約187、約188、約189、約190、約191、約192、約193、約194、約195、約196、約197、約198、約199、約200、約201、約202、約203、約204、約205、約206、約207、約208、約209、約210、約211、約212、約213、約214、約215、約216、約217、約218、約219、約220、約221、約222、約223、約224、約225、約226、約227、約228、約229、約230、約231、約232、約233、約234、約235、約236、約237、約238、約239、約240、約241、約242、約243、約244、約245、約246、約247、約248、約249、約250、約251、約252、約253、約254、約255、約256、約257、約258、約259、約260、約261、約262、約263、約264、約265、約266、約267、約268、約269、約270、約271、約272、約273、約274、約275、約276、約277、約278、約279、約280、約281、約282、約283、約284、約285、約286、約287、約288、約289、約290、約291、約292、約293、約294、約295、約296、約297、約298、約299、または約300nmとすることができる。いくつかの実施形態において、本開示のポリプレックスの粒子サイズは約60nm~約250nmである。いくつかの実施形態において、本開示のポリプレックスの粒子サイズは約175nm~約250nmである。
いくつかの実施形態において、本開示のポリプレックスのゼータ電位は約0mV~約100mVである。例えば、本開示のポリプレックスは、約0、約1、約2、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9、約10、約11、約12、約13、約14、約15、約16、約17、約18、約19、約20、約21、約22、約23、約24、約25、約26、約27、約28、約29、約30、約31、約32、約33、約34、約35、約36、約37、約38、約39、約40、約41、約42、約43、約44、約45、約46、約47、約48、約49、約50、約51、約52、約53、約54、約55、約56、約57、約58、約59、約60、約61、約62、約63、約64、約65、約66、約67、約68、約69、約70、約71、約72、約73、約74、約75、約76、約77、約78、約78、約79、約80、約81、約82、約83、約84、約85、約86、約87、約88、約89、約90、約91、約92、約93、約94、約95、約96、約97、約98、約99~約100mVを範囲とすることができる。いくつかの実施形態において、ゼータ電位は約30mV~約34mVである。
いくつかの実施形態において、本開示のポリプレックスのゼータ電位は、約0、約1、約2、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9、約10、約11、約12、約13、約14、約15、約16、約17、約18、約19、約20、約21、約22、約23、約24、約25、約26、約27、約28、約29、約30、約31、約32、約33、約34、約35、約36、約37、約38、約39、約40、約41、約42、約43、約44、約45、約46、約47、約48、約49、約50、約51、約52、約53、約54、約55、約56、約57、約58、約59、約60、約61、約62、約63、約64、約65、約66、約67、約68、約69、約70、約71、約72、約73、約74、約75、約76、約77、約78、約78、約79、約80、約81、約82、約83、約84、約85、約86、約87、約88、約89、約90、約91、約92、約93、約94、約95、約96、約97、約98、約99、または約100mVである。
いくつかの実施形態において、ポリプレックスの核酸成分は、プラスミド、ナノプラスミド、核酸、ミニサークル、または遺伝子編集システムである。いくつかの実施形態において、ポリプレックスの核酸成分はプラスミドである。いくつかの実施形態において、ポリプレックスの核酸成分はナノプラスミドである。いくつかの実施形態において、ナノプラスミドは、真核導入遺伝子及び0.5kb未満のサイズの細菌骨格を含む。いくつかの実施形態において、プラスミドまたはナノプラスミドは、抗生物質耐性マーカーなしのプラスミドまたは抗生物質耐性マーカーなしのナノプラスミドである。いくつかの実施形態において、プラスミドまたはナノプラスミドは、スクロース選択マーカーまたはナンセンスサプレッサーマーカーを含む。
いくつかの実施形態において、ポリプレックスの核酸成分は遺伝子編集システムである。いくつかの実施形態において、遺伝子編集システムは、(i)クラスター化等間隔短回文リピート(CRISPR)関連(Cas)システム、(ii)転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN)システム、または(iii)ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)システムである。
いくつかの実施形態において、核酸はRNAi誘導分子である。RNAi誘導分子は、siRNA、dsRNA、shRNA、及びマイクロRNAからなる群より選択され得る。
いくつかの実施形態において、核酸成分は組織特異的プロモーターを含む。
いくつかの実施形態において、核酸成分は、遺伝子疾患または障害に関連する遺伝子を含む。遺伝子疾患または障害は、タンパク質発現の低下、不在、または機能不全をもたらす1つ以上の遺伝子の変異によって引き起こされ得る。遺伝子は、COL7A1、LAMB3、ADA、SERPINA1、CFTR、HTT、NF1、PHA、HBS、FERMT1、KRT14、DSP、SPINK5、及びFLGからなる群より選択される。いくつかの実施形態において、遺伝子はCOL7A1であり、遺伝子疾患または障害は表皮水疱症の形態である。表皮水疱症には、栄養障害型表皮水疱症(常染色体劣性)、栄養障害型表皮水疱症(限局型バリアント)、痒疹型表皮水疱症、表皮水疱症(前脛骨型)、単純型表皮水疱症(Dowling-Meara型)、単純型表皮水疱症(Koebner型)、単純型表皮水疱症(劣性1)、単純型表皮水疱症(Weber-Cockayne型)、表皮水疱症(致死性棘融解型症)が含まれる。いくつかの実施形態において、遺伝子障害または遺伝子疾患は、アデノシンデアミナーゼ(ADA)欠損症、アルファ-1アンチトリプシン欠損症、嚢胞性線維症、ハンチントン病、1型神経線維腫症、フェニルケトン尿症、鎌状赤血球症、孤発性封入体筋炎、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、キンドラー症候群、接合部型表皮水疱症、網状色素性皮膚症、Naegeli-Franceschetti-Jadassohn症候群、ネザートン症候群、尋常性魚鱗癬、アトピー性皮膚炎、アッシャー症候群、Ehlers-Danlos症候群、ホモ接合性家族性高コレステロール血症(HoFH)、またはクローン病である。
いくつかの実施形態において、遺伝子の配列は、ポリプレックスを細胞に送達した際にタンパク質発現が最大限になるように最適化されている。
医薬組成物
いくつかの実施形態において、本開示は、本開示のある特定の実施形態に従う1つ以上のポリプレックスの有効量と、医薬的に許容される担体との組合せを含む、医薬組成物を提供する。
いくつかの実施形態において、本開示は、本明細書で説明される1つ以上のポリプレックスの有効量と、医薬的に許容される賦形剤との組合せを含む、医薬組成物を提供する。いくつかの実施形態において、医薬的に許容される賦形剤は、1つ以上の増量剤、緩衝剤、張性剤、及び凍結保護物質からなる群より選択される。いくつかの実施形態において、増量剤は、ヒドロキシエチルデンプン、トレハロース、マンニトール、ラクトース、及びグリシンからなる群より選択される。いくつかの実施形態において、緩衝剤は、リン酸バッファー、トリスHClバッファー、クエン酸バッファー、及びヒスチジンからなる群より選択される。いくつかの実施形態において、張性剤は、マンニトール、スクロース、グリシン、グリセロール、及び塩化ナトリウムからなる群より選択される。
いくつかの実施形態において、本開示は、本明細書で説明される1つ以上のポリプレックスの有効量と、凍結保護物質との組合せを含む、医薬組成物を提供する。いくつかの実施形態において、凍結保護物質は、グルコース、スクロース、トレハロース、ラクトース、マンニトール、ソルビトール、アエロジル(コロイド状二酸化ケイ素)、マルトース、ポリ(ビニルピロリドン)、フルクトース、デキストラン、グリセロール、ポリ(ビニルアルコール)、グリシン、ヒドロキシプロピル-β-シクロデキストリン、及びゼラチンからなる群より選択される。ある特定の実施形態において、凍結保護物質は、トレハロース、スクロース、グルコース、及びマンニトールからなる群より選択される。いくつかの実施形態において、凍結保護物質はスクロースである。
いくつかの実施形態において、医薬的に許容される担体は、経口、非経口、吸入、局所、皮下、筋肉内、静脈内、眼内、または皮内の投与に適している。いくつかの実施形態において、医薬組成物は、非水性ローション、油中水型ローション、及び水中油型ローションからなる群より選択されるローションとして製剤化される。いくつかの実施形態において、医薬組成物は、将来使用するために凍結乾燥される。いくつかの実施形態において、医薬組成物は水溶液中で凍結される。
いくつかの実施形態において、医薬組成物は凍結乾燥物質である。いくつかの実施形態において、凍結乾燥物質は、本明細書で説明される1つ以上のポリプレックスの有効量と、医薬的に許容される賦形剤との組合せを含む。ある特定の実施形態において、医薬的に許容される賦形剤は、凍結保護物質を含む。ある特定の実施形態において、凍結保護物質は、トレハロース、スクロース、グルコース、及びマンニトールからなる群より選択される。いくつかの実施形態において、凍結保護物質はスクロースである。
いくつかの実施形態において、本開示は、本明細書で説明される1つ以上のポリプレックスの有効量と、医薬的に許容される担体との組合せを含む、医薬組成物を作製する方法を提供する。いくつかの実施形態において、当該方法は、本明細書で説明される1つ以上のポリプレックスを好適な溶媒と組み合わせることを含む。いくつかの実施形態において、好適な溶媒は、水、ジメチルスルホキシド、及びこれらの混合物からなる群から選択される。ある特定の実施形態において、好適な溶媒は水を含む。
いくつかの実施形態において、当該方法は、
(a)本明細書で説明される1つ以上のポリプレックスを好適な溶媒と組み合わせることと、
(b)1つ以上の医薬的に許容される賦形剤をステップ(a)の混合物に添加することと、
(c)ステップ(b)の混合物を凍結乾燥して、凍結乾燥物を得ることとを含む。
いくつかの実施形態において、ステップ(b)の1つ以上の医薬的に許容される賦形剤は、凍結保護物質を含む。ある特定の実施形態において、凍結保護物質の濃度は、ステップ(b)の混合物の約1重量%~約20重量%であり、これには約2重量%、約3重量%、約4重量%、約5重量%、約6重量%、約7重量%、約8重量%、約9重量%、約10重量%、約11重量%、約12重量%、約13重量%、約14重量%、約15重量%、約16重量%、約17重量%、約18重量%、及び約19重量%(これらの間の全ての範囲を含む)が含まれる。ある特定の実施形態において、凍結保護物質の濃度は、ステップ(b)の混合物の約1重量%、約2重量%、約3重量%、約4重量%、約5重量%、約6重量%、約7重量%、約8重量%、約9重量%、約10重量%、約11重量%、約12重量%、約13重量%、約14重量%、約15重量%、約16重量%、約17重量%、約18重量%、約19重量%、または約20重量%である。特定の実施形態において、凍結保護物質の濃度は、ステップ(b)の混合物の約1重量%である。特定の実施形態において、凍結保護物質の濃度は、ステップ(b)の混合物の約3重量%である。特定の実施形態において、凍結保護物質の濃度は、ステップ(b)の混合物の約5重量%である。
いくつかの実施形態において、本開示は、本明細書で説明される方法に従って調製される医薬組成物を提供する。
いくつかの実施形態において、本開示は、下記:
(a)本明細書で説明される1つ以上のポリプレックスを好適な溶媒と組み合わせることと、
(b)1つ以上の医薬的に許容される賦形剤をステップ(a)の混合物に添加することと、
(c)ステップ(b)の混合物を凍結乾燥して、凍結乾燥物を得ることとを含む方法によって調製される、医薬組成物を提供する。
いくつかの実施形態において、ステップ(b)の1つ以上の医薬的に許容される賦形剤は、凍結保護物質を含む。ある特定の実施形態において、凍結保護物質の濃度は、ステップ(b)の混合物の約1重量%~約20重量%であり、これには約2重量%、約3重量%、約4重量%、約5重量%、約6重量%、約7重量%、約8重量%、約9重量%、約10重量%、約11重量%、約12重量%、約13重量%、約14重量%、約15重量%、約16重量%、約17重量%、約18重量%、及び約19重量%(これらの間の全ての範囲を含む)が含まれる。ある特定の実施形態において、凍結保護物質の濃度は、ステップ(b)の混合物の約1重量%、約2重量%、約3重量%、約4重量%、約5重量%、約6重量%、約7重量%、約8重量%、約9重量%、約10重量%、約11重量%、約12重量%、約13重量%、約14重量%、約15重量%、約16重量%、約17重量%、約18重量%、約19重量%、または約20重量%である。特定の実施形態において、凍結保護物質の濃度は、ステップ(b)の混合物の約1重量%である。特定の実施形態において、凍結保護物質の濃度は、ステップ(b)の混合物の約3重量%である。特定の実施形態において、凍結保護物質の濃度は、ステップ(b)の混合物の約5重量%である。
細胞形質移入の方法
いくつかの実施形態において、本開示は、細胞形質移入の方法であって、標的細胞にポリプレックスを形質移入するのに適した条件下で、1つ以上の標的細胞を、本開示のある特定の実施形態に従う医薬組成物に接触させることを含む、方法を提供する。いくつかの実施形態において、1つ以上の標的細胞は真核細胞である。いくつかの実施形態において、1つ以上の標的細胞は、T細胞、B細胞、血球、肺胞細胞、肺細胞、脳ニューロン、皮膚ニューロン、上皮細胞、ケラチノサイト、iPS細胞、線維芽細胞、及び汗腺細胞のうちの1つ以上である。
治療方法
いくつかの実施形態において、本開示は、疾患の治療を必要とする患者における当該疾患を治療する方法であって、患者の細胞のうちの1つ以上にポリプレックス核酸成分が形質移入されるように、本開示のある特定の実施形態に従う医薬組成物の治療有効量を投与することを含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態において、本開示は、疾患の治療を必要とする患者における当該疾患を治療する方法であって、本開示のある特定の実施形態に従う医薬組成物の治療有効量を投与することを含み、当該組成物の投与が、対象における標的遺伝子の不完全な翻訳を補正する、方法を提供する。
いくつかの実施形態において、遺伝子は、COL7A1、LAMB3、ADA、SERPINA1、CFTR、HTT、NF1、PHA、HBS、FERMT1、KRT14、DSP、SPINK5、及びFLGからなる群より選択される。いくつかの実施形態において、遺伝子はCOL7A1であり、遺伝子疾患または障害は表皮水疱症の形態である。表皮水疱症には、栄養障害型表皮水疱症(常染色体劣性)、栄養障害型表皮水疱症(限局型バリアント)、痒疹型表皮水疱症、表皮水疱症(前脛骨型)、単純型表皮水疱症(Dowling-Meara型)、単純型表皮水疱症(Koebner型)、単純型表皮水疱症(劣性1)、単純型表皮水疱症(Weber-Cockayne型)、表皮水疱症(致死性棘融解型症)が含まれる。いくつかの実施形態において、遺伝子障害または遺伝子疾患は、アデノシンデアミナーゼ(ADA)欠損症、アルファ-1アンチトリプシン欠損症、嚢胞性線維症、ハンチントン病、1型神経線維腫症、フェニルケトン尿症、鎌状赤血球症、孤発性封入体筋炎、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、キンドラー症候群、接合部型表皮水疱症、網状色素性皮膚症、Naegeli-Franceschetti-Jadassohn症候群、ネザートン症候群、尋常性魚鱗癬、アトピー性皮膚炎、アッシャー症候群、Ehlers-Danlos症候群、ホモ接合性家族性高コレステロール血症(HoFH)、またはクローン病である。
以下の実施例は、本開示を例示するために提供されるものであり、これらを限定するものとして解釈されるべきではない。これらの実施例において、別段の記載がない限り、全ての部及びパーセンテージは、重量によるものである。実施例中の略語を以下に示す。
実施例1:直鎖状オリゴマーの組合せによって調製するLBPAE
線維芽細胞遺伝子送達は、まだ治療用途向けに必要な効率を示していない。本明細書で説明されるように、この限界を克服するため、新規の直鎖状オリゴマー組合せ戦略により、本開示のある特定の実施形態に従う新規の多機能LBPAE遺伝子送達材料を調製した。本開示のある特定の実施形態に従うLBPAEは、形質移入困難な線維芽細胞HPDF及び一般的に使用されている3T3において優れた形質移入効率及び細胞毒性低減を達成し、市販の試薬の分枝状PEI及びSuperFectを実質的に上回る性能を示す。LBPAEポリプレックスの高いLC50値は、線維芽細胞形質移入における好ましい生体適合性を実証するものである。機序研究からは、十分な量の1級、2級、及び3級アミンを備えたLBPAEが、均一な球状形態を有するナノサイズの粒子にDNAを凝縮し、細胞取込みを促進し、効率的なエンドソーム脱出を満たすための強力な緩衝能力を媒介することができることが示されている。LBPAE上のエステル結合を加水分解することで、DNA放出が促進され、生体適合性が著しく高まり、ポリマー/DNA w/w比の柔軟な設計及び調製が可能になる。レポーター遺伝子送達におけるLBPAEの高い性能と共に、LBPAEは、ミニサークルCOL7A1遺伝子をHPDFに効率的に送達し、皮膚の完全性を維持するために重要なC7の発現を顕著に改善することができる。これらの結果は、LBPAEが、線維芽細胞ベースの遺伝子送達において高性能の非ウイルスベクターであることを実証し、遺伝性皮膚疾患治療及び再生医療において非常に大きな可能性を秘めていることを強調するものである。
直鎖状オリゴマーが連続的に成長及び分岐することで、得られるLBPAEの直鎖状セグメント及び分岐単位の分布がより均一なものになる。驚くべきことに、形質移入が困難なHPDF及び一般的に使用されているマウス胚線維芽細胞(3T3)において、新規に開発されたLBPAEは、ロバストな遺伝子形質移入能力を示し、Gルシフェラーゼ(Gluc)発現は、市販の遺伝子形質移入試薬PEI及びSuperFectを最大3桁上回り、明らかな細胞毒性を誘導することなくほぼ100%の緑色蛍光タンパク質(GFP)発現を達成した。線維芽細胞におけるLBPAEの極めて強力な遺伝子形質移入能力の背後に考えられる機構を読み解くため、遺伝子形質移入プロセスに関連する複数の細胞外及び細胞内バリアについて検討した。結果からは、LBPAEが強力なDNA結合親和性を示し、DNAを凝縮してナノサイズのポリプレックスをほぼ100%の細胞取込み効率で製剤化できることが示されている。LBPAEの強力なプロトン緩衝能及び生分解性は、LBPAE/DNAポリプレックスのエンド/リソソーム脱出及び細胞質内のDNA放出も促進すると考えられる。さらに、LBPAEを使用して、COL7A1遺伝子(MCC7)をコードするミニサークルプラスミドをHPDFに送達し、C7発現の顕著な上方制御が検出された。これは、LBPAEがC7欠損性遺伝性皮膚疾患(例えば、破壊的で衰弱性の遺伝性皮膚障害RDEB)の治療向けに非常に有望であることを示すものである。
この実施例は、LBPAEを合成するための直鎖状オリゴマーの組合せ戦略を説明する。図8に示すように、この戦略は、2つの連続したステップ:直鎖状オリゴマーの形成及び分岐を伴う。第1のステップでは、A2型アミンは、C2型ジアクリレートと反応してアクリレート末端塩基オリゴマーを形成し、直鎖状A2-C2塩基オリゴマーを形成し、これがさらに、第2のアミンによってエンドキャップされる。精製して未反応モノマー及び過剰なエンドキャップ剤を除去した後、直鎖状A2-C2オリゴマーが形成される。第2のステップでは、B3型トリアクリレートを導入して直鎖状A2-C2オリゴマーを合わせ、LBPAEを得る。LBPAEの利点は2つあり、1)得られるLBPAEの直線セグメントの長さを予め決めるため、容易に調整することができること、及び2)LBPAEの分岐単位は直線セグメント間でより均一に分布することである。
この仮説を検証するため、5-アミノ-1-ペンタノール(AP)、トリメチロールプロパントリアクリレート(TMPTA)、1,4-ブタンジオールジアクリレート(BDA)、及び1,11-ジアミノ-3,6,9-トリオキサウンデカン(DATOU)を、それぞれLBPAE合成のA2、B3、C2型モノマー及びエンドキャップ剤として使用した。ジメチルスルホキシド(DMSO)中で化学量論比1.2:1のAP及びBDAを90℃で反応させ、重量平均分子量(M)をゲル浸透クロマトグラフィー(GPC)で測定した。24時間後、反応混合物のMが3000Daに近づいたら、室温まで冷却することにより反応を停止し、DMSOで希釈し、次いで過剰なDATOUを添加してアクリレート末端塩基オリゴマーを25℃で48時間エンドキャップした。アセトン中で未反応モノマー、エンドキャップ剤をM<3000Daのオリゴマーと共に透析によって除去した後、およそ3500DaのM及び多分散指数(PDI)1.69を有する直鎖状A2-C2オリゴマーを得た(図10)。LBPAEを生成するため、直鎖状A2-C2オリゴマー及びTMPTAをDMSOに溶解し(A2-C2:TMPTAのモル比を3:1に設定)、90℃で反応させた。Mがおよそ10kDaのときに反応を停止し、過剰なDATOUを組み込んで、全ての未反応のビニル基を消費した。次いで、ポリマーをジエチルエーテル中に沈殿させ、真空オーブン中で乾燥させて、最終LBPAE生成物を得た。GPC測定により、LBPAEがM 9.4kDa及びPDI 2.5を有することが示されている(図19)。マーク-フウィンク(MH)プロットアルファ値0.36は、高度に分岐した構造を確認するものである(図10)。LBPAEの化学組成をH-NMRによって確認した(図11)。
実施例2:LBPAEは、線維芽細胞において強力な遺伝子形質移入効率及び優れた細胞生存率を達成する
有力な遺伝子送達ベクターは、高い遺伝子形質移入効率を達成するだけでなく、最小の細胞毒性も誘導することができる。それにもかかわらず、実際には、遺伝子ベクターの形質移入効率を改善すると、通常はその生体適合性が犠牲になり、その逆も生じる。合成したLBPAEの遺伝子形質移入能力を評価し、線維芽細胞形質移入のための最も最適なパラメーターを同定するため、異なるw/w比を有する一連のLBPAE/DNAポリプレックスを、最初にHPDF及び3T3の形質移入に関して評価した。レポーター遺伝子としてGluc DNAを使用し、形質移入後のGluc活性測定値によって遺伝子形質移入効率を定量化した。アラマーブルーアッセイ及び致死濃度50(LC50)評価を使用して、形質移入後の線維芽細胞の細胞毒性及び毒性学的プロファイルを測定した。次いで、GFP DNAをレポーター遺伝子として用いたフローサイトメトリーにより、LBPAEの形質移入効力をさらに検証した。
LBPAEによる形質移入後の線維芽細胞のGluc発現及び細胞生存率
カチオン性ポリマーベース遺伝子送達ベクターに関しては、ポリマー/DNA重量比(w/w)は、形質移入効率及び細胞毒性の両方を定量するための有用なパラメーターである[5、11]。そのため、本発明者らは、最初にw/w比を系統的に最適化した。初代細胞(例えば、HPDF)が通常カチオンポリマーに対し脆弱であることを考慮して、HPDF形質移入に使用するLBPAE/DNA w/w比を10:1から50:1まで徐々に増加させた。比較のための強力なベンチマークを設定するため、2つの市販の樹状遺伝子形質移入試薬PEI及びSuperFectに使用するw/w比についても、製造業者のプロトコル及び以前の刊行物に従って最適化した[6、13]。図1aは、形質移入後のHPDFのGluc活性及び細胞生存率の概要を示したものである。PEI及びSuperFect遺伝子形質移入の最適w/w比がそれぞれ1:1及び3:1であることが明確に示されている。w/w比をさらに増大させると、Gluc活性が明らかに低下するだけでなく、細胞毒性も実質的に増大する。例えば、w/w比が3:1の場合と比較して、w/w比が9:1の場合、SuperFect/DNAポリプレックスによる形質移入後のHPDFのGluc活性は3.4倍低く、細胞生存率は89%超から44%未満に減少した。これとは全く対照的に、LBPAE/DNAポリプレックスによる形質移入後のHPDFのGluc発現は、試験したw/w比の範囲において、w/w比が最も低い10:1であっても、最適w/w比のPEI/DNAポリプレックス及びSuperFect/DNAポリプレックスによって媒介される発現よりも依然として強力である。特に、w/w比40:1でLBPAE/DNAポリプレックスによって形質移入されたHPDFのGluc活性は、PEI/DNAポリプレックスによって媒介されるものよりも最大103倍高い。重要なことには、LBPAEは明らかな細胞毒性を誘導しなかった。最も高いw/w比50:1であっても、95%超の細胞生存率が依然として保持された。3T3では、PEI/DNAポリプレックスは、HPDFの場合と同様の傾向を遺伝子形質移入効率及び細胞毒性で示した。6:1及び9:1のw/w比において、SuperFect/DNAポリプレックスはより高い遺伝子形質移入効率を示すが、62%及び49%の細胞生存率を保持するに過ぎない(図1b)。この場合も、全ての試験w/w比において、LBPAE/DNAポリプレックスは、強力な遺伝子形質移入能力及び高い細胞生存率の両方を示している。LBPAE/DNAポリプレックスによる形質移入後の3T3のGluc活性は、PEI/DNA及びSuperFect/DNAポリプレックスがその最適w/w比で媒介するものよりも桁違いに高い。驚くべきことに、w/w比70:1において、LBPAE/DNAポリプレックスは、PEI/DNAポリプレックスに比べて最大3292倍高いGluc活性を媒介したが、依然として90%超の細胞生存率を維持した。群間で同じ量のDNAが使用されたことに留意されたい。LBPAE/DNAポリプレックスに用いられた非常に高いw/w比は、PEIまたはSuperFectのいずれよりも顕著に多くのLBPAEが使用されたことを意味する。このことはさらに、LBPAEの優れた生体適合性を実証するものである。
LBPAEの毒性学的プロファイル
遺伝子形質移入のために2500超の候補が開発されスクリーニングされているが[28]、これまでのところ、線維芽細胞においてはいずれのPAEポリマーも毒性学的研究が行われていない。遺伝子形質移入におけるLBPAEの生体適合性をさらに検証するため、LBPAEの毒性学的プロファイルを決定し、LC50値を計算した。この目的のため、同じw/w比40:1を有するBPAE/DNAポリプレックスを使用して、ポリプレックス濃度を355μg mL-1から755μg mL-1に増加させてHPDF及び3T3に形質移入した。比較のため、SuperFect/DNAポリプレックスを使用し、濃度を15μg mL-1から55μg mL-1まで増加させた。形質移入から24時間後、細胞を緑色蛍光カルセイン-AM(C-AM、生細胞用)及び赤色蛍光エチジウムホモ2量体-1(EthD-1、死細胞用)で同時に染色した。未処置細胞ならびに555μg/mL-1の濃度のLBPAE/DNAポリプレックス及び35μg/mL-1の濃度のSuperFect/DNAポリプレックスで処置した細胞の代表的な蛍光画像を図2aに示す。LBPAE/DNAポリプレックスで処置したHPDF及び3T3が、1桁高い濃度にもかかわらず、SuperFect/DNAポリプレックスで処置したものと同様の細胞生存率を示したことが分かる。ポリプレックス濃度依存的細胞生存率をアラマーブルーアッセイで定量し、結果を図2b及び図2cに示す。そこから、HPDF及び3T3におけるSuperFect/DNAポリプレックスのLC50値が、それぞれ35.2μg mL-1及び39.5μg mL-1と計算される。これに対し、LBPAE/DNAポリプレックスのLC50値は538.4μg mL-1及び552.3μg mL-1であり、SuperFect/DNAカウンターパートに比べて14倍及び13倍の増加に対応する。SuperFectは、突出した生物適合性のために遺伝子形質移入に広く使用されてきた。[29、30]非常に低い細胞殺傷作用を示すLBPAEは、極めて高い生物適合性が実証されている。これは、特に、形質移入が困難な細胞型にとっては、形質移入効率を強化するのにかなり高用量のポリプレックスまたは複数の反復的な形質移入を使用することができるため、遺伝子形質移入において非常に重要なことである。
フローサイトメトリーで定量化したGFP発現
Gluc DNAを使用して、LBPAEによって媒介される全体的な導入遺伝子発現レベルを定量化し、さらにGFP DNAを使用して、形質移入された細胞のパーセンテージを定量化した。HPDF及び3T3に、上記と同じw/w比のLBPAE/DNAポリプレックスを形質移入した。図3aに示す蛍光画像によって証明されるように、全てのw/w比において、最適w/w比のPEI/DNA及びSuperFect/DNAのカウンターパートによるものよりもはるかに多くのHPDFがLBPAE/DNAポリプレックスによって形質移入された。フローサイトメトリー測定値からは、PEI/DNA及びSuperFect/DNAポリプレックスによって達成されるGFP陽性HPDFのパーセンテージが、それぞれ50%及び44%に過ぎないことが示されている。これに対し、LBPAE/DNAポリプレックスは、ヒストグラム分布内のGFPスペクトルチャネルに応答する細胞集団の離れたシフトによって反映されているように、はるかに高いレベルのGFP陽性集団を達成した(図3b)。LBPAE/DNAポリプレックスによって媒介される最も低いGFP陽性集団は、w/w比10:1で68%である。w/w比が40:1を上回る場合、HPDFの93%超がGFP陽性である。さらに、LBPAE/DNAポリプレックスによって形質移入されたHPDFの蛍光強度中央値(MFI)は、PEI/DNA及びSuperFect/DNAカウンターパートによるものよりも最大140倍高い(図3c)。3T3の場合には、LBPAE/DNAポリプレックスによって達成されたGFP陽性細胞のパーセンテージは、w/w比30:1の35%からw/w比70:1の91%超まで増加し、PEI/DNA及びSuperFect/DNAポリプレックスによって達成されたそれぞれ5%及び11%とは対照的であった(図3d及び3e)。加えて、w/w比が70:1の場合、LBPAE/DNAポリプレックスによって媒介される3T3のMFIは、PEI/DNA及びSuperFect/DNAカウンターパートのMFIよりも272倍及び230倍高かった(図3f)。これらの結果は、LBPAEがより多くの細胞数を形質移入するだけでなく、個別に形質移入した細胞におけるタンパク質発現レベルを顕著に促進することが示すものである。初代線維芽細胞は形質移入が困難な細胞型であり、LBPAEが初代HPDFで90%超の遺伝子形質移入効率を媒介できるという事実は、LBPAEの極めて強力な遺伝子形質移入能力を実証するものである。LBPAEが優れた遺伝子形質移入能力で広範囲のw/w比にわたって高い生体適合性を有することが証明されたことを考慮すれば、LBPAEが線維芽細胞遺伝子形質移入において広範な適用性を有することが想定され得る。
実施例3:極めて効力な遺伝子形質移入効率及び優れた生物適合性を達成するLBPAEにおいて考えられる機序
線維芽細胞形質移入でLBPAEが高性能であることの背後にあるであることの考えられる機序を読み解くため、DNA凝縮及び結合親和性、ポリプレックスサイズ、ゼータ電位、形態、プロトン緩衝能、分解速度、ならびにポリプレックスからのDNA放出を含めた多数の細胞外及び細胞内遺伝子送達バリアに関し一連の検討を行った。
LBPAEのDNA凝縮及び結合親和性
有効なDNA凝縮は、エンドヌクレアーゼによるDNA分解からDNAを保護するだけでなく、ポリプレックス細胞取込みにも好都合に働き、遺伝子形質移入を成功させるための前提条件である。[30]カチオンポリマーについては、DNA凝縮は主に静電相互作用によって駆動される。部分的または完全にプロトン化して正電荷を生成する様々なアミンが存在する。例えば、部分的または完全にプロトン化できるアミンは、エンドキャップ剤DATOUから誘導される複数の末端1級アミン、またはAPから誘導される多数の骨格3級アミンである。LBPAEのDNA凝縮能力をアガロースゲル電気泳動で定量した。図4aに示すように、全てのw/w比においてDNAシフトバンドは観察されなかった。このことは、負に荷電したDNAが、正に荷電したLBPAEによって効果的に遮蔽され、よって、移動なしでアガロースウェル内で保持されることを示す。市販の遺伝子形質移入試薬PEI及びSuperFectはいずれも、高いDNA凝縮能力を示しており、特にSuperFectはDNAを強く凝縮するため、DNA染色色素がDNAに接近することが困難であり、よってDNAバンドの色が薄い。DNAとLBPAEとの結合親和性をさらにPicoGreenアッセイで定量化した。図4bに示すように、LBPAEは、全てのw/w比において強力なDNA結合親和性を示す。概して、結合親和性はw/w比と共に増加し、例えば、w/w比10:1における86%からw/w比70:1における96%まで増加する。このことは、LBPAEが多いほどLBPAEとDNAとの間の静電相互作用が強力になることを実証するものである。比較すると、PEI及びSuperFectは、LBPAEにおけるほぼ100%の結合親和性よりさらに強力な結合親和性を示し、PEI及びSuperFectはその凝縮能力と非常によく相関する。ただし、過度に強い相互作用はポリプレックスからのDNA放出を損なうため、適度なDNA結合親和性の方が遺伝子形質移入には好ましいことに留意されたい。[31、32]
LBPAE/DNAポリプレックスのサイズ、ゼータ電位、及び形態
ナノメートルサイズ及び正の表面電荷は、エンドサイトーシス経路を介した粒子の細胞取込みを容易にし得る。[33、34]図4cに示すように、生理的溶液中で、全ての試験w/w比にわたり、動的光散乱法(DLS)で測定したLBPAE/DNAポリプレックスの平均サイズは全て250nm未満である。10:1~60:1のw/w比範囲において、ポリプレックスの粒子サイズは228nm~188nmである。しかし、w/w比がさらに70:1まで増加すると、ポリプレックスサイズは97nmに減少する。これに対応して、全てのポリプレックスは正のゼータ電位を示す。最も低いw/w比10:1において、LBPAE/DNAポリプレックスは、6mVという非常に低いゼータ電位を有する。w/w比が10:1より高いと、ゼータ電位は顕著に増加して30mV超となり、w/w比40:1で最も高い34mVを達成した。同じ試験条件において、SuperFect/DNAポリプレックスは、およそ92nmの非常に小さいサイズ及びおよそ37mVの高いゼータ電位を有する。これらの観察は、ポリマーのDNA縮合能力及び結合親和性と一致する。これに対し、PEI/DNAポリプレックスは、高いDNA凝縮能力及び結合能力を有するが、500nm超の実質的に大きなサイズを有する。透過電子顕微鏡(TEM)をさらに使用して、ポリプレックスのサイズ及び形態を観察した。図4dに示すように、全てのLBPAE/DNA及びSuperFect/DNAポリプレックスは、DLSによって測定されたものと同様に、60nmから250nmの間のサイズを有する均一な球状形態を示す。重要なことには、明らかなポリプレックス凝集が認められないことであり、これはポリプレックスの高い安定性を実証するものである。一方、PEI/DNAポリプレックスは楕円体形態を示し、サイズは他のポリプレックスよりもはるかに大きい。250nm未満のサイズ及び適度に正の表面電荷を有するポリプレックスは、過剰な正電荷がもたらす潜在的細胞毒性の誘導を回避する一方で細胞取込みに対してより好ましいことが広く受け入れられている[7、9]。上記の遺伝子形質移入試験は、HPDF及び3T3形質移入における最良のw/w比が、それぞれ40:1及び70:1であることを示した。このことは、有効な線維芽細胞遺伝子形質移入のための最も好ましいポリプレックスサイズ及び表面電荷が、細胞型に応じて実質的に変動し得ることを示すものである。これに関し、LBPAE/DNAポリプレックスは、広い範囲のw/w比において、常に250nm未満の平均サイズ及び中程度のゼータ電位を有しており、高性能を達成するための多様な細胞型への形質移入に広範に適用可能であることが示される。
実施例4:LBPAE/ポリプレックスの細胞取込み
ポリプレックスの細胞取込みについてさらなる検討を行った。図5aに示すように、全てのポリプレックスは、同じ細胞密度において、形質移入から4時間後、高い細胞取込み効率を示している。比較すると、PEI/DNA及びSuperFect/DNAポリプレックスと比較して、はるかに多くのLBPAE/DNAポリプレックスがHPDF及び3T3に取り込まれており、これはCy3標識DNAから観察されるはるかに強力な赤色蛍光によって裏付けられている。フローサイトメトリー定量化は、PEI/DNA及びSuperFect/DNAポリプレックスがHPDFの場合に96.5%及び98.4%の細胞取込み効率を達成することを明らかにしている(図5b)。そうであるにしても、LBPAE/DNAポリプレックスの取込み効率はなおわずかに高く、ほぼ100%(99.3%)である。3T3の場合にも同様の傾向が観察された(図5c)。さらに、HPDFにおいて、LBPAE/DNAポリプレックスの正規化MFIは3.05であり、PEI/DNA及びSuperFect/DNAカウンターパートにより達成されたものよりも1.39倍高い(図5d)。3T3の場合には、性能がそれぞれ1.98倍及び1.68倍上回っている(図5e)。これらの全ての結果は、PEI/DNAポリプレックスの細胞取込み効率が最も低い一方で、LBPAE/DNAポリプレックスが、PEI/DNA及びSuperFect/DNA両方のカウンターパートの性能を顕著に上回ることを示している。まとめると、これらの取込み結果は、上記の異なるポリプレックスのポリプレックスサイズ、ゼータ電位、及び遺伝子形質移入性能と非常によく相関する。
実施例5:プロトン緩衝能の測定
カチオン性ポリマーベースポリプレックスは、通常は、エンドサイトーシス経路を介して細胞に取り込まれ、ひとたび内在化すると、主にエンド/リソソームに捕捉される。ポリプレックスがエンド/リソソーム区画から時間内に脱出できない場合、ポリプレックス内に凝縮されたDNAは、酸性区画内の消化酵素によって分解される。そのため、エンド/リソソーム脱出は、効率的な非ウイルス遺伝子送達のために克服すべきもう1つの主要なボトルネックである。「プロトンスポンジ効果」は、エンド/リソソームからポリプレックスが脱出するのを容易にするカチオンポリマーの主要な機序と広く考えられている。「プロトンスポンジ効果」の機序を考慮すれば、エンドソーム/リソソームpHに近いpKaを有する高含量のプロトン化可能な2級及び3級アミンを有するカチオン性ポリマーは、エンドソーム/リソソームからのポリプレックス脱出においてより好ましいものであり、PEI及びSuperFectが最も典型的な代表例である[29]。LBPAEのプロトン緩衝能を検証するため、酸-塩基滴定を行った。図6aに示すように、NaCl溶液に溶解した所定量のポリマーにおいて、PEIが、pH7.4から5.1の間の酸-塩基滴定曲線における比較的平坦な勾配により最も強力なプロトン緩衝能を示すことは、驚くべきことではない。これは、PEIが非常に高い含量の1級、2級、及び3級アミンを有し、骨格内に3個の原子ごとに窒素を有するという事実によるものである。正規化後、PEI、SuperFect、及びLBPAEのプロトン緩衝能は、それぞれ5.1mmol H-1、4.6mmol H-1、及び1.6mmol H-1であることが分かる(表1)。実際に、LBPAEは、PEI及びSuperFectよりも低いプロトン緩衝能を示す。しかし、細胞毒性がはるかに低いことにより、LBPAE/DNAポリプレックスのエンド/リソソーム脱出を効果的に促進するために、実際の適用ではw/w比を顕著に増加させることができる。例えば、HPDF及び3T3遺伝子形質移入については、LBPAE/DNAポリプレックスを、それぞれ40:1及び70:1のw/w比で使用した。この条件において、使用した全体のLBPAEのプロトン緩衝能は、w/w比1:1のPEIの緩衝能よりも12倍及び21倍高く、w/w比3:1のSuperFectよりも5倍及び8倍高い。「プロトンスポンジ効果」仮説に基づけば、LBPAEの高いプロトン緩衝能は浸透圧の増加を引き起こし、エンド/リソソームの膨潤及び破裂をもたらし、こうしてLBPAE/DNAポリプレックスを時間内にかつ効率的に細胞質内に放出する。
表1.LBPAE及び市販試薬の緩衝能。
Figure 2022514113000140
実施例6:LBPAEの分解及びDNA放出評価
汎用性のある遺伝子送達ベクターは、DNAを有効に凝縮し、酵素による分解からそれを保護するだけでなく、核移入後にポリプレックスから凝縮されたDNAを放出することもできる。カチオン性ポリマーについては、細胞質内のポリマー分解を促進し、よってDNA放出を促進し、遺伝子形質移入後の蓄積した細胞毒性を低減するための一連の戦略が提唱されている。しかし、効率的な遺伝子形質移入のためには、適度に長い半減期が遺伝子ベクターに必要である。というのも、短すぎる半減期は、不十分なDNA保護及び未成熟なDNAの放出につながり、一方長すぎる半減期は、ポリプレックス解離及びDNA放出を困難にするためである。PAEの骨格上には複数のエステル結合が存在する。生理学的条件下では、エステル結合は加水分解によって分解して、生体適合性の小分子βアミノ酸及びジオールをもたらし得る。化学組成に応じて、LPAEの半減期は水性環境下で1.5時間から6時間超にわたることが報告されている。[7]本開示のある特定の実施形態及び実施例に従うLBPAEについては、37℃での2時間のインキュベーション後に43%の分解が観察された。分解は、6時間及び8時間のインキュベート後、それぞれ81%及び85%まで継続的に増加した(図6b)。対応するポリプレックスからのDNA放出は、PicoGreenアッセイによって定量される。図6cに示すように、最も低いw/w比10:1において、LBPAE/DNAポリプレックスはDNA放出速度が最も速く、2時間のインキュベート後、60%超のDNAが放出された。比較すると、40:1の中程度及び70:1の高いw/w比では、より遅いが同様の速度で、縮合されたDNAがポリプレックスから放出された。しかし、6時間後には60%超のDNAが放出された。DNA放出プロファイルはLBPAE分解プロファイルと一致しており、LBPAEが、いかなる追加の外的誘因も必要とせずに、生理学的条件下では加水分解を介し自発的に凝縮DNAを放出し得ることが示されている。DNA凝縮、結合親和性、ポリプレックスサイズ、ゼータ電位、細胞取込み、分解、及びDNA放出からの全ての結果は、LBPAE/DNAポリプレックスの遺伝子形質移入効率及び生体適合性と非常によく相関しており、これは、線維芽細胞において高性能遺伝子形質移入に好ましいポリプレックス特性を達成するためのLBPAEの組成、構造、及び機能性の操作を強調している。
実施例7:LBPAEは、HPDFにおけるC7発現を操作するための機能的COL7A1を送達する
本開示のある特定の実施形態及び実施例に従う多機能性LBPAEは、極めて高い効率性及び優れた生体適合性でGluc DNA及びGFP DNAを送達してHPDF及び3T3に形質移入可能であることが実証されている。しかし、多くの遺伝子送達ベクターは高レベルのレポーター遺伝子発現を示しており、機能性タンパク質の発現をもたらすためにこのような成功を移行させることは、はるかに困難である。したがって、HPDFにおけるC7の発現を促進する機能的COL7A1遺伝子を送達させることにより、LBPAEの有効性をさらに評価した。現在、RDEBには、対症療法的ケア以外で有効な治療法が存在しない。ケラチノサイト及び皮膚線維芽細胞はいずれもC7の生成及び分泌が可能である[35]が、後者は、遺伝性皮膚疾患の遺伝子治療における標的細胞型としては前者よりもロバストである。[21、36]ミニサークル(MC)DNAカセットは、標準的プラスミドの細菌骨格からの免疫原性応答のリスクなしに、標準的プラスミドよりも10~1000倍高く安定した非統合的導入遺伝子発現を示している。[37、38]COL7A1遺伝子が約9kbのcDNA/mRNA転写物を伴って非常に大きいことを考慮して、HPDFへの形質移入に、サイトメガロウイルスプロモーターと共に8.9kbの全長COL7A1 cDNAをコードするMCC7を使用した。図12に示すように、MCC7は、8.9kbのCOL7A1 cDNA及び3kbの骨格を含み、これは、pcDNA3.1COL7A1親プラスミドより2kb少ない。レトロウイルス及びアデノ随伴ウイルス(AAV)ベクターの最大カーゴサイズは通常8kb未満であり、[39]pcDNA3.1COL7A1及びMCC7のサイズは共に大多数のウイルスベクターの遺伝子パッケージング能力を上回るため、LBPAEによる効率的なCOL7A1遺伝子形質移入は、RDEBの遺伝子治療にとって非常に重要である。RDEBの遺伝子治療での有用性の強化を期待して、LBPAE及びMC DNAを組み合わせることにより、MCC7を送達してHPDFのC7発現を操作する。図7aは、LBPAE/MCC7ポリプレックスによる形質移入から4日後のHPDFの細胞免疫蛍光染色画像の概要を示したものである。予想されたように、明らかなC7発現(赤色蛍光)は、未処置群及び抗C7二次抗体とインキュベートしたのみの群では観察されなかった。野生型HPDF及びSuperFect処置群は、中程度の蛍光を示した。これはC7の生成を示すものである。これに対し、LBPAE/MCC7ポリプレックスにより形質移入したHPDFは最も強力な蛍光を示し、LBPAEによって得られたより多くの組換え型C7発現を実証した。フローサイトメトリーをさらに使用して、C7発現効率を定量化した。これまでの報告と整合して、[40]野生型HPDFは約41%のC7発現を示した。LBPAE/MCC7ポリプレックスによる形質移入後、C7発現効率は、SuperFect/MCC7ポリプレックスによって達成された44.9%に対し、74.4%まで顕著に増加した(図7b)。さらに、LBPAE/MCC7ポリプレックスによってMFIの40%の強化も実現した。これに対し、SuperFect/MCC7カウンターパートによって達成されたのは10%であった(図7c)。これらの全ての結果は、LBPAEがMCC7を有効に送達して全体的なC7発現HPDFの集団を増加させるだけでなく、個々のHPDFのC7レベルも強化し得ることを実証するものである。加えて、発明者らの予備試験では、C7ヌルRDEB線維芽細胞(RDEBF)において、LBPAE/MCC7による形質移入後、C7発現効率がおよそ40%に回復したことが示されており、形質移入のさらなる最適化及びRDEBFにおけるC7発現の定量化がなお進行中である。これらの知見からは、LBPAEが皮膚初代細胞に大きなcDNAを送達する強力なペイロード能力を有することが示される。初代皮膚線維芽細胞を、このポリマーベクターでさらに操作して、皮膚-表皮接合部を強化するのに重要である強力な細胞C7を分泌させることができる。非ウイルス遺伝子治療は反復適用を必要とするが、遺伝性C7機能不全皮膚疾患については、創傷部位が明らかで薬剤アクセス性が良好であることを考慮すれば、複数の局所投与が全身的遺伝子送達よりもはるかに安全であり、そのためLBPAEは、線維芽細胞ベースの遺伝子治療がC7発現を回復または強化することでRDEBの疾患表現型を逆転させる上で、非常に有望である。
実施例8:実験
材料:トリメチロールプロパントリアクリレート(TMPTA)、5-アミノ-1-ペンタノール(AP)、1,11-ジアミノ-3,6,9-トリオキサウンデカン(DATOU)、塩化ナトリウム(NaCl)、水酸化ナトリウム(NaOH)、分枝状ポリエチレンイミン(PEI、M=25kDa)、臭化リチウム(LiBr)、ジメチルスルホキシド(DMSO)、ジエチルエーテル、重水素化クロロホルム(CDCl3)、塩酸溶液(HCl)、ハンクス平衡塩溶液(HBSS)、酢酸トリス-EDTAバッファー(TAE)、トリプシンEDTA溶液(0.25%)、ダルベッコ変法イーグル培地(DMEM)、ペニシリン-ストレプトマイシン(P/S)、アガロース、パラホルムアルデヒド(PFA)、0.1% Triton X-100、マウス及びヤギ血清で生成されたモノクローナル抗コラーゲンVII抗体を、Sigma-Aldrichから購入した。酢酸ナトリウム(3.0M、Sigma-Aldrich)を使用前に0.025Mに希釈した。1,4-ブタンジオールジアクリレート(BDA)をVWRから購入し、そのまま使用した。ジメチルホルムアミド(DMF)はFisher Scientificから購入した。Gibcoから購入したウシ胎児血清(FBS)を、使用前に0.2μmフィルターで濾過した。HPDF及び3T3細胞をそれぞれLonza及びATCCから購入した。HPDFの培養及び継代培養のために、線維芽細胞基本培地、FGM-2 SingleQuots、Clonetics試薬パック(HEPES緩衝食塩水、トリプシンEDTA溶液(0.25%)、及びトリプシン中和溶液を含む)をLonzaから購入した。細胞分泌Gaussia princepsルシフェラーゼプラスミド(GLuc DNA)及びBioLux(商標)GaussiaルシフェラーゼアッセイキットをNew England Biolabs UKから購入した。Gluc-Prepキット(Qiagen)を用いて、プロトコルに従ってGluc DNAの伸長及び精製を実施した。緑色蛍光タンパク質プラスミド(GFP DNA)をAldevronから購入した。pcDNA3.1COL7A1プラスミドは、University of Dundee(UK)のDr.Andrew Southの厚意によって提供された。MCC7は、pcDNA3.1COL7A1から生じたCOL7A1配列を、System Biosciencesから提供されるMN511A-1カセットに挿入することによって構築し、ミニサークルDNAの生成は、System Bioscienceのユーザーマニュアルに従った。SuperFect遺伝子形質移入試薬をQiagenから購入した。LIVE/DEAD生存率/細胞毒性キット、ヤギ抗マウスIgG(H+L)高交差吸着二次抗体、Alexa Fluor 568、及びAlexa Fluor 647をThermo Fisher Scientificから購入した。アラマーブルーアッセイキット、SYBR safe DNAゲル染色液、IC固定バッファー、及び10×Bioscience透過バッファーをInvitrogenから購入した。Cy3 DNA標識キットをMirusから購入し、プロトコルに従って使用した。4’,6-ジアミジノ-2-フェニルインドール(DAPI)及びPicoGreenアッセイキットをLife Technologiesから購入し、製造業者のプロトコルに従って使用した。1×ダルベッコリン酸緩衝食塩水(PBS)をLife Technologiesから購入した。DAPIを含むマウンティング培地をAbcamから購入した。
LBPAEの合成及びキャラクタリゼーション:直鎖状オリゴマー組合せ戦略によりLBPAEを合成した。最初に、化学量論比が1.2:1のBDA及びAPを100mg mL-1のDMSOに溶解し、次いで90℃で反応させた。三重の検出器(屈折率検出器(RI)、粘度検出器(VS DP)、ならびに二重光散乱検出器(LS 15°及びLS 90°))を備えたAgilent 1260 Infiniteゲル浸透クロマトグラフィー(GPC)を使用して、重量平均分子量(M)、数平均分子量(M)、及び多分散指数(PDI)の成長をモニターした。GPC測定のために、反応混合物20μLを採取し、1mL DMFで希釈し、次いで0.45μmフィルターで濾過した。0.1% LiBrを含むDMFを利用して、60℃、1mL 分-1の流量でGPCカラム(Polar Gel-M、7.5×300mm、直列に2つ)を溶出した。GPCカラムの較正には、直鎖状ポリ(メチルメタクリレート)(PMMA)標準物質を使用した。Mが3000Daに近づいたら、室温まで冷却することにより反応を停止し、DMSOで希釈し、次いで過剰なエンドキャップ剤DATOUを添加し、反応をさらに48時間継続してDATOUエンドキャップ直鎖状A2-C2オリゴマーを得、これをアセトンで3日間透析することにより精製し、次いで真空オーブン内で乾燥して溶媒を除去した。次に、直鎖状A2-C2オリゴマーをDMSOに溶解し、分枝状モノマーTMPTAと90℃で反応させた。Mがおよそ10kDaのときに、反応混合物を室温まで冷却し、過剰なDATOUを添加して、さらに48時間にわたり全ての未反応のビニル基を消費した。次いで、ポリマーをジエチルエーテルで3回沈殿させることによって精製し、2日間凍結乾燥し、さらなる試験のために-20℃で保存した。最終生成物の分子量(M)、PDI、及びマーク-フウィンク(MH)プロットアルファ値(α)を測定するため、10mg LBPAEを2mL DMFに溶解し、上述のようにGPC測定を行った。LBPAEの化学組成及び純度を400MHz Varian Inova分光計のH NMRで定量した。試料は、溶媒CDCl3(7.24ppm)または内部対照(テトラメチルシラン0.00ppm)に対する百万分率(ppm)で報告した。
マーク-フウィンクアルファパラメーターの定量:屈折率検出器(RI)、粘度検出器(VS DP)、及び二重角光散乱検出器(LS 15°及びLS 90°)を備えた1260 Infinite GPC systemでポリマーのマーク-フウィンクアルファパラメーターの定量を行った。解析用のポリマーを調製するため、10.0mgの試料を2mL DMFに溶解し、次いで0.45μmのフィルターで濾過した。GPCカラム(30cm PLgel Mixed-C、直列に2つ)を、60℃、1mL/分の流量のDMF及び0.1% LiBrで溶出し、カラムを直鎖状ポリ(メチルメタクリレート)標準物質(PMMA)で較正した。ユニバーサルキャリブレーションを用いてGPCデータを解析した。
LBPAE/DNAポリプレックス調製:ポリプレックス調製のために、最初にLBPAEをDMSOに溶解して100mg mL-1ストック溶液にした。LBPAE/DNA重量比(w/w)に従って、必要量のLBPAEストック溶液及びDNA溶液を、酢酸ナトリウムバッファー(0.025M、pH=5.2)で希釈してそれぞれ等体積にした。次いで、LBPAE溶液を添加し、ボルテックスにより10秒間混合し、室温で10分間静置してポリプレックスを形成させた。
LBPAEによるDNA凝縮:アガロースゲル電気泳動を用いてLBPAEのDNA凝縮能力を測定した。1μgのDNAを各試料調製に使用し、一連のw/w比を有するポリプレックスを上記のように調製した。その後に、ウェル内の10μLのSYBR safe DNAゲル染色液を含むアガロースゲル(1×TAEバッファー中1%)に20μLのポリプレックス溶液を装填し、裸のDNAを対照として使用した。ゲル電気泳動を1×TAEバッファー中で120Vで40分間実施し、SyngeneのG:BOXを用いて画像をキャプチャーした。
LBPAEのDNA結合親和性:PicoGreenアッセイを使用してLBPAEのDNA結合親和性を定量化した。0.25μgのDNAを各試料調製に用いた。異なるw/w比のポリプレックスを15μLの酢酸ナトリウムバッファー中で調製し、次いで15μLのPicoGreen作業溶液と混合し、5分間インキュベートした。その後、220μLの1×PBSバッファーを添加して、黒色96ウェルプレート内のポリプレックスを希釈した。ポリプレックス溶液の蛍光強度(F)は、SpectraMax M3プレートリーダーにより、490nmの励起及び535nmの発光で4連で測定した。LBPAEのDNA結合親和性は、以下の式によって定義される。
Figure 2022514113000141
LBPAEのプロトン緩衝能:LBPAEのプロトン緩衝能を酸-塩基滴定によって定量した。0.1M NaCl溶液をバックグラウンド対照として使用し、PEI及びSuperFectを陽性対照として使用した。Mettler Toledo S20 pHメーターを使用してpH値を測定した。10mg LBPAE、5mg PEI、または0.8mg SuperFectを20mL 0.1M NaCl溶液に溶解した。溶液のpH値を1.0M HCl溶液で3.0に調整し、次いで0.1M NaOH溶液を用いて10.5まで滴定した。LBPAEのプロトン緩衝能(mmol g-1)は、以下の式を用いて計算した。
Figure 2022514113000142
LBPAEの分解プロファイル:分解プロファイルを測定するため、LBPAEを10mg mL-1の濃度でPBSに溶解し、37℃下で180rpmで振とうし続けた。0、2、4、6、及び8時間の時点で、1mLの溶液を採取し、直ちに凍結した。フリーズドライ後、試料を1mL DMFに溶解した。試料のMは、前述のようにGPCにより3連で測定した。LBPAE分解のパーセンテージを以下のように定義した。
Figure 2022514113000143
ポリプレックスサイズ及びゼータ電位の定量:Malvern Instruments Zetasizer(Nano-ZS90、散乱角173°、633nmレーザー)を用いてポリプレックスサイズ及びゼータ電位を測定した。4μgのDNAを各試料調製に使用し、一連のw/w比を有するポリプレックスを上記のように調製し、800μLの脱イオン水で希釈し、次いでZetasizerセルまたはキュベットに移した。サイズ及びゼータ電位の測定を25℃で4連で行った。
透過電子顕微鏡(TEM)によるポリプレックス形態キャラクタリゼーション:LBPAE/DNA、PEI/DNA、及びSuperFect/DNAポリプレックスの形態をTEMによってキャラクタリゼーションした。2μgのDNAを含む80μLのポリプレックス溶液を前述のように調製し、脱イオン水で2回洗浄して塩を除去し、次いで10μLの脱イオン水に再懸濁した。2.5μLの再懸濁ポリプレックス溶液を、200メッシュ銅グリッド上のFormvar支持フィルム上にキャストし、直ちに凍結乾燥した。TEM画像は、UCD Conway Imaging Core Centreで120kVのFEI Tecnai 120 TEMでキャプチャーした。
ポリプレックスからのDNA放出:ポリプレックスからのDNA放出は、PicoGreenアッセイを用いてLBPAEによる結合親和性の低下を測定することによって定量することができる。w/w比が10:1、40:1、及び70:1であるLBPAE/DNAポリプレックスを上記のように調製し、180rpm及び37℃で振とうし続けた。o、2、4、6、及び8時間の時点で、100μLのポリプレックス溶液を取り出し、4連で前と同様に直ちにDNA結合親和性を測定した。ポリプレックスからのDNA放出速度を以下のように定量した。
Figure 2022514113000144
細胞培養:HPDFを線維芽細胞基本培地で培養し、2% FBSを含むFGM-2 SingleQuotsを補充した。3T3を、10% FBS及び1%ペニシリン/ストレプトマイシン(P/S)を含むDMEMで培養した。両方のタイプの細胞を標準的な細胞培養条件下で37℃、5% CO2の加湿インキュベータで培養した。
Gluc発現により定量化したLBPAEの遺伝子形質移入能力:HPDF及び3T3におけるLBPAEの遺伝子形質移入能力を、最初に、レポーター遺伝子としてGluc DNAを用いたGluc発現によって評価した。96ウェルプレート内の100μL培地に、3T3についてはウェル当たり1×10細胞の密度で、HPDFについてはウェル当たり2×10細胞の密度で細胞を播種し、形質移入前の1日間インキュベートした。市販の遺伝子形質移入試薬PEI及びSuperFectを製造業者のプロトコルに従って最適化した。この目的のため、0.5μg Gluc DNAを各ウェルに使用し、PEI/DNAポリプレックスにおけるw/w比を1:1、2:1から3:1まで変化させ、SuperFect/DNAポリプレックスにおけるw/w比を3:1、6:1から9:1まで変化させた。LBPAE遺伝子形質移入については、同量の0.5μg Gluc DNAを各ウェルに使用し、異なるw/w比を有するLBPAE/DNAポリプレックスを上述のように20μLの酢酸ナトリウムバッファー中で調製し、次いで80μLの細胞培養基で希釈した。96ウェルプレート内の細胞培養基を除去し、100μLのポリプレックス含有培地を添加した。4時間後、プレート内のポリプレックス含有培地を100μLの新鮮培地と交換し、細胞をさらに44時間インキュベートした。形質移入後の細胞のGluc活性をGlucアッセイを用いて標準プロトコルに従って4連で測定した。簡潔に述べると、96ウェルプレート内の20μLの上清を取り出し、50μLのGlucアッセイ溶液を添加した。SpectraMax M3プレートリーダーを用いて発光強度を測定し、Gluc活性を相対光単位(RLU)の観点から直接プロットした。
LBPAEの遺伝子形質移入能力のGFP発現による定量化:LBPAEの遺伝子形質移入能力をさらにGFP発現によって評価した。24ウェルプレート内の500μL培地に、HPDF及び3T3細胞をウェル当たり5×10細胞の密度で播種し、形質移入前の1日間インキュベートした。2μg GFP DNAを各ウェルに使用し、異なるw/w比を有するポリプレックスを100μL酢酸ナトリウムバッファー中で調製し、次いで400μL細胞培養基と混合した。細胞内の培地を除去し、ポリプレックス含有培地を添加した。4時間後、ポリプレックス含有培地を500μLの新鮮培地と交換し、細胞をさらに44時間インキュベートした。その後、細胞をHBSSで洗浄し、蛍光顕微鏡(Olympus IX81)でイメージングした。フローサイトメトリーでGFP発現を定量化するため、形質移入した細胞をトリプシンEDTAで消化し、HBSSで2回洗浄し、次いで2% FBSを含むPBS中に再懸濁した。フローサイトメトリー測定をAcculi C6システムで3連で行い、各試料について少なくとも10,000細胞をカウントした。細胞の蛍光強度中央値(MFI)をFlowjoソフトウェアで定量化した。PEI及びSuperFectにより形質移入した細胞を陽性対照として使用し、未処置細胞を陰性対照として使用した。
アラマーブルーアッセイで測定した細胞生存率:形質移入後のHPDF及び3T3細胞の生存率をアラマーブルーアッセイで測定した。この目的のため、形質移入から48時間後に細胞上清を除去し、細胞をHBSSで2回洗浄した。次いで、HBSS中10%のアラマーブルー溶液を添加し、細胞をさらに1~3時間インキュベートした。その後、ウェル内のアラマーブルー溶液を平底96ウェルプレートに移し、SpectraMax M3プレートリーダーを用いて590nmにおける蛍光強度を4連で測定した。ポリプレックス処置なしの細胞を陽性対照として使用し、蛍光強度を100%細胞生存率として正規化した。
LBPAEの毒性学的プロファイル:LBPAEの毒性学的プロファイルを致死濃度50(LC50)評価によって定量した。LIVE/DEAD生存率/細胞毒性キットを使用して、生細胞及び死細胞を染色した。96ウェルプレート内の100μL培地に、HPDFについてはウェル当たり2×10の密度で、3T3についてはウェル当たり1×10の密度で細胞を播種した。翌日、LBPAE/DNAポリプレックス及びSuperFect/DNAポリプレックスを調製し、5つの異なる用量のポリプレックスを使用して、上述のように細胞に形質移入した。形質移入から24時間後、細胞培養基を除去し、カルセイン-AM(C-AM)(1:5000)及びエチジウムホモダイマー-1(EthD-1)(1:500)を含むHBSSで置き換え、細胞をさらに20分間インキュベートした。次いで、細胞をHBSSで洗浄し、蛍光顕微鏡(Olympus IX81)でイメージングした。4連のアラマーブルーアッセイで定量化した細胞生存率を使用してLC50を計算した。
ポリプレックス細胞取込み:ポリプレックス細胞取込み試験のために、Gluc DNAを、推奨プロトコルに従ってCy3(赤色蛍光色素)標識キットで標識した。24ウェルプレートに、線維芽細胞をウェル当たり5×10細胞の密度で播種した。0.5μg標識DNAを各ウェルに使用し、遺伝子形質移入を翌日に行った。形質移入から4時間後、細胞をHBSSで洗浄し、4% PFAで固定し、0.1%トリトン-100で透過処理し、DAPIで染色し、次いで蛍光顕微鏡(Olympus IX81)でイメージングした。フローサイトメトリーで細胞取込み効率を定量化するため、形質移入後、細胞をトリプシンEDTAで消化し、HBSSで2回洗浄し、次いで2% FBSを含むPBSに再懸濁し、Accuri C6フローサイトメトリーシステムで3連でCy3陽性細胞のパーセンテージ及びMFIを定量化した。
細胞免疫蛍光染色によるHPDFにおけるC7発現の検出:細胞免疫蛍光染色でC7発現を検出するために、8ウェルチャンバー(Ibidi)にHPDFをウェル当たり1.5×10細胞の密度で播種した。翌日、1μg MCC7を各ウェルに使用し、w/w比40:1のLBPAE/DNAポリプレックス及びw/w比3:1のSuperFect/DNAポリプレックスを用いて、上述のように遺伝子形質移入を行った。形質移入から48時間後、細胞を4% PFAで固定し、0.1%トリトン-100で透過処理し、1×PBS中5%ヤギ血清で室温で1時間ブロックし、次いで、マウスで生成されたモノクローナル抗コラーゲン及びVII型抗体の一次抗体と共に、ブロッキングバッファー(抗体希釈度:1:200)中で4℃で終夜インキュベートした。翌日、細胞をAlexa-568ヤギ抗マウスIgG(H+L)高交差吸着二次抗体と共に、1:800希釈で暗中及びDAPI中室温で1時間インキュベートした。蛍光顕微鏡(Olympus IX81)を用いて免疫蛍光画像を撮影した。抗体処置をせず二次抗体のみで処置した細胞を対照群として使用した。
フローサイトメトリーによって定量化したHPDFにおけるC7発現:フローサイトメトリーでC7発現を定量化するため、24ウェルプレートにHPDFをウェル当たり5×10細胞の密度で播種し、24時間後にトランスフェクトした。2μg MCC7を各ウェルに使用し、w/w比40:1のLBPAE/DNAポリプレックス及びw/w比3:1のSuperFect/DNAポリプレックスを用いて形質移入を上述のように行った。形質移入から4日後、細胞をトリプシンEDTAで消化し、IC固定バッファー(2% PFA)で固定し、透過バッファー(1×PBS/1% BSA/0.1%サポニン)で透過処理し、ヤギ血清(透過溶液中10%)でブロックし、次いで、マウスで生成されたモノクローナル抗コラーゲン及びVII型抗体の一次抗体と共に、1:50希釈のブロッキングバッファー中室温で1時間インキュベートした。その後、細胞を、Alexa-647ヤギ抗マウスIgG(H+L)交差吸着二次抗体と共に、暗中透過バッファー中1:3000の希釈でさらにインキュベートした。最後に、細胞をPBS中に再懸濁し、フローサイトメトリーによって3連で解析した。抗体処置をせず二次抗体のみで処置した細胞を対照群として使用した。
統計:SPSS Statistics for windows version 24(IBM Corp.,Armonk,N.Y.,USA)を統計解析に使用した。スチューデントのt検定を使用して全ての遺伝子形質移入データを解析し、データを平均±標準偏差として示した。線形回帰分析によりLC50値を計算した。P値<0.05を統計的に有意とみなした。
実施例9:劣性栄養障害型表皮水疱症ケラチノサイトへの遺伝子送達のためのCOL7A1を含むHPAEポリプレックス
以下の実施例は、約10kDa、20kDa、30kDa、及び40kDaの分子量(M)を有し、10:1、30:1、及び50:1のHPAE:COL7A1 DNA重量比を使用する、ミニサークルCOL7A1及び本開示の4つの高度に分岐したポリ(β-アミノエステル)(HPAE)を含むポリプレックスについての形質移入結果を説明する。
HPAEの合成及びキャラクタリゼーション:HPAEを2段階で調製した。段階1では、モノマー5-アミノ-1-ペンタノール、トリメチロールプロパントリアクリレート、1,4-ブタンジオールジアクリレートを反応させて、高度に分岐したC32(ポリ(5-アミノ-1-ペンタノール-co-1,4-ブタンジオールジアクリレート))(「HC32」)を得た。段階2では、HC32を1,11-ジアミノ-3,6,9-トリオキサウンデカン(DATOU)と反応させてHPAE(「HC32-DATOU」)を得た。
分子量(MW)の異なる4つのHC32-DATOUポリマーを「A2+B3+C2」マイケル付加戦略によって合成した。最初にHC32ベースポリマーを合成した。簡潔に述べると、A2モノマーAP(9.0mmol、0.923g)、B3モノマーTMPTA(0.5mmol、0.148g)、及びC2モノマーC(10.0mmol、1.98g)を3.1mL DMSOに溶解し、次いで90℃で反応させた。ゲル浸透クロマトグラフィー(GPC)を使用して、MW及び多分散指数(PDI)の成長をモニターした。20μLの反応試料を異なる時点で採取し、次に1mL DMF中で希釈し、0.2μmフィルターで濾過した後、三重の検出器:屈折率検出器(RI)、粘度検出器(VS DP)、ならびに二重光散乱検出器(LS 15°及びLS 90°)を備えたAgilent 1260 Infinite GPCでGPC測定を行った。DMF及び0.1% LiBrを使用して、60℃、1mL/分の流量でGPCカラム(PolarGel-M、7.5×300mm、直列に2つ)を溶出した。GPCカラムを直鎖状ポリ(メチルメタクリレート)(PMMA)標準物質で較正した。
ベースポリマーの重量平均分子量(M)が目標値(それぞれおよそ10、20、30、及び40kDa)に近づいたら、DMSO中の反応溶液を100mg/mLに希釈することによって反応を停止させた。その後、DMSO(100mg/mL)に溶解したエンドキャップ剤DATOU(10.0mmol、1.92g)を使用して、室温(RT)で48時間、マイケル付加によってHC32ベースポリマーをエンドキャップしてHC32-DATOUポリマーを得、これをジエチルによる2回の沈殿により精製して過剰なモノマー、オリゴマー、及びエンドキャップ剤を除去した。
最終的なHC32-DATOU生成物を真空オーブン内で24時間乾燥し、次いでさらに24時間フリーズドライして残留溶媒を除去した。最終生成物のMW及びPDIを測定するため、10mgの試料を1mL DMFに溶解し、上述のようにGPC測定を行った。プロトン核磁気共鳴(H NMR)を利用して、CDClに溶解し、H NMRスペクトルを400MHz Varian Inova分光計で取得したHC32-DATOUポリマーの化学組成及び純度を確認した。試料は、溶媒(7.24ppm)または内部対照(テトラメチルシラン0.00ppm)に対する百万分率(ppm)で報告した。
図13は、ベースポリマーの重合時間を増加させることによって、異なるMを有する4つのHC32-DATOUポリマーが得られたことを示している。HC32-DATOUのMは、ゲル化なしで11kDaから41kDaに増加し、HAPE MWを制御する上で「A2+B3+C2」マイケル付加戦略の柔軟性が高いことを実証した。全てのHC32-DATOUポリマーのMHプロットアルファ値は0.5未満であり(図13c)、これらの高度に分岐した構造を示している。以下の表は、HC32-DATOUポリマーについてのPDI及びMHプロットα値を示している。
Figure 2022514113000145
MCC7生合成。
通常のプラスミドpcDNA3.1COL7A1を入手した。pcDNA3.1COL7A1起源のCOL7A1配列をSystem Biosciencesが提供するサイトメガロウイルスプロモーターを伴ったMN511A-1カセットに挿入することによりMCC7を生合成し、System Bioscienceの使用説明書及び公開されているミニサークル技術のphiC31 plus 1-Scel消化システムに従ってミニサークルDNAの誘導及び生成を行った(Gaspar,V.;de Melo-Diogo,D.;Costa,E.;Moreira,A.;Queiroz,J.;Pichon,C.;Correia,I.;Sousa,F.Minicircle DNA Vectors for Gene Therapy:Advances and Applications.Expert Opin. Biol.Ther.2015,15(3),353-379.https://doi.org/10.1517/14712598.2015.996544.). MCC7の生合成を確認するため、DNA消化試験を行った。この目的のため、0.5μg pcDNA3.1COL7A1、親プラスミド(MN511A-1-COL7A1)、及びMCC7を1μL EcoRIで消化させ、次いで100Vで40分間アガロースゲル電気泳動に供した。次いで、SyngeneのG:BOXを用いて画像を可視化した。
ポリプレックスの調製及び製剤
HC32-DATOUをDMSOに溶解して100μg/μLストック溶液にし、これを今後の試験用に-20℃で保存した。DNAをTEバッファーに溶解し、これも-20℃で保存した。SAバッファーを使用前に希釈して0.025Mとした。
標準的なポリプレックス調製のために、ポリマー/DNA重量比(w/w)に従って、DNA及びポリマーをそれぞれSAバッファーに等体積に溶解した。ポリマー溶液をDNA溶液に添加し、ボルテックスを用いて10秒間混合し、室温でさらに10分間インキュベートしてポリプレックス形成を可能にした。製剤試験については、典型的には、5μg GFPプラスミドDNA及び150μg HC32-DATOUをそれぞれ200μL SAに溶解して、HC32-DATOU/DNAポリプレックス(w/w=30:1)を製剤化した。ポリプレックスは、新鮮なものとして直ちに使用するか、または形質移入の前に室温、4℃、-20℃、及び-80℃で保存するか、もしくは凍結乾燥した。
凍結乾燥のために、スクロースをポリプレックス溶液に添加して、それぞれ0%、1%、3%、及び5%の最終スクロース濃度とした。全ての試料を-80℃で1時間凍結し、次いで直ちにChrist Alpha 1-2 LDplus Freeze Dryerを用いて-55℃で24時間フリーズドライに供した。その後、ポリプレックスを元の体積のSAで再構成し、形質移入に使用した。
ポリプレックス調製手順の最適化後(以下の実施例10を参照)、異なる条件で保存されたGlucコードDNAと複合体化したHC32-DATOUを使用して、形質移入適用前のポリプレックスの長期保存の実現可能性を評価した。ここでは、30:1ポリマー/DNA w/w比における0.5μg DNAを、96ウェルプレートの各ウェルに使用した。
DNA凝縮及びヘパリン放出の試験
HC32-DATOUのDNA凝縮能力及びHC32-DATOU/DNAポリプレックスの物理的安定性を評価するため、アガロースゲル電気泳動を用いてDNA凝縮アッセイ及びヘパリン放出アッセイを実施した。0.5μg DNA(MCC7)を各試料に使用し、w/w比30:1でポリプレックスを調製した。ヘパリン水溶液を0.1~6IU/μLの濃度でポリプレックス溶液に添加した。ヘパリンなしの裸のDNA及びHC32-DATOU/MCC7ポリプレックスを対照として使用した。全ての試料を室温で2時間インキュベートし、次いで10μL SYBR safe DNA染色液で染色した1%アガロースゲル上に装填した。電気泳動は、1×TAEバッファー中で100Vで1時間実施した。
PicoGreenアッセイ
PicoGreenアッセイを使用して、ヘパリン存在下でのHC32-DATOUのDNA結合親和性及びDNA放出を定量化した。HC32-DATOU/MCC7ポリプレックスをw/w比30:1で0.2μgのDNAで調製し、次いでヘパリンをポリプレックス溶液にそれぞれ0.3IU/μL、3IU/μL、及び6IU/μLの濃度で導入した。ヘパリン処置なしの裸のDNA及びHC32-DATOU/MCC7ポリプレックスを対照として使用した。2時間のインキュベート後、全ての試料を10μLのPicoGreen作業溶液と混合し、さらに5分間インキュベートした。その後、混合溶液を脱イオン水で希釈して、黒色96ウェルプレート内で1μg/mLの最終濃度とした。SpectraMax M3プレートリーダーを用いて、490nmの励起及び535nmの発光で4連で蛍光測定を行った。試料の蛍光強度を裸のDNA対照を基準に正規化することにより、DNA放出効率を定量化した。
ポリプレックスのサイズ及びゼータ電位の測定
Nanosight NS300を用いたナノ粒子トラッキング解析(NTA)により、ポリプレックスのサイズを測定した。ポリプレックスは、10μLのSA中w/w比30:1の0.5μg DNAを用いて調製した。次に、ポリプレックス溶液を1mLの蒸留水に希釈し、次いでNTA解析に供した。NTAソフトウェア(バージョン3.2)を用いて粒子のブラウン運動追跡を含む60秒の動画を記録した。各試料について10トラックを評価した。Malvern Instruments Zetasizer(Nano-ZS90)を90°散乱検出器角度で用いて、ポリプレックスのゼータ電位測定を行った。
透過電子顕微鏡(TEM)観察
ポリプレックスの形態をTEMによってキャラクタリゼーションした。w/w比30:1の2μg MCC7を含む80μLのポリプレックス溶液を遠心分離し、上清を廃棄し、次いでポリプレックスをさらに80μLの蒸留水で2回洗浄して過剰な塩を除去した。その後、ポリプレックスを最終体積10μLの蒸留水に再懸濁した。次いで、2.5μLポリプレックス溶液を200メッシュ銅グリッド上のFormvar支持フィルム上にキャストし、直ちに凍結乾燥した。画像をUCD Conway Imaging Core Centerの120kVのFEI Tecnai 120 TEMでキャプチャーした。
細胞培養
RDEBK及びヒトケラチノサイト(NHK)細胞を、標準的な細胞培養条件下、37℃で5%CO2の加湿インキュベータ内で、補充パック(KGM-Gold SingleQuots)及び1% PSを含むケラチノサイト基本培地(KBM-Gold)中で培養した。
GFP発現及び細胞生存率
最初にGFPレポーター遺伝子形質移入を実施して、4つのHC32-DATOUポリマーの遺伝子形質移入効率を評価し、最良の性能を示す候補をスクリーニングした。96ウェルプレートに、RDEBKをウェル当たり2×10細胞の密度で播種した。翌日、GFPをコードするプラスミドDNA 0.5μgを各ウェルに使用した。形質移入培地として80μL新鮮培養培地と混合した20μL SA中で、異なるMを有するHC32-DATOUポリプレックスを10:1、30:1、及び50:1のポリマー/DNA w/w比で調製した。形質移入から4時間後、形質移入培地を新鮮な培地で置き換えた。形質移入から48時間後、蛍光顕微鏡(Olympus IX81)下で細胞のGFP発現を可視化した。アラマーブルーアッセイで細胞生存率を測定した。細胞上清を除去し、次いで細胞をHBSS中10%アラマーブルー試薬と共に37℃でさらに1時間インキュベートした。その後、アラマーブルー溶液を平底96ウェルプレートに移した。蛍光強度は、570nmの励起及び590nmの発光でSpectraMax M3プレートリーダーによって読み取った。未処置細胞群の蛍光強度を100%生存としてプロットした。細胞生存率を4連で測定し、試料の蛍光強度を未処置群の蛍光強度を基準に正規化することにより計算した。最も高いGFP発現及び細胞生存率を示すHC32-DATOUを次の試験に使用した。
製剤試験(以下の実施例10を参照)では、刊行物に従ってw/w比3:1でSuperFect/DNAポリプレックスを調製した(Zeng,M.;Zhou,D.;Alshehri,F.;Lara-Saez,I.;Lyu,Y.;Creagh-Flynn,J.;Xu,Q.;A,S.;Zhang,J.;Wang,W.Manipulation of Transgene Expression in Fibroblast Cells by a Multifunctional Linear-Branched Hybrid Poly(β-Amino Ester) Synthesized through an Oligomer Combination Approach.Nano Lett.2019,19(1),381-391.https://doi.org/10.1021/acs.nanolett.8b04098. Theoharis,S.;Krueger,U.;Tan,P.H.;Haskard,D.O.;Weber,M.;George,A.J.T.Targeting Gene Delivery to Activated Vascular Endothelium Using Anti E/P-Selectin Antibody Linked to PAMAM Dendrimers.J.Immunol. Methods 2009,343(2),79-90.https://doi.org/10.1016/j.jim.2008.12.005.)。リポフェクタミン2000/DNAリポプレックスを製造業者のプロトコル(2:1体積/重量比)に従って調製した。蛍光強度中央値(MFI)及びGFP陽性細胞を、3連でAcculi C6システムでフローサイトメトリーによって定量化し、さらにFlowjo V10ソフトウェアで解析した。1×10細胞を各実行ごとにカウントした。
Glucレポーター遺伝子形質移入及び細胞生存率
Glucレポーター遺伝子形質移入試験でさらにHC32-DATOUを評価した。GlucをコードするプラスミドDNA0.5μgを各ウェルに用いて、それぞれ20:1、30:1、及び40:1のw/w比でHC32-DATOU/DNAポリプレックスを調製した。過去の刊行物(Green,J.J.;Zugates,G.T.;Tedford,N.C.;Huang,Y.-H.;Griffith,L.G.;Lauffenburger,D.A.;Sawicki,J.A.;Langer,R.;Anderson,D.G.Combinatorial Modification of Degradable Polymers Enables Transfection of Human Cells Comparable to Adenovirus.Adv. Mater.2007,19(19),2836-2842.https://doi.org/10.1002/adma.200700371.Huang,J.-Y.;Gao,Y.;Cutlar,L.;O’Keeffe-Ahern,J.;Zhao,T.;Lin,F.-H.;Zhou,D.;McMahon,S.;Greiser,U.;Wang,W.;et al.Tailoring Highly Branched Poly(Beta-Amino Ester)s: A Synthetic Platform for Epidermal Gene Therapy.Chem.Commun. (Camb).2015,51(40),8473-8476.https://doi.org/10.1039/c5cc02193f. Zeng,M.;Zhou,D.;Ng,S.;Ahern,J.O.;Alshehri,F.;Gao,Y.;Pierucci,L.;Greiser,U.;Wang,W.Highly Branched Poly(5-Amino-1-Pentanol-Co-1,4-Butanediol Diacrylate) for High Performance Gene Transfection.Polymers (Basel).2017,9 (12),161.https://doi.org/10.3390/polym9050161.)に従って、PEI/DNAポリプレックスをそれぞれ1:1、2:1、及び3:1のw/w比で調製した。
RDEBKを播種し、上述のように遺伝子形質移入を行った。形質移入から48時間後、遺伝子形質移入効率を定量化するため、50μLの細胞上清を等体積のGlucアッセイ作業溶液と混合した。混合物の蛍光強度は、485nmの励起及び525nmの発光でSpectraMax M3プレートリーダーを用いて測定した。Gluc活性の結果を相対光単位(RLU)に関してプロットした。細胞生存率を上述のように測定した。Gluc活性及び細胞生存性実験の両方を4連で測定した。
ポリプレックスの細胞取込み
Cy3 DNA標識キットを使用して、標準プロトコルに従ってMCC7を標識した。96ウェルプレートに、RDEBKをウェル当たり1×10細胞の密度で播種した。翌日、0.25μg MCC7を各ウェルに用いて、細胞にHC32-DATOU/MCC7ポリプレックス(w/w=30:1)及びPEI/MCC7(w/w=1:1)を4時間形質移入し、次いで4% PFAで固定し、0.1%トリトン-100で透過処理し、HBSS中1μg/mLの作業濃度でDAPIと共にインキュベートした。蛍光顕微鏡(Olympus IX81)で蛍光画像を撮影した。細胞のMFI及びCy3陽性の割合を、Acculi C6システムにより3連で定量化した。各測定につき1×10細胞をカウントしたFlowjo V10ソフトウェアでさらに結果を解析した。
定量的逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT-qPCR)
RT-qPCRを実施してCOL7A1 mRNA発現を定量化した。形質移入の1日前に、6ウエルプレートに、RDEBKをウェル当たり2.5×10細胞の密度で播種した。細胞に、30:1及び1:1のw/w比で5μg DNAと複合体化したHC32-DATOU/MCC7及びPEI/MCC7ポリプレックスを形質移入した。処置から3日後、処置細胞及び未処置細胞を共に回収し、全RNAの精製に供した。RNeasy Mini Kitのプロトコルに従ってRNA抽出作業を行った。次に、各群から0.5μgの全RNAを使用して第1鎖cDNAを合成した。SuperScript III First-Strand Synthesis SuperMixのプロトコルに従って、50μM Oligo(dT)20プライマーを用いて逆転写を実施した。その後、1μLの最終相補的DNA(cDNA)生成物を、384ウェルプレートの1つのウェルに装填した9μLの反応混合物(0.5μL TaqManプライマー、5μL TaqMan PCR混合物、3.5μL RNaseフリー水)に添加した。各試料を3連で測定した。COL7A1の定量的遺伝子発現については、GAPDHを内在性対照として使用した。比較CT値及びTaqMan試薬、QuantStudio 7 Flex Systemを実験用にセットアップした。結果をQuantStudioリアルタイムPCRソフトウェアで解析した。
C7の細胞免疫蛍光染色
細胞免疫蛍光染色を使用して、HC32-DATOU/MCC7及びPEI/MCC7ポリプレックスで処置した後のRDEBKのC7回復を定量した。1.5×10細胞を8-ウェルチャンバー(Ibidi)内の各カバーガラスに播種した。1μg MCC7を各ウェルに使用し、HC32-DATOU/MCC7及びPEI/MCC7ポリプレックスをそれぞれ30:1及び1:1のw/w比で調製した。形質移入から3日後、細胞を4% PFAで固定し、0.1%トリトンX-100で透過させ、1×DPBS中5%ヤギ血清中で室温で1時間ブロックし、次いで、一次抗体(マウスで生成されたモノクローナル抗コラーゲン、VII型抗体)と共に4℃で終夜、ブロッキング緩衝液中1:200の抗体希釈度でインキュベートした。その後、細胞を二次抗体(Alexa-568ヤギ抗マウスIgG(H+L)、ブロッキング緩衝液中1:800の希釈度)と共にインキュベートした。最終洗浄後、DAPIを含むFluoroshieldマウンティング培地でカバーガラスをマウントした。最後に、蛍光顕微鏡(Olympus IX81)で細胞画像をキャプチャーした。
ウェスタンブロッティング
形質移入の1日前に、T-75フラスコに、RDEBKをフラスコ当たり1.5×10細胞の密度で播種した。w/w比がそれぞれ30:1及び1:1のHC32-DATOU/MCC7及びPEI/MCC7ポリプレックスを、各フラスコにつき39μg MCC7を用いた形質移入に使用した。形質移入から4日後、細胞を回収し、効率的な細胞溶解及び細胞タンパク質の可溶化を可能にするRIPAバッファーで処置した。1μL PICを細胞溶解物に添加して最終体積50μLとし、-80℃で保存した。ブラッドフォードアッセイを使用して、既知のBSA濃度を基準に試料濃度を正規化することにより、タンパク質の濃度を定量化した。40μgの変性タンパク質試料をSDS-Pageゲル(4%~10%)に装填し、次いで電気泳動を75Vで20分間、続いて120Vで1時間実行した。次いで、タンパク質試料を、室温で1時間、80Vでニトロセルロース膜に移し、続いて4℃で30分間、90Vで移した。ブロッキングバッファー(TBSTバッファー中5% BSA)中で膜ブロッキングを室温で1時間行った。β-アクチンを内在性対照として使用した。次いで、一次抗体(ブロッキングバッファー中2500希釈のポリクローナル抗C7ウサギ抗体及び抗アクチンマウス抗体)を膜に添加し、4℃で終夜インキュベートした。洗浄ステップの後、二次抗体(ブロッキングバッファー中5000希釈の抗ウサギHRP及び抗マウスHRP)を膜に添加し、室温で1時間インキュベートした。3回のTBST洗浄後、膜をPierce ECL Plus基質で可視化した。
統計
SPSS Statistics for windows version 24(IBM Corp.,Armonk,N.Y.,USA)を統計に使用した。スチューデントのt検定を使用して全ての遺伝子形質移入データを解析し、これを平均±標準偏差(SD)として表現した。全ての解析について、p値<0.05を統計的に有意とみなした。
結果:
分子量の異なるHPAEを用いたRDEBKにおけるレポーター遺伝子形質移入
遺伝子送達のための最も好ましいMWを同定するため、異なるMを有する4つのHC32-DATOUポリマーを使用して、レポーター遺伝子としてGFPコードDNAを用いてRDEBK細胞に形質移入した。図14及び図15に示すように、10:1のポリマー/DNA w/w比では明らかな細胞毒性は観察されないが、全てのHC32-DATOUポリマーからの形質移入効率は比較的低い。w/w比を30:1以上に増加させると、全てのポリマーの中で、30:1の11kDa HC32-DATOUが最も強力なGFP発現で最高の形質移入効率を達成し、同時に98%という高いレベルの細胞生存率を保持した。概して、GFP発現はHC32-DATOUポリマーのMが増加するに伴って減少した。
一方、細胞毒性は、ポリマーMの増加と非常によく相関した。例えば、50:1のw/wでは、Mが増加するにつれて、細胞生存率は、それぞれ91%から58%、42%、及び15%に減少する。形質移入効率は細胞毒性が増加するに伴って低下し、これはポリマーの主鎖の増加に起因すると考えられる。これらの結果は、MWがHC32-DATOUの形質移入性能に顕著に作用し、高い形質移入効率及び低い細胞毒性の両方を達成するには、約10kDaのMがRDEBK遺伝子形質移入により好ましいことを実証するものである。
市販の遺伝子形質移入試薬PEI(M=25kDa)と比較することにより、11kDa HC32-DATOUの高い遺伝子形質移入能力を検証した。図16aに示すように、試験した3つのw/w比全てにおいて、HC32-DATOU/DNAポリプレックスによる形質移入後のRDEBK細胞の相対Gluc活性は、PEI/DNAカウンターパートによって媒介されるものよりもはるかに高かった。w/w比30:1のHC32-DATOU/DNAポリプレックスによって達成された最も高いGluc活性は、w/w比2:1のPEI/DNAカウンターパートよりも17倍高かった。
重要なことに、HC32-DATOU/DNAポリプレックスは、明らかな細胞毒性を誘導せず、ほぼ100%の細胞生存率を維持した。これに対し、PEIは明白な用量非依存性細胞毒性を示し、細胞生存率はw/w比1:1における90%からw/w比3:1における38%まで顕著に減少した(図16b)。細胞毒性が相当程度のため、以下の試験ではw/w比1:1のPEIを使用した。
HC32-DATOU/DNAポリプレックスの高性能を確認するため、GFPコードDNAを形質移入に使用した。HC32-DATOU/DNAポリプレックスは、PEIよりもはるかに高いレベルのGFP発現を媒介し、これは実質的により強力な緑色蛍光が観察されたことにより立証される(図16c)。これに対応して、フローサイトメトリー定量分析は、より多くの細胞がGFP決定チャネルに対応してシフトすることを示している(図16d)。HC32-DATOU/DNAポリプレックスによる形質移入後にRDEBK細胞の75%がGFP陽性であったのに対し、PEI/DNAポリプレックスによって達成されたのは39%であった。さらに、HC32-DATOU/DNAポリプレックスによって形質移入されたRDEBK細胞のMFIは、PEI/DNAカウンターパートによって媒介されるものより13倍高く(図16e)、個々の細胞ではるかに高い遺伝子発現が達成されたことが示されている。これらの全ての結果は、HC32-DATOUがRDEBK細胞における遺伝子形質移入について、PEIよりもはるかに効率的で安全であることを実証するものである。
MCC7の生合成及びRDEBK細胞によるHPAE/MCC7ポリプレックスの細胞取込み
ミニサークル技術のphiC31及び1-Scel消化系(Gaspar,V.;de Melo-Diogo,D.;Costa,E.;Moreira,A.;Queiroz,J.;Pichon,C.;Correia,I.;Sousa,F.Minicircle DNA Vectors for Gene Therapy: Advances and Applications.Expert Opin. Biol.Ther.2015,15 (3),353-379.https://doi.org/10.1517/14712598.2015.996544.)を利用して、約9kbの全長COL7A1をコードするミニサークルDNAを生合成した(図17a)。ゲル電気泳動は、3つの全てのCOL7A1タグ化DNAの中で、MCC7のみが3kb長の骨格を有することを示しており、これは、通常のプラスミド(RP)pcDNA3.1COL7A1及び親プラスミド(PP)MN511A-1-COL7A1よりもそれぞれ2kb及び5kb短い(図17b)。これは、細菌配列を欠く従来のPPベクターからの小型化誘導体を有するMCC7を示している。
HC32-DATOU/MCC7ポリプレックスの細胞取込みをRDEBK細胞で行った。MCC7を赤色蛍光色素Cy3で標識し、上述のようにHC32-DATOU/MCC7ポリプレックスを調製した。4時間の形質移入後、細胞の核の周囲に非常に強力な赤色蛍光が観察された(図17c)。これに対し、PEI/MCC7ポリプレックスは、はるかに弱い赤色蛍光によって立証されるように、はるかに低い細胞取込み効率を示している。さらに、フローサイトメトリー測定値は、Cy3陽性細胞のパーセンテージは類似する(96.4%対93%、図17d)が、HC32-DATOU/MCC7ポリプレックスとインキュベートした細胞のMFIは、PEI/MCC7カウンターパートによって処置されたものよりおよそ2倍高かった(図17e)ことを実証しており、これは、より多数のDNAコピーがRDEBK細胞によって取り込まれたことを示している。RV及びアデノ随伴ウイルス(AAV)ベクターが運搬できる最大DNAサイズは、それぞれ7~8kb及び5kbである。HC32-DATOUが12kb長のMCC7を効率的にRDEBK細胞に送達可能であるという事実は、RDEB治療のために高いC7発現を達成する可能性を強調するものである。
高レベルのCOL7A1 mRNA及び組換えC7発現
内在化に続くベクター/DNAポリプレックスの課題は、エンド/リソソーム脱出、細胞質を介した輸送、DNA放出、及び核進入を含めた細胞内バリアである。細胞周期は、細胞の核取込み効率に対するもう1つの障害である。有糸分裂を経ている細胞は、細胞周期の増殖期にある細胞よりも核取込み効率が10倍以上高い。
HC32-DATOU/MCC7ポリプレックスによって媒介される転写物COL7A1 mRNA及びC7タンパク質発現を評価するため、RT-qPCR、免疫蛍光染色、及びウェスタンブロッティング試験を実施した。
図18a及び図18bは、それぞれ内在性対照GAPDH及びCOL7A1 mRNA発現のRT-qPCR増幅プロットの概要を示している。内因性対照を基準に正規化した後、HC32-DATOU/MCC7ポリプレックスが、UT細胞に比べてCOL7A1 mRNA発現の4019倍の上方制御を媒介したことが示されており(図18c)、PEI/MCC7ポリプレックスによって媒介されたものよりも2.2倍高かった。免疫蛍光染色試験(図18d)はさらに、ヌルC7発現が未処置RDEBK細胞で検出されたことを明らかにしている。これに対し、HC32-DATOU/MCC7ポリプレックスによる形質移入後、核周辺におけるはるかに高いレベルの細胞C7発現が細胞免疫蛍光画像で観察された。さらに、COL7A1 mRNA発現の結果と一致して、HC32-DATOU/DNAポリプレックスは、PEI/MCC7カウンターパートよりも効率的なC7発現を媒介した。
ウェスタンブロッティングの結果は、C7分泌が未処置RDEBK細胞から検出されなかったことを示している(図18e)。これとは反対に、HC32-DATOU/ポリプレックスによる形質移入後には、非常に明瞭なC7の290kDaタンパク質バンドが認識でき、このC7バンドは、完全なC7生成機能を有する野生型NHK細胞のバンドと同程度に強力である。PEI/MCC7ポリプレックスは顕著に高いレベルのCOL7A1 mRNA発現を達成したが、C7生成が限定的であることに留意されたい。
機序試験は、コンパクトなDNA構造が細胞取込み、細胞内ベクターコピー数、核配置、及びmRNA転写レベルを増大させることを実証している(Kobelt,D.;Schleef,M.;Schmeer,M.;Aumann,J.;Schlag,P.M.;Walther,W.Performance of High Quality Minicircle DNA for in Vitro and in Vivo Gene Transfer.Mol.Biotechnol.2013,53(1),80-89.https://doi.org/10.1007/s12033-012-9535-6.)。本明細書においては、HC32-DATOUは、最適化されたポリマー及び小型化された遺伝子構築物を利用して、COL7A1遺伝子をRDEBK細胞に有効に送達し、その後のmRNA転写及び最終的な組換えC7発現を促進し、それによって皮膚の統合性を強化することができる。
HPAE/MCC7ポリプレックスの高い遺伝子形質移入効率の機構的試験
DNA凝縮、結合、ポリプレックスサイズ、ゼータ電位、形態、及びDNA放出は、形質移入性能に関連する。HC32-DATOU/MCC7ポリプレックスによって媒介される高い遺伝子形質移入効率の機構をより十分に理解するため、これらの物理化学的パラメーターを検討した。
カチオン性のHC32-DATOUは、負に帯電したMCC7を凝縮し、静電的自己集合を介してポリプレックスを形成すると考えられる(図19a)。これを確認するため、アガロースゲル電気泳動を行ってポリプレックス調製から2時間後のHC32-DATOUのDNA凝縮能力を評価した。図19bに示すように、裸のMCC7 DNAはゲル上でシフトしたが、HC32-DATOUは明らかなDNAシフトなしにウェル上でDNAを凝縮することができた。さらに、ヘパリン競合アッセイは、低いヘパリン濃度(0.1~0.3IU/μL)を有するHC32-DATOUポリプレックスが依然として大部分のDNAを凝縮することを示した。このことは、HC32-DATOUポリプレックスの強力なDNA凝縮能力及び高度に安定な特性を示唆するものである。
同様に、PicoGreenアッセイ(図19c)によって定量化されたように、HC32-DATOUは、96.3%という安定的かつ高いDNA結合親和性を示した。このことは、DNAアンパッキングがわずか3.7%であることを示している。3及び6IU/μL濃度のヘパリンを適用した場合、それぞれ68.2%及び99.6%のDNAアンパッキングが検出された。これらの結果は、HC32-DATOUが、調整可能な負に荷電したヘパリンの存在下で、制御された方式で効率的にDNAを縮合、結合、及び放出することを実証している。
効率的なC7発現のために最適化されたw/w比(30:1)において、ナノ粒子は、それぞれ平均サイズ110nm及び最頻サイズ81nm(図19d)、ゼータ電位は+37.4mV(図19e)を示した。これは、正の表面電荷を有するコンパクトなナノ粒子構造を示すものである。ポリプレックスは、最も一般的には球形またはトロイダル形状で形成されていることが知られている。これに関し、HC32-DATOU/MCC7ポリプレックスは、均一で球状の形態を示した(図19f)。
形質移入効率の強化は、ジアミン末端基修飾から利益を得ることが報告されている。この修飾は、ポリマーのカチオン電荷を増加させ、それによってポリマー/DNA結合動力学及びDNAのナノ粒子への縮合を改善し、DNAを分解から保護する。ジアミンDATOUによる末端修飾とは別に、1級、2級、3級アミンを含む複数のDNA結合/縮合部分がHC32骨格及び末端基に存在する。概して、LPAE/DNA粒子は250nm未満であり、より小さいサイズの粒子は、細胞によってより効率的に内在化されることが分かっている。
いかなる理論にも拘束されることなく、HC32/MCC7ポリプレックスの小さくコンパクトで均一でカチオン性の特性が高い細胞取込み効率を可能にすることが考えられる。さらに、複数のイオン化可能な2級及び3級アミンは、広範囲のプロトンを緩衝することができ、これは、「プロトンスポンジ効果」を介してエンド/リソソーム脱出を容易にし得る。その後、HC32-DATOUの安定的な遺伝子パッケージング安定性は、ポリプレックスの細胞質を介した核への細胞内輸送を支援し得ることを示唆する。
効率的なベクターは、DNAを保護するのに十分な結合強度とDNAを放出する能力とのバランスをとらなければならない。いかなる理論にも拘束されることなく、HC32-DATOUとMCC7との間の適度な静電相互作用及びHC32-DATOUの生分解性特性は、核内のポリプレックスからの遺伝子放出を容易にして転写ステップを開始させ得る。
実施例10:本開示のHPAEポリプレックスを含む凍結乾燥組成物
以下の実施例は、例示的なHPAE/DNAポリプレックス製剤のための凍結乾燥プロセスにおける貯蔵条件及び凍結保護物質濃度を変化させた結果について説明する。
凍結乾燥プロセスにおける貯蔵条件及び凍結保護物質濃度を変化させることによってHC32-DATOU/DNAポリプレックス製剤を最適化した。図20aは、GFPコードDNAを用いたRDEBK細胞におけるポリプレックス凍結乾燥加工及び遺伝子形質移入の試験のスキームを図示している。新鮮に調製したポリプレックス以外に、全てのポリプレックスを調製から1日後の遺伝子形質移入に用いた。図20bに示すように、保存温度を変化させることによって、室温で保存されたものを除いて、新鮮なポリプレックスならびに4℃、-20℃、及び-80℃で保存したポリプレックスは、フローサイトメトリーヒストグラム分布において、細胞集団の顕著なシフトを伴った同等かつ高いGFP発現を示している(図20c)。図20d及び20eに示すように、フローサイトメトリーで定量化された効率は70%より高く、正規化MFIは、UT群よりおよそ10倍高かった。これらの結果は、HC32-DATOU/DNAポリプレックスの高い遺伝子形質移入能力を維持するには低い貯蔵温度が好ましいことを実証している。
次に、フリーズドライプロセス中の凍結保護物質としてスクロースを用いて、凍結保護物質濃度がHC32-DATOU/DNAポリプレックスの遺伝子形質移入能力に及ぼす作用を調べた。凍結保護物質なし(0%スクロース)のフリーズドライポリプレックスは、形質移入能力の大部分が喪失し、UT細胞に比べて20%の効率及び1.4倍高いMFIを示すにとどまった。
凍結乾燥前に1%、3%、及び5%スクロースをポリプレックス溶液に添加すると、形質移入効率は、それぞれ54%、61%、52%まで増加した。これらの結果は、HC32-DATOU/DNAポリプレックスの高い遺伝子形質移入能力を維持するには3%スクロースがより効率的であることを実証している。遺伝子形質移入は、新鮮に調製したカウンターパートよりもいくらか低かったものの、低温で保存またはスクロースを伴ってフリーズドライしたポリプレックスの遺伝子形質移入能力は、市販の試薬SuperFect及びリポフェクタミンよりも依然としてはるかに高く、これらの試薬の効率はそれぞれ10%及び32%である。
さらに、ポリプレックス凍結乾燥は固有の利点を有する。第一に、より高い濃度でポリプレックスを再構成するのを可能にする。これは、限定的な投与体積が求められるインビボ注射に特に有益である。第二に、容易に調整可能な溶質(スクロース)は、製剤中に再構成されたポリプレックス溶液を等張にすることができる。また、スクロースを伴った凍結乾燥ポリプレックスは、新鮮に調製されたポリプレックスに比べて、血清の存在下でより安定していることが予想される。最後に、凍結乾燥したポリプレックスは、有効性を喪失することなく何年も保存することができる。
保存時間の異なる高性能のHC32-DATOU/DNAポリプレックス(4℃、-20℃、-80℃)について遺伝子形質移入試験を行った。図21に示すように、4℃で0.5または1ヵ月間保存した後、ポリプレックスのGluc活性は、新鮮に調製されたものによって媒介されるものより2~3桁低かった。2か月後、ポリプレックスの効率は無視できる程度になった。
これに対し、1年後であっても、-20℃及び-80℃で保存したポリプレックスは、新鮮に製剤化したポリプレックスと同じレベルのGluc活性を媒介した。これらの結果は、HC32-DATOU/DNAポリプレックスが非常に安定しており、-20℃または-80℃で保存するだけで遺伝子形質移入の完全な機能を保持し、そのため臨床応用に非常に適していることを実証している。
実施例9及び10のための材料:モノマー:5-アミノ-1-ペンタノール(AP、99%)、トリメチロールプロパントリアクリレート(TMPTA、99%)、1,11-ジアミノ-3,6,9-トリオキサウンデカン(DATOU、98%)をSigma-Aldrichから購入し、1,4-ブタンジオールジアクリレート(BDA、98%)をVWRから購入した。化学物質:臭化リチウム(LiBr、99%)、トリス緩衝食塩水、及びTween 20(TBST)、パラホルムアルデヒド(PFA)、及びトリトンX-100をSigma-Aldrichから購入した。溶媒:ジメチルスルホキシド(DMSO、Sigma-Aldrich、99%)、ジメチルホルムアミド(DMF、Fisher Scientific、99%)、ジエチルエーテル(Sigma-Aldrich、99%)、及び重水素化クロロホルム(CDCl、Sigma-Aldrich、99.9%)をそのまま使用した。分枝状ポリエチレンイミン(PEI、M=25kDa、Sigma-Aldrich)、SuperFect(QIAGEN)、リポフェクタミン2000(Invitrogen)を、市販の試薬対照として使用した。ケラチノサイト細胞基本培地(Clonetics KBM-Gold)及び補充パック(Clonetics KGM-Gold SingleQuots)をLonzaから購入した。細胞分泌Gaussia princepsルシフェラーゼ(Gluc)プラスミド及びBioLux GaussiaルシフェラーゼアッセイキットをNew England Biolabs UKから入手した。緑色蛍光タンパク質(GFP)プラスミドをAldevronから購入した。ハンクス平衡塩溶液(HBSS)、酢酸ナトリウム(SA、pH5.2±0.1、3M)バッファー、酢酸トリス-EDTA(TAE)バッファー及び放射免疫沈降アッセイ(RIPA)バッファー、アガロース、ウシ血清アルブミン(BSA)、ヤギ血清、マウスで生成されたモノクローナル抗C7抗体、プロテアーゼ阻害薬カクテル(PIC)、及びブラッドフォード試薬をSigma-Aldrichから購入した。1×ダルベッコリン酸緩衝食塩水(PBS)、Gibco OPTI-MEM I還元血清培地、4’,6-ジアミジノ-2-フェニルインドール(DAPI)、及びPicoGreenアッセイキットをLife Technologiesから購入した。ペニシリン-ストレプトマイシン(PS)、EcoRI、Alexa-568ヤギ抗マウスIgG(H+L)高交差吸着二次抗体、及びPierce ECL plus ウェスタンブロッティング基質をThermo Fisher Scientificから購入した。アラマーブルーアッセイキット、SYBR safe DNAゲル染色液、及びSuperScript III First-Strand Synthesis SuperMixをInvitrogenから購入した。コラーゲンVII型アルファ1(Fam-MGB、プライマー及びプローブ)、ヒトグリセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ(GAPDH)内在性対照(VIC/MGBプローブ、プライマー制限)、ならびにTaqMan gene expression master mixをApplied Biosystemsから購入した。TEバッファー(QIAGEN)、Cy3 DNA標識キット(Mirus)、RNeasy Mini Kit(QIAGEN)、DAPIを含むFluoroshieldマウンティング培地(Abcam)を製造業者のプロトコルに従って使用した。ポリクローナル抗C7ウサギ一次抗体(Merck Millipore)、抗ベータアクチンマウス一次抗体(Abcam)、抗ウサギIgG HRP結合抗体(Cell Signaling)、及び抗マウスIgG HRP結合抗体(Cell Signaling)はそのまま使用した。
本明細書で引用または他の形で参照もしくは開示される全ての参考文献は、参照によりその全体があらゆる目的で援用される。
[参考文献]
Figure 2022514113000146
Figure 2022514113000147
Figure 2022514113000148

Claims (142)

  1. 以下のプロセス:
    (a)式(A)の化合物
    Figure 2022514113000149
    を、式R-NHまたはR-N(H)-Z’-N(H)-Rを有する第1のアミンと反応させることと、
    (b)ステップ(a)の生成物を、式R-NHまたはR-N(H)-Z’’-N(H)-Rを有する第2のアミンと反応させることと、
    (c)ステップ(b)の生成物を式(B)の化合物と反応させることと
    Figure 2022514113000150
    と反応させることとによって作製される、ポリマーであって、式中、
    各Jが、独立的に-O-または-NH-であり、
    Z、Z’、及びZ’’が結合部分であり、
    Aが、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、2~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、または3~30個の原子を含む複素環であり、
    Aが、任意選択で、1つ以上のハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、またはC-C10アリールで置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
    Gが、-C-、-S-、-S(O)-、-P(OR)-、または-P(OH)-であり、
    各Qが、HまたはC-C10直鎖状もしくは分枝状アルキル基であり、
    各Eが、独立的に、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択され;
    及びR2が、各々独立的に、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、またはヘテロアリールであり、このとき、前記ヘテロシクリル及び前記ヘテロアリールが、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、前記C-C40アルキル、C-C40アルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールが、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、または-N(C-Cアルキル)で置換され、Rは、非置換であるか、またはハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10)アリールのうちの1つ以上で置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
    各nが少なくとも1である、前記ポリマー。
  2. Zが、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、3~30個の炭素原子を含むアルキレン-炭素環、3~30個の原子を含む複素環、または3~30個の原子を含むアルキレン-複素環であり、
    Zが、非置換であるか、またはハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10アリールのうちの少なくとも1つで置換されている(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、請求項1に記載のポリマー。
  3. Gが-C-である、請求項1または2に記載のポリマー。
  4. 前記式(B)の化合物が
    Figure 2022514113000151
    であり、式中、
    Rが、1~10個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~10個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~10個の炭素原子を含む炭素環、または3~10個の原子を含む複素環であり、Rが、非置換であるか、またはハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10アリールのうちの少なくとも1つで置換されており(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
    ’’が、非置換または置換された、1~10個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~10個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~10個の炭素原子を含む炭素環、または3~10個の原子を含む複素環である、請求項1~3のいずれか1項に記載のポリマー。
  5. 前記式(B)の化合物が
    Figure 2022514113000152
    である、請求項4に記載のポリマー。
  6. Zが、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、または1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖である、請求項1~5のいずれか1項に記載のポリマー。
  7. Zが、1~10個の炭素原子の直鎖状または分枝状炭素鎖である、請求項6に記載のポリマー。
  8. Zが
    Figure 2022514113000153
    であって、
    式中、xが1~1000である、請求項1~6のいずれか1項に記載のポリマー。
  9. 各Zが
    Figure 2022514113000154
    である、請求項1~6のいずれか1項に記載のポリマー。
  10. 及びRが、独立的に、
    Figure 2022514113000155
    からなる群より選択される、請求項1~9のいずれか1項に記載のポリマー。

  11. Figure 2022514113000156
    であり、R
    Figure 2022514113000157
    である、請求項10に記載のポリマー。
  12. モル過剰の前記式(A)の化合物が前記第1のアミンと反応させられる、請求項1~11のいずれか1項に記載のポリマー。
  13. 前記式(A)の化合物:前記第1のアミンの化学量論比が約1.2:1である、請求項12に記載のポリマー。
  14. ステップ(a)が有機溶媒中で実施される、請求項1~13のいずれか1項に記載のポリマー。
  15. 前記有機溶媒がDMSOである、請求項14に記載のポリマー。
  16. ステップ(a)が約40℃~約120℃の温度で実施される、請求項1~15のいずれか1項に記載のポリマー。
  17. ステップ(a)が約90℃で実施される、請求項16に記載のポリマー。
  18. 前記ステップ(a)の生成物がステップ(b)の前に精製されない、請求項1~17のいずれか1項に記載のポリマー。
  19. モル過剰の前記第2のアミンが前記ステップ(a)の生成物と反応させられる、請求項1~18のいずれか1項に記載のポリマー。
  20. ステップ(b)が約20℃~約25℃の温度で実施される、請求項1~19のいずれか1項に記載のポリマー。
  21. 前記ステップ(b)の生成物がステップ(c)の前に精製される、請求項1~20のいずれか1項に記載のポリマー。
  22. ステップ(c)がステップ(b)の温度よりも高い温度で実施される、請求項1~21のいずれか1項に記載のポリマー。
  23. ステップ(c)が約90℃で実施される、請求項22に記載のポリマー。
  24. 前記ポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターが約0.5未満である、請求項1~23のいずれか1項に記載のポリマー。
  25. 前記ポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターが約0.2~約0.5である、請求項1~24のいずれか1項に記載のポリマー。
  26. 前記ポリマーのPDIが約1.01~約8.0である、請求項1~25のいずれか1項に記載のポリマー。
  27. 前記ポリマーのPDIが約2.5である、請求項1~26のいずれか1項に記載のポリマー。
  28. 前記ポリマーのMが少なくとも3kDaである、請求項1~27のいずれか1項に記載のポリマー。
  29. 前記ポリマーのMが約5kDaから50kDaの間である、請求項1~28のいずれか1項に記載のポリマー。
  30. 前記ポリマーのMが約10kDaである、請求項1~29のいずれか1項に記載のポリマー。
  31. ステップ(b)の後の前記生成物のMが約3kDaである、請求項1~30のいずれか1項に記載のポリマー。
  32. ポリマーを作製する方法であって、
    (a)式(A)の化合物
    Figure 2022514113000158
    を、式R-NHまたはR-N(H)-Z’-N(H)-Rを有する第1のアミンと反応させることと、
    (b)(a)の生成物を、式R-NHまたはR-N(H)-Z’’-N(H)-Rを有する第2のアミンと反応させることと、
    (c)(b)の生成物を式(B)の化合物と反応させることとを含み、
    Figure 2022514113000159
    式中、
    各Jが、独立的に-O-または-NH-であり、
    Z、Z’、及びZ’’が結合部分であり、
    Aが、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、2~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、または3~30個の原子を含む複素環であり、
    Aが、任意選択で、1つ以上のハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、またはC-C10アリールで置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
    Gが、-C-、-S-、-S(O)-、-P(OR)-、または-P(OH)-であり、
    各Qが、HまたはC-C10直鎖状もしくは分枝状アルキル基であり、
    各Eが、独立的に、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択され;
    及びR2が、各々独立的に、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、またはヘテロアリールであり、このとき、前記ヘテロシクリル及び前記ヘテロアリールが、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、前記C-C40アルキル、C-C40アルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールが、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、または-N(C-Cアルキル)で置換され、Rは、非置換であるか、またはハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10)アリールのうちの1つ以上で置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
    各nが少なくとも1である、前記方法。
  33. Zが、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、または3~30個の原子を含む複素環であり、
    Zが、非置換であるか、またはハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10アリールのうちの少なくとも1つで置換されている(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、請求項32に記載のポリマー。
  34. Gが-C-である、請求項32または33に記載の方法。
  35. 前記式(B)の化合物が
    Figure 2022514113000160
    であり、式中、
    Rが、非置換であるか、またはハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10アリールのうちの少なくとも1つで置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
    ’’が、非置換または置換された、1~10個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~10個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~10個の炭素原子を含む炭素環、または3~10個の原子を含む複素環である、請求項32~34のいずれか1項に記載の方法。
  36. 前記式(B)の化合物が
    Figure 2022514113000161
    である、請求項35に記載の方法。
  37. Zが、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、または1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖である、請求項32~36のいずれか1項に記載の方法。
  38. Zが、1~10個の炭素原子の直鎖状または分枝状炭素鎖である、請求項37に記載の方法。
  39. Zが
    Figure 2022514113000162
    であり、
    式中、xが1~1000である、請求項32~37のいずれか1項に記載の方法。
  40. Zが
    Figure 2022514113000163
    である、請求項32~38のいずれか1項に記載の方法。
  41. 及びRが、独立的に、
    Figure 2022514113000164
    からなる群より選択される、請求項32~40のいずれか1項に記載の方法。

  42. Figure 2022514113000165
    であり、R
    Figure 2022514113000166
    である、請求項41に記載の方法。
  43. モル過剰の前記式(A)の化合物が前記第1のアミンと反応させられる、請求項32~42のいずれか1項に記載の方法。
  44. 前記式(A)の化合物:前記第1のアミンの化学量論比が約1.2:1である、請求項43に記載の方法。
  45. ステップ(a)が有機溶媒中で実施される、請求項32~44のいずれか1項に記載の方法。
  46. 前記有機溶媒がDMSOである、請求項45に記載の方法。
  47. ステップ(a)が約20℃~約200℃の温度で実施される、請求項32~46のいずれか1項に記載の方法。
  48. ステップ(a)が約90℃で実施される、請求項47に記載の方法。
  49. 前記ステップ(a)の生成物が(b)の前に精製されない、請求項32~48のいずれか1項に記載の方法。
  50. モル過剰の前記第2のアミンが前記ステップ(a)の生成物と反応させられる、請求項32~49のいずれか1項に記載の方法。
  51. ステップ(b)が約20℃~約25℃の温度で実施される、請求項32~50のいずれか1項に記載の方法。
  52. 前記ステップ(b)の生成物がステップ(c)の前に精製される、請求項32~51のいずれか1項に記載の方法。
  53. ステップ(c)がステップ(b)の温度よりも高い温度で実施される、請求項32~52のいずれか1項に記載の方法。
  54. ステップ(c)が約90℃で実施される、請求項53に記載の方法。
  55. 前記ポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターが約0.5未満である、請求項32~54のいずれか1項に記載の方法。
  56. 前記ポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターが約0.3~約0.5である、請求項32~55のいずれか1項に記載の方法。
  57. 前記ポリマーのPDIが約2.0~約3.0である、請求項32~56のいずれか1項に記載の方法。
  58. 前記ポリマーのPDIが約2.5である、請求項32~57のいずれか1項に記載の方法。
  59. 前記ポリマーのMが少なくとも3kDaである、請求項32~58のいずれか1項に記載の方法。
  60. 前記ポリマーのMが約5kDaから50kDaの間である、請求項32~59のいずれか1項に記載の方法。
  61. 前記ポリマーのMが約10kDaである、請求項32~60のいずれか1項に記載の方法。
  62. ステップ(b)の後の前記生成物のMが約3kDaである、請求項32~61のいずれか1項に記載の方法。
  63. 核酸成分と、請求項1~31のポリマーまたは式(I)のポリマーのいずれかとを含む、ポリプレックスであって、
    Figure 2022514113000167
    式中、
    各Aが、独立的に、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、または3~30個の原子を含む複素環であり、
    Aが、任意選択で、1つ以上のハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、またはC-C10アリールで置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
    各Bが、独立的に、第1の結合部分であり、
    各Xが、独立的に、
    Figure 2022514113000168
    であり、
    各Yが、独立的に、
    Figure 2022514113000169
    であり、
    各Lが、独立的に、第2の結合部分であり、
    各R、R、及びRが、各出現において独立的に、H、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、もしくはヘテロアリールであり、前記ヘテロシクリル及び前記ヘテロアリールが、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、前記C-Cアルキル、C-Cアルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-Cアルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールが、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、もしくは-N(C-Cアルキル)で置換され、または
    及びRが、それらが結合する原子と一緒になって、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~3個のヘテロ原子を含むヘテロシクリルまたはヘテロアリールを形成してもよく、
    aが1~1000であり、
    bが1~4であり、
    cが1~3であり、
    zが1~100であり、
    ただし、R及びRの少なくとも一方がHではないことを前提とする、前記ポリプレックス。
  64. 前記式(I)のポリマーが、式(II)の構造:
    Figure 2022514113000170
    であって、式中、
    各Eが、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択され;
    各Eが、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択され;
    Gが、-C-、-S-、-S(O)-、-P(OR)-、または-P(OH)-であり、
    nが少なくとも1である、前記式(II)の構造を有する、請求項63に記載のポリプレックス。
  65. 各Bが
    Figure 2022514113000171
    である、請求項63または64に記載のポリプレックス。
  66. Bが
    Figure 2022514113000172
    である、請求項63~65のいずれか1項に記載のポリプレックス。
  67. 各Lが
    Figure 2022514113000173
    であり、
    式中、xが1~1000である、請求項63~66のいずれか1項に記載のポリプレックス。
  68. aが少なくとも2であり、
    bが3であり、
    各Xが
    Figure 2022514113000174
    である、請求項63~67のいずれか1項に記載のポリプレックス。
  69. 各Aが
    Figure 2022514113000175
    である、請求項68に記載のポリプレックス。
  70. 各Lが
    Figure 2022514113000176
    である、請求項68または69に記載のポリプレックス。
  71. Yが
    Figure 2022514113000177
    であり、各Bが
    Figure 2022514113000178
    または
    Figure 2022514113000179
    である、請求項68~70のいずれか1項に記載のポリプレックス。
  72. 各R及び/またはR
    Figure 2022514113000180
    である、請求項68~71のいずれか1項に記載のポリプレックス。
  73. 各R1が
    Figure 2022514113000181
    である、請求項68~72のいずれか1項に記載のポリプレックス。
  74. 前記式(I)のポリマーが、式(III)~(VIIe)の構造:
    Figure 2022514113000182
    Figure 2022514113000183
    Figure 2022514113000184
    であって、
    各R、R、及びRが、各出現において独立的に、H、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、もしくはヘテロアリールであり、前記ヘテロシクリル及び前記ヘテロアリールが、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、前記C-Cアルキル、C-Cアルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-Cアルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールが、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、もしくは-N(C-Cアルキル)で置換され、残りの変数が請求項1、63、または64で定義されている通りである、前記構造を有する、請求項68に記載のポリプレックス。
  75. zが1~3である、請求項63~74のいずれかに記載のポリプレックス。
  76. zが1である、請求項75に記載のポリプレックス。

  77. Figure 2022514113000185
    であり、nが1である、請求項63~74のいずれかに記載のポリプレックス。

  78. Figure 2022514113000186
    である、請求項77に記載のポリプレックス。
  79. 核酸成分と、以下のポリマー:
    Figure 2022514113000187
    とを含むポリプレックスであって、
    各Jが、独立的に-O-または-NH-であり、
    Z及びZ’’が結合部分であり、
    Aが、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、2~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、または3~30個の原子を含む複素環であり、
    Aが、任意選択で、1つ以上のハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、またはC-C10アリールで置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、
    Gが、-C-、-S-、-S(O)-、-P(OR)-、または-P(OH)-であり、
    各Qが、HまたはC-C10直鎖状もしくは分枝状アルキル基であり、
    各Eが、独立的に、共有結合、-N-、-O-、-S-、アルキレン、ヘテロアルキレン、アルケニル、ヘテロアルケニレン、アルキニル、ヘテロアルキニレンからなる群より選択され;
    及びR2が、各々独立的に、C-C40アルキル、C-C40ヘテロアルキル、C-C40アルケニル、C-C40ヘテロアルケニレン、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-C40ヘテロアルキニレン、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、またはヘテロアリールであり、このとき、前記ヘテロシクリル及び前記ヘテロアリールが、N、S、P、及びOからなる群より選択される1~5個のヘテロ原子を含み、前記C-C40アルキル、C-C40アルケニル、C-Cシクロアルケニル、C-C40アルキニル、C-Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、アリール、及びヘテロアリールが、任意選択で、D、ハロゲン、C-Cアルキル、-OH、-O-C-Cアルキル、-NH、-NH(C-Cアルキル)、または-N(C-Cアルキル)で置換され、Rは、非置換であるか、またはハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10)アリールのうちの1つ以上で置換され(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、nが少なくとも1である、前記ポリプレックス。
  80. Zが、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖、3~30個の炭素原子を含む炭素環、または3~30個の原子を含む複素環であり、
    Zが、非置換であるか、またはハロゲン、ヒドロキシル、アミノ基、スルホニル基、スルホンアミド基、チオール、C-Cアルキル、C-Cアルコキシ、C-Cエーテル、C-Cチオエーテル、C-Cスルホン、C-Cスルホキシド、C-C1級アミド、C-C2級アミド、ハロC-Cアルキル、カルボキシル基、シアノ基、ニトロ基、ニトロソ基、-OC(O)NR’R’、-N(R’)C(O)NR’R’、-N(R’)C(O)O-C-Cアルキル、C-Cシクロアルキル、C-Cヘテロシクリル、C-Cヘテロアリール、及びC-C10アリールのうちの少なくとも1つで置換されている(式中、各R’は、独立的に、水素及びC-Cアルキルからなる群より選択される)、請求項79に記載のポリプレックス。
  81. Gが-C-である、請求項79~80のいずれかに記載のポリプレックス。
  82. JがOである、請求項79~81のいずれかに記載のポリプレックス。
  83. Zが、1~30個の炭素原子の直鎖状もしくは分枝状炭素鎖、または1~30個の原子の直鎖状もしくは分枝状ヘテロ原子含有炭素鎖である、請求項79~82のいずれかに記載のポリプレックス。
  84. Zが、1~10個の炭素原子の直鎖状または分枝状炭素鎖である、請求項79~83のいずれかに記載のポリプレックス。
  85. Zが
    Figure 2022514113000188
    であり、
    式中、xが1~1000である、請求項79~83のいずれかに記載のポリプレックス。
  86. Zが
    Figure 2022514113000189
    である、請求項79~84のいずれかに記載のポリプレックス。
  87. 及びRが、独立的に、
    Figure 2022514113000190
    からなる群より選択される、請求項79~86のいずれかに記載のポリプレックス。

  88. Figure 2022514113000191
    であり、R
    Figure 2022514113000192
    である、請求項87に記載のポリプレックス。

  89. Figure 2022514113000193
    であり、R
    Figure 2022514113000194
    である、請求項87に記載のポリプレックス。
  90. 前記ポリマーが、
    Figure 2022514113000195
    を含む、請求項79~89のいずれかに記載のポリプレックス。
  91. 前記ポリマーが、
    Figure 2022514113000196
    を含む、請求項79~89のいずれかに記載のポリプレックス。
  92. 前記ポリマーが、
    Figure 2022514113000197
    を含む、請求項79~84または86~91のいずれかに記載のポリプレックス。
  93. 前記ポリマーが、
    Figure 2022514113000198
    を含み、式中、
    JがOであり、Zが
    Figure 2022514113000199
    であり、式中、xが1~1000である、請求項79~83、85,または87~91のいずれかに記載のポリプレックス。
  94. 前記ポリマーが、
    Figure 2022514113000200
    を含む、請求項79~93のいずれかに記載のポリプレックス。
  95. 前記ポリマーが、
    Figure 2022514113000201
    を含み、式中、

    Figure 2022514113000202
    であり、

    Figure 2022514113000203
    から選択される、請求項79~89のいずれかに記載のポリプレックス。
  96. 前記ポリマーが、
    Figure 2022514113000204
    を含み、式中、
    JがOであり、Zが
    Figure 2022514113000205
    であり、式中、xが1~1000であり、

    Figure 2022514113000206
    であり、

    Figure 2022514113000207
    である、請求項79~89のいずれかに記載のポリプレックス。
  97. 前記ポリマーのMが約3kDa~約200kDaである、請求項79~96のいずれかに記載のポリプレックス。
  98. 前記ポリマーのMが約5kDa~約50kDaである、請求項79~96のいずれかに記載のポリプレックス。
  99. 前記ポリマーのMが約10kDa~50kDaである、請求項79~96のいずれかに記載のポリプレックス。
  100. 前記ポリマーのMが約5kDa~約15kDaである、請求項79~96のいずれかに記載のポリプレックス。
  101. 前記ポリマーのMが約10kDaである、請求項79~96のいずれかに記載のポリプレックス。
  102. 前記ポリマーのMが約20kDaである、請求項79~96のいずれかに記載のポリプレックス。
  103. 前記ポリマーのMが約30kDaである、請求項79~96のいずれかに記載のポリプレックス。
  104. 前記ポリマーのMが約40kDaである、請求項79~96のいずれかに記載のポリプレックス。
  105. 前記ポリマーのマーク-フウィンクから定義されるアルファパラメーターが約0.5未満である、請求項79~103のいずれかに記載のポリプレックス。
  106. 前記ポリマーのマーク-フウィンクの式から定義されるアルファパラメーターが約0.3~約0.5を範囲とする、請求項79~104のいずれかに記載のポリプレックス。
  107. 前記ポリマーのPDIが約1.0~約8.0である、請求項79~105のいずれかに記載のポリプレックス。
  108. 前記ポリマーのPDIが約2.5である、請求項79~106のいずれかに記載のポリプレックス。
  109. ポリマー及び核酸成分が約20:1~約80:1(w/w)の比で存在する、請求項107に記載のポリプレックス。
  110. ポリマー及び核酸成分が約30:1(w/w)の比で存在する、請求項108に記載のポリプレックス。
  111. 約2μm未満の粒子サイズを有する、請求項63~109のいずれかに記載のポリプレックス。
  112. 約60nm~約250nmの粒子サイズを有する、請求項110に記載のポリプレックス。
  113. 約175nm~約250nmの粒子サイズを有する、請求項110に記載のポリプレックス。
  114. 約0mV~約100mVのゼータ電位を有する、請求項63~112のいずれか1項に記載のポリプレックス。
  115. 前記ゼータ電位が約30mV~約34mVである、請求項113に記載のポリプレックス。
  116. 前記ポリプレックスが球形である、請求項63~114のいずれか1項に記載のポリプレックス。
  117. 前記ポリマーのMが約10kDaである、請求項63~87のいずれか1項に記載のポリプレックス。
  118. 前記核酸成分が、プラスミド、ナノプラスミド、核酸、ミニサークル、または遺伝子編集システムである、請求項63~116のいずれか1項に記載のポリプレックス。
  119. 前記ナノプラスミドが、真核導入遺伝子及び0.5kb未満のサイズの細菌骨格を含む、請求項117に記載のポリプレックス。
  120. 前記プラスミドまたはナノプラスミドが、抗生物質耐性マーカーなしのプラスミドまたは抗生物質耐性マーカーなしのナノプラスミドである、請求項117に記載のポリプレックス。
  121. 前記プラスミドまたはナノプラスミドが、スクロース選択マーカーまたはナンセンスサプレッサーマーカーを含む、請求項117に記載のポリプレックス。
  122. 前記遺伝子編集システムが、(i)クラスター化等間隔短回文リピート(CRISPR)関連(Cas)システム、(ii)転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN)システム、または(iii)ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)システムである、請求項117に記載のポリプレックス。
  123. 前記核酸がRNAi誘導分子である、請求項117に記載のポリプレックス。
  124. 前記RNAi誘導分子が、siRNA、dsRNA、shRNA、及びマイクロRNAからなる群より選択される、請求項122に記載のポリプレックス。
  125. 前記核酸成分が組織特異的プロモーターを含む、請求項63~116のいずれか1項に記載のポリプレックス。
  126. 前記核酸成分が、遺伝子疾患または障害に関連する遺伝子を含む、請求項63~116のいずれか1項に記載のポリプレックス。
  127. 前記遺伝子疾患または障害が、タンパク質発現の低下、不在、または機能不全をもたらす1つ以上の遺伝子の変異によって引き起こされる、請求項125に記載のポリプレックス。
  128. 前記遺伝子が、COL7A1、LAMB3、ADA、SERPINA1、CFTR、HTT、NF1、PHA、HBS、FERMT1、KRT14、DSP、SPINK5、及びFLGからなる群より選択される、請求項126に記載のポリプレックス。
  129. 前記遺伝子がCOL7A1であり、前記遺伝子疾患または障害が表皮水疱症の形態である、請求項127に記載のポリプレックス。
  130. 前記遺伝子の配列が、前記ポリプレックスを細胞に送達した際にタンパク質発現が最大限になるように最適化されている、請求項125に記載のポリプレックス。
  131. 請求項63~129のいずれかに記載のポリプレックスの有効量と医薬的に許容される担体との組合せを含む、医薬組成物。
  132. 前記医薬的に許容される担体が、経口、非経口、吸入、局所、皮下、筋肉内、静脈内、眼内、または皮内の投与に適している、請求項130に記載の医薬組成物。
  133. 前記医薬組成物が、非水性ローション、油中水型ローション、及び水中油型ローションからなる群より選択されるローションとして製剤化される、請求項131に記載の医薬組成物。
  134. 前記医薬組成物が将来使用するために凍結乾燥される、請求項130に記載の医薬組成物。
  135. 前記医薬組成物が水性溶液中で凍結される、請求項130に記載の医薬組成物。
  136. 細胞形質移入の方法であって、標的細胞にポリプレックスを形質移入するのに適した条件下で、1つ以上の前記標的細胞を、請求項130~134のいずれか1項に記載の医薬組成物に接触させることを含む、前記方法。
  137. 前記1つ以上の標的細胞が真核細胞である、請求項135に記載の方法。
  138. 前記1つ以上の標的細胞が、T細胞、B細胞、血球、肺胞細胞、肺細胞、脳ニューロン、皮膚ニューロン、上皮細胞、ケラチノサイト、iPS細胞、線維芽細胞、及び汗腺細胞のうちの1つ以上である、請求項136に記載の方法。
  139. 疾患の治療を必要とする患者における前記疾患を治療する方法であって、前記患者の細胞のうちの1つ以上に前記ポリプレックス核酸成分が形質移入されるように、請求項130~134のいずれか1項に記載の医薬組成物の治療有効量を投与することを含む、前記方法。
  140. 疾患の治療を必要とする患者における前記疾患を治療する方法であって、請求項130~134のいずれか1項に記載の治療的に有効な医薬組成物を投与することを含み、前記組成物の前記投与が、対象における標的遺伝子の不完全な翻訳を補正する、前記方法。
  141. 前記遺伝子が、COL7A1、LAMB3、ADA、SERPINA1、CFTR、HTT、NF1、PHA、HBS、FERMT1、KRT14、DSP、SPINK5、及びFLGからなる群より選択される、請求項139に記載の方法。
  142. 前記疾患が、アデノシンデアミナーゼ(ADA)欠損症、アルファ-1アンチトリプシン欠損症、嚢胞性線維症、ハンチントン病、1型神経線維腫症、フェニルケトン尿症、鎌状赤血球症、孤発性封入体筋炎、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、キンドラー症候群、接合部型表皮水疱症、栄養障害型表皮水疱症(常染色体劣性)、栄養障害型表皮水疱症(限局型バリアント)、痒疹型表皮水疱症、表皮水疱症(前脛骨型)、網状色素性皮膚症、単純型表皮水疱症(Dowling-Meara型)、単純型表皮水疱症(Koebner型)、単純型表皮水疱症(劣性1)、単純型表皮水疱症(Weber-Cockayne型)、Naegeli-Franceschetti-Jadassohn症候群、表皮水疱症(致死性棘融解型症)、ネザートン症候群、尋常性魚鱗癬、アトピー性皮膚炎、アッシャー症候群、Ehlers-Danlos症候群、ホモ接合性家族性高コレステロール血症(HoFH)、またはクローン病である、請求項139に記載の方法。
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